comparison test-data/rnaz_result2.fasta @ 1:e23c455f8335 draft

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1:e23c455f8335

>AP000397.1_114390-114319
UGGAGUAUAGCCAAG--UGG--UAAGGCAU-CGGUUUUUGGUACCGGCAU---------GCAAAGGUUCGAAUCCUUUUACUCCAG
(((((((..(((...--.))--)...((((-((((.......))))..))---------))(((((.......)))))))))))). ( -22.00, z-score =  -1.73, R)
>X03715.1_388-461
CGGAAAGUAGCUUAGCUUGG--UAGAGCAC-UCGGUUUGGGACCGAGGGG---------UCGCAGGUUCGAAUCCUGUCUUUCCGA
(((((((..((((.((((..--..)))).(-((((((...))))))))))---------).(((((.......)))))))))))). ( -28.90, z-score =  -2.35, R)
>U67517.1_7511-7582
GCCGGGGUGGGGUAG--UGG--CCAUCCUGGGGGACUGUGGAUCCC-CUG---------ACCCGGGUUCAAUUCCCGGUCCCGGCC
.(((((((((.....--...--)))))))))(((((((.(((..((-(..---------....)))......)))))))))).... ( -35.60, z-score =  -1.36, R)
>X99256.1_11558-11626
GUAAACAUAGUUUA----AU--CAAAACAU-UAGAUUGUGAAUCUAACA----------AUAGAGGCUCGAAACCUCUUGCUUACC
((((.(((((((((----((--......))-))))))))).........----------..(((((.......)))))...)))). ( -13.90, z-score =  -2.44, R)
>M10217.1_5910-5978
AGUAAAGUCAGCUA----AA--AAAGCUUUUGGGCCCAU--ACCCCAAAC---------AUGUUGGUUAAACCCCUUCCUUUACUA
(((((((..((((.----..--..))))((((((.....--..)))))).---------...................))))))). ( -13.90, z-score =  -2.40, R)
>AC021639.5_181586-181505
GCAGUCGUGGCCGAGU---GGUUAAGGCGU-CUGACUCGAAAUCAGAUUCCCUCUGGGAGCGUAGGUUCGAAUCCUACCGGCUGCG
((((((((((((....---)))))..((((-((((.......))))))((((...))))))(((((.......)))))))))))). ( -31.20, z-score =  -1.31, R)
>AP000063.1_59179-59095
GCGGGGGUGCCCGAGCCUGGCCAAAGGGGU-CGGGCUCAGGACCCGAUGGCGUAGGCCUGCGUGGGUUCAAAUCCCACCCCCCGCA
(((((((((...((((((((((.....)))-))))))).(((((((..(((....)))....)))))))......)).))))))). ( -52.80, z-score =  -4.23, R)
>consensus
GCGAAAGUAGCCUAG__UGG__UAAGGCAU_CGGACUCUGGACCCGACAG_________ACGUAGGUUCGAAUCCUACCCCUCCCA
(((((((..(((.............)))...((((.......))))...............(((((.......)))))))))))). (-27.32 = -19.11 +  -8.22)