Repository 'sparql_uniprot'
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Changeset 23:478f5587f12a (2017-10-22)
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sparql_uniprot.py
b
diff -r 84c9f65ed7c6 -r 478f5587f12a sparql_uniprot.py
--- a/sparql_uniprot.py Sun Oct 22 15:27:01 2017 -0400
+++ b/sparql_uniprot.py Sun Oct 22 15:57:18 2017 -0400
b
@@ -174,7 +174,7 @@
 def sparqlwrap(proteinId, proteinName, geneName, organismName, diseaseAnnotation, domainName, similarityAnnotation, locationAnnotation, functionAnnotation, pharmaceuticalAnnotation, output):
 
  query = buildQuery(proteinId, proteinName, geneName, organismName, diseaseAnnotation, domainName, similarityAnnotation, locationAnnotation, functionAnnotation, pharmaceuticalAnnotation)
- print query
+ print (query)
 
  # Creamos un objeto del tipo SPARQLWrapper indicando en que
  # direccion esta el servicio que recibe consultas en sparql
@@ -193,20 +193,20 @@
  # Esta es la instruccion que realiza la consulta a
  # uniprot. Devuelve un objeto de python que hay que
  # tratar.
- print "Ejecutando query"
+ print ("Ejecutando query")
  results = sparql.query()
 
  # Con esto, convertimos el objeto devuelto por
  # el servicio al formato que especificamos antes.
  # En este caso, json.
- print "Conviertiendo a json"
+ print ("Conviertiendo a json")
  json = results.convert()
- print "Fin conversion a json"
+ print ("Fin conversion a json")
 
  # Dentro de la variable results tenemos informacion
  # (metadatos) de lo que ha devuelto el servidor de
  # uniprot.
- print results.info()
+ print (results.info())
 
  # Imprimir resultados
  printResults(json, output)