Repository 'profile2cami'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/iuc/profile2cami

Changeset 3:6bc0c090133f (2024-08-15)
Previous changeset 2:edc9559928d3 (2024-08-15) Next changeset 4:d38b9fdf04e0 (2024-11-04)
Commit message:
planemo upload for repository https://github.com/shenwei356/taxonkit commit 5607ad57d394e88c2b8b22f5bf4475b729d95c26
modified:
tool-data/ncbi_taxonomy.loc.sample
tool_data_table_conf.xml.sample
added:
tool_data_table_conf.xml.test
b
diff -r edc9559928d3 -r 6bc0c090133f tool-data/ncbi_taxonomy.loc.sample
--- a/tool-data/ncbi_taxonomy.loc.sample Thu Aug 15 09:50:14 2024 +0000
+++ b/tool-data/ncbi_taxonomy.loc.sample Thu Aug 15 13:34:52 2024 +0000
b
@@ -1,2 +1,1 @@
-#value name path
-test-db-tox "Test Database"  ${__HERE__}/test-db
+#value name path
\ No newline at end of file
b
diff -r edc9559928d3 -r 6bc0c090133f tool_data_table_conf.xml.sample
--- a/tool_data_table_conf.xml.sample Thu Aug 15 09:50:14 2024 +0000
+++ b/tool_data_table_conf.xml.sample Thu Aug 15 13:34:52 2024 +0000
b
@@ -3,6 +3,6 @@
         <!-- Locations of taxonomy data downloaded from NCBI -->
     <table name="ncbi_taxonomy" comment_char="#">
         <columns>value, name, path</columns>
-        <file path="${__HERE__}/test-data/ncbi_taxonomy.loc.test" />
+        <file path="tool-data/ncbi_taxonomy.loc" />
     </table>
 </tables>
b
diff -r edc9559928d3 -r 6bc0c090133f tool_data_table_conf.xml.test
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/tool_data_table_conf.xml.test Thu Aug 15 13:34:52 2024 +0000
b
@@ -0,0 +1,8 @@
+<?xml version="1.0"?>
+<tables>
+        <!-- Locations of taxonomy data downloaded from NCBI -->
+    <table name="ncbi_taxonomy" comment_char="#">
+        <columns>value, name, path</columns>
+        <file path="${__HERE__}/test-data/ncbi_taxonomy.loc.test" />
+    </table>
+</tables>