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Commit message:
planemo upload for repository https://git.ufz.de/lehmanju/rnaquast commit d68ebc953fe79f2909c79ef1b133300f450aa822 |
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modified:
macros.xml rna_quast.xml test-data/test_08_short_report.tab |
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added:
test-data/transcriptome-02.fasta test-data/transcriptome?02.fasta |
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removed:
test-data/transcriptome02.fasta |
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| b |
| @@ -12,6 +12,6 @@ </xrefs> </xml> <token name="@TOOL_VERSION@">2.2.3</token> - <token name="@VERSION_SUFFIX@">0</token> + <token name="@VERSION_SUFFIX@">1</token> <token name="@PROFILE@">20.05</token> </macros> \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 8e66f695d859 -r 3125faf00ffd rna_quast.xml --- a/rna_quast.xml Wed Jan 10 13:24:53 2024 +0000 +++ b/rna_quast.xml Fri Aug 30 13:23:03 2024 +0000 |
| [ |
| @@ -13,16 +13,16 @@ mkdir -p './fasta_files/' && #import os, re, glob #for $i in $transcripts - ln -s '$i' '${re.sub('[^\w\-.]', '_', i.element_identifier)}' && + ln -s '$i' '${re.sub('[^\w.]', '_', i.element_identifier)}' && #end for #if $reference #for $rf in $reference - ln -s '$rf' '${re.sub('[^\w\-.]', '_', rf.element_identifier)}' && + ln -s '$rf' '${re.sub('[^\w.]', '_', rf.element_identifier)}' && #end for #end if #if $gene_coordinates.selector == "true" #for $g in $gene_coordinates.gtf - ln -s '$g' '${re.sub('[^\w\-.]', '_', g.element_identifier)}' && + ln -s '$g' '${re.sub('[^\w.]', '_', g.element_identifier)}' && #end for #end if mkdir outputdir && @@ -30,7 +30,7 @@ --threads \${GALAXY_SLOTS:-8} --transcripts #for $i in $transcripts - '${re.sub('[^\w\-.]', '_', i.element_identifier)}' + '${re.sub('[^\w.]', '_', i.element_identifier)}' #end for #if $reads_option.selector == 'paired' --left_reads '${reads_option.forward_reads}' @@ -45,13 +45,13 @@ #if $reference -r #for $rf in $reference - '${re.sub('[^\w\-.]', '_', rf.element_identifier)}' + '${re.sub('[^\w.]', '_', rf.element_identifier)}' #end for #end if #if $gene_coordinates.selector == "true" --gtf #for $g in $gene_coordinates.gtf - '${re.sub('[^\w\-.]', '_', g.element_identifier)}' + '${re.sub('[^\w.]', '_', g.element_identifier)}' #end for $gene_coordinates.disable_infer_genes $gene_coordinates.disable_infer_transcripts @@ -82,7 +82,7 @@ #end if #if len($transcripts) == 1 - #set $path = "/".join(['outputdir',($transcripts[0].element_identifier).split(".")[0]]) + "_output" + #set $path = "/".join(['outputdir',re.sub('[^\w.]', '_', $transcripts[0].element_identifier).split(".")[0]]) + "_output" && mv '${path}' './results' ## rename .list files to .txt files to make them detectable && find './results/' -name "*.list" -exec mv {} {}.txt \; @@ -99,7 +99,7 @@ && mkdir -p './results/' #if $gene_coordinates.selector == 'true' and $reference #for $i, $transcript in enumerate($transcripts) - #set $path = "/".join(['outputdir',($transcripts[$i].element_identifier).split(".")[0]]) + "_output" + #set $path = "/".join(['outputdir',re.sub('[^\w.]', '_', $transcripts[$i].element_identifier).split(".")[0]]) + "_output" && rm -r ./results && cp -r $path './results' && mv ./results/*fasta './fasta_files/' @@ -385,7 +385,7 @@ </test> <!-- Test 08: Multiple inputs--> <test expect_num_outputs="6"> - <param name="transcripts" value="transcriptome01.fasta,transcriptome02.fasta"/> + <param name="transcripts" value="transcriptome01.fasta,transcriptome?02.fasta"/> <param name="reference" value="reference.fasta"/> <conditional name="gene_coordinates"> <param name="selector" value="true"/> @@ -407,7 +407,7 @@ <param name="single_reads" value="single_end.fastq.gz"/> </conditional> <output name="short_report_tabular" value="test_08_short_report.tab" ftype="tabular"/> - <output name="short_report_pdf" value="test_08_short_report.pdf" ftype="pdf"/> + <output name="short_report_pdf" value="test_08_short_report.pdf" ftype="pdf" compare="sim_size" delta_frac="0.1"/> <output name="stats" value="test_08_complete_report.tab" ftype="txt" lines_diff="6" /> <output_collection name="fasta_files" type="list" count="14"> <element name="transcriptome01.paralogs" file="test_08_paralogs.fasta" ftype="fasta"/> @@ -432,7 +432,55 @@ </element> </output_collection> </test> - + <!