Repository 'gtdbtk_classify_wf'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/iuc/gtdbtk_classify_wf

Changeset 11:c30adf839acd (2025-03-11)
Previous changeset 10:4d9445dff47b (2024-09-28) Next changeset 12:ed407eeb69ee (2025-04-21)
Commit message:
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/gtdbtk commit 54172b87ffedce4d5a3c73f68f5533541933e178
modified:
gtdbtk_classify_wf.xml
macros.xml
b
diff -r 4d9445dff47b -r c30adf839acd gtdbtk_classify_wf.xml
--- a/gtdbtk_classify_wf.xml Sat Sep 28 16:26:12 2024 +0000
+++ b/gtdbtk_classify_wf.xml Tue Mar 11 14:54:53 2025 +0000
[
@@ -15,7 +15,7 @@
 #for $i in $input:
     ## gtdbtk uses the file extension to determine the input format.
     #set ext = "." + $i.ext
-    #set input_identifier = re.sub('[^\s\w\-]', '_', str($i.element_identifier)) + $ext
+    #set input_identifier = re.sub('[^\w\-.]', '_', str($i.element_identifier)) + $ext
     ln -s '${i}' input_dir/'${input_identifier}' &&
 #end for
 export GTDBTK_DATA_PATH=$gtdbtk_db.fields.path &&
b
diff -r 4d9445dff47b -r c30adf839acd macros.xml
--- a/macros.xml Sat Sep 28 16:26:12 2024 +0000
+++ b/macros.xml Tue Mar 11 14:54:53 2025 +0000
b
@@ -1,6 +1,6 @@
 <macros>
     <token name="@TOOL_VERSION@">2.4.0</token>
-    <token name="@VERSION_SUFFIX@">0</token>
+    <token name="@VERSION_SUFFIX@">1</token>
     <token name="@PROFILE@">22.05</token>
     <xml name="requirements">
         <requirements>