| Previous changeset 4:e345aadf914f (2021-09-01) Next changeset 6:cd5f98911089 (2022-05-11) |
|
Commit message:
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/stacks2 commit 16654f3b3faaba994cea5fda8d4907ea4f059605" |
|
modified:
macros.xml macros_process.xml stacks_clonefilter.xml test-data/demultiplexed/PopA_01.fq test-data/procrad/process_radtags.out test-data/procrad/process_radtags2.out test-data/procrad/process_radtags_paired.out test-data/shortreads/process_shortreads.out |
|
added:
test-data/procrad/R1_01.fq test-data/procrad/R1_02.fq test-data/procrad/R1_03.fq test-data/procrad/R1_04.fq test-data/procrad/R2_01.fq test-data/procrad/R2_02.fq test-data/procrad/R2_03.fq test-data/procrad/R2_04.fq test-data/procrad/process_radtags_paired_no_barcode.out |
|
removed:
test-data/procrad/R1.fa.discards test-data/procrad/R1.fq test-data/procrad/R1.fq.discards test-data/procrad/R2.fq test-data/procrad/R2.fq.discards test-data/shortreads/PopA_01.fq |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 macros.xml --- a/macros.xml Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ b/macros.xml Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| @@ -2,15 +2,15 @@ <macros> <xml name="requirements"> <requirements> - <requirement type="package" version="@STACKS_VERSION@">stacks</requirement> + <requirement type="package" version="@TOOL_VERSION@">stacks</requirement> <requirement type="package" version="3.7">python</requirement> <requirement type="package" version="4.6.0">findutils</requirement> <yield/> </requirements> </xml> - <token name="@STACKS_VERSION@">2.55</token> - <token name="@WRAPPER_VERSION@">1</token> + <token name="@TOOL_VERSION@">2.55</token> + <token name="@VERSION_SUFFIX@">2</token> <token name="@PROFILE@">20.05</token> <xml name="citation"> @@ -217,22 +217,32 @@ </expand> </xml> + + <xml name="barcode_selector"> + <param name="barcode_encoding" type="select" label="Barcode location"> + <option value="">Disabled</option> + <yield/> + </param> + <param name="barcode" argument="-b" type="data" format="tabular,txt" optional="true" label="Barcode file" help="The barcode file is only used if barcode_input"/> + </xml> + + <!-- fastq input (used in denovomap, tsv2bam, ustacks) - fastq_optional: makes fastq input optional (true/false) - se_option: wording for "single end" option (for tsv2bam this is the reverse reads for the others its the forward reads) - help: help text --> - <xml name="fastq_input" token_fastq_optional="false" token_se_option="single end or forward reads" token_help=""> + <xml name="fastq_input" token_fastq_optional="false" token_se_option="single end or forward reads" token_help="" token_multiple="false" token_listtype="paired"> <conditional name="input_type"> <param name="input_type_select" type="select" label="Short read data from individuals" help="@HELP@"> <option value="single" selected="true">@SE_OPTION@</option> <option value="paired">(paired) dataset list</option> </param> <when value="single"> - <param name="fqinputs" argument="-f" format="fastqsanger,fastqsanger.gz,fasta,fasta.gz" type="data" label="Reads" multiple="true" optional="@FASTQ_OPTIONAL@"/> + <param name="fqinputs" argument="-f" format="fastqsanger,fastqsanger.gz,fasta,fasta.gz" type="data" label="Reads" multiple="@MULTIPLE@" optional="@FASTQ_OPTIONAL@"/> </when> <when value="paired"> - <param name="fqinputs" argument="-f" type="data_collection" collection_type="list:paired" format="fastqsanger,fastqsanger.gz,fasta,fasta.gz" label="List for forward reads or read pairs" optional="@FASTQ_OPTIONAL@"/> + <param name="fqinputs" argument="-f" type="data_collection" collection_type="@LISTTYPE@" format="fastqsanger,fastqsanger.gz,fasta,fasta.gz" label="List for forward reads or read pairs" optional="@FASTQ_OPTIONAL@"/> </when> </conditional> </xml> |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 macros_process.xml --- a/macros_process.xml Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ b/macros_process.xml Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| [ |
| @@ -4,14 +4,17 @@ <macros> + <token name="@PROCESS_IOOPTIONS@"><![CDATA[ -p stacks_inputs/ #if $input_type.input_type_select == "paired" --paired #end if -i $inputype - -b '$barcode' $input_type.barcode_encoding + #if $input_type.barcode_encoding != '' + -b '$input_type.barcode' + #end if #if str( $outype ) != "auto" -y $outype #end if @@ -38,20 +41,11 @@ </xml> <xml name="process_outputs"> - <collection name="demultiplexed" type="list" label="${tool.name} on ${on_string} Demultiplexed reads"> - <filter>input_type['input_type_select'] == "single"</filter> - <expand macro="discover_faqgz_output_macro" pattern="(?P<name>.+)" dir="stacks_outputs"/> - </collection> - <collection name="demultiplexed_paired" type="list:paired" label="${tool.name} on ${on_string} Demultiplexed reads"> - <filter>input_type['input_type_select'] == "paired"</filter> - <expand macro="discover_faqgz_output_macro" pattern="(?P<identifier_0>.+)\.(?P<identifier_1>[^.]+)" dir="stacks_outputs"/> - </collection> - + <yield/> <collection name="remaining" type="list:paired" label="${tool.name} on ${on_string} Remaining orphan reads"> <filter>input_type['input_type_select'] == "paired"</filter> <expand macro="discover_faqgz_output_macro" pattern="(?P<identifier_0>.+)\.rem\.(?P<identifier_1>[^.]+)" dir="stacks_outputs/remaining"/> </collection> - <!-- note irrespective of -y output is always named fastq and are never zipped --> <collection name="discarded" type="list" label="${tool.name} on ${on_string} Discarded reads"> <filter>capture is True and input_type['input_type_select'] == "single"</filter> @@ -78,7 +72,7 @@ <param argument="--filter-illumina" name="filter_illumina" type="boolean" checked="false" truevalue="--filter-illumina" falsevalue="" label="Discard reads that have been marked by Illumina's chastity/purity filter as failing"/> </when> <when value="no"> - <param argument="--len_limit" type="integer" value="" optional="true" label="Minimum sequence length" help="useful if your data has already been trimmed"/> + <param argument="--len_limit" type="integer" value="" optional="true" label="Minimum sequence length" help="Useful if your data has already been trimmed"/> </when> </conditional> <param name="capture" type="boolean" checked="false" truevalue="-D" falsevalue="" argument="-D" label="Capture discarded reads to a file"/> |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 stacks_clonefilter.xml --- a/stacks_clonefilter.xml Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ b/stacks_clonefilter.xml Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| @@ -1,4 +1,4 @@ -<tool id="stacks2_clonefilter" name="Stacks2: clone filter" profile="@PROFILE@" version="@STACKS_VERSION@+galaxy@WRAPPER_VERSION@"> +<tool id="stacks2_clonefilter" name="Stacks2: clone filter" profile="@PROFILE@" version="@TOOL_VERSION@+galaxy@VERSION_SUFFIX@"> <description>Identify PCR clones</description> <macros> <import>macros.xml</import> |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/demultiplexed/PopA_01.fq --- a/test-data/demultiplexed/PopA_01.fq Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_01.fq Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,147 +1,3 @@\n-@lane1_fakedata0_0 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_1 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_2 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_3 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_4 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_5 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_6 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_7 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_8 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_9 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_10 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_11 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_12 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_13 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_14 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_15 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAGTCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_16 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_17 1:N:0:/1\n-AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'TGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_1 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_2 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_3 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_4 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_5 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_6 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_7 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_8 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_9 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_10 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_11 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_12 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_13 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_14 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_15 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_16 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata7_17 1:N:0:/1\n-AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/R1.fa.discards --- a/test-data/procrad/R1.fa.discards Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,9556 +0,0 @@\n->lane1_fakedata0_11 1:N:0:\n-GGTTGTAATTTGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n->lane1_fakedata1_0 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGCTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_1 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_2 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_3 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_4 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_5 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_6 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGGTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_7 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_8 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_9 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_0 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_1 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_2 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_3 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_4 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_5 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTGGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_6 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_7 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_8 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_9 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTGAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_10 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_11 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_12 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGGCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_13 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGGCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_14 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGGCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_15 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGGCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_16 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGGCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_17 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGGCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_18 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGGCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n->lane1_fakedata1_19 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGGCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAA'..b'_11 1:N:0:\n-AGGAAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_12 1:N:0:\n-AGGAAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_13 1:N:0:\n-AGGAAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_0 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_1 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_2 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_3 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATTACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_4 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_5 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_6 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_7 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_8 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_9 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTGCCAATGACC\n->lane1_fakedata9_10 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATAACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_11 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_12 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_13 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_14 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_15 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_16 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_17 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_18 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_19 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_20 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_21 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_22 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_23 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_0 1:N:0:\n-AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_1 1:N:0:\n-AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_2 1:N:0:\n-AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n->lane1_fakedata9_3 1:N:0:\n-AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/R1.fq --- a/test-data/procrad/R1.fq Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,28000 +0,0 @@\n-@lane1_fakedata0_0 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_1 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_2 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_3 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_4 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_5 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_6 