changeset 2:aea952be68cb draft

"planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit cd8f633245d53cf47eaf860a4e0ae8d806c34419"
author artbio
date Wed, 16 Sep 2020 22:58:28 +0000
parents 921c1f55481d
children e332cf9dfa06
files mutational_patterns.R mutational_patterns.xml test-data/EGF037F.vcf test-data/EGF089.vcf test-data/EGF167.vcf test-data/F.vcf test-data/FGHI_levels.tab test-data/G.vcf test-data/GH_levels.tab test-data/H.vcf test-data/I.vcf test-data/cosmic_output1.pdf test-data/denovo_output1.pdf test-data/levels.tab test-data/output.pdf test-data/spectrum_output1.pdf
diffstat 16 files changed, 21066 insertions(+), 13272 deletions(-) [+]
line wrap: on
line diff
--- a/mutational_patterns.R	Sun Sep 13 22:27:03 2020 +0000
+++ b/mutational_patterns.R	Wed Sep 16 22:58:28 2020 +0000
@@ -5,8 +5,8 @@
 warnings()
 library(optparse)
 library(rjson)
-library(MutationalPatterns)
-library(ggplot2)
+library(grid)
+library(gridExtra)
 
 # Arguments
 option_list = list(
@@ -35,7 +35,38 @@
     help = "selects the N most significant signatures in samples to express mutational patterns"
   ),
   make_option(
-    "--output",
+    "--nrun",
+    default = 2,
+    type = 'integer',
+    help = "Number of runs to fit signatures"
+  ),
+  make_option(
+    "--rank",
+    default = 2,
+    type = 'integer',
+    help = "number of ranks to display for parameter optimization"
+  ),
+    make_option(
+    "--newsignum",
+    default = 2,
+    type = 'integer',
+    help = "Number of new signatures to be captured"
+  ),
+
+  make_option(
+    "--output_spectrum",
+    default = NA,
+    type = 'character',
+    help = "path to output dataset"
+  ),
+  make_option(
+    "--output_denovo",
+    default = NA,
+    type = 'character',
+    help = "path to output dataset"
+  ),
+  make_option(
+    "--output_cosmic",
     default = NA,
     type = 'character',
     help = "path to output dataset"
@@ -45,82 +76,214 @@
 opt = parse_args(OptionParser(option_list = option_list),
                  args = commandArgs(trailingOnly = TRUE))
 
+################ Manage input data ####################
 json_dict <- opt$inputs
 parser <- newJSONParser()
 parser$addData(json_dict)
 fileslist <- parser$getObject()
 vcf_files <- attr(fileslist, "names")
 sample_names <- unname(unlist(fileslist))
-pdf(opt$output, paper = "special", width = 11.69, height = 11.69)
 ref_genome <- opt$genome
+vcf_table <- data.frame(sample_name=sample_names, path=vcf_files)
+
+library(MutationalPatterns)
 library(ref_genome, character.only = TRUE)
 
 # Load the VCF files into a GRangesList:
 vcfs <- read_vcfs_as_granges(vcf_files, sample_names, ref_genome)
-levels_table  <- read.delim(opt$levels, header=FALSE, col.names=c("sample_name","level"))
-vcf_table <- data.frame(path=vcf_files, sample_name=sample_names)
-metadata_table <- merge(vcf_table, levels_table, by.x=2, by.y=1)
-levels <- metadata_table$level
-muts = mutations_from_vcf(vcfs[[1]])
-types = mut_type(vcfs[[1]])
-context = mut_context(vcfs[[1]], ref_genome)
-type_context = type_context(vcfs[[1]], ref_genome)
-type_occurrences <- mut_type_occurrences(vcfs, ref_genome)
-# p1 <- plot_spectrum(type_occurrences)
-# p2 <- plot_spectrum(type_occurrences, CT = TRUE)
-# p3 <- plot_spectrum(type_occurrences, CT = TRUE, legend = FALSE)
-# 
-# plot(p2)
-# p4 <- plot_spectrum(type_occurrences, by = levels, CT = TRUE, legend = TRUE)
-# palette <- c("pink", "orange", "blue", "lightblue", "green", "red", "purple")
-# p5 <- plot_spectrum(type_occurrences, CT=TRUE, legend=TRUE, colors=palette)
-# 
-# plot(p4)
+if (!is.na(opt$levels)[1]) {  # manage levels if there are
+    levels_table  <- read.delim(opt$levels, header=FALSE, col.names=c("sample_name","level"))
+    library(dplyr)
+    metadata_table <- left_join(vcf_table, levels_table, by = "sample_name")
+#    detach("package:dplyr", unload=TRUE)
+    tissue <- metadata_table$level
+}
+
+##### This is done for any section ######
 mut_mat <- mut_matrix(vcf_list = vcfs, ref_genome = ref_genome)
-# plot_96_profile(mut_mat[,1:length(as.data.frame(mut_mat))], condensed = TRUE)
-mut_mat <- mut_mat + 0.0001
-# library("NMF")
-# estimate <- nmf(mut_mat, rank=2:5, method="brunet", nrun=100, seed=123456)
-# plot(estimate)
-# nmf_res <- extract_signatures(mut_mat, rank = 4, nrun = 100)
-# colnames(nmf_res$signatures) <- c("Signature A", "Signature B", "Signature C", "Signature D")
-# rownames(nmf_res$contribution) <- c("Signature A", "Signature B", "Signature C", "Signature D")
-# plot_96_profile(nmf_res$signatures, condensed = TRUE)
-sp_url <- paste("https://cancer.sanger.ac.uk/cancergenome/assets/", "signatures_probabilities.txt", sep = "")
-cancer_signatures = read.table(sp_url, sep = "\t", header = TRUE)
-new_order = match(row.names(mut_mat), cancer_signatures$Somatic.Mutation.Type)
-cancer_signatures = cancer_signatures[as.vector(new_order),]
-row.names(cancer_signatures) = cancer_signatures$Somatic.Mutation.Type
-cancer_signatures = as.matrix(cancer_signatures[,4:33])
-# plot_96_profile(cancer_signatures, condensed = TRUE, ymax = 0.3)
-hclust_cosmic = cluster_signatures(cancer_signatures, method = "average")
-cosmic_order = colnames(cancer_signatures)[hclust_cosmic$order]
-# plot(hclust_cosmic)
-cos_sim(mut_mat[,1], cancer_signatures[,1])
-cos_sim_samples_signatures = cos_sim_matrix(mut_mat, cancer_signatures)
-plot_cosine_heatmap(cos_sim_samples_signatures, col_order = cosmic_order, cluster_rows = TRUE)
-fit_res <- fit_to_signatures(mut_mat, cancer_signatures)
-threshold <- tail(sort(unlist(rowSums(fit_res$contribution), use.names = FALSE)), opt$signum)[1]
-select <- which(rowSums(fit_res$contribution) >= threshold) # ensure opt$signum best signatures in samples are retained, the others discarded
-plot_contribution(fit_res$contribution[select,], cancer_signatures[,select], coord_flip = T, mode = "absolute")
-plot_contribution(fit_res$contribution[select,], cancer_signatures[,select], coord_flip = T, mode = "relative")
-plot_contribution_heatmap(fit_res$contribution, cluster_samples = TRUE, method = "complete")
 
 
-sig5data <- as.data.frame(t(head(fit_res$contribution[select,])))
-colnames(sig5data) <- gsub("nature", "", colnames(sig5data))
-sig5data_percents <- sig5data / (apply(sig5data,1,sum)) * 100
-sig5data_percents$sample <- rownames(sig5data_percents)
-library(reshape2)
-melted_sig5data_percents <-melt(data=sig5data_percents)
-melted_sig5data_percents$label <- sub("Sig.", "", melted_sig5data_percents$variable)
-melted_sig5data_percents$pos <- cumsum(melted_sig5data_percents$value) - melted_sig5data_percents$value/2
-ggplot(melted_sig5data_percents, aes(x="", y=value, group=variable, fill=variable)) +
-  geom_bar(width = 1, stat = "identity") +
-  geom_text(aes(label = label), position = position_stack(vjust = 0.5), color="black", size=3) +
-  coord_polar("y", start=0) + facet_wrap(~ sample) +
-  labs(x="", y="Samples", fill = "Signatures (Cosmic_v2,March 2015)") +
-    theme(axis.text = element_blank(),
-        axis.ticks = element_blank(),
-        panel.grid  = element_blank())
-dev.off()
+###### Section 1 Mutation characteristics and spectrums #############
+if (!is.na(opt$output_spectrum)[1]) {
+    pdf(opt$output_spectrum, paper = "special", width = 11.69, height = 11.69)
+    type_occurrences <- mut_type_occurrences(vcfs, ref_genome)
+    
+    # mutation spectrum, total or by sample
+    
+    if (is.na(opt$levels)[1]) {
+        p1 <- plot_spectrum(type_occurrences, CT = TRUE, legend=TRUE)
+        plot(p1)
+    } else {
+        p2 <- plot_spectrum(type_occurrences, by = tissue, CT=TRUE, legend=TRUE) # by sample
+        p3 <- plot_spectrum(type_occurrences, CT=TRUE, legend=TRUE) # total
+        grid.arrange(p2, p3, ncol=2, widths=c(4,2.3), heights=c(4,1))
+    }
+    plot_96_profile(mut_mat, condensed = TRUE)
+    dev.off()
+}
+
+###### Section 2: De novo mutational signature extraction using NMF #######
+if (!is.na(opt$output_denovo)[1]) {
+    mut_mat <- mut_mat + 0.0001 # First add a small psuedocount to the mutation count matrix
+    # Use the NMF package to generate an estimate rank plot
+    library("NMF")
+    estimate <- nmf(mut_mat, rank=1:opt$rank+1, method="brunet", nrun=opt$nrun, seed=123456)
+    # And plot it
+    pdf(opt$output_denovo, paper = "special", width = 11.69, height = 11.69)
+    p.trans <- plot(estimate)
+    grid.arrange(p.trans)
+    # Extract 4 (PARAMETIZE) mutational signatures from the mutation count matrix with extract_signatures
+    # (For larger datasets it is wise to perform more iterations by changing the nrun parameter
+    # to achieve stability and avoid local minima)
+    nmf_res <- extract_signatures(mut_mat, rank=opt$rank, nrun=opt$nrun)
+    # Assign signature names
+    colnames(nmf_res$signatures) <- paste0("NewSig_", 1:opt$rank)
+    rownames(nmf_res$contribution) <- paste0("NewSig_", 1:opt$rank)
+    # Plot the 96-profile of the signatures:
+    p.trans <- plot_96_profile(nmf_res$signatures, condensed = TRUE)
+    grid.arrange(p.trans)
+    # Visualize the contribution of the signatures in a barplot
+    pc1 <- plot_contribution(nmf_res$contribution, nmf_res$signature, mode="relative", coord_flip = TRUE)
+    # Visualize the contribution of the signatures in absolute number of mutations
+    pc2 <- plot_contribution(nmf_res$contribution, nmf_res$signature, mode="absolute", coord_flip = TRUE)
+    # Combine the two plots:
+    grid.arrange(pc1, pc2)
+        
+    # The relative contribution of each signature for each sample can also be plotted as a heatmap with
+    # plot_contribution_heatmap, which might be easier to interpret and compare than stacked barplots.
+    # The samples can be hierarchically clustered based on their euclidean dis- tance. The signatures
+    # can be plotted in a user-specified order.
+    # Plot signature contribution as a heatmap with sample clustering dendrogram and a specified signature order:
+    pch1 <- plot_contribution_heatmap(nmf_res$contribution,
+                                      sig_order = paste0("NewSig_", 1:opt$rank))
+    # Plot signature contribution as a heatmap without sample clustering:
+    pch2 <- plot_contribution_heatmap(nmf_res$contribution, cluster_samples=FALSE)
+    #Combine the plots into one figure:
+    grid.arrange(pch1, pch2, ncol = 2, widths = c(2,1.6))
+    
+    # Compare the reconstructed mutational profile with the original mutational profile:   
+    plot_compare_profiles(mut_mat[,1],
+                          nmf_res$reconstructed[,1],
+                          profile_names = c("Original", "Reconstructed"),
+                          condensed = TRUE)
+    dev.off()
+}
+##### Section 3: Find optimal contribution of known signatures: COSMIC mutational signatures ####
+
+if (!is.na(opt$output_cosmic)[1]) {
+    pdf(opt$output_cosmic, paper = "special", width = 11.69, height = 11.69)
+    sp_url <- paste("https://cancer.sanger.ac.uk/cancergenome/assets/", "signatures_probabilities.txt", sep = "")
+    cancer_signatures = read.table(sp_url, sep = "\t", header = TRUE)
+    mut_mat <- mut_mat + 0.0001 # First add a small psuedocount to the mutation count matrix
+    new_order = match(row.names(mut_mat), cancer_signatures$Somatic.Mutation.Type)
+    cancer_signatures = cancer_signatures[as.vector(new_order),]
+    row.names(cancer_signatures) = cancer_signatures$Somatic.Mutation.Type
+    cancer_signatures = as.matrix(cancer_signatures[,4:33])
+    
+    # Plot mutational profiles of the COSMIC signatures
+    colnames(cancer_signatures) <- gsub("Signature.", "", colnames(cancer_signatures)) # shorten signature labels
+    p.trans <- plot_96_profile(cancer_signatures, condensed = TRUE, ymax = 0.3)
+    grid.arrange(p.trans, top = textGrob("COSMIC signature profiles",gp=gpar(fontsize=12,font=3)))
+
+    # Hierarchically cluster the COSMIC signatures based on their similarity with average linkage
+    # hclust_cosmic = cluster_signatures(cancer_signatures, method = "average")
+    # store signatures in new order
+    # cosmic_order = colnames(cancer_signatures)[hclust_cosmic$order]
+    # plot(hclust_cosmic)
+    
+    # Similarity between mutational profiles and COSMIC signatures
+    
+    
+    # The similarity between each mutational profile and each COSMIC signature, can be calculated
+    # with cos_sim_matrix, and visualized with plot_cosine_heatmap. The cosine similarity reflects
+    # how well each mutational profile can be explained by each signature individually. The advantage
+    # of this heatmap representation is that it shows in a glance the similarity in mutational
+    # profiles between samples, while at the same time providing information on which signatures
+    # are most prominent. The samples can be hierarchically clustered in plot_cosine_heatmap.
+    # The cosine similarity between two mutational profiles/signatures can be calculated with cos_sim :
+    # cos_sim(mut_mat[,1], cancer_signatures[,1])
+    
+    # Calculate pairwise cosine similarity between mutational profiles and COSMIC signatures
+    
+    # cos_sim_samples_signatures = cos_sim_matrix(mut_mat, cancer_signatures)
+    # Plot heatmap with specified signature order
+    # p.trans <- plot_cosine_heatmap(cos_sim_samples_signatures, col_order = cosmic_order, cluster_rows = TRUE)
+    # grid.arrange(p.trans)
+    
+    # Find optimal contribution of COSMIC signatures to reconstruct 96 mutational profiles
+    fit_res <- fit_to_signatures(mut_mat, cancer_signatures)
+
+    # Select signatures with some contribution (above a threshold)
+    threshold <- tail(sort(unlist(rowSums(fit_res$contribution), use.names = FALSE)), opt$signum)[1]
+    select <- which(rowSums(fit_res$contribution) >= threshold) # ensure opt$signum best signatures in samples are retained, the others discarded
+    # Plot contribution barplots
+    pc1 <- plot_contribution(fit_res$contribution[select,], cancer_signatures[,select], coord_flip = T, mode = "absolute")
+    pc2 <- plot_contribution(fit_res$contribution[select,], cancer_signatures[,select], coord_flip = T, mode = "relative")
+    # Combine the two plots:
+    grid.arrange(pc1, pc2)
+    ## pie charts of comic signatures contributions in samples
+    
+    sig_data_pie <- as.data.frame(t(head(fit_res$contribution[select,])))
+    colnames(sig_data_pie) <- gsub("nature", "", colnames(sig_data_pie))
+    sig_data_pie_percents <- sig_data_pie / (apply(sig_data_pie,1,sum)) * 100
+    sig_data_pie_percents$sample <- rownames(sig_data_pie_percents)
+    library(reshape2)
+    melted_sig_data_pie_percents <-melt(data=sig_data_pie_percents)
+    melted_sig_data_pie_percents$label <- sub("Sig.", "", melted_sig_data_pie_percents$variable)
+    melted_sig_data_pie_percents$pos <- cumsum(melted_sig_data_pie_percents$value) - melted_sig_data_pie_percents$value/2
+    library(ggplot2)
+    p.trans <-  ggplot(melted_sig_data_pie_percents, aes(x="", y=value, group=variable, fill=variable)) +
+                       geom_bar(width = 1, stat = "identity") +
+                       geom_text(aes(label = label), position = position_stack(vjust = 0.5), color="black", size=3) +
+                       coord_polar("y", start=0) + facet_wrap(~ sample) +
+                       labs(x="", y="Samples", fill = "Signatures (Cosmic_v2,March 2015)") +
+                       theme(axis.text = element_blank(),
+                             axis.ticks = element_blank(),
+                             panel.grid  = element_blank())
+    grid.arrange(p.trans)
+
+    # Plot relative contribution of the cancer signatures in each sample as a heatmap with sample clustering
+    p.trans <- plot_contribution_heatmap(fit_res$contribution, cluster_samples = TRUE, method = "complete")
+    grid.arrange(p.trans)
+
+    # Compare the reconstructed mutational profile of sample 1 with its original mutational profile
+    # plot_compare_profiles(mut_mat[,1], fit_res$reconstructed[,1],
+    #                       profile_names = c("Original", "Reconstructed"),
+    #                       condensed = TRUE)
+    
+    # Calculate the cosine similarity between all original and reconstructed mutational profiles with
+    # `cos_sim_matrix`
+    
+    # calculate all pairwise cosine similarities
+    cos_sim_ori_rec <- cos_sim_matrix(mut_mat, fit_res$reconstructed)
+    # extract cosine similarities per sample between original and reconstructed
+    cos_sim_ori_rec <- as.data.frame(diag(cos_sim_ori_rec))
+    
+    # We can use ggplot to make a barplot of the cosine similarities between the original and
+    # reconstructed mutational profile of each sample. This clearly shows how well each mutational
+    # profile can be reconstructed with the COSMIC mutational signatures. Two identical profiles
+    # have a cosine similarity of 1. The lower the cosine similarity between original and
+    # reconstructed, the less well the original mutational profile can be reconstructed with
+    # the COSMIC signatures. You could use, for example, cosine similarity of 0.95 as a cutoff.
+    
+    # Adjust data frame for plotting with gpplot
+    colnames(cos_sim_ori_rec) = "cos_sim"
+    cos_sim_ori_rec$sample = row.names(cos_sim_ori_rec)
+    # Make barplot
+    p.trans <- ggplot(cos_sim_ori_rec, aes(y=cos_sim, x=sample)) +
+                      geom_bar(stat="identity", fill = "skyblue4") +
+                      coord_cartesian(ylim=c(0.8, 1)) +
+                      # coord_flip(ylim=c(0.8,1)) +
+                      ylab("Cosine similarity\n original VS reconstructed") +
+                      xlab("") +
+                      # Reverse order of the samples such that first is up
+                      # xlim(rev(levels(factor(cos_sim_ori_rec$sample)))) +
+                      theme_bw() +
+                      theme(panel.grid.minor.y=element_blank(),
+                      panel.grid.major.y=element_blank()) +
+                      # Add cut.off line
+                      geom_hline(aes(yintercept=.95))
+    grid.arrange(p.trans, top = textGrob("Similarity between true and reconstructed profiles (with all Cosmic sig.)",gp=gpar(fontsize=12,font=3)))    
+    
+    dev.off()
+}
--- a/mutational_patterns.xml	Sun Sep 13 22:27:03 2020 +0000
+++ b/mutational_patterns.xml	Wed Sep 16 22:58:28 2020 +0000
@@ -1,10 +1,11 @@
-<tool id="mutational_patterns" name="Analyse Mutational Patters/Signatures" version="2.0.0_galaxy_2">
+<tool id="mutational_patterns" name="Analyse Mutational Patters/Signatures" version="2.0.0+galaxy3">
     <description>from genomic variations in vcf files</description>
     <requirements>
         <requirement type="package" version="2.0.0=r40_0">bioconductor-mutationalpatterns</requirement>
         <requirement type="package" version="1.6.6=r40h6115d3f_1">r-optparse</requirement>
         <requirement type="package" version="0.2.20=r40h0357c0b_1002">r-rjson</requirement>
         <requirement type="package" version="0.21.0=r40h0357c0b_1004">r-nmf</requirement>
+        <requirement type="package" version="2.3=r40h6115d3f_1003">r-gridextra</requirement>
         <requirement type="package" version="1.4.3=r40_0">bioconductor-bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38</requirement>
         <requirement type="package" version="0.99.1=r40_4">bioconductor-bsgenome.hsapiens.1000genomes.hs37d5</requirement>
         <requirement type="package" version="1.4.3=r40_0">bioconductor-bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19</requirement>
@@ -28,9 +29,26 @@
     #end for
     '#echo json.dumps(filename_to_element_identifiers)#'
     --genome '$genome'
-    --levels '$levels'
-    --signum '$signum'
-    --output '$output'
+    
+    #if $set_levels.choices == 'yes':
+      --levels '$set_levels.levels'
+    #end if
+
+    #if $set_spectrum.choices == 'yes':
+        --output_spectrum $spectrum
+    #end if
+    
+    #if $set_denovo.choices == 'yes':
+        --nrun $set_denovo.nrun
+        --rank $set_denovo.rank
+        --newsignum $set_denovo.newsignum
+        --output_denovo $denovo
+    #end if
+
+    #if $set_cosmic.choices == 'yes':
+        --signum '$set_cosmic.signum'
+        --output_cosmic $cosmic
+    #end if
             
 ]]></command>
     <inputs>
@@ -43,38 +61,143 @@
             <!--<option value="BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10">BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10</option>
             <option value="BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9">BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9</option>-->
         </param>
-        <param name="levels" type="data" format="tabular"
-               label="A two-column tab-separated file describing levels attributed to each sample name"
-               help="Tip: the sample name list in the vcf collection can be obtained using
-               the IUC Galaxy tool 'Extract element identifiers of a list collection' &lt;br&gt;
-               example:&lt;br&gt;
-               sample1 female&lt;br&gt;
-               sample2 female&lt;br&gt;
-               sample3 male&lt;br&gt;
-               sample4 female&lt;br&gt;
-               sample5 male&lt;br&gt;
-               sample5 male" />
-        <param name="signum" type="integer" value="2" min="2" max="30"
-               label="selects the N most significant signatures in samples to express mutational patterns"
-               help="an integer between 2 and 30 signature types from cosmic"/>
+        <conditional name="set_levels">
+            <param name="choices" type="select" label="samples have levels/labels for grouping them in the analysis" display="radio"
+                   help="for instance, female/male or genotype-1/genotype-2/genotype-3, etc.">
+                <option value="no" selected="true">No</option>
+                <option value="yes">Yes</option>
+            </param>
+            <when value="yes">
+                <param name="levels" type="data" format="tabular"
+                       label="A two-column tab-separated file describing levels attributed to each sample name"
+                       help="Tip: the sample name list in the vcf collection can be obtained using
+                       the IUC Galaxy tool 'Extract element identifiers of a list collection' &lt;br&gt;
+                       example:&lt;br&gt;
+                       sample1 female&lt;br&gt;
+                       sample2 female&lt;br&gt;
+                       sample3 male&lt;br&gt;
+                       sample4 female&lt;br&gt;
+                       sample5 male&lt;br&gt;
+                       sample5 male" />
+            </when>
+            <when value="no" />
+        </conditional>
+        <conditional name="set_spectrum">
+            <param name="choices" type="select" label="Analyse Mutational Spectrum" display="radio">
+                <option value="yes" selected="true">Yes</option>
+                <option value="no">No</option>
+            </param>
+            <when value="yes" />
+            <when value="no" />
+        </conditional>
+        <conditional name="set_denovo">
+            <param name="choices" type="select" label="Extract de novo signatures with MutationalPatterns" display="radio">
+                <option value="yes" selected="true">Yes</option>
+                <option value="no">No</option>
+            </param>
+            <when value="yes">
+                <param name="nrun" type="integer" value="10" min="10" max="200"
+                       label="Number of cycles to find best fitting of signatures"
+                       help="High values extend the computational time"/>
+                <param name="rank" type="integer" value="4" min="3" max="30"
+                       label="Number of ranks to be displayed for control of optimal number of signature"
+                       help="High values extend the computational time"/>
+                <param name="newsignum" type="integer" value="4" min="2" max="30"
+                       label="Number of de novo signatures to capture"
+                       help="High values extend the computational time"/>
+            </when>
+            <when value="no" />
+        </conditional>
 
+        <conditional name="set_cosmic">
+            <param name="choices" type="select" label="Decompose with Cosmic signature v2" display="radio">
+                <option value="yes" selected="true">Yes</option>
+                <option value="no">No</option>
+            </param>
+            <when value="yes">
+                <param name="signum" type="integer" value="3" min="2" max="30"
+                       label="selects the N most significant signatures in samples to express mutational patterns"
+                       help="an integer between 2 and 30 signature types from cosmic"/>
+            </when>
+             <when value="no" />
+       </conditional>
     </inputs>
     <outputs>
-        <data name="output" format="pdf" label="Mutational Patterns/Signatures" />
+        <data name="spectrum" format="pdf" label="Mutational Spectrum">
+            <filter>set_spectrum['choices'] == "yes"</filter>
+        </data>
+        <data name="denovo" format="pdf" label="De novo signatures">
+            <filter>set_denovo['choices'] == "yes"</filter>
+        </data>
+        <data name="cosmic" format="pdf" label="Cosmic signatures">
+            <filter>set_cosmic['choices'] == "yes"</filter>
+        </data>
     </outputs>
     <tests>
         <test>
             <param name="vcfs">
                 <collection type="list">
-                    <element name="1" value="EGF167.vcf"/>
-                    <element name="2" value="EGF089.vcf"/>
-                    <element name="3" value="EGF037F.vcf"/>
+                    <element name="1" ftype="vcf" value="G.vcf"/>
+                    <element name="2" ftype="vcf" value="H.vcf"/>
+                </collection>
+            </param>
+            <param name="genome" value="BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38"/>
+            <param name="levels" value="GH_levels.tab" ftype="tabular"/>
+            <conditional name="set_spectrum">
+                <param name="choices" value="no"/>
+            </conditional>
+            <conditional name="set_denovo">
+                <param name="choices" value="no"/>
+            </conditional>
+            <conditional name="set_cosmic">
+                <param name="choices" value="yes"/>
+            </conditional>
+            <param name="signum" value="3" />
+            <output name="cosmic" file="cosmic_output1.pdf" compare="sim_size" ftype="pdf"/>
+        </test>
+        <test>
+            <param name="vcfs">
+                <collection type="list">
+                    <element name="6" value="F.vcf"/>
+                    <element name="7" value="G.vcf"/>
+                    <element name="8" value="H.vcf"/>
+                    <element name="9" value="I.vcf"/>
                 </collection>
             </param>
             <param name="genome" value="BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38"/>
-            <param name="levels" value="levels.tab" ftype="tabular"/>
-            <param name="signum" value="3" />
-            <output name="output" file="output.pdf" compare="sim_size" ftype="pdf"/>
+            <conditional name="set_spectrum">
+                <param name="choices" value="no"/>
+            </conditional>
+            <conditional name="set_denovo">
+                <param name="choices" value="yes"/>
+            </conditional>
+            <conditional name="set_cosmic">
+                <param name="choices" value="no"/>
+            </conditional>
+            <output name="denovo" file="denovo_output1.pdf" compare="sim_size" ftype="pdf"/>
+        </test>
+        <test>
+            <param name="vcfs">
+                <collection type="list">
+                    <element name="1" ftype="vcf" value="G.vcf"/>
+                    <element name="2" ftype="vcf" value="H.vcf"/>
+                </collection>
+            </param>
+            <param name="genome" value="BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38"/>
+            <conditional name="set_levels">
+                <param name="choices" value="yes"/>
+            </conditional>
+            <param name="levels" value="GH_levels.tab" ftype="tabular"/>
+            <conditional name="set_spectrum">
+                <param name="choices" value="yes"/>
+            </conditional>
+            <conditional name="set_denovo">
+                <param name="choices" value="no"/>
+            </conditional>
+            <conditional name="set_cosmic">
+                <param name="choices" value="no"/>
+            </conditional>
+            <output name="spectrum" file="spectrum_output1.pdf" compare="sim_size" ftype="pdf"/>
         </test>
     </tests>
     <help>
--- a/test-data/EGF037F.vcf	Sun Sep 13 22:27:03 2020 +0000
+++ /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
@@ -1,4331 +0,0 @@
-##fileformat=VCFv4.2
-##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed">
-##reference=hg38
-##source=varscan.py
-##contig=<ID=chr1,length=248956422>
-##contig=<ID=chr10,length=133797422>
-##contig=<ID=chr11,length=135086622>
-##contig=<ID=chr12,length=133275309>
-##contig=<ID=chr13,length=114364328>
-##contig=<ID=chr14,length=107043718>
-##contig=<ID=chr15,length=101991189>
-##contig=<ID=chr16,length=90338345>
-##contig=<ID=chr17,length=83257441>
-##contig=<ID=chr18,length=80373285>
-##contig=<ID=chr19,length=58617616>
-##contig=<ID=chr2,length=242193529>
-##contig=<ID=chr20,length=64444167>
-##contig=<ID=chr21,length=46709983>
-##contig=<ID=chr22,length=50818468>
-##contig=<ID=chr3,length=198295559>
-##contig=<ID=chr4,length=190214555>
-##contig=<ID=chr5,length=181538259>
-##contig=<ID=chr6,length=170805979>
-##contig=<ID=chr7,length=159345973>
-##contig=<ID=chr8,length=145138636>
-##contig=<ID=chr9,length=138394717>
-##contig=<ID=chrM,length=16569>
-##contig=<ID=chrX,length=156040895>
-##contig=<ID=chrY,length=57227415>
-##filter="SOMATIC"
-##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL">
-##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total depth of quality bases">
-##INFO=<ID=SOMATIC,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates if record is a somatic mutation">
-##INFO=<ID=SS,Number=1,Type=String,Description="Somatic status of variant (0=Reference,1=Germline,2=Somatic,3=LOH, or 5=Unknown)">
-##INFO=<ID=SSC,Number=1,Type=String,Description="Somatic score in Phred scale (0-255) derived from somatic p-value">
-##INFO=<ID=GPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor+normal versus no variant for Germline calls">
-##INFO=<ID=SPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor versus normal for Somatic/LOH calls">
-##FILTER=<ID=str10,Description="Less than 10% or more than 90% of variant supporting reads on one strand">
-##FILTER=<ID=indelError,Description="Likely artifact due to indel reads at this position">
-##FILTER=<ID=VarCount,Description="Fewer than 4 variant-supporting reads">
-##FILTER=<ID=VarFreq,Description="Variant allele frequency below 0.05">
-##FILTER=<ID=VarAvgRL,Description="Average clipped length of variant-supporting reads < 90">
-##FILTER=<ID=VarReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
-##FILTER=<ID=VarDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
-##FILTER=<ID=VarMMQS,Description="Average mismatch quality sum for variant reads > 100">
-##FILTER=<ID=VarMapQual,Description="Average mapping quality of variant reads < 15">
-##FILTER=<ID=VarBaseQual,Description="Average base quality of variant reads < 15">
-##FILTER=<ID=Strand,Description="Strand representation of variant reads < 0.01">
-##FILTER=<ID=RefAvgRL,Description="Average clipped length of ref-supporting reads < 90">
-##FILTER=<ID=RefReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
-##FILTER=<ID=RefDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
-##FILTER=<ID=RefMapQual,Description="Average mapping quality of reference reads < 15">
-##FILTER=<ID=RefBaseQual,Description="Average base quality of ref-supporting reads < 15">
-##FILTER=<ID=RefMMQS,Description="Average mismatch quality sum for ref-supporting reads > 100">
-##FILTER=<ID=MMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) > 50">
-##FILTER=<ID=MinMMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) < 50">
-##FILTER=<ID=MapQualDiff,Description="Mapping quality difference (ref - var) > 50">
-##FILTER=<ID=MaxBAQdiff,Description="Average base quality difference (ref - var) > 50">
-##FILTER=<ID=ReadLenDiff,Description="Average supporting read length difference (ref - var) > 0.25">
-##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype code">
-##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality">
-##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
-##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele">
-##FORMAT=<ID=ADF,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the forward strand">
-##FORMAT=<ID=ADR,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the reverse strand">
-#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	TUMOR
-chr1	184576	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.019075;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:6,3:30,6
-chr1	269371	.	A	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.01875;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:21,3:19,5
-chr1	283183	.	C	G	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.0053658;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:21,8:22,2
-chr1	738332	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.043011;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:33,8:3,1
-chr1	738586	.	G	A	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=9.9539e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:57,13:25,5:32,8
-chr1	738733	.	T	C	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.016466;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:20,5:25,3
-chr1	1028545	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.043159;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,2:5,1
-chr1	1573439	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:0,2:0,1:0,1
-chr1	2071063	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.011351;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:10,1:4,5
-chr1	2342857	.	AT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.044297;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:6,2:12,3
-chr1	2671870	.	C	A	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.00012417;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,3:5,2
-chr1	2672087	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0012127;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:3,2:8,3
-chr1	3927491	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,6:4,3:4,3
-chr1	4079275	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.6102e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:13,9:8,6
-chr1	4173876	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0022746;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:11,8:10,2
-chr1	4318436	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:8,1:6,3
-chr1	4530714	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:5,2:2,1:3,1
-chr1	5796213	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.084408;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:16,3:8,2:8,1
-chr1	6641377	.	CAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.057118;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,7:7,6:7,1
-chr1	6926438	.	C	CTCTTTCTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,7:1,1:11,6
-chr1	7913728	.	GTT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033483;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,1:5,3
-chr1	8574368	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:1,1:5,7
-chr1	8852528	.	AAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0087276;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:4,5:7,4
-chr1	11854533	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,2:1,1:3,1
-chr1	12897156	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
-chr1	12939075	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.026469;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:5,1:9,6
-chr1	13046693	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.021584;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:5,1:5,3
-chr1	13150128	.	C	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,2:3,2
-chr1	13155510	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013014;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:3,2:7,5
-chr1	13369851	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.018596;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:18,4:9,3
-chr1	16164067	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020191;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,10:8,5:8,5
-chr1	16536071	.	G	A	0	PASS	DP=384;GPV=1;SPV=0.044443;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:148,19:78,12:70,7
-chr1	16550749	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.044689;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:22,6:15,6
-chr1	16560810	.	C	T	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.048505;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:96,16:48,9:48,7
-chr1	16564382	.	G	C	0	PASS	DP=354;GPV=1;SPV=0.030816;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:140,16:104,6:36,10
-chr1	16571744	.	C	T	0	PASS	DP=211;GPV=1;SPV=0.018301;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:86,17:47,8:39,9
-chr1	16571771	.	G	A	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.045999;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:92,17:45,9:47,8
-chr1	16576444	.	G	C	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.031308;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:80,15:31,3:49,12
-chr1	16577822	.	T	C	0	PASS	DP=176;GPV=1;SPV=0.025445;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:60,14:24,5:36,9
-chr1	16599312	.	C	T	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.037127;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:87,16:50,5:37,11
-chr1	16601408	.	T	C	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.042617;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:79,18:31,4:48,14
-chr1	16603496	.	C	T	0	PASS	DP=208;GPV=1;SPV=0.037802;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:85,15:47,8:38,7
-chr1	16618314	.	G	C	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.014024;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:86,16:38,6:48,10
-chr1	16624325	.	G	A	0	PASS	DP=354;GPV=1;SPV=0.023677;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:152:126,26:59,14:67,12
-chr1	16628633	.	A	G	0	PASS	DP=246;GPV=1;SPV=0.042221;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:95,20:51,10:44,10
-chr1	16656288	.	G	C	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.007124;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:64,19:31,13:33,6
-chr1	16674958	.	A	G	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.014272;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:71,10:39,9:32,1
-chr1	16708815	.	C	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0043049;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,16:12,11:17,5
-chr1	16733054	.	C	T	0	PASS	DP=269;GPV=1;SPV=0.039538;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:108,18:44,8:64,10
-chr1	16756749	.	A	G	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.045414;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:89,15:43,9:46,6
-chr1	16795485	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:7,2:0,5
-chr1	17257031	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:8,5:0,1
-chr1	18014818	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.016282;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:19,2:9,4
-chr1	19019158	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.2113e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:16,19:5,11:11,8
-chr1	19410476	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=6.5658e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:6,3:7,6
-chr1	19611469	.	A	ATTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,4:7,3:4,1
-chr1	22555088	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.13043;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,2:2,1:5,1
-chr1	22992252	.	CA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,3:2,1
-chr1	23826355	.	TTGG	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,2:5,2
-chr1	23881611	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00061448;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,3:3,3
-chr1	23979057	.	G	GT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,9:3,8:4,1
-chr1	24049441	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,2:3,1:4,1
-chr1	24196805	.	T	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.00761;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:2,7:1,3:1,4
-chr1	25464338	.	CTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:1,3:4,1
-chr1	27454650	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00011345;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:12,4:5,5
-chr1	28262621	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
-chr1	28540810	.	CTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0055741;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,6:3,1
-chr1	30054513	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.043924;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:11,4:8,2
-chr1	30480962	.	ATGTGTGTG	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0059154;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:4,5:0,1
-chr1	31255828	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.07563;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,1:10,3
-chr1	36962640	.	A	AAG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00074257;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,5:3,4
-chr1	37702951	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.022117;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,5:8,3
-chr1	40922013	.	G	GT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.223e-06;SS=2;SSC=59;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:10,6:8,6
-chr1	40998789	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.2959e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:4,3:9,10
-chr1	42355597	.	A	AAAAAAAAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.012694;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,7:2,2:5,5
-chr1	42819170	.	C	CGT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.026067;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:9,3:2,2
-chr1	42922001	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,2:4,1:3,1
-chr1	43117234	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.030658;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,3:15,1
-chr1	43461485	.	C	CTCTCTTTCTCTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0077055;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:1,4:5,2
-chr1	43817407	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.086154;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:0,1:6,1
-chr1	45774703	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.017094;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:1,2:4,1
-chr1	47097820	.	A	AT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.035434;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,3:7,1
-chr1	48980718	.	AATATATATATATATATATATATATATATATAT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0077399;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,2:1,4
-chr1	49370145	.	TTA	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0080525;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:9,5:10,4
-chr1	49972516	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.9869e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:11,10:10,6
-chr1	50729058	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04741;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,8:8,2:5,6
-chr1	51081004	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,4:1,1
-chr1	52093630	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.035721;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:4,3:2,1
-chr1	52266405	.	TAAA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.010883;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:2,2:1,3
-chr1	52964214	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,5:8,3
-chr1	55273567	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.029433;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,2:5,2
-chr1	56723946	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00051333;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:13,3:8,5
-chr1	57768175	.	T	TAA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0075758;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,5:1,4:0,1
-chr1	68047321	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0011582;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:10,6:9,2
-chr1	68213451	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,5:12,3:5,2
-chr1	68982123	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=6.6326e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,2:6,7
-chr1	70297287	.	A	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
-chr1	70647900	.	TAC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,2:5,2
-chr1	70981312	.	CTTCCTTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:2,2:14,2
-chr1	71155378	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00022877;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:11,6:13,5
-chr1	75302112	.	G	GTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:6,3:0,1
-chr1	76669544	.	T	TTTTTTTTA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00012488;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:5,6:7,4
-chr1	77304407	.	TTTC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,3:14,1
-chr1	78238004	.	C	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:3,1:2,1
-chr1	78690904	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,10:1,6:2,4
-chr1	79201821	.	A	AGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.036526;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:4,3:6,1
-chr1	79959408	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=4.6582e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:10,7:10,7
-chr1	83303544	.	C	CAAA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,6:0,3:1,3
-chr1	83359203	.	G	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,3:1,2:2,1
-chr1	84311332	.	T	TAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:6,5:4,1
-chr1	85296311	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.017385;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,3:1,3
-chr1	85536978	.	TATATATAC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.020557;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,2:5,4
-chr1	86200361	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:4,4:0,0
-chr1	88097222	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0007761;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:3,2:10,5
-chr1	89653369	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.4236e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,16:13,6:3,10
-chr1	90406935	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.065063;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:17,6:12,3
-chr1	91144703	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=5.0341e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,18:7,9:7,9
-chr1	91364001	.	T	TATGGAGGGGAACACATTGGGAC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013155;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,3:3,3
-chr1	92507111	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,3:11,1
-chr1	92814250	.	A	ATT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,4:5,3
-chr1	93998713	.	A	ATTTAT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.019226;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,7:8,2
-chr1	94295709	.	A	ATC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:7,3:5,1
-chr1	95074345	.	TC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016596;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:2,3:9,1
-chr1	96005255	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,3:4,2:1,1
-chr1	96140608	.	CT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.040043;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,5:1,4:0,1
-chr1	97362616	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0003089;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:12,5:13,7
-chr1	97904795	.	G	GTAT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00019093;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:8,5:6,5
-chr1	98348089	.	CT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,3:3,2
-chr1	100159600	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
-chr1	100358293	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=6.1031e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:11,4:8,7
-chr1	102966708	.	C	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031813;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:4,2:6,2
-chr1	104873363	.	GGAAAA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0081269;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,5:2,4:2,1
-chr1	105426794	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.049127;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,3:11,1
-chr1	105746932	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00065827;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:12,7:8,5
-chr1	106712000	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:4,2:6,3
-chr1	106812711	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00076161;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:4,6:4,5
-chr1	107049529	.	GGTT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:1,3:7,2
-chr1	108523875	.	TATATATATG	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:3,1:6,3
-chr1	108771460	.	AATAT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,3:9,1
-chr1	108772352	.	A	ATATC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.015732;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,3:4,1
-chr1	108954010	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.014656;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:7,6:6,2
-chr1	109852477	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00073537;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:7,5:8,2
-chr1	111062544	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=5.5082e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,4:4,5
-chr1	111227411	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.037551;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:14,4:10,1
-chr1	111615829	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.010926;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,4:4,3
-chr1	111908435	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.1845e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:10,10:7,6
-chr1	112474079	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0011868;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:2,3:5,8
-chr1	112484222	.	T	TATATATACAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,5:7,2:2,3
-chr1	113509914	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0005553;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:12,8:4,1
-chr1	113584966	.	C	CAATTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,2:8,2
-chr1	114205271	.	ATATATGTGAT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15966;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:5,2:12,1
-chr1	115791931	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00012315;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:4,2:9,6
-chr1	115792300	.	GTAGTA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.020719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,6:4,1:4,5
-chr1	116770414	.	G	GGAGAGAGA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:11,4:6,1
-chr1	117127034	.	T	TC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.022163;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:1,1:10,6
-chr1	118576067	.	C	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013155;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,1:3,5
-chr1	119265512	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011129;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,6:2,1
-chr1	119500265	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.011012;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,6:4,1
-chr1	120187664	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:7,3:6,4
-chr1	120456434	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0039871;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:8,3:6,9
-chr1	120458978	.	C	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
-chr1	120999034	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,1:6,3
-chr1	121016463	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.036704;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,1:16,3
-chr1	121049803	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.057887;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:13,1:14,4
-chr1	121447300	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=1.0919e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,13:7,8:5,5
-chr1	121741553	.	G	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:4,2:3,5
-chr1	122138830	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:0,0:13,4
-chr1	122284147	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.001014;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:9,2:17,11
-chr1	122333339	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.03926;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:19,6:11,2
-chr1	122382656	.	C	G	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.03683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:109,20:37,2:72,18
-chr1	122404413	.	G	T	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.035811;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:47,5:4,1
-chr1	123755350	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.03024;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:19,4:0,0
-chr1	124819577	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,2:6,4
-chr1	124862955	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,1:4,4
-chr1	124924067	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.12384;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,3:5,2:2,1
-chr1	124935455	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,0:9,4
-chr1	125141871	.	TTTC	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.018195;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:15,4:17,8
-chr1	143194701	.	C	T	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.042501;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:85,13:31,11:54,2
-chr1	143234677	.	G	A	0	PASS	DP=168;GPV=1;SPV=0.0080857;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:74,9:7,2:67,7
-chr1	143262456	.	G	A	0	PASS	DP=5138;GPV=1;SPV=0.049301;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2584:2270,265:755,71:1515,194
-chr1	143393078	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.013894;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,0:7,4
-chr1	144031996	.	GTT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051826;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:6,3:11,3
-chr1	144500177	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.049808;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
-chr1	144569911	.	CTGTGTG	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0049438;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,6:2,2:1,4
-chr1	144772388	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.020233;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:4,4:12,4
-chr1	145129856	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.728e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:8,5:9,10
-chr1	145259810	.	C	CAACATCA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.018191;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:12,2:8,4
-chr1	145986946	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.011858;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:4,15:2,13:2,2
-chr1	146136588	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:10,1:8,4
-chr1	146740554	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0052707;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,2:5,6
-chr1	147608330	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:4,3:2,1
-chr1	148560207	.	C	G	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.023176;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:37,6:21,2
-chr1	148838480	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr1	149080154	.	C	G	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.045884;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:54,10:22,1:32,9
-chr1	150453034	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.010243;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:9,6:4,2
-chr1	152234092	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,1:7,3
-chr1	152234093	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,1:7,3
-chr1	152234095	.	AGT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,1:6,3
-chr1	153917795	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0068571;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:10,3:9,3
-chr1	154024688	.	A	AT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,8:0,3:2,5
-chr1	154032950	.	GAAGAAAAGAA	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0048821;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:2,7:1,4:1,3
-chr1	155348913	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,3:2,2:2,1
-chr1	155422303	.	A	AT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,4:6,4
-chr1	156930100	.	T	TC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,9:2,7:4,2
-chr1	157349714	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:0,1:8,4
-chr1	157618389	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0044113;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:9,4:14,5
-chr1	157712211	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:4,5:2,1
-chr1	159075613	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.048497;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,3:8,1
-chr1	160735894	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:3,5:5,5
-chr1	160918153	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,2:13,3
-chr1	161064827	.	GAAAGAGAA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.048962;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:9,2:2,3
-chr1	161423322	.	TG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.13793;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:6,2:7,1
-chr1	161569065	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.03925;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,1:9,3
-chr1	161600163	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,3:2,3
-chr1	161658875	.	T	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.038053;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:19,8:14,1
-chr1	164065177	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.049522;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,1:15,3
-chr1	165581230	.	A	ACACATG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.013457;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:17,7:8,5
-chr1	167200851	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:10,2:2,2
-chr1	168110527	.	A	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,3:2,1
-chr1	168110531	.	AG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,3:4,1
-chr1	168933831	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,4:3,1
-chr1	169075433	.	A	AATATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
-chr1	169342576	.	GTA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034205;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,2:2,2
-chr1	170854867	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=5.5032e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:9,7:4,6
-chr1	171100237	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0001432;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:7,10:8,2
-chr1	171577770	.	C	CATA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0094953;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:7,6:0,2
-chr1	173340323	.	TAC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0070433;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,10:4,8:1,2
-chr1	173834744	.	T	TC	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,2:1,3
-chr1	174069508	.	A	AT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0099416;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:4,4:5,1
-chr1	174349588	.	AC	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.13514;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:11,2:6,1
-chr1	174634305	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.032072;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:4,5:12,4
-chr1	175547605	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.032243;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:9,3:4,1
-chr1	176122139	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,5:3,2
-chr1	177110790	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=7.8832e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:8,8:12,3
-chr1	177402840	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.13137;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:17,1:14,4
-chr1	178006272	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.08111;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:17,2:8,2
-chr1	178076750	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011728;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:7,7:6,3
-chr1	178574225	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,1:7,3
-chr1	178695883	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,4:10,1:7,3
-chr1	178975705	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,1:11,3
-chr1	179335015	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,6:4,5:0,1
-chr1	179462679	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=3.5908e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:6,6:10,7
-chr1	180350023	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,3:3,1:0,2
-chr1	180613394	.	GT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.024875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:8,4:7,6
-chr1	183773015	.	CAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,4:2,2
-chr1	184275120	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010777;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,2:6,4
-chr1	187288570	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.5724e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:9,6:10,9
-chr1	188474530	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0074494;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:6,5:5,2
-chr1	188886337	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.009828;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,8:4,2:8,6
-chr1	189686809	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,4:9,1:6,3
-chr1	191617509	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.10313;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,3:14,1
-chr1	194698876	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040809;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:10,5:4,3
-chr1	194895616	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:6,4:3,2:3,2
-chr1	195451267	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.019281;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,4:12,1
-chr1	195742125	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,4:4,2
-chr1	196759540	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,3:9,1
-chr1	197793654	.	AAG	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
-chr1	198440146	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,5:7,1:6,4
-chr1	201800444	.	T	TA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.0913e-06;SS=2;SSC=59;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:10,8:9,9
-chr1	204146286	.	A	AAGCTC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0024076;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:13,2:8,5
-chr1	205193870	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.062683;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:12,4:4,1
-chr1	207796693	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,7:4,2:2,5
-chr1	208200577	.	CTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:1,4:2,2
-chr1	210799575	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0027818;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:7,3:10,3
-chr1	211196099	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:8,4:6,2
-chr1	211496361	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
-chr1	211622573	.	CT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.022724;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,4:6,2:3,2
-chr1	212248907	.	GA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.014832;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:5,9:3,1
-chr1	215463441	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=1.1679e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:2,2:8,8
-chr1	216245470	.	T	TGAGAGAGA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:5,2:1,4
-chr1	217141024	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.064844;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:17,3:13,2
-chr1	218798280	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,4:2,3
-chr1	219409446	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,3:8,2
-chr1	219589948	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0049862;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:15,4:12,3
-chr1	222488807	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.044218;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:21,6:17,3
-chr1	222595802	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0036482;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,9:3,1:3,8
-chr1	223050053	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00072464;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,9:4,7:2,2
-chr1	223439757	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,5:3,3:6,2
-chr1	224102822	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.024795;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,3:8,1
-chr1	227315955	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.016809;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:9,5:2,1
-chr1	230038404	.	A	AAAGAAAG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,4:13,1:11,3
-chr1	230156233	.	A	AAG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:4,3:3,2
-chr1	232271499	.	A	ATCTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,1:8,3
-chr1	232759266	.	CTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.030046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,7:6,2:4,5
-chr1	234780250	.	T	C	0	PASS	DP=190;GPV=1;SPV=0.0024028;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:70,20:39,8:31,12
-chr1	235217432	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.025971;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:6,4:9,3
-chr1	235217437	.	C	CATATACATACATACACTCACAT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0022188;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,7:3,5:6,2
-chr1	235220795	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0015078;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:8,3:11,4
-chr1	235924960	.	CACACACAT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:3,2:1,2
-chr1	236390941	.	G	GTTATTATTATTATTATTA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.004257;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,9:3,5:1,4
-chr1	238891518	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.028362;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:8,2:16,3
-chr1	239249557	.	T	TTTTATTTATTTATTTATTTA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.002122;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,3:1,2
-chr1	239933754	.	GAAAGAAAGAAAGAA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:6,5:0,1
-chr1	240479086	.	TA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,6:2,5:1,1
-chr1	240812437	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.016795;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:7,6:4,1
-chr1	241235918	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.071698;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,2:10,3
-chr1	241705558	.	TA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,3:11,1
-chr1	241960337	.	A	AT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.024029;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:9,6:10,4
-chr1	243854312	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,1:6,4
-chr1	243972195	.	T	TC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:2,4:5,2
-chr1	245103006	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.016411;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,1:7,7
-chr1	245192248	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0025268;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:7,4:6,2
-chr1	245299320	.	GTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:8,2:2,2
-chr1	246535521	.	A	ATTTTCTTTTTTTTTTTC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,4:6,2
-chr1	246619881	.	ACT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.07108;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:4,1:11,2
-chr1	247837462	.	AAAAAG	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.021798;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:4,4:9,3
-chr1	248354980	.	GAATT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010107;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,3:8,2
-chr10	862256	.	T	TAA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0090299;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:2,2:1,2
-chr10	940012	.	AT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.013021;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,2:6,3
-chr10	1010151	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.041156;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:10,1:14,6
-chr10	1015706	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.032107;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,3:2,2
-chr10	1015709	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,3:2,2
-chr10	1015710	.	C	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:5,3:1,2
-chr10	1992884	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=8.0714e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,8:7,3
-chr10	2029107	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.015873;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:8,4:8,4
-chr10	2350964	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.038561;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,3:12,1
-chr10	2510784	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.032518;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,1:11,3
-chr10	2511571	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.012445;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:6,4:6,6
-chr10	2511572	.	T	TA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00534;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:6,4:6,6
-chr10	2536476	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.059705;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,2:9,2
-chr10	2561419	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=3.7015e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,18:9,8:5,10
-chr10	3252001	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
-chr10	3457411	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,1:2,5
-chr10	3771027	.	TTC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:10,3:4,7
-chr10	4209012	.	C	CAGAGAG	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,6:2,5:2,1
-chr10	4665375	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018307;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,13:3,11:1,2
-chr10	4738997	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:2,2:1,1:1,1
-chr10	5304010	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.078413;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,2:14,2
-chr10	6093178	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.016464;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:6,3:14,3
-chr10	8332995	.	CCTCTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.011858;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:1,2:3,3
-chr10	11497411	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01463;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,8:7,6:4,2
-chr10	11711365	.	AAAATAAATAAAT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010062;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:2,3:4,4
-chr10	12281275	.	T	TA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,2:9,2
-chr10	14008162	.	C	CTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,4:3,3:2,1
-chr10	15329629	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,2:0,1:1,1
-chr10	16546145	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=5.4215e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:6,7:8,12
-chr10	17223725	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.5134e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:4,4:11,12
-chr10	17628955	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0063217;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:4,1:7,8
-chr10	18634768	.	CA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037605;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:10,1:7,5
-chr10	19088536	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0019118;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,5:4,2
-chr10	19237572	.	ATATAATTATAATTATATAATTATATAAT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,2:4,2
-chr10	19292894	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,3:3,1:3,2
-chr10	19447041	.	AACACACACACACACACACACATACACAGACAC	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:8,4:6,2
-chr10	20072481	.	CAAAG	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,7:2,1
-chr10	21316823	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0091635;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:8,6:9,2
-chr10	21968504	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0033467;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:6,5:8,3
-chr10	22716451	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.042832;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:12,3:6,4
-chr10	23212778	.	T	TGA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,9:3,7:4,2
-chr10	24449324	.	AT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.042266;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:14,3:7,2
-chr10	24924710	.	G	GA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023752;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
-chr10	25303385	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0088503;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,4:11,3
-chr10	27685443	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:2,5:4,1
-chr10	27923993	.	A	AGG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020833;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,6:6,2
-chr10	28325998	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0046299;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:0,2:7,9
-chr10	28325999	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0033618;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,13:1,4:6,9
-chr10	28902067	.	ATATT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.01858;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,5:10,6
-chr10	29268495	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0098662;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:17,3:8,4
-chr10	29902732	.	T	TTATATA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:1,2:2,3
-chr10	31562426	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0041401;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,3:9,5
-chr10	32828458	.	AGAAGAAGAG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,2:2,2
-chr10	33077355	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,3:3,2:2,1
-chr10	34383705	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.082759;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,2:4,1:3,1
-chr10	34573738	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.012097;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:3,1:5,3
-chr10	35587354	.	GTCTCTCTCTCTCTCTCTC	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0056638;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,8:5,6:4,2
-chr10	35652253	.	CCCTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:1,0:9,4
-chr10	37030816	.	ATTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,4:4,1
-chr10	37641011	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=5.8393e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:5,6:5,5
-chr10	38129304	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013906;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,11:8,9:5,2
-chr10	38177616	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00028986;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:3,4:2,5
-chr10	38270480	.	C	CAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.034379;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:4,3:14,3
-chr10	38460833	.	GT	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.031786;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:12,6:16,2
-chr10	38528482	.	T	A	0	PASS	DP=197;GPV=1;SPV=0.02621;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:57,8:23,4:34,4
-chr10	38636396	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.079426;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:18,3:18,1
-chr10	38661131	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.019409;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:29,10:11,5
-chr10	38679100	.	C	CAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0033618;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,10:3,8:4,2
-chr10	38869089	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.037959;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,4:7,3:4,1
-chr10	38969052	.	A	ATAATT	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.035742;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,5:13,2:21,3
-chr10	39276187	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0013091;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:7,4:10,3
-chr10	41311337	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.015183;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:10,2:14,8
-chr10	41498724	.	A	G	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.0055633;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:71,10:60,8:11,2
-chr10	41498775	.	G	T	0	PASS	DP=263;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:106,12:77,7:29,5
-chr10	41584224	.	A	T	0	PASS	DP=477;GPV=1;SPV=0.0064468;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:229:199,30:145,22:54,8
-chr10	41588208	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.026691;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:12,2:8,4
-chr10	41589576	.	C	T	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.041092;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:4,4:46,3
-chr10	41883926	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.006408;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:15,1:7,7
-chr10	41904677	.	TTGGAA	T	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.004862;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:57,16:25,5:32,11
-chr10	41913976	.	C	A	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.02271;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:86,18:33,14:53,4
-chr10	42070560	.	C	T	0	PASS	DP=7830;GPV=1;SPV=0.025336;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:3811:3377,416:3054,375:323,41
-chr10	42130201	.	C	G	0	PASS	DP=467;GPV=1;SPV=0.01108;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:208,25:74,8:134,17
-chr10	42157887	.	G	A	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.043444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:50,11:32,7:18,4
-chr10	42157986	.	CAT	C	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.048686;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:91,16:57,12:34,4
-chr10	42315581	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:0,3:0,1:0,2
-chr10	42772046	.	GGC	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=1.4316e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,13:7,9:0,4
-chr10	42968800	.	TCAAAGACTATGATCATTTTTAAG	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0022404;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:12,4:5,2
-chr10	42968825	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0023621;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:10,4:9,2
-chr10	45836143	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.02714;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:11,7:14,1
-chr10	46363734	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,3:10,1
-chr10	46601432	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,4:10,1
-chr10	46786273	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.060295;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,1:13,3
-chr10	46786415	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0053319;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,11:14,6:12,5
-chr10	48300206	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.10989;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,2:2,1:1,1
-chr10	48920722	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00030577;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:11,6:11,4
-chr10	48953335	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.064595;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:15,4:4,1
-chr10	49104962	.	CAG	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:4,8:3,2
-chr10	49682597	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0001999;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:3,4:2,5
-chr10	50116473	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:11,3:3,2
-chr10	50164442	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,1:7,3
-chr10	50748900	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.036288;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,1:9,3
-chr10	51156323	.	A	ACACACACACACACACACC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0053105;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:4,4:5,1
-chr10	52939279	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.025045;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,2:10,2
-chr10	55084458	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040085;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
-chr10	55192730	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.031156;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,3:8,1
-chr10	55418614	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=4.965e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:10,6:8,6
-chr10	55537439	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.017193;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:19,3:8,5
-chr10	55894485	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00063544;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:9,8:12,4
-chr10	56911826	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=7.2622e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:4,7:8,7
-chr10	57270463	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.017674;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,5:8,3:2,2
-chr10	57509335	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0075758;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:0,6:0,3:0,3
-chr10	58946152	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.049659;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,2:14,3
-chr10	59748091	.	G	GT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.015939;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:13,6:3,1
-chr10	61048481	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00034257;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:13,5:8,10
-chr10	62430253	.	GT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:2,3:3,2
-chr10	63031554	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00026061;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:7,5:5,5
-chr10	63314956	.	G	GT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:9,6:1,1
-chr10	63742380	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024122;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:17,3:4,3
-chr10	64077470	.	T	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr10	64530430	.	A	ATG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.046752;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,6:4,1
-chr10	65555929	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:4,5:4,1
-chr10	66157510	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.19426;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,5:12,4:16,1
-chr10	66346234	.	TATATATATATATAGAGAGAGAGAGAGAG	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,4:1,1
-chr10	66767456	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,7:4,1
-chr10	67420280	.	AT	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00036759;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:11,7:16,5
-chr10	67762186	.	A	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,2:1,1:2,1
-chr10	69539382	.	A	AGAAGAGGAAGAG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.032869;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,2:0,2
-chr10	71926124	.	T	TTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.043382;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:2,2:9,2
-chr10	72448151	.	C	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
-chr10	74011165	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.030289;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:6,4:1,1
-chr10	74961333	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00043265;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:12,6:5,4
-chr10	76077992	.	ATTTTTTT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:7,3:5,3
-chr10	76627257	.	AGTGTGTGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,4:2,3:4,1
-chr10	77171402	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.2364;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:15,1:6,4
-chr10	77324940	.	ACTCTCTCTCT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,5:10,3:3,2
-chr10	78148347	.	T	TC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0013435;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:9,1:10,7
-chr10	78759385	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.42424;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,2:6,2:0,0
-chr10	79700446	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.048408;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:14,6:10,3
-chr10	79773554	.	AT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:3,1:9,3
-chr10	80032868	.	T	TAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,2:3,1:0,1
-chr10	80041722	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0047619;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,6:0,2:0,4
-chr10	80534827	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036526;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,3:1,1
-chr10	81510195	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:4,5:6,3
-chr10	82109581	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.041502;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,3:4,2:2,1
-chr10	83040096	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00042856;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,4:3,3
-chr10	84157895	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023024;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,2:5,6
-chr10	85120251	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:5,2:4,2
-chr10	86340312	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00014662;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:10,5:8,4
-chr10	87203329	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0084306;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:7,8:2,1
-chr10	87239603	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,2:6,2
-chr10	87592174	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.035604;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:6,2:9,4
-chr10	92098160	.	TAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:3,3:6,1
-chr10	92966287	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:3,1:8,4
-chr10	93188392	.	TG	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0036233;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:8,6:7,6
-chr10	93693518	.	TATATATATACACC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
-chr10	94530854	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010883;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,3:1,2
-chr10	95041787	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.014079;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:7,7:3,1
-chr10	97700201	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.085385;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,3:18,1
-chr10	97700202	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.056634;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:17,2:20,3
-chr10	97700203	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.051231;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:15,2:19,3
-chr10	99198067	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.030401;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:8,8:6,2
-chr10	99401166	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=2.4155e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:6,7:6,5
-chr10	99600898	.	TC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.076832;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,3:13,1
-chr10	99825071	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.046347;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:14,1:9,5
-chr10	100694253	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=3.2757e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:7,7:6,5
-chr10	101429504	.	T	TC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
-chr10	102476042	.	G	GTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.030844;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:8,4:6,1
-chr10	102476051	.	G	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00014085;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,13:5,6:5,7
-chr10	102476052	.	G	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=9.186e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,16:5,8:4,8
-chr10	103265250	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0027776;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:5,4:4,5
-chr10	105454819	.	C	CTA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:4,2:0,0
-chr10	105672567	.	C	CTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,6:2,4:0,2
-chr10	105782821	.	CTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,4:1,1
-chr10	105825981	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=2.5102e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:5,6:1,4
-chr10	106774426	.	A	AGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018761;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:7,2:13,4
-chr10	106994063	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:9,6:1,1
-chr10	108584901	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00045891;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:8,6:12,5
-chr10	109346489	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0336;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:8,3:12,1
-chr10	109533268	.	T	TAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:6,10:2,7:4,3
-chr10	109742465	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:9,7:7,1
-chr10	111192642	.	G	GA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,5:2,3
-chr10	111342364	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=2.0246e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:8,7:9,12
-chr10	112744459	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:4,3:6,6
-chr10	115000596	.	A	AAGAG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.059099;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:13,1:4,3
-chr10	115515318	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,8:0,5:3,3
-chr10	115661890	.	G	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,0:6,4
-chr10	118879687	.	A	AAGAAAGAAAGAAAGAG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:0,5:0,2:0,3
-chr10	118924791	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.026941;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:10,2:12,4
-chr10	120990546	.	G	GTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:5,3:2,2
-chr10	121200757	.	T	TA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00544;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,9:7,2
-chr10	121385846	.	C	CAA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,5:1,4:1,1
-chr10	123094546	.	C	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=4.2836e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:9,6:4,6
-chr10	124912341	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,2:2,2
-chr10	125889586	.	G	C	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0019405;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:54,9:43,8:11,1
-chr10	128205910	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.5174e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:8,5:5,5
-chr10	128219388	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:0,2:4,2
-chr10	128430438	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.8089e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:13,11:10,6
-chr10	128924462	.	C	CTATCATCTATCT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,8:4,2:2,6
-chr10	129736461	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.004671;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:4,6:9,3
-chr10	129736462	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0054795;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:5,7:10,3
-chr10	129736463	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0068797;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:5,7:10,3
-chr10	130655022	.	CAG	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:3,3:2,2
-chr10	132218551	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.033939;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:15,4:11,1
-chr10	132268768	.	CCTGT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010572;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:5,5:1,1
-chr10	132548792	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
-chr10	133011539	.	AGTGTGTGATGTGTGTTAGC	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.07056;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,2:10,2
-chr10	133658890	.	C	T	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.010381;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:81,19:48,11:33,8
-chr11	194825	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:3,3:9,1
-chr11	1681722	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:3,5:8,1
-chr11	1681723	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.015843;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,5:6,1
-chr11	1874014	.	G	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,2:2,3
-chr11	3204328	.	G	GCAGGCACC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.027558;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,7:12,5:8,2
-chr11	3702326	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,6:2,2:5,4
-chr11	4229359	.	C	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0053956;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:10,4:5,7
-chr11	4318596	.	T	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.031452;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:45,15:21,2:24,13
-chr11	4322328	.	G	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.043254;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:44,8:21,7:23,1
-chr11	4360623	.	G	GA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.076832;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,2:12,2
-chr11	4453530	.	ATTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,2:5,2
-chr11	6989150	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,5:6,4:4,1
-chr11	7745587	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:33:1,3:0,0:1,3
-chr11	8979905	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.012102;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,3:7,4
-chr11	12608045	.	CA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0093911;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,7:3,1
-chr11	13020278	.	C	CAAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.077477;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:4,5:4,1
-chr11	15814860	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=7.0087e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:7,7:3,5
-chr11	16177623	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,2:2,1:3,1
-chr11	17317974	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,2:5,3
-chr11	18076632	.	AAAG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.047343;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:3,2:3,2
-chr11	19036353	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0022441;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:8,7:7,9
-chr11	19709546	.	CAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:4,4:3,2
-chr11	19861261	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.01632;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:12,1:14,5
-chr11	21185293	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,4:2,2:1,2
-chr11	22978993	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
-chr11	23077020	.	TAGATATGAAACATCTGTACACTGAATAGTATAAAACA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:5,3:13,1
-chr11	23723103	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,4:2,3:3,1
-chr11	24122300	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:15,3:10,1
-chr11	25136860	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00011229;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:16,10:14,4
-chr11	25635713	.	C	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.016747;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:6,4:11,6
-chr11	25642808	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00048101;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,18:5,9:4,9
-chr11	27463067	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00387;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,6:1,5:3,1
-chr11	28236433	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00052187;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,5:6,4
-chr11	28287156	.	ATG	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,7:3,6:0,1
-chr11	29179215	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0013136;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
-chr11	29506307	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=4.8916e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:9,5:8,8
-chr11	31283971	.	C	CCT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0059539;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,14:3,7:5,7
-chr11	31840982	.	CCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:1,1:7,4
-chr11	32421397	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=9.8512e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:11,6:7,8
-chr11	32522513	.	T	TCTTA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:0,0:5,4
-chr11	32581434	.	C	CGT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.004156;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,9:2,6:2,3
-chr11	33186819	.	AT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,3:4,1
-chr11	34520272	.	GT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.037022;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:8,5:10,3
-chr11	34520276	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031869;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:5,5:12,3
-chr11	34926224	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00048775;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,4:11,4
-chr11	36209353	.	CTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:4,3:2,1
-chr11	36797793	.	A	AT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.039737;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:2,4:6,1
-chr11	37022094	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:16,1:14,4
-chr11	37035328	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010101;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:0,7:0,6:0,1
-chr11	37347904	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.029433;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,3:6,1
-chr11	37347998	.	ATG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,2:7,2
-chr11	37744880	.	A	G	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.034292;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:66,13:36,7:30,6
-chr11	37941477	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,4:2,3:0,1
-chr11	39296506	.	A	AT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=2.1371e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,18:13,11:4,7
-chr11	39574955	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,3:3,1
-chr11	40476116	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.000837;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,4:9,6
-chr11	40978118	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=6.3944e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:8,8:6,5
-chr11	41523661	.	CATTG	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0068131;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:5,5:11,6
-chr11	41561930	.	T	TAA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,4:5,1
-chr11	43157285	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=5.4482e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,6:8,6
-chr11	43831167	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.3876e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:7,7:12,11
-chr11	44509830	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
-chr11	45105884	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00061695;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:8,2:21,10
-chr11	45813586	.	G	GTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.030583;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,6:4,1
-chr11	46630568	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:5,4:2,1
-chr11	46765599	.	CTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,5:2,1
-chr11	47824052	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.12384;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,3:4,2:3,1
-chr11	49885748	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.038682;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:13,2:7,7
-chr11	50171655	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=8.4617e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:7,9:13,3
-chr11	51252751	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.064347;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:3,1:27,3
-chr11	51253776	.	G	T	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.036743;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:49,6:36,3:13,3
-chr11	51598715	.	T	C	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.020114;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:84,14:33,6:51,8
-chr11	51920154	.	C	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.040748;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:19,6:7,1
-chr11	52497199	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.055222;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:20,4:2,0
-chr11	53000384	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.038206;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:16,5:11,1
-chr11	53000388	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.063676;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:20,1:7,4
-chr11	53300757	.	C	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.024789;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:17,1:20,7
-chr11	53594324	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.013782;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:15,4:6,4
-chr11	53598678	.	G	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0015682;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:39,18:19,8:20,10
-chr11	54400380	.	A	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.01321;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:51,7:21,5:30,2
-chr11	54400735	.	T	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr11	54400754	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
-chr11	54401959	.	TG	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.030542;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:34,4:12,2
-chr11	54418755	.	A	G	0	PASS	DP=465;GPV=1;SPV=0.049731;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:215:190,25:89,15:101,10
-chr11	54528315	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.089706;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:11,3:24,1
-chr11	55549822	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=6.2662e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:7,5:10,6
-chr11	55978381	.	TAAAAAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,6:3,3:5,3
-chr11	57121117	.	G	GT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0036768;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:9,4:5,1
-chr11	58010671	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033264;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,1:5,5
-chr11	58427783	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00018235;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:14,7:13,7
-chr11	58436136	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:3,4:3,1
-chr11	59106681	.	G	GCCGCCAGCGCGCGGCTC	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,3:4,3
-chr11	60865847	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,2:3,6
-chr11	62279222	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,1:7,3
-chr11	63191686	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0025127;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,19:12,7:9,12
-chr11	63483785	.	ATATATATATATATATGTATATAT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,7:2,4:3,3
-chr11	63526790	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.1878e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:5,8:13,4
-chr11	63734734	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0097821;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,1:6,6
-chr11	64271296	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0075758;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,6:0,4:0,2
-chr11	65513703	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=3.2742e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,11:2,4:3,7
-chr11	65762828	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.019226;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:10,4:7,5
-chr11	67923129	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.019344;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:17,7:16,1
-chr11	68490423	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=9.3592e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:7,6:7,5
-chr11	68861507	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.012958;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:16,3:8,4
-chr11	71673775	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010572;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:1,3:5,3
-chr11	71755076	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.018691;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:13,4:12,1
-chr11	72049585	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,1:3,3
-chr11	73943269	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.025641;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,3:1,2
-chr11	74987890	.	TTTTTTTTC	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:1,4:2,4
-chr11	77171385	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.8905e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:8,5:11,8
-chr11	79616351	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=8.9618e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:7,8:7,7
-chr11	82112555	.	C	CTG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.030499;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,6:7,3:4,3
-chr11	82588774	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.032243;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:9,3:4,1
-chr11	82651015	.	TAGAGAATCCAAACTGCAACACATCTCAGGCAGCAAATGAGA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,2:8,2
-chr11	83511087	.	G	GACACACACACACACAC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:6,2:2,2
-chr11	84106954	.	AAGAG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.078947;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,2:2,1:2,1
-chr11	85787701	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018564;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:4,4:8,4
-chr11	88174640	.	AAC	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.025437;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:8,5:8,1
-chr11	88657202	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=3.5161e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:7,9:7,6
-chr11	89316563	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.028792;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:11,1:2,5
-chr11	89515369	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=7.554e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:5,7:4,5
-chr11	89667996	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.003388;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:13,6:15,1
-chr11	89716988	.	C	CTA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0035849;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:6,11:10,3
-chr11	89899896	.	T	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=3.8932e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:38,13:20,11:18,2
-chr11	90186730	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00058349;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:4,3:4,9
-chr11	90568520	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:9,6:5,3:4,3
-chr11	90616126	.	TGGTTGGCA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.025519;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,4:3,2
-chr11	90616137	.	A	ACCCT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,4:3,2
-chr11	91336805	.	CATATATATAT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:5,2:1,3
-chr11	92223783	.	CCTCTCT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.043019;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,2:6,2
-chr11	93490106	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0068571;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:9,3:10,3
-chr11	94237566	.	G	A	0	PASS	DP=516;GPV=1;SPV=0.032943;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:255:216,39:107,23:109,16
-chr11	94330670	.	TC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022078;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,2:6,4
-chr11	94330675	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:10,3:3,3
-chr11	94612316	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:2,2:1,1:1,1
-chr11	94753306	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,2:4,2
-chr11	96558489	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00014072;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:15,6:8,7
-chr11	96585172	.	A	AT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,3:2,1
-chr11	97596417	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00039828;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:13,3:6,6
-chr11	98107766	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=2.1926e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:6,6:7,4
-chr11	98248416	.	GTT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.010718;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,9:2,7:3,2
-chr11	98761483	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0064996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:1,5:3,4
-chr11	99185885	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0011156;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,5:5,4
-chr11	101263877	.	GTATATA	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:17,2:9,2
-chr11	101263885	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.14555;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:17,2:8,2
-chr11	101263887	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:16,2:8,2
-chr11	101283303	.	A	ATTAAC	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0018313;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:10,4:14,4
-chr11	101283304	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00054466;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:9,5:13,4
-chr11	101283308	.	T	TTG	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0018313;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:10,4:14,4
-chr11	101374333	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.028437;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:12,3:10,6
-chr11	101600388	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0036217;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:9,4:15,5
-chr11	101865140	.	A	AACAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,7:5,4:1,3
-chr11	103188222	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.9366e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,15:8,4:3,11
-chr11	103842758	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,7:10,6:10,1
-chr11	104811359	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.027005;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,8:7,7:8,1
-chr11	105161948	.	GA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:7,1:1,3
-chr11	105491173	.	TTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,4:1,2:2,2
-chr11	105516595	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,2:4,1:2,1
-chr11	105965792	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00049183;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:2,6:19,4
-chr11	107837525	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:7,7:6,1
-chr11	111005139	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.019231;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:3,4:0,0
-chr11	111696514	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00013202;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:13,5:4,4
-chr11	112273035	.	TTTCCTTC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.026676;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,2:8,3
-chr11	112645955	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:6,4:2,1
-chr11	113195495	.	ATT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:4,1:3,3
-chr11	113507905	.	GCTCT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00074848;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,9:3,8:0,1
-chr11	113973294	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,10:3,5:3,5
-chr11	114557652	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.39286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,3:5,1:4,2
-chr11	115080381	.	ACAC	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.16035;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:23,3:14,2:9,1
-chr11	116969289	.	CA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:1,7:2,1
-chr11	117264897	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=4.0511e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,17:5,6:10,11
-chr11	119657739	.	A	AAATAATAAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12384;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,3:4,1:3,2
-chr11	120328678	.	A	AGTGTGT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,3:1,2:3,1
-chr11	122859629	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00034731;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:14,4:3,5
-chr11	124433397	.	ATG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0071396;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,7:4,5:3,2
-chr11	125189421	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,3:3,2:1,1
-chr11	125866611	.	T	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,2:2,3
-chr11	126707783	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=2.8326e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:9,19:3,10:6,9
-chr11	129693712	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:1,3:1,3:0,0
-chr11	130641107	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0063246;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:4,5:1,3
-chr11	131680604	.	C	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.014972;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,5:15,4:20,1
-chr11	131733467	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.17314;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:9,2:19,3
-chr11	132521000	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0093079;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:12,1:10,5
-chr12	707613	.	TTC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.05461;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,3:9,1
-chr12	1440600	.	TTGTGTG	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,2:4,2
-chr12	1516164	.	C	CTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:5,3:4,1
-chr12	2545212	.	A	AT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,8:3,5:0,3
-chr12	2883075	.	A	AAAAAAAAACAAC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:3,2:3,5
-chr12	3666358	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.091388;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,6:7,5:8,1
-chr12	6156091	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0059828;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:8,4:0,2
-chr12	6591707	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=2.5948e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:4,3:10,11
-chr12	6617994	.	G	GACACACACAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.027154;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,5:8,1:8,4
-chr12	7483843	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,1:6,3
-chr12	7682835	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0075758;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:0,5:0,4:0,1
-chr12	7883267	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:4,1:2,5
-chr12	9301106	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.048396;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:23,7:14,1
-chr12	9428531	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.028561;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:14,1:12,4
-chr12	9431081	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0094549;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:2,3:9,4
-chr12	9442266	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.16084;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,4:13,1
-chr12	9444361	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.017231;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:11,4:5,3
-chr12	9463271	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
-chr12	11302137	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,5:2,1
-chr12	11302264	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.045508;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,2:7,2
-chr12	14280488	.	C	CAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0091533;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:2,5:4,1
-chr12	14481935	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.037091;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:9,3:12,1
-chr12	14481936	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.04;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:9,3:12,1
-chr12	14949106	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0051219;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,13:7,9:5,4
-chr12	15681305	.	G	GTAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0079383;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,5:5,3
-chr12	15901861	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:1,2:0,1:1,1
-chr12	17997427	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=9.1903e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:13,20:7,4:6,16
-chr12	18517031	.	C	CT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.02677;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:8,4:8,4
-chr12	19084009	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=1.1033e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,15:5,9:7,6
-chr12	21396055	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=3.1465e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:6,8:7,7
-chr12	21926363	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=8.6637e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:12,2:6,8
-chr12	21982167	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.06037;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:8,2:20,2
-chr12	22432849	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.010774;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:6,4:12,4
-chr12	22432855	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,8:6,5:10,3
-chr12	24075277	.	T	TA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,2:2,2
-chr12	25224183	.	TA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:7,5:3,3
-chr12	25225290	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,4:1,3:0,1
-chr12	25271961	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0032306;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,11:4,8:1,3
-chr12	26232934	.	T	TA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,9:3,7:0,2
-chr12	26568011	.	T	TATATA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,2:2,1:0,1
-chr12	26591083	.	A	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:1,1:4,1
-chr12	28605811	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00028966;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,4:7,4
-chr12	28932263	.	AAG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0058287;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:4,3:7,2
-chr12	28980001	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=5.6087e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:1,10:0,6:1,4
-chr12	29081657	.	GGTGTGT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,9:1,5:5,4
-chr12	30658876	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:6,4:2,2
-chr12	30790062	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028751;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:12,6:6,3
-chr12	31070300	.	A	ATTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013669;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:1,2:13,3
-chr12	31183168	.	A	AAATG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03735;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
-chr12	31741127	.	G	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.011071;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:3,7:4,4
-chr12	31890534	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.095042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,3:11,1
-chr12	32005286	.	A	ATATG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:3,5:8,2
-chr12	32659204	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=5.8035e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:16,6:8,10
-chr12	33360524	.	GT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0041497;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:8,4:8,4
-chr12	33412362	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0026972;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:10,7:8,7
-chr12	33836693	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0018489;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:6,1:8,6
-chr12	34334877	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.019962;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:8,1:16,4
-chr12	34778762	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.022623;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:3,1:13,5
-chr12	34897599	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.024618;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:38,10:0,1
-chr12	34899863	.	T	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.029889;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:0,0:26,4
-chr12	34945692	.	G	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.026239;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:8,4:26,6
-chr12	35078228	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.02537;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:20,7:6,2
-chr12	35186013	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027191;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:1,2:8,4
-chr12	35346780	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:26,4:0,0
-chr12	35780582	.	T	A	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.029253;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:63,9:35,8:28,1
-chr12	35780597	.	A	T	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.0032527;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:45,19:26,11:19,8
-chr12	36311802	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,3:13,2
-chr12	36311803	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.05154;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,3:15,2
-chr12	36464687	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr12	36721677	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.068908;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:26,4:2,0
-chr12	36885604	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:16,4:0,0
-chr12	36941010	.	G	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.017934;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:25,8:7,2
-chr12	36941239	.	A	G	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.015193;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:27,4:27,2
-chr12	36991443	.	G	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:10,3:2,1
-chr12	37247184	.	T	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:5,4:3,6
-chr12	37263826	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=5.5832e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:3,5:4,5
-chr12	37263827	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=2.299e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:3,5:3,5
-chr12	37441936	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.016312;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:11,8:18,3
-chr12	38561510	.	A	AT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.014985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,8:0,3:2,5
-chr12	38894658	.	ACTCTCTCTCTCTCT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,7:2,5:3,2
-chr12	39325498	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,2:6,4
-chr12	39925030	.	A	ATTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,6:0,5:3,1
-chr12	40630542	.	TTTCTTTC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,6:7,5:4,1
-chr12	40706002	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026404;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:11,4:18,2
-chr12	41571376	.	TCACA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:5,1:1,5
-chr12	43615239	.	G	GTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.006993;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,8:1,5:1,3
-chr12	43741568	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0054545;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,2:11,4
-chr12	43958795	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.029609;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,4:8,6
-chr12	44311797	.	G	GTA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,2:5,2
-chr12	45435714	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:1,2:1,1:0,1
-chr12	47354714	.	T	TATAG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,10:1,4:2,6
-chr12	48912437	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091388;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:8,5:7,1
-chr12	49036478	.	AT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,2:4,2
-chr12	49787094	.	A	AT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019118;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,3:6,1
-chr12	51424037	.	C	CA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,5:2,4:0,1
-chr12	53162338	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.024686;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:6,7:13,8
-chr12	55067453	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.015459;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,6:9,2
-chr12	55898651	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.030651;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:3,3:8,2
-chr12	58054993	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.01458;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,5:3,4
-chr12	58378552	.	CA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00057702;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:7,6:9,5
-chr12	58696750	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=2.3275e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:11,10:10,10
-chr12	58856895	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.173e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,17:9,8:11,9
-chr12	59883789	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.3208e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:6,10:5,3
-chr12	60869682	.	TTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.051138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:7,1:11,4
-chr12	60869725	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,1:4,5
-chr12	63674050	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=6.9341e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:9,6:7,6
-chr12	64040804	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0020355;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:11,4:9,3
-chr12	64366214	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,3:10,1
-chr12	64676467	.	CTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:1,3:6,1
-chr12	65738517	.	T	TTCTCTC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:11,4:4,1
-chr12	66497260	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00053433;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,3:4,3
-chr12	67380425	.	C	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018404;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,2:5,3
-chr12	67380512	.	TA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:9,6:3,4
-chr12	67678215	.	A	AAAAAAAAAAAAGTTCTC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0058074;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:10,3:4,7
-chr12	68632146	.	G	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13725;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,2:4,1:1,1
-chr12	69995387	.	GTT	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.010836;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,4:1,1
-chr12	70564842	.	TA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,7:4,6:7,1
-chr12	71216197	.	C	CACACACAG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00017491;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,10:10,8:3,2
-chr12	76723001	.	GTATATA	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:0,2:2,2
-chr12	77043362	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00026518;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:6,6:9,5
-chr12	79179028	.	A	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,2:2,1:5,1
-chr12	81007094	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.025729;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:18,3:5,2
-chr12	81007095	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.02531;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:17,2:4,3
-chr12	81954178	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=1.062e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,14:2,5:7,9
-chr12	83586957	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.048357;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:12,7:10,1
-chr12	83837218	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.013982;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:7,4:16,1
-chr12	85354446	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00027927;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:13,5:4,3
-chr12	92151443	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00518;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:10,7:4,4
-chr12	93365275	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0098985;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,4:4,2
-chr12	93463255	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:1,8:5,1
-chr12	93492513	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00020271;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:10,8:12,8
-chr12	94040342	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,5:2,1:4,4
-chr12	94986642	.	AC	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:8,4:6,4
-chr12	95101681	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,2:2,2
-chr12	95654770	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,3:6,1
-chr12	96453881	.	GATATATATATATATATATATAT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.020979;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,7:1,6:1,1
-chr12	97335973	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:2,3:4,3
-chr12	97598862	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.244e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,16:8,10:6,6
-chr12	98257900	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.017995;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,4:11,1
-chr12	99761065	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.021523;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,4:3,4
-chr12	99864079	.	C	CA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:4,3:0,1
-chr12	100364047	.	C	CAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:8,5:2,1
-chr12	101948762	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,6:7,3:1,3
-chr12	102476410	.	T	TGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0065417;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,6:2,2
-chr12	103085541	.	AT	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.2309e-07;SS=2;SSC=66;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,17:8,8:5,9
-chr12	103166076	.	A	AGAAGGAAG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.042122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:13,3:3,5
-chr12	103619755	.	CG	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,2:7,4
-chr12	103974988	.	AAAAAAG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.017042;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:8,7:8,3
-chr12	104001705	.	A	AT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.051834;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,1:11,3
-chr12	104267707	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr12	104454404	.	AAC	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.055981;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,1:14,3
-chr12	104454411	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.055981;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,2:14,2
-chr12	105100364	.	CTCTTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:4,1:12,5
-chr12	106054475	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00086916;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:3,4:11,3
-chr12	107205546	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0076174;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,9:0,7:1,2
-chr12	107944897	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.016363;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:11,1:13,5
-chr12	108096721	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=8.1433e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,18:11,8:4,10
-chr12	109572411	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,5:6,1
-chr12	113488953	.	CCTTTCTTTCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.020128;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:0,2:10,5
-chr12	113785755	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00017884;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:13,5:8,5
-chr12	115281918	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.034112;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:15,5:12,1
-chr12	115394477	.	A	AATGG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.070897;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,5:7,3:13,2
-chr12	116566616	.	T	TAAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057118;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:5,4:8,2
-chr12	117041342	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0079418;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:12,2:8,4
-chr12	117629414	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.4873e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:9,5:8,6
-chr12	118888779	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.032688;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:11,2:11,5
-chr12	119317335	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.033431;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:6,5:9,1
-chr12	121966423	.	G	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,2:2,3
-chr12	122016764	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0011083;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:14,5:7,3
-chr12	122427208	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.021584;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,3:2,1
-chr12	122427209	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:6,3:1,1
-chr12	123756307	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.01726;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:9,9:2,1
-chr12	125617344	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01707;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:10,3:3,2
-chr12	125656013	.	G	GA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.029893;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:13,4:10,2
-chr12	127444530	.	A	AAT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030984;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:10,2:8,3
-chr12	127736409	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013285;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,3:5,3
-chr12	128090909	.	G	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.016493;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,3:11,3
-chr12	128295003	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011145;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:9,2:10,4
-chr12	128988629	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.010101;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:1,4:1,1:0,3
-chr12	129187809	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=6.9059e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:12,12:12,7
-chr12	129521915	.	AT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0030216;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:11,4:10,4
-chr12	129525226	.	GT	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
-chr12	129877174	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:8,1:12,4
-chr12	130050276	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:3,1:11,6
-chr12	130441414	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,3:7,1
-chr12	131150300	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.083787;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:8,1:14,5
-chr12	131419456	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=9.2359e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,18:2,10:10,8
-chr12	132381475	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,4:3,1
-chr12	132391135	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0010975;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:15,3:6,4
-chr12	132919379	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.018803;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,1:5,3
-chr13	18172309	.	TAGAATGAA	T	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.029173;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:102,13:48,4:54,9
-chr13	18172325	.	T	A	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.011983;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:93,13:39,4:54,9
-chr13	18172326	.	A	T	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.024745;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:97,12:43,3:54,9
-chr13	18172327	.	T	A	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.022597;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:89,13:42,4:47,9
-chr13	18172333	.	T	TTTTCATTC	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.041149;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:93,12:37,3:56,9
-chr13	18197090	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,3:7,1
-chr13	18206038	.	CAA	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.032687;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,8:13,7:7,1
-chr13	18271449	.	G	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,5:2,1
-chr13	18531171	.	AGCAAACACCCCACAGCATGG	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.029793;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:13,4:9,5
-chr13	18545200	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.019855;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:10,8:16,2
-chr13	18808933	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.043261;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:15,4:13,1
-chr13	19048992	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=2.8359e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:8,10:13,7
-chr13	19290200	.	A	AT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0029061;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,11:14,4:6,7
-chr13	20148253	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:2,4:2,1
-chr13	21050147	.	G	GATAGATAGATAGATACATACATAC	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.031261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,6:7,3:8,3
-chr13	21853573	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:2,3:1,2:1,1
-chr13	22478011	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00027241;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:7,5:9,5
-chr13	22512021	.	C	CAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,5:5,1
-chr13	22713588	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0317;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,2:13,2
-chr13	24697639	.	CAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,5:3,3:4,2
-chr13	25160257	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0085545;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:4,8:6,1
-chr13	25717440	.	C	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,8:2,6:4,2
-chr13	25751273	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0003248;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:9,6:9,7
-chr13	26485192	.	AG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0084353;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,3:2,3
-chr13	26907752	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.006277;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:19,3:10,4
-chr13	28034119	.	A	ATCATAT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0033296;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,5:7,2
-chr13	28034406	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0016051;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:9,2:11,5
-chr13	28037847	.	CG	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00086768;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:10,5:9,3
-chr13	28085343	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0093911;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,8:4,7:2,1
-chr13	28745358	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00077001;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,6:6,2
-chr13	28931190	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.031154;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:14,1:18,4
-chr13	30523150	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.3691e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:11,6:8,7
-chr13	31817645	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=1.3103e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:6,5:6,7
-chr13	32541676	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:3,5:4,2
-chr13	32637218	.	A	AATAAGGGT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,5:0,2:0,3
-chr13	33181267	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021709;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:2,11:2,6:0,5
-chr13	33209457	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0005812;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:7,9:7,2
-chr13	34971819	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00071076;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:4,6:8,2
-chr13	35813730	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.013043;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,5:3,1
-chr13	35967635	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0013435;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:8,3:11,5
-chr13	37153528	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.026299;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:5,1:12,5
-chr13	37153529	.	C	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.027859;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:3,1:12,5
-chr13	37301190	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,3:1,1
-chr13	37309075	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,3:4,1
-chr13	37753581	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.012033;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:3,4:5,2
-chr13	37989356	.	T	TAGATAGATAGATAGATAGATAGAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.004158;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:6,2:8,6
-chr13	41076269	.	AT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:10,3:7,2
-chr13	42206975	.	T	TTTTCTTTC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.039138;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:5,3:14,2
-chr13	42881605	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,2:6,5
-chr13	43690259	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:1,2:0,0:1,2
-chr13	45211673	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.024817;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,2:10,5
-chr13	46788054	.	G	GT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016895;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:9,2:15,3
-chr13	48847500	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0082418;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:0,3:2,1
-chr13	52256869	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00019163;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:14,8:2,4
-chr13	52519790	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.046691;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:19,3:12,2
-chr13	53000431	.	C	CT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.056049;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:14,4:10,1
-chr13	53177159	.	CA	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=8.5151e-06;SS=2;SSC=50;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,17:11,12:9,5
-chr13	53232170	.	ATCTC	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.014585;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,3:9,1
-chr13	54011938	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0004157;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,5:7,5
-chr13	55704368	.	GTA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.010145;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:3,4:5,2
-chr13	55704462	.	A	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,5:2,2:3,3
-chr13	56885075	.	TTATATA	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,2:1,2
-chr13	57140339	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.021978;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:29,13:11,2
-chr13	57218442	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0029833;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:8,5:18,4
-chr13	57395150	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,4:1,3:5,1
-chr13	57612097	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12484;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:11,1:11,2
-chr13	57693315	.	C	CAT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:5,5:4,2
-chr13	57983872	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0034395;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,4:11,4
-chr13	58418567	.	T	TA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00010896;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:9,6:7,5
-chr13	58624833	.	CAA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:1,3:3,1
-chr13	60084015	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.04724;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,4:3,3:4,1
-chr13	60941018	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.053645;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:18,2:12,2
-chr13	62814203	.	A	AGT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.010053;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,4:5,5
-chr13	64231639	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=2.7919e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:3,13:1,10:2,3
-chr13	68338318	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0004629;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:14,6:8,5
-chr13	68610689	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.002076;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,4:8,4
-chr13	69149741	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0084306;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,9:7,8:2,1
-chr13	69157963	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=3.1e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,18:8,4:4,14
-chr13	69412498	.	ATTT	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0022624;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,6:1,1:1,5
-chr13	69863387	.	C	CAAAAGAGGATCCTAGAAGAAGACTAGGCACCAGT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:10,3:8,1
-chr13	70218558	.	AT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=2.4722e-08;SS=2;SSC=76;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,16:4,9:4,7
-chr13	71783965	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:1,3:1,2:0,1
-chr13	72153116	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=1.172e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:9,12:4,4
-chr13	72358634	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:5,2:4,7
-chr13	72990213	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
-chr13	73108638	.	A	ATC	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.068908;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:12,2:16,2
-chr13	73915307	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=4.5491e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,19:8,11:5,8
-chr13	74436978	.	AT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.383;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,4:10,3:6,1
-chr13	75687821	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0013031;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,15:5,10:7,5
-chr13	76942709	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00017947;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:7,7:10,4
-chr13	77704093	.	A	C	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.033883;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:55,11:29,7:26,4
-chr13	78665322	.	A	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,2:0,1:1,1
-chr13	81904389	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:6,1:11,3
-chr13	82169368	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.022727;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:10,2:3,3
-chr13	82458884	.	T	TA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0016308;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:12,6:4,2
-chr13	85227345	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0010272;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:13,4:7,6
-chr13	85333993	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0026298;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:3,4:9,2
-chr13	85922076	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00013428;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:12,5:5,5
-chr13	86063548	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00070165;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,5:5,4
-chr13	86498492	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.093333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
-chr13	87124262	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0067244;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:9,3:3,3
-chr13	88200508	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
-chr13	91746505	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.060769;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:19,3:14,2
-chr13	92930628	.	TATATATTCCAGATATAA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0043101;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:8,3:6,4
-chr13	93376776	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00056132;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:7,6:6,3
-chr13	93667735	.	G	GTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:11,4:7,1
-chr13	93905097	.	A	AG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0025519;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,10:2,7:2,3
-chr13	94088595	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,2:0,2:0,0
-chr13	94288946	.	GATAGATAT	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,3:0,1
-chr13	94585799	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0051416;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:10,6:5,4
-chr13	96105006	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,4:6,3:4,1
-chr13	97790091	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00030733;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:6,4:8,4
-chr13	97852692	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:8,2:7,2
-chr13	97860642	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.016968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,7:3,6:1,1
-chr13	99414007	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.011679;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:4,5:7,3
-chr13	100463335	.	GGT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0080645;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:3,3:4,1
-chr13	101362815	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=7.0663e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:10,3:6,8
-chr13	102189022	.	GAAGA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,4:8,3:6,1
-chr13	103563902	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.6063e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:10,9:9,6
-chr13	104490654	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=3.0818e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:8,5:3,7
-chr13	105089164	.	ATATATTTATATATATGTGTATACATATATGTATATATT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,5:4,2:4,3
-chr13	105684597	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,3:13,1
-chr13	105788377	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.3475e-10;SS=2;SSC=94;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:11,21:3,5:8,16
-chr13	106472885	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.029272;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:6,3:12,1
-chr13	107911166	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00091327;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,6:9,2
-chr13	108348447	.	CTCTCTCTG	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0033365;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:6,6:8,5
-chr13	108425575	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.001961;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:14,7:15,5
-chr13	109330635	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0004259;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:15,7:7,3
-chr13	110497503	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0094538;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
-chr13	110894963	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=4.2116e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:9,8:5,5
-chr13	112333425	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.2072e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:13,11:7,9
-chr13	113547177	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0018932;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,4:14,5
-chr13	113940556	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.086687;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:1,1:5,2
-chr14	18275552	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0010797;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:6,4:7,7
-chr14	18659364	.	T	A	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.025834;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:52,14:32,8:20,6
-chr14	18661329	.	C	T	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.031534;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:67,19:22,5:45,14
-chr14	18927932	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,2:2,2
-chr14	19002747	.	C	T	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.029561;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:87,18:40,10:47,8
-chr14	19058704	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.02706;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:12,3:20,2
-chr14	19058850	.	C	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.037114;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:15,4:26,4
-chr14	19059168	.	T	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.042542;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:36,8:17,3
-chr14	19074202	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.064347;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:18,2:12,2
-chr14	19126082	.	T	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.041077;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:19,8:18,3
-chr14	19161348	.	AG	A	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.033162;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:68,16:31,9:37,7
-chr14	19170300	.	C	CTCTA	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.0043066;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:60,9:25,7:35,2
-chr14	19176820	.	T	G	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.0055223;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:58,16:30,8:28,8
-chr14	19241644	.	G	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.014214;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:21,4:23,1
-chr14	19267795	.	C	T	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.00055263;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:51,10:29,5:22,5
-chr14	19276455	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.032961;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:20,4:12,2
-chr14	19363580	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.042412;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,2:9,2
-chr14	19371982	.	T	C	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.012376;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:70,17:33,6:37,11
-chr14	19380912	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.049837;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:22,7:18,6
-chr14	19391950	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.054545;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
-chr14	19433678	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0088061;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:6,5:2,2
-chr14	19475827	.	T	TA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,2:7,2
-chr14	19666234	.	C	T	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.043643;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:62,13:31,10:31,3
-chr14	19678523	.	T	C	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.03683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:26,3:28,3
-chr14	19716664	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:8,3:1,1
-chr14	19780669	.	C	T	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.0093558;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:19,4:24,9
-chr14	20352568	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:4,3:2,2
-chr14	23422586	.	TCTTTCTTTCTCTC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030844;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:7,3:7,2
-chr14	24088803	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.017469;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,2:6,6
-chr14	24206345	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.0256e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:11,10:8,8
-chr14	25232587	.	T	TCTCC	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:1,1:3,3
-chr14	27961347	.	C	CT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.056405;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:15,3:12,1
-chr14	28674553	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0029061;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,7:8,4
-chr14	30361142	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00047821;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:11,6:9,4
-chr14	30532663	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:2,4:1,1
-chr14	31937328	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.068498;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,2:14,2
-chr14	32462901	.	C	CA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
-chr14	32687408	.	C	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,2:3,1:4,1
-chr14	33087171	.	T	TA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,4:5,1:13,3
-chr14	34643055	.	AT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,2:1,1:3,1
-chr14	35240294	.	C	CTTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:3,2:0,0
-chr14	36798902	.	A	AAG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018018;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:4,6:5,1
-chr14	40019808	.	T	TCACACA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:7,5:6,4
-chr14	41167237	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0018182;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,4:7,3
-chr14	41175901	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.9448e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:7,3:10,9
-chr14	41243449	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00010136;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:9,5:6,6
-chr14	41808408	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,2:4,2:0,0
-chr14	42051447	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.009581;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:2,6:9,2
-chr14	42070911	.	TTCTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0055972;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,9:3,6:4,3
-chr14	42159445	.	C	CTTTCTTTCT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.055556;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:3,1:2,1
-chr14	45416861	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.002243;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:10,2:3,3
-chr14	48315922	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0001844;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:6,8:8,1
-chr14	50122391	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,5:2,1
-chr14	51144228	.	C	CAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,2:3,1:1,1
-chr14	52656711	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:7,4:3,4
-chr14	52786059	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0062713;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,6:2,4:0,2
-chr14	54862379	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,2:4,2:0,0
-chr14	56705573	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0024876;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,13:8,11:4,2
-chr14	56935197	.	TTCTTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0025247;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:4,6:15,10
-chr14	58962926	.	C	CTA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.26049;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:12,2:9,1
-chr14	59175182	.	TA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0069576;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:11,4:9,5
-chr14	61746397	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019737;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:8,3:2,5
-chr14	61938026	.	A	AACACACACACACACAC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,8:4,6:2,2
-chr14	62908782	.	AT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:4,2:1,2
-chr14	64428107	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,1:3,4
-chr14	64657457	.	TG	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.011868;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:1,1:3,6
-chr14	64785351	.	GAA	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0055231;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,4:3,2
-chr14	65123077	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,5:3,1
-chr14	65810255	.	ATTTGGCTCCC	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.046752;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:7,3:6,4
-chr14	66154886	.	G	GATAGAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.027296;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,4:6,3
-chr14	69102591	.	G	GACACACACACACACAC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,6:3,3:1,3
-chr14	69776603	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.056596;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,3:12,1
-chr14	70860105	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018691;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:1,4:6,2
-chr14	71263275	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:1,4:6,5
-chr14	71590042	.	AAAATATAT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:6,3:4,2
-chr14	72990689	.	CTT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,1:2,3
-chr14	73045353	.	AT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0049438;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:3,3:0,3
-chr14	76333418	.	TATC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0055231;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:9,5:0,1
-chr14	76333425	.	T	TG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00054683;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:8,5:0,3
-chr14	76799906	.	GA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:5,7:4,1
-chr14	78550538	.	AAAC	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=1.0239e-06;SS=2;SSC=59;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:7,5:4,9
-chr14	79064707	.	TATTTTTCATAATTACCC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0092138;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,1:4,6
-chr14	79064727	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0092138;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,2:4,5
-chr14	79064735	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.012068;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:11,2:4,4
-chr14	79064737	.	ATG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0051722;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,2:4,5
-chr14	80996590	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.021791;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:8,2:12,2
-chr14	81265647	.	G	GTAATAATAATAATAATAATAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.008413;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,7:3,5:1,2
-chr14	81593003	.	TTCTC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.045025;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,3:6,2
-chr14	81599517	.	G	GTTTTTC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0001418;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,3:3,4
-chr14	81645964	.	ATT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,6:1,1
-chr14	83882802	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.018159;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,3:9,1
-chr14	84641209	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0041266;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,11:8,2:8,9
-chr14	84814695	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,3:0,0:4,3
-chr14	84870460	.	G	GT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0036228;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:13,6:3,3
-chr14	85361378	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=3.2748e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:7,7:6,4
-chr14	87516712	.	GC	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.5057e-06;SS=2;SSC=54;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:13,8:5,10
-chr14	87606497	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.5334e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:17,21:11,8:6,13
-chr14	87781407	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.1265e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,17:7,8:9,9
-chr14	88755840	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=1.9493e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,12:8,5:5,7
-chr14	90126531	.	CTTG	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037638;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:8,4:8,5
-chr14	91318917	.	C	CAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:4,5:4,1
-chr14	91519138	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.083004;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,2:5,1:0,1
-chr14	91915686	.	C	CA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:1,3:3,1
-chr14	92767689	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,3:4,1
-chr14	93234186	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0017181;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,8:2,7:0,1
-chr14	93452375	.	ATT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,4:9,2:4,2
-chr14	94540842	.	T	TTCTC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,6:1,4:2,2
-chr14	94648586	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:3,3:1,1
-chr14	94897018	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0042869;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:12,6:12,3
-chr14	95610788	.	AAG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039737;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:5,1:3,4
-chr14	95766412	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0012644;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,4:5,3
-chr14	98014124	.	CCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:0,0:14,4
-chr14	98115803	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.014742;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,5:7,2
-chr14	98155143	.	TATAGAG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:3,7:8,2
-chr14	98234881	.	TGATAGATAGATGATAGATA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.043209;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,8:9,4:9,4
-chr14	98234915	.	TA	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0052029;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,12:8,7:7,5
-chr14	99410862	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=9.9525e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:9,5:4,7
-chr14	99826105	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.049808;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,3:4,1
-chr14	100198742	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030289;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:3,4:4,1
-chr14	100931842	.	TATATATA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:1,3:0,2:1,1
-chr14	104204478	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0032734;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,7:1,2:2,5
-chr14	105654000	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.013714;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,5:8,4
-chr14	105736712	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:2,2:12,4
-chr14	105736981	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.037012;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:13,5:6,2
-chr14	105749983	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.047874;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:21,5:7,3
-chr14	105755579	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.047169;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,2:16,7
-chr14	106327993	.	C	G	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.0082929;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:72,17:39,13:33,4
-chr14	106351142	.	CT	C	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.013419;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:68,18:39,7:29,11
-chr15	18366043	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:1,1:9,3
-chr15	18566117	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:27,4:0,0
-chr15	19222180	.	G	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.044826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:18,4:0,0
-chr15	19563637	.	T	C	0	PASS	DP=872;GPV=1;SPV=0.00095602;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:413:366,46:182,40:184,6
-chr15	19835775	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=2.6922e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,11:1,3:0,8
-chr15	19902524	.	A	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.038854;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:38,8:10,1:28,7
-chr15	19925830	.	C	A	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.022371;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:64,15:17,6:47,9
-chr15	20115657	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.03557;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:17,6:15,4
-chr15	20119707	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.035271;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:10,3:22,3
-chr15	20120551	.	ACAAG	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.03948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:29,5:12,1
-chr15	20256614	.	C	T	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.01383;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:74,20:30,12:44,8
-chr15	20272696	.	C	A	0	PASS	DP=254;GPV=1;SPV=0.001875;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:100,25:58,10:42,15
-chr15	20284725	.	T	A	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.023429;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:73,18:35,13:38,5
-chr15	20289416	.	T	C	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.020621;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:77,17:35,8:42,9
-chr15	20290883	.	G	C	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.035787;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:92,21:39,7:53,14
-chr15	20291056	.	A	G	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.045569;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:71,15:38,7:33,8
-chr15	20295526	.	C	A	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.0046454;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:106,19:46,6:60,13
-chr15	20304167	.	C	A	0	PASS	DP=314;GPV=1;SPV=0.047629;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:126,21:59,14:67,7
-chr15	20309845	.	TGAG	T	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.026602;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:72,10:36,5:36,5
-chr15	20309922	.	TGATGA	T	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.020878;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:54,13:28,8:26,5
-chr15	20338110	.	A	G	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.046849;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:66,15:29,12:37,3
-chr15	20357686	.	G	A	0	PASS	DP=281;GPV=1;SPV=0.036447;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:105,20:65,11:40,9
-chr15	20370348	.	AATTGAGTTCTC	A	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.036478;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:80,16:39,7:41,9
-chr15	20372213	.	C	T	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.019044;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:71,16:45,7:26,9
-chr15	20393186	.	A	AT	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.025654;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:70,10:38,4:32,6
-chr15	20415832	.	T	C	0	PASS	DP=190;GPV=1;SPV=0.0087716;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:64,16:28,8:36,8
-chr15	20555222	.	GTATATGTGTAAATA	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.029438;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:21,5:13,4
-chr15	20586743	.	C	CT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.034134;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:9,6:13,4
-chr15	20644036	.	A	G	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.047122;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:73,14:42,8:31,6
-chr15	20665834	.	C	CAA	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.0028234;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:71,19:34,9:37,10
-chr15	20741316	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,4:3,1
-chr15	21248951	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.047338;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:3,4:22,2
-chr15	21278485	.	A	G	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.033668;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:69,17:38,10:31,7
-chr15	21285805	.	C	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.045959;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:72,16:40,7:32,9
-chr15	21291652	.	G	A	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.0045101;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:62,21:27,9:35,12
-chr15	21465543	.	A	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.016976;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:47,10:29,7:18,3
-chr15	21516684	.	GC	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.031256;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:19,6:14,4
-chr15	21540209	.	T	TA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,4:4,1
-chr15	21577313	.	G	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,2:5,2
-chr15	21620069	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027568;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:11,5:10,1
-chr15	21835845	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0057417;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:6,7:1,1
-chr15	21944626	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.008578;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:15,6:20,7
-chr15	22286257	.	G	GTAGGAATTATGTATTCTGT	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.046919;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:49,8:25,6:24,2
-chr15	22361138	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.03461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:10,3:15,7
-chr15	22422114	.	T	G	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.047443;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:60,9:29,6:31,3
-chr15	22443264	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.047789;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:8,3:18,3
-chr15	23196478	.	G	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0029389;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:27,5:18,3
-chr15	23356879	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:14,5:2,1
-chr15	23440678	.	ATCT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.031844;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:14,2:6,7
-chr15	23487784	.	A	AAC	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:3,3:0,2
-chr15	23864016	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.038206;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:15,5:12,1
-chr15	24264280	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=2.0129e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:9,10:4,3
-chr15	24509453	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.031149;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:17,4:14,1
-chr15	25999667	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:0,2:4,2
-chr15	27138743	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.7114e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,20:3,9:15,11
-chr15	27918089	.	AT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,6:5,3:5,3
-chr15	28377531	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0081269;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:1,4:3,1
-chr15	28488115	.	AAG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14691;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:6,2:21,3
-chr15	28518992	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
-chr15	28545571	.	T	TGG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,2:6,2
-chr15	28589129	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.040413;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:12,6:16,3
-chr15	28589899	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.037062;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:16,4:12,2
-chr15	28598282	.	A	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0051722;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,4:5,2
-chr15	29294729	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=3.8821e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:7,4:7,9
-chr15	29527891	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00022196;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,5:7,5
-chr15	29587138	.	CGT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0055231;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,4:3,2
-chr15	30442318	.	A	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.013504;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:11,2:19,3
-chr15	30998088	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0091688;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,8:1,7:2,1
-chr15	32562048	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:9,6:4,3
-chr15	32848149	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.004102;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:13,5:13,3
-chr15	33224691	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,4:8,2
-chr15	33317307	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=2.4108e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,14:3,9:4,5
-chr15	35397859	.	T	TTATA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:8,2:8,3
-chr15	35727930	.	G	GCGTGCGCGCGCGCACACA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.011637;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:8,8:9,6
-chr15	35971864	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00047821;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:8,8:12,2
-chr15	36930202	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,8:11,3:9,5
-chr15	37695262	.	T	TTC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:5,2:1,2
-chr15	37893878	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=2.706e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,17:9,7:5,10
-chr15	38282343	.	ATG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,4:5,1:7,3
-chr15	39744820	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0059696;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,2:4,6
-chr15	40573020	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,3:2,1
-chr15	41960670	.	A	AT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0010995;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,5:1,1
-chr15	43117519	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.6255e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,13:5,5:5,8
-chr15	43628891	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.001514;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:8,11:8,2
-chr15	44962347	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.15499;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,5:10,2:7,3
-chr15	47772357	.	C	CGT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,5:1,3:3,2
-chr15	49616645	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0023473;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:9,3:4,6
-chr15	50629859	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0012626;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:0,7:0,4:0,3
-chr15	50762735	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.014912;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,2:5,3
-chr15	53729496	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,3:10,1
-chr15	55210195	.	G	GTATA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.013455;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,1:4,4
-chr15	55210208	.	C	CAT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,1:7,3
-chr15	55262545	.	G	GA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.014569;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,6:1,3:0,3
-chr15	55822490	.	ACT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.031374;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,4:5,3
-chr15	56484874	.	T	TG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0077143;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,4:11,2
-chr15	57123996	.	TC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,1:6,3
-chr15	59592718	.	GTTT	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:6,3:3,1
-chr15	59658155	.	CAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:3,3:2,1
-chr15	59740539	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.048504;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,3:7,3
-chr15	60037718	.	G	GACACAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,9:4,7:1,2
-chr15	60668964	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.022618;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,4:10,1
-chr15	61008651	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=4.363e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:11,6:9,7
-chr15	61778569	.	AAAGGAAGGAAGG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0017499;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,8:4,4:1,4
-chr15	62282875	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=7.0453e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:8,4:8,6
-chr15	63932164	.	T	TAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,3:6,2
-chr15	64002916	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.013595;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,7:3,6:2,1
-chr15	65160621	.	TCTCA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:2,3:8,5
-chr15	66596799	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,2:4,2
-chr15	68235593	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.125;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,2:4,2:0,0
-chr15	68402842	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.1392e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,7:4,3
-chr15	69260252	.	GT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,2:7,2
-chr15	69810400	.	AACACAC	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00036978;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:7,7:1,6
-chr15	69993318	.	GAAAGAGAC	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.010145;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,4:4,2
-chr15	70364401	.	A	AT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,2:2,3
-chr15	72482839	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.015907;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:2,5:8,2
-chr15	72660853	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:3,4:0,1
-chr15	74303679	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=3.5745e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:19,9:11,4
-chr15	74939066	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.036707;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,2:5,2
-chr15	75266350	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.059432;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:0,0:19,4
-chr15	75376695	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.3956;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,2:1,1:6,1
-chr15	75481742	.	G	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
-chr15	75491402	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.019042;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,10:12,6:2,4
-chr15	75528695	.	AT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0053554;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,15:4,7:3,8
-chr15	75615594	.	A	AT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:6,4:4,1
-chr15	75782577	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,2:10,2
-chr15	76249435	.	A	ATC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:3,4:4,7
-chr15	77277556	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.8785e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:10,7:6,7
-chr15	77497684	.	T	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024242;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,7:1,4:0,3
-chr15	77528920	.	G	GT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.007251;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,7:8,2
-chr15	78386955	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0020026;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:7,9:3,3
-chr15	78877113	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:5,5:1,2
-chr15	79847669	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,9:4,8:2,1
-chr15	80832324	.	G	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
-chr15	81356253	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=1.7201e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:7,9:4,4
-chr15	81878296	.	T	TCTCTCTCTCTCC	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,5:1,1:2,4
-chr15	82383908	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.025565;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,2:5,3
-chr15	82483047	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.018356;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:7,1:6,6
-chr15	82497785	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0018936;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,6:4,5:3,1
-chr15	83393258	.	CT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.014488;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:15,5:5,1
-chr15	84765535	.	G	GT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.029874;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,5:6,4:11,1
-chr15	85251985	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.031261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,3:7,3
-chr15	85252017	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027592;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,3:11,3
-chr15	85841979	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,8:1,7:5,1
-chr15	85844597	.	CAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:2,3:3,3
-chr15	85989649	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.03094;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:10,5:7,1
-chr15	86553517	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=4.8252e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:12,6:9,11
-chr15	88474552	.	T	TC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.03699;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,7:13,4:7,3
-chr15	88923804	.	C	CAAAAACA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.042412;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,4:7,2:8,2
-chr15	88966785	.	T	TTGTTTTATTTTTTGTTTG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0045015;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:6,3:6,5
-chr15	89944102	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0026087;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,5:3,2
-chr15	90496306	.	CTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
-chr15	91337841	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.012821;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,5:1,3:2,2
-chr15	91871753	.	TG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0067841;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:3,6:5,5
-chr15	93100836	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:3,4:0,0
-chr15	93978594	.	TTC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0099161;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:0,3:7,4
-chr15	96477154	.	T	TATTATATATATATATATATATAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,2:7,3
-chr15	96554807	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:1,4:0,0:1,4
-chr15	98381629	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.01454;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:12,2:9,4
-chr15	100467152	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.024548;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,1:6,4
-chr15	101860790	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00032976;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:13,5:12,8
-chr15	101954372	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0020073;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:4,5:13,8
-chr16	1250930	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0074932;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:8,6:4,1
-chr16	4774608	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013362;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,3:6,3
-chr16	6416298	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.018505;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:16,2:6,4
-chr16	6664339	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.012279;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:14,6:13,2
-chr16	6798990	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.018514;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,2:10,3
-chr16	7112644	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,6:7,1
-chr16	7120821	.	ATG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:8,2:12,2
-chr16	7203667	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:13,2:6,8
-chr16	9830480	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.00088417;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,4:1,1
-chr16	10380850	.	CT	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.036143;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:7,1:13,5
-chr16	10439049	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,5:2,3:2,2
-chr16	12062377	.	A	AAAAT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011613;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:5,7:12,3
-chr16	13622488	.	CTG	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:11,1:4,3
-chr16	14928709	.	G	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
-chr16	14982188	.	T	G	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.022391;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:60,7:38,3:22,4
-chr16	15103660	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.013238;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,1:5,7
-chr16	15202829	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.007006;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:6,4:12,5
-chr16	16134625	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:1,3:3,1
-chr16	16160628	.	CAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:4,4:2,1
-chr16	16444695	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0033619;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:11,3:8,6
-chr16	16447974	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.046007;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:11,3:15,1
-chr16	16550592	.	A	ATTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0025265;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:6,2:7,7
-chr16	16720265	.	T	TTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0062751;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:6,7:7,4
-chr16	16829613	.	ATTTTTTT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.004644;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:4,3:1,4
-chr16	17204966	.	CAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.025944;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,5:4,2
-chr16	17643997	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,4:3,2:6,2
-chr16	17916004	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.5771e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:9,9:13,5
-chr16	18181093	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.041596;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:10,3:18,1
-chr16	18237898	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.037749;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:18,4:9,2
-chr16	18963513	.	ATG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011088;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:5,5:10,2
-chr16	18963517	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0072303;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,5:6,1
-chr16	20138748	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.013124;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:2,5:5,3
-chr16	21155621	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:3,4:3,2
-chr16	21675063	.	GTCTT	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00047718;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,11:2,4:3,7
-chr16	22681401	.	CA	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.010119;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,6:16,4:11,2
-chr16	22824558	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040656;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:4,3:11,3
-chr16	23020660	.	CTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0011576;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:3,13:0,7:3,6
-chr16	25746742	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0010337;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:9,7:6,7
-chr16	25993949	.	CGTGTGT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0038647;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:3,6:4,1
-chr16	26005732	.	GA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00054483;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:11,8:7,4
-chr16	26238514	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,4:1,2:5,2
-chr16	26417291	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0779;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:7,5:10,3
-chr16	26464372	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00022959;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,2:8,6
-chr16	26653957	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,5:3,4:0,1
-chr16	27000580	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:9,3:2,1
-chr16	28361764	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.011858;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:4,15:0,4:4,11
-chr16	28424469	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr16	28738180	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.016411;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:10,6:5,2
-chr16	28739478	.	C	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:1,0:9,4
-chr16	29054144	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.031533;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:20,3:6,3
-chr16	29445775	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr16	30016057	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:2,1:5,1
-chr16	30267081	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
-chr16	30466462	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,4:2,2
-chr16	30789230	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:9,3:3,1
-chr16	30817175	.	A	AT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,4:5,3
-chr16	31013407	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:1,2:0,1:1,1
-chr16	31149092	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=6.8881e-09;SS=2;SSC=81;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:5,15:3,11:2,4
-chr16	31247659	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.012394;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,3:9,3
-chr16	31382130	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=3.1132e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:8,6:7,6
-chr16	31757826	.	ATAGG	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0073773;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,2:7,7
-chr16	32096815	.	T	A	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.0057363;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:55,19:15,6:40,13
-chr16	32107256	.	G	A	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.0095044;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:75,14:17,10:58,4
-chr16	32107271	.	C	A	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.0068574;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:71,13:15,9:56,4
-chr16	32159292	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,6:4,2
-chr16	32217275	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0034214;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:11,7:3,3
-chr16	32258018	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.010674;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,1:8,3
-chr16	32298407	.	A	G	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.014476;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:23,11:19,5
-chr16	32328266	.	C	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.039273;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:19,5:14,6
-chr16	32812945	.	C	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.03082;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:24,3:15,3
-chr16	32829994	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.020896;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:24,2:21,6
-chr16	32830026	.	G	C	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.019883;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:23,4:26,6
-chr16	32837836	.	G	C	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.0063265;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:95,23:68,20:27,3
-chr16	32891234	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0032243;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,4:3,2
-chr16	33026241	.	C	T	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.038966;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:65,10:43,8:22,2
-chr16	33029546	.	G	A	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.0042381;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:18,2:27,4
-chr16	33581695	.	C	CT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.040599;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:11,4:10,5
-chr16	33591570	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.012155;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:12,6:21,6
-chr16	33728041	.	A	ATTAAT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.020116;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:12,8:14,1
-chr16	34586236	.	T	C	0	PASS	DP=1574;GPV=1;SPV=0.018905;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:794:688,106:55,9:633,97
-chr16	34591720	.	T	TC	0	PASS	DP=868;GPV=1;SPV=0.017863;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:408:121,24:64,12:57,12
-chr16	35979167	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=1.9714e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,16:4,5:5,11
-chr16	36241585	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=4.9557e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:13,9:10,5
-chr16	36515521	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.012544;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:15,5:3,2
-chr16	36671635	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:6,4:0,0
-chr16	37862493	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0058227;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:9,10:11,2
-chr16	38129102	.	T	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.041058;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:25,3:11,1
-chr16	46456668	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.041383;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:16,3:8,2
-chr16	46468062	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.5767e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:9,9:6,4
-chr16	48316323	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.049774;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:4,5:2,1
-chr16	48527040	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.035909;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:16,4:17,2
-chr16	48579679	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.015379;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,4:8,1
-chr16	48927307	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00039851;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:8,4:12,6
-chr16	49688095	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,2:0,1:1,1
-chr16	51046768	.	CAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.002838;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,6:2,1
-chr16	52105557	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00065661;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:13,1:6,7
-chr16	54410785	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,2:1,1:0,1
-chr16	54833298	.	G	GACACACACAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.002331;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:0,6:0,3:0,3
-chr16	55426518	.	G	GCTCTCTCT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:6,5:3,1
-chr16	57362879	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.033939;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:10,2:16,3
-chr16	57877100	.	T	TA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.02396;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:3,5:2,1
-chr16	59738855	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.065116;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:16,3:4,1
-chr16	60446188	.	CAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,2:5,2
-chr16	60506800	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0052479;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:15,5:16,2
-chr16	60819181	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.022389;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:12,2:14,4
-chr16	60866253	.	T	TA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,6:6,1
-chr16	63238833	.	AAAGG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,2:12,2
-chr16	63342623	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=3.4337e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:7,7:4,3
-chr16	63831399	.	C	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.014934;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,4:6,3
-chr16	64104330	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,3:3,1
-chr16	64721892	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00016168;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:6,5:11,5
-chr16	65555993	.	G	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,5:3,1
-chr16	65687577	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.1154e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,18:10,9:3,9
-chr16	68283590	.	AAG	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,3:17,1
-chr16	68735645	.	A	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,3:1,1:2,2
-chr16	68811396	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.02882;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:11,4:3,2
-chr16	69005788	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0027337;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:8,6:2,5
-chr16	70120931	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:0,2:4,2
-chr16	70174691	.	G	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.046823;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:16,7:18,3
-chr16	71736551	.	ATTATTTAT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037055;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:3,3:6,2
-chr16	72554038	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,3:6,2
-chr16	72822795	.	GT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.004156;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:2,7:2,2
-chr16	73233108	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,10:2,8:4,2
-chr16	73890254	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,3:4,3
-chr16	74395530	.	CT	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.022661;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,7:13,6:8,1
-chr16	74838044	.	ATATATATG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.014712;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,4:2,4
-chr16	75050776	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.00022655;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,13:1,3:5,10
-chr16	75354641	.	A	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.7137e-11;SS=2;SSC=107;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:11,25:7,12:4,13
-chr16	76589820	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00037668;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:4,8:7,1
-chr16	77100673	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.13182;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:15,2:11,1
-chr16	77153592	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.001026;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:13,7:11,3
-chr16	77420002	.	T	TAAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16587;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:3,2:8,3
-chr16	78301290	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.6735e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:9,8:11,8
-chr16	79655414	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.015417;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:1,3:8,1
-chr16	79995164	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0024526;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,7:2,4:2,3
-chr16	81191374	.	A	ATT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.026907;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:1,4:11,4
-chr16	81414860	.	A	AGTGTGT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,2:2,3
-chr16	81568039	.	G	GTGTGT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,7:3,5:0,2
-chr16	82899775	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.087902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,1:16,3
-chr16	83007824	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:5,3:6,2
-chr16	83971093	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027339;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:8,2:6,2
-chr16	84697678	.	TATATATATATATATATATATATATATATATG	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
-chr16	84787898	.	T	TA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028534;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:9,7:4,1
-chr16	85100004	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0045922;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:11,7:6,7
-chr16	87187298	.	G	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:9,1:6,4
-chr16	88115662	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:8,3:1,1
-chr16	88314100	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0054356;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,7:5,1
-chr16	88521081	.	GATTA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,2:4,2:0,0
-chr16	88521088	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.10989;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,2:3,2:0,0
-chr16	88677238	.	A	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040809;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,3:9,5
-chr16	90136987	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
-chr16	90209815	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,1:3,3
-chr17	321603	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.069354;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,5:15,3:9,2
-chr17	548434	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.032347;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:14,2:10,6
-chr17	643543	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.058162;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,1:5,3
-chr17	662873	.	C	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.013487;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,6:7,5:3,1
-chr17	942786	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.049808;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,3:4,1
-chr17	1164351	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:10,4:2,3
-chr17	1328160	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.011294;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:7,5:7,2
-chr17	1328161	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011088;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:7,5:8,2
-chr17	1656561	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0092196;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:10,7:13,2
-chr17	2090184	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,2:1,1:2,1
-chr17	2487323	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00056474;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:10,6:12,5
-chr17	3327672	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,4:5,2
-chr17	3645859	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.014023;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:11,7:4,3
-chr17	3756220	.	TG	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:1,3:5,2
-chr17	4394807	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.13043;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,2:1,1:6,1
-chr17	4570600	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,2:3,3
-chr17	4578810	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.3211e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:9,6:11,9
-chr17	5240636	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
-chr17	5420125	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=6.1831e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:12,10:8,4
-chr17	5552084	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:1,2:2,2
-chr17	6662001	.	ATATTT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034418;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:2,3:10,3
-chr17	9106467	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,5:2,2:2,3
-chr17	9195209	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0099416;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:0,3:9,2
-chr17	10153519	.	CA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:4,4:1,2
-chr17	10323784	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,2:1,1:3,1
-chr17	11366816	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.010971;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:12,3:14,3
-chr17	11422051	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=3.7248e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,20:11,12:5,8
-chr17	11762306	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.019518;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:18,3:12,3
-chr17	11845265	.	TTG	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,2:6,4
-chr17	14375018	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0031185;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,4:9,3
-chr17	16328600	.	ATATATATATAT	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:0,2:0,0:0,2
-chr17	16422760	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0017851;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:9,3:15,4
-chr17	17708429	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,4:7,3:7,1
-chr17	18492068	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0017458;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:2,4:0,2
-chr17	18862802	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.016311;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,2:6,4
-chr17	19565577	.	CT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,3:2,1
-chr17	20330767	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.039686;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:8,1:21,4
-chr17	20470693	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
-chr17	20815219	.	A	ATT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.015905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,8:3,5:1,3
-chr17	21048746	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00041746;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:1,10:9,5
-chr17	21648749	.	A	AT	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0028141;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:16,8:15,6
-chr17	21712856	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.04855;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:16,9:13,1
-chr17	21723268	.	C	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.019206;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:23,8:14,3
-chr17	21740034	.	A	G	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=1.3924e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:57,18:25,11:32,7
-chr17	22198061	.	AT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00026518;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:10,8:5,3
-chr17	22217042	.	AAACAAG	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0204;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:12,6:5,4
-chr17	22384676	.	G	T	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.043277;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:55,14:8,1:47,13
-chr17	22391591	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.024109;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:13,3:6,1
-chr17	26717800	.	C	G	0	PASS	DP=555;GPV=1;SPV=0.033702;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:261:234,27:109,14:125,13
-chr17	26722452	.	G	A	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.011266;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:73,12:45,8:28,4
-chr17	26763941	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.015084;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,8:21,4:17,4
-chr17	26767603	.	A	C	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.020548;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:88,18:56,14:32,4
-chr17	26951309	.	T	C	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.014823;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:98,13:63,11:35,2
-chr17	26955229	.	G	A	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.042553;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:72,17:28,4:44,13
-chr17	26959916	.	T	G	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.03106;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:65,8:31,5:34,3
-chr17	26983562	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:14,2:14,2
-chr17	27162354	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,6:2,1
-chr17	27470016	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.046386;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,4:12,1
-chr17	28118620	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=9.4646e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,18:5,8:9,10
-chr17	28225289	.	T	TAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.069102;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:13,5:5,1
-chr17	29970637	.	G	GACACACAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.07313;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:9,3:7,2
-chr17	30015759	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.025944;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,6:4,1
-chr17	31675970	.	G	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018499;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,2:5,3
-chr17	31675974	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0086957;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,3:4,3
-chr17	32248071	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023079;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:3,1:1,4
-chr17	33464540	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:3,1:7,3
-chr17	33634710	.	CTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0035698;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,7:2,6:4,1
-chr17	34120743	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.015182;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:5,1:0,4
-chr17	35437787	.	TGCTTGCA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00068054;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,14:6,9:4,5
-chr17	36185264	.	A	G	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.0029013;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:82,18:41,8:41,10
-chr17	36238037	.	CA	C	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.047806;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:50,11:29,7:21,4
-chr17	36887234	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.019411;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:6,6:12,6
-chr17	36912504	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,2:7,2
-chr17	37022153	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.033431;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,6:7,2:8,4
-chr17	37766921	.	TCACACACACACACA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,9:3,7:1,2
-chr17	37766937	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,5:4,2
-chr17	38258518	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.024863;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,8:11,2
-chr17	38832576	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,4:4,5
-chr17	40275261	.	AC	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0045549;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,4:6,2
-chr17	40837042	.	GT	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.020979;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,7:1,5:1,2
-chr17	43569855	.	T	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:0,2:7,2
-chr17	45609919	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.04235;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:10,3:18,6
-chr17	45625576	.	T	TC	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.031028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,1:10,4
-chr17	46495135	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.04252;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:7,1:17,7
-chr17	46844305	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,5:1,3:0,2
-chr17	49173863	.	TGAGCTTTATG	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0011868;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:5,5:2,6
-chr17	49232226	.	G	GA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,4:0,3:0,1
-chr17	50030081	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,4:3,1
-chr17	50083723	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,2:4,4
-chr17	50360571	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.016023;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,10:9,9:4,1
-chr17	50524739	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.12928;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,1:9,3
-chr17	51080260	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.00020919;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,2:4,6
-chr17	52816391	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020833;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:7,6:8,2
-chr17	53327791	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,1:5,4
-chr17	54246168	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0062691;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:3,5:10,5
-chr17	54246177	.	T	TGTG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0033479;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:3,4:8,6
-chr17	54401303	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0010255;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,4:10,6
-chr17	54576215	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:5,2:8,3
-chr17	54576700	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0035488;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:7,6:7,6
-chr17	54891017	.	A	AACACACACACACAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,10:3,6:0,4
-chr17	58026563	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.4524e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,15:4,7:7,8
-chr17	58710500	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.049766;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,4:4,1
-chr17	59250613	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.019548;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,7:5,4:5,3
-chr17	60019439	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.013871;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:14,2:20,3
-chr17	60244029	.	G	GT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:2,1:3,1
-chr17	61535757	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0058007;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,9:1,8:2,1
-chr17	61577447	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.046752;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,2:4,5
-chr17	62039586	.	GA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:6,6:1,1
-chr17	62342287	.	GT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,6:7,5:4,1
-chr17	65341016	.	A	AAAAAACAAAAAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031815;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:12,5:4,2
-chr17	66407338	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00088893;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:7,6:12,6
-chr17	67329141	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
-chr17	68379421	.	A	ATT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,3:2,1
-chr17	68499368	.	A	AAG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0048821;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,9:0,7:2,2
-chr17	71468127	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0067708;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:14,5:9,2
-chr17	71608301	.	C	CTATA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,1:2,3
-chr17	77048303	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0014835;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:4,2:10,6
-chr17	77647415	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020538;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,1:6,3
-chr17	79463487	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.042892;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,3:3,1:1,2
-chr17	79463493	.	G	GCCACCT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:4,1:1,1
-chr17	80416714	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,2:0,1:7,1
-chr17	82122432	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.030827;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:12,4:15,4
-chr17	82212393	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036419;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:6,3:6,2
-chr18	113178	.	A	AAAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:4,5:1,1
-chr18	178004	.	G	GTGTT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00071601;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:7,9:7,5
-chr18	700916	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,5:4,1
-chr18	889514	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0023953;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,9:7,5:3,4
-chr18	915781	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0072464;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:6,4:2,3
-chr18	2384404	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,13:0,5:7,8
-chr18	2621263	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.027438;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,4:4,1
-chr18	2621264	.	A	AG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023764;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,4:4,1
-chr18	3343041	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.16126;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,5:9,4:4,1
-chr18	3923133	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:6,7:2,1
-chr18	4066348	.	A	AAAAT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0001352;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:5,4:8,5
-chr18	4548393	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:3,3:2,2
-chr18	4781352	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0019836;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,11:6,9:3,2
-chr18	5324617	.	A	ACAACAT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.006391;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,3:5,2
-chr18	5949713	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.02027;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,3:9,4
-chr18	6446370	.	GAC	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.021903;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,5:4,1
-chr18	7236433	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0036999;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:4,6:1,1
-chr18	8725790	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:0,5:0,1:0,4
-chr18	8838752	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=2.8089e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,20:7,8:8,12
-chr18	9480414	.	A	AT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:6,5:7,4
-chr18	10604917	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,4:6,4
-chr18	10757193	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:4,8:2,2
-chr18	11646123	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:21,3:10,4
-chr18	11646124	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0395;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:21,3:12,3
-chr18	11813263	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.030289;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,2:5,3
-chr18	12214347	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.022419;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:13,1:9,7
-chr18	13591434	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.041596;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:13,1:15,3
-chr18	13904655	.	A	AACAGGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.023962;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:11,3:6,4
-chr18	13904663	.	C	CCAAAACAGTAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.019247;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,9:11,4:8,5
-chr18	14547291	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.038345;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:10,2:18,4
-chr18	15174876	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.057873;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:14,2:26,3
-chr18	15371534	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=9.1439e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:9,5:13,7
-chr18	15406854	.	C	A	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.023607;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:72,11:50,6:22,5
-chr18	15406877	.	T	C	0	PASS	DP=197;GPV=1;SPV=0.03962;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:93,11:67,5:26,6
-chr18	15410625	.	C	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.0062788;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:43,15:8,3:35,12
-chr18	15467492	.	C	T	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.0066392;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:56,11:21,2:35,9
-chr18	15482975	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.043831;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,6:7,2:26,4
-chr18	15492794	.	T	G	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.049961;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:64,11:57,9:7,2
-chr18	15492959	.	C	G	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.017499;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:141:123,18:68,8:55,10
-chr18	15513931	.	A	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
-chr18	15534382	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0053311;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:2,4:19,2
-chr18	15551751	.	T	C	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.0022736;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:95,23:59,13:36,10
-chr18	15551816	.	C	T	0	PASS	DP=378;GPV=1;SPV=0.049575;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:155,25:58,21:97,4
-chr18	15585070	.	G	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.011783;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:1,3:8,2
-chr18	15625476	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.045508;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:0,0:19,4
-chr18	15654737	.	T	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.04252;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:8,7:16,1
-chr18	15776941	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.035565;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:21,9:22,4
-chr18	15872075	.	T	G	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.018432;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:50,10:10,1:40,9
-chr18	15968013	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr18	16465131	.	C	A	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.026665;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:48,9:39,7:9,2
-chr18	16524963	.	C	G	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.040632;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:18,7:25,5
-chr18	16645020	.	C	T	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.022836;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:71,14:32,9:39,5
-chr18	17355884	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,0:9,4
-chr18	18949466	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.060779;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:23,3:12,1
-chr18	19117525	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.032677;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:11,8:19,1
-chr18	19257442	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0019155;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,2:2,3
-chr18	19288468	.	T	A	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.040476;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:84,16:48,7:36,9
-chr18	19397234	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.043004;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:3,2:31,5
-chr18	20810329	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.035721;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
-chr18	21030198	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=2.199e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,15:10,7:5,8
-chr18	21613854	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,7:5,5:5,2
-chr18	21983286	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018436;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:4,3:7,5
-chr18	22232356	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.054545;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:20,2:14,2
-chr18	22243972	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=4.965e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:5,4:13,8
-chr18	23616122	.	CCGTA	C	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.022833;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:23,7:20,4
-chr18	24748641	.	TTTCC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0091533;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:0,1:6,5
-chr18	26007125	.	A	ATTTTGCTTATACTTCTCAGT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.026903;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:6,5:9,2
-chr18	26256819	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013932;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:2,13:0,5:2,8
-chr18	26365002	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0060573;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,6:1,1
-chr18	27155104	.	AAAG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0029007;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,3:6,3
-chr18	27219843	.	CATATATAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:1,1:3,1
-chr18	27860667	.	CTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0045249;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,6:1,3:2,3
-chr18	28271054	.	G	GTTATTGTATTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.017056;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:3,2:7,5
-chr18	28271056	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.018018;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:3,1:6,6
-chr18	29512143	.	ATATT	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:13,5:10,4
-chr18	29512159	.	T	TATTA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.021619;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:16,5:11,3
-chr18	29910419	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=6.1797e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:7,9:9,3
-chr18	30478041	.	AGTG	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.019244;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,3:5,3
-chr18	30854728	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0029895;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:10,5:7,2
-chr18	31290492	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.011302;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:10,6:10,3
-chr18	32153722	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:6,4:0,0
-chr18	32904389	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.017995;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:7,1:16,4
-chr18	33306606	.	T	TTA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.010488;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:11,4:6,8
-chr18	33926231	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=5.0681e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:6,3:5,9
-chr18	36132817	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.041011;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,2:7,2
-chr18	36264616	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00064637;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:8,5:8,5
-chr18	36270711	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01204;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,4:2,1
-chr18	37709472	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:4,1:4,3
-chr18	39135912	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.6575e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:11,10:10,3
-chr18	39324724	.	C	CAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0069323;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,8:2,4:2,4
-chr18	39379704	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.046464;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,1:9,3
-chr18	40557893	.	CTTT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,2:3,1:1,1
-chr18	40844667	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.079534;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:28,2:10,3
-chr18	41863748	.	T	TGA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0075758;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,6:1,5:0,1
-chr18	43949741	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00028843;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:10,4:7,6
-chr18	43970339	.	G	GT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,2:6,2
-chr18	44214083	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0074932;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,7:9,5:3,2
-chr18	45422642	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00057266;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,2:5,4
-chr18	47076820	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:8,2:11,2
-chr18	47419530	.	T	TA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0005667;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,9:4,5:6,4
-chr18	48510744	.	C	CAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,2:4,2
-chr18	49292592	.	GAAAAAAAAAAAAAA	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,3:2,1
-chr18	49463562	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,4:2,1
-chr18	49508668	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:10,4:0,0
-chr18	49592974	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.02087;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,1:3,5
-chr18	50180234	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00042047;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:10,4:10,4
-chr18	50361668	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.011795;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,1:7,6
-chr18	50531157	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00012397;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:5,3:9,7
-chr18	50552615	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00029607;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:10,3:9,8
-chr18	51296831	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0016775;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:15,5:6,3
-chr18	52012995	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.011037;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,6:3,4:2,2
-chr18	52753534	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0011694;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:18,4:14,6
-chr18	53699817	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,2:5,2
-chr18	57035014	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=5.8903e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:5,3:11,7
-chr18	57549425	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.021315;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:15,6:7,3
-chr18	58920735	.	CGTGT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.014142;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:3,4:2,2
-chr18	59390178	.	A	ATATATTATATTATAT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:5,2:1,2
-chr18	59882953	.	C	CATTTATTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,8:3,4:10,4
-chr18	62581837	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,3:4,1
-chr18	62924678	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028205;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,3:4,1
-chr18	63839578	.	AT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,7:4,2:7,5
-chr18	64680435	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:4,3:2,2:2,1
-chr18	64709340	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10773;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,3:13,2
-chr18	65283293	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,5:1,1:6,4
-chr18	65573943	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,3:9,1
-chr18	67365587	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.010837;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,5:6,4:2,1
-chr18	67990258	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.009946;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:14,3:10,4
-chr18	68096305	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.00026221;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,12:3,4:4,8
-chr18	69606759	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,2:4,1:1,1
-chr18	70391030	.	CTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,1:3,3
-chr18	71415223	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0060362;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,5:5,2
-chr18	71568521	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031008;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,3:8,2
-chr18	72700416	.	C	CTCTATATA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:2,2:4,2
-chr18	73201687	.	T	TC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0037594;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:3,4:0,4
-chr18	73206219	.	G	GACACATGC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0030514;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,8:5,1
-chr18	74195852	.	ATATATATATGTG	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,2:0,0:3,2
-chr18	74514554	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,4:3,1
-chr18	76312063	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.4018e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:6,6:11,4
-chr18	76377715	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010145;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,4:4,2
-chr18	77234747	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00020046;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:14,8:9,2
-chr18	78513550	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0050014;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:10,1:19,5
-chr18	78695069	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,3:4,1:1,2
-chr18	79341508	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
-chr18	79820402	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=5.1966e-11;SS=2;SSC=102;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:23:5,18:3,11:2,7
-chr19	161053	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,3:3,1
-chr19	376227	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.1572e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,19:5,11:6,8
-chr19	513703	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
-chr19	844020	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.001393;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:10,8:7,7
-chr19	1164423	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13725;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:1,1:4,1
-chr19	1164524	.	CAGG	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,5:1,2:2,3
-chr19	3475636	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,4:4,1
-chr19	3651055	.	G	GTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.013514;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:12,5:3,2
-chr19	3674167	.	A	ACT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0063654;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:14,5:10,3
-chr19	4753332	.	G	GA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.02253;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,5:5,4:0,1
-chr19	5265174	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=8.8195e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:5,2:7,9
-chr19	5357533	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=2.4214e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:4,7:7,5
-chr19	5518389	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:11,4:10,2:1,2
-chr19	7458296	.	T	TA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:8,3:11,1
-chr19	8440982	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:3,3:2,1
-chr19	8720253	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,3:1,1:5,2
-chr19	8977752	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0041454;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,1:11,5
-chr19	9014031	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=1.4124e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:4,7:5,3
-chr19	10075340	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.012138;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:4,2:5,2
-chr19	10589212	.	AT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00011933;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:7,6:7,5
-chr19	12278316	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00029659;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:7,4:6,5
-chr19	13416277	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0081556;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:4,6:7,3
-chr19	13443338	.	ATTTTAT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0042025;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,9:8,3
-chr19	13747881	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.9635e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:15,6:14,8
-chr19	14730455	.	CCTCT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.03094;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:5,3:12,3
-chr19	15038635	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.037847;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,1:9,3
-chr19	16450477	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01204;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,3:2,2
-chr19	16472433	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.018925;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,2:9,2
-chr19	19398485	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0015417;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:1,2:7,4
-chr19	21307163	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.014432;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,6:13,5:6,1
-chr19	21611259	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,1:5,7
-chr19	22445435	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.454e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,18:8,8:9,10
-chr19	22448089	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.037062;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:23,3:5,3
-chr19	22698657	.	CTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:2,5:4,2
-chr19	23964406	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.015726;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:4,3:10,1
-chr19	24389137	.	C	A	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.0064764;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:52,6:23,4:29,2
-chr19	24437013	.	A	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.020145;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:44,10:31,4:13,6
-chr19	27958087	.	T	TGATA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.012894;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:15,4:6,2
-chr19	29095436	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.073684;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,3:0,1:6,2
-chr19	29494823	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:5,2:0,0
-chr19	29901399	.	A	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
-chr19	31009586	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=4.7869e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:10,7:10,7
-chr19	32128553	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,1:4,3
-chr19	32318146	.	G	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0017334;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,14:6,5:3,9
-chr19	32318147	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00097094;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:4,5:3,7
-chr19	32351419	.	C	CTG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.011696;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:4,3:0,1
-chr19	32940266	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018485;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:0,3:10,8
-chr19	33023784	.	C	CA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:4,3:1,1
-chr19	34101461	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.059432;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:13,1:6,3
-chr19	36190991	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,5:4,1
-chr19	36268999	.	C	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
-chr19	36301999	.	C	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,3:6,3:0,0
-chr19	37268114	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0036749;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:8,3:11,8
-chr19	37290068	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.074163;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:0,0:27,4
-chr19	37493362	.	TA	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0022813;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:6,5:12,4
-chr19	38258689	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,1:4,3
-chr19	38450773	.	C	CAATAAATAAATA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0088972;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,6:4,2
-chr19	40158875	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00069047;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,4:7,3
-chr19	40773433	.	CA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
-chr19	41457272	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0066591;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:5,3:4,6
-chr19	45594061	.	AAAAT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:3,2:6,2
-chr19	46047138	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=1.9406e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:3,5:6,4
-chr19	46877250	.	A	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,2:1,1:4,1
-chr19	47338275	.	TA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.03925;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:13,2:7,2
-chr19	47922878	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr19	48582961	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:7,1:6,5
-chr19	49182090	.	ATCTG	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,3:5,1
-chr19	50074720	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0018313;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:16,1:8,7
-chr19	50099771	.	G	A	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.038131;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:91,13:40,5:51,8
-chr19	50528408	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.115;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:16,3:18,2
-chr19	50907404	.	CTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:1,2:3,3
-chr19	51425068	.	CA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,6:1,4:1,2
-chr19	51782180	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.032881;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:7,2:10,4
-chr19	52761920	.	G	GAA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:6,4:0,0
-chr19	52954040	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0048547;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:4,9:3,1
-chr19	53286939	.	AT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0059828;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,4:5,1
-chr19	53366094	.	G	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00012488;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:2,7:10,3
-chr19	53674343	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0010146;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:11,7:15,5
-chr19	53946591	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,2:2,1:5,1
-chr19	54246406	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,2:3,1:4,1
-chr19	54986556	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02545;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,7:9,5:3,2
-chr19	55409461	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:0,2:0,0:0,2
-chr19	55983465	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,2:2,1:2,1
-chr19	56962067	.	CACAGACACACAG	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0016986;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:7,8:3,3
-chr2	389235	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15966;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:9,2:8,1
-chr2	442407	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,2:5,2
-chr2	442420	.	C	CGT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,6:6,2:8,4
-chr2	570393	.	G	GAAGAAGA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0038106;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,12:8,9:3,3
-chr2	582563	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0032805;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:8,15:6,4
-chr2	582950	.	A	AGGC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:14,1:9,4
-chr2	582951	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.084231;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:15,2:11,6
-chr2	1072531	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0011582;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:10,4:9,4
-chr2	1139826	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:6,6:2,1
-chr2	1244695	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018436;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,8:7,7:4,1
-chr2	1255895	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,4:6,1
-chr2	1272706	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,3:8,1
-chr2	3269281	.	G	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0040496;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:0,3:7,6
-chr2	3530806	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.02835;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,7:6,2
-chr2	3590439	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0249;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:2,2:14,2
-chr2	4318394	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.1953e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:16,7:11,7
-chr2	5198986	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.1463;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:19,5:12,1
-chr2	5895511	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.057534;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:13,3:21,1
-chr2	6063499	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0022018;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:16,7:11,2
-chr2	6078180	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.010614;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:18,5:9,3
-chr2	6253208	.	A	ATATATACACG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,3:6,3
-chr2	6270012	.	CAA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:8,4:5,11
-chr2	9113395	.	C	CAT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.069135;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:11,2:16,2
-chr2	9254236	.	AAT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.017292;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:7,4:7,3
-chr2	9828022	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,4:0,1:14,3
-chr2	10607750	.	T	TTTATTATTATTATTATTATTATTA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.061437;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:8,5:12,4
-chr2	11142713	.	A	ATT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,7:0,5:2,2
-chr2	11334510	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.014047;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:14,10:4,3
-chr2	11607637	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12591;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,3:15,1
-chr2	11814512	.	A	ATG	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0079023;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,12:20,10:10,2
-chr2	11902372	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0031331;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,5:3,3
-chr2	12814596	.	A	AAAAAAG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,9:0,4:3,5
-chr2	13826601	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.083915;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,3:14,1
-chr2	14070832	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.012658;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:20,5:13,5
-chr2	14253010	.	CTGTGTGTGTGTGTGTGTG	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0040496;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,9:3,3:4,6
-chr2	14516681	.	TAAAAAAA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018839;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,4:6,4
-chr2	14686910	.	GAC	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.001935;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,11:2,8:2,3
-chr2	15857076	.	C	CAA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.034476;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,12:13,8:7,4
-chr2	16039566	.	T	TTC	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.012821;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,5:0,1:3,4
-chr2	16884742	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12114;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,1:10,3
-chr2	17018732	.	C	CAA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,11:7,8:5,3
-chr2	17138814	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.029832;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:11,8:4,4:7,4
-chr2	17778199	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.003803;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:5,7:7,5
-chr2	18289119	.	A	AAGAGAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:9,7:7,6:2,1
-chr2	18970585	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0068026;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:30:4,14:2,9:2,5
-chr2	19548692	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.057027;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:14,5:12,1
-chr2	20374483	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.077118;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,13:10,10:11,3
-chr2	20710610	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03942;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:8,7:8,1
-chr2	20971929	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,4:16,3:5,1
-chr2	21437292	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0021615;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:16,6:18,3
-chr2	22532172	.	T	TTA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,6:3,3:5,3
-chr2	22743862	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:6,4:3,3
-chr2	24155524	.	TATATATA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,2:0,0:2,2
-chr2	24443841	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=8.275e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:9,20:5,11:4,9
-chr2	24939079	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.2122;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,2:11,2
-chr2	25496842	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0039984;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,10:6,6:5,4
-chr2	25672203	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,7:2,6:5,1
-chr2	26654811	.	TGA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.056718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:7,1:12,4
-chr2	26906186	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.073366;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:11,5:8,3
-chr2	28076473	.	T	TTTAG	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,14:13,8:11,6
-chr2	28258615	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:2,1:4,3
-chr2	28373407	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,3:4,5
-chr2	28541184	.	AT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.12341;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:14,3:17,1
-chr2	29085657	.	TAAA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:2,3:9,2
-chr2	30319656	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0010154;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:4,5:7,9
-chr2	31725693	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00027662;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:15,10:17,3
-chr2	31803289	.	TAA	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0034858;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,19:15,16:6,3
-chr2	32555914	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.02531;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,11:13,9:3,2
-chr2	34028109	.	C	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.033799;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:26,5:18,1
-chr2	34109266	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,2:6,2
-chr2	34741971	.	T	TA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.025434;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:13,3:15,4
-chr2	34741975	.	A	AT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.026092;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,7:10,3:11,4
-chr2	35499194	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0077613;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:24,5:12,2
-chr2	36342606	.	C	CTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0030514;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:4,5:7,5
-chr2	36546763	.	ATTT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,11:1,9:6,2
-chr2	36609232	.	CAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0098951;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,15:3,11:4,4
-chr2	37309848	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.50909;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:6,2:5,1:1,1
-chr2	37396940	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011309;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,6:10,5:10,1
-chr2	39226477	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.25968;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:8,3:12,1
-chr2	39686963	.	ATGTGTGTGTG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0096894;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,6:2,5:5,1
-chr2	39721985	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:8,8:2,1
-chr2	39773575	.	AT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.060413;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,5:11,3:6,2
-chr2	40252939	.	G	GTACATA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.011671;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:3,5:10,1
-chr2	40997315	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.069027;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,5:14,3:17,2
-chr2	41045911	.	C	CGAATGAATGAAT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.063369;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:11,2:20,3
-chr2	41171427	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.023879;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:14,6:8,5:6,1
-chr2	42009802	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00059684;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:19,7:12,3
-chr2	44063689	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.15826;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:11,3:6,2:5,1
-chr2	44301738	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,6:10,5:1,1
-chr2	44310681	.	AGTT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0005858;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:1,5:7,6
-chr2	44315653	.	C	CAA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,6:1,4:1,2
-chr2	44437838	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.015694;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,5:2,1
-chr2	45310277	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.021053;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,2:2,2
-chr2	46340130	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00011639;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:9,4:8,7
-chr2	46427374	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:1,1:5,1
-chr2	48089443	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:4,3:5,1
-chr2	48878004	.	A	ATTCTTTCTTTCT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.037594;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,4:7,2:11,2
-chr2	49309311	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=5.6253e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:5,8:4,4
-chr2	49753142	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0020146;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:12,3:5,5
-chr2	50596863	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:0,3:4,1
-chr2	50601071	.	C	CA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00034047;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:14,5:5,4
-chr2	51458304	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0050687;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:9,4:10,5
-chr2	51924536	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=4.0043e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:9,9:5,10
-chr2	53870320	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0027568;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:13,3:6,6
-chr2	54682411	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.027634;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:0,2:2,2
-chr2	56864191	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.4255e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:13,12:4,2
-chr2	57006910	.	TATATATATATATATATAAACCTGTTATATATATAAAAC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023193;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:4,4:8,4
-chr2	57063466	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=5.7929e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:5,5:6,9
-chr2	57547942	.	A	AAAAG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.032107;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:6,4:0,1
-chr2	57732451	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,1:9,3
-chr2	59848883	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,5:4,2
-chr2	61007769	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0027397;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,10:4,9:5,1
-chr2	63615727	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0017612;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:5,5:5,4
-chr2	64550677	.	GCACACACACACACACA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:8,5:1,2
-chr2	65552580	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,4:1,3:1,1
-chr2	66410622	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,2:9,2
-chr2	66575383	.	CTCTG	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.01121;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,4:7,1
-chr2	67473955	.	CTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:3,3:2,3
-chr2	67773641	.	C	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:4,1:0,4
-chr2	68802407	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,8:4,7:1,1
-chr2	70361237	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:4,5:3,2
-chr2	71094258	.	ATT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:5,4:1,3
-chr2	71540059	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00063642;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,5:7,4
-chr2	72881088	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0062317;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:10,6:4,2
-chr2	77526486	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0013098;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,9:3,8:0,1
-chr2	78176814	.	G	GA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00049333;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:4,6:11,4
-chr2	78289265	.	ATTTTATTATTATTATTATTTT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:5,3:13,4
-chr2	78400872	.	CAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.054945;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,8:1,7:2,1
-chr2	79072702	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=4.6927e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,13:7,9:5,4
-chr2	79411292	.	C	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0024076;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:8,4:13,3
-chr2	79589914	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0014731;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,6:6,1
-chr2	80813512	.	G	GT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.9105e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:13,13:6,5
-chr2	80953114	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=6.2645e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:8,4:7,6
-chr2	81926246	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=8.4415e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:12,7:5,2
-chr2	83190122	.	G	GTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0033;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:3,5:5,4
-chr2	83341502	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:5,6:1,4
-chr2	84334411	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0041541;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:12,5:3,3
-chr2	85000311	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00034177;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,19:4,11:11,8
-chr2	85041762	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.017168;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,3:2,1
-chr2	85408338	.	T	TCACACACACA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0044859;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,2:5,5
-chr2	85686432	.	CA	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.023721;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:10,2:14,3
-chr2	87430689	.	AAGCC	A	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.038661;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:56,14:29,10:27,4
-chr2	87563860	.	C	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.060413;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,3:7,2
-chr2	87599153	.	CGTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:1,3:8,3
-chr2	88044863	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,8:1,3:3,5
-chr2	88463363	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr2	89094821	.	CA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:4,3:0,1
-chr2	89532659	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,3:2,4
-chr2	89540417	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
-chr2	89667558	.	T	A	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.016207;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:50,11:21,7:29,4
-chr2	89775125	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.13783;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:14,2:18,3
-chr2	90321280	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.013504;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:18,1:12,4
-chr2	90336867	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
-chr2	90372920	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0096525;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:12,9:15,5
-chr2	91442904	.	ATTTTTCCCGCCGCGGC	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.01202;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:3,2:12,4
-chr2	91504286	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.003665;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:11,1:5,5
-chr2	91521743	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.093588;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,3:10,1
-chr2	91527918	.	G	GC	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.040114;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:10,3:10,3
-chr2	91638781	.	A	G	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.020164;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:3,2:35,10
-chr2	91884370	.	A	C	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.015979;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:47,13:25,10:22,3
-chr2	91892630	.	T	C	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.027012;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:93,20:40,10:53,10
-chr2	91964214	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.044775;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:10,5:8,2
-chr2	92057665	.	G	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.013788;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,8:26,5:21,3
-chr2	92097267	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.11141;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,1:14,3
-chr2	92198924	.	G	C	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.0079465;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:58,13:47,10:11,3
-chr2	92294266	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:3,2:27,3
-chr2	92353052	.	G	T	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.0084739;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:67,17:56,11:11,6
-chr2	92353193	.	T	A	0	PASS	DP=325;GPV=1;SPV=0.015908;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:111,25:40,8:71,17
-chr2	92353271	.	A	G	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.014112;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:83,17:25,6:58,11
-chr2	92402812	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.044429;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:16,3:7,1
-chr2	92480710	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.05493;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:5,3:31,1
-chr2	92624123	.	T	A	0	PASS	DP=512;GPV=1;SPV=0.015203;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:224:201,23:113,19:88,4
-chr2	92629390	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15115;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:0,0:29,4
-chr2	92637488	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.03743;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:21,3:15,1
-chr2	92673300	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.042336;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:14,4:8,1
-chr2	92686008	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0218;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:13,7:19,2
-chr2	92830576	.	G	T	0	PASS	DP=274;GPV=1;SPV=0.030827;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:107,24:89,20:18,4
-chr2	92864893	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.047124;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
-chr2	92912300	.	C	G	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.044421;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:45,7:36,6:9,1
-chr2	93006447	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.053645;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:14,1:16,3
-chr2	93009734	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.042059;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:11,6:3,1
-chr2	93026707	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028205;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
-chr2	93138864	.	T	A	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.035811;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:13,1:38,5
-chr2	93312713	.	C	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.012965;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:34,12:3,2
-chr2	93395646	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
-chr2	93473993	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.046916;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:0,0:28,4
-chr2	93510620	.	T	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.041814;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:55,15:36,3:19,12
-chr2	93678439	.	T	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.045658;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:24,8:14,2
-chr2	93700638	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0023241;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:12,7:4,3
-chr2	93996189	.	C	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030897;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,3:6,1
-chr2	94143190	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.012732;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,2:9,5
-chr2	94271787	.	T	G	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.00074329;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:68,22:39,17:29,5
-chr2	94743299	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=1.4739e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:4,2:7,8
-chr2	97250532	.	AG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:3,1:9,3
-chr2	97260377	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,1:6,4
-chr2	100552186	.	G	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.001548;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:3,10:0,4:3,6
-chr2	101530358	.	CATATATACCCATACATATATACACATACAT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031813;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,2:5,2
-chr2	102563794	.	TGA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0023462;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:2,4:5,5
-chr2	103963608	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,4:2,1
-chr2	104278393	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=8.9498e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:11,7:8,8
-chr2	105562853	.	C	CAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:5,5:1,2
-chr2	106422542	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0092954;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:13,5:8,2
-chr2	106467439	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.02609;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:3,1:6,3
-chr2	107447361	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:1,2:1,1:0,1
-chr2	107852252	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,2:2,1:1,1
-chr2	108275816	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.012719;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,3:3,3
-chr2	108508724	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.042059;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,4:4,3
-chr2	110361374	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.046858;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:8,4:16,2
-chr2	110623400	.	C	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.027025;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:15,3:14,8
-chr2	111180004	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,3:3,1
-chr2	111613863	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,2:7,2
-chr2	112184685	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.047842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:4,3:12,1
-chr2	114364103	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00048241;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:9,7:7,6
-chr2	114396545	.	TTTC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:4,1:6,3
-chr2	115391550	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.065377;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:10,3:16,2
-chr2	115698085	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=6.1268e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:10,6:8,8
-chr2	116917336	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0081305;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,3:8,2
-chr2	118188323	.	G	GCACACACA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.013595;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,7:5,4:0,3
-chr2	118302808	.	ATATATG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:5,3:13,1
-chr2	118964887	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.04394;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:4,4:4,1
-chr2	119557958	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:5,7:0,2
-chr2	121122457	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.010459;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:10,5:9,2
-chr2	121706815	.	CA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,3:1,1
-chr2	122421266	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00019952;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:10,5:9,7
-chr2	122432981	.	G	GTGTGTGTGTGTC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.042122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,8:9,5:7,3
-chr2	126407992	.	G	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,8:7,7:1,1
-chr2	126677527	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0094148;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:9,7:2,3
-chr2	127829056	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=2.7627e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:13,8:6,8
-chr2	128268025	.	G	GT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.047789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:8,2:18,4
-chr2	128511430	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=8.9236e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,18:6,6:6,12
-chr2	130590444	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,5:2,1
-chr2	130627652	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,3:11,1
-chr2	130896509	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=3.3518e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:9,8:2,6
-chr2	131174999	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.03925;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:6,3:14,1
-chr2	131776392	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.072031;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:12,3:21,1
-chr2	131895749	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0040793;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:0,6:0,4:0,2
-chr2	132048949	.	GTTTCTTTCTTTCTTTC	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,2:7,2
-chr2	132100118	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.03112;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:11,3:16,2
-chr2	132221353	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.15556;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:12,3:7,1:5,2
-chr2	132363166	.	G	A	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.0023838;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:81,15:32,7:49,8
-chr2	132925561	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0083426;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:8,7:1,1
-chr2	133139482	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.06044;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,3:14,1
-chr2	133461101	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=3.4067e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,14:5,4:4,10
-chr2	134381383	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,2:10,2
-chr2	135496384	.	TA	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
-chr2	136689368	.	AAT	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.1019;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:21,3:9,1
-chr2	137566490	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=1.7548e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,17:8,10:5,7
-chr2	138807016	.	T	TATTATTGA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=9.3853e-06;SS=2;SSC=50;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:7,11:6,2
-chr2	139150839	.	G	GGAGA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:10,4:0,0
-chr2	139366710	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,5:6,4
-chr2	140228126	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0075865;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,2:5,3
-chr2	140228127	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.047794;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,3:5,2:5,1
-chr2	140303012	.	C	CAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:5,6:0,2
-chr2	142411798	.	ATATATG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,1:7,3
-chr2	143166001	.	A	AGAAAGAAAGAAGGAAG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:3,3:4,1
-chr2	143270022	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.5037e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:11,5:8,7
-chr2	143421802	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,4:3,2:6,2
-chr2	143430177	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0006993;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:1,8:0,3:1,5
-chr2	143861440	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.079204;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:16,3:11,3
-chr2	144522848	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0037466;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:13,3:4,2
-chr2	148308484	.	GTTCT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.056741;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:6,5:6,2
-chr2	148345476	.	T	TAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.023109;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:4,3:3,1
-chr2	148816631	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.025076;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:13,2:7,3
-chr2	149328067	.	CAAA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,4:1,1
-chr2	150278593	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,2:0,1:1,1
-chr2	151113079	.	CA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.064743;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,2:12,2
-chr2	151498891	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.010536;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:7,7:12,6
-chr2	152146271	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,5:2,1
-chr2	153357566	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=9.5438e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,15:10,10:5,5
-chr2	155917648	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0030549;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:16,5:10,6
-chr2	156917624	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.077483;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:13,3:14,2
-chr2	157442473	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:24:0,2:0,1:0,1
-chr2	157500730	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,5:5,4:6,1
-chr2	160349553	.	A	AAG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,5:3,1
-chr2	161109807	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10903;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:14,2:20,2
-chr2	163323047	.	GT	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0023627;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:5,7:7,2
-chr2	163518074	.	A	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:23:1,3:1,1:0,2
-chr2	163994673	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,2:1,3
-chr2	165735010	.	C	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0019452;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,3:3,3
-chr2	165788466	.	GGTGT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024328;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,4:4,2
-chr2	166287394	.	TA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0061831;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:10,3:5,8
-chr2	167492810	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00076774;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:8,5:11,4
-chr2	167899291	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.023173;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:10,3:1,1
-chr2	168004732	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0038917;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:4,8:3,1
-chr2	169099120	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=3.3787e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:6,9:9,4
-chr2	169826106	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14559;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,4:6,1
-chr2	171477453	.	A	ATT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0040779;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,10:8,8:14,2
-chr2	174807446	.	CTGTGTGTG	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.049486;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,3:5,2
-chr2	179521353	.	G	GTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:3,4:3,2
-chr2	180451237	.	AT	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.9986e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:10,5:7,5
-chr2	181490456	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:23:0,2:0,0:0,2
-chr2	183029460	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:14,2:6,2
-chr2	183454423	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=6.0898e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:8,7:10,7
-chr2	184798006	.	A	ATG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,6:6,4:6,2
-chr2	185010375	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.011595;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:8,2:12,3
-chr2	185865358	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.052629;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,4:13,1
-chr2	185865552	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0063654;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:10,5:14,3
-chr2	188055136	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.031681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:10,9:4,2
-chr2	188093579	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=3.1777e-10;SS=2;SSC=94;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,20:3,6:4,14
-chr2	188333244	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0065287;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,5:9,2
-chr2	188353549	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00081536;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:8,4:8,3
-chr2	190040492	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0060836;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:10,1:15,6
-chr2	191383494	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,3:1,1
-chr2	191517028	.	G	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00054114;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:6,5:14,3
-chr2	192882338	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=8.8646e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:13,8:8,5
-chr2	194369635	.	C	CTATATATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.00029138;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:0,7:0,6:0,1
-chr2	196622718	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.7298e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:8,9:9,5
-chr2	197440209	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0036697;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,5:3,3
-chr2	199788419	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.6711e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:10,6:7,5
-chr2	201805450	.	C	CA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,4:6,4:0,0
-chr2	201947222	.	G	GTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012719;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:8,5:1,2
-chr2	201959350	.	C	CCACA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043327;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:9,6:5,4
-chr2	201962210	.	CAA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.025641;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:3,4:0,0
-chr2	204986101	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0014993;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,8:6,7:1,1
-chr2	205842354	.	CTCTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.003612;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:0,1:3,4
-chr2	205912237	.	A	AGATGGATG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=9.294e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:1,2:5,8
-chr2	208772093	.	C	CTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.002331;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:0,7:0,5:0,2
-chr2	213276117	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.2748e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:9,20:5,10:4,10
-chr2	213643067	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,2:0,1:2,1
-chr2	213852516	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0016986;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,6:6,2
-chr2	213876321	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.18462;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,3:1,1:5,2
-chr2	215677637	.	AC	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.083916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:2,3:3,2
-chr2	216577470	.	TTC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01828;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,5:5,3
-chr2	219934644	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,1:6,3
-chr2	220020588	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,2:9,2
-chr2	220861515	.	GCACA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,8:8,6:1,2
-chr2	223931690	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.044913;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:12,2:2,4
-chr2	224137290	.	ATGCC	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0050177;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,3:6,5
-chr2	225181939	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
-chr2	226214446	.	C	CTG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.015238;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,12:5,8:4,4
-chr2	227073870	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.6376e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,17:8,8:8,9
-chr2	227728521	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.002854;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:8,4:8,3
-chr2	228955072	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0038981;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:11,2:5,5
-chr2	229125972	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.077856;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,2:14,2
-chr2	229904416	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:7,1:1,3
-chr2	231829139	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.047431;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
-chr2	231838616	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,1:0,1
-chr2	231842471	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.03845;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:1,0:18,4
-chr2	232438095	.	T	TA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00077529;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:9,6:10,9
-chr2	232836391	.	T	TATAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.013932;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:3,4:0,1
-chr2	233562326	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.046858;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:14,5:10,1
-chr2	233597605	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00021015;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:9,5:17,8
-chr2	234183880	.	AAG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.006865;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:6,4:0,2
-chr2	235032595	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.0078e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,18:7,6:9,12
-chr2	235878221	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0022131;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:13,2:9,4
-chr2	236120317	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=5.5438e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:6,6:8,6
-chr2	237771302	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018436;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:7,7:4,1
-chr2	238110240	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.033846;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,5:9,2:12,3
-chr2	238745493	.	GCAGTGAGGAACC	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=2.0845e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:4,5:6,4
-chr2	239121000	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0021594;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:5,9:3,2
-chr2	239865914	.	CACACAGAT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,4:7,1:13,3
-chr2	241993180	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00011443;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,11:3,8:3,3
-chr2	241993185	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00020869;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:3,8:4,3
-chr2	242088472	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,3:10,1
-chr2	242183069	.	C	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr20	1504776	.	C	CGTGTGTGT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.025784;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,7:11,5:7,2
-chr20	5026045	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,6:3,2
-chr20	6109902	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,10:3,8:3,2
-chr20	7194105	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.0613e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:8,8:6,5
-chr20	7273506	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0010258;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:7,6:9,4
-chr20	7647654	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0011821;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:17,5:8,6
-chr20	7773988	.	AT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.025088;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:13,4:6,2
-chr20	7909383	.	A	ATG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:7,4:1,1
-chr20	8744616	.	T	TAAATA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,6:5,1:2,5
-chr20	9824389	.	TA	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0015015;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,4:9,4
-chr20	10028303	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,4:10,2:7,2
-chr20	11374566	.	TTA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.042738;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,2:4,3
-chr20	11769171	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,6:3,3:0,3
-chr20	13305200	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,2:6,1:0,1
-chr20	14095330	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=8.3837e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:7,11:9,3
-chr20	14130552	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0002515;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:10,7:8,3
-chr20	14176992	.	A	AG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.01551;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
-chr20	14222821	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0021008;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:1,4:1,4:0,0
-chr20	17161170	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.046295;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,7:7,2
-chr20	19024244	.	A	AAAAG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:2,3:3,1
-chr20	19920825	.	AC	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=8.5276e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,6:4,2
-chr20	19923129	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=3.4821e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:16,10:7,6
-chr20	19958531	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0001635;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:6,3:7,6
-chr20	21166148	.	A	AT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0057786;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:2,6:9,5
-chr20	21721607	.	CATAT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,4:1,1
-chr20	22082360	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.045025;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:2,3:12,2
-chr20	22743815	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.032371;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:12,4:4,2
-chr20	23277049	.	G	GCACACACACA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.004671;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,4:5,5
-chr20	23864601	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0311;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:16,3:9,2
-chr20	24432255	.	A	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,5:3,3
-chr20	25427869	.	A	AT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0045922;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:3,4:5,5
-chr20	26450344	.	C	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:14,3:1,1
-chr20	26483655	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0066919;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:9,4:10,8
-chr20	26489609	.	A	T	0	PASS	DP=292;GPV=1;SPV=0.042754;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:112,23:93,21:19,2
-chr20	26523728	.	G	A	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.040347;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:65,9:0,1:65,8
-chr20	26523764	.	A	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.028719;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:0,2:50,5
-chr20	26523770	.	AC	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.018897;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:52,6:1,1:51,5
-chr20	27161450	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.056596;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:8,1:20,3
-chr20	28178113	.	G	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr20	28613576	.	T	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.029814;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:23,4:27,3
-chr20	28624728	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.032947;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:18,4:25,1
-chr20	28804568	.	A	G	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.022182;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:65,15:43,13:22,2
-chr20	28808514	.	T	C	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.029038;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:80,11:33,7:47,4
-chr20	28819540	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.071318;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,1:8,3
-chr20	28823977	.	A	G	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.035515;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:52,15:27,10:25,5
-chr20	28868737	.	T	G	0	PASS	DP=320;GPV=1;SPV=0.04665;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:143,24:99,21:44,3
-chr20	28900698	.	A	T	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.017497;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:84,12:50,8:34,4
-chr20	28910124	.	A	G	0	PASS	DP=246;GPV=1;SPV=0.044993;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:89,19:53,17:36,2
-chr20	28946744	.	G	A	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.028607;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:52,9:31,5:21,4
-chr20	28956255	.	C	A	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.025065;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:66,16:32,9:34,7
-chr20	29058370	.	TC	T	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.009142;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:65,20:28,12:37,8
-chr20	29072135	.	TAAAAG	T	0	PASS	DP=277;GPV=1;SPV=0.025898;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:116,19:52,4:64,15
-chr20	29083045	.	C	T	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.023393;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:82,21:67,16:15,5
-chr20	29227596	.	CTGAG	C	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.012619;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:50,14:22,8:28,6
-chr20	29227616	.	G	A	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.016958;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:55,15:26,9:29,6
-chr20	29310538	.	CTT	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.028273;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,2:8,2
-chr20	29330052	.	G	A	0	PASS	DP=279;GPV=1;SPV=0.027918;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:110,23:61,13:49,10
-chr20	29447351	.	TG	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.011252;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:15,8:8,5
-chr20	29512679	.	C	T	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.017757;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:115,23:46,8:69,15
-chr20	29521390	.	G	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.014524;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:41,11:26,5:15,6
-chr20	29657971	.	T	TGAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.005254;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,3:5,5
-chr20	29657980	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.038274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,2:6,2
-chr20	29796452	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=1.7307e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:7,9:7,6
-chr20	29942876	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr20	29956722	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.082831;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:22,3:1,1
-chr20	30355851	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0018664;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:20,8:12,9
-chr20	30521954	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.5568e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,17:5,11:6,6
-chr20	30558895	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00012852;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,6:6,3
-chr20	30819569	.	G	GC	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.049223;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:70,13:36,10:34,3
-chr20	30862731	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.027838;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:10,3:17,4
-chr20	30862734	.	T	TC	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.036975;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:9,2:16,4
-chr20	31057307	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.032208;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:26,10:9,2
-chr20	31059449	.	T	C	0	PASS	DP=295;GPV=1;SPV=0.019784;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:131,18:70,11:61,7
-chr20	31060603	.	C	T	0	PASS	DP=771;GPV=1;SPV=0.0020092;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:371:309,62:178,25:131,37
-chr20	31064183	.	T	C	0	PASS	DP=579;GPV=1;SPV=0.019464;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:260:224,36:117,14:107,22
-chr20	31068166	.	G	C	0	PASS	DP=739;GPV=1;SPV=0.007789;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:344:264,52:155,29:109,23
-chr20	31074440	.	G	T	0	PASS	DP=176;GPV=1;SPV=0.010299;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:70,13:37,10:33,3
-chr20	31187381	.	G	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.058895;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:7,1:15,4
-chr20	31187382	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.074732;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:9,1:16,4
-chr20	31229983	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.13884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:17,2:15,2
-chr20	31369385	.	G	GT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:7,7:2,1
-chr20	32295854	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:5,9:2,1
-chr20	32656863	.	C	CAAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.039653;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:7,5:7,1
-chr20	32666762	.	CAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0038647;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:4,2:3,5
-chr20	34461711	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,2:3,1:2,1
-chr20	34691039	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0079853;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,4:5,2
-chr20	36726914	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
-chr20	37480580	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,0:6,4
-chr20	38659921	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.022389;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:15,1:11,5
-chr20	38906292	.	T	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.001548;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:2,3:1,4
-chr20	39462972	.	GA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.018752;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,2:7,2
-chr20	39802656	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.9493e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:6,4:9,8
-chr20	42312802	.	CTTT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.004816;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:3,2:0,3
-chr20	42704431	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00039082;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:8,5:2,5
-chr20	42755572	.	AT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.024972;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:17,2:9,4
-chr20	44764203	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:2,3:4,1
-chr20	46200369	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.028003;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:10,3:11,2
-chr20	48153175	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=4.965e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:14,7:4,5
-chr20	48520368	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.028362;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,1:11,4
-chr20	51130153	.	T	TAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.031992;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:2,14:2,7:0,7
-chr20	52691582	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.010106;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:7,6:4,2
-chr20	53562726	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,4:3,3
-chr20	54481024	.	CATCT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,3:5,2
-chr20	55022494	.	T	TTC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,2:1,1:2,1
-chr20	55304872	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=6.2662e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:6,7:11,4
-chr20	56281649	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0079051;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,2:1,2
-chr20	57833936	.	T	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:1,1:5,1
-chr20	59050074	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.015231;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:5,4:10,5
-chr20	59300486	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.02006;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:19,2:16,3
-chr20	59474855	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,4:3,1
-chr20	59815714	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00061565;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:16,6:22,5
-chr20	60919897	.	T	TC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:5,1:5,4
-chr20	61424818	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.035975;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,1:4,3
-chr20	62070424	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00056194;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,1:6,6
-chr20	62322090	.	C	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.017013;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:18,3:14,2
-chr20	62331213	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:1,3:5,1
-chr20	63879699	.	A	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10145;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:1,1:5,1
-chr20	64173717	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.017225;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,1:5,3
-chr21	5223281	.	G	T	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.021828;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:74,12:33,6:41,6
-chr21	5247110	.	T	C	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.0057805;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:51,17:20,5:31,12
-chr21	5250830	.	T	G	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.0022313;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:46,17:22,7:24,10
-chr21	5313675	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.029623;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:10,3:35,2
-chr21	6365950	.	C	T	0	PASS	DP=281;GPV=1;SPV=0.038596;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:111,16:52,8:59,8
-chr21	6371936	.	A	G	0	PASS	DP=272;GPV=1;SPV=0.0069071;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:110,20:65,6:45,14
-chr21	7314841	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.018316;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,3:7,2
-chr21	7316307	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.065471;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:4,3:9,5
-chr21	7944360	.	G	GCCATTCAATTCCTTT	0	PASS	DP=177;GPV=1;SPV=0.039942;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:60,14:29,11:31,3
-chr21	7951615	.	ACATTC	A	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.018574;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:58,11:24,6:34,5
-chr21	7987132	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0047325;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,5:6,2
-chr21	8033313	.	T	A	0	PASS	DP=348;GPV=1;SPV=0.044691;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:143,16:49,9:94,7
-chr21	8037914	.	C	T	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.00043659;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:48,23:37,12:11,11
-chr21	8527624	.	A	T	0	PASS	DP=208;GPV=1;SPV=0.013578;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:84,14:49,8:35,6
-chr21	8528646	.	C	T	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.037617;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:103,19:52,11:51,8
-chr21	8548926	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,2:3,2
-chr21	8758126	.	TGATG	T	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.028705;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:61,12:30,2:31,10
-chr21	8759880	.	C	T	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.038112;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:61,8:34,6:27,2
-chr21	8771265	.	CT	C	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.039069;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:90,13:46,8:44,5
-chr21	8825156	.	G	A	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.031333;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:70,12:26,9:44,3
-chr21	8825344	.	C	T	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.011963;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:60,15:34,9:26,6
-chr21	8863068	.	C	T	0	PASS	DP=475;GPV=1;SPV=0.042033;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:241:215,26:116,9:99,17
-chr21	8877179	.	G	GA	0	PASS	DP=483;GPV=1;SPV=0.034022;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:242:205,36:105,19:100,17
-chr21	9044754	.	T	A	0	PASS	DP=212;GPV=1;SPV=0.031633;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:94,14:50,10:44,4
-chr21	9060251	.	C	T	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.031958;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:78,12:34,3:44,9
-chr21	9067120	.	G	C	0	PASS	DP=242;GPV=1;SPV=0.034011;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:91,17:41,3:50,14
-chr21	9089597	.	A	G	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.028141;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:60,16:44,9:16,7
-chr21	9097650	.	C	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.011943;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:47,10:35,8:12,2
-chr21	9098286	.	G	T	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.018613;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:89,14:54,2:35,12
-chr21	9104927	.	A	AC	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.018989;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:94,15:51,8:43,7
-chr21	9108830	.	A	C	0	PASS	DP=347;GPV=1;SPV=0.035405;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:139,16:60,11:79,5
-chr21	9109157	.	T	C	0	PASS	DP=288;GPV=1;SPV=0.049584;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:116,13:66,7:50,6
-chr21	9109513	.	A	G	0	PASS	DP=485;GPV=1;SPV=0.0049984;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:198,25:95,13:103,12
-chr21	9114105	.	A	T	0	PASS	DP=574;GPV=1;SPV=0.0060011;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:273:231,42:115,26:116,16
-chr21	9125433	.	G	T	0	PASS	DP=451;GPV=1;SPV=0.022258;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:182,35:101,17:81,18
-chr21	9138358	.	G	A	0	PASS	DP=418;GPV=1;SPV=0.014354;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:194:170,24:78,11:92,13
-chr21	9138911	.	G	T	0	PASS	DP=513;GPV=1;SPV=0.0048611;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:228:193,35:103,17:90,18
-chr21	9140540	.	G	A	0	PASS	DP=451;GPV=1;SPV=0.023884;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:183,29:87,11:96,18
-chr21	9141528	.	C	T	0	PASS	DP=435;GPV=1;SPV=0.0021362;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:181,40:83,20:98,20
-chr21	9143132	.	T	A	0	PASS	DP=442;GPV=1;SPV=0.03027;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:183,34:97,17:86,17
-chr21	9147618	.	C	A	0	PASS	DP=641;GPV=1;SPV=0.033085;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:291:256,35:148,13:108,22
-chr21	9158498	.	G	GA	0	PASS	DP=444;GPV=1;SPV=0.0065601;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:230:202,28:105,10:97,18
-chr21	9166301	.	C	T	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.008751;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:146:129,17:68,8:61,9
-chr21	9166896	.	C	A	0	PASS	DP=428;GPV=1;SPV=0.0047644;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:189:169,20:89,12:80,8
-chr21	9183824	.	C	T	0	PASS	DP=326;GPV=1;SPV=7.1277e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:130,20:66,11:64,9
-chr21	9186372	.	T	C	0	PASS	DP=357;GPV=1;SPV=0.035248;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:141,25:74,14:67,11
-chr21	9248472	.	A	G	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.0098761;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:87,13:43,9:44,4
-chr21	9252637	.	T	G	0	PASS	DP=554;GPV=1;SPV=0.0015313;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:277:244,33:101,14:143,19
-chr21	9254213	.	C	G	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.0079825;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:62,21:3,14:59,7
-chr21	9256336	.	C	T	0	PASS	DP=718;GPV=1;SPV=0.013224;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:351:303,44:171,26:132,18
-chr21	9256341	.	A	C	0	PASS	DP=685;GPV=1;SPV=0.011669;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:338:294,44:174,12:120,32
-chr21	9274592	.	C	T	0	PASS	DP=383;GPV=1;SPV=0.045665;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:170,26:105,19:65,7
-chr21	9299283	.	C	T	0	PASS	DP=354;GPV=1;SPV=0.038165;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:156,27:66,13:90,14
-chr21	9305926	.	G	T	0	PASS	DP=342;GPV=1;SPV=0.020347;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:134,27:57,8:77,19
-chr21	9326950	.	C	A	0	PASS	DP=446;GPV=1;SPV=0.045654;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:194,32:84,13:110,19
-chr21	9328944	.	G	A	0	PASS	DP=630;GPV=1;SPV=0.015144;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:329:291,38:148,20:143,18
-chr21	9329037	.	AG	A	0	PASS	DP=631;GPV=1;SPV=0.040879;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:306:270,36:128,15:142,21
-chr21	9329691	.	C	T	0	PASS	DP=373;GPV=1;SPV=0.025244;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:192:158,28:74,16:84,12
-chr21	9331823	.	G	A	0	PASS	DP=418;GPV=1;SPV=0.0054958;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:210:172,38:88,14:84,24
-chr21	9334167	.	T	A	0	PASS	DP=329;GPV=1;SPV=0.013871;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:135,21:79,11:56,10
-chr21	9337628	.	TG	T	0	PASS	DP=380;GPV=1;SPV=0.0087426;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:174:153,21:83,8:70,13
-chr21	9347197	.	G	C	0	PASS	DP=373;GPV=1;SPV=0.013814;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:161,19:77,12:84,7
-chr21	9347982	.	C	T	0	PASS	DP=368;GPV=1;SPV=0.0052863;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:163:142,21:76,13:66,8
-chr21	9353281	.	G	A	0	PASS	DP=377;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:167,24:80,14:87,10
-chr21	9368462	.	C	G	0	PASS	DP=694;GPV=1;SPV=0.001108;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:317:280,37:144,21:136,16
-chr21	9552040	.	T	TTC	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.0053894;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,15:13,6:31,9
-chr21	9574912	.	G	A	0	PASS	DP=249;GPV=1;SPV=0.028127;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:94,19:42,13:52,6
-chr21	9620953	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017591;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,2:5,5
-chr21	9639066	.	G	C	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.005646;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:20,6:28,7
-chr21	9644737	.	C	T	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.049145;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:61,15:26,9:35,6
-chr21	9678565	.	G	T	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.012575;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:53,16:20,14:33,2
-chr21	9694517	.	A	G	0	PASS	DP=168;GPV=1;SPV=0.028118;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:71,12:42,5:29,7
-chr21	9711556	.	T	G	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.010944;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:54,18:30,11:24,7
-chr21	9827735	.	C	CAT	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.014449;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:67,11:47,6:20,5
-chr21	9827822	.	G	A	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.0068055;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:34,6:10,5
-chr21	9979543	.	C	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.023385;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:49,15:27,8:22,7
-chr21	9981274	.	TTCTC	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.02706;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:19,3:13,2
-chr21	10036655	.	A	G	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.047815;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:63,15:35,7:28,8
-chr21	10040830	.	A	AT	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0044758;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:47,16:22,7:25,9
-chr21	10040832	.	A	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0036917;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:33,18:16,8:17,10
-chr21	10124321	.	C	T	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.0029053;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:37,17:23,8:14,9
-chr21	10164711	.	T	A	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.00069468;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:58,22:29,11:29,11
-chr21	10168682	.	T	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.043117;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:15,3:30,3
-chr21	10271285	.	A	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:12,3:6,2:6,1
-chr21	10330122	.	T	C	0	PASS	DP=298;GPV=1;SPV=0.021272;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:137:118,19:68,10:50,9
-chr21	10330762	.	T	A	0	PASS	DP=292;GPV=1;SPV=0.03222;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:120,16:56,8:64,8
-chr21	10333904	.	C	T	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.045039;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:106,12:41,6:65,6
-chr21	10342450	.	G	A	0	PASS	DP=416;GPV=1;SPV=0.0081112;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:194,23:97,12:97,11
-chr21	10344221	.	C	CA	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.023036;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:94,23:58,18:36,5
-chr21	10350705	.	G	GC	0	PASS	DP=297;GPV=1;SPV=0.023804;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:137:117,20:50,8:67,12
-chr21	10357137	.	A	T	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.011177;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:143:123,20:56,16:67,4
-chr21	10361539	.	T	A	0	PASS	DP=550;GPV=1;SPV=0.046728;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:246:220,26:118,17:102,9
-chr21	10366440	.	G	C	0	PASS	DP=277;GPV=1;SPV=0.040595;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:116,13:44,9:72,4
-chr21	10394018	.	G	C	0	PASS	DP=360;GPV=1;SPV=0.0077177;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:146,32:73,19:73,13
-chr21	10397708	.	C	A	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=4.322e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:76,17:38,7:38,10
-chr21	10419634	.	G	C	0	PASS	DP=476;GPV=1;SPV=0.044991;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:197,36:90,13:107,23
-chr21	10449909	.	C	A	0	PASS	DP=276;GPV=1;SPV=0.016547;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:110,22:53,12:57,10
-chr21	10462375	.	A	G	0	PASS	DP=366;GPV=1;SPV=0.037829;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:150,19:83,11:67,8
-chr21	10462629	.	C	T	0	PASS	DP=380;GPV=1;SPV=0.0016381;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:171,20:83,9:88,11
-chr21	10465468	.	G	A	0	PASS	DP=421;GPV=1;SPV=0.046754;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:198,23:114,15:84,8
-chr21	10474414	.	C	A	0	PASS	DP=300;GPV=1;SPV=0.023699;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:137:122,15:64,12:58,3
-chr21	10482852	.	T	C	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.031234;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:60,14:26,5:34,9
-chr21	10482853	.	C	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.023558;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:63,13:27,4:36,9
-chr21	10482863	.	C	A	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.023992;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:58,12:21,3:37,9
-chr21	10488869	.	C	T	0	PASS	DP=347;GPV=1;SPV=0.030335;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:165:147,18:74,5:73,13
-chr21	10751454	.	A	C	0	PASS	DP=248;GPV=1;SPV=0.046581;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:96,14:49,8:47,6
-chr21	10771684	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.047441;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:26,4:19,5
-chr21	10807251	.	T	A	0	PASS	DP=402;GPV=1;SPV=0.015793;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:149,17:71,12:78,5
-chr21	13044380	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.015516;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,5:7,2
-chr21	13191770	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.037288;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:9,6:9,3
-chr21	13437082	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.04497;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:14,1:13,6
-chr21	16679952	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0069146;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:7,4:6,8
-chr21	17174287	.	A	AT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.021053;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:2,2:3,2
-chr21	17730218	.	C	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:0,1:4,4
-chr21	18447439	.	C	CAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.016968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,7:4,6:0,1
-chr21	18895938	.	TA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,6:2,4:3,2
-chr21	20226487	.	A	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.02842;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:11,4:1,1
-chr21	20522459	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00019558;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,1:5,7
-chr21	20988674	.	AAG	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:17,2:3,2
-chr21	20988682	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:13,2:1,2
-chr21	21626186	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.019909;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:15,2:6,2
-chr21	21717527	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.011427;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:7,4:10,5
-chr21	21871317	.	G	GATTATT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.010144;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:11,7:9,6
-chr21	22534971	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,2:9,2
-chr21	23733973	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:1,1:5,1
-chr21	26379249	.	G	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0043505;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,3:5,4
-chr21	26456629	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=9.7241e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,15:7,7:8,8
-chr21	26708933	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10909;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,2:0,1:2,1
-chr21	27001299	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.029816;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:9,1:12,3
-chr21	28136090	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.00756;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,4:6,3
-chr21	28300178	.	TTATG	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021726;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:6,4:9,5
-chr21	28381248	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.0536e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:6,6:7,5
-chr21	29614402	.	CTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.027772;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:2,3:3,2
-chr21	30807295	.	GAA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:12,2:4,2
-chr21	30877015	.	T	TTTA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.032025;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,1:9,3
-chr21	31112171	.	GTA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.04242;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:10,4:7,2
-chr21	31871338	.	GTT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:2,1:4,5
-chr21	32361159	.	A	AG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,5:3,4:3,1
-chr21	33222900	.	GTTT	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,3:0,1
-chr21	34239300	.	CAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0030029;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:1,7:0,4:1,3
-chr21	34716857	.	C	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,3:5,2
-chr21	34716859	.	CTA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,3:4,3
-chr21	34716862	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.012987;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,5:1,3:0,2
-chr21	35851420	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.18462;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:6,3:2,1:4,2
-chr21	35894301	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0018592;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,8:7,5:3,3
-chr21	36253637	.	C	CAAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,8:2,5:3,3
-chr21	37207080	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:24:0,2:0,1:0,1
-chr21	37859532	.	A	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,3:2,1
-chr21	38194194	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=7.8688e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:3,7:9,3
-chr21	38548833	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:8,4:1,2
-chr21	38793515	.	C	CTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:8,2:1,2
-chr21	39799261	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.1561e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:11,4:5,6
-chr21	41041820	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.018803;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,2:1,2
-chr21	41840442	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,3:1,1
-chr21	42346244	.	ATACACACACCCATACATGGG	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.037555;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:16,2:10,6
-chr21	43704220	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:10,4:1,0
-chr21	44925422	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,3:3,2:0,1
-chr22	10637080	.	G	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.010072;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:41,16:8,3:33,13
-chr22	10641564	.	G	GAA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.021777;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:10,5:8,4
-chr22	10641581	.	TGA	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.010612;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:7,4:13,1
-chr22	10692496	.	G	A	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.022732;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:92,21:37,8:55,13
-chr22	10704261	.	A	AAT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,3:4,1
-chr22	10704718	.	GTA	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011954;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,4:5,4
-chr22	10704757	.	TAG	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.014881;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,2:6,3
-chr22	10725297	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.036569;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:13,3:15,6
-chr22	10733494	.	C	T	0	PASS	DP=654;GPV=1;SPV=0.0082194;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:310:269,41:128,23:141,18
-chr22	10738815	.	T	TTTATTTAAC	0	PASS	DP=301;GPV=1;SPV=0.035028;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:146:45,11:19,7:26,4
-chr22	10742869	.	T	C	0	PASS	DP=287;GPV=1;SPV=0.046361;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:120,14:56,5:64,9
-chr22	10745438	.	A	T	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.015051;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:90,25:29,5:61,20
-chr22	10757234	.	T	G	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.033479;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:95,11:36,6:59,5
-chr22	10768778	.	G	A	0	PASS	DP=346;GPV=1;SPV=0.038236;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:162,19:78,12:84,7
-chr22	10768787	.	A	G	0	PASS	DP=366;GPV=1;SPV=0.026932;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:186:167,19:79,9:88,10
-chr22	10780500	.	G	A	0	PASS	DP=389;GPV=1;SPV=0.046874;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:169,28:73,12:96,16
-chr22	10936194	.	C	CAGAGT	0	PASS	DP=450;GPV=1;SPV=0.013438;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:186,26:106,14:80,12
-chr22	11024987	.	T	C	0	PASS	DP=338;GPV=1;SPV=0.0014037;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:174:153,21:109,16:44,5
-chr22	11025062	.	C	T	0	PASS	DP=399;GPV=1;SPV=0.00012916;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:179,33:112,23:67,10
-chr22	11036904	.	T	A	0	PASS	DP=460;GPV=1;SPV=0.006115;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:230:202,28:119,18:83,10
-chr22	11040365	.	C	T	0	PASS	DP=349;GPV=1;SPV=0.015116;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:152,21:69,15:83,6
-chr22	11047471	.	T	A	0	PASS	DP=306;GPV=1;SPV=0.025476;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:128,17:64,9:64,8
-chr22	11066917	.	G	A	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.032266;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:74,16:35,7:39,9
-chr22	11287400	.	A	G	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.037475;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:64,17:35,9:29,8
-chr22	11364835	.	A	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.02202;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:16,6:19,6
-chr22	11495194	.	G	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.005134;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:36,16:13,9:23,7
-chr22	11621493	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.037288;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:20,6:13,5
-chr22	11714661	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.021226;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:14,5:24,5
-chr22	11823982	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.013266;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:7,3:9,2
-chr22	11855605	.	G	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.043506;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:76,16:51,13:25,3
-chr22	11862800	.	G	T	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.038968;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:93,16:50,9:43,7
-chr22	11862849	.	C	T	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.041357;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:66,10:29,5:37,5
-chr22	11871637	.	T	C	0	PASS	DP=580;GPV=1;SPV=0.012813;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:275:246,29:141,17:105,12
-chr22	11904955	.	T	G	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.044719;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:55,8:28,1:27,7
-chr22	11906013	.	C	A	0	PASS	DP=373;GPV=1;SPV=0.042615;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:141,28:32,3:109,25
-chr22	11916341	.	G	A	0	PASS	DP=474;GPV=1;SPV=0.010093;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:239:205,34:118,20:87,14
-chr22	11926837	.	C	T	0	PASS	DP=410;GPV=1;SPV=0.031884;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:192:163,29:38,3:125,26
-chr22	11929811	.	T	C	0	PASS	DP=551;GPV=1;SPV=0.021314;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:261:221,40:107,18:114,22
-chr22	11935421	.	G	A	0	PASS	DP=275;GPV=1;SPV=0.0017406;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:112,14:73,11:39,3
-chr22	11946538	.	G	GAA	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.026942;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,9:30,8:5,1
-chr22	11949347	.	C	T	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.036639;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:77,17:46,11:31,6
-chr22	11973396	.	G	A	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.043449;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:69,14:48,9:21,5
-chr22	11975335	.	G	A	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.00066233;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:77,21:36,10:41,11
-chr22	11976021	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.024323;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:20,2:16,6
-chr22	12042814	.	C	A	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.045055;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:66,11:22,4:44,7
-chr22	12053499	.	C	T	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.025521;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:155,18:95,8:60,10
-chr22	12054125	.	C	T	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.042478;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:75,14:40,6:35,8
-chr22	12055223	.	A	T	0	PASS	DP=291;GPV=1;SPV=0.0081715;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:106,22:57,19:49,3
-chr22	12070159	.	G	T	0	PASS	DP=287;GPV=1;SPV=0.0082858;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:143:122,21:67,7:55,14
-chr22	12118918	.	A	C	0	PASS	DP=374;GPV=1;SPV=0.00066572;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:145,28:76,11:69,17
-chr22	12126384	.	G	GT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.046917;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,7:9,4:16,3
-chr22	12138060	.	G	T	0	PASS	DP=285;GPV=1;SPV=0.0057945;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:126,24:67,13:59,11
-chr22	12150001	.	G	T	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.033633;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:78,12:62,4:16,8
-chr22	12152289	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.025903;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:10,6:9,1
-chr22	12159672	.	A	C	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.014775;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:116,13:72,10:44,3
-chr22	12182241	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,3:6,4
-chr22	12193370	.	G	A	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.01726;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:94,23:53,9:41,14
-chr22	12208767	.	A	C	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.015315;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:59,10:32,3:27,7
-chr22	12217959	.	G	A	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.0076748;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:72,10:49,6:23,4
-chr22	12293433	.	CTCTCTT	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.038142;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:5,1:19,4
-chr22	12338166	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.026058;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:15,7:7,3
-chr22	12338858	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.036132;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:8,2:8,6
-chr22	12352720	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.027873;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:10,9:11,1
-chr22	12431738	.	C	G	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.013069;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:58,15:33,10:25,5
-chr22	12541176	.	T	C	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.030792;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:50,13:30,7:20,6
-chr22	12551706	.	T	A	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.043922;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:73,15:38,7:35,8
-chr22	12576500	.	GA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:2,1:10,4
-chr22	12621083	.	TA	T	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.009217;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:109,13:45,3:64,10
-chr22	12637618	.	A	AAGAGGGAAGGAAGGAG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,8:5,6:2,2
-chr22	12722614	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.042412;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
-chr22	12726017	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,0:10,4
-chr22	12885931	.	G	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.0083841;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:13,6:21,5
-chr22	12891801	.	C	T	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.024305;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:17,2:33,5
-chr22	15238437	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:9,3:0,2
-chr22	15479128	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:3,2:11,2
-chr22	15554780	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,3:11,1
-chr22	15599675	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:9,3:4,1
-chr22	15668211	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.020691;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:13,4:10,2
-chr22	15669498	.	G	A	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.0061689;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:63,18:42,12:21,6
-chr22	15721882	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.030957;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:7,4:10,1
-chr22	15724410	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.030104;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
-chr22	15775220	.	A	AGC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014318;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:7,5:6,4
-chr22	15824122	.	T	TAAAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.010876;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,5:2,1
-chr22	15833634	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.015588;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:11,4:15,4
-chr22	15854667	.	A	G	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.033997;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:105,15:44,7:61,8
-chr22	15859621	.	A	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr22	15880756	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025213;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,3:7,3
-chr22	15941337	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.03636;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:15,7:5,1
-chr22	15941749	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,5:4,4
-chr22	16396135	.	C	CAA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.012544;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,7:10,2:8,5
-chr22	16420748	.	G	T	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.0014424;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:63,12:26,3:37,9
-chr22	16437552	.	G	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.049303;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:23,3:23,7
-chr22	17292166	.	G	GT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,2:1,2
-chr22	17399416	.	AT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.013985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,8:4,2
-chr22	17717380	.	C	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,3:2,1:2,2
-chr22	17721492	.	G	GT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:5,6:2,2
-chr22	17982716	.	A	AT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0052744;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:13,2:10,7
-chr22	18373376	.	A	C	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.036466;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:51,13:32,7:19,6
-chr22	18538824	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.018501;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,2:4,3
-chr22	18551267	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020061;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:13,2:6,3
-chr22	18736176	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.083787;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:3,1:19,5
-chr22	18846304	.	A	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0268;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:10,4:22,6
-chr22	19959866	.	G	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0086203;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,3:7,3
-chr22	20330019	.	A	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.035027;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,8:26,7:20,1
-chr22	20518070	.	T	TGACATTGACGTGAGGGACTGCCATAATGCGTC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.038176;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:4,3:5,1
-chr22	21114146	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,3:2,1
-chr22	21128721	.	GC	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.024966;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:16,5:2,3
-chr22	21128840	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.043201;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:1,2:17,4
-chr22	21149908	.	T	TC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.064403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:10,1:19,3
-chr22	21166157	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,1:7,6
-chr22	21254316	.	A	AT	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.03249;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:49,10:14,1:35,9
-chr22	21274874	.	C	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0033913;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:38,17:30,13:8,4
-chr22	21275550	.	C	T	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.0065321;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:53,13:25,4:28,9
-chr22	21278152	.	G	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,0:7,4
-chr22	21289816	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.033362;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:10,4:21,6
-chr22	21307922	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.025948;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:18,8:14,2
-chr22	21319485	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:15,3:2,1
-chr22	21319702	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.034805;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:10,1:17,7
-chr22	21354436	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.020715;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:9,3:0,3
-chr22	21842359	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0045922;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:3,2:4,6
-chr22	24651910	.	TC	T	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.0061914;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:57,9:44,7:13,2
-chr22	24670041	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.036165;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:12,4:19,1
-chr22	25547404	.	T	TAC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.005974;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:8,6:2,3
-chr22	26457209	.	A	AC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023879;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,2:7,4
-chr22	31114516	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0077765;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:4,4:3,3
-chr22	31402505	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0048821;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,7:1,6:1,1
-chr22	32368193	.	C	CAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.038233;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,4:8,3
-chr22	32447607	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01095;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,6:2,2
-chr22	33661217	.	A	ATT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.014712;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:8,7:1,1
-chr22	33774546	.	G	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,1:4,3
-chr22	33836842	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=9.9789e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:7,6:8,6
-chr22	34331129	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.6305e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,16:5,10:6,6
-chr22	35428023	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:5,7:5,2
-chr22	36860650	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=8.6742e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:16,22:5,8:11,14
-chr22	37098038	.	C	CG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.010062;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:11,3:2,3
-chr22	38067307	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,5:5,1
-chr22	39121584	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.012526;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:11,4:8,4
-chr22	39341345	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0042541;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:7,7:6,6
-chr22	41637962	.	T	TAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.062937;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,5:2,4:2,1
-chr22	41649160	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:3,3:6,2
-chr22	42731960	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.01174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:7,4:4,6
-chr22	43087837	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.040508;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:9,6:7,2
-chr22	43905254	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.038866;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:16,1:13,7
-chr22	44767339	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00035142;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:4,4:7,5
-chr22	45222632	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:5,1:13,3
-chr22	45929864	.	C	CCATTCATA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0075035;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:4,4:6,4
-chr22	45929922	.	TCCCATCCA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.030216;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,1:8,3
-chr22	47414863	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,4:3,3:5,1
-chr22	47765875	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0054908;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,4:7,2
-chr22	48788140	.	AT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.030571;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:4,1:6,4
-chr22	48950976	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00037903;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:10,5:11,8
-chr22	49167163	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.54545;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,2:0,0:7,2
-chr22	49489523	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.028921;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:3,5:7,1
-chr22	49686911	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,3:8,1
-chr22	49728793	.	GGAGAGCCGGACACCCGGGAGAGCCGGACACCCGA	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.037309;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,1:6,4
-chr22	49973519	.	ATGTGTGGTG	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.032869;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,2:1,2
-chr22	50029417	.	A	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:6,1:1,1
-chr3	599741	.	AT	A	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.034435;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:13,4:31,7
-chr3	1753287	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0015793;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:6,3:8,4
-chr3	3699388	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.030046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:8,6:2,1
-chr3	4258814	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.028271;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,1:4,5
-chr3	4843074	.	G	GT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.047431;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,3:2,1
-chr3	5247207	.	A	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,2:0,1:0,1
-chr3	5304516	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.078413;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,4:15,1:14,3
-chr3	6341515	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.021877;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:12,4:16,2
-chr3	6341516	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.054568;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:12,4:18,1
-chr3	6814474	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00018629;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:9,5:10,5
-chr3	7566110	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,2:0,0:1,2
-chr3	7566111	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,2:0,0:1,2
-chr3	8238775	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:3,2:2,3
-chr3	9406607	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0057147;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:9,9:4,2
-chr3	9479221	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,5:4,1
-chr3	9498203	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.01049;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,7:2,6:1,1
-chr3	10968336	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.040704;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,1:12,3
-chr3	11183855	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
-chr3	11404125	.	AT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,4:2,1
-chr3	12778813	.	C	CA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:0,3:3,2
-chr3	14665263	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.014744;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,9:9,7:8,2
-chr3	17775993	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.043201;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,4:6,2
-chr3	20738988	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:3,2:2,3
-chr3	20954140	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:2,2:3,4
-chr3	22686547	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:4,2:3,1:1,1
-chr3	23988023	.	C	CTCCTTCCTTCCTTCCT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.042146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:2,1:8,3
-chr3	25053747	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0009678;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:9,5:12,4
-chr3	26591051	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0001095;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:8,6:7,6
-chr3	26826129	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0044376;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:1,5:1,1
-chr3	26963139	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0065711;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:4,8:9,4
-chr3	26987052	.	C	CAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,6:4,1
-chr3	27063816	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.7872e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,18:6,7:6,11
-chr3	32300976	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.01494;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:12,8:3,5:9,3
-chr3	32573362	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,3:2,1
-chr3	32787355	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:2,4:5,2
-chr3	33296682	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.3134e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:10,7:6,6
-chr3	35443151	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=5.7929e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:7,8:4,6
-chr3	35985014	.	G	GT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0023186;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:6,7:9,2
-chr3	36699022	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.6443e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:10,4:9,9
-chr3	37305094	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.018191;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:14,2:11,4
-chr3	39232485	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.095042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:15,2:10,2
-chr3	39560325	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.4901e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:7,10:13,9
-chr3	40462373	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:3,2:5,2
-chr3	41012356	.	C	CTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:6,4:3,2
-chr3	42412362	.	GA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.013803;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:11,5:1,1
-chr3	42483212	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0091334;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:5,4:3,3
-chr3	42655741	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=6.8268e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:13,6:6,12
-chr3	43322951	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:2,2:3,2
-chr3	44846771	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,5:3,1
-chr3	44966036	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.028;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:7,2:12,2
-chr3	45350184	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=9.294e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:8,6:9,6
-chr3	46654156	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:0,6:0,4:0,2
-chr3	47529887	.	T	TA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.010021;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:5,2:6,3
-chr3	50142006	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:1,3:7,2
-chr3	50190920	.	G	GAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.022476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:9,5:0,3
-chr3	51774593	.	TAGAG	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,5:2,3:0,2
-chr3	53520894	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0016587;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:1,3:5,4
-chr3	53520902	.	TTC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.012102;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,7:6,3:5,4
-chr3	54318693	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.013124;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:6,5:1,3
-chr3	54660143	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0012644;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,4:5,3
-chr3	55388463	.	G	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.025058;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,5:0,1:1,4
-chr3	58228101	.	CAAATAAAT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:4,6:9,4
-chr3	58990754	.	G	GGTGTGT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.083787;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:15,3:7,3
-chr3	59166836	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.055981;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,2:13,2
-chr3	60483824	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00029085;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:10,9:13,6
-chr3	63198755	.	G	GTATA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,4:8,2:7,2
-chr3	64128743	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,8:2,7:1,1
-chr3	64456467	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023915;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:8,11:10,7
-chr3	64791797	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0098124;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,3:7,1
-chr3	64899720	.	T	TATACATATATATATATAC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.018803;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:1,3:6,1
-chr3	65621917	.	T	TCACACACACACACACA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024789;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,3:5,2
-chr3	66882631	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
-chr3	67782427	.	G	GTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:5,2:3,2
-chr3	69366062	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.12281;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,2:3,1:2,1
-chr3	71147019	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00061107;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:13,3:10,7
-chr3	71632297	.	A	AACACACACACAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.084679;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,5:8,3:11,2
-chr3	72908239	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.4009e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:8,12:10,4
-chr3	73205094	.	AAG	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,6:4,4:0,2
-chr3	73241254	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,4:5,3:8,1
-chr3	73424541	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,3:4,1
-chr3	75186856	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043132;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,3:14,1
-chr3	75358988	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:4,5:9,2
-chr3	75580890	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.015698;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:5,2:6,3
-chr3	75775340	.	TTAAAG	T	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.027384;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:45,13:13,7:32,6
-chr3	75854035	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.027169;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:23,2:10,3
-chr3	76028843	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.5134e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,5:8,4
-chr3	76579786	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0022624;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:2,9:1,7:1,2
-chr3	76834020	.	T	TTCTC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.013481;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:11,1:11,6
-chr3	77112487	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00013223;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:12,7:7,3
-chr3	77565112	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.053727;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:13,2:13,3
-chr3	77787423	.	G	GTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,4:4,3:3,1
-chr3	79953852	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00012013;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:10,9:11,2
-chr3	80399093	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=1.3529e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:6,6:7,5
-chr3	81149010	.	A	AT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,3:2,3
-chr3	81604286	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,3:3,1:1,2
-chr3	81813389	.	AAAATAAATAAAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.02545;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,3:7,4
-chr3	82905562	.	G	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:5,3:12,1
-chr3	83640202	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0005553;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,5:7,4
-chr3	86420996	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,2:1,1:2,1
-chr3	89218869	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0086203;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:8,3:6,3
-chr3	90542825	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=4.45e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:7,5:8,8
-chr3	90821830	.	C	T	0	PASS	DP=288;GPV=1;SPV=0.029015;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:115,20:59,10:56,10
-chr3	90844475	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
-chr3	90874407	.	A	G	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0072124;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:6,3:30,4
-chr3	90889587	.	G	C	0	PASS	DP=248;GPV=1;SPV=0.012149;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:91,12:34,4:57,8
-chr3	90904737	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr3	90916593	.	C	A	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.010902;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:113,15:8,1:105,14
-chr3	91018055	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.13598;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:30,4:0,0
-chr3	91081678	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.077519;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:21,4:0,0
-chr3	91161022	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.043019;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
-chr3	91185920	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.19203;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:19,3:4,1
-chr3	91189955	.	C	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,4:1,0
-chr3	91257470	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.045541;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:13,1:25,6
-chr3	91740897	.	C	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.086154;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr3	92488894	.	A	T	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.043273;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:67,17:51,13:16,4
-chr3	94791475	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00042492;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:3,4:11,4
-chr3	95459522	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=4.9559e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:7,5:7,8
-chr3	96621733	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,2:6,2
-chr3	96994734	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,3:4,1
-chr3	96994736	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,3:3,1
-chr3	98305488	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.14093;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,5:5,4:15,1
-chr3	98743000	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.017385;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,4:1,2
-chr3	98838182	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.011145;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,6:9,2:10,4
-chr3	98948536	.	AT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0021725;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,6:4,1
-chr3	99135180	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.07313;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,2:6,3
-chr3	102971951	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0004122;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:10,9:15,4
-chr3	103451785	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.21888;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,3:17,1
-chr3	103701026	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.8239e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:6,9:11,4
-chr3	104124799	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=7.0073e-09;SS=2;SSC=81;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:11,21:8,11:3,10
-chr3	109426843	.	TTTATGTTATGTTATGTTATG	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.023193;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,8:6,4:6,4
-chr3	109666693	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.048707;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,1:14,3
-chr3	110636095	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,1:14,3
-chr3	111834081	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.046888;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:9,3:8,4
-chr3	111960171	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0046174;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:16,6:13,2
-chr3	113687229	.	T	TCA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,8:2,5:1,3
-chr3	113887096	.	G	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,4:6,1:3,3
-chr3	114188210	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010536;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,3:5,3
-chr3	114901265	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.028936;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:8,3:5,1
-chr3	116009264	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.031156;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,1:11,3
-chr3	118566043	.	TGTATATAC	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.014357;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:9,5:10,5
-chr3	118717750	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024122;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:6,4:15,2
-chr3	119495392	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0081121;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:3,2:5,7
-chr3	119662181	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013462;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,3:3,2:1,1
-chr3	120262175	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0099771;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,7:4,6:1,1
-chr3	120849637	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0022747;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,5:6,3
-chr3	121160238	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=6.9497e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:3,4:8,7
-chr3	121337439	.	T	TA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0055395;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,4:2,2
-chr3	124602945	.	T	TG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.029987;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:7,4:6,3
-chr3	124643006	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.021089;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:6,8:9,3
-chr3	125198780	.	AT	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00028624;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:12,13:6,3
-chr3	125768878	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.021683;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:7,3:9,2
-chr3	125866707	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=5.4866e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:5,4:4,5
-chr3	129752683	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00014234;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:6,3:11,10
-chr3	130198260	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.043405;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:9,5:20,2
-chr3	132150603	.	C	CTGTGTG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:1,2:9,3
-chr3	135266599	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=4.0875e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:7,6:5,4
-chr3	136376016	.	C	CAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:4,3:3,2
-chr3	136769449	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,6:5,5:3,1
-chr3	138848087	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.024875;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:6,5:9,5
-chr3	138925482	.	C	CTTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.018165;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,9:9,7:6,2
-chr3	139689042	.	AAC	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.056596;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,1:12,3
-chr3	139842941	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0034822;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,3:8,3
-chr3	142575468	.	CAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:7,5:2,2
-chr3	145109442	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=2.4769e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:12,22:4,12:8,10
-chr3	145963953	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,4:4,3
-chr3	146283181	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=4.818e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:6,6:3,4
-chr3	147816087	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=6.2767e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:13,9:12,4
-chr3	148411385	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.32536;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,4:8,3:5,1
-chr3	148542106	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,3:3,2:2,1
-chr3	148542139	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:2,1:2,3
-chr3	150717139	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.039412;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:5,4:4,2
-chr3	151237366	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.004995;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:1,4:0,1:1,3
-chr3	151993951	.	T	TA	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.009324;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:1,2:1,4
-chr3	152249646	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00073638;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:15,6:12,8
-chr3	152989471	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0091398;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:3,4:3,3
-chr3	153642273	.	G	GGAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,3:6,4
-chr3	154579355	.	GA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0036547;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,3:2,4
-chr3	155772772	.	C	CTGTGTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,5:4,3:0,2
-chr3	158194690	.	C	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.012217;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:2,7:1,5:1,2
-chr3	160681400	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.024803;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:6,3:13,4
-chr3	161038233	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,5:3,4:2,1
-chr3	162307799	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,3:1,2
-chr3	162939987	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:6,3:2,3
-chr3	163161129	.	T	TTTGTA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,1:6,3
-chr3	163425777	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:3,1:2,1
-chr3	163650440	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=5.9166e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:10,8:11,4
-chr3	163770821	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=4.7123e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,4:6,5
-chr3	164942602	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,3:2,1
-chr3	165084198	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.019456;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,1:8,3
-chr3	165134330	.	CA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.017225;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,3:0,1
-chr3	165187211	.	A	AGTGT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.015677;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:12,6:3,2
-chr3	166465218	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.088868;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:12,2:18,2
-chr3	167300610	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,4:8,1:2,3
-chr3	167894972	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,2:13,2
-chr3	169237636	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.35217;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:8,2:3,2
-chr3	170424039	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.028205;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,4:4,1:4,3
-chr3	170775875	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=2.8276e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,22:8,8:10,14
-chr3	171656156	.	T	TTTTATTTATTTATTTA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0065287;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:6,6:12,1
-chr3	173123601	.	AT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,3:4,2
-chr3	173195760	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.4859e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:8,6:10,9
-chr3	173390373	.	A	AAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0024535;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:12,5:6,3
-chr3	173392472	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00083396;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:10,9:2,2
-chr3	174688478	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:1,2:0,1:1,1
-chr3	177078588	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.030583;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:9,4:2,3
-chr3	181450618	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00031835;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:10,7:13,3
-chr3	185548381	.	G	GA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.008646;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:7,2:6,6
-chr3	188220216	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00011781;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:8,3:8,6
-chr3	188625479	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.01057;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:8,3:8,3
-chr3	189523985	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=1.5161e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:9,4:4,8
-chr3	190379985	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,1:4,3
-chr3	190660288	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0049228;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:12,3:7,5
-chr3	190825850	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,4:1,3:3,1
-chr3	190883811	.	G	GTTTTATTTTATTTTA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,7:3,4:3,3
-chr3	192861597	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.010997;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,2:11,3
-chr3	194014156	.	AC	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,2:4,2
-chr3	195481361	.	C	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.026778;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:23,6:8,4
-chr3	195481549	.	C	A	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.048466;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:74,10:35,6:39,4
-chr3	195484873	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.035906;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:7,6:14,3
-chr3	195486323	.	C	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.018361;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:20,3:20,4
-chr3	195487825	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.05062;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:2,0:19,4
-chr3	195499116	.	CTGTA	C	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.045963;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:66,10:40,6:26,4
-chr3	195499282	.	G	A	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.03119;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:66,11:28,6:38,5
-chr3	195669138	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.048496;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:20,6:12,3
-chr3	195689548	.	G	T	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.03424;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:60,7:35,3:25,4
-chr3	196015564	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.1254e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:13,10:5,8
-chr3	197665144	.	C	T	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.0051126;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:55,14:39,4:16,10
-chr3	198013820	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.01373;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,1:3,4
-chr3	198103562	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
-chr4	25558	.	T	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.0026406;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:5,1:36,6
-chr4	27296	.	C	A	0	PASS	DP=287;GPV=1;SPV=0.021392;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:115,18:46,10:69,8
-chr4	28635	.	G	T	0	PASS	DP=279;GPV=1;SPV=0.017318;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:115,27:68,17:47,10
-chr4	29099	.	G	C	0	PASS	DP=333;GPV=1;SPV=0.02492;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:128,16:63,8:65,8
-chr4	39539	.	G	A	0	PASS	DP=326;GPV=1;SPV=0.0050242;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:133,22:64,9:69,13
-chr4	40433	.	T	C	0	PASS	DP=289;GPV=1;SPV=0.015862;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:120,20:47,10:73,10
-chr4	48672	.	C	T	0	PASS	DP=284;GPV=1;SPV=0.042966;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:126,23:73,14:53,9
-chr4	1493999	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.051194;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:15,2:17,2
-chr4	1767413	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,0:7,4
-chr4	3973437	.	G	GGAGA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,7:7,6:5,1
-chr4	5176438	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0016312;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:4,6:0,2
-chr4	6569717	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11029;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,2:4,2:0,0
-chr4	6977075	.	C	CCCT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.010718;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:3,4:2,5
-chr4	7165318	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,2:4,1:2,1
-chr4	7739206	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.004688;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:14,4:12,4
-chr4	7817635	.	T	TG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013669;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:4,4:10,1
-chr4	9040909	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:10,6:1,1
-chr4	10136329	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:1,3:1,1:0,2
-chr4	11886330	.	C	CAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0076913;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,5:13,2
-chr4	13007575	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=3.0378e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,13:6,7:1,6
-chr4	13515440	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=7.6487e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,17:9,12:6,5
-chr4	16910536	.	TC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18182;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,2:1,1:2,1
-chr4	17000537	.	T	TCC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040508;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:7,2:9,6
-chr4	18105962	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,9:1,7:1,2
-chr4	18358266	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00056426;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,7:9,1
-chr4	19012460	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0011064;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,6:4,1
-chr4	19135688	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,4:10,3:2,1
-chr4	19799201	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=2.0205e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,16:7,11:9,5
-chr4	20261340	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=5.4482e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:11,6:5,6
-chr4	20303009	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.012328;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,5:5,2:7,3
-chr4	20362937	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00025782;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:4,3:9,4
-chr4	20803470	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,5:1,1
-chr4	20837623	.	G	GAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0052884;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,5:5,4
-chr4	21200339	.	CAT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,2:6,2
-chr4	21200348	.	ATGTGTG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.05132;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,2:6,2
-chr4	21519732	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.093333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
-chr4	22777492	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,6:4,2:7,4
-chr4	24159206	.	C	CTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,3:4,1
-chr4	24229843	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.012445;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,10:11,6:1,4
-chr4	24387764	.	GAGAGAA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:7,3:3,1
-chr4	24430255	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:5,3:2,1
-chr4	27702962	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0001763;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:4,4:8,7
-chr4	27832897	.	G	GTA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,3:1,1
-chr4	28368863	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0010998;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:6,9:2,3
-chr4	28599638	.	AT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10577;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:3,4:3,1
-chr4	28780849	.	G	GA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.038274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,2:8,2
-chr4	29036293	.	T	TAGAGAGAG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,5:7,3:2,2
-chr4	30251742	.	G	GT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.042595;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,2:6,2
-chr4	31794502	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.021615;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:15,3:14,4
-chr4	31949442	.	T	TCTGTGAATGCCCAAGTC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043327;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:7,4:7,7
-chr4	31998540	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.07056;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,2:13,2
-chr4	32328479	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.9527e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:17,23:5,14:12,9
-chr4	32415428	.	AGTTAGCT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0029033;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:3,7:7,3
-chr4	32419738	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.8683e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:11,6:12,7
-chr4	33608707	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.8161e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:9,8:3,2
-chr4	34188552	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00048983;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:13,4:9,8
-chr4	36555442	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:5,5:2,1
-chr4	38135874	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.04966;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:7,2:13,4
-chr4	40216136	.	A	AT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0020738;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:10,8:3,2
-chr4	40642727	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:2,1:2,1
-chr4	41460395	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,1:5,8
-chr4	41515324	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0035372;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,3:8,2
-chr4	42257822	.	GTATT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0054438;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,8:5,2:6,6
-chr4	42936026	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0011989;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,16:2,4:5,12
-chr4	43101703	.	ATGTGTGTGTGTG	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,2:1,2:0,0
-chr4	43271980	.	AAGATAGAT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.02677;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,6:6,2
-chr4	44045765	.	G	GA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0034446;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:4,4:6,2
-chr4	44989685	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00042977;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,1:7,8
-chr4	45692158	.	TAA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.022977;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:1,8:0,4:1,4
-chr4	45740364	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00020684;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:6,3:9,8
-chr4	46152997	.	T	TCAAGGTTACACAGGTACTAAATGGCAAAGC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0074932;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,3:3,4
-chr4	47195444	.	ATGATAGATAGAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,5:8,2:2,3
-chr4	49034001	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=7.3475e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:12,9:12,7
-chr4	49155725	.	GATTCTGTTCCATTCCATTCCATTCCATTCC	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.042001;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:7,2:6,4
-chr4	49158126	.	A	G	0	PASS	DP=261;GPV=1;SPV=0.00047133;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:105,14:40,10:65,4
-chr4	49159598	.	A	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.023819;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:65,19:31,12:34,7
-chr4	49188826	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.029893;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:40,9:19,2:21,7
-chr4	49195988	.	C	T	0	PASS	DP=233;GPV=1;SPV=0.0187;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:76,13:37,9:39,4
-chr4	49209561	.	CTTCT	C	0	PASS	DP=426;GPV=1;SPV=0.028794;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:201:177,24:128,19:49,5
-chr4	49235636	.	T	C	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.049948;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:71,15:33,9:38,6
-chr4	49268131	.	C	T	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.014656;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:100,18:56,9:44,9
-chr4	49292167	.	T	TGGG	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.045585;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:52,10:34,2:18,8
-chr4	49298009	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.028693;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:9,1:14,7
-chr4	49504533	.	G	A	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.032041;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:45,10:19,6:26,4
-chr4	49521658	.	G	A	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.029111;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:59,11:35,9:24,2
-chr4	49538737	.	C	T	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.027785;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:72,11:39,4:33,7
-chr4	49539297	.	G	A	0	PASS	DP=212;GPV=1;SPV=0.030851;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:91,17:60,11:31,6
-chr4	49546529	.	C	G	0	PASS	DP=388;GPV=1;SPV=0.043726;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:210:174,27:61,11:113,16
-chr4	49580423	.	C	G	0	PASS	DP=466;GPV=1;SPV=0.036691;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:193,24:83,11:110,13
-chr4	49623761	.	G	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.017246;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:23,3:18,3
-chr4	49893743	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.040622;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:6,1:29,3
-chr4	50431596	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
-chr4	50600013	.	C	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
-chr4	50644126	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.30924;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:19,3:2,0
-chr4	51059315	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.013215;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,8:8,1
-chr4	51574080	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
-chr4	51895201	.	TA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0010272;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,3:11,7
-chr4	55629615	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:2,4:4,1
-chr4	56545718	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:4,3:3,1
-chr4	56548991	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030289;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:4,2:3,3
-chr4	57021485	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,4:2,4:0,0
-chr4	58752969	.	ATT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,3:7,3
-chr4	59130721	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0014606;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,14:5,8:7,6
-chr4	60066131	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,4:3,1
-chr4	60220865	.	G	GTGTATATATA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.021263;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,3:7,1
-chr4	60696202	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0020609;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:17,8:13,3
-chr4	61893112	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.018803;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,4:1,1:6,3
-chr4	62980752	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=3.3946e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:6,8:9,4
-chr4	63086068	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0064344;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:4,2:12,3
-chr4	63351189	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.6179e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,17:5,6:9,11
-chr4	63535392	.	C	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,3:5,2
-chr4	63536748	.	GACAA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:5,2:9,2
-chr4	64155422	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,3:0,1:0,2
-chr4	64351087	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.011858;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,3:4,1
-chr4	64610087	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00042022;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:15,6:12,4
-chr4	64880892	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0012514;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,2:4,3
-chr4	65045263	.	T	TAAGAAGAAGAAGAAG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.094902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,5:14,3:8,2
-chr4	65317488	.	A	AT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,2:11,2
-chr4	65681947	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=5.5244e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,6:7,3
-chr4	66516477	.	G	GTA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,5:3,4
-chr4	67371441	.	G	GTGTGTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.065489;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:10,1:7,3
-chr4	67604809	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=4.5525e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:6,9:16,7
-chr4	68041060	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0025253;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,2:4,8
-chr4	69526108	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:4,4:3,1
-chr4	70837563	.	C	CA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,4:0,2:4,2
-chr4	72007650	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.5329e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:6,10:5,4
-chr4	73644879	.	GGT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:5,4:2,1
-chr4	74917072	.	C	CTTTTTTTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.006993;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,5:0,4:2,1
-chr4	75187112	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:2,1:8,3
-chr4	76091679	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,6:2,5:1,1
-chr4	76336181	.	CAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.018485;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,11:7,9:3,2
-chr4	76646225	.	A	AATAAATATAT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.040809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:9,7:5,1
-chr4	76918351	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.011197;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:17,4:23,4
-chr4	78872303	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,3:6,1
-chr4	79303076	.	TTATATATATATATA	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:4,3:0,1
-chr4	80060190	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00018954;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,7:6,2
-chr4	80868907	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.031591;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,4:10,1
-chr4	81366582	.	A	AAAACCGACC	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.053727;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:11,2:15,3
-chr4	83521118	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.021691;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:1,1:10,4
-chr4	85875093	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:2,4:2,2
-chr4	87022662	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.33319;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,2:14,2
-chr4	87197952	.	G	GTAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.013933;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:6,8:7,1
-chr4	90007095	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0080725;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:13,7:6,3
-chr4	90796417	.	TTA	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.020897;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,10:8,7:8,3
-chr4	91766222	.	C	CTA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,7:3,5:6,2
-chr4	91782584	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
-chr4	92073528	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.8161e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:2,5:10,5
-chr4	92708101	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0044785;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,4:11,3
-chr4	92958866	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=1.3655e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:9,4:5,8
-chr4	93371741	.	C	CT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
-chr4	94418545	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00015299;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:9,5:5,6
-chr4	94524368	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,5:2,4:0,1
-chr4	95087259	.	CATAT	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.015001;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,1:10,3
-chr4	95087265	.	CTTCTAATCAATT	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.018519;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,1:11,3
-chr4	95890247	.	TTA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:2,4:4,3
-chr4	96292651	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.1124;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:12,1:14,2
-chr4	98754508	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0072285;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:21,6:11,2
-chr4	100568361	.	C	CAAAAAAAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:2,4:0,0
-chr4	100836100	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=1.4836e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,14:5,2:2,12
-chr4	102908195	.	CTT	C	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.033882;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:56,13:32,5:24,8
-chr4	104464362	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.016858;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,5:2,1
-chr4	105099523	.	G	GAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0010365;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,9:6,3:3,6
-chr4	107234720	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0073297;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,5:3,2
-chr4	108230622	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.02902;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:18,3:14,2
-chr4	109430064	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:1,4:0,1:1,3
-chr4	111078136	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=2.2678e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:5,5:9,9
-chr4	112224517	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:1,1:3,1
-chr4	113205235	.	C	CAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.02396;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:2,5:3,1
-chr4	113856891	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.010227;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:12,4:9,3
-chr4	117227836	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0012555;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:8,4:12,6
-chr4	117610365	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,4:2,2:2,2
-chr4	118451984	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0063218;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:4,3:4,3
-chr4	119835931	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.01246;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:4,5:6,2
-chr4	120099655	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0001095;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:9,6:6,6
-chr4	120560931	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,2:4,1:2,1
-chr4	121124888	.	AGG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:15,3:5,1
-chr4	121145979	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0012203;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:12,3:5,5
-chr4	121162601	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.7819e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:8,3:6,11
-chr4	121427233	.	C	CT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.014324;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,2:9,3
-chr4	125180690	.	AAG	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:7,3:1,1
-chr4	130548221	.	G	GA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:16,2:2,2
-chr4	131741404	.	A	G	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.015965;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:74,10:42,3:32,7
-chr4	132151879	.	AT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0024544;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,2:9,5
-chr4	132956792	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01208;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,3:5,2
-chr4	133766670	.	G	GA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:21,3:6,1
-chr4	134154324	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=5.0667e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,18:6,9:3,9
-chr4	134230518	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0018725;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:13,5:15,6
-chr4	134599757	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.1146e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:10,5:8,10
-chr4	134628423	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.028003;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:9,2:12,3
-chr4	135232343	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.1173e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:9,5:7,6
-chr4	135424024	.	A	ATTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0003147;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,10:0,6:1,4
-chr4	136353407	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0023953;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:9,6:1,3
-chr4	137294181	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.2381;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,3:2,1:1,2
-chr4	137486932	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,3:11,1
-chr4	137728455	.	AT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.1199e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:8,17:6,13:2,4
-chr4	140764434	.	GAAA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.050152;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,2:9,2
-chr4	141070820	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0044568;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:4,3:11,2
-chr4	141070845	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0032451;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:3,3:9,2
-chr4	142571089	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0035559;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:6,7:2,3
-chr4	143147103	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0018182;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,6:9,1
-chr4	145488476	.	TTG	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0023616;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:7,10:9,5
-chr4	145740240	.	CAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,3:1,1
-chr4	147060358	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.004949;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:7,8:6,3
-chr4	148104340	.	T	TGTTTTGGTTTG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,2:8,2
-chr4	148589700	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.7714e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:15,6:6,6
-chr4	148749498	.	GA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,6:6,5:2,1
-chr4	149703913	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00076774;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:11,4:8,5
-chr4	149861290	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00010405;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:10,3:5,6
-chr4	149995142	.	A	AAG	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,1:9,3
-chr4	150108246	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.6371e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:8,7:11,7
-chr4	150733578	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,5:8,3:2,2
-chr4	155825297	.	T	TAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=3.507e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,12:2,9:2,3
-chr4	157525468	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0010012;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:14,4:5,4
-chr4	158429863	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:15,2:8,2
-chr4	159198271	.	CTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:0,1:7,4
-chr4	159340667	.	CCA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.016809;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,2:4,4
-chr4	162333631	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0012565;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:14,5:9,6
-chr4	162717143	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,4:4,2:6,2
-chr4	163590057	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037417;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:5,5:5,1
-chr4	163812152	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.002657;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:10,6:12,6
-chr4	164354726	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.079656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,1:14,3
-chr4	164541450	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.4158e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:8,6:6,5
-chr4	164939267	.	CAAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0092274;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:11,26:5,17:6,9
-chr4	165690124	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:0,2:1,2
-chr4	166578529	.	TA	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.05848;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,2:3,2:0,0
-chr4	168959565	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,2:3,2
-chr4	169892545	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0027776;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:7,4:2,5
-chr4	170222811	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.010538;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,10:6,8:1,2
-chr4	170486385	.	A	ATG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,4:1,2:2,2
-chr4	172069553	.	A	ATG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0046252;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,2:3,3
-chr4	173497650	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0034325;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,6:3,5:2,1
-chr4	173868968	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=5.9337e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:12,9:11,11
-chr4	174110292	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=3.79e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,7:6,2
-chr4	174609558	.	C	CTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:6,3:3,1
-chr4	175490507	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0022052;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:10,5:4,3
-chr4	175953008	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=1.298e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,17:4,10:6,7
-chr4	177184945	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,5:4,4:1,1
-chr4	177184947	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,4:5,3:2,1
-chr4	178472657	.	T	TAAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019346;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:7,5:6,3
-chr4	178673782	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.14404;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,4:5,1
-chr4	178822382	.	GA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0031364;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:10,3:9,8
-chr4	178822384	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027568;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:9,3:12,3
-chr4	179450058	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.033794;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,3:5,2
-chr4	179538614	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.021744;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:11,1:13,4
-chr4	181791460	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=4.0902e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,16:10,9:6,7
-chr4	181803954	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,2:2,1:3,1
-chr4	185076265	.	TA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.18182;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,2:0,1:3,1
-chr4	185093140	.	CTTT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,1:2,3
-chr4	185239771	.	TTTC	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.004102;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:14,3:12,5
-chr4	185239776	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.034496;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:12,2:9,3
-chr4	186929943	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.029503;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,7:12,5:3,2
-chr4	187027218	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:9,5:9,1
-chr4	188130754	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0040588;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,3:8,2
-chr4	189197004	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0060655;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:10,3:14,6
-chr4	189693572	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,3:2,2
-chr4	190097105	.	C	T	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.016545;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:82,15:30,8:52,7
-chr4	190108463	.	C	A	0	PASS	DP=300;GPV=1;SPV=0.017876;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:121,17:65,7:56,10
-chr4	190117450	.	G	GT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.05337;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:10,2:12,4
-chr4	190203701	.	C	T	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.044094;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:57,12:21,4:36,8
-chr5	786736	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.025784;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:13,5:5,2
-chr5	787732	.	G	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.042625;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:47,10:27,4:20,6
-chr5	801057	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.017545;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:16,5:6,5
-chr5	834381	.	C	T	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.031495;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:58,11:32,5:26,6
-chr5	1291685	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:8,4:1,2
-chr5	2925045	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=4.4743e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:14,7:9,8
-chr5	3067337	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.018307;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,1:4,5
-chr5	3281558	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036872;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,2:13,3
-chr5	3660148	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.057842;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,2:6,2
-chr5	4075662	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:4,3:6,8
-chr5	4111044	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=7.9674e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:12,20:6,11:6,9
-chr5	4295528	.	AC	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0002482;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:9,4:5,8
-chr5	4435548	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=8.1326e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,13:3,5:7,8
-chr5	7995134	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=9.3592e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:9,6:5,5
-chr5	8994427	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=6.9341e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:5,7:11,5
-chr5	9035959	.	C	CA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.020979;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,7:1,6:1,1
-chr5	9724344	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0065088;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,11:5,7:4,4
-chr5	11736626	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.021989;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:10,6:18,5
-chr5	13300269	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0067708;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:7,4:16,3
-chr5	13421330	.	G	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr5	13554519	.	CTCCTTCCTTCCTTCCTTCCT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0018511;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:1,7:0,1:1,6
-chr5	15904349	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=1.4125e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:6,5:6,6
-chr5	17065219	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=4.7807e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:7,5:6,5
-chr5	17067679	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:0,5:0,2:0,3
-chr5	18035622	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.088868;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:11,1:19,3
-chr5	18311530	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00010063;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:9,7:13,8
-chr5	19382649	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,5:1,1:2,4
-chr5	20463302	.	GA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00058624;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:6,4:5,7
-chr5	20646319	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0127;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:5,1:10,7
-chr5	21488938	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.015769;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:16,4:11,3
-chr5	21875683	.	C	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,3:7,1
-chr5	22523981	.	AT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.011783;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,4:2,1
-chr5	24198074	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:6,4:6,4
-chr5	24913764	.	G	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,3:13,1
-chr5	25117122	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,3:8,1
-chr5	25848929	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00081542;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:8,5:8,4
-chr5	29310817	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00029784;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,7:6,2
-chr5	30426114	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.032225;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:16,3:8,1
-chr5	30426139	.	AG	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.018352;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,4:11,1
-chr5	30474110	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.02066;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:4,4:2,1
-chr5	30756258	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0004914;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:7,2:10,7
-chr5	30978445	.	G	GTGTGTATATATATATA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,5:2,1:10,4
-chr5	31577922	.	A	AT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0074736;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,1:11,5
-chr5	31684563	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00084538;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:5,6:5,5
-chr5	31794393	.	CTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:1,5:4,1
-chr5	32330471	.	C	CGTGTGCATGTGTGCACAT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0036088;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:7,2:12,9
-chr5	32994567	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.037198;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,5:9,4:1,1
-chr5	34188039	.	C	T	0	PASS	DP=449;GPV=1;SPV=0.0034144;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:237:197,40:101,16:96,24
-chr5	35337023	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.011736;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:10,4:13,2
-chr5	35714680	.	T	TTTTA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00062385;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,14:7,10:6,4
-chr5	36663380	.	A	ATTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,2:6,2
-chr5	37392177	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=1.3766e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,11:3,8:4,3
-chr5	39971756	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:7,4:8,3
-chr5	40790526	.	T	TC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.062457;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:7,3:13,2
-chr5	41496627	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.02002;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,9:10,8:2,1
-chr5	42735836	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.036877;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,1:11,7
-chr5	42925502	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,3:2,1:1,2
-chr5	43731181	.	C	CTCT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.02253;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:2,2:3,3
-chr5	43938390	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=3.26e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:4,13:2,8:2,5
-chr5	46173991	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=4.1324e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:3,6:10,5
-chr5	46384061	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=2.5801e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:8,11:7,2
-chr5	46625466	.	T	A	0	PASS	DP=426;GPV=1;SPV=0.031626;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:204:175,29:80,13:95,16
-chr5	47119184	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.038786;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:11,3:21,2
-chr5	47119442	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.011316;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,4:4,5
-chr5	47141678	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,3:6,1
-chr5	50132477	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr5	50141734	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027027;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:15,3:1,3
-chr5	50142658	.	C	G	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.0086507;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:102,18:63,13:39,5
-chr5	50143548	.	A	T	0	PASS	DP=435;GPV=1;SPV=0.038728;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:201:170,31:72,18:98,13
-chr5	51103574	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=6.5361e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:13,9:5,4
-chr5	52439551	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.037381;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,2:14,2
-chr5	53598043	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.059705;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,3:10,1
-chr5	53601186	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0027946;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:8,4:10,5
-chr5	53658784	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:8,4:3,1
-chr5	56135351	.	CTTTCT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,1:4,5
-chr5	56341091	.	G	GT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,2:1,2
-chr5	57138557	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,1:0,3
-chr5	57458000	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:1,3:9,6
-chr5	57719698	.	C	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.035343;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:11,2:5,3
-chr5	58088476	.	AAT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.065325;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,3:5,2
-chr5	58625856	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036129;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,5:6,4
-chr5	62636219	.	GT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,6:4,4:0,2
-chr5	63267550	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.035568;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,5:8,3:7,2
-chr5	65223801	.	A	ATT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:15,3:2,1
-chr5	65321738	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0070913;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:3,4:3,6
-chr5	66259639	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.046752;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,4:7,3
-chr5	66648034	.	ATGTGTGTGTGTGTGTG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:8,3:3,1
-chr5	68527167	.	AT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.025729;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,3:12,2
-chr5	69151114	.	T	TAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0079853;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,6:6,5:6,1
-chr5	69673590	.	A	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
-chr5	70081412	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr5	72704906	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00026317;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,2:4,6
-chr5	73938160	.	C	CCACACACACA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,10:6,6:1,4
-chr5	74503607	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035604;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,6:10,2:5,4
-chr5	74748880	.	TA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020407;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:2,3:10,3
-chr5	74914922	.	TGTG	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,5:3,3
-chr5	75750741	.	C	CATTCATCTATCTATCT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.031169;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:14,4:10,6
-chr5	76778462	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,3:1,2:1,1
-chr5	77225848	.	G	GCA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0054795;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:10,5:5,5
-chr5	77794886	.	GC	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0014231;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:5,3:1,2
-chr5	78768352	.	C	CTTTTTTTTTTTCT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024462;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:4,2:6,2
-chr5	80178537	.	A	ATT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:1,3:2,1
-chr5	80182555	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,0:6,4
-chr5	80738651	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0015905;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,4:6,3
-chr5	81618308	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,1:4,4
-chr5	81798603	.	G	GCA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.043382;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:7,3:4,1
-chr5	82186593	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:1,2:0,0:1,2
-chr5	82473017	.	TATATATTATC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,2:4,2
-chr5	82473099	.	TTATAA	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0078894;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:4,2:9,3
-chr5	82979395	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.3;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,2:7,2:0,0
-chr5	85103160	.	G	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.014907;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,5:3,4:4,1
-chr5	85555745	.	C	CTATATATATA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:2,3:2,1
-chr5	85980904	.	C	CAAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,5:2,4:3,1
-chr5	86041764	.	CTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
-chr5	94847684	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11053;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,2:1,1:4,1
-chr5	96954713	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.049808;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,1:6,3
-chr5	98280732	.	G	GGATAGATAGATA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:6,3:3,3
-chr5	98911146	.	A	AATATATAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047431;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:3,2:2,2
-chr5	98996250	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=4.4713e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:6,6:9,8
-chr5	102138395	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.04308;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,3:4,2
-chr5	103865661	.	G	GGTGTGT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.056718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,3:7,2
-chr5	107659496	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0012716;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,11:2,6:4,5
-chr5	109202422	.	ATG	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.042283;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:7,1:6,2
-chr5	109342265	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,3:4,1
-chr5	110524408	.	AAAG	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,5:9,2:4,3
-chr5	112889829	.	A	ATT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.015905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,8:1,4:3,4
-chr5	114236398	.	T	TAATTCAATTAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018956;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,3:6,4
-chr5	114891042	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.7528e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,18:9,12:8,6
-chr5	116688375	.	G	GTATC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,2:0,0:4,2
-chr5	117585075	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.004119;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,8:4,7:3,1
-chr5	117638790	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.098039;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,2:2,1:2,1
-chr5	118850309	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=2.8354e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:2,8:3,1
-chr5	119894971	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0079383;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:6,4:3,4
-chr5	120518564	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.016617;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:6,5:5,6
-chr5	121493096	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.020557;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,6:5,4:5,2
-chr5	122461669	.	GT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00027871;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,7:2,4:2,3
-chr5	125196155	.	C	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.024679;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,3:5,3
-chr5	125276936	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0013275;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,4:5,2
-chr5	126517357	.	A	ATT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0016018;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,10:3,8:1,2
-chr5	126954199	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0091635;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:11,6:6,2
-chr5	127921100	.	A	AAGGAAAGGAGAAAGGAG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,3:9,1
-chr5	129498798	.	AT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.044826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,2:11,2
-chr5	129816647	.	A	ACG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.019748;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:6,8:11,3
-chr5	130083941	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.02651;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:15,2:12,5
-chr5	132123273	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,6:4,1
-chr5	134544329	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=5.2583e-10;SS=2;SSC=92;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:13,20:3,9:10,11
-chr5	134594308	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:1,2:7,5
-chr5	135093687	.	T	TTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.044511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:6,7:7,1
-chr5	136046402	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0019282;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:9,6:10,1
-chr5	136048771	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00091602;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:11,5:9,2
-chr5	136723206	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,3:3,1:2,2
-chr5	137065227	.	C	CAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.36264;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,4:3,3:5,1
-chr5	137473356	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00073711;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:12,5:6,4
-chr5	138195699	.	G	GTA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.040316;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,2:4,2
-chr5	141792627	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,5:7,4:4,1
-chr5	144278485	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:2,7:6,1
-chr5	145152125	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0217;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,4:6,2
-chr5	146271565	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00029342;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:5,5:12,4
-chr5	146271566	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=9.1801e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:4,4:11,6
-chr5	146989276	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11302;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:9,3:12,1
-chr5	147027634	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0054348;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,7:5,4:3,3
-chr5	147249908	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:5,4:2,1
-chr5	147604800	.	TTTA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023277;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,9:3,4:10,5
-chr5	149809275	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12566;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:10,3:6,3
-chr5	151238956	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.11088;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:19,1:14,3
-chr5	151384249	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0040413;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,4:13,3
-chr5	152714933	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=7.4643e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:8,8:5,4
-chr5	153648838	.	A	AC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.039018;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:11,1:4,9
-chr5	155108106	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.5408e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:7,5:14,12
-chr5	156631460	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,6:4,1
-chr5	157064339	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.019016;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:9,4:4,2
-chr5	157448096	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.017225;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,3:2,1
-chr5	158502028	.	GTA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.033472;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:7,2:8,6
-chr5	158586147	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,2:1,1:4,1
-chr5	160063966	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.004662;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,5:0,4:0,1
-chr5	160075805	.	TA	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:3,4:3,2
-chr5	160249765	.	AAAATAAATAAATAAATAAAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0093762;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,3:6,5
-chr5	161177701	.	G	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00048277;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:4,3:8,5
-chr5	161700455	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:14,2:19,4
-chr5	163329002	.	ACACACACACACACACACACATC	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,4:3,2
-chr5	164428259	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00116;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:16,5:9,3
-chr5	165866760	.	A	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=7.4709e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:4,4:8,10
-chr5	166426334	.	ATTT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:8,4:1,4
-chr5	167070107	.	A	ATATTTATTTATT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,7:1,4:2,3
-chr5	168334430	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0022813;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:11,6:7,3
-chr5	169328955	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016081;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:9,5:12,2
-chr5	170918403	.	T	TACACACACAC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.016633;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:10,6:7,3
-chr5	171276918	.	TAA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,6:3,5:2,1
-chr5	171339649	.	AT	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00024587;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:4,2:11,7
-chr5	172223586	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,3:1,1
-chr5	172610316	.	G	GCACACACACACACA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0033988;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,5:5,2
-chr5	174382247	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,4:6,4
-chr5	174818008	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:6,3:7,1
-chr5	175874420	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.0986e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:7,7:3,8
-chr5	175999344	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:3,5:5,1
-chr5	176628407	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=6.6996e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:5,6:4,6
-chr5	177854131	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.025973;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:6,5:16,1
-chr5	178530930	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.044629;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,3:15,1
-chr5	178804228	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0083519;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:5,8:4,1
-chr5	178823181	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0012285;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,6:2,2
-chr5	179156359	.	A	AT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023692;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:7,6:4,4
-chr5	179510765	.	C	CA	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:0,3:4,1
-chr5	180360305	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0094281;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,1:11,4
-chr5	180617169	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.093333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
-chr6	2326994	.	TATATA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.39766;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,4:7,3:6,1
-chr6	5007386	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.024548;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:10,3:8,2
-chr6	5176066	.	A	AGT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0028726;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,15:10,11:9,4
-chr6	7021565	.	TTG	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,3:5,3
-chr6	7021611	.	A	AC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,3:6,3
-chr6	7933569	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027836;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
-chr6	8567024	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016203;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,1:7,7
-chr6	9525052	.	AAAAAAC	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,3:2,1
-chr6	9676581	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00097732;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:8,1:8,7
-chr6	13409149	.	G	GAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.014666;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,5:4,1:0,4
-chr6	13409930	.	AAAAAAAAAAAG	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:4,1:0,7
-chr6	14858616	.	T	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,3:2,1:3,2
-chr6	14989974	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.041509;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:6,6:11,4
-chr6	15980662	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,2:3,1:2,1
-chr6	17493775	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0094843;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,11:6,7:3,4
-chr6	18887884	.	TGG	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,2:1,1:2,1
-chr6	18929526	.	G	GTACATATACATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.035015;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,1:5,4
-chr6	19174803	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0029252;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:3,7:6,5
-chr6	19613513	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00019519;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:11,4:8,7
-chr6	19787417	.	A	ATT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,4:4,1
-chr6	19810897	.	TTA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.11088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:17,3:16,1
-chr6	21114247	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,1:2,3
-chr6	22371326	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00034904;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:9,8:7,3
-chr6	22608659	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.042577;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:18,4:12,1
-chr6	22849274	.	A	ATGTGTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,5:6,2
-chr6	22980709	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=9.2147e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:8,8:6,6
-chr6	23288756	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,3:2,2:4,1
-chr6	23288758	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,3:2,2:4,1
-chr6	26440809	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.07563;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:9,2:15,2
-chr6	27485579	.	CG	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.069378;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,1:10,3
-chr6	27567279	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:7,3:4,1
-chr6	27718696	.	CA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.076832;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:14,1:8,3
-chr6	27764016	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,2:7,2
-chr6	28808465	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00026518;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,3:7,8
-chr6	29123667	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.020274;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:10,3:15,2
-chr6	29317941	.	G	GTA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023879;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:12,5:2,1
-chr6	30022323	.	A	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,1:4,3
-chr6	30135216	.	C	CA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,8:1,6:1,2
-chr6	30373939	.	CTTCT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:1,1:6,4
-chr6	31619069	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,1:6,3
-chr6	32392502	.	A	AG	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,4:2,1
-chr6	33556655	.	T	TTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:5,2:5,2
-chr6	34840391	.	T	TA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.015182;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
-chr6	34850013	.	C	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0034865;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:12,4:7,4
-chr6	34991735	.	TATATATAC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:4,3:4,1
-chr6	35273722	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,8:3,1
-chr6	36933211	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.003791;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:10,4:12,5
-chr6	38830634	.	CAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.004902;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:0,2:2,2
-chr6	38873770	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.018307;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,6:1,3:4,3
-chr6	39979558	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=7.8332e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:8,8:1,5
-chr6	41440255	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:4,3:3,2
-chr6	41568407	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.1994e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:9,23:6,12:3,11
-chr6	41650573	.	C	CTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,7:2,3:3,4
-chr6	44642499	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00037668;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:8,3:3,6
-chr6	45302467	.	C	CAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:1,4:3,2
-chr6	46072236	.	GA	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.00021109;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:2,7:2,6:0,1
-chr6	46332313	.	A	AT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019062;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:2,3:10,2
-chr6	48366126	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12547;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,3:14,1
-chr6	48897335	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.049719;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:21,2:11,4
-chr6	50424202	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.1474e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:9,7:9,5
-chr6	50810018	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:6,3:7,3
-chr6	51101673	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.033473;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:13,5:8,1
-chr6	54317392	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.044429;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:12,3:11,1
-chr6	54809924	.	C	CAAGAAAGA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:6,4:5,1
-chr6	57845096	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=3.4748e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:4,6:7,6
-chr6	58216143	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00034756;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:5,10:2,2
-chr6	58236748	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0018544;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:5,7:11,2
-chr6	58406214	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.034441;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,1:9,3
-chr6	58407963	.	T	TTTTATTTATTTATTTATTTATTTA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0079853;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:5,4:7,2
-chr6	60275841	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.03973;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:7,5:12,2
-chr6	61316474	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=4.3478e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:10,3:7,11
-chr6	63259044	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.065934;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:2,2:1,1:1,1
-chr6	63600781	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0079864;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,4:3,3
-chr6	63834638	.	C	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.074026;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:4,3:11,1
-chr6	63863664	.	TTTTCTTTTTTC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:3,3:4,1
-chr6	65649137	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,4:3,2
-chr6	66722997	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.13725;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,2:2,1:3,1
-chr6	66761648	.	CATACAT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:6,2:6,6
-chr6	67787159	.	G	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:2,5:0,1
-chr6	67827667	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.9702e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:8,5:10,8
-chr6	67947687	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=3.1551e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:10,11:7,6
-chr6	68956303	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.013165;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:6,5:16,4
-chr6	70234303	.	AC	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.071318;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,1:13,3
-chr6	70637218	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.03818;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:8,4:5,1
-chr6	71020944	.	G	GCGCA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,5:6,3:14,2
-chr6	72411671	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.010126;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:15,2:7,5
-chr6	73124976	.	TATATACACAC	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,4:0,1:2,3
-chr6	74276896	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.041988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,2:11,2
-chr6	75326112	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,2:8,2
-chr6	75735448	.	C	CTCTCTCTCTATATATA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:4,2:12,2
-chr6	76386785	.	C	CAAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0020034;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,12:8,8:5,4
-chr6	77097105	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=2.8475e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,16:5,8:4,8
-chr6	77520751	.	GA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:6,6:1,3
-chr6	78788156	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,3:0,2:0,1
-chr6	79739208	.	TGTGTTA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.021122;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,8:4,4:7,4
-chr6	81387847	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0031585;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,1:5,5
-chr6	82559691	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.011166;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:2,5:6,4
-chr6	82723481	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.059432;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,2:10,2
-chr6	84350069	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00012326;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,5:5,4
-chr6	84630361	.	C	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,1:7,5
-chr6	85263223	.	T	TATACACATATACATATATAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,4:1,1:4,3
-chr6	85799173	.	A	AT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.018226;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:11,4:4,1
-chr6	85918931	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.7286e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,5:8,6
-chr6	86617490	.	TATATATATATAG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031813;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,1:5,3
-chr6	86743844	.	TG	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.018478;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,2:3,3
-chr6	89242667	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.030475;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,3:6,3
-chr6	90213726	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0015295;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:8,6:11,6
-chr6	91843111	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.03297;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:9,4:15,2
-chr6	92250287	.	ATG	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,5:4,3:5,2
-chr6	92413584	.	AT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00024826;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,9:3,6:3,3
-chr6	92643495	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00012488;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:6,4:6,6
-chr6	93624766	.	A	AGG	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:5,6:4,1
-chr6	94088690	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.027862;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:15,4:5,1
-chr6	94711582	.	G	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,3:5,1
-chr6	95601716	.	ATTT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,5:1,2:4,3
-chr6	96315368	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0003269;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:12,6:5,6
-chr6	96711141	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,4:5,3:2,1
-chr6	97660619	.	T	TTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0001711;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,13:4,10:4,3
-chr6	98939075	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.011858;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:5,4:0,0
-chr6	99095148	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.12;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,2:4,1:3,1
-chr6	101109446	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:1,2:1,1:0,1
-chr6	101109450	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,2:3,1:1,1
-chr6	101133838	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=8.3997e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,21:7,12:7,9
-chr6	102572805	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00041713;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:3,5:2,1
-chr6	102720122	.	A	AT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=4.8311e-06;SS=2;SSC=53;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:7,3:5,8
-chr6	103955036	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=4.0733e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:6,7:4,5
-chr6	105521621	.	A	AT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.8197e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:8,6:14,7
-chr6	107499161	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0035067;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:12,2:8,6
-chr6	107863971	.	CGT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:7,5:1,1
-chr6	107931487	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:1,2:0,1:1,1
-chr6	108718547	.	C	CTCTCGT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0072348;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,6:2,3:2,3
-chr6	109409579	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,5:2,2:8,3
-chr6	109417385	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:1,2:0,0:1,2
-chr6	109437548	.	CTTT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0048077;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,5:1,3:1,2
-chr6	109822797	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0058007;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,8:2,5:1,3
-chr6	110350762	.	CAAAAT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00038136;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,6:3,2
-chr6	113069811	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.066e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,16:2,9:5,7
-chr6	113589996	.	AG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,2:4,3
-chr6	114750491	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.054945;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,8:0,4:3,4
-chr6	115825428	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:8,4:0,1
-chr6	118827497	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0065856;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:11,5:8,2
-chr6	120460510	.	GTTATTTTATTTTATTTTATTTTATT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.010538;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:1,6:6,4
-chr6	120532901	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,6:5,5:3,1
-chr6	121355893	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.016422;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:11,7:5,2
-chr6	122846726	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:2,2:2,2:0,0
-chr6	123445642	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,1:5,6
-chr6	125029781	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=2.7317e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:8,22:6,9:2,13
-chr6	125788698	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0012917;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,3:4,3
-chr6	126816648	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,1:5,2
-chr6	127501003	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0018182;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:10,4:8,3
-chr6	128493560	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:15,1:5,3
-chr6	128637917	.	GTTTTTT	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:3,2:3,2
-chr6	130504622	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0015456;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,13:9,10:1,3
-chr6	130680465	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,5:1,1:2,4
-chr6	131727555	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.020376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,6:3,1
-chr6	132442627	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0012081;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:11,1:5,6
-chr6	132489200	.	T	TA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:4,5:4,2
-chr6	132505739	.	T	TAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.01095;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,10:3,8:6,2
-chr6	132757997	.	A	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:4,5:3,4
-chr6	133394291	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:4,2:1,2
-chr6	133792776	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0082071;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:5,3:8,4
-chr6	133948660	.	A	AAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0039459;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,6:2,1
-chr6	134180871	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0052761;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:9,8:2,2
-chr6	134232429	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,8:8,2:0,6
-chr6	134497927	.	C	CAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:5,4:0,0
-chr6	135173464	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.021554;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:6,2:11,3
-chr6	136744502	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=3.1333e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:3,8:7,4
-chr6	137898140	.	C	CA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=8.1928e-06;SS=2;SSC=50;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:7,5:7,8
-chr6	138437361	.	TATATATATATACAC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:3,2:6,3
-chr6	138873898	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019062;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:3,3:9,2
-chr6	139243492	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:5,4:5,5
-chr6	139845378	.	C	CTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0065492;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:3,5:1,3
-chr6	140361223	.	TTGTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,7:1,3:3,4
-chr6	141571986	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.001096;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,4:2,3
-chr6	141644789	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,3:3,1:1,2
-chr6	141919119	.	C	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0070234;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,1:3,4
-chr6	142067416	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.2584e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:7,6:6,9
-chr6	142801413	.	CAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:2,3:3,2
-chr6	144290752	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:3,3:2,2
-chr6	144635138	.	GT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.011071;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:5,8:2,1
-chr6	145242149	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:0,4:0,2:0,2
-chr6	146818579	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:2,3:4,1
-chr6	147666774	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.1994e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:9,23:6,12:3,11
-chr6	148308274	.	G	GCC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.020196;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:9,1:5,4
-chr6	149253958	.	AAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0010096;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,11:2,5:2,6
-chr6	149476819	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.04522;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:12,2:9,4
-chr6	150483588	.	A	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0016865;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,8:1,3:0,5
-chr6	150483601	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,2:3,2
-chr6	150688939	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0073497;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:14,4:6,5
-chr6	150700933	.	ATAGCTTGTAT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,4:7,4
-chr6	150700945	.	GCTTTATTTCCCATATTTGGGTTA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,4:4,4
-chr6	150968807	.	GC	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=1.8763e-06;SS=2;SSC=57;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:3,13:0,5:3,8
-chr6	151605903	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,2:2,1:0,1
-chr6	151852639	.	G	GTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.016983;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,9:1,5:0,4
-chr6	152364686	.	G	GAGGA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,4:11,3:4,1
-chr6	153185637	.	C	CTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.004995;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:1,3:0,1
-chr6	153963149	.	TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTTC	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0045767;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:5,4:0,2
-chr6	154003721	.	C	CAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00761;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,7:1,5:1,2
-chr6	154740625	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.027751;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,2:5,3
-chr6	155742675	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.035158;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,7:8,1
-chr6	157122423	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0047599;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:14,3:9,3
-chr6	157263058	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=7.881e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,15:5,6:7,9
-chr6	157730215	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,3:1,2:2,1
-chr6	158978725	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=4.9545e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,16:3,7:5,9
-chr6	159547211	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:1,1:5,5
-chr6	159654588	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018966;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,6:5,5:6,1
-chr6	160576410	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,3:0,1:0,2
-chr6	160932467	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.092258;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,1:10,3
-chr6	161443896	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0015405;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:8,4:10,5
-chr6	161568972	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0035931;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,7:9,3:9,4
-chr6	162650315	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01064;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,2:10,3
-chr6	163846289	.	GTT	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0093911;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:5,6:1,2
-chr6	163917572	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.0747e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:11,4:10,11
-chr6	164777257	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=2.979e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:6,6:11,6
-chr6	165890076	.	A	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
-chr6	166942058	.	C	CTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.01548;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,5:1,1
-chr6	167175552	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.043127;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:21,3:9,2
-chr6	167178468	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0078321;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:13,6:11,7
-chr6	167390528	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.048497;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:5,1:12,3
-chr6	167660804	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00035539;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,4:6,5
-chr6	167785661	.	CAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,3:4,1
-chr6	168088144	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00033054;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:14,2:10,8
-chr6	168610977	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.01301;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,2:2,4
-chr6	169900320	.	GA	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,3:5,1
-chr6	170394572	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.029105;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:8,7:14,1
-chr6	170708298	.	T	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.014706;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:0,1:4,4
-chr7	35473	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:6,3:9,2
-chr7	133047	.	CTGT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.044826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,2:8,2
-chr7	1327470	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.019243;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,6:10,4:7,2
-chr7	1996232	.	T	TC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.047956;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:4,4:9,1
-chr7	2867457	.	CCTCT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0029185;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,10:5,9:4,1
-chr7	2943771	.	A	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
-chr7	3213222	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,4:2,1
-chr7	3269884	.	G	GGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:3,4:6,1
-chr7	3299677	.	A	AGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.003311;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:3,2:8,7
-chr7	3992327	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.076397;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:12,1:21,3
-chr7	4965431	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.014934;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:6,5:3,2
-chr7	5905902	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.02396;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,3:4,3
-chr7	6731469	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.016254;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:3,4:2,1
-chr7	6743760	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.055494;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:15,2:8,2
-chr7	8078208	.	T	TAAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:4,4:2,1
-chr7	8787468	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.049645;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:7,3:12,1
-chr7	9006021	.	T	TCACACACACACACACA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.016311;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,3:7,3
-chr7	9586159	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,6:2,3:4,3
-chr7	11643605	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.096304;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,3:18,1
-chr7	15564057	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020843;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,5:4,1
-chr7	16056810	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040008;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:12,4:4,5
-chr7	16478728	.	CT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0083111;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:13,5:5,4
-chr7	21178080	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00050723;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:6,9:5,4
-chr7	22526566	.	TAAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,3:3,1
-chr7	22732290	.	TGTGTATATATA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016761;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,3:6,3
-chr7	24215816	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,2:3,2
-chr7	24500287	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0058007;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,8:1,4:2,4
-chr7	24953942	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00019158;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,17:7,7:6,10
-chr7	25581638	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0074546;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:7,6:8,4
-chr7	26353459	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.006865;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,2:1,3
-chr7	27705391	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0075692;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,1:7,7
-chr7	28232988	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=9.3485e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:10,20:5,10:5,10
-chr7	28912826	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,2:2,1:4,1
-chr7	29002866	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,6:3,1
-chr7	29688843	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.15352;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,3:16,1
-chr7	30486877	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.044477;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:0,0:12,4
-chr7	31212749	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,4:7,3:6,1
-chr7	32084709	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.040404;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
-chr7	32112846	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.02037;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:1,2:8,3
-chr7	32511548	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=2.6068e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:8,9:6,6
-chr7	33048178	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:6,2:5,1:1,1
-chr7	33196467	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=1.2409e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:5,6:9,9
-chr7	34327969	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0098662;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:13,6:12,1
-chr7	34652637	.	T	TTAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:8,2:11,2
-chr7	36126869	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.7296e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:6,8:8,4
-chr7	37794892	.	A	AT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:4,3:4,1
-chr7	38498811	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=2.7873e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:4,8:4,5
-chr7	39050234	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.017618;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:13,3:9,2
-chr7	39559112	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.013615;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,3:2,4
-chr7	40953503	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0087781;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:12,6:11,1
-chr7	43898788	.	AATTT	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0072753;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,13:8,10:7,3
-chr7	43963446	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
-chr7	46616809	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00090437;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:5,6:14,5
-chr7	47766843	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,8:0,2:2,6
-chr7	48051347	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,5:1,2:0,3
-chr7	48309033	.	G	GCACACACACA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0030514;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:9,5:2,5
-chr7	49379798	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0023233;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,13:8,8:4,5
-chr7	51943328	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=8.0475e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:4,9:11,3
-chr7	52260968	.	G	GT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00012013;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:9,3:12,8
-chr7	52260971	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.3095e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:8,4:13,8
-chr7	54494984	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.13498;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:21,2:15,2
-chr7	54640948	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.045571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:13,4:3,3
-chr7	56526422	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.024581;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:14,3:13,3
-chr7	56596547	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0045549;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,4:4,2
-chr7	56621678	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.8683e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:10,6:13,7
-chr7	56801360	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.079656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:15,1:12,3
-chr7	56814006	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.046683;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:4,2:12,3
-chr7	56883052	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,1:7,3
-chr7	57108080	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:3,3:7,3
-chr7	58074443	.	T	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.026749;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:27,3:18,2
-chr7	59230501	.	T	C	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.034532;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:52,11:30,7:22,4
-chr7	59235792	.	C	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.023086;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,4:19,3:6,1
-chr7	60949959	.	C	T	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.027027;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:58,16:37,11:21,5
-chr7	60996788	.	GAGATGAAA	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.077337;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:19,2:12,2
-chr7	61158914	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.041502;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
-chr7	61221694	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:13,4:0,0
-chr7	61384046	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0077283;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:4,1:23,10
-chr7	61426250	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:0,0:16,4
-chr7	61458723	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.025641;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:0,2:5,3
-chr7	61488423	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.030987;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:23,4:2,0
-chr7	61491458	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0071446;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:5,1:14,4
-chr7	62171994	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=3.3156e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:4,7:9,6
-chr7	62266337	.	C	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.038175;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:15,4:29,7
-chr7	62382114	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.045347;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,7:20,4:15,3
-chr7	63037940	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=2.1506e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:7,7:9,6
-chr7	63111811	.	A	ATTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,6:2,3:5,3
-chr7	63624963	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.023051;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:7,5:15,2
-chr7	63627813	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.031709;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,3:5,2
-chr7	63628250	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0063301;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:13,4:16,10
-chr7	63647439	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.035255;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:7,5:7,2
-chr7	63797093	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,8:0,7:5,1
-chr7	64323008	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00015969;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:4,7:7,7
-chr7	65327229	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=5.5291e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:9,4:4,5
-chr7	65505802	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.073359;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,2:6,2
-chr7	66612768	.	C	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:1,4:4,4
-chr7	67204543	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:2,2:14,2
-chr7	67501558	.	GT	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,3:3,3
-chr7	67734055	.	CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028205;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,3:6,1
-chr7	67849899	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.014706;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:4,3:0,2
-chr7	68320392	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=3.1278e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,13:4,4:6,9
-chr7	68799109	.	C	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
-chr7	68848491	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0034541;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:10,7:12,5
-chr7	69039796	.	GT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,6:2,5:5,1
-chr7	69339334	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011726;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,1:9,4
-chr7	70043547	.	CCCTTCCTTCCTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,7:5,3:3,4
-chr7	70992281	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.041917;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:2,3:10,6
-chr7	72013247	.	AT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:10,7:0,1
-chr7	72941450	.	T	TCGAAG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=6.1321e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:6,5:4,6
-chr7	73123782	.	T	TCTCTCTCC	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.026801;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:13,1:21,5
-chr7	73265004	.	CCTCT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,1:3,4
-chr7	74167335	.	C	CTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,3:3,3
-chr7	74221410	.	CAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0098951;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:5,4:2,3
-chr7	74918935	.	TTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0063025;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:1,3:1,1
-chr7	75457572	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.065116;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:19,3:1,1
-chr7	75597739	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.042146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:7,1:3,3
-chr7	76136938	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.021511;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,6:6,3:5,3
-chr7	77057397	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.18072;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:16,2:19,2
-chr7	77391125	.	C	CAA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,5:2,4:1,1
-chr7	79136026	.	AAG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043486;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:17,4:3,1
-chr7	79200445	.	TA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00011224;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:6,4:7,5
-chr7	81343269	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,6:3,1
-chr7	81360549	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0087227;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:14,3:15,5
-chr7	81498637	.	CT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=8.5672e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:8,8:5,3
-chr7	82288424	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.3956;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:7,2:5,1:2,1
-chr7	82637666	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.584e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:6,8:7,5
-chr7	83246471	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00018019;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:8,8:14,3
-chr7	84826063	.	T	TA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.039412;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,1:6,5
-chr7	84924519	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0010395;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:5,4:12,4
-chr7	85404044	.	G	GAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.018627;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:1,13:1,9:0,4
-chr7	85954185	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=5.8193e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:6,8:11,4
-chr7	86322822	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.9498e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:9,6:9,9
-chr7	86427667	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.030104;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,4:6,1:3,3
-chr7	88519600	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0011403;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:8,2:12,5
-chr7	90250187	.	GGA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.013285;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:6,4:3,2
-chr7	91290943	.	C	CATATATATATATAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,2:3,2
-chr7	91614359	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=2.0286e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:5,6:2,3
-chr7	92104194	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.008837;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,2:2,4
-chr7	93456882	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00096298;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,2:6,5
-chr7	94025917	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.041455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,2:5,2
-chr7	94518090	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00035634;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:15,6:17,5
-chr7	95267489	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=1.5161e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:7,7:6,5
-chr7	95580042	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,3:1,2:0,1
-chr7	96128939	.	G	GCTCTCT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,5:8,4:6,1
-chr7	96943707	.	T	TAG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,2:1,1:3,1
-chr7	97467641	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=1.6688e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:12,7:2,7
-chr7	97897657	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0022599;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:15,7:5,2
-chr7	97973032	.	T	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:2,3:2,2
-chr7	99205417	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,2:3,1:0,1
-chr7	99640436	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=2.6068e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:8,5:6,10
-chr7	100524058	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0054478;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:12,5:16,4
-chr7	100524383	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.030584;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,1:14,3
-chr7	100745033	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=4.5165e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,17:6,8:4,9
-chr7	100975659	.	G	GGAGCTTAGGGCTGGAGGGGCACAGAGA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.019266;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:14,4:13,4
-chr7	101035091	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.02281;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:13,5:9,5
-chr7	101329607	.	A	AT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:6,3:2,3
-chr7	101391892	.	T	TC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.065116;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,1:8,3
-chr7	101427660	.	T	TAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0016432;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:8,6:3,7
-chr7	101740758	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.02882;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,6:8,5:6,1
-chr7	102497912	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.018307;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,3:4,3
-chr7	102520100	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr7	102580842	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:11,4:0,0
-chr7	102630085	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr7	103603023	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.025988;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:13,1:4,3
-chr7	103817937	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.022239;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,5:8,3:4,2
-chr7	105247527	.	CATAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,2:8,2
-chr7	105645640	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,9:3,3:1,6
-chr7	107249690	.	TTGTG	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,7:1,4:1,3
-chr7	109508052	.	AAAG	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00076672;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:4,5:7,7
-chr7	113086195	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.042105;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,3:2,2:3,1
-chr7	114051547	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr7	115399375	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00013159;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:6,3:1,5
-chr7	115439497	.	G	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,5:1,2:2,3
-chr7	115974451	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,5:1,2:2,3
-chr7	117027518	.	G	GTA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047173;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:6,4:9,1
-chr7	119382397	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00031989;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,5:6,3
-chr7	120503385	.	T	TGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.032166;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,7:10,6:8,1
-chr7	121867378	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.537e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:16,11:6,8
-chr7	121892679	.	CATATATAT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:3,2:4,3
-chr7	124387962	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,4:4,1
-chr7	125127127	.	TAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0028678;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:2,3:7,8
-chr7	125366962	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=8.5692e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:6,6:3,6
-chr7	127214689	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.029272;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,2:11,2
-chr7	127579933	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.944e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:7,6:7,9
-chr7	130451025	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041502;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,3:6,2:0,1
-chr7	130545175	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,2:4,1:1,1
-chr7	134147434	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.024337;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,9:7,4:5,5
-chr7	135791446	.	G	GTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.25826;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,3:5,2
-chr7	137126173	.	TAAAAAAA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:4,3:2,1
-chr7	137280871	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0051722;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:11,6:3,1
-chr7	138700714	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.096616;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:13,2:13,1
-chr7	139385311	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:6,8:1,2
-chr7	141330084	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00094404;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:5,5:8,3
-chr7	141454604	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037417;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,1:5,5
-chr7	143572908	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,3:2,1
-chr7	144237581	.	A	C	0	PASS	DP=177;GPV=1;SPV=0.0069741;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:65,18:25,6:40,12
-chr7	145629802	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=8.6732e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,16:4,9:7,7
-chr7	145806346	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00017259;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,3:7,6
-chr7	146358022	.	T	TTTTA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0082728;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,10:7,7:6,3
-chr7	146572264	.	CTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,9:3,8:1,1
-chr7	147547712	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00044867;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:10,8:8,2
-chr7	147575107	.	A	ATATG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,2:10,3
-chr7	147659905	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=5.4178e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,20:9,10:7,10
-chr7	148141034	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.022533;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:9,1:18,4
-chr7	148247629	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0041892;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,3:6,4
-chr7	148598763	.	TAGAGAG	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,2:0,1:0,1
-chr7	148751563	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.010718;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:1,7:4,2
-chr7	149215195	.	AT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,3:8,1
-chr7	149979189	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0095351;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:11,1:18,5
-chr7	150072489	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,6:3,2
-chr7	150165496	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0014508;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:1,4:6,5
-chr7	150774725	.	C	CAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:2,4:4,1
-chr7	151738278	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,3:5,1
-chr7	152693656	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.040169;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,2:8,2
-chr7	153303161	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:4,4:7,1
-chr7	153705837	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.029503;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:8,5:7,2
-chr7	153730136	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043789;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:12,4:10,1
-chr7	154096293	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:13,1:4,4
-chr7	155180011	.	TAAAAA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,5:2,1
-chr7	155348782	.	TAG	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,4:2,2
-chr7	155348793	.	CACATAG	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:11,4:1,2
-chr7	155348801	.	G	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:11,4:2,2
-chr7	155348826	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:10,5:1,2
-chr7	155348831	.	TAGAGCACTCATAGAG	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:9,5:0,2
-chr7	155919078	.	C	CGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.023736;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,10:2,9:1,1
-chr7	156400721	.	C	CTTT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.12821;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:1,1:2,1
-chr7	156610722	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00015824;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:10,5:9,7
-chr7	157954709	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00014422;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:5,6:12,5
-chr7	157995006	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
-chr7	158045866	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
-chr8	1081796	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=2.0163e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,16:6,11:5,5
-chr8	1283033	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:4,4:1,3
-chr8	1456851	.	T	TGTGCCAGGCC	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0154;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:15,4:7,5
-chr8	1609424	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,4:7,1
-chr8	2211434	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0012045;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:2,8:8,1
-chr8	2470759	.	A	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:6,1:1,1
-chr8	2623407	.	GAGAGCGCTGAGCGCCA	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0072729;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,1:9,6
-chr8	3175483	.	TCCTGCCTG	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:1,1:5,9
-chr8	3249798	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=9.7202e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,16:10,8:4,8
-chr8	3720621	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,4:9,4
-chr8	3819560	.	A	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013669;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:7,2:7,3
-chr8	5246465	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027668;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:1,2:4,1
-chr8	5308824	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.1846e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:8,9:9,6
-chr8	5766212	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.043511;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:9,2:9,7
-chr8	7294087	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
-chr8	7423063	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.026525;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:22,6:9,5
-chr8	7469467	.	C	A	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.030329;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:64,17:32,8:32,9
-chr8	7885678	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,2:5,3
-chr8	8066110	.	T	G	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.021565;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:73,11:29,9:44,2
-chr8	11627296	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.042832;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:10,3:8,4
-chr8	11641293	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0021522;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:8,3:6,3
-chr8	12176130	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:4,1:27,6
-chr8	12191738	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.013049;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:11,2:12,6
-chr8	12415019	.	T	C	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.0093436;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:50,18:35,12:15,6
-chr8	12504775	.	G	T	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.025272;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:66,8:31,7:35,1
-chr8	12524232	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.045253;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:12,1:11,7
-chr8	12550602	.	C	A	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.021273;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:85,21:41,11:44,10
-chr8	12551039	.	G	A	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.020361;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:92,22:42,13:50,9
-chr8	12563407	.	T	C	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.029034;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:114,20:47,8:67,12
-chr8	12596345	.	C	T	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.045664;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:104,17:64,12:40,5
-chr8	12596504	.	C	A	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.00016521;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:94,30:47,14:47,16
-chr8	13248244	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0016044;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:10,5:12,4
-chr8	14408969	.	GTGCA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,3:14,1
-chr8	14519067	.	TA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.057027;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:11,2:15,4
-chr8	14575913	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.015718;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,7:4,6:1,1
-chr8	14762624	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.7819e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:6,6:8,8
-chr8	15292481	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00048101;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:5,9:4,3
-chr8	15443336	.	T	TTG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:6,2:3,3
-chr8	16803010	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:1,3:1,1:0,2
-chr8	16944916	.	T	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.01047;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:13,2:8,5
-chr8	17322942	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.01132;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,4:3,2
-chr8	17439426	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,4:11,1:6,3
-chr8	21095590	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=7.4135e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:4,7:8,4
-chr8	21529509	.	A	AGT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.022922;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:3,3:18,2
-chr8	21533378	.	GAA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,6:9,4:1,2
-chr8	21772682	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00032906;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:4,2:8,9
-chr8	23480847	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00011387;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,6:8,5
-chr8	24218765	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=6.4776e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,15:5,7:7,8
-chr8	24548351	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0068026;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,6:4,5:0,1
-chr8	25912466	.	G	GCACACACACA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:4,5:1,1
-chr8	26680339	.	CTCTCTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:4,1:14,3
-chr8	26691587	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,6:2,3:7,3
-chr8	27200594	.	GCA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022413;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:6,3:6,5
-chr8	27251900	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.01219;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:13,2:14,4
-chr8	27257459	.	AACACACAC	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,8:1,3:5,5
-chr8	28022157	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.021053;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,2:1,2
-chr8	28293162	.	TA	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.059571;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:10,6:7,2
-chr8	28320096	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:2,1:4,1
-chr8	30375913	.	G	GAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00074811;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,9:4,5:2,4
-chr8	30661150	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0029095;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:14,4:14,5
-chr8	31096744	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00021796;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:4,3:6,7
-chr8	32132185	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.3453e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:11,8:7,5
-chr8	32662515	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.8159e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:11,8:9,10
-chr8	33195381	.	A	ATG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.013867;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:4,4:4,3
-chr8	33519082	.	TC	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.045061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:17,2:8,3
-chr8	34484897	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.006844;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:12,3:13,4
-chr8	34728271	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0056882;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:11,3:9,3
-chr8	35474387	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00020504;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:14,8:16,6
-chr8	36156511	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.02969;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,1:8,3
-chr8	36599288	.	AATATAT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,6:1,5:3,1
-chr8	43520908	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.016248;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:19,4:11,2
-chr8	43844204	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=6.2649e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:10,4:9,12
-chr8	43850604	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.03925;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,2:10,2
-chr8	44080375	.	C	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr8	44316208	.	G	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
-chr8	44523758	.	G	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr8	45339224	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:9,5:0,1
-chr8	46226517	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0042664;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,3:8,1
-chr8	47066875	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.015238;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:7,8:2,1
-chr8	48017378	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.011495;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:12,6:11,1
-chr8	50660426	.	GAAGA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,4:0,4:0,0
-chr8	51217130	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=3.8791e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,15:3,10:9,5
-chr8	51356497	.	T	TA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00014733;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,14:2,11:6,3
-chr8	51397755	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0009828;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,3:5,5
-chr8	53451451	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,1:11,3
-chr8	53468932	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00084928;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,4:9,5
-chr8	53706295	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.548e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:12,10:7,8
-chr8	54216289	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018761;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:7,3:13,3
-chr8	55552407	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=4.8916e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:8,3:9,10
-chr8	55746317	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0055944;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,8:0,7:1,1
-chr8	56082376	.	T	TTTTG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.032696;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,7:5,1:7,6
-chr8	56137576	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.046332;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,4:8,2:6,2
-chr8	56837298	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.054928;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,3:9,1
-chr8	58078547	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
-chr8	60192939	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:1,4:1,3:0,1
-chr8	60293496	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.0635e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:9,5:8,10
-chr8	60391531	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:7,3:7,2
-chr8	63551197	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.20221;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,7:4,5:4,2
-chr8	64075846	.	C	CT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.019655;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,7:14,6:10,1
-chr8	64621734	.	A	AT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0041541;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:10,4:5,4
-chr8	64689465	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.077856;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:17,3:13,1
-chr8	66285220	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,2:5,1:2,1
-chr8	66677212	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=5.9904e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:4,6:9,9
-chr8	69729446	.	CAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,5:2,3:2,2
-chr8	70442097	.	G	GA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.058442;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
-chr8	70493053	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0012176;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:8,3:6,9
-chr8	71790704	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,4:5,2
-chr8	72151514	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02002;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,4:4,5
-chr8	72182016	.	T	TAGATAGATGATA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.004156;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,10:3,5:1,5
-chr8	72197763	.	CAT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.05154;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,3:15,2
-chr8	74401141	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:18,2:10,2
-chr8	75102759	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,2:1,1:4,1
-chr8	75105266	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,1:5,3
-chr8	77785927	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00162;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,1:6,4
-chr8	77824395	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.048497;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:4,3:13,1
-chr8	78843814	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0432;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,3:13,1
-chr8	79688530	.	TA	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.016731;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,1:7,4
-chr8	81726706	.	C	CTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0037707;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:3,6:0,1
-chr8	82384510	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=5.2411e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:5,7:6,6
-chr8	85567765	.	CAT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.047273;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:14,2:8,2
-chr8	85575297	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=8.756e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:5,7:11,4
-chr8	85650554	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,4:4,1
-chr8	85653042	.	C	G	0	PASS	DP=482;GPV=1;SPV=0.03412;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:228:202,26:84,12:118,14
-chr8	85769882	.	C	T	0	PASS	DP=329;GPV=1;SPV=0.03173;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:133,24:4,1:129,23
-chr8	85774081	.	G	T	0	PASS	DP=1398;GPV=1;SPV=0.037656;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:682:608,73:284,20:324,53
-chr8	85774470	.	A	T	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.0052014;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:67,14:6,6:61,8
-chr8	85963127	.	A	AGTGTGT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0027697;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:9,5:2,5
-chr8	87753303	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:2,5:1,2
-chr8	88578361	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.3986e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,21:8,11:11,10
-chr8	88647557	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02791;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:13,2:13,4
-chr8	90416172	.	A	AAAAAAAACAAAAAC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.32536;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,4:7,1:6,3
-chr8	90721358	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00014106;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:11,8:8,6
-chr8	93394841	.	C	CG	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0011596;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:9,5:13,3
-chr8	93453316	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.01454;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:11,2:10,4
-chr8	96854555	.	A	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.025565;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,2:3,3
-chr8	97998519	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.011868;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,10:2,8:2,2
-chr8	98133049	.	C	CA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.017225;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
-chr8	98224755	.	C	CTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0075758;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:0,6:0,4:0,2
-chr8	99772206	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:3,4:8,5
-chr8	101025452	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.016601;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,3:3,1
-chr8	101196244	.	T	TATGG	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.047969;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,4:6,2
-chr8	101515176	.	G	GCACACACACA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.03733;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:3,5:2,1
-chr8	102396661	.	CACACATAT	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.030401;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,10:8,5:6,5
-chr8	103059898	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.011905;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:0,3:0,2:0,1
-chr8	103081487	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.015475;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,6:5,3
-chr8	104118370	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.01322;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:7,5:5,3
-chr8	105330625	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:3,2:3,3
-chr8	108098163	.	G	GGAAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.027634;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,4:2,4:0,0
-chr8	108608315	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.016254;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,5:0,3:5,2
-chr8	111208276	.	CAT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,6:2,4:0,2
-chr8	111492590	.	G	GT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00024776;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:9,8:12,2
-chr8	111934396	.	TA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.016282;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:15,2:13,4
-chr8	113327769	.	TA	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.01107;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:17,5:17,6
-chr8	113984641	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,5:0,1:2,4
-chr8	116508940	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,7:5,5:4,2
-chr8	116756383	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.023708;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:13,3:9,3
-chr8	117052992	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.2234e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:13,9:9,8
-chr8	119498425	.	TATATATATATGGGAAG	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,2:5,7
-chr8	119498452	.	CAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0055997;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:3,2:4,7
-chr8	122382785	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=2.9161e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,15:7,9:8,6
-chr8	122394427	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0064629;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:8,10:6,5
-chr8	122591787	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.026826;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:13,8:10,2
-chr8	124399901	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0094953;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,3:3,5
-chr8	124399913	.	TCTTA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,2:4,8
-chr8	126682726	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.049272;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:14,2:7,3
-chr8	126682727	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.018191;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:13,3:7,3
-chr8	127984837	.	TTTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.032371;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:3,3:13,3
-chr8	127985196	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00049976;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,5:6,5
-chr8	128710036	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,3:3,2
-chr8	132242402	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.5408e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:9,5:12,12
-chr8	132409460	.	T	TA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:8,5:7,2
-chr8	133977912	.	A	AGTGTGT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:6,4:6,3
-chr8	135402902	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.6444e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,3:4,6
-chr8	135691606	.	TA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0015637;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,6:7,1
-chr8	135769197	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.020376;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,3:7,4
-chr8	136020188	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00014106;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:8,11:11,3
-chr8	136702035	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,2:4,1:3,1
-chr8	136891951	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.1868e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,22:8,7:5,15
-chr8	137247376	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=4.0261e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:4,11:8,3
-chr8	137618002	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0051097;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:10,2:10,4
-chr8	137962213	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=7.1707e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,16:8,8:6,8
-chr8	138066493	.	ATATATATATATATT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014142;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,3:2,3
-chr8	138281099	.	GA	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.022285;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:12,2:14,3
-chr8	138309986	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.0935e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:9,3:7,11
-chr8	140502381	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00706;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:8,5:11,3
-chr8	141497158	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
-chr8	141813792	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
-chr8	142222102	.	C	CATT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:0,5:0,3:0,2
-chr8	142483734	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
-chr8	142589725	.	G	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:6,2:0,0
-chr8	143728958	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.15e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:7,4:7,7
-chr9	141308	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0098105;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,1:4,4
-chr9	448271	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0088091;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:5,2:13,3
-chr9	2686086	.	C	CATAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.021053;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
-chr9	6176302	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.04724;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,4:4,3:3,1
-chr9	6820714	.	CTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,4:5,3
-chr9	8483801	.	CAA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:26:1,7:1,2:0,5
-chr9	9352327	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016809;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,6:10,3:1,3
-chr9	10643562	.	CT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.082831;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,1:12,3
-chr9	10962039	.	A	AC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0057228;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,5:0,2:6,3
-chr9	11220595	.	TA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0062893;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:4,3:13,2
-chr9	12587153	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.019411;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:9,5:9,9
-chr9	12677964	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,4:8,1:6,3
-chr9	12677966	.	A	AATAAAAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,4:8,1:6,3
-chr9	13418779	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.03024;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:13,1:6,3
-chr9	13629642	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00077986;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,3:8,5
-chr9	14417774	.	G	GT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:10,7:0,2
-chr9	15494565	.	CA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,7:2,6:2,1
-chr9	15569846	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:2,3:0,0:2,3
-chr9	17764719	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.01205;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:0,1:9,6
-chr9	18626916	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,1:4,4
-chr9	19794596	.	T	TAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.014448;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:4,12:1,9:3,3
-chr9	19812178	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.014039;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:17,2:9,3
-chr9	20679121	.	ATGTGTGTG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,4:8,3:3,1
-chr9	20778345	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00056446;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,15:3,5:4,10
-chr9	23936282	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=1.259e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:1,3:8,8
-chr9	23951283	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.011461;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:14,3:7,3
-chr9	24577022	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.010223;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,5:9,3
-chr9	25055019	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,4:2,1
-chr9	25388030	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.011486;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,3:13,2
-chr9	25574963	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0057228;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:6,16:2,12:4,4
-chr9	26083642	.	G	GT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:5,5:2,4
-chr9	30749255	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,2:12,2
-chr9	31238476	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=9.6614e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,5:3,4
-chr9	31379009	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.045513;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,1:14,3
-chr9	32584663	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.044088;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:5,1:12,3
-chr9	33713898	.	T	TA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.00761;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:2,8:0,1:2,7
-chr9	33856888	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.010836;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:3,3:1,2
-chr9	34166012	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:4,5:4,1
-chr9	35030581	.	A	AT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,9:2,4:6,5
-chr9	35228740	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.059099;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,1:9,3
-chr9	38261077	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:2,1:8,4
-chr9	38838402	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:12,4:3,1
-chr9	38991273	.	C	T	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.027492;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:62,17:31,8:31,9
-chr9	38993510	.	G	A	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.0021265;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:82,25:43,11:39,14
-chr9	38998991	.	T	C	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.047895;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:60,14:28,7:32,7
-chr9	39013407	.	G	A	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.015148;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:75,16:34,3:41,13
-chr9	39045534	.	T	G	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.00056973;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:56,18:26,13:30,5
-chr9	39051047	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.021208;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:7,6:13,3
-chr9	39113991	.	TACAC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,3:9,1
-chr9	39179286	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,3:4,1
-chr9	39499487	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,4:5,1
-chr9	39517006	.	C	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr9	39520803	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,3:10,1
-chr9	39557320	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,3:1,2:4,1
-chr9	39626787	.	C	G	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.035593;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:55,15:26,8:29,7
-chr9	39817326	.	AT	A	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.045271;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:16,9:20,1
-chr9	40016751	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,1:2,3
-chr9	40164578	.	C	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030046;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:2,2:8,5
-chr9	40316090	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr9	40325426	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
-chr9	40379276	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.045291;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:14,2:12,6
-chr9	40383552	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:2,1:10,3
-chr9	40389076	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0062875;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:13,6:15,9
-chr9	40390275	.	G	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.028009;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,2:5,6
-chr9	40412716	.	T	TA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,0:6,4
-chr9	40577105	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.019692;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:11,3:9,4
-chr9	40706905	.	CTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.010883;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:0,3:3,2
-chr9	40810927	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0030131;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:12,5:3,1
-chr9	40907626	.	C	T	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.030133;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:58,12:28,3:30,9
-chr9	40911723	.	G	A	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0072137;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:41,15:15,7:26,8
-chr9	40913616	.	G	A	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.032141;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:71,19:35,6:36,13
-chr9	40957130	.	A	G	0	PASS	DP=243;GPV=1;SPV=0.0063211;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:94,23:45,12:49,11
-chr9	40986021	.	A	AT	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.029076;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:15,3:21,8
-chr9	40992886	.	C	A	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.045651;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:49,9:21,5:28,4
-chr9	40993289	.	C	CA	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.010922;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:48,15:21,5:27,10
-chr9	41043749	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00090839;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:7,5:20,12
-chr9	41051859	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.036533;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:14,2:21,9
-chr9	41119368	.	C	T	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.030612;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:49,6:29,5:20,1
-chr9	41209773	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:5,3:9,3
-chr9	41262200	.	C	G	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.023539;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:72,10:27,5:45,5
-chr9	41291398	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
-chr9	41496373	.	G	GAAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,4:7,2:7,2
-chr9	41506780	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.14256;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:17,1:14,3
-chr9	41543621	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.034946;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,1:5,4
-chr9	41573276	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.028928;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:13,6:18,1
-chr9	41575110	.	C	T	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.0018877;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,11:15,7:33,4
-chr9	41627594	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.033473;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:16,5:5,1
-chr9	41668607	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.046205;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:16,4:23,4
-chr9	41668787	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.020101;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:16,4:12,6
-chr9	41681322	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr9	41850150	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03274;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:9,1:5,9
-chr9	41922394	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.00035723;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:2,10:2,5:0,5
-chr9	42370600	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.04187;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,7:15,4:9,3
-chr9	42897072	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.028033;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:15,2:13,7
-chr9	43026155	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.011868;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:1,2:3,5
-chr9	43260114	.	C	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.044221;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:16,3:18,2
-chr9	43303518	.	T	C	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.0077665;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:85,24:40,14:45,10
-chr9	43303907	.	T	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0083637;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:13,3:18,3
-chr9	43385608	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.049878;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:19,5:18,2
-chr9	43385794	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.052629;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:7,1:15,4
-chr9	43385818	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.055194;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:6,1:14,4
-chr9	43689454	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0030816;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:0,7:9,1
-chr9	43964692	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.047669;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:8,2:21,6
-chr9	44013050	.	T	C	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.013579;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:52,9:10,8:42,1
-chr9	44060709	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.048804;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:33,4:0,0
-chr9	44240310	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0076953;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:17,5:12,3
-chr9	44377131	.	A	G	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.013537;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:74,19:41,10:33,9
-chr9	44579928	.	G	T	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.011122;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:62,14:55,13:7,1
-chr9	44897587	.	G	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
-chr9	60577250	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
-chr9	60608908	.	T	A	0	PASS	DP=700;GPV=1;SPV=0.021051;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:320:282,38:264,37:18,1
-chr9	60608959	.	G	A	0	PASS	DP=849;GPV=1;SPV=0.0043538;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:389:347,42:254,28:93,14
-chr9	60921369	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0092021;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,2:2,4
-chr9	61155501	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:12,3:2,1
-chr9	61217953	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.019772;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:10,5:11,4
-chr9	62817309	.	T	G	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.032022;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:51,14:30,10:21,4
-chr9	63285253	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
-chr9	63294249	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:5,4:0,3
-chr9	63552393	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0060154;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:15,8:12,1
-chr9	63607657	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=2.6077e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:8,4:5,7
-chr9	63756011	.	A	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.034004;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:52,13:31,6:21,7
-chr9	63757580	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.028815;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:20,4:17,3
-chr9	63770649	.	T	C	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.011638;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:54,15:24,7:30,8
-chr9	63777515	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.013181;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:13,4:16,1
-chr9	63880093	.	TA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.044481;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:11,3:15,2
-chr9	63990199	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,1:1,3
-chr9	64007863	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:5,4:10,3
-chr9	64340344	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020195;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,8:10,2
-chr9	64377602	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.049827;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:8,4:11,5
-chr9	64379465	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
-chr9	64485419	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027357;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,3:8,2
-chr9	64788946	.	A	G	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.04678;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:85,13:68,7:17,6
-chr9	64977584	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13316;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:16,3:9,1
-chr9	65286138	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0017867;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:5,2:7,8
-chr9	65400707	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=4.0177e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,16:9,8:7,8
-chr9	65516350	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.059705;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,2:11,2
-chr9	65517345	.	ATT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:5,3:6,1
-chr9	65539927	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=6.8069e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:12,7:6,4
-chr9	65577304	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.016295;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
-chr9	65646095	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.032025;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,1:8,3
