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| author | dereeper |
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| date | Wed, 11 Sep 2013 09:08:15 -0400 |
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##fileformat=VCFv4.0 ##FILTER=<ID=LowQual,Description="Low quality"> ##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed"> ##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth (only filtered reads used for calling)"> ##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Float,Description="Genotype Quality"> ##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype"> ##FORMAT=<ID=PL,Number=3,Type=Float,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for AA,AB,BB genotypes where A=ref and B=alt; not applicable if site is not biallelic"> ##INFO=<ID=AC,Number=.,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed"> ##INFO=<ID=AF,Number=.,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed"> ##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes"> ##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total Depth"> ##INFO=<ID=DS,Number=0,Type=Flag,Description="Were any of the samples downsampled?"> ##INFO=<ID=Dels,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of Reads Containing Spanning Deletions"> ##INFO=<ID=HRun,Number=1,Type=Integer,Description="Largest Contiguous Homopolymer Run of Variant Allele In Either Direction"> ##INFO=<ID=HaplotypeScore,Number=1,Type=Float,Description="Consistency of the site with two (and only two) segregating haplotypes"> ##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality"> ##INFO=<ID=MQ0,Number=1,Type=Integer,Description="Total Mapping Quality Zero Reads"> ##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant Confidence/Quality by Depth"> ##INFO=<ID=SB,Number=1,Type=Float,Description="Strand Bias"> ##UnifiedGenotyper="analysis_type=UnifiedGenotyper input_file=[Eugenioides_Solexa.BWA.RG.unique.bam] sample_metadata=[] read_buffer_size=null phone_home=STANDARD read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null reference_sequence=../NeoArabica/reajusted_reference.fa rodBind=[] rodToIntervalTrackName=null BTI_merge_rule=UNION DBSNP=null downsampling_type=null downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 performanceLog=null useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 validation_strictness=SILENT unsafe=ALLOW_UNINDEXED_BAM num_threads=1 interval_merging=ALL read_group_black_list=null processingTracker=null restartProcessingTracker=false processingTrackerStatusFile=null processingTrackerID=-1 allow_intervals_with_unindexed_bam=false enable_experimental_low_memory_sharding=false logging_level=INFO log_to_file=null quiet_output_mode=false debug_mode=false help=false genotype_likelihoods_model=SNP p_nonref_model=EXACT heterozygosity=0.001 pcr_error_rate=1.0E-4 genotyping_mode=DISCOVERY output_mode=EMIT_VARIANTS_ONLY standard_min_confidence_threshold_for_calling=50.0 standard_min_confidence_threshold_for_emitting=10.0 noSLOD=false assume_single_sample_reads=null abort_at_too_much_coverage=-1 min_base_quality_score=17 min_mapping_quality_score=20 max_mismatches_in_40bp_window=3 use_reads_with_bad_mates=false max_deletion_fraction=0.05 min_indel_count_for_genotyping=5 indel_heterozygosity=1.25E-4 insertionStartProbability=0.001 insertionEndProbability=0.5 alphaDeletionProbability=0.001 indelGapContinuationPenalty=10.0 indelGapOpenPenalty=40.0 indelHaplotypeSize=80 doContextDependentGapPenalties=false indelDebug=false s1=null s2=null dovit=false newlike=false exactCalculation=LINEAR_EXPERIMENTAL output_all_callable_bases=false genotype=false out=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub NO_HEADER=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub sites_only=org.broadinstitute.sting.gatk.io.stubs.VCFWriterStub verbose_mode=null metrics_file=null annotation=[]" #CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT Eug2 85-ref 25 . C T 244.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.87;SB=-0.01;sumGLbyD=39.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:277,21,0 85-ref 161 . A G 555.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.68;MQ0=0;QD=17.36;SB=-0.01;sumGLbyD=18.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:30:99:585,0,414 85-ref 184 . A G 296.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.63;MQ0=0;QD=10.99;SB=-0.01;sumGLbyD=12.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,11:27:99:327,0,544 85-ref 190 . T G 312.39 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=36.64;MQ0=0;QD=11.16;SB=-0.01;sumGLbyD=12.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:28:99:342,0,590 85-ref 296 . C T 616.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.8130;MQ=36.66;MQ0=0;QD=20.56;SB=-0.01;sumGLbyD=21.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,19:30:99:647,0,336 85-ref 302 . C A 649.40 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.03;HRun=3;HaplotypeScore=3.8464;MQ=36.67;MQ0=0;QD=20.95;SB=-0.01;sumGLbyD=21.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:30:99:679,0,301 85-ref 371 . G T 881.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.66;SB=-0.01;sumGLbyD=33.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:25:72.23:915,72,0 85-ref 388 . G T 1055.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.71;SB=-0.01;sumGLbyD=38.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.27:1089,84,0 85-ref 425 . A G 295.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.56;SB=-0.01;sumGLbyD=11.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,11:27:99:326,0,554 85-ref 445 . C T 691.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4658;MQ=36.70;MQ0=0;QD=20.34;SB=-0.01;sumGLbyD=21.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:33:99:722,0,367 85-ref 453 . T C 1317.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.71;MQ0=0;QD=37.63;SB=-0.01;sumGLbyD=38.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1350,105,0 85-ref 513 . A G 1749.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.79;MQ0=0;QD=37.23;SB=-0.01;sumGLbyD=37.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:46:99:1783,138,0 85-ref 648 . C A 251.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.07;SB=-0.01;sumGLbyD=11.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:282,0,527 85-ref 781 . T G 232.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=19.35;SB=-0.01;sumGLbyD=21.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:262,0,108 85-ref 806 . T C 15.63 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8661;MQ=35.98;MQ0=0;QD=1.56;SB=-0.01;sumGLbyD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:45.50:46,0,263 85-ref 809 . G A 235.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.61;SB=-0.01;sumGLbyD=38.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:268,21,0 178-ref 1706 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=28.79;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,2:1:1.76:40,3,0 178-ref 1749 . C T 322.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.51;MQ0=0;QD=32.26;SB=-40.00;sumGLbyD=35.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.09:356,27,0 178-ref 1828 . G A 683.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.98;SB=-0.01;sumGLbyD=39.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.18:717,54,0 178-ref 1884 . G A 12 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=4.9156;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.00;SB=-0.01;sumGLbyD=3.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:41.71:42,0,337 178-ref 1977 . A G 369.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=30.76;SB=-0.01;sumGLbyD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:6.49:401,6,0 178-ref 1985 . G A 355 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=29.58;SB=-0.01;sumGLbyD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:6.48:386,6,0 178-ref 2060 . A G 330.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=34.93;MQ0=0;QD=33.02;SB=-0.01;sumGLbyD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:363,30,0 178-ref 2111 . A C 514.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.03;MQ0=0;QD=34.33;SB=-0.01;sumGLbyD=36.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.12:548,45,0 178-ref 2121 . G T 451.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9469;MQ=33.80;MQ0=0;QD=32.23;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.11:484,39,0 178-ref 2218 . C T 586.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6686;MQ=35.98;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:18:14.17:619,14,0 178-ref 2285 . A T 602.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.65;SB=-0.01;sumGLbyD=39.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.16:635,48,0 178-ref 2374 . T G 161.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=35.28;MQ0=0;QD=27.00;SB=-0.01;sumGLbyD=32.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:6:15.05:195,15,0 205-ref 31 . G C 396.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.08;SB=-0.01;sumGLbyD=39.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:430,33,0 205-ref 115 . C T 515.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=36.80;SB=-0.01;sumGLbyD=39.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:548,42,0 205-ref 196 . T C 644.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.46;MQ0=0;QD=32.24;SB=-0.01;sumGLbyD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:18:54.17:678,54,0 205-ref 204 . A T 778.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.66;MQ0=0;QD=33.85;SB=-0.01;sumGLbyD=35.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:22:66.20:812,66,0 205-ref 272 . C G 920.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.61;MQ0=0;QD=35.42;SB=-0.01;sumGLbyD=36.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:25:75.23:954,75,0 205-ref 328 . G A 684.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.3359;MQ=36.54;MQ0=0;QD=31.13;SB=-0.01;sumGLbyD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:21:24.62:718,25,0 205-ref 377 . G A 506.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.79;SB=-0.01;sumGLbyD=35.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.13:540,42,0 205-ref 499 . 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G A 389.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.22;MQ0=0;QD=29.94;SB=-0.01;sumGLbyD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.09:422,39,0 205-ref 748 . C G 388.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.22;MQ0=0;QD=29.91;SB=-0.01;sumGLbyD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.09:422,39,0 205-ref 839 . G A 794.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9462;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.78;SB=-0.01;sumGLbyD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,23:25:3.34:824,0,3 205-ref 1009 . T C 1742.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=2.4146;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.08;SB=-0.01;sumGLbyD=37.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:47:99:1776,138,0 205-ref 1059 . G C 416.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9119;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.87;SB=-0.01;sumGLbyD=9.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:46:99:447,0,1061 205-ref 1132 . 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A G 26898.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=713;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=44.4918;MQ=36.42;MQ0=0;QD=37.73;SB=-40.01;sumGLbyD=37.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,711:702:99:26897,2113,0 281-ref 654 . G T 14022.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=395;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=20.0096;MQ=34.85;MQ0=0;QD=35.50;SB=-0.01;sumGLbyD=35.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,387:387:99:13855,999,0 281-ref 669 . G C 8288.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=246;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.2880;MQ=31.96;MQ0=0;QD=33.69;SB=-0.01;sumGLbyD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,241:244:99:8142,589,0 281-ref 674 . C T 6739.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=15.5147;MQ=31.06;MQ0=0;QD=32.72;SB=-0.01;sumGLbyD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,200:205:99:6514,419,0 281-ref 680 . T C 1104.53 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=170;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.9977;MQ=30.08;MQ0=0;QD=6.50;SB=-0.01;sumGLbyD=6.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,53:132:99:1135,0,2543 281-ref 695 . 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C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 312-ref 180 . G T 162.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.51;SB=-0.01;sumGLbyD=39.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:195,15,0 312-ref 228 . G A 1569.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.57;MQ0=0;QD=33.40;SB=-0.01;sumGLbyD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:47:99:1603,123,0 312-ref 247 . G A 2055.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.63;MQ0=0;QD=38.06;SB=-0.01;sumGLbyD=38.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:53:99:2088,160,0 312-ref 319 . G T 1192.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=57;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7852;MQ=35.19;MQ0=0;QD=20.93;SB=-0.01;sumGLbyD=21.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,39:57:99:1223,0,541 312-ref 339 . A C 1845.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.22;MQ0=0;QD=35.49;SB=-0.01;sumGLbyD=36.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:51:99:1879,153,0 312-ref 352 . C A 1135.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.4862;MQ=35.05;MQ0=0;QD=21.43;SB=-0.01;sumGLbyD=21.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,36:52:99:1166,0,473 312-ref 435 . A T 376.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.03;MQ0=0;QD=28.98;SB=-0.01;sumGLbyD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:12:36.09:410,36,0 312-ref 441 . A G 222.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=27.82;SB=-0.01;sumGLbyD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:256,24,0 312-ref 450 . T G 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 312-ref 451 . G C 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 312-ref 492 . T A 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 312-ref 494 . T C 76.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=12.68;SB=-0.01;sumGLbyD=17.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:61.97:106,0,62 312-ref 523 . C A 765.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.69;SB=-0.01;sumGLbyD=25.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:795,0,137 312-ref 540 . G C 1113.76 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.1610;MQ=35.63;MQ0=0;QD=24.75;SB=-0.01;sumGLbyD=25.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,35:43:99:1144,0,215 312-ref 552 . 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T C 157.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.81;MQ0=0;QD=5.63;SB=-0.01;sumGLbyD=6.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:27:99:188,0,599 312-ref 1128 . C T 218.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=33.20;MQ0=0;QD=5.60;SB=-0.01;sumGLbyD=6.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,12:39:99:249,0,881 312-ref 1131 . C T 1420.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=32.52;MQ0=0;QD=33.04;SB=-0.01;sumGLbyD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1454,129,0 312-ref 1137 . C T 112.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=32.17;MQ0=0;QD=2.30;SB=-0.01;sumGLbyD=2.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,10:49:99:143,0,1254 312-ref 1149 . T C 1648.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.30;MQ0=0;QD=34.34;SB=-0.01;sumGLbyD=35.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1681,144,0 312-ref 1191 . 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A T 2034.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.81;MQ0=0;QD=38.38;SB=-0.01;sumGLbyD=39.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2067,160,0 360-ref 716 . G C 1952.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=36.80;MQ0=0;QD=38.28;SB=-0.01;sumGLbyD=38.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1985,153,0 360-ref 755 . C G 519.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.42;SB=-0.01;sumGLbyD=15.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:549,0,641 360-ref 791 . A T 341.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7839;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.14;SB=-0.01;sumGLbyD=8.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,13:42:99:372,0,1012 360-ref 829 . G A 1477.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7312;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.93;SB=-0.01;sumGLbyD=37.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1510,117,0 360-ref 919 . 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T C 377.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=34.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:411,33,0 363-ref 646 . A C 134.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=22.46;SB=-0.01;sumGLbyD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:11.57:165,0,12 463-ref 19 . G A 183.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=26.20;SB=-0.01;sumGLbyD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:216,21,0 463-ref 20 . A G 126.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=18.11;SB=-0.01;sumGLbyD=22.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15.94:157,0,16 463-ref 38 . A C 1103.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.5774;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.49;SB=-0.01;sumGLbyD=35.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:31:93.27:1137,93,0 463-ref 56 . A C 671.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8675;MQ=35.61;MQ0=0;QD=11.38;SB=-0.01;sumGLbyD=11.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,23:59:99:702,0,1171 463-ref 75 . C T 3633.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6127;MQ=36.06;MQ0=0;QD=37.07;SB=-78.59;sumGLbyD=36.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,96:98:99:3562,224,0 463-ref 1223 . A G 233.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=343;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=46.6946;MQ=36.41;MQ0=0;QD=0.68;SB=-0.01;sumGLbyD=0.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:306,37:336:99:263,0,10521 463-ref 1257 . C A 9614.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=258;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=16.3529;MQ=36.49;MQ0=0;QD=37.27;SB=-0.01;sumGLbyD=36.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,251:255:99:9372,563,0 463-ref 1265 . C T 9164 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=16.6614;MQ=36.45;MQ0=0;QD=38.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,236:238:99:9024,611,0 463-ref 1354 . G A 2575.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=81;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7297;MQ=36.63;MQ0=0;QD=31.80;SB=-0.01;sumGLbyD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,74:81:0.23:2604,0,0 463-ref 1382 . T A 110.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=9.9833;MQ=36.15;MQ0=0;QD=3.07;SB=-0.01;sumGLbyD=3.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:141,0,1034 463-ref 1387 . C T 660.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.41;SB=-0.01;sumGLbyD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:65.26:690,0,65 463-ref 1399 . T C 533.16 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.39;SB=-0.01;sumGLbyD=26.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:563,0,121 463-ref 1551 . C T 630.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=37.09;SB=-0.01;sumGLbyD=39.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:664,51,0 463-ref 1564 . A T 625.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=36.77;SB=-0.01;sumGLbyD=38.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:658,51,0 463-ref 1580 . A C 634.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=37.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:668,51,0 493-ref 246 . G A 344.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=7.5736;MQ=35.55;MQ0=0;QD=5.38;SB=-0.01;sumGLbyD=5.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,17:64:99:374,0,1646 493-ref 251 . A C 177.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=67;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=7.6937;MQ=35.62;MQ0=0;QD=2.65;SB=-0.01;sumGLbyD=3.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,13:65:99:207,0,1714 493-ref 363 . T C 1343.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.72;MQ0=0;QD=37.32;SB=-0.01;sumGLbyD=38.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1377,108,0 493-ref 464 . T C 67.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=67;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.7088;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.01;SB=-0.01;sumGLbyD=1.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,8:66:97.96:98,0,2063 493-ref 524 . G A 1741.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.4260;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:45:99:1775,135,0 493-ref 608 . C A 381.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=34.71;SB=-0.01;sumGLbyD=37.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:415,33,0 493-ref 630 . T A 65.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=6;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=21.67;SB=-0.01;sumGLbyD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:97,9,0 493-ref 631 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 493-ref 632 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 710-ref 48 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 710-ref 286 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 710-ref 425 . T G 423.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.61;SB=-0.01;sumGLbyD=35.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:12:36.11:457,36,0 710-ref 555 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 710-ref 666 . A G 327.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.71;SB=-0.01;sumGLbyD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.09:360,27,0 710-ref 698 . A G 327.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.42;SB=-0.01;sumGLbyD=25.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:358,0,118 710-ref 814 . A G 180.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=34.15;MQ0=0;QD=16.38;SB=-0.01;sumGLbyD=19.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:210,0,124 710-ref 819 . G C 87.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=34.15;MQ0=0;QD=7.95;SB=-0.01;sumGLbyD=10.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:117,0,210 710-ref 828 . G A 18.26 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9916;MQ=33.48;MQ0=0;QD=2.03;SB=-0.01;sumGLbyD=5.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:48.18:48,0,219 710-ref 829 . 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T A 37.98 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=9.50;SB=-0.01;sumGLbyD=16.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:57.59:68,0,58 710-ref 1222 . T C 247.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.07;SB=-0.01;sumGLbyD=21.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:278,0,154 710-ref 1300 . G A 247.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.65;SB=-0.01;sumGLbyD=23.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:278,0,124 710-ref 1346 . C T 294.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.46;SB=-0.01;sumGLbyD=32.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9.22:324,0,9 710-ref 1411 . G A 160.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.19;SB=-0.01;sumGLbyD=38.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:194,15,0 710-ref 1470 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 789-ref 130 . C T 990.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.39;SB=-0.01;sumGLbyD=36.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:27:81.24:1024,81,0 789-ref 391 . C T 2142.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.3359;MQ=36.83;MQ0=0;QD=36.94;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:56:99:2176,169,0 789-ref 471 . A G 1528.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=35.53;MQ0=0;QD=36.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1561,126,0 789-ref 475 . A G 880.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6006;MQ=35.57;MQ0=0;QD=20.47;SB=-0.01;sumGLbyD=21.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,29:42:99:910,0,406 789-ref 520 . G C 1475.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.48;MQ0=0;QD=37.83;SB=-0.01;sumGLbyD=38.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1508,117,0 789-ref 557 . A G 842.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.63;SB=-0.01;sumGLbyD=38.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.22:875,69,0 789-ref 630 . G A 1176.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8653;MQ=36.10;MQ0=0;QD=34.61;SB=-40.01;sumGLbyD=35.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:32:96.29:1210,96,0 789-ref 682 . A G 1462.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9988;MQ=36.49;MQ0=0;QD=36.57;SB=-0.01;sumGLbyD=37.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1496,120,0 789-ref 723 . C T 1535.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=57;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7920;MQ=36.65;MQ0=0;QD=26.93;SB=-0.01;sumGLbyD=27.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,47:55:99:1565,0,187 789-ref 740 . G T 19.88 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7799;MQ=36.82;MQ0=0;QD=0.35;SB=-0.01;sumGLbyD=0.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,7:54:49.82:50,0,1707 789-ref 796 . A G 1462.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.6513;MQ=36.60;MQ0=0;QD=29.25;SB=-0.01;sumGLbyD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,43:50:99:1493,0,111 789-ref 847 . A T 1704.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.5999;MQ=36.02;MQ0=0;QD=32.78;SB=-0.01;sumGLbyD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,49:50:70.43:1737,70,0 789-ref 902 . T A 1957.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.4907;MQ=35.89;MQ0=0;QD=35.59;SB=-0.01;sumGLbyD=36.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:53:99:1990,159,0 789-ref 997 . C T 1825.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.5219;MQ=36.17;MQ0=0;QD=29.93;SB=-0.01;sumGLbyD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,55:61:47.91:1856,0,48 789-ref 1004 . C G 1815.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=62;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9951;MQ=36.18;MQ0=0;QD=29.28;SB=-0.01;sumGLbyD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,55:60:61.79:1845,0,62 789-ref 1014 . G C 2005.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=67;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9962;MQ=36.24;MQ0=0;QD=29.93;SB=-0.01;sumGLbyD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,58:67:99:2035,0,152 789-ref 1142 . G A 53.88 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=80;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.6987;MQ=36.62;MQ0=0;QD=0.67;SB=3.00;sumGLbyD=1.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,8:78:83.87:84,0,2489 789-ref 1189 . A C 33.04 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8656;MQ=36.49;MQ0=0;QD=0.56;SB=6.01;sumGLbyD=1.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,7:56:63.03:63,0,1681 789-ref 1194 . G A 1909.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.63;MQ0=0;QD=35.36;SB=-80.02;sumGLbyD=35.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:53:99:1943,153,0 789-ref 1198 . G A 1948.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.47;SB=-80.02;sumGLbyD=38.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:51:99:1981,153,0 789-ref 1248 . A T 1308.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.13;MQ0=0;QD=35.35;SB=-112.16;sumGLbyD=36.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1341,111,0 789-ref 1306 . G A 593.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=62;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.5296;MQ=35.14;MQ0=0;QD=9.57;SB=6.01;sumGLbyD=10.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,21:61:99:623,0,1310 789-ref 1320 . A G 2020.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6545;MQ=33.53;MQ0=0;QD=34.83;SB=-0.01;sumGLbyD=35.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:57:99:2053,171,0 789-ref 1328 . G C 172.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8558;MQ=32.52;MQ0=0;QD=2.92;SB=-0.01;sumGLbyD=3.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,11:59:99:202,0,1497 789-ref 1337 . T C 33.98 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8558;MQ=30.57;MQ0=0;QD=0.65;SB=-0.01;sumGLbyD=1.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,7:52:63.98:64,0,1343 789-ref 1446 . T C 181.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.16;SB=6.05;sumGLbyD=21.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:9:91.55:212,0,92 789-ref 1464 . T C 319.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.48;SB=-75.21;sumGLbyD=39.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:352,27,0 789-ref 1686 . A G 179.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9988;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.93;SB=-0.01;sumGLbyD=20.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:209,0,128 845-ref 167 . T G 847.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4671;MQ=36.56;MQ0=0;QD=36.85;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.20:880,69,0 845-ref 240 . A G 813.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.54;MQ0=0;QD=37.00;SB=-0.01;sumGLbyD=38.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.20:847,66,0 845-ref 350 . C T 750.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.4019;MQ=36.49;MQ0=0;QD=37.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:784,60,0 845-ref 573 . G T 32.36 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.85;MQ0=0;QD=3.24;SB=-0.01;sumGLbyD=6.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:62.36:62,0,244 845-ref 789 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 845-ref 969 . C G 999.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.87;MQ0=0;QD=37.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.25:1032,81,0 845-ref 984 . A G 804.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.60;MQ0=0;QD=36.55;SB=-0.01;sumGLbyD=38.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.20:837,66,0 845-ref 1117 . G A 320.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.56;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:353,27,0 958-ref 71 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 958-ref 105 . C A 158.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.78;SB=-0.01;sumGLbyD=38.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:192,15,0 958-ref 130 . A G 390.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.48;SB=-0.01;sumGLbyD=38.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:423,33,0 958-ref 353 . C T 665.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=33.27;SB=-0.01;sumGLbyD=34.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:54.17:698,54,0 958-ref 435 . A G 18.61 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.33;SB=19.81;sumGLbyD=6.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:7:48.54:49,0,167 958-ref 629 . C T 2006.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8316;MQ=36.23;MQ0=0;QD=37.86;SB=-0.01;sumGLbyD=38.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2039,159,0 958-ref 639 . C T 1911.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.20;MQ0=0;QD=37.48;SB=-0.01;sumGLbyD=38.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1944,153,0 958-ref 692 . C T 1339 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.3256;MQ=36.52;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:39:74.35:1372,74,0 958-ref 792 . A G 46.15 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9985;MQ=36.22;MQ0=0;QD=3.55;SB=-0.01;sumGLbyD=5.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:76.14:76,0,348 958-ref 795 . C A 84.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9995;MQ=36.15;MQ0=0;QD=7.06;SB=-0.01;sumGLbyD=9.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:11:99:115,0,234 958-ref 808 . T C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 958-ref 811 . T G 33.64 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=16.82;SB=-0.01;sumGLbyD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:65,6,0 1012-ref 24 . A G 141.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.20;MQ0=0;QD=11.77;SB=3.57;sumGLbyD=14.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:171,0,138 1012-ref 35 . G A 408.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.76;MQ0=0;QD=29.21;SB=-177.71;sumGLbyD=31.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.09:442,42,0 1012-ref 36 . C G 443.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.27;MQ0=0;QD=27.72;SB=-177.72;sumGLbyD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.09:477,45,0 1012-ref 74 . G A 158.81 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.8321;MQ=28.27;MQ0=0;QD=9.93;SB=18.03;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:15:99:189,0,202 1012-ref 81 . C G 148.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=27.76;MQ0=0;QD=10.62;SB=-3.81;sumGLbyD=12.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:13:99:179,0,154 1012-ref 92 . C G 180.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=26.34;MQ0=0;QD=22.61;SB=-59.05;sumGLbyD=26.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.04:214,21,0 1012-ref 115 . A G 20.91 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.35;MQ0=0;QD=1.74;SB=34.00;sumGLbyD=4.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:50.87:51,0,213 1012-ref 126 . T G 116.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.35;MQ0=0;QD=6.84;SB=-61.40;sumGLbyD=8.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:16:99:146,0,229 1012-ref 128 . C G 138.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.05;MQ0=0;QD=7.69;SB=-77.90;sumGLbyD=9.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:168,0,260 1012-ref 194 . A G 35.23 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.3548;MQ=35.42;MQ0=0;QD=1.36;SB=-0.01;sumGLbyD=2.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:65.23:65,0,753 1012-ref 208 . C A 884.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=34.07;MQ0=0;QD=35.36;SB=-29.63;sumGLbyD=36.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.21:917,75,0 1012-ref 214 . G A 944.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=34.11;MQ0=0;QD=32.56;SB=-149.65;sumGLbyD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:28:54.62:977,55,0 1012-ref 253 . C A 778.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8600;MQ=33.96;MQ0=0;QD=27.80;SB=-174.67;sumGLbyD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:15.37:808,0,15 1012-ref 274 . A T 1093.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.6370;MQ=35.20;MQ0=0;QD=31.25;SB=-180.40;sumGLbyD=32.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,32:35:8.02:1125,8,0 1012-ref 332 . T C 622.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.47;MQ0=0;QD=32.74;SB=-113.62;sumGLbyD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:18.60:655,19,0 1012-ref 352 . A T 742.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=37.13;SB=-159.34;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:776,60,0 1012-ref 475 . A G 1018.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.72;SB=-0.01;sumGLbyD=38.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.26:1052,81,0 1012-ref 544 . T C 979.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.63;MQ0=0;QD=36.28;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:26:78.25:1013,78,0 1012-ref 562 . G A 693.04 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.56;MQ0=0;QD=30.13;SB=-0.01;sumGLbyD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,20:23:37.39:723,0,37 1012-ref 602 . A G 51.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9981;MQ=35.91;MQ0=0;QD=1.85;SB=-26.62;sumGLbyD=2.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:28:81.70:82,0,784 1012-ref 732 . G T 839.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.22:873,66,0 1012-ref 771 . G A 953.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.15;SB=-0.01;sumGLbyD=39.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.24:987,75,0 1012-ref 799 . C T 922.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.45;SB=-0.01;sumGLbyD=39.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.24:956,72,0 1012-ref 850 . A G 121.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.34;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:154,12,0 1012-ref 875 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 1015-ref 53 . G T 74.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.91;SB=-0.01;sumGLbyD=35.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:107,9,0 1015-ref 71 . A G 871.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.88;SB=-0.01;sumGLbyD=36.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:35.24:905,35,0 1015-ref 287 . C T 4706.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.5213;MQ=36.67;MQ0=0;QD=37.96;SB=-0.01;sumGLbyD=37.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,122:122:99:4666,327,0 1015-ref 305 . C T 4816.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.36;MQ0=0;QD=38.22;SB=-0.01;sumGLbyD=38.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:125:99:4816,376,0 1015-ref 356 . T A 1805.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9658;MQ=35.06;MQ0=0;QD=17.88;SB=-0.01;sumGLbyD=18.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:99:99:1839,153,0 1015-ref 369 . C T 3044.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9957;MQ=34.81;MQ0=0;QD=35.81;SB=-0.01;sumGLbyD=36.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,85:82:99:3077,247,0 1015-ref 380 . 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C A 850.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.53;MQ0=0;QD=31.51;SB=-0.01;sumGLbyD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:26:78.17:884,78,0 1066-ref 300 . A G 898.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.53;MQ0=0;QD=33.27;SB=-0.01;sumGLbyD=34.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.19:931,81,0 1066-ref 392 . A G 8256.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=242;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.1276;MQ=32.48;MQ0=0;QD=34.12;SB=-110.40;sumGLbyD=33.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,241:239:99:8219,716,0 1066-ref 413 . C G 8957.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.2316;MQ=36.63;MQ0=0;QD=38.61;SB=-434.07;sumGLbyD=38.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,229:230:99:8927,663,0 1066-ref 1013 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 1108-ref 57 . C T 174.24 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.6630;MQ=32.27;MQ0=0;QD=6.97;SB=-0.01;sumGLbyD=8.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:204,0,522 1108-ref 62 . T C 789.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6630;MQ=32.27;MQ0=0;QD=31.59;SB=-0.01;sumGLbyD=32.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:23:69.19:823,69,0 1108-ref 78 . T A 1003.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.97;MQ0=0;QD=34.62;SB=-0.01;sumGLbyD=35.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.24:1037,87,0 1108-ref 79 . G A 892.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.65;MQ0=0;QD=33.06;SB=-0.01;sumGLbyD=34.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:26:78.21:926,78,0 1108-ref 188 . G A 1561.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7922;MQ=36.53;MQ0=0;QD=36.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:42:99:1594,126,0 1108-ref 234 . A G 1667.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.3018;MQ=36.77;MQ0=0;QD=37.89;SB=-0.01;sumGLbyD=38.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1700,132,0 1108-ref 296 . G A 1850.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8478;MQ=35.98;MQ0=0;QD=37.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1884,150,0 1108-ref 304 . C T 1689.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.8454;MQ=35.87;MQ0=0;QD=37.55;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1723,135,0 1108-ref 405 . A C 730.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.60;MQ0=0;QD=33.19;SB=-0.01;sumGLbyD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:21:63.18:763,63,0 1108-ref 409 . C T 849.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.77;MQ0=0;QD=33.98;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:24:72.21:883,72,0 1108-ref 410 . A G 840.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.77;MQ0=0;QD=33.63;SB=-0.01;sumGLbyD=34.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:24:72.20:874,72,0 1108-ref 471 . T C 1514.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7675;MQ=36.52;MQ0=0;QD=36.05;SB=-0.01;sumGLbyD=36.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:41:99:1547,123,0 1108-ref 512 . A C 721.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.2233;MQ=36.72;MQ0=0;QD=20.03;SB=-0.01;sumGLbyD=20.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,22:36:99:751,0,422 1108-ref 557 . C T 1370.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.72;MQ0=0;QD=38.07;SB=-0.01;sumGLbyD=38.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1404,108,0 1108-ref 581 . T C 1411.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9995;MQ=36.75;MQ0=0;QD=34.42;SB=-0.01;sumGLbyD=35.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:39:79.58:1444,80,0 1108-ref 781 . G T 1897.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.73;SB=-0.01;sumGLbyD=39.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1931,147,0 1108-ref 839 . G T 665.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.29;MQ0=0;QD=31.67;SB=-0.01;sumGLbyD=33.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.15:698,63,0 1108-ref 854 . T C 475.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.28;MQ0=0;QD=29.72;SB=-0.01;sumGLbyD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.11:509,48,0 1108-ref 860 . G A 433.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.69;MQ0=0;QD=28.93;SB=-0.01;sumGLbyD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.09:467,45,0 1108-ref 868 . A T 260.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.66;SB=-0.01;sumGLbyD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.05:293,30,0 1119-ref 110 . T G 35.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.78;SB=-0.01;sumGLbyD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:67,6,0 1119-ref 112 . A G 85.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.62;SB=-0.01;sumGLbyD=39.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:118,9,0 1119-ref 189 . G A 204.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.02;SB=-0.01;sumGLbyD=39.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:237,18,0 1119-ref 195 . T G 205.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:238,18,0 1119-ref 234 . G A 324.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.11;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:358,27,0 1119-ref 431 . G C 99.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8311;MQ=35.28;MQ0=0;QD=16.64;SB=-0.01;sumGLbyD=21.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:6:24.96:130,0,25 1119-ref 515 . C A 108.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.06;SB=-0.01;sumGLbyD=23.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:59.09:138,0,59 1119-ref 542 . T C 37.29 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.46;SB=-0.01;sumGLbyD=13.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67.28:67,0,68 1119-ref 623 . C A 305.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=33.89;SB=-0.01;sumGLbyD=37.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:338,27,0 1119-ref 677 . C T 343.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=34.34;SB=-0.01;sumGLbyD=37.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:376,30,0 1119-ref 698 . T C 160.64 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.15;MQ0=0;QD=13.39;SB=-0.01;sumGLbyD=15.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:191,0,204 1119-ref 896 . T C 138.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.36;SB=-0.01;sumGLbyD=18.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:168,0,120 1119-ref 1005 . T A 478.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.19;SB=-0.01;sumGLbyD=36.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.13:512,39,0 1119-ref 1052 . T G 61.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.80;SB=-0.01;sumGLbyD=10.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:8:91.19:91,0,175 1119-ref 1127 . A G 397.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4681;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.09;SB=-0.01;sumGLbyD=39.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:430,33,0 1119-ref 1499 . 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T C 109.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=27.29;SB=-0.01;sumGLbyD=35.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:142,12,0 1154-ref 385 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 1154-ref 398 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 1154-ref 674 . G C 44.35 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.18;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 1154-ref 676 . G A 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 1154-ref 747 . 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T G 276.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=25.15;SB=-0.01;sumGLbyD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:8:24.07:310,24,0 1154-ref 878 . T A 355.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.53;SB=-0.01;sumGLbyD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:388,30,0 1154-ref 977 . A G 256.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.48;SB=-0.01;sumGLbyD=31.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:8.17:286,0,8 1154-ref 1019 . C T 341.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.16;SB=-0.01;sumGLbyD=37.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:375,30,0 1154-ref 1050 . T G 74.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9993;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.71;SB=-0.01;sumGLbyD=15.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:50.65:105,0,51 1154-ref 1063 . 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T C 360.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.09;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:394,30,0 1286-ref 108 . T A 300.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.02;SB=-0.01;sumGLbyD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9.91:330,0,10 1286-ref 179 . T A 930.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.19;MQ0=0;QD=37.20;SB=-0.01;sumGLbyD=38.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.22:963,75,0 1286-ref 225 . A T 860.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=35.84;SB=-0.01;sumGLbyD=37.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.21:893,72,0 1286-ref 234 . T C 995.62 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=70;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4625;MQ=30.37;MQ0=0;QD=14.22;SB=-0.01;sumGLbyD=14.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,40:70:99:1026,0,906 1286-ref 248 . 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T G 495.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=25.70;MQ0=0;QD=23.59;SB=-0.01;sumGLbyD=25.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:20:25.76:528,26,0 1286-ref 342 . A T 425.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9384;MQ=35.80;MQ0=0;QD=25.04;SB=-28.23;sumGLbyD=26.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,15:15:5.13:457,5,0 1286-ref 364 . T C 22872.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=626;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=14.7899;MQ=36.68;MQ0=0;QD=36.54;SB=-499.67;sumGLbyD=36.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,616:612:99:22637,1627,0 1286-ref 376 . C A 15905.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=895;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=44.5526;MQ=36.74;MQ0=0;QD=17.77;SB=-407.41;sumGLbyD=14.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:479,414:874:99:13273,0,15274 1286-ref 451 . T C 15711.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=417;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=25.6391;MQ=36.16;MQ0=0;QD=37.68;SB=-0.01;sumGLbyD=37.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,414:414:99:15601,1137,0 1286-ref 472 . C T 1724.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=69;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=17.0626;MQ=33.23;MQ0=0;QD=24.99;SB=-0.01;sumGLbyD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,59:67:11.18:1754,0,11 1286-ref 475 . C T 10.70 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.4604;MQ=25.87;MQ0=0;QD=1.78;SB=-0.01;sumGLbyD=6.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:5:40.31:40,0,76 1286-ref 479 . A T 1974.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.7767;MQ=24.06;MQ0=0;QD=22.96;SB=-0.01;sumGLbyD=23.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,80:81:99:2007,142,0 1286-ref 520 . G C 36739.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=43.6081;MQ=35.94;MQ0=0;QD=36.74;SB=-109.36;sumGLbyD=36.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,995:978:99:36599,2842,0 1286-ref 599 . G A 35487.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=980;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=52.6828;MQ=36.40;MQ0=0;QD=36.21;SB=-0.01;sumGLbyD=36.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,974:946:99:35453,2816,0 1286-ref 644 . G A 30190.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=877;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=46.2622;MQ=35.62;MQ0=0;QD=34.42;SB=-0.01;sumGLbyD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,865:829:99:30055,2386,0 1286-ref 663 . C G 27019.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=736;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=26.0227;MQ=35.39;MQ0=0;QD=36.71;SB=-29.63;sumGLbyD=36.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,730:728:99:26916,2090,0 1286-ref 679 . C A 6057.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=388;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=54.2118;MQ=34.64;MQ0=0;QD=15.61;SB=-47.31;sumGLbyD=12.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:213,174:384:99:4866,0,6471 1286-ref 685 . T G 1109 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=280;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=308.4189;MQ=34.51;MQ0=0;QD=3.96;SB=3.00;sumGLbyD=4.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:221,55:272:99:1139,0,6558 1286-ref 690 . A C 1101.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=245;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=49.9013;MQ=35.19;MQ0=0;QD=4.50;SB=-0.01;sumGLbyD=4.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:185,59:242:99:1131,0,6163 1286-ref 694 . A C 13039.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=373;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=100.9839;MQ=36.40;MQ0=0;QD=34.96;SB=-0.01;sumGLbyD=32.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,343:371:99:12086,164,0 1286-ref 814 . A G 36769.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=62.7215;MQ=36.44;MQ0=0;QD=36.77;SB=-24.97;sumGLbyD=36.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,995:978:99:36615,2791,0 1286-ref 854 . A G 16853.69 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=49.1095;MQ=32.95;MQ0=0;QD=16.85;SB=-23.63;sumGLbyD=13.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:526,469:966:99:13937,0,13633 1286-ref 862 . G C 15707.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=965;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=37.6695;MQ=30.52;MQ0=0;QD=16.28;SB=-33.32;sumGLbyD=13.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:514,451:954:99:12823,0,12719 1286-ref 892 . T A 24272.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=789;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=33.3359;MQ=29.13;MQ0=0;QD=30.76;SB=-0.01;sumGLbyD=30.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,783:778:99:24205,2330,0 1286-ref 931 . A T 4589.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=9.5654;MQ=22.86;MQ0=0;QD=26.38;SB=-0.01;sumGLbyD=25.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:172:99:4455,501,0 1286-ref 989 . C T 402.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=30.95;SB=-0.01;sumGLbyD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:14.43:435,14,0 1286-ref 991 . C T 412.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=31.70;SB=-0.01;sumGLbyD=34.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:14.43:445,14,0 1286-ref 1140 . A T 16327.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=444;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.1805;MQ=34.69;MQ0=0;QD=36.77;SB=-40.01;sumGLbyD=36.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,441:440:99:16256,1289,0 1286-ref 1149 . T C 15621.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=425;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.1999;MQ=34.50;MQ0=0;QD=36.76;SB=-40.01;sumGLbyD=36.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,423:423:99:15592,1245,0 1286-ref 1172 . G T 12775.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=352;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=44.8607;MQ=33.96;MQ0=0;QD=36.29;SB=-38.58;sumGLbyD=36.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,350:351:99:12743,1025,0 1286-ref 1186 . G A 824.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.94;MQ0=0;QD=26.58;SB=-0.01;sumGLbyD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:53.17:857,53,0 1286-ref 1188 . A T 110.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=18.41;SB=-0.01;sumGLbyD=23.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.27:140,0,21 1288-ref 213 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 1288-ref 241 . C G 75.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.13;SB=-0.01;sumGLbyD=35.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:107,9,0 1288-ref 280 . 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A C 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 1288-ref 410 . T C 736.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.84;SB=-0.01;sumGLbyD=38.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:770,60,0 1288-ref 489 . T G 494.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.12:528,42,0 1288-ref 503 . G C 595.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.91;MQ0=0;QD=35.01;SB=-0.01;sumGLbyD=36.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.15:628,51,0 1288-ref 526 . C T 521.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.92;MQ0=0;QD=30.69;SB=-0.01;sumGLbyD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.12:555,48,0 1288-ref 548 . 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T C 1021.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.84;SB=-0.01;sumGLbyD=39.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.26:1055,81,0 1288-ref 840 . G A 1030.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4357;MQ=36.64;MQ0=0;QD=36.79;SB=-0.01;sumGLbyD=37.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:28:81.26:1063,81,0 1288-ref 878 . G A 1359.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7005;MQ=36.20;MQ0=0;QD=35.78;SB=-0.01;sumGLbyD=36.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1393,108,0 1288-ref 914 . C G 1517.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6643;MQ=36.24;MQ0=0;QD=37.93;SB=-0.01;sumGLbyD=38.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1550,120,0 1288-ref 950 . A G 980.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.61;MQ0=0;QD=37.70;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.25:1013,78,0 1288-ref 1174 . A C 1361.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=32.16;MQ0=0;QD=34.04;SB=-0.01;sumGLbyD=34.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1395,120,0 1288-ref 1198 . G A 1231.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.09;MQ0=0;QD=33.28;SB=-0.01;sumGLbyD=34.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1264,111,0 1288-ref 1214 . C A 874.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.94;MQ0=0;QD=31.24;SB=-0.01;sumGLbyD=32.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.19:908,84,0 1288-ref 1216 . A G 799.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.23;MQ0=0;QD=30.75;SB=-0.01;sumGLbyD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.17:832,78,0 1288-ref 1324 . A G 1978.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.3658;MQ=36.42;MQ0=0;QD=38.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2011,156,0 1288-ref 1678 . G T 3057.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.6201;MQ=36.46;MQ0=0;QD=35.97;SB=-0.01;sumGLbyD=36.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,84:84:99:3091,213,0 1311-ref 6 . T C 21.42 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.19;SB=-0.01;sumGLbyD=2.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:51.38:51,0,518 1311-ref 246 . G A 6972.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=9.4793;MQ=36.78;MQ0=0;QD=37.28;SB=-40.01;sumGLbyD=37.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:182:99:6971,548,0 1311-ref 468 . T G 5167.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.5800;MQ=33.08;MQ0=0;QD=34.68;SB=-0.01;sumGLbyD=34.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:145:99:5166,436,0 1311-ref 489 . T C 4515.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=132;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8485;MQ=32.28;MQ0=0;QD=34.21;SB=-0.01;sumGLbyD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,131:130:99:4481,388,0 1311-ref 500 . 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A G 4190.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.4888;MQ=35.87;MQ0=0;QD=35.82;SB=-0.01;sumGLbyD=35.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:110:99:4191,331,0 1311-ref 870 . T G 4285.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.4581;MQ=36.82;MQ0=0;QD=37.59;SB=-0.01;sumGLbyD=37.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:112:99:4285,337,0 1311-ref 963 . G A 3439.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.6974;MQ=36.77;MQ0=0;QD=39.09;SB=-0.01;sumGLbyD=39.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:3440,265,0 1311-ref 1085 . T A 2318.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.02;HRun=1;HaplotypeScore=0.9998;MQ=36.67;MQ0=0;QD=38.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2352,181,0 1311-ref 1182 . C T 2701.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.9403;MQ=36.87;MQ0=0;QD=35.54;SB=-0.01;sumGLbyD=35.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:73:99:2734,220,0 1311-ref 1502 . G T 653.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.62;MQ0=0;QD=29.72;SB=-176.72;sumGLbyD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:19:57.16:687,57,0 1311-ref 1537 . T C 69.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.86;MQ0=0;QD=9.94;SB=-0.01;sumGLbyD=14.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:5:24.98:100,0,25 1323-ref 48 . G A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 1323-ref 62 . A G 69.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.05;SB=-0.01;sumGLbyD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:101,9,0 1323-ref 83 . A T 84.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=21.09;SB=-0.01;sumGLbyD=29.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.03:116,9,0 1323-ref 273 . A G 242.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.58;SB=-0.01;sumGLbyD=39.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:275,21,0 1323-ref 379 . G C 584.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.8121;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.75;SB=-0.01;sumGLbyD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:22.83:614,0,23 1323-ref 545 . G A 757.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.87;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.20:790,60,0 1323-ref 624 . T A 306.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=34.03;SB=-0.01;sumGLbyD=37.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:339,27,0 1323-ref 629 . A C 226.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=32.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:259,21,0 1323-ref 633 . C T 224.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=32.02;SB=-0.01;sumGLbyD=36.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:257,21,0 1323-ref 729 . A G 423.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=35.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:456,36,0 1323-ref 737 . T A 609.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.80;MQ0=0;QD=35.85;SB=-0.01;sumGLbyD=37.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:642,51,0 1323-ref 797 . A G 908.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.19;MQ0=0;QD=36.35;SB=-0.01;sumGLbyD=37.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.21:942,75,0 1323-ref 801 . A T 1007.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.64;MQ0=0;QD=35.98;SB=-0.01;sumGLbyD=37.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:27:81.26:1040,81,0 1323-ref 878 . 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T C 1097.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.84;SB=-0.01;sumGLbyD=38.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.28:1130,87,0 1323-ref 1278 . T C 1499.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9973;MQ=36.75;MQ0=0;QD=37.50;SB=-0.01;sumGLbyD=38.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1533,120,0 1323-ref 1293 . C T 1359.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.72;MQ0=0;QD=37.77;SB=-0.01;sumGLbyD=38.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1393,108,0 1323-ref 1632 . G T 1584.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.0988;MQ=36.55;MQ0=0;QD=35.22;SB=-0.01;sumGLbyD=35.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,44:44:92.41:1618,92,0 1323-ref 1852 . A G 11.18 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.9907;MQ=37.00;MQ0=0;QD=0.49;SB=-0.01;sumGLbyD=1.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:40.83:41,0,688 1323-ref 1908 . G C 250.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=31.34;SB=-0.01;sumGLbyD=35.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:284,24,0 1323-ref 1923 . C T 134.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=26.84;SB=-0.01;sumGLbyD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:167,15,0 1323-ref 1936 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 1323-ref 1938 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 1323-ref 1954 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 1323-ref 2000 . C T 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 1323-ref 2042 . C A 147.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.60;SB=-0.01;sumGLbyD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.95:178,0,22 1323-ref 2137 . C T 77.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.90;SB=-0.01;sumGLbyD=36.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 1345-ref 166 . G A 264.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6566;MQ=35.98;MQ0=0;QD=26.48;SB=-0.01;sumGLbyD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:8:24.07:298,24,0 1345-ref 188 . A G 306.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.06;SB=-0.01;sumGLbyD=37.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:340,27,0 1345-ref 304 . A G 211.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.40;SB=-0.01;sumGLbyD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15.93:241,0,16 1345-ref 331 . C T 325.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.18;SB=-0.01;sumGLbyD=39.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:359,27,0 1345-ref 413 . T G 205.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 1345-ref 688 . C T 332.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.26;SB=-0.01;sumGLbyD=33.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:3.02:362,0,3 1345-ref 697 . G T 94.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4683;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.45;SB=-0.01;sumGLbyD=12.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:124,0,205 1345-ref 811 . T C 75.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.21;SB=-0.01;sumGLbyD=5.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:106,0,493 1345-ref 856 . A G 328.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.83;SB=-0.01;sumGLbyD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:6.21:358,0,6 1345-ref 976 . A G 639.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.64;SB=-0.01;sumGLbyD=39.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:673,51,0 1345-ref 994 . G A 277.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.32;SB=-0.01;sumGLbyD=19.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:15:99:307,0,190 1345-ref 1057 . T G 179 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.38;SB=-0.01;sumGLbyD=26.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:55.93:209,0,56 1345-ref 1236 . T G 333.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.83;SB=-0.01;sumGLbyD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:38.24:364,0,38 1345-ref 1300 . C T 323.10 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.37;SB=-0.01;sumGLbyD=32.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:4.69:352,0,5 1345-ref 1319 . A G 150.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4538;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.03;SB=-0.01;sumGLbyD=12.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:180,0,305 1345-ref 1351 . G A 660.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=33.03;SB=-0.01;sumGLbyD=34.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:18:54.17:694,54,0 1345-ref 1362 . T C 205.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.52;MQ0=0;QD=9.77;SB=-0.01;sumGLbyD=11.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:235,0,438 1345-ref 1477 . G A 715.35 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.51;SB=-0.01;sumGLbyD=28.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,23:24:35.45:745,0,35 1345-ref 1556 . G C 980.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7987;MQ=36.70;MQ0=0;QD=28.83;SB=-0.01;sumGLbyD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,29:33:50.42:1010,0,50 1345-ref 1657 . G A 513.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8666;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.68;SB=-0.01;sumGLbyD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:20:52.48:544,0,52 1345-ref 1700 . G A 219.64 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.92;SB=-0.01;sumGLbyD=14.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:250,0,294 1345-ref 1773 . G A 516.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.35;SB=-0.01;sumGLbyD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:28.84:546,0,29 1345-ref 1784 . G C 35.86 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.99;SB=-0.01;sumGLbyD=3.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:65.85:66,0,524 1345-ref 1785 . A T 375.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9953;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.76;SB=-0.01;sumGLbyD=21.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:405,0,218 1345-ref 1860 . C A 109.84 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8661;MQ=35.98;MQ0=0;QD=5.49;SB=-0.01;sumGLbyD=6.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:19:99:140,0,459 1345-ref 1915 . C G 408.30 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9981;MQ=36.40;MQ0=0;QD=24.02;SB=-0.01;sumGLbyD=25.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:93.71:438,0,94 1345-ref 1955 . T G 397.16 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.48;SB=-0.01;sumGLbyD=28.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:14:34.24:427,0,34 1345-ref 2106 . 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G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 1378-ref 805 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 1378-ref 898 . G A 44.31 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.16;SB=-0.01;sumGLbyD=38.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 1378-ref 1002 . G A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 1378-ref 1015 . T C 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 1378-ref 1125 . A G 40.57 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.29;SB=-0.01;sumGLbyD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:72,6,0 1378-ref 1188 . A G 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 1378-ref 1223 . G A 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 1378-ref 1273 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.00;SB=-0.01;sumGLbyD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9.03:120,9,0 1378-ref 1390 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 1378-ref 1591 . A T 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 1396-ref 20 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-38.76;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 1396-ref 26 . A G 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-39.55;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 1396-ref 144 . G A 392 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.67;SB=-0.01;sumGLbyD=35.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.10:425,36,0 1396-ref 150 . T G 256.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=32.07;SB=-0.01;sumGLbyD=36.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:290,24,0 1396-ref 171 . G A 113.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.32;SB=-0.01;sumGLbyD=36.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:146,12,0 1396-ref 197 . A G 80.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.74;SB=-0.01;sumGLbyD=37.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:112,9,0 1396-ref 307 . A G 1451.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=35.81;MQ0=0;QD=33.77;SB=-0.01;sumGLbyD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:40:99:1485,120,0 1396-ref 322 . A G 1318.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6218;MQ=35.46;MQ0=0;QD=32.95;SB=-0.01;sumGLbyD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:36:99:1351,108,0 1396-ref 363 . T G 1404.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8593;MQ=34.45;MQ0=0;QD=31.91;SB=-0.01;sumGLbyD=32.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:89.37:1437,89,0 1396-ref 622 . C A 1659.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.58;SB=-0.01;sumGLbyD=39.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1692,129,0 1396-ref 737 . T C 2086.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=36.65;MQ0=0;QD=35.98;SB=-0.01;sumGLbyD=36.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:57:99:2120,134,0 1396-ref 759 . C T 1603.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7998;MQ=36.57;MQ0=0;QD=34.12;SB=-0.01;sumGLbyD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:44:99:1637,132,0 1396-ref 828 . T C 1161.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=36.39;MQ0=0;QD=35.20;SB=-0.01;sumGLbyD=36.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:69.68:1195,70,0 1396-ref 1191 . G C 3729.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4357;MQ=36.79;MQ0=0;QD=38.06;SB=-0.01;sumGLbyD=38.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:97:99:3730,292,0 1396-ref 1428 . C T 3321.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.8611;MQ=35.63;MQ0=0;QD=36.90;SB=-0.01;sumGLbyD=36.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:88:99:3321,265,0 1396-ref 1463 . G T 2557.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.23;MQ0=0;QD=36.53;SB=-0.01;sumGLbyD=37.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:69:99:2590,208,0 1396-ref 1473 . T G 2536.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8326;MQ=35.18;MQ0=0;QD=37.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2569,205,0 1396-ref 1549 . A T 1851.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.60;MQ0=0;QD=37.04;SB=-0.01;sumGLbyD=37.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:1885,110,0 1396-ref 1557 . C G 1848.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=36.58;MQ0=0;QD=38.51;SB=-0.01;sumGLbyD=39.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1882,144,0 1396-ref 1639 . T C 279.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.97;SB=-0.01;sumGLbyD=39.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:313,24,0 1423-ref 66 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 1423-ref 100 . T C 214.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=26.80;SB=-0.01;sumGLbyD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:247,24,0 1423-ref 120 . T G 174.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.92;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:207,21,0 1423-ref 130 . A G 250.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.11;MQ0=0;QD=27.86;SB=-0.01;sumGLbyD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.06:284,27,0 1423-ref 132 . A C 252.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.11;MQ0=0;QD=28.11;SB=-0.01;sumGLbyD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.06:286,27,0 1423-ref 191 . G T 403.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.68;SB=-0.01;sumGLbyD=39.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:436,33,0 1423-ref 211 . T C 502.