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_7 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_8 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_9 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_10 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_11 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_12 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_13 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_14 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_15 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_16 1:N:0:\n-GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'BBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_11 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_12 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_13 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_14 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_15 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_16 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_17 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_18 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_19 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_20 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_21 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_22 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_23 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_0 1:N:0:\n-AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_1 1:N:0:\n-AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_2 1:N:0:\n-AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_3 1:N:0:\n-AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/R1.fq.discards --- a/test-data/procrad/R1.fq.discards Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,19112 +0,0 @@\n-@lane1_fakedata0_11 1:N:0:\n-GGTTGTAATTTGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_0 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGCTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_1 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_2 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_3 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_4 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_5 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_6 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGGTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_7 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_8 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_9 1:N:0:\n-GGTGTGAATTACGTCCGCGTTTGGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_0 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_1 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_2 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_3 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_4 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata1_5 1:N:0:\n-TTTAAGAATTACGTCCGCGTTTAGATTTGGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCTTTTTTAGGGTAGCT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n'..b'BBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_11 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_12 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_13 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_14 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_15 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_16 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_17 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_18 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_19 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_20 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_21 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_22 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_23 1:N:0:\n-GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_0 1:N:0:\n-AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_1 1:N:0:\n-AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_2 1:N:0:\n-AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_3 1:N:0:\n-AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/R1_01.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/procrad/R1_01.fq Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,8704 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_16 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'akedata2_5 1:N:0:\n+GGGTTGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_6 1:N:0:\n+GGGTTGAATTCTCTACCCCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_7 1:N:0:\n+GGGTTGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_8 1:N:0:\n+GGGTTGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_9 1:N:0:\n+GGGTTGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_10 1:N:0:\n+GGGTTGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_11 1:N:0:\n+GGGTTGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_0 1:N:0:\n+TGGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_1 1:N:0:\n+TGGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_2 1:N:0:\n+TGGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_3 1:N:0:\n+TGGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_4 1:N:0:\n+TGGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_5 1:N:0:\n+TGGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_0 1:N:0:\n+GAGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_1 1:N:0:\n+GAGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_2 1:N:0:\n+GAGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_3 1:N:0:\n+GAGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/R1_02.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/procrad/R1_02.fq Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,8700 @@\n+@lane1_fakedata2_5 1:N:0:\n+GAGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_6 1:N:0:\n+GAGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_7 1:N:0:\n+GAGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_8 1:N:0:\n+GAGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_9 1:N:0:\n+GAGAAGAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_0 1:N:0:\n+AGTAGAAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_1 1:N:0:\n+AGTAGAAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_2 1:N:0:\n+AGTAGAAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_3 1:N:0:\n+AGTAGAAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_0 1:N:0:\n+GGGATAAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_1 1:N:0:\n+GGGATAAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_2 1:N:0:\n+GGGATAAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_3 1:N:0:\n+GGGATAAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_4 1:N:0:\n+GGGATAAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_5 1:N:0:\n+GGGATAAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_6 1:N:0:\n+GGGATAAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_7 1:N:0:\n+GGGATAAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@'..b'data5_31 1:N:0:\n+ATAGTTAATTTATCTGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTGTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_32 1:N:0:\n+ATAGTTAATTTATCTGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTGTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_33 