Repository 'vgx_converter'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/computationaltranscriptomics/vgx_converter

Changeset 15:cb4dce1042ef (2016-06-02)
Previous changeset 14:0726953d86f3 (2016-06-01) Next changeset 16:567274fa974d (2016-06-04)
Commit message:
Changed VGX to JGF
modified:
vgx_converter.xml
b
diff -r 0726953d86f3 -r cb4dce1042ef vgx_converter.xml
--- a/vgx_converter.xml Wed Jun 01 10:29:09 2016 -0400
+++ b/vgx_converter.xml Thu Jun 02 09:32:40 2016 -0400
b
@@ -1,5 +1,5 @@
-<tool id="vgx_converter" name="SIF-to-VGX" version="0.0.3">
- <description>Converts a SIF file to a JSON file in node-link format for visualization in VisualGraphX</description>
+<tool id="vgx_converter" name="SIF-to-JGF" version="0.0.4">
+ <description>Converts a SIF file to a JSON Graph Format (JGF) file for visualization in VisualGraphX</description>
  <command interpreter="python">vgx_converter.py $input1 $delimiter $input2 $output</command>
  <inputs>
  <param format="txt" name="input1" type="data" label="Network"/>
@@ -10,11 +10,11 @@
  </param>
  </inputs>
  <outputs>
- <data format="json" name="output"/>
+ <data format="jgf" name="output"/>
  </outputs>
 
  <help>
- This tool converts the simple interaction format (.sif) to the JavaScript Object Notation (.json) 
+ This tool converts the simple interaction format (.sif) to the JavaScript Graph Format JGF (.jgf) 
  that can be visualized using VisualGraphX. Furthermore, a attributes list can be provided to enhance 
  the information of the nodes in the graph.
  </help>