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=35.88;SB=-0.01;sumGLbyD=38.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:535,42,0 1423-ref 230 . G C 374.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=34.06;SB=-0.01;sumGLbyD=37.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:408,33,0 1423-ref 268 . T C 396.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=33.04;SB=-0.01;sumGLbyD=35.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.10:429,36,0 1423-ref 276 . 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T A 414.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.12;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.10:447,39,0 1423-ref 405 . G A 411.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.03;MQ0=0;QD=31.62;SB=-0.01;sumGLbyD=34.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.10:444,39,0 1423-ref 462 . A G 712.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.32;MQ0=0;QD=30.96;SB=-0.01;sumGLbyD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:22:66.17:745,66,0 1423-ref 478 . A C 679.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=32.36;SB=-0.01;sumGLbyD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.16:713,63,0 1423-ref 486 . T C 908.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.22;MQ0=0;QD=33.64;SB=-0.01;sumGLbyD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.21:941,81,0 1423-ref 504 . 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G T 47.91 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7005;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.42;SB=-0.01;sumGLbyD=5.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:77.90:78,0,367 1432-ref 186 . C T 25.40 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.21;SB=-0.01;sumGLbyD=2.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:55.38:55,0,650 1432-ref 195 . A T 634.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.66;MQ0=0;QD=27.57;SB=-0.01;sumGLbyD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,19:22:51.60:664,0,52 1432-ref 204 . A C 587.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.53;MQ0=0;QD=27.98;SB=-0.01;sumGLbyD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,18:21:56.83:618,0,57 1432-ref 240 . C T 609.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.18;MQ0=0;QD=35.85;SB=-0.01;sumGLbyD=37.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.15:642,51,0 1432-ref 258 . 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G T 1148.65 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.7049;MQ=36.74;MQ0=0;QD=29.45;SB=-0.01;sumGLbyD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,34:39:81.98:1179,0,82 1432-ref 605 . G T 62.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4189;MQ=36.71;MQ0=0;QD=1.79;SB=-0.01;sumGLbyD=2.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:92.49:92,0,1041 1432-ref 619 . A C 36.74 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.5226;MQ=36.40;MQ0=0;QD=1.08;SB=-0.01;sumGLbyD=1.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:31:66.73:67,0,942 1432-ref 662 . A C 552.40 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.2286;MQ=35.35;MQ0=0;QD=22.10;SB=-0.01;sumGLbyD=23.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:25:99:582,0,203 1432-ref 678 . A G 392.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8661;MQ=35.28;MQ0=0;QD=21.83;SB=-0.01;sumGLbyD=23.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:99:423,0,145 1432-ref 713 . A C 63.74 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.08;SB=-0.01;sumGLbyD=10.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:8:93.73:94,0,176 1432-ref 727 . A G 137.30 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.26;SB=-0.01;sumGLbyD=18.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:167,0,120 1432-ref 729 . G T 171.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=17.11;SB=-0.01;sumGLbyD=20.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:9:92.93:201,0,93 1432-ref 746 . C T 83.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=8.39;SB=-0.01;sumGLbyD=11.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:114,0,187 1432-ref 759 . C G 160.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=16.01;SB=-0.01;sumGLbyD=19.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:190,0,119 1432-ref 785 . 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A C 811.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=29.25;MQ0=0;QD=31.22;SB=-0.01;sumGLbyD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.15:845,78,0 1473-ref 20 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 1473-ref 39 . C G 305.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.94;SB=-0.01;sumGLbyD=37.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:338,27,0 1473-ref 164 . A G 484.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.25;SB=-0.01;sumGLbyD=39.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:517,39,0 1473-ref 304 . C T 782.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.59;SB=-0.01;sumGLbyD=37.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.20:816,66,0 1473-ref 365 . 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C T 1029.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.91;MQ0=0;QD=36.78;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.26:1063,84,0 1473-ref 750 . A C 1074.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.3348;MQ=34.31;MQ0=0;QD=34.65;SB=-0.01;sumGLbyD=35.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.26:1107,90,0 1473-ref 761 . C G 729.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.14;MQ0=0;QD=33.16;SB=-0.01;sumGLbyD=34.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:21:63.18:762,63,0 1473-ref 792 . G T 678.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9726;MQ=32.95;MQ0=0;QD=32.31;SB=-0.01;sumGLbyD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:20:60.16:712,60,0 1473-ref 859 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 1473-ref 1003 . A G 86.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.87;SB=-0.01;sumGLbyD=39.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 1473-ref 1052 . T C 236.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.82;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:270,21,0 1509-ref 151 . G T 191.88 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9998;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.71;SB=-0.01;sumGLbyD=15.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:222,0,235 1509-ref 317 . A G 589.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7465;MQ=36.37;MQ0=0;QD=36.82;SB=-0.01;sumGLbyD=38.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:622,48,0 1509-ref 351 . G C 455.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.22;MQ0=0;QD=35.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:488,39,0 1509-ref 405 . A G 430.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.88;SB=-0.01;sumGLbyD=38.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:464,36,0 1509-ref 436 . A G 350.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.02;SB=-0.01;sumGLbyD=38.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:383,30,0 1509-ref 447 . A G 23.18 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=34.93;MQ0=0;QD=4.64;SB=-0.01;sumGLbyD=10.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:53.15:53,0,103 1509-ref 483 . G C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 1509-ref 522 . C T 126.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 1509-ref 529 . 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T C 415.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.60;SB=-0.01;sumGLbyD=37.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:448,36,0 1511-ref 38 . G T 413.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.48;SB=-0.01;sumGLbyD=37.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:447,36,0 1511-ref 58 . A G 223.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9999;MQ=35.60;MQ0=0;QD=10.15;SB=-0.01;sumGLbyD=11.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:99:253,0,450 1511-ref 81 . A G 1112.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.05;MQ0=0;QD=34.77;SB=-0.01;sumGLbyD=35.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:56.29:1146,56,0 1511-ref 257 . T C 1185.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.93;SB=-0.01;sumGLbyD=36.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:31:93.30:1219,93,0 1511-ref 473 . C G 511.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.0813;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.46;SB=-0.01;sumGLbyD=13.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:39:99:541,0,690 1511-ref 879 . G T 1510.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6649;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.75;SB=-0.01;sumGLbyD=38.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1543,117,0 1511-ref 932 . G T 1830.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.5661;MQ=36.00;MQ0=0;QD=35.89;SB=-0.01;sumGLbyD=36.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:50:99:1863,150,0 1511-ref 977 . C G 444.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=33.22;MQ0=0;QD=31.78;SB=-0.01;sumGLbyD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:478,42,0 1511-ref 979 . T G 282.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=32.73;MQ0=0;QD=28.28;SB=-0.01;sumGLbyD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.07:316,27,0 1515-ref 302 . 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G A 142.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.42;SB=-0.01;sumGLbyD=34.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.02:175,15,0 1515-ref 841 . C A 111.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.85;SB=-0.01;sumGLbyD=36.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:144,12,0 1515-ref 1048 . G A 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 1515-ref 1132 . T C 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 1515-ref 1136 . C A 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 1515-ref 1198 . C T 39.24 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.62;SB=-0.01;sumGLbyD=35.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 1515-ref 1237 . C T 121.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.34;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:154,12,0 1515-ref 1267 . A G 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 1515-ref 1297 . T A 61.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.57;SB=-0.01;sumGLbyD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:94,9,0 1515-ref 1339 . T G 83.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 1543-ref 271 . 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T C 209.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4671;MQ=36.27;MQ0=0;QD=14.98;SB=-0.01;sumGLbyD=17.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:240,0,161 1543-ref 494 . G C 172.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.15;MQ0=0;QD=14.37;SB=-0.01;sumGLbyD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:202,0,192 1543-ref 616 . C T 213.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.37;SB=-0.01;sumGLbyD=22.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:243,0,113 1543-ref 622 . T A 248.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7885;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.67;SB=-0.01;sumGLbyD=23.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:278,0,117 1543-ref 799 . G C 25.96 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.72;MQ0=0;QD=3.24;SB=-0.01;sumGLbyD=6.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55.94:56,0,202 1543-ref 832 . 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C T 1844.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.8127;MQ=36.82;MQ0=0;QD=33.54;SB=-0.01;sumGLbyD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,52:55:46.92:1878,47,0 1567-ref 769 . A G 1984.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8211;MQ=36.46;MQ0=0;QD=35.43;SB=-0.01;sumGLbyD=36.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2017,162,0 1567-ref 786 . T C 1725.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4346;MQ=35.91;MQ0=0;QD=36.70;SB=-0.01;sumGLbyD=37.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:46:99:1758,138,0 1567-ref 854 . T C 1164.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8618;MQ=36.67;MQ0=0;QD=37.58;SB=-0.01;sumGLbyD=38.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.27:1198,93,0 1567-ref 983 . T C 223.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=27.98;SB=-0.01;sumGLbyD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.06:257,21,0 1567-ref 1010 . T C 155.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=25.91;SB=-0.01;sumGLbyD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.04:188,15,0 1567-ref 1074 . G A 37.70 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.85;SB=-0.01;sumGLbyD=34.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:69,6,0 1567-ref 1110 . T A 32.74 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=16.37;SB=-0.01;sumGLbyD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:64,6,0 1567-ref 1147 . A C 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 1567-ref 1178 . C T 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 1567-ref 1269 . 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C T 9732.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=254;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=10.6457;MQ=36.76;MQ0=0;QD=38.32;SB=-0.01;sumGLbyD=38.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,252:249:99:9732,749,0 1598-ref 212 . A G 927.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.67;SB=-0.01;sumGLbyD=36.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:25:75.24:961,75,0 1598-ref 304 . C T 609.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=29.04;SB=-0.01;sumGLbyD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.13:643,63,0 1598-ref 311 . T G 500.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=27.79;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.10:533,54,0 1598-ref 312 . G T 500.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=27.79;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.10:533,54,0 1598-ref 327 . 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C T 259.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.65;SB=-0.01;sumGLbyD=15.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:289,0,334 1694-ref 448 . C A 126.55 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.5774;MQ=36.07;MQ0=0;QD=11.50;SB=-0.01;sumGLbyD=14.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:157,0,207 1694-ref 457 . T A 394.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.84;SB=-0.01;sumGLbyD=38.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:427,33,0 1694-ref 693 . G T 20.86 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=0.91;SB=-0.01;sumGLbyD=2.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:50.82:51,0,703 1694-ref 782 . A G 635.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.41;SB=-0.01;sumGLbyD=39.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:669,51,0 1694-ref 947 . 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A G 2322.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.8577;MQ=36.83;MQ0=0;QD=38.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2356,181,0 1694-ref 2611 . C T 2244.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.70;SB=-0.01;sumGLbyD=39.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2277,175,0 1694-ref 2620 . G A 1149.87 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=62;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=1.7870;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.55;SB=-0.01;sumGLbyD=19.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,37:60:99:1180,0,767 1694-ref 2776 . A G 4156.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.91;MQ0=0;QD=38.85;SB=-0.01;sumGLbyD=38.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:106:99:4156,319,0 1694-ref 2778 . C A 4096.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.91;MQ0=0;QD=38.64;SB=-0.01;sumGLbyD=38.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:4096,319,0 1694-ref 2911 . 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T G 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 1953-ref 1421 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 1953-ref 1430 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 1953-ref 1623 . T A 199.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.22;SB=-0.01;sumGLbyD=38.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:232,18,0 1953-ref 1675 . T G 182.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=30.46;SB=-0.01;sumGLbyD=35.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:216,18,0 1953-ref 1718 . 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A G 850.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.00;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.22:884,69,0 1953-ref 1949 . G A 354.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.47;SB=-0.01;sumGLbyD=38.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:388,30,0 1953-ref 1957 . T C 365.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.56;SB=-0.01;sumGLbyD=39.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:399,30,0 1953-ref 2103 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 1965-ref 134 . T C 558.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.23;SB=-0.01;sumGLbyD=39.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:591,45,0 1965-ref 142 . 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T C 864.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.58;MQ0=0;QD=36.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:23:69.22:897,69,0 1965-ref 1033 . G A 716.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6219;MQ=36.56;MQ0=0;QD=31.17;SB=-0.01;sumGLbyD=32.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:21:63.18:750,63,0 1973-ref 152 . C T 247.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.30;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:280,21,0 1973-ref 169 . G A 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 1973-ref 203 . C A 289.72 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.97;SB=-0.01;sumGLbyD=32.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:7.70:319,0,8 1973-ref 281 . 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A G 6273.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=175;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.4940;MQ=35.41;MQ0=0;QD=35.85;SB=-0.01;sumGLbyD=35.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,172:170:99:6163,428,0 1973-ref 1010 . G A 7006.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.2665;MQ=35.51;MQ0=0;QD=36.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,189:190:99:6902,535,0 1973-ref 1031 . C T 6929.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=189;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.3429;MQ=35.76;MQ0=0;QD=36.66;SB=-0.01;sumGLbyD=36.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,188:184:99:6896,521,0 1973-ref 1113 . A T 8147.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=213;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=11.1473;MQ=36.95;MQ0=0;QD=38.25;SB=-0.01;sumGLbyD=37.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,210:210:99:8056,594,0 1973-ref 1179 . A C 7673.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=10.7259;MQ=36.95;MQ0=0;QD=37.80;SB=-0.01;sumGLbyD=37.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,200:199:99:7639,564,0 1973-ref 1379 . A G 7233.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=194;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.5733;MQ=36.69;MQ0=0;QD=37.29;SB=-0.01;sumGLbyD=36.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,192:191:99:7153,495,0 1973-ref 1427 . T A 8645.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.1356;MQ=36.82;MQ0=0;QD=38.26;SB=-0.01;sumGLbyD=37.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,222:226:99:8507,542,0 1973-ref 1515 . A G 10848.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=280;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.7844;MQ=36.75;MQ0=0;QD=38.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,278:278:99:10812,801,0 1973-ref 1541 . A T 9739 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=255;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=16.0974;MQ=36.76;MQ0=0;QD=38.19;SB=-0.01;sumGLbyD=37.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,250:251:99:9621,638,0 1973-ref 1609 . C T 10205.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=266;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.6757;MQ=36.85;MQ0=0;QD=38.37;SB=-0.01;sumGLbyD=38.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,264:264:99:10141,788,0 1973-ref 1677 . T C 4115.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=211;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=32.6886;MQ=36.81;MQ0=0;QD=19.51;SB=-0.01;sumGLbyD=16.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,112:201:99:3510,0,2972 1973-ref 1728 . G A 4080.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.8486;MQ=36.82;MQ0=0;QD=37.44;SB=-0.01;sumGLbyD=36.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,106:108:99:4007,252,0 1973-ref 1810 . T C 3350.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.88;MQ0=0;QD=38.51;SB=-0.01;sumGLbyD=38.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:3350,262,0 1973-ref 1883 . T C 1506.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.8880;MQ=35.66;MQ0=0;QD=32.75;SB=-40.01;sumGLbyD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,43:45:56.07:1540,56,0 1973-ref 1925 . T A 95.80 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9980;MQ=34.78;MQ0=0;QD=3.42;SB=3.00;sumGLbyD=4.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,7:28:99:126,0,746 1973-ref 1926 . A G 66.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.4672;MQ=34.69;MQ0=0;QD=2.46;SB=3.00;sumGLbyD=3.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,6:27:96.50:96,0,741 1973-ref 1927 . G T 66.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=3.4672;MQ=34.69;MQ0=0;QD=2.46;SB=3.00;sumGLbyD=3.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,6:27:96.50:97,0,732 1973-ref 1951 . C T 357.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.80;SB=-0.01;sumGLbyD=39.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:391,30,0 1973-ref 1952 . A C 60.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.68;SB=-0.01;sumGLbyD=10.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:90.07:90,0,213 1973-ref 1960 . T A 162.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.51;SB=-0.01;sumGLbyD=39.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:195,15,0 1973-ref 1964 . T C 71.36 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.84;SB=-0.01;sumGLbyD=25.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25.76:101,0,26 1974-ref 213 . A T 8207.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=392;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=19.8249;MQ=36.79;MQ0=0;QD=20.94;SB=-0.01;sumGLbyD=17.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:171,219:384:99:7050,0,5529 1974-ref 234 . C T 12769.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=341;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=17.2754;MQ=36.76;MQ0=0;QD=37.45;SB=-0.01;sumGLbyD=37.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,339:332:99:12728,959,0 1974-ref 399 . G T 12852.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=329;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=17.1454;MQ=36.94;MQ0=0;QD=39.06;SB=-0.01;sumGLbyD=38.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,328:327:99:12812,944,0 1974-ref 535 . A G 9162.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=241;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.8055;MQ=36.92;MQ0=0;QD=38.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,237:241:99:9012,602,0 1974-ref 636 . A T 8611.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=233;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=13.9358;MQ=36.74;MQ0=0;QD=36.96;SB=-0.01;sumGLbyD=36.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,233:223:99:8611,671,0 1974-ref 686 . G C 6525.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=178;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.9053;MQ=36.77;MQ0=0;QD=36.66;SB=-0.01;sumGLbyD=36.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,178:171:99:6525,515,0 1974-ref 819 . A G 6108.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.5759;MQ=35.70;MQ0=0;QD=37.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,164:163:99:6108,490,0 1974-ref 834 . G T 6467.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8245;MQ=35.74;MQ0=0;QD=38.05;SB=-0.01;sumGLbyD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,169:170:99:6436,509,0 1974-ref 854 . C T 5784.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=35.46;MQ0=0;QD=38.05;SB=-0.01;sumGLbyD=38.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,152:151:99:5784,454,0 1974-ref 1033 . 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G A 351.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=32.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.08:384,36,0 1975-ref 109 . T C 452.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.69;MQ0=0;QD=30.19;SB=-0.01;sumGLbyD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.10:486,45,0 1975-ref 139 . T C 388.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.69;MQ0=0;QD=25.88;SB=-0.01;sumGLbyD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:15.48:421,15,0 1975-ref 165 . C T 153.88 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9989;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.39;SB=-0.01;sumGLbyD=18.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:8:5.58:183,0,6 1975-ref 166 . A G 100.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9989;MQ=25.00;MQ0=0;QD=12.53;SB=-0.01;sumGLbyD=16.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:11.59:130,0,12 1975-ref 181 . C T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 1975-ref 187 . G A 563.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.92;MQ0=0;QD=33.14;SB=-0.01;sumGLbyD=35.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.13:596,51,0 1975-ref 191 . G A 771.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.33;MQ0=0;QD=33.54;SB=-0.01;sumGLbyD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.18:804,69,0 1975-ref 242 . G A 4377.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=1.5774;MQ=35.06;MQ0=0;QD=37.42;SB=-0.01;sumGLbyD=37.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:116:99:4377,349,0 1975-ref 260 . A G 5538.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.4812;MQ=35.61;MQ0=0;QD=37.68;SB=-0.01;sumGLbyD=37.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:145:99:5538,436,0 1975-ref 282 . 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G T 6266.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=174;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.8661;MQ=36.29;MQ0=0;QD=36.02;SB=-0.01;sumGLbyD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,174:167:99:6266,502,0 1975-ref 632 . A G 8225.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=220;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=15.9437;MQ=36.49;MQ0=0;QD=37.39;SB=-40.01;sumGLbyD=37.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,219:218:99:8224,656,0 1975-ref 685 . C G 4512.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=10.2148;MQ=34.12;MQ0=0;QD=35.53;SB=-0.01;sumGLbyD=35.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:125:99:4512,376,0 1975-ref 699 . G A 3226.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8937;MQ=33.20;MQ0=0;QD=35.07;SB=-0.01;sumGLbyD=35.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3259,277,0 1975-ref 708 . G A 2182.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.9713;MQ=32.03;MQ0=0;QD=33.58;SB=-0.01;sumGLbyD=34.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:64:99:2216,192,0 1975-ref 726 . A G 233.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.96;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.05:267,27,0 1975-ref 742 . G A 322.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=26.87;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.07:355,36,0 1975-ref 755 . G A 1238.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=28.81;SB=-0.01;sumGLbyD=29.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1272,129,0 1975-ref 763 . G A 1424.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.50;MQ0=0;QD=29.67;SB=-0.01;sumGLbyD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1457,144,0 1975-ref 790 . G A 2277.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9784;MQ=29.32;MQ0=0;QD=31.20;SB=-0.01;sumGLbyD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,72:73:99:2310,181,0 1975-ref 814 . T A 1935.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9998;MQ=29.94;MQ0=0;QD=30.72;SB=-0.01;sumGLbyD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,62:62:99:1968,146,0 1975-ref 840 . C T 748.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.34;MQ0=0;QD=28.78;SB=-0.01;sumGLbyD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:25:35.18:781,35,0 1975-ref 848 . G A 208.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=26.06;SB=-0.01;sumGLbyD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.03:241,24,0 1975-ref 850 . A G 96.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:129,12,0 2013-ref 139 . T C 982.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:26:78.25:1015,78,0 2013-ref 201 . G C 1174.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=36.68;MQ0=0;QD=36.70;SB=-0.01;sumGLbyD=37.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:31:93.30:1207,93,0 2013-ref 204 . G A 1034.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9987;MQ=36.66;MQ0=0;QD=34.48;SB=-0.01;sumGLbyD=35.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:30:52.93:1067,53,0 2013-ref 329 . C A 95.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.3304;MQ=36.01;MQ0=0;QD=3.10;SB=-0.01;sumGLbyD=4.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,6:31:99:126,0,863 2013-ref 353 . A G 22.02 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.30;MQ0=0;QD=0.76;SB=-0.01;sumGLbyD=1.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:51.98:52,0,883 2013-ref 417 . A G 124.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9301;MQ=34.73;MQ0=0;QD=3.88;SB=-0.01;sumGLbyD=4.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,8:31:99:154,0,821 2013-ref 442 . 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G A 36.42 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.7546;MQ=35.05;MQ0=0;QD=0.98;SB=-0.01;sumGLbyD=1.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,6:37:66.41:66,0,1085 2013-ref 576 . C T 100.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.0572;MQ=34.93;MQ0=0;QD=2.50;SB=-0.01;sumGLbyD=3.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,8:39:99:130,0,1075 2013-ref 623 . T C 179.04 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6983;MQ=36.54;MQ0=0;QD=4.07;SB=-0.01;sumGLbyD=4.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,9:42:99:209,0,1163 2013-ref 628 . T C 1319.37 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6983;MQ=36.59;MQ0=0;QD=26.93;SB=-0.01;sumGLbyD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,40:47:99:1349,0,196 2013-ref 712 . T C 445.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6372;MQ=36.60;MQ0=0;QD=8.74;SB=-0.01;sumGLbyD=9.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,16:49:99:476,0,1089 2013-ref 768 . A G 400.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.19;MQ0=0;QD=15.41;SB=-0.01;sumGLbyD=16.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:431,0,350 2013-ref 780 . A C 152.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.30;MQ0=0;QD=7.62;SB=-0.01;sumGLbyD=9.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:182,0,416 2013-ref 781 . A G 124.55 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.85;MQ0=0;QD=6.23;SB=-0.01;sumGLbyD=7.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:155,0,455 2013-ref 782 . C T 396.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=15.9922;MQ=33.48;MQ0=0;QD=22.04;SB=-0.01;sumGLbyD=23.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:14:11.19:427,0,11 2013-ref 788 . C T 34.36 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9989;MQ=34.69;MQ0=0;QD=1.91;SB=-0.01;sumGLbyD=3.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:64.35:64,0,486 2013-ref 845 . T C 29.06 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.84;SB=-0.01;sumGLbyD=9.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59.05:59,0,141 2013-ref 863 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 2013-ref 877 . G C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 2013-ref 910 . C T 30.64 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=10.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20.60:61,0,21 2013-ref 955 . A G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 2013-ref 984 . A G 38.78 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.93;SB=-0.01;sumGLbyD=22.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:69,0,31 2013-ref 1012 . A G 34.97 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.99;SB=-0.01;sumGLbyD=12.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64.96:65,0,104 2013-ref 1038 . C T 84.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:117,9,0 2013-ref 1046 . C G 49.55 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=4.96;SB=-0.01;sumGLbyD=7.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:79.55:80,0,232 2013-ref 1050 . C T 239.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=21.73;SB=-0.01;sumGLbyD=24.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:74.33:269,0,74 2013-ref 1087 . G A 833.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=29.76;SB=-0.01;sumGLbyD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:27:81.18:866,81,0 2013-ref 1088 . A G 929.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.58;MQ0=0;QD=29.98;SB=-0.01;sumGLbyD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:30:90.20:963,90,0 2013-ref 1104 . G A 137.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=30.85;MQ0=0;QD=3.34;SB=-0.01;sumGLbyD=4.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,9:40:99:167,0,939 2013-ref 1123 . C T 1961.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=32.49;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=34.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:1994,171,0 2013-ref 1129 . G A 1903.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.62;MQ0=0;QD=35.92;SB=-0.01;sumGLbyD=36.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:1937,159,0 2013-ref 1191 . A G 1256.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7976;MQ=34.01;MQ0=0;QD=35.91;SB=-0.01;sumGLbyD=36.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1290,105,0 2013-ref 1204 . A C 997.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.58;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=35.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.23:1031,87,0 2013-ref 1216 . A G 1056.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.51;MQ0=0;QD=34.08;SB=-0.01;sumGLbyD=35.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.25:1090,93,0 2013-ref 1245 . T C 1342 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.20;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=35.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1375,117,0 2013-ref 1248 . G A 1111.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=34.24;MQ0=0;QD=32.69;SB=-0.01;sumGLbyD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:31:93.27:1145,93,0 2013-ref 1281 . A T 969.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.82;MQ0=0;QD=37.30;SB=-0.01;sumGLbyD=38.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.24:1003,78,0 2026-ref 45 . G C 507.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.27;SB=-0.01;sumGLbyD=38.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.12:541,42,0 2026-ref 313 . A T 1434.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.1195;MQ=36.75;MQ0=0;QD=34.98;SB=-0.01;sumGLbyD=35.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:40:87.75:1467,88,0 2026-ref 824 . C T 1912.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.7820;MQ=31.66;MQ0=0;QD=32.42;SB=-0.01;sumGLbyD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,58:59:99:1946,137,0 2026-ref 865 . A G 2662.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.7176;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.48;SB=-0.01;sumGLbyD=36.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,72:71:99:2696,174,0 2026-ref 929 . G A 2339.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9652;MQ=36.69;MQ0=0;QD=35.44;SB=-0.01;sumGLbyD=35.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,65:63:99:2372,150,0 2026-ref 1034 . C T 3797.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.8299;MQ=36.91;MQ0=0;QD=35.49;SB=-0.01;sumGLbyD=35.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,106:102:99:3759,269,0 2026-ref 1096 . C T 3871.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.2004;MQ=36.90;MQ0=0;QD=38.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:100:99:3835,265,0 2026-ref 1135 . A G 3498.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.8659;MQ=36.89;MQ0=0;QD=39.31;SB=-0.01;sumGLbyD=38.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:89:99:3461,265,0 2026-ref 1191 . C A 4247.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.1662;MQ=36.82;MQ0=0;QD=38.27;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,109:110:99:4180,288,0 2026-ref 1660 . 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A G 1907.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=29.03;MQ0=0;QD=29.35;SB=-0.01;sumGLbyD=29.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,63:64:99:1941,127,0 2026-ref 1930 . T C 1990.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.85;MQ0=0;QD=30.62;SB=-0.01;sumGLbyD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,62:63:99:2024,113,0 2026-ref 1965 . T C 1857.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=8.1507;MQ=34.20;MQ0=0;QD=33.16;SB=-0.01;sumGLbyD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,54:56:88.47:1890,88,0 2026-ref 2082 . A T 19.09 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9987;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.36;SB=-0.01;sumGLbyD=16.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:49,0,31 2052-ref 29 . T G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 2052-ref 532 . 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C T 430.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=27.65;MQ0=0;QD=26.92;SB=-0.01;sumGLbyD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.09:464,45,0 2054-ref 525 . T C 354.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8664;MQ=27.65;MQ0=0;QD=22.14;SB=-0.01;sumGLbyD=24.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:5.09:385,5,0 2054-ref 536 . G A 413.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9545;MQ=29.55;MQ0=0;QD=27.56;SB=-0.01;sumGLbyD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:14:42.09:446,42,0 2054-ref 597 . C A 114.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.42;SB=-0.01;sumGLbyD=5.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,6:26:99:145,0,689 2054-ref 667 . C T 710.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.03;MQ0=0;QD=33.84;SB=-0.01;sumGLbyD=35.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:37.50:744,38,0 2054-ref 712 . C G 1237.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9038;MQ=36.39;MQ0=0;QD=37.50;SB=-0.01;sumGLbyD=38.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1271,99,0 2054-ref 726 . A G 1095.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.77;SB=-0.01;sumGLbyD=38.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.28:1128,87,0 2054-ref 864 . G A 1102.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.75;SB=-0.01;sumGLbyD=37.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:29:87.28:1135,87,0 2054-ref 871 . G A 1073.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.66;MQ0=0;QD=35.79;SB=-0.01;sumGLbyD=36.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:29:87.25:1107,87,0 2054-ref 908 . G A 1289.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8319;MQ=36.74;MQ0=0;QD=33.08;SB=-0.01;sumGLbyD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:37:71.32:1323,71,0 2054-ref 1122 . A G 1065.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.65;MQ0=0;QD=36.73;SB=-0.01;sumGLbyD=37.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:28:84.27:1098,84,0 2054-ref 1137 . T G 610.66 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.66;MQ0=0;QD=20.36;SB=-0.01;sumGLbyD=21.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:28:99:641,0,265 2054-ref 1195 . A C 952.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.29;SB=-0.01;sumGLbyD=36.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:25:75.24:986,75,0 2054-ref 1196 . A C 962.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.66;SB=-0.01;sumGLbyD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:25:75.25:996,75,0 2054-ref 1303 . A T 1267.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8319;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.22;SB=-0.01;sumGLbyD=36.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:68.33:1301,68,0 2054-ref 1345 . A G 1533.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8625;MQ=34.78;MQ0=0;QD=36.51;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1567,126,0 2054-ref 1376 . A G 350.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.84;MQ0=0;QD=14.60;SB=-0.01;sumGLbyD=15.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,12:24:99:380,0,336 2054-ref 1393 . A G 311.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=31.15;SB=-0.01;sumGLbyD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:345,30,0 2054-ref 1397 . G A 260.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.91;MQ0=0;QD=28.98;SB=-0.01;sumGLbyD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.06:294,27,0 2054-ref 1401 . T A 43.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=8.77;SB=-0.01;sumGLbyD=14.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:44.22:74,0,44 2054-ref 1403 . 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G A 254.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=9.77;SB=-0.01;sumGLbyD=10.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:284,0,554 2054-ref 1570 . T A 550.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.70;SB=-0.01;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:584,45,0 2054-ref 1587 . G T 202.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.92;SB=-0.01;sumGLbyD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.06:235,18,0 2054-ref 1593 . G A 126.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 2077-ref 32 . C T 906.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=34.88;MQ0=0;QD=23.23;SB=-0.01;sumGLbyD=24.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,29:39:99:936,0,266 2077-ref 34 . 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T A 81.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=17.3111;MQ=33.70;MQ0=0;QD=0.95;SB=-0.01;sumGLbyD=1.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,13:81:99:112,0,2278 2077-ref 149 . C A 1260.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=14.3382;MQ=33.42;MQ0=0;QD=20.32;SB=-0.01;sumGLbyD=20.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:60:99:1293,111,0 2077-ref 154 . T G 121.65 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=15.4811;MQ=33.10;MQ0=0;QD=2.48;SB=-0.01;sumGLbyD=3.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,9:47:99:152,0,1166 2077-ref 161 . C T 44.57 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.9921;MQ=33.02;MQ0=0;QD=1.39;SB=-0.01;sumGLbyD=2.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,6:32:74.56:75,0,837 2181-ref 75 . A T 4415.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8662;MQ=36.82;MQ0=0;QD=39.07;SB=-0.01;sumGLbyD=38.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:4377,302,0 2181-ref 106 . G A 9161.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=240;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.7330;MQ=36.92;MQ0=0;QD=38.17;SB=-592.63;sumGLbyD=37.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,238:237:99:9084,635,0 2181-ref 109 . A G 9481.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.7330;MQ=36.92;MQ0=0;QD=38.23;SB=-664.00;sumGLbyD=37.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,246:244:99:9411,691,0 2181-ref 142 . G A 19928.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=525;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=17.2076;MQ=36.71;MQ0=0;QD=37.96;SB=-671.66;sumGLbyD=37.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,522:516:99:19888,1513,0 2181-ref 191 . C T 31625.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=839;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=55.3936;MQ=36.75;MQ0=0;QD=37.69;SB=-0.01;sumGLbyD=37.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,836:823:99:31623,2477,0 2181-ref 294 . A C 34995.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=944;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=45.6824;MQ=36.74;MQ0=0;QD=37.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,942:922:99:34962,2772,0 2181-ref 333 . C T 37999.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=38.8737;MQ=36.65;MQ0=0;QD=38.00;SB=-0.01;sumGLbyD=37.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,997:983:99:37919,2952,0 2181-ref 394 . C G 30084.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=831;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=19.8360;MQ=34.72;MQ0=0;QD=36.20;SB=-29.63;sumGLbyD=36.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,829:812:99:30081,2443,0 2181-ref 401 . C T 30039.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=846;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=25.1926;MQ=34.11;MQ0=0;QD=35.51;SB=-0.01;sumGLbyD=35.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,841:828:99:29971,2427,0 2181-ref 437 . A T 21045.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=632;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.1393;MQ=32.53;MQ0=0;QD=33.30;SB=-29.63;sumGLbyD=33.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,627:615:99:20937,1841,0 2181-ref 451 . A G 20889.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=641;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.0838;MQ=32.85;MQ0=0;QD=32.59;SB=-0.01;sumGLbyD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,636:613:99:20816,1803,0 2181-ref 468 . C G 26761.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=765;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=24.7306;MQ=35.22;MQ0=0;QD=34.98;SB=-0.01;sumGLbyD=34.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,761:733:99:26700,2173,0 2181-ref 507 . A C 34930.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=925;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=29.2095;MQ=36.66;MQ0=0;QD=37.76;SB=-0.01;sumGLbyD=37.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,922:913:99:34927,2747,0 2181-ref 615 . T C 33755.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=999;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=69.3256;MQ=36.74;MQ0=0;QD=33.79;SB=-29.63;sumGLbyD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,991:906:99:33641,2643,0 2181-ref 669 . C T 33803.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=960;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=42.4486;MQ=36.47;MQ0=0;QD=35.21;SB=-0.01;sumGLbyD=35.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,955:923:99:33682,2696,0 2181-ref 702 . G C 36789.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=999;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=53.0873;MQ=36.54;MQ0=0;QD=36.83;SB=-63.98;sumGLbyD=36.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,997:969:99:36787,2916,0 2181-ref 765 . G C 36499.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=83.5398;MQ=36.55;MQ0=0;QD=36.50;SB=-0.01;sumGLbyD=36.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,990:968:99:36303,2809,0 2181-ref 813 . T C 36828.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=997;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=52.1153;MQ=36.67;MQ0=0;QD=36.94;SB=-34.36;sumGLbyD=36.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,993:972:99:36825,2925,0 2181-ref 1020 . G A 33831.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=895;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=44.5623;MQ=36.89;MQ0=0;QD=37.80;SB=-40.01;sumGLbyD=37.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,888:878:99:33685,2531,0 2181-ref 1143 . C T 31252.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=821;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=61.0836;MQ=36.74;MQ0=0;QD=38.07;SB=-40.01;sumGLbyD=37.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,817:811:99:31144,2361,0 2181-ref 1201 . G A 20093.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=522;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=45.0975;MQ=36.52;MQ0=0;QD=38.49;SB=-29.63;sumGLbyD=38.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,518:516:99:20092,1553,0 2181-ref 1253 . T G 12.73 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.16;SB=-0.01;sumGLbyD=3.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:42.49:42,0,307 2196-ref 526 . T C 3058.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.6062;MQ=23.37;MQ0=0;QD=26.83;SB=-0.01;sumGLbyD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:111:99:3092,333,0 2196-ref 752 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,2:1:1.76:40,3,0 2196-ref 753 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,2:1:1.76:40,3,0 2196-ref 841 . C T 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 2196-ref 910 . 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G A 36.18 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.09;SB=-0.01;sumGLbyD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:67,6,0 2196-ref 1337 . T G 163.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9789;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.28;SB=-0.01;sumGLbyD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.05:196,15,0 2196-ref 1486 . A G 78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.50;SB=-0.01;sumGLbyD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:22.31:108,0,22 2196-ref 1490 . A G 72.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.55;SB=-0.01;sumGLbyD=20.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:57.10:103,0,57 2228-ref 70 . G A 236.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.79;SB=-0.01;sumGLbyD=38.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:269,21,0 2228-ref 113 . C T 162.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=27.07;SB=-0.01;sumGLbyD=32.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.02:195,18,0 2228-ref 126 . A T 172.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=28.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:205,18,0 2228-ref 154 . T G 230.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.07;MQ0=0;QD=28.84;SB=-0.01;sumGLbyD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:264,24,0 2228-ref 167 . C T 232.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.07;MQ0=0;QD=29.03;SB=-0.01;sumGLbyD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:265,24,0 2228-ref 183 . A G 176.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=29.34;SB=-0.01;sumGLbyD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:209,18,0 2228-ref 219 . T C 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 2228-ref 375 . G A 745.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.26;SB=-0.01;sumGLbyD=38.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:778,60,0 2228-ref 425 . T G 393.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.75;SB=-0.01;sumGLbyD=38.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:426,33,0 2228-ref 480 . T C 460.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=35.46;SB=-0.01;sumGLbyD=38.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:494,39,0 2228-ref 518 . C T 517.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.21;MQ0=0;QD=34.51;SB=-0.01;sumGLbyD=36.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:551,45,0 2228-ref 527 . G A 487.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.21;MQ0=0;QD=32.47;SB=-0.01;sumGLbyD=34.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.12:520,42,0 2228-ref 561 . A G 600.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.18;MQ0=0;QD=35.30;SB=-40.01;sumGLbyD=37.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.15:633,51,0 2228-ref 653 . T C 467.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=35.96;SB=-0.01;sumGLbyD=38.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:501,39,0 2228-ref 745 . A G 441.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.80;SB=-0.01;sumGLbyD=39.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:475,36,0 2228-ref 784 . T C 442.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.88;SB=-0.01;sumGLbyD=39.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:476,36,0 2228-ref 821 . T C 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-39.76;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 2228-ref 839 . C T 325.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.18;SB=-40.00;sumGLbyD=39.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:359,27,0 2228-ref 876 . G A 364.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.49;SB=-0.01;sumGLbyD=39.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:398,30,0 2228-ref 906 . T C 199.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:233,18,0 2228-ref 914 . T C 80.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.71;SB=-0.01;sumGLbyD=37.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:112,9,0 2228-ref 925 . T A 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 2228-ref 936 . G A 318.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.41;SB=-0.01;sumGLbyD=39.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:352,27,0 2228-ref 958 . A G 395.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:428,33,0 2228-ref 1007 . G T 323 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.07;MQ0=0;QD=29.36;SB=-0.01;sumGLbyD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:0.33:351,0,0 2228-ref 1046 . A G 344.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=31.28;SB=-40.00;sumGLbyD=34.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.09:377,30,0 2228-ref 1074 . A C 431.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.78;MQ0=0;QD=30.82;SB=-28.65;sumGLbyD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.11:465,39,0 2228-ref 1144 . A T 1113.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.10;SB=-0.01;sumGLbyD=38.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:30:87.28:1146,87,0 2228-ref 1259 . G A 1302.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.8853;MQ=35.86;MQ0=0;QD=35.19;SB=-0.01;sumGLbyD=36.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:36:80.67:1335,81,0 2228-ref 1301 . T C 502.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.1324;MQ=30.99;MQ0=0;QD=19.32;SB=-0.01;sumGLbyD=20.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,18:25:99:532,0,146 2228-ref 1341 . G A 323.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.66;MQ0=0;QD=32.37;SB=-27.66;sumGLbyD=35.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:357,30,0 2228-ref 1353 . C A 367.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.88;MQ0=0;QD=33.40;SB=-27.67;sumGLbyD=36.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:400,33,0 2228-ref 1641 . T C 1327.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6994;MQ=35.87;MQ0=0;QD=36.87;SB=-0.01;sumGLbyD=37.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1360,108,0 2228-ref 1665 . G T 1718.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.80;SB=-199.35;sumGLbyD=36.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:47:99:1752,141,0 2228-ref 1692 . G A 781.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.54;MQ0=0;QD=35.51;SB=-192.26;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.20:814,66,0 2228-ref 1836 . G C 232.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.28;SB=-79.82;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:266,21,0 2228-ref 1866 . 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A G 997.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.35;SB=-0.01;sumGLbyD=39.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.25:1030,78,0 2230-ref 127 . A T 1287.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.70;MQ0=0;QD=37.86;SB=-0.01;sumGLbyD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1320,102,0 2230-ref 215 . A G 1211.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.73;SB=-0.01;sumGLbyD=37.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:32:96.31:1245,96,0 2230-ref 317 . G A 1826.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.8620;MQ=35.96;MQ0=0;QD=37.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1860,147,0 2230-ref 342 . A G 1851.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4538;MQ=35.96;MQ0=0;QD=37.79;SB=-0.01;sumGLbyD=38.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1885,147,0 2230-ref 368 . A G 1812.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9644;MQ=36.38;MQ0=0;QD=37.00;SB=-0.01;sumGLbyD=37.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:48:99:1846,144,0 2230-ref 438 . T G 1866.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.79;MQ0=0;QD=38.09;SB=-0.01;sumGLbyD=38.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1899,147,0 2230-ref 506 . T C 2027.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7778;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.57;SB=-0.01;sumGLbyD=36.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:55:99:2060,162,0 2230-ref 551 . A G 1123.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=57;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7875;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.72;SB=-0.01;sumGLbyD=20.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,34:57:99:1154,0,705 2230-ref 614 . G T 2745.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6828;MQ=36.73;MQ0=0;QD=37.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:72:99:2779,217,0 2230-ref 923 . T C 3712.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.5083;MQ=36.69;MQ0=0;QD=37.88;SB=-0.01;sumGLbyD=37.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:97:99:3672,252,0 2230-ref 939 . G A 3683.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9660;MQ=36.69;MQ0=0;QD=37.97;SB=-0.01;sumGLbyD=37.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:97:99:3645,254,0 2230-ref 1042 . T A 3695.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=3.9591;MQ=36.90;MQ0=0;QD=37.71;SB=-0.01;sumGLbyD=37.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:96:99:3656,250,0 2230-ref 1171 . G A 2805.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.6971;MQ=36.33;MQ0=0;QD=36.91;SB=-0.01;sumGLbyD=37.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:2838,220,0 2230-ref 1175 . T C 2743.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8578;MQ=36.30;MQ0=0;QD=37.58;SB=-0.01;sumGLbyD=38.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:72:99:2776,217,0 2230-ref 1187 . A G 898.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=67;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9931;MQ=36.55;MQ0=0;QD=13.41;SB=-0.01;sumGLbyD=13.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,30:66:99:928,0,1237 2230-ref 1254 . T A 27.45 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.04;HRun=4;HaplotypeScore=6.7816;MQ=36.82;MQ0=0;QD=0.50;SB=-0.01;sumGLbyD=1.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,7:52:57.43:57,0,1625 2230-ref 1294 . G A 3692.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.0353;MQ=36.59;MQ0=0;QD=37.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:95:99:3692,286,0 2230-ref 1306 . A T 1525.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=105;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.7333;MQ=36.61;MQ0=0;QD=14.52;SB=-0.01;sumGLbyD=14.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:102:99:1555,0,1832 2230-ref 1336 . C T 4050 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.4403;MQ=36.72;MQ0=0;QD=36.82;SB=-0.01;sumGLbyD=36.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,109:107:99:4050,322,0 2230-ref 1548 . T G 222.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.4528;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.96;SB=-0.01;sumGLbyD=7.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:31:99:253,0,766 2230-ref 1550 . G T 105.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.4529;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.52;SB=-0.01;sumGLbyD=4.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,6:30:99:136,0,857 2230-ref 1552 . T A 83.65 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.4529;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.88;SB=-0.01;sumGLbyD=3.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:28:99:114,0,807 2230-ref 1554 . C G 847.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.4531;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.32;SB=-0.01;sumGLbyD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:877,0,130 2230-ref 1652 . T C 152.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=25.36;SB=-0.01;sumGLbyD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.04:185,15,0 2230-ref 1675 . T A 27.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.26;SB=-0.01;sumGLbyD=19.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28.77:58,0,29 2230-ref 1677 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 2308-ref 32 . G A 894.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=37.26;SB=-0.01;sumGLbyD=38.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.23:927,72,0 2308-ref 60 . A G 1190.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5508;MQ=36.42;MQ0=0;QD=34.03;SB=-0.01;sumGLbyD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:35:96.30:1224,96,0 2308-ref 320 . T C 982.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.68;SB=-0.01;sumGLbyD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,28:31:26.71:1012,0,27 2308-ref 426 . A G 2051.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.4104;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.00;SB=-0.01;sumGLbyD=36.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:57:99:2085,140,0 2308-ref 563 . T C 1524.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.0883;MQ=36.76;MQ0=0;QD=36.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:92.96:1558,93,0 2308-ref 608 . C T 1375.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.75;MQ0=0;QD=34.38;SB=-0.01;sumGLbyD=35.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,38:40:48.83:1408,49,0 2308-ref 647 . A G 1699.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.63;SB=-0.01;sumGLbyD=39.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1733,132,0 2308-ref 800 . T C 2257.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=36.21;MQ0=0;QD=35.27;SB=-0.01;sumGLbyD=35.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,62:63:99:2290,126,0 2308-ref 806 . T C 2278.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=37.97;SB=-0.01;sumGLbyD=38.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2311,181,0 2308-ref 857 . T C 2223.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.6033;MQ=35.68;MQ0=0;QD=35.86;SB=-0.01;sumGLbyD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,61:62:99:2256,147,0 2308-ref 866 . A G 2346.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9830;MQ=35.74;MQ0=0;QD=36.09;SB=-0.01;sumGLbyD=36.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:64:99:2379,153,0 2308-ref 1001 . T C 2846.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8311;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.49;SB=-0.01;sumGLbyD=36.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,76:78:99:2879,155,0 2308-ref 1067 . G A 2341.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.6961;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.59;SB=-0.01;sumGLbyD=37.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:62:99:2375,152,0 2331-ref 284 . A G 115.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.98;SB=-0.01;sumGLbyD=37.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:148,12,0 2331-ref 453 . C T 40.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.43;SB=-0.01;sumGLbyD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:70,0,31 2331-ref 578 . G C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 2331-ref 584 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 2331-ref 593 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 2331-ref 602 . C G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 2331-ref 673 . G A 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29.55:71,0,30 2331-ref 681 . A G 136.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=27.23;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:169,15,0 2331-ref 719 . A G 125.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=25.15;SB=-0.01;sumGLbyD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:158,15,0 2331-ref 745 . G C 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 2331-ref 749 . A G 17.31 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=27.82;MQ0=0;QD=3.46;SB=-0.01;sumGLbyD=9.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:5:47.22:47,0,58 2331-ref 759 . G T 110.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=27.62;SB=-0.01;sumGLbyD=35.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:143,12,0 2331-ref 920 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 2331-ref 959 . A G 36.55 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.14;SB=-0.01;sumGLbyD=16.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66.54:67,0,68 2331-ref 969 . C T 35.77 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.94;SB=-0.01;sumGLbyD=16.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65.76:66,0,68 2331-ref 995 . T G 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.94;SB=-0.01;sumGLbyD=20.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:8:12.04:160,12,0 2331-ref 1027 . A T 72.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.55;SB=-0.01;sumGLbyD=20.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.96:103,0,65 2331-ref 1162 . G C 35.34 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.78;SB=-0.01;sumGLbyD=21.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:65,0,31 2331-ref 1235 . T C 57.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=14.31;SB=-0.01;sumGLbyD=21.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.98:87,0,28 2331-ref 1252 . C G 17.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.21:47,0,68 2331-ref 1254 . A G 17.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.21:47,0,63 2331-ref 1255 . T C 17.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.21:47,0,68 2331-ref 1346 . C T 31.10 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.22;SB=-0.01;sumGLbyD=12.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61.09:61,0,104 2331-ref 1361 . G A 84.87 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.06;SB=-0.01;sumGLbyD=8.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:115,0,358 2331-ref 1410 . C G 53.24 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.44;SB=-0.01;sumGLbyD=6.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:83.24:83,0,306 2331-ref 1425 . A G 15.62 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.56;SB=-0.01;sumGLbyD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:45.50:45,0,276 2331-ref 1426 . T G 15.62 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.56;SB=-0.01;sumGLbyD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:45.50:45,0,279 2331-ref 1427 . T G 21.56 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.70;SB=-0.01;sumGLbyD=6.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51.52:52,0,203 2331-ref 1502 . T G 18.56 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.98;MQ0=0;QD=1.86;SB=-0.01;sumGLbyD=4.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:48.49:48,0,277 2331-ref 1543 . T A 85.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9907;MQ=34.01;MQ0=0;QD=12.17;SB=-0.01;sumGLbyD=16.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:98.96:115,0,99 2331-ref 1544 . T A 88.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9907;MQ=34.01;MQ0=0;QD=12.60;SB=-0.01;sumGLbyD=16.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:98.96:118,0,99 2331-ref 1563 . T C 11.52 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=1.92;SB=-0.01;sumGLbyD=6.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:41.19:41,0,141 2331-ref 1598 . A G 28.89 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.78;SB=-0.01;sumGLbyD=11.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58.88:59,0,103 2331-ref 1607 . C T 169.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.78;SB=-0.01;sumGLbyD=22.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:92.93:199,0,93 2331-ref 1661 . T C 460 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.86;SB=-0.01;sumGLbyD=35.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.12:493,39,0 2331-ref 1706 . A G 36.55 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.14;SB=-0.01;sumGLbyD=16.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66.54:67,0,68 2331-ref 1739 . T C 31.96 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.33;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61.95:62,0,141 2331-ref 1757 . C T 71.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.99;SB=-0.01;sumGLbyD=16.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97.54:102,0,98 2331-ref 1770 . C G 70.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.04;SB=-0.01;sumGLbyD=20.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.96:100,0,65 2331-ref 1925 . G C 205.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.30;SB=-0.01;sumGLbyD=39.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 2331-ref 1968 . G A 435.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=36.27;SB=-0.01;sumGLbyD=39.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:468,36,0 2331-ref 1982 . A G 343.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=34.36;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:377,30,0 2331-ref 2027 . T C 274.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=27.42;SB=-0.01;sumGLbyD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9.92:304,0,10 2331-ref 2033 . T G 131.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=33.48;MQ0=0;QD=21.87;SB=-0.01;sumGLbyD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.96:161,0,22 2331-ref 2039 . A G 131.24 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8661;MQ=33.48;MQ0=0;QD=21.87;SB=-0.01;sumGLbyD=26.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:20.53:161,0,21 2379-ref 29 . T C 111.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.79;SB=-0.01;sumGLbyD=35.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:144,12,0 2379-ref 234 . A G 433.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.15;SB=-0.01;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:467,36,0 2379-ref 585 . T C 906.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9995;MQ=36.19;MQ0=0;QD=36.26;SB=-0.01;sumGLbyD=37.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.22:939,75,0 2379-ref 805 . G A 1018.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9729;MQ=36.35;MQ0=0;QD=32.85;SB=-0.01;sumGLbyD=33.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:41.95:1051,42,0 2379-ref 871 . T C 755.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.78;SB=-0.01;sumGLbyD=39.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:789,60,0 2379-ref 1119 . T A 29.26 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.7299;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.72;SB=-0.01;sumGLbyD=3.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:16:59.25:59,0,470 2407-ref 94 . G C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 2407-ref 109 . C A 27.61 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9998;MQ=34.39;MQ0=0;QD=6.90;SB=-0.01;sumGLbyD=14.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:57.59:58,0,68 2407-ref 124 . T C 18.63 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=2.66;SB=-0.01;sumGLbyD=6.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:48.56:49,0,179 2407-ref 157 . A T 50.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=1.9984;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.86;SB=-0.01;sumGLbyD=6.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:80.20:80,0,359 2407-ref 178 . T C 390.81 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.05;SB=-0.01;sumGLbyD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:14:37.88:421,0,38 2407-ref 188 . A C 348.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.08;SB=-0.01;sumGLbyD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:12:30.09:382,30,0 2407-ref 353 . G A 64.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9987;MQ=34.39;MQ0=0;QD=16.15;SB=-0.01;sumGLbyD=23.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26.54:95,0,27 2407-ref 361 . T C 14.41 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9987;MQ=32.73;MQ0=0;QD=2.88;SB=-0.01;sumGLbyD=8.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.24:44,0,75 2407-ref 362 . A G 53.35 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8310;MQ=32.73;MQ0=0;QD=10.67;SB=-0.01;sumGLbyD=16.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:4:27.98:83,0,28 2407-ref 415 . C G 141.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=17.68;SB=-0.01;sumGLbyD=21.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:51.20:171,0,51 2407-ref 434 . A G 147.