| Next changeset 1:eea53e013f9e (2016-06-15) |
|
Commit message:
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/stacks commit f3a59c91c231cc1582479109e776d05602b7f24d-dirty |
|
added:
macros.xml stacks_refmap.xml test-data/demultiplexed/PopA_01.1.fa test-data/demultiplexed/PopA_01.1.fq test-data/demultiplexed/PopA_01.2.fq test-data/demultiplexed/PopA_01.rem.1.fa test-data/demultiplexed/PopA_01.rem.1.fq test-data/demultiplexed/PopA_01.rem.2.fq test-data/demultiplexed/PopA_02.1.fq test-data/demultiplexed/PopA_02.2.fq test-data/demultiplexed/PopA_02.rem.1.fq test-data/demultiplexed/PopA_02.rem.2.fq test-data/demultiplexed/PopA_03.1.fq test-data/demultiplexed/PopA_03.2.fq test-data/demultiplexed/PopA_03.rem.1.fq test-data/demultiplexed/PopA_03.rem.2.fq test-data/demultiplexed/PopA_04.1.fq test-data/demultiplexed/PopA_04.2.fq test-data/demultiplexed/PopA_04.rem.1.fq test-data/demultiplexed/PopA_04.rem.2.fq test-data/demultiplexed/PopB_01.1.fq test-data/demultiplexed/PopB_01.2.fq test-data/demultiplexed/PopB_01.rem.1.fq test-data/demultiplexed/PopB_01.rem.2.fq test-data/demultiplexed/PopB_02.1.fq test-data/demultiplexed/PopB_02.2.fq test-data/demultiplexed/PopB_02.rem.1.fq test-data/demultiplexed/PopB_02.rem.2.fq test-data/demultiplexed/PopB_03.1.fq test-data/demultiplexed/PopB_03.2.fq test-data/demultiplexed/PopB_03.rem.1.fq test-data/demultiplexed/PopB_03.rem.2.fq test-data/demultiplexed/PopB_04.1.fq test-data/demultiplexed/PopB_04.2.fq test-data/demultiplexed/PopB_04.rem.1.fq test-data/demultiplexed/PopB_04.rem.2.fq test-data/denovo_map/popmap.tsv test-data/genotypes/PopA_01.alleles.tsv test-data/genotypes/PopA_01.matches.tsv test-data/genotypes/PopA_01.snps.tsv test-data/genotypes/PopA_01.tags.tsv test-data/genotypes/PopA_02.alleles.tsv test-data/genotypes/PopA_02.matches.tsv test-data/genotypes/PopA_02.snps.tsv test-data/genotypes/PopA_02.tags.tsv test-data/genotypes/batch_1.catalog.alleles.tsv test-data/genotypes/batch_1.catalog.snps.tsv test-data/genotypes/batch_1.catalog.tags.tsv test-data/procrad/R1.fq test-data/procrad/R2.fq test-data/procrad/barcodes test-data/procrad/process_radtags.out test-data/refmap/PopA_01.bam test-data/refmap/PopA_02.bam test-data/refmap/PopA_03.bam test-data/refmap/PopA_04.bam test-data/refmap/PopB_01.bam test-data/refmap/PopB_02.bam test-data/refmap/PopB_03.bam test-data/refmap/PopB_04.bam test-data/refmap/reference.fasta tool_dependencies.xml |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 macros.xml --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/macros.xml Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| [ |
| b'@@ -0,0 +1,376 @@\n+<?xml version="1.0"?>\n+<macros>\n+ <xml name="requirements">\n+ <requirements>\n+ <requirement type="package" version="1.40">stacks</requirement>\n+ <requirement type="package" version="1.2.10">velvet</requirement>\n+ <container type="docker">quay.io/mulled/stacks:1.40--1</container>\n+ <yield/>\n+ </requirements>\n+ </xml>\n+\n+ <token name="@WRAPPER_VERSION@">1.40</token>\n+\n+ <xml name="stdio">\n+ <stdio>\n+ <exit_code range="1:" level="fatal" description="Error in Stacks execution" />\n+ </stdio>\n+ </xml>\n+\n+ <xml name="citation">\n+ <citations>\n+ <citation type="doi">10.1111/mec.12354</citation>\n+ <citation type="doi">10.1111/mec.12330</citation>\n+ <citation type="doi">10.1534/g3.111.000240</citation>\n+ <citation type="doi">10.1534/genetics.111.127324</citation>\n+ <citation type="doi">10.1111/j.1755-0998.2010.02967.x</citation>\n+ <citation type="doi">10.1073/pnas.1006538107</citation>\n+ </citations>\n+ </xml>\n+\n+ <token name="@STACKS_INFOS@">\n+<![CDATA[\n+--------\n+\n+**Created by:**\n+\n+Stacks was developed by Julian Catchen with contributions from Angel Amores, Paul Hohenlohe, and Bill Cresko\n+\n+**Project links:**\n+\n+`Stacks website <http://creskolab.uoregon.edu/stacks/>`_\n+\n+`Stacks manual <http://creskolab.uoregon.edu/stacks/stacks_manual.pdf>`_\n+\n+`Stacks google group <http://groups.google.com/group/stacks-users>`_\n+]]></token>\n+\n+ <xml name="enzymes">\n+ <option value="aciI">aciI</option>\n+ <option value="ageI">ageI</option>\n+ <option value="aluI">aluI</option>\n+ <option value="apeKI">apeKI</option>\n+ <option value="apoI">apoI</option>\n+ <option value="aseI">aseI</option>\n+ <option value="bamHI">bamHI</option>\n+ <option value="bfaI">bfaI</option>\n+ <option value="bgIII">bgIII</option>\n+ <option value="bspDI">bspDI</option>\n+ <option value="bstYI">bstYI</option>\n+ <option value="claI">claI</option>\n+ <option value="ddeI">ddeI</option>\n+ <option value="dpnII">dpnII</option>\n+ <option value="eaeI">eaeI</option>\n+ <option value="ecoRI">ecoRI</option>\n+ <option value="ecoRV">ecoRV</option>\n+ <option value="ecoT22I">ecoT22I</option>\n+ <option value="hindIII">hindIII</option>\n+ <option value="kpnI">kpnI</option>\n+ <option value="mluCI">mluCI</option>\n+ <option value="mseI">mseI</option>\n+ <option value="mspI">mspI</option>\n+ <option value="ndeI">ndeI</option>\n+ <option value="nheI">nheI</option>\n+ <option value="nlaIII">nlaIII</option>\n+ <option value="notI">notI</option>\n+ <option value="nsiI">nsiI</option>\n+ <option value="pstI">pstI</option>\n+ <option value="rsaI">rsaI</option>\n+ <option value="sacI">sacI</option>\n+ <option value="sau3AI">sau3AI</option>\n+ <option value="sbfI">sbfI</option>\n+ <option value="sexAI">sexAI</option>\n+ <option value="sgrAI">sgrAI</option>\n+ <option value="speI">speI</option>\n+ <option value="sphI">sphI</option>\n+ <option value="taqI">taqI</option>\n+ <option value="xbaI">xbaI</option>\n+ <option value="xhoI">xhoI</option>\n+ </xml>\n+\n+ <xml name="cross_types">\n+ <option value="CP">CP (F1 cross)</option>\n+ <option value="F2">F2 (F2 cross)</option>\n+ <option value="BC1">BC1 (backcross)</option>\n+ <option value="DH">DH (double haploid cross)</option>\n+ <option value="GEN">GEN (generic, unspecific to any map type)</option>\n+ </xml>\n+\n+ <token name="@NORM_GENOTYPES_OUTPUT_LIGHT@">\n+ <![CDATA[\n+ ##\xc2\xa0We need to do this as the output file names contains the value of an option (min progeny)\n+ &&\n+ cd stacks_outputs/ &&\n+ ln -s batch_1.haplotypes_1.tsv batch_1.ha'..b'_genomic" label="Each nucleotide position in all population members with ${tool.name} on ${on_string}" from_work_dir="stacks_outputs/batch_1.genomic.tsv">\n+ <filter>populations_output[\'options_genomic\'][\'genomic\']</filter>\n+ </data>\n+\n+ </xml>\n+\n+ <xml name="snp_options">\n+ <conditional name="select_model">\n+ <param name="model_type" type="select" label="Choose the model">\n+ <option value="snp" selected="true">SNP</option>\n+ <option value="bounded">Bounded SNP</option>\n+ <option value="fixed">Fixed</option>\n+ </param>\n+ <when value="snp">\n+ <param name="alpha" argument="--alpha" type="select" label="Chi square significance level required to call a heterozygote or homozygote" >\n+ <option value="0.1">0.1</option>\n+ <option value="0.05" selected="True">0.05</option>\n+ <option value="0.01">0.01</option>\n+ <option value="0.001">0.001</option>\n+ </param>\n+ </when>\n+ <when value="bounded">\n+ <param name="bound_low" argument="--bound_low" type="float" value="0.0" min="0.0" max="1.0" label="lower bound for epsilon, the error rate" help="between 0 and 1.0"/>\n+ <param name="bound_high" argument="--bound_high" type="float" value="1.0" min="0.0" max="1.0" label="upper bound for epsilon, the error rate" help="between 0 and 1.0" />\n+ <param name="alpha" argument="--alpha" type="select" label="Chi square significance level required to call a heterozygote or homozygote" >\n+ <option value="0.1">0.1</option>\n+ <option value="0.05" selected="True">0.05</option>\n+ <option value="0.01">0.01</option>\n+ <option value="0.001">0.001</option>\n+ </param>\n+ </when>\n+ <when value="fixed">\n+ </when>\n+ </conditional>\n+ </xml>\n+\n+ <xml name="snp_options_full">\n+ <conditional name="select_model">\n+ <param name="model_type" type="select" label="Choose the model">\n+ <option value="snp" selected="true">SNP</option>\n+ <option value="bounded">Bounded SNP</option>\n+ <option value="fixed">Fixed</option>\n+ </param>\n+ <when value="snp">\n+ <param name="alpha" argument="--alpha" type="select" label="Chi square significance level required to call a heterozygote or homozygote" >\n+ <option value="0.1">0.1</option>\n+ <option value="0.05" selected="True">0.05</option>\n+ <option value="0.01">0.01</option>\n+ <option value="0.001">0.001</option>\n+ </param>\n+ </when>\n+ <when value="bounded">\n+ <param name="bound_low" argument="--bound_low" type="float" value="0.0" min="0.0" max="1.0" label="lower bound for epsilon, the error rate" help="between 0 and 1.0"/>\n+ <param name="bound_high" argument="--bound_high" type="float" value="1.0" min="0.0" max="1.0" label="upper bound for epsilon, the error rate" help="between 0 and 1.0" />\n+ <param name="alpha" argument="--alpha" type="select" label="Chi square significance level required to call a heterozygote or homozygote" >\n+ <option value="0.1">0.1</option>\n+ <option value="0.05" selected="True">0.05</option>\n+ <option value="0.01">0.01</option>\n+ <option value="0.001">0.001</option>\n+ </param>\n+ </when>\n+ <when value="fixed">\n+ <param name="bc_err_freq" argument="--bc_err_freq" type="float" value="0.1" min="0.0" max="1.0" label="Barcode error frequency" help="between 0 and 1.0"/>\n+ </when>\n+ </conditional>\n+ </xml>\n+</macros>\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 stacks_refmap.xml --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/stacks_refmap.xml Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| [ |
| b'@@ -0,0 +1,442 @@\n+<tool id="stacks_refmap" name="Stacks: reference map" version="@WRAPPER_VERSION@.0">\n+ <description>the Stacks pipeline with a reference genome (ref_map.pl)</description>\n+ <macros>\n+ <import>macros.xml</import>\n+ </macros>\n+ <expand macro="requirements"/>\n+ <expand macro="stdio"/>\n+ <command><![CDATA[\n+ #from os.path import splitext\n+ #import re\n+\n+ #if str( $options_usage.rad_analysis_type ) == "genetic":\n+ #for $input_parent in $options_usage.parent_alignments:\n+ #if $input_parent.ext == "sam":\n+ #set $data_path = splitext($input_parent.name)[0]\n+ #set $data_path = re.sub(r\'\\.1$\', \'\', $data_path)\n+ #set $data_path = $data_path + ".sam"\n+ #else:\n+ #set $data_path = splitext($input_parent.name)[0]\n+ #set $data_path = re.sub(r\'\\.1$\', \'\', $data_path)\n+ #set $data_path = $data_path + ".bam"\n+ #end if\n+\n+ ln -s "${input_parent}" "${data_path}" &&\n+ #end for\n+\n+ #for $input_progeny in $options_usage.progeny_alignments:\n+\n+ #if $input_progeny.ext == "sam":\n+ #set $data_path = splitext($input_progeny.name)[0]\n+ #set $data_path = re.sub(r\'\\.1$\', \'\', $data_path)\n+ #set $data_path = $data_path + ".sam"\n+ #else:\n+ #set $data_path = splitext($input_progeny.name)[0]\n+ #set $data_path = re.sub(r\'\\.1$\', \'\', $data_path)\n+ #set $data_path = $data_path + ".bam"\n+ #end if\n+\n+ ln -s "${input_progeny}" "${data_path}" &&\n+ #end for\n+ #else:\n+ #for $input_indiv in $options_usage.individual_sample:\n+\n+ #if $input_indiv.ext == "sam":\n+ #set $data_path = splitext($input_indiv.name)[0]\n+ #set $data_path = re.sub(r\'\\.1$\', \'\', $data_path)\n+ #set $data_path = $data_path + ".sam"\n+ #else:\n+ #set $data_path = splitext($input_indiv.name)[0]\n+ #set $data_path = re.sub(r\'\\.1$\', \'\', $data_path)\n+ #set $data_path = $data_path + ".bam"\n+ #end if\n+\n+ ln -s "${input_indiv}" "${data_path}" &&\n+ #end for\n+ #end if\n+\n+ mkdir stacks_outputs\n+\n+ &&\n+\n+ ref_map.pl\n+\n+ -T \\${GALAXY_SLOTS:-1}\n+\n+ #if str( $options_usage.rad_analysis_type ) == "genetic":\n+ #for $input_parent in $options_usage.parent_alignments:\n+ #if $input_parent.ext == "sam":\n+ #set $data_path = splitext($input_parent.name)[0]\n+ #set $data_path = re.sub(r\'\\.1$\', \'\', $data_path)\n+ #set $data_path = $data_path + ".sam"\n+ #else:\n+ #set $data_path = splitext($input_parent.name)[0]\n+ #set $data_path = re.sub(r\'\\.1$\', \'\', $data_path)\n+ #set $data_path = $data_path + ".bam"\n+ #end if\n+\n+ -p "${data_path}"\n+ #end for\n+\n+ -A $options_usage.cross_type\n+\n+ #for $input_progeny in $options_usage.progeny_alignments:\n+ #if $input_progeny.ext == "sam":\n+ #set $data_path = splitext($input_progeny.name)[0]\n+ #set $data_path = re.sub(r\'\\.1$\', \'\', $data_path)\n+ #set $data_path = $data_path + ".sam"\n+ #else:\n+ #set $data_path = splitext($input_progeny.name)[0]\n+ #set $data_path = re.sub(r\'\\.1$\', \'\', $data_path)\n+ #set $data_path = $data_path + ".bam"\n+ #end if\n+\n+ '..b's_text text="Smoothed Pi" />\n+ </assert_contents>\n+ </output>\n+\n+ <!-- samples -->\n+ <output_collection name="tags">\n+ <element name="PopA_01.tags">\n+ <assert_contents>\n+ <has_text text="generated on " />\n+ </assert_contents>\n+ </element>\n+ </output_collection>\n+ <output_collection name="snps">\n+ <element name="PopA_01.snps">\n+ <assert_contents>\n+ <has_text text="generated on " />\n+ </assert_contents>\n+ </element>\n+ </output_collection>\n+ <output_collection name="alleles">\n+ <element name="PopA_01.alleles">\n+ <assert_contents>\n+ <has_text text="generated on " />\n+ </assert_contents>\n+ </element>\n+ </output_collection>\n+ <output_collection name="matches">\n+ <element name="PopA_01.matches">\n+ <assert_contents>\n+ <has_text text="generated on " />\n+ </assert_contents>\n+ </element>\n+ </output_collection>\n+ </test>\n+ </tests>\n+\n+ <help>\n+<![CDATA[\n+.. class:: infomark\n+\n+**What it does**\n+\n+This program expects data that have been aligned to a reference genome, and can accept data directly from Bowtie, or from any aligner that can produce SAM format. To avoid datasets names problems, we recommand the use of the *Map with BWA for STACKS tool*. This program will execute each of the Stacks components: first, running pstacks on each of the samples specified, building loci (based on the reference alignment) and calling SNPs in each. Second, cstacks will be run to create a catalog of all loci specified as \'parents\' or \'samples\' on the command line, again using alignment to match loci in the catalog. Finally, sstacks will be executed to match each sample against the catalog. The ref_map.pl program will also load the results of each stage of the analysis: individual loci, the catalog, and matches against the catalog into the database (although this can be disabled). After matching the program will build a database index to speed up access (index_radtags.pl) and enable web-based filtering.