1:N:0:\n+ATAGTTAATTTATCTGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTGTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_34 1:N:0:\n+ATAGTTAATTTATCTGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTGTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_35 1:N:0:\n+ATAGTTAATTTATCTGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTGTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_0 1:N:0:\n+TGTGAGAATTTATCGGGCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_1 1:N:0:\n+TGTGAGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_0 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_1 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_2 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCTCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_3 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_4 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_5 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_6 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_7 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_8 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_9 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/R1_03.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/procrad/R1_03.fq Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,8704 @@\n+@lane1_fakedata5_11 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_12 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_13 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_14 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_15 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_16 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_17 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_18 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCGCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_19 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGTGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_20 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_21 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_22 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_23 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_24 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_25 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_26 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_27 1:N:0:\n+TTTGTGAATTTATCGGTCAGCGTGGCTCCCCTCTATCTTTTTGTTTGGGATCATGACTGAAGTCACATTGAGTCCAAGGGCGCCAATTAGCCACTCACCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'_fakedata8_2 1:N:0:\n+AGGGTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_3 1:N:0:\n+AGGGTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_4 1:N:0:\n+AGGGTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_5 1:N:0:\n+AGGGTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_6 1:N:0:\n+AGGGTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_7 1:N:0:\n+AGGGTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_8 1:N:0:\n+AGGGTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_9 1:N:0:\n+AGGGTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_0 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_1 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_2 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGTAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_3 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_4 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_5 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_6 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_7 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_8 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/R1_04.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/procrad/R1_04.fq Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,1880 @@\n+@lane1_fakedata8_10 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_11 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_12 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_13 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_14 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_15 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGAGGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_16 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_17 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_18 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_19 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_20 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_21 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACACAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_22 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_23 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_24 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_25 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_26 1:N:0:\n+GAGTTAAATTGTGACACGCAGCCTGGGTGACGTCTCTTCTGATAGGCATTGGCAGATTGACTACGCATAGGCGCTCTGTTCGGACCGCACGGAAATATTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'BBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_11 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_12 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_13 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_14 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_15 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_16 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_17 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_18 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_19 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_20 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_21 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_22 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_23 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_0 1:N:0:\n+AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_1 1:N:0:\n+AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_2 1:N:0:\n+AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_3 1:N:0:\n+AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/R2.fq --- a/test-data/procrad/R2.fq Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,28000 +0,0 @@\n-@lane1_fakedata0_0 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATATGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_1 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_2 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_3 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTGGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_4 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_5 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_6 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTTCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_7 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_8 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_9 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_10 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_11 1:N:0:\n-CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_12 1:N:0:\n-CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_13 1:N:0:\n-CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_14 1:N:0:\n-CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_15 