Repository 'get_gr_set'
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Changeset 62:8673a0225e2b (2018-01-11)
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Commit message:
Deleted selected files
removed:
GRsetFromGEO/.Rapp.history
GRsetFromGEO/.Rhistory
GRsetFromGEO/._.DS_Store
GRsetFromGEO/._GRsetFromGEO.xml
GRsetFromGEO/._~$setFromGEO.xml
GRsetFromGEO/~$setFromGEO.xml
b
diff -r 2382697aad09 -r 8673a0225e2b GRsetFromGEO/.Rhistory
--- a/GRsetFromGEO/.Rhistory Thu Jan 11 12:48:29 2018 -0500
+++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
[
@@ -1,16 +0,0 @@
-require("minfi", quietly = TRUE)
-?require
-require("minfi", quietly = TRUE)
-minfi
-as.data.frame(GRset)
-GRset <- getGenomicRatioSetFromGEO(GSE)
-getGenomicRatioSetFromGEO
-require("minfi", quietly = TRUE)
-options(warn = -1)
-options("download.file.method"="wget")
-args <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)
-GSE = args[1]
-output = args[2]
-GRset <- getGenomicRatioSetFromGEO(GSE)
-save(GRset,file = output)
-sessionInfo()
b
diff -r 2382697aad09 -r 8673a0225e2b GRsetFromGEO/._.DS_Store
b
Binary file GRsetFromGEO/._.DS_Store has changed
b
diff -r 2382697aad09 -r 8673a0225e2b GRsetFromGEO/._GRsetFromGEO.xml
b
Binary file GRsetFromGEO/._GRsetFromGEO.xml has changed
b
diff -r 2382697aad09 -r 8673a0225e2b GRsetFromGEO/._~$setFromGEO.xml
b
Binary file GRsetFromGEO/._~$setFromGEO.xml has changed
b
diff -r 2382697aad09 -r 8673a0225e2b GRsetFromGEO/~$setFromGEO.xml
b
Binary file GRsetFromGEO/~$setFromGEO.xml has changed