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=21.07;SB=-0.01;sumGLbyD=25.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18.95:177,0,19 2407-ref 436 . T A 117.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=16.83;SB=-0.01;sumGLbyD=21.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:58.26:148,0,58 2407-ref 445 . T A 17.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.21:47,0,67 2407-ref 492 . A G 82.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:114,9,0 2407-ref 527 . A G 77.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.71;SB=-0.01;sumGLbyD=36.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:109,9,0 2407-ref 547 . C T 98.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9993;MQ=35.53;MQ0=0;QD=14.08;SB=-0.01;sumGLbyD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:86.91:129,0,87 2407-ref 572 . T C 238.69 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7883;MQ=36.07;MQ0=0;QD=21.70;SB=-0.01;sumGLbyD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:10:49.92:269,0,50 2407-ref 580 . C T 436.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=34.58;MQ0=0;QD=31.20;SB=-27.67;sumGLbyD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:14:39.10:470,39,0 2407-ref 606 . T C 12.77 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.16;MQ0=0;QD=1.06;SB=3.00;sumGLbyD=3.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:42.53:43,0,327 2407-ref 678 . G T 374.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.36;MQ0=0;QD=24.97;SB=-0.01;sumGLbyD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:14:2.09:404,2,0 2407-ref 693 . T C 480.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.13;MQ0=0;QD=30.05;SB=-0.01;sumGLbyD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:8.13:513,8,0 2407-ref 707 . A T 642.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=32.02;MQ0=0;QD=29.20;SB=-0.01;sumGLbyD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:26.15:675,26,0 2407-ref 942 . T A 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-28.84;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 2407-ref 956 . A G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-28.84;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 2407-ref 965 . G A 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-28.84;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 2407-ref 1008 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 2407-ref 1055 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 2407-ref 1101 . G A 284.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.61;SB=-0.01;sumGLbyD=39.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:318,24,0 2407-ref 1108 . G A 172.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.75;SB=-0.01;sumGLbyD=34.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.01:205,18,0 2407-ref 1143 . C T 84.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:116,9,0 2407-ref 1165 . A C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 2407-ref 1283 . G T 165.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.18;SB=-0.01;sumGLbyD=39.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 2407-ref 1310 . A C 196.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.68;SB=-0.01;sumGLbyD=38.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:229,18,0 2407-ref 1330 . A G 194.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.44;SB=-0.01;sumGLbyD=37.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:228,18,0 2409-ref 105 . G T 205.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 2409-ref 148 . C G 78.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.38;SB=-0.01;sumGLbyD=6.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:17:99:109,0,460 2409-ref 220 . G C 362.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.13;SB=-0.01;sumGLbyD=21.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:18:30.10:395,30,0 2409-ref 250 . G T 393.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.25;SB=-0.01;sumGLbyD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:0.88:422,0,1 2409-ref 261 . G T 546.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.12:580,45,0 2409-ref 330 . C A 486.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.68;MQ0=0;QD=25.59;SB=-0.01;sumGLbyD=27.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:62.86:516,0,63 2409-ref 357 . C A 574.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7340;MQ=33.26;MQ0=0;QD=33.78;SB=-0.01;sumGLbyD=35.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.14:607,51,0 2409-ref 364 . A G 324.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=33.85;MQ0=0;QD=16.21;SB=-0.01;sumGLbyD=17.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:18:99:354,0,162 2409-ref 389 . G A 257.65 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=12.27;SB=-0.01;sumGLbyD=13.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:288,0,360 2409-ref 400 . C T 355.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.74;SB=-0.01;sumGLbyD=21.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:17:99:385,0,187 2409-ref 428 . C A 395.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=19.76;SB=-0.01;sumGLbyD=21.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:425,0,195 2409-ref 442 . T C 425.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.77;MQ0=0;QD=32.73;SB=-0.01;sumGLbyD=35.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.10:458,39,0 2409-ref 481 . A G 552.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.23;MQ0=0;QD=32.49;SB=-0.01;sumGLbyD=34.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.13:585,51,0 2409-ref 487 . C A 550.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=31.23;MQ0=0;QD=32.35;SB=-0.01;sumGLbyD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.13:583,51,0 2409-ref 512 . T G 662.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7885;MQ=33.68;MQ0=0;QD=34.88;SB=-0.01;sumGLbyD=36.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.16:696,57,0 2409-ref 561 . A G 822.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.12;MQ0=0;QD=35.77;SB=-0.01;sumGLbyD=37.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.19:856,69,0 2409-ref 595 . C G 677.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9999;MQ=35.93;MQ0=0;QD=35.66;SB=-0.01;sumGLbyD=37.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.17:711,57,0 2409-ref 605 . G A 455.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.63;MQ0=0;QD=30.35;SB=-0.01;sumGLbyD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:5.13:486,5,0 2409-ref 624 . C G 501.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.85;SB=-0.01;sumGLbyD=38.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:535,42,0 2409-ref 655 . G T 176.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=8.82;SB=-0.01;sumGLbyD=10.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:206,0,426 2409-ref 681 . T G 316.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.09;MQ0=0;QD=17.57;SB=-0.01;sumGLbyD=19.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:17:99:346,0,165 2409-ref 682 . G T 586.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.09;MQ0=0;QD=32.56;SB=-0.01;sumGLbyD=34.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:17:51.14:619,51,0 2409-ref 697 . G T 499.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=33.48;MQ0=0;QD=33.33;SB=-0.01;sumGLbyD=35.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.12:533,45,0 2409-ref 721 . A G 205.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=29.37;SB=-0.01;sumGLbyD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:239,21,0 2409-ref 736 . G T 214.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=30.65;SB=-0.01;sumGLbyD=35.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:247,21,0 2409-ref 802 . T A 166.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.89;SB=-0.01;sumGLbyD=14.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:13:99:196,0,232 2409-ref 841 . A T 747.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.35;SB=-0.01;sumGLbyD=39.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:780,60,0 2409-ref 865 . G C 266.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.35;SB=-0.01;sumGLbyD=14.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:19:99:297,0,319 2409-ref 898 . G A 1090.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.67;MQ0=0;QD=35.19;SB=-0.01;sumGLbyD=36.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:53.29:1124,53,0 2409-ref 936 . G A 1529.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.77;MQ0=0;QD=35.57;SB=-0.01;sumGLbyD=36.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:89.38:1563,89,0 2409-ref 942 . T C 1513.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.76;MQ0=0;QD=36.03;SB=-0.01;sumGLbyD=36.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:90.26:1546,90,0 2409-ref 1019 . C G 589.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.38;MQ0=0;QD=31.01;SB=-0.01;sumGLbyD=32.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:17.16:622,17,0 2409-ref 1039 . G A 237.16 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.06;MQ0=0;QD=14.82;SB=-0.01;sumGLbyD=16.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:267,0,241 2409-ref 1053 . T C 198.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9979;MQ=34.93;MQ0=0;QD=13.27;SB=-0.01;sumGLbyD=15.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:14:99:229,0,198 2409-ref 1060 . A T 40.83 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9997;MQ=31.58;MQ0=0;QD=6.80;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:70.82:71,0,96 2409-ref 1067 . G A 46.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=11.71;SB=-0.01;sumGLbyD=19.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.98:77,0,28 2409-ref 1072 . G A 46.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=11.71;SB=-0.01;sumGLbyD=19.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.98:77,0,28 2409-ref 1120 . A G 126.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=26.80;MQ0=0;QD=15.85;SB=-0.01;sumGLbyD=19.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:8:14.21:157,0,14 2409-ref 1140 . A C 206.84 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=26.45;MQ0=0;QD=20.68;SB=-0.01;sumGLbyD=23.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:8.52:237,0,9 2409-ref 1142 . G T 22.82 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9996;MQ=28.48;MQ0=0;QD=1.90;SB=-0.01;sumGLbyD=4.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:52.79:53,0,258 2409-ref 1165 . A G 227.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9999;MQ=28.23;MQ0=0;QD=17.47;SB=-0.01;sumGLbyD=19.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:69.58:257,0,70 2409-ref 1183 . C T 173.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8399;MQ=28.77;MQ0=0;QD=15.81;SB=-0.01;sumGLbyD=18.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:76.56:204,0,77 2409-ref 1199 . A C 67.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=30.72;MQ0=0;QD=9.63;SB=-0.01;sumGLbyD=13.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:97.44:97,0,99 2409-ref 1210 . G T 103.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=31.58;MQ0=0;QD=12.88;SB=-0.01;sumGLbyD=16.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:83.73:133,0,84 2409-ref 1225 . A C 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 2409-ref 1239 . G A 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 2474-ref 34 . C A 36.43 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.22;SB=-0.01;sumGLbyD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:68,6,0 2474-ref 105 . T C 472.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.36;SB=-0.01;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:506,39,0 2474-ref 574 . T C 408.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.17;SB=-0.01;sumGLbyD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:13:4.77:439,5,0 2474-ref 664 . T C 869.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.15;MQ0=0;QD=36.23;SB=-0.01;sumGLbyD=37.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.22:903,72,0 2474-ref 673 . G A 797.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=36.26;SB=-0.01;sumGLbyD=37.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.20:831,66,0 2474-ref 927 . G A 1193.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.70;MQ0=0;QD=35.10;SB=-0.01;sumGLbyD=36.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:33:60.75:1226,61,0 2474-ref 1010 . A G 1097.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.41;SB=-0.01;sumGLbyD=36.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:58.03:1131,58,0 2474-ref 1032 . C T 1035.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4344;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.41;SB=-0.01;sumGLbyD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:29:52.93:1069,53,0 2474-ref 1161 . C G 1330.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.4961;MQ=36.74;MQ0=0;QD=34.11;SB=-0.01;sumGLbyD=34.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:45.22:1363,45,0 2474-ref 1319 . A T 1706.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.0345;MQ=36.79;MQ0=0;QD=36.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:99:1739,135,0 2474-ref 1360 . C G 1936.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9973;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.59;SB=-0.01;sumGLbyD=35.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,53:56:48.53:1970,49,0 2474-ref 1423 . T A 10.74 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8649;MQ=37.00;MQ0=0;QD=0.45;SB=-0.01;sumGLbyD=1.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:40.35:40,0,736 2474-ref 1425 . T A 680.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.02;SB=-0.01;sumGLbyD=35.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:20.19:713,20,0 2474-ref 1445 . C T 366.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.58;SB=-0.01;sumGLbyD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:3.89:396,0,4 2474-ref 1493 . A C 183.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9982;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.24;SB=-0.01;sumGLbyD=30.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:17.51:214,0,18 2474-ref 1498 . C T 137.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.64;SB=-0.01;sumGLbyD=23.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:7:16.30:167,0,16 2474-ref 1619 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 2474-ref 1626 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 2474-ref 1630 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 2474-ref 1642 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 2474-ref 1742 . C T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 2474-ref 1748 . G A 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 2491-ref 19 . T C 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=15.52;SB=-0.01;sumGLbyD=22.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:3:9.03:110,9,0 2491-ref 33 . A G 403.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.42;MQ0=0;QD=31.02;SB=-0.01;sumGLbyD=33.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:12:36.10:436,36,0 2491-ref 78 . A G 1570.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.1869;MQ=36.29;MQ0=0;QD=36.52;SB=-0.01;sumGLbyD=37.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:42:99:1603,126,0 2491-ref 188 . G A 1501.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.74;MQ0=0;QD=38.51;SB=-0.01;sumGLbyD=39.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1535,117,0 2491-ref 223 . T C 1173.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=36.37;MQ0=0;QD=36.67;SB=-0.01;sumGLbyD=37.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.26:1206,96,0 2491-ref 479 . G A 1550.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4352;MQ=36.29;MQ0=0;QD=36.06;SB=-0.01;sumGLbyD=36.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:89.40:1584,89,0 2491-ref 522 . C G 1441.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.6644;MQ=36.49;MQ0=0;QD=36.04;SB=-0.01;sumGLbyD=36.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:80.37:1474,80,0 2491-ref 524 . C T 1389.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.6644;MQ=36.49;MQ0=0;QD=34.73;SB=-0.01;sumGLbyD=35.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:39:78.79:1422,79,0 2491-ref 683 . C T 2936.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=7.1971;MQ=36.74;MQ0=0;QD=38.14;SB=-0.01;sumGLbyD=38.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2970,232,0 2491-ref 766 . A C 2716.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9976;MQ=36.44;MQ0=0;QD=37.73;SB=-0.01;sumGLbyD=38.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:71:99:2749,214,0 2491-ref 775 . A C 2206.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8639;MQ=36.41;MQ0=0;QD=31.98;SB=-0.01;sumGLbyD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,64:68:5.30:2238,5,0 2491-ref 929 . G A 3622.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.8334;MQ=36.78;MQ0=0;QD=39.37;SB=-0.01;sumGLbyD=39.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3622,277,0 2491-ref 998 . T C 2920.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9224;MQ=36.87;MQ0=0;QD=38.94;SB=-0.01;sumGLbyD=39.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:2954,226,0 2491-ref 1046 . A T 2829.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=36.86;MQ0=0;QD=38.77;SB=-0.01;sumGLbyD=39.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:2863,220,0 2491-ref 1267 . G C 126.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 2491-ref 1328 . T C 287.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:320,24,0 2491-ref 1329 . A T 287.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:320,24,0 2491-ref 1339 . C T 858.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.3359;MQ=36.19;MQ0=0;QD=34.35;SB=-0.01;sumGLbyD=35.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.22:892,69,0 2491-ref 1380 . C G 2334.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.8620;MQ=36.50;MQ0=0;QD=38.27;SB=-0.01;sumGLbyD=38.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2367,184,0 2491-ref 1454 . C T 2295.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.1115;MQ=35.20;MQ0=0;QD=36.43;SB=-0.01;sumGLbyD=36.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:63:99:2328,187,0 2491-ref 1455 . A G 2142.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.2174;MQ=35.08;MQ0=0;QD=36.32;SB=-0.01;sumGLbyD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:58:99:2176,175,0 2491-ref 1472 . G A 1285.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=1.9454;MQ=34.09;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=36.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1319,108,0 2491-ref 1522 . A G 324.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.11;SB=-0.01;sumGLbyD=39.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:358,27,0 2491-ref 1614 . A G 110.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.53;SB=-0.01;sumGLbyD=35.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:143,12,0 2519-ref 105 . G A 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 2519-ref 122 . T C 196.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.68;SB=-0.01;sumGLbyD=38.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:229,18,0 2519-ref 169 . A G 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 2519-ref 300 . 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C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=7.9608;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.26;SB=-0.01;sumGLbyD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6.02:80,6,0 2519-ref 491 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=7.9608;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.26;SB=-0.01;sumGLbyD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6.02:80,6,0 2532-ref 41 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 2532-ref 80 . G T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 2532-ref 96 . A G 122.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.62;SB=-0.01;sumGLbyD=38.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:155,12,0 2532-ref 97 . G T 86.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.61;SB=-0.01;sumGLbyD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:11.98:119,12,0 2532-ref 181 . G C 276.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.22;MQ0=0;QD=30.73;SB=-0.01;sumGLbyD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:310,27,0 2532-ref 185 . T A 250.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.22;MQ0=0;QD=27.85;SB=-0.01;sumGLbyD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:8:24.07:284,24,0 2532-ref 196 . G T 248.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.22;MQ0=0;QD=27.58;SB=-0.01;sumGLbyD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.04:281,27,0 2532-ref 290 . A G 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 2532-ref 293 . G A 126.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 2532-ref 403 . T C 118.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.53;SB=-0.01;sumGLbyD=37.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:151,12,0 2532-ref 456 . G C 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 2532-ref 472 . T A 114.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.73;SB=-0.01;sumGLbyD=36.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:147,12,0 2532-ref 525 . A G 118.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.71;SB=-0.01;sumGLbyD=37.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:151,12,0 2532-ref 609 . G A 109.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=27.41;SB=-0.01;sumGLbyD=35.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:142,12,0 2532-ref 623 . G T 112.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.10;SB=-0.01;sumGLbyD=36.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:145,12,0 2532-ref 680 . C A 231.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.09;SB=-0.01;sumGLbyD=37.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:265,21,0 2532-ref 700 . G C 225.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=32.24;SB=-0.01;sumGLbyD=36.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:259,21,0 2532-ref 789 . G T 375.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=31.27;SB=-0.01;sumGLbyD=34.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:11:33.10:408,33,0 2532-ref 792 . G A 391.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=32.61;SB=-0.01;sumGLbyD=35.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.08:424,36,0 2532-ref 824 . C T 250.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=31.28;SB=-0.01;sumGLbyD=35.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:283,24,0 2532-ref 854 . T C 757.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.03;MQ0=0;QD=36.08;SB=-0.01;sumGLbyD=37.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.18:791,63,0 2532-ref 906 . T C 737.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.90;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:771,60,0 2532-ref 964 . G A 800.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:21:63.21:834,63,0 2532-ref 1158 . G C 193.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.31;SB=-0.01;sumGLbyD=37.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:227,18,0 2610-ref 8 . A G 33.54 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.71;SB=-0.01;sumGLbyD=12.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63.53:64,0,104 2610-ref 40 . C T 165.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.02;SB=-0.01;sumGLbyD=39.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:198,15,0 2610-ref 78 . G C 78.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.27;SB=-0.01;sumGLbyD=37.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:111,9,0 2610-ref 97 . G T 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29.55:71,0,30 2610-ref 470 . C G 317.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.23;SB=-0.01;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:350,27,0 2610-ref 665 . G A 191.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.32;SB=-0.01;sumGLbyD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.06:224,18,0 2610-ref 704 . A T 232.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.21;SB=-0.01;sumGLbyD=37.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:265,21,0 2610-ref 735 . G T 68.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.35;SB=-0.01;sumGLbyD=16.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98.08:98,0,98 2610-ref 795 . T C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 2610-ref 934 . G T 37.98 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.60;SB=-0.01;sumGLbyD=13.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:4:67.97:68,0,68 2610-ref 938 . C T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.26;SB=-0.01;sumGLbyD=26.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:4:12.04:160,12,0 2610-ref 948 . C G 189.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.50;SB=-0.01;sumGLbyD=36.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:222,18,0 2610-ref 995 . A G 65.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.24;SB=-0.01;sumGLbyD=11.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:95.94:96,0,175 2610-ref 1103 . T A 268.10 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9983;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.81;SB=-0.01;sumGLbyD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9.92:298,0,10 2610-ref 1370 . 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G A 751.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9734;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.58;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:785,60,0 2610-ref 2081 . A T 1156.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=36.69;MQ0=0;QD=35.05;SB=-0.01;sumGLbyD=36.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:59.30:1190,59,0 2610-ref 2213 . C G 432.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9654;MQ=36.15;MQ0=0;QD=36.03;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:465,36,0 2610-ref 2222 . C T 504.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=36.05;SB=-0.01;sumGLbyD=38.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:538,42,0 2610-ref 2477 . T C 662.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.85;SB=-0.01;sumGLbyD=36.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:18:54.17:695,54,0 2610-ref 2510 . 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A C 1815.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.18;MQ0=0;QD=35.60;SB=-0.01;sumGLbyD=36.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:50:99:1849,150,0 2610-ref 3161 . G A 1463.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.6805;MQ=36.23;MQ0=0;QD=27.61;SB=-0.01;sumGLbyD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:52:99:1496,117,0 2610-ref 3204 . A G 1161.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.2903;MQ=36.58;MQ0=0;QD=24.19;SB=-0.01;sumGLbyD=24.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,35:48:99:1191,0,357 2610-ref 3269 . G C 2119.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.1672;MQ=36.48;MQ0=0;QD=36.55;SB=-0.01;sumGLbyD=37.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:57:99:2153,135,0 2610-ref 3312 . G C 2352.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8306;MQ=36.36;MQ0=0;QD=37.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2385,190,0 2610-ref 3416 . G T 334.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.8309;MQ=36.27;MQ0=0;QD=5.98;SB=-0.01;sumGLbyD=6.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,14:55:99:365,0,1396 2610-ref 3422 . C T 2277.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.5652;MQ=36.33;MQ0=0;QD=37.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:60:99:2310,181,0 2610-ref 3467 . T C 2331.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.9876;MQ=36.22;MQ0=0;QD=35.88;SB=-0.01;sumGLbyD=36.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:63:99:2365,190,0 2610-ref 3488 . A T 787.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=75;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7312;MQ=36.73;MQ0=0;QD=10.50;SB=-0.01;sumGLbyD=10.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,27:75:99:818,0,1620 2610-ref 3530 . T G 2354.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6553;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.79;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:62:99:2387,187,0 2610-ref 3584 . A C 430.37 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=60;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.5125;MQ=36.66;MQ0=0;QD=7.17;SB=-0.01;sumGLbyD=7.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,17:59:99:460,0,1461 2610-ref 3602 . T C 548.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=15.8514;MQ=36.61;MQ0=0;QD=10.54;SB=-0.01;sumGLbyD=11.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,19:51:99:578,0,1085 2610-ref 3678 . A C 710.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8320;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.92;SB=-0.01;sumGLbyD=14.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,23:50:99:740,0,842 2610-ref 3699 . C T 1225.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9923;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.02;SB=-0.01;sumGLbyD=35.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:33:99:1259,99,0 2610-ref 3762 . G T 516.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.89;SB=-120.02;sumGLbyD=39.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:549,42,0 2610-ref 3768 . C A 507.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.24;SB=-119.33;sumGLbyD=38.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:540,42,0 2610-ref 3802 . A G 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-39.55;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 2625-ref 105 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 2625-ref 106 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 2625-ref 305 . G T 40.57 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.52;SB=-0.01;sumGLbyD=24.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:2:6.02:72,6,0 2625-ref 371 . 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T C 262.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.83;SB=-0.01;sumGLbyD=36.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:296,24,0 2625-ref 1172 . T A 286.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.80;SB=-0.01;sumGLbyD=39.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:319,24,0 2625-ref 1249 . A G 517.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.98;SB=-0.01;sumGLbyD=39.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:551,42,0 2625-ref 1302 . A G 548.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.57;SB=-0.01;sumGLbyD=38.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:581,45,0 2625-ref 1364 . G C 500.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.3332;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.39;SB=-0.01;sumGLbyD=35.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:15:42.13:534,42,0 2625-ref 1458 . G C 353.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:386,30,0 2625-ref 1478 . A T 512.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.19;SB=-0.01;sumGLbyD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.14:546,42,0 2625-ref 1610 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.26;SB=-0.01;sumGLbyD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6.02:80,6,0 2635-ref 65 . A G 29.06 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=462;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=26.2821;MQ=36.83;MQ0=0;QD=0.06;SB=3.00;sumGLbyD=0.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:421,41:454:59.04:59,0,14798 2635-ref 67 . G A 746.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=493;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=27.2819;MQ=36.84;MQ0=0;QD=1.52;SB=3.00;sumGLbyD=1.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:427,65:488:99:777,0,15065 2635-ref 104 . T C 22769.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=600;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=31.8826;MQ=36.85;MQ0=0;QD=37.95;SB=-174.81;sumGLbyD=37.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,594:592:99:22626,1702,0 2635-ref 225 . C T 29058.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=765;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=39.1596;MQ=36.83;MQ0=0;QD=37.99;SB=-815.89;sumGLbyD=37.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,761:759:99:28952,2180,0 2635-ref 258 . C A 30788.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=819;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=41.2454;MQ=36.33;MQ0=0;QD=37.59;SB=-462.60;sumGLbyD=37.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,814:811:99:30677,2396,0 2635-ref 303 . G C 34410.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=932;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=48.9688;MQ=36.26;MQ0=0;QD=36.92;SB=-969.94;sumGLbyD=36.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,918:917:99:34061,2501,0 2635-ref 304 . C G 34464 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=942;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=47.8605;MQ=36.27;MQ0=0;QD=36.59;SB=-916.84;sumGLbyD=36.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,930:924:99:34209,2529,0 2635-ref 373 . T C 26447.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=697;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=40.5957;MQ=36.54;MQ0=0;QD=37.94;SB=-9282.07;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,691:691:99:26250,1884,0 2635-ref 397 . C G 16535.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=443;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=18.6284;MQ=36.46;MQ0=0;QD=37.33;SB=-6907.87;sumGLbyD=36.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,436:435:99:16348,1123,0 2635-ref 465 . G A 4557.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=145;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.7817;MQ=31.87;MQ0=0;QD=31.43;SB=-0.01;sumGLbyD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:139:99:4520,383,0 2635-ref 606 . C T 34150.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=895;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=53.6269;MQ=36.86;MQ0=0;QD=38.16;SB=-110.61;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,888:881:99:33999,2533,0 2635-ref 753 . A G 33235.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=876;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=65.6312;MQ=36.92;MQ0=0;QD=37.94;SB=-40.01;sumGLbyD=37.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,869:861:99:33033,2412,0 2635-ref 898 . T C 5051.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=252;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=21.7854;MQ=34.92;MQ0=0;QD=20.05;SB=-0.01;sumGLbyD=17.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,147:252:99:4292,0,3280 2635-ref 900 . C T 3087.64 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=217;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=22.8050;MQ=34.62;MQ0=0;QD=14.23;SB=-0.01;sumGLbyD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,112:214:99:3118,0,3238 2635-ref 905 . T C 780.53 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=149;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=29.1953;MQ=33.56;MQ0=0;QD=5.24;SB=-0.01;sumGLbyD=5.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,45:147:99:811,0,3399 2635-ref 911 . T A 2283.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=77;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.5392;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.66;SB=-0.01;sumGLbyD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,70:77:5.78:2313,0,6 2635-ref 913 . T A 1027.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8105;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.34;SB=-0.01;sumGLbyD=27.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,32:39:99:1057,0,147 2635-ref 914 . T A 180.64 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=16.8231;MQ=36.56;MQ0=0;QD=7.85;SB=-0.01;sumGLbyD=9.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:211,0,500 2635-ref 942 . C T 4101.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8588;MQ=32.97;MQ0=0;QD=35.36;SB=-0.01;sumGLbyD=35.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:4100,349,0 2635-ref 983 . C T 4007.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.3734;MQ=32.85;MQ0=0;QD=35.46;SB=-0.01;sumGLbyD=35.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:113:99:4007,340,0 2635-ref 994 . A T 1204.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4566;MQ=27.17;MQ0=0;QD=26.18;SB=-0.01;sumGLbyD=26.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,42:44:90.68:1237,91,0 2635-ref 995 . T C 967.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9300;MQ=25.73;MQ0=0;QD=24.18;SB=-0.01;sumGLbyD=25.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,38:36:74.76:1000,75,0 2635-ref 998 . A G 659.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.4514;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.96;SB=-0.01;sumGLbyD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,20:21:24.62:692,25,0 2635-ref 1010 . G A 6783.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.3827;MQ=36.72;MQ0=0;QD=37.27;SB=-0.01;sumGLbyD=36.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,180:177:99:6720,495,0 2635-ref 1074 . A C 16638.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=428;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=31.3364;MQ=36.86;MQ0=0;QD=38.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,424:427:99:16496,1143,0 2635-ref 1152 . A G 1291.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.00;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1325,102,0 2663-ref 234 . G A 463.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.66;SB=-0.01;sumGLbyD=38.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:497,39,0 2663-ref 489 . G A 383.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=34.84;SB=-0.01;sumGLbyD=37.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:416,33,0 2663-ref 495 . G A 334.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=34.93;MQ0=0;QD=33.40;SB=-0.01;sumGLbyD=36.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:367,30,0 2663-ref 672 . C G 72.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=24.28;SB=-0.01;sumGLbyD=35.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:105,9,0 2663-ref 682 . A T 33.56 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.39;SB=-0.01;sumGLbyD=15.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63.55:64,0,68 2663-ref 707 . G A 326.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.26;SB=-0.01;sumGLbyD=39.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:359,27,0 2663-ref 813 . 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A C 1000.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.63;MQ0=0;QD=37.07;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.25:1034,81,0 2663-ref 1349 . A T 1080.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.58;SB=-0.01;sumGLbyD=39.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.27:1113,84,0 2663-ref 1364 . A G 1101.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.97;SB=-0.01;sumGLbyD=39.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.28:1134,87,0 2663-ref 1544 . C T 1091.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=36.32;MQ0=0;QD=36.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:29:87.28:1125,87,0 2663-ref 1595 . C G 963.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.61;MQ0=0;QD=37.07;SB=-0.01;sumGLbyD=38.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.25:997,78,0 2663-ref 1637 . 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T A 1809.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.6376;MQ=36.59;MQ0=0;QD=18.46;SB=-0.01;sumGLbyD=18.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,55:96:99:1839,0,1314 2672-ref 710 . G T 1249.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=106;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=5.7794;MQ=36.23;MQ0=0;QD=11.79;SB=-0.01;sumGLbyD=12.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,42:105:99:1279,0,2126 2672-ref 714 . C G 1092.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=101;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.8784;MQ=36.19;MQ0=0;QD=10.82;SB=-0.01;sumGLbyD=11.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,38:100:99:1123,0,2111 2672-ref 739 . G T 1090.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=93;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.9963;MQ=36.01;MQ0=0;QD=11.72;SB=-0.01;sumGLbyD=12.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,37:92:99:1120,0,1880 2672-ref 780 . T A 1462.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8630;MQ=35.33;MQ0=0;QD=34.02;SB=-0.01;sumGLbyD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:43:93.88:1496,94,0 2672-ref 781 . G C 644.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9984;MQ=35.24;MQ0=0;QD=15.72;SB=-0.01;sumGLbyD=16.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,21:41:99:674,0,616 2672-ref 902 . A C 28.92 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.9646;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.78;SB=-0.01;sumGLbyD=11.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58.91:59,0,102 2672-ref 903 . A C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 2714-ref 125 . A T 34.81 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=4.35;SB=-0.01;sumGLbyD=8.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:64.80:65,0,171 2714-ref 126 . A T 28.80 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.85;MQ0=0;QD=2.88;SB=-0.01;sumGLbyD=5.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:58.78:59,0,238 2714-ref 151 . 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T C 145.81 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.93;MQ0=0;QD=13.26;SB=3.00;sumGLbyD=15.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:176,0,125 2714-ref 231 . C T 432.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.91;MQ0=0;QD=33.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.11:466,39,0 2714-ref 352 . A C 600.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=1.9654;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.39;SB=-0.01;sumGLbyD=16.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:36:99:630,0,531 2714-ref 385 . C T 1360.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.87;SB=-0.01;sumGLbyD=35.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:36:99:1393,108,0 2714-ref 428 . T G 544.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.61;SB=-0.01;sumGLbyD=14.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,18:40:99:574,0,724 2714-ref 470 . 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A T 14745.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=383;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=16.0730;MQ=36.76;MQ0=0;QD=38.50;SB=-0.01;sumGLbyD=38.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,380:380:99:14632,1100,0 2763-ref 992 . A T 14274.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=402;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=16.7159;MQ=36.60;MQ0=0;QD=35.51;SB=-0.01;sumGLbyD=35.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,399:386:99:14273,1161,0 2763-ref 1025 . A G 16406.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=425;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=22.2634;MQ=36.74;MQ0=0;QD=38.60;SB=-0.01;sumGLbyD=38.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,424:421:99:16365,1264,0 2763-ref 1329 . G A 19056.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=505;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=25.4794;MQ=36.30;MQ0=0;QD=37.74;SB=-0.01;sumGLbyD=37.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,503:498:99:19015,1459,0 2763-ref 1336 . C A 22285.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=586;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=22.6735;MQ=36.32;MQ0=0;QD=38.03;SB=-0.01;sumGLbyD=37.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,585:579:99:22248,1707,0 2763-ref 1381 . 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T G 67.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=22.36;SB=-0.01;sumGLbyD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 2848-ref 354 . G T 37.70 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.85;SB=-0.01;sumGLbyD=34.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:69,6,0 2848-ref 468 . G A 65.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=21.67;SB=-0.01;sumGLbyD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:97,9,0 2848-ref 490 . A G 17.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=2.54;SB=-0.01;sumGLbyD=6.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:6:47.71:48,0,107 2848-ref 493 . A G 164.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=23.55;SB=-0.01;sumGLbyD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.04:198,18,0 2848-ref 513 . T C 109.62 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=32.73;MQ0=0;QD=10.96;SB=-0.01;sumGLbyD=13.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:9:99:140,0,106 2848-ref 523 . G A 281.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7876;MQ=32.73;MQ0=0;QD=28.11;SB=-0.01;sumGLbyD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:314,27,0 2848-ref 575 . A C 236.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=34.15;MQ0=0;QD=21.47;SB=-0.01;sumGLbyD=24.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:70.89:266,0,71 2848-ref 590 . C T 12.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8104;MQ=34.69;MQ0=0;QD=1.42;SB=-0.01;sumGLbyD=4.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:42.55:43,0,243 2848-ref 594 . A C 148.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9772;MQ=34.93;MQ0=0;QD=14.90;SB=-0.01;sumGLbyD=17.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:10:48.56:179,0,49 2848-ref 620 . C T 311.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.98;MQ0=0;QD=31.19;SB=-0.01;sumGLbyD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:345,27,0 2848-ref 649 . G T 301.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.13;SB=-0.01;sumGLbyD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:9:27.06:334,27,0 2848-ref 695 . C A 65.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.24;SB=-0.01;sumGLbyD=11.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:95.94:96,0,176 2848-ref 796 . A T 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 2848-ref 820 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 2848-ref 828 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 2848-ref 829 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 2848-ref 843 . G C 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 2848-ref 849 . C G 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 2848-ref 917 . C T 92.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=10.28;SB=-0.01;sumGLbyD=13.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:123,0,173 2848-ref 945 . C T 129.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=16.13;SB=-0.01;sumGLbyD=19.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:95.25:159,0,95 2848-ref 969 . A G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 2848-ref 1058 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 2872-ref 99 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 2872-ref 131 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 2872-ref 149 . A G 120.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.14;SB=-0.01;sumGLbyD=38.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:153,12,0 2872-ref 161 . C G 165.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 2872-ref 208 . T C 166.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 2872-ref 367 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 2872-ref 368 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 2872-ref 626 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 2872-ref 647 . T G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 2872-ref 1106 . G T 160.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.07;SB=-0.01;sumGLbyD=38.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:193,15,0 2872-ref 1216 . G T 75.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.31;SB=-0.01;sumGLbyD=36.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:108,9,0 2872-ref 1316 . G T 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 2872-ref 1343 . A T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 2872-ref 1541 . G T 82.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:114,9,0 2872-ref 1544 . G T 74.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.91;SB=-0.01;sumGLbyD=35.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:107,9,0 2872-ref 1568 . C A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 2872-ref 1770 . A G 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 2872-ref 1953 . 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A G 28.01 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.60;SB=-0.01;sumGLbyD=11.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58:58,0,105 2872-ref 2316 . T G 161.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.40;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:195,15,0 2872-ref 2394 . A T 276.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.55;SB=-0.01;sumGLbyD=38.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:309,24,0 2872-ref 2420 . A T 237.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.96;SB=-0.01;sumGLbyD=38.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:271,21,0 2872-ref 2493 . T G 103.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=25.78;SB=-0.01;sumGLbyD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:136,12,0 2872-ref 2527 . C T 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 2872-ref 2532 . A G 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 2939-ref 214 . G A 162.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.41;SB=-0.01;sumGLbyD=38.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:195,15,0 2939-ref 227 . G T 316.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=35.19;SB=-0.01;sumGLbyD=38.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:350,27,0 2939-ref 294 . T A 309.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9330;MQ=36.07;MQ0=0;QD=28.11;SB=-0.01;sumGLbyD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:6.92:339,0,7 2939-ref 324 . T G 298 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.80;SB=-0.01;sumGLbyD=32.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9.22:328,0,9 2939-ref 419 . G A 564.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.66;SB=-0.01;sumGLbyD=39.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:598,45,0 2939-ref 599 . C T 185.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.92;SB=-0.01;sumGLbyD=36.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:218,18,0 2939-ref 662 . G C 424.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.65;SB=-0.01;sumGLbyD=35.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.09:457,36,0 2939-ref 759 . C G 486.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.74;SB=-0.01;sumGLbyD=37.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.13:519,39,0 2939-ref 824 . C T 557.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.19;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:591,45,0 2939-ref 958 . C T 445.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.28;SB=-0.01;sumGLbyD=36.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:12:36.12:479,36,0 2939-ref 1141 . T C 363.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.35;SB=-0.01;sumGLbyD=39.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:397,30,0 2939-ref 1187 . T C 521.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:555,42,0 2939-ref 1198 . A G 487.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.47;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:520,39,0 2939-ref 1312 . G T 760.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.05;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.20:794,60,0 2939-ref 1617 . G A 741.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.49;MQ0=0;QD=37.07;SB=-0.01;sumGLbyD=38.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:774,60,0 2939-ref 1715 . G A 1012.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.51;SB=-0.01;sumGLbyD=38.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.26:1046,81,0 2939-ref 1730 . C G 1139.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.00;SB=-0.01;sumGLbyD=39.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.29:1173,90,0 2939-ref 1776 . C T 1086.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.67;MQ0=0;QD=35.06;SB=-0.01;sumGLbyD=36.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:29:87.28:1120,87,0 2939-ref 1945 . A C 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 2939-ref 1954 . T C 200.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.50;SB=-0.01;sumGLbyD=38.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:234,18,0 2939-ref 2033 . T A 598.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.43;SB=-0.01;sumGLbyD=39.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.16:632,48,0 2939-ref 2091 . A C 246.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=30.84;SB=-0.01;sumGLbyD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:280,24,0 2939-ref 2110 . A G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 2939-ref 2114 . A T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 2939-ref 2116 . C T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 2954-ref 80 . T C 1093.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.67;MQ0=0;QD=35.28;SB=-0.01;sumGLbyD=36.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:56.32:1127,56,0 2954-ref 92 . A T 1308.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=36.72;MQ0=0;QD=36.35;SB=-0.01;sumGLbyD=37.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1342,108,0 2954-ref 374 . G A 1870.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.39;MQ0=0;QD=37.40;SB=-0.01;sumGLbyD=38.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1903,150,0 2954-ref 419 . A G 2117.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.2991;MQ=36.66;MQ0=0;QD=35.90;SB=-0.01;sumGLbyD=36.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:56:99:2151,169,0 2954-ref 533 . A G 1483.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9379;MQ=34.88;MQ0=0;QD=33.73;SB=-29.63;sumGLbyD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:41:99:1517,123,0 2954-ref 539 . T C 1496.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=1.8853;MQ=34.78;MQ0=0;QD=35.63;SB=-29.63;sumGLbyD=36.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:41:99:1530,123,0 2954-ref 575 . C T 1683.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.69;MQ0=0;QD=35.83;SB=-29.63;sumGLbyD=36.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:46:99:1717,138,0 2954-ref 602 . T A 1723.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.2558;MQ=36.42;MQ0=0;QD=33.15;SB=-0.01;sumGLbyD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,49:52:38.67:1757,39,0 2954-ref 662 . C A 2463.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.3592;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.75;SB=-0.01;sumGLbyD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,70:71:97.51:2497,98,0 2954-ref 909 . G T 1309.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9832;MQ=33.14;MQ0=0;QD=29.76;SB=-0.01;sumGLbyD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,41:44:23.96:1343,24,0 2954-ref 916 . G A 1010 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.90;MQ0=0;QD=28.06;SB=-0.01;sumGLbyD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:35:25.26:1043,25,0 2954-ref 919 . T A 908.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.20;MQ0=0;QD=28.38;SB=-0.01;sumGLbyD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:28.56:941,29,0 2954-ref 947 . G A 779.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4629;MQ=29.55;MQ0=0;QD=25.99;SB=-0.01;sumGLbyD=27.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:11.61:812,12,0 2954-ref 982 . G A 382.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.52;SB=-0.01;sumGLbyD=27.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:30.13:413,0,30 2954-ref 986 . A T 356.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7333;MQ=34.01;MQ0=0;QD=25.49;SB=-0.01;sumGLbyD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:36.46:387,0,36 2954-ref 1002 . G A 165.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8653;MQ=34.39;MQ0=0;QD=20.65;SB=-77.23;sumGLbyD=24.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:55.25:195,0,55 2954-ref 1018 . T A 996.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9996;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.21;SB=-116.79;sumGLbyD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:10.28:1028,10,0 2954-ref 1107 . C G 40.09 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.05;SB=-0.01;sumGLbyD=36.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 2954-ref 1121 . T C 166.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 2954-ref 1224 . C G 161.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.33;SB=-0.01;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:194,15,0 2999-ref 147 . T C 516.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.27;SB=-0.01;sumGLbyD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.12:549,45,0 2999-ref 705 . A G 788.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.52;MQ0=0;QD=37.55;SB=-0.01;sumGLbyD=39.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:822,63,0 2999-ref 717 . G T 693.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=36.47;MQ0=0;QD=36.52;SB=-0.01;sumGLbyD=38.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.16:727,57,0 2999-ref 818 . T C 1000.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.48;SB=-0.01;sumGLbyD=39.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.26:1033,78,0 2999-ref 881 . C T 556.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.91;SB=-0.01;sumGLbyD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:17:12.59:589,13,0 2999-ref 935 . T C 775.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.54;MQ0=0;QD=35.23;SB=-0.01;sumGLbyD=36.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:21:63.20:808,63,0 2999-ref 1033 . C T 1141.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.05;SB=-0.01;sumGLbyD=39.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.29:1174,90,0 2999-ref 1145 . A C 1000.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.25:1033,81,0 2999-ref 1205 . A C 1289.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7552;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.92;SB=-0.01;sumGLbyD=38.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1322,102,0 2999-ref 1304 . C T 475.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.78;MQ0=0;QD=33.98;SB=-0.01;sumGLbyD=36.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:509,42,0 2999-ref 1341 . C T 372.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=33.86;SB=-0.01;sumGLbyD=36.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:405,33,0 2999-ref 1357 . G A 207.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=29.66;SB=-0.01;sumGLbyD=34.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:241,21,0 2999-ref 1373 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 3005-ref 54 . A T 43.84 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=8.77;SB=-0.01;sumGLbyD=14.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:59.53:74,0,60 3005-ref 106 . T A 25.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=2.34;SB=-0.01;sumGLbyD=5.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:55.77:56,0,276 3005-ref 114 . C G 25.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=2.34;SB=-0.01;sumGLbyD=5.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:55.77:56,0,285 3005-ref 115 . G C 25.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=2.34;SB=-0.01;sumGLbyD=5.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:55.77:56,0,285 3005-ref 132 . T G 14.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4426;MQ=35.87;MQ0=0;QD=1.59;SB=-0.01;sumGLbyD=4.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:8:44.12:44,0,213 3005-ref 169 . C T 80.84 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=13.47;SB=-0.01;sumGLbyD=18.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:53.51:111,0,54 3005-ref 176 . A G 74.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=9.35;SB=-0.01;sumGLbyD=13.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:105,0,123 3005-ref 194 . C T 244.89 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=22.26;SB=-0.01;sumGLbyD=24.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:64.72:275,0,65 3005-ref 227 . C T 300.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=30.05;SB=-0.01;sumGLbyD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:2.78:329,0,0 3005-ref 362 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 3005-ref 372 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 3005-ref 378 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=9;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 3005-ref 445 . C A 202.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.74;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 3005-ref 489 . T A 19.96 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.00;SB=-0.01;sumGLbyD=4.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49.91:50,0,283 3028-ref 17 . G A 154.39 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7884;MQ=34.69;MQ0=0;QD=17.15;SB=-0.01;sumGLbyD=20.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:86.86:184,0,87 3028-ref 73 . G C 295.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9998;MQ=32.18;MQ0=0;QD=15.53;SB=3.00;sumGLbyD=17.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:325,0,201 3028-ref 82 . A G 150.69 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4690;MQ=32.18;MQ0=0;QD=7.93;SB=-37.00;sumGLbyD=9.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:181,0,367 3028-ref 85 . A G 577.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=31.89;MQ0=0;QD=32.09;SB=-40.01;sumGLbyD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.13:611,54,0 3028-ref 106 . G T 183.84 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.06;MQ0=0;QD=15.32;SB=3.00;sumGLbyD=17.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:214,0,124 3028-ref 112 . A C 91.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.24;MQ0=0;QD=7.64;SB=-34.79;sumGLbyD=10.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:122,0,238 3028-ref 121 . 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A C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 3028-ref 240 . C T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 3028-ref 265 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 3028-ref 308 . A T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 3028-ref 347 . A G 278.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.83;SB=-0.01;sumGLbyD=38.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:312,24,0 3028-ref 359 . A G 286.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.80;SB=-0.01;sumGLbyD=39.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:319,24,0 3028-ref 463 . C G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 3028-ref 478 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 3028-ref 488 . G A 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 3028-ref 503 . G C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 3028-ref 617 . 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G C 187.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=31.21;SB=-0.01;sumGLbyD=36.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:220,18,0 3028-ref 1187 . T G 847.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.31;SB=-0.01;sumGLbyD=36.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.21:880,69,0 3028-ref 1218 . G A 424.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=30.29;SB=-0.01;sumGLbyD=32.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:7.77:456,8,0 3028-ref 1254 . T G 44.35 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.18;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 3058-ref 16 . C T 34.51 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=17.26;SB=-0.01;sumGLbyD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:66,6,0 3058-ref 31 . A G 62.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=20.84;SB=-0.01;sumGLbyD=31.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:95,9,0 3058-ref 65 . G A 547.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=36.53;SB=-0.01;sumGLbyD=38.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:581,45,0 3058-ref 86 . T C 552.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=36.87;SB=-0.01;sumGLbyD=39.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:586,45,0 3058-ref 249 . C T 575.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.06;MQ0=0;QD=36.00;SB=-29.63;sumGLbyD=38.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:609,48,0 3058-ref 250 . T C 569.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.06;MQ0=0;QD=35.58;SB=-29.63;sumGLbyD=37.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:602,48,0 3058-ref 254 . C T 482.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.78;MQ0=0;QD=34.46;SB=-29.63;sumGLbyD=36.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.12:515,42,0 3058-ref 521 . G A 1028.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9987;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.46;SB=-0.01;sumGLbyD=36.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:55.71:1061,56,0 3058-ref 569 . T C 745.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.90;SB=-0.01;sumGLbyD=35.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:26.21:779,26,0 3058-ref 581 . T C 956.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.25;SB=-0.01;sumGLbyD=39.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.24:989,75,0 3058-ref 711 . C A 1063.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.68;SB=-0.01;sumGLbyD=37.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:28:84.27:1097,84,0 3058-ref 818 . C T 721.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=36.09;SB=-0.01;sumGLbyD=37.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.18:755,60,0 3058-ref 893 . C G 859.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.37;SB=-0.01;sumGLbyD=35.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:35.23:892,35,0 3058-ref 932 . A T 1473.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6647;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.09;SB=-0.01;sumGLbyD=35.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:41:84.06:1507,84,0 3058-ref 1116 . A G 2668.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.72;MQ0=0;QD=37.59;SB=-0.01;sumGLbyD=38.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:70:99:2702,211,0 3058-ref 1219 . T C 1913.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.80;MQ0=0;QD=37.52;SB=-0.01;sumGLbyD=38.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:50:99:1947,150,0 3058-ref 1407 . G A 1645.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.3359;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.57;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:44:99:1679,132,0 3058-ref 1485 . A G 624.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8286;MQ=34.69;MQ0=0;QD=34.67;SB=-0.01;sumGLbyD=36.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.16:657,54,0 3058-ref 1489 . G C 540.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6175;MQ=34.55;MQ0=0;QD=31.80;SB=-0.01;sumGLbyD=33.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:574,48,0 3058-ref 1509 . T C 333.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=31.12;MQ0=0;QD=25.68;SB=-0.01;sumGLbyD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:33.08:367,33,0 3058-ref 1524 . C A 598.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.36;MQ0=0;QD=27.22;SB=-0.01;sumGLbyD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:26.14:632,26,0 3058-ref 1528 . 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C T 4374.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5173;MQ=34.90;MQ0=0;QD=37.08;SB=-0.01;sumGLbyD=37.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:118:99:4374,355,0 3084-ref 1077 . A G 2205.36 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=185;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=10.4020;MQ=35.56;MQ0=0;QD=11.92;SB=-0.01;sumGLbyD=12.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,77:182:99:2235,0,3488 3084-ref 1094 . G A 7218.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.8221;MQ=35.18;MQ0=0;QD=36.46;SB=-0.01;sumGLbyD=36.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:194:99:7218,584,0 3084-ref 1131 . T G 5840.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.4202;MQ=31.85;MQ0=0;QD=34.35;SB=-0.01;sumGLbyD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,170:169:99:5839,508,0 3084-ref 1148 . C T 6141.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=182;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9926;MQ=31.32;MQ0=0;QD=33.75;SB=-0.01;sumGLbyD=33.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,181:180:99:6111,538,0 3084-ref 1161 . C T 5684 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8765;MQ=31.58;MQ0=0;QD=33.83;SB=-0.01;sumGLbyD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:166:99:5683,499,0 3084-ref 1185 . A G 6682.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=187;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9942;MQ=33.50;MQ0=0;QD=35.73;SB=-0.01;sumGLbyD=35.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,187:187:99:6681,563,0 3084-ref 1358 . T C 10271.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=272;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=13.5276;MQ=36.78;MQ0=0;QD=37.76;SB=-0.01;sumGLbyD=37.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,269:266:99:10200,730,0 3084-ref 1386 . C T 10808.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=282;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=17.1247;MQ=36.68;MQ0=0;QD=38.33;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,279:280:99:10748,811,0 3084-ref 1447 . C T 8643.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=229;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=11.4306;MQ=36.47;MQ0=0;QD=37.74;SB=-0.01;sumGLbyD=37.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,226:225:99:8573,634,0 3084-ref 1464 . 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C A 657.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=73;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.29;MQ0=0;QD=9.00;SB=-0.01;sumGLbyD=9.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,28:72:99:687,0,1406 3084-ref 1710 . G A 4026.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8318;MQ=31.19;MQ0=0;QD=33.01;SB=-0.01;sumGLbyD=32.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,121:120:99:3986,322,0 3084-ref 1715 . C A 2180.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=131;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.3010;MQ=31.62;MQ0=0;QD=16.65;SB=-0.01;sumGLbyD=16.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,77:130:99:2211,0,1491 3084-ref 1744 . C T 2249.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9945;MQ=29.96;MQ0=0;QD=31.68;SB=-0.01;sumGLbyD=32.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,70:71:99:2282,173,0 3084-ref 1754 . G A 2250.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.09;MQ0=0;QD=32.62;SB=-0.01;sumGLbyD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2284,207,0 3084-ref 1791 . G A 61.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=20.52;SB=-0.01;sumGLbyD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:94,9,0 3084-ref 1792 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 3085-ref 34 . A G 729.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8920;MQ=36.80;MQ0=0;QD=14.59;SB=-0.01;sumGLbyD=15.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,24:48:99:759,0,714 3085-ref 139 . G C 1992.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.81;MQ0=0;QD=38.31;SB=-0.01;sumGLbyD=38.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2025,156,0 3085-ref 238 . G A 2553.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.85;MQ0=0;QD=38.10;SB=-0.01;sumGLbyD=38.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2586,202,0 3085-ref 244 . T C 2778.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.86;MQ0=0;QD=37.55;SB=-0.01;sumGLbyD=38.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:73:99:2812,220,0 3085-ref 312 . C T 2409.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.8548;MQ=36.85;MQ0=0;QD=35.44;SB=-0.01;sumGLbyD=35.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,67:66:99:2443,160,0 3085-ref 367 . G A 3012.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9813;MQ=36.51;MQ0=0;QD=36.74;SB=-0.01;sumGLbyD=37.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:80:99:3045,241,0 3085-ref 385 . C T 2813.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9989;MQ=36.59;MQ0=0;QD=38.02;SB=-0.01;sumGLbyD=38.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:74:99:2846,223,0 3085-ref 418 . G A 752.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8110;MQ=36.66;MQ0=0;QD=12.76;SB=-0.01;sumGLbyD=13.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,26:58:99:783,0,1077 3085-ref 463 . 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T G 79.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.95;SB=-0.01;sumGLbyD=10.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:109,0,205 3085-ref 792 . G A 152.02 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.34;SB=-0.01;sumGLbyD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:17.19:182,0,17 3091-ref 94 . C T 858.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6935;MQ=36.58;MQ0=0;QD=35.78;SB=-0.01;sumGLbyD=37.