1:N:0:\n-CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_16 1:N:0:\n-CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'BBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_11 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_12 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_13 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_14 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_15 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCGTGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_16 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTGGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_17 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_18 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_19 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_20 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_21 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_22 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_23 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTAGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_0 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_1 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_2 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_3 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/R2.fq.discards --- a/test-data/procrad/R2.fq.discards Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,28000 +0,0 @@\n-@lane1_fakedata0_0 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATATGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_1 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_2 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_3 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTGGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_4 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_5 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_6 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTTCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_7 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_8 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_9 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_10 1:N:0:\n-CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_11 1:N:0:\n-CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_12 1:N:0:\n-CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_13 1:N:0:\n-CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_14 1:N:0:\n-CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_15 1:N:0:\n-CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_16 1:N:0:\n-CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'BBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_11 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_12 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_13 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_14 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_15 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCGTGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_16 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTGGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_17 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_18 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_19 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_20 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_21 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_22 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_23 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTAGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_0 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_1 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_2 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_3 1:N:0:\n-CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/R2_01.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/procrad/R2_01.fq Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,8704 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATATGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTGGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTTCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_16 1:N:0:\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'akedata2_5 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_6 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTAAGGAATGCTATATAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_7 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTAAGGAATGCTATATAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_8 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTAAGGAATGCTATATAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_9 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTAAGGAATGCTATATAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_10 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTAAGGAATGCTATATAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_11 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTAAGGAATGCTATATAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_0 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_1 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTATTCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_2 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_3 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_4 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_5 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_0 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_1 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_2 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_3 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/R2_02.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/procrad/R2_02.fq Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,8700 @@\n+@lane1_fakedata2_5 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_6 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_7 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_8 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_9 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_0 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGGACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_1 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_2 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATATAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_3 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATATAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_0 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_1 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_2 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_3 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_4 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_5 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAAGCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_6 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_7 1:N:0:\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@'..b'data5_31 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAAAGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_32 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAAAGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_33 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAAAGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_34 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAAAGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_35 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAAAGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_0 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_1 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_0 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_1 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_2 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_3 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_4 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_5 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_6 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_7 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_8 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_9 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/R2_03.