\n+\n+--------\n+\n+**Input files**\n+\n+- SAM, BAM\n+\n+- Population map::\n+\n+ indv_01 1\n+ indv_02 1\n+ indv_03 1\n+ indv_04 2\n+ indv_05 2\n+ indv_06 2\n+\n+**Output files**\n+\n+- XXX.tags.tsv file:\n+\n+See `Stacks output description <http://catchenlab.life.illinois.edu/stacks/manual/#files>`_\n+\n+Notes: For the tags file, each stack will start in the file with a consensus sequence for the entire stack followed by the flags for that stack. Then, each individual read that was merged into that stack will follow. The next stack will start with another consensus sequence.\n+\n+\n+- XXX.snps.tsv file:\n+\n+See `Stacks output description <http://catchenlab.life.illinois.edu/stacks/manual/#files>`_\n+\n+Notes: If a stack has two SNPs called within it, then there will be two lines in this file listing each one.\n+\n+\n+- XXX.alleles.tsv file:\n+\n+See `Stacks output description <http://catchenlab.life.illinois.edu/stacks/manual/#files>`_\n+\n+\n+- XXX.matches.tsv file:\n+\n+See `Stacks output description <http://catchenlab.life.illinois.edu/stacks/manual/#files>`_\n+\n+Notes: Each line in this file records a match between a catalog locus and a locus in an individual, for a particular haplotype. The Batch ID plus the Catalog ID together represent a unique locus in the entire population, while the Sample ID and the Stack ID together represent a unique locus in an individual sample.\n+\n+\n+- other files:\n+\n+See `Stacks output description <http://catchenlab.life.illinois.edu/stacks/manual/#files>`_\n+\n+@STACKS_INFOS@\n+]]>\n+ </help>\n+ <expand macro="citation" />\n+</tool>\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopA_01.1.fa --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_01.1.fa Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,132 @@\n+>lane1_fakedata0_0 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_1 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_2 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_3 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_4 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_5 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_6 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_7 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_8 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_9 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_10 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_11 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_12 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_13 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_14 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_15 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAGTCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_16 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_17 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_18 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_19 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_20 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_21 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_22 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_23 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_24 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_25 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_26 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata0_27 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n+>lane1_fakedata2_0 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_1 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_2 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_3 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAG'..b' 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_7 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_8 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_9 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_10 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_11 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_12 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_13 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_14 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_15 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_16 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_17 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCCAGA\n+>lane1_fakedata2_18 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata2_19 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n+>lane1_fakedata7_0 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n+>lane1_fakedata7_1 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n+>lane1_fakedata7_2 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n+>lane1_fakedata7_3 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n+>lane1_fakedata7_4 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n+>lane1_fakedata7_5 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n+>lane1_fakedata7_6 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n+>lane1_fakedata7_7 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n+>lane1_fakedata7_8 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n+>lane1_fakedata7_9 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n+>lane1_fakedata7_10 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n+>lane1_fakedata7_11 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n+>lane1_fakedata7_12 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n+>lane1_fakedata7_13 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n+>lane1_fakedata7_14 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n+>lane1_fakedata7_15 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n+>lane1_fakedata7_16 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n+>lane1_fakedata7_17 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopA_01.1.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_01.1.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,264 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAGTCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_16 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_17 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'TGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_1 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_2 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_3 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_4 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_5 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_6 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_7 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_8 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_9 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_10 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_11 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_12 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_13 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_14 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_15 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_16 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_17 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopA_01.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_01.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,264 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACATCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_16 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b':N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_2 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_3 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_4 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_5 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_6 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_7 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_8 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_9 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_10 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_11 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_12 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAATAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_13 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_14 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_15 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_16 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_17 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopA_01.rem.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_01.rem.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,376 @@\n+@lane1_fakedata3_0 1:N:0:_2\n+CCGCGTGGGGGGCTCCACGCCCTTGCACGGTAGCCATCACTTCCTTCCAAACCATGCAGTAGCACATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGGCCCGAAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_1 1:N:0:_2\n+CCGCGTGGGGGGCTCCACGCCCTTGCACGGTAGCCATCACTTCCTTCCAAACCATGCAGTAGCACATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGGCCCGAAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_2 1:N:0:_2\n+CCGCGTGGGGGGCTCCACGCCCTTGCACGGTAGCCATCACTTCCTTCCAAACCATGCAGTAGCACATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGGCCCGGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_3 1:N:0:_2\n+CCGCGTGGGGGGCTCCACGCCCTGCACGGTAGACTATCGCTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCGCATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGCCGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_4 1:N:0:_2\n+CCGCGTGGGGGGCTCCACGCCCTGCACGGTAGACTATCGCTTCCCGTTCCGAAACTATGCAGTAGCCGCATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTCGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_5 1:N:0:_2\n+CCGCGTGGGGGGCTCCACGCCCTGCACGGTAGACTATCGCTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCGCATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGCCGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata4_0 1:N:0:_2\n+CCGACATTCCTTGTGAAGTTAGAATAACTTGCTAAAGCGTCTTGGCCTCTACTTTGAACTCGTAGGCACCAGTAGCCATCGGGAAGAAACGAGACCGTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata4_1 1:N:0:_2\n+CCGACATTCCTTGTGAAGTTAGAATAACTTGCTAAAGCGTCTTGGCCTCTACTTTGAACTCGTAGGCACCAGTAGCCATCGGGAAGAAACGAGACCGTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata4_2 1:N:0:_2\n+CCGACATTCCTTGTGAAGTTAGAATAACTTGCTAAAGCGTCTTGGCCTCTACTTTGAACTCGTAGGCACCAGTAGCCATCGGGAAGAAACGAGACCGTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata4_3 1:N:0:_2\n+CCGACATTCCTTGTGAAGTTAGAATAACTTGCTAAAGCGTCTTGGCCTCTACTTTGAACTCGTAGGCACCAGTAGCCATCGGGAAGAAACGAGACCGTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata4_4 1:N:0:_2\n+CCGACATTCCTTGTGAAGTTAGAATAACTTGCTAAAGCGTCTTGGCCTCTACTTTGAACTCGTAGGCACCAGTAGCCATCGGGAAGAAACGAGACCGTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata4_5 1:N:0:_2\n+CCGACATTCCTTGTGAAGTTAGAATAACTTGCTAAAGCGTCTTGGCCTCTACTTTGAACTCGTAGGCACCAGTAGCCATCGGGAAGAAACGAGACCGTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata4_6 1:N:0:_2\n+CCGACATTCCTTGTGAAGTTAGAATAACTTGCTAAAGCGTCTTGGCCTCTACTTTGAACTCGTAGGCACCAGTAGCCATCGGGAAGAAACGAGACCGTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata4_7 1:N:0:_2\n+CCGACATTCCTTGTGAAGTTAGAATAACTTGCTAAAGCGTCTTGGCCTCTACTTTGAACTCGTAGGCACCAGTAGCCATCGGGAAGAAACGAGACCGTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata4_8 1:N:0:_2\n+CCGACATTCCTTGTGAAGTTAGAATAACTTGCTAAAGCGTCTTGGCCTCTACTTTGAACTCGTAGGCACCAGTAGCCATCGGGAAGAAACGAGACCGTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata4_9 1:N:0:_2\n+CCGACATTCCTTGTGAAGTTAGAATAACTTGCTAAAGCGTCTTGGCCTCTACTTTGAACTCGTAGGCACCAGTAGCCATCGGGAAGAAACGATACCGTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata4_10 1:N:0:_2\n+CCGACATTCCTTGTGAAGTTAGAATAACTTGCTAAAGCGTCTTGGCCTCTACTTTGAACTCGTAGGCACCAGTAGCCATCGGGAAGAAACGAGACCGTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b':0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_4 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_5 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_6 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_7 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_8 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_9 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_10 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_11 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_12 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_13 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_14 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_15 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_16 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_17 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_18 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_19 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTGCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopA_02.1.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_02.1.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,240 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_16 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_17 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'ACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_15 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_16 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_17 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_18 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_19 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_0 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_1 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_2 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_3 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_4 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_5 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_6 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAACCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_7 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_8 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_9 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_10 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTTTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_11 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopA_02.