Repository revision
Select a revision to inspect and download versions of Galaxy utilities from this repository.

Repository sra_tools
Name: sra_tools
Owner: iuc
Synopsis: NCBI Sequence Read Archive toolkit utilities
The Galaxy tool wrappers contained in this tool shed repository rely on software developed by the NCBI Sequence Read Archive: Use of SRA Toolkit software herin should comply with the GPL v2 or greater. Copyright (C) 2013 Matthew Shirley This program is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms of the GNU General Public License as published by the Free Software Foundation, either version 2 of the License, or (at your option) any later version. This program is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU General Public License for more details. You should have received a copy of the GNU General Public License along with this program. If not, see <>. INSTALLATION This software release was designed to run under Linux, MacOSX operating systems on Intel x86-compatible 64 bit architectures. Build Requirements: ar bash make gcc, g++ libxml2 libcurl4 zlib On a debian based Linux OS use: apt-get install build-essential libxml2-dev libcurl4-openssl-dev zlib-dev CONTROLLED-ACCESS DATA Encrypted, controlled-access data is not supported in this version of the SRA Toolkit Galaxy tool shed.
Clone this repository: hg clone
Type: unrestricted
Revision: 13:c38286ea7047
This revision can be installed: True
Times cloned / installed: 2049

Contents of this repository

Name Description Version Minimum Galaxy Version
format from NCBI SRA 16.01
format from NCBI SRA 16.01
from NCBI SRA 16.01

Data Source - Tools for retrieving data from external data sources
Fastq Manipulation - Tools for manipulating fastq data