-chr9	65654536	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.028165;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:6,3:15,6
-chr9	66042320	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.22913;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:5,3:15,1
-chr9	66058307	.	AC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0085545;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:2,1:8,8
-chr9	66066707	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:5,3:4,5
-chr9	66153735	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.044429;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:9,2:14,2
-chr9	66386854	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.02969;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,1:9,3
-chr9	66628778	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.020817;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:6,3:11,4
-chr9	66746618	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.086687;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:5,1:1,2
-chr9	66803794	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.026881;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:12,4:12,6
-chr9	66833505	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.049123;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
-chr9	67168091	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,3:7,1
-chr9	67363023	.	G	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,1:11,3
-chr9	67388219	.	TAAC	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.020257;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:18,7:17,5
-chr9	67587707	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,2:7,2
-chr9	67766314	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:0,0:12,4
-chr9	67877848	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:8,2:12,6
-chr9	68336611	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.027436;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:26,9:9,1
-chr9	68648213	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:8,4:0,4
-chr9	69367680	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.083817;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
-chr9	70101358	.	G	GA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0021946;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:6,6:4,4
-chr9	70505606	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06057;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:10,2:11,3
-chr9	71122950	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0077271;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:11,5:12,1
-chr9	71282102	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.050426;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:6,4:7,1
-chr9	72378593	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.04247;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:11,3:6,2
-chr9	72388243	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:1,3:0,1:1,2
-chr9	72841870	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0081572;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:16,5:5,1
-chr9	73594095	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.026676;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,1:6,4
-chr9	74769141	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.013481;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:11,4:11,3
-chr9	75996815	.	G	GT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0035197;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,9:3,6:5,3
-chr9	76593952	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020061;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,1:8,4
-chr9	76593953	.	AG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049096;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,1:7,3
-chr9	77962892	.	C	CA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.016254;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,3:3,2
-chr9	78608846	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00019835;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:11,6:9,4
-chr9	80885401	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.050713;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:15,3:8,3
-chr9	83144326	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.055194;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,5:14,2:6,3
-chr9	83568955	.	GATAC	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.042668;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:7,3:8,4
-chr9	85471484	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00048402;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:5,8:7,4
-chr9	87251215	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,5:4,3:1,2
-chr9	88063283	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.3691e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:11,6:8,7
-chr9	88136328	.	C	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.03057;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:13,6:23,2
-chr9	88625472	.	T	TCTCTCCCTCTCC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011726;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:14,4:4,1
-chr9	88625522	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.032477;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,2:3,4
-chr9	89182522	.	AAAAATAAAATAAAATAAAAT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.025931;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,3:3,3
-chr9	89589617	.	A	AAAG	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.5201e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,11:9,5:6,6
-chr9	91037509	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=8.0594e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:15,8:13,8
-chr9	94080988	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,3:6,1
-chr9	94267862	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.019231;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:1,3:2,1
-chr9	95510348	.	G	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0057488;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:9,10:7,2
-chr9	95514885	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0072188;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:6,3:11,3
-chr9	98517892	.	AGGGAGTCAGAGGACCAGTGAGAGCCTAGC	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:11,4:4,2
-chr9	98648114	.	T	TAGATAGATA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.021122;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,3:5,4
-chr9	101780957	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=1.587e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:4,6:4,5
-chr9	102198903	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:10,2:6,2
-chr9	102921881	.	A	AAT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.032869;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,2:2,2
-chr9	103351270	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=7.0929e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:6,9:11,5
-chr9	103879939	.	C	CAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:5,1:4,4
-chr9	104021349	.	C	CTG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.011586;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:3,3:8,2
-chr9	107603936	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0055231;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:8,5:1,1
-chr9	108051587	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.6336e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:11,5:7,7
-chr9	109218126	.	C	CT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.024242;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:0,7:0,5:0,2
-chr9	109767959	.	AAAG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.018961;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,5:8,3
-chr9	110206331	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036872;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:12,2:15,3
-chr9	110286333	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,3:3,1
-chr9	110342020	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0015792;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:3,7:2,1
-chr9	110587698	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,8:9,2:8,6
-chr9	112051428	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,2:4,1:3,1
-chr9	112948023	.	CTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.012757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:10,6:0,5
-chr9	113139456	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=4.2046e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,17:11,5:5,12
-chr9	114134176	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.014275;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,5:4,3
-chr9	114263662	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.023347;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,2:8,2
-chr9	114536637	.	ATTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,1:0,3
-chr9	114673471	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:6,4:2,1
-chr9	114674602	.	TTTCCTTCC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:1,2:7,2
-chr9	114676620	.	C	CTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0020202;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:0,8:0,6:0,2
-chr9	115237473	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=5.8478e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:8,3:6,8
-chr9	116502775	.	G	GAAGA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,6:2,5:3,1
-chr9	116768315	.	CCA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:1,3:0,2:1,1
-chr9	116790954	.	GA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,5:2,3
-chr9	117533058	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00026967;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:8,3:8,6
-chr9	120906184	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,2:9,2
-chr9	121838781	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048922;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,5:11,3:9,2
-chr9	125542054	.	A	ATC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:4,1:8,6
-chr9	125712706	.	AAAAATAT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.17622;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,4:2,1:3,3
-chr9	126488366	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,2:2,1:5,1
-chr9	126590106	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:0,2:0,2:0,0
-chr9	126898606	.	T	TCACACA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0021645;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,5:0,2:0,3
-chr9	127188056	.	CTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,5:0,2:3,3
-chr9	130007239	.	C	CAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:2,4:3,1
-chr9	131045228	.	A	AACAAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043327;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:6,5:8,5
-chr9	131516045	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:8,2:4,1:4,1
-chr9	132792212	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=1.6547e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,3:5,8
-chr9	133016718	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.042547;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:4,3:9,2
-chr9	134254139	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.073684;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,3:1,1:5,2
-chr9	134873908	.	TG	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:0,2:0,1:0,1
-chr9	135612181	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,2:5,1:2,1
-chr9	135838112	.	CAG	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0099771;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,2:2,5
-chr9	137039700	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.024173;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:14,3:12,2
-chr9	137496141	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.011174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,3:7,3
-chrM	1664	.	G	A	0	PASS	DP=14766;GPV=1;SPV=0;SS=2;SSC=255;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7327:6522,805:3321,393:3201,412
-chrX	2973355	.	C	CA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.005418;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,5:1,1
-chrX	3155718	.	A	ATC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.2381;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:3,3:2,2:1,1
-chrX	3155754	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,3:6,1
-chrX	8280848	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,1:4,3
-chrX	13713458	.	C	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,1:2,3
-chrX	15427695	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.022239;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,2:7,3
-chrX	20818746	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.031621;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:3,2:2,1
-chrX	23610373	.	A	AGGAAGGAAGGAAAAAG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:5,2:2,3
-chrX	26106457	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,2:2,1:1,1
-chrX	26353521	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=5.7608e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,8:1,6:0,2
-chrX	27322232	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.046332;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,3:8,1
-chrX	27766301	.	T	TAGAG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.02253;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
-chrX	32690279	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0063218;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,2:4,4
-chrX	38032389	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=4.8074e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,11:0,4:1,7
-chrX	43673185	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,1:8,3
-chrX	44810964	.	T	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,2:3,2
-chrX	45068823	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:5,1:0,4
-chrX	45302126	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,2:3,2
-chrX	48643102	.	G	GTATAT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.014448;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,2:0,2
-chrX	48659242	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.072581;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
-chrX	53786753	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=5.6565e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:1,14:0,11:1,3
-chrX	54099013	.	CT	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.0050505;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,7:0,6:1,1
-chrX	55647611	.	C	CTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0061703;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,7:1,6:2,1
-chrX	62965197	.	G	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
-chrX	62965210	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
-chrX	64894658	.	G	GT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=1.6438e-12;SS=2;SSC=117;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:0,25:0,10:0,15
-chrX	70800693	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
-chrX	74744921	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
-chrX	77254632	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01049;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,7:1,6:1,1
-chrX	82026565	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.00050167;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:1,2:3,5
-chrX	82724604	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=7.2702e-06;SS=2;SSC=51;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,11:3,9:2,2
-chrX	86997609	.	T	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00050744;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,3:2,4
-chrX	87737067	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,1:2,4
-chrX	94877881	.	GT	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=3.4022e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,9:0,4:1,5
-chrX	99460022	.	G	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=5.9538e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:1,10:0,5:1,5
-chrX	100286017	.	TA	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0011258;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,4:1,2
-chrX	103534879	.	C	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,4:3,2
-chrX	104311165	.	CT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:1,5:2,1
-chrX	105204934	.	T	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=2.7282e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:2,20:0,7:2,13
-chrX	106315848	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.017857;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,3:0,3:0,0
-chrX	108607350	.	C	CA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:0,6:0,5:0,1
-chrX	108862017	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=1.2237e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,9:0,2:0,7
-chrX	109511092	.	T	TA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=3.4022e-06;SS=2;SSC=54;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:0,9:0,3:0,6
-chrX	111316086	.	T	TA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:9,4:1,1
-chrX	116966675	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:5,3:9,2
-chrX	118885370	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,2:6,2
-chrX	125063861	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=3.2871e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,12:0,6:0,6
-chrX	127570537	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,2:0,1:1,1
-chrX	127876849	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:7,2:1,2
-chrX	128786380	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,1:9,3
-chrX	128786384	.	AG	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,1:10,3
-chrX	129574322	.	T	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=8.0605e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:4,14:3,7:1,7
-chrX	131132819	.	C	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=9.2039e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:1,15:0,7:1,8
-chrX	131144086	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=3.3652e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:1,14:0,6:1,8
-chrX	133295076	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0088413;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:1,2:3,4
-chrX	141695017	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0067977;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,3:3,3
-chrX	142355886	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00012759;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,3:3,5
-chrX	142569108	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=5.4125e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,10:0,4:0,6
-chrX	142966123	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=4.9975e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,10:1,6:3,4
-chrX	145887442	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=3.2174e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:0,20:0,11:0,9
-chrX	147183945	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037203;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
-chrX	149418257	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=1.8826e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,10:0,2:0,8
-chrX	151449442	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
-chrX	151718110	.	GAGGA	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,3:3,4
-chrY	6605656	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=3.6639e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:1,20:1,6:0,14
-chrY	8733140	.	C	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=3.8442e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:2,9:1,5:1,4
-chrY	8843676	.	G	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=7.6201e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,10:0,3:0,7
-chrY	10154028	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:6,1:1,4
-chrY	10823428	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=4.6568e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:0,11:0,5:0,6
-chrY	11096116	.	CAGAT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.044194;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:4,1:8,5
-chrY	11101976	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.028024;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:6,1:19,6
-chrY	11114766	.	G	C	0	PASS	DP=211;GPV=1;SPV=0.022997;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:85,16:36,6:49,10
-chrY	11167265	.	C	T	0	PASS	DP=197;GPV=1;SPV=0.04954;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:91,14:65,9:26,5
-chrY	11170829	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02607;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,3:6,1
-chrY	11179197	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0030496;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:15,8:11,1
-chrY	11200714	.	T	C	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.02431;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:64,13:39,7:25,6
-chrY	11218441	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.036947;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,6:13,1:8,5
-chrY	11237773	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.025539;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:53,11:24,5:29,6
-chrY	11565379	.	T	A	0	PASS	DP=378;GPV=1;SPV=0.0071414;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:185:152,33:71,12:81,21
-chrY	14137338	.	GA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.00034998;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:2,5:2,4
-chrY	14935493	.	C	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=8.3212e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,8:1,3:0,5
-chrY	17397837	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=5.3237e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:1,15:0,6:1,9
-chrY	20279911	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0013381;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:8,3:3,7
-chrY	21298142	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.074074;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:1,1:5,1
-chrY	24688602	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,2:6,2:0,0
-chrY	56714262	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
-chrY	56721070	.	G	C	0	PASS	DP=208;GPV=1;SPV=0.041206;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:90,11:47,4:43,7
-chrY	56860161	.	A	T	0	PASS	DP=584;GPV=1;SPV=0.012228;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:284:245,39:142,20:103,19
-chrY	56884320	.	TCAAAAAA	T	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.025188;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:52,14:24,4:28,10
-chrY	56885135	.	C	G	0	PASS	DP=324;GPV=1;SPV=0.017498;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:145,22:63,15:82,7
--- a/test-data/EGF089.vcf	Sun Sep 13 22:27:03 2020 +0000
+++ /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
@@ -1,4413 +0,0 @@
-##fileformat=VCFv4.2
-##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed">
-##reference=hg38
-##source=varscan.py
-##contig=<ID=chr1,length=248956422>
-##contig=<ID=chr10,length=133797422>
-##contig=<ID=chr11,length=135086622>
-##contig=<ID=chr12,length=133275309>
-##contig=<ID=chr13,length=114364328>
-##contig=<ID=chr14,length=107043718>
-##contig=<ID=chr15,length=101991189>
-##contig=<ID=chr16,length=90338345>
-##contig=<ID=chr17,length=83257441>
-##contig=<ID=chr18,length=80373285>
-##contig=<ID=chr19,length=58617616>
-##contig=<ID=chr2,length=242193529>
-##contig=<ID=chr20,length=64444167>
-##contig=<ID=chr21,length=46709983>
-##contig=<ID=chr22,length=50818468>
-##contig=<ID=chr3,length=198295559>
-##contig=<ID=chr4,length=190214555>
-##contig=<ID=chr5,length=181538259>
-##contig=<ID=chr6,length=170805979>
-##contig=<ID=chr7,length=159345973>
-##contig=<ID=chr8,length=145138636>
-##contig=<ID=chr9,length=138394717>
-##contig=<ID=chrM,length=16569>
-##contig=<ID=chrX,length=156040895>
-##contig=<ID=chrY,length=57227415>
-##filter="SOMATIC"
-##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL">
-##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total depth of quality bases">
-##INFO=<ID=SOMATIC,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates if record is a somatic mutation">
-##INFO=<ID=SS,Number=1,Type=String,Description="Somatic status of variant (0=Reference,1=Germline,2=Somatic,3=LOH, or 5=Unknown)">
-##INFO=<ID=SSC,Number=1,Type=String,Description="Somatic score in Phred scale (0-255) derived from somatic p-value">
-##INFO=<ID=GPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor+normal versus no variant for Germline calls">
-##INFO=<ID=SPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor versus normal for Somatic/LOH calls">
-##FILTER=<ID=str10,Description="Less than 10% or more than 90% of variant supporting reads on one strand">
-##FILTER=<ID=indelError,Description="Likely artifact due to indel reads at this position">
-##FILTER=<ID=VarCount,Description="Fewer than 4 variant-supporting reads">
-##FILTER=<ID=VarFreq,Description="Variant allele frequency below 0.05">
-##FILTER=<ID=VarAvgRL,Description="Average clipped length of variant-supporting reads < 90">
-##FILTER=<ID=VarReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
-##FILTER=<ID=VarDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
-##FILTER=<ID=VarMMQS,Description="Average mismatch quality sum for variant reads > 100">
-##FILTER=<ID=VarMapQual,Description="Average mapping quality of variant reads < 15">
-##FILTER=<ID=VarBaseQual,Description="Average base quality of variant reads < 15">
-##FILTER=<ID=Strand,Description="Strand representation of variant reads < 0.01">
-##FILTER=<ID=RefAvgRL,Description="Average clipped length of ref-supporting reads < 90">
-##FILTER=<ID=RefReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
-##FILTER=<ID=RefDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
-##FILTER=<ID=RefMapQual,Description="Average mapping quality of reference reads < 15">
-##FILTER=<ID=RefBaseQual,Description="Average base quality of ref-supporting reads < 15">
-##FILTER=<ID=RefMMQS,Description="Average mismatch quality sum for ref-supporting reads > 100">
-##FILTER=<ID=MMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) > 50">
-##FILTER=<ID=MinMMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) < 50">
-##FILTER=<ID=MapQualDiff,Description="Mapping quality difference (ref - var) > 50">
-##FILTER=<ID=MaxBAQdiff,Description="Average base quality difference (ref - var) > 50">
-##FILTER=<ID=ReadLenDiff,Description="Average supporting read length difference (ref - var) > 0.25">
-##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype code">
-##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality">
-##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
-##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele">
-##FORMAT=<ID=ADF,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the forward strand">
-##FORMAT=<ID=ADR,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the reverse strand">
-#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	TUMOR
-chr1	109575	.	CGTGT	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.035881;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,10:10,5:17,5
-chr1	109580	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0062666;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:13,7:22,4
-chr1	136733	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.072331;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:13,4:13,1
-chr1	183800	.	C	G	0	PASS	DP=506;GPV=1;SPV=0.0068358;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:288:251,37:120,16:131,21
-chr1	188062	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.041617;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:21,6:5,2
-chr1	464057	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.019428;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:7,5:12,6
-chr1	608256	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,3:2,1
-chr1	857687	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028205;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
-chr1	1030397	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.33518;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,2:12,2
-chr1	1134829	.	GA	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.016677;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:42,17:21,10:21,7
-chr1	2432621	.	G	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=8.6397e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:45,15:25,8:20,7
-chr1	2671789	.	A	T	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.044752;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:91,12:71,10:20,2
-chr1	3066327	.	C	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=7.263e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:47,17:26,7:21,10
-chr1	3868678	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.025178;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,7:16,2:4,5
-chr1	4644163	.	A	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0011965;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:8,3:24,5
-chr1	6516868	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020689;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:5,4:10,1
-chr1	6516870	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027709;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:5,4:14,1
-chr1	7219542	.	T	TAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:6,3:3,1
-chr1	7310714	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:3,2:13,2
-chr1	8276928	.	C	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
-chr1	8366917	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:3,2:3,2:0,0
-chr1	8501943	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,2:4,1:3,1
-chr1	10014390	.	C	CT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.014256;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:15,3:17,4
-chr1	11718315	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.021848;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:4,4:1,1
-chr1	11997879	.	C	CTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:9,4:7,1
-chr1	13242734	.	TTACAAAGAACCTTCTTAAGGGTGGGGGAGAC	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.0045646;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:59,7:29,4:30,3
-chr1	15904478	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:3,2:5,5
-chr1	15904479	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:3,2:9,5
-chr1	16112755	.	T	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00022955;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:20,8:24,6
-chr1	16512652	.	C	A	0	PASS	DP=259;GPV=1;SPV=0.031459;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:115,19:78,16:37,3
-chr1	16516845	.	T	G	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.02177;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:85,19:26,7:59,12
-chr1	16535787	.	G	A	0	PASS	DP=509;GPV=1;SPV=0.030136;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:293:262,31:136,23:126,8
-chr1	16550749	.	C	A	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.019915;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:92,20:51,8:41,12
-chr1	16594434	.	T	C	0	PASS	DP=474;GPV=1;SPV=0.00152;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:259:226,33:111,16:115,17
-chr1	16595518	.	C	T	0	PASS	DP=358;GPV=1;SPV=0.049846;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:194:164,30:84,14:80,16
-chr1	16606649	.	A	G	0	PASS	DP=488;GPV=1;SPV=0.01332;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:265:227,38:123,21:104,17
-chr1	16611797	.	G	A	0	PASS	DP=458;GPV=1;SPV=0.022882;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:201,32:99,15:102,17
-chr1	16623756	.	AG	A	0	PASS	DP=541;GPV=1;SPV=0.026576;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:272:241,31:141,22:100,9
-chr1	16626425	.	G	A	0	PASS	DP=463;GPV=1;SPV=0.046149;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:247:216,31:98,18:118,13
-chr1	16628965	.	G	A	0	PASS	DP=423;GPV=1;SPV=0.028487;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:247:215,32:107,17:108,15
-chr1	16652640	.	G	A	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.0084969;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:71,19:40,16:31,3
-chr1	16735009	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.059933;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:23,4:0,0
-chr1	16874574	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0048994;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:34,16:20,11:14,5
-chr1	17367486	.	G	GTCTTTTGTGTGGGAGTCGACTTTCCCAC	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.023323;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:12,6:18,3
-chr1	17658621	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=8.648e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:15,7:16,5
-chr1	17683340	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0055436;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:10,9:7,1
-chr1	18286956	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00073529;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:22,5:19,7
-chr1	18296624	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00039485;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:19,5:16,5
-chr1	18611271	.	G	GAGGAAGGA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.064666;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:21,3:4,1
-chr1	20011131	.	C	CA	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.042596;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:24,5:26,1
-chr1	20647466	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12566;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,8:14,6:2,2
-chr1	23487144	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023812;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:9,4:7,3
-chr1	23703868	.	AATAT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.085668;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,2:11,2
-chr1	24189141	.	T	TTCTC	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.040489;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:9,4:11,4
-chr1	25875571	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=4.2157e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:21,10:21,6
-chr1	26158356	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=2.4863e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:45,16:25,12:20,4
-chr1	26435430	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:3,3:5,3
-chr1	26803792	.	A	AC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,1:12,3
-chr1	27277036	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.068062;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:23,3:19,2
-chr1	28303493	.	CT	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.068498;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:18,3:12,1
-chr1	29365423	.	T	TCTCTCC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,4:7,2:9,2
-chr1	29554795	.	A	ATGTGCTGTGGTGTGGCATGGTGTGTGTG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0054024;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,7:11,4:5,3
-chr1	29723904	.	TACC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00072598;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:5,5:1,5
-chr1	31154909	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.001715;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:19,5:16,6
-chr1	33404286	.	T	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00013825;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:24,4:8,7
-chr1	35116835	.	A	ATTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049774;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:2,4:4,2
-chr1	35238703	.	T	TAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
-chr1	35705018	.	AAGAAAGAGAGAGAGAGAG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.28542;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,6:23,4:8,2
-chr1	36449835	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
-chr1	37414047	.	CTT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.024163;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,7:5,5:5,2
-chr1	37980841	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.012681;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:6,9:5,4
-chr1	39138072	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.029963;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,10:9,9:6,1
-chr1	39505985	.	C	CAA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.022251;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,8:15,4:4,4
-chr1	40558252	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.083965;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:17,2:19,2
-chr1	40670574	.	T	TTATATATATATATATA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,2:2,3
-chr1	43875897	.	CTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.031499;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,11:6,2:13,9
-chr1	44046539	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0063642;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:16,9:9,6:7,3
-chr1	44415506	.	C	T	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0058868;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:19,6:18,4
-chr1	45520723	.	CA	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.034818;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,8:10,7:11,1
-chr1	45727494	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16375;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:0,0:29,4
-chr1	45762019	.	A	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=2.2816e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:21,4:11,8
-chr1	46101980	.	C	CTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.034857;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:10,10:12,2
-chr1	46272025	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,3:7,1
-chr1	47588411	.	T	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.011956;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:19,14:13,8:6,6
-chr1	47653083	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,3:5,1
-chr1	48827995	.	T	TACAC	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.043618;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,7:11,4:5,3
-chr1	50692241	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.011329;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,9:9,7:6,2
-chr1	54704793	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.007971;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,5:2,1
-chr1	54780507	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0014835;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:14,8:5,5:9,3
-chr1	56647364	.	T	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=2.1555e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:18,9:25,7
-chr1	57555025	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028921;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:4,3:6,3
-chr1	57735609	.	GTT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0095308;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:10,3:2,3
-chr1	58473549	.	T	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.011682;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:28,15:12,8:16,7
-chr1	59955307	.	C	CATAT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.18741;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:20,2:16,2
-chr1	61347165	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,6:4,3:9,3
-chr1	62838780	.	C	CA	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0011955;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,9:21,8:11,1
-chr1	65375282	.	A	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00037424;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:15,5:26,7
-chr1	66187579	.	A	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.045403;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:52,10:28,9:24,1
-chr1	67259965	.	G	GA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:9,7:5,1
-chr1	67482066	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.29549;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,3:10,1
-chr1	68737235	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023889;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:14,5:15,1
-chr1	70237513	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=2.9469e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:47,15:27,8:20,7
-chr1	72895693	.	G	GTT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:5,5:3,2:2,3
-chr1	73747985	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0079864;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:9,7:2,3:7,4
-chr1	74224724	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0013656;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:18,5:20,6
-chr1	74722610	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.039635;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:17,5:14,3
-chr1	75886415	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0088091;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:10,4:8,1
-chr1	75886416	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0082105;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,4:8,1
-chr1	77367763	.	A	ATGTAAT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,2:0,1:4,1
-chr1	77475382	.	ATATATG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,3:6,1
-chr1	78838429	.	ATTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.030781;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,9:11,5:10,4
-chr1	78840128	.	T	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0015624;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:49,14:25,5:24,9
-chr1	79559217	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0022144;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:14,1:21,9
-chr1	80455065	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.084679;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,5:15,4:4,1
-chr1	84245172	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.011783;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:6,4:3,1
-chr1	85409396	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=4.1341e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:24,9:19,7
-chr1	85914304	.	A	ATG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.014832;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,10:3,7:5,3
-chr1	88623526	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:3,3:3,1:0,2
-chr1	90311030	.	T	TTTCCTTCCTTCC	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0042046;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,9:11,5:20,4
-chr1	90499440	.	A	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.010217;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,8:20,5:26,3
-chr1	92412374	.	C	CTTT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.19282;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,4:12,1:15,3
-chr1	93053223	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:4,2:15,2
-chr1	93126159	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:1,2:0,1:1,1
-chr1	94591266	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,4:16,3:10,1
-chr1	94881184	.	C	G	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.00080381;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:49,11:27,4:22,7
-chr1	97529514	.	T	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.9106e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:38,18:18,9:20,9
-chr1	99708626	.	ATAT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,4:2,3:1,1
-chr1	100028321	.	GTT	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.022644;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:28,2:14,4
-chr1	101750012	.	T	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.1832e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:32,18:18,8:14,10
-chr1	102118219	.	GCAA	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.013188;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:37,6:18,3
-chr1	103195970	.	CTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.02905;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:4,1:15,5
-chr1	103196013	.	TTC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0071858;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:2,1:9,7
-chr1	103320217	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.015638;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:14,2:17,5
-chr1	105071539	.	A	ACTCTCTCTCTCTCTCT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,6:6,5:8,1
-chr1	105075289	.	T	TATAC	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018761;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:15,2:5,4
-chr1	105176574	.	C	G	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=7.3001e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:17,6:25,8
-chr1	106711994	.	T	TGA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.056165;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,5:13,2:20,3
-chr1	108227490	.	A	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
-chr1	108241901	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:0,0:17,4
-chr1	108489196	.	G	GT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.027875;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:14,2:16,2
-chr1	108489197	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.033417;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,5:15,3:18,2
-chr1	108523875	.	TATATATATG	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.12939;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,4:16,2:13,2
-chr1	109469827	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0065559;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:8,6:1,1
-chr1	113423259	.	T	TG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00387;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:10,9:0,1
-chr1	114024625	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:5,8:2,2
-chr1	114784814	.	C	CTTTTTTTT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.046785;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:14,8:8,1
-chr1	116830698	.	T	TTCTC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.011899;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,9:2,8:6,1
-chr1	117137454	.	C	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.022846;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:21,2:15,3
-chr1	118312815	.	GC	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020843;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,3:5,3
-chr1	120061685	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.039481;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:7,10:22,2
-chr1	120118304	.	T	C	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.0081296;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:45,13:30,11:15,2
-chr1	120120057	.	T	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.024659;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:26,6:26,1
-chr1	120122567	.	T	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.036338;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:56,13:27,10:29,3
-chr1	120124322	.	G	C	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.012563;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:52,12:26,8:26,4
-chr1	120147514	.	CT	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.042357;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:57,13:29,2:28,11
-chr1	120199379	.	C	CCTCT	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.0027718;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:30,18:13,6:17,12
-chr1	120511371	.	G	A	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.045519;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:75,21:30,9:45,12
-chr1	120865334	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,3:9,1
-chr1	120920945	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.083411;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:24,4:15,1
-chr1	121006911	.	C	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.014857;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:60,20:21,17:39,3
-chr1	121017426	.	A	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.0489;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:50,12:29,10:21,2
-chr1	121035524	.	C	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.0051375;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:58,10:32,5:26,5
-chr1	121070056	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.096448;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,2:14,2
-chr1	121123014	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.028548;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:15,7:9,4
-chr1	121123034	.	G	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0030354;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:18,9:11,5
-chr1	121295036	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14592;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:21,3:8,2
-chr1	121312943	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.025682;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:21,3:14,2
-chr1	121375318	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,7:6,4:6,3
-chr1	121398942	.	G	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.0053111;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:12,10:27,6
-chr1	121655844	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.057792;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
-chr1	121662952	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.02099;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:18,2:28,5
-chr1	121769292	.	T	C	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.0098206;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:74,9:29,7:45,2
-chr1	121918780	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.031046;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:19,1:2,4
-chr1	121938737	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.039155;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:18,4:24,1
-chr1	121951935	.	G	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.045061;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:17,2:8,3
-chr1	121952283	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.010627;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:15,7:10,7
-chr1	122122886	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:16,3:1,1
-chr1	122164394	.	T	C	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.015096;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:24,4:20,2
-chr1	122164557	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:3,1:12,6
-chr1	122290901	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.060567;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:27,1:4,3
-chr1	123692217	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.057784;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:36,4:0,0
-chr1	123845299	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.19246;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:6,1:19,3
-chr1	124786953	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.031149;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:22,3:9,2
-chr1	124788615	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:5,5:0,1
-chr1	124804266	.	T	A	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.010263;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:64,12:45,9:19,3
-chr1	124819244	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.036822;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:17,3:15,3
-chr1	124832181	.	T	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0079695;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:11,6:4,2
-chr1	124833991	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.039036;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:19,3:12,2
-chr1	124866881	.	T	A	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.023164;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:114,17:76,11:38,6
-chr1	125135958	.	C	G	0	PASS	DP=211;GPV=1;SPV=0.00014152;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:86,29:34,5:52,24
-chr1	125135961	.	A	T	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.00031663;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:93,28:34,5:59,23
-chr1	125170319	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.082408;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:1,3:30,1
-chr1	125178301	.	A	C	0	PASS	DP=13569;GPV=1;SPV=9.8163e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:6911:6057,728:633,39:5424,689
-chr1	125182272	.	G	A	0	PASS	DP=12697;GPV=1;SPV=0.0060736;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:6772:6000,739:5014,473:986,266
-chr1	143185845	.	C	T	0	PASS	DP=548;GPV=1;SPV=0.00057945;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:359:289,68:177,52:112,16
-chr1	143187209	.	A	C	0	PASS	DP=1386;GPV=1;SPV=0.0018903;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:813:721,90:227,40:494,50
-chr1	143194773	.	A	T	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.031672;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:77,14:31,3:46,11
-chr1	143201663	.	G	A	0	PASS	DP=638;GPV=1;SPV=0.01979;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:396:346,47:107,19:239,28
-chr1	143210881	.	C	T	0	PASS	DP=1180;GPV=1;SPV=0.0011506;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:732:648,79:617,41:31,38
-chr1	143214275	.	A	G	0	PASS	DP=8966;GPV=1;SPV=0.0034751;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:5453:4819,619:4117,404:702,215
-chr1	143214277	.	C	G	0	PASS	DP=9389;GPV=1;SPV=0.0017894;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:5732:5012,625:4106,424:906,201
-chr1	143237848	.	T	A	0	PASS	DP=3596;GPV=1;SPV=0.036833;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2154:1930,219:1400,145:530,74
-chr1	143245469	.	A	G	0	PASS	DP=1075;GPV=1;SPV=0.022884;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:641:554,79:532,74:22,5
-chr1	143324676	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
-chr1	143505908	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.3167;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:22,4:6,1
-chr1	143743001	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.014985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,12:21,9:11,3
-chr1	143769128	.	T	C	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.025318;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:75,18:44,9:31,9
-chr1	143791240	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.21414;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:17,4:5,1
-chr1	143816122	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=1.1349e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,22:5,10:8,12
-chr1	143876753	.	C	CTA	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0094722;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,8:19,5:7,3
-chr1	143908474	.	G	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.041053;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:97,18:45,2:52,16
-chr1	144103951	.	G	A	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.037815;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:86,16:46,13:40,3
-chr1	144484369	.	C	CA	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.048523;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,7:32,6:14,1
-chr1	144592574	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.058582;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:16,5:12,1
-chr1	144592578	.	G	GA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.086254;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,7:14,6:6,1
-chr1	144827138	.	A	G	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.041942;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:73,15:27,2:46,13
-chr1	144827697	.	A	AATG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.053126;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:4,1:19,6
-chr1	144827768	.	TTAAA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.26796;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:2,1:34,3
-chr1	144988999	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:5,8:9,4
-chr1	145136580	.	A	G	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.019561;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:63,12:37,10:26,2
-chr1	145162688	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.02761;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:16,5:7,6
-chr1	145411387	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,17:6,11:11,6
-chr1	145445127	.	C	CT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.035929;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:10,9:13,3
-chr1	146333614	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0097372;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:11,6:9,6
-chr1	146397990	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.7941e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:29,18:13,8:16,10
-chr1	146443480	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0037023;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:8,1:15,8
-chr1	146717129	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:7,6:4,1
-chr1	147090778	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.18565;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:26,2:11,3
-chr1	148239596	.	CT	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.023047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:48,18:28,12:20,6
-chr1	148471265	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.045222;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,11:18,5:15,6
-chr1	148474192	.	GTT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.37843;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:19,3:4,1
-chr1	149058110	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.021975;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,5:11,3
-chr1	149157370	.	T	C	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.02174;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:73,18:49,5:24,13
-chr1	149176407	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.029779;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:17,7:11,7
-chr1	149398307	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00019831;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:26,34:12,13:14,21
-chr1	149424393	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0010994;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:11,5:12,12
-chr1	149475128	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.017006;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,5:9,5
-chr1	149528005	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023166;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,1:5,4
-chr1	149569833	.	C	T	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.040363;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:86,18:38,12:48,6
-chr1	149583520	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.15137;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,4:27,1:7,3
-chr1	149602017	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.016573;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:18,1:12,6
-chr1	149609586	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0040088;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:18,9:10,2
-chr1	149634139	.	GCCCCCACCGA	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.024131;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:17,6:15,4
-chr1	149644757	.	AC	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.016341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,6:15,4:10,2
-chr1	149685676	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11425;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,4:10,1
-chr1	149771820	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13128;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:13,2:14,3
-chr1	149789393	.	A	AAATAATAATAATAATAAT	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.00012454;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:53,17:26,13:27,4
-chr1	150020956	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=1.3844e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:52,21:24,11:28,10
-chr1	150724165	.	C	CTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.045954;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,10:8,8:9,2
-chr1	150775822	.	ATTT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,6:13,3:4,3
-chr1	151999734	.	G	A	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.00016247;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:67,22:30,10:37,12
-chr1	153558554	.	G	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.018547;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:74,9:44,6:30,3
-chr1	154113157	.	TA	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.02492;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:70,9:29,3:41,6
-chr1	154593135	.	C	CAAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.040919;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,16:12,14:7,2
-chr1	154714319	.	G	GGTGTGTGTGGGGT	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.074687;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:52,6:22,4:30,2
-chr1	155065700	.	CTTTATTTATTTA	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0036289;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:15,5:24,10
-chr1	155584670	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.20137;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:27,3:3,1
-chr1	156617351	.	C	CTT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.010745;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,16:15,13:7,3
-chr1	156756793	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.052073;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,6:19,5:9,1
-chr1	156787448	.	TTG	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.008238;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:8,8:6,7:2,1
-chr1	156979361	.	C	CTT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.010186;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,14:16,12:13,2
-chr1	157035934	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.1019;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,3:15,1
-chr1	157274173	.	C	CTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:5,2:7,2
-chr1	158084688	.	T	C	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0029786;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:63,11:25,3:38,8
-chr1	160569542	.	G	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.092902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:25,5:8,3:17,2
-chr1	160973841	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1532;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:6,5:7,1
-chr1	161097738	.	G	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.012533;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:16,9:6,7:10,2
-chr1	161443332	.	G	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.011182;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:88,10:30,2:58,8
-chr1	161513933	.	G	A	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.024873;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:81,15:43,4:38,11
-chr1	161629853	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.32052;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:32,2:2,2
-chr1	161981444	.	C	A	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.0009232;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:73,14:23,2:50,12
-chr1	162403503	.	AAAAAAAAAATATATATATATAT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.20823;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:16,1:19,3
-chr1	164776899	.	TTGTGTG	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01792;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,13:16,9:7,4
-chr1	164793872	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.11976;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,4:10,1
-chr1	165117026	.	C	T	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=1.6016e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:58,22:30,13:28,9
-chr1	165591334	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:6,1:14,3
-chr1	165695487	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0083313;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,7:5,2
-chr1	167111513	.	TACAC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,4:2,1:5,3
-chr1	168153906	.	CAA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0093016;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,15:12,12:9,3
-chr1	168466949	.	C	T	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.003938;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:76,13:43,9:33,4
-chr1	169997884	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.031247;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,12:13,10:9,2
-chr1	170166140	.	C	CT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:5,6:1,2:4,4
-chr1	170331019	.	A	AT	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.0030735;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:65,14:33,4:32,10
-chr1	171694664	.	G	GAA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.11157;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,5:19,3:18,2
-chr1	174795790	.	G	T	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.00059571;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:81,20:46,13:35,7
-chr1	174973979	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,5:16,4:4,1
-chr1	175085874	.	C	CAA	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.013604;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:33,20:26,17:7,3
-chr1	175122455	.	TTGCTAACAAAGGACTGAAGAAGAGCCAGTGAGTTAGGAAAATCAAGGGAGTA	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.022351;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:19,10:20,6
-chr1	179410300	.	G	A	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=5.0817e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:52,24:30,16:22,8
-chr1	181727163	.	G	A	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=2.1332e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:56,36:31,18:25,18
-chr1	182141378	.	CTTTCTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:7,2:7,2
-chr1	183364655	.	A	ATTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0089603;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:36,15:17,2:19,13
-chr1	183441072	.	G	A	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.0010762;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:64,13:37,5:27,8
-chr1	184811511	.	T	TGTTTTTTTTTG	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.054778;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:45,9:14,7:31,2
-chr1	185858586	.	ATTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.2649;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:14,2:14,2
-chr1	186163946	.	A	T	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.01109;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:79,10:37,7:42,3
-chr1	189139638	.	C	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.0037905;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:69,8:43,3:26,5
-chr1	190277113	.	A	ATATATATATATATATATT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.062937;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:1,1:3,4
-chr1	190280208	.	A	C	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.00043432;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:55,14:31,6:24,8
-chr1	190408019	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0070393;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,10:6,9:3,1
-chr1	191089426	.	TATATATTTGTGTGTATACATGTGTATGTATACGCAC	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.16867;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:16,2:19,2
-chr1	191581492	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.064856;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,9:7,7:8,2
-chr1	191806131	.	GAAT	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.12939;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:29,4:11,3:18,1
-chr1	192048740	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.01311;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,8:26,6:3,2
-chr1	192550559	.	G	A	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=9.5454e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:68,20:30,4:38,16
-chr1	192606029	.	A	AAGAG	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.14384;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:29,2:7,2
-chr1	193177358	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.01273;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,16:24,15:3,1
-chr1	193564348	.	TTATA	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.024837;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:71,13:36,8:35,5
-chr1	193988983	.	A	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.0017076;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:69,14:39,6:30,8
-chr1	194673631	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01018;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,11:11,8:7,3
-chr1	194834203	.	T	A	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.01342;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:25,8:11,3:14,5
-chr1	195543282	.	GGTGT	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.10026;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:26,4:7,1
-chr1	196235161	.	T	C	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.0015681;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:62,19:29,8:33,11
-chr1	198404753	.	A	C	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=3.3498e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:60,30:30,14:30,16
-chr1	198977744	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.28876;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,4:12,2:13,2
-chr1	199200439	.	C	CT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00036531;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:14,11:9,9
-chr1	200073268	.	T	TTATA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,9:5,5:5,4
-chr1	200736164	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.26519;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,3:11,1:5,2
-chr1	200919962	.	C	CT	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.15872;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:33,5:13,2:20,3
-chr1	201765404	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.023939;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:5,5:28,2
-chr1	201901513	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0011846;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:5,17:1,12:4,5
-chr1	202065074	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.043306;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,13:13,11:11,2
-chr1	202721205	.	C	CTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.040398;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:12,10:6,9:6,1
-chr1	203315362	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=1.021e-10;SS=2;SSC=99;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:25,32:23,23:2,9
-chr1	203315363	.	G	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=2.3122e-10;SS=2;SSC=96;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:27,32:23,23:4,9
-chr1	203918573	.	A	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.023333;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:23,6:9,1:14,5
-chr1	204099424	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.011427;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,9:13,8:4,1
-chr1	205314328	.	T	G	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=4.0037e-17;SS=2;SSC=163;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:36,56:17,18:19,38
-chr1	205898579	.	T	TTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,2:6,3
-chr1	205956552	.	C	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.0001101;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:78,19:38,10:40,9
-chr1	206118843	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.066379;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,8:9,4:9,4
-chr1	206322898	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.053126;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:6,2:17,5
-chr1	206345228	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0072004;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:4,4:9,5
-chr1	207118198	.	A	G	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.018568;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:57,14:27,3:30,11
-chr1	211214809	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.050308;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:20,4:23,2
-chr1	211440639	.	CA	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00017113;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:30,27:15,17:15,10
-chr1	211535137	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0024246;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:26,16:10,3:16,13
-chr1	212116319	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0043177;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,10:11,8:10,2
-chr1	212806847	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.018872;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:14,9:22,4
-chr1	212865485	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.011608;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,8:15,7:2,1
-chr1	212896856	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.018479;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:6,17:4,9:2,8
-chr1	213355745	.	C	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.0061895;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:64,10:44,7:20,3
-chr1	213714274	.	T	A	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.012157;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:61,7:35,3:26,4
-chr1	213728937	.	G	GTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.012914;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,11:9,7:2,4
-chr1	215732544	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0048547;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:4,8:3,4
-chr1	216880304	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.019316;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:12,9:6,1
-chr1	216912226	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,2:7,2:0,0
-chr1	217958962	.	C	T	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=7.2352e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:81,27:41,12:40,15
-chr1	218230928	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.012102;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:9,5:2,2
-chr1	218991845	.	G	A	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=1.7265e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:65,29:24,12:41,17
-chr1	219165731	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0038232;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:15,14:8,5:7,9
-chr1	219927678	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,8:6,3:3,5
-chr1	221297986	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,9:5,6:4,3
-chr1	221524306	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,4:4,3:2,1
-chr1	223065455	.	CTTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.097821;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:8,3:11,4
-chr1	223268044	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027027;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:6,3:10,3
-chr1	223656676	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.016951;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,7:14,5:5,2
-chr1	224011834	.	GGACAT	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,4:16,2:7,2
-chr1	224342475	.	ATCTC	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.018933;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,11:9,7:10,4
-chr1	226844839	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,3:5,3
-chr1	228817691	.	A	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.00021864;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:29,9:19,4
-chr1	229069432	.	T	TA	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.017657;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:12,2:20,9
-chr1	229116825	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.076651;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,5:3,3:9,2
-chr1	229550525	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0052123;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:15,9:3,3
-chr1	229870926	.	A	ACACAC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,2:4,1:1,1
-chr1	231169368	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:8,4:5,1
-chr1	232368199	.	CAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15645;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:11,2:15,3
-chr1	233120164	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.030612;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,7:20,6:4,1
-chr1	233729406	.	TGGC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.01817;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,2:13,5
-chr1	234108657	.	TTA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.069262;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:22,3:15,4
-chr1	235080879	.	G	GA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0047012;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,11:9,9:3,2
-chr1	235926950	.	CAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.032608;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,10:14,9:3,1
-chr1	237594886	.	GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024462;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:5,2:5,2
-chr1	237827936	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14184;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:11,5:9,1
-chr1	237884033	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0024202;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,15:6,6:9,9
-chr1	240248861	.	T	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00027224;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:47,16:29,3:18,13
-chr1	240277525	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:5,4:3,1
-chr1	240364499	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.00013601;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:26,8:14,5
-chr1	241571864	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.028117;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:7,8:12,2
-chr1	242512288	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0010162;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:17,3:13,5
-chr1	243079412	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00081679;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:24,6:16,4
-chr1	245006970	.	A	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.034441;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,4:9,1:12,3
-chr1	245781338	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00022306;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:25,4:11,7
-chr1	246267930	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=3.0204e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:50,20:33,9:17,11
-chr1	246273153	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:6,3:12,1
-chr1	246408663	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,4:2,2
-chr1	247852884	.	GACACACACAC	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.018096;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:20,4:14,4
-chr1	247958619	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00015449;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:17,9:26,4
-chr1	248475596	.	TTAAA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033483;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
-chr1	248938433	.	T	C	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.022333;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:53,7:21,3:32,4
-chr1	248945547	.	GGAGGGT	G	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.028385;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:65,10:25,3:40,7
-chr1	248945740	.	TA	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,1:1,3
-chr10	51939	.	T	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0093264;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:51,8:24,6:27,2
-chr10	260402	.	C	CAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013043;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:6,3:2,3
-chr10	685159	.	AAAATATATATATATATATATATATATACATAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:4,1:10,6
-chr10	794158	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.022194;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:15,8:6,2
-chr10	1542823	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.031109;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:12,3:1,4
-chr10	2205050	.	CA	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=3.8981e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:37,16:15,9:22,7
-chr10	2583951	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.02706;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:18,2:14,3
-chr10	4117550	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,3:1,2
-chr10	4169431	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:15,8:4,2
-chr10	4929666	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.008578;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:21,7:21,3
-chr10	5370687	.	A	ATG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0046642;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,8:6,5:0,3
-chr10	8613475	.	CTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.025795;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,8:7,6:6,2
-chr10	9058088	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,5:6,4:3,1
-chr10	9133448	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.048301;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:15,8:15,3
-chr10	9321021	.	C	CTT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.1519;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:11,2:21,3
-chr10	9776111	.	C	CAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.040415;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,8:16,7:4,1
-chr10	10127847	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:20,4:14,2:6,2
-chr10	10383234	.	A	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.05154;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:23,5:11,3:12,2
-chr10	10621243	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0087248;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,10:8,8:5,2
-chr10	10652124	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.004796;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:8,3:13,10
-chr10	11197070	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,2:5,1:0,1
-chr10	11645046	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.010514;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,11:16,9:6,2
-chr10	11662229	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.12928;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,2:12,2
-chr10	12131682	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,6:5,1:6,5
-chr10	12256163	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03895;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:13,8:3,1
-chr10	12330744	.	CTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016858;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:8,3:1,2
-chr10	12385739	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,13:5,9:2,4
-chr10	14191806	.	TC	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.024274;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:17,3:19,2
-chr10	14374865	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.022357;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:15,2:3,6
-chr10	14628112	.	G	GTTTTTTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,4:6,1:8,3
-chr10	15379603	.	G	GTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,5:5,4:4,1
-chr10	15390270	.	A	AT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.02262;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,8:13,6:14,2
-chr10	15930344	.	G	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0023029;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:51,8:27,2:24,6
-chr10	17520917	.	GA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.11029;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,2:4,2:0,0
-chr10	18426955	.	A	ATTTTTTTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0070913;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,10:2,4:4,6
-chr10	18563165	.	AATGGAATGGAATGGAGAATGGT	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.027747;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:13,3:19,7
-chr10	19023687	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0047508;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:24,6:13,3
-chr10	19885779	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.032911;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:27,4:17,1
-chr10	20682249	.	T	TA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,9:8,8:5,1
-chr10	21664944	.	C	CTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,9:5,6:5,3
-chr10	22298888	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0029478;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:16,6:16,2
-chr10	23051201	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.032391;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:16,5:20,4
-chr10	25200869	.	T	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.14184;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,6:11,3:9,3
-chr10	25211071	.	G	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.00067164;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:21,7:23,4
-chr10	25713463	.	T	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.014855;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,10:9,8:9,2
-chr10	25753378	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:10,4:3,2
-chr10	25908233	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,4:10,1:11,3
-chr10	27404164	.	A	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.005129;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:20,4:17,3
-chr10	27446902	.	CTTTTCT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0084291;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,6:5,1:4,5
-chr10	27656879	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0048547;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:7,10:2,2:5,8
-chr10	27948779	.	A	ATT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,4:14,3:5,1
-chr10	28465570	.	C	CA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.010573;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,10:10,7:10,3
-chr10	28521937	.	G	A	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.00011299;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:25,6:19,6
-chr10	29481168	.	T	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.11468;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:13,3:32,2
-chr10	29507556	.	CAT	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.033939;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:15,2:11,3
-chr10	30073685	.	C	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.036876;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:10,4:16,7
-chr10	31312481	.	G	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.0064153;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,8:23,4:26,4
-chr10	31889619	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,2:3,2
-chr10	31920449	.	C	CAAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.20433;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,6:17,5:6,1
-chr10	31922180	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,9:3,6:4,3
-chr10	33897211	.	G	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.079813;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:32,5:19,3:13,2
-chr10	34371514	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,4:5,1
-chr10	35262257	.	C	CAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,7:3,6:5,1
-chr10	36383345	.	A	G	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00022873;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:29,6:15,7
-chr10	38071302	.	C	CAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.016961;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:9,7:7,2
-chr10	38215937	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:12,5:1,1
-chr10	38600954	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:2,1:4,6
-chr10	38651226	.	A	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.026174;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:27,6:18,3
-chr10	38953450	.	T	C	0	PASS	DP=414;GPV=1;SPV=0.023922;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:238:210,28:107,18:103,10
-chr10	39720018	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0032962;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:28,6:5,2
-chr10	39986132	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11839;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:33,4:0,0
-chr10	39998840	.	G	A	0	PASS	DP=513;GPV=1;SPV=0.001616;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:277:243,34:143,25:100,9
-chr10	40278008	.	T	TA	0	PASS	DP=415;GPV=1;SPV=0.0062425;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:236:195,39:157,31:38,8
-chr10	40421309	.	C	T	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.03755;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:66,9:33,5:33,4
-chr10	40477143	.	A	T	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.00059398;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:67,29:50,22:17,7
-chr10	40701121	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.32006;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:24,3:17,1:7,2
-chr10	40792873	.	A	G	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.014753;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:87,21:42,4:45,17
-chr10	41066625	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.076205;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:8,1:15,3
-chr10	41072437	.	G	A	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.041395;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:93,20:53,10:40,10
-chr10	41413507	.	C	G	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.020165;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:59,7:19,1:40,6
-chr10	41550741	.	A	G	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.0090706;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:96,18:34,8:62,10
-chr10	41559853	.	T	A	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.034486;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:110,26:87,10:23,16
-chr10	41584224	.	A	T	0	PASS	DP=330;GPV=1;SPV=0.041571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:192:169,23:112,19:57,4
-chr10	41587208	.	G	T	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.041845;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:79,11:13,6:66,5
-chr10	41592961	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.012992;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:0,9:17,1
-chr10	41874905	.	G	GGAATGGAATGCAACA	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0073197;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:33,10:22,3:11,7
-chr10	41882526	.	C	T	0	PASS	DP=484;GPV=1;SPV=0.0071833;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:254:215,39:112,24:103,15
-chr10	41899853	.	C	CGAATGGAATG	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.024355;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:37,11:18,4:19,7
-chr10	41912099	.	T	A	0	PASS	DP=410;GPV=1;SPV=0.02222;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:235:205,30:108,20:97,10
-chr10	42073671	.	T	A	0	PASS	DP=3712;GPV=1;SPV=0.016542;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2025:1788,237:832,129:956,108
-chr10	42079479	.	C	T	0	PASS	DP=4454;GPV=1;SPV=0.022841;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2370:2099,271:1599,238:500,33
-chr10	42085585	.	G	C	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.038256;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:90,11:18,3:72,8
-chr10	42085807	.	G	A	0	PASS	DP=473;GPV=1;SPV=0.0037187;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:278:249,29:133,13:116,16
-chr10	42130126	.	T	C	0	PASS	DP=692;GPV=1;SPV=0.024327;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:380:325,55:159,30:166,25
-chr10	42130137	.	G	C	0	PASS	DP=728;GPV=1;SPV=0.034664;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:398:345,53:170,16:175,37
-chr10	42766332	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.20063;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:26,4:8,1
-chr10	42831180	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.0058807;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:50,8:31,5:19,3
-chr10	42891280	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00010642;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:15,5:12,7
-chr10	44382770	.	A	C	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=4.5383e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:46,21:21,15:25,6
-chr10	45741650	.	C	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.014179;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:29,6:28,1
-chr10	45836673	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033449;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:12,7:4,4
-chr10	46323835	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0080848;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:44,8:24,6:20,2
-chr10	46484868	.	A	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.014737;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:51,10:29,8:22,2
-chr10	46525521	.	CAT	C	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.016073;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:69,18:31,8:38,10
-chr10	47520838	.	TA	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.021295;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,10:13,6:11,4
-chr10	48051799	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.017584;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:11,10:16,2
-chr10	48140522	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10903;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,3:17,1
-chr10	50028240	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,3:2,1
-chr10	50748900	.	T	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.038215;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,9:18,4:23,5
-chr10	51091344	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00062159;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:20,5:23,11
-chr10	51285968	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.04872;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:20,4:18,1
-chr10	52036899	.	G	C	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.041079;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:50,11:34,6:16,5
-chr10	52380498	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0010177;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:27,5:11,5
-chr10	53164463	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=2.6315e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:20,8:19,8
-chr10	53729877	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.013778;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:13,7:19,4
-chr10	55582628	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02037;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:5,2:4,3
-chr10	56175687	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,3:5,2:1,1
-chr10	56684222	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.8184e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:14,7:13,6
-chr10	57620739	.	C	CATATATATATATATAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.022727;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,3:6,2
-chr10	57811028	.	T	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=1.2729e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:38,18:19,5:19,13
-chr10	61120281	.	G	GTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:6,2:7,2
-chr10	61680578	.	T	TATA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0088769;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,7:6,2
-chr10	62977815	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018244;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:6,5:0,1
-chr10	64460856	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,7:2,1
-chr10	65470642	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0026067;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:22,6:14,5
-chr10	66380758	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0019257;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:22,4:13,5
-chr10	66421834	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.046847;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,4:2,2
-chr10	66976334	.	T	C	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=3.5233e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:13,6:17,8
-chr10	68821532	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.050822;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:13,2:27,3
-chr10	70045898	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.016941;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:14,1:23,8
-chr10	70311222	.	A	AT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.02977;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:14,8:10,5
-chr10	71590884	.	AAAC	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.035289;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,6:8,4:11,2
-chr10	72319091	.	C	CT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.043948;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,5:14,3:13,2
-chr10	73724908	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,3:4,1
-chr10	74018177	.	G	GATATATATATAT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.014286;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,4:0,4:0,0
-chr10	74602105	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:13,7:1,1
-chr10	75109823	.	G	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0075351;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,8:30,5:19,3
-chr10	78459622	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0017333;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:26,8:11,1
-chr10	80032868	.	T	TAAA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.17622;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:5,4:2,2:3,2
-chr10	80383621	.	G	GTATACGTATATATATATATATA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:13,3:15,1
-chr10	84047174	.	C	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0039955;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:26,5:22,8
-chr10	84437150	.	C	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:4,6:1,5:3,1
-chr10	84922885	.	T	TGTAAGAGGTTG	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.025097;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:16,3:23,3
-chr10	86600343	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0036889;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:17,3:20,5
-chr10	86625377	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011299;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:9,7:2,2
-chr10	87219963	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,2:7,2
-chr10	87351605	.	A	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.018263;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:19,5:23,5
-chr10	87985763	.	CAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
-chr10	88613770	.	G	GTATA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0024902;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,8:1,6:2,2
-chr10	90289883	.	T	TACACACACAC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14912;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:24,2:8,2
-chr10	92582076	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.048675;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:28,1:16,4
-chr10	93644896	.	ATATAG	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,1:16,3
-chr10	93693480	.	GTGTATA	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.020192;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:12,3:7,7
-chr10	93693509	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.010436;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,10:8,2:9,8
-chr10	93693514	.	TATATATATATATACACC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035132;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:8,1:12,7
-chr10	96025192	.	AAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:10,2:9,2
-chr10	96794402	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.017686;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:15,2:17,5
-chr10	97166543	.	GA	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.016354;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:13,2:6,3
-chr10	97449861	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,3:6,1
-chr10	99321534	.	A	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:26,4:21,3
-chr10	99321537	.	AAGAACC	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.073758;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:48,6:26,5:22,1
-chr10	99922502	.	GTT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19804;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,4:9,1
-chr10	99929440	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00011756;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:16,6:14,4
-chr10	102663393	.	A	AAAT	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.12627;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,4:21,3:9,1
-chr10	103728043	.	C	A	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=4.2495e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:50,16:28,8:22,8
-chr10	103776395	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.022854;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:8,5:8,3
-chr10	104293563	.	A	AT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0061419;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,6:18,4:7,2
-chr10	104306020	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00048357;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:14,15:11,12:3,3
-chr10	104534704	.	TTCTTTC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.020689;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,5:2,3:13,2
-chr10	105512880	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.407e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:14,11:10,3
-chr10	106125874	.	A	AAG	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.012602;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,10:13,6:17,4
-chr10	108123939	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=6.9523e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:39,17:18,5:21,12
-chr10	109500156	.	GTGTGGGCTGAATTCTGAGCACTACACATCA	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.03317;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:38,16:22,9:16,7
-chr10	111375645	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.020244;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,7:5,3:10,4
-chr10	113073503	.	CA	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.043711;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:16,5:7,3
-chr10	113156115	.	C	CT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00077751;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,10:7,9:6,1
-chr10	113348938	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00080682;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:13,5:24,6
-chr10	114083902	.	AATATTATATATAAAT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:1,3:7,3
-chr10	118600042	.	G	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.00026184;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:53,13:26,8:27,5
-chr10	119636647	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.020593;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:50,8:25,4:25,4
-chr10	119717299	.	A	AT	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00018434;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:23,6:10,5
-chr10	121080935	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.00036241;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:18,6:27,6
-chr10	121421866	.	G	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=2.2741e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:22,4:17,10
-chr10	121455813	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,5:1,3:3,2
-chr10	121650820	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.006961;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:19,3:8,5
-chr10	123068657	.	CACAT	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0091599;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:21,5:18,2
-chr10	123211730	.	G	GTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.013574;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:13,6:5,3
-chr10	125826996	.	T	TAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0082486;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,10:10,6:8,4
-chr10	125864929	.	CAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0045249;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,5:1,1
-chr10	125894099	.	AAT	A	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.028118;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:100,16:33,4:67,12
-chr10	127755343	.	C	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=7.5652e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:16,8:19,7
-chr10	130347228	.	G	GT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0092633;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:7,3:3,6
-chr10	131350780	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0010195;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:21,4:14,6
-chr10	131746881	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0052114;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,6:6,2:12,4
-chr10	132816830	.	G	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=2.593e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:34,21:19,9:15,12
-chr10	133011316	.	T	TTA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.023176;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,2:3,3
-chr10	133430349	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.015108;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:24,3:21,3
-chr10	133625834	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0086278;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:23,3:21,11
-chr10	133657822	.	A	T	0	PASS	DP=389;GPV=1;SPV=0.02169;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:211:175,36:91,22:84,14
-chr11	123174	.	AAAAC	A	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.035374;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:68,10:39,6:29,4
-chr11	349700	.	C	CAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,1:8,3
-chr11	897146	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020382;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:20,5:3,2
-chr11	1096112	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.01598;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:21,5:11,2
-chr11	2917012	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.029749;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:20,8:13,3
-chr11	3754941	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.065833;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,6:11,3:10,3
-chr11	4046059	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.30935;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,5:10,3:6,2
-chr11	4174497	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00096207;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:7,8:12,9
-chr11	4233598	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,1:9,3
-chr11	4244066	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.040748;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:11,5:15,2
-chr11	4297902	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.031471;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:16,1:15,3
-chr11	4308516	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.065183;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:17,1:21,6
-chr11	4353566	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.036854;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:14,3:8,4
-chr11	4819566	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,4:6,1
-chr11	5692793	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.026055;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,8:10,7:9,1
-chr11	8854016	.	AT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:9,1:5,3
-chr11	9719093	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0079779;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,12:17,9:7,3
-chr11	10108515	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.19203;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:14,3:9,1
-chr11	12155973	.	G	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=2.1165e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:42,19:16,11:26,8
-chr11	12306140	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00010265;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,13:18,6:21,7
-chr11	12330900	.	A	AGAGT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.18393;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,4:18,3:8,1
-chr11	12837681	.	T	TTTCTCCTTTCTCCC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:12,2:16,6
-chr11	15283720	.	C	CT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0012048;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:15,8:11,2
-chr11	18274075	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=3.3037e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:34,19:22,10:12,9
-chr11	18598411	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,3:5,1
-chr11	22334110	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,10:7,7:6,3
-chr11	22339167	.	TATATATATATG	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,2:14,2
-chr11	23228372	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.039737;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,5:6,2:2,3
-chr11	25219930	.	CAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.015942;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:6,4:2,1
-chr11	25650319	.	C	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.012311;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:21,8:16,2
-chr11	25650327	.	GTATA	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.013578;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,9:17,7:15,2
-chr11	25849885	.	T	TA	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00014302;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,14:23,5:14,9
-chr11	25857940	.	C	CTTATTATTATTATTATTA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0093999;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:14,4:15,5
-chr11	29143731	.	G	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,9:4,1
-chr11	29504566	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,7:1,2:2,5
-chr11	30888060	.	AAG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,5:12,4:5,1
-chr11	30888104	.	AAG	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023578;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,9:14,7:10,2
-chr11	32855211	.	C	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=5e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:17,11:25,5
-chr11	33310270	.	G	GTCTATCTTATCTATCTA	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.071484;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:18,3:17,1
-chr11	34237276	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:20,4:1,0
-chr11	35887994	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.022257;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:19,5:20,2
-chr11	36793927	.	TATATATATA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010836;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,5:2,2:2,3
-chr11	37315818	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=2.1193e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:33,19:15,10:18,9
-chr11	38943261	.	T	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=4.7395e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:24,10:17,3
-chr11	39326384	.	T	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=2.3519e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:36,17:17,10:19,7
-chr11	40906706	.	C	CTG	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.027169;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,3:16,2
-chr11	41303775	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019062;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:3,1:9,4
-chr11	43888382	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,2:2,4
-chr11	45337328	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.045915;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,9:9,1
-chr11	47545867	.	CTGCGTG	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,4:8,1:11,3
-chr11	47862750	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.011497;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:17,3:25,4
-chr11	52225432	.	C	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:1,0:21,4
-chr11	52599572	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1041;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:25,4:7,1
-chr11	52599777	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.092724;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:6,4:44,2
-chr11	52737767	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:21,4:0,0
-chr11	53072080	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.073823;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:3,3:16,2
-chr11	53300818	.	C	A	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.01649;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:115,13:43,4:72,9
-chr11	53535337	.	T	A	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.01123;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:98,22:45,10:53,12
-chr11	53616452	.	G	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr11	54256182	.	G	A	0	PASS	DP=246;GPV=1;SPV=0.0093624;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:94,23:37,10:57,13
-chr11	54351934	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,3:1,1
-chr11	54353579	.	C	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.044477;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,1:8,3
-chr11	54362637	.	A	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,1:10,3
-chr11	54382746	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.060731;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:14,1:20,3
-chr11	54393362	.	C	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.012341;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:89,19:1,1:88,18
-chr11	54421961	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.04394;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,4:4,1
-chr11	54530924	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr11	54536160	.	T	G	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.029289;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:68,17:35,14:33,3
-chr11	55317589	.	C	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0058707;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:26,2:14,6
-chr11	55568525	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.7247e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:14,8:10,6
-chr11	55608897	.	C	CTATATATA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,7:5,4:3,3
-chr11	55993111	.	A	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.038888;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:22,8:15,2:7,6
-chr11	56498551	.	C	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0003709;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:14,5:16,4
-chr11	56974177	.	A	AATAT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:6,4:1,1
-chr11	58320076	.	GT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.035323;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:10,4:5,4
-chr11	58697156	.	G	C	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.048805;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:57,10:35,8:22,2
-chr11	59905247	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,10:3,9:2,1
-chr11	61376652	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00062737;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:17,6:18,4
-chr11	61657599	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,8:8,4:6,4
-chr11	62098145	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.016315;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,11:14,6:8,5
-chr11	62184483	.	A	G	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=4.0571e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,16:19,7:25,9
-chr11	63145562	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0035559;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:2,4:6,6
-chr11	63177835	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.012629;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:13,4:8,4
-chr11	64170679	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:3,3:6,4
-chr11	64582112	.	T	TCACCAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.25362;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,3:7,1:10,2
-chr11	66270245	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:13,5:7,3:6,2
-chr11	67670248	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:17,3:6,1
-chr11	68511463	.	A	AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.010126;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,7:9,6:13,1
-chr11	69715028	.	AAGAGAGAGAG	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0092391;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,14:11,10:8,4
-chr11	70678532	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:4,4:2,1
-chr11	71931566	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00024808;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:41,15:21,7:20,8
-chr11	72907599	.	G	GTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.029887;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,12:10,8:9,4
-chr11	73735920	.	T	TAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014318;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:9,6:4,3
-chr11	73762590	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0048917;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:15,4:11,2
-chr11	74353860	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0028145;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:1,4:3,2
-chr11	76076802	.	G	GTATTTATTTATT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.032545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,10:10,5:20,5
-chr11	77920226	.	TACATAC	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0078411;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,8:18,7:22,1
-chr11	78535632	.	C	CT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.060679;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,4:23,3:10,1
-chr11	78942108	.	TA	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.006277;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:14,5:15,2
-chr11	79124893	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.20154;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,9:17,4:9,5
-chr11	80326049	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0037001;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:18,7:21,1
-chr11	85598630	.	A	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.00022326;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:30,3:10,9
-chr11	85753760	.	CT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.14912;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:23,3:9,1
-chr11	86939405	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,2:6,2
-chr11	87189098	.	CG	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.068696;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:9,2:20,2
-chr11	88080857	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.25926;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,4:15,4:0,0
-chr11	89060285	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.076205;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:23,4:12,2:11,2
-chr11	89157084	.	T	TATAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:7,3:3,1
-chr11	89422795	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0023788;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,9:7,8:4,1
-chr11	89757187	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,8:7,7:2,1
-chr11	89861631	.	C	T	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.018449;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:51,10:25,6:26,4
-chr11	90552211	.	GT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0032719;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:9,9:6,4
-chr11	91670125	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,2:2,1:2,1
-chr11	92010898	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0011397;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:11,2:28,8
-chr11	92293064	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.031089;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:15,4:9,1
-chr11	92712942	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.013703;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:22,1:19,6
-chr11	93591583	.	C	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015718;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,7:2,1:3,6
-chr11	95337512	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.051974;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:26,2:7,3
-chr11	96232615	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00032416;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:12,8:28,5
-chr11	96932088	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,10:5,7:4,3
-chr11	97579453	.	ACACACACACACACC	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0073017;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:14,9:10,5
-chr11	97899853	.	GACATATTAAAATAAATTCTTCAGAGAGAACCA	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0048961;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:17,6:8,4
-chr11	98135976	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.059972;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,6:17,2:18,4
-chr11	98316306	.	TA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,2:1,1:3,1
-chr11	98697052	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:6,3:4,1:2,2
-chr11	98859045	.	C	CTATATATATA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1226;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,6:7,5:4,1
-chr11	99727378	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.013425;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:13,11:16,4
-chr11	101046292	.	ATTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,2:6,2
-chr11	101622377	.	G	GAAAGAAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:13,4:6,3:7,1
-chr11	101629982	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.033473;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,2:11,4
-chr11	102149977	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:5,2:3,2
-chr11	103125366	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0001763;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,14:7,12:3,2
-chr11	103487799	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.032072;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,9:5,5:11,4
-chr11	103526491	.	ATTTTTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,6:7,1
-chr11	105365792	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=8.9306e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:22,6:17,7
-chr11	106000360	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.010101;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:1,4:0,2:1,2
-chr11	106855905	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0014228;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,18:7,12:9,6
-chr11	107512304	.	T	G	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.046944;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:52,13:23,10:29,3
-chr11	107540628	.	A	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.038009;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:33,5:26,4
-chr11	108856170	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=1.5282e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:19,10:16,4
-chr11	111276453	.	A	AAATATAT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:8,9:7,7:1,2
-chr11	112102806	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=5.656e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:10,8:22,9
-chr11	112255078	.	TG	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:4,4:3,2:1,2
-chr11	112677726	.	C	CTTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.035511;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:14,8:4,1
-chr11	113210775	.	A	AACAC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.016244;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,10:14,7:3,3
-chr11	116818311	.	AT	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.057736;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,6:20,1:16,5
-chr11	118504565	.	A	G	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=3.0753e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:42,19:21,13:21,6
-chr11	118609315	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.027862;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:9,1:11,4
-chr11	118802450	.	T	TATATATATATATA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,6:6,4:4,2
-chr11	118831563	.	A	ATTTATTTTTATT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.021689;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,11:8,3:21,8
-chr11	119818978	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.022061;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:21,8:8,5:13,3
-chr11	121120793	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=5.6929e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:25,9:14,3
-chr11	121147059	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.7558e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:10,7:8,5
-chr11	121765653	.	TTCTC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.010021;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:3,1:8,4
-chr11	121765659	.	C	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:2,1:6,4
-chr11	122558020	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,5:10,2
-chr11	123368271	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.098694;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:11,2:20,3
-chr11	123403451	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.029506;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:22,5:13,4
-chr11	123614151	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=6.0843e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:13,7:20,4
-chr11	123709175	.	CT	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:15,2:20,2
-chr11	123750349	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00017791;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:19,4:23,10
-chr11	124337155	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.007251;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:5,6:7,3
-chr11	125623068	.	CAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0050719;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:13,7:3,1
-chr11	126417787	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.047777;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:16,2:26,4
-chr11	126923098	.	TCTTCTC	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:3,2:23,2
-chr11	126956487	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0012263;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:19,5:15,4
-chr11	127617757	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1671;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,5:9,4:9,1
-chr11	127992652	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,1:6,3
-chr11	128985860	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.06037;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:14,2:14,2
-chr11	129043381	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
-chr11	130091047	.	A	C	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.0011005;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:45,20:20,10:25,10
-chr11	131680469	.	C	CTG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0083484;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:10,5:7,7
-chr11	132069996	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02791;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:12,2:14,4
-chr11	132217352	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.094058;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:18,2:18,2
-chr11	132599386	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.049096;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,4:9,1:9,3
-chr11	134896512	.	C	T	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00036516;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:23,6:21,6
-chr12	43841	.	T	C	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.016532;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:91,11:66,9:25,2
-chr12	422048	.	AC	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.14184;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:15,1:7,2
-chr12	1501253	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.064526;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,1:11,3
-chr12	1604830	.	A	AGT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,2:3,2
-chr12	1933007	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.026239;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,10:24,8:17,2
-chr12	3072183	.	C	CTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,8:2,2:7,6
-chr12	5133551	.	A	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0003312;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:20,8:19,5
-chr12	5658624	.	A	G	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.031023;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:47,16:25,13:22,3
-chr12	5932324	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.025884;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:38,15:19,9:19,6
-chr12	5998499	.	ATAT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.060606;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:2,6:2,4:0,2
-chr12	6400481	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0078411;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:18,4:22,4
-chr12	7197123	.	A	AT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.071698;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,5:10,3:13,2
-chr12	7197197	.	T	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0031015;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,15:16,6:16,9
-chr12	7197198	.	A	AT	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.036143;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:17,4:21,6
-chr12	7300180	.	AG	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.05062;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:14,3:7,1
-chr12	7421606	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,7:4,3:2,4
-chr12	7874783	.	A	ACG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.057887;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,5:12,2:15,3
-chr12	8983395	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.025395;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:7,2:6,5
-chr12	9284446	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.045574;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:14,4:11,5
-chr12	9440307	.	A	G	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.021699;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:61,10:20,1:41,9
-chr12	9445081	.	A	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.029989;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:61,8:34,4:27,4
-chr12	9775802	.	C	CT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0040214;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:12,12:6,2
-chr12	10229652	.	CTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.047343;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:6,4:0,0
-chr12	10860794	.	GGGAAA	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,4:1,1
-chr12	11301199	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.21758;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,1:14,3
-chr12	12433348	.	A	AAT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.015123;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,12:8,9:4,3
-chr12	14586637	.	CAT	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.095143;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:19,2:16,2
-chr12	14684586	.	TTCCTTCC	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0011312;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,7:0,3:2,4
-chr12	16157109	.	CTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021442;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:12,3:8,3
-chr12	16523882	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.00035725;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:22,7:25,5
-chr12	17001438	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=1.2854e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,16:12,3:21,13
-chr12	17429190	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0037716;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:21,5:23,4
-chr12	17437782	.	A	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:10,4:4,3:6,1
-chr12	17535764	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0075589;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:17,3:19,5
-chr12	18650700	.	GTGTGTATATATCTATATATATATATATATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,6:2,3
-chr12	20195673	.	A	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00062967;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:49,15:25,6:24,9
-chr12	20386122	.	AAT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020906;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:13,2:10,6
-chr12	21579349	.	CTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018977;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,12:7,9:6,3
-chr12	22651683	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.12521;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:26,8:17,6:9,2
-chr12	22655358	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0019815;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,17:13,10:12,7
-chr12	23184603	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:6,3:3,1
-chr12	24965737	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00021938;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:17,9:17,3
-chr12	26182586	.	T	TC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:3,1:7,3
-chr12	29076043	.	GAA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,4:3,1
-chr12	29588287	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.0013642;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:26,2:20,8
-chr12	30698745	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,3:0,1:2,2
-chr12	31256208	.	CTTTCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,2:0,0:4,2
-chr12	31600148	.	TAA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,6:5,3:6,3
-chr12	32118087	.	A	AT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10903;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,2:18,2
-chr12	34396603	.	G	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.00018046;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,12:24,4:22,8
-chr12	34809155	.	C	T	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.048332;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:58,15:26,7:32,8
-chr12	34897693	.	C	A	0	PASS	DP=412;GPV=1;SPV=0.044198;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:247:213,34:190,29:23,5
-chr12	34900136	.	G	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.028877;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:52,16:16,9:36,7
-chr12	34907389	.	C	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,1:5,3
-chr12	35119500	.	G	C	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.047506;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:63,18:38,14:25,4
-chr12	35131522	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.3107;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:0,0:27,4
-chr12	35346166	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr12	35410170	.	C	A	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.019872;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:64,17:19,5:45,12
-chr12	35536409	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.029251;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:14,4:18,5
-chr12	35732599	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.33518;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:23,4:0,0
-chr12	36077545	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0048798;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:1,1:20,10
-chr12	36081326	.	G	A	0	PASS	DP=494;GPV=1;SPV=0.037777;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:289:249,40:112,13:137,27
-chr12	36345295	.	G	A	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.026669;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:141,20:48,9:93,11
-chr12	36354434	.	A	T	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.021426;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:111,23:56,15:55,8
-chr12	36440145	.	G	C	0	PASS	DP=284;GPV=1;SPV=0.028831;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:141,19:72,10:69,9
-chr12	36512617	.	G	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.018096;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:61,11:57,3:4,8
-chr12	36687647	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14912;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:14,1:18,3
-chr12	36941561	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr12	37065138	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr12	37109804	.	AC	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.09755;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:24,1:9,3
-chr12	37109806	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.10242;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:25,1:9,3
-chr12	37235869	.	C	T	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.024763;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:76,12:21,3:55,9
-chr12	37239433	.	A	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.040852;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:20,4:13,3
-chr12	37239914	.	T	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.024972;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:25,3:16,2
-chr12	37570739	.	T	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0060738;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:19,4:19,3
-chr12	39534883	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.022431;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,8:16,5:6,3
-chr12	39653558	.	T	TTC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.030984;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,5:11,3:7,2
-chr12	41270326	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.071318;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:20,4:11,2:9,2
-chr12	41713007	.	CTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
-chr12	41744307	.	T	TTTTTC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.027873;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,10:12,4:9,6
-chr12	41950085	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
-chr12	42485239	.	GTTTTTT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,5:12,4:5,1
-chr12	45376368	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.024372;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:12,4:19,10
-chr12	46874014	.	TTC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.014083;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:8,5:11,3
-chr12	48055293	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00012694;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:18,8:16,6
-chr12	48271915	.	C	CTTT	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.046436;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,6:24,5:7,1
-chr12	48879131	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0070569;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:19,4:14,3
-chr12	49313495	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0074524;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,13:8,9:4,4
-chr12	49385862	.	TG	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.030617;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:21,5:20,2
-chr12	49548096	.	G	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.029376;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:29,10:12,3:17,7
-chr12	51721081	.	T	TTATATA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,4:11,1:11,3
-chr12	52374729	.	A	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00024819;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:20,4:15,7
-chr12	52423554	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=4.8427e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:43,17:23,9:20,8
-chr12	52943056	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=2.468e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:18,7:18,7
-chr12	55098653	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.034248;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,3:10,2
-chr12	55928676	.	CAAA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.027524;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,7:6,1
-chr12	56690308	.	T	TAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.045694;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,6:7,5:6,1
-chr12	57970676	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:7,2:17,2
-chr12	60537210	.	A	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00030968;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:17,5:15,6
-chr12	61400232	.	ATTTAAGAATATTTAAATAAAGAATTAGTATATTC	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0062315;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:20,5:18,7
-chr12	61461169	.	GA	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0051771;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:22,3:23,5
-chr12	63011208	.	A	C	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.00026049;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:50,14:32,8:18,6
-chr12	63839163	.	A	AAAAC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.032183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:9,5:14,3
-chr12	66390272	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0024615;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:15,7:27,3
-chr12	67184674	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,4:5,4
-chr12	69200826	.	TGAGG	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:16,3:3,1
-chr12	69299620	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,3:3,3
-chr12	69357532	.	C	CTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:11,2:12,2
-chr12	69840286	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.00010162;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:49,15:25,9:24,6
-chr12	69960686	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0082862;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:11,6:7,6
-chr12	70596519	.	T	TA	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.025619;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:26,1:24,5
-chr12	71901930	.	T	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00015233;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:23,10:17,5
-chr12	72551787	.	A	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=8.2952e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:15,8:17,5
-chr12	75429935	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.016397;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:11,4:11,5
-chr12	75669850	.	ATTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,4:1,1:2,3
-chr12	76019229	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0094835;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,9:7,6:6,3
-chr12	78274684	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:9,5:7,1
-chr12	79179243	.	G	GAT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.023972;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:10,1:10,8
-chr12	79632300	.	TATATATACATAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.015215;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:11,7:2,1
-chr12	79632312	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13725;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,2:4,1:1,1
-chr12	80431621	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0017568;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,13:11,9:1,4
-chr12	80552643	.	AATTATATAT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:3,1:1,3
-chr12	82227812	.	A	AATGTTTATT	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.020631;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:19,5:27,2
-chr12	82227814	.	A	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.023704;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:21,5:26,2
-chr12	82227815	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.037567;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:20,4:26,2
-chr12	84155582	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.00068089;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:53,13:24,9:29,4
-chr12	85993908	.	C	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.016475;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:66,9:38,7:28,2
-chr12	86595999	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00082226;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:18,8:22,5
-chr12	86612739	.	CA	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00042315;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:12,5:8,4
-chr12	87202646	.	A	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00049606;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:22,4:10,5
-chr12	87747203	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.010857;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:11,2:13,11
-chr12	88522481	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=3.2868e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:36,16:12,8:24,8
-chr12	90093214	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,3:8,1
-chr12	90866407	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.24135;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:20,3:8,1
-chr12	93401164	.	A	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.037663;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:52,8:16,1:36,7
-chr12	93614404	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.012068;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:2,1:13,5
-chr12	96220382	.	A	AT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0062647;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,12:20,9:8,3
-chr12	96291628	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,8:5,7:4,1
-chr12	96909176	.	C	CA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0082862;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,12:12,9:6,3
-chr12	101437951	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0048847;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:28,3:13,6
-chr12	101810432	.	T	TAC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:10,3:2,1
-chr12	102829664	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0032271;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,5:9,5
-chr12	102831578	.	T	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.044568;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:28,1:23,5
-chr12	103039964	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0098054;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:25,4:17,3
-chr12	103224524	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.030671;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:44,8:22,1:22,7
-chr12	103259056	.	T	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=6.1657e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:49,19:18,10:31,9
-chr12	103831770	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0047817;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,6:7,3
-chr12	104323684	.	A	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.022711;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:19,3:10,7
-chr12	105036516	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:4,1:1,1
-chr12	105598715	.	A	ATGTGTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02761;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,11:15,8:8,3
-chr12	106109555	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.021089;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,11:13,9:2,2
-chr12	106115736	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=9.0588e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:20,7:21,6
-chr12	107069643	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0070569;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:22,3:11,4
-chr12	112655563	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:4,4:6,1
-chr12	113432209	.	CTTCTTTCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,5:3,1:14,4
-chr12	113642131	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,10:3,1:6,9
-chr12	113941612	.	A	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.031957;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:32,10:20,4:12,6
-chr12	114207721	.	A	ATT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.045384;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,10:15,6:11,4
-chr12	114912242	.	C	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.0073381;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:49,12:28,4:21,8
-chr12	115083989	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00025208;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:27,9:19,5
-chr12	115909594	.	A	G	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=1.0227e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:41,22:22,10:19,12
-chr12	116385440	.	C	CTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:7,5:6,1
-chr12	117285531	.	GA	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.076397;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:26,3:7,1
-chr12	117321992	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
-chr12	118003891	.	C	CA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.019651;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,6:17,5:12,1
-chr12	118709094	.	T	TTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0046784;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,10:1,4:5,6
-chr12	118757668	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:5,2:6,5
-chr12	119075452	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,3:11,1
-chr12	119377254	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0087645;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:13,10:3,1
-chr12	120441974	.	ATTAT	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
-chr12	122156931	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00047755;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:14,7:16,7
-chr12	122696119	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
-chr12	125390634	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00089506;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:27,6:12,6
-chr12	126225669	.	CT	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0086452;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,9:11,4:15,5
-chr12	126697301	.	G	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0023465;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:28,5:14,4
-chr12	127103899	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:6,4:4,1
-chr12	127341272	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.14279;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,5:10,4:6,1
-chr12	127480647	.	C	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,4:4,2
-chr12	127747591	.	T	TTTCC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.043618;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,7:7,3:9,4
-chr12	128016648	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.50909;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:6,2:4,1:2,1
-chr12	128701903	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.054119;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:21,2:11,2
-chr12	129043525	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0012547;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:19,4:17,5
-chr12	130533037	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.018505;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:14,4:8,2
-chr12	131539486	.	ATGGTGATGG	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.031797;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:13,6:12,2
-chr12	132165171	.	TATA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0054438;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,2:7,6
-chr12	132463893	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,4:8,1:8,3
-chr12	132758936	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.037005;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:11,4:7,4
-chr13	18318089	.	TTTTA	T	0	PASS	DP=252;GPV=1;SPV=0.049683;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:84,11:40,8:44,3
-chr13	21393699	.	CAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,4:1,0
-chr13	21853434	.	T	TA	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.010252;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:44,10:26,2:18,8
-chr13	22379938	.	C	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=5.5065e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:22,3:21,11
-chr13	22701443	.	GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042547;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:8,3:5,2
-chr13	23059875	.	TTC	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.010151;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:4,1:15,4
-chr13	23101730	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11553;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:19,2:4,3
-chr13	23318367	.	G	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00018163;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:19,6:21,9
-chr13	24406427	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.12939;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,2:15,2
-chr13	24584653	.	T	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00014015;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:41,17:22,7:19,10
-chr13	24587447	.	T	C	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.049596;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:85,19:24,10:61,9
-chr13	24764890	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:40:1,6:1,4:0,2
-chr13	24961756	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.030258;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:11,9:15,1
-chr13	25399397	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:2,5:2,1
-chr13	25888068	.	A	ACCCC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:1,0:10,4
-chr13	25953522	.	T	TA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064424;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,5:21,4:13,1
-chr13	26982961	.	A	AAAG	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,4:20,1:7,3
-chr13	27466530	.	T	C	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.00043273;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:46,13:26,6:20,7
-chr13	28059974	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:4,3:2,1:2,2
-chr13	28099048	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00091067;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:24,5:16,5
-chr13	29566785	.	T	C	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.00076988;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:26,7:20,2
-chr13	31999431	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.047124;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,1:15,3
-chr13	33178023	.	G	GA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0085139;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:2,5:3,1
-chr13	34013843	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0084455;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:16,4:22,3
-chr13	34136234	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0033188;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:44,10:15,5:29,5
-chr13	34362913	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:3,5:6,1
-chr13	35809161	.	A	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0005101;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:45,13:22,6:23,7
-chr13	38207779	.	GAGAGA	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.092709;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:20,2:12,2
-chr13	38988367	.	T	TAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10735;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:14,2:13,1
-chr13	39566731	.	T	TAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:11,3:3,1
-chr13	42836567	.	ATATATATAT	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.011905;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,6:0,1:0,5
-chr13	43100205	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:9,2:2,3
-chr13	45019034	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.060034;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,2:16,2
-chr13	46625631	.	G	GT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.029113;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:7,6:11,4
-chr13	47144838	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=8.3622e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:19,8:25,7
-chr13	48174576	.	A	AT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0081878;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,8:10,7:16,1
-chr13	49378723	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,3:9,1
-chr13	49775153	.	ACT	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.017354;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:9,8:15,6
-chr13	51604796	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00039728;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:23,9:16,6
-chr13	52078073	.	C	CA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.080505;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:19,2:15,2
-chr13	54177183	.	T	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=1.9766e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:14,9:25,5
-chr13	54874289	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.019164;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:55,8:31,4:24,4
-chr13	55556250	.	C	CTT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.026086;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,14:7,4:15,10
-chr13	55614797	.	A	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0254;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:24,3:17,4
-chr13	56654601	.	C	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=5.6815e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:39,17:22,6:17,11
-chr13	56804533	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0011362;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:26,8:14,2
-chr13	57884182	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.0096294;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:25,2:21,5
-chr13	58781479	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.020516;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:24,11:18,2:6,9
-chr13	58866893	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,1:17,3
-chr13	59749444	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.01483;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:23,3:6,3
-chr13	63260054	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.010704;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:10,7:6,2:4,5
-chr13	63429909	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.04872;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:25,2:13,3
-chr13	63864907	.	C	CTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1852;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,5:7,2:15,3
-chr13	64509325	.	C	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00023731;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:19,6:14,4
-chr13	67019188	.	C	CTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046683;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,5:9,3:7,2
-chr13	67174318	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.041983;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:12,4:17,2
-chr13	68412521	.	A	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=1.9489e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:44,17:27,9:17,8
-chr13	70292136	.	C	CAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,9:8,8:6,1
-chr13	70382679	.	G	GATATATAT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022595;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:4,2:5,4
-chr13	71118149	.	G	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.052643;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:12,2:2,4
-chr13	71700588	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,3:1,1:3,2
-chr13	72949960	.	A	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00025924;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:45,14:28,9:17,5
-chr13	74429226	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2122;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:7,2:18,2
-chr13	75771542	.	T	TTTTAA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.05421;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:18,2:22,3
-chr13	75771545	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.061918;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,5:13,2:23,3
-chr13	75940903	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:5,5:3,1
-chr13	76835153	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:26,4:9,2:17,2
-chr13	76835645	.	G	GAA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.18687;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:31,3:3,1
-chr13	76964894	.	G	GTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.092279;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,5:13,4:7,1
-chr13	77748398	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:9,5:1,2
-chr13	78078379	.	T	TAC	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=7.4607e-06;SS=2;SSC=51;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:11,8:14,7
-chr13	79116653	.	TAC	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.049204;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:19,4:18,7
-chr13	80627712	.	TTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,4:6,1
-chr13	80848572	.	A	ATTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0094722;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,8:4,2:22,6
-chr13	81849772	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0078067;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,10:9,7:7,3
-chr13	82981586	.	TAGATA	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.019438;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:14,4:12,5
-chr13	83763729	.	G	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00099218;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:27,6:18,6
-chr13	84580274	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00025429;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:15,5:22,7
-chr13	85395893	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.091614;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,3:12,1
-chr13	87074528	.	T	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0064982;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:17,6:15,4
-chr13	89441315	.	T	TAGATAGATAGAC	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.044315;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,7:14,2:15,5
-chr13	89463802	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.034805;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:12,4:15,4
-chr13	91073961	.	C	CTG	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.020856;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:21,9:15,5
-chr13	91093399	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020447;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:10,8:5,4
-chr13	91432209	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:13,10:8,5:5,5
-chr13	93649934	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=3.0999e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:41,19:17,9:24,10
-chr13	95126885	.	A	ATATATT	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.013635;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,11:24,5:12,6
-chr13	96348818	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00037553;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:14,5:25,6
-chr13	96589619	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00069515;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,15:25,9:17,6
-chr13	96754757	.	T	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.017808;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:18,2:17,3
-chr13	96943450	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0219;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
-chr13	97105084	.	TA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,3:1,2
-chr13	98391600	.	T	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0012787;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:17,4:22,6
-chr13	100232351	.	C	CGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.12943;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:21,3:11,1
-chr13	100232357	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.029506;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:16,5:19,4
-chr13	101332397	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:11,5:1,3
-chr13	102974309	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.021263;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,6:17,1:24,5
-chr13	103047630	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.003331;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:12,5:19,6
-chr13	105065149	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.028679;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:14,4:13,5
-chr13	105467729	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0027647;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,15:12,12:6,3
-chr13	106216651	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.045253;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:19,7:4,1
-chr13	106867015	.	CAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.077519;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,2:11,2
-chr13	107565384	.	C	CAAA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.01458;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:12,10:5,7:7,3
-chr13	107668673	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0059563;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:20,3:15,4
-chr13	108046191	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=2.9162e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:17,9:16,4
-chr13	108543460	.	C	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0050209;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:22,5:13,2
-chr13	108761545	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=1.7586e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:30,19:17,13:13,6
-chr13	109336084	.	G	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00019321;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:20,6:17,6
-chr13	110219664	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.034636;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,5:11,1:9,4
-chr13	110506255	.	CCA	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.056634;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:21,2:16,3
-chr13	111281181	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:6,3:4,3
-chr13	111859149	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,4:6,1:10,3
-chr13	112383157	.	G	GA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:15,2:4,2
-chr13	112863429	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:7,2:12,2
-chr13	112961104	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.021818;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:34,12:11,6:23,6
-chr13	113055459	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,4:3,2
-chr14	18270100	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.040969;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:16,2:19,6
-chr14	18379672	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.021229;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:22,8:0,1
-chr14	18520206	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr14	18938656	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:0,0:19,4
-chr14	18952842	.	C	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.047824;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:44,10:23,9:21,1
-chr14	18999953	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,2:7,2
-chr14	19013983	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:6,4:1,2
-chr14	19014505	.	G	C	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.036063;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:51,7:37,5:14,2
-chr14	19014583	.	A	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.04103;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:25,5:12,7
-chr14	19212342	.	G	C	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.036428;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:77,19:33,13:44,6
-chr14	19237864	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.20218;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,3:13,1
-chr14	19276115	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
-chr14	19289034	.	T	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.012161;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:54,19:17,5:37,14
-chr14	19291750	.	C	T	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.0064441;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:72,22:41,16:31,6
-chr14	19293378	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:7,3:1,3
-chr14	19318253	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.030482;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,15:19,4:23,11
-chr14	19335869	.	T	TG	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023594;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:2,4:23,7
-chr14	19351441	.	C	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.0042191;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:67,17:29,10:38,7
-chr14	19377333	.	T	TA	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.01768;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:118,14:69,2:49,12
-chr14	19377338	.	C	T	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.012506;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:111,15:63,2:48,13
-chr14	19449258	.	G	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.064826;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:0,0:23,4
-chr14	19488364	.	G	A	0	PASS	DP=287;GPV=1;SPV=0.03486;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:141,25:74,16:67,9
-chr14	19506468	.	C	CTTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:11,3:9,1
-chr14	19507331	.	C	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0067016;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:6,6:31,2
-chr14	19642736	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.04729;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:12,3:24,8
-chr14	19645109	.	TA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.24396;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:13,3:20,1
-chr14	19685723	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:25,4:0,0
-chr14	19686710	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:16,2:2,2
-chr14	19891409	.	T	TTTC	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.049892;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,5:27,3:9,2
-chr14	19900360	.	C	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=1.3363e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:85,22:39,9:46,13
-chr14	20179034	.	CGT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1713;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,3:14,1
-chr14	23002451	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.016015;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,13:18,10:2,3
-chr14	23234622	.	T	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.00010394;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:42,13:22,7:20,6
-chr14	25124162	.	C	CAA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0096904;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,9:18,8:4,1
-chr14	25745394	.	A	AG	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0029353;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:17,3:22,6
-chr14	26345632	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00018429;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:15,6:20,4
-chr14	26732225	.	T	TTTC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.010741;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,7:4,2:13,5
-chr14	27841292	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:6,2:4,1:2,1
-chr14	27873697	.	G	GT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.04422;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,7:9,6:5,1
-chr14	30724072	.	T	TA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.039561;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:13,3:8,7
-chr14	33517594	.	T	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0007833;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:23,4:21,8
-chr14	34159596	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0036508;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,6:1,2:0,4
-chr14	34709787	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.028662;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,10:15,8:4,2
-chr14	34735162	.	C	CACAG	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.047026;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:19,1:16,3
-chr14	36468370	.	A	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0010064;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:21,6:19,5
-chr14	37186587	.	TA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,8:6,7:3,1
-chr14	37348983	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013587;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,8:12,6:2,2
-chr14	37351986	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0069797;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,16:2,4:10,12
-chr14	38100237	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:13,1:8,3
-chr14	38603160	.	A	AAGAGAG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16749;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,3:11,2:3,1
-chr14	40192069	.	C	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00067686;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:21,4:20,10
-chr14	45045543	.	GTATATATATATATA	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.027862;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,2:10,3
-chr14	45045559	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.027541;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,2:9,3
-chr14	45306696	.	C	G	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=4.8407e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:48,20:28,14:20,6
-chr14	46149252	.	G	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.023395;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:54,8:24,3:30,5
-chr14	50016709	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,7:2,1
-chr14	52197581	.	A	C	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.00026888;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:51,13:27,9:24,4
-chr14	52402875	.	T	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00054005;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:25,6:15,5
-chr14	52697647	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,1:10,3
-chr14	54131908	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0018745;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:16,6:14,2
-chr14	54267301	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0012111;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:20,9:27,3
-chr14	55445592	.	GAAAAA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034759;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:11,3:1,1
-chr14	56596794	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,4:17,3:18,1
-chr14	56669459	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,1:11,3
-chr14	56875540	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.013266;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,5:10,4:6,1
-chr14	56922104	.	CACATAT	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.046164;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:15,3:11,5
-chr14	57880034	.	GAGGAAGGAAGGAAGGA	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.032;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,7:11,6:6,1
-chr14	60741658	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0089005;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,8:11,5:12,3
-chr14	60898142	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.044529;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:21,8:6,1:15,7
-chr14	61002392	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=4.8132e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:38,19:14,9:24,10
-chr14	63003516	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11664;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:7,1:18,4
-chr14	63126362	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.4158e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:16,8:10,5
-chr14	63959287	.	CTTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.24868;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,4:12,1
-chr14	64253610	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.005945;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:5,4:15,1
-chr14	64380668	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.011899;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,6:3,3
-chr14	64869619	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.024141;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:19,3:9,5
-chr14	66921444	.	G	GT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00091899;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,11:16,8:12,3
-chr14	67466994	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,7:5,6:0,1
-chr14	67643852	.	TAA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01393;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,7:8,4:6,3
-chr14	69397452	.	G	GAAA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.022951;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:18,7:7,5
-chr14	69842784	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.093588;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,4:18,3:8,1
-chr14	70654587	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,7:4,2
-chr14	73440263	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.041596;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,1:16,3
-chr14	73689026	.	GTT	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.026706;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,9:13,5:4,4
-chr14	73772839	.	TG	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.034091;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,11:10,6:13,5
-chr14	74092315	.	GT	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:18,4:11,2:7,2
-chr14	74320563	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,3:7,2
-chr14	74340528	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.00016256;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:19,6:18,4
-chr14	76503172	.	TC	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:20,2:8,2
-chr14	77513016	.	C	CTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,4:3,2:12,2
-chr14	77905633	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0001383;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:16,11:15,2
-chr14	79790615	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.14936;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:18,4:5,1
-chr14	80184516	.	TA	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0012479;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:19,5:10,8
-chr14	81303059	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.033219;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,11:20,8:13,3
-chr14	81966199	.	CA	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0084152;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,9:19,7:9,2
-chr14	82862874	.	ATTTTTTT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.046549;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,6:12,4:3,2
-chr14	83590209	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.030468;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:16,8:14,2
-chr14	85917277	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.040784;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:13,3:16,6
-chr14	86279901	.	C	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=1.2862e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:17,8:14,5
-chr14	86287051	.	AGGAAG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034547;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:6,5:8,2
-chr14	89613116	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.011012;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,7:6,5:2,2
-chr14	91108526	.	T	TGTGAGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,5:1,2:3,3
-chr14	92448345	.	T	TACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.089356;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,7:12,6:6,1
-chr14	92911791	.	G	C	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.02785;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:57,8:37,2:20,6
-chr14	94088499	.	C	CTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.024419;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,7:8,3
-chr14	94815455	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=1.056e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:43,20:29,8:14,12
-chr14	96340130	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,4:5,3:10,1
-chr14	96340131	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,4:4,3:9,1
-chr14	96621139	.	TC	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0057212;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:20,2:12,6
-chr14	97376058	.	G	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0021438;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:18,6:20,3
-chr14	98401101	.	G	GAGAAAGAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:3,3:2,1
-chr14	99903784	.	C	CTT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.01976;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:15,10:9,3
-chr14	99959377	.	CCT	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.01339;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,8:16,2:16,6
-chr14	99959385	.	C	CT	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.023261;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,6:23,2:16,4
-chr14	101089548	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.040631;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:32,6:21,1:11,5
-chr14	101607561	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.21337;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:2,0:21,4
-chr14	103908165	.	C	CAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.021719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,13:13,9:4,4
-chr14	104225631	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.047547;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,7:13,3:19,4
-chr14	105594814	.	T	C	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.029663;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:59,17:43,13:16,4
-chr14	105665211	.	GTT	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:6,6:0,1
-chr14	105759956	.	CT	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.0052291;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:18,3:21,7
-chr15	17063205	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0068563;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:16,3:17,6
-chr15	19872473	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:5,5:4,1
-chr15	20001506	.	TAGAG	T	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.036939;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:71,12:52,7:19,5
-chr15	20053156	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.024972;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:22,5:4,1
-chr15	20104346	.	A	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
-chr15	20332701	.	TAC	T	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.009197;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:58,17:26,15:32,2
-chr15	20332717	.	C	G	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.032853;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:80,16:35,14:45,2
-chr15	20427539	.	T	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.059617;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:13,4:21,1
-chr15	20457729	.	A	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.048603;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:53,6:25,2:28,4
-chr15	20537493	.	C	A	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.0067746;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:58,13:37,7:21,6
-chr15	20573432	.	G	GT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.26796;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:0,0:36,4
-chr15	20640595	.	G	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.023456;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:20,2:26,8
-chr15	20651177	.	G	T	0	PASS	DP=317;GPV=1;SPV=0.0032421;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:170:134,36:63,17:71,19
-chr15	20737194	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:3,6:6,2
-chr15	20957725	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.067259;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:10,3:15,2
-chr15	21053699	.	G	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.0058709;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:57,13:43,8:14,5
-chr15	21135521	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
-chr15	21253620	.	A	G	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.033925;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:112,15:71,2:41,13
-chr15	21346492	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.0065235;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:69,17:18,3:51,14
-chr15	21549180	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,2:8,2
-chr15	21554146	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:6,1:11,4
-chr15	21554908	.	TGAAG	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.076205;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:16,3:7,1
-chr15	22440026	.	C	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0068284;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:49,7:21,3:28,4
-chr15	23041097	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.20486;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:12,2:9,1
-chr15	23195795	.	A	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.028972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:66,16:46,6:20,10
-chr15	23363256	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.024221;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:17,5:11,1
-chr15	24262448	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.015035;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,5:4,2
-chr15	24353047	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.014016;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:15,1:24,5
-chr15	24395903	.	C	CATATATATACAT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:7,3:3,1
-chr15	25170183	.	T	G	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00011182;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:13,6:30,8
-chr15	25786617	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:8,3:5,3
-chr15	25845332	.	G	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.042088;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:20,3:19,5
-chr15	25854517	.	G	C	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00020622;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:23,9:18,4
-chr15	26142377	.	T	TTC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.049645;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,4:3,2:16,2
-chr15	27257538	.	T	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00038112;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,12:14,8:10,4
-chr15	28151020	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00012153;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:40,17:19,7:21,10
-chr15	28378480	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
-chr15	28453922	.	G	C	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.0010594;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:43,19:23,7:20,12
-chr15	29534106	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0055231;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,3:2,3
-chr15	30344256	.	T	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.027562;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:47,11:26,4:21,7
-chr15	31921025	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=7.9372e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:20,5:21,8
-chr15	32234382	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12114;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:22,4:0,0
-chr15	32306060	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033079;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:16,6:14,2
-chr15	32329566	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0086319;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:17,3:8,11
-chr15	32813042	.	T	C	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0097526;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:29,3:30,6
-chr15	33419056	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.033251;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:20,2:16,3
-chr15	34062554	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0063215;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,7:10,1:5,6
-chr15	34310771	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:4,2:3,1:1,1
-chr15	35074963	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00081325;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:22,6:17,4
-chr15	35733612	.	T	C	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=7.5848e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:24,8:17,4
-chr15	35971475	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.036822;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:8,4:24,2
-chr15	36991779	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,3:6,4
-chr15	38681355	.	C	CTCT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0065499;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,12:8,3:15,9
-chr15	38846873	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,3:4,1
-chr15	38903984	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029588;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,11:7,9:5,2
-chr15	38965037	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:4,3:3,1:1,2
-chr15	38989442	.	CCTATGCTATGCTATGCTATGCTATGCTATGCTATGCTATG	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.027296;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,6:9,1
-chr15	43697631	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00089389;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:28,7:16,5
-chr15	43964997	.	A	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.0017697;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:21,5:24,4
-chr15	44824992	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0001703;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:24,5:14,7
-chr15	44875797	.	C	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=1.4002e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:44,27:22,16:22,11
-chr15	45798088	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0033421;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:9,10:6,4
-chr15	46169548	.	A	ATT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.036581;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,11:17,9:5,2
-chr15	46954340	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0049996;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:27,4:18,5
-chr15	47384814	.	GTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,3:4,1
-chr15	47657719	.	CTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,3:6,1
-chr15	50393532	.	A	ATATATATGTG	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:3,2:1,1:2,1
-chr15	50585050	.	A	ATT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.025116;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,11:9,9:8,2
-chr15	50629859	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0048312;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:5,5:5,4
-chr15	50644797	.	C	CA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.069354;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,5:16,4:8,1
-chr15	51194251	.	CTT	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.049052;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:8,3:20,5
-chr15	51353714	.	TA	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.15343;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:24,3:12,1
-chr15	53495192	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,1:3,3
-chr15	54249209	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0059483;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:20,6:18,5
-chr15	54687307	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:33:0,5:0,3:0,2
-chr15	55210213	.	A	ATG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0019705;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,12:12,9:8,3
-chr15	60065017	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:5,7:4,1
-chr15	63466031	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,3:10,5
-chr15	64277781	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.038165;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:19,3:21,7
-chr15	64715925	.	TAC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.089726;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:25,4:10,3
-chr15	66551345	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0036895;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,10:7,9:4,1
-chr15	66616079	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.00015443;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:52,16:19,8:33,8
-chr15	67353366	.	T	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.007321;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,8:27,5:11,3
-chr15	68269598	.	CAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01391;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:5,6:6,1
-chr15	69534230	.	A	ATTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.01494;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,8:5,4:7,4
-chr15	72163112	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00072854;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:21,6:18,4
-chr15	72725059	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043517;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:18,2:15,4
-chr15	73238271	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,7:5,4:4,3
-chr15	73661242	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012052;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,9:8,2
-chr15	73898880	.	A	AAAAAAAAAAT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,5:3,4:0,1
-chr15	74939066	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,7:3,6:3,1
-chr15	75432685	.	C	CA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.017254;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,12:13,10:9,2
-chr15	75503490	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.050822;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:16,3:24,2
-chr15	75503628	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.10359;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,2:16,2
-chr15	75830581	.	C	CA	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=6.1657e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:49,19:23,9:26,10
-chr15	77408156	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.021295;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:24,10:10,6:14,4
-chr15	77992856	.	C	CCCACT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,2:0,0:5,2
-chr15	80089259	.	G	GTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02247;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,8:8,7:9,1
-chr15	81258773	.	C	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00081654;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:16,4:21,8
-chr15	82337538	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0096214;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:17,2:17,9
-chr15	82341038	.	G	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.024526;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:11,7:32,6
-chr15	82524026	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033483;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:12,2:2,2
-chr15	83340285	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.065677;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:18,3:26,2
-chr15	83384284	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.1625;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:10,1:19,4
-chr15	83450759	.	C	CTT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.2381;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,3:0,1:3,2
-chr15	84520959	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,1:14,3
-chr15	84700593	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.072233;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:18,4:0,0
-chr15	84777696	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0011108;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:13,8:7,3
-chr15	84796237	.	AAAATATATATATATATATATATATATATTTTATATATATAT	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.013369;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:2,5:0,1
-chr15	84885731	.	C	CAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0082261;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,6:10,5:7,1
-chr15	85245352	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020407;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:1,2:11,4
-chr15	85270641	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
-chr15	86104945	.	C	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=6.3166e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:18,11:15,3
-chr15	87417776	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.03701;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:38,13:19,8:19,5
-chr15	88540969	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.12341;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:20,1:11,3
-chr15	88552759	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,2:10,2
-chr15	88966789	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.038586;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:22,2:17,6
-chr15	90129213	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.014644;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:13,4:13,8
-chr15	90173939	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.017079;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:13,7:15,5
-chr15	90328484	.	C	CTTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0085654;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:16,8:6,3
-chr15	90331980	.	AGG	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033614;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,2:15,3
-chr15	90331984	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.024272;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:17,2:18,4
-chr15	90331991	.	AAG	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.064197;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,4:21,1:12,3
-chr15	90392748	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:11,3:4,2
-chr15	91196879	.	G	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=5.473e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:42,13:29,6:13,7
-chr15	93131667	.	T	TA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.11618;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:14,1:20,3
-chr15	94162147	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.064462;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,3:17,1
-chr15	94868218	.	C	CT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.026312;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:9,9:12,2
-chr15	95581318	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0012733;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:18,7:17,4
-chr15	95948056	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0002546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:18,8:13,4
-chr15	96357729	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.071891;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:6,2:30,3
-chr15	96470894	.	C	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.006601;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:54,9:29,5:25,4
-chr15	96707509	.	G	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0027396;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:48,9:23,4:25,5
-chr15	100377498	.	AT	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.033697;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:18,5:15,2
-chr15	101920402	.	G	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.0086553;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:44,17:24,6:20,11
-chr15	101928520	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.034006;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:21,4:25,7
-chr16	579814	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.041011;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:14,1:4,3
-chr16	1011197	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,2:2,1:4,1
-chr16	1466923	.	CAA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.011302;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,9:13,8:7,1
-chr16	1593399	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0016018;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:16,8:27,4
-chr16	2343751	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.1436;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:16,2:19,3
-chr16	2441937	.	T	TTATA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:4,5:1,1
-chr16	3657602	.	T	C	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=6.3106e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:52,16:33,9:19,7
-chr16	4621368	.	A	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.049419;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:28,4:13,2
-chr16	5183258	.	C	T	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=8.6019e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:58,15:28,8:30,7
-chr16	5827911	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.018191;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:4,1:21,5
-chr16	5895759	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=9.8817e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:12,10:20,3
-chr16	6170796	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00014469;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:14,6:11,6
-chr16	6442611	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00025381;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:24,10:19,2
-chr16	6487690	.	AAAAAAAAAAAATATATAT	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,2:4,1:0,1
-chr16	6694859	.	A	G	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=3.4067e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:41,15:14,5:27,10
-chr16	6955677	.	TTAGGTATGTATG	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.11312;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:30,5:12,1:18,4
-chr16	7165410	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,2:11,2
-chr16	7810991	.	T	TATGTGTGTGG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047515;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:13,6:7,4
-chr16	8382337	.	G	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0073566;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:19,4:17,2
-chr16	8660816	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:8,5:0,2
-chr16	8999575	.	CTTAT	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0060651;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:35,17:17,9:18,8
-chr16	9292581	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.049919;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:14,3:29,3
-chr16	9437492	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00071257;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:18,5:18,5
-chr16	9597697	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,6:4,1
-chr16	9970635	.	T	TA	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0051091;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:48,12:24,7:24,5
-chr16	10268417	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,3:10,1
-chr16	10568780	.	C	CTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.017079;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:6,5:2,1
-chr16	12243985	.	G	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00014785;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:46,15:30,8:16,7
-chr16	13216133	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00026114;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:19,8:16,5
-chr16	13746557	.	CT	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00025924;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:45,14:24,9:21,5
-chr16	14785942	.	T	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.04208;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:18,2:22,3
-chr16	15308471	.	G	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.036166;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:13,5:12,1
-chr16	16470372	.	T	TCTTCCTTCCTTC	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.013337;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:46,14:11,2:35,12
-chr16	16701811	.	C	CT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.034293;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:19,1:16,5
-chr16	16717740	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.057792;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
-chr16	16959714	.	TTTTTTTTAATTTAAAAAAAC	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.018681;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:7,5:15,4
-chr16	17603381	.	AT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014137;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:10,3:5,3
-chr16	18151399	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.041183;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,8:11,6:9,2
-chr16	18238291	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.030078;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:25,8:12,4
-chr16	18246717	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:1,1:7,4
-chr16	21026700	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011322;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,9:9,8:8,1
-chr16	21155621	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0029033;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,10:5,8:5,2
-chr16	21177619	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.008557;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:12,11:2,1
-chr16	21613168	.	CTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00028986;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,14:2,11:3,3
-chr16	22173903	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:7,1:16,3
-chr16	22627936	.	CAA	C	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.043079;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:45,12:29,6:16,6
-chr16	23207170	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=3.4959e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:38,17:23,13:15,4
-chr16	23374573	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.043779;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,5:4,2
-chr16	23902732	.	C	CCCTCCCTCCCTCCCTCCCTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:0,0:10,4
-chr16	24432837	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.029998;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:20,3:9,5
-chr16	24579241	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.015771;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:13,9:5,2
-chr16	24588697	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,4:13,1:3,3
-chr16	24627697	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.02835;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:5,6:9,3
-chr16	25059861	.	C	CT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.01597;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:9,5:8,6
-chr16	26177870	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.038233;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:6,5:6,2
-chr16	26766064	.	AGAT	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.023442;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:23,3:11,3
-chr16	26770730	.	T	TTAGA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.01641;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:19,3:3,3
-chr16	26958789	.	ATATATTTT	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:13,11:8,4:5,7
-chr16	27265161	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.062937;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:2,2:2,3
-chr16	28464022	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.10662;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:29,2:7,3
-chr16	28662310	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.048554;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:7,2:14,4
-chr16	28810791	.	T	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.025834;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:57,15:16,10:41,5
-chr16	29504437	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.041011;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,3:9,1
-chr16	29504509	.	AAT	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.025941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,7:15,1:17,6
-chr16	30499712	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:6,5:7,1
-chr16	30499730	.	TA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,2:8,2
-chr16	31104840	.	G	A	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.019899;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:79,15:38,11:41,4
-chr16	31220456	.	G	GT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:3,3:6,1
-chr16	31989663	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.028667;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:13,1:17,5
-chr16	32083617	.	C	A	0	PASS	DP=233;GPV=1;SPV=0.040993;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:110,19:43,3:67,16
-chr16	32143910	.	A	G	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.0078097;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:92,19:48,17:44,2
-chr16	32288934	.	A	C	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.013189;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:68,8:36,6:32,2
-chr16	32300620	.	T	TTAAAA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.048123;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,6:20,5:10,1
-chr16	32383739	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.04495;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:54,8:29,3:25,5
-chr16	32441647	.	C	A	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.020195;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:88,19:45,4:43,15
-chr16	32441648	.	CTT	C	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.045156;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:87,16:42,3:45,13
-chr16	32545620	.	T	TAA	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.023547;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:64,22:31,18:33,4
-chr16	32802161	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
-chr16	32812264	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.018772;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:31,5:23,1
-chr16	32862141	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.069027;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:16,3:15,2
-chr16	32982841	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:14,4:1,1
-chr16	33018909	.	G	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.039534;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:20,10:23,4
-chr16	33057658	.	T	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.039144;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:15,1:36,5
-chr16	33777396	.	TTG	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.03143;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:42,12:14,9:28,3
-chr16	34258608	.	A	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0016161;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:24,7:15,3
-chr16	35857796	.	A	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=4.8866e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:11,5:25,8
-chr16	35905106	.	A	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00014322;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:17,3:12,8
-chr16	37737580	.	G	A	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.020107;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:60,14:11,4:49,10
-chr16	46386931	.	T	C	0	PASS	DP=13529;GPV=1;SPV=0.014552;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7486:6666,807:4068,379:2598,428
-chr16	46391132	.	T	C	0	PASS	DP=15299;GPV=1;SPV=0.0021004;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7644:6746,838:2104,221:4642,617
-chr16	46446274	.	T	G	0	PASS	DP=469;GPV=1;SPV=0.037765;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:261:225,36:106,15:119,21
-chr16	47074889	.	C	CA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.003791;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,9:14,8:8,1
-chr16	48482430	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.044124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:14,5:6,3
-chr16	51719029	.	CAA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.004738;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,10:7,9:9,1
-chr16	52992519	.	AAG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.038102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,5:17,3:5,2
-chr16	53742793	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00022082;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:21,4:15,8
-chr16	55078551	.	G	GA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:42:1,3:0,0:1,3
-chr16	56277776	.	TACACACACACACACACACACAC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0019985;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:4,7:2,1
-chr16	56596519	.	AG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.11061;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:11,2:24,3
-chr16	56825205	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,3:3,1
-chr16	56930231	.	G	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.038859;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:23,5:18,2
-chr16	57006413	.	C	CTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:6,4:5,2
-chr16	57327670	.	CAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,5:3,1
-chr16	57414410	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.023692;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,11:9,8:2,3
-chr16	58675346	.	G	GA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.020195;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,10:13,9:5,1
-chr16	60011342	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.020403;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,19:15,15:6,4
-chr16	60527880	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.042807;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:13,4:14,2
-chr16	61167057	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00020665;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:17,11:19,3
-chr16	61466756	.	G	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=7.3327e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:10,6:13,7
-chr16	61634118	.	GT	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.044109;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:28,5:16,4
-chr16	61812854	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0013605;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:20,5:16,7
-chr16	62057788	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0014811;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:22,5:23,7
-chr16	62126380	.	G	GTA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.074336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,5:14,1:8,4
-chr16	62946969	.	T	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00013409;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:21,7:23,8
-chr16	63084008	.	G	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0037159;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:19,6:17,4
-chr16	63084012	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.049892;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:18,4:18,1
-chr16	63509414	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0042232;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:22,3:18,7
-chr16	64257783	.	A	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00057799;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:27,6:14,7
-chr16	64560021	.	TTC	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.060214;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:14,2:12,2
-chr16	65012026	.	A	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=1.8341e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,16:20,9:24,7
-chr16	65463338	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=5.3308e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:35,16:15,7:20,9
-chr16	65893148	.	AT	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.042684;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:12,4:17,4
-chr16	66861190	.	AAAG	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0051799;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:18,11:11,3
-chr16	68010049	.	TTTCC	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.017879;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:6,6:20,7
-chr16	68753212	.	C	CAA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.043206;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,7:11,5:6,2
-chr16	68928298	.	A	ATTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.047286;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:6,3:10,3
-chr16	68980437	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,11:5,6:4,5
-chr16	70039712	.	C	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.0007532;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:57,12:30,6:27,6
-chr16	70052158	.	C	CGG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.020186;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:16,9:4,1
-chr16	70825625	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.020691;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:12,1:11,5
-chr16	70941764	.	T	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.032479;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:19,4:24,5
-chr16	71134600	.	G	C	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.016085;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:33,1:24,6
-chr16	71148368	.	A	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.004694;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,8:29,7:20,1
-chr16	71163030	.	T	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.030587;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:58,7:30,1:28,6
-chr16	72545153	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=4.6265e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:32,20:19,12:13,8
-chr16	74082162	.	GTT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.028182;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:19,3:7,6
-chr16	74494403	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,7:3,5:2,2
-chr16	75873770	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=8.0875e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:31,22:11,8:20,14
-chr16	76098933	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14279;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,5:8,4:8,1
-chr16	76937902	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.060034;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,2:11,2
-chr16	77469657	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0019982;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:23,3:16,5
-chr16	78002391	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.057396;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,5:11,1:12,4
-chr16	79289867	.	T	TTTTTTTTTTTTTC	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.041497;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,8:9,3:6,5
-chr16	80010206	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:7,4:5,3:2,1
-chr16	80142912	.	C	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.0055347;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:29,5:14,1
-chr16	83659785	.	CT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0041408;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,12:5,7:3,5
-chr16	84697711	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:2,6:5,1
-chr16	85855426	.	CATAT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.046683;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,5:12,4:4,1
-chr16	86791022	.	C	A	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.00039387;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:56,13:28,8:28,5
-chr16	87174641	.	TTTGTTTTTTTTTTG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:4,2:4,2
-chr16	87193365	.	TAC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.025641;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,8:1,7:2,1
-chr16	87928756	.	CTTTGTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.006865;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:3,3:3,3
-chr16	88371972	.	C	CCAT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.17398;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,4:13,2:21,2
-chr16	88545320	.	G	GT	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.00024453;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:49,13:25,7:24,6
-chr16	88862588	.	C	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.039374;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:13,6:14,2
-chr16	88988070	.	C	CTT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.032244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:2,4:27,5
-chr16	89215991	.	G	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=8.7205e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:43,19:22,11:21,8
-chr16	89411921	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.024173;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:6,4:20,1
-chr16	89536520	.	C	CAGGTGAGGCAGGTG	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.053676;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,6:16,4:14,2
-chr16	89634091	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,4:0,3:3,1
-chr16	89688077	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018492;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,4:1,1
-chr16	89812652	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.037909;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:17,5:16,2
-chr17	244209	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.046149;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,7:18,4:6,3
-chr17	314822	.	T	C	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.038495;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:91,18:50,8:41,10
-chr17	402995	.	C	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:4,1:11,4
-chr17	415383	.	TTG	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.16171;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:8,3:19,1
-chr17	672169	.	A	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,1:5,3
-chr17	942611	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,2:7,2
-chr17	1256435	.	GT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:13,4:5,3
-chr17	2356376	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,2:7,2
-chr17	2730521	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.011346;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:10,9:6,1
-chr17	2772859	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.021388;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:11,3:13,4
-chr17	3320546	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.046548;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:6,4:11,1
-chr17	3635245	.	G	GGAAGGAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:16,3:0,1
-chr17	3641384	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.2381;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,3:2,2:1,1
-chr17	6941618	.	T	TCTCACTCTCA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:5,1:12,3
-chr17	7073723	.	CA	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.020195;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,10:13,8:5,2
-chr17	7274080	.	CAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031608;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,7:10,5:5,2
-chr17	7277976	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.011316;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,9:8,8:4,1
-chr17	7378264	.	AGAG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030792;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:3,4:10,1
-chr17	8363861	.	ATT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,4:3,1:14,3
-chr17	10881914	.	GACAA	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.038125;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:18,3:17,2
-chr17	11509020	.	C	CCAGCTGATTATAAAAT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.03973;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:9,5:10,2
-chr17	11707959	.	CCACACACACACACACA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.076205;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,4:16,3:7,1
-chr17	12452680	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0019875;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:10,1:12,7
-chr17	12630428	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0094429;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:16,2:18,4
-chr17	13082355	.	ATG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,3:13,1
-chr17	13687794	.	T	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0014365;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:19,4:20,6
-chr17	14186097	.	G	A	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.039231;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:51,11:27,9:24,2
-chr17	14346247	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,4:1,3:2,1
-chr17	16161240	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.082705;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:28,5:17,4:11,1
-chr17	18395786	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020274;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:1,2:16,7
-chr17	18926236	.	A	ATTAT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.009672;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:9,1:11,6
-chr17	19700763	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0071869;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:10,7:4,2
-chr17	20099511	.	C	CA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.015677;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,8:12,7:3,1
-chr17	20309815	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:5,2:7,6
-chr17	20554552	.	C	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.016944;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:48,14:26,12:22,2
-chr17	21347012	.	T	C	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.019345;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:24,6:15,1
-chr17	21429100	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.041253;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:20,3:23,2
-chr17	21618605	.	C	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.0017091;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:65,12:31,7:34,5
-chr17	21638255	.	C	CT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.052808;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:15,1:22,4
-chr17	21745153	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0079024;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:9,8:8,6
-chr17	21906166	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.13808;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:35,4:19,2:16,2
-chr17	23165463	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
-chr17	26522412	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.074026;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,2:3,2
-chr17	26578810	.	C	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.04645;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:16,4:17,4
-chr17	26601793	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:1,1:17,3
-chr17	26630320	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.10922;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:14,1:6,2
-chr17	26742711	.	A	G	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.0036329;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:80,26:33,18:47,8
-chr17	26743898	.	G	T	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.0407;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:128,27:69,17:59,10
-chr17	26955510	.	ATAT	A	0	PASS	DP=159;GPV=1;SPV=0.0079553;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:72,18:37,15:35,3
-chr17	28488776	.	C	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00010626;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:47,15:34,7:13,8
-chr17	28894616	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:6,4:8,3
-chr17	29691498	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.013018;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:40,8:21,4:19,4
-chr17	30466795	.	T	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=2.3687e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,15:13,8:19,7
-chr17	30846409	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0054479;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:12,5:9,6
-chr17	32072443	.	A	AC	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.020415;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:15,7:14,2
-chr17	32653607	.	CAA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00076786;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,18:11,13:3,5
-chr17	33436853	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17622;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,4:1,2:4,2
-chr17	35561745	.	AAAAAAAAG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,6:4,4
-chr17	37260301	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,3:3,2:1,1
-chr17	38202136	.	G	GATATATATATATAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11425;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,5:16,3:5,2
-chr17	38944848	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,8:8,7:4,1
-chr17	39170524	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023193;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:8,5:4,3
-chr17	39355855	.	C	CAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.012394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,6:13,5:4,1
-chr17	39498513	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.2992e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,17:15,9:18,8
-chr17	40679936	.	T	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=2.607e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:14,7:12,9
-chr17	41094456	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0002133;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:38,13:27,3:11,10
-chr17	41151528	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00017414;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:22,8:21,6
-chr17	41330198	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.13725;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,2:3,1:2,1
-chr17	41633660	.	GGT	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.039014;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,9:19,6:16,3
-chr17	42048377	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:5,2:3,1:2,1
-chr17	42356541	.	T	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0010854;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:21,4:22,7
-chr17	44181155	.	G	GGGT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.050247;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:21,2:8,2
-chr17	44640699	.	TA	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.30655;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:27,3:15,2:12,1
-chr17	44954088	.	C	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.00046201;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:55,12:32,8:23,4
-chr17	44985119	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.023036;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:15,2:11,8
-chr17	45603026	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.033857;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:33,6:6,6
-chr17	45791854	.	A	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.020048;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:16,5:15,3
-chr17	46125081	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,2:6,2:0,0
-chr17	46213288	.	T	TTTG	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.026147;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:65,19:40,12:25,7
-chr17	46228676	.	T	TTTG	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.0079248;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:40,16:27,11:13,5
-chr17	46232324	.	G	C	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.015123;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:52,12:27,10:25,2
-chr17	46256885	.	T	TG	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.029088;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:63,16:30,13:33,3
-chr17	46688553	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031197;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:5,4:13,4
-chr17	47000064	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.078605;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:17,3:8,3
-chr17	47724490	.	A	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0002844;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:18,5:21,8
-chr17	48224071	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:6,1:1,1
-chr17	48541816	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.013977;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:2,1:22,7
-chr17	49395490	.	T	TTTC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.03973;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:6,2:13,5
-chr17	49504773	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0029007;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,1:3,5
-chr17	51854780	.	C	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.00094598;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:28,5:25,6
-chr17	52712033	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0234;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:21,11:18,4
-chr17	52783194	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.031171;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:20,2:20,4
-chr17	53021068	.	G	GT	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.00098386;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:49,14:33,7:16,7
-chr17	53627705	.	ACAACT	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.064931;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:27,3:14,2
-chr17	53855532	.	C	CA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0040897;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:16,5:13,3
-chr17	53909895	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00047197;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:18,5:11,6
-chr17	54139013	.	ATT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022502;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:8,4:9,3
-chr17	55506816	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:3,2:3,1
-chr17	59219059	.	ATTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.27897;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:5,1:10,2
-chr17	59673100	.	T	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.024242;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:50:1,3:0,2:1,1
-chr17	63742930	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.051469;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:8,5:9,2
-chr17	64082704	.	T	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=1.4092e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:20,6:10,7
-chr17	65147587	.	C	CTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.057853;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,7:12,5:10,2
-chr17	65460125	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=8.9175e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:22,9:12,5
-chr17	65838091	.	T	TA	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0054114;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:15,3:31,6
-chr17	65870065	.	G	GA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.038888;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,8:20,6:2,2
-chr17	66482098	.	CA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0030632;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,11:4,9:3,2
-chr17	66746154	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.082922;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,3:6,3
-chr17	67089668	.	T	TATATATAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.032243;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,4:6,2:7,2
-chr17	67309496	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.6e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:31,17:14,6:17,11
-chr17	67767795	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.057887;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,2:13,3
-chr17	67894880	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=1.7841e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,17:19,8:14,9
-chr17	69197027	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.098288;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:23,4:13,1
-chr17	71295236	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:8,6:3,1
-chr17	72147114	.	A	AAGG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.068336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,5:16,4:5,1
-chr17	72504634	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018564;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:4,6:8,2
-chr17	72754041	.	TATATACACATAC	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0054956;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,10:10,3:5,7
-chr17	73026187	.	G	GAGAGAAGAGAAGAGA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.020644;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,9:4,8:9,1
-chr17	73224840	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.059053;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:48,6:30,3:18,3
-chr17	73855711	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=5.5727e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:41,19:19,8:22,11
-chr17	74423357	.	TTG	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0065856;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:19,7:5,3:14,4
-chr17	74423362	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0051054;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:21,7:7,3:14,4
-chr17	74791357	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.038854;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:21,1:15,8
-chr17	75269548	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.075059;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:14,4:3,2
-chr17	75560802	.	T	TA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:10,2:2,4
-chr17	76031286	.	A	ATTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,2:3,1:1,1
-chr17	76297870	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0024201;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,10:11,8:2,2
-chr17	77638792	.	T	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18039;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:20,2:0,2
-chr17	77665949	.	T	TCATG	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.045096;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:32,2:12,4
-chr17	77905259	.	T	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.00010709;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:47,14:28,4:19,10
-chr17	78635453	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.019428;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,11:16,8:3,3
-chr17	79283954	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0040253;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:36,19:21,7:15,12
-chr17	79656702	.	AAGGAAG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,2:3,1:3,1
-chr17	80148544	.	CT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,6:10,5:8,1
-chr17	80915773	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.019011;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,5:8,3
-chr17	81048476	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.0010149;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:22,5:21,5
-chr17	81339604	.	A	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:4,6:3,2:1,4
-chr17	82746093	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.011327;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,9:12,8:4,1
-chr17	82856751	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.094974;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:9,1:10,2
-chr17	83032028	.	AC	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.039321;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:54,8:24,5:30,3
-chr18	147641	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.021189;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,10:7,8:7,2
-chr18	696206	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.040316;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,4:2,2:3,2
-chr18	731966	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.032417;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,8:8,7:4,1
-chr18	2986548	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.039801;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:12,6:20,1
-chr18	3926773	.	GAGCACCTAT	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00040227;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,15:23,10:19,5
-chr18	3927940	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.00037832;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:14,6:29,4
-chr18	4306464	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.17449;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:21,5:8,4:13,1
-chr18	4510780	.	T	TGTG	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,4:13,2:15,2
-chr18	4510905	.	G	GA	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.0034365;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:85,11:41,2:44,9
-chr18	4524842	.	G	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=6.0755e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:51,18:28,12:23,6
-chr18	6432242	.	T	TGCGCGC	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.027616;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,8:21,5:16,3
-chr18	8472568	.	G	GAAGAAAGAAAGA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.033806;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,9:10,6:9,3
-chr18	9641349	.	T	TAGAA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.034112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,6:11,4:16,2
-chr18	11644947	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04287;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:6,6:9,3
-chr18	12022528	.	A	AAATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:4,1:0,3
-chr18	12874140	.	C	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.00020345;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:48,12:28,9:20,3
-chr18	14451784	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.048762;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:19,5:16,2
-chr18	15152436	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.055222;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:22,4:8,2:14,2
-chr18	15406802	.	A	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.031533;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:92,11:57,6:35,5
-chr18	15471993	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.021795;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:5,1:37,9
-chr18	15484444	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr18	15494057	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.064403;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:8,1:21,3
-chr18	15517248	.	G	T	0	PASS	DP=358;GPV=1;SPV=0.022723;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:194:169,25:102,13:67,12
-chr18	15520846	.	T	C	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.0080062;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:93,26:25,7:68,19
-chr18	15528080	.	T	C	0	PASS	DP=271;GPV=1;SPV=0.028874;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:115,21:34,14:81,7
-chr18	15534382	.	G	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0042842;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:5,6:28,9
-chr18	15540233	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.023885;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:26,12:3,1
-chr18	15555357	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027027;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:2,1:14,5
-chr18	15573280	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr18	15580200	.	G	C	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.02679;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:93,17:26,3:67,14
-chr18	15582785	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:16,3:4,1
-chr18	15588637	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.049445;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:2,1:29,4
-chr18	15684083	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
-chr18	15713707	.	G	C	0	PASS	DP=386;GPV=1;SPV=0.012311;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:191,35:94,24:97,11
-chr18	15727235	.	G	C	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.022784;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:57,19:49,17:8,2
-chr18	15727935	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:1,0:16,4
-chr18	16442072	.	T	C	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0061782;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:50,16:2,2:48,14
-chr18	16913119	.	A	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
-chr18	16959666	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.048633;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:20,1:2,8
-chr18	17065706	.	G	T	0	PASS	DP=473;GPV=1;SPV=0.022877;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:242:207,35:30,9:177,26
-chr18	17300370	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0007759;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:22,12:4,1
-chr18	17638914	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
-chr18	17676479	.	C	A	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.046569;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:68,14:51,11:17,3
-chr18	17732441	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:0,0:22,4
-chr18	18040886	.	G	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.01615;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:53,8:33,6:20,2
-chr18	18231134	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.019616;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:43,11:5,2
-chr18	19053810	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.013809;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:13,2:21,4
-chr18	19869150	.	T	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.049403;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:49,9:11,3:38,6
-chr18	20445267	.	C	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,3:3,2
-chr18	20582385	.	T	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.027025;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:26,7:14,4
-chr18	20786158	.	C	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
-chr18	20923340	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:0,0:13,4
-chr18	21640623	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,6:3,5:7,1
-chr18	21899266	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.045915;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:10,7:11,3
-chr18	22079428	.	G	GT	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0006601;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,12:24,6:22,6
-chr18	25960005	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.044045;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:17,2:25,3
-chr18	27501014	.	C	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.017025;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:23,5:25,2
-chr18	27702207	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=1.3702e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,18:11,7:17,11
-chr18	28772839	.	T	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.027339;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:14,4:6,2:8,2
-chr18	28873679	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0013442;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:16,6:27,7
-chr18	29311057	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.062626;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,7:16,6:11,1
-chr18	30454417	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.011449;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:28,4:24,3
-chr18	31308385	.	AT	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00020572;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,15:16,5:21,10
-chr18	33610413	.	C	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.018132;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:19,3:13,2
-chr18	35214060	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.37564;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,4:8,2:4,2
-chr18	35445026	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.022451;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,6:6,3:11,3
-chr18	36133897	.	GTTTTTT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.090553;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,7:11,2:12,5
-chr18	37382878	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=5.077e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:15,8:18,7
-chr18	37727602	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0061213;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:25,3:20,6
-chr18	38567748	.	G	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.00015275;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:23,5:19,9
-chr18	39706587	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.10577;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:6,5:4,3:2,2
-chr18	39863531	.	GCACGCACACACACACA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014604;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,7:7,2
-chr18	40192263	.	C	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0095308;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:9,1:3,5
-chr18	40241814	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00012515;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:15,4:20,11
-chr18	42054126	.	GTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,6:7,3:4,3
-chr18	42278307	.	C	CAAA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.010276;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,8:18,4:10,4
-chr18	42922557	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00046557;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:19,9:19,5
-chr18	43745787	.	A	AATCT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0054715;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:17,15:7,7:10,8
-chr18	45346968	.	AAAATAAAAATAAAAAT	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.040632;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,12:16,3:17,9
-chr18	45615840	.	A	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.022208;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:53,8:30,4:23,4
-chr18	45830583	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:12,3:3,2
-chr18	46330410	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=1.8341e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,16:24,8:20,8
-chr18	47982777	.	A	AGAGAGG	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:5,2:0,0
-chr18	48281933	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0084605;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:31,16:13,5:18,11
-chr18	51977546	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0019724;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:30,7:19,3
-chr18	53598647	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=8.1726e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,15:17,8:20,7
-chr18	54771591	.	A	AGT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.011272;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,9:5,5:5,4
-chr18	54980069	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0098204;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:13,3:12,3
-chr18	55711294	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.045694;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:8,5:5,1
-chr18	56158489	.	C	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00013409;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:18,8:26,7
-chr18	56736924	.	A	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00018926;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:45,18:15,8:30,10
-chr18	56738798	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,2:7,2
-chr18	56900082	.	GTATA	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:2,2:2,1:0,1
-chr18	59882954	.	ATT	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.049546;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:25,3:17,7
-chr18	61010065	.	C	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=1.5622e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:16,7:15,7
-chr18	62189275	.	G	GT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.031485;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,11:11,5:15,6
-chr18	63174820	.	CA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.049356;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:14,7:7,2
-chr18	65891839	.	A	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0013864;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:20,7:23,4
-chr18	67394999	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
-chr18	72173274	.	T	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=5.8144e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:36,20:18,11:18,9
-chr18	72528962	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,5:3,2
-chr18	72690942	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=3.0143e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:46,21:16,7:30,14
-chr18	73899710	.	C	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=3.4355e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:16,7:19,8
-chr18	74737392	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00045086;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:21,5:15,5
-chr18	76028583	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=1.076e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:36,18:14,10:22,8
-chr18	76458795	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0044583;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:5,8:11,2
-chr18	77708903	.	G	A	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=3.6562e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:47,25:23,10:24,15
-chr18	77958179	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.020648;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:21,1:11,4
-chr18	78042031	.	GTT	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0007185;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:24,12:14,7:10,5
-chr18	78513404	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12395;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:12,4:14,1
-chr18	78840321	.	TGA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:11,6:3,2
-chr18	79618653	.	A	C	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.035863;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:70,13:31,9:39,4
-chr19	106852	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.052666;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:0,1:21,6
-chr19	160592	.	G	T	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.028659;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:91,12:41,6:50,6
-chr19	190040	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:0,1:4,3
-chr19	350618	.	CAT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.012598;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:4,3:11,4
-chr19	481425	.	AGAAGGATGATGGG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:12,2:4,2
-chr19	492581	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:4,2:6,3
-chr19	714358	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:5,3:10,2
-chr19	1035181	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.044401;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:26,4:15,1
-chr19	1877185	.	C	T	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.022449;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,12:21,6:25,6
-chr19	2725749	.	C	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=7.7806e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:48,15:32,11:16,4
-chr19	2864729	.	GAAAGAAAAAGAAAA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01828;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:3,1:7,7
-chr19	3528158	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.00073223;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:14,5:25,4
-chr19	3972314	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:2,5:5,4
-chr19	4068661	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.046571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:52,6:29,4:23,2
-chr19	4232769	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.049454;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,10:18,6:15,4
-chr19	4334836	.	C	CTGTCCA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,2:2,3
-chr19	4952393	.	C	CTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11785;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,7:8,5:5,2
-chr19	5463442	.	TTCC	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.031089;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,1:11,4
-chr19	5516651	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:13,10:8,6:5,4
-chr19	6162566	.	C	CAAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.037576;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,9:18,8:9,1
-chr19	6287882	.	T	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=4.2775e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,19:18,10:14,9
-chr19	6455720	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:2,2:2,1:0,1
-chr19	6614552	.	G	GTTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.021122;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,7:9,6:3,1
-chr19	6994039	.	T	TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAC	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0037845;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,11:13,6:11,5
-chr19	8063855	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.075102;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:10,3:15,1
-chr19	8423985	.	C	CA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.035556;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:33,14:20,11:13,3
-chr19	8541425	.	GT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.028446;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:15,8:7,2
-chr19	8785481	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:20,4:0,0
-chr19	8853515	.	A	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.049592;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:23,6:14,1
-chr19	8959981	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.015072;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:20,4:22,2
-chr19	9428062	.	A	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00032403;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:21,7:15,4
-chr19	9970015	.	T	TG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0021563;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,11:3,4:6,7
-chr19	10196339	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=4.7992e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:30,4:13,10
-chr19	10307347	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,4:1,3:3,1
-chr19	11159637	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.05;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:54:0,3:0,2:0,1
-chr19	11974110	.	TTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.016686;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:8,4:25,8
-chr19	13291633	.	T	TA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00011777;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,21:16,14:6,7
-chr19	16341517	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=9.1667e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:36,16:14,7:22,9
-chr19	18072946	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.019247;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:12,8:7,1
-chr19	18159144	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016908;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:2,4:7,2
-chr19	18201263	.	A	AAAAGAAAG	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.023995;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,8:15,6:14,2
-chr19	19744153	.	CTT	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.10771;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:9,2:29,3
-chr19	20890454	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.046474;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:9,2:18,2
-chr19	21709169	.	C	CAA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0097243;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,12:14,8:8,4
-chr19	22655736	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.01458;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,3:3,6
-chr19	23417434	.	GTATATA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,4:1,1
-chr19	24346300	.	T	C	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.017291;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:86,11:46,6:40,5
-chr19	25408284	.	G	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.13636;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:2,1:13,2
-chr19	26019887	.	T	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr19	27414078	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0013497;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:20,6:20,6
-chr19	27437536	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=2.1314e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,18:18,5:17,13
-chr19	28819963	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.022285;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:26,2:18,4
-chr19	29548626	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0007833;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:23,7:21,5
-chr19	29782829	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.041455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:13,4:1,0
-chr19	29874253	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:1,2:0,0
-chr19	29900314	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:3,1:3,4
-chr19	32019290	.	GAGAGAGAGAA	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.046683;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,5:7,4:9,1
-chr19	32667832	.	C	CAAA	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.006922;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,15:18,11:15,4
-chr19	33961138	.	C	CTTT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0040779;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:11,4:11,6
-chr19	34451536	.	GT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.049275;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
-chr19	36428649	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.03385;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:22,4:5,1
-chr19	36975136	.	A	ATTTC	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.027342;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:11,4:20,7
-chr19	37184356	.	AAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.032887;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,7:12,3:12,4
-chr19	37283037	.	G	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.013084;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:20,3:21,9
-chr19	37551835	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.010281;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:17,5:18,1
-chr19	38422132	.	G	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=8.3659e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:58,18:30,8:28,10
-chr19	43765527	.	G	GAC	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00034173;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:15,3:20,9
-chr19	44338836	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.00035589;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:51,15:30,10:21,5
-chr19	45372147	.	T	TGTGTGTGTGTGTGCGC	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00033727;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,15:6,5:13,10
-chr19	45903858	.	C	CAA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.019414;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,12:18,10:6,2
-chr19	46157787	.	A	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00027053;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:17,6:11,3
-chr19	47051770	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10123;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:8,1:18,3
-chr19	47747779	.	CTTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0084717;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,5:3,3
-chr19	47895696	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,6:6,4:5,2
-chr19	48153637	.	A	AACAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:8,3:2,3
-chr19	48331200	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,2:8,3
-chr19	48829635	.	C	CTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11275;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:12,4:7,1
-chr19	48958345	.	AT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:14,2:2,3
-chr19	49182467	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,4:13,2:6,2
-chr19	49544708	.	CAG	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.047358;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:10,2:14,7
-chr19	50346024	.	AT	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.101;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:12,3:23,1
-chr19	50618106	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.015393;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:26,3:13,4
-chr19	50738867	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,4:6,1:16,3
-chr19	51393559	.	T	TTTTA	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.038138;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:20,8:22,6
-chr19	52997685	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=8.2016e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,21:10,9:13,12
-chr19	53470160	.	T	TCCTTCCTTCCTTCCTTCC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.028482;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,9:13,2:10,7
-chr19	53470177	.	C	CT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0069242;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:14,5:8,10
-chr19	53821031	.	CTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.1039;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,3:10,2:4,1
-chr19	53921585	.	GT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.19536;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:16,3:6,2:10,1
-chr19	53923820	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,3:4,5
-chr19	53954418	.	A	ATCTT	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.027602;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:36,14:14,4:22,10
-chr19	54413375	.	GGTGT	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00073139;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,13:12,9:6,4
-chr19	54492716	.	C	T	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.0087887;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:61,15:23,8:38,7
-chr19	54636053	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.014985;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:19,2:13,10
-chr19	54862802	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0068111;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,7:4,5:1,2
-chr19	55319433	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
-chr19	55864705	.	T	C	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0015871;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:14,4:26,4
-chr19	55990079	.	CTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,3:2,1
-chr19	56696976	.	T	TATATGTGTATAC	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.02769;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,8:11,6:6,2
-chr19	57165803	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.02761;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,11:16,9:7,2
-chr19	57281556	.	A	AT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.049356;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:15,4:6,5
-chr19	57457933	.	A	AGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:4,3:9,1
-chr19	58232766	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.014077;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:11,6:3,3:8,3
-chr19	58390426	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:3,3:2,1
-chr2	913213	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.24396;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:17,2:16,2
-chr2	923366	.	A	ATT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,2:11,2
-chr2	1281225	.	GTTTATGTGGTGTGGT	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043132;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,1:13,3
-chr2	1547975	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:1,2:0,0:1,2
-chr2	1719834	.	TTGTG	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:6,2:13,8
-chr2	3180664	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.040535;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:6,4:8,4
-chr2	3669728	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00016747;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:21,2:18,9
-chr2	4405526	.	C	CAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.044964;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,12:17,10:3,2
-chr2	4522520	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=5.7203e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:8,5:21,8
-chr2	5333727	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0023465;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:22,5:20,4
-chr2	5600394	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.035066;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,6:14,5:4,1
-chr2	6134131	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0042725;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:22,9:22,2
-chr2	6862573	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00044152;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:19,10:24,4
-chr2	9118194	.	TTCTC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0053523;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,4:7,4
-chr2	10554207	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0082048;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:20,7:14,3
-chr2	10554273	.	G	GA	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.014217;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:16,9:20,3
-chr2	10690415	.	C	CAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0064663;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,7:13,6:4,1
-chr2	10727051	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020274;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:0,1:17,8
-chr2	12199778	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034767;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,6:5,3
-chr2	13280936	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0013781;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:22,4:25,8
-chr2	13484441	.	ATGTGTGTGTG	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.038795;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,8:9,6:11,2
-chr2	14757402	.	A	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00053467;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:16,5:24,5
-chr2	15846446	.	G	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=5.5211e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:22,9:22,5
-chr2	16092284	.	GT	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.042122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,8:12,6:4,2
-chr2	16299765	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,4:11,3:10,1
-chr2	17707999	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:17,5:10,2:7,3
-chr2	17921915	.	G	GTA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.029349;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,4:2,4
-chr2	18029352	.	ATTT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037417;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:4,4:6,2
-chr2	18296634	.	A	AGT	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.015651;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:69,22:31,18:38,4
-chr2	18530290	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,3:5,2
-chr2	19263268	.	G	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=1.2759e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:46,19:25,9:21,10
-chr2	22738315	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0036201;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:45,10:25,6:20,4
-chr2	23581828	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.052666;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,7:15,6:6,1
-chr2	23918202	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.014414;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:17,10:3,1
-chr2	24621432	.	ATTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04422;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,4:4,3
-chr2	25901727	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030792;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,4:6,1
-chr2	26668091	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00061273;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:19,6:20,5
-chr2	27539702	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10694;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:6,1:11,2
-chr2	28258632	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,2:11,2
-chr2	28443199	.	AT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00094846;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,15:9,9:4,6
-chr2	28939057	.	T	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11275;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:5,3:14,2
-chr2	30193879	.	AT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0041629;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,6:4,2
-chr2	30886989	.	T	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.003441;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:19,7:26,1
-chr2	31243452	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,4:8,2:2,2
-chr2	31245545	.	ATATATATATT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0055032;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,7:12,4:5,3
-chr2	31881495	.	TA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:7,5:7,3
-chr2	32030629	.	C	CAA	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.015555;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,14:21,12:9,2
-chr2	32343478	.	T	TA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028534;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:6,6:7,2
-chr2	32446738	.	G	GT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,3:8,1
-chr2	33654935	.	GA	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0057212;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:19,3:13,5
-chr2	34123925	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0012005;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:25,9:14,4
-chr2	34314362	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,3:10,2
-chr2	35214857	.	A	AT	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.046149;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,7:14,4:10,3
-chr2	35541650	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.022366;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,9:5,2:9,7
-chr2	35610856	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0001474;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:22,7:22,7
-chr2	37519556	.	AATATATATGT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,2:5,2
-chr2	37519805	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.044512;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:14,4:12,2
-chr2	39978827	.	CTA	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.05702;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:32,2:9,3
-chr2	41452723	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,2:5,2
-chr2	42121772	.	G	GA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013378;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:12,6:6,3
-chr2	42403477	.	G	GTTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,1:14,3
-chr2	42451204	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.032622;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,8:12,7:4,1
-chr2	42525516	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.091638;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:5,1:28,3
-chr2	42628772	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.026638;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:19,5:6,4
-chr2	44588374	.	G	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:1,1:8,6
-chr2	44666612	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.22913;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:15,3:5,1
-chr2	45064398	.	G	GT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0028422;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:17,6:14,8
-chr2	45716732	.	AAAGT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14853;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,6:16,5:2,1
-chr2	45868214	.	CTT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0013974;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,12:8,8:2,4
-chr2	46299246	.	G	GCGAAT	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.00018801;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:58,16:28,11:30,5
-chr2	46299254	.	C	G	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.00012803;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:57,16:27,10:30,6
-chr2	47259984	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00010638;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:34,15:17,11:17,4
-chr2	49358589	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0014915;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:19,1:18,7
-chr2	51939045	.	G	GT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.01049;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,7:1,4:1,3
-chr2	53439035	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00029953;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:19,5:12,7
-chr2	54930953	.	C	CTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.092279;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,5:13,4:7,1
-chr2	55425116	.	A	AAG	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=7.7172e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:12,4:15,6
-chr2	57376462	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:9,5:3,3:6,2
-chr2	57912417	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00010821;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:42,17:20,10:22,7
-chr2	60166802	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00071811;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:20,5:17,5
-chr2	61054725	.	ATG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.031169;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:14,6:10,4
-chr2	61623897	.	TAATAAAATAAAATAA	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.016656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:12,4:11,7
-chr2	61676192	.	GT	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.03601;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:15,4:8,4
-chr2	61715319	.	C	CTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.024419;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,10:9,6:8,4
-chr2	62629617	.	CTCTCCCTCTCCCCACGG	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12547;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,4:16,3:8,1
-chr2	63455439	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.052103;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:21,2:17,3
-chr2	65220216	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0065088;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,11:4,9:5,2
-chr2	65699924	.	G	C	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00019326;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:45,14:27,9:18,5
-chr2	67945849	.	C	CTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034996;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:7,4:7,2
-chr2	69662992	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0090729;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,7:4,1
-chr2	70219738	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.017733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:16,10:1,1
-chr2	70396496	.	C	CA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.013912;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,10:13,9:8,1
-chr2	71161823	.	G	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=8.8589e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:40,22:20,11:20,11
-chr2	75186371	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.043206;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:11,6:6,1
-chr2	76300327	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.048573;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:6,3:12,3
-chr2	77509384	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.00017939;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:45,16:19,9:26,7
-chr2	78858407	.	C	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0015983;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:18,5:22,5
-chr2	79187261	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.057027;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:14,3:12,3
-chr2	79283033	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.035066;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,3:6,3
-chr2	79395157	.	C	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=4.2848e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:32,7:14,7
-chr2	79851737	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.05132;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,1:7,3
-chr2	79982253	.	TACAC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.031354;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:4,2:11,7
-chr2	80375562	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:8,4:3,1
-chr2	80932071	.	C	CATAT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.017571;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,9:9,4:5,5
-chr2	86902578	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00064447;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:27,23:10,10:17,13
-chr2	87116473	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.015567;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:12,3:7,7
-chr2	87178306	.	T	TG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.028693;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,10:9,4:16,6
-chr2	87201007	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
-chr2	87247722	.	A	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.012017;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:15,8:26,5
-chr2	87345906	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:4,2:21,2
-chr2	87388545	.	C	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0030596;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,18:24,9:11,9
-chr2	87398126	.	CGCCA	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.079421;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:20,4:21,1
-chr2	87420984	.	C	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,2:4,2
-chr2	87706027	.	T	C	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.043168;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:52,14:30,9:22,5
-chr2	89534524	.	G	GTGAT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.16149;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:10,3:1,0:9,3
-chr2	89597075	.	A	G	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=2.2566e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:45,23:28,10:17,13
-chr2	89767663	.	GT	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.040655;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:49,6:29,4:20,2
-chr2	89837671	.	T	A	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.021811;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:49,14:25,7:24,7
-chr2	90247912	.	G	A	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.0064228;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:58,19:32,12:26,7
-chr2	90249171	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.048023;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:50,13:35,6:15,7
-chr2	90311614	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0018363;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:32,18:23,11:9,7
-chr2	90323215	.	C	G	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.038293;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:49,7:15,3:34,4
-chr2	90324502	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:6,2:1,5
-chr2	90326314	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.043382;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
-chr2	90350028	.	A	T	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.0092286;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:72,19:42,11:30,8
-chr2	90401619	.	G	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.019783;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:79,18:45,15:34,3
-chr2	91472627	.	C	T	0	PASS	DP=246;GPV=1;SPV=0.0025124;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:113,22:54,12:59,10
-chr2	91476732	.	T	C	0	PASS	DP=270;GPV=1;SPV=0.0036469;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:121,24:51,5:70,19
-chr2	91546596	.	A	G	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.00060653;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:71,21:36,7:35,14
-chr2	91601565	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.027931;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,10:13,5:20,5
-chr2	91711048	.	G	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.0012651;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:45,13:12,7:33,6
-chr2	91711082	.	C	T	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.048471;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:55,12:12,8:43,4
-chr2	91895156	.	G	GCT	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.023718;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:104,14:49,10:55,4
-chr2	91911069	.	A	C	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.0052731;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:84,10:35,8:49,2
-chr2	91932523	.	T	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.018291;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:30,3:27,4
-chr2	92198813	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.20884;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,4:30,4:3,0
-chr2	92204805	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:2,0:19,4
-chr2	92208558	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.20116;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:0,0:32,4
-chr2	92218555	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.079426;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:34,4:2,0
-chr2	92295228	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,0:7,4
-chr2	92332611	.	G	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.023569;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:54,10:28,2:26,8
-chr2	92366760	.	T	G	0	PASS	DP=276;GPV=1;SPV=0.023461;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:132,23:2,9:130,14
-chr2	92386741	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,3:10,1
-chr2	92392766	.	C	T	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.0050942;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:88,25:40,15:48,10
-chr2	92418824	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:20,4:0,0
-chr2	92485165	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.12943;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:3,0:29,4
-chr2	92491173	.	T	G	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.026545;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:68,9:42,6:26,3
-chr2	92511077	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.022365;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:9,6:19,1
-chr2	92564394	.	T	A	0	PASS	DP=244;GPV=1;SPV=0.029233;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:137:113,20:61,5:52,15
-chr2	92674209	.	T	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.044237;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:76,10:62,5:14,5
-chr2	92684703	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.080505;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:2,0:32,4
-chr2	92746667	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.026152;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:12,5:28,2
-chr2	92746668	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.049115;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,6:11,5:30,1
-chr2	92763497	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011977;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:19,11:4,1
-chr2	92828797	.	T	A	0	PASS	DP=287;GPV=1;SPV=0.0079688;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:153,18:1,1:152,17
-chr2	92856348	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,1:5,8
-chr2	92909528	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.022996;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:14,1:10,8
-chr2	92956450	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10169;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:0,1:35,4
-chr2	92992587	.	T	A	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.01794;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:75,19:35,13:40,6
-chr2	93070152	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.011208;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,7:5,1
-chr2	93077499	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023024;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,5:5,3
-chr2	93100041	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.16867;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:35,4:0,0
-chr2	93114949	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11923;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:11,3:25,1
-chr2	93164279	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10123;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:17,1:9,3
-chr2	93215666	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.043236;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:17,2:16,5
-chr2	93233897	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080194;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:8,1:23,5
-chr2	93249883	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
-chr2	93432710	.	C	T	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.031747;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:66,12:26,7:40,5
-chr2	93459900	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2122;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:0,3:25,1
-chr2	93551914	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:0,5:6,4
-chr2	93575342	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.023393;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:30,7:9,1
-chr2	93596222	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.025703;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:41,6:6,1
-chr2	93672880	.	C	G	0	PASS	DP=339;GPV=1;SPV=0.017673;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:189,23:62,12:127,11
-chr2	93683512	.	A	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
-chr2	93690772	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.25968;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:13,1:7,3
-chr2	93864295	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0066847;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:11,5:11,5
-chr2	93958145	.	A	G	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.0012808;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:119,21:98,18:21,3
-chr2	94073421	.	GAA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.23474;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:18,2:9,1
-chr2	94084064	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.29538;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:20,3:14,1
-chr2	94084147	.	G	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
-chr2	94084897	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14592;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:11,3:18,2
-chr2	94286187	.	A	G	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.011597;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:100,27:56,12:44,15
-chr2	94287837	.	G	T	0	PASS	DP=388;GPV=1;SPV=0.0017827;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:198,28:75,3:123,25
-chr2	94851909	.	G	GTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,4:16,3:3,1
-chr2	95484068	.	T	TA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.012518;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:12,9:11,3
-chr2	95936776	.	C	A	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.030583;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:102,20:70,16:32,4
-chr2	95987605	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0047325;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:5,3:6,4
-chr2	96009000	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=6.3244e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:15,6:22,8
-chr2	96023181	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.016968;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:21,4:29,2
-chr2	96462406	.	C	T	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.015623;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:65,10:35,8:30,2
-chr2	97060632	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0034588;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:25,5:18,4
-chr2	100014783	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,4:4,2
-chr2	102487178	.	G	GGT	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.0025178;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:20,3:25,5
-chr2	102818770	.	C	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.043302;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:26,3:20,3
-chr2	103496471	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=3.4306e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:22,7:14,8
-chr2	103705085	.	TATATATAA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.02121;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,7:5,2
-chr2	105522330	.	AAG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,4:3,2:7,2
-chr2	106287921	.	AAAC	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.077531;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:10,1:20,4
-chr2	106394211	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.015335;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:13,5:12,8
-chr2	106464556	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0044711;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:14,5:29,1
-chr2	107904796	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.003233;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:14,11:25,3
-chr2	109606672	.	CTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036089;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:6,3:1,2
-chr2	110175315	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00037706;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:16,4:17,6
-chr2	111551691	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0021846;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:2,2:6,9
-chr2	111812295	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.064595;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,3:8,2
-chr2	113236228	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,3:7,1
-chr2	113394909	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0097821;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:0,1:9,6
-chr2	113561824	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15115;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,3:16,1
-chr2	113594232	.	AG	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.046454;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:58,7:30,2:28,5
-chr2	114026437	.	G	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.000332;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:51,14:22,3:29,11
-chr2	116900074	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:12,4:9,1:3,3
-chr2	116900753	.	TC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011003;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:10,5:11,6
-chr2	117042252	.	T	TTA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.042657;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:19,7:10,3
-chr2	117736666	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00015203;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:18,6:10,6
-chr2	118030701	.	T	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=1.0575e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:46,19:25,12:21,7
-chr2	118200387	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.13742;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,4:9,3:15,1
-chr2	118200397	.	TATATACAC	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:21,5:7,3:14,2
-chr2	118563884	.	AAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,7:8,5:4,2
-chr2	119529550	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013393;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,13:7,11:1,2
-chr2	121235579	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0026133;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:7,5:9,6
-chr2	123358800	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,4:2,1
-chr2	124237077	.	C	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00019654;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:46,13:22,5:24,8
-chr2	125013436	.	T	TA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,4:2,1
-chr2	125032097	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0029706;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:21,2:12,6
-chr2	125894961	.	CAT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.013285;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:5,1:4,5
-chr2	128606445	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0068293;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:17,8:20,1
-chr2	129435058	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.017739;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:5,8:9,1
-chr2	130226771	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.029035;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:20,1:20,9
-chr2	130637244	.	T	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0082085;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:33,18:20,6:13,12
-chr2	130680549	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,3:9,1
-chr2	131275700	.	C	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr2	132012048	.	TA	T	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.023941;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:100,18:36,6:64,12
-chr2	132052015	.	A	C	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.034853;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:90,13:47,3:43,10
-chr2	132723140	.	A	AT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.020153;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,7:14,5:7,2
-chr2	133302829	.	C	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=1.6041e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:45,19:24,8:21,11
-chr2	133960430	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037959;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:9,2:2,2
-chr2	134465189	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.077652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:18,3:27,2
-chr2	137781367	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=4.3552e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:34,16:19,9:15,7
-chr2	137911418	.	ATTTTTTTT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0079921;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,11:9,8:4,3
-chr2	138984952	.	TCTTC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.07563;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:7,2:17,2
-chr2	139200479	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00022098;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:17,3:11,7
-chr2	139975755	.	C	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0012829;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:48,16:27,13:21,3
-chr2	140743990	.	AAGT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00059538;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,10:1,4:0,6
-chr2	141645469	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:9,5:1,1
-chr2	141962869	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0010228;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:20,5:19,6
-chr2	142353850	.	C	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019548;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,2:5,5
-chr2	143090910	.	C	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0011295;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:15,3:27,7
-chr2	145080448	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.15966;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:17,3:8,1:9,2
-chr2	146135294	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0047012;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:7,9:5,2
-chr2	148411512	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,4:10,1
-chr2	149675021	.	A	ATCTATCTATCTATCTATCTATC	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.04668;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:28,8:8,6:20,2
-chr2	149988264	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0083921;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:21,5:21,2
-chr2	150184369	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.03053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:18,8:4,3
-chr2	150304967	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00048032;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:22,9:15,4
-chr2	150653021	.	C	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=2.3536e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:41,24:17,8:24,16
-chr2	153069708	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=8.0829e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:21,7:22,6
-chr2	153345635	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.009702;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,9:1,6:15,3
-chr2	153414478	.	A	AT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.010719;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:21,6:8,1
-chr2	154118282	.	C	CTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.032462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,16:10,7:10,9
-chr2	154417282	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.023489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,7:12,5:4,2
-chr2	154620996	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11785;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:3,2:10,4
-chr2	155613561	.	T	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:5,8:3,5:2,3
-chr2	156462454	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.044826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,4:5,1:13,3
-chr2	156617063	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,4:10,3:13,1
-chr2	156773425	.	T	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0066107;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:19,6:27,3
-chr2	162285325	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.032385;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:28,5:23,1
-chr2	164259174	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0013605;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:15,5:21,7
-chr2	164584147	.	AT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:4,3:5,1
-chr2	165520782	.	AT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.32712;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,4:9,3:1,1
-chr2	165766678	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.038035;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:17,6:6,1
-chr2	165927223	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:5,2:5,2
-chr2	167683806	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.1162e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:12,6:14,10
-chr2	169079881	.	GAA	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,3:6,2
-chr2	169284256	.	C	CTCT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,4:5,1
-chr2	169466445	.	TATAAAC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.13115;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,5:17,1:6,4
-chr2	169591920	.	AT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0095308;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,6:10,2:2,4
-chr2	169969548	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0011242;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,12:10,9:3,3
-chr2	170230336	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.040008;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,9:8,4:8,5
-chr2	171496400	.	A	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.064743;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,4:16,1:8,3
-chr2	171508528	.	C	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=4.7992e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:24,7:19,7
-chr2	172744982	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=7.0728e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:17,9:25,7
-chr2	172857881	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,4:6,3:7,1
-chr2	172911758	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,1:10,3
-chr2	173844256	.	C	CGTGTGT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0032844;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:13,14:9,8:4,6
-chr2	174110302	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0023112;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:9,15:5,12:4,3
-chr2	174540463	.	C	CAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,8:4,7:6,1
-chr2	177853678	.	ATATGTG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,4:1,2:7,2
-chr2	177855903	.	AACAC	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0023233;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:12,13:8,10:4,3
-chr2	179027646	.	CAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:4,3:9,1
-chr2	181301902	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0089356;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:20,5:23,4
-chr2	181418864	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,1:4,4
-chr2	183242462	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0090729;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,8:4,3:8,5
-chr2	183265413	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:6,5:8,1
-chr2	183283860	.	TTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.085684;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:16,3:26,3
-chr2	186406821	.	A	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.045381;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:20,2:24,4
-chr2	187243808	.	T	TACACACACAC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.034248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,5:15,3:8,2
-chr2	189835906	.	C	CAAA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.015597;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,10:19,9:4,1
-chr2	191524061	.	G	GT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,4:8,2:4,2
-chr2	194519854	.	A	AT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.024221;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:16,4:12,2
-chr2	194623176	.	TTG	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.011999;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,7:25,4:21,3
-chr2	196613582	.	T	TA	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00015878;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:40,14:22,9:18,5
-chr2	196626026	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0039984;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:6,8:5,2
-chr2	197240374	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0078195;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,13:12,11:6,2
-chr2	197695447	.	T	TA	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.036723;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:25,2:26,4
-chr2	197853604	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00037553;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:19,4:20,7
-chr2	198253112	.	G	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0064775;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:48,8:21,6:27,2
-chr2	199290797	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=3.1445e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:39,17:26,9:13,8
-chr2	199701299	.	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,7:6,6:4,1
-chr2	203271080	.	ATATTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,6:4,4:3,2
-chr2	203512621	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.019226;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,7:8,2
-chr2	204362490	.	A	AGATAGATAGATAGATG	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0049095;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,13:11,10:8,3
-chr2	206180734	.	C	CATTATTATT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0095299;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,13:5,7:11,6
-chr2	207820890	.	CTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:4,4:4,1
-chr2	208173120	.	CAA	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0031524;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,11:7,9:3,2
-chr2	209510211	.	G	GT	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0066158;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:24,6:18,3
-chr2	211317921	.	CG	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.044904;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,8:15,5:7,3
-chr2	212949823	.	GTTT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,6:4,3
-chr2	214595549	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.03415;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:11,6:15,5
-chr2	214608659	.	T	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.041404;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:18,4:16,2
-chr2	215246625	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.076205;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,4:7,3:16,1
-chr2	216187470	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:6,2:4,1:2,1
-chr2	217150072	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00022563;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:25,8:5,3
-chr2	217229439	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,4:9,2:5,2
-chr2	217293693	.	A	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=2.52e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:20,6:17,8
-chr2	217809576	.	GATAGGTGC	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.02182;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,8:9,3:15,5
-chr2	218321623	.	CT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0062802;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:17,7:5,3
-chr2	218588588	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:4,1:3,5
-chr2	219159526	.	C	CAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,4:12,2:5,2
-chr2	220791974	.	AT	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:4,1:1,1
-chr2	220833442	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.010567;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,15:15,13:8,2
-chr2	221405710	.	T	TTTTGTTTTTTTTTTTTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013894;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,4:3,1:4,3
-chr2	221868009	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=8.0829e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:19,7:24,6
-chr2	222323434	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,9:1,4:3,5
-chr2	222816602	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.18154;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:4,1:11,2
-chr2	223321343	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=4.8214e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,15:24,8:13,7
-chr2	223547202	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:26,4:13,2:13,2
-chr2	223626106	.	G	GGAA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.022123;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,6:22,5:5,1
-chr2	223626112	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.023915;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:18,9:11,6:7,3
-chr2	227045783	.	CAT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.052629;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,1:12,4
-chr2	227377124	.	T	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:1,2:0,1:1,1
-chr2	227427984	.	C	CTCTTTTCTTTCTTT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.038786;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,5:8,2:24,3
-chr2	228055142	.	C	CAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,2:3,2:0,0
-chr2	228139910	.	T	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.21504;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,3:2,2:8,1
-chr2	228393427	.	T	TATAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.05461;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:10,2:10,2
-chr2	228403532	.	A	G	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0020126;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:63,12:36,6:27,6
-chr2	230222840	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10034;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:15,2:7,2
-chr2	230782817	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,1:12,3
-chr2	231852022	.	TC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,5:2,3:4,2
-chr2	232886127	.	A	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.05558;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:29,5:12,2:17,3
-chr2	233253340	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0070941;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:5,5:3,5
-chr2	233258016	.	AATATCTAT	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0024809;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:13,3:14,12
-chr2	234561655	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=8.9917e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:17,9:16,5
-chr2	234747587	.	AT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0030816;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,14:5,8:4,6
-chr2	235090896	.	CTTCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.033381;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,12:13,4:22,8
-chr2	236024021	.	G	GT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.069135;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,2:16,2
-chr2	238162785	.	G	A	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.0029955;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:72,10:28,7:44,3
-chr2	239094421	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.883e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:18,8:9,9
-chr2	241848563	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:1,2:7,5
-chr2	242178601	.	T	G	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.017245;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:89,16:49,9:40,7
-chr20	227692	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.052186;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,2:12,2
-chr20	508437	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=6.7435e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:13,9:15,3
-chr20	1948736	.	AAAAAAG	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.034215;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,6:16,3:15,3
-chr20	4103854	.	C	CAA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.018271;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,9:15,8:6,1
-chr20	4768812	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.12821;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:3,2:2,1:1,1
-chr20	5763290	.	C	CA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0049095;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,13:17,11:2,2
-chr20	6530251	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=8.189e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:48,16:24,8:24,8
-chr20	6606159	.	CTT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.044481;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:3,1:23,4
-chr20	7810723	.	CT	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.045061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:13,4:12,1
-chr20	8031760	.	GATGTATGTGTGTATGTATGATGT	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.046772;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,5:13,4:16,1
-chr20	8123251	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.072687;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:21,3:23,3
-chr20	9189274	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:14,3:6,1
-chr20	9191345	.	AT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,2:5,2
-chr20	10118020	.	A	AAT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:6,6:1,2
-chr20	10336200	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00038475;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:16,4:7,7
-chr20	12341282	.	T	TG	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.045641;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:20,3:21,5
-chr20	13960126	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.8386e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:37,17:22,11:15,6
-chr20	14008889	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00041767;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:20,6:23,6
-chr20	15294120	.	T	TAAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.011404;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,15:10,11:12,4
-chr20	18118892	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.44608;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,4:3,2:8,2
-chr20	18464667	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,3:5,1
-chr20	20411129	.	C	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=6.1367e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:55,17:28,9:27,8
-chr20	20937991	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00030699;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:28,9:14,7
-chr20	21463989	.	C	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00089328;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:20,6:19,2
-chr20	21944595	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00011575;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:23,6:20,10
-chr20	22082620	.	G	GTATATATGA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.12945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,3:18,1
-chr20	25027351	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.00017575;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:42,12:18,5:24,7
-chr20	26514233	.	G	T	0	PASS	DP=257;GPV=1;SPV=0.019443;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:124,15:105,6:19,9
-chr20	26534544	.	T	A	0	PASS	DP=248;GPV=1;SPV=0.0069962;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:122,16:122,13:0,3
-chr20	27540217	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
-chr20	28518449	.	T	A	0	PASS	DP=1270;GPV=1;SPV=0.039135;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:738:660,78:195,25:465,53
-chr20	28521867	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064294;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:23,2:8,2
-chr20	28547142	.	T	G	0	PASS	DP=547;GPV=1;SPV=0.027317;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:305:273,31:215,23:58,8
-chr20	28614307	.	TTC	T	0	PASS	DP=395;GPV=1;SPV=0.043453;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:198,25:112,13:86,12
-chr20	28623285	.	C	T	0	PASS	DP=318;GPV=1;SPV=0.012606;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:185:149,36:105,20:44,16
-chr20	28640875	.	C	T	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.026665;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:99,11:54,9:45,2
-chr20	28645448	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027524;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:10,5:5,3
-chr20	28861781	.	AC	A	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.031078;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:70,13:42,8:28,5
-chr20	28890149	.	C	CA	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.012413;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:96,17:29,4:67,13
-chr20	29073075	.	TA	T	0	PASS	DP=407;GPV=1;SPV=0.03738;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:207:178,29:72,4:106,25
-chr20	29073097	.	C	T	0	PASS	DP=384;GPV=1;SPV=0.048485;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:206:175,31:61,8:114,23
-chr20	29119431	.	T	C	0	PASS	DP=311;GPV=1;SPV=0.028171;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:140,19:63,6:77,13
-chr20	29248974	.	C	CA	0	PASS	DP=376;GPV=1;SPV=0.026235;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:256:229,27:131,17:98,10
-chr20	29321156	.	CA	C	0	PASS	DP=296;GPV=1;SPV=0.0019801;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:132,39:69,11:63,28
-chr20	29503185	.	A	G	0	PASS	DP=436;GPV=1;SPV=0.014857;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:248:212,36:109,11:103,25
-chr20	29504586	.	AT	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.0088583;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:61,19:25,6:36,13
-chr20	29662251	.	T	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.042124;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:20,6:18,1
-chr20	29738863	.	A	G	0	PASS	DP=301;GPV=1;SPV=0.043134;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:143,24:63,6:80,18
-chr20	29821788	.	T	C	0	PASS	DP=255;GPV=1;SPV=0.0047543;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:118,20:48,15:70,5
-chr20	29880455	.	G	A	0	PASS	DP=928;GPV=1;SPV=0.0029875;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:501:450,51:251,31:199,20
-chr20	29880516	.	G	A	0	PASS	DP=828;GPV=1;SPV=0.01893;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:438:387,51:204,35:183,16
-chr20	29897157	.	G	T	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.046093;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:144,25:68,14:76,11
-chr20	30154381	.	C	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0012895;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:49,12:21,7:28,5
-chr20	30727455	.	CACACACACACGT	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.024635;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,8:17,6:12,2
-chr20	30727526	.	C	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.017892;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:54,11:33,8:21,3
-chr20	31054776	.	T	A	0	PASS	DP=671;GPV=1;SPV=0.033557;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:343:300,43:145,20:155,23
-chr20	31060810	.	G	C	0	PASS	DP=1686;GPV=1;SPV=0.011049;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:995:882,100:445,75:437,25
-chr20	31069228	.	T	A	0	PASS	DP=1178;GPV=1;SPV=0.001115;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:699:588,111:204,27:384,84
-chr20	31072178	.	T	TGGAAA	0	PASS	DP=1113;GPV=1;SPV=0.040867;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:663:553,70:251,41:302,29
-chr20	31171448	.	G	GAAT	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.045288;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:15,5:26,1
-chr20	34650694	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.077531;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:12,2:18,3
-chr20	35578117	.	C	CTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:1,4:4,2
-chr20	35926362	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.042577;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,4:15,1
-chr20	36317223	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0045492;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,9:5,3:17,6
-chr20	37073705	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:8,10:4,4:4,6
-chr20	37480592	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,5:0,3:3,2
-chr20	37519404	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.011194;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:22,6:3,1
-chr20	38468121	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.00055593;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:49,12:28,5:21,7
-chr20	38662745	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.041365;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:15,3:8,1
-chr20	39636426	.	G	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.018013;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:49,6:28,4:21,2
-chr20	39700651	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00075349;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:26,10:14,2
-chr20	40094345	.	CTTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:9,3:10,1
-chr20	41555257	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.027859;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,5:7,1
-chr20	41848464	.	AT	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0069091;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:18,6:17,4
-chr20	42363270	.	TTATATATATATATA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:16,3:7,1
-chr20	42423178	.	T	TAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:11,6:7,4
-chr20	42655416	.	G	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0011693;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:26,5:18,7
-chr20	45942278	.	C	CT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.055772;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:20,4:18,1
-chr20	46568401	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.011308;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:11,7:8,2
-chr20	47039835	.	C	CTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0012546;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,13:3,11:2,2
-chr20	48515196	.	C	G	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.0065333;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:55,7:15,4:40,3
-chr20	54481002	.	C	CT	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.037368;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:49,11:29,4:20,7
-chr20	55587924	.	G	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00018355;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:48,18:25,4:23,14
-chr20	56114844	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00029833;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:20,4:13,6
-chr20	57350881	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr20	58736472	.	C	CAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.14971;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,7:17,5:8,2
-chr20	59491334	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0041352;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,8:13,5:6,3
-chr20	60018702	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,2:5,3
-chr20	61126462	.	T	TA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.03212;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:13,7:19,5
-chr20	61329895	.	G	GTCCATCTGT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0053893;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,14:2,3:18,11
-chr20	61329897	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011956;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:2,3:17,11
-chr20	62226743	.	G	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=9.3901e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:47,13:23,5:24,8
-chr20	63221510	.	CGGACTGCAGGGATTGCAG	C	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.008266;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:61,10:30,8:31,2
-chr20	63626400	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045056;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:21,5:14,1
-chr20	64131416	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.26796;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:17,1:19,3
-chr21	5377310	.	G	GA	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.019526;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:16,8:17,1
-chr21	5377321	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0090348;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:13,10:16,2
-chr21	7234619	.	C	A	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.019047;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:61,17:35,11:26,6
-chr21	7284211	.	G	A	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.034032;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:62,8:33,3:29,5
-chr21	7311054	.	C	G	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.0082281;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:56,15:17,4:39,11
-chr21	7947593	.	C	T	0	PASS	DP=324;GPV=1;SPV=0.012346;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:139,27:61,10:78,17
-chr21	7956671	.	T	G	0	PASS	DP=261;GPV=1;SPV=0.04126;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:111,15:52,5:59,10
-chr21	8032662	.	G	T	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.037103;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:75,11:38,6:37,5
-chr21	8043442	.	T	C	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.024791;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:102,25:39,10:63,15
-chr21	8530938	.	G	T	0	PASS	DP=310;GPV=1;SPV=0.049839;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:146,27:68,10:78,17
-chr21	8545244	.	C	T	0	PASS	DP=203;GPV=1;SPV=0.026785;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:88,16:43,6:45,10
-chr21	8549900	.	ACGCGGCTTTTTGCGCCCACCGC	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,2:14,2
-chr21	8671742	.	A	C	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.0027686;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:65,24:40,13:25,11
-chr21	8702759	.	C	CAT	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.011216;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:101,25:58,9:43,16
-chr21	8763455	.	G	T	0	PASS	DP=366;GPV=1;SPV=0.0029205;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:190:157,33:86,17:71,16
-chr21	8763673	.	G	T	0	PASS	DP=363;GPV=1;SPV=0.043572;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:201:177,24:90,14:87,10
-chr21	8771691	.	T	A	0	PASS	DP=325;GPV=1;SPV=0.049824;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:172:149,23:74,17:75,6
-chr21	8778000	.	G	A	0	PASS	DP=450;GPV=1;SPV=0.032269;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:247:216,31:112,15:104,16
-chr21	8779650	.	T	A	0	PASS	DP=380;GPV=1;SPV=0.016695;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:207:176,31:91,20:85,11
-chr21	8797707	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.022054;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:4,1:26,7
-chr21	8806422	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.028409;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,1:16,3
-chr21	8806745	.	G	C	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.04515;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:96,13:61,8:35,5
-chr21	8815758	.	C	T	0	PASS	DP=587;GPV=1;SPV=0.034858;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:321:276,44:96,18:180,26
-chr21	8816612	.	A	G	0	PASS	DP=292;GPV=1;SPV=0.043024;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:132,28:114,21:18,7
-chr21	8819382	.	C	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.046688;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:24,3:17,3
-chr21	8823242	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043789;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,3:12,2
-chr21	8825121	.	C	T	0	PASS	DP=440;GPV=1;SPV=0.047395;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:202,25:102,11:100,14
-chr21	8839785	.	C	T	0	PASS	DP=357;GPV=1;SPV=0.029043;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:188:168,20:114,9:54,11
-chr21	8878700	.	T	C	0	PASS	DP=841;GPV=1;SPV=0.047098;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:463:412,51:229,31:183,20
-chr21	8987900	.	A	G	0	PASS	DP=2146;GPV=1;SPV=0.0050428;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:1153:1002,143:844,72:158,71
-chr21	8993706	.	C	T	0	PASS	DP=447;GPV=1;SPV=0.04647;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:245:220,25:108,13:112,12
-chr21	9008657	.	T	C	0	PASS	DP=404;GPV=1;SPV=0.018758;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:232:207,25:85,7:122,18
-chr21	9013374	.	A	G	0	PASS	DP=350;GPV=1;SPV=0.0048849;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:148,35:82,23:66,12
-chr21	9013554	.	C	CT	0	PASS	DP=326;GPV=1;SPV=0.043271;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:141,28:78,11:63,17
-chr21	9013741	.	G	A	0	PASS	DP=367;GPV=1;SPV=0.046477;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:218:185,33:96,16:89,17
-chr21	9015952	.	A	G	0	PASS	DP=522;GPV=1;SPV=0.046044;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:282:243,39:125,20:118,19
-chr21	9020764	.	G	A	0	PASS	DP=500;GPV=1;SPV=0.012366;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:289:251,38:135,19:116,19
-chr21	9024027	.	C	A	0	PASS	DP=529;GPV=1;SPV=0.021783;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:281:249,32:132,16:117,16
-chr21	9024957	.	A	C	0	PASS	DP=476;GPV=1;SPV=0.038402;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:251:220,31:97,16:123,15
-chr21	9032118	.	G	A	0	PASS	DP=544;GPV=1;SPV=0.029411;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:286:257,29:143,20:114,9
-chr21	9033231	.	G	A	0	PASS	DP=511;GPV=1;SPV=0.0026081;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:262:229,33:118,14:111,19
-chr21	9041943	.	G	A	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.042496;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:149,18:81,9:68,9
-chr21	9056372	.	A	T	0	PASS	DP=428;GPV=1;SPV=0.036967;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:203,30:131,22:72,8
-chr21	9059642	.	A	T	0	PASS	DP=388;GPV=1;SPV=0.036616;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:222:194,28:121,19:73,9
-chr21	9070128	.	G	A	0	PASS	DP=575;GPV=1;SPV=0.039435;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:285:256,29:133,23:123,6
-chr21	9102690	.	T	G	0	PASS	DP=495;GPV=1;SPV=0.038667;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:272:231,41:151,14:80,27
-chr21	9106027	.	C	T	0	PASS	DP=294;GPV=1;SPV=0.037169;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:135,21:72,12:63,9
-chr21	9110896	.	T	C	0	PASS	DP=780;GPV=1;SPV=0.011975;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:451:383,68:172,26:211,42
-chr21	9120170	.	T	C	0	PASS	DP=497;GPV=1;SPV=0.040604;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:278:245,33:123,17:122,16
-chr21	9123976	.	C	A	0	PASS	DP=852;GPV=1;SPV=0.022951;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:474:417,57:223,31:194,26
-chr21	9131132	.	C	T	0	PASS	DP=874;GPV=1;SPV=0.04638;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:456:396,60:206,28:190,32
-chr21	9150722	.	A	C	0	PASS	DP=750;GPV=1;SPV=0.032696;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:402:348,54:179,29:169,25
-chr21	9155364	.	C	T	0	PASS	DP=467;GPV=1;SPV=0.030253;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:262:231,31:168,23:63,8
-chr21	9166199	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=272;GPV=1;SPV=0.037934;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:152:85,21:38,18:47,3
-chr21	9169532	.	T	A	0	PASS	DP=733;GPV=1;SPV=0.02235;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:418:371,47:179,16:192,31
-chr21	9172451	.	A	T	0	PASS	DP=524;GPV=1;SPV=0.038483;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:297:258,39:143,17:115,22
-chr21	9177169	.	C	T	0	PASS	DP=605;GPV=1;SPV=0.0073745;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:339:298,41:176,19:122,22
-chr21	9192936	.	G	GA	0	PASS	DP=457;GPV=1;SPV=0.038651;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:256:215,41:104,12:111,29
-chr21	9255491	.	G	A	0	PASS	DP=952;GPV=1;SPV=0.0017834;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:530:470,54:204,18:266,36
-chr21	9264019	.	T	A	0	PASS	DP=415;GPV=1;SPV=0.021377;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:189,32:99,24:90,8
-chr21	9265282	.	AG	A	0	PASS	DP=325;GPV=1;SPV=0.0071758;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:185:156,29:104,19:52,10
-chr21	9286058	.	T	G	0	PASS	DP=270;GPV=1;SPV=0.040609;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:133,20:105,12:28,8
-chr21	9292979	.	GT	G	0	PASS	DP=374;GPV=1;SPV=0.021292;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:176,36:44,4:132,32
-chr21	9321336	.	GT	G	0	PASS	DP=571;GPV=1;SPV=0.01829;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:308:264,44:132,23:132,21
-chr21	9334566	.	A	G	0	PASS	DP=487;GPV=1;SPV=0.0040494;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:260:211,48:106,20:105,28
-chr21	9348069	.	T	G	0	PASS	DP=669;GPV=1;SPV=0.00026859;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:363:295,68:130,28:165,40
-chr21	9362795	.	C	T	0	PASS	DP=473;GPV=1;SPV=0.00051641;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:264:225,39:123,11:102,28
-chr21	9368395	.	C	T	0	PASS	DP=1221;GPV=1;SPV=0.0091982;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:635:565,70:290,46:275,24
-chr21	9374811	.	G	T	0	PASS	DP=861;GPV=1;SPV=0.040834;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:462:402,60:179,37:223,23
-chr21	9568119	.	GATA	G	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.021101;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:81,19:45,7:36,12
-chr21	9579930	.	G	C	0	PASS	DP=297;GPV=1;SPV=0.00087408;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:122,35:57,19:65,16
-chr21	9604525	.	C	CAA	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.0084205;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:66,15:43,10:23,5
-chr21	9619052	.	C	T	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.011468;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:78,22:54,17:24,5
-chr21	9689135	.	C	T	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.026206;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:122,26:65,10:57,16
-chr21	9721868	.	C	T	0	PASS	DP=212;GPV=1;SPV=0.033766;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:96,21:57,11:39,10
-chr21	9820722	.	G	T	0	PASS	DP=588;GPV=1;SPV=0.021097;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:313:272,41:139,27:133,14
-chr21	9820972	.	G	A	0	PASS	DP=797;GPV=1;SPV=0.0025079;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:426:371,55:144,25:227,30
-chr21	9858418	.	A	C	0	PASS	DP=211;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:104,26:49,17:55,9
-chr21	9880504	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.0052311;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:45,16:23,8:22,8
-chr21	9942462	.	C	A	0	PASS	DP=308;GPV=1;SPV=0.030683;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:145,25:67,11:78,14
-chr21	10024042	.	G	T	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.047615;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:74,20:43,14:31,6
-chr21	10087051	.	A	G	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.00063389;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:102,29:53,17:49,12
-chr21	10325231	.	TATATA	T	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.046502;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:69,9:43,8:26,1
-chr21	10333904	.	C	T	0	PASS	DP=480;GPV=1;SPV=0.0018907;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:264:233,31:84,13:149,18
-chr21	10366189	.	T	C	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.040644;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:141:119,22:54,11:65,11
-chr21	10423803	.	T	A	0	PASS	DP=544;GPV=1;SPV=0.010678;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:235,43:134,22:101,21
-chr21	10467542	.	A	G	0	PASS	DP=502;GPV=1;SPV=0.029368;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:269:239,30:120,16:119,14
-chr21	10469473	.	G	A	0	PASS	DP=532;GPV=1;SPV=0.024453;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:291:247,44:120,20:127,24
-chr21	10472512	.	GAAC	G	0	PASS	DP=520;GPV=1;SPV=0.0031242;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:269:220,49:120,27:100,22
-chr21	10480244	.	T	C	0	PASS	DP=509;GPV=1;SPV=0.0024418;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:282:237,45:123,28:114,17
-chr21	10480245	.	G	A	0	PASS	DP=518;GPV=1;SPV=0.0042244;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:287:242,45:129,28:113,17
-chr21	10485910	.	C	T	0	PASS	DP=277;GPV=1;SPV=0.011841;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:162:137,25:70,13:67,12
-chr21	10679026	.	ATTCCG	A	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.016439;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:89,20:48,12:41,8
-chr21	10785034	.	A	G	0	PASS	DP=270;GPV=1;SPV=0.0013993;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:139,30:56,10:83,20
-chr21	10798374	.	G	A	0	PASS	DP=581;GPV=1;SPV=0.015273;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:361:315,46:170,26:145,20
-chr21	13137513	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.046561;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:9,7:34,1
-chr21	13144811	.	C	A	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.047696;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:30,2:24,4
-chr21	13379484	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.013587;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,5:9,3
-chr21	13641624	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.032295;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:18,1:13,8
-chr21	13907540	.	G	A	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.03431;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:60,9:35,6:25,3
-chr21	16854693	.	TTTC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022726;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:7,2:8,6
-chr21	17483379	.	C	CTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,4:7,1:8,3
-chr21	17973417	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.020011;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,6:5,2
-chr21	18982554	.	A	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0067604;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:44,8:26,3:18,5
-chr21	19463992	.	C	CATACATATATATATAT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.05384;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,5:12,4:9,1
-chr21	19628116	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.068138;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,4:21,3:11,1
-chr21	22232667	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.052643;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:6,4:8,2
-chr21	23590599	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.015395;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:13,6:4,1
-chr21	23697931	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.025013;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:21,9:9,1:12,8
-chr21	24846151	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,2:5,2:0,0
-chr21	24948990	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0052229;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:13,4:16,4
-chr21	25615142	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:11,5:4,2:7,3
-chr21	27298891	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.015718;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:4,5:1,2
-chr21	27347967	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.1174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,4:15,2:15,2
-chr21	27354565	.	T	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0037211;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:26,4:19,5
-chr21	27416163	.	TG	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:7,4:4,1
-chr21	27814389	.	CACACACACACACACACACACATACACACACACACATATAT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.018505;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:9,3:13,3
-chr21	28617212	.	G	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0040373;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,8:20,5:27,3
-chr21	28877054	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
-chr21	31944841	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0030877;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:19,5:20,3
-chr21	31947865	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=2.1435e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:39,17:17,3:22,14
-chr21	32258875	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0097766;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:19,2:20,6
-chr21	33443898	.	T	TG	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.41384;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:34,4:17,2:17,2
-chr21	33577660	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,3:5,3
-chr21	34886880	.	T	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=2.4883e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:37,16:20,10:17,6
-chr21	35224837	.	TAAAAA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00060756;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,13:3,11:7,2
-chr21	36401545	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.059432;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,2:10,2
-chr21	36679792	.	G	GA	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.03324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,7:26,3:10,4
-chr21	37715702	.	G	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=3.2932e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:44,17:21,7:23,10
-chr21	38080849	.	G	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.00015222;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:17,5:27,6
-chr21	38247073	.	GATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGC	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12656;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:15,2:18,2
-chr21	38823821	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00014004;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:10,5:23,7
-chr21	40856359	.	A	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.055222;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:22,4:9,1:13,3
-chr21	42726623	.	TA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,4:3,2:3,2
-chr21	43285797	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11553;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:5,1:18,4
-chr21	43285798	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.23453;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:5,1:20,3
-chr21	45798200	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.064069;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:24,2:12,2
-chr21	46011608	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.034481;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:6,2:8,4
-chr21	46135606	.	C	CCCCCTCACAAATGT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.045809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:8,5:8,5
-chr21	46290029	.	T	TCG	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.0010541;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:63,17:37,6:26,11
-chr22	10689007	.	G	C	0	PASS	DP=320;GPV=1;SPV=0.0079376;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:133,27:55,10:78,17
-chr22	10700391	.	G	C	0	PASS	DP=523;GPV=1;SPV=0.033443;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:298:268,30:126,16:142,14
-chr22	10714537	.	G	A	0	PASS	DP=513;GPV=1;SPV=0.036131;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:283:252,31:148,18:104,13
-chr22	10733494	.	C	T	0	PASS	DP=981;GPV=1;SPV=0.043216;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:518:460,58:232,33:228,25
-chr22	10736687	.	T	C	0	PASS	DP=893;GPV=1;SPV=0.013435;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:485:424,61:222,32:202,29
-chr22	10747965	.	T	TAA	0	PASS	DP=527;GPV=1;SPV=0.0026073;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:240,38:123,4:117,34
-chr22	10750862	.	C	A	0	PASS	DP=456;GPV=1;SPV=0.039077;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:265:238,27:134,14:104,13
-chr22	10751852	.	G	T	0	PASS	DP=304;GPV=1;SPV=0.035037;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:144,27:57,20:87,7
-chr22	10769175	.	C	T	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.023598;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:110,26:42,11:68,15
-chr22	10770017	.	C	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.023772;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:15,2:38,9
-chr22	10859372	.	G	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
-chr22	11037850	.	CATGGTCTATCCACCAGAAGCTCCACT	C	0	PASS	DP=409;GPV=1;SPV=0.016737;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:192,25:116,11:76,14
-chr22	11045266	.	A	G	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.049948;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:105,12:62,3:43,9
-chr22	11450271	.	C	G	0	PASS	DP=403;GPV=1;SPV=0.048218;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:189,28:69,18:120,10
-chr22	11461986	.	C	T	0	PASS	DP=298;GPV=1;SPV=0.04756;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:132,26:86,14:46,12
-chr22	11581793	.	T	A	0	PASS	DP=242;GPV=1;SPV=0.0010021;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:141:108,33:54,17:54,16
-chr22	11681871	.	AT	A	0	PASS	DP=318;GPV=1;SPV=0.035282;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:129,24:61,8:68,16
-chr22	11723034	.	C	T	0	PASS	DP=327;GPV=1;SPV=0.045514;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:199:170,29:63,9:107,20
-chr22	11786618	.	A	G	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.043844;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:58,9:24,3:34,6
-chr22	11792346	.	CTA	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00031414;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:15,9:5,4
-chr22	11794198	.	G	A	0	PASS	DP=362;GPV=1;SPV=0.0037187;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:176,21:79,10:97,11
-chr22	11863677	.	C	T	0	PASS	DP=398;GPV=1;SPV=0.0072569;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:213:187,26:103,15:84,11
-chr22	11879766	.	T	A	0	PASS	DP=976;GPV=1;SPV=0.036518;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:541:469,72:283,42:186,30
-chr22	11903218	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,4:5,3:2,1
-chr22	11909680	.	A	T	0	PASS	DP=352;GPV=1;SPV=0.0010556;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:200:164,36:101,15:63,21
-chr22	11929057	.	C	T	0	PASS	DP=969;GPV=1;SPV=0.022939;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:522:467,55:249,31:218,24
-chr22	11930912	.	A	C	0	PASS	DP=951;GPV=1;SPV=0.044041;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:513:454,59:233,29:221,30
-chr22	11932496	.	T	C	0	PASS	DP=676;GPV=1;SPV=0.044802;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:360:319,41:130,17:189,24
-chr22	11932569	.	G	A	0	PASS	DP=625;GPV=1;SPV=0.031177;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:317:277,40:124,23:153,17
-chr22	11936610	.	G	A	0	PASS	DP=405;GPV=1;SPV=0.027745;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:229:199,30:77,7:122,23
-chr22	11937738	.	C	T	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.0085398;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:94,26:37,4:57,22
-chr22	11942202	.	C	T	0	PASS	DP=445;GPV=1;SPV=0.039894;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:239:210,29:82,20:128,9
-chr22	11946259	.	T	C	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.0058279;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:66,10:33,4:33,6
-chr22	11946261	.	C	T	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.0040059;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:69,11:31,5:38,6
-chr22	11976519	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.019883;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:28,9:21,1
-chr22	11976540	.	C	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.008073;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:51,13:33,11:18,2
-chr22	12033461	.	A	C	0	PASS	DP=614;GPV=1;SPV=0.029847;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:334:300,34:150,21:150,13
-chr22	12050597	.	A	T	0	PASS	DP=544;GPV=1;SPV=0.016893;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:322:285,37:127,19:158,18
-chr22	12055207	.	T	G	0	PASS	DP=357;GPV=1;SPV=0.036506;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:165,26:80,15:85,11
-chr22	12061675	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,0:10,4
-chr22	12088780	.	CTT	C	0	PASS	DP=319;GPV=1;SPV=0.022509;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:153,18:83,10:70,8
-chr22	12142166	.	A	T	0	PASS	DP=203;GPV=1;SPV=0.025642;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:91,13:37,6:54,7
-chr22	12152516	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.045548;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:49,12:28,7:21,5
-chr22	12166049	.	G	A	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.021333;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:32,6:11,4
-chr22	12185462	.	G	T	0	PASS	DP=462;GPV=1;SPV=0.038331;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:250:216,34:112,17:104,17
-chr22	12195493	.	A	C	0	PASS	DP=335;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:187:168,19:73,15:95,4
-chr22	12203053	.	A	C	0	PASS	DP=440;GPV=1;SPV=0.011802;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:259:214,45:139,13:75,32
-chr22	12208373	.	T	C	0	PASS	DP=263;GPV=1;SPV=0.02796;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:115,27:40,9:75,18
-chr22	12220167	.	T	C	0	PASS	DP=442;GPV=1;SPV=0.047508;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:207,26:121,14:86,12
-chr22	12308408	.	G	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.04336;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:47,9:18,1:29,8
-chr22	12309863	.	G	T	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.02033;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:103,13:61,11:42,2
-chr22	12318474	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0012208;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:7,6:9,9
-chr22	12367917	.	C	T	0	PASS	DP=190;GPV=1;SPV=0.00052148;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:74,27:30,11:44,16
-chr22	12414131	.	T	G	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.0080936;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:106,29:44,15:62,14
-chr22	12414141	.	T	C	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.0039034;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:108,32:44,15:64,17
-chr22	12621815	.	A	G	0	PASS	DP=432;GPV=1;SPV=0.012537;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:242:217,25:105,18:112,7
-chr22	12622715	.	CAT	C	0	PASS	DP=269;GPV=1;SPV=0.01243;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:125,15:58,6:67,9
-chr22	12704191	.	A	C	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.018695;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:114,28:48,14:66,14
-chr22	12717397	.	T	A	0	PASS	DP=417;GPV=1;SPV=0.029457;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:230:199,30:91,4:108,26
-chr22	12721141	.	G	A	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.0064155;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:101,28:36,18:65,10
-chr22	12721329	.	C	T	0	PASS	DP=344;GPV=1;SPV=0.020704;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:163,33:104,17:59,16
-chr22	12725414	.	T	A	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.030986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:83,20:49,13:34,7
-chr22	12783586	.	A	G	0	PASS	DP=177;GPV=1;SPV=0.041242;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:76,15:34,5:42,10
-chr22	12807090	.	G	T	0	PASS	DP=311;GPV=1;SPV=0.006667;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:172:149,22:75,10:74,12
-chr22	12811984	.	A	C	0	PASS	DP=238;GPV=1;SPV=0.039103;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:117,16:54,10:63,6
-chr22	12874391	.	C	T	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.018876;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:116,14:1,1:115,13
-chr22	12899067	.	A	AAG	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.0096207;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:80,22:9,2:71,20
-chr22	12899086	.	C	T	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.016357;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:79,23:10,2:69,21
-chr22	15246055	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.010276;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:18,3:10,5
-chr22	15328198	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.044843;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:26,6:20,5
-chr22	15362633	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0054483;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:30,4:11,5
-chr22	15375380	.	A	G	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.015007;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:32,8:27,1
-chr22	15493116	.	TTTTATTTA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01404;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:6,1:8,5
-chr22	15522715	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.037221;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:21,8:13,3
-chr22	15541395	.	T	C	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.030268;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:98,19:51,9:47,10
-chr22	15561011	.	A	G	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.037527;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:52,15:23,2:29,13
-chr22	15646529	.	GA	G	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.0033681;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:67,18:43,10:24,8
-chr22	15724758	.	C	T	0	PASS	DP=327;GPV=1;SPV=0.047029;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:175:147,28:85,15:62,13
-chr22	15781692	.	C	T	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.0032617;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:69,11:38,7:31,4
-chr22	15792412	.	C	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:2,1:10,3
-chr22	15811856	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.031652;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:14,1:9,8
-chr22	15813627	.	A	T	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.038366;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:72,10:49,8:23,2
-chr22	15851023	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
-chr22	15890034	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.014047;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:2,3:4,1
-chr22	15941887	.	C	G	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.019626;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:65,18:59,17:6,1
-chr22	15941905	.	C	G	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.014796;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:69,19:64,18:5,1
-chr22	15948114	.	T	C	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.0090593;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:97,27:52,14:45,13
-chr22	16071022	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,2:2,5
-chr22	16149178	.	G	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=2.8187e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:43,17:20,8:23,9
-chr22	16255232	.	C	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00049344;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:41,21:25,15:16,6
-chr22	16358075	.	C	CTGGAATGGAATGGAATGGAA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023399;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,7:11,3
-chr22	16451280	.	C	T	0	PASS	DP=298;GPV=1;SPV=0.036095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:148,18:101,14:47,4
-chr22	16545715	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.048152;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:21,4:12,1
-chr22	16558256	.	G	GGCCAGCCAA	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.012849;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,14:14,4:15,10
-chr22	16772010	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.012694;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,14:5,12:2,2
-chr22	17710067	.	T	TAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.03177;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,9:12,5:7,4
-chr22	18172991	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.018829;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:18,7:23,7
-chr22	18357235	.	C	A	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.043095;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:79,14:34,8:45,6
-chr22	18501462	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027524;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,6:9,2
-chr22	18551852	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.01699;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:10,2:16,9
-chr22	18775887	.	G	A	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.01;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:37,1:21,7
-chr22	18856566	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.015096;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:20,1:24,5
-chr22	18864091	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.014772;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:13,5:23,4
-chr22	20201442	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,3:0,0:2,3
-chr22	21023436	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.0078472;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:21,4:23,2
-chr22	21123786	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.048804;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,3:15,1
-chr22	21129361	.	G	C	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.038397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:108,26:66,14:42,12
-chr22	21160939	.	C	CA	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0069435;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,13:22,10:5,3
-chr22	21183055	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:23,4:2,0
-chr22	21194980	.	T	C	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.0095288;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:49,9:29,8:20,1
-chr22	21199929	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.040092;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:19,2:23,6
-chr22	21256321	.	A	G	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.020495;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:52,11:32,6:20,5
-chr22	21276374	.	G	A	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.0032688;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:79,19:30,7:49,12
-chr22	21281758	.	C	CAA	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.038365;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:68,16:41,11:27,5
-chr22	21282567	.	G	A	0	PASS	DP=159;GPV=1;SPV=0.037464;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:76,12:37,2:39,10
-chr22	22906108	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0089808;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:13,4:20,4
-chr22	23916807	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.017646;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:17,3:1,2
-chr22	23937746	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,2:7,3
-chr22	23937765	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:15,1:10,3
-chr22	23951323	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.047026;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:26,1:9,3
-chr22	25085783	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:24,3:1,1
-chr22	26294892	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.025639;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:11,3:12,5
-chr22	26773211	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.031743;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:23,9:13,2
-chr22	27506065	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,6:5,1
-chr22	27769552	.	A	ATTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.28173;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:3,3:8,1
-chr22	29159129	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:15,2:9,5
-chr22	31913686	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,4:4,1
-chr22	32213647	.	TATAC	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0342;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,7:6,4:12,3
-chr22	32409823	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:17,4:6,2:11,2
-chr22	34423171	.	C	CT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.015231;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,9:5,4:10,5
-chr22	34440931	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00013624;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:22,10:17,3
-chr22	34729243	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00041682;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:16,5:19,6
-chr22	35002572	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,10:12,8:1,2
-chr22	36074155	.	ATATATG	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.087004;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:19,1:13,3
-chr22	37152929	.	C	CTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,5:4,4:6,1
-chr22	37325753	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:2,5:3,1
-chr22	38550946	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.10359;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:18,2:11,2
-chr22	39057005	.	G	GTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:4,4:4,2
-chr22	39110577	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.019973;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:12,2:19,5
-chr22	40075154	.	A	ATT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:11,3:8,1
-chr22	40164779	.	GTT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00098508;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:1,9:0,6:1,3
-chr22	40586903	.	GTGC	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.018872;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:20,3:16,3
-chr22	41039446	.	TA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.031685;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:11,4:19,2
-chr22	41187130	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,8:4,7:7,1
-chr22	41649139	.	A	AAAAAAAATATATATATATATAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.041455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,1:7,3
-chr22	41649160	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0054797;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:10,5:12,4
-chr22	42982888	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045968;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:5,3:11,3
-chr22	43281460	.	C	CTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,4:8,2:6,2
-chr22	43281461	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:7,4:6,2
-chr22	43344508	.	G	GCA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.029194;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,9:18,8:4,1
-chr22	45321847	.	C	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0059888;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:47,10:29,4:18,6
-chr22	45670438	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047956;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,1:4,4
-chr22	46628577	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.042462;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:20,4:4,2
-chr22	47425042	.	A	ATCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.015968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,8:1,3:11,5
-chr22	47822489	.	T	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.00016147;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,12:28,2:18,10
-chr22	48414872	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.013151;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:14,6:19,6
-chr22	48493497	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=4.2021e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:33,18:22,7:11,11
-chr22	48661949	.	T	TG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.115;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:20,4:14,1
-chr22	48736261	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0032318;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:8,8:3,3
-chr22	48926645	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:0,1:6,4
-chr22	48942477	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.038776;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:20,2:24,3
-chr22	49071003	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,4:2,1:4,3
-chr22	49981606	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.13742;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,4:18,2:6,2
-chr22	50397790	.	T	TCC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.027557;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:11,4:1,0
-chr3	539552	.	C	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=2.9334e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:26,11:20,3
-chr3	594638	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=8.3492e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:35,21:19,9:16,12
-chr3	760398	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.047242;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:12,2:13,6
-chr3	2798074	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.089726;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,6:18,2:19,4
-chr3	4456773	.	C	CGTGTAT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.026963;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,7:10,3:16,4
-chr3	4457038	.	GTATATATATATACGTGTGTGTATATATATATATATACGTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.12945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:18,3:17,1
-chr3	7928613	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.011853;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:15,4:8,10
-chr3	7928614	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.015065;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:11,4:9,8
-chr3	9556782	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.040958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:17,7:13,5
-chr3	12095535	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:1,3:9,1
-chr3	13682097	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0223;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:12,8:19,2
-chr3	15446818	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.062192;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,6:9,5:8,1
-chr3	17943713	.	C	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=2.4942e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:22,7:18,8
-chr3	18853399	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=4.4921e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:19,10:20,6
-chr3	21143522	.	T	TATATAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
-chr3	22541399	.	C	CATATACACACATATGTGTACAT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.039984;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,10:14,6:12,4
-chr3	23328661	.	TC	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.055024;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:28,4:12,2
-chr3	23921570	.	GT	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00098502;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:12,13:8,2
-chr3	23921574	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0022239;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:8,13:14,3
-chr3	25849097	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=1.3678e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,18:20,11:15,7
-chr3	27902453	.	AT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:11,2:6,3
-chr3	27916234	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.048274;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:17,5:16,2
-chr3	28865466	.	CCT	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10299;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:14,1:23,4
-chr3	30172443	.	TGA	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,4:10,2:18,2
-chr3	30509594	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.002901;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:15,2:25,8
-chr3	32938730	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.012825;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,10:15,2:7,8
-chr3	33113157	.	G	GA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0091169;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:18,4:3,2
-chr3	34543707	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00010498;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:18,11:17,3
-chr3	34705068	.	A	ATAT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.022424;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:9,8:11,1
-chr3	34705070	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.014937;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:9,8:10,2
-chr3	36398591	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,4:5,1
-chr3	37004861	.	A	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.00029634;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:18,4:21,7
-chr3	38161250	.	ATATATTTCATG	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.029223;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:54,11:26,7:28,4
-chr3	38949519	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=5.5261e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:23,5:17,10
-chr3	39169713	.	AGAAG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,5:5,4:2,1
-chr3	41123103	.	C	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=7.7811e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:20,6:19,7
-chr3	42272301	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=2.6976e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:40,18:18,9:22,9
-chr3	43016925	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016558;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:18,3:17,4
-chr3	43580142	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.036288;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:15,2:5,2
-chr3	44405951	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.014318;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,9:10,7:3,2
-chr3	46161710	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.090728;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,6:11,2:10,4
-chr3	49790111	.	TTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.038306;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,6:4,3:12,3
-chr3	50016829	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.089909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,4:13,3:16,1
-chr3	50946094	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:5,4:4,2
-chr3	50975454	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.024549;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:12,10:15,2
-chr3	51016122	.	G	GAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,4:4,1
-chr3	51760324	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0046387;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:18,4:11,3
-chr3	54547672	.	CT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0033618;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,10:6,3:1,7
-chr3	54918336	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020817;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:11,6:6,1
-chr3	55003739	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0037149;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:19,4:23,4
-chr3	55368311	.	CCACA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:13,8:3,2
-chr3	55651038	.	T	TG	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0041072;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,11:9,2:9,9
-chr3	57959637	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.019611;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:23,3:20,3
-chr3	58386290	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:3,4:3,2
-chr3	59082428	.	TATA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:3,2:6,4
-chr3	60058130	.	GT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,1:4,3
-chr3	60206152	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.049205;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:17,5:20,2
-chr3	60418374	.	GTGTATATA	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.014569;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:1,6:1,5:0,1
-chr3	60418426	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.013387;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:1,1:7,6
-chr3	60859723	.	ATTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:9,3:4,1
-chr3	60860722	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.020146;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:9,3:10,6
-chr3	62005690	.	CTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,6:5,2
-chr3	62750353	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,8:5,7:4,1
-chr3	62847576	.	A	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:0,1:4,7
-chr3	62855091	.	A	ATTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:6,1:5,3
-chr3	64475229	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=3.9759e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:35,17:17,9:18,8
-chr3	65929402	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0012029;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:25,7:19,4
-chr3	66095020	.	T	TC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.25926;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,4:9,2:6,2
-chr3	67265479	.	T	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.018065;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:22,1:23,7
-chr3	67838857	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=3.0224e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:16,12:14,6
-chr3	67911386	.	T	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0044491;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:23,4:23,5
-chr3	68076855	.	C	T	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.04767;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:50,8:32,1:18,7
-chr3	68444771	.	A	AATAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0056039;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,9:7,3:5,6
-chr3	68760215	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00061221;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:18,3:17,10
-chr3	68760216	.	A	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0016391;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:22,3:17,9
-chr3	69263817	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:2,2:3,2
-chr3	69477359	.	A	AT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0027151;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:9,3:12,12
-chr3	69560415	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,2:3,2
-chr3	70154530	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00083722;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:12,5:22,6
-chr3	72045562	.	CTATAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.035372;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:3,5:5,1
-chr3	72857229	.	C	CA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11923;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:25,3:11,1
-chr3	73600335	.	A	ACTCT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,5:2,1:9,4
-chr3	73734013	.	C	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=3.9089e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:42,23:18,16:24,7
-chr3	74210363	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.0504e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:32,16:21,6:11,10
-chr3	75155073	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0010228;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:22,7:17,4
-chr3	75697563	.	TG	T	0	PASS	DP=346;GPV=1;SPV=0.032276;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:150,27:71,15:79,12
-chr3	75880014	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=2.017e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:34,15:20,7:14,8
-chr3	76273403	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00045564;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:20,5:16,7
-chr3	76682685	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=2.8766e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:49,19:18,6:31,13
-chr3	76760920	.	C	CT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.01062;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:15,4:15,3
-chr3	78673605	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:4,1:4,3
-chr3	79023696	.	GTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:13,1:2,4
-chr3	79024828	.	C	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=2.6242e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:46,17:24,7:22,10
-chr3	84324433	.	G	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00023502;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:18,6:21,5
-chr3	85568473	.	C	CTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.17622;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:5,4:0,3:5,1
-chr3	86405125	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018485;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:7,6:3,5
-chr3	86596078	.	G	A	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.0011685;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:63,19:32,15:31,4
-chr3	86843970	.	T	TAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:3,8:8,1
-chr3	86859807	.	A	AAT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.24893;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,4:11,3:13,1
-chr3	86859822	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.13783;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,5:12,4:20,1
-chr3	87794982	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,4:3,1
-chr3	90798808	.	C	G	0	PASS	DP=281;GPV=1;SPV=0.0046815;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:137,19:4,1:133,18
-chr3	90805489	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:1,3:6,1
-chr3	90831428	.	A	G	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.045123;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:64,11:53,10:11,1
-chr3	90851104	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27277;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:1,0:20,4
-chr3	90886829	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:27,3:1,1
-chr3	90903284	.	A	C	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.0022767;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:64,8:19,7:45,1
-chr3	90903489	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15115;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:18,1:11,3
-chr3	90905544	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.017926;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:9,4:25,3
-chr3	90939262	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0027092;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:11,6:3,2
-chr3	90948816	.	T	A	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.049765;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:90,14:39,12:51,2
-chr3	90954559	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.13255;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:0,1:31,3
-chr3	90984477	.	T	A	0	PASS	DP=363;GPV=1;SPV=0.0024643;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:209:187,22:117,16:70,6
-chr3	90997507	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:0,3:17,1
-chr3	91002253	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.15567;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,4:28,1:5,3
-chr3	91014694	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.053889;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:1,0:30,4
-chr3	91018076	.	G	A	0	PASS	DP=288;GPV=1;SPV=0.0016556;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:141,19:107,17:34,2
-chr3	91018090	.	C	A	0	PASS	DP=273;GPV=1;SPV=0.0016843;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:152:133,19:97,17:36,2
-chr3	91018462	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.10571;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:1,0:35,4
-chr3	91027672	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0074891;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,1:1,4
-chr3	91048782	.	C	T	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.0011912;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:88,22:76,20:12,2
-chr3	91069464	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.059099;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:17,1:0,3
-chr3	91090520	.	G	C	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.031628;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:73,11:50,6:23,5
-chr3	91090645	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.051203;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:7,3:13,3
-chr3	91149523	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.087004;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:0,3:32,1
-chr3	91152348	.	T	G	0	PASS	DP=481;GPV=1;SPV=0.005532;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:244:218,26:55,4:163,22
-chr3	91177444	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:30,4:0,0
-chr3	91283350	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045135;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:26,4:6,1
-chr3	91932493	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
-chr3	92156121	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.05384;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:3,2:18,3
-chr3	95131785	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,4:6,3:6,1
-chr3	96994759	.	A	AGAGAGC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.041509;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,10:9,5:8,5
-chr3	99263623	.	C	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,3:1,1:0,2
-chr3	100135438	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.016961;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:11,5:5,4
-chr3	100956214	.	AACACACACACAC	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.019569;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,7:12,6:8,1
-chr3	101616345	.	CCTTTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014604;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,7:7,2
-chr3	102517213	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.022089;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,15:16,13:12,2
-chr3	103099702	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063158;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:2,1:4,2
-chr3	103235162	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026014;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:3,2:12,2
-chr3	103490639	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,4:9,1
-chr3	103750097	.	C	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.00017007;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:57,18:32,10:25,8
-chr3	104465360	.	T	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00082723;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:20,5:26,6
-chr3	105266608	.	T	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:21,4:9,2:12,2
-chr3	105529504	.	A	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=2.1899e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:38,17:16,7:22,10
-chr3	106707337	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10396;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,5:11,2:14,3
-chr3	108795945	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0053746;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,10:4,9:6,1
-chr3	109321582	.	GT	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.019606;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:13,8:10,4
-chr3	109527907	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:19,4:8,2:11,2
-chr3	109906974	.	GATAT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,3:3,1
-chr3	109930083	.	C	CCCTTCCCTCCTTCCCTCCTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.27439;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,3:7,2:17,1
-chr3	110172450	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00070127;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:21,7:16,5
-chr3	110648326	.	C	CT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0097737;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:12,4:10,1
-chr3	112012215	.	G	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,13:1,1:9,12
-chr3	112562096	.	C	A	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.0003713;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:56,11:28,5:28,6
-chr3	115537067	.	TATAG	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:4,2:6,3
-chr3	115776408	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0034116;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:32,6:10,2
-chr3	116421443	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=9.7046e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:18,6:25,10
-chr3	116664364	.	TAAC	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0083333;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:31:0,7:0,5:0,2
-chr3	117131025	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0097133;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:44,7:20,4:24,3
-chr3	118133343	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.023519;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:25,4:12,3
-chr3	119623721	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.047696;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:5,3:10,3
-chr3	119845421	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=2.5707e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:20,6:18,8
-chr3	120169863	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0049041;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:26,4:20,5
-chr3	122430515	.	A	AGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:11,3:6,1
-chr3	123724139	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,3:3,1
-chr3	124144641	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.013761;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:18,4:15,2
-chr3	124853407	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=1.7206e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:17,6:18,9
-chr3	131181745	.	C	CAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0084599;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,8:5,7:8,1
-chr3	132355509	.	AT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.041513;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,5:5,2
-chr3	134701428	.	A	ATG	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.099673;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:19,1:17,3
-chr3	134860174	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.064086;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:16,3:22,2
-chr3	135738067	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.17024;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,5:11,2:19,3
-chr3	136227187	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.017643;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:16,5:14,9
-chr3	136447596	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.032072;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,9:14,5:2,4
-chr3	136702123	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.037023;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,8:11,3:13,5
-chr3	138397587	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.00048225;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:20,5:20,5
-chr3	138890387	.	CTCTCGCTCGCTT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.039259;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:2,2:14,2
-chr3	139860290	.	T	G	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=5.7843e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:19,9:24,7
-chr3	139955112	.	C	CTATATATATATATA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:4,3:2,1
-chr3	140518474	.	G	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=8.0627e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:17,6:20,8
-chr3	141636481	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0095308;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:12,6:8,3:4,3
-chr3	142920596	.	G	GTGTTTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.019247;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:10,6:9,3
-chr3	143920646	.	T	TAC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.01326;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:16,4:9,2
-chr3	143920676	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.017377;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:13,7:6,2
-chr3	143976584	.	G	GAGAGAGAGAA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.030474;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,9:9,4:8,5
-chr3	144568320	.	C	CAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0094148;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:7,9:4,1
-chr3	145631060	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.42424;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:6,2:0,1:6,1
-chr3	147818553	.	GA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:14,3:3,1
-chr3	147936619	.	G	A	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=1.9997e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:49,15:17,10:32,5
-chr3	149417090	.	G	A	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=4.8957e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:47,14:18,7:29,7
-chr3	151525002	.	CTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0098105;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
-chr3	152644923	.	T	TATAGAG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:2,6:2,2:0,4
-chr3	153206221	.	C	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,4:17,1:11,3
-chr3	153350196	.	C	CTCTCTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0034381;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,11:9,4:9,7
-chr3	153711346	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0035757;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:18,2:15,8
-chr3	154646137	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,4:6,3:6,1
-chr3	155140410	.	CTT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.033476;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:6,2:7,6
-chr3	155237763	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0026248;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,10:3,8:2,2
-chr3	155928019	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:3,3:1,1
-chr3	157963976	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:17,4:6,1:11,3
-chr3	159691416	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0071396;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,4:2,3
-chr3	160674106	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.045175;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:18,3:21,2
-chr3	160771543	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:14,3:4,1
-chr3	160976605	.	G	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=7.3373e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:18,9:16,4
-chr3	161369286	.	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.051138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,4:7,1
-chr3	161605235	.	T	TTTTATATATATATATATATATA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,4:3,2:3,2
-chr3	162603638	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:3,5:6,1
-chr3	163040250	.	TATATAG	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.029248;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:17,6:14,3
-chr3	163784956	.	GT	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.7096e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:16,17:13,12:3,5
-chr3	164011343	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.09921;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:21,1:22,4
-chr3	164765099	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,3:7,1
-chr3	165488881	.	GT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:6,2:4,2
-chr3	165983125	.	C	G	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.0045735;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:50,9:33,3:17,6
-chr3	166880502	.	AATATATATT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:9,3:10,1
-chr3	168568422	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGGTGT	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=9.1446e-07;SS=2;SSC=60;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:16,20:13,9:3,11
-chr3	170285078	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0014958;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:13,19:8,17:5,2
-chr3	171562565	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034636;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:5,2:15,3
-chr3	171586739	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.035373;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:25,6:15,5
-chr3	171710872	.	C	CT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.036439;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,18:18,16:6,2
-chr3	172623989	.	A	G	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=3.4682e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:40,31:23,13:17,18
-chr3	173978835	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,4:4,2:8,2
-chr3	175174789	.	A	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.15567;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:33,4:19,3:14,1
-chr3	175656897	.	T	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=2.561e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:40,35:21,17:19,18
-chr3	177805499	.	T	TAAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0041408;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:8,12:2,9:6,3
-chr3	180244709	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,2:10,2
-chr3	180592693	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.27607;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,2:6,2
-chr3	181702070	.	CCA	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.069705;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:22,2:12,3
-chr3	181957214	.	A	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.038206;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:27,6:15,1:12,5
-chr3	181976434	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.075059;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,6:11,5:6,1
-chr3	182665652	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0026749;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:36,2:17,9
-chr3	183167172	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.028809;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,7:4,4:17,3
-chr3	183234707	.	T	TTTTTTTA	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.013385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:32,15:20,4:12,11
-chr3	183609768	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:16,1:8,3
-chr3	184617634	.	GAGA	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.098102;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:21,1:20,5
-chr3	185091968	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:5,3:4,1
-chr3	185454379	.	GATATATGAGAT	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.029627;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,13:16,2:11,11
-chr3	185454601	.	TGA	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00065651;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:14,4:12,9
-chr3	185454626	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0082759;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:13,5:14,8
-chr3	185455148	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.11141;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,4:19,2:10,2
-chr3	185455151	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10033;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,4:19,2:12,2
-chr3	185638985	.	CAA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.17119;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,8:13,6:7,2
-chr3	186786051	.	T	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=4.2601e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:33,25:10,14:23,11
-chr3	187856602	.	G	GT	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=2.4148e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:42,17:25,14:17,3
-chr3	188142523	.	GAAGA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00082127;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,9:8,1
-chr3	188524881	.	TTCCTTCCTTCCGTCCG	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0084177;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,10:2,5:15,5
-chr3	188638313	.	AG	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.014646;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:15,5:7,3
-chr3	188770347	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.020196;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:7,2:7,3
-chr3	189966137	.	AAG	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:26,6:12,1
-chr3	191632973	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.0011102;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:27,9:22,1
-chr3	191875373	.	CTT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.026352;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,10:9,5:11,5
-chr3	193596361	.	CTTAA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.15731;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:25,3:8,1:17,2
-chr3	195290848	.	A	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.03708;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:51,17:33,15:18,2
-chr3	195482567	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.069135;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:19,2:8,2
-chr3	195487256	.	C	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.038826;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:46,15:33,13:13,2
-chr3	195487534	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10169;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:17,4:18,1
-chr3	195489437	.	T	A	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.011845;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:82,22:34,3:48,19
-chr3	195622600	.	C	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.013931;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:42,8:7,2
-chr3	195698193	.	C	T	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.02706;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:65,15:33,9:32,6
-chr3	195719427	.	CTTT	C	0	PASS	DP=176;GPV=1;SPV=0.0099771;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:5,7:1,4:4,3
-chr3	195816817	.	T	TGCCCA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,4:8,1:16,3
-chr3	195978090	.	C	T	0	PASS	DP=275;GPV=1;SPV=0.0068093;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:135,21:71,11:64,10
-chr3	196037653	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,7:9,6:6,1
-chr3	196052292	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10722;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:11,4:10,2
-chr3	196346919	.	C	CTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,4:13,3:5,1
-chr3	196910335	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:6,3:1,1
-chr3	196949037	.	T	TC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,1:4,3
-chr3	197459525	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:2,1:4,1
-chr3	197624815	.	C	T	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.010631;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:62,11:29,3:33,8
-chr4	15464	.	G	C	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.018837;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:89,21:62,9:27,12
-chr4	20957	.	T	C	0	PASS	DP=259;GPV=1;SPV=0.033085;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:100,19:72,14:28,5
-chr4	24734	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
-chr4	34973	.	A	T	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.032843;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:103,18:52,11:51,7
-chr4	450958	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:3,4:2,3:1,1
-chr4	1906654	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,3:3,2
-chr4	3198215	.	AT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.024875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:13,5:2,5
-chr4	3788247	.	C	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=3.9178e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:40,25:25,12:15,13
-chr4	4082660	.	T	TCACACACACACACACACACACACA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.029276;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:9,4:14,2
-chr4	4606615	.	ATTT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:6,1:9,6
-chr4	7115598	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.092258;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,4:18,3:9,1
-chr4	7566015	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.021554;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:8,3:9,2
-chr4	8263816	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.051471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:4,3:2,2:2,1
-chr4	8630136	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18039;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:19,4:1,0
-chr4	8652924	.	C	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=5.454e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:54,17:31,9:23,8
-chr4	8692329	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.027874;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:24,4:17,1
-chr4	9090052	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.025971;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,6:4,1
-chr4	9140304	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0062652;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:3,4:4,3
-chr4	9981256	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:1,1:6,7
-chr4	11565730	.	AC	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,2:0,1:5,1
-chr4	12428449	.	C	CTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0076326;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,11:7,7:6,4
-chr4	14834044	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.018064;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:16,6:19,8
-chr4	15664550	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:6,1:11,4
-chr4	16816407	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045366;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:12,9:6,2
-chr4	17035717	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00041767;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:26,5:17,7
-chr4	17154514	.	G	GTTCTTT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0051634;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,15:10,11:8,4
-chr4	17392769	.	GA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.17641;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:20,3:7,1
-chr4	17696172	.	T	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0005289;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:11,5:28,8
-chr4	18160746	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022726;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,6:7,2
-chr4	18207818	.	T	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0011693;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:21,5:23,7
-chr4	18277327	.	C	CAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,10:7,8:1,2
-chr4	19259011	.	C	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.9322e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:19,11:9,5
-chr4	20211807	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.044785;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:18,6:18,2
-chr4	20716612	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.9388e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:13,5:11,8
-chr4	22084117	.	G	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0010978;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,12:22,6:24,6
-chr4	22815365	.	ATATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,5:1,3:2,2
-chr4	23603769	.	TTG	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.091638;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:13,2:20,2
-chr4	24726335	.	C	CTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0029195;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,11:11,10:2,1
-chr4	25444486	.	G	GTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.017473;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,2:2,2
-chr4	26316502	.	TATATATTC	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.041596;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:19,3:9,1
-chr4	27501814	.	G	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00047924;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:20,6:13,4
-chr4	27781760	.	T	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=4.7366e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:18,8:21,7
-chr4	27837405	.	G	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00074812;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,12:19,8:27,4
-chr4	28397577	.	G	GT	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.047026;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:22,1:13,3
-chr4	28725976	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.022472;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,5:16,1:18,4
-chr4	28933105	.	CAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,6:7,5:5,1
-chr4	29036293	.	T	TAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.030558;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:13,10:8,4
-chr4	29055438	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0030877;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:16,5:23,3
-chr4	29514900	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00011761;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:18,5:21,9
-chr4	31368449	.	C	CCTCTCTCTCT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21504;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,3:3,2:7,1
-chr4	32154568	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,9:9,8:2,1
-chr4	32793744	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.048633;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,9:14,8:8,1
-chr4	32856257	.	CTTT	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.037745;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,5:20,3:17,2
-chr4	32862019	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.034373;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,4:13,2:11,2
-chr4	35953472	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:7,2:4,1:3,1
-chr4	36713372	.	C	CTT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.026985;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:12,8:6,1
-chr4	37348581	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0093911;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:1,6:5,2
-chr4	37774975	.	G	C	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.011371;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:53,7:30,4:23,3
-chr4	37777168	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.079011;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,2:17,2
-chr4	39297302	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,3:12,1
-chr4	39793488	.	TCCTTTC	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.036334;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:19,2:20,5
-chr4	39793511	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0028438;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:20,5:16,7
-chr4	40045853	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026993;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,9:10,8:5,1
-chr4	40405377	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=7.4138e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,15:18,6:24,9
-chr4	43384910	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:10,3:4,3
-chr4	44282396	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0007003;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:25,4:13,7
-chr4	46348939	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.011661;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:32,6:10,3
-chr4	47195456	.	T	TAGA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:36:0,2:0,1:0,1
-chr4	48092553	.	TGGACACATTTTTCCAAAAGTGTGACTTACAAGAGCAATGTGTAAAGGGAGAAAGAGTTAGGGCAGCA	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.064593;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,2:14,2
-chr4	49102880	.	A	ATTCCT	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.021398;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,6:24,2:26,4
-chr4	49117668	.	ACCATT	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.048559;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,6:27,2:21,4
-chr4	49161694	.	C	T	0	PASS	DP=278;GPV=1;SPV=0.018289;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:146:122,24:53,13:69,11
-chr4	49173848	.	G	A	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.0098093;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:71,9:41,1:30,8
-chr4	49235503	.	T	C	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.049851;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:77,18:43,13:34,5
-chr4	49237120	.	G	C	0	PASS	DP=212;GPV=1;SPV=0.024925;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:83,20:33,8:50,12
-chr4	49237791	.	CACTTAAA	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.037423;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:48,9:27,2:21,7
-chr4	49246131	.	C	A	0	PASS	DP=402;GPV=1;SPV=0.0056713;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:229:201,28:145,19:56,9
-chr4	49249561	.	C	T	0	PASS	DP=366;GPV=1;SPV=0.032859;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:200:168,32:94,23:74,9
-chr4	49252795	.	C	T	0	PASS	DP=577;GPV=1;SPV=0.04704;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:292:260,32:152,21:108,11
-chr4	49256477	.	T	A	0	PASS	DP=426;GPV=1;SPV=0.0033633;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:178,37:91,25:87,12
-chr4	49257937	.	T	A	0	PASS	DP=413;GPV=1;SPV=0.023553;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:192,29:86,15:106,14
-chr4	49264667	.	GTGTT	G	0	PASS	DP=614;GPV=1;SPV=0.0099073;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:342:243,46:159,17:84,29
-chr4	49266327	.	AT	A	0	PASS	DP=712;GPV=1;SPV=0.0051943;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:406:349,54:165,15:184,39
-chr4	49292267	.	G	A	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.0096171;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:124,19:69,6:55,13
-chr4	49498308	.	T	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.045686;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:19,1:27,5
-chr4	49519369	.	C	T	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.028218;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:94,13:54,8:40,5
-chr4	49519466	.	TA	T	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.035166;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:65,17:42,9:23,8
-chr4	49554189	.	C	CA	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.0068684;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:118,16:58,7:60,9
-chr4	49556231	.	G	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.029547;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:49,11:30,8:19,3
-chr4	49558512	.	T	C	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.012898;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:53,20:26,9:27,11
-chr4	49579191	.	C	T	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.034495;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:108,22:27,7:81,15
-chr4	49591746	.	G	A	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.0043003;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:172:140,32:94,21:46,11
-chr4	49591755	.	G	C	0	PASS	DP=317;GPV=1;SPV=0.009297;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:146,36:100,23:46,13
-chr4	49610504	.	A	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.014844;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,8:17,2:32,6
-chr4	49636085	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0002515;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:7,9:11,1
-chr4	49647349	.	G	A	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.044924;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:77,9:48,8:29,1
-chr4	49788517	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,4:7,1
-chr4	49893276	.	C	A	0	PASS	DP=645;GPV=1;SPV=0.011987;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:362:311,51:144,24:167,27
-chr4	50045157	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.022376;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:30,3:4,7
-chr4	50531544	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr4	50752559	.	T	C	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.045908;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:57,10:57,3:0,7
-chr4	51099347	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr4	51567766	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.016282;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:22,4:6,2
-chr4	51717602	.	G	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,2:7,2
-chr4	52424285	.	G	GAAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.036581;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,11:14,9:8,2
-chr4	54622537	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,4:10,2:25,2
-chr4	55117039	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0077737;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:21,3:21,4
-chr4	55344846	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,7:5,6:4,1
-chr4	55542385	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:26:0,6:0,1:0,5
-chr4	55761622	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.026414;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,6:19,3:16,3
-chr4	56619681	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.01722;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:50,8:27,4:23,4
-chr4	56651878	.	G	GTGTGTT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.17898;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,5:11,3:25,2
-chr4	56901844	.	GT	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0063671;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,12:11,9:7,3
-chr4	57103659	.	TC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.022451;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,5:8,1
-chr4	57429325	.	T	TC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:5,3:6,1
-chr4	58216382	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0057881;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:18,4:25,5
-chr4	58877410	.	CTATA	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.05753;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:26,5:20,4
-chr4	59158894	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=3.3036e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:22,4:13,10
-chr4	60170060	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:7,8:6,1
-chr4	60338297	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,1:3,3
-chr4	61930175	.	CA	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=5.5762e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:31,16:23,12:8,4
-chr4	62079954	.	C	CA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.042605;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:17,8:4,1
-chr4	63417628	.	T	TACAC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,7:9,5:5,2
-chr4	63422490	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00095274;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:19,4:16,7
-chr4	63509573	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=8.9306e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:18,7:21,6
-chr4	63535392	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.038888;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:10,3:12,5
-chr4	63535460	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.037131;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:10,5:7,2
-chr4	64653798	.	A	AAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAGAAAAG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.041838;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,2:12,3
-chr4	65334585	.	C	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.00025319;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:50,12:26,5:24,7
-chr4	66317249	.	A	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00034554;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:18,8:23,6
-chr4	66681806	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=2.344e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:51,20:21,13:30,7
-chr4	67342257	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,8:5,7:3,1
-chr4	67540341	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0037102;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:21,6:20,2
-chr4	68714842	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,4:10,2:10,2
-chr4	68977991	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.050238;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:17,3:24,2
-chr4	69335373	.	GTA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.062133;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:15,3:13,2
-chr4	69472099	.	TACAAAA	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0063865;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:30,17:16,7:14,10
-chr4	73349484	.	TA	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.028888;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,4:20,2:14,2
-chr4	74561269	.	A	AAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,5:4,3
-chr4	75665626	.	AAC	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.023939;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:18,3:15,4
-chr4	76167671	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
-chr4	76889847	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,7:6,1
-chr4	76917675	.	G	A	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.044051;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:57,9:47,8:10,1
-chr4	76918224	.	C	T	0	PASS	DP=197;GPV=1;SPV=0.0047068;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:81,22:57,14:24,8
-chr4	80750416	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0017641;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:14,5:18,3
-chr4	82248742	.	CGT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.033476;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,8:7,6:6,2
-chr4	84242410	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0030266;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:25,5:21,6
-chr4	86799825	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:5,1:2,3
-chr4	87113590	.	T	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0007893;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:15,5:24,6
-chr4	87746818	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.034759;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:12,4:14,6
-chr4	88098645	.	G	GAGATAGAT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.018938;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,11:13,6:9,5
-chr4	88887530	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,4:3,2
-chr4	90865779	.	C	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0019678;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:21,5:17,3
-chr4	92149762	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0001398;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:17,6:12,8
-chr4	93244513	.	C	CTATTATA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020413;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:10,4:9,3
-chr4	93612825	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037023;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:16,7:8,1
-chr4	96513383	.	G	A	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=1.6916e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:45,21:32,9:13,12
-chr4	100104827	.	A	ATATGTATATATG	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.094058;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,4:18,2:18,2
-chr4	100226787	.	GTT	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.027005;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,10:8,9:5,1
-chr4	101470541	.	CAT	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.041296;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:18,3:14,1
-chr4	101470555	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.045506;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:16,3:15,1
-chr4	102798279	.	A	AATATATATATATAT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.017962;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,11:12,8:10,3
-chr4	102926038	.	A	C	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.042888;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:56,10:38,5:18,5
-chr4	103732723	.	C	CCGTATATATGCA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0072137;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,13:19,7:6,6
-chr4	104220900	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,4:6,3:12,1
-chr4	105284064	.	ACGTG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14093;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,5:9,3:11,2
-chr4	105914373	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00034907;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:3,6:7,6
-chr4	107719187	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0024737;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,16:17,13:6,3
-chr4	109753059	.	TATA	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0136;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,6:14,2:16,4
-chr4	109753065	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.036679;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:13,2:17,4
-chr4	113804741	.	A	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=7.1737e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,18:13,8:22,10
-chr4	115118961	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.016274;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,15:14,8:23,7
-chr4	117192020	.	ATG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,10:9,9:4,1
-chr4	118501329	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.017739;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,8:5,1
-chr4	118810137	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.016929;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,9:4,2:9,7
-chr4	118876667	.	CTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.012898;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,11:0,2:14,9
-chr4	119418794	.	G	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.014047;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
-chr4	119479109	.	T	TGATTACCTCTGTAAAATCA	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.023273;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,10:6,5:22,5
-chr4	119531060	.	C	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00432;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:26,4:17,6
-chr4	119576953	.	A	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.15365;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:26,4:13,1:13,3
-chr4	119734507	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00037553;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:27,6:12,5
-chr4	121405687	.	A	ATAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,2:4,2
-chr4	124026110	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.019772;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:11,6:10,3
-chr4	125814698	.	G	GGA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0095885;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,16:11,12:12,4
-chr4	128662542	.	C	CT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.047358;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,9:16,5:8,4
-chr4	128807055	.	C	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=5.3794e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:42,20:21,7:21,13
-chr4	129956700	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00010382;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:21,6:18,6
-chr4	130350139	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.095042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:0,0:25,4
-chr4	131278724	.	C	CT	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.024074;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:22,1:22,4
-chr4	132783622	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00029292;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:22,7:16,4
-chr4	132999967	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0042441;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:17,7:27,5
-chr4	133456730	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0031698;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:9,3:23,6
-chr4	135272246	.	GT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0012088;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,16:5,13:8,3
-chr4	136925000	.	G	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00040855;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:22,5:20,5
-chr4	139092416	.	C	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.036354;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:23,4:14,4
-chr4	139092417	.	A	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.026881;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:24,4:12,3
-chr4	139092418	.	T	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.006996;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:21,4:13,4
-chr4	139989902	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.060769;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:11,3:22,2
-chr4	140800462	.	A	ATATT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.14763;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,4:17,2:5,2
-chr4	141580080	.	TTC	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:24,4:9,3:15,1
-chr4	143948795	.	C	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.00029442;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:60,14:27,8:33,6
-chr4	144292744	.	C	A	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.024171;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:63,7:30,5:33,2
-chr4	144562388	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=9.7059e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:41,16:16,6:25,10
-chr4	146542376	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,4:5,2
-chr4	148324367	.	T	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.052629;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:22,5:14,3:8,2
-chr4	148492842	.	AGTATCCTCTATACATAGTATTTTATATATATC	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:1,2:1,2:0,0
-chr4	149102144	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:11,3:6,2
-chr4	150380982	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.018436;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,7:2,1
-chr4	150647352	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:1,3:0,1
-chr4	150780633	.	A	ATATATATACGTGTATATATATACATATATATACACG	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.055746;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,4:8,3:16,1
-chr4	150970557	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,6:8,3:6,3
-chr4	151008397	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0015215;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:14,4:19,5
-chr4	151222669	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.12189;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,2:10,3
-chr4	152701645	.	A	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00040756;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:23,7:18,7
-chr4	153399890	.	ATT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,3:4,2
-chr4	153566329	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=1.6594e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:13,8:18,4
-chr4	154176775	.	C	CT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.041383;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:11,3:13,2
-chr4	154385557	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=3.8419e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:7,12:21,7
-chr4	154433395	.	C	CCTTTTTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:0,0:5,4
-chr4	154751761	.	A	AAG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:3,2:3,2
-chr4	157599693	.	C	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0021288;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:23,4:19,5
-chr4	158255594	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0395;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:18,3:15,3
-chr4	158492068	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0066451;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:19,14:10,6:9,8
-chr4	160555509	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00024258;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:25,8:17,6
-chr4	161887403	.	CT	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.067189;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,6:15,4:15,2
-chr4	162657480	.	ATATAGTATAGAC	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0077271;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,6:7,5:16,1
-chr4	164864400	.	A	AGAG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,6:4,1
-chr4	164892111	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00013794;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:13,9:26,5
-chr4	165235571	.	A	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.016048;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:48,6:23,3:25,3
-chr4	166473672	.	A	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00048809;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:17,6:24,6
-chr4	167327273	.	C	CAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0074763;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,8:8,7:2,1
-chr4	169103086	.	ATT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.040008;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,9:8,7:8,2
-chr4	172552837	.	T	TAAAAAAAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.014706;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:1,3:2,1
-chr4	176418256	.	C	CT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.001413;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:24,23:10,10:14,13
-chr4	176809676	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0012733;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:20,5:15,6
-chr4	177205827	.	CA	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.016636;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:10,3:23,5
-chr4	177511398	.	AT	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.0010149;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:23,7:20,3
-chr4	177919881	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.02825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:13,6:7,4
-chr4	178098024	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.043916;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:30,2:19,8
-chr4	180436765	.	C	CAA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036153;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:14,9:13,2
-chr4	181411099	.	A	AG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0062613;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:10,5:15,3
-chr4	181825425	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,7:4,3:6,4
-chr4	181844536	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00013137;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:20,6:22,8
-chr4	182049097	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.02185;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:48,9:23,3:25,6
-chr4	184308769	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:5,5:3,2
-chr4	184607094	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00075514;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:16,2:16,6
-chr4	184928147	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.034441;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,8:6,6:8,2
-chr4	185443342	.	A	ATATATATTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.27198;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:7,1:1,3
-chr4	186478194	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
-chr4	186970880	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,4:5,5
-chr4	186981764	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:12,2:16,2
-chr4	187078357	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.047407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:10,9:15,1
-chr4	187298453	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0011232;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:15,3:19,8
-chr4	187639769	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,3:3,2
-chr4	187943519	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0066158;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:17,4:25,5
-chr4	188443382	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.084679;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:9,4:10,1
-chr4	188698800	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=1.959e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:20,6:17,7
-chr4	188974431	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14474;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:8,3:2,2:6,1
-chr4	189205947	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.057396;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,5:11,2:12,3
-chr4	189447454	.	A	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0086439;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,6:18,4:15,2
-chr4	189447455	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.032947;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,5:18,3:25,2
-chr4	189685393	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.019428;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,11:13,9:6,2
-chr4	189757141	.	G	GT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.015407;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,13:10,3:15,10
-chr4	190050837	.	C	T	0	PASS	DP=293;GPV=1;SPV=0.049845;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:138,21:65,14:73,7
-chr4	190116123	.	T	C	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.029934;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:117,18:58,9:59,9
-chr5	100875	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.16035;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:23,3:13,2:10,1
-chr5	502907	.	C	T	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.025674;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:79,13:35,11:44,2
-chr5	649065	.	TG	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.062133;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:18,3:10,2
-chr5	649720	.	CCG	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,2:2,2
-chr5	682627	.	C	G	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.020165;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:59,7:32,2:27,5
-chr5	700911	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.027715;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:15,3:11,4
-chr5	700916	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048244;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:16,3:11,3
-chr5	714493	.	AT	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.031765;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:6,3:30,7
-chr5	847849	.	T	G	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.041895;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:58,7:23,2:35,5
-chr5	1238415	.	G	GA	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.035178;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,5:18,1:21,4
-chr5	2580850	.	CCTTCCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.010837;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,5:2,1:6,4
-chr5	2594305	.	TGCACAGAGATACACACAGACACACAGAGATACACAGGCACAGACAGAC	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.071484;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:22,3:13,1
-chr5	4040418	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,5:8,1:9,4
-chr5	4506713	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.014858;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:20,2:27,5
-chr5	4559105	.	A	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.01722;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:50,8:25,5:25,3
-chr5	5816146	.	GAT	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,6:2,1:16,5
-chr5	6260056	.	A	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00057272;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:17,5:20,5
-chr5	6313801	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.011847;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:13,6:7,4
-chr5	6995984	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=1.2479e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:37,17:15,10:22,7
-chr5	7288807	.	TTCTTCTTC	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016301;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:12,3:15,3
-chr5	7776193	.	T	TA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0051328;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:16,16:7,14:9,2
-chr5	8454942	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.03854;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:18,2:16,8
-chr5	9021991	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=4.3022e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:41,16:16,7:25,9
-chr5	9674709	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00043374;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:22,7:12,3
-chr5	9766290	.	T	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=1.3389e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:35,17:21,6:14,11
-chr5	9954291	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0032629;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:22,5:12,2
-chr5	10285688	.	C	CTCTCTCTT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.03878;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,11:14,6:13,5
-chr5	10352719	.	T	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.00039347;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:50,14:20,8:30,6
-chr5	10864421	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,3:9,5
-chr5	11228353	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036457;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,7:10,5:6,2
-chr5	12099554	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0059953;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,8:16,3:12,5
-chr5	13029343	.	A	AGGG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.083916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,5:5,3:0,2
-chr5	13149494	.	CAGATAGAT	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.011623;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:35,17:18,8:17,9
-chr5	15033020	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.083787;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:16,5:6,1
-chr5	15265506	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.068062;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:20,1:22,4
-chr5	15379417	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00076695;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:13,5:16,5
-chr5	16142884	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.010145;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:7,5:1,1
-chr5	16232857	.	A	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0021309;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:26,7:14,5
-chr5	17217075	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.060567;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:8,1:23,3
-chr5	17343355	.	A	AAATAATAAT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0042467;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,13:8,8:8,5
-chr5	17595177	.	G	A	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.040357;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:65,11:65,7:0,4
-chr5	18369049	.	A	ATGG	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.024981;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,4:13,1:5,3
-chr5	18780674	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,8:1,4:5,4
-chr5	19382635	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.020403;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,10:13,4:8,6
-chr5	20095323	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,2:4,1:1,1
-chr5	21970839	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0082418;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:2,4:0,0
-chr5	22466525	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.022062;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:15,3:17,2
-chr5	25382046	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.011784;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:13,7:17,4
-chr5	26121258	.	A	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0016467;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:24,3:22,8
-chr5	26803072	.	A	G	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.00058548;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:54,13:30,8:24,5
-chr5	27949409	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:3,3:5,1
-chr5	29877631	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.06407;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,4:11,1
-chr5	29947445	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.000239;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:18,7:19,7
-chr5	30771958	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=5.3599e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:43,19:29,12:14,7
-chr5	33178032	.	CCA	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00021757;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:8,3:10,16
-chr5	33881564	.	C	CT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.023403;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:21,2:10,3
-chr5	33911832	.	T	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00064041;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:18,8:23,4
-chr5	34665043	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,2:10,2
-chr5	35880888	.	A	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.00011099;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:52,17:34,9:18,8
-chr5	39028201	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:7,3:20,1
-chr5	39371299	.	G	A	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=1.7232e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:47,15:29,7:18,8
-chr5	40294210	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=2.9026e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:38,15:21,9:17,6
-chr5	40546086	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0065197;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:11,2:16,11
-chr5	41426844	.	A	AT	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=1.7371e-06;SS=2;SSC=57;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:36,16:19,10:17,6
-chr5	42917957	.	C	T	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00047993;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:20,4:23,7
-chr5	43645657	.	C	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,1:6,8
-chr5	44748860	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.035343;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:16,5:6,1:10,4
-chr5	45807187	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.030792;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:11,3:2,2
-chr5	46663683	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.017166;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:7,2:12,5
-chr5	46665462	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:1,1:34,12
-chr5	46665464	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0093922;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:1,1:31,13
-chr5	46756249	.	G	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.013393;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,4:2,4
-chr5	46783409	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.011463;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:54,11:16,2:38,9
-chr5	47112438	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.062847;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:7,3:22,3
-chr5	47112440	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.071601;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:8,3:23,3
-chr5	47116274	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.28678;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:4,2:29,2
-chr5	47116995	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.10478;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:29,4:7,2
-chr5	47297581	.	G	A	0	PASS	DP=260;GPV=1;SPV=0.039095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:127,20:78,9:49,11
-chr5	50141951	.	C	A	0	PASS	DP=190;GPV=1;SPV=0.025998;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:87,16:21,8:66,8
-chr5	50145036	.	T	G	0	PASS	DP=460;GPV=1;SPV=0.020017;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:248:221,27:69,8:152,19
-chr5	50628618	.	T	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0033793;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:31,5:14,4
-chr5	50655431	.	C	CTT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.021615;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,7:3,1:11,6
-chr5	51500712	.	C	CCTCT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:6,4:4,1
-chr5	51567438	.	G	GTA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.044074;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,8:11,4:7,4
-chr5	51609127	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020314;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:12,7:6,1
-chr5	51879386	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:11,3:7,1
-chr5	52103502	.	G	GATTTT	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00077065;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:12,8:16,11
-chr5	54798863	.	A	AAGAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,5:2,3:4,2
-chr5	58817454	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0095669;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:19,5:21,3
-chr5	60668159	.	T	TTTTA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0098611;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,10:5,5:7,5
-chr5	60874986	.	G	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=1.3278e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:44,18:28,10:16,8
-chr5	61638540	.	T	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.2598e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:36,17:15,10:21,7
-chr5	62238968	.	A	AT	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.028602;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:24,7:19,1
-chr5	62238999	.	T	TG	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.039663;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:48,8:28,7:20,1
-chr5	64463583	.	G	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.019795;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:20,5:23,7
-chr5	65007626	.	CTTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0045748;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,12:6,7:2,5
-chr5	66389037	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0040054;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:40,9:20,4:20,5
-chr5	66522574	.	T	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0047446;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,8:15,6:31,2
-chr5	67398893	.	A	ATTATTTATTTATTTATTTAT	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.031786;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,8:8,4:20,4
-chr5	67508890	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:7,3:5,1
-chr5	68217627	.	G	GGTGTGTGT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.028582;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,17:20,14:13,3
-chr5	73682418	.	C	CT	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.011394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,18:20,13:15,5
-chr5	76829263	.	CTT	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.20253;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:22,4:14,2:8,2
-chr5	77443876	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,4:4,3
-chr5	79567406	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.062905;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,9:11,1
-chr5	80066094	.	CA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.048297;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,5:7,2
-chr5	80338707	.	T	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0090267;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:48,8:18,7:30,1
-chr5	80600615	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.030957;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:8,2:9,3
-chr5	80612791	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,5:11,4:3,1
-chr5	80617029	.	CTATATATATA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,4:17,2:5,2
-chr5	80762778	.	T	TTTTTA	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.029694;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,11:16,7:21,4
-chr5	82050839	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.038556;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,4:5,2
-chr5	82472884	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.042665;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:37,9:3,1
-chr5	82505422	.	C	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.027702;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:26,2:28,4
-chr5	84238665	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0074891;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,5:1,4:4,1
-chr5	84359577	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=8.5136e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:23,7:18,5
-chr5	85392531	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.010345;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:25,4:16,4
-chr5	85392541	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.015734;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:24,3:19,4
-chr5	85392546	.	CA	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.043084;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:25,3:20,2
-chr5	85420733	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.031527;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:17,4:23,4
-chr5	85420734	.	TTA	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.022898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:17,4:25,4
-chr5	86218528	.	A	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=3.9621e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:20,11:17,3
-chr5	89121849	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.031077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,3:10,2
-chr5	89480700	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=5.7039e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:13,8:11,4
-chr5	91035846	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,2:3,2
-chr5	91150009	.	CTTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.015726;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
-chr5	93142335	.	A	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.7484e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:37,19:22,10:15,9
-chr5	93341444	.	C	CTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0092864;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,7:8,6:5,1
-chr5	93351645	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00053646;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:25,8:19,3
-chr5	96680383	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,2:1,1:6,1
-chr5	97634997	.	G	GT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.015665;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,8:15,7:10,1
-chr5	98071411	.	A	AAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.15021;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:6,3:2,2
-chr5	98851539	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:15,4:1,0
-chr5	99954797	.	C	CA	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00080682;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,11:14,6:23,5
-chr5	101381937	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.11371;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,4:13,3:15,1
-chr5	102050841	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,1:5,5
-chr5	102414907	.	GTAAA	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.029668;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:14,9:20,5
-chr5	107827145	.	GA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:14,3:3,1
-chr5	108558362	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.35897;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:6,2:2,1:4,1
-chr5	109780510	.	CTG	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0024346;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:31,20:18,14:13,6
-chr5	109932957	.	T	TTG	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.049775;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,11:14,6:14,5
-chr5	111098300	.	C	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00075282;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:18,9:26,2
-chr5	111964873	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.026042;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,1:5,3
-chr5	112035948	.	ATGTTTAGTTCTCACTTATAAGTGAGAGCATACAGTATTTGGTTTTC	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.018989;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:12,9:9,4
-chr5	112377215	.	G	GA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0082887;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:15,9:9,1
-chr5	113418689	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.024912;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:18,4:16,2
-chr5	113424132	.	T	TACACACACACAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0037215;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:7,2:2,4
-chr5	113942875	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:4,4:4,1
-chr5	114385521	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.065336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:16,4:21,1
-chr5	115547937	.	G	GTGTGTGTGTGTGTATA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.25926;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,2:4,2
-chr5	118300419	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.00035702;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:54,18:31,9:23,9
-chr5	119089293	.	T	TA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,1:2,4
-chr5	119259999	.	TAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.025988;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:6,4:7,3
-chr5	119503076	.	T	TTG	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.030283;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:21,4:6,8
-chr5	120048971	.	T	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027654;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:6,5:11,2
-chr5	121758050	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00033668;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,15:21,7:21,8
-chr5	121946774	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:52:1,3:1,2:0,1
-chr5	122768581	.	GAAGAAGAAGAAA	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.040341;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:20,4:6,2
-chr5	125385480	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0046299;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,11:3,4:4,7
-chr5	126209194	.	C	CGACACTTATGACCTCACTTAATCTTAACTACT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.044908;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:10,4:22,2
-chr5	126301689	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.020196;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:10,3:4,2
-chr5	127674413	.	T	TC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0023514;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,10:12,5:8,5
-chr5	128479998	.	A	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.14706;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,3:5,1:2,2
-chr5	128818607	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02607;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:9,2:2,2
-chr5	128818611	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01707;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:10,2:3,3
-chr5	128862735	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00054719;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:38,13:19,7:19,6
-chr5	133040733	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:17,4:3,6
-chr5	133132133	.	A	AT	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.038534;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:16,2:21,6
-chr5	133132135	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.04432;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:15,1:15,6
-chr5	133625816	.	TC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11664;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:14,3:11,2
-chr5	133625871	.	CCATAT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.072233;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:14,2:4,2
-chr5	133625903	.	CCAT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037203;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,2:5,2
-chr5	134581621	.	C	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.012341;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:14,4:29,3
-chr5	135465724	.	C	CA	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=2.2194e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:45,15:22,6:23,9
-chr5	135886603	.	AT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.048951;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,4:3,1:0,3
-chr5	135886606	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,2:1,1:0,1
-chr5	137160497	.	C	CTA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.020124;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:0,2:7,5
-chr5	137916478	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.043214;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:20,5:14,4
-chr5	138719109	.	C	CA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0072028;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:17,10:1,1
-chr5	138947465	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.0001115;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:45,15:21,9:24,6
-chr5	139003676	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=8.4049e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:12,7:18,5
-chr5	140286600	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,3:1,2:0,1
-chr5	140467115	.	TTG	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.018474;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:27,4:25,3
-chr5	142188590	.	A	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.024367;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:23,5:11,2
-chr5	142683857	.	AATCCTTT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:11,4:3,4
-chr5	144465779	.	C	CTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.028042;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,5:5,2
-chr5	145502843	.	G	GT	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0034956;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:12,5:22,4
-chr5	147260167	.	C	CTG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:2,1:3,1
-chr5	147651165	.	T	TTTATCATTACTATAAGAAAA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.014541;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:14,7:11,5
-chr5	148212537	.	T	TATATA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,2:8,3
-chr5	151474176	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.071753;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,2:10,2
-chr5	151474178	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.024248;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,5:9,2:8,3
-chr5	152278458	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:3,2:4,2
-chr5	153189298	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00097618;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,11:27,8:15,3
-chr5	153217085	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0032114;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,4:8,4
-chr5	153428652	.	AG	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.046412;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:21,8:12,2
-chr5	154464170	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0014109;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:56,15:21,4:35,11
-chr5	155032165	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:13,2:14,2
-chr5	155033235	.	TA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13283;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:23,3:5,1
-chr5	156660289	.	C	T	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.010351;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:51,17:31,10:20,7
-chr5	157890366	.	AT	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.028779;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:35,6:17,2:18,4
-chr5	158567730	.	C	CTTTCTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.097821;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,7:6,4:13,3
-chr5	160354597	.	AG	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:9,10:4,2:5,8
-chr5	161809637	.	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.020223;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:16,11:3,2:13,9
-chr5	162681843	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:5,3:3,2:2,1
-chr5	162685313	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00035338;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:1,13:0,9:1,4
-chr5	162688688	.	G	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0040464;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:22,4:21,4
-chr5	162688689	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0040417;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:23,4:22,4
-chr5	163626366	.	ACT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0072753;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:8,7:7,6
-chr5	165884152	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0071318;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:22,3:15,4
-chr5	167181504	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:7,3:17,1
-chr5	168502386	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.052808;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:23,1:14,4
-chr5	168539872	.	A	ATTTTTTTT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.015377;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,11:14,6:12,5
-chr5	168908214	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=7.9266e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:19,9:14,3
-chr5	170264978	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.016233;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,6:3,3
-chr5	170503711	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.016386;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:16,4:7,2
-chr5	170731693	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.068336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:16,3:5,2
-chr5	172052164	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0030721;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:18,6:27,3
-chr5	172725544	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0039154;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:16,3:19,4
-chr5	172857589	.	C	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,2:0,1:1,1
-chr5	173289783	.	CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:0,0:11,4
-chr5	173516978	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:8,4:10,2
-chr5	174061909	.	CT	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.044481;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:17,7:5,3
-chr5	175918325	.	C	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.039973;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:8,5:13,3
-chr5	178018091	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.011798;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:27,2:21,5
-chr5	178027845	.	T	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.006972;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:22,8:22,1
-chr5	178027971	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.021516;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:30,1:29,8
-chr5	179013776	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,1:9,3
-chr5	179397489	.	GTATATATATATATA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
-chr5	179429980	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.027835;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:16,9:12,4
-chr5	179594547	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0021594;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,14:1,2:7,12
-chr5	180300049	.	G	A	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.018747;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:78,10:44,1:34,9
-chr5	180530909	.	C	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.032217;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:58,12:24,2:34,10
-chr5	181032233	.	AG	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,2:3,1:2,1
-chr5	181032238	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:3,2:1,1:2,1
-chr6	1111770	.	C	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.727e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:16,7:13,7
-chr6	1512694	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0068176;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,4:8,6
-chr6	2828420	.	G	GA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:5,3:1,3
-chr6	2940604	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.02519;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:13,7:19,2
-chr6	4867772	.	G	GT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.043808;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,5:14,4:21,1
-chr6	5292829	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.022916;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:33,5:19,2
-chr6	6332752	.	TA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,8:3,4:4,4
-chr6	6817878	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:9,3:7,1
-chr6	7117388	.	GTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0097821;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:5,5:4,2
-chr6	7449715	.	A	ATT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.027568;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,6:13,3:8,3
-chr6	7659339	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,10:5,6:3,4
-chr6	7957018	.	A	AGTGTGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0066622;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,6:11,4:4,2
-chr6	8041312	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.028628;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,7:11,4
-chr6	8901169	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,11:5,8:1,3
-chr6	9204743	.	T	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.0014733;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:51,11:23,4:28,7
-chr6	9494455	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10909;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,2:2,1:0,1
-chr6	12337054	.	C	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00065809;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:48,14:33,9:15,5
-chr6	13732406	.	C	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0071789;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:18,5:22,2
-chr6	14448843	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.041422;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,6:11,3:17,3
-chr6	14684389	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0011599;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:17,7:17,3
-chr6	15277795	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.15091;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:21,5:6,1:15,4
-chr6	16443208	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:8,4:0,1
-chr6	18570841	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.048187;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:17,3:22,2
-chr6	19941221	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.040102;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:19,2:10,4
-chr6	20021488	.	A	AAAATAAAT	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.02282;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:17,7:19,8
-chr6	20273024	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04287;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:11,5:4,4
-chr6	20371541	.	CA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.017517;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:13,8:6,4
-chr6	21156424	.	C	CAAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0020034;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:8,9:5,3
-chr6	21965351	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,0:13,4
-chr6	22162978	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.038803;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:15,3:6,7
-chr6	22162980	.	AGT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.011696;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:16,4:8,7
-chr6	22163000	.	ATAGATAGT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.002513;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:13,4:11,6
-chr6	23731309	.	ATT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:2,4:1,3:1,1
-chr6	26137737	.	CATATATATATATATATATATAT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:7,4:0,3
-chr6	26315902	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,4:10,2:6,2
-chr6	26382666	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.011098;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,6:12,4:15,2
-chr6	26522893	.	A	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0027576;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,8:24,4:23,4
-chr6	26605221	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0048714;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:16,2:10,8
-chr6	27100546	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,1:11,3
-chr6	27217046	.	A	AAAAACAAAACAAAAC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.049992;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,6:14,4:15,2
-chr6	27217081	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0026559;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,18:10,8:4,10
-chr6	27235620	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,4:2,1:5,3
-chr6	27748895	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00037553;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:21,5:18,6
-chr6	29238947	.	TTATA	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:26,4:11,3:15,1
-chr6	29932035	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01269;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:9,3:6,2
-chr6	30467010	.	ATTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016525;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:6,1:12,5
-chr6	31487417	.	CA	C	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.0038365;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:64,11:41,3:23,8
-chr6	31487481	.	G	T	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.028495;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:69,19:45,6:24,13
-chr6	32979047	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,4:8,2:10,2
-chr6	32993949	.	TTTTTTTTTTTTTGG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,8:6,7:4,1
-chr6	33361461	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00079781;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:22,6:16,5
-chr6	34212002	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.014832;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,10:3,8:5,2
-chr6	34258748	.	A	ATATTTTTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:2,3:5,2
-chr6	35543076	.	T	A	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.00017103;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:31,10:17,3
-chr6	35652253	.	A	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.040434;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:51,7:33,6:18,1
-chr6	35791058	.	AG	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.030144;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:62,19:19,9:43,10
-chr6	36153472	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00026004;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:24,4:14,7
-chr6	37262032	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,4:5,2:3,2
-chr6	38228351	.	C	CCA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,4:5,1:3,3
-chr6	38772971	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.021064;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:5,9:7,2
-chr6	39058671	.	C	T	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.012167;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:48,15:25,6:23,9
-chr6	41802025	.	G	GT	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0081641;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,6:19,2:15,4
-chr6	41985304	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:7,8:1,1
-chr6	42138850	.	A	AACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,9:4,5:6,4
-chr6	42494445	.	T	TC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:6,3:4,3
-chr6	43570311	.	CAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:9,4:0,2
-chr6	44271370	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.084652;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:24,2:11,2
-chr6	45100541	.	T	TA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.031247;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:9,7:13,5
-chr6	45399773	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.12269;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:13,3:9,2
-chr6	45891633	.	C	CA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.020186;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:11,8:9,2
-chr6	46877227	.	C	CTTTCTTTCTTTCTTTCT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.033698;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,7:8,2:17,5
-chr6	48304249	.	T	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00047744;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:14,7:23,4
-chr6	53157950	.	AAAG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.034034;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,3:14,2
-chr6	54675034	.	A	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.018053;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:49,7:28,4:21,3
-chr6	55962557	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.048018;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:12,2:21,4
-chr6	57539658	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,4:8,3:15,1
-chr6	57913549	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=5.9634e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:40,21:21,10:19,11
-chr6	58755015	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr6	59422846	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.031141;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:6,5:10,2
-chr6	63148838	.	CA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.040965;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:19,4:6,1
-chr6	63458066	.	TTA	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.079949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,2:18,2
-chr6	67659586	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.024816;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:24,3:16,3
-chr6	68904069	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,3:0,1
-chr6	69533355	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.027692;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:21,3:22,3
-chr6	69921531	.	C	CAT	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.0048013;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:20,8:18,6
-chr6	72074925	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0018753;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:20,10:24,4
-chr6	74438585	.	AT	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.046916;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,2:11,2
-chr6	75137886	.	A	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00022955;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:24,10:20,4
-chr6	75456565	.	C	CT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00056917;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:19,6:4,3
-chr6	75536160	.	A	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,4:0,1:0,3
-chr6	76272024	.	CTT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0056817;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,7:1,3:18,4
-chr6	77270294	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0009357;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:12,5:11,7
-chr6	77561686	.	G	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00032937;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:17,3:15,6
-chr6	79373616	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=6.6836e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:18,10:18,5
-chr6	80318686	.	T	TA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.027805;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:10,8:15,5
-chr6	80806606	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.057784;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:16,2:20,2
-chr6	81559728	.	C	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0055147;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:18,3:18,4
-chr6	81612427	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0054566;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,18:13,8:15,10
-chr6	82422987	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00070597;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:14,6:23,5
-chr6	85872303	.	TTC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,9:4,2:14,7
-chr6	86090284	.	CTT	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.039205;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:12,2:20,2
-chr6	86167786	.	A	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=8.9917e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:16,3:17,11
-chr6	86743844	.	TG	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,2:13,2
-chr6	89845243	.	ATG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,10:5,9:2,1
-chr6	90473373	.	C	CTG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.043685;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:10,6:9,2
-chr6	90964127	.	TATATACTAC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:2,2:11,2
-chr6	91841142	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.045802;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:7,2:15,4
-chr6	93015866	.	TCCTCTGTAAAGAG	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0028658;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:22,5:19,3
-chr6	94917868	.	C	CA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.027604;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:13,2:11,4
-chr6	95121561	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0054024;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,3:7,4
-chr6	95323596	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0014181;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,11:28,6:14,5
-chr6	95601716	.	ATT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:7,2:6,2
-chr6	96136242	.	T	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=4.1533e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:16,6:17,9
-chr6	96411350	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00019202;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:14,3:22,9
-chr6	96594227	.	TTATATATATATA	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.20757;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,11:6,8:8,3
-chr6	97091981	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.05132;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,4:9,2:4,2
-chr6	98623447	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00047803;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:17,4:15,9
-chr6	100497438	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00069443;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:17,3:16,7
-chr6	100659197	.	G	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00035126;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:45,17:25,6:20,11
-chr6	102463894	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0083313;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:5,7:6,4
-chr6	102757247	.	A	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0025743;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:18,6:25,3
-chr6	103465401	.	C	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=7.238e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:16,5:17,8
-chr6	103999545	.	C	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=8.6514e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:20,5:10,6
-chr6	104020542	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.032802;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:13,5:17,3
-chr6	105542764	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.049667;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:7,6:6,1
-chr6	110270837	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.018907;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,6:12,5:7,1
-chr6	111058932	.	C	CTT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0015829;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,12:11,7:8,5
-chr6	113582269	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.056492;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:16,2:18,4
-chr6	114320954	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.5866e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:9,6:11,6
-chr6	114913348	.	T	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:5,4:3,3:2,1
-chr6	117069620	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0057488;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,17:8,7:8,10
-chr6	117738740	.	TA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,6:6,1
-chr6	118519466	.	GTGTGT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:5,5:1,1
-chr6	118760105	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00073099;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:14,11:21,2
-chr6	122228508	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0017182;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:49,11:22,8:27,3
-chr6	122353620	.	A	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00029045;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:21,5:18,7
-chr6	124139079	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,10:4,7:4,3
-chr6	124658961	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.020406;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:14,2:17,3
-chr6	124687519	.	TAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,6:8,1
-chr6	128291921	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0034056;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:19,2:21,5
-chr6	129055186	.	TTA	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.080505;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,4:17,1:17,3
-chr6	130728750	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.010573;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:13,9:7,1
-chr6	131499479	.	G	GT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,4:5,1:1,3
-chr6	131559893	.	C	CT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0060843;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,13:13,6:11,7
-chr6	133394282	.	GTGTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,7:5,6:1,1
-chr6	133644593	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00076721;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:19,6:9,6
-chr6	136369356	.	T	C	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.00015018;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:50,12:30,7:20,5
-chr6	138853256	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00015449;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:14,7:29,6
-chr6	139341552	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0013696;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,9:10,5:24,4
-chr6	141441319	.	T	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.032222;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:14,3:16,8
-chr6	142818711	.	G	GA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043486;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:15,3:5,2
-chr6	142818723	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:15,3:6,1
-chr6	142908854	.	C	CAAA	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0010314;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:13,16:10,13:3,3
-chr6	145301406	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0012682;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:20,5:17,4
-chr6	148326414	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0098884;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:4,5:4,1
-chr6	148482688	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.044564;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,9:16,5:11,4
-chr6	149915078	.	C	CCTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10911;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:16,2:3,4
-chr6	150833044	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,2:5,1:2,1
-chr6	153349342	.	CA	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.01339;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:24,3:8,5
-chr6	153496288	.	C	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00014589;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:22,10:14,2
-chr6	154331405	.	A	AAGAAAGAAAGAAAGAAAGAG	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.049488;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,6:27,2:8,4
-chr6	154687498	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.058895;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,3:12,2
-chr6	154812292	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029349;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:8,7:4,1
-chr6	156003552	.	A	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0017721;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,10:19,4:22,6
-chr6	157279320	.	A	AAG	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.018965;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:19,3:23,4
-chr6	157522730	.	CTCCTCCCTCCCTCCCTTTCT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:1,2:8,3
-chr6	158761301	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.099229;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,5:18,4:8,1
-chr6	159010200	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.040224;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:6,1:21,4
-chr6	159133753	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.04992;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,7:9,1:18,6
-chr6	160872501	.	C	CTTTTCT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.019162;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,3:8,4
-chr6	162021463	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,4:9,3:5,1
-chr6	162418613	.	A	AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.046347;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,6:14,4:9,2
-chr6	162612597	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0073681;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:16,11:5,4
-chr6	162658671	.	AAAG	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00483;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:36,21:13,7:23,14
-chr6	164370462	.	TA	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00012362;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,11:6,3:12,8
-chr6	164513819	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.045025;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,3:5,2
-chr6	164848823	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00016948;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:16,4:13,5
-chr6	165136817	.	C	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.075844;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:25,2:15,3
-chr6	166164374	.	C	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=9.7731e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:18,9:18,3
-chr6	167376005	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.020267;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:11,8:16,3
-chr6	167941643	.	A	AG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,4:2,1
-chr6	168001615	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00074754;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,12:7,3:9,9
-chr6	168560884	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr6	168589727	.	G	GCC	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.047311;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:28,3:17,6
-chr6	168589730	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.036692;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:24,5:15,8
-chr6	168911467	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,4:10,2:5,2
-chr6	170039884	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,5:15,2:4,3
-chr6	170736435	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.21163;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:24,1:6,4
-chr7	1190285	.	G	GAGTC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.064462;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,1:11,3
-chr7	1408585	.	A	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0012326;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:19,6:14,2
-chr7	2452593	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:0,0:11,4
-chr7	2859404	.	C	CAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,10:1,7:7,3
-chr7	2895183	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:9,5:3,1
-chr7	3280111	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.012883;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:11,4:11,7
-chr7	4083708	.	T	TGCTC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:0,1:15,7
-chr7	4598967	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033483;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,1:8,3
-chr7	6457972	.	CT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,2:10,2
-chr7	6745558	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,4:5,3:10,1
-chr7	6757889	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.047407;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:13,4:15,1
-chr7	9045935	.	A	ATT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:10,1:5,3
-chr7	9143957	.	A	ATATATAAACATATATATATAAATATATG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047035;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:4,1:5,3
-chr7	9203198	.	ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:7,1:5,3
-chr7	10723665	.	C	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.012866;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:19,11:10,7:9,4
-chr7	11179957	.	TATATATAATGTATATATACATAATATATA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:3,1:20,4
-chr7	13148829	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.039138;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:5,1:14,4
-chr7	13587394	.	G	GTT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0012561;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,17:11,8:9,9
-chr7	14259379	.	TTCTC	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.017938;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:13,4:15,2
-chr7	14418390	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.021894;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:10,4:11,7
-chr7	15014868	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0088578;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,7:0,5:1,2
-chr7	15406281	.	CAT	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.03714;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:15,5:27,4
-chr7	15735093	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.017694;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,6:9,5:3,1
-chr7	16415707	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0029154;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:14,6:16,4
-chr7	16990931	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.033577;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,11:16,9:14,2
-chr7	17752194	.	G	GT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0013728;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:14,9:18,3
-chr7	18706160	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.082337;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:7,4:9,2
-chr7	19302139	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.041838;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,5:14,4:9,1
-chr7	20661540	.	C	CTT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,6:13,4:13,2
-chr7	20668664	.	C	A	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.035422;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:73,14:25,7:48,7
-chr7	22114012	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.016586;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:7,3:18,4
-chr7	23046402	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0037629;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:15,11:4,3
-chr7	23637163	.	AG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
-chr7	23690199	.	A	ATATATATAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.04287;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,9:4,4:11,5
-chr7	24355915	.	CTA	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10169;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:17,2:18,3
-chr7	24430732	.	ATATATATAAATG	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.064403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,3:15,1
-chr7	25253506	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0021281;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:21,3:12,4
-chr7	26083654	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=1.5421e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:41,22:23,12:18,10
-chr7	26962990	.	TAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.051628;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:7,7:11,1
-chr7	28057410	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=6.763e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:42,18:21,9:21,9
-chr7	28725645	.	T	TTAAA	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.047268;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,12:25,7:12,5
-chr7	29123628	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
-chr7	29784970	.	A	C	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.00038558;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:59,15:26,9:33,6
-chr7	29986717	.	AT	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.034293;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,12:24,4:13,8
-chr7	30766197	.	A	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.13974;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:29,4:21,2:8,2
-chr7	32374118	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:19,4:1,0
-chr7	32954414	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036526;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:4,2:6,2
-chr7	33695812	.	T	TTATATATATATATA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:2,5:4,2
-chr7	34128086	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=3.0233e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:16,7:23,7
-chr7	34953728	.	A	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.047669;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:29,8:12,5:17,3
-chr7	36517204	.	TTC	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02403;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:3,4:12,4
-chr7	37882605	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,5:11,3:4,2
-chr7	39015837	.	A	ATT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,3:1,2:1,1
-chr7	39015991	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.17909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:14,4:5,1
-chr7	39015997	.	T	TTATATATATTATATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.18039;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:14,3:6,1
-chr7	43983807	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.03116;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:20,1:13,4
-chr7	44032112	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.023029;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:23,3:9,3
-chr7	45841359	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=4.0373e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:14,6:16,6
-chr7	46010128	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.1599;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,8:7,3:12,5
-chr7	46843617	.	TA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,10:3,9:7,1
-chr7	48550265	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0040597;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:9,10:15,2
-chr7	48913634	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.047959;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,7:16,1:15,6
-chr7	48922573	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0031611;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:13,4:13,4
-chr7	49014897	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=1.4291e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:41,18:28,9:13,9
-chr7	49032613	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00054309;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:21,5:16,6
-chr7	52476780	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.067259;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,5:11,3:14,2
-chr7	52562752	.	C	CAAA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.045845;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,8:20,7:6,1
-chr7	53458023	.	G	C	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.00010387;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:57,21:29,12:28,9
-chr7	53700155	.	A	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=6.5776e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:14,9:16,9
-chr7	53761057	.	G	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00048809;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:23,6:18,6
-chr7	54397052	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.06127;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:17,4:15,2
-chr7	54397100	.	T	TA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.026658;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:12,5:18,2
-chr7	54397143	.	T	TA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0071548;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:11,6:21,7
-chr7	54416638	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.062192;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,6:10,2:7,4
-chr7	55323229	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.052719;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,5:14,2:13,3
-chr7	56736408	.	A	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.028989;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:17,2:20,5
-chr7	56736546	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.011899;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:17,1:19,8
-chr7	56802275	.	T	C	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.021192;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:65,16:38,6:27,10
-chr7	56870984	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.043084;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:20,3:25,2
-chr7	56972510	.	G	T	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.02467;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:54,16:31,11:23,5
-chr7	57389185	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=5.8494e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:21,7:15,7
-chr7	59452090	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.13255;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:0,0:31,4
-chr7	60996788	.	GAGATGAAA	G	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.0069242;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:91,11:58,9:33,2
-chr7	61247396	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=5.4574e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:13,8:14,5
-chr7	61381733	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.011433;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:16,7:20,3
-chr7	63759651	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.043658;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:0,1:27,3
-chr7	64254999	.	C	CAAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0013639;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:8,10:3,9:5,1
-chr7	65123873	.	T	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.035299;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:23,1:35,7
-chr7	65622845	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.016132;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:24,13:12,9:12,4
-chr7	66421225	.	C	CAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.010685;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,12:10,10:6,2
-chr7	66562091	.	AG	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.048716;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:15,1:13,4
-chr7	66598828	.	T	TCTGCTGCTGCTG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0027565;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,13:6,9:4,4
-chr7	67180423	.	TA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,3:14,1
-chr7	67252893	.	C	CAAAT	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=3.1103e-06;SS=2;SSC=55;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:26,26:12,17:14,9
-chr7	67409850	.	TTC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.036036;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:1,0:12,4
-chr7	67435937	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00015256;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:3,14:1,11:2,3
-chr7	67548523	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0073893;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:44,8:22,3:22,5
-chr7	67903888	.	T	TA	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.036173;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:21,9:10,1
-chr7	67989694	.	T	TAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12446;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,5:15,4:13,1
-chr7	68600503	.	C	CT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.041607;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,9:10,5:12,4
-chr7	70084077	.	C	CA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=3.4423e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:14,6:13,8
-chr7	71290347	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=9.1458e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:50,18:30,11:20,7
-chr7	72299689	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0095364;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:6,8:7,1
-chr7	72593820	.	TAAA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020128;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
-chr7	72756201	.	T	TTTTTATTTTA	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.037443;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:30,14:7,10:23,4
-chr7	72876661	.	C	CAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:3,3:4,1
-chr7	73211608	.	C	CTT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.035907;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:16,6:6,1
-chr7	74016494	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,2:5,3
-chr7	74671079	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,4:3,1
-chr7	74861501	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,9:4,8:4,1
-chr7	74955968	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043618;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,1:9,6
-chr7	74960683	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.037117;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,10:10,7:11,3
-chr7	76046341	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:3,4:4,5
-chr7	76088684	.	CA	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.069135;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,4:15,3:12,1
-chr7	76262840	.	GA	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.079534;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:28,4:10,1
-chr7	76460515	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.19282;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,3:14,1
-chr7	76500368	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.031994;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:10,1:15,8
-chr7	76622297	.	C	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.016746;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:25,1:21,8
-chr7	76641285	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:9,2:15,2
-chr7	76969216	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.010634;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:2,6:12,3
-chr7	76970542	.	C	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.023497;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:51,9:25,3:26,6
-chr7	78070630	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.054119;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:24,1:8,3
-chr7	78430240	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.036419;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,5:6,3:6,2
-chr7	79625141	.	T	TATATA	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.044663;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:13,3:20,2
-chr7	79767092	.	G	A	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=4.326e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:49,16:24,9:25,7
-chr7	80152558	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026716;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:14,6:3,2
-chr7	80964594	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:4,5:2,3:2,2
-chr7	81736894	.	G	GGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.018698;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,6:10,4
-chr7	82322451	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.019737;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,8:8,7:2,1
-chr7	82512544	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=1.8109e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:37,20:18,10:19,10
-chr7	84736856	.	A	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.12591;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:27,4:19,1:8,3
-chr7	84750620	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=8.6302e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,19:17,6:15,13
-chr7	85481067	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0020696;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:6,6:11,4
-chr7	85717463	.	CT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0096405;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,9:11,8:5,1
-chr7	87350028	.	T	C	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=2.9752e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:23,6:20,10
-chr7	87766872	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.017595;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:21,5:25,2
-chr7	88604328	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00034961;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:18,8:12,3
-chr7	91922242	.	AAAAAAAC	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0050167;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:7,4:10,7
-chr7	93405435	.	T	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:13,4:20,2
-chr7	96868173	.	A	ATTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,6:5,5:6,1
-chr7	96898974	.	T	TTTATTATTATTATTATTATTA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0063671;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:7,6:11,6
-chr7	97712859	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.9538e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:36,19:20,10:16,9
-chr7	98420585	.	G	GTA	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.036437;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:14,5:19,2
-chr7	99180901	.	A	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
-chr7	100457801	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.027751;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:5,3:4,2
-chr7	100998245	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
-chr7	101140194	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.047842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:4,2:12,2
-chr7	101140236	.	GAA	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,1:0,3
-chr7	101146056	.	C	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0017227;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:48,12:28,7:20,5
-chr7	101241637	.	C	CTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.027296;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:13,6:3,1
-chr7	102547818	.	GAA	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
-chr7	102554519	.	G	A	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.0040935;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:104,22:24,12:80,10
-chr7	102570134	.	GA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.034481;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:4,2:10,4
-chr7	102572592	.	T	C	0	PASS	DP=588;GPV=1;SPV=0.044139;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:304:264,40:139,20:125,20
-chr7	102665519	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.064743;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:5,1:19,3
-chr7	102668693	.	G	A	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.037009;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:84,19:39,10:45,9
-chr7	105071580	.	GTGTATATATATATA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:5,3:8,1
-chr7	105455567	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,3:13,1
-chr7	105727777	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.072836;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,7:7,4:9,3
-chr7	107065336	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,3:3,2:3,1
-chr7	107158258	.	TAGAA	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.01609;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:25,2:18,4
-chr7	107158264	.	G	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.011583;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:24,2:17,4
-chr7	107909839	.	CT	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.035511;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,9:12,6:6,3
-chr7	108549354	.	T	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.0010134;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:20,7:26,3
-chr7	108891130	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1371;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:13,5:4,1
-chr7	109038790	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:9,3:4,1
-chr7	109751577	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:6,3:1,1
-chr7	111537527	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0037321;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:10,8:5,1
-chr7	116562964	.	A	AAAG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:20,3:7,1
-chr7	116562978	.	GGA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:22,3:6,1
-chr7	117529217	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:4,4:16,1
-chr7	119646481	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00014726;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:15,4:11,8
-chr7	119654833	.	G	GA	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0057229;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:19,7:20,2
-chr7	120050531	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.028465;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:9,3:16,2
-chr7	120167623	.	G	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=2.0285e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:28,7:18,7
-chr7	120265704	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.039155;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:22,3:20,2
-chr7	121380733	.	T	TTATATATATATATATATATATA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:17,2:9,2
-chr7	121395252	.	G	GATAC	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.031169;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,5:21,3:14,2
-chr7	123990564	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0018214;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:16,1:17,6
-chr7	124784842	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:5,3:3,1
-chr7	124991025	.	G	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.00024999;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:58,16:33,4:25,12
-chr7	125143216	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,7:6,5:4,2
-chr7	125289405	.	G	GATATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0055944;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:1,8:1,7:0,1
-chr7	126763472	.	TACACAC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:4,2:3,1:1,1
-chr7	127029006	.	A	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00047793;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:23,5:15,6
-chr7	127125765	.	A	AACACACACACAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0015492;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,9:4,6:1,3
-chr7	129114664	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=8.8849e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:18,4:14,8
-chr7	129659073	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016464;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:17,3:3,3
-chr7	129696084	.	A	AAAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.032005;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:8,2:1,3
-chr7	129790556	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:10,5:3,1:7,4
-chr7	129884416	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036457;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:8,6:8,1
-chr7	130257636	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.019231;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,4:0,0:3,4
-chr7	131189547	.	C	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.083225;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:25,5:11,2:14,3
-chr7	131227477	.	C	CTT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.086167;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:12,2:21,2
-chr7	131227493	.	TTC	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.069705;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,5:12,3:22,2
-chr7	132217179	.	A	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.0002238;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:22,5:19,7
-chr7	132615927	.	A	ATCTCTCTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.25076;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,4:8,1:21,3
-chr7	133247882	.	AT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.034541;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:14,7:8,3
-chr7	133737909	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.27368;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:2,5:9,2
-chr7	135309610	.	C	CTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,8:5,5:7,3
-chr7	135819017	.	T	C	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=4.4906e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:50,18:26,7:24,11
-chr7	136191578	.	C	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.047407;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:25,10:14,5:11,5
-chr7	137792282	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0071224;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:47,9:29,6:18,3
-chr7	138636470	.	A	AT	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0019055;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:18,5:18,5
-chr7	138745963	.	AT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18039;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,2:13,2
-chr7	139905057	.	T	TTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.025917;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,5:14,1:10,4
-chr7	140266059	.	A	ATT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.024063;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:14,7:7,2
-chr7	140961346	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047956;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,1:10,4
-chr7	141432146	.	CTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,5:5,1
-chr7	142378361	.	G	GTT	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.033108;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:17,2:22,3
-chr7	142814163	.	CTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0053554;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:2,6:5,2
-chr7	144318748	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0068026;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:0,3:4,3
-chr7	145673910	.	C	CAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.022623;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:11,5:5,1
-chr7	146901870	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0068445;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:4,6:14,4
-chr7	147033176	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,4:3,1:3,3
-chr7	147239929	.	G	C	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.00041262;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:31,10:17,3
-chr7	148598765	.	G	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,8:4,3:0,5
-chr7	149542686	.	C	CA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0042972;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,12:14,11:3,1
-chr7	150007999	.	C	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.028806;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:55,9:29,1:26,8
-chr7	150797514	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=6.6865e-10;SS=2;SSC=91;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:30,27:17,18:13,9
-chr7	152238768	.	T	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.03511;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:47,14:23,7:24,7
-chr7	152480647	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.012115;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:21,3:14,5
-chr7	152511786	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:13,8:3,2
-chr7	152874515	.	G	GC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.16482;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:2,2:25,3
-chr7	152938560	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=8.7178e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:20,4:16,9
-chr7	153762484	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0056915;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:18,4:22,3
-chr7	153845294	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.001855;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:27,5:19,6
-chr7	154776250	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.047725;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:41,11:32,4:9,7
-chr7	155050527	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.038903;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,12:20,10:11,2
-chr7	155111533	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:2,5:7,1
-chr7	155539625	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=3.4257e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,15:21,7:16,8
-chr7	156024264	.	C	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.00017676;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:56,16:27,9:29,7
-chr7	156389357	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.010436;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:28,2:30,6
-chr7	157498375	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037307;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:10,3:15,2
-chr7	157982292	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,2:6,4
-chr7	158089591	.	A	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.018729;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:27,4:14,5
-chr7	158166518	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.039387;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:13,5:6,1
-chr7	158320111	.	ACACACACACAGCCTCCCT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:17,1:0,3
-chr8	283011	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.26049;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:18,1:3,2
-chr8	403891	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.092258;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,1:16,3
-chr8	1017526	.	C	CTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.056718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,3:7,2
-chr8	1104182	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=8.0217e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,16:20,10:13,6
-chr8	1275848	.	T	TAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2122;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:7,3:18,1
-chr8	1275920	.	AAT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031602;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:11,1:10,5
-chr8	2120675	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:0,2:4,3
-chr8	2516725	.	T	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=6.5335e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:33,21:17,8:16,13
-chr8	3068584	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00020622;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:26,7:15,6
-chr8	3390899	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=6.289e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:40,16:26,8:14,8
-chr8	3906261	.	G	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0010064;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:14,7:26,4
-chr8	4409642	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,8:2,7:2,1
-chr8	5269651	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0049996;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:21,8:24,1
-chr8	5624850	.	T	TAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,4:12,3:7,1
-chr8	5655618	.	A	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0012714;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:20,3:20,7
-chr8	6113421	.	TACTATATACAGTGTATATACACTATAGAC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.32127;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,2:12,2
-chr8	6261270	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.014917;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:18,2:23,5
-chr8	6768735	.	GAA	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.029045;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,7:14,5:8,2
-chr8	7207095	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0093016;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:8,10:13,5
-chr8	7376048	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.064743;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,3:11,1
-chr8	7376049	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.098182;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:12,2:10,1
-chr8	7482193	.	A	G	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.016522;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:56,18:31,5:25,13
-chr8	7583423	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:17,4:0,0
-chr8	7801383	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00038792;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,18:23,14:5,4
-chr8	7818239	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:11,5:1,1
-chr8	8057148	.	A	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
-chr8	8067091	.	G	A	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.024755;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:92,14:54,4:38,10
-chr8	8142268	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
-chr8	8183755	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.077596;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:16,4:20,1
-chr8	8313737	.	T	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=1.4277e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:13,9:20,5
-chr8	8436016	.	G	GT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
-chr8	8447410	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,5:9,1:6,4
-chr8	8558379	.	C	A	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=4.326e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:49,16:13,5:36,11
-chr8	8879564	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=8.3554e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:25,5:11,10
-chr8	9973961	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.040392;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:16,5:12,2
-chr8	10048938	.	GT	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00070234;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:23,9:20,3
-chr8	11700075	.	T	C	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.00053331;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,11:24,8:24,3
-chr8	12001900	.	C	CTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.019231;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,4:0,3:3,1
-chr8	12209513	.	C	G	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.040163;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:60,15:28,9:32,6
-chr8	12286375	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,3:5,1
-chr8	12442343	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.040934;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:14,2:12,7
-chr8	12522519	.	CTCT	C	0	PASS	DP=187;GPV=1;SPV=0.028869;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:89,20:35,10:54,10
-chr8	12555537	.	C	A	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.049651;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:143:118,25:41,9:77,16
-chr8	12556968	.	G	A	0	PASS	DP=279;GPV=1;SPV=0.036536;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:117,23:67,10:50,13
-chr8	12559343	.	G	A	0	PASS	DP=281;GPV=1;SPV=0.010149;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:125,32:59,14:66,18
-chr8	12566962	.	C	G	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.040469;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:131,24:64,8:67,16
-chr8	12590428	.	G	A	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.044471;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:134,23:58,12:76,11
-chr8	12591444	.	G	A	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.011397;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:94,26:40,11:54,15
-chr8	12774582	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.042981;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:10,5:8,2
-chr8	14948879	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.019247;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:19,9:14,4:5,5
-chr8	15648068	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=7.0149e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:34,17:20,7:14,10
-chr8	15782334	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=1.8338e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:51,19:26,9:25,10
-chr8	16122843	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.014951;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:11,9:4,4
-chr8	16707079	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,2:2,1:4,1
-chr8	16947855	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.079663;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:24,4:11,1
-chr8	18509669	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.8323e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:11,7:16,7
-chr8	21813654	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.046916;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,2:16,2
-chr8	22592057	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.12341;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:10,2:21,2
-chr8	22860188	.	ATATG	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.020178;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:21,1:16,6
-chr8	23374399	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.010763;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:26,4:18,5
-chr8	23652544	.	CCTTCCTTCCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.017837;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:7,3:13,6
-chr8	25903607	.	G	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.00089077;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:21,6:24,3
-chr8	26731248	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.095044;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,5:23,4:4,1
-chr8	28881475	.	GA	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.048964;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:28,2:16,4
-chr8	30046474	.	TAAAAAAA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:7,2:9,2
-chr8	30089770	.	A	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.032967;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:1,2:0,0:1,2
-chr8	30173970	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.016248;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:14,5:16,1
-chr8	30692495	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:4,5:4,2
-chr8	32389771	.	T	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0030396;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:14,2:17,5
-chr8	32412421	.	TAC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.34673;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,3:13,1:11,2
-chr8	35523578	.	CT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.023028;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:24,9:5,3
