Repository 'effectivet3'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/peterjc/effectivet3

Changeset 11:ed8c1babc166 (2024-03-12)
Previous changeset 10:a46d7861c32c (2021-04-16)
Commit message:
v0.0.21 - Added bio.tools xref
modified:
tools/effectiveT3/README.rst
tools/effectiveT3/effectiveT3.py
tools/effectiveT3/effectiveT3.xml
b
diff -r a46d7861c32c -r ed8c1babc166 tools/effectiveT3/README.rst
--- a/tools/effectiveT3/README.rst Fri Apr 16 22:34:56 2021 +0000
+++ b/tools/effectiveT3/README.rst Tue Mar 12 16:04:13 2024 +0000
b
@@ -101,6 +101,7 @@
 v0.0.19 - Python 3 compatible exception handling.
 v0.0.20 - Work with Effective T3 as installed by BioConda (which provides a
           wrapper script which can be used to find the main JAR file folder).
+v0.0.21 - Added bio.tools xref
 ======= ======================================================================
 
 
b
diff -r a46d7861c32c -r ed8c1babc166 tools/effectiveT3/effectiveT3.py
--- a/tools/effectiveT3/effectiveT3.py Fri Apr 16 22:34:56 2021 +0000
+++ b/tools/effectiveT3/effectiveT3.py Tue Mar 12 16:04:13 2024 +0000
b
@@ -128,6 +128,7 @@
         of os.environ.get("PATH"), or can be overridden with a custom search
         path.
         """
+
         # Check that a given file can be accessed with the correct mode.
         # Additionally check that `file` is not a directory, as on Windows
         # directories pass the os.access check.
b
diff -r a46d7861c32c -r ed8c1babc166 tools/effectiveT3/effectiveT3.xml
--- a/tools/effectiveT3/effectiveT3.xml Fri Apr 16 22:34:56 2021 +0000
+++ b/tools/effectiveT3/effectiveT3.xml Tue Mar 12 16:04:13 2024 +0000
b
@@ -1,5 +1,8 @@
-<tool id="effectiveT3" name="Effective T3" version="0.0.20">
+<tool id="effectiveT3" name="Effective T3" version="0.0.21">
     <description>Find bacterial effectors in protein sequences</description>
+    <xrefs>
+        <xref type="bio.tools">effectivet3</xref>
+    </xrefs>
     <requirements>
         <requirement type="package" version="1.0.1">effectiveT3</requirement>
     </requirements>