Mercurial > repos > artbio > rsem
diff test-data/de_isoform_abundances.tab @ 4:1823c8e07d96 draft
planemo upload for repository https://github.com/artbio/tools-artbio/tree/master/tools/rsem commit a3df058f7bb29ae3d42b85d6e911b68679150c9f
| author | artbio |
|---|---|
| date | Fri, 01 Jun 2018 03:00:34 -0400 |
| parents | |
| children |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/de_isoform_abundances.tab Fri Jun 01 03:00:34 2018 -0400 @@ -0,0 +1,118 @@ +transcript_id gene_id length effective_length expected_count TPM FPKM IsoPct +ENST00000332831 ENSG00000185097 995 783.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000335137 ENSG00000186092 918 706.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000416718 ENSG00000198744 547 335.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000410691 ENSG00000222623 104 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000411249 ENSG00000223181 104 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000452176 ENSG00000223659 802 590.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000450305 ENSG00000223972 632 420.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000456328 ENSG00000223972 1657 1445.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000515242 ENSG00000223972 1653 1441.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000518655 ENSG00000223972 1483 1271.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000445840 ENSG00000224813 180 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000506640 ENSG00000224956 1236 1024.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000457540 ENSG00000225630 1044 832.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000416931 ENSG00000225972 372 160.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000423562 ENSG00000227232 1669 1457.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000438504 ENSG00000227232 1783 1571.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000488147 ENSG00000227232 1351 1139.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000538476 ENSG00000227232 1583 1371.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000541675 ENSG00000227232 1416 1204.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000428504 ENSG00000228327 1317 1105.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000335577 ENSG00000228463 510 298.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000424587 ENSG00000228463 2257 2045.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000442116 ENSG00000228463 1292 1080.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000448958 ENSG00000228463 1925 1713.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000427426 ENSG00000229344 682 470.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000440782 ENSG00000229376 2455 2243.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000422528 ENSG00000229905 456 244.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000414688 ENSG00000230021 750 538.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000419394 ENSG00000230021 480 268.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000440200 ENSG00000230021 413 201.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000441245 ENSG00000230021 629 417.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000447954 ENSG00000230021 336 124.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000448605 ENSG00000230021 370 158.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000447500 ENSG00000230092 523 311.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000590817 ENSG00000230092 523 311.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000417636 ENSG00000231709 842 630.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000432723 ENSG00000233653 2477 2265.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000442987 ENSG00000233750 3812 3600.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000423796 ENSG00000235146 607 395.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000450696 ENSG00000235146 402 190.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000426406 ENSG00000235249 995 783.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000416385 ENSG00000235373 4860 4648.00 1.00 500000.00 107573.15 100.00 +ENST00000412666 ENSG00000236601 426 214.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000450983 ENSG00000236601 607 395.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000458203 ENSG00000236679 385 173.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000441866 ENSG00000236743 676 464.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000419160 ENSG00000237094 607 395.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000423728 ENSG00000237094 573 361.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000425496 ENSG00000237094 2661 2449.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000431321 ENSG00000237094 406 194.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000431812 ENSG00000237094 336 124.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000432964 ENSG00000237094 575 363.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000440038 ENSG00000237094 746 534.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000440163 ENSG00000237094 462 250.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000453935 ENSG00000237094 498 286.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000455207 ENSG00000237094 413 201.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000455464 ENSG00000237094 735 523.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000599771 ENSG00000237094 457 245.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000601486 ENSG00000237094 696 484.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000601814 ENSG00000237094 635 423.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000358533 ENSG00000237491 1194 982.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000412115 ENSG00000237491 581 369.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000429505 ENSG00000237491 441 229.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000434264 ENSG00000237491 513 301.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000443772 ENSG00000237491 417 205.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000457084 ENSG00000237491 566 354.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000585745 ENSG00000237491 168 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000585768 ENSG00000237491 394 182.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000585826 ENSG00000237491 390 178.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000586288 ENSG00000237491 1040 828.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000586928 ENSG00000237491 598 386.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000587126 ENSG00000237491 495 283.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000587530 ENSG00000237491 881 669.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000588951 ENSG00000237491 607 395.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000589531 ENSG00000237491 714 502.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000589899 ENSG00000237491 809 597.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000590848 ENSG00000237491 726 514.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000591440 ENSG00000237491 780 568.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000591702 ENSG00000237491 1873 1661.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000592547 ENSG00000237491 608 396.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000593022 ENSG00000237491 693 481.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000417324 ENSG00000237613 1187 975.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000461467 ENSG00000237613 590 378.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000423372 ENSG00000237683 2661 2449.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000414273 ENSG00000237973 1543 1331.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000453576 ENSG00000238009 336 124.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000466430 ENSG00000238009 2748 2536.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000471248 ENSG00000238009 629 417.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000477740 ENSG00000238009 491 279.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000357876 ENSG00000239664 498 286.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000440196 ENSG00000239664 439 227.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000493797 ENSG00000239906 323 111.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000495576 ENSG00000239945 1319 1107.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000492842 ENSG00000240361 940 728.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000467115 ENSG00000240409 207 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000435300 ENSG00000240453 402 190.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000417659 ENSG00000240618 295 83.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000496488 ENSG00000241599 457 245.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000424429 ENSG00000241670 363 151.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000450734 ENSG00000241670 457 245.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000466557 ENSG00000241860 1301 1089.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000484859 ENSG00000241860 4860 4648.00 1.00 500000.00 107573.15 100.00 +ENST00000490997 ENSG00000241860 518 306.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000491962 ENSG00000241860 278 66.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000469289 ENSG00000243485 535 323.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000473358 ENSG00000243485 712 500.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000607096 ENSG00000243485 138 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000514057 ENSG00000248527 681 469.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000514436 ENSG00000250575 1239 1027.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000540477 ENSG00000256186 90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000594647 ENSG00000268020 126 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000606857 ENSG00000268020 840 628.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000438434 ENSG00000268663 424 212.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000494149 ENSG00000268903 755 543.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000437905 ENSG00000269732 363 151.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000599533 ENSG00000269831 129 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 +ENST00000595919 ENSG00000269981 284 72.00 0.00 0.00 0.00 0.00