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.22:892,69,0 3091-ref 275 . A C 1153.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.67;MQ0=0;QD=37.21;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.29:1187,93,0 3091-ref 410 . T A 1236.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.70;MQ0=0;QD=36.36;SB=-0.01;sumGLbyD=37.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:33:99:1269,99,0 3091-ref 646 . G A 1010.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:27:81.25:1044,81,0 3091-ref 781 . C T 1942.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9734;MQ=36.80;MQ0=0;QD=38.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1975,153,0 3091-ref 954 . C T 989.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.3000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.11;SB=-0.01;sumGLbyD=35.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:27:78.25:1022,78,0 3091-ref 1415 . C T 2280.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=4.9653;MQ=36.17;MQ0=0;QD=37.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:60:99:2313,181,0 3091-ref 1420 . T C 2454.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.9653;MQ=36.23;MQ0=0;QD=37.19;SB=-0.01;sumGLbyD=37.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2487,199,0 3091-ref 1660 . C T 2183.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=36.83;MQ0=0;QD=35.79;SB=-0.01;sumGLbyD=36.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,60:60:99:2216,141,0 3091-ref 1921 . T C 4639.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=121;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.2782;MQ=36.83;MQ0=0;QD=38.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,120:120:99:4640,361,0 3091-ref 2002 . A G 2462.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.5016;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.21;SB=-0.01;sumGLbyD=36.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,67:68:99:2495,165,0 3091-ref 2096 . G A 4327.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.4534;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.96;SB=-0.01;sumGLbyD=37.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:4255,297,0 3091-ref 2458 . T A 2774.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=189;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.2460;MQ=36.89;MQ0=0;QD=14.68;SB=-0.01;sumGLbyD=14.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,89:188:99:2804,0,3225 3091-ref 2629 . G C 1954.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=151;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=14.3313;MQ=36.53;MQ0=0;QD=12.94;SB=-0.01;sumGLbyD=13.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:86,64:149:99:1984,0,2861 3091-ref 2653 . G A 300.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=79;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.0828;MQ=36.36;MQ0=0;QD=3.81;SB=3.00;sumGLbyD=4.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,16:79:99:331,0,2245 3091-ref 2654 . A G 89.62 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=73;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.2941;MQ=36.30;MQ0=0;QD=1.23;SB=3.00;sumGLbyD=1.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,10:73:99:120,0,2271 3091-ref 2655 . G C 54.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=72;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.2941;MQ=36.30;MQ0=0;QD=0.76;SB=3.00;sumGLbyD=1.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,9:72:84.84:85,0,2256 3091-ref 2657 . A T 2389.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.3353;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.93;SB=-39.32;sumGLbyD=38.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,62:63:99:2422,152,0 3091-ref 2663 . G A 2556.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.4276;MQ=36.70;MQ0=0;QD=37.59;SB=-40.01;sumGLbyD=38.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:67:99:2589,199,0 3091-ref 2671 . C A 2839.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.73;MQ0=0;QD=37.36;SB=-40.01;sumGLbyD=37.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,75:76:99:2873,193,0 3091-ref 2748 . G C 3154.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.0487;MQ=36.30;MQ0=0;QD=36.26;SB=-0.01;sumGLbyD=36.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:87:99:3188,253,0 3091-ref 2805 . T C 908.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.65;MQ0=0;QD=33.65;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.21:942,81,0 3091-ref 2810 . A T 549.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.29;MQ0=0;QD=26.15;SB=-0.01;sumGLbyD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:8.18:579,0,8 3091-ref 2811 . C A 606.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.63;MQ0=0;QD=31.94;SB=-0.01;sumGLbyD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.14:640,57,0 3188-ref 85 . A G 279.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=27.93;SB=-0.01;sumGLbyD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.07:312,27,0 3188-ref 111 . T G 1108.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.19;MQ0=0;QD=30.79;SB=-0.01;sumGLbyD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:35:99:1141,105,0 3188-ref 114 . G A 1475.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=30.65;MQ0=0;QD=32.80;SB=-0.01;sumGLbyD=33.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1509,135,0 3188-ref 164 . G A 6704.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.5327;MQ=35.70;MQ0=0;QD=37.04;SB=-80.02;sumGLbyD=36.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,177:178:99:6585,470,0 3188-ref 178 . G A 7258.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8573;MQ=35.75;MQ0=0;QD=36.84;SB=-80.02;sumGLbyD=36.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:192:99:7257,578,0 3188-ref 262 . A G 7642.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=13.9682;MQ=36.85;MQ0=0;QD=37.65;SB=-0.01;sumGLbyD=37.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,202:197:99:7642,593,0 3188-ref 321 . G A 8142.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=223;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.7754;MQ=36.91;MQ0=0;QD=36.51;SB=-0.01;sumGLbyD=36.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,221:212:99:8142,638,0 3188-ref 397 . C T 7697.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=14.5738;MQ=36.75;MQ0=0;QD=38.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:199:99:7667,596,0 3188-ref 462 . A G 2666.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8324;MQ=36.72;MQ0=0;QD=37.55;SB=-0.01;sumGLbyD=38.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,70:70:99:2699,211,0 3259-ref 36 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 3259-ref 50 . A T 96.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:129,12,0 3259-ref 54 . C A 96.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:129,12,0 3259-ref 104 . T C 591.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.55;MQ0=0;QD=34.77;SB=-0.01;sumGLbyD=36.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.12:624,51,0 3259-ref 116 . C T 636.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=35.36;SB=-0.01;sumGLbyD=37.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.16:669,54,0 3259-ref 233 . G A 1307.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.45;SB=-0.01;sumGLbyD=39.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1340,102,0 3259-ref 254 . G A 1270.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.49;SB=-0.01;sumGLbyD=39.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1303,99,0 3259-ref 298 . T C 238.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.05;SB=-0.01;sumGLbyD=38.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:271,21,0 3259-ref 322 . G A 65.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.09;SB=-0.01;sumGLbyD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.96:95,0,65 3259-ref 324 . A T 195.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.64;SB=-0.01;sumGLbyD=38.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:229,18,0 3259-ref 393 . A G 683.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.53;SB=-0.01;sumGLbyD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:20:25.84:716,26,0 3259-ref 559 . A G 42.19 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.52;SB=-0.01;sumGLbyD=6.02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:72.19:72,0,321 3259-ref 696 . T G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 3259-ref 710 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 3340-ref 46 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 3340-ref 77 . C A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 3340-ref 80 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 3340-ref 83 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 3340-ref 132 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 3340-ref 219 . A G 315.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.9578;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.59;SB=-0.01;sumGLbyD=34.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:9:27.09:349,27,0 3340-ref 224 . T G 19.97 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.9578;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.22;SB=-0.01;sumGLbyD=5.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49.92:50,0,227 3340-ref 527 . C T 393.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:427,33,0 3340-ref 679 . C A 16.09 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=1.79;SB=-0.01;sumGLbyD=5.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:45.97:46,0,231 3340-ref 693 . C G 154.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.94;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:187,15,0 3340-ref 698 . C G 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 3340-ref 749 . G A 195.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.93;SB=-0.01;sumGLbyD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.06:228,18,0 3340-ref 826 . C T 746.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9578;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.32;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:779,60,0 3340-ref 919 . A C 303.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.36;SB=-0.01;sumGLbyD=33.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.08:337,27,0 3340-ref 931 . C A 32.14 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.36;SB=-0.01;sumGLbyD=10.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:5:62.13:62,0,86 3340-ref 934 . A C 63.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.03;SB=-0.01;sumGLbyD=13.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:6:93.18:93,0,101 3340-ref 1040 . C T 642 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8658;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.79;SB=-0.01;sumGLbyD=35.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:21.06:675,21,0 3340-ref 1148 . G A 1121.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=36.67;MQ0=0;QD=36.18;SB=-0.01;sumGLbyD=37.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.28:1155,93,0 3340-ref 1332 . T A 1344.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.34;SB=-0.01;sumGLbyD=38.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1377,108,0 3340-ref 1345 . A G 980.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.31;SB=-0.01;sumGLbyD=37.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:26:78.25:1013,78,0 3340-ref 1391 . G T 24.51 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.50;SB=-0.01;sumGLbyD=7.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54.49:54,0,169 3340-ref 1405 . C T 218.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.35;SB=-0.01;sumGLbyD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:12.90:249,0,13 3340-ref 1417 . C T 128.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.85;SB=-0.01;sumGLbyD=12.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:158,0,268 3340-ref 1476 . A G 921.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.19;MQ0=0;QD=35.45;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.22:955,78,0 3340-ref 1499 . G A 647.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9921;MQ=33.02;MQ0=0;QD=26.97;SB=-0.01;sumGLbyD=28.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:22:36.53:680,37,0 3340-ref 1504 . T C 638.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9980;MQ=32.83;MQ0=0;QD=27.75;SB=-0.01;sumGLbyD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,21:23:2.96:667,0,3 3340-ref 1532 . C G 795.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=34.28;MQ0=0;QD=34.59;SB=-0.01;sumGLbyD=36.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.18:828,69,0 3340-ref 1673 . C T 1501.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9972;MQ=36.78;MQ0=0;QD=33.36;SB=-0.01;sumGLbyD=34.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,43:45:57.57:1534,58,0 3340-ref 1685 . A G 1369.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.1334;MQ=36.73;MQ0=0;QD=36.04;SB=-0.01;sumGLbyD=36.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:78.23:1403,78,0 3340-ref 1740 . G T 229.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.80;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:263,21,0 3340-ref 1877 . G A 339.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.04;MQ0=0;QD=28.29;SB=-0.01;sumGLbyD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:8.43:371,8,0 3340-ref 1912 . A C 1465.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9883;MQ=36.19;MQ0=0;QD=35.73;SB=-0.01;sumGLbyD=36.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:88.12:1498,88,0 3340-ref 1975 . T C 1027.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=32.75;MQ0=0;QD=30.22;SB=-0.01;sumGLbyD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:32:96.17:1060,96,0 3362-ref 317 . G A 814.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.54;MQ0=0;QD=33.94;SB=-0.01;sumGLbyD=35.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.19:848,72,0 3362-ref 326 . G A 571.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.91;MQ0=0;QD=31.77;SB=-0.01;sumGLbyD=33.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.12:605,54,0 3362-ref 347 . C T 292.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=26.62;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.06:326,33,0 3362-ref 349 . 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C T 1879.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7552;MQ=36.80;MQ0=0;QD=37.59;SB=-0.01;sumGLbyD=38.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:49:99:1913,147,0 3362-ref 819 . C T 1834.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.79;MQ0=0;QD=38.21;SB=-0.01;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1867,144,0 3362-ref 868 . G A 1274.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9987;MQ=36.70;MQ0=0;QD=37.48;SB=-0.01;sumGLbyD=38.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1307,102,0 3362-ref 877 . C G 278.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4672;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.28;SB=-0.01;sumGLbyD=10.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,10:30:99:308,0,693 3362-ref 941 . T A 632.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=35.13;SB=-0.01;sumGLbyD=36.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.16:665,54,0 3362-ref 980 . G A 355.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=32.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:388,33,0 3362-ref 982 . T C 101.04 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=9.19;SB=-0.01;sumGLbyD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:131,0,191 3362-ref 997 . C T 475.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.68;SB=-0.01;sumGLbyD=33.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.12:508,42,0 3362-ref 1003 . G T 487.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=34.85;SB=-0.01;sumGLbyD=37.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:521,42,0 3362-ref 1087 . T A 1548.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.77;MQ0=0;QD=36.00;SB=-0.01;sumGLbyD=36.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1581,123,0 3362-ref 1105 . C T 1553.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.75;MQ0=0;QD=37.88;SB=-0.01;sumGLbyD=38.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1586,123,0 3362-ref 1158 . C G 28.41 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=9.47;SB=-0.01;sumGLbyD=19.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:58,0,31 3362-ref 1179 . A G 105.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.12;SB=-0.01;sumGLbyD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.96:136,0,25 3362-ref 1185 . G A 223.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.91;SB=-0.01;sumGLbyD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15.93:253,0,16 3362-ref 1212 . C T 871.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.28;SB=-0.01;sumGLbyD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,25:27:6:903,6,0 3362-ref 1278 . G T 466.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.08;SB=-0.01;sumGLbyD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:15:39.12:499,39,0 3362-ref 1363 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=9;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 3362-ref 1414 . T C 202.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.78;SB=-0.01;sumGLbyD=39.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:236,18,0 3387-ref 343 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 3387-ref 768 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 3387-ref 779 . C T 110.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=27.55;SB=-0.01;sumGLbyD=35.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:143,12,0 3387-ref 809 . G A 186.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=31.07;SB=-0.01;sumGLbyD=36.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:219,18,0 3387-ref 849 . C T 129.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=21.52;SB=-0.01;sumGLbyD=26.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:13.50:159,0,14 3387-ref 853 . T A 57.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=14.31;SB=-0.01;sumGLbyD=21.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.98:87,0,28 3387-ref 921 . T A 278.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.22;MQ0=0;QD=30.89;SB=-0.01;sumGLbyD=34.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:311,27,0 3387-ref 925 . T C 315.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.26;SB=-0.01;sumGLbyD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:10:30.08:348,30,0 3387-ref 977 . T C 858.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9578;MQ=33.89;MQ0=0;QD=31.81;SB=-0.01;sumGLbyD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:41.22:892,41,0 3387-ref 981 . G C 701.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9994;MQ=33.32;MQ0=0;QD=30.50;SB=-0.01;sumGLbyD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:30.61:734,31,0 3387-ref 1072 . G A 1220.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9726;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.90;SB=-0.01;sumGLbyD=36.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:63.75:1254,64,0 3387-ref 1105 . T C 984.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.61;MQ0=0;QD=37.88;SB=-0.01;sumGLbyD=39.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.25:1018,78,0 3387-ref 1140 . G A 1065.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.64;MQ0=0;QD=38.07;SB=-0.01;sumGLbyD=39.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.27:1099,84,0 3387-ref 1194 . C T 758.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=31.58;SB=-0.01;sumGLbyD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:40.65:791,41,0 3387-ref 1200 . T C 631.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=30.07;SB=-0.01;sumGLbyD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:31.61:664,32,0 3387-ref 1213 . G A 312.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.23;MQ0=0;QD=24.08;SB=-0.01;sumGLbyD=26.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:7.53:345,8,0 3387-ref 1243 . A T 286.02 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.11;MQ0=0;QD=26.00;SB=-0.01;sumGLbyD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:0.35:314,0,0 3387-ref 1264 . G A 261.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=29.06;SB=-0.01;sumGLbyD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:9:24.07:295,24,0 3387-ref 1371 . T C 692.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=34.65;SB=-0.01;sumGLbyD=36.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:19:57.17:726,57,0 3387-ref 1380 . G T 704.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.93;MQ0=0;QD=37.10;SB=-0.01;sumGLbyD=38.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:738,57,0 3387-ref 1481 . C G 561.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.44;SB=-0.01;sumGLbyD=39.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:595,45,0 3387-ref 1489 . A T 529.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.09;SB=-0.01;sumGLbyD=35.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:13.80:562,14,0 3387-ref 1512 . 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C G 109.76 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.29;SB=-0.01;sumGLbyD=23.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:61.95:140,0,62 3591-ref 301 . A G 31.96 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.33;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61.95:62,0,136 3591-ref 307 . G A 204.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.02;SB=-0.01;sumGLbyD=39.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:237,18,0 3591-ref 345 . T G 37.98 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.49;SB=-0.01;sumGLbyD=16.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67.97:68,0,68 3591-ref 356 . C T 142.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9986;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.94;SB=-0.01;sumGLbyD=15.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:11:91.19:172,0,91 3591-ref 413 . T C 155.89 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.7334;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.66;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:186,0,390 3591-ref 419 . A G 41.87 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7334;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.46;SB=-0.01;sumGLbyD=4.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:16:71.86:72,0,453 3591-ref 430 . A G 45.68 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.26;SB=-0.01;sumGLbyD=5.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:75.67:76,0,387 3591-ref 501 . G A 293.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7338;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.72;SB=-0.01;sumGLbyD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:43.88:324,0,44 3591-ref 509 . A C 33.07 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9999;MQ=36.32;MQ0=0;QD=2.20;SB=-0.01;sumGLbyD=4.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:63.06:63,0,426 3591-ref 533 . A G 68.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9988;MQ=36.49;MQ0=0;QD=3.40;SB=-0.01;sumGLbyD=4.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:19:98.09:98,0,532 3591-ref 554 . C T 13.73 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8496;MQ=35.91;MQ0=0;QD=0.69;SB=-0.01;sumGLbyD=2.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:43.53:44,0,575 3591-ref 555 . G A 90.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8496;MQ=35.91;MQ0=0;QD=4.51;SB=-0.01;sumGLbyD=6.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:19:99:120,0,481 3591-ref 566 . T C 111.70 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.9956;MQ=36.01;MQ0=0;QD=5.08;SB=-0.01;sumGLbyD=6.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:22:99:142,0,561 3591-ref 568 . G C 173.39 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.9956;MQ=36.17;MQ0=0;QD=6.67;SB=-0.01;sumGLbyD=7.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:25:99:203,0,606 3591-ref 572 . A G 169.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.9942;MQ=36.17;MQ0=0;QD=6.52;SB=-0.01;sumGLbyD=7.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:26:99:200,0,654 3591-ref 581 . T C 168.74 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.9975;MQ=35.28;MQ0=0;QD=6.25;SB=-0.01;sumGLbyD=7.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:27:99:199,0,589 3591-ref 645 . A G 147.76 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9937;MQ=34.04;MQ0=0;QD=7.39;SB=-36.31;sumGLbyD=8.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:178,0,428 3591-ref 662 . T A 245.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=35.34;MQ0=0;QD=17.56;SB=3.00;sumGLbyD=19.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:276,0,146 3591-ref 678 . G A 125.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9997;MQ=36.18;MQ0=0;QD=8.98;SB=-37.00;sumGLbyD=11.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:156,0,303 3591-ref 701 . C T 115.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9984;MQ=35.54;MQ0=0;QD=7.69;SB=3.00;sumGLbyD=9.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:14:99:145,0,296 3591-ref 761 . C G 154.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9923;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.27;SB=-0.01;sumGLbyD=23.02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:45.57:184,0,46 3591-ref 762 . A C 186.88 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9923;MQ=32.22;MQ0=0;QD=20.76;SB=-0.01;sumGLbyD=24.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:9:15.94:217,0,16 3591-ref 781 . C T 715.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.46;MQ0=0;QD=35.77;SB=-35.26;sumGLbyD=37.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.18:748,60,0 3591-ref 840 . G A 462.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.12;MQ0=0;QD=35.59;SB=-0.01;sumGLbyD=38.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:496,39,0 3591-ref 841 . T A 405.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.04;MQ0=0;QD=33.80;SB=-0.01;sumGLbyD=36.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.09:439,36,0 3610-ref 48 . G T 287.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:320,24,0 3610-ref 891 . C T 747.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.40;SB=-0.01;sumGLbyD=39.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:781,60,0 3610-ref 1027 . A G 511.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=36.54;SB=-0.01;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:545,42,0 3610-ref 1035 . G T 584.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=36.51;SB=-0.01;sumGLbyD=38.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:617,48,0 3610-ref 1120 . G A 781.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4679;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.21;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:814,63,0 3610-ref 1160 . T A 827.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.00;SB=-0.01;sumGLbyD=37.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.20:861,69,0 3610-ref 1239 . G A 879.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.26;SB=-0.01;sumGLbyD=39.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.23:913,69,0 3610-ref 1317 . A G 583.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9810;MQ=36.47;MQ0=0;QD=30.70;SB=-0.01;sumGLbyD=32.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:18:14.17:616,14,0 3679-ref 89 . T C 520.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.5226;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.53;SB=-0.01;sumGLbyD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.12:554,45,0 3679-ref 99 . T C 21.57 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.20;SB=-0.01;sumGLbyD=2.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:51.53:52,0,528 3679-ref 153 . A G 626.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.82;SB=-0.01;sumGLbyD=36.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:17:51.16:660,51,0 3679-ref 269 . G C 332.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=33.22;SB=-0.01;sumGLbyD=36.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:365,30,0 3679-ref 276 . G A 460.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.42;MQ0=0;QD=35.40;SB=-0.01;sumGLbyD=37.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:493,39,0 3679-ref 361 . A G 389.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.49;SB=-0.01;sumGLbyD=35.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:11:33.10:423,33,0 3679-ref 389 . G A 78.47 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=8.72;SB=-0.01;sumGLbyD=12.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:108,0,170 3679-ref 410 . A G 340.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=34.93;MQ0=0;QD=34.05;SB=-0.01;sumGLbyD=37.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:374,30,0 3679-ref 420 . G T 36.25 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=34.69;MQ0=0;QD=4.03;SB=-0.01;sumGLbyD=7.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:66.25:66,0,203 3679-ref 421 . T G 237.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9997;MQ=34.69;MQ0=0;QD=26.40;SB=-0.01;sumGLbyD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12.93:267,0,13 3679-ref 463 . C G 101.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.65;SB=-0.01;sumGLbyD=16.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:7:98.95:131,0,99 3679-ref 538 . T C 484.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.32;MQ0=0;QD=32.33;SB=-0.01;sumGLbyD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:14:42.12:518,42,0 3679-ref 585 . T C 366.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.20;SB=4.50;sumGLbyD=30.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:37.86:397,0,38 3679-ref 648 . T C 322.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.36;SB=-0.01;sumGLbyD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:0.33:351,0,0 3679-ref 655 . T C 173.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.85;SB=-0.01;sumGLbyD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:13.29:204,0,13 3679-ref 731 . T C 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 3907-ref 130 . G T 629.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.97;SB=-0.01;sumGLbyD=36.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:662,51,0 3907-ref 197 . A G 2050.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.9078;MQ=36.45;MQ0=0;QD=37.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:54:99:2084,163,0 3907-ref 351 . G A 3673.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.3352;MQ=36.79;MQ0=0;QD=37.49;SB=-0.01;sumGLbyD=37.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:96:99:3674,289,0 3907-ref 534 . C A 3140.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9312;MQ=35.78;MQ0=0;QD=37.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:83:99:3174,250,0 3907-ref 542 . G C 3768.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8898;MQ=35.87;MQ0=0;QD=38.06;SB=-0.01;sumGLbyD=38.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:3768,298,0 3907-ref 568 . G C 3207.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7878;MQ=35.71;MQ0=0;QD=36.86;SB=-0.01;sumGLbyD=37.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,86:87:99:3240,226,0 3907-ref 674 . G A 3321.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.7296;MQ=36.66;MQ0=0;QD=37.32;SB=-0.01;sumGLbyD=37.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:3321,265,0 3907-ref 713 . T A 2564.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=4.1963;MQ=36.57;MQ0=0;QD=36.64;SB=-0.01;sumGLbyD=37.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,69:68:99:2598,165,0 3907-ref 852 . A C 280.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.01;SB=-0.01;sumGLbyD=39.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:313,24,0 3907-ref 872 . C T 206.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 3907-ref 898 . C G 241.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.55;SB=-0.01;sumGLbyD=39.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:275,21,0 3921-ref 82 . T C 440.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.35;SB=-0.01;sumGLbyD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:2.07:470,2,0 3921-ref 339 . A G 584.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.37;SB=-0.01;sumGLbyD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.15:617,48,0 3921-ref 343 . A G 603.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.49;SB=-0.01;sumGLbyD=37.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.15:636,51,0 3921-ref 437 . G T 768.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7356;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.41;SB=-0.01;sumGLbyD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:21:63.20:801,63,0 3921-ref 908 . G A 983.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.63;MQ0=0;QD=36.41;SB=-0.01;sumGLbyD=37.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.25:1016,78,0 3921-ref 1052 . C T 1399.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6208;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.83;SB=-0.01;sumGLbyD=38.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:36:99:1433,108,0 3921-ref 1686 . T A 20.39 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.55;SB=-0.01;sumGLbyD=6.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:6:50.35:50,0,111 3930-ref 16 . G C 68.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.85;SB=-0.01;sumGLbyD=14.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:98.95:99,0,138 3930-ref 22 . G A 84.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=31.18;MQ0=0;QD=5.66;SB=-0.01;sumGLbyD=7.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:115,0,312 3930-ref 24 . A G 308.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.9997;MQ=30.83;MQ0=0;QD=19.28;SB=-0.01;sumGLbyD=21.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:339,0,104 3930-ref 64 . C T 356.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=9.9986;MQ=31.78;MQ0=0;QD=12.30;SB=-0.01;sumGLbyD=13.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:387,0,448 3930-ref 65 . G A 30.91 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=9.9986;MQ=31.78;MQ0=0;QD=1.07;SB=-0.01;sumGLbyD=2.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:29:60.90:61,0,757 3930-ref 66 . A G 269.40 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=9.9986;MQ=31.78;MQ0=0;QD=9.29;SB=-0.01;sumGLbyD=10.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:299,0,531 3930-ref 86 . T A 303.52 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.8654;MQ=31.36;MQ0=0;QD=11.24;SB=-0.01;sumGLbyD=12.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:334,0,430 3930-ref 87 . G T 149.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.9988;MQ=31.58;MQ0=0;QD=5.34;SB=-0.01;sumGLbyD=6.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:179,0,608 3930-ref 98 . C G 51.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=34.64;MQ0=0;QD=2.36;SB=-0.01;sumGLbyD=3.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:81.92:82,0,614 3930-ref 112 . C T 157.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9928;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.84;SB=-0.01;sumGLbyD=8.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:22:99:187,0,527 3930-ref 117 . A G 443.24 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.65;MQ0=0;QD=15.28;SB=-0.01;sumGLbyD=16.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:473,0,471 3930-ref 167 . G A 736.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9265;MQ=36.25;MQ0=0;QD=27.29;SB=-0.01;sumGLbyD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,22:26:74.17:767,0,74 3930-ref 187 . G C 328.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9779;MQ=35.72;MQ0=0;QD=20.56;SB=-0.01;sumGLbyD=22.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:16:2.47:358,0,2 3930-ref 222 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 3930-ref 238 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 3930-ref 281 . C T 342.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=24.46;SB=-0.01;sumGLbyD=26.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:14:30.09:375,30,0 3930-ref 285 . G A 66.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=4.75;SB=-0.01;sumGLbyD=6.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:96.45:96,0,331 3930-ref 326 . G C 239.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=31.58;MQ0=0;QD=29.93;SB=-0.01;sumGLbyD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:272,24,0 3930-ref 348 . T C 79.40 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=13.23;SB=-0.01;sumGLbyD=18.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:61.97:109,0,62 3930-ref 359 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 3930-ref 392 . G C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 3938-ref 578 . G A 148.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.28;SB=-0.01;sumGLbyD=25.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:58.94:179,0,59 3938-ref 651 . A C 61.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.31;SB=-0.01;sumGLbyD=23.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9:93,9,0 3938-ref 678 . A C 43.12 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.56;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:74,6,0 3938-ref 818 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 3938-ref 1091 . A G 123.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.97;SB=-0.01;sumGLbyD=39.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:156,12,0 3943-ref 7 . T C 79.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=19.76;SB=-0.01;sumGLbyD=27.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:112,12,0 3943-ref 40 . C G 342.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.11;MQ0=0;QD=31.14;SB=-0.01;sumGLbyD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.08:376,33,0 3943-ref 51 . A G 506.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=33.75;SB=-0.01;sumGLbyD=35.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:539,45,0 3943-ref 58 . G T 1792.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.5048;MQ=35.91;MQ0=0;QD=32.00;SB=-0.01;sumGLbyD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,53:55:54.98:1825,55,0 3943-ref 130 . T A 4992.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.9067;MQ=34.05;MQ0=0;QD=35.16;SB=-0.01;sumGLbyD=33.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,137:142:99:4803,238,0 3943-ref 159 . G A 2319.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9986;MQ=31.33;MQ0=0;QD=32.67;SB=-0.01;sumGLbyD=33.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,70:71:99:2352,178,0 3943-ref 167 . T C 1808.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.62;MQ0=0;QD=32.29;SB=-0.01;sumGLbyD=32.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1841,168,0 3943-ref 178 . A G 885.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=28.56;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.17:918,93,0 3943-ref 251 . G A 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 3943-ref 256 . G A 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 3943-ref 272 . C T 919.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.77;SB=-0.01;sumGLbyD=38.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:24:72.24:952,72,0 3943-ref 495 . T G 5685.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.6996;MQ=36.93;MQ0=0;QD=38.16;SB=-0.01;sumGLbyD=38.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:148:99:5685,445,0 3943-ref 564 . C T 6075.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=160;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=6.6751;MQ=36.87;MQ0=0;QD=37.97;SB=-0.01;sumGLbyD=37.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,157:157:99:6016,448,0 3943-ref 788 . T A 667.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.07;SB=-160.03;sumGLbyD=38.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.15:700,54,0 3943-ref 791 . C T 724.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.52;SB=-160.03;sumGLbyD=36.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:19:57.19:758,57,0 3943-ref 863 . T C 1895.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.19;MQ0=0;QD=37.90;SB=-0.01;sumGLbyD=38.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1928,150,0 3943-ref 908 . A T 911.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.35;MQ0=0;QD=36.47;SB=-0.01;sumGLbyD=37.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.23:945,75,0 3943-ref 926 . T C 226.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=32.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:259,21,0 3943-ref 928 . T C 21.10 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=10.55;SB=-0.01;sumGLbyD=26.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:5.99:52,6,0 3974-ref 122 . G A 128.70 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4265;MQ=35.87;MQ0=0;QD=14.30;SB=-0.01;sumGLbyD=17.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:159,0,114 3974-ref 197 . C T 128.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.64;SB=-0.01;sumGLbyD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.01:161,15,0 3974-ref 218 . C T 44.89 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9384;MQ=34.39;MQ0=0;QD=11.22;SB=-0.01;sumGLbyD=19.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:2:6.02:76,6,0 3974-ref 333 . G C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=33.48;MQ0=0;QD=12.80;SB=-0.01;sumGLbyD=23.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 3974-ref 353 . C G 29.94 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=14.97;SB=-0.01;sumGLbyD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:61,6,0 3974-ref 398 . T C 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 3974-ref 449 . T C 114.30 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.86;SB=-0.01;sumGLbyD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:21.93:144,0,22 3974-ref 506 . G A 152.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9987;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.40;SB=-0.01;sumGLbyD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.05:185,15,0 3974-ref 558 . T C 134.87 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=16.86;SB=-0.01;sumGLbyD=20.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:7:52.89:165,0,53 3974-ref 569 . T C 213.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6630;MQ=34.39;MQ0=0;QD=26.63;SB=-0.01;sumGLbyD=30.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:7:21.06:246,21,0 3974-ref 582 . A G 92.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8308;MQ=33.48;MQ0=0;QD=15.34;SB=-37.00;sumGLbyD=20.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:51.58:122,0,52 3974-ref 617 . T G 158.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9987;MQ=34.93;MQ0=0;QD=15.85;SB=-37.00;sumGLbyD=18.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:188,0,117 3974-ref 787 . G A 200.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=20.01;SB=-0.01;sumGLbyD=23.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:70.95:230,0,71 3974-ref 809 . C T 60.16 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=35.53;MQ0=0;QD=8.59;SB=-0.01;sumGLbyD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:6:88.40:90,0,88 3974-ref 817 . A G 97.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=35.87;MQ0=0;QD=10.79;SB=-0.01;sumGLbyD=14.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:7:95.24:127,0,95 3974-ref 968 . C G 267.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=33.44;SB=-0.01;sumGLbyD=37.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:300,24,0 3974-ref 971 . C T 168.55 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=21.07;SB=-0.01;sumGLbyD=24.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:53.73:199,0,54 3974-ref 979 . C T 26.66 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.44;SB=-0.01;sumGLbyD=9.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56.65:57,0,141 3998-ref 43 . A T 122.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.56;SB=-0.01;sumGLbyD=38.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:155,12,0 3998-ref 45 . T A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 3998-ref 141 . T C 43.53 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.77;SB=-0.01;sumGLbyD=37.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 3998-ref 389 . A G 191.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.86;SB=-0.01;sumGLbyD=37.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:224,18,0 3998-ref 404 . 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G A 741.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.12;MQ0=0;QD=32.23;SB=-0.01;sumGLbyD=33.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:22:26.20:774,26,0 3998-ref 950 . G A 695.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.03;MQ0=0;QD=33.13;SB=-0.01;sumGLbyD=34.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:23.19:729,23,0 3998-ref 992 . G T 461.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.21;MQ0=0;QD=30.79;SB=-0.01;sumGLbyD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.11:495,42,0 3998-ref 1009 . G T 436.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=34.78;MQ0=0;QD=31.15;SB=-0.01;sumGLbyD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:13:39.11:469,39,0 3998-ref 1026 . A G 518.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=35.06;MQ0=0;QD=32.43;SB=-0.01;sumGLbyD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.13:552,45,0 3998-ref 1188 . A T 546.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.14;SB=-0.01;sumGLbyD=36.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.14:579,45,0 3998-ref 1261 . T A 306.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=34.03;SB=-0.01;sumGLbyD=37.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:339,27,0 3998-ref 1337 . C T 170.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.7981;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.15;SB=-0.01;sumGLbyD=15.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:201,0,236 3998-ref 1400 . G A 589.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=32.76;SB=-0.01;sumGLbyD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:16:48.15:623,48,0 3998-ref 1452 . C G 83.53 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=36.15;MQ0=0;QD=6.96;SB=-0.01;sumGLbyD=9.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:114,0,279 3998-ref 1482 . 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A C 615.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.80;MQ0=0;QD=36.18;SB=-22.68;sumGLbyD=38.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.14:648,51,0 3999-ref 652 . A G 879 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.22;SB=-0.01;sumGLbyD=39.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.23:912,69,0 3999-ref 671 . C T 17.49 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=0.83;SB=-0.01;sumGLbyD=2.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:47.40:47,0,648 3999-ref 1026 . G A 1349.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.8635;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.59;SB=-0.01;sumGLbyD=35.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:39:49.62:1382,50,0 3999-ref 1301 . T C 1112.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.10;SB=-0.01;sumGLbyD=38.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.28:1146,90,0 4016-ref 17 . G C 273.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.22;SB=-0.01;sumGLbyD=38.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:307,24,0 4016-ref 62 . T C 1706.37 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.4540;MQ=36.50;MQ0=0;QD=27.97;SB=-0.01;sumGLbyD=28.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,51:60:99:1736,0,218 4016-ref 103 . T C 2123.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=76;DS;Dels=0.01;HRun=2;HaplotypeScore=15.3077;MQ=36.33;MQ0=0;QD=27.94;SB=-0.01;sumGLbyD=28.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,62:75:99:2154,0,278 4016-ref 141 . C G 291.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=71;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8055;MQ=36.43;MQ0=0;QD=4.11;SB=-0.01;sumGLbyD=4.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,14:70:99:322,0,1962 4016-ref 172 . T A 815.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=108;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.7369;MQ=36.72;MQ0=0;QD=7.55;SB=-0.01;sumGLbyD=7.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,30:106:99:846,0,2630 4016-ref 183 . T C 409.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=110;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=22.8365;MQ=36.82;MQ0=0;QD=3.72;SB=-0.01;sumGLbyD=3.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,20:109:99:439,0,3088 4016-ref 189 . T C 287.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=116;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=23.4553;MQ=36.91;MQ0=0;QD=2.48;SB=-0.01;sumGLbyD=2.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,17:114:99:318,0,3448 4016-ref 214 . C T 1353.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=124;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.7548;MQ=36.92;MQ0=0;QD=10.92;SB=-0.01;sumGLbyD=11.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:79,45:121:99:1383,0,2620 4016-ref 293 . T A 490.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=103;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=4.4520;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.76;SB=-0.01;sumGLbyD=5.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,21:103:99:520,0,2865 4016-ref 307 . C A 1613.24 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=105;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.4278;MQ=36.81;MQ0=0;QD=15.36;SB=-0.01;sumGLbyD=15.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,50:104:99:1643,0,1740 4016-ref 354 . G A 4328.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.0347;MQ=36.82;MQ0=0;QD=37.97;SB=-0.01;sumGLbyD=37.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:113:99:4289,301,0 4016-ref 422 . C T 3317.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.7910;MQ=36.66;MQ0=0;QD=37.70;SB=-0.01;sumGLbyD=37.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:87:99:3277,222,0 4016-ref 476 . T A 204.52 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=91;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=6.9671;MQ=36.89;MQ0=0;QD=2.25;SB=-0.01;sumGLbyD=2.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,13:89:99:235,0,2706 4016-ref 538 . G C 1775.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.98;MQ0=0;QD=34.15;SB=-0.01;sumGLbyD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:51:99:1809,153,0 4016-ref 552 . G A 86.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.7881;MQ=32.44;MQ0=0;QD=1.59;SB=-0.01;sumGLbyD=2.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,8:54:99:116,0,1443 4016-ref 576 . A T 888.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.03;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.69;MQ0=0;QD=29.62;SB=-0.01;sumGLbyD=30.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.19:922,87,0 4016-ref 586 . C T 830.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.97;MQ0=0;QD=28.65;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:28:84.17:864,84,0 4016-ref 591 . G T 1194.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.99;MQ0=0;QD=31.45;SB=-0.01;sumGLbyD=32.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1228,114,0 4016-ref 610 . A T 389.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=33.30;MQ0=0;QD=9.75;SB=-0.01;sumGLbyD=10.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,16:40:99:420,0,764 4016-ref 644 . G A 2239.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.7241;MQ=36.15;MQ0=0;QD=37.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:59:99:2273,178,0 4016-ref 717 . 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G A 951.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7876;MQ=35.95;MQ0=0;QD=24.40;SB=-0.01;sumGLbyD=25.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,29:39:99:981,0,261 4016-ref 861 . T A 466.64 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.82;MQ0=0;QD=24.56;SB=-0.01;sumGLbyD=26.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:497,0,101 4016-ref 876 . A T 176.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=34.01;MQ0=0;QD=12.63;SB=-0.01;sumGLbyD=14.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:207,0,225 4016-ref 878 . T A 116.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=33.77;MQ0=0;QD=8.94;SB=-0.01;sumGLbyD=11.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:146,0,245 4079-ref 98 . A C 73.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=24.57;SB=-0.01;sumGLbyD=35.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:106,9,0 4079-ref 99 . A C 114.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.73;SB=-0.01;sumGLbyD=36.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:147,12,0 4079-ref 100 . A G 113.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.38;SB=-0.01;sumGLbyD=36.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:146,12,0 4079-ref 162 . A T 107.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.64;SB=-0.01;sumGLbyD=7.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:137,0,496 4079-ref 288 . C G 492.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=35.15;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:525,42,0 4079-ref 372 . T C 78.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.61;SB=-0.01;sumGLbyD=7.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:108,0,355 4079-ref 391 . T G 822.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.75;SB=-0.01;sumGLbyD=37.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.21:855,66,0 4079-ref 441 . A G 469.30 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.18;SB=-0.01;sumGLbyD=17.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:499,0,463 4079-ref 506 . C A 965.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.13;SB=-0.01;sumGLbyD=38.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.24:999,78,0 4079-ref 511 . C G 868.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.74;SB=-0.01;sumGLbyD=39.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.22:901,69,0 4079-ref 731 . G A 760.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.22;SB=-0.01;sumGLbyD=37.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.19:794,63,0 4079-ref 780 . A G 991.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.25;MQ0=0;QD=36.71;SB=-0.01;sumGLbyD=37.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.25:1024,81,0 4079-ref 819 . T G 546.02 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9085;MQ=35.09;MQ0=0;QD=20.22;SB=-0.01;sumGLbyD=21.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:99:576,0,262 4079-ref 822 . C T 775.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9085;MQ=35.28;MQ0=0;QD=25.86;SB=-0.01;sumGLbyD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:23:69.15:809,69,0 4079-ref 849 . G A 595.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.74;MQ0=0;QD=15.26;SB=-0.01;sumGLbyD=16.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,19:39:99:625,0,624 4116-ref 18 . G A 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28.77:71,0,29 4116-ref 73 . G A 619.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=29.49;SB=-0.01;sumGLbyD=31.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.13:652,63,0 4116-ref 90 . A G 533.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.77;MQ0=0;QD=28.09;SB=-0.01;sumGLbyD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.11:567,57,0 4116-ref 91 . A C 596.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.70;MQ0=0;QD=28.40;SB=-0.01;sumGLbyD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.12:629,63,0 4116-ref 94 . T G 599.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.70;MQ0=0;QD=28.55;SB=-0.01;sumGLbyD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.12:632,63,0 4116-ref 150 . A C 819.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.28;MQ0=0;QD=35.62;SB=-0.01;sumGLbyD=37.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.20:852,69,0 4116-ref 163 . T C 294.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.94;MQ0=0;QD=12.29;SB=-0.01;sumGLbyD=13.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:325,0,412 4116-ref 181 . C T 561.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.22;MQ0=0;QD=31.20;SB=-0.01;sumGLbyD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.10:595,54,0 4116-ref 187 . C T 323.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=26.94;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:12:33.07:356,33,0 4116-ref 202 . C T 354.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=29.55;SB=-0.01;sumGLbyD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.06:388,36,0 4116-ref 214 . A T 412.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.12;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=34.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.10:445,39,0 4116-ref 247 . A C 1138.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=34.50;SB=-0.01;sumGLbyD=35.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:31:93.28:1172,93,0 4116-ref 333 . T G 765.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.0436;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.96;SB=-0.01;sumGLbyD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,24:47:99:796,0,762 4116-ref 479 . G A 1602.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8332;MQ=36.29;MQ0=0;QD=37.26;SB=-0.01;sumGLbyD=38.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1635,129,0 4116-ref 517 . T C 1544.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.05;MQ0=0;QD=35.93;SB=-0.01;sumGLbyD=36.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:41:99:1578,123,0 4116-ref 535 . T G 1771.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=36.15;MQ0=0;QD=36.91;SB=-0.01;sumGLbyD=37.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:47:99:1805,141,0 4116-ref 1027 . T C 2517.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.5994;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,67:67:99:2550,178,0 4116-ref 1081 . C T 2877.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=3.8594;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.86;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:76:99:2910,226,0 4228-ref 79 . G C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 4228-ref 87 . T G 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 4228-ref 140 . A C 660.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=36.70;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:694,54,0 4228-ref 152 . 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A C 742.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.34;SB=-0.01;sumGLbyD=36.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:20:60.19:775,60,0 4231-ref 1272 . C G 1396.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.2326;MQ=36.73;MQ0=0;QD=37.75;SB=-0.01;sumGLbyD=38.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1430,111,0 4231-ref 1402 . G A 1377.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.72;MQ0=0;QD=38.26;SB=-0.01;sumGLbyD=39.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1411,108,0 4231-ref 1422 . G C 1294.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7453;MQ=36.74;MQ0=0;QD=33.20;SB=-0.01;sumGLbyD=34.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,36:37:76.09:1328,76,0 4231-ref 1529 . T C 768.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.60;MQ0=0;QD=30.75;SB=-0.01;sumGLbyD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:24:11.96:801,12,0 4231-ref 1576 . C G 357.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9326;MQ=36.22;MQ0=0;QD=27.52;SB=-0.01;sumGLbyD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:37.86:388,0,38 4231-ref 1699 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 4319-ref 90 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 4319-ref 106 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 4319-ref 270 . G C 120.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.07;SB=-0.01;sumGLbyD=38.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:153,12,0 4319-ref 364 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 4319-ref 507 . G C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 4319-ref 530 . C G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 4319-ref 546 . G A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 4319-ref 631 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 4319-ref 670 . A G 122.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.56;SB=-0.01;sumGLbyD=38.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:155,12,0 4319-ref 754 . A G 45.74 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:77,6,0 4319-ref 789 . C T 240.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.37;SB=-0.01;sumGLbyD=39.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:274,21,0 4319-ref 862 . C G 112.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.25;SB=-0.01;sumGLbyD=36.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:145,12,0 4319-ref 1013 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.00;SB=-0.01;sumGLbyD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.03:120,9,0 4319-ref 1044 . G A 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:71,0,31 4319-ref 1220 . C T 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 4319-ref 1304 . C T 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28.77:71,0,29 4319-ref 1312 . T C 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.29:71,0,30 4319-ref 1394 . T C 77.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.50;SB=-0.01;sumGLbyD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.28:108,0,27 4319-ref 1408 . A G 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 4319-ref 1424 . T A 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 4319-ref 1499 . C T 94.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8332;MQ=27.82;MQ0=0;QD=18.83;SB=-0.01;sumGLbyD=25.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:127,12,0 4319-ref 1523 . T C 136.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=27.23;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:169,15,0 4319-ref 1529 . T C 96.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:129,12,0 4319-ref 1538 . G A 146.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:179,15,0 4319-ref 1761 . G A 163.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.73;SB=-0.01;sumGLbyD=39.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 4319-ref 1786 . T C 31.03 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9916;MQ=34.39;MQ0=0;QD=7.76;SB=-0.01;sumGLbyD=15.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:57.59:61,0,58 4319-ref 1836 . A C 234.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.50;SB=-0.01;sumGLbyD=38.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:267,21,0 4319-ref 1891 . T A 24.58 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.92;SB=-0.01;sumGLbyD=10.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:54.56:55,0,105 4319-ref 1904 . C T 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 4319-ref 1907 . A G 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 4319-ref 2099 . A T 83.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.85;SB=-0.01;sumGLbyD=38.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:116,9,0 4389-ref 179 . C T 2104.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=72;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.5418;MQ=36.58;MQ0=0;QD=29.23;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,61:72:99:2135,0,215 4389-ref 198 . G A 11.49 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.6997;MQ=36.68;MQ0=0;QD=0.18;SB=-0.01;sumGLbyD=0.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,6:63:41.17:41,0,2004 4389-ref 210 . A G 1927.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.7952;MQ=36.55;MQ0=0;QD=28.34;SB=-37.00;sumGLbyD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,58:67:99:1957,0,186 4389-ref 237 . G A 2016.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8107;MQ=36.53;MQ0=0;QD=31.02;SB=-72.85;sumGLbyD=31.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,60:64:7.45:2046,0,7 4389-ref 326 . A G 161.10 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7330;MQ=36.79;MQ0=0;QD=3.29;SB=-0.01;sumGLbyD=3.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,9:49:99:191,0,1409 4389-ref 364 . C T 1821.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=7;HaplotypeScore=9.1537;MQ=36.62;MQ0=0;QD=34.37;SB=-0.01;sumGLbyD=34.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,50:52:83.44:1855,83,0 4389-ref 427 . C A 2254.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.2566;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.65;SB=-0.01;sumGLbyD=34.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,62:66:50.43:2288,50,0 4389-ref 744 . T C 103.64 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=77;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.9491;MQ=36.87;MQ0=0;QD=1.35;SB=-0.01;sumGLbyD=1.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,10:76:99:134,0,2367 4389-ref 760 . G C 65.16 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=78;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7322;MQ=36.87;MQ0=0;QD=0.84;SB=-0.01;sumGLbyD=1.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,9:74:95.15:95,0,2321 4389-ref 841 . G T 1252.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.69;MQ0=0;QD=37.97;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1286,99,0 4389-ref 930 . A G 92.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=87;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=11.1638;MQ=36.77;MQ0=0;QD=1.06;SB=-0.01;sumGLbyD=1.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,10:87:99:122,0,2706 4389-ref 931 . G A 103.87 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=87;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=11.1638;MQ=36.77;MQ0=0;QD=1.19;SB=-0.01;sumGLbyD=1.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,10:85:99:134,0,2661 4389-ref 1041 . G C 231.40 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=110;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.2248;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.10;SB=-37.00;sumGLbyD=2.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:95,15:109:99:261,0,3373 4389-ref 1047 . T C 193.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=110;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.6025;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.76;SB=-37.00;sumGLbyD=2.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:96,14:107:99:223,0,3296 4389-ref 1412 . A T 56.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=14.14;SB=-0.01;sumGLbyD=21.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26.55:87,0,27 4389-ref 1488 . C G 236.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.72;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:269,21,0 4389-ref 1499 . A G 270.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=33.81;SB=-0.01;sumGLbyD=37.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:303,24,0 4389-ref 1524 . T C 179.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.87;MQ0=0;QD=19.92;SB=-0.01;sumGLbyD=23.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:82.55:209,0,83 4389-ref 1574 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 4389-ref 1582 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 4395-ref 146 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 4395-ref 185 . T G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 4395-ref 190 . T G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 4395-ref 342 . T C 200.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.37;SB=-0.01;sumGLbyD=38.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:233,18,0 4395-ref 370 . A G 18.63 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8401;MQ=35.53;MQ0=0;QD=2.66;SB=-0.01;sumGLbyD=6.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:48.57:49,0,165 4395-ref 414 . A T 77.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=15.47;SB=-0.01;sumGLbyD=21.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:4:17.59:107,0,18 4395-ref 421 . C T 155.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:188,15,0 4395-ref 457 . G T 19.42 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9987;MQ=35.28;MQ0=0;QD=3.24;SB=-0.01;sumGLbyD=8.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:49.36:49,0,141 4395-ref 485 . A G 24.94 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.78;MQ0=0;QD=1.78;SB=-0.01;sumGLbyD=3.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:54.92:55,0,367 4395-ref 500 . G T 173.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=34.78;MQ0=0;QD=12.41;SB=-0.01;sumGLbyD=14.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:204,0,230 4395-ref 505 . C G 227 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=33.91;MQ0=0;QD=13.35;SB=-0.01;sumGLbyD=15.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:257,0,266 4395-ref 529 . G A 219.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=13.73;SB=-0.01;sumGLbyD=15.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:250,0,220 4395-ref 547 . A T 615.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=31.26;MQ0=0;QD=32.37;SB=-0.01;sumGLbyD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.14:648,57,0 4395-ref 552 . T A 218.12 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=30.07;MQ0=0;QD=13.63;SB=-0.01;sumGLbyD=15.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:248,0,192 4395-ref 578 . G T 430.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.29;MQ0=0;QD=20.50;SB=-0.01;sumGLbyD=21.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,16:21:99:461,0,135 4395-ref 593 . A G 345.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.7881;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=20.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:18:99:375,0,109 4395-ref 598 . A T 28.52 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.7883;MQ=31.23;MQ0=0;QD=1.68;SB=-0.01;sumGLbyD=3.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:58.51:59,0,421 4395-ref 639 . C A 79.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=34.93;MQ0=0;QD=8.00;SB=-0.01;sumGLbyD=11.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:9:99:110,0,173 4395-ref 691 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 4395-ref 703 . C A 69.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.21;SB=-0.01;sumGLbyD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:102,9,0 4395-ref 704 . A G 74.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.90;SB=-0.01;sumGLbyD=35.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:107,9,0 4395-ref 803 . A G 349.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.97;SB=-0.01;sumGLbyD=38.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:383,30,0 4395-ref 854 . T C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 4395-ref 872 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 4409-ref 190 . T A 1106.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.96;MQ0=0;QD=35.68;SB=-0.01;sumGLbyD=36.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.27:1139,93,0 4409-ref 224 . A C 873.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9983;MQ=33.63;MQ0=0;QD=34.92;SB=-0.01;sumGLbyD=36.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.21:906,75,0 4409-ref 247 . C T 342.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.04;MQ0=0;QD=31.14;SB=-0.01;sumGLbyD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.08:376,33,0 4409-ref 260 . 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G C 1521.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:40:99:1554,120,0 4409-ref 581 . A G 1170.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.48;SB=-0.01;sumGLbyD=36.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:32:96.27:1204,96,0 4409-ref 758 . A G 1750.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.47;MQ0=0;QD=37.24;SB=-0.01;sumGLbyD=37.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1783,141,0 4409-ref 763 . G A 1828.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=37.32;SB=-0.01;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1862,147,0 4409-ref 770 . G C 1791.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.56;MQ0=0;QD=35.84;SB=-0.01;sumGLbyD=36.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,49:50:99:1825,116,0 4409-ref 893 . A G 1819.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9827;MQ=36.79;MQ0=0;QD=37.14;SB=-0.01;sumGLbyD=37.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:49:99:1853,144,0 4409-ref 975 . C T 1858.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.17;MQ0=0;QD=37.93;SB=-0.01;sumGLbyD=38.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1892,147,0 4409-ref 1007 . C T 1813.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.75;MQ0=0;QD=37.01;SB=-0.01;sumGLbyD=37.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1846,147,0 4409-ref 1031 . C T 1864.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.01;MQ0=0;QD=35.86;SB=-0.01;sumGLbyD=36.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:51:99:1898,153,0 4409-ref 1067 . C T 2364.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.6444;MQ=35.88;MQ0=0;QD=36.95;SB=-0.01;sumGLbyD=37.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2398,187,0 4409-ref 1113 . A G 2011.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.43;MQ0=0;QD=37.95;SB=-0.01;sumGLbyD=38.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2044,159,0 4409-ref 1160 . C T 2705.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=36.07;SB=-0.01;sumGLbyD=36.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:72:99:2738,217,0 4409-ref 1172 . T G 2721.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9153;MQ=36.04;MQ0=0;QD=36.77;SB=-0.01;sumGLbyD=37.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:74:99:2754,220,0 4409-ref 1232 . G A 1091.