Mercurial > repos > artbio > lumpy_smoove
view test-data/test_vcf2hrdetect.tab @ 7:8b0005fdfd04 draft
"planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/lumpy_smoove commit 558dc75a7a265e2b3572d9ce938d9f9f5673abda"
author | artbio |
---|---|
date | Sun, 18 Apr 2021 17:08:22 +0000 |
parents | ad8853ee9909 |
children | 8711df965d4b |
line wrap: on
line source
chr1 pos1 chr2 pos2 type 1 28515659 19 24027918 TRA 1 42552553 4 44842163 TRA 1 44059282 1 44059890 INV 1 64897140 6 159204434 TRA 1 66804423 13 59377693 TRA 1 80794627 1 80795137 INV 1 91151631 8 85437297 TRA 1 105428633 7 93357413 TRA 1 119401195 15 51189306 TRA 1 168024578 19 24033135 TRA 1 221827800 13 61315891 TRA 1 234805693 16 59323740 TRA 2 12019022 7 52399206 TRA 2 77358259 18 59713754 TRA 2 78091959 4 174044216 TRA 2 153997618 17 74377266 TRA 2 160095376 2 160095824 INV 2 178351450 19 52567370 TRA 2 178351470 19 52567638 TRA 2 204273805 4 68944782 TRA 3 12818457 5 144122990 TRA 3 38399708 8 75876952 TRA 3 48372309 7 32225987 TRA 3 54428366 12 28226427 TRA 3 75960769 11 130675918 TRA 3 105828859 5 141379626 TRA 3 151748833 3 176444683 INV 3 158034493 6 32688592 TRA 3 182298978 11 94948981 TRA 3 182299013 9 1940734 TRA 3 184156702 20 231409 TRA 3 192376521 10 65545580 TRA 4 81136688 6 68923562 TRA 4 99513602 6 32589570 TRA 4 162642267 X 3599701 TRA 4 162642407 X 3599706 TRA 4 175534267 10 123120353 TRA 4 183256660 8 131547788 TRA 4 186382139 9 129005120 TRA 5 5595231 15 52589534 TRA 5 37709852 7 8663298 TRA 5 53122606 5 53125511 INV 5 53122773 5 53125484 INV 5 54865791 10 75489275 TRA 5 54865801 10 75489000 TRA 5 147553039 5 147554616 INV 5 157223490 5 176652060 INV 5 157223548 11 3760878 TRA 5 169597700 5 169598748 INV 5 176651964 11 3760899 TRA 6 17608998 X 117432517 TRA 6 26625483 7 68758443 TRA 6 37295025 12 22085955 TRA 6 74156485 14 71480241 TRA 6 107307808 8 105231718 TRA 6 161336425 7 85956546 TRA 7 70420972 7 70438890 INV 7 98015910 X 136092975 TRA 7 111053752 12 108203254 TRA 7 127930431 16 76865795 TRA 7 156387047 7 156387226 INV 8 30145409 17 7167951 TRA 8 59616000 16 3354097 TRA 8 96265720 19 18835613 TRA 8 140475500 12 58359059 TRA 8 140475502 11 56303340 TRA 9 127885505 18 71711520 TRA 9 141058509 10 107209 TRA 10 51019958 12 46175132 TRA 10 59256942 10 59257951 INV 10 59257660 10 59257985 INV 10 68673027 16 59976476 TRA 10 132635667 10 132636051 INV 11 106143090 11 106143794 INV 12 104359630 12 125801144 INV 13 35787786 X 11952984 TRA 14 47118175 14 63226299 INV 14 65842539 14 65843134 INV 14 90299534 14 90302487 INV 14 106484224 15 22486809 TRA 15 75867566 16 89281701 TRA 21 32956225 X 47183861 TRA X 114216686 X 114544524 INV 1 14436660 1 14438563 DUP 1 43694066 1 43695538 DEL 1 80221789 1 80223032 DEL 1 92232065 1 92233362 DEL 2 18118870 2 18120031 DEL 2 19002880 2 19003387 DEL 2 34797601 2 34801579 DEL 2 34965732 2 34967261 DEL 2 48990532 2 48991191 DEL 2 76773562 2 76775444 DEL 2 120417073 2 120418454 DUP 2 125766561 2 125768399 DUP 2 156774338 2 156776256 DEL 2 179315148 2 179315689 DEL 2 189119618 2 189120979 DEL 3 32203783 3 32204153 DEL 3 124936235 3 124937163 DEL 3 129763389 3 129806742 DEL 3 144517821 3 144518457 DEL 3 190785116 3 190789319 DEL 4 73831211 4 73831818 DEL 4 88268261 4 88274334 DEL 4 102787795 4 102788358 DEL 4 144573271 4 144573612 DEL 4 151011309 4 151011648 DUP 5 1178285 5 1180725 DEL 5 26796704 5 26801897 DEL 5 95966521 5 95967361 DEL 5 103062313 5 103062635 DEL 5 108595090 5 108601127 DEL 5 127336004 5 127336923 DEL 5 178109055 5 178113407 DEL 6 20169115 6 108322150 DUP 6 32315438 6 32316258 DEL 6 37294925 6 37295284 DEL 6 65022877 6 65023371 DUP 6 72863847 6 72873539 DEL 6 74932726 6 74933069 DEL 6 89921735 6 89922171 DEL 6 136589486 6 136590574 DEL 7 65857652 7 65860106 DEL 7 76134084 7 76140082 DEL 7 86615393 7 86615759 DEL 7 93541820 7 93542546 DEL 7 97993595 7 97993987 DEL 7 100056291 7 129157154 DUP 7 151230203 7 151231867 DEL 8 11245570 8 11247212 DEL 8 14588058 8 14588822 DEL 8 16821879 8 16822259 DEL 8 118980771 8 118981151 DEL 9 104182136 9 104182429 DUP 9 104714849 9 104724476 DEL 9 110033442 9 110035532 DEL 9 139427511 9 139427797 DEL 10 35593223 10 35593548 DEL 10 45158118 10 45158533 DEL 10 55893654 10 55894125 DEL 10 87242583 10 87243046 DUP 10 132858454 10 132858819 DEL 10 132988685 10 132991206 DEL 11 93695221 11 93702091 DEL 11 97172221 11 97172970 DEL 11 99185461 11 99186696 DEL 12 12026417 12 12027146 DEL 12 30478280 12 30480988 DEL 13 38071947 13 38085574 DEL 13 74915300 13 74916746 DEL 13 89421953 13 89422932 DEL 14 23105069 14 23107950 DEL 14 32953296 14 32954345 DEL 14 41829108 14 41980350 DEL 14 42486317 14 42486634 DEL 14 60341404 14 60343237 DEL 14 61058056 14 61059493 DEL 14 80106294 14 80115045 DEL 15 39744398 15 39744849 DEL 15 62706095 15 62707781 DEL 16 13294470 16 13296490 DEL 16 33485944 16 33486280 DEL 16 69854786 16 69859026 DUP 16 85302496 16 85304389 DEL 17 45634774 17 45635284 DEL 17 46615627 17 46617222 DUP 17 68159938 17 68160278 DEL 17 70815221 17 70821355 DEL 18 39585688 18 39586313 DEL 18 77309929 18 77312095 DEL 19 15046341 19 15049471 DEL 19 51077891 19 51082521 DEL 20 3821170 20 3825120 DEL 20 61724700 20 61725614 DEL 20 62949719 20 62959202 DEL 22 17770355 22 17779150 DEL 22 19099927 22 19100621 DEL X 55702382 X 55709885 DEL