Repository 'hmdb_ms_search'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/fgiacomoni/hmdb_ms_search

Changeset 17:49f87ddb2c78 (2019-01-23)
Previous changeset 16:8b2fbd449ffd (2019-01-16) Next changeset 18:ec7c05889e67 (2019-01-23)
Commit message:
Master branch Updating - - Fxx
modified:
lib/hmdb.pm
wsdl_hmdb.pl
b
diff -r 8b2fbd449ffd -r 49f87ddb2c78 lib/hmdb.pm
--- a/lib/hmdb.pm Wed Jan 16 10:56:59 2019 -0500
+++ b/lib/hmdb.pm Wed Jan 23 02:57:07 2019 -0500
[
@@ -245,7 +245,7 @@
   } else {
    $status_line = $res->status_line ;
    ($status_line) = ($status_line =~ /(\d+)/);
-   warn "\tHMDB service issue !! the server returned a $status_line HTTP error\n" ;
+   warn "\t[HMDB service issue !! the server returned a $status_line HTTP error]" ;
   }
 
 
b
diff -r 8b2fbd449ffd -r 49f87ddb2c78 wsdl_hmdb.pl
--- a/wsdl_hmdb.pl Wed Jan 16 10:56:59 2019 -0500
+++ b/wsdl_hmdb.pl Wed Jan 23 02:57:07 2019 -0500
[
@@ -255,15 +255,16 @@
 # Input : accurate mz or list of accurate masses
 # Author : Franck Giacomoni and Marion Landi
 # Email : fgiacomoni\@inra.fr
-# Version : 1.5
+# Version : 1.6
 # Created : 08/07/2012
-# Updated : 19/01/2018
+# Updated : 23/01/2019 - 1.6
 USAGE :  
  wsdl_hmdb.pl  -mass [one mass or a string list of exact masses] -delta [mz delta] -mode [molecular species: positive|negative|neutral] -output [output tabular file] -view [output html file] 
 
  or 
  wsdl_hmdb.pl  -masses [an input file of mzs] -colfactor [col of mz] -header_choice [yes|no] -nblineheader [nb of lines containing file header : 0-n]
- -delta [mz delta] -mode [molecular species: positive|negative|neutral] -output [output tabular file] -view [output html file] 
+ -delta [mz delta] -mode [molecular species: positive|negative|neutral] -output [output tabular file] -view [output html file]
+ -advancedFeatures [Default 0, set to 1 for advanced features as logp, inchi, ...]
 
  or 
  wsdl_hmdb.pl  -h for help
@@ -322,6 +323,8 @@
 
 version 1.4 : 21 / 01 / 2016 - a clean version for community
 
-version 1.5 : 19 / 01 / 2018 - modifiy parser to match HMDB V4.0 formats
+version 1.5 : 19 / 01 / 2018 - modify parser to match HMDB V4.0 formats
+
+version 1.6 : 23 / 01 / 2019 - Manage UA http error and advanced feature from hmdb.
 
 =cut
\ No newline at end of file