-chr8	38574646	.	T	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.019217;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:58,7:37,3:21,4
-chr8	39749587	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.036723;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:31,4:20,2
-chr8	40067256	.	TTC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.089038;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:5,1:14,2
-chr8	40332741	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:14,4:6,1
-chr8	40680701	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:15,4:5,3:10,1
-chr8	42203992	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.01549;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,9:8,1:11,8
-chr8	44933113	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:5,2:1,1
-chr8	48746954	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00018197;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:18,9:21,4
-chr8	49787630	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00012803;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:22,4:18,11
-chr8	51349171	.	GT	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.092709;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:32,4:16,3:16,1
-chr8	54478540	.	C	CTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.010436;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,7:10,3
-chr8	55750541	.	C	CTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0033813;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,7:6,1
-chr8	56633257	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:5,5:4,1
-chr8	61166136	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.027483;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:14,3:24,3
-chr8	61262000	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.026618;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:21,3:25,7
-chr8	61752495	.	CA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.021168;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:7,4:14,2
-chr8	61752509	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.05461;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:5,3:15,1
-chr8	63017600	.	C	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00028775;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:42,12:23,6:19,6
-chr8	63166003	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=3.2412e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:38,17:16,4:22,13
-chr8	63819075	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00071194;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:15,8:21,3
-chr8	64040802	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=7.4953e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:34,20:17,11:17,9
-chr8	64549678	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.023574;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,6:5,2
-chr8	65596309	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016761;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,6:5,1:7,5
-chr8	66851018	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0080832;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:53,9:22,4:31,5
-chr8	67403755	.	A	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
-chr8	67468972	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00017122;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:19,5:9,5
-chr8	67475817	.	CCTTTCT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,6:2,2:12,4
-chr8	68095500	.	AATAC	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.012987;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:14,3:17,5
-chr8	68095521	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.016986;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:10,4:17,8
-chr8	68268006	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:2,2:7,3
-chr8	68525956	.	C	CTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:12,3:8,1
-chr8	70643527	.	T	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=4.5526e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:17,9:18,5
-chr8	72152181	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.014234;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:16,6:14,5
-chr8	73090922	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00024465;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:24,6:15,7
-chr8	74802578	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0015192;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:15,3:19,8
-chr8	75287608	.	AAT	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.093588;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:26,4:10,3:16,1
-chr8	75584552	.	C	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00019435;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:17,6:11,4
-chr8	75644593	.	A	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=5.4584e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:11,8:23,4
-chr8	76731856	.	C	CATTATT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0060061;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:12,8:13,3
-chr8	77133292	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:8,4:4,1
-chr8	77473407	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:7,2:3,1:4,1
-chr8	77486236	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:10,3:13,2
-chr8	79683371	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,6:3,1
-chr8	80086101	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,6:4,1
-chr8	81980963	.	TATATATA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:4,3:7,4
-chr8	84151550	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.00027199;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:54,15:36,8:18,7
-chr8	85180511	.	CATATATATATATATAT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0044521;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,10:3,7:2,3
-chr8	85654505	.	G	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:18,3:5,1
-chr8	85657690	.	A	G	0	PASS	DP=733;GPV=1;SPV=0.037764;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:378:331,47:95,18:236,29
-chr8	85741876	.	C	G	0	PASS	DP=812;GPV=1;SPV=0.020207;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:452:399,53:195,28:204,25
-chr8	86162635	.	T	TTA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:4,4:2,1
-chr8	86162674	.	A	ATAATATATAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,4:2,1
-chr8	86162689	.	T	TTA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:11,3:3,1
-chr8	86600776	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.039565;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,9:8,5:15,4
-chr8	88749707	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0014381;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:20,3:8,5
-chr8	88830408	.	ATATATGTACTATATATGCATGTATGCATC	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.024749;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:17,8:22,5
-chr8	88867842	.	ATATATATAGT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:4,2:4,2
-chr8	89753827	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.053564;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:26,3:24,4
-chr8	89753830	.	ATATT	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.058382;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:29,3:23,4
-chr8	90202884	.	CTTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020644;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:11,8:2,1
-chr8	92631352	.	A	AGT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.036061;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,12:22,9:10,3
-chr8	95553955	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.098694;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:19,4:12,1
-chr8	95581559	.	G	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=6.5448e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:18,2:26,10
-chr8	95625128	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0020227;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:18,5:25,6
-chr8	98105121	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,2:2,1:5,1
-chr8	98115388	.	CAAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031197;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:6,6:12,2
-chr8	98421016	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0035237;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:25,6:21,4
-chr8	98680981	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.008898;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:5,9:5,2
-chr8	98858323	.	T	TATAGAG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:3,5:2,1
-chr8	101049459	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.073823;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:0,2:19,3
-chr8	101592100	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,5:1,1:2,4
-chr8	102371275	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,5:8,4:5,1
-chr8	103059898	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:5,3:1,2:4,1
-chr8	103684539	.	TTTTTATTTTATTTTATTTTA	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.042981;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,7:6,4:12,3
-chr8	104549400	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.010488;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:9,7:8,5
-chr8	106161086	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0048593;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:18,5:18,4
-chr8	106704393	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:3,3:6,2
-chr8	106984409	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=4.5526e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:15,5:20,9
-chr8	107033169	.	A	AAAAAAAAAAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.026469;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,7:7,4:7,3
-chr8	108097991	.	AGAAGGAAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:13,3:6,1
-chr8	108098147	.	AGAAGGAAGGAAGGAAG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,4:20,1:1,3
-chr8	108614685	.	A	G	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=4.1184e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:18,5:23,9
-chr8	109608824	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00011817;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:21,10:18,3
-chr8	110152082	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020843;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,2:7,4
-chr8	113537715	.	T	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.002391;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:18,4:14,4
-chr8	116366082	.	GGGAAGGAAGGAAGGAA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.044074;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,6:8,2
-chr8	116752665	.	GAAGAAAGAAAGA	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.039029;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,3:8,2
-chr8	117920671	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00018514;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:17,5:14,7
-chr8	120078337	.	CAA	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0049412;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,12:17,8:8,4
-chr8	120920575	.	TTATA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.080441;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:16,1:7,4
-chr8	121112767	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.8286e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:33,18:17,10:16,8
-chr8	123702459	.	A	G	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=1.0881e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:15,7:18,6
-chr8	125540475	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00083722;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:18,5:16,6
-chr8	126196445	.	A	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=1.613e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:40,19:16,13:24,6
-chr8	127817460	.	AAT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14763;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,3:11,1
-chr8	129449402	.	G	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:6,2:0,0
-chr8	132409076	.	T	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=9.7521e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:41,18:20,14:21,4
-chr8	133578440	.	AAGAAAAAG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,2:5,2
-chr8	134113457	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0034446;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:24,6:11,3
-chr8	134190431	.	GGTTGT	G	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.048023;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:50,13:32,11:18,2
-chr8	134214861	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.024674;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:9,5:4,4
-chr8	135515365	.	TAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.035568;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:8,4:7,1
-chr8	135645992	.	ATTT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,4:11,2:6,2
-chr8	135782500	.	C	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=6.0337e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:17,5:20,7
-chr8	137237914	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.053645;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,3:14,1
-chr8	137433570	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.0011997;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:19,5:22,4
-chr8	137569743	.	T	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00084558;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:22,8:19,4
-chr8	140033660	.	T	TTTTTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:6,1:15,4
-chr8	140902036	.	T	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.18462;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:6,3:3,1:3,2
-chr8	141540940	.	C	CACAG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.10033;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:13,3:18,1
-chr8	142760623	.	C	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:4,2:1,1
-chr8	142887418	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.038264;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:17,6:7,1
-chr8	143908400	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00031571;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:21,3:14,7
-chr8	144188449	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:1,0:12,4
-chr9	400004	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,3:5,1
-chr9	528469	.	CT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,3:1,1
-chr9	932654	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.001805;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:18,6:20,5
-chr9	1551518	.	C	CT	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=1.467e-06;SS=2;SSC=58;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:17,5:14,10
-chr9	4465756	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0096404;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:13,3:25,8
-chr9	4857407	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0017262;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:14,5:17,3
-chr9	5919543	.	A	AACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,6:8,4:2,2
-chr9	6179458	.	T	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.01818;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:53,7:35,5:18,2
-chr9	9034725	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0016349;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:16,4:22,6
-chr9	9158600	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0040567;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:26,4:13,4
-chr9	11399613	.	A	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0040654;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:19,6:17,2
-chr9	12019965	.	G	A	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=5.0519e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:49,15:29,4:20,11
-chr9	12038241	.	G	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=7.9911e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:19,3:9,10
-chr9	12386854	.	CATATAT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.25826;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:8,2:2,2
-chr9	14768275	.	A	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:42:1,4:0,0:1,4
-chr9	15345467	.	C	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.054832;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:25,5:13,2:12,3
-chr9	15363370	.	CAT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.014079;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,7:5,1
-chr9	15534643	.	T	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0002546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:21,3:10,9
-chr9	16367422	.	A	ATT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:6,2:5,2
-chr9	17608147	.	C	CTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:2,4:5,4
-chr9	18283607	.	T	TAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,4:3,2
-chr9	22361749	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0022864;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:15,3:21,5
-chr9	22753409	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00071247;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:16,11:2,1
-chr9	22830913	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.10313;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,4:18,3:7,1
-chr9	22905412	.	AT	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=8.9917e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:21,11:12,3
-chr9	23159451	.	C	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,2:6,4
-chr9	23228610	.	G	GA	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.017057;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:30,16:20,12:10,4
-chr9	23289832	.	CAA	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.115;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:24,4:10,1
-chr9	23627441	.	GTATATATATATATA	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0045822;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:5,9:5,3
-chr9	24471382	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=4.6702e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:16,6:18,7
-chr9	24609154	.	A	AT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0048907;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:11,9:17,2
-chr9	25012710	.	A	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=5.8151e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:18,6:18,9
-chr9	25460823	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.035008;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,10:21,9:12,1
-chr9	25552600	.	T	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00018501;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:18,10:17,5
-chr9	26003300	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=7.3924e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:22,7:16,7
-chr9	26121984	.	C	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=1.5702e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:41,16:19,9:22,7
-chr9	27875868	.	AAC	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0049255;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:13,5:12,4
-chr9	27880014	.	G	A	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=7.2274e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:52,16:30,8:22,8
-chr9	28848160	.	ATATAGT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:12,3:8,2:4,1
-chr9	29024836	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=1.9604e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:18,6:15,8
-chr9	29085281	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.33771;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:14,3:6,1
-chr9	32165011	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00041078;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:17,7:15,4
-chr9	32601670	.	T	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.0001031;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:18,4:22,9
-chr9	34416213	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.029588;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:8,9:4,1
-chr9	35333964	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.036676;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:17,4:12,2:5,2
-chr9	36156385	.	TAA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.044451;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:12,8:4,3
-chr9	36792753	.	CCA	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.028317;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:24,5:12,1
-chr9	38460772	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.044477;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,3:3,1
-chr9	38989371	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.051196;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:18,3:16,3
-chr9	39054976	.	C	T	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.042295;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:60,10:32,7:28,3
-chr9	39584585	.	A	AAAAAAAG	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.02264;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:68,8:36,4:32,4
-chr9	39796987	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.054403;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:11,1:16,5
-chr9	40040894	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.041933;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:16,4:5,2
-chr9	40068507	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.039226;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:24,5:13,2
-chr9	40200174	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,16:24,10:20,6
-chr9	40516774	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.039259;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,3:9,1
-chr9	40731686	.	A	AT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.025396;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,6:15,1:23,5
-chr9	40804756	.	C	CCTTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.015839;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,11:8,3:14,8
-chr9	40851579	.	A	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.012703;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:47,6:18,3:29,3
-chr9	40960658	.	A	T	0	PASS	DP=240;GPV=1;SPV=0.037876;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:115,25:58,18:57,7
-chr9	40973717	.	G	A	0	PASS	DP=316;GPV=1;SPV=0.029368;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:155,18:76,13:79,5
-chr9	40979805	.	TAA	T	0	PASS	DP=386;GPV=1;SPV=0.047842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:202,25:114,13:88,12
-chr9	40995624	.	G	C	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.0046679;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:76,9:57,8:19,1
-chr9	41075176	.	TGTGTAC	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.029296;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,13:13,3:24,10
-chr9	41112893	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.036359;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:10,8:15,1
-chr9	41203255	.	G	A	0	PASS	DP=168;GPV=1;SPV=0.042316;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:70,9:29,3:41,6
-chr9	41204487	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030844;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,3:8,2
-chr9	41221222	.	G	A	0	PASS	DP=393;GPV=1;SPV=0.010139;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:203:172,31:104,19:68,12
-chr9	41253107	.	G	C	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.0010047;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:99,16:47,7:52,9
-chr9	41275062	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0041548;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:7,7:24,7
-chr9	41275865	.	C	T	0	PASS	DP=324;GPV=1;SPV=0.008596;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:144,22:59,6:85,16
-chr9	41326243	.	A	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.018267;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:17,3:13,11
-chr9	41338692	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0096193;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:20,10:12,3
-chr9	41460901	.	G	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.041853;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:15,1:25,6
-chr9	41460991	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0016204;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:4,2:20,10
-chr9	41482510	.	T	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.033965;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:53,9:20,3:33,6
-chr9	41501442	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.026137;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:11,6:16,4
-chr9	41717094	.	A	AT	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.022536;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:58,13:37,5:21,8
-chr9	41920840	.	G	A	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.0053225;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:97,28:60,18:37,10
-chr9	41932622	.	C	T	0	PASS	DP=197;GPV=1;SPV=0.0060414;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:79,25:41,9:38,16
-chr9	42187574	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.026125;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:18,2:9,6
-chr9	42189883	.	T	C	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.021814;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:59,17:33,9:26,8
-chr9	43005960	.	A	T	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.02464;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:76,16:50,5:26,11
-chr9	43034421	.	G	A	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.04063;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:72,8:33,2:39,6
-chr9	43040612	.	T	C	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.017696;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:29,11:15,3
-chr9	43319585	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0013404;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:27,5:17,7
-chr9	43435546	.	T	G	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.03335;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:70,13:62,11:8,2
-chr9	43497226	.	T	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.019473;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:63,8:42,3:21,5
-chr9	43555952	.	C	T	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.046991;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:122,23:93,19:29,4
-chr9	43657784	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:15,1:6,4
-chr9	43737971	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr9	44129620	.	G	A	0	PASS	DP=387;GPV=1;SPV=0.028788;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:191,26:132,23:59,3
-chr9	44310318	.	A	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr9	44414745	.	T	C	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.019624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:90,14:23,3:67,11
-chr9	44843023	.	A	G	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.016542;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:62,19:56,2:6,17
-chr9	44895497	.	G	C	0	PASS	DP=467;GPV=1;SPV=0.010463;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:255:219,36:140,29:79,7
-chr9	44934534	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:4,2:11,2
-chr9	45123799	.	G	C	0	PASS	DP=455;GPV=1;SPV=0.006184;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:239:215,24:123,12:92,12
-chr9	45374360	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.064347;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:29,4:1,0
-chr9	45419343	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.025685;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:2,8:12,1
-chr9	60610139	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:1,0:22,4
-chr9	61161872	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0091926;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:6,9:9,2
-chr9	61915782	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.017906;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:45,7:19,1:26,6
-chr9	62099604	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0011775;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:1,10:0,2:1,8
-chr9	62800114	.	C	T	0	PASS	DP=487;GPV=1;SPV=0.031305;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:240,39:124,15:116,24
-chr9	62802278	.	C	T	0	PASS	DP=480;GPV=1;SPV=0.043145;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:254:215,39:100,14:115,25
-chr9	62811764	.	T	C	0	PASS	DP=310;GPV=1;SPV=0.025293;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:139,25:62,13:77,12
-chr9	62826395	.	G	C	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.02156;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:143:127,16:69,2:58,14
-chr9	62835638	.	G	C	0	PASS	DP=296;GPV=1;SPV=0.01712;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:150,19:79,6:71,13
-chr9	62840770	.	G	C	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.0035057;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:190:164,26:39,6:125,20
-chr9	62841157	.	A	T	0	PASS	DP=258;GPV=1;SPV=0.033344;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:110,21:55,5:55,16
-chr9	62885216	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0432;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:14,3:26,8
-chr9	62904052	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.023646;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:19,8:9,1
-chr9	62905632	.	TC	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064294;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:31,4:0,0
-chr9	63345898	.	T	G	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.01398;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:43,15:16,7:27,8
-chr9	63757194	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.00082552;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:51,13:32,9:19,4
-chr9	63812339	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.032541;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:51,9:28,4:23,5
-chr9	63819760	.	G	T	0	PASS	DP=567;GPV=1;SPV=0.014374;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:300:261,39:120,23:141,16
-chr9	63861709	.	C	A	0	PASS	DP=263;GPV=1;SPV=0.015469;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:112,28:35,7:77,21
-chr9	63861710	.	A	G	0	PASS	DP=260;GPV=1;SPV=0.023576;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:112,27:39,7:73,20
-chr9	63870056	.	A	G	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.020167;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:51,12:33,7:18,5
-chr9	63870158	.	G	A	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.021202;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:57,10:31,3:26,7
-chr9	63870195	.	CT	C	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.014363;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:51,6:29,1:22,5
-chr9	64077123	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.03931;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,12:16,10:3,2
-chr9	64107800	.	C	A	0	PASS	DP=400;GPV=1;SPV=0.046046;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:209:182,27:90,18:92,9
-chr9	64375598	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.010536;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:8,4:11,9
-chr9	64386168	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.031028;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:17,4:3,1
-chr9	64469826	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,4:4,1:3,3
-chr9	64492136	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.041089;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:10,7:17,2
-chr9	64493849	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.041004;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:36,2:8,3
-chr9	64682117	.	G	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:0,5:3,1
-chr9	65256879	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.015873;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:0,1:16,7
-chr9	65269468	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.3426;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:16,2:3,1
-chr9	65287393	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0019324;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:2,4:4,3
-chr9	65653714	.	T	G	0	PASS	DP=247;GPV=1;SPV=0.017356;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:109,19:62,13:47,6
-chr9	65936253	.	A	C	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.049277;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:65,13:30,7:35,6
-chr9	65967821	.	G	T	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.03329;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:53,12:23,5:30,7
-chr9	66031944	.	T	C	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.0014401;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:71,23:40,12:31,11
-chr9	66042285	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:3,3:7,2
-chr9	66171597	.	T	C	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.049508;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:75,16:38,9:37,7
-chr9	66171811	.	T	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.018795;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:52,16:26,9:26,7
-chr9	66176323	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.027751;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,1:2,4
-chr9	66220831	.	C	T	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.031662;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:79,16:42,9:37,7
-chr9	66354771	.	AAAGG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.26573;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:1,0:22,4
-chr9	66356240	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016558;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,6:11,1:6,5
-chr9	66738566	.	G	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.024045;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:21,8:19,2
-chr9	66886167	.	A	ATT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.038251;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:12,4:9,7
-chr9	67126309	.	A	C	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.00032488;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:61,13:34,8:27,5
-chr9	67505891	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0035197;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,8:3,1
-chr9	67616303	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.023721;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:6,2:18,3
-chr9	67749642	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:0,0:12,4
-chr9	67778907	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.028868;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:6,3:28,4
-chr9	67810124	.	A	T	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.020503;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:73,9:35,7:38,2
-chr9	67897767	.	G	GT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.064244;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:15,1:17,3
-chr9	68235379	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.047588;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,10:16,6:19,4
-chr9	68257015	.	GGTTTTTT	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,2:2,1:2,1
-chr9	68263305	.	G	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
-chr9	68293018	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.13808;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:34,4:1,0
-chr9	68302441	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.02545;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,5:3,2
-chr9	68331415	.	C	T	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.027329;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:60,7:28,5:32,2
-chr9	68331508	.	A	G	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.03356;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:65,9:21,2:44,7
-chr9	68356290	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.044109;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:26,7:18,2
-chr9	70505606	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.011214;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:18,1:19,9
-chr9	70505607	.	CT	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.11654;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:15,1:23,4
-chr9	71928186	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:6,15:3,13:3,2
-chr9	74549551	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,3:5,3:0,0
-chr9	74847168	.	T	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00019647;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:21,6:19,6
-chr9	76351610	.	GA	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.028362;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:18,2:6,3
-chr9	77431748	.	G	A	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=3.6348e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:44,19:21,10:23,9
-chr9	77951092	.	C	CTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.019062;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,5:6,4:6,1
-chr9	79516885	.	C	CA	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.064152;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:19,2:15,2
-chr9	79516891	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.024282;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:15,6:9,3:6,3
-chr9	79845036	.	C	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00017085;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:17,5:18,6
-chr9	80682810	.	G	GTGTGTACATA	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0012204;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,17:15,7:10,10
-chr9	80758140	.	CACAT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,2:10,2
-chr9	81017974	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00035994;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:15,5:14,7
-chr9	81082749	.	TTC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.020884;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:6,1:10,8
-chr9	82276208	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.013935;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:15,6:15,6
-chr9	83158653	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.10931;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,4:17,2:13,2
-chr9	83378261	.	G	GT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.014733;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,15:4,11:12,4
-chr9	84773759	.	A	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00042036;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:21,4:16,7
-chr9	84797611	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,2:0,0:6,2
-chr9	84924229	.	TAGAAAGAA	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0010569;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:13,10:9,6
-chr9	85219269	.	T	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0052387;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:18,3:25,5
-chr9	85259866	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.021798;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,1:7,6
-chr9	87183343	.	G	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.00025363;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:20,6:25,6
-chr9	88136022	.	C	G	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.020238;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:58,17:31,7:27,10
-chr9	88178055	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.039403;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,10:6,2:17,8
-chr9	88423726	.	AT	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0034815;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,14:17,10:12,4
-chr9	90352561	.	A	T	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=1.2761e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:33,21:18,12:15,9
-chr9	91372933	.	T	TTTG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,4:3,1:9,3
-chr9	92156756	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.03611;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:16,2:14,8
-chr9	96165262	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.014087;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:23,3:18,3
-chr9	96456759	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,3:2,1
-chr9	97946938	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=2.6269e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:43,19:20,13:23,6
-chr9	98246667	.	TC	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00032303;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:19,9:25,3
-chr9	98729589	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0056752;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:44,8:19,5:25,3
-chr9	100973502	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:0,2:0,0:0,2
-chr9	102747129	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=7.4988e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:21,9:13,5
-chr9	102910576	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0001091;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:14,8:18,6
-chr9	103157090	.	AT	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.6127e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:14,7:17,8
-chr9	103157095	.	A	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.0255e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:13,6:17,8
-chr9	103168002	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.007985;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:50,9:22,7:28,2
-chr9	103739609	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:2,1:11,3
-chr9	109332155	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033265;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,6:8,3:5,3
-chr9	109510558	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.059209;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,5:11,1:15,4
-chr9	110245653	.	TA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,3:1,1:0,2
-chr9	111153004	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0022504;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,13:10,10:2,3
-chr9	111985797	.	G	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00032727;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:21,8:16,3
-chr9	112161821	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:7,4:5,1:2,3
-chr9	112290707	.	T	TACACACACAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011333;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,11:5,4:11,7
-chr9	112477701	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:22,5:17,6
-chr9	112775542	.	T	TTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.021554;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:12,3:5,2
-chr9	113248462	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.032107;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:3,4:3,1
-chr9	114496542	.	A	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.020919;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,6:8,5:14,1
-chr9	114949683	.	C	CTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.080194;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,5:5,2:21,3
-chr9	114949709	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.020314;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:1,3:17,5
-chr9	115298062	.	CAAA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,5:12,1:9,4
-chr9	116141871	.	T	TGGAAGGAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:7,4:7,1
-chr9	119043947	.	A	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,4:13,1:13,3
-chr9	121002240	.	ATATGTATATATATG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.012978;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:12,3:10,5
-chr9	122391368	.	T	TAC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,2:7,2
-chr9	123848228	.	TAA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,3:5,1
-chr9	123946971	.	AT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,1:7,3
-chr9	125126591	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.025527;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:16,4:6,1
-chr9	125368651	.	TTA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.024893;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,10:7,5:7,5
-chr9	126043190	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00025457;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:17,5:15,7
-chr9	126720734	.	T	TA	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.013592;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:18,2:17,5
-chr9	128830632	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0036482;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:5,2:1,7
-chr9	129493970	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0091766;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:14,4:3,1
-chr9	130334549	.	G	GTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:10,11:6,9:4,2
-chr9	130955308	.	G	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:0,5:3,1
-chr9	131462836	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040316;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:4,2:1,2
-chr9	132313931	.	T	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.11505;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:31,4:22,2:9,2
-chr9	132708087	.	AAGAAAG	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027472;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,9:10,3:10,6
-chr9	132964743	.	CT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0036125;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,6:4,2:3,4
-chr9	134679626	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr9	135125996	.	GT	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.043084;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:16,1:29,4
-chr9	136452449	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:11,9:5,1
-chr9	136802875	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,4:4,3:23,1
-chr9	137323590	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.022631;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:24,10:3,2
-chr9	137379006	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:4,1:12,3
-chr9	138218119	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.046765;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:58,7:35,6:23,1
-chrM	4201	.	G	A	0	PASS	DP=14053;GPV=1;SPV=0;SS=2;SSC=255;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7031:5235,1795:2022,765:3213,1030
-chrX	3092212	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.029045;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:8,4:14,3
-chrX	3309177	.	A	AAT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00068379;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:10,8:9,4
-chrX	3659728	.	TG	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.10909;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,2:0,1:2,1
-chrX	4121774	.	T	TCTC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,1:10,3
-chrX	7992178	.	T	TTCTC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:0,4:3,1
-chrX	9313051	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,4:0,4:0,0
-chrX	9411434	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.068498;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:12,3:18,1
-chrX	13675572	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12547;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,2:10,2
-chrX	14545758	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=1.7034e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:6,7:6,5
-chrX	18214152	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=4.9037e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,15:7,7:4,8
-chrX	21331652	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00017618;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,15:6,8:6,7
-chrX	22690043	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=2.9309e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:5,7:8,6
-chrX	26425516	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00012264;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:6,3:5,8
-chrX	27042819	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=9.7816e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:6,6:5,7
-chrX	27096437	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:0,2:0,0:0,2
-chrX	28945905	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.068336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,2:10,3
-chrX	33412878	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.037062;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:14,4:14,2
-chrX	34032854	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.00010021;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,7:5,4
-chrX	38518516	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.064151;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,5:7,1
-chrX	44125010	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
-chrX	44616563	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,2:3,2:0,0
-chrX	45302124	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.19342;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:14,3:8,3
-chrX	46037998	.	GATATATAT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:4,3:3,9
-chrX	46917834	.	C	CCTCT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,5:2,3:0,2
-chrX	48779797	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=4.5999e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,17:6,8:0,9
-chrX	51692739	.	A	ACGCG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:7,3:1,5
-chrX	53078022	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:1,4:1,3:0,1
-chrX	53463626	.	T	TTCTTCTTTCTA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:8,1:12,3
-chrX	55940070	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0033075;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,6:5,2
-chrX	59031791	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0050575;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,5:2,1
-chrX	61711362	.	G	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:0,0:11,4
-chrX	72049295	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=4.8084e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:6,7:10,8
-chrX	79631705	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0010246;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:6,5:9,5
-chrX	80453521	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00053602;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:7,7:2,5
-chrX	82060681	.	C	CTCT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.13462;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:6,2:12,1
-chrX	82593914	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.095675;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:18,2:12,4
-chrX	83754213	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.063124;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:19,2:16,3
-chrX	87257915	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.003412;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:7,3:9,5
-chrX	87796085	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00013922;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:8,5:5,5
-chrX	88491057	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01393;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:6,1:7,5
-chrX	88811126	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=2.0919e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,15:3,9:6,6
-chrX	90203941	.	C	CTCTTTCTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:2,2:4,4
-chrX	91286984	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=7.3793e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:8,3:6,8
-chrX	91807176	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.07313;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:13,4:3,1
-chrX	91893509	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=8.5672e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:7,5:6,6
-chrX	93083071	.	ATTTTAT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.051203;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:13,1:7,5
-chrX	93083081	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02299;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:14,1:10,5
-chrX	97016615	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=1.3047e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:3,6:8,8
-chrX	100214822	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,2:0,1:1,1
-chrX	100501914	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.26154;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,3:10,1:4,2
-chrX	107347815	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0071858;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,4:8,4
-chrX	107623602	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.035315;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:4,3:11,5
-chrX	110091519	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=3.3228e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,12:3,7:3,5
-chrX	110912416	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,2:5,1:1,1
-chrX	111269239	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.001265;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:9,5:7,9
-chrX	111766846	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0014461;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:8,5:2,3
-chrX	116312761	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,3:12,1
-chrX	117350431	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,2:9,4
-chrX	117350432	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041126;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:6,2:9,3
-chrX	118009278	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,3:10,1
-chrX	123694621	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:0,2:0,1:0,1
-chrX	123916752	.	AAGTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0098105;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,2:3,3
-chrX	124536737	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=8.1543e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,17:4,8:3,9
-chrX	126872642	.	T	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0023473;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:3,4:10,5
-chrX	126945081	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1839;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,5:3,2:9,3
-chrX	126945083	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,4:2,2:8,2
-chrX	127531176	.	TGTA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0041657;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:4,3:6,8
-chrX	127921041	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:1,4:1,1:0,3
-chrX	128936893	.	GTA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12821;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,2:3,1:0,1
-chrX	129599558	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=1.5459e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,14:2,5:7,9
-chrX	130732698	.	T	TCA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.09062;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,2:9,2
-chrX	139415082	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=5.8711e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,14:4,5:9,9
-chrX	147897926	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,1:7,3
-chrX	152244389	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=8.2699e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:7,6:8,8
-chrX	153679546	.	T	TTTTTC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:2,2:9,2
-chrX	154888408	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,4:8,2:8,2
-chrX	155051710	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0042541;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:11,5:7,4
-chrY	3056481	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,2:14,2
-chrY	3309359	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.091905;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,1:16,4
-chrY	3773083	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.50909;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:0,1:6,1
-chrY	3795271	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.073354;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,2:14,2
-chrY	3809249	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=4.3264e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:9,10:4,5
-chrY	4571151	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=5.6034e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,20:9,10:6,10
-chrY	4616746	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.070174;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,2:13,3
-chrY	4631875	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.073845;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:14,1:12,5
-chrY	5682239	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:4,1:1,1
-chrY	6718333	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.023207;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,1:12,4
-chrY	8465534	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,2:5,3
-chrY	9196507	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0004971;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:5,4:4,4
-chrY	9462573	.	G	C	0	PASS	DP=305;GPV=1;SPV=0.040288;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:133,17:52,5:81,12
-chrY	9469163	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:1,0:10,4
-chrY	10065090	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=5.941e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:4,6:10,8
-chrY	10669371	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.23636;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:11,3:8,2:3,1
-chrY	11123549	.	CT	C	0	PASS	DP=258;GPV=1;SPV=0.0092257;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:96,25:54,13:42,12
-chrY	11161812	.	T	A	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.028338;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:73,12:41,9:32,3
-chrY	11193193	.	C	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.045127;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:77,14:35,5:42,9
-chrY	11222315	.	T	C	0	PASS	DP=618;GPV=1;SPV=0.012111;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:324:285,39:156,20:129,19
-chrY	11240134	.	T	C	0	PASS	DP=820;GPV=1;SPV=0.018731;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:432:380,52:202,25:178,27
-chrY	11250509	.	C	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0094467;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:51,11:26,4:25,7
-chrY	11259114	.	T	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.04336;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:47,9:28,7:19,2
-chrY	11266802	.	G	C	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.011379;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:92,20:52,12:40,8
-chrY	11280375	.	T	C	0	PASS	DP=499;GPV=1;SPV=0.017248;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:274:244,30:105,11:139,19
-chrY	11299445	.	T	TTTCCA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.020935;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,9:11,4:14,5
-chrY	11548439	.	T	TATGGAATGGAATGGA	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.014981;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:36,6:22,5:14,1
-chrY	12093051	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:3,3:4,1
-chrY	13654970	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00026317;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,5:3,3
-chrY	15682277	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,1:9,3
-chrY	20082265	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.033133;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:16,2:11,5
-chrY	20087972	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:14,7:6,1
-chrY	22241393	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:5,7:5,1
-chrY	22241422	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:10,4:2,4
-chrY	26671555	.	T	A	0	PASS	DP=1600;GPV=1;SPV=0.041367;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:888:797,89:312,39:485,50
-chrY	56728619	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:0,0:22,4
-chrY	56752448	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.083915;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,4:0,0:29,4
-chrY	56828396	.	T	G	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.00081136;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:105,16:55,12:50,4
-chrY	56834375	.	CTCTAT	C	0	PASS	DP=380;GPV=1;SPV=0.01997;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:205:173,28:94,15:79,13
-chrY	56854458	.	C	G	0	PASS	DP=422;GPV=1;SPV=0.046799;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:218:185,33:108,18:77,15
-chrY	56871363	.	G	T	0	PASS	DP=934;GPV=1;SPV=0.037494;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:499:435,64:207,37:228,27
-chrY	56878387	.	A	G	0	PASS	DP=839;GPV=1;SPV=0.048414;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:458:408,50:204,23:204,27
-chrY	56879897	.	T	C	0	PASS	DP=317;GPV=1;SPV=0.028389;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:129,25:77,14:52,11
-chrY	56883281	.	G	A	0	PASS	DP=251;GPV=1;SPV=0.035565;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:124,14:55,8:69,6
--- a/test-data/EGF167.vcf	Sun Sep 13 22:27:03 2020 +0000
+++ /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
@@ -1,4432 +0,0 @@
-##fileformat=VCFv4.2
-##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed">
-##reference=hg38
-##source=varscan.py
-##contig=<ID=chr1,length=248956422>
-##contig=<ID=chr10,length=133797422>
-##contig=<ID=chr11,length=135086622>
-##contig=<ID=chr12,length=133275309>
-##contig=<ID=chr13,length=114364328>
-##contig=<ID=chr14,length=107043718>
-##contig=<ID=chr15,length=101991189>
-##contig=<ID=chr16,length=90338345>
-##contig=<ID=chr17,length=83257441>
-##contig=<ID=chr18,length=80373285>
-##contig=<ID=chr19,length=58617616>
-##contig=<ID=chr2,length=242193529>
-##contig=<ID=chr20,length=64444167>
-##contig=<ID=chr21,length=46709983>
-##contig=<ID=chr22,length=50818468>
-##contig=<ID=chr3,length=198295559>
-##contig=<ID=chr4,length=190214555>
-##contig=<ID=chr5,length=181538259>
-##contig=<ID=chr6,length=170805979>
-##contig=<ID=chr7,length=159345973>
-##contig=<ID=chr8,length=145138636>
-##contig=<ID=chr9,length=138394717>
-##contig=<ID=chrM,length=16569>
-##contig=<ID=chrX,length=156040895>
-##contig=<ID=chrY,length=57227415>
-##filter="SOMATIC"
-##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL">
-##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total depth of quality bases">
-##INFO=<ID=SOMATIC,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates if record is a somatic mutation">
-##INFO=<ID=SS,Number=1,Type=String,Description="Somatic status of variant (0=Reference,1=Germline,2=Somatic,3=LOH, or 5=Unknown)">
-##INFO=<ID=SSC,Number=1,Type=String,Description="Somatic score in Phred scale (0-255) derived from somatic p-value">
-##INFO=<ID=GPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor+normal versus no variant for Germline calls">
-##INFO=<ID=SPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor versus normal for Somatic/LOH calls">
-##FILTER=<ID=str10,Description="Less than 10% or more than 90% of variant supporting reads on one strand">
-##FILTER=<ID=indelError,Description="Likely artifact due to indel reads at this position">
-##FILTER=<ID=VarCount,Description="Fewer than 4 variant-supporting reads">
-##FILTER=<ID=VarFreq,Description="Variant allele frequency below 0.05">
-##FILTER=<ID=VarAvgRL,Description="Average clipped length of variant-supporting reads < 90">
-##FILTER=<ID=VarReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
-##FILTER=<ID=VarDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
-##FILTER=<ID=VarMMQS,Description="Average mismatch quality sum for variant reads > 100">
-##FILTER=<ID=VarMapQual,Description="Average mapping quality of variant reads < 15">
-##FILTER=<ID=VarBaseQual,Description="Average base quality of variant reads < 15">
-##FILTER=<ID=Strand,Description="Strand representation of variant reads < 0.01">
-##FILTER=<ID=RefAvgRL,Description="Average clipped length of ref-supporting reads < 90">
-##FILTER=<ID=RefReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
-##FILTER=<ID=RefDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
-##FILTER=<ID=RefMapQual,Description="Average mapping quality of reference reads < 15">
-##FILTER=<ID=RefBaseQual,Description="Average base quality of ref-supporting reads < 15">
-##FILTER=<ID=RefMMQS,Description="Average mismatch quality sum for ref-supporting reads > 100">
-##FILTER=<ID=MMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) > 50">
-##FILTER=<ID=MinMMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) < 50">
-##FILTER=<ID=MapQualDiff,Description="Mapping quality difference (ref - var) > 50">
-##FILTER=<ID=MaxBAQdiff,Description="Average base quality difference (ref - var) > 50">
-##FILTER=<ID=ReadLenDiff,Description="Average supporting read length difference (ref - var) > 0.25">
-##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype code">
-##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality">
-##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
-##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele">
-##FORMAT=<ID=ADF,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the forward strand">
-##FORMAT=<ID=ADR,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the reverse strand">
-#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	TUMOR
-chr1	64976	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.045103;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:13,1:9,7
-chr1	103756	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.032644;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:16,5:6,2
-chr1	185034	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00088719;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:15,3:19,6
-chr1	186728	.	A	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.018661;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:61,15:31,5:30,10
-chr1	739365	.	G	A	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.043949;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:59,7:27,3:32,4
-chr1	790461	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.047347;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:17,4:14,4
-chr1	1290925	.	G	A	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=2.0989e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:38,21:20,12:18,9
-chr1	1749629	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,3:4,2
-chr1	2687442	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045135;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:19,4:13,1
-chr1	3934011	.	C	CTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.004222;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,9:6,6:3,3
-chr1	5673561	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00023464;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:12,8:13,3
-chr1	5750713	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00053311;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:15,5:16,4
-chr1	6160432	.	GAGA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:18,4:1,0
-chr1	6662128	.	G	GT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.039538;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,9:13,5:10,4
-chr1	7083961	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00097732;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:7,4:9,4
-chr1	7572902	.	T	C	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=2.2819e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:39,26:18,16:21,10
-chr1	8007444	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.026369;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:11,4:7,4
-chr1	8263331	.	ACG	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.037745;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:22,3:15,2
-chr1	8781356	.	C	CAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.004796;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:11,9:9,3
-chr1	10273740	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:8,5:5,2:3,3
-chr1	10538613	.	T	TTC	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00068981;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:24,5:16,6
-chr1	11631652	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.0105e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,5:7,4
-chr1	12043425	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.13907;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:16,3:10,2
-chr1	12876485	.	C	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
-chr1	12879513	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.01756;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:19,9:20,4
-chr1	12887164	.	A	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.022406;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:18,3:26,6
-chr1	12936058	.	G	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=4.5404e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:65,15:49,8:16,7
-chr1	13251355	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.025641;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,4:3,1
-chr1	14124658	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=8.4105e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:14,13:13,3
-chr1	15251295	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:17,5:6,4:11,1
-chr1	15971571	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,2:13,2
-chr1	16200383	.	A	G	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=6.2138e-11;SS=2;SSC=102;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:26,31:21,15:5,16
-chr1	16508168	.	C	T	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.032064;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:103,12:52,3:51,9
-chr1	16553056	.	T	G	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.045458;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:59,15:26,12:33,3
-chr1	16561095	.	C	A	0	PASS	DP=347;GPV=1;SPV=0.0093043;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:184:156,28:85,16:71,12
-chr1	16575059	.	C	T	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.048526;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:75,12:35,5:40,7
-chr1	16578491	.	T	C	0	PASS	DP=300;GPV=1;SPV=0.032164;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:143:118,25:48,12:70,13
-chr1	16596571	.	G	A	0	PASS	DP=339;GPV=1;SPV=0.032119;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:184:160,24:80,16:80,8
-chr1	16610160	.	C	T	0	PASS	DP=376;GPV=1;SPV=0.031944;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:195:170,25:88,14:82,11
-chr1	16613024	.	G	T	0	PASS	DP=390;GPV=1;SPV=0.017709;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:186,35:94,15:92,20
-chr1	16632466	.	C	G	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.025558;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:122,27:68,10:54,17
-chr1	16653179	.	T	C	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.03937;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:63,16:36,8:27,8
-chr1	16692440	.	G	A	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.008973;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:60,20:34,16:26,4
-chr1	16701425	.	G	A	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.048492;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:66,8:36,5:30,3
-chr1	16731644	.	T	C	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.027018;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:54,9:29,2:25,7
-chr1	16756272	.	A	T	0	PASS	DP=398;GPV=1;SPV=0.036166;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:201:171,30:86,11:85,19
-chr1	16774088	.	T	C	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.00059662;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:65,21:29,12:36,9
-chr1	16882059	.	TAA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.020314;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,8:9,2:9,6
-chr1	16896455	.	C	G	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.03107;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:100,18:34,7:66,11
-chr1	16902883	.	G	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.048236;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:47,9:20,6:27,3
-chr1	17175906	.	CTA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0065492;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,5:2,2
-chr1	17487165	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.8454e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:22,7:9,8
-chr1	19683758	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0074891;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,5:3,4:2,1
-chr1	20651805	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.029828;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:10,3:17,8
-chr1	21387063	.	CG	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:3,1:2,1
-chr1	21945968	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,8:4,5:1,3
-chr1	24901173	.	C	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=8.7093e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,23:12,12:10,11
-chr1	25098735	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=2.3507e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:32,20:13,10:19,10
-chr1	25764475	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.2544e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:12,11:12,9
-chr1	26037226	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:7,3:7,2
-chr1	26095828	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=4.9557e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:35,16:18,10:17,6
-chr1	26407725	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.027999;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,16:8,5:6,11
-chr1	26593918	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.03809;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,7:13,6:5,1
-chr1	26818069	.	T	TG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.026014;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,1:8,3
-chr1	28236460	.	T	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=1.8875e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:16,6:14,9
-chr1	29873254	.	T	TA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.035132;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:13,7:7,1
-chr1	31186395	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,4:2,3:2,1
-chr1	31850450	.	GT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.030558;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:13,8:8,6
-chr1	34362437	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.6106e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:34,25:16,11:18,14
-chr1	34371742	.	T	TA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00054583;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:2,10:1,2:1,8
-chr1	34512079	.	T	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=1.245e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:25,23:9,12:16,11
-chr1	35705066	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.011795;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,6:4,1
-chr1	36213962	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.031374;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,7:11,5:3,2
-chr1	37078451	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:6,2:3,1:3,1
-chr1	37359811	.	G	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00099533;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:11,4:13,3
-chr1	39194317	.	ATTTCTTTTCT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16375;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:6,2:23,2
-chr1	39940663	.	A	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=3.7619e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:39,27:27,13:12,14
-chr1	41545371	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0020332;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:6,5:3,5
-chr1	42057169	.	T	TA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0021337;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:13,4:6,4
-chr1	42921136	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0034225;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:9,10:2,1
-chr1	44065405	.	GTT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.042122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,7:6,1
-chr1	44091635	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.016023;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:9,9:4,1
-chr1	44259924	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.022447;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:30,7:10,4
-chr1	44386736	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=8.408e-10;SS=2;SSC=90;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:24,25:9,9:15,16
-chr1	46232818	.	T	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.01117;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:24,15:14,6:10,9
-chr1	47550338	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:4,5:4,2
-chr1	54476217	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.14664;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:4,2:26,2
-chr1	55047134	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.8594e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:4,3:14,7
-chr1	56322079	.	C	CAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.021839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,12:8,9:4,3
-chr1	57924627	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.046726;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,2:11,2
-chr1	58387722	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,3:6,3:0,0
-chr1	59846599	.	TC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,1:7,3
-chr1	60376642	.	A	ACAC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.017385;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:3,6:1,2:2,4
-chr1	61952253	.	T	TGAGAGAGA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0020298;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:13,12:13,4
-chr1	64603266	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=2.2204e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,19:13,10:6,9
-chr1	65708676	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.00087413;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,6:0,5:1,1
-chr1	66434631	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.21414;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:12,3:10,2
-chr1	67953866	.	T	TCTC	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,2:2,5
-chr1	68354547	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:6,1:3,4
-chr1	69004827	.	T	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=1.1895e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:31,19:13,11:18,8
-chr1	70658070	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,2:10,2
-chr1	71597432	.	G	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:3,2:2,1
-chr1	72088796	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.013867;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:6,6:2,1
-chr1	74056251	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.1076e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:16,15:11,4
-chr1	77449659	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.04342;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:17,2:19,3
-chr1	79571375	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:7,2:12,2
-chr1	79649737	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.022632;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:5,7:12,2
-chr1	82541637	.	C	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=4.3414e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:9,7:15,9
-chr1	83487712	.	T	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.019975;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:19,2:20,8
-chr1	84498559	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.028003;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:10,3:11,2
-chr1	86738252	.	G	GT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.027342;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:18,7:13,4
-chr1	86768048	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=2.5366e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,18:12,9:16,9
-chr1	87891193	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,8:10,7:3,1
-chr1	88047083	.	GAA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,4:9,3:4,1
-chr1	89502764	.	T	TCACACACACA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.047956;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:5,3:8,2
-chr1	89776380	.	TA	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.077619;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:22,3:17,2
-chr1	89776412	.	T	TA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,10:10,7:9,3
-chr1	96825934	.	ATGTGTGTG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0054311;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:5,5:8,5
-chr1	100327770	.	G	GTGTGT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0045922;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,14:6,8:11,6
-chr1	100327773	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.01147;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,13:8,7:9,6
-chr1	100550598	.	C	CT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.17898;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,5:6,2:30,3
-chr1	101258579	.	GTCTTTCTT	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.038416;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,5:6,3:15,2
-chr1	101855904	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=5.197e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:16,6:14,9
-chr1	102769692	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.1765e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:12,3:14,12
-chr1	105154315	.	A	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:46:1,3:1,1:0,2
-chr1	105171195	.	CTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,4:2,1
-chr1	108658099	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,4:8,3:8,1
-chr1	108865213	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,6:13,3:1,3
-chr1	109171951	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0019813;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:18,6:21,9
-chr1	111005120	.	T	TA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.040965;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:13,4:12,1
-chr1	111502084	.	AAT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0025292;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:6,4:9,9
-chr1	111502097	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0020721;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:7,4:8,10
-chr1	111502124	.	A	ATAGG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0019759;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:7,3:12,9
-chr1	111502125	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0025754;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:7,3:9,9
-chr1	112337596	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:5,6:2,2
-chr1	113069477	.	C	CA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,7:1,1:1,6
-chr1	113070430	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.082831;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:21,4:2,0
-chr1	113938941	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.006865;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,6:2,3:4,3
-chr1	114660139	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.1203e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,18:9,11:18,7
-chr1	114789069	.	C	CTTTCTTTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,4:6,1:7,3
-chr1	115079137	.	C	CCACA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0041929;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:7,4:7,6
-chr1	115415941	.	G	GATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:10,3:12,1
-chr1	115910145	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0017056;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:11,6:6,1
-chr1	116253903	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00092166;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:11,2:19,6
-chr1	117134134	.	G	GTGTACGTA	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.01036;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,7:14,5:19,2
-chr1	118139338	.	A	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0025423;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:27,2:19,8
-chr1	118784421	.	C	CATAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:2,6:3,2
-chr1	120168801	.	T	TCA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.082831;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,2:9,2
-chr1	120169213	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.051443;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:21,4:18,1
-chr1	120345124	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.031399;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:9,4:12,3
-chr1	120446150	.	A	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.006307;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:24,11:20,4
-chr1	120860952	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:2,6:6,1
-chr1	121537706	.	C	A	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.03412;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:53,16:29,13:24,3
-chr1	121537819	.	C	G	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.0057897;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:42,18:26,7:16,11
-chr1	121673339	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr1	121692848	.	A	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:1,1:7,3
-chr1	121817176	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10523;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,3:16,1
-chr1	121817303	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.045506;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:19,2:12,2
-chr1	121817879	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.048616;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:17,3:11,3
-chr1	121908948	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.026058;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:1,2:21,8
-chr1	121919722	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.018729;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,5:6,2
-chr1	122070636	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.010718;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:2,3:3,6
-chr1	122382529	.	T	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.047399;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:40,8:15,1
-chr1	123243045	.	T	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr1	124797823	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0051201;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:20,7:11,7
-chr1	124804084	.	T	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.045229;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:54,7:30,6:24,1
-chr1	124820032	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.13227;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:4,3:25,3
-chr1	124846536	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.079011;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:26,3:2,1
-chr1	124847040	.	T	C	0	PASS	DP=277;GPV=1;SPV=0.0091812;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:143:121,22:21,10:100,12
-chr1	124847056	.	A	T	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.0069251;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:100,20:15,11:85,9
-chr1	124861830	.	T	G	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.019611;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:80,16:71,15:9,1
-chr1	124864475	.	G	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.071484;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:29,3:6,1
-chr1	124881542	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.19365;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:1,0:32,4
-chr1	124895211	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:8,3:9,2
-chr1	124919453	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.018505;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:11,1:11,5
-chr1	125141867	.	T	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.036077;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:16,5:26,2
-chr1	125174130	.	G	T	0	PASS	DP=304;GPV=1;SPV=0.0015423;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:165:128,37:90,32:38,5
-chr1	143210830	.	A	T	0	PASS	DP=697;GPV=1;SPV=0.030353;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:360:312,48:298,24:14,24
-chr1	143210881	.	C	T	0	PASS	DP=780;GPV=1;SPV=0.010966;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:407:357,49:338,25:19,24
-chr1	143258960	.	A	C	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.015095;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:84,23:23,5:61,18
-chr1	143287623	.	TA	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.073933;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:25,4:13,1
-chr1	143287625	.	T	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.060799;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:25,4:12,1
-chr1	143287626	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.034354;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:26,5:13,1
-chr1	143306655	.	TA	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.036552;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,8:34,4:13,4
-chr1	143306705	.	T	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.0049119;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:38,6:11,4
-chr1	143341813	.	TA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0054348;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:7,5:1,2
-chr1	144106291	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0081121;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:6,3:2,6
-chr1	144422041	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.041838;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,4:15,1
-chr1	144926620	.	G	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.0043757;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:25,8:18,2
-chr1	144956439	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,3:6,1
-chr1	146040573	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,4:8,1
-chr1	146122266	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:0,0:12,4
-chr1	146186479	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.044985;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:23,9:25,4
-chr1	146670550	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00042668;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,18:6,13:4,5
-chr1	146911184	.	T	C	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.010436;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:26,2:32,6
-chr1	147202313	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.046544;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:12,6:5,3
-chr1	148156731	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.019962;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:0,3:24,2
-chr1	148418215	.	G	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.027816;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:54,8:26,4:28,4
-chr1	148702391	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.032289;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:13,4:25,2
-chr1	148941544	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024462;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
-chr1	148952750	.	T	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.059933;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,4:8,3:15,1
-chr1	149075897	.	TA	T	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.01295;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:67,16:30,7:37,9
-chr1	149137986	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.059933;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,1:9,3
-chr1	150318976	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.020934;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:14,1:16,6
-chr1	150885343	.	CAAA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,7:4,6:3,1
-chr1	151450023	.	A	ATT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,6:11,4:3,2
-chr1	151517853	.	C	CTT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00072083;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:20,20:9,17:11,3
-chr1	151629586	.	A	AT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.009128;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,9:17,6:19,3
-chr1	151692406	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:2,2:5,2
-chr1	152644015	.	TCACA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023594;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:16,9:9,2
-chr1	152964062	.	A	AC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.17382;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,5:30,2:10,3
-chr1	153112676	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.00027577;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:59,20:29,13:30,7
-chr1	153406780	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0015324;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:25,5:19,6
-chr1	153987515	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,4:10,3:14,1
-chr1	154490794	.	G	GT	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0084221;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,10:19,7:23,3
-chr1	154868936	.	CAA	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.18741;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:13,1:23,3
-chr1	155436491	.	C	CTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,4:13,3:12,1
-chr1	155729884	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.001145;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:57,14:27,9:30,5
-chr1	156310037	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,12:8,11:1,1
-chr1	156313363	.	AG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.13544;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:13,1:20,3
-chr1	156578259	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.046332;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:6,5:19,7
-chr1	157180917	.	A	ACTCTCTCTCTCTCT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0020002;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,12:8,3:6,9
-chr1	159483237	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.007626;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:23,4:16,7
-chr1	159932249	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=2.2441e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:42,19:25,12:17,7
-chr1	160112965	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.033188;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:20,7:11,2
-chr1	160751856	.	CTCTCTCTATATATATA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:5,4:15,5
-chr1	160853782	.	TA	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14184;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,8:7,7:14,1
-chr1	161471866	.	G	C	0	PASS	DP=297;GPV=1;SPV=0.048391;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:147,19:71,5:76,14
-chr1	161559730	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.039102;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:47,9:26,4:21,5
-chr1	161641777	.	T	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.051843;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:53,6:29,4:24,2
-chr1	161646609	.	G	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.0037074;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:54,16:25,10:29,6
-chr1	162403488	.	GAAAAAAAAA	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,4:15,2:9,2
-chr1	163548254	.	GTTTTTT	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0089185;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:10,4:7,5
-chr1	163794200	.	T	C	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.021113;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:27,8:26,3
-chr1	164927646	.	C	CTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0098611;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,10:5,9:7,1
-chr1	165622729	.	G	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0063951;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:23,5:8,4
-chr1	165820486	.	T	TAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.10034;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:14,2:8,2
-chr1	166677437	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.028036;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,12:14,10:10,2
-chr1	167061586	.	GT	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.034541;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:17,8:5,2
-chr1	167985210	.	T	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0023257;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:45,10:15,2:30,8
-chr1	168639090	.	TTC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.047306;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,10:5,5:18,5
-chr1	169620795	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0094953;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,8:0,3:7,5
-chr1	169778636	.	TG	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.24396;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,4:16,2:17,2
-chr1	169810834	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,2:5,2
-chr1	169847313	.	TAAAAA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:9,12:8,9:1,3
-chr1	170226562	.	T	TCCTCCCTCCCTCCCTCCCTC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:0,0:13,4
-chr1	170585727	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.2201;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:16,5:5,1
-chr1	170667312	.	A	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.16587;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:11,5:8,2:3,3
-chr1	171353802	.	CT	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.01601;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:25,5:13,4
-chr1	171944377	.	A	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0034588;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:22,5:21,4
-chr1	172694443	.	C	CAT	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.025491;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:57,7:22,2:35,5
-chr1	172758534	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0034427;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,12:7,9:8,3
-chr1	174136219	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.11141;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:9,2:20,2
-chr1	174265544	.	G	GA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.021523;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,8:6,6:6,2
-chr1	174378863	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0011386;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:11,1:10,8
-chr1	174378864	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0018974;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:12,1:11,8
-chr1	175125703	.	CTCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.34557;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,4:0,2:14,2
-chr1	175403206	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=3.1057e-13;SS=2;SSC=125;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:19,34:9,14:10,20
-chr1	176041345	.	CT	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.10224;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:26,5:22,2
-chr1	176178338	.	CAA	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.12076;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:51,6:35,3:16,3
-chr1	177734589	.	GCTT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.068571;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:8,2:17,4
-chr1	178696324	.	AGAT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.04073;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,3:13,4
-chr1	179597332	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.032072;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,8:7,1
-chr1	180980206	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:9,4:5,1
-chr1	181894088	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=2.0132e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:29,41:17,23:12,18
-chr1	182341376	.	CT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11921;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:18,4:13,1
-chr1	183438201	.	G	GAA	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.051443;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,5:26,2:13,3
-chr1	184884215	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,2:2,4
-chr1	185652665	.	A	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.0013673;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:51,12:21,7:30,5
-chr1	185927910	.	A	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00015783;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:18,6:21,9
-chr1	186631576	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,6:9,4:5,2
-chr1	186868071	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.018671;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,8:8,7:5,1
-chr1	186966119	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,4:13,2:15,2
-chr1	187686787	.	A	C	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=3.8302e-12;SS=2;SSC=114;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:30,45:13,23:17,22
-chr1	189117603	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:7,4:7,1
-chr1	189161360	.	T	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0014886;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,20:3,9:4,11
-chr1	190018670	.	G	GAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.01049;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:1,4:2,2
-chr1	190195804	.	C	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00048878;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:16,6:21,8
-chr1	190365808	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.26877;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:13,6:7,4:6,2
-chr1	191299707	.	C	CTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.064151;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,6:11,5:8,1
-chr1	191349460	.	ATTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0073497;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,9:11,7:9,2
-chr1	191907551	.	TTC	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.039036;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:8,2:23,3
-chr1	192799509	.	TA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.049128;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:16,4:8,3
-chr1	192857317	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:1,1:5,1
-chr1	193550723	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.8037e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:31,21:16,13:15,8
-chr1	194098959	.	T	TA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.027999;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,16:8,6:6,10
-chr1	194280332	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:7,2:1,2
-chr1	194303668	.	TATAA	T	0	PASS	DP=197;GPV=1;SPV=0.042129;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:101,22:58,9:43,13
-chr1	194398803	.	G	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:6,6:4,2:2,4
-chr1	194578836	.	C	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0037205;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:17,3:23,7
-chr1	195886836	.	C	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0032849;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:51,12:31,7:20,5
-chr1	195990833	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.21542;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:12,3:24,2
-chr1	196820506	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0043846;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:10,5:8,7
-chr1	198524124	.	T	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.54715;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:16,4:5,1:11,3
-chr1	200127708	.	AAATAT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,2:8,2
-chr1	200383093	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:16,2:3,2
-chr1	200509269	.	C	CTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,9:2,8:2,1
-chr1	200581761	.	CT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.003052;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:8,7:9,8
-chr1	200686036	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.057386;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,10:8,9:8,1
-chr1	200774073	.	G	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=3.62e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:51,16:30,7:21,9
-chr1	200774074	.	T	C	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.00029843;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:52,13:30,6:22,7
-chr1	202149367	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=1.984e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:30,20:14,10:16,10
-chr1	202401361	.	A	AT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:6,2:3,3
-chr1	202786166	.	A	AT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,12:4,10:2,2
-chr1	202938064	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030401;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:6,7:8,3
-chr1	203479706	.	CAA	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.060553;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,9:19,8:9,1
-chr1	204158411	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.014079;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,8:6,7:4,1
-chr1	204452288	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,6:3,2:10,4
-chr1	204811028	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:9,4:3,1
-chr1	206267113	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.021607;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:55,7:30,3:25,4
-chr1	206523350	.	AT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.035283;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:4,1:15,6
-chr1	207617691	.	CCTTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023024;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:5,11:8,5
-chr1	208086990	.	TGAGA	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.004662;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:1,7:0,5:1,2
-chr1	208221381	.	GTT	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.039921;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,7:12,6:3,1
-chr1	208844667	.	GAAAGGA	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0091986;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:16,7:11,1
-chr1	208845676	.	AATAG	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=9.3443e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:14,11:9,8
-chr1	209698180	.	TAGA	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.040883;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:25,6:12,2:13,4
-chr1	210109590	.	AG	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.057106;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:12,1:19,3
-chr1	210867364	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.1569;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:39,7:19,3:20,4
-chr1	211029334	.	TA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0095299;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:6,6:10,7
-chr1	212168573	.	A	ATATTTTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023342;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,6:10,3:5,3
-chr1	212481402	.	T	TAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.15614;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,4:14,2:14,2
-chr1	212633936	.	C	CT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.027364;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:19,4:8,2
-chr1	212851790	.	TA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00096505;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:19,13:2,1
-chr1	213363772	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0045767;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,3:4,3
-chr1	214350707	.	A	ATTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.032805;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,10:7,6:4,4
-chr1	216039333	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0018064;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:47,11:21,8:26,3
-chr1	216098427	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0032764;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:44,11:27,6:17,5
-chr1	216377791	.	GAGAAGGAAAGAAATAA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:9,3:7,1
-chr1	217080671	.	GTT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.25926;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,4:9,3:6,1
-chr1	217188193	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.028508;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,6:15,1:10,5
-chr1	217694010	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.03781;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:14,9:11,5
-chr1	217795362	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.087294;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:6,6:7,1
-chr1	220032243	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.18462;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:6,3:3,1:3,2
-chr1	220835311	.	GA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.027649;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:20,5:3,2
-chr1	220883332	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.0121e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:20,31:10,13:10,18
-chr1	220952530	.	C	CTA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.058243;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:16,5:20,2
-chr1	220971720	.	A	AAT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.027829;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:14,2:21,5
-chr1	221983183	.	C	CGT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.027219;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,12:8,9:6,3
-chr1	222039722	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.012061;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,7:10,1:10,6
-chr1	222138220	.	GTA	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0014895;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:15,4:19,8
-chr1	222154901	.	AAAAAAC	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.017042;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:12,9:4,1
-chr1	222480540	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.091614;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:15,1:7,3
-chr1	223439672	.	T	TCTC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.20063;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:12,2:22,3
-chr1	223675743	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.10445;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,7:22,3:3,4
-chr1	223682908	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:12,2:2,2
-chr1	223930244	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0024349;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:7,9:18,1
-chr1	224209064	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.049315;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:25,9:18,6:7,3
-chr1	224443682	.	GATATCT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,4:8,1
-chr1	224452781	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,15:8,13:6,2
-chr1	225831560	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.031932;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:26,7:5,1:21,6
-chr1	226064434	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.031822;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:23,5:19,3
-chr1	226504641	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0073028;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:33,6:12,6
-chr1	227126468	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.13974;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:29,4:14,2:15,2
-chr1	227156121	.	T	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.030583;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:11,7:7,4:4,3
-chr1	227196338	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:3,5:3,3
-chr1	227380955	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.11618;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:14,3:20,1
-chr1	228819196	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=5.8392e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:26,38:17,19:9,19
-chr1	229590256	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.024751;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:12,7:4,1:8,6
-chr1	230319848	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0031524;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:6,9:4,2
-chr1	231615380	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.026121;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,12:11,6:16,6
-chr1	232123741	.	C	T	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.0057052;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:46,19:18,6:28,13
-chr1	232568977	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=5.4628e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:41,15:27,6:14,9
-chr1	232656016	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.011272;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:10,14:6,10:4,4
-chr1	233918822	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:11,7:5,1:6,6
-chr1	233922486	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0023473;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:13,17:9,7:4,10
-chr1	234143288	.	C	CT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.13974;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:21,3:8,1
-chr1	234446633	.	A	AAATTATATAATTTCTTAATATAT	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.014645;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:40,14:23,4:17,10
-chr1	234779794	.	C	T	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.009407;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:118,30:62,18:56,12
-chr1	234946032	.	AAAAAAATATATATATAT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.018593;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,9:4,6:4,3
-chr1	236842784	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.01095;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,10:5,6:4,4
-chr1	237565157	.	C	CTT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.015259;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,12:1,3:24,9
-chr1	237952151	.	TATATATATATATA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,1:5,4
-chr1	237952166	.	A	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,4:4,1:0,3
-chr1	238153670	.	TTCTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.021719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,13:5,7:12,6
-chr1	238188360	.	CCTCCTCCTTCTTCTTCTTCTT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,4:1,0:19,4
-chr1	240178447	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0055469;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:10,8:8,3:2,5
-chr1	240742610	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,3:3,1
-chr1	240919005	.	G	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=9.1325e-14;SS=2;SSC=130;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:19,46:9,18:10,28
-chr1	241017411	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.0643e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:21,30:8,11:13,19
-chr1	241068203	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0020554;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:9,3:13,9
-chr1	241744410	.	T	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0032559;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,12:19,5:27,7
-chr1	242207878	.	TTATATA	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.022676;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:8,5:13,9
-chr1	242337258	.	T	TCATGAGGCAGTAGATTGTATTTTAAAGATGAC	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.003144;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,13:7,10:18,3
-chr1	242490879	.	A	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00025984;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:17,7:23,8
-chr1	243583193	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.073823;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:8,1:11,4
-chr1	245045757	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.10542;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:34,5:20,1:14,4
-chr1	245857516	.	T	TGCATAGGTCTGGTCCTGGATTCTCCCTCTGCTTC	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.034415;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:34,14:16,6:18,8
-chr1	246362764	.	G	C	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.023364;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:84,20:46,15:38,5
-chr1	246892301	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:2,2:8,2
-chr1	247219140	.	T	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.011658;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:16,9:27,4
-chr1	247852918	.	CAGAGAGAGAGAGAGAG	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:3,5:2,2:1,3
-chr1	247907113	.	TTTTTTC	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.073271;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:5,1:27,4
-chr1	248168028	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.012992;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:8,3:9,7
-chr1	248306538	.	CG	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046615;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:3,4:12,4
-chr1	248452271	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.064856;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:13,2:2,5
-chr1	248943908	.	C	G	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.0028471;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:76,24:42,12:34,12
-chr10	1265691	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:10,3:16,1
-chr10	3818912	.	T	TC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.001984;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,13:7,5:1,8
-chr10	4149533	.	G	C	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.027754;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:55,7:28,4:27,3
-chr10	6155205	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.034789;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,5:13,4:6,1
-chr10	6170702	.	AGG	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,4:10,2:11,2
-chr10	6932014	.	CA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:10,12:6,8:4,4
-chr10	7220830	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.029233;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:12,1:17,5
-chr10	8026028	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:5,5:4,4
-chr10	8280630	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.015156;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:10,3:19,7
-chr10	8422085	.	C	CTTTCTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:5,1:12,3
-chr10	8545427	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,4:2,1:4,3
-chr10	9358808	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.1265e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,17:9,11:7,6
-chr10	10296730	.	C	CTCTTTTT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,3:4,1
-chr10	14209718	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0030692;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:12,7:12,2
-chr10	15469418	.	C	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0030239;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:24,3:12,6
-chr10	16841910	.	C	CAAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.30409;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,4:6,3:6,1
-chr10	18600978	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.25826;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:8,1:2,3
-chr10	19064769	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0086203;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,5:5,1
-chr10	19467802	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:41:1,3:0,2:1,1
-chr10	19955074	.	A	ATT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.031815;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,7:12,6:4,1
-chr10	21343903	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.14559;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:7,4:5,1
-chr10	21704329	.	T	TTCTC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,5:10,2:8,3
-chr10	21881844	.	T	TA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.027099;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:11,6:5,2
-chr10	23457003	.	T	TGTGTGTGCGC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.011437;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,6:6,3:6,3
-chr10	23818343	.	TATA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,3:10,1
-chr10	24895253	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,3:1,2:2,1
-chr10	24972517	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.9991e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:10,4:16,11
-chr10	25639028	.	ATTTC	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:6,2:17,2
-chr10	28836271	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,4:1,0:9,4
-chr10	29776765	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,5:3,1:14,4
-chr10	30410480	.	A	G	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=9.1412e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:23,9:13,6
-chr10	30890083	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.03735;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,5:4,1
-chr10	32438069	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=9.6275e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,21:13,8:6,13
-chr10	33028330	.	CTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12337;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:8,2:16,3
-chr10	33121193	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=4.2988e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:17,7:12,7
-chr10	33671715	.	A	ATATGAC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0099416;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,4:4,1
-chr10	33671725	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0047431;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:0,4:5,1
-chr10	33671731	.	A	ATATATATATGAC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0072239;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,4:2,3:1,1
-chr10	34645186	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.019307;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:17,4:20,3
-chr10	35745310	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.001927;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:20,5:16,4
-chr10	36050368	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0056445;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:18,3:17,6
-chr10	36322330	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.015e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:11,10:10,10
-chr10	36480667	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.013537;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:14,10:11,6
-chr10	37113363	.	T	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.014496;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:47,11:19,8:28,3
-chr10	38327263	.	T	TTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0074752;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,9:4,4:2,5
-chr10	38496005	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.033228;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:13,2:15,4
-chr10	38496006	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.027512;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,9:11,6:13,3
-chr10	38576386	.	AAATGG	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:5,3:2,1
-chr10	38651476	.	CAT	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.084652;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,1:18,3
-chr10	38652470	.	T	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.04533;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:16,3:13,5
-chr10	38689754	.	G	A	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.00022978;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:76,13:42,6:34,7
-chr10	38923521	.	T	C	0	PASS	DP=336;GPV=1;SPV=0.0033879;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:157,20:87,10:70,10
-chr10	39835327	.	A	T	0	PASS	DP=294;GPV=1;SPV=0.041879;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:135,15:74,6:61,9
-chr10	40287592	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.029233;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:6,3:23,3
-chr10	40300954	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.034849;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:9,1:22,3
-chr10	40691595	.	A	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.041896;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:17,6:15,5
-chr10	40761927	.	A	C	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.014577;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:69,9:27,1:42,8
-chr10	40857299	.	C	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.039341;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:0,0:4,4
-chr10	40884373	.	G	C	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.0030742;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:67,19:12,5:55,14
-chr10	40892303	.	G	A	0	PASS	DP=588;GPV=1;SPV=0.025852;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:310:261,39:147,23:114,16
-chr10	40920706	.	C	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.06379;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,3:2,2:12,1
-chr10	40963788	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.054928;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,1:14,3
-chr10	40965940	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0005505;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:17,9:9,1
-chr10	41104823	.	G	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:22,4:1,0
-chr10	41494604	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:24,4:2,0
-chr10	41527518	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.059209;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:11,3:15,2
-chr10	41584168	.	C	T	0	PASS	DP=669;GPV=1;SPV=0.022969;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:351:303,48:227,41:76,7
-chr10	41881947	.	CGAGTGTAATT	C	0	PASS	DP=310;GPV=1;SPV=0.030017;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:144,20:112,14:32,6
-chr10	41882734	.	T	C	0	PASS	DP=371;GPV=1;SPV=0.033617;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:208:176,32:93,21:83,11
-chr10	41891344	.	C	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.031173;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:21,4:15,1
-chr10	41892391	.	A	T	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.042405;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:54,7:29,2:25,5
-chr10	41896230	.	G	GGAATGGAATC	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.018345;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:77,9:46,5:31,4
-chr10	41900107	.	A	T	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.0011011;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:53,10:30,1:23,9
-chr10	41906114	.	C	CAATGG	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.026485;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,7:22,4:12,3
-chr10	41912903	.	T	A	0	PASS	DP=251;GPV=1;SPV=0.031646;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:111,19:47,15:64,4
-chr10	41914068	.	G	A	0	PASS	DP=203;GPV=1;SPV=0.0015108;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:84,29:39,17:45,12
-chr10	42080954	.	C	T	0	PASS	DP=1854;GPV=1;SPV=0.0032918;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:979:878,99:59,15:819,84
-chr10	42130201	.	C	G	0	PASS	DP=604;GPV=1;SPV=0.010879;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:328:286,42:114,11:172,31
-chr10	42152600	.	GTATATC	G	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.042771;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:61,16:24,3:37,13
-chr10	42182059	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.16534;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:23,2:3,1
-chr10	42213791	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.038396;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:17,1:4,6
-chr10	42213848	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.028463;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:14,1:5,4
-chr10	42281418	.	A	G	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.029327;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:65,18:29,3:36,15
-chr10	42299381	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.11288;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:32,4:20,2:12,2
-chr10	44878064	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.19205;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:15,5:9,2:6,3
-chr10	45391072	.	CCACGG	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,5:5,2
-chr10	45749836	.	A	AAAAAAAATATATAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.05321;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,8:15,1:10,7
-chr10	45823138	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.017469;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,3:5,5
-chr10	45889994	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,2:5,5
-chr10	45890429	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0035718;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:15,1:9,7
-chr10	46408881	.	T	G	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.0042791;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:59,8:33,3:26,5
-chr10	46660447	.	T	TA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:15,4:0,0
-chr10	46768125	.	G	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.019877;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:25,10:18,3
-chr10	46935640	.	A	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.046112;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:23,7:8,3
-chr10	46979530	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.046521;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:14,3:22,2
-chr10	47235996	.	T	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=5.3434e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:13,14:14,3
-chr10	47938554	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.034525;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:17,4:1,0
-chr10	47987548	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.042061;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:23,4:15,3
-chr10	48080905	.	A	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.013329;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:20,6:21,3
-chr10	48928398	.	T	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,2:16,2
-chr10	49891621	.	ATATTTT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,4:2,2:2,2
-chr10	49962894	.	C	CT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.046334;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:11,5:14,1
-chr10	50109548	.	G	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.03763;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:19,8:15,2
-chr10	51464890	.	CA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.014937;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:11,8:8,2
-chr10	54853422	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.011736;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,6:19,3:4,3
-chr10	55235906	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.017499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,8:3,7:5,1
-chr10	55602627	.	C	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.072974;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:16,1:29,4
-chr10	55609015	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.01056;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:18,2:13,9
-chr10	55830519	.	GA	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0029888;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:15,5:8,6
-chr10	55953998	.	CA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059432;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:17,2:2,2
-chr10	56858096	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=6.9536e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,20:15,10:12,10
-chr10	57420264	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:2,4:3,1
-chr10	58009272	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0073773;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,7:6,2
-chr10	59037349	.	A	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00022306;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:19,6:17,5
-chr10	59681738	.	TATG	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:5,2:5,2
-chr10	60158685	.	C	CTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.014013;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:9,7:8,1
-chr10	61263235	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.3195e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,18:8,14:8,4
-chr10	63606263	.	T	TTTTCTTTCTTTCTTTTTC	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.028555;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:6,3:12,5
-chr10	63861106	.	C	CGCGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0057417;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,7:5,1:3,6
-chr10	65087396	.	TAC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.37283;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,4:2,1:17,3
-chr10	67833444	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.060665;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,5:10,4:15,1
-chr10	68059870	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.014395;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:12,8:8,2
-chr10	68923937	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,5:2,4:8,1
-chr10	72283779	.	CAA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.016233;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,7:8,2
-chr10	72454784	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,2:1,1:2,1
-chr10	73250711	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.1858e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:8,7:14,11
-chr10	73756899	.	AT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:5,1:8,5
-chr10	73833909	.	G	GT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2419;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,4:8,2:6,2
-chr10	74128124	.	AGGAAAAG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.22807;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,4:3,2:8,2
-chr10	74201684	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,6:12,2:14,4
-chr10	74760868	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,7:3,1
-chr10	75856489	.	C	CAAGT	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00014322;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:12,6:17,5
-chr10	76084364	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.010792;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,2:5,3
-chr10	76379161	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0068919;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:8,2:12,6
-chr10	79183824	.	TCC	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0010762;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:14,5:12,3
-chr10	81167688	.	C	CT	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0051557;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:25,10:11,7:14,3
-chr10	81693963	.	GAT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.016957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:2,2:6,4
-chr10	82031071	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.2667e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:14,10:9,9
-chr10	83081279	.	A	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=4.0149e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:10,7:19,12
-chr10	84007300	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.044477;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:9,2:3,2
-chr10	84018271	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:14,4:7,2:7,2
-chr10	84884296	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0011799;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:12,5:18,5
-chr10	85854248	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00061273;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:22,5:17,6
-chr10	86939833	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.053518;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:25,7:12,3:13,4
-chr10	87354692	.	C	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.012964;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:20,5:22,11
-chr10	87389196	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.0076335;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:48,8:24,7:24,1
-chr10	87390198	.	A	G	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0043761;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,8:15,6:31,2
-chr10	87418174	.	TTATA	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.013809;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:17,5:17,1
-chr10	87523518	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:3,3:2,1:1,2
-chr10	87701339	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10738;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,4:18,2:13,2
-chr10	89576802	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=4.9339e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:19,24:10,12:9,12
-chr10	90976006	.	A	AAAAAAAAAAAAG	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0010173;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,17:12,11:11,6
-chr10	92199392	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,2:1,1:3,1
-chr10	92948573	.	C	CACTACTACTACTACT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,5:14,3:2,2
-chr10	94883510	.	C	CA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00064847;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:17,8:8,5
-chr10	96817689	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:2,4:4,3
-chr10	97657811	.	ACTGTCACCACCATCCATCTCCAGAGCTCTTTTTGTTGTTGTTGAGACCGAGTCTTGCT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.12627;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:19,3:11,1
-chr10	98386546	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00024277;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:6,10:6,4
-chr10	103265049	.	CAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,10:8,5:3,5
-chr10	103278903	.	G	GCACACACACACA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.047515;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:13,9:7,1
-chr10	104534877	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:11,3:3,2
-chr10	105771010	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=5.8491e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:8,10:11,5
-chr10	106899591	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:8,4:6,2
-chr10	109059631	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0001197;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:17,3:11,8
-chr10	109208025	.	AT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.015273;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,1:10,4
-chr10	111119516	.	GCT	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.032855;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:15,9:6,1
-chr10	112966194	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,4:8,4
-chr10	113803008	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,4:10,1:11,3
-chr10	113948684	.	TATATATATATATATATATATACACAC	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.013932;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:3,3:0,2
-chr10	114066524	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0021577;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:15,3:17,5
-chr10	114202173	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.8111e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:31,18:11,12:20,6
-chr10	115383511	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0045408;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:13,5:20,3
-chr10	118949359	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.020734;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:2,3:1,1
-chr10	119411842	.	CTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:2,1:3,1
-chr10	119955275	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0003337;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,10:3,8:5,2
-chr10	120368900	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=3.0775e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:11,11:15,2
-chr10	121636873	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.022531;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,14:15,10:8,4
-chr10	121667273	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.088975;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:19,1:15,4
-chr10	122423110	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.026993;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:15,9:8,3:7,6
-chr10	122681334	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,2:3,4
-chr10	123181855	.	A	AT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:11,2:4,4
-chr10	123653723	.	AG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:5,4:5,5
-chr10	123738268	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.065402;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:20,4:20,2
-chr10	124158737	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.033359;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:14,3:20,2
-chr10	125892689	.	G	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.027462;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:75,15:23,2:52,13
-chr10	127045200	.	T	TA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.008238;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,8:7,6:1,2
-chr10	127093202	.	C	CTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:1,1:11,3
-chr10	129841050	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0006809;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:15,7:16,3
-chr10	130530431	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.002853;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:17,6:7,6
-chr10	131675469	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=2.2497e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:31,22:15,10:16,12
-chr10	133423970	.	A	AGGAGCGCCGCGGTG	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0019513;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:16,6:4,9
-chr10	133464329	.	G	GC	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.050579;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:18,3:12,1
-chr11	180483	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.019748;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:9,9:8,2
-chr11	287677	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:13,1:3,3
-chr11	1087343	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:4,3:9,2
-chr11	1116392	.	CGGGCTGTTCCCTGAGTGTGCTGGGCT	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.030923;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:23,4:12,4
-chr11	1417831	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
-chr11	1597972	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.1671;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,5:8,4:10,1
-chr11	3111965	.	GTGTGCATATGTGTGCGCGCA	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.012858;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,8:16,1
-chr11	3782570	.	A	AT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0045225;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,13:17,8:5,5
-chr11	3920129	.	T	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.50909;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:6,2:2,1:4,1
-chr11	4045762	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049808;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,2:3,2
-chr11	4327773	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=5.1287e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:19,6:8,10
-chr11	4895219	.	AAATTCTTTATATACATCATTAC	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0033007;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,19:18,12:14,7
-chr11	4898833	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.027191;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:9,6:4,2:5,4
-chr11	5838847	.	C	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.3989e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:11,6:12,10
-chr11	5870589	.	ACC	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11425;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:15,2:6,3
-chr11	6301244	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=7.7872e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:36,19:19,8:17,11
-chr11	6578652	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.056165;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:14,1:19,4
-chr11	8314484	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:11,4:8,3:3,1
-chr11	8462402	.	C	CAT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.010978;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,8:9,4:6,4
-chr11	9375041	.	C	CAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0204;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,10:11,8:6,2
-chr11	10504138	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.040341;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:12,4:14,2
-chr11	10731941	.	A	ATG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.038709;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:16,4:7,2
-chr11	11463225	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0095002;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:10,5:15,3
-chr11	13363127	.	CATATATAT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,10:2,6:5,4
-chr11	13534505	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=1.1462e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:30,21:12,13:18,8
-chr11	14841349	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0025048;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:7,2:12,6
-chr11	15651738	.	C	CTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0067861;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:4,1:7,8
-chr11	15998454	.	TG	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.042668;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:6,5:9,2
-chr11	16196830	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:8,2:4,2
-chr11	16994530	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.8991e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:13,10:7,10
-chr11	18622101	.	A	AAAAAAAAAAAC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,4:2,1:0,3
-chr11	23317106	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.019285;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,3:9,1
-chr11	24328584	.	T	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.034902;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:23,2:19,3
-chr11	24649978	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.023995;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:15,3:14,5
-chr11	24918965	.	T	C	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.0072049;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:87,14:41,3:46,11
-chr11	27496001	.	A	AAC	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0006722;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:14,5:12,7
-chr11	28310962	.	GTGGGT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.072233;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,4:18,4:0,0
-chr11	30103519	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00031821;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:6,8:0,2
-chr11	31142102	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0058719;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:19,3:13,3
-chr11	31204428	.	GA	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00013297;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:11,6:10,6
-chr11	32201444	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=7.7194e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:10,6:13,10
-chr11	35894837	.	C	CTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,3:2,1
-chr11	36054840	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,7:3,2:6,5
-chr11	37881192	.	TA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,2:1,1:0,1
-chr11	39220874	.	AGAAG	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,5:3,3:3,2
-chr11	40665325	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.024242;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,3:0,2:0,1
-chr11	40851180	.	GA	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00070074;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:14,2:20,8
-chr11	41182848	.	TAA	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0038457;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:21,12:11,7:10,5
-chr11	41460454	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.1624e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:8,7:11,10
-chr11	41655087	.	T	TCTC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,5:1,1:9,4
-chr11	43619164	.	G	GAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0041629;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,3:4,6
-chr11	43619215	.	A	AAT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016422;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,3:7,6
-chr11	44379144	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,4:4,2
-chr11	46271364	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=5.9715e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:10,6:15,6
-chr11	47046665	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:6,4:9,2
-chr11	48500539	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=7.0452e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:28,20:17,14:11,6
-chr11	49002488	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.13663;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,2:15,2
-chr11	49926902	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00010628;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:21,7:13,7
-chr11	50023502	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.036467;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:18,1:14,6
-chr11	51572510	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.091638;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:3,0:30,4
-chr11	51664424	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10123;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:5,1:21,3
-chr11	52107622	.	T	C	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.029527;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:95,14:37,8:58,6
-chr11	52129259	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.033358;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:13,1:21,9
-chr11	53175444	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.048962;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:4,2:7,3
-chr11	53602042	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
-chr11	54234630	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
-chr11	54270934	.	C	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014907;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
-chr11	54334166	.	A	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr11	54382388	.	G	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.043161;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:49,7:38,4:11,3
-chr11	54382389	.	G	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.038418;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:36,4:11,3
-chr11	54392352	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.074501;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:11,5:3,2
-chr11	54416246	.	A	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.045941;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:5,2:39,3
-chr11	55873506	.	C	A	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=3.0487e-10;SS=2;SSC=95;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:38,34:20,23:18,11
-chr11	56157088	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.5006e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:7,10:14,4
-chr11	56267744	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00092696;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,8:5,6:3,2
-chr11	57185270	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0059696;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:5,7:3,1
-chr11	59554905	.	A	AAG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.064336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,7:12,6:5,1
-chr11	59554927	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.056428;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:17,5:4,1
-chr11	60832412	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00075779;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:9,7:14,2
-chr11	64022867	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,6:4,4:7,2
-chr11	64196395	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.022431;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,8:16,7:6,1
-chr11	64310536	.	GT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,3:11,1
-chr11	65734436	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:6,5:2,2
-chr11	66311088	.	AC	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:2,2:2,2:0,0
-chr11	68219436	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,4:10,1:6,3
-chr11	69274380	.	C	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=6.8415e-10;SS=2;SSC=91;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:19,28:9,16:10,12
-chr11	71168031	.	G	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.038682;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:14,7:6,2
-chr11	72201585	.	T	TAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14763;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,1:10,3
-chr11	73253497	.	C	CATAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0057971;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,6:5,5:2,1
-chr11	75757189	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.031686;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,9:8,4:10,5
-chr11	77314398	.	A	ATATATATATATAT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10909;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,2:0,0:2,2
-chr11	79643065	.	GGGAA	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,4:3,3
-chr11	79696275	.	C	CATAT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.014848;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:12,5:12,2
-chr11	83148729	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.3326e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:14,7:10,6
-chr11	84313641	.	A	AAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.010101;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:0,4:0,3:0,1
-chr11	84483430	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.042122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:8,5:8,3
-chr11	84990342	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0019129;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:13,4:15,5
-chr11	85232357	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=2.1719e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:27,25:9,9:18,16
-chr11	85630075	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=4.9752e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:10,7:9,11
-chr11	85816915	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014934;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:6,5:3,2
-chr11	86110351	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047306;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:10,8:14,3
-chr11	86319242	.	A	ATTTTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.01623;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,9:0,6:6,3
-chr11	86328929	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:1,2:1,1:0,1
-chr11	87080165	.	A	AGT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00012649;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:3,7:8,7
-chr11	87675968	.	A	AT	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=3.3064e-06;SS=2;SSC=54;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:11,9:14,6
-chr11	88928484	.	GTATATATGTA	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.07299;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,4:9,2:21,2
-chr11	89751342	.	G	GACTA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.045385;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:8,3:8,4
-chr11	91053193	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.03148;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,9:7,4:9,5
-chr11	91525961	.	AATT	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.056777;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,1:15,3
-chr11	92478948	.	C	CTTTCT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.041183;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:4,5:16,3
-chr11	92754700	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,4:3,1
-chr11	96522974	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.3;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,2:1,1:6,1
-chr11	96585172	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.059099;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
-chr11	96800198	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:40:0,2:0,1:0,1
-chr11	98636046	.	AT	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.3143e-07;SS=2;SSC=62;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:30,23:21,11:9,12
-chr11	104119230	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:0,4:4,1
-chr11	105172422	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.017391;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,7:2,3:7,4
-chr11	106272580	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.050554;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:16,2:8,3
-chr11	106272616	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.047988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,5:9,2:12,3
-chr11	108241742	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0037594;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,8:2,3:1,5
-chr11	110215369	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,7:4,3:10,4
-chr11	112084799	.	C	CTTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016961;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:8,4:8,5
-chr11	112095884	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.050152;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:5,3:15,1
-chr11	112273033	.	TCTTTCCTTCTTC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0094722;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:13,1:13,7
-chr11	113894392	.	C	CAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020274;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:10,8:7,1
-chr11	115134000	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.02121;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:14,9:6,2:8,7
-chr11	115257841	.	GCAT	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.3324e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,14:15,7:12,7
-chr11	116818336	.	TA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.036166;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:12,4:13,2
-chr11	117329839	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.012248;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:13,4:6,5
-chr11	117769222	.	TTGTATATATTATATATTTTATATA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:3,3:6,1
-chr11	120943107	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.041917;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,9:7,6:5,3
-chr11	122167018	.	C	CAT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,11:3,8:3,3
-chr11	123318282	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0395;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:21,5:12,1
-chr11	123704349	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.6295e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:10,8:13,4
-chr11	124317257	.	TTG	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0084125;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:10,7:7,4
-chr11	125401768	.	T	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.026556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:16,5:36,2
-chr11	125665869	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,2:7,4
-chr11	126131217	.	A	ATGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.025685;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:5,5:9,4
-chr11	126683357	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.6465e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:11,9:11,11
-chr11	127323554	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10283;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,7:9,5:8,2
-chr11	127799896	.	TTG	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.01106;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:11,2:5,7
-chr11	129095191	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=1.0506e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:15,10:8,8
-chr11	129564218	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.019156;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:13,4:9,4
-chr11	130090969	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.076397;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:16,1:17,3
-chr11	130294538	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.10034;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:20,4:2,0
-chr11	130590053	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.032575;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:9,2:12,5
-chr11	131003590	.	GTGTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,4:2,1
-chr11	131265322	.	GAT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034789;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:9,3:10,2
-chr11	131265436	.	C	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.067367;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:8,3:8,3
-chr11	131577151	.	A	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=3.768e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:13,8:19,9
-chr11	131680400	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0972;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:10,4:14,1
-chr11	133766032	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.6e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:31,17:19,7:12,10
-chr11	134284924	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,9:6,6:4,3
-chr11	134840333	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.11818;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:25,3:13,2:12,1
-chr12	44285	.	T	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.042124;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:21,1:17,6
-chr12	748212	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:4,1:7,3
-chr12	4874098	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:11,4:5,2:6,2
-chr12	5489833	.	G	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=1.9282e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:32,20:14,12:18,8
-chr12	9284447	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.017823;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:48,12:22,6:26,6
-chr12	9308117	.	C	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.016746;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:24,1:22,8
-chr12	9607334	.	TC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027568;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:8,2:13,4
-chr12	9869858	.	CAA	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.033575;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:19,1:17,5
-chr12	11938175	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0054163;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
-chr12	13016392	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.016493;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,5:7,1
-chr12	13445435	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.6036e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,20:9,10:10,10
-chr12	13776177	.	C	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.5071e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:25,25:9,12:16,13
-chr12	14235266	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=2.606e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,17:15,8:18,9
-chr12	14323950	.	G	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,1:0,2
-chr12	14481935	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.044629;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:12,3:17,1
-chr12	17161030	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00029978;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:13,7:13,7
-chr12	17237002	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11628;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:14,1:5,2
-chr12	19280036	.	GT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.028921;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,5:4,1
-chr12	19896768	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.04058;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:14,2:12,3
-chr12	21555502	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.5408e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:11,7:11,6
-chr12	22303848	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.3;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:7,2:5,1:2,1
-chr12	22895817	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.1151e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:13,8:13,12
-chr12	26617691	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.058687;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:14,3:1,1
-chr12	30915287	.	C	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.014385;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:52,6:25,3:27,3
-chr12	31685810	.	AG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.050426;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:1,4:12,1
-chr12	31685815	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,3:4,1
-chr12	32061587	.	CTATATATATATA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:2,3:5,1
-chr12	32148032	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0013413;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:18,4:14,6
-chr12	33153456	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0021888;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:13,3:16,6
-chr12	33475345	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=6.7478e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:7,4:13,12
-chr12	34836788	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.011343;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:12,7:2,3
-chr12	34915929	.	T	A	0	PASS	DP=373;GPV=1;SPV=0.012968;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:190:169,21:150,20:19,1
-chr12	35245095	.	G	A	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.00069823;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:68,15:38,10:30,5
-chr12	36205455	.	G	C	0	PASS	DP=364;GPV=1;SPV=0.024344;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:204:181,23:118,5:63,18
-chr12	36239917	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr12	36247818	.	A	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
-chr12	36381030	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.039138;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:11,4:8,1
-chr12	38468208	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.4106e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:13,6:10,10
-chr12	40113195	.	A	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=5.2636e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:15,7:14,8
-chr12	40602940	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,4:2,2:3,2
-chr12	40760042	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0086626;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,4:8,1
-chr12	41458994	.	TGAGGAATTAGGTTTGAGATCAGAGTTCAAAG	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0047364;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:9,7:14,4
-chr12	41673678	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0096038;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:16,2:5,8
-chr12	43161497	.	G	GTTTTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:8,10:4,7:4,3
-chr12	44447451	.	TA	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.020567;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,11:21,3:21,8
-chr12	44862859	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00013315;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:14,12:15,7
-chr12	45554574	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.056718;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:5,3:14,2
-chr12	45561590	.	TTTCC	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.033476;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,8:6,4:7,4
-chr12	46089097	.	C	CTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,5:6,1:11,4
-chr12	47232905	.	TTTTA	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.002519;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:7,12:15,3
-chr12	47634583	.	T	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:2,1:1,1
-chr12	48186521	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.077519;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,2:8,2
-chr12	48186530	.	TGTATATGTGC	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10903;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:13,2:21,2
-chr12	48207769	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,6:1,3:2,3
-chr12	48540100	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,9:9,8:2,1
-chr12	48635402	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,5:0,2:7,3
-chr12	49004813	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00012936;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,17:8,9:9,8
-chr12	49880551	.	CGT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,1:10,3
-chr12	50754334	.	T	TC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0042405;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:10,8:7,5
-chr12	50872860	.	AT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.080441;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:14,1:9,4
-chr12	50872864	.	C	CG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.031932;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:17,1:9,6
-chr12	50949526	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,5:4,1
-chr12	52745107	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10523;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,2:11,2
-chr12	52938136	.	C	CTATA	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,3:4,1
-chr12	55100164	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.013049;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:4,6:11,5
-chr12	55411261	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.1253;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:20,3:12,2
-chr12	56363209	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.055746;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,4:17,1:7,3
-chr12	58373220	.	C	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=3.9106e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:28,21:11,8:17,13
-chr12	59013656	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=6.2842e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:29,26:8,19:21,7
-chr12	59486352	.	G	GTATA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.027005;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:6,4:7,6
-chr12	60694394	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.4229e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:18,4:10,12
-chr12	62507315	.	C	CTT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.020181;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:7,3:14,6
-chr12	62939616	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,7:5,5:0,2
-chr12	63538702	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.02161;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:26,7:20,2
-chr12	64258945	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:5,2:5,2
-chr12	64288489	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016203;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:12,4:3,4
-chr12	65639747	.	T	TCTCTCTGACACA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00052506;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,11:6,7:4,4
-chr12	65639748	.	G	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00096036;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:6,7:3,5
-chr12	68277320	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.048259;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:17,3:7,1
-chr12	68417459	.	G	GAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.064826;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:19,1:4,3
-chr12	68450327	.	T	TTA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0037707;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:2,3:1,4
-chr12	68528198	.	CTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,4:2,3:0,1
-chr12	68937641	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.277e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:16,10:12,9
-chr12	69357532	.	C	CTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.073359;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:8,2:8,2
-chr12	69817653	.	T	TACACACACACACAC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:10,11:5,7:5,4
-chr12	70018140	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,2:5,2
-chr12	71468709	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0069996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:4,6:2,1
-chr12	73061526	.	AAT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0051416;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:8,6:7,4
-chr12	73488896	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.6127e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:11,8:8,8
-chr12	76077980	.	C	CAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0073947;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:7,9:4,1
-chr12	77946260	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.049645;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:19,4:11,1:8,3
-chr12	80962382	.	AC	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.047571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:26,1:8,4
-chr12	81145358	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=1.9952e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,22:13,11:15,11
-chr12	81498080	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.6776e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:28,23:15,10:13,13
-chr12	81562574	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00082339;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:42,12:21,8:21,4
-chr12	82993260	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0013338;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:15,7:24,4
-chr12	84352437	.	A	AT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.012731;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,7:12,4:13,3
-chr12	84554009	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:3,5:4,2
-chr12	85201243	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0093112;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:11,6:5,3
-chr12	85860503	.	G	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,2:3,1:4,1
-chr12	86433743	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=5.1287e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:15,8:12,8
-chr12	87549406	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.086687;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,3:6,3:0,0
-chr12	88548425	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=3.4893e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:11,13:11,7
-chr12	88664963	.	A	ATGTGTG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.01726;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,10:5,7:6,3
-chr12	89412848	.	T	TTCCTTCCTTTCC	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.017166;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,7:5,1:14,6
-chr12	91240357	.	A	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=5.8593e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:34,18:17,8:17,10
-chr12	92680235	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.040413;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:19,1:9,8
-chr12	92761625	.	AG	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:14,6:9,4:5,2
-chr12	93548022	.	CCCTTCCTTCCTTCCTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,8:6,3:8,5
-chr12	94692459	.	G	GTATATATAATA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.1056;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,5:19,4:8,1
-chr12	95216669	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,4:7,3:3,1
-chr12	96086880	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:8,3:2,1
-chr12	96190492	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,3:7,1
-chr12	97144381	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0056092;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:14,4:20,4
-chr12	97595809	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0019055;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:12,7:24,3
-chr12	100515057	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=4.2346e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:12,8:18,7
-chr12	101185906	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.2848e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:12,6:12,12
-chr12	101212484	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0035197;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:5,9:3,2
-chr12	101591837	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0154;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:6,3:16,6
-chr12	101614325	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.053518;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:25,7:7,4:18,3
-chr12	101661915	.	A	AAAAGAAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.069853;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:8,2:9,3
-chr12	106908276	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:5,3:1,2
-chr12	107196356	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,1:13,3
-chr12	107999325	.	G	GTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.040159;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:11,5:3,1
-chr12	108212615	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.01641;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:12,3:10,3
-chr12	108347833	.	T	TTTTGTAAATATATA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10313;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,4:14,2:11,2
-chr12	108425213	.	TTTTTGTTTTG	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0018135;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:2,6:15,8
-chr12	108490233	.	T	TAAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.25822;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,5:15,3:11,2
-chr12	108712570	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049781;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:15,9:5,1
-chr12	109046092	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0093911;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,7:3,1
-chr12	110392092	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.071485;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,7:15,2:3,5
-chr12	110867438	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,3:8,1
-chr12	111616957	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,2:4,1:0,1
-chr12	113976473	.	A	AAAG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.043024;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,9:7,2:13,7
-chr12	114367244	.	ACAAAAAAG	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.16219;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:22,3:12,1
-chr12	114580338	.	C	CAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0032151;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,10:1,9:1,1
-chr12	114589716	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,4:2,1
-chr12	116120479	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027836;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,4:7,2:3,2
-chr12	118179207	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00035448;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:22,3:7,6
-chr12	118362317	.	T	TAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.025088;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:14,3:5,3
-chr12	118777194	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.6323e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:22,21:12,12:10,9
-chr12	119160301	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.049315;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:25,9:7,5:18,4
-chr12	119234527	.	CATATATATATAT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:5,5:1,1
-chr12	119456064	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.033449;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,11:7,7:9,4
-chr12	120952465	.	CAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:5,7:8,2
-chr12	120960569	.	G	GA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00018161;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:9,9:7,1
-chr12	122336415	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:5,2:2,1:3,1
-chr12	122701007	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0092671;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:13,5:11,8
-chr12	122712596	.	C	CAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.006529;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,9:11,6:6,3
-chr12	123693376	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:3,3:11,3
-chr12	124134997	.	C	CTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:8,2:9,2
-chr12	124602540	.	C	CTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0078247;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,9:4,7:3,2
-chr12	125885746	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.2952e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:14,9:14,6
-chr12	126289622	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=6.5336e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:9,6:10,9
-chr12	127304833	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12206;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:8,2:17,2
-chr12	128236113	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.4921e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:13,8:9,4
-chr12	128841485	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0077765;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,7:4,2:3,5
-chr12	128965732	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,7:11,2:6,5
-chr12	129241850	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00064966;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:16,5:13,6
-chr12	129514986	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.9327e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:27,26:12,14:15,12
-chr12	129586993	.	T	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.6403e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:11,13:13,7
-chr12	129877174	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.11988;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,1:16,4
-chr12	130015247	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.058687;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,1:8,3
-chr12	131579543	.	CTCTCTGTACTGTGTCTG	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0053893;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:13,2:7,12
-chr12	132267812	.	C	CAT	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.01279;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:14,7:18,7
-chr12	133237285	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.036709;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:13,5:9,4
-chr13	18339332	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.049645;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:18,4:1,0
-chr13	19710163	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0084761;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:19,3:17,4
-chr13	20283337	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=1.2226e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:37,22:20,12:17,10
-chr13	21447930	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.043206;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:13,6:4,1
-chr13	21743410	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,1:8,3
-chr13	22215066	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:5,3:3,1:2,2
-chr13	22625441	.	C	CATATAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.043512;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,5:2,2:1,3
-chr13	22781019	.	T	TTG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00023992;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:10,6:9,5
-chr13	22868769	.	TATA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,3:10,2
-chr13	24318682	.	T	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.030381;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:45,10:24,6:21,4
-chr13	26178591	.	C	CGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11053;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:5,2:0,0
-chr13	28493115	.	C	CA	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=4.1567e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:34,16:16,5:18,11
-chr13	28819747	.	A	AGCTGGG	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.010181;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:25,9:8,3
-chr13	30928825	.	G	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=6.8293e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:20,2:17,10
-chr13	32405892	.	CTT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036566;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,6:9,3:8,3
-chr13	32436785	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,5:6,4:3,1
-chr13	32631118	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:9,7:8,3:1,4
-chr13	34885994	.	A	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.043479;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:14,7:5,2
-chr13	35010753	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:4,4:6,1
-chr13	36009672	.	G	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.29987;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:14,2:12,2
-chr13	36869777	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.1223e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:10,8:10,4
-chr13	37259431	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0063578;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:10,3:4,3
-chr13	38646241	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0011256;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:15,4:13,5
-chr13	38866667	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00043265;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,10:12,9:5,1
-chr13	39114436	.	T	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=3.6897e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:30,22:20,11:10,11
-chr13	39490095	.	CAA	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.057534;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:21,3:13,1
-chr13	39562603	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.025505;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,8:14,4:7,4
-chr13	39562605	.	TAC	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.036217;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,8:16,3:9,5
-chr13	41447470	.	A	AT	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.00010853;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:50,24:24,8:26,16
-chr13	43940571	.	TTTC	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.03601;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:8,4:15,4
-chr13	44717446	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0098053;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:15,4:16,2
-chr13	45103866	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:7,7:5,5
-chr13	45938615	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=3.542e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:12,7:11,8
-chr13	46635467	.	C	CTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023879;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:4,3:10,3
-chr13	46876399	.	TATATA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.012894;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:13,3:8,3
-chr13	48834704	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.22206;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:26,4:18,3:8,1
-chr13	49620861	.	TA	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.19246;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,4:15,3:10,1
-chr13	51371263	.	C	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=3.5378e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:14,11:14,8
-chr13	54456982	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:8,1:17,3
-chr13	54822460	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0030923;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:15,5:19,4
-chr13	54978196	.	T	TCTG	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0031698;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,9:15,4:17,5
-chr13	54978198	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0047817;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,9:0,4:15,5
-chr13	55939310	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0059497;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,8:3,7:4,1
-chr13	56047122	.	G	GAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,4:10,2:4,2
-chr13	56059202	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=1.7034e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:10,8:2,4
-chr13	56673893	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.068138;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:12,2:20,2
-chr13	56886793	.	G	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0057679;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:18,5:24,3
-chr13	59366827	.	A	AAAAAAAAAAAAAGAAAAAAG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01134;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:3,3:11,5
-chr13	60567892	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:6,2:3,1:3,1
-chr13	62709373	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=2.6125e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:21,22:9,12:12,10
-chr13	63651229	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.016883;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:12,7:6,3
-chr13	64029473	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.0665e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:12,9:12,6
-chr13	65030733	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.037198;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,12:4,6:6,6
-chr13	65287935	.	TTA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.015215;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:7,3:6,5
-chr13	65550403	.	A	AT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.014256;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:15,5:17,2
-chr13	65937905	.	CTCTCTCAGTGTG	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.030107;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:11,2:9,5
-chr13	67280322	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=5.3034e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:15,6:9,8
-chr13	67861113	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0094953;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,13:4,4:3,9
-chr13	68341888	.	C	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=1.1616e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:26,24:14,11:12,13
-chr13	68520918	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.043461;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:20,6:17,3
-chr13	69231759	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,5:3,1
-chr13	71477108	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:6,5:8,1
-chr13	71864180	.	T	TACAC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:1,5:6,2
-chr13	72628285	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.467e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,19:18,12:14,7
-chr13	72809132	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,8:3,6:3,2
-chr13	75106360	.	AC	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=2.1173e-06;SS=2;SSC=56;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:31,19:12,8:19,11
-chr13	75391036	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:2,2:1,1:1,1
-chr13	75687265	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=9.9664e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,16:23,5:10,11
-chr13	76031962	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:8,2:12,2
-chr13	76259937	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00079043;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,10:2,8:12,2
-chr13	79438248	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
-chr13	79619710	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0007273;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:14,2:12,7
-chr13	79669998	.	A	AACACACACAC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
-chr13	80106247	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,1:9,3
-chr13	80648002	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15365;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:10,1:16,3
-chr13	80648035	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,4:3,2:4,2
-chr13	80803021	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.22704;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:9,7:7,4:2,3
-chr13	82684632	.	T	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.029693;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:8,6:18,3
-chr13	84745270	.	G	GA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,4:6,3:8,1
-chr13	85437319	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.027663;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:17,4:15,2
-chr13	85437344	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.027663;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:18,2:14,4
-chr13	85560807	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.721e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:12,13:5,4
-chr13	86078171	.	TACAC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,1:5,5
-chr13	86078187	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,1:8,4
-chr13	86538288	.	G	GTGTA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:1,3:1,1:0,2
-chr13	86655220	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040085;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,2:5,3
-chr13	88224501	.	C	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,4:2,3:1,1
-chr13	88930417	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.095238;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,2:3,1:0,1
-chr13	89441265	.	A	AATGGATGG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0095925;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:6,5:7,4
-chr13	90249759	.	A	AGAAAG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,2:12,2
-chr13	90372376	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.11845;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:23,3:6,2
-chr13	91398650	.	GGGCGGCGGAGGCGGC	G	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0060488;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:20,2:19,4
-chr13	93491145	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:10,1:18,3
-chr13	95025502	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.00054667;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,9:1,8:0,1
-chr13	96468477	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.010062;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:6,9:3,8:3,1
-chr13	96499030	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:7,2:5,1:2,1
-chr13	97001186	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.04045;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:22,5:17,1
-chr13	97001187	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,8:19,6:15,2
-chr13	97320261	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:8,6:6,2
-chr13	97696568	.	C	T	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=2.8389e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:14,12:14,7
-chr13	98559002	.	TAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0070393;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,10:4,7:5,3
-chr13	99637962	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0059157;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:5,5:6,2
-chr13	100043996	.	A	ATT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:2,1:5,4
-chr13	100505843	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:1,2:0,1:1,1
-chr13	101346089	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.092902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,3:14,2
-chr13	101346091	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,2:12,2
-chr13	102245264	.	G	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=1.9604e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:15,6:18,8
-chr13	103445508	.	C	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0017218;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:26,5:9,4
-chr13	104097476	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.015935;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:19,5:18,2
-chr13	104302092	.	A	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.13598;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:30,4:18,1:12,3
-chr13	104325344	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.071484;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:13,2:22,2
-chr13	104512774	.	T	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00037812;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:46,13:24,7:22,6
-chr13	107279043	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,2:5,4
-chr13	108699076	.	GTC	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0016383;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:12,8:13,10
-chr13	108873751	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0023885;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:4,3:7,8
-chr13	109228451	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00028692;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:38,15:21,5:17,10
-chr13	109346813	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,3:11,1
-chr13	112195638	.	C	CCCTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.04242;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:4,1:13,5
-chr13	112297897	.	G	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.036642;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,1:9,5
-chr13	114195916	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0015389;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:9,12:5,2
-chr14	18275569	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.040392;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:16,3:12,4
-chr14	18277913	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:0,1:3,4
-chr14	18293396	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.027835;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:24,8:4,5
-chr14	18348735	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.03876;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,2:9,3
-chr14	18600029	.	A	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.03782;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:34,7:10,2
-chr14	18623916	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.048554;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:31,12:6,1
-chr14	18675772	.	G	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0018642;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:26,15:13,11:13,4
-chr14	18701161	.	C	CA	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.0075688;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:39,17:27,15:12,2
-chr14	18883954	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:8,1:15,3
-chr14	18903501	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.023213;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:1,4:32,6
-chr14	18930867	.	G	T	0	PASS	DP=268;GPV=1;SPV=0.0090992;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:116,24:72,14:44,10
-chr14	18967593	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,2:0,1
-chr14	19008500	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.11618;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:8,1:26,3
-chr14	19009534	.	G	T	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.04659;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:61,15:21,8:40,7
-chr14	19023336	.	TTCTTTTTCCTTCC	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14912;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:14,3:18,1
-chr14	19075816	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0071887;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:15,4:9,2
-chr14	19080792	.	C	T	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.021872;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:65,11:45,7:20,4
-chr14	19130715	.	T	C	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.028804;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:66,17:39,9:27,8
-chr14	19132173	.	T	C	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.036884;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:63,10:30,7:33,3
-chr14	19157089	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.039124;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,8:35,7:14,1
-chr14	19158466	.	C	G	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.0074315;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:51,10:27,9:24,1
-chr14	19167784	.	T	G	0	PASS	DP=302;GPV=1;SPV=0.0051068;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:162:132,30:63,10:69,20
-chr14	19182046	.	C	T	0	PASS	DP=289;GPV=1;SPV=0.025097;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:131,22:59,18:72,4
-chr14	19203458	.	C	A	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.025927;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:84,18:45,7:39,11
-chr14	19209070	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:6,3:14,1
-chr14	19267820	.	C	T	0	PASS	DP=379;GPV=1;SPV=0.02757;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:206:183,23:91,15:92,8
-chr14	19296488	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27277;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:21,4:0,0
-chr14	19296490	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:18,4:0,0
-chr14	19303656	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0023146;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:16,8:16,5
-chr14	19331110	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
-chr14	19340923	.	C	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.04753;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:59,8:52,5:7,3
-chr14	19367032	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
-chr14	19436243	.	C	G	0	PASS	DP=296;GPV=1;SPV=0.0055829;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:152:129,23:80,6:49,17
-chr14	19487998	.	C	T	0	PASS	DP=325;GPV=1;SPV=0.012617;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:172:153,19:91,10:62,9
-chr14	19498454	.	G	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,2:0,2
-chr14	19507184	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.024122;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,6:8,2:13,4
-chr14	19716664	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:10,3:7,1
-chr14	19724259	.	G	T	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.013119;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:66,9:34,8:32,1
-chr14	19724585	.	C	G	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.0079005;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:51,19:25,11:26,8
-chr14	20275448	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0048847;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:27,4:14,5
-chr14	20638971	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:6,5:4,1:2,4
-chr14	21255222	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.2576e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:13,7:14,12
-chr14	21302865	.	G	GT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.034996;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:12,4:2,2
-chr14	23858347	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.057784;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:24,3:12,1
-chr14	25206151	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.038164;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:25,5:16,4
-chr14	25866235	.	CTATA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.019231;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,9:1,5:2,4
-chr14	26452982	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.052515;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:11,2:15,2
-chr14	26624273	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0034956;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:24,6:10,3
-chr14	26975883	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=7.5582e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:12,9:20,5
-chr14	27030195	.	GT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,8:7,6:2,2
-chr14	27069381	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0013223;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:15,5:7,3
-chr14	27420828	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=8.4049e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:10,6:20,6
-chr14	28242328	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.8111e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:31,18:18,8:13,10
-chr14	28370799	.	C	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.8466e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:9,8:16,7
-chr14	29722786	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=5.3456e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:10,9:10,7
-chr14	30003083	.	CT	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0086439;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:16,4:17,2
-chr14	30084265	.	C	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.2077e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:13,11:12,10
-chr14	31650291	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.044578;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:21,6:6,2
-chr14	31831518	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.040005;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:21,5:11,5
-chr14	31831522	.	CT	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.011327;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:22,3:12,4
-chr14	32068460	.	C	CATACATACATAGATAG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0051214;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:11,5:7,6
-chr14	32532619	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.5483e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:14,11:14,8
-chr14	32800165	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.042367;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:19,5:10,3
-chr14	32967914	.	T	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:3,3:1,2:2,1
-chr14	33165234	.	C	T	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=3.0434e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:31,22:18,8:13,14
-chr14	34341564	.	G	GTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12591;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:18,2:9,2
-chr14	34442955	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0088608;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:4,6:10,2
-chr14	34477676	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00016626;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:9,8:14,7
-chr14	35314744	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,4:10,1:9,3
-chr14	36913491	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0014226;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:19,4:24,10
-chr14	37144786	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:34:0,2:0,1:0,1
-chr14	37200900	.	ATT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,5:3,2:4,3
-chr14	38020623	.	G	GGAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:2,2:1,1:1,1
-chr14	40079351	.	C	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.4501e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:18,23:11,13:7,10
-chr14	40327825	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027884;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:18,2:4,7
-chr14	44939478	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=8.2732e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:13,8:12,6
-chr14	47328511	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=1.3827e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,19:7,10:12,9
-chr14	48092117	.	CT	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0016295;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:19,7:5,2
-chr14	48117599	.	T	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=5.9462e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,19:11,8:9,11
-chr14	48297784	.	T	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=2.3127e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,16:18,7:15,9
-chr14	48623342	.	CAAT	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.01186;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:11,3:13,3
-chr14	48838104	.	A	AGTATAT	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0016268;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:22,11:26,2
-chr14	48864561	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.1187e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:11,6:9,8
-chr14	50298241	.	C	CA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0028764;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,9:14,6:15,3
-chr14	50592913	.	C	CAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0090305;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,8:6,3:4,5
-chr14	50706587	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,7:6,1:5,6
-chr14	50804024	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00013722;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:17,5:18,8
-chr14	52114937	.	T	TTTCCTTCCTTCC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0090318;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,7:6,2:11,5
-chr14	53220706	.	C	CT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.015262;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:22,1:12,6
-chr14	56952731	.	A	AATTT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0033813;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,8:9,5:6,3
-chr14	59706254	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=1.1021e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,23:14,16:8,7
-chr14	60150195	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.041463;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:14,3:14,3
-chr14	62069460	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0022758;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:19,4:21,6
-chr14	65242028	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.016958;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,13:13,10:6,3
-chr14	67239659	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=3.4636e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,16:18,9:15,7
-chr14	67610681	.	T	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=1.1251e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:13,6:18,8
-chr14	70612062	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.046393;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:14,2:14,4
-chr14	71462760	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=2.4736e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:10,9:19,6
-chr14	71741826	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.6327e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:6,10:12,9
-chr14	72825700	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,2:0,0:3,2
-chr14	73404927	.	A	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=2.6657e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:23,25:9,15:14,10
-chr14	73537688	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.07266;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:15,3:27,2
-chr14	78500814	.	AC	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=8.6e-07;SS=2;SSC=60;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:32,21:14,12:18,9
-chr14	78500816	.	T	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.1886e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:30,20:13,12:17,8
-chr14	79958641	.	C	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=1.1457e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:18,12:6,7
-chr14	81593003	.	TTCTC	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.01488;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:12,3:19,3
-chr14	82675517	.	C	CCT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:15,3:12,1
-chr14	82675520	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.14145;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,4:16,3:18,1
-chr14	82745894	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.026013;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:21,5:16,2
-chr14	83518393	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013612;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:11,11:8,2
-chr14	83643358	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.079949;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:19,1:16,3
-chr14	83643359	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.084652;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:19,1:16,3
-chr14	84975142	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.037117;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,10:9,7:12,3
-chr14	85700546	.	T	TGTATATATATATATACAC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.041607;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:13,5:9,4
-chr14	85757078	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00011418;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:13,4:17,8
-chr14	86443404	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,3:6,1
-chr14	86443424	.	T	TATTA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,2:7,2
-chr14	86443426	.	A	AT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:4,2:7,2
-chr14	86443457	.	ATAT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:4,3:3,2
-chr14	87053919	.	C	CAT	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.031137;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,11:17,4:19,7
-chr14	87298808	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0042046;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:15,4:16,5
-chr14	87592377	.	TACATATATATAC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.025112;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:0,2:3,2
-chr14	87625150	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0047438;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,13:6,7:12,6
-chr14	87690858	.	C	CAAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:10,7:4,1
-chr14	87754364	.	TAA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11404;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:7,4:3,1
-chr14	87997375	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:15,3:2,1
-chr14	88279364	.	CGT	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.016381;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:27,4:7,6
-chr14	89246542	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,3:2,1
-chr14	89446196	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,5:0,2:3,3
-chr14	90126442	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.03614;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:19,4:24,5
-chr14	90142313	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,5:6,4:4,1
-chr14	90235234	.	G	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=9.4293e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:33,24:19,13:14,11
-chr14	90793611	.	TTC	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.047211;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:20,4:21,1
-chr14	91235478	.	TA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.017694;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,6:7,5:5,1
-chr14	91967135	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.046124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:14,8:6,3
-chr14	92661723	.	T	TCACACACACACACA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.011835;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:9,8:12,4
-chr14	93758594	.	CA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0021328;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:10,13:7,3
-chr14	94577597	.	A	AATGGATGGATGGATGG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:7,6:8,2
-chr14	94577713	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.067367;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,6:7,3:9,3
-chr14	95565365	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0012204;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:3,6:1,3
-chr14	95731012	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048922;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:17,4:3,1
-chr14	96288807	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,5:17,1:1,4
-chr14	96340090	.	ATATGC	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0063215;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:5,5:10,2
-chr14	96340102	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0041611;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,6:8,2
-chr14	96340103	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.016908;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:3,4:6,2
-chr14	96402185	.	G	GCA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.040001;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,11:15,9:9,2
-chr14	96923926	.	C	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.14923;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:24,3:15,2:9,1
-chr14	97788393	.	AT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.024094;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:10,7:8,3
-chr14	99040695	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=4.9392e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:18,5:7,10
-chr14	99090775	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.5041e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:11,8:14,8
-chr14	101724124	.	C	CTATA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0075746;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:2,3:6,2
-chr14	101724481	.	A	ATG	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.019978;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,6:9,3:11,3
-chr14	102534417	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.033617;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,6:5,1
-chr14	102919147	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,5:2,3:3,2
-chr14	103455725	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0039567;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,12:7,9:4,3
-chr14	104618695	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.016099;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:15,3:27,3
-chr14	104941075	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.6174e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:30,16:15,10:15,6
-chr14	105117430	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=2.9216e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,18:14,10:13,8
-chr14	105578997	.	C	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,4:3,3
-chr14	106336406	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0066012;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:44,17:23,5:21,12
-chr14	106364035	.	A	C	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.023607;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:76,15:46,9:30,6
-chr14	106616599	.	AT	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.015078;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,10:17,3:7,7
-chr14	106718552	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0042611;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:7,4:8,6
-chr14	106742478	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.048497;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,3:10,1
-chr15	17043584	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.036099;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,6:11,5:18,1
-chr15	17071844	.	T	TAATAA	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.0075974;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:62,21:32,13:30,8
-chr15	17745355	.	C	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,4:4,1
-chr15	19940628	.	A	G	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.01412;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:73,16:21,2:52,14
-chr15	19947231	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.04413;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:17,4:24,2
-chr15	19970462	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=5.014e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:11,10:12,9
-chr15	20046046	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr15	20297628	.	A	ATGTGTG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.074732;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:17,3:8,2
-chr15	20338480	.	C	T	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.034269;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:62,7:32,1:30,6
-chr15	20446348	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,2:2,2
-chr15	20447359	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.015935;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:19,6:18,1
-chr15	20514557	.	G	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,3:7,1
-chr15	20550996	.	AT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,4:12,3:9,1
-chr15	20761447	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.039629;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:10,6:10,3
-chr15	20792295	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.030143;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,1:9,7
-chr15	21109547	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
-chr15	21109799	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.019651;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:13,2:16,4
-chr15	21130291	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:17,1:7,3
-chr15	21390562	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.044826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:6,3:12,1
-chr15	21600826	.	TTC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.13742;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,4:10,1:14,3
-chr15	21611434	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.018436;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,5:2,3
-chr15	22597817	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.05944;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:17,2:13,3
-chr15	22671885	.	G	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.013095;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:10,5:5,3
-chr15	23175822	.	C	G	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.0021754;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:52,8:29,7:23,1
-chr15	23187645	.	CT	C	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.00038121;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:109,19:49,13:60,6
-chr15	23223334	.	A	C	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.01981;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:59,10:33,2:26,8
-chr15	23226593	.	C	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.081933;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:0,0:24,4
-chr15	23788490	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=8.5877e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:13,10:15,7
-chr15	24104211	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00033318;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:11,7:9,3
-chr15	24381735	.	T	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00011781;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:17,7:20,6
-chr15	24918765	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.32536;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,4:6,1:7,3
-chr15	25977620	.	TTGTG	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,7:7,4:3,3
-chr15	26037581	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.2745e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:8,5:11,8
-chr15	27997863	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0025754;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:12,6:3,6
-chr15	28313192	.	A	ATT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00039787;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,12:15,9:6,3
-chr15	28340529	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016632;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:15,5:0,1
-chr15	28488252	.	C	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.034622;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,8:29,7:18,1
-chr15	30211882	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.022897;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:24,3:13,6
-chr15	30524903	.	G	A	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.034072;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:51,14:31,6:20,8
-chr15	30747226	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=7.1199e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:17,8:8,8
-chr15	31019495	.	G	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=5.3546e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:19,6:16,5
-chr15	31704792	.	T	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.015927;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:22,9:12,5
-chr15	32737928	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.46076;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,5:8,4:7,1
-chr15	32777904	.	C	CATTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:2,2:15,2
-chr15	32994212	.	C	CCTCTCTCT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.043916;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,11:9,7:13,4
-chr15	33933524	.	CAGAGAGAGAG	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:7,7:6,4:1,3
-chr15	34424470	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.023399;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:13,4:10,6
-chr15	34685910	.	TTG	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:7,5:4,2:3,3
-chr15	35083633	.	G	GGCTTCTATCAATGTTGTCCTTA	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.079262;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,6:18,3:28,3
-chr15	35732877	.	C	CAA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00083319;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,16:14,10:7,6
-chr15	36743179	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=1.843e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:29,23:14,13:15,10
-chr15	37695262	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.012757;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,11:4,4:6,7
-chr15	38266651	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.042491;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,7:9,1:10,6
-chr15	38269024	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=9.2124e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:16,9:10,8
-chr15	40839018	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.02675;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:27,3:13,3
-chr15	43537708	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.54545;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,2:2,1:5,1
-chr15	43628891	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039873;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,3:13,1
-chr15	44540265	.	ATATT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:6,2:9,4
-chr15	44772919	.	G	GTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018778;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,10:4,8:1,2
-chr15	45070502	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.012262;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:61,8:32,5:29,3
-chr15	45082496	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0087902;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:13,1:16,9
-chr15	46625108	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=5.2105e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:39,24:23,15:16,9
-chr15	47025527	.	CAA	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0037333;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,11:14,8:3,3
-chr15	47903612	.	A	T	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=1.2618e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:41,29:19,18:22,11
-chr15	47989175	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,1:14,3
-chr15	50085959	.	ATATT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:2,4:9,3
-chr15	51353734	.	A	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.00033652;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,8:1,6:2,2
-chr15	52964525	.	GTTT	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,6:5,5:2,1
-chr15	53187110	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.6047e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,21:13,9:10,12
-chr15	53650893	.	G	GTTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,8:9,7:5,1
-chr15	55089869	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=4.6867e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:27,21:13,9:14,12
-chr15	55363799	.	C	CTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:5,3:2,1
-chr15	55627492	.	GT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0094148;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:8,9:3,1
-chr15	56103129	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:8,5:1,1
-chr15	58269300	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=4.2691e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:13,3:8,8
-chr15	58274244	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,8:4,1
-chr15	58787140	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,4:8,3
-chr15	59072450	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.017591;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:6,6:2,1
-chr15	60011899	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=8.3139e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:13,10:6,8
-chr15	61293962	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.20253;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:12,3:10,1
-chr15	61650775	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:9,3:2,4
-chr15	61856687	.	CTT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.038233;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,5:5,2
-chr15	62710720	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:1,3:7,2
-chr15	64343208	.	A	AACACACACACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:3,2:5,2
-chr15	64510205	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.046544;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,9:9,6:8,3
-chr15	65706489	.	CACACACAT	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.032215;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,9:18,5:10,4
-chr15	65831632	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.8683e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:12,9:11,4
-chr15	66993354	.	GGAAGGAAGGAAGGAAA	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.019687;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:19,9:6,3
-chr15	68050470	.	T	TATATAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,1:14,3
-chr15	68050503	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.17909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,5:8,2:11,3
-chr15	68263213	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,2:4,2
-chr15	69078432	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,6:3,5:3,1
-chr15	69993326	.	CAGAG	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.057842;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,4:11,3:1,1
-chr15	70398548	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0012942;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:14,10:11,4
-chr15	71243781	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.014712;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,6:2,2
-chr15	72003703	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.022587;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,7:7,6:6,1
-chr15	72397082	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.10033;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:25,3:6,1
-chr15	74743217	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.024827;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:17,3:4,7
-chr15	74914348	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.040005;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:19,3:13,7
-chr15	75287685	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,3:2,1
-chr15	75822868	.	A	ACACACACACACGCACG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.030957;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,5:10,2:7,3
-chr15	76466419	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:0,3:5,1
-chr15	82321103	.	G	A	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=4.3683e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:59,20:24,6:35,14
-chr15	82345109	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.029553;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:11,4:32,1
-chr15	82367236	.	C	CAT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10169;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:18,2:17,3
-chr15	82382507	.	C	CGT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02121;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,9:8,4:6,5
-chr15	84409726	.	G	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.044392;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:28,4:27,5
-chr15	85458138	.	C	CA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.017221;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,4:8,1
-chr15	85841139	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0003221;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,11:0,5:2,6
-chr15	86475330	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00014151;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:7,3:15,6
-chr15	86597882	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.0618e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:16,11:6,7
-chr15	86838941	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,5:5,3:6,2
-chr15	86940060	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
-chr15	87000260	.	G	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.026042;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
-chr15	87724250	.	C	CA	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0019458;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:14,5:13,5
-chr15	92047592	.	TA	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,2:1,1:0,1
-chr15	92511469	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=5.4759e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:9,12:14,5
-chr15	93460381	.	G	GT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.026469;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:9,5:5,2
-chr15	93790249	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=5.1342e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:16,5:15,10
-chr15	96682798	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=8.9663e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:12,12:13,8
-chr15	97626677	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0012673;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,1:3,8
-chr15	97911574	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.031275;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,9:13,4:12,5
-chr15	98437651	.	A	AATGGATGGATGG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.026907;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,1:5,7
-chr15	99153623	.	A	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=7.7259e-10;SS=2;SSC=91;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:7,12:11,7
-chr15	99602653	.	G	GGTGTGTGT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.023079;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,5:0,4:4,1
-chr15	100292452	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.1564e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,14:8,11:5,3
-chr15	100658178	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0047133;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,11:4,3:10,8
-chr15	100909498	.	C	CTTCG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:10,4:2,1
-chr15	101920402	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,2:11,2
-chr15	101961023	.	C	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
-chr16	494909	.	G	T	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.00042394;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:72,27:36,20:36,7
-chr16	900681	.	ATG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.012681;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:5,9:6,1
-chr16	3378992	.	C	CTTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:6,2:3,4
-chr16	4232516	.	AT	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.010719;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:16,4:13,3
-chr16	4998004	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.075102;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,2:12,2
-chr16	5180418	.	CA	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.044221;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:17,1:17,4
-chr16	5202775	.	T	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024176;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:5,1:3,3
-chr16	6077684	.	T	TTTTATTTATTTATTTA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.04992;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,7:13,4:14,3
-chr16	6315386	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0059873;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,6:9,2
-chr16	6637411	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,2:7,2:0,0
-chr16	6985832	.	T	TAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,8:10,7:10,1
-chr16	7165410	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.20253;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:14,3:8,1
-chr16	7567242	.	C	CCTAT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.030984;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,5:9,2:9,3
-chr16	8056147	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=1.308e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:29,20:13,7:16,13
-chr16	8111775	.	TATATATAC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,3:7,2
-chr16	9028587	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00080108;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:3,9:8,5
-chr16	9264919	.	T	TATATA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:2,2:4,3
-chr16	9744591	.	AT	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=6.589e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,5:10,6
-chr16	9894592	.	ATGGAC	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.060567;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:13,1:18,3
-chr16	10372566	.	A	ATCTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:0,0:7,4
-chr16	10730016	.	T	TAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.077477;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:5,4:3,2
-chr16	11251294	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=5.9061e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:33,18:18,10:15,8
-chr16	11515850	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:0,3:9,1
-chr16	11637880	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.021584;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
-chr16	12063366	.	CTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0059497;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:5,7:2,1
-chr16	13052959	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049808;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:5,2:6,2
-chr16	13469407	.	AAG	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.046654;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,5:20,2:4,3
-chr16	14766859	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.012947;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,2:6,3
-chr16	15114927	.	AT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.029887;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,12:10,7:9,5
-chr16	15292837	.	A	ATATTAT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.042577;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:16,1:14,4
-chr16	15379440	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0036034;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:13,8:17,10
-chr16	16156942	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:6,10:4,9:2,1
-chr16	16427345	.	C	G	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.022435;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:51,17:26,8:25,9
-chr16	16439040	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.064595;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:8,3:11,2
-chr16	16629946	.	CTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.20218;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,3:9,1
-chr16	16808114	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.048922;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,5:17,3:3,2
-chr16	16836537	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0058774;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:3,6:9,5
-chr16	17536361	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.5551e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:31,16:15,10:16,6
-chr16	18075713	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.053645;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:11,3:19,1
-chr16	18201427	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.050895;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:12,1:19,3
-chr16	18528014	.	T	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.022438;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:12,5:15,2
-chr16	18963503	.	G	GTA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.16992;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:28,2:9,3
-chr16	19141438	.	A	ATATATATATATATTTTTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.024869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:7,3:6,2
-chr16	19438407	.	AAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.010948;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:3,7:9,4
-chr16	19623817	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:3,3:4,1
-chr16	22534576	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10365;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:10,3:8,2
-chr16	22562538	.	G	A	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.0039917;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:46,18:18,6:28,12
-chr16	22584112	.	AAGAG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.024122;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,6:15,3:6,3
-chr16	22868405	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031408;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
-chr16	23257175	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:8,4:6,2:2,2
-chr16	23783168	.	AT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:12,3:6,1
-chr16	24168715	.	TA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021576;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:10,4:5,5
-chr16	24237363	.	C	CTTTCT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0031469;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,7:0,4:2,3
-chr16	24380998	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,8:3,7:2,1
-chr16	25756154	.	GCACA	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:4,5:3,3:1,2
-chr16	28866800	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0002546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:14,6:17,6
-chr16	29053135	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.064743;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:1,0:23,4
-chr16	29254389	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00014241;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,6:10,4
-chr16	29713576	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:13,3:1,1
-chr16	29961904	.	T	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=2.5409e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:34,18:24,10:10,8
-chr16	30032642	.	GT	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.028437;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,9:14,5:8,4
-chr16	30169000	.	T	TG	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.018965;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:18,4:17,2
-chr16	30250297	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,3:10,1
-chr16	30297471	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0033983;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,9:5,7:4,2
-chr16	31959233	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.034474;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:22,4:29,2
-chr16	32014442	.	T	TA	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0001118;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,10:9,3:12,7
-chr16	32071960	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.011057;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,1:10,4
-chr16	32082635	.	G	A	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.012801;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:62,11:52,10:10,1
-chr16	32094230	.	C	T	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.032481;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:86,12:51,3:35,9
-chr16	32154617	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.046104;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:16,3:12,6
-chr16	32293572	.	TTTTTTA	T	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.026445;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:54,9:24,4:30,5
-chr16	32298678	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.025505;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:6,4:15,4
-chr16	32805762	.	TCTTTC	T	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.012815;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:55,17:27,4:28,13
-chr16	32838152	.	G	T	0	PASS	DP=561;GPV=1;SPV=0.036478;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:281:245,36:96,14:149,22
-chr16	32839423	.	T	C	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.048544;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:95,17:34,7:61,10
-chr16	32840065	.	G	A	0	PASS	DP=504;GPV=1;SPV=0.0021163;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:269:222,47:111,28:111,19
-chr16	33021244	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.012566;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:19,7:20,3
-chr16	33029848	.	A	C	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.014739;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:53,17:31,6:22,11
-chr16	33035433	.	T	A	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.023528;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:109,21:71,14:38,7
-chr16	33040372	.	T	G	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.045845;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:74,17:30,6:44,11
-chr16	33042087	.	T	C	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.035068;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:67,19:40,13:27,6
-chr16	33602215	.	C	CTAG	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.034984;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:94,21:55,17:39,4
-chr16	33718663	.	CAAT	C	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.013983;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:59,18:34,7:25,11
-chr16	34133309	.	G	GA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0018044;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:15,9:2,3
-chr16	34575351	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,5:3,3
-chr16	34790316	.	A	T	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.011042;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:58,9:30,6:28,3
-chr16	35307190	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=1.2853e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:29,24:13,16:16,8
-chr16	35619905	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=4.8556e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:15,7:10,11
-chr16	36094020	.	C	A	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.01117;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:68,14:27,5:41,9
-chr16	36098635	.	C	T	0	PASS	DP=413;GPV=1;SPV=0.04071;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:210:180,30:106,19:74,11
-chr16	36382885	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:13,6:1,1
-chr16	36470976	.	T	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:20,4:0,0
-chr16	37816259	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,2:2,2
-chr16	47538848	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=5.1236e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:27,23:9,9:18,14
-chr16	50126791	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.4085e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:15,10:8,6
-chr16	51301860	.	G	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=5.7568e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:11,8:17,7
-chr16	52536627	.	C	CTA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:1,3:3,1
-chr16	52700844	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=4.2987e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:10,8:12,7
-chr16	52837994	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=5.286e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:11,13:13,6
-chr16	52929139	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=2.443e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:6,11:8,8
-chr16	53017812	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,4:15,1:6,3
-chr16	54127403	.	GGTT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,10:7,8:0,2
-chr16	54681096	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034636;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:14,2:6,3
-chr16	55721867	.	GT	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.041747;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:20,7:17,3
-chr16	56568213	.	GAGAAAGAAAGAAAGAA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,7:7,6:3,1
-chr16	56740769	.	G	A	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.0026422;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:69,23:39,8:30,15
-chr16	57230005	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.025641;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,2:2,2
-chr16	57832990	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=7.7207e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:9,6:17,10
-chr16	58817716	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:7,2:4,2
-chr16	59697172	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.015836;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,3:11,5
-chr16	60296883	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,4:5,3:7,1
-chr16	60739479	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0037019;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,15:15,8:17,7
-chr16	61460072	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0126;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:22,4:19,3
-chr16	61760283	.	T	TTTTA	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0073467;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,18:25,10:10,8
-chr16	63658223	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:9,4:7,1
-chr16	64432980	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,6:6,5:2,1
-chr16	64520362	.	GT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.016106;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,3:5,2
-chr16	65283797	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,4:13,3:6,1
-chr16	65576409	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=5.225e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,23:12,16:11,7
-chr16	65690709	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.042336;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:11,2:11,3
-chr16	68020873	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,3:7,3
-chr16	68201820	.	CGATGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGGCATAGGAGA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:13,3:7,1
-chr16	68283590	.	AAG	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.02764;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:19,1:19,4
-chr16	68745593	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.12189;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,2:8,3
-chr16	69738629	.	GT	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.020833;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:15,8:12,3:3,5
-chr16	70853896	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.045291;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:16,2:10,6
-chr16	71030715	.	G	C	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.0025201;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:48,18:27,7:21,11
-chr16	71048938	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.026582;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:17,7:16,3
-chr16	71061490	.	G	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.041014;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:50,12:29,6:21,6
-chr16	71124265	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=4.4803e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:11,11:11,8
-chr16	71286445	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:16,5:11,3:5,2
-chr16	71380292	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.025058;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,6:1,5:0,1
-chr16	71768500	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10482;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,6:6,4:6,2
-chr16	72009509	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:2,4:7,1
-chr16	73447373	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.01971;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:25,1:17,5
-chr16	73826292	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.015276;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:11,6:12,1
-chr16	74084559	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0014624;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:9,3:28,7
-chr16	74181019	.	GAA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:19,2:4,2
-chr16	74181028	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10123;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:20,2:6,2
-chr16	74358404	.	CA	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.039873;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:17,1:8,3
-chr16	74408435	.	C	T	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.023961;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:64,14:37,6:27,8
-chr16	74412400	.	G	T	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.0014102;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:106,33:48,15:58,18
-chr16	74425829	.	TA	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.025351;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,13:20,3:18,10
-chr16	75137461	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,9:3,8:1,1
-chr16	75929766	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.068336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,5:13,4:8,1
-chr16	76916277	.	GTGTA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.17135;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,1:8,4
-chr16	76929939	.	A	ATT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0013175;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:2,15:2,8:0,7
-chr16	77349524	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011322;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,4:6,5
-chr16	78490133	.	A	AT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.084652;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:22,2:13,2
-chr16	78723554	.	CTTCTT	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0061323;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,9:6,5:22,4
-chr16	80089327	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.014502;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,3:4,5
-chr16	82594630	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.7747e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:10,8:15,11
-chr16	82761021	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0012781;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:4,11:4,2
-chr16	82931506	.	T	TC	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0010847;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,12:18,8:11,4
-chr16	83132455	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:0,0:2,4
-chr16	83400122	.	G	GT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=9.4663e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:10,7:13,4
-chr16	83564413	.	TTTG	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.091638;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:12,1:21,3
-chr16	84536779	.	T	TTTTTTTTTTTG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,11:1,3:7,8
-chr16	87038636	.	GGGAGGGAGGGAGGGAAGGAA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
-chr16	88236683	.	A	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.038032;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:49,6:28,1:21,5
-chr16	88501640	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.021613;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:16,1:14,4
-chr16	89325473	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.063124;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:13,4:22,1
-chr16	90180905	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:4,3:7,7
-chr17	307247	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:4,2:2,1
-chr17	672109	.	G	GACACACACAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01623;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,9:4,7:2,2
-chr17	768795	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.044477;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:11,3:1,1
-chr17	963214	.	G	GAC	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.5053e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:13,7:11,6
-chr17	1427030	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,4:8,3:5,1
-chr17	1775825	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=1.8106e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:13,8:10,14
-chr17	2623261	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035742;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,4:9,4
-chr17	3031324	.	G	GT	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.001535;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:52,18:22,6:30,12
-chr17	3061221	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025708;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:5,4:6,1
-chr17	4027594	.	C	CTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,3:11,1
-chr17	4280336	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:8,3:3,1
-chr17	4414140	.	AATGTGT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:10,3:8,7
-chr17	4567821	.	CTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,9:1,4:2,5
-chr17	4667996	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.015695;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:18,6:16,5
-chr17	5910630	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:6,5:6,1
-chr17	6015119	.	TA	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.18206;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:19,4:15,1
-chr17	6516563	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.011374;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,10:4,7:1,3
-chr17	6987008	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,4:3,1
-chr17	7302655	.	T	TG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024337;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,9:12,8:0,1
-chr17	7609931	.	T	TATAC	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.075568;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:22,2:13,2
-chr17	8585286	.	G	GTATATATATATATATATA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,1:4,3
-chr17	8685358	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.032869;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,3:0,1
-chr17	10428686	.	C	CA	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=3.9497e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,13:15,5:13,8
-chr17	10432289	.	C	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=2.0936e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,16:15,9:18,7
-chr17	11277284	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:5,5:1,3:4,2
-chr17	11459218	.	CA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0042808;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:11,13:6,2
-chr17	11954769	.	T	TA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.085668;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:15,2:12,2
-chr17	12351263	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,2:4,1:3,1
-chr17	12410555	.	GT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010837;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,4:4,1
-chr17	12828028	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.037417;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,6:6,5:4,1
-chr17	13045725	.	GA	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00055029;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:16,6:15,5
-chr17	13396788	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=6.7231e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:5,8:14,5
-chr17	14186986	.	T	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:4,3:2,2:2,1
-chr17	15585912	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.041058;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:20,2:16,2
-chr17	15730704	.	T	TGTGCGCGC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.052652;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,6:11,5:14,1
-chr17	17375416	.	T	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=2.0418e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:9,8:12,9
-chr17	17386164	.	A	AGAGAGAGAG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.085668;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:11,2:16,2
-chr17	18305475	.	A	AACACACATAC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0023163;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,17:8,10:11,7
-chr17	19820053	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.082705;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,5:16,2:12,3
-chr17	20470600	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.014154;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,3:6,5
-chr17	20555213	.	T	C	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.019395;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:24,2:22,8
-chr17	20608791	.	C	CTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.034267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:10,2:9,8
-chr17	21056611	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.058259;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:11,2:20,3
-chr17	21344228	.	C	T	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.029956;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:51,15:26,12:25,3
-chr17	21410094	.	G	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.016322;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:21,3:23,2
-chr17	21512963	.	GCTGTCCCTGGCCTAGGGCGCTCCTCCCCAAATTTTCCAAGGCTTCTTTTGGCTGCCAGGGAT	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.045726;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:11,5:14,2
-chr17	21582606	.	T	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.053387;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:16,1:13,3
-chr17	21682302	.	C	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0059749;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:23,5:25,2
-chr17	21730180	.	C	CTTT	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.035679;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:14,3:20,9
-chr17	21839938	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.035224;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:27,2:18,4
-chr17	22133455	.	A	C	0	PASS	DP=276;GPV=1;SPV=0.038188;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:133,17:67,7:66,10
-chr17	22834926	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.065116;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,1:13,3
-chr17	22839887	.	G	C	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.044058;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:82,17:37,7:45,10
-chr17	22869952	.	A	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.017284;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:23,3:17,3
-chr17	22881965	.	G	C	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.011784;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:61,11:45,4:16,7
-chr17	22919047	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:15,4:1,0
-chr17	22948887	.	C	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
-chr17	22957215	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.045335;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:11,4:17,5
-chr17	23070454	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:1,3:6,2
-chr17	23090370	.	C	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:0,0:12,4
-chr17	26625487	.	A	G	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.017973;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:72,9:33,2:39,7
-chr17	26742703	.	T	C	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.0038604;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:85,15:41,10:44,5
-chr17	26752099	.	A	G	0	PASS	DP=326;GPV=1;SPV=0.044761;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:186:159,27:34,7:125,20
-chr17	26777277	.	A	G	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.036831;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:64,9:30,3:34,6
-chr17	26777345	.	GT	G	0	PASS	DP=208;GPV=1;SPV=0.030216;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:86,16:42,5:44,11
-chr17	26777377	.	G	A	0	PASS	DP=243;GPV=1;SPV=0.031422;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:102,21:44,8:58,13
-chr17	27001136	.	C	CCTT	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.03904;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:41,11:22,5:19,6
-chr17	27055172	.	CA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.025784;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,7:14,6:4,1
-chr17	29380622	.	A	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:4,3:0,2:4,1
-chr17	30980186	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
-chr17	31563409	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.004644;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,1:3,6
-chr17	32094600	.	GA	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.082705;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:19,3:9,2
-chr17	32697643	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:44:0,3:0,1:0,2
-chr17	34508057	.	AGAGAGAGAAAGGAAAG	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.12341;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:27,3:4,1
-chr17	36714264	.	C	CTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.19543;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,6:13,3:6,3
-chr17	37100630	.	C	CA	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.001025;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,10:17,9:9,1
-chr17	37902894	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
-chr17	39025970	.	AG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:15,2:8,2
-chr17	39802221	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,3:6,1
-chr17	39842058	.	AAC	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,9:3,5:8,4
-chr17	39885207	.	G	GT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0074853;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,11:15,5:5,6
-chr17	42438009	.	T	TG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0025185;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:6,7:4,5
-chr17	43696346	.	TC	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=4.7646e-09;SS=2;SSC=83;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:30,29:21,13:9,16
-chr17	45218112	.	TTGTTTTTG	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.020557;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,2:6,4
-chr17	45598064	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,6:8,5:5,1
-chr17	45612517	.	CTTT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.012526;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,8:10,7:9,1
-chr17	46230687	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.027339;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:11,7:11,5
-chr17	46257213	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.033172;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:58,9:28,4:30,5
-chr17	46259199	.	CAACA	C	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.018868;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:51,15:40,6:11,9
-chr17	46688854	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0096894;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:6,5:1,1
-chr17	47000062	.	AT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.019067;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,6:8,4:10,2
-chr17	47169645	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.035086;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:12,2:10,4
-chr17	47751895	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=4.6734e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:24,23:13,9:11,14
-chr17	47889622	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,7:6,1
-chr17	49083686	.	T	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00077962;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,9:8,5:7,4
-chr17	49154021	.	T	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0024191;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:17,7:18,2
-chr17	49635632	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0012607;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,9:6,8:3,1
-chr17	50108261	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.00025621;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:17,6:20,5
-chr17	51010568	.	GA	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.01018;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,11:7,9:11,2
-chr17	51983874	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.6283e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:11,8:10,9
-chr17	52079849	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=2.2039e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,22:18,10:10,12
-chr17	52307276	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=3.7879e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:14,12:11,9
-chr17	52941175	.	T	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=1.3599e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:33,19:17,10:16,9
-chr17	53736331	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.002624;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:17,6:14,2
-chr17	57062212	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.034267;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:2,3:17,7
-chr17	57884192	.	CTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,5:2,2
-chr17	58502158	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:7,4:6,3:1,1
-chr17	59999606	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.037566;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:7,2:11,6
-chr17	62021134	.	C	A	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.018274;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:53,8:34,3:19,5
-chr17	62316628	.	C	CAAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.03735;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:5,5:7,1
-chr17	62457987	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.027098;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:16,6:22,1
-chr17	64048951	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=8.6716e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:14,5:15,9
-chr17	64888377	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.039749;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:17,3:16,9
-chr17	64916942	.	CAA	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:26,8:6,3
-chr17	65346040	.	CA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.008934;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,7:16,2:3,5
-chr17	65639836	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,4:5,1
-chr17	67300355	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.075976;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:28,2:15,3
-chr17	67300610	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=8.6693e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,19:9,10:12,9
-chr17	69177955	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:5,3:2,1
-chr17	69361949	.	CCCTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:1,3:7,2
-chr17	69422124	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.023277;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:12,6:1,3
-chr17	69562661	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,6:1,5:2,1
-chr17	69622108	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=7.0937e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:26,24:15,14:11,10
-chr17	70408174	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.021074;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:45,7:19,1:26,6
-chr17	70858401	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.12392;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,4:24,3:10,1
-chr17	71150579	.	C	CT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.008646;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,8:7,6:6,2
-chr17	71338884	.	C	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0094041;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,2:8,3
-chr17	71338888	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020689;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:5,2:10,3
-chr17	71338895	.	T	TC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0091605;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,2:9,4
-chr17	71365860	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,7:4,4:6,3
-chr17	71584822	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.012101;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:4,4:10,8
-chr17	71720755	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0084993;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:18,4:23,4
-chr17	73296419	.	A	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,2:3,1:4,1
-chr17	73635627	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00274;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:16,3:18,6
-chr17	73749472	.	TGAA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.047242;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:13,4:12,4
-chr17	74600273	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.013139;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,5:15,1:6,4
-chr17	74733466	.	GGA	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,4:5,3
-chr17	74818759	.	G	T	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=4.7009e-10;SS=2;SSC=93;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:37,32:18,15:19,17
-chr17	75269548	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:9,2:4,2
-chr17	75674711	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.069378;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,2:13,2
-chr17	75687919	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.2874e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,22:7,12:11,10
-chr17	76388585	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:1,1:7,4
-chr17	77238107	.	G	GTT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00041739;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:16,12:7,4
-chr17	77334421	.	CA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:9,7:13,3
-chr17	77376672	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.016064;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:26,4:20,2
-chr17	78551146	.	C	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=7.2955e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,16:15,11:18,5
-chr17	79746195	.	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,6:4,5:6,1
-chr17	80024394	.	GAC	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.04045;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:16,3:23,3
-chr17	80889970	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0077803;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:3,4:5,5
-chr17	81425680	.	G	GGTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:8,2:7,2
-chr17	82905817	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.036355;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:24,5:12,2
-chr17	82958958	.	GT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.075059;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,6:8,1:9,5
-chr18	83504	.	G	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.049419;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:23,5:18,1
-chr18	83870	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.02166;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:40,9:24,3:16,6
-chr18	1377693	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.074732;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,4:14,1
-chr18	1962813	.	A	ATAC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,2:5,7
-chr18	2596677	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.9778e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:34,24:16,11:18,13
-chr18	3461843	.	A	ATTTTTTTTT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.031844;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:8,3:12,6
-chr18	3680788	.	C	CAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.012955;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,11:10,9:7,2
-chr18	4004943	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.046334;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,6:12,1:13,5
-chr18	4548656	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0017478;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:16,7:17,3
-chr18	4869281	.	A	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=3.542e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:13,8:10,7
-chr18	6090790	.	A	ATT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.010994;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:10,3:5,7
-chr18	6634495	.	A	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.3115e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:18,9:7,10
-chr18	7297782	.	GTTGAACAGCC	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=3.6769e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:17,10:14,4
-chr18	7446124	.	A	ATTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.01473;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,9:5,6:6,3
-chr18	7960482	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.033247;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,5:6,1:5,4
-chr18	8875363	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:3,1:9,4
-chr18	9369140	.	TA	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:5,4:0,2:5,2
-chr18	9645519	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.7753e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:14,7:6,9
-chr18	10567305	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,1:2,3
-chr18	10607078	.	T	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.0057987;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:30,4:16,6
-chr18	10995082	.	A	AAAAAAAAAAGAAAG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.023702;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,9:9,6:8,3
-chr18	11018382	.	CGTGT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0075692;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,8:10,7:1,1
-chr18	12270894	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,4:5,3:3,1
-chr18	12788432	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:3,4:3,2
-chr18	13046829	.	C	CT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0041493;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,11:6,5:8,6
-chr18	14674558	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.027169;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:16,4:17,1
-chr18	15393853	.	TA	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0382;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:15,2:15,5
-chr18	15405554	.	C	T	0	PASS	DP=289;GPV=1;SPV=0.0068706;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:133,16:46,5:87,11
-chr18	15407537	.	C	G	0	PASS	DP=640;GPV=1;SPV=0.0073785;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:347:299,48:143,22:156,26
-chr18	15407609	.	T	C	0	PASS	DP=598;GPV=1;SPV=0.023319;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:310:266,44:134,18:132,26
-chr18	15476491	.	T	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.017632;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:4,1:30,7
-chr18	15482160	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,4:7,1
-chr18	15490420	.	G	A	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.0062772;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:53,6:20,4:33,2
-chr18	15492464	.	T	C	0	PASS	DP=210;GPV=1;SPV=0.0048146;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:101,14:47,7:54,7
-chr18	15499116	.	G	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.023519;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:46,15:40,13:6,2
-chr18	15516659	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:3,2:13,2
-chr18	15528075	.	G	C	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.030672;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:96,18:28,6:68,12
-chr18	15529602	.	TC	T	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.012138;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:67,16:19,7:48,9
-chr18	15584624	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.11411;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:7,4:25,1
-chr18	15590084	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027592;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,4:11,2
-chr18	15595349	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:2,3:7,2
-chr18	15601574	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.049775;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:10,5:18,6
-chr18	15647625	.	C	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
-chr18	15659226	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.054264;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,2:8,2
-chr18	15659867	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.019899;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,4:7,2
-chr18	15689453	.	GC	G	0	PASS	DP=282;GPV=1;SPV=0.016853;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:140,16:35,12:105,4
-chr18	15707448	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
-chr18	15731936	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:0,4:16,1
-chr18	15761508	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.1174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:28,4:2,0
-chr18	16047156	.	C	G	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.025835;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:55,13:35,9:20,4
-chr18	16855255	.	T	C	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.033504;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:74,14:31,2:43,12
-chr18	17261111	.	G	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
-chr18	17415801	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.030376;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:14,5:22,7
-chr18	17638914	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,3:4,1
-chr18	18127189	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.031062;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,1:12,4
-chr18	18558206	.	C	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
-chr18	18582541	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023562;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:12,4:3,1
-chr18	19054139	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01971;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:3,4:7,4
-chr18	19293697	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.058162;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:11,3:2,1
-chr18	19375972	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.047106;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:2,1:20,6
-chr18	20343782	.	T	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:4,2:12,2
-chr18	20759837	.	G	T	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.03415;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:64,9:25,8:39,1
-chr18	22010504	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:4,8:1,3:3,5
-chr18	22964628	.	AAT	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.054119;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,3:14,1
-chr18	25487439	.	A	AAAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02037;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:6,4:3,1
-chr18	30817403	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.001488;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:19,7:21,4
-chr18	31353073	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.026101;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:19,4:23,2
-chr18	32662915	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.9826e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:25,17:12,4:13,13
-chr18	34046607	.	C	CATATATAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:6,3:0,1
-chr18	34436623	.	CTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:4,3:8,1
-chr18	34549507	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0001464;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:16,8:11,6
-chr18	35825421	.	TTA	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.042775;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:13,4:11,2
-chr18	35830911	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.068133;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:26,2:9,3
-chr18	36720699	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.12189;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:20,5:9,4:11,1
-chr18	37052182	.	C	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00017146;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:38,17:18,9:20,8
-chr18	38726232	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.047035;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,2:4,2
-chr18	40562185	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=4.965e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:10,7:8,5
-chr18	41653016	.	C	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.002256;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:16,6:19,2
-chr18	43115119	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00032813;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:11,5:17,5
-chr18	43242078	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=5.4752e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:8,4:12,9
-chr18	48043953	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00064879;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:17,8:15,6
-chr18	49292351	.	GACAGACAC	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.020482;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,6:14,4:10,2
-chr18	49454907	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0079921;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:8,9:5,2
-chr18	50250236	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.073628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:14,3:21,2
-chr18	52318204	.	C	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=6.642e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:28,24:11,14:17,10
-chr18	52330027	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=1.0254e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:35,23:20,10:15,13
-chr18	52765199	.	A	ATTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030925;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,1:8,4
-chr18	52984585	.	T	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.267e-10;SS=2;SSC=98;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:17,22:5,8:12,14
-chr18	53663093	.	C	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.02021;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,2:14,2
-chr18	55511329	.	T	TAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.036566;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,6:13,5:4,1
-chr18	55866048	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=8.8861e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:8,10:15,4
-chr18	56379548	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,9:1,8:3,1
-chr18	60265967	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:2,3:6,1
-chr18	60756331	.	AGG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0012994;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:5,6:10,2
-chr18	60756348	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040169;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:4,3:13,1
-chr18	61780003	.	A	ACACC	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,3:0,1:2,2
-chr18	61971779	.	A	ATT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.046785;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:11,5:11,4
-chr18	62951812	.	AT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.044481;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:9,7:13,3
-chr18	62993737	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0046122;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:18,8:9,7
-chr18	63050845	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:9,4:8,2:1,2
-chr18	63758467	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.8955e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,22:13,9:9,13
-chr18	64955064	.	T	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=1.4977e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:33,20:16,7:17,13
-chr18	65277414	.	C	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.020648;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:14,2:18,3
-chr18	65782057	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:1,1:5,1
-chr18	65829775	.	A	AGTGTGT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,8:8,6:4,2
-chr18	66019160	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.075568;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:14,1:21,3
-chr18	66111606	.	AG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0098105;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:5,1:2,4
-chr18	66476437	.	G	GTTTTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.018307;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,6:3,4:2,2
-chr18	67746907	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0017074;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,5:6,2
-chr18	67773429	.	TA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:3,1:10,3
-chr18	70211408	.	A	ATAAAAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.019439;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,6:12,3:4,3
-chr18	70211419	.	AC	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.041527;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:19,4:3,2
-chr18	70211425	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.016051;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:15,5:2,3
-chr18	71425609	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00079179;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,3:11,5
-chr18	73245252	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.043835;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:14,1:8,3
-chr18	74229041	.	CAA	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0096376;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:15,11:10,5
-chr18	74276528	.	G	GCACA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0090069;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,9:11,6:2,3
-chr18	74616946	.	ACCACACG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.06407;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,2:15,3
-chr18	75406241	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=3.9474e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:31,16:8,10:23,6
-chr18	76764892	.	GT	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
-chr18	79340984	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.034849;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:9,1:22,3
-chr18	79479582	.	G	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=3.6015e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:40,20:19,8:21,12
-chr18	79687173	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,2:7,2
-chr18	79807965	.	G	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:0,1:11,3
-chr19	236375	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0076814;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:13,6:8,1
-chr19	351062	.	T	TAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.26815;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:8,2:10,1
-chr19	718514	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00102;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:17,4:19,5
-chr19	735177	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
-chr19	1780973	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.041183;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:13,3:7,5
-chr19	2349302	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,1:9,3
-chr19	2707883	.	A	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.2804e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,20:12,13:6,7
-chr19	3078048	.	GAAGA	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:19,2:7,2
-chr19	3078056	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12656;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:22,2:11,2
-chr19	3815759	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0004679;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:9,9:12,6
-chr19	3885109	.	T	TAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,5:12,4:5,1
-chr19	3977414	.	C	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.0055282;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:29,3:17,4
-chr19	4737346	.	A	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,2:0,0:4,2
-chr19	5409321	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.012883;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:13,6:9,5
-chr19	5477430	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,3:5,1:0,2
-chr19	5982652	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15091;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,4:8,1
-chr19	7061145	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.049275;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,5:6,1
-chr19	7599423	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
-chr19	8326631	.	C	CAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0028145;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:4,12:1,9:3,3
-chr19	8510286	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.017591;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,7:5,5:3,2
-chr19	8768742	.	G	A	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.028342;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:73,12:54,8:19,4
-chr19	8774970	.	G	C	0	PASS	DP=298;GPV=1;SPV=0.015225;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:137,20:60,12:77,8
-chr19	8890533	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.015262;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:16,4:18,3
-chr19	8969621	.	GAA	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.012947;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:18,4:0,1
-chr19	10028368	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.049793;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,8:12,4:6,4
-chr19	10262018	.	G	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.00094537;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:42,12:25,8:17,4
-chr19	10577423	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,6:5,3:7,3
-chr19	10665615	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.023332;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,12:9,4:15,8
-chr19	11587555	.	GGA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.036089;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:6,4:1,1
-chr19	12308693	.	A	AATAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,6:8,3:2,3
-chr19	12402416	.	C	CTT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045087;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,10:20,9:4,1
-chr19	12981782	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:10,3:7,1
-chr19	14762629	.	AT	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.020491;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:18,5:10,6
-chr19	15533591	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0035559;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,10:4,9:4,1
-chr19	15688367	.	CA	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00058715;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:19,7:12,5
-chr19	15834007	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.000105;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:20,5:13,7
-chr19	16063511	.	GGAAAGAAA	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:5,2:0,0
-chr19	16295080	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.018518;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:11,8:4,1
-chr19	16790643	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.033332;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:13,5:17,2
-chr19	17607489	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:6,7:0,1
-chr19	17656852	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014079;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,8:6,5:4,3
-chr19	18885523	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.13907;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:17,3:9,2
-chr19	20008074	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.019259;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:47,6:21,5:26,1
-chr19	20063524	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.004958;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,4:3,3
-chr19	20342244	.	CA	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.077856;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,2:15,2
-chr19	21074205	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0035182;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:14,8:11,2
-chr19	21112816	.	A	AT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,3:1,2
-chr19	22396955	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=6.7474e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,18:12,6:14,12
-chr19	22414244	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.42424;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,2:5,1:1,1
-chr19	22984571	.	AAAAAATAC	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020382;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:14,4:9,3
-chr19	23373346	.	TTA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,4:6,4
-chr19	23373387	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.14404;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,5:6,1:8,4
-chr19	23472408	.	TTA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.02409;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:12,4:13,3
-chr19	25143274	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.065489;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:17,4:0,0
-chr19	26158860	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
-chr19	27498371	.	T	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.2351e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:30,24:17,9:13,15
-chr19	27860475	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.4339e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:20,21:11,10:9,11
-chr19	30808091	.	CT	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0011108;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,9:2,6:4,3
-chr19	31893176	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0083484;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:15,10:2,2
-chr19	32902046	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:3,2:16,2
-chr19	33223309	.	GAAA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.033617;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,7:11,6:6,1
-chr19	34201113	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.5018e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:9,6:11,9
-chr19	34658808	.	AACAAC	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.057027;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:15,5:11,1
-chr19	35105578	.	CCACCATCACCATCATCAT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.021894;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:9,5:12,6
-chr19	36163532	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021189;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,9:10,8:4,1
-chr19	36501143	.	GTT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,3:8,1
-chr19	36786266	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,5:3,2
-chr19	37273558	.	A	G	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.022957;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:81,11:36,5:45,6
-chr19	37278500	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.20188;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:26,4:0,0
-chr19	37730225	.	AT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0032919;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:13,7:7,2
-chr19	37900560	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.033617;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,6:5,1
-chr19	38673657	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:26:0,4:0,1:0,3
-chr19	39098275	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,6:4,1
-chr19	39430213	.	C	CTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10134;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,6:8,4:8,2
-chr19	40164027	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,2:10,2
-chr19	40287856	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,5:5,1
-chr19	40885953	.	G	GT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0037259;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:5,7:9,7
-chr19	41188848	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.048951;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:2,3:1,1
-chr19	41723946	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.012459;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:17,8:5,2
-chr19	41880481	.	G	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,7:5,1
-chr19	42087595	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,4:0,0:8,4
-chr19	42199199	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.00047993;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:20,7:23,4
-chr19	43985541	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.001936;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:34,15:28,4:6,11
-chr19	44688183	.	C	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.011495;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:23,7:10,1:13,6
-chr19	44721406	.	G	GA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:5,4:2,1
-chr19	44946191	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0063756;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,8:4,7:11,1
-chr19	46562814	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=2.7228e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:31,22:18,12:13,10
-chr19	46863942	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00054148;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:16,6:17,4
-chr19	47064721	.	T	TA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0025984;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:7,5:11,8
-chr19	47300513	.	T	TTC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026014;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:4,1:11,3
-chr19	47707784	.	CA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00025886;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,16:6,13:4,3
-chr19	47840703	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,2:6,5
-chr19	47841571	.	A	AT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15365;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,2:11,2
-chr19	47953157	.	A	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.043478;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:15,4:15,6
-chr19	48153773	.	C	CACACACACACTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013014;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,7:3,1:7,6
-chr19	48521892	.	G	GTCTCTCTC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:1,2:14,2
-chr19	48648203	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:11,9:4,2
-chr19	48664051	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=2.4081e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:25,26:15,17:10,9
-chr19	48710414	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015942;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:8,4:0,1
-chr19	50452504	.	G	GTATCTATC	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.031844;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,9:9,6:11,3
-chr19	50967511	.	C	CCACACACACACA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.064666;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,4:15,3:10,1
-chr19	52090654	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0020828;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,10:7,5:2,5
-chr19	52376496	.	GCC	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:1,3:0,0:1,3
-chr19	53423658	.	T	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,2:0,2
-chr19	53809517	.	C	CAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,9:8,8:5,1
-chr19	54825943	.	T	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.011999;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:19,3:27,4
-chr19	54926205	.	G	GGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0025413;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,10:10,5:5,5
-chr19	55472169	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.047937;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:6,1:12,9
-chr19	56067747	.	T	TAAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.020191;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:6,8:10,2
-chr19	57110398	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.02531;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:12,3:9,2
-chr19	57330913	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.019426;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:8,3:8,4
-chr19	57690459	.	GTATA	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.046608;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,7:11,2:12,5
-chr19	58241180	.	T	TATA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.054264;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:8,2:11,2
-chr19	58427387	.	TTTCTTTCTTTCTTTCTTTCC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:1,3:9,6
-chr2	932430	.	CCT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.059432;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:14,1:5,3
-chr2	932433	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.038102;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:17,2:5,3
-chr2	1975247	.	T	TGCCAGATCCCACCGCCAGATCCCACC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0079397;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:11,6:7,3
-chr2	2122837	.	A	ATG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.020413;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,7:13,5:6,2
-chr2	2236812	.	TTC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:1,3:0,2:1,1
-chr2	3057938	.	G	GGTA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11486;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:16,3:13,2:3,1
-chr2	5032952	.	A	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:4,3:2,2:2,1
-chr2	5158655	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00011485;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:16,5:11,6
-chr2	6157462	.	CT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.021836;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:13,2:12,5
-chr2	6169264	.	TTC	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.18558;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:11,1:19,3
-chr2	6376099	.	C	CTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,4:5,2:2,2
-chr2	7170701	.	CCTCT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0094549;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:7,6:4,1
-chr2	7189371	.	GAA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:6,3:11,1
-chr2	7240623	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,2:9,2
-chr2	7240625	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.19804;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:8,2:10,3
-chr2	7924897	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=6.2097e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,23:15,15:8,8
-chr2	8620963	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.022211;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,11:13,5:13,6
-chr2	9125436	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:5,3:6,2
-chr2	10916609	.	AT	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=5.7203e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:14,8:15,5
-chr2	11035152	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0052761;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:7,8:4,2
-chr2	11090929	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,3:9,1
-chr2	13841761	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.2056e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:10,10:17,3
-chr2	15098024	.	AAT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:2,3:3,5
-chr2	15648603	.	GA	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0088769;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:10,8:2,1
-chr2	16787052	.	C	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.5724e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,20:18,7:9,13
-chr2	16787478	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.218e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:12,7:14,9
-chr2	17129427	.	T	TAAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,9:1,6:3,3
-chr2	17477942	.	A	AAAG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.058687;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,2:5,2
-chr2	22238326	.	TTATATA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,7:2,5:5,2
-chr2	22415345	.	G	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=4.619e-10;SS=2;SSC=93;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:25,24:18,15:7,9
-chr2	22654476	.	G	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=4.3081e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:38,20:16,8:22,12
-chr2	22918431	.	T	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.6127e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:15,7:16,8
-chr2	23074655	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0001575;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:16,5:16,6
-chr2	23203690	.	CAA	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,4:15,2:4,2
-chr2	23711346	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,3:3,1:0,2
-chr2	23839131	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.3992e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:18,7:9,10
-chr2	24331068	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:4,4:9,2
-chr2	24642037	.	T	TGTGTGTGCGC	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0072439;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,10:10,5:13,5
-chr2	25193025	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.048408;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:8,2:16,7
-chr2	25526390	.	TATA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0019379;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,10:5,5:3,5
-chr2	25963673	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.036457;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,7:9,2:7,5
-chr2	26892756	.	T	TGAGAGAGA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.04277;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:16,3:10,4
-chr2	27539957	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:10,5:3,1
-chr2	27699820	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.024242;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,3:1,2:0,1
-chr2	30989659	.	TATATATATTAGTATATATAAAAA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036526;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,3:4,1
-chr2	32019835	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.27198;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:8,4:5,2:3,2
-chr2	32157941	.	CAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0091441;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:4,2:3,5
-chr2	32762276	.	AGTGTGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,8:4,3:3,5
-chr2	33227799	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:7,4:2,1
-chr2	34144808	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=5.02e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:11,6:12,11
-chr2	35144715	.	A	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.9834e-09;SS=2;SSC=87;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:11,12:7,7
-chr2	35418817	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
-chr2	35496703	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,4:15,1:9,3
-chr2	43012620	.	ATTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,3:2,1
-chr2	43775854	.	A	ATT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:3,3:8,1
-chr2	43904701	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.045519;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,5:8,3:4,2
-chr2	44066335	.	A	ATT	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,4:11,3:12,1
-chr2	44354474	.	T	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=1.2502e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:30,16:16,8:14,8
-chr2	44805528	.	G	GC	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=4.6364e-06;SS=2;SSC=53;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:14,7:17,8
-chr2	45414714	.	GTATA	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.060943;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,6:27,3:15,3
-chr2	45418677	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:1,4:1,2:0,2
-chr2	45877089	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.25496;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,4:17,1:10,3
-chr2	46004180	.	C	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=5.3433e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:12,2:12,9
-chr2	46607781	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=3.2598e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,23:17,14:6,9
-chr2	46944430	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0001796;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:9,6:12,7
-chr2	47900609	.	C	CACACGT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:1,3:8,2
-chr2	48059603	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.026073;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,5:7,3:5,2
-chr2	50026859	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
-chr2	50606606	.	C	CAATAATAATAATAAT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.035226;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:18,7:14,4
-chr2	51966739	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.5197e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:12,8:6,10
-chr2	54087912	.	A	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:34:0,3:0,1:0,2
-chr2	54753664	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:6,2:2,1:4,1
-chr2	56922408	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.032909;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,6:21,3:16,3
-chr2	57529639	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0024898;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:17,6:13,3
-chr2	60435528	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03378;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,3:5,3
-chr2	61417735	.	TTTTCTTTTC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.022116;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:7,6:8,2
-chr2	61933771	.	TC	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.10571;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:20,2:16,2
-chr2	61963159	.	C	CA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0053061;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:16,6:16,1
-chr2	61975118	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:1,1:4,3
-chr2	62315376	.	C	CAAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.017292;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,7:4,6:10,1
-chr2	63909413	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:2,4:4,2
-chr2	64170709	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0041611;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,7:5,1
-chr2	66091570	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.01699;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:21,5:9,5
-chr2	67461581	.	ATATATATATGTGTG	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,4:5,1:8,3
-chr2	68413223	.	T	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0067079;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:1,5:2,2
-chr2	69651830	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:0,3:0,3:0,0
-chr2	70917151	.	C	CAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.024017;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,8:3,7:5,1
-chr2	73630958	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.038305;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:25,2:20,4
-chr2	73871565	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.20158;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:13,5:2,3:11,2
-chr2	74742473	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.02121;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:11,7:3,2
-chr2	75251101	.	AGG	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,5:2,2:3,3
-chr2	75905250	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=2.4155e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:4,7:8,5
-chr2	76692291	.	T	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00012116;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:23,7:10,5
-chr2	76913543	.	A	ATTTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.32176;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,4:16,3:9,1
-chr2	77103647	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.013236;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,8:8,7:10,1
-chr2	77479101	.	G	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.011919;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:47,9:19,3:28,6
-chr2	77686348	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.011394;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:6,1:8,6
-chr2	77931828	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.3654e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:15,9:6,9
-chr2	78549115	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0006295;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:16,8:14,5
-chr2	79845172	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,7:5,5:2,2
-chr2	80057175	.	G	GT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0061655;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:15,6:11,2
-chr2	80589903	.	T	TGTGTGTGC	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.031686;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,9:10,5:8,4
-chr2	80641753	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.0312e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:8,5:14,11
-chr2	80984528	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=4.3937e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:16,13:7,9
-chr2	81700693	.	T	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=9.7046e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:26,7:17,9
-chr2	81701068	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:4,11:8,3
-chr2	81720931	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.7347e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:32,21:10,8:22,13
-chr2	82109248	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:9,3:3,2
-chr2	82135167	.	T	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.018182;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:0,8:0,1:0,7
-chr2	82176577	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00031835;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:10,4:13,6
-chr2	82468469	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.20188;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,4:21,2:5,2
-chr2	83232224	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:4,3:2,1
-chr2	83429897	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.5223e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:11,8:13,7
-chr2	84276435	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.26374;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,5:4,4:3,1
-chr2	85425230	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=9.8808e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:12,7:12,7
-chr2	86569318	.	A	AT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:5,1:3,3
-chr2	87107818	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.023702;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,5:9,4
-chr2	87192569	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.041892;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:8,1:13,6
-chr2	87228717	.	T	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.026424;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:47,15:24,4:23,11
-chr2	87361097	.	A	T	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.025783;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:101,14:63,12:38,2
-chr2	87361322	.	T	C	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.027614;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:56,12:17,5:39,7
-chr2	87378763	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.098694;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:20,4:11,1
-chr2	87424878	.	C	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0018749;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,11:11,7:8,4
-chr2	87884055	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.029613;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:13,6:25,6
-chr2	87885399	.	C	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.011249;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,6:20,3:17,3
-chr2	89534390	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.020062;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:11,7:14,1
-chr2	90263274	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.010783;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:5,1:19,9
-chr2	90317559	.	AG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:4,3:14,1
-chr2	90327067	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020644;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:6,1:7,8
-chr2	90356868	.	AGCATT	A	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.038484;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:46,7:34,6:12,1
-chr2	91467591	.	T	C	0	PASS	DP=177;GPV=1;SPV=0.0058698;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:78,12:28,3:50,9
-chr2	91473716	.	G	C	0	PASS	DP=315;GPV=1;SPV=0.044973;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:140,24:68,13:72,11
-chr2	91475304	.	C	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.036902;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:51,15:23,2:28,13
-chr2	91512064	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.093588;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:0,0:26,4
-chr2	91590867	.	A	C	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:47,13:18,7:29,6
-chr2	92109426	.	G	C	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.02189;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:101,17:47,8:54,9
-chr2	92244933	.	A	C	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.0031124;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:121,23:45,11:76,12
-chr2	92300353	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:5,2:15,2
-chr2	92308722	.	A	G	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.035968;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:50,8:33,7:17,1
-chr2	92317187	.	G	A	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.036464;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:48,2:9,5
-chr2	92384123	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:14,2:1,2
-chr2	92401141	.	T	A	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.0017431;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:77,10:4,2:73,8
-chr2	92403422	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.088868;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:1,0:29,4
-chr2	92417092	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0066147;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:6,10:24,3
-chr2	92551166	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:7,1:17,3
-chr2	92557382	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.10034;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:20,4:2,0
-chr2	92637920	.	C	T	0	PASS	DP=417;GPV=1;SPV=0.017433;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:228:202,23:122,13:80,10
-chr2	92641309	.	C	A	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.00067309;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:85,16:30,7:55,9
-chr2	92815545	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:1,0:19,4
-chr2	92815587	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12206;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:1,0:24,4
-chr2	92817406	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.050318;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:7,3:19,3
-chr2	92839007	.	G	T	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.0022779;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:82,24:51,12:31,12
-chr2	92956270	.	T	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.037798;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:53,6:50,5:3,1
-chr2	93026762	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.15427;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,3:6,2:14,1
-chr2	93044283	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.045335;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:6,2:22,7
-chr2	93107130	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.035875;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:7,2:26,3
-chr2	93158796	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14851;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:2,0:25,4
-chr2	93179369	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:5,1:16,3
-chr2	93219004	.	T	C	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.019646;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:108,19:36,8:72,11
-chr2	93259672	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0097246;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:11,4:15,4
-chr2	93311255	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
-chr2	93346162	.	T	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:8,5:1,1
-chr2	93454506	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13793;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:3,2:10,1
-chr2	93465530	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.28079;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:11,2:6,1
-chr2	93653271	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0012238;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:14,8:1,5
-chr2	93753410	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16375;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:1,0:28,4
-chr2	93807122	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016795;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:2,2:9,5
-chr2	93889142	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.064915;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:21,4:1,0
-chr2	93889691	.	T	A	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.042961;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:79,10:35,6:44,4
-chr2	93962263	.	C	T	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.038189;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:53,9:26,2:27,7
-chr2	94005337	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0063358;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:22,4:1,2
-chr2	94155150	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:20,4:0,0
-chr2	94156095	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.023677;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:21,5:14,8
-chr2	95650859	.	T	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.0047322;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:15,7:21,7
-chr2	95858004	.	C	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.019345;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:22,2:17,5
-chr2	97583326	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040085;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:3,4:7,1
-chr2	98036209	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,2:8,2
-chr2	99867003	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:8,9:5,2:3,7
-chr2	103705075	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023024;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,4:8,4
-chr2	105055493	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:5,6:0,1
-chr2	105211096	.	ACC	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.16209;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:15,2:7,1
-chr2	105388668	.	C	CA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.043884;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:12,4:14,2
-chr2	106394427	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010459;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:11,3:8,4
-chr2	106823442	.	A	AACACACACAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:10,2:4,2
-chr2	106917333	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:11,6:4,1
-chr2	110306649	.	CA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,3:1,1
-chr2	111369841	.	C	G	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.00080463;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:53,14:29,4:24,10
-chr2	111369856	.	GCAGGCTGCA	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.022382;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:57,11:32,3:25,8
-chr2	111387092	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.03119;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:14,7:11,3
-chr2	111574482	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:1,1:5,1
-chr2	111642192	.	CAA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.051826;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,6:10,5:7,1
-chr2	111978449	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0087027;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:24,9:10,5:14,4
-chr2	112047086	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013155;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:6,5:0,1
-chr2	113484023	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0072523;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:6,3:18,6
-chr2	115985368	.	TC	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0036217;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,9:10,1:14,8
-chr2	116200289	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.1439e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:9,5:13,10
-chr2	116976996	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0072004;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:6,5:7,4
-chr2	117074818	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.014116;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:18,5:16,3
-chr2	118695940	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.02396;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:5,5:0,1
-chr2	120973017	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=5.5881e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:11,9:19,8
-chr2	122335347	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=4.4872e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:34,18:16,11:18,7
-chr2	123234970	.	A	AT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,2:1,1:3,1
-chr2	123356747	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,2:1,1:3,1
-chr2	123414026	.	G	GAAGAAAGAAAGAAAGAAAGA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,2:4,2:0,0
-chr2	124419896	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.035975;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:6,4:23,5
-chr2	125734514	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,7:4,1:0,6
-chr2	125776549	.	A	ATTTATTTATTTATTTG	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.029853;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:16,9:11,1
-chr2	127252159	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,5:4,1
-chr2	128816521	.	ATATATAATATG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.083396;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,6:10,3:10,3
-chr2	129272202	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:2,2:1,1:1,1
-chr2	130031192	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00021386;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:14,7:14,5
-chr2	131270314	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0091489;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:19,6:17,3
-chr2	131318005	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=5.7314e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:26,19:16,9:10,10
-chr2	131357474	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.022225;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,6:8,3
-chr2	131945583	.	A	G	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.037818;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:48,10:34,8:14,2
-chr2	132016825	.	TACA	T	0	PASS	DP=368;GPV=1;SPV=0.023337;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:199:165,34:84,24:81,10
-chr2	132404802	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,4:2,2:13,2
-chr2	132514068	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.1043e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:14,11:8,4
-chr2	133177183	.	T	TATATATATAC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,4:11,3:11,1
-chr2	134869706	.	G	GTA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.015231;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,6:6,3
-chr2	135619021	.	C	CAA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.026092;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,7:9,6:12,1
-chr2	135975753	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0044346;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,9:10,8:2,1
-chr2	136760923	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=4.0612e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:11,5:13,14
-chr2	139139937	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,5:5,4:8,1
-chr2	140228200	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,5:13,1:5,4
-chr2	140228202	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,5:14,1:4,4
-chr2	140228204	.	T	TATATATTC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,4:13,1:5,3
-chr2	140228419	.	AATAT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.013346;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:11,10:8,3
-chr2	142111478	.	A	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.889e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:29,18:15,7:14,11
-chr2	144394989	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:8,3:1,1
-chr2	144663035	.	GTTTATGAAGATGCAAAGTCACATGGCAAATTATCAATATTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:4,4:6,3
-chr2	146287171	.	C	CT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.4395e-06;SS=2;SSC=56;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:8,7:10,7
-chr2	146566577	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.019062;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:16,2:18,4
-chr2	147035532	.	GAAGAAAGAAAGAAAGAAAGA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.027191;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,6:8,5:1,1
-chr2	147611680	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=6.7474e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,18:14,12:12,6
-chr2	148294505	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1114;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,2:6,4
-chr2	150205885	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,5:7,4:6,1
-chr2	151133461	.	AGAAAGAAG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,4:15,2:7,2
-chr2	152719764	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.072331;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:14,2:18,2
-chr2	152923482	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:3,1:2,3
-chr2	153089504	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0039417;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:16,4:25,5
-chr2	154939176	.	A	ATATATT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,1:1,3
-chr2	154939185	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:4,1:2,4
-chr2	155754615	.	T	TAAATAAAATA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0090863;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:29,16:13,10:16,6
-chr2	156352879	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.035679;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:23,10:11,2
-chr2	157611849	.	G	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=3.0975e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:33,18:15,5:18,13
-chr2	158000067	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.057534;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:24,3:10,1
-chr2	159324625	.	TAC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,5:8,2:5,3
-chr2	161660592	.	C	CT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.027649;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,7:3,5:20,2
-chr2	162558175	.	CT	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.9786e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:14,7:9,6
-chr2	162954239	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.0094e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:7,11:11,6
-chr2	165923743	.	G	GTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.01607;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:8,8:11,1
-chr2	166312986	.	AATT	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.027465;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:18,1:18,4
-chr2	168867808	.	T	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.014044;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:14,6:29,4
-chr2	168867850	.	A	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.019385;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:16,9:24,4
-chr2	168975468	.	GATAAATAT	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.023608;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:32,8:14,2:18,6
-chr2	169277193	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,10:3,9:2,1
-chr2	170519972	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0083519;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,9:4,8:5,1
-chr2	170543495	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.6518e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:10,6:13,8
-chr2	171081852	.	TTG	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=3.8083e-07;SS=2;SSC=64;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:9,8:15,9
-chr2	171851511	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.055194;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,5:6,3:14,2
-chr2	172109645	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.083965;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:16,1:20,3
-chr2	172568327	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.033264;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,6:8,5:5,1
-chr2	172914319	.	ATTT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:9,2:6,2
-chr2	173192079	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0062765;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:25,10:14,5:11,5
-chr2	174423777	.	CTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,1:6,3
-chr2	175313335	.	A	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0014181;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,11:22,6:20,5
-chr2	177592339	.	T	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=2.8928e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:17,10:10,9
-chr2	177631599	.	A	ATG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:5,2:2,3
-chr2	180164419	.	C	CTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0025987;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,9:3,6:3,3
-chr2	180329767	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=4.2691e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:13,3:8,8
-chr2	184134307	.	G	GTT	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.012316;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:33,16:19,8:14,8
-chr2	185526322	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.1162e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:15,9:11,7
-chr2	186851520	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.35897;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:6,2:3,1:3,1
-chr2	187406187	.	C	CAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.01206;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:14,8:12,6
-chr2	190314330	.	T	TAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,3:8,1
-chr2	190665678	.	C	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00013696;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:19,9:17,4
-chr2	192188507	.	T	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=3.3802e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:31,29:12,11:19,18
-chr2	192682970	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.053387;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:12,3:17,1
-chr2	192682971	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.064462;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,3:17,1
-chr2	195740603	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:9,1:3,3
-chr2	195848382	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=8.9593e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:38,22:15,8:23,14
-chr2	197072046	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0078247;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,9:4,2:3,7
-chr2	200522366	.	TTC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:8,1:17,3
-chr2	200683642	.	C	CCA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.065739;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:8,1:11,2
-chr2	201101362	.	C	CTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023137;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:7,8:8,2
-chr2	201694608	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:2,2:5,4
-chr2	202675445	.	C	CAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:3,4:2,1
-chr2	203482018	.	AC	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.054338;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:19,3:14,1
-chr2	205730824	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.9377e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:9,14:13,6
-chr2	206249562	.	ATT	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.003241;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,12:12,10:8,2
-chr2	206315513	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00039944;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,16:7,9:4,7
-chr2	208176963	.	A	ATC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,8:9,3:3,5
-chr2	208237764	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0093762;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:6,5:5,3
-chr2	208818593	.	CTGCT	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:2,2:0,1:2,1
-chr2	209091906	.	GAT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10523;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,1:11,3
-chr2	209925100	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00029281;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:9,3:12,7
-chr2	210978778	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:0,3:7,3
-chr2	211401493	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0014707;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:16,5:9,3
-chr2	212204816	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10288;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:11,4:3,2
-chr2	212510205	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.17622;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:4,3:1,1
-chr2	213980478	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.010483;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:9,3:14,5
-chr2	216031691	.	G	GAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:12,2:1,2
-chr2	218684106	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:3,5:3,2
-chr2	219043934	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:11,7:7,6:4,1
-chr2	219262643	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=4.6565e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:24,23:13,14:11,9
-chr2	219822906	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,10:1,5:3,5
-chr2	220013230	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0093841;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:2,3:13,7
-chr2	220013251	.	C	CTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0065417;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,9:4,2:6,7
-chr2	220400875	.	G	GTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:2,3:4,1
-chr2	223654163	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:11,3:3,1
-chr2	223789835	.	CA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.016427;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:10,9:5,1
-chr2	223866479	.	C	CTTCT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.007794;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,11:2,3:10,8
-chr2	224166291	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00017003;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:12,12:20,5
-chr2	225126009	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.004156;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,10:3,9:1,1
-chr2	225758347	.	CGTGGTGGCGGG	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00082087;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:18,8:6,3
-chr2	226041206	.	C	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0038251;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:13,3:30,6
-chr2	227730181	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.034157;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:28,2:9,9
-chr2	227745978	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:0,2:0,1:0,1
-chr2	227762536	.	T	TCTTTC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:1,2:0,1:1,1
-chr2	228092463	.	TGTGCC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,1:5,4
-chr2	228271845	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=4.2648e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:12,11:13,8
-chr2	228501735	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:3,3:6,7
-chr2	228505700	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.6974e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:15,11:12,2
-chr2	228867416	.	C	CT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0015605;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:18,7:13,3
-chr2	229762700	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=2.7847e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:38,19:25,5:13,14
-chr2	229938845	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16375;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:17,2:12,2
-chr2	231692705	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.019794;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:19,3:9,3
-chr2	231848489	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.060413;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:8,4:9,1
-chr2	233321986	.	TACACACACACACACACACACAC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0046784;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,11:3,9:3,2
-chr2	234297597	.	C	CCCTTTCTTTCTTTCTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.020443;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:6,2:14,3
-chr2	235358886	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.18182;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:3,2:1,1:2,1
-chr2	235746377	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:2,6:5,1
-chr2	236416721	.	TTATA	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:4,2:1,2
-chr2	236808656	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00021594;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:12,6:18,6
-chr2	237578900	.	A	AAC	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.001961;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:18,9:11,3
-chr2	239185034	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:4,2:4,2:0,0
-chr2	239253765	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.6295e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:13,6:10,6
-chr2	240672171	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=1.0492e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:33,25:21,12:12,13
-chr2	241392949	.	G	GA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.043687;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,14:4,9:15,5
-chr2	242169565	.	T	TG	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.011252;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:17,3:20,7
-chr20	1421653	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00021937;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:17,8:17,6
-chr20	1668219	.	C	CTTTTTCTTTTCT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.31002;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,4:11,2:13,2
-chr20	2854238	.	T	TACACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.042868;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,3:7,3
-chr20	2910020	.	TCTATC	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,4:7,1:13,3
-chr20	3597071	.	T	TATATATATATATATATATAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027099;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:7,3:9,5
-chr20	3648606	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=7.5915e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:29,22:13,7:16,15
-chr20	3724489	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:7,4:8,2
-chr20	3724490	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.069853;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,4:7,1
-chr20	4032934	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:2,1:12,3
-chr20	4055300	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.01279;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,8:13,7:1,1
-chr20	5213537	.	AGTGTGTGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,11:0,9:6,2
-chr20	5266921	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15115;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:19,3:10,1
-chr20	5266924	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.18072;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:22,3:13,1
-chr20	5672704	.	ATTTTATT	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.064915;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:7,3:15,1
-chr20	5959690	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0023297;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:4,6:6,1
-chr20	6318106	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.084986;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:10,1:20,4
-chr20	7022334	.	CA	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.10523;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,4:18,2:6,2
-chr20	10479355	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0055953;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:15,8:7,4
-chr20	11065849	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=6.9242e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:38,18:16,5:22,13
-chr20	11507909	.	TATATACAC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:4,2:6,5
-chr20	12364160	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.9635e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:16,9:13,5
-chr20	12755372	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.018628;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,3:11,3
-chr20	13159970	.	CT	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.033108;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:26,4:13,1
-chr20	13627733	.	T	TAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,3:11,1
-chr20	13934341	.	T	TC	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.052565;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,6:10,4:26,2
-chr20	14083122	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:3,2:2,1:1,1
-chr20	14190702	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,2:0,1:1,1
-chr20	16410036	.	C	CAT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:3,1:2,1
-chr20	16671238	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:7,2:0,1:7,1
-chr20	17294499	.	T	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=1.0237e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:12,8:13,5
-chr20	19844619	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10103;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:5,2:23,3
-chr20	19984000	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.043779;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:6,2:9,5
-chr20	21721607	.	CATAT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,6:4,1
-chr20	21748369	.	T	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0003586;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:8,3:13,5
-chr20	23526154	.	T	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=6.589e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,7:8,4
-chr20	23683258	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.035082;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:15,3:25,2
-chr20	24508218	.	A	ATT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.012749;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:5,5:2,1
-chr20	25388787	.	C	CTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,10:4,7:8,3
-chr20	25792739	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr20	26237768	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.03936;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:22,2:19,3
-chr20	26894806	.	C	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037198;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,1:4,4
-chr20	27057752	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,0:9,4
-chr20	27213207	.	G	A	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=9.5044e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:94,15:32,4:62,11
-chr20	27213245	.	T	C	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.011213;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:84,16:33,3:51,13
-chr20	28531506	.	G	A	0	PASS	DP=540;GPV=1;SPV=0.031934;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:315:266,33:107,13:159,20
-chr20	28601114	.	C	T	0	PASS	DP=274;GPV=1;SPV=0.012392;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:106,27:39,3:67,24
-chr20	28624166	.	C	T	0	PASS	DP=444;GPV=1;SPV=0.022899;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:194,32:120,14:74,18
-chr20	28639014	.	A	C	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.01847;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:89,18:36,7:53,11
-chr20	28839977	.	GT	G	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.046076;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:92,18:35,7:57,11
-chr20	28889768	.	C	CCATTCCATTT	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.0080696;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:66,10:32,6:34,4
-chr20	29091576	.	ATCAT	A	0	PASS	DP=371;GPV=1;SPV=0.02386;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:160,31:84,14:76,17
-chr20	29114498	.	C	T	0	PASS	DP=328;GPV=1;SPV=0.034198;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:165:139,26:63,13:76,13
-chr20	29124918	.	G	A	0	PASS	DP=378;GPV=1;SPV=0.021382;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:205:169,36:94,19:75,17
-chr20	29504644	.	AAAATT	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0059872;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:17,3:16,6
-chr20	29515438	.	G	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.006436;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:57,8:32,5:25,3
-chr20	29898556	.	G	A	0	PASS	DP=324;GPV=1;SPV=0.015448;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:174:150,24:77,17:73,7
-chr20	29920296	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:16,4:0,0
-chr20	29972768	.	T	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0032969;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:13,9:18,6
-chr20	30415770	.	A	T	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.029803;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:67,10:32,2:35,8
-chr20	30864416	.	A	G	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.030834;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:103,17:43,9:60,8
-chr20	30907965	.	ATTCT	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.021554;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,5:3,2:14,3
-chr20	31055102	.	C	T	0	PASS	DP=255;GPV=1;SPV=0.044983;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:120,18:58,11:62,7
-chr20	31070023	.	G	A	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.0041726;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:26,10:17,6
-chr20	31070181	.	G	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.0078692;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:56,15:29,7:27,8
-chr20	31090625	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.012456;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:7,2:6,6
-chr20	31580080	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:4,4:8,4
-chr20	33699579	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.025586;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,6:5,3
-chr20	33764545	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:6,4:0,1
-chr20	33793413	.	G	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00018052;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:25,6:15,7
-chr20	34305122	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.013828;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:21,5:7,4
-chr20	34385222	.	G	GTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:5,2:3,2
-chr20	34584504	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:11,4:5,1
-chr20	37507861	.	G	GGTGTGTGT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13094;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,7:7,6:7,1
-chr20	37603317	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:0,0:20,4
-chr20	37747378	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,3:5,1
-chr20	37965858	.	G	GTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:8,3:9,2
-chr20	38020327	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,4:8,1
-chr20	38600200	.	CACCT	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.064069;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:21,2:15,2
-chr20	41689410	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.7194e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:11,6:11,11
-chr20	43176217	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:9,2:1,3
-chr20	43668194	.	CTTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:6,5:5,1
-chr20	44745427	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.01087;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:5,4:1,1
-chr20	45369596	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,5:4,2
-chr20	45742354	.	C	CTG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:7,6:7,2
-chr20	45863169	.	G	GT	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.031655;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,1:17,3
-chr20	46124751	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,6:11,3:6,3
-chr20	46163323	.	A	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=5.7714e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:31,16:15,8:16,8
-chr20	46273335	.	G	C	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=3.1409e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:35,18:20,10:15,8
-chr20	47890440	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.060943;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:21,4:21,2
-chr20	48220906	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,14:5,12:5,2
-chr20	48222211	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:20,2:2,2
-chr20	48505407	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15365;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:9,3:17,1
-chr20	48933905	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=1.2638e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:36,22:23,11:13,11
-chr20	49129280	.	A	ATT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057842;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:8,1:4,3
-chr20	52314969	.	CTCTCTCTCTCTCTG	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:0,3:0,1:0,2
-chr20	52383847	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,2:1,2:0,0
-chr20	52900213	.	T	TTTTCTTTC	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.040748;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,7:14,2:12,5
-chr20	53845411	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.011401;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:6,5:0,2
-chr20	54842880	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.040883;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,6:10,1:15,5
-chr20	55314528	.	CA	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0077416;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:15,2:15,5
-chr20	55514525	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.10265;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:17,4:13,1
-chr20	55514526	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.064844;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:17,4:13,1
-chr20	57669142	.	C	CATTTATTTATTTATTT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.076076;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,6:20,4:12,2
-chr20	58473712	.	G	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00069954;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:23,6:13,7
-chr20	58660713	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.00387;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:0,1:2,3
-chr20	58979628	.	A	AC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.041383;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:22,2:2,3
-chr20	60507281	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,4:9,1:9,3
-chr20	62341039	.	AAAATAAATAAATAAAT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.025865;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:17,3:4,6
-chr20	63068602	.	C	G	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.031417;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:57,9:36,1:21,8
-chr20	64195401	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,5:0,3:4,2
-chr21	5220172	.	T	G	0	PASS	DP=419;GPV=1;SPV=0.01533;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:210:179,31:89,18:90,13
-chr21	5232760	.	G	A	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.011403;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:133,21:69,13:64,8
-chr21	5270148	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.01767;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:21,6:22,8
-chr21	6361949	.	C	T	0	PASS	DP=490;GPV=1;SPV=0.0088782;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:275:247,28:118,14:129,14
-chr21	7218911	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.040797;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:21,7:4,3
-chr21	7246044	.	G	A	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.038198;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:131,16:73,9:58,7
-chr21	7252722	.	C	A	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.010036;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:50,16:35,11:15,5
-chr21	7281326	.	T	C	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.040746;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:98,15:48,11:50,4
-chr21	7315101	.	A	G	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.031233;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:74,20:39,7:35,13
-chr21	7318116	.	T	C	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.028389;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:85,21:48,11:37,10
-chr21	7916759	.	A	G	0	PASS	DP=203;GPV=1;SPV=0.015515;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:95,24:51,14:44,10
-chr21	7928708	.	TC	T	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.02013;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:93,20:45,10:48,10
-chr21	7942110	.	C	T	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=7.5651e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:104,14:52,3:52,11
-chr21	7946994	.	C	G	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.011018;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:91,23:49,10:42,13
-chr21	7947020	.	C	T	0	PASS	DP=235;GPV=1;SPV=0.018736;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:96,22:48,11:48,11
-chr21	7948925	.	C	T	0	PASS	DP=256;GPV=1;SPV=0.016707;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:114,26:62,20:52,6
-chr21	7950849	.	TC	T	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.0099971;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:80,23:41,11:39,12
-chr21	7950853	.	TTCCA	T	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.0099623;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:65,20:39,9:26,11
-chr21	7957223	.	T	A	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.038297;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:36,12:14,5:22,7
-chr21	7958453	.	C	T	0	PASS	DP=444;GPV=1;SPV=0.014015;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:256:217,39:120,22:97,17
-chr21	8021953	.	C	T	0	PASS	DP=168;GPV=1;SPV=0.010888;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:72,23:59,11:13,12
-chr21	8033537	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.022245;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:7,2:13,5
-chr21	8036516	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.016292;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:23,1:12,9
-chr21	8575932	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:0,0:23,4
-chr21	8615202	.	G	A	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.018379;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:71,18:40,9:31,9
-chr21	8766338	.	C	T	0	PASS	DP=421;GPV=1;SPV=0.01124;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:204:175,29:73,13:102,16
-chr21	8766772	.	C	A	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.00013834;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:62,12:47,5:15,7
-chr21	8783934	.	G	T	0	PASS	DP=380;GPV=1;SPV=0.0071481;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:174,23:68,9:106,14
-chr21	8786423	.	TTCC	T	0	PASS	DP=259;GPV=1;SPV=0.037144;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:141:118,21:70,9:48,12
-chr21	8827093	.	T	G	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.041463;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:88,16:54,12:34,4
-chr21	8837938	.	G	A	0	PASS	DP=422;GPV=1;SPV=0.048908;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:240:215,25:139,19:76,6
-chr21	8840952	.	G	A	0	PASS	DP=392;GPV=1;SPV=0.035916;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:166,31:66,8:100,23
-chr21	8845647	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.035906;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,7:8,2
-chr21	8850770	.	G	C	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.039474;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:53,12:10,2:43,10
-chr21	8858565	.	G	C	0	PASS	DP=554;GPV=1;SPV=0.006701;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:300:263,37:162,24:101,13
-chr21	8861884	.	T	C	0	PASS	DP=317;GPV=1;SPV=0.01295;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:175:151,24:49,15:102,9
-chr21	8881102	.	AC	A	0	PASS	DP=367;GPV=1;SPV=0.0046877;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:195:170,25:118,17:52,8
-chr21	9000317	.	A	T	0	PASS	DP=382;GPV=1;SPV=0.022287;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:202:178,24:94,15:84,9
-chr21	9000360	.	C	T	0	PASS	DP=451;GPV=1;SPV=0.036817;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:256:225,31:121,17:104,14
-chr21	9000802	.	C	A	0	PASS	DP=384;GPV=1;SPV=0.025601;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:198:174,24:91,8:83,16
-chr21	9000994	.	CTGGGAAAACTGGCT	C	0	PASS	DP=371;GPV=1;SPV=0.0061423;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:171,26:75,6:96,20
-chr21	9001046	.	A	G	0	PASS	DP=364;GPV=1;SPV=0.033603;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:174,22:73,4:101,18
-chr21	9011684	.	C	T	0	PASS	DP=484;GPV=1;SPV=0.033479;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:252:224,28:120,17:104,11
-chr21	9011923	.	C	T	0	PASS	DP=411;GPV=1;SPV=0.0084415;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:207:181,26:82,13:99,13
-chr21	9019913	.	C	T	0	PASS	DP=407;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:210:186,24:90,11:96,13
-chr21	9033212	.	G	A	0	PASS	DP=434;GPV=1;SPV=0.0085647;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:204,23:102,15:102,8
-chr21	9043378	.	G	A	0	PASS	DP=498;GPV=1;SPV=0.0059937;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:253:217,36:106,20:111,16
-chr21	9084596	.	G	GTGTGTGTGTGTGTT	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.028334;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:68,17:20,6:48,11
-chr21	9092235	.	A	C	0	PASS	DP=461;GPV=1;SPV=0.025641;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:225:198,27:89,7:109,20
-chr21	9096011	.	T	C	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.0057924;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:107,23:53,11:54,12
-chr21	9102967	.	T	C	0	PASS	DP=480;GPV=1;SPV=0.027549;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:229:202,27:120,21:82,6
-chr21	9124467	.	G	T	0	PASS	DP=625;GPV=1;SPV=0.049959;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:304:272,32:153,18:119,14
-chr21	9136435	.	G	A	0	PASS	DP=491;GPV=1;SPV=0.011234;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:245:220,25:127,16:93,9
-chr21	9154575	.	C	T	0	PASS	DP=678;GPV=1;SPV=0.019822;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:360:316,44:153,19:163,25
-chr21	9157822	.	C	G	0	PASS	DP=409;GPV=1;SPV=0.01118;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:198:177,21:100,15:77,6
-chr21	9177607	.	A	G	0	PASS	DP=493;GPV=1;SPV=0.0076654;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:230:197,33:89,16:108,17
-chr21	9184712	.	C	A	0	PASS	DP=446;GPV=1;SPV=0.027931;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:246:219,27:107,13:112,14
-chr21	9253945	.	T	G	0	PASS	DP=709;GPV=1;SPV=0.028605;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:394:352,42:122,21:230,21
-chr21	9268439	.	C	A	0	PASS	DP=593;GPV=1;SPV=0.027544;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:318:269,49:123,29:146,20
-chr21	9270905	.	T	A	0	PASS	DP=382;GPV=1;SPV=0.021248;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:190:163,27:59,14:104,13
-chr21	9272226	.	C	G	0	PASS	DP=316;GPV=1;SPV=0.0044996;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:137,21:57,3:80,18
-chr21	9272460	.	A	G	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.046025;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:124,24:64,4:60,20
-chr21	9309037	.	G	A	0	PASS	DP=496;GPV=1;SPV=0.04638;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:266:239,27:124,16:115,11
-chr21	9317266	.	A	T	0	PASS	DP=466;GPV=1;SPV=0.010295;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:245:219,26:131,19:88,7
-chr21	9323107	.	G	A	0	PASS	DP=648;GPV=1;SPV=0.014018;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:341:291,50:139,33:152,17
-chr21	9324423	.	G	A	0	PASS	DP=496;GPV=1;SPV=0.01913;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:267:240,27:152,19:88,8
-chr21	9334862	.	C	T	0	PASS	DP=469;GPV=1;SPV=0.026473;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:228:205,23:88,7:117,16
-chr21	9347264	.	G	T	0	PASS	DP=523;GPV=1;SPV=0.0085766;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:285:250,35:119,17:131,18
-chr21	9351081	.	C	A	0	PASS	DP=508;GPV=1;SPV=0.016554;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:292:259,33:144,16:115,17
-chr21	9357060	.	T	A	0	PASS	DP=531;GPV=1;SPV=0.012241;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:278:248,30:134,16:114,14
-chr21	9367890	.	C	T	0	PASS	DP=713;GPV=1;SPV=0.024546;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:355:309,42:137,14:172,28
-chr21	9369275	.	G	A	0	PASS	DP=918;GPV=1;SPV=0.031693;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:495:440,55:201,22:239,33
-chr21	9373504	.	G	GAGAT	0	PASS	DP=473;GPV=1;SPV=0.048323;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:262:235,27:109,4:126,23
-chr21	9564852	.	A	T	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.0036247;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:75,23:35,13:40,10
-chr21	9574243	.	C	A	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.0017606;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:75,20:41,14:34,6
-chr21	9576700	.	G	A	0	PASS	DP=286;GPV=1;SPV=0.014616;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:152:135,17:66,8:69,9
-chr21	9581253	.	T	C	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.044808;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:54,7:30,5:24,2
-chr21	9591067	.	A	ATAGACACAAGGTTTCACTATAT	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.038826;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:47,8:20,5:27,3
-chr21	9606696	.	A	G	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.015765;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:84,20:40,9:44,11
-chr21	9673062	.	T	C	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.017581;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:77,21:35,12:42,9
-chr21	9715188	.	G	A	0	PASS	DP=219;GPV=1;SPV=8.7935e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:83,35:41,12:42,23
-chr21	9765769	.	T	G	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.010687;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:61,19:46,16:15,3
-chr21	9819014	.	G	C	0	PASS	DP=1593;GPV=1;SPV=0.041702;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:856:766,90:347,37:419,53
-chr21	9854292	.	G	A	0	PASS	DP=204;GPV=1;SPV=0.038086;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:90,22:51,14:39,8
-chr21	9857848	.	G	A	0	PASS	DP=208;GPV=1;SPV=0.016928;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:91,25:39,7:52,18
-chr21	9883337	.	G	A	0	PASS	DP=210;GPV=1;SPV=0.0094936;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:91,24:41,12:50,12
-chr21	9895530	.	A	T	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.0054636;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:84,22:29,8:55,14
-chr21	9910990	.	A	G	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.011682;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:69,22:38,10:31,12
-chr21	9923103	.	T	C	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.0042647;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:80,24:32,13:48,11
-chr21	9929347	.	A	C	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.0051875;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:83,27:42,10:41,17
-chr21	9973003	.	C	T	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.023625;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:97,25:36,17:61,8
-chr21	9981102	.	CTTTCTT	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.048675;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:5,1:39,4
-chr21	10122235	.	C	T	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.012779;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:73,22:38,13:35,9
-chr21	10137758	.	C	T	0	PASS	DP=242;GPV=1;SPV=0.041384;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:106,24:39,9:67,15
-chr21	10139215	.	C	T	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.049177;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:107,12:60,10:47,2
-chr21	10325690	.	C	T	0	PASS	DP=308;GPV=1;SPV=0.038903;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:140,24:70,13:70,11
-chr21	10331097	.	A	G	0	PASS	DP=452;GPV=1;SPV=0.026031;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:243:211,32:96,13:115,19
-chr21	10333449	.	TCTC	T	0	PASS	DP=408;GPV=1;SPV=0.028843;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:206,27:112,13:94,14
-chr21	10370486	.	T	TTATC	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.045325;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,10:9,8:19,2
-chr21	10372845	.	A	AAAAAGAAAAGAAAAG	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.024544;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:72,9:47,8:25,1
-chr21	10374957	.	G	C	0	PASS	DP=278;GPV=1;SPV=0.0063768;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:122,28:52,4:70,24
-chr21	10410279	.	C	A	0	PASS	DP=280;GPV=1;SPV=0.032388;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:135,22:61,11:74,11
-chr21	10440223	.	A	G	0	PASS	DP=494;GPV=1;SPV=0.049025;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:282:250,32:101,16:149,16
-chr21	10453718	.	G	A	0	PASS	DP=426;GPV=1;SPV=0.031111;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:230:206,24:107,14:99,10
-chr21	10675252	.	C	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0012943;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:19,8:18,2
-chr21	10691179	.	A	T	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.0042448;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:70,21:31,10:39,11
-chr21	10733585	.	CCATTCCATTCCATTCCAT	C	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.02107;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:77,17:41,5:36,12
-chr21	10756286	.	G	C	0	PASS	DP=401;GPV=1;SPV=0.021145;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:197,29:104,9:93,20
-chr21	13016291	.	A	AG	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.0027062;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:50,9:27,7:23,2
-chr21	13109689	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.21541;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:18,1:18,3
-chr21	13178547	.	A	G	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.048782;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:57,10:39,9:18,1
-chr21	13370830	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.040848;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:18,2:17,3
-chr21	13507129	.	T	TATGC	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.062923;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:22,4:17,1
-chr21	13507133	.	TG	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.014256;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:20,4:12,3
-chr21	13507148	.	C	CATATCCATAT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.019777;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:21,4:15,3
-chr21	15220771	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.040295;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:11,1:26,4
-chr21	15220773	.	A	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.048187;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:13,1:26,4
-chr21	15939487	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.036677;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:15,4:13,1
-chr21	16546313	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=9.186e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:9,16:5,14:4,2
-chr21	16689769	.	C	CAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.030207;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:6,4:2,1
-chr21	18365632	.	T	TTC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:4,1:10,3
-chr21	20508556	.	TG	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.054119;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:11,1:21,3
-chr21	21720242	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.058442;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,4:9,1:5,3
-chr21	23147147	.	G	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0084455;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:20,5:18,2
-chr21	23785046	.	A	AG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:5,4:0,0
-chr21	24248367	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.2488;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:6,2:6,2
-chr21	25177275	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.000113;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:9,4:14,9
-chr21	25831247	.	A	AAAAAAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.020644;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,9:6,7:7,2
-chr21	25917261	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,5:13,4:9,1
-chr21	26395875	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,1:9,3
-chr21	29100700	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.030792;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,3:5,2
-chr21	30580160	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0032828;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:19,7:21,3
-chr21	31064060	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.19298;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:9,8:6,7:3,1
-chr21	31564155	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0087912;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:0,11:0,4:0,7
-chr21	31785300	.	T	TCACCACCACCAC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:0,5:0,4:0,1
-chr21	33242728	.	C	CAAA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:0,2:2,2
-chr21	33275152	.	CT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00052122;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:10,7:2,2
-chr21	33985104	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.017549;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,5:11,5
-chr21	34079602	.	ATT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0032051;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:4,4:6,7
-chr21	34563754	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.32712;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:5,2:5,2
-chr21	34563796	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:2,1:6,5
-chr21	34859485	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.0094e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,17:13,10:5,7
-chr21	35985942	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.012987;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:0,5:0,2:0,3
-chr21	36115398	.	AT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:5,5:1,1
-chr21	36458485	.	A	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=7.9266e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:19,7:14,5
-chr21	36489333	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0031363;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:38,16:22,9:16,7
-chr21	41655990	.	AAC	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040214;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:7,2:6,5
-chr21	41781015	.	A	AAGGAAGGGAGGG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:13,4:0,0
-chr21	42795970	.	C	CAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:2,5:6,1
-chr21	42840043	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,1:13,3
-chr21	42840044	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.065116;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:8,1:12,3
-chr21	42952795	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0042194;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,9:7,2
-chr21	44828163	.	C	CAAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.049781;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,10:14,9:6,1
-chr21	44973001	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.032506;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:20,6:26,3
-chr21	46005922	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.079663;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:14,4:21,1
-chr21	46209576	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.7127e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:27,21:14,9:13,12
-chr21	46502437	.	AT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:9,3:3,2
-chr22	10515468	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0026385;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,4:3,4
-chr22	10527435	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:1,0:17,4
-chr22	10532777	.	C	A	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.028811;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:93,21:45,5:48,16
-chr22	10558134	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:0,0:35,4
-chr22	10595912	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.015249;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:12,8:4,3
-chr22	10619665	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.027107;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,11:29,7:13,4
-chr22	10687725	.	G	T	0	PASS	DP=294;GPV=1;SPV=0.028858;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:131,17:64,7:67,10
-chr22	10688005	.	G	A	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.01099;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:87,16:35,9:52,7
-chr22	10689266	.	TTA	T	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.013255;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:47,11:18,4:29,7
-chr22	10710438	.	T	G	0	PASS	DP=477;GPV=1;SPV=7.9607e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:271:237,34:116,16:121,18
-chr22	10713037	.	A	C	0	PASS	DP=488;GPV=1;SPV=0.049445;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:237:211,26:118,15:93,11
-chr22	10713116	.	T	C	0	PASS	DP=486;GPV=1;SPV=0.031031;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:250:221,29:125,11:96,18
-chr22	10715443	.	G	C	0	PASS	DP=398;GPV=1;SPV=0.035464;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:193,24:78,10:115,14
-chr22	10735435	.	G	A	0	PASS	DP=591;GPV=1;SPV=0.025866;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:251,28:104,14:147,14
-chr22	10740709	.	T	C	0	PASS	DP=745;GPV=1;SPV=0.027163;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:400:345,55:187,30:158,25
-chr22	10774323	.	C	G	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.047186;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:112,18:43,7:69,11
-chr22	10783174	.	C	G	0	PASS	DP=537;GPV=1;SPV=0.0073097;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:300:268,32:153,20:115,12
-chr22	11025039	.	C	T	0	PASS	DP=536;GPV=1;SPV=0.046535;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:244,35:161,25:83,10
-chr22	11025413	.	A	C	0	PASS	DP=356;GPV=1;SPV=0.00050264;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:200:161,39:73,12:88,27
-chr22	11032829	.	C	G	0	PASS	DP=340;GPV=1;SPV=0.024978;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:187:160,27:85,12:75,15
-chr22	11037145	.	G	T	0	PASS	DP=580;GPV=1;SPV=0.030083;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:302:268,34:108,13:160,21
-chr22	11051002	.	A	AT	0	PASS	DP=339;GPV=1;SPV=0.0056207;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:174:123,25:79,15:44,10
-chr22	11051392	.	C	CTT	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.0010608;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:141:83,33:48,14:35,19
-chr22	11052377	.	G	A	0	PASS	DP=284;GPV=1;SPV=0.021315;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:132,24:60,14:72,10
-chr22	11053495	.	G	A	0	PASS	DP=524;GPV=1;SPV=0.03049;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:269:240,29:147,13:93,16
-chr22	11067683	.	G	T	0	PASS	DP=502;GPV=1;SPV=0.016094;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:280:239,41:117,19:122,22
-chr22	11704828	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.039473;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:15,4:11,2
-chr22	11706815	.	C	A	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.029311;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:85,19:43,12:42,7
-chr22	11716434	.	G	A	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.033757;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:56,11:26,4:30,7
-chr22	11789821	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.035057;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:11,5:27,1
-chr22	11792484	.	C	A	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.003997;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:70,23:29,9:41,14
-chr22	11800116	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.071318;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,1:13,3
-chr22	11808139	.	A	G	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.021598;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:107,15:37,6:70,9
-chr22	11824968	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.039036;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:17,4:14,1
-chr22	11849927	.	T	A	0	PASS	DP=280;GPV=1;SPV=0.015956;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:108,24:39,8:69,16
-chr22	11851137	.	C	T	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.0478;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:72,12:9,6:63,6
-chr22	11862800	.	G	T	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.0023027;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:138,26:75,6:63,20
-chr22	11862849	.	C	T	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.0099818;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:91,17:37,5:54,12
-chr22	11863886	.	T	C	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.021636;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:87,17:24,3:63,14
-chr22	11872739	.	G	A	0	PASS	DP=598;GPV=1;SPV=0.037931;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:321:276,45:67,26:209,19
-chr22	11880183	.	C	A	0	PASS	DP=758;GPV=1;SPV=0.029906;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:424:380,44:182,25:198,19
-chr22	11884747	.	T	C	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.022025;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:61,17:33,10:28,7
-chr22	11891373	.	G	A	0	PASS	DP=276;GPV=1;SPV=0.0083297;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:165:140,25:61,6:79,19
-chr22	11910029	.	T	C	0	PASS	DP=534;GPV=1;SPV=0.0017436;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:298:253,45:117,18:136,27
-chr22	11910052	.	ATT	A	0	PASS	DP=588;GPV=1;SPV=0.0077303;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:317:276,41:121,16:155,25
-chr22	11910108	.	C	T	0	PASS	DP=508;GPV=1;SPV=0.044125;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:249,30:105,14:144,16
-chr22	11919665	.	G	A	0	PASS	DP=689;GPV=1;SPV=0.044565;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:365:319,46:163,26:156,20
-chr22	11949405	.	A	T	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.023767;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,9:33,8:20,1
-chr22	11965872	.	A	AT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:14,5:13,6
-chr22	12041709	.	T	C	0	PASS	DP=376;GPV=1;SPV=0.027322;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:194:166,28:85,12:81,16
-chr22	12059080	.	T	C	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.031253;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:51,10:10,1:41,9
-chr22	12117801	.	CTTT	C	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.030243;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:55,9:23,4:32,5
-chr22	12141119	.	T	C	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.0016122;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:112,14:41,6:71,8
-chr22	12141913	.	T	A	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.035797;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:90,11:37,8:53,3
-chr22	12150278	.	A	T	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.03149;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:107,14:36,6:71,8
-chr22	12204530	.	A	G	0	PASS	DP=377;GPV=1;SPV=0.030182;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:198:168,30:78,11:90,19
-chr22	12217824	.	G	A	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.011982;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:72,21:47,16:25,5
-chr22	12297999	.	G	C	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.041699;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:85,20:27,7:58,13
-chr22	12379640	.	A	T	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.0093892;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:75,20:44,5:31,15
-chr22	12395058	.	C	T	0	PASS	DP=243;GPV=1;SPV=0.020863;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:107,25:59,17:48,8
-chr22	12494373	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.012821;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:28,9:2,1
-chr22	12621814	.	C	T	0	PASS	DP=320;GPV=1;SPV=0.031921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:170:150,20:75,13:75,7
-chr22	12621815	.	A	G	0	PASS	DP=327;GPV=1;SPV=0.0045834;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:153,24:75,16:78,8
-chr22	12628383	.	T	G	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.0056617;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:165:147,18:91,15:56,3
-chr22	12720595	.	C	T	0	PASS	DP=168;GPV=1;SPV=0.04159;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:71,11:41,9:30,2
-chr22	12791545	.	T	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.008703;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:24,7:21,1
-chr22	12807142	.	G	A	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.0090814;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:100,16:48,9:52,7
-chr22	12873772	.	C	T	0	PASS	DP=728;GPV=1;SPV=0.017611;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:393:350,43:189,14:161,29
-chr22	15251751	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.010876;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,4:5,2
-chr22	15544861	.	CT	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.014087;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:26,1:15,5
-chr22	15557613	.	A	T	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.032489;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:75,15:41,8:34,7
-chr22	15564283	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0074047;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,2:11,6
-chr22	15565713	.	G	A	0	PASS	DP=236;GPV=1;SPV=0.016353;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:100,18:58,8:42,10
-chr22	15569125	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr22	15578215	.	G	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.022403;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:57,16:27,6:30,10
-chr22	15679673	.	C	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.031468;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:40,14:21,7:19,7
-chr22	15737058	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.036388;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:16,4:10,8
-chr22	15737153	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,1:10,3
-chr22	15755684	.	C	A	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.0010651;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:59,11:30,4:29,7
-chr22	15803926	.	CA	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.030404;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:22,2:14,6
-chr22	15803932	.	A	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.033733;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:22,2:10,6
-chr22	15817353	.	C	A	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.033127;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:60,16:33,9:27,7
-chr22	16451898	.	T	C	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.023234;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:72,10:32,2:40,8
-chr22	16677660	.	CT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,3:1,1
-chr22	17680215	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01398;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:10,8:5,1
-chr22	18491271	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.025398;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:10,2:15,4
-chr22	18526584	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.045802;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:8,3:14,3
-chr22	18631998	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.040114;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:9,5:11,1
-chr22	18748951	.	T	C	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.0042912;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:51,19:22,8:29,11
-chr22	19589749	.	ATGTGTGTG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:7,1:8,3
-chr22	19647482	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:5,2:2,1:3,1
-chr22	21167912	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr22	21171889	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.049568;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:12,3:9,4
-chr22	21283575	.	G	A	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.0052909;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:54,13:48,9:6,4
-chr22	21327287	.	ATATTTAATG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041126;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,1:5,4
-chr22	21789901	.	TA	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.035754;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:24,3:13,5
-chr22	22336932	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.035811;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:15,5:16,4
-chr22	22634572	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.011338;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:7,2:31,4
-chr22	22636857	.	A	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.074196;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:20,2:21,3
-chr22	22638606	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.023491;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:14,1:24,5
-chr22	23156145	.	G	GAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.026014;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:7,2:8,2
-chr22	23718138	.	CAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,6:5,4:2,2
-chr22	23917756	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.015459;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:13,6:1,2
-chr22	23951068	.	TC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:5,1:14,3
-chr22	24261891	.	G	A	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.028928;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:57,9:29,8:28,1
-chr22	24643645	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.04342;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:16,1:20,4
-chr22	25497868	.	CAAA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0012088;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:11,14:2,2
-chr22	26416397	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=2.1596e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:15,12:7,7
-chr22	27036071	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.032284;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:8,5:4,2
-chr22	27041284	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=8.6693e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,19:13,9:8,10
-chr22	27130166	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,5:3,1
-chr22	30454606	.	ATAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1396;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:5,2:19,3
-chr22	31129542	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:4,3:5,3
-chr22	31377200	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.028009;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,8:5,6:5,2
-chr22	31795065	.	AT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.030178;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:15,8:3,2
-chr22	32559832	.	C	CA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.016203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,6:17,4:16,2
-chr22	33139537	.	C	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.1736e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:32,20:16,9:16,11
-chr22	33220224	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=4.4311e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:30,19:10,11:20,8
-chr22	33574686	.	TTGTGTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,10:4,4:4,6
-chr22	33805508	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.6689e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:13,9:12,5
-chr22	33805761	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0080302;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:12,8:3,5:9,3
-chr22	34168569	.	C	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00018622;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:40,14:19,6:21,8
-chr22	34437204	.	GA	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.0526e-06;SS=2;SSC=55;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:11,8:10,7
-chr22	34664854	.	A	AT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00025582;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,10:8,8:7,2
-chr22	35875607	.	GGTGT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:5,3:6,2
-chr22	36210011	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=6.4115e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:14,7:10,7
-chr22	36251070	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.019126;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,8:17,7:4,1
-chr22	36354956	.	A	AACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.11312;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:14,4:16,1
-chr22	37711592	.	AC	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.010299;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,8:7,6:12,2
-chr22	37728262	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:5,2:2,1:3,1
-chr22	38478534	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0093932;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,10:4,4:7,6
-chr22	39620766	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.16591;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:24,4:13,2:11,2
-chr22	40145067	.	C	CAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.041183;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,8:9,7:11,1
-chr22	41033338	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.013602;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:16,5:12,8
-chr22	41066798	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=2.8289e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:21,22:14,12:7,10
-chr22	41357774	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=6.1491e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:16,8:21,6
-chr22	41457120	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.012882;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,6:3,1
-chr22	41864324	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011216;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:3,3:3,2
-chr22	41864326	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01192;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,8:5,6:4,2
-chr22	42666228	.	C	CAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0095299;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,13:11,11:5,2
-chr22	43165890	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:12,3:2,1
-chr22	44629323	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.048243;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,7:11,5:9,2
-chr22	45063002	.	AATTTT	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.023653;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:7,8:19,2
-chr22	47667517	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,2:2,2
-chr22	48726557	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.031171;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:13,5:27,1
-chr22	48726583	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.048775;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:12,2:20,3
-chr22	48726597	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,3:17,1
-chr22	48956408	.	A	AC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0030462;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:4,3:7,6
-chr22	49066953	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.11845;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:13,2:16,3
-chr22	49433501	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:8,3:5,1
-chr22	49693705	.	T	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00011692;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:16,3:17,10
-chr3	4566604	.	G	GCACACACA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019985;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,10:6,8:3,2
-chr3	5111167	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,0:13,4
-chr3	6429035	.	C	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,2:9,2
-chr3	6799365	.	G	GA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0020146;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:13,5:4,3
-chr3	8612658	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.026298;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:5,5:9,1
-chr3	8742375	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.030897;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:4,3:8,1
-chr3	9511350	.	CA	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0034707;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:14,5:7,2
-chr3	11841073	.	ATTT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.025708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:9,3:2,2
-chr3	18305569	.	C	CTCTCTCT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:2,4:2,1:0,3
-chr3	18324800	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.04073;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:6,2:16,5
-chr3	18553747	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.0994e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:14,9:12,4
-chr3	20755436	.	T	TTG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.024017;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,8:3,5:5,3
-chr3	20856087	.	CCAGAGT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023613;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:9,5:3,1
-chr3	20856104	.	C	CCAGAGT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.012694;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,7:6,5:1,2
-chr3	20988867	.	CTT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,8:8,4:6,4
-chr3	21682728	.	CT	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=9.7753e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:15,7:15,8
-chr3	21689130	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.013927;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,8:8,2
-chr3	22530753	.	G	GTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
-chr3	22546163	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.017286;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:9,4:5,7
-chr3	23113226	.	C	CAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,5:0,4:3,1
-chr3	23290889	.	T	TAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0079695;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:10,7:5,1
-chr3	23752505	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:5,4:5,5
-chr3	24787864	.	TATACAC	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.041843;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:13,6:10,5
-chr3	24913402	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:23:3,9:3,4:0,5
-chr3	25133963	.	T	TAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.014127;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,9:8,5:12,4
-chr3	27587474	.	A	AT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.7952e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:5,9:12,4
-chr3	28015880	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,1:5,3
-chr3	29435973	.	C	CAA	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00034388;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:30,18:12,15:18,3
-chr3	30186088	.	T	TTAA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.088833;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:17,1:19,3
-chr3	33434289	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,1:2,3
-chr3	34654288	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:0,0:18,4
-chr3	36918610	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.030957;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,4:7,1
-chr3	38033298	.	A	ATTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,7:2,4:10,3
-chr3	38259441	.	CAT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:5,4:3,1
-chr3	38759067	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0035502;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:16,5:17,4
-chr3	39512143	.	G	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0027042;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:27,4:16,6
-chr3	42271566	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=3.6217e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,18:11,10:6,8
-chr3	42427757	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0059941;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,9:8,7:6,2
-chr3	44191534	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,4:8,2:4,2
-chr3	45205918	.	CATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.02087;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,3:3,3
-chr3	46699060	.	A	ATT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0037707;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,7:2,5:1,2
-chr3	47316564	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,1:8,3
-chr3	47539503	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10559;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:19,2:13,2
-chr3	47650304	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.069378;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,2:13,2
-chr3	47708086	.	T	TTTTTC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,3:10,1
-chr3	47769210	.	C	CCA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:2,4:6,1
-chr3	48100231	.	A	ATTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.0012432;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,7:0,4:1,3
-chr3	48825028	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,5:4,2
-chr3	49145119	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:3,4:10,1
-chr3	49564269	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.295e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:26,21:17,11:9,10
-chr3	50729353	.	TTA	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.053325;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:24,3:17,3
-chr3	51515929	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0737;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:10,5:5,1
-chr3	51527671	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.013574;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:12,6:6,3
-chr3	51777374	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.032319;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,10:13,6:10,4
-chr3	52793297	.	A	AT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.013344;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,8:15,4:10,4
-chr3	53316596	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:6,10:3,5:3,5
-chr3	53555439	.	T	TGG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,4:14,2:7,2
-chr3	55589215	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:12,3:7,1
-chr3	57649530	.	T	TA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0026369;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:9,6:8,7
-chr3	59646497	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:2,4:3,1
-chr3	64193563	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.0579e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:13,6:13,6
-chr3	66941692	.	TCTAG	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.017873;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,6:10,4:4,2
-chr3	67679793	.	T	TA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,7:3,6:3,1
-chr3	68148279	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=1.8779e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:13,12:12,9
-chr3	69656637	.	TGTGCAACA	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=3.2589e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:12,4:11,9
-chr3	73162166	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0034955;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,14:7,9:9,5
-chr3	74233543	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=5.8154e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:6,7:11,7
-chr3	75443072	.	CATATATAT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.056191;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,7:5,3:5,4
-chr3	75466093	.	TTCTCTC	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049667;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,7:9,6:4,1
-chr3	75544518	.	T	TA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.030143;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:11,3:4,5
-chr3	75630855	.	T	C	0	PASS	DP=432;GPV=1;SPV=0.0086559;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:193,34:89,14:104,20
-chr3	75636215	.	TTTACA	T	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.00073785;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:34,18:23,7:11,11
-chr3	75799240	.	G	A	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.043876;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:65,8:37,6:28,2
-chr3	76160831	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00040665;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:15,4:18,8
-chr3	76603332	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:6,3:6,1
-chr3	76941714	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=3.6992e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:14,10:10,8
-chr3	77437661	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=4.4652e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:26,19:15,11:11,8
-chr3	78712038	.	A	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,2:5,3
-chr3	82029772	.	A	C	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=8.5764e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:15,6:21,6
-chr3	82731343	.	T	TCA	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.045958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,9:13,3:8,6
-chr3	83829507	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0018636;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:23,7:14,4
-chr3	84560279	.	T	TA	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0019283;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:13,2:24,7
-chr3	84817008	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=6.8751e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:8,7:12,5
-chr3	85175919	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019062;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,4:5,1
-chr3	85327554	.	C	CCACACACA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,3:6,2
-chr3	85769360	.	GTA	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.036961;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:15,7:8,3
-chr3	85776336	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.048633;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:14,8:8,1
-chr3	86455500	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=4.5883e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:23,6:13,8
-chr3	86819647	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.25076;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:11,1:18,3
-chr3	86843970	.	T	TAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,3:5,2
-chr3	86934470	.	CTA	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.13232;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:19,1:15,3
-chr3	87168932	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,3:11,1
-chr3	88600837	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.6063e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:7,7:12,8
-chr3	89415467	.	A	AATATATATATATATAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:15,1:6,3
-chr3	89570143	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.032087;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,12:17,7:4,5
-chr3	90078631	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=9.0699e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:19,5:13,9
-chr3	90709652	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=7.1674e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:3,17:1,6:2,11
-chr3	90793933	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.041838;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:10,2:13,3
-chr3	90798273	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.019069;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:1,1:22,8
-chr3	90819203	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.13808;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:34,4:1,0
-chr3	90820754	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0075937;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:26,4:11,5
-chr3	90940738	.	C	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.03083;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:18,4:24,6
-chr3	90946971	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:1,1:4,7
-chr3	90960127	.	T	C	0	PASS	DP=427;GPV=1;SPV=0.017457;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:202,25:43,5:159,20
-chr3	90960336	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.049167;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:25,3:18,2
-chr3	90964893	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:21,4:1,0
-chr3	90972114	.	T	A	0	PASS	DP=294;GPV=1;SPV=0.046319;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:118,20:8,1:110,19
-chr3	91033421	.	C	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.22913;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:17,3:3,1
-chr3	91114091	.	C	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.01548;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:0,1:4,5
-chr3	91136381	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
-chr3	91155170	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
-chr3	91168881	.	T	A	0	PASS	DP=270;GPV=1;SPV=0.039095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:127,20:46,5:81,15
-chr3	91185986	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.071233;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:14,1:22,3
-chr3	91257575	.	A	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.023;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:11,6:22,6
-chr3	91734902	.	T	G	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.020773;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:74,14:52,10:22,4
-chr3	92895933	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.11326;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:17,4:24,1
-chr3	93231826	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0097821;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,5:7,2
-chr3	93628962	.	A	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
-chr3	95045306	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.2804e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,20:8,10:10,10
-chr3	95799926	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=2.1763e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:30,19:13,13:17,6
-chr3	97179717	.	G	GTCTCTCTC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.047969;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:11,5:12,4
-chr3	97516006	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00016135;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:14,8:6,4
-chr3	97669261	.	G	GT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0012641;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:13,5:14,4
-chr3	98689394	.	T	TATACATGGAAACATATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,2:3,2
-chr3	98761022	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00030829;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:22,5:13,8
-chr3	102475930	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=2.6232e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:31,19:18,10:13,9
-chr3	103575380	.	A	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=5.1599e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:7,8:12,8
-chr3	104230578	.	CAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:2,5:8,1
-chr3	104405069	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:3,3:8,1
-chr3	105280352	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.1019;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,2:17,2
-chr3	106155491	.	GCA	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.015187;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:13,11:8,2
-chr3	107251876	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00055017;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:16,6:18,6
-chr3	107829977	.	CTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,5:5,1
-chr3	108704397	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,4:7,2:6,2
-chr3	108780415	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.7129e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:14,7:15,12
-chr3	109355488	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:12,7:2,1
-chr3	109421528	.	T	TC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0090069;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:9,8:4,1
-chr3	111869715	.	G	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.048716;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:12,2:16,3
-chr3	112483140	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,6:5,1
-chr3	113087776	.	A	AGT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0064207;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:15,11:12,6:3,5
-chr3	113113781	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,11:1,8:6,3
-chr3	113683464	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:5,2:6,2
-chr3	115111003	.	TAA	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.013855;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:17,4:18,2
-chr3	118309745	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=6.2466e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,17:6,5:10,12
-chr3	119504434	.	C	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=7.4019e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:25,25:13,15:12,10
-chr3	119662233	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0033075;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:12,6:1,2
-chr3	120377256	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0018544;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:10,1:6,8
-chr3	121486895	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:5,3:2,2:3,1
-chr3	123152111	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024337;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:3,8:9,1
-chr3	124437274	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.030818;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:16,6:17,1
-chr3	126807268	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.0613e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:10,8:4,5
-chr3	133107455	.	G	GGT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0033467;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,8:9,4:5,4
-chr3	135035840	.	A	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=2.8928e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:13,10:14,9
-chr3	135277886	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:1,2:0,1:1,1
-chr3	135588978	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.024419;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:11,7:6,3
-chr3	137401062	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=9.5596e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:18,7:17,5
-chr3	138005386	.	G	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033449;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:2,2:14,10
-chr3	138100978	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.6652e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,22:16,9:12,13
-chr3	141458365	.	T	TTATATA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.005394;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:9,8:4,2
-chr3	142496280	.	A	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.012987;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,5:0,4:0,1
-chr3	142528879	.	A	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0625;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,3:2,1:2,2
-chr3	142919712	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:7,3:4,2
-chr3	143854335	.	A	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=5.0272e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:8,8:14,9
-chr3	143929350	.	TAG	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.021372;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:13,4:16,1
-chr3	143967825	.	AC	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,2:7,2
-chr3	147567553	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:14,4:7,1
-chr3	147669410	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=3.684e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:40,16:14,8:26,8
-chr3	148190448	.	A	AACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.020817;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:8,4:9,3
-chr3	148565382	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.021135;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:13,4:9,1
-chr3	150111994	.	C	CAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:6,3:2,1
-chr3	151071977	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.04952;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,3:6,5
-chr3	152727690	.	AAGAGAGAGAGAGAGAG	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.011438;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,4:3,2:0,2
-chr3	152988157	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.040975;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:9,4:22,6
-chr3	153038706	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.062923;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:20,3:19,2
-chr3	153264487	.	A	AAC	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.037551;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:15,4:9,1
-chr3	154187380	.	A	ATT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00044676;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:9,7:6,5
-chr3	154667490	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,4:8,1
-chr3	157202415	.	C	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.040969;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:14,6:21,2
-chr3	158518150	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:6,1:4,4
-chr3	161289048	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:14,3:7,1
-chr3	163096266	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.020382;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,7:14,5:9,2
-chr3	163902659	.	T	TAATA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.046295;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,9:9,6:5,3
-chr3	165738521	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:9,11:5,8:4,3
-chr3	167775225	.	T	TTTA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0034869;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:12,5:12,6
-chr3	169550820	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,8:4,2:7,6
-chr3	169772316	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.21107;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:10,3:9,2
-chr3	170158927	.	G	GA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.028751;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,9:8,7:10,2
-chr3	170700348	.	C	CT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00014726;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:15,9:11,3
-chr3	171478467	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.8834e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:21,22:11,11:10,11
-chr3	171639566	.	TA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1671;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,5:9,4:9,1
-chr3	172156801	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.031443;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:18,6:25,1
-chr3	175242572	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.1486e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:31,22:15,8:16,14
-chr3	177090517	.	T	TAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.046659;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:16,3:5,5
-chr3	178908086	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=3.1049e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,23:7,15:15,8
-chr3	179023713	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,7:2,3:2,4
-chr3	179624571	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.16358;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,4:18,1:4,3
-chr3	179679794	.	GT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:8,3:1,1
-chr3	179847051	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0028187;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:10,6:16,4
-chr3	180010267	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:2,3:12,1
-chr3	180276865	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00082467;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:10,5:15,8
-chr3	180877568	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=3.8427e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:14,12:13,12
-chr3	181725038	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0062713;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,6:1,5:1,1
-chr3	182762165	.	C	CAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.010647;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,11:10,7:9,4
-chr3	184075552	.	A	AACACACACAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0086792;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:11,7:4,3
-chr3	184542153	.	A	ACGACGAGACCCAGCTCACAATGGGAC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.036872;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:13,1:14,4
-chr3	184640882	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
-chr3	186625004	.	T	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.064931;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:18,1:23,4
-chr3	188294056	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:16,4:1,0
-chr3	189881272	.	T	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0072131;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:31,1:8,7
-chr3	191528605	.	TA	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.064526;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,2:13,2
-chr3	191528613	.	T	TA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.060505;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:14,2:16,2
-chr3	191528616	.	TA	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.076851;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:16,2:16,2
-chr3	192190468	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,4:2,1
-chr3	194092184	.	GGTTTT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.35217;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:9,3:2,1
-chr3	195045214	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,3:4,3
-chr3	195185100	.	AG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,5:2,3:2,2
-chr3	195498776	.	G	A	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.046033;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:86,10:62,8:24,2
-chr3	195499154	.	C	A	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.025408;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:84,12:46,4:38,8
-chr3	195649841	.	CAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAG	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.024221;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:22,2:6,4
-chr3	195730099	.	CAAAAAAA	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.043916;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,11:17,9:5,2
-chr3	195857983	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:4,5:2,3
-chr3	195872023	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.039859;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:16,9:12,2
-chr3	196025207	.	ACGC	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.065833;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,3:16,2
-chr3	196766931	.	C	CGTGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.046544;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,9:14,6:3,3
-chr3	196769817	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.010302;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,10:8,3:11,7
-chr3	197652901	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.017918;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:20,1:7,4
-chr3	197664611	.	A	G	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.049555;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:25,9:19,4
-chr3	197665269	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.028535;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:41,15:5,2:36,13
-chr3	198103423	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018146;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,3:4,4
-chr4	21086	.	TA	T	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.038694;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:76,18:34,10:42,8
-chr4	21124	.	C	T	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.019434;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:57,15:16,6:41,9
-chr4	28967	.	C	T	0	PASS	DP=500;GPV=1;SPV=0.020359;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:267:236,31:115,17:121,14
-chr4	30599	.	C	T	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.030157;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:110,15:57,6:53,9
-chr4	47344	.	G	T	0	PASS	DP=430;GPV=1;SPV=0.032683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:235:209,26:108,11:101,15
-chr4	1152938	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:3,5:6,1
-chr4	1357096	.	C	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.04248;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,11:17,5:25,6
-chr4	1424134	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018564;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:11,6:1,2
-chr4	1615502	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00012864;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:6,9:1,2
-chr4	4076282	.	G	GTATGTA	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.13283;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:28,4:14,1:14,3
-chr4	4857672	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.023724;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:18,5:21,2
-chr4	5740470	.	CAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.023166;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:7,2:7,3
-chr4	6067677	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.037705;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:7,3:15,3
-chr4	7362923	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,4:5,2:11,2
-chr4	7525810	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,1:4,3
-chr4	7862415	.	C	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,2:6,2:0,0
-chr4	8823593	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.010536;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:2,5:7,1
-chr4	8842317	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.002173;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:3,9:2,4:1,5
-chr4	9249263	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.086687;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
-chr4	9710191	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=2.0186e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:27,23:12,16:15,7
-chr4	10778181	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.079656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,3:15,1
-chr4	10953112	.	ATCTTTCTTTCTTTCTT	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0023163;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,7:4,2:11,5
-chr4	14436315	.	C	CAA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.027568;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,7:13,4:3,3
-chr4	15790424	.	G	A	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.0084712;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:63,8:35,4:28,4
-chr4	16004829	.	T	TTCTTTCTTTTTTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,5:4,1:17,4
-chr4	16094108	.	GGAGAGAGAGAGAGAGA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,4:12,3:6,1
-chr4	16179788	.	T	TTATATATATATATATATGTGTATA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.040844;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:11,3:10,3
-chr4	16312513	.	CT	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.017433;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:18,7:6,2
-chr4	17182251	.	TTG	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.044315;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:15,2:14,5
-chr4	17440806	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0047587;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:11,3:3,3
-chr4	17703014	.	C	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=7.4469e-09;SS=2;SSC=81;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:29,24:14,11:15,13
-chr4	19226220	.	AAT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:3,2:7,7
-chr4	19543854	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.7594e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,18:14,10:12,8
-chr4	19683119	.	C	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0011232;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:13,5:21,6
-chr4	20748560	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,4:0,2:1,2
-chr4	22316714	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.092709;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,2:14,2
-chr4	22389501	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0014573;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,17:6,11:10,6
-chr4	23724299	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.018169;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:17,5:29,1
-chr4	23727998	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,11:5,7:3,4
-chr4	24049324	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:14,2:14,2
-chr4	26210662	.	T	TC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,2:16,2
-chr4	26210686	.	C	CTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:0,1:4,1
-chr4	26793722	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:7,7:7,1
-chr4	27175793	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0059543;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,6:1,1:9,5
-chr4	27218850	.	A	AT	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0011791;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:25,7:6,2
-chr4	27808133	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:8,8:5,2
-chr4	28359297	.	A	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00079295;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:18,6:16,4
-chr4	29872258	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=4.1611e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,17:14,11:6,6
-chr4	31720292	.	G	GT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:1,2:3,2
-chr4	31798786	.	C	CGTGTGT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0062769;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,13:12,10:10,3
-chr4	31861304	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0029048;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:17,7:20,4
-chr4	32090979	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=6.109e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:41,16:25,9:16,7
-chr4	32185674	.	A	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.002307;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:47,9:24,4:23,5
-chr4	32201646	.	CTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
-chr4	32703978	.	C	CA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0014364;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,3:10,7
-chr4	33791174	.	G	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.00019843;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:42,12:20,8:22,4
-chr4	35203275	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:9,2:4,4
-chr4	36161793	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:5,3:4,2
-chr4	38733519	.	GTGTTGGTGT	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.046608;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:12,5:11,2
-chr4	39621686	.	CTTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011976;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,8:10,7:2,1
-chr4	40579423	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:5,2:4,4
-chr4	40862856	.	CAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.021719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,12:15,11:2,1
-chr4	43758090	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,2:14,2
-chr4	44556770	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,3:13,2
-chr4	45867458	.	G	GTGTATATATATATATA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:3,2:4,2
-chr4	46289907	.	ATT	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.044221;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:22,3:12,2
-chr4	48054636	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.17909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:7,1:12,4
-chr4	48328708	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0087456;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:14,4:10,3
-chr4	48525196	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:6,4:7,6
-chr4	49092498	.	C	CTCCAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,4:3,2:2,2
-chr4	49158430	.	C	A	0	PASS	DP=304;GPV=1;SPV=0.031269;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:165:141,24:84,16:57,8
-chr4	49160935	.	CA	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.017397;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:19,6:20,9
-chr4	49165571	.	G	T	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.018516;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:88,17:56,9:32,8
-chr4	49165572	.	G	A	0	PASS	DP=212;GPV=1;SPV=0.042337;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:88,15:56,7:32,8
-chr4	49166740	.	A	T	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.020034;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:56,16:20,9:36,7
-chr4	49172846	.	C	T	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.038903;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:95,11:59,6:36,5
-chr4	49203841	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.0047291;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:48,14:24,9:24,5
-chr4	49265404	.	G	A	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.011339;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:107,18:56,10:51,8
-chr4	49303883	.	A	C	0	PASS	DP=403;GPV=1;SPV=0.049703;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:183,34:57,17:126,17
-chr4	49322686	.	A	C	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.028229;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:80,19:50,10:30,9
-chr4	49487962	.	T	C	0	PASS	DP=484;GPV=1;SPV=0.028327;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:254:214,40:132,28:82,12
-chr4	49489739	.	TA	T	0	PASS	DP=258;GPV=1;SPV=0.037715;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:109,22:77,18:32,4
-chr4	49496839	.	C	T	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.033017;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:62,14:33,8:29,6
-chr4	49519551	.	CT	C	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.011027;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:59,8:31,2:28,6
-chr4	49527442	.	G	A	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.010246;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:63,20:39,15:24,5
-chr4	49529342	.	G	C	0	PASS	DP=592;GPV=1;SPV=0.0055449;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:317:277,40:165,24:112,16
-chr4	49533523	.	G	A	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.046806;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:61,11:41,5:20,6
-chr4	49537433	.	C	G	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.019956;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:46,16:22,12:24,4
-chr4	49542539	.	G	A	0	PASS	DP=427;GPV=1;SPV=0.0057894;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:201:173,28:108,19:65,9
-chr4	49555640	.	AG	A	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.022795;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:86,18:50,14:36,4
-chr4	49575288	.	T	C	0	PASS	DP=830;GPV=1;SPV=0.0027971;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:443:393,50:222,14:171,36
-chr4	49586916	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.068062;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:22,1:20,4
-chr4	49850379	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.037462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:16,6:13,4
-chr4	49851921	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0094549;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,5:6,2
-chr4	49939383	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.14664;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:30,4:0,0
-chr4	50038969	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.033201;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:17,3:20,2
-chr4	50184328	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.022285;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:7,1:19,4
-chr4	50313315	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
-chr4	50463062	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
-chr4	51200019	.	T	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,2:0,1
-chr4	51366296	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.010902;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:21,7:1,1
-chr4	51482938	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
-chr4	55112523	.	ATT	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:15,6:5,4
-chr4	55599562	.	C	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=9.2297e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:11,8:9,6
-chr4	57004352	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0038335;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:7,3:1,4
-chr4	57745313	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=4.6766e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,17:11,9:22,8
-chr4	62365096	.	A	AAGAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00062679;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,12:2,6:12,6
-chr4	62386861	.	TAATTA	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.047782;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,4:11,2:12,2
-chr4	62461367	.	G	GTA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:6,4:3,1
-chr4	63196055	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047649;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:9,2:12,5
-chr4	65150951	.	CTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,2:1,1:3,1
-chr4	65879955	.	G	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=5.7369e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,15:19,6:18,9
-chr4	67908105	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.2487e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:12,11:16,6
-chr4	68430719	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=3.7488e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:9,10:10,6
-chr4	71724273	.	G	GT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,4:6,3:2,1
-chr4	72041131	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=6.0035e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:12,6:17,6
-chr4	74589660	.	A	AAAGAAAAAGAAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.023057;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,11:14,7:12,4
-chr4	75109844	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:3,2:2,1:1,1
-chr4	75132082	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.025792;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:17,3:24,4
-chr4	75648366	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:5,2:3,1:2,1
-chr4	76916700	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0097756;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:18,5:13,9
-chr4	76918370	.	C	G	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.042657;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:80,13:29,7:51,6
-chr4	77797102	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.043236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,6:5,5:5,1
-chr4	78930885	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.023736;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,11:11,4:7,7
-chr4	80729592	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,5:3,2
-chr4	83466706	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0011564;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:23,7:13,5
-chr4	83578938	.	T	TTTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:2,1:21,3
-chr4	84635633	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.10299;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:2,1:35,4
-chr4	84784885	.	TATATATAC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:10,2:2,5
-chr4	85570379	.	T	TTTC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,4:7,2:8,2
-chr4	86932059	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,5:4,1:1,4
-chr4	87505725	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.056777;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:11,1:18,3
-chr4	88231894	.	C	CTCTCTCTCTCTGTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021064;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,11:8,3:4,8
-chr4	91138278	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.004644;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:5,2:0,5
-chr4	91879966	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.0683e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:7,7:18,9
-chr4	94087635	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.035616;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:14,2:21,3
-chr4	95130728	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.036816;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:10,2:7,5
-chr4	98021197	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.014547;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:14,5:6,5
-chr4	98308297	.	C	CTATATATATATATA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,5:4,1
-chr4	98651864	.	CTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.013932;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:1,3:2,2
-chr4	98809849	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,4:7,3:7,1
-chr4	99506685	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.098889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:12,1:20,3
-chr4	99580151	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.6764e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:6,4:7,7
-chr4	99879928	.	CCTA	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.011404;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:10,12:12,3
-chr4	100244880	.	T	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0077364;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:19,4:12,2
-chr4	100394409	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.036308;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:14,5:17,3
-chr4	100864149	.	T	TCTGTTTTGGTACCAAAACCATG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.11667;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:10,2:10,1
-chr4	102104244	.	A	AT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0060915;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:11,8:10,1
-chr4	102864425	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030178;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:10,7:8,3
-chr4	104192187	.	AGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00042498;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,16:13,12:10,4
-chr4	104844854	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=1.3642e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:28,21:14,15:14,6
-chr4	105621869	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.8323e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:11,6:16,8
-chr4	108175384	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.044595;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:19,5:1,1
-chr4	109239396	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:10,4:6,1:4,3
-chr4	109600286	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.0945e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:11,13:11,7
-chr4	110333607	.	CT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.049659;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:13,3:12,2
-chr4	111158096	.	A	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=1.4098e-13;SS=2;SSC=128;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:17,29:9,14:8,15
-chr4	116499744	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.081098;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,1:15,3
-chr4	118645727	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0092391;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:7,3:12,11
-chr4	122130051	.	G	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=2.6286e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:35,19:20,7:15,12
-chr4	122811152	.	C	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.075047;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,5:16,4:12,1
-chr4	122811153	.	C	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.065377;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,5:15,4:11,1
-chr4	122918612	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=8.7554e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:14,10:9,3
-chr4	124870777	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0092505;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:2,2:8,3
-chr4	125372363	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00052629;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:4,8:6,4
-chr4	125416368	.	AT	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00054114;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:14,5:6,3
-chr4	125814620	.	T	TAC	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.030258;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:16,7:10,3
-chr4	126826572	.	G	GTATA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,8:6,7:0,1
-chr4	126826600	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,2:3,1:2,1
-chr4	128112466	.	A	AT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
-chr4	128166964	.	CTCTCTCTA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0070686;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:3,4:10,2
-chr4	128569414	.	G	GTC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.026923;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:15,6:11,5
-chr4	130205019	.	C	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=1.7469e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:31,26:16,13:15,13
-chr4	130270827	.	G	GT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:1,4:7,1
-chr4	130854009	.	T	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00013424;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:17,11:16,4
-chr4	131135835	.	G	GCACACA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.045915;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,10:10,8:11,2
-chr4	131740266	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.004483;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:2,2:9,4
-chr4	132831138	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00029821;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:18,6:14,6
-chr4	132902637	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.060413;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:12,4:5,1
-chr4	133496249	.	TATATAC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037594;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,3:10,1
-chr4	134641189	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.010272;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,7:10,3
-chr4	134956521	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.19246;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,1:12,3
-chr4	137022669	.	G	GA	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.040564;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:21,5:6,2
-chr4	138854401	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.22535;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:11,2:15,1
-chr4	138923840	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11029;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:4,2:2,1:2,1
-chr4	140614921	.	CA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0095364;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:11,6:2,3
-chr4	140983742	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0014575;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:11,4:10,4
-chr4	141119050	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.013909;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:6,1:14,4
-chr4	145215419	.	G	GTTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.32536;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,4:5,3:8,1
-chr4	146765921	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=7.0418e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:35,17:20,8:15,9
-chr4	147798761	.	CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.013369;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:2,6:0,3:2,3
-chr4	147867863	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.018307;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:2,5:3,1
-chr4	149267825	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.862e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:9,12:16,6
-chr4	150086512	.	T	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0064693;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:17,5:12,6
-chr4	150754542	.	AG	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,3:7,2
-chr4	153163495	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,8:2,2:2,6
-chr4	153456166	.	G	GAA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.11527;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:24,2:21,4
-chr4	153895592	.	G	GTTT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:5,2:0,0
-chr4	155173126	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.031711;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:19,2:20,4
-chr4	155982067	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=4.2063e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:13,10:18,5
-chr4	157669914	.	T	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=1.0479e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:34,17:14,8:20,9
-chr4	158916630	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.077327;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,5:8,4:13,1
-chr4	158916631	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.074336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,5:8,4:14,1
-chr4	159005221	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,6:5,1
-chr4	159430345	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00029985;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:6,5:8,5
-chr4	160360770	.	C	CTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0025584;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:5,5:3,5
-chr4	161052263	.	C	CTCTCTCTA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,2:2,1:1,1
-chr4	161186214	.	A	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=8.3642e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:32,16:18,6:14,10
-chr4	161342541	.	TTTATGTTATGTTATG	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.043779;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:7,3:8,4
-chr4	162351929	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,1:2,3
-chr4	162485398	.	GA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0014491;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:11,3:3,6
-chr4	162657510	.	AGAC	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.056049;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,5:16,4:8,1
-chr4	162915733	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00047367;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:22,5:9,6
-chr4	163199042	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.4696e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:10,8:15,8
-chr4	163223224	.	C	CA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.031154;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:22,2:10,3
-chr4	164497765	.	G	GAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0037259;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,14:8,11:6,3
-chr4	165014989	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,5:4,3:8,2
-chr4	166363782	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=9.0495e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:12,10:10,8
-chr4	166665954	.	A	AATATATATG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:3,8:0,6:3,2
-chr4	166666013	.	T	TA	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.1172;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:20,3:20,2
-chr4	166666014	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.10871;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:21,3:19,2
-chr4	167109021	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.021089;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:3,2:12,11
-chr4	167975896	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=9.4913e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:9,9:9,9
-chr4	171518253	.	CT	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.017274;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:15,3:14,2
-chr4	171518255	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0069114;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:13,3:13,3
-chr4	171656936	.	G	GTA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016254;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,5:5,4:0,1
-chr4	173754359	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0033601;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:25,7:10,7
-chr4	174859389	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.013587;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:7,3:7,5
-chr4	174862643	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.021726;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:11,7:4,2
-chr4	176076213	.	TA	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,4:8,3:4,1
-chr4	176421497	.	A	AT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.6461e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:10,9:18,6
-chr4	177498550	.	G	GATATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.058687;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,2:2,2
-chr4	177885341	.	C	CAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.004156;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,9:4,6:0,3
-chr4	179122135	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0032257;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:15,5:14,3
-chr4	179566552	.	C	CTTTTTTTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0067977;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,2:5,4
-chr4	180439431	.	T	TTA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,2:1,1:3,1
-chr4	183407768	.	CTT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0097931;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:7,5:11,9
-chr4	183874991	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:4,3:1,3
-chr4	184133165	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.011528;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:13,7:10,6:3,1
-chr4	185584163	.	GC	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:8,9:5,1
-chr4	185874841	.	G	GC	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.024131;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:14,4:18,6
-chr4	185874842	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.012735;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:14,4:10,6
-chr4	185985229	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.045915;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,10:6,1:15,9
-chr4	186540733	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.051203;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:8,3:12,3
-chr4	187466874	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.079813;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,5:19,3:13,2
-chr4	187652621	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.014141;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,8:6,1
-chr4	187901083	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00012624;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:10,4:12,7
-chr4	188246179	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=3.46e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:16,10:14,5
-chr4	188270840	.	A	AGCC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.062683;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,5:10,1:6,4
-chr4	188659313	.	G	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=9.4727e-10;SS=2;SSC=90;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:42,26:20,9:22,17
-chr4	188765953	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0031851;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:12,10:6,2
-chr5	110378	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.062683;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:9,4:7,1
-chr5	302652	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.007417;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:13,11:5,4
-chr5	727404	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.009628;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:5,6:5,4
-chr5	1047356	.	ATGAG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0033308;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:7,4:6,9
-chr5	1238415	.	G	GA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12114;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,2:9,2
-chr5	2124221	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=6.3214e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:9,9:26,5
-chr5	2406565	.	CT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0062506;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,2:7,3
-chr5	3961564	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.0255e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:11,10:19,4
-chr5	4064997	.	A	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:36:0,2:0,2:0,0
-chr5	5610645	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.16368;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:4,1:23,2
-chr5	5816583	.	ATG	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:6,2:2,8
-chr5	7372251	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.083867;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:8,4:14,1
-chr5	8775499	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.010145;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:1,4:7,2
-chr5	9186029	.	T	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=3.4522e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:30,19:14,8:16,11
-chr5	9581458	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.4522e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:10,4:16,11
-chr5	9761414	.	GA	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.021052;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:20,5:6,2
-chr5	10733208	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.012681;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,10:2,3:9,7
-chr5	13816555	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0023514;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,9:10,1
-chr5	14609621	.	ATTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:6,4:1,3
-chr5	14878438	.	ATTT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0014893;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,11:7,9:6,2
-chr5	15089076	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00062483;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:16,6:13,3
-chr5	16242555	.	T	TA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0015751;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:17,7:3,2
-chr5	16411124	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=2.1466e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:14,7:22,6
-chr5	16818410	.	G	GTATATATATATA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:2,2:0,0:2,2
-chr5	16942100	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
-chr5	17113048	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.035372;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,5:4,1
-chr5	19743921	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,7:7,6:6,1
-chr5	20356751	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027967;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:11,7:14,1
-chr5	20734951	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.020776;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:50,8:21,6:29,2
-chr5	20838145	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:2,2:1,1:1,1
-chr5	21222942	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.023954;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,5:8,3:17,2
-chr5	21265262	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00076085;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:17,7:11,3
-chr5	21478808	.	A	G	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.0016094;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:48,23:26,20:22,3
-chr5	21735669	.	A	ATTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.046549;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:9,4:6,2
-chr5	22460713	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:3,1:3,4
-chr5	22470415	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016905;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:9,8:17,1
-chr5	25997143	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.012627;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:20,5:10,3
-chr5	26058682	.	A	ATT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011327;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:11,5:5,4
-chr5	26442455	.	T	TGATAGATA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0067906;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:8,7:13,9
-chr5	27790901	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.033431;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:10,2:5,4
-chr5	27835934	.	A	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12281;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:3,1:2,1
-chr5	28251874	.	GAAAGAAAA	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00011781;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,9:12,8:4,1
-chr5	28251886	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0057854;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,9:10,8:3,1
-chr5	30358840	.	GAA	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,5:2,4:0,1
-chr5	30922728	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.50909;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:6,2:2,1:4,1
-chr5	31199458	.	GTA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.10502;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,3:5,2:10,1
-chr5	32158132	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:2,6:2,5:0,1
-chr5	34189559	.	C	T	0	PASS	DP=445;GPV=1;SPV=0.035198;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:224:189,35:127,20:62,15
-chr5	38395421	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=7.3814e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:26,19:15,8:11,11
-chr5	42069239	.	T	TTTC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.049793;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,8:9,3:9,5
-chr5	42579149	.	GAT	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.015826;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:20,9:8,3:12,6
-chr5	42728250	.	TTCTCTCTCTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:5,5:6,2
-chr5	44685791	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,4:9,2:9,2
-chr5	46663721	.	G	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.015572;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:10,2:25,9
-chr5	46972870	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12547;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,3:10,1
-chr5	46985293	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.081731;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:32,4:0,0
-chr5	47002249	.	T	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.044762;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:34,6:7,1
-chr5	47073942	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
-chr5	47103778	.	A	T	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=7.8805e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:64,15:31,6:33,9
-chr5	48226543	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr5	50140189	.	G	T	0	PASS	DP=419;GPV=1;SPV=0.0033206;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:201:167,34:99,30:68,4
-chr5	50143487	.	G	T	0	PASS	DP=692;GPV=1;SPV=0.043168;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:379:333,42:181,23:152,19
-chr5	50414528	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.032243;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:10,3:3,1
-chr5	51895903	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00022582;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:18,6:17,9
-chr5	52891262	.	C	CTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.025265;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,9:8,7:5,2
-chr5	53271173	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=2.3788e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:29,26:19,13:10,13
-chr5	53492812	.	ATTATATATATAATATATGTATATAATT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.030757;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:8,4:10,2
-chr5	53993046	.	C	CA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.022271;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:13,3:20,2
-chr5	54935204	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.010099;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:6,2:10,5
-chr5	56166165	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016993;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,2:4,2
-chr5	58350170	.	A	ATG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:4,4:8,1
-chr5	60863625	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=5.5913e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:14,10:14,3
-chr5	61569371	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.1442e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:10,11:10,5
-chr5	62470816	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.00043849;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,10:3,8:4,2
-chr5	63823958	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.048842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:17,3:9,2
-chr5	64606043	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027027;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:5,4:11,2
-chr5	64878470	.	TA	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,4:1,1
-chr5	65004936	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0036482;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,13:1,6:5,7
-chr5	65321708	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,1:4,5
-chr5	66522544	.	TA	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.02849;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:18,1:13,9
-chr5	69631390	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:18,4:0,0
-chr5	69911442	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.049167;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:42,4:1,1
-chr5	70339524	.	C	T	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.019787;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:74,9:44,1:30,8
-chr5	70378692	.	G	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0049019;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:15,7:10,6
-chr5	70778416	.	T	G	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.03043;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:76,16:38,7:38,9
-chr5	71116274	.	CA	C	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.00018069;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:33,20:27,17:6,3
-chr5	71175667	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
-chr5	71618544	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.065489;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:5,3:12,1
-chr5	71721271	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.03726;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:15,7:6,5:9,2
-chr5	72102894	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.37564;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,4:3,1:9,3
-chr5	77378046	.	AC	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.072233;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,4:9,1:9,3
-chr5	80692235	.	CAT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,3:4,1
-chr5	80693224	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,2:6,2
-chr5	81293248	.	C	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.035434;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,3:8,1
-chr5	82929000	.	C	CTTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.043209;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,7:8,1
-chr5	83350869	.	G	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.023022;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:15,1:22,4
-chr5	83650632	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.044511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,8:11,7:2,1
-chr5	83737041	.	T	TAGAGAG	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:5,2:7,2
-chr5	83764973	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=2.8066e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:8,13:15,6
-chr5	84522919	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0019161;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:14,5:16,2
-chr5	85396299	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=3.295e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:14,3:11,10
-chr5	85425650	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.6e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:31,17:13,10:18,7
-chr5	89176455	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.4111e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,6:11,9
-chr5	89187090	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.011977;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:13,2:12,4
-chr5	89414231	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00059141;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:19,8:17,7
-chr5	95078039	.	C	CATGTATCTGTCT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,2:5,2
-chr5	97577406	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=2.9514e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:30,16:17,5:13,11
-chr5	97629863	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.060295;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:16,3:11,1
-chr5	97629864	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.12627;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:19,3:11,1
-chr5	98138582	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0094148;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:6,4:5,6
-chr5	98756790	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=7.6074e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:16,14:11,5
-chr5	98864517	.	CAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.034767;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:10,7:3,1
-chr5	99225249	.	G	GC	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.010345;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:25,3:16,5
-chr5	99402438	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00039484;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:11,10:9,6
-chr5	99642003	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=3.2141e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:33,27:22,17:11,10
-chr5	100493024	.	AAT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:6,3:5,1
-chr5	101547616	.	GTA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:6,3:2,2
-chr5	102779886	.	C	CATAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.014907;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:5,4:2,1
-chr5	103370179	.	C	CTATA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0095459;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:2,11:2,5:0,6
-chr5	103820598	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034961;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:12,9:6,2
-chr5	104223378	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:5,2:4,2
-chr5	104667584	.	C	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,4:8,1:1,3
-chr5	105902354	.	G	GT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0048071;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,8:10,4:12,4
-chr5	106555754	.	A	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
-chr5	107763997	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.4899e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,20:9,8:9,12
-chr5	113187754	.	CAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,10:5,9:2,1
-chr5	113346636	.	A	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.069354;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,5:13,1:11,4
-chr5	113735616	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.039775;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,3:15,1
-chr5	113786209	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0071396;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:3,4:4,3
-chr5	114504168	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.049835;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:16,4:20,7
-chr5	115793449	.	CGTGT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0062699;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,11:2,7:8,4
-chr5	116327605	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.14672;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,3:10,1:7,2
-chr5	116883195	.	G	GA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.42424;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,2:5,1:1,1
-chr5	117149034	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00020455;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:13,2:13,9
-chr5	118934272	.	T	TA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:7,4:6,1
-chr5	120516423	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:7,2:3,2
-chr5	121294570	.	TG	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.16084;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,5:9,2:13,3
-chr5	121496862	.	T	TAC	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0039721;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,12:17,10:9,2
-chr5	122362993	.	A	AT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0026611;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:14,4:8,5
-chr5	122783083	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00090199;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:12,4:12,5
-chr5	125728450	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0059787;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:12,4:15,2
-chr5	128539884	.	T	TCA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:0,2:0,2:0,0
-chr5	128568884	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0023815;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,9:1,8:2,1
-chr5	128760745	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.017137;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:15,9:6,5
-chr5	128863776	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.024972;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:11,1:15,5
-chr5	131179474	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.3;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,2:4,1:3,1
-chr5	132433778	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.003085;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,10:11,8:3,2
-chr5	135530280	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=3.256e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:30,23:13,16:17,7
-chr5	136936478	.	T	TTA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.034629;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,3:9,1
-chr5	137951209	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023812;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,7:10,6:6,1
-chr5	138309734	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13283;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:14,3:14,1
-chr5	138693351	.	CT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.044156;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:2,1:17,4
-chr5	139068673	.	AAG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.010266;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:6,5:7,6
-chr5	140960717	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,4:11,2:11,2
-chr5	141271696	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=1.9441e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:16,9:15,6
-chr5	141315300	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0066622;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,6:6,3:9,3
-chr5	141455860	.	ATTAT	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0051599;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:11,10:10,2
-chr5	142608583	.	TACAC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,3:0,1:3,2
-chr5	144047478	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=2e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:11,13:13,4
-chr5	145421522	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.11998;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,1:16,3
-chr5	146086024	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.16752;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:18,3:7,2
-chr5	146131496	.	T	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.029826;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:17,9:11,3
-chr5	146438006	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:2,2:4,2
-chr5	146708356	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.011315;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,10:11,6:5,4
-chr5	146875502	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.6503e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,19:6,8:13,11
-chr5	147949033	.	GATGTAAATATATATACATTATATATACA	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0065453;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:16,2:13,8
-chr5	148979723	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.0446e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:10,11:13,4
-chr5	149900375	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:3,2:3,3
-chr5	149920938	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.022541;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:12,3:2,1
-chr5	152298973	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00040366;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:13,8:16,3
-chr5	154219834	.	T	TCACACACACACACACA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.056428;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:12,2:9,4
-chr5	156239399	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,5:2,4:3,1
-chr5	157111969	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.2381;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:3,3:0,2:3,1
-chr5	157182105	.	A	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.799e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:16,8:12,9
-chr5	157219113	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:9,5:6,2
-chr5	157476166	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=8.2498e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:14,9:8,7
-chr5	158956754	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,5:2,1
-chr5	159227875	.	CTTCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.030593;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:1,1:18,7
-chr5	161336814	.	C	CAA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0013479;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,11:12,8:9,3
-chr5	161509760	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.1149e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,19:11,9:10,10
-chr5	161829603	.	AAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAC	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.048922;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,5:8,4:12,1
-chr5	164130085	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:1,6:3,3
-chr5	164995450	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.042605;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:8,5:13,4
-chr5	165021986	.	AATAT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:10,4:3,1
-chr5	166028483	.	CT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0014035;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:6,9:18,3
-chr5	167872316	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:0,2:0,1:0,1
-chr5	168703226	.	T	TTG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:7,2:7,2
-chr5	168714743	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=2.2297e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:12,9:16,8
-chr5	169137303	.	CAT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,2:4,1:0,1
-chr5	169189527	.	GATATATATATATAT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:8,3:3,1
-chr5	171562612	.	T	TATATAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01393;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:6,3:7,3
-chr5	171562655	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:1,3:3,5
-chr5	171690066	.	C	CATAG	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.05944;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,5:16,2:14,3
-chr5	172525610	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.2257e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:25,23:17,10:8,13
-chr5	172804549	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16126;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,5:8,4:5,1
-chr5	174722840	.	G	GT	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00019233;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,8:10,2
-chr5	175386375	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=8.6921e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:32,24:19,8:13,16
-chr5	175510173	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0049761;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:22,5:13,4
-chr5	176014838	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:1,0:17,4
-chr5	177499487	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,14:6,10:6,4
-chr5	177872471	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.033452;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:16,2:15,9
-chr5	177874892	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0050863;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:17,1:15,9
-chr5	177967786	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:1,1:9,4
-chr5	178041678	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.5449e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:15,9:9,5
-chr5	178821674	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.010536;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:7,6:12,7
-chr5	179441206	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0012784;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:20,3:11,5
-chr6	310904	.	T	A	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=1.9531e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:52,21:25,13:27,8
-chr6	1905414	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.01696;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:1,4:10,2
-chr6	2920154	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0045877;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,7:3,6:2,1
-chr6	3234823	.	G	GTTCT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.044773;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:8,3:7,2
-chr6	3925951	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.039892;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:15,2:9,7
-chr6	4432917	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,4:0,0:0,4
-chr6	5444515	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.044118;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,2:1,1:1,1
-chr6	5897460	.	C	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0019985;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:3,1:3,7
-chr6	6304860	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00022182;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,16:7,13:3,3
-chr6	8595870	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.018687;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:6,3:4,1:2,2
-chr6	8853701	.	G	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0044376;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:2,6:1,5:1,1
-chr6	9013037	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0035042;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:3,9:0,2:3,7
-chr6	10047852	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.004794;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,5:0,3:3,2
-chr6	10474352	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00079857;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,6:2,2:2,4
-chr6	14582704	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0026065;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:11,2:8,4
-chr6	15415603	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,4:7,2
-chr6	18670753	.	T	TCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTTCCTTCCTC	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.006993;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,4:0,0:0,4
-chr6	19182361	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=3.2061e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,15:3,7:4,8
-chr6	21784591	.	ATATATAT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,2:2,1:1,1
-chr6	26453583	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.060606;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:2,3:1,2:1,1
-chr6	26884833	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00090694;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:3,4:4,3
-chr6	26884873	.	T	TCCC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.019122;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,1:4,3
-chr6	27208925	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.005895;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:2,4:6,1
-chr6	27676094	.	G	GT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.006706;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,2:2,2
-chr6	27959755	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=4.0518e-10;SS=2;SSC=93;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:4,17:3,8:1,9
-chr6	29980519	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,3:1,1:4,2
-chr6	32067094	.	AATG	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.095186;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:24,2:13,3
-chr6	32242530	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.028;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:10,2:9,2
-chr6	32415088	.	TA	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.03684;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:48,8:23,1:25,7
-chr6	33526158	.	TA	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.10242;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:27,3:7,1
-chr6	35802004	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.2053e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:15,6:10,9
-chr6	37402786	.	T	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:3,3:0,2:3,1
-chr6	38289261	.	C	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=3.6033e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:34,19:18,7:16,12
-chr6	40113950	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12713;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:23,3:15,3
-chr6	40113951	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11483;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:24,3:14,3
-chr6	42716612	.	G	GT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,3:5,1
-chr6	48953532	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0032221;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,4:2,3
-chr6	50560396	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024163;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,7:6,6:4,1
-chr6	51058706	.	AT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01188;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:4,2:10,4
-chr6	51330108	.	C	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0023062;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:5,6:14,3
-chr6	52838757	.	A	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=9.5945e-10;SS=2;SSC=90;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,23:10,13:13,10
-chr6	53226342	.	TTTTATA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22398;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:3,3:10,1
-chr6	54142918	.	C	CA	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0034605;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,9:10,5:18,4
-chr6	54533007	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.9748e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:20,21:11,6:9,15
-chr6	55043370	.	T	TG	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.018314;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:13,2:22,5
-chr6	55220155	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=5.1525e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:28,21:15,10:13,11
-chr6	55567296	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.3189e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:30,23:13,9:17,14
-chr6	56872833	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
-chr6	57371143	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.070922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:3,3:18,1
-chr6	57439404	.	GTTT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:6,3:3,1
-chr6	57722372	.	A	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.01724;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,8:32,6:15,2
-chr6	58233071	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:6,2:9,4
-chr6	58450569	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.22913;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:20,4:0,0
-chr6	58555199	.	T	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.03374;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:80,12:27,2:53,10
-chr6	59563748	.	G	A	0	PASS	DP=464;GPV=1;SPV=0.013039;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:255:229,26:51,9:178,17
-chr6	59623233	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
-chr6	59781933	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.053645;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:28,2:2,2
-chr6	60287954	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.062937;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,5:2,1:2,4
-chr6	61245245	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0017223;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:15,5:19,5
-chr6	63242386	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.022078;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,6:11,4:7,2
-chr6	65492336	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.011201;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:19,5:12,4
-chr6	65730800	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.053889;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:16,2:15,2
-chr6	65737373	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.035086;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,6:11,3:11,3
-chr6	65737415	.	T	TATAC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:12,2:16,2
-chr6	67213948	.	GATAT	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.060034;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,4:9,2:15,2
-chr6	68471407	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.065934;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:2,2:2,1:0,1
-chr6	70113842	.	CTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.066203;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,5:3,2
-chr6	70831938	.	A	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00070294;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:21,4:8,5
-chr6	72549326	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0084228;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:18,4:18,4
-chr6	72941373	.	TTTCCTCC	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,2:0,0:4,2
-chr6	73034859	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,3:11,1
-chr6	73573302	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.6753e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:9,11:14,7
-chr6	75046689	.	A	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,2:2,1:3,1
-chr6	76557631	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.051748;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,1:18,3
-chr6	77485738	.	ATC	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.07056;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,1:10,3
-chr6	78462066	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.0868e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:15,8:6,3
-chr6	80055046	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.6056e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:12,10:11,12
-chr6	84111838	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.8323e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:15,8:12,6
-chr6	84553785	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=6.2178e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:13,12:12,8
-chr6	85139497	.	TA	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.012113;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:24,6:22,4
-chr6	86079873	.	TG	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
-chr6	86084768	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00022479;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:18,10:16,3
-chr6	86919045	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.407e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:9,5:15,9
-chr6	89898209	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,4:0,2:5,2
-chr6	89898210	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:5,4:0,2:5,2
-chr6	92600290	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=4.4665e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,16:12,10:17,6
-chr6	92865613	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.006558;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:20,4:17,3
-chr6	93868128	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.0101e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:11,6:5,9
-chr6	94020487	.	C	CTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:1,5:2,2
-chr6	94693792	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.029299;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:17,3:20,2
-chr6	94877715	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=6.7628e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:19,6:8,11
-chr6	95761800	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.057784;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:16,3:20,1
-chr6	96014087	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=1.4866e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:34,20:20,11:14,9
-chr6	96606824	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0018869;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:10,3:13,4
-chr6	102982459	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0014491;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:15,5:23,5
-chr6	103661442	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0004646;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:9,8:14,3
-chr6	104029816	.	A	AT	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=3.0489e-06;SS=2;SSC=55;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:31,18:17,5:14,13
-chr6	105100608	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.015574;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,2:11,9
-chr6	109266216	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=4.8252e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:11,9:10,8
-chr6	111552074	.	TCTGTAAGATAACACACCTGCTCGGTGCC	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=9.7235e-06;SS=2;SSC=50;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:15,9:14,3
-chr6	115737485	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.016865;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:19,9:9,1
-chr6	115845939	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=1.1232e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:31,17:17,10:14,7
-chr6	116865987	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.14763;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:9,2:13,2
-chr6	117043420	.	A	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=4.0601e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:37,15:21,9:16,6
-chr6	117204895	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=2.509e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:11,8:14,11
-chr6	117327934	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=3.406e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:7,8:17,4
-chr6	120492825	.	G	GT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,7:6,5:2,2
-chr6	122939368	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=5.5438e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:2,5:12,7
-chr6	125115312	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=4.2777e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:27,23:11,5:16,18
-chr6	125388817	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037585;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,6:8,3
-chr6	127107190	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00026518;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:18,7:13,4
-chr6	127400962	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11425;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:12,2:9,3
-chr6	128108069	.	A	AAC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.041933;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,6:12,3:9,3
-chr6	128995167	.	A	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=7.3375e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:15,7:14,7
-chr6	129256765	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,4:5,1
-chr6	129718386	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.30847;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:16,2:8,1:8,1
-chr6	131887554	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:3,2:13,2
-chr6	132188514	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0079864;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:8,6:1,1
-chr6	132812197	.	CAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.010225;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:7,9:6,2
-chr6	135134361	.	C	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=7.7318e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:21,11:12,3
-chr6	137563806	.	T	TAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.21475;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:19,3:2,1
-chr6	137869337	.	A	AGATG	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.016315;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:47,19:29,10:18,9
-chr6	138793970	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0038641;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:9,10:4,2
-chr6	139193824	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,1:8,4
-chr6	140483649	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=3.9692e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:33,20:18,10:15,10
-chr6	140605492	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.19369;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,5:5,4:5,1
-chr6	141678628	.	T	TG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:10,1:8,4
-chr6	143935212	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00010084;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:14,8:15,7
-chr6	145235631	.	T	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.004662;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:0,7:0,5:0,2
-chr6	145276229	.	AT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.026073;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:9,3:3,2
-chr6	147579454	.	ATT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,3:6,4
-chr6	147797074	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,3:5,2
-chr6	148504588	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=7.4436e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:19,5:17,9
-chr6	149234864	.	G	GA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.034441;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,8:12,7:2,1
-chr6	150582652	.	C	CTGTGTGTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.01623;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,9:3,6:3,3
-chr6	152988793	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,1:6,1
-chr6	153664278	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=9.559e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:15,8:11,7
-chr6	153851624	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.015475;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,4:5,5
-chr6	154331369	.	AG	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.052565;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:19,3:17,3
-chr6	154525428	.	CATATAT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:3,2:21,2
-chr6	154721214	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0039984;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:6,7:5,3
-chr6	154955391	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:14,3:6,1
-chr6	155094546	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.32712;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:7,3:3,1
-chr6	156440895	.	G	GAAA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.051834;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:20,1:4,3
-chr6	157060630	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00078745;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,11:0,7:3,4
-chr6	158020219	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031408;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:6,3:9,1
-chr6	158380894	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027218;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:6,3:2,1
-chr6	161516848	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.23684;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:8,2:3,1:5,1
-chr6	162840075	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.027999;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:6,1:8,7
-chr6	163269971	.	G	GA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:20,4:0,0
-chr6	164431026	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0044903;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:12,3:21,4
-chr6	164931741	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.04741;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,6:5,2
-chr6	164998919	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00019233;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:11,4:14,6
-chr6	165128078	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.01188;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,6:12,3:2,3
-chr6	166021090	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.16591;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,3:13,1
-chr6	167169069	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.039749;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:12,8:21,4
-chr6	168058269	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.077519;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:6,1:15,3
-chr6	169006874	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:4,3:3,2:1,1
-chr6	169222817	.	GA	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,5:7,4:3,1
-chr6	170220841	.	G	GAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.013906;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:11,9:2,2
-chr6	170466290	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,5:7,3:16,2
-chr7	125989	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,6:8,5:3,1
-chr7	742841	.	A	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.077327;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,5:14,2:7,3
-chr7	900880	.	CGAA	C	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.012058;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:48,6:20,2:28,4
-chr7	1784983	.	T	TTTCA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.16556;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,4:21,3:10,1
-chr7	1785213	.	CGTTCTTT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043486;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,1:10,4
-chr7	1786165	.	T	TC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.027438;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,5:1,4:5,1
-chr7	2283028	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.032677;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:19,2:12,5
-chr7	2365625	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0062705;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:7,5:20,6
-chr7	2499632	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.0024716;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:52,11:23,5:29,6
-chr7	2708118	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=8.388e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:16,4:16,9
-chr7	3700286	.	A	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00012616;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:8,5:19,5
-chr7	4283561	.	T	TA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.030925;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,5:10,4:6,1
-chr7	4945185	.	T	TTTCTTCTTC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:2,3:11,1
-chr7	5242710	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:18,3:7,1
-chr7	6207086	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,2:3,2
-chr7	6641248	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=4.4921e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:19,5:20,11
-chr7	6885994	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,3:4,1
-chr7	7723348	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=3.5101e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:31,19:11,9:20,10
-chr7	7784756	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,7:3,5:3,2
-chr7	7964089	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=5.1287e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:15,7:12,9
-chr7	8339959	.	C	CCT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:1,3:7,2
-chr7	8995723	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:8,5:1,1
-chr7	9154860	.	T	TA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0026989;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:10,4:7,4
-chr7	9307186	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,2:0,0:4,2
-chr7	9522092	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.023032;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:15,8:3,1
-chr7	10335426	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=6.8006e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:15,12:11,10
-chr7	11076567	.	C	CTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0036151;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,7:9,6:1,1
-chr7	11917838	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.3877e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:14,9:11,7
-chr7	12276954	.	A	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=1.153e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:14,11:13,8
-chr7	14260855	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.00029634;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:20,6:19,5
-chr7	14723024	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.077337;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:14,2:17,2
-chr7	16731927	.	A	AT	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.03699;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,7:6,6:14,1
-chr7	18098177	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0027963;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:14,2:14,5
-chr7	19219807	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10365;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,5:5,3:13,2
-chr7	19299685	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0033096;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:15,5:23,4
-chr7	21828760	.	G	GT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0027946;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:9,6:9,3
-chr7	21956238	.	A	AT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,3:3,1
-chr7	21971073	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.067927;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,7:9,3:17,4
-chr7	23364547	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
-chr7	24215811	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13094;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,7:10,3:4,4
-chr7	24388530	.	C	CTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.069102;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:9,3:9,3
-chr7	24428043	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.010479;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:12,9:5,5:7,4
-chr7	25085914	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024176;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:6,3:2,1
-chr7	25749249	.	T	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:14,3:6,1
-chr7	27613172	.	TAA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:4,3:3,2
-chr7	29538789	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=6.2994e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:18,6:11,8
-chr7	30056742	.	AGTGT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.012749;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:2,5:5,1
-chr7	30126166	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0012929;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:5,4:8,8
-chr7	30126168	.	C	CAGGCTTGTGTGAAGGCCCTGA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.018715;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:7,2:9,7
-chr7	31859456	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:30:1,3:0,1:1,2
-chr7	32572431	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.071749;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,2:17,2
-chr7	34805479	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0036984;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:7,7:3,1
-chr7	37270883	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.032477;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:10,6:3,3:7,3
-chr7	37292568	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:5,2:14,2
-chr7	39071654	.	AACACAC	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.027751;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:7,3:2,2
-chr7	41793616	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:12,1:1,3
-chr7	41829126	.	A	AATTTCCCTTAGGC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00429;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:17,8:7,6
-chr7	43101336	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:0,0:1,4
-chr7	43710371	.	A	AAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,2:4,2
-chr7	43910382	.	ATTT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:7,2:7,6
-chr7	43974178	.	T	TC	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.049981;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,7:12,6:11,1
-chr7	44687091	.	A	AT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048875;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,8:4,4:11,4
-chr7	44914984	.	G	GTAAAATAAAATAAAATAAAA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.046858;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:8,4:16,2
-chr7	45933631	.	G	GTGTGTATATATATATATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.025641;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,4:1,2:2,2
-chr7	46322435	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.029113;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:12,7:6,3
-chr7	46494124	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0041535;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,8:8,7:1,1
-chr7	46854685	.	AAG	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0054249;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:8,3:16,3
-chr7	48685289	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=1.2446e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:16,11:14,7
-chr7	48779323	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0040452;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:15,5:12,2
-chr7	50125285	.	CACAT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.23279;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:13,2:9,1
-chr7	50125311	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.22793;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:14,2:6,1
-chr7	52119708	.	C	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,4:21,1:3,3
-chr7	52960966	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
-chr7	53352375	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.9877e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:29,30:17,16:12,14
-chr7	53511530	.	C	CT	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.6174e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,12:11,8:14,4
-chr7	53725863	.	T	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=1.6173e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:20,7:12,7
-chr7	54140025	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=7.4436e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:21,10:15,4
-chr7	54464390	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.6047e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,21:8,14:15,7
-chr7	55783389	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0054024;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,7:8,5:8,2
-chr7	56127231	.	C	CA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0011989;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,10:4,7:3,3
-chr7	56461566	.	T	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.001598;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:25,4:7,4
-chr7	56638434	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=3.2896e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:7,13:11,4
-chr7	56836506	.	T	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.038534;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:21,4:16,4
-chr7	58080955	.	G	A	0	PASS	DP=316;GPV=1;SPV=0.032754;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:158,23:92,16:66,7
-chr7	59230222	.	C	T	0	PASS	DP=616;GPV=1;SPV=0.02511;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:343:302,41:188,22:114,19
-chr7	59570491	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.20823;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:29,3:6,1
-chr7	60036939	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0067216;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:22,10:6,2
-chr7	60039753	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.021448;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:18,4:0,0
-chr7	60949959	.	C	T	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.0071561;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:98,19:63,14:35,5
-chr7	60955048	.	G	C	0	PASS	DP=279;GPV=1;SPV=0.034864;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:138,16:56,6:82,10
-chr7	60996619	.	TGA	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.048603;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:53,6:24,2:29,4
-chr7	61385398	.	TA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.13598;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:19,2:11,2
-chr7	61488604	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.021997;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:25,4:7,3
-chr7	61506551	.	A	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.021309;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:1,1:42,9
-chr7	61724133	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.045334;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:11,1:18,5
-chr7	61803165	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.022093;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:14,5:18,2
-chr7	62106160	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.054634;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,3:5,5
-chr7	62256928	.	C	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.039915;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:68,13:22,5:46,8
-chr7	62266780	.	G	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=1.7776e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,18:12,8:15,10
-chr7	62277206	.	C	G	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.012901;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:58,11:11,6:47,5
-chr7	63448596	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18182;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,2:0,0:3,2
-chr7	63553934	.	CT	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.012389;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,8:10,2
-chr7	63598391	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.12939;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:24,3:5,1
-chr7	63632179	.	T	TA	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.029668;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:39,11:22,8:17,3
-chr7	63752221	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.11141;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:19,3:10,1
-chr7	63757713	.	A	C	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.0065609;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:92,13:38,7:54,6
-chr7	63944244	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0010226;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:14,7:16,3
-chr7	64222086	.	T	TA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.033688;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,5:10,3:19,2
-chr7	64666914	.	AAGGTGGAAATTTTCTGGTCACGTAATCAGAGCTTAATTGGCAGTTCATGGTTGATTAAG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:11,5:5,2
-chr7	65519244	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.03902;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,6:20,4:17,2
-chr7	65847313	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0041408;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,4:3,4
-chr7	66096249	.	C	CA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00021148;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,12:17,6:9,6
-chr7	66328888	.	A	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.073684;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:4,1:2,2
-chr7	66337299	.	A	AT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:11,7:2,4
-chr7	68320052	.	TTATATAAAATGATATAATCATTA	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0061323;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:16,7:12,2
-chr7	68392265	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0027973;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,8:5,7:2,1
-chr7	68749044	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0019458;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:11,6:16,4
-chr7	68799621	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:15,7:1,1
-chr7	68803172	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00087424;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:13,7:13,3
-chr7	69092754	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=7.7788e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:29,18:14,9:15,9
-chr7	69459100	.	A	ATATG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
-chr7	69459102	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
-chr7	70716636	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.033806;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,6:2,1
-chr7	71090756	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.12384;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,9:5,5:2,4
-chr7	71431210	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:4,3:5,4
-chr7	71901426	.	C	CA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00029659;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,9:5,4:8,5
-chr7	72620481	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.021372;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:16,3:13,2
-chr7	73836515	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0018031;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,8:4,1
-chr7	75103559	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.048878;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:22,2:17,4
-chr7	75151114	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.025775;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:18,2:18,7
-chr7	75663980	.	A	ATG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:2,1:8,3
-chr7	75740366	.	C	CGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00329;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:12,7:3,4
-chr7	76640861	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,1:4,7
-chr7	76855720	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=2.8637e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:28,21:15,12:13,9
-chr7	77983435	.	C	CTCTCCCTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,2:0,0:4,2
-chr7	80284488	.	TATACAC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,3:0,2:2,1
-chr7	87720542	.	ATG	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0065837;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:8,5:13,9
-chr7	89430318	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0001214;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:14,7:16,8
-chr7	91290943	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.037765;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:7,5:13,1
-chr7	92125953	.	C	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0019211;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:24,3:8,6
-chr7	92712882	.	T	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.037048;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:27,2:16,4
-chr7	94859942	.	CTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,5:6,4
-chr7	96588397	.	C	CGAGAGA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10773;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,5:8,4:14,1
-chr7	97016257	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,3:11,1
-chr7	98453806	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023342;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:10,5:5,1
-chr7	98558737	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,5:5,2:6,3
-chr7	98811329	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,3:7,1
-chr7	99122772	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.015549;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,18:6,4:12,14
-chr7	99181145	.	CTCTCCGTCTGTG	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
-chr7	99209704	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,2:8,2
-chr7	99909732	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.02798;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,5:7,2
-chr7	100001262	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,4:3,2
-chr7	100911939	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.048243;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,7:16,6:4,1
-chr7	101070347	.	C	CAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,4:8,3:6,1
-chr7	101329607	.	A	ATTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:8,1:5,4
-chr7	101630135	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0086957;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:5,15:3,13:2,2
-chr7	101790096	.	CAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,4:5,2
-chr7	102345852	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.045941;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:21,1:23,4
-chr7	102776713	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.01162;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:13,3:17,5
-chr7	103063712	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.026248;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,4:5,3
-chr7	103518350	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.076651;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,5:8,2:4,3
-chr7	104860178	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.03735;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:12,6:7,4:5,2
-chr7	107260075	.	G	GATATATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,2:10,2
-chr7	108164196	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.083394;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:12,3:12,1:0,2
-chr7	108335434	.	CTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,3:3,1
-chr7	108696762	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.007164;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:20,4:19,3
-chr7	109510329	.	T	TA	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0012714;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:20,5:20,5
-chr7	111031406	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.019517;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,11:8,2:16,9
-chr7	114043333	.	ATATT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,3:4,3
-chr7	115946417	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.065336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:21,2:16,3
-chr7	116968289	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,3:0,0:1,3
