Repository 'rdock_rbcavity'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/bgruening/rdock_rbcavity

Changeset 1:5f73eb32ddbf (2020-03-17)
Previous changeset 0:06f376dc117a (2019-10-02) Next changeset 2:d52d6ee95cf2 (2020-04-03)
Commit message:
"planemo upload for repository https://github.com/bgruening/galaxytools/tree/master/chemicaltoolbox/rdock commit 9ffbed897a816616ac05c479dcff75103cf9a7e8"
added:
test-data/poses-ascending.sdf
test-data/poses-descending.sdf
test-data/poses.sdf
b
diff -r 06f376dc117a -r 5f73eb32ddbf test-data/poses-ascending.sdf
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/poses-ascending.sdf Tue Mar 17 09:26:50 2020 -0400
b
@@ -0,0 +1,130 @@
+COCC(C)C(CCl)c1cccc(Br)c1
+ OpenBabel03162018053D
+libRbt.so/2013.1/901 2013/11/27
+ 15 15  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
+   10.1119   -3.9277    5.3225 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    9.0310   -3.0413    5.0553 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    7.9945   -3.7187    4.3397 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.8246   -2.7535    4.0816 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.7024   -3.4607    3.3058 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.3075   -2.0336    5.3805 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.2468   -0.9323    5.0952 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    4.6163   -0.0866    6.5353 Cl  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.9603   -2.9922    6.5383 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    4.7490   -3.7097    6.5798 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    4.4577   -4.5984    7.6187 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.3584   -4.7793    8.6615 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.5372   -4.0453    8.6712 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    7.7688   -4.2708   10.0891 Br  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.8278   -3.1495    7.6389 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+  1  2  1  0  0  0  0
+  2  3  1  0  0  0  0
+  3  4  1  0  0  0  0
+  4  5  1  1  0  0  0
+  4  6  1  0  0  0  0
+  6  7  1  6  0  0  0
+  6  9  1  0  0  0  0
+  7  8  1  0  0  0  0
+  9 10  1  0  0  0  0
+  9 15  2  0  0  0  0
+ 10 11  2  0  0  0  0
+ 11 12  1  0  0  0  0
+ 12 13  2  0  0  0  0
+ 13 14  1  0  0  0  0
+ 13 15  1  0  0  0  0
+M  END
+>  <Name>
+COCC(C)C(CCl)c1cccc(Br)c1
+
+>  <TransFSScore>
+0.000052
+
+$$$$
+COCC(C)C(CO)c1ccc(Br)cc1
+ OpenBabel03162018053D
+libRbt.so/2013.1/901 2013/11/27
+ 16 16  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
+    8.0891  -17.4910    5.6428 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    8.7776  -17.2166    6.8572 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    9.8614  -18.1239    7.0701 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   10.5740  -17.7750    8.3957 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    9.6152  -18.0787    9.5619 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   11.9364  -18.5267    8.5391 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   11.7889  -20.0488    8.2998 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   11.0437  -20.6799    9.3396 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   13.0327  -17.9696    7.6253 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   14.1839  -17.4039    8.2015 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   15.2110  -16.8983    7.4013 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   15.0973  -16.9557    6.0161 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   16.4814  -16.2619    4.9318 Br  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   13.9696  -17.5220    5.4242 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   12.9423  -18.0292    6.2262 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   11.5383  -20.5488   10.1686 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+  1  2  1  0  0  0  0
+  2  3  1  0  0  0  0
+  3  4  1  0  0  0  0
+  4  5  1  1  0  0  0
+  4  6  1  0  0  0  0
+  6  7  1  6  0  0  0
+  6  9  1  0  0  0  0
+  7  8  1  0  0  0  0
+  8 16  1  0  0  0  0
+  9 10  1  0  0  0  0
+  9 15  2  0  0  0  0
+ 10 11  2  0  0  0  0
