Repository 'gecko'
hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/iuc/gecko

Changeset 1:8acaa11e3b6b (2020-12-18)
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Commit message:
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/gecko commit d5a38da952de32b218895725c80b5bdac54c7dbf"
modified:
gecko.xml
added:
test-data/mycoplasma-232.fasta
test-data/mycoplasma-7422.fasta
b
diff -r 09459f6ffe08 -r 8acaa11e3b6b gecko.xml
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+++ b/gecko.xml Fri Dec 18 10:21:00 2020 +0000
b
@@ -1,7 +1,7 @@
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     <description>Ungapped genome comparison</description>
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@@ -84,6 +84,24 @@
                 </assert_contents>
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     <help>
 *GECKO*
b
diff -r 09459f6ffe08 -r 8acaa11e3b6b test-data/mycoplasma-232.fasta
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
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b
b'@@ -0,0 +1,17857 @@\n+>gi|54019969|ref|NC_006360.1|\n+ATGCAAACAAATAAAAATAATTTAAAGGTTAGAACACAGCAAATTAGGCA\n+ACAAATTGAAAATTTATTAAATGATCGAATGTTGTATAACAACTTTTTTA\n+GCACAATTTATGTACTCAACGAGACAGAAACTGAAATTATTATAGATTTT\n+ACAGACTTAATCGCGAAACAGGAAGTGATTTCACGCTGAGTTGATACGGT\n+TGAAAAAGCTATTAAAAATCTTGAAATTTCAAAAATCCTAACTTTTAACA\n+ATACAAATAATTATACCATTAATTCAAAAGAAAGCCAAAACTTTTCCATA\n+AAAAATAAATATTGCAGCTTTAATATTAACAATGTTTTAAACAAATTTAC\n+CTTTAGAAATTTTATAAAATCAAGTTATAATTTCCAAATTTTTAGTATTT\n+ATGACGCAATAGTCGCAAATTCAAGACTAAATTACTCACCAATTTTTATT\n+TCAGGACCATCAGGAATTGGAAAAACGCATTTTATTAATGCGATTGGAAA\n+TTTACTTGTAGAAAAACAGAAGAAAGTTTTCTACATTAACGACTATAAAT\n+TTATCAGTTGCGTTTCTTCCTGGATGCAAAATGGTCAAAATGAAAAAATT\n+AGTGAATTTTTAAACTGATTGTCTCAAGTTGACGCTTTTCTTTTTGATGA\n+TATCCAAGGTTTGGCTAACAAACAACAAACTTCAATTGTTGCACTTGAAA\n+TTTTAAATAGATTTATCGAAGAGGATAAAACAGTGATAATAACATCTGAT\n+AAATCGCCTTCTTTACTTGGTGGATTTGAAGAAAGATTTATAACGCGATT\n+TAGTTCAGGGTTGCACATTAAATTAAACAAGCCGAAAAAAGAAGACTTTT\n+TGCGGATTTTTAAGCATAAATTAGTTGAAGAAAAATTAGAAAAACATATT\n+TGAACAAATGATGCTTTTGAATTTTTGTCAAAGCATTTTCGAAATTCGAT\n+TCGTGAGCTTGAAGGTGCGCTAAAATCAATTGTTTTTTATATCCAAACAA\n+ATAAAAATAAATTTGAGGATGAAATTTATTTTGATAAGAAAAAAATGTTT\n+GAAATTTTTGTTGAAAAATATGAAATCGAACAAACAATCACCCCTGATTT\n+AATCATTGAGGTTGTCTCAAAATATTATGGCGTCTCAATTTTAGATATAA\n+AAAGTGAAAAAAGAGGCAAAAATATTGTGCATGCCCGCGATATTGCAATC\n+TGATTAATTAAAAATATTCTGGATTTAACTCATAATAGCGTAGGAACTTT\n+TTTTAACAACAGAAGACATTCAACAATAATTTCTACCCTTAAAAAAATTG\n+ATACTTTAAAACAAAGCAACAATAATGAACTTGAAATTGCCCTTAACCAT\n+ATTTATAAACAATTAAACTGAAGTTTTAAACAGCGAAAATAAAAATATTA\n+AACAGCTTTTTGGGCAAAAAGTACTATAAATTAAAGTGGTTTTTTATCTT\n+TTCTACATTTCTACACCCTTATTATTTTTATTATTAAAACTAAATAAAAA\n+TTAACTAAATATAATATAATTATTAAAGGTAAAAATATGAAATTTACAAT\n+TGAAAAAAAAATTATTGAATGACAAATTGAAAGAATGCAATCAGCAATTC\n+TTAATAATGTAAATTCACCATTAAGTTCATTTTTTTTAAAACTTACAAGA\n+AGCGGATTATTTATAATTTCAACAAATAGCGAACTTTCCTATAAAGTTTT\n+TATTAATAAAAAAGATTTAATTGAAATTTATGATGTTGGAAGTTGCTTAA\n+TTGACGGTGTTTTTTTACGTGATGTTATTAGAAAAAGTGATAAACAATTA\n+AGTTTTCATCTAATTGGTTCTGAATTAAAAGTTTTTTGGGAAGATGCTAT\n+TTTTTCAAAGACAACTCGCGATTCTTCTTTTTTTCCAGAAATTAACTTTG\n+AACAAAAAGGAATTAAATTAACTGTAAATGCTAAAAATTTTAAAAGAGCA\n+ATAAAAAATACAGCTTTTGCAACAACAAATAATCCTTCACAGCCGATTTT\n+ATCGGCAATAAATCTTAGATCTGAAGCCGGTTTTCTACATTTTTCAGCAA\n+CAGATACAACTCGATTTGCCTCAGAAAAAATCGAAATTTCGAATAAAAGT\n+AGAATAAATATTTCTGTTAGCGCGAAAAATTTAAAAGATTTTATCCCACC\n+TGAACTTGATAAGGATATCGAATTAAATATTGAATCTTCAAAAATTAGTT\n+ATATTTATGATAATTTAACGATCCAGTCGCGAATTTTCACTATTGAATAC\n+AAGGATATTTCAAATATCCTACCAAAAGACAGCGAAATTTTATACTCACT\n+TACAATCAACAAACGCGACATCCTCGATCTGATTGATAAAACAACAATAA\n+TTACCCCCGGAAAAGATAATGTTATCAACCTTTCGATGTCAAAAAATGCG\n+TTAAAAGGCTATATTTCCCAATATGATTCGGGTCAGTCGAATGTTCAGAC\n+AAAAAATGTTCTTGATTTCAGATTTAACCCAAGATTTGCATCAGATTTTC\n+GATTCGACCCTGAATTAGCTCAGGTTAATATAAATTATCGCTATTTAAAA\n+GATGCAATTTCTGTTTTTGATAAAGTAATTGATATTCACATTAATGAAAA\n+AATGAACAAAATGTTGATAGTTTCGCCAGAAAAACCAGAAATTTGTCAGT\n+TAGTCGGTCTTGTTTTAGTCTAAATTTTCTCTAAAATTTAGACTATTTTT\n+TGATTAAAATTCAAAAAAATAAGCTATTTTATAGTATAATTTAAAAAAAA\n+GAAACTAATTTGAGGAAATTTTTAATGTCAAAAAAATCTAAAAATTCAAG\n+CATTGAATTTGATGCTATTGTTGTCGGTGGCGGCCATGCTGGGATCGAAG\n+CAGTTTATGCATTATTAAAAAAAAAGTTAAAAGTTGTTCTAATAACTCTC\n+GATAAGAAAAAATTAGCTTCAATGCCTTGTAATCCCGCAATTGGTGGGCC\n+AGCAAAAGGAATTATAACTCGCGAGATCGATGCCCTTGGAGGAGTTCAGG\n+GAAAACTTTCAGATTTAGCAATGATCCAAATTAAATATTTAAATGAATCA\n+AAAGGTCCTGCCGTTTTAGCGATTAGAGCCCAAATTGATAAGGAAAAATA\n+TTCAAAATTAATATTAAAGGATTTGAAAAAACAGGAAAATTTATTAATTA\n+TCGAGGATTTGGTTAGTGAACTTCTAGTTGAAAAAAATCGTGTTTTTGGT\n+CTAAAAACAGCGAAAAAACAAGTGTTTTTTTCAAAAACTGTGATTATTAC\n+AACAGGCACCTACATGGATTCAAAAGTTCTTCGAGGCTCATTAGCGATTC\n+CAAGTGGGCCAGATGGTCAACAAACTTCAAATTTGCTTTCAAATAATTTA\n+AAAACGCTTGGTTTTGAACTACAAAGGTTAAAAACTGGAACTCCCCCGCG\n+AATTTTTACTTCTTCAATTGACTTTTCAAAAGTTGAAAAAGAGGTTTTGC\n+CTGTTTATAATATAAATTTTTCTTTCCAATCAAAGCATAAGTTAAAAAAA\n+CAAATTTCTTGTTATTTGACTTATACAACAGCAAAAACTCATGATATAAT\n+TAACAAAAATTTAGGAAAATCCTCGATGTATTCAGGTCTAATTTCCGGTG\n+TTGGACCACGTTATTGTCCTTCGATTGAAGATAAAATTGTTCGCTTTTCA\n+GAAAAACCTCGCCACCAAATATTTTTCGAACCAGAAACAAAAAAACAAGA\n+TATAATGTATATTAATGGCCTTTCAACGTCGATGCCCGAGGATGTTCAGC\n+TTGAAATGGTTAAAACAATTCCTGGTTTGGAAAATGCAAAAATTGCA'..b'TTCATAAGTTTTTTCAATTTCTTTTTCAACAGCATT\n+TTGCTTTGGACAACAATTTTGTTCTAAATTATTAGAAATTATGCGAATAT\n+CGCTCTGTTTTTCTTGTATTTTTTCTTCAATTTCAAGTTTTTCAACTGAA\n+TTTGTGGAAGTTAAATCTGCATTTTCAAGAGAAATTTGGTGACTTTCTGC\n+TTGATCCTTATCATTAAAATTTGCGGGTAATTCTGATAAATCAACTTTAT\n+TTTCTTGACTATTTTCTAAAATAGCTTCTAATTCAATATCAACTTTTTCG\n+GGGTTATTTGAAATTGTAGTTGAAATATCTTGATTTATTTGTGTTTCTTG\n+TAAGGAATTTTCTAAATTTTTCTCCGGTTGATTTTCTAGATGATTAATTG\n+ATGCTTTAAACCTTATAGTATTATCCTTTTTTTCCTCAAGATTATTTGCC\n+TCTTTTTGCATAAGAACATCAACGATATAATCGTAATTTGCTTGTGAATT\n+TTGGGTTAAATAATTTGATCATTTTTCAGAATCTAACCTAATCAAACTTG\n+CTTTTTCAAAATTATAACTTTCCAGCTGATTATTACATCTTTTAATTAAT\n+TCATCAATCCTTGAATATCAGTGATCATAAAGTTTTATTTTAAAAAAATT\n+AATGTTATATTGTTGATTTTTTCCCCGAGATGACAAAACTTCAAAAAAAA\n+CTCCTGAAATTAAAATATAAAAAATATGATCTTTTTGTTTTAAATTGTAA\n+CGGAGTAATTTTATGTTAAATTCAGCGCAAACTGGTTCGCCAAAATTAAA\n+ATTTTGAAATATTTCATCAACAGAAACAGGAGAATTGTTCTGTTTTTTAA\n+GCAATTCAAGCGTCATTTTAAAAATATGAC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