Repository 'commet'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/cmonjeau/commet

Changeset 6:a53ce9294c0a (2015-09-10)
Previous changeset 5:8b2edb8a315e (2015-09-10) Next changeset 7:9590778f5181 (2015-09-11)
Commit message:
fix logs output
modified:
commet.py
commet.xml
b
diff -r 8b2edb8a315e -r a53ce9294c0a commet.py
--- a/commet.py Thu Sep 10 14:37:19 2015 +0000
+++ b/commet.py Thu Sep 10 14:40:43 2015 +0000
b
@@ -35,7 +35,7 @@
         parser.add_argument("-e", dest="minshannonindex")
         parser.add_argument("-m", dest="maxreads")
 
-        parser.add_argument("--output")
+        parser.add_argument("--output_logs")
         parser.add_argument("--output_vectors")
         parser.add_argument("--output_dendro")
         parser.add_argument("--output_matrix")
b
diff -r 8b2edb8a315e -r a53ce9294c0a commet.xml
--- a/commet.xml Thu Sep 10 14:37:19 2015 +0000
+++ b/commet.xml Thu Sep 10 14:40:43 2015 +0000
b
@@ -20,6 +20,7 @@
 --output_vectors $output_vectors
 --output_dendro $output_dendro
 --output_matrix $output_matrix
+--output_logs $output_logs
 --output_heatmap1 $output_heatmap1
 --output_heatmap2 $output_heatmap2
 --output_heatmap3 $output_heatmap3