Repository 'metaphlan2_hutlab'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/george-weingart/metaphlan2_hutlab

Changeset 3:6bdae6616ca4 (2016-04-24)
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metaphlan2_hutlab/metaphlan2.xml
b
diff -r 2a2df9ca8958 -r 6bdae6616ca4 metaphlan2_hutlab/metaphlan2.xml
--- a/metaphlan2_hutlab/metaphlan2.xml Sun Apr 24 13:39:30 2016 -0400
+++ b/metaphlan2_hutlab/metaphlan2.xml Sun Apr 24 13:50:37 2016 -0400
b
@@ -7,7 +7,7 @@
  <description>metagenomic profiler V2</description>
  <command interpreter="python">metaphlan2.py $input 
  --mpa_pkl  \${METAPHLAN2_PATH}/db_v20/mpa_v20_m200.pkl    
- --bowtie2db \${METAPHLAN2_PATH}//db_v20/mpa_v20_m200 
+ --bowtie2db \${METAPHLAN2_PATH}/db_v20/mpa_v20_m200 
  --input_type  fastq
  --no_map 
  --bt2_ps $PresetsForBowtie2