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/procrad/R2_03.fq Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,8704 @@\n+@lane1_fakedata5_11 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_12 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCTACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_13 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_14 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_15 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_16 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_17 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGGCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_18 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_19 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_20 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_21 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_22 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_23 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_24 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_25 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_26 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAATACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_27 1:N:0:\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'_fakedata8_2 1:N:0:\n+CCGGGTATCGATATGTATATAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACAAATTCTCTTCAATAGTATCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_3 1:N:0:\n+CCGGGTATCGATATGTATATAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACAAATTCTCTTCAATAGTATCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_4 1:N:0:\n+CCGGGTATCGATATGTATATAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACAAATTCTCTTCAATAGTATCA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_5 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_6 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_7 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_8 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_9 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_0 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_1 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_2 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_3 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_4 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_5 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_6 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATCTGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_7 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_8 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/R2_04.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/procrad/R2_04.fq Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,1880 @@\n+@lane1_fakedata8_10 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_11 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_12 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_13 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_14 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_15 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_16 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_17 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_18 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_19 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_20 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_21 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_22 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_23 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_24 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_25 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_26 1:N:0:\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'BBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_11 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_12 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_13 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_14 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_15 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCGTGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_16 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTGGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_17 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_18 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_19 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_20 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_21 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_22 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_23 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTAGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_0 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_1 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_2 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_3 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/process_radtags.out --- a/test-data/procrad/process_radtags.out Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ b/test-data/procrad/process_radtags.out Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| @@ -1,13 +1,16 @@ -process_radtags v2.2, executed 2018-11-23 13:34:27 -process_radtags -p stacks_inputs/ -i fastq -b /tmp/tmp2_xu5h/files/000/dataset_2.dat --inline_null -e ecoRI -o stacks_outputs +process_radtags v2.55, executed 2022-01-04 19:49:25 (zlib-1.2.11) +process_radtags -p stacks_inputs/ -i fastq -b /tmp/tmp1omqb2_d/files/2/a/2/dataset_2a2dd860-d29c-4b1a-9d82-80c8f91d4013.dat --inline_null -o stacks_outputs -e ecoRI File Retained Reads Low Quality Barcode Not Found RAD cutsite Not Found Total -R1.fastq 2222 0 0 4778 7000 +R1_01.fastq 1375 0 0 801 2176 +R1_02.fastq 97 0 0 2078 2175 +R1_03.fastq 749 0 0 1427 2176 +R1_04.fastq 0 0 0 470 470 -Total Sequences 7000 +Total Sequences 6997 Barcode Not Found 0 Low Quality 0 -RAD Cutsite Not Found 4778 -Retained Reads 2222 +RAD Cutsite Not Found 4776 +Retained Reads 2221 Barcode Filename Total NoRadTag LowQuality Retained ATGGGG PopA_01 160 94 0 66 @@ -22,7 +25,7 @@ TGTGAG PopA_10 168 128 0 40 ATAGTT PopA_11 200 132 0 68 