-chr7	116968293	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,2:0,0:1,2
-chr7	117027498	.	T	TAAAGTA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.019211;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:9,1:8,4
-chr7	117027518	.	G	GTA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.021554;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:12,1:5,4
-chr7	117161593	.	T	TTC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.002293;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,9:4,5:13,4
-chr7	117368531	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.6779e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:30,16:15,8:15,8
-chr7	119352975	.	A	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=7.3373e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:19,5:15,8
-chr7	119470828	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.2626e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:9,5:13,7
-chr7	119563108	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=3.0044e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:1,5:10,8
-chr7	119683798	.	A	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.0223e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:9,8:14,14
-chr7	120832936	.	A	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=1.5865e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:31,18:18,9:13,9
-chr7	122817966	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0010673;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:3,5:9,3
-chr7	124273969	.	C	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=6.8612e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:21,5:18,11
-chr7	125376962	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=2.9284e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:29,22:19,14:10,8
-chr7	126270448	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00010787;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:11,9:16,6
-chr7	126819275	.	T	TACACACACACACACAC	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.016864;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,12:13,10:11,2
-chr7	128110674	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.11302;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:12,3:9,1
-chr7	130138858	.	T	TG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0076433;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:10,4:8,3
-chr7	130537779	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.03237;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:17,3:18,5
-chr7	131634569	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:0,4:3,1
-chr7	131828699	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.042901;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:1,1:10,4
-chr7	132469136	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.090036;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:14,1:17,4
-chr7	133110986	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.009828;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,5:7,3
-chr7	134728845	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:8,3:1,3
-chr7	135778671	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00042894;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:14,6:14,8
-chr7	136216482	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00069152;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:12,6:10,5
-chr7	137153236	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:5,3:8,1
-chr7	142027018	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=1.9039e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:18,6:14,8
-chr7	142504164	.	C	CA	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.011694;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:18,4:20,10
-chr7	143414019	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=9.708e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,17:2,3:11,14
-chr7	143969350	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,2:0,1:5,1
-chr7	144189461	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027836;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
-chr7	144245406	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:0,0:11,4
-chr7	144276614	.	G	C	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.017212;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:58,14:30,3:28,11
-chr7	144960605	.	CTT	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:2,3:0,1:2,2
-chr7	146031126	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.5721e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:30,19:12,10:18,9
-chr7	148369181	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:5,1:3,3
-chr7	148502355	.	C	CA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.014706;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,4:1,3:2,1
-chr7	149220929	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.064526;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:19,1:8,3
-chr7	151437550	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=5.7714e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:31,16:12,4:19,12
-chr7	151874357	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11923;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:26,2:10,2
-chr7	151874429	.	TATG	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0972;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:18,2:6,3
-chr7	151874450	.	TATG	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.041933;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:17,2:4,4
-chr7	152411361	.	C	CT	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0077049;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:14,4:19,7
-chr7	152411367	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.029255;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:15,2:24,5
-chr7	152770419	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.050539;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:21,4:14,1
-chr7	154157139	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.021727;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:53,13:31,2:22,11
-chr7	154800711	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00091233;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,10:14,6:27,4
-chr7	155337547	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=6.0843e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:17,4:16,7
-chr7	155615496	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.25167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:13,1:9,2
-chr7	155616708	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:1,2:5,1
-chr7	156321270	.	C	CTTCT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0097922;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,7:8,2:18,5
-chr7	156548362	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0016791;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:17,4:12,5
-chr7	157648761	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:6,3:11,1
-chr7	158165133	.	CAAAG	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0081402;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,3:10,7
-chr8	94650	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.065325;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:3,4:12,1
-chr8	299056	.	T	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.046182;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:12,1:19,5
-chr8	625246	.	A	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0020209;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:45,15:27,7:18,8
-chr8	3266604	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,8:4,7:3,1
-chr8	5057443	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.040404;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,4:12,3:1,1
-chr8	6059536	.	A	AAAAAAAAAAAAAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.006993;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:0,8:0,4:0,4
-chr8	7219935	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0017323;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:16,6:14,5
-chr8	7411399	.	C	G	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.047881;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:87,13:41,3:46,10
-chr8	7413090	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:21,4:0,0
-chr8	7413451	.	T	C	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.030614;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:74,17:34,8:40,9
-chr8	7444971	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00045133;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:24,9:7,5
-chr8	7584732	.	C	G	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.033917;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:66,15:32,3:34,12
-chr8	7603062	.	G	A	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.039121;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:74,9:42,4:32,5
-chr8	7615899	.	T	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.036261;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:22,1:18,6
-chr8	7774759	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=4.9545e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,16:1,9:7,7
-chr8	7807920	.	ATC	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.013574;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:15,7:3,2
-chr8	8017431	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0049791;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:8,2:28,11
-chr8	8073044	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0071032;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:1,7:6,4
-chr8	8153779	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.02362;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,3:3,1
-chr8	8169112	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.044315;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:25,6:4,1
-chr8	8170515	.	C	G	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.017921;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:106,19:57,9:49,10
-chr8	8170820	.	C	T	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.00073289;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:64,15:37,9:27,6
-chr8	8204394	.	T	A	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.034513;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:72,19:36,13:36,6
-chr8	11969487	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.21475;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:7,1:14,3
-chr8	12117723	.	G	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.012991;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:44,17:24,5:20,12
-chr8	12176643	.	A	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.037547;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,11:30,6:18,5
-chr8	12419722	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.065116;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:2,2:18,2
-chr8	12448115	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.033431;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:0,5:15,1
-chr8	12546522	.	C	CAA	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.037025;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:79,15:53,8:26,7
-chr8	12554173	.	T	C	0	PASS	DP=256;GPV=1;SPV=0.036908;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:110,21:69,12:41,9
-chr8	12559473	.	C	A	0	PASS	DP=254;GPV=1;SPV=0.016787;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:118,29:44,12:74,17
-chr8	12560294	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.069378;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,5:21,2:20,3
-chr8	12570721	.	C	T	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.029464;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:152:127,25:63,14:64,11
-chr8	12579161	.	C	T	0	PASS	DP=293;GPV=1;SPV=0.019813;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:133,25:65,11:68,14
-chr8	12584069	.	A	C	0	PASS	DP=268;GPV=1;SPV=0.029589;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:126,29:60,16:66,13
-chr8	13143846	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.033467;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,8:13,6:6,2
-chr8	13699577	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.51128;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,4:6,3:8,1
-chr8	15719516	.	CCACACACA	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:7,4:5,2:2,2
-chr8	16708195	.	TAC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.11976;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,5:5,2:11,3
-chr8	17763014	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=7.814e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:8,15:16,5
-chr8	19655561	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.043229;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:14,5:16,1
-chr8	20030870	.	C	CTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.027424;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,7:7,3:10,4
-chr8	20865118	.	TATATATAAAA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11404;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:10,4:0,1
-chr8	20875100	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.3971e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:12,15:10,5
-chr8	22079301	.	T	TATATATATATATATA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.02037;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:4,4:5,1
-chr8	22079303	.	A	AG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,2:6,3
-chr8	22245096	.	C	T	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=2.2221e-10;SS=2;SSC=96;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:42,26:20,20:22,6
-chr8	22401543	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:3,2:7,2
-chr8	22611406	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.030957;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:5,3:12,2
-chr8	24440959	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00070294;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:13,6:16,3
-chr8	25169760	.	T	TAC	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0076361;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,13:12,9:10,4
-chr8	25410976	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,2:1,1:3,1
-chr8	26012319	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.1392e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:11,12:15,2
-chr8	26113292	.	GAA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0041486;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,11:6,9:4,2
-chr8	26257535	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0033619;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,9:10,3:9,6
-chr8	26917157	.	C	CA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.044908;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:18,3:14,3
-chr8	28881794	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023889;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:19,5:10,1
-chr8	29666136	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.035386;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:13,3:24,2
-chr8	30030807	.	AAG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:1,2:1,1:0,1
-chr8	31927439	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:9,2:6,2
-chr8	33245631	.	GT	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0059264;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:19,3:20,5
-chr8	33537950	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.14555;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:25,4:12,1:13,3
-chr8	34824884	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,2:1,1:3,1
-chr8	35149090	.	C	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:2,5:4,1
-chr8	35404880	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.0708e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:10,6:12,6
-chr8	35428346	.	A	ATT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.050426;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:5,3:8,2
-chr8	36134356	.	AT	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00015539;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:7,8:26,6
-chr8	36215626	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=9.7816e-11;SS=2;SSC=100;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:16,22:8,8:8,14
-chr8	36260946	.	C	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.2115e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:11,9:14,3
-chr8	36278286	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.008786;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:15,3:24,3
-chr8	36525243	.	GA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14093;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,5:16,3:4,2
-chr8	39594793	.	GTT	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,8:6,4:3,4
-chr8	40117166	.	CTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:6,2:2,3
-chr8	41887242	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:1,8:8,2
-chr8	42225690	.	A	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=3.7295e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:15,8:17,6
-chr8	44962509	.	C	A	0	PASS	DP=472;GPV=1;SPV=0.0034572;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:239:199,40:90,19:109,21
-chr8	45929132	.	G	C	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.047932;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:115,19:81,11:34,8
-chr8	47037598	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.2436e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:13,8:12,11
-chr8	47764017	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:11,1:2,3
-chr8	47764018	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,1:3,3
-chr8	47999362	.	C	CT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0042057;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:13,3:16,4
-chr8	49876663	.	G	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=2.701e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:17,6:13,11
-chr8	50053623	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.033467;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,8:10,2:9,6
-chr8	50693392	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=2.9903e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:5,4:18,13
-chr8	52535677	.	TA	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0025434;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:15,4:12,5
-chr8	52978238	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,4:8,3:11,1
-chr8	52989291	.	CTTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0084306;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:8,5:1,4
-chr8	55855177	.	T	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00065599;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:18,3:5,6
-chr8	57210828	.	G	C	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.0021333;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:159,24:105,18:54,6
-chr8	58518952	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
-chr8	58716687	.	T	TAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011528;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:9,5:4,2
-chr8	60219929	.	T	TA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,8:3,4:4,4
-chr8	60917314	.	C	CT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.041383;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:5,3:19,2
-chr8	60928420	.	GAA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0016018;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,10:4,8:0,2
-chr8	60971071	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:2,2:8,5
-chr8	65516206	.	AT	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.038786;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:15,2:17,3
-chr8	66355392	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=6.9149e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:15,4:15,9
-chr8	66521790	.	GGAGAGAGAGAGA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.062714;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:6,5:6,1
-chr8	66987287	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03735;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,5:6,1
-chr8	67583820	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.015386;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:15,2:7,2
-chr8	67975694	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11404;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:4,4:6,1
-chr8	68268026	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:7,10:2,3:5,7
-chr8	69258254	.	T	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:3,2:3,1
-chr8	69853653	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.029803;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:13,7:16,4
-chr8	69873267	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:12,4:3,2:9,2
-chr8	71305668	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048875;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,7:9,1
-chr8	71328691	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=2.3366e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:12,9:15,5
-chr8	71712677	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,2:4,2
-chr8	73007093	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0039926;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,4:5,3
-chr8	73996368	.	CATTCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024823;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:5,1:14,4
-chr8	74872603	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00035827;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:17,8:14,2
-chr8	76922395	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024348;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:1,1:4,2
-chr8	77520698	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,2:3,1:4,1
-chr8	77691448	.	T	TATATATATATAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:6,1:7,4
-chr8	78459433	.	T	TAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:2,1:2,1
-chr8	80296492	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,2:3,1:3,1
-chr8	81908285	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.3703e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:15,9:12,7
-chr8	82217222	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.067367;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:16,6:5,1:11,5
-chr8	83384842	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,1:9,3
-chr8	83614431	.	C	CTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.29515;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:10,6:2,1:8,5
-chr8	84047207	.	TA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,2:0,0:1,2
-chr8	84112667	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=4.1518e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:13,9:14,7
-chr8	84379753	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.2075e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:16,5:4,8
-chr8	84732683	.	T	TATATATATATATATATATATACACACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.062277;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,5:8,3:16,2
-chr8	85190497	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:3,3:4,2
-chr8	85805171	.	TC	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.028654;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:20,5:18,1
-chr8	86145349	.	AGAAG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,3:3,1
-chr8	87707682	.	TA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.17135;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:11,2:5,3
-chr8	88479820	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.0752e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,22:9,8:13,14
-chr8	88491755	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.057106;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,3:16,1
-chr8	88701673	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0021594;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:8,14:4,5:4,9
-chr8	89201130	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.016119;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:16,4:24,2
-chr8	89359069	.	T	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.05154;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,5:6,3:17,2
-chr8	91743919	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,5:16,3:4,2
-chr8	91761495	.	GTTT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.023126;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,9:11,8:8,1
-chr8	92005985	.	T	TACACACACACACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00084741;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:6,4:8,4
-chr8	95092578	.	CTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.015172;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,4:3,2
-chr8	96375594	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:5,2:4,1:1,1
-chr8	96663978	.	A	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=5.135e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:27,21:12,8:15,13
-chr8	99906834	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.049775;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:13,4:15,7
-chr8	101338458	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0051722;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:6,5:8,2
-chr8	102830650	.	CA	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.17271;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,4:20,2:12,2
-chr8	102868226	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0035224;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:12,7:5,7
-chr8	105514307	.	CTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:3,2:1,2
-chr8	105998895	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:12,7:5,1
-chr8	106864978	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0219;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,5:3,2
-chr8	106953979	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,4:0,1:1,3
-chr8	108098097	.	A	AAG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.043422;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:15,4:2,2
-chr8	109311561	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:8,2:9,3
-chr8	111010596	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.020124;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:3,4:4,3
-chr8	112279013	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,5:9,3:8,2
-chr8	112755352	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0307;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:15,4:17,3
-chr8	114171555	.	C	CT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.044221;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:24,4:10,1
-chr8	116277942	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=5.6774e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:12,10:6,7
-chr8	116366086	.	A	AG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,4:2,1:0,3
-chr8	116813168	.	T	TA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.009828;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:4,6:8,2
-chr8	117384014	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:2,4:1,2:1,2
-chr8	119162057	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.047124;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,1:9,3
-chr8	120055647	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0056039;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,5:6,4
-chr8	120919173	.	C	CTATA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0011313;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:7,11:10,5
-chr8	121268067	.	A	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00043374;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:18,6:16,4
-chr8	121843518	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=8.3852e-10;SS=2;SSC=90;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:24,27:17,19:7,8
-chr8	124296254	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0025397;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:12,9:5,3
-chr8	124409811	.	CAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:3,4:5,1
-chr8	125502794	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:4,1:10,4
-chr8	126824610	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:1,1:2,4
-chr8	127267109	.	C	CT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.002513;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:18,8:6,2
-chr8	127528139	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037605;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:10,1:7,5
-chr8	129014802	.	A	AACAC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0075692;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,8:7,5:4,3
-chr8	129877663	.	GGT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.39286;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:9,4:2,2:7,2
-chr8	130041968	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0055944;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:37:2,7:1,3:1,4
-chr8	131369290	.	T	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.0665e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:13,7:11,8
-chr8	131377354	.	G	GTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:11,3:6,1
-chr8	131731718	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:12,3:9,1
-chr8	132155056	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.1019e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:12,12:14,5
-chr8	132498035	.	T	TCACACACA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,9:5,5:1,4
-chr8	132853447	.	GTT	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.082408;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,1:16,3
-chr8	133067867	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,3:2,3
-chr8	136066837	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036365;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:16,6:5,2
-chr8	136080861	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=1.8161e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:9,10:18,9
-chr8	137797438	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=2.0159e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:8,11:13,5
-chr8	140646440	.	C	CAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0085309;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,9:18,8:3,1
-chr8	140877025	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:3,2:3,2
-chr8	141777461	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00011358;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:18,3:19,9
-chr8	141955673	.	T	TAC	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.044156;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,4:10,3:18,1
-chr8	142222500	.	TCATC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:2,3:4,1
-chr8	143816728	.	C	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=3.4274e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:30,23:15,7:15,16
-chr8	143865501	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:0,3:11,1
-chr8	144297901	.	A	G	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=1.6512e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:29,21:14,5:15,16
-chr8	144953029	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:4,2:3,1:1,1
-chr9	117800	.	G	T	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.0164;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:30,2:28,6
-chr9	374453	.	G	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:7,2:1,4
-chr9	954556	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.7838e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:7,11:11,8
-chr9	1660092	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=4.8849e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:11,7:18,4
-chr9	5080892	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0061493;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,10:7,7:3,3
-chr9	5131435	.	A	ATTTTTTTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.066061;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:17,4:11,2
-chr9	10065141	.	T	TAGAAAGAAAGAAAGAAAGAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.012389;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,8:12,4:11,4
-chr9	10908115	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.1076e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:18,10:9,9
-chr9	11546252	.	GT	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=3.0028e-06;SS=2;SSC=55;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:39,17:18,9:21,8
-chr9	12257671	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:39:1,3:1,2:0,1
-chr9	12745528	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,3:1,1
-chr9	13981005	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.13232;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:14,1:20,3
-chr9	14825488	.	CAA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.005418;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:2,1:2,5
-chr9	17996165	.	AT	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=8.9651e-09;SS=2;SSC=80;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:13,24:11,12:2,12
-chr9	18626806	.	TTTC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.01552;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:6,2:14,5
-chr9	19226767	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,2:3,2
-chr9	20097720	.	ATTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,2:4,2
-chr9	22101703	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.029148;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,8:4,4:10,4
-chr9	22552406	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00010628;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:23,7:11,7
-chr9	24347063	.	A	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=3.4048e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:32,16:15,7:17,9
-chr9	25152059	.	T	TAC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.013373;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,8:9,5:7,3
-chr9	25191113	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=8.3077e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:16,5:12,10
-chr9	25686026	.	C	CGTGT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.015574;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,11:13,5:7,6
-chr9	25786770	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,4:2,3:2,1
-chr9	26037639	.	G	GCACACACA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.013487;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:10,14:8,9:2,5
-chr9	26296673	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.01049;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,7:0,6:3,1
-chr9	30751042	.	T	TTA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:4,4:3,3
-chr9	30885030	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.043511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:14,8:4,1
-chr9	30960417	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=7.5529e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:9,6:7,6
-chr9	31513934	.	A	ATT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.033472;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:7,3:8,5
-chr9	32224004	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:4,4:0,2:4,2
-chr9	32324105	.	TA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.028693;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:10,4:15,6
-chr9	32750824	.	AG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.038941;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:22,1:8,6
-chr9	34005434	.	CA	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.016449;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,11:16,8:2,3
-chr9	34725072	.	T	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.032223;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:18,4:15,5
-chr9	36512491	.	A	AAAATATATATG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.16587;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,6:4,2:7,4
-chr9	36512530	.	A	ATATATG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:6,10:1,3:5,7
-chr9	37593507	.	C	CTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:5,6:1,1
-chr9	37985881	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=8.8749e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:7,5:18,16
-chr9	39062770	.	T	G	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.024377;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:79,13:37,5:42,8
-chr9	39077977	.	G	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.031136;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:22,5:14,2
-chr9	39078499	.	A	T	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.027105;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:72,19:33,10:39,9
-chr9	39082641	.	C	T	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.0033577;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:61,13:40,8:21,5
-chr9	39447377	.	C	G	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.031831;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:51,11:26,8:25,3
-chr9	39471618	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.022424;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:7,4:13,5
-chr9	39802183	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
-chr9	39817969	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.16358;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:2,0:20,4
-chr9	39822306	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.023254;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:3,1:16,5
-chr9	39856617	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,0:7,4
-chr9	39892865	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,1:0,1
-chr9	40199857	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0028381;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,15:25,13:7,2
-chr9	40285602	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
-chr9	40335822	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.046295;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,7:6,2
-chr9	40353883	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:14,4:1,0
-chr9	40649247	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
-chr9	40721745	.	G	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.02489;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:21,7:22,4
-chr9	40781006	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.049128;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:13,2:21,2
-chr9	40829629	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00042879;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:7,5:17,8
-chr9	40863176	.	C	CTT	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0457;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:17,9:23,1
-chr9	40957019	.	C	T	0	PASS	DP=243;GPV=1;SPV=0.0041396;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:120,24:64,14:56,10
-chr9	40957044	.	C	G	0	PASS	DP=274;GPV=1;SPV=0.0025752;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:133,27:65,19:68,8
-chr9	40994477	.	G	A	0	PASS	DP=245;GPV=1;SPV=0.049069;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:105,22:46,9:59,13
-chr9	40996429	.	C	A	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.0079392;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:97,27:35,7:62,20
-chr9	41009910	.	T	C	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.0011165;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:86,10:40,7:46,3
-chr9	41092878	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.0037018;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:23,10:19,6
-chr9	41219934	.	A	G	0	PASS	DP=227;GPV=1;SPV=0.012217;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:91,23:65,16:26,7
-chr9	41260339	.	C	G	0	PASS	DP=159;GPV=1;SPV=0.027233;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:60,17:35,10:25,7
-chr9	41295625	.	G	T	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.046353;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:65,18:30,5:35,13
-chr9	41456106	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0033365;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:7,9:7,2
-chr9	41524691	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.03962;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:42,12:24,9:18,3
-chr9	41543438	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.01079;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,5:10,2
-chr9	41619182	.	CA	C	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.023987;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:45,11:26,9:19,2
-chr9	41629752	.	G	A	0	PASS	DP=197;GPV=1;SPV=0.011889;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:85,21:49,14:36,7
-chr9	41654836	.	G	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.01466;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:22,4:22,11
-chr9	41754427	.	C	A	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.00039703;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:73,31:38,17:35,14
-chr9	41758406	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.015213;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:13,7:10,2
-chr9	41781296	.	A	C	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.026722;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:78,10:46,6:32,4
-chr9	41850515	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:0,0:20,4
-chr9	41861347	.	G	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
-chr9	42030750	.	C	CAGAGAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:9,4:0,0
-chr9	42334258	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.046134;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:16,1:20,6
-chr9	42930756	.	G	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.017302;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:24,4:23,3
-chr9	43299406	.	A	T	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.0099979;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:64,18:45,13:19,5
-chr9	43399857	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.13663;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:1,0:26,4
-chr9	43620725	.	A	T	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.045298;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:129,20:81,8:48,12
-chr9	43698558	.	C	G	0	PASS	DP=168;GPV=1;SPV=0.037934;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:81,12:58,8:23,4
-chr9	43804025	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:28,4:0,0
-chr9	43804413	.	C	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.032961;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:12,4:16,7
-chr9	43804414	.	A	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.018813;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:13,4:15,8
-chr9	43842933	.	A	T	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.010739;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:79,17:24,4:55,13
-chr9	44305562	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:19,4:1,0
-chr9	44305563	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11302;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:20,4:1,0
-chr9	44521259	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.065116;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,1:8,3
-chr9	44521710	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.012087;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:11,3:15,3
-chr9	44556710	.	A	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0058007;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:3,1:0,7
-chr9	44579928	.	G	T	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:70,10:54,9:16,1
-chr9	44737074	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:8,5:0,1
-chr9	45123818	.	T	G	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.034022;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:90,10:49,4:41,6
-chr9	45502833	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:23,4:1,0
-chr9	60569052	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066077;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:8,3:14,2
-chr9	60638466	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:18,4:1,0
-chr9	60653336	.	G	C	0	PASS	DP=432;GPV=1;SPV=0.044742;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:219:192,27:8,1:184,26
-chr9	61869465	.	TC	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.033522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:19,5:14,1
-chr9	62801044	.	G	C	0	PASS	DP=391;GPV=1;SPV=0.0059915;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:202:177,25:87,12:90,13
-chr9	62813372	.	A	G	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.018566;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:103,20:56,8:47,12
-chr9	62813624	.	T	C	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.0082734;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:111,16:66,12:45,4
-chr9	62821722	.	A	T	0	PASS	DP=221;GPV=1;SPV=0.033791;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:91,17:41,10:50,7
-chr9	62830190	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.021689;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:8,5:21,6
-chr9	62837642	.	G	T	0	PASS	DP=246;GPV=1;SPV=0.045816;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:100,20:50,8:50,12
-chr9	62883872	.	A	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0083664;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:37,7:8,2
-chr9	62893729	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1356;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:9,1:23,5
-chr9	62903251	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.034686;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:53,12:27,6:26,6
-chr9	63398809	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:0,2:4,2
-chr9	63701977	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.02072;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:13,3:21,3
-chr9	63756111	.	G	T	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.03921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:69,13:44,7:25,6
-chr9	63759339	.	G	A	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.038714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:86,13:32,2:54,11
-chr9	63868480	.	G	A	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.019296;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:56,13:46,9:10,4
-chr9	64025479	.	T	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.012169;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:23,10:9,4
-chr9	64119933	.	T	A	0	PASS	DP=336;GPV=1;SPV=0.0001077;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:140,26:50,9:90,17
-chr9	64416413	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.048123;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:22,4:8,2
-chr9	64436111	.	T	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.048085;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:8,4:32,9
-chr9	64513266	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0097768;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:8,2:6,6
-chr9	64598624	.	G	GTATA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.13232;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,4:15,2:19,2
-chr9	64768679	.	G	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,2:3,5
-chr9	64788946	.	A	G	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.044279;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:96,18:70,12:26,6
-chr9	64907503	.	G	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,2:7,2
-chr9	64910453	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,2:3,2
-chr9	65187717	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
-chr9	65276523	.	AT	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.075692;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:28,4:9,1
-chr9	65276529	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:28,3:7,1
-chr9	65276582	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.075047;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:26,4:2,1
-chr9	65293096	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.047135;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:10,1:19,6
-chr9	65306269	.	G	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,3:10,2
-chr9	65379043	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.045034;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:18,9:14,1
-chr9	65573606	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.054338;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:19,1:14,3
-chr9	65967880	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.012629;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:5,1:16,7
-chr9	65967881	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.017466;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:4,1:16,6
-chr9	66076158	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,3:3,1
-chr9	66079607	.	C	T	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.03446;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:91,18:44,8:47,10
-chr9	66158767	.	G	C	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.047289;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:58,11:20,2:38,9
-chr9	66160804	.	CA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.082831;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:21,4:2,0
-chr9	66161100	.	C	T	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.0012909;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:51,24:32,17:19,7
-chr9	66170499	.	C	A	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.016945;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:87,21:52,10:35,11
-chr9	66182996	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.031008;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:21,2:10,4
-chr9	66197438	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.0048003;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:22,9:21,1
-chr9	66257253	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.003096;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,1:1,5
-chr9	66274253	.	T	C	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.012396;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:65,9:37,3:28,6
-chr9	66697103	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.025558;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:17,5:17,6
-chr9	66705158	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.09062;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:6,2:11,2
-chr9	66705530	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063158;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
-chr9	66737443	.	C	T	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.019877;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:14,5:29,8
-chr9	66740151	.	AAC	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0143;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,5:6,1
-chr9	66961920	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00021015;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:15,6:11,7
-chr9	67008709	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:19,4:0,0
-chr9	67010407	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:2,2:9,6
-chr9	67109278	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=7.6789e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:4,4:7,10
-chr9	67168505	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,1:4,3
-chr9	67604241	.	G	A	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=8.5423e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:56,16:17,9:39,7
-chr9	67645801	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.023193;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:1,1:11,7
-chr9	67687829	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:1,3:12,3
-chr9	67910316	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.013816;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:18,5:2,2
-chr9	67916278	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
-chr9	70301415	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=3.279e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:26,25:11,14:15,11
-chr9	70517355	.	TTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTG	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:4,2:0,0:4,2
-chr9	72606947	.	A	ATATGTATG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.025544;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:13,8:11,3
-chr9	73490320	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=4.219e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:7,9:12,8
-chr9	75495712	.	TC	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:3,2:1,1:2,1
-chr9	77840230	.	T	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=2.0023e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:10,8:13,14
-chr9	79855857	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.013657;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,6:10,4:1,2
-chr9	80644179	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.018479;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:6,5:4,3:2,2
-chr9	81254683	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.026907;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,5:4,3
-chr9	82847149	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.020423;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:16,5:20,1
-chr9	83160690	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=5.7558e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:16,9:8,6
-chr9	83372369	.	C	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0066382;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:11,5:5,2:6,3
-chr9	84192814	.	CTT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.064826;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:14,2:9,2
-chr9	85680513	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=5.765e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:9,4:14,11
-chr9	86176985	.	A	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=5.6241e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:17,11:13,3
-chr9	86405912	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=3.1007e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:8,7:12,5
-chr9	87430255	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0035197;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:6,4:2,5
-chr9	87540183	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,6:2,1
-chr9	87831691	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.038906;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:30,6:19,4:11,2
-chr9	87853699	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.030612;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,7:14,3:10,4
-chr9	88011352	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,9:0,6:3,3
-chr9	88150465	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=1.4701e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:10,7:13,13
-chr9	88589008	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.1205e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:8,8:16,6
-chr9	89182535	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0092996;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:11,5:9,6
-chr9	96502595	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,2:3,1:1,1
-chr9	97772414	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=3.4237e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:37,16:20,8:17,8
-chr9	100932673	.	C	CTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.026907;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:6,5:6,3
-chr9	102410335	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0018783;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:17,4:8,4
-chr9	102966026	.	A	ATTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,4:3,3:1,1
-chr9	104059407	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13206;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,7:11,3:9,4
-chr9	104659686	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.021523;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:11,6:1,2
-chr9	104995718	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,2:7,2
-chr9	105485533	.	G	GT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:8,4:9,1
-chr9	108466081	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.068133;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:24,2:11,3
-chr9	109021507	.	G	GT	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.03863;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:22,4:19,2
-chr9	109073856	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0018191;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:9,6:4,3
-chr9	109260410	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:10,2:3,2
-chr9	110745259	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.011348;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:18,3:19,6
-chr9	111641320	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.15761;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:24,3:11,1
-chr9	115449416	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,1:6,6
-chr9	116048961	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=9.1856e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:11,9:8,3
-chr9	116088504	.	C	CAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.44608;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:10,4:1,0
-chr9	116656682	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0087022;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,3:3,2
-chr9	118714270	.	C	CT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.093615;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:7,1:28,4
-chr9	118759933	.	A	AT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.016518;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:16,5:8,3
-chr9	118846936	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:22,4:11,2:11,2
-chr9	118948756	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=5.3601e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,17:13,9:7,8
-chr9	119140426	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,2:8,2
-chr9	119172303	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=7.0959e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:13,4:12,11
-chr9	119412506	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0011745;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:10,4:21,6
-chr9	119999714	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,3:3,1:2,2
-chr9	121228422	.	ATATTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028205;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
-chr9	121333566	.	T	TA	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=6.5058e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:15,4:21,9
-chr9	124366088	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00040604;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:19,5:12,5
-chr9	126202168	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0063642;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:4,5:12,4
-chr9	126736711	.	A	ATATATG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:11,2:3,3
-chr9	126960219	.	C	CCCTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.32536;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:0,0:13,4
-chr9	128818108	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0027222;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:15,8:5,1
-chr9	128954419	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:15,2:6,2
-chr9	129393660	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.20979;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,4:1,3:5,1
-chr9	129410444	.	T	TCAC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.021073;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:1,4:9,1
-chr9	130062095	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.019651;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:15,1:14,5
-chr9	130071035	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0072239;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,5:0,4:2,1
-chr9	130114029	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:4,7:1,1
-chr9	130753428	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.011329;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,7:6,2
-chr9	131587223	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,2:3,2:0,0
-chr9	131964347	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,1:2,3
-chr9	132333394	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,2:9,2
-chr9	132396675	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,4:2,2:5,2
-chr9	132930587	.	C	CAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,4:11,3:1,1
-chr9	134025267	.	C	CAG	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,4:4,1
-chr9	134513183	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:4,3:2,2
-chr9	135208007	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.13122;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,5:13,3:12,2
-chr9	136573344	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.5034e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:14,5:10,9
-chr9	137517239	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.14706;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,3:1,1:6,2
-chr9	138207134	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,1:9,3
-chr9	138228081	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.026333;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:16,6:4,2
-chrM	12283	.	G	A	0	PASS	DP=14647;GPV=1;SPV=0;SS=2;SSC=255;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7264:4867,2396:1986,1012:2881,1384
-chrX	2846056	.	T	TATATATATA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:3,1:2,3
-chrX	3116325	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.044988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:17,2:7,2
-chrX	3152301	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00011765;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:10,4:14,8
-chrX	3598596	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,2:4,3
-chrX	3600513	.	G	GTGTAAAGTTTCAGTCA	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.0006993;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,8:0,5:0,3
-chrX	3685264	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046139;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:6,1:13,5
-chrX	3688872	.	TA	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0042329;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:14,5:10,2
-chrX	3788573	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:5,2:1,1:4,1
-chrX	3827170	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00062132;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:8,6:7,10
-chrX	4293487	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.034373;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,3:11,1
-chrX	4383022	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:2,3:5,1
-chrX	4942192	.	AG	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.07597;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:14,2:20,2
-chrX	4942199	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.07597;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,2:18,2
-chrX	5809652	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=7.7888e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:12,9:14,6
-chrX	5832883	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,9:0,4:11,5
-chrX	5847352	.	T	TAG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.050426;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:4,4:9,1
-chrX	6055094	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00011108;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:17,5:16,6
-chrX	6510956	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=6.7349e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:13,7:11,6
-chrX	6900575	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.048243;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:7,6:13,1
-chrX	7275929	.	C	CT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0033651;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,13:9,8:9,5
-chrX	7279325	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.12;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,2:4,1:3,1
-chrX	8388917	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13316;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,1:13,3
-chrX	9411334	.	T	G	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.031284;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:119,19:56,12:63,7
-chrX	9792178	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.03024;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,2:7,2
-chrX	11320766	.	T	TAC	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.025477;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,5:9,5
-chrX	11323811	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.2794e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:20,21:13,9:7,12
-chrX	12773205	.	C	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.0504e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:32,16:14,8:18,8
-chrX	14223751	.	CA	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0009678;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,2:8,7
-chrX	14422840	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.17135;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,5:7,4:9,1
-chrX	14823079	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.010021;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,4:4,1
-chrX	14839432	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=3.7594e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:12,7:9,8
-chrX	17059920	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.019179;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:16,8:9,3
-chrX	17977306	.	CT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00057277;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:11,8:7,3
-chrX	18844332	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.062923;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:19,3:20,2
-chrX	19284527	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00012972;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:36,18:22,9:14,9
-chrX	21339631	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=1.4808e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,17:13,12:20,5
-chrX	21995667	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0099161;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:0,4:7,3
-chrX	22501795	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=1.4647e-10;SS=2;SSC=98;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:22,25:8,13:14,12
-chrX	22898755	.	AT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01707;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,4:7,1
-chrX	22898764	.	A	ATTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.009828;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:7,4:6,2
-chrX	22983526	.	CTA	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.01617;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:17,6:19,6
-chrX	23400309	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.5419e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:11,9:16,7
-chrX	24709584	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.045829;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:11,2:26,5
-chrX	25045430	.	C	CA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037307;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:14,3:11,2
-chrX	25061948	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022127;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,2:6,2
-chrX	27705060	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.046007;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:11,3:15,1
-chrX	27756805	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.9644e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:14,7:8,7
-chrX	27991343	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00029953;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:9,6:22,6
-chrX	28839659	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=5.1149e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:26,21:15,12:11,9
-chrX	29142698	.	A	ATT	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.00038469;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:30,14:12,9:18,5
-chrX	30652124	.	GA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010204;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,1:3,3
-chrX	30729345	.	C	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.022084;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:20,2:19,3
-chrX	31816796	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,3:4,2
-chrX	32885829	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12206;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,3:11,1
-chrX	33009102	.	GTA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:1,4:7,1
-chrX	33060837	.	CA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.03159;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,8:6,1
-chrX	33432973	.	CAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,3:5,1
-chrX	34250198	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,1:3,5
-chrX	34834603	.	AAT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:8,6:5,3
-chrX	35692244	.	ATT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.23279;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:5,1:17,2
-chrX	38811924	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=5.287e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:13,6:13,6
-chrX	40631256	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.095238;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:3,2:1,1:2,1
-chrX	41181436	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0098934;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,7:4,3
-chrX	41299167	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,1:9,3
-chrX	42419349	.	AT	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=7.7636e-06;SS=2;SSC=51;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:9,11:12,3
-chrX	44602073	.	GTATGTATA	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.10034;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:14,3:8,1
-chrX	47353997	.	C	CTTTTCTTTTCT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:2,3:17,1
-chrX	47369156	.	CTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.045694;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,6:5,2:8,4
-chrX	48284148	.	T	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:9,2:2,2
-chrX	48643108	.	CTA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040656;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:11,4:4,2
-chrX	49344146	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:27,4:0,0
-chrX	49885042	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010718;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,9:3,8:2,1
-chrX	51541752	.	T	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=4.3002e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,22:14,10:11,12
-chrX	52799679	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:1,2:6,8
-chrX	55389535	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=9.7647e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:14,12:13,7
-chrX	55442043	.	T	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00037848;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:15,4:13,5
-chrX	58002624	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=5.3456e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:9,7:11,9
-chrX	58271215	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:2,1:5,5
-chrX	60450576	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
-chrX	63780880	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.031966;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:16,3:21,4
-chrX	65956050	.	T	C	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.037547;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,11:22,9:26,2
-chrX	66569122	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=3.1863e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:25,17:16,8:9,9
-chrX	67300206	.	A	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=3.0955e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:30,21:14,7:16,14
-chrX	70619816	.	C	CT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0094403;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:15,8:7,2
-chrX	70647683	.	A	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=4.4308e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:30,20:19,11:11,9
-chrX	70971461	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:10,1:2,3
-chrX	71230854	.	A	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
-chrX	72453464	.	T	TAAAG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0069343;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,10:6,6:8,4
-chrX	72710825	.	A	AT	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.033817;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:23,4:18,3
-chrX	73577343	.	T	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=8.5797e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:31,17:16,10:15,7
-chrX	73842797	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.68e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:9,8:11,10
-chrX	74960268	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00010649;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:15,10:13,7
-chrX	76209416	.	TATATATATCTAC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,5:6,2
-chrX	76549620	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.12799;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:3,2:4,3
-chrX	77073861	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=7.0297e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:15,4:5,5
-chrX	78548854	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0017066;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:13,5:13,3
-chrX	79841717	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00066603;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:18,3:11,7
-chrX	79915565	.	CATATATATAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:1,4:5,1
-chrX	80000132	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00058486;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:3,5:9,6
-chrX	80753589	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.033295;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:44,7:21,4:23,3
-chrX	80845891	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=3.1065e-10;SS=2;SSC=95;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:30,25:15,16:15,9
-chrX	81067614	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:26:1,3:0,1:1,2
-chrX	83187133	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.1572e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,19:7,2:4,17
-chrX	83517110	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00058357;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:12,5:15,4
-chrX	84659249	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=4.5319e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:25,23:8,7:17,16
-chrX	86689156	.	A	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.218e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:9,5:11,14
-chrX	87233876	.	T	TAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.059999;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,6:12,2:13,4
-chrX	87234360	.	TACATATATATTATATATAC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.02253;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,2:4,3
-chrX	87379839	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.15761;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:21,2:14,2
-chrX	88703648	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.010344;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:12,5:3,1
-chrX	88880465	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=3.3311e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:14,5:14,8
-chrX	89836645	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.014208;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:14,2:12,5
-chrX	89895899	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:4,3:9,2
-chrX	90257641	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.040635;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:20,4:14,3
-chrX	90269467	.	T	TTATA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,4:7,2:13,2
-chrX	90901597	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0044132;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:19,8:14,6
-chrX	91065127	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.035066;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,6:12,5:6,1
-chrX	91224128	.	A	AAATAATAAT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.04524;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:13,5:12,6
-chrX	91251493	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.016812;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:10,4:13,5
-chrX	91828120	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030178;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:13,9:5,1
-chrX	91896087	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00023423;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:10,4:10,5
-chrX	91953315	.	C	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=2.1224e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:19,7:17,7
-chrX	92078122	.	T	TA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=2.7081e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:13,8:9,7
-chrX	92566592	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0049255;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:9,8:16,1
-chrX	92576041	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00011056;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:5,7:6,3
-chrX	92743454	.	GA	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.007358;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:19,6:12,2
-chrX	93419812	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=3.4423e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:13,6:14,8
-chrX	94795827	.	AT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.021554;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:12,3:5,2
-chrX	96067419	.	A	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00021276;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:17,9:18,5
-chrX	96434670	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.5666e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:12,8:15,16
-chrX	96837435	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,8:5,3:7,5
-chrX	98001253	.	C	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=4.7997e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,18:15,9:13,9
-chrX	98325244	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=7.2254e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,20:16,10:11,10
-chrX	98827187	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=7.0663e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:11,6:5,5
-chrX	99552903	.	A	AATATAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.018634;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,1:2,4
-chrX	99869226	.	A	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=1.3324e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:13,6:14,8
-chrX	101792604	.	CGTGT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,5:5,3:9,2
-chrX	106200872	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=6.5488e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:13,10:14,3
-chrX	106510355	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.459e-10;SS=2;SSC=92;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:20,24:12,10:8,14
-chrX	107557797	.	CTATATA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,6:1,4:3,2
-chrX	107754072	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=5.967e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:26,21:9,13:17,8
-chrX	108343134	.	AAT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.022121;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:19,3:2,4
-chrX	108874131	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=4.5693e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:10,9:11,11
-chrX	109753999	.	C	CAAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.023496;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:17,9:5,1
-chrX	109882816	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,4:8,1
-chrX	110084379	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,3:3,2:3,1
-chrX	110689604	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.020719;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,6:4,4:4,2
-chrX	110689606	.	C	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.063462;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,3:5,2:3,1
-chrX	113097201	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,3:9,1
-chrX	113206719	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.3703e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:9,10:18,6
-chrX	113671430	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.023574;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:8,4:2,4
-chrX	115458659	.	CAAGCAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.041892;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,5:11,2
-chrX	115888354	.	G	A	0	PASS	DP=324;GPV=1;SPV=0.048847;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:150,18:79,5:71,13
-chrX	116895479	.	TC	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:18,1:10,3
-chrX	117369732	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=3.46e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:18,7:12,8
-chrX	118231918	.	AAAGAAGAAG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.026224;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,6:0,5:4,1
-chrX	118323949	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.057503;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:12,7:7,1
-chrX	118438797	.	G	GTTTTTTTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:11,3:8,1
-chrX	119156971	.	CTATATATATATATA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:3,3:5,1
-chrX	120068061	.	AC	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,2:10,2
-chrX	121458402	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.8347e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:27,22:12,13:15,9
-chrX	122945234	.	TC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.011012;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,7:4,3:4,4
-chrX	123288134	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.010112;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:15,6:18,2
-chrX	123849603	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0041602;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,8:5,7:5,1
-chrX	123864455	.	G	GT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:7,3:4,2
-chrX	123926466	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:6,3:4,1
-chrX	124436936	.	CTT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,8:9,4:5,4
-chrX	125516959	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.5419e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:14,5:13,11
-chrX	126154797	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.454e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:14,10:14,7
-chrX	126758503	.	G	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=3.2088e-10;SS=2;SSC=94;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:16,26:7,10:9,16
-chrX	126765903	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00034023;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:21,6:16,8
-chrX	127180258	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.032967;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:40:1,10:0,2:1,8
-chrX	127905933	.	T	TATATATATATATATATATATATATAG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,4:5,3:4,1
-chrX	129053010	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0007826;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:13,9:20,3
-chrX	129469054	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00019866;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:14,3:17,11
-chrX	129599286	.	C	CT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0029501;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:11,4:8,4
-chrX	130087798	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00029546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:9,3:16,7
-chrX	130335457	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:12,3:3,1
-chrX	130489927	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.046841;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:15,5:19,3
-chrX	130786650	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0056253;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:10,3:12,5
-chrX	130864313	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.0798e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:29,17:9,8:20,9
-chrX	131117619	.	A	ATT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.013095;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:8,4:0,1
-chrX	132138750	.	T	TAATA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0075277;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,13:12,9:9,4
-chrX	133148474	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=1.5518e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,22:12,7:16,15
-chrX	134950870	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0073947;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:8,5:3,5
-chrX	137105225	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.6974e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:12,5:15,8
-chrX	137492843	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:14,3:5,1
-chrX	137523728	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.5625e-10;SS=2;SSC=95;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:17,23:10,13:7,10
-chrX	139523037	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00025079;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:12,4:7,5
-chrX	141098121	.	GTGTATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.024419;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,10:12,5:5,5
-chrX	142287597	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.9669e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:19,22:12,9:7,13
-chrX	142551074	.	A	ATATG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.031028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,3:9,2
-chrX	143600240	.	C	CA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00047367;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:13,5:18,6
-chrX	143631629	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=8.729e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:9,7:11,6
-chrX	144171912	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.036342;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,2:11,4
-chrX	144847540	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0043057;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:18,5:18,4
-chrX	144848827	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.3393e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:11,7:12,7
-chrX	144878667	.	C	CT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0057228;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:6,16:1,12:5,4
-chrX	145173170	.	AAG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047988;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:10,3:11,2
-chrX	145612584	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0017437;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:20,3:19,6
-chrX	145938390	.	A	ATGTGTG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.015839;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:16,8:6,3
-chrX	146835816	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:13,2:4,2
-chrX	146972101	.	G	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.03614;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:26,1:17,8
-chrX	147512886	.	TTACACATTGTAATACACATTGCAATACAA	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.036707;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,2:16,2
-chrX	147982851	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00049033;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:13,6:12,9
-chrX	148430035	.	TATATAATATATAAATATATTATATATTATATAA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.094639;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:6,4:11,1
-chrX	150398367	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031602;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:13,5:8,1
-chrX	151073038	.	ATATG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.021584;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:6,3:4,1
-chrX	151781807	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.5203e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:14,9:14,6
-chrX	152074475	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:35:0,2:0,0:0,2
-chrX	152127579	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=4.9813e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:14,8:10,12
-chrX	152296703	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.018989;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:13,10:8,3
-chrX	152808054	.	T	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=3.3869e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:29,20:18,10:11,10
-chrX	153012235	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0010185;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:14,5:9,4
-chrX	153091352	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=1.2506e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,16:18,9:11,7
-chrX	153569113	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=6.8562e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:11,10:15,10
-chrX	153619138	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,6:7,1:3,5
-chrX	154191398	.	G	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:5,2:1,3
-chrY	11137800	.	CA	C	0	PASS	DP=288;GPV=1;SPV=0.011245;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:136,20:67,12:69,8
-chrY	11147115	.	A	G	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.049806;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:75,13:30,9:45,4
-chrY	11177613	.	G	A	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.017287;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:61,12:44,8:17,4
-chrY	11198115	.	A	T	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.035283;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:41,12:14,4:27,8
-chrY	11199942	.	T	A	0	PASS	DP=203;GPV=1;SPV=0.036234;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:83,17:70,12:13,5
-chrY	11236902	.	T	G	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.019653;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:61,13:36,7:25,6
-chrY	11403141	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0272;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:12,3:15,4
-chrY	11479240	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:1,2:4,1
-chrY	56827498	.	A	G	0	PASS	DP=301;GPV=1;SPV=0.0040244;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:132,22:54,7:78,15
-chrY	56864133	.	A	G	0	PASS	DP=616;GPV=1;SPV=0.0023512;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:342:293,49:163,26:130,23
-chrY	56881916	.	T	C	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.043553;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:81,11:35,6:46,5
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/F.vcf	Wed Sep 16 22:58:28 2020 +0000
@@ -0,0 +1,4089 @@
+##fileformat=VCFv4.2
+##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed">
+##reference=hg38
+##source=varscan.py
+##contig=<ID=chr1,length=248956422>
+##contig=<ID=chr10,length=133797422>
+##contig=<ID=chr11,length=135086622>
+##contig=<ID=chr12,length=133275309>
+##contig=<ID=chr13,length=114364328>
+##contig=<ID=chr14,length=107043718>
+##contig=<ID=chr15,length=101991189>
+##contig=<ID=chr16,length=90338345>
+##contig=<ID=chr17,length=83257441>
+##contig=<ID=chr18,length=80373285>
+##contig=<ID=chr19,length=58617616>
+##contig=<ID=chr2,length=242193529>
+##contig=<ID=chr20,length=64444167>
+##contig=<ID=chr21,length=46709983>
+##contig=<ID=chr22,length=50818468>
+##contig=<ID=chr3,length=198295559>
+##contig=<ID=chr4,length=190214555>
+##contig=<ID=chr5,length=181538259>
+##contig=<ID=chr6,length=170805979>
+##contig=<ID=chr7,length=159345973>
+##contig=<ID=chr8,length=145138636>
+##contig=<ID=chr9,length=138394717>
+##contig=<ID=chrM,length=16569>
+##contig=<ID=chrX,length=156040895>
+##contig=<ID=chrY,length=57227415>
+##filter="SOMATIC"
+##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL">
+##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total depth of quality bases">
+##INFO=<ID=SOMATIC,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates if record is a somatic mutation">
+##INFO=<ID=SS,Number=1,Type=String,Description="Somatic status of variant (0=Reference,1=Germline,2=Somatic,3=LOH, or 5=Unknown)">
+##INFO=<ID=SSC,Number=1,Type=String,Description="Somatic score in Phred scale (0-255) derived from somatic p-value">
+##INFO=<ID=GPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor+normal versus no variant for Germline calls">
+##INFO=<ID=SPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor versus normal for Somatic/LOH calls">
+##FILTER=<ID=str10,Description="Less than 10% or more than 90% of variant supporting reads on one strand">
+##FILTER=<ID=indelError,Description="Likely artifact due to indel reads at this position">
+##FILTER=<ID=VarCount,Description="Fewer than 4 variant-supporting reads">
+##FILTER=<ID=VarFreq,Description="Variant allele frequency below 0.05">
+##FILTER=<ID=VarAvgRL,Description="Average clipped length of variant-supporting reads < 90">
+##FILTER=<ID=VarReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
+##FILTER=<ID=VarDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
+##FILTER=<ID=VarMMQS,Description="Average mismatch quality sum for variant reads > 100">
+##FILTER=<ID=VarMapQual,Description="Average mapping quality of variant reads < 15">
+##FILTER=<ID=VarBaseQual,Description="Average base quality of variant reads < 15">
+##FILTER=<ID=Strand,Description="Strand representation of variant reads < 0.01">
+##FILTER=<ID=RefAvgRL,Description="Average clipped length of ref-supporting reads < 90">
+##FILTER=<ID=RefReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
+##FILTER=<ID=RefDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
+##FILTER=<ID=RefMapQual,Description="Average mapping quality of reference reads < 15">
+##FILTER=<ID=RefBaseQual,Description="Average base quality of ref-supporting reads < 15">
+##FILTER=<ID=RefMMQS,Description="Average mismatch quality sum for ref-supporting reads > 100">
+##FILTER=<ID=MMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) > 50">
+##FILTER=<ID=MinMMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) < 50">
+##FILTER=<ID=MapQualDiff,Description="Mapping quality difference (ref - var) > 50">
+##FILTER=<ID=MaxBAQdiff,Description="Average base quality difference (ref - var) > 50">
+##FILTER=<ID=ReadLenDiff,Description="Average supporting read length difference (ref - var) > 0.25">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype code">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality">
+##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
+##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele">
+##FORMAT=<ID=ADF,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the forward strand">
+##FORMAT=<ID=ADR,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the reverse strand">
+#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	TUMOR
+chr1	167967	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr1	271578	.	A	AT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.012429;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,5:7,2:10,3
+chr1	636494	.	A	G	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.031633;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:47,13:24,9:23,4
+chr1	996625	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.083867;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:19,2:3,3
+chr1	1644921	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.045371;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:16,5:13,5
+chr1	1864314	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:6,6:2,1
+chr1	1976870	.	C	CAG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00016042;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,16:2,6:7,10
+chr1	2142262	.	A	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
+chr1	2913844	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.1392e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:14,6:12,8
+chr1	3181193	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.024399;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:5,5:13,2
+chr1	4251782	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:9,3:5,1
+chr1	5606389	.	A	AATATATATATATAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,7:2,6:1,1
+chr1	5732600	.	A	AG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0043505;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,3:3,4
+chr1	7051663	.	C	CTGCCAGGACAGACTCATCCCTGTT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.031156;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,1:9,3
+chr1	8167511	.	GCACA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:4,3:3,2
+chr1	8233826	.	A	ATATATTTT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:1,1:2,1
+chr1	8501213	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:3,2:14,2
+chr1	8647643	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.048962;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,5:8,4:3,1
+chr1	9647481	.	A	AATTATTATT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0046297;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:3,5:8,5
+chr1	9916882	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.059432;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,1:7,3
+chr1	10583224	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022127;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,1:7,3
+chr1	10616234	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.9275e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:7,10:12,8
+chr1	11045998	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00030325;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:10,6:18,7
+chr1	11771345	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.4859e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:13,9:5,6
+chr1	12381912	.	C	CTTTCT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.022593;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:1,4:15,4
+chr1	12871201	.	C	CT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.018007;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,3:9,7
+chr1	12881560	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.013032;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,3:11,3
+chr1	12947985	.	CTACAAAAA	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0010116;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:9,3:15,7
+chr1	13040570	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,3:7,1
+chr1	13168970	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.020006;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,1:1,3
+chr1	13198698	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.024875;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:11,4:4,6
+chr1	13199161	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.03148;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,6:7,3
+chr1	13217209	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:2,1:5,1
+chr1	13341194	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0036109;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:21,6:14,1
+chr1	13926652	.	T	TA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00036335;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,3:4,4
+chr1	14528362	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.057503;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,8:6,3:13,5
+chr1	15194917	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0074752;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,11:5,8:1,3
+chr1	15293726	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.024383;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:9,3:10,4
+chr1	16311503	.	A	AATAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.083772;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:9,3:6,4
+chr1	16631115	.	G	A	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.0019297;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:81,24:42,14:39,10
+chr1	16656105	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:11,6:2,1
+chr1	16690451	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0079357;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,12:8,3:17,9
+chr1	16732665	.	A	G	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.011554;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:60,10:37,8:23,2
+chr1	16733940	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:0,0:13,4
+chr1	16746403	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.018572;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:8,5:12,7
+chr1	16755063	.	G	A	0	PASS	DP=227;GPV=1;SPV=6.2457e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:98,13:53,5:45,8
+chr1	16849895	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.019869;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:17,8:17,6
+chr1	16860384	.	C	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0059855;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:19,3:20,9
+chr1	16896326	.	A	C	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.0087261;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:16,3:24,4
+chr1	17296935	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0067299;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,4:10,3
+chr1	17822187	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0017389;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:8,2:13,4
+chr1	18611271	.	GAGGA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:6,3:0,1
+chr1	21699192	.	AT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr1	21977914	.	GC	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0028915;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:5,2:7,9
+chr1	24266066	.	T	TTGGA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018564;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:7,4:5,4
+chr1	24407443	.	A	AT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0010171;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,10:6,8:6,2
+chr1	26214945	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.21465;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,5:5,3:6,2
+chr1	27824672	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,4:5,1
+chr1	28923111	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,3:3,1:2,2
+chr1	33493334	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=4.8916e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:8,4:9,9
+chr1	33510173	.	A	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
+chr1	33890232	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0081527;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:9,8:6,4
+chr1	34128594	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.001651;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:12,4:15,6
+chr1	34959242	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,3:5,1
+chr1	35207403	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0014564;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:6,8:2,2
+chr1	36806360	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.6735e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:9,6:11,10
+chr1	37427639	.	G	GAAGAAAGAAAGAAAGA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,4:2,4:0,0
+chr1	38514430	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:5,3:3,2
+chr1	39021177	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,3:0,0:5,3
+chr1	39021181	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,2:0,0:5,2
+chr1	39045665	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:3,1:7,6
+chr1	41260924	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06057;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,1:10,4
+chr1	42131047	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.035721;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:3,3:3,1
+chr1	43813905	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:1,2:0,0:1,2
+chr1	43882975	.	A	AT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.023174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:9,5:11,2
+chr1	44006586	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:12,3:4,1
+chr1	45539020	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064803;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,6:10,3:16,3
+chr1	46212281	.	A	AT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0093079;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,6:13,4:9,2
+chr1	46242260	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:11,7:1,0
+chr1	46700982	.	A	AGT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:4,3:6,3
+chr1	48192907	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010572;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,2:2,4
+chr1	51933945	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=8.4086e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:9,8:9,6
+chr1	52783985	.	C	CGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:12,6:8,3
+chr1	54985221	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:4,4:4,4:0,0
+chr1	55030784	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.079204;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:12,4:15,2
+chr1	55941187	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.018827;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,3:11,4
+chr1	56227866	.	T	TACAC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.017469;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,4:4,4
+chr1	57139968	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00037187;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:11,5:9,6
+chr1	59805102	.	A	ATG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0041795;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:12,9:4,2
+chr1	59860777	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022366;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:6,4:8,5
+chr1	60301295	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,3:2,2
+chr1	63283765	.	A	AAG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:5,3:5,3
+chr1	63817884	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.4829e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:8,7:12,6
+chr1	64268120	.	A	AAAAAAAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.012328;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:4,2:8,3
+chr1	64398280	.	AAG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,4:2,2
+chr1	65038938	.	T	TTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.046888;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:9,4:8,3
+chr1	65518871	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:2,1:10,3
+chr1	65731219	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0045987;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:9,5:11,1
+chr1	65736482	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00020766;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:14,2:8,7
+chr1	68406582	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.040021;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,5:7,2:10,3
+chr1	71928161	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,8:3,5:2,3
+chr1	74111090	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0044219;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:7,3:8,3
+chr1	74448376	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0047587;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:11,4:3,2
+chr1	77533509	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,7:6,5:1,2
+chr1	77765735	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,3:2,3
+chr1	77793626	.	AT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.2759;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:13,2:13,1
+chr1	78005365	.	CT	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.028465;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:15,4:10,1
+chr1	79202929	.	AC	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.026676;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:5,1:9,4
+chr1	80497577	.	TA	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.8738e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:10,11:18,5
+chr1	81825657	.	C	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0096686;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:3,1:1,4
+chr1	82627810	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,2:1,1:3,1
+chr1	83241791	.	C	CATAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:16,3:3,1
+chr1	83248504	.	A	AT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0060587;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:18,12:11,2
+chr1	83390671	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.011442;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:12,6:21,1
+chr1	83716701	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=2.4826e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:12,9:10,9
+chr1	84418338	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,1:9,3
+chr1	86985509	.	CAT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016414;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:3,4:9,1
+chr1	88567358	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,7:5,6:2,1
+chr1	91040277	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:4,6:2,4
+chr1	95681557	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=3.7162e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:6,6:7,6
+chr1	96650554	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031354;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:6,1:9,8
+chr1	98112422	.	TAA	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:2,4:0,0
+chr1	99227734	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00036745;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:15,5:12,12
+chr1	99822926	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.017056;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,7:5,1:5,6
+chr1	100283934	.	AG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,3:5,2
+chr1	100394111	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14851;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,3:14,1
+chr1	101306166	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,8:4,1
+chr1	101529118	.	G	GAC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00010085;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:11,5:8,7
+chr1	102577728	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=7.6466e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:7,10:8,4
+chr1	102810163	.	C	CAA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
+chr1	103792409	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0010691;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:7,8:11,5
+chr1	104883863	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00044723;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:16,5:7,8
+chr1	105455897	.	AT	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=6.0123e-06;SS=2;SSC=52;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:9,8:6,3
+chr1	106599829	.	C	CTCTCTCTCTA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:3,1:3,3
+chr1	108164778	.	T	TTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.026993;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,4:7,5
+chr1	110808911	.	T	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0089783;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:1,5:2,1
+chr1	111632921	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11976;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,5:14,3:2,2
+chr1	112383177	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,8:6,7:3,1
+chr1	112918065	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00086701;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:7,5:10,10
+chr1	114716126	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00056474;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:6,5:16,6
+chr1	115766865	.	TGATA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0020828;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,10:3,6:6,4
+chr1	118287981	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:10,5:6,4:4,1
+chr1	118682202	.	ATG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,8:2,6:5,2
+chr1	121753005	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036872;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:6,3:21,2
+chr1	121773480	.	TC	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.038637;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:9,2:18,2
+chr1	122138561	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.013215;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,7:4,2
+chr1	122258262	.	G	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr1	124704670	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,4:8,1
+chr1	124798780	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.065489;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:17,4:0,0
+chr1	124872883	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.010192;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:1,1:26,4
+chr1	124906269	.	A	T	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.0092839;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:76,21:41,6:35,15
+chr1	124921389	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.14706;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,3:2,1:5,2
+chr1	124924096	.	G	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:8,3:6,2:2,1
+chr1	125094391	.	T	C	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.016143;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:83,17:45,7:38,10
+chr1	143217456	.	T	A	0	PASS	DP=14662;GPV=1;SPV=0.048859;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7342:6526,739:1761,246:4765,493
+chr1	143217457	.	C	A	0	PASS	DP=13749;GPV=1;SPV=0.0086744;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:6854:6080,740:1673,258:4407,482
+chr1	143241404	.	A	G	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.0089788;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:62,19:58,18:4,1
+chr1	143256117	.	A	T	0	PASS	DP=1640;GPV=1;SPV=0.03986;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:847:755,92:200,20:555,72
+chr1	143334185	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr1	143388651	.	ATAT	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.0036516;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:28,9:10,5
+chr1	143509985	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0045966;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:4,1:26,7
+chr1	143729574	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,4:3,3
+chr1	143739631	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.017469;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,1:4,7
+chr1	144104657	.	C	T	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.037546;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:74,13:34,5:40,8
+chr1	144105904	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.03525;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:14,8:15,1
+chr1	144517710	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:7,1:6,8
+chr1	144529624	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018956;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,6:7,1
+chr1	144549585	.	TA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
+chr1	145227356	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:1,2:0,0
+chr1	145257749	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,1:13,3
+chr1	145602319	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,12:3,4:5,8
+chr1	146129855	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=2.3666e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:5,2:4,7
+chr1	146626712	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.029248;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:20,3:11,6
+chr1	148067460	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0018071;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,5:3,3
+chr1	148106039	.	GA	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.093588;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:14,3:12,1
+chr1	148556832	.	C	CCCTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
+chr1	148869643	.	C	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,1:4,3
+chr1	148893065	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,6:0,5:0,1
+chr1	148906381	.	G	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.020124;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:1,2:6,5
+chr1	149801515	.	GAAGT	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023812;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,4:9,3
+chr1	150088434	.	A	AATATATAT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,5:4,2
+chr1	150241670	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034961;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:8,5:10,6
+chr1	150312297	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.020244;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:13,5:7,2
+chr1	150741885	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.19203;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,4:15,1:8,3
+chr1	153202842	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021442;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:8,5:12,1
+chr1	153877887	.	TA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.024795;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:12,2:2,2
+chr1	154304368	.	GT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014142;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:4,5:1,1
+chr1	157035978	.	AAT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,4:5,1
+chr1	158444953	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,5:7,2
+chr1	158984028	.	G	GT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0036613;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,10:3,7:4,3
+chr1	159126648	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,8:3,7:7,1
+chr1	160335883	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017385;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,6:1,4:2,2
+chr1	160948627	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.010552;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,6:4,2
+chr1	161142085	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,3:2,2
+chr1	161543514	.	T	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.044015;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:16,6:30,3
+chr1	161594229	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,2:8,2
+chr1	161746600	.	C	CTCTCTCTCTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.015516;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:5,1:9,4
+chr1	162467966	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0057228;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:5,4:1,1
+chr1	162693713	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00024212;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:5,5:8,4
+chr1	163328474	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00037903;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:10,6:11,7
+chr1	165020483	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.015907;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,3:4,4
+chr1	166896635	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.005305;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,3:2,1
+chr1	167558484	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0028678;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:6,7:3,4
+chr1	168009472	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:3,1:13,3
+chr1	168440410	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,4:5,4
+chr1	170282189	.	T	TA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.018904;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,6:10,2
+chr1	170933516	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,2:2,2
+chr1	171045482	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00039944;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,16:3,6:8,10
+chr1	171681188	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020212;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,1:3,3
+chr1	171694664	.	G	GAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,4:13,2:6,2
+chr1	171906127	.	AT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00011732;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,6:3,3
+chr1	172872876	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr1	174136273	.	T	TTA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027859;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,6:9,3:6,3
+chr1	174607239	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0022162;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:16,5:9,4
+chr1	174946916	.	AAAT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,2:4,3
+chr1	175417011	.	AAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11424;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:6,1:9,5
+chr1	176042270	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,9:7,6:5,3
+chr1	176406395	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0010863;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:6,3:13,6
+chr1	178695925	.	TA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.030658;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,2:10,2
+chr1	182650202	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.9131e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,3:11,8
+chr1	183166550	.	C	CAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:10,4:2,1
+chr1	185077375	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.005596;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:4,1:14,6
+chr1	185454785	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00025863;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:9,7:15,7
+chr1	185655759	.	ATG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12656;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:19,2:14,2
+chr1	186628414	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.9826e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:17,7:9,13
+chr1	187637839	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.014488;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:10,3:10,3
+chr1	187827169	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.026923;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:1,11:1,2:0,9
+chr1	188473743	.	A	AG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0094953;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,13:5,2:2,11
+chr1	188805737	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.5288e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:7,11:10,3
+chr1	188848105	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,2:6,3
+chr1	191806127	.	ATTTG	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,2:1,1:2,1
+chr1	192627568	.	TAA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.015905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,8:2,5:2,3
+chr1	194088881	.	T	TTATCTATCTATC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.008542;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:5,6:9,3
+chr1	194698706	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00026263;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,6:9,2
+chr1	195004485	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00017262;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,5:11,5
+chr1	196806094	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0057417;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,6:5,1
+chr1	196904226	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00011139;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:10,4:12,8
+chr1	197365625	.	TC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,2:14,2
+chr1	199367532	.	T	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0028686;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:4,6:1,4
+chr1	200443192	.	A	ATT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00057632;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,11:5,5:1,6
+chr1	200942179	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.016908;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,5:2,1
+chr1	202847186	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.074026;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,2:8,2
+chr1	202928823	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,6:7,5:5,1
+chr1	203330817	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024751;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,4:9,3
+chr1	204195269	.	CACAT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,4:6,2
+chr1	204195292	.	A	ACATATACG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018404;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:3,3:8,2
+chr1	205884539	.	CAT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,1:5,3
+chr1	207213830	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,3:0,1:1,2
+chr1	207729251	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,7:5,6:4,1
+chr1	208845734	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016895;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:11,1:13,4
+chr1	210798040	.	CT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.048497;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
+chr1	212210694	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,1:3,3
+chr1	212224368	.	C	CAG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.048094;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:9,2:18,3
+chr1	213812952	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0056882;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:5,3:15,3
+chr1	214398606	.	CCTG	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,2:8,3
+chr1	216165808	.	G	GT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0041486;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:10,9:0,2
+chr1	218395611	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:2,2:3,4
+chr1	218482328	.	A	AT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,7:3,2:4,5
+chr1	218788920	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00076774;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:12,2:7,7
+chr1	222192151	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00057068;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:14,5:5,6
+chr1	222488201	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0043971;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:13,4:4,2
+chr1	222936762	.	TAA	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:2,4:3,2
+chr1	224260699	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,2:7,2
+chr1	224711794	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,4:6,3:3,1
+chr1	226114622	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0053554;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,3:3,5
+chr1	226252318	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10544;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:14,1:14,3
+chr1	226732102	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:3,8:3,2
+chr1	226795555	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:0,3:1,1
+chr1	226886041	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0069488;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:4,5:12,1
+chr1	227726185	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.013278;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:6,8:4,2
+chr1	228903868	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=6.6453e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:11,8:3,11
+chr1	232424065	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0058348;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:14,4:7,3
+chr1	232496560	.	C	CAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.021659;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:8,8:8,2
+chr1	232849287	.	CTT	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,1:2,3
+chr1	234623890	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,2:4,2:0,0
+chr1	234786202	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.059099;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,2:10,2
+chr1	236464427	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,3:4,2
+chr1	238605947	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,4:5,1
+chr1	238739107	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0014624;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:12,6:7,5
+chr1	240729885	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:8,2:1,5
+chr1	241235918	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,3:2,3
+chr1	241327129	.	A	AG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
+chr1	241428779	.	C	CTT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:2,1:3,1
+chr1	242091832	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,1:3,4
+chr1	242207816	.	T	TTA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:1,6:0,2:1,4
+chr1	242831901	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23569;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,5:10,3:5,2
+chr1	245443291	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,6:5,2
+chr1	245612107	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,2:10,2
+chr1	246232920	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.23453;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,2:12,2
+chr1	247428109	.	C	CTG	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0093304;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:21,5:11,7
+chr1	248658775	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.023086;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,1:14,3
+chr1	248942173	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.02714;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:21,7:4,1
+chr10	201585	.	T	TACACACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:5,4:0,3
+chr10	347891	.	G	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.012987;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,5:0,2:1,3
+chr10	348012	.	C	CCCCACACTCA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:23,2:3,2
+chr10	467539	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:33:0,2:0,1:0,1
+chr10	2430663	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,3:0,1
+chr10	2571322	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,3:2,2:3,1
+chr10	2967703	.	C	CGT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,7:6,5:3,2
+chr10	3323486	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:5,4:1,1
+chr10	5370005	.	G	GTA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.27607;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,4:4,1:12,3
+chr10	5398439	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,2:9,2
+chr10	5610441	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:2,2:0,0:2,2
+chr10	5692149	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,9:8,8:4,1
+chr10	5707654	.	T	TTC	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.01548;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:0,4:4,2
+chr10	5998631	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0022186;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,19:7,10:12,9
+chr10	6402371	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.010145;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,6:8,5:0,1
+chr10	6517588	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:3,4:1,1
+chr10	6876594	.	T	TCTCA	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.000999;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:0,10:0,6:0,4
+chr10	8216268	.	CTCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.033794;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:1,2:7,3
+chr10	8696501	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,2:16,2
+chr10	10743101	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00016735;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,7:10,3
+chr10	10857649	.	G	GTA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,4:3,1
+chr10	12056441	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00071703;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:1,7:4,3
+chr10	12226655	.	GAT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.017674;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:5,2:5,3
+chr10	12574497	.	T	TTTA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:4,3:9,1
+chr10	13789769	.	ATG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:6,3:3,1
+chr10	14417553	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.3691e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:13,7:6,6
+chr10	15600251	.	TA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.9244e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:8,8:10,10
+chr10	15728097	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=4.9403e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,2:7,8
+chr10	16324158	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,5:4,1
+chr10	16652392	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:11,4:1,1
+chr10	21770395	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,3:4,2
+chr10	24369179	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0088484;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:3,4:7,3
+chr10	24436757	.	CAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:5,3:1,1
+chr10	24456706	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.003276;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,5:3,2
+chr10	25983935	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0017823;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:8,3:15,5
+chr10	26721425	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.005667;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,2:4,6
+chr10	27572311	.	AT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0025759;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:6,5:6,3
+chr10	29329657	.	ATCTC	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.036566;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,6:6,2:11,4
+chr10	29445342	.	GAGAGAA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr10	34724899	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0058421;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:19,4:14,8
+chr10	35196895	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.018501;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,1:4,5
+chr10	37327549	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=7.0959e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:16,10:9,5
+chr10	38621941	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.016232;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:17,2:14,4
+chr10	38745197	.	GATGAAATGAA	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.028648;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:15,3:7,1
+chr10	38930473	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.018934;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:20,6:25,6
+chr10	38957246	.	C	T	0	PASS	DP=356;GPV=1;SPV=0.047562;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:176:158,18:95,3:63,15
+chr10	38966360	.	C	T	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.0056063;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:113,23:64,11:49,12
+chr10	38966727	.	T	C	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.033863;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:20,5:34,1
+chr10	39997897	.	G	T	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.0061832;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:123,16:52,4:71,12
+chr10	40000624	.	C	A	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.030441;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:103,20:55,16:48,4
+chr10	40608677	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:2,2:9,3
+chr10	40706691	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046847;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,3:7,3
+chr10	40864302	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr10	40920571	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.033517;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,6:11,1:18,5
+chr10	40975414	.	C	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.012197;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:23,2:13,5
+chr10	41135564	.	T	A	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.04186;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:64,12:57,11:7,1
+chr10	41150961	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.032688;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,4:10,3
+chr10	41202411	.	C	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0087417;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:9,1:27,6
+chr10	41232580	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:7,5:0,2
+chr10	41425591	.	A	T	0	PASS	DP=289;GPV=1;SPV=0.0047975;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:124,15:11,3:113,12
+chr10	41552857	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.023472;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,3:10,2
+chr10	41552862	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.044988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,2:11,2
+chr10	41562381	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0034912;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:7,10:12,2
+chr10	41562631	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.010634;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:6,2:8,7
+chr10	41564142	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:19,4:24,2
+chr10	41576755	.	C	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.032789;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:17,6:19,2
+chr10	41713561	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0042869;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:8,3:16,6
+chr10	41864307	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027099;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,5:6,3
+chr10	41912091	.	G	C	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.014084;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:66,17:29,11:37,6
+chr10	42073656	.	C	G	0	PASS	DP=654;GPV=1;SPV=0.012143;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:347:299,40:129,22:170,18
+chr10	42073671	.	T	A	0	PASS	DP=648;GPV=1;SPV=0.013281;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:334:287,47:131,26:156,21
+chr10	42080556	.	G	T	0	PASS	DP=821;GPV=1;SPV=0.04623;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:411:359,52:199,26:160,26
+chr10	42103837	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011867;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:15,5:9,3
+chr10	42130049	.	A	T	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.0077328;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:151,17:105,13:46,4
+chr10	42190895	.	GAT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.014047;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:3,3:3,1
+chr10	42227104	.	C	CTCA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.049555;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,2:14,7
+chr10	42271021	.	C	G	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.0039034;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:58,16:26,7:32,9
+chr10	43330621	.	TA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,4:5,2
+chr10	43729991	.	AAG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.24625;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,4:12,2:7,2
+chr10	44338700	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=2.3557e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,16:5,6:5,10
+chr10	45507811	.	G	GA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03378;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:5,5:4,1
+chr10	45695659	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037203;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,2:4,2
+chr10	45775775	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0090384;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,3:6,7
+chr10	46391919	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.053635;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:20,3:11,2
+chr10	46411570	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.033847;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:12,6:19,4
+chr10	46455528	.	C	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,2:9,2
+chr10	46541273	.	GT	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.02442;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:8,1:26,8
+chr10	46541275	.	C	CAG	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:8,1:28,8
+chr10	47584258	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,3:11,1
+chr10	47606142	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.017732;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:11,3:12,6
+chr10	47995404	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.016464;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:13,3:7,3
+chr10	48806215	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=4.3619e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:7,8:10,11
+chr10	51621007	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,6:1,2:1,4
+chr10	52866670	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:3,4:4,1
+chr10	53604670	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,3:5,2
+chr10	54105277	.	GATATAT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:3,3:3,6
+chr10	54146887	.	TGTGTATAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:9,1:8,2
+chr10	54221600	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.029984;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,5:3,1
+chr10	54503225	.	A	ATATGTG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.018374;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,10:13,7:6,3
+chr10	54873697	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030897;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,2:8,2
+chr10	55253253	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.074732;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:9,4:16,1
+chr10	55781207	.	GA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:5,3:3,2
+chr10	56390120	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,2:1,1:1,1
+chr10	56546403	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0011625;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,3:14,6
+chr10	57379700	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0004914;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:12,6:5,3
+chr10	57813753	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=6.8987e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:10,7:10,6
+chr10	58038377	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.017938;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:15,2:13,4
+chr10	58136758	.	G	GTA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.012821;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,5:1,2:2,3
+chr10	59162436	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.004102;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:14,3:12,5
+chr10	60822450	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.5971e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:10,3:11,10
+chr10	63556634	.	GTT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,4:1,2:0,2
+chr10	63652988	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:15,2:8,2
+chr10	63733760	.	TAGATCTATATCTAC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=3.7518e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,19:3,7:4,12
+chr10	64509039	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:1,2:5,1
+chr10	67057674	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.030658;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,2:9,2
+chr10	70248478	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:1,1:4,1
+chr10	71642393	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:4,1:5,3
+chr10	74302101	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,3:1,1:4,2
+chr10	75884245	.	T	TTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:1,2:5,4
+chr10	76535243	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0028662;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:7,5:10,3
+chr10	77324971	.	C	CTG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,6:0,2:3,4
+chr10	78266694	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,10:2,9:5,1
+chr10	79787227	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016895;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:12,4:12,1
+chr10	80061163	.	C	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,2:4,1:3,1
+chr10	80158813	.	G	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00057068;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:9,7:10,4
+chr10	80990997	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,5:4,2:9,3
+chr10	82170653	.	G	GGT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,5:1,1
+chr10	84174493	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.01205;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,4:3,3
+chr10	84319447	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,4:4,2:4,2
+chr10	84394385	.	A	ATGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,5:4,4:2,1
+chr10	88478570	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=3.9238e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,9:5,2
+chr10	90037498	.	G	GA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.013387;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:6,3:2,4
+chr10	90102009	.	C	CAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016238;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,7:11,6:3,1
+chr10	90604983	.	GAGAT	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:13,5:9,5
+chr10	91153473	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00034236;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,3:10,7
+chr10	91664097	.	G	GGGAT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.057396;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,5:12,3:11,2
+chr10	92675142	.	AC	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01921;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,3:4,4
+chr10	92983490	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,11:1,7:4,4
+chr10	93982563	.	C	CCTCT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.01018;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:7,5:11,6
+chr10	97282839	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0070941;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,8:4,2
+chr10	97819830	.	G	GT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:0,5:0,4:0,1
+chr10	100676628	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.043486;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,5:11,3:9,2
+chr10	102520212	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035568;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:9,3:6,2
+chr10	102894439	.	TAA	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.16089;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,4:10,1:10,3
+chr10	103639625	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,4:4,1:8,3
+chr10	104620423	.	T	TTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.066203;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,7:8,5:3,2
+chr10	104696666	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.20979;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,4:4,3:2,1
+chr10	105411722	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00018161;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:7,5:9,5
+chr10	106291175	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=7.0793e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:11,3:4,7
+chr10	106779547	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,6:8,2:4,4
+chr10	107171514	.	C	CTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,7:1,5:3,2
+chr10	108936941	.	CTG	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,2:12,2
+chr10	109850929	.	CAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,10:4,9:4,1
+chr10	112251080	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=7.2935e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:9,5:14,11
+chr10	113118664	.	G	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,3:1,2:5,1
+chr10	113658881	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:3,1:4,3
+chr10	116267948	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.10989;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,2:2,1:1,1
+chr10	116628774	.	C	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,2:5,1:1,1
+chr10	117146974	.	ATT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,6:3,5:6,1
+chr10	118438311	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,4:4,3:4,1
+chr10	118944739	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.046332;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,2:8,2
+chr10	119001107	.	ATG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.023193;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:6,5:6,3
+chr10	119567417	.	AT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
+chr10	119666547	.	T	TGTGCTCAGCGAGATGCATGAG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.046549;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:9,3:6,3
+chr10	121167304	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=9.9495e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,5:6,3
+chr10	121955444	.	AT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,7:2,3:0,4
+chr10	123078525	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:5,3:2,1
+chr10	124580721	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,4:0,0:4,4
+chr10	124587024	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,2:3,3
+chr10	124949522	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:4,1:0,1
+chr10	125486448	.	T	TAAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.003311;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:3,5:8,4
+chr10	126558020	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00161;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:10,3:12,4
+chr10	126651080	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=5.0681e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:8,6:7,6
+chr10	129343960	.	A	ATT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:10,5:0,3
+chr10	130705325	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.57e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:8,4:10,9
+chr10	133645068	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.0040096;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,9:14,7:23,2
+chr10	133657809	.	A	G	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.029166;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:124,15:66,8:58,7
+chr11	179314	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.014318;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:17,2:10,10
+chr11	350146	.	A	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,4:2,1
+chr11	350151	.	C	CACA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
+chr11	2178862	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00056474;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:14,6:8,5
+chr11	3257577	.	G	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,6:6,1
+chr11	4160122	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,4:9,3:6,1
+chr11	4228378	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.038913;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:12,1:17,5
+chr11	4276958	.	C	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.010145;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,1:4,5
+chr11	4335202	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,4:8,1
+chr11	6385445	.	A	AAAGGAAGG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:3,2:5,2
+chr11	7282591	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00088456;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,5:11,6
+chr11	7407360	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:10,2:5,2
+chr11	7889212	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0030692;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:14,4:10,5
+chr11	8862322	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0032575;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:4,12:3,9:1,3
+chr11	9671357	.	TAAATA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0041408;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:2,1:6,7
+chr11	10901712	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,2:1,1:1,1
+chr11	14781161	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0028662;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,6:9,2
+chr11	15298915	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,3:0,0:5,3
+chr11	15298919	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,3:0,0:6,3
+chr11	15502822	.	G	GCA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,4:8,3:4,1
+chr11	16149796	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=6.7064e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:5,8:11,7
+chr11	17756520	.	AACACACAC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.014706;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,9:3,5:1,4
+chr11	18377215	.	G	GTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,6:6,5:2,1
+chr11	19234145	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.013278;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,12:9,10:1,2
+chr11	20289136	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,4:7,2:12,2
+chr11	20549262	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,2:10,2
+chr11	21251540	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0041203;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:15,5:7,3
+chr11	21697973	.	A	AATT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,5:4,2
+chr11	21697974	.	T	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,6:1,5:3,1
+chr11	22659898	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,2:1,2:0,0
+chr11	24926388	.	TAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:5,1:13,3
+chr11	25300473	.	C	CTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0063246;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,8:3,7:2,1
+chr11	25475491	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=6.2951e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:4,4:8,6
+chr11	26447206	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,5:7,4:1,1
+chr11	26726156	.	TCTTCCTTC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,8:4,3:2,5
+chr11	28433172	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.074026;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,4:8,2:7,2
+chr11	29820724	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=6.6326e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,5:4,4
+chr11	30235108	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=9.1194e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:3,5:14,9
+chr11	30790121	.	GA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:14,2:3,2
+chr11	31148210	.	T	TAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:7,3:7,1
+chr11	31163795	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=7.0087e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:4,7:6,5
+chr11	32503846	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:2,1:3,1
+chr11	34424259	.	C	CAA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:3,3:1,1
+chr11	37194539	.	CTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.010145;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,6:3,4:5,2
+chr11	37216846	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=9.263e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,3:8,9
+chr11	40578140	.	GGTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022967;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:2,4:1,3
+chr11	40834919	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:9,3:14,1
+chr11	40851076	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=4.316e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:6,5:9,7
+chr11	41083294	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00014258;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:11,7:4,6
+chr11	41304529	.	T	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
+chr11	41938396	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047696;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:9,3:6,3
+chr11	42125346	.	AC	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:1,7:0,1:1,6
+chr11	43810371	.	AT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.012987;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:0,5:0,2:0,3
+chr11	45923985	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.004257;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,7:4,5:0,2
+chr11	45989490	.	T	TAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,9:3,6:4,3
+chr11	46816787	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,3:3,2:2,1
+chr11	49035339	.	ATTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,1:4,3
+chr11	49212688	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=9.3552e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:10,6:7,4
+chr11	49857032	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00029985;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:7,5:7,5
+chr11	51289722	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:6,2:22,2
+chr11	51622370	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020274;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:1,2:16,7
+chr11	51850532	.	C	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
+chr11	52142061	.	A	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
+chr11	52304615	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.064197;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:2,0:31,4
+chr11	52482834	.	A	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.024396;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:74,10:30,3:44,7
+chr11	52556895	.	T	C	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.016892;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:53,14:9,7:44,7
+chr11	53372519	.	T	G	0	PASS	DP=376;GPV=1;SPV=0.025298;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:172:150,22:81,3:69,19
+chr11	53604369	.	G	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0085098;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:14,5:20,2
+chr11	53628092	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.031193;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:14,10:20,2
+chr11	53698751	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.032518;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:0,0:16,4
+chr11	54372015	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036365;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:8,2:13,6
+chr11	54384523	.	C	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:14,3:5,1
+chr11	54533839	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024656;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,1:8,3
+chr11	55775691	.	C	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.034379;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:10,4:8,2
+chr11	56166092	.	GA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0055032;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,5:5,2
+chr11	60451481	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.039341;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,3:2,1
+chr11	62899037	.	C	CAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:7,3:3,1
+chr11	64236716	.	CAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:2,3:4,2
+chr11	64733395	.	AACAC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:4,5:2,1
+chr11	66213902	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=6.4422e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:12,9:15,7
+chr11	68426423	.	C	CTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:13,3:4,1
+chr11	68954772	.	A	AAAG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:1,1:4,3
+chr11	69026145	.	CAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0012058;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:6,7:2,2
+chr11	70157979	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,5:9,4:3,1
+chr11	71133346	.	A	ATGGCTGGCTGGC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,2:3,2
+chr11	71658720	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.057396;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:15,2:8,3
+chr11	74636665	.	C	CT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00052897;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:10,8:9,4
+chr11	74656744	.	G	GT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0033983;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,9:8,7:1,2
+chr11	76236832	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0034541;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:12,7:9,4
+chr11	76494720	.	TTCC	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.12281;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:1,1:4,1
+chr11	83008989	.	G	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0069488;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,3:9,3
+chr11	83467810	.	T	TACAC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:3,1:1,3
+chr11	83848124	.	CTT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:11,2:6,5
+chr11	86602116	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11792;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:24,3:12,1:12,2
+chr11	87419191	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00039192;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,17:8,11:6,6
+chr11	88052933	.	T	TG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,2:2,1:1,1
+chr11	88570571	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,4:4,2:2,2
+chr11	89749670	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.011696;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:12,7:12,4
+chr11	89772506	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.019233;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:16,1:14,8
+chr11	89883593	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0143;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:2,3:15,3
+chr11	89960943	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024176;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr11	90971910	.	G	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,1:3,3
+chr11	92315479	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,3:0,1
+chr11	92950475	.	TCTCCCTCCCTCCCTTCCTTCCTTCCTTCTTTC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.23636;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:11,3:1,0:10,3
+chr11	93243149	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:13,4:7,4
+chr11	93420517	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0051564;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:3,2:11,4
+chr11	94810793	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0010673;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,4:5,4
+chr11	95403130	.	AT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:2,4:2,1
+chr11	95654621	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.069378;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:11,2:15,2
+chr11	98275560	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01707;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,1:7,4
+chr11	98977220	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.026047;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,2:2,4
+chr11	99080980	.	GT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.044901;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,4:7,1
+chr11	99151211	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.061499;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:10,4:17,2
+chr11	99724327	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0035931;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,3:10,4
+chr11	100194603	.	GA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00078184;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:10,10:6,2
+chr11	101263877	.	GTATA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.012394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,6:15,3:2,3
+chr11	101263883	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.034629;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:13,2:2,2
+chr11	104194686	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:3,4:2,4
+chr11	105161856	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0089783;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,1:1,5
+chr11	107523052	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:5,2:1,1:4,1
+chr11	107572651	.	A	AT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0060836;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:17,4:8,3
+chr11	109323949	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00034172;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,14:5,9:3,5
+chr11	109757896	.	TTCTCTCTCTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028205;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:4,1:4,3
+chr11	111005139	.	A	ATG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:5,5:3,1
+chr11	111177973	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,5:4,4:5,1
+chr11	111768842	.	C	CGTGTGT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:5,2:0,4
+chr11	112108914	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.027541;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:15,3:3,2
+chr11	114468134	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:1,2:0,1:1,1
+chr11	115169206	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:5,3:3,2
+chr11	116818336	.	TA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,2:9,2
+chr11	117514578	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.032696;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,1:5,6
+chr11	118419127	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.4113e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,4:8,8
+chr11	118852964	.	A	AT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.019318;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,5:13,3:14,2
+chr11	119022957	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:2,3:4,1
+chr11	119763937	.	TTTTTC	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,2:5,2
+chr11	123102279	.	G	GTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030289;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:4,4:3,1
+chr11	123565202	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:10,8:1,1
+chr11	126863356	.	A	AGTGTGTGTTTGAGTGCGT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10123;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:13,2:13,2
+chr11	127364704	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.026693;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:16,2:13,3
+chr11	127553387	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.048514;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:11,6:3,1
+chr11	129585183	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0051722;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:7,4:6,2
+chr11	129585356	.	G	GT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.041497;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,8:5,7:10,1
+chr11	129688629	.	CAAA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.052323;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:15,3:6,6
+chr11	130037592	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.024807;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:10,2:7,7
+chr11	130596877	.	C	CGGATGGAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02564;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:5,6:6,2
+chr11	131137267	.	C	CACACATACACACAT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.04269;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,8:12,4:5,4
+chr11	131265696	.	A	ATCT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,2:3,3
+chr11	131325631	.	C	CTG	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00011829;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,12:8,8:9,4
+chr11	131578609	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.9881e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:6,8:14,7
+chr11	132161395	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.010538;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,10:3,4:4,6
+chr11	133437271	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0011582;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:5,5:14,3
+chr11	135047060	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.02835;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,8:6,1
+chr12	544240	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.11667;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:17,1:3,2
+chr12	1122125	.	G	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.26316;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:8,2:5,1:3,1
+chr12	1522170	.	A	AAAAAAAATAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,6:7,1
+chr12	1522184	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:4,5:6,1
+chr12	3496214	.	A	ATATT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:8,6:1,1
+chr12	3919773	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,3:2,1
+chr12	4512508	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.030096;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:15,3:14,8
+chr12	6820855	.	TGAGA	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:1,5:1,1:0,4
+chr12	8215041	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.01931;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:14,2:16,6
+chr12	8455116	.	G	GATTTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:9,5:3,1
+chr12	9216233	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00072423;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:11,3:12,7
+chr12	9284109	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.034629;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,3:10,1
+chr12	10239540	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013043;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:1,1:7,5
+chr12	10526141	.	CACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,6:2,4:0,2
+chr12	11160485	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,5:5,1:3,4
+chr12	11524456	.	CTTAG	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=6.1809e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:7,8:11,4
+chr12	12909937	.	T	TAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:4,4:7,1
+chr12	13698823	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00076774;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:12,5:7,4
+chr12	13880506	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0054908;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,2:7,4
+chr12	15143335	.	T	TA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0084034;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,4:5,2:3,2
+chr12	15166540	.	GGTA	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.10731;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,2:18,2
+chr12	15610657	.	T	TA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.025398;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:12,5:13,1
+chr12	16235270	.	ATG	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.053645;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,2:14,2
+chr12	17722701	.	GA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,4:3,2:9,2
+chr12	18255252	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,4:10,1:9,3
+chr12	18516261	.	G	GTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=3.7614e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,13:4,6:3,7
+chr12	18524479	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=6.7124e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:6,6:8,9
+chr12	19439669	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.08867;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,2:3,1:4,1
+chr12	21181585	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=7.8463e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,5:8,5
+chr12	21419847	.	T	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,2:7,9
+chr12	23379875	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,5:2,4:0,1
+chr12	23726118	.	CGAGA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.30409;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:8,3:4,1
+chr12	23907746	.	CAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.069923;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,8:7,5:9,3
+chr12	28183993	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00019854;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:11,5:2,4
+chr12	29299213	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:6,5:3,1
+chr12	30362495	.	ATATATATATGTATATATATATATATATATATG	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,2:0,2:0,0
+chr12	31048468	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.077856;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:9,2:21,2
+chr12	31108896	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.012102;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,6:7,1
+chr12	32676648	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00010246;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,3:4,4
+chr12	32742129	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0066191;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:8,5:12,8
+chr12	33459924	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02299;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:12,2:12,4
+chr12	33962526	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00051786;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:16,3:8,6
+chr12	34349437	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,3:2,1
+chr12	34796338	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0054096;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,6:2,1
+chr12	34907117	.	G	T	0	PASS	DP=376;GPV=1;SPV=0.0066075;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:179:156,23:75,19:81,4
+chr12	34916097	.	T	C	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.031211;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:62,7:28,1:34,6
+chr12	35037606	.	A	C	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.033931;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:18,2:28,4
+chr12	35208597	.	C	G	0	PASS	DP=422;GPV=1;SPV=0.022837;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:201:169,32:74,16:95,16
+chr12	35302590	.	T	C	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.024674;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:75,17:33,7:42,10
+chr12	36508012	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
+chr12	36854572	.	G	C	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.027728;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:103,14:94,12:9,2
+chr12	36965324	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,1:7,1
+chr12	37433992	.	G	GTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.016957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:7,5:1,1
+chr12	37948223	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.18371;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:16,1:11,2
+chr12	46415122	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,4:2,2
+chr12	46716673	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:1,1:0,1
+chr12	48078370	.	CAT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
+chr12	50172552	.	A	ATT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:11,3:2,1
+chr12	51199139	.	GATGGAACCAAGTGGTCAAGGCCCCGCAGAGGCTA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,1:13,3
+chr12	53788018	.	G	GTA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0070433;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:3,8:2,2
+chr12	54026966	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,5:9,4:9,1
+chr12	54412066	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.025527;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,2:13,3
+chr12	56691319	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01204;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,4:3,1
+chr12	56876294	.	C	CTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023736;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:1,3:2,2
+chr12	57658719	.	CAA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,4:1,3:0,1
+chr12	58023731	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0069323;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:3,7:1,1
+chr12	58261437	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00013297;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:12,6:9,6
+chr12	61299907	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13128;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:16,2:11,3
+chr12	61518665	.	A	AAAG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:7,6:2,3
+chr12	62059139	.	A	ATGTGTGTGTG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.023489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:7,6:9,1
+chr12	64288489	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0070131;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:10,7:1,3
+chr12	64328700	.	AAAAAAAATATATATATATAT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,5:2,2
+chr12	66000736	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,4:2,2:8,2
+chr12	66815848	.	CTT	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043132;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,3:14,1
+chr12	67634086	.	A	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,5:2,2:0,3
+chr12	68683283	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,9:5,7:1,2
+chr12	69200310	.	ATAAGAAAGAGATAAGAGATAAGAGG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.042832;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,3:9,4
+chr12	69491505	.	AT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:7,5:3,2
+chr12	70103509	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0016986;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,5:9,3
+chr12	72373657	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.1266e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:9,7:8,5
+chr12	73319208	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030844;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:5,3:9,2
+chr12	75435052	.	G	GTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.092234;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,4:2,2
+chr12	76122077	.	TATATA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:8,1:2,3
+chr12	76122145	.	TA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:14,1:3,3
+chr12	76122149	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,1:2,3
+chr12	77090322	.	TTCCTTCCTTCCC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:1,0:9,4
+chr12	79486998	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,2:1,3
+chr12	79563504	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=3.9623e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:9,9:6,3
+chr12	79890901	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:3,1:3,2
+chr12	80355229	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,3:5,2:0,1
+chr12	80504030	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.004138;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:5,3:9,3
+chr12	81922880	.	A	AT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.034479;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,3:3,1
+chr12	83409601	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.18462;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,3:4,2:2,1
+chr12	84275060	.	T	TATATATAAAATATATTTTATATATATATA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:5,3:6,1
+chr12	85464656	.	TACAC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:8,1:0,4
+chr12	85488282	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.002853;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:11,5:13,7
+chr12	86376844	.	CAGAG	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.013285;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,6:6,5:3,1
+chr12	86502767	.	ATG	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.45333;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:15,2:4,1:11,1
+chr12	88745578	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:9,5:1,1
+chr12	89677954	.	TTATA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:6,7:4,2
+chr12	89862508	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,4:6,2:8,2
+chr12	90181091	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,3:2,2:2,1
+chr12	91180314	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0432;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,2:8,2
+chr12	92079801	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,2:1,1:3,1
+chr12	92537344	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.02229;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:9,2:10,3
+chr12	92632819	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.2072e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:8,9:12,11
+chr12	92998044	.	G	GAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.030474;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,7:6,2
+chr12	94014289	.	C	CT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:0,1:2,3
+chr12	95055952	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.023452;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,3:0,1
+chr12	95347547	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.19298;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,3:4,1:5,2
+chr12	95424716	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,4:5,5
+chr12	95641273	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.045693;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,2:11,3
+chr12	96561704	.	TACACACAC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0093665;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:8,4:4,3
+chr12	96591717	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00022263;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:9,4:14,7
+chr12	96868430	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0094148;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,10:6,8:5,2
+chr12	97614646	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.073359;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:9,1:7,3
+chr12	98037742	.	G	GGGAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.008898;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,11:8,6:2,5
+chr12	99151541	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.001665;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,6:7,4
+chr12	99322275	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.011127;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,1:8,4
+chr12	99693781	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.060413;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:6,3:11,2
+chr12	102337565	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00056917;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:16,4:7,5
+chr12	105088569	.	A	AAACAACAACAAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.026636;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:6,12:5,6:1,6
+chr12	106200353	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036526;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,2:4,2
+chr12	107124459	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:14,4:0,0
+chr12	107987959	.	T	TACACACACACACAC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0085139;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,10:3,6:2,4
+chr12	110311733	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.05;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:0,3:0,1:0,2
+chr12	113061450	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00065454;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,4:11,4
+chr12	114219607	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,4:3,4
+chr12	114556107	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.048e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:11,5:14,9
+chr12	114617380	.	G	GTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:10,3:1,2
+chr12	114698158	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,6:6,1:9,5
+chr12	114783555	.	TA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00070128;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,3:4,4
+chr12	115353202	.	TC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=6.5361e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:8,8:10,5
+chr12	115441818	.	CTCTATA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:1,2:8,2
+chr12	115627826	.	TAA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.009628;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:7,6:3,4
+chr12	116356029	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,5:2,4:4,1
+chr12	116800812	.	T	TTAAAATAAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,4:5,3:10,1
+chr12	117135743	.	CTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.022967;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,7:1,5:2,2
+chr12	117283855	.	C	CAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:16,3:2,1
+chr12	117632218	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:2,2:6,2
+chr12	117734745	.	C	CATGGATGGATGGATGGATGG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.026469;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,4:4,3
+chr12	117833965	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0054096;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,4:5,3
+chr12	118345748	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00077493;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:8,4:6,7
+chr12	118701939	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016233;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,9:9,6:3,3
+chr12	118938845	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=3.0928e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,17:6,8:7,9
+chr12	119731475	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0078215;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:6,6:3,2
+chr12	120201481	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0016572;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:3,3:0,4
+chr12	121530227	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:9,5:2,1
+chr12	122124584	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0019379;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:5,8:3,2
+chr12	122458532	.	A	ATTTAAT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.030143;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,5:7,3
+chr12	123273990	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00041286;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:10,8:9,5
+chr12	123733313	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0014958;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:9,10:4,2
+chr12	125696500	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00083898;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:12,9:6,3:6,6
+chr12	125708010	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.8667e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:12,11:11,6
+chr12	126612632	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:3,2:6,2
+chr12	127036284	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0001362;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:8,5:8,6
+chr12	127136130	.	G	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=8.543e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:12,9:8,7
+chr12	127592713	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=6.605e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:6,7:7,8
+chr12	128462101	.	GT	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.10033;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:13,1:18,3
+chr12	129297613	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0076814;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:8,3:13,4
+chr12	129588746	.	TTC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,3:1,2:2,1
+chr12	130532162	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:2,3:6,7
+chr12	131278535	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0044741;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,4:5,1
+chr12	132054452	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00018612;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:8,7:10,6
+chr12	132380926	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016594;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:8,3:8,3
+chr12	132692796	.	G	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0074932;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,4:3,3
+chr12	132895660	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,2:4,4
+chr12	132965438	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
+chr13	18178573	.	A	G	0	PASS	DP=326;GPV=1;SPV=0.027138;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:140,19:67,12:73,7
+chr13	18194779	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.01173;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:10,4:12,4
+chr13	18336400	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.01598;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:12,2:8,6
+chr13	18747015	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.023954;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:9,4:16,1
+chr13	19779877	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.015217;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:16,5:7,2
+chr13	20851711	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,5:3,4:3,1
+chr13	21884018	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,1:11,3
+chr13	22402137	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,8:0,4:6,4
+chr13	24421478	.	G	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.035001;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:30,8:15,1
+chr13	25159298	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.044826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:6,3:12,1
+chr13	25159308	.	A	AAT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.025437;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:7,4:9,2
+chr13	25310519	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:4,4:3,2
+chr13	25740308	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0031242;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:6,9:2,2
+chr13	26723699	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0093762;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:2,3:9,5
+chr13	26805525	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00058707;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:4,6:6,5
+chr13	26897028	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.4106e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:12,11:7,7
+chr13	28646352	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0031516;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,8:6,4:4,4
+chr13	28737290	.	A	AAGT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,1:6,3
+chr13	29168888	.	C	CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:2,4:4,2
+chr13	29181857	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00033748;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:4,5:13,8
+chr13	31038665	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.13742;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,2:16,2
+chr13	34362939	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,3:6,1
+chr13	34368386	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0016883;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,3:5,3
+chr13	34802492	.	T	TA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.014855;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:12,2:18,4
+chr13	34992238	.	G	GTATA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,6:3,4:1,2
+chr13	36142687	.	AC	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:3,3:5,3
+chr13	37335480	.	A	ATTTACCCCAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.043236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:5,4:5,2
+chr13	37844797	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00043265;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,6:10,4
+chr13	42841090	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,1:8,3
+chr13	43434943	.	T	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0089783;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:0,5:3,1
+chr13	43879836	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:6,3:7,1
+chr13	44066175	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.011037;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:2,4:3,2
+chr13	47559950	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,3:3,1
+chr13	47702279	.	A	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,6:5,5:1,1
+chr13	48636013	.	T	TACATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.015417;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:5,1:4,3
+chr13	48641363	.	C	CAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010106;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:5,6:6,2
+chr13	51479845	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.12281;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:3,1:2,1
+chr13	51963736	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.027836;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:9,4:1,0
+chr13	52223586	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.013095;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:5,1:3,4
+chr13	52281163	.	TGTGTGTGTGC	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.045903;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:52,15:22,5:30,10
+chr13	52333747	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.039673;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:17,6:16,1
+chr13	52504583	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019548;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:3,5:7,2
+chr13	54672674	.	GGT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021053;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:2,3:3,1
+chr13	56018887	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.011027;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:15,5:14,4
+chr13	56024786	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00094048;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:10,6:10,3
+chr13	56089113	.	TA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.011057;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,3:10,2
+chr13	56277723	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.022727;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,3:5,2
+chr13	56368797	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0041064;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:15,5:10,3
+chr13	58582543	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.054928;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,4:13,1:8,3
+chr13	59443228	.	T	TAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:2,4:4,3
+chr13	60014969	.	T	TTTTTGTTTTG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.011765;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:11,12:3,5:8,7
+chr13	60321660	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0059289;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,4:2,1
+chr13	60662347	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,3:2,4
+chr13	60859020	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=7.8995e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:18,8:10,4
+chr13	61015496	.	C	CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010905;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,7:12,5:4,2
+chr13	64416401	.	CATCTATCT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.026352;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,5:10,5
+chr13	65280394	.	A	AGTGTGTGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00066757;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,13:9,5:4,8
+chr13	65288043	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,2:9,2
+chr13	65513553	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.013595;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,11:4,8:1,3
+chr13	66114842	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,2:5,3
+chr13	66687365	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0028364;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:9,4:10,3
+chr13	66756542	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014137;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,6:5,3:10,3
+chr13	66820549	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00070506;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:4,5:13,4
+chr13	69784882	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,3:3,3
+chr13	70753162	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.017168;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,3:2,1
+chr13	71864164	.	AGCGC	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.014706;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:1,2:3,3
+chr13	77377562	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.039138;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:14,2:5,3
+chr13	79219049	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,2:0,1:5,1
+chr13	81088696	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.2865e-09;SS=2;SSC=88;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:12,24:6,10:6,14
+chr13	81658352	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.25826;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,4:5,2:5,2
+chr13	82684636	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.060625;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:13,2:19,2
+chr13	86756239	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.2416;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,4:6,3:15,1
+chr13	87090543	.	C	CT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0092175;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:9,4:7,9
+chr13	87331654	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.001382;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:12,6:11,1
+chr13	87837249	.	T	TTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:3,4:10,1
+chr13	88347891	.	A	AG	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:5,2:0,0
+chr13	89527562	.	C	CTTTTCTTTTCT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0018592;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,8:5,6:5,2
+chr13	90344571	.	C	CATATAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.04308;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:6,4:3,1
+chr13	92064310	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=2.8865e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:16,10:6,7
+chr13	93459617	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=8.3669e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:10,9:9,5
+chr13	93495622	.	TTTCTG	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.02253;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,3:4,2
+chr13	94214796	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00046384;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:8,8:11,2
+chr13	94455381	.	T	TAG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.035323;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:7,3:8,5
+chr13	94738966	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=5.0918e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:6,4:10,7
+chr13	96074548	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018018;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,5:7,2
+chr13	97852827	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0063975;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,5:9,2
+chr13	98064640	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:5,4:5,1
+chr13	98078917	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=2.3919e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,14:4,6:5,8
+chr13	98705202	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,7:1,1:1,6
+chr13	101092811	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0001513;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:6,4:11,8
+chr13	101693624	.	G	GTCTGTCTA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:3,5:8,2
+chr13	102728046	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0065417;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,8:4,4:5,4
+chr13	104498343	.	ATATATTTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0027765;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:1,4:5,4
+chr13	106245764	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,2:6,2
+chr13	106763047	.	ACCCTCTCTCTCTCT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,4:6,2:4,2
+chr13	107176318	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.010674;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:5,3:3,1
+chr13	109147175	.	GA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,4:5,1
+chr13	109765530	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,1:8,3
+chr13	110960659	.	GT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.057396;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:15,4:8,1
+chr13	111622955	.	C	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.023736;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,3:1,2
+chr13	112640591	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.010101;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,4:0,1:1,3
+chr13	112787108	.	C	CG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.031421;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,5:7,1
+chr13	113512592	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.016558;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,3:9,3
+chr13	113593081	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.016935;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,3:4,1:2,2
+chr13	113804730	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.019346;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,5:8,3
+chr14	16085235	.	G	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:4,4:1,4
+chr14	18276446	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
+chr14	18288630	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.044297;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:14,4:4,1
+chr14	18293945	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:10,5:15,8
+chr14	18426424	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.03636;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:7,2:13,6
+chr14	18529582	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013155;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,3:2,3
+chr14	18700193	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.022061;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:12,6:9,2
+chr14	18939956	.	CCTGA	C	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.00027128;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:60,21:28,7:32,14
+chr14	18969317	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,7:8,6:3,1
+chr14	18969319	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.009659;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:12,6:16,1
+chr14	18974856	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.57e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:7,4:8,12
+chr14	18979682	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13043;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr14	19108286	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0086983;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:16,4:12,1
+chr14	19232448	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.077327;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,3:8,2
+chr14	19298439	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,4:2,3:1,1
+chr14	19301996	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:13,4:7,1
+chr14	19372235	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.016655;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:7,3:9,2
+chr14	19390940	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.033806;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,3:2,4
+chr14	19475066	.	T	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
+chr14	19667110	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040303;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,1:7,4
+chr14	19817651	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.5681e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,20:4,9:4,11
+chr14	21222040	.	CAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:5,3:1,1
+chr14	21696025	.	GTT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.050152;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,2:10,2
+chr14	22034527	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,3:4,2
+chr14	22637442	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:2,1:5,1
+chr14	23962302	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.026928;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:12,4:3,1
+chr14	24719632	.	ATG	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0089783;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,1:1,5
+chr14	25523801	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
+chr14	26813631	.	GT	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:4,2:0,0
+chr14	29466327	.	TA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037605;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:5,3:12,3
+chr14	29826544	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:4,2:7,2
+chr14	30445162	.	GA	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00058755;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:10,7:7,2
+chr14	31052934	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,5:4,3
+chr14	31933233	.	ATT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.006192;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,3:1,2
+chr14	32475678	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:5,3:3,1
+chr14	34702539	.	AT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,2:5,2
+chr14	34840768	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,2:0,1:6,1
+chr14	35007749	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10544;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,2:13,2
+chr14	36122153	.	A	ATT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,9:2,5:4,4
+chr14	37200850	.	ATG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.001204;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,7:0,6:5,1
+chr14	39187659	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.025265;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,4:5,5
+chr14	39300937	.	TATATAC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.019016;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,2:5,4
+chr14	39300953	.	CAT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.047286;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:10,2:6,4
+chr14	39300963	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.046549;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,6:10,2:5,4
+chr14	42051617	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:4,4:5,2
+chr14	42624923	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=7.799e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:8,8:9,8
+chr14	43213467	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=3.148e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:9,11:13,7
+chr14	43528639	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.537e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:12,6:10,13
+chr14	45692176	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037585;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:11,6:6,9
+chr14	45887569	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0076872;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:5,3:10,3
+chr14	48767763	.	A	AT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.043843;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:10,7:12,3
+chr14	49960412	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:2,3:3,2
+chr14	50224327	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:13,3:6,1
+chr14	50236734	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047431;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,3:3,1:3,2
+chr14	50479008	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,2:3,1:1,1
+chr14	50811544	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:5,2:1,2
+chr14	56444101	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:2,4:8,3
+chr14	56922072	.	C	CAT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:4,5:6,1
+chr14	57323176	.	CAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,7:2,5:2,2
+chr14	60667650	.	A	AATAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:6,1:2,3
+chr14	63439356	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.030658;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,3:13,1
+chr14	63846582	.	T	TTTCTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:6,2:7,3
+chr14	64492119	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,2:1,1:5,1
+chr14	64583073	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0027027;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,5:8,2
+chr14	64949722	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,9:4,7:4,2
+chr14	65247931	.	C	CACACAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.006031;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,12:5,7:5,5
+chr14	65266406	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:2,4:1,3:1,1
+chr14	66516183	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00016223;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:6,2:9,9
+chr14	67780754	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=8.1801e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,19:6,13:7,6
+chr14	67803228	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.076832;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
+chr14	69654792	.	T	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:1,2:1,1:0,1
+chr14	69745994	.	T	TACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.020719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:5,3:3,3
+chr14	70710663	.	CTTTCT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.058162;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:1,2:12,2
+chr14	70710706	.	TTC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:1,2:10,2
+chr14	71906790	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0081121;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:7,5:1,4
+chr14	71906791	.	G	GAAAAGCATATGCTGAAAAGCATAATACTTTTTA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0020704;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:6,5:1,3
+chr14	73536516	.	T	TA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014845;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,4:6,1
+chr14	74014389	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.14744;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:24,2:11,2
+chr14	74520801	.	AAATG	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0079392;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:11,6:8,6
+chr14	74868313	.	TTATA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:3,3:1,1
+chr14	75153777	.	C	CTTTTTTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045968;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:6,3:10,3
+chr14	75257469	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00012491;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:13,8:11,6
+chr14	79233666	.	C	CTG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0036809;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,7:5,2
+chr14	79233730	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0041486;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:7,4:3,7
+chr14	79343870	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.537e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:13,9:10,5
+chr14	80195814	.	TA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00021796;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:8,9:2,1
+chr14	81572276	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.060215;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
+chr14	82823662	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00063642;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,3:7,6
+chr14	83327150	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0016044;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:7,5:15,4
+chr14	83577812	.	G	GAT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:7,4:3,4
+chr14	83936135	.	AAG	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.029654;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:3,2:2,2
+chr14	84703045	.	GATATAT	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.019067;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:10,2:8,4
+chr14	85440994	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0091533;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:6,5:0,1
+chr14	85470210	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=1.7795e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:6,23:2,14:4,9
+chr14	87551018	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:2,2:1,1:1,1
+chr14	88484211	.	CTAT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.033935;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,4:7,5
+chr14	88716732	.	AAC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00049132;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,12:3,8:0,4
+chr14	90237501	.	A	AAGG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0043369;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,12:3,5:6,7
+chr14	90983813	.	C	CTCTCTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.035372;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,6:7,2:1,4
+chr14	91572426	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:4,4:3,5
+chr14	91661524	.	C	CAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0015312;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,9:4,6:1,3
+chr14	92808663	.	G	GT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00024986;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:6,7:3,5
+chr14	92808701	.	G	GA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0011741;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,11:8,5:3,6
+chr14	93357775	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014142;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:0,2:5,4
+chr14	94533813	.	TAA	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,6:10,3:6,3
+chr14	95476466	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0024931;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:16,4:11,4
+chr14	97068412	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:3,2:9,2
+chr14	97154203	.	TTTCCTTCCTTCC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:0,1:12,3
+chr14	97193720	.	A	AT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00067301;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:8,7:10,3
+chr14	99130508	.	GAA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0094953;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:7,7:0,1
+chr14	99811184	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=9.8865e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:5,5:7,5
+chr14	99846281	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.010024;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:11,9:1,1
+chr14	101397815	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0078215;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:8,4:1,4
+chr14	101397817	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037198;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,3:2,2
+chr14	101674930	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031763;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:12,2:6,2
+chr14	101942512	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0025217;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,5:5,2
+chr14	102202372	.	GT	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,2:3,2
+chr14	104097956	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:2,2:3,7
+chr14	105598771	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.016371;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,8:6,1
+chr14	105927535	.	AGG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.077519;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,2:9,2
+chr14	106419214	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0065876;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:3,3:1,1
+chr14	106459602	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.054945;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,8:1,6:2,2
+chr15	17745729	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040316;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,3:4,1
+chr15	18358341	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031815;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,3:9,4
+chr15	18749305	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr15	19910197	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=6.3405e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:9,10:10,7
+chr15	20170452	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.036717;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:13,7:19,1
+chr15	20247398	.	C	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.036143;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:10,3:28,7
+chr15	20336424	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0036197;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:6,7:10,3
+chr15	20336442	.	G	GTTTTTTGTTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0073947;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:6,7:5,3
+chr15	20347933	.	G	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.020231;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:21,5:16,8
+chr15	20355877	.	C	CTTTCTTTCTTTTTTTT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,4:15,1:13,3
+chr15	20550951	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04308;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,4:4,1
+chr15	20582882	.	T	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.049331;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:17,9:23,3
+chr15	20670150	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,2:7,2
+chr15	21254323	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.014276;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,4:8,1
+chr15	22422812	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.024399;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,6:10,1
+chr15	22444687	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.016949;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:16,9:10,3
+chr15	22949262	.	TGCCTAAGCCTAAAGCGGGGACCAGGCGGGCCGGAAGGCGGGCACAATGC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:12,2:4,2
+chr15	23217430	.	ATTT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.07313;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,5:10,3:6,2
+chr15	24080017	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.7719e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:6,3:10,10
+chr15	24334109	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.085094;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:19,1:22,4
+chr15	25132879	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,7:5,2
+chr15	26251855	.	A	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
+chr15	28422218	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:2,2:16,2
+chr15	28493416	.	T	C	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.032621;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:110,13:66,7:44,6
+chr15	29057406	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=7.6729e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:5,4:12,7
+chr15	30524903	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.020062;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:13,5:12,3
+chr15	30691517	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.025964;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,3:8,1
+chr15	31165579	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,5:4,1
+chr15	31567594	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00058845;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:19,10:8,3
+chr15	32044253	.	C	CTCCTTCCTTCCTTCCTTCCT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,5:5,3:5,2
+chr15	32162135	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.011004;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:13,6:2,4
+chr15	32181183	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
+chr15	32580639	.	C	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,3:4,3
+chr15	33343334	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.022e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:11,13:9,7
+chr15	33889981	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.4224e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:8,7:12,7
+chr15	34053319	.	A	AATAT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:2,1:1,1
+chr15	34423155	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.1208;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:19,2:13,2
+chr15	34543009	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,2:4,4
+chr15	34949276	.	A	ATGAGCCACTACACTGGGCC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,5:5,1
+chr15	35482218	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.4893e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:12,5:10,10
+chr15	36178301	.	A	AT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00085567;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:9,7:13,3
+chr15	36278095	.	CATAT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,2:7,2
+chr15	36286610	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0090312;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,4:5,1
+chr15	36471641	.	C	CAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10134;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:11,5:5,1
+chr15	36722985	.	G	GTGTGTGTGTGTT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.10396;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,5:11,3:14,2
+chr15	40504337	.	G	GTGTATATA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.035289;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,6:9,1:10,5
+chr15	40951605	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,2:0,0:1,2
+chr15	41179528	.	A	AAAGGAAGGAAGGAAGG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:4,3:4,4
+chr15	42789854	.	T	TACACACACACAC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00026695;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:8,7:4,5
+chr15	45934450	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00070687;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,5:6,3
+chr15	48314237	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
+chr15	48435768	.	GTA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,5:2,2:0,3
+chr15	50874129	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0074524;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:3,4:9,8
+chr15	51583106	.	CT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
+chr15	51747017	.	T	TA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,4:2,1
+chr15	51912441	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.08867;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,2:5,1:2,1
+chr15	52462280	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.034205;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,4:2,1:3,3
+chr15	55518897	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,4:6,2:7,2
+chr15	55778195	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:3,2:9,3
+chr15	56312269	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:4,5:9,5
+chr15	57007764	.	TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTC	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.059289;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:0,0:4,2
+chr15	57223643	.	GTTT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.1532;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:9,4:4,2
+chr15	57336148	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,6:3,5:0,1
+chr15	59093361	.	T	TC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:3,1:3,4
+chr15	59359330	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0023112;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,4:3,4
+chr15	59719506	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,4:3,1
+chr15	60009125	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:35:0,2:0,1:0,1
+chr15	60132343	.	GGGA	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,2:3,1:0,1
+chr15	60993644	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0099161;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,10:3,9:4,1
+chr15	61451616	.	T	TTTTTTC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:2,1:3,4
+chr15	62096613	.	AT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00077001;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:11,5:4,3
+chr15	64718753	.	G	GGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034996;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:8,2:6,4
+chr15	66432959	.	A	AGTGTGT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:6,5:2,1
+chr15	67055971	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:7,5:4,2
+chr15	68741633	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.026636;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:5,5:1,1
+chr15	69078387	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0072477;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:7,2:11,6
+chr15	72665570	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010436;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,3:8,7
+chr15	74073767	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.049123;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
+chr15	76330727	.	T	TTA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,6:1,5:2,1
+chr15	76572915	.	T	TCACACA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,9:2,3:2,6
+chr15	77024962	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.4083e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:9,8:7,4
+chr15	77343482	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,6:2,3:9,3
+chr15	77509555	.	CGTGTGT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.027772;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:4,4:1,1
+chr15	77883340	.	C	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,5:2,2
+chr15	78215763	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.069354;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:17,2:7,3
+chr15	78877117	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,2:4,1:1,1
+chr15	80339873	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0014199;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:12,4:14,6
+chr15	80382911	.	C	CAATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027154;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,4:10,1
+chr15	81179982	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:10,3:5,3
+chr15	82383908	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,4:6,2
+chr15	82427338	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.082831;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:6,1:17,3
+chr15	82523942	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
+chr15	82916807	.	A	AT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.011338;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:13,3:11,4
+chr15	83417902	.	T	TA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.01095;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,10:5,8:4,2
+chr15	83822769	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.1474e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:8,7:10,5
+chr15	84419727	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0219;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:10,7:4,3:6,4
+chr15	84425290	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.014936;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:10,5:7,2
+chr15	85151765	.	CAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:4,4:4,1
+chr15	85504515	.	A	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
+chr15	85841139	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,4:5,2
+chr15	86380935	.	A	AGTGTGT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0010872;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,4:6,4
+chr15	86703427	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=8.1679e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:6,4:5,6
+chr15	86826036	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0076326;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,15:8,9:5,6
+chr15	87055660	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.3351e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:12,8:9,4
+chr15	89354401	.	CTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.043512;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,5:2,2:1,3
+chr15	89952550	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,4:5,1
+chr15	90175683	.	CT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0015067;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,7:4,2
+chr15	90407221	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0005505;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:16,3:10,7
+chr15	90651919	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:5,3:3,2
+chr15	90735236	.	AAT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.013932;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,12:2,9:1,3
+chr15	91420126	.	CTG	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
+chr15	92587513	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.013891;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,7:9,6:5,1
+chr15	92767870	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.017924;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:7,2:8,5
+chr15	92999083	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015182;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,4:4,1
+chr15	93677756	.	A	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.027339;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,2:8,2
+chr15	93940288	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:2,4:8,3
+chr15	94162144	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:6,4:7,2
+chr15	96447738	.	TATC	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.013865;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:8,4:10,4
+chr15	96857600	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023277;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:9,8:4,1
+chr15	96865316	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.1208;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:15,2:17,2
+chr15	99085857	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,2:4,1:3,1
+chr15	100759176	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=1.3625e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:10,8:6,7
+chr15	101258008	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.039412;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,2:2,4
+chr15	101743927	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.04982;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:15,1:13,6
+chr16	1833555	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.064336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:11,4:6,3
+chr16	2542624	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.028132;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,4:12,1
+chr16	3329169	.	G	GACACAC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,6:1,5:1,1
+chr16	3889002	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00013223;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:6,2:13,8
+chr16	5801341	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020486;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,4:4,2
+chr16	6134683	.	A	ATTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,4:6,2
+chr16	6220657	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013378;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:11,5:7,4
+chr16	6367254	.	G	GTTTTGT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0019606;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:15,17:6,9:9,8
+chr16	6562757	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0043971;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,1:8,5
+chr16	8563144	.	AG	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.024978;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:13,5:6,3
+chr16	9019654	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,2:8,2
+chr16	9199895	.	GTCCT	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,5:2,2:0,3
+chr16	10612629	.	A	AG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.039138;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:9,2:10,3
+chr16	11067187	.	TTG	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.13514;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:9,2:8,1
+chr16	11505470	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,2:3,5
+chr16	11712929	.	A	AACACACACACACAC	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,2:4,2
+chr16	12105223	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10145;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr16	12380394	.	C	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr16	12817263	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,3:4,3
+chr16	14360253	.	C	CCA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00026837;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,11:3,8:2,3
+chr16	14978118	.	G	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.049005;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:28,7:14,1
+chr16	15164208	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,5:1,1:3,4
+chr16	15175445	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.039721;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:13,7:22,5
+chr16	15857202	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.022078;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,6:14,4:4,2
+chr16	15861496	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:5,3:4,2
+chr16	16139611	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:4,6:4,1
+chr16	16274259	.	T	TTGGA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.038169;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:5,3:10,4
+chr16	16462130	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0070044;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,7:5,2
+chr16	16464052	.	G	GTGTGTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.015379;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:4,2:13,3
+chr16	16602352	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=8.1261e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:8,10:2,5
+chr16	16918059	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.3463e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:8,7:5,9
+chr16	17044323	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,3:6,1
+chr16	18121796	.	GGTTT	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.037048;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:22,5:21,1
+chr16	18130476	.	TAAAAAA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.018634;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:2,2:5,3
+chr16	18144826	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,5:3,3
+chr16	19101995	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,5:3,3:0,2
+chr16	19162689	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02313;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,1:8,3
+chr16	20195336	.	A	AATTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01192;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:3,3:6,5
+chr16	20295279	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.00761;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,8:1,7:1,1
+chr16	20489820	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.028251;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,2:12,3
+chr16	20545378	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0022994;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:15,4:5,3
+chr16	20596673	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.085094;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:26,1:15,4
+chr16	21269193	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.010026;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,4:6,4
+chr16	21307622	.	GTATATA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0055997;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,9:2,4:5,5
+chr16	21354148	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.011503;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:12,1:9,6
+chr16	22469165	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022366;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,4:7,5
+chr16	22553505	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.023251;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:18,3:9,1
+chr16	22632007	.	CTATA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,9:5,6:6,3
+chr16	23875759	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.021895;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:9,6:14,2
+chr16	24479358	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13043;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
+chr16	24579241	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.19016;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,5:20,3:5,2
+chr16	26887122	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:6,1:0,1
+chr16	28162560	.	A	AT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.085726;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:17,2:10,3
+chr16	29482918	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:0,0:12,4
+chr16	29648003	.	T	TTG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:2,2:3,2
+chr16	30032642	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,3:3,3
+chr16	30342200	.	A	AT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.02253;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
+chr16	32125849	.	GT	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0053747;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:15,4:12,4
+chr16	32176170	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr16	32465038	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.021299;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:15,3:15,8
+chr16	32837836	.	G	C	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.021664;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:106,23:69,20:37,3
+chr16	32838865	.	A	G	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.024159;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:165:146,19:81,14:65,5
+chr16	32839745	.	G	A	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.0027228;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:80,15:47,9:33,6
+chr16	33049073	.	GA	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.18393;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:21,1:5,3
+chr16	33506889	.	TAAAAAA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.038556;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,4:5,2
+chr16	33543309	.	C	G	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.024242;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:53,12:21,8:32,4
+chr16	33912493	.	T	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.013578;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:17,1:15,8
+chr16	34585666	.	C	A	0	PASS	DP=7755;GPV=1;SPV=0.025427;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:3857:3455,402:2115,221:1340,181
+chr16	34811099	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0003763;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:13,4:12,8
+chr16	35340267	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=4.1874e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,6:7,5
+chr16	37852470	.	G	T	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.029413;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:99,17:30,5:69,12
+chr16	37878930	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
+chr16	46460582	.	A	G	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.023263;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:52,15:25,12:27,3
+chr16	48416181	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:0,2:0,2:0,0
+chr16	49058614	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.27198;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:4,2:4,2
+chr16	49702923	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064294;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:9,2:22,2
+chr16	50938942	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.0799e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:14,6:11,8
+chr16	51663775	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.9786e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:7,3:16,10
+chr16	52826730	.	AGT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:2,3:3,2
+chr16	53403333	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0021291;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,2:6,3
+chr16	53551675	.	CAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:2,7:5,1
+chr16	54680831	.	A	ATACATGTATGTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:3,2:8,4
+chr16	55472560	.	TAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:5,3:2,1
+chr16	56300008	.	C	CGTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:7,4:8,4
+chr16	57002644	.	TG	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,1:7,3
+chr16	58085568	.	A	ATTTTTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:9,2:7,2
+chr16	59312571	.	T	TTC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:2,1:8,4
+chr16	59312572	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:1,0:9,4
+chr16	59858527	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.7587e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:6,5:8,5
+chr16	60311989	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00078689;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,14:13,6:7,8
+chr16	61428604	.	CTTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,2:2,1:2,1
+chr16	62079731	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0078215;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:8,6:1,2
+chr16	62486857	.	A	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,3:4,1:2,2
+chr16	62658786	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=1.1853e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:8,6:5,6
+chr16	63024573	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=6.6009e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,3:10,7
+chr16	64370054	.	G	GCACACACA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.021468;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,8:10,2
+chr16	64398295	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00016426;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:15,5:6,7
+chr16	69944708	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.04269;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:10,3:7,5
+chr16	70050982	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:3,1:16,2
+chr16	71022770	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.028482;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:13,4:10,5
+chr16	71832216	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.057792;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,2:0,1
+chr16	74423310	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.051458;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
+chr16	74495106	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.016783;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:3,5:0,1
+chr16	74502722	.	GT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0077399;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,9:2,4:2,5
+chr16	74821501	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00011781;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:10,3:6,6
+chr16	75180991	.	A	AAAG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0067977;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:3,1:6,5
+chr16	75732085	.	CAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:2,3:1,1
+chr16	75939212	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.001906;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:12,4:9,3
+chr16	78078648	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.032417;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,3:7,5
+chr16	80672318	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,2:8,2
+chr16	81280320	.	CACAG	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:1,1:2,4
+chr16	81376465	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,6:4,5:0,1
+chr16	84013729	.	CT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016727;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:8,9:9,3
+chr16	84940732	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0056634;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:16,6:17,2
+chr16	86197778	.	G	GTGTGTGTGT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0023232;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,11:3,3:7,8
+chr16	87013968	.	TTCCCTCATTCAC	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,7:5,2
+chr16	87562669	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,8:4,6:6,2
+chr16	87564563	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:24:0,2:0,1:0,1
+chr16	88728472	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12479;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:3,1:16,2
+chr16	89426529	.	T	TCACA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0065388;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:8,6:6,2
+chr16	90207896	.	A	AG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,5:4,1
+chr17	243024	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
+chr17	515956	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,3:0,1
+chr17	579185	.	C	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,4:4,2
+chr17	605741	.	G	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0037594;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:3,10:3,9:0,1
+chr17	1417665	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:7,4:1,1
+chr17	2509676	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.7714e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:13,8:8,4
+chr17	2760947	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.09062;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:4,2:13,2
+chr17	2872213	.	C	CA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
+chr17	2979460	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,3:4,1
+chr17	4215925	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0097246;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:12,4:14,4
+chr17	4747337	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0050388;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:9,3:1,6
+chr17	7676333	.	CCTCCAGGT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.048951;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,4:1,3:2,1
+chr17	7714124	.	C	CGT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,9:5,8:3,1
+chr17	8299542	.	T	TA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.00756;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:5,2:9,5
+chr17	8401335	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,7:5,2:4,5
+chr17	9754279	.	CT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.055494;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,3:12,1
+chr17	9773741	.	T	TC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0018566;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,9:3,1:3,8
+chr17	10363315	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:5,7:3,1
+chr17	11543910	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.021576;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,5:3,2
+chr17	12020110	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.001198;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:15,5:12,5
+chr17	12676253	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,3:6,4
+chr17	13235142	.	AGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,4:6,4
+chr17	13595847	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,4:5,3:4,1
+chr17	14694438	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:7,1:5,4
+chr17	14876514	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0039329;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,5:5,1:2,4
+chr17	15264253	.	GAT	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.15598;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:17,1:9,2
+chr17	15264255	.	T	TAG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.021691;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,5:6,4:5,1
+chr17	15810688	.	T	TAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:12,2:6,2
+chr17	15810734	.	CATGTGTGT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10577;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,5:2,2:4,3
+chr17	15826095	.	G	GT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:5,4:2,2
+chr17	16161240	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,2:3,1:2,1
+chr17	16812494	.	G	GCTGCTGGAGGAGTTCCCATCCCTGCAGGTGT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,2:4,5
+chr17	18436242	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.038781;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:7,5:12,3
+chr17	19638169	.	TACAC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,11:3,7:3,4
+chr17	20393023	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.038786;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:18,4:14,1
+chr17	20490397	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023562;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:11,3:4,2
+chr17	20579254	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.028543;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:16,5:11,5
+chr17	21569888	.	G	GTGTGTGTGTGTGTA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:0,10:0,6:0,4
+chr17	21665064	.	A	G	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.026358;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:21,7:20,5
+chr17	21987851	.	AAG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.041183;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:8,6:12,2
+chr17	22823512	.	G	A	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.020573;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:78,13:21,5:57,8
+chr17	22868198	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046053;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:12,3:5,1:7,2
+chr17	22912586	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,3:7,1
+chr17	22953324	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,3:7,1
+chr17	26738747	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.032184;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:19,8:8,1
+chr17	26750226	.	G	A	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.011419;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:61,8:11,1:50,7
+chr17	26750553	.	TA	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.014972;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:15,4:20,1
+chr17	26750627	.	G	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.044441;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:18,4:11,1
+chr17	26756863	.	G	A	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.01171;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:49,18:18,9:31,9
+chr17	26777173	.	C	A	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.045845;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:74,17:35,9:39,8
+chr17	26846954	.	C	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.048755;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:8,3:10,3
+chr17	26953277	.	A	G	0	PASS	DP=311;GPV=1;SPV=0.0092;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:130,18:49,6:81,12
+chr17	26958286	.	G	A	0	PASS	DP=275;GPV=1;SPV=0.046035;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:131,16:61,4:70,12
+chr17	26958523	.	A	T	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.009667;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:56,9:28,3:28,6
+chr17	29424436	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.031813;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:9,4:1,0
+chr17	29743907	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:4,2:4,2
+chr17	31537633	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0031736;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,5:10,2
+chr17	31675974	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.023188;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,1:4,5
+chr17	31866887	.	C	CAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:2,4:2,1
+chr17	34754836	.	GCTTAC	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,1:17,3
+chr17	35530512	.	GA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:13,3:1,1
+chr17	35581299	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,2:1,1:1,1
+chr17	35871916	.	AT	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,2:3,3
+chr17	36270978	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:24,4:2,0
+chr17	36536524	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:5,8:2,1
+chr17	37439942	.	A	AT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,4:6,2:4,2
+chr17	39153334	.	G	GGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.092234;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,6:4,3:5,3
+chr17	40728399	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0079051;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
+chr17	40815568	.	TA	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:11,2:15,2
+chr17	41225342	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.004375;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,18:7,11:9,7
+chr17	41226775	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.033503;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:4,3:21,3
+chr17	41733052	.	T	TTTTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03835;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:0,1:4,3
+chr17	41928852	.	T	TAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0074142;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,13:2,10:3,3
+chr17	42973190	.	T	TG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:5,3:2,5
+chr17	43177572	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,4:10,1:4,3
+chr17	45250258	.	TAC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0042363;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,7:4,5:1,2
+chr17	45757480	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:5,3:1,2
+chr17	47890931	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0057417;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,8:4,4:3,4
+chr17	48985838	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:6,4:7,2
+chr17	49553043	.	CCACA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.025565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:5,3:2,2
+chr17	51849183	.	GTA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,7:2,2:0,5
+chr17	53025193	.	T	TTC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0038647;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,13:2,5:5,8
+chr17	53334019	.	T	TAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:3,11:3,7:0,4
+chr17	53702004	.	AT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.039412;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,4:6,2
+chr17	54593370	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=3.4873e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:9,7:14,8
+chr17	55277235	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0012432;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:0,7:0,3:0,4
+chr17	55336527	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=1.7815e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:10,10:5,4
+chr17	55402087	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,5:2,3
+chr17	56303851	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:13,1:4,4
+chr17	57030254	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0041286;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:2,3:10,3
+chr17	57860372	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,5:2,2:1,3
+chr17	61311903	.	CAT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0017321;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:6,5:13,11
+chr17	63086771	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:6,2:3,3
+chr17	63629362	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00013375;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:10,7:11,7
+chr17	65286372	.	T	TAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.034267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:8,6:11,4
+chr17	65989245	.	AAAAAAAG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.010569;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,12:6,6:6,6
+chr17	67579625	.	T	TC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:5,9:7,1
+chr17	67952084	.	C	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0017509;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:2,4:7,4
+chr17	68163538	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,4:3,3:2,1
+chr17	68172141	.	A	AG	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.046007;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:10,1:16,3
+chr17	70417232	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:9,3:3,1
+chr17	70494004	.	T	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.22036;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:17,2:11,2
+chr17	70602851	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:15,3:5,1
+chr17	71032587	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:3,3:4,1
+chr17	71338895	.	T	TC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
+chr17	71608515	.	A	ATC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,5:5,1
+chr17	72117696	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00020424;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:12,4:16,9
+chr17	73569199	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:6,3:3,1
+chr17	74176320	.	T	TAAAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:6,5:6,2
+chr17	74285976	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,3:7,4
+chr17	74867306	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,4:5,1
+chr17	75358914	.	T	TATATAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:7,3:7,2
+chr17	75938864	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,3:4,4
+chr17	76238085	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.019243;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:12,4:5,2
+chr17	76935870	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033472;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:4,3:11,5
+chr17	77145095	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,6:6,1:5,5
+chr17	77413954	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.051458;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
+chr17	77718749	.	G	GTGTGTGTCTGTGTGTGCACATGCA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.095044;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:12,3:15,2
+chr17	77876975	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:14,3:5,1
+chr17	80024355	.	A	ACAC	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.044481;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:1,2:25,3
+chr17	80024394	.	GAC	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.04522;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:5,3:16,3
+chr17	81661858	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:7,5:2,1
+chr18	77738	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.055746;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,1:12,3
+chr18	105445	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:1,3:3,1
+chr18	1629634	.	ATATGTGAATG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.042059;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,3:6,4
+chr18	1632822	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.015123;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:9,8:3,4
+chr18	1748634	.	ATT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,1:6,3
+chr18	2826171	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.01057;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:8,2:8,4
+chr18	3378878	.	C	CAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0045767;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:3,5:2,1
+chr18	3382688	.	G	GA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:5,5:1,2
+chr18	3782035	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,2:2,1:2,1
+chr18	3827062	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00026567;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,5:9,5
+chr18	3992328	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0025527;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:9,5:11,3
+chr18	4080891	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,4:4,2:5,2
+chr18	7842889	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
+chr18	10208596	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0013375;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:10,4:9,3
+chr18	11133872	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0017532;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:14,5:11,6
+chr18	12521336	.	CT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.036744;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:15,4:6,3
+chr18	12792282	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.011071;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:4,6:3,3
+chr18	13275039	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00048831;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,16:6,11:6,5
+chr18	13443709	.	T	TCTCCTCCTCCTCCTC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0062699;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,13:7,7:3,6
+chr18	14467281	.	C	CTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,9:3,8:2,1
+chr18	14716165	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,2:9,2
+chr18	15197059	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00028843;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:8,2:9,8
+chr18	15410300	.	C	A	0	PASS	DP=176;GPV=1;SPV=0.022939;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:73,18:32,8:41,10
+chr18	15467183	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.033038;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:27,4:1,0
+chr18	15552815	.	G	T	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.045507;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:57,13:45,7:12,6
+chr18	15603964	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.060505;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:12,2:18,2
+chr18	15622831	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.053885;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:4,2:14,2
+chr18	15651172	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:0,0:17,4
+chr18	15699753	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0079853;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:3,1:9,5
+chr18	16959351	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.021073;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:9,4:1,1
+chr18	17368130	.	T	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
+chr18	17377058	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0029264;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:13,5:5,3
+chr18	17837660	.	G	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr18	18293571	.	C	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.029181;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:58,14:17,6:41,8
+chr18	18629431	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.05062;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:18,3:3,1
+chr18	19039313	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.041455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,0:13,4
+chr18	19502295	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
+chr18	20557981	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:1,0:16,4
+chr18	20815525	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0011434;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:12,2:8,4
+chr18	20838526	.	TC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0048875;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:3,4:6,6
+chr18	20838540	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,2:8,5
+chr18	20956155	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.038561;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:12,3:11,1
+chr18	22232505	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0016259;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:13,1:15,9
+chr18	22232528	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.010404;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,1:8,7
+chr18	23414331	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.020274;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,9:13,7:4,2
+chr18	24729487	.	CT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.004662;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,7:0,4:0,3
+chr18	27137977	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0038981;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,4:6,3
+chr18	27567221	.	T	TAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:3,5:3,1
+chr18	28518417	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.01229;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:6,3:13,4
+chr18	30059360	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=2.9583e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:10,7:11,6
+chr18	30706535	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=4.3012e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:12,6:4,6
+chr18	31001091	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0091169;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:10,6:9,2
+chr18	32086355	.	G	GT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:6,4:2,5
+chr18	32567283	.	CA	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.02299;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,6:17,4:7,2
+chr18	33093675	.	AT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0028364;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:12,6:7,1
+chr18	33109832	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=5.4595e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:7,8:5,6
+chr18	33768234	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0086905;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:11,5:7,12
+chr18	34440623	.	AG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0015629;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:10,2:9,6
+chr18	34691046	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0018974;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:14,4:9,5
+chr18	35885155	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0045189;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,5:2,1
+chr18	36206244	.	C	CT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:1,4:2,1
+chr18	36463387	.	AAAAT	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.063808;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:42,5:17,3:25,2
+chr18	36720277	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:4,1:10,4
+chr18	36869541	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00090261;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:6,3:14,10
+chr18	36984904	.	CAA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,7:3,5:5,2
+chr18	37462794	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:8,4:3,1:5,3
+chr18	37857488	.	CTTTCTTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.030957;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:6,3:11,2
+chr18	40601560	.	C	CTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.046888;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:2,2:15,5
+chr18	42825432	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00014918;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:10,6:6,4
+chr18	43425274	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.4904e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:6,5:14,8
+chr18	45209180	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0047407;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:8,8:1,1
+chr18	50852319	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.028977;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:3,1:9,3
+chr18	50913860	.	T	TATACACACACACACAC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.013177;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
+chr18	51131287	.	TAC	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.026055;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:5,5:14,3
+chr18	51384788	.	TATATATATATA	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,3:0,0:2,3
+chr18	51844934	.	GT	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031008;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,2:7,3
+chr18	53407528	.	G	GATATATAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12799;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,5:4,4:3,1
+chr18	53499957	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0038679;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,3:11,7
+chr18	57390047	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0035421;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,4:11,4
+chr18	57527638	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.11998;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:21,3:8,1
+chr18	58646138	.	AG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.089104;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:13,1:13,4
+chr18	58920735	.	CGTGTGTGTGT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.010876;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,6:10,5:0,1
+chr18	59237459	.	C	CA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,4:2,1
+chr18	59522993	.	C	CAAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,5:2,4:0,1
+chr18	62850074	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,2:2,1:4,1
+chr18	63878575	.	G	GAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0083111;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,8:11,1
+chr18	64062944	.	C	CTA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016993;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
+chr18	64062989	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017591;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,4:5,3
+chr18	65420400	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0026788;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:13,4:10,4
+chr18	66760271	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.5142e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:11,9:10,7
+chr18	67402010	.	A	AG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:5,1:3,4
+chr18	68026237	.	T	TA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034789;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:7,4:12,1
+chr18	68504776	.	G	GAGGAAGGAAGGA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,6:4,4:0,2
+chr18	69214371	.	CTT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.016783;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,6:1,3:2,3
+chr18	71156912	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.02564;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,1:8,7
+chr18	71205760	.	C	CTCCA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028921;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,6:3,4:7,2
+chr18	71210783	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:3,2:6,3
+chr18	71420401	.	G	GTATATATATATATATA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:11,3:2,3
+chr18	72625698	.	C	CTA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00030146;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:3,4:4,6
+chr18	73094559	.	AAAC	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.038102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:12,3:10,2
+chr18	73983993	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.033472;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:11,6:4,2
+chr18	74174891	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00070165;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,9:7,6:6,3
+chr18	76126690	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=1.7815e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:6,8:9,6
+chr18	77796251	.	CT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.010905;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,7:7,4:9,3
+chr18	78012529	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00023235;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:9,6:9,5
+chr18	78109088	.	TTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.049275;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,3:7,3
+chr18	79017137	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.015156;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
+chr18	79505741	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.33824;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:15,1:6,2
+chr18	79732475	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022281;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,3:1,1
+chr19	103817	.	TAC	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0030733;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:20,11:7,3
+chr19	319605	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:11,5:7,1
+chr19	785067	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0053746;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:4,6:6,4
+chr19	2155498	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0021594;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:6,8:2,3
+chr19	2990703	.	A	ACAT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0023444;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,10:7,7:4,3
+chr19	3313188	.	T	TGTTGGAGACCATGAAGGGAGGCC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,5:7,5
+chr19	3789721	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,3:3,1
+chr19	5433796	.	C	CAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.062937;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,5:1,4:3,1
+chr19	5465489	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.9702e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:14,8:4,5
+chr19	7355068	.	TCACACACACACACACACACA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,3:3,5
+chr19	7692107	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,4:1,1
+chr19	8771295	.	G	T	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.046443;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:103,23:76,19:27,4
+chr19	8775174	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.036961;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:0,2:23,8
+chr19	8987807	.	ATTGTT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:3,6:9,4
+chr19	9820707	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,3:0,0:2,3
+chr19	9908464	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,6:0,3:2,3
+chr19	10301799	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,1:13,3
+chr19	10724339	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.2849e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,13:8,6:4,7
+chr19	12308695	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,5:0,2:3,3
+chr19	13572639	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0015405;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:8,4:10,5
+chr19	13903673	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.038355;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:16,8:9,3
+chr19	14318078	.	ATATATATAT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,2:3,3
+chr19	15650803	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:5,1:5,3
+chr19	16790642	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.045025;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,3:5,2
+chr19	17681069	.	C	CTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:0,3:2,1
+chr19	18159144	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:2,1:4,3
+chr19	18345725	.	C	CA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:8,3:1,1
+chr19	18621422	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,4:6,1:13,3
+chr19	18983363	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,5:3,3
+chr19	19318113	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.042892;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,3:1,1:3,2
+chr19	19440986	.	TTTCCTTCCC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0074534;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,6:3,3:4,3
+chr19	19691395	.	C	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0014993;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:2,2:5,6
+chr19	19984567	.	C	CA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,2:2,2
+chr19	20770110	.	AG	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.028958;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:10,1:22,7
+chr19	20770112	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.036531;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:11,1:19,6
+chr19	21565265	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020843;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,5:4,1
+chr19	22489382	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.9123e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:13,9:5,9
+chr19	22885732	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.1758e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:16,7:8,8
+chr19	23478513	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:2,2:0,0:2,2
+chr19	24355432	.	G	GAAAT	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.044976;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:50,15:26,2:24,13
+chr19	24372163	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.00041668;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:40,21:23,10:17,11
+chr19	24395330	.	C	T	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=2.0682e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:50,17:20,6:30,11
+chr19	24441180	.	C	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.038827;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:31,9:6,1
+chr19	25425602	.	T	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr19	25963563	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr19	26161162	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
+chr19	28819965	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.016072;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,1:9,3
+chr19	29901079	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,4:1,0
+chr19	30333181	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16375;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:11,3:18,1
+chr19	30881294	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,3:2,2
+chr19	32421647	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,7:3,4:4,3
+chr19	35624102	.	G	GTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,3:2,3
+chr19	36771535	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:2,4:6,2
+chr19	36956601	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.01246;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,7:5,5:5,2
+chr19	37229616	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:6,1:13,2
+chr19	37355397	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0001676;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,4:6,4
+chr19	37375315	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:4,1:10,6
+chr19	37537911	.	AT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024176;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:1,1:7,3
+chr19	39633991	.	T	TC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.026907;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:6,4:6,4
+chr19	41645411	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,0:13,4
+chr19	43303650	.	ATGTGTGTGTGTGTGTG	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:4,6:2,1
+chr19	44167314	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0022121;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:4,6:1,3
+chr19	44532565	.	AAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,7:3,2:5,5
+chr19	44587574	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:11,3:1,1
+chr19	45626380	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:3,4:3,1
+chr19	46200507	.	TTC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:5,1:12,3
+chr19	46399136	.	TG	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.034267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,5:9,5
+chr19	46793102	.	T	TAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,2:6,2
+chr19	46941876	.	T	TAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:6,3:4,1
+chr19	47420910	.	T	TCTCACA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.015156;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,3:7,1
+chr19	47908463	.	T	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr19	47915101	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr19	47920306	.	A	C	0	PASS	DP=327;GPV=1;SPV=0.024939;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:137,20:71,14:66,6
+chr19	47939926	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
+chr19	48016456	.	TTTTCTTTCCTTC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:2,1:11,5
+chr19	48559006	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.014432;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:7,3:12,3
+chr19	48655202	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.095238;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:3,2:0,0
+chr19	49321321	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,2:0,1:1,1
+chr19	51362170	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10365;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,5:16,3:2,2
+chr19	51608754	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,4:3,3:7,1
+chr19	51995567	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,1:5,3
+chr19	52865470	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11077;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,2:6,1:1,1
+chr19	52865924	.	TATG	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:6,3:7,3
+chr19	52865936	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.03094;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,3:6,3
+chr19	53007064	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:9,4:5,3
+chr19	53125130	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.7463e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:7,9:9,3
+chr19	53127875	.	C	CAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,5:4,4:9,1
+chr19	53309270	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.016233;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:10,8:2,1
+chr19	53820691	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0016476;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,13:3,9:2,4
+chr19	54221926	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.048616;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:14,3:14,3
+chr19	54286038	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.031211;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:10,1:12,5
+chr19	54353176	.	AG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022451;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,6:6,4:11,2
+chr19	54779651	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0076246;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:3,4:8,2
+chr19	55335498	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0050719;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:8,4:8,4
+chr19	55734371	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.54545;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,2:2,1:5,1
+chr19	56745414	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.025744;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:13,2:18,6
+chr2	736402	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.072331;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:16,2:10,3
+chr2	802134	.	C	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0067841;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:3,4:5,7
+chr2	869219	.	C	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:9,3:3,2
+chr2	1235444	.	GC	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:7,3:7,2
+chr2	1262695	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0092864;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,4:5,3
+chr2	1342708	.	C	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
+chr2	1861649	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:2,1:7,4
+chr2	3199807	.	G	GGA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:5,1:11,3
+chr2	6151090	.	C	CTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011088;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,6:5,1
+chr2	6169093	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:2,1:5,5
+chr2	6677975	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,2:1,2:0,0
+chr2	6677977	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,2:1,2:0,0
+chr2	6896532	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0028986;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,8:3,6:2,2
+chr2	7480506	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00099636;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:16,19:10,7:6,12
+chr2	8995590	.	A	AT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00088132;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:10,8:8,1
+chr2	10554207	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:16,2:8,2
+chr2	12825828	.	TA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0023186;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:7,5:8,4
+chr2	12878380	.	GTATATATATATGTGTATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.027296;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,4:9,3
+chr2	14735748	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,2:2,2
+chr2	16006439	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.2354e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,4:6,4
+chr2	17447149	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.003465;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:9,2:8,5
+chr2	17503990	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:6,5:3,1
+chr2	21572766	.	TA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.021701;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,5:7,4
+chr2	22395978	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0044459;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:16,7:16,6
+chr2	23910651	.	T	TGAGGTCA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0089978;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:12,9:1,1
+chr2	24109152	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,7:10,5:0,2
+chr2	24116876	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.050152;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:10,3:10,1
+chr2	24773141	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,2:3,1:4,1
+chr2	27642960	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,4:6,1
+chr2	31618478	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0033467;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,5:9,3
+chr2	31737876	.	G	GACAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:9,3:5,1
+chr2	32461047	.	C	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,1:5,4
+chr2	33341729	.	A	AAAATATATATAT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.031374;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,7:6,3:8,4
+chr2	34243744	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0065359;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,10:2,9:1,1
+chr2	34787738	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:7,3:3,1
+chr2	35521833	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0056979;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,1:5,4
+chr2	35701204	.	TAA	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.053387;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,1:15,3
+chr2	35974670	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10733;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:9,2:1,4
+chr2	38482904	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,1:12,4
+chr2	38482905	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039873;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,1:13,3
+chr2	39207517	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.6127e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:9,14:10,2
+chr2	39619216	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023277;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,6:5,3
+chr2	40972280	.	T	TAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0088578;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,6:1,5:0,1
+chr2	41324684	.	T	TTCTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.056191;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:3,4:7,3
+chr2	42347307	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.011229;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:5,5:4,4
+chr2	43636340	.	A	AGAT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040214;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:4,4:9,3
+chr2	44346784	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=3.3707e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:7,10:13,9
+chr2	44400928	.	GTGTA	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,1:1,3
+chr2	46769584	.	G	GA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0041286;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
+chr2	47009888	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.11053;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,2:3,1:2,1
+chr2	47344111	.	TAA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0069071;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:6,3:4,7
+chr2	47950544	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0034325;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,1:2,5
+chr2	48288282	.	A	AGAGT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0058369;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:6,7:5,3
+chr2	48288283	.	CTTTTAT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0066039;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:7,7:7,5
+chr2	50951963	.	A	ATATTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,7:10,4:7,3
+chr2	51413347	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.002854;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:8,2:8,5
+chr2	51834653	.	ATCTATATATCTATATATATATATATCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022366;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,4:5,5
+chr2	52111307	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.028335;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:5,5:5,2
+chr2	52305046	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.9001e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:5,7:6,6
+chr2	55726018	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.884e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:7,4:9,11
+chr2	56693547	.	T	TATATATATATATATATACAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011671;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:5,5:8,1
+chr2	56889637	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0099416;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,5:6,4:3,1
+chr2	57595116	.	T	TGC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.026907;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,8:6,4:6,4
+chr2	60251438	.	T	TTAGA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0061654;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,6:10,5
+chr2	60560194	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=3.3518e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:5,6:6,8
+chr2	60625053	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.013909;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,5:9,1
+chr2	61596396	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,1:7,3
+chr2	65125864	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:0,1:1,3
+chr2	65234600	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0047587;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:6,3:8,3
+chr2	65444840	.	TTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.016237;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:4,4:10,6
+chr2	65647998	.	AT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0033311;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:5,5:8,1
+chr2	66130391	.	T	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,5:4,2:3,3
+chr2	71245513	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,5:3,3
+chr2	71635766	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,2:2,1:2,1
+chr2	71635770	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,2:5,1:2,1
+chr2	74182834	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0015405;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:6,3:12,6
+chr2	74473763	.	AT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021189;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,7:6,2
+chr2	77603466	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,1:0,1
+chr2	78518329	.	CT	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.012115;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:22,3:13,5
+chr2	78543274	.	G	GTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0001029;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:6,13:5,10:1,3
+chr2	79046766	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00024707;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,3:8,8
+chr2	80881318	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=8.5672e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:3,4:10,7
+chr2	81963292	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.032072;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:11,13:5,2
+chr2	82186972	.	GTA	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.032848;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,3:9,1
+chr2	82477666	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00064337;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:10,8:11,7
+chr2	83212156	.	A	AT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.15761;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:18,2:17,2
+chr2	84141454	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0084701;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:6,3:12,3
+chr2	84480962	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024656;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,2:7,2
+chr2	85194385	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=4.8428e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:8,4:4,8
+chr2	86226632	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,3:6,2
+chr2	86716902	.	A	AAAAAAAAAACAAAC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,3:8,2
+chr2	87080887	.	GAACT	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.072031;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:16,3:17,1
+chr2	87140408	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.013126;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:7,5:16,4
+chr2	87175658	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.11077;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
+chr2	87348767	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.034192;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:6,3:9,4
+chr2	87361291	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.016609;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:19,5:19,4
+chr2	87364750	.	TGATGA	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.023935;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:48,8:28,2:20,6
+chr2	87368746	.	TA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.071412;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:14,1:19,4
+chr2	87417936	.	CA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.13725;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:2,1:3,1
+chr2	87425940	.	CAAGCCAGCCACCCAGCA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:9,1:6,3
+chr2	87472920	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.002173;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:3,9:2,5:1,4
+chr2	87597072	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.02064;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,3:3,2:0,1
+chr2	87656421	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,3:4,1
+chr2	87721053	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0055231;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,3:5,3
+chr2	87879624	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:0,2:8,7
+chr2	89315609	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.010747;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,4:4,3
+chr2	89538074	.	T	C	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.030096;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:59,19:24,10:35,9
+chr2	89552645	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,3:2,1
+chr2	89559108	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,0:10,4
+chr2	89593824	.	A	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.048552;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:25,6:8,3
+chr2	90022764	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016895;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:14,4:10,1
+chr2	90058484	.	C	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:0,1:4,3
+chr2	90133849	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.013278;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:7,8:3,4
+chr2	90254023	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.04931;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:1,1:30,4
+chr2	90287226	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.042693;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:21,6:19,1
+chr2	90371425	.	A	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.037418;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,10:7,4:26,6
+chr2	90371859	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:13,2:3,2
+chr2	91427568	.	C	G	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.0079957;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:71,9:37,1:34,8
+chr2	91432684	.	G	C	0	PASS	DP=236;GPV=1;SPV=0.033118;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:115,14:58,5:57,9
+chr2	91451180	.	T	C	0	PASS	DP=197;GPV=1;SPV=0.018932;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:93,18:46,10:47,8
+chr2	91472185	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.035165;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,10:24,7:12,3
+chr2	91473716	.	G	C	0	PASS	DP=271;GPV=1;SPV=0.017556;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:113,22:55,17:58,5
+chr2	91499851	.	TTGGCTGGC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01539;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,5:6,1
+chr2	91649254	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.026147;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:6,1:19,5
+chr2	91669627	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:2,3:11,1
+chr2	91727840	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031813;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,0:10,4
+chr2	91892509	.	C	T	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.026338;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:68,10:21,3:47,7
+chr2	92057127	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr2	92057166	.	T	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr2	92197366	.	G	T	0	PASS	DP=449;GPV=1;SPV=0.002724;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:198,29:117,17:81,12
+chr2	92358452	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.012894;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:13,1:11,6
+chr2	92376082	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018165;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:2,1:13,8
+chr2	92380957	.	T	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.027334;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:60,13:5,1:55,12
+chr2	92416953	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.049645;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:12,1:7,3
+chr2	92436292	.	T	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.022694;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:18,8:19,2
+chr2	92595112	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr2	92667798	.	T	G	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0087838;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:24,6:15,2
+chr2	92687005	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.043165;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:13,5:21,4
+chr2	92705371	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.021326;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,1:7,6
+chr2	92795746	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.028929;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,9:23,8:6,1
+chr2	93249851	.	T	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.033687;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:1,0:34,4
+chr2	93253263	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:10,2:17,2
+chr2	93263138	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0084925;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:33,7:2,0
+chr2	93455444	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.058442;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
+chr2	93485871	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030104;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
+chr2	93580446	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.068312;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:28,2:3,2
+chr2	93674089	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr2	93824475	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:1,1:16,3
+chr2	93857398	.	C	A	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.02357;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:88,19:87,18:1,1
+chr2	93879854	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18803;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:10,2:2,1:8,1
+chr2	93883067	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.036878;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,4:14,5
+chr2	93946886	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr2	94219398	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.010246;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:16,7:9,7
+chr2	94739855	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.026412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:15,4:12,1
+chr2	95639887	.	G	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:3,4:14,3
+chr2	95885787	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0074736;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,2:6,4
+chr2	97166079	.	A	ATGG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.031714;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:5,1:14,5
+chr2	97514685	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.035343;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:5,1:11,4
+chr2	97667268	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:7,2:3,2
+chr2	98635988	.	A	AAAAAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018694;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,2:2,4
+chr2	102260258	.	AG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.026903;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,4:6,3
+chr2	102958716	.	G	GT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00021623;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:16,8:6,3
+chr2	103359765	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.1901e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:8,8:11,6
+chr2	104375468	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0084306;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:3,6:6,3
+chr2	105996608	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.1294e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:12,8:12,5
+chr2	107095278	.	GA	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00019854;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:10,5:3,4
+chr2	107904832	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.019667;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:9,7:19,2
+chr2	108122467	.	AAAAAAAAAATATATATATATAT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014907;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,4:2,1
+chr2	108292393	.	AACAC	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0026559;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,12:12,6:2,6
+chr2	110049908	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0075507;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:39,18:19,11:20,7
+chr2	110226308	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00024036;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,3:6,5
+chr2	111506131	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0081354;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:14,5:9,4
+chr2	111593055	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.04437;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:18,3:17,5
+chr2	112338859	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,4:1,1:0,3
+chr2	112373873	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:2,2:8,2
+chr2	113077537	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.037732;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:3,4:5,3
+chr2	113589594	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.020182;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:18,2:19,11
+chr2	114426588	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00024866;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,1:9,8
+chr2	114812583	.	G	GACAC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.065377;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,5:12,4:14,1
+chr2	116463887	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0018182;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:7,2:11,5
+chr2	117407919	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.12281;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:0,0:5,2
+chr2	119114640	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00051776;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:8,6:8,2
+chr2	119922218	.	TAA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.014934;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,6:4,1
+chr2	120142114	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,2:1,2:0,0
+chr2	120142116	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:0,2:0,2:0,0
+chr2	121151724	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:2,2:0,1:2,1
+chr2	121672921	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0015417;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,4:4,2
+chr2	121891029	.	C	CAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:6,3:2,2
+chr2	124655937	.	G	GAGAAAGAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021691;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:7,3:4,2
+chr2	125894961	.	CAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:1,2:3,2
+chr2	129549054	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.9426e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:16,5:11,11
+chr2	130074871	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0017104;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:11,4:7,7
+chr2	131534031	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.584e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:17,6:10,13
+chr2	131709276	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00057068;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:4,6:15,5
+chr2	132362152	.	CAT	C	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.043085;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:57,11:32,6:25,5
+chr2	132362164	.	G	GC	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.03724;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:56,11:30,6:26,5
+chr2	133482871	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=8.4874e-06;SS=2;SSC=50;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:9,11:10,6
+chr2	134145214	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00135;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:13,8:9,8
+chr2	134193675	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,6:2,5:1,1
+chr2	134516780	.	C	CATATATATATGCATATATATGAATAT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.14279;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:7,2:9,3
+chr2	135699053	.	TA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.092902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:16,2:9,3
+chr2	139873820	.	ATAT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0071795;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,2:2,2
+chr2	140228179	.	AAT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,4:2,3:2,1
+chr2	141088021	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.1154e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:11,9:8,4
+chr2	142448453	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:8,6:4,4
+chr2	143680030	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:3,1:1,1
+chr2	144484185	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,8:3,6:4,2
+chr2	145541243	.	AT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,4:4,2:6,2
+chr2	145893425	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,5:7,1
+chr2	146979198	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0078215;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,11:5,7:4,4
+chr2	147397397	.	AACATT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.025662;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:11,4:20,3
+chr2	147398202	.	CAAA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0031585;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:9,4:5,2
+chr2	149720221	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0004122;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:9,6:16,7
+chr2	150284846	.	CTT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
+chr2	151285589	.	G	GA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:5,6:3,1
+chr2	153390112	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=6.0912e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:9,7:8,7
+chr2	154216802	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,3:2,1
+chr2	155721753	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,5:3,4:2,1
+chr2	155815260	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=2.7022e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:7,5:5,5
+chr2	156256911	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.023554;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:14,2:8,3
+chr2	156256938	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.037167;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,1:7,3
+chr2	158962657	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0033296;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,3:6,4
+chr2	159874193	.	TATTGTAA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.038501;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,5:11,1
+chr2	159874209	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.02545;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,7:5,4:7,3
+chr2	160324880	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:10,4:3,1
+chr2	162820209	.	T	TTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.022136;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,7:1,3:5,4
+chr2	162908321	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.053885;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,3:8,1
+chr2	163934847	.	TA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,5:4,1:4,4
+chr2	164142977	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,1:9,3
+chr2	166100056	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021726;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,5:6,4
+chr2	166414462	.	GATAT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,4:3,2
+chr2	167590345	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,11:4,7:1,4
+chr2	168897560	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.28347;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:9,1:12,2
+chr2	169327154	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,1:8,3
+chr2	169466284	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,1:1,3
+chr2	170149646	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0015602;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,3:1,3
+chr2	170681049	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.014907;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,13:5,5:2,8
+chr2	171048626	.	GAAACCC	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.022974;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,4:6,3
+chr2	171048633	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.016311;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,4:5,2
+chr2	171496401	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.13598;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:19,3:11,1
+chr2	172117902	.	T	TATATATATATATACAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0056039;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,9:7,5:5,4
+chr2	172203335	.	C	CAAA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,3:2,2
+chr2	175787160	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0027568;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:7,4:12,5
+chr2	176542107	.	GA	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:3,3:3,1
+chr2	176656424	.	T	TTTCCTTCCTTCC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14559;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:11,3:1,2
+chr2	177019690	.	T	TATATATATATATATACACAC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.028555;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,7:12,2:8,5
+chr2	179663713	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.021073;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,4:3,1
+chr2	184229750	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0060802;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,5:9,1
+chr2	184448586	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.01309;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:12,3:11,3
+chr2	186242677	.	C	CT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.0050505;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,7:1,6:0,1
+chr2	188800494	.	CAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.020719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,5:3,1
+chr2	189931387	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=4.6765e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:10,7:6,6
+chr2	190270282	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00042977;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,4:6,5
+chr2	192947802	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=5.1236e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:14,6:9,13
+chr2	194450607	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATAT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,3:6,3
+chr2	196922577	.	G	GACAC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:8,6:1,1
+chr2	197103228	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,2:3,1:2,1
+chr2	198158230	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.3187e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:6,7:10,6
+chr2	201561893	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.016233;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,5:6,4
+chr2	203216011	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.18182;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,2:2,1:1,1
+chr2	207423566	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,6:7,2:4,4
+chr2	207462764	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.26692;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:14,3:4,1
+chr2	207818542	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037811;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,6:8,5
+chr2	208157628	.	GTT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:2,3:0,0:2,3
+chr2	208856067	.	C	CTGATGGTCCTTTAACTGCAGTGTACTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.044511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:7,4:6,4
+chr2	209081372	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.21538;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:8,1:5,2
+chr2	210330336	.	G	GT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0031353;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:3,7:3,3
+chr2	212145727	.	TAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:4,1:2,5
+chr2	212864383	.	TTA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.083654;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:7,2:19,1
+chr2	213030812	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.012393;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,7:8,4:4,3
+chr2	213322357	.	C	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:0,5:0,3:0,2
+chr2	213608771	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=9.863e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:11,10:8,6
+chr2	213800335	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,2:0,0:5,2
+chr2	214037864	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,5:4,4:1,1
+chr2	214977880	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0006592;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,9:5,4:7,5
+chr2	215786411	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.7296e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:10,5:4,7
+chr2	219933255	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03274;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:11,5:3,5
+chr2	220257285	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,2:0,2:0,0
+chr2	224305397	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,7:3,1
+chr2	224357093	.	CAAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:6,3:4,1
+chr2	224458590	.	GTT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,10:1,5:3,5
+chr2	225204941	.	C	CTTTCTTTCT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,6:7,3:4,3
+chr2	225655885	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,3:1,1
+chr2	225764030	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,7:2,1
+chr2	226318398	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0088417;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,2:1,2
+chr2	226354884	.	G	GT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.055746;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,2:16,2
+chr2	227656624	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.025922;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,1:9,3
+chr2	228501713	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:1,4:1,3:0,1
+chr2	228808589	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00014325;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,5:8,3
+chr2	230119123	.	A	AT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.18018;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,2:9,1:5,1
+chr2	231725370	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016206;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:1,3:0,2:1,1
+chr2	231801630	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:6,4:9,1
+chr2	235278477	.	C	CTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,5:0,3:2,2
+chr2	235831185	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:5,3:2,2:3,1
+chr2	237307233	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12281;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,2:3,1:2,1
+chr2	238086708	.	T	TAAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.025058;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,5:0,2:1,3
+chr2	238110553	.	A	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:6,1:1,1
+chr2	240308866	.	GTGTCTC	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.077856;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,4:12,3:18,1
+chr2	240411015	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,5:3,2
+chr2	240976465	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.034164;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:13,1:7,7
+chr2	241338719	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,1:3,6
+chr2	241648688	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.034034;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:13,3:12,2
+chr2	241774683	.	TC	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.039485;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,4:13,1
+chr2	241819955	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:2,2:3,1
+chr2	242006800	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.046752;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,1:7,6
+chr2	242183243	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.017865;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:13,2:16,4
+chr20	149164	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.017268;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:15,1:13,7
+chr20	3635363	.	T	TAATAAATAAATA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.013238;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:4,6:6,2
+chr20	4231083	.	T	TC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.09062;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:6,1:11,3
+chr20	4747645	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0070897;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:7,3:9,10
+chr20	4985134	.	TC	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,1:11,3
+chr20	5005000	.	A	AAAAT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.006682;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:5,5:13,4
+chr20	5250006	.	AT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0002157;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,4:5,5
+chr20	6425084	.	A	AAAAAAGAG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,8:7,1:7,7
+chr20	6690801	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,5:4,1
+chr20	7535830	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=9.0835e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,5:7,4
+chr20	7680055	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0011112;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,5:4,2
+chr20	7815911	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.1927e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:12,6:11,10
+chr20	8556656	.	GGT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0073495;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:4,6:6,1
+chr20	8633101	.	TACACACACAC	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00045491;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:14,7:2,7
+chr20	8896268	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,7:8,6:1,1
+chr20	9879554	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0091533;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:5,4:1,2
+chr20	10082287	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:10,7:2,1
+chr20	10891617	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:3,3:3,1
+chr20	11374566	.	TTA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.049139;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,1:11,5
+chr20	11854879	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0018815;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:3,5:2,5
+chr20	11859724	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.046752;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:9,6:4,1
+chr20	12342744	.	GA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,1:13,3
+chr20	12681880	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.03842;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:14,4:9,2
+chr20	13612491	.	A	AACAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0024835;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:9,5:3,5
+chr20	14071695	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=4.2509e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:15,5:4,6
+chr20	17479809	.	A	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,12:2,4:4,8
+chr20	17504905	.	G	GT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0028667;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,5:8,4
+chr20	20000330	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0028364;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:12,4:7,3
+chr20	20000533	.	AC	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0012459;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,3:16,6
+chr20	21353266	.	C	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,2:1,1:4,1
+chr20	22762349	.	TAGAGAC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,5:1,3:3,2
+chr20	22904023	.	A	ATTTTTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:7,4:7,4
+chr20	24913641	.	TG	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.019011;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:8,2:10,6
+chr20	25472324	.	GATATAT	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.039341;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,2:0,2
+chr20	25594374	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0056638;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,7:5,1
+chr20	25611226	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.026832;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:7,4:3,1
+chr20	26220241	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.058134;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:24,1:20,4
+chr20	26478052	.	C	A	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.047425;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:75,11:26,8:49,3
+chr20	26568343	.	GT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:13,4:0,0
+chr20	26568349	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.29565;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,3:14,3:0,0
+chr20	26697336	.	G	A	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.032344;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:89,19:39,10:50,9
+chr20	27291338	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr20	28299891	.	A	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.048496;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:15,3:17,6
+chr20	28546561	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:3,1:7,4
+chr20	28636613	.	C	G	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.012643;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:32,9:11,2
+chr20	28638505	.	GCCTTGGT	G	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.0032755;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:64,18:40,8:24,10
+chr20	28804568	.	A	G	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.03277;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:91,19:72,15:19,4
+chr20	29076856	.	TG	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.014499;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:17,4:12,7
+chr20	29105731	.	AAT	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.015946;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,5:10,3:15,2
+chr20	29312353	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023024;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:6,6:7,2
+chr20	29312389	.	AG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0005304;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,10:6,5:4,5
+chr20	29312393	.	AAAG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.018356;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:8,3:5,4
+chr20	29312487	.	AAGGG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.035323;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:14,5:1,3
+chr20	29513081	.	G	A	0	PASS	DP=314;GPV=1;SPV=0.016919;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:134,17:88,13:46,4
+chr20	29877931	.	G	A	0	PASS	DP=306;GPV=1;SPV=0.043172;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:130,19:55,12:75,7
+chr20	29880455	.	G	A	0	PASS	DP=461;GPV=1;SPV=0.028207;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:193,33:106,16:87,17
+chr20	30185432	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.027227;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:17,3:12,6
+chr20	30198474	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:5,3:3,1
+chr20	30217154	.	A	G	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.043773;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:58,10:32,6:26,4
+chr20	30217160	.	A	C	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.028517;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:52,11:30,7:22,4
+chr20	30296138	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.048995;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:13,2:16,4
+chr20	30358649	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.024141;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:16,9:18,4
+chr20	30401783	.	TTTCTA	T	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.026485;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:28,3:26,3
+chr20	30638478	.	T	C	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.03661;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:57,14:24,2:33,12
+chr20	30674344	.	TA	T	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.039831;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:77,16:37,8:40,8
+chr20	30756951	.	G	GT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.048775;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:14,1:18,4
+chr20	30815445	.	C	T	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.024294;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:113,20:50,7:63,13
+chr20	30820376	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.017537;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:17,2:21,3
+chr20	30839004	.	G	T	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.01741;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:54,15:32,5:22,10
+chr20	31056505	.	TTGGAA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10365;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:11,4:7,1
+chr20	31058549	.	T	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.037815;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:42,13:24,7:18,6
+chr20	31059753	.	C	A	0	PASS	DP=204;GPV=1;SPV=0.033896;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:82,14:40,7:42,7
+chr20	31061380	.	GAATGGAATGT	G	0	PASS	DP=863;GPV=1;SPV=0.0043696;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:415:368,44:168,18:200,26
+chr20	31063668	.	A	AGGAAT	0	PASS	DP=219;GPV=1;SPV=0.0067066;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:80,13:52,7:28,6
+chr20	31064863	.	T	A	0	PASS	DP=257;GPV=1;SPV=0.019901;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:102,15:45,8:57,7
+chr20	31069987	.	T	G	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.0013934;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:56,12:38,7:18,5
+chr20	31082413	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.015968;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:9,2:3,9
+chr20	31186507	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.025853;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,3:13,4
+chr20	33329513	.	TC	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=6.0153e-06;SS=2;SSC=52;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:11,9:7,7
+chr20	33329515	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.001032;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:31:0,16:0,8:0,8
+chr20	36406397	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.039259;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,3:2,1
+chr20	37480584	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,5:0,1:0,4
+chr20	37614567	.	ATATATTTTT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,6:4,4
+chr20	38209339	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=4.435e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:10,5:14,10
+chr20	38379407	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:17,1:6,3
+chr20	39238316	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.011004;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,12:8,7:7,5
+chr20	41000645	.	G	GAAAATAAAATAAAATAAAAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,12:4,7:3,5
+chr20	41918191	.	TTTCC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,6:0,4:0,2
+chr20	42516774	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00011008;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:12,5:7,8
+chr20	47184413	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,15:7,6:4,9
+chr20	47255746	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,1:1,4
+chr20	48160689	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.1812e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:20,25:8,12:12,13
+chr20	48280400	.	AT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0038123;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,7:7,4:4,3
+chr20	48514859	.	C	G	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.01884;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:25,7:19,7
+chr20	49132759	.	CCAAAA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.035929;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:8,7:15,5
+chr20	49722846	.	A	AATAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.05132;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:9,3:4,1
+chr20	49972568	.	TA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0044123;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,3:3,6
+chr20	50162720	.	G	GACAC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.051458;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,2:10,2
+chr20	52881023	.	T	TTC	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.053561;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:20,2:16,3
+chr20	52913480	.	C	CCTCTCTCT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:6,4:3,1
+chr20	53179221	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0017056;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:7,3:10,4
+chr20	54311908	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.2211e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:6,4:12,7
+chr20	55408731	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00035994;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:16,3:13,9
+chr20	55734036	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.01291;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:8,6:10,5
+chr20	56705597	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00062884;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:18,9:16,2
+chr20	58386147	.	A	ATTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0082573;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,3:5,2
+chr20	60875644	.	T	TCTTTCTTTCTTTCTTTCTTC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.053977;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,5:6,3:10,2
+chr20	61202206	.	T	TG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,3:10,1:7,2
+chr20	61214659	.	A	ATGTGTGTGTG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.076601;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,7:5,5:7,2
+chr20	61340589	.	CT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0028186;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,6:6,2
+chr20	61868708	.	G	GTGTCCCCCCACACTGGGCGGA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.015604;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,9:6,3:15,6
+chr20	62313988	.	AGT	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:1,4:2,2
+chr21	5216824	.	A	T	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.033361;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:118,15:66,9:52,6
+chr21	5222177	.	T	A	0	PASS	DP=233;GPV=1;SPV=0.0064634;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:81,18:28,8:53,10
+chr21	5235224	.	T	G	0	PASS	DP=454;GPV=1;SPV=0.0030909;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:239:215,24:88,15:127,9
+chr21	5314304	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,2:4,3
+chr21	5367797	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.012914;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,4:3,4
+chr21	6373962	.	T	A	0	PASS	DP=285;GPV=1;SPV=0.019912;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:117,19:73,8:44,11
+chr21	6375346	.	T	C	0	PASS	DP=326;GPV=1;SPV=0.039471;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:176:156,20:77,4:79,16
+chr21	7209105	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0026385;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:0,1:9,7
+chr21	7222022	.	A	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.021295;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:17,2:18,10
+chr21	7225469	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.021579;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:21,3:18,3
+chr21	7284211	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.019625;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:16,1:19,6
+chr21	7307621	.	G	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.0019938;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:17,5:21,2
+chr21	7921289	.	T	C	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.028675;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:50,13:24,7:26,6
+chr21	7930121	.	A	G	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.046157;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:86,17:45,9:41,8
+chr21	8229974	.	C	CCT	0	PASS	DP=324;GPV=1;SPV=0.017801;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:113,14:19,4:94,10
+chr21	8401672	.	A	G	0	PASS	DP=1680;GPV=1;SPV=0.00098206;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:675:599,76:379,45:220,31
+chr21	8434180	.	T	C	0	PASS	DP=11481;GPV=1;SPV=0.0010525;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:5295:4745,549:2821,341:1924,208
+chr21	8443332	.	CT	C	0	PASS	DP=4328;GPV=1;SPV=0.0030189;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:1924:1731,193:144,4:1587,189
+chr21	8447275	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,2:0,0:6,2
+chr21	8465033	.	G	A	0	PASS	DP=1572;GPV=1;SPV=0.0013903;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:536:461,67:211,42:250,25
+chr21	8540814	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:20,4:0,0
+chr21	8554165	.	G	GATGAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.013932;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:2,4:0,0
+chr21	8584900	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.037765;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:6,3:14,3
+chr21	8600030	.	AATCATCATC	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:1,2:1,2:0,0
+chr21	8760950	.	TATA	T	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.038391;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:118,18:59,2:59,16
+chr21	8762801	.	C	T	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.035066;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:67,14:34,9:33,5
+chr21	8766588	.	G	T	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.0076057;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:86,20:35,9:51,11
+chr21	8786330	.	T	TTA	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.01398;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:163:135,17:65,12:70,5
+chr21	8793237	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.025634;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:15,9:21,2
+chr21	8800254	.	C	T	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.033041;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:70,14:37,10:33,4
+chr21	8806881	.	CGCGT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027099;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:5,3:11,5
+chr21	8839468	.	G	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.014375;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:8,5:18,5
+chr21	8839785	.	C	T	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.044078;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:68,10:52,6:16,4
+chr21	8840921	.	C	T	0	PASS	DP=319;GPV=1;SPV=0.017205;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:136,19:46,2:90,17
+chr21	8842183	.	AC	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.036589;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:17,8:21,4
+chr21	8845410	.	A	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.038644;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:10,4:24,4
+chr21	8848326	.	G	T	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.027845;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:102,15:51,4:51,11
+chr21	8851808	.	T	G	0	PASS	DP=369;GPV=1;SPV=0.002886;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:193:158,35:73,16:85,19
+chr21	8854791	.	G	A	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.0017759;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:11,8:33,7
+chr21	8858689	.	T	A	0	PASS	DP=338;GPV=1;SPV=0.024747;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:153,29:86,9:67,20
+chr21	8879134	.	T	G	0	PASS	DP=448;GPV=1;SPV=0.012621;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:220:196,24:111,11:85,13
+chr21	8880786	.	T	G	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.008366;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:106,15:41,3:65,12
+chr21	8999488	.	A	T	0	PASS	DP=318;GPV=1;SPV=0.031407;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:138,19:76,7:62,12
+chr21	9004659	.	A	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.0011357;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:53,16:29,8:24,8
+chr21	9016088	.	G	C	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.017335;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:134,21:73,16:61,5
+chr21	9016237	.	A	G	0	PASS	DP=369;GPV=1;SPV=0.0115;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:153,28:76,15:77,13
+chr21	9026251	.	G	A	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.016619;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:130,23:62,17:68,6
+chr21	9026268	.	T	C	0	PASS	DP=327;GPV=1;SPV=0.013028;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:137,22:65,17:72,5
+chr21	9032681	.	C	T	0	PASS	DP=332;GPV=1;SPV=0.04664;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:146,18:69,11:77,7
+chr21	9050202	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.04952;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:23,6:23,8
+chr21	9064459	.	G	A	0	PASS	DP=273;GPV=1;SPV=0.036768;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:143:127,16:68,6:59,10
+chr21	9086619	.	C	T	0	PASS	DP=335;GPV=1;SPV=0.026265;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:132,22:73,11:59,11
+chr21	9102967	.	T	C	0	PASS	DP=332;GPV=1;SPV=0.0097214;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:144,17:73,14:71,3
+chr21	9108624	.	G	A	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.031242;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:84,11:46,5:38,6
+chr21	9118263	.	G	A	0	PASS	DP=367;GPV=1;SPV=0.012376;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:156,35:91,23:65,12
+chr21	9118901	.	G	A	0	PASS	DP=406;GPV=1;SPV=0.014637;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:202:170,32:97,18:73,14
+chr21	9121545	.	A	T	0	PASS	DP=263;GPV=1;SPV=0.00068551;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:109,23:50,14:59,9
+chr21	9121963	.	C	T	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.033951;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:92,17:55,10:37,7
+chr21	9131132	.	C	T	0	PASS	DP=454;GPV=1;SPV=0.036715;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:222:196,26:98,9:98,17
+chr21	9132966	.	G	C	0	PASS	DP=412;GPV=1;SPV=0.024501;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:165,26:84,9:81,17
+chr21	9142219	.	T	A	0	PASS	DP=508;GPV=1;SPV=0.024478;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:251:217,34:112,16:105,18
+chr21	9165984	.	A	G	0	PASS	DP=377;GPV=1;SPV=0.0079952;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:190:111,23:56,13:55,10
+chr21	9167416	.	A	G	0	PASS	DP=357;GPV=1;SPV=0.044098;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:189:167,22:103,4:64,18
+chr21	9172802	.	A	G	0	PASS	DP=376;GPV=1;SPV=0.013747;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:161,22:100,11:61,11
+chr21	9173280	.	T	A	0	PASS	DP=390;GPV=1;SPV=0.013109;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:199:168,31:72,11:96,20
+chr21	9174974	.	G	T	0	PASS	DP=258;GPV=1;SPV=0.031092;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:114,17:43,7:71,10
+chr21	9189404	.	C	T	0	PASS	DP=417;GPV=1;SPV=0.043995;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:203:179,24:85,13:94,11
+chr21	9248111	.	G	T	0	PASS	DP=432;GPV=1;SPV=0.033383;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:216:190,26:89,10:101,16
+chr21	9248375	.	CAGTGG	C	0	PASS	DP=350;GPV=1;SPV=0.0208;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:115,25:67,21:48,4
+chr21	9251567	.	T	C	0	PASS	DP=1009;GPV=1;SPV=0.00015531;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:529:455,74:218,39:237,35
+chr21	9254687	.	A	G	0	PASS	DP=489;GPV=1;SPV=0.0030471;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:234:201,33:105,19:96,14
+chr21	9262060	.	CTT	C	0	PASS	DP=248;GPV=1;SPV=0.026434;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:116,14:63,10:53,4
+chr21	9265351	.	G	GT	0	PASS	DP=426;GPV=1;SPV=0.0053784;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:200:166,33:87,19:79,14
+chr21	9272355	.	A	G	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.022441;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:90,10:37,7:53,3
+chr21	9274547	.	A	C	0	PASS	DP=347;GPV=1;SPV=0.047456;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:144,26:110,15:34,11
+chr21	9292728	.	C	A	0	PASS	DP=490;GPV=1;SPV=0.0051027;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:237:196,41:102,22:94,19
+chr21	9296111	.	T	C	0	PASS	DP=282;GPV=1;SPV=0.0071273;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:125,17:43,7:82,10
+chr21	9296276	.	G	C	0	PASS	DP=399;GPV=1;SPV=0.0094903;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:209:180,29:108,16:72,13
+chr21	9303023	.	C	T	0	PASS	DP=413;GPV=1;SPV=0.031045;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:207:182,25:96,9:86,16
+chr21	9310548	.	A	G	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.046618;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:141,19:70,9:71,10
+chr21	9324691	.	A	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.049403;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,9:23,3:26,6
+chr21	9330352	.	G	A	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.011472;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:112,13:57,7:55,6
+chr21	9331411	.	G	A	0	PASS	DP=363;GPV=1;SPV=0.040762;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:154,23:68,11:86,12
+chr21	9342123	.	C	T	0	PASS	DP=415;GPV=1;SPV=0.018889;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:206:180,26:86,9:94,17
+chr21	9345074	.	C	T	0	PASS	DP=428;GPV=1;SPV=0.00093647;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:201,32:111,23:90,9
+chr21	9348919	.	G	T	0	PASS	DP=335;GPV=1;SPV=0.0015484;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:187:161,26:80,18:81,8
+chr21	9361283	.	G	A	0	PASS	DP=650;GPV=1;SPV=0.013952;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:333:296,37:135,19:161,18
+chr21	9365190	.	T	C	0	PASS	DP=618;GPV=1;SPV=0.0045248;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:320:269,51:137,36:132,15
+chr21	9365624	.	G	T	0	PASS	DP=588;GPV=1;SPV=0.024203;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:298:261,37:92,17:169,20
+chr21	9556399	.	A	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.0091486;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:57,21:29,7:28,14
+chr21	9606113	.	G	A	0	PASS	DP=159;GPV=1;SPV=0.031226;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:68,19:24,6:44,13
+chr21	9628172	.	T	G	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.0069375;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:52,18:26,13:26,5
+chr21	9638268	.	G	A	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=8.9074e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:52,15:27,13:25,2
+chr21	9765488	.	A	AGTGTAGTGAATGATGGGACAGT	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.0041422;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:42,19:21,13:21,6
+chr21	9821495	.	G	C	0	PASS	DP=1275;GPV=1;SPV=0.046842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:607:499,67:285,26:214,41
+chr21	9850023	.	A	G	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.018431;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:61,8:27,3:34,5
+chr21	9881159	.	T	C	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.0019529;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:57,22:27,8:30,14
+chr21	9919461	.	C	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.039548;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:52,13:28,9:24,4
+chr21	9990371	.	A	C	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.020704;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:53,14:24,4:29,10
+chr21	10021470	.	C	G	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.0040553;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:48,18:16,6:32,12
+chr21	10080386	.	A	T	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.040884;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:65,17:41,7:24,10
+chr21	10086175	.	C	T	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.0010453;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:54,24:30,14:24,10
+chr21	10097757	.	T	A	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.0084706;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:45,16:29,12:16,4
+chr21	10151268	.	T	C	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.049348;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:59,13:35,8:24,5
+chr21	10272847	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00045089;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:10,5:7,6
+chr21	10324728	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.039697;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:14,3:19,1
+chr21	10329291	.	C	T	0	PASS	DP=323;GPV=1;SPV=0.016545;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:125,23:53,8:72,15
+chr21	10342477	.	C	A	0	PASS	DP=372;GPV=1;SPV=0.046158;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:189:166,23:87,8:79,15
+chr21	10361114	.	C	G	0	PASS	DP=593;GPV=1;SPV=0.024432;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:293:254,39:133,18:121,21
+chr21	10365143	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.013531;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:23,4:19,3
+chr21	10392780	.	C	T	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.028575;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:73,14:22,4:51,10
+chr21	10406244	.	C	T	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.0021767;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:76,9:17,2:59,7
+chr21	10415521	.	G	T	0	PASS	DP=381;GPV=1;SPV=0.00088859;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:146,37:72,16:74,21
+chr21	10415652	.	G	A	0	PASS	DP=418;GPV=1;SPV=0.010425;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:195:163,32:102,22:61,10
+chr21	10417512	.	G	A	0	PASS	DP=629;GPV=1;SPV=0.018643;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:323:275,48:164,25:111,23
+chr21	10419095	.	G	A	0	PASS	DP=598;GPV=1;SPV=0.020884;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:296:260,36:116,20:144,16
+chr21	10420063	.	G	T	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.0094397;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:98,25:40,12:58,13
+chr21	10422931	.	G	GT	0	PASS	DP=263;GPV=1;SPV=0.049712;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:105,13:71,9:34,4
+chr21	10425535	.	G	A	0	PASS	DP=585;GPV=1;SPV=0.025935;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:302:264,38:133,18:131,20
+chr21	10429776	.	A	G	0	PASS	DP=602;GPV=1;SPV=0.049364;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:300:263,37:128,21:135,16
+chr21	10430637	.	C	T	0	PASS	DP=471;GPV=1;SPV=0.005776;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:231:201,30:102,15:99,15
+chr21	10437112	.	A	G	0	PASS	DP=393;GPV=1;SPV=0.046443;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:200:173,27:68,8:105,19
+chr21	10445465	.	T	A	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.048543;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:61,9:29,7:32,2
+chr21	10449982	.	C	G	0	PASS	DP=302;GPV=1;SPV=0.018207;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:115,24:59,7:56,17
+chr21	10449987	.	TATTTC	T	0	PASS	DP=316;GPV=1;SPV=0.037054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:146:127,19:68,5:59,14
+chr21	10451024	.	A	C	0	PASS	DP=406;GPV=1;SPV=0.02949;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:186:161,25:73,8:88,17
+chr21	10461146	.	T	C	0	PASS	DP=344;GPV=1;SPV=0.020052;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:143,25:75,14:68,11
+chr21	10462629	.	C	T	0	PASS	DP=385;GPV=1;SPV=0.014232;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:193:158,35:74,16:84,19
+chr21	10464875	.	G	A	0	PASS	DP=412;GPV=1;SPV=0.015602;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:215:179,36:80,20:99,16
+chr21	10467788	.	C	G	0	PASS	DP=398;GPV=1;SPV=0.0066795;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:156,25:84,10:72,15
+chr21	10475546	.	C	T	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.025186;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:130,19:54,8:76,11
+chr21	10583185	.	C	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=1.6182e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:54,16:32,10:22,6
+chr21	10665385	.	A	G	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.021267;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:51,15:26,7:25,8
+chr21	10693311	.	C	A	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.040129;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:20,7:25,5
+chr21	10744491	.	C	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0060775;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,8:25,4:21,4
+chr21	10745524	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:25,3:0,1
+chr21	10806728	.	G	A	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.015258;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:161,19:79,9:82,10
+chr21	13282962	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.046772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:15,4:14,1
+chr21	13330523	.	TTATCTATC	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:0,2:3,4
+chr21	13352710	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00012397;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:11,7:3,3
+chr21	13432290	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.029835;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:12,5:14,2
+chr21	13524811	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.031128;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:14,1:14,4
+chr21	13530697	.	G	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.046744;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:14,5:15,4
+chr21	18194603	.	TA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=9.7744e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,4:9,5
+chr21	19227218	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.047782;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,2:9,2
+chr21	20508555	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,1:8,3
+chr21	21994806	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.16587;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,5:7,4:4,1
+chr21	23072541	.	CTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:3,3:1,1
+chr21	23219743	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.6336e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:13,2:5,10
+chr21	23685848	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.038906;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:15,5:15,1
+chr21	24811016	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0025828;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:17,8:12,3
+chr21	25655350	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.043842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,3:5,3
+chr21	26062230	.	A	AAC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:6,4:3,1
+chr21	27240865	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00026636;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:12,7:11,4
+chr21	27257780	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00075779;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:11,5:12,4
+chr21	27940507	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0092633;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,6:3,3
+chr21	28413998	.	T	TC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03733;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,6:2,1:3,5
+chr21	28831522	.	AGAAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.030571;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,3:2,2
+chr21	30571058	.	T	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.015937;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:14,3:15,5
+chr21	31941311	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:7,2:9,3
+chr21	32481509	.	G	GA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.004816;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:3,4:0,1
+chr21	33237082	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.031374;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:5,3:9,4
+chr21	33337714	.	TATAC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.015793;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,3:7,3
+chr21	34671143	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,3:2,2:2,1
+chr21	34787254	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00019352;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:7,5:7,3
+chr21	35526972	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,3:3,1
+chr21	35704576	.	GAGAA	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.012821;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:2,3:1,2
+chr21	35960240	.	CTCTCTA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,2:13,2
+chr21	36176106	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:6,2:8,5
+chr21	37004264	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,2:3,2
+chr21	37033999	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013362;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,3:4,3
+chr21	37389925	.	G	GT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.021798;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:7,5:6,2
+chr21	39177130	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=6.2544e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:15,6:9,8
+chr21	39245602	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:4,2:2,1:2,1
+chr21	39378669	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:1,2:0,1:1,1
+chr21	39715048	.	CT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:0,2:0,0:0,2
+chr21	39819608	.	TCTATC	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,2:5,2
+chr21	39953826	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.02087;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,3:3,3
+chr21	40898219	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0052114;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:11,3:7,3
+chr21	42840044	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021256;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,3:5,3
+chr21	44863127	.	G	GAC	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.043229;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,6:16,5:14,1
+chr21	44972960	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.029276;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:11,4:12,2
+chr21	44973001	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0041395;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:11,5:12,2
+chr21	45902313	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0076628;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,3:2,1
+chr21	46294304	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.015045;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,2:2,4
+chr22	10547332	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.054545;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
+chr22	10550830	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:17,4:0,0
+chr22	10709382	.	CT	C	0	PASS	DP=366;GPV=1;SPV=0.023069;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:167,29:97,14:70,15
+chr22	10753801	.	A	G	0	PASS	DP=320;GPV=1;SPV=0.04636;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:163:140,23:64,12:76,11
+chr22	10754578	.	A	G	0	PASS	DP=386;GPV=1;SPV=0.04514;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:164,27:62,5:102,22
+chr22	10761243	.	C	CAAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,8:6,4:4,4
+chr22	10765275	.	G	A	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.018029;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:60,16:18,9:42,7
+chr22	10780040	.	A	C	0	PASS	DP=296;GPV=1;SPV=0.011605;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:120,27:71,14:49,13
+chr22	11027060	.	A	G	0	PASS	DP=315;GPV=1;SPV=0.045494;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:135,19:86,9:49,10
+chr22	11338143	.	C	T	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.04179;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:103,22:55,13:48,9
+chr22	11348943	.	A	C	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.039295;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:70,12:29,7:41,5
+chr22	11477170	.	C	T	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.041719;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:66,15:33,9:33,6
+chr22	11696409	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.00756;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:2,1:12,6
+chr22	11704981	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.03093;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,7:25,6:9,1
+chr22	11710948	.	A	G	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.019466;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:53,15:36,11:17,4
+chr22	11801203	.	C	G	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.045184;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:58,15:37,9:21,6
+chr22	11808059	.	T	C	0	PASS	DP=227;GPV=1;SPV=0.039916;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:96,19:56,10:40,9
+chr22	11854158	.	TA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.042122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,2:5,6
+chr22	11863430	.	G	C	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.026088;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:16,3:24,8
+chr22	11870867	.	T	C	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.0070634;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:53,17:34,15:19,2
+chr22	11871871	.	T	A	0	PASS	DP=685;GPV=1;SPV=0.032896;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:347:311,36:178,18:133,18
+chr22	11874817	.	T	C	0	PASS	DP=324;GPV=1;SPV=0.025014;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:145,19:93,8:52,11
+chr22	11912157	.	G	T	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.034312;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:77,19:38,11:39,8
+chr22	11912224	.	C	T	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.042527;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:79,15:34,8:45,7
+chr22	11913684	.	G	A	0	PASS	DP=363;GPV=1;SPV=0.035839;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:140,28:45,9:95,19
+chr22	11914787	.	T	C	0	PASS	DP=411;GPV=1;SPV=0.046627;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:183,29:109,15:74,14
+chr22	11917800	.	A	G	0	PASS	DP=585;GPV=1;SPV=0.029142;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:297:258,39:118,20:140,19
+chr22	11940484	.	T	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.011798;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:26,2:22,5
+chr22	11942962	.	CA	C	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.0055173;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:47,12:33,10:14,2
+chr22	11972802	.	G	A	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.0050678;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:50,19:27,9:23,10
+chr22	11974475	.	C	A	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.037788;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:64,10:13,5:51,5
+chr22	12036085	.	C	A	0	PASS	DP=334;GPV=1;SPV=0.0045758;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:141,18:61,11:80,7
+chr22	12060744	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016594;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:2,2:14,4
+chr22	12112120	.	G	T	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.029151;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:58,16:28,6:30,10
+chr22	12119341	.	A	C	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.0067648;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:52,15:30,2:22,13
+chr22	12154648	.	C	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.015096;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:22,2:22,4
+chr22	12166049	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.028904;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:14,5:4,2
+chr22	12193191	.	G	T	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.0023926;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:74,20:50,8:24,12
+chr22	12193684	.	A	G	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.047103;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:108,16:53,7:55,9
+chr22	12199201	.	A	C	0	PASS	DP=333;GPV=1;SPV=0.015491;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:130,19:55,11:75,8
+chr22	12200388	.	G	A	0	PASS	DP=344;GPV=1;SPV=0.014258;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:172:152,20:76,9:76,11
+chr22	12209191	.	T	G	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.0033214;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:55,17:30,8:25,9
+chr22	12218039	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.012776;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:40,14:25,5:15,9
+chr22	12218817	.	TTATTTA	T	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.0064636;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:67,21:42,16:25,5
+chr22	12295505	.	A	G	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.033746;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:63,8:23,1:40,7
+chr22	12315376	.	A	AG	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0562;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,2:11,2
+chr22	12315438	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0096691;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:24,8:6,6
+chr22	12362977	.	A	G	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.04804;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:83,10:50,6:33,4
+chr22	12368037	.	G	A	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.038911;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:23,5:23,9
+chr22	12421244	.	TA	T	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.011472;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:70,10:39,4:31,6
+chr22	12559389	.	TG	T	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.047491;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:71,13:32,6:39,7
+chr22	12619844	.	C	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.014369;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:63,14:32,10:31,4
+chr22	12637781	.	TAAG	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.054264;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:19,4:0,0
+chr22	12703951	.	G	T	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.048991;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:83,18:50,12:33,6
+chr22	12709021	.	A	C	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.018392;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:94,11:55,6:39,5
+chr22	12720922	.	C	G	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.038263;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:75,14:31,9:44,5
+chr22	12721011	.	A	G	0	PASS	DP=279;GPV=1;SPV=0.044359;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:105,21:41,9:64,12
+chr22	12787768	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.044641;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,4:10,1
+chr22	12804136	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.048003;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:15,4:10,1
+chr22	12811984	.	A	C	0	PASS	DP=176;GPV=1;SPV=0.019622;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:66,19:28,10:38,9
+chr22	12871086	.	C	G	0	PASS	DP=208;GPV=1;SPV=0.043857;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:78,14:51,7:27,7
+chr22	12875723	.	T	A	0	PASS	DP=299;GPV=1;SPV=0.0087155;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:111,27:30,14:81,13
+chr22	12879835	.	G	A	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.01238;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:71,19:47,8:24,11
+chr22	12889651	.	G	A	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.047833;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:101,12:71,10:30,2
+chr22	12891489	.	C	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.04238;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:73,10:42,6:31,4
+chr22	13533510	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr22	15220225	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,3:6,1
+chr22	15480387	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0083426;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,7:2,1
+chr22	15562148	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,3:0,1
+chr22	15748494	.	C	A	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.042235;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:24,6:18,4
+chr22	15752140	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.044153;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,3:5,2
+chr22	15787648	.	TTG	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.033621;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:43,14:14,5:29,9
+chr22	15815076	.	C	G	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.049247;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:47,10:25,5:22,5
+chr22	15837952	.	T	TTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.026661;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,5:19,2:25,3
+chr22	15856012	.	T	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.011448;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:38,13:22,6:16,7
+chr22	15881643	.	G	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.047431;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
+chr22	16164202	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0006592;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:10,6:2,3
+chr22	16416347	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.044716;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:11,3:13,4
+chr22	16431788	.	A	AT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0025099;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:11,11:13,6
+chr22	16434619	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.011955;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:18,5:14,3
+chr22	16450533	.	C	T	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.038122;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:52,12:25,8:27,4
+chr22	17178722	.	A	AGAGTGAT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:5,3:3,4
+chr22	17343151	.	G	GT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0086626;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:9,3:7,2
+chr22	17605694	.	T	TC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:5,7:4,1
+chr22	17626325	.	A	AAAAG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,8:2,1:0,7
+chr22	18125513	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:9,4:2,1
+chr22	18188614	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048922;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:15,2:5,3
+chr22	18234348	.	A	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.051478;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:15,1:18,3
+chr22	18363031	.	G	GA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.012473;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:13,4:20,5
+chr22	18846304	.	A	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,2:3,4
+chr22	18982721	.	C	CAAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.025058;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,5:0,4:1,1
+chr22	20164469	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.035289;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:13,3:6,3
+chr22	20341553	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:1,2:4,1
+chr22	20343677	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0022919;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:44,17:21,10:23,7
+chr22	21135936	.	G	A	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.011147;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:53,6:30,3:23,3
+chr22	21166611	.	G	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,4:6,1
+chr22	21166864	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0017012;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,3:6,4
+chr22	21170330	.	G	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,1:4,5
+chr22	21313803	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:12,4:1,0
+chr22	21335516	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:12,6:11,3
+chr22	21789843	.	T	TATAACATAACATAACATAAC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.040169;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:8,1:9,3
+chr22	22517876	.	T	TAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.02002;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,7:5,2
+chr22	23331669	.	A	AATTATTATT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,7:0,4:5,3
+chr22	23855210	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.054545;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:2,2:4,1
+chr22	26451996	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:6,2:0,1:6,1
+chr22	29159124	.	G	GT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,3:6,1
+chr22	29402766	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.012187;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:10,2:3,6
+chr22	29535261	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.018778;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,6:2,1
+chr22	30076606	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.4205e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:15,6:11,7
+chr22	30308332	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.044913;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:14,8:15,1
+chr22	32505862	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0023186;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,4:7,5
+chr22	32799358	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0038291;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:11,4:9,3
+chr22	33201344	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,5:7,3:6,2
+chr22	33282639	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00017455;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:11,6:15,5
+chr22	33403962	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0014018;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:8,3:12,8
+chr22	35694644	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027592;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,4:11,2
+chr22	39018818	.	CAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:10,5:3,1
+chr22	41132286	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:1,4:3,1
+chr22	41167560	.	TTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057118;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:7,4:6,2
+chr22	41194019	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:6,2:1,4
+chr22	42666228	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013014;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
+chr22	44284901	.	T	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.052629;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:8,3:14,2
+chr22	45182623	.	G	GT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0049438;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,6:3,5:0,1
+chr22	47493701	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.4873e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,7:9,4
+chr22	49072416	.	A	AAAAAGAAG	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,4:3,3:2,1
+chr22	50021649	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0099771;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,6:2,1
+chr3	1119322	.	C	CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:4,5:3,1
+chr3	1170236	.	C	CA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,6:3,1
+chr3	1210426	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.029963;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,10:12,5:3,5
+chr3	1348241	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:4,4:6,4
+chr3	2226518	.	AATT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=7.6384e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:8,9:6,4
+chr3	2520259	.	CTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:4,2:0,2
+chr3	3339466	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.062937;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:2,4:2,1
+chr3	3762779	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:5,3:8,3
+chr3	5306469	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.02882;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,3:5,3
+chr3	8831343	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,5:3,4:0,1
+chr3	9972462	.	GAAA	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:4,5:1,1
+chr3	11294017	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,5:3,2
+chr3	12221298	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,6:4,1
+chr3	14738817	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,5:7,2:4,3
+chr3	16633137	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0066141;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,6:1,4:2,2
+chr3	18846669	.	G	GT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.046332;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,2:4,2
+chr3	19293817	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0040349;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:12,6:13,5
+chr3	20018690	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,2:10,2
+chr3	20312112	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,2:2,1:5,1
+chr3	20356709	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00069576;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:8,2:12,8
+chr3	20595413	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.2171e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:14,8:10,5
+chr3	21148171	.	A	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,3:3,1:1,2
+chr3	21193894	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0054797;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:9,6:13,3
+chr3	22380646	.	G	GGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0068755;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:10,5:6,6
+chr3	22541727	.	ATATATGTG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.030792;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:7,4:6,1
+chr3	22541750	.	CATATATATGTGTACAT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr3	22813731	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,4:1,3
+chr3	23196721	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:0,2:0,1:0,1
+chr3	23842245	.	GT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,1:7,3
+chr3	25785136	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:0,2:0,1:0,1
+chr3	27204305	.	T	TTTG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11053;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:0,0:5,2
+chr3	27884071	.	GAT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13793;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:7,2:6,1
+chr3	28255241	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.011037;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:4,4:1,2
+chr3	28649287	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.017646;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,3:9,2
+chr3	29475379	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0033004;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,15:8,6:7,9
+chr3	30034589	.	AAAGGAAGGAAGGAAGG	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:1,3:3,1
+chr3	32249030	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:1,2:1,2
+chr3	32721647	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027191;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:7,4:2,2
+chr3	35253133	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0033254;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:9,4:9,2
+chr3	35305121	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.030376;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:18,2:9,5
+chr3	36104907	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.020196;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,4:6,1
+chr3	36183915	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016738;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:10,10:4,2
+chr3	36346943	.	AG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00077087;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,3:5,4
+chr3	36515975	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,4:2,3
+chr3	40846033	.	C	CAG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,5:8,2:6,3
+chr3	42349199	.	T	TTC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0070739;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:2,3:8,5
+chr3	42349200	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:2,4:10,6
+chr3	42743587	.	T	TTATATATATATATATATATATA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0084353;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:4,4:5,1
+chr3	44723874	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,5:1,2:2,3
+chr3	45415897	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,4:1,2:0,2
+chr3	45569952	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,2:7,2
+chr3	46372541	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.039302;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,3:15,2
+chr3	46441899	.	CAGAGAG	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:10,2:7,2
+chr3	46507138	.	C	CATT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.035511;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:8,3:10,6
+chr3	50281670	.	A	AT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,3:2,1
+chr3	52718472	.	CAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:3,4:1,1
+chr3	53221115	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:3,4:0,2
+chr3	54060178	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0070234;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:3,4:3,1
+chr3	54226312	.	C	CTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.014706;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,4:2,1
+chr3	55222209	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.032887;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:7,4:17,3
+chr3	55675960	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0014155;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,3:6,4
+chr3	57054643	.	AT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,2:4,3
+chr3	57427113	.	ATATT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0052761;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:6,6:5,4
+chr3	57754987	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037959;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:7,3:4,1
+chr3	58003748	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.015516;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,4:5,3
+chr3	60895665	.	CCTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:0,2:7,4
+chr3	61900879	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=9.0511e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:11,8:6,7
+chr3	62926096	.	GAA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:14,3:7,1
+chr3	63112336	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.0035e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:11,6:9,8
+chr3	64451256	.	C	CAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048951;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,6:2,3:1,3
+chr3	64670139	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,4:4,3:7,1
+chr3	65132927	.	GA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.28173;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,4:4,2:7,2
+chr3	65346987	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=7.1534e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:11,9:12,7
+chr3	67350128	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00056247;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:8,9:9,3
+chr3	68021185	.	C	CAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:7,3:4,1
+chr3	68545006	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0007761;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,5:4,2
+chr3	70336814	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:3,4:3,1
+chr3	73203639	.	TA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.03385;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:10,2:17,3
+chr3	74391557	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:5,5:2,1
+chr3	74711393	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0012182;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:13,3:3,6
+chr3	75446337	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.079329;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:8,5:2,1
+chr3	75646619	.	G	A	0	PASS	DP=236;GPV=1;SPV=0.020742;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:109,16:54,7:55,9
+chr3	75825024	.	G	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.042449;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:54,10:33,1:21,9
+chr3	76427003	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0039305;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,2:11,4
+chr3	77039673	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.0271e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,19:6,4:9,15
+chr3	77135567	.	AT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00070906;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:10,6:4,2
+chr3	77323048	.	ATATAATATAT	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.068138;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:19,3:13,1
+chr3	78251357	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0010255;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,3:10,7
+chr3	78310783	.	GA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:12,5:2,1
+chr3	78311905	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0034481;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,4:5,3
+chr3	78941630	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.000461;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:4,4:12,5
+chr3	79519628	.	C	CAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:3,3:4,1
+chr3	79675075	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.095104;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,2:17,2
+chr3	79675076	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.11141;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,2:15,2
+chr3	80594472	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.9796e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:11,5:6,10
+chr3	82214511	.	CGT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,2:16,2
+chr3	82915520	.	A	AAT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,3:3,2
+chr3	83084765	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00081261;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:7,8:3,7
+chr3	83418140	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00011093;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:10,6:10,7
+chr3	83907471	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:1,2:2,4
+chr3	83919255	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:9,1:7,3
+chr3	84517268	.	TTATATATATATATATATATATATATATA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:2,2:2,3
+chr3	84949434	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.012068;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:6,4:9,2
+chr3	85269986	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00021136;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,7:8,2
+chr3	85515617	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.058162;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:9,2:4,2
+chr3	85651984	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.025795;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,8:8,7:5,1
+chr3	89136384	.	G	GA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:2,2:2,3
+chr3	89316505	.	A	AATAT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,5:2,4:0,1
+chr3	89411165	.	CT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0040439;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,3:7,2
+chr3	89778644	.	GTT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.07827;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:10,3:7,1:3,2
+chr3	90555751	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0059828;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,1:2,4
+chr3	90795678	.	A	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr3	90795679	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr3	90796078	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,2:0,2
+chr3	90798071	.	G	T	0	PASS	DP=777;GPV=1;SPV=0.014721;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:366:321,42:193,22:128,20
+chr3	90806513	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16089;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:17,2:3,2
+chr3	90806570	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,2:5,2
+chr3	90824580	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.071233;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:36,4:0,0
+chr3	90880190	.	C	T	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.03135;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:47,13:32,10:15,3
+chr3	90892203	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0059289;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,3:3,2
+chr3	90946611	.	A	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.046434;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:6,1:27,10
+chr3	90979496	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.042576;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:1,0:24,4
+chr3	91022659	.	C	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.047794;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:3,2:33,4
+chr3	91029637	.	A	G	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.038605;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:54,9:45,6:9,3
+chr3	91063281	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10145;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,1:0,1
+chr3	91091786	.	G	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.008448;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:6,4:44,2
+chr3	91141897	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0056194;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:1,1:8,6
+chr3	91177837	.	T	G	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.015911;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:94,13:89,12:5,1
+chr3	91205533	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.029092;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:0,0:32,4
+chr3	91218372	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.064197;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:6,1:27,3
+chr3	93591170	.	G	C	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.013747;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:104,13:100,12:4,1
+chr3	93591186	.	CT	C	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.028852;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:116,14:112,13:4,1
+chr3	94936374	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0011874;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:7,5:11,6
+chr3	95784347	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:5,4:0,1
+chr3	96171183	.	GA	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026257;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:14,3:12,2
+chr3	96518048	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00021015;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:12,7:14,6
+chr3	96983705	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.01412;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:8,5:12,2
+chr3	97879569	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.6767e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:7,9:9,4
+chr3	98427377	.	TGTGAGA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.076651;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:9,3:3,2
+chr3	100854188	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.012535;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:10,1:8,5
+chr3	101431508	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
+chr3	101440054	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.020048;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:12,4:7,4
+chr3	101930935	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,4:7,3:7,1
+chr3	103975233	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00013031;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,8:3,1
+chr3	106534734	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0013735;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:12,5:11,3
+chr3	106542761	.	TA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00026263;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,5:9,3
+chr3	106775348	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.057257;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,2:14,2
+chr3	106775349	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.029196;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:18,3:17,2
+chr3	108173766	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,8:7,4:1,4
+chr3	108958612	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=5.7534e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:11,8:6,8
+chr3	109529342	.	G	GT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0059828;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:2,2:6,4
+chr3	109529360	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0052475;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,2:7,4
+chr3	109963081	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.011174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,3:7,3
+chr3	110129439	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00017742;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:11,7:6,8
+chr3	112261530	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=9.4663e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:7,6:16,5
+chr3	113826339	.	TACAC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0011989;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,10:7,8:0,2
+chr3	113935487	.	AAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.033476;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,6:8,2
+chr3	115698281	.	AAATATAAT	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:3,1:1,1
+chr3	115698297	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
+chr3	115736864	.	C	CT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr3	115895057	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00029504;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,3:7,6
+chr3	116119672	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,6:9,5:5,1
+chr3	116350967	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00043396;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:6,6:7,5
+chr3	117315395	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.14505;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:21,4:10,1
+chr3	117979641	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.2822e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:14,7:6,7
+chr3	118392849	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.008555;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:13,3:10,3
+chr3	120118602	.	TAAAAA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.28173;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,4:5,3:6,1
+chr3	123183268	.	TTC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.032284;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,1:9,6
+chr3	123694091	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0029206;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,1:6,4
+chr3	124597073	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:1,3:0,1:1,2
+chr3	125030879	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=2.7719e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,13:7,4:9,9
+chr3	125214652	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00023483;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,15:5,9:4,6
+chr3	125712093	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00094346;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:14,4:9,4
+chr3	126891525	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00059303;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:14,3:10,6
+chr3	127244996	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.018691;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:7,4:0,2
+chr3	130001138	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.046672;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:21,3:13,1
+chr3	130639103	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=4.4247e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,18:9,10:7,8
+chr3	130986903	.	GT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,5:8,2:7,3
+chr3	131615891	.	T	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,3:3,2:2,1
+chr3	131631897	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.21557;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:16,3:10,2:6,1
+chr3	133150342	.	G	GTTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:7,6:4,1
+chr3	133449949	.	AAGAGAG	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,2:4,3
+chr3	134289297	.	A	ACAAAAAC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.030143;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:5,3:10,5
+chr3	134582164	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00034194;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:5,3:10,8
+chr3	135541930	.	GTA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.018356;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,7:7,5:6,2
+chr3	138050905	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,2:10,2
+chr3	147343399	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024176;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr3	147860263	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=4.2249e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:10,5:7,6
+chr3	148614914	.	TGAGA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:6,2:5,2
+chr3	148811068	.	A	ATCT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0041352;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:7,1:12,7
+chr3	148811069	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0004646;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:9,2:14,9
+chr3	150723292	.	TTCTTTCTTTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,5:1,3:15,2
+chr3	151174855	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00016103;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:11,8:10,8
+chr3	156590063	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00020424;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:15,10:13,3
+chr3	157005999	.	AT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.013286;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:13,4:6,3
+chr3	157071796	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:1,2:0,0:1,2
+chr3	157304038	.	T	TATATATATATATATATATATAC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.031941;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:7,2:5,4
+chr3	157674912	.	A	ATTCTTTCT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0030816;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,8:1,3:8,5
+chr3	159626255	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,2:2,1:3,1
+chr3	160137036	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,4:10,2:5,2
+chr3	167725256	.	CAAAAAAGAAAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,5:3,1
+chr3	168886414	.	TAC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:4,3:4,2
+chr3	171813199	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00015824;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:9,5:10,7
+chr3	172712727	.	CCTCTCTCT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,6:5,5:4,1
+chr3	173233574	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,6:6,3:3,3
+chr3	174348015	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,5:5,1
+chr3	174368155	.	TAAA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0085139;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:5,5:0,1
+chr3	174703303	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0048875;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,5:4,5
+chr3	175016670	.	AT	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=2.5614e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:13,5:7,7
+chr3	175016675	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0002841;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:11,5:7,7
+chr3	175232234	.	G	GAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAAGA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:4,3:2,2
+chr3	175384300	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=7.9253e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:7,4:8,10
+chr3	177540989	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,4:4,1:14,3
+chr3	177687164	.	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:4,3:4,3
+chr3	178283385	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,3:3,1
+chr3	180444297	.	CT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0012555;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:13,5:7,5
+chr3	180755577	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.025784;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,5:7,2
+chr3	180864487	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,6:1,5:1,1
+chr3	181447069	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:4,6:5,2
+chr3	183657107	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.095104;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:21,2:9,2
+chr3	183725041	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0013736;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,5:0,3:0,2
+chr3	184617395	.	GAA	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,2:2,3
+chr3	184658008	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0054348;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:5,5:3,2
+chr3	186259095	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.015379;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,5:7,1:10,4
+chr3	187137817	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00022958;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:5,9:5,6
+chr3	187137821	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.005394;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:5,8:8,2
+chr3	187303546	.	CTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.019763;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,2:6,2
+chr3	187434294	.	C	CAT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:6,1:8,4
+chr3	187434387	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037117;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:10,4:11,6
+chr3	187597736	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,7:3,4:4,3
+chr3	191463020	.	C	CTTTCTTTCTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:0,0:4,2
+chr3	192656320	.	CAGAG	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.04724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,4:5,2:2,2
+chr3	192788183	.	G	GT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,3:1,2:2,1
+chr3	193264511	.	C	CT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0083293;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,11:10,6:5,5
+chr3	194011714	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.012914;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:7,6:4,2
+chr3	194866663	.	GTATATATATA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:7,4:1,2
+chr3	195728090	.	T	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.042229;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:52,16:25,9:27,7
+chr3	195746888	.	G	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.039792;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:48,10:24,7:24,3
+chr3	195983454	.	A	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.028926;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:6,1:39,5
+chr3	197623223	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.03191;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,6:8,3
+chr3	197827646	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.711e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:10,6:9,8
+chr4	16009	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.021504;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:19,4:10,4
+chr4	41218	.	T	C	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.015504;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:98,13:43,6:55,7
+chr4	45414	.	A	C	0	PASS	DP=304;GPV=1;SPV=0.028326;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:137,21:60,7:77,14
+chr4	49031	.	G	C	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.040434;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:84,13:43,7:41,6
+chr4	49132	.	G	C	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.046495;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:76,12:40,5:36,7
+chr4	59576	.	A	G	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.018653;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:116,18:64,7:52,11
+chr4	62314	.	G	C	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.0081263;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:97,17:40,12:57,5
+chr4	1283150	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,2:9,2
+chr4	1296586	.	G	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027154;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:7,1:9,4
+chr4	1860669	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
+chr4	3580444	.	T	TCATCCATCCATCCATC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:6,2:12,2
+chr4	4010099	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0032628;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,7:3,1
+chr4	5441527	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0079024;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:8,7:9,7
+chr4	8409607	.	T	TGC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.030844;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,3:8,2
+chr4	8626671	.	G	GT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:16,3:1,1
+chr4	10610050	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,4:3,1
+chr4	10786561	.	G	GT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,3:2,1
+chr4	11305451	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.013369;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:1,3:1,3
+chr4	14012406	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.08867;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
+chr4	14471731	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.055222;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,3:12,1
+chr4	14548401	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00017105;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:10,8:6,3
+chr4	15722592	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:10,7:2,3
+chr4	17404560	.	CAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:9,3:1,1
+chr4	17448183	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,7:2,5:1,2
+chr4	17925890	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,3:0,1:2,2
+chr4	18948670	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0015903;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:12,5:9,4
+chr4	19324347	.	AT	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00012761;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:14,7:9,7
+chr4	20211809	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.095143;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,3:18,1
+chr4	22181677	.	CATAG	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.014502;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,4:5,3
+chr4	22872559	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:6,4:0,1
+chr4	24122385	.	A	ATG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0046348;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,6:3,2
+chr4	25046334	.	TACACACAC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.008413;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,7:4,1:0,6
+chr4	25453947	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.014049;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,1:5,4
+chr4	25679119	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.011461;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:15,3:6,3
+chr4	25808836	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,3:7,1
+chr4	26244317	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:4,2:10,2
+chr4	26590809	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024176;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,3:6,1
+chr4	27108120	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:4,7:5,3
+chr4	27792425	.	C	CAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,4:5,1
+chr4	27799164	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00059303;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:12,7:12,2
+chr4	29733016	.	GTT	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.040563;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:22,2:14,3
+chr4	29965622	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00061478;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:7,7:7,3
+chr4	32641732	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=1.8212e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,15:1,10:6,5
+chr4	32671096	.	AC	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0028593;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,4:3,5
+chr4	32717008	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0029614;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:1,6:6,3
+chr4	35152970	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.01548;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,6:3,1:1,5
+chr4	35233969	.	G	GTA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0010229;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,10:8,4:6,6
+chr4	35312910	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=8.0398e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:11,5:12,6
+chr4	35468056	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.022198;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:6,3:10,6
+chr4	38087862	.	AG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.011037;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:0,4:5,2
+chr4	38438950	.	G	GA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.021719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:8,6:9,7
+chr4	38718049	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.974e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:11,10:12,7
+chr4	39179952	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.8896e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:7,4:9,10
+chr4	39789185	.	G	GA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0070165;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:8,7:5,1
+chr4	40481486	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0067079;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:0,3:3,4
+chr4	41343610	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00014652;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:7,7:3,8
+chr4	42555146	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,2:8,2
+chr4	43503790	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=5.6363e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:4,6:9,6
+chr4	43758095	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0021846;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,10:3,5:5,5
+chr4	43846701	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00057502;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:3,15:3,7:0,8
+chr4	44121593	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=5.8313e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:7,5:6,7
+chr4	44349071	.	G	GCCA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00025277;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,3:4,7
+chr4	44987638	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027592;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:14,2:7,4
+chr4	46100707	.	G	GA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:1,7:1,6:0,1
+chr4	48393386	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,7:3,4:3,3
+chr4	48823432	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.001147;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:7,5:12,6
+chr4	48943952	.	TAA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.073823;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:6,2:13,3
+chr4	49150033	.	G	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.042547;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,2:6,3
+chr4	49158494	.	C	T	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.038593;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:77,14:40,7:37,7
+chr4	49159235	.	G	A	0	PASS	DP=187;GPV=1;SPV=0.024688;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:78,10:24,1:54,9
+chr4	49184579	.	A	C	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.029498;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:24,6:20,7
+chr4	49195425	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.013575;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:55,7:34,4:21,3
+chr4	49226686	.	C	T	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.017843;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:82,17:46,14:36,3
+chr4	49241359	.	G	A	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.013299;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:63,12:35,6:28,6
+chr4	49241573	.	G	C	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.045618;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:51,13:21,9:30,4
+chr4	49246982	.	C	T	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.0048956;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:60,12:25,10:35,2
+chr4	49252716	.	T	A	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.011007;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:75,17:36,8:39,9
+chr4	49261767	.	T	A	0	PASS	DP=323;GPV=1;SPV=0.028096;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:139,19:66,6:73,13
+chr4	49263781	.	A	C	0	PASS	DP=236;GPV=1;SPV=0.0034993;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:107,13:59,6:48,7
+chr4	49273073	.	A	C	0	PASS	DP=640;GPV=1;SPV=0.018305;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:295:254,41:130,20:124,21
+chr4	49490706	.	G	A	0	PASS	DP=483;GPV=1;SPV=0.022536;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:244:211,33:118,15:93,18
+chr4	49497096	.	G	GAT	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.038776;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:22,4:22,1
+chr4	49520640	.	TAGGGTTGGATTAGTGTGAGGGTG	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:21,4:1,0
+chr4	49543512	.	C	T	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.0083518;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:152,17:34,6:118,11
+chr4	49585249	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0048935;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:11,8:8,7
+chr4	49612408	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.031714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:14,10:18,2
+chr4	49714997	.	C	T	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.0051851;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:47,9:33,1:14,8
+chr4	50007021	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:23,4:0,0
+chr4	50273970	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.037745;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:17,2:20,3
+chr4	50413448	.	G	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr4	50463635	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.045508;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:4,3:15,1
+chr4	50481840	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.030747;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:2,1:17,4
+chr4	50723811	.	C	T	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.031484;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:52,14:23,10:29,4
+chr4	51016099	.	C	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr4	51292859	.	A	T	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.0074367;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:50,16:26,6:24,10
+chr4	52528380	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,3:2,1:2,2
+chr4	52835837	.	TA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0062713;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:2,6:1,4:1,2
+chr4	54654426	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.068312;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:18,2:13,2
+chr4	55170346	.	TG	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.058895;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:11,3:11,2
+chr4	55375916	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.33939;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,3:5,3:0,0
+chr4	55604679	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.016968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:2,3:2,3
+chr4	55761557	.	T	TATATATATACAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,7:9,4:6,3
+chr4	56609050	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01473;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,4:6,5
+chr4	56721176	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,4:6,2:1,2
+chr4	56750279	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,5:2,3:6,2
+chr4	56898314	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.35897;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,2:4,1:2,1
+chr4	57672617	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0034711;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:10,7:11,3
+chr4	59362900	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=2.7606e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:10,4:5,7
+chr4	59604543	.	CCTCTCT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,8:2,5:5,3
+chr4	61596005	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=4.8434e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,15:7,9:4,6
+chr4	63262848	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.002076;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:13,4:5,4
+chr4	63539399	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0027222;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:11,7:9,2
+chr4	64460069	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00012961;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:10,8:10,4
+chr4	64669447	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.014275;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,5:4,3
+chr4	65229314	.	G	GA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0054264;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:16,4:9,4
+chr4	66352614	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=9.6988e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:10,6:8,6
+chr4	66786246	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:0,2:0,2:0,0
+chr4	68764743	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=5.4752e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:8,5:12,8
+chr4	68870508	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,3:1,2
+chr4	70100946	.	G	GA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018436;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,8:7,5:4,3
+chr4	71577684	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.007849;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:8,5:4,5
+chr4	72532492	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,4:7,3:16,1
+chr4	73318657	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.043422;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:1,2:16,4
+chr4	73785611	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,9:2,7:4,2
+chr4	73861691	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0041113;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:8,3:2,3
+chr4	76316900	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,6:3,5:1,1
+chr4	76424292	.	T	TA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0073297;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:5,6:4,1
+chr4	77103258	.	CATATAT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,9:3,7:1,2
+chr4	77753902	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:5,3:4,1:1,2
+chr4	78040335	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00079368;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:12,7:11,7
+chr4	78081067	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.5057e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:4,9:14,9
+chr4	78968710	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12821;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,2:3,2:0,0
+chr4	81307689	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0024472;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:7,6:1,1
+chr4	81533599	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:4,4:3,1
+chr4	82702130	.	CTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,3:2,2
+chr4	82809422	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0060573;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:0,4:4,3
+chr4	82947233	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:4,4:1,3
+chr4	83182848	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016795;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,1:5,6
+chr4	83634132	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,3:7,1
+chr4	83893982	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,1:6,4
+chr4	84078144	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034789;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:7,4:12,1
+chr4	87542730	.	TCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:4,1:10,6
+chr4	87616352	.	CAGCAATGAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1039;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,3:11,2:3,1
+chr4	87774476	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.012656;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:19,4:14,3
+chr4	90083296	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:6,7:5,2
+chr4	90854409	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.001818;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,2:8,4
+chr4	90942828	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00011829;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:7,4:10,8
+chr4	91041659	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00013428;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,3:10,7
+chr4	92336954	.	G	GTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,4:4,3:3,1
+chr4	92588678	.	CAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.032107;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
+chr4	92911766	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00012227;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:7,6:4,6
+chr4	95047250	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00039828;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:7,3:12,6
+chr4	96629329	.	T	TATTA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=3.2748e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:4,4:9,7
+chr4	97072239	.	TAA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,6:5,2
+chr4	97589537	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=1.2409e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:11,7:3,8
+chr4	97793370	.	T	TAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.021576;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,4:3,3
+chr4	98437791	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:10,7:10,2
+chr4	99879799	.	C	CCTA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.025971;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,3:6,4
+chr4	99879808	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.014276;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,1:7,4
+chr4	100378940	.	TTTTCC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,7:0,6:3,1
+chr4	100749881	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.4158e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:11,6:3,5
+chr4	100794963	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.043956;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,9:0,4:3,5
+chr4	101582055	.	G	GAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:6,5:7,2
+chr4	101748749	.	A	ATG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:8,4:12,6
+chr4	101748762	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024122;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,2:11,4
+chr4	104853700	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.3091e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:13,10:10,4
+chr4	105406114	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0028986;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:5,6:2,2
+chr4	108247355	.	CATATATATATATATATAT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:6,2:1,2
+chr4	111402103	.	TA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0021401;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:7,5:14,2
+chr4	112204072	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0011989;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:4,8:3,2
+chr4	114791514	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022078;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,3:11,3
+chr4	115463073	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.7718e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:14,20:9,13:5,7
+chr4	116204797	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,4:5,4
+chr4	118563314	.	G	GT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.023838;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
+chr4	119769356	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0012565;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:12,5:11,6
+chr4	120224633	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.00058257;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,12:3,7:4,5
+chr4	120489546	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0048426;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:14,3:7,5
+chr4	120644181	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,3:15,1
+chr4	123373069	.	T	TAAAGAAAG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:3,4:6,2
+chr4	125249246	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.8879e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:5,4:12,7
+chr4	128563468	.	GTT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.036526;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,2:3,2
+chr4	128731300	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,2:2,2
+chr4	130360918	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=7.3464e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:5,4:14,7
+chr4	130720455	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:11,7:7,4:4,3
+chr4	131674287	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0053469;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:15,2:9,5
+chr4	131745978	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
+chr4	132042003	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=2.4323e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:5,10:9,5
+chr4	132205992	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00068948;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:15,6:9,7
+chr4	132438919	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0086626;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:9,3:7,2
+chr4	133731278	.	CAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:7,4:4,1
+chr4	134669019	.	C	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016117;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,3:5,1
+chr4	134774594	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.9466e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:11,9:9,7
+chr4	135597776	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0014466;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,5:10,2
+chr4	136057133	.	C	CGT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,9:10,3:4,6
+chr4	139572216	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,2:10,2
+chr4	140901671	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0016174;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:10,4:13,5
+chr4	141101739	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.2414e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:13,5:5,7
+chr4	141956697	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.028465;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:10,4:15,1
+chr4	142579879	.	G	GTAGGTAGATAGA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,5:9,3:7,2
+chr4	143880094	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026257;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:11,1:15,4
+chr4	144158703	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,1:7,3
+chr4	144473366	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021523;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,8:9,4:3,4
+chr4	145706808	.	A	AT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048875;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,6:7,2
+chr4	145864420	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,10:8,8:2,2
+chr4	149102144	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:11,4:2,1
+chr4	150148381	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.032805;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:4,8:7,2
+chr4	150228159	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00038673;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:2,3:12,4
+chr4	150818532	.	C	CTG	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023594;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:15,6:10,5
+chr4	151074116	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00012852;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,4:7,5
+chr4	151328963	.	CAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0037445;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,4:1,1
+chr4	151697953	.	GTATATATA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12821;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,2:0,1:3,1
+chr4	151811965	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:1,2:3,4
+chr4	155015980	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:8,4:5,1
+chr4	156851930	.	CAAAAAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0055469;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,7:5,1
+chr4	157277890	.	GTA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.050152;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:8,1:12,3
+chr4	160193329	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0012507;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:3,5:6,7
+chr4	163883259	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027778;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:0,2:0,0:0,2
+chr4	163883260	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:0,2:0,0:0,2
+chr4	164754450	.	ACT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043486;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,3:9,2
+chr4	164854493	.	AT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:7,3:11,2
+chr4	165254553	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.036638;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:13,2:14,5
+chr4	165289509	.	G	GT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0016314;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,5:3,3
+chr4	166666435	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.051138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,3:10,2
+chr4	167111783	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=3.2263e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:8,5:7,9
+chr4	168386575	.	G	GAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0060713;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:10,11:4,2
+chr4	169787292	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.040231;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:16,4:13,3
+chr4	169985113	.	TATCTATCAATC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.025825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:7,4:9,5
+chr4	175484848	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:3,1:1,1
+chr4	175706655	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.0101e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:8,8:8,7
+chr4	176056801	.	C	CAATA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.028555;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:5,2:13,6
+chr4	176204540	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022727;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:6,4:7,1
+chr4	176500213	.	T	TCACACA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.024154;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:6,2:3,3
+chr4	176570483	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,3:9,1
+chr4	176617441	.	T	TATTCCCATTTTAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.043842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,6:4,3:8,3
+chr4	176617455	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.040085;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,5:4,2:6,3
+chr4	177002018	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:1,4:0,2:1,2
+chr4	177410391	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.010741;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:14,4:3,3
+chr4	178835888	.	AT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012829;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:11,4:6,3
+chr4	179560034	.	T	TAAAAAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00053043;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,14:5,9:3,5
+chr4	179974374	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01204;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:4,4:3,1
+chr4	180011122	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=4.702e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:12,8:6,7
+chr4	181253700	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.045508;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:12,3:7,1
+chr4	181789218	.	A	ATTTATTTTAT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.044727;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:11,4:15,5
+chr4	182125139	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,2:4,3
+chr4	182223783	.	C	CAAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,5:4,3:4,2
+chr4	183374863	.	AAT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.05832;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:14,3:9,3
+chr4	184005474	.	A	AAAAAAC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,4:9,6
+chr4	184814290	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.025944;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:6,6:3,1
+chr4	185453543	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,4:3,2
+chr4	186476636	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,3:14,1
+chr4	187427448	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:4,2:1,1:3,1
+chr4	187939899	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00057914;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:6,7:9,4
+chr4	187991036	.	T	TAAAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.035323;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:11,3:4,5
+chr4	187996987	.	GGGAGCATGGAGCATGGAGCGTGGAGCGT	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,1:9,3
+chr4	188270847	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0015991;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,10:10,9:12,1
+chr4	188797423	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.513e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:9,9:14,4
+chr4	188801720	.	T	TTTTATTTATTTA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.036129;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,9:7,7:7,2
+chr4	189686678	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.042825;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:9,3:2,1
+chr4	189691776	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.042478;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:14,1:16,5
+chr4	189787161	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.018404;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,5:4,4:7,1
+chr4	189808046	.	CACACACACACACACACATACAT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.13236;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:15,3:8,4
+chr4	190053653	.	T	A	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.0093712;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:83,14:32,5:51,9
+chr5	710573	.	C	CTG	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.10169;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:18,3:17,2
+chr5	1076411	.	C	CATCCTGTGACCA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.020644;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,9:6,3:7,6
+chr5	2580934	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:0,0:7,4
+chr5	2907358	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,2:6,2
+chr5	4107442	.	G	GA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.032072;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:18,5:7,1
+chr5	4258666	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,2:5,2:0,0
+chr5	4326862	.	C	CCT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.040404;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:5,1:8,3
+chr5	4479231	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00014249;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:6,6:10,7
+chr5	4825300	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=5.9839e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:7,4:5,7
+chr5	4912782	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:14,3:1,1
+chr5	5908876	.	CTATTTTATTTTATTTTATTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.038556;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:5,4:8,2
+chr5	5925042	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,3:6,1
+chr5	6751444	.	G	GCTTTTCAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,3:5,4
+chr5	7207044	.	T	TTCC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:2,3:7,2
+chr5	11081086	.	A	ACACACACACACACACACACT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,4:14,1:6,3
+chr5	11441368	.	ATTT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
+chr5	12166540	.	A	AAAAG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:8,3:3,2
+chr5	12348504	.	GT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,4:3,1
+chr5	13921475	.	TCA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.027424;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:5,1:12,6
+chr5	13921481	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0026248;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,8:1,2:4,6
+chr5	15255713	.	G	GA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0013843;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:14,4:2,3
+chr5	15993627	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.6656e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:19,6:9,8
+chr5	16905836	.	C	CA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.15e-06;SS=2;SSC=53;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:8,5:6,6
+chr5	16912802	.	G	GCA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:7,5:2,1
+chr5	16948192	.	A	ATT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,10:2,3:2,7
+chr5	17048058	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:32:0,4:0,2:0,2
+chr5	17517981	.	A	G	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.0039287;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:65,20:25,10:40,10
+chr5	17520616	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.084652;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:3,0:32,4
+chr5	17520622	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.11412;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:3,0:32,4
+chr5	18898273	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.4825e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:10,6:8,7
+chr5	19142888	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.0255e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:15,8:15,6
+chr5	21880592	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:1,0:12,4
+chr5	22696370	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.04287;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,9:9,8:6,1
+chr5	22885764	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,2:10,2
+chr5	23093753	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=2.5256e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:10,11:6,4
+chr5	23715625	.	ATATAATATATATATATATATAT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:6,1:0,3
+chr5	23818651	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=5.7558e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:11,9:13,6
+chr5	24362633	.	G	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,2:3,1:2,1
+chr5	24449752	.	GTATATATATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.049774;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:4,3:2,3
+chr5	25931554	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,3:2,3
+chr5	26298904	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.36264;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,4:3,1:5,3
+chr5	26933496	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.9242e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:14,12:10,5
+chr5	27327781	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,7:5,4:4,3
+chr5	27560009	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:9,5:0,1
+chr5	27656828	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.5302e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:17,6:5,6
+chr5	28127451	.	AG	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.1474e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:12,7:6,5
+chr5	28138339	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0016259;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:18,4:10,6
+chr5	28440136	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.3183e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:5,7:14,6
+chr5	29223416	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0011582;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:15,4:4,4
+chr5	30155111	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00043265;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:10,5:7,5
+chr5	30655965	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=8.6537e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:12,5:5,7
+chr5	31199444	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.03185;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:2,3:10,2
+chr5	33073496	.	GTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,6:2,4:7,2
+chr5	34401085	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,1:6,6
+chr5	34530037	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0015209;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:7,6:10,3
+chr5	35294767	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:1,5:8,5
+chr5	37105334	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,5:6,4:7,1
+chr5	38134496	.	AGAG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011437;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
+chr5	38272776	.	GTC	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.10026;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:16,3:17,2
+chr5	39053890	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.028335;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,7:6,6:4,1
+chr5	39333595	.	C	CCCTTTCCATG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.025519;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:2,4:6,2
+chr5	39478507	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.20035;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:12,1:10,2
+chr5	42448845	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0021725;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,3:6,4
+chr5	43088211	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.036676;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:13,2:4,2
+chr5	43681259	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:6,7:3,2
+chr5	44209224	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0024409;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:6,8:1,1
+chr5	44868214	.	AT	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.091905;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,1:16,4
+chr5	46627803	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.007849;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:6,6:6,4
+chr5	46693227	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:1,1:9,3
+chr5	46772267	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,2:3,2
+chr5	47048025	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.093168;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:8,3:6,1:2,2
+chr5	47183378	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045519;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,4:8,1
+chr5	50134813	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.022618;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:5,2:15,3
+chr5	50140509	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:51,9:8,3:43,6
+chr5	50142018	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0083637;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:8,2:23,4
+chr5	50353017	.	A	AGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0737;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:9,5:6,1
+chr5	51703098	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=1.3217e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:5,4:2,6
+chr5	54275851	.	A	AT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031354;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,9:6,3:9,6
+chr5	54749468	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:5,6:2,2
+chr5	55249182	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:4,6:1,1
+chr5	61756494	.	G	GGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.041183;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,8:12,4:8,4
+chr5	64208956	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=7.064e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:10,5:11,8
+chr5	65559630	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.22807;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,4:8,1:3,3
+chr5	66113763	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:5,3:1,1
+chr5	67280831	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00024201;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:9,7:2,5
+chr5	67984149	.	T	TAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0057971;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:7,7:1,1
+chr5	68648681	.	A	ACATGGGTATTTTCGCAGCTTCC	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0081402;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,10:9,5:8,5
+chr5	69092095	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.042367;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,8:16,5:13,3
+chr5	71442703	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11839;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,3:15,1
+chr5	72008798	.	GA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0018707;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:11,7:7,2
+chr5	73449741	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:6,4:2,1
+chr5	76182959	.	CAGAG	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:1,2:0,1:1,1
+chr5	77335532	.	G	GGTGTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.032417;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,2:3,6
+chr5	77466806	.	A	ATT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01322;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,6:4,2
+chr5	77694855	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=6.5361e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:11,4:7,9
+chr5	78904685	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,5:5,2
+chr5	79137077	.	T	TGAATATA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028936;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr5	79566669	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:15,2:7,2
+chr5	80224133	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,9:4,7:3,2
+chr5	80275747	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,2:4,2
+chr5	81296613	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,3:4,1
+chr5	82534451	.	GT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00019163;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:11,10:5,2
+chr5	82661949	.	AAGAG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.012445;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:9,7:3,3
+chr5	84374197	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=1.6358e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:5,7:0,3
+chr5	84934274	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:8,7:5,2
+chr5	85443188	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=4.3264e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:6,8:7,7
+chr5	85994895	.	AT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,2:10,3
+chr5	88132228	.	A	ATAAACTAATTATACAATTAGTTTAT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.024679;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,5:6,1
+chr5	88464585	.	GA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=1.784e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,5:4,4
+chr5	88904619	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.018514;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:15,1:5,4
+chr5	92309593	.	T	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.0254e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:13,10:7,4
+chr5	94954147	.	C	CAA	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,1:1,3
+chr5	95009056	.	AAGAGAG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,5:5,4:0,1
+chr5	95263507	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.015665;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:14,2:11,6
+chr5	98901749	.	T	TA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0050264;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:5,9:8,3
+chr5	99027283	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0002652;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:8,6:1,4
+chr5	99523029	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.025471;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:22,3:22,10
+chr5	101502647	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,2:1,2:0,0
+chr5	105295049	.	TA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0027511;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,12:12,9:4,3
+chr5	105678880	.	AT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00023971;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:5,3:6,7
+chr5	107194847	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0019836;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,11:8,8:1,3
+chr5	107649910	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00090534;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:6,8:6,4
+chr5	109353445	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1039;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,3:7,1:7,2
+chr5	110128036	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00010989;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:14,10:10,7
+chr5	110620577	.	ATCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.2419;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:4,1:10,3
+chr5	117203277	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.057257;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,2:14,2
+chr5	117366735	.	TTATATA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.26374;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,3:4,2:3,1
+chr5	118438718	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,1:3,3
+chr5	118543049	.	GTGTATATGTATTAC	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:2,2:8,2
+chr5	118543768	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:4,6:2,4
+chr5	118577937	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.021523;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,4:3,4
+chr5	120048898	.	ATCCTATG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022127;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
+chr5	120048914	.	CTA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.018737;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,4:6,1
+chr5	120048956	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.073359;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,3:7,1
+chr5	120195278	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,2:3,7
+chr5	121343977	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,5:7,2:3,3
+chr5	121493096	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0092138;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,7:8,1:6,6
+chr5	122128378	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.022595;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,4:6,2
+chr5	124521954	.	A	AC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0067861;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:1,2:10,7
+chr5	125216989	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.014912;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:10,5:7,3:3,2
+chr5	126721755	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.1839;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,5:5,2:7,3
+chr5	127930227	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,4:10,2:10,2
+chr5	128915495	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00022655;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:6,13:3,7:3,6
+chr5	129436180	.	C	CT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00051949;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:9,2:12,7
+chr5	129816655	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.029646;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:8,6:11,3
+chr5	130538347	.	G	GA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03285;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,5:5,1
+chr5	130540752	.	TACACAC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,8:3,2:1,6
+chr5	130765983	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.152e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:11,6:7,10
+chr5	132328823	.	TTATATA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.040085;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:6,2:4,3
+chr5	136513473	.	GAA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.039737;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,4:3,1
+chr5	137518612	.	AAAGAAAG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.00035367;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:4,4:0,2
+chr5	138267188	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:6,6:5,1
+chr5	138433114	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:2,4:3,2
+chr5	138772864	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.009553;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,2:4,5
+chr5	139717201	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0016927;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:12,6:9,5
+chr5	139826200	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0031706;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:11,4:11,5
+chr5	140707351	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00059971;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:5,5:9,4
+chr5	141395556	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.049216;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,5:10,3
+chr5	141989692	.	CAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10526;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,10:4,9:3,1
+chr5	142306913	.	C	CAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.029368;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:9,6:7,1
+chr5	142311564	.	TTTGTTGTTGTTGTTG	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00072806;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,11:3,7:2,4
+chr5	142392104	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,4:2,3:2,1
+chr5	142498760	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0017818;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,3:4,6
+chr5	144256615	.	TTG	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00014241;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,6:10,4
+chr5	146174144	.	TAA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0040793;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:0,6:0,5:0,1
+chr5	146239484	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,2:5,6
+chr5	148212480	.	TTA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0033988;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,2:6,5
+chr5	148233325	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048922;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:9,3:11,2
+chr5	148547566	.	T	TA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10123;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,2:10,2
+chr5	148560205	.	TA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.062683;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:14,3:2,2
+chr5	148945971	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0089978;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:9,6:4,4
+chr5	149598777	.	GAT	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,2:1,1:1,1
+chr5	151764045	.	TATATATA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,4:0,3:1,1
+chr5	151971915	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00084999;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:13,8:8,2
+chr5	153098547	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00016168;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,5:10,5
+chr5	154525165	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=8.2514e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:7,11:11,8
+chr5	154525791	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00058707;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:0,5:9,6
+chr5	154574640	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.012894;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,1:11,5
+chr5	155528491	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0046429;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,2:6,4
+chr5	156298576	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,5:1,1
+chr5	156307555	.	G	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:2,2:1,2
+chr5	156981160	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,5:5,2:7,3
+chr5	157490891	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,8:8,7:1,1
+chr5	157607172	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,5:4,4:1,1
+chr5	158310000	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr5	159241128	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.059824;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:6,2:16,2
+chr5	159579503	.	G	GTGTATATA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,7:2,6:1,1
+chr5	160009597	.	C	CATAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.020191;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:9,5:7,5
+chr5	162316689	.	C	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.041563;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
+chr5	164834924	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.049123;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,3:1,1:4,2
+chr5	165595663	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0079657;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,4:7,2
+chr5	166085665	.	TAGAAGAATCTAACTAGAG	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.01794;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,3:6,5
+chr5	167101939	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,6:6,1
+chr5	168374065	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,4:3,3:4,1
+chr5	168548035	.	T	TACACACACACAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0024977;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,6:4,2
+chr5	169026345	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.5269e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:13,8:11,8
+chr5	170636716	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.8479e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,4:8,7
+chr5	173289783	.	CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,1:7,3
+chr5	174950954	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:10,4:1,0
+chr5	175929273	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.029194;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:11,7:11,2
+chr5	175955410	.	G	C	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.049555;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:28,6:16,7
+chr5	176072362	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.040785;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:12,8:23,3
+chr5	176076559	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0311;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:15,1:10,4
+chr5	176089142	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.092709;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:16,1:16,3
+chr5	176104048	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.011566;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:11,2:21,5
+chr5	176231512	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.029148;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:10,1:4,7
+chr5	176873132	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.032243;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:11,3:2,1
+chr5	177838191	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11923;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:20,1:16,3
+chr5	177890659	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0026931;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:3,5:11,6
+chr5	178002192	.	CCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,4:1,0:14,4
+chr5	178731336	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00044686;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,13:2,5:8,8
+chr5	178854098	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0005304;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:2,8:8,2
+chr5	179003538	.	AT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.051834;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,1:10,3
+chr5	179077809	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0086957;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,4:2,3
+chr5	180233038	.	A	AACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,5:5,3:2,2
+chr5	181169685	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.057399;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:20,2:13,2
+chr6	325357	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:2,2:11,3
+chr6	857841	.	TCGATCCAC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
+chr6	1521364	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.08111;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,2:11,2
+chr6	3298769	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.8219e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:7,12:11,6
+chr6	4756590	.	G	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.19341;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:14,2:17,2
+chr6	5304618	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00021682;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:9,8:4,8
+chr6	6796626	.	ATT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:9,2:3,2
+chr6	6855132	.	C	CAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0041602;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,8:6,5:4,3
+chr6	7418032	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00097732;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,4:10,4
+chr6	8567230	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.039341;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
+chr6	9159529	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,4:0,1:0,3
+chr6	11259935	.	A	AACACACACACACACAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.031608;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,4:6,3
+chr6	11776926	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0078236;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
+chr6	11931079	.	G	GGAGA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.047842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:7,2:9,2
+chr6	12001582	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,2:4,1:3,1
+chr6	13799827	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:3,5:2,1
+chr6	14947393	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,7:2,4:2,3
+chr6	15404519	.	GCACA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:2,5:3,1
+chr6	16933294	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00026567;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:11,5:8,5
+chr6	17587129	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.017571;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,2:5,7
+chr6	18492372	.	AAAC	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037638;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:12,6:4,3
+chr6	19618705	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00095695;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,3:4,4
+chr6	20472025	.	A	AACACACACAC	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.20979;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:4,3:2,1
+chr6	20936241	.	A	AT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:7,5:0,1
+chr6	21909773	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,1:5,4
+chr6	21909776	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,1:6,3
+chr6	24327451	.	A	AAGTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0017164;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:6,5:11,6
+chr6	24624012	.	G	GTTTTC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.11976;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,4:6,1
+chr6	24967909	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,5:2,3
+chr6	25853406	.	GT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:7,4:2,1
+chr6	26913994	.	G	GAGAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038306;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:5,1:11,5
+chr6	27265641	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.01269;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,2:5,3
+chr6	27561063	.	TC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,2:4,5
+chr6	27646781	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,1:7,3
+chr6	28063651	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,5:3,4:2,1
+chr6	30382634	.	A	AAATAATAATAATAATAAT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.073845;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:13,3:13,3
+chr6	31168238	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.027999;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,2:5,6
+chr6	31428117	.	TATTC	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:0,1:4,1
+chr6	31722845	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,8:8,7:2,1
+chr6	32044978	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.018384;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:12,5:15,5
+chr6	36496043	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,3:5,4
+chr6	36549329	.	CTCT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,9:0,2:6,7
+chr6	36777773	.	CA	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:0,1:3,4
+chr6	37464892	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0019606;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:9,7:6,7
+chr6	39281122	.	G	GTT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.011209;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:23,2:7,7
+chr6	42640399	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0066302;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:11,7:4,5
+chr6	42974448	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021256;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:3,5:7,1
+chr6	43294524	.	T	TCAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:8,3:9,1
+chr6	43460695	.	A	ATT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0012227;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:15,9:8,4
+chr6	45958424	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:1,7:1,4:0,3
+chr6	46941470	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.028266;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:15,4:5,2
+chr6	49280081	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00056171;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:16,6:12,7
+chr6	49297543	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00036855;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:13,4:5,6
+chr6	52172643	.	AAAGAAAGG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0094161;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,3:5,4
+chr6	52880731	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.0412e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:9,6:7,8
+chr6	52945464	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0073133;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:11,3:10,3
+chr6	53323576	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.012217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,7:0,5:2,2
+chr6	53821879	.	GT	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01204;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,5:5,4:2,1
+chr6	54210730	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,5:6,3:5,2
+chr6	54520748	.	A	AACAC	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.026985;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:11,5:7,4
+chr6	54552173	.	A	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:4,1:1,1
+chr6	56595997	.	ACTTT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15115;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:9,1:20,3
+chr6	56706326	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,4:6,1:8,3
+chr6	57252437	.	G	GCCT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.0995e-06;SS=2;SSC=59;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:8,7:6,8
+chr6	58194425	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00060405;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,5:10,3
+chr6	58924430	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.074026;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:14,4:1,0
+chr6	60295723	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.5356e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,17:10,4:10,13
+chr6	60417585	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,2:4,2
+chr6	60944908	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.864e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:11,10:8,7
+chr6	61210112	.	CAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:3,3:4,3
+chr6	64697953	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.003938;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,7:7,2:14,5
+chr6	65293726	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=2.5502e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:11,10:8,7
+chr6	66148255	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.6321e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:8,9:9,6
+chr6	67293929	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.080441;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,5:8,3:15,2
+chr6	67293930	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.05384;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,5:9,3:12,2
+chr6	67293931	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.073823;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,5:9,3:10,2
+chr6	67442154	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,2:8,7
+chr6	69219487	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:1,2:3,2
+chr6	69532257	.	CTCTG	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,5:9,3
+chr6	69888777	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,6:6,4:3,2
+chr6	70271703	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=7.3475e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:12,7:12,9
+chr6	70652449	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0033618;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:5,8:2,2
+chr6	70873403	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00013918;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:12,7:16,6
+chr6	71315288	.	T	TATATATATATATATATCCA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:6,4:3,5
+chr6	72895114	.	TA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:3,5:3,2
+chr6	73673929	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.00010562;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:2,2:1,6
+chr6	74031899	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=3.2589e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:10,7:13,6
+chr6	75944917	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,2:0,1:1,1
+chr6	76171460	.	T	TTTA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:1,2:0,2
+chr6	77706329	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00012791;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,5:8,6
+chr6	78087069	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.012665;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:11,3:8,3
+chr6	78117123	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.158e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:6,8:9,2
+chr6	79102143	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.013043;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,6:4,1:4,5
+chr6	81776487	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:6,7:0,1
+chr6	82919438	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.001632;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,3:5,8
+chr6	84249054	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0034481;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:5,2:8,5
+chr6	84402981	.	CAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:2,3:4,4
+chr6	84491047	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,8:1,5:1,3
+chr6	84995233	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.017466;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:8,1:12,6
+chr6	85023514	.	T	TAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:6,2:4,2
+chr6	85654481	.	CAA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:1,4:2,2
+chr6	87128727	.	ATCATATG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:1,3:9,7
+chr6	90323992	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:5,1:12,3
+chr6	91172037	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:1,6:1,5:0,1
+chr6	91436194	.	TTGTG	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,8:2,5:2,3
+chr6	93168016	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.037288;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:12,7:6,2
+chr6	93556958	.	A	ATG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,2:2,2
+chr6	93699539	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0034395;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:7,5:10,3
+chr6	94335781	.	G	GAGAT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,1:10,3
+chr6	96100250	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,2:5,1:2,1
+chr6	97976066	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00029607;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:13,7:6,4
+chr6	98359516	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1129;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,3:7,2:6,1
+chr6	99385976	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0063768;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,6:3,2
+chr6	100074033	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00050477;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:10,7:12,3
+chr6	102373125	.	AAT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0039611;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,13:8,4:12,9
+chr6	102726156	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00013031;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,3:3,6
+chr6	102763104	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.9968e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:13,10:8,4
+chr6	102790516	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0010576;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:5,2:13,7
+chr6	104394911	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00069928;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:9,5:12,6
+chr6	105886762	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,5:7,2:2,3
+chr6	106517435	.	C	CACACATATATAT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.019715;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,9:13,5:6,4
+chr6	107177131	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,9:5,7:2,2
+chr6	108022016	.	TA	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.101;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:18,1:17,3
+chr6	109655627	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=2.706e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,17:10,4:4,13
+chr6	110553287	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.02002;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,9:7,8:5,1
+chr6	111163146	.	ATT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.015417;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,2:2,2
+chr6	113314517	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:11,3:6,1
+chr6	113611727	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,2:15,2
+chr6	113666600	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:5,2:0,0
+chr6	114459985	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,4:3,2
+chr6	117398476	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00023992;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:7,7:12,4
+chr6	117452883	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00091926;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:10,3:10,5
+chr6	117609264	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,5:6,3
+chr6	118070992	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:3,1:5,5
+chr6	118989801	.	C	CATTTATTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.03973;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:6,4:13,3
+chr6	122357957	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010883;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,13:0,8:3,5
+chr6	122799961	.	C	CTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:2,4:7,1
+chr6	123266483	.	A	AAT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:2,1:3,3
+chr6	123799546	.	CATATATAT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:2,4:2,1
+chr6	126147120	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0081185;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,3:3,4
+chr6	126287669	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=1.2131e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:5,20:2,10:3,10
+chr6	127263211	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00015537;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,5:3,2
+chr6	129048489	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:4,1:9,5
+chr6	130861874	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,3:7,1
+chr6	132589742	.	CAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,5:1,4:1,1
+chr6	133394284	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,5:2,1:0,4
+chr6	134528947	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,2:1,1:1,1
+chr6	134754863	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:10,4:1,1
+chr6	134926822	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0034395;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,7:8,1
+chr6	136381917	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.097397;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:15,2:9,4
+chr6	137377819	.	CAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024163;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,6:2,1
+chr6	143042681	.	TA	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0021;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:10,5:13,2
+chr6	145396551	.	CTCAGGTACATAAACTTTGCAATGTCTGCCT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.045916;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:9,3:9,3
+chr6	147790792	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,3:1,2:5,1
+chr6	147863838	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:9,2:2,2
+chr6	148568676	.	A	ATATC	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:1,4:3,1
+chr6	150886435	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:12,4:1,1
+chr6	151208830	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=7.799e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:10,9:7,7
+chr6	151740285	.	A	ATT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,1:5,4
+chr6	152697504	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:7,6:7,2
+chr6	154331411	.	GAGAA	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,2:5,2
+chr6	154426346	.	T	TTTTATTTA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.017962;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:10,7:12,4
+chr6	155502665	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=7.5695e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,5:6,5
+chr6	155828878	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,5:3,4:2,1
+chr6	156433103	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,2:0,0:4,2
+chr6	156880739	.	C	CA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:5,3:4,1
+chr6	157507369	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00023911;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,16:6,5:3,11
+chr6	158029042	.	C	CCCTGCAGAGGGTGGGCCCTGGGTCT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,1:7,3
+chr6	159269210	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.026061;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:3,3:12,6
+chr6	159269281	.	TATCTATCTATCC	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.011795;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,3:9,4
+chr6	159408174	.	T	TA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,2:7,2
+chr6	160958101	.	C	CTATATATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
+chr6	161453741	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr6	162279405	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
+chr6	162667953	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.0465e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:12,15:11,7
+chr6	164719165	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00017983;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:15,23:11,14:4,9
+chr6	165202989	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.055233;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:20,2:14,3
+chr6	165306915	.	T	TTG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0077494;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:3,7:5,1
+chr6	165943346	.	G	GAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:7,6:4,1
+chr6	166304496	.	G	GGCTGAAATTACCAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,3:7,1
+chr6	166650231	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00037902;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:6,4:7,4
+chr6	167490297	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12799;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,5:2,4:5,1
+chr6	168364594	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0069124;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:3,9:11,1
+chr6	168572298	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:2,1:5,1
+chr6	168680341	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:0,3:0,1:0,2
+chr6	169514544	.	GA	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.028551;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:14,2:5,4
+chr6	169895224	.	G	GA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=8.0768e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:12,5:7,5
+chr7	31456	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.012958;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:11,1:15,7
+chr7	1693824	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.5955e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:6,7:9,7
+chr7	1903563	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024017;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:3,4:5,4
+chr7	4448610	.	AT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.018907;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:10,1:9,5
+chr7	4819072	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,2:3,4
+chr7	4973319	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15021;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:6,4:2,1
+chr7	5484639	.	A	AT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.016023;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:5,6:8,4
+chr7	5857708	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.029938;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:5,5:12,6
+chr7	6313076	.	ATT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047337;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:4,3:9,3
+chr7	6743832	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.027715;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:18,2:8,5
+chr7	7022753	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:16,1:3,3
+chr7	8410432	.	TATATATATA	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.0034965;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:0,3:2,3
+chr7	12538980	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0002515;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:9,4:9,6
+chr7	12608319	.	ATG	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02313;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,1:9,3
+chr7	12621637	.	GT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,9:3,8:1,1
+chr7	13476115	.	A	ATTTTTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0036508;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,9:0,8:1,1
+chr7	14211317	.	TA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.054264;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,1:9,3
+chr7	16219670	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,4:6,2
+chr7	16352879	.	GCACA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,5:2,3:0,2
+chr7	16551767	.	TAA	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0034707;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:13,3:8,4
+chr7	16556070	.	TA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00094545;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,5:8,3
+chr7	16556706	.	GT	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=9.1018e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:13,5:11,5
+chr7	18799038	.	AAGACACACACACACAC	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0031186;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,12:10,6:4,6
+chr7	18817299	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=8.0727e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:5,8:14,6
+chr7	21218988	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027772;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,5:4,2:1,3
+chr7	21570883	.	TA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027654;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:8,5:9,2
+chr7	21619979	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,2:15,2
+chr7	22491415	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00012013;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:11,6:10,5
+chr7	22592889	.	TAGGAAAGAATGTTGCCCTGTAG	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00031586;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:4,4:8,7
+chr7	23618563	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:7,4:10,3
+chr7	23630505	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,1:11,3
+chr7	24117614	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00097732;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:7,4:9,4
+chr7	24152155	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0076269;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:10,5:7,2
+chr7	24377884	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.072233;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,2:8,2
+chr7	25084082	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:4,3:3,1
+chr7	26284380	.	GTATA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.031941;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:11,4:1,2
+chr7	26317659	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
+chr7	27309471	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.1295e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:8,8:12,6
+chr7	29541131	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,2:4,2
+chr7	30006116	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,8:3,6:2,2
+chr7	31192393	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,3:3,4
+chr7	33525617	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:17,2:13,2
+chr7	34400745	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:2,3:3,1
+chr7	34686960	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.029051;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:8,4:1,2
+chr7	35281894	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0027765;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,8:3,7:3,1
+chr7	36272519	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.063676;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:18,4:9,1
+chr7	38344493	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13372;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:16,1:4,2
+chr7	38408752	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.39286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,4:2,2:7,2
+chr7	39930838	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11029;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,2:2,1:2,1
+chr7	40064817	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.00042089;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:7,7:4,4
+chr7	43028716	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.1295e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:13,4:7,10
+chr7	43945776	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:10,5:4,3
+chr7	44872252	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.1148e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,22:9,15:9,7
+chr7	45782740	.	AT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,5:6,2:2,3
+chr7	45817605	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.022724;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,1:4,3
+chr7	46142778	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01921;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,5:3,2
+chr7	48759056	.	A	AACACACACACACAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037959;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:10,3:1,1
+chr7	50539850	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00032942;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:14,7:11,4
+chr7	51896176	.	C	CTTAAGCAA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0026395;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,8:8,2:14,6
+chr7	51896180	.	T	TGGATTAAGG	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.008813;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,7:9,1:13,6
+chr7	51896182	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0067299;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,7:8,2:14,5
+chr7	52353057	.	A	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.6121e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:14,14:12,8
+chr7	54254829	.	GT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0014755;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,6:6,3
+chr7	56166301	.	C	CAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0064996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:1,8:3,1
+chr7	56768611	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:6,5:3,1
+chr7	56986716	.	C	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:1,5:6,3
+chr7	57034955	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,2:9,2
+chr7	58069949	.	C	T	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.0235;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:60,10:41,9:19,1
+chr7	58074607	.	A	G	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.024322;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:85,15:58,7:27,8
+chr7	58767509	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,2:0,0:7,2
+chr7	58894373	.	A	G	0	PASS	DP=304;GPV=1;SPV=0.00010709;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:96,34:32,7:64,27
+chr7	60031408	.	A	T	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.015827;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:60,13:45,8:15,5
+chr7	60047386	.	C	G	0	PASS	DP=453;GPV=1;SPV=0.020488;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:235:210,25:146,14:64,11
+chr7	60914309	.	GATGATGATTCCTTTCGATATCATTTGATGATTCCATTCAATTCCATTCT	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.079011;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,3:16,1
+chr7	60966013	.	G	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.0069542;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:62,11:26,4:36,7
+chr7	61419712	.	CT	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.02424;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:9,2:12,2
+chr7	62273765	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.035271;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:14,3:18,3
+chr7	62331223	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0001759;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:11,3:12,10
+chr7	62431487	.	G	T	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.039578;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:21,10:24,2
+chr7	63757346	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
+chr7	63759423	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.056405;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:19,2:8,2
+chr7	63759567	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.119;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:0,0:26,4
+chr7	64089741	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.7368e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,8:11,7
+chr7	64096569	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0028734;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:10,4:3,3
+chr7	65099169	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045858;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:16,3:8,4
+chr7	65101107	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.011071;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:4,8:3,1
+chr7	65784392	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0092406;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:16,9:10,1
+chr7	66324807	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,2:1,1:1,1
+chr7	67225790	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011304;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:5,4:11,4
+chr7	67712804	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.045385;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,2:7,5
+chr7	67730877	.	TAG	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:5,4:2,1
+chr7	67967899	.	A	ATTAT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,5:10,4:8,1
+chr7	68476999	.	A	ATG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027654;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:10,6:7,1
+chr7	69021853	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:12,1:11,3
+chr7	69073218	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:3,8:6,1
+chr7	69927186	.	T	TTATATA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.037194;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:11,4:5,3
+chr7	71447728	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=8.1411e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,15:10,8:10,7
+chr7	72588022	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030898;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:12,6:9,1
+chr7	72602750	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0061179;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:18,7:7,1
+chr7	72615348	.	G	GGA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.016937;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:17,3:7,5
+chr7	72713300	.	CA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
+chr7	73156587	.	GC	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.038274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,1:4,3
+chr7	73639000	.	GA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00026967;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:5,8:11,1
+chr7	74336891	.	T	TTTG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,5:6,4:2,1
+chr7	74410895	.	AGAGAGAAG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0059157;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,5:7,2
+chr7	74460418	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=9.5049e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:14,8:13,5
+chr7	75715458	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,5:9,1:4,4
+chr7	75723951	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.018803;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,4:6,3:1,1
+chr7	76514912	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.05;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:0,3:0,1:0,2
+chr7	76757277	.	T	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0077399;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:1,5:3,1
+chr7	76882331	.	G	GAGAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18281;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,6:10,3:8,3
+chr7	76993485	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.044663;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:18,1:15,4
+chr7	79653897	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.8158e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:12,5:7,9
+chr7	83387850	.	GT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,4:6,3:11,1
+chr7	83515293	.	GA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011976;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,5:2,3
+chr7	86187771	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:9,2:4,2
+chr7	87999987	.	TA	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0041611;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:7,5:6,3
+chr7	88127476	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.2075e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:11,8:9,5
+chr7	88266099	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.010479;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:9,4:7,7
+chr7	88814447	.	A	AAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,8:4,5:2,3
+chr7	89176587	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,3:5,2:1,1
+chr7	90331378	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=7.9892e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,5:5,4
+chr7	91729131	.	G	GGAAGGGA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,2:2,2:0,0
+chr7	94339211	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.003791;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:9,5:13,4
+chr7	94376048	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,4:7,1
+chr7	95100844	.	AT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.011868;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:4,6:0,1
+chr7	95580039	.	TTATATATATATATATATATA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10577;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
+chr7	98889555	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.015475;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,9:8,6:3,3
+chr7	98889557	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0088061;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:5,4:3,3
+chr7	101063702	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.083916;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,5:3,2:2,3
+chr7	101825753	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0054096;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:7,5:2,2
+chr7	102488756	.	A	G	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.034205;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:22,6:24,4
+chr7	102490814	.	C	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.034752;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:17,4:18,4
+chr7	102502759	.	C	CA	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.0096458;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:50,10:28,6:22,4
+chr7	102592517	.	C	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.014313;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:35,9:7,1
+chr7	102605663	.	G	A	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.0092848;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:71,14:48,8:23,6
+chr7	105492052	.	CAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,7:5,6:4,1
+chr7	106628825	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0066141;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:1,3:2,3
+chr7	107722685	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0045822;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,9:6,4:4,5
+chr7	108024743	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034636;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,3:8,2
+chr7	108749132	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0011981;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:14,6:17,6
+chr7	108884387	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,7:8,4:1,3
+chr7	110802341	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.018803;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,4:4,2:3,2
+chr7	110802349	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,4:2,3:4,1
+chr7	111217126	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,4:4,2:5,2
+chr7	111632668	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,5:4,1
+chr7	112445062	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,5:1,2
+chr7	113840324	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00028547;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:13,7:9,7
+chr7	114176298	.	T	TTC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,3:0,2:1,1
+chr7	116288619	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,5:6,1
+chr7	118804763	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=9.294e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:9,7:8,5
+chr7	118952191	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=7.2318e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:10,4:3,6
+chr7	119014250	.	G	GTA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:4,3:5,1
+chr7	119221565	.	A	AT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
+chr7	119839161	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00019536;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,7:8,3
+chr7	120768774	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,6:6,2:5,4
+chr7	122150366	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:1,3:1,2:0,1
+chr7	125349432	.	GTA	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00057944;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:7,4:6,3
+chr7	126019610	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0015164;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,5:9,5
+chr7	127483685	.	AATAT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:8,3:3,1
+chr7	128512979	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0064613;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,4:4,3
+chr7	129033906	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:9,4:2,1
+chr7	130626708	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.237e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:11,3:8,11
+chr7	130940445	.	CAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:2,2:3,3
+chr7	131444745	.	TAGTAGTAGTAGTAGA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.011679;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,3:3,5
+chr7	131868548	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0044739;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:3,5:2,1
+chr7	132711346	.	T	TGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,2:4,2
+chr7	133076058	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:6,9:3,1
+chr7	133397331	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=1.7738e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:5,7:7,4
+chr7	133649465	.	T	TTTTTTC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.027357;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,5:8,2:9,3
+chr7	133745729	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.019985;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,1:4,9
+chr7	134527015	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:0,1:4,3
+chr7	136880046	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,4:4,1
+chr7	137023785	.	T	TGATA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.024656;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,4:5,3:7,1
+chr7	137324435	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,2:8,2
+chr7	137640006	.	G	GT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0143;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,5:8,1
+chr7	137696766	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00022263;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:7,9:16,2
+chr7	138654500	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,6:5,3:3,3
+chr7	139110664	.	TA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,7:4,6:7,1
+chr7	143767673	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.036975;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:17,5:8,1
+chr7	144204888	.	C	T	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.044454;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:81,15:46,8:35,7
+chr7	144362416	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
+chr7	144530700	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0012555;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:12,5:8,5
+chr7	145746199	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016594;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,4:9,2
+chr7	146555527	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.11618;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:22,2:12,2
+chr7	147198955	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:13,4:1,3
+chr7	148283259	.	G	GA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,3:1,2
+chr7	149906416	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,2:0,1:2,1
+chr7	149973119	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.049445;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:16,4:15,1
+chr7	150041507	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.049123;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,3:4,1:1,2
+chr7	150158985	.	A	AGG	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.056165;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:18,4:15,1
+chr7	150366215	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.944e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:7,7:7,8
+chr7	150987805	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.27198;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:8,4:2,1:6,3
+chr7	151443970	.	A	AT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,2:6,2
+chr7	152379913	.	C	G	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.0019945;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:75,13:42,5:33,8
+chr7	152796880	.	T	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:2,1:5,1
+chr7	153694853	.	TAA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:6,5:2,1
+chr7	156205191	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,1:7,3
+chr7	156886047	.	G	GA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,8:0,7:2,1
+chr7	157648793	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,2:5,3
+chr7	158152191	.	A	AAAAAAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,9:6,3:3,6
+chr7	158720933	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,3:8,1
+chr7	158720943	.	TA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016081;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:13,4:8,3
+chr7	159195589	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
+chr8	200941	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0041252;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:11,5:10,3
+chr8	933541	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr8	1690703	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:4,3:3,1
+chr8	2446587	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.033154;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:20,4:18,1
+chr8	3262190	.	T	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.023173;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
+chr8	3308731	.	A	AATTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,8:1,3:2,5
+chr8	3712438	.	CAGACAGAG	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.11312;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,5:13,4:17,1
+chr8	4933931	.	G	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011437;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:3,3:9,3
+chr8	5038381	.	AT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0013537;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,5:5,2
+chr8	6592821	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,2:2,1:2,1
+chr8	6874118	.	T	TAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023613;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,3:6,3
+chr8	7280617	.	T	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0063539;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:3,3:8,3
+chr8	7388774	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.013586;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,4:11,3
+chr8	7445427	.	A	G	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.042142;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:23,8:23,2
+chr8	7590600	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:11,2:19,2
+chr8	7741855	.	G	A	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.031602;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:83,19:28,9:55,10
+chr8	7765543	.	C	A	0	PASS	DP=357;GPV=1;SPV=0.03449;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:143,16:58,4:85,12
+chr8	7767717	.	T	C	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.047471;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:7,1:35,6
+chr8	7894605	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:18,4:1,0
+chr8	7905079	.	C	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0069996;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,7:0,1:6,6
+chr8	7949368	.	C	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:4,1:1,7
+chr8	8023753	.	T	G	0	PASS	DP=325;GPV=1;SPV=0.0016451;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:129,36:55,19:74,17
+chr8	8037828	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.058687;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:3,2:12,2
+chr8	8068506	.	G	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
+chr8	8074498	.	A	G	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.033059;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,8:22,1:27,7
+chr8	8161332	.	C	A	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.032509;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:63,9:36,7:27,2
+chr8	9398157	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=8.543e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:9,8:11,8
+chr8	10219867	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.075059;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,4:6,2
+chr8	10991891	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0010554;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:7,3:13,5
+chr8	11180735	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0054457;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:8,6:10,10
+chr8	12189987	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.030651;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,4:3,1
+chr8	12449811	.	A	ATG	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.03999;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:41,13:24,11:17,2
+chr8	12483538	.	C	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.011673;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:22,9:17,5
+chr8	12495803	.	C	T	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.046457;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:49,13:27,10:22,3
+chr8	12497170	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:1,3:5,1
+chr8	12501192	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.057585;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,5:7,2
+chr8	12509931	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10145;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr8	12516289	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:0,0:11,4
+chr8	12552262	.	A	G	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.033288;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:86,18:44,14:42,4
+chr8	12577813	.	T	C	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.0068415;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:82,25:37,10:45,15
+chr8	12577823	.	A	G	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.0026385;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:88,20:36,13:52,7
+chr8	12584810	.	G	A	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.012888;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:84,19:44,12:40,7
+chr8	12588896	.	T	C	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.03851;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:90,17:42,9:48,8
+chr8	12594078	.	A	C	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.010693;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:70,18:41,9:29,9
+chr8	12596034	.	TC	T	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.016696;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:77,18:39,9:38,9
+chr8	12884712	.	A	AACACACACACAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0068111;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,7:3,5:2,2
+chr8	13753701	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00017105;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:2,6:14,5
+chr8	13935838	.	A	AT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,8:3,4:4,4
+chr8	15558792	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0094436;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:8,10:11,3
+chr8	15923495	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,3:4,1:1,2
+chr8	16926818	.	A	ATGTAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00387;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,4:1,3:1,1
+chr8	18271057	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0013228;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:11,7:8,10
+chr8	18991373	.	T	TACAC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,5:0,3:2,2
+chr8	19666793	.	AAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,3:2,1
+chr8	20199604	.	GT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.012394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:14,3:3,3
+chr8	20516661	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,4:3,1:2,3
+chr8	20936544	.	C	CAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.014985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:2,4:0,0
+chr8	22106419	.	CAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
+chr8	22649850	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0094041;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,5:9,1:3,4
+chr8	22765825	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,3:9,1
+chr8	23876294	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0055944;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,6:0,3:1,3
+chr8	24758151	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.3892e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:5,6:8,10
+chr8	24924432	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:0,2:0,0:0,2
+chr8	26618315	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:5,2:11,8
+chr8	27021715	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:1,2:1,2:0,0
+chr8	32366679	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:2,3:3,1
+chr8	33433611	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0011632;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:2,8:7,3
+chr8	34993484	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=4.6796e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:3,4:11,8
+chr8	35551220	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0029872;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,1:11,5
+chr8	35864646	.	T	TAC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,4:0,1:0,3
+chr8	36225747	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:12,3:2,1
+chr8	37657098	.	TAC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,10:4,6:2,4
+chr8	38148813	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:30:0,2:0,2:0,0
+chr8	41504120	.	T	TAAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0093361;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,12:13,9:4,3
+chr8	43972750	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,0:10,4
+chr8	44142988	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:0,2:10,4
+chr8	44211094	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.10777;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:12,2:6,1
+chr8	45086951	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:1,6:6,1
+chr8	46208097	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=5.5231e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,7:11,4
+chr8	46279883	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0011018;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,3:7,4
+chr8	46673421	.	T	TA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=8.275e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:9,7:9,4
+chr8	47015050	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:5,5:2,2
+chr8	47648800	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.4255e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:10,7:7,7
+chr8	50961698	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:12,2:6,2
+chr8	52963543	.	T	TG	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0076838;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,12:11,9:13,3
+chr8	54239104	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00036687;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:10,7:9,4
+chr8	54547199	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.4566e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:11,8:5,3
+chr8	55755593	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:1,2:1,1:0,1
+chr8	55801582	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,2:5,2
+chr8	56285203	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,3:1,1
+chr8	57159303	.	T	TGACA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.15499;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,1:8,4
+chr8	57261742	.	T	TG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.018778;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:4,6:1,1
+chr8	59389650	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01441;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,7:7,5:6,2
+chr8	60425281	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0003586;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:14,6:7,2
+chr8	62385634	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0048347;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:12,1:13,6
+chr8	62465619	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=3.4904e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:8,7:12,8
+chr8	62870770	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.00041135;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,9:0,3:0,6
+chr8	63080732	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0095174;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:15,3:6,5
+chr8	63285041	.	TTCC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.11761;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:4,2:23,3
+chr8	63937992	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:5,5:4,8
+chr8	64396808	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.018404;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:4,4:7,1
+chr8	65126348	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025213;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,4:7,2
+chr8	66867551	.	AAAT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.033718;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:8,3:11,6
+chr8	67218207	.	A	AAATAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12799;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,5:2,1:5,4
+chr8	69444882	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14256;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:13,2:18,2
+chr8	69931130	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.3365e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,18:5,11:6,7
+chr8	70378743	.	T	TAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,3:4,3
+chr8	71208737	.	GA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0062663;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:7,7:9,7
+chr8	72249868	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,4:1,2:4,2
+chr8	73106573	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.2714e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:8,3:13,7
+chr8	73256869	.	C	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.35897;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,2:2,1:4,1
+chr8	73699451	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.3207e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,20:12,8:2,12
+chr8	74230754	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013657;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,6:5,5:6,1
+chr8	75916038	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:7,8:3,3:4,5
+chr8	76140882	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00025084;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:17,8:11,3
+chr8	77040107	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.076832;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:6,2:16,2
+chr8	77040108	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.059705;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,2:14,2
+chr8	78843814	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:12,1:7,4
+chr8	80127839	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,7:3,4:5,3
+chr8	80329468	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,4:5,1:6,3
+chr8	82396759	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.1081e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:10,9:9,7
+chr8	83820094	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00011224;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:5,5:8,4
+chr8	83945783	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,5:5,4:6,1
+chr8	83949234	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00070506;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,7:9,2
+chr8	83959734	.	G	GCA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.03809;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,7:16,6:2,1
+chr8	84903683	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0002546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:11,7:17,5
+chr8	85653042	.	C	G	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.0084042;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:127,31:62,12:65,19
+chr8	86362063	.	C	CAT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:3,2:1,7
+chr8	88456275	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.7463e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,9:8,3
+chr8	89751607	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.034681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,4:4,3
+chr8	90070865	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.14511;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:12,1:21,3
+chr8	90100331	.	AT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.002101;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:6,4:9,2
+chr8	90522683	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0011083;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:9,5:12,3
+chr8	92042938	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.5662e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:9,11:11,4
+chr8	92569374	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00024975;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:12,1:4,7
+chr8	92626183	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.025213;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:6,3:6,3
+chr8	93281553	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=8.1991e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:16,22:8,12:8,10
+chr8	97123152	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,3:13,2:6,1
+chr8	97347890	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=5.2542e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,5:5,3
+chr8	97621742	.	TAAAAAA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,3:4,1
+chr8	100093513	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00017406;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:9,4:9,6
+chr8	100100291	.	AT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0053469;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:12,5:12,2
+chr8	100493756	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,4:9,2:6,2
+chr8	101124545	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,3:6,5
+chr8	102528666	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0066001;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,3:7,2
+chr8	103992278	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00014576;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,17:6,4:3,13
+chr8	107192192	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,1:9,3
+chr8	107551396	.	G	GTA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021576;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:7,3:8,6
+chr8	107551422	.	G	GTA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.069853;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:10,2:7,3
+chr8	108466442	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029349;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:8,7:4,1
+chr8	109269251	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0020965;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:10,7:12,8
+chr8	110395508	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11923;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:13,1:23,3
+chr8	110764485	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,3:2,1:1,2
+chr8	110953462	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0052889;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:11,4:7,6
+chr8	111806622	.	TC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.054945;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,3:2,1:1,2
+chr8	111833170	.	T	TTAGATAGATAGA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,5:4,4:4,1
+chr8	114796569	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=8.1682e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:7,5:9,8
+chr8	117558717	.	C	CTGTGTG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.015516;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,3:5,2
+chr8	117563233	.	CAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:6,4:3,2
+chr8	117748531	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=2.2591e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:8,7:12,6
+chr8	118637996	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=7.3076e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:6,8:11,1
+chr8	118840904	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=5.4752e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:7,6:13,7
+chr8	122223529	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0014372;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,4:8,4
+chr8	123545013	.	C	CAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,3:2,1
+chr8	123671946	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00092217;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:6,5:8,4
+chr8	124302600	.	AATAT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:4,2:6,3
+chr8	124302660	.	AATAT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.22984;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:8,1:9,2
+chr8	125911787	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.8653e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:7,7:11,4
+chr8	127408101	.	TATGG	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,2:4,4
+chr8	127408113	.	T	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,3:0,2:4,1
+chr8	128952445	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.261e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:13,5:5,9
+chr8	129184572	.	AC	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0069381;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,6:7,2
+chr8	129610157	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:2,7:2,6:0,1
+chr8	130758196	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.006237;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:11,3:3,4
+chr8	132154192	.	AGTTTTTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:1,3:6,2
+chr8	132782895	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=1.3655e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:6,9:8,3
+chr8	133395213	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.021372;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,1:3,4
+chr8	133928343	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00017351;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:13,5:8,6
+chr8	135058547	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00041251;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:9,4:12,6
+chr8	135117214	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,2:1,1:2,1
+chr8	137335629	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
+chr8	137446909	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00012301;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:8,5:8,5
+chr8	137610924	.	A	ATT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0053956;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,8:7,3
+chr8	137863580	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=4.9323e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:3,7:5,1
+chr8	137905012	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0014004;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:13,3:11,6
+chr8	138281212	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00010966;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:9,9:13,7
+chr8	138314693	.	C	CAATAAATAAATAAATAAATA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:2,4:2,1
+chr8	138795528	.	G	GACACACACACAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:13,3:7,1
+chr8	139068153	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,8:5,7:5,1
+chr8	139223325	.	CT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00024036;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,5:2,3
+chr8	139390449	.	A	AT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:6,1:3,3
+chr8	140225168	.	C	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0027568;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:15,4:4,5
+chr8	140283294	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0045767;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:3,4:2,2
+chr8	140448153	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:8,3:11,1
+chr8	141345359	.	T	TA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015942;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,4:2,1
+chr8	142397036	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.087302;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:10,3:3,1:7,2
+chr8	143287678	.	T	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.014981;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:16,1:20,5
+chr8	143670217	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=4.8725e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:6,7:15,5
+chr9	13621	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,3:6,1
+chr9	55054	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,1:2,6
+chr9	56883	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,1:13,3
+chr9	60874	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0054804;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:16,6:17,7
+chr9	704992	.	CAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:6,3:2,2
+chr9	4213079	.	G	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.3459e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:8,9:10,8
+chr9	4270925	.	GTGTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.010459;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,1:4,6
+chr9	5080727	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=4.0511e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,17:2,14:13,3
+chr9	5626226	.	A	AT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00080386;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:3,6:8,5
+chr9	6542885	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,6:2,1
+chr9	10511947	.	CGT	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,4:0,2:1,2
+chr9	10875971	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.364e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:11,10:6,6
+chr9	12799746	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00012301;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:8,7:8,3
+chr9	13925346	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00023686;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:12,4:10,5
+chr9	15664695	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,3:5,1:1,2
+chr9	16059502	.	TTTC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:6,2:9,3
+chr9	16779114	.	T	TAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016673;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:8,4:6,2
+chr9	17668652	.	A	ATTTAT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.01932;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:12,8:6,3
+chr9	18238768	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.0388e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:11,9:7,10
