Repository 'blast2html'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/jankanis/blast2html

Changeset 33:3bb5da68305e (2014-05-15)
Previous changeset 32:ce8f29efc0a1 (2014-05-15) Next changeset 34:5d7a82f49485 (2014-05-15)
Commit message:
add test update script, add url to github page
modified:
blast2html.html.jinja
test-data/blast xml example1.html
test-data/blast xml example2.html
test-data/blast xml example3.html
test-data/blast xml example4.html
added:
test-data/refresh_test_results.sh
b
diff -r ce8f29efc0a1 -r 3bb5da68305e blast2html.html.jinja
--- a/blast2html.html.jinja Thu May 15 17:22:02 2014 +0200
+++ b/blast2html.html.jinja Thu May 15 17:29:44 2014 +0200
b
@@ -2,7 +2,7 @@
 <html>
   <head>
     <meta charset="UTF-8">
-    <meta name=generator content="blast2html; see ...">
+    <meta name=generator content="blast2html; see https://github.com/thehyve/blast2html/">
     
     <title>Blast output</title>
     
@@ -620,7 +620,7 @@
     </div>
 
     <footer>
-      This page was generated by <a href="...">blast2html</a>.
+      This page was generated by <a href="https://github.com/thehyve/blast2html/">blast2html</a>.
     </footer>
   </body>
 </html>
b
diff -r ce8f29efc0a1 -r 3bb5da68305e test-data/blast xml example1.html
--- a/test-data/blast xml example1.html Thu May 15 17:22:02 2014 +0200
+++ b/test-data/blast xml example1.html Thu May 15 17:29:44 2014 +0200
b
@@ -2,7 +2,7 @@
 <html>
   <head>
     <meta charset="UTF-8">
-    <meta name=generator content="blast2html; see ...">
+    <meta name=generator content="blast2html; see https://github.com/thehyve/blast2html/">
     
     <title>Blast output</title>
     
@@ -13213,7 +13213,7 @@
     </div>
 
     <footer>
-      This page was generated by <a href="...">blast2html</a>.
+      This page was generated by <a href="https://github.com/thehyve/blast2html/">blast2html</a>.
     </footer>
   </body>
 </html>
b
diff -r ce8f29efc0a1 -r 3bb5da68305e test-data/blast xml example2.html
--- a/test-data/blast xml example2.html Thu May 15 17:22:02 2014 +0200
+++ b/test-data/blast xml example2.html Thu May 15 17:29:44 2014 +0200
b
@@ -2,7 +2,7 @@
 <html>
   <head>
     <meta charset="UTF-8">
-    <meta name=generator content="blast2html; see ...">
+    <meta name=generator content="blast2html; see https://github.com/thehyve/blast2html/">
     
     <title>Blast output</title>
     
@@ -417,7 +417,7 @@
     </div>
 
     <footer>
-      This page was generated by <a href="...">blast2html</a>.
+      This page was generated by <a href="https://github.com/thehyve/blast2html/">blast2html</a>.
     </footer>
   </body>
 </html>
b
diff -r ce8f29efc0a1 -r 3bb5da68305e test-data/blast xml example3.html
--- a/test-data/blast xml example3.html Thu May 15 17:22:02 2014 +0200
+++ b/test-data/blast xml example3.html Thu May 15 17:29:44 2014 +0200
b
@@ -2,7 +2,7 @@
 <html>
   <head>
     <meta charset="UTF-8">
-    <meta name=generator content="blast2html; see ...">
+    <meta name=generator content="blast2html; see https://github.com/thehyve/blast2html/">
     
     <title>Blast output</title>
     
@@ -3523,7 +3523,7 @@
     </div>
 
     <footer>
-      This page was generated by <a href="...">blast2html</a>.
+      This page was generated by <a href="https://github.com/thehyve/blast2html/">blast2html</a>.
     </footer>
   </body>
 </html>
b
diff -r ce8f29efc0a1 -r 3bb5da68305e test-data/blast xml example4.html
--- a/test-data/blast xml example4.html Thu May 15 17:22:02 2014 +0200
+++ b/test-data/blast xml example4.html Thu May 15 17:29:44 2014 +0200
b
@@ -2,7 +2,7 @@
 <html>
   <head>
     <meta charset="UTF-8">
-    <meta name=generator content="blast2html; see ...">
+    <meta name=generator content="blast2html; see https://github.com/thehyve/blast2html/">
     
     <title>Blast output</title>
     
@@ -1599,7 +1599,7 @@
     </div>
 
     <footer>
-      This page was generated by <a href="...">blast2html</a>.
+      This page was generated by <a href="https://github.com/thehyve/blast2html/">blast2html</a>.
     </footer>
   </body>
 </html>
b
diff -r ce8f29efc0a1 -r 3bb5da68305e test-data/refresh_test_results.sh
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/refresh_test_results.sh Thu May 15 17:29:44 2014 +0200
b
@@ -0,0 +1,8 @@
+#!/bin/sh
+
+# run this from the directory it exists in to update the test outputs
+
+for i in 1 2 3 4
+do
+ ../blast2html.py -i "blast xml example$i.xml" -o "blast xml example$i.html"
+done