Repository 'ewastools'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/kpbioteam/ewastools

Changeset 31:261b4787df3a (2019-02-22)
Previous changeset 30:ebb549745674 (2019-02-22) Next changeset 32:82b560779475 (2019-02-22)
Commit message:
Uploaded
added:
test-data/M_Value_Matrix.txt
b
diff -r ebb549745674 -r 261b4787df3a test-data/M_Value_Matrix.txt
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/M_Value_Matrix.txt Fri Feb 22 10:55:51 2019 -0500
b
b'@@ -0,0 +1,485513 @@\n+"1" "2" "3" "4"\n+"cg00050873" 3.44105308932244 3.53269731173063 3.11451813808205 3.32866672067078\n+"cg00212031" -2.5298209465287 -1.6064956622708 -0.67235651274313 -1.9168060644736\n+"cg00213748" 1.29598482763508 0.775646062330266 0.369485347464436 0.758742536561458\n+"cg00214611" -1.54563008832306 -1.59207990559031 -2.6762776674671 -1.71620703399941\n+"cg00455876" 1.01564518087684 1.8492980552982 1.48592942081437 1.20015318085718\n+"cg01707559" -2.08275958127628 -1.74936590694844 -2.2592487961023 -2.87697754265506\n+"cg02004872" -3.77312054100273 -4.9330472137299 -5.16741814583174 -4.71100895985128\n+"cg02011394" 6.11770071532434 6.16040574250414 5.97388087602709 5.98545096150308\n+"cg02050847" 4.64449962769852 5.35167543828141 4.41503749927884 4.15152399406487\n+"cg02233190" -4.09381367340273 -3.20523947389523 -3.12719970244448 -3.41058571470776\n+"cg02494853" -6.67640676191852 -6.4594316186373 -6.3153113265712 -5.92667721750733\n+"cg02839557" -3.98757055045848 -2.82774404241617 -2.80327374524579 -3.31699119616719\n+"cg02842889" -2.51316114994851 -3.16308757138876 -3.03771966594916 -3.5933537709803\n+"cg03052502" 6.59726630158549 5.46078774755516 6.12437840797901 5.04930403348226\n+"cg03155755" 3.87851141543571 4.84068838472515 4.17944905853061 4.16591193893569\n+"cg03244189" -1.70828283946212 -1.85851582184024 -1.00260649581448 -1.85947765313374\n+"cg03443143" 3.72458259279311 3.94450196265988 3.49503994570732 3.38113368428608\n+"cg03683899" -2.95995963979865 -3.05138538626691 -3.23609669054433 -2.67111914447087\n+"cg03695421" 1.11396996145046 0.9170514287984 1.27347482686029 1.09896645080102\n+"cg03706273" -0.192353069340113 -0.128359142234677 0.488021647997594 0.454430431442513\n+"cg03750315" -2.13523335012511 -2.63764281739733 -1.93548436738465 -1.70747882966583\n+"cg03767353" 1.33184356375245 2.06151055564786 2.08553281415194 1.14401591191483\n+"cg04016144" 4.92858566670784 4.37951692387831 5.21184892709498 4.64129915259435\n+"cg04023335" -1.22302554837179 -1.47698138008605 -1.89263786214353 -2.49295722290615\n+"cg04042030" -4.95598514513669 -5.29355635061069 -5.25334100962995 -4.66466396684327\n+"cg04303809" -1.19703684705955 -2.6112897831515 -1.14319463582779 -1.12330964216718\n+"cg04448376" -0.66781943312544 0.317527394858317 -0.943649145618636 -2.72623918757315\n+"cg04462340" 3.06828473956647 3.15250255512249 2.82474864295107 3.23527371263318\n+"cg04689676" -2.84859941023499 -2.98553463806173 -3.18802680781762 -3.41325087980483\n+"cg04792227" -1.56044253633286 -0.927096193622831 -1.91200835564317 -1.94683997565623\n+"cg04840163" -1.52280602465859 -1.61708127522349 -1.28504302676755 -0.961408225194603\n+"cg04964672" 3.60170848000267 3.5541974152022 3.47904570171708 3.05367986201516\n+"cg05213048" 2.73475524435298 2.31088348560951 2.23497279201911 3.94295985031604\n+"cg05230942" 0.155749232677945 0.0752881273042372 0.0707879174894269 0.223543354816626\n+"cg05480730" -4.25677541536211 -3.33616533254413 -3.63489457000591 -3.74084455378595\n+"cg05544622" 5.38687730059526 5.61791405429607 4.95792902926321 5.48125798109048\n+"cg05621349" -2.79839405448598 -2.94955097731264 -1.69694227390487 -2.15894524599604\n+"cg05865243" 6.583230956609 6.04429989638609 5.40162052425042 5.73929747997986\n+"cg05890011" -2.02611284031913 -2.26206452677818 -2.53929690108573 -2.20674527498725\n+"cg06322277" 2.6769042036803 2.32832586608551 2.04574988882474 1.56755282246153\n+"cg06479204" -3.093948494215 -2.5632735836109 -3.50881537068783 -2.5651778487067\n+"cg07731488" -5.63349065649448 -5.59347181784832 -6.4700267338765 -5.59494658929378\n+"cg07747963" 2.18739996799694 1.64173969242641 1.59181617176222 1.04485423578426\n+"cg07939587" 0.582475094862061 0.980952339297552 0.510845811672722 0.845156954769988\n+"cg08242338" 6.1953745466471 