+chr9	18894345	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:9,4:4,1
+chr9	20545096	.	CAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.014049;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,4:5,1
+chr9	20974069	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00092488;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:5,4:4,8
+chr9	21565186	.	C	CAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037638;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,4:7,5
+chr9	23263748	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.4608e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:4,12:12,3
+chr9	25102456	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00072423;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:10,5:13,5
+chr9	25241546	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00042492;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,3:5,5
+chr9	25760556	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,1:13,3
+chr9	26233976	.	GT	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.3574e-07;SS=2;SSC=68;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:11,13:9,6
+chr9	27211204	.	A	AAT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.018628;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:13,2:8,4
+chr9	27380785	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0013149;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:2,3:10,4
+chr9	27635638	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
+chr9	27797636	.	AT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.018907;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:11,1:8,5
+chr9	28297829	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00049368;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:7,3:13,6
+chr9	28498477	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0028764;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:21,3:8,6
+chr9	30467575	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:24:1,3:1,2:0,1
+chr9	32360274	.	A	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:1,1:5,1
+chr9	33157065	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.54545;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,2:1,1:6,1
+chr9	33437246	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0063848;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:6,4:11,9
+chr9	33579951	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,1:6,3
+chr9	35309222	.	AGTGT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0069323;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,10:3,8:1,2
+chr9	36216327	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:5,3:2,1
+chr9	38564762	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0069576;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:15,4:5,5
+chr9	38825196	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr9	38973013	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.040748;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:17,1:9,6
+chr9	39038729	.	T	C	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.04207;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:60,14:37,3:23,11
+chr9	39477841	.	CAA	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.025745;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:14,2:5,4
+chr9	39790829	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.033111;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:1,8:33,3
+chr9	39806065	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.040794;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:18,4:6,4
+chr9	39811309	.	T	TA	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.03895;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:63,17:31,8:32,9
+chr9	39817917	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:0,1:16,3
+chr9	40141902	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10773;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:11,1:11,4
+chr9	40299040	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,3:2,5
+chr9	40887604	.	C	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.002391;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:20,7:12,1
+chr9	40984387	.	A	G	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.025831;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:51,7:26,5:25,2
+chr9	41055190	.	AAGG	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.014823;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:10,2:8,4
+chr9	41124566	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0045001;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:17,7:5,6
+chr9	41149757	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.034482;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:10,7:18,2
+chr9	41294007	.	G	A	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.015832;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:69,14:29,3:40,11
+chr9	41390057	.	AT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.02769;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,4:6,4
+chr9	41496485	.	GAAAGGA	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.034215;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,6:28,4:3,2
+chr9	41527965	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.033733;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:17,5:15,3
+chr9	41661484	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.071753;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,3:10,1
+chr9	41770012	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
+chr9	41830987	.	C	T	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.012325;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:80,16:38,6:42,10
+chr9	41940481	.	A	G	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.0032578;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:63,24:34,12:29,12
+chr9	42027461	.	T	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:5,5:0,1
+chr9	42286662	.	G	A	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.0019358;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:64,8:34,6:30,2
+chr9	42534142	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.014968;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:15,4:19,9
+chr9	42564238	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.014448;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
+chr9	42990597	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.073271;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:16,2:16,3
+chr9	43008955	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.099673;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:15,1:21,3
+chr9	43398652	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:0,0:22,4
+chr9	43450256	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.03569;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,1:2,3
+chr9	43491159	.	G	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
+chr9	43569176	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033651;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:18,2:8,2
+chr9	44012425	.	G	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.043382;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:4,2:7,2
+chr9	44081441	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.01244;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:19,8:6,1
+chr9	45015567	.	C	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.095042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:15,2:10,2
+chr9	45173488	.	C	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.04859;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:38,5:0,1
+chr9	60560821	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.037194;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:0,1:16,6
+chr9	60655675	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,2:4,4
+chr9	61534271	.	A	ATG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.04269;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,1:6,7
+chr9	61698971	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:12,4:1,0
+chr9	61972395	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.010479;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,4:8,5
+chr9	62578345	.	C	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.033589;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:15,1:20,6
+chr9	62804228	.	G	C	0	PASS	DP=299;GPV=1;SPV=0.019582;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:132,16:52,4:80,12
+chr9	62804246	.	T	C	0	PASS	DP=310;GPV=1;SPV=0.010327;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:135,19:53,6:82,13
+chr9	62805547	.	C	T	0	PASS	DP=289;GPV=1;SPV=0.014771;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:137:115,22:63,12:52,10
+chr9	62816131	.	C	G	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.014587;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:91,21:55,13:36,8
+chr9	62832112	.	C	T	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.041377;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:63,14:41,9:22,5
+chr9	62832215	.	G	T	0	PASS	DP=284;GPV=1;SPV=0.033849;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:120,20:68,9:52,11
+chr9	62832227	.	A	G	0	PASS	DP=259;GPV=1;SPV=0.021249;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:114,20:62,10:52,10
+chr9	62834514	.	G	A	0	PASS	DP=350;GPV=1;SPV=0.027412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:176:156,20:79,7:77,13
+chr9	63271325	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0076269;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:9,3:8,4
+chr9	63367584	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,1:2,6
+chr9	63767558	.	A	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.049649;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:13,1:13,8
+chr9	63794610	.	A	G	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.028344;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:64,10:35,9:29,1
+chr9	63852085	.	A	G	0	PASS	DP=244;GPV=1;SPV=0.033866;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:95,18:44,6:51,12
+chr9	63875499	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0026263;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:18,8:16,2
+chr9	64054984	.	T	A	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.0023845;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:55,8:23,3:32,5
+chr9	64364444	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0031054;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:15,6:7,3
+chr9	64375257	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.067818;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,1:17,3
+chr9	64475776	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
+chr9	64543521	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,1:8,3
+chr9	64724833	.	AAAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:13,3:10,1
+chr9	65559995	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.035906;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:19,1:2,8
+chr9	66058425	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040008;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:5,2:11,7
+chr9	66058712	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:9,1:15,3
+chr9	66234321	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022983;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:10,4:7,7
+chr9	66246635	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.011389;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:12,2:12,9
+chr9	66343510	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.045253;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:5,6:18,2
+chr9	66374592	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.030284;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:15,10:19,3
+chr9	66817730	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0088349;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:8,7:11,3
+chr9	66942755	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0082692;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,3:6,4
+chr9	66949045	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.064347;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,2:15,2
+chr9	66958756	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
+chr9	67103214	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0024876;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,13:6,2:6,11
+chr9	67165889	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:2,2:6,3
+chr9	67428816	.	G	GC	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.043261;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:22,3:6,2
+chr9	67563763	.	A	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,4:2,3
+chr9	67709320	.	A	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr9	67737196	.	A	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.010238;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:26,5:17,7
+chr9	68265354	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,0:7,4
+chr9	70008285	.	A	AGATAGATAGAT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.020584;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,9:14,5:9,4
+chr9	70792518	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.024248;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:7,3:10,2
+chr9	72205110	.	C	CAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0068111;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,9:2,8:3,1
+chr9	72273869	.	C	CTCTGTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:5,5:3,1
+chr9	77164452	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:7,6:4,1
+chr9	78715470	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,5:1,2:5,3
+chr9	79155809	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=7.6484e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,21:7,14:9,7
+chr9	79835821	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:3,3:5,2
+chr9	79891930	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.013673;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:14,4:14,3
+chr9	80561564	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.3459e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:10,10:8,7
+chr9	80678615	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0067079;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:3,10:2,8:1,2
+chr9	80914871	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00094384;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:12,4:11,9
+chr9	80949038	.	T	TAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:8,8:3,1
+chr9	81017936	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,4:6,1:10,3
+chr9	82212576	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=9.6434e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:7,8:2,3
+chr9	83350623	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.011625;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,6:2,5:2,1
+chr9	85248479	.	ATG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,5:5,3
+chr9	85612007	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.1184e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:5,6:11,5
+chr9	85691522	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020538;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,2:6,2
+chr9	86037438	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.029984;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,3:3,3
+chr9	86216454	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,6:4,1
+chr9	87387357	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.010876;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:6,5:4,1
+chr9	88264218	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:6,2:1,2
+chr9	89182522	.	A	AAAAAT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.035241;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,4:7,3
+chr9	90541817	.	TA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0027337;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,11:5,4:5,7
+chr9	91562181	.	AAAGGAAGG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024328;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,4:2,2
+chr9	94308754	.	TCAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
+chr9	94452715	.	ATATATATATAATAGATATTATATATAAATATC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,4:8,1
+chr9	96284215	.	TAAAAA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00094923;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,11:3,6:3,5
+chr9	96371474	.	CAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:1,7:4,1
+chr9	96429027	.	T	TAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.015843;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,4:4,2
+chr9	96603155	.	G	GAC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.011229;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:7,6:2,3
+chr9	97743548	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,1:8,4
+chr9	99195776	.	AT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:5,4:2,1
+chr9	99500142	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.044512;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:15,5:11,1
+chr9	103728043	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=6.2544e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:14,2:10,12
+chr9	104045357	.	A	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,3:0,1:2,2
+chr9	104690644	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1599;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,4:7,2
+chr9	104696115	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,3:3,1:3,2
+chr9	107242263	.	A	AAG	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
+chr9	107641702	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00033576;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:7,5:9,5
+chr9	108095796	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:6,3:1,2
+chr9	108996155	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0067968;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:9,5:8,6
+chr9	109249721	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0013464;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:10,4:7,2
+chr9	109357854	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:7,4:4,1
+chr9	110313480	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00037187;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:14,6:6,5
+chr9	112320312	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,1:9,3
+chr9	112448507	.	TCTTTCTTTCTTTCCTC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.008898;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:3,5:7,6
+chr9	113000950	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0012203;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:10,3:7,5
+chr9	113050469	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:32:0,2:0,1:0,1
+chr9	113218379	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,5:3,4:3,1
+chr9	115355012	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00043396;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:4,9:9,2
+chr9	116389810	.	GT	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.002854;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,3:7,4
+chr9	116882828	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.040404;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,4:7,2:6,2
+chr9	117005080	.	A	ATTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,2:2,2
+chr9	117134295	.	TACACACACAC	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,2:3,1:0,1
+chr9	117187917	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.4083e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,6:8,6
+chr9	117362368	.	C	CA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=6.911e-06;SS=2;SSC=51;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:12,10:2,4
+chr9	118141002	.	A	ATT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.004773;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:10,6:4,6
+chr9	120004935	.	AT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00080119;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,3:4,4
+chr9	122606773	.	ACCTAT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.19341;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:13,2:18,2
+chr9	123395472	.	G	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:6,3:11,1
+chr9	126697837	.	C	CTGTTT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.020561;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:5,4:15,5
+chr9	128598272	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00068482;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:11,5:8,5
+chr9	129575015	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0053975;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:9,10:6,4
+chr9	129659598	.	TTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.049808;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:7,2:4,2
+chr9	130121181	.	T	TCAAAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:9,2:7,3
+chr9	130123533	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.03148;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:7,3:9,6
+chr9	131317261	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:10,5:3,1
+chr9	132172722	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,6:12,2:2,4
+chr9	132361988	.	A	AT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,1:7,3
+chr9	135730990	.	T	TAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0065226;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:2,5:7,3
+chr9	136236902	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012829;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:3,2:14,5
+chrX	2857148	.	ATCTATCTATCTAGACCTAGATG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.029045;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,2:10,5
+chrX	3417799	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00013223;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:15,6:4,4
+chrX	5706845	.	CTA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.028248;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,1:7,3
+chrX	5740439	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.537e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:13,9:10,5
+chrX	6313965	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=4.316e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:6,10:9,2
+chrX	6352929	.	CACACACACACATATATATAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
+chrX	7716394	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0018791;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,4:7,4
+chrX	8960822	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=2.0941e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:11,7:7,7
+chrX	9405116	.	C	G	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.039026;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:23,6:12,3
+chrX	9413850	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.016724;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,3:13,1
+chrX	9976423	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0031242;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:8,13:0,0
+chrX	10691809	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.077531;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:17,3:13,2
+chrX	11656387	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00011173;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:12,6:11,5
+chrX	13128799	.	G	GTA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:3,4:9,1
+chrX	14487387	.	TA	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,3:2,2
+chrX	14604543	.	AGTGTGT	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,5:1,1
+chrX	14933447	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,5:4,3
+chrX	15397163	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.1811e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,17:3,9:12,8
+chrX	15675424	.	TG	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.051974;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:15,3:18,2
+chrX	15742793	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.5776e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:10,8:8,6
+chrX	15975953	.	TTC	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0087495;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,3:3,5
+chrX	18155664	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.031941;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,4:5,2
+chrX	18550063	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0025995;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:14,5:20,5
+chrX	19634031	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.23867;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,3:12,2:4,1
+chrX	20141814	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=3.7627e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:8,9:14,8
+chrX	21235464	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0030624;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:11,5:8,5
+chrX	23065635	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=2.3891e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:3,6:4,6
+chrX	23350060	.	TAAAAAA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.001482;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,11:5,6:2,5
+chrX	24741874	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=8.5672e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:9,4:4,7
+chrX	25466850	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.6055e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,7:9,3
+chrX	25998490	.	G	GCACACACACACACACACA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010459;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,7:6,6:6,1
+chrX	26792298	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,8:5,7:1,1
+chrX	26870981	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0022747;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:13,7:2,1
+chrX	29218352	.	AT	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00024436;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,2:11,6
+chrX	31588872	.	GT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0009828;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,5:5,3
+chrX	31748518	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=5.2411e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:6,6:5,7
+chrX	32592107	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=4.2654e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:11,9:8,9
+chrX	32710937	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.3982e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,23:5,6:7,17
+chrX	33062862	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=6.5751e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:5,5:13,8
+chrX	33129325	.	CTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:1,4:3,2
+chrX	33908153	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=3.1587e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:9,9:5,4
+chrX	35405459	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0049024;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,2:8,3
+chrX	35678154	.	AT	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.003791;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:10,4:12,5
+chrX	39563033	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0060979;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,1:5,4
+chrX	39733942	.	AGGAT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.030143;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,4:6,4
+chrX	41648794	.	CT	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.1718e-05;SS=2;SSC=49;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:7,5:11,12
+chrX	42022824	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,4:2,1
+chrX	43589283	.	TA	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
+chrX	44852267	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,2:6,2
+chrX	45220178	.	T	TA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.16358;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:17,3:5,1
+chrX	47856048	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.015905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:3,6:1,2
+chrX	48091469	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,3:8,5
+chrX	48096043	.	G	GAAA	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.026017;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:10,8:12,1
+chrX	49341543	.	C	T	0	PASS	DP=331;GPV=1;SPV=0.018877;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:149,20:98,12:51,8
+chrX	50149916	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018761;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:9,1:11,5
+chrX	51225373	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0018697;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:19,8:10,2
+chrX	53010524	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,2:3,4
+chrX	53181137	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0046664;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:10,4:13,3
+chrX	53507860	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.18182;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,2:0,1:3,1
+chrX	53721402	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0014171;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:16,8:9,1
+chrX	55101106	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=5.9904e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:8,6:5,9
+chrX	55597620	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.015939;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:7,6:9,1
+chrX	55614666	.	A	ATATATATATATCCTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030651;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:5,3:6,2
+chrX	57038082	.	GA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.022121;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:5,5:16,2
+chrX	57306724	.	GTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.025586;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:1,4:10,5
+chrX	63643360	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0037582;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:8,5:7,2
+chrX	65566646	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010777;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:12,3:5,3
+chrX	67184170	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.13094;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,7:7,6:7,1
+chrX	67415469	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,1:3,3
+chrX	67422657	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14184;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:11,2:9,4
+chrX	68650782	.	C	CAAACAAAACA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,6:9,4:6,2
+chrX	69898419	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0026031;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:12,4:8,3
+chrX	70338953	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.049645;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,3:8,1
+chrX	70577735	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=1.6121e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,11:2,8:2,3
+chrX	70632121	.	G	GAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.19805;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:12,5:4,1
+chrX	71364171	.	G	GA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.054928;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:14,3:7,1
+chrX	72057396	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0093175;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:18,3:15,3
+chrX	74070376	.	TAAATA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,4:5,3
+chrX	74388455	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=7.0663e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:4,4:12,7
+chrX	75728930	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0066036;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,5:11,3
+chrX	76106112	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.2339e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:8,6:4,5
+chrX	77073595	.	T	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=8.7225e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:20,25:14,14:6,11
+chrX	78965898	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:6,1:15,3
+chrX	82488047	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0006592;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,4:3,5
+chrX	84591550	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=5.8565e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:6,9:11,4
+chrX	85642275	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00010095;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:8,5:10,6
+chrX	86113285	.	GATTT	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0432;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,2:10,2
+chrX	86140667	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0011868;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:4,8:3,3
+chrX	87211070	.	TTCCTTCCTTCC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,6:3,1:5,5
+chrX	87234171	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,6:6,5:8,1
+chrX	87912589	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00080253;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:11,5:9,3
+chrX	89202018	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00087495;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,9:2,7:2,2
+chrX	89202024	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0035042;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:3,9:1,7:2,2
+chrX	89597156	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:2,2:3,2
+chrX	89900161	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.12189;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,1:10,4
+chrX	89900371	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.21337;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,3:13,1
+chrX	89905042	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0055336;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:0,1:3,4
+chrX	90159408	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0076872;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:9,1:6,5
+chrX	90179343	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0045549;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,3:6,3
+chrX	90315318	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.7786e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:11,9:10,8
+chrX	90824432	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0056817;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:9,4:10,3
+chrX	91215008	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:13,3:4,1
+chrX	91710886	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00012397;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:6,3:8,7
+chrX	92578105	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.016596;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:6,6:10,4
+chrX	93344490	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.010126;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:13,5:9,2
+chrX	96082566	.	T	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
+chrX	96105973	.	CAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,3:4,2
+chrX	97129145	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.049139;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:7,3:12,3
+chrX	97129146	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:2,4:9,1
+chrX	101318824	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.064935;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:2,1:2,1
+chrX	103136865	.	AT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.040844;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:13,3:8,3
+chrX	104310937	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00021607;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:11,6:8,3
+chrX	104465952	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:4,6:6,6
+chrX	106356782	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.9388e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:8,8:16,5
+chrX	107235832	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.3992e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,6:9,5
+chrX	108656846	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.7952e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:10,10:7,3
+chrX	109064210	.	C	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:2,1:5,4
+chrX	109201859	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00034703;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:11,1:10,9
+chrX	109245103	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=1.4033e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,16:6,8:8,8
+chrX	112713503	.	C	CAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011437;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
+chrX	112740421	.	A	AAAG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:11,4:0,0
+chrX	112954507	.	TC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.026636;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:1,2:5,4
+chrX	113025085	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,2:2,3
+chrX	113339159	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,3:3,5
+chrX	114387168	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:7,2:6,2
+chrX	114387169	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,4:6,2:4,2
+chrX	114387198	.	G	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:8,1:8,3
+chrX	115895510	.	A	AT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0078247;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:3,8:4,4
+chrX	116771502	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00014241;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:7,7:13,3
+chrX	117424521	.	A	ATG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,1:9,3
+chrX	117582261	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00052875;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:10,5:14,5
+chrX	118072252	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.041988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,1:10,3
+chrX	119058281	.	CTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:3,3:3,1
+chrX	119615883	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00015402;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:10,8:7,1
+chrX	121762835	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.2826e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:12,7:8,9
+chrX	122588930	.	AT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0030632;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:1,3:6,8
+chrX	122846270	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:1,4:4,1
+chrX	122937514	.	A	AT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.10077;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:25,3:14,1:11,2
+chrX	122945040	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=2.4323e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:5,6:9,9
+chrX	123874694	.	AT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0032406;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:8,9:4,2
+chrX	123937999	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022502;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:8,3:9,4
+chrX	123938000	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.019711;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:9,3:19,4
+chrX	124025140	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00061059;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,6:8,2
+chrX	124088615	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
+chrX	124550761	.	AT	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0026395;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:14,5:8,3
+chrX	124592434	.	GT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:11,4:4,2
+chrX	126737139	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=5.1896e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:5,6:8,9
+chrX	127815860	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0040433;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:9,7:14,5
+chrX	129924283	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.016858;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:3,5:7,1
+chrX	131499198	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0003269;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:13,4:4,8
+chrX	132811663	.	A	AACTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.027668;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:0,2:4,2
+chrX	132923062	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:10,4:8,2
+chrX	134161309	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.021448;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,1:9,3
+chrX	134452113	.	GGA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,8:4,7:4,1
+chrX	134503061	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0017056;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:11,6:6,1
+chrX	135760399	.	G	A	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.036255;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:75,11:56,5:19,6
+chrX	135975981	.	C	CA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11029;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:3,1:1,1
+chrX	138530197	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.218e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:12,8:8,11
+chrX	139667050	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00010405;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,5:6,4
+chrX	141171923	.	T	TA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0143;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,4:6,2
+chrX	141576665	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,1:4,4
+chrX	142607510	.	TA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.014575;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:8,4:7,3
+chrX	143003764	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=1.2376e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:4,7:6,5
+chrX	143901303	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00080797;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:13,9:12,2
+chrX	144115647	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=9.3552e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:10,7:7,3
+chrX	144115648	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.7463e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:10,8:6,4
+chrX	144922972	.	ATATATATT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.001935;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,4:1,3
+chrX	145116759	.	A	AAAAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.020181;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,4:6,6
+chrX	145944797	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0013091;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:5,4:12,3
+chrX	146120230	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.3183e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:6,4:13,9
+chrX	146175122	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=2.481e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,5:10,5
+chrX	146340931	.	TCCTTTCC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024337;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:5,1:7,8
+chrX	146431808	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0009678;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:11,5:10,4
+chrX	147282283	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.023962;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,6:5,1
+chrX	147282284	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.026903;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,6:5,1
+chrX	148625000	.	C	CT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.023954;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:15,3:10,2
+chrX	151449467	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.091614;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,2:15,2
+chrX	151750280	.	GA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0010749;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,6:5,3
+chrX	152241307	.	CTCAGGGG	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0088512;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,5:9,2
+chrX	152265933	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=7.0663e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:10,7:6,4
+chrX	152698051	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020486;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,4:5,2
+chrX	153030841	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0045929;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:16,2:17,7
+chrX	153664066	.	A	AAAAAAAAAAC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:4,3:2,1
+chrX	153860467	.	T	TTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,4:5,2:13,2
+chrX	153870995	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0008665;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:8,5:13,6
+chrX	155018031	.	AT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.017896;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,3:5,1
+chrX	155077239	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.0279e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:14,9:8,8
+chrY	3749578	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,4:1,1
+chrY	11109189	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,3:11,1
+chrY	11136382	.	T	C	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.0018526;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:5,2:31,8
+chrY	11186458	.	A	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.016106;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:26,6:15,6
+chrY	11198115	.	A	T	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.010994;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:26,13:14,6:12,7
+chrY	11198341	.	G	A	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.0070645;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:158,22:78,7:80,15
+chrY	11200655	.	G	T	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.032837;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:77,14:44,7:33,7
+chrY	11226998	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,3:3,1
+chrY	11234720	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013362;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,3:4,3
+chrY	11240233	.	T	G	0	PASS	DP=295;GPV=1;SPV=0.006285;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:119,29:57,9:62,20
+chrY	11240847	.	G	A	0	PASS	DP=255;GPV=1;SPV=0.027677;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:103,18:63,5:40,13
+chrY	11251840	.	A	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.032756;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:20,8:14,2
+chrY	11261967	.	C	T	0	PASS	DP=298;GPV=1;SPV=0.042588;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:126,19:69,11:57,8
+chrY	56837265	.	G	A	0	PASS	DP=337;GPV=1;SPV=0.0027187;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:135,16:72,8:63,8
+chrY	56866220	.	T	C	0	PASS	DP=255;GPV=1;SPV=0.029132;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:88,22:35,4:53,18
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/FGHI_levels.tab	Wed Sep 16 22:58:28 2020 +0000
@@ -0,0 +1,4 @@
+F.vcf	lung
+G.vcf	lung
+H.vcf	ovary
+I.vcf	ovary
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/G.vcf	Wed Sep 16 22:58:28 2020 +0000
@@ -0,0 +1,5437 @@
+##fileformat=VCFv4.2
+##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed">
+##reference=hg38
+##source=varscan.py
+##contig=<ID=chr1,length=248956422>
+##contig=<ID=chr10,length=133797422>
+##contig=<ID=chr11,length=135086622>
+##contig=<ID=chr12,length=133275309>
+##contig=<ID=chr13,length=114364328>
+##contig=<ID=chr14,length=107043718>
+##contig=<ID=chr15,length=101991189>
+##contig=<ID=chr16,length=90338345>
+##contig=<ID=chr17,length=83257441>
+##contig=<ID=chr18,length=80373285>
+##contig=<ID=chr19,length=58617616>
+##contig=<ID=chr2,length=242193529>
+##contig=<ID=chr20,length=64444167>
+##contig=<ID=chr21,length=46709983>
+##contig=<ID=chr22,length=50818468>
+##contig=<ID=chr3,length=198295559>
+##contig=<ID=chr4,length=190214555>
+##contig=<ID=chr5,length=181538259>
+##contig=<ID=chr6,length=170805979>
+##contig=<ID=chr7,length=159345973>
+##contig=<ID=chr8,length=145138636>
+##contig=<ID=chr9,length=138394717>
+##contig=<ID=chrM,length=16569>
+##contig=<ID=chrX,length=156040895>
+##contig=<ID=chrY,length=57227415>
+##filter="SOMATIC"
+##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL">
+##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total depth of quality bases">
+##INFO=<ID=SOMATIC,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates if record is a somatic mutation">
+##INFO=<ID=SS,Number=1,Type=String,Description="Somatic status of variant (0=Reference,1=Germline,2=Somatic,3=LOH, or 5=Unknown)">
+##INFO=<ID=SSC,Number=1,Type=String,Description="Somatic score in Phred scale (0-255) derived from somatic p-value">
+##INFO=<ID=GPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor+normal versus no variant for Germline calls">
+##INFO=<ID=SPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor versus normal for Somatic/LOH calls">
+##FILTER=<ID=str10,Description="Less than 10% or more than 90% of variant supporting reads on one strand">
+##FILTER=<ID=indelError,Description="Likely artifact due to indel reads at this position">
+##FILTER=<ID=VarCount,Description="Fewer than 4 variant-supporting reads">
+##FILTER=<ID=VarFreq,Description="Variant allele frequency below 0.05">
+##FILTER=<ID=VarAvgRL,Description="Average clipped length of variant-supporting reads < 90">
+##FILTER=<ID=VarReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
+##FILTER=<ID=VarDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
+##FILTER=<ID=VarMMQS,Description="Average mismatch quality sum for variant reads > 100">
+##FILTER=<ID=VarMapQual,Description="Average mapping quality of variant reads < 15">
+##FILTER=<ID=VarBaseQual,Description="Average base quality of variant reads < 15">
+##FILTER=<ID=Strand,Description="Strand representation of variant reads < 0.01">
+##FILTER=<ID=RefAvgRL,Description="Average clipped length of ref-supporting reads < 90">
+##FILTER=<ID=RefReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
+##FILTER=<ID=RefDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
+##FILTER=<ID=RefMapQual,Description="Average mapping quality of reference reads < 15">
+##FILTER=<ID=RefBaseQual,Description="Average base quality of ref-supporting reads < 15">
+##FILTER=<ID=RefMMQS,Description="Average mismatch quality sum for ref-supporting reads > 100">
+##FILTER=<ID=MMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) > 50">
+##FILTER=<ID=MinMMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) < 50">
+##FILTER=<ID=MapQualDiff,Description="Mapping quality difference (ref - var) > 50">
+##FILTER=<ID=MaxBAQdiff,Description="Average base quality difference (ref - var) > 50">
+##FILTER=<ID=ReadLenDiff,Description="Average supporting read length difference (ref - var) > 0.25">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype code">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality">
+##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
+##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele">
+##FORMAT=<ID=ADF,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the forward strand">
+##FORMAT=<ID=ADR,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the reverse strand">
+#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	TUMOR
+chr1	38775	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr1	52058	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.041853;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:18,4:22,3
+chr1	93819	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.076076;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:23,1:9,5
+chr1	136733	.	G	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,2:6,2
+chr1	136764	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.32759;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:9,2:9,1
+chr1	181917	.	G	T	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.0094908;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:55,20:34,8:21,12
+chr1	188252	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.067805;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:22,2:21,5
+chr1	610844	.	G	A	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=9.8076e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:40,21:18,11:22,10
+chr1	692574	.	T	C	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.024095;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:84,10:49,1:35,9
+chr1	872970	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.17641;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,1:10,3
+chr1	2675066	.	G	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.014863;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:79,14:63,12:16,2
+chr1	3287407	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.20253;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,2:13,2
+chr1	3908420	.	GTCTCTCTCTC	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:6,4:3,1
+chr1	4751034	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.0893e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:25,27:14,18:11,9
+chr1	6421408	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00012338;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:14,6:12,6
+chr1	6929498	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.5271e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:15,8:11,7
+chr1	6963302	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:2,3:11,1
+chr1	8366915	.	AC	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.015626;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:15,2:7,5
+chr1	8490999	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=1.6895e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:29,22:14,12:15,10
+chr1	9131231	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:7,2:7,1:0,1
+chr1	9845814	.	CAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00090577;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:6,10:2,2
+chr1	10332501	.	ATT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,1:5,5
+chr1	11041404	.	G	GTGGATGGA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:5,4:2,1
+chr1	11771031	.	ATG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,5:3,3:5,2
+chr1	12285929	.	CTTCCT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035568;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,3:8,2
+chr1	12809352	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.041843;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,11:12,9:11,2
+chr1	12867528	.	TTTCTTTC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:2,1:6,6
+chr1	12877779	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,3:8,1
+chr1	13048038	.	A	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,2:5,2
+chr1	13308308	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10903;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:5,2:29,2
+chr1	13320513	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=2.9276e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,22:22,12:6,10
+chr1	13391530	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.9796e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:13,3:11,8
+chr1	14497335	.	TAAA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,8:5,7:3,1
+chr1	15448170	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.059571;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:7,6:10,3
+chr1	16513214	.	C	G	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.022218;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:73,12:49,6:24,6
+chr1	16533137	.	A	G	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.012934;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:60,10:30,4:30,6
+chr1	16534573	.	C	T	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.021029;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:56,16:21,3:35,13
+chr1	16572153	.	G	A	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.018439;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:88,17:53,8:35,9
+chr1	16591685	.	C	T	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.018042;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:72,19:26,6:46,13
+chr1	16674332	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.043448;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:26,3:13,7
+chr1	16687956	.	C	CA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.012849;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:17,5:12,9
+chr1	16728743	.	C	T	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.028883;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:82,14:41,6:41,8
+chr1	16747651	.	G	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
+chr1	16896032	.	C	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0005299;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:39,9:14,2
+chr1	16969810	.	C	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=7.827e-09;SS=2;SSC=81;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:29,31:17,12:12,19
+chr1	17352065	.	GGTGGGAA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,1:10,3
+chr1	18700080	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.054436;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:19,3:16,3
+chr1	18795159	.	CATAAAATAAAATAAA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.032529;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,8:15,3:5,5
+chr1	18940562	.	C	CGGAT	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0036346;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:14,7:13,10
+chr1	19874142	.	C	CCACCACCACCATCACCACCACCACCAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,4:12,3:14,1
+chr1	19965980	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,2:3,3
+chr1	20475026	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=1.4245e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:30,19:12,9:18,10
+chr1	20559688	.	GGTGTGT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:7,3:1,2
+chr1	20580501	.	C	CAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,6:6,5:4,1
+chr1	20655174	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.075416;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:13,4:17,2
+chr1	21435430	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=4.1499e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:15,10:11,7
+chr1	21576218	.	T	TGATG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.010902;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,8:10,5:12,3
+chr1	21576287	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.034034;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:18,4:7,1
+chr1	22898118	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.041509;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,13:10,10:7,3
+chr1	23837636	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1371;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:12,3:5,3
+chr1	26109124	.	G	GT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0058313;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:6,7:10,2
+chr1	27204812	.	G	GTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:8,2:5,2
+chr1	27680860	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,2:3,1:4,1
+chr1	27899512	.	AG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,1:9,3
+chr1	28847055	.	G	GTCCCCTTTCCTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.010106;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,8:5,4:6,4
+chr1	29307749	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,2:8,3
+chr1	29503981	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=3.8811e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:27,21:15,11:12,10
+chr1	30465017	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr1	30468602	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00020157;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:15,9:14,4
+chr1	31038986	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.022357;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,8:10,3:8,5
+chr1	31254369	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,2:1,1:4,1
+chr1	31842010	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0098105;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:5,3:2,2
+chr1	31986380	.	TAATAA	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16049;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:14,4:17,1
+chr1	32648963	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,5:7,2
+chr1	32699153	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0015083;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,6:1,4:1,2
+chr1	32974597	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.059571;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:7,3:10,5
+chr1	32990704	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0052761;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:8,9:3,1
+chr1	33695543	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=3.2519e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:14,7:20,7
+chr1	33975486	.	T	TACACACACACACACAC	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.037106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,8:14,4:15,4
+chr1	34254910	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0021249;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:12,6:4,7
+chr1	34922969	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.8239e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:6,5:11,8
+chr1	35050454	.	C	CTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:6,7:5,1
+chr1	35800326	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.043948;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,5:16,4:11,1
+chr1	37131785	.	CCTTCCTTCCTT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,0:6,4
+chr1	39579857	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,5:5,3:6,2
+chr1	39764267	.	A	AT	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.017728;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:37,18:20,12:17,6
+chr1	40291839	.	C	CTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0045803;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:11,4:5,3
+chr1	40730964	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00013412;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:17,5:14,9
+chr1	40934307	.	A	ATGTATTTATTTATTTG	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0018492;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,13:13,9:8,4
+chr1	41018828	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.011166;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,5:4,4
+chr1	42545186	.	A	AAAAAAAT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:6,2:4,3
+chr1	42887127	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.0668e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:15,11:11,6
+chr1	43281408	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016716;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:11,5:2,1
+chr1	43686151	.	G	GT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,8:2,4:2,4
+chr1	44597468	.	GCACACACACA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018307;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,12:3,7:2,5
+chr1	45611456	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:4,5:2,1
+chr1	46171705	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.1812e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:21,25:11,13:10,12
+chr1	46235123	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.008898;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:8,4:2,7
+chr1	46290916	.	G	GTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,4:3,2:4,2
+chr1	49087734	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.8539e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:10,7:12,12
+chr1	50219767	.	A	ATG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:2,4:2,1:0,3
+chr1	51929784	.	TG	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.3557e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:8,11:15,5
+chr1	53097955	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:17,3:5,1
+chr1	53203775	.	CTT	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.079656;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,2:14,2
+chr1	53284251	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12563;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:19,5:9,2
+chr1	53378059	.	C	CAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.28876;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,4:16,3:9,1
+chr1	53462097	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.2621e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:12,10:8,9
+chr1	54561922	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020884;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:3,4:13,5
+chr1	54562373	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0024657;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:6,3:5,8
+chr1	54828365	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=8.5758e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:17,10:7,7
+chr1	55792004	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.09755;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:14,1:19,3
+chr1	55799118	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,1:2,3
+chr1	57606559	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.029368;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,2:6,5
+chr1	59557756	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=2.1926e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:15,13:9,7
+chr1	61668090	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,2:8,2
+chr1	63997844	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.059824;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,4:9,2:13,2
+chr1	65519152	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,2:8,2
+chr1	65563555	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:14,4:7,1
+chr1	66631681	.	TTCTCTCTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,6:2,1
+chr1	67164653	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.027873;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,4:9,6
+chr1	67786949	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.010783;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:11,4:13,6
+chr1	68444324	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=1.5227e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:29,17:12,8:17,9
+chr1	69526605	.	CAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,5:3,1
+chr1	69916165	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.019285;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,2:5,2
+chr1	70669231	.	GTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:6,2:1,2
+chr1	71310903	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:4,7:2,1
+chr1	71329711	.	G	GTTA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0071456;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:9,7:17,4
+chr1	71358681	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=6.3166e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:15,8:18,6
+chr1	72712614	.	CAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:5,4:0,0
+chr1	72998125	.	T	TACAC	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0043853;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,12:13,4:14,8
+chr1	73996641	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.042547;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,5:9,1:4,4
+chr1	74471845	.	G	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.774e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:30,24:13,10:17,14
+chr1	74978805	.	TA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.6729e-07;SS=2;SSC=65;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:4,22:1,11:3,11
+chr1	75378068	.	TG	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,1:9,3
+chr1	75710562	.	TAAA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:1,6:6,1
+chr1	76872068	.	A	AAC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.011976;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:12,12:8,7:4,5
+chr1	80462558	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=5.8035e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:12,5:12,11
+chr1	80943296	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,1:4,3
+chr1	82381401	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0082862;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:9,7:9,5
+chr1	83103986	.	ATGTACG	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.082408;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:14,2:17,2
+chr1	83446760	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0092573;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:18,4:16,6
+chr1	84601128	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.0081e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:29,23:15,13:14,10
+chr1	86828934	.	CAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.011272;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:4,7:6,2
+chr1	88874069	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00096111;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:15,5:17,7
+chr1	90643879	.	T	TTTCTTTC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.33319;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:6,1:20,3
+chr1	91951039	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,4:10,1:10,3
+chr1	91952819	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=2.7175e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,4:8,8
+chr1	91958124	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=8.5186e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:23,25:10,10:13,15
+chr1	92467452	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=3.8603e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:10,11:15,9
+chr1	93396901	.	T	TA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065833;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,6:12,3:9,3
+chr1	93777402	.	T	TTCCTCTTCC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.29549;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,4:8,2:12,2
+chr1	96364934	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=3.5118e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:8,13:12,5
+chr1	97525758	.	T	TAGAGAGAG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0054686;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:14,5:7,9
+chr1	97656966	.	A	AT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.036548;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,7:6,6:8,1
+chr1	100915256	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.12547;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:9,1:15,3
+chr1	101846998	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.5507e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:9,8:11,7
+chr1	102648603	.	A	ACC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018839;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,2:6,6
+chr1	103199869	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011401;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:4,6:2,1
+chr1	104438856	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.1102e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:11,10:7,9
+chr1	104883578	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.068498;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,1:14,3
+chr1	104964690	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0034427;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:4,6:11,6
+chr1	105395278	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,4:1,1
+chr1	105522363	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:21,3:7,1
+chr1	105939139	.	C	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=6.7637e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:29,21:6,7:23,14
+chr1	106912405	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.0704e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:18,21:8,12:10,9
+chr1	107049530	.	GT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0054674;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:7,7:4,3
+chr1	107112163	.	TA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.01652;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,2:10,3
+chr1	107209895	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11839;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:13,2:20,2
+chr1	107968049	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,4:13,1:13,3
+chr1	108229759	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,0:9,4
+chr1	108458398	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
+chr1	110213170	.	T	TAAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,4:8,3:2,1
+chr1	110374011	.	A	ATATATATATATATATATATCCTTAGTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.026055;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:11,3:8,5
+chr1	111594590	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.055299;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:17,5:7,1
+chr1	113129309	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:8,9:2,8:6,1
+chr1	114689570	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.2913e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:27,29:11,18:16,11
+chr1	115355591	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.030002;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:14,3:13,4
+chr1	115414865	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.1015e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:29,21:19,14:10,7
+chr1	116263076	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=1.3876e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:29,27:15,18:14,9
+chr1	116934531	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.8872e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:2,4:15,8
+chr1	117196403	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=2.6346e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:11,23:5,13:6,10
+chr1	117504330	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.085385;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,1:18,3
+chr1	118089354	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.37127;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:13,2:13,2
+chr1	118324442	.	T	TTC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:2,2:7,3
+chr1	119843465	.	C	CTTTTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,7:1,5:4,2
+chr1	120379034	.	C	CTT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0071208;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:11,9:16,7
+chr1	120418603	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0037422;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:11,11:8,4
+chr1	120508455	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,5:2,1
+chr1	120560460	.	C	CAT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.055494;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,3:13,1
+chr1	120563830	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12206;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,3:12,1
+chr1	120704427	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.052515;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:17,3:9,1
+chr1	121126844	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.016771;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:9,8:2,1
+chr1	121202431	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.025405;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:14,6:10,4
+chr1	121238011	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,1:8,3
+chr1	121341391	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,3:6,1
+chr1	121640231	.	C	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,3:2,2
+chr1	121731784	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,6:6,1
+chr1	121764804	.	T	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.0015366;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:90,12:29,10:61,2
+chr1	121777230	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.094058;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:14,3:22,1
+chr1	121793875	.	AG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,3:17,1
+chr1	121793879	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.25496;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:9,3:18,1
+chr1	121803036	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:13,3:15,5
+chr1	121814437	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.21541;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:0,1:36,3
+chr1	121841017	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.023578;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:15,5:9,4
+chr1	121925466	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.16752;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:9,3:16,2
+chr1	122043610	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.13105;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:9,4:12,1
+chr1	122091755	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,1:6,1
+chr1	122181447	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr1	122282736	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0050701;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,14:2,1:20,13
+chr1	122293456	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,2:5,2
+chr1	122345629	.	G	T	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.022505;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:60,13:9,4:51,9
+chr1	122390092	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.05461;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,1:8,3
+chr1	124797823	.	A	T	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.040389;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:66,11:38,8:28,3
+chr1	124829379	.	T	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.049793;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,6:8,2
+chr1	124843346	.	GC	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.031046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:5,1:16,4
+chr1	124856963	.	CT	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.083854;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:30,2:6,3
+chr1	124858310	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.090728;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:3,3:18,3
+chr1	124869470	.	C	T	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.0050296;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:110,20:90,16:20,4
+chr1	124877015	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.038459;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:18,5:10,6
+chr1	124893993	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.050238;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:18,3:23,2
+chr1	124901802	.	AG	A	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.012137;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:59,10:36,6:23,4
+chr1	124901833	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0071318;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:25,4:12,3
+chr1	124926649	.	G	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0737;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:15,3:0,3
+chr1	124929931	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,2:9,5
+chr1	124929932	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.029984;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:3,2:5,4
+chr1	125124300	.	G	A	0	PASS	DP=360;GPV=1;SPV=0.041751;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:181,31:100,12:81,19
+chr1	125147758	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.15614;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,4:15,1:13,3
+chr1	125183179	.	G	C	0	PASS	DP=1545;GPV=1;SPV=8.5196e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:919:812,102:91,3:721,99
+chr1	143185074	.	G	C	0	PASS	DP=2826;GPV=1;SPV=0.0075839;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:1512:1314,173:705,113:609,60
+chr1	143212534	.	G	A	0	PASS	DP=14005;GPV=1;SPV=0.00031864;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7467:6550,830:2892,534:3658,296
+chr1	143216012	.	A	C	0	PASS	DP=928;GPV=1;SPV=0.0030993;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:533:464,64:130,19:334,45
+chr1	143230867	.	G	C	0	PASS	DP=288;GPV=1;SPV=0.035681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:130,27:79,16:51,11
+chr1	143239214	.	T	G	0	PASS	DP=497;GPV=1;SPV=0.00014353;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:277:220,57:159,37:61,20
+chr1	143255660	.	C	G	0	PASS	DP=7301;GPV=1;SPV=0.0048443;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:4112:3187,422:1670,104:1517,318
+chr1	143443500	.	C	T	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.046114;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:62,8:25,7:37,1
+chr1	143758803	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11275;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:10,4:9,1
+chr1	144103864	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.07667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:8,1:26,5
+chr1	144480297	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.043024;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:6,7:14,2
+chr1	145411387	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.01726;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:2,5:9,5
+chr1	145780618	.	T	TA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024928;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,9:11,6:4,3
+chr1	146333876	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0062802;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:8,8:14,2
+chr1	146333962	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.15847;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:10,1:14,4
+chr1	146337736	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:0,0:16,4
+chr1	146366233	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.037277;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:12,5:21,8
+chr1	148815547	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,5:8,4:9,1
+chr1	149046625	.	G	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.022117;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,4:8,4
+chr1	149046626	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.025362;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:9,3:6,4
+chr1	149054280	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.020191;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:7,2:9,8
+chr1	149144781	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.014227;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:19,1:11,8
+chr1	149176408	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.04667;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:18,4:18,5
+chr1	149241005	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,3:7,1
+chr1	149393069	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.03685;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:8,4:5,2
+chr1	150229296	.	T	TTA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,1:15,4
+chr1	150423793	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:3,2:1,1:2,1
+chr1	150501293	.	CAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,7:4,1
+chr1	151497704	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:3,5:5,1
+chr1	151600822	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.027999;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:7,6:7,2
+chr1	151637339	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.1014e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:29,22:17,11:12,11
+chr1	151932761	.	TATATATATATATATATATATATATATACAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0076326;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:10,8:3,3
+chr1	152228065	.	AAT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:4,2:2,2
+chr1	152645481	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.1644e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:20,23:9,9:11,14
+chr1	153859914	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:8,6:7,1
+chr1	154676330	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00012241;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:14,4:11,10
+chr1	155876235	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,5:4,3:7,2
+chr1	157178895	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.17001;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,6:10,3:7,3
+chr1	158123253	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.1971e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:36,18:16,6:20,12
+chr1	159021939	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,2:4,6
+chr1	159755212	.	TA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,3:13,1
+chr1	160732207	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.2259e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:29,25:15,11:14,14
+chr1	160984686	.	A	ATG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18941;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:25,3:18,1:7,2
+chr1	161055905	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0050131;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,9:8,4:6,5
+chr1	161661251	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.01652;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,5:17,4:6,1
+chr1	161728460	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.014395;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:13,7:7,3
+chr1	162416406	.	A	AAGAG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.047734;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:22,6:9,1
+chr1	163656351	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.013096;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:5,7:9,4
+chr1	164229777	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=7.7636e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:9,10:12,4
+chr1	164435466	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.0563e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:31,24:13,10:18,14
+chr1	166285268	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=6.9014e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,19:5,9:7,10
+chr1	170585727	.	T	TAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0041408;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:3,5:5,3
+chr1	171225139	.	TTATATATA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,9:5,3:2,6
+chr1	171835883	.	CAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.054634;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,8:9,7:5,1
+chr1	172304206	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,7:4,2
+chr1	172747690	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.012087;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:4,5:8,3
+chr1	172835631	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.2979e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:12,5:10,10
+chr1	172901636	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=6.6277e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:24,23:15,6:9,17
+chr1	173630818	.	TA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:9,6:0,1
+chr1	175207798	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.5139e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:23,26:11,13:12,13
+chr1	176042270	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,5:1,4:1,1
+chr1	176275360	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,9:8,7:3,2
+chr1	176300459	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.0582e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,20:11,7:8,13
+chr1	176836611	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.9689e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:11,9:6,10
+chr1	177075433	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.7744e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,20:7,12:11,8
+chr1	177402840	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0037194;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:24,1:19,7
+chr1	177594049	.	TA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:7,2:10,3
+chr1	178030248	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.8231e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:13,7:11,11
+chr1	178164504	.	T	TGTGC	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.019231;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,7:11,4:22,3
+chr1	178590468	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022983;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,4:9,7
+chr1	178650426	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.039412;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:8,5:1,1
+chr1	178695591	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.034818;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:13,6:8,2
+chr1	178695713	.	T	TA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.26692;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,4:7,3:11,1
+chr1	179013365	.	C	CAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010901;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:9,8:6,4
+chr1	179295966	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:7,2:6,2
+chr1	180559644	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.0858e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,22:9,12:15,10
+chr1	180575130	.	TTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.020561;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:5,3:15,6
+chr1	180588706	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:13,2:5,2
+chr1	180711722	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.3202e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:11,9:6,8
+chr1	181537106	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,4:8,2:3,2
+chr1	182109765	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,9:4,6:3,3
+chr1	183156625	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,5:2,1
+chr1	183624519	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.039341;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:4,4:2,1:2,3
+chr1	184024655	.	C	CTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.012912;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:13,8:5,3
+chr1	185494559	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1599;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:7,4:12,2
+chr1	186652267	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033264;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:2,3:11,3
+chr1	187257763	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.047467;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:14,5:10,6
+chr1	187303719	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0074752;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,9:4,2:2,7
+chr1	187303763	.	CCTTCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:3,1:11,4
+chr1	188985760	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.2273e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:20,24:7,6:13,18
+chr1	190260557	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00051706;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:14,5:9,5
+chr1	190706678	.	TC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:9,11:4,5:5,6
+chr1	190959631	.	GTA	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.038416;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,5:13,3:8,2
+chr1	191433483	.	A	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:3,3:2,1
+chr1	191703593	.	A	AT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,5:5,3:5,2
+chr1	192223097	.	GTGTA	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.048788;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,8:10,5:14,3
+chr1	192320520	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.048018;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:19,4:14,2
+chr1	193941137	.	GTATATATATATA	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:4,2:3,1:1,1
+chr1	194212699	.	A	AATATATAT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:3,4:3,2
+chr1	194623934	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=5.4453e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:25,23:14,14:11,9
+chr1	194768659	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12206;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,2:12,2
+chr1	195632162	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025213;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,5:4,1
+chr1	195990677	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:2,2:5,6
+chr1	196638281	.	AAAAAG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,3:3,1
+chr1	196714597	.	ATG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,7:6,2
+chr1	197951046	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,8:2,6:2,2
+chr1	198660503	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.08973;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:19,1:20,4
+chr1	198660504	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.1268;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:15,1:21,3
+chr1	198983869	.	C	CTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0018037;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:4,12:3,10:1,2
+chr1	200164867	.	GT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.056741;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,5:3,2
+chr1	200938862	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:5,3:3,1
+chr1	201007285	.	CACAG	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.39535;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,2:14,2
+chr1	201178375	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,5:5,1
+chr1	201266373	.	T	TTTCC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:1,0:13,4
+chr1	202971255	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.086046;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:12,4:6,4
+chr1	203724118	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=6.4115e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:11,9:13,5
+chr1	204660581	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.013387;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:8,7:4,4:4,3
+chr1	206171646	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:3,5:0,2
+chr1	206255661	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.19282;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,3:14,1
+chr1	207057302	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.017537;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,8:15,7:5,1
+chr1	209084697	.	CTCACATGTTGTGAAGCTACCT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.036961;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:9,6:14,4
+chr1	209215742	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=9.9977e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:28,27:19,15:9,12
+chr1	209827240	.	CT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.4893;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,4:9,3:9,1
+chr1	212136772	.	T	TA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0036299;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,17:12,10:9,7
+chr1	212210698	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.016188;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:6,4:10,7
+chr1	212771611	.	C	CAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,4:7,1
+chr1	212806856	.	ATATG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0055835;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,8:2,7:3,1
+chr1	212886042	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:7,7:7,1
+chr1	213319312	.	C	CAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,8:1,7:4,1
+chr1	214741429	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.5451e-09;SS=2;SSC=88;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:13,24:8,10:5,14
+chr1	214796417	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:3,2:14,3
+chr1	215312157	.	CATATAT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,5:1,3:1,2
+chr1	215764977	.	T	TA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=3.1405e-06;SS=2;SSC=55;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,21:13,14:13,7
+chr1	216084534	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00030969;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:30,16:13,9:17,7
+chr1	218720878	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,2:5,1
+chr1	219353072	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=3.1863e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:25,17:11,5:14,12
+chr1	219598196	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.013119;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:19,3:23,6
+chr1	219655529	.	ATGATAGAT	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:9,4:3,2:6,2
+chr1	219747368	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,1:11,3
+chr1	220214946	.	T	TTATATATATA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:4,3:1,3
+chr1	220311319	.	CTTCTTTCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.18323;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:23,3:6,2:17,1
+chr1	220965682	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.031574;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,7:9,4:20,3
+chr1	221279608	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:2,2:17,2
+chr1	221916527	.	GAC	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.032095;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:16,6:8,4:8,2
+chr1	221920288	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,2:2,3
+chr1	222308853	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:7,8:5,2
+chr1	222480478	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0066111;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,4:11,5
+chr1	222754232	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0021846;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,11:5,8:3,3
+chr1	223692817	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.6283e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:8,5:13,12
+chr1	223855748	.	T	TA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.059347;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:15,7:9,1
+chr1	223963079	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0013797;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,9:1,7:2,2
+chr1	224209064	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.013912;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,10:11,8:10,2
+chr1	226243695	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0015608;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,5:2,1
+chr1	226844827	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01473;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:5,8:6,6
+chr1	226845216	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.026716;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,8:10,7:7,1
+chr1	226960345	.	G	GTGGTGGTGCT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.18393;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,3:14,1
+chr1	226960383	.	G	GTGATGGTACT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,3:9,1
+chr1	230038337	.	AGG	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.079426;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:26,3:10,1
+chr1	230626692	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.20263;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,5:11,2:10,3
+chr1	230986668	.	ATTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,3:4,1
+chr1	232314349	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.016158;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:12,6:14,1
+chr1	233285686	.	C	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.045641;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:31,5:19,2:12,3
+chr1	233400932	.	C	CA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.018721;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:12,11:13,2
+chr1	234181071	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.537e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:15,7:7,12
+chr1	234995695	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.032711;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,10:17,8:12,2
+chr1	235353791	.	T	TGTTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.064595;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:7,4:12,1
+chr1	235924946	.	T	TACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.030046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,7:5,4:5,3
+chr1	235924960	.	CACACACAT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,7:1,3:3,4
+chr1	235961336	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,7:7,1
+chr1	236106068	.	G	GT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00032973;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:6,7:10,5
+chr1	236279504	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.043812;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,10:15,8:9,2
+chr1	237077437	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.031538;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,6:11,2
+chr1	237133924	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:8,9:6,8:2,1
+chr1	237536714	.	C	CAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.019247;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:14,7:5,2
+chr1	237795838	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.026412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,2:13,3
+chr1	237883979	.	CACAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.076601;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,7:7,5:5,2
+chr1	239563916	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=5.9535e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:30,24:16,12:14,12
+chr1	240708216	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=2.0574e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:20,25:8,19:12,6
+chr1	240916109	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.020644;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:8,6:5,3
+chr1	241562906	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,2:5,1:2,1
+chr1	241771945	.	CAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:2,8:2,1
+chr1	243317319	.	A	AT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.039035;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,13:17,6:14,7
+chr1	244479028	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:10,3:5,1
+chr1	245281529	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.027239;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:8,8:11,1
+chr1	246825912	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.030728;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,5:8,1:8,4
+chr1	248170703	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.081098;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:14,1:19,3
+chr1	248383360	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
+chr1	248657457	.	T	TAC	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.034303;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:22,10:21,2
+chr1	248753485	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,4:4,2
+chr1	248753486	.	CAT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,4:4,2
+chr10	53793	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0083305;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:11,6:9,3
+chr10	1159831	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.042775;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:13,2:11,4
+chr10	1499307	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=1.9296e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:3,14:2,10:1,4
+chr10	1777971	.	CTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.017385;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:1,5:2,1
+chr10	2544339	.	G	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=3.7128e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:30,19:18,8:12,11
+chr10	2562056	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.8465e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:12,6:12,8
+chr10	3179629	.	T	TGTGTC	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.029934;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:12,5:6,1
+chr10	3318475	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:15,2:10,2
+chr10	3440844	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.049115;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:22,5:19,1
+chr10	3545930	.	G	GTTATTA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.039741;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:7,2:10,6
+chr10	4513347	.	A	ATTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0023616;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:10,13:6,2
+chr10	5249117	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.16149;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:10,3:6,1:4,2
+chr10	5428038	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0027337;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:10,11:5,4:5,7
+chr10	5428047	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,9:5,4:3,5
+chr10	6115875	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:8,4:8,2:0,2
+chr10	6161643	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.018989;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:13,7:8,6
+chr10	6206367	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,3:5,1
+chr10	6345669	.	C	CCATCCATCCATCCATG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:18,4:5,1
+chr10	6410976	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.046544;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:14,8:3,1
+chr10	6819421	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0017612;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,5:4,4
+chr10	6819425	.	CG	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0017841;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,5:4,4
+chr10	6911780	.	CTT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,2:11,2
+chr10	7113568	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:3,3:0,2
+chr10	8084592	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.048243;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,7:12,5:8,2
+chr10	10759296	.	CTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:3,6:3,1
+chr10	10988298	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.0959e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,15:16,10:9,5
+chr10	11426859	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:6,4:2,1
+chr10	11736399	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:13,3:3,1
+chr10	12007833	.	AG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.041563;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,4:3,1:4,3
+chr10	12267997	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00030073;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,13:2,5:4,8
+chr10	12307313	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:15,3:5,2
+chr10	12333229	.	A	AAAAAAAAAC	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.030024;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,11:13,9:9,2
+chr10	12564155	.	C	CTGTCTG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,6:10,3:8,3
+chr10	12644826	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.728e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:13,13:15,6
+chr10	13072859	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.01441;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,2:7,5
+chr10	14039459	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:9,9:6,3:3,6
+chr10	14280982	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0094549;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,4:4,3
+chr10	14339933	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=2.3136e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,23:7,9:14,14
+chr10	14517750	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.087004;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:16,2:16,2
+chr10	14690027	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:25,3:1,1
+chr10	15052729	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.032;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:13,6:4,1
+chr10	15287091	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037022;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,8:13,7:5,1
+chr10	17404064	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:4,9:4,2
+chr10	17507626	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.1396;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,5:12,3:12,2
+chr10	18107602	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.6406e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:17,7:9,7
+chr10	18137133	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,1:14,3
+chr10	18787462	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0091605;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:8,3:8,3
+chr10	19334119	.	G	GTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,7:3,3:6,4
+chr10	19695519	.	CTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:10,13:6,8:4,5
+chr10	19876601	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,4:5,1
+chr10	20217596	.	CTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,8:2,7:2,1
+chr10	20914969	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.029113;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:11,6:7,4
+chr10	21408723	.	C	CTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,9:8,7:1,2
+chr10	21813165	.	TCTCTCTCTCC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:7,1:9,3
+chr10	23136121	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.048713;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,10:10,9:3,1
+chr10	24018556	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.3;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:7,2:0,1:7,1
+chr10	24656407	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:6,3:17,1
+chr10	24829333	.	CTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12909;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:8,1:23,5
+chr10	25403110	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=7.0452e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:28,20:11,13:17,7
+chr10	26240731	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0086905;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:11,7:7,5
+chr10	26245250	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=2.174e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:11,5:5,7
+chr10	28155598	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.022459;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:10,4:3,1
+chr10	28347052	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.034034;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:14,2:11,3
+chr10	29037896	.	A	ATTAT	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.015407;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,13:9,6:16,7
+chr10	30679362	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.084652;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:24,3:11,1
+chr10	31670539	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.027747;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:17,7:15,3
+chr10	32061248	.	C	CAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0048547;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,9:5,7:4,2
+chr10	32619910	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,12:8,4:4,8
+chr10	33870971	.	T	TAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.20486;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,3:17,2:4,1
+chr10	34492615	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=5.8377e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:25,28:15,17:10,11
+chr10	34851877	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,8:5,2:5,6
+chr10	35497726	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.022827;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,12:18,10:1,2
+chr10	35514075	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:8,3:1,1
+chr10	36768081	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.5203e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:10,7:18,8
+chr10	38112798	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0082728;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,10:5,6:8,4
+chr10	38633095	.	C	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=1.6658e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:49,18:24,9:25,9
+chr10	38716636	.	A	AT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00099441;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:12,8:4,1
+chr10	38812968	.	CCATTCCATTT	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026083;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:18,7:8,6
+chr10	38891590	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:6,4:3,2
+chr10	38911635	.	ACAGTGGAGTG	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
+chr10	38920914	.	C	G	0	PASS	DP=269;GPV=1;SPV=0.0065695;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:121,30:68,13:53,17
+chr10	38932039	.	A	AG	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.022433;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:46,8:32,7:14,1
+chr10	38966310	.	C	CACAA	0	PASS	DP=363;GPV=1;SPV=0.038776;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:172,25:93,14:79,11
+chr10	38969377	.	C	G	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.00080513;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:24,9:15,7
+chr10	38973239	.	CT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00045089;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:7,8:10,3
+chr10	39691510	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.011374;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:3,6:2,4
+chr10	39719987	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.046828;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:28,4:7,5
+chr10	39845077	.	C	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.049919;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:36,5:7,1
+chr10	40066085	.	C	T	0	PASS	DP=451;GPV=1;SPV=0.028977;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:242:208,33:47,5:161,28
+chr10	40217971	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.040749;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:12,12:17,2
+chr10	40387974	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:19,1:2,3
+chr10	40408508	.	C	A	0	PASS	DP=249;GPV=1;SPV=0.0081709;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:110,17:82,15:28,2
+chr10	40426686	.	A	G	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.0093405;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:66,8:18,4:48,4
+chr10	40484098	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.19282;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:10,3:17,1
+chr10	40541808	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:18,2:6,2
+chr10	40547140	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:0,0:16,4
+chr10	40854565	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr10	40895085	.	A	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.046035;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:49,9:30,5:19,4
+chr10	40963846	.	T	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.01835;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:4,5:31,5
+chr10	41117922	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.062923;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:18,4:21,1
+chr10	41222386	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.054928;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:0,0:21,4
+chr10	41228173	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,3:4,1
+chr10	41232714	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11839;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:10,2:23,2
+chr10	41360989	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.01483;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:2,1:27,5
+chr10	41425052	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.017441;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:24,9:3,2
+chr10	41425419	.	T	G	0	PASS	DP=219;GPV=1;SPV=0.028155;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:89,19:77,16:12,3
+chr10	41498689	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.090326;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:42,2:2,3
+chr10	41506033	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr10	41509795	.	G	C	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.021029;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:27,1:25,6
+chr10	41527683	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.035034;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:36,4:10,2
+chr10	41550590	.	C	T	0	PASS	DP=219;GPV=1;SPV=0.0098271;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:98,13:40,4:58,9
+chr10	41563298	.	G	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.010615;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:57,8:14,1:43,7
+chr10	41571058	.	G	T	0	PASS	DP=329;GPV=1;SPV=0.038805;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:186:159,27:81,8:78,19
+chr10	41574180	.	C	G	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.028312;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:75,16:39,12:36,4
+chr10	41576085	.	G	A	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.00030758;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:83,29:39,22:44,7
+chr10	41705085	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0093079;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:12,4:10,2
+chr10	41893643	.	G	T	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.0083873;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:62,20:31,8:31,12
+chr10	41895333	.	A	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.028327;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,12:19,5:16,7
+chr10	41912745	.	G	C	0	PASS	DP=485;GPV=1;SPV=0.01458;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:289:259,30:136,15:123,15
+chr10	42070501	.	G	T	0	PASS	DP=3887;GPV=1;SPV=0.038722;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2243:1978,262:1920,253:58,9
+chr10	42072684	.	G	C	0	PASS	DP=572;GPV=1;SPV=0.044586;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:324:284,40:22,2:262,38
+chr10	42077623	.	T	A	0	PASS	DP=873;GPV=1;SPV=0.017567;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:471:422,49:185,34:237,15
+chr10	42077625	.	A	G	0	PASS	DP=807;GPV=1;SPV=0.036286;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:440:383,57:156,28:227,29
+chr10	42078977	.	C	A	0	PASS	DP=900;GPV=1;SPV=0.022287;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:500:446,54:387,29:59,25
+chr10	42130128	.	T	G	0	PASS	DP=468;GPV=1;SPV=0.0011696;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:261:210,51:113,25:97,26
+chr10	42142848	.	A	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.03082;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:50,16:29,4:21,12
+chr10	42146210	.	C	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.043589;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:17,4:22,7
+chr10	42182059	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037023;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:23,7:1,1
+chr10	43493708	.	AAATATATATATATAT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,7:4,4:4,3
+chr10	44202309	.	TAAAAAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:4,5:1,5
+chr10	45784310	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:5,2:0,6
+chr10	45794560	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.097509;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,5:10,1:9,4
+chr10	46726100	.	T	C	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=9.7584e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:70,29:29,13:41,16
+chr10	47230850	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.4139e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:19,25:11,10:8,15
+chr10	47526940	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:1,1:19,3
+chr10	47542263	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
+chr10	47623839	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.0822e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,18:9,11:6,7
+chr10	47743405	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:1,5:2,1
+chr10	49096622	.	C	CGT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.011404;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,15:11,9:11,6
+chr10	49212799	.	A	AAG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036419;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:9,4:3,1
+chr10	49968267	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.019572;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:40,9:21,6:19,3
+chr10	50006736	.	C	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.032391;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:18,6:18,3
+chr10	50012825	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0037422;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:13,3:6,12
+chr10	50709797	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.038146;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,2:9,6
+chr10	50748900	.	T	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.042021;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:19,2:20,5
+chr10	52244815	.	A	AAT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048922;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,2:9,3
+chr10	52244825	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034789;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,2:8,3
+chr10	52244830	.	AC	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.031046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:12,2:9,3
+chr10	52244836	.	AT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.046386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,2:12,3
+chr10	53469806	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0030753;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,21:8,8:17,13
+chr10	53639326	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:0,0:6,2
+chr10	54155194	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00016659;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,4:11,7
+chr10	54655302	.	GAC	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,3:5,1
+chr10	55330870	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.073064;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:8,3:19,4
+chr10	55538966	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,2:1,1:4,1
+chr10	55802444	.	G	GT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00015814;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:11,9:9,9
+chr10	56247968	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.068e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,19:12,6:9,13
+chr10	56373261	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.044964;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:12,10:8,2
+chr10	56402550	.	A	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=6.0445e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:11,9:13,9
+chr10	57173571	.	T	TAAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0027704;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,10:12,4:4,6
+chr10	59067922	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00030171;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:21,10:15,3
+chr10	59760440	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.2598e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,18:10,8:7,10
+chr10	60724209	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:8,6:8,1
+chr10	62311289	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10544;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:21,2:7,2
+chr10	62556385	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=3.0481e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:34,22:19,11:15,11
+chr10	62947004	.	GTCCCTC	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.025825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:3,4:13,5
+chr10	63031081	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:6,4:3,2
+chr10	63309494	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:9,7:5,1
+chr10	63500746	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0082708;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,14:10,7:16,7
+chr10	63828472	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,7:6,2
+chr10	65221068	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=5.6124e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,20:12,13:5,7
+chr10	66050424	.	AT	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00037324;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:8,6:15,4
+chr10	66840364	.	TCTCTCTCTCACACA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14093;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:9,2:11,3
+chr10	68018900	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.032284;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:10,5:2,2
+chr10	68676257	.	TATATATATATA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.05;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:0,3:0,1:0,2
+chr10	69434486	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=3.1322e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,23:11,13:10,10
+chr10	69804809	.	CAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:10,7:1,2
+chr10	70248467	.	G	GT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.010217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,7:3,5:2,2
+chr10	70663953	.	T	TA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:9,6:2,1
+chr10	70768302	.	CAA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0020704;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:4,6:3,2
+chr10	71689203	.	TTGGTGGAGTCAGGGA	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,6:11,3:7,3
+chr10	71759838	.	CACACACACATAT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0070729;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,4:4,6
+chr10	72805099	.	TTC	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.050167;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,5:4,1:26,4
+chr10	73188768	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.011153;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,4:6,3:6,1
+chr10	74052946	.	A	AT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0032284;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:14,4:7,5
+chr10	74136202	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.5725e-12;SS=2;SSC=113;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:12,33:6,15:6,18
+chr10	75048398	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.010569;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:6,7:6,5
+chr10	75159063	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0729;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,6:11,5:13,1
+chr10	77025240	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:4,4:2,2
+chr10	78138404	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.068312;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:18,2:13,2
+chr10	78276605	.	A	ATT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0057333;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,5:8,5
+chr10	79063602	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=7.241e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,23:10,16:12,7
+chr10	79212197	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=9.9383e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:23,24:14,13:9,11
+chr10	79533787	.	A	AAACAACAACAAC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.046347;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:17,1:6,5
+chr10	79755284	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0089009;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:11,5:4,1
+chr10	79758480	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.39766;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:6,3:7,1
+chr10	80232305	.	T	TA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,7:5,5:1,2
+chr10	80930787	.	CCTAAATGTAAGAG	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00073638;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:17,6:10,8
+chr10	81693944	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,1:7,3
+chr10	81693976	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr10	82968662	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046139;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:18,3:1,3
+chr10	83295063	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=6.9734e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:15,21:6,11:9,10
+chr10	83989626	.	C	CAGAAAGAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,5:12,4:8,1
+chr10	84600483	.	CTT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,8:5,7:4,1
+chr10	85694558	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,3:3,2:0,1
+chr10	85745182	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
+chr10	86161139	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=4.8508e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:12,6:11,14
+chr10	86850612	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00016135;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:10,5:10,7
+chr10	87063069	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,4:6,2:9,2
+chr10	87234735	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.014185;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:20,3:6,7
+chr10	87964537	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.026092;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,7:10,3:11,4
+chr10	88546974	.	A	AC	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.6102e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:8,10:13,5
+chr10	90050470	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.029089;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:18,9:7,3:11,6
+chr10	90070613	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0038279;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,9:2,6:4,3
+chr10	91389230	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:8,7:3,1
+chr10	91400009	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.5306e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:27,22:17,14:10,8
+chr10	91573283	.	G	GAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.040021;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:14,4:3,1
+chr10	91898698	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:6,6:4,1
+chr10	92025810	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,8:5,7:2,1
+chr10	92580171	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.4794e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:12,11:6,6
+chr10	93141921	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23612;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,4:10,1
+chr10	93369110	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:5,5:1,1
+chr10	95365173	.	A	ATGTGTGTGTG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:4,2:9,2
+chr10	96142315	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0092066;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:15,6:10,9
+chr10	96629930	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,4:4,3:0,1
+chr10	96663627	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:6,6:3,1
+chr10	96676655	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:1,3:1,2:0,1
+chr10	99094551	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,7:1,4:4,3
+chr10	99669740	.	G	GT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:8,1:3,5
+chr10	100111300	.	AG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.044862;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:6,6:17,1
+chr10	100368998	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=4.3898e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:30,20:15,13:15,7
+chr10	100698242	.	C	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=6.3645e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:41,23:22,11:19,12
+chr10	101075616	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.31501;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,5:18,3:6,2
+chr10	101318994	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27607;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,4:10,1:6,3
+chr10	101343299	.	A	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=6.3041e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:34,20:20,5:14,15
+chr10	102638179	.	TA	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.024526;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:22,5:16,3
+chr10	103251002	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.20188;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,4:2,0:24,4
+chr10	105242432	.	A	ATATT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014077;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,6:1,1:10,5
+chr10	105242433	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014077;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,6:1,1:10,5
+chr10	106342384	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,2:11,2
+chr10	106764798	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=1.2829e-09;SS=2;SSC=88;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:22,31:13,19:9,12
+chr10	107220138	.	A	ACTCTCTCTCT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,7:3,4:4,3
+chr10	107333064	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr10	108073020	.	A	AACACACAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024928;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:14,6:1,4
+chr10	108244394	.	C	CTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037712;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,9:12,5:12,4
+chr10	108335624	.	CT	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.135e-05;SS=2;SSC=49;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:13,9:9,8
+chr10	108335629	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=3.7627e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:12,9:10,8
+chr10	109514597	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.5408e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:7,10:14,7
+chr10	110360446	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:6,1:14,3
+chr10	111631182	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00024281;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:18,7:13,7
+chr10	111733716	.	TATAG	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0036085;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,5:6,2
+chr10	111747465	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.2731e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:16,10:13,9
+chr10	112207705	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=9.2378e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:19,13:11,4
+chr10	113077858	.	CTTATTTATTTATTTATTTAT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.015787;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:16,4:12,4
+chr10	115148744	.	G	GTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.03285;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:4,5:7,1
+chr10	115310134	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.1571e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:26,21:14,8:12,13
+chr10	117305485	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.2122;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,4:12,3:13,1
+chr10	124961033	.	T	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.4168e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:23,26:13,14:10,12
+chr10	125282185	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.1528e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:15,10:10,10
+chr10	125570181	.	T	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=2.4766e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:36,19:21,11:15,8
+chr10	125894933	.	GC	G	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.020645;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:70,21:34,11:36,10
+chr10	126645504	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00011008;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:12,5:7,8
+chr10	126659528	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=4.2071e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:33,19:16,16:17,3
+chr10	127508738	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.065116;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,1:11,3
+chr10	128961543	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.8449e-09;SS=2;SSC=87;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:23,28:12,15:11,13
+chr10	130129930	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,4:10,2:12,2
+chr10	130786522	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.1154e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:10,2:9,11
+chr10	131176620	.	AC	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.055387;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:69,8:37,2:32,6
+chr10	131346980	.	CCTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:0,0:26,4
+chr10	131540385	.	CTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,3:6,3
+chr10	132622891	.	A	ACCGT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0065388;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:12,7:2,1
+chr10	133011515	.	GTGTGTTAGTGTGTGA	G	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.01692;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:58,7:33,2:25,5
+chr10	133042047	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,4:5,1
+chr10	133181833	.	T	TACACACACACACACAC	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.04979;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,13:18,7:12,6
+chr10	133431304	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
+chr10	133658674	.	C	G	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.029612;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:69,14:51,9:18,5
+chr11	128855	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:18,1:6,3
+chr11	696767	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010948;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,11:7,6:5,5
+chr11	2938092	.	GGTGTGAATATGCTTT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.23776;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,3:13,1
+chr11	3206756	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.048018;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:14,2:19,4
+chr11	3556345	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.045597;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:19,2:19,3
+chr11	4287898	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:3,2:8,3
+chr11	4290799	.	C	T	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.0087657;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:141:114,27:61,18:53,9
+chr11	5175771	.	TCCC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.19282;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,2:16,2
+chr11	5537895	.	T	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0033931;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:11,10:12,4
+chr11	5693189	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:3,5:3,1
+chr11	6496505	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049774;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:4,4:2,2
+chr11	7694803	.	C	CTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.049827;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,9:10,7:9,2
+chr11	8434077	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=9.2295e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:19,25:11,18:8,7
+chr11	9229899	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:2,4:4,1
+chr11	9419560	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.063176;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:7,4:16,3
+chr11	9868366	.	A	AG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:9,1:4,3
+chr11	10310651	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,4:10,1:8,3
+chr11	10680344	.	GGAAA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
+chr11	12010756	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,4:6,3:19,1
+chr11	12289556	.	G	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,5:9,1:1,4
+chr11	13002884	.	CTCTCTCTGTG	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.013277;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:11,4:15,5
+chr11	14425512	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00042977;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,9:10,6:5,3
+chr11	14779766	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=6.0898e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:9,5:9,9
+chr11	15422225	.	A	AT	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.6e-06;SS=2;SSC=52;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:31,17:20,9:11,8
+chr11	16389969	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:7,2:12,2
+chr11	16480645	.	A	AC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014699;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:5,2:17,13
+chr11	18512723	.	A	ATTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.023137;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,10:10,8:5,2
+chr11	20275711	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00012961;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:9,6:11,6
+chr11	21269378	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0068563;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:14,5:19,4
+chr11	21501591	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=2.3315e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:13,8:11,8
+chr11	21697973	.	A	AATTGT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,7:2,5:1,2
+chr11	22269541	.	AAAGG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,1:3,3
+chr11	24745610	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.6713e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:13,10:9,10
+chr11	25651441	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.014656;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,8:6,2:7,6
+chr11	25651442	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,8:7,2:7,6
+chr11	25680333	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.2783e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:22,25:9,14:13,11
+chr11	25902175	.	CATATATACAT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.15556;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,3:11,1:1,2
+chr11	25902191	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.18154;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:11,1:4,2
+chr11	25902197	.	CAT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:10,1:4,3
+chr11	26150425	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=5.242e-11;SS=2;SSC=102;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:12,27:5,20:7,7
+chr11	26406676	.	AGT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,10:4,7:3,3
+chr11	26418714	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=4.9538e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:38,24:19,13:19,11
+chr11	29476007	.	T	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=3.5765e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:14,13:13,11
+chr11	31294814	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,4:22,3:0,1
+chr11	31294820	.	AAG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,4:17,3:1,1
+chr11	32755665	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:3,2:14,2
+chr11	33844928	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.051974;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,5:20,4:13,1
+chr11	33854868	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.04269;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,8:7,5:10,3
+chr11	34734637	.	AT	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.5134e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:7,4:15,12
+chr11	35100537	.	C	CAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,5:12,4:8,1
+chr11	36105240	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.13128;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:27,5:10,2:17,3
+chr11	36146773	.	C	CTTTATTTTATTTTATTTTAT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.040883;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:11,2:14,4
+chr11	36158525	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0625;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,3:2,1:2,2
+chr11	37001487	.	CTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0093911;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,8:4,6:2,2
+chr11	37190545	.	AAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0060611;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:8,9:3,2
+chr11	37362759	.	G	GA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.020833;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:12,7:3,1
+chr11	37515803	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.091905;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:16,3:17,2
+chr11	37743824	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.18154;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:5,1:10,2
+chr11	37743835	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.07313;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,2:10,3
+chr11	38560483	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,9:6,8:0,1
+chr11	40544332	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00019397;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:13,10:12,5
+chr11	40998503	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0012979;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:11,6:18,3
+chr11	41834706	.	GTA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:4,3:4,5
+chr11	42844486	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,5:4,3:3,2
+chr11	43147196	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.6364e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:27,21:11,10:16,11
+chr11	43788690	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,2:2,1:1,1
+chr11	44348165	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=3.1322e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,21:6,10:10,11
+chr11	45448674	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=4.122e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:18,10:12,7
+chr11	46625279	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0092889;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,4:9,7
+chr11	47809759	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0015312;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,10:1,1:4,9
+chr11	48199359	.	C	CACACATATAT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.024218;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,8:11,6:10,2
+chr11	49035339	.	ATTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:10,5:2,1
+chr11	49743675	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:4,5:2,1
+chr11	51411656	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.17398;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:3,0:31,4
+chr11	51583228	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.064666;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:24,4:1,0
+chr11	51612622	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0030535;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:8,1:14,7
+chr11	51687436	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.031539;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:8,1:18,6
+chr11	51770980	.	A	G	0	PASS	DP=349;GPV=1;SPV=0.020319;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:179:159,20:94,13:65,7
+chr11	52556390	.	A	G	0	PASS	DP=298;GPV=1;SPV=0.0015334;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:139,20:54,8:85,12
+chr11	52673774	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.039259;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:3,2:13,2
+chr11	52721947	.	G	T	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.012324;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:82,18:61,11:21,7
+chr11	52780877	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.28552;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,3:11,1
+chr11	53328021	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.036498;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:18,2:13,5
+chr11	53345622	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,0:9,4
+chr11	53411563	.	A	C	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.030597;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:59,10:51,9:8,1
+chr11	53602042	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.055746;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:23,4:1,0
+chr11	53704843	.	C	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.010491;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:9,5:27,9
+chr11	53728797	.	A	T	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.02839;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:83,14:49,12:34,2
+chr11	54385190	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,2:6,4
+chr11	54406711	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:27,4:0,0
+chr11	54421856	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.045374;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:13,9:22,2
+chr11	54424282	.	C	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
+chr11	54580932	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:2,2:1,1:1,1
+chr11	55299524	.	G	GATATAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:8,5:0,0
+chr11	55642650	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.5716e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:25,17:15,10:10,7
+chr11	55815761	.	CTCTCTCTCTCTCTATATATATATA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:6,1:5,3
+chr11	55900224	.	C	CAAAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:4,3:5,1
+chr11	56049215	.	TGCAC	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026257;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:11,1:15,4
+chr11	57633376	.	C	CAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,3:3,1
+chr11	57790542	.	C	CTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,4:10,1
+chr11	58697156	.	G	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.013898;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:19,4:17,2
+chr11	58774870	.	C	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.1952e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:23,29:14,16:9,13
+chr11	59645024	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.017806;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:3,4:12,6
+chr11	61642075	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.05702;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,5:23,2:18,3
+chr11	61853239	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,2:0,0:7,2
+chr11	62043126	.	C	CTATT	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.015202;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:15,6:24,7
+chr11	62090839	.	G	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=2.1747e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:40,27:18,12:22,15
+chr11	62245854	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:8,1:3,3
+chr11	62697384	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,6:8,1:6,5
+chr11	63077873	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=7.8642e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:10,9:7,8
+chr11	63802379	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.019162;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,3:7,4
+chr11	64114356	.	GA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.053977;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:10,1:6,4
+chr11	66009427	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0099771;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,12:3,9:2,3
+chr11	66704429	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=5.6577e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,22:10,8:12,14
+chr11	67583357	.	A	AAT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.073271;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,5:22,2:10,3
+chr11	67839931	.	A	ATTTTTTTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020979;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,7:0,1:2,6
+chr11	68639250	.	TC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019168;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:2,4:15,8
+chr11	68855739	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=8.9862e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:28,21:11,11:17,10
+chr11	68888058	.	CTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:2,5:4,1
+chr11	69071114	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:0,2:0,1:0,1
+chr11	69153941	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,7:6,3:1,4
+chr11	70076964	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.05053;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:20,5:11,3
+chr11	70194328	.	G	GTGGA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.27357;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,5:7,3:7,2
+chr11	70196380	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:13,4:6,3:7,1
+chr11	70579739	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=7.4607e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:12,8:13,7
+chr11	70833124	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=2.1659e-11;SS=2;SSC=106;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:22,26:11,16:11,10
+chr11	71146373	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.030755;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:16,8:19,5
+chr11	71344357	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0076145;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:17,3:21,3
+chr11	71460622	.	C	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=5.304e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:32,20:12,8:20,12
+chr11	71642221	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.048187;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:19,1:20,4
+chr11	71642222	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.035875;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:14,1:19,4
+chr11	72297636	.	GGT	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.084115;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,6:13,3:11,3
+chr11	72475951	.	A	ATTT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0041742;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,9:12,4:13,5
+chr11	76110211	.	C	CATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.20161;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:15,2:13,2
+chr11	76401773	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.030583;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:8,6:3,1
+chr11	77005992	.	T	TA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022269;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:1,12:0,5:1,7
+chr11	77098510	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.32127;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:10,1:18,3
+chr11	77578002	.	CA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.10544;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:21,2:7,2
+chr11	79681739	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.2077e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:11,12:14,9
+chr11	79696275	.	C	CATAT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.072331;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,5:14,1:12,4
+chr11	79791527	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.308e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:10,7:15,7
+chr11	79831170	.	G	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.6566e-09;SS=2;SSC=87;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:25,26:13,16:12,10
+chr11	80243161	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0014229;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:14,1:10,7
+chr11	80406888	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00024094;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,6:16,3
+chr11	80479358	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.030888;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,4:8,1
+chr11	82424826	.	TA	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.3095e-06;SS=2;SSC=54;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:12,13:11,9
+chr11	82483317	.	C	CGTGTGT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,10:6,8:4,2
+chr11	83850123	.	A	AGTGT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.025519;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:7,3:1,3
+chr11	84058504	.	T	TAAAATAATAATAATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.19205;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,7:6,4:9,3
+chr11	85205140	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.15143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:24,4:21,1
+chr11	88253114	.	C	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,4:1,3:3,1
+chr11	89005694	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.5248e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:14,11:10,7
+chr11	90611083	.	TA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,5:5,3:0,2
+chr11	92765789	.	A	AG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037638;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:11,5:5,4
+chr11	93549615	.	A	ATTTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00015682;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:4,1:7,6
+chr11	93549627	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=9.3131e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:5,2:8,10
+chr11	93912142	.	T	TC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,5:6,2:12,3
+chr11	95704253	.	CTGGATCTGCCCAG	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=7.4864e-06;SS=2;SSC=51;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,20:13,13:6,7
+chr11	96199196	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,6:13,5:3,1
+chr11	96790885	.	G	GT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0030987;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:12,7:10,9
+chr11	96914325	.	GTCTC	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0029007;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,6:5,4:5,2
+chr11	96949996	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=6.569e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:39,18:22,11:17,7
+chr11	98354556	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.060295;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,1:13,3
+chr11	98406759	.	C	CTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,3:2,1
+chr11	98425657	.	C	CAAAAAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:4,6:4,1
+chr11	98832036	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.035811;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:19,5:12,4
+chr11	99193908	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.4655e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:2,17:1,10:1,7
+chr11	99523668	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.26877;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,4:4,2:9,2
+chr11	99747460	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:4,5:3,1
+chr11	99819481	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.048301;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:27,10:3,1
+chr11	100176610	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=4.3946e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:5,8:6,6
+chr11	100502368	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=6.6438e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:10,4:10,9
+chr11	101041779	.	G	GA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=4.6765e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,13:8,10:8,3
+chr11	101144253	.	TA	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=5.0774e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:5,8:14,8
+chr11	101785493	.	TTTC	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00086088;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:8,2:15,8
+chr11	103025629	.	ATACG	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,4:10,3:11,1
+chr11	103025635	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,4:8,3:13,1
+chr11	103224749	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.2255e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:21,27:8,20:13,7
+chr11	103233875	.	TGTGG	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:11,11:3,4:8,7
+chr11	104119550	.	A	AATAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.00387;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:4,3:0,3
+chr11	105472804	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27277;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:17,3:4,1
+chr11	106335502	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.012658;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:16,6:17,4
+chr11	106668985	.	GATATAT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:17,3:9,1
+chr11	106671248	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:13,4:1,0
+chr11	107231861	.	GAT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.075461;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:9,5:14,2
+chr11	107231878	.	G	GAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,5:12,4:8,1
+chr11	107231884	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.12376;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:14,5:9,1
+chr11	108922243	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:11,4:3,1
+chr11	111028911	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0060788;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,12:8,10:7,2
+chr11	111898788	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.6305e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,16:7,8:4,8
+chr11	112394177	.	A	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=1.6597e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:25,29:15,18:10,11
+chr11	113485600	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0045179;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,13:6,11:3,2
+chr11	115111632	.	G	GACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031923;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,4:6,4
+chr11	115685919	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:2,3:14,1
+chr11	115831750	.	ACCCT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:9,3:12,1
+chr11	116630100	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.9186e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:8,8:9,11
+chr11	117138905	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.14706;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:2,5:5,3
+chr11	118432823	.	A	AT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.011333;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:9,7:7,4
+chr11	118763838	.	TA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.040748;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:16,1:10,6
+chr11	119330536	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065325;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:5,2:10,3
+chr11	119448941	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.038233;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,5:3,2
+chr11	120174924	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:4,4:2,3:2,1
+chr11	120580196	.	GTTCT	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00089081;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,15:10,6:11,9
+chr11	121919473	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.016809;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,2:4,4
+chr11	122761779	.	CTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,2:9,2
+chr11	125584229	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:5,4:9,1
+chr11	126296217	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,10:2,8:4,2
+chr11	126302359	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,4:1,2
+chr11	126725332	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=3.5005e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,21:9,12:14,9
+chr11	127052937	.	GTAGTAATAATAA	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02692;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:12,7:9,5
+chr11	127306776	.	TC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.057118;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,6:2,5:11,1
+chr11	127306787	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:5,5:15,1
+chr11	127497143	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:2,6:6,1
+chr11	128565061	.	A	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.050822;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,5:20,2:20,3
+chr11	129642545	.	A	ATG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,13:15,10:7,3
+chr11	130057831	.	A	ATT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.01441;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,7:7,5:6,2
+chr11	132213730	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024674;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:10,8:3,1
+chr11	132716416	.	A	ATCTG	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:26,4:15,1:11,3
+chr11	132818615	.	TA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.24135;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:9,3:19,1
+chr11	132928109	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.6289e-11;SS=2;SSC=107;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:18,41:16,25:2,16
+chr11	133498490	.	G	A	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=9.3652e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:56,20:23,9:33,11
+chr11	134138202	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.35962;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,2:12,2
+chr11	134773486	.	G	GAGAA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.15576;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,5:22,3:15,2
+chr11	134813424	.	G	GTA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.02026;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,8:15,3:22,5
+chr11	134827657	.	ATATG	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.082972;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:51,6:28,5:23,1
+chr11	135055865	.	T	TA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.087834;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:15,5:10,2
+chr12	16088	.	AG	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.0090346;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:53,8:9,5:44,3
+chr12	16321	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0043285;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:11,3:16,11
+chr12	423473	.	TTTTGTGTTTTTTTTTGTTTTG	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048951;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,4:0,0:3,4
+chr12	2850653	.	TTTTTG	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0053439;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:8,8:10,5
+chr12	4620474	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0024499;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,10:3,9:3,1
+chr12	5375449	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=2.1217e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,22:15,14:9,8
+chr12	5636605	.	TAC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.036735;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:16,6:5,3
+chr12	5931794	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16375;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,3:15,1
+chr12	7137793	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0012364;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,10:9,5:13,5
+chr12	7197123	.	A	AT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.03797;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:14,3:14,4
+chr12	7389960	.	T	TTA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00072464;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,9:6,3:0,6
+chr12	7475097	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,8:7,7:1,1
+chr12	7924946	.	T	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.033043;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:23,10:12,4
+chr12	9513023	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13316;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:9,1:16,3
+chr12	9607313	.	CTTCT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.27439;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:24,3:8,1:16,2
+chr12	9953386	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:3,9:1,7:2,2
+chr12	10239453	.	C	CCTTATT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.030593;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:2,2:17,6
+chr12	10239466	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.025768;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:4,1:16,7
+chr12	10239469	.	C	CCTTATT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.036024;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,8:3,1:16,7
+chr12	10603313	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.064856;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,6:5,1
+chr12	10610576	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.25826;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,4:6,2:4,2
+chr12	10674873	.	CCGCG	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0013983;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,16:5,8:9,8
+chr12	11168404	.	G	GGA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:23,2:0,2
+chr12	12081456	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.044511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:9,7:4,1
+chr12	13457272	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,4:0,0:7,4
+chr12	14246866	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr12	14586568	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020486;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,3:7,3
+chr12	17413201	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023193;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,8:8,6:4,2
+chr12	17535950	.	C	CTG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,2:9,2
+chr12	18163528	.	A	ATATATAT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,3:7,1
+chr12	18521510	.	C	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=4.7205e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:34,23:11,15:23,8
+chr12	19400856	.	A	AT	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.043302;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:25,2:21,4
+chr12	19518218	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0070941;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,12:5,9:3,3
+chr12	20711810	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=3.8087e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:16,13:10,7
+chr12	21592165	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.062847;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:25,4:4,2
+chr12	22955726	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=5.0013e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:22,21:15,13:7,8
+chr12	23412257	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.097509;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,5:13,3:6,2
+chr12	23500259	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:7,1:1,5
+chr12	23577193	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:3,1:10,3
+chr12	23779814	.	T	TACAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0021316;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,10:7,5:0,5
+chr12	24505872	.	TGC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.21758;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:11,3:21,1
+chr12	24948481	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.4368e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:25,24:18,17:7,7
+chr12	25077330	.	T	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.070922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,3:8,1
+chr12	25488234	.	C	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
+chr12	27874093	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.005778;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,3:4,4
+chr12	28508610	.	C	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=6.0159e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:13,11:15,8
+chr12	30138549	.	G	GA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,10:4,9:1,1
+chr12	30399886	.	G	GA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:15,8:1,2
+chr12	30540173	.	TTTGTTTG	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.057946;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:12,1:12,6
+chr12	31031571	.	ACT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:1,2:10,3
+chr12	31613788	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.025551;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:18,12:20,2
+chr12	31840469	.	G	GAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:5,4:2,1
+chr12	32005190	.	ATATATG	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.019067;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:9,4:9,2
+chr12	32117709	.	T	TACAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0044074;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,4:8,5
+chr12	32142467	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,3:9,1
+chr12	32300631	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:12,3:4,1
+chr12	32673869	.	AT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.12341;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,3:16,1
+chr12	32959639	.	A	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=7.8387e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:21,27:11,9:10,18
+chr12	34141907	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.02099;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:12,7:9,4
+chr12	34779934	.	A	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:4,6:1,2
+chr12	34880972	.	C	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr12	34885476	.	T	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.047933;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:33,9:8,4
+chr12	35012841	.	C	T	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.025566;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:63,14:26,8:37,6
+chr12	35058634	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.06044;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:29,4:0,0
+chr12	35324342	.	C	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.046114;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:51,10:17,5:34,5
+chr12	35332845	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.014996;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:12,5:18,7
+chr12	35337682	.	C	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.018943;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:78,22:39,11:39,11
+chr12	35473953	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16089;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,3:13,1
+chr12	35473959	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,3:14,1
+chr12	35473968	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,3:12,1
+chr12	35500729	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.026864;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:18,4:10,2
+chr12	35538803	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.04568;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:8,1:12,6
+chr12	35541957	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.029881;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:8,4:35,5
+chr12	35544547	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.2649;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:2,0:26,4
+chr12	35689053	.	T	C	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.010005;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:120,15:95,8:25,7
+chr12	35735880	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0035197;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:3,8:5,3
+chr12	35788169	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:18,4:2,0
+chr12	35858401	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0079898;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:8,1:21,4
+chr12	35974352	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.053889;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:29,4:2,0
+chr12	36704968	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.033449;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,5:11,3
+chr12	36704970	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.035006;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:13,6:11,3
+chr12	36806763	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.022644;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:14,1:28,5
+chr12	36881419	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.025704;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:18,4:11,6
+chr12	36939834	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:14,3:12,1
+chr12	37007145	.	A	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr12	37058953	.	T	G	0	PASS	DP=275;GPV=1;SPV=0.017715;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:101,19:51,14:50,5
+chr12	37240035	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.037769;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:18,3:14,3
+chr12	37814669	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.032805;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:6,4:5,6
+chr12	39712017	.	TATGTATATATAC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,2:8,2
+chr12	42514901	.	CT	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.029043;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:13,6:17,3
+chr12	43421284	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.042577;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,4:15,1
+chr12	43654565	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.1921e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:11,8:9,12
+chr12	43958795	.	C	CT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.026443;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,7:16,4:8,3
+chr12	44461624	.	AAG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:16,3:10,1
+chr12	44587284	.	A	AAAAAAAAATATAT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:6,2:4,2
+chr12	44644623	.	T	TAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.38255;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:19,1:8,3
+chr12	44953896	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.009553;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,3:5,4
+chr12	44971251	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21886;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:8,4:6,1
+chr12	45022298	.	G	GTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,3:5,3
+chr12	45080147	.	TAC	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,4:17,2:8,2
+chr12	45711984	.	G	GCCTCCAAGGTGCTAGGATTACAGGTGT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.015407;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,13:7,6:18,7
+chr12	48332596	.	A	ACC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.054417;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,7:9,1:22,6
+chr12	49376709	.	AT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.031941;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:10,5:2,1
+chr12	49606486	.	G	GACAC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.055299;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,6:15,2:9,4
+chr12	49908462	.	CAAA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,6:1,1
+chr12	51046344	.	A	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:7,1:4,4
+chr12	51197147	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.046819;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:17,1:12,8
+chr12	51400785	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:2,4:4,3
+chr12	52633627	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.020689;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,5:7,1:8,4
+chr12	52633628	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.013669;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,5:7,1:7,4
+chr12	53645358	.	TA	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,4:3,1
+chr12	53763982	.	T	TTATTTTATTTTTATA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0031185;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:14,4:4,3
+chr12	53763983	.	TGAGGGGG	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0016215;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:16,4:4,4
+chr12	53763992	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0021337;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:15,4:4,4
+chr12	55052474	.	TTTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.11117;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,8:4,4:17,4
+chr12	55100164	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011216;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:12,5:10,9
+chr12	56001118	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:3,2:7,2
+chr12	56102806	.	T	TAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:4,4:2,2
+chr12	56429497	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045694;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:9,3:4,3
+chr12	57003174	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=8.3573e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:19,10:14,5
+chr12	57423808	.	TA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,8:3,6:1,2
+chr12	57722695	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.033061;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,3:3,1
+chr12	58032649	.	CT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=3.4248e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:7,13:6,2
+chr12	58452126	.	CTATCTAGATATATATGATA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.03159;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:10,8:7,1
+chr12	61279630	.	C	CAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,5:1,3:1,2
+chr12	62286937	.	C	CAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,10:9,8:1,2
+chr12	63737080	.	A	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.02185;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:22,4:14,7
+chr12	63763961	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,4:4,4:0,0
+chr12	64203996	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.041043;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:21,4:17,5
+chr12	64204010	.	CATTA	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.017109;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:17,6:17,5
+chr12	64380125	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,5:5,6
+chr12	64772237	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02948;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:9,6:4,1
+chr12	64947767	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.2099e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:10,6:15,12
+chr12	65422388	.	GTATATATATATATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.02396;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,11:4,6:1,5
+chr12	65661709	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.040809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:10,5:4,3
+chr12	65793271	.	AT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0084717;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,6:4,2
+chr12	66006908	.	G	GAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11371;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:22,2:6,2
+chr12	66006919	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.046186;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:23,2:7,3
+chr12	66173784	.	C	CTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,8:7,4:6,4
+chr12	66730701	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,5:11,4:7,1
+chr12	67756548	.	C	CGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.030517;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,10:21,8:12,2
+chr12	67873271	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:5,2:2,2
+chr12	68101180	.	AACACACACACAC	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,10:9,6:1,4
+chr12	69522190	.	T	TTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.016175;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:13,5:9,5
+chr12	70126484	.	C	CAAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:17,8:3,1
+chr12	71055549	.	G	GT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0028686;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:4,8:1,2
+chr12	71248746	.	CTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.015905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,8:3,4:1,4
+chr12	72496234	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=3.5163e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:23,24:9,11:14,13
+chr12	72955677	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,4:6,1:14,3
+chr12	73557031	.	T	TAAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.015231;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:10,6:5,3
+chr12	74319765	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00010787;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:11,8:16,7
+chr12	74494246	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=6.152e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:8,11:7,5
+chr12	75490195	.	T	TCA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,11:5,2:1,9
+chr12	76661923	.	GTGTGTGTATATATATA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:4,2:3,1:1,1
+chr12	76855015	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:10,4:8,1:2,3
+chr12	77279015	.	C	CTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.025527;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:11,4:10,3
+chr12	77539752	.	A	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.8544e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:11,9:12,10
+chr12	77976665	.	TC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,1:5,4
+chr12	78651145	.	C	CCTCTCTCT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,5:11,4:6,1
+chr12	79204778	.	CTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:4,2:2,3
+chr12	79253483	.	G	GTCTCTC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.030289;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,5:3,2:4,3
+chr12	79568594	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027027;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,5:7,1
+chr12	79841051	.	T	TA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.035086;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:16,4:6,2
+chr12	81242708	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.014934;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,3:3,4
+chr12	81412335	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0094835;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:11,8:2,1
+chr12	81927189	.	TCATA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.042363;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:14,3:7,4
+chr12	81927217	.	T	TCATA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.048707;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,2:12,2
+chr12	83014769	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=6.3199e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,20:7,8:9,12
+chr12	83895039	.	T	TA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.036677;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,5:15,4:13,1
+chr12	84514468	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.2636e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:11,14:11,6
+chr12	85221285	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=4.8137e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:19,22:11,12:8,10
+chr12	85659476	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,5:3,4:4,1
+chr12	86426352	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=6.7524e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:17,11:8,9
+chr12	86502770	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036036;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,1:6,3
+chr12	86566317	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.002293;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,5:9,4
+chr12	87893158	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.06e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:23,7:9,10
+chr12	88595703	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.059099;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:13,3:4,1
+chr12	88665001	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:8,2:17,2
+chr12	89887113	.	G	GTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,8:4,7:1,1
+chr12	91308224	.	C	CA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00046907;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:15,9:9,3
+chr12	91467146	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0011679;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:9,6:6,10
+chr12	92516137	.	C	CTGTGTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,4:5,1
+chr12	92921866	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:10,8:0,1
+chr12	92995012	.	T	TTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011272;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,14:8,11:2,3
+chr12	93291515	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.020137;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:10,9:15,1
+chr12	93514299	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.044908;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,6:16,3:16,3
+chr12	94516083	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.042547;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,5:7,2:6,3
+chr12	94904262	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=4.3844e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:8,11:7,3
+chr12	95053681	.	GT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.014414;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:14,5:6,6
+chr12	95599688	.	TTA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,4:9,2:6,2
+chr12	95702858	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.030583;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:2,3:9,4
+chr12	96190492	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.00070028;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,5:1,4:0,1
+chr12	96466181	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.3044e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:31,17:9,5:22,12
+chr12	96978485	.	CTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,3:2,4
+chr12	97988353	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,2:1,2
+chr12	98334636	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=7.2341e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:12,7:6,10
+chr12	99532748	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.2103e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,21:8,13:11,8
+chr12	100012716	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.1661e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:8,8:14,5
+chr12	100385116	.	C	CTG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0052219;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:9,9:12,5
+chr12	100475124	.	C	CCTATCTATCTAT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0094816;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,14:16,6:10,8
+chr12	100483066	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.4647e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:19,7:10,8
+chr12	101040124	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=1.8133e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:25,28:14,13:11,15
+chr12	101193291	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00031521;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:15,8:10,6
+chr12	101259836	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=2.0246e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,20:8,13:9,7
+chr12	101259878	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,5:11,4:4,1
+chr12	102036362	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,10:9,8:4,2
+chr12	102228465	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=9.3791e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:11,25:5,8:6,17
+chr12	103404920	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.6819e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:37,22:15,12:22,10
+chr12	103775010	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.013346;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,13:14,10:5,3
+chr12	104161217	.	A	AT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0075114;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,4:11,7
+chr12	104637392	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0010679;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,12:6,11:0,1
+chr12	105619178	.	CAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0091688;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,8:2,7:1,1
+chr12	105631649	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0066111;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:14,6:4,3
+chr12	105865663	.	CA	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.017221;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:15,4:6,1
+chr12	106477891	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.010876;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,6:7,4:3,2
+chr12	107482985	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,2:3,1:4,1
+chr12	107643752	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.055718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:9,3:6,2
+chr12	108490233	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.005418;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,6:3,4:1,2
+chr12	108757194	.	TACACAC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,6:9,5:0,1
+chr12	109349658	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.015123;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:6,9:6,3
+chr12	109354618	.	T	TTAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.033228;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,6:13,4:15,2
+chr12	109427316	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,6:5,3
+chr12	109443214	.	GTA	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.115;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:15,4:19,1
+chr12	109443262	.	GTA	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.048762;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:18,5:17,2
+chr12	110595211	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0089009;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:11,4:4,2
+chr12	112713051	.	CCTTCTTCTTCTTCTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17622;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:0,3:5,1
+chr12	112739417	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=6.4011e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:15,16:10,5
+chr12	113491777	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.0232e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:24,23:13,9:11,14
+chr12	114357023	.	G	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0082398;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:15,3:20,6
+chr12	114576263	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:1,0:18,4
+chr12	114781830	.	T	TAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0044074;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,9:12,7:5,2
+chr12	115927160	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,5:2,1
+chr12	117011127	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.025784;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:10,3:8,4
+chr12	117088680	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.010905;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,7:10,4:6,3
+chr12	117215869	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.07313;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,4:8,1
+chr12	117361858	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.18462;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:6,3:2,2:4,1
+chr12	117893017	.	AT	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.5381e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:9,8:12,5
+chr12	117995993	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.034767;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:9,7:4,2
+chr12	118204255	.	G	GA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00054483;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,12:13,9:5,3
+chr12	118646576	.	G	GT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.22807;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,6:10,4:1,2
+chr12	119075497	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,2:17,2
+chr12	120528211	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:4,2:3,1:1,1
+chr12	120868474	.	TTG	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.05717;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:16,1:16,4
+chr12	121644589	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0058024;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,8:11,2
+chr12	124901888	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0065088;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:9,12:6,10:3,2
+chr12	127042467	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=4.2186e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:21,24:12,12:9,12
+chr12	127089069	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.037462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:13,4:16,6
+chr12	127225612	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,3:5,2
+chr12	127475365	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,8:2,5:2,3
+chr12	127590198	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.2826e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:8,3:12,13
+chr12	127697209	.	GGTGATAGTGGTGATGATGGCA	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.042786;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:22,3:13,4
+chr12	127736409	.	C	CTTTCT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:3,3:3,2
+chr12	128060616	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,2:3,1:4,1
+chr12	128278750	.	A	ATG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.036024;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:14,5:5,3
+chr12	128874102	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,5:4,3:11,2
+chr12	129643513	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.0437e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:9,8:14,6
+chr12	130155274	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.037408;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:12,4:10,7
+chr12	130897372	.	G	GACACACACACACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,8:5,6:2,2
+chr12	131259917	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.034956;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:14,3:4,2
+chr12	131925532	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:3,2:2,4
+chr12	132243194	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.21888;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:20,2:10,2
+chr12	132321203	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0069983;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,7:7,4:11,3
+chr12	132692569	.	T	TA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.039528;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:22,2:15,5
+chr12	132742222	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.033476;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:13,8:9,5:4,3
+chr13	18174876	.	T	C	0	PASS	DP=280;GPV=1;SPV=0.025123;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:144,16:72,6:72,10
+chr13	18194860	.	C	T	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.027244;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:75,17:35,12:40,5
+chr13	18320625	.	A	T	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.0020701;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:81,25:42,14:39,11
+chr13	19311248	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,9:2,8:3,1
+chr13	19779663	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.26692;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:16,2:2,2
+chr13	19970600	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.009224;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,7:3,2
+chr13	20063841	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015942;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:2,2:6,3
+chr13	20218615	.	C	CCT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.01905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,8:6,1:10,7
+chr13	20394727	.	C	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=1.0869e-10;SS=2;SSC=99;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:33,28:18,16:15,12
+chr13	20958455	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,10:2,7:2,3
+chr13	21081796	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.067367;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:10,4:6,2
+chr13	21136300	.	T	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=9.5177e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:14,6:11,10
+chr13	21377451	.	G	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.0017334;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:52,20:27,3:25,17
+chr13	21946632	.	C	CTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.03366;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:11,8:13,5
+chr13	22314271	.	TTTTTTG	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0090872;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,4:7,3
+chr13	22562413	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=8.7616e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:11,9:10,7
+chr13	22570106	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00040437;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:7,8:13,4
+chr13	23065294	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=2.701e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:17,10:13,7
+chr13	23204617	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,1:13,3
+chr13	23387468	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.10662;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:15,2:21,3
+chr13	23774784	.	CTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:7,3:1,1
+chr13	23775127	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0096412;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:7,5:14,4
+chr13	24163332	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.6678e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:23,25:14,9:9,16
+chr13	24424673	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.013499;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,8:8,4
+chr13	24472891	.	GTT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00037946;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,14:10,11:3,3
+chr13	24586838	.	C	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.047734;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:25,6:17,1
+chr13	25004051	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,3:8,1
+chr13	25081463	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:9,2:2,3
+chr13	25100046	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:8,5:2,4
+chr13	26901899	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.04668;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:6,6:14,3
+chr13	27751173	.	C	CGAGAGA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.055194;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,5:11,4:9,1
+chr13	27990755	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.10815;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:21,1:9,5
+chr13	29286668	.	G	GTCTATCTATCTATCTATCTATCTA	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.018147;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,10:16,4:12,6
+chr13	30146490	.	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.01095;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:4,5:5,3
+chr13	30688026	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,2:1,1:1,1
+chr13	30764285	.	G	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=1.8308e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:34,26:12,18:22,8
+chr13	30842612	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.24625;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,3:13,1
+chr13	30966432	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,9:4,6:1,3
+chr13	31685958	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14404;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,6:7,5:8,1
+chr13	32523390	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.011404;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:9,8:13,7
+chr13	32799312	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,7:2,6:2,1
+chr13	33296436	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.031483;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:21,7:12,1
+chr13	34713680	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0044505;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:8,5:5,1
+chr13	35853771	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.9123e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:5,10:12,7
+chr13	36010051	.	C	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00071247;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:11,6:7,6
+chr13	39497293	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=3.3844e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,23:8,13:15,10
+chr13	39576811	.	T	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.023921;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,5:6,2:10,3
+chr13	40201734	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010062;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,5:2,2
+chr13	40714439	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.031468;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:21,1:23,5
+chr13	41758392	.	ACGCTAG	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:3,1:1,1
+chr13	42171828	.	C	CTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,8:4,7:0,1
+chr13	45958652	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.34103;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,4:6,3:11,1
+chr13	46515602	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,2:2,2
+chr13	48080396	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0062663;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,8:7,2
+chr13	48110844	.	GTATATATATATATATATATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023736;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,10:1,5:2,5
+chr13	48110884	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.00059227;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:3,13:0,6:3,7
+chr13	50316876	.	G	GATAAATAAATAAATAAATAA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,11:10,5:18,6
+chr13	50743178	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0395;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,7:7,4:13,3
+chr13	51825636	.	T	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:6,3:4,2:2,1
+chr13	53374580	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=6.5235e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:11,10:12,10
+chr13	53824645	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=5.7991e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:18,23:10,14:8,9
+chr13	54392755	.	T	TAA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0082887;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:9,4:15,6
+chr13	54963344	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.064151;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,6:9,4:10,2
+chr13	55338258	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.037194;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:11,5:5,2
+chr13	55388469	.	AAG	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.14744;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,3:18,1
+chr13	56933829	.	C	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,4:5,4
+chr13	57959564	.	T	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.0555e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:10,7:16,7
+chr13	58465615	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=9.0336e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:14,12:12,10
+chr13	58857633	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0011442;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:16,4:13,5
+chr13	59663665	.	G	GCACACACA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.024807;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:12,7:5,2
+chr13	60776126	.	T	TTTTATTTATTTA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.015078;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:17,7:7,3
+chr13	61260559	.	T	TAGAG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10927;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,7:8,3:7,4
+chr13	61864731	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0030535;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:13,3:9,5
+chr13	61864743	.	A	ATTTACTTAATGAGAAATTAACT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039588;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:15,3:14,2
+chr13	63445366	.	ATATAGATGAG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,1:5,3
+chr13	63534837	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,2:3,1:2,1
+chr13	64354724	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,8:12,7:1,1
+chr13	64633674	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,4:9,3:2,1
+chr13	64922205	.	C	CAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:10,7:1,1
+chr13	66873940	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.02396;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:2,1:3,5
+chr13	67557953	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.2509e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,24:12,9:12,15
+chr13	68070422	.	G	GAGAGAAGAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0054674;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:11,10:7,3:4,7
+chr13	69542750	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.097509;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,3:8,2
+chr13	71291325	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,5:9,1
+chr13	71590875	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:3,3:6,1
+chr13	72945581	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=3.5309e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:10,10:10,8
+chr13	72966941	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0010086;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:2,7:8,5
+chr13	73934950	.	ATTAT	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0056474;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:14,7:8,3
+chr13	74814335	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=2.9228e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:18,13:8,9
+chr13	75142489	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020376;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,7:6,3:5,4
+chr13	75157414	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=6.9612e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:8,15:12,5
+chr13	76318655	.	C	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,4:5,2:5,2
+chr13	76318660	.	A	ATG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,4:5,2:5,2
+chr13	76457792	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,4:3,3:13,1
+chr13	82047149	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0001126;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:5,11:9,8
+chr13	82082276	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.8837e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:21,22:9,15:12,7
+chr13	82084148	.	G	GGT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.015511;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,8:15,4:7,4
+chr13	82392688	.	TAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.010683;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,11:8,7:6,4
+chr13	85510720	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=4.5153e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:9,10:20,9
+chr13	87433344	.	CACTTGAAACTAACAATATTTTAAAAG	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.063556;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:10,4:10,4
+chr13	87860077	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.3;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:7,2:4,1:3,1
+chr13	89038023	.	G	GTA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.17207;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:13,5:10,1
+chr13	90271648	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:1,7:0,1:1,6
+chr13	90314350	.	CACAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.19246;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:10,2:15,2
+chr13	90314366	.	TAC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.065833;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:5,3:16,3
+chr13	90314394	.	C	CACT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12337;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,5:10,4:14,1
+chr13	90314398	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.051469;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:8,5:9,2
+chr13	90535531	.	GT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:12,12:6,8:6,4
+chr13	93102644	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.069764;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,8:14,7:7,1
+chr13	93719694	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.9137e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,19:7,7:8,12
+chr13	93979319	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.031815;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:2,4:14,3
+chr13	95350698	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.04524;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:15,8:10,3
+chr13	96242577	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.21758;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:16,1:16,3
+chr13	96866641	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.042556;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,7:8,3:4,4
+chr13	96943450	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:4,1:3,4
+chr13	97745962	.	TAA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=9.1959e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:7,21:4,10:3,11
+chr13	98372081	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.013375;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:9,8:1,1
+chr13	98488160	.	G	GACAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0061246;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,8:3,7:3,1
+chr13	100067016	.	G	GTATA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,3:11,1
+chr13	100348890	.	TTTCC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.1043;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:11,2:14,4
+chr13	100524374	.	C	CGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.01504;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:5,3:18,7
+chr13	100609682	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.058759;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:13,4:20,2
+chr13	100812765	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=6.3369e-11;SS=2;SSC=101;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:19,30:12,17:7,13
+chr13	101256765	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:4,8:7,1
+chr13	104361264	.	C	CT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.3655e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,12:9,9:5,3
+chr13	104467288	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.1402e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:14,9:11,6
+chr13	104934498	.	C	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=4.489e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,23:15,14:8,9
+chr13	105286843	.	C	CTTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:7,3:7,8
+chr13	106169412	.	T	TAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0007996;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,14:5,9:2,5
+chr13	106281922	.	AAAT	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12656;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:19,1:14,3
+chr13	106395375	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.5832e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,22:14,11:11,11
+chr13	109392632	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.23992;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:8,2:13,1
+chr13	109670435	.	G	GT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:2,4:1,2:1,2
+chr13	109765589	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:1,0:12,4
+chr13	110481218	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10365;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:5,4:13,1
+chr13	110516896	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045968;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:3,4:13,2
+chr13	110603307	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00017215;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,10:4,8:4,2
+chr13	111680082	.	AAG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:0,4:7,8
+chr13	112279249	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:15,1:4,3
+chr13	112292665	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.082314;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:23,4:19,4
+chr13	112300579	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,1:9,3
+chr13	112863264	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.028868;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:10,6:9,2
+chr13	113512746	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,2:3,2
+chr13	113600427	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:4,3:7,2
+chr13	113640819	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00023524;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:18,10:12,8
+chr13	114028232	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,3:3,1
+chr14	16032010	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.026087;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,0:7,4
+chr14	18254190	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048825;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,5:10,5
+chr14	18403011	.	C	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,3:4,2
+chr14	18631061	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:18,3:10,1
+chr14	18679857	.	TA	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.027603;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:41,15:24,9:17,6
+chr14	18951065	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0054626;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:5,3:12,9
+chr14	18953821	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.016516;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:20,2:30,5
+chr14	19115443	.	A	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:17,4:1,1
+chr14	19271533	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
+chr14	19339980	.	T	TC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.028508;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,6:12,3:13,3
+chr14	19340017	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:16,3:2,1
+chr14	19397645	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016895;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:10,1:14,4
+chr14	19475796	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:3,2:11,2
+chr14	19480483	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.047268;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:26,8:11,4
+chr14	19489756	.	T	G	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.03269;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:71,21:28,9:43,12
+chr14	19708740	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.14106;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:31,4:14,1
+chr14	19833665	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=6.6042e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:12,6:13,14
+chr14	20506338	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0070965;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,14:1,3:6,11
+chr14	21460585	.	C	CAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,7:3,2
+chr14	22782464	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.045689;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:22,3:21,4
+chr14	23016888	.	AT	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.092709;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,3:14,1
+chr14	23129127	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.0826e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,18:13,10:13,8
+chr14	23779038	.	CTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.006993;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,8:1,1:1,7
+chr14	24004269	.	T	TA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0048364;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:12,5:0,1
+chr14	25125164	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.059881;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:13,5:2,1
+chr14	26941188	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.5607e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:17,23:10,12:7,11
+chr14	27112425	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.0511e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,19:9,12:3,7
+chr14	28392771	.	C	CT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.3087e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:11,6:10,7
+chr14	28562095	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,1:14,3
+chr14	29466224	.	TAAATATATAATATATAA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,5:6,3
+chr14	30434626	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:5,2:5,2
+chr14	32056469	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.025586;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,12:1,3:10,9
+chr14	33541098	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.038751;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:20,5:15,2
+chr14	34371073	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:13,5:4,1
+chr14	34784368	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,5:0,2:4,3
+chr14	34890002	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,10:6,8:10,2
+chr14	35259993	.	G	GT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:8,4:5,5
+chr14	35977406	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.21888;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:14,1:16,3
+chr14	37181064	.	TTTTA	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:9,8:10,3
+chr14	37200892	.	GTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.049827;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:11,6:8,3
+chr14	37433616	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=2.7351e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:12,21:5,14:7,7
+chr14	38953429	.	A	AGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:4,5:2,1
+chr14	38989050	.	AAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0023054;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,9:8,3:8,6
+chr14	40464959	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=2.4234e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:14,12:9,10
+chr14	41051835	.	C	CATTATTATTATTATTATTATT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,10:4,5:3,5
+chr14	41494216	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=5.8335e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,23:9,14:12,9
+chr14	42157721	.	TA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.070365;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,7:6,3:14,4
+chr14	44684892	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0049228;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:16,5:3,3
+chr14	45757259	.	G	GGCTTGCTTGCTTGCTTGCTT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0015921;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,12:8,4:12,8
+chr14	46266489	.	CAAACA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,1:7,3
+chr14	46275141	.	TAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,4:6,3:6,1
+chr14	47361207	.	C	CTA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0018885;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:12,7:9,2
+chr14	49799207	.	C	CAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.064856;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,7:11,6:4,1
+chr14	50239185	.	AAAG	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0023885;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,11:7,8:4,3
+chr14	50585894	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.4733e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:27,21:10,16:17,5
+chr14	51068346	.	CAAA	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.035023;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:27,4:23,2
+chr14	51247352	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,7:4,5:2,2
+chr14	51646318	.	CAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:9,4:3,1
+chr14	52107305	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:2,2:5,2
+chr14	52739632	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,5:4,1
+chr14	52762858	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,4:5,1
+chr14	52779724	.	T	TAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:1,5:4,1
+chr14	54208438	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00064075;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:10,6:16,4
+chr14	55099607	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,9:6,2:5,7
+chr14	55990192	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.069424;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:13,3:9,4
+chr14	56102549	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.004119;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:4,6:3,2
+chr14	56546913	.	AT	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=9.0495e-07;SS=2;SSC=60;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:8,6:14,12
+chr14	56883287	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:4,3:3,1
+chr14	57381058	.	A	AGAAG	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.070174;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,5:10,4:17,1
+chr14	57381064	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.028751;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,9:9,7:9,2
+chr14	58743217	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.023494;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:18,4:15,4
+chr14	58954563	.	T	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.00014931;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:46,20:25,12:21,8
+chr14	59289767	.	G	GATATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.018966;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:7,3:4,3
+chr14	59575505	.	CTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00096036;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,12:9,6:0,6
+chr14	59749420	.	C	CTA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,2:1,1:3,1
+chr14	60784179	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,9:2,4:4,5
+chr14	61106104	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:31:0,6:0,3:0,3
+chr14	61607114	.	G	GGTGTGTGCGT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.047515;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,10:13,4:7,6
+chr14	62799573	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:5,4:2,2
+chr14	63074461	.	TATGTCA	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=3.7204e-08;SS=2;SSC=74;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:13,6:4,11
+chr14	64716465	.	CA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.02087;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,6:3,3:3,3
+chr14	65436630	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:5,2:1,1:4,1
+chr14	67179340	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=3.0979e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:22,27:11,13:11,14
+chr14	67323261	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.14256;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:20,3:11,1
+chr14	67389775	.	C	CT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00060405;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:12,4:4,4
+chr14	67655028	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,10:6,9:3,1
+chr14	68388076	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.093861;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:21,1:10,3
+chr14	68635709	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=3.2589e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:9,8:14,5
+chr14	70659134	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:15,5:16,2
+chr14	71708015	.	GT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016908;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,5:5,1
+chr14	71845111	.	T	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0051416;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:7,2:8,8
+chr14	71845125	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,1:6,5
+chr14	71899692	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.637e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:10,13:9,3
+chr14	73258618	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,4:14,1:4,3
+chr14	73395037	.	T	TTG	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.004257;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,7:4,5:0,2
+chr14	73401563	.	AT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.042832;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,4:9,3
+chr14	73834946	.	A	AGT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:2,3:3,3
+chr14	73844185	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,4:10,2:8,2
+chr14	74335740	.	A	AT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.034367;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:14,1:8,4
+chr14	76678199	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=6.0264e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,23:13,14:9,9
+chr14	77501593	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:5,5:5,1
+chr14	77642878	.	ATAAATGTGTGT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,10:9,5:1,5
+chr14	77648612	.	GAAAGGAAAGAAGA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.024217;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:10,7:8,3
+chr14	77657742	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:4,4:4,1
+chr14	78073537	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:7,3:8,4
+chr14	79284343	.	CATATAT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,5:6,3:0,2
+chr14	79601040	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0035197;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,11:1,9:7,2
+chr14	79921819	.	T	TTC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:0,2:0,0:0,2
+chr14	81807138	.	TCAC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:5,6:15,2
+chr14	82885965	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.031249;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,8:14,7:2,1
+chr14	83298937	.	G	GT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:10,4:8,3
+chr14	83759808	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.9123e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:11,8:7,10
+chr14	84790356	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,2:1,1:0,1
+chr14	85109882	.	ATACG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,1:12,3
+chr14	85109901	.	C	CG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.1672;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,4:17,1:16,3
+chr14	85504440	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0099771;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,12:2,10:3,2
+chr14	85598916	.	G	GTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:14,8:2,2
+chr14	87349200	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.17135;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:8,4:8,1
+chr14	88205542	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02564;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:8,4:3,4
+chr14	88212109	.	A	AATATATATATATATATATAT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:10,3:8,2
+chr14	88990751	.	T	TC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.045802;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:10,2:12,4
+chr14	89336250	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:4,4:15,1
+chr14	90046237	.	CTT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:4,1:1,1
+chr14	90144495	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,8:2,5:3,3
+chr14	90515076	.	CT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.021743;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:16,4:3,2
+chr14	90675064	.	C	CCGGTGGTT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.040958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,12:13,9:17,3
+chr14	90675068	.	CCCCTA	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.017517;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,14:13,9:14,5
+chr14	90675076	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0067999;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,13:12,9:11,4
+chr14	90675077	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.012514;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:15,10:12,5
+chr14	91044346	.	AGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAAAGAAGGAAAGAAAGAAAGAAG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.032243;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,2:5,2
+chr14	91586577	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.07056;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,1:13,3
+chr14	91586581	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.083817;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,2:15,2
+chr14	94598852	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=8.9063e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:13,13:14,11
+chr14	94701786	.	G	GA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.04269;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:10,3:7,5
+chr14	94740143	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=2.2394e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:29,23:19,14:10,9
+chr14	95578854	.	CTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:4,6:2,1
+chr14	95817827	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.9774e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:10,10:8,7
+chr14	95845501	.	T	TCA	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00068033;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,20:13,5:12,15
+chr14	95943673	.	A	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.1682e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:10,11:13,8
+chr14	98014407	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.047431;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,3:5,2:1,1
+chr14	98090703	.	CTTT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0062751;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:8,8:4,2
+chr14	98247482	.	A	AT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,4:5,1
+chr14	98430947	.	C	CA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0045584;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,8:20,6:12,2
+chr14	98656998	.	TA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0094013;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,6:13,3:4,3
+chr14	98667025	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.057792;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
+chr14	100100784	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.093821;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,7:11,6:10,1
+chr14	101724878	.	CTA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.044153;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:12,4:13,4
+chr14	101765734	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:13,1:7,3
+chr14	102198097	.	CTTTATTTA	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.026923;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:9,4:17,7
+chr14	102202372	.	GT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.27668;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:8,1:5,2
+chr14	102463416	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.048842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,5:21,1:5,4
+chr14	102692768	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:2,4:4,4
+chr14	103467674	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0729;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,6:16,5:8,1
+chr14	103683237	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=9.577e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:31,18:13,12:18,6
+chr14	105736712	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.041509;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:1,6:16,4
+chr14	105744265	.	T	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.015261;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:48,8:24,5:24,3
+chr14	105763959	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.028667;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:22,5:8,1
+chr14	105992368	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.04073;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:5,1:17,6
+chr14	105992391	.	T	TCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.24625;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,4:9,2:10,2
+chr14	106330206	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.04214;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:44,8:17,5:27,3
+chr15	17074312	.	T	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.035564;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:51,8:27,3:24,5
+chr15	17949032	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:15,2:3,2
+chr15	19417458	.	G	A	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.042691;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:75,12:40,7:35,5
+chr15	19904285	.	CT	C	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0080542;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:64,10:27,2:37,8
+chr15	19925520	.	G	A	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.021921;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:95,15:54,5:41,10
+chr15	20034110	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.077637;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:19,1:23,4
+chr15	20104979	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16049;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:13,4:18,1
+chr15	20123651	.	TA	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.021168;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:8,2:13,4
+chr15	20141272	.	G	T	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.0033445;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:64,20:45,12:19,8
+chr15	20239156	.	T	C	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.012734;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:55,7:36,4:19,3
+chr15	20251534	.	C	T	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.021476;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:83,21:36,10:47,11
+chr15	20274409	.	T	C	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.018172;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:72,22:38,8:34,14
+chr15	20309052	.	TGATGA	T	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.023365;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:58,7:39,1:19,6
+chr15	20427360	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.048554;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:13,5:8,1
+chr15	20495787	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,4:3,4
+chr15	20542554	.	C	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.001061;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:22,15:12,9:10,6
+chr15	20585598	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.012777;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:21,4:16,4
+chr15	20760843	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14229;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,2:7,2:0,0
+chr15	20940008	.	A	AGCGAGGCAAG	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.026673;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:62,14:33,7:29,7
+chr15	21112441	.	TGGCTA	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.059112;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:53,6:31,2:22,4
+chr15	21275609	.	C	CA	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.029691;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:88,21:43,10:45,11
+chr15	21355190	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.075302;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:15,3:16,2
+chr15	21442268	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.015531;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:21,6:20,3
+chr15	21495301	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,1:7,3
+chr15	21640770	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,6:8,1
+chr15	21642220	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.26383;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,5:5,2:15,3
+chr15	21917714	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.021811;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:49,14:19,10:30,4
+chr15	22421798	.	A	C	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.039392;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:62,17:26,9:36,8
+chr15	22597673	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00014569;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:11,5:10,15
+chr15	22821649	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:1,2:1,1:0,1
+chr15	23041964	.	G	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.082337;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,1:7,5
+chr15	23043520	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.26573;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:16,3:7,1
+chr15	23047926	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013285;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,3:5,3
+chr15	23149525	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.033582;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,6:5,1
+chr15	23347821	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.057558;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:24,1:12,4
+chr15	24262448	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0060315;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,6:4,3
+chr15	24369770	.	AT	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.04773;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,2:14,2
+chr15	25953441	.	CTT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.086687;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,10:3,6:3,4
+chr15	25967006	.	TTTATATATA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.020719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,2:3,4
+chr15	26355115	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=4.108e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:25,25:15,12:10,13
+chr15	26361251	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:4,2:9,2
+chr15	26665926	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.7527e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:8,8:11,9
+chr15	26760768	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0027222;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:14,5:6,4
+chr15	26946807	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=4.2987e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:12,7:10,8
+chr15	27001888	.	G	GTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,5:2,4:4,1
+chr15	27306943	.	TATATA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.058021;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:13,3:13,4
+chr15	27307407	.	A	ATG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,4:11,3:13,1
+chr15	27602343	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.2072e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:6,11:14,9
+chr15	28472246	.	T	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.036691;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:24,4:20,1
+chr15	28488117	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,4:9,1:10,3
+chr15	28808374	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.011156;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:46,17:23,5:23,12
+chr15	29975228	.	C	CAAGA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,12:9,9:5,3
+chr15	30150979	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.028132;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:18,2:4,3
+chr15	30326364	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.19804;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,5:11,3:7,2
+chr15	30371006	.	G	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.036306;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:17,6:21,1
+chr15	30596779	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.033698;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:14,1:11,6
+chr15	30652848	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013375;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:4,2:6,7
+chr15	31199330	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:5,1:12,3
+chr15	32387887	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.027339;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:3,2:19,10
+chr15	32424950	.	A	T	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.01026;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:92,25:52,17:40,8
+chr15	32457303	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.042279;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:12,4:29,5
+chr15	32591731	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,3:10,1
+chr15	32738083	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028205;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:7,3:1,1
+chr15	33271983	.	ATT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:1,2:0,0:1,2
+chr15	33572654	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13283;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:23,3:5,1
+chr15	34181727	.	C	CAT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,4:11,3:12,1
+chr15	34518917	.	G	GAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.03366;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,14:10,8:14,6
+chr15	34709673	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:4,2:7,7
+chr15	36521645	.	AGAAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0073297;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,7:8,4:1,3
+chr15	36521672	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.038274;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,2:0,2
+chr15	37334425	.	T	TTATATA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0054438;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:8,7:3,1
+chr15	37402739	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.043422;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,1:8,5
+chr15	38112415	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:47:2,8:0,2:2,6
+chr15	38369233	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,4:3,1:1,3
+chr15	40073724	.	CTTT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.035178;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:10,6:15,5
+chr15	40318685	.	T	TA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.04741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,8:7,7:6,1
+chr15	40377313	.	C	CA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0019978;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,13:8,9:10,4
+chr15	41615216	.	A	AT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.565e-06;SS=2;SSC=54;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:28,20:13,9:15,11
+chr15	42785115	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.019162;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,6:9,1
+chr15	43261074	.	GTGT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,2:6,2
+chr15	43608459	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.071818;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:13,4:9,2
+chr15	44764928	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.7648e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:12,10:8,4
+chr15	46106874	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.03936;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:16,2:25,3
+chr15	46546000	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.3453e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:9,6:9,7
+chr15	47083875	.	T	TTG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045213;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:13,7:9,4
+chr15	47133961	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0073228;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:10,9:4,2
+chr15	48568052	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,4:15,3:3,1
+chr15	50169282	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.12269;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:22,5:9,1:13,4
+chr15	50615163	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17207;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:15,5:8,1
+chr15	50772849	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,5:2,2:3,3
+chr15	51079855	.	CAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0083426;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,5:2,3
+chr15	52697957	.	ATTT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,3:7,1
+chr15	53135920	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.016315;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:16,9:6,2
+chr15	53703277	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00011889;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,20:17,8:10,12
+chr15	54280745	.	TAC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:7,3:7,4
+chr15	54475281	.	TTTATTATTATTATTA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0022329;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:8,20:5,9:3,11
+chr15	55119378	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.074336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:12,4:10,1
+chr15	55370885	.	GAA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030401;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,10:13,8:1,2
+chr15	55428466	.	TCTCA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0078215;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:5,4:4,7
+chr15	58726567	.	C	CA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,4:1,3:0,1
+chr15	60878343	.	CAAA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,10:8,9:3,1
+chr15	61184986	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:2,4:4,1
+chr15	61277734	.	T	TC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:9,8:6,2:3,6
+chr15	63158567	.	ATT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0015492;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,14:0,11:5,3
+chr15	64577230	.	AATAC	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.029832;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,5:2,3
+chr15	65221802	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0022391;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:2,5:9,8
+chr15	65284337	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:10,3:4,3
+chr15	65986793	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:6,2:4,2
+chr15	66632730	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,9:5,6:5,3
+chr15	67244127	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.5575e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:13,12:10,7
+chr15	67875410	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,2:4,3
+chr15	68368877	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:4,2:11,2
+chr15	69808686	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,4:8,2:11,2
+chr15	71416711	.	ATTTTG	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036162;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:13,6:11,4
+chr15	72151953	.	TTTATTTA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.17271;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:15,1:17,3
+chr15	72436772	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=8.075e-10;SS=2;SSC=90;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:18,31:12,17:6,14
+chr15	72860754	.	TATCTATCTATCTATCTATCTATCC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0307;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,6:14,3:8,3
+chr15	72948523	.	T	TAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04422;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:7,6:7,1
+chr15	74076151	.	T	G	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.041086;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:14,3:26,10
+chr15	74170093	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.049242;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:17,6:18,2
+chr15	74894039	.	AGTGTGTGTGTGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.10909;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,2:2,2:0,0
+chr15	75184978	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.013985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:3,9:6,1
+chr15	76475634	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.1043e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,6:11,9
+chr15	77378188	.	T	TTATATATATATA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.013807;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:13,8:10,5
+chr15	77746207	.	CAAA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.006848;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,10:11,8:5,2
+chr15	78920737	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=8.3675e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,5:3,3
+chr15	78968262	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.030276;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,6:22,3:15,3
+chr15	79273657	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27277;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:14,1:7,3
+chr15	80637342	.	C	CAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.032417;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,8:11,7:1,1
+chr15	82108073	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,5:4,4:4,1
+chr15	82367272	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0050719;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:7,1:9,7
+chr15	82367273	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022726;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:7,1:8,7
+chr15	82367274	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.011329;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:7,2:8,7
+chr15	82520259	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.21758;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:14,3:18,1
+chr15	82526543	.	ATTTATAGTTTAAATTTATTTGTGTTTCTAATTTATAG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.012459;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,10:12,5:10,5
+chr15	82902197	.	A	AT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00022489;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:14,15:8,11:6,4
+chr15	84426018	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.026626;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:24,7:17,6
+chr15	85293018	.	ATT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:11,3:9,5
+chr15	85355163	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,7:1,4:10,3
+chr15	85359195	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.029349;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,8:6,7:6,1
+chr15	85765636	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,4:3,1:4,3
+chr15	85896830	.	G	GTCTC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,4:2,1:5,3
+chr15	86160099	.	GT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0028624;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:6,5:4,7
+chr15	86271043	.	A	ATTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,3:7,1
+chr15	86391640	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,1:6,3
+chr15	86724235	.	C	CAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,6:11,5:3,1
+chr15	89424577	.	G	GAATTAGAAAGGTTGCTTCTGCCACCCAGTCACTTCCCAAAGT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,2:10,2
+chr15	89424578	.	T	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,2:10,2
+chr15	89541444	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00037187;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,5:10,6
+chr15	91406849	.	CAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,8:5,7:0,1
+chr15	93463490	.	C	CAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,4:6,3:3,1
+chr15	94744908	.	AGGAG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
+chr15	95100648	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00022188;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:10,7:12,3
+chr15	95620717	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:8,5:3,3
+chr15	97186929	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=6.0344e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:16,26:6,11:10,15
+chr15	97466847	.	GAA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,2:9,2
+chr15	98367147	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,3:3,1:1,2
+chr15	98489320	.	G	GTA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,1:4,3
+chr15	98878663	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:8,4:0,1
+chr15	99750660	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.012427;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:17,3:10,6
+chr15	100356520	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=7.0704e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:20,22:10,14:10,8
+chr15	100535801	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.031065;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,3:6,5
+chr15	101661101	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.090326;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:22,4:22,1
+chr15	101755793	.	G	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,1:4,3
+chr15	101759784	.	C	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.028059;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:25,3:17,3
+chr15	101944808	.	C	T	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.0027971;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:98,29:52,19:46,10
+chr15	101951124	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.024579;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:11,4:9,2
+chr16	825460	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.1717e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,16:13,6:16,10
+chr16	858660	.	G	GC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14691;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:13,3:14,2
+chr16	1092432	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.28111;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:7,3:20,1
+chr16	1511927	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0012196;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:9,2:15,8
+chr16	2524524	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.1033e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:21,22:11,10:10,12
+chr16	2599069	.	T	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=4.0325e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:31,21:17,14:14,7
+chr16	3146294	.	G	GC	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00017382;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:10,4:10,14
+chr16	3944592	.	AAAGAAGAAGAAG	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0020704;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:7,6:0,2
+chr16	4227064	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.017118;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:12,3:8,7
+chr16	4237956	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=4.0661e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:13,7:13,10
+chr16	5202753	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:10,1:5,4
+chr16	5488566	.	TG	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:14,4:2,2
+chr16	6806836	.	A	ATATATATATATAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17217;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:5,1:4,4
+chr16	6861823	.	G	GTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:6,3:4,2
+chr16	6864991	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.062457;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,1:9,4
+chr16	7330510	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.013487;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,6:4,2:6,4
+chr16	7508622	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00037122;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:16,8:12,5
+chr16	8707353	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0087781;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,7:8,4:15,3
+chr16	8773105	.	TACAC	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0051611;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:21,16:12,12:9,4
+chr16	8990182	.	C	CA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0026611;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,9:15,7:7,2
+chr16	9193261	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.076832;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,1:14,3
+chr16	9193263	.	CTTTCTGTCTCTT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040021;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:4,1:13,4
+chr16	9965116	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=9.2748e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:14,6:13,8
+chr16	10986012	.	ATTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:7,1:6,5
+chr16	11486257	.	AGATGGATGGATGGAGG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.18237;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:8,5:13,1
+chr16	11520664	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:8,5:7,1
+chr16	11855946	.	GTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,9:7,6:4,3
+chr16	11893093	.	G	GT	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=9.5714e-08;SS=2;SSC=70;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:14,11:8,8
+chr16	12101301	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:1,3:3,1
+chr16	12182189	.	G	GT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.014832;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,10:5,9:3,1
+chr16	12441089	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.065489;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:11,3:6,1
+chr16	12619111	.	GAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0039295;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,8:2,7:2,1
+chr16	12970351	.	GTGTATATA	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,5:2,2:1,3
+chr16	13107472	.	G	GAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0096894;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,6:6,5:1,1
+chr16	14435896	.	T	TCACA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.027067;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:18,14:18,12:0,2
+chr16	15263066	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.13506;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:23,2:19,4
+chr16	16324387	.	C	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.041457;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:50,13:11,4:39,9
+chr16	16468806	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064494;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:20,5:18,1
+chr16	16473782	.	G	C	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.026432;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:42,13:14,4:28,9
+chr16	16508138	.	GA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15645;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:11,1:15,4
+chr16	16600714	.	TC	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:13,4:9,3:4,1
+chr16	16607270	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0075808;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:10,3:14,9
+chr16	16663176	.	T	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.024133;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:20,9:24,3
+chr16	16936582	.	A	ATAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,3:0,0:0,3
+chr16	18683772	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,2:1,2
+chr16	19093031	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:14,6:2,2:12,4
+chr16	19363464	.	CAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,9:4,8:0,1
+chr16	20513554	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00016294;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:13,5:11,6
+chr16	21244072	.	TA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0395;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:16,2:17,4
+chr16	21921367	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
+chr16	22042437	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.0279e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:9,9:13,8
+chr16	22081064	.	T	TAA	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.036285;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:19,7:18,4
+chr16	22234877	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:6,7:1,1
+chr16	22955353	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0014133;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:45,13:24,9:21,4
+chr16	23875562	.	C	CAT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.040176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,9:19,7:10,2
+chr16	23875617	.	CAT	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.031193;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:22,7:12,5
+chr16	24396302	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0010413;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:7,4:7,7
+chr16	24420042	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.2196e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:13,4:12,12
+chr16	24440766	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0056638;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,5:3,3
+chr16	24461423	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.00037161;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,7:3,3:1,4
+chr16	24482261	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,6:2,3
+chr16	24830828	.	ATT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11404;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,2:5,3
+chr16	24888478	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,2:3,2:0,0
+chr16	25182809	.	A	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:6,3:2,2:4,1
+chr16	26663859	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,1:11,3
+chr16	26737206	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,5:5,1:6,4
+chr16	27077403	.	C	CCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTTCTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,4:4,1:15,3
+chr16	28819391	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,7:4,1
+chr16	29057728	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,1:13,3
+chr16	29495118	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.1625;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:16,3:13,2
+chr16	29677012	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.029832;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,8:6,6:5,2
+chr16	30219035	.	AACACACACACACACAC	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,6:18,4:0,2
+chr16	30244853	.	A	AT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.024615;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,9:28,7:5,2
+chr16	30327682	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0022268;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:13,8:12,13
+chr16	31027172	.	ATT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,2:5,4
+chr16	31660065	.	T	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=4.4711e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:24,33:14,18:10,15
+chr16	32431415	.	C	CA	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.0046163;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:77,9:36,3:41,6
+chr16	32432148	.	CTATTTT	C	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.043374;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:57,14:22,2:35,12
+chr16	32742591	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.011783;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:3,2:6,3
+chr16	32806184	.	C	A	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.037006;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:123,15:61,11:62,4
+chr16	32828383	.	A	G	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.0064393;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:79,18:33,11:46,7
+chr16	32840133	.	T	C	0	PASS	DP=508;GPV=1;SPV=0.033921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:283:248,35:118,22:130,13
+chr16	32840428	.	A	G	0	PASS	DP=331;GPV=1;SPV=0.0037718;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:149,32:56,7:93,25
+chr16	32924356	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,1:5,3
+chr16	33066992	.	G	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.03297;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:11,2:13,4
+chr16	33336271	.	G	C	0	PASS	DP=248;GPV=1;SPV=0.025434;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:133,22:74,15:59,7
+chr16	33337167	.	T	C	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.026253;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:91,13:43,5:48,8
+chr16	33573794	.	C	T	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=4.2437e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:48,26:24,15:24,11
+chr16	33733280	.	AC	A	0	PASS	DP=349;GPV=1;SPV=0.015777;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:153,21:81,11:72,10
+chr16	33737560	.	G	T	0	PASS	DP=287;GPV=1;SPV=0.025573;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:137,20:45,8:92,12
+chr16	33913297	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=7.4607e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:13,10:12,5
+chr16	34641277	.	T	TA	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.031989;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,7:31,2:16,5
+chr16	34641305	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.015177;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:52,6:30,2:22,4
+chr16	34790316	.	A	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.046508;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:48,14:26,10:22,4
+chr16	34805509	.	G	A	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.0039048;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:83,13:61,9:22,4
+chr16	36108857	.	A	G	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.046237;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:48,6:22,1:26,5
+chr16	36121348	.	C	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.039594;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:73,12:30,4:43,8
+chr16	36122861	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=3.0806e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:14,7:8,7
+chr16	37816259	.	A	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,1:3,3
+chr16	37852203	.	G	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.006543;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,8:17,7:30,1
+chr16	37852518	.	C	G	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.028777;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:94,14:13,5:81,9
+chr16	38280337	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0076646;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:3,4:30,8
+chr16	47102417	.	A	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=1.0295e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:23,25:11,14:12,11
+chr16	48737570	.	T	TACAC	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0088657;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,11:9,5:9,6
+chr16	48805638	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.026903;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,7:10,6:5,1
+chr16	50116900	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:9,4:4,2
+chr16	50761746	.	A	ATATCTATCTATCTATC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.034267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:9,7:10,3
+chr16	51523034	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=3.9184e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,15:5,9:7,6
+chr16	52660470	.	TAAAAAAA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,4:5,3
+chr16	52804555	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=1.6121e-06;SS=2;SSC=57;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,13:2,6:2,7
+chr16	52991588	.	CA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.052719;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:17,3:10,2
+chr16	54702775	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.059571;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:13,6:4,2
+chr16	57030466	.	GAAAA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,4:13,2:5,2
+chr16	57899327	.	A	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=2.0528e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:25,27:15,18:10,9
+chr16	57973361	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.015475;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:4,6:7,3
+chr16	58478403	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.020668;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,4:7,1:4,3
+chr16	59284332	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.107e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:11,10:12,12
+chr16	59666520	.	T	TAC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.01056;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:14,9:7,5
+chr16	60238853	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=6.2662e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:10,4:7,7
+chr16	62126371	.	ATATATTCAG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.044477;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,2:5,2
+chr16	62471538	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.1631e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:14,9:10,9
+chr16	63421692	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:38:0,2:0,0:0,2
+chr16	64312021	.	TA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,4:6,1
+chr16	65648766	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:3,3:2,2:1,1
+chr16	65690848	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.055194;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,4:8,1
+chr16	66861200	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.047776;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:22,6:4,5
+chr16	66970863	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.6406e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:12,9:14,5
+chr16	68532521	.	CTGTGTGTGTGTG	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0038666;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:12,7:10,7
+chr16	68583454	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,8:0,7:3,1
+chr16	68922027	.	TA	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=3.5648e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:15,7:14,7
+chr16	69511409	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10559;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:12,1:20,3
+chr16	69665646	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.098151;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:7,2:15,4
+chr16	70090016	.	A	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.04939;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:18,4:18,4
+chr16	70125552	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.050318;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,6:19,5:7,1
+chr16	70187410	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.048775;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,5:15,1:17,4
+chr16	70188113	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.022677;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:11,3:14,3
+chr16	70532357	.	C	CAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,7:9,4:15,3
+chr16	70902823	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,4:4,3:4,1
+chr16	70937669	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:6,8:5,2
+chr16	71031199	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.006391;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:3,4:5,1
+chr16	71092724	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.017327;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,2:7,7
+chr16	71382155	.	A	AAGGAAGGAAGGAAGGAAG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.033431;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,6:10,5:5,1
+chr16	72195980	.	AATGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.093861;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,1:16,3
+chr16	72323845	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.029259;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,7:13,6:6,1
+chr16	73155180	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:20,4:3,1
+chr16	73346634	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=4.699e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:19,26:12,16:7,10
+chr16	73534743	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.0995e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:7,9:8,7
+chr16	73606180	.	TAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,2:5,2
+chr16	74109717	.	ATTTAAT	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.075047;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:15,1:13,4
+chr16	74138987	.	T	TACAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,8:4,6:1,2
+chr16	74512160	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.028446;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:6,8:16,2
+chr16	74882807	.	CAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:8,5:3,1
+chr16	75438992	.	C	CTT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.037457;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,9:13,8:4,1
+chr16	76056284	.	CT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00084999;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:10,7:12,4
+chr16	76092653	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.4245e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:10,7:10,8
+chr16	76518615	.	T	TG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,4:9,1:8,3
+chr16	76974053	.	A	AT	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=8.9816e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,19:20,11:7,8
+chr16	77910158	.	A	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.6041e-09;SS=2;SSC=87;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:20,26:15,11:5,15
+chr16	78229508	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.005531;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:9,5:14,4
+chr16	78991600	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:7,9:4,1
+chr16	80723975	.	G	GAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.025116;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,9:10,5:7,4
+chr16	81159638	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=1.1066e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:31,28:21,19:10,9
+chr16	82901364	.	GTGTC	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.040194;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:15,7:13,6
+chr16	83000574	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.027005;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:8,5:5,5
+chr16	83191464	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:14,3:8,1
+chr16	83201744	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0017626;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:11,4:7,4
+chr16	83334363	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.19386;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:19,3:16,1
+chr16	83405655	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00046557;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:20,7:18,7
+chr16	83443717	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATAT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.013867;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,15:4,7:4,8
+chr16	83460982	.	A	AACAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.024017;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,8:7,6:1,2
+chr16	83843818	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:21,2:14,2
+chr16	85387996	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,5:1,4:5,1
+chr16	85443982	.	C	CTTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.043512;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,5:1,3:2,2
+chr16	86040590	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,3:13,1
+chr16	86108465	.	TTAC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06862;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:16,3:8,4
+chr16	86421862	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16205;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:15,5:7,1
+chr16	86470758	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,9:7,8:3,1
+chr16	86720545	.	T	TCTCTCTCTCACACACACACACACACA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.031293;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,8:20,2:6,6
+chr16	87814170	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,5:1,1
+chr16	88590564	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,5:6,1
+chr16	89634087	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0055698;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:9,4:5,7
+chr17	118657	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.04316;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:21,2:14,12
+chr17	218207	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.035018;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:16,5:17,5
+chr17	232829	.	CGTGT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,9:9,6:4,3
+chr17	234083	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:1,4:8,1
+chr17	242763	.	A	AC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15472;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:9,2:19,3
+chr17	489078	.	T	TG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:9,3:1,3
+chr17	643595	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0016056;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:19,12:0,6
+chr17	724675	.	TA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:1,2:1,2:0,0
+chr17	790918	.	C	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,2:3,1:2,1
+chr17	994181	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:1,1:8,3
+chr17	1121543	.	TC	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.033085;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:17,4:24,2
+chr17	1164351	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.03797;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:23,2:5,5
+chr17	1404055	.	GAGAGGGC	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.01571;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,16:12,9:14,7
+chr17	1427030	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:7,3:5,3
+chr17	1563700	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00066955;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,10:1,7:3,3
+chr17	1961983	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0070131;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:11,10:8,8:3,2
+chr17	1964788	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.00011908;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:1,8:0,6:1,2
+chr17	2352775	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:6,4:12,2
+chr17	2778007	.	T	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:6,6:2,1
+chr17	2889889	.	A	ATATATATATTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,5:8,4:6,1
+chr17	3240047	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.018621;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:15,5:6,6
+chr17	3649451	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0056346;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:7,8:4,4
+chr17	3966363	.	GTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,4:4,2
+chr17	4564645	.	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:2,1:10,4
+chr17	4715726	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.083573;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:16,5:13,2
+chr17	4999797	.	G	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.0006e-10;SS=2;SSC=95;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:21,29:14,18:7,11
+chr17	5098508	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,2:10,3
+chr17	7005474	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,4:3,1
+chr17	7664407	.	CT	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.041463;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:7,4:21,2
+chr17	8020089	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.22175;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,5:8,3:9,2
+chr17	8044105	.	G	GAGGAAGGA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:8,3:6,1
+chr17	9113937	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.884e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:8,10:10,6
+chr17	9887384	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=3.7963e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:32,22:18,16:14,6
+chr17	10162066	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.18543;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,5:21,4:6,1
+chr17	10846696	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,3:7,1
+chr17	11200174	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.0799e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:12,10:13,4
+chr17	11435295	.	A	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=9.1893e-11;SS=2;SSC=100;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:4,13:10,6
+chr17	12743486	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:9,4:2,1
+chr17	12807119	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.0952e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,18:6,7:11,11
+chr17	13396594	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.22913;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,2:11,2
+chr17	14522470	.	GA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,5:4,1
+chr17	14950148	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0029865;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,14:13,9:5,5
+chr17	15317992	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.022727;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:8,1:5,4
+chr17	18608787	.	C	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.018744;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:47,18:24,7:23,11
+chr17	18687312	.	T	TC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:4,2:9,4
+chr17	18717186	.	A	ATG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,9:5,1:6,8
+chr17	19587866	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.1063;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:24,2:19,3
+chr17	19951263	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.025931;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,5:5,1
+chr17	20144182	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022163;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,6:4,1
+chr17	20780985	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.037131;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:17,7:11,2:6,5
+chr17	21324903	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.038797;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,11:19,6:23,5
+chr17	21356979	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00014725;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:8,4:12,11
+chr17	21694470	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.050308;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:22,5:21,1
+chr17	21754166	.	A	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.043039;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:17,5:19,7
+chr17	21776339	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:4,2:2,1:2,1
+chr17	21987969	.	GTAATGTAATA	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.013655;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:31,12:12,5:19,7
+chr17	22855727	.	G	A	0	PASS	DP=273;GPV=1;SPV=0.041915;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:133,15:56,4:77,11
+chr17	22930425	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.068138;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:30,4:2,0
+chr17	22945311	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.044156;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:15,1:4,4
+chr17	23140593	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.10313;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:25,1:0,3
+chr17	23145205	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:1,0:14,4
+chr17	26578449	.	A	G	0	PASS	DP=302;GPV=1;SPV=0.046444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:131,23:74,12:57,11
+chr17	26597652	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.028065;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:3,3:34,6
+chr17	26750493	.	CA	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.035593;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:22,5:12,4
+chr17	26950327	.	C	A	0	PASS	DP=344;GPV=1;SPV=0.010726;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:151,17:70,11:81,6
+chr17	26950336	.	T	C	0	PASS	DP=349;GPV=1;SPV=0.03988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:170:147,23:72,11:75,12
+chr17	26950372	.	G	A	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.0004366;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:142,25:73,16:69,9
+chr17	26958530	.	C	A	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.029729;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:93,22:43,10:50,12
+chr17	26970947	.	C	T	0	PASS	DP=203;GPV=1;SPV=0.041873;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:101,17:41,4:60,13
+chr17	27491304	.	GGTGTGTGTGTGT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,8:6,7:5,1
+chr17	28503758	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:9,3:4,1
+chr17	28553186	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:13,4:1,0
+chr17	29602901	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=4.6208e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:10,12:10,6
+chr17	31200443	.	C	CA	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=2.5306e-06;SS=2;SSC=55;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:27,22:15,13:12,9
+chr17	31451458	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0039984;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:8,6:5,3
+chr17	32603522	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0066111;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,9:16,6:2,3
+chr17	32632586	.	T	TAC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.023915;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,9:14,8:4,1
+chr17	32893334	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:14,4:7,3:7,1
+chr17	33233620	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=6.4811e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:16,24:7,11:9,13
+chr17	33768011	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0041183;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,9:12,6:7,3
+chr17	33857486	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.8997e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:21,27:11,16:10,11
+chr17	34659136	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=1.1879e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:29,26:19,16:10,10
+chr17	34912446	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:4,3:3,1
+chr17	36163680	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.010382;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:31,3:6,10
+chr17	36167665	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.016719;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:41,11:40,8:1,3
+chr17	36176137	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,1:9,3
+chr17	36208207	.	T	TTATATATA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034394;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,5:10,2
+chr17	36254409	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,3:2,1
+chr17	36337263	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.022245;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:18,6:2,1
+chr17	36350885	.	C	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.005383;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:61,22:36,11:25,11
+chr17	36448257	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.6735e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:12,12:8,4
+chr17	36789051	.	CTG	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016895;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,2:11,3
+chr17	36789063	.	C	CTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0088503;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:12,2:9,5
+chr17	36854288	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,8:6,6:2,2
+chr17	36877008	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.041497;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:7,5:8,3
+chr17	37403368	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.00028635;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:5,9:0,1
+chr17	37951297	.	TAA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0011038;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,10:4,2:7,8
+chr17	38192668	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:0,0:11,4
+chr17	39037193	.	A	AC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0019978;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:13,6:5,7
+chr17	41301085	.	CA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.015698;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:11,18:8,16:3,2
+chr17	41364916	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=2.876e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:29,30:13,20:16,10
+chr17	41561112	.	T	TAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,7:5,6:2,1
+chr17	43349954	.	ATCC	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.0124e-05;SS=2;SSC=49;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,16:14,9:15,7
+chr17	43404625	.	TA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039921;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,3:5,4
+chr17	44062221	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0061699;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,9:12,8:3,1
+chr17	45586178	.	C	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.026276;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:67,11:24,3:43,8
+chr17	45587450	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:2,3:7,1
+chr17	45835683	.	T	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=3.9119e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:35,35:17,13:18,22
+chr17	46096153	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.013354;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:5,3:15,6
+chr17	46198422	.	TAAA	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.056363;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,8:19,7:9,1
+chr17	46245801	.	AG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.26796;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:29,3:7,1
+chr17	46298641	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:7,7:3,1
+chr17	46693693	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.04952;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:1,2:16,6
+chr17	46900162	.	CATATACATATAT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.29464;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,5:3,3:5,2
+chr17	47340766	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,2:8,4
+chr17	47653271	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030401;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,4:9,4
+chr17	48069374	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=8.4582e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,23:10,11:12,12
+chr17	48976580	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.010284;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:18,4:16,3
+chr17	49163751	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00034194;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:6,9:9,2
+chr17	49288055	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.083772;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,7:10,6:5,1
+chr17	49347740	.	G	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,3:3,1:2,2
+chr17	50093976	.	CAA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.046847;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,6:9,5:2,1
+chr17	50645371	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:6,3:4,1
+chr17	50864056	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:3,3:3,3
+chr17	50913604	.	TTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1599;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:5,1:14,5
+chr17	51026674	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0013501;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,6:6,3
+chr17	52259764	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.079656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:6,3:21,1
+chr17	53556009	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.4432e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,16:9,8:7,8
+chr17	55515086	.	G	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,2:1,2
+chr17	57062208	.	T	TG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.064064;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:9,2:22,4
+chr17	57083097	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.033188;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:16,4:15,5
+chr17	57129427	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,8:12,7:1,1
+chr17	57767301	.	T	TTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.047124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:11,1:4,3
+chr17	58629217	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=5.2697e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:16,7:10,10
+chr17	60978906	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.030816;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:19,1:17,5
+chr17	61113793	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.073684;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
+chr17	61670595	.	GAT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.034996;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,6:10,4:4,2
+chr17	61940990	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:7,5:3,3
+chr17	62094937	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,5:9,1:9,4
+chr17	62820819	.	C	CGTGTGT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:13,13:8,10:5,3
+chr17	63500193	.	C	CTTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.029349;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:8,6:4,2
+chr17	63890018	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0086905;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:9,6:9,6
+chr17	64360582	.	C	CTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.030329;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:18,7:11,4
+chr17	64909760	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.0018344;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:50,24:25,14:25,10
+chr17	64932791	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.065677;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:18,4:26,1
+chr17	65503063	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00088893;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:9,6:10,6
+chr17	66554880	.	C	CTTTTTTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:2,3:2,1
+chr17	67391149	.	G	GA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0073681;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,15:11,4:10,11
+chr17	68381243	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=3.5193e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:23,26:11,14:12,12
+chr17	68455361	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.001816;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,13:11,12:2,1
+chr17	68622246	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.024999;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:3,4:10,2
+chr17	69831580	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,2:5,2
+chr17	70003024	.	C	CCTTCCTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.2416;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,4:5,2:16,2
+chr17	71469205	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.036342;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:10,4:11,2
+chr17	71610436	.	CTA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:1,3:2,4
+chr17	71906247	.	G	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.015516;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:5,2:9,3
+chr17	72484836	.	GA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16126;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:9,4:4,1
+chr17	72590124	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.038501;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:11,5:7,1
+chr17	72809202	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.043736;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:17,2:11,9
+chr17	73224263	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,9:3,5:5,4
+chr17	73963872	.	T	TAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,3:2,3
+chr17	75233385	.	TTCTTTC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.017005;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:7,3:15,14
+chr17	75497344	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr17	75527167	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0032719;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:10,8:5,5
+chr17	75532079	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,4:8,1:10,3
+chr17	75630844	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00032421;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,12:12,8:6,4
+chr17	76092335	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.6557e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:27,23:14,10:13,13
+chr17	76096511	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,8:10,6:3,2
+chr17	76600480	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.036e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:14,7:8,9
+chr17	77025779	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.472e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:19,24:8,13:11,11
+chr17	77485248	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.093318;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:22,4:8,1
+chr17	78382636	.	G	GT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,5:3,1
+chr17	79030319	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.048447;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,11:15,7:12,4
+chr17	80024394	.	GAC	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.022253;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:19,5:25,4
+chr17	80634716	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,3:2,1
+chr17	80750079	.	T	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=2.5245e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:32,27:11,15:21,12
+chr17	81125044	.	GTGA	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.11404;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:10,5:1,3:9,2
+chr17	81140904	.	TGGGGCCGTG	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.21475;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,4:14,3:7,1
+chr17	81339604	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.029105;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:22,8:13,6:9,2
+chr17	82969411	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:19,1:7,3
+chr18	918966	.	C	CT	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=6.5169e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:17,7:12,8
+chr18	1572078	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.096176;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:16,3:12,3
+chr18	3028219	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00022883;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,10:1,6:4,4
+chr18	3422679	.	T	TG	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,4:5,1
+chr18	4510860	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1182;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,6:9,5:11,1
+chr18	4550743	.	TC	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.067259;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,3:13,2
+chr18	5541252	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.01776;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,9:18,8:2,1
+chr18	6090593	.	TACACACAC	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0029068;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:13,8:10,10
+chr18	6594714	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=7.6418e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,19:10,4:9,15
+chr18	6841208	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.3;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,2:0,0:7,2
+chr18	6937623	.	A	AAAATAAATAAAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.011208;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,7:6,3:7,4
+chr18	6991389	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,6:2,1
+chr18	7269333	.	TAGAG	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,5:5,3
+chr18	8264794	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.23569;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,5:7,3:8,2
+chr18	8488955	.	TTGAATTCTATAAAATGTTCATACCC	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.020157;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:11,6:12,6
+chr18	9404353	.	A	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:4,3:3,1:1,2
+chr18	9444134	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:0,5:0,1:0,4
+chr18	9468342	.	CAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.26795;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,6:13,5:4,1
+chr18	9912048	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.171e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:29,21:10,13:19,8
+chr18	9913971	.	CG	C	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=1.5311e-09;SS=2;SSC=88;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:29,27:15,13:14,14
+chr18	10150832	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10901;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,7:16,2:15,5
+chr18	11685540	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.097821;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:15,6:4,1
+chr18	12461571	.	GTACATACA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.04952;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:10,3:7,5
+chr18	12525276	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.046295;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:11,8:3,1
+chr18	12671637	.	ACTTT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,8:9,3
+chr18	13505735	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0093359;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:14,5:11,6
+chr18	14672212	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,1:4,6
+chr18	14672475	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,2:7,2
+chr18	15392253	.	A	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.018528;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:59,8:38,3:21,5
+chr18	15410300	.	C	A	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.023883;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:106,20:37,9:69,11
+chr18	15469770	.	A	C	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.024523;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:15,5:28,2
+chr18	15479572	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,3:6,1
+chr18	15483374	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027668;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,3:0,1
+chr18	15520726	.	A	C	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.020742;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:77,10:43,5:34,5
+chr18	15580219	.	G	A	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.022036;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:71,10:17,2:54,8
+chr18	15584416	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10722;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:17,5:4,1
+chr18	15609223	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.044122;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:24,2:10,6
+chr18	15637983	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.20188;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:0,0:26,4
+chr18	15646675	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:15,1:6,3
+chr18	15649309	.	G	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.037368;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:39,1:2,5
+chr18	15666055	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027357;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:5,4:12,1
+chr18	15675677	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.033861;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:29,8:9,1
+chr18	15703657	.	G	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
+chr18	15727935	.	A	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,0:13,4
+chr18	15737152	.	C	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.021053;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
+chr18	15737631	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
+chr18	16053308	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.021659;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:7,4:9,6
+chr18	16360743	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.032417;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:1,1:11,7
+chr18	16697190	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.038274;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
+chr18	18318482	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0048811;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:3,3:17,5
+chr18	18419373	.	C	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:20,7:12,2
+chr18	18730629	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,1:10,3
+chr18	18892542	.	G	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,1:0,1
+chr18	19397249	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.029368;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:8,1:8,6
+chr18	20724838	.	C	G	0	PASS	DP=273;GPV=1;SPV=0.028926;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:106,21:48,8:58,13
+chr18	20835814	.	C	T	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.0060998;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:67,16:40,12:27,4
+chr18	22232784	.	CCATA	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.074196;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,5:23,2:18,3
+chr18	22425547	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=2.2853e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:0,8:0,7:0,1
+chr18	22605099	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=4.8216e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,17:0,7:10,10
+chr18	23076959	.	A	ATT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:8,11:6,7:2,4
+chr18	23218612	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:6,3:11,1
+chr18	23371945	.	T	TG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,8:3,4:3,4
+chr18	23455398	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.028534;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:2,1:11,7
+chr18	24592034	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.005394;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:10,2:3,8
+chr18	26117056	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=2.8289e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:21,22:10,15:11,7
+chr18	26309245	.	ATTTTTTTT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:6,2:4,2
+chr18	26715724	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,5:4,4
+chr18	27155106	.	AG	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,2:3,1:2,1
+chr18	28947408	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.0855e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:20,24:6,13:14,11
+chr18	29511579	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.024272;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:13,5:22,1
+chr18	29511757	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0076703;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:12,3:8,4
+chr18	30549168	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.5589e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:12,9:9,6
+chr18	31121482	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.092258;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:15,2:12,2
+chr18	31459826	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.4255e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:10,6:7,8
+chr18	31712287	.	ATTTTTTT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.038078;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:8,4:5,3
+chr18	31934960	.	A	AAATAAATT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=8.1216e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:18,14:8,7:10,7
+chr18	31989079	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,9:3,5:2,4
+chr18	32482155	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,7:2,3:1,4
+chr18	32874122	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.4103e-10;SS=2;SSC=90;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:14,26:4,10:10,16
+chr18	33593258	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,4:8,1
+chr18	33719224	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.016636;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:18,3:15,5
+chr18	34400477	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.070897;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,2:9,3
+chr18	35931434	.	G	GA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,4:1,0
+chr18	37385061	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.8286e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:8,6:13,9
+chr18	37515175	.	A	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=2.9231e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:28,30:11,13:17,17
+chr18	39190202	.	ATCTC	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.031046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:17,4:4,1
+chr18	40103686	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:15,1:8,4
+chr18	40957409	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.951e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:12,11:11,7
+chr18	46574388	.	T	TACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.046254;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:13,3:9,3
+chr18	47967316	.	CTTTCTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:4,5:9,1
+chr18	48635327	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,4:4,1
+chr18	50449675	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.022974;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:20,2:22,7
+chr18	50521728	.	G	GTA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:6,3:4,1
+chr18	51406764	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:1,10:1,6:0,4
+chr18	52738745	.	G	GT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=2.0088e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:12,12:6,4
+chr18	53762026	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,8:6,7:3,1
+chr18	53810350	.	G	GTA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:7,4:2,2
+chr18	55278562	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.050563;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:23,3:17,3
+chr18	55387512	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.8608e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:23,25:8,13:15,12
+chr18	56754289	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,3:14,1
+chr18	57474702	.	T	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=6.3755e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:26,19:14,11:12,8
+chr18	57627205	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,9:3,6:8,3
+chr18	57761122	.	A	AAT	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,4:18,2:8,2
+chr18	59390195	.	ATAT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:8,5:4,2:4,3
+chr18	59491827	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.049892;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:19,4:17,1
+chr18	59758967	.	T	TACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.04108;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:16,6:4,1
+chr18	61136306	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=6.0159e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:11,10:17,9
+chr18	61629966	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.1361e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:26,25:16,17:10,8
+chr18	62640070	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:11,1:3,3
+chr18	63963071	.	CTCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0091926;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,11:1,3:14,8
+chr18	64148466	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=5.007e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:18,10:9,14
+chr18	65357014	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:4,5:4,1
+chr18	65713628	.	AGG	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.017739;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:10,5:4,4
+chr18	66455795	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0066378;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:4,1:16,6
+chr18	68007627	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.01632;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:13,3:13,3
+chr18	68199591	.	CT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00029312;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,11:5,8:5,3
+chr18	68761432	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=7.8076e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:29,18:13,7:16,11
+chr18	70930266	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.025362;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,1:4,6
+chr18	71592609	.	C	CAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:3,5:2,1
+chr18	71650624	.	T	TCAACAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.030499;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:20,8:6,4
+chr18	72185919	.	T	TA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00094142;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,13:13,8:8,5
+chr18	72536935	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00070139;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:14,8:9,7
+chr18	73293503	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:6,10:4,9:2,1
+chr18	74569060	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.3533e-10;SS=2;SSC=96;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:17,25:8,9:9,16
+chr18	75999618	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=9.5082e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:12,14:11,4
+chr18	76611977	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.075;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:25,3:21,1:4,2
+chr18	76641242	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.047546;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:16,4:16,4
+chr18	76642774	.	T	TTTATTATTA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0059827;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,11:5,6:8,5
+chr18	77624277	.	TAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:6,3:4,2
+chr18	78321767	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.0069e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:20,23:11,10:9,13
+chr18	78416496	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.011905;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:34:0,3:0,2:0,1
+chr18	78599589	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.8873e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:24,26:8,11:16,15
+chr18	78917262	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,1:11,3
+chr18	78953544	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.015361;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:16,5:19,3
+chr18	78953545	.	A	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.043461;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:15,6:22,3
+chr18	78995311	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=3.1431e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:13,8:12,13
+chr18	79482090	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:0,5:4,3
+chr18	79828951	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0046784;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,11:4,6:2,5
+chr18	79831580	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0065388;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:10,6:4,2
+chr19	108091	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00060516;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:10,11:0,1
+chr19	720442	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0050929;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:15,3:6,12
+chr19	760364	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.065471;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,4:4,3
+chr19	1280915	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=3.4904e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,15:17,8:15,7
+chr19	1290639	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=3.4855e-12;SS=2;SSC=114;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:19,26:12,16:7,10
+chr19	1538695	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,5:3,3:2,2
+chr19	1727959	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0017573;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:31,19:14,13:17,6
+chr19	2683486	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=8.8646e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:7,9:14,4
+chr19	3169661	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:7,3:1,1
+chr19	3299611	.	T	TTTC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.021189;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,9:5,4:9,5
+chr19	3354209	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
+chr19	3385570	.	GTTGT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0097821;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,6:5,1
+chr19	3719982	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0006045;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:6,2:15,7
+chr19	4043725	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,2:0,0:7,2
+chr19	5057705	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.0971e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,20:12,9:5,11
+chr19	5162315	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=2.7433e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:13,10:14,9
+chr19	6235148	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=9.3033e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:15,9:10,10
+chr19	6814667	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016212;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:6,2:12,6
+chr19	7060204	.	T	C	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.039151;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:94,19:44,9:50,10
+chr19	7202996	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,8:2,7:4,1
+chr19	7229324	.	G	GGATA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,6:6,4:1,2
+chr19	7457353	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04422;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,6:4,1
+chr19	8037374	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.03876;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:8,2:12,3
+chr19	8331980	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:8,3:4,3
+chr19	8767852	.	C	T	0	PASS	DP=503;GPV=1;SPV=0.026761;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:285:243,42:131,22:112,20
+chr19	8777797	.	C	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.2538;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:1,0:21,4
+chr19	8781025	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:16,4:0,0
+chr19	8988006	.	ATT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:6,3:10,2
+chr19	9938034	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,3:4,1
+chr19	10190765	.	AAAAATAAAAT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.038795;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:9,4:11,4
+chr19	12845411	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.015249;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:12,9:4,1
+chr19	12981782	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.019439;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,2:7,4
+chr19	13198576	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,5:2,2:2,3
+chr19	13260331	.	TA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.33319;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,4:11,2:15,2
+chr19	14314098	.	A	ACACACACAGTTTCACATTCACACCCCATACGCT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,3:5,4
+chr19	14759502	.	TA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,3:12,1
+chr19	14866670	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,10:11,9:1,1
+chr19	15011734	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0087248;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,11:14,9:4,2
+chr19	15595616	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=5.007e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:13,13:14,11
+chr19	16341955	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0060117;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,14:8,12:9,2
+chr19	16352764	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
+chr19	16432591	.	TACAAATAC	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,4:8,2:7,2
+chr19	16474897	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0083443;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,13:11,9:8,4
+chr19	16767167	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:6,7:2,2
+chr19	16888396	.	G	GTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.071753;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,3:9,1
+chr19	16901298	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=5.3362e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:32,34:20,17:12,17
+chr19	17430632	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0069381;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:3,5:9,3
+chr19	17430636	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:8,3:10,3
+chr19	17584067	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.5999e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:15,10:7,6
+chr19	17918501	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,3:10,1
+chr19	18529091	.	C	CAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.013698;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:12,5:5,4
+chr19	18936313	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0040291;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:11,4:6,3
+chr19	18960837	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02037;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,5:3,3:6,2
+chr19	19687492	.	AATATTTATCTATTACATTAATAT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.042521;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,2:10,2
+chr19	19790844	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,2:1,1:2,1
+chr19	20743548	.	A	AATAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:2,3:2,2
+chr19	20753022	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=2.6571e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:30,25:13,12:17,13
+chr19	21011659	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00095261;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,9:1,6:1,3
+chr19	22040397	.	G	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=3.3634e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:32,29:20,20:12,9
+chr19	22107631	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.29579;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:16,3:11,2:5,1
+chr19	22763927	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.046664;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,3:7,4
+chr19	22881134	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.037585;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,9:6,4:11,5
+chr19	23004422	.	T	TAAAAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:8,3:7,2
+chr19	26881424	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:3,1:6,3
+chr19	27440028	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=2.6364e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:14,10:6,8
+chr19	27605591	.	A	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=7.5907e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:30,20:15,9:15,11
+chr19	29059312	.	TC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,2:10,2
+chr19	29646926	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
+chr19	29744609	.	AC	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.04115;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:17,4:17,1
+chr19	30271299	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:7,3:6,2
+chr19	31226977	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:10,3:2,3
+chr19	31958446	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.086635;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,4:11,1
+chr19	32019272	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,4:10,2:5,2
+chr19	32190561	.	G	GTCTCTC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0089185;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,9:7,3:10,6
+chr19	32515023	.	C	CT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.035232;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:21,10:8,4
+chr19	33851187	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0024472;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:8,6:5,4
+chr19	35374030	.	AGAAGGAAGGAAGGAAG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,6:8,3:4,3
+chr19	35973022	.	AACACAC	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,10:11,5:7,5
+chr19	36391473	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,5:9,3:4,2
+chr19	37269045	.	T	TC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,4:10,1
+chr19	37289000	.	G	C	0	PASS	DP=276;GPV=1;SPV=0.016422;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:120,24:71,9:49,15
+chr19	37857275	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:37:1,4:0,2:1,2
+chr19	38138910	.	A	AAAAAAAAAAAAACAAAAAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,4:5,2:9,2
+chr19	38920950	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.097509;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,5:9,3:10,2
+chr19	39512009	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,3:5,1
+chr19	39775772	.	C	CAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,6:3,5:1,1
+chr19	40163148	.	CGT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:1,3:5,3
+chr19	40692926	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=5.174e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:16,8:9,5
+chr19	40785791	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=6.3605e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:25,23:16,13:9,10
+chr19	40834261	.	CCCAGCTACTCGGG	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0011495;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:14,7:13,6
+chr19	40834276	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00035192;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:14,7:9,6
+chr19	40834279	.	TGAG	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00057944;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:14,7:10,5
+chr19	40845531	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.1529e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:11,10:13,10
+chr19	43155799	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040508;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,7:5,1
+chr19	43440230	.	TA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:6,4:8,1
+chr19	44180086	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,6:9,1
+chr19	44532564	.	GA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,7:4,5:0,2
+chr19	45021573	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:4,3:11,2
+chr19	45477031	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0016292;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,10:9,9:8,1
+chr19	46406261	.	CTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.009224;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,10:6,5:4,5
+chr19	46668014	.	CAAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0058774;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:8,9:4,2
+chr19	47265987	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
+chr19	47645942	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=6.6772e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:24,27:14,14:10,13
+chr19	47731785	.	A	AT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=8.0727e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,14:11,10:8,4
+chr19	47748446	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00041185;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:12,4:20,8
+chr19	47774924	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.019715;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:10,5:9,4
+chr19	47824990	.	A	ATT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,6:14,3:4,3
+chr19	47987760	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=4.9568e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:13,20:8,9:5,11
+chr19	48028497	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:3,6:3,3
+chr19	49346182	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.062847;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:9,5:20,1
+chr19	49410486	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:8,8:2,4
+chr19	49885451	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,2:3,1:4,1
+chr19	50078405	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:7,2:2,1:5,1
+chr19	50182988	.	T	TTCCCTCCCTCCC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:0,0:8,4
+chr19	50520630	.	G	GA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0061831;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,11:10,8:5,3
+chr19	50816955	.	T	TAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.090923;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:11,3:8,3
+chr19	50937767	.	CTCCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.036807;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:7,3:16,4
+chr19	51189641	.	T	TATATATATATATATATAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,4:7,2:5,2
+chr19	51714695	.	T	TAAAAAAA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,5:3,3:0,2
+chr19	51795508	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,3:4,4
+chr19	53916342	.	GGTACCAAGGCCCAGAATTGCATAGAGAGTTGCCCATAA	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.033591;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:16,5:15,5
+chr19	53924195	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:3,7:5,6
+chr19	54002284	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.025884;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:13,4:7,9
+chr19	54012556	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=8.4872e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:9,9:4,7
+chr19	54848277	.	G	C	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.00012294;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:68,18:27,8:41,10
+chr19	54995148	.	T	TA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,7:4,3
+chr19	55033047	.	CGTGTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.074501;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:3,4:11,3
+chr19	55547071	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:21,2:5,2
+chr19	55953792	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,3:7,1
+chr19	55962955	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.9149e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,20:16,12:11,8
+chr19	56216585	.	CTTCCTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr19	56710871	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.5354e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:28,20:15,12:13,8
+chr19	57505106	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.040948;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:10,4:23,2
+chr19	58119844	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.011327;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:6,4:10,5
+chr2	837627	.	G	GTGTATATATATATA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.079204;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,6:13,4:14,2
+chr2	914985	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.011343;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:5,8:9,2
+chr2	1009653	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046139;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:13,2:6,4
+chr2	1009654	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:13,2:4,2
+chr2	1279081	.	CCT	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.13146;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:20,2:17,3
+chr2	1279091	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.14299;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:20,2:17,3
+chr2	1387475	.	T	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.046e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:28,20:12,8:16,12
+chr2	1480776	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.048386;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:17,2:7,4
+chr2	2034291	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.21569;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:1,2:18,1
+chr2	2716686	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,3:12,1
+chr2	3032681	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.7895e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:29,17:12,4:17,13
+chr2	3075648	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.020447;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,12:11,10:4,2
+chr2	3531025	.	G	GTAT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.025567;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,11:19,8:9,3
+chr2	3550142	.	T	TAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.059881;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:8,2:7,4
+chr2	4260644	.	TTA	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0087152;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:14,3:11,4
+chr2	4260661	.	TTA	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.059705;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,4:11,1:10,3
+chr2	4382243	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.2016e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:26,23:19,11:7,12
+chr2	4612518	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.069923;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,5:5,3
+chr2	5774635	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=2.7562e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,21:9,12:5,9
+chr2	5989357	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.9573e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:18,26:9,15:9,11
+chr2	7240598	.	TTTTA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,4:2,1:6,3
+chr2	7937979	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.37283;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,4:8,2:11,2
+chr2	7937980	.	TC	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.30799;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,4:7,2:11,2
+chr2	9183583	.	GA	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.24882;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:29,2:7,2
+chr2	9193871	.	TTC	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.013481;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:10,2:12,5
+chr2	10297146	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.092234;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:6,3:3,3
+chr2	11463263	.	TTAC	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.2213e-05;SS=2;SSC=49;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:28,26:16,12:12,14
+chr2	13288665	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,14:8,10:5,4
+chr2	13891576	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,3:2,1
+chr2	14159206	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.969e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,16:2,11:12,5
+chr2	14686910	.	G	GAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0034481;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,5:4,2
+chr2	14843581	.	CA	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.059869;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:28,3:14,2
+chr2	14852201	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:6,3:19,1
+chr2	15528880	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,2:2,1:4,1
+chr2	17622506	.	AAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.35366;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:11,1:16,2
+chr2	21808890	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.3942e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,23:9,9:3,14
+chr2	21816173	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0030632;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:4,7:3,5
+chr2	23120689	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0071577;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:18,10:13,8:5,2
+chr2	23881360	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,5:10,4:2,1
+chr2	25098831	.	A	ATT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.025988;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,1:7,6
+chr2	26935691	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,9:4,6:1,3
+chr2	26943540	.	G	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=7.2192e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,19:10,9:22,10
+chr2	27866737	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.5018e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:11,4:9,11
+chr2	28100462	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.021382;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,7:16,6:2,1
+chr2	28837742	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:3,9:4,2
+chr2	28880560	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011765;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:0,3:11,9
+chr2	29540592	.	TAAA	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.12341;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,4:13,2:18,2
+chr2	30304930	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013014;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,3:3,4
+chr2	31190121	.	C	CTTTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,4:9,4
+chr2	33064021	.	T	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=9.2047e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:26,21:14,11:12,10
+chr2	34482612	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=5.6651e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:12,11:11,11
+chr2	35126335	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.002136;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:5,5:16,6
+chr2	35865373	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.012866;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:11,7:8,4
+chr2	36165831	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.03159;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,6:6,3
+chr2	36209313	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.072233;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,2:11,2
+chr2	36715554	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=6.2617e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:9,8:12,12
+chr2	43189854	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:9,14:5,12:4,2
+chr2	43272623	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036457;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,5:6,2
+chr2	43617891	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0012136;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:7,11:4,2
+chr2	43635551	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.03453;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:4,3:19,7
+chr2	43971485	.	T	TAAAAAAAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:3,3:5,1
+chr2	44304813	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.20158;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,5:7,2:6,3
+chr2	44974693	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0093911;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:1,7:5,1
+chr2	45689901	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,9:3,6:6,3
+chr2	45744576	.	T	TCC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0013497;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,10:6,3:7,7
+chr2	46203576	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.19804;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:14,3:4,2
+chr2	46285615	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0023325;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:5,4:9,5
+chr2	47393498	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00086667;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:18,8:10,6
+chr2	48800016	.	A	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.3321e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:14,5:11,13
+chr2	49779401	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.6188e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:10,13:9,5
+chr2	49868843	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=2.6281e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:28,24:15,13:13,11
+chr2	50093473	.	G	GA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,9:5,6:3,3
+chr2	50516103	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.8015e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:10,9:15,12
+chr2	51495069	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.22807;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:10,4:1,0
+chr2	51716479	.	GTATATA	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,1:3,3
+chr2	52782338	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00087744;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:12,2:11,7
+chr2	54406048	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=9.7905e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:24,21:12,15:12,6
+chr2	55597623	.	A	AAAACAAAC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.021526;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,13:12,8:14,5
+chr2	55619937	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:8,4:4,2
+chr2	56519661	.	C	CAT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.13128;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,5:13,3:14,2
+chr2	56976616	.	AT	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.086e-06;SS=2;SSC=56;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:14,9:9,10
+chr2	57330546	.	G	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:9,7:6,4
+chr2	59081779	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.028868;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:15,1:19,6
+chr2	59382419	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038416;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:15,4:6,1
+chr2	60208082	.	TC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15115;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,1:15,3
+chr2	60851863	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.095238;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:3,2:2,1:1,1
+chr2	61515938	.	C	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,5:1,3:2,2
+chr2	61515940	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,7:2,3:3,4
+chr2	61799695	.	A	AAAAAAAAT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:3,1:2,3
+chr2	62629632	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:8,3:2,1
+chr2	63204336	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,4:5,2
+chr2	63338569	.	AATATAT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:0,1:4,1
+chr2	63686847	.	AGTGCTGAAAAAACTGTATATCCATATTCAGATCCACATTCT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.036677;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:12,3:16,2
+chr2	63951206	.	C	CT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.035026;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,5:14,4
+chr2	64025689	.	TTATATATATATATATATATATATA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0091605;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:5,4:11,2
+chr2	64191486	.	CCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.018961;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:3,5:14,3
+chr2	64273188	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.048554;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:21,6:11,4:10,2
+chr2	64376031	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.13783;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:19,1:13,4
+chr2	64376137	.	T	TACC	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.13649;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,5:18,4:24,1
+chr2	65119842	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,4:4,1:9,3
+chr2	65600861	.	C	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,2:5,2
+chr2	66775102	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.022424;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:8,5:12,4
+chr2	67582657	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.030178;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,15:12,6:6,9
+chr2	68991108	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,3:11,1
+chr2	68991113	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11371;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,3:13,1
+chr2	68998749	.	AGAGATAGAGAGAGG	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0028455;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,10:10,7:5,3
+chr2	69433085	.	GGTTGCAGTGAGCCGAGATC	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00053043;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,14:1,2:7,12
+chr2	69662992	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.014049;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,4:2,1
+chr2	69924748	.	CT	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=5.5219e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,18:20,9:7,9
+chr2	69924750	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=4.2622e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:15,9:8,11
+chr2	69941863	.	TAC	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.057534;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:14,2:20,2
+chr2	70056604	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:3,8:1,5:2,3
+chr2	70128634	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0057892;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:12,7:8,1
+chr2	70197453	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:6,2:8,2
+chr2	70338595	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:5,2:2,1:3,1
+chr2	71441110	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:3,3:5,1
+chr2	72542962	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.9601e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:9,10:12,5
+chr2	73047219	.	TAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:2,3:10,1
+chr2	73978483	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.5589e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:8,6:13,9
+chr2	74474791	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=1.7519e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:32,26:17,9:15,17
+chr2	76332700	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr2	77721081	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.9327e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:27,26:13,14:14,12
+chr2	77866354	.	TA	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00022812;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:16,3:17,10
+chr2	77955960	.	ATCT	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.8089e-06;SS=2;SSC=57;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:13,8:10,9
+chr2	77955964	.	A	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=3.6545e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:13,9:11,7
+chr2	80075621	.	T	TTATAAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.15021;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,5:3,1:5,4
+chr2	80123447	.	G	GA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0087276;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:10,8:1,1
+chr2	80192627	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00016426;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:13,7:8,5
+chr2	80192628	.	GCGATTCTC	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00038475;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:15,6:8,5
+chr2	80832317	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,7:7,6:2,1
+chr2	80857039	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.6156e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:10,10:12,9
+chr2	81034978	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=4.405e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,22:16,7:8,15
+chr2	81962147	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:9,3:2,1
+chr2	82952571	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.5282e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,22:5,9:19,13
+chr2	83217571	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0063246;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:5,8:3,3:2,5
+chr2	84598187	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:8,1:15,3
+chr2	85298191	.	C	CAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.010101;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,4:0,4:0,0
+chr2	85329996	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.032284;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,7:7,6:5,1
+chr2	85364804	.	C	CAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:1,3:3,1
+chr2	86041192	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,5:6,1:8,4
+chr2	86217684	.	T	TTTTTTTTTTC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,4:11,1:12,3
+chr2	87345542	.	G	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.019537;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:15,4:7,7
+chr2	87366406	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.069853;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:13,3:4,2
+chr2	87386273	.	T	A	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.032113;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:99,24:43,14:56,10
+chr2	87395392	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.011049;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:15,3:15,5
+chr2	87405081	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0052983;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,13:19,9:23,4
+chr2	87414607	.	A	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.13285;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:23,3:9,4
+chr2	87415391	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10396;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:18,3:7,2
+chr2	87419569	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1713;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,1:15,3
+chr2	87515462	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.032693;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:17,4:16,2
+chr2	87551150	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.013346;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:9,5:10,8
+chr2	87650939	.	T	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025213;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
+chr2	87737292	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.043188;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:6,3:17,7
+chr2	87865551	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.030755;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:10,3:14,7
+chr2	87960257	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0044438;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:8,7:13,8
+chr2	88463345	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:13,3:0,1
+chr2	88487414	.	AT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0034395;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:13,7:5,2
+chr2	88625332	.	TACAC	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0059827;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:13,11:5,4:8,7
+chr2	89760247	.	C	CTT	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.0026065;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:54,19:30,14:24,5
+chr2	89878508	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.069378;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,3:13,1
+chr2	89878509	.	T	TTTAC	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.028145;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:15,3:16,3
+chr2	90235961	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.065679;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:22,1:32,5
+chr2	90358675	.	C	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.04667;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:17,2:19,7
+chr2	90392157	.	T	C	0	PASS	DP=3014;GPV=1;SPV=0.034818;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:1677:1439,182:1214,142:225,40
+chr2	90397513	.	G	A	0	PASS	DP=3904;GPV=1;SPV=0.018625;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2205:1942,262:1601,221:341,41
+chr2	90397514	.	G	A	0	PASS	DP=4009;GPV=1;SPV=0.034286;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2234:1969,263:1596,229:373,34
+chr2	90397522	.	T	A	0	PASS	DP=4450;GPV=1;SPV=0.0060816;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2458:2156,300:1717,251:439,49
+chr2	91472787	.	TAAA	T	0	PASS	DP=291;GPV=1;SPV=0.031471;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:132,24:72,15:60,9
+chr2	91514668	.	G	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.023535;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:57,13:21,5:36,8
+chr2	91518504	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.12575;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:19,2:26,4
+chr2	91548974	.	A	AAC	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.0099619;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:57,17:23,9:34,8
+chr2	91659987	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.032622;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:25,2:30,7
+chr2	91675456	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0039629;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:16,5:16,9
+chr2	91776604	.	ATG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:5,5:4,3
+chr2	91872488	.	A	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.022683;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:14,10:18,2
+chr2	91988869	.	GAA	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.046336;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,11:17,9:11,2
+chr2	92111507	.	C	A	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=2.5363e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:123,19:76,12:47,7
+chr2	92199111	.	G	T	0	PASS	DP=334;GPV=1;SPV=0.013223;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:192:172,20:97,9:75,11
+chr2	92233793	.	G	C	0	PASS	DP=355;GPV=1;SPV=0.0015939;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:184:156,28:34,3:122,25
+chr2	92272955	.	T	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.15322;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,3:15,2
+chr2	92273398	.	A	G	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.017;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:89,10:52,9:37,1
+chr2	92308713	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.060821;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:28,1:13,4
+chr2	92396225	.	G	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.045403;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:52,10:6,2:46,8
+chr2	92416782	.	C	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.0089064;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:51,9:29,8:22,1
+chr2	92421752	.	T	C	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.046042;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:134,16:117,13:17,3
+chr2	92426580	.	C	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,3:7,1
+chr2	92443667	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.012509;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:16,4:19,5
+chr2	92545721	.	G	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.0080873;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:23,5:19,1
+chr2	92551876	.	C	A	0	PASS	DP=464;GPV=1;SPV=0.0081141;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:263:215,48:189,43:26,5
+chr2	92588273	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.088876;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:36,2:6,3
+chr2	92619739	.	C	T	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.0016152;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:56,14:52,13:4,1
+chr2	92620212	.	T	C	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.0070779;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:53,10:12,9:41,1
+chr2	92622459	.	TC	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.18741;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:33,4:3,0
+chr2	92750551	.	G	C	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.043608;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:124,24:70,12:54,12
+chr2	92771321	.	C	G	0	PASS	DP=329;GPV=1;SPV=0.0041606;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:152,26:19,5:133,21
+chr2	92822653	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.20161;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:25,3:3,1
+chr2	92866630	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:5,2:10,3
+chr2	92930378	.	A	G	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.046865;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:115,15:77,2:38,13
+chr2	92995470	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.011605;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:11,3:17,7
+chr2	93032963	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:1,4:23,2
+chr2	93039274	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0032719;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:6,11:9,2
+chr2	93100868	.	A	T	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:91,20:26,5:65,15
+chr2	93138680	.	C	A	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.01151;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:90,16:65,11:25,5
+chr2	93312547	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.051138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:2,4:16,1
+chr2	93641680	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:19,4:0,0
+chr2	93753399	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.18072;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:0,0:35,4
+chr2	93753410	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.18072;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:0,0:35,4
+chr2	93775972	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:2,0:23,4
+chr2	94087365	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.01322;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:6,4:31,3
+chr2	94145947	.	T	G	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.034765;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:97,19:48,2:49,17
+chr2	94271661	.	G	C	0	PASS	DP=295;GPV=1;SPV=0.020189;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:139,18:61,14:78,4
+chr2	94287043	.	A	G	0	PASS	DP=315;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:162:144,18:81,6:63,12
+chr2	94646732	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,3:8,1
+chr2	95791873	.	G	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
+chr2	96096278	.	T	TA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:6,6:5,1
+chr2	97607287	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,1:6,5
+chr2	97923628	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,6:0,4:3,2
+chr2	98014637	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026716;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:9,11:8,8
+chr2	99074351	.	C	CGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:3,6:3,1
+chr2	99534592	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0071032;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,11:3,8:4,3
+chr2	100304790	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.080441;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:10,4:13,1
+chr2	101600527	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=4.8188e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:10,9:11,6
+chr2	101608339	.	TC	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.014944;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:7,5:32,3
+chr2	102958979	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0067079;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,10:3,6:0,4
+chr2	103589519	.	A	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=2.0095e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:23,26:12,17:11,9
+chr2	103666547	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=3.7941e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:8,11:15,8
+chr2	104002968	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.016968;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:2,4:2,2
+chr2	104916714	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=6.0898e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:13,7:5,7
+chr2	105110931	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.015393;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:18,5:21,2
+chr2	106458682	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.16358;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:17,3:5,1
+chr2	107159048	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.03809;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,7:11,1:7,6
+chr2	107171493	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,1:9,3
+chr2	107629681	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,5:4,4:3,1
+chr2	108313079	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.077419;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,2:2,1:5,1
+chr2	108509733	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.047632;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:13,3:7,4
+chr2	110068906	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
+chr2	111392237	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.068908;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,3:11,1
+chr2	111572997	.	A	AAGGG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:11,4:0,0
+chr2	111583445	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0076585;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:6,3:14,9
+chr2	111596205	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03285;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:11,4:0,2
+chr2	111755585	.	GAC	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.060731;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:22,3:12,1
+chr2	112132043	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,5:3,4:6,1
+chr2	112753526	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.057118;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:10,6:4,1
+chr2	113591192	.	G	C	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.043637;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:94,20:63,15:31,5
+chr2	113620330	.	C	CAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,2:3,5
+chr2	114371220	.	A	ATAAATATATATTTATATATATTTC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:0,2:0,2:0,0
+chr2	114497241	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.021089;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:9,3:6,10
+chr2	114697749	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0098611;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:6,7:6,3
+chr2	115044355	.	CT	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=2.7081e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,9:11,6
+chr2	115675665	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0040654;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:18,5:18,3
+chr2	115827343	.	A	ATG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.042462;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:8,5:16,1
+chr2	116030269	.	AT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00052096;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:10,5:8,4
+chr2	117508901	.	T	TATAG	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.049895;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:13,1:15,3
+chr2	117607686	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.6483e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,18:10,14:7,4
+chr2	118449070	.	C	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.0714e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,22:11,16:11,6
+chr2	119876897	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.23776;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:15,3:8,1
+chr2	121278029	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12799;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,5:4,3:3,2
+chr2	121854393	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.031253;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,7:11,2:7,5
+chr2	123610163	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0011832;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:15,7:0,5
+chr2	123749949	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=7.7086e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,14:0,8:5,6
+chr2	124149403	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.011071;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:6,8:1,1
+chr2	124320037	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=8.6457e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:30,24:19,14:11,10
+chr2	124857550	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.8454e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:15,8:16,7
+chr2	125354392	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.1663e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:19,14:7,8
+chr2	125595779	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,4:11,2:8,2
+chr2	125946992	.	A	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:2,1:8,3
+chr2	126264772	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,1:14,3
+chr2	126956722	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.2544e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:9,10:15,10
+chr2	127788709	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.044019;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:23,3:7,4
+chr2	127952452	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:4,2:2,1:2,1
+chr2	128766892	.	C	CTTCT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,4:2,1:14,3
+chr2	128861947	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15115;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,2:14,2
+chr2	130064088	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.084679;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:7,4:12,1
+chr2	130090797	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12395;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:14,4:12,1
+chr2	130248523	.	G	C	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.032646;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:45,14:22,5:23,9
+chr2	130997863	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0020091;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:8,4:11,10
+chr2	131112156	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,1:10,3
+chr2	131253757	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0088303;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:9,3:5,7
+chr2	131531493	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.047994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:11,6:22,2
+chr2	132492612	.	ATC	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.20218;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,2:13,2
+chr2	133128945	.	ATT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,5:5,3
+chr2	133518344	.	A	AT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:4,3:3,1
+chr2	134871678	.	G	GACAC	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0032857;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,12:13,8:9,4
+chr2	135837613	.	T	TAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,5:5,4:1,1
+chr2	136551498	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011208;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,2:5,6
+chr2	136964873	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=8.8207e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:22,24:10,14:12,10
+chr2	137200855	.	AGATGGGGACTCCTATGTTGCCCAGACTG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0072786;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:10,2:11,9
+chr2	138858850	.	G	GGTGTGTGT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.069102;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:11,3:7,3
+chr2	139088395	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=4.6939e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:9,8:12,9
+chr2	139966003	.	CATCT	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0068367;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,8:16,4:12,4
+chr2	139982211	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.090639;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,3:17,1
+chr2	139982216	.	TAC	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.081098;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:17,2:16,2
+chr2	140228200	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:4,1:10,3
+chr2	140228419	.	AATAT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.026299;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:12,4:5,2
+chr2	141840257	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:7,4:1,1
+chr2	142162559	.	GA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024305;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:13,7:3,1
+chr2	142418880	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,6:8,3:5,3
+chr2	144225024	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.3048e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:12,14:14,6
+chr2	147731214	.	TA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.030049;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:8,4:12,4
+chr2	148294509	.	T	TTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTTTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.094639;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,5:9,1:8,4
+chr2	148667293	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.9466e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:12,8:8,8
+chr2	149507574	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=2.2798e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:11,9:11,11
+chr2	150648952	.	CACACACACAG	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.016864;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,12:11,9:13,3
+chr2	151010114	.	TTTATTTTTA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:4,1:12,3
+chr2	152383273	.	C	CTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,10:2,8:2,2
+chr2	152811407	.	G	GT	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.5471e-07;SS=2;SSC=68;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:10,9:13,11
+chr2	154007180	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=7.6126e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:13,10:8,10
+chr2	155372561	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:9,3:3,1
+chr2	158508389	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,6:5,1:6,5
+chr2	158942780	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=7.3933e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:4,9:9,4
+chr2	159643876	.	CA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.01088;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:17,9:4,1
+chr2	160120731	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,4:4,6
+chr2	161661349	.	C	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=6.7963e-09;SS=2;SSC=81;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:22,25:14,12:8,13
+chr2	162345125	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.20321;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:15,1:3,2
+chr2	162689143	.	C	CTATTATTATTAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.049216;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:7,6:9,2
+chr2	163117432	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:5,3:6,2
+chr2	163812960	.	T	TCGCG	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.101;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,1:18,3
+chr2	164374846	.	A	ATT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:3,3:2,3
+chr2	165398055	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.012505;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:18,8:11,3
+chr2	166310918	.	T	TA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.057842;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:2,2:10,2
+chr2	167680549	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.021894;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:6,5:15,6
+chr2	168520598	.	CTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:3,1:6,4
+chr2	168739052	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.056741;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,7:7,3:5,4
+chr2	168888924	.	CGTGTGT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016449;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:10,6:8,5
+chr2	169361352	.	C	CTCTCTCTG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0071736;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:5,3:23,6
+chr2	169463881	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0020358;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:17,4:8,6
+chr2	169548420	.	T	TA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00094133;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:15,10:14,9
+chr2	170959821	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,8:7,3
+chr2	171973400	.	C	CAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0029985;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:8,13:6,9:2,4
+chr2	171992121	.	G	GA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.040919;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,9:15,8:4,1
+chr2	172107292	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,8:5,2:3,6
+chr2	172622674	.	CATATATT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.22736;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:14,3:17,1
+chr2	172622723	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0058029;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:12,8:8,6
+chr2	173005520	.	G	GTTTTTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:16,3:5,2
+chr2	173166910	.	G	GTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.018977;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,11:8,7:5,4
+chr2	173657640	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00028276;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:7,6:10,8
+chr2	176045337	.	CAA	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0033584;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:13,13:6,3
+chr2	177351096	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,2:1,1:0,1
+chr2	177495917	.	CAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0012916;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,10:2,8:1,2
+chr2	177622392	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=8.1411e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:11,5:9,10
+chr2	178747853	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=9.3895e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,22:12,13:13,9
+chr2	180013868	.	G	GTT	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0039979;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,14:13,7:13,7
+chr2	181677112	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,1:2,3
+chr2	181948670	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,1:14,3
+chr2	182972246	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,3:2,2:3,1
+chr2	183144629	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.1861e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:16,22:10,10:6,12
+chr2	183283891	.	CTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTCTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,5:0,2:4,3
+chr2	183644763	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.4703e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:9,9:9,6
+chr2	184213659	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,2:5,1:0,1
+chr2	184531464	.	GAT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.013487;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:3,4:7,2
+chr2	186276309	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.2056e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:15,7:10,9
+chr2	187053684	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00027216;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:13,6:10,13
+chr2	187117005	.	AT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.02948;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,7:7,6:6,1
+chr2	187261193	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:5,9:4,4
+chr2	187358530	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23366;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,4:2,3:7,1
+chr2	188931860	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=6.3838e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:9,5:13,12
+chr2	189670190	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.019042;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:9,9:5,1
+chr2	189714972	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,2:2,1:3,1
+chr2	190823113	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:8,1:11,3
+chr2	190972816	.	G	GGT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0042171;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,13:10,7:10,6
+chr2	191017618	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.056479;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,6:21,1:26,5
+chr2	192995417	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:4,2:2,1:2,1
+chr2	194048674	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.072536;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:16,4:8,4
+chr2	194491933	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,2:16,2
+chr2	196991764	.	T	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:3,2:2,1:1,1
+chr2	197034050	.	T	TAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:11,11:8,8:3,3
+chr2	197145312	.	TA	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.027216;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:17,2:16,4
+chr2	197608623	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011224;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,16:4,11:6,5
+chr2	197922935	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:9,4:4,3
+chr2	198732500	.	AT	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00020368;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,12:13,6:8,6
+chr2	198811945	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
+chr2	199109602	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=9.3322e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:15,9:11,4
+chr2	199355348	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00077002;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:32:1,11:1,4:0,7
+chr2	199489596	.	CTT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10396;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,2:14,3
+chr2	200803621	.	T	TACACACACACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0030624;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:7,4:12,6
+chr2	201409279	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00051722;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:15,8:5,5
+chr2	202405687	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,9:4,7:4,2
+chr2	202803400	.	CAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,8:2,7:6,1
+chr2	202836812	.	TATAG	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.21643;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:20,1:14,3
+chr2	202836818	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.27503;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,5:17,2:14,3
+chr2	202885308	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=6.4027e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:12,7:9,10
+chr2	205017666	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.2813e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,22:12,13:13,9
+chr2	205037381	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.036704;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,3:13,1
+chr2	205127296	.	C	CAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018809;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,8:13,6:6,2
+chr2	205188782	.	TC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.16171;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:18,1:9,3
+chr2	205413674	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.1625e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,22:13,13:11,9
+chr2	205567304	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03285;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,5:3,1
+chr2	207009049	.	AGT	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:13,14:7,8:6,6
+chr2	207409313	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,2:7,1:0,1
+chr2	207679413	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=4.1304e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:20,22:10,10:10,12
+chr2	208100923	.	GTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:3,6:5,2
+chr2	208103138	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.014419;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,8:11,7:9,1
+chr2	209164458	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.025393;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,7:8,1
+chr2	210451039	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.9457e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:23,24:9,12:14,12
+chr2	210497893	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,10:2,9:2,1
+chr2	211856366	.	C	CTATTTATTTATT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033424;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,13:17,7:11,6
+chr2	214511921	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,6:9,5:7,1
+chr2	215015169	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.03569;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:16,4:7,3:9,1
+chr2	217295628	.	T	TA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:4,4:2,2
+chr2	218202779	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0062663;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:11,8:5,2
+chr2	218408723	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:2,3:1,1:1,2
+chr2	220020588	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.024817;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:10,5:12,2
+chr2	220818415	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.058162;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,4:4,2:9,2
+chr2	223426084	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,7:3,6:1,1
+chr2	223579690	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.5018e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:8,7:12,8
+chr2	223832135	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.01205;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:9,17:4,10:5,7
+chr2	225053895	.	A	ATATATTTTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.026055;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,8:9,4:10,4
+chr2	225204909	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:5,1:6,4
+chr2	227599021	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.067259;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,3:14,2
+chr2	227656632	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.024543;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:18,2:19,8
+chr2	228461502	.	TTG	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00082127;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:6,4:11,6
+chr2	229668522	.	GTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:1,4:6,2
+chr2	231451014	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,6:2,1:2,5
+chr2	231826069	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.19378;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:5,1:15,2
+chr2	231828108	.	C	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
+chr2	231830216	.	AG	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.12376;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:16,1:7,5
+chr2	231847018	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.32176;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,1:12,3
+chr2	231940065	.	CA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00793;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:5,7:8,2
+chr2	232694003	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:6,7:6,1
+chr2	232734109	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:3,6:4,1
+chr2	233218804	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=8.6672e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:17,22:9,11:8,11
+chr2	233567231	.	T	G	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.043553;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:65,16:29,9:36,7
+chr2	234408303	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,3:5,1
+chr2	236344992	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.069887;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:21,2:23,3
+chr2	238196072	.	T	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,1:2,4
+chr2	240284281	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.2998e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:13,8:9,11
+chr2	240850366	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.037048;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:28,5:15,1
+chr2	240881091	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.9498e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:8,7:10,8
+chr2	241338945	.	TTA	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,3:1,2
+chr2	241338962	.	A	AT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,3:3,3
+chr2	241338967	.	AAATAT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,3:4,2
+chr2	242181823	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.049592;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:20,6:17,1
+chr2	242182971	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,2:8,2
+chr20	833025	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03726;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:5,2:10,5
+chr20	1559135	.	G	GTATATATATATA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.062277;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,5:16,2:8,3
+chr20	3696133	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.10963;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:17,4:25,1
+chr20	3746301	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:3,3:5,1
+chr20	3818084	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.10288;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,8:8,6:6,2
+chr20	3887307	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.050247;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:12,1:17,3
+chr20	5479327	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.8644e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:12,7:8,6
+chr20	5542922	.	AGT	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.063538;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:48,6:29,2:19,4
+chr20	5542926	.	AT	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.045288;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:26,2:15,4
+chr20	5701011	.	ACCTGGAATCATTCAACAGTGAAAACCTATGAACTTTATTTACT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.063391;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:6,1:18,5
+chr20	5871836	.	GGAA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
+chr20	6198774	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.5855e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:11,5:9,13
+chr20	7224002	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14559;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:8,3:4,2
+chr20	8704984	.	C	CTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.011868;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,10:1,9:3,1
+chr20	9203777	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.029588;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:8,6:4,4
+chr20	10453318	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.036717;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:18,3:14,5
+chr20	11100141	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=2.1422e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:36,21:23,13:13,8
+chr20	12653895	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.423e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:25,27:14,12:11,15
+chr20	12963109	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=5.0503e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:20,22:10,13:10,9
+chr20	13951296	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:5,3:13,1
+chr20	14210364	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.7288e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:15,9:9,6
+chr20	16200995	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:5,2:5,5
+chr20	16259183	.	TC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:5,4:0,1
+chr20	16347575	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:19,4:9,1:10,3
+chr20	16514585	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.057842;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,4:7,2:5,2
+chr20	17335857	.	G	GGTGTGT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00093746;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:14,6:4,6
+chr20	17347787	.	CGAAAGAAAGAAAGAAA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,4:8,3:7,1
+chr20	17483028	.	A	ATTT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00016659;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,7:10,4
+chr20	17851390	.	A	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0061141;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:24,7:12,1
+chr20	17851402	.	CT	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.090639;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,4:23,3:11,1
+chr20	18054782	.	AG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.07056;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,3:13,1
+chr20	18184062	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=8.9729e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:25,23:12,13:13,10
+chr20	18250697	.	TAA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.060214;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:17,3:9,1
+chr20	18579211	.	GTTTTTT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.079329;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,6:8,4:2,2
+chr20	19116484	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.03685;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,5:4,1
+chr20	19147598	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0737;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:13,5:2,1
+chr20	19187357	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00031092;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:16,4:14,10
+chr20	19322981	.	C	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.8934e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:26,24:18,16:8,8
+chr20	19513736	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.045605;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:10,7:11,3
+chr20	19696971	.	AAGGGAGGGAGGG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:8,5:1,2
+chr20	21012812	.	C	T	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=5.4427e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:31,27:11,11:20,16
+chr20	22836039	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.1617e-10;SS=2;SSC=96;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:13,20:3,5:10,15
+chr20	23803669	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,2:1,1:4,1
+chr20	26270392	.	C	CA	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.037417;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:22,1:19,7
+chr20	26441655	.	C	A	0	PASS	DP=708;GPV=1;SPV=0.013532;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:420:376,44:161,25:215,19
+chr20	26542186	.	A	T	0	PASS	DP=1421;GPV=1;SPV=0.0048167;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:768:678,87:337,50:341,37
+chr20	26603057	.	AG	A	0	PASS	DP=252;GPV=1;SPV=0.01924;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:117,23:29,5:88,18
+chr20	27655384	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0028871;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,9:25,3:4,6
+chr20	27765802	.	C	G	0	PASS	DP=551;GPV=1;SPV=0.021477;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:314:264,50:219,45:45,5
+chr20	27962669	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.017734;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:6,4:7,6
+chr20	28514774	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14022;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:2,3:20,2
+chr20	28516630	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.083817;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:19,2:3,2
+chr20	28624228	.	C	T	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.028401;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:189:162,27:97,18:65,9
+chr20	28642942	.	A	AAT	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.040321;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:53,10:28,5:25,5
+chr20	28777653	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,2:5,3
+chr20	28839112	.	G	C	0	PASS	DP=286;GPV=1;SPV=0.015773;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:163:145,17:139,15:6,2
+chr20	28900911	.	C	A	0	PASS	DP=310;GPV=1;SPV=0.038337;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:151,26:68,14:83,12
+chr20	28959558	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.048243;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:25,1:11,7
+chr20	29030826	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=9.0569e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:11,8:13,11
+chr20	29072931	.	G	C	0	PASS	DP=421;GPV=1;SPV=0.020403;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:228:201,27:85,14:116,13
+chr20	29222612	.	G	A	0	PASS	DP=235;GPV=1;SPV=0.044307;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:110,23:56,14:54,9
+chr20	29242240	.	CA	C	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.037913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:179:155,24:82,7:73,17
+chr20	29242274	.	A	C	0	PASS	DP=316;GPV=1;SPV=0.0092047;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:154,24:85,8:69,16
+chr20	29508233	.	G	A	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.027818;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:146:130,16:69,9:61,7
+chr20	29882272	.	G	A	0	PASS	DP=622;GPV=1;SPV=0.023889;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:350:300,50:118,22:182,28
+chr20	29974817	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:8,4:0,5
+chr20	29988308	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037959;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:2,3:9,1
+chr20	30105925	.	G	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.040005;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:21,2:11,8
+chr20	30105984	.	G	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.029347;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:22,3:32,3
+chr20	30114859	.	TC	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.028807;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:51,16:34,10:17,6
+chr20	30258827	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,3:7,1
+chr20	30258829	.	T	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:0,3:5,1
+chr20	30356428	.	A	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.049484;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:73,12:30,2:43,10
+chr20	30394669	.	A	G	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.027216;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:64,17:34,6:30,11
+chr20	30507298	.	AAGAAAGAG	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.044305;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:11,5:13,4
+chr20	30861112	.	C	T	0	PASS	DP=243;GPV=1;SPV=0.004446;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:104,27:57,20:47,7
+chr20	31055552	.	G	T	0	PASS	DP=463;GPV=1;SPV=0.021878;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:269:240,29:135,13:105,16
+chr20	31063384	.	G	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.095044;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:27,5:8,3:19,2
+chr20	31075736	.	C	A	0	PASS	DP=907;GPV=1;SPV=0.043392;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:592:454,69:121,26:333,43
+chr20	31096487	.	C	CAATGG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12446;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:13,3:15,2
+chr20	31096524	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.13133;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:16,3:13,2
+chr20	31346990	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,9:4,7:6,2
+chr20	31957819	.	TATATATATATATATATATTCTGTA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,1:4,3
+chr20	32850549	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.049275;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,5:4,1
+chr20	33536358	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0054348;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:1,5:7,2
+chr20	33557004	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr20	33910437	.	CTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:10,4:5,1
+chr20	34375696	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,3:2,1
+chr20	35090180	.	T	TAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0021067;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:10,6:9,8
+chr20	35153833	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.17513;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:17,2:19,2
+chr20	35186566	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.015482;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:14,9:4,1
+chr20	35214688	.	C	CA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0053306;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,14:13,11:13,3
+chr20	36014118	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.3402e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,17:3,7:9,10
+chr20	36763885	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.069923;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,8:9,7:7,1
+chr20	37126314	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,3:7,1
+chr20	37908680	.	G	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=3.085e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:31,33:18,18:13,15
+chr20	38379162	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,3:6,1
+chr20	38640174	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.13137;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,5:13,3:18,2
+chr20	38708430	.	A	AAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.011329;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,9:9,5:5,4
+chr20	39135065	.	C	CT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.012896;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,15:13,6:12,9
+chr20	39203388	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=5.1055e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:17,10:8,10
+chr20	40161346	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,6:7,4
+chr20	41019977	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,12:5,7:2,5
+chr20	41227191	.	T	TG	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.9762e-07;SS=2;SSC=60;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:6,8:12,7
+chr20	41787546	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,3:7,1
+chr20	41876054	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.009224;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,9:9,7:1,2
+chr20	42850389	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.1303e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:28,21:15,9:13,12
+chr20	43287842	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.9117e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,20:6,8:11,12
+chr20	44680826	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1672;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:16,2:17,2
+chr20	45697379	.	A	ATTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.024972;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:11,4:15,2
+chr20	45738910	.	CTATATATAGTTA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,3:6,4
+chr20	47450571	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=3.2073e-10;SS=2;SSC=94;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:21,32:13,16:8,16
+chr20	47490809	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:6,2:2,1:4,1
+chr20	47593334	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:8,3:3,1
+chr20	48412456	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00098758;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:3,1:8,6
+chr20	48512118	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.27668;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:7,2:6,1
+chr20	50667286	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.018691;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:5,4:2,2
+chr20	51241063	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0083603;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:11,10:6,4
+chr20	51472629	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:6,4:6,1
+chr20	51961764	.	TA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.011401;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:2,5:4,2
+chr20	52077167	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.019351;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:12,8:7,4
+chr20	52113592	.	C	CTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.013278;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,10:7,7:3,3
+chr20	52922077	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:2,3:2,1
+chr20	53096927	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.023594;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:20,2:12,3
+chr20	54564919	.	C	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.6327e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:21,26:13,12:8,14
+chr20	56302246	.	C	CTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0058029;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,12:7,10:13,2
+chr20	58122733	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030401;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,7:5,1
+chr20	58466125	.	C	CAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.018356;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,7:10,6:3,1
+chr20	58798661	.	C	CTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0017432;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,17:2,7:1,10
+chr20	59443486	.	TACACAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.037674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,10:15,4:3,6
+chr20	60647654	.	CTCTCTGTGTGTG	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.043024;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:13,6:7,3
+chr20	61071639	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=2.8402e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:15,13:12,11
+chr20	61383296	.	ATG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.030521;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:11,3:16,3
+chr20	61383377	.	GGAT	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.008813;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:11,3:11,4
+chr20	61383394	.	T	TATG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.019947;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,6:13,2:14,4
+chr20	62325123	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.18255;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:20,3:19,2
+chr20	62593036	.	TGTGTGCATGTGTGA	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.028542;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,9:15,2:11,7
+chr20	63101758	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:15,2:3,2
+chr20	63221532	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.015574;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,11:11,7:9,4
+chr20	63257805	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.043618;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,7:16,4:0,3
+chr20	63257807	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022502;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:17,4:0,3
+chr20	63257808	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.030049;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,8:19,5:1,3
+chr20	63257828	.	AGGACAGTGAT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.096448;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:23,2:6,2
+chr20	63492639	.	ACAAT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.028934;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:13,8:3,1
+chr20	63609857	.	CT	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.16867;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:26,2:9,2
+chr20	63847301	.	G	GAGACACACACAGACACTGACACACAC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,7:4,6:7,1
+chr21	5225998	.	A	G	0	PASS	DP=349;GPV=1;SPV=0.02483;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:188:162,26:68,14:94,12
+chr21	5226679	.	T	C	0	PASS	DP=509;GPV=1;SPV=0.030746;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:274:238,36:116,13:122,23
+chr21	5231730	.	C	G	0	PASS	DP=208;GPV=1;SPV=0.010705;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:90,21:38,9:52,12
+chr21	5251434	.	T	G	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.045679;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:103,21:36,8:67,13
+chr21	6376086	.	G	A	0	PASS	DP=354;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:206:185,21:106,12:79,9
+chr21	7254538	.	T	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.024408;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:26,5:17,3
+chr21	7281326	.	T	C	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.0072587;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:86,25:55,15:31,10
+chr21	7958662	.	T	C	0	PASS	DP=512;GPV=1;SPV=0.00091737;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:294:239,55:121,34:118,21
+chr21	7958780	.	T	A	0	PASS	DP=487;GPV=1;SPV=0.022966;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:266:222,44:101,16:121,28
+chr21	7966316	.	G	C	0	PASS	DP=274;GPV=1;SPV=0.0021228;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:117,28:57,15:60,13
+chr21	7995998	.	A	T	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.0018624;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:63,19:37,7:26,12
+chr21	8035866	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.12392;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:22,2:12,2
+chr21	8039154	.	A	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.048393;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,12:24,8:12,4
+chr21	8419850	.	A	ACTGT	0	PASS	DP=1226;GPV=1;SPV=0.011035;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:781:664,106:356,77:308,29
+chr21	8440697	.	G	A	0	PASS	DP=3237;GPV=1;SPV=0.0067114;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2059:1834,224:1141,168:693,56
+chr21	8536809	.	T	C	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.035525;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:129,18:65,8:64,10
+chr21	8546996	.	C	T	0	PASS	DP=242;GPV=1;SPV=0.028437;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:124,16:72,7:52,9
+chr21	8554722	.	AATG	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.042156;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:37,12:18,2:19,10
+chr21	8625901	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0099066;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:6,2:37,6
+chr21	8660444	.	G	A	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.048236;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:57,16:28,3:29,13
+chr21	8675401	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.036877;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:13,6:4,2
+chr21	8682330	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.024897;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:10,8:14,1
+chr21	8769953	.	C	T	0	PASS	DP=235;GPV=1;SPV=0.046124;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:110,14:49,8:61,6
+chr21	8779016	.	C	A	0	PASS	DP=282;GPV=1;SPV=0.024803;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:137,21:63,16:74,5
+chr21	8787009	.	TGTC	T	0	PASS	DP=284;GPV=1;SPV=0.015842;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:133,31:64,20:69,11
+chr21	8795779	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:25,4:0,0
+chr21	8799600	.	A	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.020858;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:26,10:19,2
+chr21	8816612	.	A	G	0	PASS	DP=204;GPV=1;SPV=0.012785;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:96,19:73,12:23,7
+chr21	8818460	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0059499;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:7,1:17,5
+chr21	8830956	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:18,4:2,0
+chr21	8832637	.	G	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.028559;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:54,16:37,14:17,2
+chr21	8834266	.	A	C	0	PASS	DP=523;GPV=1;SPV=0.026699;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:270:227,43:113,23:114,20
+chr21	8846751	.	A	G	0	PASS	DP=646;GPV=1;SPV=0.010371;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:368:325,43:158,14:167,29
+chr21	8853664	.	G	A	0	PASS	DP=583;GPV=1;SPV=0.0061804;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:305:267,38:128,13:139,25
+chr21	8857552	.	A	G	0	PASS	DP=464;GPV=1;SPV=0.027757;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:248:221,27:79,7:142,20
+chr21	8863068	.	C	T	0	PASS	DP=612;GPV=1;SPV=0.044801;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:340:297,43:161,20:136,23
+chr21	8865457	.	A	T	0	PASS	DP=583;GPV=1;SPV=0.001813;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:318:280,38:175,27:105,11
+chr21	8885938	.	G	C	0	PASS	DP=585;GPV=1;SPV=0.0065017;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:319:283,36:131,17:152,19
+chr21	9006958	.	G	C	0	PASS	DP=378;GPV=1;SPV=0.046043;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:177,24:94,12:83,12
+chr21	9010439	.	C	T	0	PASS	DP=356;GPV=1;SPV=0.027572;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:205:183,22:105,7:78,15
+chr21	9015907	.	G	A	0	PASS	DP=373;GPV=1;SPV=0.019314;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:198:175,23:88,12:87,11
+chr21	9018769	.	C	T	0	PASS	DP=362;GPV=1;SPV=0.0016674;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:159,37:81,23:78,14
+chr21	9030012	.	T	C	0	PASS	DP=288;GPV=1;SPV=0.029096;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:174:150,24:69,13:81,11
+chr21	9030013	.	G	A	0	PASS	DP=284;GPV=1;SPV=0.014282;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:145,23:68,13:77,10
+chr21	9058265	.	T	G	0	PASS	DP=354;GPV=1;SPV=0.044755;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:182,30:86,18:96,12
+chr21	9059947	.	G	A	0	PASS	DP=331;GPV=1;SPV=0.027458;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:161,22:72,11:89,11
+chr21	9070503	.	G	A	0	PASS	DP=405;GPV=1;SPV=0.036246;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:197,26:94,12:103,14
+chr21	9073841	.	C	T	0	PASS	DP=300;GPV=1;SPV=0.041439;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:170:150,20:59,5:91,15
+chr21	9076389	.	A	G	0	PASS	DP=304;GPV=1;SPV=0.0013819;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:145,33:88,14:57,19
+chr21	9091122	.	C	T	0	PASS	DP=405;GPV=1;SPV=0.010665;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:178,39:112,20:66,19
+chr21	9101789	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.045802;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:10,3:12,3
+chr21	9102555	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=256;GPV=1;SPV=0.0082606;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:124,15:70,10:54,5
+chr21	9110288	.	A	T	0	PASS	DP=636;GPV=1;SPV=0.034218;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:346:308,38:180,18:128,20
+chr21	9110896	.	T	C	0	PASS	DP=574;GPV=1;SPV=0.0023613;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:325:285,40:132,13:153,27
+chr21	9123920	.	T	A	0	PASS	DP=521;GPV=1;SPV=0.016704;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:295:263,32:146,18:117,14
+chr21	9126698	.	C	G	0	PASS	DP=553;GPV=1;SPV=0.029204;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:243,36:154,18:89,18
+chr21	9126790	.	C	T	0	PASS	DP=604;GPV=1;SPV=0.007596;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:312:274,38:159,18:115,20
+chr21	9141392	.	T	A	0	PASS	DP=580;GPV=1;SPV=0.026096;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:315:266,49:137,26:129,23
+chr21	9151734	.	G	T	0	PASS	DP=452;GPV=1;SPV=0.043814;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:242:205,37:107,28:98,9
+chr21	9151776	.	A	G	0	PASS	DP=435;GPV=1;SPV=0.031767;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:231:199,32:124,22:75,10
+chr21	9174854	.	G	A	0	PASS	DP=391;GPV=1;SPV=0.0016586;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:210:182,28:97,12:85,16
+chr21	9175241	.	A	C	0	PASS	DP=435;GPV=1;SPV=0.019887;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:191,35:124,19:67,16
+chr21	9183135	.	C	T	0	PASS	DP=479;GPV=1;SPV=0.034094;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:268:225,43:110,24:115,19
+chr21	9186837	.	G	C	0	PASS	DP=511;GPV=1;SPV=0.016891;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:280:233,47:104,19:129,28
+chr21	9186947	.	A	C	0	PASS	DP=474;GPV=1;SPV=0.031342;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:268:240,28:123,18:117,10
+chr21	9194375	.	G	A	0	PASS	DP=898;GPV=1;SPV=0.025909;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:483:433,50:246,39:187,11
+chr21	9259601	.	G	A	0	PASS	DP=586;GPV=1;SPV=0.00027813;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:342:285,57:144,33:141,24
+chr21	9266003	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,1:6,4
+chr21	9274388	.	G	A	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.039332;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:67,16:64,13:3,3
+chr21	9297708	.	G	A	0	PASS	DP=453;GPV=1;SPV=0.012951;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:250:224,26:103,10:121,16
+chr21	9304507	.	G	A	0	PASS	DP=610;GPV=1;SPV=0.040493;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:355:319,36:153,12:166,24
+chr21	9309334	.	C	T	0	PASS	DP=476;GPV=1;SPV=0.028189;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:244:219,25:129,18:90,7
+chr21	9315263	.	T	C	0	PASS	DP=530;GPV=1;SPV=0.024312;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:298:266,32:133,15:133,17
+chr21	9333403	.	A	T	0	PASS	DP=441;GPV=1;SPV=0.010601;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:259:231,28:116,14:115,14
+chr21	9340796	.	T	C	0	PASS	DP=385;GPV=1;SPV=0.048947;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:213:191,22:136,12:55,10
+chr21	9340825	.	T	C	0	PASS	DP=438;GPV=1;SPV=0.0060631;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:250:222,28:133,18:89,10
+chr21	9343680	.	T	G	0	PASS	DP=416;GPV=1;SPV=0.046557;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:244:219,25:107,12:112,13
+chr21	9346068	.	C	G	0	PASS	DP=615;GPV=1;SPV=0.049783;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:333:287,46:141,9:146,37
+chr21	9350207	.	A	AT	0	PASS	DP=488;GPV=1;SPV=0.031053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:265:227,38:107,9:120,29
+chr21	9354669	.	G	C	0	PASS	DP=399;GPV=1;SPV=0.0263;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:243:218,25:129,12:89,13
+chr21	9355187	.	G	T	0	PASS	DP=560;GPV=1;SPV=0.023377;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:329:276,53:147,24:129,29
+chr21	9362484	.	T	G	0	PASS	DP=384;GPV=1;SPV=0.040314;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:220:194,26:96,16:98,10
+chr21	9527333	.	C	T	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.018462;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:54,15:43,11:11,4
+chr21	9551000	.	ACT	A	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.022332;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:91,18:39,11:52,7
+chr21	9551005	.	T	TGAGGTCAGGA	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.023467;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:90,19:37,12:53,7
+chr21	9628624	.	A	G	0	PASS	DP=203;GPV=1;SPV=0.00071048;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:78,30:41,13:37,17
+chr21	9657307	.	C	CAA	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.014457;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:22,13:14,10:8,3
+chr21	9664360	.	C	T	0	PASS	DP=299;GPV=1;SPV=0.037377;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:139,28:67,11:72,17
+chr21	9675117	.	G	A	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.009354;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:106,19:51,11:55,8
+chr21	9676168	.	C	T	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.044993;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:97,21:42,5:55,16
+chr21	9680606	.	G	A	0	PASS	DP=219;GPV=1;SPV=0.048526;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:103,21:49,13:54,8
+chr21	9687709	.	G	A	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.024684;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:103,19:62,8:41,11
+chr21	9694189	.	G	A	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.043687;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:107,21:50,11:57,10
+chr21	9705739	.	G	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,1:6,3
+chr21	9817080	.	G	T	0	PASS	DP=3580;GPV=1;SPV=0.014742;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2013:1779,234:674,75:1105,159
+chr21	9818669	.	G	A	0	PASS	DP=790;GPV=1;SPV=0.020873;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:445:386,49:298,37:88,12
+chr21	9843165	.	A	G	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.0047134;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:84,24:47,15:37,9
+chr21	9908583	.	C	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.018498;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:74,18:39,14:35,4
+chr21	9909302	.	G	A	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.007021;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:87,24:55,11:32,13
+chr21	9909505	.	G	T	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.04634;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:165:139,26:71,13:68,13
+chr21	9909534	.	C	T	0	PASS	DP=276;GPV=1;SPV=0.033658;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:114,21:53,12:61,9
+chr21	9941161	.	T	C	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.01166;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:137:115,22:61,11:54,11
+chr21	9951540	.	G	A	0	PASS	DP=242;GPV=1;SPV=0.010745;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:104,24:62,11:42,13
+chr21	9956562	.	T	C	0	PASS	DP=204;GPV=1;SPV=0.036658;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:86,20:41,12:45,8
+chr21	9967057	.	G	C	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=2.8573e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:87,16:40,9:47,7
+chr21	10074081	.	T	A	0	PASS	DP=252;GPV=1;SPV=0.0070661;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:108,30:57,11:51,19
+chr21	10163368	.	G	A	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.040113;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:105,25:53,14:52,11
+chr21	10343994	.	C	T	0	PASS	DP=323;GPV=1;SPV=6.3894e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:174:152,22:67,6:85,16
+chr21	10358499	.	C	T	0	PASS	DP=298;GPV=1;SPV=0.027824;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:146,23:68,15:78,8
+chr21	10359428	.	G	A	0	PASS	DP=317;GPV=1;SPV=0.00076568;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:156,27:76,17:80,10
+chr21	10361076	.	G	C	0	PASS	DP=623;GPV=1;SPV=0.020065;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:340:259,48:130,24:129,24
+chr21	10361114	.	C	G	0	PASS	DP=698;GPV=1;SPV=0.0029897;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:366:308,58:165,24:143,34
+chr21	10403331	.	C	T	0	PASS	DP=276;GPV=1;SPV=0.017765;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:133,22:47,3:86,19
+chr21	10422921	.	G	A	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.036589;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:119,15:83,11:36,4
+chr21	10460505	.	T	C	0	PASS	DP=399;GPV=1;SPV=0.021557;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:224:197,27:108,13:89,14
+chr21	10469718	.	G	A	0	PASS	DP=389;GPV=1;SPV=0.015551;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:218:185,33:109,21:76,12
+chr21	10473424	.	C	T	0	PASS	DP=362;GPV=1;SPV=0.0071959;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:172,25:61,13:111,12
+chr21	10488409	.	A	G	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.018334;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:86,14:57,8:29,6
+chr21	10488554	.	G	T	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.012581;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:98,18:61,11:37,7
+chr21	10663986	.	C	T	0	PASS	DP=233;GPV=1;SPV=0.0045943;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:109,31:51,18:58,13
+chr21	10716321	.	T	G	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.0050663;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:96,21:56,8:40,13
+chr21	10746406	.	C	T	0	PASS	DP=475;GPV=1;SPV=0.025619;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:287:254,33:128,15:126,18
+chr21	10756286	.	G	C	0	PASS	DP=414;GPV=1;SPV=0.015409;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:216:190,26:91,10:99,16
+chr21	10798012	.	T	A	0	PASS	DP=606;GPV=1;SPV=0.041582;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:340:302,38:155,25:147,13
+chr21	10808909	.	G	A	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.042499;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:147,26:67,12:80,14
+chr21	12976028	.	G	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=7.0417e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:69,18:33,7:36,11
+chr21	13027223	.	C	CA	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.035746;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:45,15:22,2:23,13
+chr21	13100149	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.032357;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:24,5:10,4
+chr21	13139744	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.074336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,4:12,1
+chr21	13139745	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.062277;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:9,4:15,1
+chr21	13225211	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.005596;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,7:16,6:2,1
+chr21	13485001	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=4.6629e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:14,7:10,8
+chr21	13490606	.	ATATATTT	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,2:1,1:1,1
+chr21	13550568	.	A	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.045262;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:56,9:33,5:23,4
+chr21	13612108	.	C	CAT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.074732;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,2:14,3
+chr21	13810187	.	AGGGG	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.083854;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,5:16,3:20,2
+chr21	14061959	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.004133;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,13:3,6:7,7
+chr21	15239757	.	CTATA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:10,12:6,9:4,3
+chr21	16145996	.	ATGTGAGCCAGCAAAGTAATGTGAGGAGTTGCCTTGGGCCTGGGAGAATC	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.022393;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:19,6:7,3
+chr21	16420345	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=6.9776e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,19:8,11:9,8
+chr21	17057769	.	AGTAAAAGT	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00016727;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:12,6:18,8
+chr21	17530114	.	A	AT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.026224;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,6:2,3:2,3
+chr21	18070027	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr21	18174120	.	GGT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,3:4,3
+chr21	19524779	.	C	CAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0021328;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,16:9,11:8,5
+chr21	20144940	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.21758;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:17,2:15,2
+chr21	20349991	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=2.6597e-09;SS=2;SSC=85;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:22,26:6,19:16,7
+chr21	22562732	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:3,2:2,2
+chr21	25193617	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.6179e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:18,21:11,13:7,8
+chr21	25621758	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:1,6:5,2
+chr21	26226543	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=6.2936e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:6,6:9,8
+chr21	27627381	.	T	A	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.028841;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:77,15:33,5:44,10
+chr21	27879185	.	A	AT	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00074156;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:4,22:2,12:2,10
+chr21	30490177	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.9336e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:8,8:13,10
+chr21	30562390	.	T	TAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,2:2,1:1,1
+chr21	31473429	.	CAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.19205;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:11,4:4,1
+chr21	31735263	.	GAAAAAAAAAAAAAAAA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:3,7:2,1
+chr21	31770100	.	GTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0027123;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,9:2,4:2,5
+chr21	32030655	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.22736;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,4:18,2:13,2
+chr21	32255498	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016338;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:5,2:13,7
+chr21	33876219	.	T	TTC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,1:10,3
+chr21	34135346	.	G	GT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,11:5,8:5,3
+chr21	35769468	.	AATATAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0086957;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,7:3,4:3,3
+chr21	35793297	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,3:9,1
+chr21	36115398	.	A	AT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11424;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:6,5:9,1
+chr21	36436742	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0081568;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,16:15,12:7,4
+chr21	37212564	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,6:3,2:5,4
+chr21	38201730	.	GTCTA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:5,3:5,1
+chr21	38358110	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.16972;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:28,4:20,1:8,3
+chr21	39682186	.	TA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00057614;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:13,8:9,7
+chr21	40353480	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.2902e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:21,30:11,17:10,13
+chr21	40818102	.	CAAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0070393;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,9:4,8:5,1
+chr21	40875087	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.060214;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:18,2:8,2
+chr21	41311236	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:10,3:6,1
+chr21	41655939	.	C	CCACACACA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,10:7,7:2,3
+chr21	41671014	.	C	CT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.05944;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:8,1:22,4
+chr21	41726529	.	C	CTCT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.21337;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,4:12,2:11,2
+chr21	41733013	.	T	TACACACACACACACAC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034981;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,10:11,5:8,5
+chr21	41745315	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.1955e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:16,14:9,6
+chr21	42008571	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,2:2,1:4,1
+chr21	42212707	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:2,2:1,1:1,1
+chr21	42311322	.	GGCAGGCAGCGCTCACAGGAGGCCCAA	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.013462;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:18,6:7,5
+chr21	42362097	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.027692;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:17,2:26,4
+chr21	42883098	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0031186;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,12:10,10:4,2
+chr21	43337398	.	C	CCACCAT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0090365;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,11:7,8:8,3
+chr21	44257696	.	ATAAAT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.026312;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:13,6:8,5
+chr21	44345311	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=1.0398e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:31,22:16,10:15,12
+chr21	44598534	.	A	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.8098e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:28,24:11,11:17,13
+chr21	44789384	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:7,6:4,1
+chr21	45610068	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.637e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:9,9:10,7
+chr21	46321901	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.14279;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:13,4:3,1
+chr21	46446680	.	G	GTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.040363;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,8:13,4:9,4
+chr22	10527469	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.025076;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:3,1:17,4
+chr22	10531809	.	TGA	T	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.010226;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:75,13:49,8:26,5
+chr22	10612761	.	T	C	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.015286;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:74,10:34,1:40,9
+chr22	10641581	.	TGA	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.041309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:45,9:27,5:18,4
+chr22	10650005	.	G	GAA	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.00037634;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:73,18:47,12:26,6
+chr22	10690286	.	T	C	0	PASS	DP=190;GPV=1;SPV=0.021635;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:92,16:32,2:60,14
+chr22	10698681	.	A	G	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.010064;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:98,14:62,9:36,5
+chr22	10733640	.	G	A	0	PASS	DP=622;GPV=1;SPV=0.035246;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:356:319,37:157,19:162,18
+chr22	10737705	.	A	G	0	PASS	DP=376;GPV=1;SPV=0.016527;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:219:191,28:91,13:100,15
+chr22	10760350	.	G	A	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.0066425;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:96,15:64,12:32,3
+chr22	10760366	.	T	TTA	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.0088568;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:100,12:73,10:27,2
+chr22	10760379	.	T	A	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:105,14:79,11:26,3
+chr22	10765864	.	A	G	0	PASS	DP=269;GPV=1;SPV=0.0048919;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:111,28:43,11:68,17
+chr22	10767229	.	C	T	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.038719;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:101,17:56,8:45,9
+chr22	10771026	.	C	T	0	PASS	DP=328;GPV=1;SPV=0.024823;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:152,31:79,14:73,17
+chr22	10951034	.	C	T	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.041605;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:80,11:33,4:47,7
+chr22	11033002	.	G	A	0	PASS	DP=361;GPV=1;SPV=0.048903;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:203:182,21:80,8:102,13
+chr22	11047586	.	T	TAC	0	PASS	DP=333;GPV=1;SPV=0.029758;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:162:88,12:41,8:47,4
+chr22	11054290	.	G	A	0	PASS	DP=470;GPV=1;SPV=0.038644;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:254:226,28:123,17:103,11
+chr22	11056829	.	G	T	0	PASS	DP=350;GPV=1;SPV=0.032197;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:199:171,28:108,15:63,13
+chr22	11057590	.	C	A	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.016529;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:99,17:43,8:56,9
+chr22	11059377	.	C	T	0	PASS	DP=286;GPV=1;SPV=0.034641;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:140,20:54,12:86,8
+chr22	11061247	.	C	T	0	PASS	DP=333;GPV=1;SPV=0.046295;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:162,20:93,12:69,8
+chr22	11062802	.	G	A	0	PASS	DP=352;GPV=1;SPV=0.035925;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:186:162,24:80,13:82,11
+chr22	11064460	.	C	G	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.047192;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:123,19:41,10:82,9
+chr22	11337982	.	T	TTTA	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.0075827;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:165:146,17:86,10:60,7
+chr22	11358586	.	T	C	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.0025746;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:106,23:45,13:61,10
+chr22	11359091	.	T	C	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.001598;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:63,26:41,11:22,15
+chr22	11455564	.	G	C	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.011593;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:63,18:21,6:42,12
+chr22	11681998	.	TA	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.014807;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:90,16:31,5:59,11
+chr22	11703850	.	G	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.027799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:28,5:15,7
+chr22	11705259	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0092558;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:6,2:36,7
+chr22	11714754	.	G	T	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.020188;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:120,15:46,3:74,12
+chr22	11791237	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.084652;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:18,2:17,2
+chr22	11793951	.	C	T	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.015938;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:66,10:61,8:5,2
+chr22	11797775	.	G	A	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.048875;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:123,19:59,15:64,4
+chr22	11832943	.	A	G	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.030878;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:67,15:41,6:26,9
+chr22	11833156	.	T	G	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.034567;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:95,21:37,15:58,6
+chr22	11834671	.	T	G	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.034547;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:105,13:20,5:85,8
+chr22	11841442	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.032243;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:13,4:0,0
+chr22	11845146	.	G	A	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.00082342;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:63,12:35,6:28,6
+chr22	11865156	.	G	A	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.048415;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:83,15:47,9:36,6
+chr22	11871637	.	T	C	0	PASS	DP=606;GPV=1;SPV=0.026301;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:350:306,44:200,29:106,15
+chr22	11884747	.	T	C	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.00064121;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:55,23:44,16:11,7
+chr22	11885181	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.048436;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:16,3:34,4
+chr22	11891373	.	G	A	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.015085;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:90,12:40,3:50,9
+chr22	11895984	.	C	A	0	PASS	DP=521;GPV=1;SPV=0.010284;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:306:266,40:87,13:179,27
+chr22	11906163	.	C	T	0	PASS	DP=260;GPV=1;SPV=0.045317;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:131,16:27,2:104,14
+chr22	11909971	.	C	T	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.00094504;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:141:123,18:66,14:57,4
+chr22	11923710	.	C	T	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.018527;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:75,12:57,10:18,2
+chr22	11935953	.	C	T	0	PASS	DP=383;GPV=1;SPV=0.015369;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:215:187,28:119,24:68,4
+chr22	12033044	.	A	G	0	PASS	DP=569;GPV=1;SPV=0.011073;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:308:271,37:126,8:145,29
+chr22	12039706	.	T	C	0	PASS	DP=288;GPV=1;SPV=0.025824;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:123,27:56,9:67,18
+chr22	12043443	.	G	A	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.012671;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:80,19:46,11:34,8
+chr22	12069675	.	T	C	0	PASS	DP=338;GPV=1;SPV=0.047797;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:198:177,21:118,7:59,14
+chr22	12088827	.	A	T	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.037554;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:96,17:52,10:44,7
+chr22	12118834	.	G	A	0	PASS	DP=440;GPV=1;SPV=0.044889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:229:198,31:115,15:83,16
+chr22	12146047	.	C	A	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.0017936;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:64,26:38,23:26,3
+chr22	12149864	.	AGAG	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.044501;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:92,15:50,12:42,3
+chr22	12156454	.	G	A	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.042675;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:92,15:36,5:56,10
+chr22	12195122	.	T	G	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.01993;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:98,24:66,14:32,10
+chr22	12219625	.	A	T	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.035918;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:135,24:64,14:71,10
+chr22	12220317	.	A	G	0	PASS	DP=348;GPV=1;SPV=0.028848;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:193:166,27:72,11:94,16
+chr22	12297193	.	A	G	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.00066193;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:105,18:47,7:58,11
+chr22	12351292	.	A	C	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.038942;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:60,10:42,6:18,4
+chr22	12352794	.	G	A	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.049836;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:83,17:46,8:37,9
+chr22	12361039	.	T	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,3:6,3:0,0
+chr22	12387088	.	C	T	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.0074262;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:90,24:42,16:48,8
+chr22	12427862	.	T	G	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.037363;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:73,17:35,10:38,7
+chr22	12525510	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.018465;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:21,2:18,5
+chr22	12575901	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.092258;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:15,3:12,1
+chr22	12605667	.	CT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,5:9,3:8,2
+chr22	12695078	.	T	A	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.0035609;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:95,18:50,5:45,13
+chr22	12696778	.	T	TG	0	PASS	DP=235;GPV=1;SPV=0.017206;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:124,16:61,4:63,12
+chr22	12710410	.	C	T	0	PASS	DP=204;GPV=1;SPV=0.021079;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:100,19:44,7:56,12
+chr22	12721426	.	CACATAAAA	C	0	PASS	DP=455;GPV=1;SPV=0.020099;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:249:223,26:98,10:125,16
+chr22	12799629	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0094855;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:31,2:11,8
+chr22	12803331	.	T	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0099003;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:22,7:15,4
+chr22	12805364	.	T	A	0	PASS	DP=278;GPV=1;SPV=0.014734;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:123,19:67,9:56,10
+chr22	12817911	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.064294;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:0,0:31,4
+chr22	12882421	.	G	C	0	PASS	DP=468;GPV=1;SPV=0.0005702;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:263:232,29:152,10:80,19
+chr22	12882822	.	G	A	0	PASS	DP=573;GPV=1;SPV=0.035159;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:308:264,44:130,22:134,22
+chr22	12904103	.	T	A	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.029313;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:14,4:22,8
+chr22	13409654	.	G	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr22	13409657	.	C	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr22	15238702	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,9:6,5:5,4
+chr22	15525972	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.032993;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:6,2:14,9
+chr22	15535592	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.11088;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:14,1:19,3
+chr22	15554048	.	G	A	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.042965;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:115,20:42,4:73,16
+chr22	15567784	.	T	C	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.0096848;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:66,19:47,10:19,9
+chr22	15571833	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.01441;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:7,6:6,1
+chr22	15575357	.	G	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
+chr22	15628399	.	C	T	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.004149;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:91,23:56,17:35,6
+chr22	15670174	.	C	T	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.04729;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:80,17:32,9:48,8
+chr22	15713197	.	T	C	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.04126;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:58,11:33,4:25,7
+chr22	15737153	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.31172;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,4:21,3:12,1
+chr22	15741615	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:3,5:3,4
+chr22	15745113	.	CT	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.029717;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,6:27,1:21,5
+chr22	15747068	.	C	T	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.01536;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:59,18:30,10:29,8
+chr22	15787990	.	A	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.012601;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:52,12:27,8:25,4
+chr22	15790824	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0027222;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:9,3:11,6
+chr22	15821211	.	G	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.021168;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:47,13:26,4:21,9
+chr22	15829890	.	G	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.025801;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:50,17:25,3:25,14
+chr22	15833829	.	ATTTTC	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,1:6,3
+chr22	15880948	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,2:4,2
+chr22	15917376	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,2:6,2
+chr22	15940680	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.055772;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:16,4:22,1
+chr22	15940780	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.038714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:16,3:24,7
+chr22	16367520	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.057853;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,7:12,5:10,2
+chr22	16523138	.	CAT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,7:2,3:0,4
+chr22	16558307	.	C	CA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.1382;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:30,5:7,1:23,4
+chr22	16622614	.	GACACAC	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.097821;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,7:18,5:1,2
+chr22	16887739	.	TATATATATATATAG	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,3:13,1
+chr22	17756436	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.22398;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,4:6,1:7,3
+chr22	17757402	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0059497;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,8:4,5:3,3
+chr22	18226222	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037417;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,4:4,2
+chr22	18517964	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.036364;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
+chr22	18525675	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,3:5,1
+chr22	18570148	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0021989;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,7:7,6:0,1
+chr22	18652609	.	G	A	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.028852;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:61,8:25,2:36,6
+chr22	18656144	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,5:4,1:6,4
+chr22	18791976	.	C	T	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.035784;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:81,18:39,9:42,9
+chr22	18846493	.	G	T	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.0098534;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:10,5:40,1
+chr22	18911395	.	A	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.025848;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:18,4:20,10
+chr22	19341452	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:5,2:2,1:3,1
+chr22	19586736	.	AAAAAACAAAAAAAAAAAAC	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0094582;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:17,10:13,8
+chr22	20333103	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.02099;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:11,9:10,8
+chr22	20357187	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.029113;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:6,6:12,4
+chr22	20358112	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.095133;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:12,6:10,2
+chr22	20360105	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.033698;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:16,4:9,3
+chr22	20689430	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.072303;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:11,4:28,1
+chr22	21164570	.	CAG	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,1:14,3
+chr22	21164577	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2122;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:10,1:15,3
+chr22	21209601	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
+chr22	21216501	.	A	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.046752;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:52,11:30,2:22,9
+chr22	21247741	.	AT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:13,4:1,0
+chr22	21274288	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.03902;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,6:25,4:12,2
+chr22	21283959	.	C	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.048426;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,13:18,4:24,9
+chr22	21333348	.	G	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.011133;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,16:23,9:21,7
+chr22	21690957	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10638;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:13,3:7,4
+chr22	21912604	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:5,2:3,2
+chr22	22543000	.	A	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.9315e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:27,22:16,13:11,9
+chr22	23597502	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.027568;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,6:15,5:6,1
+chr22	23980515	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.027219;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,5:5,2
+chr22	23990220	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.02269;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:9,2:15,7
+chr22	23990273	.	GA	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.011902;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:16,2:19,9
+chr22	24257335	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.033817;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:17,6:24,1
+chr22	24659196	.	C	G	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.048394;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:21,2:24,10
+chr22	24675083	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.041933;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:11,5:10,1
+chr22	25230922	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=3.7944e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,20:7,13:10,7
+chr22	25491699	.	T	TTC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.059099;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,4:7,2:10,2
+chr22	25491711	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,4:8,2:6,2
+chr22	26047125	.	A	AT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00039513;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:13,4:13,7
+chr22	26542240	.	T	TA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0032973;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:7,6:9,5
+chr22	26634592	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.049619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:13,3:6,4
+chr22	26679647	.	C	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00019573;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:21,9:9,2
+chr22	26772544	.	ACTT	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.058975;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:22,3:21,2
+chr22	27441102	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.2532e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:13,5:15,8
+chr22	27501803	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=1.2145e-10;SS=2;SSC=99;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:21,28:13,11:8,17
+chr22	28883207	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,8:7,6:7,2
+chr22	28883208	.	G	GA	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.025745;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,6:8,5:11,1
+chr22	28883210	.	G	GAA	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.029606;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:15,5:15,1
+chr22	29280862	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022726;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:8,5:7,3
+chr22	29437953	.	A	ATT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0018443;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:10,6:5,3
+chr22	30313550	.	AT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:9,3:3,2
+chr22	30497989	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.3065e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:10,8:12,8
+chr22	31145349	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.0538e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,17:15,7:18,10
+chr22	33203101	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.04108;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,6:16,5:19,1
+chr22	33309850	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=5.7731e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,22:11,6:7,16
+chr22	33661840	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.0577e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:10,7:9,7
+chr22	34073523	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.11785;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,7:7,3:6,4
+chr22	34155855	.	C	CTTTCTTTTCTTTTCT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.057946;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:6,1:18,6
+chr22	34357060	.	CAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0065417;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,8:3,1
+chr22	35498150	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.974e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:7,10:16,7
+chr22	35977727	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:5,2:3,2
+chr22	36347820	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,4:7,1:9,3
+chr22	37138061	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=3.6194e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:22,21:15,15:7,6
+chr22	37894264	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,4:8,4
+chr22	38923747	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.090553;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:5,1:18,5
+chr22	40982177	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,3:4,1
+chr22	41063290	.	AAG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1713;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:17,1:13,3
+chr22	41785906	.	T	TA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.010406;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,11:4,4:11,7
+chr22	42407903	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:13,4:5,1
+chr22	42839124	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.043976;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,9:4,7:14,2
+chr22	42863309	.	CAAA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0047817;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:10,8:5,1
+chr22	42896400	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.23178;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,2:10,2
+chr22	43334660	.	TCAC	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.14256;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:16,2:15,2
+chr22	43579419	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,2:9,2
+chr22	43579420	.	G	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036566;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,4:9,2
+chr22	43836404	.	A	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,5:3,3
+chr22	44066804	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0075858;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:7,2:8,5
+chr22	44763802	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.30409;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,5:8,2:4,3
+chr22	44774518	.	A	ATT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.076179;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,6:11,4:8,2
+chr22	45670438	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,6:3,2:4,4
+chr22	46940716	.	A	AC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.11976;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:7,2:9,3
+chr22	46940879	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,8:4,2
+chr22	47414330	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:1,3:6,3
+chr22	47467579	.	G	GT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00032526;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,15:12,9:6,6
+chr22	48636614	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.078605;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:7,3:18,3
+chr22	49091116	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.10738;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:14,2:17,2
+chr22	49149156	.	G	GAGCTCTGCTGGGTGCTGGTGAGTCGGGAGCCCTGACTC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,9:1,3:4,6
+chr22	50638443	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.035742;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:21,4:13,1
+chr22	50748762	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.017734;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:10,8:3,1
+chr3	996388	.	GT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,4:5,1
+chr3	1210425	.	GA	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.011976;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,8:8,5:4,3
+chr3	1997735	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:4,4:3,1
+chr3	2394784	.	G	GTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,10:6,8:0,2
+chr3	2920420	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00050514;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:6,11:7,4
+chr3	3270834	.	AAAG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.015065;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:9,3:11,9
+chr3	5353098	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0087495;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,8:3,6:4,2
+chr3	5914126	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.0802e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,20:10,12:7,8
+chr3	7385289	.	ATTT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0018037;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,9:3,7:1,2
+chr3	7566111	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,4:4,1:5,3
+chr3	7634478	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,3:8,1
+chr3	8542002	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,3:5,1
+chr3	9824737	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,4:3,2
+chr3	10072523	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=1.3344e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:6,6:19,14
+chr3	11103903	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0070433;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:1,4:4,6
+chr3	11171123	.	C	CTTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.011263;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,13:9,7:11,6
+chr3	11487352	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:3,2:5,4
+chr3	11649895	.	ATTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGG	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.047106;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:11,4:11,3
+chr3	12221298	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04308;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:8,3:1,2
+chr3	13682077	.	CACGCATGTGTGTGTGAGT	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.032693;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,6:20,1:13,5
+chr3	13682097	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.046535;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:28,1:15,5
+chr3	13907950	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,1:8,3
+chr3	14062633	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=4.6832e-09;SS=2;SSC=83;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:19,23:7,11:12,12
+chr3	14965522	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,8:4,7:0,1
+chr3	16095206	.	GTT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01162;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,9:7,4:3,5
+chr3	17263366	.	CAA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.02776;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:15,8:3,2
+chr3	17705338	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.033902;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,6:6,3
+chr3	18798204	.	CTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:10,3:1,1
+chr3	20756723	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=6.934e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:9,10:13,8
+chr3	21512145	.	C	CAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.026907;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,8:7,7:5,1
+chr3	21600115	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.2818e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:14,6:9,5
+chr3	21855465	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=7.0946e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,18:10,8:17,10
+chr3	22164216	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024799;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,2:4,3
+chr3	22181697	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024928;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:6,6:9,3
+chr3	22329076	.	C	CAA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.02761;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,11:18,9:5,2
+chr3	23179213	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.049774;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:4,5:2,1
+chr3	24843900	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.043967;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:14,8:7,1
+chr3	25210558	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:3,4:7,2
+chr3	26152563	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:4,2:3,1:1,1
+chr3	26512253	.	C	CCTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:6,3:5,1
+chr3	27407111	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:2,2:1,1:1,1
+chr3	27965073	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:11,4:4,1
+chr3	29498188	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=9.067e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:13,4:12,11
+chr3	29514650	.	C	CATATATATAT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.048897;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,7:9,5:10,2
+chr3	30631621	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:4,4:6,1
+chr3	34214669	.	C	CATATGTGTGTGT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,5:7,4:8,1
+chr3	34417100	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=2.5198e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:6,10:7,2
+chr3	35635040	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.13974;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:18,2:11,2
+chr3	36793773	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01472;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,8:8,3
+chr3	37407353	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.01132;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:13,6:4,2
+chr3	37518093	.	C	CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.029072;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:10,4:15,3
+chr3	39438589	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:8,4:2,1
+chr3	39441101	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.00086785;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:7,9:2,2
+chr3	39469386	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.030856;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,8:9,2:12,6
+chr3	39674718	.	TAAA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:10,10:4,2
+chr3	40377077	.	AAAGGG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:8,4:0,0
+chr3	42029324	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=2.679e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:19,25:11,13:8,12
+chr3	43508943	.	T	TA	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.6009e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:12,6:7,6
+chr3	44033758	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018593;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,7:8,3:0,4
+chr3	45427825	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.039341;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:4,13:0,8:4,5
+chr3	47049323	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,2:3,1:4,1
+chr3	48056114	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.011836;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:61,9:36,3:25,6
+chr3	48074676	.	T	TTG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.01494;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,8:9,3:3,5
+chr3	49202495	.	TTGTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.056741;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,7:7,2:5,5
+chr3	49243757	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:6,3:8,1
+chr3	50010900	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,9:5,8:5,1
+chr3	51599746	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:3,2:2,1:1,1
+chr3	52832750	.	GT	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.046922;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:11,4:10,3
+chr3	53898962	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.03685;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:5,3:8,3
+chr3	54554870	.	CTTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.010266;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:9,8:4,3
+chr3	55388459	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,6:7,1
+chr3	55876778	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.8531e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:13,10:7,9
+chr3	61172717	.	TCTAAAATTCACTGACACTGGAGCTTAAATCCACGTGCCTAGAATGCTC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037638;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:7,3:9,6
+chr3	61748425	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.016027;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:21,2:26,5
+chr3	62819407	.	C	CGT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0081996;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,10:14,6:5,4
+chr3	63245680	.	TGAGA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:5,3:7,2
+chr3	63314068	.	CATAT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:0,4:0,2:0,2
+chr3	65023977	.	T	TA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.018634;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,2:2,3
+chr3	65109719	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.036993;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:16,2:15,5
+chr3	65957520	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.029588;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,10:9,9:3,1
+chr3	67197014	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.073242;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:21,3:25,3
+chr3	67782428	.	T	TTTTTTTG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:0,4:8,2
+chr3	68084950	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=8.7132e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:13,8:10,10
+chr3	68127751	.	CGGT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
+chr3	68193747	.	C	CA	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.513e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:11,6:12,7
+chr3	68479229	.	C	CAAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.014712;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:5,7:4,1
+chr3	68900083	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:9,7:4,3:5,4
+chr3	71343554	.	A	ATTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,11:4,8:1,3
+chr3	72183638	.	CA	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.017354;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:17,7:7,7
+chr3	72183640	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0256;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:17,7:13,5
+chr3	75146049	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.044901;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:7,2:11,3
+chr3	75637216	.	A	G	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.025503;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:115,17:50,8:65,9
+chr3	75645127	.	G	C	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.0146;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:66,21:34,12:32,9
+chr3	76910745	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.014569;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:1,6:0,2:1,4
+chr3	76962638	.	C	CAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.029259;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,7:16,6:3,1
+chr3	76977752	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.2353e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:14,11:13,5
+chr3	77126782	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,4:2,1
+chr3	77132923	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.6189e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:13,11:8,7
+chr3	79226543	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0024454;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:9,6:6,5
+chr3	79848847	.	TCC	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10606;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:1,1:2,3
+chr3	81082161	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00020455;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:11,4:15,7
+chr3	81990993	.	T	TG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:3,3:7,3
+chr3	83025863	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=4.4433e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:8,9:14,11
+chr3	86171357	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:10,6:3,1
+chr3	88540939	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:38:0,2:0,2:0,0
+chr3	89415467	.	A	AATATATATATATATAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,6:7,2:8,4
+chr3	89540948	.	GT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.01458;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,5:6,4
+chr3	90172561	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0015434;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:4,5:14,8
+chr3	90789318	.	C	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.0053729;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:49,13:10,9:39,4
+chr3	90789415	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.25039;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:1,2:26,1
+chr3	90793448	.	A	T	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.043644;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:33,6:26,3
+chr3	90835792	.	C	T	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.0015408;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:88,22:80,21:8,1
+chr3	90836180	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.07265;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:19,2:12,2
+chr3	90888861	.	T	C	0	PASS	DP=598;GPV=1;SPV=0.028125;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:315:280,35:4,1:276,34
+chr3	90900911	.	A	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.2364;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:12,1:9,4
+chr3	90938510	.	A	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.017081;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:48,10:35,4:13,6
+chr3	90951588	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:12,6:1,0
+chr3	90992803	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.034293;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:28,4:9,8
+chr3	91000939	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.080441;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,1:15,4
+chr3	91007033	.	G	C	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.041014;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:66,8:53,6:13,2
+chr3	91074842	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.035048;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:4,1:19,5
+chr3	91094421	.	C	G	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.035994;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:56,7:33,2:23,5
+chr3	91094508	.	G	A	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.016038;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:62,9:21,7:41,2
+chr3	91141286	.	C	G	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.037488;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:86,14:51,8:35,6
+chr3	91146787	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:3,2:3,1
+chr3	91165899	.	G	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:7,3:10,2
+chr3	91165902	.	GA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:6,3:10,4
+chr3	91195210	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
+chr3	91226160	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr3	91283652	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.026247;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:3,10:26,3
+chr3	91557056	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.036466;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:21,4:4,2
+chr3	91740664	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,4:4,1
+chr3	91764104	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:1,1:15,5
+chr3	91876564	.	A	T	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.037726;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:58,15:11,2:47,13
+chr3	91933099	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.034293;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:18,2:19,10
+chr3	92303938	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
+chr3	92777906	.	A	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.039121;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:74,9:38,7:36,2
+chr3	93117036	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.019617;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:27,4:8,4
+chr3	93342330	.	A	T	0	PASS	DP=177;GPV=1;SPV=0.031855;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:76,10:58,9:18,1
+chr3	93647998	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.01904;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:7,3:28,7
+chr3	93925821	.	T	TA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0042621;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:6,6:8,5
+chr3	94553985	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,3:13,1
+chr3	94628188	.	T	TCTTC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0058824;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:0,13:0,2:0,11
+chr3	95317090	.	T	TGAGAGAGA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0089185;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,10:11,8:7,2
+chr3	96004721	.	AT	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,8:15,5:5,3
+chr3	96004740	.	T	TAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.20188;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,4:14,2:12,2
+chr3	96114203	.	TAA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.015259;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:16,6:9,6
+chr3	96580477	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:9,4:5,1
+chr3	97451743	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00018662;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:13,6:10,5
+chr3	98074420	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,5:3,3
+chr3	99696976	.	AT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,4:15,2:3,2
+chr3	101843020	.	TA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:15,3:3,2
+chr3	103756573	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.9336e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:11,10:10,8
+chr3	104653635	.	GTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.045954;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,10:7,5:10,5
+chr3	106707369	.	T	TA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.031077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,2:12,3
+chr3	107196510	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,4:0,1:5,3
+chr3	108955590	.	TAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,4:5,1
+chr3	109137637	.	G	GTGTGTATATATATATATATA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:1,1:3,3
+chr3	109333349	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:8,6:1,2
+chr3	109421529	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:16,1:1,3
+chr3	109529342	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.24135;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:15,1:13,3
+chr3	109552628	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.049781;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:15,9:5,1
+chr3	111149459	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1182;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,6:16,4:4,2
+chr3	113260686	.	AC	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.065833;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:9,4:12,2
+chr3	113504571	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,6:5,1
+chr3	113843049	.	G	GT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,5:4,1
+chr3	113849994	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.042976;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:7,5:18,11
+chr3	114426337	.	CAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0063246;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,8:4,5:1,3
+chr3	116086758	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.5592e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:22,21:4,9:18,12
+chr3	117163885	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,4:5,2:6,2
+chr3	118133474	.	GAAAAAGAA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.14555;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,4:21,2:4,2
+chr3	118917790	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.059869;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:18,4:24,1
+chr3	119837945	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:4,2:3,1:1,1
+chr3	120201184	.	G	GTTTTTTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,3:4,2
+chr3	120649139	.	CTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.035343;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:11,2:5,3
+chr3	121395164	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=4.9772e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:12,9:9,9
+chr3	122281880	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.16358;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:22,4:12,2:10,2
+chr3	122346941	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1671;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:10,4:8,1
+chr3	122773303	.	GTT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0023953;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,9:7,8:3,1
+chr3	124347274	.	C	CTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.050669;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,7:9,2:6,5
+chr3	125215920	.	GTT	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:4,3:3,1
+chr3	125897872	.	C	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.0095826;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:22,2:19,4
+chr3	126086407	.	T	TG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:1,6:8,3
+chr3	126086417	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:2,10:7,2
+chr3	126333527	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.041993;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:17,6:10,2
+chr3	126949585	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12446;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:14,2:14,3
+chr3	128600310	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0096036;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:8,8:5,4
+chr3	128639455	.	G	GA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:6,3:4,1
+chr3	129094505	.	C	CT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:2,1:3,1
+chr3	129400120	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.01971;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,8:9,7:1,1
+chr3	130566811	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.1797e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,23:12,11:9,12
+chr3	130680060	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043327;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:9,8:5,3
+chr3	131653446	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.1423e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:12,10:10,9
+chr3	131717874	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,5:6,2:11,3
+chr3	131953239	.	TAA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.1287e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:11,17:8,12:3,5
+chr3	132052774	.	A	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.02327;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:22,7:15,7
+chr3	132812112	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,8:5,1
+chr3	134090006	.	G	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=6.3104e-11;SS=2;SSC=101;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:27,33:14,15:13,18
+chr3	134204596	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:14,3:12,1
+chr3	134204597	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.06964;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,3:11,1
+chr3	134249918	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.077483;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,5:9,4:18,1
+chr3	134399017	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,1:15,4
+chr3	135099322	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.10359;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,4:17,1:12,3
+chr3	135599612	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:5,3:1,1
+chr3	135814821	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.070897;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,5:11,4:9,1
+chr3	136041250	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0019499;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:9,3:10,7
+chr3	136061920	.	CTA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024928;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:12,6:3,3
+chr3	136290671	.	G	GTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:4,2:6,2
+chr3	136447596	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:10,5:1,2
+chr3	138051047	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10954;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:19,4:14,1
+chr3	138154119	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.065012;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:10,2:11,2
+chr3	138815162	.	A	AATAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,9:10,4:2,5
+chr3	139257745	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=8.8092e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:6,7:15,5
+chr3	140251584	.	G	GTTCCTTTCCT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0023885;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,11:5,4:6,7
+chr3	140367515	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:7,4:4,3:3,1
+chr3	141421278	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:10,4:2,2
+chr3	141973093	.	G	GTA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.017005;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,12:14,7:8,5
+chr3	142391750	.	ATAT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,4:9,2:7,2
+chr3	143071596	.	G	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=4.8163e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:26,26:14,10:12,16
+chr3	143748692	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0033344;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:7,7:1,3
+chr3	144825127	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.034961;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:15,8:3,3
+chr3	145425313	.	A	ATTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,1:5,3
+chr3	146337911	.	G	GAAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:12,14:9,11:3,3
+chr3	146797543	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.0121e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,23:8,15:8,8
+chr3	146952504	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.10966;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:21,3:5,1
+chr3	147156572	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01494;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,7:2,1
+chr3	148892856	.	T	TAGTCCCGGCTACTTGGGAGGCTG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.022983;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,11:7,5:10,6
+chr3	148964030	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.064935;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,2:4,1:0,1
+chr3	149380455	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.035909;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:25,4:8,2
+chr3	149625100	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:4,5:7,2
+chr3	149696112	.	C	CAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016771;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,9:8,8:3,1
+chr3	150028648	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.025979;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:17,3:13,3
+chr3	150428595	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:4,3:3,1:1,2
+chr3	151198345	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.077637;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:19,3:23,2
+chr3	151423014	.	A	AATAT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0018554;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,13:8,10:8,3
+chr3	152880189	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.001166;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:10,5:20,8
+chr3	153175616	.	G	GT	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.9143e-06;SS=2;SSC=55;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:11,10:13,6
+chr3	154099718	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:9,9:4,1
+chr3	155119742	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1672;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:22,2:11,2
+chr3	155125444	.	CT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.021468;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:9,4:11,6
+chr3	156982909	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.22668;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,6:5,4:13,2
+chr3	158330838	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.4608e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:10,7:6,8
+chr3	159553967	.	CGT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.014604;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,9:6,6:8,3
+chr3	160008042	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.056741;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:10,5:2,3
+chr3	160018031	.	A	AAG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.19205;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,5:8,3:7,2
+chr3	161300205	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.012432;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:14,8:6,4
+chr3	161841078	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,5:9,2:12,3
+chr3	161969282	.	AT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.022687;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,11:10,8:10,3
+chr3	163502251	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:5,9:1,7:4,2
+chr3	163945200	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0012277;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:13,7:10,3
+chr3	164574495	.	AT	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.6008e-06;SS=2;SSC=57;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:11,9:14,11
+chr3	165422609	.	ATATATATACATGTATATATATACATGTATATATACTG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,3:7,1
+chr3	165488881	.	G	GTT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:4,1:0,1
+chr3	166231536	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0003763;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:8,7:17,5
+chr3	166826852	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0003327;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:8,10:7,2
+chr3	167726114	.	GTTT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038682;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,17:15,9:5,8
+chr3	168037064	.	A	ATCTATGAATGCCCATTCATAGATGGGCATTTGT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.094604;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,7:23,4:23,3
+chr3	168515447	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.5475e-10;SS=2;SSC=98;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:18,37:7,13:11,24
+chr3	169663474	.	GTCTCTCTCTCTCTC	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0088119;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:14,12:7,8:7,4
+chr3	170126525	.	TA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.23136;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:14,1:22,3
+chr3	171145090	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.083322;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:25,2:18,5
+chr3	171562723	.	CCTTCTTCTTCTTCTT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.3532;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,6:5,5:18,1
+chr3	171599827	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0048942;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,6:5,1
+chr3	171866586	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.21886;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,5:7,2:7,3
+chr3	172229084	.	AAC	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0072008;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:21,17:17,12:4,5
+chr3	172701449	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10315;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:11,4:16,2
+chr3	174066516	.	G	GTC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.20188;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,4:21,3:5,1
+chr3	174234985	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:9,3:6,2
+chr3	174816415	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.14555;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,4:14,2:11,2
+chr3	174989937	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00021276;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:15,11:20,3
+chr3	175013099	.	T	TATGTA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,14:4,4:7,10
+chr3	175013145	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0050131;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,1:6,8
+chr3	175173321	.	T	TA	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.010542;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:17,11:17,8:0,3
+chr3	176627669	.	AAG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.032319;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:15,7:8,3
+chr3	176844403	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00081261;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:7,6:3,9
+chr3	177248298	.	GC	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.25496;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:0,0:27,4
+chr3	179120075	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=3.9119e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:30,31:21,15:9,16
+chr3	179359596	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.017612;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:7,5:7,3
+chr3	179457921	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.075976;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:22,4:21,1
+chr3	179836955	.	T	TG	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.00032758;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:46,15:22,8:24,7
+chr3	179836957	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=4.9433e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:43,19:20,10:23,9
+chr3	180010225	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00047641;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,18:13,8:14,10
+chr3	180062134	.	C	CTGTGTGTG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,11:8,7:7,4
+chr3	180695723	.	T	TA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.098102;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:18,1:23,5
+chr3	180695725	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.055212;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:18,1:21,6
+chr3	181150490	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.075107;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:20,5:23,2
+chr3	181787646	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.049356;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:12,2:9,7
+chr3	181984974	.	TTCTTTCTC	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.019606;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:23,17:8,7:15,10
+chr3	182099491	.	C	CAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0779;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:11,5:6,3
+chr3	182263268	.	G	GAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.23571;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,4:21,3:11,1
+chr3	182338370	.	A	AT	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=1.167e-05;SS=2;SSC=49;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:45,23:27,15:18,8
+chr3	182495384	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.00010432;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:56,28:23,15:33,13
+chr3	183608422	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.15023;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:23,5:22,1
+chr3	184067796	.	T	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.00038454;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:62,18:33,10:29,8
+chr3	185256601	.	T	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=1.6584e-12;SS=2;SSC=117;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:24,35:11,17:13,18
+chr3	185522636	.	G	GAGAGAAAGAA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.079204;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,6:22,5:5,1
+chr3	185522654	.	G	GA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:15,7:12,5:3,2
+chr3	186353690	.	ATATCTATATCTATAT	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.032726;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:22,4:8,9
+chr3	186353705	.	T	TCTA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:21,4:16,2:5,2
+chr3	186597603	.	TTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0034102;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,20:5,4:19,16
+chr3	186836730	.	GT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.029368;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:11,6:5,1
+chr3	186868037	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.026248;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,8:6,7:2,1
+chr3	187402484	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.047306;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,11:17,8:7,3
+chr3	187411083	.	G	A	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=7.827e-09;SS=2;SSC=81;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:29,36:17,22:12,14
+chr3	187845993	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,2:0,0:5,2
+chr3	190244160	.	C	CA	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.020615;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,11:21,7:18,4
+chr3	190729296	.	A	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=1.6289e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:46,21:18,11:28,10
+chr3	191661498	.	TA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0074524;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,12:6,8:6,4
+chr3	192378026	.	T	TTTCTCTCTC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0069124;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,10:1,3:13,7
+chr3	193706986	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0053523;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,8:7,5:5,3
+chr3	194752055	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.013927;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,14:12,9:12,5
+chr3	195487344	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.050324;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:32,6:11,1
+chr3	195487359	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.12651;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:31,4:9,1
+chr3	195489448	.	T	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.033858;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:62,8:29,1:33,7
+chr3	195489724	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0172;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:12,6:19,9
+chr3	195498073	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.036993;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:13,4:18,3
+chr3	195505012	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.090326;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,5:18,1:26,4
+chr3	195598434	.	C	CTGTGTG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.03159;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,9:7,3:10,6
+chr3	195631851	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.26692;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,2:5,2
+chr3	195657804	.	G	C	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.026777;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:48,9:24,5:24,4
+chr3	195677199	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0034858;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:11,7:10,11
+chr3	195680645	.	A	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.02191;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:18,8:15,1
+chr3	195682065	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.020173;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:50,11:31,4:19,7
+chr3	195775470	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13206;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:0,3:20,4
+chr3	195783015	.	G	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12909;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:17,4:14,2
+chr3	195788323	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.057459;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:20,7:14,6
+chr3	195872007	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.01451;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:26,5:15,7
+chr3	195872008	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.012454;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,11:23,5:10,6
+chr3	195913045	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:7,5:4,2:3,3
+chr3	195969825	.	T	C	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.0048554;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:58,22:25,17:33,5
+chr3	196006432	.	T	C	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.04515;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:58,13:35,3:23,10
+chr3	196337050	.	TC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.39982;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:15,1:11,2
+chr3	196531298	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.18393;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:2,0:24,4
+chr3	196768484	.	T	TTATG	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00031868;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:38,21:18,12:20,9
+chr3	196973207	.	T	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.11021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:46,8:26,4:20,4
+chr3	197384162	.	C	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.001321;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:72,19:27,12:45,7
+chr3	197623199	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.12257;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:16,4:14,2
+chr3	197897937	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.094543;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:20,4:21,3
+chr4	36988	.	C	T	0	PASS	DP=346;GPV=1;SPV=0.035617;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:156,25:84,13:72,12
+chr4	679239	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016027;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:17,5:9,4
+chr4	1350766	.	T	TA	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0020039;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,15:9,10:12,5
+chr4	1590955	.	CAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.021053;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,3:3,1
+chr4	1687805	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0068111;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,7:1,6:4,1
+chr4	1951443	.	TACACACACACACACACAC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.018839;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,8:9,6:6,2
+chr4	1951462	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.015939;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:13,6:3,1
+chr4	2728896	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0041535;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:6,7:3,1
+chr4	3310033	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.19941;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:9,2:18,5
+chr4	3673057	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.9248e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,16:13,7:16,9
+chr4	4266332	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.2558e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:11,11:17,8
+chr4	4581663	.	C	CA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:5,3:0,1
+chr4	5053994	.	A	AATAAATAAATAAATAAATAAAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.013256;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:14,7:7,2
+chr4	5358700	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.010572;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:6,6:5,3:1,3
+chr4	5602291	.	T	TA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,3:7,2
+chr4	6043111	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.0279e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:8,10:14,7
+chr4	6353413	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr4	6570167	.	GAA	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0053947;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:18,6:4,3
+chr4	6742478	.	AAACG	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.085385;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,1:18,3
+chr4	6742485	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.11618;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,1:17,3
+chr4	6947661	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.031844;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,9:13,4:7,5
+chr4	7175997	.	GTTT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.064151;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,2:7,4
+chr4	7178846	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0050388;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,6:3,3
+chr4	7373478	.	ATTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.24265;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:4,4:4,2
+chr4	7803190	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.4682e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,20:12,12:7,8
+chr4	7900336	.	TAGCACATTTAGCATTTAGCACATTTAG	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.04524;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:14,2:11,9
+chr4	8608649	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0065243;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:13,4:8,7
+chr4	8632069	.	G	A	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.0064202;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:80,22:47,5:33,17
+chr4	8657494	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=8.9472e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:11,7:12,13
+chr4	8765599	.	C	CAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.039878;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,10:11,9:14,1
+chr4	8829432	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.6364e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:27,21:16,11:11,10
+chr4	9038283	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=6.1538e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:10,5:12,15
+chr4	9272438	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:0,0:26,4
+chr4	9416977	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:3,4:4,1
+chr4	11662604	.	GA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00049102;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:5,8:16,5
+chr4	12327953	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.011e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:14,11:12,11
+chr4	12913820	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=9.0328e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:14,12:12,8
+chr4	14731562	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,6:2,5:3,1
+chr4	15471628	.	C	CA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.2848e-08;SS=2;SSC=78;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:3,20:3,17:0,3
+chr4	16522285	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.032545;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:17,5:13,5
+chr4	16919903	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTATATATA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.097509;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,5:13,2:6,3
+chr4	17696814	.	A	AAATG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0051175;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:9,2:15,10
+chr4	17751306	.	CAA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:11,6:5,2
+chr4	17751823	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.30409;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,4:10,1:2,3
+chr4	18534789	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,3:4,7
+chr4	18764359	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:0,1:1,1
+chr4	18883082	.	G	GTATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:4,5:2,1
+chr4	19400971	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.041455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,1:13,3
+chr4	19541224	.	G	GTA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0040779;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,10:11,7:11,3
+chr4	25315712	.	GTT	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.032993;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,5:8,6
+chr4	26279785	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:6,3:0,4
+chr4	27253614	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.005919;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:18,3:11,6
+chr4	27348730	.	A	ATCTCTC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.065471;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:1,3:12,5
+chr4	31549953	.	A	ATTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0032809;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,6:3,2
+chr4	31784181	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00025582;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:10,6:5,4
+chr4	31967319	.	C	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.056718;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:8,2:11,3
+chr4	32399582	.	TATATAC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,2:4,2
+chr4	32829767	.	A	ATTTATATATTAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:1,2:5,2
+chr4	33419054	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=9.4025e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:7,5:5,7
+chr4	34198775	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00046785;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,13:13,6:9,7
+chr4	34506607	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.6644e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,22:11,9:11,13
+chr4	36226988	.	G	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=2.4234e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:14,9:9,13
+chr4	36804353	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00025351;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:9,5:18,8
+chr4	37604776	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:25,3:10,1
+chr4	39187419	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021523;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,10:9,8:3,2
+chr4	39208303	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.044511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,13:10,9:3,4
+chr4	39693657	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:1,5:5,1
+chr4	40295271	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.11287;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:49,6:27,2:22,4
+chr4	40424981	.	A	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:1,2:1,2:0,0
+chr4	40900454	.	G	GT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0045922;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,14:10,10:7,4
+chr4	41625846	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00019536;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:12,6:5,4
+chr4	41900589	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.1624e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:11,7:11,9
+chr4	41963752	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.27368;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,3:5,1:6,2
+chr4	42096568	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17677;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:10,3:4,2
+chr4	43996437	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,2:7,2
+chr4	44868702	.	C	CTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
+chr4	45102348	.	G	GGAAAGAAAGAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.026299;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:15,3:2,3
+chr4	46439449	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.035509;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:6,7:10,3
+chr4	46853356	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0014413;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:20,7:9,8
+chr4	48651289	.	C	CTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:6,2:3,3
+chr4	48969828	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.7047e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:6,8:11,8
+chr4	49077969	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.6435e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:9,13:15,7
+chr4	49166427	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:17,2:15,2
+chr4	49168066	.	C	A	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.043396;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:106,16:59,12:47,4
+chr4	49186951	.	G	A	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.040226;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:69,12:35,4:34,8
+chr4	49186952	.	G	A	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.017173;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:72,12:34,4:38,8
+chr4	49191933	.	TTC	T	0	PASS	DP=292;GPV=1;SPV=0.048091;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:146,23:76,14:70,9
+chr4	49200136	.	A	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.028346;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:25,10:7,2
+chr4	49237985	.	T	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0067584;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:44,10:30,2:14,8
+chr4	49240739	.	AC	A	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.041341;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:138:110,17:67,10:43,7
+chr4	49261063	.	T	C	0	PASS	DP=380;GPV=1;SPV=0.032451;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:212:185,27:71,14:114,13
+chr4	49272511	.	T	A	0	PASS	DP=447;GPV=1;SPV=0.048344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:255:215,40:140,18:75,22
+chr4	49493061	.	A	AT	0	PASS	DP=607;GPV=1;SPV=0.043452;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:316:278,38:110,20:168,18
+chr4	49496659	.	A	G	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.042287;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:56,12:22,7:34,5
+chr4	49509541	.	A	T	0	PASS	DP=518;GPV=1;SPV=0.0062804;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:269:226,43:160,30:66,13
+chr4	49523914	.	G	C	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.027531;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:83,19:47,4:36,15
+chr4	49529857	.	C	T	0	PASS	DP=302;GPV=1;SPV=0.0063826;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:163,19:65,5:98,14
+chr4	49531294	.	C	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.041135;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:48,13:25,11:23,2
+chr4	49535901	.	T	G	0	PASS	DP=397;GPV=1;SPV=2.2475e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:220:167,53:87,27:80,26
+chr4	49555605	.	T	A	0	PASS	DP=262;GPV=1;SPV=0.006048;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:132,17:77,8:55,9
+chr4	49563245	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.010338;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:10,5:10,2
+chr4	49569166	.	T	C	0	PASS	DP=368;GPV=1;SPV=0.043105;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:200,23:108,13:92,10
+chr4	49570692	.	C	G	0	PASS	DP=187;GPV=1;SPV=0.014016;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:81,14:26,2:55,12
+chr4	49573600	.	C	T	0	PASS	DP=640;GPV=1;SPV=0.037546;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:376:325,51:174,32:151,19
+chr4	49575935	.	G	A	0	PASS	DP=617;GPV=1;SPV=0.0064767;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:349:290,59:141,27:149,32
+chr4	49579650	.	C	A	0	PASS	DP=374;GPV=1;SPV=0.022186;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:205:181,24:107,18:74,6
+chr4	49579667	.	T	C	0	PASS	DP=423;GPV=1;SPV=0.021503;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:231:207,24:120,18:87,6
+chr4	49616846	.	G	A	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.044458;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:67,11:43,8:24,3
+chr4	49628414	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.19313;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:9,3:20,1
+chr4	49643728	.	G	C	0	PASS	DP=591;GPV=1;SPV=0.045671;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:343:296,47:178,25:118,22
+chr4	49807936	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,4:7,2
+chr4	49851921	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023879;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,5:5,1
+chr4	50599090	.	T	G	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.029897;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:57,14:48,13:9,1
+chr4	50660768	.	T	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.038371;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:18,1:32,6
+chr4	50839265	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.071318;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:6,3:14,1
+chr4	50839266	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038416;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:7,4:14,1
+chr4	51247605	.	T	A	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.00038175;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:96,14:54,6:42,8
+chr4	51300765	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr4	51454069	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
+chr4	52465363	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.017846;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:12,4:5,6
+chr4	52820939	.	C	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.029435;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:10,3:30,2
+chr4	53254030	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=3.7005e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:6,8:13,8
+chr4	53857209	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0099003;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:18,8:10,1
+chr4	54458417	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.01291;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:10,3:8,8
+chr4	55510630	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.015123;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:12,12:7,6:5,6
+chr4	55565973	.	GTT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0023112;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:7,6:2,2
+chr4	56567442	.	GT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,5:4,4
+chr4	59160279	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:21,4:10,2:11,2
+chr4	59396458	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.6435e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:11,10:13,10
+chr4	59594998	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,6:7,1
+chr4	60337595	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0060382;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:10,8:2,3
+chr4	60595364	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.041509;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:6,5:11,5
+chr4	62219080	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.037815;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,3:12,2
+chr4	62980196	.	GA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00010467;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:11,10:3,2
+chr4	63096250	.	TGAGAGA	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:11,14:8,8:3,6
+chr4	63306618	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.2971e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:5,9:15,9
+chr4	64457238	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0001695;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:13,6:10,6
+chr4	64746293	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,2:3,1:2,1
+chr4	64888261	.	TAAAAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.013393;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:8,3:0,5
+chr4	65620108	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,7:7,6:8,1
+chr4	65640279	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0047357;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,12:11,4:12,8
+chr4	67336359	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.022078;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,6:7,5:11,1
+chr4	67584098	.	GAA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:11,4:2,3
+chr4	67590745	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.019045;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,4:5,3
+chr4	68115356	.	CAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,5:4,2
+chr4	68531882	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.017499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:6,5:2,3
+chr4	68796080	.	GA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.020314;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:17,7:1,1
+chr4	69223356	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=6.9241e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,21:11,13:12,8
+chr4	69584226	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:1,8:1,7:0,1
+chr4	69593977	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,4:14,2:9,2
+chr4	70363897	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=3.2034e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:14,9:15,10
+chr4	71011232	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:5,6:10,1
+chr4	71443116	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,4:6,2:6,2
+chr4	71812954	.	TA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.01548;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,11:1,8:3,3
+chr4	71867311	.	ATGTGTGTGTGTGTGTGTG	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:3,5:6,2
+chr4	73035627	.	C	CAAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.010538;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,10:1,8:6,2
+chr4	73378217	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.7348e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:7,9:10,7
+chr4	74782763	.	T	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.2489e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:28,23:15,9:13,14
+chr4	75098906	.	C	CTT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00055962;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:19,25:7,13:12,12
+chr4	75487692	.	CAT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,2:9,2
+chr4	75599548	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,7:3,1
+chr4	76552011	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.064336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:6,2:11,5
+chr4	76720151	.	GT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,3:4,1
+chr4	76756417	.	C	CT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.001437;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,11:11,5:14,6
+chr4	77559921	.	C	CAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.014733;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,11:11,9:5,2
+chr4	79009542	.	G	GTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:5,3:2,1
+chr4	80390934	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.041156;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,7:13,3:11,4
+chr4	80447132	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.039556;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:6,3:12,2
+chr4	82375523	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0010246;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,10:10,9:5,1
+chr4	82730585	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,8:4,7:4,1
+chr4	83020773	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0079526;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,10:10,8:1,2
+chr4	84894947	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0079921;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,11:8,7:5,4
+chr4	85643234	.	GTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:12,1:3,3
+chr4	87157514	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:1,3:1,2:0,1
+chr4	87306905	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,5:11,4:6,1
+chr4	89108575	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:12,1:16,3
+chr4	89600378	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=1.0522e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,18:1,8:6,10
+chr4	90870190	.	C	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.2773e-09;SS=2;SSC=88;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:22,25:10,17:12,8
+chr4	92131666	.	T	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,6:2,1:11,5
+chr4	97078479	.	CATATATAT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:5,4:1,1
+chr4	99237399	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,4:2,2
+chr4	99506397	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:2,1:20,4
+chr4	100648830	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=8.5814e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:7,10:14,8
+chr4	100702053	.	A	AC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,4:6,3:0,1
+chr4	101124725	.	GAGAAAGAA	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,7:10,6:1,1
+chr4	103329256	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.9835e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:38,21:19,11:19,10
+chr4	104745124	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=8.5538e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:15,13:7,4
+chr4	105756582	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.054281;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:19,6:6,1:13,5
+chr4	105898328	.	GTCTC	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,5:10,4:7,1
+chr4	106412538	.	TA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=3.4463e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:9,5:8,9
+chr4	107447368	.	G	GT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.019168;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,4:9,5
+chr4	107478346	.	T	TAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0033619;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,9:13,6:6,3
+chr4	108694191	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=8.8825e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:15,9:10,9
+chr4	108781537	.	A	ATTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:4,2:4,4
+chr4	109569497	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,3:4,5
+chr4	110884300	.	CAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.030702;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:1,1:2,3
+chr4	111127550	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.8683e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:30,27:16,11:14,16
+chr4	111253923	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:5,3:3,2
+chr4	113567168	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,4:5,3
+chr4	113605019	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=8.0013e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,22:9,9:9,13
+chr4	114754988	.	G	GT	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=6.8419e-08;SS=2;SSC=71;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:23,20:13,8:10,12
+chr4	114760198	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=7.4178e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,16:3,7:6,9
+chr4	118238155	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.042556;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,7:7,5:5,2
+chr4	118627860	.	T	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.041297;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:30,9:14,6
+chr4	118701183	.	G	GTT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.012614;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,10:13,5:8,5
+chr4	118712619	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.013751;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:14,7:3,4
+chr4	119260950	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,7:7,3:2,4
+chr4	119505921	.	TCTC	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.883e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:13,6:14,11
+chr4	120075462	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.6543e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:10,9:12,6
+chr4	122444130	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.074501;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:12,6:2,2
+chr4	124351183	.	C	CTTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:5,3:2,1
+chr4	125828134	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0053999;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:19,10:4,7
+chr4	127088245	.	T	TAAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.01828;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,6:4,2
+chr4	127288170	.	G	GACACACACAC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.045253;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,8:10,4:13,4
+chr4	127895565	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.017316;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:9,4:12,11
+chr4	128166930	.	TTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.022587;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:5,5:8,2
+chr4	128264482	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=1.662e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:29,25:12,11:17,14
+chr4	128616674	.	C	CAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:5,4:1,1
+chr4	130999757	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0066141;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:0,4:3,2
+chr4	131155329	.	C	CACACACACACACACACACACAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.092279;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,5:12,3:8,2
+chr4	131980985	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00021002;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:9,5:14,9
+chr4	133214730	.	CTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.20158;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,6:9,3:4,3
+chr4	134257697	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.026469;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:14,7:9,4:5,3
+chr4	135352112	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013612;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:14,3:5,7
+chr4	135539116	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0033813;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:12,6:3,2
+chr4	136752910	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00019465;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:14,6:12,10
+chr4	137904686	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=9.5082e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:11,7:12,11
+chr4	138368321	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=3.4968e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:7,5:13,14
+chr4	138582710	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.5042e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:9,11:14,7
+chr4	139114561	.	T	TCCAGTCTCACACACACACACA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.011519;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,12:13,4:8,8
+chr4	139579034	.	CTTTCTTT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,4:6,3:7,1
+chr4	140083969	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,2:1,1:1,1
+chr4	140083971	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,2:1,1:1,1
+chr4	140835726	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.17513;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:25,1:11,3
+chr4	140852408	.	TTTATTATTA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.011004;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:7,1:8,9
+chr4	141539521	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=3.777e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:4,10:6,5
+chr4	143109062	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018564;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,3:7,5
+chr4	143335243	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03733;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,6:4,4:1,2
+chr4	144323307	.	A	AATTTGAGGATAATATCCTCAAATAT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.043916;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,11:13,4:9,7
+chr4	144473366	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016244;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,10:13,6:4,4
+chr4	144681421	.	CTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,9:2,6:4,3
+chr4	146172129	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,4:6,2:11,2
+chr4	146286200	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.021517;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:16,6:13,3
+chr4	147358353	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.24893;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:9,3:15,1