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4967;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.10;SB=-0.01;sumGLbyD=35.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:31:93.26:1124,93,0 4409-ref 1241 . C T 843.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.94;MQ0=0;QD=35.16;SB=-0.01;sumGLbyD=36.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.21:877,72,0 4409-ref 1254 . T C 222.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.07;MQ0=0;QD=27.86;SB=-0.01;sumGLbyD=31.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:256,24,0 4409-ref 1259 . T C 270.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.91;MQ0=0;QD=30.08;SB=-0.01;sumGLbyD=33.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:304,27,0 4409-ref 1271 . G A 751.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.60;SB=-0.01;sumGLbyD=39.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:785,60,0 4409-ref 1358 . T C 2165.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=9.7069;MQ=36.31;MQ0=0;QD=36.71;SB=-0.01;sumGLbyD=37.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,58:57:99:2199,172,0 4409-ref 1376 . C T 1158.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.67;MQ0=0;QD=37.36;SB=-0.01;sumGLbyD=38.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.28:1191,93,0 4461-ref 15 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 4461-ref 122 . T G 63.74 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.97;SB=-0.01;sumGLbyD=11.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:93.73:94,0,173 4461-ref 162 . T C 92.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9998;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.23;SB=-0.01;sumGLbyD=12.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:122,0,210 4461-ref 182 . G C 269.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.72;SB=-0.01;sumGLbyD=37.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:303,24,0 4461-ref 210 . A T 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 4461-ref 220 . A T 108.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.57;SB=-0.01;sumGLbyD=19.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:98.95:139,0,99 4461-ref 265 . A G 151.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4679;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.71;SB=-0.01;sumGLbyD=26.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.95:182,0,22 4461-ref 352 . C T 25.95 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.24;SB=-0.01;sumGLbyD=6.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55.93:56,0,213 4461-ref 361 . C T 203.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.91;SB=-0.01;sumGLbyD=39.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:236,18,0 4461-ref 362 . G T 165.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.02;SB=-0.01;sumGLbyD=39.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:198,15,0 4690-ref 30 . G T 283.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.44;SB=-0.01;sumGLbyD=39.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:316,24,0 4690-ref 39 . G T 315.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.00;SB=-0.01;sumGLbyD=38.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:348,27,0 4690-ref 189 . G A 845.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7005;MQ=36.64;MQ0=0;QD=30.20;SB=-0.01;sumGLbyD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:28:35.06:876,0,35 4690-ref 228 . A C 1199.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.47;SB=-0.01;sumGLbyD=38.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.30:1232,96,0 4690-ref 464 . T C 941.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7333;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:25:75.24:974,75,0 4690-ref 558 . T A 117.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9822;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.41;SB=-0.01;sumGLbyD=10.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:148,0,309 4690-ref 708 . G A 438.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.51;SB=-0.01;sumGLbyD=39.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:471,36,0 4690-ref 720 . T A 478.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.82;SB=-0.01;sumGLbyD=39.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:512,39,0 4690-ref 750 . C T 425.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.60;MQ0=0;QD=32.70;SB=-0.01;sumGLbyD=35.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.11:458,39,0 4690-ref 774 . C A 451.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.60;MQ0=0;QD=34.73;SB=-0.01;sumGLbyD=37.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.11:484,39,0 4690-ref 801 . 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A G 509.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.23;MQ0=0;QD=29.97;SB=-0.01;sumGLbyD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.12:542,48,0 4690-ref 901 . A G 496.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9998;MQ=34.39;MQ0=0;QD=31.06;SB=-0.01;sumGLbyD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.12:530,45,0 4690-ref 936 . A C 705.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.52;MQ0=0;QD=33.60;SB=-0.01;sumGLbyD=35.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:20:60.17:739,60,0 4690-ref 945 . T C 832.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.67;SB=-0.01;sumGLbyD=36.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.20:865,72,0 4690-ref 999 . C T 792 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=36.00;SB=-0.01;sumGLbyD=37.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.19:825,66,0 4690-ref 1026 . T C 186.39 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=35.80;MQ0=0;QD=10.96;SB=-0.01;sumGLbyD=12.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:216,0,310 4690-ref 1149 . T A 284.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.94;SB=-0.01;sumGLbyD=12.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:25:99:314,0,482 4690-ref 1286 . T C 615.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.41;SB=-0.01;sumGLbyD=34.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:18.60:649,19,0 4690-ref 1329 . A C 289.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9981;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.18;SB=-0.01;sumGLbyD=14.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,11:21:99:320,0,336 4690-ref 1364 . G A 667.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.09;SB=-0.01;sumGLbyD=38.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:701,54,0 4690-ref 1584 . C T 1213.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.93;SB=-0.01;sumGLbyD=38.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.31:1247,96,0 4755-ref 53 . C T 721.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.7845;MQ=36.07;MQ0=0;QD=32.81;SB=-0.01;sumGLbyD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.15:755,63,0 4755-ref 233 . C T 932.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.09;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=35.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:26:78.23:965,78,0 4755-ref 269 . T C 1143.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7875;MQ=34.87;MQ0=0;QD=33.62;SB=-0.01;sumGLbyD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:62.29:1176,62,0 4755-ref 272 . A C 1197.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9988;MQ=34.80;MQ0=0;QD=36.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1231,99,0 4755-ref 402 . G A 954.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.61;MQ0=0;QD=36.72;SB=-0.01;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.24:988,78,0 4755-ref 487 . A G 1161.65 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=66;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.3353;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.60;SB=-0.01;sumGLbyD=18.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,36:65:99:1192,0,944 4755-ref 605 . T C 1995.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.61;MQ0=0;QD=38.37;SB=-0.01;sumGLbyD=39.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2028,156,0 4755-ref 620 . C T 1547.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.52;MQ0=0;QD=36.85;SB=-0.01;sumGLbyD=37.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:41:99:1581,123,0 4755-ref 671 . G A 2024.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.45;MQ0=0;QD=36.80;SB=-0.01;sumGLbyD=37.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:54:99:2057,163,0 4755-ref 679 . G A 1999.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.46;MQ0=0;QD=35.70;SB=-0.01;sumGLbyD=36.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:55:99:2032,165,0 4755-ref 713 . C G 1738.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.57;MQ0=0;QD=36.98;SB=-0.01;sumGLbyD=37.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:46:99:1771,138,0 4816-ref 43 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 4816-ref 530 . G C 116.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.11;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:149,12,0 4816-ref 557 . C T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 4816-ref 558 . A G 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 4816-ref 824 . T G 319.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.7876;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.46;SB=-0.01;sumGLbyD=39.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:352,27,0 4816-ref 1019 . C T 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 4816-ref 1292 . A G 525.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.86;SB=-0.01;sumGLbyD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:13.80:558,14,0 4816-ref 1361 . C T 562.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.47;SB=-0.01;sumGLbyD=39.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:595,45,0 4816-ref 1393 . C T 402.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.61;SB=-0.01;sumGLbyD=39.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:436,33,0 4816-ref 1592 . C T 476 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=36.62;SB=-0.01;sumGLbyD=39.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:509,39,0 4816-ref 1697 . A G 597.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.37;SB=-0.01;sumGLbyD=39.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.16:631,48,0 4816-ref 1740 . G A 343.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.04;MQ0=0;QD=31.21;SB=-0.01;sumGLbyD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.08:376,33,0 4816-ref 1741 . T C 304.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=30.48;SB=-0.01;sumGLbyD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:338,30,0 4816-ref 1768 . T C 457.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=32.71;SB=-0.01;sumGLbyD=35.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:491,42,0 4816-ref 1777 . A G 464.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=33.20;SB=-0.01;sumGLbyD=35.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:498,42,0 4816-ref 1826 . C A 770.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.69;SB=-0.01;sumGLbyD=38.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:804,63,0 4816-ref 2001 . A G 888.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.23:921,72,0 4816-ref 2036 . A T 519.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.08;SB=-0.01;sumGLbyD=39.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:552,42,0 4816-ref 2234 . 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G C 1067.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.2579;MQ=31.41;MQ0=0;QD=30.50;SB=-0.01;sumGLbyD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:33:99:1101,99,0 4816-ref 2453 . A T 954.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=31.58;MQ0=0;QD=31.80;SB=-0.01;sumGLbyD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:29:87.22:987,87,0 4816-ref 2485 . G A 620.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=34.47;SB=-0.01;sumGLbyD=36.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.15:654,54,0 4816-ref 2621 . A T 638.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.55;SB=-0.01;sumGLbyD=39.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:671,51,0 4816-ref 2675 . C T 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 4816-ref 2679 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 4816-ref 2711 . G A 114.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.73;SB=-0.01;sumGLbyD=36.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:147,12,0 4816-ref 2726 . C T 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 4816-ref 2757 . A G 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 4890-ref 235 . T G 1064.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.50;SB=-0.01;sumGLbyD=36.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:29:87.27:1098,87,0 4890-ref 374 . G T 596.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9734;MQ=36.37;MQ0=0;QD=37.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:630,48,0 4890-ref 403 . G A 16.46 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=2.35;SB=-0.01;sumGLbyD=6.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:46.36:46,0,173 4890-ref 404 . T C 13.55 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=1.69;SB=-0.01;sumGLbyD=5.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:43.35:43,0,201 4890-ref 426 . C T 232.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.25;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:266,21,0 4890-ref 627 . T A 43.49 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8656;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.62;SB=-0.01;sumGLbyD=6.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:11:73.48:73,0,274 4890-ref 666 . T C 111.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:144,12,0 4890-ref 789 . C A 1099.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.3809;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.90;SB=-0.01;sumGLbyD=39.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.28:1132,87,0 4890-ref 972 . G A 987.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9525;MQ=36.61;MQ0=0;QD=37.99;SB=-0.01;sumGLbyD=39.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.25:1021,78,0 4890-ref 1015 . G C 943.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.60;MQ0=0;QD=37.75;SB=-0.01;sumGLbyD=39.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.24:977,75,0 4890-ref 1170 . T C 1368.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.20;MQ0=0;QD=36.02;SB=-0.01;sumGLbyD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1402,114,0 4890-ref 1232 . C G 1281.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.4741;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.60;SB=-0.01;sumGLbyD=36.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1315,105,0 4890-ref 1256 . G C 577.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=33.98;SB=-0.01;sumGLbyD=35.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.15:611,48,0 4890-ref 1371 . T A 509.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.05;MQ0=0;QD=29.95;SB=-0.01;sumGLbyD=31.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.11:542,51,0 4890-ref 1380 . T A 547.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.84;MQ0=0;QD=30.41;SB=-0.01;sumGLbyD=32.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.12:580,54,0 4890-ref 1398 . G A 717.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9995;MQ=31.04;MQ0=0;QD=32.60;SB=-0.01;sumGLbyD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.16:750,66,0 4890-ref 1408 . G C 713.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.95;MQ0=0;QD=33.96;SB=-0.01;sumGLbyD=35.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.17:746,63,0 4890-ref 1483 . T C 476.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.66;SB=-0.01;sumGLbyD=39.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:510,39,0 4890-ref 1524 . G A 202.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.74;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 4890-ref 1575 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 4890-ref 1655 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 4979-ref 67 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 4979-ref 71 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 4979-ref 90 . G T 202.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.74;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 4979-ref 140 . T A 458.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.37;MQ0=0;QD=28.67;SB=-0.01;sumGLbyD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:13:39.12:492,39,0 4979-ref 185 . T A 356.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.67;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:390,30,0 4979-ref 382 . A G 883.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.42;SB=-0.01;sumGLbyD=39.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.23:917,69,0 4979-ref 449 . C G 424.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=35.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:457,36,0 4979-ref 460 . T C 420.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=35.28;MQ0=0;QD=35.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:454,36,0 4979-ref 465 . A T 343.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=34.34;SB=-0.01;sumGLbyD=37.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:376,30,0 4979-ref 670 . A G 1089.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.56;SB=-0.01;sumGLbyD=38.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.27:1122,87,0 4979-ref 697 . 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A G 556.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4357;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.76;SB=-0.01;sumGLbyD=36.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:589,45,0 4979-ref 1255 . T C 435.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.51;SB=-0.01;sumGLbyD=36.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:13:36.12:469,36,0 4979-ref 1371 . C T 534.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.41;SB=-0.01;sumGLbyD=35.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.13:568,48,0 4979-ref 1450 . C A 280.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8646;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.67;SB=-0.01;sumGLbyD=10.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,10:29:99:311,0,671 4979-ref 1480 . T A 872.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.94;SB=-0.01;sumGLbyD=39.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.22:906,69,0 4979-ref 1695 . 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T G 827.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.54;MQ0=0;QD=37.63;SB=-0.01;sumGLbyD=39.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.21:861,66,0 4979-ref 1946 . T A 586.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=36.63;SB=-0.01;sumGLbyD=38.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:619,48,0 5021-ref 135 . G T 12141.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=327;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.3544;MQ=36.75;MQ0=0;QD=37.13;SB=-1074.72;sumGLbyD=37.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,327:314:99:12140,945,0 5021-ref 146 . G A 15128.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=395;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=10.3645;MQ=36.77;MQ0=0;QD=38.30;SB=-1156.30;sumGLbyD=38.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,394:389:99:15127,1171,0 5021-ref 312 . A G 10913.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=284;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=13.4462;MQ=36.86;MQ0=0;QD=38.43;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,283:281:99:10873,843,0 5021-ref 418 . G T 12714.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=338;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=14.3125;MQ=35.97;MQ0=0;QD=37.62;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,335:333:99:12678,999,0 5021-ref 433 . G A 14197.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=376;DS;Dels=0.01;HRun=2;HaplotypeScore=8.3880;MQ=36.00;MQ0=0;QD=37.76;SB=-0.01;sumGLbyD=37.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,372:372:99:14128,1052,0 5021-ref 460 . A G 15341.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=402;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=12.8070;MQ=36.19;MQ0=0;QD=38.16;SB=-0.01;sumGLbyD=38.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,400:398:99:15303,1195,0 5046-ref 350 . A C 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 5046-ref 402 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 5046-ref 449 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 5046-ref 500 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5046-ref 502 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5046-ref 513 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5046-ref 631 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5046-ref 703 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 5046-ref 926 . C A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 5049-ref 48 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5049-ref 114 . T C 71.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.88;SB=-0.01;sumGLbyD=26.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.02:104,9,0 5049-ref 545 . A T 849.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.20:883,69,0 5049-ref 641 . A T 1047.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.90;SB=-0.01;sumGLbyD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:28:84.26:1080,84,0 5049-ref 746 . T C 1921.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9912;MQ=36.62;MQ0=0;QD=36.26;SB=-0.01;sumGLbyD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:51:99:1955,153,0 5049-ref 986 . A G 1549.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:86.41:1583,86,0 5049-ref 1421 . A C 354.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.7818;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.85;SB=-0.01;sumGLbyD=22.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:28.55:384,0,29 5139-ref 121 . C T 41.01 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=13.67;SB=-0.01;sumGLbyD=23.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20.60:71,0,21 5139-ref 153 . T A 114.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.69;SB=-0.01;sumGLbyD=36.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:147,12,0 5139-ref 208 . T A 99.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9996;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.38;SB=-0.01;sumGLbyD=16.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:129,0,135 5139-ref 293 . A G 616.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6208;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.27;SB=-0.01;sumGLbyD=38.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:650,51,0 5139-ref 360 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5139-ref 419 . A G 306.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.04;SB=-0.01;sumGLbyD=37.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:339,27,0 5139-ref 420 . 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G T 31.97 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4687;MQ=33.48;MQ0=0;QD=5.33;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61.96:62,0,114 5139-ref 632 . G A 126.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 5139-ref 675 . A T 67.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.90;SB=-0.01;sumGLbyD=24.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:98,0,28 5139-ref 726 . G A 432.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9988;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.00;SB=-0.01;sumGLbyD=38.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:465,36,0 5139-ref 808 . C A 557.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.18;SB=-0.01;sumGLbyD=39.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:591,45,0 5139-ref 988 . T G 423.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.33;SB=-0.01;sumGLbyD=38.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:457,36,0 5139-ref 998 . A G 307.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=25.58;SB=-0.01;sumGLbyD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:43.90:337,0,44 5139-ref 1031 . T C 364.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.14;MQ0=0;QD=33.10;SB=-0.01;sumGLbyD=36.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:397,33,0 5139-ref 1040 . C G 135.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.11;MQ0=0;QD=12.31;SB=-0.01;sumGLbyD=15.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:165,0,157 5139-ref 1042 . G A 135.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.11;MQ0=0;QD=12.31;SB=-0.01;sumGLbyD=15.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:165,0,156 5139-ref 1082 . T G 125.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=12.58;SB=-0.01;sumGLbyD=15.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:10:15.03:158,15,0 5139-ref 1093 . T A 52.02 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=30.72;MQ0=0;QD=7.43;SB=-0.01;sumGLbyD=11.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:82.01:82,0,102 5139-ref 1103 . A T 136.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=27.23;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:169,15,0 5139-ref 1116 . G A 106.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.52;SB=-0.01;sumGLbyD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 5139-ref 1131 . G A 104.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.14;SB=-0.01;sumGLbyD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:137,12,0 5139-ref 1169 . G T 126 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=14.00;SB=-0.01;sumGLbyD=17.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:156,0,133 5139-ref 1194 . C T 305.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=33.96;SB=-0.01;sumGLbyD=37.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:339,27,0 5139-ref 1229 . T C 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 5139-ref 1249 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5139-ref 1288 . G T 31.96 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.33;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61.95:62,0,141 5139-ref 1310 . G C 19.96 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.00;SB=-0.01;sumGLbyD=4.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49.91:50,0,283 5139-ref 1355 . G C 309.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.43;SB=-0.01;sumGLbyD=38.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:343,27,0 5139-ref 1364 . G T 194.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.44;SB=-0.01;sumGLbyD=37.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:228,18,0 5139-ref 1473 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5140-ref 55 . G C 42.72 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.36;SB=-0.01;sumGLbyD=37.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:74,6,0 5140-ref 108 . G C 530.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=35.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:564,45,0 5140-ref 189 . A G 562.39 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8888;MQ=36.29;MQ0=0;QD=13.08;SB=-0.01;sumGLbyD=13.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:39:99:592,0,640 5140-ref 241 . T C 570.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.06;MQ0=0;QD=35.63;SB=-0.01;sumGLbyD=37.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:603,48,0 5140-ref 245 . C T 443.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=31.68;SB=-0.01;sumGLbyD=34.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.09:477,39,0 5140-ref 266 . C A 33.15 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9998;MQ=31.58;MQ0=0;QD=8.29;SB=-0.01;sumGLbyD=15.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:3:20.60:63,0,21 5140-ref 274 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 5140-ref 275 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 5140-ref 281 . G A 123.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=24.74;SB=-0.01;sumGLbyD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:156,15,0 5140-ref 345 . G A 885.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=36.60;MQ0=0;QD=35.44;SB=-0.01;sumGLbyD=36.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:24:72.23:919,72,0 5140-ref 407 . T C 1121.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.28:1155,87,0 5140-ref 429 . A G 1060.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.87;SB=-0.01;sumGLbyD=39.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.27:1093,84,0 5140-ref 514 . G T 1029.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9822;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.78;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:28:81.26:1063,81,0 5140-ref 677 . G T 13.17 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.32;SB=-0.01;sumGLbyD=4.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:42.95:43,0,290 5140-ref 733 . G T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 5161-ref 15 . T C 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 5161-ref 19 . 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A G 257.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=32.13;SB=-0.01;sumGLbyD=36.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:290,24,0 5161-ref 934 . A G 237.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.97;SB=-0.01;sumGLbyD=38.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:271,21,0 5161-ref 988 . A G 16.08 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.79;SB=-0.01;sumGLbyD=5.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:45.96:46,0,240 5161-ref 1421 . G C 11.23 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9984;MQ=37.00;MQ0=0;QD=0.86;SB=-0.01;sumGLbyD=3.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,2:13:40.89:41,0,388 5161-ref 1534 . G A 274.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:307,24,0 5161-ref 1752 . G A 443.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.65;SB=-0.01;sumGLbyD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:2.07:473,2,0 5161-ref 1757 . G C 411.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.62;SB=-0.01;sumGLbyD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:0.88:440,0,1 5183-ref 31 . T C 19.42 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.24;SB=-0.01;sumGLbyD=8.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:49.36:49,0,137 5183-ref 121 . T C 776.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4679;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.98;SB=-0.01;sumGLbyD=38.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.19:810,63,0 5183-ref 174 . C T 326.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.68;SB=-0.01;sumGLbyD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:6.90:356,0,7 5183-ref 199 . C A 254.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.41;SB=-0.01;sumGLbyD=28.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:9:8.17:284,0,8 5183-ref 319 . T C 125.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.48;SB=-0.01;sumGLbyD=12.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:156,0,234 5183-ref 488 . C T 587.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.63;SB=-0.01;sumGLbyD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:16:48.15:620,48,0 5183-ref 523 . C T 203.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.57;SB=-0.01;sumGLbyD=15.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:233,0,256 5183-ref 647 . T G 82.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.58;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 5183-ref 661 . C T 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 5183-ref 666 . T C 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 5183-ref 947 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5183-ref 972 . T C 25.66 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.8662;MQ=34.04;MQ0=0;QD=6.41;SB=-0.01;sumGLbyD=13.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:55.64:56,0,68 5195-ref 315 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5205-ref 105 . T G 244.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.51;SB=-0.01;sumGLbyD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.07:277,21,0 5205-ref 179 . C T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 5205-ref 192 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 5205-ref 226 . C G 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8315;MQ=27.37;MQ0=0;QD=19.23;SB=-0.01;sumGLbyD=24.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:5:15.03:148,15,0 5205-ref 230 . C A 149.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=24.93;SB=-0.01;sumGLbyD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:182,18,0 5205-ref 252 . G A 214.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=30.65;SB=-0.01;sumGLbyD=35.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:247,21,0 5205-ref 290 . T C 215.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=30.85;SB=-0.01;sumGLbyD=35.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:249,21,0 5205-ref 315 . G A 191.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.94;MQ0=0;QD=27.32;SB=-0.01;sumGLbyD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:224,21,0 5205-ref 350 . T C 195.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.94;MQ0=0;QD=27.88;SB=-0.01;sumGLbyD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:228,21,0 5205-ref 363 . G A 153.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=25.64;SB=-0.01;sumGLbyD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:187,18,0 5205-ref 369 . G A 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 5205-ref 391 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 5205-ref 407 . G T 134.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=26.94;SB=-0.01;sumGLbyD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.02:167,15,0 5205-ref 408 . T G 142.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=28.53;SB=-0.01;sumGLbyD=35.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:175,15,0 5205-ref 459 . T G 630.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.76;MQ0=0;QD=31.53;SB=-0.01;sumGLbyD=33.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.14:664,60,0 5205-ref 469 . T A 592.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.32;MQ0=0;QD=31.16;SB=-0.01;sumGLbyD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.13:625,57,0 5205-ref 495 . T C 466.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.65;MQ0=0;QD=29.17;SB=-0.01;sumGLbyD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.10:500,48,0 5205-ref 504 . G A 322.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=26.87;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.07:355,36,0 5205-ref 533 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 5205-ref 535 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 5205-ref 555 . 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T G 184.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=23.10;SB=-0.01;sumGLbyD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.04:218,21,0 5205-ref 741 . G A 214.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=26.80;SB=-0.01;sumGLbyD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:247,24,0 5205-ref 751 . G C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 5205-ref 814 . C T 335.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.85;MQ0=0;QD=33.59;SB=-0.01;sumGLbyD=36.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:369,30,0 5205-ref 840 . T C 524.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=32.75;SB=-0.01;sumGLbyD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.12:557,48,0 5205-ref 872 . 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A G 30.88 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=15.44;SB=-0.01;sumGLbyD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:62,6,0 5205-ref 1106 . A G 155.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=31.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:188,18,0 5205-ref 1111 . G T 118.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=23.65;SB=-0.01;sumGLbyD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:151,15,0 5205-ref 1112 . C T 122.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=24.55;SB=-0.01;sumGLbyD=31.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:155,15,0 5205-ref 1131 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 5205-ref 1185 . 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T C 204.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.04:237,24,0 5205-ref 1348 . G A 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=10.75;SB=-0.01;sumGLbyD=14.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:4:12.02:118,12,0 5205-ref 1377 . C A 204.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.04:237,24,0 5205-ref 1383 . A G 204.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.04:237,24,0 5205-ref 1393 . G T 204.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.04:237,24,0 5205-ref 1423 . T C 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 5205-ref 1424 . T A 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 5205-ref 1441 . C A 272.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8332;MQ=31.04;MQ0=0;QD=24.81;SB=-0.01;sumGLbyD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:306,27,0 5205-ref 1442 . A G 340.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.04;MQ0=0;QD=30.99;SB=-0.01;sumGLbyD=33.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.08:374,33,0 5205-ref 1508 . C T 1120.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=36.35;MQ0=0;QD=36.13;SB=-0.01;sumGLbyD=37.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.28:1153,90,0 5205-ref 1575 . G T 254.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=25.44;SB=-0.01;sumGLbyD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.06:287,27,0 5205-ref 1577 . G C 278.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=27.81;SB=-0.01;sumGLbyD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.05:311,30,0 5205-ref 1590 . C T 214.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=26.80;SB=-0.01;sumGLbyD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:247,24,0 5205-ref 1600 . A G 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 5214-ref 261 . A T 937.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6643;MQ=36.61;MQ0=0;QD=36.04;SB=-0.01;sumGLbyD=37.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:25:75.24:970,75,0 5214-ref 290 . C T 230.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.63;MQ0=0;QD=8.55;SB=-0.01;sumGLbyD=9.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:261,0,607 5214-ref 425 . G A 204.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8154;MQ=36.47;MQ0=0;QD=10.78;SB=-0.01;sumGLbyD=12.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:235,0,371 5214-ref 429 . G T 131.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8154;MQ=36.40;MQ0=0;QD=7.72;SB=-0.01;sumGLbyD=9.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:161,0,383 5214-ref 545 . G A 779.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.15;MQ0=0;QD=32.49;SB=-0.01;sumGLbyD=33.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:23:29.21:813,29,0 5214-ref 547 . A G 766.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.15;MQ0=0;QD=31.94;SB=-0.01;sumGLbyD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:24:29.20:799,29,0 5214-ref 634 . 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T C 275.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:308,24,0 5263-ref 86 . G A 269.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=33.74;SB=-0.01;sumGLbyD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:303,24,0 5263-ref 148 . A G 387.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.24;SB=-0.01;sumGLbyD=38.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:421,33,0 5263-ref 187 . T C 275.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:308,24,0 5263-ref 222 . A G 430.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.84;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:463,36,0 5263-ref 232 . C T 422.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.22;SB=-0.01;sumGLbyD=37.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:456,36,0 5263-ref 283 . C T 464.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.42;MQ0=0;QD=35.70;SB=-0.01;sumGLbyD=38.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:497,39,0 5263-ref 303 . A T 433.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=36.09;SB=-0.01;sumGLbyD=38.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:466,36,0 5263-ref 305 . A T 433.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=36.15;SB=-0.01;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:467,36,0 5263-ref 371 . A C 315.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.67;SB=-0.01;sumGLbyD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:5.42:346,5,0 5263-ref 387 . T C 353.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.48;SB=-0.01;sumGLbyD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:3.91:383,0,4 5263-ref 470 . C T 607.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.96;SB=-0.01;sumGLbyD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:51.15:640,51,0 5263-ref 525 . G T 397.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.15;MQ0=0;QD=33.16;SB=-0.01;sumGLbyD=35.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:11:33.11:431,33,0 5263-ref 621 . T C 435.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.91;MQ0=0;QD=33.47;SB=-0.01;sumGLbyD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.11:468,39,0 5263-ref 622 . C A 432.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.91;MQ0=0;QD=33.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.11:466,39,0 5263-ref 653 . T G 510.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.71;MQ0=0;QD=31.91;SB=-0.01;sumGLbyD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.09:544,48,0 5263-ref 678 . C A 514.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=32.15;SB=-0.01;sumGLbyD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.13:547,45,0 5263-ref 787 . T A 239.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.16;SB=-0.01;sumGLbyD=38.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:272,21,0 5263-ref 801 . G A 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 5263-ref 812 . T G 122.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.69;SB=-0.01;sumGLbyD=38.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:155,12,0 5263-ref 914 . T C 243.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.77;SB=-0.01;sumGLbyD=39.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:276,21,0 5263-ref 949 . A C 562.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.47;SB=-0.01;sumGLbyD=39.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:595,45,0 5263-ref 954 . A T 477.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.82;SB=-0.01;sumGLbyD=33.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:5.14:508,5,0 5263-ref 1040 . T A 322.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.85;MQ0=0;QD=32.28;SB=-0.01;sumGLbyD=35.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:356,30,0 5263-ref 1042 . T C 284.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=31.62;SB=-0.01;sumGLbyD=35.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:318,27,0 5263-ref 1049 . G A 237.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=29.69;SB=-0.01;sumGLbyD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:270,24,0 5375-ref 219 . A G 284.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:317,24,0 5375-ref 583 . G A 146.76 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9992;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.46;SB=-0.01;sumGLbyD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.95:177,0,22 5375-ref 728 . T A 394.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.82;SB=-0.01;sumGLbyD=38.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:427,33,0 5375-ref 780 . G C 280.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.12;SB=-0.01;sumGLbyD=39.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:314,24,0 5375-ref 928 . C G 470.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:13:39.12:504,39,0 5375-ref 1002 . T G 235.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.07;MQ0=0;QD=29.39;SB=-0.01;sumGLbyD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:268,24,0 5375-ref 1008 . G A 234.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.07;MQ0=0;QD=29.31;SB=-0.01;sumGLbyD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:267,24,0 5375-ref 1010 . G A 232.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.07;MQ0=0;QD=29.12;SB=-0.01;sumGLbyD=33.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:266,24,0 5375-ref 1046 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 5439-ref 120 . T A 146.12 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.35;SB=-0.01;sumGLbyD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:18.92:176,0,19 5439-ref 234 . T C 531.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=33.21;SB=-0.01;sumGLbyD=35.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.13:564,48,0 5439-ref 256 . C A 301.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.93;MQ0=0;QD=27.43;SB=-0.01;sumGLbyD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.07:335,30,0 5439-ref 268 . C T 432.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.84;MQ0=0;QD=30.87;SB=-0.01;sumGLbyD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.10:465,42,0 5439-ref 277 . A C 396.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=30.72;MQ0=0;QD=28.31;SB=-0.01;sumGLbyD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.09:429,39,0 5439-ref 330 . T C 487.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.97;MQ0=0;QD=32.51;SB=-0.01;sumGLbyD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.12:521,45,0 5439-ref 332 . C T 412.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.12;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=34.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.10:445,39,0 5439-ref 339 . C T 22.80 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.22;MQ0=0;QD=1.63;SB=-0.01;sumGLbyD=3.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:12:52.77:53,0,295 5439-ref 353 . A C 452.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8664;MQ=32.41;MQ0=0;QD=32.33;SB=-0.01;sumGLbyD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:486,42,0 5439-ref 381 . T G 525.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.18;MQ0=0;QD=30.92;SB=-0.01;sumGLbyD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:11.15:558,11,0 5439-ref 382 . T C 645.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.38;MQ0=0;QD=33.98;SB=-0.01;sumGLbyD=35.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:18:54.16:679,54,0 5439-ref 436 . G T 644.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=32.24;SB=-0.01;sumGLbyD=33.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.15:678,60,0 5439-ref 457 . C A 260.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=26.03;SB=-0.01;sumGLbyD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.05:293,30,0 5439-ref 460 . T C 261.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=26.13;SB=-0.01;sumGLbyD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.05:294,30,0 5439-ref 470 . A C 328.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.21;MQ0=0;QD=27.34;SB=-0.01;sumGLbyD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.07:361,36,0 5439-ref 487 . G A 418.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9987;MQ=35.53;MQ0=0;QD=29.86;SB=-0.01;sumGLbyD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:7.77:450,8,0 5439-ref 570 . A G 714.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6251;MQ=36.54;MQ0=0;QD=32.48;SB=-0.01;sumGLbyD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:35.60:748,36,0 5439-ref 649 . G A 577.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.12;SB=-0.01;sumGLbyD=38.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:611,48,0 5439-ref 794 . G C 678.81 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.68;MQ0=0;QD=21.21;SB=-0.01;sumGLbyD=22.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,21:32:99:709,0,335 5439-ref 847 . A G 823.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.4521;MQ=36.61;MQ0=0;QD=31.66;SB=-0.01;sumGLbyD=32.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:24:36.10:856,36,0 5439-ref 959 . G A 1002.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.57;SB=-0.01;sumGLbyD=35.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:27:81.23:1035,81,0 5439-ref 1039 . A G 863.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.98;SB=-0.01;sumGLbyD=37.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.21:897,72,0 5439-ref 1075 . T C 1207.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.73;SB=-0.01;sumGLbyD=38.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.30:1240,96,0 5439-ref 1237 . T C 1728.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7549;MQ=36.78;MQ0=0;QD=37.57;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:45:99:1761,135,0 5439-ref 1333 . T C 2516.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.39;MQ0=0;QD=38.12;SB=-0.01;sumGLbyD=38.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2549,199,0 5439-ref 1336 . A G 2408.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.37;MQ0=0;QD=37.64;SB=-0.01;sumGLbyD=38.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:63:99:2442,190,0 5439-ref 1373 . G A 1634.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.54;MQ0=0;QD=37.15;SB=-0.01;sumGLbyD=37.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:43:99:1668,129,0 5439-ref 1510 . C T 680.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7340;MQ=29.38;MQ0=0;QD=27.22;SB=-0.01;sumGLbyD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:23:69.14:713,69,0 5439-ref 1517 . C G 718.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=29.95;SB=-0.01;sumGLbyD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.15:752,72,0 5439-ref 1532 . A T 569.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.73;MQ0=0;QD=28.49;SB=-29.63;sumGLbyD=30.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.12:603,60,0 5439-ref 1543 . G A 582.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=27.72;SB=-29.63;sumGLbyD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.10:615,63,0 5439-ref 1563 . A C 463.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=30.88;SB=-0.01;sumGLbyD=33.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.10:496,45,0 5439-ref 1588 . T C 830.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=33.34;MQ0=0;QD=31.93;SB=-0.01;sumGLbyD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:24:72.20:863,72,0 5439-ref 1593 . G T 895.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.34;MQ0=0;QD=34.46;SB=-0.01;sumGLbyD=35.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.21:929,78,0 5439-ref 1627 . C A 1479.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=35.33;MQ0=0;QD=34.40;SB=-0.01;sumGLbyD=35.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1512,123,0 5439-ref 1735 . T A 70.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.72;SB=-0.01;sumGLbyD=25.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9.03:103,9,0 5439-ref 1737 . T A 39.26 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.63;SB=-0.01;sumGLbyD=35.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 5461-ref 67 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5461-ref 465 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5461-ref 1208 . A T 44.89 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 5461-ref 1257 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 5461-ref 1292 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5461-ref 1454 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5510-ref 107 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 5510-ref 126 . T A 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 5510-ref 153 . G A 101.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=16.93;SB=-0.01;sumGLbyD=21.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:61.96:132,0,62 5510-ref 181 . T A 135.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=19.37;SB=-0.01;sumGLbyD=23.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:58.95:166,0,59 5510-ref 293 . G T 26.84 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.95;SB=-0.01;sumGLbyD=18.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:57,0,31 5510-ref 477 . C T 39.56 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.19;SB=-0.01;sumGLbyD=23.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:70,0,31 5510-ref 685 . G T 32.33 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.78;SB=-0.01;sumGLbyD=20.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22.52:62,0,23 5510-ref 689 . 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A G 768.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.8282;MQ=36.05;MQ0=0;QD=24.00;SB=-0.01;sumGLbyD=24.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,24:32:99:798,0,212 5510-ref 1276 . C T 127.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.58;SB=-0.01;sumGLbyD=14.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:157,0,207 5510-ref 1285 . C T 82.02 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.54;MQ0=0;QD=6.84;SB=-0.01;sumGLbyD=9.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:112,0,241 5510-ref 1328 . C G 360.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.97;MQ0=0;QD=9.49;SB=-0.01;sumGLbyD=10.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:391,0,769 5510-ref 1349 . C T 732.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.38;MQ0=0;QD=20.94;SB=-0.01;sumGLbyD=21.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:35:99:763,0,275 5510-ref 1350 . 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T G 280.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8661;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.78;SB=-0.01;sumGLbyD=11.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:310,0,552 5554-ref 177 . C G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7219;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.00;SB=-0.01;sumGLbyD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:3:9.03:120,9,0 5556-ref 94 . C G 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 5556-ref 165 . G C 199.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.28;SB=-0.01;sumGLbyD=38.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:233,18,0 5556-ref 185 . C T 284.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.62;SB=-0.01;sumGLbyD=39.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:318,24,0 5556-ref 186 . C T 284.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:317,24,0 5556-ref 245 . C T 261.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.75;SB=-0.01;sumGLbyD=36.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:295,24,0 5556-ref 300 . G T 583.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:616,48,0 5556-ref 399 . G A 437.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.48;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:471,36,0 5556-ref 710 . C G 592.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.94;SB=-0.01;sumGLbyD=34.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:14.17:626,14,0 5556-ref 799 . 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A G 34.11 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8050;MQ=35.42;MQ0=0;QD=2.62;SB=-0.01;sumGLbyD=4.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:11:64.10:64,0,271 5556-ref 1809 . T A 1760.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.27;SB=-0.01;sumGLbyD=38.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1794,138,0 5556-ref 1953 . A G 1962.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.03;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:52:99:1996,156,0 5556-ref 2121 . A G 1653.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.5050;MQ=36.78;MQ0=0;QD=36.74;SB=-0.01;sumGLbyD=37.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,44:45:99:1686,99,0 5556-ref 2207 . G C 2662.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6532;MQ=36.29;MQ0=0;QD=37.50;SB=-0.01;sumGLbyD=37.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:2696,214,0 5556-ref 2243 . A C 2382.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.2971;MQ=36.22;MQ0=0;QD=36.66;SB=-0.01;sumGLbyD=37.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:65:99:2416,166,0 5556-ref 2280 . A G 2013.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.1602;MQ=36.64;MQ0=0;QD=35.96;SB=-0.01;sumGLbyD=36.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:56:99:2047,130,0 5556-ref 2350 . C T 1735.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7876;MQ=36.59;MQ0=0;QD=35.42;SB=-0.01;sumGLbyD=36.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:72.21:1769,72,0 5556-ref 2374 . G A 1894.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.2689;MQ=36.60;MQ0=0;QD=37.90;SB=-0.01;sumGLbyD=38.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:49:99:1928,147,0 5556-ref 2413 . A G 1711.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=36.57;MQ0=0;QD=36.42;SB=-0.01;sumGLbyD=37.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,46:47:99:1745,101,0 5556-ref 2451 . A G 1382.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.73;MQ0=0;QD=36.39;SB=-36.14;sumGLbyD=37.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:37:99:1416,111,0 5556-ref 2473 . C T 1032.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.9363;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.90;SB=-30.97;sumGLbyD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,31:37:65.45:1062,0,65 5556-ref 2576 . G A 435.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:468,36,0 5561-ref 3 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5561-ref 40 . A C 1931.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.15;SB=-0.01;sumGLbyD=37.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:52:99:1965,119,0 5561-ref 41 . 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G T 50.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.9979;MQ=34.66;MQ0=0;QD=1.64;SB=-0.01;sumGLbyD=2.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:80.89:81,0,866 5561-ref 140 . T A 87.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9658;MQ=34.66;MQ0=0;QD=2.81;SB=-0.01;sumGLbyD=3.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,8:30:99:117,0,754 5561-ref 148 . A G 1839.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1873,144,0 5561-ref 181 . A C 3536.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7705;MQ=36.79;MQ0=0;QD=37.23;SB=-76.14;sumGLbyD=37.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:93:99:3537,280,0 5561-ref 217 . A C 5280.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.4758;MQ=34.99;MQ0=0;QD=36.67;SB=-40.01;sumGLbyD=36.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,143:142:99:5245,393,0 5561-ref 259 . C G 2311.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.5625;MQ=33.10;MQ0=0;QD=33.99;SB=-0.01;sumGLbyD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2345,202,0 5561-ref 270 . C T 1004.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=29.16;MQ0=0;QD=30.44;SB=-0.01;sumGLbyD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1038,99,0 5561-ref 274 . T C 554.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=27.73;SB=-0.01;sumGLbyD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.10:588,60,0 5561-ref 319 . A G 436.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.70;MQ0=0;QD=12.85;SB=-0.01;sumGLbyD=13.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,16:33:99:467,0,605 5561-ref 592 . T C 3638.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.0798;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.51;SB=-0.01;sumGLbyD=37.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:94:99:3598,243,0 5561-ref 749 . A T 2579.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.50;SB=-0.01;sumGLbyD=38.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2612,202,0 5561-ref 788 . C A 741.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.60;MQ0=0;QD=29.65;SB=-0.01;sumGLbyD=30.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:23:29.19:774,29,0 5561-ref 807 . A G 36.57 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.14;SB=-0.01;sumGLbyD=16.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:3:30.98:67,0,31 5561-ref 850 . A G 1430.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.74;MQ0=0;QD=36.67;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:39:85.83:1463,86,0 5561-ref 882 . G A 2758.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.5937;MQ=36.86;MQ0=0;QD=38.32;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:2792,214,0 5561-ref 1045 . 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T C 2963.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.75;MQ0=0;QD=36.14;SB=-0.01;sumGLbyD=36.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:77:99:2997,232,0 5606-ref 1723 . C A 3014.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.2823;MQ=36.88;MQ0=0;QD=35.47;SB=-0.01;sumGLbyD=35.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,82:82:99:3048,244,0 5606-ref 1844 . C T 3553.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.3103;MQ=36.38;MQ0=0;QD=36.26;SB=-0.01;sumGLbyD=35.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,95:96:99:3452,188,0 5606-ref 1877 . T C 4172.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.2983;MQ=36.39;MQ0=0;QD=35.97;SB=-0.01;sumGLbyD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,112:112:99:4024,188,0 5606-ref 1913 . T C 3167.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=35.81;MQ0=0;QD=36.83;SB=-0.01;sumGLbyD=37.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:85:99:3200,256,0 5606-ref 1949 . 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C G 4945.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=137;DS;Dels=0.01;HRun=0;HaplotypeScore=8.6880;MQ=34.34;MQ0=0;QD=36.10;SB=-0.01;sumGLbyD=35.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:135:99:4904,366,0 5606-ref 2249 . G A 2150.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.86;MQ0=0;QD=31.62;SB=-0.01;sumGLbyD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2183,204,0 5606-ref 2252 . G T 1884.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.95;MQ0=0;QD=30.39;SB=-0.01;sumGLbyD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:61:99:1917,183,0 5606-ref 2263 . A C 1739.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.26;MQ0=0;QD=29.00;SB=-0.01;sumGLbyD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,58:60:99:1773,111,0 5606-ref 2296 . C T 1615.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.79;MQ0=0;QD=31.68;SB=-0.01;sumGLbyD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:50:99:1648,150,0 5606-ref 2343 . C T 997.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9984;MQ=31.42;MQ0=0;QD=26.95;SB=-0.01;sumGLbyD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,34:37:2.27:1026,2,0 5606-ref 2344 . A C 1151.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.9984;MQ=31.42;MQ0=0;QD=31.13;SB=-0.01;sumGLbyD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:71.27:1185,71,0 5606-ref 2351 . G A 843.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.12;MQ0=0;QD=29.07;SB=-0.01;sumGLbyD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:47.20:876,47,0 5606-ref 2419 . C T 464.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4676;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.15;SB=-0.01;sumGLbyD=35.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:497,39,0 5606-ref 2422 . A T 429.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=35.53;MQ0=0;QD=30.68;SB=-0.01;sumGLbyD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:4.33:460,4,0 5606-ref 2425 . T C 461 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.42;MQ0=0;QD=35.46;SB=-0.01;sumGLbyD=38.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:494,39,0 5698-ref 28 . G A 192.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.48;MQ0=0;QD=8.76;SB=-71.79;sumGLbyD=10.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:223,0,488 5698-ref 52 . G A 334.62 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.61;MQ0=0;QD=11.54;SB=-73.31;sumGLbyD=12.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:365,0,591 5698-ref 59 . G A 629.37 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.67;MQ0=0;QD=17.98;SB=6.01;sumGLbyD=18.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,20:33:99:659,0,447 5698-ref 147 . T C 702.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.77;MQ0=0;QD=16.33;SB=-0.01;sumGLbyD=17.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,22:43:99:732,0,697 5698-ref 191 . 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G T 114.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.57;SB=-0.01;sumGLbyD=36.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:147,12,0 5698-ref 391 . G A 19.97 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=2.00;SB=-0.01;sumGLbyD=4.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49.92:50,0,279 5698-ref 397 . T G 244.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=24.43;SB=-0.01;sumGLbyD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49.92:274,0,50 5698-ref 415 . T C 15.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=35.98;MQ0=0;QD=1.53;SB=-0.01;sumGLbyD=4.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:45.17:45,0,279 5714-ref 1112 . A G 599.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.46;SB=-0.01;sumGLbyD=39.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.16:632,48,0 5714-ref 1536 . A T 737.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.14;SB=-0.01;sumGLbyD=36.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:20:60.19:771,60,0 5714-ref 1648 . T C 392.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.68;SB=-0.01;sumGLbyD=38.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:425,33,0 5714-ref 1698 . G T 11.57 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.89;SB=-0.01;sumGLbyD=10.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:41.25:41,0,68 5714-ref 1737 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 5725-ref 58 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 5725-ref 87 . A T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 5725-ref 299 . C G 38.18 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.73;SB=-0.01;sumGLbyD=22.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:17.66:68,0,18 5725-ref 302 . T A 27.72 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.24;SB=-0.01;sumGLbyD=19.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25.33:58,0,25 5725-ref 394 . T A 24.20 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8649;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.03;SB=-0.01;sumGLbyD=9.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:54.18:54,0,127 5725-ref 399 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 5725-ref 516 . C T 153.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.77;SB=-0.01;sumGLbyD=37.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:187,15,0 5725-ref 629 . G A 244.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.89;SB=-0.01;sumGLbyD=39.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:277,21,0 5725-ref 730 . A G 404.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.81;SB=-0.01;sumGLbyD=39.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:438,33,0 5725-ref 741 . C T 399.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.30;SB=-0.01;sumGLbyD=39.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:432,33,0 5725-ref 891 . A G 469.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.22;MQ0=0;QD=36.13;SB=-0.01;sumGLbyD=38.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:503,39,0 5725-ref 1054 . T A 165.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.60;SB=-0.01;sumGLbyD=27.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18.96:195,0,19 5725-ref 1296 . C A 366.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.64;SB=-0.01;sumGLbyD=39.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:399,30,0 5738-ref 59 . C G 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 5738-ref 69 . G T 42.68 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.34;SB=-0.01;sumGLbyD=37.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:74,6,0 5738-ref 103 . C G 138.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=27.62;SB=-0.01;sumGLbyD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:171,15,0 5738-ref 106 . A G 354.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.3359;MQ=34.50;MQ0=0;QD=27.26;SB=-0.01;sumGLbyD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:11:33.09:387,33,0 5738-ref 122 . T C 51.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9674;MQ=30.34;MQ0=0;QD=1.61;SB=-0.01;sumGLbyD=2.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,6:32:81.54:82,0,789 5738-ref 136 . A G 78.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=30.19;MQ0=0;QD=2.37;SB=-0.01;sumGLbyD=3.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:33:99:108,0,790 5738-ref 143 . G C 1180.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4536;MQ=29.56;MQ0=0;QD=31.06;SB=-29.63;sumGLbyD=31.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:37:99:1213,111,0 5738-ref 181 . C T 309.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=18.8575;MQ=26.93;MQ0=0;QD=8.59;SB=-26.62;sumGLbyD=9.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:35:99:339,0,519 5738-ref 186 . C T 529.74 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=21.9850;MQ=25.64;MQ0=0;QD=18.92;SB=-26.62;sumGLbyD=19.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:27:86.80:560,0,87 5738-ref 187 . G A 56.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=21.9850;MQ=25.64;MQ0=0;QD=2.03;SB=3.00;sumGLbyD=3.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:27:86.82:87,0,553 5738-ref 188 . A C 522.81 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=21.9850;MQ=25.64;MQ0=0;QD=18.67;SB=-26.62;sumGLbyD=19.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:27:86.82:553,0,87 5738-ref 218 . G A 1024.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.38;MQ0=0;QD=33.05;SB=-0.01;sumGLbyD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.23:1058,93,0 5738-ref 247 . A G 681.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=32.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.14:715,63,0 5738-ref 281 . G T 43.84 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=8.77;SB=-0.01;sumGLbyD=14.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:58.40:74,0,58 5738-ref 282 . C G 43.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=8.77;SB=-0.01;sumGLbyD=14.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:49.67:74,0,50 5738-ref 321 . T A 438.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.54;SB=-0.01;sumGLbyD=39.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:472,36,0 5738-ref 345 . G C 604.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.80;MQ0=0;QD=35.54;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.15:637,51,0 5738-ref 346 . G A 571.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=37.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:604,48,0 5738-ref 397 . 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C G 776.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.06;MQ0=0;QD=32.37;SB=-0.01;sumGLbyD=33.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.18:810,69,0 5738-ref 625 . A G 412.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.63;MQ0=0;QD=21.69;SB=-0.01;sumGLbyD=23.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:18:65.88:442,0,66 5738-ref 649 . G A 638.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.47;MQ0=0;QD=27.76;SB=-29.63;sumGLbyD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:47.46:672,47,0 5738-ref 653 . G A 647.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.95;MQ0=0;QD=29.45;SB=-27.67;sumGLbyD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.13:681,66,0 5738-ref 665 . T C 477.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.18;MQ0=0;QD=31.86;SB=-29.63;sumGLbyD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.11:511,45,0 5738-ref 677 . C T 1040.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.21;MQ0=0;QD=34.67;SB=-29.63;sumGLbyD=35.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.25:1073,90,0 5774-ref 138 . G C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 5774-ref 189 . A T 260.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=32.55;SB=-0.01;sumGLbyD=36.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:293,24,0 5774-ref 356 . T G 54.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.92;SB=-0.01;sumGLbyD=7.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:84.06:84,0,268 5774-ref 359 . C T 351.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=32.00;SB=-0.01;sumGLbyD=35.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.08:385,33,0 5774-ref 377 . A G 226.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=32.36;SB=-0.01;sumGLbyD=37.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:259,21,0 5774-ref 393 . A T 460.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=35.43;SB=-0.01;sumGLbyD=37.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:494,39,0 5774-ref 494 . A T 476.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.80;SB=-0.01;sumGLbyD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:5.14:508,5,0 5774-ref 593 . G T 535.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.48;SB=-0.01;sumGLbyD=35.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.14:569,45,0 5774-ref 613 . A G 14.07 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.17;SB=-0.01;sumGLbyD=3.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:43.89:44,0,362 5774-ref 687 . T G 733.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=36.69;SB=-0.01;sumGLbyD=38.