Repository 'openms_peptideindexer'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/galaxyp/openms_peptideindexer

Changeset 4:e039cc5c7aed (2018-01-11)
Previous changeset 3:5bb67ddfb406 (2017-10-28) Next changeset 5:fc6ccd403439 (2018-02-12)
Commit message:
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproteomics/tools-galaxyp/tree/master/tools/openms commit 8a95bc868914fb41c7452907f73a9273b03286ab
modified:
readme.md
b
diff -r 5bb67ddfb406 -r e039cc5c7aed readme.md
--- a/readme.md Sat Oct 28 05:24:47 2017 -0400
+++ b/readme.md Thu Jan 11 18:07:21 2018 -0500
[
@@ -117,7 +117,14 @@
     [...]
     ]]>
     ```
-    

+ * In Xtandem Converter and probably in others:

+    ```
+    #if str($param_missed_cleavages) != '':
+    ```
+    This is because integers needs to be compared as string otherwise `0` becomes `false`.

  * In `MetaProSIP.xml` add `R` as a requirement:
  
    ```
@@ -164,7 +171,8 @@
     ```
     
 
- * These tools have multiple outputs (number of inputs = number of outputs) which is not yet supported in Galaxy-stable and are therefore in `SKIP_TOOLS_FILES.txt`:
+ * These tools have multiple outputs (number of inputs = number of outputs) which is not yet supported in
+   by the automatic conversion step and are therefore in `SKIP_TOOLS_FILES.txt`:
     * SeedListGenerator
     * SpecLibSearcher
     * MapAlignerIdentification