Repository 'ewastools'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/kpbioteam/ewastools

Changeset 45:cd90b21abc3c (2019-02-22)
Previous changeset 44:e5a229b83461 (2019-02-22) Next changeset 46:7412a62e19ce (2019-02-22)
Commit message:
Uploaded
added:
test-data/CN_Value_Matrix.txt
b
diff -r e5a229b83461 -r cd90b21abc3c test-data/CN_Value_Matrix.txt
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/CN_Value_Matrix.txt Fri Feb 22 11:07:19 2019 -0500
b
b'@@ -0,0 +1,485513 @@\n+"1" "2" "3" "4"\n+"cg00050873" 13.9593680789095 14.0196775932187 14.1270270430046 13.8823564686542\n+"cg00212031" 10.667111542075 10.0714623625566 10.0579917227592 10.4356702609366\n+"cg00213748" 9.44708322620965 8.96289600533726 8.7279204545632 9.467605550083\n+"cg00214611" 10.6465587101545 10.4019461239765 10.3454052467178 10.3987436919382\n+"cg00455876" 11.9218409370745 11.9541963103869 11.9277779620823 11.8273427042341\n+"cg01707559" 11.9218409370745 11.9259252649729 12.1677317411032 12.4120405145517\n+"cg02004872" 11.9248125036058 12.0347989625773 11.7919768208987 11.8525295094042\n+"cg02011394" 14.3330854506017 14.4188408652985 14.4229188789801 14.298062567719\n+"cg02050847" 12.7725207763148 12.5565060546719 12.4059391933424 12.5524289485265\n+"cg02233190" 11.4978518369511 11.4726908392428 11.4978518369511 11.2749604721406\n+"cg02494853" 13.9096118658021 13.770354179858 14.1406700304151 13.8868397058844\n+"cg02839557" 11.7481928495895 11.1000052244227 11.4640351521899 11.7858611057596\n+"cg02842889" 10.5915223465707 10.4553272203046 10.4419067045422 10.3520434257954\n+"cg03052502" 13.6889059306127 13.6730881929094 13.6447575925163 13.4141566792741\n+"cg03155755" 12.8982234712156 12.8326922628053 12.9399464524587 12.4729446337796\n+"cg03244189" 10.667111542075 10.7490313820402 10.6978363579624 10.4346282276367\n+"cg03443143" 14.1629419907384 14.2748876951314 14.1064811526935 14.0447356260569\n+"cg03683899" 10.2324209271761 10.2491134527137 10.2395985292491 9.90388184573618\n+"cg03695421" 11.0347989625773 10.9772799234999 10.5410966153495 10.0525680508042\n+"cg03706273" 13.8294254458641 13.8401878240405 14.2752515434703 14.0584145896734\n+"cg03750315" 10.7439928610602 10.7714894695006 10.8517490414161 10.5274770060604\n+"cg03767353" 11.6266216523584 11.7870863245516 12.1721149325331 11.0112272554233\n+"cg04016144" 13.3888245380236 13.3206595436486 13.5217231126579 13.2829436131151\n+"cg04023335" 13.5431526844149 13.5609298526529 14.0508689632907 13.8918786142437\n+"cg04042030" 12.2871351860867 11.8997345423575 12.1854949242109 12.3715044120433\n+"cg04303809" 10.2467405984931 10.3297963382207 10.1124395067816 10.0126245388651\n+"cg04448376" 10.0375469539622 9.78953364497036 9.5018371849023 9.26912667914942\n+"cg04462340" 11.8454900509444 11.8021124185861 11.3281138948337 11.1817734388088\n+"cg04689676" 11.0914353863236 10.8917837032183 11.3826240265749 11.2008986050384\n+"cg04792227" 13.1702380523366 12.9349808326538 12.7103759712045 12.7193888209421\n+"cg04840163" 10.9136374280491 10.8665062122262 11.2749604721406 10.9322147519684\n+"cg04964672" 13.9350729440691 13.7727269492398 13.5143442113573 13.3611213347348\n+"cg05213048" 13.6099866797037 13.610563503925 13.5462916037337 13.3376219019925\n+"cg05230942" 10.0457596613827 10.0154150523867 10.0498485494506 10.1848753429083\n+"cg05480730" 11.5971214287896 11.3912435894274 11.6474584264549 11.4522412404308\n+"cg05544622" 13.6058267231592 13.6526209346382 13.5960732547481 13.4557125040673\n+"cg05621349" 11.3275526440812 11.3100446796475 10.7747870596012 11.1817734388088\n+"cg05865243" 13.9645213738972 13.9239773689712 13.9151324489507 13.7604080920677\n+"cg05890011" 11.1176431013891 10.8113746935099 11.1649069266757 10.4262647547021\n+"cg06322277" 11.1579784499454 11.4040771362412 11.0694497674278 11.0313565962557\n+"cg06479204" 12.1302487840507 11.998237821888 11.834866038362 11.6515002206527\n+"cg07731488" 13.1216953905566 12.9628960053373 13.2806257975092 13.0674343607565\n+"cg07747963" 9.74986942739684 9.62021982550749 9.13442632022093 9.18487534290828\n+"cg07939587" 11.9166259222112 11.8692082505508 12.0461008450288 11.8887432488983\n+"cg08242338" 14.2538474849874 14.0810672800613 14.0729699685421 13.8785299428624\n+"cg08265308" 10.6829945836817 10.8902642770211 