+chr4	148457975	.	AT	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.4813e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,15:18,7:7,8
+chr4	148807689	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,4:12,3:1,1
+chr4	149331280	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,8:8,7:2,1
+chr4	150674297	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.6188e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:13,12:9,8
+chr4	154530741	.	TA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.059881;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:14,5:1,1
+chr4	157202962	.	CTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.092234;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:7,5:2,1
+chr4	157248567	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:2,1:2,1
+chr4	157248568	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:2,1:2,1
+chr4	157274921	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048897;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:16,3:3,4
+chr4	157486670	.	T	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.012653;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:26,3:15,5
+chr4	157486679	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.047685;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:25,3:15,2
+chr4	158529245	.	TTG	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016036;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:17,2:20,6
+chr4	158964157	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.055222;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,4:15,1:7,3
+chr4	162223330	.	C	CA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.004173;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,13:21,10:4,3
+chr4	164514816	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=8.0734e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:20,23:9,14:11,9
+chr4	164873353	.	AG	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:4,1:0,1
+chr4	166195617	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=9.0569e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:14,9:10,10
+chr4	166665288	.	A	AT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.05062;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:14,2:7,2
+chr4	166856811	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.053858;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:13,1:14,6
+chr4	166856812	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.053838;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:19,1:19,5
+chr4	168767542	.	A	AT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0087537;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:8,9:12,5
+chr4	168971437	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,2:2,1:3,1
+chr4	169428351	.	G	GATATATATATATATAT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.23453;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,4:12,3:13,1
+chr4	169720526	.	T	TTCTCTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.064412;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,8:11,4:14,4
+chr4	170478430	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.017818;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:12,3:6,4
+chr4	170478449	.	TAG	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.062683;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,1:6,4
+chr4	170478480	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:9,1:7,3
+chr4	170581068	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.020124;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,8:4,5:3,3
+chr4	170915196	.	A	AAG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,7:6,5:2,2
+chr4	173399546	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.079081;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:14,3:21,4
+chr4	174273323	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0041286;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,2:4,4
+chr4	174909366	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11497;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:16,3:16,4
+chr4	175680388	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0059953;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:16,4:12,4
+chr4	178559825	.	CAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,4:2,1
+chr4	180245137	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016081;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:7,3:14,4
+chr4	180818931	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:2,3:5,1
+chr4	181605480	.	GAGAAAGAAAGAAAGAA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,2:6,2
+chr4	181953298	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:12,7:6,5:6,2
+chr4	182030528	.	T	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.0729e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:19,10:11,7
+chr4	182098963	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0023306;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:6,1:1,5
+chr4	182220384	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.18182;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:3,2:2,1:1,1
+chr4	182456905	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=9.9016e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:17,21:8,10:9,11
+chr4	183045502	.	A	G	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=7.6151e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:36,20:18,9:18,11
+chr4	183198789	.	T	TAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:4,8:3,4
+chr4	183341967	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,2:4,4
+chr4	185216513	.	GT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01327;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,10:11,7:6,3
+chr4	185877871	.	AAAC	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.017166;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:9,4:10,3
+chr4	186446583	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.2952e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:11,6:17,9
+chr4	186475348	.	GAA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.073845;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:20,5:6,1
+chr4	186478438	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.12939;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:18,2:11,2
+chr4	186651039	.	TTTA	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.058259;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:17,4:14,1
+chr4	187055034	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.064462;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,3:16,1
+chr4	187630481	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=2.0618e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:13,9:9,9
+chr4	188780081	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0050575;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:8,5:0,1
+chr4	188936870	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.013649;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:10,3:11,5
+chr4	188974270	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1371;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,3:9,1:5,2
+chr4	189490834	.	C	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.20894;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:9,2:8,1
+chr4	189743894	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.080505;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,1:18,3
+chr4	189836362	.	ACACCAT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.16556;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,4:12,3:19,1
+chr4	189881455	.	A	C	0	PASS	DP=476;GPV=1;SPV=0.014385;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:299:254,45:98,23:156,22
+chr4	190025179	.	CAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,1:4,5
+chr4	190044812	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.031895;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:16,2:13,2
+chr4	190054909	.	CCTGTA	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.027384;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:11,5:10,3
+chr4	190095436	.	C	G	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.0085394;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:96,13:47,6:49,7
+chr4	190118950	.	G	A	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.0039489;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:74,11:32,5:42,6
+chr5	59933	.	TGTA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0052836;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,9:7,3:6,6
+chr5	328255	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:9,3:4,1
+chr5	436256	.	GAGGGACCCACCACCCCT	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.03948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:17,1:24,5
+chr5	608766	.	TGTGGGAGCGTGCGCTGGGATGGGGAGGGGTCACTGTGAGCACGGTGCGTC	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.024972;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:8,1:18,5
+chr5	629839	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,1:8,3
+chr5	629945	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,2:7,8
+chr5	710921	.	T	TGA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:3,1:9,4
+chr5	1042652	.	GTGAGTTAGTGAA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.35726;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,4:9,2:9,2
+chr5	2794836	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=8.3106e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:3,6:16,10
+chr5	2798125	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.1412e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,23:9,10:12,13
+chr5	2940178	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.2005e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:7,5:14,9
+chr5	3324107	.	T	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.044728;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:53,10:16,6:37,4
+chr5	3751219	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=8.063e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:10,8:8,8
+chr5	4009290	.	TGATA	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.10265;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:17,2:13,3
+chr5	4583580	.	C	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=1.3648e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:32,22:13,14:19,8
+chr5	5305111	.	CCACA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:6,3:7,1
+chr5	5305356	.	C	CAG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.16972;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:18,3:10,1
+chr5	5817171	.	TAGATAGATGATA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,4:12,3:8,1
+chr5	7016947	.	CA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.028009;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,8:7,6:3,2
+chr5	7112066	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.9746e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:31,18:17,8:14,10
+chr5	7989144	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=2.3827e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:16,11:10,6
+chr5	9704363	.	GA	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.4592e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:11,10:6,6
+chr5	9796721	.	GA	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00086785;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:9,11:5,9:4,2
+chr5	10758417	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0076062;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:13,7:10,7
+chr5	12333595	.	A	ATATATG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0050975;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,9:10,4:5,5
+chr5	12628150	.	T	TA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,5:4,4:2,1
+chr5	13347332	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.027067;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:15,9:3,2
+chr5	13379088	.	CAT	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.011905;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:35:0,6:0,2:0,4
+chr5	13422513	.	T	TA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17217;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:7,3:2,2
+chr5	14116340	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,2:4,2
+chr5	14793007	.	A	AAAAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.25926;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
+chr5	14975431	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018564;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,6:7,2
+chr5	15188580	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.1848e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,20:10,10:8,10
+chr5	15662852	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=8.4091e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:7,10:10,7
+chr5	15664469	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:5,3:10,2
+chr5	15942324	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018839;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:11,5:4,3
+chr5	16299826	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.6639e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:11,7:13,11
+chr5	16792110	.	TACAC	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.16556;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:21,3:10,1
+chr5	17137530	.	C	CT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00013176;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:7,8:15,9
+chr5	17583646	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
+chr5	17849095	.	CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,5:0,1:2,4
+chr5	17899698	.	TTATC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.057437;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:21,4:10,2
+chr5	17899720	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.070174;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:20,4:7,1
+chr5	18149172	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:38:0,2:0,0:0,2
+chr5	18507863	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.7295e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:22,21:8,12:14,9
+chr5	18976341	.	ATG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.065377;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:9,1:17,4
+chr5	20056680	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,11:6,10:0,1
+chr5	20271560	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.0865e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:8,8:12,8
+chr5	20757924	.	C	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.025831;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:21,3:22,6
+chr5	20881099	.	G	GTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0060573;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,2:1,5
+chr5	21489456	.	TA	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.04801;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:55,9:33,5:22,4
+chr5	22036158	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=3.5059e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:17,28:10,9:7,19
+chr5	23521237	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.7585e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:10,6:13,10
+chr5	23965892	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.9236e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:13,8:5,7
+chr5	24563597	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,9:5,8:1,1
+chr5	24651517	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=3.9467e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:11,12:14,8
+chr5	25020096	.	ATCCCTTAAAAAATGT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03735;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
+chr5	25235811	.	CAT	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.095104;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,2:17,2
+chr5	25576719	.	CCTTT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00019727;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,11:8,2:6,9
+chr5	26606116	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.1801e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:15,13:9,4
+chr5	26955604	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.15343;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:16,1:20,3
+chr5	27968898	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00751;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:7,5:11,9
+chr5	28251892	.	AAG	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:8,4:5,3:3,1
+chr5	28972704	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00058098;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:32,18:11,9:21,9
+chr5	29013269	.	G	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=2.6556e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,21:6,12:17,9
+chr5	29429312	.	G	GAAAAAAAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.013474;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,10:8,9:8,1
+chr5	29862401	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=1.1225e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:24,22:13,10:11,12
+chr5	30153936	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0005395;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:20,7:15,5
+chr5	30707695	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.074026;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:11,3:4,1
+chr5	31777926	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.19365;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:20,2:13,2
+chr5	32281899	.	C	CAA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.022955;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:11,8:9,4
+chr5	32499604	.	T	TTTCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.046405;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,8:19,3:11,5
+chr5	32551720	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.6375e-09;SS=2;SSC=81;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,18:10,10:3,8
+chr5	33097535	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=6.9536e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,20:18,9:9,11
+chr5	34087880	.	G	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.033526;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:26,6:20,3
+chr5	35014452	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.013867;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,8:6,7:3,1
+chr5	35433032	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=8.0199e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:9,10:8,5
+chr5	35824242	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.5343e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:9,8:15,8
+chr5	36322414	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0035678;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:10,7:8,9
+chr5	36738638	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13122;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:15,1:10,4
+chr5	38333916	.	GT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:5,3:3,2
+chr5	39781530	.	C	CAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00083905;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:4,14:3,12:1,2
+chr5	40023602	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,8:6,6:2,2
+chr5	42310527	.	CT	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:4,1:0,1
+chr5	42579128	.	TA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0432;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,1:11,3
+chr5	42650578	.	C	CATAT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00030514;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:11,18:7,11:4,7
+chr5	42739692	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0018511;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,9:1,4:0,5
+chr5	42900260	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=2.9862e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:18,24:2,14:16,10
+chr5	42902678	.	ATTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,6:5,1
+chr5	43198209	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.20154;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,6:3,4:23,2
+chr5	43560061	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.1439;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:13,2:15,2
+chr5	44060310	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=5.8369e-10;SS=2;SSC=92;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:18,23:12,11:6,12
+chr5	44451477	.	TTG	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
+chr5	45890883	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:19,3:9,1
+chr5	46582296	.	G	A	0	PASS	DP=246;GPV=1;SPV=0.027768;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:126,16:36,4:90,12
+chr5	46667716	.	G	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,3:8,1
+chr5	46672473	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:0,0:18,4
+chr5	46721513	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.092709;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:4,3:28,1
+chr5	46746519	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,7:2,1
+chr5	47115870	.	C	A	0	PASS	DP=248;GPV=1;SPV=0.033326;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:110,19:39,14:71,5
+chr5	47119711	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.017792;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:50,9:22,6:28,3
+chr5	47143865	.	C	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.017331;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:48,15:37,11:11,4
+chr5	47210350	.	T	A	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.008825;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:74,20:55,11:19,9
+chr5	47210473	.	T	A	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.031909;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:92,21:42,4:50,17
+chr5	49661142	.	C	T	0	PASS	DP=337;GPV=1;SPV=0.016263;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:159,37:77,19:82,18
+chr5	50621975	.	A	AAAAGAAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,10:12,9:4,1
+chr5	50905586	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=1.6642e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:31,23:19,15:12,8
+chr5	50913028	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.0101e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:6,8:10,7
+chr5	51991814	.	T	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.0109e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:20,22:11,5:9,17
+chr5	54092047	.	A	AACACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.022251;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:9,6:10,2
+chr5	54549504	.	A	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=2.9279e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:10,9:14,7
+chr5	54925925	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:2,6:1,2
+chr5	55372892	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,10:5,9:4,1
+chr5	56173541	.	CCTCT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0069996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,7:1,4:5,3
+chr5	57138557	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.094639;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:7,2:10,3
+chr5	59806844	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=5.5655e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:25,24:10,8:15,16
+chr5	61942589	.	A	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,3:0,3:0,0
+chr5	62236304	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.041472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:15,3:18,2
+chr5	62248035	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.022833;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:18,1:19,7
+chr5	64937921	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.062192;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,4:6,2
+chr5	65707395	.	T	TAC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.03548;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,8:17,4:9,4
+chr5	67049035	.	A	ACACG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,3:13,1
+chr5	67339629	.	C	CCTTTCTTCCTTCCTTCTTTCCTTCCTTCCTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,7:5,3:9,4
+chr5	68237131	.	C	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=1.5429e-09;SS=2;SSC=88;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:24,25:11,18:13,7
+chr5	68240687	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.6883e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:7,8:14,10
+chr5	69377612	.	TAC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:11,3:9,1
+chr5	69515608	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13122;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,1:13,4
+chr5	69610330	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.20823;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:22,3:13,1
+chr5	69906805	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
+chr5	70503142	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.15614;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:0,0:28,4
+chr5	70678178	.	G	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.046569;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:74,13:34,9:40,4
+chr5	70755720	.	C	CACAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
+chr5	72130276	.	T	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=5.6452e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:28,25:12,14:16,11
+chr5	72522028	.	TTATATA	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,2:3,2
+chr5	74111166	.	A	AAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,2:3,4
+chr5	74702067	.	CTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:4,3:3,2
+chr5	75200297	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:5,6:8,3
+chr5	76503174	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,5:2,2:4,3
+chr5	77945005	.	A	AG	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.051974;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:16,3:17,2
+chr5	77948482	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.039653;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:8,5:6,1
+chr5	78455041	.	AT	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.052957;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:44,7:18,2:26,5
+chr5	78455090	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.044064;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:13,2:24,5
+chr5	78749499	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:1,2:0,0:1,2
+chr5	78753391	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.10395;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,1:15,3
+chr5	78848273	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:2,1:3,7
+chr5	79138859	.	T	TTATATATATA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0016175;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,11:9,7:13,4
+chr5	79456145	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,9:3,6:0,3
+chr5	79606106	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.032529;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:18,6:2,2
+chr5	79782528	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.032095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,2:7,4
+chr5	79842655	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.467e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,19:11,11:21,8
+chr5	80388623	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010143;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,14:4,11:4,3
+chr5	80602612	.	G	GATATAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.013474;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:11,8:5,2
+chr5	80654917	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.10395;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:14,3:19,1
+chr5	81296613	.	C	CTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,4:5,1
+chr5	82059664	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.042579;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:18,3:18,4
+chr5	82592361	.	TCCTCC	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:3,3:12,1
+chr5	83550887	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,5:4,1
+chr5	83854054	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:6,3:1,2
+chr5	84160742	.	TTTCTTTCCTTTCC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:4,3:5,3
+chr5	84340548	.	A	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,2:4,1:3,1
+chr5	84800768	.	A	AGAAGGAAGGAAG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:14,3:1,1
+chr5	85167738	.	GGTTT	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:5,5:0,1
+chr5	86206231	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.024795;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:7,2:7,2
+chr5	86348377	.	T	TA	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.043401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:15,5:17,1
+chr5	88079405	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.03619;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:14,3:20,4
+chr5	88215877	.	T	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=7.5915e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:29,22:17,11:12,11
+chr5	88702983	.	T	TAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018961;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:16,6:1,2
+chr5	89568337	.	ATT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,5:3,2
+chr5	90114719	.	AAT	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0031357;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:13,8:10,9
+chr5	90281470	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=8.5986e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:14,20:9,12:5,8
+chr5	91014136	.	C	CCACACACACACACACA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.12566;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,6:10,5:6,1
+chr5	91179947	.	A	AG	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:7,3:1,4
+chr5	92113985	.	GTATATATA	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,4:2,2:2,2
+chr5	92346045	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,2:6,1:0,1
+chr5	92717487	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,1:10,3
+chr5	93040928	.	CTT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.10283;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,7:11,4:6,3
+chr5	93080862	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,4:3,2
+chr5	93123893	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.6554e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:9,12:13,6
+chr5	93793239	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,3:4,3
+chr5	95134992	.	CAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:10,4:0,0
+chr5	95326965	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,3:7,1
+chr5	96579179	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.4707e-10;SS=2;SSC=98;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:16,26:8,12:8,14
+chr5	96648728	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.019526;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:20,7:13,2
+chr5	97614899	.	CAG	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056191;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,3:5,4
+chr5	98103764	.	T	C	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=2.915e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:32,31:12,13:20,18
+chr5	99470884	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.053387;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:16,3:13,1
+chr5	99523793	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.020202;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:19,7:13,2
+chr5	99535107	.	C	CTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.017445;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:2,5:8,1
+chr5	100006299	.	TA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00018181;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:3,5:4,7
+chr5	103754429	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,8:0,6:4,2
+chr5	105144833	.	AT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,1:1,3
+chr5	105331051	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.3543e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:9,9:8,10
+chr5	105366838	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
+chr5	106254272	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=7.0453e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:5,6:11,4
+chr5	107013991	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029515;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:4,5:3,2
+chr5	107097634	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016427;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,3:6,7
+chr5	107435315	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,4:3,3:3,1
+chr5	107766518	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,10:2,7:4,3
+chr5	110102154	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00046953;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:31,16:20,6:11,10
+chr5	111410285	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.9448e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:10,8:7,4
+chr5	111413801	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.0268e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:11,9:9,10
+chr5	113333838	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
+chr5	113776664	.	G	GA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.014951;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:10,9:14,7
+chr5	115725800	.	C	CT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.9869e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:15,10:6,6
+chr5	117993358	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.01943;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:14,4:17,8
+chr5	118087859	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00012866;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:15,8:9,8
+chr5	118438416	.	A	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17119;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:7,1:13,5
+chr5	119880334	.	C	CAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.086635;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:16,2:8,3
+chr5	120737307	.	GTTTTTTT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.062714;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,6:7,5:5,1
+chr5	120829860	.	CTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:6,3:5,1
+chr5	122329262	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.002076;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:11,3:7,5
+chr5	123053488	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,2:0,0:4,2
+chr5	124559310	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0080824;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:10,10:8,3
+chr5	125130486	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:1,2:0,1:1,1
+chr5	126163846	.	CAT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17217;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:2,1:7,4
+chr5	126481221	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:7,2:10,2
+chr5	126536120	.	CAA	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11839;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:24,2:9,2
+chr5	126688340	.	G	GT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.31269;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:14,5:6,1
+chr5	126973879	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0082825;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,4:5,4
+chr5	127119095	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045968;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,6:12,4:4,2
+chr5	131523279	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,7:5,1
+chr5	131820074	.	C	CT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.025884;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:13,9:7,4
+chr5	137076608	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:5,3:4,1:1,2
+chr5	138756027	.	CTTAT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.011669;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:14,6:11,6
+chr5	140052681	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=1.0101e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:6,9:10,6
+chr5	140636480	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00046416;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,20:10,10:11,10
+chr5	142075636	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:2,2:10,2
+chr5	143254319	.	C	CAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:13,3:1,1
+chr5	144590836	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=6.0795e-10;SS=2;SSC=92;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:21,26:11,11:10,15
+chr5	146496869	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.051469;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:14,6:3,1
+chr5	146509492	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00011224;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:4,5:9,4
+chr5	146580713	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.12392;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,2:17,2
+chr5	148588529	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,1:5,3
+chr5	149354836	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,4:5,1
+chr5	149784560	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:6,4:2,2
+chr5	150463069	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,3:3,1
+chr5	150493168	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:6,2:2,2
+chr5	152277161	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=8.5814e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:10,7:11,11
+chr5	152847763	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0019458;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:13,8:14,2
+chr5	153163069	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=8.605e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,17:8,8:8,9
+chr5	154003178	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.015873;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,4:5,4
+chr5	154064160	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,6:3,1
+chr5	155443463	.	C	CTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.036581;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:10,3:12,8
+chr5	156009081	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=1.6252e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:10,6:17,13
+chr5	158226194	.	ATATATATATATATATATTTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:3,6:3,4
+chr5	160092013	.	G	GATATATATATATATAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,8:3,4:1,4
+chr5	160233880	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,4:6,2:11,2
+chr5	162160353	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.9315e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:27,22:9,12:18,10
+chr5	163131669	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:5,4:4,5
+chr5	163143077	.	C	CTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,5:3,4:3,1
+chr5	164790169	.	GTA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:7,13:3,7:4,6
+chr5	166418120	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=5.9527e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:13,10:10,12
+chr5	166892730	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.006192;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:3,4:1,1
+chr5	167597162	.	TTTC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00057702;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:8,8:8,3
+chr5	168777109	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.014656;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,8:6,2:7,6
+chr5	170316063	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0055835;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,12:1,4:4,8
+chr5	170860295	.	TAA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:12,2:2,3
+chr5	171415713	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0070393;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,10:4,7:5,3
+chr5	172348653	.	TC	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.025658;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,6:9,5:9,1
+chr5	172978676	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.064743;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:20,1:4,3
+chr5	173166560	.	GATATATATAT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,8:7,4:1,4
+chr5	173302768	.	A	AGT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0016605;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:13,2:12,6
+chr5	173622113	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0070885;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,4:3,3
+chr5	174272340	.	T	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.8504e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:27,24:16,13:11,11
+chr5	174426387	.	G	GCTCGCTCACTCA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.010954;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,12:15,9:11,3
+chr5	174837994	.	A	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.9011e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:30,28:23,13:7,15
+chr5	175313714	.	CCTCT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,3:3,2
+chr5	175650718	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.074196;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:14,1:27,4
+chr5	175650720	.	TC	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.073933;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:11,1:27,4
+chr5	175958254	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0025282;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:13,2:15,6
+chr5	176048461	.	A	AG	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.008914;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:22,9:14,3
+chr5	177480969	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,10:6,3:5,7
+chr5	177672070	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.028928;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:19,6:12,1
+chr5	177749020	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.21475;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,3:8,1
+chr5	177767877	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.26573;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,3:10,1
+chr5	177885544	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.011208;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:5,6:8,2
+chr5	177920547	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:6,8:4,2
+chr5	177988854	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.16401;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,3:8,1:13,2
+chr5	178025459	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.03318;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:16,5:14,7
+chr5	179004688	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.051469;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:12,5:5,2
+chr5	179376012	.	A	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr5	179479049	.	CTTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,8:10,3:5,5
+chr5	179642093	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0076491;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:11,9:17,5
+chr5	179674561	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,3:5,1
+chr5	180015736	.	GA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.37843;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,4:19,3:4,1
+chr5	180174491	.	C	CGT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.046386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,5:18,2:5,3
+chr5	180228444	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:1,5:5,5
+chr6	1948483	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=7.8657e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,17:9,12:5,5
+chr6	4247407	.	GT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:7,3:2,1
+chr6	4923902	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,2:3,1:4,1
+chr6	5493209	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0042621;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:10,7:4,4
+chr6	5503405	.	CAGAGAG	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:5,4:2,1:3,3
+chr6	6046596	.	A	AAT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,2:6,2
+chr6	6722660	.	CA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:5,3:1,1
+chr6	7000651	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:10,8:0,1
+chr6	7117388	.	GTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,9:8,7:1,2
+chr6	7286916	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.023277;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,9:9,6:4,3
+chr6	7838974	.	G	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=8.258e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,20:4,3:14,17
+chr6	8853685	.	CACACACACACACACAG	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,4:3,2:4,2
+chr6	9146089	.	TATAG	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:4,1:11,3
+chr6	9303915	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:1,2:0,0:1,2
+chr6	10993857	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021523;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,8:6,7:6,1
+chr6	10994483	.	A	AAGAAAAG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.003663;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,10:0,6:1,4
+chr6	11501455	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.2608e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,20:10,10:6,10
+chr6	11855203	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018307;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,6:4,3:1,3
+chr6	12348035	.	CTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.062457;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,5:3,2:17,3
+chr6	13458757	.	CAAAAAAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,13:14,11:1,2
+chr6	13507347	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.038274;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,4:7,3:8,1
+chr6	13793125	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0044521;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,10:3,9:2,1
+chr6	13926792	.	T	TG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00018595;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,16:10,9:13,7
+chr6	13926794	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00016529;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,17:11,10:12,7
+chr6	14754524	.	ATTTTTTTT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,9:8,7:2,2
+chr6	14998417	.	ATTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.001935;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,3:2,4
+chr6	15818956	.	A	AC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,6:0,2:2,4
+chr6	16391161	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,5:5,1
+chr6	18290629	.	C	CTTTATTTATTTATTTA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.10026;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,1:16,4
+chr6	18749571	.	G	GCGCGCA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:16,3:6,1
+chr6	18769079	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,3:1,2:2,1
+chr6	18939913	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.030216;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,1:5,3
+chr6	19567413	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=6.6453e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:6,12:8,7
+chr6	19894547	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.2173e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:27,21:13,9:14,12
+chr6	21889339	.	C	CT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:0,5:2,1
+chr6	23667897	.	C	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.002997;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:0,5:0,2:0,3
+chr6	23797596	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,3:2,2:0,1
+chr6	23971680	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.8775e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,16:10,9:6,7
+chr6	25031699	.	TTATATATATATA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:3,2:4,2
+chr6	27105858	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=3.3508e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:10,9:11,11
+chr6	27777967	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:10,4:2,3
+chr6	29462079	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.5219e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:10,9:11,9
+chr6	31854578	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.032284;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,4:9,3
+chr6	32027543	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
+chr6	32135286	.	T	TAAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:13,3:4,1
+chr6	32238597	.	T	TA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014604;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:11,3:3,6
+chr6	33154868	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:6,2:3,2
+chr6	33481609	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.22017;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:15,2:16,3
+chr6	34192501	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,8:2,5:5,3
+chr6	34416799	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.011976;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,8:7,7:5,1
+chr6	34428911	.	TA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:10,1:6,4
+chr6	38328564	.	CGT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037585;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,6:6,3
+chr6	39149355	.	TCACACACA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,6:11,2
+chr6	39149365	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027524;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,6:9,2
+chr6	39152883	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:1,2:0,0:1,2
+chr6	40113988	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,1:9,3
+chr6	40113989	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,1:9,3
+chr6	40491504	.	G	GTC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00058463;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:10,7:9,8
+chr6	40583202	.	A	ATATATACACTATATACATATATAG	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0030487;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,10:12,6:5,4
+chr6	41415989	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1672;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:17,2:16,2
+chr6	41730964	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=8.0594e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:12,7:16,9
+chr6	42636180	.	TTG	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.043779;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:5,4:10,3
+chr6	42990699	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,4:6,2
+chr6	43870747	.	T	TTTCCTTCC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,4:3,3:4,1
+chr6	44182285	.	C	CCA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043302;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,13:22,7:5,6
+chr6	44492865	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,5:12,3:5,2
+chr6	45180518	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,4:15,3:7,1
+chr6	45831858	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.002743;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:21,27:9,11:12,16
+chr6	46263477	.	G	GTA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:7,7:2,5:5,2
+chr6	47056841	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0059539;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,9:6,8:2,1
+chr6	47582786	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.075102;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:15,1:10,3
+chr6	47775858	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=2.5416e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:32,24:19,11:13,13
+chr6	48261664	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.065169;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:15,5:18,1
+chr6	48993875	.	G	GATATATAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,3:8,1
+chr6	49073002	.	A	ACG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,6:9,3:2,3
+chr6	49349888	.	CAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058443;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:17,3:1,2
+chr6	50609954	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0010173;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:11,6:11,7
+chr6	51975626	.	T	TAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.035782;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,4:5,2
+chr6	52810109	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.3687e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,24:9,13:15,11
+chr6	53707006	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.001804;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,15:9,6:5,9
+chr6	54414560	.	GGTGTGT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.015549;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:8,6:10,4
+chr6	55539859	.	G	GAAGAAAGA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043382;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:9,3:2,1
+chr6	55853195	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.031813;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:7,1:3,3
+chr6	56053862	.	A	AGT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.15275;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,5:15,3:4,2
+chr6	56260876	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:13,3:3,1
+chr6	59006644	.	G	C	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.00019944;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:55,15:26,7:29,8
+chr6	59643763	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.2008;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:10,2:26,2
+chr6	59707692	.	T	C	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.041603;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:64,10:11,1:53,9
+chr6	61309829	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=3.4806e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:6,5:12,14
+chr6	63505553	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.28142;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,3:7,1
+chr6	63973297	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.8722e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,18:13,9:13,9
+chr6	64085342	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:16,1:7,3
+chr6	64094733	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=5.7856e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,22:14,10:11,12
+chr6	64643112	.	T	TCC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01327;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,10:8,5:9,5
+chr6	64758447	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.339e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:12,6:11,9
+chr6	65268336	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=8.8931e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:24,20:14,11:10,9
+chr6	66020600	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.0729e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:18,8:12,9
+chr6	67213948	.	GATAT	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.038102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,5:9,4:13,1
+chr6	67291667	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=5.5655e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:25,24:15,19:10,5
+chr6	67368956	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0088608;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:11,8:1,1
+chr6	67432489	.	CTATATATAGGT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14404;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:5,3:9,2
+chr6	68139482	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0065845;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:12,7:13,2
+chr6	68453959	.	GATATATATATATATAT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,6:2,2:1,4
+chr6	68511146	.	G	GTATATATATATATATA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:7,4:0,0
+chr6	68643438	.	C	CTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.32759;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:8,1:10,2
+chr6	68903992	.	G	GA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:10,6:3,1
+chr6	71386851	.	G	GTTTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:3,5:6,1
+chr6	71788649	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=6.1955e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:15,10:13,6
+chr6	72500207	.	AAG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.32898;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,3:23,2:4,1
+chr6	73197580	.	TAC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,7:7,5:3,2
+chr6	73777119	.	T	TG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02457;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:4,8:12,4
+chr6	73839726	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.044913;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,3:5,3
+chr6	74207299	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.016983;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,4:1,4:0,0
+chr6	75620082	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.015238;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,9:3,8:6,1
+chr6	75965626	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.09062;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:2,3:15,1
+chr6	77485758	.	A	ATC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10931;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,1:15,3
+chr6	77603242	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.19341;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:16,3:15,1
+chr6	78679138	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.016203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,8:11,6:4,2
+chr6	80625694	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0062662;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:6,8:3,1
+chr6	81549622	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.02948;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,7:9,6:4,1
+chr6	81622692	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.3613e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,18:15,6:12,12
+chr6	82560513	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.023055;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:9,1:20,6
+chr6	82727946	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.23366;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:4,3:5,1
+chr6	85837908	.	G	GCTCTCC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.057027;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,6:20,2:6,4
+chr6	87128528	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
+chr6	87576511	.	C	CAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066077;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:13,2:9,3
+chr6	87673155	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.36477;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,4:12,1:3,3
+chr6	88817749	.	AT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,4:5,2
+chr6	89226316	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0083603;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:14,2:3,12
+chr6	90100726	.	CAG	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.039826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:16,3:16,4
+chr6	90869070	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0022624;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:2,6:0,2:2,4
+chr6	92362251	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.2304e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:33,22:13,8:20,14
+chr6	93972375	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.8499e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:23,19:13,10:10,9
+chr6	93972376	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.4089e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:13,10:8,8
+chr6	94734298	.	T	TATA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,6:2,3:2,3
+chr6	95206300	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.2103;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,2:15,2
+chr6	95222683	.	C	CTTTATTTA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.011012;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,7:1,4:7,3
+chr6	95486213	.	CAT	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.033212;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:19,5:18,8
+chr6	95986165	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00023962;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,14:8,13:1,1
+chr6	97518133	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:1,5:0,1:1,4
+chr6	97752884	.	GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0042363;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:5,15:2,9:3,6
+chr6	99194841	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.5862e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:19,26:8,12:11,14
+chr6	99536268	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,1:6,3
+chr6	99854166	.	T	TCTTTCTTTCTTG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.18054;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,7:11,1:14,6
+chr6	100278030	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=6.7064e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:6,8:10,7
+chr6	101006187	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=7.6418e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,19:10,11:9,8
+chr6	101464501	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,5:4,3:0,2
+chr6	101478574	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.1349e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,23:7,6:9,17
+chr6	101920016	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.1925e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:13,8:11,11
+chr6	102592586	.	TAC	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,2:2,2
+chr6	103119646	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.6846e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:29,21:17,11:12,10
+chr6	104416698	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=9.9525e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:7,6:6,6
+chr6	106471817	.	GAA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.013986;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:0,3:0,2:0,1
+chr6	106542608	.	CATTTTATTTT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.012393;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:2,4:10,3
+chr6	106946765	.	AAT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0037028;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,1:8,4
+chr6	107464075	.	T	TTA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=7.6853e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:2,10:2,6:0,4
+chr6	108179492	.	CTG	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.011625;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,12:2,6:2,6
+chr6	108194201	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=1.1416e-12;SS=2;SSC=119;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:2,20:1,9:1,11
+chr6	110963703	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00027326;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,9:3,7:0,2
+chr6	111100952	.	TTCTCTCCC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,4:4,3:0,1
+chr6	111523087	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.01202;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:9,2:6,4
+chr6	111526908	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043286;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:3,2:13,2
+chr6	111532656	.	G	GTTTTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.015851;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,4:5,1
+chr6	112273188	.	G	GT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:2,3:1,2
+chr6	112340122	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0098578;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:1,4:1,3:0,1
+chr6	112815220	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=1.1468e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:4,12:1,6:3,6
+chr6	113143734	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00012036;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:1,3:4,3
+chr6	113647950	.	CTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:1,6:3,2
+chr6	113855010	.	CTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.01049;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:0,5:3,1
+chr6	114744473	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.05;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:2,2:2,2:0,0
+chr6	114872481	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.035975;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,1:8,3
+chr6	114957420	.	ATCTCTC	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.004156;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:1,5:3,4
+chr6	115030939	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00074646;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:2,7:2,3:0,4
+chr6	118540758	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:6,3:3,1:3,2
+chr6	118567249	.	GTATATATATATATA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.05;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:0,3:0,1:0,2
+chr6	118638207	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00027194;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:4,4:3,3
+chr6	118746433	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00090356;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,4:3,3
+chr6	122703941	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.030207;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,2:3,2
+chr6	122799961	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:1,5:3,1
+chr6	124716810	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0014706;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,3:0,1:0,2
+chr6	125140009	.	T	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.00019367;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:1,3:5,6
+chr6	125946953	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0024264;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,6:3,2
+chr6	127538842	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.000258;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:0,6:0,2:0,4
+chr6	127543935	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0001754;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,7:1,5:0,2
+chr6	128658432	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=6.0551e-13;SS=2;SSC=122;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:24:3,21:2,12:1,9
+chr6	129256763	.	C	CAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:5,3:1,1
+chr6	130154695	.	GAAAAAAAA	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,4:0,3:1,1
+chr6	131367234	.	TA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00027385;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:3,3:3,7
+chr6	131669655	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0019985;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:2,7:4,1
+chr6	131701894	.	A	AAAAG	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.018284;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:48,13:32,4:16,9
+chr6	132717180	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.026298;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:8,2:6,4
+chr6	137107283	.	TTTCCTTCC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:0,4:3,3
+chr6	137684774	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.42424;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,2:0,1:6,1
+chr6	139152418	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:3,5:0,1
+chr6	139391578	.	A	AATAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00055741;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:2,3:2,3
+chr6	139423756	.	A	ATT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0085588;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,3:3,3
+chr6	140681966	.	TAC	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0032151;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:2,7:2,5:0,2
+chr6	141236493	.	TC	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=3.2572e-11;SS=2;SSC=104;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:3,16:1,6:2,10
+chr6	142862557	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033752;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:10,6:13,3
+chr6	144030254	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00027871;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,7:2,6:2,1
+chr6	144854279	.	TG	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.012218;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,4:7,1
+chr6	145079334	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.017294;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,5:7,1
+chr6	145390563	.	T	TTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=1.6227e-06;SS=2;SSC=57;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,11:0,6:1,5
+chr6	147113553	.	G	GT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0063768;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:2,5:4,3
+chr6	148310424	.	G	GA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=8.7675e-06;SS=2;SSC=50;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,12:0,8:3,4
+chr6	148368774	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
+chr6	148429385	.	TAAA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.005418;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,10:4,8:0,2
+chr6	148482688	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.028937;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,1:5,3
+chr6	148510995	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.013595;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,11:3,8:2,3
+chr6	148537776	.	CTGTGTGTGTGTGTG	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0012276;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:3,6:4,3
+chr6	149182971	.	C	CA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.6076e-11;SS=2;SSC=107;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:6,21:2,12:4,9
+chr6	149253940	.	AAG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:5,1:5,3
+chr6	149498307	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.013155;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:4,4:2,2
+chr6	149711255	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00035303;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:32:1,5:0,1:1,4
+chr6	150494265	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.004329;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:33:0,2:0,1:0,1
+chr6	150547198	.	T	TGAAATAAAAGCAAACAGGCAGACTC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=7.4322e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:1,4:2,4
+chr6	150806223	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.016601;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:5,3:1,1
+chr6	151374930	.	T	TA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00041113;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:2,7:3,1
+chr6	153229197	.	C	CTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=4.1725e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,13:6,8:2,5
+chr6	154572176	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:1,2:1,1:0,1
+chr6	154955391	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.020734;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:2,3:1,1
+chr6	155112125	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:4,4:3,3
+chr6	157010640	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:1,3:0,1:1,2
+chr6	157062708	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040303;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,2:8,3
+chr6	158260824	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.012255;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,3:2,1:0,2
+chr6	158365881	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.006993;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,4:0,0:1,4
+chr6	158438604	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00037527;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:30:2,6:1,4:1,2
+chr6	158957669	.	C	CAA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,5:2,4:0,1
+chr6	159010668	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=9.8367e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,11:1,8:0,3
+chr6	160000728	.	GTT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:5,3:1,2
+chr6	160399614	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.8199e-13;SS=2;SSC=125;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:5,23:2,10:3,13
+chr6	160584170	.	TTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:2,2:7,6
+chr6	161859610	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:6,5:2,1
+chr6	163603806	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.018062;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
+chr6	165128078	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,5:3,2:0,3
+chr6	166005467	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.3223e-11;SS=2;SSC=108;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:4,16:3,7:1,9
+chr6	166449922	.	C	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0017012;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,5:7,2
+chr6	166449945	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0032306;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:0,5:5,2
+chr6	167338868	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042146;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:1,0:9,4
+chr6	167671652	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.008228;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,1:6,5
+chr6	168309421	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.032849;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,4:4,1
+chr6	168311597	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023923;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,3:1,1:1,2
+chr6	168714925	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:1,2:0,0:1,2
+chr6	169024831	.	T	TCGG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,2:0,0:2,2
+chr6	169032514	.	GA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.00084958;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:2,2:3,8
+chr6	169186616	.	T	TGCCATGAGCTCAATAAACCCCACTACGCCCTC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00048033;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:2,2:1,4
+chr6	169923874	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=2.8145e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,8:0,2:0,6
+chr6	170394572	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.014432;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:3,4:16,2
+chr6	170398819	.	G	T	0	PASS	DP=255;GPV=1;SPV=0.004943;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:96,11:60,5:36,6
+chr6	170453100	.	AGTGTAT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.018737;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:16,3:0,2
+chr6	170453117	.	G	GT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.034379;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:14,2:4,4
+chr6	170743352	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.076398;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:47,6:22,4:25,2
+chr7	1258930	.	A	ATTTTTTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,6:2,3:0,3
+chr7	1504780	.	C	CTAATAATAATAA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.035377;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:20,4:15,6
+chr7	2515047	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.022502;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:14,5:3,2
+chr7	2519556	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=3.7206e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:17,8:8,10
+chr7	3147626	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0025203;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:5,17:4,14:1,3
+chr7	3485683	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:6,2:1,3
+chr7	3655485	.	ATATATATATATATATATATG	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
+chr7	5097841	.	C	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.1839;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,5:5,1:7,4
+chr7	5364459	.	GA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.029599;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,8:13,5:8,3
+chr7	5886635	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018485;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:7,5:3,5
+chr7	5942560	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0064122;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:10,9:8,2
+chr7	6049645	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,5:3,1:3,4
+chr7	6174539	.	G	GTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,8:4,3:4,5
+chr7	6372792	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:9,5:4,2
+chr7	6807540	.	A	G	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.045587;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:49,15:24,7:25,8
+chr7	7649158	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,4:13,3:6,1
+chr7	7673310	.	TAGCAGC	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.012896;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,15:17,7:8,8
+chr7	8739171	.	TA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,5:8,2:5,3
+chr7	9322189	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00025134;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:8,10:9,5
+chr7	11248413	.	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0052504;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,15:9,10:17,5
+chr7	12946653	.	ATTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.087294;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:11,5:2,2
+chr7	13213807	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030651;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:5,1:6,4
+chr7	13778320	.	CAAAAAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.016957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,6:3,5:5,1
+chr7	14265318	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:4,3:3,1
+chr7	14340159	.	CTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:8,3:0,2
+chr7	15356953	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:11,11:1,1
+chr7	16342820	.	C	CATATATAG	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:4,2:1,2
+chr7	16732383	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:6,2:15,2
+chr7	17540920	.	A	ATT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,2:6,2
+chr7	17751092	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=4.6765e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:13,9:3,4
+chr7	18257118	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048962;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,5:4,2:7,3
+chr7	18783838	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.5134e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:14,8:8,8
+chr7	18980778	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15091;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:12,2:9,3
+chr7	21179338	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.6188e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:12,10:7,8
+chr7	22000749	.	A	AAAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,4:4,1:0,3
+chr7	22615614	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.07e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:19,19:11,11:8,8
+chr7	23243947	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:9,3:6,1
+chr7	23382894	.	C	CAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:6,4:3,1
+chr7	23937962	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.5717e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,18:4,13:9,5
+chr7	24503296	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=9.863e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:13,6:6,10
+chr7	24599525	.	T	TTTTTTTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.098151;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,6:11,2:11,4
+chr7	25018615	.	C	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.25735;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:8,2:11,1
+chr7	26252693	.	GA	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11245;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:30,4:9,1
+chr7	27100382	.	C	CA	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00020455;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:10,5:16,6
+chr7	27288061	.	C	CAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0021594;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:8,11:2,9:6,2
+chr7	27613171	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.014917;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,4:9,3
+chr7	28608123	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:2,7:5,1
+chr7	28974605	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.097821;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,7:14,4:5,3
+chr7	30393033	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.076981;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:14,3:7,4
+chr7	31124226	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.091905;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:18,1:15,4
+chr7	34309486	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.013646;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,8:17,2:11,6
+chr7	34427902	.	GTA	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,6:2,3:1,3
+chr7	35115753	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.048842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:15,2:11,3
+chr7	35115757	.	A	AGAGAAAAG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,1:11,3
+chr7	35579561	.	A	AT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0036289;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:13,2:16,6
+chr7	36650136	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.012702;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:17,5:16,1
+chr7	36757915	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:3,6:4,6
+chr7	37449431	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.083916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:4,3:1,2
+chr7	37847824	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr7	38855210	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.017857;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,3:0,0:2,3
+chr7	38944891	.	C	CAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,4:2,3:1,1
+chr7	39057163	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.2151e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:20,24:11,15:9,9
+chr7	39820298	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.007794;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:9,8:3,3
+chr7	39871439	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=2.7292e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:10,6:13,9
+chr7	39939877	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.029742;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,2:8,4
+chr7	40089725	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,4:5,1:5,3
+chr7	41260472	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTGTT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.025589;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,9:13,4:14,5
+chr7	41369105	.	CTTT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,2:13,2
+chr7	42114991	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.0851e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:18,24:8,8:10,16
+chr7	42166650	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,2:6,4
+chr7	43483547	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.2419;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:10,2:4,2
+chr7	45283429	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:9,5:3,2:6,3
+chr7	45283430	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0040786;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:8,6:3,4:5,2
+chr7	46926730	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,4:5,4:0,0
+chr7	47586408	.	TC	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,4:10,2:9,2
+chr7	48001522	.	G	GT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065116;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:15,2:5,2
+chr7	49059558	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.23366;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:3,2:6,2
+chr7	49588796	.	ATATT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:8,4:1,2
+chr7	50843129	.	CA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0034446;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,6:6,5:4,1
+chr7	51566510	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.537e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:6,12:16,7
+chr7	52185078	.	G	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.5863e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:16,12:10,8
+chr7	52299337	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:7,10:1,1
+chr7	52652664	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.2103e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:11,9:9,6
+chr7	53369483	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:1,2:0,1:1,1
+chr7	54761973	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,2:5,1:0,1
+chr7	56813424	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.031941;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:2,3:10,3
+chr7	56815916	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.025226;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:28,6:9,3
+chr7	56816060	.	T	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.030972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:49,14:19,3:30,11
+chr7	56823993	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12337;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:11,3:13,2
+chr7	56826427	.	C	G	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.020375;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:97,14:20,2:77,12
+chr7	56881387	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.018549;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:14,4:26,2
+chr7	57078312	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:0,1:11,4
+chr7	57690906	.	G	GCTTT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.017404;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:19,5:11,3
+chr7	58057572	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.4146e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:11,9:12,8
+chr7	58093136	.	A	G	0	PASS	DP=195;GPV=1;SPV=0.04915;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:102,19:45,11:57,8
+chr7	59144468	.	G	C	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.034705;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:55,14:15,4:40,10
+chr7	60997686	.	G	T	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.0472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:95,22:57,15:38,7
+chr7	61383935	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.11838;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:19,1:25,4
+chr7	61420012	.	G	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.031766;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:62,7:32,6:30,1
+chr7	61450357	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.11088;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:2,0:31,4
+chr7	61458212	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,0:9,4
+chr7	61499553	.	T	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
+chr7	61519323	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.038105;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:9,2:29,4
+chr7	62208143	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.05493;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:22,3:14,1
+chr7	62247650	.	C	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.4132e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:24,26:10,13:14,13
+chr7	63108831	.	A	AAAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00043157;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,12:5,7:0,5
+chr7	63125260	.	G	GTTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,10:2,5:3,5
+chr7	63266483	.	C	CAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.042019;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:18,5:6,5
+chr7	63420340	.	C	CAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:8,1:3,3
+chr7	63493980	.	C	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:9,3:12,1
+chr7	63499197	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00024591;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,11:13,6:0,5
+chr7	63538726	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.046254;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:10,1:12,5
+chr7	63635885	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.025864;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:13,3:11,3
+chr7	63764777	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
+chr7	64083704	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0005577;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:12,5:14,6
+chr7	64238898	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.8395e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,24:10,15:14,9
+chr7	64955977	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,6:7,5:4,1
+chr7	65123739	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.088082;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:19,1:18,4
+chr7	65536082	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035568;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:7,1:8,4
+chr7	65553140	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.092902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:20,4:5,1
+chr7	66109180	.	CTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.065325;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:12,2:3,3
+chr7	66223987	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.3652e-08;SS=2;SSC=76;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:12,8:7,10
+chr7	66296676	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,5:5,4:0,1
+chr7	66687113	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
+chr7	66874154	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.028921;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
+chr7	66983916	.	A	ATT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0737;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,6:10,4:5,2
+chr7	67853945	.	C	CAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0028986;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,8:4,7:1,1
+chr7	67938498	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:9,4:3,1:6,3
+chr7	68959639	.	GAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAA	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:2,3:2,5
+chr7	69434282	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=7.0303e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:26,27:13,13:13,14
+chr7	70990521	.	TTC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:5,1:15,3
+chr7	70990543	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:5,1:9,5
+chr7	71451878	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.9774e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:7,8:11,9
+chr7	72046709	.	TA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,2:5,2
+chr7	73040521	.	ATT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,9:2,3:5,6
+chr7	73369923	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.048713;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,10:6,6:7,4
+chr7	73588509	.	T	TA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
+chr7	73609236	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.057585;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,7:9,6:9,1
+chr7	73857461	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.028792;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:3,1:10,5
+chr7	74311933	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:9,4:3,2:6,2
+chr7	74792229	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0039384;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:34,16:17,10:17,6
+chr7	74960681	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.12042;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,7:13,4:3,3
+chr7	75616584	.	G	GGGAGGAGGA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.039954;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:14,6:16,3
+chr7	75798478	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=3.1775e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:32,20:14,12:18,8
+chr7	76005852	.	GGAGGAGA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,4:12,2:9,2
+chr7	76445508	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.21475;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:14,3:7,1
+chr7	76493649	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.087068;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:16,4:16,1
+chr7	76976851	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.026132;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:15,3:17,5
+chr7	76997644	.	A	ATG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:21,2:2,3
+chr7	77448829	.	T	TC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0788;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:12,4:7,3
+chr7	78355331	.	C	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00069954;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:22,6:14,7
+chr7	79157945	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.2488;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,4:3,1:9,3
+chr7	79535993	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.022593;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:13,3:3,5
+chr7	80667754	.	T	TTTTTTTTG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.038306;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,6:8,3:8,3
+chr7	80683350	.	A	ATATGTG	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.14744;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,4:18,1:17,3
+chr7	80683365	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.17398;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:20,2:14,2
+chr7	80683370	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.17881;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:18,1:13,3
+chr7	81785356	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.044239;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:13,5:10,1
+chr7	82710682	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=5.3499e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,21:15,8:4,13
+chr7	83533600	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.029609;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:17,10:8,5:9,5
+chr7	83533601	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.013002;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:16,11:7,5:9,6
+chr7	84987123	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,2:7,4
+chr7	85333008	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.051194;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,2:14,2
+chr7	85445397	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:4,4:5,1
+chr7	85460245	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00094923;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:2,2:4,8
+chr7	86627732	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,6:2,3
+chr7	87552711	.	G	GA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,9:1,8:3,1
+chr7	88045888	.	TTG	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,8:3,2:3,6
+chr7	92998049	.	T	TTTCC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:1,3:13,2
+chr7	93023328	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.023519;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:20,1:17,6
+chr7	94482669	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:7,3:4,1
+chr7	94541537	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:6,3:3,3
+chr7	96991900	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12406;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,10:3,5:5,5
+chr7	97398988	.	C	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=3.8752e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:10,11:15,9
+chr7	97973032	.	T	TAG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.003663;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:1,4:1,2:0,2
+chr7	98083223	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.043;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:20,2:9,3
+chr7	98573677	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,2:7,2:0,0
+chr7	98842400	.	TATACAC	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.23571;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,4:14,1:18,3
+chr7	99146737	.	AAAAAAAAAAAAC	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.039412;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,4:7,2
+chr7	99181023	.	G	GTGTCTC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,7:0,5:2,2
+chr7	99187790	.	CTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.17641;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:18,3:9,1
+chr7	99416717	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024497;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:8,5:5,1
+chr7	100300585	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.012803;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:16,3:10,3
+chr7	100505916	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00074257;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,8:3,1
+chr7	100731172	.	A	ATTTCT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,4:11,1:14,3
+chr7	100975659	.	G	GGAGCTTAGGGCTGGAGGGGCACAGAGA	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.020548;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:53,16:20,3:33,13
+chr7	100977050	.	CAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.00086221;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,8:1,7:3,1
+chr7	101129670	.	G	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.34557;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:12,3:2,1
+chr7	101530566	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.021523;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,6:4,2
+chr7	102041666	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.016617;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:8,8:3,3
+chr7	102502679	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.22036;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:18,3:10,1
+chr7	102525408	.	G	GACCT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0040831;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:0,1:6,7
+chr7	102545789	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0070176;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,1:6,5
+chr7	102566497	.	C	A	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.012066;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:47,15:19,6:28,9
+chr7	102572315	.	G	A	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.0084663;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:88,23:54,13:34,10
+chr7	102737971	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.014866;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:2,1:8,5
+chr7	102775654	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.02254;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:11,1:11,6
+chr7	102778232	.	C	CA	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.029475;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,7:11,1
+chr7	104835764	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.04188;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:4,3:3,2:1,1
+chr7	105170953	.	A	AAG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.017286;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:1,3:1,1
+chr7	105258420	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065359;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,2:1,1:2,1
+chr7	105961488	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.011868;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,7:2,6:2,1
+chr7	106947079	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.021122;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:6,3:6,4
+chr7	106974638	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.025641;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:0,1:3,3
+chr7	109507335	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=1.2938e-11;SS=2;SSC=108;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:3,19:1,5:2,14
+chr7	109848658	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037662;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:2,3:2,1:0,2
+chr7	110136642	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:1,3:1,3:0,0
+chr7	110669024	.	AGTATGTGTGTGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,5:4,2
+chr7	110873429	.	C	CAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:6,4:0,0
+chr7	111281166	.	GAA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031813;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,2:6,2
+chr7	111702887	.	A	ATT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0064996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:4,5:0,4
+chr7	113294142	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0010878;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:0,4:8,2
+chr7	113615090	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.039216;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:2,2:1,1:1,1
+chr7	113712765	.	CTA	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.018073;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,3:6,4
+chr7	114929084	.	G	GATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.031805;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,3:2,2
+chr7	115934090	.	A	ATGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,5:2,3:0,2
+chr7	117883407	.	GAA	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:2,4:0,2
+chr7	119513863	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.030854;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,3:5,2
+chr7	119604986	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=5.0269e-15;SS=2;SSC=142;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:3,25:2,15:1,10
+chr7	121413715	.	AT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.015738;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:1,3:0,2:1,1
+chr7	121635818	.	AT	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.6852e-10;SS=2;SSC=94;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:24:3,19:1,14:2,5
+chr7	121824269	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
+chr7	122023777	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.010953;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
+chr7	122023787	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013479;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
+chr7	122064553	.	T	TTTTG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.000258;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:0,6:0,1:0,5
+chr7	123108357	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=4.9735e-11;SS=2;SSC=103;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:4,23:2,14:2,9
+chr7	123623931	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.027634;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:1,2:1,2
+chr7	123648340	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:17,3:15,4
+chr7	124298019	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0002442;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,4:1,3:0,1
+chr7	124454122	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:0,2:0,1:0,1
+chr7	124537302	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0030303;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:23:0,7:0,4:0,3
+chr7	125742595	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=4.9042e-14;SS=2;SSC=133;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:2,19:1,8:1,11
+chr7	125758857	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=9.3817e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,6:1,4:0,2
+chr7	126456519	.	T	TA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.022967;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,7:2,6:1,1
+chr7	126869933	.	T	TA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0011576;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,8:2,7:1,1
+chr7	126995904	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.4479e-13;SS=2;SSC=128;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:2,18:1,13:1,5
+chr7	128258439	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:3,4:0,0
+chr7	130581224	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063158;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:3,1:3,2
+chr7	132493755	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0022942;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,5:3,3:3,2
+chr7	132621264	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,2:2,1:2,1
+chr7	133898745	.	CAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,5:4,1
+chr7	133899745	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0024526;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:5,5:1,1
+chr7	135236276	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.016295;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,3:10,1
+chr7	135320002	.	C	CAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:4,4:2,1
+chr7	135526213	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.00052709;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,10:1,5:4,5
+chr7	136094834	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027339;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:13,4:1,0
+chr7	136275026	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,2:0,0:2,2
+chr7	137811390	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0046977;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:6,2:0,6
+chr7	137905393	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:1,2:1,1:0,1
+chr7	137946786	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.00027737;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:1,3:1,3
+chr7	138309420	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,2:9,2
+chr7	138820771	.	AT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,3:5,4
+chr7	138846533	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:9,3:2,2
+chr7	138903792	.	AGTGTGTGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,3:3,4
+chr7	139498140	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,2:0,2:0,0
+chr7	140647891	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,4:4,2
+chr7	140948253	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0054137;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,5:0,2:1,3
+chr7	141343525	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.015905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:2,2:2,6
+chr7	142447384	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:7,4:0,1
+chr7	143750910	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0036482;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:3,3:3,6
+chr7	144153330	.	TA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.036707;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:5,1:2,3
+chr7	144156150	.	AAGAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0032938;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:3,2:0,2
+chr7	144156170	.	AAAAAG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040085;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,3:4,2
+chr7	144180904	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,4:2,3
+chr7	144227383	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0050687;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:13,5:6,4
+chr7	144327328	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.096448;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:16,2:13,2
+chr7	144559994	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.009705;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:2,7:7,1
+chr7	147081583	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:3,3:3,2
+chr7	147193952	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,4:3,1:2,3
+chr7	147949440	.	G	GTATATATATATATATATA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.029654;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:2,3:3,1
+chr7	148259179	.	TA	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,5:4,1
+chr7	148429736	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.04741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:11,7:2,1
+chr7	148942840	.	C	CTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,8:3,7:1,1
+chr7	149526935	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.001677;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:1,5:0,1:1,4
+chr7	150001441	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0076579;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:14,3:5,6
+chr7	150359978	.	A	AC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:7,4:0,2
+chr7	150496012	.	AATATAAATATAATTTATTTATATTATAAATAT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0070965;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:1,5:6,3
+chr7	151703845	.	A	AACAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,4:3,1
+chr7	152245691	.	G	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.047874;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:13,5:15,3
+chr7	152247622	.	AT	A	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.0021227;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:54,22:35,16:19,6
+chr7	152279938	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.035613;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:15,5:18,6
+chr7	152403904	.	TGGAGACTCAGAAGGTTGGGAGGCTGGGA	T	0	PASS	DP=244;GPV=1;SPV=0.010049;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:117,32:62,15:55,17
+chr7	152789549	.	ATTT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0035252;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:13,3:8,5
+chr7	153701292	.	GACGA	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.013973;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,6:8,3
+chr7	153857322	.	T	TTCTCTCTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:2,3:4,1
+chr7	153988960	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.036156;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:16,7:11,2
+chr7	154301810	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.00024198;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,11:2,2:2,9
+chr7	154778820	.	A	AACACC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.058442;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,1:6,3
+chr7	155482634	.	T	TTCAGAACACGCTCAGAACATGC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:4,3:2,2
+chr7	155724990	.	TTG	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,15:3,9:6,6
+chr7	156049334	.	A	AAAG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.001677;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,5:0,4:1,1
+chr7	156594952	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=2.735e-11;SS=2;SSC=105;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:5,15:3,9:2,6
+chr7	158087988	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.076651;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,2:5,3
+chr7	158406094	.	A	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.013369;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:2,1:0,5
+chr7	158496193	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,3:1,1:0,2
+chr7	158496194	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.040959;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,3:1,1:0,2
+chr8	299656	.	C	G	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.039905;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:49,10:26,2:23,8
+chr8	358395	.	ATTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:10,2:1,2
+chr8	798487	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.085035;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:17,6:17,1
+chr8	811362	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.096304;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:13,1:21,3
+chr8	1040226	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:5,8:2,3
+chr8	1874778	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043517;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:7,1:26,5
+chr8	2229155	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.9868e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:7,9:11,8
+chr8	2444748	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.047227;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:14,8:17,3
+chr8	2472888	.	C	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.015361;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:19,3:24,2
+chr8	3021702	.	C	CATCCAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.038682;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:6,3:14,6
+chr8	4524252	.	C	CA	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.4703e-09;SS=2;SSC=81;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,19:9,16:6,3
+chr8	5069234	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,4:13,1
+chr8	5464267	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=5.0234e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,24:12,14:12,10
+chr8	5560584	.	TAA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049667;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:4,4:9,3
+chr8	5715391	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00010362;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:16,7:16,10
+chr8	5971516	.	C	CAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.061797;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:11,3:11,3
+chr8	6486262	.	ATC	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,10:3,4:4,6
+chr8	6527899	.	A	ATTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.049992;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:13,3:16,3
+chr8	6567257	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.28552;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,2:13,2
+chr8	6576046	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0047817;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,7:7,2
+chr8	7158841	.	G	A	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.0056646;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:84,28:44,12:40,16
+chr8	7394778	.	T	G	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.031998;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:68,13:39,8:29,5
+chr8	7412099	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.003625;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:8,5:22,7
+chr8	7413451	.	T	C	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.04944;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:52,13:26,6:26,7
+chr8	7443791	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.021326;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:7,1:11,6
+chr8	7482816	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.077619;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:21,1:18,4
+chr8	7728128	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.032338;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:8,1:25,8
+chr8	7788059	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0012781;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,13:7,5:0,8
+chr8	7862559	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00063544;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:11,5:10,7
+chr8	7870447	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.022141;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:30,7:11,5
+chr8	7885678	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:8,3:11,1
+chr8	7933590	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:12,4:1,1
+chr8	8025448	.	A	G	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.036171;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:149,22:92,12:57,10
+chr8	8058875	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.034141;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:21,3:7,5
+chr8	8073671	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.017233;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:18,6:7,4
+chr8	8188444	.	G	T	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.047567;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:65,15:22,6:43,9
+chr8	9158542	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.0798e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:29,17:17,11:12,6
+chr8	9857271	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.2098e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:17,26:10,20:7,6
+chr8	9871654	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:4,4:5,1
+chr8	10129761	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.7807e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:11,7:9,8
+chr8	12156549	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.03609;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:11,4:14,5
+chr8	12351193	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0063215;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:15,5:0,2
+chr8	12408339	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.021611;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:26,5:17,8
+chr8	12444059	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.002684;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:3,4:15,9
+chr8	12457388	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.02455;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,4:9,3
+chr8	12477051	.	G	A	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.038811;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:108,23:43,11:65,12
+chr8	12481078	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030499;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,5:6,1
+chr8	12488765	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0057362;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:2,1:37,14
+chr8	12523396	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.038682;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:5,3:15,6
+chr8	12553640	.	G	A	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.019575;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:111,23:51,11:60,12
+chr8	12554999	.	G	C	0	PASS	DP=246;GPV=1;SPV=0.011245;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:112,27:54,12:58,15
+chr8	12559174	.	T	G	0	PASS	DP=305;GPV=1;SPV=0.041368;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:156,21:90,14:66,7
+chr8	12566578	.	A	T	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.034655;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:129,25:67,14:62,11
+chr8	12575468	.	A	T	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.027986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:111,18:47,11:64,7
+chr8	12575947	.	C	G	0	PASS	DP=252;GPV=1;SPV=0.014876;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:152:122,30:62,15:60,15
+chr8	12578071	.	G	A	0	PASS	DP=291;GPV=1;SPV=0.0094149;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:118,30:60,11:58,19
+chr8	12584053	.	G	A	0	PASS	DP=269;GPV=1;SPV=0.0010457;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:114,33:58,16:56,17
+chr8	12591386	.	C	T	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.020299;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:104,21:48,10:56,11
+chr8	12592545	.	C	G	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.00095766;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:69,11:37,5:32,6
+chr8	12597860	.	C	T	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.029283;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:95,23:50,11:45,12
+chr8	12996992	.	TTTA	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:3,2:14,2
+chr8	14207151	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018501;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,2:5,3
+chr8	14479740	.	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.022269;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:1,12:1,9:0,3
+chr8	14920883	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.99e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:17,22:8,12:9,10
+chr8	15066315	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022413;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,5:3,3
+chr8	15578761	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.025071;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:23,3:25,4
+chr8	16226991	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=6.6057e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:14,8:10,9
+chr8	16460723	.	C	CAGATAGAT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.007899;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:15,7:13,5
+chr8	17199545	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040021;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:8,1:9,4
+chr8	17547785	.	A	AGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0019317;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:6,11:5,7:1,4
+chr8	17657799	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0037289;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,12:7,10:5,2
+chr8	18727584	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.06964;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,3:14,1
+chr8	19906397	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,5:4,2
+chr8	20060686	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.015907;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:4,6:6,1
+chr8	21024149	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0032306;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,11:3,6:2,5
+chr8	23526447	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.012732;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,7:7,2:11,5
+chr8	24336580	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,5:8,4:6,1
+chr8	24453702	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=9.2103e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:27,23:18,12:9,11
+chr8	26211161	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0077399;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:4,5:0,1
+chr8	26397641	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.015459;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:7,1:7,7
+chr8	26459352	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,2:1,2:0,0
+chr8	26867416	.	TTGTG	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.060625;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:18,3:14,1
+chr8	28198597	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.010572;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,6:2,2:4,4
+chr8	28452937	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.077337;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:19,2:12,2
+chr8	28452938	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.038786;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:20,2:12,3
+chr8	28684958	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.013798;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:18,4:9,6
+chr8	28905295	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=5.3228e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:30,22:14,12:16,10
+chr8	31689385	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=8.063e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:7,8:11,8
+chr8	31702451	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0021265;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:3,14:2,7:1,7
+chr8	31987320	.	A	ATG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0088769;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,9:7,3:5,6
+chr8	32364957	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00022435;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,8:1,3:2,5
+chr8	32685308	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=5.8399e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:18,27:10,17:8,10
+chr8	33509979	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,7:2,1
+chr8	33519252	.	CCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:2,3:12,2
+chr8	33999608	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=8.3252e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:11,7:11,7
+chr8	34006849	.	G	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.3912e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:15,7:13,7
+chr8	34529226	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0023627;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,7:5,2
+chr8	34683207	.	G	GT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0010489;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:14,6:8,5
+chr8	35005401	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.5956e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,23:11,12:12,11
+chr8	35021243	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=6.234e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:15,7:11,5
+chr8	36201245	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=1.2833e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,22:12,8:16,14
+chr8	36846788	.	G	GAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,8:6,7:1,1
+chr8	37542086	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.23498;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,5:1,2:11,3
+chr8	38581989	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.026864;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:11,3:17,3
+chr8	39490853	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0050177;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:10,6:7,2
+chr8	43106509	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037131;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:13,6:4,1
+chr8	45507566	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.025658;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:12,4:6,2
+chr8	45928734	.	G	C	0	PASS	DP=396;GPV=1;SPV=0.0078175;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:195,31:78,12:117,19
+chr8	46302903	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=1.2903e-09;SS=2;SSC=88;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:19,23:10,9:9,14
+chr8	47647651	.	AGAGG	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.020348;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:14,3:13,4
+chr8	48475489	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.5771e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:13,7:9,7
+chr8	49316765	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.23136;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:22,3:14,1
+chr8	49995314	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=9.6906e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:8,8:10,10
+chr8	52849803	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.5103e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:19,28:11,17:8,11
+chr8	54483873	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,9:1,3:4,6
+chr8	54882775	.	C	CTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.030499;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:13,8:13,4
+chr8	55041021	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,3:10,1
+chr8	60406577	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,3:3,1
+chr8	60462774	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,5:10,3:7,2
+chr8	61523320	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.013095;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,5:7,1:1,4
+chr8	62595382	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,6:2,5:2,1
+chr8	63133416	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.027027;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,6:6,3:10,3
+chr8	64939647	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.3884e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:9,7:8,9
+chr8	65268629	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:38:1,3:1,1:0,2
+chr8	66521790	.	GGAGAGAGAGA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:6,5:3,1
+chr8	69230820	.	GAT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,4:3,2:2,2
+chr8	69646938	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:6,3:6,4
+chr8	69904302	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027524;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,4:7,4
+chr8	71041817	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.9669e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:19,22:8,12:11,10
+chr8	71790725	.	A	AGAAAGAAAG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0026087;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:3,1:2,5
+chr8	72732990	.	T	TA	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.7941e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,18:18,9:11,9
+chr8	73605866	.	CACACACACACAT	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016096;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:21,6:6,4
+chr8	74188250	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.21337;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,1:12,3
+chr8	75838937	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.015968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,7:3,1
+chr8	76126828	.	CAG	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0010258;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:13,8:3,2
+chr8	76444527	.	GTATATA	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.27668;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:2,1:11,2
+chr8	78627039	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=2.9228e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:8,8:18,14
+chr8	79201310	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=1.444e-11;SS=2;SSC=108;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:16,32:8,12:8,20
+chr8	79233810	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00015011;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:8,5:18,9
+chr8	80362139	.	A	AG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.007794;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:5,4:7,7
+chr8	83012785	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:9,2:2,5
+chr8	83094532	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00010136;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,4:8,7
+chr8	83847711	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,2:11,2
+chr8	84235767	.	C	CTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.03809;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,7:12,6:6,1
+chr8	85805567	.	C	A	0	PASS	DP=274;GPV=1;SPV=0.025007;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:152:135,17:77,12:58,5
+chr8	85811985	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.27738;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:0,0:24,4
+chr8	86248962	.	TAG	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.084372;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:15,2:18,3
+chr8	86991392	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.487e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:12,7:15,8
+chr8	87297163	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.012217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,7:0,6:2,1
+chr8	87428135	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.07563;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:17,1:7,3
+chr8	88416538	.	G	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=4.3416e-10;SS=2;SSC=93;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:24,30:13,15:11,15
+chr8	88956317	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0050026;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:16,2:17,9
+chr8	89638936	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:11,4:6,1
+chr8	90370514	.	AT	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=4.6848e-06;SS=2;SSC=53;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:7,4:15,9
+chr8	91755145	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:7,5:4,2:3,3
+chr8	91755147	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,4:3,2:4,2
+chr8	92247825	.	CTTCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.04668;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,9:4,4:16,5
+chr8	92439776	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0095875;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,9:14,8:6,1
+chr8	93412693	.	T	TA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00014964;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:17,12:7,5
+chr8	93644645	.	T	TTATA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0044739;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,3:2,3
+chr8	94690276	.	A	ATT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.16556;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:19,3:12,1
+chr8	94705156	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:8,3:3,2
+chr8	94708595	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,3:4,3
+chr8	95245992	.	C	CT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.014795;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,9:15,7:7,2
+chr8	96309193	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:6,3:1,1
+chr8	97732895	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1114;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,6:14,2:3,4
+chr8	97900258	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=1.216e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:35,25:18,16:17,9
+chr8	99438034	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:6,6:1,1
+chr8	100925460	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=1.0869e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:11,11:17,6
+chr8	100935082	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=6.5574e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:12,11:9,7
+chr8	101656873	.	G	GACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.016341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,6:19,4:6,2
+chr8	102762274	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=4.9905e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,23:12,14:10,9
+chr8	102770856	.	G	GCTCAAGTGATTCTCCCGC	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.031137;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:13,4:23,7
+chr8	102955075	.	CTT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0049208;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,12:5,2:7,10
+chr8	103533661	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.020376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:8,6:3,1
+chr8	107282553	.	C	CAT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.12799;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:4,3:3,2
+chr8	107906379	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.20884;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:15,1:18,3
+chr8	108008782	.	A	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.025371;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,8:8,1
+chr8	108233836	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,12:6,11:0,1
+chr8	110181574	.	G	GT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,3:0,1
+chr8	110898449	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.2772e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:12,6:13,7
+chr8	111912027	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.32536;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:6,2:7,2
+chr8	113954535	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.077418;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,5:12,3:12,2
+chr8	115691028	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.064462;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:8,1:20,3
+chr8	117284889	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=9.5575e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:10,6:9,12
+chr8	117409285	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.4245e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:12,4:8,11
+chr8	117968552	.	TA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,1:5,3
+chr8	118132970	.	GTGTATATATATATA	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:5,3:0,2
+chr8	118165618	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,3:4,2:0,1
+chr8	118257784	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.8879e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:9,6:8,5
+chr8	119490725	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.6652e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,22:10,10:18,12
+chr8	122065748	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0029872;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:8,6:12,2
+chr8	123007749	.	ATTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,7:4,3:7,4
+chr8	123936462	.	G	GTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.14559;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,5:7,4:5,1
+chr8	124717411	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.049892;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:20,4:16,1
+chr8	125316732	.	T	TTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:0,0:4,2
+chr8	125376818	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:1,5:5,1
+chr8	126443782	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0105;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,9:13,7:8,2
+chr8	126983830	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.038251;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:9,2:12,9
+chr8	129496996	.	GTA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.28142;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,2:9,2
+chr8	129991943	.	C	CAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:11,3:2,1
+chr8	130920144	.	T	TAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0036197;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:9,7:7,3
+chr8	131396100	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=7.0926e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,18:6,11:10,7
+chr8	133441437	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:0,1:9,5
+chr8	133880995	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=9.2295e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:19,28:8,14:11,14
+chr8	134215454	.	C	CTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.016716;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:7,3:6,3
+chr8	135751485	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,3:11,1
+chr8	136094179	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:5,1:4,3
+chr8	138609088	.	T	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.6989e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:29,23:16,8:13,15
+chr8	141252918	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031133;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:10,6:13,6
+chr8	141789461	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=1.0504e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:37,26:10,9:27,17
+chr8	141872048	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14022;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:11,2:11,3
+chr8	142223287	.	TAC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,3:8,1
+chr8	142223297	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,3:8,1
+chr8	143119856	.	TAA	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.026101;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:20,2:22,4
+chr9	13542	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:8,5:11,5
+chr9	55850	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.032946;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:20,3:19,6
+chr9	671559	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.04886;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:15,7:17,4
+chr9	911470	.	ATTTTTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0088119;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,12:6,7:8,5
+chr9	1837598	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=5.2009e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:16,6:10,10
+chr9	2488782	.	ATATATATATATATTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,5:2,1
+chr9	3505365	.	AT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02791;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:19,4:7,2
+chr9	3505482	.	TA	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.081913;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:29,3:5,2
+chr9	4545189	.	G	GTCTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.049793;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,8:9,5:9,3
+chr9	5113191	.	CTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.012653;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:3,4:7,1
+chr9	6697718	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.008238;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,10:5,9:3,1
+chr9	7424942	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:20,4:11,1:9,3
+chr9	11665189	.	CT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00018113;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:5,6:5,5
+chr9	12366212	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.3654e-07;SS=2;SSC=68;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:13,5:8,13
+chr9	12477580	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.016311;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,2:7,4
+chr9	12541727	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.01961;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:14,2:14,3
+chr9	13330806	.	C	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.9695e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,15:20,8:12,7
+chr9	13691837	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=5.02e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:12,11:11,6
+chr9	14886321	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.022446;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,2:10,9
+chr9	14976300	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,7:3,1:3,6
+chr9	15341116	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.048842;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:8,1:18,4
+chr9	17185771	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.018613;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,12:17,9:4,3
+chr9	17366310	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:10,3:18,1
+chr9	17599600	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.015e-07;SS=2;SSC=69;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:11,13:10,7
+chr9	18267771	.	AAAAC	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.075844;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:19,3:21,2
+chr9	18359827	.	G	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:0,0:5,2
+chr9	18756076	.	AATATATAT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1839;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:9,2:3,3
+chr9	19321788	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=4.6028e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:9,5:10,12
+chr9	19382844	.	C	CT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.023736;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:9,5:9,6
+chr9	19540910	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.20161;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:13,1:15,3
+chr9	20573193	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.083854;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:21,3:15,2
+chr9	21209735	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.016144;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:18,3:25,5
+chr9	21355822	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.089571;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:23,4:18,2
+chr9	22126574	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12152;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:16,5:2,1
+chr9	23194075	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.6904e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:19,29:9,19:10,10
+chr9	24804384	.	A	AATATAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,7:6,3:0,4
+chr9	24872725	.	GTGTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.038035;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:8,4:15,3
+chr9	26123501	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0050173;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:8,9:5,3
+chr9	26334676	.	G	GCACACACACA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,9:8,4:1,5
+chr9	26434898	.	TA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=5.8963e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:7,6:8,7
+chr9	27532584	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:4,2:3,1:1,1
+chr9	28062576	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.10359;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:20,2:9,2
+chr9	32130820	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:10,4:2,1
+chr9	32900610	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.19342;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:8,2:14,4
+chr9	32900627	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:8,1:12,4
+chr9	33554181	.	A	AAAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,9:14,5:6,4
+chr9	34142503	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:9,2:4,3
+chr9	34593490	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=2.1109e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:28,19:18,9:10,10
+chr9	35030338	.	T	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.03499;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:23,4:18,1
+chr9	35897023	.	T	TTTATTATTA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.032315;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,7:11,5:8,2
+chr9	35950813	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:3,4:8,6
+chr9	36061393	.	T	TACACACACAC	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0084717;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,8:7,4:1,4
+chr9	37379213	.	TTA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010837;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,3:2,2
+chr9	38239622	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,4:1,0:13,4
+chr9	38419888	.	C	CCTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.012101;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:14,12:6,3:8,9
+chr9	38816954	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.29549;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,3:11,1
+chr9	38969560	.	C	T	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.0051636;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:67,22:32,9:35,13
+chr9	38988871	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.044421;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,8:37,7:4,1
+chr9	39128880	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,6:6,1
+chr9	39372028	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.017499;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,4:2,4
+chr9	39400748	.	T	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.041731;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:22,5:19,1
+chr9	39405589	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,4:4,3
+chr9	39509905	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06057;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:10,3:11,2
+chr9	39532000	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,3:13,1
+chr9	39595207	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.086635;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:17,3:7,2
+chr9	39667342	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr9	39745305	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.018809;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:11,3:8,5
+chr9	39820099	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:5,1:9,6
+chr9	40145659	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.042105;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
+chr9	40183672	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0013579;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:16,11:4,3
+chr9	40285600	.	TA	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11371;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:28,4:0,0
+chr9	40285614	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.055222;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:22,4:0,0
+chr9	40298133	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.077483;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:20,3:7,2
+chr9	40299278	.	A	G	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.00068097;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:45,15:20,7:25,8
+chr9	40306702	.	G	A	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.020139;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:189:168,21:77,12:91,9
+chr9	40335612	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:1,0:27,4
+chr9	40579635	.	T	C	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.043937;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:51,14:17,10:34,4
+chr9	40611077	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.020406;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:28,8:9,4
+chr9	40661826	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:4,3:4,2
+chr9	40697499	.	T	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00087959;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:16,6:19,8
+chr9	40960658	.	A	T	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.0098875;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:91,22:43,18:48,4
+chr9	40998632	.	G	T	0	PASS	DP=356;GPV=1;SPV=0.03833;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:143,24:85,6:58,18
+chr9	41108289	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.054568;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:22,4:8,1
+chr9	41113935	.	G	A	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.016601;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:92,24:54,13:38,11
+chr9	41118301	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.01951;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:14,7:15,5
+chr9	41145993	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,2:10,2
+chr9	41146643	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
+chr9	41242173	.	T	G	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0084226;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:24,2:34,6
+chr9	41242177	.	T	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.0073237;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:22,2:36,6
+chr9	41362484	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10523;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,3:11,1
+chr9	41630797	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:12,2:1,2
+chr9	41688986	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.029805;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:11,3:11,7
+chr9	41968416	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.072836;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,3:7,4
+chr9	42042742	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020843;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,5:4,1
+chr9	42089151	.	G	GAGA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0070885;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:7,3:1,4
+chr9	42089154	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024846;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,3:3,4
+chr9	42103937	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
+chr9	42323965	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.056405;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,2:13,2
+chr9	42956074	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,6:5,2:2,4
+chr9	43039861	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.067362;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:16,1:16,4
+chr9	43297666	.	T	C	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.027641;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:65,9:31,6:34,3
+chr9	43497197	.	A	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.031187;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:23,2:17,3
+chr9	43620679	.	G	A	0	PASS	DP=240;GPV=1;SPV=0.041516;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:120,14:78,10:42,4
+chr9	43668116	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.015732;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
+chr9	43689780	.	G	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:15,1:1,4
+chr9	43768939	.	T	A	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:14,3:41,6
+chr9	43841173	.	C	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.043968;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:13,1:26,5
+chr9	43916288	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
+chr9	44023533	.	G	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.021109;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:24,8:22,3
+chr9	44099639	.	T	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr9	44201242	.	C	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:5,2:1,1
+chr9	44338865	.	C	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.29601;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:2,1:20,2
+chr9	44440552	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:12,4:1,0
+chr9	44453150	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.027179;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:24,5:5,3
+chr9	44542024	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.088082;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:27,2:10,3
+chr9	44688356	.	G	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.00097947;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,11:27,5:15,6
+chr9	45123859	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13372;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:5,1:15,2
+chr9	45174115	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:0,0:16,4
+chr9	45294434	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,1:5,3
+chr9	45374637	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.037223;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:9,5:22,7
+chr9	45389007	.	C	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
+chr9	60680938	.	A	T	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.042221;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:64,16:39,11:25,5
+chr9	61224599	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.028374;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:19,2:22,7
+chr9	61837378	.	AC	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.044803;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:27,6:21,1
+chr9	61931359	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
+chr9	61940002	.	G	GT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.035315;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,8:10,4:5,4
+chr9	62801828	.	C	T	0	PASS	DP=315;GPV=1;SPV=0.031186;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:148,29:68,12:80,17
+chr9	62802684	.	G	A	0	PASS	DP=452;GPV=1;SPV=0.043558;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:264:230,34:112,16:118,18
+chr9	62803933	.	C	G	0	PASS	DP=445;GPV=1;SPV=0.014385;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:236:200,36:99,23:101,13
+chr9	62815266	.	A	T	0	PASS	DP=347;GPV=1;SPV=0.0124;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:179:146,33:78,16:68,17
+chr9	62815267	.	T	C	0	PASS	DP=362;GPV=1;SPV=0.014244;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:191:157,34:85,17:72,17
+chr9	62819905	.	G	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.036683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:15,4:31,5
+chr9	62824658	.	G	A	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.00626;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:152,28:77,15:75,13
+chr9	62829944	.	C	A	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.012578;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:78,17:8,5:70,12
+chr9	62829977	.	A	C	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.00014198;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:59,19:1,1:58,18
+chr9	62832774	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.01087;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,1:4,4
+chr9	62836383	.	A	G	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.047996;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:87,15:32,11:55,4
+chr9	62899957	.	C	G	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.017492;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:64,16:34,10:30,6
+chr9	62917536	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.025934;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:22,2:15,3
+chr9	62917779	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:1,0:19,4
+chr9	62921641	.	T	C	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.04637;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:63,14:30,8:33,6
+chr9	63157556	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr9	63283693	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.1146;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:19,4:12,4
+chr9	63757391	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.0022355;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:15,14:17,3
+chr9	63764445	.	G	A	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.019648;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:130,20:71,12:59,8
+chr9	63767998	.	A	T	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.023725;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:74,11:59,7:15,4
+chr9	63777282	.	C	A	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.014641;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:78,13:49,2:29,11
+chr9	63809392	.	C	G	0	PASS	DP=416;GPV=1;SPV=0.028429;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:196,27:109,18:87,9
+chr9	63841203	.	G	GTTAA	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.0017596;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:63,13:36,2:27,11
+chr9	63872967	.	TG	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.0070763;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:43,18:24,7:19,11
+chr9	64329169	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.040505;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:20,5:11,3
+chr9	64330435	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.049831;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:40,11:31,7:9,4
+chr9	64365022	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:1,0:14,4
+chr9	64399530	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:4,2:14,2
+chr9	64435226	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.020146;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:6,1:13,8
+chr9	64789412	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.10033;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,4:0,0:31,4
+chr9	64910453	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,6:2,1
+chr9	64918204	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,1:10,3
+chr9	65563407	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0045803;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:13,8:18,7
+chr9	65702685	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:1,1:12,10
+chr9	65742989	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.017241;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:12,7:13,2
+chr9	65822249	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
+chr9	65908897	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.05461;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,2:10,2
+chr9	66014140	.	G	T	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.029558;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:54,17:25,9:29,8
+chr9	66031656	.	GTATAA	G	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.014734;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:85,17:40,9:45,8
+chr9	66031662	.	G	C	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.0092019;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:83,18:38,10:45,8
+chr9	66176323	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
+chr9	66246819	.	A	G	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.018937;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:61,19:38,13:23,6
+chr9	66343510	.	C	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.019321;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:6,9:28,3
+chr9	66384998	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:2,1:3,7
+chr9	66702087	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:8,3:12,1
+chr9	66740151	.	AAC	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22398;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:11,2:2,2
+chr9	66810630	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016944;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:15,5:16,8
+chr9	66813660	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.0047712;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:55,15:38,11:17,4
+chr9	66831566	.	G	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.038208;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:60,7:23,3:37,4
+chr9	66843453	.	G	A	0	PASS	DP=176;GPV=1;SPV=9.6213e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:77,28:35,10:42,18
+chr9	67394112	.	G	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:0,2:7,4
+chr9	67394154	.	TG	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:0,1:6,4
+chr9	67428071	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.00761;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:2,7:0,4:2,3
+chr9	67462701	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,3:2,1
+chr9	67760386	.	T	A	0	PASS	DP=221;GPV=1;SPV=0.029858;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:105,21:56,11:49,10
+chr9	67787556	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.024045;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:38,16:5,7:33,9
+chr9	67889140	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1041;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:8,1:24,4
+chr9	68272928	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:0,3:4,3
+chr9	68303202	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011954;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:1,5:15,3
+chr9	70570302	.	GTT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,6:3,1
+chr9	71282430	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,4:13,2:4,2
+chr9	72662352	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0074587;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,3:9,5
+chr9	73430930	.	GTCTATTCTATTCTAT	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.015771;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,11:6,8:12,3
+chr9	73951254	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0002546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:15,4:16,8
+chr9	77054665	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.13316;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,4:16,1:9,3
+chr9	77136184	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.013867;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:8,3:1,5
+chr9	77761294	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00035596;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:2,4:3,6
+chr9	77853774	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:4,5:3,1
+chr9	77889410	.	CAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:5,7:6,3
+chr9	78048583	.	AAC	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0072464;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:6,6:2,1
+chr9	80147181	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.6753e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:13,7:10,11
+chr9	80259058	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.9053e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:14,26:5,16:9,10
+chr9	80545519	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01398;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:7,7:8,2
+chr9	81583255	.	A	AGAGAAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.12566;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,6:9,2:7,4
+chr9	81739537	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0029219;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:11,5:14,5
+chr9	82274114	.	TAG	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.7557e-06;SS=2;SSC=55;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:8,8:11,4
+chr9	83612064	.	AGT	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.6034e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:12,13:8,3
+chr9	85132495	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=1.2378e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:27,26:16,19:11,7
+chr9	85245751	.	CA	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=2.7762e-07;SS=2;SSC=65;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:13,21:7,9:6,12
+chr9	85454708	.	ATG	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.07056;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,4:8,2:14,2
+chr9	85795856	.	G	GT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:8,4:2,1
+chr9	86031449	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,5:7,4:7,1
+chr9	86462953	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.119;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:8,1:18,3
+chr9	86808629	.	C	CT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0050488;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:12,7:10,3
+chr9	86948027	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0085139;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,1:4,5
+chr9	88873077	.	G	GGA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,7:5,5:2,2
+chr9	89709437	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.04473;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:5,1:24,5
+chr9	89709444	.	C	CTT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10395;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,4:12,1:21,3
+chr9	89763019	.	A	AACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:10,3:5,2
+chr9	90622276	.	T	TCATA	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0016804;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,15:9,5:12,10
+chr9	91744213	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0069996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,10:2,6:4,4
+chr9	92939400	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=6.5439e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:12,7:11,10
+chr9	94529740	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23366;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:7,1:2,3
+chr9	95683965	.	T	TA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00022877;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,11:9,7:15,4
+chr9	97729466	.	A	ATTTTTTTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,4:4,3:7,1
+chr9	100762761	.	T	TACAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.029832;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,4:3,4
+chr9	100879022	.	G	GAAAAA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:4,3:1,1
+chr9	101495140	.	GATTTTATATATATTATAT	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:0,1:4,4
+chr9	103169408	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=1.6294e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,18:5,7:6,11
+chr9	103557358	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0088148;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:16,5:2,3
+chr9	107096076	.	C	CGTGT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.010144;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,13:15,9:5,4
+chr9	107256003	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,4:2,1
+chr9	107561912	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,9:5,5:5,4
+chr9	108416311	.	CA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00015298;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,23:8,14:8,9
+chr9	109066452	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0019577;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:7,6:4,2
+chr9	109657938	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.029588;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:12,10:6,8:6,2
+chr9	110422681	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.24135;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:14,3:14,1
+chr9	111209287	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,4:9,2:12,2
+chr9	111551400	.	GTT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.035343;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:14,4:2,1
+chr9	111580755	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.010105;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,9:12,8:3,1
+chr9	111642052	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.1172;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:12,1:28,4
+chr9	112077499	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,2:3,2
+chr9	113264864	.	C	CAA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.03376;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,6:14,3:5,3
+chr9	114528246	.	T	TA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031133;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:13,7:10,5
+chr9	115953384	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.0078e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,18:8,6:8,12
+chr9	117108438	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,5:5,3:4,2
+chr9	117986268	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,10:8,6:2,4
+chr9	119202281	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.2897e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:10,11:12,8
+chr9	120033961	.	TTGTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00042941;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,17:11,12:7,5
+chr9	120351269	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=6.2631e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:28,22:19,15:9,7
+chr9	120495863	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,2:11,2
+chr9	121826153	.	A	AAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:2,6:4,1
+chr9	122833485	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,3:5,2
+chr9	122859252	.	CTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023574;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:5,6:5,2
+chr9	122860405	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,9:3,7:0,2
+chr9	124093281	.	C	CTG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.028506;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:17,7:9,7
+chr9	124292992	.	C	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=2.5627e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:18,12:11,7
+chr9	124670216	.	CA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.042069;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:12,6:10,4
+chr9	125401768	.	A	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.034336;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,8:25,2:24,6
+chr9	126850541	.	A	AT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.016968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,6:0,1:4,5
+chr9	126894705	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0022883;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,12:3,10:2,2
+chr9	128124186	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=1.3687e-08;SS=2;SSC=78;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,24:5,18:19,6
+chr9	129454508	.	G	GTGGTGGAGA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:9,4:0,0
+chr9	130140524	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=6.7374e-10;SS=2;SSC=91;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:22,26:10,13:12,13
+chr9	130542924	.	C	CGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14804;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,5:9,2:16,3
+chr9	131335733	.	CCTTTCT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.053977;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,4:6,1
+chr9	131363925	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,7:3,6:1,1
+chr9	131430510	.	TATAGATAG	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0096647;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:9,5:7,5
+chr9	131435307	.	G	GA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0094835;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:12,8:1,1
+chr9	131760905	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,7:8,4:3,3
+chr9	132964743	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,7:3,4:6,3
+chr9	133682710	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0017035;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:3,5:6,7
+chr9	134089610	.	A	AAAAT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.049775;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,11:12,6:16,5
+chr9	134847041	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.064403;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:17,1:12,3
+chr9	134945705	.	G	GAGGGCAGAGGGCAGAGGGCAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.031259;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,6:10,2:16,4
+chr9	135041240	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.3531e-09;SS=2;SSC=84;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,17:6,7:4,10
+chr9	136174238	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,4:9,1:5,3
+chr9	137001013	.	TGACCTCGGGGGCGGCGA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15645;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,5:21,3:5,2
+chr9	137329978	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:0,1:4,1
+chr9	137401152	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.013393;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:5,4:3,4
+chr9	137693588	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:1,1:18,3
+chr9	137824174	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=9.9241e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:14,5:3,6
+chr9	137861559	.	TTTTTC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:6,2:7,4
+chr9	138029609	.	CTT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,10:1,7:5,3
+chr9	138203561	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,5:10,2:11,3
+chrX	2932395	.	C	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016632;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,2:7,4
+chrX	4067377	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=5.9538e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,9:0,2:0,7
+chrX	4067401	.	TC	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0045249;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:0,1:3,5
+chrX	5378042	.	GT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0028986;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:5,5:2,7
+chrX	5847356	.	T	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=9.6148e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:1,10:1,3:0,7
+chrX	7279309	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:5,2:6,3
+chrX	8407352	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:8,5:1,1
+chrX	9082385	.	AG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:10,2:2,2
+chrX	9276951	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,2:7,2
+chrX	9413118	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.040535;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,7:9,1
+chrX	9414048	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:15,7:5,2
+chrX	10685877	.	T	TAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,9:3,5:2,4
+chrX	11005587	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=9.592e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,11:2,6:4,5
+chrX	16716483	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=3.1646e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:4,14:2,8:2,6
+chrX	16964812	.	CG	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:1,3:16,1
+chrX	19345572	.	TA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:1,4:5,2
+chrX	20810590	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=1.0776e-08;SS=2;SSC=79;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:1,14:0,6:1,8
+chrX	24882684	.	G	GGTGTGTGT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,5:1,2:0,3
+chrX	26157137	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=5.9414e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:2,19:1,10:1,9
+chrX	26320245	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.32086;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:17,1:14,3
+chrX	26543486	.	C	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=6.8795e-09;SS=2;SSC=81;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:2,20:1,13:1,7
+chrX	28969902	.	AAC	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037959;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,3:4,1
+chrX	34715810	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
+chrX	36133730	.	C	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=1.744e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,12:4,7:1,5
+chrX	36618496	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=1.3684e-10;SS=2;SSC=98;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:0,16:0,9:0,7
+chrX	40246808	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,11:2,9:2,2
+chrX	40380891	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=3.1782e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:3,25:0,11:3,14
+chrX	42053561	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.00067304;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:2,4:2,4
+chrX	44165536	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=8.169e-12;SS=2;SSC=110;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:2,20:0,10:2,10
+chrX	44797121	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,1:8,3
+chrX	46893247	.	A	AT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=8.3047e-07;SS=2;SSC=60;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:3,14:1,8:2,6
+chrX	49060427	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:2,5:6,7
+chrX	52553396	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=1.7328e-12;SS=2;SSC=117;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:1,28:0,19:1,9
+chrX	52792095	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=2.1862e-11;SS=2;SSC=106;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:1,20:0,13:1,7
+chrX	53098050	.	C	CA	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.043512;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:1,4:2,1
+chrX	57865071	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=7.6201e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,10:0,9:0,1
+chrX	71412123	.	T	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,2:1,2:0,0
+chrX	73548458	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0070393;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:6,5:3,4
+chrX	73627137	.	C	CAA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,8:1,7:0,1
+chrX	73729834	.	AGAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,3:7,1
+chrX	75239816	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=1.0931e-09;SS=2;SSC=89;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:3,19:1,15:2,4
+chrX	77956726	.	C	CCTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:4,4:10,1
+chrX	79119133	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,3:2,2
+chrX	79957198	.	AGAGAGAGATG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,5:3,4:0,1
+chrX	83349506	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=2.4562e-09;SS=2;SSC=86;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:23:1,22:0,14:1,8
+chrX	83520862	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=1.6595e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:2,20:1,7:1,13
+chrX	83981200	.	AAG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
+chrX	85257415	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=4.2733e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:1,15:0,5:1,10
+chrX	89835746	.	A	ATTT	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:0,1:5,1
+chrX	92910966	.	C	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=8.3212e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:1,16:0,10:1,6
+chrX	92953345	.	TTATATATATATA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.22704;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,7:4,4:5,3
+chrX	93761563	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=5.0332e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:24:2,22:1,9:1,13
+chrX	94633618	.	TCTA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:6,4:1,3
+chrX	95970112	.	C	CTAAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,10:2,7:2,3
+chrX	98286045	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=2.5916e-11;SS=2;SSC=105;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:3,22:1,11:2,11
+chrX	100853261	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.22398;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,4:4,2:9,2
+chrX	109217384	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,3:8,1
+chrX	118044433	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,4:0,0:0,4
+chrX	118585845	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=1.96e-11;SS=2;SSC=107;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:0,22:0,10:0,12
+chrX	118929560	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,3:4,2
+chrX	123434487	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=2.9781e-11;SS=2;SSC=105;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:0,18:0,10:0,8
+chrX	125161039	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.00026653;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,14:3,11:3,3
+chrX	128814913	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,4:1,3:6,1
+chrX	130510191	.	A	ATGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:4,12:3,6:1,6
+chrX	133403133	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=2.1967e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:1,18:1,10:0,8
+chrX	134621444	.	CA	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,5:1,1
+chrX	137555032	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,1:3,3
+chrX	137664250	.	T	TTC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:1,1:10,4
+chrX	145503667	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=6.3565e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,11:2,6:2,5
+chrX	145548273	.	CAAA	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
+chrX	145727300	.	G	GA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=2.1794e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:3,10:2,8:1,2
+chrX	147574832	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=1.9463e-12;SS=2;SSC=117;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:0,20:0,12:0,8
+chrX	148486637	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=6.7878e-08;SS=2;SSC=71;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,17:1,8:0,9
+chrX	151078786	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=2.1967e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:2,18:0,11:2,7
+chrX	151457070	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00041408;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:5,15:4,12:1,3
+chrX	151530151	.	G	GT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=2.2344e-08;SS=2;SSC=76;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:3,19:1,14:2,5
+chrX	155077213	.	T	TA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=9.4736e-09;SS=2;SSC=80;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:5,20:2,6:3,14
+chrY	3024501	.	AT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,3:4,1
+chrY	3075729	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03726;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,3:5,4
+chrY	3092641	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:5,2:13,2
+chrY	3299174	.	G	GT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.033408;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:10,2:7,4
+chrY	3489132	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.090128;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:17,3:12,3
+chrY	4766472	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=2.5454e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:2,16:1,8:1,8
+chrY	5416744	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=6.2541e-10;SS=2;SSC=92;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:1,20:0,8:1,12
+chrY	5658242	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,1:13,4
+chrY	5972856	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.01597;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,5:9,6
+chrY	8767437	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=4.2409e-12;SS=2;SSC=113;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:31:1,30:0,11:1,19
+chrY	9523481	.	A	C	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.01659;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:61,11:23,3:38,8
+chrY	9533996	.	CAT	C	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.028931;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:49,12:33,10:16,2
+chrY	10654088	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,5:3,4:4,1
+chrY	10963506	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=1.9269e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,12:0,3:0,9
+chrY	11097921	.	G	A	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.042491;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:63,15:31,11:32,4
+chrY	11105770	.	A	G	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.043833;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:94,12:44,5:50,7
+chrY	11142922	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.042579;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:15,1:21,6
+chrY	11144433	.	C	G	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.004369;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:53,9:28,1:25,8
+chrY	11175863	.	GC	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.042644;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:42,12:28,10:14,2
+chrY	11193832	.	AGG	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.019378;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:20,6:17,2
+chrY	11203339	.	G	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.035038;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:9,5:35,8
+chrY	11220150	.	ATTT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.032993;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,11:9,5:11,6
+chrY	11223744	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.037331;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:46,13:23,10:23,3
+chrY	11236585	.	A	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0029706;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:22,7:11,1
+chrY	11272437	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.048788;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:11,1:13,7
+chrY	11284353	.	T	C	0	PASS	DP=444;GPV=1;SPV=0.038976;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:237:205,26:54,18:151,8
+chrY	11303581	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:1,3:1,2:0,1
+chrY	11347753	.	T	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.035943;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:52,11:29,6:23,5
+chrY	11565379	.	T	A	0	PASS	DP=525;GPV=1;SPV=0.042965;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:290:246,44:102,12:144,32
+chrY	11567195	.	T	A	0	PASS	DP=233;GPV=1;SPV=0.017981;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:116,14:66,8:50,6
+chrY	11853987	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0015076;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:3,7:3,3
+chrY	13193942	.	AAAT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0085545;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:4,8:6,7
+chrY	15108020	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=7.4782e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:1,14:1,7:0,7
+chrY	15163095	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,7:3,4:0,3
+chrY	20122203	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.032417;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:11,6:1,2
+chrY	20126331	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.039018;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:10,8:5,2
+chrY	20137261	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00020969;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,20:16,14:11,6
+chrY	20349541	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.23142;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:18,4:22,2
+chrY	26647432	.	T	A	0	PASS	DP=295;GPV=1;SPV=0.017142;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:156,21:95,18:61,3
+chrY	26668102	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.085726;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:7,2:20,3
+chrY	26670121	.	T	A	0	PASS	DP=1393;GPV=1;SPV=0.017933;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:791:697,94:407,45:290,49
+chrY	26672403	.	G	T	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.047949;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:57,14:31,10:26,4
+chrY	56677373	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.048559;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:48,6:1,1:47,5
+chrY	56745054	.	A	G	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.046999;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:87,12:53,7:34,5
+chrY	56767649	.	G	A	0	PASS	DP=601;GPV=1;SPV=0.0014573;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:345:282,63:33,3:249,60
+chrY	56828396	.	T	G	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.042377;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:79,12:54,6:25,6
+chrY	56835356	.	TATTCCACTCCACTCCACTCCAGTAC	T	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.0064908;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:105,28:59,18:46,10
+chrY	56835388	.	C	T	0	PASS	DP=212;GPV=1;SPV=0.0035919;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:88,28:47,21:41,7
+chrY	56852614	.	T	G	0	PASS	DP=323;GPV=1;SPV=0.0091544;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:141,25:80,13:61,12
+chrY	56871315	.	AT	A	0	PASS	DP=575;GPV=1;SPV=0.027352;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:310:269,41:132,19:137,22
+chrY	56878251	.	G	GCACACACACA	0	PASS	DP=300;GPV=1;SPV=0.048489;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:136,26:76,16:60,10
+chrY	56879311	.	T	C	0	PASS	DP=491;GPV=1;SPV=0.033825;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:267:234,32:124,17:110,15
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/GH_levels.tab	Wed Sep 16 22:58:28 2020 +0000
@@ -0,0 +1,2 @@
+G.vcf	lung
+H.vcf	ovary
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/H.vcf	Wed Sep 16 22:58:28 2020 +0000
@@ -0,0 +1,5750 @@
+##fileformat=VCFv4.2
+##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed">
+##reference=hg38
+##source=varscan.py
+##contig=<ID=chr1,length=248956422>
+##contig=<ID=chr10,length=133797422>
+##contig=<ID=chr11,length=135086622>
+##contig=<ID=chr12,length=133275309>
+##contig=<ID=chr13,length=114364328>
+##contig=<ID=chr14,length=107043718>
+##contig=<ID=chr15,length=101991189>
+##contig=<ID=chr16,length=90338345>
+##contig=<ID=chr17,length=83257441>
+##contig=<ID=chr18,length=80373285>
+##contig=<ID=chr19,length=58617616>
+##contig=<ID=chr2,length=242193529>
+##contig=<ID=chr20,length=64444167>
+##contig=<ID=chr21,length=46709983>
+##contig=<ID=chr22,length=50818468>
+##contig=<ID=chr3,length=198295559>
+##contig=<ID=chr4,length=190214555>
+##contig=<ID=chr5,length=181538259>
+##contig=<ID=chr6,length=170805979>
+##contig=<ID=chr7,length=159345973>
+##contig=<ID=chr8,length=145138636>
+##contig=<ID=chr9,length=138394717>
+##contig=<ID=chrM,length=16569>
+##contig=<ID=chrX,length=156040895>
+##contig=<ID=chrY,length=57227415>
+##filter="SOMATIC"
+##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL">
+##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total depth of quality bases">
+##INFO=<ID=SOMATIC,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates if record is a somatic mutation">
+##INFO=<ID=SS,Number=1,Type=String,Description="Somatic status of variant (0=Reference,1=Germline,2=Somatic,3=LOH, or 5=Unknown)">
+##INFO=<ID=SSC,Number=1,Type=String,Description="Somatic score in Phred scale (0-255) derived from somatic p-value">
+##INFO=<ID=GPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor+normal versus no variant for Germline calls">
+##INFO=<ID=SPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor versus normal for Somatic/LOH calls">
+##FILTER=<ID=str10,Description="Less than 10% or more than 90% of variant supporting reads on one strand">
+##FILTER=<ID=indelError,Description="Likely artifact due to indel reads at this position">
+##FILTER=<ID=VarCount,Description="Fewer than 4 variant-supporting reads">
+##FILTER=<ID=VarFreq,Description="Variant allele frequency below 0.05">
+##FILTER=<ID=VarAvgRL,Description="Average clipped length of variant-supporting reads < 90">
+##FILTER=<ID=VarReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
+##FILTER=<ID=VarDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
+##FILTER=<ID=VarMMQS,Description="Average mismatch quality sum for variant reads > 100">
+##FILTER=<ID=VarMapQual,Description="Average mapping quality of variant reads < 15">
+##FILTER=<ID=VarBaseQual,Description="Average base quality of variant reads < 15">
+##FILTER=<ID=Strand,Description="Strand representation of variant reads < 0.01">
+##FILTER=<ID=RefAvgRL,Description="Average clipped length of ref-supporting reads < 90">
+##FILTER=<ID=RefReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
+##FILTER=<ID=RefDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
+##FILTER=<ID=RefMapQual,Description="Average mapping quality of reference reads < 15">
+##FILTER=<ID=RefBaseQual,Description="Average base quality of ref-supporting reads < 15">
+##FILTER=<ID=RefMMQS,Description="Average mismatch quality sum for ref-supporting reads > 100">
+##FILTER=<ID=MMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) > 50">
+##FILTER=<ID=MinMMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) < 50">
+##FILTER=<ID=MapQualDiff,Description="Mapping quality difference (ref - var) > 50">
+##FILTER=<ID=MaxBAQdiff,Description="Average base quality difference (ref - var) > 50">
+##FILTER=<ID=ReadLenDiff,Description="Average supporting read length difference (ref - var) > 0.25">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype code">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality">
+##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
+##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele">
+##FORMAT=<ID=ADF,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the forward strand">
+##FORMAT=<ID=ADR,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the reverse strand">
+#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	TUMOR
+chr1	101393	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.044769;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:25,2:5,7
+chr1	131552	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,3:5,1
+chr1	181481	.	A	AG	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0027902;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:20,15:13,12:7,3
+chr1	202670	.	C	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr1	288242	.	G	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.018307;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,4:2,2
+chr1	992992	.	GA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,4:6,2:12,2
+chr1	992995	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12114;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,2:15,2
+chr1	993003	.	A	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,2:14,2
+chr1	993004	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:7,2:12,2
+chr1	1124108	.	CACACACCTGCGCACACCACTGCAT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:7,7:6,1
+chr1	1146234	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.9644e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:10,8:12,6
+chr1	1351361	.	G	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
+chr1	1641642	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.20263;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,1:8,4
+chr1	1985120	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00046276;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:6,5:19,5
+chr1	2617426	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,7:3,6:5,1
+chr1	2671975	.	G	A	0	PASS	DP=321;GPV=1;SPV=0.026206;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:148,20:69,10:79,10
+chr1	2696836	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0094843;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:8,5:1,6
+chr1	2845230	.	A	AACAAAAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0016992;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,9:4,5:4,4
+chr1	3223178	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00072552;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,18:6,7:4,11
+chr1	3868659	.	GCCACA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:7,4:4,3
+chr1	4398515	.	C	CGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.019548;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,7:6,4:4,3
+chr1	5631298	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.042767;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,7:10,6:9,1
+chr1	6275712	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.015395;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:15,4:2,3
+chr1	6570444	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02776;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:16,7:2,3
+chr1	7139230	.	ATATATATT	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.071412;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,5:18,3:15,2
+chr1	7492741	.	A	ACGTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.044075;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:8,4:7,3
+chr1	8121082	.	GTGGCATGAACACTGATTT	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00018017;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,4:9,5
+chr1	8239060	.	CTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:6,2:2,2
+chr1	8601626	.	C	CCACA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.014142;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,6:4,4:1,2
+chr1	8861880	.	T	TA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.038543;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,13:13,6:10,7
+chr1	8901204	.	T	TTTTTA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,1:14,3
+chr1	9099655	.	G	GGCCAGTGCAGATCTGCAAGTCAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14763;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
+chr1	9379767	.	GGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,5:12,2:3,3
+chr1	9634149	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,4:8,3:2,1
+chr1	10199513	.	A	AG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10365;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:7,4:11,1
+chr1	10228364	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.17909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:19,5:10,3:9,2
+chr1	10235862	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,8:0,7:4,1
+chr1	10918938	.	ATTT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,12:5,7:1,5
+chr1	10987386	.	A	AAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0056131;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:11,8:9,2
+chr1	11854533	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,4:3,2:6,2
+chr1	12174172	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.064803;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,6:7,1:19,5
+chr1	12888972	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:2,1:5,8
+chr1	13149557	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
+chr1	13169757	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,3:8,1
+chr1	13701438	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=3.4807e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:10,9:7,6
+chr1	14133379	.	AAG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.22807;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:5,2:6,2
+chr1	14348051	.	A	ATTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,13:2,9:4,4
+chr1	15580201	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020843;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,4:3,2
+chr1	15595170	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.044481;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:16,1:10,4
+chr1	15971476	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,4:13,1:12,3
+chr1	16426583	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
+chr1	16509814	.	G	T	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.0081452;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:100,18:26,8:74,10
+chr1	16547745	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0026193;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:6,3:6,5
+chr1	16606288	.	G	C	0	PASS	DP=311;GPV=1;SPV=0.0016457;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:175:141,34:81,12:60,22
+chr1	16622717	.	C	T	0	PASS	DP=308;GPV=1;SPV=0.012902;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:153,24:73,16:80,8
+chr1	16624955	.	A	AAG	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.011056;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:75,14:33,5:42,9
+chr1	16633203	.	G	A	0	PASS	DP=359;GPV=1;SPV=0.017651;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:210:182,28:101,17:81,11
+chr1	16634406	.	TGTGTGTGTGTGC	T	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.011244;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:102,12:49,4:53,8
+chr1	16644389	.	T	C	0	PASS	DP=389;GPV=1;SPV=0.02049;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:195,26:127,14:68,12
+chr1	16650688	.	C	T	0	PASS	DP=271;GPV=1;SPV=0.014354;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:127,24:65,12:62,12
+chr1	16681062	.	T	C	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:78,11:45,5:33,6
+chr1	16694826	.	G	A	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.022123;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:103,21:46,11:57,10
+chr1	16698874	.	T	G	0	PASS	DP=250;GPV=1;SPV=0.0018208;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:107,33:53,15:54,18
+chr1	16699684	.	C	G	0	PASS	DP=280;GPV=1;SPV=0.046587;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:133,22:75,16:58,6
+chr1	16701595	.	C	T	0	PASS	DP=272;GPV=1;SPV=0.049711;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:143:119,24:50,12:69,12
+chr1	16709200	.	C	T	0	PASS	DP=251;GPV=1;SPV=0.00279;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:113,32:61,17:52,15
+chr1	16709246	.	C	T	0	PASS	DP=240;GPV=1;SPV=0.039109;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:117,18:69,11:48,7
+chr1	16714068	.	A	G	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.047562;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:129,24:68,9:61,15
+chr1	16716376	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.030879;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:18,3:16,7
+chr1	16752059	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11302;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:20,4:1,0
+chr1	16760970	.	G	A	0	PASS	DP=291;GPV=1;SPV=0.041885;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:129,21:72,9:57,12
+chr1	16874735	.	CA	C	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.013765;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:69,11:33,7:36,4
+chr1	16874979	.	C	T	0	PASS	DP=393;GPV=1;SPV=0.040233;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:209:185,24:117,16:68,8
+chr1	17134599	.	G	GCACACA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.043639;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:9,5:18,6
+chr1	17359299	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.0564e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:4,3:9,9
+chr1	18304726	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.075302;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:14,3:17,2
+chr1	19132605	.	T	TAAAAAAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,4:7,1
+chr1	19528188	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.017385;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,5:1,1
+chr1	19653115	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=4.9593e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:11,24:9,17:2,7
+chr1	20815669	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11664;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:6,1:19,4
+chr1	20831279	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.016096;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:15,4:12,6
+chr1	21406937	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.2103;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,2:15,2
+chr1	22336661	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0038123;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:10,2:1,5
+chr1	22790608	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00074026;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:10,7:15,3
+chr1	23256758	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.020884;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,9:5,2:11,7
+chr1	23392474	.	A	AATAC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.13725;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,2:5,1:0,1
+chr1	23392494	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.057792;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,1:0,2
+chr1	23484632	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:2,3:8,7
+chr1	24975159	.	A	AGACGGAAGGAAGGAAG	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,5:4,2
+chr1	26552386	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,5:3,1
+chr1	27167737	.	TC	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.095143;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:22,1:13,3
+chr1	29493274	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00013472;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:27,18:13,9:14,9
+chr1	30780180	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:4,4:5,2
+chr1	31252104	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.031089;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,5:13,1:11,4
+chr1	31252107	.	A	ACAAT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.074163;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,4:15,1:12,3
+chr1	31270360	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00071539;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:13,4:9,6
+chr1	31894583	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.015475;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:9,6:2,3
+chr1	32094117	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:5,4:4,1
+chr1	33598665	.	GT	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.043842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:10,4:2,2
+chr1	33679199	.	GT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0022121;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,13:2,11:3,2
+chr1	33923868	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0019889;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:10,6:16,4
+chr1	35800326	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.13316;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,4:11,3:14,1
+chr1	36158141	.	CA	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.028132;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:15,1:7,4
+chr1	36403222	.	TTA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,2:1,1:1,1
+chr1	36546905	.	GAAAAAGAA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.28552;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,4:18,3:4,1
+chr1	37772399	.	A	AAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00061022;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:2,6:4,4
+chr1	37963872	.	T	TAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,5:1,2:4,3
+chr1	39530887	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0016908;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:10,12:1,1
+chr1	40393541	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,6:7,4:1,2
+chr1	40557103	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
+chr1	41438047	.	T	TA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0011293;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,11:1,9:4,2
+chr1	42183978	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00045819;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:7,7:11,11
+chr1	42214496	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.038206;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:17,2:10,4
+chr1	42864327	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:11,4:1,0
+chr1	43112481	.	TTTTTTTTG	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.009224;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,6:4,3
+chr1	43744652	.	C	CAATAAATAAATAAATAAATA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.31126;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,4:20,1:10,3
+chr1	44259924	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.10026;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:18,4:15,1
+chr1	45223857	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:19,1:8,3
+chr1	46177374	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.036704;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,1:14,3
+chr1	46855143	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.045774;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:18,5:17,3
+chr1	53037879	.	TAC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:10,5:4,3
+chr1	53136668	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.32536;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,5:5,3:8,2
+chr1	53592384	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.022863;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:19,1:19,6
+chr1	54165021	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:4,3:2,2:2,1
+chr1	54382985	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,5:12,4:9,1
+chr1	54411478	.	G	GA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0081016;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,12:3,7:8,5
+chr1	54663700	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.10033;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:13,2:18,2
+chr1	54691803	.	A	AGTGT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0027765;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:1,2:5,6
+chr1	54819812	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:0,0:11,4
+chr1	55480421	.	T	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=9.0495e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:22,18:7,9:15,9
+chr1	55910573	.	ATAAGATGCATGTATT	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0013988;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:17,8:10,7
+chr1	56347475	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0026904;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:10,5:11,4
+chr1	58266064	.	G	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0066857;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:8,2:13,5
+chr1	58323924	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0075295;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:10,6:3,1
+chr1	60409766	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.17449;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:8,1:13,4
+chr1	60637754	.	A	AGAT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.10815;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,6:17,4:13,2
+chr1	61059586	.	G	GT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.011765;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,12:5,9:6,3
+chr1	61432644	.	C	CACAT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,1:9,3
+chr1	61432652	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:13,1:6,3
+chr1	63402460	.	A	AT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:7,5:1,1
+chr1	64239080	.	G	GGAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:7,1:1,4
+chr1	64268661	.	C	CAAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.018299;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,9:9,5:13,4
+chr1	65571808	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,2:2,2
+chr1	67014670	.	G	GT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,8:3,7:4,1
+chr1	67252804	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037022;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,8:10,7:8,1
+chr1	68745664	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,6:3,1
+chr1	69094454	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.01018;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:7,8:11,3
+chr1	69942897	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0040177;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:15,5:15,5
+chr1	73575232	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0026395;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:14,6:8,2
+chr1	75266318	.	T	TACACACACAC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.02769;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,3:9,5
+chr1	75773098	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.5927e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:10,6:4,5
+chr1	75836453	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0005577;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:13,5:13,6
+chr1	78797746	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.014047;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,13:14,9:4,4
+chr1	79104840	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.088975;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:15,1:19,4
+chr1	79281755	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=4.0494e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:10,8:13,6
+chr1	79784600	.	C	CTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.20979;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:2,3:4,1
+chr1	80496447	.	CA	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.04376;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:20,3:16,3
+chr1	81777283	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.085385;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,2:18,2
+chr1	82736650	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,12:2,4:6,8
+chr1	83390878	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.045034;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:16,2:16,8
+chr1	84993619	.	CTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,2:2,2
+chr1	84993787	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11923;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:16,3:20,1
+chr1	84993795	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.093615;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:13,3:22,2
+chr1	86216519	.	G	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:9,3:6,1
+chr1	86445356	.	C	CTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.029349;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,4:7,4
+chr1	87832685	.	ATGTGTG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:3,3:3,1
+chr1	89312748	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00013643;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:14,6:10,9
+chr1	89379349	.	G	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:40:1,3:1,2:0,1
+chr1	89450419	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,4:10,2:18,2
+chr1	90643880	.	T	TTCTTTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065833;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,6:11,2:10,4
+chr1	91212539	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,2:7,2
+chr1	91991991	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.011166;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,12:7,11:1,1
+chr1	92395635	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,10:4,7:6,3
+chr1	93381633	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,4:4,2:8,2
+chr1	93753543	.	TACAC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,10:4,6:3,4
+chr1	93920959	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.18182;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:3,2:3,1:0,1
+chr1	94538288	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=8.7596e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:12,11:11,6
+chr1	95033400	.	TAC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.13974;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:17,1:12,3
+chr1	95569922	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:8,2:4,2
+chr1	95942371	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:5,8:8,4
+chr1	96265847	.	T	TAA	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.015722;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:17,4:15,5
+chr1	96265872	.	T	TAA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.048018;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:15,3:18,3
+chr1	96265897	.	T	TA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1672;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:15,1:18,3
+chr1	98202738	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.03094;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,6:8,3:9,3
+chr1	98219836	.	G	GTCTA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00021044;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,11:9,6:1,5
+chr1	98277222	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=8.6637e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:10,6:8,4
+chr1	99087969	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.055194;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:13,2:7,3
+chr1	99088005	.	GGAAGGAAA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.083817;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
+chr1	100757864	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.16587;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,5:5,4:6,1
+chr1	101132132	.	CATAT	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,4:10,2:9,2
+chr1	101242014	.	T	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,3:12,1
+chr1	101629378	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.017056;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:2,4:8,3
+chr1	102336800	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0071577;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:8,3:10,7
+chr1	102336801	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0027895;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,3:11,7
+chr1	102774230	.	A	ACG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.16084;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:15,3:7,2
+chr1	103296396	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:17,2:9,2
+chr1	103296399	.	CT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.095042;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,2:11,2
+chr1	103361403	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0018037;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,9:1,7:3,2
+chr1	103903581	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.14256;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,3:16,1
+chr1	104507984	.	G	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0028145;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,6:2,4:2,2
+chr1	108180627	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0063215;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,6:5,1
+chr1	108765591	.	T	TTTTTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.051628;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,10:10,2:8,8
+chr1	108956882	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.096154;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,3:4,3:0,0
+chr1	109799145	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0004629;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:12,7:10,4
+chr1	109865700	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.021438;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:19,5:11,1
+chr1	110680507	.	GTTT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:2,2:6,2
+chr1	110710259	.	G	GA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0076326;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:8,8:5,3
+chr1	111010823	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,3:9,1
+chr1	112670362	.	C	CTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.056741;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,7:2,1
+chr1	113070496	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,2:8,2
+chr1	114713908	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00088132;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:13,4:5,5
+chr1	116631317	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0023627;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:10,7:2,2
+chr1	116787614	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00027215;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:9,6:15,5
+chr1	116936521	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0018869;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:11,4:12,3
+chr1	117804204	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.022967;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,7:1,4:2,3
+chr1	119093474	.	A	ATACTAGATTATAGTGGGCTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.011304;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:9,6:9,6
+chr1	120388912	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15365;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:9,2:17,2
+chr1	120651747	.	TTATATATATATA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:8,2:7,2
+chr1	120667417	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.29549;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:6,2:14,2
+chr1	120751114	.	T	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:0,2:5,6
+chr1	120875225	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0054352;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:17,13:10,4
+chr1	120894049	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.079656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:9,1:18,3
+chr1	121106049	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.041446;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:18,8:18,2
+chr1	121261263	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.017225;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
+chr1	121540803	.	GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,3:2,1
+chr1	121683492	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.01255;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:11,10:19,5
+chr1	121817841	.	C	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0047429;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:34,16:21,11:13,5
+chr1	121818090	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.015065;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:13,7:7,5
+chr1	121841329	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.05132;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:1,0:12,4
+chr1	122073628	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr1	122130689	.	C	T	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.034173;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:48,14:9,4:39,10
+chr1	122140191	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:0,0:12,4
+chr1	122211581	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.026676;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:11,3:3,2
+chr1	122777707	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.15567;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:33,4:0,0
+chr1	122777712	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.15343;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:36,4:0,0
+chr1	123438511	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr1	123674920	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
+chr1	124805293	.	C	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,3:10,1
+chr1	124805315	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,3:8,1
+chr1	124816173	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.019316;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:10,7:8,3
+chr1	124829525	.	C	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.010211;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:27,10:3,2
+chr1	124847703	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.40407;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:12,1:17,3
+chr1	124864436	.	A	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.015835;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:60,15:57,14:3,1
+chr1	124886925	.	C	A	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.0073143;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:91,14:55,11:36,3
+chr1	124904278	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.047927;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:2,2:34,4
+chr1	124937130	.	T	C	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:53,8:29,7:24,1
+chr1	143217372	.	G	A	0	PASS	DP=12153;GPV=1;SPV=7.3112e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:6716:5967,679:2289,208:3678,471
+chr1	143219159	.	T	G	0	PASS	DP=6082;GPV=1;SPV=0.0015091;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:3598:3201,394:848,79:2353,315
+chr1	143221432	.	C	G	0	PASS	DP=2929;GPV=1;SPV=0.0058024;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:1839:1627,206:612,25:1015,181
+chr1	143238836	.	A	G	0	PASS	DP=624;GPV=1;SPV=0.012636;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:379:312,39:185,33:127,6
+chr1	143286130	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:1,1:11,3
+chr1	143286145	.	G	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,1:10,3
+chr1	143341813	.	TA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.032618;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:14,2:6,4
+chr1	143548981	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0018005;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:8,4:11,9
+chr1	143712484	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.017225;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:5,4:3,2:2,2
+chr1	144105070	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr1	144139172	.	GTCATT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:15,4:0,1
+chr1	144140974	.	CTCATCTCATT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,0:9,4
+chr1	144809977	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.036364;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
+chr1	144826218	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:1,2:4,1
+chr1	144979925	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.053176;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:27,1:19,6
+chr1	145216558	.	T	TA	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.06166;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:49,6:30,3:19,3
+chr1	145259609	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.018299;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:16,8:14,5
+chr1	145459639	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:6,2:21,2
+chr1	145509861	.	GC	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.03376;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,5:7,1
+chr1	145509867	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.041933;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:14,5:7,1
+chr1	146132649	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
+chr1	146367117	.	C	CAAATAAAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:5,1:5,3
+chr1	146471895	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,2:4,1:2,1
+chr1	146814489	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.012445;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,3:4,6
+chr1	146822050	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:4,7:0,5:4,2
+chr1	146898337	.	GA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
+chr1	146978456	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.095044;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:11,4:16,1
+chr1	147059346	.	GAGAA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0066512;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:9,8:7,4
+chr1	147314778	.	C	CAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0078195;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:13,10:5,3
+chr1	147820458	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.3888e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:16,12:9,9
+chr1	148102043	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.033201;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:9,1:28,4
+chr1	148109008	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:7,2:21,2
+chr1	148471265	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,4:15,2:11,2
+chr1	148631544	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,1:5,3
+chr1	148950409	.	T	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.015249;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:56,12:21,5:35,7
+chr1	149080154	.	C	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.0068761;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:11,2:31,14
+chr1	149370784	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0091476;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,7:7,5:8,2
+chr1	149564326	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.029368;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,2:7,5
+chr1	149653495	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,3:9,1
+chr1	149676655	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.01473;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:10,9:14,1
+chr1	149709540	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0021542;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:14,6:15,8
+chr1	150023512	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.1624e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:10,9:12,7
+chr1	150260751	.	G	GAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,5:1,3:4,2
+chr1	150879491	.	T	TA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,3:2,1
+chr1	150898932	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.099229;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:16,1:10,4
+chr1	150898935	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,1:7,4
+chr1	151148183	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0021064;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:19,6:12,6
+chr1	151600630	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0369;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:8,1:18,6
+chr1	151725107	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.016968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,6:1,5:3,1
+chr1	151758506	.	AAG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.039385;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:5,6:16,6
+chr1	151758508	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,5:3,1:14,4
+chr1	152289480	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.17398;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:19,2:15,2
+chr1	152774068	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=4.1835e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:8,9:11,6
+chr1	153169283	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00014469;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:9,5:16,7
+chr1	153709363	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=2.1506e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:9,7:7,6
+chr1	155204585	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.040363;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:7,8:12,3
+chr1	155517793	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,4:3,2
+chr1	155617244	.	C	CAGGCTCATGGAGGTTCCTGTCTGGGGT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.031538;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:13,2:9,6
+chr1	155858636	.	G	GT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:10,3:6,1
+chr1	156292376	.	AGTGTGTGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0079921;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,11:6,7:7,4
+chr1	157165238	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:3,4:1,1:2,3
+chr1	157340218	.	G	GT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:3,4:4,1
+chr1	157665600	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0033296;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:4,3:12,4
+chr1	157984180	.	TC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.22942;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:12,2:17,2
+chr1	159957140	.	C	CAA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:0,4:0,3:0,1
+chr1	160318480	.	AAAAAAAAAAAAC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,9:6,4:6,5
+chr1	160828888	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14559;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,5:9,1:3,4
+chr1	161055918	.	A	ATAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036566;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:13,4:4,2
+chr1	161055927	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.059981;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:12,4:8,2
+chr1	161055929	.	AT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040221;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:14,4:8,2
+chr1	161055935	.	T	TATA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033935;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,7:6,2
+chr1	161187944	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,3:3,1
+chr1	161423322	.	TG	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.011679;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,7:7,1
+chr1	161558554	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.025171;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:19,2:13,11
+chr1	162124506	.	TG	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.1916;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:25,3:18,2
+chr1	162485998	.	A	AT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.024807;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,6:8,3
+chr1	164978035	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:8,5:1,1
+chr1	165103400	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:2,1:5,7
+chr1	165350173	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0015905;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,9:1,8:1,1
+chr1	165596298	.	ATT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10288;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:14,4:0,2
+chr1	166203242	.	G	GCT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037811;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:5,3:10,8
+chr1	167801285	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0088119;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,12:8,6:6,6
+chr1	168158595	.	TA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0047847;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,5:1,3:3,2
+chr1	169478523	.	ATT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,2:7,5
+chr1	169490735	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:9,5:1,1
+chr1	170244419	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.308e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:12,7:13,7
+chr1	174833402	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,2:6,2
+chr1	175030281	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0001697;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:13,8:14,5
+chr1	176454837	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0017779;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,5:11,6
+chr1	178695649	.	T	TA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.027239;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,9:11,4:8,5
+chr1	179040690	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0064207;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:11,3:4,9
+chr1	179287327	.	T	TAGAAAGAAAGAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,8:6,7:3,1
+chr1	180287409	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:8,3:4,2
+chr1	180514584	.	GA	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,5:2,1
+chr1	180680357	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1182;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:13,2:7,4
+chr1	181210081	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0011498;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:15,6:11,5
+chr1	181893628	.	A	AGT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:10,11:8,6:2,5
+chr1	182174861	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0018511;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,8:0,6:2,2
+chr1	182868520	.	C	CTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,3:8,1
+chr1	182977144	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018873;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,4:3,2
+chr1	183229635	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.13206;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:17,5:7,1
+chr1	184414221	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00037035;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:16,7:19,7
+chr1	185225693	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.033417;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:18,2:15,3
+chr1	186263030	.	CATAATAATA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:12,3:1,3
+chr1	186750129	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00016884;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:7,6:18,5
+chr1	187827169	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,10:8,7:3,3
+chr1	191414328	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.035498;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:16,2:20,3
+chr1	194082117	.	C	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.014019;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:15,5:18,2
+chr1	194151542	.	CTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.008238;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,10:4,7:4,3
+chr1	194743209	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.083396;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:10,1:10,5
+chr1	194978296	.	T	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00059684;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:11,6:20,4
+chr1	195243063	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=3.4904e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:8,8:13,7
+chr1	196714701	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:3,5:0,1
+chr1	196903286	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00035641;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:13,5:11,10
+chr1	199886021	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0002204;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,17:7,7:4,10
+chr1	199912436	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,4:11,1:5,3
+chr1	200014606	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.3618e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:10,10:16,5
+chr1	200094182	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.079987;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:15,2:14,3
+chr1	200587301	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0041401;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,4:9,4
+chr1	200689150	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.014419;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:5,2:15,6
+chr1	201269186	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00099051;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:14,4:14,5
+chr1	202231821	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0069077;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:13,5:14,2
+chr1	202986372	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,6:7,5:5,1
+chr1	203973992	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.028362;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:11,3:13,2
+chr1	204597995	.	GT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:9,2:6,2
+chr1	204754578	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0035259;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:10,5:7,4
+chr1	205538068	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0045484;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:17,7:12,4
+chr1	207359516	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,10:1,7:4,3
+chr1	207515162	.	CATATATAGGTATATACATATAT	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039984;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:18,5:8,5
+chr1	207617598	.	TATATATATATATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,3:6,2
+chr1	207796695	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,4:9,1:11,3
+chr1	209075904	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:0,4:0,4:0,0
+chr1	210450294	.	T	TG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0048875;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,5:4,5
+chr1	210502383	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,5:3,3:3,2
+chr1	211462755	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0034395;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,5:11,3
+chr1	211700176	.	A	AGAAG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,6:4,4:9,2
+chr1	212235662	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00034731;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,5:9,4
+chr1	212253698	.	C	CAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.015677;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,8:9,7:6,1
+chr1	212891303	.	TTGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATTGCTTGAATC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0095284;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:7,4:12,5
+chr1	213702553	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0013541;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:12,8:19,6
+chr1	213798182	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0091975;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:14,5:18,3
+chr1	214569915	.	TGATAGATA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:1,4:0,0:1,4
+chr1	214869483	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.29596;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:12,1:8,2
+chr1	214988039	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,10:5,3:8,7
+chr1	215037002	.	C	CTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0043848;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:5,6:10,4
+chr1	215510953	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00032467;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:12,6:12,5
+chr1	215740118	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=8.0199e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:5,5:12,10
+chr1	216586581	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:5,2:3,2
+chr1	216658848	.	AAGAAGAGAAGAGAAG	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,7:5,3:7,4
+chr1	217611387	.	GCTTCA	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00024118;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:23,23:17,15:6,8
+chr1	218026763	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.001482;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,11:3,9:4,2
+chr1	218643556	.	A	AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:5,5:3,5
+chr1	219698217	.	TCGCGCGCG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:0,2:0,2:0,0
+chr1	219942272	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.065183;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:26,4:12,3
+chr1	221173349	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0079853;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,2:5,4
+chr1	221545261	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.4407e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:25,17:10,8:15,9
+chr1	221877823	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.010459;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,4:7,3
+chr1	222175243	.	G	GTTTATTTATTTA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.035881;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:12,8:15,2
+chr1	222464470	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11553;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,5:12,2:11,3
+chr1	222492235	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0099688;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:16,5:13,3
+chr1	223937919	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0070449;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:4,6:6,4
+chr1	224588968	.	G	GTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:11,3:6,1
+chr1	224735880	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.0437e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:9,6:14,8
+chr1	226176429	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:10,2:4,2
+chr1	227457651	.	A	ATTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,10:3,5:3,5
+chr1	229060485	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.087068;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:12,1:20,4
+chr1	230640922	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0053746;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:5,7:5,3
+chr1	230768045	.	T	TA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,4:13,1:8,3
+chr1	231024914	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:4,4:4,1
+chr1	231045947	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,2:0,1:1,1
+chr1	231532131	.	AACACACACACACACACACACACACACAC	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0087495;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:4,4:3,5
+chr1	231615387	.	TTC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.038146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,4:8,4
+chr1	232386566	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00036492;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:9,6:18,4
+chr1	233318563	.	C	CTTTTTCTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
+chr1	234779794	.	C	T	0	PASS	DP=286;GPV=1;SPV=0.036448;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:133,24:70,13:63,11
+chr1	235452548	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:7,2:4,1:3,1
+chr1	235619159	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:7,2:5,2
+chr1	235877855	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.051826;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,6:10,4:7,2
+chr1	236094275	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:5,5:1,1
+chr1	237070031	.	C	CTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.022366;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,9:9,7:5,2
+chr1	237623359	.	G	GTTTCTTTCTTTCTTTGTTTGTTTC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
+chr1	240993117	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.37564;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,4:12,4:0,0
+chr1	242394382	.	G	GTA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0011874;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:6,7:12,4
+chr1	242421072	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.033818;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:16,5:10,3
+chr1	242795319	.	T	TTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020884;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:11,1:5,8
+chr1	242807126	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0053235;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,5:7,1
+chr1	242945390	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:6,4:0,0
+chr1	243108698	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.04053;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,3:2,5
+chr1	243422206	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.5999e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:9,10:13,6
+chr1	243910533	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.014788;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:13,3:17,4
+chr1	244357228	.	T	TTACTTTCTAATGAGGGCAGGG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.029963;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,1:6,9
+chr1	244664020	.	G	GA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024163;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:6,6:4,1
+chr1	244962517	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.28876;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,4:16,2:9,2
+chr1	245244756	.	T	TCACACA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0026087;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,14:4,10:1,4
+chr1	245408349	.	CTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.070365;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:11,3:9,4
+chr1	246137147	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=7.0323e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,15:7,8:8,7
+chr1	246233552	.	A	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,2:3,2
+chr1	246276021	.	G	GT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0073497;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:7,2:13,7
+chr1	246546312	.	T	TAAAAAAAGAAAAAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.041497;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:8,7:7,1
+chr1	247170154	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,6:4,1
+chr1	248445024	.	CTT	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.075568;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:24,1:11,3
+chr1	248474970	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,3:11,1
+chr1	248553696	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.043382;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:11,4:5,2:6,2
+chr1	248566888	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.024262;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:11,4:12,5
+chr1	248646853	.	TATAA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.064595;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:16,3:3,2
+chr1	248933423	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.15761;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:23,1:12,3
+chr10	39740	.	G	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,1:7,4
+chr10	264916	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,3:3,1
+chr10	384271	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:8,4:2,3
+chr10	1987672	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10396;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:9,2:16,3
+chr10	2164519	.	T	TA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.039018;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:11,6:4,4
+chr10	2252824	.	T	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0003089;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:7,6:18,6
+chr10	2354136	.	CATAT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042556;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,3:7,4
+chr10	2423901	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0032719;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:4,5:11,8
+chr10	3062566	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021122;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,2:4,6
+chr10	3597990	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,6:0,4:6,2
+chr10	5842915	.	C	CAAAT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.011265;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:11,7:11,3
+chr10	5957593	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.010837;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:4,4:4,1
+chr10	6302379	.	T	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:1,3:6,1
+chr10	6960037	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00024732;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:12,4:13,10
+chr10	7228730	.	TCTTTCCTTTC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:9,3:9,1
+chr10	7634088	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.011294;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:9,6:5,1
+chr10	7988572	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:9,3:4,1
+chr10	8268931	.	T	TA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:3,4:6,2
+chr10	8268957	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,3:7,1
+chr10	8471423	.	G	GTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0094549;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,7:3,5:8,2
+chr10	8536317	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.14763;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,4:17,1:5,3
+chr10	11628933	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:10,3:2,1
+chr10	12056448	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.17217;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:4,3:5,2
+chr10	13136505	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,4:9,3:3,1
+chr10	13290115	.	CAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.011899;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:7,7:1,1
+chr10	13750073	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.14038;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:19,6:8,1
+chr10	13884103	.	A	AAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023137;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:7,8:8,2
+chr10	15037580	.	C	CAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.029599;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,8:8,6:13,2
+chr10	15135203	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.031709;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:15,4:14,4
+chr10	15749660	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:11,2:5,3
+chr10	15827176	.	TA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,10:5,8:3,2
+chr10	16955374	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,6:2,1
+chr10	17379320	.	A	AGAAGAGGAGAGGG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:15,8:3,2
+chr10	17474821	.	G	GT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0054674;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,10:5,9:6,1
+chr10	17762616	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,3:1,2:4,1
+chr10	18499807	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.04473;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:15,3:14,3
+chr10	19238757	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,5:2,3
+chr10	20333222	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,5:3,4:12,1
+chr10	20348042	.	CCA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0070433;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,10:5,5:0,5
+chr10	21382464	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:5,9:6,2
+chr10	22197222	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.029097;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,12:11,8:6,4
+chr10	22198049	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.025362;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,4:5,3
+chr10	23134573	.	G	GAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,4:6,3:10,1
+chr10	23817962	.	CAT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:4,2:2,2
+chr10	25241316	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,1:12,3
+chr10	25450826	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0017392;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:12,5:12,5
+chr10	26333448	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:9,4:4,1
+chr10	26432529	.	A	AAAAATAAAAT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.013387;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,7:1,4:7,3
+chr10	27442949	.	ATATACATG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.021198;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:13,6:9,1
+chr10	27442960	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.014495;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,7:10,6:9,1
+chr10	28460077	.	C	CTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:3,2:3,4
+chr10	28541417	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:4,6:7,1
+chr10	28541419	.	TG	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.083772;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:7,3:8,4
+chr10	29003220	.	AT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0025933;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:7,6:11,5
+chr10	29003240	.	TTA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.028014;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:8,4:9,4
+chr10	29003243	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:6,4:9,3
+chr10	29702175	.	C	CAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:6,2:3,2
+chr10	30037934	.	T	TAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036129;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,5:5,4
+chr10	30230380	.	G	GT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.01049;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,7:3,5:0,2
+chr10	30349279	.	T	TA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:4,5:3,1
+chr10	30431035	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.044393;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:14,4:16,3
+chr10	30431036	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.025513;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:14,5:16,3
+chr10	30611566	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.016716;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:10,5:3,1
+chr10	30626969	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.049127;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,1:11,3
+chr10	30650858	.	C	CAAATAAATAAAT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00021441;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,11:0,4:5,7
+chr10	30661198	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.011004;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:8,3:7,7
+chr10	30739448	.	AAG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035509;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,10:15,7:1,3
+chr10	31675541	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0022464;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:17,6:15,5
+chr10	31980130	.	TAGATAGGA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0035849;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:11,5:5,9
+chr10	32649442	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.6015e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:11,6:8,11
+chr10	33837987	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.001508;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:11,7:18,4
+chr10	33842853	.	A	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040465;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,8:10,3:8,5
+chr10	33864862	.	TCA	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.029588;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,11:10,9:2,2
+chr10	35861759	.	C	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00014249;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:9,8:7,5
+chr10	37214540	.	G	GTA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.014023;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:8,4:7,6
+chr10	37961857	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0036228;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,18:12,6:4,12
+chr10	38623792	.	C	CA	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.01031;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:22,5:13,5
+chr10	38646573	.	T	A	0	PASS	DP=168;GPV=1;SPV=0.042626;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:74,16:40,8:34,8
+chr10	38655361	.	AG	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.0077239;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,16:15,4:29,12
+chr10	38719714	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.052773;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:19,4:13,1
+chr10	38886532	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.037012;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:10,6:9,1
+chr10	38961421	.	G	A	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.027722;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:63,9:35,4:28,5
+chr10	39160804	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0014612;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:17,6:23,9
+chr10	39468920	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,4:5,1
+chr10	39576813	.	C	T	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.044303;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:100,20:54,11:46,9
+chr10	39999510	.	T	C	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.013792;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:113,13:66,4:47,9
+chr10	40412289	.	T	G	0	PASS	DP=203;GPV=1;SPV=0.019829;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:97,21:60,7:37,14
+chr10	40483815	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.04926;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:30,10:0,1
+chr10	40545213	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048244;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:12,5:15,1
+chr10	40586508	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.011161;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:37,17:4,2:33,15
+chr10	40593167	.	T	TG	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.11654;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:13,1:25,4
+chr10	40595283	.	T	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.013497;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:34,11:5,1
+chr10	40607366	.	C	G	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.025414;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:141:116,25:98,23:18,2
+chr10	41175698	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.014021;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:5,4:27,6
+chr10	41188899	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.19386;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:0,0:35,4
+chr10	41221965	.	C	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:9,3:2,1
+chr10	41235509	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,1:9,3
+chr10	41330689	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.23474;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:5,2:22,1
+chr10	41502686	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.09755;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:25,3:8,1
+chr10	41530219	.	T	G	0	PASS	DP=388;GPV=1;SPV=0.00092621;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:176,41:96,5:80,36
+chr10	41568363	.	G	C	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.034801;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:70,10:18,6:52,4
+chr10	41574820	.	C	A	0	PASS	DP=371;GPV=1;SPV=0.032569;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:211:172,31:79,18:93,13
+chr10	41580002	.	T	TA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:21,3:4,1
+chr10	41590751	.	G	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.030865;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:58,8:50,7:8,1
+chr10	41591877	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.036993;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:0,1:31,6
+chr10	41700179	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:16,4:0,0
+chr10	41873892	.	A	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0077412;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,16:11,8:18,8
+chr10	41876136	.	A	AATGGAATGGAATGGT	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.039452;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:55,11:26,4:29,7
+chr10	41882443	.	G	C	0	PASS	DP=382;GPV=1;SPV=0.0082439;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:218:180,38:99,16:81,22
+chr10	41883355	.	C	A	0	PASS	DP=340;GPV=1;SPV=0.021995;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:185:152,33:93,23:59,10
+chr10	41886095	.	T	C	0	PASS	DP=446;GPV=1;SPV=0.017344;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:244:208,36:111,18:97,18
+chr10	41886098	.	A	T	0	PASS	DP=483;GPV=1;SPV=0.035494;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:266:232,34:137,16:95,18
+chr10	41896476	.	C	A	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.048087;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:41,7:24,6:17,1
+chr10	41906794	.	G	A	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.010477;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:44,7:23,5:21,2
+chr10	41908349	.	G	A	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.040619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:90,15:40,8:50,7
+chr10	41912211	.	C	G	0	PASS	DP=359;GPV=1;SPV=0.029288;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:219:185,33:96,18:89,15
+chr10	41914473	.	G	C	0	PASS	DP=494;GPV=1;SPV=0.00070564;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:278:221,57:162,35:59,22
+chr10	41916118	.	G	GTGGAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.023496;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:3,1:19,9
+chr10	42070978	.	G	T	0	PASS	DP=4375;GPV=1;SPV=0.046915;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2656:2378,277:805,82:1573,195
+chr10	42130126	.	T	C	0	PASS	DP=485;GPV=1;SPV=0.0068565;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:244:205,39:98,20:107,19
+chr10	42130231	.	T	C	0	PASS	DP=535;GPV=1;SPV=0.022795;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:280:249,31:75,17:174,14
+chr10	42130529	.	T	C	0	PASS	DP=247;GPV=1;SPV=0.030266;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:117,25:38,12:79,13
+chr10	42232204	.	C	T	0	PASS	DP=190;GPV=1;SPV=0.042091;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:98,16:62,13:36,3
+chr10	42257919	.	T	TG	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.036907;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:60,16:36,5:24,11
+chr10	42336689	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0051191;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:18,6:12,6
+chr10	43933103	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.011728;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,10:8,8:5,2
+chr10	44351318	.	C	CTT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.082275;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:9,4:22,1
+chr10	44387704	.	A	ATAAATAAATAAATAAATATG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.046798;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,9:9,5:17,4
+chr10	45040366	.	G	GGACACAGAGTTAATAACTCATA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0086905;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:9,7:9,5
+chr10	45040367	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:7,7:8,5
+chr10	46770659	.	A	AAACAAAACAAAAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.14282;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,6:9,1
+chr10	46788092	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.031149;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:12,3:19,2
+chr10	46790389	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.042981;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,6:10,1
+chr10	47333220	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00010136;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,7:8,4
+chr10	47533218	.	C	CACAT	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.036306;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:26,2:12,5
+chr10	47743936	.	C	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,3:10,1
+chr10	47925390	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.12269;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:14,4:8,1
+chr10	47995880	.	GT	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.040006;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:24,1:14,7
+chr10	48009476	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0066407;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:14,9:5,3
+chr10	48979576	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,4:6,1:14,3
+chr10	49148830	.	A	ATG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,3:5,1
+chr10	50153979	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021256;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:9,5:1,1
+chr10	50278329	.	GT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:5,7:1,3
+chr10	50776052	.	G	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.00090389;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:48,28:29,19:19,9
+chr10	52274536	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.10359;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:12,3:17,1
+chr10	53966068	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.036947;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:11,2:10,4
+chr10	53978658	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.025213;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,6:8,2:4,4
+chr10	54622852	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.00095261;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:2,9:2,7:0,2
+chr10	55247892	.	G	GA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023277;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,9:8,7:5,2
+chr10	57452880	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0018707;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:9,4:9,5
+chr10	58781647	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.7569e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:11,5:14,9
+chr10	63097696	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,2:7,2
+chr10	65373204	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0033085;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:13,3:9,7
+chr10	65653553	.	C	CAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,12:4,9:1,3
+chr10	65793818	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=6.8867e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:19,7:11,10
+chr10	66036862	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0091209;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:11,5:3,4
+chr10	66082275	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0037028;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:4,2:11,3
+chr10	66745587	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,2:5,3
+chr10	66829854	.	T	TTTGTTGTTGTTG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,8:3,3:6,5
+chr10	68485798	.	A	ATT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0033833;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:10,7:7,5
+chr10	68589662	.	ATT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,3:3,4
+chr10	68929299	.	CTCTCTCTCTCTCTCTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:2,1:11,4
+chr10	69233935	.	G	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.014832;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:5,4:3,6
+chr10	69251087	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,6:3,2
+chr10	70133098	.	AAGAGAGAGAG	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.023137;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,10:11,6:4,4
+chr10	70149547	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.023079;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:2,4:2,1
+chr10	71091725	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,1:4,5
+chr10	71420496	.	GGTA	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:4,5:2,5
+chr10	71910482	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:8,11:5,9:3,2
+chr10	72421002	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:10,6:5,1
+chr10	72587464	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,10:9,9:4,1
+chr10	73736975	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:5,7:2,2
+chr10	74694147	.	A	ATT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01204;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,14:6,6:1,8
+chr10	74733234	.	G	GC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.042069;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:11,2:11,8
+chr10	75330233	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.9498e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:9,5:9,10
+chr10	76485873	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00030588;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:18,9:8,6
+chr10	76562367	.	C	CAGAGAGAG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.011519;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:16,10:5,2
+chr10	76617883	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.10288;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:11,2:3,4
+chr10	77445367	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,4:7,3:11,1
+chr10	77937874	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011316;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,7:3,2
+chr10	78030446	.	CTA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024751;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:10,5:2,2
+chr10	78924630	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.3144e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:8,7:16,12
+chr10	79424206	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0010783;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:11,6:10,5
+chr10	80566090	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,4:3,1
+chr10	82094896	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.5053e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:9,8:15,5
+chr10	82713119	.	CAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.077477;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:4,5:4,1
+chr10	82892679	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.16171;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,1:13,3
+chr10	83829207	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.2772e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:12,9:13,4
+chr10	85225562	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=1.9493e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:6,7:7,5
+chr10	85810124	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.20218;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:6,1:18,3
+chr10	87343048	.	G	GTCGCC	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.019585;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:29,7:15,7
+chr10	87349109	.	A	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00021594;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:16,7:14,5
+chr10	87592124	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,2:13,2
+chr10	87853117	.	A	AT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0035197;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,9:5,4:3,5
+chr10	88672625	.	AACACACAC	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076651;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:9,3:3,2
+chr10	89196270	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.20218;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,4:15,3:9,1
+chr10	89534644	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:4,6:2,1
+chr10	90331440	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:4,4:3,1
+chr10	92015428	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00031133;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:7,10:20,3
+chr10	92295315	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,5:0,4:1,1
+chr10	92439486	.	ACTCTCTCT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.1839;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,6:5,1:7,5
+chr10	92523701	.	T	TA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.033527;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:9,5:11,5
+chr10	93923837	.	C	CTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,3:5,2
+chr10	93994065	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.071318;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,4:15,2:5,2
+chr10	94465670	.	A	ATATGTGTGTG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.012883;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,11:13,4:9,7
+chr10	94530160	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.025587;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:15,4:16,2
+chr10	96802771	.	GTTTC	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00093161;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:6,6:22,6
+chr10	96802886	.	T	TTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:4,1:11,4
+chr10	97102439	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,4:3,1:3,3
+chr10	97626398	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:35:3,9:0,6:3,3
+chr10	97642838	.	CCTTCCTTCCTTCCTTT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.077519;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:5,1:16,3
+chr10	97919747	.	A	AG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.017286;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:7,7:7,4
+chr10	97919771	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0052707;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:6,5:7,3
+chr10	98265338	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0065689;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,4:5,5
+chr10	98696292	.	TA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.044444;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,3:3,2
+chr10	100242673	.	CAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.017042;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:8,5:8,5
+chr10	100651274	.	CTCCCACCACCTCCACTAG	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.021053;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
+chr10	100728575	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.001881;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:10,4:10,4
+chr10	101277345	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.032693;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:22,5:11,1
+chr10	102543991	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=5.0407e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,18:9,9:3,9
+chr10	102571521	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.023972;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:12,5:8,4
+chr10	103265239	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.046615;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,8:12,1:3,7
+chr10	103482998	.	A	AG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,6:6,3:5,3
+chr10	104458568	.	GTGTA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:5,2:8,2
+chr10	104749226	.	GGT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.050519;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:7,4:13,4
+chr10	105856310	.	T	TATATGTA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,3:8,1
+chr10	107262183	.	C	CA	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.019365;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,15:14,9:13,6
+chr10	107528169	.	A	ATT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,15:3,6:6,9
+chr10	107535345	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.08973;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:19,3:20,2
+chr10	108314869	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:1,6:3,2
+chr10	108359682	.	A	ATT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:6,6:6,2
+chr10	109242766	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:1,2:5,1
+chr10	111556874	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00036768;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:14,8:13,7
+chr10	111873917	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0051191;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:14,5:16,7
+chr10	112743571	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0036217;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:14,7:10,2
+chr10	112965619	.	GTGTGTGTATA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.025787;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,2:7,6
+chr10	113539025	.	A	ACAAG	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.09755;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:25,3:8,1
+chr10	114583404	.	AACACACACAC	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:16,3:3,1
+chr10	114884964	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00045655;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:8,5:11,6
+chr10	115446841	.	AATTGTGGATCTCCG	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00011455;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:17,8:9,5
+chr10	115583563	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0048547;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:6,8:3,1
+chr10	115632864	.	T	TTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.047124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,2:7,2
+chr10	115852033	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0094722;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:16,4:10,4
+chr10	120996872	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0027508;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:13,3:12,5
+chr10	121177924	.	CTA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,1:9,3
+chr10	122136543	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.001638;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,6:4,2
+chr10	122176073	.	TTCTCTC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:6,3:7,1
+chr10	122893058	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,4:9,1:3,3
+chr10	123068651	.	T	TAC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0073135;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:10,5:15,7
+chr10	123068667	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016188;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:8,5:8,6
+chr10	124563313	.	C	CTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.054945;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,8:2,7:1,1
+chr10	125098657	.	GGAGA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,4:2,1:0,3
+chr10	125098740	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.055746;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,1:9,3
+chr10	125636372	.	A	AT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,11:5,7:2,4
+chr10	125894836	.	C	T	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.010391;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:92,12:51,8:41,4
+chr10	125900074	.	A	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.02342;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:45,7:23,6:22,1
+chr10	126002763	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:7,2:4,5
+chr10	126905003	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.6575e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,20:17,7:10,13
+chr10	128738180	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00033815;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:17,5:10,6
+chr10	129560954	.	A	AGT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0030632;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,12:4,10:3,2
+chr10	129629632	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.010836;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:9,5:16,1
+chr10	131150240	.	C	CCCCCACGGTTCTATGCACACCAGTGATCTGGGCATAGCA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,4:1,3:1,1
+chr10	131777963	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.010707;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,3:6,2
+chr10	132237175	.	TGACTGTGCTCCCTG	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,3:8,2
+chr10	132824932	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18627;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:8,1:10,2
+chr10	132858997	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0021771;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:13,5:18,4
+chr10	133403341	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:8,7:1,2
+chr10	133536297	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.019608;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:15,4:10,7
+chr10	133650165	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.06388;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:16,5:32,2
+chr10	133765527	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:18,3:12,2
+chr11	133520	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.046808;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:21,8:23,1
+chr11	148063	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0074853;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,4:10,7
+chr11	192716	.	G	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.032095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,1:7,5
+chr11	2132055	.	G	GTA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.065833;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:12,1:9,5
+chr11	3504395	.	ATTT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00020889;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:17,23:8,17:9,6
+chr11	3754941	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.20787;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,6:11,5:9,1
+chr11	4349920	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020884;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:5,4:11,5
+chr11	6214034	.	GA	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,4:1,0
+chr11	7427021	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0092391;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:8,5:11,9
+chr11	8915356	.	TTC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0737;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:5,1:10,5
+chr11	8952275	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.14184;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:10,1:12,2
+chr11	10250636	.	T	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00010692;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:13,10:14,6
+chr11	10336617	.	TCGCCACACTGACTTC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0033085;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:11,5:11,5
+chr11	11110047	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,4:9,3:4,1
+chr11	11560150	.	A	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.006865;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,4:3,2
+chr11	12168964	.	GAAAA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,4:5,3:5,1
+chr11	12484504	.	G	GGTGTGT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0037237;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,10:5,6:4,4
+chr11	12606499	.	C	CTATATATA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.091388;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:8,5:7,1
+chr11	12870983	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=7.7661e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:14,12:12,2
+chr11	13461930	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:9,8:2,1
+chr11	14415903	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.13094;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,6:7,4:7,2
+chr11	15116804	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:2,1:12,3
+chr11	15207646	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0026408;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:9,5:19,5
+chr11	16674189	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:9,3:7,1
+chr11	17051564	.	G	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.082922;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,6:12,2:6,4
+chr11	17180515	.	C	CA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043132;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,1:11,3
+chr11	17470732	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0011187;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,20:11,8:8,12
+chr11	19130795	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0016553;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:12,6:6,6
+chr11	19162412	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00020442;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,17:6,6:7,11
+chr11	20246180	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00078492;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:12,5:15,6
+chr11	20323826	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.048573;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:11,3:7,3
+chr11	20525459	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:12,1:10,4
+chr11	20895504	.	C	CTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.00014247;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,10:3,9:1,1
+chr11	21805391	.	TATAAAA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0077399;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,6:0,3:4,3
+chr11	22338812	.	GGT	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.023047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:11,8:12,5
+chr11	24594750	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.27607;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,2:6,2
+chr11	24796491	.	C	CTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0082728;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:9,5:4,5
+chr11	25075242	.	A	AGAATTTAGAATTAGGTGGTT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00040909;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,9:10,3:12,6
+chr11	25075245	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0014004;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,9:12,3:12,6
+chr11	25413650	.	G	GA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:7,6:4,4
+chr11	25422012	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=2.7081e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:10,9:12,6
+chr11	25526201	.	GAACCCT	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0027902;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:9,6:11,9
+chr11	25939239	.	AC	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:2,3:1,1:1,2
+chr11	27280562	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.030384;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:24,4:8,2
+chr11	29243445	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.002428;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:17,7:14,3
+chr11	29589997	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0064655;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:17,3:17,4
+chr11	29850687	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0026395;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:12,4:10,4
+chr11	29943767	.	G	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.4224e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:14,7:6,7
+chr11	30215486	.	A	AATAT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0058369;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:6,9:5,1
+chr11	31488181	.	G	GA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=2.2013e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:7,7:7,5
+chr11	32685005	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00096973;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:8,3:19,6
+chr11	32755691	.	A	ATG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0099605;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:3,1:2,3
+chr11	33615191	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=7.9328e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:10,8:12,6
+chr11	35244742	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00019519;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:8,2:11,9
+chr11	35466726	.	C	CAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.064336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:11,6:6,1
+chr11	39502414	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0055442;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:10,8:17,2
+chr11	40042470	.	G	GATGT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0079397;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:8,4:10,5
+chr11	40739007	.	TTG	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0019977;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:12,7:11,11
+chr11	40739012	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.02308;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:13,4:13,10
+chr11	41314601	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0014171;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:12,4:13,5
+chr11	41754571	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.000113;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:13,10:10,3
+chr11	42281746	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00080797;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:14,6:11,5
+chr11	42682166	.	GTA	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.1041;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:20,2:12,3
+chr11	42791649	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.04277;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:11,6:15,1
+chr11	43588608	.	AG	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.25578;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:20,1:12,3
+chr11	43668265	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00032166;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:14,6:5,6
+chr11	43673492	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.096154;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,7:2,4:2,3
+chr11	43873897	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00059631;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:14,7:9,5
+chr11	43999488	.	C	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0029195;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:9,5:4,8
+chr11	45990712	.	G	GT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:9,6:2,3
+chr11	47421249	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:4,3:4,1
+chr11	48268292	.	CTTA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.015172;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,6:3,2:4,4
+chr11	49096715	.	GTATATA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.010876;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,6:6,4:4,2
+chr11	49096717	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,6:2,4:4,2
+chr11	50212999	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,7:7,6:0,1
+chr11	50258764	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00043913;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:11,5:3,6
+chr11	50687286	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.048707;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,2:11,2
+chr11	51203809	.	G	C	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.028967;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:79,15:3,1:76,14
+chr11	51268122	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.031805;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:12,5:25,9
+chr11	51584839	.	G	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,1:10,3
+chr11	51918829	.	T	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.20097;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:34,4:0,0
+chr11	52454893	.	C	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.022359;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:45,10:29,8:16,2
+chr11	52688785	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.015078;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,10:12,7:12,3
+chr11	53273209	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.031574;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:17,5:12,2
+chr11	53713343	.	A	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.036103;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:45,10:27,6:18,4
+chr11	54346041	.	G	A	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.039819;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:58,12:8,2:50,10
+chr11	54359415	.	T	C	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.030326;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:59,11:32,7:27,4
+chr11	54373339	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.047029;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,5:18,2:17,3
+chr11	54527614	.	A	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.023165;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:51,13:28,9:23,4
+chr11	54528337	.	G	A	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.045252;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:69,17:27,10:42,7
+chr11	54716696	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=3.7006e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,20:11,11:6,9
+chr11	54930773	.	A	T	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.030304;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:46,13:20,8:26,5
+chr11	57403449	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.018691;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,3:2,3
+chr11	57716572	.	A	ACCC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,1:8,3
+chr11	58053630	.	A	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:7,2:2,2
+chr11	59153703	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:11,6:5,4
+chr11	59570881	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:8,6:3,1
+chr11	59632729	.	C	CTATA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
+chr11	59729119	.	ACTTCCGTGTGGCCACCATCACCATCCCCTTC	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.027483;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:21,4:17,2
+chr11	61199053	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00020157;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:17,9:12,4
+chr11	61538352	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0025067;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:11,7:7,5
+chr11	61939559	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0015209;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:12,7:5,2
+chr11	62951703	.	ATG	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0024326;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:1,2:3,6
+chr11	62951735	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.0067873;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:3,2:0,4
+chr11	63062558	.	C	CTTTTTTTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0030303;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:0,4:0,2:0,2
+chr11	64444240	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.038078;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:4,4:9,3
+chr11	64549871	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,5:3,4:3,1
+chr11	64595844	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,3:4,1
+chr11	64929914	.	T	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.032593;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:6,7:13,4
+chr11	65250286	.	G	GAGAGAAAGAAAGAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:7,3:6,1
+chr11	65637377	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0036482;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:3,5:3,4
+chr11	65732470	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.060413;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:12,4:5,1
+chr11	65781006	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0011112;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:14,6:20,7
+chr11	68421686	.	CTG	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0035533;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:6,12:6,2
+chr11	68511463	.	A	AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024823;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:10,3:9,2
+chr11	69009315	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.0256e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:8,9:11,9
+chr11	69020915	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00023464;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:10,4:15,7
+chr11	69020916	.	G	GC	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00027215;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:10,4:14,7
+chr11	69020917	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.000451;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:10,4:14,6
+chr11	69020918	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00065599;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:9,4:14,5
+chr11	70740115	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.020178;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:9,8:12,2
+chr11	71730993	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.1063;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:23,1:20,4
+chr11	71886995	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00084999;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:14,6:7,4
+chr11	71982335	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0041408;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:6,10:2,2
+chr11	72150044	.	C	CAA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.001998;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,9:0,7:0,2
+chr11	72258983	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,1:6,3
+chr11	72346999	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10559;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:16,1:16,3
+chr11	73131931	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0010794;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:15,8:16,6
+chr11	76174508	.	TCATC	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0036197;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:7,5:9,5
+chr11	76303861	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=7.061e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:12,5:14,12
+chr11	77057058	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0001506;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:12,8:10,3
+chr11	77397245	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0025855;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:10,3:15,6
+chr11	77479602	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.20979;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:5,3:1,1
+chr11	78108608	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.594e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:7,11:18,8
+chr11	79324390	.	TA	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.017796;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:15,3:15,3
+chr11	79509907	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:9,6:3,1
+chr11	80100384	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.4794e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:8,8:10,9
+chr11	81523077	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.057396;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:14,3:9,2
+chr11	83508403	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.022727;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,3:6,2
+chr11	83510830	.	G	GTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:3,2:4,2
+chr11	85325809	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,2:10,2
+chr11	85536214	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:7,4:7,1
+chr11	88556319	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:14,3:3,2
+chr11	89210366	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.014776;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:9,7:9,5
+chr11	89210381	.	TGAAATAAAGTAA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.032072;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:7,5:9,4
+chr11	89262873	.	C	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,2:0,0:4,2
+chr11	89935310	.	AT	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.003711;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:5,5:12,4
+chr11	91801131	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0035851;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,18:5,10:12,8
+chr11	93346145	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0015381;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:18,7:14,6
+chr11	93452906	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=6.2649e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:7,7:12,9
+chr11	94238696	.	G	A	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.039739;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:130,28:70,11:60,17
+chr11	95318308	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=2.6145e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:8,5:9,9
+chr11	95462565	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:3,1:11,3
+chr11	95724559	.	G	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0012048;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:15,6:11,4
+chr11	95899636	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.044118;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:2,12:0,9:2,3
+chr11	97605010	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=2.3706e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:8,6:13,8
+chr11	97800296	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00095953;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:7,4:8,5
+chr11	99547003	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.02002;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,8:6,1
+chr11	100579989	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0009678;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,5:8,4
+chr11	100636542	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01236;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,10:10,7:3,3
+chr11	100796768	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021189;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:13,7:1,2
+chr11	101085525	.	T	TAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,7:2,5:5,2
+chr11	101548588	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0019763;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,21:4,13:10,8
+chr11	101626454	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0025527;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:11,4:9,4
+chr11	102490405	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.014223;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:7,5:9,1
+chr11	103526491	.	ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,2:2,2
+chr11	103627150	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,7:5,5:6,2
+chr11	103985078	.	TATTTATTTAATATATTATATATTA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.14555;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,4:12,3:13,1
+chr11	104675226	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0023332;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:10,1:13,7
+chr11	107859582	.	T	TAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,2:6,2
+chr11	107986890	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=7.2622e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:9,7:3,7
+chr11	108190312	.	CAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,8:6,7:2,1
+chr11	108573200	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.25578;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:25,2:7,2
+chr11	109502297	.	T	TGG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.019439;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:6,2:10,4
+chr11	110212787	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.061686;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:29,3:8,4
+chr11	112138696	.	G	GT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,9:9,7:1,2
+chr11	112258281	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.013387;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,5:3,2
+chr11	112272994	.	CTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,8:1,4:8,4
+chr11	112359680	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,10:1,7:2,3
+chr11	114890146	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.4853e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:9,10:10,6
+chr11	115738577	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.13884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:15,1:17,3
+chr11	116128030	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0024076;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:7,4:14,3
+chr11	116815591	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:6,2:4,2
+chr11	119066564	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.049732;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:12,2:14,5
+chr11	119441391	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=8.8917e-09;SS=2;SSC=80;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,18:6,10:7,8
+chr11	121344692	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0075968;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,16:5,8:11,8
+chr11	121347807	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0017048;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:11,5:4,5
+chr11	121474639	.	T	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0091933;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:23,4:14,4
+chr11	121830325	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.4315e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:12,6:11,6
+chr11	122017449	.	TAC	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.043924;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:18,4:1,2
+chr11	122367751	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04422;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,7:11,6:3,1
+chr11	122367757	.	GAA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,8:10,7:1,1
+chr11	122374174	.	C	CTGTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,14:1,8:6,6
+chr11	122861418	.	A	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,3:0,1:0,2
+chr11	123668120	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0025434;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,9:16,5:11,4
+chr11	124828284	.	AATTTATTT	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.032794;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,5:11,3
+chr11	124857970	.	ATATATATAT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,2:3,1:0,1
+chr11	124968725	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0040177;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:15,5:15,5
+chr11	127568678	.	C	CAAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.044511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,8:11,6:2,2
+chr11	127821345	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.069764;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:11,4:10,4
+chr11	127940250	.	G	GTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,7:1,5:4,2
+chr11	130398137	.	C	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.6575e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:27,20:16,14:11,6
+chr11	131080791	.	A	ATTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.035315;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,6:7,2
+chr11	131193574	.	C	CT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.014457;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:8,6:14,7
+chr11	131266416	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0013974;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,12:3,5:7,7
+chr11	131653832	.	A	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00044773;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:13,5:22,9
+chr11	131722021	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:2,3:5,2
+chr11	132764193	.	C	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=5.2009e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:11,9:15,7
+chr11	133393042	.	C	CTTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,2:10,2
+chr11	133534575	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0003086;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:13,7:8,4
+chr11	133647801	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0062702;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:19,5:9,5
+chr11	133675445	.	G	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0069146;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:10,8:5,2
+chr11	134454134	.	G	GT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.041468;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:22,3:16,3
+chr11	134457831	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,3:7,1
+chr12	398444	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:3,2:1,1:2,1
+chr12	722069	.	G	GAGAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:6,4:2,2
+chr12	1501252	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.11252;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,1:10,6
+chr12	1662346	.	C	CCT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:0,0:6,4
+chr12	2873398	.	C	CAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,6:9,4:3,2
+chr12	2883504	.	TATATATA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,2:3,1:1,1
+chr12	3304425	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00056062;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:10,2:17,8
+chr12	3752353	.	CACGG	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.001437;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,11:18,8:7,3
+chr12	3931690	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,2:0,1:4,1
+chr12	4316865	.	GTT	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0086713;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,9:22,5:12,4
+chr12	4709366	.	G	GT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030401;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,3:5,5
+chr12	5837205	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.074026;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,4:6,3:9,1
+chr12	6057480	.	T	TTTA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.037198;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,5:5,2:5,3
+chr12	6068835	.	CGTGT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0012607;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:3,3:6,6
+chr12	7257197	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01971;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,4:5,4
+chr12	7517715	.	A	AGAAAG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14404;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,7:12,6:3,1
+chr12	7590078	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:1,1:6,3
+chr12	7827073	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:9,1:14,3
+chr12	7869465	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016558;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:21,1:14,6
+chr12	7878993	.	A	AC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0065359;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,10:1,6:2,4
+chr12	8050896	.	C	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:0,0:5,2
+chr12	8205043	.	GC	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.048024;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:20,3:19,7
+chr12	8213852	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.033008;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:19,3:16,8
+chr12	8217002	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.011994;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:17,4:19,2
+chr12	8463123	.	GAACT	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=5.6664e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,19:7,12:8,7
+chr12	9109034	.	T	TTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0067749;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:6,6:10,8
+chr12	9120852	.	C	CATGTGTGTGT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,9:2,5:8,4
+chr12	9293180	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:1,2:9,5
+chr12	10319865	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:6,7:1,1
+chr12	10339343	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.026073;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,4:6,1
+chr12	12619615	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.058176;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:14,3:18,4
+chr12	12694188	.	CTTT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.13725;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:4,1:1,1
+chr12	13466979	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,2:3,1:1,1
+chr12	14025896	.	TAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.32536;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:11,1:2,3
+chr12	14308319	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,4:3,1
+chr12	16204435	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0010064;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:6,8:10,6
+chr12	16674968	.	GTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0016312;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,14:3,11:1,3
+chr12	16723821	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:4,5:2,3:2,2
+chr12	16844587	.	ATG	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,9:5,4:7,5
+chr12	17770160	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:7,4:0,3
+chr12	18085870	.	GAGCCAC	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0028986;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:1,1:6,7
+chr12	20321544	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,9:2,6:4,3
+chr12	21201550	.	T	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00029349;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:17,6:19,6
+chr12	21287197	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.037551;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:14,4:10,1
+chr12	22175363	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,3:9,1
+chr12	24428212	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.031968;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:12,4:10,5
+chr12	25464080	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024017;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,3:4,5
+chr12	25870445	.	C	CTTTCT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.025116;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:7,7:10,2
+chr12	26035438	.	T	TATTATATA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,4:3,1:2,3
+chr12	26653241	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,2:2,2
+chr12	26909472	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.028073;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:12,7:1,1
+chr12	28049532	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.001508;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:13,7:16,4
+chr12	29326534	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.034034;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,1:13,4
+chr12	31083313	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.19313;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:21,3:8,1
+chr12	33033991	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0011939;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:24,8:16,7
+chr12	34780417	.	T	C	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.048024;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:51,12:10,2:41,10
+chr12	34809155	.	C	T	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.02399;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:100,12:51,4:49,8
+chr12	34821905	.	C	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0021672;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:0,2:3,4
+chr12	34841473	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:22,4:0,0
+chr12	34862089	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr12	34862093	.	A	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr12	34873361	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.042219;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:5,1:17,8
+chr12	34899613	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0035972;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:11,2:15,6
+chr12	34982824	.	G	T	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.024753;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:90,13:57,11:33,2
+chr12	34988434	.	C	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.23776;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:23,4:0,0
+chr12	35082495	.	C	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:2,1:8,3
+chr12	35127510	.	G	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:0,0:13,4
+chr12	35131108	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.20253;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,3:9,1
+chr12	35134509	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,1:10,3
+chr12	35134528	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.11761;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:15,4:12,1
+chr12	35135093	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,0:5,4
+chr12	35227415	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15365;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:26,4:0,0
+chr12	35261065	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14804;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:22,4:3,1
+chr12	35286147	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.083134;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:28,4:2,0
+chr12	35587910	.	TC	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,1:2,3
+chr12	35657521	.	G	T	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.0024936;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:111,14:72,12:39,2
+chr12	35696775	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.085333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:22,4:14,2
+chr12	35717049	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:9,1:11,4
+chr12	35839434	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:0,0:13,4
+chr12	35933157	.	A	T	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.04153;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:72,11:16,3:56,8
+chr12	35966445	.	A	G	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.0062073;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:82,14:26,2:56,12
+chr12	36072677	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.087004;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:31,4:1,0
+chr12	36073041	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:0,0:13,4
+chr12	36178499	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.12928;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:1,0:22,4
+chr12	36490969	.	C	T	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.01371;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:54,7:32,4:22,3
+chr12	36525148	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.13984;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:25,3:21,1:4,2
+chr12	36609436	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:17,3:1,1
+chr12	36700884	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0024117;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:9,7:0,2
+chr12	37060803	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:0,0:11,4
+chr12	37237277	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.074973;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:12,2:29,4
+chr12	38928697	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,12:5,9:3,3
+chr12	40288421	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00022;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:11,5:10,4
+chr12	40294164	.	T	TATC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.027541;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,3:9,2
+chr12	40294176	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.027862;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,3:9,2
+chr12	40296839	.	GTCTTTCTC	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0094327;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:19,4:12,4
+chr12	40924881	.	C	CATATATATATATATAT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,3:8,1
+chr12	40925834	.	G	GTA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,5:7,3:7,2
+chr12	41822421	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.040848;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:14,3:21,2
+chr12	42484059	.	C	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.017499;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,5:3,3
+chr12	42974639	.	GTGTATATATA	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:2,1:2,3
+chr12	43476187	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0087567;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:2,1:4,7
+chr12	43554876	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.010836;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:3,4:1,1
+chr12	43620454	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.034215;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:19,5:12,1
+chr12	44214138	.	AT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.03285;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,11:7,8:4,3
+chr12	46256636	.	C	CAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.010978;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,8:11,5:4,3
+chr12	46488153	.	TAC	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.040535;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:10,3:4,5
+chr12	47354710	.	CAT	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.033698;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:12,3:13,4
+chr12	47396025	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00091263;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:17,10:11,5
+chr12	47971844	.	T	TAG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1382;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,5:11,2:19,3
+chr12	48983302	.	AAAAAAATATAT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:5,2:3,4
+chr12	49345559	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0010308;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:26,21:12,13:14,8
+chr12	50158060	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.02882;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:11,3:3,3
+chr12	50214051	.	C	CACACACACACACACACAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.03931;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,12:11,3:8,9
+chr12	50218910	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.49123;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:13,4:6,1:7,3
+chr12	50378577	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.076601;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,7:5,4:7,3
+chr12	51721131	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:4,5:8,3
+chr12	52005109	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=7.761e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:13,7:13,6
+chr12	52954857	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:6,3:3,2:3,1
+chr12	54202733	.	CAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014907;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,4:2,1
+chr12	54323622	.	C	CTCTTTCTTTCTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,4:2,1:22,3
+chr12	54370136	.	GT	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.02902;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:23,4:9,1
+chr12	55052474	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,8:2,2:10,6
+chr12	55667695	.	TTG	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.029488;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:17,8:6,3
+chr12	56481199	.	CT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
+chr12	56658163	.	T	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,2:3,1:0,1
+chr12	57100718	.	GAA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.020734;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:3,4:0,0
+chr12	57656371	.	GTCTAGCTCAAGGTTTGTAAACACACCAATCAGCACCCTGTA	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.028809;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:9,3:12,4
+chr12	57675761	.	C	CTTTTTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046847;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:3,2:8,4
+chr12	57697934	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0046297;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:7,6:4,4
+chr12	59014908	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00083483;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:9,5:14,6
+chr12	59437058	.	A	AAAGAAAG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:4,4:0,0
+chr12	60262266	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=3.4873e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:12,9:11,6
+chr12	61019806	.	G	GTA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.038274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,3:2,1
+chr12	62211121	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0022162;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:8,4:17,5
+chr12	63045175	.	G	GACAC	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.032993;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,11:15,5:5,6
+chr12	64039628	.	C	CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.23636;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,3:7,1:4,2
+chr12	64288687	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0038864;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:23,6:6,7
+chr12	65074817	.	C	CAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.016957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:5,5:3,1
+chr12	65133739	.	T	TGGAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.020376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:12,5:13,5
+chr12	65855699	.	A	AGATGAT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0033988;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:9,16:5,5:4,11
+chr12	66723239	.	T	TCTTCCTTCCTTC	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:1,2:3,2
+chr12	67634086	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2381;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,3:3,2:0,1
+chr12	69200335	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:4,4:5,1
+chr12	69200653	.	GAAGAGAT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:6,2:9,3
+chr12	69282822	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,2:6,2
+chr12	69346764	.	A	ATT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,3:4,6
+chr12	69361272	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.16972;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,2:11,2
+chr12	69747333	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.057118;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,6:5,3:8,3
+chr12	72429338	.	C	CATAATA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0054686;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:15,10:6,4
+chr12	73778707	.	T	TA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.019411;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,14:12,10:6,4
+chr12	75379854	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,4:9,1:8,3
+chr12	76215499	.	TATA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:1,5:0,1:1,4
+chr12	77722882	.	AATG	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00038845;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:8,3:16,8
+chr12	77873768	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,2:0,1:3,1
+chr12	79046386	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.5976e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:12,10:12,6
+chr12	80394221	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,4:6,3:1,1
+chr12	80462236	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.021075;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:25,2:14,6
+chr12	81584908	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.070922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,3:10,1
+chr12	81927492	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.065353;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,3:8,1
+chr12	83045707	.	T	TCA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0016775;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:11,3:10,5
+chr12	83360999	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:6,3:3,2:3,1
+chr12	83944936	.	A	ATTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,2:5,2
+chr12	84615815	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036872;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:13,1:14,4
+chr12	86152090	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00063139;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,4:10,6
+chr12	86809568	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.10224;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:13,2:14,1
+chr12	87425877	.	G	GGGAAATTGTAGGATACAATAAATTCCTCTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.011333;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:10,5:6,6
+chr12	88086704	.	T	TATCCATCCATCCATCCATCC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0065482;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:14,3:11,8
+chr12	88703657	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.074163;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:13,2:14,2
+chr12	89393181	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.017327;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,8:7,1
+chr12	90418660	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=2.1107e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:14,9:8,6
+chr12	90694392	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,4:4,1
+chr12	91421235	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.011899;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:3,6:5,3
+chr12	91630884	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00028557;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:15,7:17,7
+chr12	91752587	.	TTC	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.079987;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:15,4:14,1
+chr12	92007252	.	A	ATT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,4:5,1
+chr12	92023405	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:6,4:4,1
+chr12	93496643	.	T	TAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:4,5:7,1
+chr12	93917083	.	T	TA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.015895;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:9,5:6,6
+chr12	94668467	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.062683;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:9,3:7,2
+chr12	94941821	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.051796;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:13,3:15,2
+chr12	95029559	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:6,7:3,1
+chr12	95594665	.	A	AT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.21886;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:8,3:6,2
+chr12	96482765	.	G	GA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034961;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,11:12,9:6,2
+chr12	96902920	.	CTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:5,3:2,1
+chr12	96916230	.	T	TTTATTA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:4,1:5,7
+chr12	98002955	.	G	GA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057842;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:12,3:0,1
+chr12	98252998	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10365;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,5:13,3:5,2
+chr12	99907812	.	TAA	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:3,6:4,2
+chr12	101009613	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=3.0981e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:10,9:9,8
+chr12	101470401	.	C	CT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.022272;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:11,7:11,6
+chr12	101661908	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.13742;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,3:16,1
+chr12	101661912	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.068571;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,6:10,4:15,2
+chr12	101884369	.	C	CAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04422;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:11,6:3,1
+chr12	102962470	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026993;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,9:5,2:10,7
+chr12	104115579	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:7,4:1,4
+chr12	104440482	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042146;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,2:5,2
+chr12	104763912	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0010074;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:5,8:10,3
+chr12	105186622	.	T	TATGATATCG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.026928;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,5:9,2:6,3
+chr12	105361811	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00040059;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,4:7,4
+chr12	106200353	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.14936;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:10,4:13,1
+chr12	106372343	.	T	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.038501;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:10,4:8,2
+chr12	106935571	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.025729;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,1:10,4
+chr12	106991393	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.019644;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:19,7:15,3
+chr12	107654842	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14851;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,3:11,1
+chr12	108108401	.	A	ATTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=9.123e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,17:6,10:4,7
+chr12	108422367	.	A	ATTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:4,3:5,4
+chr12	109493040	.	T	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00022263;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:11,3:12,8
+chr12	109834869	.	C	CTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.027668;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:4,15:1,7:3,8
+chr12	109969162	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065471;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,8:7,2:6,6
+chr12	110293870	.	AT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,1:4,5
+chr12	110797520	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0079921;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:10,5:3,6
+chr12	111376994	.	A	ATT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,3:5,1
+chr12	111811827	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0027837;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:11,5:15,3
+chr12	112677377	.	TCCTC	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,3:0,0:2,3
+chr12	113214507	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:10,6:0,1
+chr12	113472797	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00016475;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:9,6:24,9
+chr12	114003961	.	C	CACACACACACACAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:0,4:0,3:0,1
+chr12	114816695	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00080274;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:18,10:14,4
+chr12	114915630	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0066305;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:7,5:19,4
+chr12	115260841	.	C	CGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.011352;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:2,14:0,10:2,4
+chr12	115799482	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.18915;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:8,1:27,4
+chr12	116775261	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018762;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:9,5:5,3
+chr12	117560566	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.019794;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:13,4:15,2
+chr12	117858708	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=4.5846e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:10,12:15,9
+chr12	120279628	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,2:1,1:6,1
+chr12	120301362	.	C	CA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.064915;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,4:7,2:15,2
+chr12	120802397	.	ATG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:6,1:7,3
+chr12	121296804	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00052641;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:9,11:5,8
+chr12	121297857	.	C	CTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.11096;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:4,2:13,3
+chr12	121842741	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:6,3:4,1
+chr12	121912868	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,7:5,6:5,1
+chr12	122250341	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00015414;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:10,7:15,7
+chr12	122357505	.	GT	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.11998;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,1:16,3
+chr12	122499269	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:6,2:2,3
+chr12	123511963	.	TCTG	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:3,3:5,1
+chr12	123894082	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,6:4,3
+chr12	124365796	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.1151e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:10,7:16,13
+chr12	124927433	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00056247;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:6,6:11,6
+chr12	124927434	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.010309;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:6,7:12,5
+chr12	125077959	.	C	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=9.7831e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:15,8:15,10
+chr12	125204231	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.035434;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:3,3:16,1
+chr12	126194711	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0077151;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:11,3:14,4
+chr12	126323039	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00011403;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,7:8,5
+chr12	127096468	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.074163;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:18,2:9,2
+chr12	128241172	.	CATGT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,1:11,3
+chr12	128698206	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030499;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,4:6,2
+chr12	128717041	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11371;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:19,2:9,2
+chr12	128919975	.	C	CCA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:1,2:0,0:1,2
+chr12	129019084	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.17398;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,1:17,3
+chr12	129205376	.	GA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0062662;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,15:7,12:2,3
+chr12	130533169	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00012624;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:15,6:7,5
+chr12	131585278	.	T	TG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:7,3:3,3
+chr12	131585295	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.042901;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,3:4,2
+chr12	131588543	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,3:0,1
+chr12	131801480	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.051471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,3:0,1:4,2
+chr12	132136345	.	A	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:4,2:4,2
+chr12	132770233	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:7,2:3,1:4,1
+chr12	132830326	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0057786;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,11:6,9:5,2
+chr12	132937359	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,11:5,9:3,2
+chr13	16971208	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr13	16971209	.	A	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr13	18450173	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,3:6,1
+chr13	18462680	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,2:10,2
+chr13	19353957	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027099;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,3:10,5
+chr13	20708978	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14279;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,2:8,3
+chr13	21206414	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.029105;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,5:11,3
+chr13	22384933	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,7:1,6:2,1
+chr13	22511663	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00024849;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:16,9:12,4
+chr13	22852482	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,6:12,5:2,1
+chr13	22855254	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.019346;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,4:5,4
+chr13	24468400	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0096894;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,12:3,5:4,7
+chr13	24973356	.	AAC	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.012176;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:11,4:3,5
+chr13	25835059	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0028757;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:14,8:12,8
+chr13	26768786	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=7.3464e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:7,5:12,6
+chr13	27214401	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,5:9,3:13,2
+chr13	28006728	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.018634;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:5,3:2,2
+chr13	28411546	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023193;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:6,7:6,1
+chr13	29073530	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:24,4:15,2:9,2
+chr13	30219405	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0021523;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:13,5:16,6
+chr13	30433665	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.052652;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:11,1:14,5
+chr13	30787963	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00011498;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:11,5:16,8
+chr13	34601288	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0040793;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:1,6:1,2:0,4
+chr13	35732109	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.12939;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:19,2:10,2
+chr13	37254645	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.3615e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:22,21:10,15:12,6
+chr13	38209691	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,6:5,3:3,3
+chr13	38676047	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.074171;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,7:17,4:8,3
+chr13	38977750	.	AT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,4:11,3:5,1
+chr13	39984753	.	CTAAAATAAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01828;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,14:2,6:8,8
+chr13	41881750	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.069853;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:12,2:5,3
+chr13	42133185	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:8,2:17,2
+chr13	42362135	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:3,3:6,2
+chr13	42877448	.	A	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:0,0:6,2
+chr13	42882941	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.024224;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,5:2,2:6,3
+chr13	43048325	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0060655;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,9:18,8:6,1
+chr13	43434941	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:9,3:11,3
+chr13	43643650	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043132;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:11,2:15,2
+chr13	45153976	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:4,6:6,1
+chr13	45435530	.	CATATATATAT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.026515;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,5:1,4:1,1
+chr13	46136076	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,4:6,2:1,2
+chr13	46648338	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00016784;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,6:11,4
+chr13	47055948	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00024491;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,16:12,5:21,11
+chr13	47244961	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.6849e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:26,21:8,10:18,11
+chr13	48027627	.	AT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0032683;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,11:6,3:7,8
+chr13	48209639	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.09513;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:17,2:15,3
+chr13	49839205	.	T	TACAC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.044074;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,8:6,4:12,4
+chr13	50796833	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00039186;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:8,5:14,7
+chr13	51393074	.	A	AT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:17,8:7,6
+chr13	53122959	.	A	AT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.026941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:12,1:10,5
+chr13	53122978	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.092234;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,6:3,1:6,5
+chr13	53736791	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=3.3224e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:18,21:8,9:10,12
+chr13	54365389	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0020001;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:22,7:13,5
+chr13	55329147	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,8:6,7:3,1
+chr13	56266222	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.035568;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:9,4:6,1
+chr13	56726381	.	AGTGTGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.29231;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,4:8,1:9,3
+chr13	57862275	.	G	GTATC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.020192;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,7:9,3
+chr13	59366834	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:4,4:6,2
+chr13	61357580	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11302;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,1:9,3
+chr13	62010071	.	C	CTA	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,1:2,3
+chr13	62613024	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00012187;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:11,3:8,6
+chr13	62711562	.	AT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:5,1:1,3
+chr13	63511422	.	TCCTTTATGTCTTTCAGCCAG	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.06588;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:16,3:16,6
+chr13	63772227	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0008665;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:13,5:8,6
+chr13	63781265	.	AT	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00065978;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:14,9:13,2
+chr13	63781267	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00040099;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:14,9:14,2
+chr13	64231492	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14279;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:13,2:3,3
+chr13	64714566	.	A	ATTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:4,1:7,3
+chr13	66198592	.	T	TTA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.14923;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:24,3:16,1:8,2
+chr13	67483902	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.016905;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:18,4:16,3
+chr13	67561844	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.020125;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:9,5:17,5
+chr13	69458583	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,5:7,4:6,1
+chr13	69884934	.	CT	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.18687;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:21,3:13,1
+chr13	70256043	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00012866;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:11,6:13,10
+chr13	70259728	.	TAGATGG	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0068286;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:16,6:12,7
+chr13	70549015	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:2,5:1,4:1,1
+chr13	70961531	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00088242;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:20,11:7,8
+chr13	71749199	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.012218;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:13,4:6,1
+chr13	72542867	.	AGAGAGAT	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.03845;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,4:10,3:9,1
+chr13	72542882	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.041011;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,4:10,3:8,1
+chr13	73402909	.	CACACATATATAT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11425;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,2:8,3
+chr13	73932713	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=6.8069e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:6,9:12,2
+chr13	75142489	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.022328;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,10:8,4:15,6
+chr13	76968491	.	C	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=4.2063e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:20,9:11,6
+chr13	77360820	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.003096;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,6:2,4:1,2
+chr13	77519769	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.042521;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:0,0:20,4
+chr13	78087327	.	CACTTATTAA	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0028166;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:17,5:14,4
+chr13	78087338	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0011256;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:17,5:11,4
+chr13	78191168	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=9.8808e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:7,8:17,6
+chr13	78822993	.	A	AAAG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.023692;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,10:6,3:5,7
+chr13	79628093	.	T	TTAAATAAATAAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.019466;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:7,9:15,1
+chr13	82339780	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.011976;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:5,4:7,8
+chr13	83964182	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03942;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,4:6,4
+chr13	84796800	.	T	TTC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0013799;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:12,6:6,9
+chr13	85340126	.	AT	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:14,4:8,1:6,3
+chr13	85927534	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
+chr13	87465103	.	A	ATG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,5:8,2:15,3
+chr13	87465110	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.075461;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:10,3:13,4
+chr13	87782673	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0091917;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:10,4:12,4
+chr13	88317179	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,3:1,1:2,2
+chr13	88317181	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,3:1,2:2,1
+chr13	88622742	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00020063;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:13,5:18,6
+chr13	90500067	.	C	CT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.15576;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:22,2:15,3
+chr13	91642713	.	C	CTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.025685;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:11,5:3,4
+chr13	92166958	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:3,4:3,2:0,2
+chr13	92525437	.	A	AGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11425;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:10,2:11,3
+chr13	93223019	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0084717;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,7:3,1
+chr13	93255797	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.6406e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:16,7:10,7
+chr13	94076640	.	TTGGG	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00060001;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:11,3:11,7
+chr13	95302342	.	A	AGTGTGTGT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00095639;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:10,9:6,5
+chr13	95602909	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=4.4652e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:26,19:14,9:12,10
+chr13	97031769	.	AAAAAAAAAAAAAAAATAATAATAATAATAATAAT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:7,6:6,3
+chr13	97408704	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00031477;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:11,6:11,6
+chr13	97500521	.	CAA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011166;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:8,9:3,6:5,3
+chr13	99628396	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.6063e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:8,10:11,5
+chr13	99711403	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,3:1,1
+chr13	99784451	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,3:1,1:3,2
+chr13	101526154	.	TC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.15876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:24,3:13,1:11,2
+chr13	101705292	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0078247;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:6,7:1,2
+chr13	101779357	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=6.2767e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:10,8:15,5
+chr13	102136060	.	T	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.4315e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:13,6:10,6
+chr13	102323957	.	ATGTGTG	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0041535;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:9,13:9,7:0,6
+chr13	102692180	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0027159;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:15,5:9,3
+chr13	102905314	.	A	AT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.017733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:10,8:7,3
+chr13	102939754	.	G	GTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,6:3,4:2,2
+chr13	103526253	.	C	CCACACA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.040889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,6:7,5:4,1
+chr13	103768251	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=8.3669e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:9,6:10,8
+chr13	104697530	.	G	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=1.6006e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:15,9:15,9
+chr13	105804138	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.01102;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:21,5:16,2
+chr13	106085301	.	T	TA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:6,3:5,1
+chr13	107010352	.	T	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.035e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:14,8:4,8
+chr13	107736223	.	ACGCG	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:27:0,5:0,3:0,2
+chr13	107888693	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.085027;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:15,1:17,5
+chr13	107959959	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.085333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:18,3:18,3
+chr13	108658859	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.7594e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,18:16,12:10,6
+chr13	109173980	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0070433;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:5,5:0,5
+chr13	110649933	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,4:1,1:3,3
+chr13	110724595	.	CTTT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011728;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:7,6:6,4
+chr13	112465988	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00021529;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:21,6:15,9
+chr13	113033031	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:2,3:8,7
+chr13	113786629	.	ATCATCACCATCATCACTGTCGTTACCC	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027099;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:4,3:12,5
+chr13	113912799	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=2.6785e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:10,5:13,8
+chr13	113956341	.	G	GAGT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.026811;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,9:8,7:12,2
+chr13	114011410	.	T	TGGGCGTCCC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0057036;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:7,2:14,6
+chr13	114011427	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0026611;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,2:14,7
+chr13	114011428	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0012555;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:6,3:14,7
+chr13	114011431	.	AGC	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0017739;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:9,3:14,7
+chr14	18242075	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.012719;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:1,1:9,5
+chr14	18303525	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.036972;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:16,6:12,3
+chr14	18466529	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0045748;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:4,6:4,5
+chr14	18527284	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.034902;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:8,5:16,5
+chr14	18977222	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.032166;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:17,1:11,8
+chr14	19003629	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,1:11,3
+chr14	19008300	.	C	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.041213;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:19,6:23,3
+chr14	19023348	.	CCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.03735;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,6:6,4:6,2
+chr14	19050241	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.28678;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:19,3:14,1
+chr14	19096492	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.044777;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:37,4:3,1
+chr14	19105551	.	A	G	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.032429;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:90,16:56,12:34,4
+chr14	19108832	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.046541;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:13,2:19,6
+chr14	19233877	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
+chr14	19351163	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,1:4,3
+chr14	19390794	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:2,1:10,4
+chr14	19437836	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0018327;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:5,3:9,6
+chr14	19463797	.	G	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:0,0:13,4
+chr14	19475447	.	AATTT	A	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.045947;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:63,10:34,6:29,4
+chr14	19510043	.	A	ATT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.014666;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,14:1,7:3,7
+chr14	19689768	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0063671;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:5,4:13,8
+chr14	19690605	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.018909;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:9,1:12,4
+chr14	19703569	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.042412;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,3:4,1
+chr14	20506819	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.026326;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:13,5:11,2
+chr14	20975145	.	G	GT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,3:2,2
+chr14	21178782	.	GCA	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.075568;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:20,2:15,2
+chr14	21203990	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.7569e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:15,9:10,5
+chr14	21881710	.	GA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.021719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:9,7:8,5
+chr14	22665192	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00078492;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:16,4:11,7
+chr14	23887635	.	A	AGAAGGAAG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,7:5,3:6,4
+chr14	23890812	.	AAG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.018613;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:9,4:13,4
+chr14	24505174	.	T	TTC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016422;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:11,7:5,2
+chr14	24905596	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0015312;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:9,4:9,7
+chr14	25954318	.	C	CTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:4,4:0,1
+chr14	26368340	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:12,3:7,1
+chr14	28510631	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.14664;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:18,1:12,3
+chr14	29046920	.	G	GTA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0021846;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,11:4,5:4,6
+chr14	29522631	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0014163;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:16,7:15,4
+chr14	29990494	.	TATATATACATATGTATATATAC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020843;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:3,2:8,4
+chr14	31695345	.	CT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00084635;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:12,6:8,6
+chr14	32880218	.	C	CTTCT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:2,1:12,4
+chr14	33312488	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.012731;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:14,3:11,4
+chr14	34664149	.	ATT	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,9:3,5:8,4
+chr14	35792817	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:9,3:3,1
+chr14	37302633	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0056638;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:6,9:3,3
+chr14	37337360	.	T	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,2:2,1:3,1
+chr14	37524565	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:9,3:4,2
+chr14	37950296	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.081731;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:10,2:22,2
+chr14	38857336	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.9786e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:14,9:9,4
+chr14	41218417	.	ATTCTTTTT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,2:3,2
+chr14	41368412	.	CCT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.016858;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,2:2,3
+chr14	41401360	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21886;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:12,3:2,2
+chr14	42705264	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.15091;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,5:8,1:13,4
+chr14	46648949	.	C	CAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.25826;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,4:3,3:7,1
+chr14	46750528	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.008238;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:2,5:6,3
+chr14	47771589	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.13168;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,6:15,2:4,4
+chr14	48462905	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=9.3592e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:9,4:5,7
+chr14	49570238	.	G	GA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.046295;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,9:11,7:3,2
+chr14	49643082	.	CAAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0041547;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:7,9:6,2
+chr14	49919773	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:3,2:2,3
+chr14	50592929	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.041383;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,7:12,2:11,5
+chr14	51077386	.	G	GTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:6,2:1,3
+chr14	51365694	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.022022;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,2:14,3
+chr14	53080718	.	T	TTCC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:6,6:2,1
+chr14	53229696	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011884;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,4:6,1
+chr14	53949884	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.17982;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,3:15,1
+chr14	54852874	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.01322;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:14,4:16,3
+chr14	55738029	.	CT	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.077856;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:14,1:16,3
+chr14	55741660	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,2:0,0:4,2
+chr14	57311732	.	T	TC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,4:1,1:1,3
+chr14	62011872	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023562;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:11,3:4,2
+chr14	62011928	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.055222;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:16,2:6,2
+chr14	63088543	.	A	AAT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.01699;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:13,4:13,7
+chr14	63116699	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.004133;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,13:6,9:4,4
+chr14	63422729	.	TA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:11,5:2,2
+chr14	63566276	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:4,2:9,3
+chr14	63627152	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,4:2,3:3,1
+chr14	64261239	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,9:0,8:2,1
+chr14	64463642	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.013657;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:11,6:5,3:6,3
+chr14	64923273	.	C	CAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.069853;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,5:6,4:11,1
+chr14	65016920	.	G	GT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.031946;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:13,4:5,4
+chr14	65102741	.	GGC	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
+chr14	65575579	.	CCTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:2,1:10,3
+chr14	66811561	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,4:5,1:13,3
+chr14	66841011	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.015732;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,1:5,3
+chr14	67022567	.	T	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.025708;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:4,1:7,4
+chr14	67382912	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.046149;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:10,3:14,4
+chr14	68570891	.	ACACACATG	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.036704;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,2:11,2
+chr14	69879448	.	C	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=1.6852e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:14,8:6,12
+chr14	70113003	.	A	ATTGTATTCTGAGGTTCTGGGTGGACTTGAAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.03818;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,3:6,2
+chr14	70709721	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00038049;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,14:12,9:14,5
+chr14	71898691	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.020985;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:8,4:14,8
+chr14	72024278	.	TAACAGTA	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0022884;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:21,4:8,4
+chr14	72481805	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01393;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:5,2:8,4
+chr14	72874115	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037117;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:8,10:13,6
+chr14	73278745	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.025708;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,5:5,2:6,3
+chr14	73350074	.	T	TACAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0079902;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,11:8,9:4,2
+chr14	73352433	.	TAC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:4,2:0,3
+chr14	73385496	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,5:3,1
+chr14	73440198	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.35897;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:6,2:3,1:3,1
+chr14	74159574	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.17651;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:16,3:10,2
+chr14	74325449	.	AC	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.052719;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:13,2:14,3
+chr14	74401689	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=4.9508e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:13,5:17,8
+chr14	74427118	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,2:9,4
+chr14	75235381	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,4:2,3
+chr14	76113654	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0018324;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:14,5:10,6
+chr14	76445466	.	C	CAA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:6,4:0,0
+chr14	76564798	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,2:4,2:0,0
+chr14	76926439	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0018191;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,9:6,1:7,8
+chr14	77168290	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:14,5:4,1
+chr14	79376267	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,2:0,1:4,1
+chr14	79803901	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:5,2:1,1:4,1
+chr14	80274525	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,4:8,2:8,2
+chr14	81572257	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:1,1:4,1
+chr14	83100850	.	TC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.26374;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,5:1,3:6,2
+chr14	85889810	.	C	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,2:1,3
+chr14	87048226	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:5,2:2,1:3,1
+chr14	88592491	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:5,4:4,2
+chr14	88759685	.	T	TAAAAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0084353;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:5,3:4,2
+chr14	90802969	.	T	TA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.014951;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:10,8:14,8
+chr14	91943401	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.064803;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:16,3:10,3
+chr14	92351236	.	G	GCGCGCACACACACACACACACACACA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.031813;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:4,3:6,1
+chr14	92896194	.	TA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.041917;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,9:10,3:2,6
+chr14	93484905	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.2103e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:13,9:7,6
+chr14	94864180	.	A	AAG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11053;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:1,1:4,1
+chr14	95122959	.	C	CAAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.004158;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,4:4,3
+chr14	95744395	.	ATGTGTGTG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0038647;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,7:1,4:6,3
+chr14	95843649	.	CA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.19282;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,1:14,3
+chr14	96715737	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:2,3:3,1
+chr14	97067392	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:11,9:4,5:7,4
+chr14	97154229	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:1,0:14,4
+chr14	97405405	.	TAA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0060449;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:13,5:4,10
+chr14	97514252	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:3,1:12,3
+chr14	97788367	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.032967;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:23:1,10:1,1:0,9
+chr14	98693319	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0012048;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:13,6:13,4
+chr14	99107972	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,3:7,1
+chr14	99790865	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,4:8,2:11,2
+chr14	100546780	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.062457;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,5:12,3:8,2
+chr14	100578856	.	C	CTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.034547;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:8,6:6,1
+chr14	100770434	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00083564;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:12,1:11,7
+chr14	100843833	.	GT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:3,6:4,4
+chr14	101724296	.	T	TC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,9:6,5:5,4
+chr14	101724298	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,8:7,5:4,3
+chr14	101724305	.	C	CTA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016188;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:9,7:7,4
+chr14	101724481	.	A	ATG	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00949;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,7:6,2:9,5
+chr14	101724601	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020802;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,3:5,4
+chr14	101725015	.	TAC	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,1:5,3
+chr14	102228697	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:6,9:3,8:3,1
+chr14	102293702	.	A	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,4:4,1:5,3
+chr14	102369784	.	AAC	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.017995;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,2:11,3
+chr14	103301836	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.011625;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:4,12:2,10:2,2
+chr14	103346259	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:3,6:6,2
+chr14	104049116	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,5:9,3:9,2
+chr14	104872401	.	GCGTGGGTGTGC	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.074026;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,2:2,2
+chr14	105561151	.	ACCCTGTC	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:1,2:19,2
+chr14	105565695	.	G	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0057362;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:32,2:7,13
+chr14	105698357	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0081718;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:8,7:12,5
+chr14	105759956	.	CT	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.011402;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:21,2:22,5
+chr14	105766139	.	C	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.00011602;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:60,16:22,7:38,9
+chr14	105992391	.	T	TCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.031608;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,7:9,1:6,6
+chr14	106309123	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.019439;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,6:10,3:6,3
+chr14	106331794	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029934;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:6,5:12,1
+chr15	17069468	.	CT	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.012263;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:19,3:15,5
+chr15	17072076	.	C	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.01199;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,11:19,5:29,6
+chr15	17078615	.	T	A	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.03685;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:64,13:31,6:33,7
+chr15	18359793	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:12,8:0,0
+chr15	18750174	.	C	T	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.042611;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:51,12:11,5:40,7
+chr15	18845299	.	A	C	0	PASS	DP=506;GPV=1;SPV=0.0098083;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:282:250,29:168,15:82,14
+chr15	19417500	.	G	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.0027914;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:87,10:19,3:68,7
+chr15	19572075	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0307;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:16,5:6,1
+chr15	19904285	.	CT	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.04792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:50,8:28,2:22,6
+chr15	19928272	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.032378;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:19,4:12,2
+chr15	19957403	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00091899;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:16,7:12,4
+chr15	20012291	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,2:11,4
+chr15	20037701	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11371;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,2:16,2
+chr15	20099253	.	T	TACA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0070608;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:11,3:19,9
+chr15	20223076	.	CA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.016633;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,9:6,7:11,2
+chr15	20249734	.	C	T	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.030276;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:63,17:39,5:24,12
+chr15	20253720	.	C	CTATT	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.016793;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:58,13:25,9:33,4
+chr15	20259214	.	AG	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.029347;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,9:21,5:12,4
+chr15	20280383	.	G	A	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.041351;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:106,25:36,15:70,10
+chr15	20286892	.	A	G	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.0067522;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:54,19:27,10:27,9
+chr15	20286894	.	ATATG	A	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.0016863;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:47,20:24,11:23,9
+chr15	20288707	.	A	AT	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.015652;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:51,15:27,12:24,3
+chr15	20292295	.	G	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.012558;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:91,16:48,7:43,9
+chr15	20335036	.	T	A	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.0040471;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:62,20:19,4:43,16
+chr15	20369449	.	T	C	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.0020434;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:71,25:37,11:34,14
+chr15	20503316	.	CT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:18,3:7,1
+chr15	20541692	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:13,4:0,0
+chr15	20550505	.	T	C	0	PASS	DP=176;GPV=1;SPV=0.0034318;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:78,26:39,13:39,13
+chr15	20551970	.	G	A	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.030477;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:67,9:30,5:37,4
+chr15	20555222	.	GTATATGTGTAAATA	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.041853;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:28,5:11,4
+chr15	20655655	.	T	C	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.0018747;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:46,19:21,10:25,9
+chr15	20742744	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,2:2,3
+chr15	20761130	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,3:4,1
+chr15	21045807	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.017873;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,5:7,1
+chr15	21046013	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.020485;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:13,3:13,5
+chr15	21070503	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0066692;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,1:3,4
+chr15	21123418	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr15	21133616	.	C	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.073684;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,1:6,2
+chr15	21143778	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.043884;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:11,3:15,3
+chr15	21181101	.	T	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
+chr15	21251752	.	C	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.035464;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:18,4:18,5
+chr15	21253620	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.04887;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:18,1:11,6
+chr15	21302947	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:9,3:14,1
+chr15	21372850	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.045913;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:16,3:16,1
+chr15	21441761	.	T	C	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.046139;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:55,15:27,7:28,8
+chr15	21496299	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0026985;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:11,4:8,7
+chr15	21574589	.	C	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,1:5,5
+chr15	22084246	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,3:5,1
+chr15	22444547	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.026352;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,5:11,5
+chr15	22574358	.	G	GTGAAGGGTGGC	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0035182;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:15,5:16,9
+chr15	22624526	.	C	CAAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:6,3:3,1
+chr15	22676559	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0093849;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:11,9:5,1
+chr15	22801507	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,6:4,4:3,2
+chr15	22930389	.	C	CAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:9,4:0,2
+chr15	24484100	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:8,9:7,2:1,7
+chr15	24916499	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.1103e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:7,3:15,10
+chr15	25028250	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.037457;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,9:10,8:7,1
+chr15	25977620	.	TTGTGTG	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18039;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:14,1:6,3
+chr15	26142375	.	CTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.058687;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:1,0:14,4
+chr15	26251825	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,3:2,2:4,1
+chr15	26326358	.	CAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,5:4,2
+chr15	26469181	.	A	AAAGAAAGG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047937;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,10:12,8:6,2
+chr15	27406472	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=6.2206e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:16,5:6,7
+chr15	28224134	.	T	TACACACACACAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0062312;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:11,6:5,2
+chr15	28419072	.	A	G	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.0051507;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:104,17:85,14:19,3
+chr15	28463372	.	C	CAAA	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.037801;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:42,14:19,8:23,6
+chr15	28566577	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
+chr15	28589665	.	G	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.02299;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:16,1:8,5
+chr15	30141449	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:17,3:7,1
+chr15	30320597	.	A	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr15	30376095	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.054928;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:21,4:14,3:7,1
+chr15	30515836	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.063892;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,7:11,5:8,2
+chr15	30929816	.	ATAT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,1:3,3
+chr15	31195376	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037811;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:5,3:10,8
+chr15	31697225	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031197;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:10,4:8,4
+chr15	32281297	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
+chr15	32440237	.	CCCA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.022707;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:2,1:21,9
+chr15	32513704	.	GTTCTGGAGGCTGCCCAACTTGTGAATTGT	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,3:12,1
+chr15	32877887	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=4.8916e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:11,4:6,9
+chr15	33794043	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:9,3:12,1
+chr15	33794044	.	A	AT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:8,3:9,1
+chr15	33794051	.	TA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18039;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,3:11,1
+chr15	34177633	.	T	TAAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:3,2:2,2
+chr15	34577507	.	TACACAC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:0,3:6,2
+chr15	34671303	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,5:9,1:6,4
+chr15	36015090	.	T	G	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=6.3972e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:12,9:13,9
+chr15	36457108	.	G	GCACA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:14,3:4,1
+chr15	38542913	.	ATATG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,1:11,3
+chr15	39075207	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.062714;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,9:5,5:7,4
+chr15	39123538	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:2,3:8,1
+chr15	41289671	.	AAATAT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,2:3,2:0,0
+chr15	42369870	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,4:9,1:2,3
+chr15	42734779	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,3:8,5
+chr15	46401794	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.043306;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:9,4:15,9
+chr15	46728037	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00080188;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:8,2:7,8
+chr15	48220131	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,4:8,2:9,2
+chr15	49525667	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,3:2,2:1,1
+chr15	50635685	.	AAAAAAAG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,2:1,1:4,1
+chr15	50891330	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00024009;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:14,12:13,7
+chr15	51175616	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14093;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,2:10,3
+chr15	52612504	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.3;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,2:6,1:1,1
+chr15	54250753	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:6,4:7,2
+chr15	54442250	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.17984;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:11,10:9,9:2,1
+chr15	54842393	.	CGT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01567;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:16,7:4,3
+chr15	55744263	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=1.3655e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:4,2:10,10
+chr15	55744264	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=4.2481e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:4,3:9,10
+chr15	57426612	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0050173;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:6,9:7,6
+chr15	57738279	.	ATT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.048951;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:3,6:3,3:0,3
+chr15	58283455	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0045748;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:4,8:4,4
+chr15	59600806	.	AT	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.046347;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:10,1:13,5
+chr15	59600919	.	A	AT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.043416;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:11,3:8,5
+chr15	60613696	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:5,4:2,2
+chr15	60763065	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
+chr15	61456541	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00069544;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:29,17:10,10:19,7
+chr15	62742024	.	G	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:4,8:2,5:2,3
+chr15	62750256	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00018832;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:13,9:13,5
+chr15	63202277	.	C	CA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00093315;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,16:7,10:12,6
+chr15	63789151	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,4:6,3
+chr15	64645012	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.011166;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:0,1:8,8
+chr15	64953802	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.029135;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:6,2:8,7
+chr15	65142928	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,2:3,6
+chr15	66079512	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:1,1:7,3
+chr15	66966775	.	T	TTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:1,2:5,2
+chr15	67045069	.	C	CTATTTATTTATT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:3,2:6,2
+chr15	67418577	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,4:3,2
+chr15	68798260	.	TCTCCAGTGTTACTATTCAGA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02791;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:15,4:11,2
+chr15	68798282	.	A	AATT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.028465;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:14,4:11,1
+chr15	68798283	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.019947;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:15,4:12,2
+chr15	68883630	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.080194;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,5:14,3:12,2
+chr15	68939156	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=2.3706e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:13,4:8,10
+chr15	69255138	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.021615;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:15,5:14,2
+chr15	70792750	.	C	CTTTCTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.023574;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,8:2,3:8,5
+chr15	70827305	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013375;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,7:4,2
+chr15	72130557	.	A	AT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.22398;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:9,3:4,1
+chr15	74071858	.	A	C	0	PASS	DP=311;GPV=1;SPV=0.040856;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:142,26:54,11:88,15
+chr15	74818014	.	G	GA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.041183;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,8:14,7:6,1
+chr15	75090710	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.006192;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:1,4:3,1
+chr15	77738758	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0034214;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:8,7:6,3
+chr15	77743790	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02531;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:10,6:6,5
+chr15	77951781	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.011899;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:14,4:22,5
+chr15	78909032	.	G	GTTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018778;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,10:2,7:3,3
+chr15	79828226	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,4:11,1:15,3
+chr15	80152658	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.54545;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,2:7,2:0,0
+chr15	81692901	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:9,3:3,1
+chr15	82307797	.	GGTAAAGGAGTGGGAGAGCTTTCAGGGAACGGCAGAACC	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.070174;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:13,4:14,1
+chr15	82488442	.	A	AG	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.04422;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:14,7:10,5:4,2
+chr15	83229856	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.041793;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,3:9,1
+chr15	83874351	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.995e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:21,21:6,4:15,17
+chr15	83883142	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.046683;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,5:11,3:5,2
+chr15	85359195	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:5,4:6,2
+chr15	86396245	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:6,4:2,1:4,3
+chr15	90374581	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.012749;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:5,5:2,1
+chr15	91655974	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.001113;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,18:13,11:13,7
+chr15	92162133	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,6:2,1
+chr15	92850801	.	ATT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.037194;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:11,5:5,2
+chr15	92874879	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=6.3565e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:6,5:8,8
+chr15	94213325	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045366;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:10,3:8,8
+chr15	95268394	.	T	TTG	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0092175;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,13:10,6:6,7
+chr15	95309358	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040221;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:11,1:11,5
+chr15	95439722	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0032114;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:7,7:4,1
+chr15	95762823	.	T	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0010521;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:14,8:9,6
+chr15	95796709	.	A	AG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18039;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:16,3:4,1
+chr15	96472595	.	GA	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:13,14:6,11:7,3
+chr15	97124918	.	AAAAAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,6:8,3:7,3
+chr15	97336448	.	T	TTC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.15847;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,2:11,3
+chr15	98467626	.	A	AAAAATGTTT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0020977;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,14:7,5:10,9
+chr15	98537039	.	AAAGGGAAGGGAAGGGAAGGG	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,5:7,4:1,1
+chr15	98593638	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023574;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:7,7:3,1
+chr15	99319659	.	G	GTT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=3.0636e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:13,21:7,10:6,11
+chr15	99973989	.	C	CAGAATAAAGCCTTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.040223;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,3:16,6
+chr15	100458206	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.9336e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:9,11:12,7
+chr15	100467837	.	GTA	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,4:16,2:9,2
+chr15	100667845	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00016163;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:21,8:13,5
+chr15	100939255	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=8.2383e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,19:9,6:13,13
+chr15	101757944	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.059824;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,3:15,1
+chr15	101908220	.	T	TCC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.010101;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:26:0,7:0,3:0,4
+chr16	329272	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:2,4:5,4
+chr16	837840	.	TTTC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.004158;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,7:9,1
+chr16	859186	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.028067;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:13,5:10,4
+chr16	917480	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00072423;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:15,6:8,4
+chr16	1217108	.	G	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.015797;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:27,3:21,4
+chr16	2795130	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013285;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,2:5,4
+chr16	2851650	.	C	CAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,8:5,1
+chr16	3814215	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.00070363;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,12:3,8:0,4
+chr16	4211669	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0264;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:6,5:10,4
+chr16	4584354	.	A	ATTTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:1,1:5,5
+chr16	4809188	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,9:4,8:5,1
+chr16	5203355	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023024;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:12,3:1,5
+chr16	5669422	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018307;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,12:5,10:0,2
+chr16	5718941	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0055747;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:12,8:7,6
+chr16	7341720	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,1:7,1
+chr16	8008927	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.061499;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:13,2:14,4
+chr16	10109031	.	AAAAAC	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,3:8,1
+chr16	11419177	.	AAAC	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0071642;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:11,4:8,10
+chr16	11831582	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:5,2:6,2
+chr16	12768867	.	C	CTT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.02502;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:13,7:9,2
+chr16	12964384	.	G	GT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0064629;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,15:8,11:6,4
+chr16	12997410	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03942;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:10,7:6,1
+chr16	13015906	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:0,0:11,4
+chr16	13672033	.	GAC	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00010076;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:14,5:11,7
+chr16	14984027	.	G	T	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.030074;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:64,16:37,7:27,9
+chr16	15175445	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.016688;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:36,17:16,8:20,9
+chr16	15205476	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,1:14,3
+chr16	15354699	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.046683;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,5:6,2:10,3
+chr16	15370422	.	T	TCA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0079779;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:12,8:12,5
+chr16	15900355	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:3,2:5,4
+chr16	15990816	.	A	ATTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,8:3,3:2,5
+chr16	16368457	.	A	G	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.011997;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:47,6:26,1:21,5
+chr16	17039743	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00017085;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:35,17:12,9:23,8
+chr16	17750759	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,8:2,1:4,7
+chr16	17932390	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0012439;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:18,7:18,4
+chr16	18089694	.	A	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:4,3:1,6
+chr16	18100039	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0032976;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:16,3:12,8
+chr16	18248812	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026257;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:15,2:11,3
+chr16	19181999	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0074524;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:11,10:1,2
+chr16	20242017	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:6,3:4,1:2,2
+chr16	21587186	.	A	ATATAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:5,5:7,5
+chr16	21874887	.	G	A	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.016836;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:44,10:21,5:23,5
+chr16	22356949	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:8,3:5,2
+chr16	22447928	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
+chr16	22541751	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.02202;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:11,6:18,5
+chr16	23040714	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.058442;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:6,3:8,1
+chr16	23109841	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0013324;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,12:5,6:3,6
+chr16	23260121	.	GGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAA	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:4,4:0,0
+chr16	23277615	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0027387;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,8:0,7:2,1
+chr16	23437888	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0046274;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:13,2:21,8
+chr16	23553896	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.043687;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,14:12,9:7,5
+chr16	23726071	.	CTG	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0086957;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:4,5:1,1
+chr16	24049257	.	C	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:12,2:11,2
+chr16	24615462	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.029275;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:14,5:20,1
+chr16	25640694	.	AAGTACAC	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0075593;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:12,4:14,2
+chr16	25828296	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,2:4,1:1,1
+chr16	26509225	.	G	GAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.023137;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,10:10,8:5,2
+chr16	26950190	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0014217;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:20,10:18,4
+chr16	27187399	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.057558;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:19,3:17,2
+chr16	27842101	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,1:7,3
+chr16	28140694	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,5:6,2:6,3
+chr16	28918068	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016351;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,5:9,3
+chr16	28918076	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.022461;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:9,6:11,3
+chr16	29285970	.	G	GTTT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0084125;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,11:11,8:6,3
+chr16	29756688	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:7,2:4,1:3,1
+chr16	30049781	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.036325;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:18,2:12,3
+chr16	30141432	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:3,6:4,1
+chr16	30244008	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.042203;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:31,4:3,0
+chr16	30850209	.	CA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.034541;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:10,9:12,1
+chr16	31105371	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.012926;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:30,2:3,6
+chr16	31670582	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.025729;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,3:11,2
+chr16	31736517	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.040398;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:3,7:9,3
+chr16	32111730	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.022505;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:14,6:21,1
+chr16	32116657	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0042869;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:10,1:14,8
+chr16	32824134	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.025256;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:15,3:17,2
+chr16	33033898	.	C	A	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.015731;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:56,14:35,12:21,2
+chr16	33822591	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.22398;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:8,3:5,1
+chr16	33921319	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011528;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:12,4:1,3
+chr16	34060541	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.018682;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:24,8:12,1
+chr16	34165392	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.041086;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:22,6:18,7
+chr16	34288419	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.073359;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:12,1:4,3
+chr16	36093993	.	G	A	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.043365;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:63,7:24,1:39,6
+chr16	36106679	.	T	C	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.009971;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:53,18:35,10:18,8
+chr16	36678218	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.29588;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:10,1:8,2
+chr16	36750942	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:10,2:0,4
+chr16	37335382	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0013413;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:3,1:29,9
+chr16	38267947	.	T	C	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.038711;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:78,19:51,2:27,17
+chr16	46386931	.	T	C	0	PASS	DP=11044;GPV=1;SPV=0.0087432;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:6613:5937,671:3513,300:2424,371
+chr16	46386999	.	A	G	0	PASS	DP=13419;GPV=1;SPV=3.1864e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:6785:6054,731:3430,367:2624,364
+chr16	46389736	.	C	T	0	PASS	DP=14190;GPV=1;SPV=0.013955;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7169:6353,776:3885,330:2468,446
+chr16	46391132	.	T	C	0	PASS	DP=15216;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7698:6838,788:1845,207:4993,581
+chr16	46460236	.	T	C	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.019249;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:77,23:52,9:25,14
+chr16	46486268	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0010012;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:12,4:7,4
+chr16	46975040	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049096;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,2:9,2
+chr16	47860058	.	TAC	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:13,3:14,1
+chr16	49729639	.	CTAT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.020181;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:10,5:5,5
+chr16	50108803	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0052889;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:17,8:1,1
+chr16	50417312	.	A	ATGCGTGTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0039567;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,12:7,5:4,7
+chr16	51134127	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.032422;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:22,2:7,4
+chr16	52014585	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.035509;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:7,7:9,6
+chr16	52803772	.	AAG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.071753;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:14,1:5,3
+chr16	54745473	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.10871;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:22,3:18,2
+chr16	55086179	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00022484;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:11,10:11,3
+chr16	55770105	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.058443;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,5:9,3:9,2
+chr16	56021703	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,4:1,1:5,3
+chr16	56256720	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.065325;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,5:6,3:9,2
+chr16	56740171	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.039456;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:14,5:16,1
+chr16	56815902	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038416;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:14,2:7,3
+chr16	57030382	.	A	AGATGGATGGATG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.086046;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,8:5,6:13,2
+chr16	57311487	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,5:2,2:5,3
+chr16	57628903	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15091;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:9,1:12,4
+chr16	58421385	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0074921;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:16,3:11,6
+chr16	59258541	.	T	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045809;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:5,6:11,4
+chr16	60007186	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,2:6,2
+chr16	60007188	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:2,3:6,2
+chr16	60490959	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.023295;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:17,2:14,4
+chr16	60774449	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.090497;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:14,3:9,2
+chr16	60895417	.	CATTTATTT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00595;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:12,6:9,5
+chr16	60895426	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0081718;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:10,7:10,5
+chr16	60910286	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018485;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:6,9:4,1
+chr16	61960119	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.046863;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:29,10:15,5:14,5
+chr16	62779476	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:13,3:6,1
+chr16	64575222	.	GC	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00098594;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:16,5:17,6
+chr16	64625946	.	C	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.044221;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:16,3:18,2
+chr16	66199028	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:8,3:12,1
+chr16	66384078	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:0,1:7,4
+chr16	67130346	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.023188;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,2:3,4
+chr16	67370630	.	CAAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0031702;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,14:7,11:2,3
+chr16	67794864	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00055217;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:3,5:5,8
+chr16	67803650	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011437;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:9,5:3,1
+chr16	68601090	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0021563;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:6,8:3,3
+chr16	68787825	.	A	ATTTTTTTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.23178;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,2:16,2
+chr16	69103003	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,8:3,5:1,3
+chr16	69207215	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.003036;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:11,9:15,3
+chr16	69952303	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.016694;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:8,8:15,4
+chr16	70179149	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,3:10,2
+chr16	71133955	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.033359;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:18,3:16,2
+chr16	71584459	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,5:7,2:10,3
+chr16	71898370	.	G	GA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02882;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:10,5:4,1
+chr16	72882977	.	GGT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.044074;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:13,6:5,2
+chr16	73105370	.	CAT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,2:7,2
+chr16	73603772	.	C	CTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0096618;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,5:3,2
+chr16	73682940	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:12,4:3,2
+chr16	74110141	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.016839;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:12,5:11,3
+chr16	74409270	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.028787;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:13,4:16,7
+chr16	74411066	.	T	G	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.0035276;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:78,15:39,11:39,4
+chr16	74837934	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13122;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,3:13,2
+chr16	78010669	.	A	AAT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.010905;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,7:6,3:10,4
+chr16	78159672	.	GT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0035224;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:7,8:5,2
+chr16	78422758	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,4:7,1:4,3
+chr16	79289854	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023574;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:4,5:6,3
+chr16	80093544	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0035775;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:10,1:12,6
+chr16	81419489	.	TTAAAAA	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0021827;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:11,6:9,7
+chr16	82345628	.	AT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.025729;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,5:14,2:9,3
+chr16	82627341	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.047937;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:18,10:3,6:15,4
+chr16	84051475	.	G	GC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16089;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,3:10,1
+chr16	85288290	.	T	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=7.7636e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:10,9:11,5
+chr16	86128278	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:2,4:6,3
+chr16	86464582	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:2,3:3,5
+chr16	86694506	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.0638e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:8,9:15,6
+chr16	88292798	.	C	CAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,8:5,7:3,1
+chr16	88565653	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00010896;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:11,8:5,3
+chr16	88729697	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:14,4:10,3
+chr16	88729827	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.069135;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:20,2:7,2
+chr16	88794460	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.12152;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:10,5:8,1
+chr16	89677606	.	G	GAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:4,7:5,1
+chr16	89885002	.	G	GC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,3:4,4
+chr16	89976561	.	G	GTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.082922;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:13,5:5,1
+chr16	90120777	.	T	C	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.01402;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:54,13:15,5:39,8
+chr16	90120924	.	CTA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:1,0:15,4
+chr16	90172845	.	CAAA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.23453;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,4:15,3:10,1
+chr16	90226065	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.037715;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:13,2:18,7
+chr17	595251	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:8,4:2,4
+chr17	987235	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,4:1,3:5,1
+chr17	1415477	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0055997;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:4,5:3,4
+chr17	1704223	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:8,3:4,1
+chr17	2217587	.	AGCAAAG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0073497;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:12,4:8,5
+chr17	2217595	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01758;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,4:6,4
+chr17	2454563	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0093841;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:10,6:5,4
+chr17	2531534	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00079441;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:12,5:15,7
+chr17	2541168	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,3:3,4
+chr17	2825751	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.047273;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:14,2:8,2
+chr17	3058740	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.084679;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,2:7,3
+chr17	3254642	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.027664;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:9,6:7,4
+chr17	4652833	.	G	GGA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,8:5,7:3,1
+chr17	4852020	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14763;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
+chr17	4857195	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=3.6836e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:11,11:14,8
+chr17	5369906	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.001305;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:9,6:16,2
+chr17	5717301	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.16358;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:6,2:16,2
+chr17	5856042	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0075805;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:5,3:9,2
+chr17	6482060	.	C	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,4:4,2
+chr17	6929272	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.0078e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:3,7:14,12
+chr17	6976470	.	GCGAAAC	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0033765;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:13,3:11,4
+chr17	7190077	.	GA	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,4:3,3
+chr17	9289793	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.053561;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:18,2:18,3
+chr17	9729234	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.010005;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:18,6:16,4
+chr17	10461933	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.011827;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:14,6:14,2
+chr17	10744042	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.077418;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,5:6,3:18,2
+chr17	13368851	.	G	GAT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:3,4:4,2
+chr17	13584551	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.059571;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:13,4:4,4
+chr17	13782415	.	C	CAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.010217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:3,6:2,1
+chr17	14151526	.	AACACACACAC	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0074142;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,13:3,7:2,6
+chr17	14440191	.	G	GGAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:10,7:1,2
+chr17	14753594	.	T	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.09797;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:24,2:17,3
+chr17	15242251	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.01458;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:7,9:5,1
+chr17	15665402	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.018751;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:13,8:15,1
+chr17	15673794	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.037304;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:40,13:27,2:13,11
+chr17	16340427	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:2,3:4,1
+chr17	16796879	.	C	CT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0037453;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,11:9,8:7,3
+chr17	17878452	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0014418;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:14,8:17,4
+chr17	18368399	.	C	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.2099e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:13,8:12,10
+chr17	18398680	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.042853;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:14,6:19,7
+chr17	18661275	.	CAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0069323;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,8:3,5:1,3
+chr17	18679197	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00025694;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:15,9:11,7
+chr17	18679198	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.9747e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,18:16,10:10,8
+chr17	21346975	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.069447;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:27,2:16,4
+chr17	21424791	.	T	TA	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.03763;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,10:14,7:20,3
+chr17	21432479	.	AC	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.021284;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:42,12:22,3:20,9
+chr17	21626815	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,3:1,1
+chr17	21849662	.	A	G	0	PASS	DP=251;GPV=1;SPV=0.029297;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:119,20:51,15:68,5
+chr17	21991867	.	A	AGGAATGGAAT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0078215;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:3,4:6,4
+chr17	22149474	.	CT	C	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.011233;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:80,20:44,10:36,10
+chr17	22153548	.	T	TA	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.073628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:35,5:20,3:15,2
+chr17	22745558	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049096;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,2:8,2
+chr17	22882295	.	G	T	0	PASS	DP=295;GPV=1;SPV=0.017626;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:142,17:96,15:46,2
+chr17	22882296	.	A	T	0	PASS	DP=306;GPV=1;SPV=0.033148;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:143,18:95,14:48,4
+chr17	22884020	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.055873;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:15,2:35,4
+chr17	22915550	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034921;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,0:9,4
+chr17	22985684	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:9,3:6,2
+chr17	22997213	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:8,3:1,1
+chr17	23172989	.	G	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0025892;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:39,15:27,13:12,2
+chr17	26577119	.	C	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041126;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:6,1:9,4
+chr17	26579154	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:2,2:3,1
+chr17	26730150	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:26,1:15,4
+chr17	26743321	.	C	T	0	PASS	DP=246;GPV=1;SPV=0.017577;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:114,21:69,15:45,6
+chr17	27077935	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0015164;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,3:9,7
+chr17	27637752	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.031612;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:26,7:15,1
+chr17	29236531	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027027;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:5,3:11,3
+chr17	30189852	.	GTATTTTT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.062192;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,2:8,4
+chr17	30439368	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,7:4,5:1,2
+chr17	30943848	.	AAAAT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.021798;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,4:5,3
+chr17	31483196	.	A	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,2:4,1:3,1
+chr17	32025030	.	G	GTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:5,4:4,1
+chr17	32614072	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0032037;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,12:1,10:4,2
+chr17	32948034	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.29549;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:2,3:18,1
+chr17	33094106	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.014944;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:18,4:21,4
+chr17	35963052	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,13:11,8:1,5
+chr17	35974455	.	C	CACCTATATATATATAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,2:10,2
+chr17	36271647	.	AT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.13974;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:12,2:17,2
+chr17	36402265	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:1,5:5,2
+chr17	37202712	.	TACAC	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:0,2:0,0:0,2
+chr17	37453759	.	ATTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:13,3:1,1
+chr17	37895642	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
+chr17	37912651	.	CAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,3:1,1
+chr17	38258518	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.10359;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:10,3:19,1
+chr17	39280235	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.013867;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:7,7:2,1
+chr17	40501685	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0032628;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:15,2:16,6
+chr17	40640666	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=7.8889e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:10,6:13,8
+chr17	41084542	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,2:9,2
+chr17	41109461	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.035223;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:16,7:18,5
+chr17	41220267	.	G	GA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,4:9,4:0,0
+chr17	41310356	.	A	AG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0099465;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:16,5:9,6
+chr17	41719890	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.015905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,8:1,5:3,3
+chr17	42965126	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,2:1,1:2,1
+chr17	43361367	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.070897;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,2:10,3
+chr17	43842922	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.1338e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:11,9:7,6
+chr17	43851133	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045694;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,6:8,5:5,1
+chr17	44652655	.	A	AAAAAAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0038981;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:7,5:9,2
+chr17	44729683	.	T	TAC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:4,4:5,2
+chr17	45035480	.	T	TA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:2,4:4,4
+chr17	45276823	.	C	CTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,5:10,3:6,2
+chr17	45619471	.	TC	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.029113;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:4,5:14,5
+chr17	45882230	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.016617;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:6,9:5,2
+chr17	46046840	.	T	TA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,8:2,6:3,2
+chr17	46775609	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,3:6,1
+chr17	46845785	.	CTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:4,3:3,1
+chr17	47530351	.	GT	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,8:6,5:3,3
+chr17	48089102	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,12:4,10:1,2
+chr17	48103734	.	C	CTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0064629;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:7,9:7,3
+chr17	48143189	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:1,6:2,1
+chr17	48213350	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0024977;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,8:7,7:4,1
+chr17	48385938	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00027241;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,5:7,5
+chr17	48728883	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,4:8,1:8,3
+chr17	49024083	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.032107;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:6,2:0,3
+chr17	49265122	.	T	TTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.26316;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,3:7,1:16,2
+chr17	49347736	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,2:3,1:0,1
+chr17	50442326	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.3956;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,2:4,1:3,1
+chr17	50623263	.	A	AT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:5,7:5,4
+chr17	52559818	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0070965;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,14:3,5:4,9
+chr17	52564848	.	T	TAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,10:6,3:1,7
+chr17	53700738	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.16084;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,5:5,3:17,2
+chr17	54632086	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,2:5,5
+chr17	56192869	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.003085;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:11,3:3,7
+chr17	56671696	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,4:1,2:2,2
+chr17	59409693	.	C	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=7.7505e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:16,4:14,10
+chr17	59860012	.	A	AT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.049793;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:7,4:11,4
+chr17	60142207	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,8:5,6:2,2
+chr17	61561201	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.04108;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:21,4:14,2
+chr17	62691771	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016464;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,6:15,4:5,2
+chr17	62734552	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.012731;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:13,4:12,3
+chr17	62962865	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,10:4,5:1,5
+chr17	63300958	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.2361e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:11,7:12,11
+chr17	63740107	.	T	TATATATATATATATATACAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.043382;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,4:4,3:7,1
+chr17	64929079	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:25,4:14,7
+chr17	65015662	.	T	TAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,9:2,1:3,8
+chr17	65031890	.	G	GAGAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,9:4,6:6,3
+chr17	66470190	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,6:4,5:5,1
+chr17	66587869	.	ATG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:10,3:7,1
+chr17	67782954	.	A	AATATATATATATAT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.04668;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,9:5,6:15,3
+chr17	67944240	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.000638;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:21,4:13,9
+chr17	68000292	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,2:3,1:3,1
+chr17	70482847	.	A	AG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0041541;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,8:9,5:6,3
+chr17	71424528	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00031133;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:13,6:14,7
+chr17	71447533	.	T	TTATATATATA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0093911;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:4,3:2,5
+chr17	71490902	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.5051e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,18:10,9:11,9
+chr17	71654194	.	T	TAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.25968;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,3:9,1
+chr17	71940992	.	A	ATTTG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.044074;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,5:9,3
+chr17	71950356	.	T	TTC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.056405;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,1:13,3
+chr17	72368737	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,1:10,3
+chr17	72368800	.	G	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,3:8,1
+chr17	72754051	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,8:8,2:2,6
+chr17	72882799	.	T	TTTTTTTTTTTTCTTTTTC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018691;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:2,3:5,3
+chr17	73320702	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0018783;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:11,3:14,5
+chr17	74169302	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,3:11,1
+chr17	74332218	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.014832;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,10:5,6:3,4
+chr17	74515870	.	G	GATATATATATATAT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.09062;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,3:5,1
+chr17	76298181	.	A	ATTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,9:3,3:2,6
+chr17	76984386	.	TAAA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0021686;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:8,4:10,7
+chr17	77141369	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:2,1:7,7
+chr17	77383182	.	TTCTCTCCC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11424;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:7,3:8,3
+chr17	77988752	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.11412;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:14,2:21,2
+chr17	80024394	.	GAC	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.033228;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:14,4:14,2
+chr17	80097900	.	AAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0035566;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:5,2:7,7
+chr17	80634201	.	CTG	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0041266;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:6,4:10,7
+chr17	80689350	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00060445;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:14,7:14,2
+chr17	81177240	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,9:1,8:5,1
+chr17	82471791	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:4,3:10,2
+chr17	82829999	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:3,3:1,1:2,2
+chr17	83134778	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.027763;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:18,4:11,3
+chr17	83214281	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0084599;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:9,5:4,3
+chr17	83217917	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.013798;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:4,8:23,2
+chr18	555540	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0025765;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:12,6:15,8
+chr18	599947	.	C	CAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020223;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,11:8,6:8,5
+chr18	608500	.	AAAAC	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.025579;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:13,7:9,5
+chr18	645810	.	A	ATAT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:2,2:5,2
+chr18	2584287	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,9:8,5:4,4
+chr18	2678251	.	CTT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.059981;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,6:6,3:14,3
+chr18	2889133	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,2:2,3
+chr18	3598465	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0081016;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,12:8,10:3,2
+chr18	3600680	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036036;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,3:9,1
+chr18	3602593	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.019162;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,6:5,1
+chr18	7044162	.	CAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,5:4,1
+chr18	7228952	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:10,4:2,1
+chr18	7746638	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00015597;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:7,7:12,8
+chr18	7985437	.	GTATA	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.077418;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:12,4:12,1
+chr18	8653545	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.028009;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,8:9,7:1,1
+chr18	9310495	.	A	ATTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,5:4,4:3,1
+chr18	9386260	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00086348;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:14,8:17,6
+chr18	10171803	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0099161;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,7:3,6:4,1
+chr18	10196534	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0088578;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:1,7:1,3:0,4
+chr18	10788427	.	AAAGG	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,9:3,5:6,4
+chr18	11492817	.	G	GTGTGT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:6,12:1,7:5,5
+chr18	11492818	.	GATAGATAGATAGA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:6,12:1,7:5,5
+chr18	11616252	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:4,2:6,2
+chr18	12230663	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0043077;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:5,9:8,2
+chr18	12958064	.	CTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:4,2:5,3
+chr18	13370715	.	T	TTTTTTTTTTTTTTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:4,1:6,3
+chr18	14722118	.	G	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:3,2:0,3
+chr18	15363671	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.15352;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:13,2:18,2
+chr18	15477796	.	T	G	0	PASS	DP=254;GPV=1;SPV=0.020836;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:146,23:6,1:140,22
+chr18	15506211	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.050152;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:1,0:19,4
+chr18	15519375	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:2,0:20,4
+chr18	15540844	.	G	C	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.029466;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:81,16:32,11:49,5
+chr18	15576003	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
+chr18	15608486	.	A	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.04428;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:52,9:46,8:6,1
+chr18	15638824	.	C	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.19365;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:33,4:0,0
+chr18	15671242	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
+chr18	15683167	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:16,4:1,0
+chr18	15721901	.	T	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.014346;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:20,5:13,8
+chr18	15872075	.	T	G	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.037731;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:56,11:12,3:44,8
+chr18	16113970	.	C	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:18,4:0,0
+chr18	16226236	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:1,0:17,4
+chr18	16262949	.	C	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:0,0:17,4
+chr18	16438479	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:0,0:22,4
+chr18	16484155	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048244;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:6,2:21,4
+chr18	16931632	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:0,0:21,4
+chr18	17213738	.	G	C	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.00088281;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:80,14:56,11:24,3
+chr18	17213876	.	C	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.012647;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:75,18:21,9:54,9
+chr18	17413566	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27277;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:19,4:2,0
+chr18	18124860	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.093821;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:16,1:5,6
+chr18	18693208	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:22,4:0,0
+chr18	18745300	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
+chr18	19324556	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.047782;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:23,4:0,0
+chr18	19334057	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,0:9,4
+chr18	19669683	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.15761;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:26,2:9,2
+chr18	19921088	.	C	T	0	PASS	DP=215;GPV=1;SPV=0.01571;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:95,18:9,5:86,13
+chr18	20081322	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16366;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:4,3:16,2
+chr18	20242118	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.056683;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:6,1:22,4
+chr18	20744710	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.05717;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:20,4:12,1
+chr18	20767030	.	G	A	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.038258;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:55,12:31,5:24,7
+chr18	21003903	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=8.1152e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:5,11:19,6
+chr18	21221838	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00013614;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:10,4:12,8
+chr18	21322186	.	A	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.014944;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:23,2:11,4
+chr18	21389333	.	G	GTTTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,6:8,4:4,2
+chr18	21886258	.	G	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.051974;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,3:16,2
+chr18	24116819	.	G	GT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.012694;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,6:2,1
+chr18	24562425	.	A	AATATTAAAAGATGATTTTAAAATG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.022677;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:16,4:9,2
+chr18	25996366	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,10:3,9:3,1
+chr18	26508705	.	ATATTTC	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0048849;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,14:6,7:9,7
+chr18	26673929	.	CAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr18	30307766	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0020937;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:12,8:16,4
+chr18	30449261	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=4.0251e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:10,3:11,9
+chr18	31352508	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:19,3:8,1
+chr18	31406903	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00029111;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,14:5,5:8,9
+chr18	32174185	.	C	CCA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.30914;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,4:16,2:5,2
+chr18	33394943	.	GTATATA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.011899;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,6:2,2
+chr18	34199145	.	GT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,3:3,4
+chr18	34378476	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.014587;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:9,2:13,4
+chr18	34908494	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,4:5,1
+chr18	35160497	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.004949;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,11:6,7:7,4
+chr18	35281533	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0011798;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:14,4:9,8
+chr18	35517882	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0021552;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:16,5:17,6
+chr18	36076876	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.22175;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,5:4,2:13,3
+chr18	36792027	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.010567;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,8:10,7:4,1
+chr18	37082166	.	A	ATT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:8,7:3,1
+chr18	37332729	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=9.9379e-08;SS=2;SSC=70;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:7,5:6,8
+chr18	37364252	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.5288e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:7,7:10,7
+chr18	37995127	.	A	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:2,4:4,1
+chr18	38339263	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00010748;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:6,3:13,8
+chr18	38339635	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00031429;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:9,8:13,3
+chr18	39129371	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.036816;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:5,6:12,1
+chr18	39971006	.	TTA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:11,3:13,4
+chr18	40397519	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0010058;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:15,8:14,5
+chr18	40601153	.	A	AT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.090128;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,6:13,2:16,4
+chr18	42312057	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00029342;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,4:6,5
+chr18	42476389	.	T	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.03514;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,5:6,2:11,3
+chr18	43404148	.	GTA	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:3,1:0,1
+chr18	44457096	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00043522;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,4:8,3
+chr18	44457097	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0016713;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:5,4:10,2
+chr18	47328804	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.030957;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:11,2:6,3
+chr18	48457995	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.043327;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,10:12,9:2,1
+chr18	49292355	.	G	GACACAC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.031374;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,7:12,6:2,1
+chr18	49298795	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0001375;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,3:11,8
+chr18	54619461	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0081488;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:18,2:21,7
+chr18	54739456	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0027397;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,10:5,9:4,1
+chr18	56262775	.	G	GTATATACATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,4:5,1
+chr18	56262778	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,4:4,1
+chr18	57393915	.	AAGAAAGAAAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.040114;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,6:15,3:5,3
+chr18	57949913	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=7.9781e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:11,6:10,8
+chr18	58115245	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,6:6,2
+chr18	58480510	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:9,6:3,4
+chr18	58905403	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0016018;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:5,7:1,2
+chr18	59248682	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=2.3802e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:4,12:3,5:1,7
+chr18	59879236	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.11202;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:15,1:13,4
+chr18	62444492	.	C	CAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.007843;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,11:16,9:7,2
+chr18	62521989	.	TAA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:3,6:4,2
+chr18	65500304	.	AT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.042547;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:13,5:6,3:7,2
+chr18	65696775	.	CAAACCAA	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.5397e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:11,7:16,8
+chr18	66453549	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00015854;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:17,7:7,7
+chr18	66468026	.	AT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,2:6,2
+chr18	66524569	.	T	TATATATATATAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:5,3:8,3
+chr18	67776316	.	ACACACATCTATC	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.065116;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,3:9,1
+chr18	68114184	.	T	TA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:5,9:5,1
+chr18	68885588	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00066023;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:10,6:7,4
+chr18	69416181	.	C	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.33939;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,3:5,3:0,0
+chr18	70416410	.	CAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013387;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,7:5,6:3,1
+chr18	71265887	.	C	CACACACACACACACAT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.043302;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,13:12,6:15,7
+chr18	74029253	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.0067873;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,4:1,2
+chr18	74263146	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.028534;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,8:10,6:3,2
+chr18	75988054	.	A	AAAT	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0395;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:20,4:13,2
+chr18	76545276	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0013797;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:3,11:3,7:0,4
+chr18	77084428	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:6,4:0,1
+chr18	77258636	.	ATGG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,2:5,3
+chr18	77690521	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,2:2,2
+chr18	78513235	.	A	C	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.030951;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:66,9:38,6:28,3
+chr18	78818327	.	TG	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.13742;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,2:14,2
+chr18	78840400	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018244;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,2:2,4
+chr18	79435356	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.1253;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:18,1:14,4
+chr18	79732517	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,2:5,2
+chr18	79742081	.	AGAGGCCTGGGGGCAGCAGAGGAGGCATGAGGTG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,3:7,1
+chr18	80033994	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:1,3:7,1
+chr19	160613	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.052773;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:7,1:25,4
+chr19	274374	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0046784;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,11:3,7:3,4
+chr19	895257	.	T	TA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:8,6:6,4
+chr19	962513	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.041461;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,7:7,5:10,2
+chr19	2321098	.	GC	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.053635;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:10,3:21,2
+chr19	2605507	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:7,4:10,3
+chr19	3363275	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,3:2,1:1,2
+chr19	3954562	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,3:3,1
+chr19	4475891	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=7.8301e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,15:8,5:3,10
+chr19	4568915	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0072004;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:9,7:4,2
+chr19	5324226	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:12,4:1,0
+chr19	5409321	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.010783;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:14,6:10,4
+chr19	6192071	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,7:0,6:4,1
+chr19	6288169	.	C	CTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040535;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:8,7:6,1
+chr19	7036981	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048297;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,1:10,6
+chr19	7037326	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
+chr19	7152391	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.17768;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:11,2:18,2
+chr19	7437635	.	A	ATTTCTTTTTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.025544;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:8,4:16,7
+chr19	7605147	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.036132;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:5,3:11,5
+chr19	7736445	.	TTTCCTTCC	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0071642;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:6,2:13,12
+chr19	8235007	.	C	CTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,5:1,4:1,1
+chr19	8587333	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:4,2:6,2
+chr19	8617496	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0010146;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:18,3:8,9
+chr19	8774409	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.047407;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,5:21,3:7,2
+chr19	8780062	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.073644;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:11,3:36,4
+chr19	9108117	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:3,3:2,1
+chr19	9416663	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:3,2:6,2
+chr19	9619920	.	TC	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.036334;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:25,4:19,2
+chr19	9877543	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,2:2,1:3,1
+chr19	10253470	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026224;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,6:3,2:1,4
+chr19	10439982	.	C	CTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0082728;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:6,8:7,2
+chr19	10860840	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.036085;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:15,6:4,2
+chr19	11533899	.	T	TA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0061425;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:11,2:2,5
+chr19	11605080	.	C	CTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:6,3:2,1
+chr19	11825791	.	C	CTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00504;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:6,6:7,1
+chr19	12506933	.	CAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.022074;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,3:4,1
+chr19	12602081	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.024972;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:18,2:8,4
+chr19	13334593	.	T	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:2,2:6,3
+chr19	14689100	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.01933;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:16,5:11,3
+chr19	15088907	.	CAGAT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,5:5,3
+chr19	15088982	.	TG	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:12,3:2,1
+chr19	15099150	.	AAAGGG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:11,1:9,3
+chr19	16061298	.	T	TTTTTTTAAACAGGATC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00033903;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:9,8:4,4
+chr19	17031553	.	C	CGT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.063391;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:13,5:11,1
+chr19	17370001	.	T	TA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.040129;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:12,6:8,4
+chr19	17754131	.	G	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.9329e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:11,6:11,7
+chr19	17918501	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,2:11,2
+chr19	18222657	.	TTCTCTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,10:0,4:5,6
+chr19	18902360	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=5.4482e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:7,5:9,7
+chr19	18937308	.	T	TAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0008238;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:4,7:1,1
+chr19	20163916	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010901;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:7,10:8,2
+chr19	20249584	.	T	TTC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.037194;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:5,4:11,3
+chr19	21482642	.	C	CAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,6:4,4:6,2
+chr19	21535437	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.29987;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:11,1:15,3
+chr19	21548710	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:7,3:4,2
+chr19	22783712	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00035871;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:29,18:15,11:14,7
+chr19	22991841	.	TG	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0095299;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:10,7:6,6
+chr19	23413237	.	C	CTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.021615;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:9,4:5,3
+chr19	24400418	.	C	T	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.017809;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:72,22:32,14:40,8
+chr19	24402598	.	ACT	A	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.0096107;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:69,18:35,9:34,9
+chr19	24435868	.	C	G	0	PASS	DP=299;GPV=1;SPV=0.031613;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:148,23:41,11:107,12
+chr19	24436165	.	G	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.082694;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:6,3:39,2
+chr19	24438581	.	G	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.042011;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:75,16:35,7:40,9
+chr19	26389831	.	A	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
+chr19	27354774	.	T	C	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.0043657;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:95,32:49,13:46,19
+chr19	28206805	.	AAAGG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,7:2,2:6,5
+chr19	29151695	.	G	GAGAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.26815;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,3:9,2:9,1
+chr19	29423409	.	A	ATG	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.012239;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,6:7,3:9,3
+chr19	29426679	.	GT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:8,6:11,4
+chr19	31354256	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.086665;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:24,3:19,2
+chr19	31530696	.	G	GA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.034267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,10:6,9:13,1
+chr19	32399209	.	G	GA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,8:3,7:2,1
+chr19	32511717	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.034367;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:13,4:9,1
+chr19	32591635	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.12674;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:16,4:26,1
+chr19	32591639	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.09386;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,6:15,5:25,1
+chr19	33618669	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.018803;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,3:2,1
+chr19	33876432	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10733;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,6:6,5:4,1
+chr19	34101461	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.055222;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:12,3:10,1
+chr19	36253979	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0059495;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:20,5:15,5
+chr19	36281823	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:16,4:0,0
+chr19	36281824	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
+chr19	36281826	.	C	CAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
+chr19	36491329	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.040749;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:17,12:12,2
+chr19	37294646	.	G	A	0	PASS	DP=1989;GPV=1;SPV=0.010233;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:1137:1016,121:301,51:715,70
+chr19	38240318	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0043101;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,4:5,3
+chr19	39102118	.	T	TCACACACACACA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.083787;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:14,2:8,4
+chr19	39121578	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:9,4:0,0
+chr19	39255782	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,5:5,1
+chr19	39794164	.	C	CAAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.020557;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:7,5:3,1
+chr19	39886594	.	G	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.061837;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:40,5:14,3:26,2
+chr19	40183967	.	CA	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0054076;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:7,6:10,7
+chr19	40317715	.	C	CTGTTTTTTTTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.021089;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,11:10,6:5,5
+chr19	40418215	.	CT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:4,8:0,1:4,7
+chr19	40695350	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.099229;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:15,1:11,4
+chr19	40781308	.	AAATG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0076667;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:6,4:2,3
+chr19	41060381	.	A	AAGAAAGATAGATAGATAGATAGAT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.04669;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,7:13,3:5,4
+chr19	41103469	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.13808;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:24,2:11,2
+chr19	41909699	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.010119;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:11,7:18,3
+chr19	42615273	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0018992;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:8,5:12,5
+chr19	42816574	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.04391;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,11:24,6:18,5
+chr19	43393074	.	G	GGGAAGGAAGGAAGGAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.046752;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:10,5:3,2
+chr19	43568977	.	TA	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.001098;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,15:7,8:5,7
+chr19	43709954	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0068571;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:11,3:8,3
+chr19	43786294	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:7,2:3,1:4,1
+chr19	44016948	.	CTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,5:4,2
+chr19	44719936	.	C	CACACACAT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:0,3:0,0:0,3
+chr19	44764193	.	AG	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:17,4:1,0
+chr19	45325902	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.11976;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,5:12,4:4,1
+chr19	46129307	.	TTG	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.038543;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:14,10:9,3
+chr19	47051638	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0048053;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:9,11:15,3
+chr19	47368298	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
+chr19	47431677	.	AAAAC	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,2:2,1:3,1
+chr19	47579397	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.049139;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:10,4:9,2
+chr19	47774924	.	A	AT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:3,5:6,2
+chr19	47938818	.	A	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0032151;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:2,7:2,6:0,1
+chr19	47963898	.	TTTTCTTTTC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.06407;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,3:15,2
+chr19	48543966	.	A	AGC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.20757;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:14,3:1,0:13,3
+chr19	48684183	.	G	GA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:8,6:3,2
+chr19	48729709	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,5:2,2:0,3
+chr19	49742496	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02043;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,3:5,4
+chr19	50133090	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.086635;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:17,1:7,4
+chr19	50172889	.	GA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0041488;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:7,7:7,3
+chr19	50277917	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.02275;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:12,6:10,3
+chr19	50641888	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0019875;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:14,5:8,3
+chr19	50786867	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.008557;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:9,6:5,6
+chr19	50918309	.	T	TTAGA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.019608;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,11:14,7:11,4
+chr19	51405410	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.28173;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:11,4:7,3:4,1
+chr19	51854496	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.049275;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,4:7,2
+chr19	52508893	.	ATTT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042556;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:8,4:4,3
+chr19	52695639	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:4,3:4,4
+chr19	53111340	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.020843;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:9,5:2,1
+chr19	53482722	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042724;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:5,3:6,3
+chr19	53782098	.	CTCTTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,1:10,3
+chr19	53913785	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,9:7,7:2,2
+chr19	54004334	.	TTTGTGTGTGTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,4:6,1
+chr19	54894564	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,3:3,1
+chr19	55178753	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:2,3:4,1
+chr19	55270937	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.001961;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:17,9:12,3
+chr19	55463403	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0010937;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:15,6:16,7
+chr19	55768578	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.10111;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:28,5:18,1
+chr19	55853883	.	ATCTCTT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.09513;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:15,1:17,4
+chr19	55853907	.	TTCTC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.089104;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:12,1:14,4
+chr19	56037693	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0071858;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,3:3,5
+chr19	56218050	.	C	CTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:8,4:5,1
+chr19	56850512	.	G	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.00021701;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:40,15:22,6:18,9
+chr19	56947032	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,2:2,1:2,1
+chr19	56973386	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01971;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,9:5,5:5,4
+chr19	57104244	.	G	GGTTTTGTTTT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.025815;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,8:10,4:9,4
+chr19	57843567	.	G	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032869;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:2,1:2,3
+chr19	58037161	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0016548;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:11,6:14,6
+chr19	58427343	.	C	CTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,8:1,1:14,7
+chr19	58427348	.	TC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.26877;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,6:2,2:11,4
+chr19	58427358	.	C	CTCT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.062683;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,5:1,1:15,4
+chr19	58427361	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:4,1:19,3
+chr19	58605246	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.014514;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,3:8,6
+chr2	238259	.	T	TTG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0044123;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,15:6,9:2,6
+chr2	583086	.	GGCC	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.029601;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:11,4:16,9
+chr2	597535	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.0089356;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:20,3:23,6
+chr2	739644	.	G	GA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0049268;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:13,11:11,8
+chr2	750206	.	G	GTTTATTTTATTTTATTTTAT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.056363;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,8:13,5:15,3
+chr2	797194	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.055492;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:45,6:27,3:18,3
+chr2	939932	.	C	CTA	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.033642;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:19,4:22,5
+chr2	1027475	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.026369;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:6,4:12,4
+chr2	1143750	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.24882;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:19,3:17,1
+chr2	1255843	.	AAT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.21107;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,5:7,3:12,2
+chr2	1262694	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.13105;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,5:8,2:13,3
+chr2	1323547	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16049;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:15,1:16,4
+chr2	1509725	.	G	GCCCACCCTCTTTTTTCAGGGATAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.17449;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,5:11,2:10,3
+chr2	1706834	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.035448;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:11,9:15,3
+chr2	1780382	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,2:2,1:3,1
+chr2	2004320	.	G	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.062714;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,3:6,3
+chr2	2561206	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016345;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:12,2:16,12
+chr2	2953278	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0039495;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:20,7:13,5
+chr2	3049625	.	A	AATATATATAT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,2:2,2
+chr2	3775110	.	CTGAGCTAGGCAGCTGTGGCTG	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.091614;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:7,2:15,2
+chr2	4260661	.	TTA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0014993;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,14:4,6:3,8
+chr2	4926342	.	TTTTA	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.019292;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:36,16:12,5:24,11
+chr2	4974165	.	GAGGGTGTTT	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.01494;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:6,2:6,6
+chr2	5561566	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.086635;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:10,2:14,3
+chr2	5652595	.	G	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=7.0026e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:31,16:16,11:15,5
+chr2	6420993	.	CAAA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016738;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:10,10:4,2
+chr2	6651481	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,3:4,2
+chr2	7165540	.	C	CAGATAGATAGATAGAT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.002598;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:11,6:10,11
+chr2	7261995	.	ATT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.014003;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:13,8:5,5
+chr2	8092204	.	GAAAGAAAGAAAGA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:19,2:5,2
+chr2	8324335	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00017063;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:33,18:12,11:21,7
+chr2	9254298	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,3:5,5
+chr2	9499113	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.37564;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:12,4:6,3:6,1
+chr2	9989124	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.010163;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:39,21:21,9:18,12
+chr2	9998827	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.21465;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,5:10,1:1,4
+chr2	10181750	.	CTCTCTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:6,5:5,1
+chr2	10291618	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1356;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:11,3:21,3
+chr2	10809668	.	A	AAC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,9:7,5:2,4
+chr2	10902465	.	T	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.01018;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:26,7:15,2
+chr2	12772913	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.069855;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:21,3:14,4
+chr2	14073665	.	C	CT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0086143;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:12,8:8,5
+chr2	14567980	.	G	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.1371;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:17,6:9,4:8,2
+chr2	16018180	.	C	CCT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:1,2:0,0:1,2
+chr2	16832369	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0067079;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,10:2,9:1,1
+chr2	17477961	.	G	GA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:5,4:3,1
+chr2	17530584	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:6,4:4,1
+chr2	18050699	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.037585;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,15:10,11:7,4
+chr2	18755763	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,5:4,2
+chr2	19070434	.	G	GTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10396;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,5:20,4:5,1
+chr2	20102735	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.047734;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:23,4:8,3
+chr2	21286995	.	AT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01473;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:4,2:7,12
+chr2	21353165	.	G	GGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.004133;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:5,8:5,4
+chr2	21895316	.	G	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=5.242e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:28,21:13,11:15,10
+chr2	22517357	.	ATATG	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.057585;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,7:13,1:5,6
+chr2	22743819	.	GGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.069354;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,5:16,3:8,2
+chr2	22747322	.	CAAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,6:7,2
+chr2	23120689	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.10244;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:26,8:15,7:11,1
+chr2	23640965	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.093123;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:21,3:25,3
+chr2	24106316	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.29231;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,4:16,4:1,0
+chr2	25632192	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.083396;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,6:16,1:4,5
+chr2	25661744	.	A	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=2.0987e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:32,22:17,13:15,9
+chr2	25884694	.	T	TA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,8:4,1
+chr2	28334847	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.080744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:20,5:11,4:9,1
+chr2	28511788	.	C	CTTTTTTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:11,3:7,1
+chr2	30143186	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0038562;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:10,9:5,1
+chr2	30712644	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.17119;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,8:18,4:2,4
+chr2	32200845	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.15649;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:49,6:29,2:20,4
+chr2	32271536	.	TAG	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.2607;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,5:12,4:11,1
+chr2	32389989	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00014297;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:12,8:16,6
+chr2	32646557	.	G	GT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.011343;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,16:8,10:6,6
+chr2	33244860	.	T	TTATCTATCTATCTATC	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.082021;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:38,7:26,3:12,4
+chr2	33428495	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.20705;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,5:7,4:9,1
+chr2	33709749	.	A	ATT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.048713;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,10:7,9:6,1
+chr2	34292459	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.080979;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:11,3:24,3
+chr2	35418835	.	AATTG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,4:12,1:6,3
+chr2	37153339	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020843;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,3:5,3
+chr2	37585207	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0090365;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:15,11:6,7:9,4
+chr2	38403856	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0042182;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:7,4:7,10
+chr2	39044866	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.08134;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:20,3:20,2
+chr2	39773575	.	AT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.069699;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,6:16,3:11,3
+chr2	39841978	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11483;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:15,4:23,2
+chr2	39872346	.	ATTTCTTTCTTTCTTTC	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0035488;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,12:2,1:12,11
+chr2	40219875	.	A	AT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.16587;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,4:4,1
+chr2	42076342	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038709;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:21,5:2,1
+chr2	42076351	.	GAAAGAAAA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.059999;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:23,5:2,1
+chr2	42717127	.	GTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:5,4:3,1
+chr2	43274998	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,6:7,3:5,3
+chr2	43635551	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.03639;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:9,2:23,7
+chr2	43724370	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=6.196e-09;SS=2;SSC=82;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:19,32:6,16:13,16
+chr2	43754869	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.024674;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:7,5:6,4
+chr2	43980553	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1396;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,5:19,2:5,3
+chr2	44113489	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,2:2,1:1,1
+chr2	44125392	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,7:6,5:5,2
+chr2	44410247	.	AT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,5:3,3:3,2
+chr2	44542496	.	T	TACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.035453;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,10:20,9:5,1
+chr2	44828126	.	A	ATT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0021156;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:5,8:12,3
+chr2	46855219	.	C	CCT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.015711;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,6:5,2
+chr2	46978562	.	T	TAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0091635;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,5:6,3
+chr2	47288788	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0099736;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:20,4:6,2
+chr2	47290841	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:5,9:2,1
+chr2	47323077	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.077519;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,3:9,1
+chr2	47323092	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,3:13,1
+chr2	48177831	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,4:14,2:4,2
+chr2	49110400	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.025962;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:18,2:13,8
+chr2	49604146	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0034722;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,15:15,7:13,8
+chr2	50239662	.	GTATATATATATATA	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:5,3:0,1
+chr2	50984134	.	A	ATT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.27607;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,4:6,2:10,2
+chr2	51504653	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:8,7:3,4:5,3
+chr2	51854925	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.024419;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,4:10,6
+chr2	51854926	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020195;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:6,4:11,6
+chr2	52275815	.	C	CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.16269;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:19,5:20,1
+chr2	52320713	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.024823;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:14,3:9,8
+chr2	52581829	.	CAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.03895;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:8,5:8,4
+chr2	52585110	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=4.2445e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:16,27:6,14:10,13
+chr2	53393256	.	C	CTATATATA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,11:6,6:3,5
+chr2	53718203	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=4.2116e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:14,24:8,17:6,7
+chr2	54058837	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.015228;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:25,5:12,5
+chr2	55367528	.	G	GTTTTTTTTTTTTTTGTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,8:3,7:2,1
+chr2	56257146	.	C	CT	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.024868;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:27,3:18,5
+chr2	56617423	.	GTA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:15,3:5,1
+chr2	56617441	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.030844;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:10,4:4,1
+chr2	56617448	.	TAC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:11,4:3,1
+chr2	58531968	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.11157;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:20,3:17,2
+chr2	58973678	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0077789;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,9:8,3
+chr2	59401041	.	G	GAAGAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,4:12,3:2,1
+chr2	59590866	.	C	CTTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,7:5,2
+chr2	60074575	.	T	TTTCCTTCC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.011304;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,16:10,10:8,6
+chr2	61104483	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:4,2:3,1:1,1
+chr2	61715319	.	C	CTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,10:5,8:2,2
+chr2	62115832	.	T	TTTCTTTC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.044964;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,12:7,2:13,10
+chr2	62562855	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.021815;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:44,10:29,6:15,4
+chr2	63651474	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.018404;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:11,5:8,1:3,4
+chr2	64589944	.	TGGGGG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,11:3,10:0,1
+chr2	64802633	.	GAA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.10445;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:17,3:8,4
+chr2	65339112	.	CG	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
+chr2	65339119	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:8,3:12,2
+chr2	65363239	.	CAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.046124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,13:15,9:5,4
+chr2	65407245	.	C	CTTTTTTTTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.077118;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:13,3:8,3
+chr2	65579406	.	G	T	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.00011122;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:45,17:17,5:28,12
+chr2	68173576	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.012445;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:7,6:5,4
+chr2	68246067	.	CTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.026248;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:2,6:6,1
+chr2	68621704	.	G	GGGAAGGAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.064595;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,5:11,4:8,1
+chr2	69395436	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,5:8,2:4,3
+chr2	71411446	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.035299;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:23,2:15,6
+chr2	74707505	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.10307;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:30,7:11,1:19,6
+chr2	75813568	.	C	CT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.14969;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:18,2:18,3
+chr2	76299016	.	TCACACACACA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.22727;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,2:2,1:2,1
+chr2	76675240	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.016858;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:5,3:5,3
+chr2	76703554	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.027005;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:7,6:6,6
+chr2	76974139	.	TAC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.013698;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:7,4:10,5
+chr2	76974155	.	CAT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.049965;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:4,3:15,2
+chr2	77091680	.	T	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.028327;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:12,2:23,10
+chr2	77178784	.	A	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.037745;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:21,1:16,4
+chr2	78371002	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.10909;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,2:1,1:1,1
+chr2	78880794	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00051824;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:18,8:11,7
+chr2	79081401	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00034436;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:29,19:13,10:16,9
+chr2	79501965	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:8,4:6,1
+chr2	81224895	.	T	TAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.32408;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,3:7,1
+chr2	81976851	.	C	CTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:1,2:3,2
+chr2	82868644	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,4:5,3
+chr2	82868649	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0036253;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,6:3,2
+chr2	85410864	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,4:2,1:12,3
+chr2	85417477	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:7,5:0,0
+chr2	85563192	.	AT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,2:13,2
+chr2	86195416	.	G	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00087116;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:26,9:18,6
+chr2	86368498	.	GA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:0,4:0,4:0,0
+chr2	86424227	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.1392e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:6,10:20,4
+chr2	87177743	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,1:10,3
+chr2	87261110	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.040649;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:9,1:27,7
+chr2	87361199	.	T	C	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.036213;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:68,9:33,5:35,4
+chr2	87414607	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031197;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:12,6:6,2
+chr2	87688887	.	TA	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0023953;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,7:3,2
+chr2	87706870	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:3,3:6,1
+chr2	87870077	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.030159;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:17,5:11,2
+chr2	87973479	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,6:5,2
+chr2	89134598	.	A	AT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,3:6,2
+chr2	90271018	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:3,2:13,2
+chr2	90356801	.	T	C	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.00099512;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:65,15:30,11:35,4
+chr2	91427296	.	C	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.042733;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:90,21:46,16:44,5
+chr2	91428718	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10544;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,3:11,1
+chr2	91523483	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0055662;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,12:13,4:6,8
+chr2	91523498	.	G	GGTGGCTTC	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.010388;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,6:16,3:20,3
+chr2	91785317	.	C	G	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.034685;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:68,14:42,9:26,5
+chr2	91880349	.	GTCAGATCT	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.00074948;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:58,11:26,8:32,3
+chr2	92248969	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10169;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:34,2:1,3
+chr2	92262987	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:8,3:24,1
+chr2	92330480	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01393;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,1:6,6
+chr2	92353193	.	T	A	0	PASS	DP=459;GPV=1;SPV=0.024517;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:277:248,29:72,6:176,23
+chr2	92353805	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.13115;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:0,2:23,3
+chr2	92398925	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr2	92471310	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.048399;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:29,7:1,0
+chr2	92758805	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.069699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:21,4:6,2
+chr2	92790806	.	T	G	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.016861;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:86,13:22,3:64,10
+chr2	92814334	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,3:2,1
+chr2	92889070	.	T	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:1,0:12,4
+chr2	92909789	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.33319;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:2,0:24,4
+chr2	92948033	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.037062;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:20,4:8,2
+chr2	92970138	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.011302;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:9,2:11,7
+chr2	93179406	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.072233;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,2:11,2
+chr2	93285132	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:9,1:14,3
+chr2	93480292	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.048788;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:16,5:8,3
+chr2	93567150	.	A	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.037983;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:20,1:20,7
+chr2	93567311	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0069073;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:4,1:20,10
+chr2	93587754	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.072233;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:6,1:12,3
+chr2	93594667	.	C	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.046341;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:23,6:14,3
+chr2	93641679	.	A	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.25735;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:18,3:1,0
+chr2	93672946	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.034525;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:2,1:16,3
+chr2	93852825	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.083225;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:6,4:19,1
+chr2	93953668	.	G	C	0	PASS	DP=168;GPV=1;SPV=0.018672;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:89,14:10,7:79,7
+chr2	94141721	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.031109;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,1:5,6
+chr2	94286439	.	T	C	0	PASS	DP=416;GPV=1;SPV=0.016109;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:242:212,30:87,15:125,15
+chr2	94636668	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00064075;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:10,5:16,5
+chr2	95041163	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.1656e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:13,9:3,6
+chr2	95291901	.	CTTAAATATATATATATACGTACATATATTTA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.059705;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,3:11,1
+chr2	96779508	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0020026;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,12:7,10:3,2
+chr2	97221605	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.046334;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:15,3:10,3
+chr2	97793993	.	CAA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.016783;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,6:2,5:1,1
+chr2	97800595	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,8:2,6:1,2
+chr2	98031629	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0023617;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,11:9,5:6,6
+chr2	99510713	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.019592;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,4:11,4
+chr2	99643055	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.020897;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,6:7,4
+chr2	99648934	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.14559;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,6:10,1:13,5
+chr2	99716882	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.014854;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:13,6:10,8
+chr2	101678129	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.16851;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,3:11,2:8,1
+chr2	104882243	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,12:3,7:4,5
+chr2	105249282	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:11,3:4,2
+chr2	105678576	.	TTCCTTCCCGTGTTAGCTCGGTCA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0015408;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:13,6:7,4
+chr2	106451304	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.069378;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:8,3:18,1
+chr2	106466890	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.086154;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
+chr2	108769916	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00047582;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:10,5:17,10
+chr2	109066559	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0011061;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:13,4:14,5
+chr2	109075890	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.2423e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:9,7:6,5
+chr2	109794608	.	C	CGGCCG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:9,4:1,0
+chr2	110159886	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.037081;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:13,2:13,3
+chr2	110318236	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.032095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,5:7,1
+chr2	110360672	.	T	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,3:5,1
+chr2	110619926	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:47,7:27,1:20,6
+chr2	111284730	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.015187;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:11,6:10,7
+chr2	111285290	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,1:8,3
+chr2	111757049	.	GAAGA	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,4:6,3:4,1
+chr2	112433207	.	ACC	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.080505;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:20,1:14,3
+chr2	112983898	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.025222;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:18,2:14,4
+chr2	113427302	.	A	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr2	113559179	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.01507;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:42,19:25,8:17,11
+chr2	113584515	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.015143;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:19,3:20,8
+chr2	113598180	.	A	ACCCTGG	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.03089;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:76,11:48,6:28,5
+chr2	113615278	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.021983;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:5,7:19,2
+chr2	113615483	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,1:7,3
+chr2	113741338	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.7634e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:15,27:3,18:12,9
+chr2	113770215	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,7:3,5:3,2
+chr2	113949377	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.014907;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,4:3,1
+chr2	115693550	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=8.4931e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:32,18:14,8:18,10
+chr2	116583705	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.043456;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:9,2:19,3
+chr2	116887745	.	AGTGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00081085;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,10:1,4:2,6
+chr2	117750541	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.006031;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:6,5:4,7
+chr2	118895755	.	C	CTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00040256;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:3,6:6,5
+chr2	119519825	.	AAAG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0029985;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,7:3,1
+chr2	120886159	.	AGTGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042556;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,4:7,3
+chr2	120945957	.	T	TCACACACACACA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,8:7,2:2,6
+chr2	121134596	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
+chr2	122220081	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.012882;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,7:5,6:4,1
+chr2	122568073	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0014541;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:10,6:14,4
+chr2	123494750	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=5.2547e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:17,26:7,14:10,12
+chr2	124029475	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0014541;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:12,3:12,7
+chr2	124232827	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00036759;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:14,7:13,5
+chr2	124419896	.	T	TTTTC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.061797;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:7,2:15,4
+chr2	124571525	.	TTC	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,2:10,2
+chr2	124956034	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.003619;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:11,3:17,5
+chr2	125739694	.	T	TC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.036268;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,2:10,9
+chr2	126737262	.	T	TGATA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.039955;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:5,3:11,4
+chr2	127787999	.	T	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:2,2:3,1
+chr2	127788000	.	T	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:1,3:3,1
+chr2	128221306	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00021386;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:19,9:9,3
+chr2	130129973	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,1:2,4
+chr2	130216099	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.046334;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:17,5:8,1
+chr2	130762170	.	G	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.025682;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:15,4:20,1
+chr2	131023074	.	C	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.32312;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:14,1:5,3
+chr2	131223219	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.077327;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,3:8,2
+chr2	131455425	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:6,2:7,2
+chr2	131688504	.	CT	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0052563;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:16,8:12,1
+chr2	131765473	.	AGTCCCCAGGTTGATACCTG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:7,1:12,3
+chr2	131912638	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.017466;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:18,7:13,1
+chr2	132029651	.	A	ACACAC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.033527;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:14,5:6,5
+chr2	132048452	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.28797;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,4:3,1:11,3
+chr2	132049441	.	G	A	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.017552;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:64,8:36,7:28,1
+chr2	132258640	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00017421;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:12,3:12,10
+chr2	132264069	.	A	ATAAATAAATAAATAAATAAATAAAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,4:10,2:9,2
+chr2	133567659	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,4:9,2:8,2
+chr2	133729208	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00036473;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:16,6:19,7
+chr2	133948596	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0048347;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:15,2:10,5
+chr2	134372186	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.016436;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:12,2:9,4
+chr2	134759427	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043327;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:7,7:7,3
+chr2	135881598	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.001019;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:9,2:13,6
+chr2	137699040	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0048714;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:12,5:14,5
+chr2	138449450	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:4,3:4,1:0,2
+chr2	139062024	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:16,2:9,2
+chr2	139277983	.	C	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00023167;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:14,3:18,10
+chr2	140107109	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.016569;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,8:10,4:17,4
+chr2	140600767	.	GT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:5,4:4,1
+chr2	142478952	.	G	GT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024017;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:2,8:6,3
+chr2	142572908	.	A	AATG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:7,12:3,8:4,4
+chr2	142824679	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0055971;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:14,9:12,4
+chr2	143318509	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:2,4:2,2
+chr2	143823230	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.01412;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:9,6:11,1
+chr2	144636481	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:13,4:1,0
+chr2	145609330	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,6:3,5:1,1
+chr2	146056035	.	GAAA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041126;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:12,4:3,1
+chr2	146056082	.	AAAG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.033555;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,3:7,1
+chr2	147049309	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00054466;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:14,5:8,4
+chr2	147105609	.	G	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.013649;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:14,4:7,4
+chr2	147820226	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016596;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:9,8:7,2
+chr2	148647619	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:1,3:4,1
+chr2	149435613	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=2.8454e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:13,10:18,5
+chr2	149965864	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0061653;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:20,5:15,6
+chr2	150025327	.	AAT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0039984;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:5,5:6,5
+chr2	150249947	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,4:9,3:8,1
+chr2	150636654	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.044663;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,2:16,3
+chr2	150930638	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:1,3:1,2:0,1
+chr2	151005494	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.11618;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:21,2:13,2
+chr2	151132476	.	A	AAGGGAGAG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11921;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:11,3:20,2
+chr2	152915501	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:10,3:2,5
+chr2	153074663	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00014841;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,19:3,12:9,7
+chr2	154299455	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.013278;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,10:6,8:4,2
+chr2	154862380	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.054281;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,6:9,4:10,2
+chr2	155334085	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:14,3:8,1
+chr2	158895384	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.004257;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,9:1,8:3,1
+chr2	159025189	.	T	TTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,5:3,1:8,4
+chr2	159075417	.	A	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,2:2,1:1,1
+chr2	159802428	.	ATT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,5:4,2:3,3
+chr2	160410221	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.064336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:6,6:11,1
+chr2	162748939	.	C	CCT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:2,1:3,1
+chr2	163525725	.	ATT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,8:6,5:3,3
+chr2	165057743	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0015308;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:14,2:9,5
+chr2	166684335	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.073359;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,4:7,1:9,3
+chr2	168788810	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.02438;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,3:13,2
+chr2	169522705	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:6,3:4,1
+chr2	170794023	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.062277;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:9,1:15,4
+chr2	171015415	.	AACACAC	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0071032;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,10:4,4:3,6
+chr2	171194818	.	GGGA	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.015238;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:6,8:3,1
+chr2	171234442	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,4:6,2:1,2
+chr2	171257157	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.2419;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,4:3,3:11,1
+chr2	171293140	.	GA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012052;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:9,2:6,9
+chr2	171902833	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.077327;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:12,2:9,3
+chr2	172190374	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.07313;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,1:8,4
+chr2	172441559	.	T	TA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,3:6,1
+chr2	172622551	.	C	CTCATATATT	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.072031;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,4:17,2:16,2
+chr2	172622558	.	GAT	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.021294;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:19,3:18,4
+chr2	173815234	.	GA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:15,3:4,1
+chr2	174720839	.	T	TAAAAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.033516;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:14,8:9,1
+chr2	178032621	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0037034;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:26,7:10,6
+chr2	178127994	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,2:7,3
+chr2	178157505	.	G	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=1.2492e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:15,5:15,13
+chr2	178432094	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0075752;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:18,4:10,10
+chr2	178718105	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=1.012e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,21:10,9:9,12
+chr2	179015093	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
+chr2	179040693	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.023047;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:5,6:18,7
+chr2	183969689	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:2,3:6,7
+chr2	184213722	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:9,6:1,1
+chr2	184587718	.	AAG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,6:6,1
+chr2	184912624	.	TC	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0001497;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:19,5:8,7
+chr2	188066338	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.18281;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,6:9,5:9,1
+chr2	188368923	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,3:7,1
+chr2	189059585	.	GT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,1:3,3
+chr2	190314359	.	GTA	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.11785;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:10,2:3,4
+chr2	190737761	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,3:6,2:0,1
+chr2	191120145	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00030992;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:10,8:14,8
+chr2	191120753	.	ACAC	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.010002;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:21,4:17,4
+chr2	191120759	.	TATATAAA	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0085279;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:18,3:15,4
+chr2	191383549	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:3,4:3,2
+chr2	192421667	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0002648;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:10,5:15,8
+chr2	192981193	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.029349;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,8:2,6:10,2
+chr2	194048427	.	G	GCATGTATACACATATATGTATATA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:5,3:10,1
+chr2	194916085	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0088413;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,6:2,4:2,2
+chr2	196927409	.	TA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,2:8,2
+chr2	197763472	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0089009;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,3:7,2
+chr2	197864800	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=6.2242e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:8,7:14,7
+chr2	198954354	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=2.7571e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:10,10:4,9
+chr2	201917376	.	GCA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0066141;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:3,12:3,7:0,5
+chr2	202338609	.	TC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:3,1:1,1
+chr2	202691649	.	TTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,11:5,9:3,2
+chr2	202766061	.	AAC	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.018293;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:12,6:5,2
+chr2	203209412	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.069378;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:11,3:15,1
+chr2	203354515	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.2001e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:32,19:19,7:13,12
+chr2	206163937	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:2,1:2,1
+chr2	206386681	.	CA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.045061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:22,3:3,2
+chr2	206479508	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00060836;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:12,9:18,6
+chr2	206596899	.	CTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.004257;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,7:2,6:2,1
+chr2	206793248	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.091388;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,6:6,4:9,2
+chr2	207521122	.	AT	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0018044;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:17,3:14,7
+chr2	207521134	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0062626;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:18,3:13,7
+chr2	207657123	.	ACCTCGTGATTGAGGCCTCGGCCTC	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0020087;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:15,2:18,8
+chr2	207688933	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0003086;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:9,4:12,7
+chr2	208559894	.	TTTTTC	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0309;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:17,4:12,11
+chr2	208571470	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00079602;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:12,8:14,3
+chr2	209247765	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.012812;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:10,6:7,5
+chr2	209312880	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,3:5,1
+chr2	209819145	.	GCTAAC	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00023693;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:8,5:9,5
+chr2	211110158	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.036268;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,11:14,8:6,3
+chr2	211165683	.	CGTGTGTGTGT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,8:3,7:5,1
+chr2	211296874	.	T	TATAC	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0027957;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,8:3,2:8,6
+chr2	211414506	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:1,3:0,2:1,1
+chr2	211944181	.	A	ATATAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0013343;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,11:6,7:5,4
+chr2	212519717	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=7.9047e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:17,5:11,11
+chr2	212864431	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10815;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:12,1:18,5
+chr2	212897252	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.079813;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:14,3:18,2
+chr2	212964856	.	A	ATGTC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.32176;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,4:9,2:16,2
+chr2	213648658	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00017084;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:9,10:9,6
+chr2	215184107	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.6913e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:17,10:6,5
+chr2	215943838	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:4,4:5,1
+chr2	216263435	.	AAGAG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.020223;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:12,6:4,5
+chr2	217198931	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.035372;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,3:3,3
+chr2	217198932	.	A	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.018182;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,8:0,3:1,5
+chr2	217198934	.	C	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.041026;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:2,3:4,1
+chr2	217410516	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.063158;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:6,12:3,4:3,8
+chr2	218359341	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027524;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:10,7:5,1
+chr2	218433443	.	GA	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0057036;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:15,4:6,4
+chr2	218434197	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0034107;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,17:9,13:9,4
+chr2	220867018	.	A	AAAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.032462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:13,6:7,4
+chr2	222116486	.	G	GA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.02905;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:14,5:5,1
+chr2	222116495	.	GA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036566;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:13,5:4,1
+chr2	222571217	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00011169;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:13,7:8,6
+chr2	224254054	.	GAC	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.034789;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:10,2:9,3
+chr2	224695697	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.15766;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:18,3:10,2:8,1
+chr2	224820211	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0034183;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:14,4:13,5
+chr2	226097503	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.012731;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:16,2:9,5
+chr2	226566406	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0050608;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:18,4:14,6
+chr2	227104638	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0087495;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:3,6:4,3
+chr2	227441286	.	CA	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.13148;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:20,2:19,3
+chr2	228425351	.	C	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.026907;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,2:4,6
+chr2	228496261	.	GAA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.057143;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,2:2,1:0,1
+chr2	229092038	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,4:10,1
+chr2	229512734	.	T	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00030064;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,17:15,6:18,11
+chr2	230089325	.	A	AT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,6:3,2:3,4
+chr2	231521977	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,1:8,3
+chr2	232763831	.	C	CA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0016269;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,17:10,6:10,11
+chr2	232847517	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:13,7:6,5:7,2
+chr2	233768582	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,5:2,3:3,2