GGAAGG PopA_12 178 136 0 42 -TTTGTG PopA_13 190 152 0 38 +TTTGTG PopA_13 189 151 0 38 TTAAAT PopA_14 166 96 0 70 AATAAG PopA_15 152 74 0 78 AAGAGG PopA_16 174 112 0 62 @@ -42,13 +45,13 @@ GGGAAT PopB_09 198 126 0 72 AGTAAT PopB_10 164 120 0 44 GGGATA PopB_11 146 90 0 56 -GAGAAG PopB_12 162 110 0 52 +GAGAAG PopB_12 161 110 0 51 AGTAGA PopB_13 204 146 0 58 AAGGAT PopB_14 180 128 0 52 AGGGTA PopB_15 134 72 0 62 TGTTTT PopB_16 138 98 0 40 ATGATG PopB_17 142 100 0 42 -GAGTTA PopB_18 160 112 0 48 +GAGTTA PopB_18 159 111 0 48 ATGTAG PopB_19 146 104 0 42 Sequences not recorded |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/process_radtags2.out --- a/test-data/procrad/process_radtags2.out Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ b/test-data/procrad/process_radtags2.out Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| @@ -1,5 +1,5 @@ -process_radtags v2.4, executed 2019-09-30 14:57:00 (zlib-1.2.11) -process_radtags -p stacks_inputs/ -i gzfastq -b /tmp/tmpe_shit/files/d/e/d/dataset_ded45538-15ef-471f-9585-07ee09b6e6d4.dat --inline_null -y gzfastq -o stacks_outputs -w 0.1 -s 11 -c -q -D -e ecoRI +process_radtags v2.55, executed 2022-01-04 19:49:47 (zlib-1.2.11) +process_radtags -p stacks_inputs/ -i gzfastq -b /tmp/tmp1omqb2_d/files/6/1/9/dataset_6199c14a-22f0-45b7-aea7-7725c6dbf716.dat --inline_null -y gzfastq -o stacks_outputs -w 0.1 -s 11 -c -q -D -e ecoRI File Retained Reads Low Quality Barcode Not Found RAD cutsite Not Found Total R1.fastq.gz 2222 0 0 4778 7000 R2.fastq.gz 0 0 7000 0 7000 |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/process_radtags_paired.out --- a/test-data/procrad/process_radtags_paired.out Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ b/test-data/procrad/process_radtags_paired.out Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| @@ -1,5 +1,5 @@ -process_radtags v2.2, executed 2018-11-23 13:35:34 -process_radtags -p stacks_inputs/ --paired -i fastq -b /tmp/tmp2_xu5h/files/000/dataset_91.dat --len_limit 50 -D -y gzfasta --inline_null -e ecoRI -o stacks_outputs +process_radtags v2.55, executed 2022-01-04 19:50:15 (zlib-1.2.11) +process_radtags -p stacks_inputs/ --paired -i fastq -b /tmp/tmp1omqb2_d/files/2/4/2/dataset_24218646-a203-4cdb-b2b6-7e572d65add7.dat --inline_null -y gzfasta -o stacks_outputs --len_limit 50 -D -e ecoRI File Retained Reads Low Quality Barcode Not Found RAD cutsite Not Found Total reads_R1_0.fastq 9222 0 0 4778 14000 |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/procrad/process_radtags_paired_no_barcode.out --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/procrad/process_radtags_paired_no_barcode.out Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| @@ -0,0 +1,9 @@ +process_radtags -p stacks_inputs/ --paired -i gzfastq -y gzfasta -o stacks_outputs -e ecoRI +File Retained Reads Low Quality Barcode Not Found RAD cutsite Not Found Total +reads_R1_0.fastq.gz 7000 0 0 7000 14000 + +Total Sequences 14000 +Barcode Not Found 0 +Low Quality 0 +RAD Cutsite Not Found 7000 +Retained Reads 7000 |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/shortreads/PopA_01.fq --- a/test-data/shortreads/PopA_01.fq Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,640 +0,0 @@\n-@lane1_fakedata0_0 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_1 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_2 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_3 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_4 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_5 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_6 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_7 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_8 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_9 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_10 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_11 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_12 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_13 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_14 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_15 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAGTCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_16 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata0_17 1:N:0:/1\n-ATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'_fakedata9_2 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_3 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_4 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_5 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_6 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_7 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_8 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_9 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_10 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_11 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_12 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCGATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_13 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_14 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_15 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_16 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_17 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_18 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n-@lane1_fakedata9_19 1:N:0:/1\n-ATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n-+\n-BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r e345aadf914f -r 42201b90e3f4 test-data/shortreads/process_shortreads.out --- a/test-data/shortreads/process_shortreads.out Wed Sep 01 11:28:07 2021 +0000 +++ b/test-data/shortreads/process_shortreads.out Thu Apr 14 09:26:53 2022 +0000 |
| b |
| @@ -1,14 +1,17 @@ -process_shortreads v2.53, executed 2020-07-10 13:51:53 (zlib-1.2.11) -process_shortreads -p stacks_inputs/ -i fastq -b /tmp/tmpidt4mij_/files/7/7/8/dataset_778705df-5f0c-4210-9ad6-4c43e8aacd52.dat --inline_null -o stacks_outputs +process_shortreads v2.55, executed 2022-01-05 15:53:50 (zlib-1.2.11) +process_shortreads -p stacks_inputs/ -i fastq -b /tmp/tmplyzlyqbv/files/4/1/2/dataset_412528b4-0c03-422a-93ff-0020f0e11824.dat --inline_null -o stacks_outputs File Retained Reads Low Quality Ambiguous Barcodes Trimmed Reads Orphaned paired-end reads Total -R1.fastq 7000 0 0 0 0 7000 +R1_01.fastq 2176 0 0 0 0 2176 +R1_02.fastq 2175 0 0 0 0 2175 +R1_03.fastq 2176 0 0 0 0 2176 +R1_04.fastq 470 0 0 0 0 470 -Total Sequences 7000 +Total Sequences 6997 Ambiguous Barcodes 0 Low Quality 0 Trimmed Reads 0 Orphaned Paired-ends 0 -Retained Reads 7000 +Retained Reads 6997 Barcode Filename Total Retained ATGGGG PopA_01 160 160 @@ -23,7 +26,7 @@ TGTGAG PopA_10 168 168 ATAGTT PopA_11 200 200 GGAAGG PopA_12 178 178 -TTTGTG PopA_13 190 190 +TTTGTG PopA_13 189 189 TTAAAT PopA_14 166 166 AATAAG PopA_15 152 152 AAGAGG PopA_16 174 174 @@ -43,13 +46,13 @@ GGGAAT PopB_09 198 198 AGTAAT PopB_10 164 164 GGGATA PopB_11 146 146 -GAGAAG PopB_12 162 162 +GAGAAG PopB_12 161 161 AGTAGA PopB_13 204 204 AAGGAT PopB_14 180 180 AGGGTA PopB_15 134 134 TGTTTT PopB_16 138 138 ATGATG PopB_17 142 142 -GAGTTA PopB_18 160 160 +GAGTTA PopB_18 159 159 ATGTAG PopB_19 146 146 Sequences not recorded |