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_02.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,240 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAAGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_2\n+CCGTACTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTGCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_16 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGCCAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b' 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_16 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_17 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_18 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_19 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_0 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_1 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_2 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_3 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_4 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_5 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_6 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_7 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACGATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_8 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_9 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_10 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_11 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCTATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopA_02.rem.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_02.rem.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,344 @@\n+@lane1_fakedata1_0 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_1 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_2 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCTGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_3 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_4 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_5 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_6 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_7 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_8 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_9 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_10 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_11 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_12 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_13 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_0 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCGCATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_1 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCGCATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_2 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCGCATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_8 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_9 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_10 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_11 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_12 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_13 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_14 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_15 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCGTGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_16 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTGGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_17 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_18 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_19 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_20 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_21 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_22 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_23 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTAGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopA_03.1.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_03.1.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,368 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCCAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_0 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_1 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'AATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_21 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_22 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_23 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_24 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_25 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_26 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_27 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_28 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_29 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_30 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_31 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_32 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_33 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_34 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_35 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_36 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_37 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopA_03.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_03.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,368 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGGTGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTCATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGGCAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_0 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATATAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_22 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_23 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_24 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_25 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_26 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_27 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_28 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_29 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_30 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_31 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_32 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_33 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_34 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGGCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_35 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATAGAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_36 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_37 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopA_03.rem.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_03.rem.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,528 @@\n+@lane1_fakedata1_0 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_1 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCATCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_2 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_3 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_4 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_5 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_6 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_7 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_8 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_9 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_10 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_11 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_12 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGAGCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_13 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGATTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_14 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_15 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_16 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b' 1:N:0:_2\n+CCGGAGATCAAATTGAATTAGGTGGTATCGGATAGTATGGAATTAACCAACGCACCCGGGTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_24 1:N:0:_2\n+CCGGAGATCAAATTGAATTAGGTGGTATCGGATAGTATTGAATTAACCAACGCACCCGGGTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_25 1:N:0:_2\n+CCGGAGATCAAATTGAATTAGGTGGTATCGGATAGTATTGAATTAACCAACGCACCCGGGTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_0 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_1 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_2 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_3 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_4 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_5 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_6 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_7 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_8 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_9 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_10 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_11 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_12 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_13 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopA_04.1.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_04.1.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,88 @@ +@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_1 +AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_1 +AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_0 1:N:0:_1 +AATTCTTTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_1 1:N:0:_1 +AATTCTTTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_2 1:N:0:_1 +AATTCTTTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_3 1:N:0:_1 +AATTCTTTACACCACAGCATCACTTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_4 1:N:0:_1 +AATTCTTTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_5 1:N:0:_1 +AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_6 1:N:0:_1 +AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_7 1:N:0:_1 +AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_8 1:N:0:_1 +AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_9 1:N:0:_1 +AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_0 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_1 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_2 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_3 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_4 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_5 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_6 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_7 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_8 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_9 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopA_04.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_04.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,88 @@ +@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_2 +CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_2 +CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_0 1:N:0:_2 +CCGAGTTCACAAACTCACTCAACGGTTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATATATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_1 1:N:0:_2 +CCGAGTTCACAAACTCACTCAACGGTTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATATATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_2 1:N:0:_2 +CCGAGTTCACAAACTCACTCAACGGTTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATATATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_3 1:N:0:_2 +CCGAGTTCACAAACTCACTCAACGGTTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATATATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_4 1:N:0:_2 +CCGAGTTCACAAACTCACTCAACGGTTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATATATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_5 1:N:0:_2 +CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_6 1:N:0:_2 +CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_7 1:N:0:_2 +CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_8 1:N:0:_2 +CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_9 1:N:0:_2 +CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_0 1:N:0:_2 +CCGACATCAGCATAGTAGTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGATAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_1 1:N:0:_2 +CCGACATCAGCATAGTAGTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_2 1:N:0:_2 +CCGACATCAGCATAGTAGTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_3 1:N:0:_2 +CCGACATCAGCATAGTAGTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_4 1:N:0:_2 +CCGACATCAGCATAGTAGTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGAAG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_5 1:N:0:_2 +CCGACGTCAGCATAGTAGTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_6 1:N:0:_2 +CCGACATCAGCATAGTAGTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_7 1:N:0:_2 +CCGACATCAGCATAGTAGTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_8 1:N:0:_2 +CCGACATCAGCATAGTAGTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_9 1:N:0:_2 +CCGACATCAGCATAGTAGTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopA_04.rem.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopA_04.rem.