Mercurial > repos > ashvark > qiime_1_8_0
directory /bwa-0.6.2/ @ 2:a294fbfcb1db draft default tip
name | size | permissions |
---|---|---|
[up] | drwxr-xr-x | |
COPYING | 35147 | -rw-r--r-- |
ChangeLog | 125657 | -rw-r--r-- |
Makefile | 1119 | -rw-r--r-- |
NEWS | 19118 | -rw-r--r-- |
QSufSort.c | 12734 | -rw-r--r-- |
QSufSort.h | 1646 | -rw-r--r-- |
README | 814 | -rw-r--r-- |
bamlite.c | 4650 | -rw-r--r-- |
bamlite.h | 2420 | -rw-r--r-- |
bntseq.c | 9795 | -rw-r--r-- |
bntseq.h | 2386 | -rw-r--r-- |
bwa.1 | 19400 | -rw-r--r-- |
bwa.c | 8069 | -rw-r--r-- |
bwa.h | 3291 | -rw-r--r-- |
bwape.c | 29996 | -rw-r--r-- |
bwase.c | 21662 | -rw-r--r-- |
bwase.h | 1050 | -rw-r--r-- |
bwaseqio.c | 6592 | -rw-r--r-- |
bwt.c | 10990 | -rw-r--r-- |
bwt.h | 4751 | -rw-r--r-- |
bwt_gen.c | 51917 | -rw-r--r-- |
bwt_lite.c | 2641 | -rw-r--r-- |
bwt_lite.h | 674 | -rw-r--r-- |
bwtaln.c | 11914 | -rw-r--r-- |
bwtaln.h | 3957 | -rw-r--r-- |
bwtgap.c | 8683 | -rw-r--r-- |
bwtgap.h | 968 | -rw-r--r-- |
bwtindex.c | 5663 | -rw-r--r-- |
bwtio.c | 1981 | -rw-r--r-- |
bwtmisc.c | 6125 | -rw-r--r-- |
bwtsw2.h | 1489 | -rw-r--r-- |
bwtsw2_aux.c | 26320 | -rw-r--r-- |
bwtsw2_chain.c | 2600 | -rw-r--r-- |
bwtsw2_core.c | 18893 | -rw-r--r-- |
bwtsw2_main.c | 3816 | -rw-r--r-- |
bwtsw2_pair.c | 10855 | -rw-r--r-- |
cs2nt.c | 5944 | -rw-r--r-- |
fastmap.c | 3428 | -rw-r--r-- |
is.c | 6596 | -rw-r--r-- |
khash.h | 16893 | -rw-r--r-- |
kseq.h | 7490 | -rw-r--r-- |
ksort.h | 9651 | -rw-r--r-- |
kstring.c | 641 | -rw-r--r-- |
kstring.h | 825 | -rw-r--r-- |
ksw.c | 14039 | -rw-r--r-- |
ksw.h | 1631 | -rw-r--r-- |
kvec.h | 2886 | -rw-r--r-- |
main.c | 3380 | -rw-r--r-- |
main.h | 670 | -rw-r--r-- |
qualfa2fq.pl | 616 | -rwxr-xr-x |
simple_dp.c | 5154 | -rw-r--r-- |
solid2fastq.pl | 3176 | -rwxr-xr-x |
stdaln.c | 36285 | -rw-r--r-- |
stdaln.h | 4721 | -rw-r--r-- |
utils.c | 4105 | -rw-r--r-- |
utils.h | 2570 | -rw-r--r-- |
xa2multi.pl | 730 | -rwxr-xr-x |