Repository 'bedclip'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/rmarenco/bedclip

Changeset 0:3275f20f1368 (2016-07-23)
Commit message:
planemo upload for repository https://github.com/remimarenco/bedclip
added:
bedclip.xml
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b
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[
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+    ]]></help>
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b'@@ -0,0 +1,1420 @@\n+>contig16\n+TTAATATGAGAAAAGTGCAAGAAAAGTATAACAAGAAAGGAAGTAAACTTCGGCAAGCCG\n+AAGTTTTTATACCCTTGCAGATATCTGCAAGGATTATTGCTAGCTTCAGTGGTATATGAT\n+ATAGTCTTAATCAAATTTATTTCGAAATTCAAAACTAATTAAACAATTTTATTTCCAAGC\n+GTAGGAGGTTCAAGGTTAAAAAACCTCAAATATATTTATTTTTTGTTCCGCACCCCGCTG\n+AAACAAACTTGCGCTGCGCTGGAAGCCCAGGAATCTGCATGCCAAGTTTGAATGTTCTAT\n+CTCTTATAGTTTCCGAGATCTCAGCGTTCATACGGACAGACAGACGGACATGACTAGATC\n+GACTCGGCTAGTGATCCTGATCATGAATATATATGGGGTCTGAAACGCTTCCTTCTACCT\n+TTTACATACTTTCCGACGAAAGTAGCATACTTATATAAGTTTTACTTATTGGTTTATTAA\n+CATATTTGGATACAATAACAATAGCCATTTGTAGCATACTTTGTATAATATGTATGTATC\n+GTCCAATCGTGTGCAAATAAAATATTCCGGAACCAAAAAGTAAAAAAAACCGTAAAAAAG\n+CATGTAAAAACTAAGTTTTTCTTTTTGTTTTATCAATTAATAGGTTAAGGAAGATGGTTA\n+GCCTACCTATTTCGTCATTCTTTTTTATTTGCCATTTCAATATAAAAAATCCAAAATAAT\n+CATTATGAATGAAAAAATAATTAAAAAGAACAGCAATAAACATGTTTTTAATAGATTAGA\n+TTAGATAATAGAGTTCTTAAATTCACAAGAAGTCAAGGAAACGTATTCTTCTTCATGTCT\n+TTATGAAACCAATATCAGAATAAGTAGCCTAGTTCATTTAGTCATATCCGTCGGTCCAAG\n+CGAATGCTAACATCTCCGAAATTATAAAAATAACTAGTTTGGATATGGGTCATGCAGATT\n+CTTACATTTCCTGTACAGCACAAGTTTGTTTCGTCGAAGTGCCACGCCCACTATTTCTTC\n+TAATACGCGAACTCAATCTGTCTGGAGCCCAAACTTTTGAATATTGTGTCAACATTTAAT\n+TTTGTTTTGAATATCAACATGAGAATTATTCTTGGTGAATATCTTTATAAAGGTGTGCCA\n+ATGGTTTTAACTTGACCATTTATTTAAATTGATTACCTGAGTAAAGGTTATCTTAAATTC\n+GAGGCACTCAACTAAAGCGATCTCCCTTACTTACCCTTAAACTATTAATTGTTATTCTGA\n+AAACTTAAATTCGATAGCTAAATGCCTTATTCAAAGTTCTCGTAATGTTATTTTTAACAG\n+AAAGATTCCGTAAATATTTATTTTAAGTGACGACCAGATTATCTCGTTAAAGTTCGAGAC\n+GTGTAAAACTTTCTGAAAGTTTAAGAGCTGAACCAGGGAAGGTCTTCTTTATAGAATCGA\n+AAACACTTTCTTTCACCTATTGCACTATTAAGTCAAGAACATATATAGTTTATGGGGTTG\n+GAAACGTTTCCTTTACTGCGTTGCAAGCTTCTGACAGAAATTATAATACCCTCTGCAAAA\n+ATAAAAAATTGCGGTTACAGTGTTGCACTATGATAAACACAGTGGGAAGTACGTAAAAAC\n+ATGGTTACTAAATCGAATCGGTCCGAAAGGTTTCCCTTTTAAGGCCCATACTGCACACTG\n+GTGCAAACATATTTTTAAACATCTTTACTTTGTTAAACAAAAACAGAAGTCCCATAATTG\n+CCCATTTATTTGGAAATATGTTTAAAATATATTGATATATACATAATACATGAATATTTA\n+TTAAAGTTATTTATTTCATATGACTATAGGAATTACATTTAATTTTTGTATTTAATATAG\n+CTTGTGTTACAAGGGGTCCTTTGGAACACGCTGTGATCTGAAAATAGTATTTAAATAGTT\n+TATAAATGCATTAGTTAAACAAGAAAGGACGTTGGCTTTGGCAAGCCAAAGTTTGTATAC\n+CCTTGCAGCTATAAGAAATACTCTATATTAGTAACAGCATGTTAAATTTTTAAGGATTGT\n+TCCTGGCTAGTGATGCTGATCAAGAATATATGTACTTTATGTGGTCGGAAACGTGTCGTT\n+CACTGCGTTGCAAACTTCTGAATGAAATCATTATACCCTCTGCAGGCGTTTATAAATTTG\n+TACAAATGGTACAGACTCTTCCAAGGGAAGATGCCAAGAGCTAACGAATGATGAAAACGT\n+TAAGAAGTAAAGAAAATTATTTCGCAATACGCATCACTATCACTGAGGATGTCGATATAT\n+CGCCAGGCTCGGACCATGATATTTCCTCTAATCGAAATTGCTAAATTTAGACCAAAACAA\n+GAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCTGAAGTTTGTATACCCTTGCAGACATAAGAAATAAT\n+AAGCTTTAGTAAATAATTTTTTCATATTATTTCCCACTAATTTCCCGATTGCTCCTATGA\n+CAGCTATATGATATAGGCGACCGATTTTGATACAATTTAAGTAGAAATTCAGAACTAATT\n+AAAAAATTTTATTTCTATGCTTACAAGGTTATATGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTT\n+TTTCATATTATTTTACTACTAATTTTCCGATCTTTCATATGGCAGCTATATGATATAGTC\n+GTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGACCTAACTATAAAATGACATTTCCAA\n+GCTTAGAAGGTGATATGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTCATATTATTTTAATA\n+CTAACTTTCCGATCTTTCATATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAAT\n+TTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTTCAAGCTTAGAAGGTGATATGT\n+TAAAAATCACAGAAGATATAATTTTTTCATATTATTTTAATACTAATTTTCCGATCTTTC\n+ATATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAA\n+CTAATTAAAAAATGTTATTTTCAAGCTTAGAAGGTGATATGTTAAAAAACAGCGAAGGTA\n+TAATTTTTTCATATTATTTTAATTCTATTGATATAGTGGTCCGATTTTGATTAAATTTAA\n+TTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTCATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATGCTACA\n+AAACACCGAATATATAATTTTTAAAAATTTTTCCCCTATAGTTCCAATGGGAGCTATAAA\n+ATATAGTTGTCTGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATACAAAGAAAACT\n+TTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTCAGAACTGAGGGACTAGTTTGCGTAGAAACGGA\n+CGGCCAGGCGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGAATCGTCTAGTGACGTTGATTAA\n+GAATGTATATATTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACT\n+GAAATTATTATACCCTCTGCAAGGGTATAATGAACATCACATAAGCACCGCACAAGAACT\n+ATTCAATGACGTCAACGACGATCCAGATTTACTCAAAAAAGTCGTAGCTGGTCCCGAATT\n+CTGGGTTTTTGCTTATAATTTCGGTACCAAAGCCCAATCCTTCTAACGGAAGAGCACAGA\n+TGAGCCAAGACCGAAAAAGCTAACCTTTACGCCTCTAACAACCGAACAAAGAATGATATA\n+AACTTGAAACAAGGTACAGGTGTTTTGGAAAAAGTGTACCTATATACCAAACCAAAAAAA\n+TTGATAATCGAAAATACGTGGCCCTCGAAGTTTGAAAAGTCACCTTTTTTTTTGAACACA\n+'..b'CTATAGTCGAGTGCCTTGCCTAGCAGTTACTTTTATT\n+TAGCTAAAGGGAGATGAGGTGGATGGAGATATACAAGAAGAAAGTCAGCTATTCCCATGA\n+TTTCACACCAATGGCCACTTAGCGTTCATGCTTTCACAAACAGACAGGCATTGCTGACGG\n+GACTGGAGATCCAGATCAAATTGAACATGCTTTATAGGGCCGGAAGCACTTTCTTCAATT\n+TGTCTATTGTACCCATTTGCTCTACGATTAAAGGTATAAAAATGGTCTTTATGTCTTATT\n+CTTCACCAAAATGTAAACATTGCTTGCGCCTAAACAAGTTTTCAAAACATTTTTTCCACT\n+CCGATTAAGACACCTCCAAAACAAGGTTTTTGAAATCTTTAACCGCATCTTATGGCATTT\n+TTCTCTTAATGTGCGGGAATAAAAGGAAGTCATTTGATACAAAGTTAGGTTCTAATTGGC\n+AATCATTAAATTATTACATTATCAAGACAATTTATGGATATGTAATGAGCAAGCTTAATA\n+AACATAAACATTGATACATTTTTAATTAAATACATTTTTAAATATATATATCTTTATTAC\n+GCATTAAAATAGAGTGCATTAAACATTTCGTTTCCTGATCATCCAAATTTGTTTTCATAC\n+CTGACAACAATGTTAGTAATATCCGATAAATTGAAAATAGTAAATCATTTAAGTGACTTG\n+GGTCGTTTATAGTCCTAAATTTTCACAAGCAAAATATATTACCAACTATTGGTTTAAGCA\n+ACGACGGTATATTTACGTAAAAAATTGGAAAAAGTACGAATCTTTACCTGTCCCGATGAT\n+GAAGTTTGCAAATAAGAAGAAACGTCCGTCTCGATCATACAGCCTCTTAAAGTATCTGGT\n+ATAAAC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+contig16 11774 11975 JUNC00000004 13 - 11774 11975 255,0,0 2 84,54 0,147
+contig16 11774 11975 JUNC00000005 5 - 11774 11975 255,0,0 2 87,54 0,147
+contig16 11921 12673 JUNC00000006 14 - 11921 12673 255,0,0 2 54,73 0,679
+contig16 11939 17275 JUNC00000007 1 - 11939 17275 255,0,0 2 36,54 0,5282
+contig16 12723 17294 JUNC00000008 11 - 12723 17294 255,0,0 2 88,73 0,4498
+contig16 12782 21003 JUNC00000009 1 - 12782 21003 255,0,0 2 29,61 0,8160
+contig16 17256 17490 JUNC00000010 14 - 17256 17490 255,0,0 2 81,85 0,149
+contig16 17307 21307 JUNC00000011 1 - 17307 21307 255,0,0 2 30,60 0,3940
+contig16 21007 21283 JUNC00000012 1 - 21007 21283 255,0,0 2 54,36 0,240
+contig16 21250 22512 JUNC00000013 7 - 21250 22512 255,0,0 2 86,58 0,1204
+contig16 22206 25361 JUNC00000014 1 + 22206 25361 255,0,0 2 39,51 0,3104
+contig16 27016 27178 JUNC00000015 2 + 27016 27178 255,0,0 2 33,70 0,92
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+contig16 35110 42519 JUNC00000020 4 + 35110 42519 255,0,0 2 64,64 0,7345
+contig16 42508 43097 JUNC00000021 6 + 42508 43097 255,0,0 2 82,65 0,524
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+contig17 23265 23487 JUNC00000032 10 + 23265 23487 255,0,0 2 81,75 0,147