Repository revision
Select a revision to inspect and download versions of Galaxy utilities from this repository.

Repository sra_tools
Name: sra_tools
Owner: iuc
Synopsis: NCBI Sequence Read Archive toolkit utilities
The Galaxy tool wrappers contained in this tool shed repository rely on software developed by the NCBI Sequence Read Archive: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=software. Use of SRA Toolkit software herin should comply with the GPL v2 or greater. Copyright (C) 2013 Matthew Shirley This program is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms of the GNU General Public License as published by the Free Software Foundation, either version 2 of the License, or (at your option) any later version. This program is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU General Public License for more details. You should have received a copy of the GNU General Public License along with this program. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. INSTALLATION This software release was designed to run under Linux, MacOSX operating systems on Intel x86-compatible 64 bit architectures. Build Requirements: ar bash make gcc, g++ libxml2 libcurl4 zlib On a debian based Linux OS use: apt-get install build-essential libxml2-dev libcurl4-openssl-dev zlib-dev CONTROLLED-ACCESS DATA Encrypted, controlled-access data is not supported in this version of the SRA Toolkit Galaxy tool shed.
Clone this repository: hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/iuc/sra_tools
Type: unrestricted
Revision: 13:c38286ea7047
This revision can be installed: True
Times cloned / installed: 2049

Contents of this repository

Name Description Version Minimum Galaxy Version
format from NCBI SRA 2.9.1.3 16.01
format from NCBI SRA 2.9.1.3 16.01
from NCBI SRA 2.9.1.2 16.01

Categories
Data Source - Tools for retrieving data from external data sources
Fastq Manipulation - Tools for manipulating fastq data