6.19109085847934 6.59047075597529 6.10959380391447\n+"cg08265308" 1.21905091424706 1.50695998871988 0.933086666660533 1.3336008982532\n+"cg08921682" -0.43620506677976 -0.243411310082304 1.30361178825176 0.788599128798525\n+"cg0935091'..b' -2.41471302611447 -2.60576381944343 -2.39938290277685 -2.58990929238445\n+"ch.22.107403R" -4.87817929896699 -5.11563552049146 -4.58365252948502 -4.62641323459956\n+"ch.22.137888R" -2.68069129909607 -2.64125741826127 -2.55512420492412 -2.56238572750962\n+"ch.22.138449R" -3.1500965551662 -4.03653485691749 -2.96536299832798 -3.09432738254815\n+"ch.22.147839R" -4.08650899325468 -3.06807824202932 -4.90549601353677 -3.89194936203704\n+"ch.22.149158R" -2.64320764175711 -3.22396885023949 -2.16308757138876 -2.02946690894067\n+"ch.22.163059F" -3.58646452588639 -3.92136201488186 -4.23887764556096 -4.283088353024\n+"ch.22.22597277R" -4.69735754748888 -4.81162725935027 -5.0393056460294 -4.45256819957841\n+"ch.22.217069R" -3.92687670349714 -4.53148273425479 -3.49833891458415 -3.36582090131755\n+"ch.22.22928834R" -4.90763713898398 -4.4632933966493 -3.3144626446408 -4.00430146375156\n+"ch.22.243204R" -1.78910921312959 -2.8971392110448 -2.16829667729554 -2.1001818975442\n+"ch.22.23746271F" -4.75393017297048 -4.57839583011731 -4.58055395629483 -5.08132402272258\n+"ch.22.25752197R" -5.11969785887418 -5.75529741693846 -5.3692739285473 -5.45506622893469\n+"ch.22.26167205F" -5.10308755925619 -5.36755917797347 -5.12402603154787 -5.26758360979854\n+"ch.22.317144R" -3.88359542812295 -3.97774719315287 -4.11215616427403 -4.61214200889404\n+"ch.22.26442001R" -5.00814252139495 -5.15584369097116 -4.73074735656755 -5.06473278653654\n+"ch.22.363412F" -1.99200720924647 -3.4447848426729 -2.88790749224095 -3.26160245034066\n+"ch.22.28920330F" -3.70098719586857 -3.6462415579846 -1.50120609531734 -2.02278560440148\n+"ch.22.30020508R" -5.2714956772971 -5.24329343941764 -3.67902834422756 -3.81520186591666\n+"ch.22.427671F" -4.55549568273982 -4.95325772793175 -4.33476322106002 -4.60886957493025\n+"ch.22.436090R" -3.08101935112486 -3.45312244659581 -1.99598693749338 -2.3945318438442\n+"ch.22.439136F" -3.65782537408071 -4.45548443412063 -3.60474715273561 -4.27452522565657\n+"ch.22.441164F" -4.67740874948575 -4.63307970612233 -3.98245374492528 -4.14899434357271\n+"ch.22.467397R" -5.10292264457613 -5.42479614913847 -3.62982503957118 -3.61810384523279\n+"ch.22.31817810F" -5.05200479333993 -5.13717228851926 -4.61063366404187 -4.58104532470376\n+"ch.22.33863861F" -3.84179294382534 -3.93133026330664 -3.86819937367492 -3.80704767148869\n+"ch.22.528917R" -2.8943589637999 -2.6743774215549 -1.84528739806732 -1.93179593737134\n+"ch.22.533187F" -3.9346344410949 -4.55046127684334 -4.38065783200702 -4.20974388598694\n+"ch.22.569473R" -2.70395230079554 -2.35214270793437 -2.37866475662811 -2.59297477958471\n+"ch.22.38010425R" -4.42578989758852 -4.58233661577667 -4.59925553819659 -4.87935464592014\n+"ch.22.694298R" -3.21252032052736 -3.80995047605466 -2.13657305287544 -2.57641317175648\n+"ch.22.707049R" -4.03984026453179 -4.26922833824405 -4.19543187650727 -3.71768653167132\n+"ch.22.707968R" -5.20628840266114 -5.02289119233435 -5.12196621509783 -4.78617636011388\n+"ch.22.728807R" -2.29046416633445 -2.45748246944522 -2.3032780377797 -2.59775405416653\n+"ch.22.734399R" -2.23135885815931 -2.81563044211511 -2.29014160621971 -2.2186144943569\n+"ch.22.740407F" -4.39985292569968 -4.3249368447597 -4.4077888315412 -3.93946473136578\n+"ch.22.757911F" -4.37392273252562 -4.04112323041526 -4.05528243550119 -4.75684445727144\n+"ch.22.772318F" -3.6426011265891 -3.66911887986548 -3.54248364515562 -3.57957930402425\n+"ch.22.43177094F" -5.96204376565632 -6.14488734204883 -5.79585347759425 -5.40564992078487\n+"ch.22.44116734F" -4.07474058031523 -4.12820194155463 -4.10548871660529 -4.0841810869304\n+"ch.22.909671F" -3.03549641248872 -3.64562331270039 -3.03129613048954 -2.82339493332187\n+"ch.22.46830341F" -4.89185414255762 -5.07901365141452 -5.10765674225208 -4.73007493701085\n+"ch.22.1008279F" -5.13697941105838 -5.50104359820762 -6.73245011304371 -5.59421974851914\n+"ch.22.47579720R" -3.54512520164375 -3.90890225529893 -3.73494891697271 -3.75963389264693\n+"ch.22.48274842R" -3.53506527904335 -3.81150757804889 -2.93197765166622 -3.4121934806841\n'