+ 11 12  1  0  0  0  0
+ 12 13  1  0  0  0  0
+ 12 14  2  0  0  0  0
+ 14 15  1  0  0  0  0
+M  END
+>  <Name>
+COCC(C)C(CO)c1ccc(Br)cc1
+
+>  <TransFSScore>
+0.000113
+
+$$$$
+COCC(C)OCCOc1ccc(Br)cc1
+ OpenBabel03162018053D
+libRbt.so/2013.1/901 2013/11/27
+ 16 16  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
+   -3.9406   -3.6524   26.0345 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   -3.0091   -3.2577   25.0376 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   -1.6782   -3.1793   25.5508 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   -0.7080   -2.7487   24.4377 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+   -1.0018   -1.3118   24.0009 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    0.6316   -2.8817   24.9410 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    1.0553   -4.2385   25.0759 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    2.3836   -4.2980   25.8222 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    2.7118   -5.6728   26.0281 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    3.8212   -5.9445   26.7790 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    4.9743   -5.1619   26.8458 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.0387   -5.5484   27.6691 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.9457   -6.7188   28.4197 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    7.3792   -7.2299   29.5403 Br  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    4.8038   -7.5103   28.3520 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    3.7442   -7.1209   27.5286 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+  1  2  1  0  0  0  0
+  2  3  1  0  0  0  0
+  3  4  1  0  0  0  0
+  4  5  1  1  0  0  0
+  4  6  1  0  0  0  0
+  6  7  1  0  0  0  0
+  7  8  1  0  0  0  0
+  8  9  1  0  0  0  0
+  9 10  1  0  0  0  0
+ 10 11  1  0  0  0  0
+ 10 16  2  0  0  0  0
+ 11 12  2  0  0  0  0
+ 12 13  1  0  0  0  0
+ 13 14  1  0  0  0  0
+ 13 15  2  0  0  0  0
+ 15 16  1  0  0  0  0
+M  END
+>  <Name>
+COCC(C)OCCOc1ccc(Br)cc1
+
+>  <TransFSScore>
+0.029289
+
+$$$$
b
diff -r 06f376dc117a -r 5f73eb32ddbf test-data/poses-descending.sdf
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/poses-descending.sdf Tue Mar 17 09:26:50 2020 -0400
b
@@ -0,0 +1,130 @@
+COCC(C)OCCOc1ccc(Br)cc1
+ OpenBabel03162018053D
+libRbt.so/2013.1/901 2013/11/27
+ 16 16  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
+    5.6650   -5.5958   25.3680 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.1057   -4.4972   26.0732 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.0785   -3.4881   26.3491 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.4358   -2.3388   27.1440 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    4.9482   -2.8397   28.5054 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.4151   -1.2967   27.2873 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.6267   -0.5481   26.0900 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.3817    0.2676   25.7585 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.6866    1.1011   24.6394 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.7821    0.4960   23.4174 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.7162   -0.8770   23.1782 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.8146   -1.3676   21.8707 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.9820   -0.4818   20.8080 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.1007   -1.1472   19.0431 Br  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.0584    0.8879   21.0380 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.9602    1.3731   22.3447 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+  1  2  1  0  0  0  0
+  2  3  1  0  0  0  0
+  3  4  1  0  0  0  0
+  4  5  1  1  0  0  0
+  4  6  1  0  0  0  0
+  6  7  1  0  0  0  0
+  7  8  1  0  0  0  0
+  8  9  1  0  0  0  0
+  9 10  1  0  0  0  0
+ 10 11  1  0  0  0  0
+ 10 16  2  0  0  0  0
+ 11 12  2  0  0  0  0
+ 12 13  1  0  0  0  0
+ 13 14  1  0  0  0  0
+ 13 15  2  0  0  0  0
+ 15 16  1  0  0  0  0
+M  END
+>  <Name>
+COCC(C)OCCOc1ccc(Br)cc1
+
+>  <TransFSScore>
+0.900000
+
+$$$$
+COCC(C)C(CCl)c1cccc(Br)c1
+ OpenBabel03162018053D
+libRbt.so/2013.1/901 2013/11/27
