Repository 'data_manager_mmseqs2_database'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/iuc/data_manager_mmseqs2_database

Changeset 1:561c4b181bfa (2025-03-27)
Previous changeset 0:75cc3fb4c10f (2025-03-27) Next changeset 2:35885ec2e59b (2025-04-14)
Commit message:
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/data_managers/data_manager_mmseqs2_database commit 25b603890e8048ac7bbffb81eaaa440f87049521
modified:
tool-data/mmseqs2_databases.loc.sample
b
diff -r 75cc3fb4c10f -r 561c4b181bfa tool-data/mmseqs2_databases.loc.sample
--- a/tool-data/mmseqs2_databases.loc.sample Thu Mar 27 14:37:32 2025 +0000
+++ b/tool-data/mmseqs2_databases.loc.sample Thu Mar 27 16:42:41 2025 +0000
b
@@ -1,4 +1,13 @@
 #This is a sample file distributed with Galaxy that enables tools
 #to use a directory of metagenomics files.  
 #file has this format (white space characters are TAB characters)
-#UniRef100-16102024 UniRef100 (MMseqs2) UniRef100.15.6f452 /path/to/data   15.6f452
\ No newline at end of file
+# Tab separated with 6 columns:
+# value : unique value used to generate the database path
+# name: name of the database generate using the date and version of the mmseqs2 databases 
+# type : type of the database (aminoacid, nucleotide...)
+# taxonomy : whether or not the database should contain taxonomy information
+# path : final path to mmseqs2 databases on galaxy
+# version : tool version to filter database version depending of the tool
+# value, name, type, taxonomy, path, version
+# eg.
+#SILVA-15.6f452-10022025 SILVA 10022025 nucleotide yes /path/to/data 15.6f452
\ No newline at end of file