10.958552715431 10.8297227350861\n+"cg08921682" 12.4439795426013 12.2986354067342 12.0098286173681 11.9701058906122\n+"cg09350919" 13.6545241526766 13.7018479125339 13.5347892114803 13.4482453883104\n+"cg09460641" 13.9393955601816 13.927'..b'F" 12.1247675358225 12.2249060907198 12.0967151544885 11.9322147519684\n+"ch.22.78028F" 12.2931842307595 12.2940463132715 12.2387032794277 12.2215871212648\n+"ch.22.17803970R" 14.4816733164473 14.5454471816781 14.5930409115894 14.3894969037164\n+"ch.22.107403R" 14.591756076023 14.6099289845949 14.6227382178711 14.5006551833366\n+"ch.22.137888R" 14.2511865035243 14.2841011259971 14.2376581186797 14.2510385272135\n+"ch.22.138449R" 11.9729797860663 12.093417564388 11.237209960755 11.0484868739923\n+"ch.22.147839R" 11.6447575925163 11.7103759712045 11.0613711926598 10.7673568541257\n+"ch.22.149158R" 11.3331553503106 11.5703301010308 10.5933911227917 10.6447575925163\n+"ch.22.163059F" 11.6087168540206 11.693051295397 11.9715435539508 11.6772791913122\n+"ch.22.22597277R" 14.415477707698 14.6018868306391 14.6637248672792 14.376532412848\n+"ch.22.217069R" 12.7017396386744 12.8593406539675 13.1225044843139 12.794009645021\n+"ch.22.22928834R" 13.2858356558614 13.1961410297182 13.5361257716003 13.3370643386847\n+"ch.22.243204R" 11.2772874001304 11.2437690319619 11.0801513096141 10.9417812422785\n+"ch.22.23746271F" 13.194449079479 13.1571890135149 13.4111137155214 13.2730670757221\n+"ch.22.25752197R" 14.4297336386311 14.3927869736506 14.5836704472703 14.4648647824311\n+"ch.22.26167205F" 14.1778866563488 14.1536311941017 14.3864014236408 14.1810745903133\n+"ch.22.317144R" 12.2449583931511 12.4885933338354 12.7168194613299 12.5828476285503\n+"ch.22.26442001R" 14.0718813000515 14.0063260785249 14.1998256843743 14.1840229839153\n+"ch.22.363412F" 9.81538329581354 10.3264294871223 10.7431513941125 10.1189410727235\n+"ch.22.28920330F" 13.0557908145659 13.2103669456326 13.2951949558807 13.1587674546361\n+"ch.22.30020508R" 13.4682421923602 13.4050084652067 13.7033628939642 13.5795516528066\n+"ch.22.427671F" 14.6503786353977 14.5382495685993 14.8370858352488 14.6034524879042\n+"ch.22.436090R" 10.286557761608 10.5449644327892 10.8105716347411 9.59991284218713\n+"ch.22.439136F" 12.1472049249422 12.0354864512922 12.1449768240501 11.9765641234153\n+"ch.22.441164F" 11.8201789624152 12.1163439612375 11.9957671508778 11.7903484967519\n+"ch.22.467397R" 14.237060543838 14.3648870026891 14.5338772100333 14.2808432509787\n+"ch.22.31817810F" 13.1981380524011 13.3919148289319 13.4300604616941 13.4887188456055\n+"ch.22.33863861F" 15.0786095011542 14.984373952468 15.2393001743642 15.1038205235568\n+"ch.22.528917R" 11.6077926419192 11.495355392236 11.6110247973074 11.333714426094\n+"ch.22.533187F" 13.6698815883177 13.7554092159221 13.9077356771757 13.6758467983636\n+"ch.22.569473R" 13.0596824472476 12.9797824307031 12.7185328760692 13.0751448440663\n+"ch.22.38010425R" 14.8042823025803 14.6829945836817 14.7726238664603 14.5786085607378\n+"ch.22.694298R" 12.3490047180277 12.3890935219045 12.3791075655611 12.2030420555625\n+"ch.22.707049R" 12.0907740546408 12.1876613657391 12.4961047793401 12.2285180977162\n+"ch.22.707968R" 13.7762273885073 13.794517403813 13.8102703724199 13.7232343008934\n+"ch.22.728807R" 11.3564519702218 11.357002092265 11.3376219019925 11.4367115421372\n+"ch.22.734399R" 11.1573469353628 11.2264121927888 11.2485206049384 11.2708792953288\n+"ch.22.740407F" 13.0776502485296 13.2990648867794 13.3720488252728 13.2973461989467\n+"ch.22.757911F" 12.2100624832402 12.2606255560682 12.4971033570169 12.3866708596376\n+"ch.22.772318F" 11.2772874001304 11.4003457965347 11.6096404744368 11.179287104646\n+"ch.22.43177094F" 14.6784901063007 14.6408662640886 14.7786931832238 14.7521715451624\n+"ch.22.44116734F" 11.8089641749193 12.2691266791494 12.2203783276952 12.0310119074377\n+"ch.22.909671F" 12.3100446796475 12.2443638351205 12.0306671362469 11.8595347863827\n+"ch.22.46830341F" 14.4573167464664 14.5410360983487 14.5980525001616 14.4416473902536\n+"ch.22.1008279F" 12.9521952199141 12.7899411283909 13.2378074737231 13.0995121919952\n+"ch.22.47579720R" 13.5900021814427 13.7500788626938 14.0885398194238 13.8764210195035\n+"ch.22.48274842R" 14.4794013552834 14.4244943753819 14.4173910528752 14.2576824807088\n'