+ 15 15  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
+   10.5975   -1.6265   24.3456 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    9.9876   -2.4972   23.3994 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    8.5655   -2.3484   23.4275 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    7.9288   -3.2311   22.3401 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    8.0397   -4.7166   22.7175 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.4621   -2.8051   21.9660 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.4266   -3.1085   23.0863 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.5671   -2.0982   24.5513 Cl  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.3532   -1.4007   21.3371 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.4668   -0.2249   22.1042 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.3963    1.0427   21.5193 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.1859    1.1744   20.1518 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.0190    0.0317   19.3806 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.7201    0.1935   17.5198 Br  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.0801   -1.2369   19.9634 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+  1  2  1  0  0  0  0
+  2  3  1  0  0  0  0
+  3  4  1  0  0  0  0
+  4  5  1  1  0  0  0
+  4  6  1  0  0  0  0
+  6  7  1  1  0  0  0
+  6  9  1  0  0  0  0
+  7  8  1  0  0  0  0
+  9 10  1  0  0  0  0
+  9 15  2  0  0  0  0
+ 10 11  2  0  0  0  0
+ 11 12  1  0  0  0  0
+ 12 13  2  0  0  0  0
+ 13 14  1  0  0  0  0
+ 13 15  1  0  0  0  0
+M  END
+>  <Name>
+COCC(C)C(CCl)c1cccc(Br)c1
+
+>  <TransFSScore>
+0.258377
+
+$$$$
+COCC(C)C(CO)c1ccc(Br)cc1
+ OpenBabel03162018053D
+libRbt.so/2013.1/901 2013/11/27
+ 16 16  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000
+    5.1209   -3.0737   26.6189 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    5.2470   -2.2997   25.4319 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.6087   -2.1896   25.0116 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.6915   -1.2882   23.7597 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    8.1245   -0.7354   23.6481 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.2475   -2.0456   22.4671 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    4.8752   -2.7399   22.6419 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    4.9977   -4.0000   23.2991 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.2126   -1.1502   21.2243 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.1393   -1.7450   19.9523 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.0915   -0.9617   18.7969 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.1145    0.4251   18.9029 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.0611    1.4863   17.3396 Br  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.1760    1.0355   20.1544 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    6.2225    0.2504   21.3109 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+    4.0953   -4.3353   23.4490 H   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
+  1  2  1  0  0  0  0
+  2  3  1  0  0  0  0
+  3  4  1  0  0  0  0
+  4  5  1  6  0  0  0
+  4  6  1  0  0  0  0
+  6  7  1  1  0  0  0
+  6  9  1  0  0  0  0
+  7  8  1  0  0  0  0
+  8 16  1  0  0  0  0
+  9 10  1  0  0  0  0
+  9 15  2  0  0  0  0
+ 10 11  2  0  0  0  0
+ 11 12  1  0  0  0  0
+ 12 13  1  0  0  0  0
+ 12 14  2  0  0  0  0
+ 14 15  1  0  0  0  0
+M  END
+>  <Name>
+COCC(C)C(CO)c1ccc(Br)cc1
+
+>  <TransFSScore>
+0.173348
+
+$$$$
b
diff -r 06f376dc117a -r 5f73eb32ddbf test-data/poses.sdf
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/poses.sdf Tue Mar 17 09:26:50 2020 -0400
b
