Repository 'blastxml_to_top_descr'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/peterjc/blastxml_to_top_descr

Changeset 5:662fea0fe6b2 (2013-02-20)
Previous changeset 4:34a0adda2770 (2013-02-20) Next changeset 6:8a0771c5e236 (2013-04-17)
Commit message:
Uploaded v0.0.4, quotes filenames in case the contain spaces
modified:
tools/ncbi_blast_plus/blastxml_to_top_descr.txt
tools/ncbi_blast_plus/blastxml_to_top_descr.xml
b
diff -r 34a0adda2770 -r 662fea0fe6b2 tools/ncbi_blast_plus/blastxml_to_top_descr.txt
--- a/tools/ncbi_blast_plus/blastxml_to_top_descr.txt Wed Feb 20 13:18:07 2013 -0500
+++ b/tools/ncbi_blast_plus/blastxml_to_top_descr.txt Wed Feb 20 13:36:37 2013 -0500
b
@@ -51,6 +51,7 @@
 v0.0.2 - Since BLAST+ was moved out of the Galaxy core, now have a dependency
          on the 'blast_datatypes' repository in the Tool Shed.
 v0.0.3 - Include the test files required to run the unit tests
+v0.0.4 - Quote filenames in case they contain spaces (internal change)
 
 
 Developers
b
diff -r 34a0adda2770 -r 662fea0fe6b2 tools/ncbi_blast_plus/blastxml_to_top_descr.xml
--- a/tools/ncbi_blast_plus/blastxml_to_top_descr.xml Wed Feb 20 13:18:07 2013 -0500
+++ b/tools/ncbi_blast_plus/blastxml_to_top_descr.xml Wed Feb 20 13:36:37 2013 -0500
b
@@ -1,7 +1,7 @@
-<tool id="blastxml_to_top_descr" name="BLAST top hit descriptions" version="0.0.1">
+<tool id="blastxml_to_top_descr" name="BLAST top hit descriptions" version="0.0.4">
     <description>Make a table from BLAST XML</description>
     <command interpreter="python">
-      blastxml_to_top_descr.py $blastxml_file $tabular_file $topN
+      blastxml_to_top_descr.py "${blastxml_file}" "${tabular_file}" ${topN}
     </command>
     <inputs>
         <param name="blastxml_file" type="data" format="blastxml" label="BLAST results as XML"/>