Repository 'prims_metabolomics2'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/pieterlukasse/prims_metabolomics2

Changeset 2:44bfd7e34b39 (2015-03-19)
Previous changeset 1:223d1167de58 (2015-03-19) Next changeset 3:86d41d9c4a91 (2015-03-19)
Commit message:
added comment
added:
next.r
b
diff -r 223d1167de58 -r 44bfd7e34b39 next.r
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/next.r Thu Mar 19 10:39:27 2015 +0100
b
@@ -0,0 +1,9 @@
+# next script, useful for plotting the CAMERA groups pseudo-spectra:
+plotPsSpectrum( LC$xset,320,maxlabel=10) 
+320 is group id
+plotEICs( LC$xset,35,maxlabel=5) 
+
+
+could use this for the items identified by "annotate" step.
+could also integrate this to getEIC tool (add option to give group list instead of m/z list)...but then rt and other options
+   are also not so relevant...maybe a separate tool is more clear
\ No newline at end of file