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,584 @@\n+@lane1_fakedata1_0 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGTGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_1 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGTGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_2 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGTGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_3 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGTGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_4 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGTGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_5 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGTGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_6 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGTGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_7 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGTGCGCCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_8 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGTGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_9 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGTGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_10 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGTGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_11 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGTGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_12 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_13 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_14 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_15 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_16 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_8 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_9 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_10 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATCCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_11 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_12 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_13 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_14 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_15 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_16 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_17 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_18 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_19 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_20 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_21 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_22 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGAGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_23 1:N:0:_2\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopB_01.1.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopB_01.1.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,184 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_0 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_1 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_2 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCATAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_3 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_4 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_5 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_6 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_7 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'TGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_1 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_2 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_3 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_4 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_5 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_6 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_7 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_8 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_9 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_10 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_11 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_12 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_13 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_14 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_15 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_16 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_17 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopB_01.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopB_01.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,184 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCGCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCGCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCGCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCGCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCGCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_0 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_1 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_2 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_3 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_4 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_5 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_6 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b':N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_2 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_3 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_4 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_5 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_6 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_7 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_8 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_9 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_10 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_11 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_12 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGGTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_13 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_14 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATATGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_15 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_16 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_17 1:N:0:_2\n+CCGCATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCGAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopB_01.rem.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopB_01.rem.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,360 @@\n+@lane1_fakedata1_0 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGTGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_1 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGATCTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_0 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCACATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_1 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCACATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_2 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCACATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_3 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCACATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_4 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCACATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_5 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCACATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_6 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAATCCATGCAGTAGCCACATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_7 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCACATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_8 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCACATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_9 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCACATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_10 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCGCATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_11 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCGCATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_12 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCGCATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_13 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCGCATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata3_14 1:N:0:_2\n+CCGCCTTGCACGGTAGACTCATCGACTTCCCGTTCCGAAACCATGCAGTAGCCGCATCTTGATGGCACGGTTCTTCGCTCAGTGCCCGAAAATCCGGACT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTAGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_12 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTAGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_13 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTAGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_14 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_15 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_16 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_17 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_18 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_19 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_20 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCCTACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_21 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_22 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_23 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_24 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_25 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCATGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_26 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_27 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopB_02.1.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopB_02.1.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,232 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGGTTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCGAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGCATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_16 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_17 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'CACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata2_9 1:N:0:_1\n+AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_0 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_1 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_2 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_3 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_4 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_5 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_6 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_7 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_8 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_9 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_10 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_11 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_12 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_13 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_14 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_15 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopB_02.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopB_02.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,232 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGGGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_16 1:N:0:_2\n+CCGGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b' 1:N:0:_2\n+CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATATAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_0 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_1 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_2 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_3 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_4 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_5 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_6 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_7 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_8 1:N:0:_2\n+CCGACATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_9 1:N:0:_2\n+CCGACATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_10 1:N:0:_2\n+CCGACATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_11 1:N:0:_2\n+CCGACATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGGTGGCCCAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_12 1:N:0:_2\n+CCGACATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_13 1:N:0:_2\n+CCGACATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAAGGTGTATAACTATTTGGTAGAGAGAACTGCTGCTATCACTCCCGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_14 1:N:0:_2\n+CCGACATCAGCATCAGTAGTTTTCAAAGAGCTGGCCCAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_15 1:N:0:_2\n+CCGACATCAGCATTAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAAGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopB_02.rem.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopB_02.rem.