view test-data/test_vcf2hrdetect.tab @ 10:8711df965d4b draft default tip

planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/main/tools/lumpy_smoove commit 355389e3d1b38d93b1bc1c683c25094d5c6f8223

chr1	pos1	chr2	pos2	type
10	132635667	10	132636051	INV
18	77309929	18	77312095	DEL
10	132988685	10	132991206	DEL
10	132858454	10	132858819	DEL
5	26796704	5	26801897	DEL
5	147553039	5	147554616	INV
20	3821170	20	3825120	DEL
6	26625483	7	68758443	TRA
6	161336425	7	85956546	TRA
1	42552553	4	44842163	TRA
4	73831211	4	73831818	DEL
8	59616000	16	3354097	TRA
8	30145409	17	7167951	TRA
3	158034493	6	32688592	TRA
8	140475500	12	58359059	TRA
11	99185461	11	99186696	DEL
16	33485944	16	33486280	DEL
3	12818457	5	144122990	TRA
3	105828859	5	141379626	TRA
8	96265720	19	18835613	TRA
6	32315438	6	32316258	DEL
10	55893654	10	55894125	DEL
7	97993595	7	97993987	DEL
5	53122773	5	53125484	INV
6	65022877	6	65023371	DUP
19	15046341	19	15049471	DEL
1	105428633	7	93357413	TRA
1	91151631	8	85437297	TRA
13	38071947	13	38085574	DEL
1	64897140	6	159204434	TRA
2	156774338	2	156776256	DEL
14	23105069	14	23107950	DEL
21	32956225	X	47183861	TRA
8	16821879	8	16822259	DEL
8	140475502	11	56303340	TRA
3	124936235	3	124937163	DEL
7	98015910	X	136092975	TRA
7	127930431	16	76865795	TRA
11	106143090	11	106143794	INV
6	37294925	6	37295284	DEL
2	179315148	2	179315689	DEL
4	162642267	X	3599701	TRA
4	162642407	X	3599706	TRA
4	144573271	4	144573612	DEL
7	86615393	7	86615759	DEL
2	48990532	2	48991191	DEL
X	114216686	X	114544524	INV
2	160095376	2	160095824	INV
17	46615627	17	46617222	DUP
17	45634774	17	45635284	DEL
20	62949719	20	62959202	DEL
2	18118870	2	18120031	DEL
10	59257660	10	59257985	INV
9	127885505	18	71711520	TRA
10	51019958	12	46175132	TRA
10	59256942	10	59257951	INV
10	68673027	16	59976476	TRA
7	100056291	7	129157154	DUP
5	37709852	7	8663298	TRA
3	129763389	3	129806742	DEL
5	54865791	10	75489275	TRA
5	54865801	10	75489000	TRA
3	144517821	3	144518457	DEL
5	103062313	5	103062635	DEL
6	74932726	6	74933069	DEL
2	189119618	2	189120979	DEL
16	13294470	16	13296490	DEL
6	72863847	6	72873539	DEL
4	81136688	6	68923562	TRA
20	61724700	20	61725614	DEL
4	99513602	6	32589570	TRA
6	136589486	6	136590574	DEL
17	70815221	17	70821355	DEL
17	68159938	17	68160278	DEL
10	35593223	10	35593548	DEL
4	88268261	4	88274334	DEL
10	45158118	10	45158533	DEL
14	90299534	14	90302487	INV
9	141058509	10	107209	TRA
3	151748833	3	176444683	INV
1	92232065	1	92233362	DEL
22	19099927	22	19100621	DEL
22	17770355	22	17779150	DEL
3	32203783	3	32204153	DEL
13	35787786	X	11952984	TRA
14	106484224	15	22486809	TRA
2	19002880	2	19003387	DEL
X	55702382	X	55709885	DEL
4	102787795	4	102788358	DEL
12	30478280	12	30480988	DEL
15	75867566	16	89281701	TRA
4	186382139	9	129005120	TRA
4	183256660	8	131547788	TRA
2	12019022	7	52399206	TRA
7	76134084	7	76140082	DEL
4	175534267	10	123120353	TRA
15	62706095	15	62707781	DEL
14	47118175	14	63226299	INV
12	12026417	12	12027146	DEL
14	60341404	14	60343237	DEL
14	61058056	14	61059493	DEL
6	17608998	X	117432517	TRA
5	108595090	5	108601127	DEL
11	93695221	11	93702091	DEL
2	34965732	2	34967261	DEL
2	34797601	2	34801579	DEL
6	74156485	14	71480241	TRA
7	151230203	7	151231867	DEL
7	156387047	7	156387226	INV
1	14436660	1	14438563	DUP
5	127336004	5	127336923	DEL
5	157223490	5	176652060	INV
5	1178285	5	1180725	DEL
3	190785116	3	190789319	DEL
11	97172221	11	97172970	DEL
14	80106294	14	80115045	DEL
14	65842539	14	65843134	INV
16	69854786	16	69859026	DUP
15	39744398	15	39744849	DEL
7	65857652	7	65860106	DEL
1	43694066	1	43695538	DEL
1	44059282	1	44059890	INV
9	104714849	9	104724476	DEL
9	104182136	9	104182429	DUP
7	70420972	7	70438890	INV
6	89921735	6	89922171	DEL
3	182299013	9	1940734	TRA
5	157223548	11	3760878	TRA
3	192376521	10	65545580	TRA
3	48372309	7	32225987	TRA
3	38399708	8	75876952	TRA
5	95966521	5	95967361	DEL
6	107307808	8	105231718	TRA
3	182298978	11	94948981	TRA
3	75960769	11	130675918	TRA
6	37295025	12	22085955	TRA
4	151011309	4	151011648	DUP
6	20169115	6	108322150	DUP
9	139427511	9	139427797	DEL
13	74915300	13	74916746	DEL
1	168024578	19	24033135	TRA
2	125766561	2	125768399	DUP
2	120417073	2	120418454	DUP
14	32953296	14	32954345	DEL
7	93541820	7	93542546	DEL
8	11245570	8	11247212	DEL
7	111053752	12	108203254	TRA
1	234805693	16	59323740	TRA
1	80794627	1	80795137	INV
9	110033442	9	110035532	DEL
1	80221789	1	80223032	DEL
1	66804423	13	59377693	TRA
1	221827800	13	61315891	TRA
1	119401195	15	51189306	TRA
16	85302496	16	85304389	DEL
8	118980771	8	118981151	DEL
3	54428366	12	28226427	TRA
18	39585688	18	39586313	DEL
3	184156702	20	231409	TRA
13	89421953	13	89422932	DEL
5	169597700	5	169598748	INV
2	76773562	2	76775444	DEL
5	178109055	5	178113407	DEL
10	87242583	10	87243046	DUP
8	14588058	8	14588822	DEL
19	51077891	19	51082521	DEL
2	78091959	4	174044216	TRA
2	204273805	4	68944782	TRA
5	176651964	11	3760899	TRA
5	5595231	15	52589534	TRA
1	28515659	19	24027918	TRA
2	153997618	17	74377266	TRA
12	104359630	12	125801144	INV
2	178351470	19	52567638	TRA
2	178351450	19	52567370	TRA
2	77358259	18	59713754	TRA
14	42486317	14	42486634	DEL
14	41829108	14	41980350	DEL
5	53122606	5	53125511	INV