Repository 'samtools_sort'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/devteam/samtools_sort

Changeset 6:d54a4df48867 (2024-09-08)
Previous changeset 5:a577ea614bed (2023-11-20) Next changeset 7:9ede25e390ff (2025-06-19)
Commit message:
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tool_collections/samtools/samtools_sort commit 9c5a35ce695c3d134e41d8695487edd5f71ea33c
modified:
macros.xml
test-data/1_sort.bam
test-data/1_sort_read_names.bam
test-data/minhash.expected.bam
test-data/name.sort.expected.bam
test-data/pos.sort.expected.bam
test-data/tag.as.sort.expected.bam
test-data/tag.fi.sort.expected.bam
test-data/tag.rg.n.sort.expected.bam
test-data/tag.rg.sort.expected.bam
b
diff -r a577ea614bed -r d54a4df48867 macros.xml
--- a/macros.xml Mon Nov 20 22:16:43 2023 +0000
+++ b/macros.xml Sun Sep 08 03:26:44 2024 +0000
[
@@ -11,9 +11,9 @@
          please only bump the minor version in order to let the requirement
          version catch up eventually). To find the tools check:
         `grep "<tool" . -r | grep -v VERSION_SUFFIX | cut -d":" -f 1` -->
-    <token name="@TOOL_VERSION@">1.15.1</token>
+    <token name="@TOOL_VERSION@">1.20</token>
     <token name="@VERSION_SUFFIX@">2</token>
-    <token name="@PROFILE@">20.05</token>
+    <token name="@PROFILE@">22.05</token>
     <token name="@FLAGS@"><![CDATA[
         #set $flags = 0
         #if $filter
b
diff -r a577ea614bed -r d54a4df48867 test-data/1_sort.bam
b
Binary file test-data/1_sort.bam has changed
b
diff -r a577ea614bed -r d54a4df48867 test-data/1_sort_read_names.bam
b
Binary file test-data/1_sort_read_names.bam has changed
b
diff -r a577ea614bed -r d54a4df48867 test-data/minhash.expected.bam
b
Binary file test-data/minhash.expected.bam has changed
b
diff -r a577ea614bed -r d54a4df48867 test-data/name.sort.expected.bam
b
Binary file test-data/name.sort.expected.bam has changed
b
diff -r a577ea614bed -r d54a4df48867 test-data/pos.sort.expected.bam
b
Binary file test-data/pos.sort.expected.bam has changed
b
diff -r a577ea614bed -r d54a4df48867 test-data/tag.as.sort.expected.bam
b
Binary file test-data/tag.as.sort.expected.bam has changed
b
diff -r a577ea614bed -r d54a4df48867 test-data/tag.fi.sort.expected.bam
b
Binary file test-data/tag.fi.sort.expected.bam has changed
b
diff -r a577ea614bed -r d54a4df48867 test-data/tag.rg.n.sort.expected.bam
b
Binary file test-data/tag.rg.n.sort.expected.bam has changed
b
diff -r a577ea614bed -r d54a4df48867 test-data/tag.rg.sort.expected.bam
b
Binary file test-data/tag.rg.sort.expected.bam has changed