| Previous changeset 6:93eb36300900 (2019-05-02) Next changeset 8:6572347b3e1a (2019-05-02) |
|
Commit message:
planemo upload commit 6a252d04f4b2f79606ab6679b6a91f957e33da7b-dirty |
|
modified:
optbiodes.xml out1.csv |
| b |
| diff -r 93eb36300900 -r e328a5f60135 optbiodes.xml --- a/optbiodes.xml Thu May 02 07:53:12 2019 -0400 +++ b/optbiodes.xml Thu May 02 09:27:23 2019 -0400 |
| b |
| @@ -7,7 +7,7 @@ python $__tool_directory__/toolOptBioDes.py $input1 $input2 $output1 $output2 -server $server ]]></command> <inputs> - <param type="data" name="input1" format="xlsx" /> + <param type="data" name="input1" format="txt" /> <param type="integer" name="input2" value="48" label="Library size" help="Library size" /> <param name="server" type="text" label="OptBioDes RES server" value="http://doe.synbiochem.co.uk/REST" help="OptBioDes REST server" /> </inputs> |
| b |
| diff -r 93eb36300900 -r e328a5f60135 out1.csv --- a/out1.csv Thu May 02 07:53:12 2019 -0400 +++ b/out1.csv Thu May 02 09:27:23 2019 -0400 |
| b |
| @@ -1,129 +1,129 @@ promoter3,promoter5,promoter7,promoter9,gene10,promoter11,pos -1,3,2,0,1,3,8 -0,3,1,0,0,2,17 -0,2,1,0,0,2,18 -1,2,1,0,1,3,16 -0,0,1,0,0,1,14 -0,2,1,2,1,1,8 -0,2,0,3,1,1,17 -1,1,3,3,0,3,6 -0,3,3,1,0,1,12 -1,0,0,0,1,1,6 -0,3,0,1,1,0,13 -1,3,3,3,1,3,1 -1,0,3,0,0,0,8 -0,0,2,1,0,2,3 -0,2,0,1,0,2,12 -1,3,2,1,0,2,10 -0,0,3,2,0,1,10 -0,2,3,1,1,3,17 -1,0,1,3,1,2,11 -0,0,3,2,1,3,0 -0,1,0,0,1,3,0 -1,3,0,2,0,0,14 -1,0,1,0,0,2,17 -0,1,3,2,1,2,14 -1,2,2,0,0,1,9 -0,1,2,1,1,0,11 -0,1,1,2,1,0,9 -1,1,1,1,0,1,13 -0,0,3,1,1,1,9 -0,0,3,1,1,0,19 -1,1,2,1,1,3,16 -1,3,1,1,1,1,15 -0,2,2,3,0,3,11 -0,3,3,3,1,1,2 -0,1,1,3,1,0,18 -1,1,0,2,0,3,17 -1,2,1,2,1,2,1 -1,0,0,0,0,2,2 -0,0,1,3,0,3,8 -0,2,2,3,1,1,14 -0,2,2,2,1,0,2 -0,0,1,1,0,2,0 -0,0,3,3,0,2,15 -1,2,0,1,1,2,7 -0,2,2,0,1,0,15 -1,3,0,3,1,1,4 -1,2,0,3,1,0,18 -1,2,1,1,1,3,10 -0,2,1,1,0,3,2 -0,0,1,2,0,0,4 -0,3,0,2,0,2,16 -0,3,1,3,1,0,9 -0,3,3,2,1,2,16 -1,2,3,2,1,0,5 -0,2,3,3,0,2,9 -0,1,1,3,0,0,16 -0,3,0,1,1,0,6 -0,1,3,0,1,1,2 -1,0,0,3,1,0,13 -0,2,2,0,0,1,19 -0,0,2,1,1,1,18 -0,0,2,2,0,0,5 -0,3,2,1,0,1,1 -1,3,1,2,0,1,11 -1,1,2,2,0,1,19 -1,0,0,3,1,2,7 -0,2,2,2,0,2,6 -1,0,0,3,0,0,12 -0,0,2,0,1,3,1 -0,3,2,2,1,2,13 -0,2,3,0,0,3,13 -1,3,1,2,1,3,3 -1,0,2,2,1,0,17 -1,2,0,3,0,1,0 -1,2,2,2,1,3,12 -1,3,1,1,0,3,7 -1,0,2,1,1,2,4 -1,0,3,2,1,3,10 -0,3,0,1,1,3,14 -1,2,3,0,1,0,3 -1,2,3,1,0,0,11 -1,1,3,0,0,2,4 -0,1,1,0,0,0,1 -1,2,1,1,0,3,6 -1,2,1,2,1,2,0 -0,3,2,3,0,3,4 -1,3,0,0,1,2,9 -1,3,3,3,0,2,19 -0,1,2,3,0,0,7 -0,1,0,2,0,3,3 -1,1,2,3,0,3,15 -0,3,3,0,1,1,7 -1,3,2,0,0,0,0 -1,1,2,2,1,2,2 -1,2,3,3,0,1,3 -1,1,1,0,1,1,12 -1,0,1,1,0,0,2 -0,2,0,2,1,1,4 -1,0,2,3,0,1,16 -1,3,3,2,0,0,6 -0,0,1,2,0,1,7 -0,1,1,3,1,2,12 -1,3,1,0,1,0,19 -1,0,3,3,0,3,13 -1,1,2,1,0,1,5 -0,3,3,0,0,3,18 -1,3,2,2,0,1,18 -1,1,0,2,0,3,9 -0,1,1,3,1,1,10 -0,2,0,0,0,0,10 -1,1,0,2,0,1,1 -0,3,0,0,0,2,5 -0,1,2,0,1,2,3 -0,1,0,1,0,0,8 -1,2,3,1,0,0,14 -1,0,0,0,1,1,11 -0,1,0,0,0,3,11 -1,1,3,0,1,0,15 -0,3,1,3,1,3,5 -1,1,3,1,1,2,8 -1,3,2,3,0,0,10 -0,1,2,3,1,2,6 -0,0,0,2,0,3,15 -1,0,2,0,1,3,14 -1,1,3,1,0,2,18 -1,1,0,1,1,1,5 -0,0,0,1,1,3,19 -1,2,0,3,0,2,19 +1,3,2,2,1,0,0 +0,1,2,0,0,2,15 +1,0,3,3,0,1,16 +0,2,1,2,1,3,13 +1,2,2,0,1,2,7 +1,0,1,1,0,0,15 +0,1,0,1,1,2,19 +0,0,3,2,0,3,6 +1,3,3,1,0,2,7 +1,2,2,1,0,0,10 +0,3,3,0,1,3,11 +0,3,2,3,0,0,18 +1,1,0,3,1,1,6 +0,1,3,2,1,1,1 +0,3,3,0,0,0,5 +1,3,0,3,1,2,0 +1,2,3,2,0,2,11 +0,3,0,2,0,2,2 +1,1,1,2,0,3,18 +1,3,0,1,1,2,10 +1,3,0,0,0,3,4 +0,2,1,3,0,3,7 +0,2,3,1,1,1,14 +1,2,2,0,1,3,2 +0,2,1,3,0,2,6 +1,2,0,1,0,1,11 +1,2,1,3,1,2,3 +1,3,2,2,0,1,14 +0,2,2,2,0,2,17 +0,1,3,3,1,2,5 +0,3,1,1,0,1,17 +1,3,2,1,0,0,5 +1,1,1,2,1,3,8 +1,1,2,2,0,2,13 +0,1,3,1,1,2,14 +1,2,3,0,0,2,2 +0,1,2,2,0,0,17 +1,1,0,0,1,0,7 +0,0,2,1,0,2,16 +1,1,3,1,1,0,3 +0,0,0,1,1,0,19 +1,0,2,2,1,1,7 +0,2,3,0,0,3,0 +1,2,2,1,0,2,0 +0,0,1,0,0,2,3 +0,3,1,3,1,1,7 +1,3,1,0,0,2,13 +0,0,3,0,1,0,10 +1,2,3,1,0,1,9 +0,2,0,3,0,3,3 +1,3,3,3,1,3,8 +1,0,2,3,0,2,8 +0,1,3,2,0,3,0 +1,3,1,1,1,3,6 +0,2,1,2,1,0,12 +1,1,1,1,0,3,5 +0,1,2,3,0,0,9 +0,3,3,3,1,0,13 +0,3,2,2,1,3,9 +0,1,0,1,0,3,7 +1,1,1,1,1,1,0 +1,0,0,0,0,3,13 +0,2,1,0,0,1,8 +1,3,3,1,0,3,18 +0,3,0,2,0,1,3 +0,0,2,1,0,3,4 +0,2,2,0,1,1,19 +1,0,2,2,1,1,18 +0,0,0,1,1,1,13 +1,1,0,0,0,1,12 +0,0,3,3,1,2,15 +0,1,3,1,1,2,8 +0,0,2,3,1,0,11 +1,2,3,2,1,0,15 +0,2,0,2,1,0,12 +1,1,1,2,0,0,19 +1,3,3,0,0,1,9 +0,3,2,0,1,3,15 +0,0,0,0,1,2,18 +0,1,2,1,0,1,6 +1,0,1,0,1,0,9 +1,3,3,0,0,0,3 +0,0,0,2,0,0,8 +1,1,1,0,1,2,17 +0,2,2,3,0,3,1 +0,1,1,3,1,3,2 +0,2,0,1,1,2,9 +0,3,1,3,0,0,4 +0,1,3,3,0,1,13 +1,0,3,2,0,3,19 +0,1,0,0,1,3,16 +1,0,1,3,0,2,12 +1,2,0,1,1,3,1 +1,1,3,2,1,2,4 +1,3,2,3,1,1,2 +0,3,2,1,1,3,12 +1,1,0,3,0,0,1 +0,2,1,0,1,1,5 +1,2,1,1,1,0,16 +1,3,1,3,0,2,19 +0,0,1,0,1,1,0 +0,0,1,1,0,0,2 +0,0,1,0,0,3,14 +1,3,1,2,1,1,11 +1,2,0,2,1,0,4 +1,1,2,0,1,1,10 +1,2,3,0,1,0,6 +0,2,2,3,1,1,4 +1,2,0,3,0,3,10 +0,0,1,2,1,2,10 +0,2,3,3,1,0,18 +0,3,0,2,0,2,14 +0,3,0,2,1,2,16 +1,1,2,0,0,0,16 +0,3,1,1,1,0,1 +0,3,0,0,0,1,8 +0,0,3,2,0,1,1 +0,1,0,0,0,0,11 +0,1,1,3,0,1,10 +1,0,2,0,1,2,1 +1,0,3,3,1,3,17 +1,1,2,3,1,3,14 +1,0,0,2,1,3,5 +1,0,0,3,1,1,17 +1,2,0,2,0,1,15 +1,0,0,3,0,0,14 +0,0,2,1,1,3,3 +1,0,3,1,0,1,12 |