Repository 'bcftools_consensus'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/iuc/bcftools_consensus

Changeset 6:1829900b5dcd (2017-12-12)
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Commit message:
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/bcftools commit 880627162bdeb854582e9f58ddab451de35feba3
modified:
macros.xml
b
diff -r 858a3580dc70 -r 1829900b5dcd macros.xml
--- a/macros.xml Thu Apr 13 17:46:10 2017 -0400
+++ b/macros.xml Tue Dec 12 13:55:24 2017 -0500
b
@@ -49,7 +49,7 @@
   bgzip -c '$input_file' > $input_vcf &&
   bcftools index $input_vcf &&
 #elif $input_file.is_of_type('vcf_bgzip')
-  ln -s '$input_file' $input_vcf
+  ln -s '$input_file' $input_vcf &&
 #elif $input_file.is_of_type('bcf')
   #set $input_vcf = 'input.bcf'
   ln -s '$input_file' $input_vcf &&
@@ -59,7 +59,7 @@
     bcftools index $input_vcf &&
   #end if
 #elif $input_file.is_of_type('bcf_bgzip')
-  ln -s '$input_file' $input_vcf
+  ln -s '$input_file' $input_vcf &&
 #end if
 ]]>
   </token>