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,432 @@\n+@lane1_fakedata1_0 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_1 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_2 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_3 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTAATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_4 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_5 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGACTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_6 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_7 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_8 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_9 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_10 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_11 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_12 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_13 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_14 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAGACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_15 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_16 1:N:0:_2\n+CCGCGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'5_23 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata6_0 1:N:0:_2\n+CCGCGCGCGACGACATCGGGATAGTTTAGATGGGGTCTGGTCATATTTTTGTCATCCACGATGAAAGTGTGGTCTAACGGAAGTTAAACGCAGCGCACCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata6_1 1:N:0:_2\n+CCGCGCGCGACGACATCGGGATAGTTTAGATGGGGTCTGGTCATATTTTTGTCATCCACGATGAAAGTGTGGTCTAACGGAAGTTAAACGCAGCGCACCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata6_2 1:N:0:_2\n+CCGCGCGCGACGACATCGGGATAGTTTAGATGGGGTCTGGTCATATTTTTGTCATCCACGATGAAAGTGTGGTCTAACGGAAGTTAAACGCAGCGCACCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata6_3 1:N:0:_2\n+CCGCGCGCGACGACATCGGGATAGTTTAGATGGGGTCTGGTCATATTTTTGTCATCCACGATGAAAGTGTGGTCTAACGGAAGTTAAACGCAGCGCACCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata6_4 1:N:0:_2\n+CCGCGCGCGACGACATCGGGATAGTTTAGATGGGGTCTGGTCATATTTTTGTCATCCACGATGAAAGTGTGGTCTAACGGAAGTTAAACGCAGCGCACCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata6_5 1:N:0:_2\n+CCGCGCGCGACGACATCGGGATAGTTTAGATGGGGTCTGGTCATATTTTTGTCATCCACGATGAAAGTTTGGTCTAACGGAAGTTAAACGCAGCGCACCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata6_6 1:N:0:_2\n+CCGCGCGCGACGACATCGGGATATTTTAGATGGGGTCTGGTCATATTTTTGTCATCCACGTTGAAAGTGTGGTCTAACGGAAGTTAAACGCAGCGCACCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata6_7 1:N:0:_2\n+CCGCGCGCGACGACATCGGGATAGTTTAGATGGGGTCTGGTCATATTTTTGTCATCCACGTTGAAAGTGTGGTCTAACGGAAGTTAAACGCAGCGCACCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata6_8 1:N:0:_2\n+CCGCGCGCGACGACATCGGGATAGTTTAGATGGGGTCTGGTCATATTTTTGTCATCCACGTTGAAAGTGTGGTCTAACGGAAGTTAAACGCAGCGCACCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata6_9 1:N:0:_2\n+CCGCGCGCGACGACATCGGGATAGTTTAGATGGGGTCTGGTCATATTTTTGTCATCCACGTTGAAAGTGTGGTCTAACGGAAGTTAAACGCAGCGCACCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata6_10 1:N:0:_2\n+CCGCGCGCGACGACATCGGGATAGTTTAGATGGGGTCTGGTCATATTTTTGTCATCCACGTTGAAAGTGTGGTCTAACGGAAGTTAAACGCAGCGCACTC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata6_11 1:N:0:_2\n+CCGCGCGCGACGACATCGGGATAGTTTAGATGGGGTCTGGTCATATTTTTGTCATCCACGTTGAAAGTGTGGTCTAACGGAAGTTAAACGCAGCGCACCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_0 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_1 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATAAGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTACAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_2 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCGGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_3 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopB_03.1.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopB_03.1.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,296 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATTGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_16 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_17 1:N:0:_1\n+AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'AATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_11 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_12 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_13 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_14 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_15 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_16 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_17 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_18 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_19 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_20 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_21 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_22 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_23 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_24 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_25 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_26 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_27 1:N:0:_1\n+AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopB_03.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopB_03.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,296 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCATTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_2\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_16 1:N:0:_2\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_12 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_13 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_14 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_15 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_16 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_17 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_18 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_19 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_20 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_21 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_22 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_23 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_24 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_25 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGGCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_26 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata7_27 1:N:0:_2\n+CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopB_03.rem.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopB_03.rem.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,296 @@\n+@lane1_fakedata1_0 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_1 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_2 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_3 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_4 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_5 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_6 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_7 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_8 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_9 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_10 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_11 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_12 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_13 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_14 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_15 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_16 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_8 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_9 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_10 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_11 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_12 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_13 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_14 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_15 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_16 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_17 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAGAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_18 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_19 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_20 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_21 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_22 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAGATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata5_23 1:N:0:_2\n+CCGTGGTAACTTGGTCAATCTTAAATGACAGTCGGGGACCCCCAACACTCCTATAAGTGCAAGGCATGCCACTTGGGGACGGAAAAACAGATGCCAGCAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopB_04.1.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopB_04.1.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,96 @@ +@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_1 +AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_1 +AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_1 +AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_1 +AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_1 +AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_1 +AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_1 +AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_1 +AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_1 +AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_1 +AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_0 1:N:0:_1 +AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_1 1:N:0:_1 +AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_0 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_1 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_2 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_3 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_4 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATGTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_5 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_6 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAAACGAGGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_7 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGAGGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_8 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGAGGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_9 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGAGGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_10 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGAGGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_11 1:N:0:_1 +AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGAGGCTGCCAGACGCGAGAC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopB_04.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopB_04.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,96 @@ +@lane1_fakedata0_0 1:N:0:_2 +CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCGCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_1 1:N:0:_2 +CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCGCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_2 1:N:0:_2 +CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCGCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_3 1:N:0:_2 +CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCGCCTTTGATGTTATCCATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_4 1:N:0:_2 +CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCGCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_5 1:N:0:_2 +CCGGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_6 1:N:0:_2 +CCGGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_7 1:N:0:_2 +CCGGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_8 1:N:0:_2 +CCGGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata0_9 1:N:0:_2 +CCGGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_0 1:N:0:_2 +CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGACCGTGAACTCAGGAATGCTATGTAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata2_1 1:N:0:_2 +CCGGTTCACTAAACTCACTCAACGGTTGGCGATATTGGCCGTGAACTCAGGAATGCTATATAATCCAGTCAAGGTACCGAGCGAAGGACGTCCAGCAGCC ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_0 1:N:0:_2 +CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_1 1:N:0:_2 +CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_2 1:N:0:_2 +CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_3 1:N:0:_2 +CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_4 1:N:0:_2 +CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_5 1:N:0:_2 +CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_6 1:N:0:_2 +CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_7 1:N:0:_2 +CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_8 1:N:0:_2 +CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_9 1:N:0:_2 +CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_10 1:N:0:_2 +CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB +@lane1_fakedata7_11 1:N:0:_2 +CCGATCAGCATCAGTAGTTTTCAACGAGCTGGCCCAATGGTGTATAACTATGTGGTAGAGAGAAACTGCTGCTATCACTCACGATATAAGCCCTCTGACG ++ +BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/demultiplexed/PopB_04.rem.2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/demultiplexed/PopB_04.rem.2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,624 @@\n+@lane1_fakedata1_0 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_1 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_2 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_3 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_4 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_5 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_6 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_7 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_8 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_9 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_10 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_11 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_12 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_13 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_14 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGGGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_15 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata1_16 1:N:0:_2\n+CCGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b' 1:N:0:_2\n+CCGCGCGCGACGACATCGGGATAGTTTAGATGGGGTCTGGTCATATTTTTGTCATCCACGTTGAAAGTGTGGTCTAACGGAAGTTAAACGCAGCGCTCCC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_0 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_1 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_2 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_3 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_4 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_5 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_6 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_7 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_8 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_9 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_10 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_11 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_12 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAACTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_13 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_14 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata8_15 1:N:0:_2\n+CCGGTGGTATCGGATATGTATATGAATTAACCAAGCGCACCCGGGTTTCTGGCATACCAGTTCCATATACACACCCAAGCCACACAATTCTCTTCAATAG\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/denovo_map/popmap.tsv --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/denovo_map/popmap.tsv Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,8 @@ +PopA_01 myPopA +PopA_02 myPopA +PopA_03 myPopA +PopA_04 myPopA +PopB_01 myPopB +PopB_02 myPopB +PopB_03 myPopB +PopB_04 myPopB |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/genotypes/PopA_01.alleles.tsv --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/genotypes/PopA_01.alleles.tsv Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,3 @@ +# ustacks version 1.37; generated on 2016-04-18 07:36:21 +0 1 1 AC 50.00 9 +0 1 1 CA 50.00 9 |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/genotypes/PopA_01.matches.tsv --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/genotypes/PopA_01.matches.tsv Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,5 @@ +# sstacks version 1.37; generated on 2016-04-18 07:36:21 +0 1 1 1 1 AC 9 -3.36972 +0 1 1 1 1 CA 9 -3.36972 +0 1 2 1 2 consensus 20 -4.15 +0 1 3 1 3 consensus 28 -2.08 |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/genotypes/PopA_01.snps.tsv --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/genotypes/PopA_01.snps.tsv Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,283 @@ +# ustacks version 1.37; generated on 2016-04-18 07:36:21 +0 1 1 0 O 24.95 A - +0 1 1 1 O 24.95 A - +0 1 1 2 O 24.95 T - +0 1 1 3 O 24.95 T - +0 1 1 4 O 24.95 C - +0 1 1 5 O 24.95 G - +0 1 1 6 O 24.95 T - +0 1 1 7 O 24.95 T - +0 1 1 8 O 24.95 T - +0 1 1 9 O 24.95 G - +0 1 1 10 O 24.95 C - +0 1 1 11 O 24.95 T - +0 1 1 12 O 24.95 G - +0 1 1 13 O 24.95 C - +0 1 1 14 O 24.95 T - +0 1 1 15 O 24.95 T - +0 1 1 16 O 24.95 C - +0 1 1 17 O 24.95 A - +0 1 1 18 O 24.95 G - +0 1 1 19 O 24.95 G - +0 1 1 20 O 24.95 A - +0 1 1 21 O 24.95 A - +0 1 1 22 O 24.95 T - +0 1 1 23 O 24.95 C - +0 1 1 24 O 24.95 T - +0 1 1 25 O 24.95 C - +0 1 1 26 O 24.95 T - +0 1 1 27 O 24.95 C - +0 1 1 28 O 24.95 G - +0 1 1 29 O 24.95 T - +0 1 1 30 O 24.95 A - +0 1 1 31 O 24.95 T - +0 1 1 32 O 24.95 A - +0 1 1 33 E -19.78 A C +0 1 1 34 O 24.95 T - +0 1 1 35 O 24.95 C - +0 1 1 36 O 24.95 T - +0 1 1 37 O 24.95 G - +0 1 1 38 O 24.95 A - +0 1 1 39 O 24.95 G - +0 1 1 40 O 24.95 T - +0 1 1 41 O 24.95 A - +0 1 1 42 O 24.95 T - +0 1 1 43 O 24.95 G - +0 1 1 44 O 24.95 T - +0 1 1 45 O 24.95 G - +0 1 1 46 O 24.95 C - +0 1 1 47 O 24.95 G - +0 1 1 48 O 24.95 T - +0 1 1 49 O 24.95 A - +0 1 1 50 O 24.95 C - +0 1 1 51 O 24.95 G - +0 1 1 52 O 24.95 T - +0 1 1 53 O 24.95 A - +0 1 1 54 O 24.95 C - +0 1 1 55 O 24.95 G - +0 1 1 56 O 24.95 C - +0 1 1 57 O 24.95 T - +0 1 1 58 O 24.95 A - +0 1 1 59 O 24.95 T - +0 1 1 60 O 24.95 T - +0 1 1 61 O 24.95 T - +0 1 1 62 O 24.95 A - +0 1 1 63 O 24.95 G - +0 1 1 64 O 24.95 A - +0 1 1 65 O 24.95 T - +0 1 1 66 O 24.95 G - +0 1 1 67 O 24.95 G - +0 1 1 68 O 24.95 A - +0 1 1 69 O 24.95 T - +0 1 1 70 O 24.95 A - +0 1 1 71 O 24.95 A - +0 1 1 72 O 24.95 C - +0 1 1 73 O 24.95 C - +0 1 1 74 O 24.95 G - +0 1 1 75 O 24.95 A - +0 1 1 76 O 24.95 C - +0 1 1 77 O 24.95 G - +0 1 1 78 O 24.95 C - +0 1 1 79 O 24.95 T - +0 1 1 80 O 24.95 G - +0 1 1 81 O 24.95 C - +0 1 1 82 O 24.95 C - +0 1 1 83 O 24.95 A - +0 1 1 84 O 24.95 G - +0 1 1 85 O 24.95 A - +0 1 1 86 O 24.95 C - +0 1 1 87 O 24.95 G - +0 1 1 88 E -19.78 A C +0 1 1 89 O 24.95 G - +0 1 1 90 O 24.95 A - +0 1 1 91 O 24.95 G - +0 1 1 92 O 24.95 A - +0 1 1 93 O 24.95 C - +0 1 2 0 O 27.73 A - +0 1 2 1 O 27.73 A - +0 1 2 2 O 27.73 T - +0 1 2 3 O 27.73 T - +0 1 2 4 O 27.73 C - +0 1 2 5 O 27.73 T - +0 1 2 6 O 27.73 C - +0 1 2 7 O 27.73 T - +0 1 2 8 O 27.73 A - +0 1 2 9 O 27.73 C - +0 1 2 10 O 27.73 A - +0 1 2 11 O 27.73 C - +0 1 2 12 O 27.73 C - +0 1 2 13 O 27.73 A - +0 1 2 14 O 27.73 C - +0 1 2 15 O 27.73 A - +0 1 2 16 O 27.73 G - +0 1 2 17 O 27.73 C - +0 1 2 18 O 27.73 A - +0 1 2 19 O 27.73 T - +0 1 2 20 O 27.73 C - +0 1 2 21 O 27.73 A - +0 1 2 22 O 27.73 A - +0 1 2 23 O 27.73 T - +0 1 2 24 O 27.73 T - +0 1 2 25 O 27.73 C - +0 1 2 26 O 27.73 T - +0 1 2 27 O 27.73 A - +0 1 2 28 O 27.73 A - +0 1 2 29 O 27.73 A - +0 1 2 30 O 27.73 A - +0 1 2 31 O 27.73 A - +0 1 2 32 O 27.73 T - +0 1 2 33 O 27.73 G - +0 1 2 34 O 27.73 A - +0 1 2 35 O 27.73 C - +0 1 2 36 O 27.73 T - +0 1 2 37 O 27.73 A - +0 1 2 38 O 27.73 C - +0 1 2 39 O 27.73 C - +0 1 2 40 O 27.73 A - +0 1 2 41 O 27.73 G - +0 1 2 42 O 27.73 A - +0 1 2 43 O 27.73 G - +0 1 2 44 O 27.73 A - +0 1 2 45 O 27.73 G - +0 1 2 46 O 27.73 A - +0 1 2 47 O 27.73 C - +0 1 2 48 O 27.73 A - +0 1 2 49 O 27.73 A - +0 1 2 50 O 27.73 C - +0 1 2 51 O 27.73 T - +0 1 2 52 O 27.73 C - +0 1 2 53 O 27.73 C - +0 1 2 54 O 27.73 G - +0 1 2 55 O 27.73 C - +0 1 2 56 O 27.73 A - +0 1 2 57 O 27.73 G - +0 1 2 58 O 27.73 T - +0 1 2 59 O 17.59 T - +0 1 2 60 O 27.73 A - +0 1 2 61 O 27.73 A - +0 1 2 62 O 27.73 A - +0 1 2 63 O 27.73 C - +0 1 2 64 O 27.73 A - +0 1 2 65 O 27.73 C - +0 1 2 66 O 27.73 T - +0 1 2 67 O 27.73 C - +0 1 2 68 O 27.73 T - +0 1 2 69 O 27.73 G - +0 1 2 70 O 27.73 A - +0 1 2 71 O 27.73 C - +0 1 2 72 O 27.73 T - +0 1 2 73 O 27.73 G - +0 1 2 74 O 27.73 C - +0 1 2 75 O 27.73 C - +0 1 2 76 O 27.73 A - +0 1 2 77 O 27.73 C - +0 1 2 78 O 27.73 G - +0 1 2 79 O 27.73 C - +0 1 2 80 O 27.73 C - +0 1 2 81 O 27.73 A - +0 1 2 82 O 27.73 G - +0 1 2 83 O 27.73 C - +0 1 2 84 O 27.73 T - +0 1 2 85 O 27.73 A - +0 1 2 86 O 27.73 C - +0 1 2 87 O 27.73 C - +0 1 2 88 O 27.73 T - +0 1 2 89 O 27.73 C - +0 1 2 90 O 17.59 T - +0 1 2 91 O 27.73 A - +0 1 2 92 O 27.73 G - +0 1 2 93 O 27.73 A - +0 1 3 0 O 38.82 A - +0 1 3 1 O 38.82 A - +0 1 3 2 O 38.82 T - +0 1 3 3 O 38.82 T - +0 1 3 4 O 38.82 C - +0 1 3 5 O 38.82 G - +0 1 3 6 O 38.82 G - +0 1 3 7 O 38.82 C - +0 1 3 8 O 38.82 T - +0 1 3 9 O 38.82 T - +0 1 3 10 O 38.82 G - +0 1 3 11 O 38.82 C - +0 1 3 12 O 38.82 A - +0 1 3 13 O 38.82 A - +0 1 3 14 O 38.82 C - +0 1 3 15 O 38.82 G - +0 1 3 16 O 38.82 C - +0 1 3 17 O 38.82 A - +0 1 3 18 O 38.82 A - +0 1 3 19 O 38.82 G - +0 1 3 20 O 38.82 T - +0 1 3 21 O 38.82 G - +0 1 3 22 O 38.82 A - +0 1 3 23 O 38.82 C - +0 1 3 24 O 38.82 G - +0 1 3 25 O 38.82 A - +0 1 3 26 O 38.82 T - +0 1 3 27 O 38.82 T - +0 1 3 28 O 38.82 C - +0 1 3 29 O 38.82 C - +0 1 3 30 O 38.82 C - +0 1 3 31 O 38.82 A - +0 1 3 32 O 38.82 C - +0 1 3 33 O 38.82 G - +0 1 3 34 O 38.82 G - +0 1 3 35 O 38.82 A - +0 1 3 36 O 38.82 C - +0 1 3 37 O 38.82 A - +0 1 3 38 O 38.82 T - +0 1 3 39 O 38.82 A - +0 1 3 40 O 38.82 A - +0 1 3 41 O 38.82 C - +0 1 3 42 O 38.82 T - +0 1 3 43 O 38.82 G - +0 1 3 44 O 38.82 A - +0 1 3 45 O 38.82 T - +0 1 3 46 O 38.82 C - +0 1 3 47 O 38.82 T - +0 1 3 48 O 38.82 A - +0 1 3 49 O 38.82 A - +0 1 3 50 O 38.82 G - +0 1 3 51 O 38.82 T - +0 1 3 52 O 38.82 A - +0 1 3 53 O 38.82 A - +0 1 3 54 O 38.82 C - +0 1 3 55 O 38.82 T - +0 1 3 56 O 38.82 T - +0 1 3 57 O 38.82 C - +0 1 3 58 O 38.82 C - +0 1 3 59 O 38.82 A - +0 1 3 60 O 38.82 A - +0 1 3 61 O 27.99 A - +0 1 3 62 O 38.82 T - +0 1 3 63 O 38.82 C - +0 1 3 64 O 38.82 T - +0 1 3 65 O 38.82 G - +0 1 3 66 O 38.82 G - +0 1 3 67 O 38.82 G - +0 1 3 68 O 38.82 A - +0 1 3 69 O 38.82 A - +0 1 3 70 O 38.82 T - +0 1 3 71 O 38.82 G - +0 1 3 72 O 38.82 G - +0 1 3 73 O 38.82 G - +0 1 3 74 O 38.82 A - +0 1 3 75 O 38.82 T - +0 1 3 76 O 38.82 T - +0 1 3 77 O 38.82 T - +0 1 3 78 O 38.82 C - +0 1 3 79 O 38.82 A - +0 1 3 80 O 38.82 T - +0 1 3 81 O 38.82 A - +0 1 3 82 O 38.82 A - +0 1 3 83 O 38.82 T - +0 1 3 84 O 38.82 T - +0 1 3 85 O 38.82 A - +0 1 3 86 O 38.82 A - +0 1 3 87 O 38.82 G - +0 1 3 88 O 38.82 G - +0 1 3 89 O 38.82 A - +0 1 3 90 O 38.82 C - +0 1 3 91 O 38.82 T - +0 1 3 92 O 38.82 A - +0 1 3 93 O 38.82 T - |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/genotypes/PopA_01.tags.tsv --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/genotypes/PopA_01.tags.tsv Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,73 @@\n+# ustacks version 1.37; generated on 2016-04-18 07:36:21\n+0\t1\t1\t\t0\t+\tconsensus\t\t\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t0\t0\t0\t-3.36972\n+0\t1\t1\t\t\t\tmodel\t\t\tOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOEOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOEOOOOO\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata7_0 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata7_1 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata7_2 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata7_3 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata7_4 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata7_5 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata7_6 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata7_7 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata7_8 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_9 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_10 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_11 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_12 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_13 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_14 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_15 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_16 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_17 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t1\t2\t\t0\t+\tconsensus\t\t\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t0\t0\t0\t-4.15\n+0\t1\t2\t\t\t\tmodel\t\t\tOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO\t\t\t\t\n+0\t1\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_0 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t1\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_1 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t1\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_2 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t1\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_3 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t1\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_4 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t1\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_6 1:N:0:_1\tAATTCTCTACAC'..b'ATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_1 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_2 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_3 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_4 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_5 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_6 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_7 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_8 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_9 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_10 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_11 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_12 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_13 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_14 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_16 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_17 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_18 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_19 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_20 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_21 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_22 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_23 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_24 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_25 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_26 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_27 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t1\t3\t\t\t\tsecondary\t\tlane1_fakedata0_15 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAGTCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/genotypes/PopA_02.alleles.tsv --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/genotypes/PopA_02.alleles.tsv Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,3 @@ +# ustacks version 1.37; generated on 2016-04-18 07:36:21 +0 2 1 AC 50.00 6 +0 2 1 CA 33.33 4 |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/genotypes/PopA_02.matches.tsv --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/genotypes/PopA_02.matches.tsv Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,5 @@ +# sstacks version 1.37; generated on 2016-04-18 07:36:21 +0 1 1 2 1 AC 6 -7.08958 +0 1 1 2 1 CA 4 -7.08958 +0 1 2 2 2 consensus 20 -2.07 +0 1 3 2 3 consensus 28 -4.16 |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/genotypes/PopA_02.snps.tsv --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/genotypes/PopA_02.snps.tsv Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,283 @@ +# ustacks version 1.37; generated on 2016-04-18 07:36:21 +0 2 1 0 O 16.64 A - +0 2 1 1 O 16.64 A - +0 2 1 2 O 16.64 T - +0 2 1 3 O 16.64 T - +0 2 1 4 O 16.64 C - +0 2 1 5 O 16.64 G - +0 2 1 6 O 16.64 T - +0 2 1 7 O 16.64 T - +0 2 1 8 O 16.64 T - +0 2 1 9 O 16.64 G - +0 2 1 10 O 16.64 C - +0 2 1 11 O 16.64 T - +0 2 1 12 O 16.64 G - +0 2 1 13 O 16.64 C - +0 2 1 14 O 16.64 T - +0 2 1 15 O 16.64 T - +0 2 1 16 O 16.64 C - +0 2 1 17 O 16.64 A - +0 2 1 18 O 16.64 G - +0 2 1 19 O 16.64 G - +0 2 1 20 O 16.64 A - +0 2 1 21 O 16.64 A - +0 2 1 22 O 7.55 T - +0 2 1 23 O 16.64 C - +0 2 1 24 O 16.64 T - +0 2 1 25 O 7.55 C - +0 2 1 26 O 16.64 T - +0 2 1 27 O 16.64 C - +0 2 1 28 O 16.64 G - +0 2 1 29 O 16.64 T - +0 2 1 30 O 16.64 A - +0 2 1 31 O 16.64 T - +0 2 1 32 O 16.64 A - +0 2 1 33 E -13.18 A C +0 2 1 34 O 16.64 T - +0 2 1 35 O 16.64 C - +0 2 1 36 O 16.64 T - +0 2 1 37 O 16.64 G - +0 2 1 38 O 16.64 A - +0 2 1 39 O 16.64 G - +0 2 1 40 O 16.64 T - +0 2 1 41 O 16.64 A - +0 2 1 42 O 16.64 T - +0 2 1 43 O 16.64 G - +0 2 1 44 O 16.64 T - +0 2 1 45 O 16.64 G - +0 2 1 46 O 16.64 C - +0 2 1 47 O 16.64 G - +0 2 1 48 O 16.64 T - +0 2 1 49 O 16.64 A - +0 2 1 50 O 16.64 C - +0 2 1 51 O 16.64 G - +0 2 1 52 O 16.64 T - +0 2 1 53 O 16.64 A - +0 2 1 54 O 16.64 C - +0 2 1 55 O 16.64 G - +0 2 1 56 O 16.64 C - +0 2 1 57 O 16.64 T - +0 2 1 58 O 16.64 A - +0 2 1 59 O 16.64 T - +0 2 1 60 O 16.64 T - +0 2 1 61 O 16.64 T - +0 2 1 62 O 16.64 A - +0 2 1 63 O 16.64 G - +0 2 1 64 O 16.64 A - +0 2 1 65 O 16.64 T - +0 2 1 66 O 16.64 G - +0 2 1 67 O 16.64 G - +0 2 1 68 O 16.64 A - +0 2 1 69 O 16.64 T - +0 2 1 70 O 16.64 A - +0 2 1 71 O 16.64 A - +0 2 1 72 O 16.64 C - +0 2 1 73 O 16.64 C - +0 2 1 74 O 16.64 G - +0 2 1 75 O 16.64 A - +0 2 1 76 O 16.64 C - +0 2 1 77 O 16.64 G - +0 2 1 78 O 16.64 C - +0 2 1 