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:767,60,0 5774-ref 702 . G A 631.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4357;MQ=35.93;MQ0=0;QD=33.22;SB=-0.01;sumGLbyD=34.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:18:54.14:664,54,0 5774-ref 748 . T C 589.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.84;SB=-0.01;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:622,48,0 5774-ref 822 . T A 986.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5838;MQ=36.61;MQ0=0;QD=37.94;SB=-0.01;sumGLbyD=39.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.25:1020,78,0 5774-ref 890 . G C 645.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.98;SB=-0.01;sumGLbyD=39.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:679,51,0 5774-ref 943 . G C 35.88 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.99;SB=-0.01;sumGLbyD=3.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:65.87:66,0,517 5774-ref 1201 . T G 484.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=34.64;SB=-0.01;sumGLbyD=37.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:518,42,0 5774-ref 1202 . C A 496.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=33.08;SB=-0.01;sumGLbyD=35.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.13:529,42,0 5774-ref 1223 . T C 262.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.47;MQ0=0;QD=13.82;SB=-0.01;sumGLbyD=15.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:292,0,335 5774-ref 1305 . C G 357.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.72;SB=-0.01;sumGLbyD=39.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:390,30,0 5774-ref 1513 . A T 117.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.53;SB=-0.01;sumGLbyD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.04:150,12,0 5774-ref 1584 . G T 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 5774-ref 1599 . T C 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 5840-ref 185 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 5863-ref 119 . C G 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 5863-ref 191 . C G 115.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.93;SB=-0.01;sumGLbyD=37.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:148,12,0 5863-ref 216 . A G 145.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=29.06;SB=-0.01;sumGLbyD=35.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:178,15,0 5863-ref 227 . C T 116.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.11;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:149,12,0 5863-ref 247 . G A 74.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.00;SB=-0.01;sumGLbyD=20.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:62.75:105,0,63 5863-ref 416 . C G 162.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.51;SB=-0.01;sumGLbyD=39.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:195,15,0 5863-ref 465 . G A 159.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.57;SB=-0.01;sumGLbyD=32.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.05:192,15,0 5863-ref 500 . T C 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 5863-ref 509 . C T 105.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.04;SB=-0.01;sumGLbyD=19.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:91.44:135,0,91 5863-ref 621 . A G 165.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.03;SB=-0.01;sumGLbyD=39.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:198,15,0 5863-ref 682 . C T 79.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=15.99;SB=-0.01;sumGLbyD=21.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.98:110,0,25 5863-ref 721 . 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A G 836.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.54;MQ0=0;QD=38.00;SB=-0.01;sumGLbyD=39.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.21:869,66,0 5863-ref 1102 . T G 569.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.6624;MQ=35.80;MQ0=0;QD=33.52;SB=-0.01;sumGLbyD=35.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.15:603,48,0 5863-ref 1134 . A G 146.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=33.48;MQ0=0;QD=24.42;SB=-0.01;sumGLbyD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:179,15,0 5863-ref 1143 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 5863-ref 1233 . C T 285.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:319,24,0 5863-ref 1400 . G T 419.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9989;MQ=35.28;MQ0=0;QD=35.00;SB=-0.01;sumGLbyD=37.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:453,36,0 5863-ref 1431 . G C 470.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9159;MQ=36.22;MQ0=0;QD=36.19;SB=-0.01;sumGLbyD=38.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:504,39,0 5863-ref 1567 . A G 565.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=35.37;SB=-0.01;sumGLbyD=37.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:599,48,0 5863-ref 1601 . A G 224.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=32.10;SB=-0.01;sumGLbyD=36.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:258,21,0 5863-ref 1605 . A T 195.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.57;SB=-0.01;sumGLbyD=38.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:228,18,0 5863-ref 1722 . T C 37.70 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.85;SB=-0.01;sumGLbyD=34.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:69,6,0 5863-ref 1756 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5863-ref 1769 . G A 39.56 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.19;SB=-0.01;sumGLbyD=23.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29.55:70,0,30 5863-ref 1797 . C T 498.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.60;SB=-0.01;sumGLbyD=37.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:531,42,0 5863-ref 1820 . T C 319.41 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9982;MQ=34.28;MQ0=0;QD=13.89;SB=-0.01;sumGLbyD=15.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:349,0,363 5863-ref 1863 . G C 492.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=31.97;MQ0=0;QD=32.81;SB=-0.01;sumGLbyD=35.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.12:525,45,0 5863-ref 1870 . A G 380.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=31.67;SB=-0.01;sumGLbyD=34.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.09:413,36,0 5863-ref 1873 . T C 16.92 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=24.9911;MQ=31.04;MQ0=0;QD=1.54;SB=-0.01;sumGLbyD=4.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:6:46.82:47,0,136 5863-ref 1883 . G A 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 5863-ref 1887 . T A 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 5872-ref 238 . G T 359.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.70;SB=-0.01;sumGLbyD=35.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.10:393,30,0 5872-ref 281 . G A 305.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.99;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:339,27,0 5872-ref 399 . G A 25.01 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.17;SB=-0.01;sumGLbyD=9.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:54.99:55,0,139 5872-ref 493 . A G 256.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.4534;MQ=36.52;MQ0=0;QD=12.21;SB=-0.01;sumGLbyD=13.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:20:99:286,0,373 5872-ref 817 . G A 629.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.5309;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.11;SB=-0.01;sumGLbyD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:18.61:662,19,0 5872-ref 967 . C T 1044.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.01;MQ0=0;QD=33.70;SB=-0.01;sumGLbyD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:30:50.28:1078,50,0 5872-ref 1022 . C A 1563.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.7884;MQ=36.52;MQ0=0;QD=37.23;SB=-0.01;sumGLbyD=38.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:41:99:1597,123,0 5872-ref 1167 . G T 553.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7313;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.87;SB=-0.01;sumGLbyD=18.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:31:99:584,0,455 5872-ref 1313 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.26;SB=-0.01;sumGLbyD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6.02:80,6,0 5872-ref 1355 . T G 474.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.50;SB=-0.01;sumGLbyD=39.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:507,39,0 5872-ref 1470 . A C 124.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:157,12,0 5872-ref 1565 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5918-ref 85 . A G 5300.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.6158;MQ=36.85;MQ0=0;QD=39.26;SB=-0.01;sumGLbyD=38.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,134:135:99:5260,403,0 5918-ref 312 . C A 6606.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.2604;MQ=36.59;MQ0=0;QD=38.19;SB=-0.01;sumGLbyD=38.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,172:171:99:6582,512,0 5918-ref 347 . T A 8198.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=214;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=7.7997;MQ=36.53;MQ0=0;QD=38.31;SB=-0.01;sumGLbyD=38.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,212:213:99:8162,606,0 5918-ref 371 . T A 8624.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.0237;MQ=36.64;MQ0=0;QD=38.33;SB=-0.01;sumGLbyD=38.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,224:221:99:8624,665,0 5918-ref 452 . C G 7549.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=15.7821;MQ=36.75;MQ0=0;QD=37.94;SB=-0.01;sumGLbyD=37.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,199:197:99:7549,593,0 5918-ref 457 . A T 2389.70 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=175;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.3597;MQ=36.77;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=13.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,76:174:99:2420,0,3341 5918-ref 586 . A G 11275.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=293;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.8646;MQ=36.86;MQ0=0;QD=38.48;SB=-0.01;sumGLbyD=38.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,290:290:99:11253,870,0 5918-ref 658 . C G 11615.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=302;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=17.3121;MQ=36.19;MQ0=0;QD=38.46;SB=-0.01;sumGLbyD=38.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,301:301:99:11574,903,0 5918-ref 699 . 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G A 162.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.57;SB=-0.01;sumGLbyD=39.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 5962-ref 385 . T C 28.96 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.14;SB=-0.01;sumGLbyD=8.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58.94:59,0,173 5962-ref 453 . A G 314.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:347,27,0 5962-ref 485 . C G 512.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=36.59;SB=-0.01;sumGLbyD=38.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:545,42,0 5962-ref 565 . C A 694.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.57;SB=-0.01;sumGLbyD=38.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:728,57,0 5962-ref 615 . G A 513.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=34.25;SB=-0.01;sumGLbyD=36.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:547,45,0 5962-ref 663 . T A 315.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=31.51;SB=-0.01;sumGLbyD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:348,30,0 5962-ref 671 . A G 315.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=31.51;SB=-0.01;sumGLbyD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:348,30,0 5962-ref 683 . T G 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 5962-ref 703 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5962-ref 705 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5962-ref 742 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 5984-ref 29 . A C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 5984-ref 79 . C T 244.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=30.51;SB=-88.64;sumGLbyD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:277,24,0 5984-ref 97 . G T 37.91 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.07;MQ0=0;QD=6.32;SB=-20.59;sumGLbyD=11.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:67.90:68,0,71 5984-ref 112 . A T 43.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=27.07;MQ0=0;QD=7.31;SB=-23.60;sumGLbyD=12.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:5:41.29:74,0,41 5984-ref 136 . A G 15.40 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4689;MQ=24.52;MQ0=0;QD=3.85;SB=-17.61;sumGLbyD=11.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:45.27:45,0,47 6011-ref 88 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6011-ref 103 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6011-ref 166 . A C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=12.80;SB=-0.01;sumGLbyD=23.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6.02:70,6,0 6011-ref 187 . G A 107.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=17.87;SB=-0.01;sumGLbyD=22.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:5:14.58:137,0,15 6011-ref 190 . T C 107.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=17.93;SB=-0.01;sumGLbyD=22.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:5:14.58:137,0,15 6011-ref 260 . G A 58.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=19.59;SB=-0.01;sumGLbyD=30.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:91,9,0 6011-ref 263 . G T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 6011-ref 264 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 6011-ref 266 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 6011-ref 376 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6011-ref 391 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6011-ref 646 . C A 78.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=19.54;SB=-0.01;sumGLbyD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.01:111,12,0 6011-ref 853 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 6011-ref 872 . A C 148.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.71;SB=-0.01;sumGLbyD=36.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:181,15,0 6011-ref 937 . T G 22.96 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.55;SB=-0.01;sumGLbyD=5.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52.93:53,0,236 6011-ref 964 . G A 189.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.56;SB=-0.01;sumGLbyD=37.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:222,18,0 6011-ref 967 . G A 159.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.90;SB=-0.01;sumGLbyD=38.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:192,15,0 6011-ref 1132 . G T 175.89 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7320;MQ=23.39;MQ0=0;QD=10.99;SB=-0.01;sumGLbyD=12.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:15:99:206,0,125 6011-ref 1139 . A T 84.87 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.3528;MQ=23.35;MQ0=0;QD=4.72;SB=-0.01;sumGLbyD=6.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:115,0,280 6011-ref 1148 . G A 158.41 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.0900;MQ=25.05;MQ0=0;QD=7.54;SB=-0.01;sumGLbyD=8.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:20:99:188,0,276 6011-ref 1154 . G T 159.84 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.0900;MQ=25.05;MQ0=0;QD=7.61;SB=-0.01;sumGLbyD=9.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:20:99:190,0,276 6011-ref 1175 . T C 193.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.25;MQ0=0;QD=10.18;SB=-0.01;sumGLbyD=11.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,10:19:99:223,0,216 6011-ref 1189 . G A 152.12 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=25.82;MQ0=0;QD=10.14;SB=-0.01;sumGLbyD=12.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:182,0,175 6011-ref 1211 . 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G T 77.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.96;SB=-0.01;sumGLbyD=36.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 6011-ref 1467 . G A 180.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=25.85;SB=-0.01;sumGLbyD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:0.62:209,0,1 6011-ref 1471 . A G 42.84 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.54;MQ0=0;QD=1.95;SB=-0.01;sumGLbyD=3.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:72.83:73,0,512 6011-ref 1521 . C T 1026.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.64;MQ0=0;QD=36.65;SB=-0.01;sumGLbyD=37.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.23:1059,84,0 6011-ref 1534 . C T 72.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.4641;MQ=36.64;MQ0=0;QD=2.58;SB=-0.01;sumGLbyD=3.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:27:99:102,0,787 6011-ref 1579 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 6011-ref 1587 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 6011-ref 1599 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6011-ref 1622 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6011-ref 1656 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6017-ref 59 . A T 42.86 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=8.57;SB=-0.01;sumGLbyD=14.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.98:73,0,65 6017-ref 66 . T C 173.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.77;MQ0=0;QD=15.81;SB=-0.01;sumGLbyD=18.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:85.51:204,0,86 6017-ref 78 . C T 224.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.69;MQ0=0;QD=14.94;SB=-0.01;sumGLbyD=16.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:14:99:254,0,118 6017-ref 80 . A G 118.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.79;MQ0=0;QD=7.00;SB=-0.01;sumGLbyD=8.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:149,0,313 6017-ref 109 . A G 781.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.58;MQ0=0;QD=32.54;SB=-0.01;sumGLbyD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.18:814,72,0 6017-ref 134 . A T 794.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=32.73;MQ0=0;QD=26.49;SB=-0.01;sumGLbyD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,26:30:56.30:825,0,56 6017-ref 143 . A G 922.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.7887;MQ=34.87;MQ0=0;QD=27.12;SB=-0.01;sumGLbyD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,29:33:97.92:952,0,98 6017-ref 145 . A C 89.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.18;MQ0=0;QD=2.65;SB=-0.01;sumGLbyD=3.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,6:34:99:120,0,945 6017-ref 296 . C G 85.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8315;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.18;SB=-0.01;sumGLbyD=2.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,6:39:99:115,0,1189 6017-ref 457 . T C 172.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.9611;MQ=36.64;MQ0=0;QD=3.08;SB=-0.01;sumGLbyD=3.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,10:56:99:202,0,1661 6017-ref 484 . T C 237.40 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.7831;MQ=36.60;MQ0=0;QD=4.75;SB=-0.01;sumGLbyD=5.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:267,0,1375 6017-ref 496 . T C 231.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7886;MQ=36.60;MQ0=0;QD=4.63;SB=-0.01;sumGLbyD=5.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:261,0,1369 6017-ref 561 . G A 70.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.62;SB=-0.01;sumGLbyD=25.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:100,0,28 6017-ref 562 . T A 70.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.55;SB=-0.01;sumGLbyD=25.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:100,0,28 6017-ref 564 . T A 34.09 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.36;SB=-0.01;sumGLbyD=21.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:64,0,31 6017-ref 569 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6046-ref 213 . C A 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 6046-ref 214 . C T 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 6046-ref 280 . C A 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 6046-ref 396 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 6046-ref 440 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6046-ref 507 . G A 43.12 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.56;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:74,6,0 6046-ref 527 . T C 75.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.21;SB=-0.01;sumGLbyD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:108,9,0 6046-ref 568 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6046-ref 572 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6084-ref 51 . A C 271.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.98;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:305,24,0 6084-ref 201 . C T 142.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.79;SB=-0.01;sumGLbyD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:175,15,0 6084-ref 210 . C G 18.50 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.31;SB=-0.01;sumGLbyD=6.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:48.43:48,0,204 6084-ref 279 . A G 423.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.63;MQ0=0;QD=28.26;SB=-0.01;sumGLbyD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:14:2.08:453,2,0 6084-ref 323 . G A 586.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=36.68;SB=-0.01;sumGLbyD=38.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:620,48,0 6084-ref 336 . G T 556.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=34.81;SB=-0.01;sumGLbyD=36.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.13:590,48,0 6084-ref 498 . T C 582.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.40;SB=-0.01;sumGLbyD=38.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:615,48,0 6084-ref 626 . G T 129.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.22;SB=-0.01;sumGLbyD=11.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:159,0,264 6084-ref 642 . A C 330.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.10;SB=-0.01;sumGLbyD=36.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:364,30,0 6084-ref 761 . A T 821.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=37.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.18:854,69,0 6084-ref 889 . C T 946.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:25:75.24:979,75,0 6084-ref 954 . A T 406.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.26;SB=-0.01;sumGLbyD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:2.40:435,1,0 6139-ref 107 . A G 256.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=28.49;SB=-0.01;sumGLbyD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:2.54:285,0,3 6139-ref 129 . A C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 6139-ref 152 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6196-ref 501 . C A 21.15 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=21.55;MQ0=0;QD=10.57;SB=-0.01;sumGLbyD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 6196-ref 582 . A G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 6196-ref 586 . T G 81.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.85;MQ0=0;QD=20.27;SB=-0.01;sumGLbyD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.01:114,12,0 6196-ref 638 . C T 388.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.92;MQ0=0;QD=29.90;SB=-0.01;sumGLbyD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.08:422,39,0 6196-ref 654 . A G 242.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.92;MQ0=0;QD=18.64;SB=-0.01;sumGLbyD=20.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:70.55:272,0,71 6196-ref 661 . G A 137.02 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.91;MQ0=0;QD=15.22;SB=-0.01;sumGLbyD=18.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:80.36:167,0,80 6196-ref 668 . T C 15.72 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.72;MQ0=0;QD=1.97;SB=-0.01;sumGLbyD=5.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:45.60:46,0,144 6196-ref 669 . G A 112.84 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.72;MQ0=0;QD=14.10;SB=-0.01;sumGLbyD=17.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:45.60:143,0,46 6196-ref 698 . A G 53.76 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.37;MQ0=0;QD=10.75;SB=-0.01;sumGLbyD=16.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25.01:84,0,25 6196-ref 700 . G A 32.07 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.37;MQ0=0;QD=6.41;SB=-0.01;sumGLbyD=12.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:4:28.01:62,0,28 6235-ref 152 . A G 163.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.73;SB=-0.01;sumGLbyD=39.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 6235-ref 227 . T G 155.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:188,15,0 6235-ref 237 . C A 146.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=29.36;SB=-0.01;sumGLbyD=35.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:180,15,0 6235-ref 239 . T C 154.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.80;SB=-0.01;sumGLbyD=37.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:187,15,0 6235-ref 1260 . A C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 6235-ref 1280 . A G 44.93 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=3.00;SB=-0.01;sumGLbyD=4.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:74.92:75,0,310 6235-ref 1305 . G A 280.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=18.69;SB=-0.01;sumGLbyD=20.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:74.92:310,0,75 6235-ref 1308 . G A 442.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=29.50;SB=-0.01;sumGLbyD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.10:475,45,0 6235-ref 1325 . C G 288.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.12;MQ0=0;QD=22.18;SB=-0.01;sumGLbyD=24.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:2.77:317,0,0 6235-ref 1333 . G A 322.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=26.87;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.07:355,36,0 6235-ref 1681 . A G 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 6235-ref 1722 . T C 133.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=22.29;SB=-0.01;sumGLbyD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.95:164,0,22 6235-ref 1734 . C G 152.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.50;SB=-0.01;sumGLbyD=37.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:185,15,0 6235-ref 1746 . T C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 6281-ref 94 . G A 35.36 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=17.68;SB=-0.01;sumGLbyD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:67,6,0 6281-ref 106 . C T 37.70 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.85;SB=-0.01;sumGLbyD=34.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:69,6,0 6281-ref 136 . G A 71.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.98;SB=-0.01;sumGLbyD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:104,9,0 6281-ref 147 . G C 69.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.05;SB=-30.76;sumGLbyD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:101,9,0 6281-ref 213 . G T 76.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.64;SB=-0.01;sumGLbyD=36.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:109,9,0 6281-ref 231 . G C 112.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.10;SB=-0.01;sumGLbyD=36.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:145,12,0 6281-ref 256 . G C 115.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.93;SB=-0.01;sumGLbyD=37.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:148,12,0 6281-ref 285 . G T 109.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=27.41;SB=-0.01;sumGLbyD=35.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:142,12,0 6281-ref 308 . T C 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 6281-ref 309 . T C 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 6378-ref 75 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6378-ref 197 . A G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 6378-ref 204 . G C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 6378-ref 228 . C G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 6399-ref 47 . A G 13.62 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.51;SB=3.00;sumGLbyD=4.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:43.42:43,0,245 6399-ref 76 . A C 556.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.12;SB=-0.01;sumGLbyD=39.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:590,45,0 6399-ref 118 . T C 393.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.58;SB=-0.01;sumGLbyD=15.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:26:99:424,0,425 6399-ref 170 . C A 577.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=12.7152;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.62;SB=-0.01;sumGLbyD=19.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:30:99:607,0,367 6399-ref 240 . C T 277.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.47;SB=-0.01;sumGLbyD=20.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:14:99:307,0,150 6399-ref 279 . C T 163.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8656;MQ=32.41;MQ0=0;QD=23.32;SB=-0.01;sumGLbyD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:8.57:193,0,9 6399-ref 296 . G A 57.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=14.32;SB=-0.01;sumGLbyD=21.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:17.60:87,0,18 6399-ref 316 . C T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 6399-ref 318 . A G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 6465-ref 307 . G A 202.70 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9967;MQ=35.87;MQ0=0;QD=22.52;SB=-0.01;sumGLbyD=25.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52.93:233,0,53 6465-ref 348 . T A 203.70 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9999;MQ=36.07;MQ0=0;QD=18.52;SB=-0.01;sumGLbyD=21.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:234,0,123 6465-ref 379 . A G 65.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.16;SB=-0.01;sumGLbyD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:95.25:95,0,168 6499-ref 74 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6499-ref 78 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6499-ref 158 . G C 306.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:340,27,0 6499-ref 169 . C G 201.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4357;MQ=35.53;MQ0=0;QD=28.84;SB=-0.01;sumGLbyD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 6499-ref 227 . G C 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 6499-ref 324 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6499-ref 745 . A G 79.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.50;SB=-0.01;sumGLbyD=37.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:112,9,0 6499-ref 925 . A G 4488.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=9.2487;MQ=36.83;MQ0=0;QD=38.70;SB=-0.01;sumGLbyD=38.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:116:99:4462,346,0 6499-ref 1038 . G T 2102.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9487;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.23;SB=-0.01;sumGLbyD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2135,166,0 6502-ref 100 . G A 565.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=31.43;SB=-0.01;sumGLbyD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:15.58:599,16,0 6502-ref 133 . C T 468.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9983;MQ=33.71;MQ0=0;QD=29.31;SB=-0.01;sumGLbyD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:20.46:502,20,0 6502-ref 138 . G A 417.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.77;MQ0=0;QD=32.09;SB=-0.01;sumGLbyD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.10:450,39,0 6502-ref 186 . C T 494.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:528,42,0 6502-ref 372 . T G 865.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.84;MQ0=0;QD=36.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.21:899,72,0 6502-ref 402 . T G 617.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=34.32;SB=-0.01;sumGLbyD=36.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.15:651,54,0 6502-ref 420 . A G 190.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.94;MQ0=0;QD=27.20;SB=-0.01;sumGLbyD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:223,21,0 6502-ref 423 . A G 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 6502-ref 435 . T C 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 6502-ref 480 . A G 612.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=36.05;SB=-0.01;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.15:646,51,0 6502-ref 482 . C G 623.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=36.66;SB=-0.01;sumGLbyD=38.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:656,51,0 6502-ref 580 . A T 1624.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9654;MQ=36.31;MQ0=0;QD=36.92;SB=-0.01;sumGLbyD=37.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:43:99:1658,129,0 6502-ref 586 . A G 1459.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7973;MQ=36.22;MQ0=0;QD=37.42;SB=-0.01;sumGLbyD=38.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1492,117,0 6502-ref 699 . G C 1337.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.22;SB=-0.01;sumGLbyD=39.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1371,105,0 6502-ref 894 . T C 1501.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9330;MQ=36.24;MQ0=0;QD=37.53;SB=-0.01;sumGLbyD=38.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1534,120,0 6502-ref 905 . C T 1523.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.07;MQ0=0;QD=34.61;SB=-0.01;sumGLbyD=35.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:42:99:1556,126,0 6502-ref 1125 . T C 1499.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7337;MQ=36.76;MQ0=0;QD=35.70;SB=-0.01;sumGLbyD=36.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:86.38:1532,86,0 6502-ref 1290 . C T 1241.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.10;MQ0=0;QD=36.53;SB=-0.01;sumGLbyD=37.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:33:99:1275,99,0 6502-ref 1320 . G A 1212.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=34.87;MQ0=0;QD=35.65;SB=-0.01;sumGLbyD=36.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1245,102,0 6502-ref 1326 . G A 1204.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9933;MQ=34.99;MQ0=0;QD=33.45;SB=-0.01;sumGLbyD=34.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:35:77.64:1237,78,0 6502-ref 1358 . G T 1177.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.64;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:33:99:1210,99,0 6502-ref 1398 . 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C T 121.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.47;SB=-0.01;sumGLbyD=38.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:154,12,0 6686-ref 368 . A C 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:71,0,31 6686-ref 385 . A G 85.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.59;SB=-0.01;sumGLbyD=39.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:118,9,0 6686-ref 439 . T G 153.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.61;SB=-0.01;sumGLbyD=37.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:186,15,0 6686-ref 547 . G A 112.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.58;SB=-0.01;sumGLbyD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:12.62:143,0,13 6686-ref 632 . G A 65 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.83;SB=-0.01;sumGLbyD=15.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:95:95,0,95 6686-ref 739 . G A 150.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.16;SB=-0.01;sumGLbyD=36.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:184,15,0 6686-ref 742 . G A 116.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.11;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:149,12,0 6686-ref 1085 . A G 253.24 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8930;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.10;SB=-0.01;sumGLbyD=23.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:283,0,122 6686-ref 1135 . C T 394.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9987;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:428,33,0 6686-ref 1275 . A G 204.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.16;SB=-0.01;sumGLbyD=39.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:238,18,0 6686-ref 1310 . T C 196.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.72;SB=-0.01;sumGLbyD=38.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:229,18,0 6686-ref 1459 . A G 345.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=34.56;SB=-0.01;sumGLbyD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:379,30,0 6686-ref 1476 . G T 242.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=24.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:86.91:272,0,87 6686-ref 1707 . T C 557.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6643;MQ=36.37;MQ0=0;QD=34.82;SB=-0.01;sumGLbyD=36.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:590,45,0 6686-ref 1790 . A C 689.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.93;MQ0=0;QD=36.31;SB=-0.01;sumGLbyD=38.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:723,57,0 6686-ref 1820 . T A 729.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9953;MQ=36.03;MQ0=0;QD=34.75;SB=-0.01;sumGLbyD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:21:60.19:763,60,0 6686-ref 1866 . C T 645.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.98;SB=-0.01;sumGLbyD=39.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:679,51,0 6686-ref 1942 . T C 287.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:320,24,0 6686-ref 1980 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6769-ref 135 . 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A G 8608.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=823;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=37.3516;MQ=35.41;MQ0=0;QD=10.46;SB=-0.01;sumGLbyD=7.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:595,227:811:99:6146,0,19391 6818-ref 173 . T C 21830.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=819;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=60.3717;MQ=35.38;MQ0=0;QD=26.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,594:778:99:19487,0,5236 6818-ref 174 . A G 8440.10 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=818;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=60.5047;MQ=35.38;MQ0=0;QD=10.32;SB=-0.01;sumGLbyD=7.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:594,224:809:99:6003,0,19669 6818-ref 209 . G C 12354.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=346;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=23.8861;MQ=34.16;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,341:343:99:12212,958,0 6818-ref 227 . T A 4277.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=4.4518;MQ=30.34;MQ0=0;QD=31.45;SB=-0.01;sumGLbyD=30.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,134:134:99:4200,361,0 6818-ref 231 . A G 1939.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.7835;MQ=25.39;MQ0=0;QD=25.52;SB=-0.01;sumGLbyD=25.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,69:72:99:1972,144,0 6818-ref 233 . T A 690.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.4692;MQ=35.16;MQ0=0;QD=24.67;SB=-0.01;sumGLbyD=25.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:26:66.10:724,66,0 6818-ref 244 . T A 4411.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.7831;MQ=35.45;MQ0=0;QD=35.01;SB=22.67;sumGLbyD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,124:122:99:4359,341,0 6818-ref 268 . C A 143.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=148;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=4.8409;MQ=34.25;MQ0=0;QD=0.97;SB=-0.01;sumGLbyD=1.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,21:147:99:174,0,4315 6818-ref 290 . A C 1909.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=216;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8308;MQ=31.74;MQ0=0;QD=8.84;SB=3.00;sumGLbyD=8.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:128,87:216:99:1940,0,4185 6818-ref 308 . A G 1912.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=378;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=13.6834;MQ=28.08;MQ0=0;QD=5.06;SB=-31.35;sumGLbyD=5.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:290,88:374:99:1942,0,7401 6818-ref 309 . T A 471.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=338;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=11.8175;MQ=26.62;MQ0=0;QD=1.40;SB=-0.01;sumGLbyD=1.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:293,45:336:99:502,0,7666 6818-ref 311 . G C 9028.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=309;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9987;MQ=25.19;MQ0=0;QD=29.22;SB=-0.01;sumGLbyD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,308:305:99:8990,882,0 6818-ref 324 . A G 10573.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=358;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.96;MQ0=0;QD=29.53;SB=-0.01;sumGLbyD=28.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,345:358:99:10049,556,0 6818-ref 344 . G A 12656.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=424;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=29.18;MQ0=0;QD=29.85;SB=-0.01;sumGLbyD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,396:421:99:11663,298,0 6818-ref 346 . T C 2866.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=535;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.1126;MQ=30.60;MQ0=0;QD=5.36;SB=-0.01;sumGLbyD=5.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:411,124:527:99:2896,0,11582 6818-ref 349 . A G 8654.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=684;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.4915;MQ=32.14;MQ0=0;QD=12.65;SB=-0.01;sumGLbyD=9.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:454,227:678:99:6527,0,12962 6818-ref 356 . A G 15580.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=808;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=24.5385;MQ=33.47;MQ0=0;QD=19.28;SB=-0.01;sumGLbyD=16.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:349,457:799:99:13151,0,10712 6818-ref 394 . C A 21834.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=932;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=46.1224;MQ=36.04;MQ0=0;QD=23.43;SB=-26.62;sumGLbyD=20.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:357,575:924:99:19051,0,10898 6818-ref 423 . A T 23739.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=632;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=94.4284;MQ=36.16;MQ0=0;QD=37.56;SB=-0.01;sumGLbyD=36.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,614:626:99:23194,1673,0 6818-ref 434 . T C 5425.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=285;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=50.2169;MQ=35.82;MQ0=0;QD=19.04;SB=-0.01;sumGLbyD=15.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:135,141:281:99:4311,0,4057 6818-ref 451 . G C 1477.12 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=84;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9662;MQ=35.53;MQ0=0;QD=17.58;SB=-0.01;sumGLbyD=17.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,48:83:99:1507,0,1133 6818-ref 465 . G A 53.36 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=13.34;SB=-0.01;sumGLbyD=20.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24.95:83,0,25 6818-ref 471 . C A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 6853-ref 104 . G C 2104.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.82;MQ0=0;QD=37.58;SB=-0.01;sumGLbyD=38.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:55:99:2138,166,0 6853-ref 403 . G A 3201.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.1789;MQ=30.00;MQ0=0;QD=29.37;SB=-0.01;sumGLbyD=29.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,108:104:99:3234,285,0 6853-ref 1012 . C G 1636.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9328;MQ=36.74;MQ0=0;QD=38.07;SB=-0.01;sumGLbyD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1670,129,0 6853-ref 1027 . T G 109.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.04;MQ0=0;QD=27.49;SB=-0.01;sumGLbyD=35.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:142,12,0 6853-ref 1083 . G A 933.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.33;SB=-0.01;sumGLbyD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:27:43.46:966,43,0 6853-ref 1086 . A T 1263.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.15;SB=-0.01;sumGLbyD=35.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:36:68.32:1296,68,0 6853-ref 1158 . T C 2338.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.3013;MQ=31.16;MQ0=0;QD=32.93;SB=-0.01;sumGLbyD=33.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:70:99:2371,210,0 6853-ref 1161 . G A 2060.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.3013;MQ=30.34;MQ0=0;QD=32.71;SB=-0.01;sumGLbyD=33.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2094,189,0 6853-ref 1168 . G A 1596.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=29.24;MQ0=0;QD=29.02;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:50:99:1629,150,0 6853-ref 1182 . T C 1092.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=28.75;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1126,114,0 6853-ref 1202 . A G 890.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.29;MQ0=0;QD=31.80;SB=-0.01;sumGLbyD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.20:923,84,0 6853-ref 1213 . G C 892.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.29;MQ0=0;QD=31.86;SB=-0.01;sumGLbyD=33.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.20:925,84,0 6853-ref 1228 . A G 900.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.29;MQ0=0;QD=32.16;SB=-0.01;sumGLbyD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.20:933,84,0 6853-ref 1262 . T A 64.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=7.9624;MQ=28.11;MQ0=0;QD=7.16;SB=-0.01;sumGLbyD=10.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:9:94.44:94,0,105 6896-ref 17 . A G 22.02 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.15;SB=-0.01;sumGLbyD=7.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51.98:52,0,177 6896-ref 143 . T A 722.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.01;SB=-0.01;sumGLbyD=39.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.19:755,57,0 6896-ref 194 . C T 638.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.55;SB=-0.01;sumGLbyD=39.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:671,51,0 6896-ref 207 . G C 575.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:608,48,0 6896-ref 347 . A T 48.21 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.82;SB=-0.01;sumGLbyD=7.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:78.21:78,0,245 6896-ref 510 . A T 12.73 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.16;SB=-0.01;sumGLbyD=3.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:42.48:42,0,327 6896-ref 609 . A T 22.09 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.45;SB=-0.01;sumGLbyD=5.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:8:52.06:52,0,209 6896-ref 728 . A G 81.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.01;SB=-0.01;sumGLbyD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:113,9,0 6896-ref 729 . A T 75.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.08;SB=-0.01;sumGLbyD=35.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:107,9,0 6896-ref 730 . G T 28.43 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.21;SB=-0.01;sumGLbyD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 6927-ref 63 . T A 432.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.5774;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:465,36,0 6927-ref 169 . T A 51.41 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9377;MQ=33.16;MQ0=0;QD=5.71;SB=-0.01;sumGLbyD=9.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:8:81.41:81,0,153 6927-ref 187 . A G 12.78 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8652;MQ=32.65;MQ0=0;QD=1.60;SB=-0.01;sumGLbyD=5.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:42.54:43,0,191 6927-ref 339 . C T 1272.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=36.06;MQ0=0;QD=37.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1306,102,0 6927-ref 372 . G C 341.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=36.30;MQ0=0;QD=11.77;SB=-0.01;sumGLbyD=12.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,12:29:99:371,0,581 6927-ref 380 . C G 566.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=35.72;MQ0=0;QD=35.40;SB=-0.01;sumGLbyD=37.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.13:599,48,0 6927-ref 386 . C T 100.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=25.11;SB=-0.01;sumGLbyD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:133,12,0 6927-ref 423 . T C 30.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.3460;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.25;SB=-0.01;sumGLbyD=20.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6:62,6,0 6927-ref 460 . G A 371.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=33.73;SB=-0.01;sumGLbyD=36.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:404,33,0 6927-ref 505 . G C 36.18 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.09;SB=-0.01;sumGLbyD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:67,6,0 6927-ref 506 . G C 25.87 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=8.62;SB=-0.01;sumGLbyD=18.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28.77:56,0,29 6927-ref 524 . G C 572.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4685;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.78;SB=-0.01;sumGLbyD=37.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:605,48,0 6927-ref 574 . T C 733.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.1612;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.29;SB=-0.01;sumGLbyD=16.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,23:44:99:763,0,699 6927-ref 629 . C G 694 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=36.15;MQ0=0;QD=28.92;SB=-0.01;sumGLbyD=30.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:24:57.17:727,57,0 6927-ref 669 . G A 769.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=36.62;SB=-0.01;sumGLbyD=38.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.19:802,63,0 6927-ref 737 . C T 800.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8648;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.34;SB=-0.01;sumGLbyD=34.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:32.19:833,32,0 6927-ref 856 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6927-ref 859 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6941-ref 249 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6941-ref 307 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6944-ref 72 . T G 202.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 6944-ref 207 . A G 315.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=35.11;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:349,27,0 6944-ref 225 . C T 156.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.24;SB=-0.01;sumGLbyD=37.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:189,15,0 6944-ref 239 . T A 34.03 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.34;SB=-0.01;sumGLbyD=21.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:64,0,31 6944-ref 398 . G A 215.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=30.85;SB=-0.01;sumGLbyD=35.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:249,21,0 6944-ref 425 . T C 344.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=37.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:377,30,0 6944-ref 428 . A T 135.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=9.70;SB=-0.01;sumGLbyD=11.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:166,0,265 6944-ref 448 . A G 498.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.63;SB=-0.01;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:532,42,0 6944-ref 500 . T A 484.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.60;SB=-0.01;sumGLbyD=36.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.12:517,42,0 6944-ref 506 . A C 285.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:319,24,0 6985-ref 123 . C G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 6985-ref 134 . A G 28.98 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=14.49;SB=-0.01;sumGLbyD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:60,6,0 6985-ref 377 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 6985-ref 429 . G T 98.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.74;SB=-0.01;sumGLbyD=25.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.97:129,0,25 6985-ref 470 . T G 316.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=35.19;SB=-0.01;sumGLbyD=38.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:350,27,0 6985-ref 502 . G A 183.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=30.61;SB=-0.01;sumGLbyD=36.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:217,18,0 6985-ref 574 . G C 40.31 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.16;SB=-0.01;sumGLbyD=36.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:72,6,0 6985-ref 586 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7036-ref 36 . G A 204.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.05;SB=-0.01;sumGLbyD=39.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:237,18,0 7036-ref 118 . A T 706.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.65;SB=-0.01;sumGLbyD=35.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.13:740,63,0 7036-ref 172 . T C 874.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.43;SB=-0.01;sumGLbyD=37.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.21:907,72,0 7036-ref 333 . G A 238.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.78;SB=-0.01;sumGLbyD=33.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.07:271,21,0 7036-ref 340 . G A 180.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.58;SB=-0.01;sumGLbyD=26.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:6:18.04:214,18,0 7036-ref 515 . G A 896.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.23:930,72,0 7036-ref 583 . T A 1001.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.25:1034,81,0 7036-ref 710 . C G 758.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.60;SB=-0.01;sumGLbyD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:23:33.06:791,33,0 7036-ref 765 . A G 961.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.35;SB=-0.01;sumGLbyD=35.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:26:78.25:995,78,0 7036-ref 804 . C T 1215.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.70;MQ0=0;QD=35.75;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:33:99:1249,99,0 7036-ref 873 . G T 874.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.63;SB=-0.01;sumGLbyD=34.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:24:72.22:907,72,0 7036-ref 975 . C T 415.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.66;SB=-0.01;sumGLbyD=37.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:449,36,0 7036-ref 1005 . G A 174.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=29.06;SB=-0.01;sumGLbyD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:207,18,0 7036-ref 1011 . T G 204.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=29.27;SB=-0.01;sumGLbyD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:238,21,0 7036-ref 1023 . T A 223.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=27.92;SB=-0.01;sumGLbyD=32.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:256,24,0 7036-ref 1038 . C T 148.10 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.51;SB=-0.01;sumGLbyD=22.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:7:15.94:178,0,16 7036-ref 1053 . C T 449.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8318;MQ=34.93;MQ0=0;QD=29.97;SB=-0.01;sumGLbyD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:5.81:481,6,0 7036-ref 1146 . G T 565.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:599,45,0 7036-ref 1191 . T G 304.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.45;SB=-0.01;sumGLbyD=25.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:73.94:335,0,74 7036-ref 1216 . G A 179.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.61;SB=-0.01;sumGLbyD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18.94:209,0,19 7036-ref 1267 . T G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 7036-ref 1270 . T A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 7036-ref 1303 . T C 36.57 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.19;SB=-0.01;sumGLbyD=22.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:67,0,31 7036-ref 1314 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7036-ref 1334 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7036-ref 1346 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7064-ref 304 . C T 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 7064-ref 478 . T C 77.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.50;SB=-0.01;sumGLbyD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:108,0,28 7064-ref 491 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.00;SB=-0.01;sumGLbyD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:3:9.03:120,9,0 7064-ref 510 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 7064-ref 595 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7141-ref 82 . G A 44.89 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 7141-ref 154 . G A 69.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.05;SB=-0.01;sumGLbyD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:101,9,0 7141-ref 159 . C A 76.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.39;SB=-0.01;sumGLbyD=36.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 7141-ref 201 . T A 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 7141-ref 225 . C T 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 7141-ref 230 . T A 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 7141-ref 277 . C G 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=23.43;SB=-0.01;sumGLbyD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.04:150,12,0 7275-ref 32 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7275-ref 91 . T C 514.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.74;SB=-237.80;sumGLbyD=39.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:547,42,0 7275-ref 114 . C T 522.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=6;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.33;SB=-236.98;sumGLbyD=39.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:556,42,0 7275-ref 145 . C G 24.97 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=8.32;SB=-0.01;sumGLbyD=18.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:55,0,31 7275-ref 146 . A G 65.12 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8643;MQ=34.93;MQ0=0;QD=13.02;SB=-0.01;sumGLbyD=19.02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:4:27.97:95,0,28 7275-ref 305 . A C 2934.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.01;HRun=2;HaplotypeScore=9.3278;MQ=36.77;MQ0=0;QD=34.12;SB=-0.01;sumGLbyD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,82:83:99:2967,141,0 7275-ref 670 . 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T C 5485.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6553;MQ=36.93;MQ0=0;QD=38.63;SB=-0.01;sumGLbyD=38.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:141:99:5485,424,0 7289-ref 802 . C G 29.70 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.9940;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.75;SB=-0.01;sumGLbyD=3.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:59.69:60,0,469 7289-ref 809 . A T 36.24 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.08;SB=-0.01;sumGLbyD=22.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:66,0,31 7289-ref 849 . G T 1010.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.65;MQ0=0;QD=34.84;SB=-0.01;sumGLbyD=35.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:52.90:1043,53,0 7289-ref 1006 . T A 77.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.60;SB=-0.01;sumGLbyD=21.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:4:27.97:108,0,28 7289-ref 1111 . T A 14.37 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=2.87;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.20:44,0,102 7289-ref 1112 . C A 17.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.21:47,0,68 7289-ref 1114 . T A 17.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.22:47,0,61 7289-ref 1115 . G A 17.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.21:47,0,68 7375-ref 485 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7375-ref 754 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7401-ref 106 . T A 223.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.34;MQ0=0;QD=31.96;SB=-0.01;sumGLbyD=36.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:257,21,0 7401-ref 141 . T C 141.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.14;MQ0=0;QD=28.38;SB=-0.01;sumGLbyD=34.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:175,15,0 7401-ref 352 . T A 362.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.22;SB=-0.01;sumGLbyD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:12:30.10:396,30,0 7401-ref 537 . C A 155.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.19;SB=-0.01;sumGLbyD=37.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:189,15,0 7401-ref 664 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7427-ref 234 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7427-ref 236 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7429-ref 99 . A C 57.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=19.21;SB=-0.01;sumGLbyD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.01:90,9,0 7429-ref 103 . C T 94.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=23.54;SB=-29.17;sumGLbyD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:127,12,0 7429-ref 141 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 7429-ref 300 . T A 4167.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4592;MQ=36.63;MQ0=0;QD=36.55;SB=-29.63;sumGLbyD=35.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:4101,306,0 7429-ref 301 . C A 6967.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=214;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=4.8655;MQ=31.13;MQ0=0;QD=32.56;SB=-1855.43;sumGLbyD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,212:210:99:6935,628,0 7429-ref 363 . G A 11883.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=46.4627;MQ=26.72;MQ0=0;QD=11.88;SB=-107.36;sumGLbyD=8.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:490,496:962:99:8909,0,13669 7429-ref 375 . T G 1757.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=999;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=64.5448;MQ=25.03;MQ0=0;QD=1.76;SB=-287.63;sumGLbyD=1.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:849,147:992:99:1787,0,20531 7429-ref 440 . G A 266.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7997;MQ=25.06;MQ0=0;QD=19.05;SB=-0.01;sumGLbyD=21.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,11:10:30.05:300,30,0 7429-ref 441 . T C 231.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.6439;MQ=23.89;MQ0=0;QD=17.82;SB=-0.01;sumGLbyD=20.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,10:11:5.39:263,5,0 7429-ref 469 . A G 25917.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=45.0380;MQ=21.64;MQ0=0;QD=25.92;SB=-27.67;sumGLbyD=25.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,993:988:99:25772,2927,0 7491-ref 148 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7491-ref 172 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7491-ref 247 . C T 244.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.87;SB=-0.01;sumGLbyD=39.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:277,21,0 7491-ref 334 . T A 223.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.90;SB=-0.01;sumGLbyD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15.93:253,0,16 7491-ref 336 . C A 224.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.07;SB=-0.01;sumGLbyD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15.93:255,0,16 7491-ref 347 . C T 273.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.21;SB=-0.01;sumGLbyD=38.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:307,24,0 7491-ref 380 . C T 132.89 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.94;MQ0=0;QD=18.98;SB=-0.01;sumGLbyD=23.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:5.64:162,0,6 7491-ref 383 . T G 135.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=30.07;MQ0=0;QD=16.96;SB=-0.01;sumGLbyD=20.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:7:18.96:166,0,19 7491-ref 413 . G T 353.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.11;MQ0=0;QD=32.16;SB=-0.01;sumGLbyD=35.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:387,33,0 7491-ref 422 . A T 304.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=30.43;SB=-0.01;sumGLbyD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.06:337,30,0 7491-ref 479 . T C 412.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=34.60;MQ0=0;QD=31.76;SB=-0.01;sumGLbyD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:12:36.11:446,36,0 7491-ref 494 . T A 348.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.05;SB=-0.01;sumGLbyD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:7.45:380,7,0 7491-ref 530 . 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A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 7491-ref 1255 . T C 24.11 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=12.05;SB=-0.01;sumGLbyD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:55,6,0 7491-ref 1264 . C T 24.11 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=12.05;SB=-0.01;sumGLbyD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:55,6,0 7492-ref 492 . C T 1185.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.23;SB=-0.01;sumGLbyD=39.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.30:1218,93,0 7492-ref 657 . G A 2058.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.6348;MQ=36.65;MQ0=0;QD=36.12;SB=-0.01;sumGLbyD=36.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,55:56:99:2092,132,0 7492-ref 671 . 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A G 4465.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.4304;MQ=35.66;MQ0=0;QD=36.60;SB=-120.02;sumGLbyD=36.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:118:99:4465,355,0 7492-ref 1954 . C A 3808.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=107;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.2282;MQ=35.85;MQ0=0;QD=35.59;SB=-120.02;sumGLbyD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,102:105:99:3614,122,0 7492-ref 2054 . C G 3643.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.3972;MQ=35.77;MQ0=0;QD=36.44;SB=-38.58;sumGLbyD=35.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,98:99:99:3563,218,0 7492-ref 2071 . C G 2188.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=35.3745;MQ=35.57;MQ0=0;QD=25.45;SB=-0.01;sumGLbyD=25.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,62:73:99:2218,0,168 7492-ref 2073 . C A 153.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=80;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=11.1863;MQ=35.46;MQ0=0;QD=1.92;SB=-0.01;sumGLbyD=2.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,14:80:99:184,0,2276 7492-ref 2074 . A G 64.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=81;DS;Dels=0.01;HRun=1;HaplotypeScore=10.1869;MQ=35.48;MQ0=0;QD=0.79;SB=-0.01;sumGLbyD=1.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,11:78:94.17:94,0,2288 7492-ref 2274 . T C 272.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.02;SB=-0.01;sumGLbyD=38.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:305,24,0 7492-ref 2386 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7540-ref 321 . T C 1229.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5581;MQ=36.06;MQ0=0;QD=36.17;SB=-235.47;sumGLbyD=37.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1263,102,0 7540-ref 339 . T C 1045.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8941;MQ=36.27;MQ0=0;QD=37.34;SB=-239.35;sumGLbyD=38.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.26:1078,84,0 7540-ref 575 . 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A G 277.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.70;SB=-0.01;sumGLbyD=38.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:311,24,0 7555-ref 566 . G A 1006.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9992;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.93;SB=-0.01;sumGLbyD=37.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:48.15:1039,48,0 7555-ref 797 . G A 508.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.34;SB=-0.01;sumGLbyD=38.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:542,42,0 7555-ref 908 . C G 651.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9652;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.19;SB=-0.01;sumGLbyD=38.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:684,54,0 7555-ref 951 . G A 585.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.58;SB=-0.01;sumGLbyD=38.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:618,48,0 7555-ref 1037 . 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A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7686-ref 127 . G A 26860.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=48.5561;MQ=23.11;MQ0=0;QD=26.86;SB=-0.01;sumGLbyD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,992:974:99:26672,2783,0 7708-ref 93 . C G 270.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.55;SB=-0.01;sumGLbyD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:10:7.71:300,0,8 7708-ref 119 . C T 33.21 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.07;SB=-0.01;sumGLbyD=21.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:63,0,31 7708-ref 128 . G A 2501.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.17;MQ0=0;QD=28.43;SB=34.35;sumGLbyD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:88:99:2535,230,0 7708-ref 131 . G A 3483.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=27.98;MQ0=0;QD=30.83;SB=34.35;sumGLbyD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:113:99:3448,305,0 7708-ref 137 . C T 27684.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=826;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=30.8708;MQ=35.67;MQ0=0;QD=33.52;SB=-13236.58;sumGLbyD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,805:781:99:27514,2213,0 7708-ref 140 . C A 34749.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=63.8044;MQ=36.51;MQ0=0;QD=34.75;SB=-8953.15;sumGLbyD=33.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,974:963:99:33956,2534,0 7708-ref 415 . A G 36934.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=6.2710;MQ=36.16;MQ0=0;QD=36.93;SB=-0.01;sumGLbyD=36.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,991:973:99:36814,2892,0 7708-ref 422 . T C 36911.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=36.5405;MQ=36.80;MQ0=0;QD=36.91;SB=-0.01;sumGLbyD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,994:978:99:36880,2940,0 7708-ref 512 . G A 37196.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=43.5887;MQ=36.95;MQ0=0;QD=37.20;SB=-71.24;sumGLbyD=37.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,994:972:99:37165,2896,0 7708-ref 745 . C T 34930.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=66.7758;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.93;SB=-0.01;sumGLbyD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,979:972:99:34516,2639,0 7708-ref 792 . G A 36855.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.1321;MQ=36.71;MQ0=0;QD=36.86;SB=-0.01;sumGLbyD=36.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,996:968:99:36776,2871,0 7708-ref 796 . T G 35070.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=31.9523;MQ=36.81;MQ0=0;QD=35.07;SB=-0.01;sumGLbyD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,991:946:99:34977,2757,0 7708-ref 880 . T C 38058.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=67.7627;MQ=36.93;MQ0=0;QD=38.06;SB=-0.01;sumGLbyD=37.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,989:989:99:37738,2814,0 7708-ref 997 . C G 34281.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=37.5039;MQ=36.63;MQ0=0;QD=34.28;SB=-0.01;sumGLbyD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,988:935:99:34139,2705,0 7708-ref 1030 . A G 34222.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=57.4135;MQ=36.84;MQ0=0;QD=34.22;SB=-0.01;sumGLbyD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,992:933:99:34188,2804,0 7708-ref 1191 . T C 23820.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=642;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=71.9307;MQ=36.92;MQ0=0;QD=37.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,639:626:99:23765,1878,0 7761-ref 553 . T C 69.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.87;SB=-0.01;sumGLbyD=19.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:51.81:99,0,52 7761-ref 617 . G A 275.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:308,24,0 7767-ref 628 . T A 442.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.86;SB=-0.01;sumGLbyD=39.