b'@@ -0,0 +1,2730 @@\n+COCC(C)C(CCl)c1cccc(Br)c1\n+ OpenBabel03162018053D\n+libRbt.so/2013.1/901 2013/11/27\n+ 15 15  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000\n+   10.5975   -1.6265   24.3456 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    9.9876   -2.4972   23.3994 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    8.5655   -2.3484   23.4275 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    7.9288   -3.2311   22.3401 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    8.0397   -4.7166   22.7175 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.4621   -2.8051   21.9660 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.4266   -3.1085   23.0863 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.5671   -2.0982   24.5513 Cl  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.3532   -1.4007   21.3371 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.4668   -0.2249   22.1042 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.3963    1.0427   21.5193 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.1859    1.1744   20.1518 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.0190    0.0317   19.3806 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.7201    0.1935   17.5198 Br  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.0801   -1.2369   19.9634 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+  1  2  1  0  0  0  0\n+  2  3  1  0  0  0  0\n+  3  4  1  0  0  0  0\n+  4  5  1  1  0  0  0\n+  4  6  1  0  0  0  0\n+  6  7  1  1  0  0  0\n+  6  9  1  0  0  0  0\n+  7  8  1  0  0  0  0\n+  9 10  1  0  0  0  0\n+  9 15  2  0  0  0  0\n+ 10 11  2  0  0  0  0\n+ 11 12  1  0  0  0  0\n+ 12 13  2  0  0  0  0\n+ 13 14  1  0  0  0  0\n+ 13 15  1  0  0  0  0\n+M  END\n+>  <Name>\n+COCC(C)C(CCl)c1cccc(Br)c1\n+\n+>  <TransFSScore>\n+0.258377\n+\n+$$$$\n+COCC(C)C(CCl)c1cccc(Br)c1\n+ OpenBabel03162018053D\n+libRbt.so/2013.1/901 2013/11/27\n+ 15 15  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000\n+    5.6183   -0.0012   26.1615 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.1674   -1.0474   25.3681 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.1412   -1.6856   24.6032 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.7556   -2.7964   23.7339 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    4.6702   -3.4858   22.8925 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.9796   -2.3138   22.8727 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    7.6828   -3.4659   22.0996 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    8.1636   -4.8702   23.0913 Cl  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.7068   -1.0412   22.0446 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.9589    0.2496   22.5488 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.7362    1.3947   21.7787 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.2313    1.2861   20.4884 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.9256    0.0281   19.9861 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.2267   -0.1367   18.2360 Br  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.1388   -1.1182   20.7563 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+  1  2  1  0  0  0  0\n+  2  3  1  0  0  0  0\n+  3  4  1  0  0  0  0\n+  4  5  1  6  0  0  0\n+  4  6  1  0  0  0  0\n+  6  7  1  6  0  0  0\n+  6  9  1  0  0  0  0\n+  7  8  1  0  0  0  0\n+  9 10  1  0  0  0  0\n+  9 15  2  0  0  0  0\n+ 10 11  2  0  0  0  0\n+ 11 12  1  0  0  0  0\n+ 12 13  2  0  0  0  0\n+ 13 14  1  0  0  0  0\n+ 13 15  1  0  0  0  0\n+M  END\n+>  <Name>\n+COCC(C)C(CCl)c1cccc(Br)c1\n+\n+>  <TransFSScore>\n+0.047733\n+\n+$$$$\n+COCC(C)C(CCl)c1cccc(Br)c1\n+ OpenBabel03162018053D\n+libRbt.so/2013.1/901 2013/11/27\n+ 15 15  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000\n+    7.9912   -4.2501   22.2375 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    7.3105   -3.3249   23.0780 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    8.2107   -2.3148   23.5412 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    7.4791   -1.3723   24.5125 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    8.4280   -0.2734   25.0159 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.1337   -0.7983   23.9352 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.3067    0.0046   24.9796 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    4.6297   -0.9578   26.3221 Cl  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.2752   -0.1245   22.5547 C   0  0  0  0 '..b'-1.1938   19.3289 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.9926   -1.8088   20.5659 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+  1  2  1  0  0  0  0\n+  2  3  1  0  0  0  0\n+  