Repository package_tabix_0_2_6
Owner: iuc
Synopsis: Tabix: Generic indexer for TAB-delimited genome position files + bgzip
Tabix indexes a TAB-delimited genome position file in.tab.bgz and creates an index file in.tab.bgz.tbi when region is absent from the command-line. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip which has a gzip(1) like interface. After indexing, 
tabix is able to quickly retrieve data lines overlapping regions specified in the format "chr:beginPos-endPos". Fast data retrieval also works over network if URI is given as a file name and in this case the index file will be downloaded if it is not present locally. 

http://samtools.sourceforge.net/tabix.shtml

Repository-Maintainer: Björn Grüning
Repository-Development: https://github.com/bgruening/galaxytools
Type: tool_dependency_definition
Revision: 1:389d2376b60b
This revision can be installed: True
Times cloned / installed: 1850
Dependencies of this repository

Name Version Type
tabix 0.2.6 package

Categories
Tool Dependency Packages - Repositories that contain third-party tool dependency package installation definitions