Repository 'nanopolish_variants'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/bgruening/nanopolish_variants

Changeset 6:3185b305255a (2021-05-07)
Previous changeset 5:63af3144371a (2020-05-29) Next changeset 7:a3afc5f0a96c (2021-07-30)
Commit message:
"planemo upload for repository https://github.com/bgruening/galaxytools/tree/master/tools/nanopolish commit 4883f9a9a2779e2b4792314bd6128c7c109c00e1"
removed:
test-data/all_fasta.loc
test-data/all_fasta.loc.sample
tool-data/all_fasta.loc.sample
b
diff -r 63af3144371a -r 3185b305255a test-data/all_fasta.loc
--- a/test-data/all_fasta.loc Fri May 29 13:29:14 2020 -0400
+++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
b
@@ -1,1 +0,0 @@
-draft draft draft ${__HERE__}/draft.fa
\ No newline at end of file
b
diff -r 63af3144371a -r 3185b305255a test-data/all_fasta.loc.sample
--- a/test-data/all_fasta.loc.sample Fri May 29 13:29:14 2020 -0400
+++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
b
@@ -1,1 +0,0 @@
-draft draft draft ${__HERE__}/draft.fa
\ No newline at end of file
b
diff -r 63af3144371a -r 3185b305255a tool-data/all_fasta.loc.sample
--- a/tool-data/all_fasta.loc.sample Fri May 29 13:29:14 2020 -0400
+++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
b
@@ -1,19 +0,0 @@
-#This file lists the locations and dbkeys of all the fasta files
-#under the "genome" directory (a directory that contains a directory
-#for each build). The script extract_fasta.py will generate the file
-#all_fasta.loc. This file has the format (white space characters are
-#TAB characters):
-#
-#<unique_build_id> <dbkey> <display_name> <file_path>
-#
-#So, all_fasta.loc could look something like this:
-#
-#apiMel3 apiMel3 Honeybee (Apis mellifera): apiMel3 /path/to/genome/apiMel3/apiMel3.fa
-#hg19canon hg19 Human (Homo sapiens): hg19 Canonical /path/to/genome/hg19/hg19canon.fa
-#hg19full hg19 Human (Homo sapiens): hg19 Full /path/to/genome/hg19/hg19full.fa
-#
-#Your all_fasta.loc file should contain an entry for each individual
-#fasta file. So there will be multiple fasta files for each build,
-#such as with hg19 above.
-#
-