79 O 16.64 T - +0 2 1 80 O 16.64 G - +0 2 1 81 O 16.64 C - +0 2 1 82 O 16.64 C - +0 2 1 83 O 16.64 A - +0 2 1 84 O 16.64 G - +0 2 1 85 O 16.64 A - +0 2 1 86 O 16.64 C - +0 2 1 87 O 16.64 G - +0 2 1 88 E -13.18 A C +0 2 1 89 O 16.64 G - +0 2 1 90 O 16.64 A - +0 2 1 91 O 16.64 G - +0 2 1 92 O 16.64 A - +0 2 1 93 O 16.64 C - +0 2 2 0 O 27.73 A - +0 2 2 1 O 27.73 A - +0 2 2 2 O 27.73 T - +0 2 2 3 O 27.73 T - +0 2 2 4 O 27.73 C - +0 2 2 5 O 27.73 T - +0 2 2 6 O 27.73 C - +0 2 2 7 O 27.73 T - +0 2 2 8 O 27.73 A - +0 2 2 9 O 27.73 C - +0 2 2 10 O 27.73 A - +0 2 2 11 O 27.73 C - +0 2 2 12 O 27.73 C - +0 2 2 13 O 27.73 A - +0 2 2 14 O 27.73 C - +0 2 2 15 O 17.59 A - +0 2 2 16 O 27.73 G - +0 2 2 17 O 27.73 C - +0 2 2 18 O 27.73 A - +0 2 2 19 O 27.73 T - +0 2 2 20 O 27.73 C - +0 2 2 21 O 27.73 A - +0 2 2 22 O 27.73 A - +0 2 2 23 O 27.73 T - +0 2 2 24 O 27.73 T - +0 2 2 25 O 27.73 C - +0 2 2 26 O 27.73 T - +0 2 2 27 O 27.73 A - +0 2 2 28 O 27.73 A - +0 2 2 29 O 27.73 A - +0 2 2 30 O 27.73 A - +0 2 2 31 O 27.73 A - +0 2 2 32 O 27.73 T - +0 2 2 33 O 27.73 G - +0 2 2 34 O 27.73 A - +0 2 2 35 O 27.73 C - +0 2 2 36 O 27.73 T - +0 2 2 37 O 27.73 A - +0 2 2 38 O 27.73 C - +0 2 2 39 O 27.73 C - +0 2 2 40 O 27.73 A - +0 2 2 41 O 27.73 G - +0 2 2 42 O 27.73 A - +0 2 2 43 O 27.73 G - +0 2 2 44 O 27.73 A - +0 2 2 45 O 27.73 G - +0 2 2 46 O 27.73 A - +0 2 2 47 O 27.73 C - +0 2 2 48 O 27.73 A - +0 2 2 49 O 27.73 A - +0 2 2 50 O 27.73 C - +0 2 2 51 O 27.73 T - +0 2 2 52 O 27.73 C - +0 2 2 53 O 27.73 C - +0 2 2 54 O 27.73 G - +0 2 2 55 O 27.73 C - +0 2 2 56 O 27.73 A - +0 2 2 57 O 27.73 G - +0 2 2 58 O 27.73 T - +0 2 2 59 O 27.73 T - +0 2 2 60 O 27.73 A - +0 2 2 61 O 27.73 A - +0 2 2 62 O 27.73 A - +0 2 2 63 O 27.73 C - +0 2 2 64 O 27.73 A - +0 2 2 65 O 27.73 C - +0 2 2 66 O 27.73 T - +0 2 2 67 O 27.73 C - +0 2 2 68 O 27.73 T - +0 2 2 69 O 27.73 G - +0 2 2 70 O 27.73 A - +0 2 2 71 O 27.73 C - +0 2 2 72 O 27.73 T - +0 2 2 73 O 27.73 G - +0 2 2 74 O 27.73 C - +0 2 2 75 O 27.73 C - +0 2 2 76 O 27.73 A - +0 2 2 77 O 27.73 C - +0 2 2 78 O 27.73 G - +0 2 2 79 O 27.73 C - +0 2 2 80 O 27.73 C - +0 2 2 81 O 27.73 A - +0 2 2 82 O 27.73 G - +0 2 2 83 O 27.73 C - +0 2 2 84 O 27.73 T - +0 2 2 85 O 27.73 A - +0 2 2 86 O 27.73 C - +0 2 2 87 O 27.73 C - +0 2 2 88 O 27.73 T - +0 2 2 89 O 27.73 C - +0 2 2 90 O 27.73 T - +0 2 2 91 O 27.73 A - +0 2 2 92 O 27.73 G - +0 2 2 93 O 27.73 A - +0 2 3 0 O 38.82 A - +0 2 3 1 O 38.82 A - +0 2 3 2 O 38.82 T - +0 2 3 3 O 38.82 T - +0 2 3 4 O 38.82 C - +0 2 3 5 O 38.82 G - +0 2 3 6 O 38.82 G - +0 2 3 7 O 38.82 C - +0 2 3 8 O 38.82 T - +0 2 3 9 O 38.82 T - +0 2 3 10 O 38.82 G - +0 2 3 11 O 38.82 C - +0 2 3 12 O 38.82 A - +0 2 3 13 O 38.82 A - +0 2 3 14 O 38.82 C - +0 2 3 15 O 38.82 G - +0 2 3 16 O 38.82 C - +0 2 3 17 O 38.82 A - +0 2 3 18 O 38.82 A - +0 2 3 19 O 38.82 G - +0 2 3 20 O 38.82 T - +0 2 3 21 O 38.82 G - +0 2 3 22 O 38.82 A - +0 2 3 23 O 38.82 C - +0 2 3 24 O 38.82 G - +0 2 3 25 O 38.82 A - +0 2 3 26 O 38.82 T - +0 2 3 27 O 38.82 T - +0 2 3 28 O 38.82 C - +0 2 3 29 O 38.82 C - +0 2 3 30 O 38.82 C - +0 2 3 31 O 27.99 A - +0 2 3 32 O 38.82 C - +0 2 3 33 O 38.82 G - +0 2 3 34 O 38.82 G - +0 2 3 35 O 38.82 A - +0 2 3 36 O 38.82 C - +0 2 3 37 O 38.82 A - +0 2 3 38 O 38.82 T - +0 2 3 39 O 38.82 A - +0 2 3 40 O 38.82 A - +0 2 3 41 O 38.82 C - +0 2 3 42 O 38.82 T - +0 2 3 43 O 38.82 G - +0 2 3 44 O 38.82 A - +0 2 3 45 O 38.82 T - +0 2 3 46 O 38.82 C - +0 2 3 47 O 38.82 T - +0 2 3 48 O 38.82 A - +0 2 3 49 O 38.82 A - +0 2 3 50 O 38.82 G - +0 2 3 51 O 38.82 T - +0 2 3 52 O 38.82 A - +0 2 3 53 O 27.99 A - +0 2 3 54 O 38.82 C - +0 2 3 55 O 38.82 T - +0 2 3 56 O 38.82 T - +0 2 3 57 O 38.82 C - +0 2 3 58 O 38.82 C - +0 2 3 59 O 38.82 A - +0 2 3 60 O 38.82 A - +0 2 3 61 O 38.82 A - +0 2 3 62 O 38.82 T - +0 2 3 63 O 38.82 C - +0 2 3 64 O 38.82 T - +0 2 3 65 O 38.82 G - +0 2 3 66 O 38.82 G - +0 2 3 67 O 38.82 G - +0 2 3 68 O 38.82 A - +0 2 3 69 O 38.82 A - +0 2 3 70 O 38.82 T - +0 2 3 71 O 38.82 G - +0 2 3 72 O 38.82 G - +0 2 3 73 O 38.82 G - +0 2 3 74 O 38.82 A - +0 2 3 75 O 38.82 T - +0 2 3 76 O 38.82 T - +0 2 3 77 O 38.82 T - +0 2 3 78 O 38.82 C - +0 2 3 79 O 38.82 A - +0 2 3 80 O 38.82 T - +0 2 3 81 O 38.82 A - +0 2 3 82 O 38.82 A - +0 2 3 83 O 38.82 T - +0 2 3 84 O 38.82 T - +0 2 3 85 O 38.82 A - +0 2 3 86 O 38.82 A - +0 2 3 87 O 38.82 G - +0 2 3 88 O 38.82 G - +0 2 3 89 O 38.82 A - +0 2 3 90 O 38.82 C - +0 2 3 91 O 38.82 T - +0 2 3 92 O 38.82 A - +0 2 3 93 O 38.82 T - |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/genotypes/PopA_02.tags.tsv --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/genotypes/PopA_02.tags.tsv Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,67 @@\n+# ustacks version 1.37; generated on 2016-04-18 07:36:21\n+0\t2\t1\t\t0\t+\tconsensus\t\t\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t0\t0\t0\t-7.08958\n+0\t2\t1\t\t\t\tmodel\t\t\tOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOEOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOEOOOOO\t\t\t\t\n+0\t2\t1\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata7_7 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t2\t1\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata7_8 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t2\t1\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata7_9 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t2\t1\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata7_11 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t2\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_0 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t2\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_1 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t2\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_2 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t2\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_3 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t2\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_4 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t2\t1\t\t\t\tprimary\t1\tlane1_fakedata7_5 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGCGAGAC\t\t\t\t\n+0\t2\t1\t\t\t\tsecondary\t\tlane1_fakedata7_10 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTTTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t2\t1\t\t\t\tsecondary\t\tlane1_fakedata7_6 1:N:0:_1\tAATTCGTTTGCTGCTTCAGGAACCTCTCGTATACTCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC\t\t\t\t\n+0\t2\t2\t\t0\t+\tconsensus\t\t\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t0\t0\t0\t-2.07\n+0\t2\t2\t\t\t\tmodel\t\t\tOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO\t\t\t\t\n+0\t2\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_0 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t2\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_2 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t2\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_3 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t2\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_4 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t2\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_5 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t2\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_6 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t2\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_7 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t2\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_8 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t2\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_9 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t2\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_10 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t2\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_11 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA\t\t\t\t\n+0\t2\t2\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata2_12 1:N:0:_1\tAATTCTCTACACC'..b'TCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_1 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_2 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_3 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_4 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_5 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_6 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_7 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_8 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_9 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_10 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_11 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_12 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_13 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_14 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_15 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_16 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_17 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_18 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_19 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_20 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_21 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_23 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_24 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_25 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tprimary\t0\tlane1_fakedata0_27 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tsecondary\t\tlane1_fakedata0_26 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTATCTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n+0\t2\t3\t\t\t\tsecondary\t\tlane1_fakedata0_22 1:N:0:_1\tAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCCCGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\t\t\t\t\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/genotypes/batch_1.catalog.alleles.tsv --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/genotypes/batch_1.catalog.alleles.tsv Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,3 @@ +# cstacks version 1.37; catalog generated on 2016-04-18 07:36:21 +0 1 1 AC 0 0 +0 1 1 CA 0 0 |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/genotypes/batch_1.catalog.snps.tsv --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/genotypes/batch_1.catalog.snps.tsv Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,3 @@ +# cstacks version 1.37; catalog generated on 2016-04-18 07:36:21 +0 1 1 33 E -19.78 A C - - +0 1 1 88 E -19.78 A C - - |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/genotypes/batch_1.catalog.tags.tsv --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/genotypes/batch_1.catalog.tags.tsv Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,4 @@ +# cstacks version 1.37; catalog generated on 2016-04-18 07:36:21 +0 1 1 0 + consensus 0 1_1 AATTCGTTTGCTGCTTCAGGAATCTCTCGTATAATCTGAGTATGTGCGTACGTACGCTATTTAGATGGATAACCGACGCTGCCAGACGAGAGAC 0 0 0 0 +0 1 2 0 + consensus 0 1_2 AATTCTCTACACCACAGCATCAATTCTAAAAATGACTACCAGAGAGACAACTCCGCAGTTAAACACTCTGACTGCCACGCCAGCTACCTCTAGA 0 0 0 0 +0 1 3 0 + consensus 0 1_3 AATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT 0 0 0 0 |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/procrad/R1.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/procrad/R1.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,28000 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_16 1:N:0:\n+GGTGTGAATTCGGCTTGCAACGCAAGTGACGATTCCCACGGACATAACTGATCTAAGTAACTTCCAAATCTGGGAATGGGATTTCATAATTAAGGACTAT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'BBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_11 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_12 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_13 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_14 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_15 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_16 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_17 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_18 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_19 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_20 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_21 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_22 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_23 1:N:0:\n+GGGTAAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_0 1:N:0:\n+AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_1 1:N:0:\n+AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_2 1:N:0:\n+AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_3 1:N:0:\n+AAGATAAATTATAACAAAGGTCGACCTGACTCAGCCATTGTTGATAGACGCGAAAATAACGAAGCAGGATGACCGCAAGTGCAAACCATTACCAATGACC\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/procrad/R2.fq --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/procrad/R2.fq Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,28000 @@\n+@lane1_fakedata0_0 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATATGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_1 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_2 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_3 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTGGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_4 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_5 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_6 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTTCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_7 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_8 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_9 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_10 1:N:0:\n+CCGTGTATTCTCCCATGCGACAGCAGGACCTCCCATCCCCCTCTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGT\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_11 1:N:0:\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_12 1:N:0:\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_13 1:N:0:\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_14 1:N:0:\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_15 1:N:0:\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata0_16 