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:475,36,0 7767-ref 679 . C A 124.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:157,12,0 7777-ref 375 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7860-ref 181 . C G 83.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 7860-ref 294 . C T 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.82;SB=-0.01;sumGLbyD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.03:119,9,0 7860-ref 352 . A G 233 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.12;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.07:266,21,0 7860-ref 370 . A C 244.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.53;SB=-0.01;sumGLbyD=34.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:7:21.07:277,21,0 7860-ref 483 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 7860-ref 506 . T A 45.91 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.96;SB=-0.01;sumGLbyD=39.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:77,6,0 7860-ref 573 . A C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 7860-ref 574 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 8030-ref 137 . C A 1483.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.9973;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.05;SB=-0.01;sumGLbyD=38.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1517,117,0 8030-ref 165 . C T 872.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.57;SB=-0.01;sumGLbyD=34.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:25:75.21:906,75,0 8030-ref 530 . C G 1213.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=23.05;MQ0=0;QD=26.97;SB=-0.01;sumGLbyD=27.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1247,135,0 8030-ref 626 . T C 573.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4440;MQ=36.40;MQ0=0;QD=10.83;SB=-0.01;sumGLbyD=11.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:52:99:604,0,1113 8030-ref 684 . C T 631.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.6777;MQ=36.60;MQ0=0;QD=12.62;SB=-0.01;sumGLbyD=13.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,21:50:99:661,0,973 8030-ref 689 . G A 598.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.6981;MQ=36.56;MQ0=0;QD=13.02;SB=-0.01;sumGLbyD=13.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:629,0,860 8030-ref 779 . C T 424.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.48;MQ0=0;QD=26.55;SB=-0.01;sumGLbyD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.06:458,48,0 8030-ref 856 . A G 599.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=31.39;MQ0=0;QD=13.03;SB=-110.99;sumGLbyD=13.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,20:46:99:629,0,651 8030-ref 901 . G A 226.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.95;MQ0=0;QD=25.12;SB=-0.01;sumGLbyD=28.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.03:259,27,0 8030-ref 909 . A G 10.71 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=2.14;SB=-0.01;sumGLbyD=8.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:40.31:40,0,68 8095-ref 193 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 8095-ref 337 . A T 75.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.13;SB=-0.01;sumGLbyD=35.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:107,9,0 8095-ref 338 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=16.26;SB=-0.01;sumGLbyD=26.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6.02:80,6,0 8095-ref 361 . C A 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 8095-ref 467 . G C 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=16.80;SB=-0.01;sumGLbyD=24.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.02:99,9,0 8095-ref 483 . C T 125.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=25.15;SB=-0.01;sumGLbyD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:158,15,0 8095-ref 490 . A G 125.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=25.15;SB=-0.01;sumGLbyD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:158,15,0 8095-ref 505 . T A 193.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.94;MQ0=0;QD=27.68;SB=-0.01;sumGLbyD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:227,21,0 8095-ref 533 . T G 400.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=33.41;SB=-0.01;sumGLbyD=36.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.10:434,36,0 8095-ref 558 . G T 418.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=34.83;SB=-0.01;sumGLbyD=37.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:451,36,0 8095-ref 662 . G A 235.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.61;SB=-0.01;sumGLbyD=38.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:268,21,0 8095-ref 689 . A C 274.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.31;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:307,24,0 8095-ref 755 . T C 242.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.62;SB=-0.01;sumGLbyD=39.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:275,21,0 8095-ref 756 . T G 233.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.41;SB=-0.01;sumGLbyD=38.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:267,21,0 8095-ref 852 . C T 511.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.09;SB=-0.01;sumGLbyD=36.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.13:544,42,0 8095-ref 876 . A G 559.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:593,45,0 8095-ref 910 . G A 126.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.22;SB=-0.01;sumGLbyD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.04:159,12,0 8095-ref 940 . T C 311.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.65;SB=-0.01;sumGLbyD=38.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:345,27,0 8095-ref 1015 . G C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 8095-ref 1018 . C T 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28.77:71,0,29 8095-ref 1050 . A T 38.36 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=7;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.18;SB=-0.01;sumGLbyD=35.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 8095-ref 1141 . A G 313.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.78;SB=-0.01;sumGLbyD=38.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:346,27,0 8095-ref 1176 . T A 477.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:510,39,0 8095-ref 1218 . A T 390.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=32.51;SB=-0.01;sumGLbyD=35.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:11:33.10:423,33,0 8095-ref 1219 . A T 424.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.36;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:457,36,0 8095-ref 1367 . C A 630.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4095;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:664,51,0 8095-ref 1383 . G A 494.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.78;MQ0=0;QD=35.32;SB=-0.01;sumGLbyD=37.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:528,42,0 8095-ref 1438 . A G 510.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=30.83;MQ0=0;QD=31.91;SB=-0.01;sumGLbyD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.12:544,48,0 8095-ref 1444 . C G 501.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.07;MQ0=0;QD=31.32;SB=-0.01;sumGLbyD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.11:534,48,0 8095-ref 1488 . A G 294.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.12;MQ0=0;QD=29.44;SB=-0.01;sumGLbyD=32.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:327,30,0 8095-ref 1492 . T C 329.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.93;MQ0=0;QD=29.98;SB=-0.01;sumGLbyD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.08:363,33,0 8095-ref 1501 . A C 95.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.91;MQ0=0;QD=10.62;SB=-0.01;sumGLbyD=13.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:8:99:126,0,105 8095-ref 1585 . T A 152.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.43;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:185,15,0 8095-ref 1604 . T G 103.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=20.78;SB=-0.01;sumGLbyD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:21.93:134,0,22 8095-ref 1680 . T A 126.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 8095-ref 1705 . T G 122.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.69;SB=-0.01;sumGLbyD=38.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:155,12,0 8132-ref 103 . A T 679.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.73;SB=-0.01;sumGLbyD=39.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.18:712,54,0 8132-ref 122 . G T 638.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.54;SB=-0.01;sumGLbyD=39.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:671,51,0 8132-ref 185 . C T 236.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.79;SB=-0.01;sumGLbyD=38.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:269,21,0 8132-ref 430 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 8132-ref 454 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 8158-ref 15 . G A 56.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.54;MQ0=0;QD=5.18;SB=6.01;sumGLbyD=7.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:86.94:87,0,238 8158-ref 122 . A G 326.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.4595;MQ=24.83;MQ0=0;QD=8.82;SB=-0.01;sumGLbyD=9.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,16:36:99:356,0,442 8158-ref 132 . A T 393.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.4569;MQ=25.28;MQ0=0;QD=10.64;SB=-0.01;sumGLbyD=11.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,19:37:99:424,0,436 8158-ref 415 . 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A G 914.84 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9999;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.79;SB=-74.00;sumGLbyD=21.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,28:43:99:945,0,464 8189-ref 167 . C G 963.76 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9999;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.90;SB=-74.00;sumGLbyD=22.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,29:42:99:994,0,425 8189-ref 201 . A C 591.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=91;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.6198;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.50;SB=-74.13;sumGLbyD=6.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,23:91:99:622,0,2406 8189-ref 227 . A T 3137.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=224;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.4540;MQ=36.10;MQ0=0;QD=14.01;SB=-550.33;sumGLbyD=14.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,103:217:99:3168,0,3509 8189-ref 229 . A G 4913.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=253;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=13.1545;MQ=36.21;MQ0=0;QD=19.42;SB=-1043.42;sumGLbyD=16.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:119,134:247:99:4170,0,3640 8189-ref 263 . T C 2316.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=311;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=17.5281;MQ=36.36;MQ0=0;QD=7.45;SB=-571.26;sumGLbyD=7.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:222,88:304:99:2347,0,7548 8189-ref 264 . C G 2320.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=307;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=16.5348;MQ=36.35;MQ0=0;QD=7.56;SB=-548.69;sumGLbyD=7.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:219,87:301:99:2351,0,7487 8189-ref 321 . A T 482.10 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.37;SB=-108.50;sumGLbyD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:48.47:512,0,48 8189-ref 322 . T A 92.04 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.15;SB=3.00;sumGLbyD=17.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:85.90:122,0,86 8189-ref 358 . G A 480.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.81;MQ0=0;QD=26.72;SB=-0.01;sumGLbyD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:17:51.10:514,51,0 8189-ref 367 . C T 83.24 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.16;MQ0=0;QD=2.69;SB=48.08;sumGLbyD=3.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,7:30:99:113,0,648 8189-ref 386 . C T 1111.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.31;MQ0=0;QD=31.74;SB=-541.38;sumGLbyD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1144,105,0 8189-ref 389 . T G 1281.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=29.95;MQ0=0;QD=31.26;SB=-629.77;sumGLbyD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:40:99:1315,120,0 8189-ref 391 . T C 1466.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9658;MQ=31.08;MQ0=0;QD=30.55;SB=-605.99;sumGLbyD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:47:99:1499,104,0 8189-ref 454 . G C 9052.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=345;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.7994;MQ=34.47;MQ0=0;QD=26.24;SB=-74.00;sumGLbyD=23.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:105,238:341:99:8024,0,2546 8189-ref 466 . A G 2044.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=385;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.0968;MQ=34.76;MQ0=0;QD=5.31;SB=-0.01;sumGLbyD=5.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:287,98:376:99:2075,0,9641 8189-ref 467 . C G 13667.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=376;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.0772;MQ=34.71;MQ0=0;QD=36.35;SB=-0.01;sumGLbyD=36.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,376:372:99:13665,1119,0 8189-ref 485 . A C 13080.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=360;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.8201;MQ=34.63;MQ0=0;QD=36.33;SB=-0.01;sumGLbyD=36.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,359:356:99:13039,1032,0 8189-ref 501 . A T 1880.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=293;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=6.1353;MQ=34.84;MQ0=0;QD=6.42;SB=-0.01;sumGLbyD=6.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:211,82:292:99:1910,0,7110 8189-ref 550 . A T 355.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=156;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.6947;MQ=36.61;MQ0=0;QD=2.28;SB=-0.01;sumGLbyD=2.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:132,24:156:99:385,0,4686 8189-ref 554 . T A 202.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=146;DS;Dels=0.02;HRun=1;HaplotypeScore=18.1635;MQ=36.65;MQ0=0;QD=1.39;SB=-0.01;sumGLbyD=1.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,17:143:99:233,0,4401 8189-ref 561 . A C 901.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=166;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=15.6889;MQ=36.82;MQ0=0;QD=5.43;SB=-0.01;sumGLbyD=5.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,39:160:99:931,0,4324 8189-ref 600 . G A 5517.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;DS;Dels=0.01;HRun=0;HaplotypeScore=6.4613;MQ=36.79;MQ0=0;QD=38.31;SB=-0.01;sumGLbyD=38.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:142:99:5517,427,0 8189-ref 640 . A G 1830.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9328;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.61;SB=-0.01;sumGLbyD=37.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1863,150,0 8189-ref 644 . A T 441.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.99;SB=-0.01;sumGLbyD=36.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:475,39,0 8189-ref 697 . T G 9577.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=252;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.3402;MQ=36.96;MQ0=0;QD=38.01;SB=-2315.42;sumGLbyD=38.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,252:248:99:9577,746,0 8189-ref 700 . T C 1820.81 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=267;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.7083;MQ=36.96;MQ0=0;QD=6.82;SB=-537.10;sumGLbyD=6.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:199,68:263:99:1851,0,6735 8189-ref 787 . G A 91.39 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.60;MQ0=0;QD=2.77;SB=6.01;sumGLbyD=3.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:33:99:121,0,932 8189-ref 799 . A C 917.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.30;SB=-80.02;sumGLbyD=36.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:39.68:951,40,0 8189-ref 800 . C T 912.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.64;MQ0=0;QD=32.61;SB=-77.97;sumGLbyD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:9.01:945,9,0 8189-ref 811 . 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C T 960.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.90;MQ0=0;QD=28.24;SB=-168.89;sumGLbyD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:66.96:993,67,0 8189-ref 999 . T C 1400.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=28.31;MQ0=0;QD=23.73;SB=-73.84;sumGLbyD=24.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,52:59:99:1430,0,100 8189-ref 1007 . T C 1570.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9736;MQ=28.61;MQ0=0;QD=31.41;SB=-139.26;sumGLbyD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1604,150,0 8189-ref 1014 . C G 823.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9683;MQ=29.66;MQ0=0;QD=21.66;SB=-20.60;sumGLbyD=22.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,32:36:99:853,0,130 8189-ref 1043 . T G 307 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9983;MQ=26.80;MQ0=0;QD=19.19;SB=3.01;sumGLbyD=21.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:53.08:337,0,53 8294-ref 1 . 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G T 13.51 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.81;MQ0=0;QD=3.38;SB=-0.01;sumGLbyD=10.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:43.31:43,0,54 8318-ref 77 . C T 297.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.1188;MQ=33.70;MQ0=0;QD=16.52;SB=-0.01;sumGLbyD=18.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:15:64.11:327,0,64 8318-ref 119 . G C 458.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.3076;MQ=26.12;MQ0=0;QD=8.35;SB=-46.36;sumGLbyD=8.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,23:55:99:489,0,767 8318-ref 139 . G T 1199.87 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8494;MQ=25.83;MQ0=0;QD=19.67;SB=-46.36;sumGLbyD=20.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,53:58:61.17:1230,0,61 8318-ref 182 . A G 257.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.7266;MQ=26.51;MQ0=0;QD=8.89;SB=3.00;sumGLbyD=9.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:288,0,376 8318-ref 389 . T A 396.88 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.8799;MQ=36.37;MQ0=0;QD=8.27;SB=-0.01;sumGLbyD=8.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:46:99:427,0,1032 8318-ref 544 . G C 232.62 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=140;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=14.8380;MQ=33.18;MQ0=0;QD=1.66;SB=-0.01;sumGLbyD=1.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:117,22:131:99:263,0,3507 8318-ref 614 . C T 4777.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.4083;MQ=36.34;MQ0=0;QD=37.92;SB=-39.32;sumGLbyD=37.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,125:125:99:4737,336,0 8318-ref 658 . G A 16.48 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.9573;MQ=35.67;MQ0=0;QD=0.69;SB=-0.01;sumGLbyD=1.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:46.37:46,0,708 8318-ref 808 . C G 710.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=100;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.1314;MQ=23.60;MQ0=0;QD=7.11;SB=-0.01;sumGLbyD=7.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,38:98:99:741,0,1407 8318-ref 846 . G T 827.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=3.9326;MQ=24.83;MQ0=0;QD=25.86;SB=-0.01;sumGLbyD=26.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:30:90.11:860,90,0 8318-ref 1036 . G C 438.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.71;MQ0=0;QD=24.34;SB=-0.01;sumGLbyD=26.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:16:48.07:471,48,0 8318-ref 1076 . G T 257.81 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6988;MQ=31.56;MQ0=0;QD=19.83;SB=-0.01;sumGLbyD=22.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:72.93:288,0,73 8318-ref 1083 . A T 259.10 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6988;MQ=31.56;MQ0=0;QD=19.93;SB=-0.01;sumGLbyD=22.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:33.53:289,0,34 8328-ref 307 . G C 275.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.58;SB=-0.01;sumGLbyD=34.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:9:24.08:308,24,0 8328-ref 316 . A G 394.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.86;SB=-0.01;sumGLbyD=38.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:427,33,0 8328-ref 339 . A G 191.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=35.87;MQ0=0;QD=10.62;SB=-0.01;sumGLbyD=12.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:221,0,354 8328-ref 351 . A G 476.04 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7884;MQ=36.07;MQ0=0;QD=21.64;SB=-0.01;sumGLbyD=23.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,15:22:99:506,0,209 8328-ref 388 . G C 551.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.26;MQ0=0;QD=32.44;SB=-0.01;sumGLbyD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.14:585,48,0 8328-ref 415 . G C 300.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=25.07;SB=-0.01;sumGLbyD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:3.92:330,0,4 8328-ref 431 . G C 178.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=25.55;SB=-0.01;sumGLbyD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.03:212,21,0 8328-ref 445 . T C 46.95 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=9.39;SB=-0.01;sumGLbyD=15.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:4:13.67:77,0,14 8328-ref 456 . G C 24.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=12.04;SB=-0.01;sumGLbyD=28.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 8328-ref 487 . A G 45.74 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:77,6,0 8328-ref 511 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 8328-ref 512 . C G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 8403-ref 30 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 8403-ref 36 . C T 227.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=32.54;SB=-0.01;sumGLbyD=37.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:261,21,0 8403-ref 63 . A T 1255.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.83;MQ0=0;QD=35.88;SB=-0.01;sumGLbyD=36.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:34:99:1289,102,0 8403-ref 119 . C G 16952.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=450;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.7143;MQ=36.46;MQ0=0;QD=37.67;SB=-0.01;sumGLbyD=37.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,447:441:99:16951,1327,0 8403-ref 125 . A G 19808.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=539;DS;Dels=0.02;HRun=0;HaplotypeScore=44.2125;MQ=36.47;MQ0=0;QD=36.75;SB=-0.01;sumGLbyD=36.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,528:524:99:19731,1534,0 8403-ref 191 . C T 36754.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=54.5398;MQ=36.73;MQ0=0;QD=36.75;SB=-0.01;sumGLbyD=36.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,999:984:99:36711,2921,0 8403-ref 232 . A G 35383.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=962;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=39.3207;MQ=35.33;MQ0=0;QD=36.78;SB=-0.01;sumGLbyD=36.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,957:949:99:35240,2743,0 8403-ref 285 . G A 16820.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=489;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=12.9447;MQ=31.95;MQ0=0;QD=34.40;SB=-0.01;sumGLbyD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,487:486:99:16789,1434,0 8403-ref 298 . G C 12842.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=386;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=16.2035;MQ=30.55;MQ0=0;QD=33.27;SB=-0.01;sumGLbyD=33.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,385:385:99:12803,1122,0 8403-ref 300 . C G 12122.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=366;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=17.8257;MQ=30.33;MQ0=0;QD=33.12;SB=-0.01;sumGLbyD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,365:364:99:12079,1055,0 8403-ref 316 . C G 2250.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=106;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.5539;MQ=26.08;MQ0=0;QD=21.23;SB=-0.01;sumGLbyD=21.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,88:101:79:2281,0,79 8403-ref 352 . G T 3761.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.69;MQ0=0;QD=38.38;SB=-1469.32;sumGLbyD=38.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:97:99:3761,292,0 8403-ref 355 . A G 6643.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.0124;MQ=36.83;MQ0=0;QD=37.53;SB=-2349.51;sumGLbyD=37.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,176:172:99:6615,515,0 8403-ref 442 . A G 37572.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=63.5248;MQ=36.90;MQ0=0;QD=37.57;SB=-0.01;sumGLbyD=37.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,995:985:99:37440,2920,0 8403-ref 535 . 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C A 1625.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=25.01;SB=-0.01;sumGLbyD=25.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:62:99:1659,159,0 8826-ref 192 . G A 2368.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=26.32;SB=-0.01;sumGLbyD=26.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,89:89:99:2402,240,0 8826-ref 274 . G A 9012.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=271;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=15.9394;MQ=32.36;MQ0=0;QD=33.26;SB=-0.01;sumGLbyD=32.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,265:265:99:8852,638,0 8826-ref 396 . G C 8236.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=218;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.8941;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.78;SB=-0.01;sumGLbyD=37.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,217:212:99:8196,635,0 8826-ref 504 . C T 5838.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=156;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=10.5972;MQ=35.95;MQ0=0;QD=37.43;SB=-0.01;sumGLbyD=36.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,152:154:99:5751,429,0 8826-ref 525 . A C 5387.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.4864;MQ=35.95;MQ0=0;QD=36.90;SB=-0.01;sumGLbyD=36.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:142:99:5320,421,0 8826-ref 550 . C T 4943.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=133;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.7379;MQ=36.00;MQ0=0;QD=37.17;SB=-0.01;sumGLbyD=37.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,133:130:99:4943,391,0 8826-ref 660 . G T 1012.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.49;SB=-0.01;sumGLbyD=38.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.26:1045,81,0 8983-ref 84 . C T 11.90 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.07;MQ0=0;QD=1.08;SB=-0.01;sumGLbyD=3.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:41.60:42,0,317 8983-ref 98 . G T 355.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.60;SB=-0.01;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:389,30,0 8983-ref 177 . C T 349.84 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.44;SB=-0.01;sumGLbyD=21.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:380,0,226 8983-ref 301 . T C 114.40 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.17;SB=-0.01;sumGLbyD=10.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:144,0,279 8983-ref 384 . C T 100.70 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.39;SB=-0.01;sumGLbyD=18.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:95.07:131,0,95 8983-ref 485 . T A 102.40 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=20.48;SB=-0.01;sumGLbyD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.96:132,0,25 8983-ref 494 . A G 27.53 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9996;MQ=35.53;MQ0=0;QD=3.93;SB=-0.01;sumGLbyD=8.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57.52:58,0,166 8983-ref 500 . G A 185.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=35.28;MQ0=0;QD=30.91;SB=-0.01;sumGLbyD=36.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:218,18,0 8983-ref 577 . T G 151.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.49;SB=-0.01;sumGLbyD=11.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:182,0,339 8983-ref 655 . A G 353.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.32;SB=-0.01;sumGLbyD=38.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:386,30,0 8983-ref 738 . C T 174.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:207,18,0 8983-ref 765 . T C 215.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=30.85;SB=-0.01;sumGLbyD=35.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:249,21,0 8983-ref 766 . C T 289.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=32.20;SB=-0.01;sumGLbyD=35.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:323,27,0 8983-ref 783 . G T 42.18 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=6;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=4.69;SB=-0.01;sumGLbyD=8.02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:72.17:72,0,211 8983-ref 973 . C T 322.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.83;SB=-0.01;sumGLbyD=39.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:355,27,0 8983-ref 1095 . A T 24.55 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.51;SB=-0.01;sumGLbyD=7.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54.52:55,0,177 8983-ref 1219 . A C 505.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.12;SB=-0.01;sumGLbyD=38.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:539,42,0 9022-ref 117 . T C 372.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.82;SB=-0.01;sumGLbyD=36.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:405,33,0 9022-ref 170 . T G 466.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.86;SB=-0.01;sumGLbyD=38.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:499,39,0 9022-ref 287 . A G 504.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=36.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:537,42,0 9022-ref 316 . T C 465.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9987;MQ=36.22;MQ0=0;QD=35.83;SB=-0.01;sumGLbyD=38.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:499,39,0 9022-ref 441 . G A 319.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.52;SB=-0.01;sumGLbyD=39.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:353,27,0 9114-ref 22 . T G 321.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.74;SB=-0.01;sumGLbyD=39.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:355,27,0 9114-ref 100 . T C 684.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.02;SB=-40.01;sumGLbyD=39.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.18:717,54,0 9114-ref 194 . C T 1596.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.69;MQ0=0;QD=38.00;SB=-0.01;sumGLbyD=38.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1629,126,0 9114-ref 226 . G A 985.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.91;SB=-0.01;sumGLbyD=39.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.24:1019,78,0 9114-ref 280 . T G 317.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=20.40;MQ0=0;QD=22.68;SB=-74.06;sumGLbyD=25.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:41.95:351,42,0 9133-ref 64 . 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G A 1605.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.49;SB=-0.01;sumGLbyD=37.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:43:99:1639,129,0 9133-ref 517 . A G 2053.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.74;SB=-0.01;sumGLbyD=39.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2086,160,0 9133-ref 597 . A G 2170 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.41;SB=-0.01;sumGLbyD=37.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:58:99:2203,172,0 9133-ref 616 . G A 1672.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.02;SB=-0.01;sumGLbyD=38.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1706,132,0 9133-ref 724 . A G 983.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7719;MQ=35.16;MQ0=0;QD=35.12;SB=-0.01;sumGLbyD=36.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.24:1016,81,0 9133-ref 736 . T C 987.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9825;MQ=35.09;MQ0=0;QD=36.58;SB=-0.01;sumGLbyD=37.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.24:1021,81,0 9183-ref 298 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 9183-ref 299 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 9183-ref 336 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 9224-ref 83 . G T 232.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.22;SB=-37.00;sumGLbyD=13.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:262,0,369 9224-ref 223 . T G 518.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.06;SB=-0.01;sumGLbyD=39.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:552,42,0 9224-ref 311 . A G 314.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.45;SB=-0.01;sumGLbyD=24.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:344,0,118 9224-ref 312 . A G 654.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.37;SB=-0.01;sumGLbyD=38.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:688,54,0 9224-ref 617 . T G 765.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=4.4569;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.27;SB=-0.01;sumGLbyD=22.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,23:36:99:796,0,397 9224-ref 734 . C T 160.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.2032;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.17;SB=-0.01;sumGLbyD=7.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:24:99:190,0,555 9224-ref 812 . C G 765.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:798,63,0 9224-ref 826 . A G 746.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.95;SB=-0.01;sumGLbyD=35.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:31.85:780,32,0 9224-ref 982 . G T 1013.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9990;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.96;SB=-0.01;sumGLbyD=36.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:51.12:1047,51,0 9224-ref 989 . A G 1044.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.83;SB=-0.01;sumGLbyD=35.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:50.28:1078,50,0 9224-ref 1072 . G A 780.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.18;SB=-0.01;sumGLbyD=38.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:814,63,0 9224-ref 1205 . G C 474.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.46;SB=-0.01;sumGLbyD=39.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:507,39,0 9339-ref 28 . T C 101.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.21;SB=-0.01;sumGLbyD=26.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:22.75:131,0,23 9339-ref 109 . G T 3526.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.0038;MQ=36.58;MQ0=0;QD=36.73;SB=-0.01;sumGLbyD=36.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,94:93:99:3491,277,0 9339-ref 133 . A G 1834.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9929;MQ=36.37;MQ0=0;QD=28.66;SB=-0.01;sumGLbyD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,53:64:99:1865,0,237 9339-ref 136 . G A 209.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=60;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9929;MQ=36.32;MQ0=0;QD=3.50;SB=-0.01;sumGLbyD=4.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,11:60:99:240,0,1716 9339-ref 179 . A C 14 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=2.00;SB=-0.01;sumGLbyD=6.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:43.82:44,0,167 9339-ref 248 . T A 1572.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.2032;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1605,123,0 9339-ref 381 . A C 973.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.59;MQ0=0;QD=34.76;SB=-0.01;sumGLbyD=35.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:26:78.24:1006,78,0 9339-ref 452 . A C 2512.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=99;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.8273;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.38;SB=-0.01;sumGLbyD=25.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,73:99:99:2543,0,721 9339-ref 519 . A C 1077.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.49;SB=-0.01;sumGLbyD=39.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.27:1111,84,0 9339-ref 700 . T C 2711.53 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=135;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=9.7333;MQ=36.55;MQ0=0;QD=20.09;SB=-0.01;sumGLbyD=20.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,82:133:99:2742,0,1673 9339-ref 715 . C T 5753.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.4985;MQ=36.53;MQ0=0;QD=38.36;SB=-0.01;sumGLbyD=38.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:5753,448,0 9339-ref 839 . T G 6111.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.2014;MQ=36.74;MQ0=0;QD=38.93;SB=-0.01;sumGLbyD=38.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:157:99:6111,472,0 9339-ref 841 . A T 1178.80 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=160;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=9.0672;MQ=36.75;MQ0=0;QD=7.37;SB=-0.01;sumGLbyD=7.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:116,44:159:99:1209,0,4045 9339-ref 944 . G T 6474.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=165;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.5721;MQ=37.00;MQ0=0;QD=39.24;SB=-0.01;sumGLbyD=39.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:164:99:6474,494,0 9339-ref 968 . C T 1482.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=166;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=9.6888;MQ=36.94;MQ0=0;QD=8.93;SB=-0.01;sumGLbyD=9.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:114,51:164:99:1512,0,3948 9339-ref 1047 . A G 2790.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=15.3670;MQ=34.73;MQ0=0;QD=18.48;SB=-0.01;sumGLbyD=18.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:147:99:2824,220,0 9339-ref 1057 . G T 937.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=101;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.3698;MQ=33.55;MQ0=0;QD=9.28;SB=-0.01;sumGLbyD=9.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,40:99:99:967,0,1924 9339-ref 1061 . G A 850.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=93;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.6317;MQ=33.24;MQ0=0;QD=9.14;SB=-0.01;sumGLbyD=9.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,37:92:99:880,0,1843 9339-ref 1065 . T C 1141.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=104;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.1009;MQ=33.66;MQ0=0;QD=10.97;SB=-0.01;sumGLbyD=11.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,45:101:99:1171,0,1847 9339-ref 1108 . 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G A 4465.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.3345;MQ=29.34;MQ0=0;QD=29.97;SB=-389.26;sumGLbyD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,147:142:99:4434,397,0 9377-ref 64 . G C 36692.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.6711;MQ=36.64;MQ0=0;QD=36.69;SB=-115.99;sumGLbyD=36.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,986:969:99:36521,2821,0 9377-ref 69 . C G 37929.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=22.8688;MQ=36.76;MQ0=0;QD=37.93;SB=-63.06;sumGLbyD=37.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,1000:992:99:37926,2985,0 9377-ref 156 . T C 28184.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=811;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=56.0788;MQ=33.55;MQ0=0;QD=34.75;SB=-0.01;sumGLbyD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,810:806:99:28149,2421,0 9377-ref 161 . C G 25963.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=754;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=33.1087;MQ=33.34;MQ0=0;QD=34.43;SB=-0.01;sumGLbyD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,752:750:99:25923,2222,0 9377-ref 172 . G T 7949.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=265;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.4661;MQ=26.68;MQ0=0;QD=30.00;SB=-0.01;sumGLbyD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,262:264:99:7874,753,0 9377-ref 173 . A C 6768.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=232;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.2019;MQ=25.19;MQ0=0;QD=29.17;SB=-0.01;sumGLbyD=29.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,229:229:99:6765,688,0 9377-ref 179 . C A 38.15 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=12.72;SB=-0.01;sumGLbyD=22.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20.60:68,0,21 9377-ref 358 . A G 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 9377-ref 361 . G A 29343.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=795;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=12.6562;MQ=35.16;MQ0=0;QD=36.91;SB=-5530.19;sumGLbyD=36.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,789:788:99:29285,2340,0 9377-ref 367 . 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G T 500.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=27.79;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.10:533,54,0 9378-ref 13 . A G 3084.66 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=196;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=20.9263;MQ=20.81;MQ0=0;QD=15.74;SB=-0.01;sumGLbyD=15.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,147:194:99:3115,0,612 9378-ref 62 . A T 5050.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=201;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.6291;MQ=20.91;MQ0=0;QD=25.13;SB=-0.01;sumGLbyD=24.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,200:199:99:5013,593,0 9378-ref 80 . A C 4120.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=163;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7845;MQ=20.84;MQ0=0;QD=25.28;SB=-0.01;sumGLbyD=24.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,161:163:99:4064,461,0 9378-ref 263 . T A 17752.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=606;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=25.05;MQ0=0;QD=29.30;SB=-269.09;sumGLbyD=29.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,601:604:99:17595,1666,0 9378-ref 271 . A C 17927.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=608;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.4667;MQ=25.10;MQ0=0;QD=29.49;SB=-473.96;sumGLbyD=29.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,605:605:99:17919,1818,0 9378-ref 286 . A G 36428.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=11.4666;MQ=36.33;MQ0=0;QD=36.43;SB=-51.29;sumGLbyD=36.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,989:974:99:36093,2660,0 9378-ref 288 . C A 34678.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.01;HRun=2;HaplotypeScore=12.2552;MQ=35.54;MQ0=0;QD=34.68;SB=-23.69;sumGLbyD=34.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,991:943:99:34674,2837,0 9378-ref 356 . G A 17458.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=567;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=38.6087;MQ=29.15;MQ0=0;QD=30.79;SB=-36.99;sumGLbyD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,560:560:99:17248,1502,0 9378-ref 377 . C T 17.38 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.5075;MQ=30.41;MQ0=0;QD=2.90;SB=-0.01;sumGLbyD=7.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:3:30.99:47,0,31 9378-ref 454 . A G 47.98 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=22.82;MQ0=0;QD=12.00;SB=-23.90;sumGLbyD=20.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9:80,9,0 9378-ref 493 . C T 39.94 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9989;MQ=26.28;MQ0=0;QD=7.99;SB=2.99;sumGLbyD=13.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:49.67:70,0,50 9399-ref 106 . A G 313.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.64;MQ0=0;QD=26.11;SB=-40.01;sumGLbyD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.04:346,36,0 9399-ref 112 . A G 381.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.76;MQ0=0;QD=27.25;SB=-37.80;sumGLbyD=29.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.06:415,42,0 9399-ref 447 . G T 1147.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.24;SB=-0.01;sumGLbyD=39.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.29:1180,90,0 9399-ref 492 . T C 32.95 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.83;SB=-0.01;sumGLbyD=3.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62.94:63,0,543 9399-ref 561 . A C 796.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.5226;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.85;SB=-0.01;sumGLbyD=33.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:22:66.20:829,66,0 9399-ref 585 . T C 679.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.99;SB=-0.01;sumGLbyD=35.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:19:57.16:713,57,0 9399-ref 663 . C A 654.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=35.87;MQ0=0;QD=36.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.15:687,54,0 9399-ref 723 . C G 308.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.83;SB=-0.01;sumGLbyD=34.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.07:341,27,0 9399-ref 749 . T A 199.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.53;SB=-0.01;sumGLbyD=33.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.06:233,18,0 9399-ref 829 . A G 221.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.64;SB=-0.01;sumGLbyD=36.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:254,21,0 9399-ref 949 . G A 114.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.59;SB=-0.01;sumGLbyD=36.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:147,12,0 9399-ref 1050 . T G 40.31 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.16;SB=-0.01;sumGLbyD=36.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:72,6,0 9400-ref 660 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 9400-ref 693 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 9400-ref 719 . C A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 9400-ref 749 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 9445-ref 255 . T C 25.95 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.24;SB=-0.01;sumGLbyD=6.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55.93:56,0,203 9445-ref 268 . A G 34.28 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.86;SB=-0.01;sumGLbyD=12.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64.27:64,0,105 9445-ref 276 . G A 34.97 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.99;SB=-0.01;sumGLbyD=12.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64.96:65,0,105 9514-ref 294 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 9514-ref 513 . C T 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 9514-ref 525 . A G 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 9514-ref 529 . C T 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 9514-ref 547 . C T 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 9518-ref 158 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 9555-ref 48 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.21;SB=-0.01;sumGLbyD=22.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.02:89,9,0 9555-ref 84 . G A 40.84 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=20.47;MQ0=0;QD=2.15;SB=-0.01;sumGLbyD=3.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:6:70.83:71,0,71 9555-ref 89 . G C 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8312;MQ=20.47;MQ0=0;QD=7.62;SB=-0.01;sumGLbyD=9.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:6:18.03:178,18,0 9555-ref 99 . A G 11.53 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8307;MQ=20.47;MQ0=0;QD=0.61;SB=-0.01;sumGLbyD=2.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:6:41.21:41,0,100 9555-ref 124 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.9954;MQ=19.46;MQ0=0;QD=2.55;SB=-0.01;sumGLbyD=5.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,3:2:6.01:59,6,0 9555-ref 347 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 9555-ref 355 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 9555-ref 384 . C A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 9555-ref 398 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 9591-ref 774 . T A 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 9591-ref 780 . C T 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 9591-ref 848 . A G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 9591-ref 850 . G A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 9591-ref 897 . T C 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 9591-ref 956 . C G 271.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.12;SB=-0.01;sumGLbyD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:8.50:301,0,9 9591-ref 973 . A C 298.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.87;SB=-0.01;sumGLbyD=32.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9.91:329,0,10 9591-ref 1019 . T C 265.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=33.20;SB=-0.01;sumGLbyD=37.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:299,24,0 9591-ref 1045 . A G 416.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=34.74;SB=-0.01;sumGLbyD=37.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:450,36,0 9591-ref 1066 . C T 498.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=35.58;SB=-0.01;sumGLbyD=37.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:531,42,0 9591-ref 1177 . G T 124.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.90;SB=-0.01;sumGLbyD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:4:12.04:157,12,0 9591-ref 1178 . C T 205.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:238,18,0 9591-ref 1212 . T C 162.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.41;SB=-0.01;sumGLbyD=38.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:195,15,0 9591-ref 1240 . C T 364.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.49;SB=-0.01;sumGLbyD=39.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:398,30,0 9591-ref 1339 . A G 161.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.33;SB=-0.01;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:194,15,0 9591-ref 1351 . C T 164.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.88;SB=-0.01;sumGLbyD=39.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:197,15,0 9591-ref 1364 . A G 121.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.34;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:154,12,0 9591-ref 1486 . A G 123.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.91;SB=-0.01;sumGLbyD=39.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:156,12,0 9591-ref 1575 . A C 161.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=26.96;SB=-0.01;sumGLbyD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:195,18,0 9591-ref 1584 . T C 165.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=27.61;SB=-0.01;sumGLbyD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:199,18,0 9591-ref 1614 . A G 235.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.07;MQ0=0;QD=29.39;SB=-0.01;sumGLbyD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:268,24,0 9591-ref 1626 . G A 125.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=17.97;SB=-0.01;sumGLbyD=22.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:5:15.03:158,15,0 9659-ref 196 . A G 76.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.14;SB=-0.01;sumGLbyD=26.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:107,0,28 9659-ref 216 . G A 202.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.74;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 9659-ref 277 . C G 202.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.78;SB=-0.01;sumGLbyD=39.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:236,18,0 9659-ref 375 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=7;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 9659-ref 399 . G T 121.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.47;SB=-0.01;sumGLbyD=38.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:154,12,0 9659-ref 413 . G A 59.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.92;SB=-0.01;sumGLbyD=22.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:90,0,28 9659-ref 498 . T A 164.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.85;SB=-36.74;sumGLbyD=39.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:197,15,0 9659-ref 503 . C T 37.32 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.33;SB=-0.01;sumGLbyD=16.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:49.66:67,0,50 9741-ref 169 . A C 133.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=22.19;SB=-0.01;sumGLbyD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.02:166,18,0 9741-ref 198 . T A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=29.82;MQ0=0;QD=3.83;SB=-0.01;sumGLbyD=8.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56.76:57,0,130 9741-ref 241 . C G 111.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:61.95:142,0,62 9741-ref 261 . C T 34.97 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.99;SB=-0.01;sumGLbyD=12.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64.96:65,0,105 9741-ref 262 . G A 74.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.00;SB=-0.01;sumGLbyD=20.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.27:105,0,64 9741-ref 265 . G T 30.41 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.08;SB=-0.01;sumGLbyD=12.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60.40:60,0,105 9741-ref 272 . T G 28.07 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.61;SB=-0.01;sumGLbyD=11.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58.06:58,0,105 9741-ref 346 . T C 321.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:354,27,0 9741-ref 406 . T C 233.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.30;SB=-0.01;sumGLbyD=38.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:266,21,0 9741-ref 412 . A C 221.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=31.68;SB=-0.01;sumGLbyD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:255,21,0 9741-ref 605 . T C 264.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=33.01;SB=-0.01;sumGLbyD=37.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:297,24,0 9741-ref 647 . T C 19.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=3.24;SB=-0.01;sumGLbyD=8.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:49.37:49,0,128 9741-ref 648 . C G 18.62 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=3.10;SB=-0.01;sumGLbyD=8.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:48.55:49,0,131 9741-ref 654 . G C 107.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=26.79;SB=-0.01;sumGLbyD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:140,12,0 9741-ref 665 . G T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 9741-ref 696 . C G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 9741-ref 697 . C T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 9741-ref 698 . A G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 9741-ref 887 . A G 316.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.87;MQ0=0;QD=35.19;SB=-0.01;sumGLbyD=38.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:350,27,0 9741-ref 902 . A G 418.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.15;MQ0=0;QD=34.86;SB=-0.01;sumGLbyD=37.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.09:451,36,0 9741-ref 1405 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 9785-ref 211 . T A 31.68 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.81;MQ0=0;QD=15.84;SB=-26.42;sumGLbyD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:63,6,0 9804-ref 74 . A G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 9804-ref 77 . A G 72.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=24.28;SB=-0.01;sumGLbyD=35.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:105,9,0 9804-ref 99 . G A 132.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.74;MQ0=0;QD=26.44;SB=-0.01;sumGLbyD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:165,15,0 9804-ref 146 . T G 59.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.44;MQ0=0;QD=19.81;SB=-0.01;sumGLbyD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.01:91,9,0 9804-ref 220 . A G 41.05 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=10.26;SB=-24.70;sumGLbyD=17.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:15.65:71,0,16 9804-ref 227 . C T 41.05 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=10.26;SB=-24.70;sumGLbyD=17.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:15.65:71,0,16 9804-ref 354 . T G 184.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=27.40;MQ0=0;QD=23.04;SB=-0.01;sumGLbyD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:217,21,0 9804-ref 368 . G A 28.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.40;MQ0=0;QD=3.62;SB=-0.01;sumGLbyD=7.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:7:58.98:59,0,117 9804-ref 374 . T C 187.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.98;MQ0=0;QD=26.76;SB=-0.01;sumGLbyD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:220,21,0 9804-ref 386 . T G 37.97 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9996;MQ=28.72;MQ0=0;QD=6.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:6:64.98:68,0,65 9804-ref 501 . T C 445.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.5441;MQ=28.84;MQ0=0;QD=10.36;SB=-53.04;sumGLbyD=11.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:41:99:475,0,562 9804-ref 509 . C T 545.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.7553;MQ=29.13;MQ0=0;QD=11.86;SB=-131.73;sumGLbyD=12.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,22:45:99:575,0,597 9804-ref 522 . A G 223.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.6661;MQ=31.07;MQ0=0;QD=4.38;SB=-15.98;sumGLbyD=4.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,12:49:99:254,0,1084 9804-ref 565 . A G 1348.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.88;MQ0=0;QD=35.50;SB=-147.69;sumGLbyD=36.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1382,114,0 9804-ref 585 . A G 1141.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.63;MQ0=0;QD=36.84;SB=-118.59;sumGLbyD=37.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:30:90.29:1175,90,0 9804-ref 668 . C A 89.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=14.91;SB=-27.02;sumGLbyD=19.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:5:24.97:119,0,25 9804-ref 669 . A C 86.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=17.29;SB=12.53;sumGLbyD=23.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.97:116,0,25 9804-ref 670 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 9840-ref 755 . C G 35.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.16;SB=-0.01;sumGLbyD=13.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:4:43.21:66,0,43 9840-ref 757 . A G 48.55 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.71;SB=-0.01;sumGLbyD=15.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:4:26.55:79,0,27 9840-ref 1032 . G T 45.87 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.93;SB=-0.01;sumGLbyD=39.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:77,6,0 9840-ref 1063 . G T 35.36 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=33.48;MQ0=0;QD=11.79;SB=-0.01;sumGLbyD=22.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:2:6.01:67,6,0 9840-ref 1122 . G T 63.74 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=15.94;SB=-0.01;sumGLbyD=23.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:23.22:94,0,23 9840-ref 1125 . C T 71.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.98;SB=-0.01;sumGLbyD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:104,9,0 9840-ref 1258 . A G 37.41 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.71;SB=-0.01;sumGLbyD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:69,6,0 9840-ref 1470 . G C 16.46 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=2.35;SB=-0.01;sumGLbyD=6.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:46.36:46,0,170 9901-ref 141 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 9901-ref 168 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 9901-ref 288 . C T 57.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.73;SB=-0.01;sumGLbyD=8.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:10:87.28:87,0,212 9901-ref 324 . G C 125.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.55;SB=-0.01;sumGLbyD=15.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:155,0,167 9901-ref 363 . C G 433.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.37;SB=-0.01;sumGLbyD=35.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:12:36.12:467,36,0 9901-ref 414 . G A 277.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.68;SB=-0.01;sumGLbyD=38.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:310,24,0 9901-ref 483 . C T 165.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.02;SB=-0.01;sumGLbyD=39.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:198,15,0 9901-ref 573 . T C 52.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.84;SB=-0.01;sumGLbyD=9.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:82.53:83,0,200 9901-ref 615 . A T 113.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=35.87;MQ0=0;QD=12.62;SB=-0.01;sumGLbyD=15.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:9:22.75:144,0,23 9901-ref 633 . C T 120.64 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=12.06;SB=-0.01;sumGLbyD=15.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:151,0,145 9901-ref 837 . G A 415.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.66;SB=-0.01;sumGLbyD=37.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:449,36,0 9901-ref 867 . C G 211.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6006;MQ=33.02;MQ0=0;QD=26.47;SB=-0.01;sumGLbyD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.06:245,21,0 9901-ref 873 . C T 88.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=22.00;SB=-0.01;sumGLbyD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.01:120,12,0 9901-ref 960 . C T 224.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=32.09;SB=-0.01;sumGLbyD=36.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:258,21,0 9901-ref 966 . A G 232.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.26;SB=-0.01;sumGLbyD=37.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:266,21,0 9901-ref 1221 . A G 327.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.2859;MQ=36.52;MQ0=0;QD=15.58;SB=-0.01;sumGLbyD=17.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:357,0,299 9901-ref 1248 . G A 593.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9350;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.91;SB=-0.01;sumGLbyD=36.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.16:627,48,0 9901-ref 1314 . C T 486.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.46;SB=-0.01;sumGLbyD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:10.79:519,11,0 9901-ref 1320 . G A 477.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9973;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.85;SB=-0.01;sumGLbyD=34.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:10.79:510,11,0 9901-ref 1361 . C A 13.17 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.20;SB=-0.01;sumGLbyD=3.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:10:42.95:43,0,275 9901-ref 1423 . C T 562.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.59;SB=-0.01;sumGLbyD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:20.63:592,0,21 9901-ref 1461 . C T 512.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9265;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.26;SB=-0.01;sumGLbyD=23.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:21:67.29:542,0,67 9901-ref 1530 . C T 351.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.14;SB=-0.01;sumGLbyD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:75.76:382,0,76 9901-ref 1554 . G A 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 9901-ref 1580 . C T 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 9907-ref 12 . T C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9384;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.51;SB=-0.01;sumGLbyD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:4:12.04:160,12,0 9907-ref 184 . C A 660.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.71;SB=-316.17;sumGLbyD=38.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:694,54,0 9907-ref 189 . C T 896.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.36;SB=-356.18;sumGLbyD=38.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.23:930,72,0 9907-ref 262 . G A 1016.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.79;SB=-24.08;sumGLbyD=33.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:31:13.27:1049,13,0 9907-ref 295 . A G 65.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9998;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.24;SB=-0.01;sumGLbyD=11.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:95.94:96,0,176 10036-ref 341 . G T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 10036-ref 356 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 10036-ref 359 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 10036-ref 385 . A T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 10036-ref 683 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10036-ref 692 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10036-ref 714 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10048-ref 370 . C G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 10048-ref 399 . G C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 10091-ref 19 . C A 66.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.18;SB=-0.01;sumGLbyD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 10091-ref 62 . C T 17.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.21:47,0,65 10091-ref 64 . T C 17.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.22:47,0,62 10091-ref 68 . A G 36.56 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=9.14;SB=-0.01;sumGLbyD=16.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.21:67,0,47 10091-ref 83 . T C 136.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=27.23;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:169,15,0 10091-ref 87 . G A 31.97 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=5.33;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61.96:62,0,110 10091-ref 91 . T A 155.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:188,15,0 10091-ref 122 . G A 461.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=35.51;SB=-0.01;sumGLbyD=38.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:495,39,0 10091-ref 153 . A G 56.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9996;MQ=36.52;MQ0=0;QD=2.69;SB=-0.01;sumGLbyD=4.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:86.44:86,0,615 10091-ref 192 . A G 78.88 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.38;SB=-0.01;sumGLbyD=6.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:17:99:109,0,433 10091-ref 209 . T C 41.01 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.73;SB=-0.01;sumGLbyD=4.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,420 10091-ref 220 . C A 127.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.14;SB=3.00;sumGLbyD=11.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:158,0,315 10091-ref 247 . G A 165.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9999;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.02;SB=-39.76;sumGLbyD=39.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:198,15,0 10091-ref 251 . T C 77.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.50;SB=9.99;sumGLbyD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:108,0,28 10091-ref 332 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10091-ref 377 . G T 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 10091-ref 393 . G A 72.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9999;MQ=32.73;MQ0=0;QD=14.55;SB=-0.01;sumGLbyD=20.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:44.20:103,0,44 10091-ref 452 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 10091-ref 454 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 10091-ref 563 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:2:1.76:40,3,0 10091-ref 601 . C G 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 10094-ref 95 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 10094-ref 284 . A G 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 10094-ref 290 . C T 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.2032;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.31;SB=-0.01;sumGLbyD=23.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:3:9.03:119,9,0 10094-ref 351 . A T 584.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9332;MQ=36.03;MQ0=0;QD=13.92;SB=-0.01;sumGLbyD=14.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,20:42:99:615,0,722 10094-ref 383 . C G 2300.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.0895;MQ=36.06;MQ0=0;QD=35.39;SB=-0.01;sumGLbyD=35.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:63:99:2334,190,0 10094-ref 423 . A G 1827.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.17;MQ0=0;QD=37.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1861,147,0 10094-ref 441 . A G 1438.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.96;SB=-0.01;sumGLbyD=36.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:39:99:1472,117,0 10094-ref 465 . A G 1037.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=37.05;SB=-0.01;sumGLbyD=38.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.24:1070,84,0 10094-ref 546 . A G 788.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.32;MQ0=0;QD=34.27;SB=-0.01;sumGLbyD=35.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.19:821,69,0 10094-ref 568 . A G 776.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.33;MQ0=0;QD=33.75;SB=-0.01;sumGLbyD=35.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.18:809,69,0 10094-ref 572 . A G 658.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=32.93;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.15:692,60,0 10094-ref 585 . C T 430.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=30.77;SB=-0.01;sumGLbyD=33.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.10:464,42,0 10094-ref 721 . A G 12.96 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.9735;MQ=36.58;MQ0=0;QD=0.54;SB=-0.01;sumGLbyD=1.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:42.72:43,0,734 10094-ref 723 . G A 12.18 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=6;HaplotypeScore=4.8401;MQ=36.58;MQ0=0;QD=0.51;SB=-0.01;sumGLbyD=1.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:41.91:42,0,741 10094-ref 777 . G C 600.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.80;MQ0=0;QD=35.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.14:634,51,0 10094-ref 861 . C T 289.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.25;SB=-0.01;sumGLbyD=24.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:12:43.93:319,0,44 10094-ref 895 . C T 71.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.82;SB=-0.01;sumGLbyD=34.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:103,9,0 10223-ref 52 . C T 796.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=28.44;SB=-355.47;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.16:829,84,0 10223-ref 53 . C G 796.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=28.44;SB=-355.47;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.16:829,84,0 10223-ref 56 . A G 1114.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.03;MQ0=0;QD=30.13;SB=-355.48;sumGLbyD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1148,111,0 10223-ref 57 . A T 1022.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.03;MQ0=0;QD=27.63;SB=-355.48;sumGLbyD=28.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:35:99:1055,105,0 10223-ref 111 . A G 2455.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.5774;MQ=31.11;MQ0=0;QD=32.31;SB=-0.01;sumGLbyD=32.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:73:99:2488,220,0 10223-ref 145 . T C 3394.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.69;MQ0=0;QD=33.95;SB=-0.01;sumGLbyD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:99:99:3394,298,0 10223-ref 165 . A G 3920.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.94;MQ0=0;QD=34.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,113:112:99:3919,337,0 10223-ref 166 . C T 3853.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.89;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,112:111:99:3853,334,0 10223-ref 199 . A G 1587.53 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=108;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.6152;MQ=35.77;MQ0=0;QD=14.70;SB=-0.01;sumGLbyD=14.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,53:108:99:1618,0,1817 10223-ref 261 . T A 1923.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=140;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.1321;MQ=36.78;MQ0=0;QD=13.74;SB=-0.01;sumGLbyD=13.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,62:136:99:1954,0,2507 10223-ref 295 . C G 2433.