3  4  1  0  0  0  0\n+  4  5  1  6  0  0  0\n+  4  6  1  0  0  0  0\n+  6  7  1  0  0  0  0\n+  7  8  1  0  0  0  0\n+  8  9  1  0  0  0  0\n+  9 10  1  0  0  0  0\n+ 10 11  1  0  0  0  0\n+ 10 16  2  0  0  0  0\n+ 11 12  2  0  0  0  0\n+ 12 13  1  0  0  0  0\n+ 13 14  1  0  0  0  0\n+ 13 15  2  0  0  0  0\n+ 15 16  1  0  0  0  0\n+M  END\n+>  <Name>\n+COCC(C)OCCOc1ccc(Br)cc1\n+\n+>  <TransFSScore>\n+0.052545\n+\n+$$$$\n+COCC(C)OCCOc1ccc(Br)cc1\n+ OpenBabel03162018053D\n+libRbt.so/2013.1/901 2013/11/27\n+ 16 16  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000\n+    1.5854   -4.4167   26.8713 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    2.9171   -3.9650   27.0697 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    3.3204   -3.0325   26.0654 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    4.0629   -3.7637   24.9341 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    3.0725   -4.5314   24.0556 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    4.7894   -2.7836   24.1743 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.8770   -3.3338   23.4307 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.3647   -2.3248   22.3968 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.2636   -1.9969   21.5481 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.5320   -1.2441   20.4392 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.2993   -1.6247   19.1173 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.6084   -0.7491   18.0695 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.1526    0.5029   18.3492 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.5557    1.6873   16.9327 Br  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.3970    0.8871   19.6636 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.0874    0.0098   20.7062 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+  1  2  1  0  0  0  0\n+  2  3  1  0  0  0  0\n+  3  4  1  0  0  0  0\n+  4  5  1  6  0  0  0\n+  4  6  1  0  0  0  0\n+  6  7  1  0  0  0  0\n+  7  8  1  0  0  0  0\n+  8  9  1  0  0  0  0\n+  9 10  1  0  0  0  0\n+ 10 11  1  0  0  0  0\n+ 10 16  2  0  0  0  0\n+ 11 12  2  0  0  0  0\n+ 12 13  1  0  0  0  0\n+ 13 14  1  0  0  0  0\n+ 13 15  2  0  0  0  0\n+ 15 16  1  0  0  0  0\n+M  END\n+>  <Name>\n+COCC(C)OCCOc1ccc(Br)cc1\n+\n+>  <TransFSScore>\n+0.239591\n+\n+$$$$\n+COCC(C)OCCOc1ccc(Br)cc1\n+ OpenBabel03162018053D\n+libRbt.so/2013.1/901 2013/11/27\n+ 16 16  0  0  0  0  0  0  0  0999 V2000\n+    5.6650   -5.5958   25.3680 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.1057   -4.4972   26.0732 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.0785   -3.4881   26.3491 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.4358   -2.3388   27.1440 C   0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    4.9482   -2.8397   28.5054 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.4151   -1.2967   27.2873 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.6267   -0.5481   26.0900 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.3817    0.2676   25.7585 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.6866    1.1011   24.6394 O   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.7821    0.4960   23.4174 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.7162   -0.8770   23.1782 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.8146   -1.3676   21.8707 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.9820   -0.4818   20.8080 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.1007   -1.1472   19.0431 Br  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    6.0584    0.8879   21.0380 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+    5.9602    1.3731   22.3447 C   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0\n+  1  2  1  0  0  0  0\n+  2  3  1  0  0  0  0\n+  3  4  1  0  0  0  0\n+  4  5  1  1  0  0  0\n+  4  6  1  0  0  0  0\n+  6  7  1  0  0  0  0\n+  7  8  1  0  0  0  0\n+  8  9  1  0  0  0  0\n+  9 10  1  0  0  0  0\n+ 10 11  1  0  0  0  0\n+ 10 16  2  0  0  0  0\n+ 11 12  2  0  0  0  0\n+ 12 13  1  0  0  0  0\n+ 13 14  1  0  0  0  0\n+ 13 15  2  0  0  0  0\n+ 15 16  1  0  0  0  0\n+M  END\n+>  <Name>\n+COCC(C)OCCOc1ccc(Br)cc1\n+\n+>  <TransFSScore>\n+0.900000\n+\n+$$$$\n'