-- Test 09: Multiple inputs with dash in names--> + <test expect_num_outputs="6"> + <param name="transcripts" value="transcriptome01.fasta,transcriptome-02.fasta"/> + <param name="reference" value="reference.fasta"/> + <conditional name="gene_coordinates"> + <param name="selector" value="true"/> + <param name="gtf" value="reference.gtf"/> + </conditional> + <section name="output_options"> + <param name="out_sr" value="tabular,pdf"/> + </section> + <conditional name="use_busco"> + <param name="selector" value="true"/> + <conditional name="lineage_conditional"> + <param name="selector" value="cached"/> + <param name="cached_db" value="busco-demo-db-20230328"/> + </conditional> + </conditional> + <param name="out_add" value="complete,fasta,logs,gz"/> + <conditional name="reads_option"> + <param name="selector" value="single"/> + <param name="single_reads" value="single_end.fastq.gz"/> + </conditional> + <output name="short_report_tabular" value="test_08_short_report.tab" ftype="tabular"/> + <output name="short_report_pdf" value="test_08_short_report.pdf" ftype="pdf" compare="sim_size" delta_frac="0.1"/> + <output name="stats" value="test_08_complete_report.tab" ftype="txt" lines_diff="6" /> + <output_collection name="fasta_files" type="list" count="14"> + <element name="transcriptome01.paralogs" file="test_08_paralogs.fasta" ftype="fasta"/> + </output_collection> + <output_collection name="list_logs" type="list" count="14"> + <element name="STAR.out" ftype="txt"> + <assert_contents> + <has_text text="STAR --runThreadN"/> + <has_text text="finished successfully"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="gmap_build.out" ftype="txt"> + <assert_contents> + <has_text text="No alternate scaffolds observed"/> + </assert_contents> + </element> + <element name="rnaQUAST" ftype="txt"> + <assert_contents> + <has_text text="THE QUALITY OF TRANSCRIPTOME ASSEMBLY DONE"/> + <has_text text="Thank you for using rnaQUAST!"/> + </assert_contents> + </element> + </output_collection> + </test> </tests> <help><![CDATA[ |
| b |
| diff -r 8e66f695d859 -r 3125faf00ffd test-data/test_08_short_report.tab --- a/test-data/test_08_short_report.tab Wed Jan 10 13:24:53 2024 +0000 +++ b/test-data/test_08_short_report.tab Fri Aug 30 13:23:03 2024 +0000 |
| b |
| @@ -1,4 +1,4 @@ -METRICS/TRANSCRIPTS transcriptome01 transcriptome02 +METRICS/TRANSCRIPTS transcriptome01 transcriptome_02 Genes 1 1 Avg. number of exons per isoform 1.0 1.0 Transcripts 1 1 |
| b |
| diff -r 8e66f695d859 -r 3125faf00ffd test-data/transcriptome-02.fasta --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/transcriptome-02.fasta Fri Aug 30 13:23:03 2024 +0000 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,626 @@\n+>STRG.1.1\n+ATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAAAAATTATCTTGATAAAGCAGGAATTA\n+CTACTGCTTGTTTACGAATTAAATCGAAGTGGACTGCTGGCGGAAAATGAGAAAATTCGACCTATCCTTG\n+CGCAGCTCGAGAAGCTCTTACTTTGCGACCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGT\n+TGGATGAGGAGAAGTGGCTTAATATGCTTGGCACGTTCGTCAAGGACTGGTTTAGATATGAGTCACATTT\n+TGTTCATGGTAGAGATTCTCTTGTTGACATTTTAAAAGAGCGTGGATTACTATCTGAGTCCGATGCTGTT\n+CAACCACTAATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTTTCCAGACCGCTTTGGC\n+CTCTATTAAGCTCATTCAGGCTTCTGCCGTTTTGGATTTAACCGAAGATGATTTCGATTTTCTGACGAGT\n+AACAAAGTTTGGATTGCTACTGACCGCTCTCGTGCTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGC\n+TGGACTTTGTGGGATACCCTCGCTTTCCTGCTCCTGTTGAGTTTATTGCTGCCGTCATTGCTTATTATGT\n+TCATCCCGTCAACATTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAAGGCGCTGAATTTACGGAAAACATTATTAAT\n+GGCGTCGAGCGTCCGGTTAAAGCCGCTGAATTGTTCGCGTTTACCTTGCGTGTACGCGCAGGAAACACTG\n+ACGTTCTTACTGACGCAGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCAGAAGGAGTGATGTAATGTCTAAA\n+GGTAAAAAACGTTCTGGCGCTCGCCCTGGTCGTCCGCAGCCGTTGCGAGGTACTAAAGGCAAGCGTAAAG\n+GCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGTGGTCAACAATTTTAATTGCAGGGGCTTCGGCCCCTTACTTGAGGATA\n+AATTATGTCTAATATTCAAACTGGCGCCGAGCGTATGCCGCATGACCTTTCCCATCTTGGCTTCCTTGCT\n+GGTCAGATTGGTCGTCTTATTACCATTTCAACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACG\n+CCGTTGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTGCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTACTGTAGACATTTTTAC\n+TTTTTATGTCCCTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGATGGTGTTAATGCC\n+ACTCCTCTCCCGACTGTTAACACTACTGGTTATATTGACCATGCCGCTTTTCTTGGCACGATTAACCCTG\n+ATACCAATAAAATCCCTAAGCATTTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTAAAGCGCC\n+GTGGATGCCTGACCGTACCGAGGCTAACCCTAATGAGCTTAATCAAGATGATGCTCGTTATGGTTTCCGT\n+TGCTGCCATCTCAAAAACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGACGA\n+CTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAATTTGCATACTGACCAAGAACG\n+TGATTACTTCATGCAGCGTTACCGTGATGTTATTTCTTCATTTGGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGAC\n+AACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAATCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAA\n+CGTCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCC\n+TGAGCATGGCACTATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTAC\n+CTTAACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGCAACTTGCCGC\n+CGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAAGATTGCTGAGGG\n+TCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATT\n+CAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCC\n+AGTCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGAC\n+CACTCGCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAAA\n+TTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATCAT\n+GTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACTTTTTTTCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACT\n+CCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGA\n+CGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCA\n+GGTTGTTTCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTT\n+GAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGAATGGTCGCCATGATG\n+GTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATAATGTTTA\n+TGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTT\n+ATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTAT\n+TGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGC\n+ATTCAAGGTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCA\n+TTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGC\n+TGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTG\n+GTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTC\n+CTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGA\n+GAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACTGGACAATCAGAAAGAGATTGCCGAGATGCAAAATGAGACT\n+CAAAAAGAGATTGCTGGCATTCAGTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAA\n+ATGAGATGCTTGCTTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCT\n+TTCCAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGGTCAGTAT\n+TTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGACTTAGTTCATCAGCAAA\n+CGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGCAAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGA\n+TGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGGTATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTC\n+TGGAAAGAC'..b'AACATTTGGACTGCTCCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGACGA\n+CTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAAGCTGCTTATGCTAATTTGCATACTGACCAAGAACG\n+TGATTACTTCATGCAGCGTTACCGTGATGTTATTTCTTCATTTGGAGGTAAAACCTCTTATGACGCTGAC\n+AACCGTCCTTTACTTGTCATGCGCTCTAATCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAA\n+CGTCGTTAGGCCAGTTTTCTGGTCGTGTTCAACAGACCTATAAACATTCTGTGCCGCGTTTCTTTGTTCC\n+TGAGCATGGCACTATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCAGTAC\n+CTTAACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGCAACTTGCCGC\n+CGCGTGAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAGTTTAAGATTGCTGAGGG\n+TCAGTGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGAAGGCTTCCCATTCATT\n+CAGGAACCGCCTTCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACCAGTGTTTCC\n+AGTCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGAC\n+CACTCGCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAAA\n+TTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGTTGACCAAGCGAAGCGCGGTAGGTTTTCTGCTTAGGAGTTTAATCAT\n+GTTTCAGACTTTTATTTCTCGCCATAATTCAAACTTTTTTTCTGATAAGCTGGTTCTCACTTCTGTTACT\n+CCAGCTTCTTCGGCACCTGTTTTACAGACACCTAAAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGA\n+CGGTTAATGCTGGTAATGGTGGTTTTCTTCATTGCATTCAGATGGATACATCTGTCAACGCCGCTAATCA\n+GGTTGTTTCTGTTGGTGCTGATATTGCTTTTGATGCCGACCCTAAATTTTTTGCCTGTTTGGTTCGCTTT\n+GAGTCTTCTTCGGTTCCGACTACCCTCCCGACTGCCTATGATGTTTATCCTTTGAATGGTCGCCATGATG\n+GTGGTTATTATACCGTCAAGGACTGTGTGACTATTGACGTCCTTCCCCGTACGCCGGGCAATAATGTTTA\n+TGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCGCTGAATCAGGTT\n+ATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTAAGTGAGGTGATTTATGTTTGGTGCTATTGCTGGCGGTAT\n+TGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGTCAAAAAGCCGCCTCCGGTGGC\n+ATTCAAGGTGATGTGCTTGCTACCGATAACAATACTGTAGGCATGGGTGATGCTGGTATTAAATCTGCCA\n+TTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGC\n+TGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTG\n+GTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATACTCGTGATTATCTTGCTGCTGCATTTC\n+CTGAGCTTAATGCTTGGGAGCGTGCTGGTGCTGATGCTTCCTCTGCTGGTATGGTTGACGCCGGATTTGA\n+GAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACTGGACAATCAGAAAGAGATTGCCGAGATGCAAAATGAGACT\n+CAAAAAGAGATTGCTGGCATTCAGTCGGCGACTTCACGCCAGAATACGAAAGACCAGGTATATGCACAAA\n+ATGAGATGCTTGCTTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTATTATGGAAAACACCAATCT\n+TTCCAAGCAACAGCAGGTTTCCGAGATTATGCGCCAAATGCTTACTCAAGCTCAAACGGCTGGTCAGTAT\n+TTTACCAATGACCAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGACTTAGTTCATCAGCAAA\n+CGCAGAATCAGCGGTATGGCTCTTCTCATATTGGCGCTACTGCAAAGGATATTTCTAATGTCGTCACTGA\n+TGCTGCTTCTGGTGTGGTTGATATTTTTCATGGTATTGATAAAGCTGTTGCCGATACTTGGAACAATTTC\n+TGGAAAGACGGTAAAGCTGATGGTATTGGCTCTAATTTGTCTAGGAAATAACCGTCAGGATTGACACCCT\n+CCCAATTGTATGTTTTCATGCCTCCAAATCTTGGAGGCTTTTTTATGGTTCGTTCTTATTACCCTTCTGA\n+ATGTCACGCTGATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCTTGTGGCATT\n+TCTACTCTTTCTCAATCCCCAATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCGCATCAAGCTCTTGGAAG\n+AGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGGTGATATGTATGTTGACGGCCATAAGGC\n+TGCTTCTGACGTTCGTGATGAGTTTGTATCTGTTACTGAGAAGTTAATGGATGAATTGGCACAATGCTAC\n+AATGTGCTCCCCCAACTTGATATTAATAACACTATAGACCACCGCCCCGAAGGGGACGAAAAATGGTTTT\n+TAGAGAACGAGAAGACGGTTACGCAGTTTTGCCGCAAGCTGGCTGCTGAACGCCCTCTTAAGGATATTCG\n+CGATGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATGAGTGTTCAAGATTGCTGGAGGCCTCCACT\n+ATGAAATCGCGTAGAGGCTTTACTATTCAGCGTTTGATGAATGCAATGCGACAGGCTCATGCTGATGGTT\n+GGTTTATCGTTTTTGACACTCTCACGTTGGCTGACGACCGATTAGAGGCGTTTTATGATAATCCCAATGC\n+TTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTATGGTTCTTGCTGCCGAGGGTCGCAAGGCTAATGATTCA\n+CACGCCGACTGCTATCAGTATTTTTGTGTGCCTGAGTATGGTACAGCTAATGGCCGTCTTCATTTCCATG\n+CGGTGCATTTTATGCGGACACTTCCTACAGGTAGCGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCG\n+CCGCCAGTTAAATAGCTTGCAAAATACGTGGCCTTATGGTTACAGTATGCCCATCGCAGTTCGCTACACG\n+CAGGACGCTTTTTCACGTTCTGGTTGGTTGTGGCCTGTTGATGCTAAAGGTGAGCCGCTTAAAGCTACCA\n+GTTATATGGCTGTTGGTTTCTATGTGGCTAAATACGTTAACAAAAAGTCAGATATGGACCTTGCTGCTAA\n+AGGTCTAGGAGCTAAAGAATGGAACAACTCACTAAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTC\n+AGAATCAGAATGAGCCGCAACTTCGGGATGAAAATGCTCACAATGACAAATCTGTCCACGGAGTGCTTAA\n+TCCAACTTACCAAGCTGGGTTACGACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGA\n+GATGAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGACGTTTTGGCGGCGCAACCTGTGACGACAAATCTG\n+CTCAAATTTATGCGCGCTTCGATAAAAATGATTGGCGTATCCAACCTGC\n+\n+\n' |
| b |
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