1:N:0:\n+CCGTATTCTCCCATGCGACAGTAGGACCTCCGGATCCCCCTTTGATGTTATCAATCATAAGACGCTTCGATGGGCCTAGGTCTGTGGATTGCTCGTCGTA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB'..b'BBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_11 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_12 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_13 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_14 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_15 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCGTGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_16 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTGGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_17 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_18 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_19 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_20 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_21 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_22 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_23 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTAGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_0 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_1 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_2 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n+@lane1_fakedata9_3 1:N:0:\n+CCGCGGTTAAAATTGCTCAGTTCCGTCCAAGCAGGTTCTTTCCTCAACCGATGCGATTGGGTTCGCAACAGCGAGCAAGGTTGCATGCTTGGTAGCCGAA\n++\n+BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/procrad/barcodes --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/procrad/barcodes Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,40 @@ +ATGGGG PopA_01 +GGGTAA PopA_02 +AGGAAA PopA_03 +TTTAAG PopA_04 +GGTGTG PopA_05 +TGATGT PopA_06 +GGTTGT PopA_07 +ATAAGT PopA_08 +AAGATA PopA_09 +TGTGAG PopA_10 +ATAGTT PopA_11 +GGAAGG PopA_12 +TTTGTG PopA_13 +TTAAAT PopA_14 +AATAAG PopA_15 +AAGAGG PopA_16 +TAGTGT PopA_17 +TGGAAG PopA_18 +GGGTTG PopA_19 +CATCAT PopA_20 +GGAGAG PopB_20 +GTTTTA PopB_01 +TGATAA PopB_02 +GTTGAT PopB_03 +AGATTA PopB_04 +GTATAG PopB_05 +TTGGGA PopB_06 +ATATAT PopB_07 +GATGAG PopB_08 +GGGAAT PopB_09 +AGTAAT PopB_10 +GGGATA PopB_11 +GAGAAG PopB_12 +AGTAGA PopB_13 +AAGGAT PopB_14 +AGGGTA PopB_15 +TGTTTT PopB_16 +ATGATG PopB_17 +GAGTTA PopB_18 +ATGTAG PopB_19 |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/procrad/process_radtags.out --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/procrad/process_radtags.out Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,56 @@ +process_radtags -1 /tmp/tmpTg8Tep/files/000/dataset_1.dat -2 /tmp/tmpTg8Tep/files/000/dataset_2.dat -i fastq -b /tmp/tmpTg8Tep/files/000/dataset_3.dat --inline_null -e ecoRI -y fastq -D -w 0.15 -q -s 10 -o galaxy_outputs +process_radtags version 1.37 executed 2016-03-31 10:44:24 + +File Retained Reads Low Quality Ambiguous Barcodes Ambiguous RAD-Tag Total +dataset_1.dat 1767 0 0 233 2000 + +Total Sequences 2000 +Ambiguous Barcodes 0 +Low Quality 0 +Ambiguous RAD-Tag 233 +Retained Reads 1767 + +Barcode Filename Total No RadTag Low Quality Retained +ATGGGG PopA_01 56 0 0 56 +GGGTAA PopA_02 84 14 0 70 +AGGAAA PopA_03 76 22 0 54 +TTTAAG PopA_04 52 24 0 28 +GGTGTG PopA_05 64 10 0 54 +TGATGT PopA_06 100 32 0 68 +GGTTGT PopA_07 100 31 0 69 +ATAAGT PopA_08 84 12 0 72 +AAGATA PopA_09 68 26 0 42 +TGTGAG PopA_10 0 0 0 0 +ATAGTT PopA_11 52 0 0 52 +GGAAGG PopA_12 36 0 0 36 +TTTGTG PopA_13 44 0 0 44 +TTAAAT PopA_14 52 0 0 52 +AATAAG PopA_15 52 0 0 52 +AAGAGG PopA_16 28 0 0 28 +TAGTGT PopA_17 56 0 0 56 +TGGAAG PopA_18 72 0 0 72 +GGGTTG PopA_19 36 0 0 36 +CATCAT PopA_20 76 24 0 52 +GGAGAG PopB_20 44 0 0 44 +GTTTTA PopB_01 20 0 0 20 +TGATAA PopB_02 64 0 0 64 +GTTGAT PopB_03 40 0 0 40 +AGATTA PopB_04 20 0 0 20 +GTATAG PopB_05 12 0 0 12 +TTGGGA PopB_06 52 0 0 52 +ATATAT PopB_07 40 0 0 40 +GATGAG PopB_08 64 0 0 64 +GGGAAT PopB_09 44 0 0 44 +AGTAAT PopB_10 52 0 0 52 +GGGATA PopB_11 48 0 0 48 +GAGAAG PopB_12 28 0 0 28 +AGTAGA PopB_13 44 0 0 44 +AAGGAT PopB_14 64 22 0 42 +AGGGTA PopB_15 64 0 0 64 +TGTTTT PopB_16 8 0 0 8 +ATGATG PopB_17 0 0 0 0 +GAGTTA PopB_18 44 0 0 44 +ATGTAG PopB_19 60 16 0 44 + +Sequences not recorded +Barcode Total |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/refmap/PopA_01.bam |
| b |
| Binary file test-data/refmap/PopA_01.bam has changed |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/refmap/PopA_02.bam |
| b |
| Binary file test-data/refmap/PopA_02.bam has changed |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/refmap/PopA_03.bam |
| b |
| Binary file test-data/refmap/PopA_03.bam has changed |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/refmap/PopA_04.bam |
| b |
| Binary file test-data/refmap/PopA_04.bam has changed |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/refmap/PopB_01.bam |
| b |
| Binary file test-data/refmap/PopB_01.bam has changed |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/refmap/PopB_02.bam |
| b |
| Binary file test-data/refmap/PopB_02.bam has changed |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/refmap/PopB_03.bam |
| b |
| Binary file test-data/refmap/PopB_03.bam has changed |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/refmap/PopB_04.bam |
| b |
| Binary file test-data/refmap/PopB_04.bam has changed |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 test-data/refmap/reference.fasta --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/refmap/reference.fasta Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,7680 @@\n+>Contig_1\n+AATTCACAAGAAGCTAACATGAAGTTTGGATGATCAGTTTCGTCGTACGTAGCCTCGCCTGCTTGCGTAATACCAAAAGAGGTCTATGAGCTGCNNNNNNNNNNCGGGAATTAAAACCGAGGCCCGGAATCCCACTTGGTCTAACTGAGAGGGGAGAGCTGGACGCGCCATTTCTTTCAAACAAAAGAAAAGCGTTTCTGGTGG\n+>Contig_2\n+AATTCTCCAAATCAGGTAGGTACACCTTCCTGAAGAAGCATAAGCCCCCAAGCCGTCCTTTATGACTGATTAGTTGTAACGTGACACGGGCGGGNNNNNNNNNNCGGATATTCAAAGCAATTTCAGAAGCCGCAACCCGGTAACCGAGCGTTCCTTGGACAGAACGGGCAGCGCAGTCCAGCCTTCTTAGCGAACAATTTACGC\n+>Contig_3\n+AATTCTTAGATGATGAGACTCAAACAGTTCGGTCGAAAGCTTAAGTTACTGTATTCACATCTTTCCAGGCTCACGTGATTTCCTGTACGCGTTGNNNNNNNNNNCGGGCAGCTTTCCAAGGGGACAACCAGTCATCGTGCTGCCTCAGGGTGTCATGAGGATCATAATAGTCTCGGTTCCCGTCGCTATCCTATTCCCGATTTG\n+>Contig_4\n+AATTCAGCCAGAGAATGAGTACGTATAAAATAAACACTGGAGGTTTGCTACGCTCTGTAGGAAAAAACCTATTGTATGCGATGTCACGTGTTTANNNNNNNNNNCGGATTGAAGTAGGACACGATGAGCTCAGGTTCGGGTTTAAATCGTGGCTGATCGTTAAGCTTAATCGGGGGTATTGGTGGTGTCACCTGATTTACAGTT\n+>Contig_5\n+AATTCTCGATTCTTCTCTATATCTGATACAACCCCAGAGATTTCCACACTAAGCCTGGCCTCGTAGTACGAACACCGACCTTGGGGCCATTTCTNNNNNNNNNNCGGCTGGACGCAATAGCTAGCCACCCTCGCTATCGAGTTTTAGGTAGCTAGACAGCATCTGGGCACTTACACTGGAAGACGGAACACAGATACCTATTCT\n+>Contig_6\n+AATTCTCTCATAGCATAAACTGGTACTGGGATGGGAGGAACGTGGCGTGGACAACGGCTAATCTTGAGAGAGGTGAGGTACGGAAGGCACCAGGNNNNNNNNNNCGGCGGTGGGAGACATGCCCGTACAAATGGAGGAGATCGCTATCTGTCAGCTGGTCCTTTCTGACCAAATCGCCGGGCAGTAACATGACGATAATGTGAG\n+>Contig_7\n+AATTCTGAGCCAATAAACAACAGGCGCGTGCGGCTTGGTCCCGTCAGAACTACCTATCAGCGTATAATAGTAGGATTCAGGTATTACCCACGGGNNNNNNNNNNCGGACGTATCTTGCACTCCAAACTCGGATGCGACATCGCCCTGAAGCGGTTGCCCAGAGGTGGAGCAGAGCCCGCCATACGATGGAAATTTCTTGTCCAC\n+>Contig_8\n+AATTCCCATGCAGGATAACGTCTCAATGACGATTCTAAAAAAACTCACAACCAAGTGCTGGAAGATGTTGGACAAAAAGAAGACTATGAACTATNNNNNNNNNNCGGTTATGGAAGCACACCGTCATCTAGACCGCTTCGAATTCTAAGAGCTTAGGGCTAACGTGGGGCACTTAGTATTCCGCATCTGAGATTGGTGCAAAGG\n+>Contig_9\n+AATTCGGGGCAAGCAGGAGAACTGATTATATGGGGTGAGGTGGGATCCGTACGTGCGACGAATGGTTTTAGCTAGTTATAAGTATTGAATTTTCNNNNNNNNNNCGGTTTCGGGGAGATGAATACCTTGGCTACTCAGTGAGAATAACAGACGTTGGCACTGCGCGGCTCGCATCCGCGGGTCCTTCGTGTAGAACTGCCCAGA\n+>Contig_10\n+AATTCATTATATCTACGGATACAATCCACGGTCAATTTCAAATTAACATTACAACGCTAAGCTCAACCCCAATCGTTGGATAACTCAGACCCGTNNNNNNNNNNCGGGCATGCGGGATTAGAGTCAACTTAGGTTGAAGTTAAATTGTAGTCCCTCCCACAAGCTCATAATTCGCTGCCTTGTGTTATTCTATCAGCAACTCGT\n+>Contig_11\n+AATTCCGGCGACCGAGTAGTAGTGCCTCACGTTGTTACGGGTACAAAGAGTACATTAAGCGGGGATACCAGTTATTCCTTAGGTTGCTGGTTTANNNNNNNNNNCGGGCCCGTGTACATTCTAAAAAATAAATGTTCCCCATGATTGTCTAACTGGATGGGAACTTTCCATATTGTTATTTATCTTGCCGTGCTCTAATCATGC\n+>Contig_12\n+AATTCAGGGTCTTGCTGAGGTGTGTGATGTTTGTCTCTGCATTGATGCGCCAATAAGCACCTTGGGCAAAATTAGCTACAGCGGACATCGGCGANNNNNNNNNNCGGTTAGGCTTCTAGTCATACTGCCGTAGAGCCCTCTTTATGCAGTGCGGATGCTGAGGAGCGAAAGAGAGTCCCAGTCTTTTTCCGGATGAAACCAAGC\n+>Contig_13\n+AATTCCTCGTAGAATCTGGGCGTGCGTAGAGGCCGCGATGTTCGATTTCGACTGTCTACAGTTATCACGGCATGCACTGATGTGGAGGTCGCGGNNNNNNNNNNCGGGTTACCGCCAAGGACCTGGTGATCTTTAAGCAGGAGGCGCTTTTTTCATCGCTTATAAATCTATACATGAGGCGCGATTCGACTACAAGACGTTGAA\n+>Contig_14\n+AATTCGTGGGGTTAGCTCCTGCTGGAGAGGGAATTGAGCGCTACCAGAGTCCACGGCAGTTTTAATTCGATAACGGGACCGATGACTGGGCCCTNNNNNNNNNNCGGAGCATAATCTTCAGTGCACAGGATATGTCGAATAGCGGCCATGCAGCGAGGACGTATCTCGTTTATGGCCGGACGTGTTCAGGTGATGTGTCGTAAG\n+>Contig_15\n+AATTCAACAACGCGGCCGCTGTTGTTAACTGCCGGCAAGTCCTGAGCGTACTAGTTGCACCCAGACTTGGAAACAAGTAATACTGACACACAATNNNNNNNNNNCGGGCTTAGGCGCAGAGCTCATGGCACGTGTCAAGAGGCGTACATAAAAGGGGCACCCCAGGGGATCTCCAGTAGCTTTACTAGACCCGCCGCTTCTCCC\n+>Contig_16\n+AATTCGCGTCGTCCCAGGTCGTAGCAAAGCTCTCATAGTACACTCCTGGGCACTGGGATAGAAGCACCTGGGATGCGACCGTATGTATACCGTGNNNNNNNNNNCGGCGTATGAGAGCACAGACACAAGCACCAGCTGAAGGGATAGCGTAGAGAATTTTTGACCGTGAAGAAGTCTGTGCATCTTTACAGGCAGACCCAGTAG\n+>Contig_17\n+AATTCCCGTAAGGAACGCCCTTGAATGAAGGATAGTCTCAGAGGTGACACCTACGCCGCTTACGGAAGATCGGATATGGGTCGCACTGGAGCCTNNNNNNNNNNCGGAATCTTATACGGCACTTGCATGGGAGAGTGCCGACGGTCGGCGATATTCCGCTTACATTGCCGTGTGTCGGCAGGAACGCAACCCATAAGATGACAA\n+>Contig_18\n+AATTCTAATATTTCGGGATCTGCGCAAGCCCAGGGTAGATCATGGGTAAGCGAAACCCCTGGCTCTGCAGCGTGTATCGTTCTAGTGCGTACTGNNNNNNNNNNCGGAAGAATGTGCCCGCGACTGCTTTTCCAGGCCTGACTGGAGCTATAACTCGGGCGACCGGTAGGTCCAGGGGACCCGCCCATAACGGCGGGGTTCAGT\n+>Contig_19\n+AATTCCTCGGACGATCGGCGCTGATTCGTCGGCGAGGGTGTGACCAAGAAAT'..b'TATATGTAATTGGCCGCGATATTCTCGCCTCTCACTAA\n+>Contig_3823\n+AATTCCGGAGGAGCGGTACAGAGCAGAAGCAATGGGATACGCCTGTTTTATGCTGCATCGTTGGACGGTATAAATTGGGATTGCCGCTCAGTTTNNNNNNNNNNCGGATAGAACAAGCCCAGCGTACAATTTACTGCGGTCATGTGGGTCTTCTGTAGCGAGCCGTAACGCAAAACTACGAAAATGACCTTAGTAAACCAGTAC\n+>Contig_3824\n+AATTCCGTCCGCGTTTAGATTTTGGACTCGGGTCCTGTGTCCGTTGCCAGGACAAGTAAGCTGAAAGTATTCCCTTCTCCTTTTTAGGGTAGCTNNNNNNNNNNCGGGTCTGCAGCATGTGCGCGGCTCGCACTCAGAGAACTCGTCCGTGGCTTTAAACATATGGACAAGAATATAGCCTCGGTTCACAGGGAACTGATCTGG\n+>Contig_3825\n+AATTCAATCAGCCTCCTTGACCTGTAGGCCACTGCCCAACCCCGTACGAGTTGAATCTTTATTGCGGTTAGCCTTAACTATTTAATCAGAAGCGNNNNNNNNNNCGGCCGTACAGTTCAGCGGTGTTTCCATCATTGAATTTTATACGATACCTGTCCTATGCTCACGACTGTCCCGCAAGTCCAGCGTAGGGACGGGGCGAAC\n+>Contig_3826\n+AATTCTTTTAAAACGTTACACTCTGAAAGCGTACATGATACTATCGACTACGCAGTTGACTGATCATCTTAACTGTTGATTAAATCAAAACAACNNNNNNNNNNCGGGTACGTGGACGCGCAGCCACTAGCCAGGGTTCTAGTTTTGTTTGCAGAAACGTCGCGCTAATACCGCCATTAAGCGGTAGCCACTTCCCCCTCATTC\n+>Contig_3827\n+AATTCTGGAACCTTAATAAGTAAACACGAGCAGACCTGCGTCAGGTGCCTACGTAGTGCTCAAGGGTTAAAAGTTCCTCATACTGTCTACCTCANNNNNNNNNNCGGCGTGCCAGAGCATCTGTCAAACGGGATGTATAGCGGTCTATGTTGGTTCGTTGATTAACGCTCCGGGTGTTTGTGCTGCGTATCATTTTATGCTAAC\n+>Contig_3828\n+AATTCCAGACAATACTGGAGCCCTATTTGCAGGTATAAGGGTTCCGGCATCACTCAACTTCCATAGCTACGCTGTTCAGTGCGCGGGCGGATGANNNNNNNNNNCGGACTGCCACCGGGCGGAACTTCAAACTCAAGTGCTACTGCAGAGCTCAAGTATCGTTCATAAGGGTGAAACAACAACTAGCAATCATGTGCCCGGACT\n+>Contig_3829\n+AATTCGGTCTTGGATAGCGCTACGACATAACTACGTCGAACTATCATCAATCGACGAAGGTATCTACTCTTAGCCCCTACTGGCATATTGGGTGNNNNNNNNNNCGGTAAACGGGGCTTAGCAATATATCTAACCTATCGAAAGAGAATTCGACGGTTAACTAGTGCAGTCTAGCTGAGACATATCACGGGCCGTTAGTTGCGC\n+>Contig_3830\n+AATTCGTGGATCTAGAGTCCTATTTCACGGGAGGTCCAACCGGCGTAGGAACTCGCGAATGTGCACTGAGCCTCACTAAATGTCGGACATAAGTNNNNNNNNNNCGGAAATTGTGCCCCAGTCCGCCACAGGAGATCTGCGTTTAAGATGCCAAAATGACTGGGATTGGAATTGAACTCTAATCGCAGAAGCGTGGTAAGGATC\n+>Contig_3831\n+AATTCATTGCGGGGCTTAGACTCAGATGGCTGCGCGTGGTGCCTTTCACGTACTGCCCAGGGGTCGCACCCGTGCTTCCGAGTCCACTTGTATCNNNNNNNNNNCGGGATTATACTCATTGAAGAGGATTTTCAAATGCCCACGAGCAAAGTGACAGCTGAATAAATTCGGCCATGCGGCGTGCGACGTCCATATGGCATAGTA\n+>Contig_3832\n+AATTCTAAGCCTCGCAGTGGGGTCCGGTAGCGGAACACAAAGAGAGCTTACCCCCCGCGGGAGACATACTGCTGGAAATGAGAACGCCCGAGATNNNNNNNNNNCGGTAGACGGGGGCCAGTTGCTCCACTCTATATGCATTTAACCACACTAATTTGTCTACTTGGGTGGGGCGCTTATGAAAAATTTGAACAGGTTCGGCCA\n+>Contig_3833\n+AATTCAGTGGAACTGGCCTCTGCAGCAATTCAGACGTGAAGATCTTGCGGGAGGGGACTGTGCTTCAGGCCGTGTTTGTCAACTTGTGAGGATTNNNNNNNNNNCGGCGAGTTCTTACTATATTAGCGCTCGCTTGATTTTTCCGTCGGGATCTCCTAGATTCGCTAAGGTTCATTGATTTCTGTAGCTAGGACTACAGATATG\n+>Contig_3834\n+AATTCTTGATTCGCACCAAACAAAACACGATGTCTACCAGACATTCGGATTGTCAAAGAGGTGATCGAGTAGATGGCGGCTGAGAAATGCTCCCNNNNNNNNNNCGGATTAGTTATTTCAAATTCACTGGCGATACAGTACCGGCGGCAGCAATGGAACTGAGAATACGGCGACACGCCCCGGCCAGTTTTACATTAAGCTCAC\n+>Contig_3835\n+AATTCTTCAATGCAATCTTTGACAGGAAAGCATGACTTTGGGGGGCCCCCTAGCTCCTAGATACAGGATGAAATCTTCTTATTCAAGCGAGCGGNNNNNNNNNNCGGGGAGGCTAACCAGTGCGACATCCTCTTTCGAGAGATGTAGTGAGGTCGCCTAAAAGCTGGGAGACGGAACGCCTCGAGTTTCTTAAAAGGTGTGGGG\n+>Contig_3836\n+AATTCAGGCAGGGCGTCAGCACGACACTATGTGCGACCGATCTGTAAGACGGAATGTTCCCCATTTGTGCCACAAAATAGGGGTCACGACCTCCNNNNNNNNNNCGGAACTCACCCAGAAATCACGCGGACGTCGATGGCTATCTACATTCCTACCGGGCGGTACGCGAAGTCGAACTCCCGCACACACGGCTCTACGCGTGTT\n+>Contig_3837\n+AATTCGCTAGATGTTGGTGAAGTTCGAGTCGGCCACAGTAAATCCACTTTCACTCTGTGGTGCCTCGCCTAAGGCGACGTGAGGATTAAAGCCTNNNNNNNNNNCGGTACCAGACTGACCATAAACGTTGAGGGAACAAGCATTATTGTCTCATCGATCCCTTGAAATGTTAAAAGTTGGGGAGGACCATTGCAGCTTACGTCA\n+>Contig_3838\n+AATTCATAGCCCCGCGTTCTCCATATTGCCCCACGATCTCCGGAGAGAGCCTTAGGTCGGCTACTTTCTGAATTGGTTACTCGGTCGAGAGCCGNNNNNNNNNNCGGGCTTCAGGGGTTCTAATTAGAAAGGATGCAGGGGTTAAAAAGTGAAGTAGTTGTCGAGATCTTCTGTGCGGCTGAGACTTGCCTGCCACTGTGGCGT\n+>Contig_3839\n+AATTCACGGAGTCGTTGCGCCCTAAGCCAGGGCATGTCTACCTTGCACACAAACATTTCGCTAGCCTCCCCATACTCAGGGGGCCGTCCGACGCNNNNNNNNNNCGGATGCATCCCGCTTTCATTGTTATCTATTCATTCACAGGGGATCACGTCCCGCCTTGTGGATATACAAATCACGGCGGCTTACCCCGACGTAGTTAAT\n+>Contig_3840\n+AATTCGAACCATTTTTGTCTTCTAGTTCCAAAGTCAAATAGCTTCACGCCCCGCTTGTGGCGGTTCTGGTTTACAGCCGAAAGTATCAGTACATNNNNNNNNNNCGGTCATTCCTAGATGTTACGTGTACTACCAAGAGTGTGAGAGGAGAGCGGGCTCTTGTTGTACCGGCCGTTTTATAGGGGACGACGCATCTGGATTTCT\n' |
| b |
| diff -r 000000000000 -r 66d3c1ae3937 tool_dependencies.xml --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/tool_dependencies.xml Tue Jun 14 14:06:44 2016 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,9 @@ +<?xml version="1.0"?> +<tool_dependency> + <package name="stacks" version="1.40"> + <repository changeset_revision="5eac5e2d91e2" name="package_stacks_1_40" owner="iuc" toolshed="https://toolshed.g2.bx.psu.edu" /> + </package> + <package name="velvet" version="1.2.10"> + <repository changeset_revision="93d32326537b" name="package_velvet_1_2_10" owner="devteam" toolshed="https://toolshed.g2.bx.psu.edu" /> + </package> +</tool_dependency> |