+chr2	234510916	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,8:2,7:4,1
+chr2	236630911	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.00022114;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:2,8:1,7:1,1
+chr2	236645120	.	C	CTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.067367;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:11,5:5,1
+chr2	237516830	.	AGGAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.02457;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,12:5,5:11,7
+chr2	237629467	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:3,7:4,2
+chr2	237974514	.	TG	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0779;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:13,5:4,3
+chr2	238837721	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,10:5,6:1,4
+chr2	239008853	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00067124;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:15,7:10,4
+chr2	239802883	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.028662;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:14,8:5,2
+chr2	240308864	.	GTGTGTCTC	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.031685;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:12,3:18,3
+chr2	242043203	.	T	TA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.11412;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:14,1:21,3
+chr2	242183177	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.19313;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:18,1:11,3
+chr20	161991	.	G	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.017846;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:8,8:9,2
+chr20	743121	.	GTC	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,7:7,4:8,3
+chr20	1248045	.	C	CA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.029515;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:4,6:3,1
+chr20	1766142	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.24377;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:5,1:13,2
+chr20	1766165	.	ATACATATATGTG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.29565;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,3:2,1:12,2
+chr20	1900328	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.9081e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,20:13,8:12,12
+chr20	2892289	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041917;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,7:5,2
+chr20	3062830	.	C	CAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:3,3:4,1
+chr20	3090966	.	A	ATT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,5:3,2:1,3
+chr20	3829618	.	ACATGACGTAGAGTATCTTTCCTATGCTTACTTGCC	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,2:13,2
+chr20	3885499	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.4315e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:9,6:14,6
+chr20	4055295	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0024499;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:3,6:3,4
+chr20	4085893	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.029887;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,13:6,10:13,3
+chr20	4231267	.	G	GTTATTATTATTATTA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,6:4,3:3,3
+chr20	4550398	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,6:0,3:2,3
+chr20	5434642	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00069104;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:34,15:13,9:21,6
+chr20	5501509	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.24868;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:11,2:11,3
+chr20	5713917	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,2:1,1:0,1
+chr20	5985441	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:2,5:5,2
+chr20	6240633	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:7,1:10,4
+chr20	7961816	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0096036;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:11,9:2,4
+chr20	8031836	.	GT	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.043742;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:13,2:18,5
+chr20	8114313	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.057736;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:4,3:16,4
+chr20	8229883	.	TA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.077327;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:12,3:9,2
+chr20	8906183	.	C	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00012114;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:20,6:16,9
+chr20	9799939	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:11,3:3,1
+chr20	9991653	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0026219;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:14,5:12,2
+chr20	10438472	.	GT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.03685;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:7,5:6,1
+chr20	12322747	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,11:9,9:4,2
+chr20	12757177	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.050822;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:25,4:15,1
+chr20	13129774	.	G	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=5.4096e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:12,8:15,7
+chr20	13588250	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:3,8:3,7:0,1
+chr20	13592397	.	C	CAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.013406;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:9,7:7,2
+chr20	14119159	.	A	AT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:4,2:2,3
+chr20	14215115	.	C	CAT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.18206;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:16,1:18,4
+chr20	14857810	.	G	GTTTGTTTTGTTTTGT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.031683;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,10:10,7:13,3
+chr20	15378182	.	C	CATA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00076814;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:7,10:7,9
+chr20	17137901	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=2.6145e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:9,7:8,7
+chr20	17769643	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00090273;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:18,4:13,11
+chr20	18486115	.	A	AAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,4:6,2
+chr20	20175489	.	TTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTG	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,1:13,3
+chr20	20356494	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.032848;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
+chr20	22083501	.	GTATATTAATATAGACGTATATATAATATATACA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:12,2:10,3
+chr20	22958183	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.5037e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:12,4:7,8
+chr20	24408123	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=2.7406e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:5,15:1,3:4,12
+chr20	26242394	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=6.4318e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:16,14:8,4
+chr20	26470782	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:0,0:18,4
+chr20	26479354	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:19,4:0,0
+chr20	26489709	.	A	G	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.0021765;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:112,14:67,11:45,3
+chr20	26509415	.	G	T	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.048817;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:71,10:35,1:36,9
+chr20	26579202	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:1,3:7,1
+chr20	26755353	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.29609;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:17,1:9,2
+chr20	28117242	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.21337;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,3:10,1
+chr20	28513947	.	A	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.037241;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:48,10:8,1:40,9
+chr20	28514447	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.015905;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:2,7:2,1
+chr20	28515137	.	G	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.017025;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:48,7:45,5:3,2
+chr20	28515216	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.022781;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:17,3:16,3
+chr20	28524338	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.093615;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:11,2:24,3
+chr20	28531086	.	T	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.06863;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:19,4:26,1
+chr20	28547028	.	A	G	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.026138;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:64,18:57,17:7,1
+chr20	28557603	.	T	G	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.029213;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:108,18:63,9:45,9
+chr20	28565778	.	A	G	0	PASS	DP=369;GPV=1;SPV=0.0096569;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:177,20:40,6:137,14
+chr20	28616398	.	A	C	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.011508;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:74,24:25,13:49,11
+chr20	28645739	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.21107;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:14,1:5,4
+chr20	28811966	.	G	A	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.0016571;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:80,28:40,15:40,13
+chr20	28910155	.	A	G	0	PASS	DP=252;GPV=1;SPV=0.044953;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:148:125,23:57,13:68,10
+chr20	28910215	.	T	G	0	PASS	DP=279;GPV=1;SPV=0.0014333;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:131,33:57,20:74,13
+chr20	28948565	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,3:4,2
+chr20	29061215	.	T	G	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.0019957;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:79,15:29,9:50,6
+chr20	29072865	.	C	G	0	PASS	DP=343;GPV=1;SPV=0.0075268;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:155,27:96,14:59,13
+chr20	29073075	.	TA	T	0	PASS	DP=282;GPV=1;SPV=0.0353;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:111,22:38,4:73,18
+chr20	29113396	.	A	T	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.038983;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:89,13:47,10:42,3
+chr20	29295714	.	T	C	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:57,15:29,9:28,6
+chr20	29295725	.	T	G	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.0027823;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:62,12:35,7:27,5
+chr20	29350739	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0056194;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,5:3,2
+chr20	29449141	.	CCTGGCTCGGCCAG	C	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.02667;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:75,12:50,5:25,7
+chr20	29451370	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12547;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:0,0:24,4
+chr20	29484242	.	A	C	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.0086347;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:82,18:35,11:47,7
+chr20	29587475	.	C	CAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,3:2,1
+chr20	29731270	.	GA	G	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0036541;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:51,17:27,5:24,12
+chr20	29828270	.	C	T	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.0080158;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:87,16:45,9:42,7
+chr20	29882271	.	C	T	0	PASS	DP=523;GPV=1;SPV=0.006049;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:283:238,45:94,14:144,31
+chr20	29923169	.	A	T	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.044127;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,8:31,1:15,7
+chr20	29938133	.	G	C	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.011373;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:48,19:39,16:9,3
+chr20	29942344	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:1,0:10,4
+chr20	29956057	.	G	T	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.018085;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:52,17:45,9:7,8
+chr20	29957830	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043618;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:11,4:5,3
+chr20	29977144	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.29794;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:3,3:20,1
+chr20	29998621	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:6,1:11,5
+chr20	29999359	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.31829;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:2,2:24,1
+chr20	30010022	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10559;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:26,1:6,3
+chr20	30362776	.	C	T	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.045463;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:108,12:60,8:48,4
+chr20	30392740	.	G	A	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.014505;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:70,9:35,8:35,1
+chr20	30693968	.	G	A	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.048604;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:92,16:35,8:57,8
+chr20	30727081	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.1019;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,3:17,1
+chr20	30730187	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.083916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:4,3:1,2
+chr20	30907965	.	ATTCT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.062154;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,8:3,6:12,2
+chr20	30986105	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,1:10,3
+chr20	30986106	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14555;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,1:13,3
+chr20	31069965	.	A	C	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.049481;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:60,16:31,9:29,7
+chr20	31072670	.	G	A	0	PASS	DP=256;GPV=1;SPV=0.015365;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:146:123,23:90,14:33,9
+chr20	31072734	.	G	T	0	PASS	DP=411;GPV=1;SPV=0.0096234;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:236:211,25:155,13:56,12
+chr20	31106036	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.042146;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:6,2:4,2
+chr20	31325557	.	G	GA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0053975;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:7,7:8,7
+chr20	31364188	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016795;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:6,5:5,2
+chr20	32176627	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.073684;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:4,1:2,2
+chr20	32470214	.	A	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=3.5095e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:38,19:26,11:12,8
+chr20	32835364	.	G	GTTTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0071396;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:3,6:4,1
+chr20	33185671	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=6.5488e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:13,7:14,6
+chr20	34053383	.	ATT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,3:5,1
+chr20	36947405	.	GGTGT	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.029515;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:3,6:4,1
+chr20	36977673	.	AGAGAGG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.16587;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,3:4,2
+chr20	36977713	.	GA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.083787;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:11,3:11,3
+chr20	37690460	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,3:3,1
+chr20	38123637	.	CCT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.011666;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,3:13,4
+chr20	38653259	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.044156;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,2:7,3
+chr20	38653297	.	TG	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0044219;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:8,2:7,4
+chr20	39063527	.	TTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.040008;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,9:5,6:11,3
+chr20	39347890	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=3.4813e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:16,4:9,11
+chr20	40461268	.	T	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.006186;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:21,3:6,4
+chr20	43727641	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0034395;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,3:11,5
+chr20	44053540	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.060413;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,5:9,4:8,1
+chr20	44125113	.	CA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0038025;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:10,9:6,4
+chr20	44134112	.	TA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.014985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,4:1,2:1,2
+chr20	44162813	.	C	CACACAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:0,5:0,2:0,3
+chr20	45425137	.	CTTTCTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:1,1:16,3
+chr20	45776658	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,2:9,2
+chr20	45776660	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.43772;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:7,2:8,2
+chr20	46117352	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.025766;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:25,6:12,3
+chr20	47403265	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:3,7:8,4
+chr20	47422211	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.009828;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:12,8:6,3:6,5
+chr20	48462068	.	C	CTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,9:0,6:3,3
+chr20	48510399	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:5,3:15,1
+chr20	48514872	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.014151;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:12,6:6,4
+chr20	48867710	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.041361;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,11:8,7:13,4
+chr20	49873771	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:6,6:2,1
+chr20	50026372	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0018932;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:12,5:10,4
+chr20	51718814	.	CAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.37564;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,5:10,4:1,1
+chr20	51970612	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:5,4:5,1
+chr20	52074568	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0039567;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:4,10:7,4
+chr20	52424157	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
+chr20	53352777	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0010973;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,14:10,12:3,2
+chr20	53501711	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:6,6:2,2
+chr20	53885610	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.13122;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,4:14,1
+chr20	54006822	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.032097;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:21,5:10,3
+chr20	54162530	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.025159;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:8,2:17,5
+chr20	54371623	.	AAC	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.064595;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:6,2:13,3
+chr20	55052284	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00026967;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:7,2:9,7
+chr20	55734036	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.029574;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:17,9:6,3
+chr20	56349267	.	TG	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,5:9,1:6,4
+chr20	56993886	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0052686;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:9,5:19,3
+chr20	57212079	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.006722;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:18,5:11,3
+chr20	58196827	.	CAG	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.19313;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,3:14,1
+chr20	58668684	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0017568;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,16:5,6:7,10
+chr20	58778312	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.022123;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:14,5:13,1
+chr20	59221253	.	TAGGGATTCGGG	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00030254;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,4:10,7
+chr20	61390651	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:12,3:6,1
+chr20	61390665	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:11,6:3,2
+chr20	62594852	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,3:10,1:13,2
+chr20	63037881	.	C	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:5,3:8,5
+chr20	63765076	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.029433;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,4:9,2:2,2
+chr20	63774676	.	C	CTG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.031923;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:7,4:10,4
+chr21	5217576	.	C	A	0	PASS	DP=326;GPV=1;SPV=0.026622;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:185:160,25:73,10:87,15
+chr21	5224758	.	AG	A	0	PASS	DP=333;GPV=1;SPV=0.048801;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:207:181,26:89,13:92,13
+chr21	5229502	.	C	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.021774;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:51,8:30,4:21,4
+chr21	5246466	.	G	A	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.025054;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:79,19:42,9:37,10
+chr21	5344248	.	C	T	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.026837;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:48,12:23,7:25,5
+chr21	5378938	.	G	C	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.018278;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:64,14:31,10:33,4
+chr21	5383502	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.018636;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:7,3:16,7
+chr21	5388534	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.026376;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:17,4:6,2
+chr21	6365393	.	C	T	0	PASS	DP=337;GPV=1;SPV=0.026886;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:188:162,26:84,17:78,9
+chr21	6367895	.	G	T	0	PASS	DP=315;GPV=1;SPV=0.039173;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:161,21:74,12:87,9
+chr21	7225577	.	A	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.04501;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:12,4:24,6
+chr21	7240755	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.095042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,3:13,1
+chr21	7277533	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:4,8:0,1
+chr21	7288695	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:9,1:4,3
+chr21	7290397	.	T	C	0	PASS	DP=446;GPV=1;SPV=0.014532;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:276:248,28:131,14:117,14
+chr21	7933408	.	G	A	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.039889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:115,21:67,12:48,9
+chr21	7942278	.	T	C	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.0096594;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:77,19:49,8:28,11
+chr21	7942322	.	GTTCCATTCCGTTCCATTCCA	G	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.036061;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:85,16:40,7:45,9
+chr21	7961874	.	A	G	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.029147;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:109,25:53,11:56,14
+chr21	7963862	.	G	C	0	PASS	DP=417;GPV=1;SPV=0.020503;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:232:207,25:123,9:84,16
+chr21	8018801	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.14244;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:28,2:11,3
+chr21	8032190	.	T	G	0	PASS	DP=301;GPV=1;SPV=0.020463;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:184:165,19:124,12:41,7
+chr21	8032601	.	G	T	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.0070468;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:50,19:13,3:37,16
+chr21	8043464	.	G	T	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.00019823;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:119,14:56,9:63,5
+chr21	8044801	.	C	T	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.046271;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:82,15:65,11:17,4
+chr21	8530938	.	G	T	0	PASS	DP=259;GPV=1;SPV=0.044154;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:143:121,22:64,10:57,12
+chr21	8538822	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:23,4:1,0
+chr21	8577634	.	A	G	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.044794;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:66,16:25,5:41,11
+chr21	8577643	.	C	A	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.045525;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:69,19:26,7:43,12
+chr21	8660444	.	G	A	0	PASS	DP=118;GPV=1;SPV=0.033238;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:53,15:21,4:32,11
+chr21	8662131	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10954;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:15,1:18,4
+chr21	8693198	.	T	C	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.014501;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:65,16:28,3:37,13
+chr21	8771343	.	C	G	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.0081245;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:91,25:42,21:49,4
+chr21	8778910	.	C	A	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.014037;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:68,21:35,12:33,9
+chr21	8779026	.	C	A	0	PASS	DP=208;GPV=1;SPV=0.021125;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:95,21:47,11:48,10
+chr21	8781555	.	C	T	0	PASS	DP=283;GPV=1;SPV=0.033579;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:150,28:87,14:63,14
+chr21	8798865	.	G	A	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.010757;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:67,19:24,8:43,11
+chr21	8807667	.	T	C	0	PASS	DP=566;GPV=1;SPV=0.030587;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:336:301,35:113,14:188,21
+chr21	8810006	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.011245;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:18,8:8,1
+chr21	8811166	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:18,4:0,0
+chr21	8818458	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:4,3:23,1
+chr21	8823307	.	T	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:5,6:0,1
+chr21	8836406	.	C	A	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.048287;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:101,18:49,6:52,12
+chr21	8849019	.	C	T	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.0054687;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:68,19:37,7:31,12
+chr21	8849824	.	C	T	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.049168;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:116,23:61,14:55,9
+chr21	8852441	.	T	A	0	PASS	DP=311;GPV=1;SPV=0.043592;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:184:153,31:52,4:101,27
+chr21	8854470	.	C	A	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.048902;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:146:125,21:41,5:84,16
+chr21	8868313	.	G	A	0	PASS	DP=505;GPV=1;SPV=0.037241;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:275:236,39:134,17:102,22
+chr21	8870443	.	T	A	0	PASS	DP=292;GPV=1;SPV=0.044935;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:136,23:43,11:93,12
+chr21	9006811	.	C	G	0	PASS	DP=347;GPV=1;SPV=0.016226;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:186:159,27:74,10:85,17
+chr21	9011354	.	A	G	0	PASS	DP=377;GPV=1;SPV=0.024095;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:193:161,32:87,21:74,11
+chr21	9025010	.	A	G	0	PASS	DP=275;GPV=1;SPV=0.019533;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:138,16:45,4:93,12
+chr21	9030942	.	C	G	0	PASS	DP=376;GPV=1;SPV=0.039254;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:214:190,24:95,12:95,12
+chr21	9033936	.	T	A	0	PASS	DP=320;GPV=1;SPV=0.047518;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:128,22:68,14:60,8
+chr21	9044257	.	C	T	0	PASS	DP=211;GPV=1;SPV=0.044244;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:110,22:62,10:48,12
+chr21	9056375	.	GGTAA	G	0	PASS	DP=306;GPV=1;SPV=0.012078;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:165:137,28:85,24:52,4
+chr21	9072877	.	TGGA	T	0	PASS	DP=279;GPV=1;SPV=0.0061354;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:126,18:59,6:67,12
+chr21	9073118	.	G	A	0	PASS	DP=244;GPV=1;SPV=0.036973;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:104,21:55,10:49,11
+chr21	9074353	.	T	C	0	PASS	DP=431;GPV=1;SPV=0.028571;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:226:203,23:90,9:113,14
+chr21	9075159	.	C	G	0	PASS	DP=450;GPV=1;SPV=0.0088953;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:195,28:100,16:95,12
+chr21	9075169	.	C	T	0	PASS	DP=451;GPV=1;SPV=0.021315;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:198,29:104,17:94,12
+chr21	9081112	.	G	A	0	PASS	DP=338;GPV=1;SPV=0.046502;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:188:169,19:78,11:91,8
+chr21	9098683	.	A	G	0	PASS	DP=379;GPV=1;SPV=0.028976;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:209:172,35:100,18:72,17
+chr21	9099661	.	C	G	0	PASS	DP=323;GPV=1;SPV=0.00064544;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:148,29:74,10:74,19
+chr21	9101268	.	A	G	0	PASS	DP=426;GPV=1;SPV=0.042675;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:240:215,25:42,3:173,22
+chr21	9135070	.	A	G	0	PASS	DP=482;GPV=1;SPV=0.016766;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:242,37:121,22:121,15
+chr21	9148053	.	G	A	0	PASS	DP=478;GPV=1;SPV=0.015643;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:254:221,33:111,17:110,16
+chr21	9151666	.	T	G	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.0063978;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:131,22:57,13:74,9
+chr21	9153070	.	C	T	0	PASS	DP=589;GPV=1;SPV=0.049622;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:321:266,46:133,24:133,22
+chr21	9156546	.	G	A	0	PASS	DP=274;GPV=1;SPV=0.046721;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:143,17:79,9:64,8
+chr21	9165973	.	T	C	0	PASS	DP=439;GPV=1;SPV=0.032983;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:240:214,26:104,15:110,11
+chr21	9185069	.	G	A	0	PASS	DP=457;GPV=1;SPV=0.012961;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:259:228,31:132,14:96,17
+chr21	9186142	.	T	C	0	PASS	DP=397;GPV=1;SPV=0.015658;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:225:202,23:112,13:90,10
+chr21	9186193	.	C	T	0	PASS	DP=389;GPV=1;SPV=0.022827;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:215:189,26:91,11:98,15
+chr21	9190875	.	G	A	0	PASS	DP=409;GPV=1;SPV=0.045307;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:224:199,25:96,11:103,14
+chr21	9260710	.	G	A	0	PASS	DP=590;GPV=1;SPV=0.032029;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:325:292,33:125,10:167,23
+chr21	9268737	.	A	T	0	PASS	DP=367;GPV=1;SPV=0.041187;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:169,27:69,8:100,19
+chr21	9293655	.	C	T	0	PASS	DP=348;GPV=1;SPV=0.023033;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:210:179,31:92,20:87,11
+chr21	9295067	.	C	G	0	PASS	DP=254;GPV=1;SPV=0.041289;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:131,20:48,8:83,12
+chr21	9302711	.	T	C	0	PASS	DP=467;GPV=1;SPV=0.015684;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:267:229,38:105,20:124,18
+chr21	9308811	.	G	A	0	PASS	DP=300;GPV=1;SPV=0.035184;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:145,26:106,19:39,7
+chr21	9332356	.	T	G	0	PASS	DP=478;GPV=1;SPV=0.043725;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:258:229,29:110,17:119,12
+chr21	9333921	.	T	A	0	PASS	DP=240;GPV=1;SPV=0.026718;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:113,18:25,2:88,16
+chr21	9337912	.	C	T	0	PASS	DP=461;GPV=1;SPV=0.029736;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:245:220,25:107,13:113,12
+chr21	9357361	.	G	C	0	PASS	DP=412;GPV=1;SPV=0.037824;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:214:188,26:88,14:100,12
+chr21	9365733	.	G	A	0	PASS	DP=642;GPV=1;SPV=0.010632;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:336:289,45:159,21:130,24
+chr21	9369383	.	T	A	0	PASS	DP=463;GPV=1;SPV=0.013096;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:246:211,35:82,7:129,28
+chr21	9370023	.	C	T	0	PASS	DP=684;GPV=1;SPV=0.0077443;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:382:333,49:165,28:168,21
+chr21	9536188	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.024163;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,7:6,6:4,1
+chr21	9607113	.	G	GT	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.017175;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:19,3:24,3
+chr21	9612085	.	A	C	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.039782;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:61,15:32,8:29,7
+chr21	9627948	.	A	G	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0034366;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:61,15:33,9:28,6
+chr21	9655058	.	G	A	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.01095;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:83,23:53,13:30,10
+chr21	9666461	.	T	C	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.02113;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:78,23:34,11:44,12
+chr21	9707048	.	C	T	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.034081;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:80,18:40,9:40,9
+chr21	9792584	.	C	G	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.0063498;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:72,25:34,12:38,13
+chr21	9811163	.	G	A	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:109,25:67,14:42,11
+chr21	9816521	.	C	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.04073;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:8,1:14,6
+chr21	9824548	.	A	C	0	PASS	DP=509;GPV=1;SPV=0.021372;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:275:245,30:106,9:139,21
+chr21	9829679	.	G	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:8,4:0,0
+chr21	9850534	.	C	A	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.012381;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:63,20:38,12:25,8
+chr21	9874503	.	A	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.0075878;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:51,17:23,5:28,12
+chr21	9881164	.	C	T	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.033327;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:71,16:28,6:43,10
+chr21	9883000	.	C	T	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.018617;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:88,20:42,7:46,13
+chr21	9887652	.	A	T	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.044135;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:79,17:36,8:43,9
+chr21	9898097	.	G	T	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.02564;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:75,21:37,13:38,8
+chr21	9917343	.	G	A	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.0034987;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:69,26:36,11:33,15
+chr21	9986792	.	C	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.0057226;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:54,18:32,14:22,4
+chr21	10044542	.	C	T	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.046497;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:75,18:34,9:41,9
+chr21	10105062	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.023995;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,8:8,3:21,5
+chr21	10153677	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.029773;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:25,4:13,2
+chr21	10153725	.	T	C	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.032698;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:46,6:35,4:11,2
+chr21	10162749	.	C	T	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.0243;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:73,15:38,8:35,7
+chr21	10326762	.	T	C	0	PASS	DP=324;GPV=1;SPV=0.047718;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:134,22:75,16:59,6
+chr21	10327082	.	C	T	0	PASS	DP=275;GPV=1;SPV=0.034031;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:141,20:79,10:62,10
+chr21	10329305	.	C	T	0	PASS	DP=299;GPV=1;SPV=0.039976;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:145,21:68,6:77,15
+chr21	10342457	.	G	C	0	PASS	DP=333;GPV=1;SPV=0.010474;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:153,27:81,12:72,15
+chr21	10351577	.	G	A	0	PASS	DP=263;GPV=1;SPV=0.017232;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:114,22:54,6:60,16
+chr21	10424416	.	A	C	0	PASS	DP=569;GPV=1;SPV=0.045468;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:320:273,47:127,22:146,25
+chr21	10429776	.	A	G	0	PASS	DP=549;GPV=1;SPV=0.026308;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:309:269,40:120,24:149,16
+chr21	10440190	.	G	C	0	PASS	DP=328;GPV=1;SPV=0.0084739;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:195:168,27:74,14:94,13
+chr21	10449909	.	C	A	0	PASS	DP=272;GPV=1;SPV=0.034798;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:138,17:78,7:60,10
+chr21	10450507	.	T	C	0	PASS	DP=446;GPV=1;SPV=0.010601;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:253:225,28:105,17:120,11
+chr21	10453619	.	C	T	0	PASS	DP=197;GPV=1;SPV=0.043106;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:98,20:52,10:46,10
+chr21	10455786	.	AAAT	A	0	PASS	DP=356;GPV=1;SPV=0.0052846;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:187:168,19:54,13:114,6
+chr21	10455856	.	G	A	0	PASS	DP=331;GPV=1;SPV=0.01364;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:186:165,21:68,8:97,13
+chr21	10456762	.	C	A	0	PASS	DP=286;GPV=1;SPV=0.049637;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:149,19:68,4:81,15
+chr21	10474414	.	C	A	0	PASS	DP=331;GPV=1;SPV=0.043199;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:175:156,19:91,11:65,8
+chr21	10487921	.	GTATCT	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.038944;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:27,6:13,1
+chr21	10556894	.	A	AT	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.0092117;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:51,20:28,11:23,9
+chr21	10607511	.	G	A	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.0043731;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:82,27:42,15:40,12
+chr21	10613891	.	G	C	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.0071254;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:65,22:43,10:22,12
+chr21	10633425	.	C	T	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.0024813;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:51,21:26,7:25,14
+chr21	10654765	.	CATTCT	C	0	PASS	DP=110;GPV=1;SPV=0.005319;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:53,13:31,7:22,6
+chr21	10663000	.	C	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.024005;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:60,7:26,4:34,3
+chr21	10701889	.	A	T	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.04548;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:79,20:47,9:32,11
+chr21	10722821	.	C	T	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.016435;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:97,24:47,9:50,15
+chr21	10733602	.	AT	A	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.028662;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:19,10:10,5:9,5
+chr21	10735336	.	T	C	0	PASS	DP=203;GPV=1;SPV=0.024194;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:92,23:39,10:53,13
+chr21	10804405	.	T	C	0	PASS	DP=395;GPV=1;SPV=0.018756;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:225:195,30:101,17:94,13
+chr21	13016290	.	AAAG	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.043586;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:59,13:23,5:36,8
+chr21	13020336	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.048266;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:26,6:20,3
+chr21	13100149	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.053325;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:31,2:10,4
+chr21	13131259	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.019732;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,2:11,7
+chr21	13189369	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.038776;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:24,1:20,4
+chr21	13434028	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.14744;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:12,2:23,2
+chr21	13576092	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:4,2:6,7
+chr21	15120296	.	C	CT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.11412;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:20,2:15,2
+chr21	18871297	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0030458;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:7,4:9,7
+chr21	19345800	.	CTA	C	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.0094826;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:47,9:25,3:22,6
+chr21	19345830	.	A	ATGTC	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.0073403;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:47,6:28,2:19,4
+chr21	19457333	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.5052e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:10,8:11,8
+chr21	19468054	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00085179;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:14,6:13,3
+chr21	20126646	.	CA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0053231;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:3,6:13,5
+chr21	20126650	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00041537;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:2,7:13,7
+chr21	20490603	.	AT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024751;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,7:5,4:7,3
+chr21	21655214	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0033714;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:13,4:13,6
+chr21	22113150	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.019411;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:12,6:6,8
+chr21	23404392	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00057587;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:34,16:23,10:11,6
+chr21	23740006	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.01322;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:17,4:13,3
+chr21	24121385	.	A	AT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.017499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,8:7,4:1,4
+chr21	25228144	.	A	AATAT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:8,4:4,1
+chr21	27347940	.	AAG	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10365;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,4:7,1
+chr21	27425073	.	A	ATTG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0062699;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:4,5:6,6
+chr21	27425120	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:4,2:6,3
+chr21	27656003	.	GTATATATA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,8:3,6:3,2
+chr21	27687686	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055718;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:4,3:11,2
+chr21	28888397	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=4.965e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:13,9:5,3
+chr21	29054600	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,11:5,6:6,5
+chr21	29712085	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.026903;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,7:10,5:5,2
+chr21	31228221	.	A	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:3,3:1,1
+chr21	32144203	.	AGAT	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.089706;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:18,3:17,1
+chr21	32147948	.	C	CAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.013595;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,7:4,6:1,1
+chr21	32614249	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0087567;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,12:6,11:0,1
+chr21	32672079	.	AAAAAAG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.009553;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,5:5,2
+chr21	32892711	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,4:2,2:11,2
+chr21	33124400	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.008323;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:14,4:17,4
+chr21	33129288	.	T	TTATTTTATTA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:7,13:0,11:7,2
+chr21	33191488	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.084986;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:16,4:14,1
+chr21	33191496	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.004355;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,9:6,8:5,1
+chr21	33261035	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.022136;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:5,4:1,3
+chr21	33890401	.	C	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00099376;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:13,3:9,6
+chr21	34693975	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:7,4:3,4
+chr21	35429426	.	TC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.24577;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:20,1:11,4
+chr21	36026545	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10903;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,2:18,2
+chr21	37417537	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0090729;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:0,6:12,2
+chr21	37515456	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.02764;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:16,3:22,5
+chr21	37557089	.	CAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.04053;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:7,7:5,1
+chr21	37828386	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=7.7207e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:14,7:12,9
+chr21	38808616	.	GT	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.080505;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:13,2:21,2
+chr21	38808620	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.083134;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,4:11,2:19,2
+chr21	39158395	.	T	TAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0067968;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,11:7,9:10,2
+chr21	39249913	.	G	GGT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.029893;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:9,8:17,1
+chr21	39639395	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.048573;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:8,1:10,5
+chr21	39639399	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.064743;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,1:14,3
+chr21	41112550	.	G	GA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,2:5,2
+chr21	41781019	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:5,2:0,0
+chr21	41781023	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:5,2:0,0
+chr21	41814053	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:3,4:7,5
+chr21	41874521	.	A	ATTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:4,4:7,1
+chr21	42463781	.	TAAA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0066039;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:7,5:7,7
+chr21	42719645	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.027697;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:8,5:17,6
+chr21	43733251	.	CCA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:2,1:9,3
+chr21	43961524	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,9:4,7:4,2
+chr21	44257699	.	AATAAAT	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.10911;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,6:11,3:8,3
+chr21	44533241	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=4.9392e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:14,9:11,6
+chr21	44533242	.	C	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=5.5913e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:16,7:12,6
+chr21	44797741	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,10:3,6:4,4
+chr21	44981815	.	CG	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.21538;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:7,1:6,2
+chr21	45134235	.	G	GGGTGTGTGCCCGACAGT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:12,1:2,3
+chr21	45631776	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=4.0612e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:11,9:13,10
+chr21	45750398	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.073823;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,5:12,3:7,2
+chr21	46041631	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11371;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:14,2:14,2
+chr21	46349569	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0011799;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:20,5:10,5
+chr21	46696992	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031815;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:8,4:8,3
+chr22	10521617	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
+chr22	10534739	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,3:10,1
+chr22	10568215	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.05384;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,3:10,2
+chr22	10573921	.	G	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
+chr22	10604932	.	T	A	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.022475;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:69,17:41,11:28,6
+chr22	10648827	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.021526;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:18,8:8,5
+chr22	10687050	.	G	A	0	PASS	DP=289;GPV=1;SPV=0.020979;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:138,23:92,19:46,4
+chr22	10687167	.	G	T	0	PASS	DP=246;GPV=1;SPV=0.018477;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:106,22:64,13:42,9
+chr22	10695790	.	C	G	0	PASS	DP=260;GPV=1;SPV=0.035685;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:146:126,20:72,9:54,11
+chr22	10698578	.	T	C	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0037333;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:49,13:25,8:24,5
+chr22	10699522	.	CGCG	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.029562;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:37,15:19,8:18,7
+chr22	10707152	.	CTT	C	0	PASS	DP=398;GPV=1;SPV=0.031448;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:232:206,26:113,11:93,15
+chr22	10709799	.	A	T	0	PASS	DP=397;GPV=1;SPV=0.033317;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:213:188,25:90,12:98,13
+chr22	10735435	.	G	A	0	PASS	DP=528;GPV=1;SPV=0.0067305;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:289:258,31:121,22:137,9
+chr22	10750506	.	G	T	0	PASS	DP=189;GPV=1;SPV=0.017549;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:85,22:39,10:46,12
+chr22	10755128	.	A	G	0	PASS	DP=414;GPV=1;SPV=0.022789;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:203,24:114,15:89,9
+chr22	10755218	.	T	G	0	PASS	DP=327;GPV=1;SPV=0.044688;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:189:163,26:73,15:90,11
+chr22	10767552	.	A	G	0	PASS	DP=320;GPV=1;SPV=0.023574;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:150,30:66,10:84,20
+chr22	10768772	.	T	A	0	PASS	DP=373;GPV=1;SPV=0.00057237;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:213:173,40:76,13:97,27
+chr22	10773218	.	A	T	0	PASS	DP=259;GPV=1;SPV=0.018599;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:111,14:64,9:47,5
+chr22	11025747	.	CA	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.010302;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:19,10:10,4:9,6
+chr22	11025749	.	A	C	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.018274;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:53,8:19,4:34,4
+chr22	11036708	.	C	T	0	PASS	DP=339;GPV=1;SPV=0.035289;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:183:158,25:96,15:62,10
+chr22	11056722	.	A	G	0	PASS	DP=317;GPV=1;SPV=0.041051;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:187:128,21:47,7:81,14
+chr22	11060602	.	G	A	0	PASS	DP=298;GPV=1;SPV=0.0078577;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:148,18:83,12:65,6
+chr22	11066008	.	A	C	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.038415;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:109,15:61,10:48,5
+chr22	11284932	.	C	G	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.00061791;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:56,27:30,18:26,9
+chr22	11294641	.	T	TAAA	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.044607;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:86,18:49,9:37,9
+chr22	11356705	.	G	T	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.039117;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:54,13:33,8:21,5
+chr22	11456711	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.13544;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:12,1:21,3
+chr22	11461749	.	T	G	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.026656;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:75,20:36,8:39,12
+chr22	11786215	.	G	C	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.032597;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:63,9:23,3:40,6
+chr22	11811311	.	T	TA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0034395;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,4:9,4
+chr22	11829601	.	G	A	0	PASS	DP=282;GPV=1;SPV=0.043352;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:148,20:90,10:58,10
+chr22	11852874	.	A	G	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.019055;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:53,13:8,2:45,11
+chr22	11876554	.	G	T	0	PASS	DP=302;GPV=1;SPV=0.028743;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:154,28:55,10:99,18
+chr22	11878392	.	A	C	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.049172;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:179:155,24:75,9:80,15
+chr22	11902643	.	A	G	0	PASS	DP=358;GPV=1;SPV=0.039593;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:204:180,24:56,5:124,19
+chr22	11906467	.	C	A	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.040057;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:60,16:33,13:27,3
+chr22	11914787	.	T	C	0	PASS	DP=472;GPV=1;SPV=0.030584;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:256:221,35:130,22:91,13
+chr22	11915942	.	C	A	0	PASS	DP=480;GPV=1;SPV=0.045409;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:266:231,35:98,13:133,22
+chr22	11916460	.	C	A	0	PASS	DP=550;GPV=1;SPV=0.020314;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:300:263,37:123,18:140,19
+chr22	11925198	.	C	T	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.023316;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:109,24:57,11:52,13
+chr22	11925199	.	A	G	0	PASS	DP=213;GPV=1;SPV=0.011461;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:104,28:52,13:52,15
+chr22	11951633	.	G	T	0	PASS	DP=295;GPV=1;SPV=0.018415;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:134,19:79,13:55,6
+chr22	11972915	.	A	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0019044;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:38,13:18,7:20,6
+chr22	11973248	.	CA	C	0	PASS	DP=244;GPV=1;SPV=0.013251;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:117,27:66,15:51,12
+chr22	12034084	.	A	T	0	PASS	DP=275;GPV=1;SPV=0.0032644;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:134,23:47,9:87,14
+chr22	12038909	.	A	T	0	PASS	DP=431;GPV=1;SPV=0.042967;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:247:216,31:99,6:117,25
+chr22	12051301	.	G	T	0	PASS	DP=560;GPV=1;SPV=0.029679;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:307:271,36:151,19:120,17
+chr22	12051633	.	A	T	0	PASS	DP=488;GPV=1;SPV=0.023375;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:263:235,28:68,18:167,10
+chr22	12078277	.	T	C	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.03677;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:112,13:59,2:53,11
+chr22	12100010	.	T	A	0	PASS	DP=342;GPV=1;SPV=0.0097233;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:158,23:106,13:52,10
+chr22	12118817	.	CT	C	0	PASS	DP=346;GPV=1;SPV=0.01697;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:201:158,28:93,17:65,11
+chr22	12130240	.	T	C	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.048024;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:69,18:27,4:42,14
+chr22	12199154	.	C	A	0	PASS	DP=386;GPV=1;SPV=0.0045877;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:172,25:76,13:96,12
+chr22	12204165	.	A	T	0	PASS	DP=395;GPV=1;SPV=0.00035321;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:200:175,25:97,11:78,14
+chr22	12204449	.	G	A	0	PASS	DP=481;GPV=1;SPV=0.0026742;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:258:231,27:94,4:137,23
+chr22	12206096	.	T	G	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.031718;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:66,13:27,2:39,11
+chr22	12206854	.	C	T	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.028777;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:100,12:39,7:61,5
+chr22	12212222	.	G	GGT	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.024844;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:40,5:18,1:22,4
+chr22	12312303	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.031275;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,8:3,3:24,5
+chr22	12332156	.	A	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:5,1:1,1
+chr22	12346787	.	G	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.015879;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:14,9:15,4
+chr22	12379848	.	C	T	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.035155;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:102,22:47,8:55,14
+chr22	12499442	.	G	A	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.024298;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:85,20:39,8:46,12
+chr22	12591569	.	TAA	T	0	PASS	DP=185;GPV=1;SPV=0.021065;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:84,22:51,14:33,8
+chr22	12609888	.	T	C	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.001808;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:101,28:53,6:48,22
+chr22	12696321	.	G	C	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.041682;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:111,24:58,10:53,14
+chr22	12700781	.	G	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.043509;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:89,17:50,10:39,7
+chr22	12713363	.	C	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.019424;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:18,3:27,5
+chr22	12783137	.	A	G	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.016863;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:101,13:28,4:73,9
+chr22	12806249	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.044045;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:51,12:25,8:26,4
+chr22	12814734	.	G	A	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.0016612;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:76,18:38,11:38,7
+chr22	12814800	.	T	A	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.01657;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:80,18:44,13:36,5
+chr22	12869359	.	G	A	0	PASS	DP=530;GPV=1;SPV=0.028473;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:281:250,31:98,21:152,10
+chr22	12874093	.	C	T	0	PASS	DP=397;GPV=1;SPV=0.032139;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:240:214,26:100,8:114,18
+chr22	12877659	.	G	A	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.038808;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:45,4:12,3
+chr22	14956902	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12206;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:0,0:25,4
+chr22	15449266	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.017411;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:14,5:15,3
+chr22	15470739	.	G	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.022125;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:20,4:26,7
+chr22	15487624	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0059872;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:16,2:17,7
+chr22	15546506	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:4,2:10,2
+chr22	15579564	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.17881;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:31,4:0,0
+chr22	15631216	.	G	A	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.029441;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:53,15:25,8:28,7
+chr22	15706889	.	CT	C	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.00037632;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:34,22:9,8:25,14
+chr22	15732030	.	G	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.046808;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:44,9:20,4:24,5
+chr22	15753796	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.13742;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:24,4:0,0
+chr22	15769648	.	G	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047515;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,6:10,4
+chr22	15910749	.	C	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0045524;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,6:2,1
+chr22	16433519	.	G	C	0	PASS	DP=228;GPV=1;SPV=0.028339;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:119,17:66,10:53,7
+chr22	16457892	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.043007;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:16,3:22,5
+chr22	16669926	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=8.0594e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:15,7:13,9
+chr22	16877536	.	GAAGAA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:12,1:6,3
+chr22	17250563	.	T	TA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.10954;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,5:18,2:15,3
+chr22	17875682	.	T	TAAA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.023574;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:10,13:6,9:4,4
+chr22	17959010	.	G	GTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.22398;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:6,3:7,1
+chr22	18196944	.	G	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.015094;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:21,5:22,8
+chr22	18359171	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.041069;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:21,8:34,1
+chr22	18369572	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.054634;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,4:9,4
+chr22	18627931	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.03433;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:3,3:18,5
+chr22	18738690	.	C	G	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.023135;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:75,9:43,8:32,1
+chr22	18743457	.	A	G	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.007669;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:82,17:45,12:37,5
+chr22	18748805	.	A	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.037417;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:23,3:18,5
+chr22	18750670	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.058083;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:23,6:5,1
+chr22	18755626	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.044512;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:5,1:21,5
+chr22	18849248	.	G	A	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.0043627;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:56,18:19,10:37,8
+chr22	18852936	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:16,4:0,0
+chr22	18853870	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024656;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:11,3:1,1
+chr22	18940041	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023692;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:8,6:3,4
+chr22	18953985	.	C	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00018809;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:14,6:19,6
+chr22	19087971	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=4.9327e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:8,10:12,9
+chr22	20170031	.	T	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00051413;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:17,3:12,9
+chr22	20342730	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.016864;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:6,8:15,3
+chr22	20592866	.	G	GAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:6,4:2,1
+chr22	20655979	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:2,2:22,2
+chr22	21165958	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0038961;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:7,3:9,9
+chr22	21175242	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.058895;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:12,1:10,4
+chr22	21225295	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.017354;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:15,6:9,8
+chr22	21248916	.	T	C	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.0045935;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:75,17:37,9:38,8
+chr22	21334672	.	GTA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.012782;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:18,7:8,1
+chr22	21541225	.	TACAC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=4.45e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:9,5:6,8
+chr22	21659370	.	TAAA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030702;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,13:1,8:3,5
+chr22	21659377	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.044451;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:9,8:7,3
+chr22	22267277	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.028065;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:15,1:22,8
+chr22	22633065	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,2:9,2
+chr22	24277946	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.047016;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:14,8:18,3
+chr22	24649431	.	G	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.010003;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:46,9:28,6:18,3
+chr22	24659588	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.033359;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:14,2:20,3
+chr22	25910305	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.040009;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:19,2:17,4
+chr22	27114706	.	C	CAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.056191;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,7:8,6:2,1
+chr22	29111617	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,2:4,1:3,1
+chr22	29906290	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,4:12,1:2,3
+chr22	30623903	.	CAT	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.031173;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:23,4:13,1
+chr22	32157497	.	AT	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.015097;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:20,8:13,4
+chr22	32483849	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.4486e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:16,9:11,7
+chr22	32640189	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=5.1989e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:12,2:8,10
+chr22	32988328	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,1:13,3
+chr22	32990403	.	TCCAG	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:8,3:9,2
+chr22	33411588	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=7.9911e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:9,8:19,5
+chr22	33450642	.	G	GAT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.062714;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,6:6,4:6,2
+chr22	35602210	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.036731;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:20,5:16,6
+chr22	36718271	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,6:5,5:2,1
+chr22	36738070	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.10931;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,4:17,2:13,2
+chr22	36896650	.	GAGGA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024846;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,6:3,1
+chr22	37344235	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0057971;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,4:4,4
+chr22	37511357	.	CAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:6,4:2,1
+chr22	37661331	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.013888;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,9:11,5:4,4
+chr22	37711615	.	AAAACCC	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.33771;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,4:11,3:9,1
+chr22	38937568	.	TGC	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.028808;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,9:13,4:15,5
+chr22	41212396	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:3,4:4,4
+chr22	42225000	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:6,2:7,3
+chr22	42445357	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:6,10:3,3
+chr22	43587233	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0053871;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:15,5:17,4
+chr22	43878682	.	GCCAACTAT	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.015188;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,2:11,3
+chr22	43878694	.	TCCCC	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.036704;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,1:12,3
+chr22	43878699	.	G	GT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.019962;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,5:12,2:12,3
+chr22	44602533	.	C	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:1,2:0,0:1,2
+chr22	44779100	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0395;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:14,4:6,3
+chr22	44877039	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0090442;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:14,10:9,4
+chr22	44935632	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:34:1,3:0,0:1,3
+chr22	46290547	.	GGTGTTAGGAGGGTGGTGTGGCTGGAGGGTGA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040021;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:7,4:10,1
+chr22	46617258	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020833;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,5:6,3
+chr22	46897640	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0041229;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,2:4,5
+chr22	47076355	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,7:8,3:5,4
+chr22	48341751	.	AGACAGAAGGAGCAGGATG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10034;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:10,2:12,2
+chr22	49186056	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0099003;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:13,2:15,7
+chr22	49484918	.	C	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.049808;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,1:4,3
+chr22	50002495	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:2,7:4,1
+chr22	50363568	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00077962;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,5:6,4
+chr3	129852	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.019439;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,6:9,5:7,1
+chr3	239595	.	A	ATAT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.026;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,10:12,7:10,3
+chr3	432797	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.3783e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:10,6:14,9
+chr3	576388	.	G	A	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.032698;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:23,4:23,2
+chr3	576475	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.04525;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:10,3:13,2
+chr3	576584	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.018117;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:14,2:14,9
+chr3	597332	.	T	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.01228;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:11,8:16,3
+chr3	781920	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,1:2,3
+chr3	1071316	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:2,4:6,4
+chr3	1880220	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.05832;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:14,2:9,4
+chr3	1894838	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00011755;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:11,10:7,9
+chr3	2519469	.	C	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=4.361e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:32,16:17,6:15,10
+chr3	2632084	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,2:11,2
+chr3	2876362	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.9233e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:12,11:9,9
+chr3	3356760	.	T	TAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0035197;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,9:7,7:1,2
+chr3	5150463	.	A	AAAGTAAATAAAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0044074;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,9:10,4:7,5
+chr3	6196996	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0072217;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:5,6:2,2
+chr3	6443726	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:4,2:2,1:2,1
+chr3	6462261	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:13,3:15,1
+chr3	6935679	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14851;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,1:15,3
+chr3	7456450	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036129;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:6,11:8,2
+chr3	8617526	.	T	TA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0016314;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:6,6:2,2
+chr3	9516781	.	CTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,10:3,7:3,3
+chr3	10128831	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0067873;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,8:2,7:1,1
+chr3	10169014	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=4.9258e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:13,12:9,5
+chr3	11564691	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.079729;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,6:24,2:5,4
+chr3	12044200	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.087004;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:21,1:11,3
+chr3	12463229	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.023079;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:0,4:4,1
+chr3	12518321	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.002188;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:9,4:11,4
+chr3	12533659	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,9:4,7:4,2
+chr3	12683372	.	T	TA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,5:2,3
+chr3	13191477	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.034996;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,6:10,4:4,2
+chr3	13486288	.	AAG	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:4,2:13,2
+chr3	13587158	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00086916;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:7,2:7,5
+chr3	13992133	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.034948;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:21,3:19,4
+chr3	14893752	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:3,5:4,2
+chr3	15361155	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.3183e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:11,10:8,3
+chr3	15777849	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.086046;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,8:16,4:2,4
+chr3	17003734	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.01488;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:8,4:23,2
+chr3	17082139	.	G	GTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:8,3:3,1
+chr3	18596694	.	TA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,4:4,1
+chr3	18994437	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.049965;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,4:7,1
+chr3	19094960	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00020585;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:10,5:14,10
+chr3	21552466	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0060771;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:14,2:13,6
+chr3	21699535	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0010937;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:18,9:13,4
+chr3	22905849	.	GTATATATA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:3,3:4,1
+chr3	23614802	.	ATT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,9:5,3:4,6
+chr3	26948136	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.9786e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:13,9:10,4
+chr3	27803357	.	A	AATTTATTTATTT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.075102;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,2:12,2
+chr3	27823721	.	C	CTTTTTTTTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.013574;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:8,7:10,2
+chr3	28489982	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.5178e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:13,9:10,3
+chr3	28990677	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:5,6:4,1
+chr3	29763609	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.4451e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:9,4:6,10
+chr3	30032018	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0015169;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:14,5:12,3
+chr3	30255749	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.006961;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:16,3:11,5
+chr3	30950443	.	TA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,3:4,1
+chr3	31663450	.	A	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=4.2446e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:29,18:16,10:13,8
+chr3	32538625	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00045655;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:11,6:8,5
+chr3	32806445	.	AT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.012101;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:9,3:5,9
+chr3	33740789	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:4,6:7,1
+chr3	33852925	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,4:9,3:4,1
+chr3	34704588	.	G	GAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:0,2:6,4
+chr3	35417627	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=7.0259e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:8,9:12,11
+chr3	35554528	.	C	CTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,4:5,2
+chr3	36780910	.	G	GGATAGATAGATA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:9,9:4,6:5,3
+chr3	37101683	.	AAG	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.044908;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:18,4:14,2
+chr3	39585526	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.028303;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:9,4:15,5
+chr3	39678572	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:9,4:4,1:5,3
+chr3	40281294	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:0,1:1,1
+chr3	40787632	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.3618e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:13,9:13,6
+chr3	45247058	.	A	AATTTTATTTTATTTTATTTTATTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:4,3:8,1
+chr3	50008546	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,3:2,2
+chr3	51402566	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.20158;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:8,2:5,3
+chr3	51543608	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:10,3:1,2
+chr3	51793343	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,5:7,1
+chr3	52577430	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:15,2:2,2
+chr3	52945162	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034547;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:5,4:9,3
+chr3	52994688	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=6.8987e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:10,9:10,4
+chr3	54500519	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.092902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:10,1:15,4
+chr3	54793094	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0022088;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,4:16,5
+chr3	57037876	.	A	AAAAAC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.009628;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:10,13:2,7:8,6
+chr3	57531767	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:5,5:5,1
+chr3	60173917	.	GT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:3,2:6,3
+chr3	60206148	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,4:9,3:8,1
+chr3	60710074	.	T	TA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0083519;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:2,7:7,2
+chr3	62418487	.	A	AT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12566;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:10,4:6,2
+chr3	62525679	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.20188;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:14,2:12,2
+chr3	62701621	.	AAG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.020482;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:18,1:6,5
+chr3	64600051	.	CTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,8:4,5:1,3
+chr3	65044104	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,6:1,1:2,5
+chr3	65364165	.	T	TA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:0,4:4,3
+chr3	65514429	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.19282;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,1:16,3
+chr3	66032377	.	A	ATT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.045714;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,7:16,2:9,5
+chr3	66144373	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.7598e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:3,5:8,5
+chr3	66613115	.	C	CTTTCTTTCTTTCTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,4:1,1:5,3
+chr3	66874098	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.21475;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:14,2:7,2
+chr3	67792404	.	C	CAGAG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:12,4:3,2
+chr3	68231344	.	A	ATTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.01971;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,7:4,1
+chr3	69018362	.	AC	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:1,10:0,1:1,9
+chr3	69163847	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=4.8478e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:10,6:11,8
+chr3	70882485	.	G	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00023389;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:40,18:16,11:24,7
+chr3	71503601	.	G	GAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:10,3:0,1
+chr3	72339949	.	T	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.009581;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:7,9:4,3
+chr3	73139131	.	G	GT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,6:6,5:5,1
+chr3	73350465	.	T	TGTGC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:10,2:18,2
+chr3	73439820	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=6.8069e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:15,8:3,3
+chr3	74949227	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.8091e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,20:12,13:10,7
+chr3	75288669	.	GCTCCCT	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.002963;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:17,11:10,4
+chr3	75927976	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.010143;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:4,6:4,2
+chr3	76065829	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.020961;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:14,8:12,5
+chr3	76555417	.	GA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.011966;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,3:3,1
+chr3	76667693	.	GCAGTGATCAGACTTTTT	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.049216;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:5,4:11,4
+chr3	78238121	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.37283;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,4:16,3:3,1
+chr3	78238133	.	A	AGAAAG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11425;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,5:18,4:3,1
+chr3	78718782	.	AGAAG	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,5:3,1
+chr3	79534148	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.25926;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,3:2,1
+chr3	81199034	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.3425e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:8,10:11,4
+chr3	81230327	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=9.7028e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:33,17:12,7:21,10
+chr3	82916427	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.12269;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:12,1:10,4
+chr3	82916515	.	ATG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.068571;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:14,2:11,4
+chr3	83264013	.	A	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.011899;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,4:3,4
+chr3	83343566	.	A	AAAAT	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0015778;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:28,21:11,12:17,9
+chr3	83802912	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0026191;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:13,8:12,4
+chr3	84459753	.	A	ATATAATATACTAATT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.027999;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:6,2:8,6
+chr3	84498434	.	AT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0026945;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:11,9:7,7
+chr3	84907634	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,4:6,2:1,2
+chr3	85134029	.	T	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=3.774e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:32,23:13,14:19,9
+chr3	85269762	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.9644e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:8,6:14,8
+chr3	86385093	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.010747;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:12,4:9,5
+chr3	87653922	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.01246;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,7:6,4:4,3
+chr3	87905735	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.038531;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:15,9:10,3
+chr3	88457695	.	C	CAAAAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.01558;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,11:7,5:7,6
+chr3	88494803	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.024567;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:18,5:16,1
+chr3	89001840	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:4,4:16,4
+chr3	90720510	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
+chr3	90849704	.	T	C	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.00096455;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:80,14:32,2:48,12
+chr3	90885770	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:2,4:4,3
+chr3	90889498	.	A	T	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.017728;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:87,18:24,6:63,12
+chr3	90921450	.	C	A	0	PASS	DP=395;GPV=1;SPV=0.010297;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:232:204,28:109,17:95,11
+chr3	90934900	.	C	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:0,0:20,4
+chr3	90939815	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.047994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:20,6:13,2
+chr3	90952757	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,1:1,3
+chr3	90956374	.	G	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr3	90997507	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,3:8,1
+chr3	91022377	.	C	G	0	PASS	DP=276;GPV=1;SPV=0.013225;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:145,19:41,12:104,7
+chr3	91031691	.	T	C	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.022644;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:19,4:23,2
+chr3	91032152	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.10034;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,4:0,0:22,4
+chr3	91092531	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:21,1:2,3
+chr3	91141801	.	G	A	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.023151;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:55,7:0,1:55,6
+chr3	91192149	.	A	C	0	PASS	DP=427;GPV=1;SPV=0.014922;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:240:210,30:162,19:48,11
+chr3	91206664	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:23,4:1,0
+chr3	91278261	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.16867;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:19,3:16,1
+chr3	91278660	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.090326;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:25,3:19,2
+chr3	91676678	.	T	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:0,0:9,4
+chr3	91988313	.	C	T	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.028456;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:62,7:28,6:34,1
+chr3	92379478	.	C	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.058442;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
+chr3	93463936	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,1:6,3
+chr3	93559616	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:0,0:20,4
+chr3	93706202	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,3:2,1
+chr3	94379241	.	C	CTGTGTGTG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018593;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,7:3,3:5,4
+chr3	96311792	.	A	AGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043618;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,7:5,6:11,1
+chr3	97483214	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00033054;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:14,3:10,7
+chr3	97539042	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:7,2:15,3
+chr3	97674296	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.9702e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:10,6:8,7
+chr3	97815678	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,3:3,6
+chr3	98839159	.	CTT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.039387;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:5,1:14,5
+chr3	99509106	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,5:7,3:14,2
+chr3	99626435	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,9:4,8:0,1
+chr3	101133802	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=4.6357e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:5,6:12,6
+chr3	101136760	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0016781;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:14,4:12,6
+chr3	101160399	.	C	CGTGT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.064856;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,9:9,8:6,1
+chr3	101596725	.	TA	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:9,1:12,3
+chr3	102382738	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.046286;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:20,4:16,3
+chr3	104602297	.	T	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0023706;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:19,4:19,8
+chr3	104938687	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:6,4:3,3:3,1
+chr3	105370946	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=4.5693e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:8,9:13,11
+chr3	105404675	.	G	GA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0027601;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:12,8:2,6
+chr3	106109796	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:1,2:13,3
+chr3	106512578	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10008;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,6:8,5:10,1
+chr3	109286729	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.4643e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:14,9:12,11
+chr3	109575163	.	T	TATA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.071818;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,6:9,2:13,4
+chr3	109730340	.	C	CAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:9,10:5,6:4,4
+chr3	109789964	.	C	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,2:3,1:3,1
+chr3	110068619	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.047029;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:22,4:13,1
+chr3	110505831	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:7,1:4,3
+chr3	110884738	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.060034;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:9,2:15,2
+chr3	111007974	.	T	TATGTATATATAC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048554;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,6:12,4:9,2
+chr3	112051652	.	CT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.021517;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:16,3:13,6
+chr3	112199388	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.4898e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:15,8:11,7
+chr3	113119174	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:4,7:3,4
+chr3	113156313	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0052563;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:13,3:15,6
+chr3	113172202	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12656;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:13,2:20,2
+chr3	113191188	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.144e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:8,7:13,10
+chr3	113856547	.	T	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.085668;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,3:11,1
+chr3	114362265	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00067377;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:17,21:6,14:11,7
+chr3	115169556	.	G	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=3.0482e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:11,12:17,4
+chr3	115325729	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00059303;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:16,5:8,4
+chr3	115325730	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00056062;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:18,6:9,4
+chr3	116100206	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.023137;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:12,10:3,4
+chr3	116160415	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,3:0,1
+chr3	116701070	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0010146;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:16,8:10,4
+chr3	118512217	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:11,3:9,3
+chr3	118601804	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.002981;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,11:4,8:2,3
+chr3	118633883	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,4:3,3:1,1
+chr3	121228569	.	T	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.011158;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:23,5:13,1
+chr3	121764195	.	A	AACACACACAC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.022955;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:11,7:9,5
+chr3	123427220	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=4.2086e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:10,5:11,8
+chr3	125256967	.	GTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:7,9:2,3
+chr3	126059282	.	G	GA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:10,3:8,3
+chr3	129709499	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,2:5,2
+chr3	130095408	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10147;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,7:14,2:8,5
+chr3	130125033	.	TG	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,1:5,5
+chr3	130302003	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.2211e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:8,5:10,6
+chr3	132763487	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.069447;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:13,5:30,1
+chr3	132798951	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.023599;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:13,3:17,4
+chr3	134051500	.	TTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:3,5:7,2
+chr3	135026064	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.18072;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:26,3:9,1
+chr3	135640369	.	T	TGATA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.029113;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:11,4:7,6
+chr3	136498284	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:3,2:8,2
+chr3	136867108	.	CTTTCTTTCTTTG	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,2:0,0:5,2
+chr3	138339643	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00013297;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:15,8:6,4
+chr3	139047330	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.0935e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:4,7:12,7
+chr3	141004091	.	CTG	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,8:7,2:7,6
+chr3	141644602	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0013259;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,15:17,8:15,7
+chr3	141902597	.	A	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00010642;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:20,6:7,6
+chr3	141932460	.	AT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,5:6,3
+chr3	142805133	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.50909;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:6,2:4,1:2,1
+chr3	144563278	.	T	TTA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.039921;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,3:5,4
+chr3	145215163	.	TC	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.5528e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:5,4:10,8
+chr3	145665509	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0086108;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:18,3:11,4
+chr3	145898362	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0096876;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,11:8,8:6,3
+chr3	145930969	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:6,5:8,4
+chr3	146212460	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.040478;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,1:10,3
+chr3	147546917	.	A	AAAATAAAT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.022996;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,9:14,4:10,5
+chr3	148857063	.	T	TTTTTTTG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,1:5,4
+chr3	149440328	.	CTATA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:0,2:0,0:0,2
+chr3	150193142	.	GTT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:3,2:3,3
+chr3	150560608	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=6.785e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:13,7:14,8
+chr3	151746365	.	G	GT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.011528;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:8,6:5,1
+chr3	152770926	.	A	ATGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,3:7,1
+chr3	153128424	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0001119;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:13,9:13,6
+chr3	153999306	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.060505;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:17,1:13,3
+chr3	160036090	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00026073;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,16:19,5:10,11
+chr3	160970447	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,3:9,1
+chr3	161908409	.	CAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,8:2,5:3,3
+chr3	163459100	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0033421;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,11:5,5:10,6
+chr3	163494555	.	C	CCACTT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00034031;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:16,7:8,6
+chr3	163494556	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.5869e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:16,8:7,10
+chr3	163635704	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.055194;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:5,1:15,4
+chr3	164537161	.	T	TATATAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0030303;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:0,7:0,3:0,4
+chr3	165048586	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,8:7,4:2,4
+chr3	165585878	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022983;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:12,2:5,9
+chr3	165585879	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0027511;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:11,3:5,9
+chr3	166285691	.	C	CAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.08112;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,4:7,1
+chr3	167575608	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00082104;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:9,13:17,3
+chr3	170404145	.	ATTT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:4,1:3,5
+chr3	171971062	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,3:1,2:2,1
+chr3	172737350	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
+chr3	172778588	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
+chr3	173830245	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00016645;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:14,24:6,9:8,15
+chr3	174107017	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,5:8,1:6,4
+chr3	176384810	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14912;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:15,2:17,2
+chr3	177263053	.	CTT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.020164;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:11,7:3,3
+chr3	179743926	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:8,9:4,8:4,1
+chr3	179797605	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.19094;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,4:5,1:14,3
+chr3	181751957	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,3:0,1:4,2
+chr3	182645608	.	ATTT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0061246;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,8:5,3:1,5
+chr3	183531448	.	T	TTTTTG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:6,2:5,4
+chr3	183778111	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:5,2:8,3
+chr3	185077789	.	T	TG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,9:1,7:1,2
+chr3	185567814	.	A	C	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.039734;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:52,11:28,5:24,6
+chr3	185588050	.	A	ATTT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,2:4,3
+chr3	186776847	.	G	GT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.017733;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:13,9:4,2
+chr3	186864128	.	G	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.044511;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:2,2:11,6
+chr3	187892231	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.010015;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:9,4:9,6
+chr3	187892273	.	TTGGATA	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.002317;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:4,4:9,8
+chr3	188142604	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:2,3:3,1
+chr3	188936019	.	C	CTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.07313;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:9,4:7,1
+chr3	189742243	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,11:5,7:5,4
+chr3	190748294	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.049488;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:14,4:21,2
+chr3	191259852	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:10,2:8,2
+chr3	192086733	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00030989;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:16,7:17,8
+chr3	192818078	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=9.067e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:15,8:10,7
+chr3	194325045	.	CT	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.18371;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:27,3:14,2:13,1
+chr3	194673961	.	ACCTTAC	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10931;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,1:14,3
+chr3	194680228	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0026031;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:8,4:12,3
+chr3	195480294	.	T	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.015268;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:85,11:37,6:48,5
+chr3	195482428	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10523;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:5,2:19,2
+chr3	195489285	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.024281;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:23,3:23,4
+chr3	195499352	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.0032428;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:49,9:24,6:25,3
+chr3	195500853	.	A	T	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.038044;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:70,8:36,3:34,5
+chr3	195619095	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.009035;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:34,17:15,14:19,3
+chr3	195627434	.	T	TCCACTGAA	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0066776;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:18,7:17,8
+chr3	195637214	.	GGT	G	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.0050154;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:63,12:22,8:41,4
+chr3	195960350	.	A	G	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.00044669;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:49,22:19,3:30,19
+chr3	195962048	.	G	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
+chr3	195966515	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.057873;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:23,1:17,4
+chr3	196173255	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021053;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:12,2:2,6
+chr3	197658326	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.033605;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:9,7:13,1
+chr4	11120	.	C	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,3:2,3
+chr4	11422	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.013049;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:9,4:6,7
+chr4	26921	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.11412;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:32,4:3,0
+chr4	37547	.	AG	A	0	PASS	DP=305;GPV=1;SPV=0.036501;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:170:152,18:68,7:84,11
+chr4	60317	.	G	A	0	PASS	DP=313;GPV=1;SPV=0.030421;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:205:184,21:93,13:91,8
+chr4	64786	.	T	G	0	PASS	DP=323;GPV=1;SPV=0.0090726;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:171,26:90,15:81,11
+chr4	1152938	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,8:2,5:3,3
+chr4	1266472	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0003248;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:4,8:14,5
+chr4	1680330	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01393;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,4:4,3
+chr4	1786308	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=3.3703e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:12,5:15,11
+chr4	2020796	.	T	TC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.074501;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:14,8:1,4:13,4
+chr4	2205874	.	CA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.035509;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:10,8:6,5
+chr4	2618591	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0011112;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,6:3,1
+chr4	4253875	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,5:3,2
+chr4	4294877	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.040114;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:12,1:8,5
+chr4	4677535	.	A	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,2:4,1:3,1
+chr4	4697798	.	C	CCTATCTAT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.044564;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:12,3:15,6
+chr4	6003949	.	A	ATGG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.028921;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,6:7,5:3,1
+chr4	6694969	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:4,2:2,1:2,1
+chr4	8322525	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0011349;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:15,4:13,8
+chr4	8336314	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:1,2:1,1:0,1
+chr4	8348798	.	TAAATAAAATA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.046124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:11,8:9,5
+chr4	8931584	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:10,3:3,1
+chr4	9324113	.	T	C	0	PASS	DP=469;GPV=1;SPV=0.027626;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:310:277,33:267,32:10,1
+chr4	9524302	.	CTAGATACAGAGTGCCGACTGGTG	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0014616;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:12,7:16,2
+chr4	9634595	.	CAAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:7,8:3,2
+chr4	9719506	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0038917;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:17,4:11,5
+chr4	10175285	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00021886;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:13,5:9,9
+chr4	11667594	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00018263;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,17:7,8:5,9
+chr4	11796214	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.039894;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:15,3:13,2
+chr4	12715070	.	ATT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:2,3:8,3
+chr4	14491648	.	T	TATTTATATATAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047515;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,6:11,4
+chr4	14813881	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.019687;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:14,4:11,8
+chr4	15177559	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.022451;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:6,2:11,4
+chr4	15232096	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=2.3491e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:14,7:17,8
+chr4	16159514	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0028455;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:6,4:9,6
+chr4	16440716	.	TC	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.095044;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:11,4:16,1
+chr4	16586509	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,4:12,3:5,1
+chr4	16819095	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.040165;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:19,7:11,1
+chr4	17311735	.	C	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:6,3:3,2
+chr4	17569577	.	CCACA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:5,7:13,3
+chr4	17742137	.	AATATATAT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010479;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,9:9,5:3,4
+chr4	18327173	.	C	CAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,5:4,1
+chr4	19232748	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.07056;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:6,3:16,1
+chr4	20181645	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11923;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:20,3:16,1
+chr4	20311417	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0065171;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:15,3:16,5
+chr4	21501248	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0088608;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,7:6,4:6,3
+chr4	21750776	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0086866;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:14,4:12,3
+chr4	21924243	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,9:3,8:1,1
+chr4	21928129	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.095042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,3:11,1
+chr4	22061733	.	G	GTTT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0055563;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,16:12,14:8,2
+chr4	22675296	.	T	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,2:6,3
+chr4	23042370	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00018253;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:12,9:12,1
+chr4	23381713	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0011278;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,17:9,12:5,5
+chr4	23623876	.	A	AAAATAAAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.048514;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:5,3:9,4
+chr4	24137863	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=2.6311e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:10,11:9,4
+chr4	25581959	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,5:4,4:1,1
+chr4	25612981	.	T	TAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:8,3:4,1
+chr4	26851331	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0064763;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:9,4:15,13
+chr4	27571764	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0016548;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:15,4:10,8
+chr4	28055902	.	AAAAAAT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0082274;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:12,7:7,5
+chr4	28055918	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0045608;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,12:10,7:5,5
+chr4	28221328	.	TCTCTA	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0013843;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:8,3:8,4
+chr4	28806359	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,6:2,5:0,1
+chr4	29179898	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.002428;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:17,3:14,7
+chr4	29531916	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,2:8,2
+chr4	30278649	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01095;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:6,6:3,4
+chr4	32005446	.	A	ATTATTATTATTATTATTATTAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.015238;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,9:3,3:6,6
+chr4	32495047	.	C	CT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.004889;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,16:19,7:11,9
+chr4	32839548	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.15826;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:11,3:5,1:6,2
+chr4	35765386	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0001695;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:19,8:4,4
+chr4	35937283	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0013435;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:9,3:12,6
+chr4	35979284	.	T	TA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0051998;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,10:4,8:6,2
+chr4	38235026	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.5037e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:7,9:12,3
+chr4	38461959	.	CAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.040398;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:8,8:4,2
+chr4	39640987	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.023193;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,4:2,4
+chr4	39664216	.	T	TGTGTGTGCGCGC	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.046332;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,12:12,7:13,5
+chr4	39796168	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.019985;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,10:3,6:6,4
+chr4	40660610	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0070519;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,11:11,8:4,3
+chr4	41350247	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=4.5974e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:30,16:16,7:14,9
+chr4	41706637	.	CTTATTA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,9:5,6:5,3
+chr4	42436540	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00048494;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:8,9:18,5
+chr4	45024881	.	CTA	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.023494;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,8:19,3:14,5
+chr4	47195468	.	TA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:19,4:10,3:9,1
+chr4	48620601	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00025426;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:11,8:13,4
+chr4	49098215	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.045325;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,10:11,4:17,6
+chr4	49143770	.	A	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.063808;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,5:11,2:31,3
+chr4	49168402	.	G	T	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.013719;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:71,16:27,4:44,12
+chr4	49174541	.	C	T	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.046363;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:48,12:25,5:23,7
+chr4	49265281	.	C	T	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.038078;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:69,13:26,4:43,9
+chr4	49265909	.	C	T	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.031461;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:108,13:67,8:41,5
+chr4	49266927	.	T	A	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.040817;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:107,13:60,7:47,6
+chr4	49270687	.	G	T	0	PASS	DP=496;GPV=1;SPV=0.035757;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:278:235,43:139,24:96,19
+chr4	49271027	.	C	T	0	PASS	DP=521;GPV=1;SPV=0.0033901;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:299:243,56:113,32:130,24
+chr4	49271076	.	C	T	0	PASS	DP=595;GPV=1;SPV=0.00029602;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:330:275,55:148,32:127,23
+chr4	49490706	.	G	A	0	PASS	DP=518;GPV=1;SPV=0.0013516;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:296:250,46:135,20:115,26
+chr4	49493061	.	A	AT	0	PASS	DP=499;GPV=1;SPV=0.031589;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:261:226,34:93,22:133,12
+chr4	49513797	.	G	A	0	PASS	DP=4660;GPV=1;SPV=0.036427;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:2603:2324,279:771,89:1553,190
+chr4	49519726	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.015039;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,9:16,2:8,7
+chr4	49523382	.	C	T	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.0050121;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:68,8:30,1:38,7
+chr4	49527051	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.047029;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:20,2:15,3
+chr4	49532808	.	C	G	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.015725;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:52,16:20,7:32,9
+chr4	49554084	.	C	T	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0093787;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:18,8:25,1
+chr4	49565377	.	A	T	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.045294;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:42,13:21,5:21,8
+chr4	49574641	.	A	G	0	PASS	DP=576;GPV=1;SPV=0.0052595;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:308:256,52:139,26:117,26
+chr4	49591857	.	T	G	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.0018119;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:91,26:27,15:64,11
+chr4	49607800	.	A	AAC	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.0018273;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:50,13:28,6:22,7
+chr4	49612039	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.057887;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:22,4:5,1
+chr4	49653269	.	G	GGGAATGGAAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.031602;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:14,4:7,2
+chr4	49731167	.	C	A	0	PASS	DP=364;GPV=1;SPV=0.013365;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:228:204,24:149,21:55,3
+chr4	49787442	.	T	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.040768;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:7,1:38,4
+chr4	49792264	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:23,4:2,0
+chr4	49849709	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.037054;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:15,2:21,5
+chr4	49850379	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.067259;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:21,4:4,1
+chr4	50198909	.	T	C	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.0014098;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:40,13:20,11:20,2
+chr4	50560189	.	T	C	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0027297;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:41,13:19,6:22,7
+chr4	50866953	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.18626;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:1,0:31,4
+chr4	51119009	.	T	A	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.019323;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:86,18:18,8:68,10
+chr4	51169304	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.16556;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:0,0:31,4
+chr4	51274462	.	G	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
+chr4	51537779	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr4	51560944	.	A	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.038098;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:59,8:30,6:29,2
+chr4	51640205	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:2,0:26,4
+chr4	52084051	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:41:1,3:0,1:1,2
+chr4	52309381	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0067873;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,8:3,7:0,1
+chr4	52733556	.	TATACATATAC	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.036255;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:15,6:11,3
+chr4	53417767	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,2:1,1:2,1
+chr4	53788426	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,5:4,4:7,1
+chr4	53880669	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.002399;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:7,4:6,9
+chr4	54408971	.	C	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0022452;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:21,9:9,3
+chr4	55535739	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:9,7:2,2
+chr4	56285267	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.010825;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:17,4:11,3
+chr4	56862339	.	AAG	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.23453;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,2:13,2
+chr4	56915242	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,4:8,1
+chr4	57195392	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0019889;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:14,6:12,4
+chr4	58516672	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0044583;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:8,2:8,8
+chr4	58780188	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.11505;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:18,2:13,2
+chr4	58849888	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0039777;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:12,7:15,2
+chr4	59244838	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.043327;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,11:8,7:6,4
+chr4	59519025	.	ACC	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
+chr4	59905347	.	A	ATG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.026928;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:10,3:5,2
+chr4	60611412	.	GAGAA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.014502;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,5:5,2
+chr4	61072909	.	C	CTATTATTAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.039018;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,12:2,5:13,7
+chr4	61215541	.	ATT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:7,1:0,5
+chr4	62996598	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.002714;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:7,3:14,4
+chr4	64512497	.	C	CAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:5,3:4,1
+chr4	65129734	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=3.3183e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:12,7:7,6
+chr4	65365649	.	C	CTATA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,4:4,3:1,1
+chr4	65465456	.	GA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:16,1:8,3
+chr4	65995025	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027424;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:8,1:9,6
+chr4	66169113	.	G	GT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=2.6712e-05;SS=2;SSC=45;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,14:4,9:7,5
+chr4	67121416	.	T	TTCTC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.018904;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,1:10,7
+chr4	67439786	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.7856e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:12,7:11,8
+chr4	67635750	.	T	TCTTGTTGTTCAATCTAGTAATTTCTCTCTTTTCTA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034996;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,6:8,4:6,2
+chr4	69064106	.	GAAAGAA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.014159;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:5,4:3,2
+chr4	70520010	.	AT	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0048555;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:13,4:8,13
+chr4	71011232	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.14404;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:11,4:4,2
+chr4	72227238	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.019351;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,12:11,5:8,7
+chr4	72667860	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0022409;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:13,4:9,5
+chr4	73270285	.	ATT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.32536;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:7,2:6,3
+chr4	73788258	.	GGAGGAGGATGAGAAA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:6,5:1,3
+chr4	76646229	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.045693;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:15,2:9,3
+chr4	76928092	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.017292;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,6:6,1
+chr4	77595098	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0037259;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:9,7:5,7
+chr4	78137046	.	GA	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.3094e-05;SS=2;SSC=48;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:21,21:7,7:14,14
+chr4	78465956	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0011625;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,5:14,4
+chr4	79547385	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=2.3532e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:10,5:9,7
+chr4	80208540	.	A	AACAC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.032319;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:18,8:5,2
+chr4	80622916	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0026611;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:12,5:10,4
+chr4	80651704	.	T	TTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,12:5,6:3,6
+chr4	81227215	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00017189;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:11,5:13,7
+chr4	82077994	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.24625;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,4:6,1:13,3
+chr4	82318950	.	AGAAG	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,4:5,2:9,2
+chr4	82599026	.	CAA	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.034956;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,5:9,1:9,4
+chr4	83579077	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:2,1:3,3
+chr4	84121099	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.016437;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:16,8:20,2
+chr4	85598897	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0004646;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:11,5:12,6
+chr4	85888402	.	G	GA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,9:9,8:2,1
+chr4	86842707	.	AAAAAG	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.012802;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:4,1:9,9
+chr4	86842815	.	TTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,3:5,1
+chr4	87616268	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00068054;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,14:7,10:3,4
+chr4	87923765	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.038146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:13,7:4,1
+chr4	88295154	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0014004;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:11,3:13,6
+chr4	89356553	.	CTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:1,2:10,7
+chr4	89356569	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:3,2:8,5
+chr4	89846079	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.090728;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:9,5:12,1
+chr4	89903897	.	G	GAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,8:10,7:2,1
+chr4	91496796	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,1:5,3
+chr4	91974275	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.0279e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:10,7:12,10
+chr4	91997999	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00013424;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:19,8:14,7
+chr4	92083882	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00031695;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:9,5:12,7
+chr4	92646888	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.14706;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:7,8:2,3:5,5
+chr4	93870622	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.1839;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,6:6,5:6,1
+chr4	95087003	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0083551;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:14,9:2,1
+chr4	95328040	.	C	CTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.005418;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,10:1,9:3,1
+chr4	98020050	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021382;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:7,5:11,2
+chr4	98828584	.	GA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,5:1,3:2,2
+chr4	99516244	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00025356;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:8,8:13,4
+chr4	99742985	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.012389;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:14,6:9,2
+chr4	101164244	.	CCAT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,6:3,2
+chr4	101426865	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:2,2:3,4
+chr4	101664294	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.025917;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:11,4:13,1
+chr4	103237571	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,1:13,3
+chr4	103799073	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=7.4062e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:17,28:5,12:12,16
+chr4	103809930	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.4578e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,18:4,9:13,9
+chr4	105008884	.	A	ATT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0052134;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:5,7:9,4
+chr4	105204234	.	T	TAC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.090728;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,6:10,3:11,3
+chr4	106633854	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0099771;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,12:3,2:2,10
+chr4	107775491	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0018234;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:9,3:10,5
+chr4	108409382	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.19341;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:12,1:19,3
+chr4	108448970	.	A	AAAAAG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:4,3:3,3
+chr4	108600907	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.030759;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,1:10,3
+chr4	108675699	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,3:8,1
+chr4	109314581	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0022996;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:16,6:11,4
+chr4	109328151	.	G	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00082953;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:7,8:11,2
+chr4	110186820	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,7:4,4:5,3
+chr4	110256884	.	C	CT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.039872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,10:5,6:15,4
+chr4	110381304	.	CTTTTTTT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.17622;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:4,3:1,1
+chr4	112052387	.	GCA	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0025635;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:19,7:10,3
+chr4	112052390	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0022088;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:16,7:10,2
+chr4	112090482	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0010226;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:17,5:13,5
+chr4	113163770	.	A	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,2:3,1:3,1
+chr4	113459638	.	CT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.006592;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,6:4,2
+chr4	114623115	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0085883;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:18,2:12,5
+chr4	114916536	.	C	CTG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,11:10,8:5,3
+chr4	118251125	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049827;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:9,4:10,5
+chr4	119789253	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.033431;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:15,6:11,4:4,2
+chr4	119789254	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,4:11,2:5,2
+chr4	120227229	.	G	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00019041;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:21,7:13,6
+chr4	120307384	.	ATTT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10288;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:11,4:3,2
+chr4	121017432	.	AC	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.21758;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:15,2:17,2
+chr4	121635027	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,3:4,3
+chr4	122720887	.	T	TA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.019351;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:12,7:7,5
+chr4	124715670	.	T	TTATATG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0041486;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:10,11:7,5:3,6
+chr4	125715759	.	AAAC	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.03385;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:17,4:10,1
+chr4	126584511	.	A	ATT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,7:5,6:2,1
+chr4	126663898	.	A	AAAGATATATATATAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,2:10,2
+chr4	129479178	.	CTTCT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.013215;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,5:8,4
+chr4	130715213	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.002428;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:18,7:13,3
+chr4	131448941	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00094808;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:13,6:13,3
+chr4	131735926	.	A	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr4	131743490	.	G	A	0	PASS	DP=193;GPV=1;SPV=0.013808;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:94,12:61,8:33,4
+chr4	131749715	.	G	C	0	PASS	DP=218;GPV=1;SPV=0.014927;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:107,17:54,11:53,6
+chr4	131814343	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.072687;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:25,4:19,2
+chr4	132636067	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,4:4,1
+chr4	132894907	.	T	TA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0014755;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,2:7,7
+chr4	132931526	.	A	ATTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.001806;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:2,12:0,9:2,3
+chr4	134024923	.	AT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,8:2,5:3,3
+chr4	135417094	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,3:1,1:4,2
+chr4	136148051	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.028768;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,7:19,2:21,5
+chr4	136153727	.	T	TTATATATATA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:3,3:0,3
+chr4	136620055	.	GTATA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0030458;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:6,8:10,3
+chr4	137930087	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0018725;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:13,4:15,7
+chr4	139405226	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=9.3228e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:9,10:11,8
+chr4	140776840	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0010222;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:10,6:13,5
+chr4	141426356	.	A	ATCTG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0030514;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:11,10:4,7:7,3
+chr4	143036415	.	T	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00041078;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:16,3:16,8
+chr4	143123355	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.002428;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:14,3:17,7
+chr4	143956227	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.044088;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,2:6,2
+chr4	145835562	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0084353;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:4,3:5,2
+chr4	145835563	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.019883;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
+chr4	145835564	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.010792;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,3:4,2
+chr4	147541067	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048055;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,4:3,1
+chr4	147621985	.	C	CT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0012415;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,12:6,9:12,3
+chr4	148038938	.	G	GTTTTGAAACTTAGTGTTAT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.042001;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,3:4,3
+chr4	149269330	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.35897;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,2:4,1:2,1
+chr4	149374997	.	GT	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.037344;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:13,3:20,5
+chr4	151097439	.	A	ATT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0066911;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,12:11,7:8,5
+chr4	151445849	.	A	AATATATATATATAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:3,5:1,4
+chr4	151653358	.	C	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0080354;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:17,4:12,5
+chr4	151765852	.	C	CAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0065492;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,7:2,6:2,1
+chr4	152617531	.	A	ATG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.073359;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:10,3:6,1
+chr4	153117030	.	T	TA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0074524;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:12,12:8,7:4,5
+chr4	153346605	.	G	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0025344;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:7,7:11,3
+chr4	153390889	.	A	ATATGTGTGTGTG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0012716;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,11:4,3:2,8
+chr4	154875182	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0074494;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,5:5,2
+chr4	155552235	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.018909;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:8,3:13,2
+chr4	155957237	.	T	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0035042;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:3,9:0,2:3,7
+chr4	156439096	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00027127;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:11,6:12,8
+chr4	157395225	.	AGAG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.046659;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:16,6:5,2
+chr4	157665341	.	T	TCACACACACACACACACA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,7:2,5:5,2
+chr4	158529250	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.058162;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:13,4:8,2:5,2
+chr4	158695714	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00015402;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,3:9,6
+chr4	159062697	.	G	GTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:3,2:9,2
+chr4	159385405	.	TAA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0011292;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:8,3:6,10
+chr4	159808521	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0010229;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:9,8:5,2
+chr4	160144525	.	TTTG	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,2:1,1:4,1
+chr4	160547231	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00080797;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:14,4:11,7
+chr4	160633007	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.9551e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:10,6:11,7
+chr4	161332099	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:5,3:2,2:3,1
+chr4	162453267	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0087152;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:13,5:12,2
+chr4	162621887	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00090285;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:17,4:12,7
+chr4	163448601	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:3,3:1,1:2,2
+chr4	163688370	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.030474;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:9,11:8,5
+chr4	164035933	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:4,2:4,1:0,1
+chr4	164199681	.	C	CAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,2:2,1:1,1
+chr4	164313182	.	CA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0053975;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:14,9:1,5
+chr4	164735546	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.036089;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:4,3:3,2
+chr4	165707190	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.022595;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,5:3,1
+chr4	166251139	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:1,2:1,1:0,1
+chr4	166491022	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0033127;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,7:4,3
+chr4	166603720	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.12799;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:2,4:5,1
+chr4	166603732	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,2:2,1:3,1
+chr4	167345604	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.010975;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:8,5:10,8
+chr4	168333164	.	CAA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.041917;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,9:7,8:5,1
+chr4	169087473	.	A	ATT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,8:5,5:0,3
+chr4	169233248	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:4,6:3,2
+chr4	169355377	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00031521;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:11,9:14,5
+chr4	169744966	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,1:12,3
+chr4	170102794	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.090553;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,6:6,1:17,5
+chr4	170703373	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0078314;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:15,6:19,2
+chr4	171798904	.	A	ATATT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.012781;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:10,7:11,4
+chr4	172057729	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:4,5:5,1
+chr4	172503526	.	G	GTATATATATATATA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:3,3:12,2
+chr4	174296763	.	A	AT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,5:4,3:5,2
+chr4	176325561	.	T	TAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,6:10,3:8,3
+chr4	177185005	.	AAG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:23,3:5,1
+chr4	177238841	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.8646e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:11,7:10,7
+chr4	177238842	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=1.6571e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:9,7:11,7
+chr4	177417940	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,12:6,9:3,3
+chr4	178300739	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:5,5:5,1
+chr4	179137490	.	G	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0055583;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:15,3:20,5
+chr4	179279208	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0090372;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:17,8:13,5
+chr4	180290348	.	C	CTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,4:11,3:4,1
+chr4	181031797	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.041183;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:10,3:10,5
+chr4	181130688	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0069381;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,4:4,4
+chr4	181280528	.	T	TTTTAAAATAATTGATGAAATGAGGCAGATGTG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032107;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:4,3:2,2
+chr4	181801651	.	AATATAT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:3,3:1,3
+chr4	181803939	.	C	CAA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.005418;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:2,5:2,1
+chr4	182293458	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00057391;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:13,6:19,6
+chr4	183013415	.	TTCCCC	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:1,6:6,5
+chr4	185031220	.	G	GA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0054758;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,13:9,5:7,8
+chr4	185053316	.	GTT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:6,4:3,1
+chr4	185220484	.	C	CTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.029089;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:9,3:9,6
+chr4	185426879	.	CAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:5,5:6,3
+chr4	185606854	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0057699;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:9,4:13,1
+chr4	186905242	.	T	TTC	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0025855;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:8,6:8,7
+chr4	186911004	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0035252;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:12,4:9,4
+chr4	186968630	.	C	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.046386;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:14,4:9,1
+chr4	187013968	.	A	AGT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.12376;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,6:14,4:9,2
+chr4	187024475	.	C	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.028248;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,1:7,3
+chr4	188891730	.	A	ATTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:10,9:6,8:4,1
+chr4	188974981	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.40598;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,3:9,2:9,1
+chr4	189688328	.	A	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.038332;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:16,4:18,1
+chr4	190032876	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0010244;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:6,11:3,2
+chr4	190097528	.	T	C	0	PASS	DP=351;GPV=1;SPV=0.020604;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:207:181,26:89,12:92,14
+chr4	190106016	.	T	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.019271;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:46,7:9,2
+chr4	190200729	.	C	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr4	190204153	.	T	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.025299;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:44,15:4,4:40,11
+chr5	89889	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.044988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:9,1:15,3
+chr5	196677	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.01531;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:7,1:12,7
+chr5	230013	.	TAGAGTTA	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.023776;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:20,3:13,2
+chr5	415365	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.19833;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:26,3:8,1:18,2
+chr5	814097	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,2:10,2
+chr5	1339870	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.046608;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:19,6:4,1
+chr5	2128134	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00083483;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:12,4:11,7
+chr5	2585334	.	AGATG	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.031674;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,9:2,5:1,4
+chr5	2928097	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=3.6299e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:9,4:11,14
+chr5	3117652	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,4:12,2:8,2
+chr5	3233520	.	TAA	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,3:3,4
+chr5	3249463	.	C	CGT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0095255;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:6,10:15,6
+chr5	3324001	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.035683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:16,1:16,7
+chr5	5493008	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr5	5904762	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,2:7,3
+chr5	7113148	.	ATT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0041629;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:11,8:6,6:5,2
+chr5	7281323	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.33939;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:5,3:2,2:3,1
+chr5	7633573	.	T	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.010155;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,10:21,7:20,3
+chr5	7761147	.	TC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,3:6,1
+chr5	7798584	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.37283;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,5:9,2:11,3
+chr5	8375406	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.083915;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:17,2:12,2
+chr5	10099947	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.032284;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,6:5,1
+chr5	10528489	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0036508;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:1,9:1,5:0,4
+chr5	10592452	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,2:2,1:2,1
+chr5	10630886	.	AG	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12591;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:8,2:19,2
+chr5	11312684	.	A	ACACTCCCCATATACCCTCACCCTCAC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:3,3:9,2
+chr5	11541851	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.018593;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:1,3:7,4
+chr5	11600705	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,8:8,7:4,1
+chr5	11933508	.	A	AG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18393;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:12,3:14,1
+chr5	12071303	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0076491;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:9,5:20,3
+chr5	13610200	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=3.8991e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:5,9:15,11
+chr5	14548425	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.037934;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,3:2,2
+chr5	15010041	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.12939;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:14,3:15,1
+chr5	15869499	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.015769;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:13,5:14,2
+chr5	16453561	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,4:3,3:4,1
+chr5	17420129	.	A	ATGTGTGTGTG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,5:12,3:9,2
+chr5	17521046	.	C	T	0	PASS	DP=491;GPV=1;SPV=0.0058033;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:303:250,53:186,47:64,6
+chr5	18054923	.	A	ATT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.011229;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:4,7:5,2
+chr5	18584175	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.045694;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,3:4,3
+chr5	19748112	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
+chr5	20847903	.	TACACACAC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,6:7,3:3,3
+chr5	20864445	.	T	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.0073164;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:15,9:18,5
+chr5	20864483	.	C	CTTAT	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0025805;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:19,8:16,3
+chr5	20942282	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00068283;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:10,7:18,7
+chr5	21026379	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.16205;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,6:14,4:8,2
+chr5	21223000	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:2,1:10,3
+chr5	21719557	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.24484;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:26,4:9,3:17,1
+chr5	22355524	.	AT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12446;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:13,4:15,1
+chr5	22492351	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00012306;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,18:6,8:9,10
+chr5	22693655	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00079701;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:9,6:11,3
+chr5	23542017	.	ATTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,2:6,5
+chr5	23753775	.	T	TTTATTATTATTATTA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:7,6:12,4
+chr5	24145683	.	AAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.01726;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,10:7,7:4,3
+chr5	25737762	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00088019;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:17,4:7,9
+chr5	26157308	.	GTTT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12799;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,5:6,3:1,2
+chr5	27044503	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00010916;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:7,9:13,6
+chr5	27713449	.	TAA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.2488;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,4:4,1:8,3
+chr5	28560321	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0037594;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:3,10:0,4:3,6
+chr5	28701678	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.03791;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:13,7:10,1
+chr5	29044401	.	A	AT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0095255;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,16:6,9:15,7
+chr5	29489288	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.011071;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:3,5:4,6
+chr5	29745481	.	AAAT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0092175;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:8,6:8,7
+chr5	30112951	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0019214;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:14,8:9,3
+chr5	30489200	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.037288;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:6,6:12,3
+chr5	30818058	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045954;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:3,1:14,9
+chr5	31326677	.	TA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,4:4,2
+chr5	31724557	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0016144;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:7,13:8,3
+chr5	31817965	.	A	ATT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:8,14:5,5:3,9
+chr5	32086843	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:10,12:5,8:5,4
+chr5	32781090	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049781;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:7,8:13,2
+chr5	32973804	.	T	TAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.010427;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:13,4:18,6
+chr5	33158130	.	G	GA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,8:6,7:2,1
+chr5	33644536	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.088082;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:20,4:17,1
+chr5	34208425	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.12392;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:15,3:19,1
+chr5	35321597	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,4:8,3:8,1
+chr5	35793759	.	C	CACACACACACACAT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.096154;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,7:2,2:2,5
+chr5	36386679	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0021594;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:5,8:3,3
+chr5	36952018	.	C	CTGTGTG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:3,6:3,2
+chr5	39176137	.	GTTT	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:4,3:2,1
+chr5	39967683	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.039195;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:11,4:6,8
+chr5	40876480	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00010641;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:10,6:9,8
+chr5	41999490	.	TATAC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,1:8,3
+chr5	41999496	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.14022;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:14,2:8,3
+chr5	44569420	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.04473;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:17,2:12,4
+chr5	45246386	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.3467e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:6,8:13,10
+chr5	46570859	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,2:4,5
+chr5	46583919	.	G	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.03285;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:6,2:5,4
+chr5	46592559	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr5	46648171	.	C	T	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.030179;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:33,4:17,3
+chr5	46651839	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
+chr5	46663721	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.21008;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:15,1:23,4
+chr5	46664833	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.062457;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:9,1:11,4
+chr5	46666288	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.071484;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:13,2:22,2
+chr5	46680089	.	CT	C	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.035014;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:31,2:23,4
+chr5	46817927	.	G	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028335;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:9,5:1,2
+chr5	46872417	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.15567;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:0,0:33,4
+chr5	46942783	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:0,0:18,4
+chr5	47066201	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr5	47074114	.	A	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr5	47134703	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.031149;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:15,2:16,3
+chr5	47144442	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.014008;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:1,1:27,10
+chr5	47204182	.	GA	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.010244;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:15,6:22,2
+chr5	50109937	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.043846;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:16,3:16,3:0,0
+chr5	51215492	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.13695;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,5:22,1:16,4
+chr5	52108360	.	C	CTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.1043;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:12,2:13,4
+chr5	52369650	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.010479;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,9:4,7:8,2
+chr5	52655948	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,2:4,2
+chr5	53005580	.	C	CAAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,8:4,6:2,2
+chr5	53391053	.	G	GACACACACACACACAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:5,6:1,1
+chr5	54992552	.	AGAT	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.18072;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:16,1:19,3
+chr5	55185971	.	CTTT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,10:4,7:3,3
+chr5	56844183	.	G	GTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0098105;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:5,4:2,1
+chr5	57219375	.	CAAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:4,3:3,1
+chr5	57444336	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00010649;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:16,9:12,8
+chr5	58544507	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.01487;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:15,6:16,4
+chr5	60725790	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,4:4,3:4,1
+chr5	61431372	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,2:9,2
+chr5	61440360	.	T	TA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0017321;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:9,7:10,9
+chr5	62905829	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0073148;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:21,3:14,8
+chr5	63704518	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:37:1,3:1,1:0,2
+chr5	63823485	.	A	AACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.014706;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,9:3,5:1,4
+chr5	63867942	.	AT	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,4:2,1
+chr5	64669872	.	ATGAT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.40966;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:24,3:11,2:13,1
+chr5	67274485	.	ATT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,1:9,3
+chr5	67948449	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0017788;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,11:7,8:4,3
+chr5	69252494	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:3,5:3,1
+chr5	69333563	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.079426;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:18,3:18,1
+chr5	70684573	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
+chr5	70783879	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0026259;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,16:29,12:0,4
+chr5	71312022	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15197;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:14,2:7,4
+chr5	71330970	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:14,2:1,2
+chr5	72683085	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,2:4,2
+chr5	73494369	.	CTT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.023188;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,14:6,9:1,5
+chr5	74111003	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.11976;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,2:8,3
+chr5	74187781	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0017074;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:19,7:6,3
+chr5	74697727	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:14,6:3,2
+chr5	74771853	.	CA	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.079011;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:9,2:19,2
+chr5	75140281	.	GAAAGAAAGGAAGGA	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.030049;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:14,6:6,2
+chr5	75247240	.	CTTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,5:4,2
+chr5	75503842	.	T	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021189;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:6,4:8,5
+chr5	76237993	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019118;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,3:4,1
+chr5	76496729	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0054457;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:5,2:13,12
+chr5	77367532	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:1,4:0,2:1,2
+chr5	77777236	.	TTTC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:11,3:15,1
+chr5	77794934	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,4:1,1:1,3
+chr5	78436980	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00017157;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:10,6:8,11
+chr5	78673176	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0033075;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:6,5:7,3
+chr5	79427731	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,3:8,1
+chr5	79823556	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.011954;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:16,8:10,2:6,6
+chr5	80303728	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.012176;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,5:7,4
+chr5	80646105	.	G	GTTTTT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.02099;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:16,6:5,5
+chr5	80729857	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00013115;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:17,9:11,6
+chr5	80887094	.	CTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,4:3,3
+chr5	80897781	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0042541;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:14,4:4,5
+chr5	82725386	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,4:7,3:10,1
+chr5	83202042	.	C	CAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.025565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,4:3,1
+chr5	84232428	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0042803;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:13,6:9,2
+chr5	84369243	.	CAT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.074163;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,3:14,1
+chr5	84564119	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:3,4:2,2:1,2
+chr5	85217095	.	GA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.032417;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,7:3,1
+chr5	86291908	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.025884;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:14,8:6,5
+chr5	87001902	.	AAGAAAG	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0041553;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:4,16:2,9:2,7
+chr5	87989280	.	C	CAAAAAAAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.071698;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,5:11,4:12,1
+chr5	88676321	.	TTCCTCCTCCTCCTCC	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.031813;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:2,1:8,3
+chr5	88869312	.	TATAC	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.004995;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,4:0,0:0,4
+chr5	89504536	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.059933;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
+chr5	91175363	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0058487;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:13,2:17,6
+chr5	91338508	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=5.7647e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:6,5:3,6
+chr5	92113927	.	GTA	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,5:3,4:0,1
+chr5	92346468	.	A	ATG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:1,2:3,3
+chr5	95805833	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,4:3,3
+chr5	96752539	.	AAACCTCAGGGAT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,2:8,2
+chr5	97152970	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.053676;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:18,3:12,3
+chr5	98096721	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,3:11,2
+chr5	99469264	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.026352;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:15,6:5,4
+chr5	99861268	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,3:8,1
+chr5	100470648	.	C	CTAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00026093;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,13:2,11:3,2
+chr5	100493009	.	ATATATATTTATGTAAATATATATT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.058687;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,4:7,1:8,3
+chr5	100675570	.	TGTGTGTGTGTGTGCGC	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.031273;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:22,8:7,4
+chr5	100785138	.	T	TCTTC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,8:4,3:7,5
+chr5	100852114	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,5:5,2:5,3
+chr5	100875562	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00077059;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:21,6:9,7
+chr5	101471849	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=7.0935e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:20,7:15,8
+chr5	101726075	.	C	CAATAATAAT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.030143;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,8:9,6:6,2
+chr5	102050808	.	C	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,3:4,4
+chr5	102207704	.	C	CAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037585;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,5:6,4
+chr5	102931869	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0067248;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:10,3:14,7
+chr5	103997929	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.026779;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:12,3:21,4
+chr5	104725776	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=9.2183e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:8,8:11,7
+chr5	106207402	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0019104;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:10,4:17,5
+chr5	106249012	.	T	TGCTTCCTACCA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030178;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:11,6:7,4
+chr5	107131111	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,4:9,2:8,2
+chr5	108343911	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00037649;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:11,7:10,4
+chr5	110191516	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:8,2:1,2
+chr5	110470635	.	G	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0060413;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:22,3:15,6
+chr5	111576719	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,1:3,3
+chr5	114339631	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0018313;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:14,4:10,4
+chr5	114690125	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=2.0437e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:14,7:9,7
+chr5	115361420	.	CTTTGCA	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.001258;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:16,2:8,6
+chr5	117189659	.	T	TAAA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0059628;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:6,6:12,5
+chr5	118178397	.	A	ATTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,9:5,8:1,1
+chr5	119732025	.	G	GACACAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0094953;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,8:5,2:2,6
+chr5	120184382	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.046295;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,9:7,7:7,2
+chr5	121632513	.	CAAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:4,5:3,1
+chr5	121663508	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00091899;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:15,6:13,5
+chr5	121705429	.	AGG	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,2:3,2
+chr5	122598863	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.458e-06;SS=2;SSC=58;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:8,8:6,7
+chr5	123089192	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:3,2:4,2
+chr5	123237435	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.23776;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,2:10,2
+chr5	123237436	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.23776;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,2:10,2
+chr5	123743329	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.013751;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,7:9,4
+chr5	123935002	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037117;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:9,3:12,7
+chr5	124094349	.	CATATATATATATATATATAT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,2:2,2
+chr5	124662790	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0024929;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:17,6:13,4
+chr5	124762700	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0053523;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,7:3,1
+chr5	125196155	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.048897;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:12,3:7,4
+chr5	126164850	.	GATAT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,8:1,5:2,3
+chr5	126270760	.	CAAT	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.038208;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,8:17,4:17,4
+chr5	126543964	.	C	CT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0033619;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,9:7,6:12,3
+chr5	127828763	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00015222;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:15,22:6,11:9,11
+chr5	128000737	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr5	128897457	.	GATTAGAACGCTCA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0027601;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:11,8:3,6
+chr5	129891250	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00010804;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:9,7:12,5
+chr5	130113113	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0076861;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:27,19:12,9:15,10
+chr5	130258668	.	T	TA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.042491;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,7:8,6:11,1
+chr5	130772958	.	AAAT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.17449;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,1:10,4
+chr5	130772965	.	GGA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:10,2:5,3
+chr5	130942245	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.15761;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:20,1:15,3
+chr5	131054508	.	CAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,4:4,3
+chr5	131073212	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.042462;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:8,1:16,5
+chr5	131292921	.	A	AC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,10:2,6:5,4
+chr5	131521840	.	TACACACACACACACACACAC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.011229;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:7,4:2,5
+chr5	132351276	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00037187;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:7,3:13,8
+chr5	132473012	.	T	TA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0054137;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,10:1,9:0,1
+chr5	132611705	.	TA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.010569;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,12:7,7:5,5
+chr5	132673903	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00030577;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:10,4:12,6
+chr5	133625829	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:12,3:8,1
+chr5	134518582	.	T	TA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,4:5,3
+chr5	134692057	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0035559;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,10:5,7:3,3
+chr5	134906194	.	A	ATTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,2:2,2
+chr5	138120230	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.03835;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
+chr5	138650421	.	GA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.041917;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:10,7:2,2
+chr5	139233816	.	CA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.040959;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,9:1,8:0,1
+chr5	139560199	.	AT	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018564;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:5,6:7,2
+chr5	139701878	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.04277;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:15,3:11,4
+chr5	140178441	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:2,4:4,3
+chr5	140584909	.	A	AT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011765;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:5,7:6,4
+chr5	140838081	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,2:4,1:3,1
+chr5	141462116	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=5.9715e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:18,6:7,6
+chr5	141712256	.	G	GT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.011195;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:12,6:11,3
+chr5	141840617	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:13,8:4,1:9,7
+chr5	142188567	.	AGGAAG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030844;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,3:4,2
+chr5	142439845	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=6.4422e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:11,6:16,10
+chr5	143945762	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.9123e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:5,6:12,11
+chr5	144847159	.	T	TTTTATTTA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.053256;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,10:7,4:20,6
+chr5	145340776	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,2:3,1:2,1
+chr5	146372283	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.095044;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,5:19,3:8,2
+chr5	147086428	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,2:5,3
+chr5	147214520	.	GTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.10147;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,7:11,5:11,2
+chr5	147840621	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,6:4,1:4,5
+chr5	147873470	.	GGAAATAAGGGATTGGGGCACA	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00060477;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:11,11:9,7
+chr5	148778095	.	T	TTCTCTC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.016422;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:7,6:9,3
+chr5	149127910	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0012545;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:9,4:21,8
+chr5	149939140	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00010305;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:7,7:14,7
+chr5	151282890	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.053387;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,4:12,1:17,3
+chr5	152415757	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0002749;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:5,5:11,10
+chr5	153607068	.	T	TATATATATATATAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.02545;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,7:9,4:3,3
+chr5	153826411	.	CAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:9,2:7,2
+chr5	153854713	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,4:10,3:9,1
+chr5	154138321	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.028014;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,7:6,1
+chr5	154149107	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0061538;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,4:3,3:2,1
+chr5	154452729	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.036325;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:13,2:17,3
+chr5	154452743	.	A	AGTTCTTCCCACT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.018288;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,6:12,3:12,3
+chr5	155062654	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:5,4:2,1
+chr5	156841324	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.016974;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:15,4:14,3
+chr5	156841325	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0091986;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:15,5:12,3
+chr5	156841326	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0089005;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:9,5:14,3
+chr5	156841327	.	C	CCT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.020934;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:15,4:15,3
+chr5	157054190	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024846;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:7,5:4,2
+chr5	157526173	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.069705;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:28,3:6,2
+chr5	157677668	.	AAG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0038641;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:3,5:10,7
+chr5	158866861	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,2:1,1:0,1
+chr5	159466785	.	TACTGCTTATATATATATAA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.05461;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,3:11,1
+chr5	160486276	.	CTTTAGA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0056305;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:7,5:7,8
+chr5	160693403	.	A	AAC	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.02692;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,12:15,5:6,7
+chr5	160898706	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00056465;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:17,5:11,10
+chr5	161033663	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,3:0,1
+chr5	161463551	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:6,1:1,1
+chr5	162065825	.	T	TACACACACAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.017445;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,6:5,5:5,1
+chr5	163244240	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0018791;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:10,5:5,3
+chr5	163405314	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0018699;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:3,9:7,3
+chr5	163617971	.	CTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:3,1:9,7
+chr5	164970464	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=4.0661e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:11,6:15,11
+chr5	165094976	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.051138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,5:7,2:11,3
+chr5	165315188	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=2.2597e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:17,11:6,11
+chr5	165653669	.	T	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:7,5:4,3
+chr5	165919434	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.2609e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:11,7:13,12
+chr5	166057391	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:3,4:5,1
+chr5	166683568	.	ATAT	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.074732;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:16,3:9,2
+chr5	166688864	.	CATAT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.02087;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:5,5:1,1
+chr5	167834640	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:7,5:3,1
+chr5	168036644	.	ATAT	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:9,4:5,2:4,2
+chr5	168165640	.	CCCCCCCAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.013986;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:0,3:0,0:0,3
+chr5	168250104	.	GTGGATGGATGGATGGA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0014108;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,11:10,6:4,5
+chr5	169202241	.	T	TAAATA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.025432;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,12:10,6:15,6
+chr5	169635867	.	ATGTATG	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.15343;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:16,3:20,1
+chr5	169972586	.	T	TA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,5:5,2:11,3
+chr5	170589783	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:8,3:11,1
+chr5	170599624	.	GATGGACCTAGGGGTGGGGAAGAGCGAGAAGTTCCCGTGCA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011304;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:9,4:7,4
+chr5	171502913	.	AGT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.046295;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:6,3:8,6
+chr5	171878593	.	A	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,2:8,2
+chr5	173699024	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:5,3:9,2
+chr5	173937019	.	CTT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.028534;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:7,4:6,4
+chr5	174883446	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0072434;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:13,4:12,4
+chr5	175914839	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.011639;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:19,5:13,7
+chr5	175941300	.	T	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.037221;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:14,3:20,8
+chr5	176055594	.	T	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.014566;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:45,11:24,4:21,7
+chr5	176489248	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:5,6:5,6
+chr5	176591961	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.014656;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,3:5,5
+chr5	177695953	.	TGGC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15275;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:8,2:11,3
+chr5	177891695	.	A	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.041141;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:13,4:19,5
+chr5	178034774	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.083867;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:15,3:7,2
+chr5	178039933	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.046272;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:13,5:13,4
+chr5	178195604	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
+chr5	178358268	.	GTA	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:11,3:7,4
+chr5	180194002	.	G	GTGTTTGTT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.2901e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:5,19:3,9:2,10
+chr5	180945995	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:3,2:2,1:1,1
+chr5	181269984	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,2:2,3
+chr5	181475428	.	G	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.016736;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:57,8:21,5:36,3
+chr6	469644	.	GTCTCCCTCC	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:4,2:2,1
+chr6	1037543	.	ATGTT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0001145;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,18:5,9:7,9
+chr6	2357977	.	C	CTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,3:1,1
+chr6	4103893	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00052709;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:1,6:4,4
+chr6	4923902	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:0,2:0,0:0,2
+chr6	5539382	.	G	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,3:4,4
+chr6	5555755	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.6248e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,4:6,6
+chr6	6590118	.	TAA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.012749;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:4,5:3,1
+chr6	7349944	.	AAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:1,3:6,7
+chr6	7469157	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,6:2,5:5,1
+chr6	7704987	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00035596;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:4,9:1,1
+chr6	7958136	.	C	CTTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,3:2,2:2,1
+chr6	9010172	.	A	ATTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0059497;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,8:3,4:4,4
+chr6	10035301	.	ATATATG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.029433;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,1:4,3
+chr6	10087104	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,6:4,4:3,2
+chr6	10765440	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,6:5,5:2,1
+chr6	11935537	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.021554;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:6,3:11,2
+chr6	13025671	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0017126;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,13:6,10:7,3
+chr6	13762086	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:6,2:3,2
+chr6	13793125	.	C	CA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,6:0,5:1,1
+chr6	13813884	.	ATGCCGG	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=4.5018e-06;SS=2;SSC=53;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:9,8:11,7
+chr6	13813894	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=7.1318e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:10,8:8,7
+chr6	13821384	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.525e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:11,5:5,9
+chr6	14147038	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.008413;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,7:0,5:4,2
+chr6	15064967	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,5:2,4:3,1
+chr6	15120858	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,2:0,0:3,2
+chr6	15254897	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=3.2171e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:6,5:7,11
+chr6	16480154	.	C	CAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.006993;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,5:1,4:1,1
+chr6	16920634	.	AACACACACACAC	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0068111;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,7:5,1:0,6
+chr6	17083187	.	T	TACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.001857;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,2:3,6
+chr6	17474185	.	CTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0039295;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:2,6:2,2
+chr6	17587037	.	T	TAC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0054797;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:14,7:8,2
+chr6	17781623	.	G	GTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0061587;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:3,4:4,3
+chr6	17934787	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.040919;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:12,2:7,7
+chr6	19972904	.	CTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,3:3,1
+chr6	20437918	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=8.868e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:9,6:3,2
+chr6	20797760	.	C	CTTTATTTTAT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.015843;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:6,5:3,1
+chr6	20988182	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:2,4:3,2
+chr6	22379075	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039588;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:16,4:13,1
+chr6	22481638	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:23:3,10:2,7:1,3
+chr6	22885876	.	A	AGTGT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0031609;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:3,4:5,3
+chr6	23797596	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:1,2:0,1:1,1
+chr6	23797597	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:1,2:0,1:1,1
+chr6	24056447	.	T	TAAGAAAGAAAGA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.041104;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,10:10,7:14,3
+chr6	24442449	.	T	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:2,1:5,1
+chr6	24474946	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0019638;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,12:3,6:4,6
+chr6	25022532	.	ATTTTTTT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,4:3,4
+chr6	26436177	.	CT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.015259;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,12:18,10:7,2
+chr6	27101011	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.047135;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:20,4:9,3
+chr6	27101021	.	A	AC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.21118;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:19,2:8,2
+chr6	27101029	.	G	GAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048435;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,7:16,4:6,3
+chr6	27561940	.	T	TTTTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.17876;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,4:7,1:11,3
+chr6	27733493	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.017964;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,10:9,6:6,4
+chr6	28176823	.	T	TA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,3:5,2
+chr6	28594345	.	C	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0011729;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:20,8:18,6
+chr6	28872465	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021382;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:13,4:5,3
+chr6	28953876	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.039879;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:42,10:21,5:21,5
+chr6	29444735	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00097272;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:42,18:24,9:18,9
+chr6	30082997	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.029887;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:10,4:9,8
+chr6	30333357	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.043889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:9,4:11,2
+chr6	30928031	.	GTT	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.12367;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,7:18,4:4,3
+chr6	31807582	.	C	CAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0066159;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,9:12,8:1,1
+chr6	32135286	.	T	TAAAAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr6	32242474	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.031008;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:7,3:12,2
+chr6	32242510	.	T	TTTCC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0039984;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,9:7,5:6,4
+chr6	32632476	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.044074;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:8,6:10,2
+chr6	32746007	.	C	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.082592;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:47,6:17,1:30,5
+chr6	32746050	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.10036;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:23,1:22,4
+chr6	33553143	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,8:5,7:3,1
+chr6	33767012	.	A	ACACACACG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.090199;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,8:14,4:13,4
+chr6	33847578	.	A	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.030844;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:14,5:8,2:6,3
+chr6	33978334	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=5.8714e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:36,16:15,8:21,8
+chr6	33989506	.	T	TTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0077942;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,9:11,5:8,4
+chr6	34272585	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=2.4738e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:33,20:15,9:18,11
+chr6	34428164	.	C	CAAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.29987;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:14,3:12,1
+chr6	35266836	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:5,4:8,9
+chr6	35415778	.	C	CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.13907;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:19,3:7,2
+chr6	35483711	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.054338;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:15,3:18,1
+chr6	36282044	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,3:5,1
+chr6	36504898	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0048547;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:7,5:2,4
+chr6	36802217	.	CAA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.031109;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,6:4,1
+chr6	36943963	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.35509;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,4:17,1:11,3
+chr6	37181183	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,3:8,1
+chr6	38230495	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.28173;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:5,4:6,1
+chr6	39149355	.	TCACACACA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:4,2:6,2
+chr6	39806855	.	AG	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.002106;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,24:13,13:11,11
+chr6	40050106	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0091964;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:21,4:18,5
+chr6	40636965	.	A	ATG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06862;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:13,3:11,4
+chr6	40636985	.	ATG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.22567;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:14,1:11,5
+chr6	40636990	.	A	AACATATATTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.37843;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,4:14,1:9,3
+chr6	40674550	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.011294;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:14,7:6,4:8,3
+chr6	41663309	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.028335;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,7:3,2:7,5
+chr6	42206237	.	AAG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.03734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:11,7:24,6
+chr6	42290741	.	CTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0041535;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:4,4:5,9
+chr6	42507575	.	A	ATTTTTTTTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.2122;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,1:14,3
+chr6	43294350	.	T	TCAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.25735;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:8,2:11,1
+chr6	43372091	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.017734;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,10:9,6:4,4
+chr6	43567150	.	G	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00046557;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:23,8:15,6
+chr6	43738634	.	G	GT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:9,1:4,3
+chr6	43935395	.	T	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.042003;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,8:26,6:21,2
+chr6	44391089	.	C	CAT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.031062;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,5:10,2:12,3
+chr6	44606417	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00091899;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:15,3:13,8
+chr6	44871588	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.15731;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:25,3:14,1:11,2
+chr6	45866420	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.22017;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:16,1:15,4
+chr6	46127836	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=2.5202e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:18,23:7,12:11,11
+chr6	46142392	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0045935;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,2:10,8
+chr6	46831841	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.011071;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:18,6:17,8
+chr6	47287307	.	CAAAAAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,8:3,6:3,2
+chr6	48147451	.	T	TAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.014654;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,15:12,14:2,1
+chr6	48447033	.	TA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:11,4:11,5
+chr6	48993875	.	G	GATATATATAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.34759;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,2:12,2
+chr6	49226502	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.025631;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,13:14,8:4,5
+chr6	49394006	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0007826;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:14,7:19,5
+chr6	49394007	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0011981;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:13,7:18,5
+chr6	49394008	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0009984;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:14,7:17,5
+chr6	51507491	.	AT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.035177;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:11,8:13,4
+chr6	51702201	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.18959;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:11,2:19,3
+chr6	51807459	.	ATAT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,4:7,3:3,1
+chr6	52682596	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.03619;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:19,5:15,2
+chr6	53104723	.	G	GTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,13:6,11:2,2
+chr6	53409065	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:4,4:5,1
+chr6	53454593	.	T	TCACACACACACACACACACACA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.004119;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,11:5,8:2,3
+chr6	54200624	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.058259;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:15,2:16,3
+chr6	54219369	.	AC	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.23178;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,1:13,3
+chr6	54616580	.	T	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.047777;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:19,4:23,2
+chr6	55539859	.	GAAGAAAGAAAGA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.011166;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,5:4,4
+chr6	56053862	.	A	AGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.024928;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,9:9,5:6,4
+chr6	56219216	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.084679;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:14,4:5,1
+chr6	56917018	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:0,4:0,2:0,2
+chr6	57866875	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.036016;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:15,1:17,4
+chr6	58040371	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00086667;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:16,5:12,9
+chr6	58452068	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=7.269e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,18:8,11:2,7
+chr6	58724009	.	C	A	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.00087043;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:49,23:35,18:14,5
+chr6	59314063	.	G	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
+chr6	59343156	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,3:7,2
+chr6	60230066	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:10,9:0,1
+chr6	60511738	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:4,6:5,4
+chr6	61540793	.	GTATATATATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.004644;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:14:3,11:2,4:1,7
+chr6	62863532	.	TCC	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.013985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,3:5,8
+chr6	63297354	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.16835;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:10,5:4,1
+chr6	63654889	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.15499;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,2:8,3
+chr6	64045383	.	G	GTTTATTTTAT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.04561;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:10,2:11,3
+chr6	64107843	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=6.2242e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:14,7:8,7
+chr6	64542322	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00067755;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:11,5:13,6
+chr6	64585065	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.8434e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:13,9:10,3
+chr6	65306938	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14093;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,3:9,2
+chr6	69031079	.	CTCT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:3,2:8,2
+chr6	69691147	.	C	CTT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.041513;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:10,6:7,1
+chr6	70526750	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19021;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,2:9,2
+chr6	72102499	.	AC	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0039481;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:13,3:8,3
+chr6	72449805	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,2:8,2
+chr6	72873552	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0018434;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:35,13:18,10:17,3
+chr6	76401975	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.021615;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:7,5:7,2
+chr6	76401982	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12566;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:6,5:10,1
+chr6	76401989	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1599;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,5:11,1
+chr6	77029361	.	GCTTCATCCATGTCCCTGCAAAGGACATGAACT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.049793;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,6:9,2
+chr6	79860854	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.2008;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:19,1:17,3
+chr6	81468123	.	A	AAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.047286;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,6:7,1:9,5
+chr6	81665420	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0062786;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:9,9:10,1
+chr6	82659690	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=3.3767e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:16,8:10,6
+chr6	83277901	.	A	AAATAATAATAATAATAATAAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:1,1:7,3
+chr6	84274350	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0033254;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:10,2:8,4
+chr6	84310784	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.045694;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:6,5:7,1
+chr6	84989434	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.18637;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:11,2:11,1
+chr6	87851701	.	AG	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00096289;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:13,3:13,5
+chr6	88065469	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=2.5661e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:23,16:12,10:11,6
+chr6	89043428	.	AG	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
+chr6	92442985	.	C	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014243;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:16,1:11,7
+chr6	93937173	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.025866;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,13:11,7:12,6
+chr6	95151289	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.013929;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:13,4:14,3
+chr6	95371823	.	GTTGTTT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.064595;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,3:8,2
+chr6	97192213	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.08973;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:22,2:17,3
+chr6	97481994	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
+chr6	98077054	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.17647;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:6,4:1,3
+chr6	98634212	.	A	ATTT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0042118;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:13,11:7,4
+chr6	100608399	.	TTA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.31385;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:6,1:9,2
+chr6	102523047	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0035421;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:12,5:10,3
+chr6	102933593	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00082439;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:15,9:11,3
+chr6	103023913	.	TAC	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0033176;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:17,5:8,7
+chr6	103023923	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0054007;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:17,5:8,7
+chr6	104186663	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.12525;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:8,5:20,1
+chr6	104555966	.	T	TG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,5:8,3:5,2
+chr6	104555972	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,5:9,3:6,2
+chr6	104555973	.	T	TTCAGGATA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14404;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,5:9,3:5,2
+chr6	104876020	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0010684;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:9,3:20,8
+chr6	106439049	.	TG	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.034112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:15,1:12,5
+chr6	106896891	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.011004;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:12,11:3,3
+chr6	107532271	.	AC	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:14,3:12,1
+chr6	110586974	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0047824;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:13,7:18,4
+chr6	110836012	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.083396;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:18,5:2,1
+chr6	111646731	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,7:3,5:2,2
+chr6	112673463	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0051975;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:14,7:9,11
+chr6	113484182	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14093;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:13,3:7,2
+chr6	116041678	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00094527;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:14,6:10,6
+chr6	116668868	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.099494;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,1:15,3
+chr6	118085487	.	CT	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
+chr6	118310282	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=4.1076e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,17:4,5:16,12
+chr6	118569343	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,2:1,1:3,1
+chr6	118709532	.	C	CGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.01373;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:1,4:5,1
+chr6	119529462	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=2.9628e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,17:12,5:8,12
+chr6	120099200	.	CAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,5:4,4:7,1
+chr6	121044217	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=8.9122e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:14,25:6,13:8,12
+chr6	122652309	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.080354;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,1:10,3
+chr6	124730414	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.012533;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:5,5:11,4
+chr6	125301484	.	A	ACACACACGCG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.034267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:14,5:5,5
+chr6	127049658	.	ATT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,2:7,2
+chr6	127434577	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049667;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,6:4,1
+chr6	128402253	.	GTT	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.025525;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:22,3:12,7
+chr6	128717438	.	T	TAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0059497;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:5,6:2,2
+chr6	129718949	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031869;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,3:8,5
+chr6	131435804	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=3.2298e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:8,7:8,8
+chr6	133279108	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.6849e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:10,7:11,8
+chr6	133664412	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
+chr6	134155276	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.041575;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:11,4:5,2
+chr6	134717115	.	CAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.00064073;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,12:1,9:4,3
+chr6	135398058	.	GT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:9,8:7,5:2,3
+chr6	136560950	.	T	TATAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040415;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:13,4:7,4
+chr6	137454848	.	C	CATCT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031065;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:8,6:8,2
+chr6	137815658	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.082337;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,6:6,1:10,5
+chr6	138505652	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,9:9,8:3,1
+chr6	138518577	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0020064;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:12,6:6,4
+chr6	139693438	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.012894;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:9,4:12,2
+chr6	139836339	.	ACC	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.076397;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:14,3:19,1
+chr6	140064260	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
+chr6	140712153	.	TTA	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.039138;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:7,2:12,3
+chr6	140713276	.	GTATGTT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,5:5,3:12,2
+chr6	140713294	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.012992;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,10:6,6:11,4
+chr6	140862078	.	AC	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.12547;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,4:16,2:8,2
+chr6	141084311	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,6:4,2
+chr6	141188441	.	T	TCTTCCTTC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.17622;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:0,1:5,3
+chr6	141192831	.	C	CAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.038078;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:6,6:7,1
+chr6	142093999	.	TG	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.031374;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,5:6,2
+chr6	142359203	.	T	TA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.11425;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:10,4:11,1
+chr6	142638714	.	GGAAA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.026299;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,4:9,2
+chr6	144103325	.	TCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTC	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.044178;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:16,6:16,2
+chr6	144470478	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0011821;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:8,7:17,4
+chr6	145235589	.	CAT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:4,6:2,2
+chr6	146038052	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0014979;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:20,21:7,6:13,15
+chr6	146179449	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.024094;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:9,9:9,7
+chr6	146819282	.	A	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,2:7,2
+chr6	147213434	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,4:9,3:5,1
+chr6	148032223	.	C	CAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0055469;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:6,7:4,1
+chr6	148101852	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:12,3:2,1
+chr6	151092970	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0010743;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:23,22:15,12:8,10
+chr6	151146661	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.060632;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:13,5:16,3
+chr6	151335480	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.044278;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:13,3:14,8
+chr6	152444932	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00056465;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:16,6:12,9
+chr6	154687581	.	GT	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.1208;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:22,3:10,1
+chr6	155632582	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=7.9328e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:12,9:10,5
+chr6	155823264	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:13,5:11,2
+chr6	156801196	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010394;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:3,7:1,1
+chr6	157570780	.	TAC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.15567;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:20,3:13,1
+chr6	157992407	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:9,1:12,3
+chr6	158308141	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.012187;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:11,9:8,2
+chr6	158348173	.	G	GTT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.017286;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:8,8:6,3
+chr6	158522390	.	GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:9,3:1,2
+chr6	158681836	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=7.061e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:26,17:16,9:10,8
+chr6	158715599	.	T	TCACACACACACACA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,1:7,3
+chr6	158936948	.	CAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.025586;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:9,8:2,1
+chr6	159538338	.	A	AAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,10:10,9:2,1
+chr6	159547632	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0088303;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:11,5:3,5
+chr6	159637653	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0027765;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,11:2,9:4,2
+chr6	160092171	.	G	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,3:8,1
+chr6	160635080	.	C	T	0	PASS	DP=342;GPV=1;SPV=0.0081003;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:185:166,19:62,6:104,13
+chr6	161315670	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.21854;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:13,4:15,1
+chr6	162645869	.	T	TCTC	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:2,5:3,1
+chr6	164648830	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:0,6:0,4:0,2
+chr6	164841517	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00065827;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:14,7:6,5
+chr6	164841520	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.5647e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:13,7:4,8
+chr6	165158307	.	AT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.036877;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:10,3:7,5
+chr6	165883553	.	A	AAT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.013433;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,14:7,3:14,11
+chr6	165890002	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr6	166206742	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11166;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,2:6,2
+chr6	167288451	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.23612;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:18,5:10,3:8,2
+chr6	167389686	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,3:9,1
+chr6	167389695	.	CAT	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14555;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:17,3:8,1
+chr6	168523082	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024823;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:10,1:9,4
+chr6	168615690	.	A	AGG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,3:2,1
+chr6	168618422	.	T	TAAG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,2:11,2
+chr6	168842816	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.042521;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,1:8,3
+chr6	168932574	.	T	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:4,1:3,1
+chr6	169372589	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,3:2,1
+chr7	75720	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0011576;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:7,7:9,2
+chr7	598462	.	ACCCT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
+chr7	685288	.	ATG	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:1,3:0,1:1,2
+chr7	897704	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0011785;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:0,6:4,2
+chr7	1136379	.	AATATATAAAC	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.029742;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,4:8,2
+chr7	1623711	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,2:7,2
+chr7	2563377	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0036197;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:9,1:4,9
+chr7	3321786	.	T	TTCTCCC	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,2:0,0:4,2
+chr7	3321828	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,3:6,3
+chr7	4139489	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.037194;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:6,4:10,3
+chr7	4139495	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0048821;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:2,7:1,3:1,4
+chr7	4230039	.	AGAAGGAAGGAAG	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:5,3:4,1
+chr7	5009596	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,3:1,1:3,2
+chr7	5315430	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.013237;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,1:8,3
+chr7	6791510	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018966;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:10,5:1,1
+chr7	6810370	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.021538;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,3:3,2:2,1
+chr7	6818694	.	AC	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.019243;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,6:13,4:4,2
+chr7	7678781	.	ATT	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.019711;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:17,3:11,4
+chr7	8828316	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00019952;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:11,7:8,5
+chr7	9101580	.	CCGAGAT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0061699;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,7:7,2
+chr7	9392156	.	A	AAAAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=9.7173e-05;SS=2;SSC=40;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,13:2,4:5,9
+chr7	10314129	.	C	CAAA	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.0034965;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:1,4:1,2
+chr7	10464369	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0089009;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:10,4:3,1
+chr7	15152600	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00016168;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:8,4:9,6
+chr7	16605673	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00761;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:2,7:1,3:1,4
+chr7	16677051	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.004644;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:2,5:1,2
+chr7	19524984	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0021645;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,5:0,2:0,3
+chr7	20668377	.	C	A	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.010201;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:34,2:7,4
+chr7	20944718	.	TTTTTG	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0062751;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:6,6:6,4
+chr7	22831406	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.00084958;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:5,6:0,4
+chr7	22934226	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.19231;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,2:3,1:1,1
+chr7	23036374	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010837;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,3:3,2
+chr7	24338299	.	TA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.018907;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,6:11,2:8,4
+chr7	25488415	.	C	CCTCTCTCTCTCTCTCTCT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,4:7,1
+chr7	26261914	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0043971;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,2:8,4
+chr7	27510588	.	TA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,3:3,1
+chr7	28980322	.	C	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.00037084;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,8:0,7:1,1
+chr7	29396459	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.012399;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,5:2,1
+chr7	29643558	.	C	CAACTGTCCTCTTCTGAAGAAGAGAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0043071;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,2:1,3
+chr7	30557312	.	CT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=2.4682e-05;SS=2;SSC=46;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,17:5,10:3,7
+chr7	31586467	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,1:17,3
+chr7	32380404	.	A	ATTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,10:3,5:4,5
+chr7	32466943	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,5:3,2
+chr7	32466948	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0087567;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,5:3,3
+chr7	32682216	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.04724;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,4:5,2:2,2
+chr7	33411011	.	G	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,2:3,2
+chr7	34663041	.	T	TTCTCTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:3,3:3,2
+chr7	36417674	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,4:2,2
+chr7	36543947	.	C	CTTTCTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0031992;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:2,6:2,4:0,2
+chr7	37467163	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.5497e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:8,4:10,9
+chr7	42888090	.	T	TGCGC	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:1,1:5,3
+chr7	43644726	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,2:1,1:1,1
+chr7	43974329	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.024248;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:6,1:11,4
+chr7	43986652	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.041121;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:12,8:20,2
+chr7	45711646	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:3,3:1,2:2,1
+chr7	45753114	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,6:4,4:3,2
+chr7	46062612	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.04308;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,4:4,1
+chr7	47674091	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.036101;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:8,4:5,1
+chr7	47674098	.	AAAG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013095;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,4:3,1
+chr7	48245005	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.049827;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:11,2:8,7
+chr7	48475458	.	ATT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,3:4,5
+chr7	48895669	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.018062;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,2:4,2
+chr7	49800848	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,4:2,1
+chr7	52688239	.	GTATATATA	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0011717;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:22,23:9,13:13,10
+chr7	52926813	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.062087;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:10,1:9,2
+chr7	53890193	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.18072;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:18,3:17,1
+chr7	53900376	.	CAG	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.022272;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:10,7:12,6
+chr7	54138307	.	TCTC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11302;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:16,2:5,2
+chr7	55402077	.	G	GC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.1019;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:26,2:4,2
+chr7	55936265	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:9,2:14,2
+chr7	56574856	.	C	CAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:11,4:4,1
+chr7	57321339	.	AAATAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036129;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,7:6,2
+chr7	57321345	.	G	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00015096;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,12:5,8:3,4
+chr7	58080961	.	G	T	0	PASS	DP=302;GPV=1;SPV=0.013015;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:131,24:78,12:53,12
+chr7	58081744	.	C	T	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.020186;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:81,11:35,6:46,5
+chr7	60756709	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.12928;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:22,4:1,0
+chr7	60954031	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.010686;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:16,4:23,2
+chr7	60958391	.	C	T	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.015187;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:18,6:29,6
+chr7	61133326	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.25208;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:31,4:3,0
+chr7	61395961	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,2:10,2
+chr7	61409965	.	G	A	0	PASS	DP=149;GPV=1;SPV=0.024174;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:67,12:28,5:39,7
+chr7	62080576	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0089783;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,1:1,5
+chr7	62264353	.	CT	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.023608;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:21,1:11,7
+chr7	62264369	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.019062;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:19,1:15,5
+chr7	62274256	.	T	A	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.0075629;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:73,12:33,2:40,10
+chr7	62321093	.	T	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.033331;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:51,16:26,8:25,8
+chr7	62327707	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:17,1:24,4
+chr7	62337980	.	GAATGGAACCGAAAGGAATCATCATCA	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.040001;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:12,4:12,7
+chr7	63122235	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012445;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:6,3:6,7
+chr7	63188033	.	G	GCACA	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0094129;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:17,9:3,1
+chr7	63537977	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.019369;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:13,4:16,9
+chr7	63598018	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,4:5,3
+chr7	63604438	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:5,4:6,1
+chr7	63758856	.	G	C	0	PASS	DP=302;GPV=1;SPV=0.018818;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:143,25:97,16:46,9
+chr7	64337755	.	G	GTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0099524;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,10:8,7:9,3
+chr7	64963887	.	A	ATATATATATATATGTATG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.040384;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:4,5:5,4
+chr7	65587022	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0049761;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:14,2:21,7
+chr7	65588278	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.019393;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:16,3:15,3
+chr7	67435582	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.034056;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:3,5:3,1
+chr7	67730634	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,3:7,1
+chr7	67827049	.	GTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,3:8,1
+chr7	67956975	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,5:4,1
+chr7	68268808	.	T	TTC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10122;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:12,3:1,0:11,3
+chr7	68363965	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:11,2:12,2
+chr7	68545791	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,2:0,1:1,1
+chr7	68545794	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,2:0,1:1,1
+chr7	68769865	.	A	AACACACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.13168;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:13,4:6,2
+chr7	69542156	.	CTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.077477;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:7,5:1,1
+chr7	70004169	.	T	TTA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.02165;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:15,4:14,2
+chr7	70873247	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,9:1,7:3,2
+chr7	71431207	.	TTC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0065689;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:6,4:8,5
+chr7	71431210	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.3956;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,2:2,1:5,1
+chr7	71571092	.	AC	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.090497;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,2:10,3
+chr7	71947570	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=9.1194e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:8,8:9,6
+chr7	72088685	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:7,9:6,7
+chr7	72393730	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0036289;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,17:12,9:9,8
+chr7	72408270	.	T	TA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0045179;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,11:5,5:4,6
+chr7	73156171	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,4:8,2:15,2
+chr7	74339293	.	T	TTTA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.12625;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:15,4:23,1
+chr7	74528869	.	AGATGGATGGATG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.014569;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:1,6:1,5:0,1
+chr7	74667836	.	C	CTT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0038515;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,12:9,7:7,5
+chr7	74915735	.	G	C	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.036689;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:53,15:20,4:33,11
+chr7	75371230	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,2:6,2
+chr7	75500789	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.011392;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:16,2:8,3
+chr7	75611466	.	C	CAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.040656;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,6:9,4:6,2
+chr7	75906820	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,4:3,1
+chr7	75906821	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,4:3,1
+chr7	75906823	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:2,4:3,1
+chr7	76414696	.	C	CT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.020979;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:0,0:2,4
+chr7	76448259	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0054908;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:5,3:9,3
+chr7	76536740	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.13372;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:9,1:11,2
+chr7	76537020	.	C	CA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:1,4:5,1
+chr7	76606873	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr7	76652548	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,2:7,2
+chr7	76740475	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.081731;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:15,2:17,2
+chr7	76991438	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.014976;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:13,6:10,5
+chr7	76993485	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14912;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:14,1:18,3
+chr7	77039407	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.035511;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:13,8:5,1
+chr7	77060836	.	G	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.028266;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:10,1:10,5
+chr7	77334580	.	T	TA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,9:5,6:3,3
+chr7	77747911	.	C	CG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.018294;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,2:5,2
+chr7	78085583	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00022435;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,8:3,3:0,5
+chr7	78762144	.	G	GAACAAGTAGAGATTTTTGGATTAA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.018073;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:6,6:8,1
+chr7	78806867	.	CAAAAT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0020052;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:8,7:3,5
+chr7	79442451	.	A	AGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.018778;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,7:3,4:2,3
+chr7	80604350	.	ATTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.054945;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,3:3,2:0,1
+chr7	80920557	.	GTGTCTCAGACTCACGC	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=1.757e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:7,7:11,5
+chr7	81217947	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.031089;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:9,2:15,3
+chr7	82012254	.	G	GAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0064629;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:6,7:8,8
+chr7	82040452	.	C	CAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,7:3,6:1,1
+chr7	83539872	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,3:6,1
+chr7	84008509	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,4:1,2:2,2
+chr7	84024011	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010836;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,10:3,8:1,2
+chr7	85476603	.	T	TTATATATATATATATA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0011899;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:5,6:0,2
+chr7	87233899	.	G	GTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.012821;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:2,10:1,9:1,1
+chr7	87924871	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00091169;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:12,4:7,5
+chr7	90074354	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00066955;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:4,13:1,2:3,11
+chr7	90791903	.	C	CTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,4:3,2
+chr7	91211567	.	T	TAA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,3:2,1
+chr7	92516053	.	GAA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018307;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,6:1,5:4,1
+chr7	93204324	.	CTCTA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.048633;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:9,4:13,5
+chr7	94076128	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00027944;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,5:11,5
+chr7	94381648	.	T	TTCTCTCTCTCTC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,6:3,4:4,2
+chr7	94557386	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0021522;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:10,1:4,5
+chr7	97363467	.	G	GTCTGTCTATCTATCTATCTATCTA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:9,1:10,3
+chr7	98439443	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:0,1:9,5
+chr7	99181147	.	CTCCGTCTGTG	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.021073;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,3:3,2
+chr7	100325052	.	A	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0090684;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:17,4:17,5
+chr7	100495714	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.037021;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:4,4:2,1
+chr7	100911046	.	C	CTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:5,5:8,1
+chr7	100996823	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.03701;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:2,0:26,4
+chr7	101000294	.	C	T	0	PASS	DP=260;GPV=1;SPV=0.017512;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:117:103,14:37,5:66,9
+chr7	101035091	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.03525;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:15,6:10,4
+chr7	101636212	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:4,3:1,2
+chr7	101680995	.	GCA	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.01571;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:7,2:14,3
+chr7	102180904	.	TTATTTTATTTTATTG	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0041421;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:8,6:9,5
+chr7	102189365	.	C	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,2:4,1:1,1
+chr7	102497057	.	G	A	0	PASS	DP=177;GPV=1;SPV=0.013846;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:59,15:32,8:27,7
+chr7	102520792	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0098951;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:3,6:4,1
+chr7	102578254	.	C	T	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.01884;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:81,16:33,7:48,9
+chr7	102581314	.	C	T	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.014308;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:65,12:28,8:37,4
+chr7	102603623	.	T	C	0	PASS	DP=258;GPV=1;SPV=0.0050406;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:88,19:54,5:34,14
+chr7	102604828	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.018609;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:16,6:14,5
+chr7	102606201	.	AC	A	0	PASS	DP=270;GPV=1;SPV=0.029722;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:109,16:37,8:72,8
+chr7	102613305	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr7	102653761	.	G	A	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.014869;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:80,21:61,15:19,6
+chr7	102667770	.	C	T	0	PASS	DP=306;GPV=1;SPV=0.018833;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:124,20:83,9:41,11
+chr7	102679488	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0078687;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:2,2:6,5
+chr7	102737451	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.081933;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:17,2:7,2
+chr7	102779850	.	CTTT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:4,3:1,1
+chr7	102788030	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.001713;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,1:5,8
+chr7	104258838	.	C	CTTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0055336;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:1,1:3,3
+chr7	104507458	.	CAAGATGGATTA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0011962;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:6,1:2,6
+chr7	104565760	.	T	TA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.20161;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,2:12,2
+chr7	104841491	.	G	GGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0039969;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,8:2,3:3,5
+chr7	104947086	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.04366;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:1,4:6,1
+chr7	105731748	.	A	AAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:4,2:3,3
+chr7	105845204	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,4:2,2
+chr7	106375993	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,5:2,2
+chr7	106933413	.	CAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:4,3:3,1
+chr7	107112003	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.00082523;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,5:1,4:1,1
+chr7	108706816	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,4:3,1:3,3
+chr7	109368724	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:3,2:2,1:1,1
+chr7	109379377	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.689e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:10,6:7,7
+chr7	109663678	.	GATATATAGATATAGATATAGAT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0032938;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:0,3:4,3
+chr7	112058024	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,10:3,7:5,3
+chr7	113134236	.	AATAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0087276;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:8,4:3,5
+chr7	114043821	.	T	TTTTATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.02087;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,2:3,4
+chr7	115974451	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,4:1,2:4,2
+chr7	116706888	.	AT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0020691;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,5:3,2
+chr7	117817362	.	AT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0024902;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:0,7:3,1
+chr7	118363955	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.011586;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:6,4:5,1
+chr7	120561598	.	ATT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
+chr7	121047646	.	TTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
+chr7	121526189	.	G	GAGATATATATATATAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.00021109;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,7:1,6:1,1
+chr7	121691029	.	C	CAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0085986;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:1,4:2,1
+chr7	123443670	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=1.6458e-07;SS=2;SSC=67;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:4,12:2,5:2,7
+chr7	123581414	.	T	TAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:8,4:3,5
+chr7	123808418	.	C	CGT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0006886;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:9,17:5,8:4,9
+chr7	124387962	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0065088;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:5,10:4,2
+chr7	124414904	.	T	TCA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.014666;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:4,3:0,2
+chr7	124518625	.	GA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.012174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,8:3,6:3,2
+chr7	124564094	.	T	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=3.4344e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:12,4:10,6
+chr7	125478434	.	TA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.026469;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,5:5,2
+chr7	126218418	.	GTGTACACATATA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.032107;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:6,1:0,4
+chr7	126292042	.	G	GA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.030651;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,4:3,1
+chr7	127422451	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034545;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,6:6,4:4,2
+chr7	128131301	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011224;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:7,1:3,7
+chr7	130119538	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,2:1,1:1,1
+chr7	130759489	.	A	ATT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,8:2,4:2,4
+chr7	130920160	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023452;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:4,2:0,2
+chr7	131868548	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.028878;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:2,3:6,2
+chr7	132955173	.	G	GGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.15021;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:7,4:1,1
+chr7	135192108	.	GTTT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011437;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:9,2:3,4
+chr7	135236276	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038416;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,4:10,1
+chr7	135941380	.	A	ACAATGGGGAATGTCATATGCATTCCCCATTGTTG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045519;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,2:8,3
+chr7	136038520	.	G	GTA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:2,2:3,3
+chr7	136065677	.	A	AAAAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0020274;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:3,5:8,7
+chr7	136452567	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.029089;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,3:11,6
+chr7	136532076	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,1:7,3
+chr7	136760172	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027772;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
+chr7	136867784	.	C	CATAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:5,2:0,2
+chr7	136874525	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.00011908;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,10:0,3:0,7
+chr7	136987427	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0016883;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:4,1:10,5
+chr7	137056937	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0048364;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:9,4:3,2
+chr7	137310404	.	GT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,2:3,1:1,1
+chr7	137568378	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=3.8045e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:9,6:7,5
+chr7	138682968	.	C	CAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0014993;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:4,7:3,1
+chr7	140186261	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0082407;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:5,7:9,3
+chr7	142970475	.	C	CCACACA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.040449;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,4:6,1
+chr7	143045562	.	C	CAAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0027397;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,10:6,9:3,1
+chr7	143070681	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.050949;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:17,1:12,4
+chr7	143427579	.	ATTATTTAT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,5:4,2:10,3
+chr7	143886700	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:2,2:9,3
+chr7	144281139	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.03094;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,4:9,2
+chr7	145148983	.	AAAG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0025696;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,2:4,4
+chr7	146679347	.	C	CTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.01806;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:1,3:3,1
+chr7	146855807	.	GTATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0048821;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:2,9:1,6:1,3
+chr7	146855829	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:1,5:3,2
+chr7	148529630	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.027778;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:0,2:0,1:0,1
+chr7	148948385	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.038176;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:11,5:15,5
+chr7	148990009	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
+chr7	149323885	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,2:4,1:1,1
+chr7	149981276	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=6.5514e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:5,3:6,9
+chr7	150752761	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.027778;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:0,2:0,1:0,1
+chr7	150962627	.	C	CAGAG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00030073;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,13:3,3:3,10
+chr7	152238768	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.026034;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:6,1:13,8
+chr7	152283172	.	T	C	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0089913;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:25,4:21,2
+chr7	152378897	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.032315;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:11,3:8,4
+chr7	152382577	.	T	C	0	PASS	DP=260;GPV=1;SPV=0.0033915;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:109,26:84,19:25,7
+chr7	152544996	.	TA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037198;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:9,4:1,1
+chr7	154051071	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0057228;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
+chr7	154059029	.	G	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:4,6:7,3
+chr7	154817763	.	C	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.019985;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:5,5:4,5
+chr7	155158292	.	G	GAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,5:5,2:2,3
+chr7	155158307	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.073684;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,3:3,1:3,2
+chr7	155158310	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:1,2:5,2
+chr7	155520428	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:1,5:3,2
+chr7	155564150	.	AAAG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.023921;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,1:8,4
+chr7	155655534	.	C	CTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:4,5:2,1
+chr7	156352452	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.6248e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:10,7:5,3
+chr7	156489572	.	T	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:1,4:1,2
+chr7	157500116	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0031215;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:6,6:1,4:5,2
+chr8	82445	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:3,2:13,2
+chr8	320631	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00097095;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:18,6:9,6
+chr8	909568	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.023342;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:11,2:4,4
+chr8	1088941	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.011374;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:3,5:2,5
+chr8	1092551	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.5507e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:7,9:13,6
+chr8	1316402	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058443;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:10,1:8,4
+chr8	2367332	.	GA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.020191;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,3:7,7
+chr8	2787891	.	T	TCATTTTTACAATGAAGGGGATCTGAGTAATGTCCCC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:8,3:4,2
+chr8	3539763	.	T	TAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.041361;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,14:12,10:9,4
+chr8	3720623	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0095364;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:5,3:8,6
+chr8	6332561	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024163;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,3:5,4
+chr8	7407194	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.067367;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:11,4:5,2
+chr8	7407195	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.048755;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,4:6,2
+chr8	7407218	.	CT	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.005919;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:17,11:9,3
+chr8	8037533	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:18,3:5,1
+chr8	8072408	.	T	TTTC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:12,4:0,0
+chr8	8127826	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.042883;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:8,2:13,3
+chr8	8127981	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr8	8161332	.	C	A	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.013695;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:67,10:42,4:25,6
+chr8	8184705	.	C	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.029712;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:23,6:16,3
+chr8	8191363	.	G	A	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.033436;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:108,19:66,10:42,9
+chr8	8313737	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.034956;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,1:10,4
+chr8	8450684	.	TGA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.096964;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:9,4:20,1
+chr8	8450711	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.024853;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:14,5:14,3
+chr8	8581440	.	T	TA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.019537;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:10,5:12,6
+chr8	8701105	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.010406;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:6,7:9,4
+chr8	8887863	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13316;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,1:13,3
+chr8	8887867	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1396;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:14,1:10,4
+chr8	11533605	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,4:4,1:4,3
+chr8	12109141	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,4:8,4
+chr8	12211109	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0031674;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:13,4:6,7
+chr8	12433238	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.011071;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:4,3:3,8
+chr8	12470177	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0031923;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:10,4:12,9
+chr8	12480417	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,2:6,3
+chr8	12484897	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036585;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:12,5:11,4
+chr8	12501672	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.24713;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,2:16,2
+chr8	12511928	.	C	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.043162;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:49,7:26,1:23,6
+chr8	12532508	.	T	A	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.029122;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:60,16:50,11:10,5
+chr8	12540557	.	C	A	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.04744;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:84,16:46,10:38,6
+chr8	12545361	.	G	A	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.04919;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:97,21:48,10:49,11
+chr8	12548464	.	C	A	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.045745;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:110,21:52,15:58,6
+chr8	12559662	.	T	C	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.018008;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:85,21:48,11:37,10
+chr8	12560570	.	A	G	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.027097;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:70,12:33,5:37,7
+chr8	12578103	.	A	T	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.031901;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:99,19:49,11:50,8
+chr8	12584227	.	G	A	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.038707;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:97,21:52,14:45,7
+chr8	12584800	.	T	A	0	PASS	DP=219;GPV=1;SPV=0.017519;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:108,26:50,12:58,14
+chr8	12589388	.	C	T	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.038797;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:94,19:43,6:51,13
+chr8	12592376	.	C	T	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.034756;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:69,14:32,3:37,11
+chr8	12608132	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.20137;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:19,2:11,2
+chr8	13042708	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.064151;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:13,4:6,2
+chr8	13553224	.	ATATG	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,3:2,1:1,2
+chr8	13614857	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.11404;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,7:3,3:7,4
+chr8	14326030	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0050687;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:11,5:8,4
+chr8	15638515	.	CTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:3,3:4,1
+chr8	16414935	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,2:4,5
+chr8	16460759	.	TAGAAAA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10544;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:10,2:18,2
+chr8	16460780	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.068498;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,2:17,2
+chr8	16673028	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016081;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:9,4:12,3
+chr8	16708327	.	TAC	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.042684;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:16,4:13,4
+chr8	16776799	.	G	GCACACA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,1:5,3
+chr8	17054738	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:8,4:2,1
+chr8	17590236	.	C	CAAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,9:0,6:4,3
+chr8	17796289	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,2:3,3
+chr8	17968764	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.045061;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:10,4:15,1
+chr8	18968879	.	CAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.01192;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:4,5:1,1
+chr8	19102346	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
+chr8	20082331	.	C	CA	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.010836;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,3:1,2
+chr8	20318613	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=3.3009e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:25,21:11,17:14,4
+chr8	21182320	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0031524;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,11:9,7:1,4
+chr8	22759117	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00014072;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:12,6:11,7
+chr8	23631286	.	CATATATATATATATATATATATAT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,2:3,3
+chr8	24938125	.	G	GGAAAGAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080504;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,8:12,7:8,1
+chr8	25232260	.	G	GTTT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.24135;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:14,1:14,3
+chr8	25331803	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.33939;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:5,3:4,2:1,1
+chr8	25774803	.	T	TAC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0042363;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,15:2,9:3,6
+chr8	26069825	.	C	CTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,2:4,2
+chr8	27715861	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.11275;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,5:7,3:12,2
+chr8	27730488	.	A	ATTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.023736;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,10:1,6:2,4
+chr8	28085241	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0057147;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:7,7:6,9
+chr8	29371713	.	C	CATATATAT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.013985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,10:3,9:6,1
+chr8	31170775	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.016248;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:13,5:17,1
+chr8	31334164	.	C	CT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.030474;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,7:6,2
+chr8	34256937	.	C	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:1,2:0,0:1,2
+chr8	34824883	.	TC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.028586;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,12:11,8:9,4
+chr8	35043583	.	T	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.22404;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,3:11,1
+chr8	35090325	.	A	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.7643e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:13,5:12,10
+chr8	35615034	.	G	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.060606;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,3:0,2:2,1
+chr8	35615036	.	G	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,2:0,1:2,1
+chr8	38028359	.	A	AT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.017327;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:5,5:10,4
+chr8	40881282	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00081203;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:12,20:5,9:7,11
+chr8	41140138	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,3:10,1
+chr8	41803137	.	A	AG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.093821;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:12,5:9,2
+chr8	42070064	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,5:4,4:4,1
+chr8	43299183	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0082367;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:9,7:11,1
+chr8	47537201	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=2.1107e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:10,10:12,5
+chr8	48254061	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.7719e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:7,6:9,7
+chr8	49207715	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013888;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:12,8:3,1
+chr8	49207716	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.029089;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:14,8:4,1
+chr8	49938598	.	T	TTTC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.10204;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:11,5:24,2
+chr8	49938611	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.31172;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:13,1:20,3
+chr8	51074748	.	TC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.041509;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:7,6:10,7
+chr8	51957232	.	A	AGT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.034767;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,8:9,7:4,1
+chr8	52643697	.	A	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,2:2,1:4,1
+chr8	53563137	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=2.5231e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:8,7:9,6
+chr8	54002468	.	C	CA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.012179;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,13:16,9:5,4
+chr8	54110344	.	T	TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGG	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10482;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:23,3:16,1:7,2
+chr8	54347624	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00074957;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:17,5:10,4
+chr8	54661310	.	T	TCA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.1208;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:21,2:11,2
+chr8	57052018	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.014803;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:17,3:15,6
+chr8	57206208	.	G	A	0	PASS	DP=683;GPV=1;SPV=0.021319;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:389:342,47:105,20:237,27
+chr8	57361008	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0002055;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:13,6:9,6
+chr8	58189295	.	A	ATT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,3:3,2
+chr8	60419394	.	C	CTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.038233;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:11,6:1,1
+chr8	60868355	.	TTG	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.037817;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:20,2:11,4
+chr8	61268844	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:6,2:12,2
+chr8	62031560	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=4.1304e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:20,22:6,10:14,12
+chr8	62102904	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.26692;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,3:9,1
+chr8	62345374	.	CAT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,6:1,3:3,3
+chr8	62506476	.	C	CTTTCTTTCTTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,4:6,3:10,1
+chr8	62595382	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.17001;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,6:13,5:4,1
+chr8	63271871	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0037321;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,3:6,6
+chr8	63370298	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=3.9131e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,3:8,8
+chr8	63835824	.	GA	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.020485;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:18,3:8,5
+chr8	64044695	.	A	AAAAGAAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.27607;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,4:15,4:1,0
+chr8	64244709	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.064462;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:19,1:9,3
+chr8	64353844	.	C	CATAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:6,2:2,2
+chr8	64448512	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0014939;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:13,4:9,6
+chr8	64940741	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.3665e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:9,5:14,8
+chr8	64987657	.	GC	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011528;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,3:5,4
+chr8	65520675	.	G	GTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:9,2:5,2
+chr8	66042597	.	CTCT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0063768;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:2,1:4,7
+chr8	66669119	.	TTG	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0085545;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:4,6:6,3
+chr8	67468626	.	T	TAA	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.064086;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:24,2:14,3
+chr8	68164585	.	C	CTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00048402;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,12:8,10:4,2
+chr8	68754470	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0097212;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:18,5:15,8
+chr8	71769341	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,2:13,2
+chr8	72299643	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.16587;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,5:7,4:4,1
+chr8	72491880	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.033794;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:8,4:0,1
+chr8	72920437	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:7,2:9,2
+chr8	73479472	.	G	GCACACACACACACA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:7,1:12,3
+chr8	73637520	.	G	GA	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,6:1,5:1,1
+chr8	73715467	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10733;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:10,6:4,2:6,4
+chr8	73948192	.	C	CA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.011503;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,15:18,8:10,7
+chr8	75626547	.	C	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.088975;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:24,3:10,2
+chr8	75736176	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00032719;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:12,12:16,5
+chr8	78349627	.	C	CATAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:4,2:4,2
+chr8	78669967	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03895;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:5,7:11,2
+chr8	78687702	.	TTA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14763;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,2:9,2
+chr8	80545556	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.092234;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:5,4:4,2
+chr8	81874625	.	A	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.049588;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:15,5:7,3
+chr8	82014490	.	CGT	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0014483;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:27,22:11,9:16,13
+chr8	82551753	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020486;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,2:6,4
+chr8	83145260	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:6,9:3,7:3,2
+chr8	85043384	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,1:6,3
+chr8	85144402	.	ATGTGTGTGTG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,2:6,2
+chr8	85647304	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:25,4:0,0
+chr8	85653372	.	A	T	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.047615;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:176:158,18:78,7:80,11
+chr8	85805041	.	G	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.011546;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:39,14:7,3:32,11
+chr8	86799977	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00022484;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:14,3:8,10
+chr8	88701671	.	C	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.1982;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:19,3:9,1:10,2
+chr8	89552310	.	TTTTTA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.02678;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:9,6:16,6
+chr8	89836577	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0092864;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:13,7:3,3:10,4
+chr8	91576225	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0016044;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:9,4:13,5
+chr8	92496832	.	C	CTATATATATATATATATATA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:2,3:0,1
+chr8	92704790	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.01467;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:12,2:12,4
+chr8	94060351	.	C	CT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.018659;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,14:11,11:12,3
+chr8	94664120	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,2:6,2
+chr8	96216225	.	TGAGAGAGAGAGAGA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.019231;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,9:2,3:1,6
+chr8	96651281	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=1.9551e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:11,5:10,8
+chr8	97001721	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:8,3:3,2
+chr8	97123023	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,3:9,1
+chr8	97782279	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,5:2,4:4,1
+chr8	98306340	.	TG	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0018313;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:11,6:13,2
+chr8	98306342	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0006486;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:10,7:9,2
+chr8	98731722	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.01905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,6:5,2
+chr8	99029062	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0013028;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,15:9,12:6,3
+chr8	99391587	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.8221e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:10,7:11,8
+chr8	99693010	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.048707;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,2:11,2
+chr8	99906834	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00034333;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,15:8,8:7,7
+chr8	100453390	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,4:3,1
+chr8	100799021	.	GGTTCTGGA	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00038629;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:9,3:14,9
+chr8	100799032	.	ATGAGTT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00017105;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:7,2:9,9
+chr8	100799042	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.2423e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:5,3:10,9
+chr8	100799043	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.3992e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:5,3:12,8
+chr8	101092767	.	C	CCTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.035315;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,10:3,1:12,9
+chr8	101350381	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00011331;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:13,8:13,8
+chr8	101350382	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00022241;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:14,6:13,9
+chr8	101435075	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.029233;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:11,3:18,3
+chr8	101592100	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:3,7:0,1
+chr8	104730453	.	T	TGAGAGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,5:3,2:5,3
+chr8	104820449	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,6:12,5:3,1
+chr8	106607793	.	CTTTCTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1182;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:11,3:9,3
+chr8	107370340	.	A	AAG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:1,4:1,3:0,1
+chr8	108921397	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.20218;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:7,2:17,2
+chr8	109828580	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=4.6321e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:8,10:9,5
+chr8	109901978	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.01619;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:13,5:20,4
+chr8	110283401	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0044741;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:3,2:11,3
+chr8	111126098	.	TCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,2:1,1:2,1
+chr8	112410676	.	G	GTA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10365;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:9,3:9,2
+chr8	112697054	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0007924;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:8,10:7,4
+chr8	113683904	.	C	CAAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.013906;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:7,8:6,3
+chr8	114237562	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.043486;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,5:8,4:12,1
+chr8	115900857	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,2:0,0:4,2
+chr8	116365598	.	GAGAAAGAAAGAA	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:16,3:0,1
+chr8	116448122	.	TTG	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.021522;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:8,7:14,5
+chr8	117221960	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.032384;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:15,2:12,2
+chr8	117221961	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.037595;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:17,2:12,2
+chr8	117565353	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=3.7597e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:29,16:15,6:14,10
+chr8	118880173	.	TTTTGG	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0071887;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:15,4:9,2
+chr8	120735001	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.418e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:10,8:7,7
+chr8	120910420	.	CAAA	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,2:7,2
+chr8	121157153	.	CA	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.035018;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:12,7:21,3
+chr8	122591841	.	TATC	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.11412;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:19,3:16,1
+chr8	122633191	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.003361;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:16,5:12,4
+chr8	122959716	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00094257;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:11,8:16,6
+chr8	123412602	.	A	AT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0077776;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:8,4:14,4
+chr8	123918684	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0032051;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:7,13:3,2
+chr8	124302728	.	TTC	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.01289;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,4:11,1
+chr8	124916973	.	TC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.35142;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:9,1:22,3
+chr8	125349584	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:1,2:0,1:1,1
+chr8	126143332	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:8,3:8,1
+chr8	127175345	.	TA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:20,2:8,2
+chr8	127175347	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.089909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:18,2:11,2
+chr8	129304758	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:36:0,3:0,1:0,2
+chr8	130573544	.	ATCTCTCTCTC	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:5,1:13,3
+chr8	130801899	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0061246;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,9:2,5:4,4
+chr8	131216346	.	T	TATAC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0071396;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,7:4,6:3,1
+chr8	131377543	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.05558;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:15,2:14,3
+chr8	131639936	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,1:10,3
+chr8	132542395	.	C	CAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.026907;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:10,7:2,1
+chr8	132549534	.	GA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14763;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,3:9,1
+chr8	133214049	.	TAG	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.029399;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:29,12:11,5:18,7
+chr8	134243262	.	AAG	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:5,3:2,2
+chr8	135536997	.	AGG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.32353;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:2,3:7,2
+chr8	135691995	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,4:11,2:6,2
+chr8	136228066	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:6,3:1,1:5,2
+chr8	136781865	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047988;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:15,3:6,2
+chr8	136991676	.	CTATA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,4:4,1
+chr8	137234263	.	CTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:6,3:0,1
+chr8	137351941	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.548e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:12,10:7,8
+chr8	138488114	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00012009;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:13,6:13,8
+chr8	138692238	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:0,1:5,3
+chr8	139390447	.	A	AAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:5,3:3,2
+chr8	139947894	.	G	GTGTGTATATATATATATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:3,1:7,3
+chr8	141955871	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,4:13,2:6,2
+chr8	142017388	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,4:9,2:10,2
+chr8	142184794	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.10478;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:16,3:20,3
+chr8	142509099	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=3.791e-08;SS=2;SSC=74;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:24,21:13,12:11,9
+chr8	142857811	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.014457;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:8,10:14,3
+chr8	143054303	.	C	CA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:7,3:1,1
+chr8	143307170	.	C	CAGAGA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,4:7,2:9,2
+chr8	143492777	.	G	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.097509;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:6,2:13,3
+chr8	143981349	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.02087;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,6:0,3:6,3
+chr8	144558818	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0036228;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:10,8:6,1
+chr8	144769254	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.50909;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,2:5,1:1,1
+chr9	17614	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.064412;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:16,1:9,7
+chr9	135690	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:6,4:4,1
+chr9	150120	.	TG	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.23366;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:4,2:5,3
+chr9	610712	.	G	C	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=3.3767e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:11,7:15,7
+chr9	631009	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=2.3898e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:10,7:5,7
+chr9	883627	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,2:7,2
+chr9	1006623	.	C	CT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0047817;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,9:7,3:8,6
+chr9	1475189	.	A	ATTTATTTATTTATTTATTATTTATTTATTTTT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.058083;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,7:10,4:18,3
+chr9	2492304	.	C	CAAAATAAAATAAAATAAAAT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.050318;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:10,3:16,3
+chr9	3414735	.	T	TGA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.040297;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:12,4:14,4
+chr9	3499438	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0014416;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:16,7:14,6
+chr9	4867760	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=3.0166e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:4,6:10,8
+chr9	6627295	.	CAA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.045968;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,6:12,4:4,2
+chr9	8279044	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00058098;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:32,18:13,11:19,7
+chr9	8678373	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00091926;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:10,5:10,3
+chr9	9398814	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0033001;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,18:15,6:13,12
+chr9	9533471	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=8.3077e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:18,8:10,7
+chr9	10479652	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048435;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,7:13,4:9,3
+chr9	10654810	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.22398;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:10,2:3,2
+chr9	11277229	.	C	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=2.5613e-07;SS=2;SSC=65;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:28,20:15,11:13,9
+chr9	12477748	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.19313;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:12,1:17,3
+chr9	12644557	.	AT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.083817;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,3:14,1
+chr9	12888967	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00018187;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:16,5:13,7
+chr9	13245425	.	AAG	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.11371;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:10,2:18,2
+chr9	14099964	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0048945;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:19,8:17,3
+chr9	15420424	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:3,5:2,3:1,2
+chr9	15490682	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:8,8:3,1
+chr9	15565387	.	T	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=7.6915e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:17,11:11,3
+chr9	15847796	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00065457;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:16,4:12,7
+chr9	16780235	.	C	CAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,10:6,9:2,1
+chr9	17035051	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
+chr9	17554265	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:2,3:1,3
+chr9	18249138	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00058845;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:10,4:17,9
+chr9	19642986	.	CTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0046784;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,10:3,8:3,2
+chr9	19690937	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.1773;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,5:23,4:20,1
+chr9	19823297	.	TTG	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0026316;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:6,16:4,9:2,7
+chr9	20778089	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021122;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,6:6,2
+chr9	20839206	.	ATAAGGTT	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.074614;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:19,1:7,3
+chr9	21070864	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.031062;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:11,2:11,3
+chr9	23136393	.	G	GTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:6,1:2,3
+chr9	25239131	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0010863;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:8,6:11,3
+chr9	25786660	.	GTATATATGTGTGTA	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:3,4:2,5
+chr9	25786672	.	GTA	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0079365;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,4:0,3:0,1
+chr9	25788984	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:34:0,2:0,0:0,2
+chr9	26376144	.	AAATAAT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0044832;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:11,5:13,5
+chr9	28285398	.	A	AT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:6,5:3,7
+chr9	28509694	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.023333;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:15,4:8,2
+chr9	29476648	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.092709;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:16,2:16,2
+chr9	29935284	.	C	CTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,7:0,6:2,1
+chr9	32450961	.	T	TATCA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.01362;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:6,4:10,8
+chr9	33895768	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:2,6:1,2:1,4
+chr9	34210733	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.10313;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:5,2:20,2
+chr9	34756282	.	AG	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.026993;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:6,1:9,8
+chr9	35767283	.	G	GT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.024499;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,8:3,5:3,3
+chr9	36311553	.	CTTTCT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:6,6:7,4
+chr9	37074509	.	C	CAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:6,3:6,1
+chr9	38719064	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00078693;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:9,8:13,7
+chr9	38802021	.	AT	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.033452;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:19,4:12,7
+chr9	38822788	.	A	AAATATAT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.027634;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,10:2,6:0,4
+chr9	38889913	.	A	AGTGT	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.024807;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:17,9:9,4:8,5
+chr9	38899476	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.070703;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:17,2:12,4
+chr9	38979322	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.092902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:1,1:24,4
+chr9	39013532	.	TCTTGG	T	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.022332;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:55,18:23,4:32,14
+chr9	39556183	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,3:13,1
+chr9	39606028	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.05999;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:19,5:11,1
+chr9	40107877	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.12189;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:8,2:12,3
+chr9	40345499	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0096036;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:10,9:3,3
+chr9	40388287	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0092175;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:7,7:9,6
+chr9	40565850	.	C	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:1,1:2,5
+chr9	40705936	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0366;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:14,2:14,5
+chr9	40721859	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.028729;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:19,4:16,4
+chr9	40932869	.	AAAAAAAAAAAAAACAAAAC	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:4,4:1,2
+chr9	40948837	.	C	T	0	PASS	DP=190;GPV=1;SPV=0.0032124;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:83,24:45,13:38,11
+chr9	40956565	.	G	A	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.007587;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:77,9:32,1:45,8
+chr9	40996359	.	C	G	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.014283;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:175:151,24:53,7:98,17
+chr9	41057672	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:15,1:6,3
+chr9	41140582	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.011208;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:6,3:7,5
+chr9	41249409	.	G	GAA	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0044113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,12:16,7:14,5
+chr9	41296023	.	G	A	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.041703;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:71,9:26,4:45,5
+chr9	41299045	.	A	C	0	PASS	DP=196;GPV=1;SPV=0.04204;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:88,18:39,3:49,15
+chr9	41374611	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.047669;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:16,1:13,7
+chr9	41442897	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.043132;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:11,3:15,1
+chr9	41654836	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.039649;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:15,3:9,7
+chr9	41781351	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.045726;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:9,1:16,6
+chr9	41805818	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.029433;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,4:1,0
+chr9	41931650	.	T	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.016221;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:41,19:26,9:15,10
+chr9	42395473	.	C	G	0	PASS	DP=125;GPV=1;SPV=0.040321;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:53,10:29,2:24,8
+chr9	42401563	.	C	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.03885;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:15,2:29,11
+chr9	42402845	.	C	A	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.039337;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:55,17:34,15:21,2
+chr9	42405150	.	A	AC	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.021276;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:48,15:20,9:28,6
+chr9	42439163	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.012793;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:11,5:16,4
+chr9	42853307	.	C	CTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,6:3,3:2,3
+chr9	43001066	.	A	G	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.021814;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:110,25:68,16:42,9
+chr9	43036676	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.046772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:17,3:12,2
+chr9	43757652	.	A	T	0	PASS	DP=255;GPV=1;SPV=0.0050999;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:129,32:41,16:88,16
+chr9	44100356	.	A	G	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.0021853;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:69,23:17,5:52,18
+chr9	44146623	.	G	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:15,4:0,0
+chr9	44629853	.	A	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:0,0:12,4
+chr9	44695983	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr9	44945238	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:2,1:5,5
+chr9	45075668	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.090639;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:34,4:0,0
+chr9	45188123	.	C	G	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.025746;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:77,12:70,8:7,4
+chr9	61214167	.	A	G	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.033582;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:21,5:17,3
+chr9	61562470	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.031046;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,3:8,2
+chr9	61562505	.	G	GAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0019167;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:9,9:4,2
+chr9	61793845	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,2:4,3
+chr9	61814971	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.011236;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:3,4:13,6
+chr9	62717344	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:4,6:3,1
+chr9	62814849	.	G	T	0	PASS	DP=240;GPV=1;SPV=0.014437;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:96,20:45,9:51,11
+chr9	62822122	.	TAC	T	0	PASS	DP=169;GPV=1;SPV=0.014311;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:85,10:34,6:51,4
+chr9	62833027	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00079103;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:11,7:0,1
+chr9	62833039	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.021122;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:11,6:1,1
+chr9	62848844	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.062847;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:19,5:10,1
+chr9	62848863	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.041933;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:12,5:9,1
+chr9	62866765	.	CTACT	C	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.034526;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:96,16:54,12:42,4
+chr9	62884140	.	A	G	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.0031077;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:50,17:30,10:20,7
+chr9	62923168	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,3:6,3
+chr9	62925388	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
+chr9	63433982	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.15567;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:20,1:13,3
+chr9	63646962	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.071233;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:22,2:14,2
+chr9	63710394	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.039935;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:20,5:23,1
+chr9	63710417	.	GAA	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.013018;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:17,5:14,2
+chr9	63719863	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.067749;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:30,4:16,2
+chr9	63737243	.	C	G	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.014912;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:53,14:30,8:23,6
+chr9	63764708	.	G	T	0	PASS	DP=268;GPV=1;SPV=0.044983;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:120,18:65,11:55,7
+chr9	63796180	.	C	G	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.026718;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:101,20:66,17:35,3
+chr9	63868747	.	G	A	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.049948;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:71,15:25,7:46,8
+chr9	63888826	.	AT	A	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.0092268;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:50,14:25,9:25,5
+chr9	63888832	.	AT	A	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.030182;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:43,14:22,9:21,5
+chr9	63996274	.	T	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.042222;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:44,12:20,6:24,6
+chr9	64079341	.	TA	T	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.024638;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:28,8:16,6
+chr9	64416952	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.018733;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:10,5:2,4
+chr9	64724762	.	CGATGAGATGAAATGAAAG	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.045506;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:18,3:13,1
+chr9	65577304	.	A	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.022644;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:20,2:22,4
+chr9	65657817	.	G	A	0	PASS	DP=176;GPV=1;SPV=0.0021668;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:89,24:56,13:33,11
+chr9	65661656	.	T	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.017969;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:24,4:12,7
+chr9	65705007	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.033332;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:16,6:14,1
+chr9	65705611	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,1:8,3
+chr9	65705808	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,1:7,3
+chr9	65711220	.	C	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.041933;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:9,1:12,5
+chr9	65718033	.	G	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0031863;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:8,3:7,4
+chr9	65727083	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0013435;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:11,7:10,2
+chr9	65737116	.	A	G	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.00071876;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:51,18:28,12:23,6
+chr9	65737280	.	G	A	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.0016525;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:84,19:40,5:44,14
+chr9	65938797	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016673;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:8,5:6,1
+chr9	66013526	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,2:11,2
+chr9	66030237	.	C	CT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.039894;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,5:5,3:23,2
+chr9	66036762	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.046334;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:9,1:16,5
+chr9	66066173	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:0,1:12,5
+chr9	66182996	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03942;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,5:10,3
+chr9	66701874	.	T	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.081109;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:14,4:29,1
+chr9	66736184	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,1:9,3
+chr9	66784006	.	TTTTCA	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.043181;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,11:29,6:19,5
+chr9	66972569	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,3:10,1
+chr9	67016723	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.13115;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:9,4:14,1
+chr9	67052196	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.046295;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:10,4:4,5
+chr9	67093077	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,3:9,1
+chr9	67718107	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.041156;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:10,2:14,5
+chr9	67768365	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:2,9:7,3
+chr9	67795173	.	A	G	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.011526;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:59,12:52,10:7,2
+chr9	67795720	.	C	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.019038;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:57,9:30,2:27,7
+chr9	67799872	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:13,4:0,0
+chr9	67834210	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0059543;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:9,4:1,2
+chr9	67908450	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.031136;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:11,1:18,4
+chr9	68228213	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.054928;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:4,3:17,1
+chr9	68229021	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0219;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,4:4,3
+chr9	68251080	.	TAA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0032306;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,11:4,7:1,4
+chr9	68327930	.	A	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,0:10,4
+chr9	68340716	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.077337;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:16,2:15,2
+chr9	71421732	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0010255;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:14,6:11,4
+chr9	71504898	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.029196;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:19,1:16,4
+chr9	71896705	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10123;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,3:13,1
+chr9	72009559	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:6,3:6,1
+chr9	73341705	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=8.4162e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:9,7:12,4
+chr9	73515622	.	A	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=5.9884e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:31,19:15,9:16,10
+chr9	74045713	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.47009;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,3:15,2:4,1
+chr9	74346766	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.06964;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:8,3:17,1
+chr9	75534913	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.025116;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,8:6,1
+chr9	76246341	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.03285;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:6,5:5,1
+chr9	76670533	.	ACTGGGTGGAGCC	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00019486;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:7,8:18,6
+chr9	76991341	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:2,5:7,3
+chr9	77828982	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00031429;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:14,9:8,2
+chr9	78299496	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,7:3,1
+chr9	78445867	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,4:3,2
+chr9	78873962	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.15137;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:26,1:8,3
+chr9	79100925	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00010916;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:7,5:13,10
+chr9	79855857	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:8,5:6,1
+chr9	80543668	.	T	TG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:3,5:4,4
+chr9	80635888	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0037889;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,22:5,14:8,8
+chr9	81711106	.	C	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.03707;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:5,5:13,2
+chr9	82017416	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,5:5,4:5,1
+chr9	82069960	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,7:2,1
+chr9	82245858	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00056109;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:12,6:12,5
+chr9	82426748	.	T	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.012882;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,7:5,1:4,6
+chr9	82850318	.	G	GA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:0,4:0,4:0,0
+chr9	83144395	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.082705;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:19,3:9,2
+chr9	83207598	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.031734;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:4,4:1,2
+chr9	83283546	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:3,5:1,4:2,1
+chr9	84079103	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14555;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:15,2:10,2
+chr9	84833223	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00042668;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,18:7,12:3,6
+chr9	85504896	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,4:5,1
+chr9	86039133	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0012814;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:15,7:13,2
+chr9	86535101	.	TCTTCCCTTCCCTTCC	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.011783;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:3,1:6,4
+chr9	87097720	.	T	TC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.22547;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:14,3:9,2
+chr9	87260584	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.011976;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,8:6,7:6,1
+chr9	87435688	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=7.7888e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:11,6:15,9
+chr9	87684571	.	C	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=2.7845e-08;SS=2;SSC=75;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:32,32:16,14:16,18
+chr9	87853662	.	A	AGATCCTATAG	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.044481;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:10,3:12,7
+chr9	88493746	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016238;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,7:10,6:4,1
+chr9	88935927	.	AATATATATAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:6,10:4,7:2,3
+chr9	89205267	.	G	GCA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11404;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:7,4:3,1
+chr9	89450665	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,3:3,2:1,1
+chr9	89707561	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.009628;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,10:4,1:6,9
+chr9	89749664	.	G	GCACA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.037551;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:16,3:8,2
+chr9	90324141	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0077399;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,9:0,8:4,1
+chr9	90418116	.	AC	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0038805;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:4,2:11,4
+chr9	91147616	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,5:2,1:5,4
+chr9	91786928	.	G	GA	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.8667e-06;SS=2;SSC=54;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:10,5:13,12
+chr9	92033194	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=1.57e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:12,5:6,8
+chr9	92201546	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0038917;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:5,3:2,6
+chr9	93828680	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00087744;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:15,1:8,8
+chr9	95304749	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.07313;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,4:8,1
+chr9	95740046	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.1631e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:9,10:15,8
+chr9	97330066	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:5,7:9,1
+chr9	97990814	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,2:5,2
+chr9	98392958	.	C	CA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.02607;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,4:1,0:10,4
+chr9	98579949	.	G	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00037569;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:15,2:13,8
+chr9	98648116	.	T	TGTGTGTGTGTGTGTATAG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,6:4,2:0,4
+chr9	99360131	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.037081;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:11,4:15,1
+chr9	101075382	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=2.7776e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:14,7:9,7
+chr9	101477235	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.040965;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:16,4:9,1
+chr9	101573773	.	AT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:4,4:6,3
+chr9	101866531	.	GTT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:9,4:5,2
+chr9	101900231	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00011455;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:17,10:9,3
+chr9	102220760	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15275;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:9,3:10,2
+chr9	102220778	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15275;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:8,3:11,2
+chr9	103532079	.	CAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,7:2,5:1,2
+chr9	104575448	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0019214;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:13,6:10,5
+chr9	104633168	.	CT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:1,3:0,1
+chr9	105162032	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.015843;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:4,3:5,3
+chr9	107242343	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,4:8,3:2,1
+chr9	107346304	.	G	GTC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0033467;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:8,6:6,2
+chr9	107561912	.	CTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:6,2:9,2
+chr9	108247879	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.20253;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:15,1:7,3
+chr9	108280182	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0033714;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:16,7:10,3
+chr9	108466081	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:14,3:7,1
+chr9	108867211	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.026941;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:16,5:6,1
+chr9	109041453	.	A	ATT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.091388;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,5:7,1
+chr9	110058902	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:16,3:14,2
+chr9	110422900	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0094953;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:3,7:4,1
+chr9	110981784	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.013828;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:10,3:18,6
+chr9	111210068	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=2.7821e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:12,6:14,9
+chr9	111641635	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.046847;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,2:4,4
+chr9	111907628	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,4:13,3:8,1
+chr9	111943556	.	C	CTTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,5:0,3:2,2
+chr9	112017294	.	CA	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.18741;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:24,3:12,1
+chr9	112017298	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.05;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:0,3:0,2:0,1
+chr9	112277931	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01027;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:7,5:6,5
+chr9	112340893	.	TA	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.20119;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,5:20,1:22,4
+chr9	112784205	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.02651;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:11,4:16,3
+chr9	112784207	.	CCTAGGT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:13,2:15,2
+chr9	113062716	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12395;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:16,1:10,4
+chr9	115437923	.	A	AACACACACACAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01726;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,12:5,8:6,4
+chr9	115818885	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.056683;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:15,1:13,4
+chr9	116816896	.	A	AAAATAAATAAATAAAT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0036482;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:6,9:3,4:3,5
+chr9	116839857	.	T	TA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.059705;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:5,1:16,3
+chr9	116925869	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.051196;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:13,4:21,2
+chr9	117997237	.	T	TTCCTCC	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.036744;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,7:9,5:12,2
+chr9	118333571	.	TGAC	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.22942;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:29,4:17,1:12,3
+chr9	118707387	.	T	TTCTCTTTCTTTCTTTGTTGCTTTC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:8,1:7,3
+chr9	119021985	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.4732e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:5,10:13,6
+chr9	120781679	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.035079;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:16,3:14,3
+chr9	121493284	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0002735;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:12,9:7,7
+chr9	123248261	.	G	GT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.034921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:7,2:2,2
+chr9	123917179	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.009659;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:15,3:13,4
+chr9	124779546	.	GT	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.093588;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,1:10,3
+chr9	124784943	.	GTTTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,4:11,2:5,2
+chr9	126626846	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00014726;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:16,6:10,6
+chr9	127552684	.	G	GTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,3:3,1
+chr9	128528003	.	C	CT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:1,1:4,1
+chr9	129262777	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=2.6013e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:7,3:7,7
+chr9	129442360	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.001409;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,10:7,7:3,3
+chr9	130310435	.	C	G	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.025523;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:22,3:22,3
+chr9	130550336	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,8:4,1
+chr9	130603369	.	C	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12981;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:5,3:6,2
+chr9	130819853	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018157;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,13:8,6:8,7
+chr9	131303479	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0067406;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:14,4:7,4
+chr9	131426337	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,7:2,6:2,1
+chr9	132302681	.	CAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,2:5,2
+chr9	132313931	.	T	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.05832;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:23,6:9,3:14,3
+chr9	132953176	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.052823;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,2:14,2
+chr9	134093564	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.17768;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:12,3:17,1
+chr9	134104174	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:1,2:3,4
+chr9	134527759	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.032805;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:5,9:6,1
+chr9	134685055	.	A	AT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048943;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,3:5,2:4,1
+chr9	134685504	.	CCAT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,1:7,3
+chr9	135860597	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024017;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,11:6,8:2,3
+chr9	136248222	.	C	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.00018501;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:18,10:17,5
+chr9	136293425	.	T	TCACA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.025685;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,9:9,6:5,3
+chr9	136636348	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=6.7038e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:4,4:7,5
+chr9	136960671	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr9	137103150	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.031156;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:8,1:12,3
+chr9	137780384	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.19298;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:9,3:5,1:4,2
+chr9	138141015	.	C	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.0044922;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:45,17:26,13:19,4
+chr9	138182033	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.048964;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:22,1:22,5
+chrX	2932406	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
+chrX	3315355	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
+chrX	3615011	.	A	ATT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,8:8,7:4,1
+chrX	3653858	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027709;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:8,3:11,2
+chrX	3681657	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,1:7,3
+chrX	3830389	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047431;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,1:2,3
+chrX	4067356	.	CTTTCT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.067669;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:2,1:6,3
+chrX	4207330	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.063158;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,3:3,2:3,1
+chrX	4465393	.	AAAAG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0067873;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,8:2,5:1,3
+chrX	4852269	.	TA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.02027;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,2:6,5
+chrX	5011194	.	T	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,4:4,1:8,3
+chrX	5941180	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11538;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:5,2:1,4
+chrX	6082951	.	TTTTTC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,1:8,3
+chrX	8511868	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.069853;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,5:10,4:7,1
+chrX	9089555	.	G	GGA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,6:4,3:6,3
+chrX	9523960	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:6,1:6,3
+chrX	9883121	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.020485;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:16,6:10,2
+chrX	10565003	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:4,4:1,1:3,3
+chrX	12776962	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=3.4552e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:31,15:20,9:11,6
+chrX	13610765	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0010241;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:10,7:21,4
+chrX	14861346	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=1.7807e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:11,7:9,8
+chrX	15180071	.	T	TACACACACACAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020164;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:9,5:5,5
+chrX	15268331	.	C	CA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.3882;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:8,3:27,1
+chrX	15776338	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.023323;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,11:13,9:1,2
+chrX	19106661	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.6849e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:13,5:8,10
+chrX	19522002	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:3,5:7,3
+chrX	19774648	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.16591;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,4:16,1:8,3
+chrX	19838902	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0050177;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:10,2:7,6
+chrX	21950433	.	CTTT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.034961;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,13:14,6:4,7
+chrX	24047682	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=2.7628e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:11,3:15,11
+chrX	24452724	.	GGAGGGAGATGCCAGAGTCTTTTTCACAAC	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.048897;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:9,3:15,7
+chrX	25610112	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0014541;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:5,3:19,7
+chrX	26320078	.	CG	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01236;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:11,4:2,6
+chrX	26320081	.	G	GAT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0069862;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:10,4:2,6
+chrX	26919912	.	T	TTATATA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,8:1,6:2,2
+chrX	29837300	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017591;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,4:4,3
+chrX	30223696	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00046753;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:14,9:11,2
+chrX	30553137	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0019129;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:8,4:20,5
+chrX	30553139	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016217;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:11,2:21,4
+chrX	30713440	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00017018;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:12,3:6,6
+chrX	31022361	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0029833;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:15,4:11,5
+chrX	31226184	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=8.8502e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:11,10:14,9
+chrX	31370098	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.00096843;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,11:2,9:2,2
+chrX	31716551	.	C	CAACAAAACAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00059181;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:8,7:8,5
+chrX	32252877	.	AAAATATATAT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:4,4:2,3
+chrX	32922208	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00012796;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:6,6:20,5
+chrX	33026313	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:5,5:5,1
+chrX	33095964	.	AT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,7:6,3:2,4
+chrX	33106053	.	AC	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.1099;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:25,4:21,2
+chrX	33130739	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0011799;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:13,4:17,6
+chrX	33428810	.	A	AAT	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0020896;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,15:8,5:14,10
+chrX	33921674	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0040088;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:16,8:12,3
+chrX	34144127	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:2,4:5,2
+chrX	34400870	.	G	GA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.012303;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,12:11,8:6,4
+chrX	35521982	.	TATAG	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00044065;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:8,9:8,6
+chrX	36560921	.	TTTCC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.011224;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,8:6,1:4,7
+chrX	36584400	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:6,1:6,3
+chrX	36591613	.	T	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=4.361e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:32,16:24,11:8,5
+chrX	36965370	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0016717;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:16,7:15,4
+chrX	40088412	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.1254e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:6,12:12,6
+chrX	41792237	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.014208;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:9,4:17,3
+chrX	42959423	.	CTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.026636;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:6,5:0,1
+chrX	43307955	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10147;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:15,3:7,4
+chrX	43423737	.	AC	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012445;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:5,8:7,2
+chrX	45334779	.	AAATAT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,2:6,2
+chrX	45334812	.	AAATAT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,3:7,3
+chrX	46395714	.	C	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,1:0,3
+chrX	46827562	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:4,3:5,1
+chrX	47358091	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10365;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:9,4:9,1
+chrX	50563508	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.013669;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:7,2:7,3
+chrX	52009631	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0010644;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:13,3:12,6
+chrX	52424863	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0036826;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:11,7:13,3
+chrX	53012726	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.9762e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:12,7:6,8
+chrX	54708493	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0014601;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:19,9:11,2
+chrX	55573678	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00030714;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:12,8:14,4
+chrX	55864281	.	TA	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,8:3,7:1,1
+chrX	60212167	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:19,4:0,0
+chrX	63743217	.	C	CA	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.060731;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:20,1:14,3
+chrX	66337731	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,3:7,1
+chrX	66589078	.	TTG	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,1:7,4
+chrX	68317559	.	GAA	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.062683;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:13,2:3,3
+chrX	68383654	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0013497;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:4,4:9,6
+chrX	68452429	.	ATG	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:1,3:10,1
+chrX	68661970	.	CTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.041254;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:1,1:17,5
+chrX	70273422	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0016408;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:11,5:14,4
+chrX	70296083	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.036419;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,3:5,2
+chrX	70349661	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,2:2,1:5,1
+chrX	70561388	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0063768;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:4,7:2,1
+chrX	72440800	.	A	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=9.7732e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:14,8:14,6
+chrX	75553778	.	TACAC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.038251;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:11,6:10,5
+chrX	77618075	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0014944;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:11,6:12,6
+chrX	77807724	.	T	TTC	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.042571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,9:9,2:19,7
+chrX	77807744	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.028918;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:7,2:20,7
+chrX	78589925	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00011173;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:7,6:16,5
+chrX	78965833	.	CCTTTCTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.11424;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:0,3:15,3
+chrX	79317858	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0040149;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:9,3:12,8
+chrX	79550326	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,9:8,6:0,3
+chrX	80725789	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.085385;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:18,2:16,2
+chrX	80956878	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=1.6051e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,18:7,10:8,8
+chrX	85015542	.	A	ATATT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.041575;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,4:7,2
+chrX	85658013	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=9.3681e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:11,9:13,6
+chrX	86703721	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0031109;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:12,5:12,3
+chrX	87107173	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,1:9,3
+chrX	87376789	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0027236;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:15,5:20,6
+chrX	87717069	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
+chrX	88212494	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11996;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:13,2:6,2
+chrX	88416330	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.21465;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,5:8,2:3,3
+chrX	88976499	.	C	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,1:2,3
+chrX	89146034	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=8.9875e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:11,10:8,3
+chrX	91344255	.	AAACAAAAACAAAAAACAAAC	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0019452;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:5,5:1,1
+chrX	91710799	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0005553;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:6,3:10,6
+chrX	91984178	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10638;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:11,1:9,6
+chrX	92565528	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0078215;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,1:3,7
+chrX	92674911	.	G	GTATA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:10,3:4,1
+chrX	92837460	.	GGAAGGAAGGAATACTTCTAAACTCATTATAATGGGTCA	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.006961;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:12,4:15,4
+chrX	92992409	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.092279;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,5:10,3:10,2
+chrX	93493539	.	C	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=2.9482e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,18:12,11:16,7
+chrX	96829462	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.29013;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:22,5:11,4:11,1
+chrX	97295734	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.032462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:15,6:5,4
+chrX	97583100	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00097567;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:13,5:12,6
+chrX	98058757	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0043057;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:19,3:17,6
+chrX	98438684	.	AT	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0034815;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:12,8:17,6
+chrX	98675715	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.040631;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:20,2:12,4
+chrX	98758324	.	T	TATATATATAC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,2:2,1:2,1
+chrX	99387850	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:8,4:9,1
+chrX	99938667	.	GCCC	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.073354;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:17,3:12,1
+chrX	99938672	.	GGGCGGC	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.087004;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:17,3:15,1
+chrX	99938684	.	CAAAGGCTGGG	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.07299;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,3:14,1
+chrX	101158272	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16205;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:13,5:9,1
+chrX	101243201	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0046201;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:17,7:10,3
+chrX	101253540	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.016254;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
+chrX	102251392	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,3:8,1
+chrX	102499739	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0014749;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:18,2:11,7
+chrX	102824103	.	C	CTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,2:3,4
+chrX	102824504	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0002515;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:10,4:8,6
+chrX	103004914	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:7,8:2,4:5,4
+chrX	104225608	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:6,8:1,3
+chrX	104325992	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00096868;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:12,24:9,13:3,11
+chrX	105439451	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00023472;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:12,9:10,6
+chrX	105735028	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0020462;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:14,5:17,8
+chrX	106693399	.	C	CAGAG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.048755;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,6:9,4:9,2
+chrX	107275037	.	A	ATTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.002235;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:15,8:6,4
+chrX	108309801	.	AACAC	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.072836;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,7:10,5:6,2
+chrX	108526671	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,9:0,4:9,5
+chrX	109594739	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0040948;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,11:15,9:4,2
+chrX	110105721	.	G	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12846;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,3:3,1
+chrX	110689851	.	CTA	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.14864;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,6:15,2:11,4
+chrX	111404048	.	T	TTAAAATAAAATAAAA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0066813;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,12:6,8:12,4
+chrX	112226663	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.017517;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:11,2:8,10
+chrX	112350000	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0027255;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:13,8:14,2
+chrX	113024426	.	GGTAT	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.029963;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:11,7:4,3
+chrX	113024490	.	TAC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018485;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:7,5:3,6
+chrX	113836256	.	G	GGTGT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.017445;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:5,5:5,1
+chrX	115261952	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.3;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,2:4,1:3,1
+chrX	116797951	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00020206;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:15,6:9,8
+chrX	117792863	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.03876;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,5:12,2:8,3
+chrX	117863303	.	TA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:0,4:11,6
+chrX	117879355	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00069448;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:13,6:15,7
+chrX	118378790	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10564;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:9,5:14,1
+chrX	118692381	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00011959;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,22:5,6:8,16
+chrX	118952590	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0027508;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:14,4:11,4
+chrX	119152815	.	ATATCACCTG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00057277;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:12,6:6,5
+chrX	119455681	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:6,7:1,3
+chrX	119621446	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.3064;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,4:8,3:7,1
+chrX	120581950	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:12,1:5,4
+chrX	120582031	.	AG	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040008;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:13,6:3,3
+chrX	120587999	.	C	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,4:5,3:5,1
+chrX	121383661	.	ATAAAATAAAATAAAATAAAAT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0087027;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,9:16,7:8,2
+chrX	122148500	.	T	TTTTTGTTTTGTTTTG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.034367;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:7,4:15,1
+chrX	122466001	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,6:7,3:10,3
+chrX	122466025	.	A	AAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.13168;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,6:7,3:12,3
+chrX	123698457	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.082337;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,6:8,4:8,2
+chrX	123889997	.	ATTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,5:7,2:3,3
+chrX	123891823	.	T	TA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00044917;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:9,11:14,6
+chrX	123912216	.	G	GAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0078247;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,9:6,8:1,1
+chrX	123921883	.	AT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.075461;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:10,1:13,6
+chrX	123922946	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,3:3,1
+chrX	123939501	.	A	AACAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02457;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:6,3:10,9
+chrX	124218308	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:9,4:4,3
+chrX	124437104	.	ATT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.079329;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:7,4:3,2
+chrX	125117010	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.020124;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,7:4,6:3,1
+chrX	125163070	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.010975;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:5,7:13,6
+chrX	126673196	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041461;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:10,5:7,2
+chrX	127366593	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,4:6,1
+chrX	127505221	.	ATAT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0015096;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,15:6,8:2,7
+chrX	127749606	.	CAT	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.087068;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,5:16,3:16,2
+chrX	127821614	.	CTT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0038232;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,15:6,10:9,5
+chrX	127891640	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0014939;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:10,6:12,4
+chrX	128491078	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00039908;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:26,27:12,15:14,12
+chrX	128528655	.	AACACAC	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,7:5,6:4,1
+chrX	128691631	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.029233;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:13,2:16,4
+chrX	128979419	.	GTGTATATATATGTATATA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.037012;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:8,2:11,5
+chrX	129720126	.	TCTCCA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00049102;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:6,7:15,6
+chrX	131194910	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0022407;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:9,6:19,4
+chrX	131293722	.	C	CTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:7,2:2,2
+chrX	131445399	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:1,1:12,3
+chrX	132571464	.	TATAC	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,4:1,1:2,3
+chrX	133496454	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11419;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:14,1:17,5
+chrX	133498998	.	CTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01391;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,2:7,5
+chrX	135123439	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.01932;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:11,3:7,8
+chrX	135124763	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.032;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:9,1:8,6
+chrX	135824830	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.046334;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:18,5:7,1
+chrX	135867898	.	T	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.057842;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:0,0:12,4
+chrX	136109942	.	AAG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.24484;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:17,1:9,3
+chrX	136473073	.	GAGGGAGGAATGAAGGGAAGAA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0052134;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:7,9:7,3
+chrX	136600800	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.018564;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:9,5:8,2
+chrX	136644723	.	T	TCAAA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0062408;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:26,17:8,7:18,10
+chrX	136939150	.	G	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.44608;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,3:9,2:2,1
+chrX	136958091	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0078314;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:15,4:19,4
+chrX	137557538	.	AAAAT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,1:12,3
+chrX	138017063	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,6:14,4:4,2
+chrX	139304610	.	T	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00040366;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:19,5:10,6
+chrX	139503279	.	CGT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:2,7:1,1
+chrX	140188892	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.038272;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:16,7:13,4
+chrX	140215938	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.049315;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:14,4:11,5
+chrX	140723391	.	T	TAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.065833;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,6:8,2:13,4
+chrX	141095375	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.029349;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:10,4:2,4
+chrX	141111829	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.22206;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:18,3:8,1
+chrX	141349308	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0028525;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:11,7:23,4
+chrX	141508038	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,1:9,3
+chrX	141544104	.	GAA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.19974;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:18,2:8,3
+chrX	141759742	.	TAC	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.05062;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,1:8,3
+chrX	141791198	.	GT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.18393;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,2:13,2
+chrX	142171661	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011608;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,4:11,4
+chrX	142340513	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00067301;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:10,6:8,4
+chrX	142569120	.	TTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15365;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:8,1:18,3
+chrX	143206799	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=2.0941e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:10,7:8,7
+chrX	143865197	.	ATG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,9:3,6:4,3
+chrX	144103798	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00068862;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:4,5:5,7
+chrX	144103820	.	CTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=4.7337e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:4,13:2,9:2,4
+chrX	144202168	.	T	TTTCCTTCC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.042336;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:8,2:14,3
+chrX	144475856	.	T	TAA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.16556;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:18,2:13,2
+chrX	144724939	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0012196;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:11,9:13,1
+chrX	144800095	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,4:10,3:6,1
+chrX	145000425	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0031702;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:3,7:6,4
+chrX	145435578	.	CCACGG	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.045968;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,6:8,4:8,2
+chrX	145728671	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00018161;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,4:7,6
+chrX	145841803	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:16,2:6,2
+chrX	146042763	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0012285;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,3:7,5
+chrX	146042841	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0016748;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,9:5,4:4,5
+chrX	146088948	.	T	TTCTTTTC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.046124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,13:14,5:6,8
+chrX	147025443	.	T	TAAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.16089;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,4:13,1:7,3
+chrX	147111915	.	C	CACACACACACACACACACAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.084679;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,5:8,2:11,3
+chrX	147226789	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.22807;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:4,1:7,3
+chrX	147509349	.	A	AAT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:7,6:6,6
+chrX	147756133	.	C	CCA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.019523;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:12,8:8,6
+chrX	149272569	.	C	CAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.030046;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,4:3,3
+chrX	149935818	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.019281;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:12,3:10,2
+chrX	150132345	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.2122;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:17,1:8,3
+chrX	150385277	.	T	TACAC	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010569;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,12:7,9:5,3
+chrX	151092238	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.036166;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:14,3:11,3
+chrX	152182721	.	G	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:2,7:2,4:0,3
+chrX	152239978	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.28876;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:16,3:9,1
+chrX	153598416	.	GA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0024779;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:11,10:7,7
+chrX	153621258	.	GA	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:6,7:8,1
+chrX	154104672	.	CAG	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.11141;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:17,3:12,1
+chrX	154106779	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018564;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:9,6:8,1
+chrX	154240626	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:0,0:12,4
+chrX	154519083	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:4,8:3,2
+chrY	11147442	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,3:8,5
+chrY	11163520	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.031533;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:15,4:11,2
+chrY	11180965	.	A	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.020926;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:54,6:49,5:5,1
+chrY	11189765	.	T	C	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.031957;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:59,7:9,1:50,6
+chrY	11203502	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.039802;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:18,1:21,4
+chrY	11203520	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.020882;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:16,1:17,5
+chrY	11206834	.	C	CAA	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.042084;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:63,10:32,4:31,6
+chrY	11260010	.	A	G	0	PASS	DP=334;GPV=1;SPV=0.030837;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:166,30:91,13:75,17
+chrY	11284353	.	T	C	0	PASS	DP=423;GPV=1;SPV=0.048153;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:193,36:60,21:133,15
+chrY	11409692	.	G	C	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0054071;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:35,16:5,5:30,11
+chrY	56828952	.	G	T	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.039467;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:69,10:33,4:36,6
+chrY	56835443	.	G	T	0	PASS	DP=181;GPV=1;SPV=0.018332;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:90,18:44,12:46,6
+chrY	56886746	.	A	G	0	PASS	DP=238;GPV=1;SPV=0.0035615;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:137:114,23:57,9:57,14
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/I.vcf	Wed Sep 16 22:58:28 2020 +0000
@@ -0,0 +1,5405 @@
+##fileformat=VCFv4.2
+##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed">
+##reference=hg38
+##source=varscan.py
+##contig=<ID=chr1,length=248956422>
+##contig=<ID=chr10,length=133797422>
+##contig=<ID=chr11,length=135086622>
+##contig=<ID=chr12,length=133275309>
+##contig=<ID=chr13,length=114364328>
+##contig=<ID=chr14,length=107043718>
+##contig=<ID=chr15,length=101991189>
+##contig=<ID=chr16,length=90338345>
+##contig=<ID=chr17,length=83257441>
+##contig=<ID=chr18,length=80373285>
+##contig=<ID=chr19,length=58617616>
+##contig=<ID=chr2,length=242193529>
+##contig=<ID=chr20,length=64444167>
+##contig=<ID=chr21,length=46709983>
+##contig=<ID=chr22,length=50818468>
+##contig=<ID=chr3,length=198295559>
+##contig=<ID=chr4,length=190214555>
+##contig=<ID=chr5,length=181538259>
+##contig=<ID=chr6,length=170805979>
+##contig=<ID=chr7,length=159345973>
+##contig=<ID=chr8,length=145138636>
+##contig=<ID=chr9,length=138394717>
+##contig=<ID=chrM,length=16569>
+##contig=<ID=chrX,length=156040895>
+##contig=<ID=chrY,length=57227415>
+##filter="SOMATIC"
+##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL">
+##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total depth of quality bases">
+##INFO=<ID=SOMATIC,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates if record is a somatic mutation">
+##INFO=<ID=SS,Number=1,Type=String,Description="Somatic status of variant (0=Reference,1=Germline,2=Somatic,3=LOH, or 5=Unknown)">
+##INFO=<ID=SSC,Number=1,Type=String,Description="Somatic score in Phred scale (0-255) derived from somatic p-value">
+##INFO=<ID=GPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor+normal versus no variant for Germline calls">
+##INFO=<ID=SPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor versus normal for Somatic/LOH calls">
+##FILTER=<ID=str10,Description="Less than 10% or more than 90% of variant supporting reads on one strand">
+##FILTER=<ID=indelError,Description="Likely artifact due to indel reads at this position">
+##FILTER=<ID=VarCount,Description="Fewer than 4 variant-supporting reads">
+##FILTER=<ID=VarFreq,Description="Variant allele frequency below 0.05">
+##FILTER=<ID=VarAvgRL,Description="Average clipped length of variant-supporting reads < 90">
+##FILTER=<ID=VarReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
+##FILTER=<ID=VarDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
+##FILTER=<ID=VarMMQS,Description="Average mismatch quality sum for variant reads > 100">
+##FILTER=<ID=VarMapQual,Description="Average mapping quality of variant reads < 15">
+##FILTER=<ID=VarBaseQual,Description="Average base quality of variant reads < 15">
+##FILTER=<ID=Strand,Description="Strand representation of variant reads < 0.01">
+##FILTER=<ID=RefAvgRL,Description="Average clipped length of ref-supporting reads < 90">
+##FILTER=<ID=RefReadPos,Description="Relative average read position < 0.1">
+##FILTER=<ID=RefDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1">
+##FILTER=<ID=RefMapQual,Description="Average mapping quality of reference reads < 15">
+##FILTER=<ID=RefBaseQual,Description="Average base quality of ref-supporting reads < 15">
+##FILTER=<ID=RefMMQS,Description="Average mismatch quality sum for ref-supporting reads > 100">
+##FILTER=<ID=MMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) > 50">
+##FILTER=<ID=MinMMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) < 50">
+##FILTER=<ID=MapQualDiff,Description="Mapping quality difference (ref - var) > 50">
+##FILTER=<ID=MaxBAQdiff,Description="Average base quality difference (ref - var) > 50">
+##FILTER=<ID=ReadLenDiff,Description="Average supporting read length difference (ref - var) > 0.25">
+##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype code">
+##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype quality">
+##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
+##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele">
+##FORMAT=<ID=ADF,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the forward strand">
+##FORMAT=<ID=ADR,Number=R,Type=Integer,Description="Read depth for each allele on the reverse strand">
+#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	TUMOR
+chr1	269731	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.016586;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:9,2:16,5
+chr1	271443	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0016182;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:15,4:12,7
+chr1	1248267	.	A	AC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14221;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:6,1:17,3
+chr1	2020828	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00080797;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:13,4:12,7
+chr1	2085733	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.012493;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:16,2:18,5
+chr1	2348700	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0026931;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:5,6:9,5
+chr1	2366985	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.034197;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:13,3:13,3
+chr1	2658795	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
+chr1	2672087	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.11845;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:12,3:17,2
+chr1	3668055	.	C	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00031346;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:10,5:9,8
+chr1	4066911	.	A	ACT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:5,3:4,3
+chr1	4111429	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0011142;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:14,6:10,2
+chr1	4206589	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00094617;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:17,7:16,8
+chr1	6498731	.	TACGGG	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00022147;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:13,4:12,6
+chr1	8327243	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.8465e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:11,10:13,4
+chr1	8556639	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.000154;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:10,3:10,6
+chr1	9108397	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.025922;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,2:9,2
+chr1	10758330	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:14,4:3,3
+chr1	10791081	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034636;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:14,2:6,3
+chr1	10964151	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00022074;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:13,7:10,6
+chr1	11877601	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0019011;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:10,3:14,6
+chr1	12888921	.	T	TCC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,3:6,2
+chr1	12938147	.	C	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.049083;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:15,1:16,8
+chr1	13070264	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12114;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,2:14,2
+chr1	13369246	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.045787;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:12,5:15,4
+chr1	13597732	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0010783;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:14,6:7,5
+chr1	14557666	.	G	GTGTGGT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:14,2:13,2
+chr1	14883334	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:2,2:3,1
+chr1	15206627	.	T	TGTGTTTAGGAATCGGGTGAGTTTA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0062786;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:5,6:14,4
+chr1	16180433	.	A	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:3,2:2,1:1,1
+chr1	16356168	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.035315;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:11,2:4,6
+chr1	16408869	.	CAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.010143;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,8:7,7:1,1
+chr1	16509718	.	T	A	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.026634;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:60,17:33,8:27,9
+chr1	16509719	.	C	A	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.039535;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:59,17:32,8:27,9
+chr1	16512994	.	A	G	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.0097219;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:46,17:19,8:27,9
+chr1	16513547	.	G	A	0	PASS	DP=216;GPV=1;SPV=0.044761;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:114,16:61,7:53,9
+chr1	16513636	.	C	T	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.010031;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:80,22:43,10:37,12
+chr1	16564382	.	G	C	0	PASS	DP=264;GPV=1;SPV=0.037792;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:134,22:85,12:49,10
+chr1	16601216	.	C	A	0	PASS	DP=226;GPV=1;SPV=0.018555;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:103,26:39,14:64,12
+chr1	16725350	.	C	T	0	PASS	DP=273;GPV=1;SPV=0.0084694;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:130,27:60,9:70,18
+chr1	16934842	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.34103;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:17,4:9,3:8,1
+chr1	16947468	.	C	CAAT	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.041416;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:17,4:24,5
+chr1	17357944	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.071318;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:13,1:7,3
+chr1	17444539	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:4,6:8,2
+chr1	17524364	.	T	TACAC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.049774;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:3,5:3,1
+chr1	18060769	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.034015;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:11,8:7,4
+chr1	18273462	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:2,5:7,1
+chr1	18474502	.	G	GTC	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.14244;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,5:16,3:23,2
+chr1	20011131	.	C	CA	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.015316;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:9,8:16,2
+chr1	20035496	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00017262;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:12,7:13,6
+chr1	20668564	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=5.9655e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:9,8:14,6
+chr1	21214809	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00085614;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:9,15:5,11:4,4
+chr1	22069170	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0081269;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:2,2:2,3
+chr1	23142700	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:1,2:0,1:1,1
+chr1	23992096	.	T	TTTC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0016669;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:5,7:9,6
+chr1	24017891	.	T	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,3:5,1
+chr1	24196544	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:0,2:0,2:0,0
+chr1	24553122	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.021038;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,2:7,2
+chr1	27489252	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.039732;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,5:2,4:4,1
+chr1	27666312	.	A	AAT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr1	28658736	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.022713;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:13,5:11,2
+chr1	30487019	.	C	CAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,9:5,7:4,2
+chr1	31251996	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.090497;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:3,4:20,1
+chr1	31552470	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00017822;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:19,10:8,2
+chr1	32093399	.	CT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,2:4,2
+chr1	32753269	.	G	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0057147;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:11,11:2,5
+chr1	32976485	.	A	AACACACACAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:6,2:2,3
+chr1	33052839	.	T	TG	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.064526;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:21,3:6,1
+chr1	33052861	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.041383;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:16,4:7,3
+chr1	33826414	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.001327;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:8,7:9,8
+chr1	35015945	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:6,9:5,2
+chr1	36129412	.	T	TA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.043842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,4:4,2
+chr1	37078450	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:2,5:1,4:1,1
+chr1	39941007	.	C	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.00031349;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:19,3:14,8
+chr1	41301699	.	C	CT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014318;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,6:5,3
+chr1	41506602	.	T	TG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:1,2:0,1:1,1
+chr1	42335809	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:2,2:0,1:2,1
+chr1	42750999	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,3:8,1
+chr1	43141270	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00068429;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:10,7:13,4
+chr1	43670556	.	A	ATTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10577;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,5:3,1:3,4
+chr1	44844402	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.016858;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,5:6,2:3,3
+chr1	44913110	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:6,1:3,3
+chr1	45750823	.	G	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0014366;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:11,5:25,6
+chr1	46241374	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:4,2:12,2
+chr1	46501126	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.02037;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:2,3:7,2
+chr1	47880999	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00072376;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:20,8:7,8
+chr1	48083307	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.062714;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,4:7,2
+chr1	48383028	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14022;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:6,1:16,4
+chr1	50527811	.	G	GTCTCTC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,6:9,4:8,2
+chr1	51721990	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0011981;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:16,10:15,2
+chr1	53100726	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,5:9,3:9,2
+chr1	54235448	.	ATTT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:5,3:4,2
+chr1	54539667	.	CTA	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.021052;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:11,3:15,4
+chr1	55252557	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=3.545e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:9,6:9,8
+chr1	55420073	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:10,3:5,1
+chr1	56118818	.	CAAATAAAATA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014795;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:11,3:11,6
+chr1	57153623	.	GT	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.077619;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:23,1:16,4
+chr1	58373169	.	C	CTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,3:4,2
+chr1	58375665	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:8,5:4,3
+chr1	58713853	.	A	AG	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.21475;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,4:12,2:9,2
+chr1	60146729	.	G	GT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.038921;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:4,4:3,1
+chr1	60858389	.	GGTGTGTGTGTGT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.04735;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,12:8,10:2,2
+chr1	62125264	.	C	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,5:2,4:2,1
+chr1	62324554	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.057396;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:20,3:3,2
+chr1	62465482	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:4,2:1,1:3,1
+chr1	64016839	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040129;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:11,8:9,7
+chr1	65472411	.	A	AACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.12189;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:6,1:14,4
+chr1	66130826	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0063293;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:13,5:10,4
+chr1	66675541	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0024902;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:2,2:1,6
+chr1	66892898	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,2:11,2
+chr1	67205911	.	C	CTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,4:5,1:16,3
+chr1	67299917	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.087902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:21,3:10,1
+chr1	67337901	.	T	TA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030984;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,1:9,4
+chr1	67446182	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,3:7,1
+chr1	68038858	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.014127;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:11,4:9,5
+chr1	68705885	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.11622;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,2:14,2
+chr1	68705887	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10931;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,2:14,2
+chr1	69778971	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,2:4,2
+chr1	70264475	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:3,8:5,1
+chr1	70770214	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00023235;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:11,6:7,5
+chr1	70981320	.	CTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:0,1:9,7
+chr1	71570644	.	C	CTTATTA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.011427;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:7,3:10,6
+chr1	72831384	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00046753;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:11,4:14,7
+chr1	73957635	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.010972;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:30,7:5,3
+chr1	75795181	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:5,3:4,1
+chr1	75840369	.	GGGACATGGATGAAATT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037594;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,3:11,1
+chr1	75878828	.	GAA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0020556;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,14:5,8:9,6
+chr1	76123819	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00039496;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,16:3,10:3,6
+chr1	76202268	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.070566;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,6:11,2:9,4
+chr1	76936953	.	G	GGCGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014907;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:6,4:1,1
+chr1	77423219	.	T	TAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.018778;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:2,6:3,1
+chr1	78025354	.	GA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0013772;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,15:6,12:3,3
+chr1	78400057	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,5:5,1
+chr1	79093208	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,4:9,3:7,1
+chr1	79919640	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.010374;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:5,3:4,6
+chr1	80114791	.	A	AT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.01018;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:13,6:5,5
+chr1	81343072	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057118;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:4,5:9,1
+chr1	81557460	.	A	AAAGAAAG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.046752;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:7,4:6,3
+chr1	82163900	.	CAATA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.008557;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:6,7:8,5
+chr1	83122032	.	TTGTGTG	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:7,4:3,2
+chr1	83892925	.	AAAG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,4:5,3:10,1
+chr1	84508565	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.044393;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:18,5:12,2
+chr1	85084250	.	GTATA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:3,10:1,8:2,2
+chr1	85996536	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.008646;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:4,4:9,4
+chr1	88539041	.	ATGTGTG	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,4:1,4:0,0
+chr1	90378989	.	AC	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.049659;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,1:13,4
+chr1	90522609	.	G	GATAA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0008665;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,11:10,8:11,3
+chr1	90826152	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.036825;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,13:4,9:8,4
+chr1	90826155	.	T	TACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,9:4,6:6,3
+chr1	90891794	.	C	CG	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:0,4:4,1
+chr1	91929065	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.25989;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:10,2:15,2
+chr1	91958214	.	C	CTTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.03148;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:5,5:11,4
+chr1	92586588	.	G	GTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,8:2,4:2,4
+chr1	96450604	.	CAA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.12042;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,7:12,3:4,4
+chr1	97342390	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00051949;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,4:8,5
+chr1	97735685	.	CATAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040656;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,5:7,1
+chr1	98255236	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=7.2707e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:10,6:14,9
+chr1	98492648	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045397;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:12,6:7,2
+chr1	98973303	.	GGTAAATGTAGGGATTGACAGTAGGAAGAGAATACC	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.036957;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:9,4:11,3
+chr1	100843450	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
+chr1	101521631	.	C	CGT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:9,7:2,2
+chr1	101814986	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.002513;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:12,4:12,6
+chr1	102494919	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.027663;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:13,3:19,3
+chr1	102839949	.	GC	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=5.174e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:9,6:16,7
+chr1	103125344	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029259;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:11,3:8,4
+chr1	104209755	.	A	AT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.015718;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:1,4:4,3
+chr1	105484294	.	GT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00063127;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:5,4:10,6
+chr1	106356046	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0089499;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:13,3:15,5
+chr1	107319867	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.029166;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:13,4:11,2
+chr1	107813967	.	AGT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0070965;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,8:5,4:2,4
+chr1	108970973	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.035079;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:17,1:13,5
+chr1	109654189	.	AG	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,4:1,0
+chr1	109654217	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:11,7:0,1
+chr1	110568000	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0016408;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:17,5:8,4
+chr1	110800558	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00069928;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:10,4:11,7
+chr1	111065378	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.00095261;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:2,9:0,7:2,2
+chr1	111760000	.	T	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.29181;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:5,2:10,3
+chr1	112446195	.	T	TG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0095299;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:10,10:6,3
+chr1	112839632	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0064568;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,5:4,4
+chr1	112887304	.	G	GT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0012521;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,18:3,9:7,9
+chr1	113329679	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0084152;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:13,4:15,5
+chr1	113416037	.	TA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,3:13,1
+chr1	113416042	.	A	ATG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:8,3:13,2
+chr1	113826659	.	AT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0069323;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:2,3:2,5
+chr1	114023627	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0027946;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,3:11,6
+chr1	114711520	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0018005;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:11,6:8,7
+chr1	115973951	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:0,1:1,1
+chr1	116760187	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0003213;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:8,3:8,6
+chr1	118165645	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:1,3:6,1
+chr1	118318922	.	ATAACATAGATATTATATATATAAC	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.020516;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,11:14,3:10,8
+chr1	118318948	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.026312;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:21,11:13,3:8,8
+chr1	119480464	.	G	GGAAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.016957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,5:2,1
+chr1	120133006	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.026923;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:11,6:15,5
+chr1	120214625	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.041254;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:8,3:10,3
+chr1	120223626	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:7,5:4,1
+chr1	120449349	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.042184;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:14,1:17,4
+chr1	120516328	.	CTCGAACACCTGACCTCAGG	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00055646;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:5,4:8,8
+chr1	120677169	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.034767;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:7,6:6,2
+chr1	120808134	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.096745;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:12,2:14,4
+chr1	120813144	.	G	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:11,3:9,1
+chr1	120933113	.	G	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,2:5,2
+chr1	120999034	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.075059;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,2:6,4
+chr1	121014916	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:7,10:0,2
+chr1	121142206	.	G	GTGTTGCATCTAATGCA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.027219;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:11,6:3,1
+chr1	121300216	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,1:4,3
+chr1	121313677	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015942;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
+chr1	121632493	.	G	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.046332;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,3:5,1
+chr1	121633993	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.061867;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:22,3:22,3
+chr1	121724458	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0047006;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:16,6:1,1
+chr1	121746508	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.025099;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:5,1:26,4
+chr1	121765204	.	T	C	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.021678;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:19,4:25,9
+chr1	121825757	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:0,0:6,4
+chr1	122055311	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,4:2,2
+chr1	122126906	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr1	122130766	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.035683;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:0,2:32,6
+chr1	122382551	.	T	G	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.024134;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:77,10:45,7:32,3
+chr1	122382585	.	C	G	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.012337;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:68,20:37,12:31,8
+chr1	124517001	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.082831;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:1,0:22,4
+chr1	124704660	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:3,2:10,2
+chr1	124803933	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.049719;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:18,4:14,2
+chr1	124815480	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024163;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:4,6:6,1
+chr1	124819793	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.25578;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:17,1:15,3
+chr1	124824574	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.062015;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:26,4:6,1
+chr1	124829879	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:2,0:23,4
+chr1	124836421	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,1:7,4
+chr1	124864443	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.034057;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:31,3:4,5
+chr1	124872309	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:4,3:10,2
+chr1	125105666	.	G	C	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.027872;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:103,19:65,12:38,7
+chr1	125115225	.	A	G	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.037748;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:60,7:43,6:17,1
+chr1	125115420	.	A	AC	0	PASS	DP=143;GPV=1;SPV=0.013226;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:70,10:27,4:43,6
+chr1	125115460	.	G	A	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.016349;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:69,9:27,3:42,6
+chr1	125145353	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.14384;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:15,2:21,2
+chr1	125183528	.	T	C	0	PASS	DP=13535;GPV=1;SPV=0.00028913;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:7135:6347,761:6156,122:191,639
+chr1	143186576	.	G	T	0	PASS	DP=306;GPV=1;SPV=0.022409;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:159,19:107,15:52,4
+chr1	143186698	.	G	C	0	PASS	DP=380;GPV=1;SPV=0.016502;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:195,26:35,6:160,20
+chr1	143199058	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.05461;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:6,3:14,1
+chr1	143354257	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,1:8,3
+chr1	143507941	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.075102;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:4,1:21,3
+chr1	143691034	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.20161;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:22,2:6,2
+chr1	143749592	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0020871;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:7,4:17,6
+chr1	143896059	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.039302;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:12,4:18,1
+chr1	143899302	.	C	CAA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.056683;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:18,1:10,4
+chr1	144322435	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
+chr1	144907343	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0012456;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:13,7:8,3
+chr1	145563251	.	CATGGTGTA	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.034945;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:14,6:14,2
+chr1	145697763	.	ATTTTTTT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
+chr1	145731539	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0035718;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,3:11,5
+chr1	146008839	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,7:5,5:2,2
+chr1	146397037	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03942;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:7,6:9,2
+chr1	146969025	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.049127;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,1:13,3
+chr1	147096496	.	A	AATGTGTGTGTGTGTCTGTGT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:7,3:9,1
+chr1	147548979	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.060606;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,6:1,2:1,4
+chr1	148239973	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027099;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:9,3:7,5
+chr1	148268790	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,5:0,2:0,3
+chr1	148444677	.	C	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr1	148651160	.	AAAAT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021701;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,6:7,3
+chr1	148651164	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:3,3:0,2:3,1
+chr1	148884876	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,3:14,1
+chr1	148952338	.	C	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.06683;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:19,3:24,2
+chr1	149080805	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0098611;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:7,6:5,4
+chr1	149110135	.	C	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:3,5:2,2
+chr1	149142076	.	TAC	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.033332;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,7:18,6:12,1
+chr1	149158930	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
+chr1	149215311	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.086845;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,3:8,1
+chr1	149309405	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.16556;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,4:13,1:18,3
+chr1	149874716	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.021894;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:12,4:9,7
+chr1	150136771	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0061864;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,5:6,4
+chr1	150781906	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,3:6,2
+chr1	150905062	.	CCA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02253;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,14:3,10:2,4
+chr1	151660825	.	G	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.001135;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:43,16:22,6:21,10
+chr1	151780257	.	ATACTATCTATACAACCAGTCCTCAATTACTTTATATACAACCTCAGT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.073823;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:7,2:12,3
+chr1	152156625	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.18237;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:12,1:9,5
+chr1	152274875	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.079329;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,6:4,5:6,1
+chr1	153785086	.	A	AT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.030558;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:21,14:13,9:8,5
+chr1	154309581	.	CATAT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,4:12,1:2,3
+chr1	154322489	.	C	CTTCTTCTTCTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.023839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:2,7:4,1
+chr1	154937273	.	A	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.003727;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:52,10:19,5:33,5
+chr1	156640418	.	T	TC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:7,6:2,4:5,2
+chr1	157274150	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.057118;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:9,1:4,5
+chr1	157300470	.	CAT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,3:8,1
+chr1	157760686	.	A	AGAAAGAAGGAAG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:13,3:7,1
+chr1	159011398	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.25968;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:20,4:9,1:11,3
+chr1	159021939	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:6,3:3,2
+chr1	159256266	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=1.1925e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:25,22:10,9:15,13
+chr1	160270143	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0096618;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,6:6,1
+chr1	160984465	.	AAT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.030104;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,2:7,2
+chr1	161423696	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0041082;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:18,12:5,5
+chr1	161559730	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.012728;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:44,16:27,9:17,7
+chr1	162108902	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.040006;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:22,4:16,4
+chr1	162519003	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0041602;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:10,8:4,4:6,4
+chr1	162825846	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00044723;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:13,5:10,8
+chr1	163059160	.	T	TTATATATA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.013867;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:7,7:2,1
+chr1	163547125	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,3:6,2
+chr1	163758208	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.13498;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:16,1:20,3
+chr1	164079940	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.020864;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:19,4:20,4
+chr1	164563555	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0028166;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:12,7:19,2
+chr1	164773241	.	G	GCACACACACACA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.049992;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:19,5:10,1
+chr1	165139680	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0077332;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:18,7:19,2
+chr1	166038371	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0014163;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:21,4:10,7
+chr1	166318281	.	AT	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:18,4:9,1:9,3
+chr1	166327704	.	GGTCAGAGAACCT	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=5.6653e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:25,17:12,7:13,10
+chr1	166384348	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=5.3344e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:15,8:13,7
+chr1	166464009	.	TTA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.035929;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,12:14,6:9,6
+chr1	166598336	.	TA	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0044141;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:18,8:16,4
+chr1	166887954	.	CAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,8:3,6:5,2
+chr1	167044460	.	C	CTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.038102;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:11,2:11,3
+chr1	167177215	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,0:13,4
+chr1	167208546	.	G	GTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.014666;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,14:3,12:1,2
+chr1	167773894	.	TA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.18687;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:15,1:19,3
+chr1	168100235	.	G	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0070433;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:3,6:2,4
+chr1	168306397	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.3626e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:25,18:13,12:12,6
+chr1	169172356	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.052643;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:14,6:5,2:9,4
+chr1	171658179	.	G	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,4:5,2:5,2
+chr1	171658181	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,9:5,6:5,3
+chr1	174349693	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.077327;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:9,1:12,4
+chr1	174350131	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:13,3:9,2
+chr1	175087657	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0038636;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:40,14:18,6:22,8
+chr1	175091559	.	TTTTA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.17881;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:13,2:18,2
+chr1	175426880	.	TAAAATATA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,3:2,3
+chr1	176049178	.	CAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,10:8,7:3,3
+chr1	176174007	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:9,3:5,1
+chr1	176275360	.	CAAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0040248;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,9:2,8:3,1
+chr1	177867086	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27357;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,5:9,4:5,1
+chr1	178661607	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.024305;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,8:8,3:8,5
+chr1	178673275	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00051119;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,18:3,7:12,11
+chr1	179541677	.	TA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:7,5:13,4
+chr1	180234012	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00055105;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,17:2,6:9,11
+chr1	180473446	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0053012;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,12:8,9:4,3
+chr1	181034063	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.047407;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:11,1:17,4
+chr1	181188527	.	A	AAAATAAATAAAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,10:4,5:8,5
+chr1	181590418	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,5:3,3:4,2
+chr1	182075278	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:0,5:0,4:0,1
+chr1	182295503	.	GA	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.070174;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:16,1:11,4
+chr1	182295508	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10837;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:18,1:13,4
+chr1	182299870	.	G	GGA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010097;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,12:14,8:2,4
+chr1	182476052	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.11505;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,3:16,1
+chr1	182936130	.	GT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043687;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:13,6:6,4
+chr1	182946992	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.065169;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:16,2:17,4
+chr1	183236390	.	A	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.11429;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:1,3:0,0:1,3
+chr1	183446701	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=3.0659e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:21,19:10,10:11,9
+chr1	183776141	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.051203;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:14,3:6,3
+chr1	184936021	.	G	GA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.033449;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,12:10,9:6,3
+chr1	185431986	.	G	GTCC	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:24,4:9,3:15,1
+chr1	186064809	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0127;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,8:8,6:7,2
+chr1	187432871	.	T	TGTATATATATATACAC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:5,3:4,5
+chr1	189093126	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0278;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:21,2:11,5
+chr1	189818494	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.064615;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,2:3,1:2,1
+chr1	190317171	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,4:8,1:1,3
+chr1	190848998	.	T	TATAGAG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.03741;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:2,13:1,6:1,7
+chr1	191373158	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.29545;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,7:7,4:5,3
+chr1	191597193	.	TTA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.19365;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:19,2:14,2
+chr1	191597196	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.1253;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,5:20,2:12,3
+chr1	192098485	.	G	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0098951;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,15:3,4:4,11
+chr1	193564297	.	T	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.35726;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:18,4:7,2:11,2
+chr1	194191688	.	CTGTGTG	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.045605;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:13,8:8,7
+chr1	195143152	.	G	GA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.059981;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:18,3:2,3
+chr1	195286373	.	C	CTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.2092;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:6,2:21,3
+chr1	196050116	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.078917;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:29,5:15,1
+chr1	196692708	.	TTTTC	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.046254;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:10,1:12,5
+chr1	196692716	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.048435;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:8,2:14,5
+chr1	196759125	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.057896;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:14,4:4,2
+chr1	196759861	.	TTA	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.023189;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:42,15:18,3:24,12
+chr1	196773670	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.32052;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,3:18,1
+chr1	197305904	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:3,2:2,1:1,1
+chr1	201702677	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.086046;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,8:8,4:10,4
+chr1	202125153	.	CAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:13,6:2,1
+chr1	202205825	.	AC	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.002614;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,19:13,13:2,6
+chr1	202205968	.	CA	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.12149;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:20,2:15,2
+chr1	202799657	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.003703;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:6,9:13,9
+chr1	203544823	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,5:2,1
+chr1	203794717	.	CTTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:7,9:2,4
+chr1	203815379	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,8:7,7:6,1
+chr1	204308691	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027191;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:1,2:8,4
+chr1	204699211	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.20807;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:12,4:23,1
+chr1	205115043	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0027236;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:13,5:22,6
+chr1	205766586	.	AC	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,3:9,1
+chr1	206249005	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.023333;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:10,5:13,1
+chr1	206612949	.	TA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.20158;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,5:9,4:4,1
+chr1	207657873	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00033391;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:17,6:9,5
+chr1	208407255	.	C	CAAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013932;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:2,13:2,6:0,7
+chr1	210191145	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00022928;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:10,7:11,6
+chr1	210217114	.	AAG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10706;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:15,3:14,2
+chr1	210243093	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:7,7:2,1
+chr1	211222740	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0040715;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:8,4:18,5
+chr1	211535165	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:8,3:11,1
+chr1	211906826	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.37028;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:11,1:22,3
+chr1	212365429	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055341;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,5:3,1
+chr1	212796547	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0037474;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:13,7:7,4
+chr1	213046176	.	ATTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:4,8:4,3
+chr1	213063260	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=4.6521e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:9,5:10,10
+chr1	213363749	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:1,1:6,4
+chr1	213363813	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,1:9,3
+chr1	213363815	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.013285;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:4,1:5,5
+chr1	213440593	.	T	TAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0065417;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:8,6:1,2
+chr1	213651244	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0040715;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:17,5:9,4
+chr1	215133964	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0026644;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:6,7:11,10
+chr1	215192766	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.017844;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:13,4:18,6
+chr1	215391843	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=4.6905e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:21,29:13,14:8,15
+chr1	216135134	.	ACTCT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:9,2:4,3
+chr1	216169734	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0028525;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:19,3:15,8
+chr1	216439725	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
+chr1	218145450	.	G	GTGTATATATATA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.13866;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:3,3:4,1
+chr1	219170348	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,5:7,1:8,4
+chr1	219470415	.	T	TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,6:1,4:1,2
+chr1	219749979	.	C	CTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:4,4:0,1
+chr1	219927681	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.017327;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,8:7,1
+chr1	221766455	.	T	TGTGA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.010098;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,6:8,3:6,3
+chr1	221918739	.	ATATATATAT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,2:2,1:1,1
+chr1	222488773	.	CG	C	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.022703;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:56,7:46,4:10,3
+chr1	223117579	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.19365;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:12,2:21,2
+chr1	223937919	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,4:3,3
+chr1	223986360	.	C	CTAACTAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.19246;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,3:11,1
+chr1	224128983	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,8:7,7:1,1
+chr1	224276911	.	TTGACACATAAAACTAGTTTTA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,3:12,2
+chr1	224913826	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.24176;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:3,1:4,3
+chr1	225440291	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,6:3,1
+chr1	226169715	.	AC	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.16972;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:14,2:14,2
+chr1	227709976	.	G	GT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:2,2:4,2
+chr1	227959215	.	A	AT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,7:5,5:10,2
+chr1	229215269	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=7.167e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:5,8:8,5
+chr1	229421349	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.011166;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:5,7:3,5
+chr1	230354076	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0089367;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:19,3:20,8
+chr1	230580340	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.36477;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:11,1:4,3
+chr1	230830594	.	T	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,4:4,3:2,1
+chr1	233729238	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0013699;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:9,3:7,5
+chr1	234334671	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:1,4:0,1:1,3
+chr1	234342591	.	T	TTAGATAGA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.037288;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:11,5:7,4
+chr1	234699282	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,2:1,1:4,1
+chr1	234789878	.	A	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.01554;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,13:19,9:20,4
+chr1	234995623	.	ATG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.028928;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:15,6:16,1
+chr1	234995802	.	TGTATATATAG	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.02651;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:10,2:17,5
+chr1	235788804	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0022122;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:12,4:15,4
+chr1	236669073	.	T	TTTCCTTCC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,9:5,5:8,4
+chr1	237077437	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.010714;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:11,6:13,3
+chr1	237180692	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.28876;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,4:10,3:15,1
+chr1	237208940	.	A	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,2:2,2:0,0
+chr1	237451972	.	GTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:6,5:12,5
+chr1	237584647	.	C	CTGTTTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:3,3:4,2
+chr1	238337592	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.054281;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,1:11,5
+chr1	238837481	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.060295;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:14,2:13,2
+chr1	239959448	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,2:2,2
+chr1	241483294	.	A	AT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023323;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:7,5:7,6
+chr1	242385979	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0035067;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:14,5:6,3
+chr1	242475277	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=1.0723e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:23,21:12,10:11,11
+chr1	242996654	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.024218;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:14,3:7,5
+chr1	243039650	.	T	TAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.16219;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,1:17,3
+chr1	243275856	.	GT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14404;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:11,3:3,2
+chr1	244876110	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:6,5:1,1
+chr1	246288062	.	CTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:3,5:2,1
+chr1	246787147	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.010741;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:8,3:9,4
+chr1	247439061	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.035086;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:15,5:7,1
+chr1	248005651	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.025917;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:14,3:10,2
+chr1	248084006	.	A	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.045183;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:22,7:17,2
+chr10	479328	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,3:1,1
+chr10	1672704	.	C	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037811;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,5:8,6
+chr10	2723863	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.011827;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:15,3:13,5
+chr10	3458378	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:3,6:6,1
+chr10	3466719	.	G	GTA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.016109;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,12:11,8:7,4
+chr10	3957167	.	T	TTTATTATTA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010479;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,11:8,6:4,5
+chr10	4308075	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,6:4,4:3,2
+chr10	4802231	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.012987;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:35:1,5:1,1:0,4
+chr10	5047200	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.008739;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:19,2:5,4
+chr10	5957593	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10134;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,5:7,1
+chr10	6392542	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0035931;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:13,2:5,5
+chr10	6707263	.	T	TATCC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00037514;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,11:3,6:2,5
+chr10	7817849	.	GTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:7,3:4,1
+chr10	7994977	.	GA	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.040741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:6,3:3,1
+chr10	8007562	.	TTATATATATATA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:3,2:1,2
+chr10	8335904	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:8,3:4,1
+chr10	9656343	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.044512;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:14,2:12,4
+chr10	10005606	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:8,3:11,1
+chr10	10747900	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.010322;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:4,8:10,3
+chr10	11446557	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0060788;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:7,4:8,8
+chr10	11876574	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0060349;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:1,7:10,1
+chr10	12330746	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.003663;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,10:1,7:0,3
+chr10	12408848	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,5:3,1
+chr10	12413570	.	T	TTGC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14404;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:6,2:8,3
+chr10	12538885	.	C	CA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.01049;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,6:2,4:1,2
+chr10	12801333	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,1:10,3
+chr10	12889075	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.049052;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:15,4:13,4
+chr10	12929264	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:5,2:1,1:4,1
+chr10	13908164	.	T	TA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:3,8:3,2
+chr10	14373925	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,11:3,2:5,9
+chr10	15644122	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0040413;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,5:13,2
+chr10	16533321	.	A	AT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00075779;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,9:17,6:6,3
+chr10	17102252	.	C	CTTAT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014064;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,5:9,3
+chr10	17774798	.	T	TTCTCTCTC	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,7:2,3:0,4
+chr10	19563250	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.021448;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:10,3:8,1
+chr10	19748703	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.8037e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:14,5:7,9
+chr10	20140405	.	A	AAATATCTATCTATC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,8:4,6:3,2
+chr10	20721458	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0053523;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,8:8,5:4,3
+chr10	21048697	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0017392;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:11,5:13,5
+chr10	21325974	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
+chr10	21325977	.	TA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,3:3,1
+chr10	21405648	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.052629;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,5:19,2:3,3
+chr10	21871118	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00038475;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:12,4:11,7
+chr10	21883251	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,9:5,5:3,4
+chr10	23064079	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0013903;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:18,5:10,5
+chr10	23527144	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=9.1723e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:12,8:13,8
+chr10	23824646	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.00065258;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,4:2,3
+chr10	23943175	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0041352;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:10,5:9,3
+chr10	23943176	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.012535;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:11,4:7,2
+chr10	26473999	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023692;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:6,7:5,3
+chr10	26727342	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,5:2,1:11,4
+chr10	27443463	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.007525;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:8,4:9,10
+chr10	27630080	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0035533;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:4,8:8,6
+chr10	28310020	.	T	TTTTTTTA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,9:7,5:3,4
+chr10	29258674	.	AG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.065982;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:12,3:2,1
+chr10	29907575	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:4,2:12,2
+chr10	30167116	.	CATTT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0015096;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:8,15:4,11:4,4
+chr10	30706505	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.044477;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:1,0:11,4
+chr10	30715886	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:4,2:2,5
+chr10	30824000	.	G	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.4893e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:7,10:15,5
+chr10	32946749	.	TG	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,5:1,4:1,1
+chr10	33043272	.	T	TATATACA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,5:2,1:1,4
+chr10	33071607	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066077;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:8,3:14,2
+chr10	37040798	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0023764;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:15,5:9,3
+chr10	37556436	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00033391;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:12,3:14,8
+chr10	37632113	.	GA	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00024945;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,18:7,10:5,8
+chr10	37748973	.	A	ATCTCTCTC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,5:5,2
+chr10	38180750	.	A	ATTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094639;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:10,1:7,4
+chr10	38438433	.	TAA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.072845;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:20,2:9,3
+chr10	38528669	.	T	C	0	PASS	DP=475;GPV=1;SPV=0.0039538;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:263:218,45:100,21:118,24
+chr10	38652470	.	T	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12656;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:17,1:16,3
+chr10	38665946	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.040315;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:30,2:16,4
+chr10	38744008	.	AAAT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.013242;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:10,5:6,2
+chr10	38745303	.	AATG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:14,1:4,3
+chr10	38745316	.	AATG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.17641;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,1:10,3
+chr10	38807919	.	G	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13316;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,3:13,1
+chr10	38807930	.	ATTTGG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,2:13,2
+chr10	38949903	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039588;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:12,4:17,1
+chr10	38966360	.	C	T	0	PASS	DP=256;GPV=1;SPV=0.001569;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:118,26:60,7:58,19
+chr10	39156498	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0039777;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:20,4:7,5
+chr10	40065992	.	G	T	0	PASS	DP=677;GPV=1;SPV=0.0071518;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:361:312,37:167,19:145,18
+chr10	40073709	.	C	A	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.03677;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:77,10:11,2:66,8
+chr10	40371463	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.015851;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,1:5,4
+chr10	40588767	.	TC	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.056683;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:26,2:2,3
+chr10	40799584	.	C	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.021615;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:7,2:7,5
+chr10	40935692	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.19386;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:0,0:35,4
+chr10	41509751	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.021605;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:50,10:27,8:23,2
+chr10	41531607	.	A	C	0	PASS	DP=256;GPV=1;SPV=0.04229;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:131:116,15:51,2:65,13
+chr10	41542758	.	T	C	0	PASS	DP=243;GPV=1;SPV=0.032351;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:114,13:22,2:92,11
+chr10	41567788	.	C	T	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.008043;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:49,16:20,14:29,2
+chr10	41579978	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.030781;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:15,8:6,1
+chr10	41583893	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:13,3:3,2
+chr10	41589469	.	G	C	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.013577;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:62,17:48,12:14,5
+chr10	41730415	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0046915;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:24,18:12,9:12,9
+chr10	41879225	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0035252;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:7,3:14,5
+chr10	41904222	.	A	T	0	PASS	DP=177;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:86,12:59,4:27,8
+chr10	41915238	.	A	G	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.019547;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:61,7:33,3:28,4
+chr10	42071375	.	A	T	0	PASS	DP=1234;GPV=1;SPV=0.015828;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:715:629,77:2,2:627,75
+chr10	42130656	.	A	T	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.036978;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:68,17:37,9:31,8
+chr10	42841410	.	G	GA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.013124;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:3,6:4,2
+chr10	43107564	.	C	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.064915;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,2:10,2
+chr10	43167921	.	AGT	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.018608;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:15,3:15,4
+chr10	43167929	.	A	ATAATAAT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.11839;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:16,2:17,2
+chr10	44720733	.	GA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0018191;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:7,4:6,5
+chr10	45341228	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.004732;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:6,8:14,6
+chr10	45617591	.	GA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:10,4:1,1
+chr10	45710864	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0025336;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:12,11:12,8
+chr10	45749836	.	A	AAAAAAAAATATATAT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.069231;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,4:4,2:1,2
+chr10	45775938	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,3:8,3
+chr10	45836143	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,3:5,2
+chr10	45849479	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.060665;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:14,1:11,4
+chr10	45890429	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,1:6,3
+chr10	45960209	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0077158;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:10,9:4,1
+chr10	46337370	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.064086;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:14,2:24,3
+chr10	47280793	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,1:2,3
+chr10	47296068	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.13742;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,2:14,2
+chr10	49599548	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0012065;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:11,4:13,5
+chr10	50186806	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019737;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:4,1:6,7
+chr10	50722818	.	C	CTTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,5:4,3
+chr10	51349472	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,1:10,3
+chr10	51480004	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0094816;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:26,19:13,8:13,11
+chr10	51542814	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0053553;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:18,7:14,4
+chr10	52166827	.	ATG	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,1:6,4
+chr10	52244854	.	T	TAA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.064826;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:17,2:6,2
+chr10	52287706	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12458;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:8,1:5,2
+chr10	54006161	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0070897;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:8,7:8,6
+chr10	54389144	.	GGAAAAA	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.033333;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:0,3:0,2:0,1
+chr10	54558235	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00052875;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:12,7:12,3
+chr10	54853440	.	CATAT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.039138;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:15,2:4,3
+chr10	56175689	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,3:3,2:3,1
+chr10	57693902	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:14,2:5,2
+chr10	58139554	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.084902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:15,1:6,3
+chr10	58723476	.	A	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00074243;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:17,5:12,7
+chr10	60469287	.	G	GTATA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:0,2:0,1:0,1
+chr10	60469371	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:4,1:7,5
+chr10	61938883	.	GA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:5,6:2,3
+chr10	63433586	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.26429;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,4:28,3:5,1
+chr10	63486152	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024337;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,8:5,1
+chr10	64746619	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:5,6:9,2
+chr10	65077424	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:33:0,2:0,2:0,0
+chr10	65372411	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.024972;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:12,3:14,3
+chr10	65391347	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020875;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,4:5,5
+chr10	66024085	.	A	ATTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:4,3:3,1
+chr10	66845708	.	A	AAAAAAAAAAAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0047847;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,4:3,4:0,0
+chr10	66996649	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,4:7,3:4,1
+chr10	67219498	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0017936;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:11,3:17,5
+chr10	67854315	.	A	AAAAAAAT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.040043;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,5:0,4:1,1
+chr10	68203710	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.2738;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:29,3:12,2
+chr10	68760880	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:1,2:0,0:1,2
+chr10	69283124	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,4:3,3:5,1
+chr10	69632457	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.062714;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,9:4,6:8,3
+chr10	70133098	.	AAGAGAGAGAGAG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.011374;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,10:2,7:3,3
+chr10	70369605	.	CAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.044272;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,6:5,5:2,1
+chr10	70813920	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.015549;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:12,5:6,5
+chr10	73006205	.	T	TAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:3,4:2,1
+chr10	74347106	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,10:1,8:7,2
+chr10	74695615	.	GT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.24484;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:20,1:6,3
+chr10	76616929	.	CAT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:3,3:1,1
+chr10	76617080	.	A	ATAT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,3:2,6
+chr10	78221462	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.014414;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:8,3:12,8
+chr10	78814818	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.055991;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:29,6:13,2:16,4
+chr10	79322195	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0081036;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:14,3:11,3
+chr10	79806583	.	T	TTATATATATA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,8:4,6:0,2
+chr10	79879029	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00031521;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:11,9:14,5
+chr10	82132479	.	GAT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,5:8,3
+chr10	82694055	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00029546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:12,5:13,5
+chr10	82856756	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:8,7:1,1
+chr10	83255151	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0023885;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,17:7,12:4,5
+chr10	83635957	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0031185;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:7,5:11,2
+chr10	83774421	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0058487;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:14,5:16,3
+chr10	84180135	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14912;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:14,1:18,3
+chr10	85502876	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:2,3:4,1
+chr10	85930264	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0099148;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,5:8,3
+chr10	86491136	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:5,9:3,1
+chr10	86645884	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.036089;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,3:3,2
+chr10	86924514	.	A	AT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.060727;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:16,3:13,2
+chr10	88187197	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,4:2,1:4,3
+chr10	89997858	.	C	CTATCTATT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00011008;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,13:11,8:8,5
+chr10	90422967	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00016659;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,2:8,9
+chr10	90614158	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0079418;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:11,4:9,2
+chr10	92001971	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,2:1,1:6,1
+chr10	92331889	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.2419;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,4:8,1:6,3
+chr10	92721325	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011867;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:9,1:15,7
+chr10	93831288	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,4:1,3:3,1
+chr10	95066119	.	T	TGA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0059881;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:7,7:4,2
+chr10	95563605	.	CA	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027592;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:6,5:15,1
+chr10	96742764	.	CCGTA	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0001697;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:19,6:8,7
+chr10	97125533	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,10:7,7:6,3
+chr10	98397877	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,3:4,1
+chr10	98961345	.	G	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:9,2:5,2
+chr10	98997112	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.12566;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:11,5:5,1
+chr10	99356580	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12114;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:19,1:3,3
+chr10	99953819	.	A	AAAAAAAAAAAAAAAG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.042547;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:6,2:7,3
+chr10	100822227	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00081542;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:8,2:8,7
+chr10	101265768	.	ATATTTTT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,2:0,1:5,1
+chr10	103129579	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,3:4,2
+chr10	103909400	.	ATATATATG	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.29139;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:17,1:11,3
+chr10	104438348	.	G	GT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,4:7,3:5,1
+chr10	105561145	.	CG	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,1:13,3
+chr10	106277597	.	T	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0016612;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:9,3:18,6
+chr10	107044512	.	T	TA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.014832;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:7,7:1,3
+chr10	108848099	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0030923;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:13,5:21,4
+chr10	109675736	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=7.3489e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:13,22:8,10:5,12
+chr10	110165018	.	C	CTAAA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0013413;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:13,3:15,10
+chr10	110284804	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.10571;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:22,2:14,2
+chr10	111368317	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,5:12,1:10,4
+chr10	111407403	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.10049;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:16,2:17,4
+chr10	111666783	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.1241e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,19:8,12:12,7
+chr10	112265690	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=5.5695e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:7,6:10,4
+chr10	112300319	.	G	GAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.22206;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:20,3:6,1
+chr10	112546777	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.018613;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:17,4:5,4
+chr10	114638622	.	TACACACACACAC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.097397;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:18,4:6,2
+chr10	115389500	.	C	CA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.014079;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:7,4:3,4
+chr10	117191994	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03514;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,3:7,2
+chr10	117945508	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.065325;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,2:7,3
+chr10	118716605	.	C	CTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.031249;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:7,6:9,2
+chr10	118798641	.	A	ATT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,4:2,2:2,2
+chr10	119101623	.	CTCCA	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.036962;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:16,4:11,4
+chr10	119101673	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.022365;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:20,4:8,3
+chr10	120354643	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0025519;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,10:3,9:1,1
+chr10	121090620	.	CAAA	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,9:3,6:1,3
+chr10	121781176	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.10714;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:1,2:0,0
+chr10	122634430	.	TTCTCTCTCTC	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:4,1:1,3
+chr10	123072479	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:13,5:9,4:4,1
+chr10	124932281	.	AT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,5:4,4:3,1
+chr10	125352979	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00019486;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:12,7:13,7
+chr10	125894156	.	C	T	0	PASS	DP=106;GPV=1;SPV=0.023456;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:46,10:16,2:30,8
+chr10	126216045	.	C	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0011799;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:15,4:15,6
+chr10	126221389	.	CAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:9,7:2,3
+chr10	126251605	.	GATGGATGC	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.19313;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:12,3:17,1
+chr10	126649667	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00086088;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:10,4:13,6
+chr10	128924414	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.053114;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:11,1:17,3
+chr10	128924425	.	C	CATCT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.043835;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,4:7,2:15,2
+chr10	130222537	.	A	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0013769;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:16,5:13,5
+chr10	130226463	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0015113;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:5,5:17,3
+chr10	130790561	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.13721;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:14,2:22,3
+chr10	130815854	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.020691;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:14,3:9,3
+chr10	133644072	.	G	GA	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.0019294;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:64,19:31,6:33,13
+chr10	133657666	.	G	A	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.025772;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:124,27:52,11:72,16
+chr10	133660260	.	G	A	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.039804;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:64,12:31,10:33,2
+chr10	133770603	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,2:8,2
+chr10	133770626	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.23659;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,4:11,1
+chr11	131580	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.028495;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,4:11,5
+chr11	172718	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.059999;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:11,1:14,5
+chr11	897146	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
+chr11	2018276	.	T	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00055309;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:13,4:16,7
+chr11	2233897	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,1:6,5
+chr11	2233901	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,1:6,3
+chr11	2285949	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.1411e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:10,6:8,7
+chr11	2749591	.	C	CCT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.048755;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,2:6,4
+chr11	2878233	.	C	CCTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.049774;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:3,5:3,1
+chr11	3094552	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.017945;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:12,4:14,5
+chr11	5202019	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=2.4825e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:6,4:12,9
+chr11	6435147	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00065175;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:17,5:8,8
+chr11	6774952	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,2:2,2
+chr11	8149017	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.021743;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:11,4:8,2
+chr11	8330531	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,3:7,2
+chr11	9880116	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.010716;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:3,3:6,5
+chr11	10310625	.	C	CAG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.13105;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,2:10,3
+chr11	10310678	.	A	AGAGAGAGC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,5:11,1:2,4
+chr11	10562946	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:5,4:0,0
+chr11	11086280	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.274e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:10,5:9,10
+chr11	11923048	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.016783;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,6:1,2:2,4
+chr11	12564523	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,9:3,3:3,6
+chr11	15530642	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0092761;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,4:8,1
+chr11	15639211	.	A	AAG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.43134;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:24,2:12,2
+chr11	16479708	.	AAACT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.048259;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,1:9,3
+chr11	16479713	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,1:12,3
+chr11	16906224	.	T	TAGGA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.046139;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,6:13,4:6,2
+chr11	18247346	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0016408;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:6,3:19,6
+chr11	18251982	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.50909;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,2:1,1:5,1
+chr11	19351976	.	A	AGT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.020223;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:10,5:6,6
+chr11	20798970	.	GATAAATACGGACAAAATTAAACCTAATGATAAACGTCATGGAAGAAA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,1:7,3
+chr11	21192060	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00034257;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:11,6:10,9
+chr11	21358565	.	A	ATTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:2,6:3,1
+chr11	21403606	.	CAA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0015106;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:9,4:4,11
+chr11	21403609	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0027281;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,14:9,4:6,10
+chr11	22269501	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,4:7,3:5,1
+chr11	22641298	.	ATATC	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03942;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,5:10,3
+chr11	24079271	.	AAG	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12152;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,6:8,1:10,5
+chr11	24388535	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.021839;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:4,1:8,9
+chr11	24388935	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
+chr11	24455988	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00027241;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:6,4:10,6
+chr11	24984719	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0024374;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:8,8:11,2
+chr11	25804733	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=1.7307e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:2,5:12,10
+chr11	26016983	.	GAA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:10,8:4,3
+chr11	27436375	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:16,1:4,3
+chr11	27439901	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0063246;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,8:5,5:0,3
+chr11	27731810	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0025244;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:11,4:17,5
+chr11	28181258	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.092258;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:16,3:11,1
+chr11	28312566	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:34:0,2:0,0:0,2
+chr11	28455216	.	CTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,5:2,2
+chr11	28799096	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0065944;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:16,3:17,7
+chr11	29145810	.	A	AAAAAAAAAAAAAAAGG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.027053;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,3:4,3
+chr11	29504566	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,6:0,2:0,4
+chr11	30945750	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:4,2:18,3
+chr11	31518494	.	A	AT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.029832;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,4:5,4
+chr11	32498387	.	G	GTCTTTCTT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.038499;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:12,3:16,5
+chr11	33118747	.	TA	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.006003;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:25,24:10,12:15,12
+chr11	33154486	.	ACTTT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,3:6,1
+chr11	34194702	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0063293;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:8,4:15,5
+chr11	34520476	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,8:2,3:5,5
+chr11	35002384	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:2,5:4,2
+chr11	35419998	.	G	C	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=3.7727e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:28,18:13,13:15,5
+chr11	35827781	.	T	TAATAATAATAATAATAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,3:9,2:2,1
+chr11	36128154	.	ATTAAAC	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035568;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,4:7,1
+chr11	37099828	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:2,1:4,3
+chr11	37099830	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10577;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:3,1:3,4
+chr11	37190545	.	AAGAGAGAG	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11404;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:8,4:2,1
+chr11	37348286	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.017591;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,4:4,3
+chr11	37534487	.	GTT	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:7,1:4,3
+chr11	39574939	.	GTA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.034924;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,2:5,3
+chr11	39612074	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00072552;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,12:8,7:2,5
+chr11	40381954	.	G	GTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,3:3,1
+chr11	41093927	.	C	CA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
+chr11	41938402	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.014707;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:13,4:12,2
+chr11	41959443	.	A	ATATATATCTATCTATC	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0025738;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:9,3:7,3
+chr11	42383876	.	TA	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.11505;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:17,2:14,2
+chr11	43705751	.	CCT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0037594;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:2,5:1,3
+chr11	44065496	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,5:4,1
+chr11	44663344	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.083396;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,6:8,1:12,5
+chr11	44700701	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,4:8,2:11,2
+chr11	44943603	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=4.2642e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:14,13:15,2
+chr11	46169560	.	AAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:12,9:2,3
+chr11	46328664	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,4:3,2:6,2
+chr11	47250805	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.0361e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:13,8:7,7
+chr11	47488306	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.069354;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:12,4:12,1
+chr11	47765374	.	A	AAAAAGAAAAGAAAAG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:3,1:6,5
+chr11	48571931	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,4:12,2:4,2
+chr11	49406779	.	GTATATATATATATATATATATCTGTA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,4:4,2:1,2
+chr11	49803343	.	CTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,9:1,7:1,2
+chr11	49859015	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0063246;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,8:3,7:2,1
+chr11	49885040	.	A	ATTTCTTTC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,4:1,2:16,2
+chr11	51157750	.	A	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.011806;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,10:17,4:24,6
+chr11	51248292	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:15,7:14,4
+chr11	51911615	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.092258;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:8,1:19,3
+chr11	52146099	.	C	A	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.017156;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:90,16:75,14:15,2
+chr11	52284240	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:7,1:16,3
+chr11	52341887	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.022999;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:6,5:1,1
+chr11	52495354	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.048152;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:27,1:6,4
+chr11	52739176	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.098889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:21,3:11,1
+chr11	53141533	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.028921;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:2,2:8,4
+chr11	53563809	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.060214;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:21,1:5,3
+chr11	54269194	.	T	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
+chr11	54371781	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:12,5:0,1
+chr11	54401653	.	C	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.2538;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,1:13,3
+chr11	54410525	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,1:9,3
+chr11	54412246	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0057488;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:15,11:1,1
+chr11	54414499	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.02311;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:17,4:11,5
+chr11	55403395	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:1,6:1,3:0,3
+chr11	55403571	.	C	CTTTGCTTACTTTGACA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.032805;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:3,8:8,2
+chr11	55403572	.	C	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023692;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:3,9:8,1
+chr11	55639158	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0063358;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:10,2:13,4
+chr11	55765156	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.019042;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:8,8:6,2
+chr11	56497195	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.012401;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:24,2:14,6
+chr11	56756712	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,2:7,2:0,0
+chr11	56759810	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.025141;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:13,8:12,1
+chr11	57515518	.	G	A	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00035161;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:40,16:19,8:21,8
+chr11	57558174	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.020953;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:24,8:14,1
+chr11	57918856	.	A	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.011037;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:4,3:1,3
+chr11	57996477	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.042491;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:9,6:10,1
+chr11	58008340	.	G	GT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,1:5,3
+chr11	58677727	.	TCATC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,2:2,1:3,1
+chr11	59195438	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:34:0,2:0,1:0,1
+chr11	60950325	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0011003;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:17,5:18,6
+chr11	61601275	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0017165;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:16,4:22,8
+chr11	63177856	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,2:0,2:0,0
+chr11	63177859	.	TATATA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,2:1,2:0,0
+chr11	63382288	.	T	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00078184;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:7,4:9,8
+chr11	63500547	.	G	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00026014;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:8,5:14,5
+chr11	63860485	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00031973;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:8,8:12,6
+chr11	64582170	.	CTCA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:3,1:8,3
+chr11	65843220	.	CAA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,12:5,9:2,3
+chr11	68000043	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0040978;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:15,3:12,5
+chr11	68870443	.	AAG	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
+chr11	69351971	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.04647;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:16,3:18,3
+chr11	71135483	.	T	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,3:3,2:2,1
+chr11	72079109	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00040558;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:16,9:13,5
+chr11	75318174	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,2:7,3
+chr11	75821122	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=5.2903e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:12,5:7,8
+chr11	76103537	.	G	GT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026092;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:13,4:8,3
+chr11	76602194	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0025828;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:16,6:13,5
+chr11	77479602	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,3:2,2
+chr11	77617367	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.43846;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,6:7,5:10,1
+chr11	77646783	.	A	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.030474;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,5:8,4
+chr11	78160253	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:11,2:5,2
+chr11	79150786	.	G	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=1.7558e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:10,3:6,10
+chr11	79164083	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:2,3:8,2
+chr11	79337046	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0061819;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:7,5:25,4
+chr11	80400038	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0007584;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:11,7:6,12
+chr11	82380028	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.014488;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:5,3:15,3
+chr11	84408706	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014243;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:15,4:12,4
+chr11	84434118	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.019899;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,6:9,5:5,1
+chr11	85500561	.	T	TAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,2:3,2:0,0
+chr11	85862285	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00051706;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,7:11,3
+chr11	86139968	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00019835;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,6:10,4
+chr11	86307577	.	C	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.041764;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:15,8:22,5
+chr11	86496410	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:7,2:2,1:5,1
+chr11	87189112	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,1:10,3
+chr11	87690200	.	T	TA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,2:0,1:3,1
+chr11	87690207	.	A	AAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,3:1,2:2,1
+chr11	88251411	.	G	GTA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.027067;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,14:12,7:6,7
+chr11	89778365	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.010773;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:35,19:17,4:18,15
+chr11	90096787	.	C	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.019162;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,5:8,2
+chr11	90495498	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:2,2:6,9
+chr11	90855626	.	A	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,2:5,1:1,1
+chr11	91278918	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=1.2971e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:13,7:7,11
+chr11	91651351	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.013929;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:17,5:10,2
+chr11	91821128	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0021435;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:8,5:15,5
+chr11	96978545	.	GTCTGTCTA	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00010656;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:4,8:8,6
+chr11	97056518	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0006295;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:16,8:14,5
+chr11	98285550	.	GAAA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0021323;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:4,8:2,2
+chr11	98917076	.	A	AAAAGG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.025795;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,8:5,4:8,4
+chr11	99433372	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.17641;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,3:15,1
+chr11	99747460	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.30914;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:9,3:12,1
+chr11	99966592	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00027813;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:11,7:12,6
+chr11	100610603	.	T	TAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0022326;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,14:6,8:7,6
+chr11	100802424	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:7,5:6,1
+chr11	100891439	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,9:2,5:2,4
+chr11	101100605	.	C	CCACA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.006848;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:9,5:7,5
+chr11	102512185	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:5,4:3,2:2,2
+chr11	102919535	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:1,7:2,1
+chr11	103568084	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027878;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:11,4:8,5
+chr11	103875221	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.025087;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:15,4:8,4
+chr11	105540750	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.011697;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:13,2:18,5
+chr11	106418553	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0018599;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:11,5:9,7
+chr11	106698539	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0040737;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:24,7:9,8
+chr11	107816288	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:15,3:5,1
+chr11	110307048	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.046286;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:12,4:24,3
+chr11	110388783	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0042329;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:6,4:18,3
+chr11	112871174	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:5,5:2,4:3,1
+chr11	113980141	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0015657;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:20,7:13,4
+chr11	114330231	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0077158;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:6,7:8,3
+chr11	114786893	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00024383;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:14,7:15,6
+chr11	114948253	.	GT	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.001548;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:2,5:1,2
+chr11	115053884	.	A	AATGG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0014606;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:4,10:8,4
+chr11	115694770	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0017887;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:15,8:15,5
+chr11	116434916	.	C	CTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,7:7,6:5,1
+chr11	116673394	.	T	TATTTA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:9,2:8,2
+chr11	117473268	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00032976;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:12,8:13,5
+chr11	117515713	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0027092;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:4,5:10,3
+chr11	118246585	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.12566;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:8,5:8,1
+chr11	118888521	.	G	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01745;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:12,3:14,5
+chr11	118975509	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:5,2:3,1:2,1
+chr11	119805179	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0041454;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:6,2:12,4
+chr11	119848761	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,4:9,3:8,1
+chr11	121865084	.	A	ATT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02043;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:10,3:5,4
+chr11	122837751	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.3193;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,6:7,3:4,3
+chr11	124885580	.	G	GTTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.025685;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,9:7,5:7,4
+chr11	125346787	.	C	CAGGAAGGGAGGA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.01594;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:10,7:10,5
+chr11	125726507	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0023569;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:1,9:6,1
+chr11	126551652	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0079902;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,14:8,10:4,4
+chr11	129485119	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.7374e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,19:13,7:11,12
+chr11	129518147	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0092505;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:4,4:6,1
+chr11	130091211	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.012389;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:10,5:13,3
+chr11	130091323	.	A	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15365;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:9,1:17,3
+chr11	130501444	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00025408;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:11,9:12,3
+chr11	131337917	.	G	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=8.8691e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:9,4:7,8
+chr11	131566736	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0004313;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:13,4:10,5
+chr11	131873625	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:4,3:6,6
+chr11	132275701	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040348;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:5,3:10,3
+chr11	132867624	.	C	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021382;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,2:9,5
+chr11	133021718	.	G	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,1:13,3
+chr11	133231910	.	AAATGGACACATGATGTAAAAGGCTTAGGATCCTACAAGGAAGGGC	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.12928;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,2:9,2
+chr11	133538191	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,4:4,2
+chr11	134344730	.	C	G	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.038105;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:48,9:26,6:22,3
+chr11	134454134	.	G	GT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.076397;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:12,3:21,1
+chr12	11409	.	G	T	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.028618;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:75,16:26,3:49,13
+chr12	13514	.	C	T	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.036054;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:116:99,17:49,11:50,6
+chr12	187635	.	A	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.02028;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,7:1,2:1,5
+chr12	580598	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:18,4:10,2:8,2
+chr12	964966	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.087068;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:9,2:23,3
+chr12	1121638	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.024893;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:6,1:8,9
+chr12	1259506	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:10,2:6,2
+chr12	1484165	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0095299;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:9,9:7,5
+chr12	1958016	.	A	AAT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,2:6,2
+chr12	2790464	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0025828;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:17,5:12,6
+chr12	2835159	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.013095;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:12,5:3,3
+chr12	2842204	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0012781;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,13:4,5:3,8
+chr12	2883511	.	ATTTTTTTT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.016317;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:1,7:1,2:0,5
+chr12	3023790	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12406;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:8,10:3,9:5,1
+chr12	4482205	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.21888;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,2:17,2
+chr12	4835134	.	A	AT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0046097;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,13:4,11:11,2
+chr12	5923185	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,8:8,6:6,2
+chr12	6379933	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,4:3,3
+chr12	7300160	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0071032;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,10:4,5:3,5
+chr12	8184805	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.018137;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:18,10:8,2
+chr12	8310981	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.038906;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:19,3:11,3
+chr12	8397545	.	G	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.03877;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:38,14:17,9:21,5
+chr12	8983395	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:1,8:6,1
+chr12	9295114	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.039095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:16,2:8,4
+chr12	9296551	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.039229;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:38,8:9,7:29,1
+chr12	9311675	.	C	CGTT	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.049696;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,6:17,1:14,5
+chr12	9429685	.	C	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.087152;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:56,7:31,4:25,3
+chr12	11957489	.	AAAAC	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:9,2:11,2
+chr12	13469811	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0012661;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:5,4:14,6
+chr12	13999732	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:4,3:1,1
+chr12	14321198	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0029872;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:13,6:7,2
+chr12	14745345	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0024472;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,7:7,4:1,3
+chr12	16204381	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0012775;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:7,4:11,6
+chr12	16341133	.	CAT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,2:13,2
+chr12	17063515	.	TTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0084291;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,1:6,5
+chr12	17346228	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,7:2,6:1,1
+chr12	17506656	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0017392;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:16,4:8,6
+chr12	19197676	.	CTG	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.042556;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,7:6,5:6,2
+chr12	20112787	.	G	GT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.012665;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:10,4:9,2
+chr12	20400379	.	GTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:10,5:6,1
+chr12	21933091	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:8,7:7,1
+chr12	23068157	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,5:2,3:3,2
+chr12	23086073	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,3:1,2:0,1
+chr12	23807642	.	A	ATT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.021659;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:15,7:1,3
+chr12	23971530	.	A	AATATAT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0065711;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:7,9:6,3
+chr12	24811355	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0022392;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:13,5:8,3
+chr12	24955965	.	C	CTTTTTTTTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:1,6:1,5:0,1
+chr12	25015163	.	T	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,1:3,3
+chr12	25174553	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.047937;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,10:13,2:5,8
+chr12	25487810	.	G	GCT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,3:7,1
+chr12	25591811	.	C	CAGAGAG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034547;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,6:5,1
+chr12	26308736	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.015698;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,3:4,2
+chr12	28758041	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.082705;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:16,3:12,2
+chr12	29253263	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15731;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,3:18,2:7,1
+chr12	29960382	.	GT	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.023174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:12,3:8,4
+chr12	31094748	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.088975;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:11,2:23,3
+chr12	31606167	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014699;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:12,10:10,5
+chr12	32033307	.	C	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,4:7,1:9,3
+chr12	32393794	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:6,6:2,1
+chr12	32407121	.	ATT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00091984;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:6,8:1,3
+chr12	32432051	.	ATTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.013369;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,6:2,1:0,5
+chr12	33886040	.	T	TATA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr12	33996063	.	T	C	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.038868;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,10:26,5:15,5
+chr12	33996090	.	T	C	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.0015714;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:37,16:23,9:14,7
+chr12	34343706	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00055843;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:17,9:14,5
+chr12	34896723	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.09755;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:2,0:31,4
+chr12	34907276	.	A	AC	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.054264;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,4:0,3:19,1
+chr12	34946259	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.054545;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:14,1:20,3
+chr12	34993583	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.085668;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:0,0:27,4
+chr12	35105084	.	G	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,1:5,7
+chr12	35171982	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.047637;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:19,9:12,2
+chr12	35235849	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0432;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:2,0:19,4
+chr12	35286257	.	G	T	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.027638;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:82:69,13:53,11:16,2
+chr12	35560028	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.13663;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:8,2:19,2
+chr12	35577468	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.052006;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:35,4:0,0
+chr12	35655158	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.029808;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:4,2:29,4
+chr12	35682353	.	T	A	0	PASS	DP=94;GPV=1;SPV=0.0031482;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:22,5:14,2
+chr12	35759260	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:21,4:2,0
+chr12	35801570	.	C	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.043079;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:6,2:39,10
+chr12	35964280	.	C	T	0	PASS	DP=168;GPV=1;SPV=0.02841;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:73,17:62,13:11,4
+chr12	36080780	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0015009;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:6,1:13,8
+chr12	36151977	.	G	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,3:9,1
+chr12	36469140	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.12656;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:1,0:32,4
+chr12	36469188	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1713;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:0,0:30,4
+chr12	36518398	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:2,2:9,5
+chr12	36674609	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.071318;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:13,3:7,1
+chr12	36674944	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:1,0:16,4
+chr12	36959746	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.052652;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:7,1:18,5
+chr12	37014517	.	A	T	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.049161;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:92,12:66,4:26,8
+chr12	37239948	.	GA	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.01632;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:17,4:9,2
+chr12	37455881	.	C	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.044228;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:15,7:16,1
+chr12	37656089	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.036872;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:15,2:12,3
+chr12	37784945	.	AC	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,2:5,3
+chr12	38058859	.	CTTTCTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:2,2:12,2
+chr12	38453032	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00032936;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:12,10:13,5
+chr12	38538884	.	GTGA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.027067;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:10,8:8,3
+chr12	38538890	.	C	CATATAAAGAAGTTAAGAAG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0080824;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,11:9,8:9,3
+chr12	38636228	.	A	AT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0063848;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,16:11,11:6,5
+chr12	38973727	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0078484;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:8,3:18,6
+chr12	39398849	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.4853e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:12,7:7,9
+chr12	40707247	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037638;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:4,2:12,7
+chr12	40999697	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.041917;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,7:4,2
+chr12	42499725	.	A	AATTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011728;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:8,4:5,6
+chr12	42635112	.	CAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,3:4,1
+chr12	42966839	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,7:7,2:6,5
+chr12	43419885	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00043872;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,3:11,7
+chr12	44311831	.	G	GTA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0072523;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:8,6:16,3
+chr12	44488909	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0033344;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:6,7:2,3
+chr12	45899695	.	TTA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.018691;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:2,2:5,4
+chr12	46089197	.	C	CTTCTTTCT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.012102;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:5,3:6,4
+chr12	47261948	.	TG	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.055233;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:21,3:13,2
+chr12	48172711	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.17135;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,3:6,2
+chr12	50643045	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:9,3:17,1
+chr12	50643405	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,11:4,9:7,2
+chr12	50872835	.	AT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.068288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:16,3:10,2:6,1
+chr12	51248436	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:2,4:0,3:2,1
+chr12	51522310	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.033568;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:11,6:17,4
+chr12	52002135	.	C	CA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
+chr12	55266757	.	A	AT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.041136;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:16,6:13,1
+chr12	55930357	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:6,3:3,2
+chr12	56640232	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0098129;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:12,4:10,5
+chr12	56776304	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0019317;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,12:5,7:1,5
+chr12	57711038	.	CAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0093911;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,8:1,7:5,1
+chr12	57795072	.	C	CATAT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.022117;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:8,5:10,4
+chr12	61106700	.	C	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0022245;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:22,3:12,5
+chr12	62938722	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0084281;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:5,4:0,0
+chr12	63438244	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0090318;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:13,4:4,3
+chr12	63464165	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.012394;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,2:9,4
+chr12	63949081	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0045492;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:12,6:10,3
+chr12	64356180	.	A	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.10901;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:17,4:14,3
+chr12	64540990	.	AT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0059157;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:0,1:11,6
+chr12	64955122	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=4.5066e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:8,4:7,9
+chr12	64983618	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:1,2:7,2
+chr12	66227761	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034547;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:12,5:2,2
+chr12	68111401	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041126;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:13,3:2,2
+chr12	68331423	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=3.4893e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:10,6:12,9
+chr12	68616438	.	ATT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.063892;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,7:12,6:7,1
+chr12	69595688	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013514;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,6:4,1
+chr12	69817653	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,10:5,7:4,3
+chr12	71193861	.	TA	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.8197e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:11,10:11,3
+chr12	71877499	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,3:3,1:1,2
+chr12	72716379	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00031881;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,7:9,3
+chr12	73715082	.	A	AAAAAAAATATAT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,7:2,4:1,3
+chr12	73883284	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0016051;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:9,3:11,4
+chr12	74714924	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:3,3:5,6
+chr12	75507756	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0001004;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:6,4:15,7
+chr12	75905157	.	A	ATT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10134;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:13,5:3,1
+chr12	75993190	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.15872;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:18,4:15,1
+chr12	75999073	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,6:5,3
+chr12	76499350	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.030957;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,5:5,2:12,3
+chr12	76953803	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023923;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:28:2,16:2,13:0,3
+chr12	79392798	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:2,3:3,2
+chr12	79410506	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:1,4:3,1
+chr12	80462715	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.031485;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:17,1:14,9
+chr12	80514402	.	A	ACACACACACTCTCT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:6,4:7,3
+chr12	82538752	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.091614;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:9,3:13,1
+chr12	83337241	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.22807;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,4:5,2:6,2
+chr12	83506267	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0038562;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,7:6,2
+chr12	83518298	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0011889;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:10,2:9,5
+chr12	83749058	.	A	AACACACACACAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.038306;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:10,4:6,2
+chr12	83964438	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0048152;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:12,3:9,3
+chr12	84185099	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0074047;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,2:11,6
+chr12	84301493	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=4.0736e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,18:6,9:6,9
+chr12	84393961	.	C	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:1,1:5,3
+chr12	84615985	.	TAC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:5,2:5,2
+chr12	86441639	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0051557;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:18,4:7,6
+chr12	87007903	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.028995;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:13,4:15,3
+chr12	87774931	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0028652;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:11,5:14,8
+chr12	88365088	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.020419;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,7:10,3
+chr12	88992260	.	ATAT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.043711;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:13,4:10,4
+chr12	89324028	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.093231;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,7:9,2:7,5
+chr12	91106690	.	T	TAAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0023454;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:1,4:1,2
+chr12	91851986	.	T	TGATAG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036036;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:4,2:9,2
+chr12	93017161	.	CTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,3:2,1
+chr12	93729785	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.022983;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,14:11,9:6,5
+chr12	94759340	.	ATT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,9:2,2:2,7
+chr12	95813784	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:4,3:4,1
+chr12	96199480	.	C	CTG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0025584;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,10:8,7:0,3
+chr12	98327081	.	A	AGTGTGTGT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0068111;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,7:4,6:1,1
+chr12	98475036	.	GACACACACACACACACACAC	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,6:3,3:0,3
+chr12	98555416	.	C	CTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:2,6:1,1
+chr12	99730324	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:20,4:8,2:12,2
+chr12	99897852	.	TA	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.05062;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:15,2:6,2
+chr12	101451303	.	G	GTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,6:1,4:0,2
+chr12	101591855	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.11761;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:6,1:21,4
+chr12	102996453	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0082367;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:7,5:13,3
+chr12	103385770	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.001027;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,4:8,5
+chr12	103460284	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,2:3,1:2,1
+chr12	103716625	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00076721;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:12,5:16,7
+chr12	105186673	.	TG	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.18481;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,4:10,1:18,3
+chr12	105186676	.	T	TCG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.20137;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:11,1:19,3
+chr12	105876519	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:5,5:1,1
+chr12	105991252	.	CTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0079365;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:15:0,5:0,2:0,3
+chr12	106103144	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=8.1008e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:11,6:8,6
+chr12	106125324	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.004688;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:14,7:12,1
+chr12	106770243	.	C	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,5:11,1:4,4
+chr12	107452202	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049827;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:10,7:9,2
+chr12	107524073	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0074047;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:13,1:11,7
+chr12	108954113	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.026877;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,5:4,2
+chr12	109123180	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.018165;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:6,6:9,3
+chr12	109140280	.	T	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.16319;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,1:7,3
+chr12	109979272	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,5:4,2
+chr12	111143813	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=9.7753e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:14,4:16,11
+chr12	112797944	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0011747;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:30,14:15,10:15,4
+chr12	112915265	.	G	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01745;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:11,6:15,2
+chr12	113354067	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:2,3:3,1
+chr12	113496258	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.11275;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,5:11,2:8,3
+chr12	113496259	.	A	ATCTATC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,5:11,2:8,3
+chr12	114384744	.	CA	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.040224;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,2:13,3
+chr12	114556511	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0027454;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:20,6:10,6
+chr12	114803944	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0077151;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:14,4:11,3
+chr12	115416653	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.083817;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,2:12,2
+chr12	115441810	.	CTCTCTCTCTCTATATATA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.056191;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:10,7:4,2:6,5
+chr12	116697288	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,7:5,6:6,1
+chr12	117133313	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:11,3:4,1
+chr12	117265151	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=4.3702e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:15,7:15,10
+chr12	117678102	.	AT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.017137;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:11,8:10,6
+chr12	118823821	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:5,5:4,2:1,3
+chr12	119189302	.	GGTGT	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0065417;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:9,17:5,11:4,6
+chr12	120174789	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.32536;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:9,3:4,1
+chr12	120876808	.	T	TAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016242;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:9,7:3,3
+chr12	120899888	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,7:12,6:4,1
+chr12	120926962	.	ATATATATTATATAATATGTAT	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:2,1:3,1
+chr12	121219615	.	GGATA	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0052134;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,11:6,6:8,5
+chr12	121219623	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:12,16:6,7:6,9
+chr12	121494999	.	C	CTT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.028934;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:11,8:5,1
+chr12	121582304	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:2,5:2,1
+chr12	121604441	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.028534;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:11,7:2,1
+chr12	122267207	.	C	CT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.062937;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:1,4:3,1
+chr12	123246709	.	ATTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,4:4,2:4,2
+chr12	123414932	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.014654;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,10:9,8:5,2
+chr12	124022613	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:2,2:0,2
+chr12	124230450	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0040457;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:13,8:13,2
+chr12	124258456	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,8:3,7:2,1
+chr12	124260258	.	C	CACCAGGGGCTGGGGCGAAG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049781;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,14:9,6:11,8
+chr12	124367275	.	GGCACACACAGAGGCCCA	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.020935;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:10,8:13,5
+chr12	124922325	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12114;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
+chr12	125368947	.	G	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0083551;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:7,4:9,6
+chr12	126008544	.	AT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.047759;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:6,2:9,3
+chr12	126224220	.	A	AATTT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:6,4:10,5
+chr12	126612633	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.017866;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,3:9,7
+chr12	127341339	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0066425;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:5,4:17,7
+chr12	128113723	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0063642;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:8,7:8,2
+chr12	128242360	.	T	TCA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:22,3:2,1
+chr12	128775465	.	TG	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:14,1:10,3
+chr12	128874124	.	C	CTTTCTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010836;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:0,3:4,2
+chr12	129030702	.	CA	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.018421;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:20,4:6,3
+chr12	129140839	.	C	CAA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029963;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:10,9:5,4
+chr12	129506555	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.01088;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,7:9,3
+chr12	129623698	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0089009;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:6,4:7,1
+chr12	129654467	.	T	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00037701;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:18,8:12,7
+chr12	129942879	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=2.4555e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:22,14:17,5:5,9
+chr12	129958612	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0015169;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:13,4:13,4
+chr12	130905153	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.24625;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:14,3:5,1
+chr12	131255918	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.09062;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:2,1:15,3
+chr12	131414147	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:9,1:11,3
+chr12	131451477	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,8:3,7:3,1
+chr12	131574660	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.058443;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,1:10,4
+chr12	131925532	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:3,1:7,3
+chr12	132460047	.	CT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00019001;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:3,16:1,10:2,6
+chr12	132618228	.	A	AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,4:6,2:7,2
+chr12	132965125	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,5:8,3:2,2
+chr12	132981089	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.18132;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,4:5,1:2,3
+chr12	133223445	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.062192;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:15,5:2,1
+chr13	18176119	.	ATTGT	A	0	PASS	DP=349;GPV=1;SPV=0.049953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:129,19:57,11:72,8
+chr13	18196357	.	G	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.013484;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:49,7:25,3:24,4
+chr13	18242421	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00038112;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:11,6:13,6
+chr13	18349087	.	TTC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:14,1:4,4
+chr13	18460379	.	T	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.14853;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,5:11,1
+chr13	20290669	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0015113;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:10,3:12,5
+chr13	20937932	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0033344;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,10:3,7:5,3
+chr13	21702976	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10931;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:10,1:20,3
+chr13	22184374	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10288;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:6,5:8,1
+chr13	22770497	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.013164;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:13,22:10,15:3,7
+chr13	23055101	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,6:2,2
+chr13	23930675	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083916;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,5:2,4:3,1
+chr13	24664442	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037397;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,16:10,12:3,4
+chr13	24871958	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0088578;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:1,6:1,4:0,2
+chr13	25101116	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:4,5:5,1
+chr13	25159298	.	G	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.046962;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,2:4,3
+chr13	25310206	.	ATT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:7,4:6,8
+chr13	25510222	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0061587;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,7:2,4:5,3
+chr13	25560700	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:2,5:5,1
+chr13	26472514	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15441;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,2:4,1:1,1
+chr13	26683494	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.076923;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:2,2:1,1:1,1
+chr13	27051795	.	G	GATAT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.032508;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:2,2:3,2
+chr13	28326520	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:2,4:5,2
+chr13	28358395	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00056171;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:14,4:14,9
+chr13	28737317	.	TTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,5:1,2:4,3
+chr13	28772119	.	GAGCAGTGGTTTGTAGTTCTCCTTGA	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0015605;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:15,5:16,5
+chr13	29081781	.	TTTTG	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.090553;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:14,2:9,4
+chr13	29195540	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018182;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:0,8:0,6:0,2
+chr13	29978615	.	AAT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,4:4,3
+chr13	30101349	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.00086221;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:20:4,16:2,12:2,4
+chr13	30474759	.	C	CT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,3:4,1
+chr13	30674886	.	AT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:6,2:3,3
+chr13	31657376	.	CAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013867;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:3,7:6,1
+chr13	31730519	.	TTGTGTGTG	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0077803;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,9:4,6:4,3
+chr13	31860415	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0014516;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,7:4,2
+chr13	32096802	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.030702;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,4:3,4:0,0
+chr13	32571160	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00052721;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:7,6:3,9
+chr13	32631118	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0075758;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:30:1,5:1,2:0,3
+chr13	33499606	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,2:0,0:7,2
+chr13	34586081	.	GAAAGAA	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029515;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:7,6:0,1
+chr13	34624031	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:11,4:0,3
+chr13	34752795	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=1.7354e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,19:5,12:5,7
+chr13	34760342	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=2.9244e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:8,9:10,9
+chr13	35298213	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:19:1,4:1,2:0,2
+chr13	36376549	.	C	CT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.027569;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:2,3:0,2:2,1
+chr13	37309075	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,7:3,6:1,1
+chr13	37320734	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.040224;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:15,4:12,1
+chr13	37830561	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.030612;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:14,5:10,2
+chr13	39542096	.	T	TATAATAATA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,8:2,3:7,5
+chr13	39581532	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0070393;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,9:5,7:4,2
+chr13	40176928	.	AAG	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.03876;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,1:10,4
+chr13	40368888	.	A	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,5:5,2:3,3
+chr13	40867524	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.023188;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,3:4,3
+chr13	40867542	.	AT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0046977;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,4:3,4
+chr13	41596788	.	T	TACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01391;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,6:4,1
+chr13	41758415	.	T	TGGA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,5:2,1:1,4
+chr13	41758421	.	T	TGGA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,1:2,4
+chr13	41863360	.	TTA	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.011229;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:2,4:7,5
+chr13	42109651	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0023411;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,4:1,1:2,3
+chr13	42420881	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00011169;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:11,3:10,10
+chr13	42735776	.	CGTGT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,13:6,8:5,5
+chr13	43003290	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00043872;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:14,5:9,5
+chr13	43940611	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0084069;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:11,13:1,7:10,6
+chr13	44595734	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00020063;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:10,9:21,2
+chr13	44914001	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:0,2:0,2:0,0
+chr13	45191215	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,6:6,5:5,1
+chr13	45367313	.	TAAA	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.026533;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:6,5:3,3:3,2
+chr13	45438626	.	A	AC	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.048951;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,4:1,3:2,1
+chr13	45958653	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03735;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:8,5:4,1
+chr13	47126806	.	TAC	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,14:5,10:2,4
+chr13	47223657	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,3:5,1
+chr13	47638039	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01726;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,10:5,8:6,2
+chr13	48316719	.	TCACACACA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:9,4:2,1
+chr13	50100936	.	CA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.017385;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:3,9:1,8:2,1
+chr13	50298168	.	T	TTTG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,1:4,3
+chr13	50939361	.	G	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,1:6,3
+chr13	51173109	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.019857;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:20,6:12,2
+chr13	51173229	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.04213;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:19,9:23,5
+chr13	52260651	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,7:4,6:2,1
+chr13	52269146	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00024273;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:5,6:3,6
+chr13	52273946	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.012694;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:3,5:4,2
+chr13	52294613	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01473;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,5:4,4
+chr13	53138999	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00019282;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:13,5:11,6
+chr13	53306335	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,9:4,4:2,5
+chr13	53506715	.	TTATA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00090577;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,15:4,10:4,5
+chr13	54937574	.	G	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,2:2,2
+chr13	55469091	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:5,8:1,1
+chr13	55470460	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0088503;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,3:11,4
+chr13	55789913	.	T	TTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.056428;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,6:3,4:18,2
+chr13	56330838	.	T	TCACACA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,10:9,7:2,3
+chr13	56885075	.	TTA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.021672;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,9:3,7:2,2
+chr13	56972897	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.11618;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:19,2:15,2
+chr13	57819712	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0016513;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:15,2:11,7
+chr13	58487075	.	C	CA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:4,6:5,2
+chr13	58874014	.	T	TACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,7:2,2:1,5
+chr13	60136954	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,4:4,1:3,3
+chr13	60274479	.	C	CG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00068595;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:5,19:1,11:4,8
+chr13	60654876	.	TATCTTC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0012868;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:4,5:2,5
+chr13	61352315	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0031242;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,11:5,2:3,9
+chr13	62171594	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0070393;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:7,8:2,1
+chr13	63379882	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0019465;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:11,7:21,7
+chr13	63470281	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.041455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,1:9,3
+chr13	63624958	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:7,4:2,1
+chr13	63802967	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0087567;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:5,7:1,1
+chr13	63822620	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0065876;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:1,1:3,3
+chr13	63932648	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0071887;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:15,1:9,5
+chr13	63932654	.	CACAT	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.050247;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:16,1:13,3
+chr13	64375072	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0028686;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,11:5,9:0,2
+chr13	64408293	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.092234;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:5,5:4,1
+chr13	64571486	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:3,3:3,2
+chr13	64789649	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,10:11,7:0,3
+chr13	64960992	.	TCCC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01205;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:3,1:6,6
+chr13	65857034	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00021022;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:11,5:10,5
+chr13	66196318	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.092279;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:9,4:11,1
+chr13	66196322	.	GTA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,4:10,1
+chr13	66408050	.	C	CTT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0010668;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,11:4,9:4,2
+chr13	67380412	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:4,4:0,0
+chr13	67650889	.	GTATATATATATATA	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,8:3,4:4,4
+chr13	69719209	.	TGAGAGA	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.026515;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:2,5:2,1:0,4
+chr13	70336794	.	GAGAGTTGCA	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.013477;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:17,4:11,2
+chr13	70366060	.	G	GTGTGTGTGTGTGTA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.001026;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:4,12:1,9:3,3
+chr13	71412339	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=4.7337e-05;SS=2;SSC=43;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,14:3,10:3,4
+chr13	71748962	.	TTC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00022277;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,15:5,3:4,12
+chr13	72603496	.	AAGAAAGAAAAAG	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.020232;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:15,6:3,6
+chr13	73040203	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0068111;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:4,6:1,1
+chr13	73094185	.	CAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.11832;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,9:12,8:2,1
+chr13	74166087	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0053554;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,15:3,11:4,4
+chr13	74287349	.	T	TGAGAGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,9:6,7:5,2
+chr13	74545816	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,9:10,8:1,1
+chr13	74547840	.	ATAT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1958;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,3:4,1:1,2
+chr13	75544926	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,8:5,7:4,1
+chr13	75915955	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.018691;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:7,15:5,10:2,5
+chr13	76715899	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:6,2:3,1:3,1
+chr13	77360844	.	C	CTT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0007326;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:0,11:0,8:0,3
+chr13	78558913	.	C	CT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,7:8,1:16,6
+chr13	79706055	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.060184;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,8:9,5:27,3
+chr13	80095207	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045809;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:1,2:15,10
+chr13	80728695	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.021073;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:10,5:6,2:4,3
+chr13	80771699	.	CA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0058774;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,15:9,13:3,2
+chr13	81039678	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0051535;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:19,5:24,6
+chr13	81457537	.	T	TTATATATATATATATA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,4:2,2:2,2
+chr13	81666746	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.052719;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:13,4:14,1
+chr13	81717309	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,4:3,1:1,3
+chr13	82246369	.	ATG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.24135;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:18,2:10,2
+chr13	82667206	.	AT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:7,1:1,3
+chr13	83096328	.	GAA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.28142;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:17,2:2,2
+chr13	85051181	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:5,5:4,1
+chr13	85437381	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031686;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:8,8:10,1
+chr13	85744942	.	T	TTA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:11,1:11,3
+chr13	86281340	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.087004;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:14,1:18,3
+chr13	86303868	.	T	TTATTATATTA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.13793;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:13,14:7,5:6,9
+chr13	86551900	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00025277;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:8,23:6,19:2,4
+chr13	86847055	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.099672;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:16,2:22,3
+chr13	87679835	.	AGTATATATATAGTATATATAGTATATAT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.021743;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:10,3:9,3
+chr13	87679863	.	T	TATA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0032306;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:5,7:2,2:3,5
+chr13	87807205	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:8,2:0,3
+chr13	87961529	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,3:4,1:2,2
+chr13	88130374	.	TAAAC	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0091533;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:6,6:2,3:4,3
+chr13	88700035	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0019186;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:5,11:4,2
+chr13	88870847	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0024264;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,6:2,3
+chr13	89520126	.	T	TAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:8,4:5,4
+chr13	89774044	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.011071;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:7,9:4,5:3,4
+chr13	89782008	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.23683;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,5:21,4:9,1
+chr13	90158149	.	GT	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:4,4:1,1:3,3
+chr13	90467158	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00059141;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:16,7:20,8
+chr13	90654924	.	A	AT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00129;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:0,4:0,1:0,3
+chr13	90715022	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.030397;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:12,4:16,4
+chr13	90795124	.	CTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.25496;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,1:16,3
+chr13	92109061	.	G	GT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,9:6,6:5,3
+chr13	92264878	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.021691;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:11,16:6,10:5,6
+chr13	92513552	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:6,3:1,1:5,2
+chr13	92513554	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:6,3:1,1:5,2
+chr13	92965085	.	T	TA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.013985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,11:6,7:3,4
+chr13	93003909	.	T	TA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.27368;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,7:4,5:7,2
+chr13	93300166	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.01564;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:47,10:22,5:25,5
+chr13	93324613	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.001548;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:4,8:3,6:1,2
+chr13	93495730	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=3.4001e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,18:3,12:5,6
+chr13	93596614	.	T	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:8,5:6,3:2,2
+chr13	94742090	.	A	AT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:3,4:4,4
+chr13	95264864	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,13:5,9:3,4
+chr13	95296135	.	A	AAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0055603;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,15:13,12:2,3
+chr13	95679199	.	C	CT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=1.9163e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:9,22:5,15:4,7
+chr13	97069725	.	C	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00052251;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:38,20:17,9:21,11
+chr13	97856273	.	G	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0025106;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:37,12:13,6:24,6
+chr13	97869478	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00024683;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:15,10:21,4
+chr13	98419483	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00056896;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:11,20:6,15:5,5
+chr13	98647913	.	A	ATGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.025586;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,12:3,9:8,3
+chr13	98781281	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=4.0454e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:6,19:3,10:3,9
+chr13	100043996	.	A	AT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:3,3:6,6
+chr13	100577456	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.14744;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,1:18,3
+chr13	100817236	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0066141;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,6:0,2:3,4
+chr13	101035623	.	T	TTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.043618;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:16,18:10,10:6,8
+chr13	101280880	.	C	CT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00010594;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,18:6,16:1,2
+chr13	101332397	.	C	CAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,11:9,10:2,1
+chr13	101360230	.	CCT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0768;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:16,4:14,4
+chr13	101439208	.	C	CTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,8:4,5:3,3
+chr13	101557807	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.002945;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:16,7:11,2
+chr13	101847630	.	C	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.00010236;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:39,18:22,9:17,9
+chr13	101973120	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=6.4484e-07;SS=2;SSC=61;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:50:2,12:1,6:1,6
+chr13	102096003	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:6,6:4,4:2,2
+chr13	102378627	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:2,5:1,4:1,1
+chr13	102452868	.	A	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0047061;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:44,10:22,4:22,6
+chr13	102534693	.	TAA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00012397;SS=2;SSC=39;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:14,28:7,16:7,12
+chr13	103040587	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0013445;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,13:14,5:23,8
+chr13	103349821	.	T	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.010634;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:45,11:29,6:16,5
+chr13	103458657	.	GAT	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0062769;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:11,7:11,6
+chr13	104632370	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,2:6,2
+chr13	105065149	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.030617;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:24,3:17,4
+chr13	106474855	.	T	C	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.035139;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:34,8:21,1
+chr13	107021828	.	A	AG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021691;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:11,5:3,4:8,1
+chr13	108636367	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.063509;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,7:13,1:8,6
+chr13	108795574	.	G	C	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.029243;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:28,4:29,3
+chr13	109095234	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.5926e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:30,22:14,15:16,7
+chr13	111491494	.	C	CTCTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,12:1,8:6,4
+chr13	111859141	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0091533;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:6,11:1,4:5,7
+chr13	112192625	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.19619;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:20,2:16,3
+chr13	112196519	.	GTCCCCTGGTTTCCTGGT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.28142;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:4,3:15,1
+chr13	112197128	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.01549;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:14,4:5,5
+chr13	112238982	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.21542;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:7,1:29,4
+chr13	112241832	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.014654;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,10:5,5:9,5
+chr13	112296774	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.021694;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:39,18:27,4:12,14
+chr13	112440897	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=4.4228e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:0,12:0,8:0,4
+chr13	112598998	.	C	CA	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.037909;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:17,3:16,4
+chr13	113089460	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.035813;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,6:23,3:14,3
+chr13	113142386	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0021645;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:37:0,5:0,2:0,3
+chr13	113152420	.	A	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0077782;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:50,11:21,6:29,5
+chr13	113876048	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16049;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:17,3:14,2
+chr13	114020180	.	T	TAGC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0021876;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,16:7,15:0,1
+chr13	114028253	.	C	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048875;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:4,5:11,3
+chr13	114032815	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr13	114032822	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr14	18245579	.	A	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:2,1:9,6
+chr14	18245622	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.040398;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:1,3:11,7
+chr14	18275569	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.049732;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:19,1:7,6
+chr14	18312423	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:8,3:8,1
+chr14	18321677	.	T	A	0	PASS	DP=119;GPV=1;SPV=0.003305;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:56,9:25,5:31,4
+chr14	18605999	.	C	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0035942;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:22,4:15,6
+chr14	18611398	.	G	T	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.0091195;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:60,12:22,2:38,10
+chr14	18616363	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,2:5,3
+chr14	18625668	.	T	C	0	PASS	DP=177;GPV=1;SPV=0.014869;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:110:95,15:47,8:48,7
+chr14	18679857	.	TA	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.029181;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:58,14:24,9:34,5
+chr14	18695892	.	A	G	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.028161;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:45,8:16,7:29,1
+chr14	18876682	.	A	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.017984;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:16,4:23,5
+chr14	18882906	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11302;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:0,0:21,4
+chr14	18886836	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,3:10,2
+chr14	18889655	.	C	T	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.0079997;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:68,10:37,7:31,3
+chr14	18953973	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:4,3:14,7
+chr14	18977294	.	C	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.039232;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:55,9:12,3:43,6
+chr14	18979413	.	G	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr14	19060893	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,2:2,2
+chr14	19073256	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:10,3:2,1
+chr14	19120520	.	C	A	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.041668;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:68,11:32,6:36,5
+chr14	19121026	.	T	G	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.045497;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:55,13:30,8:25,5
+chr14	19201477	.	C	T	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.0075608;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:50,20:21,17:29,3
+chr14	19284994	.	T	A	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.04268;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:107,15:71,10:36,5
+chr14	19292460	.	G	A	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.011417;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:105,20:46,13:59,7
+chr14	19338757	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.022851;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:23,5:4,4
+chr14	19366231	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.058162;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:0,0:13,4
+chr14	19399403	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:16,2:5,3
+chr14	19420974	.	A	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.015138;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:43,12:1,1:42,11
+chr14	19432749	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:19,3:7,1
+chr14	19466921	.	C	CACA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.013932;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:3,3:0,2
+chr14	19480483	.	G	A	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.0081832;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:55,16:28,11:27,5
+chr14	19681182	.	C	CA	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.015845;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:55,12:36,7:19,5
+chr14	21666700	.	GTT	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0045608;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,17:5,10:10,7
+chr14	22058785	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.10123;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:16,2:10,2
+chr14	22817138	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.062277;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:11,3:13,2
+chr14	23109669	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=5.5231e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:12,7:8,4
+chr14	24670987	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0053737;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:21,5:13,5
+chr14	24719516	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0054348;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,6:3,1
+chr14	25124162	.	C	CAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.010217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,8:3,7:2,1
+chr14	25570574	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0002055;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:11,5:11,7
+chr14	26041553	.	AACAC	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.053922;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,7:2,6:4,1
+chr14	26204430	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.49123;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,4:5,3:8,1
+chr14	26734958	.	C	CA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.010225;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:9,6:4,5
+chr14	26771706	.	A	ATT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0046784;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,11:4,5:2,6
+chr14	27101424	.	C	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=6.057e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:35,16:17,7:18,9
+chr14	27387169	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.12308;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:5,3:2,1:3,2
+chr14	27827512	.	C	CTTT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.041509;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:12,8:5,5
+chr14	28593149	.	G	GTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.3064;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
+chr14	29171225	.	A	ATTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.16205;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,6:15,2:7,4
+chr14	30193259	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.028362;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:11,3:13,2
+chr14	31124809	.	AT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014776;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:9,10:9,2
+chr14	33024172	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.077206;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:15,5:21,1
+chr14	33981523	.	AAC	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.024242;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:31:1,3:0,2:1,1
+chr14	34463652	.	CAG	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.001388;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:4,6:13,11
+chr14	34876605	.	A	AT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0032683;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:4,6:9,5
+chr14	35131533	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.3956;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,2:5,1:2,1
+chr14	35557098	.	A	ATGTGTG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,6:5,5:2,1
+chr14	35727310	.	CATAT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=5.3843e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,10:2,5:1,5
+chr14	36083488	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0032051;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:3,2:7,9
+chr14	36824460	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0014372;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:6,4:11,4
+chr14	39761386	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.10738;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:18,2:13,2
+chr14	40247215	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.035377;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:16,3:19,7
+chr14	41023865	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.015886;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:11,4:20,4
+chr14	41044383	.	A	AAAGAAG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.044901;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,5:9,2:9,3
+chr14	41079335	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0032765;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,7:1,5:3,2
+chr14	41405734	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.091388;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:11,5:4,1
+chr14	41886019	.	C	CAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,5:9,4:0,1
+chr14	44191188	.	ATGTG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.009628;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:10,10:7,7:3,3
+chr14	47827124	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00077059;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:16,6:14,7
+chr14	49009544	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0095989;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:15,2:14,5
+chr14	49603511	.	T	TTTC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.043382;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,2:8,2
+chr14	50023209	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,4:7,2:2,2
+chr14	50344469	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,5:6,4:7,1
+chr14	50945542	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,6:4,1
+chr14	50957320	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,5:6,4:4,1
+chr14	50964037	.	C	CAAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.17217;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,5:5,4:4,1
+chr14	51324352	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0027568;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:9,5:10,4
+chr14	51932246	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0040134;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:4,5:2,1
+chr14	52104297	.	G	GGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0020744;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,11:6,9:7,2
+chr14	52625481	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:7,1:8,3
+chr14	52807896	.	C	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,4:5,2:7,2
+chr14	53213985	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0032284;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,6:8,3
+chr14	54085541	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,8:2,6:0,2
+chr14	54614462	.	G	GA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=6.3368e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:10,8:7,5
+chr14	54683675	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.015088;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:12,4:17,3
+chr14	54684619	.	C	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014142;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:1,1:4,5
+chr14	55109888	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0088413;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:4,5:0,1
+chr14	55281255	.	T	TAAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:2,3:4,3
+chr14	55295533	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.019947;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:14,4:13,2
+chr14	56031544	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.25463;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:9,4:4,1
+chr14	59048006	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=8.0194e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:15,24:9,10:6,14
+chr14	60008136	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0040978;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:16,4:11,4
+chr14	60695300	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.016495;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:7,5:13,3
+chr14	61341395	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0055492;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:15,2:12,5
+chr14	62242991	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.010153;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:17,5:12,6
+chr14	62599975	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040363;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:13,6:9,2
+chr14	64014929	.	TTATATATATATA	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:5,2:1,2
+chr14	64358998	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.071698;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,3:10,2
+chr14	64359307	.	T	TG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:1,4:6,4
+chr14	64518904	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:5,4:0,0
+chr14	65307895	.	GT	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0029526;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:16,16:7,10:9,6
+chr14	66048070	.	T	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01095;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,10:5,7:4,3
+chr14	67506487	.	T	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00067152;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:7,5:9,4
+chr14	69180568	.	T	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0006809;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:13,5:18,5
+chr14	69249069	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:1,2:1,1:0,1
+chr14	69533808	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.057437;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:15,2:16,4
+chr14	72113100	.	A	ATG	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.11505;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:16,3:15,1
+chr14	72148129	.	TAA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.002173;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:3,9:1,6:2,3
+chr14	72664643	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020413;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:4,1:15,6
+chr14	72915303	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0033813;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:14,3:1,5
+chr14	73095606	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.013111;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:6,8:10,5
+chr14	74477088	.	A	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,1:7,3
+chr14	75494381	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0026122;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,14:8,6:3,8
+chr14	75636481	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0047469;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:13,4:10,6
+chr14	77645594	.	T	TAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0058007;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,9:1,6:2,3
+chr14	77678087	.	C	CAAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,4:3,3:3,1
+chr14	78225972	.	TTG	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.057853;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,3:10,4
+chr14	78225986	.	T	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,1:13,3
+chr14	79119795	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00013352;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:16,19:8,7:8,12
+chr14	79427830	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.021798;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,7:7,5:6,2
+chr14	79515195	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0004233;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:17,6:13,6
+chr14	79624800	.	TTTG	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0091926;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,16:5,7:10,9
+chr14	79629839	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,4:9,2:9,2
+chr14	81226099	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,2:4,2
+chr14	81807963	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,3:10,1
+chr14	82950356	.	C	CAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1839;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:7,4:5,1
+chr14	83686764	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00063544;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:16,6:5,6
+chr14	83855476	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011145;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:7,3:12,3
+chr14	84276774	.	CT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:4,2:11,3
+chr14	84695017	.	T	TACACACAC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.040508;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:11,6:5,2
+chr14	85595251	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.012894;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:8,3:13,3
+chr14	85927893	.	T	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.046683;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,2:10,3
+chr14	89392637	.	CT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,4:3,1
+chr14	89772721	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27277;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:1,0:20,4
+chr14	90352446	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.12174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,3:3,1
+chr14	91365168	.	T	TCCCTCAC	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0094957;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:19,6:12,6
+chr14	91988633	.	T	TA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0087645;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:13,8:3,3
+chr14	92167014	.	C	CTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.031857;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,7:0,6:1,1
+chr14	94472507	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.028465;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:13,3:12,2
+chr14	94737322	.	CA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012829;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,5:5,2
+chr14	95066559	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046615;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,5:9,3
+chr14	95066560	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045954;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:8,5:9,3
+chr14	95242261	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.020642;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:11,7:7,3
+chr14	95479224	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,6:4,3:2,3
+chr14	95558897	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:14,1:9,3
+chr14	96403114	.	T	TTAAATAAATAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,8:1,6:6,2
+chr14	97903510	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:5,2:4,1:1,1
+chr14	97936171	.	T	TTTTTC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:4,1:11,3
+chr14	98204657	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0020369;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:4,5:19,3
+chr14	98492110	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00030588;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:13,10:13,5
+chr14	98744899	.	GT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,5:2,2
+chr14	98781380	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.035372;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:4,4:4,2
+chr14	100621256	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.032567;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:16,5:9,6
+chr14	102228700	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.3956;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,2:5,1:2,1
+chr14	102315820	.	TACACACACACACACACACACACACAC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,6:8,4:1,2
+chr14	103572787	.	A	AT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.17135;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,5:7,4:9,1
+chr14	103952216	.	ATATATTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.12821;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:3,1:0,1
+chr14	104499251	.	G	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.020919;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:15,5:7,1
+chr14	104566594	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0025995;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:17,4:17,6
+chr14	104683291	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0067142;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,18:11,15:7,3
+chr14	104685999	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,2:2,2:0,0
+chr14	105327896	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0019162;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:39,12:26,7:13,5
+chr14	105633937	.	T	A	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.036062;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:52,10:27,5:25,5
+chr14	105639924	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.032003;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:56,9:36,7:20,2
+chr14	105654804	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:12,1:20,3
+chr14	105699669	.	A	T	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.029471;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:58,15:35,9:23,6
+chr14	106220507	.	TTC	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0023163;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:5,11:14,6
+chr14	106626217	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=1.7288e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:10,9:14,6
+chr15	18533186	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
+chr15	19434997	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.077483;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,5:25,5:2,0
+chr15	19859576	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0024274;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,12:1,10:7,2
+chr15	19913009	.	A	AATGTGGTC	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.049607;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:47,8:20,2:27,6
+chr15	20019797	.	C	T	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.042489;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:101,17:60,8:41,9
+chr15	20142002	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.015088;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:1,2:28,5
+chr15	20142988	.	C	T	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.021552;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:105,24:52,12:53,12
+chr15	20166342	.	CA	C	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.015443;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:57,8:37,6:20,2
+chr15	20183018	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.24396;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,3:15,1
+chr15	20273978	.	G	A	0	PASS	DP=416;GPV=1;SPV=0.0025103;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:196,27:120,18:76,9
+chr15	20309395	.	G	A	0	PASS	DP=282;GPV=1;SPV=0.037602;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:100,12:57,8:43,4
+chr15	20314793	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.016979;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:15,8:9,3
+chr15	20669457	.	G	C	0	PASS	DP=481;GPV=1;SPV=0.040058;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:279:240,39:109,15:131,24
+chr15	20686189	.	TA	T	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.035492;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:112:91,21:55,14:36,7
+chr15	20686218	.	C	T	0	PASS	DP=188;GPV=1;SPV=0.0019526;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:102:75,27:46,18:29,9
+chr15	20733898	.	G	T	0	PASS	DP=262;GPV=1;SPV=0.048201;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:129,15:78,10:51,5
+chr15	20738533	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.090639;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:0,0:34,4
+chr15	20749113	.	C	T	0	PASS	DP=286;GPV=1;SPV=0.045336;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:121,19:68,8:53,11
+chr15	20749323	.	G	A	0	PASS	DP=257;GPV=1;SPV=0.048639;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:125,19:38,6:87,13
+chr15	20756584	.	G	A	0	PASS	DP=288;GPV=1;SPV=0.019754;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:129,29:84,18:45,11
+chr15	20785986	.	G	C	0	PASS	DP=229;GPV=1;SPV=0.028546;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:115,21:53,10:62,11
+chr15	20900873	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:18,3:2,1
+chr15	20940208	.	C	A	0	PASS	DP=345;GPV=1;SPV=0.01286;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:193:172,21:73,4:99,17
+chr15	21024854	.	G	A	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.033866;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:143,26:58,12:85,14
+chr15	21061789	.	GA	G	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.030763;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:53,8:35,7:18,1
+chr15	21069794	.	A	G	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.037504;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:94,19:46,12:48,7
+chr15	21122270	.	A	C	0	PASS	DP=102;GPV=1;SPV=0.028316;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:50,9:32,5:18,4
+chr15	21266784	.	C	T	0	PASS	DP=444;GPV=1;SPV=0.021614;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:261:222,39:100,18:122,21
+chr15	21272114	.	C	T	0	PASS	DP=428;GPV=1;SPV=0.029006;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:235:210,25:119,18:91,7
+chr15	21310653	.	G	A	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.018842;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:57,9:20,1:37,8
+chr15	21360144	.	G	A	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.043197;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:83,12:47,7:36,5
+chr15	21374563	.	C	T	0	PASS	DP=369;GPV=1;SPV=0.038401;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:218:192,26:104,14:88,12
+chr15	21431840	.	G	C	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.011137;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:161,21:76,7:85,14
+chr15	21482389	.	C	T	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.007533;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:73,13:47,8:26,5
+chr15	21525853	.	CA	C	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.023519;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:37,7:15,3:22,4
+chr15	21535775	.	T	TG	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.036691;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:44,5:22,3:22,2
+chr15	21550026	.	C	T	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.0026245;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:71,19:38,4:33,15
+chr15	21562361	.	A	G	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.016109;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:82,19:29,6:53,13
+chr15	21586885	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.032319;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:22,9:1,1
+chr15	21657253	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.012544;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:3,1:15,6
+chr15	21755344	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0012236;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:3,5:5,3
+chr15	22085514	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:12,4:2,1
+chr15	22250653	.	A	G	0	PASS	DP=211;GPV=1;SPV=0.011067;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:103,21:51,13:52,8
+chr15	22253145	.	T	C	0	PASS	DP=286;GPV=1;SPV=0.007382;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:123,26:67,13:56,13
+chr15	22266345	.	A	G	0	PASS	DP=256;GPV=1;SPV=0.023147;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:123,24:60,14:63,10
+chr15	22295485	.	A	G	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.04268;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:107,15:50,7:57,8
+chr15	22424314	.	GC	G	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.02354;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:57,12:31,8:26,4
+chr15	22436984	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.053073;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:24,3:9,3
+chr15	24813200	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030898;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:15,5:6,2
+chr15	25261750	.	A	AAT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:1,2:0,2
+chr15	26060244	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0040413;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,6:13,1
+chr15	26510669	.	T	TAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021122;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,3:7,5
+chr15	26709515	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0063246;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,8:2,6:3,2
+chr15	27002763	.	AGG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,1:5,3
+chr15	27002769	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
+chr15	27255740	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0011386;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,4:8,5
+chr15	28513574	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.036642;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:6,1:10,5
+chr15	28528140	.	T	TAC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
+chr15	29517443	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=6.2405e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:8,5:15,9
+chr15	30095073	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00084999;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:11,2:10,8
+chr15	30227814	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0026644;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,17:8,8:9,9
+chr15	30443176	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0024454;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:8,8:7,3
+chr15	30521653	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.029764;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:14,5:16,5
+chr15	30929794	.	TATA	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.017385;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:1,4:2,2
+chr15	31144918	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.025864;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:16,2:8,4
+chr15	32187948	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.048263;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:16,3:18,7
+chr15	32567664	.	G	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.078276;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:7,3:13,1
+chr15	32573700	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.025704;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:15,5:14,5
+chr15	32864382	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.022687;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:11,5:9,6
+chr15	33664591	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,3:5,3
+chr15	36916095	.	G	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.012389;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:16,2:7,6
+chr15	38094375	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.079729;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:11,4:18,2
+chr15	39696870	.	CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,3:1,1
+chr15	39916855	.	G	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.3992e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:11,7:6,4
+chr15	40143255	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01192;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:5,6:2,2:3,4
+chr15	40358260	.	G	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.012197;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:36,7:23,3:13,4
+chr15	40861101	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0035182;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:14,3:11,7
+chr15	40960264	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00071485;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:11,9:10,5
+chr15	41271250	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:5,7:5,2
+chr15	41301970	.	TAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.02039;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,7:8,4:3,3
+chr15	43510513	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.083134;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,2:15,2
+chr15	43554620	.	T	TAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:10,5:2,2
+chr15	43559845	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.013521;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:14,2:10,10
+chr15	43875367	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:3,2:5,2
+chr15	45724917	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0027092;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:8,3:6,5
+chr15	47573209	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0050608;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:14,6:18,4
+chr15	47820587	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036036;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,3:3,1
+chr15	50087356	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.055494;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,1:10,3
+chr15	51177593	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.065489;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
+chr15	51418432	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00014188;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:9,5:10,8
+chr15	51584112	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:4,2:2,1
+chr15	51747017	.	T	TA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023024;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:11,4:2,4
+chr15	51963897	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,4:7,3:8,1
+chr15	52801334	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=4.5156e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,8:11,7
+chr15	53068572	.	TTG	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0072753;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:5,5:10,8
+chr15	53317388	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.3107;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:16,1:11,3
+chr15	56920920	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00049463;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:16,9:10,4
+chr15	57688496	.	C	CTA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.023342;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,6:9,3:6,3
+chr15	57723856	.	C	CAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:7,4:2,1
+chr15	58377542	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0071404;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:14,8:19,4
+chr15	58573125	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,4:8,3:8,1
+chr15	59448526	.	A	AAGATAGATAGAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.042122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:2,4:14,4
+chr15	59448587	.	G	GT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:6,5:7,5
+chr15	59518117	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0030715;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:14,8:15,5
+chr15	59761668	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.1016;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:1,1:16,3
+chr15	59761671	.	TCTC	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.087777;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:1,1:20,4
+chr15	60060005	.	G	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.03809;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:16,4:2,3
+chr15	60065017	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,3:2,1
+chr15	60624399	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01971;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,5:4,4
+chr15	61277734	.	T	TC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:3,4:1,1:2,3
+chr15	61293976	.	G	GAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024476;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,8:0,6:2,2
+chr15	61304939	.	G	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00010991;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:18,4:8,7
+chr15	61716841	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.016244;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,10:9,5:8,5
+chr15	61914878	.	TAAAAAAA	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,8:3,6:0,2
+chr15	62437754	.	T	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.022061;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:13,2:8,6
+chr15	62693955	.	CTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:2,3:1,3
+chr15	62741750	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041176;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,2:4,2
+chr15	63376598	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.030729;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,4:8,1
+chr15	63581459	.	C	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0044617;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,14:5,9:5,5
+chr15	65400078	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0024549;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:16,7:8,6
+chr15	65994017	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.028734;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:13,3:15,2
+chr15	69127249	.	CAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030844;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,4:4,1
+chr15	69330881	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0016174;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:17,6:6,3
+chr15	69556773	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,1:3,3
+chr15	71391815	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.002405;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:13,7:16,5
+chr15	71459160	.	CTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:4,3:2,4
+chr15	72665926	.	G	A	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.043774;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:30,10:8,2
+chr15	74111138	.	T	TA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0066141;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:0,4:3,2
+chr15	74818014	.	G	GA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.03685;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:10,5:3,1
+chr15	74964463	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.017892;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:14,6:13,1
+chr15	77458794	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00011945;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:30,17:17,6:13,11
+chr15	77509555	.	CGTGTGT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.03028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:4,3:4,2
+chr15	80030913	.	TCCAA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.037765;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:6,3:14,3
+chr15	80031051	.	CAACCTATGCAAT	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.12627;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:20,1:10,3
+chr15	82079195	.	A	ATTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.10613;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,5:5,3:8,2
+chr15	82354580	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0069028;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:15,4:5,8
+chr15	82363710	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022366;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:10,8:4,1
+chr15	82369924	.	CTG	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.009324;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,6:1,1:1,5
+chr15	82580413	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.029893;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:19,3:4,3
+chr15	83055658	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00096763;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:10,6:4,9
+chr15	84181735	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.001132;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:16,8:12,7
+chr15	84361182	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.01412;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:4,5:16,2
+chr15	84563456	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.011374;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,10:3,7:2,3
+chr15	84708205	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:8,5:1,1
+chr15	84777695	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:3,8:2,5:1,3
+chr15	85351617	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0047011;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,14:7,5:6,9
+chr15	85896280	.	G	GTC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:5,3:8,6
+chr15	86143457	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0017947;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,4:10,3
+chr15	88117084	.	C	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=1.6212e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:8,8:10,6
+chr15	88944963	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.019346;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:6,6:7,5
+chr15	90444281	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.02914;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:4,6:8,2
+chr15	90517510	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.031264;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,6:7,5:5,1
+chr15	90836843	.	A	AT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.006865;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:3,15:3,9:0,6
+chr15	91417686	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00052;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:23,15:11,8:12,7
+chr15	91631790	.	CTG	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0026899;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:11,13:4,9:7,4
+chr15	92889476	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:5,4:8,1
+chr15	92889487	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0057971;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:2,4:5,2
+chr15	95367844	.	T	TAC	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,3:3,2:0,1
+chr15	95796674	.	AAAGAAAG	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,3:2,1
+chr15	96327526	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.12945;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,2:18,2
+chr15	97169140	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00021002;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:14,6:9,8
+chr15	98497459	.	GTTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.17677;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,5:11,2:3,3
+chr15	98869434	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:10,8:3,1
+chr15	100620534	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.019346;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:10,3:3,5
+chr15	100672746	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:4,1:3,4
+chr15	101615634	.	TGCATGCACTGTGGATGTGGCCTGCCCTCTAAGTGCC	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.046824;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:18,6:20,3
+chr15	101766901	.	T	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0031408;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:10,3:4,10
+chr15	101870043	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:5,1:11,4
+chr15	101892736	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.15775;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:3,3:12,2
+chr16	12060	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0493;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:15,4:11,1
+chr16	29811	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.023415;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:23,9:10,3
+chr16	239457	.	CA	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00044356;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:14,18:11,14:3,4
+chr16	382087	.	C	CG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:6,4:7,4
+chr16	661016	.	G	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0067873;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:0,1:3,5
+chr16	665325	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.072845;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:11,2:18,3
+chr16	1267169	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,14:9,9:4,5
+chr16	1329545	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0013799;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:7,7:11,7
+chr16	1604274	.	C	CGTGTGTGT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023692;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,10:9,8:2,2
+chr16	2263435	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=2.233e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:16,6:10,9
+chr16	2861376	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.011419;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:14,3:15,5
+chr16	3190749	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.068571;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,6:17,3:8,3
+chr16	4181197	.	TA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:5,5:6,3
+chr16	4197421	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:7,3:3,2
+chr16	4262559	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=5.0036e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:10,8:14,6
+chr16	4889232	.	G	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11404;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:8,2:2,3
+chr16	5010188	.	CAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
+chr16	5255342	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029934;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:5,2:13,4
+chr16	5825800	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.015558;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:12,4:7,8
+chr16	6253673	.	GCA	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.23992;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:9,1:12,2
+chr16	6398866	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.010118;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:42,8:23,6:19,2
+chr16	6480050	.	G	GA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,11:5,10:0,1
+chr16	7557619	.	C	CA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0081269;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,5:3,4:1,1
+chr16	7932626	.	CAT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026014;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:5,3:10,1
+chr16	9607235	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0015608;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:3,5:2,1
+chr16	10802286	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,6:5,5:8,1
+chr16	11330221	.	ATT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:3,8:3,7:0,1
+chr16	12019587	.	T	TATAG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0045492;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:13,5:9,4
+chr16	12075215	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0011386;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:10,4:11,5
+chr16	12851012	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0737;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:7,4:8,2
+chr16	13987297	.	CT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.010728;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:3,3:3,3
+chr16	14329386	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.020376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,5:7,2
+chr16	14371882	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,4:10,3:8,1
+chr16	14834687	.	G	GT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,4:6,2:4,2
+chr16	14938413	.	C	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.036143;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:19,2:19,8
+chr16	14953358	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.075461;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:18,3:5,4
+chr16	15127800	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0088777;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:24,5:23,7
+chr16	15167877	.	C	CAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0014624;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:10,5:9,6
+chr16	15302112	.	G	GAC	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.035771;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:25,2:22,10
+chr16	15307890	.	T	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:0,0:7,4
+chr16	15360843	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0065876;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:0,0:4,4
+chr16	15472860	.	C	CT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.019258;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:12,9:4,2
+chr16	16261241	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.060295;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:15,2:12,2
+chr16	16374023	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.040223;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:13,1:13,8
+chr16	16412983	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0045524;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:9,5:1,2
+chr16	16422341	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:11,3:5,1:6,2
+chr16	16449463	.	GAGAGAGAGAGACAGAGAC	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.022357;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:14,4:4,4
+chr16	16497319	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.054086;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:63,9:39,5:24,4
+chr16	16599305	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0083426;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:5,5:4,3
+chr16	16605268	.	C	CTTTCT	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.041446;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,10:14,2:22,8
+chr16	16657672	.	TTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:1,2:5,2
+chr16	16658443	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.012836;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:5,8:2,4
+chr16	16779097	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:1,1:5,2
+chr16	17174040	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0012459;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:14,5:12,4
+chr16	17226704	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0074013;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:15,6:16,4
+chr16	17320482	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.002997;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,8:0,4:0,4
+chr16	17571475	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0041203;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,5:11,3
+chr16	17868664	.	A	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
+chr16	18103845	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.014881;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,4:4,1
+chr16	18348559	.	A	G	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.036718;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:23,7:30,4
+chr16	18702360	.	GTGGTGGCA	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:2,1:4,3
+chr16	20146599	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,3:6,1
+chr16	20541679	.	TTC	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038747;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,12:8,7:5,5
+chr16	21664982	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,4:7,2:12,2
+chr16	21851256	.	TGGGGA	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
+chr16	23169118	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:3,2:0,0
+chr16	23867056	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.057743;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:4,1:10,4
+chr16	23981588	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:5,1:15,3
+chr16	24265449	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.26001;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:21,2:9,2
+chr16	25904143	.	GATGGATGGATGA	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.044124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:9,5:11,3
+chr16	26341276	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.024469;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:14,3:15,4
+chr16	26374868	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040129;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,5:11,5
+chr16	26766055	.	TA	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.003503;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:10,6:7,4
+chr16	26770773	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021659;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,10:9,7:7,3
+chr16	26770775	.	TAAATGATA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.026993;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,9:8,6:7,3
+chr16	27855740	.	AG	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:4,11:5,2
+chr16	28225839	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.011625;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:3,3:1,3
+chr16	28579203	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0088148;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:7,5:11,3
+chr16	29343974	.	TTTTTTG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,2:8,2
+chr16	30219809	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.039921;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:6,2:9,5
+chr16	30586575	.	G	GT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:4,3:3,1
+chr16	31062783	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:5,1:2,1
+chr16	31268395	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00035646;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:22,8:8,4
+chr16	31716997	.	GT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:6,3:4,1
+chr16	31962146	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.026412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:12,4:15,1
+chr16	32069030	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021726;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,4:7,5
+chr16	32192091	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.01768;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:10,8:20,5
+chr16	32303731	.	G	T	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.01064;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:70:53,17:25,5:28,12
+chr16	32327877	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.086635;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:12,4:12,1
+chr16	32626055	.	C	CTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040221;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:14,4:8,2
+chr16	32883828	.	GCCACTGACTCGGGCC	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.031686;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,6:11,3
+chr16	32925585	.	G	A	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.011252;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:37,10:21,5:16,5
+chr16	33017866	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0089143;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:3,3:17,3
+chr16	33018589	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.035086;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:9,2:13,4
+chr16	33337144	.	C	T	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.049179;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:87,18:40,10:47,8
+chr16	33582391	.	G	GCAA	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.030653;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:42,16:22,9:20,7
+chr16	33625825	.	T	C	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.038713;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:20,3:20,7
+chr16	33727080	.	CTTT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,8:3,7:4,1
+chr16	33733632	.	C	T	0	PASS	DP=294;GPV=1;SPV=0.014655;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:135,32:61,14:74,18
+chr16	33918582	.	T	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.022734;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:14,2:16,11
+chr16	34014924	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.028638;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,6:2,5:2,1
+chr16	34165244	.	G	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.012235;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:32,6:20,1
+chr16	34174419	.	C	CA	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.038871;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:77,19:41,12:36,7
+chr16	34716233	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:19,2:9,2
+chr16	35478339	.	C	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.00073344;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:40,10:19,4:21,6
+chr16	36100822	.	CAT	C	0	PASS	DP=207;GPV=1;SPV=0.040003;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:114:92,22:50,12:42,10
+chr16	36111053	.	C	T	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.031943;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:64,13:27,3:37,10
+chr16	36120992	.	GA	G	0	PASS	DP=247;GPV=1;SPV=0.0098825;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:139:113,15:41,8:72,7
+chr16	37989067	.	G	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.044889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:20,3:16,8
+chr16	38130001	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
+chr16	38166303	.	T	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr16	46743532	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00034236;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:12,5:13,5
+chr16	46780086	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00024776;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:13,6:8,4
+chr16	47675519	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.046254;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:9,2:13,4
+chr16	48416181	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:4,2:2,1:2,1
+chr16	48772945	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr16	49099105	.	CAT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,3:6,2
+chr16	49873866	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.016957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:2,4:6,2
+chr16	51288370	.	AAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0091476;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,7:8,4:7,3
+chr16	51644253	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038709;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:21,4:2,2
+chr16	53025955	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
+chr16	53360790	.	AT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:9,4:1,1
+chr16	54074919	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:10,8:6,3:4,5
+chr16	54538394	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0014418;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:16,5:15,7
+chr16	54980414	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00041135;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:1,7:1,6:0,1
+chr16	55027099	.	C	CAA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.014369;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,6:11,4:7,2
+chr16	55920846	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0015295;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,12:13,4:6,8
+chr16	56256698	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.062847;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:11,4:18,2
+chr16	56540665	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042146;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:2,1:8,3
+chr16	56620729	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0051075;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:4,2:5,8
+chr16	56620736	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01828;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:4,2:6,6
+chr16	56755268	.	G	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00076085;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:12,8:16,2
+chr16	57311441	.	G	GGTGTGTGT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.020719;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,6:5,5:3,1
+chr16	58171984	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.12353;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:4,1:2,2
+chr16	58758216	.	TTATATATATA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,13:5,6:2,7
+chr16	58831783	.	CTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTCCCTCCT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.2248;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:12,3:5,2:7,1
+chr16	60475590	.	TACACAC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.059571;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:14,6:3,3
+chr16	60639011	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0022162;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:14,6:11,3
+chr16	60991226	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0018974;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:7,5:16,4
+chr16	61446059	.	A	AATATATATATATATAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:8,2:10,2
+chr16	61726301	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0016045;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:13,8:16,4
+chr16	61960085	.	ATATG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.16193;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:16,3:9,2:7,1
+chr16	62506719	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0012998;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:13,4:9,7
+chr16	62890211	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.010225;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:4,7:9,4
+chr16	62913519	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0029833;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:13,7:13,2
+chr16	63084059	.	GTGTGTGTGTA	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0038562;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,8:6,2
+chr16	63658223	.	C	CAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,6:4,5:7,1
+chr16	64058866	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00035192;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:7,7:16,6
+chr16	64535517	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0029614;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,9:4,5:3,4
+chr16	64738125	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
+chr16	65060356	.	G	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00042646;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:6,4:5,4
+chr16	65537057	.	G	GTATA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,5:2,2:0,3
+chr16	68456296	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0019324;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:5,5:1,2
+chr16	68609146	.	CA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,3:3,1
+chr16	68743351	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023079;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,5:3,2:1,3
+chr16	68793930	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0016018;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,11:3,8:3,3
+chr16	69732501	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00040437;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:7,6:13,6
+chr16	69738472	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0026128;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:7,6:6,4
+chr16	72112803	.	G	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0001497;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:14,6:13,6
+chr16	73099710	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10911;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:13,9:6,1
+chr16	73753986	.	A	ATGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.032072;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,8:7,1
+chr16	75259850	.	T	TAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.010718;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,9:3,7:2,2
+chr16	75586220	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:14,6:8,3:6,3
+chr16	76862808	.	T	TAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.033431;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:10,4:5,2
+chr16	77311504	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00011008;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:9,6:10,7
+chr16	78358866	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,3:2,2
+chr16	78481724	.	A	AGTGT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:6,4:2,1
+chr16	79091779	.	G	GT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:5,5:4,1
+chr16	79673815	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0029415;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:14,6:16,5
+chr16	80411036	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.008813;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,4:10,3
+chr16	81033591	.	C	CTT	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:1,4:0,1:1,3
+chr16	81197668	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:8,6:2,3
+chr16	81304104	.	T	TAAA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.013049;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,11:8,5:7,6
+chr16	82298353	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:9,2:17,2
+chr16	82953245	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0030549;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:20,2:6,9
+chr16	83000574	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:4,6:4,3
+chr16	83286770	.	G	GTA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:6,5:3,2
+chr16	84050735	.	GC	G	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.016523;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:11,7:27,4
+chr16	87434994	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,2:4,1:2,1
+chr16	88236683	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.04614;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:15,1:5,3
+chr16	88558660	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:2,3:12,2
+chr16	89093509	.	T	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00061107;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:16,5:7,5
+chr17	425873	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:8,4:3,1
+chr17	884247	.	T	TA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.044511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,8:8,6:5,2
+chr17	942690	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10134;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,5:7,1
+chr17	1062786	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:5,3:17,1
+chr17	1098075	.	CT	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0031524;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:6,7:4,4
+chr17	2218028	.	CA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0047709;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:6,6:11,7
+chr17	3699052	.	G	GACACACACACACAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:7,2:7,3
+chr17	4640699	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.014135;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:12,5:18,5
+chr17	5226508	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12318;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,4:10,2:5,2
+chr17	5749632	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15275;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:8,3:11,2
+chr17	6296216	.	A	ATGTGTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.026054;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,6:7,5:4,1
+chr17	6300670	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00046907;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:12,5:12,7
+chr17	7662623	.	CT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.029565;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,5:2,2
+chr17	7754833	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=9.577e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:31,18:15,7:16,11
+chr17	7793522	.	TTC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.036676;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:5,1:12,3
+chr17	7871493	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0035252;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:10,3:11,5
+chr17	8087257	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.056596;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,2:12,2
+chr17	8339237	.	GTT	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0033069;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,11:11,8:7,3
+chr17	8343815	.	AGTGTGT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.043511;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:10,2:8,7
+chr17	8363840	.	T	TC	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.22332;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:15,3:7,2:8,1
+chr17	10005162	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.29013;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,5:9,3:13,2
+chr17	11294120	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0030237;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:12,2:12,5
+chr17	11350186	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14555;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,1:13,3
+chr17	11727047	.	CAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,5:6,4:5,1
+chr17	12197620	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0020908;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:17,7:14,3
+chr17	12396663	.	AGT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.037681;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:6,4:3,1
+chr17	12398606	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.7651e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:6,8:14,4
+chr17	12558857	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.002331;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:0,7:0,6:0,1
+chr17	12989097	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,2:6,2
+chr17	13328022	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.092532;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,4:7,2:9,2
+chr17	14544331	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:12,2:6,2
+chr17	15075577	.	T	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,3:13,1
+chr17	15543021	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.016944;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:14,11:17,2
+chr17	15757702	.	T	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.26909;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:14,2:17,2
+chr17	16476732	.	ATT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.037112;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,5:1,2
+chr17	16848058	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0087022;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,3:5,2
+chr17	17297016	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.002945;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:15,5:12,4
+chr17	17750551	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0014199;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:10,4:16,6
+chr17	19820088	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00074174;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:8,5:6,4
+chr17	20504029	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0006045;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:12,3:9,6
+chr17	21839232	.	GC	G	0	PASS	DP=105;GPV=1;SPV=0.020857;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:47,11:21,6:26,5
+chr17	21841577	.	T	G	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.0024614;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:82,14:45,2:37,12
+chr17	21987800	.	GTGGAATGGAA	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.049244;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:20,4:12,4
+chr17	22352507	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.003548;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:14,7:11,2
+chr17	22392478	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.036308;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:27,7:4,1
+chr17	22846601	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.083965;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:3,0:33,4
+chr17	22882404	.	G	A	0	PASS	DP=180;GPV=1;SPV=0.004564;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:75,21:36,13:39,8
+chr17	22927792	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.011166;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:6,4:2,5
+chr17	22927816	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0055231;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:7,3:2,3
+chr17	22963319	.	C	A	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.031592;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:17,5:27,8
+chr17	23169314	.	T	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.0094581;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:38,6:8,3
+chr17	23169339	.	G	C	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.0074015;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:52,10:41,6:11,4
+chr17	23189772	.	A	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.02406;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:14,4:16,2
+chr17	23209679	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:0,0:25,4
+chr17	26623519	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.099968;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:0,1:21,4
+chr17	26624350	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.1143;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,2:5,2
+chr17	26638376	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:9,2:10,2
+chr17	26771693	.	G	A	0	PASS	DP=107;GPV=1;SPV=0.037516;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:47,9:19,3:28,6
+chr17	27034281	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.010988;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:13,5:13,3
+chr17	27981065	.	GGAA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0972;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:15,3:9,2
+chr17	28000235	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0086388;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:14,3:10,5
+chr17	28001490	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0012831;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,2:9,6
+chr17	28540780	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.23366;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:9,4:5,1:4,3
+chr17	28754286	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0033988;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:9,5:0,2
+chr17	29072202	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0071032;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,11:6,7:1,4
+chr17	29439864	.	TAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.027772;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:5,13:0,6:5,7
+chr17	30221426	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.013095;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,2:2,3
+chr17	32092192	.	CACAT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,1:6,3
+chr17	32977656	.	G	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:5,7:0,1
+chr17	33657757	.	T	TAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021615;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:8,6:6,1
+chr17	34732698	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0017311;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:13,4:9,4
+chr17	36462975	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,4:6,1
+chr17	37119589	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.03771;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:6,3:5,2
+chr17	37449619	.	ATT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:7,12:1,8:6,4
+chr17	37453759	.	AT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:9,3:3,2
+chr17	37812533	.	TTTG	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.067288;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:2,3:7,1
+chr17	37840903	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0005812;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,11:11,8:3,3
+chr17	37880005	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,5:3,4
+chr17	39314795	.	C	CTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.1671;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,4:9,1
+chr17	40985156	.	C	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00019486;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:18,8:7,6
+chr17	41110058	.	A	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0091119;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:20,6:16,5
+chr17	41494407	.	GT	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.046045;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:17,4:20,1
+chr17	41844550	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.3956;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,2:4,1:3,1
+chr17	42096902	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0021297;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,3:5,5
+chr17	42668821	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,5:9,1:9,4
+chr17	42905430	.	AT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028751;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:10,7:8,4
+chr17	42969401	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,9:3,7:2,2
+chr17	42990874	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0024629;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,3:10,2
+chr17	43657006	.	TTCTTTC	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.22036;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:5,2:23,2
+chr17	43719734	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0063654;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:9,1:15,7
+chr17	43835250	.	C	CA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:5,3:2,1
+chr17	43931978	.	TTC	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.026941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:13,1:9,5
+chr17	44041277	.	AAAAAAAAAAAC	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:6,3:3,1
+chr17	44141903	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=1.9695e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,15:13,11:19,4
+chr17	44160573	.	TA	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0010264;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,1:11,9
+chr17	44312367	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00053327;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:9,2:8,8
+chr17	44414145	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.13408;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:8,1:11,3
+chr17	44657378	.	CTTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:5,4:5,1
+chr17	44727864	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.011706;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:7,3:11,7
+chr17	44950763	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:4,4:4,6
+chr17	45662311	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0001093;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:10,12:13,6
+chr17	46245030	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.018803;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:4,2:3,2
+chr17	46688576	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.00041408;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:3,3:2,5
+chr17	47653271	.	A	ATT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.018626;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:5,3:4,4
+chr17	47794116	.	C	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00066634;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:33,13:10,8:23,5
+chr17	48069597	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042556;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:5,6:7,1
+chr17	49071922	.	CT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0076326;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:11,10:2,1
+chr17	49268682	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11923;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:21,2:15,2
+chr17	50128482	.	TCA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0019469;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:3,9:9,1
+chr17	50530493	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.031065;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:9,3:7,5
+chr17	51455573	.	G	GGTGTGT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0018565;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:8,7:9,5
+chr17	52285783	.	CAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.019341;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:7,8:4,1
+chr17	53560037	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0059126;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:12,5:9,1
+chr17	54778400	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.087068;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:25,3:7,2
+chr17	55128925	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:8,4:2,1
+chr17	56495338	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.13316;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,3:14,1
+chr17	56616510	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0052281;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:8,2:15,4
+chr17	56881321	.	GTATATATATTTATATATAATATATGTATATATATATT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.006865;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:4,3:2,3
+chr17	57216321	.	C	CTGTGTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:3,6:6,2
+chr17	57632941	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.015393;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:27,3:12,4
+chr17	57896767	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr17	58074121	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:11,3:9,1:2,2
+chr17	58482709	.	C	CAAA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
+chr17	59015364	.	G	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.014023;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:5,4:10,6
+chr17	59209081	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.028708;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:4,3:2,1
+chr17	60102060	.	GTAAT	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0019854;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:6,6:9,1
+chr17	60982795	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0020871;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:17,3:7,7
+chr17	61609694	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.00050078;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,14:2,11:4,3
+chr17	61613251	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.10395;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:16,2:17,2
+chr17	62122094	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.029588;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:7,8:5,2
+chr17	62356003	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00025079;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:8,6:11,3
+chr17	62913422	.	A	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047988;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:7,4:14,1
+chr17	63942258	.	GGTGTGTGTGT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.015475;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:4,3:7,6
+chr17	65093583	.	C	CTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,5:7,4:5,1
+chr17	65566160	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0034859;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:36,15:21,8:15,7
+chr17	66000371	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00017604;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,6:11,9
+chr17	66038110	.	A	AAAAAAAAAAAG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.002331;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:0,6:0,3:0,3
+chr17	66169282	.	C	CTT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025287;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,3:3,3
+chr17	66411242	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.002451;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,10:0,6:1,4
+chr17	66694480	.	CAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,4:10,3:4,1
+chr17	66965185	.	CATAT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029934;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:9,4:9,2
+chr17	68575791	.	T	TACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0067873;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,6:3,4:0,2
+chr17	68880247	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0041203;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,2:11,6
+chr17	68880248	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0018932;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:11,2:11,7
+chr17	69966706	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,2:1,1:2,1
+chr17	70472124	.	T	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00059303;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:17,4:7,5
+chr17	70629593	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.074772;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:14,3:20,4
+chr17	71590803	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.014152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:13,5:10,5
+chr17	72809202	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.034636;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:7,1:13,4
+chr17	73276046	.	AT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:3,1:5,5
+chr17	74012978	.	G	GGAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.015103;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:6,5:0,2
+chr17	75696377	.	C	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035545;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:6,2:7,6
+chr17	75805810	.	A	ATGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,2:13,2
+chr17	76707291	.	CTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,5:3,3:6,2
+chr17	77216407	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.03913;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:4,1:2,4
+chr17	77630903	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026515;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,5:1,4:1,1
+chr17	78631456	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
+chr17	79860195	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.043808;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:19,3:16,2
+chr17	81426445	.	G	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,2:2,2
+chr17	81613127	.	T	TAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0011057;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:2,11:2,5:0,6
+chr17	81646679	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.016499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:3,4:3,2
+chr17	81950348	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.00089264;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:4,4:4,8
+chr17	82198650	.	C	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0081305;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,3:7,2
+chr17	82938894	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,2:4,3
+chr18	893183	.	A	AAT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:0,2:0,2:0,0
+chr18	897058	.	CTTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0005865;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:11:2,9:2,3:0,6
+chr18	1962849	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:13,1:6,3
+chr18	2689852	.	TAAAA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,6:4,5:0,1
+chr18	4034037	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,2:4,3
+chr18	5538995	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.060606;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,3:1,2:1,1
+chr18	5779294	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.10777;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:18,3:10,2:8,1
+chr18	6676936	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=2.9309e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:3,6:10,7
+chr18	7160890	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.047431;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:5,4:0,0
+chr18	7410240	.	C	CAA	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.051282;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
+chr18	7968241	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0084281;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:4,3:1,1
+chr18	8855725	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0084306;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:7,8:2,1
+chr18	10250784	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0046977;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,14:2,10:4,4
+chr18	10733448	.	A	ATTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.012217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:2,7:1,5:1,2
+chr18	11849513	.	A	AG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.17398;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:17,1:17,3
+chr18	12285764	.	CTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.064336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:12,3:5,4
+chr18	12319132	.	TCC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,4:4,1:8,3
+chr18	13743322	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,3:10,1
+chr18	13880126	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.26692;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,4:9,2:9,2
+chr18	14672212	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
+chr18	14689035	.	G	GTAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016865;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:4,5:9,3
+chr18	15317868	.	CTAAT	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.025917;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:14,1:10,4
+chr18	15393025	.	T	TG	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.034393;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:45,13:20,4:25,9
+chr18	15519095	.	A	C	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.026373;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:76,11:15,2:61,9
+chr18	15521441	.	A	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.004315;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:9,10:17,3
+chr18	15530255	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,3:8,1
+chr18	15540190	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:17,4:1,0
+chr18	15601295	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0006152;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:9,6:2,3
+chr18	15662256	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:15,4:1,0
+chr18	15679441	.	T	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.017225;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:1,2:4,2
+chr18	15691083	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043486;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:2,1:18,4
+chr18	15709768	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.16867;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:1,0:34,4
+chr18	15875759	.	A	C	0	PASS	DP=132;GPV=1;SPV=0.025693;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:56,11:22,3:34,8
+chr18	17777501	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.24484;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:24,4:2,0
+chr18	19275617	.	C	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.03903;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:53,11:32,7:21,4
+chr18	21434499	.	ATG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.011679;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,3:5,5
+chr18	21525014	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.011224;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:7,4:3,4
+chr18	21815198	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0089978;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:13,16:8,11:5,5
+chr18	22095497	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.000471;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:8,6:20,5
+chr18	22232784	.	CCATA	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.12627;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,4:18,1:12,3
+chr18	22882407	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=2.2133e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,16:11,13:6,3
+chr18	23429287	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.012731;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:10,3:15,4
+chr18	24460380	.	A	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.015039;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:16,8:9,4:7,4
+chr18	24460381	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.044901;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,5:9,4:9,1
+chr18	25113764	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:13,2:6,2
+chr18	25113765	.	C	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:15,2:6,2
+chr18	25806054	.	T	TC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.2201;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,7:8,2:13,5
+chr18	25989683	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,4:5,1
+chr18	26027701	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:2,2:7,3
+chr18	26208457	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00053327;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:12,6:5,4
+chr18	26677728	.	AAAG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.054106;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,5:6,4:5,1
+chr18	29103921	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.083134;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:17,1:13,3
+chr18	29997088	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0060788;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:2,5:13,7
+chr18	29997109	.	A	ATGCTGACAGTGATATAAACAATGAAGTCCAGGC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016716;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:1,4:12,2
+chr18	31960484	.	TG	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13025;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:3,3:10,2
+chr18	32586426	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011884;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:8,3:8,2
+chr18	32782481	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:0,0:4,2
+chr18	32841833	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00085567;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:15,5:7,5
+chr18	33193264	.	CAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.12771;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:5,3:3,1
+chr18	33379173	.	A	AAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,1:6,3
+chr18	33403489	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.029259;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,7:13,5:6,2
+chr18	34095251	.	A	ATGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.050426;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:6,4:7,1
+chr18	34839177	.	A	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=2.655e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:8,3:15,10
+chr18	35957482	.	G	GAGAGAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.011174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,6:7,4:4,2
+chr18	37186564	.	CAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,9:5,7:2,2
+chr18	37391026	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00068948;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:12,5:12,8
+chr18	38275952	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0062765;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:12,2:13,8
+chr18	40365027	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00020252;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:10,5:10,6
+chr18	40381060	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0059034;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,5:10,2
+chr18	40765834	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.023838;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:3,3:7,4
+chr18	42154251	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:5,2:1,1:4,1
+chr18	42357665	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.25826;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:4,1:6,3
+chr18	43077102	.	CAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,6:5,1
+chr18	44744769	.	T	TA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0017575;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,14:6,6:11,8
+chr18	45935610	.	G	GC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.23248;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,4:9,2:9,2
+chr18	46112884	.	GTA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:6,1:9,3
+chr18	48149805	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:4,10:1,9:3,1
+chr18	48318214	.	C	CA	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0002648;SS=2;SSC=35;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:17,9:8,4
+chr18	48514634	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.011726;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,3:9,2
+chr18	48891502	.	CAATAAAATAAAATAAAATAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.087179;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:5,2:8,3
+chr18	49202916	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:2,1:9,7
+chr18	49945762	.	GA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.02545;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,5:5,2
+chr18	50325085	.	TCTCCTTCCTCCTCCTTCCTC	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:1,2:6,6
+chr18	50670756	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:5,3:5,1
+chr18	50689404	.	TA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.072018;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,2:5,4
+chr18	50786538	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.20705;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,4:6,1
+chr18	50956895	.	G	GA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.035509;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,10:12,9:4,1
+chr18	51508914	.	C	CAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:11,8:10,7:1,1
+chr18	51614342	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0017532;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:10,3:15,8
+chr18	52226373	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.031062;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:5,2:17,3
+chr18	53393914	.	C	CCTCTCTCTCTCTCT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0025253;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,10:3,5:5,5
+chr18	53546311	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=1.9941e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:7,5:10,9
+chr18	56053026	.	T	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,2:3,1:0,1
+chr18	57850556	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.080441;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:9,3:14,2
+chr18	57899019	.	TGA	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.011302;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:7,2:13,7
+chr18	58403774	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=3.1184e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:5,6:11,5
+chr18	58629563	.	T	TCACACACACA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,6:3,3:1,3
+chr18	58630618	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0395;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,7:9,1:11,6
+chr18	58767872	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:15,4:8,1:7,3
+chr18	58936654	.	A	AT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.006961;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:13,6:14,2
+chr18	58940923	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,8:8,6:3,2
+chr18	60393218	.	T	TG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.020644;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:6,5:7,4
+chr18	60405026	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0090805;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:10,3:16,3
+chr18	61924367	.	C	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.039556;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:6,2:12,3
+chr18	61971234	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.024751;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:10,3:2,4
+chr18	62063292	.	G	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:8,1:9,3
+chr18	62502260	.	GA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:4,4:5,1
+chr18	62727227	.	CA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0087495;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:5,6:2,2
+chr18	63431086	.	TGC	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.030521;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:15,4:12,2
+chr18	63431089	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.044908;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:16,4:16,2
+chr18	63431090	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.079987;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:14,4:15,1
+chr18	63756804	.	T	TTG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0040786;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,17:4,9:2,8
+chr18	66361535	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11275;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:13,3:6,2
+chr18	67081282	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00016784;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:11,5:9,5
+chr18	67515903	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.50909;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:6,2:2,1:4,1
+chr18	68469761	.	G	GGAGAAGAGAAGAGAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:6,4:0,0
+chr18	69335023	.	T	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00099736;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:30,15:14,10:16,5
+chr18	70444986	.	GTTTTT	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:7,3:4,1
+chr18	71000492	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0048426;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:10,4:11,4
+chr18	71399982	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0011743;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:18,8:14,3
+chr18	71568486	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.072331;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:19,1:13,3
+chr18	72630564	.	C	CAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.090728;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:9,4:12,2
+chr18	73093799	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016081;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:7,2:14,5
+chr18	73206219	.	G	GACACAC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,7:4,4:1,3
+chr18	73912644	.	A	ATATATATATATATATACACATATG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.15197;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,6:9,2:12,4
+chr18	74843635	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0025391;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:12,7:10,4
+chr18	76611781	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.15;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:1,2:5,1
+chr18	77690391	.	GTCTC	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.098889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:11,1:21,3
+chr18	79016934	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,2:7,2
+chr18	79356880	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,1:4,5
+chr18	79610227	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.064666;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,3:14,1
+chr18	79815441	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.033948;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,8:4,7:3,1
+chr19	304172	.	A	ACAC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr19	395904	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.16374;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,1:0,1
+chr19	411240	.	C	A	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.031091;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:43,10:18,4:25,6
+chr19	650009	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.21475;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,3:14,1
+chr19	744061	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00010641;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:10,5:9,9
+chr19	1194866	.	CTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:3,3:6,1
+chr19	1339033	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.021468;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:18,9:2,1
+chr19	1727735	.	T	TAAAAAAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.025265;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:6,6:7,3
+chr19	1832914	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.082251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:9,3:7,1
+chr19	2817957	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13077;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:8,2:9,3
+chr19	2928844	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,3:4,1
+chr19	3595078	.	T	TA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.032243;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,10:10,8:12,2
+chr19	3648530	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.13255;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,4:18,1:13,3
+chr19	3885109	.	T	TAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:9,4:6,1
+chr19	4104265	.	T	TA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.013127;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,7:5,6:3,1
+chr19	4899765	.	A	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,4:3,3:6,1
+chr19	5518924	.	A	AG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:1,6:6,2
+chr19	6082293	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:5,8:5,1
+chr19	7231304	.	T	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.034112;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:15,2:12,4
+chr19	7772054	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,4:9,2:9,2
+chr19	7925704	.	C	A	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=5.5134e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:35,17:10,5:25,12
+chr19	8781507	.	G	A	0	PASS	DP=259;GPV=1;SPV=0.01982;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:127,23:36,8:91,15
+chr19	8901307	.	TAATAAAATAAAATAAAATAA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.020884;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:9,5:7,4
+chr19	9058423	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=6.6761e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:13,6:15,7
+chr19	9169265	.	T	TATATATATATA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,1:1,3
+chr19	10301479	.	G	GTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.018648;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,7:1,5:2,2
+chr19	10319259	.	A	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=6.2544e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:12,9:12,5
+chr19	10676260	.	GTTTGTTTTTTTTTTTTTT	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:4,3:5,4
+chr19	11293076	.	AT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.002331;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,7:1,4:0,3
+chr19	11414323	.	TCATA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:6,1:3,3
+chr19	13340426	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0625;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,3:3,2:1,1
+chr19	13486366	.	G	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.069922;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,3:9,1
+chr19	14080097	.	T	TATAATAATA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081016;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,7:11,2:6,5
+chr19	14551950	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,4:0,2:6,2
+chr19	14611371	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,3:3,4
+chr19	15228503	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.081597;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,3:4,2
+chr19	15650835	.	T	TC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,1:10,3
+chr19	15812665	.	CAGGA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:10,4:1,0
+chr19	16063886	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0030216;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:7,2:14,6
+chr19	17147672	.	AT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.016499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:1,3:5,3
+chr19	17896824	.	A	ATT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.01246;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,7:4,4:6,3
+chr19	17967502	.	C	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.081098;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:22,3:11,1
+chr19	18111530	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.017609;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:7,8:4,2
+chr19	20397289	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.047956;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,2:4,3
+chr19	20528117	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0004496;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:9,8:11,3
+chr19	21051790	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00057029;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:11,3:17,7
+chr19	23184370	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00089447;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:13,5:11,7
+chr19	23753601	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.011254;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:16,2:9,7
+chr19	24369075	.	AAC	A	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.012591;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:45,15:24,8:21,7
+chr19	24386451	.	G	T	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.024137;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:33,5:24,2
+chr19	24441846	.	C	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.081913;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:13,3:21,2
+chr19	25010777	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
+chr19	26422867	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.081081;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:17,4:0,0
+chr19	26813246	.	G	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr19	27127720	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.097906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:26,4:2,0
+chr19	27374600	.	T	A	0	PASS	DP=186;GPV=1;SPV=0.043887;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:85,19:46,10:39,9
+chr19	28625367	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00078261;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:9,4:15,5
+chr19	29434503	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0014364;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:9,5:16,5
+chr19	33095770	.	GTCAAA	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0084701;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,3:11,3
+chr19	33131273	.	G	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.019439;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,4:7,2
+chr19	33133196	.	T	TAGAG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.023235;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,8:9,6:10,2
+chr19	33146482	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021073;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,5:2,4:8,1
+chr19	33887997	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.087004;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:19,1:13,3
+chr19	34314746	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0046499;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:13,6:25,3
+chr19	35226147	.	TC	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.006186;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:15,5:12,2
+chr19	35359770	.	T	C	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.044605;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:14,3:27,11
+chr19	35444428	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.03285;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,4:3,2
+chr19	35983551	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=8.4921e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,15:7,8:11,7
+chr19	36316392	.	A	AG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.041513;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:9,4:8,3
+chr19	36365959	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036129;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:10,3:4,6
+chr19	37035408	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.075302;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:20,2:11,3
+chr19	37214962	.	T	TA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.008837;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:8,5:2,1
+chr19	37268475	.	C	CT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.02165;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:11,4:18,2
+chr19	38116538	.	A	AAAAAG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0031609;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:4,3:4,4
+chr19	38317561	.	G	GT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0035224;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:8,5:9,9
+chr19	38351607	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0051998;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,15:2,8:8,7
+chr19	38736467	.	TTTGACCAAGCCCCAGGGCAGG	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.058442;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:1,1:13,3
+chr19	39893575	.	G	C	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.00090425;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:45,13:22,4:23,9
+chr19	41365708	.	T	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,3:5,2:1,1
+chr19	42309064	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00030325;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:15,8:13,5
+chr19	42326740	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,2:4,1:0,1
+chr19	42826320	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00068948;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:10,4:14,9
+chr19	43057377	.	G	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00015269;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:27,17:7,10:20,7
+chr19	43516623	.	C	CTT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0048821;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,7:1,6:1,1
+chr19	46060873	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00011238;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:11,5:11,8
+chr19	46846442	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,2:6,1:1,1
+chr19	47816529	.	A	AT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:8,4:6,1
+chr19	47884804	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:7,5:6,1
+chr19	47921144	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.037062;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:14,2:14,4
+chr19	47924231	.	G	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:0,1:7,5
+chr19	48101126	.	A	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:3,3:2,3
+chr19	49025212	.	T	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.037233;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:18,3:13,5
+chr19	49318868	.	A	ATTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:9,3:5,2
+chr19	49758152	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0089139;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:14,8:13,4
+chr19	50136384	.	G	T	0	PASS	DP=377;GPV=1;SPV=0.049534;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:211:186,24:99,15:87,9
+chr19	50170961	.	CA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.016084;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:19,9:6,2
+chr19	50623613	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.013985;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,10:7,8:2,2
+chr19	50993513	.	CAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.023045;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:4,7:3,2
+chr19	51090116	.	C	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0002546;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:13,5:15,7
+chr19	51120845	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04669;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:15,6:3,1
+chr19	53060604	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=9.3193e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:25,13:14,5:11,8
+chr19	53914273	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.056718;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:16,4:3,1
+chr19	54914841	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0005758;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:13,7:7,3
+chr19	55082948	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.011603;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:15,4:7,2
+chr19	57179200	.	TTC	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.039973;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:10,5:11,3
+chr19	58171286	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.027191;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:7,1:2,5
+chr19	58349648	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0077494;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,6:3,2
+chr19	58405212	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.042236;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:3,1:6,7
+chr19	58427348	.	TC	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,4:0,2:3,2
+chr2	686134	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=4.6765e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:8,6:8,7
+chr2	823560	.	T	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00011829;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:4,5:13,7
+chr2	868396	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:1,2:8,3
+chr2	2773501	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00024707;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:11,7:9,4
+chr2	3510143	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.040398;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:8,9:4,1
+chr2	3530344	.	T	TGG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:0,2:2,2
+chr2	3892603	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00082439;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:12,7:14,5
+chr2	3923534	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00053926;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:10,5:3,3
+chr2	4622211	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00044128;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:14,5:15,5
+chr2	4871563	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0002055;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:9,5:13,7
+chr2	5573348	.	AAAT	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.040398;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:6,4:6,6
+chr2	6016362	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,5:9,2:3,3
+chr2	6217503	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0029154;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:15,3:15,7
+chr2	6504952	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,2:4,1:1,1
+chr2	7085270	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,3:5,3
+chr2	7315365	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.095104;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,2:17,2
+chr2	9079486	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00083483;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:11,5:12,6
+chr2	9514674	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:9,6:2,3
+chr2	9721949	.	T	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.002188;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:11,3:9,5
+chr2	10007354	.	T	TTACTATTATTATTACTACTAC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.018762;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,8:6,4:8,4
+chr2	10206245	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.01286;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:8,9:7,1
+chr2	10942692	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00012491;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,14:9,6:15,8
+chr2	11419508	.	A	AAAAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0044617;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,14:6,9:4,5
+chr2	12123234	.	TC	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.057784;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:16,3:20,1
+chr2	12369609	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00068121;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:8,6:12,7
+chr2	14716789	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0048249;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:12,3:19,6
+chr2	15723517	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.12206;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:11,3:14,1
+chr2	16279194	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.10105;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:16,5:5,1:11,4
+chr2	17353616	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=6.5042e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:23,18:12,9:11,9
+chr2	17839195	.	TA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.03908;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:9,5:3,1
+chr2	19144887	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0062663;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,14:9,10:7,4
+chr2	22050337	.	A	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.012493;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:4,4:30,3
+chr2	22659875	.	GCT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020734;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:3,14:1,7:2,7
+chr2	23120687	.	GCGCA	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0047709;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:17,13:11,9:6,4
+chr2	23714239	.	CT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.03274;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:3,7:11,3
+chr2	23899918	.	CTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:4,3:5,3
+chr2	23942967	.	C	CT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:5,4:5,4
+chr2	24912585	.	GCA	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,4:8,1:7,3
+chr2	25224723	.	TTATTA	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:6,13:1,8:5,5
+chr2	25625551	.	ATT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.29515;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:8,3:2,3
+chr2	25728041	.	A	ATG	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.025825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:10,6:6,3
+chr2	26995780	.	G	GGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.041917;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:12,9:9,5:3,4
+chr2	27691592	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0069071;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:4,7:6,3
+chr2	28461572	.	C	CAAAATAAAATAAATAAAAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:5,3:7,11
+chr2	29717171	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:4,3:5,1
+chr2	30681899	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.17647;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,7:5,6:2,1
+chr2	32001032	.	A	AT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,5:8,1
+chr2	32930451	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.031062;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:22,5:14,2:8,3
+chr2	33476728	.	C	CCT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,9:4,7:6,2
+chr2	35007269	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.028792;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:4,3:9,3
+chr2	36506181	.	TCACA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,5:9,2:9,3
+chr2	37968438	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:4,5:2,1
+chr2	38164595	.	C	CACATATATATATATAT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:9,2:4,3
+chr2	38253252	.	G	GT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0025391;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:12,4:10,7
+chr2	38392479	.	C	CCAG	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.011868;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,10:4,9:0,1
+chr2	39010899	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.021442;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:11,3:9,3
+chr2	39045273	.	A	AGTGTGT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,4:8,3:1,1
+chr2	39648042	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,8:9,7:2,1
+chr2	42018932	.	AAAAAGAAAAG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024318;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,8:2,4:9,4
+chr2	42060586	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.030521;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:10,2:17,4
+chr2	42060587	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.092279;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,1:10,4
+chr2	42409722	.	AAAAAAAAT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.043423;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:7,2:5,3
+chr2	43046823	.	ATCTCTCTCTC	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.23663;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,3:11,1
+chr2	43297376	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:3,4:0,1
+chr2	43455520	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.031253;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,7:13,4:5,3
+chr2	44457350	.	A	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00026731;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:15,10:13,5
+chr2	45611225	.	G	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=4.6208e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:12,13:6,6
+chr2	46855243	.	TCACACACACACA	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,7:2,1:1,6
+chr2	48834300	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047515;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:11,5:9,5
+chr2	49257453	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,5:10,2:6,3
+chr2	50352778	.	T	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.073359;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:6,3:10,1
+chr2	51504651	.	TGC	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,4:2,3:4,1
+chr2	51778275	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00095347;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,7:3,6:1,1
+chr2	51983544	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.011603;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:8,4:14,2
+chr2	52334968	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00031271;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:14,3:9,9
+chr2	52449055	.	G	GTAGTAATAATAATAATAATAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.046146;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,1:7,5
+chr2	52852312	.	T	TG	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0035088;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,11:8,9:5,2
+chr2	54237533	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00069999;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:14,4:8,4
+chr2	54513707	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00086088;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:14,5:9,5
+chr2	55728945	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.728e-06;SS=2;SSC=55;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:11,6:6,9
+chr2	56430889	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00020585;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:14,6:10,9
+chr2	56450099	.	G	GTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:8,3:1,2
+chr2	57116261	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0045171;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:14,7:14,2
+chr2	57569891	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.001022;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:15,5:16,5
+chr2	59467199	.	GTTCATGGCATC	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00092621;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:10,6:8,5
+chr2	59755611	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.001853;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:8,7:2,4
+chr2	59892090	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00046907;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:10,8:14,4
+chr2	60901148	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,2:4,3
+chr2	60901151	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,3:6,1:0,2
+chr2	61572716	.	CT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:5,4:0,2
+chr2	62357869	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.085739;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,5:9,2:7,3
+chr2	65218878	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.017225;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:5,4:0,0
+chr2	66341454	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.093185;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,3:14,1
+chr2	66794702	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,4:8,3:6,1
+chr2	68170747	.	C	CA	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.062714;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,6:10,5:2,1
+chr2	68760882	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.26383;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,5:9,3:11,2
+chr2	69027621	.	A	AGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.034996;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:9,1:5,5
+chr2	69639050	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0036826;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:11,6:13,4
+chr2	70293546	.	C	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=6.2443e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:13,6:11,5
+chr2	70637928	.	A	AAAAATAAAAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.030455;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,7:4,4:7,3
+chr2	71097711	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,6:6,5:3,1
+chr2	71521673	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=7.7661e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:13,8:13,6
+chr2	71618566	.	GTT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.16209;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:15,1:7,2
+chr2	72144081	.	C	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.0019761;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,11:24,5:24,6
+chr2	74135948	.	C	CT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0058007;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,9:2,8:1,1
+chr2	75813568	.	C	CT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.088868;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:14,1:16,3
+chr2	76443314	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,10:1,6:5,4
+chr2	77648462	.	T	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0094953;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,13:3,8:4,5
+chr2	78093492	.	A	AT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0082887;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:9,7:15,3
+chr2	78710692	.	A	AAAGGAAGG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,5:4,4:11,1
+chr2	79056095	.	CA	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021576;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,3:7,6
+chr2	79521107	.	GATATATATATATATATATATATATATATATAT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.085139;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:4,1:3,3
+chr2	82053878	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0040548;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:3,8:12,5
+chr2	82182734	.	TC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.042901;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:5,3:6,2
+chr2	82182736	.	C	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.03771;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:4,3:7,2
+chr2	82182739	.	ACTCTC	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.045519;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:5,3:7,2
+chr2	82441284	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0037091;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:7,4:11,2
+chr2	82784939	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.033516;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:10,2:13,7
+chr2	85328781	.	A	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:36:1,4:0,1:1,3
+chr2	86303212	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.030556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,5:5,4:5,1
+chr2	86905522	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.038493;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:15,11:11,2
+chr2	87018492	.	C	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
+chr2	87214518	.	G	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.0037978;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:32,16:13,9:19,7
+chr2	87222922	.	GGT	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048406;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:14,2:6,6
+chr2	87236895	.	CA	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.059574;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,3:8,1
+chr2	87429621	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.064666;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,1:13,3
+chr2	87429622	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.059209;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:14,2:12,3
+chr2	87430689	.	AAGCC	A	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.02276;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:68,15:34,5:34,10
+chr2	88983107	.	A	G	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.018478;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:41,6:22,3:19,3
+chr2	89592132	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00069917;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,10:1,3:10,7
+chr2	89617384	.	AAT	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.029803;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:11,7:18,4
+chr2	89836731	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0094399;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:21,3:11,4
+chr2	89909729	.	C	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:8,8:0,1
+chr2	89919282	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.20218;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,1:11,3
+chr2	90294162	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.043004;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:18,5:16,2
+chr2	90312003	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.002038;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:7,4:16,7
+chr2	90321917	.	T	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.046456;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:35,7:19,1:16,6
+chr2	90332248	.	TTA	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.057842;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
+chr2	90356850	.	A	ATT	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.045905;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:56,11:28,6:28,5
+chr2	90382966	.	A	G	0	PASS	DP=217;GPV=1;SPV=0.040517;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:119:102,17:11,2:91,15
+chr2	90401914	.	T	A	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.028609;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:142,17:61,10:81,7
+chr2	91426791	.	A	G	0	PASS	DP=417;GPV=1;SPV=0.027406;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:196,31:125,20:71,11
+chr2	91442435	.	C	A	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.024717;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:48,15:21,5:27,10
+chr2	91458943	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0053553;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:32,11:23,9:9,2
+chr2	91496251	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.038126;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:51,8:28,7:23,1
+chr2	91516287	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.074336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:13,4:9,1
+chr2	91519296	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.13473;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,1:7,3
+chr2	91542845	.	C	CGT	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.032792;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,12:16,7:12,5
+chr2	91545052	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0050385;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:6,8:6,2
+chr2	91551347	.	A	C	0	PASS	DP=137;GPV=1;SPV=0.0093814;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:70,8:32,4:38,4
+chr2	91675456	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.032567;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:8,5:17,6
+chr2	92132618	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.14256;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:19,1:12,3
+chr2	92249636	.	A	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.10559;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:6,3:26,1
+chr2	92254569	.	G	C	0	PASS	DP=121;GPV=1;SPV=0.011495;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:57,10:28,5:29,5
+chr2	92261556	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:1,1:6,3
+chr2	92276085	.	T	G	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.027257;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:94,17:33,8:61,9
+chr2	92309923	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.17143;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr2	92309928	.	T	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.15584;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr2	92383293	.	A	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.019781;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:22,8:3,3
+chr2	92499753	.	T	G	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.027282;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:74,10:54,7:20,3
+chr2	92533519	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.11998;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:21,3:8,1
+chr2	92556579	.	A	T	0	PASS	DP=268;GPV=1;SPV=0.0026044;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:158:133,25:101,20:32,5
+chr2	92728437	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.20161;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:2,0:26,4
+chr2	92759321	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17984;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:11,3:5,1:6,2
+chr2	92774895	.	C	A	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.035957;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:59,7:8,2:51,5
+chr2	92839048	.	T	A	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.032518;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:77,13:38,2:39,11
+chr2	92839081	.	G	A	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.041615;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:78,19:24,6:54,13
+chr2	92889972	.	CAT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:0,0:14,4
+chr2	93001964	.	C	T	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.025228;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:18,6:11,1
+chr2	93009752	.	C	T	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.074238;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:50,6:41,5:9,1
+chr2	93039692	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:18,4:2,0
+chr2	93040550	.	C	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.029623;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:20,1:25,4
+chr2	93042746	.	G	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.13043;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr2	93087515	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.11326;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:16,4:25,1
+chr2	93096128	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:21,4:0,0
+chr2	93097106	.	C	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:6,2:0,0
+chr2	93100515	.	T	G	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.035602;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:75,12:51,7:24,5
+chr2	93151427	.	T	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13971;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:1,0:17,4
+chr2	93255109	.	G	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17679;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:0,0:16,4
+chr2	93265760	.	A	C	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.020561;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:99:88,11:82,9:6,2
+chr2	93316463	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.17028;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:8,3:8,3:0,0
+chr2	93332537	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:6,1:5,3
+chr2	93473588	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.086656;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:22,1:4,3
+chr2	93628626	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,1:9,3
+chr2	93641763	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:3,2:9,5
+chr2	93694069	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.073684;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:6,3:0,0
+chr2	93821099	.	A	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.027524;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:13,7:2,1
+chr2	93961018	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.044901;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:4,1:14,4
+chr2	93972780	.	T	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.048464;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:11,2:21,2
+chr2	94084851	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,3:14,1
+chr2	94087228	.	G	A	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0071633;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:20,3:11,3
+chr2	94156216	.	A	AG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.068436;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:8,1:6,4
+chr2	94156217	.	A	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.025213;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,1:5,5
+chr2	94156218	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,1:5,3
+chr2	94995255	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.19632;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,3:17,1:6,2
+chr2	94995261	.	GC	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.096964;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,5:18,2:11,3
+chr2	94995266	.	G	GC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.06862;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:24,7:15,3:9,4
+chr2	95543732	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.010404;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:21,5:11,3
+chr2	96060658	.	T	C	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.016173;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:52,19:24,15:28,4
+chr2	96805418	.	G	GT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:9,7:0,2
+chr2	97012153	.	A	AAAATAAAT	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.031844;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:10,8:10,1
+chr2	97588780	.	A	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:2,1:4,5
+chr2	97665723	.	CTCTCTCTCTCTCTCTATA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.17028;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:8,8:2,4:6,4
+chr2	97979503	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.015826;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:12,5:10,5
+chr2	101712903	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.019985;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:4,8:5,2
+chr2	106289319	.	G	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.06044;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:20,1:9,3
+chr2	107433356	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.083772;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:15,8:9,4:6,4
+chr2	108098643	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.026352;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:9,3:11,7
+chr2	108360003	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0094843;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:1,4:8,7
+chr2	108452847	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.074614;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:17,2:9,2
+chr2	108500159	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:30:0,2:0,2:0,0
+chr2	109185314	.	T	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0030216;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:12,2:9,6
+chr2	111351928	.	A	AT	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.036735;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,9:11,5:10,4
+chr2	111639504	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.075514;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:12,2:22,3
+chr2	112167884	.	TG	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,2:3,2
+chr2	112388323	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:8,4:12,1
+chr2	113520484	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.075302;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:18,1:13,4
+chr2	113562784	.	T	C	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.017729;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:36,8:22,2:14,6
+chr2	113587861	.	TCTGCCCTCACTGTGCAATTCCAGGAGTGTTTTTCCTTC	T	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.042403;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:59,12:37,3:22,9
+chr2	113597419	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.054436;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:23,4:12,2
+chr2	113693857	.	CTTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0083313;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:7,7:4,2
+chr2	116864344	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01315;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,3:7,4
+chr2	116873420	.	CTGT	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0027601;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:7,7:7,7
+chr2	117652617	.	T	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.013487;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,2:2,4
+chr2	117652670	.	A	AAG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:14,3:2,1
+chr2	118620788	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01064;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,3:10,2
+chr2	119360512	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:3,4:8,4
+chr2	120680498	.	C	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:2,1:4,1
+chr2	121799626	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.019794;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:14,4:14,2
+chr2	122793789	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.1439;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,1:13,3
+chr2	123567325	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,3:7,1
+chr2	124296151	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00047821;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:16,7:4,3
+chr2	124317198	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0047364;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:9,3:14,8
+chr2	125499797	.	CT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0060611;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,11:5,8:6,3
+chr2	125798730	.	A	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0024512;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:24,9:8,5
+chr2	125854365	.	G	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.001166;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:30,13:12,4:18,9
+chr2	125891353	.	GTA	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:3,4:0,0
+chr2	125988641	.	A	AT	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0035375;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,1:7,5
+chr2	127221243	.	ATTTTT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.010374;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,9:4,4:5,5
+chr2	127711424	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
+chr2	128079612	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,3:4,1:1,2
+chr2	128677264	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.022564;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:8,9:19,2
+chr2	128677265	.	A	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.010895;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:8,9:19,2
+chr2	129973563	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.009946;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:10,4:14,3
+chr2	130110807	.	A	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.021839;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:9,6:3,4
+chr2	130124424	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.026369;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:7,5:11,3
+chr2	130197270	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037457;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:11,1:6,8
+chr2	130607976	.	G	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:0,1:7,4
+chr2	130622941	.	T	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011854;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:8,5:13,2
+chr2	130623738	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.084757;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:10,2:18,2
+chr2	130648059	.	A	G	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.010368;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:27,4:18,5
+chr2	130781815	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,3:3,1
+chr2	130926008	.	T	TTTTCTTTC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12884;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:4,1:10,3
+chr2	131040025	.	A	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.042386;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:19,4:20,1
+chr2	131264373	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.010286;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:5,2:15,7
+chr2	131602701	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.20119;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:42,5:21,1:21,4
+chr2	132591278	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.067079;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,7:1,1:8,6
+chr2	132886169	.	TA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00055994;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:16,22:9,14:7,8
+chr2	133444399	.	G	GAT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.030805;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,7:3,4:9,3
+chr2	133839416	.	T	TA	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0044;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,10:5,7:12,3
+chr2	136566790	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=3.8037e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:11,5:10,9
+chr2	136709397	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.088906;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,1:9,3
+chr2	137404476	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,2:3,1:2,1
+chr2	137729042	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.033228;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:16,1:12,5
+chr2	138089369	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00040347;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:8,9:17,5
+chr2	140112660	.	G	GAGAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.015385;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,10:11,6:2,4
+chr2	140696743	.	C	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=8.9862e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:33,15:18,4:15,11
+chr2	142086635	.	AC	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,3:4,1
+chr2	142797765	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.024846;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:8,6:3,1
+chr2	145635002	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.20979;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:4,3:2,1
+chr2	145687047	.	A	AT	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0016822;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:11,5:15,6
+chr2	146937086	.	AATGGATGGATGG	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,8:5,1
+chr2	147673537	.	C	CT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.032095;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,6:13,5:3,1
+chr2	148176304	.	GT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:14,3:4,1
+chr2	148270393	.	A	ATT	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.022676;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:14,8:7,5
+chr2	149156621	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.001804;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:9,9:5,6
+chr2	149674983	.	CTA	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.055991;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:15,4:14,2
+chr2	149675019	.	CTA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0083039;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:13,6:5,4
+chr2	149705978	.	A	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.17217;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,5:4,2:5,3
+chr2	150658979	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031121;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,9:3,6:5,3
+chr2	153246512	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0022088;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,6:16,3
+chr2	153719837	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=1.6328e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:20,12:12,5
+chr2	154620975	.	TCCTTTCTC	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.10935;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:3,2:21,3
+chr2	155334085	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.042555;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:11,5:3,3
+chr2	155334086	.	AG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016761;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,6:9,3:3,3
+chr2	155671369	.	GA	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
+chr2	158216386	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.047101;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:3,4:6,1
+chr2	158750164	.	AGT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:5,11:4,7:1,4
+chr2	159874069	.	TAA	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1174;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,1:17,3
+chr2	159874084	.	G	GTA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.023496;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:8,5:14,5
+chr2	160191662	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.030011;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:17,5:16,2
+chr2	160681459	.	C	CTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,4:2,1:4,3
+chr2	161109807	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.029557;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:39,8:20,5:19,3
+chr2	162820033	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:8,3:6,1
+chr2	163102493	.	CA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.011899;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,8:4,6:4,2
+chr2	163758054	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=3.7651e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:8,8:12,4
+chr2	165147294	.	GGT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.021659;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:10,9:6,1
+chr2	166154444	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.031046;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:11,3:10,2
+chr2	168752279	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,4:3,2:2,2
+chr2	169656413	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:13,1:13,3
+chr2	169838387	.	TTG	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.011312;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:4,6:2,4:2,2
+chr2	170160245	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.045738;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,6:6,4:8,2
+chr2	170866189	.	A	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0040937;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:19,2:9,6
+chr2	170921192	.	GTT	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,6:4,4:4,2
+chr2	171272618	.	AT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.049667;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:6,4:7,3
+chr2	172709045	.	TC	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.042184;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:16,3:15,2
+chr2	172911758	.	CTT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,7:7,5:3,2
+chr2	173939765	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,2:4,1:3,1
+chr2	174347609	.	CTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.21107;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:14,3:5,2
+chr2	174409249	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058443;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,3:10,2
+chr2	175000137	.	AT	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0055138;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:8,6:8,4
+chr2	175777946	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00025893;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:9,4:17,9
+chr2	177044292	.	GACACAC	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0086042;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,13:13,7:5,6
+chr2	177414897	.	C	CGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047817;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:9,6:7,2
+chr2	177453190	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=9.674e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,17:8,8:6,9
+chr2	178016408	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.046186;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:12,3:18,2
+chr2	179332330	.	AAAAAGG	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.060034;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:8,1:16,3
+chr2	179395127	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.035714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:12,3:12,4
+chr2	179427024	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.5381e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:11,5:10,8
+chr2	181301902	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,1:16,3
+chr2	181301903	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.11998;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:11,1:18,3
+chr2	182169922	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0066141;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:3,6:2,4:1,2
+chr2	182437546	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0057252;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:14,5:16,4
+chr2	183278919	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00031881;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:6,4:13,6
+chr2	184271914	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.7586e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:17,8:11,9
+chr2	185865597	.	A	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.033768;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:29,12:21,2:8,10
+chr2	185933382	.	CAATA	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,7:9,3
+chr2	186007102	.	T	TTCTCTCTC	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:12,4:2,3
+chr2	186213505	.	TACAC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:10,2:3,4
+chr2	186961457	.	CTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,8:3,5:2,3
+chr2	187944437	.	CTTT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0089783;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,11:1,7:2,4
+chr2	188424486	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0031368;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:10,7:15,1
+chr2	188466445	.	T	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,2:5,1:2,1
+chr2	188773787	.	T	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.072845;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:16,3:13,2
+chr2	189019131	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00021002;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:11,8:12,6
+chr2	190373244	.	T	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.020223;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:6,4:10,7
+chr2	190953950	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.23366;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:4,2:5,2
+chr2	191723162	.	G	GGTGTGT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065471;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,7:9,6:4,1
+chr2	191743433	.	AAC	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.12934;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:14,3:12,1
+chr2	192037614	.	GAAAGAGAGAGAGGAGAGAAAGAGAGAGAA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.043842;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:6,4:6,2
+chr2	192532343	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0057103;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:10,2:11,9
+chr2	193202938	.	T	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00014249;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:9,5:7,8
+chr2	195195545	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0015408;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:5,4:15,6
+chr2	195567625	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:2,0:19,4
+chr2	196051520	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.01728;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:14,3:19,4
+chr2	196248599	.	C	CACAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.070228;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,1:10,3
+chr2	196362318	.	TACACAC	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:9,5:0,3
+chr2	198043881	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,3:1,1:3,2
+chr2	198114672	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0035421;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:7,1:15,7
+chr2	198668815	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00034628;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,18:8,12:4,6
+chr2	199256010	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=1.5662e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:20,15:14,7:6,8
+chr2	199409072	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0013049;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:34,11:17,4:17,7
+chr2	200027694	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,7:3,1
+chr2	200657167	.	T	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
+chr2	201247190	.	CAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.028846;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,7:1,6:3,1
+chr2	202029033	.	CAA	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.033431;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,6:8,5:7,1
+chr2	202767157	.	CTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.14804;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:18,4:7,1
+chr2	205920262	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.048094;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:20,4:7,1
+chr2	208834439	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06057;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,2:8,3
+chr2	210361142	.	G	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=3.8667e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:23,17:14,9:9,8
+chr2	210388024	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0039305;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:11,4:8,2
+chr2	213994049	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0068919;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:4,6:16,2
+chr2	215538054	.	TC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.14395;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:10,1:10,3
+chr2	215538058	.	T	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,1:10,3
+chr2	217528407	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,4:4,1:4,3
+chr2	217566745	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0032397;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:16,7:11,3
+chr2	217980506	.	C	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:12,4:6,2:6,2
+chr2	218561652	.	GA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:5,3:2,4
+chr2	222407553	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.19804;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:13,4:5,1
+chr2	223266827	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.16375;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,2:16,2
+chr2	224535001	.	AAAATAAATAAATAAATAAATAAAT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13236;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,7:5,2:18,5
+chr2	225878815	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:5,5:1,2:4,3
+chr2	226242491	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00085757;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:17,8:8,4
+chr2	226706767	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,5:6,2:6,3
+chr2	226981435	.	C	CA	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0035718;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:12,5:12,3
+chr2	227569414	.	CAT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.03733;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:3,3:2,3
+chr2	227660450	.	T	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.46154;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:7,2:3,1:4,1
+chr2	228203825	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00051786;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:7,4:17,5
+chr2	229308673	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,6:5,5:1,1
+chr2	230645163	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0016474;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:14,5:18,7
+chr2	230834879	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0066905;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,13:8,9:5,4
+chr2	231017939	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.065325;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,5:6,1:9,4
+chr2	231628970	.	GA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,6:3,1
+chr2	231837173	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.17925;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:20,3:13,2:7,1
+chr2	232180329	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:12,3:7,2
+chr2	232673907	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.010538;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,10:4,9:3,1
+chr2	233494920	.	A	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.00024999;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:3,10:3,6:0,4
+chr2	233567321	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.089909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,2:16,2
+chr2	233852579	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023915;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:10,3:8,6
+chr2	234170428	.	T	TTTTTTTTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0091533;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:0,3:6,3
+chr2	235090896	.	CTTCT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.082337;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,6:5,1:11,5
+chr2	236160238	.	AGTGT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0055603;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,15:3,3:12,12
+chr2	236358897	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00054254;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:11,6:13,7
+chr2	236736477	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0032397;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:10,5:17,5
+chr2	236893471	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:7,2:6,1:1,1
+chr2	238780120	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.020642;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:8,7:10,3
+chr2	238783555	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.059999;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:9,5:16,1
+chr2	240479065	.	C	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0012641;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:11,5:16,4
+chr2	240516151	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.091036;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,2:16,2
+chr2	240976023	.	G	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=5.7383e-08;SS=2;SSC=72;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:20,18:10,11:10,7
+chr2	242138000	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024789;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:3,1:5,4
+chr20	348484	.	C	CGTGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.19369;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,5:3,2:7,3
+chr20	850094	.	T	TACACACACAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.045151;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:10,6:3,1
+chr20	2842821	.	GATAGACAT	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:2,2:6,2
+chr20	3998574	.	CAA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.030303;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:2,4:0,0
+chr20	4168883	.	CTATTTTATTT	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.025866;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:10,3:13,10
+chr20	4971299	.	A	AAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01398;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,9:10,4:5,5
+chr20	5583225	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:3,8:3,1
+chr20	6188805	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00060177;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:14,6:17,7
+chr20	6368317	.	A	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.011069;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:18,6:11,4
+chr20	7051087	.	A	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.067292;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:9,2:14,4
+chr20	8031594	.	G	GT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.020047;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:10,12:2,2:8,10
+chr20	8031779	.	GATGT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.045366;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:13,9:5,2
+chr20	10498679	.	CTTTTCT	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.097509;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,5:11,1:8,4
+chr20	10558363	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,4:5,1:5,3
+chr20	11519528	.	C	CATATATATAT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.039737;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,5:5,4:3,1
+chr20	11945540	.	C	CAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,4:10,4:1,0
+chr20	12188094	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0072434;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:12,3:13,5
+chr20	12506579	.	TACACACACACACAC	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0090498;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,5:3,3:0,2
+chr20	13347841	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0088148;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,8:11,7:7,1
+chr20	13655841	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00072644;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:11,6:7,5
+chr20	14854463	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0033296;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:12,3:4,4
+chr20	15713995	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:16,3:7,1
+chr20	16847421	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,3:7,3
+chr20	17164720	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.02905;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:9,5:10,1
+chr20	19758209	.	TTCCTCCTCTTCCTCC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.030792;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:7,1:6,4
+chr20	19844713	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.038406;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,6:3,4:5,2
+chr20	20054014	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00062341;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,14:4,9:5,5
+chr20	20098607	.	C	CAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:5,6:4,1
+chr20	20594728	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,5:5,1
+chr20	21215901	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=5.8478e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:5,4:9,7
+chr20	22082830	.	A	ATC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:15,2:8,2
+chr20	22145884	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.046659;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:9,5:12,3
+chr20	22907106	.	A	AT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.023323;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,11:6,6:8,5
+chr20	23648220	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,2:2,1:3,1
+chr20	23794248	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.028266;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:9,1:11,5
+chr20	24543152	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00058827;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:11,4:10,6
+chr20	26553908	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
+chr20	26553909	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:1,0:14,4
+chr20	26558541	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.034074;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:27,5:7,4
+chr20	26558545	.	A	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.046841;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:34,8:26,4:8,4
+chr20	26755238	.	T	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.013832;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:16,8:0,1
+chr20	27161441	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.083817;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,4:9,1:13,3
+chr20	27571425	.	G	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.27668;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:13,3:0,0
+chr20	28498801	.	GA	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.047062;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:38,11:26,8:12,3
+chr20	28513354	.	T	C	0	PASS	DP=294;GPV=1;SPV=0.018002;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:150:133,17:89,10:44,7
+chr20	28513906	.	A	G	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.024244;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:106:89,17:11,1:78,16
+chr20	28525782	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.045506;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:10,3:21,1
+chr20	28530574	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,1:8,3
+chr20	28764397	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0060655;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:12,3:12,6
+chr20	28841135	.	A	T	0	PASS	DP=489;GPV=1;SPV=0.012388;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:274:235,39:145,24:90,15
+chr20	29048293	.	G	A	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.030284;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:59,14:27,10:32,4
+chr20	29053060	.	T	G	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.01669;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:87,11:32,3:55,8
+chr20	29074228	.	C	T	0	PASS	DP=330;GPV=1;SPV=0.011905;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:178:160,18:78,6:82,12
+chr20	29092153	.	T	A	0	PASS	DP=174;GPV=1;SPV=0.0081632;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:76,16:49,7:27,9
+chr20	29484239	.	C	T	0	PASS	DP=157;GPV=1;SPV=0.0056503;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:59,20:33,4:26,16
+chr20	29484262	.	T	C	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.0027154;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:53,16:28,4:25,12
+chr20	29513191	.	C	T	0	PASS	DP=269;GPV=1;SPV=0.015832;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:155:126,29:59,9:67,20
+chr20	29518883	.	T	A	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.044612;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:74,12:38,6:36,6
+chr20	29764762	.	A	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:5,2:13,2
+chr20	29775827	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.031184;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:17,4:22,1
+chr20	29813639	.	A	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.036467;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:59,12:35,2:24,10
+chr20	29938136	.	C	A	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.044012;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:36,12:32,11:4,1
+chr20	29993826	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,3:5,1
+chr20	30019959	.	C	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.040043;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:1,5:0,1:1,4
+chr20	30177373	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0069365;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:20,6:8,1
+chr20	30218923	.	GGT	G	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.038382;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:61,12:33,5:28,7
+chr20	30319291	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.076397;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,1:15,3
+chr20	30756889	.	T	G	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.019521;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:71,13:23,3:48,10
+chr20	31055141	.	T	A	0	PASS	DP=190;GPV=1;SPV=0.022857;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:80,18:44,10:36,8
+chr20	31064593	.	T	TGGAAA	0	PASS	DP=330;GPV=1;SPV=0.0271;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:129,22:58,5:71,17
+chr20	31072067	.	G	GTGGAATGGAA	0	PASS	DP=453;GPV=1;SPV=0.0097515;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:266:150,27:81,19:69,8
+chr20	31832757	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.003828;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:13,6:13,6
+chr20	32094705	.	AAAAGAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.076981;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:11,6:10,1
+chr20	32176929	.	C	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:12,1:3,3
+chr20	32683247	.	C	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.049275;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,4:5,2
+chr20	32964005	.	C	CCTTCTT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.18393;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,4:14,2:12,2
+chr20	33087753	.	C	CACACACACACAA	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.017877;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:21,12:12,6:9,6
+chr20	33128672	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.035909;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,6:18,3:15,3
+chr20	33486424	.	TTG	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10954;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:18,2:15,3
+chr20	34659444	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.11202;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:28,5:17,3:11,2
+chr20	34659445	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.18741;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:17,3:19,1
+chr20	35644636	.	CTGAGAA	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0029127;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:12,7:6,5
+chr20	35722427	.	A	AAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019548;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:5,5:5,2
+chr20	35756444	.	CAAA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00096242;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,15:6,13:1,2
+chr20	37067781	.	A	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,1:6,3
+chr20	37677407	.	T	TGAGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.012384;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,6:4,2:2,4
+chr20	38122424	.	TATATATATATATACACAC	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:4,2:3,5
+chr20	38124075	.	TTA	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0096618;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,3:2,4
+chr20	39546333	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0011917;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:11,7:17,3
+chr20	39944581	.	C	CGTGT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.018762;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,8:10,5:4,3
+chr20	40435661	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.071891;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:23,3:13,2
+chr20	40799508	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0017052;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:15,9:16,5
+chr20	42794816	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:2,6:5,1
+chr20	43761217	.	T	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.069354;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:7,3:17,2
+chr20	44352966	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10927;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:7,6:8,1
+chr20	44722467	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:4,2:6,2
+chr20	47191415	.	GTGGATGGATGGATGGA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0016586;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:3,7:7,3
+chr20	47510432	.	C	CAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,4:2,1
+chr20	47890678	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.023472;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,1:15,4
+chr20	48250829	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.046816;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:7,3:5,5
+chr20	48573458	.	AGTTCTCATCACCAACTGCCTCATCCTGGTTTGAAGACAG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0073297;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,4:2,3
+chr20	49022432	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036566;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:11,3:6,3
+chr20	49254660	.	G	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0013432;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,17:9,11:6,6
+chr20	49323619	.	TAA	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0032734;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,7:2,6:1,1
+chr20	49401268	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0047847;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:1,2:3,3
+chr20	50094038	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,4:4,1:5,3
+chr20	50681241	.	AAG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.010837;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,4:4,1
+chr20	50782593	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.022677;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:13,5:12,1
+chr20	51540658	.	G	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:1,1:6,1
+chr20	52733811	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.04287;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:5,4:10,5
+chr20	52986401	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01441;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,7:6,5:7,2
+chr20	53595046	.	C	CA	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.054945;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,3:3,3:0,0
+chr20	53670953	.	A	AG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0031242;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:4,6:4,7
+chr20	53853717	.	GGAAGGAAGGAAAGAAA	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:12,4:0,0
+chr20	54058593	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,3:5,1
+chr20	55688941	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.010968;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:6,2:12,4
+chr20	55977899	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11424;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:3,4:12,2
+chr20	56735857	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0004781;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,13:0,2:6,11
+chr20	56888307	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00051706;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:7,2:16,8
+chr20	57031886	.	TG	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:1,2:12,2
+chr20	57550651	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0016175;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:7,8:15,3
+chr20	57850478	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0020871;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:6,7:18,3
+chr20	57931378	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.014582;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:16,6:18,6
+chr20	58974064	.	GGAGGAGGAAGAGGAAGAA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.011329;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,7:6,2
+chr20	59050022	.	C	CTCTTTCTTTCTT	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0096894;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:7,6:2,1:5,5
+chr20	60298262	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00038112;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:14,8:10,4
+chr20	60356443	.	CATATATATATAT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:2,5:2,1
+chr20	60937919	.	TAGTC	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:3,2:6,2
+chr20	60992639	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.34103;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,4:6,2:11,2
+chr20	61242949	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0095364;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:6,4:7,5
+chr20	63113757	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.02916;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,7:17,4:5,3
+chr20	63550977	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00012058;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:16,7:9,5
+chr20	64201999	.	CCGCGTGTCGGGAACCCCT	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.025141;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:12,6:13,3
+chr21	5221111	.	C	T	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.041809;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:171:147,24:90,12:57,12
+chr21	5233816	.	G	T	0	PASS	DP=368;GPV=1;SPV=0.037938;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:196,25:133,17:63,8
+chr21	5336009	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:8,2:11,2
+chr21	6439083	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.013369;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:8:2,6:1,1:1,5
+chr21	7259334	.	A	AGGAAT	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.010542;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:66,8:31,5:35,3
+chr21	7272733	.	G	A	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.026258;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:53,13:32,6:21,7
+chr21	7318241	.	G	C	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.016977;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:76,22:38,5:38,17
+chr21	7923952	.	C	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.002962;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:67,18:32,10:35,8
+chr21	7925632	.	G	A	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.018535;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:73,22:36,12:37,10
+chr21	7930930	.	G	A	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.046012;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:125:102,23:47,14:55,9
+chr21	7947527	.	CCCATT	C	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.021582;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:67,17:30,6:37,11
+chr21	7954799	.	G	A	0	PASS	DP=208;GPV=1;SPV=0.024987;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:95,23:46,11:49,12
+chr21	7956049	.	A	C	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.041181;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:85,20:38,11:47,9
+chr21	7957932	.	T	A	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.011693;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:63,20:32,11:31,9
+chr21	7958822	.	T	A	0	PASS	DP=387;GPV=1;SPV=0.048533;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:217:183,34:90,15:93,19
+chr21	8233759	.	GTCTC	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.010825;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:28,7:16,5:12,2
+chr21	8441992	.	GGGC	G	0	PASS	DP=2900;GPV=1;SPV=0.042171;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:1670:1429,170:517,60:912,110
+chr21	8529040	.	T	C	0	PASS	DP=235;GPV=1;SPV=0.0075541;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:119,17:60,12:59,5
+chr21	8563236	.	AC	A	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.0071452;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:50,9:19,2:31,7
+chr21	8591154	.	A	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:10,3:10,1
+chr21	8664871	.	GAAATGATGAGACA	G	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.038552;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:39,10:26,3:13,7
+chr21	8683354	.	C	T	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.0040996;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:66,19:39,11:27,8
+chr21	8700048	.	G	A	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.017086;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:57,16:29,10:28,6
+chr21	8770206	.	T	C	0	PASS	DP=211;GPV=1;SPV=0.038583;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:92,21:42,13:50,8
+chr21	8783441	.	G	GT	0	PASS	DP=237;GPV=1;SPV=0.030156;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:129:94,21:44,10:50,11
+chr21	8786423	.	TTCC	T	0	PASS	DP=266;GPV=1;SPV=0.047543;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:124,22:79,15:45,7
+chr21	8798435	.	C	T	0	PASS	DP=173;GPV=1;SPV=0.026255;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:77,18:50,8:27,10
+chr21	8806432	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0024099;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,11:4,3:6,8
+chr21	8819260	.	C	CT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0059286;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:12,8:18,3
+chr21	8824094	.	T	TA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.11785;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:4,3:9,3
+chr21	8832187	.	A	C	0	PASS	DP=129;GPV=1;SPV=0.0024352;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:62:45,17:22,8:23,9
+chr21	8850324	.	C	T	0	PASS	DP=502;GPV=1;SPV=0.01289;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:278:250,28:132,16:118,12
+chr21	8853786	.	C	T	0	PASS	DP=530;GPV=1;SPV=0.035337;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:287:257,30:129,11:128,19
+chr21	8855438	.	T	A	0	PASS	DP=325;GPV=1;SPV=0.041858;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:147:130,17:93,15:37,2
+chr21	8857169	.	C	T	0	PASS	DP=287;GPV=1;SPV=0.0012623;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:150,19:77,10:73,9
+chr21	8858565	.	G	C	0	PASS	DP=575;GPV=1;SPV=0.031343;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:329:295,34:187,16:108,18
+chr21	8864192	.	G	A	0	PASS	DP=447;GPV=1;SPV=0.043599;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:248:219,29:95,9:124,20
+chr21	8882912	.	C	G	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.031042;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:107,26:61,16:46,10
+chr21	8997035	.	C	T	0	PASS	DP=267;GPV=1;SPV=0.00075409;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:119,26:47,13:72,13
+chr21	9020577	.	G	C	0	PASS	DP=286;GPV=1;SPV=0.035284;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:135,25:61,15:74,10
+chr21	9061147	.	G	A	0	PASS	DP=269;GPV=1;SPV=0.023936;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:142:123,19:54,9:69,10
+chr21	9063715	.	C	T	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.017066;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:144,20:68,11:76,9
+chr21	9079810	.	A	G	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.0018708;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:76,18:34,5:42,13
+chr21	9084776	.	C	T	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.036095;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:70,18:33,8:37,10
+chr21	9088617	.	G	A	0	PASS	DP=303;GPV=1;SPV=0.0283;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:179:156,23:46,8:110,15
+chr21	9093909	.	T	A	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.032151;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:120:100,20:33,8:67,12
+chr21	9095993	.	C	G	0	PASS	DP=201;GPV=1;SPV=0.01759;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:90,14:37,11:53,3
+chr21	9100763	.	G	A	0	PASS	DP=493;GPV=1;SPV=0.011475;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:264:228,36:111,13:117,23
+chr21	9107269	.	G	C	0	PASS	DP=240;GPV=1;SPV=0.018499;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:108,22:55,15:53,7
+chr21	9127820	.	T	C	0	PASS	DP=480;GPV=1;SPV=0.039051;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:264:223,41:121,16:102,25
+chr21	9133399	.	A	G	0	PASS	DP=273;GPV=1;SPV=0.032516;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:163:140,23:71,8:69,15
+chr21	9134566	.	G	T	0	PASS	DP=405;GPV=1;SPV=0.02972;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:234:196,38:84,15:112,23
+chr21	9134738	.	T	TC	0	PASS	DP=351;GPV=1;SPV=0.0034009;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:157,23:90,18:67,5
+chr21	9177783	.	G	A	0	PASS	DP=401;GPV=1;SPV=0.035694;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:205:173,32:83,15:90,17
+chr21	9183977	.	G	T	0	PASS	DP=396;GPV=1;SPV=0.0064327;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:206:169,37:85,16:84,21
+chr21	9249156	.	T	A	0	PASS	DP=418;GPV=1;SPV=0.0014397;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:196:169,27:88,16:81,11
+chr21	9250971	.	G	A	0	PASS	DP=449;GPV=1;SPV=0.049173;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:251:222,29:111,21:111,8
+chr21	9253375	.	C	A	0	PASS	DP=569;GPV=1;SPV=0.014473;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:310:275,35:165,22:110,13
+chr21	9255185	.	T	A	0	PASS	DP=539;GPV=1;SPV=0.012857;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:301:269,32:134,21:135,11
+chr21	9255403	.	C	T	0	PASS	DP=512;GPV=1;SPV=0.046245;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:282:252,30:125,17:127,13
+chr21	9257802	.	A	T	0	PASS	DP=488;GPV=1;SPV=0.047707;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:260:232,28:111,9:121,19
+chr21	9257908	.	G	T	0	PASS	DP=608;GPV=1;SPV=0.011602;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:323:280,43:133,19:147,24
+chr21	9259952	.	C	A	0	PASS	DP=521;GPV=1;SPV=0.010574;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:257:213,26:118,12:95,14
+chr21	9269934	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.032349;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:46,8:17,6:29,2
+chr21	9271680	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.12627;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:29,3:1,1
+chr21	9274079	.	G	GA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,2:7,2
+chr21	9281724	.	T	C	0	PASS	DP=242;GPV=1;SPV=0.014968;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:121,23:79,15:42,8
+chr21	9281917	.	C	A	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.022598;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:137:119,18:52,10:67,8
+chr21	9290140	.	T	C	0	PASS	DP=350;GPV=1;SPV=0.037032;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:159,18:74,7:85,11
+chr21	9296068	.	T	A	0	PASS	DP=278;GPV=1;SPV=0.02408;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:163:138,25:52,6:86,19
+chr21	9296372	.	A	AG	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.013408;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:207:182,25:96,17:86,8
+chr21	9298276	.	G	A	0	PASS	DP=340;GPV=1;SPV=0.036769;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:181:151,30:55,13:96,17
+chr21	9302284	.	TG	T	0	PASS	DP=423;GPV=1;SPV=0.036025;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:223:199,24:95,11:104,13
+chr21	9302286	.	T	TAA	0	PASS	DP=419;GPV=1;SPV=0.043678;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:219:182,24:86,9:96,15
+chr21	9302543	.	G	A	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.047274;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:184:160,24:82,7:78,17
+chr21	9305569	.	A	T	0	PASS	DP=312;GPV=1;SPV=0.004428;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:155,25:73,11:82,14
+chr21	9307181	.	T	G	0	PASS	DP=374;GPV=1;SPV=0.033666;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:215:190,25:82,11:108,14
+chr21	9309745	.	C	T	0	PASS	DP=334;GPV=1;SPV=0.0012439;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:209:174,30:92,20:82,10
+chr21	9312447	.	C	T	0	PASS	DP=423;GPV=1;SPV=0.047154;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:236:207,29:109,17:98,12
+chr21	9314168	.	C	G	0	PASS	DP=483;GPV=1;SPV=8.5725e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:273:215,58:104,32:111,26
+chr21	9317020	.	G	C	0	PASS	DP=263;GPV=1;SPV=0.01741;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:111,19:64,14:47,5
+chr21	9320170	.	G	A	0	PASS	DP=407;GPV=1;SPV=0.0012808;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:180,47:65,33:115,14
+chr21	9321156	.	G	C	0	PASS	DP=358;GPV=1;SPV=0.0034652;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:199:175,24:77,13:98,11
+chr21	9324923	.	C	T	0	PASS	DP=345;GPV=1;SPV=0.033353;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:200:171,29:98,14:73,15
+chr21	9325560	.	C	T	0	PASS	DP=516;GPV=1;SPV=0.022753;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:296:266,30:148,16:118,14
+chr21	9327769	.	G	A	0	PASS	DP=361;GPV=1;SPV=0.0017408;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:194:168,26:90,16:78,10
+chr21	9327799	.	G	A	0	PASS	DP=405;GPV=1;SPV=8.6454e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:220:189,31:92,20:97,11
+chr21	9329414	.	G	C	0	PASS	DP=377;GPV=1;SPV=0.019855;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:198:171,27:76,14:95,13
+chr21	9331000	.	C	T	0	PASS	DP=284;GPV=1;SPV=0.0013678;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:125,31:63,18:62,13
+chr21	9331071	.	C	T	0	PASS	DP=305;GPV=1;SPV=9.4138e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:170:134,36:68,21:66,15
+chr21	9331208	.	T	C	0	PASS	DP=326;GPV=1;SPV=0.0090971;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:199:162,37:82,17:80,20
+chr21	9333403	.	A	T	0	PASS	DP=329;GPV=1;SPV=0.0066175;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:190:158,32:76,18:82,14
+chr21	9333753	.	G	A	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.0015494;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:154:120,34:50,17:70,17
+chr21	9335609	.	T	G	0	PASS	DP=259;GPV=1;SPV=0.035129;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:144:121,23:70,9:51,14
+chr21	9337270	.	A	T	0	PASS	DP=282;GPV=1;SPV=0.0053293;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:120,29:54,14:66,15
+chr21	9338092	.	T	C	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.00086025;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:127,32:53,15:74,17
+chr21	9340700	.	G	C	0	PASS	DP=297;GPV=1;SPV=0.0068861;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:166:138,28:66,15:72,13
+chr21	9342509	.	G	A	0	PASS	DP=342;GPV=1;SPV=0.021826;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:185:160,25:61,11:99,14
+chr21	9346496	.	A	T	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.036759;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:185:160,25:82,14:78,11
+chr21	9346571	.	T	C	0	PASS	DP=392;GPV=1;SPV=0.02125;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:193:173,20:89,5:84,15
+chr21	9349138	.	G	GC	0	PASS	DP=307;GPV=1;SPV=0.049995;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:169:149,20:79,10:70,10
+chr21	9350854	.	C	T	0	PASS	DP=387;GPV=1;SPV=0.0078513;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:221:190,31:95,17:95,14
+chr21	9353047	.	G	T	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.0063786;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:182:148,34:85,19:63,15
+chr21	9354467	.	C	T	0	PASS	DP=332;GPV=1;SPV=0.0098387;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:188:162,26:49,11:113,15
+chr21	9354918	.	T	G	0	PASS	DP=353;GPV=1;SPV=0.046627;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:192:166,26:90,11:76,15
+chr21	9356868	.	C	T	0	PASS	DP=464;GPV=1;SPV=0.021887;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:265:237,28:132,13:105,15
+chr21	9358898	.	T	C	0	PASS	DP=352;GPV=1;SPV=0.020415;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:173:144,29:69,16:75,13
+chr21	9363273	.	C	T	0	PASS	DP=321;GPV=1;SPV=0.012606;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:192:168,24:97,16:71,8
+chr21	9363641	.	C	T	0	PASS	DP=241;GPV=1;SPV=0.045542;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:100,21:41,10:59,11
+chr21	9367042	.	A	G	0	PASS	DP=642;GPV=1;SPV=0.0028539;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:356:318,38:167,21:151,17
+chr21	9368429	.	C	T	0	PASS	DP=683;GPV=1;SPV=0.046887;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:380:340,40:158,21:182,19
+chr21	9369655	.	G	A	0	PASS	DP=525;GPV=1;SPV=0.036189;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:275:240,35:130,21:110,14
+chr21	9370242	.	G	A	0	PASS	DP=444;GPV=1;SPV=0.0022937;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:194,33:85,16:109,17
+chr21	9373504	.	G	GAGAT	0	PASS	DP=347;GPV=1;SPV=0.019397;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:194:162,32:72,14:90,18
+chr21	9568769	.	C	A	0	PASS	DP=153;GPV=1;SPV=0.0005032;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:60,29:34,16:26,13
+chr21	9569908	.	C	T	0	PASS	DP=200;GPV=1;SPV=0.036987;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:82,19:46,9:36,10
+chr21	9573354	.	C	T	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.018604;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:56,17:29,10:27,7
+chr21	9575796	.	C	T	0	PASS	DP=234;GPV=1;SPV=0.039889;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:115,21:57,10:58,11
+chr21	9579060	.	A	G	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.02489;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:48,14:32,6:16,8
+chr21	9585984	.	C	G	0	PASS	DP=249;GPV=1;SPV=0.0098747;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:98,24:49,12:49,12
+chr21	9593820	.	C	T	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.016174;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:92:76,16:24,8:52,8
+chr21	9595670	.	C	T	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.025548;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:62,14:36,6:26,8
+chr21	9604294	.	C	T	0	PASS	DP=144;GPV=1;SPV=0.036297;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:61,14:28,6:33,8
+chr21	9611369	.	C	CT	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.03177;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:39,12:24,8:15,4
+chr21	9622929	.	C	T	0	PASS	DP=135;GPV=1;SPV=0.026582;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:58,16:38,6:20,10
+chr21	9644497	.	G	T	0	PASS	DP=146;GPV=1;SPV=0.019348;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:57,18:40,8:17,10
+chr21	9653120	.	A	G	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.0013323;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:54,25:27,13:27,12
+chr21	9691585	.	C	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.014408;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:98:74,24:35,13:39,11
+chr21	9700317	.	G	T	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.035691;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:47,13:29,4:18,9
+chr21	9717066	.	A	G	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.03647;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:79,12:45,7:34,5
+chr21	9722947	.	A	G	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.022057;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:71,16:33,10:38,6
+chr21	9765078	.	GTATATATATA	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0027332;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:14,10:10,8:4,2
+chr21	9806006	.	G	A	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.0014147;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:69,24:29,11:40,13
+chr21	9820500	.	C	G	0	PASS	DP=414;GPV=1;SPV=0.0030957;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:218:186,28:100,18:86,10
+chr21	9820892	.	C	G	0	PASS	DP=427;GPV=1;SPV=0.047126;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:225:181,33:92,18:89,15
+chr21	9821495	.	G	C	0	PASS	DP=541;GPV=1;SPV=0.035867;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:316:269,47:113,25:156,22
+chr21	9824116	.	C	T	0	PASS	DP=420;GPV=1;SPV=0.013515;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:247:210,37:131,25:79,12
+chr21	9827822	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.047138;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:19,6:11,2
+chr21	9874259	.	A	T	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.032088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:76,14:39,3:37,11
+chr21	9885332	.	CT	C	0	PASS	DP=156;GPV=1;SPV=0.013025;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:68,21:36,15:32,6
+chr21	9907282	.	AT	A	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.018567;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:70,8:35,3:35,5
+chr21	9922536	.	A	T	0	PASS	DP=136;GPV=1;SPV=0.00058342;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:57,10:25,7:32,3
+chr21	9983152	.	A	G	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.022997;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:53,16:26,8:27,8
+chr21	10002648	.	C	G	0	PASS	DP=117;GPV=1;SPV=0.015345;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:47,17:20,11:27,6
+chr21	10334729	.	C	T	0	PASS	DP=320;GPV=1;SPV=0.035482;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:195:167,28:88,20:79,8
+chr21	10360392	.	G	A	0	PASS	DP=443;GPV=1;SPV=0.03335;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:238:204,34:109,15:95,19
+chr21	10369115	.	C	T	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.032698;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:66,17:22,3:44,14
+chr21	10393398	.	A	C	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.049025;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:116,17:75,11:41,6
+chr21	10401605	.	T	C	0	PASS	DP=251;GPV=1;SPV=0.016593;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:132:114,18:73,15:41,3
+chr21	10421129	.	C	T	0	PASS	DP=199;GPV=1;SPV=0.0065045;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:87,21:39,9:48,12
+chr21	10427641	.	A	G	0	PASS	DP=380;GPV=1;SPV=0.0011008;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:213:176,37:88,18:88,19
+chr21	10434766	.	G	A	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.043736;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:70,10:32,6:38,4
+chr21	10442800	.	G	T	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.0040681;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:106,27:58,13:48,14
+chr21	10443821	.	C	A	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.020561;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:89,11:44,6:45,5
+chr21	10446922	.	G	T	0	PASS	DP=310;GPV=1;SPV=0.031393;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:162,18:96,12:66,6
+chr21	10468490	.	T	TGTGTGC	0	PASS	DP=306;GPV=1;SPV=0.0029326;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:136,38:73,14:63,24
+chr21	10480037	.	C	G	0	PASS	DP=351;GPV=1;SPV=0.03139;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:186:160,26:83,16:77,10
+chr21	10581802	.	G	A	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.023901;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:81,19:36,8:45,11
+chr21	10656340	.	A	C	0	PASS	DP=126;GPV=1;SPV=0.0083471;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:46,11:32,5:14,6
+chr21	10685060	.	C	G	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.006956;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:70,25:30,12:40,13
+chr21	10805196	.	CA	C	0	PASS	DP=239;GPV=1;SPV=0.010772;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:105,28:60,18:45,10
+chr21	12979753	.	G	T	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.035953;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:71,17:38,6:33,11
+chr21	13069293	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.076851;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:14,3:18,1
+chr21	13485129	.	T	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.012989;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:19,11:17,3
+chr21	13885151	.	A	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022967;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:1,1:2,6
+chr21	13942417	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00094846;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:13,15:6,9:7,6
+chr21	14017766	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,3:13,1
+chr21	16256630	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00045891;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:11,5:9,6
+chr21	16284658	.	T	TTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.049827;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:10,6:9,3
+chr21	17365348	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0013438;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,5:9,1
+chr21	17703814	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.035087;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:9,8:9,2
+chr21	18369973	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:3,7:1,6:2,1
+chr21	18387612	.	TACACACACACAC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0051869;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,12:4,5:2,7
+chr21	18705237	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=3.7005e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:19,16:10,8:9,8
+chr21	19154405	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0062692;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:9,3:10,6
+chr21	19345908	.	A	ATGTC	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.040844;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,6:16,1:5,5
+chr21	19729409	.	A	AT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.057692;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,6:4,5:1,1
+chr21	20488919	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:25:1,3:0,1:1,2
+chr21	20969566	.	T	TTACAATGAAAAATTCAG	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.025865;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,5:8,4
+chr21	21343352	.	T	TACACACACAC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.015238;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:3,4:6,5
+chr21	21742582	.	A	AT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,7:1,4:4,3
+chr21	24243452	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.05154;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,2:10,3
+chr21	25220910	.	AT	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.01828;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:13,5:10,6
+chr21	27131296	.	C	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0016717;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:12,7:19,4
+chr21	27298943	.	TA	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.038795;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:7,5:13,3
+chr21	27448654	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.001437;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:10,4:15,7
+chr21	27502369	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0015405;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:9,6:9,3
+chr21	27531878	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:4,5:2,1
+chr21	27904417	.	A	AAAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.090194;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,1:10,3
+chr21	27951396	.	A	AT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:14,8:5,2
+chr21	28179992	.	C	CTA	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.15237;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:40,6:18,5:22,1
+chr21	28864900	.	T	TAG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.043206;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,7:7,6:10,1
+chr21	29296049	.	CAA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.025586;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:10,11:1,1
+chr21	29519883	.	T	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.15909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,5:3,3:1,2
+chr21	29860020	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0085539;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:17,8:14,1
+chr21	29905619	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0219;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,4:3,3
+chr21	30153223	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.048244;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:12,1:15,5
+chr21	30558081	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,9:0,5:4,4
+chr21	30826651	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036522;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,6:5,4:2,2
+chr21	30866484	.	G	GTA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0018511;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,8:2,4:0,4
+chr21	31584399	.	C	CTTT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,4:8,1:4,3
+chr21	32652938	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=6.9826e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:26,20:12,12:14,8
+chr21	32892695	.	CTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,4:0,0:9,4
+chr21	35554234	.	C	CT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.016968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,7:2,4:2,3
+chr21	35851420	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.29167;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,3:1,1:3,2
+chr21	35865916	.	G	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.019153;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:22,4:13,5
+chr21	36644650	.	ATATATG	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.098394;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:10,2:13,2
+chr21	38329455	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:14,5:18,2
+chr21	38799741	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.022806;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:43,9:26,5:17,4
+chr21	38905139	.	T	TAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.18048;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,5:12,3:12,2
+chr21	38915434	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038416;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:15,4:6,1
+chr21	39917573	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=4.1799e-08;SS=2;SSC=73;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:16,24:8,14:8,10
+chr21	39974524	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038306;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,4:9,2
+chr21	40151130	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.019542;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:23,5:20,6
+chr21	40266635	.	T	TTATATATATATA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.29464;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:5,4:3,1
+chr21	40453040	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,5:7,2:5,3
+chr21	40765100	.	A	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.038274;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:15,4:9,2:6,2
+chr21	40856357	.	T	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.009884;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:20,8:5,3:15,5
+chr21	41041897	.	AAG	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,4:8,3:11,1
+chr21	41179498	.	C	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.036089;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:6,4:1,1
+chr21	41518516	.	AC	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.022054;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:19,7:11,1
+chr21	41604381	.	CTTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTCT	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.011513;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:4,3:28,7
+chr21	42401381	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.051203;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:14,2:6,4
+chr21	43736629	.	GTT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0054348;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,13:4,11:4,2
+chr21	43965613	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.045689;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:29,1:14,6
+chr21	44676286	.	C	T	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0034821;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:38,10:20,7:18,3
+chr21	44925418	.	GGGAGGGAAGGAA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.013474;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,10:12,6:4,4
+chr21	45511088	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,4:7,1:7,3
+chr21	45987789	.	CG	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0031242;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:2,7:6,6
+chr21	46134707	.	C	CAGGGTGAGGGTG	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0035197;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,11:6,7:2,4
+chr21	46135340	.	CAATGTCCCCTCA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.019042;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:4,3:10,11
+chr21	46201032	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.19313;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,4:4,2:25,2
+chr21	46503681	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041461;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:4,4:13,3
+chr21	46506724	.	T	TTTC	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1356;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:5,2:27,4
+chr21	46523393	.	AT	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.018157;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:16,13:10,8:6,5
+chr22	10519159	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.016106;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:31,10:0,1
+chr22	10540138	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.053114;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:21,3:7,1
+chr22	10692797	.	C	A	0	PASS	DP=249;GPV=1;SPV=0.0086306;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:108,25:61,8:47,17
+chr22	10711502	.	G	A	0	PASS	DP=202;GPV=1;SPV=0.012888;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:84,19:42,10:42,9
+chr22	10718972	.	C	A	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.012144;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:19,3:23,6
+chr22	10719050	.	C	CTCCAT	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.041973;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,7:13,2:18,5
+chr22	10730754	.	CTTG	C	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.030973;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:100,23:57,10:43,13
+chr22	10737681	.	T	A	0	PASS	DP=330;GPV=1;SPV=0.047801;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:154,21:71,7:83,14
+chr22	10747004	.	G	T	0	PASS	DP=343;GPV=1;SPV=0.016617;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:177:149,28:95,11:54,17
+chr22	11038491	.	T	C	0	PASS	DP=287;GPV=1;SPV=0.015677;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:139,20:75,11:64,9
+chr22	11039319	.	ATT	A	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.018223;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:113:93,17:43,11:50,6
+chr22	11043051	.	C	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.021519;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:48,10:27,7:21,3
+chr22	11048550	.	T	A	0	PASS	DP=222;GPV=1;SPV=0.001035;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:130:114,16:52,4:62,12
+chr22	11048836	.	T	C	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.0070553;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:77,12:30,3:47,9
+chr22	11050709	.	G	A	0	PASS	DP=225;GPV=1;SPV=0.00091932;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:112,23:68,9:44,14
+chr22	11056810	.	A	G	0	PASS	DP=292;GPV=1;SPV=4.9242e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:168:138,30:78,14:60,16
+chr22	11058156	.	A	T	0	PASS	DP=111;GPV=1;SPV=0.0096308;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:55,12:21,5:34,7
+chr22	11284131	.	A	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.034481;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,3:7,3
+chr22	11284214	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=5.846e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:18,17:11,4:7,13
+chr22	11315794	.	G	A	0	PASS	DP=265;GPV=1;SPV=0.017106;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:145:119,26:67,13:52,13
+chr22	11617036	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.000638;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:35,15:15,6:20,9
+chr22	11617229	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.043506;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:41,14:24,3:17,11
+chr22	11691473	.	A	G	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.026654;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:19,2:14,7
+chr22	11789412	.	A	C	0	PASS	DP=236;GPV=1;SPV=0.02995;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:126:109,17:50,8:59,9
+chr22	11831534	.	T	C	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.038796;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:13,2:46,7
+chr22	11834556	.	T	C	0	PASS	DP=345;GPV=1;SPV=0.029507;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:184:159,25:63,3:96,22
+chr22	11850005	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0068281;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:13,6:11,5
+chr22	11855791	.	A	G	0	PASS	DP=440;GPV=1;SPV=0.045175;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:252:213,39:85,4:128,35
+chr22	11859488	.	C	T	0	PASS	DP=191;GPV=1;SPV=0.030041;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:100:86,13:36,2:50,11
+chr22	11865928	.	G	A	0	PASS	DP=232;GPV=1;SPV=0.0098825;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:113,15:71,12:42,3
+chr22	11866660	.	T	C	0	PASS	DP=377;GPV=1;SPV=0.015796;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:192:159,33:89,12:70,21
+chr22	11869587	.	T	C	0	PASS	DP=309;GPV=1;SPV=0.029408;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:164:147,17:65,10:82,7
+chr22	11869839	.	G	A	0	PASS	DP=182;GPV=1;SPV=0.047269;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:92,15:23,4:69,11
+chr22	11890253	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.032708;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:16,3:3,1
+chr22	11890558	.	T	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.046989;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:67,12:45,10:22,2
+chr22	11890603	.	A	T	0	PASS	DP=104;GPV=1;SPV=0.0044489;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:27,5:20,7
+chr22	11892130	.	C	T	0	PASS	DP=296;GPV=1;SPV=0.016442;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:170:143,27:87,14:56,13
+chr22	11900144	.	T	C	0	PASS	DP=299;GPV=1;SPV=0.028786;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:163:137,26:95,10:42,16
+chr22	11902251	.	C	A	0	PASS	DP=677;GPV=1;SPV=0.022691;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:378:333,45:181,21:152,24
+chr22	11902252	.	A	T	0	PASS	DP=667;GPV=1;SPV=0.015515;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:375:328,47:166,21:162,26
+chr22	11911908	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.066379;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,8:8,6:10,2
+chr22	11928081	.	A	G	0	PASS	DP=655;GPV=1;SPV=0.048726;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:375:336,39:183,20:153,19
+chr22	11936070	.	A	T	0	PASS	DP=418;GPV=1;SPV=0.00059618;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:209:167,42:88,25:79,17
+chr22	11942334	.	C	G	0	PASS	DP=347;GPV=1;SPV=0.021383;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:198:165,33:44,21:121,12
+chr22	11947623	.	C	A	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.0050579;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:85,10:45,3:40,7
+chr22	11950047	.	A	G	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.044156;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:80,10:40,6:40,4
+chr22	11950699	.	TATAC	T	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.012602;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:38,12:10,2:28,10
+chr22	11958784	.	C	A	0	PASS	DP=154;GPV=1;SPV=0.0042434;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:81:64,17:36,10:28,7
+chr22	12043389	.	CT	C	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.013846;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:77,13:42,6:35,7
+chr22	12047416	.	A	G	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.038584;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:52,15:21,4:31,11
+chr22	12071725	.	T	A	0	PASS	DP=209;GPV=1;SPV=0.018587;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:110,13:59,10:51,3
+chr22	12073053	.	A	G	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.04415;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:82,19:39,9:43,10
+chr22	12078216	.	T	A	0	PASS	DP=178;GPV=1;SPV=0.044888;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:85,19:40,8:45,11
+chr22	12088780	.	CTT	C	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.0010345;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:61,17:25,12:36,5
+chr22	12088800	.	A	T	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.0065432;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:73,16:27,10:46,6
+chr22	12093764	.	T	C	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.0048439;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:115:92,23:51,11:41,12
+chr22	12096985	.	ATTTG	A	0	PASS	DP=162;GPV=1;SPV=0.0042836;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:94:76,18:47,7:29,11
+chr22	12138075	.	A	G	0	PASS	DP=426;GPV=1;SPV=0.007091;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:231:206,25:101,16:105,9
+chr22	12156723	.	A	C	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.041292;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:67:58,9:13,2:45,7
+chr22	12200447	.	C	T	0	PASS	DP=337;GPV=1;SPV=0.041512;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:180:156,24:63,8:93,16
+chr22	12208541	.	C	T	0	PASS	DP=179;GPV=1;SPV=0.029756;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:70,17:27,7:43,10
+chr22	12213734	.	G	A	0	PASS	DP=231;GPV=1;SPV=0.0092587;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:128,21:52,9:76,12
+chr22	12277008	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.00093163;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:4,3:3,6
+chr22	12284638	.	A	G	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.020841;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:127:108,19:68,13:40,6
+chr22	12305907	.	A	G	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.047813;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:100,21:78,18:22,3
+chr22	12349893	.	T	G	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.044175;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:134:118,16:63,5:55,11
+chr22	12504173	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
+chr22	12592601	.	G	A	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.0059851;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:92,19:40,4:52,15
+chr22	12617705	.	C	A	0	PASS	DP=150;GPV=1;SPV=0.034319;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:69,14:32,8:37,6
+chr22	12697095	.	G	C	0	PASS	DP=205;GPV=1;SPV=0.014095;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:97:79,18:40,10:39,8
+chr22	12700082	.	A	T	0	PASS	DP=183;GPV=1;SPV=0.025064;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:111:91,20:55,11:36,9
+chr22	12721756	.	T	C	0	PASS	DP=220;GPV=1;SPV=0.0062308;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:94,27:37,17:57,10
+chr22	12723439	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.044668;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:42,9:14,5:28,4
+chr22	12789806	.	C	CAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:4,6:4,1
+chr22	12807011	.	G	C	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.022184;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:74,14:40,5:34,9
+chr22	12810751	.	G	A	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0027702;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:45,11:31,4:14,7
+chr22	12810923	.	G	GTAAC	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.15236;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,5:29,2:14,3
+chr22	12817696	.	C	A	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.040334;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:22,5:30,2
+chr22	12869391	.	T	C	0	PASS	DP=402;GPV=1;SPV=0.0010087;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:219:193,26:72,9:121,17
+chr22	12877926	.	A	T	0	PASS	DP=281;GPV=1;SPV=0.037111;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:136,24:77,12:59,12
+chr22	12883528	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.012287;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:22,4:6,2
+chr22	12895438	.	G	C	0	PASS	DP=279;GPV=1;SPV=0.017536;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:161:134,27:85,13:49,14
+chr22	12897751	.	C	A	0	PASS	DP=285;GPV=1;SPV=0.00022687;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:159:127,32:82,21:45,11
+chr22	12901664	.	C	A	0	PASS	DP=223;GPV=1;SPV=0.011487;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:128:106,22:47,11:59,11
+chr22	12903574	.	T	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0063397;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:33,4:0,4
+chr22	12903902	.	C	A	0	PASS	DP=328;GPV=1;SPV=0.0083562;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:197:161,36:75,24:86,12
+chr22	15412353	.	G	A	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.03885;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:44,13:22,9:22,4
+chr22	15548844	.	C	T	0	PASS	DP=95;GPV=1;SPV=0.028064;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:34,8:12,1
+chr22	15659861	.	T	TA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.036709;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:0,2:22,7
+chr22	15680325	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.019548;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:1,1:9,6
+chr22	15708540	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.036782;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:7,2:4,3
+chr22	15731112	.	G	C	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.038977;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:74:61,13:40,11:21,2
+chr22	15794011	.	TA	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
+chr22	15797061	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.068133;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:14,3:21,2
+chr22	15837366	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14691;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,4:13,1
+chr22	15855606	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.19154;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:7,2:14,2
+chr22	16421475	.	T	G	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.010599;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:16,9:23,7
+chr22	16477420	.	TAA	T	0	PASS	DP=98;GPV=1;SPV=0.0076984;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:34,16:10,12:24,4
+chr22	16883577	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.066681;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:17,4:19,1
+chr22	17886804	.	CAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0040786;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,8:6,7:1,1
+chr22	18084239	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.045694;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,6:8,5:5,1
+chr22	18197351	.	G	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:0,0:6,3
+chr22	18204790	.	T	TATATA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.019827;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:16,6:9,3
+chr22	18204837	.	CATATATT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.15941;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:12,3:13,1
+chr22	18394806	.	G	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr22	18508963	.	CTTT	C	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.040005;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:32,10:22,9:10,1
+chr22	18817078	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.1063;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:20,3:23,2
+chr22	18850435	.	C	T	0	PASS	DP=171;GPV=1;SPV=0.0015486;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:71,22:38,18:33,4
+chr22	18864613	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.063369;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:18,2:13,3
+chr22	18945973	.	T	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.020498;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:35,14:19,2:16,12
+chr22	19761611	.	G	C	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.0020111;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:39,11:17,6:22,5
+chr22	20336043	.	TA	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045135;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,5:13,2:19,3
+chr22	20695805	.	A	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.04045;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:14,4:25,2
+chr22	21085828	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.039018;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,5:6,5
+chr22	21178758	.	C	G	0	PASS	DP=113;GPV=1;SPV=0.019424;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:60:46,14:19,5:27,9
+chr22	21184688	.	G	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,2:3,2
+chr22	21218520	.	G	T	0	PASS	DP=123;GPV=1;SPV=0.010965;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:66:59,7:36,6:23,1
+chr22	21223209	.	C	CT	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.045809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:4,5:12,5
+chr22	21224952	.	G	A	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.015733;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:73,15:37,9:36,6
+chr22	21256883	.	C	T	0	PASS	DP=141;GPV=1;SPV=0.022731;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:56,16:31,6:25,10
+chr22	21306870	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr22	22393137	.	GA	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.17909;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,5:9,2:10,3
+chr22	22485355	.	C	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0012565;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:11,5:12,6
+chr22	22501019	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.011299;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,8:5,1
+chr22	23953122	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.020062;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:10,5:15,3
+chr22	24251077	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.077531;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:10,4:20,1
+chr22	24611773	.	TTG	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0081121;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,8:3,1
+chr22	24647131	.	G	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.026665;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:39,16:14,6:25,10
+chr22	24649431	.	G	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.047266;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,12:15,5:17,7
+chr22	25499786	.	TCC	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.060606;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,3:2,1:0,2
+chr22	25867619	.	A	ATTTCTTTC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.013499;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:4,5:12,7
+chr22	25913947	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0021771;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:12,8:19,1
+chr22	26116686	.	A	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.064244;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:13,2:19,2
+chr22	26316871	.	GGAAA	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.012566;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,10:14,4:4,6
+chr22	26371066	.	A	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00070453;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:3,3:15,5
+chr22	26661959	.	TATAC	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.31818;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,2:4,1:1,1
+chr22	26720774	.	G	GAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.056191;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,7:6,6:4,1
+chr22	27053565	.	CTCTATATATA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,2:2,1:1,1
+chr22	28243174	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0055997;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,9:4,5:3,4
+chr22	29412875	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00051119;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:15,20:7,10:8,10
+chr22	29704228	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
+chr22	33559379	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0081203;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,4:11,1
+chr22	33597278	.	GAA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0019281;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:10,9:4,2
+chr22	34151456	.	C	CAAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.012882;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:8,6:1,1
+chr22	34300459	.	C	CTTTG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.029051;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:5,1:4,5
+chr22	35013180	.	T	TA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.016254;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,5:2,1:3,4
+chr22	35117748	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:7,1:15,2
+chr22	35709064	.	G	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0012095;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:15,4:8,4
+chr22	36214791	.	CTG	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0052174;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:7,7:4,6:3,1
+chr22	36227315	.	CAAAAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.023574;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:10,13:6,11:4,2
+chr22	37079017	.	G	GAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:20,1:4,3
+chr22	39050030	.	C	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:10,2:9,8
+chr22	40149679	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0046348;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,4:3,4
+chr22	40722477	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.035315;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,8:11,6:4,2
+chr22	41312439	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.091143;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,6:10,1:7,5
+chr22	42024930	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0003718;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:15,6:11,6
+chr22	42055525	.	G	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=5.3881e-07;SS=2;SSC=62;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:26,22:11,9:15,13
+chr22	42424414	.	C	CA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.020223;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,11:7,8:9,3
+chr22	43032297	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.094071;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:8,1:4,4
+chr22	43417447	.	C	CT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.011166;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:2,4:6,5
+chr22	43705251	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.02165;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:14,5:15,1
+chr22	43863195	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0056305;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:7,5:7,8
+chr22	44347793	.	G	T	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.00023745;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:38,15:18,3:20,12
+chr22	44408281	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0029154;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:14,7:16,3
+chr22	44637661	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=8.388e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:32,13:16,2:16,11
+chr22	44854024	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,4:1,1
+chr22	44940388	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.024567;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:14,1:20,5
+chr22	45028914	.	GGTTTTGCTCCCTCTACCTC	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.008813;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:12,3:10,4
+chr22	45031952	.	GTCAGGCATTCTAATGGAATTCAGGTATTCTAATGGAT	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11126;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:17,4:9,2
+chr22	46224970	.	CT	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:18,1:5,3
+chr22	46941418	.	A	AATAT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.041497;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:15,8:7,4:8,4
+chr22	48729291	.	A	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.053977;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,3:10,2
+chr22	49017619	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.038146;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:34,9:17,7:17,2
+chr22	49017662	.	T	TC	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.024998;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:12,11:16,3
+chr22	49031662	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00070453;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:14,4:4,4
+chr22	49149250	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.025733;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:4,7:13,3
+chr22	49700961	.	C	CT	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0099688;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:20,4:9,4
+chr3	811946	.	G	GCACCA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.039018;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:8,5:7,5
+chr3	2658965	.	GACAC	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045366;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:13,8:5,3
+chr3	2677449	.	T	TAGAG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:13,2:8,2
+chr3	2937137	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.2852e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:24,16:12,9:12,7
+chr3	3282501	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.022489;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:1,3:7,4
+chr3	3284839	.	T	TTTCTTCTTCTTC	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:9,1:8,3
+chr3	3763961	.	GT	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0017181;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:2,10:1,7:1,3
+chr3	3790537	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:7,2:7,3
+chr3	4255552	.	CAAG	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.044074;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,5:9,3
+chr3	5827030	.	T	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.0030859;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:14,5:19,5
+chr3	6338735	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.026658;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:30,7:17,6:13,1
+chr3	6802586	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:2,4:5,5
+chr3	7939348	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:9,5:6,6
+chr3	8149448	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16484;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,2:3,1:1,1
+chr3	9218606	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.001437;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:15,5:10,6
+chr3	9323802	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.02826;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:33,8:15,5:18,3
+chr3	10410412	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00021271;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:15,7:12,5
+chr3	12108899	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0043761;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:8,3:12,4
+chr3	13009209	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.015217;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:11,3:12,4
+chr3	15272630	.	CAT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.049315;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:16,3:9,6
+chr3	16761247	.	T	TTC	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.036566;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:10,4:7,2
+chr3	16761248	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026224;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,6:1,5:3,1
+chr3	18084532	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,6:4,4:4,2
+chr3	18097749	.	CTCA	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.14084;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:12,2:14,2
+chr3	18097755	.	CTGA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.12547;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,2:12,2
+chr3	18097762	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:10,2:14,2
+chr3	18097763	.	T	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,2:15,2
+chr3	18097765	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.1228;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:12,2:16,2
+chr3	18362860	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:5,4:0,0
+chr3	19434174	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0062647;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:11,5:17,7
+chr3	19562991	.	AACACAC	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,2:11,2
+chr3	20061990	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:8,3:11,1
+chr3	21229506	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00059631;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:9,3:14,9
+chr3	21681698	.	G	GA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.091659;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:9,4:4,2
+chr3	21838694	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00088019;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:15,6:9,7
+chr3	21881627	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=4.5681e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,19:7,12:4,7
+chr3	22697698	.	G	GAAAAGAAA	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:1,3:1,2:0,1
+chr3	23102581	.	C	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.012894;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:8,5:13,1
+chr3	23420498	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=7.6729e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:12,7:5,4
+chr3	23579384	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:4,5:3,1
+chr3	23716050	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0029924;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:5,5:3,7
+chr3	23883904	.	C	CAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,5:9,4:3,1
+chr3	23950902	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.01174;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:5,3:6,6
+chr3	24375396	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:18,5:10,2:8,3
+chr3	26821412	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.021052;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:9,3:17,4
+chr3	27282571	.	T	TTATATATA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.10815;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:16,4:14,2
+chr3	28563427	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.026091;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:7,6:6,5
+chr3	29109615	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10779;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:4,2:11,2
+chr3	29162145	.	C	CTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.016632;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:9,4:6,2
+chr3	29281114	.	G	GT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.008413;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,11:3,2:1,9
+chr3	30297039	.	G	GCACACA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.020174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:11,3:2,3
+chr3	31489183	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.077118;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:18,5:3,1
+chr3	31738855	.	T	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0033714;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:15,6:11,4
+chr3	31856069	.	T	TAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.025986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:10,10:7,6:3,4
+chr3	33166012	.	C	CAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.01217;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,14:5,12:7,2
+chr3	33433365	.	TA	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:8,12:4,6:4,6
+chr3	33433367	.	A	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:7,10:3,5:4,5
+chr3	33715847	.	TAA	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:4,6:1,1
+chr3	33852925	.	C	CTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,8:2,6:1,2
+chr3	34676329	.	A	ATTGCACACTTGCAAATACCAGCAAGTGTGGTAT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.17768;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,2:16,2
+chr3	35057370	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=6.1031e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,11:7,8:12,3
+chr3	35671582	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0090318;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:6,1:11,6
+chr3	36300868	.	A	ATACG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,3:8,1
+chr3	36533475	.	GTTT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046664;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,7:6,6:3,1
+chr3	38621506	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0056191;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:16,3:10,6
+chr3	39571649	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:2,1:7,3
+chr3	40426107	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0043505;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,6:2,1
+chr3	42416008	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.082353;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,3:3,2:2,1
+chr3	43903722	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.01463;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,7:5,1
+chr3	44126691	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.00014161;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:11,10:9,3
+chr3	45068384	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00057944;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:14,7:10,5
+chr3	45415809	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0063539;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:3,3:8,3
+chr3	46207649	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.42424;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:6,2:3,1:3,1
+chr3	46488434	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.015626;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,1:13,6
+chr3	46759472	.	G	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,2:5,2
+chr3	47241799	.	G	GTA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.021189;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,5:5,4
+chr3	47897378	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00061829;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:11,4:15,9
+chr3	48509583	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.02835;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:9,6:5,3
+chr3	48554407	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=6.1955e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:21,10:7,6
+chr3	48665989	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11424;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:8,3:7,3
+chr3	49295716	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12591;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:18,2:9,2
+chr3	49849845	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:1,7:5,1
+chr3	49881334	.	C	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00090214;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:17,3:10,5
+chr3	50850218	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0018631;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:9,4:8,5
+chr3	50948033	.	T	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.020315;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:2,7:11,3
+chr3	51193800	.	T	TA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1713;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:18,1:12,3
+chr3	51249008	.	C	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.10755;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:15,3:8,1
+chr3	52283819	.	TAA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:4,2:10,3
+chr3	54141061	.	C	CTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.013369;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,6:0,3:2,3
+chr3	54910793	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.013909;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:8,2:12,3
+chr3	55549477	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031702;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,6:0,2:2,4
+chr3	55842076	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.028886;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:14,2:16,3
+chr3	56032975	.	A	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.038416;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:15,4:6,1
+chr3	56906975	.	A	ATT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:8,4:1,1
+chr3	58033635	.	C	T	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0039417;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:18,4:23,5
+chr3	58328961	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:1,2:0,0:1,2
+chr3	59215302	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:10,4:12,1
+chr3	59797192	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0054287;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:18,6:9,3
+chr3	60038012	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0074978;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:19,4:11,4
+chr3	60614820	.	G	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:6,5:3,1
+chr3	61600173	.	AAT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.092437;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,5:2,4:5,1
+chr3	65122609	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00064998;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:12,19:5,9:7,10
+chr3	67947115	.	T	TTTTATTTATTTATTTATTTATTTA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,5:10,3:8,2
+chr3	68262307	.	GTATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,2:3,2
+chr3	68461282	.	A	AAAAC	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,7:5,5:4,2
+chr3	69225519	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.015535;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,11:6,9:2,2
+chr3	69242478	.	ATTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,3:2,2
+chr3	69418822	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.029963;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:5,6:10,4
+chr3	71937988	.	C	CTGTG	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.015417;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:11,5:9,6
+chr3	72633690	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0034744;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:17,6:10,8
+chr3	73347437	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.16358;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:14,1:8,3
+chr3	73534019	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0064143;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:19,5:16,4
+chr3	74269048	.	G	GA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0043101;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:9,6:5,1
+chr3	75096062	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040085;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,4:5,1
+chr3	75643476	.	C	T	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.046603;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:77:61,16:36,8:25,8
+chr3	75785855	.	G	GA	0	PASS	DP=163;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:76,19:36,10:40,9
+chr3	75811514	.	G	A	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.037707;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:72,12:30,5:42,7
+chr3	76425510	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.18176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,1:11,3
+chr3	76719798	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.020851;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:10,4:17,1
+chr3	76811818	.	CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016673;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:7,2:7,4
+chr3	76834013	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:10,10:2,3:8,7
+chr3	77077386	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0004715;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,5:14,4
+chr3	77323024	.	ATATAT	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.038499;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,8:19,4:9,4
+chr3	78310768	.	GAAGA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.014912;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,5:6,2:4,3
+chr3	78388527	.	C	CATCTGCCTGTTACCCAGTTCCAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0090305;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:2,2:8,6
+chr3	78407100	.	C	CAA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.054402;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:13,7:10,1
+chr3	78711440	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:5,1:5,3
+chr3	79221172	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.014256;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:17,3:15,4
+chr3	79411983	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.070174;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:14,3:13,2
+chr3	80015600	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.018088;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,13:2,10:7,3
+chr3	80976113	.	A	AT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.03148;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:8,2:8,7
+chr3	80976130	.	A	AT	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.020128;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:10,7:6,2:4,5
+chr3	83176263	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0003718;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:12,8:14,4
+chr3	86335842	.	TTTTA	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.024474;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:7,3:21,6
+chr3	86995549	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:4,2:0,0
+chr3	86995551	.	T	TAC	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:2,3:2,2:0,1
+chr3	87249132	.	C	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0027508;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:18,5:7,3
+chr3	88009796	.	CA	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.01497;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:9,6:1,3
+chr3	88324586	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0016295;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:13,6:11,3
+chr3	90140539	.	ATT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:7,3:1,1
+chr3	90792691	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.096637;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:0,1:24,3
+chr3	90793168	.	G	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.044239;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:19,4:4,2
+chr3	90794556	.	G	A	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.03166;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:74,12:39,9:35,3
+chr3	90795159	.	G	C	0	PASS	DP=145;GPV=1;SPV=0.028927;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:70,8:62,4:8,4
+chr3	90802407	.	G	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.070897;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:6,3:14,2
+chr3	90806554	.	C	A	0	PASS	DP=161;GPV=1;SPV=0.014168;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:80,13:48,11:32,2
+chr3	90807066	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.11288;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:0,0:32,4
+chr3	90819164	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:9,4:0,0
+chr3	90868586	.	C	G	0	PASS	DP=445;GPV=1;SPV=0.018445;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:227:186,34:130,24:56,10
+chr3	90869777	.	A	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.0071078;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:2,9:26,5
+chr3	90889577	.	C	T	0	PASS	DP=147;GPV=1;SPV=0.018335;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:65,20:12,9:53,11
+chr3	90900435	.	G	A	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.044262;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:90:81,9:15,2:66,7
+chr3	90904126	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026131;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:4,2:25,9
+chr3	90939861	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.017899;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:24,7:7,2
+chr3	90948616	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.044393;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:6,2:21,4
+chr3	90988846	.	C	T	0	PASS	DP=758;GPV=1;SPV=0.02669;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:431:385,46:385,45:0,1
+chr3	90999996	.	A	T	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.046078;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:43,11:15,3:28,8
+chr3	91019218	.	C	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.043528;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:32,4:30,4:2,0
+chr3	91063898	.	C	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.012749;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,5:2,1
+chr3	91082603	.	GT	G	0	PASS	DP=112;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:54,11:24,9:30,2
+chr3	91082660	.	C	G	0	PASS	DP=92;GPV=1;SPV=0.0061213;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:45,9:15,7:30,2
+chr3	91128600	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0031056;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:1,8:18,1
+chr3	91141548	.	A	C	0	PASS	DP=155;GPV=1;SPV=0.03166;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:85,10:12,4:73,6
+chr3	91179559	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.26429;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:31,4:2,0
+chr3	91187298	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:0,0:13,4
+chr3	91222727	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:1,0:10,4
+chr3	91229920	.	G	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.065277;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:14,3:0,3
+chr3	94740829	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00085567;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:11,2:11,8
+chr3	95832587	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0074891;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,2:1,3
+chr3	96005104	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.046272;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,8:16,1
+chr3	96317750	.	G	GTTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.016795;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,7:7,4:4,3
+chr3	97319442	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00059631;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:12,5:11,7
+chr3	98538904	.	CTT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.098383;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:6,4:3,1
+chr3	98838390	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.021576;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:5,4:10,5
+chr3	99691705	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,12:4,6:4,6
+chr3	103044860	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0048152;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:7,2:14,4
+chr3	105280352	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06057;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:10,2:11,3
+chr3	105470134	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.020691;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:15,4:8,2
+chr3	106707358	.	A	AT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.050426;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,5:5,3:8,2
+chr3	106707369	.	T	TA	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:9,3:10,1
+chr3	106875480	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.014512;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:18,3:13,4
+chr3	108720876	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00089447;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:12,6:12,6
+chr3	109317351	.	A	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,3:11,1
+chr3	111807946	.	GT	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013238;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:9,4:1,4
+chr3	114544406	.	CTTCT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.079329;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:3,2:7,4
+chr3	116618234	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0015408;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:11,6:9,4
+chr3	116760286	.	CAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,5:3,4:3,1
+chr3	117050840	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.22085;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:8,3:7,1
+chr3	117634731	.	C	CTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.016617;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,11:6,5:5,6
+chr3	118647946	.	A	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.020447;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:15,12:4,7:11,5
+chr3	120151071	.	ATT	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.078283;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:9,4:19,3
+chr3	121253810	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,3:2,4
+chr3	121764195	.	A	AACACACACAC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.041061;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:19,10:13,6:6,4
+chr3	122009324	.	A	AACACACACACAC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,5:0,2:4,3
+chr3	122145747	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00044867;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:9,6:9,4
+chr3	124044897	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.011574;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,9:3,2:11,7
+chr3	124495729	.	T	TAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0071396;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:0,4:7,3
+chr3	124668043	.	G	GAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,11:3,4:3,7
+chr3	125813770	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00041251;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:13,7:8,3
+chr3	126336272	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.087731;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:13,1:12,3
+chr3	127184619	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0089538;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:16,4:14,5
+chr3	127947372	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0058348;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:8,5:13,2
+chr3	131586850	.	G	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00065864;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:36,17:20,5:16,12
+chr3	133003397	.	A	ATG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033935;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,9:9,6:6,3
+chr3	133044974	.	T	TTC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.029233;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:15,1:14,5
+chr3	133091223	.	C	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00041251;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,7:9,3
+chr3	133158465	.	TA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0079864;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:9,19:6,13:3,6
+chr3	133425913	.	G	GGGCAAGGGAA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,2:5,3
+chr3	134321577	.	CT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0057971;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:2,3:5,3
+chr3	134401573	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.18741;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:17,3:19,1
+chr3	134858009	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00021937;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:16,6:18,8
+chr3	135253682	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.045822;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,2:5,7
+chr3	135390016	.	C	CA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.058582;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,6:13,4:15,2
+chr3	136439389	.	GAC	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.010741;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:14,6:3,1
+chr3	137135157	.	G	C	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.030261;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:43,8:18,2:25,6
+chr3	140079750	.	C	CAAAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.14691;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:17,3:10,2
+chr3	140513583	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,6:2,5:2,1
+chr3	140654957	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0036574;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:17,5:17,7
+chr3	143284404	.	A	AT	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00073094;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:18,23:8,10:10,13
+chr3	144954711	.	T	TTTTTTTG	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.013096;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,11:8,6:6,5
+chr3	144955970	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0060655;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:8,3:16,6
+chr3	147159575	.	G	GTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.027219;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,7:6,4:8,3
+chr3	147859108	.	G	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0010857;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:15,3:11,6
+chr3	148642510	.	C	CAAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.040129;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:20,15:10,13:10,2
+chr3	148822292	.	CA	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.074323;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:23,7:8,5
+chr3	149184023	.	TA	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,2:2,1:2,1
+chr3	149853455	.	GGAGAGAGAGA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0061246;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,9:4,8:2,1
+chr3	150028648	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.17909;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,5:11,3:8,2
+chr3	150211910	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:3,2:1,1:2,1
+chr3	151031259	.	GAT	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20399;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:14,2:2,2
+chr3	151072525	.	C	CT	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0073228;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,11:9,5:5,6
+chr3	151547425	.	T	TAC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.031932;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:9,4:17,3
+chr3	151547427	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.031946;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,8:7,5:11,3
+chr3	151850080	.	GT	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00066677;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:21,20:11,12:10,8
+chr3	152104773	.	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021839;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,10:6,6:6,4
+chr3	153009169	.	A	AAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.020164;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,10:11,5:3,5
+chr3	153520081	.	CT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.084394;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:15,4:11,2
+chr3	154618292	.	G	GAGAA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0085378;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,13:9,11:5,2
+chr3	158758484	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0073874;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:13,4:18,5
+chr3	158891833	.	G	GTGTGTATGTA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.010989;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,4:2,3:0,1
+chr3	158923448	.	A	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0021714;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:43,13:22,5:21,8
+chr3	159818570	.	G	T	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.015987;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:42,7:22,1:20,6
+chr3	160906602	.	T	TAAAGAAAAAAAAGAAAAGA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.046809;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,10:10,6:18,4
+chr3	161840354	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.02204;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:11,5:16,5
+chr3	162199912	.	T	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:4,5:5,1
+chr3	162590763	.	TATACAC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.083225;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,1:14,4
+chr3	163402299	.	GTT	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.17207;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,6:16,4:7,2
+chr3	163502562	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0090481;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:33,9:11,3:22,6
+chr3	163604681	.	A	ATAT	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.023188;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:7,14:4,8:3,6
+chr3	164207930	.	T	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.16752;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,2:14,3
+chr3	164363535	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.027191;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:9,6:4,5:5,1
+chr3	164386069	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.042571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:14,8:14,1
+chr3	164537163	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,4:2,2:4,2
+chr3	164604251	.	C	T	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0052479;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:20,5:11,2
+chr3	165771059	.	A	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.066176;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:17,2:18,4
+chr3	165883390	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=5.8703e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:13,7:9,8
+chr3	166073224	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0030133;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:12,7:17,3
+chr3	166106743	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0018733;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,15:4,11:2,4
+chr3	167488145	.	A	AAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0052134;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,12:7,9:7,3
+chr3	168370031	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.033902;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:9,8:6,1
+chr3	168578212	.	CATTT	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00014877;SS=2;SSC=38;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,21:8,10:8,11
+chr3	168830673	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.12152;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:22,3:17,2
+chr3	169378591	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0041535;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,8:8,7:1,1
+chr3	170140627	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.032608;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,14:10,6:7,8
+chr3	170336573	.	TC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.15679;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:16,1:7,3
+chr3	170382413	.	A	AT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.001414;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,14:8,8:3,6
+chr3	170577624	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013014;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:7,6:3,1
+chr3	171301124	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00053399;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:22,16:9,9:13,7
+chr3	171310223	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.035434;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:8,2:11,2
+chr3	171310226	.	A	ATATGACTCACAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.041011;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:8,2:10,2
+chr3	171310228	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.042521;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:9,2:11,2
+chr3	172504674	.	CT	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0086143;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,17:7,9:13,8
+chr3	172701449	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.010683;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:6,5:8,5
+chr3	172797018	.	C	CTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0095255;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:11,11:10,3
+chr3	173392472	.	C	CA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.016244;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,10:8,9:9,1
+chr3	174090019	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.020202;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:13,5:19,4
+chr3	174625059	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:12,2:3,3
+chr3	174698931	.	T	TTA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.032608;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:4,4:13,6
+chr3	174698967	.	G	GTATATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.032529;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:6,4:14,4
+chr3	175061728	.	A	AATATATAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0085423;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:10,7:6,3
+chr3	175849410	.	C	CATATAT	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,5:2,4:2,1
+chr3	176233797	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0070885;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:7,6:1,1
+chr3	177312931	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,12:2,8:6,4
+chr3	177819193	.	C	CT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0074752;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,9:3,6:3,3
+chr3	177939576	.	A	AAG	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.039093;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:44,6:28,2:16,4
+chr3	178163969	.	T	TA	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.038251;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:15,6:6,5
+chr3	178517187	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0023791;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:13,16:7,11:6,5
+chr3	178568854	.	T	TA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:17,4:10,2:7,2
+chr3	178757829	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055901;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,2:3,2
+chr3	178757830	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.12422;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:9,3:6,1:3,2
+chr3	178838570	.	CA	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034981;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:10,9:9,6
+chr3	180248085	.	CTTCTT	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.012898;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,9:6,6:7,3
+chr3	180333476	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.041472;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:19,3:14,2
+chr3	180873483	.	T	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.14912;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:17,2:15,2
+chr3	181121602	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.00022269;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:33,18:12,13:21,5
+chr3	181950827	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.11468;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:18,1:27,4
+chr3	182590903	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.06044;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,2:14,2
+chr3	183164314	.	G	GTTTTTTT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.007971;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:5,5:3,1
+chr3	183321454	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.22736;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:10,1:21,3
+chr3	183519895	.	CAA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,2:5,2
+chr3	183622530	.	A	AAAGG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.2649;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,4:19,3:9,1
+chr3	183957716	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.10745;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,2:15,2
+chr3	184500646	.	A	G	0	PASS	DP=86;GPV=1;SPV=0.0046257;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:45,12:17,7:28,5
+chr3	185875280	.	G	GTA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.015957;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:12,7:12,3
+chr3	185912906	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.00034897;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,14:10,8:4,6
+chr3	186995505	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.01971;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:8,7:2,1
+chr3	187268547	.	AAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,2:7,3
+chr3	187573591	.	G	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.008152;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:20,6:24,8
+chr3	188182772	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.046124;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:20,13:8,11:12,2
+chr3	189483916	.	G	T	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.00034436;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:11,7:23,5
+chr3	189697231	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.036146;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,10:10,5:3,5
+chr3	189942884	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0030392;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:15,7:19,5
+chr3	190489200	.	TCTTCCTTCCTTCCTTCCTCTCTTC	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.032647;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:2,1:6,9
+chr3	191216854	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.017938;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:14,2:14,4
+chr3	191619293	.	A	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040043;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:29:1,5:1,3:0,2
+chr3	192158675	.	T	TCC	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,4:0,1:0,3
+chr3	193418065	.	T	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0070131;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,15:5,6:6,9
+chr3	194143191	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.016203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:9,7:6,1
+chr3	194324950	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.22386;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,5:7,4:13,1
+chr3	194526987	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.090728;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:18,2:3,4
+chr3	194846551	.	TGAA	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.055365;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:30,5:11,2
+chr3	195067358	.	A	ACCTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0088119;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,12:5,8:9,4
+chr3	195483671	.	C	T	0	PASS	DP=230;GPV=1;SPV=0.0063764;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:156:128,28:60,12:68,16
+chr3	195491737	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.067189;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:11,3:19,3
+chr3	195502702	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.10544;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:15,1:13,3
+chr3	195502739	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.095104;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,1:15,3
+chr3	195661457	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.25076;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:19,3:10,1
+chr3	195667466	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.10935;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:14,1:10,4
+chr3	195750391	.	AGGCCT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0069124;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:9,7:5,3
+chr3	195786809	.	A	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=9.7816e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:7,7:4,6
+chr3	195812455	.	C	CTCAGTG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.079112;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:10,1:9,3
+chr3	195866336	.	G	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00086166;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:15,8:13,5
+chr3	196462980	.	T	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0070913;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:4,3:2,7
+chr3	196973207	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.13598;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,6:15,2:12,4
+chr3	197513494	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045056;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:35,6:17,4:18,2
+chr3	197617964	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.076398;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:47,6:13,1:34,5
+chr3	197630964	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.072974;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:45,5:25,3:20,2
+chr3	198099324	.	C	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.052941;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:5,4:3,2:2,2
+chr4	1641147	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:11,2:12,3
+chr4	1690259	.	T	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1056;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,5:16,4:11,1
+chr4	3522099	.	C	T	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=7.9857e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:14,9:10,4
+chr4	4065631	.	G	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0094013;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:9,4:8,2
+chr4	4891540	.	G	GGT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:5,12:4,3:1,9
+chr4	5762728	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.04958;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,2:7,4
+chr4	6012995	.	G	A	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0003546;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:19,7:17,7
+chr4	7895852	.	G	GTT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0058007;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:3,9:1,8:2,1
+chr4	8919107	.	TC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.071818;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:13,1:9,5
+chr4	9245168	.	G	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.14664;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:0,0:30,4
+chr4	9253009	.	T	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:1,1:5,1
+chr4	10096558	.	CACTACGA	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0068367;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:9,5:19,3
+chr4	10380072	.	C	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.04522;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:16,4:5,2
+chr4	10894438	.	A	ATGTGTGTG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,6:6,5:5,1
+chr4	16303360	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,2:6,2
+chr4	17459743	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0094928;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:12,5:12,7
+chr4	18140794	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00034731;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:6,4:11,5
+chr4	18384018	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:36:1,4:1,2:0,2
+chr4	18837294	.	C	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:2,3:0,1:2,2
+chr4	18851445	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0030535;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:7,1:15,7
+chr4	19416219	.	T	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.0076904;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:35,8:19,6:16,2
+chr4	21534948	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.013492;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:18,5:12,5
+chr4	23721457	.	T	TG	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,6:4,1:3,5
+chr4	23859780	.	CAAAATAAAATAAAATAAAAT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.20158;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,5:5,2:8,3
+chr4	24387746	.	AAGAG	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.10447;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,4:5,2:11,2
+chr4	24416559	.	G	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.00073216;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:14,3:17,10
+chr4	24503955	.	A	C	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.016099;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:42,6:16,3:26,3
+chr4	25612012	.	C	CA	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:4,1:1,1
+chr4	26028535	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:1,3:15,1
+chr4	26153944	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00088132;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:7,6:11,3
+chr4	26244403	.	ATG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:11,4:3,4
+chr4	27930275	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018404;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:5,3:6,2
+chr4	29338563	.	T	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0020609;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:18,7:12,4
+chr4	29990623	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0049228;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:8,5:11,3
+chr4	30265706	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00014298;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:16,7:10,8
+chr4	30545108	.	ATT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.014318;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:13,9:11,4:2,5
+chr4	30969410	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=4.5431e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:11,21:5,10:6,11
+chr4	32619397	.	TTA	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00064391;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:17,19:10,9:7,10
+chr4	32868624	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.009581;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,8:6,3:5,5
+chr4	32870349	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.0064316;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:18,3:15,4
+chr4	33477438	.	C	CT	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.11157;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,5:12,2:25,3
+chr4	36484889	.	AATATATATTAGTTTATATATATAAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:9,2:14,2
+chr4	37667875	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00037684;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:11,17:5,7:6,10
+chr4	37717454	.	G	GA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:0,4:0,4:0,0
+chr4	37846536	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00041007;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:17,8:14,5
+chr4	40440334	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0051054;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,3:11,4
+chr4	40536472	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.008555;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:16,1:7,5
+chr4	41688196	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1174;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:14,2:16,2
+chr4	42269487	.	AT	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.060606;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,3:2,1:0,2
+chr4	44068258	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0050026;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:17,6:16,5
+chr4	45463386	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0007185;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:9,8:15,4
+chr4	46482995	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0010272;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:11,8:8,2
+chr4	46880412	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016783;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,6:1,5:2,1
+chr4	47607316	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.010694;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:13,3:11,3
+chr4	48206777	.	CAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.036896;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:7,7:3,2
+chr4	48663336	.	AT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.16591;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:13,3:11,1
+chr4	49106475	.	T	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.06273;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:46,6:18,3:28,3
+chr4	49143684	.	A	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.021804;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:14,4:11,4
+chr4	49146153	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.037765;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,6:8,1:12,5
+chr4	49154652	.	ATTCCATTCCATTCCG	A	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.0046134;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:51,12:22,4:29,8
+chr4	49176935	.	C	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.0016415;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:57,23:28,9:29,14
+chr4	49189440	.	A	G	0	PASS	DP=164;GPV=1;SPV=0.04566;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:79,14:43,5:36,9
+chr4	49189600	.	T	A	0	PASS	DP=131;GPV=1;SPV=0.043504;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:62,7:21,3:41,4
+chr4	49191971	.	T	C	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.011176;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:87:76,11:41,8:35,3
+chr4	49247362	.	A	C	0	PASS	DP=436;GPV=1;SPV=0.015707;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:240:213,27:110,14:103,13
+chr4	49247728	.	G	T	0	PASS	DP=283;GPV=1;SPV=0.044397;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:130,27:43,7:87,20
+chr4	49251622	.	G	T	0	PASS	DP=431;GPV=1;SPV=0.043034;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:233:201,32:106,16:95,16
+chr4	49258258	.	G	C	0	PASS	DP=139;GPV=1;SPV=0.045994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:69:61,8:35,3:26,5
+chr4	49262059	.	G	T	0	PASS	DP=127;GPV=1;SPV=0.046309;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:59,9:37,1:22,8
+chr4	49262142	.	C	G	0	PASS	DP=130;GPV=1;SPV=0.037371;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:62,10:35,2:27,8
+chr4	49266887	.	A	T	0	PASS	DP=165;GPV=1;SPV=0.036057;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:86:69,9:31,7:38,2
+chr4	49271516	.	C	A	0	PASS	DP=514;GPV=1;SPV=0.04954;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:299:264,35:103,19:161,16
+chr4	49272320	.	CAG	C	0	PASS	DP=318;GPV=1;SPV=0.020118;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:175:149,26:92,18:57,8
+chr4	49273776	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:0,0:12,4
+chr4	49499983	.	T	A	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.024194;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:76,9:34,2:42,7
+chr4	49528367	.	C	G	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.008798;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:75,20:42,11:33,9
+chr4	49528580	.	C	T	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.016846;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:71,17:38,8:33,9
+chr4	49536801	.	C	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.079421;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:25,3:16,2
+chr4	49537004	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.044663;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:27,4:6,1
+chr4	49539589	.	G	T	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.012202;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:133:108,25:32,6:76,19
+chr4	49542594	.	T	A	0	PASS	DP=341;GPV=1;SPV=0.028817;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:167:148,19:111,14:37,5
+chr4	49556231	.	G	T	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.023936;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:41,10:21,6:20,4
+chr4	49564230	.	C	T	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.023277;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:17,6:22,3
+chr4	49577931	.	G	A	0	PASS	DP=483;GPV=1;SPV=0.016158;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:271:243,28:118,13:125,15
+chr4	49623865	.	T	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.01036;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:18,5:15,2
+chr4	49623899	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.040811;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,4:16,2:15,2
+chr4	49769446	.	A	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14763;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:17,3:5,1
+chr4	49792161	.	T	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
+chr4	49811692	.	A	G	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.007853;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:70,8:16,4:54,4
+chr4	49851853	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.059824;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,1:12,3
+chr4	50070268	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.053977;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:3,2:13,3
+chr4	50396563	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.049522;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:2,0:25,4
+chr4	50500851	.	C	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:6,5:8,1
+chr4	51168884	.	AT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,2:8,2
+chr4	51168890	.	A	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20468;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,2:9,2
+chr4	51299531	.	C	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:25,4:0,0
+chr4	51800205	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.027526;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:42,9:21,1:21,8
+chr4	51805358	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.091638;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:31,4:2,0
+chr4	51869177	.	T	TA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0065088;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:4,7:5,5
+chr4	52529341	.	G	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=5.4898e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:12,11:14,4
+chr4	52805823	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00037903;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:21,13:9,6:12,7
+chr4	54390724	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0025244;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:11,2:17,7
+chr4	54896152	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0022419;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:7,6:15,1
+chr4	55535739	.	C	CTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:7,3:3,1
+chr4	57299586	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:16,3:8,1
+chr4	57299587	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.15645;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:18,4:8,1
+chr4	58068918	.	C	CTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:2,9:0,8:2,1
+chr4	58641958	.	A	ATTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:6,11:4,5:2,6
+chr4	58875435	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.18293;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:16,3:8,1
+chr4	60180653	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.021244;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:19,5:8,4
+chr4	61040718	.	A	AAG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,4:4,2:4,2
+chr4	62942582	.	G	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0083613;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:9,4:13,2
+chr4	63780494	.	C	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00051624;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:10,4:17,5
+chr4	64291817	.	A	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0046664;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:12,2:11,5
+chr4	64834601	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,2:7,2
+chr4	65170525	.	A	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0031867;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:17,3:15,7
+chr4	65536762	.	AT	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.01326;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:13,2:12,4
+chr4	65867467	.	C	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.017857;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:0,5:0,4:0,1
+chr4	66225901	.	G	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0022875;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:7,7:15,1
+chr4	66922720	.	CAAA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,4:7,3:5,1
+chr4	66954819	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=2.0129e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:7,9:6,4
+chr4	67112889	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.02659;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:10,4:15,7
+chr4	68374231	.	A	AT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.00061425;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:5,6:6,3
+chr4	68708239	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0072434;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:10,1:15,7
+chr4	69762151	.	C	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.051532;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:13,6:21,1
+chr4	69762168	.	AC	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.16752;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,4:13,1
+chr4	72935056	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011854;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:11,4:10,3
+chr4	73199221	.	CTG	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0022326;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:13,14:7,9:6,5
+chr4	74778829	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0089809;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:4,3:14,4
+chr4	74866501	.	T	TTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0065359;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,10:1,5:2,5
+chr4	74876177	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0051097;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:8,5:12,1
+chr4	75444380	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.012154;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:9,4:19,3
+chr4	76667972	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.35897;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,2:3,1:3,1
+chr4	79035584	.	G	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.010612;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:13,2:7,3
+chr4	79919865	.	TTA	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,2:2,1:1,1
+chr4	80390934	.	T	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.040221;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:22,6:9,3:13,3
+chr4	80390952	.	CATGTAT	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,7:3,3:4,4
+chr4	80725111	.	AT	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:3,3:6,1
+chr4	80847514	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0023811;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:16,4:19,8
+chr4	81944595	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:4,2:7,2
+chr4	84413977	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=7.9781e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:21,14:11,8:10,6
+chr4	84695509	.	T	TAG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.020979;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,4:1,3:1,1
+chr4	84909029	.	T	TAC	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0044537;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:9,10:13,7
+chr4	85227114	.	GAA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:4,8:1,1
+chr4	85839849	.	T	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,2:7,3
+chr4	86191591	.	T	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0021672;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:2,11:1,2:1,9
+chr4	87354111	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0002635;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,17:7,13:5,4
+chr4	87602062	.	G	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00017769;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:13,8:9,5
+chr4	88325476	.	A	AACACACACACACACAC	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:5,4:3,3
+chr4	90548727	.	G	GAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0065711;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,12:8,8:5,4
+chr4	92874787	.	C	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.01289;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:13,1:10,4
+chr4	93398129	.	G	GTGTGTGTGTGTGTA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0070449;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,10:4,4:6,6
+chr4	94516508	.	GTCTCTC	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0042182;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:9,6:5,8
+chr4	94659494	.	ATG	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:4,10:2,7:2,3
+chr4	94686504	.	TGA	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.083578;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:13,1:2,3
+chr4	95617505	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.033048;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:37,8:9,6:28,2
+chr4	96073939	.	G	A	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.00062529;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:35,11:16,6:19,5
+chr4	96169856	.	TTA	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.024399;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:4,4:14,3
+chr4	96173079	.	C	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0010058;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:29,13:17,7:12,6
+chr4	96870642	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0055489;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:8,10:7,3
+chr4	96871087	.	A	G	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:7,4:10,1
+chr4	97246408	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.002981;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,11:5,8:1,3
+chr4	97722964	.	ATT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0018191;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,6:5,3
+chr4	97738044	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0050026;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:33,11:21,4:12,7
+chr4	98485803	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.035523;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:4,4:2,4
+chr4	101958464	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.048122;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,8:3,5:4,3
+chr4	102539236	.	C	CA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,6:5,4:2,2
+chr4	103577197	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.009884;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:4,1:16,7
+chr4	104085363	.	A	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.072765;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,1:5,3
+chr4	104689672	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.016449;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,16:13,5:5,11
+chr4	106340393	.	G	T	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.010547;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:41,11:21,4:20,7
+chr4	106340394	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.0090402;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:41,11:23,4:18,7
+chr4	108099550	.	GTGTGTA	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.018146;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:5,4:8,3
+chr4	108099560	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:5,2:8,2
+chr4	108807819	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,1:6,3
+chr4	109489638	.	TA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.092902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:11,1:14,4
+chr4	109569497	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040508;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,10:7,3:9,7
+chr4	109656379	.	TTTTTTTTTTTTTTG	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.031623;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,3:2,3
+chr4	109947819	.	G	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.00040854;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:9,5:22,6
+chr4	109968707	.	T	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.18558;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:14,3:16,1
+chr4	110127406	.	C	CAAA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.01286;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,10:13,9:2,1
+chr4	110621822	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:2,3:0,1:2,2
+chr4	111054977	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.079663;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:19,2:16,3
+chr4	111718414	.	T	G	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.00058795;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:37,14:11,10:26,4
+chr4	111946369	.	GA	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0094549;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:9,6:2,1
+chr4	112874080	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:3,8:3,2
+chr4	113036251	.	T	TA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00035427;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:14,19:8,9:6,10
+chr4	113490926	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045213;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:12,3:10,6
+chr4	114363005	.	T	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:39:0,2:0,1:0,1
+chr4	114722013	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.073064;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:14,4:13,3
+chr4	114914907	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00097763;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:11,9:15,4
+chr4	117280895	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11319;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:15,2:9,4
+chr4	118299794	.	T	TA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.044583;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,6:5,1
+chr4	118299812	.	T	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014137;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:9,5:6,1
+chr4	118566690	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.14148;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:43,5:19,2:24,3
+chr4	119065816	.	A	G	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.029631;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:41,12:19,3:22,9
+chr4	119278889	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024163;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,4:2,3
+chr4	119380045	.	ATGTGTG	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0016056;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:12,6:7,12
+chr4	121241245	.	GATATAT	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:4,5:1,1
+chr4	122262148	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0031331;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:7,17:2,10:5,7
+chr4	122659627	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.027077;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,9:6,8:4,1
+chr4	123101433	.	G	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.002347;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:19,3:12,8
+chr4	124860352	.	G	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=4.1153e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:27,25:12,13:15,12
+chr4	125873987	.	C	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=3.4736e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:7,4:20,11
+chr4	125977342	.	GT	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:10,2:5,2
+chr4	127022288	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0039729;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:8,2:10,11
+chr4	127584099	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.097639;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:22,1:21,5
+chr4	128391550	.	TTCTCAGCATC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0013772;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:6,7:3,5
+chr4	129093245	.	C	G	0	PASS	DP=91;GPV=1;SPV=0.0002415;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:42,17:21,7:21,10
+chr4	129508436	.	G	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.2196e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,16:10,11:15,5
+chr4	130548217	.	G	GA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.19203;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:17,2:6,2
+chr4	130999757	.	CT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,5:7,2:5,3
+chr4	131382119	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.057437;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:14,4:17,2
+chr4	131601676	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0011236;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:12,15:10,8:2,7
+chr4	131739922	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.07595;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:18,6:23,1
+chr4	132254108	.	G	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.0011222;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:44,14:22,3:22,11
+chr4	133188665	.	G	GT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.20626;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:15,2:9,3
+chr4	133465011	.	G	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.003755;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:8,7:18,4
+chr4	133709434	.	CTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,2:11,2
+chr4	134314408	.	CAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:4,6:2,1
+chr4	134476372	.	CT	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0018803;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,9:8,6:6,3
+chr4	135175844	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.2369e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:24,21:16,12:8,9
+chr4	135338205	.	T	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.00090248;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:42,14:27,7:15,7
+chr4	135389840	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0042224;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,12:16,8:9,4
+chr4	136581756	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.17436;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,4:2,3:12,1
+chr4	137476829	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00030915;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:9,5:12,11
+chr4	137988192	.	G	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.21212;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:4,4:2,1:2,3
+chr4	138691868	.	ATGTT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:6,4:1,1:5,3
+chr4	139294019	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=9.5813e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:9,22:2,12:7,10
+chr4	140482716	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=1.1051e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:19,20:14,10:5,10
+chr4	140509727	.	G	A	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=8.8502e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:15,11:10,8
+chr4	141195113	.	C	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0074013;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:21,8:10,2
+chr4	141365380	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.23136;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:26,3:10,1
+chr4	141367006	.	A	G	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,6:9,3:7,3
+chr4	141447702	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.085652;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:38,5:22,2:16,3
+chr4	141531350	.	ATTTT	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:17,16:12,8:5,8
+chr4	142185400	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.26323;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:11,2:22,3
+chr4	142270933	.	T	TTG	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00060741;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:18,21:12,11:6,10
+chr4	142658636	.	C	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=1.6244e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:26,25:14,12:12,13
+chr4	143691301	.	G	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.015768;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:13,3:18,6
+chr4	143792778	.	GTTT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.012898;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:13,5:0,4
+chr4	143884845	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.26692;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,3:5,1
+chr4	144367898	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.063391;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:24,6:14,2:10,4
+chr4	144396265	.	GACTTCAAACTATACTACAAGACTA	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=0.014917;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:41,7:22,5:19,2
+chr4	145471093	.	CATATAT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,2:3,2:0,0
+chr4	145514483	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.043968;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:14,3:25,3
+chr4	145693666	.	A	AC	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.020898;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:0,1:4,5
+chr4	146128392	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.016381;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:34,10:16,3:18,7
+chr4	147095728	.	C	CGT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:10,2:5,2
+chr4	147378325	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=2.4608e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:16,15:10,6:6,9
+chr4	149160054	.	T	C	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.03902;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:37,6:19,3:18,3
+chr4	150112825	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0005865;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:2,11:0,4:2,7
+chr4	151435784	.	CAAA	C	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.024875;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,10:11,4:4,6
+chr4	152377598	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.022117;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:17,13:10,11:7,2
+chr4	152804089	.	C	CAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:2,2:6,3
+chr4	153203103	.	CAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0050173;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,15:10,7:3,8
+chr4	153387688	.	C	A	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.040545;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:53:46,7:20,1:26,6
+chr4	153470210	.	CTGCAAAGTCTGGGGAATTATGG	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.030384;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:32,6:16,4:16,2
+chr4	153480517	.	C	CA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:11,3:7,1
+chr4	154284194	.	T	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00025351;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:12,9:15,4
+chr4	154690631	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.026404;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:13,5:16,1
+chr4	157780889	.	G	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.11642;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:21,3:15,3
+chr4	158105035	.	G	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:8,5:3,3:5,2
+chr4	158435477	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,1:8,3
+chr4	159072451	.	CTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.18447;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,4:5,3:4,1
+chr4	160299963	.	T	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.026663;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:45,10:22,5:23,5
+chr4	160619682	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0087719;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:15,7:16,3
+chr4	161036076	.	TTTC	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.12121;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:3,3:2,1:1,2
+chr4	162279281	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.080505;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:12,1:22,3
+chr4	162453398	.	A	ATATATATGC	0	PASS	DP=84;GPV=1;SPV=0.049459;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:32,7:23,2:9,5
+chr4	162571965	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.00019467;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:33,16:10,8:23,8
+chr4	162594584	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.54715;SS=2;SSC=2;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:16,4:4,3:12,1
+chr4	163238160	.	T	C	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.00040665;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:10,8:23,4
+chr4	163894907	.	A	ACACG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:26:0,2:0,2:0,0
+chr4	165238781	.	A	G	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.061837;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:40,5:22,1:18,4
+chr4	165481016	.	AT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0014462;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:11,17:6,8:5,9
+chr4	168113386	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16157;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:36,6:24,5:12,1
+chr4	168165391	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:1,2:1,2:0,0
+chr4	168520347	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.043687;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:9,3:10,11
+chr4	168680481	.	CA	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.028934;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:16,9:13,8:3,1
+chr4	168704664	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0401;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:10,8:6,5:4,3
+chr4	168878682	.	T	TTG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0057971;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,5:2,3
+chr4	169016051	.	ATCTCTCTCTC	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,8:1,4:8,4
+chr4	169283846	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.011513;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:13,7:19,3
+chr4	169337332	.	G	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=4.7151e-06;SS=2;SSC=53;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:26,24:14,9:12,15
+chr4	169922477	.	C	CT	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.067671;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:17,3:18,1
+chr4	170573022	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:11,5:6,1:5,4
+chr4	171410940	.	G	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0076774;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:15,14:3,9:12,5
+chr4	171423511	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0057828;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:16,1:15,7
+chr4	172085080	.	A	AATACAT	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=8.8502e-06;SS=2;SSC=50;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:25,19:10,12:15,7
+chr4	172487367	.	C	CTTCTT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.060124;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,5:2,3:11,2
+chr4	172887682	.	G	C	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=4.7666e-07;SS=2;SSC=63;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:28,24:14,11:14,13
+chr4	173022078	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12418;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:11,1:7,3
+chr4	173074876	.	AG	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.1713;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:11,2:19,2
+chr4	173799232	.	CTCTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,5:2,2:7,3
+chr4	174007990	.	G	T	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=8.4559e-06;SS=2;SSC=50;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:34,21:21,10:13,11
+chr4	174544193	.	G	GAAGAAAGAAAGAAAGA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:18,1:6,3
+chr4	174788590	.	T	TAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024017;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,11:5,8:3,3
+chr4	175564011	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.2509e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:24,24:13,15:11,9
+chr4	177349034	.	A	ATT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.008413;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,11:2,8:2,3
+chr4	178395316	.	A	AAT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028014;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:9,7:8,1
+chr4	178395352	.	A	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00048402;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,16:6,6:6,10
+chr4	178691496	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036129;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,9:11,7:3,2
+chr4	179037015	.	ATTGTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:7,1:5,3
+chr4	179924448	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=1.7081e-08;SS=2;SSC=77;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:26,26:17,15:9,11
+chr4	180257232	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.023519;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:37,7:21,3:16,4
+chr4	180278694	.	G	GA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0013083;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,16:9,16:1,0
+chr4	180401541	.	G	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.059497;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,5:3,1:6,4
+chr4	180639435	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.035616;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:14,3:21,2
+chr4	180721638	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.014917;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:10,4:8,3
+chr4	181641760	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0037594;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:3,10:1,8:2,2
+chr4	181746053	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=2.0181e-07;SS=2;SSC=66;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:12,14:8,7:4,7
+chr4	182100646	.	T	TATACAC	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.047515;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,10:12,5:8,5
+chr4	183487423	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,3:2,1
+chr4	184132818	.	TACAC	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.1268;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:19,2:17,2
+chr4	184372964	.	T	TTA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10283;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:11,1:6,6
+chr4	184430283	.	TGTCTGGCCCAGCCTTTTCCTTGTATGCCTCCTGCA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.060413;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,2:8,3
+chr4	184480460	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.055176;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,8:13,6:17,2
+chr4	184546648	.	CT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.10283;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:16,6:1,1
+chr4	185124123	.	T	TTGTGTGTG	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0056141;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:25,18:9,9:16,9
+chr4	185157455	.	CA	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.023323;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:14,11:5,9:9,2
+chr4	185433419	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:17,5:10,2:7,3
+chr4	185487365	.	GC	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00044052;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,21:9,9:10,12
+chr4	185536811	.	G	GTTTT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:10,7:7,5:3,2
+chr4	185796509	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.19619;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:12,4:24,1
+chr4	185926555	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.056428;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:21,6:11,2:10,4
+chr4	186466671	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.18072;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:20,3:15,1
+chr4	187906580	.	C	CAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028014;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:14,7:3,1
+chr4	188023604	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.030216;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,1:8,3
+chr4	188325903	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,1:15,4
+chr4	188411557	.	TGA	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:16,3:5,1
+chr4	188604588	.	AGAT	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0073681;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:21,15:11,6:10,9
+chr4	189578190	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0022098;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:33,14:13,9:20,5
+chr4	189686266	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:7,4:11,1
+chr5	302652	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.00072987;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:10,7:1,5
+chr5	426881	.	G	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.18301;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:4,1:2,1
+chr5	434455	.	TGAAAACAGAGCCAGACTCTC	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0005395;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:15,6:20,6
+chr5	434478	.	C	T	0	PASS	DP=90;GPV=1;SPV=0.00075349;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:40,12:17,6:23,6
+chr5	484383	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.022704;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:1,1:5,4
+chr5	658645	.	ATTTTTTTTTTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10277;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:9,4:2,1
+chr5	1061521	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.027042;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,4:7,2
+chr5	1379965	.	A	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0053746;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:4,5:6,5
+chr5	1867380	.	T	TG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:2,4:2,4:0,0
+chr5	3492742	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0058302;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:14,3:11,6
+chr5	3761401	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,1:11,3
+chr5	4095577	.	T	TTC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.030499;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,1:7,5
+chr5	4095578	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.041466;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:2,1:8,5
+chr5	5385200	.	C	G	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.9475e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:11,10:15,6
+chr5	5725921	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00033318;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:10,7:10,3
+chr5	6185027	.	C	CT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.052107;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:8,3:4,2
+chr5	6367923	.	TGA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:10,4:4,1
+chr5	6816160	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.041958;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,5:2,4:2,1
+chr5	7143259	.	G	GTGTGTATATATA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.13115;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:8,3:15,2
+chr5	7589498	.	G	GAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.20553;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,4:11,4:1,0
+chr5	8720398	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:9,4:1,0
+chr5	8746665	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.33333;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,2:3,1:1,1
+chr5	8972532	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.014208;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:16,5:10,2
+chr5	9593951	.	G	GTATATATATATATATATATA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,6:2,5:2,1
+chr5	9929839	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0019458;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:14,4:13,6
+chr5	9953576	.	C	CATATATATATAT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,11:1,8:4,3
+chr5	10418381	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.026469;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,7:12,5:2,2
+chr5	10638985	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:7,2:11,2
+chr5	11771192	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.021739;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,11:6,9:3,2
+chr5	11776456	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.00039776;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:7,5:7,4
+chr5	11864540	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0070909;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,6:13,4:7,2
+chr5	13798739	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0034395;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,9:9,4:9,5
+chr5	14812120	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.38182;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:5,2:4,1:1,1
+chr5	15309583	.	GAA	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.15847;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:20,1:4,4
+chr5	15715489	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0028043;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,12:9,11:2,1
+chr5	16662316	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.042986;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,5:2,2:1,3
+chr5	17965702	.	CATATATATATAT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,5:3,4:1,1
+chr5	18046470	.	TTA	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.10919;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:16,1:11,7
+chr5	18444169	.	CATGTATATATACACACATACACATAT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.11627;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:4,1:16,3
+chr5	19177693	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0085139;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:5,10:3,4:2,6
+chr5	19392403	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=2.5801e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:6,5:9,8
+chr5	19917432	.	T	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.019651;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:12,3:6,2
+chr5	20617230	.	G	GAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0087567;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,8:5,5:1,3
+chr5	20755141	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.057471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,3:8,1
+chr5	20757924	.	C	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.030818;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:15,3:18,4
+chr5	20865871	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.048994;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:4,3:10,2
+chr5	21211538	.	T	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0136;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:30,6:12,2:18,4
+chr5	22999419	.	C	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0020064;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:8,6:10,4
+chr5	23118340	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,6:4,2:5,4
+chr5	23671914	.	ATT	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1592;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:6,1:7,3
+chr5	23988366	.	A	ATTCT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,4:6,3:13,1
+chr5	24459502	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.008739;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:9,2:15,4
+chr5	24465506	.	A	G	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=2.2669e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:17,7:9,7
+chr5	24560220	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.064743;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,3:12,1
+chr5	24626897	.	T	TAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.17768;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:11,3:18,1
+chr5	24929831	.	C	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0036796;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:7,4:16,3
+chr5	26090026	.	C	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0001506;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:12,8:10,3
+chr5	26479675	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.081606;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:25,2:12,3
+chr5	26564815	.	C	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0018443;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:5,3:10,6
+chr5	28107717	.	TTATATATA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,4:2,1
+chr5	28581865	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0019152;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:17,3:12,6
+chr5	28818454	.	A	AG	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:8,2:4,2
+chr5	28929068	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00014246;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:13,13:4,5:9,8
+chr5	28975244	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00024975;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:12,4:4,4
+chr5	29032844	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.023889;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:29,6:17,5:12,1
+chr5	29403167	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.4662e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:10,4:13,8
+chr5	29837121	.	T	TCTCTCTCTCTTTC	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,2:0,0:0,2
+chr5	29927548	.	AGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:11,14:7,9:4,5
+chr5	30353234	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.11664;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:12,2:13,3
+chr5	30490627	.	G	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14851;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,2:10,2
+chr5	31293367	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.12943;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:16,3:16,1
+chr5	31578439	.	G	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1037;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,2:7,2
+chr5	31776626	.	T	TTTTATTTA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.034267;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:8,5:11,5
+chr5	33123422	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0045179;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,8:5,3
+chr5	34251894	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.071429;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:18:1,3:1,1:0,2
+chr5	36171226	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0037034;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:36,13:18,7:18,6
+chr5	36322184	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.015172;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,5:4,1
+chr5	37373706	.	A	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.46667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,2:4,1:1,1
+chr5	37874339	.	A	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,4:11,1:7,3
+chr5	37964914	.	G	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0022018;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:12,4:15,5
+chr5	39619776	.	TTTC	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.21118;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:11,3:16,1
+chr5	39967650	.	CTTTTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015561;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,7:5,1
+chr5	40018312	.	GTGGGACCTTTGGGACCAGATAGTAGAACAT	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.013486;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:10,6:12,6
+chr5	40968559	.	ATATATATTT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,2:3,1:1,1
+chr5	42962772	.	T	TGAGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.14971;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:11,3:14,4
+chr5	43273910	.	GTGTTTATCTTTT	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00046879;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:12,5:14,6
+chr5	44196047	.	G	GA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,9:4,6:1,3
+chr5	44377438	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00021022;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,6:9,4
+chr5	44852745	.	C	CAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.023031;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,7:5,1
+chr5	45031943	.	CTTTGTAAT	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.02029;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:25,6:9,4:16,2
+chr5	46366052	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0080354;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:13,7:16,2
+chr5	46648697	.	A	T	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.19386;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:35,4:25,1:10,3
+chr5	46708068	.	T	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:10,4:0,0
+chr5	47074114	.	A	C	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,4:0,0
+chr5	47100917	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=8.135e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:28,17:17,7:11,10
+chr5	47129394	.	A	G	0	PASS	DP=124;GPV=1;SPV=0.042795;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:75:66,9:11,1:55,8
+chr5	47130262	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.11624;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,2:9,2
+chr5	47136617	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:0,0:17,4
+chr5	47296981	.	A	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.027952;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:1,1:32,11
+chr5	49622546	.	A	G	0	PASS	DP=290;GPV=1;SPV=0.04415;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:127,24:50,18:77,6
+chr5	49666505	.	A	G	0	PASS	DP=514;GPV=1;SPV=0.033824;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:269:231,38:138,19:93,19
+chr5	50114336	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.079987;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:28,4:1,1
+chr5	50114341	.	T	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.045693;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:24,4:0,1
+chr5	50137140	.	G	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.10523;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:15,2:9,2
+chr5	50140793	.	A	T	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.017008;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:28,4:7,5
+chr5	51400213	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,4:2,1:7,3
+chr5	51414171	.	A	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.044512;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:16,1:10,5
+chr5	52872566	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.038306;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:6,4:10,2
+chr5	53458614	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0048811;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:13,2:7,6
+chr5	54474179	.	T	TTCTG	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0012329;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:6,4:11,7
+chr5	56115212	.	AAT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.070922;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,2:10,2
+chr5	58870530	.	A	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0050994;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:29,9:14,7:15,2
+chr5	59795974	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00012605;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:29,15:13,7:16,8
+chr5	60613826	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.047147;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:8,2:14,3
+chr5	62224050	.	AGAGTGTGTGT	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:7,2:2,2
+chr5	62248035	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.045245;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:19,2:12,6
+chr5	62441496	.	CTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:4,7:5,4
+chr5	62533215	.	C	T	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.14143;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,4:6,3:9,1
+chr5	64862369	.	A	AAAAC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00051119;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:15,18:5,14:10,4
+chr5	65271376	.	TA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.014832;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,10:3,7:5,3
+chr5	65898796	.	TTTCTC	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.032155;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:10,1:10,8
+chr5	67116208	.	GT	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.052464;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:9,1:8,4
+chr5	67958371	.	AACACACACACACAC	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.035837;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:8,6:3,1
+chr5	68303425	.	C	CA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0013501;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:9,7:2,2
+chr5	69164026	.	AATAT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:2,2:3,3
+chr5	70219857	.	G	A	0	PASS	DP=563;GPV=1;SPV=0.019992;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:305:273,32:178,21:95,11
+chr5	70427617	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12093;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:11,3:7,2
+chr5	74925221	.	TG	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.012101;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,12:10,5:4,7
+chr5	77816249	.	G	GA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0072464;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:7,6:1,1
+chr5	78279850	.	A	AATAT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.11479;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,3:12,1
+chr5	78279867	.	AAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.067038;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,4:9,1
+chr5	80035844	.	T	C	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.068498;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:16,2:14,2
+chr5	80505749	.	A	ATT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,4:2,2:5,2
+chr5	81116837	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0045171;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:13,4:15,5
+chr5	81737787	.	C	CA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.052666;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:17,4:4,3
+chr5	82370810	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.1672;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:22,2:11,2
+chr5	84864162	.	AT	A	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.04073;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:22,7:9,3:13,4
+chr5	85131821	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00089348;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:14,8:17,5
+chr5	85358431	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.015895;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:7,6:8,5
+chr5	85677331	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.00034555;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:9,21:3,10:6,11
+chr5	88191956	.	CA	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.016254;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,4:4,1
+chr5	89120537	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.01328;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:10,9:11,7
+chr5	89311458	.	A	AAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr5	92880197	.	C	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0011799;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:13,6:17,4
+chr5	94564384	.	T	TTGTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0030816;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,4:5,4
+chr5	96313865	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=0.017586;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:41,9:14,6:27,3
+chr5	97657022	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.053015;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:8,2:8,2
+chr5	99522765	.	C	G	0	PASS	DP=120;GPV=1;SPV=0.041137;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:48,11:16,4:32,7
+chr5	100066701	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.018907;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:12,2:7,4
+chr5	100493719	.	T	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.013595;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,11:3,7:2,4
+chr5	100593974	.	A	ATATC	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.098039;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,2:2,1:2,1
+chr5	105296226	.	G	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0090312;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
+chr5	105610844	.	A	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00013297;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:8,7:13,5
+chr5	106604048	.	A	AAAATATAT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0045549;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:7,15:5,11:2,4
+chr5	106755918	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.26667;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,2:5,1:1,1
+chr5	108772333	.	C	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.073359;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:5,2:11,2
+chr5	108819179	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.023188;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:3,4:4,2
+chr5	110770611	.	A	G	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=8.0653e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:24,25:10,11:14,14
+chr5	111991173	.	C	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00013948;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:14,7:13,6
+chr5	112527856	.	G	A	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00028322;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:32,17:18,6:14,11
+chr5	112818834	.	G	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:13,4:9,2:4,2
+chr5	113653297	.	A	G	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:11,7:7,5:4,2
+chr5	114664322	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.11068;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,6:4,5:4,1
+chr5	115547919	.	A	ATATGTGTGTGTG	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.15385;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:4,2:2,2
+chr5	116333491	.	CAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0072464;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,7:6,5:2,2
+chr5	116879726	.	A	C	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.037129;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:14,1:5,8
+chr5	117190472	.	T	TAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,4:12,1:8,3
+chr5	117284179	.	T	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.076651;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,2:8,3
+chr5	117689652	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.067973;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:26,3:7,1
+chr5	121657690	.	T	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.20588;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
+chr5	122513085	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.04669;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,5:10,2
+chr5	122544822	.	AAAAAAAAATATAT	A	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0017499;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,8:3,4:2,4
+chr5	123023807	.	A	AACACACACACACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.039556;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,5:9,3:9,2
+chr5	123559703	.	T	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:1,2:1,1:0,1
+chr5	124029932	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0014872;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:25,14:16,10:9,4
+chr5	124764014	.	CTT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:7,4:0,3
+chr5	124935723	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,7:6,2
+chr5	126576262	.	C	CA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02087;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:3,5:3,1
+chr5	126800951	.	CTA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046584;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:7,3:1,1
+chr5	126800956	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:7,2:3,2
+chr5	127110306	.	G	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0010933;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:13,3:15,8
+chr5	127614711	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:3,4:3,2
+chr5	127676757	.	G	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00049368;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:12,7:8,2
+chr5	127974670	.	AT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.014951;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:15,13:6,6:9,7
+chr5	128759156	.	A	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0040779;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:12,6:10,4
+chr5	129389321	.	TGTC	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:10,2:7,2
+chr5	131005742	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.034681;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:15,5:17,3
+chr5	131240280	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00039828;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:9,3:10,6
+chr5	131466384	.	A	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.051054;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,1:10,3
+chr5	132433778	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.057386;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:9,6:7,1
+chr5	132482663	.	GT	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.016254;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,10:4,8:1,2
+chr5	132726572	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=7.8617e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:8,4:7,9
+chr5	132881827	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,4:9,1:0,3
+chr5	132889001	.	T	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0031368;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:10,5:15,3
+chr5	133588185	.	G	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.15398;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,1:10,3
+chr5	135812312	.	A	C	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.014019;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:33,7:12,2:21,5
+chr5	138777250	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.032019;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,6:9,4:25,2
+chr5	139155448	.	T	TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.15033;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,4:7,2:12,2
+chr5	139180058	.	T	TAA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.014514;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,9:4,3:8,6
+chr5	139381614	.	CA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.015632;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:6,6:5,1
+chr5	144179804	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00031474;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,9:11,6
+chr5	145219813	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00034047;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:12,2:7,7
+chr5	145964307	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.065637;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:9,1:7,3
+chr5	146560118	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.13333;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,2:4,1:2,1
+chr5	146679477	.	G	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.094721;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:1,0:14,4
+chr5	147717784	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0024544;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,7:7,5:9,2
+chr5	148068578	.	A	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,4:8,3:2,1
+chr5	148091756	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:10,2:5,3
+chr5	148476969	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0035514;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:15,4:14,6
+chr5	148615692	.	TAAAG	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.08744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,1:7,3
+chr5	149956178	.	A	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.054545;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:1,2:0,1:1,1
+chr5	151788570	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,6:9,2:4,4
+chr5	153243557	.	CA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:5,2:4,2
+chr5	153577078	.	A	ATGGATGGATGGG	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.030435;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:6,4:3,1
+chr5	153577162	.	A	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.30769;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,2:3,1:3,1
+chr5	154586572	.	G	GA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.037198;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:8,4:2,1
+chr5	154646237	.	GT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.026636;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:2,4:4,2
+chr5	155487913	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0001844;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,9:11,7:3,2
+chr5	155796806	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:6,3:5,1
+chr5	156416076	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0017626;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:9,4:9,4
+chr5	156957512	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.05132;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:7,3:6,1
+chr5	156981148	.	CTCTTTCTTTCTT	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0069996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,10:1,5:5,5
+chr5	157280363	.	A	ATTTTTTT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0024977;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,3:5,5
+chr5	158163405	.	T	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:2,2:2,1:0,1
+chr5	160202798	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023376;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,6:7,2
+chr5	160236016	.	G	GT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.029563;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,6:2,1
+chr5	161571650	.	CATAT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.18462;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:1,5:5,1
+chr5	161839895	.	C	CTCTTTCTTTCTTTCTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,4:1,1:1,3
+chr5	162242657	.	GAT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,6:5,3:4,3
+chr5	162978186	.	A	AACACACACACACAC	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.023788;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:6,6:3,2
+chr5	163001832	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0025641;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:3,3:2,2
+chr5	163226988	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.12238;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,3:0,0:4,3
+chr5	163610852	.	G	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0012326;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,5:5,2
+chr5	164402989	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.00037022;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:13:0,8:0,3:0,5
+chr5	166523934	.	C	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00016765;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,8:4,2:5,6
+chr5	167288558	.	C	CAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.048889;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:4,3:6,1
+chr5	170243365	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0015313;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,6:3,2
+chr5	172286885	.	T	TA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.049017;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:6,4:3,2
+chr5	173106732	.	C	CTATTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0014808;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:13,11:3,6:10,5
+chr5	173221743	.	A	ATG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0021778;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,8:4,5:1,3
+chr5	173338133	.	GTATATATATATA	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,9:6,6:2,3
+chr5	173699017	.	A	ACGCGCGCG	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0038904;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,5:5,4:1,1
+chr5	173872574	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:6,4:5,3:1,1
+chr5	174689912	.	C	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.23077;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:5,1:0,1
+chr5	175122973	.	A	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.34286;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,2:3,1:4,1
+chr5	175930222	.	T	C	0	PASS	DP=87;GPV=1;SPV=0.012785;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:16,5:13,5
+chr5	175952831	.	T	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0072303;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:8,1:2,5
+chr5	175961219	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0034188;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,3:2,1
+chr5	176000359	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.031374;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:6,6:8,1
+chr5	176576579	.	CT	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0017828;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,11:3,9:2,2
+chr5	177048787	.	C	CTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.048872;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:5,4:3,1
+chr5	177644622	.	A	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:1,3:4,2
+chr5	177645886	.	C	CG	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:6,3:1,1
+chr5	177812290	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,3:0,0
+chr5	177871804	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,3:2,1
+chr5	178002236	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.0069323;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:2,4:2,4
+chr5	179384589	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00042646;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,5:7,3
+chr5	180954948	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,4:0,2:9,2
+chr5	181306616	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.043255;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,3:5,2
+chr6	371529	.	CAGG	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.091614;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,4:9,3:13,1
+chr6	851213	.	C	CAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.042772;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:9,5:5,1
+chr6	911480	.	TCTACAGACAGGTGAGGGGCCCC	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00040386;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:20,17:12,8:8,9
+chr6	3181862	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:12,2:9,2
+chr6	4258452	.	C	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.20263;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,5:13,1:8,4
+chr6	4674905	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00028843;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:11,3:6,7
+chr6	5444493	.	AGAG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.046953;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,4:1,1:1,3
+chr6	7450593	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.046407;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:5,5:2,1
+chr6	8044283	.	C	CAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037461;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,8:1,6:4,2
+chr6	8628542	.	C	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.016425;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:2,3:5,4
+chr6	8628547	.	TTC	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0026779;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,3:7,4
+chr6	8978319	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.020362;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,1:2,4
+chr6	9516350	.	A	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0049562;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:30,9:16,5:14,4
+chr6	9752208	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=6.9341e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:11,7:5,5
+chr6	10563774	.	A	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.26923;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,2:4,1:1,1
+chr6	11052766	.	CA	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.080745;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,3:3,1
+chr6	11083103	.	C	CTTTTTT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.042541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,8:10,4:9,4
+chr6	11319730	.	ACT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,4:10,2:3,2
+chr6	11319742	.	A	ACT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045652;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,5:7,2:3,3
+chr6	11636065	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0027473;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:0,11:0,8:0,3
+chr6	11700420	.	A	AATATATATAT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.070707;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,4:2,2:1,2
+chr6	11855203	.	T	TTGTGTG	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.015843;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,6:6,1:3,5
+chr6	12065694	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.10478;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,6:14,2:22,4
+chr6	12753779	.	A	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.016493;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:10,2:9,4
+chr6	14031306	.	TAACACACA	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0080824;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:12,6:6,5
+chr6	14163457	.	CT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.017499;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:8,8:5,5:3,3
+chr6	14353495	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=6.4422e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:27,16:15,12:12,4
+chr6	14382908	.	T	TCTTC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.16171;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:27,4:15,3:12,1
+chr6	15094541	.	A	AC	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,7:6,2:5,5
+chr6	15220872	.	CGGGGGAGAGGAAAT	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.010097;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:16,12:7,9:9,3
+chr6	15620983	.	T	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00060146;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:30,12:17,6:13,6
+chr6	16121816	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0011498;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:18,5:8,6
+chr6	16289848	.	ATTTTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.026006;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,4:2,1:3,3
+chr6	17020444	.	G	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0024472;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:6,3:2,4
+chr6	20310118	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.2066;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:10,4:7,3:3,1
+chr6	20992037	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037203;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,2:8,2
+chr6	21635083	.	G	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18479;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,5:9,3:8,2
+chr6	22077805	.	T	TTAA	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0070729;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:9,13:4,10:5,3
+chr6	22481638	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:3,2:4,2
+chr6	22868282	.	CAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.0021831;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:3,8:2,7:1,1
+chr6	23276844	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0009678;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,6:8,3
+chr6	23827822	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0025987;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:13,11:12,3
+chr6	24378956	.	G	GA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.12587;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:5,4:0,0
+chr6	24389373	.	A	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:1,2:0,1:1,1
+chr6	26042796	.	A	ATT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.13093;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:7,1:12,4
+chr6	27045173	.	G	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.001551;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:36,9:19,5:17,4
+chr6	27221394	.	T	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.093861;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:15,3:16,1
+chr6	27803526	.	TCACACA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.040458;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:10,8:9,3:1,5
+chr6	28080543	.	A	AT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.036419;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,4:6,1
+chr6	28891642	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.021198;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:13,4:9,3
+chr6	29187357	.	T	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=7.3665e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:11,6:12,7
+chr6	29707390	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,4:4,3:2,1
+chr6	30415665	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0014573;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:16,17:6,9:10,8
+chr6	30515671	.	CTAGA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.0010237;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:15,13:11,10:4,3
+chr6	31409323	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:6,2:6,5
+chr6	31455864	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:19,3:13,1
+chr6	31682815	.	AG	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.00054583;SS=2;SSC=32;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:2,10:1,6:1,4
+chr6	32010061	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:0,0:8,4
+chr6	32215812	.	CCTTT	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.014575;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,1:4,6
+chr6	32215827	.	TC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.018966;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:9,1:2,5
+chr6	32690111	.	A	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11117;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:11,6:10,2
+chr6	33230722	.	G	GGAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0088608;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,7:4,4:8,3
+chr6	33309720	.	CT	C	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:0,5:0,4:0,1
+chr6	34136563	.	GAC	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.0079095;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,8:3,4:2,4
+chr6	34397811	.	C	CT	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.12474;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:10,1:7,2
+chr6	35182724	.	TATATATATATA	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,2:0,1:1,1
+chr6	35383871	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.025813;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:16,6:15,3
+chr6	36175391	.	GA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12114;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,3:11,1
+chr6	36549329	.	CTCTTCT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.022311;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:8,6:1,3:7,3
+chr6	37044481	.	T	TA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.045954;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:12,4:5,4
+chr6	37121230	.	C	CAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.018778;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:5,10:3,9:2,1
+chr6	37959118	.	C	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0010244;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:14,5:13,5
+chr6	39724452	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0069323;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,8:3,7:1,1
+chr6	40655197	.	ATG	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.28876;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:15,2:10,2
+chr6	41283329	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.089909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:19,1:10,3
+chr6	41565463	.	A	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=3.5464e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,15:8,11:9,4
+chr6	42841075	.	TA	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.010718;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,9:4,4:1,5
+chr6	43398399	.	CT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.017846;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:6,4:11,6
+chr6	44508149	.	A	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00088456;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:8,6:12,5
+chr6	45150720	.	G	GTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.017028;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,6:3,4:2,2
+chr6	45318277	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.03797;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:15,4:13,3
+chr6	45866424	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.13357;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,1:9,3
+chr6	47660260	.	GACACACAC	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.004644;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,10:3,8:2,2
+chr6	49020323	.	T	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:1,2:1,1:0,1
+chr6	49721139	.	G	GTTT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.04469;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,6:2,4:4,2
+chr6	49769054	.	A	AACACACACACAC	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.030049;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,8:10,3:10,5
+chr6	51202674	.	G	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.038803;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:8,7:13,3
+chr6	51519797	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030178;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:4,4:14,6
+chr6	51671401	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0007325;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:11,5:13,5
+chr6	52363343	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0013429;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:32,9:15,5:17,4
+chr6	52945792	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00051706;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,10:12,3:11,7
+chr6	53253265	.	ATC	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.064915;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:11,2:11,2
+chr6	54004937	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.014884;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,7:0,6:3,1
+chr6	54305991	.	T	TATC	0	PASS	DP=82;GPV=1;SPV=0.0012439;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:36,11:20,5:16,6
+chr6	55055543	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.041422;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:20,4:8,2
+chr6	56847002	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0084817;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:8,7:3,1
+chr6	56900875	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.013014;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:4,6:6,1
+chr6	57256745	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.072149;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,5:3,3:10,2
+chr6	57941432	.	CAAA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,4:3,3:7,1
+chr6	58263125	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.001881;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:10,2:10,6
+chr6	58392444	.	A	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0077272;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:12,3:15,4
+chr6	59562159	.	G	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
+chr6	59562160	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:11,4:1,0
+chr6	59828833	.	C	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.17137;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:1,0:20,4
+chr6	60656011	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=1.0579e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,11:1,4:3,7
+chr6	60700140	.	GTATA	G	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.074661;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,6:3,3:3,3
+chr6	60807897	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00044723;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:13,6:10,7
+chr6	62166021	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0001375;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:6,7:14,4
+chr6	66768518	.	C	CA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.057037;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,3:2,1
+chr6	67152335	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.02373;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:12,4:19,4
+chr6	67662695	.	C	CT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:2,2:5,2
+chr6	68646475	.	C	CA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.014937;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:11,7:8,3
+chr6	69735444	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:2,2:1,1:1,1
+chr6	70227424	.	T	TAAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037328;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:10,5:4,2
+chr6	70938255	.	GATAC	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.035323;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,3:9,5
+chr6	71355521	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00013746;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:13,17:9,5:4,12
+chr6	71382249	.	A	AAT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.019243;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:10,4:7,2
+chr6	71807875	.	A	AC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:12,5:3,6
+chr6	72196379	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.031815;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,7:10,4:6,3
+chr6	72275120	.	GTATATATATATATATATATATATATATATATA	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.036405;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,6:2,5:1,1
+chr6	72339150	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.040704;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,3:12,1
+chr6	72500306	.	AAG	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.47431;SS=2;SSC=3;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,2:10,1:4,1
+chr6	72500330	.	AAG	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.091304;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:5,2:6,2
+chr6	72587312	.	AAAAGAAAG	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.041365;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:13,2:10,2
+chr6	74165440	.	C	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=9.4662e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:9,5:14,7
+chr6	74797476	.	C	CAT	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,4:1,3:4,1
+chr6	74810977	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0041136;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:6,6:12,4
+chr6	75326112	.	G	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.041869;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:13,4:18,2
+chr6	75370340	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027357;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:12,1:5,4
+chr6	75563329	.	C	CTGTGTGTG	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0024526;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,7:1,5:3,2
+chr6	76048137	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.020112;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:8,3:18,3
+chr6	76687005	.	A	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:2,2:2,1:0,1
+chr6	78186375	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017534;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:2,9:2,7:0,2
+chr6	78541340	.	GAGAGAGCCAGACAGCA	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0010369;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:12,6:3,4
+chr6	79461984	.	C	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0087781;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:12,5:11,2
+chr6	80145831	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=1.1889e-06;SS=2;SSC=59;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:12,9:9,7
+chr6	81647497	.	A	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00096111;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:21,8:11,4
+chr6	83221158	.	C	CAAAAAAAAA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.018671;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:8,7:5,1
+chr6	83237314	.	GA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0093841;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:10,6:5,6
+chr6	83497818	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.082213;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,5:4,4:7,1
+chr6	84254247	.	G	GT	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=3.216e-05;SS=2;SSC=44;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:7,18:2,11:5,7
+chr6	85135130	.	A	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.18947;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,2:7,1:0,1
+chr6	85939416	.	A	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.10313;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:9,1:16,3
+chr6	87128988	.	C	CGTATATATATGTATGTATATT	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.076205;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,4:7,1:16,3
+chr6	87519184	.	A	ATGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.012445;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,9:1,8:10,1
+chr6	87599354	.	A	ATTAT	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0011759;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:11,15:5,9:6,6
+chr6	87673155	.	T	A	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16176;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,4:4,1:4,3
+chr6	88860839	.	C	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,2:3,1:3,1
+chr6	90100726	.	CAG	C	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.119;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,4:14,2:12,2
+chr6	90377719	.	CTTTTTTCT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,1:8,3
+chr6	90377955	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:7,5:4,1
+chr6	90613784	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,2:2,1:0,1
+chr6	92125323	.	C	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0005561;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:27,11:13,8:14,3
+chr6	92434273	.	GT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0039973;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:14,6:6,3
+chr6	93069000	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.0061026;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:9,6:8,2
+chr6	93832826	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.036102;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:3,5:8,2
+chr6	94052100	.	C	CATCT	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.039629;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,9:6,4:14,5
+chr6	94575966	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0066305;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:10,2:16,7
+chr6	94581085	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.070286;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:11,3:26,2
+chr6	95486242	.	T	C	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.075302;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:16,2:15,3
+chr6	97284483	.	G	GCA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0067841;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:8,11:5,8:3,3
+chr6	97992099	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0096405;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:5,7:11,2
+chr6	98224506	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:3,2:2,1:1,1
+chr6	98609318	.	C	CAATAAATAAATA	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.021295;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:11,6:13,4
+chr6	99097661	.	ATT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0053012;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,14:5,12:7,2
+chr6	99107066	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.002821;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,1:13,6
+chr6	100608289	.	TTA	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:2,3:3,4
+chr6	101681421	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.10493;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:6,1:14,3
+chr6	102120230	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.00096111;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:32,12:21,3:11,9
+chr6	102244230	.	C	CAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051826;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:8,4:9,2
+chr6	103531457	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0061655;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:17,3:9,5
+chr6	103711877	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.014654;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:7,4:7,6
+chr6	104444919	.	C	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.42424;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:6,2:4,1:2,1
+chr6	105906381	.	GCACA	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,8:4,5:0,3
+chr6	105968316	.	C	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.015217;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:23,7:12,2:11,5
+chr6	106348910	.	C	CAA	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:4,8:2,6:2,2
+chr6	110923933	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=2.7315e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:7,9:15,8
+chr6	112312923	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0369;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,7:10,3:16,4
+chr6	114045997	.	G	GCACACACACACA	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.03726;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:11,5:4,2
+chr6	115067637	.	T	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.061918;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:22,3:14,2
+chr6	115531711	.	T	TATAGATAG	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014357;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:19,10:7,4:12,6
+chr6	115643130	.	C	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=6.6326e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,7:8,2
+chr6	117430681	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.040724;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,7:3,6:2,1
+chr6	118529612	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.35897;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,2:3,1:3,1
+chr6	120692029	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.16643;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:12,2:5,2
+chr6	121462554	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:6,1:7,3
+chr6	121606531	.	T	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.11947;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,8:5,5:4,3
+chr6	121928140	.	CA	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.01473;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:8,7:3,2
+chr6	122053984	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00047262;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:24,15:4,2:20,13
+chr6	122633975	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.024127;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:10,3:16,5
+chr6	122858018	.	C	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0021937;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:14,23:3,11:11,12
+chr6	123238249	.	C	T	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00054254;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:12,7:12,6
+chr6	124841840	.	ATT	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.088935;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:14,3:4,1
+chr6	125517647	.	CA	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.003791;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:18,6:4,3
+chr6	125703568	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0078821;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:9,5:16,6
+chr6	126856226	.	ATTTATTTTAT	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.027339;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:8,5:14,7
+chr6	129371607	.	C	CT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.04053;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,8:6,6:6,2
+chr6	132533977	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14626;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:6,2:11,2
+chr6	132973261	.	T	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.015866;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:3,4:4,6
+chr6	133385393	.	G	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:2,2:0,1:2,1
+chr6	134625659	.	C	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0030392;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:34,12:16,5:18,7
+chr6	135313506	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0086598;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:11,2:16,5
+chr6	135750267	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.11141;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:15,3:14,1
+chr6	136786379	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040398;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:12,10:9,9:3,1
+chr6	137948309	.	A	ACT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.036089;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:3,2:4,3
+chr6	138043394	.	C	CA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:9,3:2,1
+chr6	138147228	.	GA	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.023132;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:10,5:11,5
+chr6	138819248	.	A	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.051532;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:19,5:15,2
+chr6	138955457	.	A	AAGTGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:3,1:8,3
+chr6	139384172	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.051834;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:9,1:15,3
+chr6	142204643	.	ATTTAATCCTTTTATATTTAAAAGGATTTAAAT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:6,4:10,1
+chr6	142244318	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.05418;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:6,9:2,8:4,1
+chr6	143580508	.	C	CA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.019763;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:6,4:3,3:3,1
+chr6	143977473	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.11275;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:11,2:8,3
+chr6	145034839	.	CTGTCA	C	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.000451;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:9,7:15,3
+chr6	145934473	.	T	TAAATAAAATAAAATA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.031374;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:7,6:7,1
+chr6	146089679	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.015414;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:19,5:9,2
+chr6	146455122	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.039565;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:16,6:7,3
+chr6	146568404	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:3,2:3,2:0,0
+chr6	147461958	.	CA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
+chr6	147626818	.	G	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:7,2:0,0
+chr6	147630491	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.004211;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:17,12:12,5:5,7
+chr6	147719790	.	GT	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.048152;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:17,3:16,2
+chr6	147719796	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.044221;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:15,3:19,2
+chr6	148368772	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.055478;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:9,4:7,2
+chr6	148899092	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0039295;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:4,8:2,5:2,3
+chr6	149324826	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.035315;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,8:7,5:8,3
+chr6	149790516	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0048547;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:4,4:3,6
+chr6	150085900	.	CAA	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,11:1,6:8,5
+chr6	150202396	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.003184;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:15,6:12,2
+chr6	150884141	.	A	AT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,9:6,6:5,3
+chr6	152256431	.	AAAATAAAT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.2206;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:28,6:11,3:17,3
+chr6	153401835	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.00077962;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:7,5:8,4
+chr6	155627833	.	A	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.019883;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,3:5,1
+chr6	155968845	.	C	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0012998;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:22,11:9,5:13,6
+chr6	162713493	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:9,6:3,4:6,2
+chr6	164455129	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011343;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:14,10:6,3:8,7
+chr6	164745498	.	TC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.021576;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:7,3:2,4
+chr6	164787517	.	C	A	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=1.7213e-06;SS=2;SSC=57;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:36,19:18,8:18,11
+chr6	164939524	.	A	AG	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1396;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:12,3:12,2
+chr6	164939526	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.12337;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,3:11,2
+chr6	164939530	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.10585;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:11,3:9,2
+chr6	165398498	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.090909;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:2,2:2,2:0,0
+chr6	165656258	.	T	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.023879;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:14,6:6,2:8,4
+chr6	166893252	.	C	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0022056;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:11,6:11,4
+chr6	166963191	.	TG	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.0088769;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:7,7:5,2
+chr6	167177840	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.019711;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:16,5:12,2
+chr6	167698965	.	T	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.048018;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:33,6:19,5:14,1
+chr6	167977818	.	C	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.014142;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,5:2,1
+chr6	168603242	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.10217;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,8:4,4:4,4
+chr6	168618449	.	G	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.073366;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,8:10,2:9,6
+chr6	168931505	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:4,2:9,2
+chr6	168976849	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.038024;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:8,2:18,2
+chr6	169724395	.	C	G	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.14022;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:14,2:8,3
+chr6	170656349	.	G	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:11,1:2,3
+chr7	404072	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:1,5:3,3
+chr7	494624	.	AG	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:2,2:2,2
+chr7	735331	.	C	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.019565;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:4,3:4,2
+chr7	745433	.	C	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.027483;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:38,6:27,2:11,4
+chr7	955827	.	A	AC	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.09755;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:14,3:19,1
+chr7	1003990	.	T	TGA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:19,4:2,0
+chr7	1432727	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0023389;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,8:11,3:5,5
+chr7	2946634	.	C	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0010857;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:16,6:10,3
+chr7	3554208	.	C	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0014163;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:13,4:18,7
+chr7	4680676	.	C	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.027415;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:6,10:3,9:3,1
+chr7	5184282	.	C	CTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.045113;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:3,2:4,2
+chr7	5411515	.	C	CA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.037732;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:7,6:1,1
+chr7	5920207	.	C	CA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.030143;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:7,4:8,4
+chr7	5932183	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.040214;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:4,4:9,3
+chr7	6092010	.	TC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.1025;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,2:11,2
+chr7	6275849	.	C	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0066305;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:16,6:10,3
+chr7	6410880	.	A	AT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.19783;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,3:7,2:5,1
+chr7	6754598	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:0,0:21,4
+chr7	7429425	.	CTCACATACACACACACTCTCTT	C	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016338;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:9,2:9,7
+chr7	9156843	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0070449;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,10:6,9:4,1
+chr7	9762027	.	AAC	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06523;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:11,3:8,1
+chr7	9762054	.	ATATATATTTATAT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.039244;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:10,3:2,1
+chr7	10795416	.	C	CCACACACA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.011637;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:17,14:11,11:6,3
+chr7	11638318	.	T	A	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00054466;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:8,5:14,4
+chr7	12502281	.	C	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040876;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:11,4:4,4
+chr7	12888535	.	T	TTC	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.12491;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:3,1:18,3
+chr7	13324565	.	T	TCC	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.091949;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,6:3,1:8,5
+chr7	13820734	.	T	TCTTC	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.080042;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:9,3:9,1
+chr7	14188044	.	A	G	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.035742;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:18,2:16,3
+chr7	14577572	.	G	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00029763;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:16,4:15,10
+chr7	14906441	.	T	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16366;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:10,3:10,2
+chr7	15432333	.	T	TATATATATACATAC	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.086103;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,4:9,3:11,1
+chr7	15586829	.	G	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.014512;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:31,7:16,3:15,4
+chr7	15997975	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.011243;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:14,5:16,5
+chr7	16628905	.	GT	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.039346;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:7,7:14,1
+chr7	16919988	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00086166;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:14,7:14,6
+chr7	21203931	.	C	CCACACACA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.20979;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:3,3:3,1
+chr7	21227141	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.09755;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:21,2:12,2
+chr7	21789796	.	TC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.10766;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:6,2:13,2
+chr7	23034703	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=6.6609e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:20,16:12,10:8,6
+chr7	23154355	.	A	AAAAC	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.031691;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:8,5:13,6
+chr7	24779498	.	G	GGTGTGTGTGT	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.020195;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:13,5:5,5
+chr7	24940809	.	CT	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0336;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,1:8,3
+chr7	26090458	.	C	CAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.016673;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,6:11,5:3,1
+chr7	26301018	.	CCAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.069881;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:8,5:3,1
+chr7	28000618	.	C	T	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.019346;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,8:9,6:4,2
+chr7	28000622	.	C	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.041789;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:14,5:8,4:6,1
+chr7	28348385	.	CTCTCTCTCTCTG	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.053885;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,4:8,2:10,2
+chr7	28624676	.	G	GAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.13055;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:10,4:5,1
+chr7	32443079	.	CAAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:2,7:1,2:1,5
+chr7	33020563	.	T	C	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0012119;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:12,5:15,9
+chr7	33783473	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.23498;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,5:4,3:8,2
+chr7	34386872	.	C	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=9.3501e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:17,24:9,14:8,10
+chr7	35574098	.	AG	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.031059;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:8,4:0,2
+chr7	36056071	.	GCAGGA	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0035575;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:14,4:9,4
+chr7	36056080	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0022392;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:14,4:7,4
+chr7	36056083	.	T	TG	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0053469;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:16,3:8,4
+chr7	36056086	.	T	TA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0040413;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:15,3:7,4
+chr7	36198359	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:3,1:1,3
+chr7	36778301	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.003548;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:25,9:12,3:13,6
+chr7	37691045	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0029872;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:12,6:8,2
+chr7	38548054	.	A	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.027745;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:31,8:16,7:15,1
+chr7	40346934	.	T	C	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=1.4316e-05;SS=2;SSC=48;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:8,20:6,12:2,8
+chr7	40988895	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.2;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:1,2:1,1:0,1
+chr7	43032440	.	A	AAGAAG	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.083011;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,5:5,4:3,1
+chr7	43898788	.	AATTT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.045217;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,6:5,4:5,2
+chr7	44085359	.	C	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.051084;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,5:6,1:1,4
+chr7	45547680	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.068627;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,4:3,1:3,3
+chr7	47172855	.	T	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.013178;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,6:12,1:12,5
+chr7	47910826	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.066403;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:11,5:2,3:9,2
+chr7	48294442	.	G	GT	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.11905;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:2,4:1,2:1,2
+chr7	51086358	.	GAAAAAAAAA	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.0011057;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,8:1,6:1,2
+chr7	51271899	.	T	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.00028557;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:32,14:19,7:13,7
+chr7	51541412	.	G	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00053327;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:17,10:8,5:9,5
+chr7	51610845	.	G	GTT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,9:5,8:6,1
+chr7	52199611	.	C	CAA	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00023911;SS=2;SSC=36;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:9,16:3,8:6,8
+chr7	52403946	.	A	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.034956;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:9,2:9,3
+chr7	52445996	.	ATTTTTT	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:5,3:5,2
+chr7	53857364	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.0048332;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:33,10:16,6:17,4
+chr7	54302829	.	C	CA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.10791;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
+chr7	55143189	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0042512;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:25,10:10,5:15,5
+chr7	55323199	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.29371;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,3:3,1:3,2
+chr7	55924515	.	C	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0036989;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:11,4:17,6
+chr7	56151217	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.22147;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:21,3:13,2:8,1
+chr7	56168398	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.047619;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:21:1,3:1,3:0,0
+chr7	56447514	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:5,2:2,3
+chr7	56815431	.	G	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:10,1:6,3
+chr7	56870617	.	CT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:12,1:4,3
+chr7	57396857	.	CTT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.0062713;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:2,10:1,9:1,1
+chr7	57408800	.	G	GTTTTCTTTTT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0098833;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:3,9:0,6:3,3
+chr7	57499513	.	G	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00070765;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:13,5:7,6
+chr7	57617502	.	A	G	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.09126;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:21,3:20,2
+chr7	57708767	.	A	G	0	PASS	DP=214;GPV=1;SPV=0.042999;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:103:87,16:51,5:36,11
+chr7	58074648	.	G	T	0	PASS	DP=192;GPV=1;SPV=0.0026177;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:104:87,17:52,13:35,4
+chr7	58074649	.	C	T	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.00093139;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:105:82,23:48,19:34,4
+chr7	58081151	.	C	G	0	PASS	DP=212;GPV=1;SPV=0.029944;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:121:100,21:48,9:52,12
+chr7	58083546	.	C	G	0	PASS	DP=109;GPV=1;SPV=0.0098911;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:63:52,11:29,7:23,4
+chr7	58089349	.	CAA	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.029941;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,6:8,5:5,1
+chr7	58207631	.	A	C	0	PASS	DP=152;GPV=1;SPV=0.016846;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:71,17:29,8:42,9
+chr7	59849357	.	G	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.083867;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:1,4:21,1
+chr7	59967230	.	T	C	0	PASS	DP=142;GPV=1;SPV=0.04075;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:85:75,9:32,3:43,6
+chr7	60443284	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.0056445;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:35,9:22,8:13,1
+chr7	60938782	.	AT	A	0	PASS	DP=103;GPV=1;SPV=0.038854;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:52:36,9:17,8:19,1
+chr7	60945409	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.030386;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:57:50,7:21,4:29,3
+chr7	61002037	.	T	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.13544;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:18,3:15,1
+chr7	61013469	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.040635;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:18,5:16,2
+chr7	61116195	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.023715;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
+chr7	61117113	.	C	G	0	PASS	DP=166;GPV=1;SPV=0.034069;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:95:80,15:49,5:31,10
+chr7	61118060	.	G	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0089809;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:3,3:15,4
+chr7	61255209	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.04;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:11,3:10,1
+chr7	61409812	.	A	G	0	PASS	DP=253;GPV=1;SPV=0.011294;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:136:113,23:93,19:20,4
+chr7	61410142	.	TC	T	0	PASS	DP=184;GPV=1;SPV=0.010722;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:93:77,16:30,6:47,10
+chr7	61527517	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.029593;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:39,9:31,6:8,3
+chr7	61764874	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.11252;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:6,6:12,1
+chr7	61804323	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0036085;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:17,5:10,3
+chr7	61839512	.	T	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.24348;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:13,3:6,1:7,2
+chr7	62030363	.	C	T	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.014757;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,7:3,2:3,5
+chr7	63564349	.	A	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.13974;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:29,4:13,3:16,1
+chr7	63629694	.	G	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.085095;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:6,3:8,1
+chr7	63754992	.	T	A	0	PASS	DP=268;GPV=1;SPV=0.007447;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:149:129,20:42,4:87,16
+chr7	63769322	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.010262;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:14,4:10,6
+chr7	63835793	.	A	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.049522;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:12,3:15,1
+chr7	64004410	.	T	TAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.053755;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:4,4:7,2
+chr7	64097000	.	T	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.032916;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:12,2:8,5
+chr7	64491938	.	T	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.037956;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:7,6:11,4
+chr7	64847332	.	A	ATAT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:0,5:6,5
+chr7	64963760	.	A	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:3,2:3,1:0,1
+chr7	65241850	.	T	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.040248;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:8,4:0,2
+chr7	65505802	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.10954;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:33,5:19,4:14,1
+chr7	66509760	.	C	A	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:1,2:3,2
+chr7	66983916	.	A	AT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.028261;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:9,6:4,3:5,3
+chr7	67266492	.	A	AT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.069853;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:10,3:7,2
+chr7	68029021	.	C	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.14757;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,5:3,3:7,2
+chr7	68479343	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.021836;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:25,7:12,3:13,4
+chr7	68499365	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.25199;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:14,3:3,1
+chr7	68894513	.	C	A	0	PASS	DP=77;GPV=1;SPV=0.069378;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:41,5:17,1:24,4
+chr7	69137867	.	G	GA	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0050212;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:19,6:6,5
+chr7	70340163	.	A	AACACACACACACAC	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.04484;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:7,5:5,2
+chr7	71334028	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.037817;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:31,6:16,4:15,2
+chr7	71836622	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:8,5:2,2
+chr7	72287435	.	AT	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.040038;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,6:9,2:0,4
+chr7	73805601	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.077778;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,4:4,3:7,1
+chr7	73835197	.	TCTCCCTCTC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,8:3,2:6,6
+chr7	73836216	.	C	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.032901;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:2,1:7,5
+chr7	74547439	.	C	CT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:6,2:3,2
+chr7	75010085	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0084069;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:4,4:7,9
+chr7	75110961	.	A	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.021859;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,9:5,5:3,4
+chr7	76441133	.	T	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.031136;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:11,1:18,4
+chr7	76606109	.	G	C	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.024562;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:35,10:18,3:17,7
+chr7	76958294	.	T	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.13561;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:10,3:3,1
+chr7	77001029	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.039335;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:8,5:11,1
+chr7	77053418	.	G	A	0	PASS	DP=133;GPV=1;SPV=0.0025089;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:51,20:24,11:27,9
+chr7	77357429	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00082439;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:18,4:8,8
+chr7	77440170	.	ATTT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,3:4,5
+chr7	77998313	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00039176;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:10,10:9,7
+chr7	78004586	.	CTGTGTGTGTG	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.041917;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:12,11:6,5:6,6
+chr7	78083388	.	GA	G	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.083333;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,3:2,3:0,0
+chr7	80020388	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.045175;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:39,5:20,2:19,3
+chr7	81539388	.	A	ATATG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,4:10,2:11,2
+chr7	83775895	.	T	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17496;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:25,4:14,1:11,3
+chr7	84534144	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.00022237;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:21,16:14,7:7,9
+chr7	85333823	.	G	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0013654;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,4:2,5
+chr7	86331047	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=2.1506e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:8,9:8,4
+chr7	86627560	.	CT	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.03989;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:2,5:2,1
+chr7	88053624	.	GAAAGAAAGAA	G	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0049129;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,7:6,2:1,5
+chr7	88113703	.	AATATATAT	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:1,4:3,1
+chr7	89375746	.	C	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.10577;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:6,5:5,4:1,1
+chr7	89424208	.	T	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:9,2:3,2
+chr7	90100890	.	A	ATT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0027397;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:9,10:4,8:5,2
+chr7	90901691	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.044901;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:4,4:14,1
+chr7	91863676	.	A	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,2:0,1:3,1
+chr7	92870188	.	TA	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0032575;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:3,7:1,1
+chr7	95500568	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0015076;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:6,10:3,9:3,1
+chr7	97702887	.	C	CTTAAAG	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:3,6:3,4:0,2
+chr7	98405344	.	GCTTTCTTT	G	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.011224;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:10,8:7,5:3,3
+chr7	100181901	.	C	CAA	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.063246;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:8,5:6,4:2,1
+chr7	100697996	.	CTT	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.01037;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:2,5:2,2
+chr7	101002450	.	G	A	0	PASS	DP=291;GPV=1;SPV=0.00231;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:135:118,17:63,7:55,10
+chr7	101098714	.	G	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0033765;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:15,2:9,5
+chr7	101320558	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.018182;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:0,3:0,1:0,2
+chr7	101342021	.	T	TTTC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.21569;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:19,3:5,1:14,2
+chr7	101355066	.	TTTTTC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.011229;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,4:5,5
+chr7	101946544	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.15021;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:8,5:5,4:3,1
+chr7	102060580	.	CATATAT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.042412;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:9,3:6,1
+chr7	102564422	.	C	CAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.13663;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:22,3:5,1
+chr7	102566067	.	G	C	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.036714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:27,10:11,7:16,3
+chr7	102576894	.	G	A	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.03782;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:13,5:12,3
+chr7	102592796	.	G	A	0	PASS	DP=159;GPV=1;SPV=0.00012025;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:79:56,23:27,13:29,10
+chr7	102618555	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=4.7617e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:7,10:7,3
+chr7	105501970	.	ATAT	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:2,2:2,1:0,1
+chr7	106586896	.	A	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=2.3666e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:6,7:3,2
+chr7	107749938	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.029646;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:9,1:10,8
+chr7	108692388	.	A	ATTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.0055944;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:2,6:1,3:1,3
+chr7	108725935	.	A	AGAGAGG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.026316;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,7:4,2:1,5
+chr7	110192628	.	T	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.063158;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:2,2:4,1
+chr7	110315561	.	C	CCT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.020229;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,7:4,5:2,2
+chr7	110963987	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.029051;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,6:4,4:5,2
+chr7	110989531	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037021;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:6,2:0,3
+chr7	115821961	.	A	ATTTT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.004902;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:0,14:0,10:0,4
+chr7	117059807	.	C	CA	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.082707;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:8,4:5,3:3,1
+chr7	119335917	.	GT	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.027438;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:3,4:3,1
+chr7	120081165	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0018031;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:9,6:3,3
+chr7	120828655	.	C	CT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0095459;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,5:1,4:1,1
+chr7	123360172	.	CTGTG	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.027972;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:3,5:3,2:0,3
+chr7	125248961	.	G	GT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.012694;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:5,6:2,1
+chr7	126360474	.	C	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.042184;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:11,2:20,3
+chr7	126595400	.	T	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.001998;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,5:0,3:1,2
+chr7	128188120	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.125;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:4,2:1,1:3,1
+chr7	129963936	.	G	GT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.00068862;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,12:7,10:2,2
+chr7	130782419	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0019985;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,8:3,3:3,5
+chr7	131983250	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.00029663;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:3,5:4,4
+chr7	132020640	.	G	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.019656;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:10,5:5,1
+chr7	132716676	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.001026;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:4,10:3,8:1,2
+chr7	133227300	.	TATA	T	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.35714;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,2:2,1:1,1
+chr7	134371720	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00095953;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,9:8,7:7,2
+chr7	134544731	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0014954;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:6,1:9,5
+chr7	136452552	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.013177;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,5:5,1:1,4
+chr7	139490533	.	CA	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.00098508;SS=2;SSC=30;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:1,8:0,6:1,2
+chr7	139623517	.	CAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.01548;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:4,6:2,3:2,3
+chr7	140583926	.	G	GA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.21839;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,3:10,1
+chr7	141002399	.	C	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14141;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,4:3,1:1,3
+chr7	141604374	.	G	GTATATATATA	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.034325;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:6,6:2,5:4,1
+chr7	142383337	.	T	TTCTATAA	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:4,2:2,2
+chr7	143208151	.	A	AAGTAT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.03311;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:6,3:2,1
+chr7	143540747	.	A	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.010482;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:18,11:4,8:14,3
+chr7	144149689	.	C	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,2:0,1:2,1
+chr7	144244550	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.013378;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:4,4:14,5
+chr7	144285525	.	T	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.01061;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:34,13:20,5:14,8
+chr7	145196271	.	TTTTTCTTTTC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.023384;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:2,5:7,2
+chr7	146856297	.	G	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.024462;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:7,2:3,2
+chr7	147010007	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0032575;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,8:3,7:1,1
+chr7	147317800	.	A	ATATATGTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066185;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,4:4,2:9,2
+chr7	147995532	.	G	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.012694;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:7,7:3,4:4,3
+chr7	147997556	.	CAA	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.01192;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,6:4,5:1,1
+chr7	148737558	.	G	GTA	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.037585;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,9:6,4:11,5
+chr7	150776543	.	C	CAAA	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0053523;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:12,15:6,13:6,2
+chr7	151027375	.	TCTCCCCATGTGATGAAATATGGCCTCGTGGGAAGGGAAAGACCTGACCGTCCC	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.022869;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:10,1:6,5
+chr7	151759722	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=2.5053e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,13:6,5:2,8
+chr7	151874171	.	GATGTATATGTAT	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.023174;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:20,7:9,4:11,3
+chr7	151962609	.	G	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.030888;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:5,3:10,2
+chr7	152307195	.	GAGGAAGGAAGGAAGGAAGGA	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.11779;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,4:12,2:11,2
+chr7	152674740	.	A	AT	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.17128;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,4:10,2:2,2
+chr7	152686129	.	AAT	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.037091;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,2:13,2
+chr7	153182612	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=2.5052e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:16,14:6,3:10,11
+chr7	153217951	.	T	TCACACACACACACACACA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,5:5,4:3,1
+chr7	154436098	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0050968;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,3:8,2
+chr7	155158263	.	A	G	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.023736;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,5:2,1:1,4
+chr7	155946844	.	TTCCTTCTC	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.031056;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:1,2:6,2
+chr7	156265789	.	G	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:2,4:2,1
+chr7	157261307	.	A	G	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.0013986;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:10:1,8:0,4:1,4
+chr7	157827362	.	C	CCACAACACAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0033618;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,10:3,7:4,3
+chr7	158126119	.	A	G	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.14737;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,0:6,2
+chr7	158417950	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.0095694;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:3,3:2,2
+chr8	768418	.	A	AT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.079329;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:10,6:4,4:6,2
+chr8	1130104	.	A	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.059189;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,9:12,4:13,5
+chr8	2591252	.	C	CA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.018203;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:11,7:2,2
+chr8	3035255	.	G	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0011925;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:26,15:13,8:13,7
+chr8	3233859	.	C	G	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0018791;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:10,4:5,4
+chr8	3926079	.	CCATA	C	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.053471;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:11,1:6,3
+chr8	4023753	.	ATTT	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.045792;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:10,3:2,4
+chr8	4974183	.	A	AT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0026204;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:22,15:11,8:11,7
+chr8	5395533	.	T	TTTAC	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.027862;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:20,5:8,1:12,4
+chr8	6223947	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.099033;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,6:9,4:11,2
+chr8	6228677	.	A	AACACACAC	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.024017;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:8,11:6,6:2,5
+chr8	7102233	.	A	AAT	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.01905;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:8,5:8,3
+chr8	7178754	.	AT	A	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.016427;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:15,10:9,8:6,2
+chr8	7208193	.	T	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.051948;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:4,2:10,2
+chr8	7577272	.	C	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.064336;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:16,6:1,1
+chr8	7616393	.	A	G	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.097916;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:14,5:7,3:7,2
+chr8	7774382	.	C	T	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.00071446;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:2,7:2,2:0,5
+chr8	8059318	.	G	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.077195;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:10,1:8,4
+chr8	8140683	.	C	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0038917;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,9:4,7:3,2
+chr8	8161203	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.0083882;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:37,17:20,10:17,7
+chr8	8176793	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
+chr8	8186779	.	C	G	0	PASS	DP=100;GPV=1;SPV=0.018219;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:55:46,9:35,6:11,3
+chr8	8675975	.	CA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.018778;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,7:3,6:2,1
+chr8	9627563	.	G	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.13255;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:12,1:19,3
+chr8	9657272	.	G	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:1,1:5,3
+chr8	11567367	.	GCTCAGTCAATT	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.038024;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:26,4:15,2:11,2
+chr8	12439341	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,2:4,2
+chr8	12504320	.	G	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.029799;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,3:4,2
+chr8	12560699	.	TATAC	T	0	PASS	DP=93;GPV=1;SPV=0.047445;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:43,7:26,3:17,4
+chr8	12560716	.	ATATATACG	A	0	PASS	DP=88;GPV=1;SPV=0.039034;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:39,7:25,2:14,5
+chr8	12739967	.	G	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:20,2:12,2
+chr8	12902624	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034045;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:9,5:2,3
+chr8	14471992	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.00089348;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:31,13:12,3:19,10
+chr8	14507129	.	C	CAAACTGTCTTTTCAATTGATCGGGACAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.16591;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:11,2:13,2
+chr8	15430011	.	G	A	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0037259;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:6,7:8,7
+chr8	16297238	.	G	GTAAGT	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.2164;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:12,2:7,2
+chr8	16961661	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:8,2:2,2
+chr8	17267469	.	G	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.050264;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:28,7:12,3:16,4
+chr8	18018899	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0072464;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,7:3,3:5,4
+chr8	18164474	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0062626;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:31,10:21,3:10,7
+chr8	18562931	.	G	GA	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.12152;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:18,6:9,5:9,1
+chr8	18968867	.	A	C	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024337;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,6:6,3
+chr8	20373742	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.096892;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:16,2:3,2
+chr8	20469842	.	T	C	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.00034218;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:28,11:16,6:12,5
+chr8	20472586	.	CT	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,5:2,3:3,2
+chr8	22648907	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.011282;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:10,6:12,3
+chr8	22815366	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00020424;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:10,4:18,9
+chr8	23346100	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.072845;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:29,5:20,3:9,2
+chr8	24020415	.	CTG	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.052123;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:19,7:10,2:9,5
+chr8	24837126	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.22222;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:3,2:1,1:2,1
+chr8	25410974	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.089245;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:2,2:8,3
+chr8	25410983	.	GCACGCA	G	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.25455;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,4:2,2:3,2
+chr8	26002932	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0055469;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:3,5:7,3
+chr8	26004673	.	CA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047472;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:3,2:1,2
+chr8	26618481	.	GT	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.051469;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:13,4:4,3
+chr8	26680343	.	CTCTT	C	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.07564;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,4:4,1:9,3
+chr8	26968288	.	C	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0023514;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:20,10:7,4:13,6
+chr8	27525370	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0010271;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:21,10:12,5:9,5
+chr8	27865789	.	T	A	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.21429;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,2:2,1:0,1
+chr8	28773463	.	CA	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:4,2:7,6
+chr8	30904446	.	CA	C	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0077494;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:6,6:2,2
+chr8	31452437	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00015011;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:15,7:11,7
+chr8	31903148	.	C	CTTTTT	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,6:6,5:2,1
+chr8	32293718	.	C	CT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.11647;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,3:6,2
+chr8	32861894	.	C	CA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.0055972;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,9:2,8:5,1
+chr8	34653359	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034106;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:11,11:5,6:6,5
+chr8	34981471	.	T	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27277;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:10,2:11,2
+chr8	35423852	.	C	CT	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.030898;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:11,5:10,2
+chr8	35531347	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016624;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:5,8:1,2:4,6
+chr8	36989569	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.062277;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:24,5:13,1:11,4
+chr8	37293591	.	C	CTTT	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01204;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:2,4:5,1
+chr8	37719760	.	AAAAATCATTTTTTATAAAATGATTTAT	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.021554;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:17,5:5,4:12,1
+chr8	38155939	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,6:4,5:1,1
+chr8	38530230	.	C	CA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.20221;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:8,7:7,6:1,1
+chr8	38641551	.	A	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00051874;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:17,4:8,10
+chr8	38883251	.	CA	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.010538;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,10:4,8:3,2
+chr8	38889122	.	ATTTTTTTTT	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.1;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:9:0,2:0,1:0,1
+chr8	38933790	.	A	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.22636;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:13,3:9,1
+chr8	39862529	.	CAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:3,4:6,1
+chr8	40628239	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.00056666;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:21,11:9,4:12,7
+chr8	40885450	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.001656;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,3:9,3
+chr8	41899637	.	TA	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.16912;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:19,4:7,2:12,2
+chr8	43080779	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00011238;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:22,13:19,5:3,8
+chr8	43299102	.	CT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.15773;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:4,1:14,3
+chr8	43561054	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.01309;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:10,2:13,4
+chr8	45928279	.	T	A	0	PASS	DP=251;GPV=1;SPV=0.026298;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:140:123,17:96,13:27,4
+chr8	46948727	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.015934;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:29,14:17,8:12,6
+chr8	49391539	.	A	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.001872;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:33,12:15,7:18,5
+chr8	49706495	.	GT	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.013285;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:9,6:4,3:5,3
+chr8	49918516	.	CAGATAATTTCTTTAGAA	C	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.027273;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:34,5:20,2:14,3
+chr8	50455983	.	T	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0087456;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:14,2:10,5
+chr8	50807212	.	G	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0066036;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:11,6:11,2
+chr8	51171654	.	G	C	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0094722;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:16,6:10,2
+chr8	51887745	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.0065492;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:4,7:3,5:1,2
+chr8	53610444	.	A	ACT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.03602;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:11,6:3,2:8,4
+chr8	55021486	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00016802;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:44:28,16:16,9:12,7
+chr8	55213856	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.088235;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:3,2:3,2
+chr8	55213864	.	T	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.047826;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:9,4:4,2:5,2
+chr8	55730292	.	T	G	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00032942;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:15,6:10,5
+chr8	56106846	.	C	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02531;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:16,13:11,8:5,5
+chr8	56533074	.	T	TCACA	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0047113;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:5,9:2,7:3,2
+chr8	56848939	.	A	C	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0074736;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:5,2:13,4
+chr8	57210828	.	G	C	0	PASS	DP=339;GPV=1;SPV=0.030644;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:205:181,24:126,12:55,12
+chr8	57356054	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=6.2405e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:9,5:14,9
+chr8	57527689	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.27778;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,2:1,1:2,1
+chr8	58261941	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.026944;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:31,5:21,1:10,4
+chr8	59456165	.	G	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.13684;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,1:10,3
+chr8	59473524	.	C	CAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.037926;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:4,10:4,10:0,0
+chr8	59756155	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0019356;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:21,8:9,4:12,4
+chr8	60874150	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00056109;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:12,8:12,3
+chr8	61333479	.	C	T	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=8.1152e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:24,17:9,7:15,10
+chr8	62305584	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0019076;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:9,4:17,5
+chr8	63498774	.	A	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.014722;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:29,10:17,3:12,7
+chr8	63579606	.	G	T	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,5:3,4:6,1
+chr8	63584605	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.0021565;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:37,11:18,5:19,6
+chr8	63783492	.	G	C	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0014004;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:14,5:10,4
+chr8	64504827	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=5.1887e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:5,8:10,3
+chr8	65623892	.	A	G	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.038324;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:11,12:7,8:4,4
+chr8	66304830	.	G	GTC	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.1866;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:11,4:9,3:2,1
+chr8	66357348	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.16794;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,4:13,2:13,2
+chr8	67475816	.	TC	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.033472;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:3,1:12,7
+chr8	68366059	.	C	CA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.11302;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:8,1:13,3
+chr8	68789726	.	A	G	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0017011;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:28,12:17,3:11,9
+chr8	70242309	.	A	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00034156;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:28,15:12,3:16,12
+chr8	71712673	.	T	TTTTTTATATATATATATATATATA	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.034172;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,10:12,2:13,8
+chr8	71908412	.	T	G	0	PASS	DP=85;GPV=1;SPV=5.4865e-06;SS=2;SSC=52;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:12,10:15,5
+chr8	71914084	.	CTTTTTT	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.048379;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:9,6:2,1
+chr8	72851888	.	A	G	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0064207;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:11,8:4,3
+chr8	73465197	.	C	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0084627;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:19,15:9,7:10,8
+chr8	73831632	.	T	G	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0059655;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:6,4:9,1
+chr8	74883479	.	G	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.016974;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:29,7:16,5:13,2
+chr8	75424064	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00022212;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:9,4:10,6
+chr8	75714037	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0012364;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:12,7:10,3
+chr8	75945290	.	T	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0019062;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:28,10:14,3:14,7
+chr8	76691423	.	A	G	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0012499;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:22,12:11,4:11,8
+chr8	78001645	.	G	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.035819;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,5:10,3:4,2
+chr8	79787710	.	C	T	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.16667;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,3:1,2:2,1
+chr8	79860397	.	C	CT	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0057809;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:7,5:11,9
+chr8	82761960	.	T	TACACAC	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.14945;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:10,3:4,1
+chr8	83059537	.	CGTGT	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.027219;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,7:12,6:2,1
+chr8	83710933	.	T	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00095522;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:9,6:17,5
+chr8	84064952	.	GAATTCTGA	G	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0040715;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:26,9:15,5:11,4
+chr8	84563053	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0018707;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:11,4:7,5
+chr8	84951535	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.027005;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,8:6,4:9,4
+chr8	86082779	.	T	TTAAAAAAAAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.058442;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:4,3:10,1
+chr8	87307263	.	T	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.069705;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:34,5:19,2:15,3
+chr8	87323710	.	G	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.027099;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:16,8:6,4:10,4
+chr8	87685190	.	G	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.12627;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,1:15,3
+chr8	87764539	.	C	CCACACACACACACACA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.19203;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:18,3:5,1
+chr8	88226876	.	GTATT	G	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.02975;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:11,7:12,7
+chr8	88495491	.	T	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.058905;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:6,2:10,2
+chr8	89215700	.	AAT	A	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.029412;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:4,4:4,3:0,1
+chr8	90307988	.	T	TAA	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.011343;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:14,10:5,5:9,5
+chr8	92359845	.	G	T	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.053561;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:36,5:21,2:15,3
+chr8	93887123	.	A	AG	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.049428;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,7:3,2:5,5
+chr8	94244272	.	G	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.12905;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:17,4:7,1:10,3
+chr8	94417480	.	TA	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.00751;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:18,14:11,7:7,7
+chr8	95080164	.	T	G	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.049659;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:25,5:16,1:9,4
+chr8	98209445	.	CA	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.070365;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,7:13,6:7,1
+chr8	99639985	.	GTAA	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.091248;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:15,5:11,2:4,3
+chr8	100173752	.	T	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0086598;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:8,4:19,3
+chr8	102265001	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0031867;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:32,10:17,4:15,6
+chr8	102422896	.	A	AATAAT	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0003919;SS=2;SSC=34;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:25,11:14,5:11,6
+chr8	102422898	.	A	T	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.00014199;SS=2;SSC=38;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:12,5:12,7
+chr8	102988780	.	A	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.05251;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:11,2:4,2
+chr8	103757014	.	A	T	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.17677;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,5:4,2:10,3
+chr8	104803651	.	C	CT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.175;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,2:5,2:0,0
+chr8	105877643	.	C	T	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.10294;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:4,1:2,2
+chr8	105877656	.	ATATT	A	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.12384;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,3:4,1:3,2
+chr8	106283108	.	G	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:15,12:5,4:10,8
+chr8	106704393	.	CTTTTTTTTTTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.28571;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:2,2:0,1:2,1
+chr8	106852135	.	T	A	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.27273;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:4,2:3,1:1,1
+chr8	107012898	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0003039;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:8,6:10,4
+chr8	107241914	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.16038;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:32,4:20,3:12,1
+chr8	107342782	.	TACACACACACACAC	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.01623;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:6,9:5,7:1,2
+chr8	107370725	.	G	A	0	PASS	DP=16;GPV=1;SPV=0.23333;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:0,1:6,1
+chr8	107681071	.	TA	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.0029007;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:4,5:6,1
+chr8	109235877	.	C	CT	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.037466;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:8,3:4,4
+chr8	109725620	.	C	T	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.0012739;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:14,8:4,1
+chr8	109940110	.	T	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0053357;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:5,4:11,2
+chr8	110728374	.	T	C	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.25496;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,4:11,2:16,2
+chr8	111871255	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0027922;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:31,11:16,7:15,4
+chr8	113444374	.	G	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.015152;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:0,6:0,2:0,4
+chr8	113761203	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0025244;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:28,9:15,6:13,3
+chr8	114210471	.	CTTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:9,12:5,9:4,3
+chr8	116457834	.	C	T	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=7.4607e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:25,15:17,6:8,9
+chr8	117230448	.	C	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.00054703;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:19,13:10,8:9,5
+chr8	117261582	.	T	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.092375;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:17,3:7,1:10,2
+chr8	118002381	.	C	CAA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.030629;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:10,8:8,7:2,1
+chr8	118039557	.	CAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.01093;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:6,9:4,5:2,4
+chr8	118234710	.	C	CA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.046295;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:14,9:2,8:12,1
+chr8	118366878	.	AAAT	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.0072004;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,9:8,4:5,5
+chr8	119161003	.	C	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.17135;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:10,4:6,1
+chr8	119706719	.	TTCTA	T	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.026393;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,5:5,1:8,4
+chr8	119706737	.	C	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.040541;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:16,5:5,4:11,1
+chr8	119858172	.	C	CAA	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:8,2:3,2
+chr8	121353652	.	CTT	C	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:8,4:5,3:3,1
+chr8	122102608	.	A	AT	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0081097;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:20,13:12,8:8,5
+chr8	122307907	.	T	TCACA	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.019732;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:10,4:8,5
+chr8	122314225	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0087456;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:13,4:11,3
+chr8	124239204	.	A	AAAAAAAAGAAAG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.1226;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,6:4,3:7,3
+chr8	125477576	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.010154;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:12,2:7,8
+chr8	126053788	.	A	G	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00025694;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:12,11:14,5
+chr8	126682726	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.018909;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:21,5:13,2:8,3
+chr8	128717468	.	G	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.070652;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:10,5:7,3:3,2
+chr8	130467443	.	CAAAAAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:3,6:4,1
+chr8	130707431	.	A	T	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=1.8253e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:11,6:12,7
+chr8	130934253	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=4.5866e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,12:12,8:8,4
+chr8	131139943	.	T	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.0035972;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:26,8:12,5:14,3
+chr8	132403016	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20798;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,4:6,3:2,1
+chr8	133214050	.	AGT	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.20321;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:18,3:11,1:7,2
+chr8	133445676	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0020609;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:30,11:15,5:15,6
+chr8	134874840	.	C	CA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.021449;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,12:2,9:5,3
+chr8	135262344	.	G	T	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:2,0:18,4
+chr8	135536234	.	GTT	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:9,5:3,1
+chr8	136313794	.	T	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.034248;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:23,5:12,2:11,3
+chr8	136350316	.	A	AGATGTAATG	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.0066039;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,12:7,5:7,7
+chr8	136723179	.	G	GCACACACACA	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.025058;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:1,6:1,5:0,1
+chr8	137214206	.	GTATATATA	G	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.039683;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:0,4:0,1:0,3
+chr8	138248823	.	C	CAAAAA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.015968;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,8:8,7:4,1
+chr8	138613540	.	C	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=2.4756e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:26,16:12,5:14,11
+chr8	138829403	.	G	GTTTTT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.092308;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,4:3,3:2,1
+chr8	143065758	.	CTT	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.13842;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:21,4:5,3:16,1
+chr8	143405337	.	C	G	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.016594;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:16,6:7,1:9,5
+chr8	143430504	.	C	CCCGGCGGGGGCGGGGGGGCG	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.0056397;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,11:6,5:10,6
+chr8	144913678	.	A	AACACAC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.051826;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:17,6:12,5:5,1
+chr9	545752	.	A	T	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,5:1,4:6,1
+chr9	1573639	.	G	C	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.066411;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,1:7,3
+chr9	3707361	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.0097742;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:25,8:11,6:14,2
+chr9	6790682	.	A	AAG	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.006192;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,6:2,3:3,3
+chr9	6866971	.	TTGTGTG	T	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.038248;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,5:4,3:4,2
+chr9	7029298	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.056718;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:10,4:9,1
+chr9	8353818	.	ATATATGTATATATGT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.045818;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:4,4:13,4
+chr9	8870687	.	A	AACACACAC	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.010195;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:8,10:7,7:1,3
+chr9	9671005	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0048714;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:13,3:13,7
+chr9	9878253	.	A	G	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0003601;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:16,9:11,5
+chr9	10031987	.	T	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=6.3758e-06;SS=2;SSC=51;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:14,23:9,13:5,10
+chr9	11379751	.	C	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.073744;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:13,1:15,3
+chr9	11778177	.	C	CAAAAAAA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.057585;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,7:11,5:7,2
+chr9	12922049	.	A	C	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.00054998;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:26,12:12,4:14,8
+chr9	13345168	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00019093;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:8,8:6,2
+chr9	13668785	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.0047434;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:24,8:10,6:14,2
+chr9	14083479	.	T	TA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024242;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:1,7:0,4:1,3
+chr9	14091075	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.14145;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:34,4:16,2:18,2
+chr9	15406668	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0051722;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:9,5:5,2
+chr9	15774246	.	TAAA	T	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.07913;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,4:4,2:6,2
+chr9	15830968	.	A	AT	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.046518;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:4,5:7,8
+chr9	16779114	.	T	TA	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.1538;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,4:14,1:7,3
+chr9	16935628	.	G	T	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00022074;SS=2;SSC=36;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:13,7:10,6
+chr9	18735753	.	T	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.0083519;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,6:5,3
+chr9	19891171	.	T	A	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.0019011;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:15,3:9,6
+chr9	20599459	.	A	T	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.099099;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:18,4:9,1:9,3
+chr9	23070620	.	C	CAA	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.057736;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:20,7:18,6:2,1
+chr9	25595525	.	CTT	C	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.034438;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:14,8:9,5:5,3
+chr9	26249433	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00080797;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:19,4:6,7
+chr9	26369801	.	C	CA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.024724;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:5,8:5,7:0,1
+chr9	26621231	.	G	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.00052875;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:17,3:7,7
+chr9	26645167	.	TAC	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.050612;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:5,3:7,1
+chr9	27403516	.	ATTT	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024256;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,10:3,4:4,6
+chr9	27444154	.	A	AGAAG	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0012598;SS=2;SSC=28;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:11,13:8,8:3,5
+chr9	27691811	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:10,1:12,3
+chr9	27825162	.	G	T	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0011908;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:12,5:15,7
+chr9	29898309	.	C	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=0.00067124;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:11,7:14,4
+chr9	30518419	.	T	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0044113;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:13,2:10,7
+chr9	31290559	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0014939;SS=2;SSC=28;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:22,10:14,4:8,6
+chr9	32577585	.	G	GT	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.025825;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:16,9:11,7:5,2
+chr9	32769927	.	C	CAGAGAG	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.028986;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:8,12:3,9:5,3
+chr9	33317433	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.01269;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:4,4:11,1
+chr9	34301987	.	ATT	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.20342;SS=2;SSC=6;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,1:5,3
+chr9	34636320	.	A	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:4,2:0,1:4,1
+chr9	36187024	.	CTT	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.12913;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,5:2,4:7,1
+chr9	37258757	.	T	TA	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.14279;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:16,5:15,4:1,1
+chr9	37377794	.	A	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.17677;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,5:7,1:7,4
+chr9	37384136	.	TTTCCTTCC	T	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0047325;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:4,5:7,2
+chr9	37649466	.	C	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=3.8209e-07;SS=2;SSC=64;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:18,19:10,12:8,7
+chr9	37741450	.	G	GAC	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.04257;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:5,6:3,4:2,2
+chr9	38983868	.	C	T	0	PASS	DP=115;GPV=1;SPV=0.042309;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:52,9:18,7:34,2
+chr9	38993833	.	C	T	0	PASS	DP=151;GPV=1;SPV=0.045773;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:89:76,13:23,3:53,10
+chr9	39002559	.	T	G	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.031751;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:78:61,17:30,8:31,9
+chr9	39584576	.	C	CAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.026636;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:6,6:2,4:4,2
+chr9	39586459	.	G	T	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.0060513;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:71,9:55,5:16,4
+chr9	39625941	.	C	T	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.15152;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:22,3:16,2:6,1
+chr9	39776863	.	G	A	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.18814;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:13,4:0,0
+chr9	39818290	.	T	C	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.059274;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:13,3:5,1
+chr9	40716658	.	T	A	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.081606;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:23,2:14,3
+chr9	40971176	.	A	C	0	PASS	DP=233;GPV=1;SPV=0.029454;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:122:104,18:47,8:57,10
+chr9	41000264	.	T	G	0	PASS	DP=175;GPV=1;SPV=0.036965;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:84,17:39,6:45,11
+chr9	41082797	.	C	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.0069784;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:72:63,9:24,6:39,3
+chr9	41158015	.	G	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.037533;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:11,7:7,2:4,5
+chr9	41184026	.	C	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.023196;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:27,7:13,6:14,1
+chr9	41234892	.	C	A	0	PASS	DP=172;GPV=1;SPV=0.00011711;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:101:85,16:17,11:68,5
+chr9	41241909	.	T	C	0	PASS	DP=97;GPV=1;SPV=0.031176;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:65:53,12:24,2:29,10
+chr9	41266616	.	C	T	0	PASS	DP=114;GPV=1;SPV=0.03955;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:47,12:32,9:15,3
+chr9	41294007	.	G	A	0	PASS	DP=158;GPV=1;SPV=0.024194;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:91:75,16:29,5:46,11
+chr9	41474195	.	A	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.025784;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:8,2:10,5
+chr9	41697097	.	C	CA	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.11505;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:31,4:20,1:11,3
+chr9	41803726	.	G	A	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.036397;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,1:14,3
+chr9	42158933	.	CAGACTGGACT	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=7.8055e-05;SS=2;SSC=41;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:25,14:13,9:12,5
+chr9	42164810	.	G	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.15576;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:37,5:16,1:21,4
+chr9	43181108	.	T	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.13544;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:33,4:16,2:17,2
+chr9	43301126	.	A	T	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.014473;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:68:61,7:29,5:32,2
+chr9	43301142	.	ATATT	A	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.013323;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:64:57,7:29,6:28,1
+chr9	43301203	.	TTG	T	0	PASS	DP=134;GPV=1;SPV=0.0090494;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:76:68,8:34,6:34,2
+chr9	44027408	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.19203;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:9,3:14,1
+chr9	44030494	.	G	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.23529;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:0,0:7,2
+chr9	44545523	.	A	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.07478;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:14,4:0,0
+chr9	45308796	.	C	T	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.11304;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:0,0:10,4
+chr9	60568577	.	C	G	0	PASS	DP=101;GPV=1;SPV=0.040799;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:61:52,9:36,4:16,5
+chr9	60575712	.	CA	C	0	PASS	DP=198;GPV=1;SPV=0.033306;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:108:87,15:43,9:44,6
+chr9	60575716	.	G	C	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.047582;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:107:92,15:40,9:52,6
+chr9	61174867	.	G	A	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.11076;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:18,4:8,3:10,1
+chr9	61562987	.	A	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.034805;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:27,8:15,7:12,1
+chr9	61846153	.	G	A	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.1893;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:0,0:15,4
+chr9	61915381	.	T	C	0	PASS	DP=108;GPV=1;SPV=0.046035;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:58:49,9:25,8:24,1
+chr9	62307653	.	A	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:7,4:7,4:0,0
+chr9	62748136	.	G	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.047306;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:24,11:10,7:14,4
+chr9	63039174	.	T	G	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.004644;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:1,3:4,4
+chr9	63759448	.	C	T	0	PASS	DP=224;GPV=1;SPV=0.02963;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:118:103,15:39,6:64,9
+chr9	63825097	.	T	C	0	PASS	DP=412;GPV=1;SPV=0.035766;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:242:216,26:65,5:151,21
+chr9	63885664	.	C	G	0	PASS	DP=170;GPV=1;SPV=0.014958;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:96:86,10:48,5:38,5
+chr9	64082964	.	TTATATATA	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.10784;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,4:7,2:0,2
+chr9	64109795	.	C	CAATT	0	PASS	DP=89;GPV=1;SPV=0.0015933;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:51:34,16:16,8:18,8
+chr9	64446417	.	A	G	0	PASS	DP=99;GPV=1;SPV=0.015578;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:56:49,7:29,3:20,4
+chr9	64469826	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,4:2,2:5,2
+chr9	64722888	.	T	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.15415;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:11,4:0,0
+chr9	65061096	.	C	T	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.07699;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:2,1:13,4
+chr9	65377823	.	G	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.012829;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:15,5:2,2
+chr9	65514830	.	T	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.03355;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:41,8:24,6:17,2
+chr9	65551509	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.023216;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:10,7:18,6
+chr9	65554563	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.025087;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:14,1:9,7
+chr9	65650975	.	C	T	0	PASS	DP=148;GPV=1;SPV=0.038338;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:84:66,18:30,16:36,2
+chr9	65770295	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.15715;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:35,5:9,1:26,4
+chr9	66160564	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.011804;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:27,12:14,7:13,5
+chr9	66261718	.	C	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.016158;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:26,7:19,6:7,1
+chr9	66369884	.	A	G	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.028693;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:13,7:10,1
+chr9	67085333	.	AATTT	A	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.064151;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:19,6:13,2:6,4
+chr9	67630851	.	A	G	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.20137;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:15,2:15,2
+chr9	67787558	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.038355;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:25,11:1,1:24,10
+chr9	67798387	.	C	A	0	PASS	DP=194;GPV=1;SPV=0.020786;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:109:86,23:33,10:53,13
+chr9	67832491	.	A	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.011315;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:18,9:8,2:10,7
+chr9	67881117	.	T	A	0	PASS	DP=140;GPV=1;SPV=0.0052956;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:80:71,9:40,8:31,1
+chr9	68287357	.	G	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.006964;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:13,5:8,4
+chr9	69696380	.	A	T	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.018392;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:23,6:12,5:11,1
+chr9	72132286	.	A	C	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0026089;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:24,9:11,4:13,5
+chr9	74125462	.	G	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.00044867;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:18,10:9,4:9,6
+chr9	74319090	.	G	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=0.0032501;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,3:9,3
+chr9	74361818	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=4.9557e-05;SS=2;SSC=43;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:18,5:5,9
+chr9	77048262	.	C	T	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=8.3349e-07;SS=2;SSC=60;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:14,15:6,7:8,8
+chr9	79695351	.	T	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.028109;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,8:9,5:13,3
+chr9	80580189	.	C	G	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00011357;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:24,13:13,7:11,6
+chr9	81013339	.	G	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00064075;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:26,10:12,8:14,2
+chr9	83008891	.	C	CTCATATATATAT	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.14706;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:7,3:5,2:2,1
+chr9	83479785	.	G	A	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.035088;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:6,4:6,4:0,0
+chr9	85700487	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.031142;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:15,1:15,4
+chr9	86510989	.	T	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.00071247;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:18,12:8,8:10,4
+chr9	87239049	.	G	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0028443;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:28,8:10,3:18,5
+chr9	87518485	.	T	C	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.034541;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:22,17:8,11:14,6
+chr9	88112566	.	T	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.1733;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:23,4:8,1:15,3
+chr9	89979293	.	G	GT	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.035742;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,8:13,6:4,2
+chr9	90429584	.	C	A	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.064526;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:17,2:10,2
+chr9	90526339	.	A	G	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.094934;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,2:8,2
+chr9	93023795	.	CTTT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.026248;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:8,7:5,4:3,3
+chr9	93074431	.	CAAAA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.043344;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:5,5:4,4:1,1
+chr9	96727745	.	A	AT	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.094203;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:6,3:4,1
+chr9	99841231	.	G	GA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.008316;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:13,6:8,5:5,1
+chr9	101181127	.	A	ATG	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.16725;SS=2;SSC=7;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:10,4:6,3:4,1
+chr9	102099034	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.00046907;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:24,12:13,7:11,5
+chr9	102208043	.	C	G	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.00035208;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:23,14:14,8:9,6
+chr9	103543037	.	A	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.0033765;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:9,3:15,4
+chr9	104528724	.	C	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.00088456;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:20,11:13,5:7,6
+chr9	104944790	.	A	G	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.14286;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:1,2:1,2:0,0
+chr9	105162046	.	G	A	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017149;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:6,10:3,6:3,4
+chr9	105654873	.	CTG	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.0024274;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:8,12:6,9:2,3
+chr9	108743292	.	ATATG	A	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.034547;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:14,7:8,6:6,1
+chr9	110433364	.	CAA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.024887;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:4,7:3,4:1,3
+chr9	111499821	.	CA	C	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.006192;SS=2;SSC=22;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,6:3,5:2,1
+chr9	112515042	.	G	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.1184;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:16,4:15,4:1,0
+chr9	113061748	.	C	T	0	PASS	DP=206;GPV=1;SPV=0.033714;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:124:99,25:32,14:67,11
+chr9	113257478	.	AT	A	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.013999;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:7,7:5,4:2,3
+chr9	114660862	.	C	CT	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.028284;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:7,7:1,3:6,4
+chr9	115271886	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.004902;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:2,12:0,7:2,5
+chr9	116998569	.	CCATA	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.13598;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:30,4:13,1:17,3
+chr9	117043907	.	C	CAAAA	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0043505;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:4,5:5,2
+chr9	117067055	.	G	C	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.11013;SS=2;SSC=9;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:12,1:10,3
+chr9	117585579	.	T	C	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0039611;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:20,20:9,11:11,9
+chr9	117975199	.	T	A	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0066857;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,5:11,2
+chr9	119366504	.	G	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.022876;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:4,10:2,5:2,5
+chr9	119800001	.	C	T	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.26471;SS=2;SSC=5;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:3,1:4,1
+chr9	120020055	.	T	A	0	PASS	DP=75;GPV=1;SPV=0.07519;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:36,4:17,1:19,3
+chr9	121544139	.	CATAT	C	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.02381;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:22:0,5:0,2:0,3
+chr9	121858266	.	G	C	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.013337;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:26,6:17,3:9,3
+chr9	122727039	.	CT	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.010718;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:3,7:2,2
+chr9	126511387	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.04741;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:13,8:8,7:5,1
+chr9	127021497	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=1.904e-05;SS=2;SSC=47;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:7,16:3,13:4,3
+chr9	127471472	.	T	TA	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.023537;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,5:2,4:5,1
+chr9	127713496	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.097744;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,4:5,2:4,2
+chr9	128083513	.	C	CTTTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.034783;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,6:3,3:7,3
+chr9	130409638	.	G	T	0	PASS	DP=74;GPV=1;SPV=0.0025617;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:29,8:16,4:13,4
+chr9	132105907	.	G	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.0099286;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:14,5:17,4
+chr9	132188636	.	T	C	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=3.9192e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:18,8:18,6
+chr9	132832063	.	GA	G	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.066957;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:10,4:9,4:1,0
+chr9	134098711	.	T	A	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=1.8301e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:27,15:13,9:14,6
+chr9	134948374	.	T	G	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0011495;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:12,7:15,6
+chr9	136131338	.	C	CGGG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.045455;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:2,4:2,4:0,0
+chr9	136150424	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.18039;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:5,1:15,3
+chr9	136725211	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.03183;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,6:6,3
+chr9	136889990	.	TGA	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=5.7121e-05;SS=2;SSC=42;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:8,16:3,7:5,9
+chr9	138129089	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.12919;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:20,4:10,3:10,1
+chr9	138144598	.	A	G	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.14387;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:10,1:2,3
+chr9	138214206	.	T	C	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.018754;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:34,7:17,1:17,6
+chr9	138237340	.	AG	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.076023;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,5:8,4:1,1
+chrX	2904903	.	CT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.0070433;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:5,9:4,8:1,1
+chrX	3534618	.	C	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=2.1749e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:14,10:5,5:9,5
+chrX	3653799	.	A	T	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.074074;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:6,2:3,1:3,1
+chrX	3740839	.	A	AAAAAG	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.097902;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:4,4:4,3:0,1
+chrX	6584770	.	C	T	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040303;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:6,1:6,4
+chrX	8498537	.	T	C	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.031621;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:5,2:0,1
+chrX	8594688	.	A	G	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.0017181;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:12:2,10:1,7:1,3
+chrX	8594703	.	TATATATACAC	T	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.004156;SS=2;SSC=23;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:4,9:3,6:1,3
+chrX	9404939	.	C	G	0	PASS	DP=116;GPV=1;SPV=0.044225;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:37,9:16,6:21,3
+chrX	9405966	.	G	A	0	PASS	DP=340;GPV=1;SPV=0.0049026;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:160:141,19:76,7:65,12
+chrX	9410334	.	T	C	0	PASS	DP=128;GPV=1;SPV=0.035719;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:71:63,8:21,1:42,7
+chrX	9411980	.	C	A	0	PASS	DP=281;GPV=1;SPV=0.0018742;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:123:107,16:49,8:58,8
+chrX	9973248	.	C	G	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=3.4015e-06;SS=2;SSC=54;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:19,14:8,4:11,10
+chrX	10648510	.	G	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0017074;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:15,7:9,3:6,4
+chrX	11411183	.	T	A	0	PASS	DP=17;GPV=1;SPV=0.17857;SS=2;SSC=7;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:2,3:0,0:2,3
+chrX	11412688	.	C	A	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=2.2035e-06;SS=2;SSC=56;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:9,11:5,5:4,6
+chrX	11679886	.	TTTTCTTTC	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.038233;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,3:5,4
+chrX	13600283	.	T	C	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.21053;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:7,2:6,1:1,1
+chrX	15059829	.	G	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.00017781;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,9:4,5:5,4
+chrX	15398102	.	T	TG	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.00018275;SS=2;SSC=37;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,9:1,8:2,1
+chrX	15746022	.	CT	C	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.0091688;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:3,8:2,6:1,2
+chrX	16231503	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.073684;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:6,3:3,2:3,1
+chrX	16355097	.	T	C	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040959;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:16:1,3:1,2:0,1
+chrX	21945634	.	T	TCC	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.011438;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:0,0:3,4
+chrX	22375511	.	T	TGAGAGAGA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.014934;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:9,7:5,3:4,4
+chrX	22899014	.	ATG	A	0	PASS	DP=42;GPV=1;SPV=0.020407;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:7,3:5,3
+chrX	23377575	.	GGTGT	G	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037596;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:10,7:6,3:4,4
+chrX	23500147	.	T	TTTTTATTTTATTTTA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.033054;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,8:1,5:8,3
+chrX	24617371	.	G	GT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.0064996;SS=2;SSC=21;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,9:1,7:3,2
+chrX	24660678	.	C	CA	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.0098951;SS=2;SSC=20;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:7,7:2,4:5,3
+chrX	25828071	.	A	T	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.016117;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:7,4:4,1:3,3
+chrX	25998490	.	G	GCACACACACACACACACACA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.0011899;SS=2;SSC=29;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:5,8:3,7:2,1
+chrX	26326024	.	ATGTTTGTT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.013215;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:5,5:7,4
+chrX	27975047	.	TAC	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00041615;SS=2;SSC=33;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:12,16:4,10:8,6
+chrX	28969902	.	AAC	A	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.011818;SS=2;SSC=19;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,7:4,4:8,3
+chrX	28981090	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=21;GPV=1;SPV=0.047386;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:3,4:2,3:1,1
+chrX	30638324	.	T	A	0	PASS	DP=46;GPV=1;SPV=0.0021778;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:5,8:1,2:4,6
+chrX	32975346	.	C	CT	0	PASS	DP=19;GPV=1;SPV=0.049536;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,5:3,4:1,1
+chrX	34423647	.	C	A	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.06993;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:3,3:2,2:1,1
+chrX	36949507	.	C	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.00061448;SS=2;SSC=32;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:3,2:6,4
+chrX	38917230	.	A	T	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=1.9105e-05;SS=2;SSC=47;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:19,18:12,8:7,10
+chrX	40914902	.	A	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.00070944;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:3,7:2,2:1,5
+chrX	41272377	.	G	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.065801;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:15,4:4,1:11,3
+chrX	41290837	.	CAA	C	0	PASS	DP=18;GPV=1;SPV=0.022967;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:10:3,7:2,5:1,2
+chrX	42871500	.	C	CGTGT	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.042556;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,5:5,2
+chrX	42891118	.	T	C	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.040008;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:16,9:7,4:9,5
+chrX	42894141	.	A	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:6,5:5,3
+chrX	42972776	.	T	TAGAAAAACAAGATCCGAGAAG	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.046756;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:23,9:11,4:12,5
+chrX	44594077	.	C	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.2381;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:3,3:1,2:2,1
+chrX	44803555	.	G	C	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.036129;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:6,10:8,3
+chrX	44963440	.	A	AGT	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.15083;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:24,4:7,3:17,1
+chrX	47579180	.	G	A	0	PASS	DP=65;GPV=1;SPV=8.8092e-05;SS=2;SSC=40;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:21,12:13,6:8,6
+chrX	48529848	.	C	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=6.1566e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:19,17:12,7:7,10
+chrX	49346058	.	T	A	0	PASS	DP=486;GPV=1;SPV=0.03642;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:278:234,43:118,26:116,17
+chrX	49619948	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.043835;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:22,4:8,2:14,2
+chrX	49619950	.	A	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.048259;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:12,2:12,2
+chrX	51421220	.	C	A	0	PASS	DP=64;GPV=1;SPV=0.00025408;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:12,3:11,9
+chrX	52419147	.	C	G	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=0.00075376;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:50:36,14:16,7:20,7
+chrX	53023677	.	AT	A	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.02002;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:4,4:8,5
+chrX	54226092	.	AC	A	0	PASS	DP=32;GPV=1;SPV=0.00077284;SS=2;SSC=31;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:6,13:4,11:2,2
+chrX	54270399	.	CT	C	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029934;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:12,5:6,1
+chrX	54685643	.	T	TTC	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.040404;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:13,4:4,2:9,2
+chrX	54923568	.	G	C	0	PASS	DP=79;GPV=1;SPV=2.6553e-05;SS=2;SSC=45;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:30,18:11,9:19,9
+chrX	55564766	.	T	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0071969;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:28,13:14,6:14,7
+chrX	56915260	.	CAAAAAAAAAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.029748;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:8,6:4,5:4,1
+chrX	57744654	.	G	T	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=1.048e-05;SS=2;SSC=49;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:16,3:7,10
+chrX	60240358	.	T	C	0	PASS	DP=69;GPV=1;SPV=0.0091975;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:26,6:6,2
+chrX	61341951	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.046535;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:49:43,6:2,1:41,5
+chrX	62741422	.	T	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0035775;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:13,3:9,4
+chrX	64611760	.	A	G	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00017112;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:39:26,13:14,6:12,7
+chrX	64699661	.	G	T	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.0011798;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:23,12:15,6:8,6
+chrX	64793574	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.002842;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:35,12:18,5:17,7
+chrX	65450670	.	C	CAT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.037185;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:9,6:6,2:3,4
+chrX	65810417	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.0055487;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:11,3:20,6
+chrX	66218774	.	C	T	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00016675;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:19,21:8,6:11,15
+chrX	66303397	.	A	C	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.054139;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:32,8:10,2:22,6
+chrX	66472390	.	C	G	0	PASS	DP=81;GPV=1;SPV=0.0021701;SS=2;SSC=26;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:46:36,10:16,5:20,5
+chrX	67150890	.	A	G	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0083333;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	1/1:.:17:0,3:0,2:0,1
+chrX	67150912	.	A	G	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.49123;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:13,4:9,1:4,3
+chrX	67419912	.	G	C	0	PASS	DP=73;GPV=1;SPV=0.00064966;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:29,11:12,3:17,8
+chrX	67992259	.	CAAAAAAAA	C	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.017544;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,8:5,7:2,1
+chrX	73061472	.	T	A	0	PASS	DP=78;GPV=1;SPV=0.000163;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:31,14:17,5:14,9
+chrX	73361697	.	C	CT	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.013595;SS=2;SSC=18;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:5,7:5,5:0,2
+chrX	74744950	.	T	TC	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.076628;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:12,4:5,2:7,2
+chrX	76790727	.	C	CAAAAAA	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.056522;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:9,4:9,4:0,0
+chrX	78979489	.	T	G	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.027364;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:33:27,6:13,3:14,3
+chrX	79578104	.	G	A	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.066077;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:22,5:14,4:8,1
+chrX	79748440	.	G	A	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00010913;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:18,13:9,7:9,6
+chrX	80039055	.	C	G	0	PASS	DP=62;GPV=1;SPV=0.00027813;SS=2;SSC=35;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:7,3:16,10
+chrX	81140559	.	CA	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.11424;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,6:10,5:5,1
+chrX	81773446	.	A	T	0	PASS	DP=53;GPV=1;SPV=6.6326e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:6,7:6,2
+chrX	82101828	.	G	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.002634;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:23,9:11,3:12,6
+chrX	83560970	.	C	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.048309;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:9,7:2,3:7,4
+chrX	85615846	.	A	C	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.014806;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:27,9:14,2:13,7
+chrX	86368530	.	G	A	0	PASS	DP=63;GPV=1;SPV=0.0008518;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:14,4:8,5
+chrX	86753077	.	T	C	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.14178;SS=2;SSC=8;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:18,5:10,2:8,3
+chrX	87738329	.	AT	A	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.030075;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:12:7,5:3,4:4,1
+chrX	87741877	.	T	A	0	PASS	DP=72;GPV=1;SPV=0.0040858;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:38:30,8:13,5:17,3
+chrX	88399377	.	A	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.00040909;SS=2;SSC=33;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:22,9:13,5:9,4
+chrX	88501121	.	CA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.068111;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:7,7:3,6:4,1
+chrX	88632183	.	A	G	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.000837;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:19,10:13,3:6,7
+chrX	88674609	.	A	T	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.00016223;SS=2;SSC=37;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:5,7:10,4
+chrX	89407083	.	G	C	0	PASS	DP=49;GPV=1;SPV=0.005596;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:18,7:9,3:9,4
+chrX	89426842	.	A	ATAT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.066667;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:11,4:5,3:6,1
+chrX	89426855	.	AT	A	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.041126;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,5:8,4:7,1
+chrX	89504923	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016081;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:10,4:11,3
+chrX	89755313	.	C	T	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.00012155;SS=2;SSC=39;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,11:0,4:8,7
+chrX	89783722	.	G	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=6.0385e-05;SS=2;SSC=42;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:7,12:2,5:5,7
+chrX	89965420	.	A	T	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.020544;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:12,9:8,3:4,6
+chrX	89965421	.	T	C	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.049571;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:11,8:7,3:4,5
+chrX	90351880	.	G	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.016081;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:21,7:5,3:16,4
+chrX	90950728	.	G	A	0	PASS	DP=80;GPV=1;SPV=0.013018;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:40,8:19,5:21,3
+chrX	93311798	.	TA	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.038462;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:9:4,4:3,2:1,2
+chrX	93452164	.	G	GTA	0	PASS	DP=33;GPV=1;SPV=0.024751;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:12,7:7,3:5,4
+chrX	94925670	.	GAA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.018634;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,5:6,4:1,1
+chrX	96018623	.	C	CA	0	PASS	DP=60;GPV=1;SPV=0.0019356;SS=2;SSC=27;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,8:12,6:9,2
+chrX	96980998	.	C	CAAA	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.1088;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:21:15,5:11,4:4,1
+chrX	97145325	.	G	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.037203;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:5,2:9,2
+chrX	97161051	.	G	GT	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.0033;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:8,9:3,5:5,4
+chrX	99836512	.	G	A	0	PASS	DP=55;GPV=1;SPV=0.0015923;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:36:23,13:16,3:7,10
+chrX	100321805	.	TC	T	0	PASS	DP=38;GPV=1;SPV=0.044851;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:19:8,8:4,2:4,6
+chrX	101405236	.	C	CA	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.025362;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:15,7:10,5:5,2
+chrX	102420569	.	T	C	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.013211;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:24,10:14,4:10,6
+chrX	102824103	.	C	CTT	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.088889;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:12,4:4,3:8,1
+chrX	107038536	.	G	GAA	0	PASS	DP=30;GPV=1;SPV=0.30409;SS=2;SSC=5;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:12,4:7,3:5,1
+chrX	108444223	.	CT	C	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.017848;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:8,8:5,4:3,4
+chrX	108775705	.	ACAT	A	0	PASS	DP=43;GPV=1;SPV=0.022078;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:8,4:10,2
+chrX	109041056	.	T	TATA	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=0.13283;SS=2;SSC=8;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:32:28,4:16,3:12,1
+chrX	109057693	.	T	G	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.018356;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:13,7:8,3:5,4
+chrX	110689536	.	C	A	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.24893;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:24,4:18,2:6,2
+chrX	110689544	.	C	A	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.083717;SS=2;SSC=10;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:15,3:7,4
+chrX	111820197	.	C	T	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.036325;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:35:30,5:16,2:14,3
+chrX	113914381	.	TGGGGCCTCCA	T	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0020037;SS=2;SSC=26;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:48:34,14:16,9:18,5
+chrX	115698647	.	G	A	0	PASS	DP=23;GPV=1;SPV=0.016999;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,6:1,5:6,1
+chrX	115885482	.	C	T	0	PASS	DP=20;GPV=1;SPV=0.049123;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:8:5,3:0,0:5,3
+chrX	116116510	.	A	G	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.024328;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:10,6:6,2:4,4
+chrX	116284047	.	A	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034965;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:3,4:1,1:2,3
+chrX	117233726	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.04058;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:26,5:16,3:10,2
+chrX	117472419	.	CAA	C	0	PASS	DP=26;GPV=1;SPV=0.080632;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:12,6:5,3:7,3
+chrX	118626065	.	C	CT	0	PASS	DP=34;GPV=1;SPV=0.05132;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:7,3:6,1
+chrX	119823558	.	C	T	0	PASS	DP=22;GPV=1;SPV=0.41667;SS=2;SSC=3;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:14:4,2:4,1:0,1
+chrX	120582061	.	GAA	G	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.034533;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:5,5:3,4:2,1
+chrX	120694831	.	TTCTCTTTC	T	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.097251;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:14,4:4,2:10,2
+chrX	122374580	.	C	G	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.0028662;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:7,3:10,5
+chrX	122743892	.	CTT	C	0	PASS	DP=25;GPV=1;SPV=0.055138;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:13:7,4:5,3:2,1
+chrX	123306392	.	A	T	0	PASS	DP=56;GPV=1;SPV=0.00091169;SS=2;SSC=30;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:19,9:10,3:9,6
+chrX	124028985	.	TTA	T	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.029938;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:17,11:9,7:8,4
+chrX	124028993	.	A	T	0	PASS	DP=39;GPV=1;SPV=0.028152;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:15,11:4,6:11,5
+chrX	124179087	.	T	TACACACACACACACACACACACACACACACAC	0	PASS	DP=36;GPV=1;SPV=0.089257;SS=2;SSC=10;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:18,5:8,3:10,2
+chrX	125697474	.	C	T	0	PASS	DP=67;GPV=1;SPV=0.0063951;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:31,9:23,4:8,5
+chrX	126030636	.	C	A	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0038133;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:27,13:11,2:16,11
+chrX	126477462	.	C	A	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=7.6729e-05;SS=2;SSC=41;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:17,11:11,5:6,6
+chrX	126605126	.	C	G	0	PASS	DP=47;GPV=1;SPV=0.0049682;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:18,8:5,5:13,3
+chrX	127192185	.	C	CA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.047124;SS=2;SSC=13;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:20:15,4:10,2:5,2
+chrX	127533529	.	T	TAAAA	0	PASS	DP=29;GPV=1;SPV=0.10021;SS=2;SSC=9;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:13,4:8,2:5,2
+chrX	128447366	.	T	A	0	PASS	DP=52;GPV=1;SPV=2.2678e-05;SS=2;SSC=46;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:14,14:8,9:6,5
+chrX	129058522	.	T	C	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.00068429;SS=2;SSC=31;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:34:23,11:10,9:13,2
+chrX	129368973	.	G	C	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.0047009;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:11:6,5:2,2:4,3
+chrX	129606990	.	A	AGAAG	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.074336;SS=2;SSC=11;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:22,5:12,3:10,2
+chrX	131500587	.	G	GAAAAGA	0	PASS	DP=27;GPV=1;SPV=0.32967;SS=2;SSC=4;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:16:7,3:4,2:3,1
+chrX	131861544	.	G	A	0	PASS	DP=70;GPV=1;SPV=0.00039513;SS=2;SSC=34;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:37:26,11:15,3:11,8
+chrX	134571038	.	T	TA	0	PASS	DP=54;GPV=1;SPV=0.0029872;SS=2;SSC=25;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:28:20,8:11,4:9,4
+chrX	135523978	.	T	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0019773;SS=2;SSC=27;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:24,7:10,3:14,4
+chrX	136904766	.	T	TA	0	PASS	DP=40;GPV=1;SPV=0.017286;SS=2;SSC=17;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:14,13:7,4:7,9
+chrX	138341932	.	T	A	0	PASS	DP=24;GPV=1;SPV=0.011374;SS=2;SSC=19;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:5,10:1,3:4,7
+chrX	139082520	.	G	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.0035775;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:29:22,7:9,5:13,2
+chrX	141695017	.	A	G	0	PASS	DP=66;GPV=1;SPV=0.025802;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:23,8:12,3:11,5
+chrX	141790862	.	A	G	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.036947;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:27:21,6:7,1:14,5
+chrX	142118797	.	A	AAAAG	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.033189;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:26:17,9:8,5:9,4
+chrX	142298163	.	C	A	0	PASS	DP=76;GPV=1;SPV=3.3767e-05;SS=2;SSC=44;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:26,14:18,7:8,7
+chrX	143689782	.	A	ATTACCAGTTAGATAACCAAACT	0	PASS	DP=58;GPV=1;SPV=0.0034744;SS=2;SSC=24;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:41:27,14:12,6:15,8
+chrX	143689783	.	C	G	0	PASS	DP=59;GPV=1;SPV=0.024998;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:42:28,14:13,6:15,8
+chrX	144486319	.	G	A	0	PASS	DP=57;GPV=1;SPV=0.019629;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:40:30,10:12,3:18,7
+chrX	144516420	.	G	A	0	PASS	DP=71;GPV=1;SPV=0.0011981;SS=2;SSC=29;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:43:31,12:15,7:16,5
+chrX	144668547	.	TATGC	T	0	PASS	DP=37;GPV=1;SPV=0.020668;SS=2;SSC=16;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:15:11,4:3,3:8,1
+chrX	145443745	.	C	A	0	PASS	DP=51;GPV=1;SPV=0.0074736;SS=2;SSC=21;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:9,3:9,3
+chrX	145550923	.	C	A	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.0057104;SS=2;SSC=22;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:30:21,9:11,5:10,4
+chrX	145601392	.	C	T	0	PASS	DP=41;GPV=1;SPV=0.029934;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:18,6:14,5:4,1
+chrX	147036928	.	C	CT	0	PASS	DP=31;GPV=1;SPV=0.037648;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:18:9,7:6,6:3,1
+chrX	148704244	.	TTA	T	0	PASS	DP=48;GPV=1;SPV=0.031028;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:20,5:12,4:8,1
+chrX	149424245	.	GCCCAGTAGCCCTACTGGGTGGCTAGA	G	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.031869;SS=2;SSC=14;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:25:17,8:11,2:6,6
+chrX	150327631	.	AAAG	A	0	PASS	DP=61;GPV=1;SPV=0.060295;SS=2;SSC=12;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:31:27,4:13,1:14,3
+chrX	151806088	.	A	ATGTG	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.031556;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:23:9,8:4,5:5,3
+chrX	154088031	.	C	T	0	PASS	DP=50;GPV=1;SPV=0.003465;SS=2;SSC=24;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:17,7:9,4:8,3
+chrX	154941879	.	A	G	0	PASS	DP=45;GPV=1;SPV=0.0091605;SS=2;SSC=20;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:22:16,6:7,2:9,4
+chrX	155470241	.	T	TATAA	0	PASS	DP=96;GPV=1;SPV=0.025403;SS=2;SSC=15;INDEL;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:54:39,15:23,11:16,4
+chrY	11184593	.	C	A	0	PASS	DP=35;GPV=1;SPV=0.20294;SS=2;SSC=6;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:20,4:12,1:8,3
+chrY	11185093	.	T	G	0	PASS	DP=28;GPV=1;SPV=0.062963;SS=2;SSC=12;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:17:12,5:4,3:8,2
+chrY	11188522	.	A	T	0	PASS	DP=44;GPV=1;SPV=0.039138;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:24:19,5:9,3:10,2
+chrY	11221710	.	C	T	0	PASS	DP=68;GPV=1;SPV=0.074416;SS=2;SSC=11;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:45:39,6:14,3:25,3
+chrY	11239989	.	G	A	0	PASS	DP=167;GPV=1;SPV=0.043031;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:88:71,17:54,13:17,4
+chrY	11247437	.	T	C	0	PASS	DP=122;GPV=1;SPV=0.024624;SS=2;SSC=16;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:59:52,7:30,4:22,3
+chrY	11267878	.	G	T	0	PASS	DP=83;GPV=1;SPV=0.0041457;SS=2;SSC=23;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:47:38,9:13,5:25,4
+chrY	11280293	.	A	T	0	PASS	DP=400;GPV=1;SPV=0.015554;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:218:179,39:80,23:99,16
+chrY	56834173	.	C	T	0	PASS	DP=160;GPV=1;SPV=0.043963;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:83:71,12:29,4:42,8
+chrY	56851994	.	G	A	0	PASS	DP=275;GPV=1;SPV=0.043257;SS=2;SSC=13;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:157:130,27:71,10:59,17
+chrY	56853118	.	A	C	0	PASS	DP=271;GPV=1;SPV=0.013381;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:153:118,28:61,12:57,16
+chrY	56864412	.	C	A	0	PASS	DP=533;GPV=1;SPV=0.017044;SS=2;SSC=17;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:293:258,35:134,19:124,16
+chrY	56870747	.	A	G	0	PASS	DP=258;GPV=1;SPV=0.03366;SS=2;SSC=14;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:151:133,18:72,11:61,7
+chrY	56875350	.	A	C	0	PASS	DP=581;GPV=1;SPV=0.025519;SS=2;SSC=15;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:292:257,35:131,16:126,19
+chrY	56875498	.	C	T	0	PASS	DP=426;GPV=1;SPV=0.0029475;SS=2;SSC=25;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:232:201,31:107,12:94,19
+chrY	56875990	.	G	C	0	PASS	DP=420;GPV=1;SPV=0.01275;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:219:191,28:88,15:103,13
+chrY	56886877	.	C	T	0	PASS	DP=138;GPV=1;SPV=0.014715;SS=2;SSC=18;SOMATIC	GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR	0/1:.:73:62,11:26,6:36,5
Binary file test-data/cosmic_output1.pdf has changed
Binary file test-data/denovo_output1.pdf has changed
--- a/test-data/levels.tab	Sun Sep 13 22:27:03 2020 +0000
+++ /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
@@ -1,3 +0,0 @@
-EGF037F.vcf	AAA
-EGF089.vcf	BBB
-EGF167.vcf	CCC
Binary file test-data/output.pdf has changed
Binary file test-data/spectrum_output1.pdf has changed