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=124;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.1998;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.63;SB=-0.01;sumGLbyD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,73:121:99:2464,0,1506 10223-ref 424 . C T 7945.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=206;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=9.7725;MQ=36.95;MQ0=0;QD=38.57;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,204:204:99:7917,585,0 10223-ref 492 . G C 7683 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=203;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.6872;MQ=36.85;MQ0=0;QD=37.85;SB=-0.01;sumGLbyD=37.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,203:198:99:7682,596,0 10223-ref 600 . T G 221 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=13.9898;MQ=35.80;MQ0=0;QD=13.00;SB=-0.01;sumGLbyD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:15:99:251,0,227 10223-ref 601 . T C 592.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.9921;MQ=35.82;MQ0=0;QD=22.78;SB=-0.01;sumGLbyD=24.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:26:17.17:625,17,0 10223-ref 602 . G A 28.05 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=9.9954;MQ=35.87;MQ0=0;QD=1.04;SB=-0.01;sumGLbyD=2.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:58.03:58,0,772 10223-ref 679 . A G 7551.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=197;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.9753;MQ=36.54;MQ0=0;QD=38.33;SB=-0.01;sumGLbyD=38.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,197:195:99:7551,587,0 10223-ref 740 . T G 4515.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6342;MQ=34.18;MQ0=0;QD=35.84;SB=-0.01;sumGLbyD=35.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:124:99:4492,370,0 10223-ref 746 . G T 4295.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.6342;MQ=33.98;MQ0=0;QD=36.40;SB=-0.01;sumGLbyD=36.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,118:117:99:4295,352,0 10223-ref 751 . A T 3961.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=110;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=34.05;MQ0=0;QD=36.02;SB=-0.01;sumGLbyD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:109:99:3961,328,0 10223-ref 785 . G C 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 10223-ref 804 . T C 35.36 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=17.68;SB=-0.01;sumGLbyD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:67,6,0 10223-ref 826 . G A 562.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=35.16;SB=-0.01;sumGLbyD=37.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:596,48,0 10223-ref 865 . T C 1423.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7615;MQ=35.72;MQ0=0;QD=35.60;SB=-0.01;sumGLbyD=36.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1457,117,0 10223-ref 921 . C G 556.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.2997;MQ=35.06;MQ0=0;QD=34.76;SB=-0.01;sumGLbyD=36.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:589,48,0 10223-ref 935 . A G 19.89 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=3.98;SB=-0.01;sumGLbyD=9.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:49.84:50,0,95 10228-ref 236 . C T 1203.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=90;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.2389;MQ=36.08;MQ0=0;QD=13.37;SB=-0.01;sumGLbyD=13.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,41:86:99:1233,0,1539 10228-ref 263 . T C 4456.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=36.23;MQ0=0;QD=37.45;SB=-29.63;sumGLbyD=37.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,118:117:99:4417,313,0 10228-ref 290 . T C 1344.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=88;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8663;MQ=35.84;MQ0=0;QD=15.28;SB=-26.62;sumGLbyD=15.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,43:87:99:1374,0,1414 10228-ref 296 . G A 3437.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8600;MQ=35.87;MQ0=0;QD=38.20;SB=-29.63;sumGLbyD=38.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:3438,271,0 10228-ref 365 . A G 2583.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=36.30;MQ0=0;QD=35.88;SB=-0.01;sumGLbyD=36.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:70:99:2616,211,0 10228-ref 386 . A G 763.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.7112;MQ=35.26;MQ0=0;QD=11.74;SB=-0.01;sumGLbyD=12.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,27:63:99:793,0,1170 10228-ref 418 . T G 1717.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7338;MQ=35.32;MQ0=0;QD=35.05;SB=-0.01;sumGLbyD=35.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:1751,107,0 10228-ref 424 . T C 13.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9998;MQ=35.25;MQ0=0;QD=0.29;SB=-0.01;sumGLbyD=0.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,6:47:43.66:44,0,1453 10228-ref 450 . C T 1473.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9969;MQ=35.28;MQ0=0;QD=35.08;SB=-0.01;sumGLbyD=35.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:90.25:1506,90,0 10228-ref 452 . T A 1374.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9969;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.36;SB=-0.01;sumGLbyD=35.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:39:83.92:1407,84,0 10228-ref 504 . G C 137.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=27.47;SB=-0.01;sumGLbyD=34.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:170,15,0 10228-ref 506 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 10283-ref 13 . T A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 10283-ref 21 . A C 221.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=31.61;SB=-0.01;sumGLbyD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:254,21,0 10283-ref 64 . C T 571.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=31.74;SB=-0.01;sumGLbyD=33.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:16:48.15:604,48,0 10283-ref 85 . A C 949.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=36.50;SB=-0.01;sumGLbyD=37.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.24:982,78,0 10283-ref 201 . G A 537.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8652;MQ=35.46;MQ0=0;QD=26.87;SB=-26.62;sumGLbyD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:41.26:567,0,41 10283-ref 213 . C A 59.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.2579;MQ=35.53;MQ0=0;QD=8.47;SB=-0.01;sumGLbyD=12.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:6:86.35:89,0,86 10283-ref 232 . G T 512.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6553;MQ=36.47;MQ0=0;QD=26.97;SB=-0.01;sumGLbyD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:18:41.17:542,0,41 10283-ref 281 . G A 1730.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.6051;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.32;SB=-0.01;sumGLbyD=35.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:73.10:1763,73,0 10283-ref 498 . C G 1009.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.40;SB=-80.02;sumGLbyD=38.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.26:1043,81,0 10283-ref 517 . G T 753.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.65;MQ0=0;QD=31.40;SB=-120.02;sumGLbyD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.14:787,72,0 10302-ref 210 . C G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 10302-ref 572 . 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G A 1027.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.63;MQ0=0;QD=34.24;SB=-0.01;sumGLbyD=35.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:30:53.29:1060,53,0 10364-ref 221 . C G 1024.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9989;MQ=34.66;MQ0=0;QD=33.06;SB=-0.01;sumGLbyD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:58.01:1058,58,0 10364-ref 241 . G C 803.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.28;MQ0=0;QD=34.95;SB=-0.01;sumGLbyD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.19:837,69,0 10364-ref 272 . A G 245.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=30.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:279,24,0 10364-ref 311 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10364-ref 375 . G T 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 10364-ref 384 . A G 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.8641;MQ=33.48;MQ0=0;QD=16.03;SB=-0.01;sumGLbyD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:2:6.02:79,6,0 10389-ref 270 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10389-ref 368 . T G 72.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.32;SB=-0.01;sumGLbyD=35.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:105,9,0 10389-ref 481 . T G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 10448-ref 73 . T G 88.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.9972;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.82;SB=-0.01;sumGLbyD=11.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:118,0,206 10448-ref 140 . T G 1322.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.71;MQ0=0;QD=37.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1356,105,0 10448-ref 167 . T C 885.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.19;MQ0=0;QD=35.41;SB=-0.01;sumGLbyD=36.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:24:72.22:918,72,0 10448-ref 299 . A C 1519.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=37.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:40:99:1553,120,0 10448-ref 314 . T C 1348.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.90;MQ0=0;QD=36.44;SB=-116.31;sumGLbyD=37.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:36:99:1381,108,0 10448-ref 330 . G C 939.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.22;MQ0=0;QD=32.38;SB=-116.15;sumGLbyD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:26:78.23:972,78,0 10448-ref 385 . A G 352.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.11;MQ0=0;QD=32.02;SB=-0.01;sumGLbyD=35.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:385,33,0 10448-ref 387 . C G 285.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=28.55;SB=-0.01;sumGLbyD=31.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.07:319,27,0 10448-ref 389 . A T 249.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=31.17;SB=-0.01;sumGLbyD=35.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:282,24,0 10448-ref 411 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 10448-ref 433 . C G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 10448-ref 473 . T C 213.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.60;MQ0=0;QD=12.56;SB=-0.01;sumGLbyD=14.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,9:17:99:244,0,257 10448-ref 498 . A G 614.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.86;MQ0=0;QD=34.13;SB=-0.01;sumGLbyD=35.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.15:647,54,0 10448-ref 515 . A G 670.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.30;MQ0=0;QD=33.52;SB=-0.01;sumGLbyD=35.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.16:703,60,0 10448-ref 520 . T G 639.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.09;MQ0=0;QD=33.63;SB=-0.01;sumGLbyD=35.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.15:672,57,0 10448-ref 582 . T A 163 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.60;SB=-0.01;sumGLbyD=39.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 10480-ref 89 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10571-ref 143 . C G 902.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.62;SB=-0.01;sumGLbyD=38.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.23:936,72,0 10571-ref 160 . G A 626.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.85;SB=-0.01;sumGLbyD=38.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:659,51,0 10571-ref 234 . C T 1862.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=1.6988;MQ=36.40;MQ0=0;QD=36.52;SB=-0.01;sumGLbyD=37.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:50:99:1896,150,0 10660-ref 740 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10660-ref 821 . G C 15.14 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=2.52;SB=-0.01;sumGLbyD=7.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:45:45,0,141 10660-ref 887 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10660-ref 1680 . C T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 10660-ref 1689 . C G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 10683-ref 289 . A G 396.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=36.06;SB=-0.01;sumGLbyD=39.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:430,33,0 10683-ref 322 . C T 139.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=27.92;SB=-0.01;sumGLbyD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.02:172,15,0 10683-ref 326 . C G 146.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:179,15,0 10683-ref 373 . A C 76.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.64;SB=-0.01;sumGLbyD=36.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:109,9,0 10683-ref 375 . A T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 10683-ref 397 . 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G T 597.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=22.97;SB=-0.01;sumGLbyD=24.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:25:47.39:630,47,0 10764-ref 373 . G T 575.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=26.16;SB=-0.01;sumGLbyD=27.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.06:609,66,0 10764-ref 854 . T G 78.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=19.54;SB=-0.01;sumGLbyD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.01:111,12,0 10764-ref 969 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10764-ref 1007 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10764-ref 1252 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10793-ref 100 . C G 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 10793-ref 128 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-38.76;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 10793-ref 218 . C G 305.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=33.96;SB=-0.01;sumGLbyD=37.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:339,27,0 10793-ref 244 . G A 412.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=34.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:446,36,0 10793-ref 262 . T G 346.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=34.69;SB=-0.01;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:380,30,0 10793-ref 320 . A G 273.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=30.42;SB=-0.01;sumGLbyD=34.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:8:24.07:307,24,0 10793-ref 345 . A G 354.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:387,30,0 10793-ref 347 . A G 351.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.14;SB=-0.01;sumGLbyD=38.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:384,30,0 10793-ref 439 . T C 609.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.44;MQ0=0;QD=33.88;SB=-0.01;sumGLbyD=35.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:17:51.16:643,51,0 10793-ref 507 . C T 924.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.51;SB=-0.01;sumGLbyD=39.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.24:957,72,0 10793-ref 571 . G C 670.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.25;SB=-0.01;sumGLbyD=39.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.18:704,54,0 10793-ref 608 . G T 273.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.22;SB=-0.01;sumGLbyD=38.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:307,24,0 10793-ref 634 . A G 441.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.75;SB=-0.01;sumGLbyD=39.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:474,36,0 10793-ref 657 . G A 630.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.12;SB=-0.01;sumGLbyD=39.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:664,51,0 10793-ref 899 . G T 600.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8499;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.37;SB=-0.01;sumGLbyD=35.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:16:48.16:634,48,0 10793-ref 925 . T A 723.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8318;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.15;SB=-0.01;sumGLbyD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,21:23:9.39:756,9,0 10793-ref 1177 . T A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 10810-ref 280 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10810-ref 317 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10856-ref 41 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10856-ref 180 . A G 78.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.62;SB=-0.01;sumGLbyD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:111,9,0 10856-ref 594 . T C 166.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 10856-ref 859 . A G 44.35 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.18;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 10856-ref 1021 . A C 80.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.71;SB=-0.01;sumGLbyD=37.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:112,9,0 10856-ref 1332 . T G 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 10856-ref 1359 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10856-ref 1560 . G A 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:71,0,31 10856-ref 1561 . G T 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:71,0,31 10856-ref 1654 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10856-ref 1666 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10962-ref 107 . C T 45.87 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.93;SB=-0.01;sumGLbyD=39.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:77,6,0 10962-ref 212 . C G 29.70 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.90;SB=-0.01;sumGLbyD=19.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26.23:60,0,26 10962-ref 272 . C T 287.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:320,24,0 10962-ref 303 . T C 20.76 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.31;SB=-0.01;sumGLbyD=5.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50.71:51,0,253 10962-ref 453 . C T 34.28 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.86;SB=-0.01;sumGLbyD=12.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64.27:64,0,97 10962-ref 456 . G T 41.56 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.94;SB=-0.01;sumGLbyD=10.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:71.55:72,0,134 10962-ref 486 . A T 272.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.03;SB=-0.01;sumGLbyD=38.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:305,24,0 10962-ref 600 . G T 175.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.52;SB=-0.01;sumGLbyD=20.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:205,0,123 10962-ref 639 . T C 125.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.49;SB=-0.01;sumGLbyD=12.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:156,0,233 10962-ref 732 . G T 360.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9469;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.08;SB=-0.01;sumGLbyD=32.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.10:394,30,0 10963-ref 115 . T C 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-38.07;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 10983-ref 122 . G T 200.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9974;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.32;SB=-0.01;sumGLbyD=16.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:230,0,232 10983-ref 165 . A G 974.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.61;MQ0=0;QD=37.47;SB=-0.01;sumGLbyD=38.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.25:1007,78,0 10983-ref 281 . C T 432.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=36.03;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:465,36,0 10983-ref 290 . C G 183.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=30.58;SB=-0.01;sumGLbyD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:216,18,0 10983-ref 301 . C T 183.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=30.58;SB=-0.01;sumGLbyD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:216,18,0 10983-ref 332 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 10983-ref 382 . C T 715.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.54;MQ0=0;QD=32.53;SB=-0.01;sumGLbyD=34.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:20:60.17:749,60,0 10983-ref 439 . C T 881.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.04;HRun=2;HaplotypeScore=2.9420;MQ=33.77;MQ0=0;QD=33.92;SB=-0.01;sumGLbyD=35.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.21:915,75,0 10983-ref 446 . T A 413.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.9629;MQ=34.01;MQ0=0;QD=14.76;SB=-0.01;sumGLbyD=15.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:28:99:443,0,408 10983-ref 481 . G A 722.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=34.39;SB=-0.01;sumGLbyD=35.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.17:755,63,0 10983-ref 489 . G A 392.41 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7552;MQ=34.39;MQ0=0;QD=16.35;SB=-0.01;sumGLbyD=17.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,14:23:99:422,0,271 10999-ref 122 . G A 33.64 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=16.82;SB=-28.38;sumGLbyD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:65,6,0 10999-ref 153 . A G 315.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=31.51;SB=-29.62;sumGLbyD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:348,30,0 10999-ref 154 . T A 314.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=31.45;SB=-29.62;sumGLbyD=34.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:347,30,0 10999-ref 159 . A G 28.80 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=2.88;SB=3.00;sumGLbyD=5.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:58.79:59,0,229 10999-ref 183 . A G 28.80 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=2.88;SB=3.00;sumGLbyD=5.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:58.79:59,0,229 10999-ref 203 . T G 112.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.10;SB=-0.01;sumGLbyD=36.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:145,12,0 10999-ref 323 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-28.84;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 10999-ref 334 . G A 358.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.58;MQ0=0;QD=29.84;SB=-59.24;sumGLbyD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.08:391,36,0 10999-ref 374 . T G 426.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=28.44;SB=-59.25;sumGLbyD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:15:42.10:460,42,0 10999-ref 375 . T C 453.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=30.24;SB=-59.25;sumGLbyD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.10:487,45,0 10999-ref 404 . G A 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 10999-ref 408 . G C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 10999-ref 564 . T C 78.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.41;MQ0=0;QD=15.63;SB=-27.21;sumGLbyD=22.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.01:111,12,0 10999-ref 580 . G A 200.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.1335;MQ=25.16;MQ0=0;QD=22.30;SB=-27.64;sumGLbyD=25.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:8:24.03:234,24,0 10999-ref 636 . T G 90.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.18;MQ0=0;QD=22.63;SB=-0.01;sumGLbyD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:123,12,0 11222-ref 78 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 11222-ref 107 . A C 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 11222-ref 112 . G C 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 11222-ref 127 . C T 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 11222-ref 131 . A G 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 11222-ref 188 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 11222-ref 197 . G C 79.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.51;SB=-0.01;sumGLbyD=37.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:112,9,0 11222-ref 215 . G A 164.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:197,15,0 11222-ref 294 . T C 254.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=31.81;SB=-0.01;sumGLbyD=35.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:287,24,0 11222-ref 308 . T C 132.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=26.44;SB=-0.01;sumGLbyD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:165,15,0 11222-ref 316 . C T 155.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=31.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:188,18,0 11222-ref 346 . A C 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 11222-ref 361 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 11222-ref 363 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 11222-ref 466 . G A 83.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 11222-ref 470 . A G 126.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 11222-ref 585 . T C 165.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9734;MQ=35.28;MQ0=0;QD=27.64;SB=-0.01;sumGLbyD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.05:199,15,0 11222-ref 613 . C T 191.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=31.89;SB=-0.01;sumGLbyD=37.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:224,18,0 11222-ref 671 . G T 392.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=38.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:426,33,0 11222-ref 701 . T C 304.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=33.82;SB=-0.01;sumGLbyD=37.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:337,27,0 11222-ref 719 . T C 115.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.76;SB=-0.01;sumGLbyD=36.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:148,12,0 11222-ref 738 . T G 85.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.59;SB=-0.01;sumGLbyD=39.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:118,9,0 11222-ref 757 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 11252-ref 214 . G C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 11252-ref 548 . C A 165.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 11252-ref 695 . C G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 11365-ref 61 . A C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 11365-ref 99 . C T 197.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:231,18,0 11365-ref 235 . T C 930.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.19;MQ0=0;QD=37.23;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.23:964,75,0 11365-ref 252 . A G 1049.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=37.50;SB=-0.01;sumGLbyD=38.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.25:1083,84,0 11365-ref 253 . A G 1056.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=37.75;SB=-0.01;sumGLbyD=38.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.27:1090,84,0 11365-ref 396 . G A 697.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4679;MQ=36.22;MQ0=0;QD=26.84;SB=-0.01;sumGLbyD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:23:40.50:731,41,0 11365-ref 414 . G A 940.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.19;MQ0=0;QD=37.62;SB=-0.01;sumGLbyD=38.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.24:973,75,0 11365-ref 444 . A G 998.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.25;MQ0=0;QD=36.97;SB=-0.01;sumGLbyD=38.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.25:1031,81,0 11365-ref 602 . G C 1591.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7879;MQ=36.31;MQ0=0;QD=36.17;SB=-0.01;sumGLbyD=36.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:42:99:1624,126,0 11365-ref 891 . C T 2814.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.3387;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.56;SB=-0.01;sumGLbyD=36.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:75:99:2848,223,0 11365-ref 1013 . A T 3800.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;DS;Dels=0.02;HRun=1;HaplotypeScore=4.7963;MQ=36.80;MQ0=0;QD=37.63;SB=-0.01;sumGLbyD=37.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,98:98:99:3761,255,0 11490-ref 88 . G A 579.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9149;MQ=33.68;MQ0=0;QD=30.51;SB=-0.01;sumGLbyD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.14:613,54,0 11490-ref 89 . C A 16.78 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.9142;MQ=33.48;MQ0=0;QD=0.93;SB=-0.01;sumGLbyD=2.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:17:46.68:47,0,459 11490-ref 91 . G A 327.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9645;MQ=32.73;MQ0=0;QD=21.82;SB=-0.01;sumGLbyD=23.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:13:2.08:357,2,0 11490-ref 101 . T C 424.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.03;MQ0=0;QD=32.67;SB=-0.01;sumGLbyD=35.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.10:458,39,0 11490-ref 134 . T C 14.76 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9993;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.85;SB=-0.01;sumGLbyD=5.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:44.61:45,0,215 11490-ref 176 . T G 118.87 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.99;SB=-0.01;sumGLbyD=8.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:149,0,425 11490-ref 299 . T G 889.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.4502;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.22;SB=-0.01;sumGLbyD=35.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:51.54:923,52,0 11490-ref 446 . C G 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29.55:71,0,30 11522-ref 68 . G A 753.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7324;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.33;SB=-0.01;sumGLbyD=20.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,23:39:99:784,0,499 11522-ref 161 . G T 1148.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9987;MQ=36.67;MQ0=0;QD=37.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.29:1181,93,0 11522-ref 359 . T C 337.30 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.75;SB=-0.01;sumGLbyD=19.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:367,0,259 11522-ref 389 . G A 628.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9832;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.96;SB=-0.01;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:661,51,0 11522-ref 419 . G A 50.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.64;SB=-0.01;sumGLbyD=5.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:13:80.89:81,0,354 11522-ref 530 . C T 622.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.62;SB=-0.01;sumGLbyD=38.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:655,51,0 11522-ref 560 . A G 242.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.19;SB=-0.01;sumGLbyD=22.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:272,0,124 11601-ref 52 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 11601-ref 56 . A G 201.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.65;SB=-39.88;sumGLbyD=39.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 11601-ref 63 . G A 456.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7291;MQ=36.71;MQ0=0;QD=13.04;SB=3.00;sumGLbyD=13.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,15:35:99:486,0,651 11601-ref 75 . T C 1138.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.6633;MQ=36.66;MQ0=0;QD=19.30;SB=-27.59;sumGLbyD=19.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,35:59:99:1168,0,754 11601-ref 155 . C T 3034.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=163;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=6.9211;MQ=36.69;MQ0=0;QD=18.62;SB=-0.01;sumGLbyD=18.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,91:162:99:3065,0,2238 11601-ref 157 . 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T C 6700.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.2077;MQ=36.50;MQ0=0;QD=36.62;SB=-0.01;sumGLbyD=36.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,182:176:99:6672,527,0 11893-ref 83 . T C 30.56 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9357;MQ=33.48;MQ0=0;QD=5.09;SB=-0.01;sumGLbyD=10.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:5:60.55:61,0,84 11893-ref 177 . C T 726.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.02;SB=-0.01;sumGLbyD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:20:60.19:760,60,0 11893-ref 243 . A G 420 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7803;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.09;SB=-0.01;sumGLbyD=20.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,13:22:99:450,0,282 11893-ref 298 . T C 353.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=36.73;MQ0=0;QD=9.30;SB=-0.01;sumGLbyD=10.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,13:38:99:383,0,862 11893-ref 310 . T C 281.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.73;MQ0=0;QD=7.61;SB=-0.01;sumGLbyD=8.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,11:37:99:311,0,907 11893-ref 350 . G A 1126.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.12;SB=-0.01;sumGLbyD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:32:96.25:1159,96,0 11893-ref 410 . A T 1369.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9998;MQ=36.73;MQ0=0;QD=36.05;SB=-0.01;sumGLbyD=36.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:74.36:1403,74,0 11893-ref 414 . T A 1291.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9732;MQ=36.73;MQ0=0;QD=34.91;SB=-0.01;sumGLbyD=35.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:36:68.34:1325,68,0 11893-ref 452 . G A 793.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.56;MQ0=0;QD=34.52;SB=-0.01;sumGLbyD=35.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:29.22:827,29,0 11893-ref 527 . G A 1423.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.6651;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.47;SB=-0.01;sumGLbyD=39.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1456,111,0 11893-ref 759 . A C 888.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.58;MQ0=0;QD=37.02;SB=-0.01;sumGLbyD=38.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.22:921,72,0 11893-ref 784 . T C 889.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8320;MQ=36.61;MQ0=0;QD=34.22;SB=-0.01;sumGLbyD=35.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:38.24:923,38,0 11893-ref 847 . A G 626.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.40;MQ0=0;QD=36.83;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:659,51,0 11893-ref 907 . C T 345.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=35.98;MQ0=0;QD=34.57;SB=-0.01;sumGLbyD=37.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:379,30,0 11893-ref 1232 . A G 38 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.38;SB=-0.01;sumGLbyD=4.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:67.99:68,0,449 11947-ref 169 . G A 324.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:358,27,0 11947-ref 320 . A G 14 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=2.00;SB=-0.01;sumGLbyD=6.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:43.82:44,0,156 11947-ref 327 . T A 196.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=28.06;SB=-0.01;sumGLbyD=32.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.02:229,21,0 11947-ref 328 . T G 215.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=30.83;SB=-0.01;sumGLbyD=35.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:249,21,0 11947-ref 365 . G A 155.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.11;SB=-0.01;sumGLbyD=37.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:188,15,0 11947-ref 653 . C T 414.36 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8069;MQ=36.49;MQ0=0;QD=20.72;SB=-0.01;sumGLbyD=22.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:444,0,210 11947-ref 680 . T A 930.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.60;MQ0=0;QD=37.23;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.24:964,75,0 11947-ref 808 . C T 634.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.30;SB=-40.01;sumGLbyD=39.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:667,51,0 11947-ref 826 . A G 192.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9288;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.71;SB=-0.01;sumGLbyD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:223,0,379 11947-ref 905 . A G 426.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.51;SB=-0.01;sumGLbyD=38.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:459,36,0 11947-ref 930 . G A 464.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8332;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.81;SB=-0.01;sumGLbyD=27.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:97.22:494,0,97 11947-ref 1130 . C G 285.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.40;SB=-0.01;sumGLbyD=12.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:24:99:315,0,455 11947-ref 1271 . T C 437.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.4537;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.83;SB=-0.01;sumGLbyD=17.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,14:26:99:468,0,372 11947-ref 1349 . C T 1263.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1297,99,0 11947-ref 1479 . G A 1337.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=1.4357;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.22;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1371,105,0 11947-ref 1763 . C T 394.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.08;SB=-0.01;sumGLbyD=15.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:99:424,0,509 11947-ref 1947 . G A 485.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.36;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:519,39,0 11947-ref 1966 . A G 145.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7876;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.60;SB=-0.01;sumGLbyD=17.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:8:84.58:176,0,85 11947-ref 1969 . T A 15.62 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7876;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.56;SB=-0.01;sumGLbyD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:45.50:45,0,279 11961-ref 255 . A T 36.43 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.22;SB=-0.01;sumGLbyD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:68,6,0 11961-ref 263 . C T 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 11961-ref 284 . A T 163.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=27.24;SB=-0.01;sumGLbyD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:196,18,0 11961-ref 323 . A G 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 11961-ref 327 . C T 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 11961-ref 330 . C T 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 11993-ref 105 . G A 198.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.12;SB=-0.01;sumGLbyD=38.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:232,18,0 11993-ref 111 . T C 257.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=32.21;SB=-0.01;sumGLbyD=36.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:291,24,0 11993-ref 163 . T A 655.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=33.48;MQ0=0;QD=27.32;SB=-0.01;sumGLbyD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,21:23:0.29:684,0,0 11993-ref 178 . A G 662.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7876;MQ=33.02;MQ0=0;QD=27.61;SB=-0.01;sumGLbyD=28.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,22:24:6.39:692,0,6 11993-ref 220 . C A 573.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=29.55;MQ0=0;QD=23.91;SB=-0.01;sumGLbyD=25.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,22:23:10.85:604,0,11 11993-ref 223 . G A 627.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=30.58;MQ0=0;QD=26.14;SB=-0.01;sumGLbyD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,22:24:5.63:657,0,6 11993-ref 245 . C G 689.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=27.57;SB=-0.01;sumGLbyD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,23:25:4.14:719,0,4 11993-ref 263 . T C 795.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=33.15;SB=-0.01;sumGLbyD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.19:829,69,0 11993-ref 298 . T C 539.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.44;MQ0=0;QD=29.99;SB=-0.01;sumGLbyD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:17:11.15:572,11,0 11993-ref 372 . 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C A 203.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.92;SB=-0.01;sumGLbyD=39.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:236,18,0 12077-ref 34 . G T 581.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.36;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:615,48,0 12077-ref 64 . T A 394.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.75;SB=-0.01;sumGLbyD=22.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:19:33.11:427,33,0 12077-ref 127 . G C 431.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9861;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.96;SB=-0.01;sumGLbyD=38.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:464,36,0 12077-ref 135 . A T 232.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9861;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.50;SB=-0.01;sumGLbyD=17.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:15:99:263,0,194 12077-ref 164 . G A 705.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.25;SB=-0.01;sumGLbyD=36.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:19:57.18:738,57,0 12077-ref 475 . T A 1285.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9987;MQ=35.33;MQ0=0;QD=34.75;SB=-0.01;sumGLbyD=35.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:74.35:1319,74,0 12077-ref 483 . A G 1177.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9987;MQ=35.18;MQ0=0;QD=34.63;SB=-0.01;sumGLbyD=35.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,33:34:65.33:1210,65,0 12077-ref 488 . C A 54.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=35.23;MQ0=0;QD=1.55;SB=-0.01;sumGLbyD=2.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:84.33:84,0,1027 12077-ref 527 . A G 1519.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.75;MQ0=0;QD=37.05;SB=-0.01;sumGLbyD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:40:99:1552,120,0 12077-ref 606 . C T 875.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8662;MQ=36.19;MQ0=0;QD=35.03;SB=-0.01;sumGLbyD=36.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:24:72.22:909,72,0 12077-ref 798 . A G 810.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.66;MQ0=0;QD=35.24;SB=-0.01;sumGLbyD=36.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.20:844,69,0 12077-ref 799 . C G 737.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.13;SB=-0.01;sumGLbyD=36.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.18:771,63,0 12077-ref 816 . C T 625.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9982;MQ=36.03;MQ0=0;QD=29.80;SB=-0.01;sumGLbyD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:21:21.60:659,22,0 12077-ref 915 . C T 177.12 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.08;SB=-0.01;sumGLbyD=8.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:24:99:207,0,595 12077-ref 934 . 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G A 575.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.45;MQ0=0;QD=28.77;SB=-0.01;sumGLbyD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.12:608,60,0 12077-ref 1053 . T A 540.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.77;MQ0=0;QD=28.43;SB=-0.01;sumGLbyD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.11:573,57,0 12077-ref 1128 . T C 47.53 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.32;SB=-0.01;sumGLbyD=7.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:77.52:78,0,264 12077-ref 1140 . T G 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 12117-ref 823 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 12117-ref 845 . 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A C 65 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.83;SB=-0.01;sumGLbyD=15.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:95:95,0,102 12117-ref 1781 . A G 68.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.35;SB=-0.01;sumGLbyD=16.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:94.18:98,0,94 12117-ref 1783 . T A 74.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=14.86;SB=-0.01;sumGLbyD=20.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:44.20:104,0,44 12117-ref 1784 . T G 145.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.02;SB=-0.01;sumGLbyD=35.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:178,15,0 12117-ref 1803 . A G 143.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=28.70;SB=-0.01;sumGLbyD=35.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:176,15,0 12117-ref 1828 . T G 368.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=33.47;SB=-0.01;sumGLbyD=36.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:401,33,0 12117-ref 1853 . C G 568.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.06;MQ0=0;QD=35.56;SB=-0.01;sumGLbyD=37.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:602,48,0 12117-ref 1877 . T C 789.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.52;MQ0=0;QD=37.61;SB=-0.01;sumGLbyD=39.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:823,63,0 12117-ref 1919 . C T 896.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.87;SB=-0.01;sumGLbyD=37.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.23:930,72,0 12117-ref 1972 . G A 422.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.47;SB=-0.01;sumGLbyD=35.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:12:36.11:455,36,0 12117-ref 2013 . G C 28.96 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9578;MQ=35.53;MQ0=0;QD=4.14;SB=-0.01;sumGLbyD=8.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58.95:59,0,166 12117-ref 2018 . A G 223.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=31.89;SB=-0.01;sumGLbyD=36.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:256,21,0 12166-ref 668 . A G 195.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.56;SB=-0.01;sumGLbyD=38.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:228,18,0 12166-ref 698 . T A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=33.48;MQ0=0;QD=12.80;SB=-0.01;sumGLbyD=23.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:2:6.02:70,6,0 12166-ref 728 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 12166-ref 791 . A T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 12166-ref 872 . T A 184.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.32;SB=-0.01;sumGLbyD=30.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:16.73:214,0,17 12166-ref 980 . A T 38.78 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.93;SB=-0.01;sumGLbyD=22.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:69,0,31 12166-ref 1083 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 12200-ref 321 . T C 1233.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.69;MQ0=0;QD=37.39;SB=-0.01;sumGLbyD=38.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1267,99,0 12200-ref 370 . 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T G 153.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.61;SB=-0.01;sumGLbyD=37.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:186,15,0 12229-ref 131 . T C 356.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.67;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:390,30,0 12229-ref 624 . T A 354.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:388,30,0 12229-ref 684 . C T 256.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8653;MQ=35.72;MQ0=0;QD=32.11;SB=-29.60;sumGLbyD=36.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:290,24,0 12229-ref 685 . G C 105.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8653;MQ=35.72;MQ0=0;QD=13.14;SB=-0.01;sumGLbyD=16.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:7:98.95:135,0,99 12229-ref 795 . G A 477.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.75;SB=-0.01;sumGLbyD=39.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:511,39,0 12229-ref 828 . G A 367.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.71;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:400,30,0 12229-ref 1054 . G A 15.66 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.57;SB=-0.01;sumGLbyD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:8:45.53:46,0,215 12248-ref 51 . A C 1954.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.6972;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.53;SB=-0.01;sumGLbyD=36.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:53:99:1987,159,0 12287-ref 151 . C T 117.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 12287-ref 214 . 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C T 553.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.44;MQ0=0;QD=30.76;SB=-0.01;sumGLbyD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:18:51.12:587,51,0 12401-ref 236 . G A 1135.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.29:1169,90,0 12401-ref 286 . A T 1255.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7464;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.86;SB=-0.01;sumGLbyD=36.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:35:65.33:1288,65,0 12401-ref 448 . C A 809.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.6540;MQ=36.07;MQ0=0;QD=36.81;SB=-0.01;sumGLbyD=38.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.20:843,66,0 12401-ref 504 . C T 670.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=33.51;SB=-0.01;sumGLbyD=35.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:19:57.16:703,57,0 12401-ref 512 . 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G A 3017.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=119;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=8.7770;MQ=36.40;MQ0=0;QD=25.35;SB=-0.01;sumGLbyD=25.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,88:117:99:3047,0,783 12596-ref 1067 . C G 3338.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.4757;MQ=35.98;MQ0=0;QD=37.09;SB=-0.01;sumGLbyD=37.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:88:99:3338,265,0 12596-ref 1070 . T G 3164.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.3462;MQ=35.96;MQ0=0;QD=35.96;SB=-0.01;sumGLbyD=36.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:85:99:3198,256,0 12596-ref 1087 . A G 708.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=116;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.4485;MQ=36.30;MQ0=0;QD=6.11;SB=-0.01;sumGLbyD=6.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,29:115:99:739,0,2967 12596-ref 1119 . C T 5355.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=146;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.9572;MQ=36.51;MQ0=0;QD=36.68;SB=-0.01;sumGLbyD=36.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:142:99:5355,427,0 12596-ref 1181 . 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G A 28761.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=794;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=218.6683;MQ=34.05;MQ0=0;QD=36.22;SB=-0.01;sumGLbyD=36.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,790:793:99:28597,2225,0 12701-ref 88 . G C 10451.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=785;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=213.0876;MQ=34.04;MQ0=0;QD=13.31;SB=-0.01;sumGLbyD=10.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:493,292:780:99:8100,0,15572 12701-ref 91 . T C 7133.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=700;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=215.5059;MQ=34.16;MQ0=0;QD=10.19;SB=-0.01;sumGLbyD=7.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:502,198:697:99:5032,0,16185 12701-ref 99 . G A 7314.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=239;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.1974;MQ=29.42;MQ0=0;QD=30.61;SB=-0.01;sumGLbyD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,234:234:99:7173,565,0 12701-ref 124 . C G 14800.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=382;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.75;SB=-555.14;sumGLbyD=38.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,380:381:99:14721,1067,0 12701-ref 203 . T A 263.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9701;MQ=32.91;MQ0=0;QD=6.75;SB=18.05;sumGLbyD=7.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,14:34:99:293,0,689 12701-ref 208 . A T 978.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9701;MQ=32.11;MQ0=0;QD=29.65;SB=-29.62;sumGLbyD=30.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,31:33:30.73:1011,31,0 12701-ref 213 . T A 600.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=78;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=31.6901;MQ=27.56;MQ0=0;QD=7.70;SB=-0.01;sumGLbyD=8.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,41:60:99:631,0,832 12701-ref 222 . T C 782.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=200;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=16.1905;MQ=23.44;MQ0=0;QD=3.91;SB=-391.58;sumGLbyD=4.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:149,51:192:99:812,0,3391 12701-ref 224 . C A 6628.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=247;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=14.9818;MQ=23.37;MQ0=0;QD=26.84;SB=-470.29;sumGLbyD=26.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,243:240:99:6546,644,0 12701-ref 252 . C G 471.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=818;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=71.5560;MQ=31.37;MQ0=0;QD=0.58;SB=1945.97;sumGLbyD=0.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:732,84:807:99:501,0,21411 12701-ref 285 . A G 5863.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=844;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=67.1814;MQ=31.37;MQ0=0;QD=6.95;SB=333.75;sumGLbyD=4.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:649,191:783:99:3500,0,16999 12701-ref 357 . G A 2013.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.5843;MQ=22.98;MQ0=0;QD=23.14;SB=-335.76;sumGLbyD=23.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,83:82:99:2046,149,0 12701-ref 408 . G A 9098.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=332;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.6467;MQ=24.67;MQ0=0;QD=27.40;SB=-502.72;sumGLbyD=27.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,325:316:99:8997,881,0 12701-ref 424 . C A 7218.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=256;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=22.7093;MQ=25.21;MQ0=0;QD=28.20;SB=-182.67;sumGLbyD=27.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,245:249:99:7035,590,0 12701-ref 426 . 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A C 14459.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=474;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=5.0404;MQ=27.48;MQ0=0;QD=30.50;SB=-5427.06;sumGLbyD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,467:468:99:14311,1264,0 12701-ref 517 . G A 9711.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=333;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.5264;MQ=25.35;MQ0=0;QD=29.16;SB=-3211.84;sumGLbyD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,329:328:99:9598,903,0 12701-ref 531 . T A 5334.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=185;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=25.48;MQ0=0;QD=28.83;SB=-1461.89;sumGLbyD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,182:180:99:5292,501,0 12701-ref 703 . A C 929.76 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=141;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.4190;MQ=22.39;MQ0=0;QD=6.59;SB=-0.01;sumGLbyD=6.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,53:137:99:960,0,1852 12701-ref 884 . G A 1098 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=238;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=13.9679;MQ=23.17;MQ0=0;QD=4.61;SB=-0.01;sumGLbyD=4.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:170,68:228:99:1128,0,3827 12701-ref 919 . 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A T 1665.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.77;MQ0=0;QD=38.72;SB=-0.01;sumGLbyD=39.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1698,129,0 12761-ref 1163 . A C 680.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.79;SB=-0.01;sumGLbyD=37.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.16:713,57,0 12761-ref 1173 . A T 527.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.94;SB=-0.01;sumGLbyD=35.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.13:560,45,0 12795-ref 18 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 12795-ref 54 . A G 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:50,0,31 12795-ref 62 . A C 20.28 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27.96:50,0,28 12795-ref 67 . A G 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28.78:50,0,29 12795-ref 389 . T C 438.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.57;SB=-0.01;sumGLbyD=39.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:472,36,0 12795-ref 405 . T G 316.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8662;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.42;SB=-0.01;sumGLbyD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:40.26:347,0,40 12795-ref 512 . G A 721.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7333;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.00;SB=-0.01;sumGLbyD=39.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.19:755,57,0 12795-ref 528 . T G 638.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.58;SB=-0.01;sumGLbyD=35.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:17.18:671,17,0 12795-ref 600 . T C 350.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.00;SB=-0.01;sumGLbyD=38.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:383,30,0 12795-ref 640 . G T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=1.9325;MQ=34.39;MQ0=0;QD=19.40;SB=-0.01;sumGLbyD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:3:9.03:110,9,0 12795-ref 648 . G A 63.74 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=15.93;SB=-0.01;sumGLbyD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24.94:94,0,25 12795-ref 663 . G A 30.62 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=10.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:61,0,31 12795-ref 815 . C T 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 12795-ref 885 . C T 123.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.97;SB=-0.01;sumGLbyD=39.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:156,12,0 12807-ref 13 . A T 43.46 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.73;SB=-0.01;sumGLbyD=37.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 12807-ref 103 . T G 161.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.31;SB=-0.01;sumGLbyD=38.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:194,15,0 12807-ref 260 . C G 1241.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.0563;MQ=34.69;MQ0=0;QD=34.49;SB=-0.01;sumGLbyD=35.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:35:99:1275,105,0 12807-ref 270 . C T 662.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.5983;MQ=34.39;MQ0=0;QD=16.57;SB=-0.01;sumGLbyD=17.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,25:37:99:693,0,425 12807-ref 277 . G C 1412.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=34.52;MQ0=0;QD=33.62;SB=-0.01;sumGLbyD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:40:99:1445,120,0 12807-ref 304 . C A 1184.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.84;SB=-0.01;sumGLbyD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:33:99:1217,99,0 12807-ref 379 . A G 1432.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.74;MQ0=0;QD=36.74;SB=-0.01;sumGLbyD=37.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:38:99:1466,114,0 12807-ref 395 . C G 1230.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.70;MQ0=0;QD=36.19;SB=-0.01;sumGLbyD=37.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:33:99:1264,99,0 12807-ref 562 . A T 2364.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.9832;MQ=36.67;MQ0=0;QD=38.77;SB=-0.01;sumGLbyD=39.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2398,184,0 12807-ref 631 . T C 1818.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9734;MQ=36.59;MQ0=0;QD=37.11;SB=-0.01;sumGLbyD=37.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:48:99:1851,144,0 12807-ref 661 . T A 685.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.47;MQ0=0;QD=36.08;SB=-39.32;sumGLbyD=37.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:719,57,0 12807-ref 681 . T A 57.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=11.53;SB=3.01;sumGLbyD=17.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63.54:88,0,64 12965-ref 125 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 12965-ref 132 . G C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 12965-ref 159 . T A 85.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.59;SB=-0.01;sumGLbyD=39.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:118,9,0 12965-ref 232 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 12965-ref 445 . T C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 12965-ref 475 . C T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 12965-ref 515 . 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C T 1931.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=97;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=9.9665;MQ=22.37;MQ0=0;QD=19.91;SB=-0.01;sumGLbyD=20.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,85:96:32.47:1961,0,32 12981-ref 416 . A G 1015.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.5856;MQ=28.76;MQ0=0;QD=24.76;SB=-0.01;sumGLbyD=25.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,37:40:17.25:1048,17,0 12981-ref 418 . C T 65.69 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.4523;MQ=30.55;MQ0=0;QD=1.29;SB=-0.01;sumGLbyD=1.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,9:51:95.68:96,0,1267 12981-ref 514 . T C 3950.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.6827;MQ=35.12;MQ0=0;QD=33.77;SB=-0.01;sumGLbyD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,114:110:99:3915,328,0 12981-ref 613 . C G 6347.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.5502;MQ=35.70;MQ0=0;QD=37.78;SB=-0.01;sumGLbyD=37.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:167:99:6286,472,0 12981-ref 638 . G T 7772.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=204;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=11.2892;MQ=36.45;MQ0=0;QD=38.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,201:200:99:7742,599,0 12981-ref 687 . T G 3146.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.8469;MQ=36.51;MQ0=0;QD=38.37;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:82:99:3180,244,0 12981-ref 698 . G A 1233.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=37.38;SB=-0.01;sumGLbyD=38.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1267,99,0 12981-ref 713 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 12991-ref 210 . A G 2384.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.13;MQ0=0;QD=29.44;SB=-0.01;sumGLbyD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,79:81:99:2418,188,0 12991-ref 217 . G T 3652.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=123;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.3662;MQ=27.36;MQ0=0;QD=29.70;SB=-0.01;sumGLbyD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,121:122:99:3595,311,0 12991-ref 264 . G A 4415.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.8344;MQ=26.55;MQ0=0;QD=29.44;SB=-0.01;sumGLbyD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,147:148:99:4358,389,0 12991-ref 297 . A G 2264.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=9.5564;MQ=31.33;MQ0=0;QD=31.03;SB=-0.01;sumGLbyD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,70:70:99:2298,188,0 12991-ref 421 . A G 3188.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8319;MQ=32.56;MQ0=0;QD=33.92;SB=-0.01;sumGLbyD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,93:94:99:3222,243,0 12991-ref 442 . C T 1694.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=1.9984;MQ=28.54;MQ0=0;QD=30.81;SB=-0.01;sumGLbyD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:55:99:1727,162,0 12991-ref 448 . C T 1412.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.60;MQ0=0;QD=28.83;SB=-0.01;sumGLbyD=29.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:1446,107,0 12991-ref 474 . C T 1111.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.36;MQ0=0;QD=27.12;SB=-0.01;sumGLbyD=27.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:83.23:1145,83,0 12991-ref 490 . G T 15.64 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.57;MQ0=0;QD=1.42;SB=-0.01;sumGLbyD=4.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:45.51:46,0,234 12991-ref 491 . T C 37.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=9.50;SB=-0.01;sumGLbyD=17.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.21:68,0,47 12991-ref 497 . T A 14.37 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=2.87;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.20:44,0,105 12991-ref 572 . T G 86.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.61;SB=-0.01;sumGLbyD=12.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:116,0,153 12991-ref 590 . C T 164.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.89;SB=-0.01;sumGLbyD=39.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:197,15,0 12991-ref 597 . A G 113.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.7742;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.72;SB=-0.01;sumGLbyD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.04:146,12,0 12991-ref 614 . C T 41.26 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.63;SB=-0.01;sumGLbyD=36.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 12991-ref 624 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 12991-ref 671 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 13033-ref 687 . G T 245.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:279,21,0 13033-ref 688 . C T 246.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.20;SB=-0.01;sumGLbyD=39.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:279,21,0 13064-ref 51 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 13064-ref 110 . G T 418.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=34.89;SB=-0.01;sumGLbyD=37.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.09:452,36,0 13064-ref 155 . G A 817.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9085;MQ=36.30;MQ0=0;QD=28.18;SB=-0.01;sumGLbyD=29.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:25:35.21:850,35,0 13064-ref 171 . C A 39.90 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=8;HaplotypeScore=3.9977;MQ=36.63;MQ0=0;QD=1.48;SB=-0.01;sumGLbyD=2.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:69.89:70,0,802 13064-ref 489 . G A 1694.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7128;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.59;SB=-0.01;sumGLbyD=35.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:46:99:1728,138,0 13064-ref 609 . G T 988.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7851;MQ=36.67;MQ0=0;QD=16.21;SB=-0.01;sumGLbyD=16.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,31:61:99:1019,0,985 13064-ref 630 . C A 2093.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.6132;MQ=36.29;MQ0=0;QD=36.73;SB=-0.01;sumGLbyD=37.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2127,172,0 13064-ref 674 . A C 2397.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.38;MQ0=0;QD=36.89;SB=-0.01;sumGLbyD=37.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:63:99:2431,190,0 13064-ref 789 . A G 3188.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8661;MQ=36.53;MQ0=0;QD=37.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,85:86:99:3221,220,0 13064-ref 798 . C G 3292.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8321;MQ=36.53;MQ0=0;QD=38.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3292,259,0 13064-ref 879 . C T 1026.36 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=90;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=6.9498;MQ=36.66;MQ0=0;QD=11.40;SB=-0.01;sumGLbyD=11.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,34:89:99:1056,0,1862 13064-ref 1017 . A G 1030.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=60;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.7230;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.17;SB=-0.01;sumGLbyD=17.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,34:58:99:1060,0,844 13064-ref 1101 . 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A T 985.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9954;MQ=36.66;MQ0=0;QD=32.84;SB=-0.01;sumGLbyD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:22.84:1018,23,0 13247-ref 554 . C T 457 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=32.64;SB=-0.01;sumGLbyD=35.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:490,42,0 13247-ref 572 . G T 184.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=26.40;SB=-0.01;sumGLbyD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:218,21,0 13247-ref 573 . A T 184.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=26.40;SB=-0.01;sumGLbyD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:218,21,0 13247-ref 585 . G T 184.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=26.40;SB=-0.01;sumGLbyD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:218,21,0 13247-ref 664 . 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C G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-28.38;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 13285-ref 196 . A C 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-39.22;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 13285-ref 202 . G T 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-39.22;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 13285-ref 274 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 13291-ref 239 . A T 706.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.9977;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.64;SB=-115.74;sumGLbyD=35.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:21:60.17:739,60,0 13291-ref 396 . C T 324.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=32.49;SB=-0.01;sumGLbyD=35.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:358,30,0 13291-ref 433 . C G 650.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.44;MQ0=0;QD=36.14;SB=-0.01;sumGLbyD=37.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:684,54,0 13291-ref 453 . C T 704.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.47;MQ0=0;QD=37.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:738,57,0 13291-ref 517 . C T 1482.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.75;MQ0=0;QD=37.06;SB=-0.01;sumGLbyD=37.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:39:99:1515,117,0 13291-ref 522 . T C 1524.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.75;MQ0=0;QD=37.19;SB=-0.01;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:40:99:1558,120,0 13291-ref 649 . G A 24.20 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.03;SB=-0.01;sumGLbyD=9.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:54.18:54,0,122 13291-ref 1111 . G A 1489.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=22.5113;MQ=29.82;MQ0=0;QD=27.08;SB=-0.01;sumGLbyD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,52:53:84.93:1522,85,0 13291-ref 1112 . T A 27.75 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=40.4867;MQ=30.55;MQ0=0;QD=0.57;SB=-0.01;sumGLbyD=1.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,6:36:57.73:58,0,930 13291-ref 1113 . A G 509.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.8648;MQ=25.49;MQ0=0;QD=20.39;SB=-0.01;sumGLbyD=21.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,21:25:5.24:539,0,5 13291-ref 1114 . C G 433.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=25.94;MQ0=0;QD=20.63;SB=-0.01;sumGLbyD=22.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:20:19.91:463,0,20 13291-ref 1115 . G C 310.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=26.91;MQ0=0;QD=20.67;SB=-0.01;sumGLbyD=22.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:34.92:340,0,35 13291-ref 1119 . G T 78.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.26;SB=-0.01;sumGLbyD=37.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:111,9,0 13291-ref 1189 . C A 726.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=20.77;SB=-0.01;sumGLbyD=21.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,30:34:86.46:757,0,86 13291-ref 1191 . G A 1021.02 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=23.21;SB=-0.01;sumGLbyD=23.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,39:43:65.09:1051,0,65 13291-ref 1242 . G A 15572.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=410;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=12.3419;MQ=35.75;MQ0=0;QD=37.98;SB=-0.01;sumGLbyD=37.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,409:409:99:15549,1209,0 13291-ref 1254 . T A 17569.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=463;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.2238;MQ=35.90;MQ0=0;QD=37.95;SB=-0.01;sumGLbyD=37.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,463:460:99:17568,1384,0 13291-ref 1378 . C G 14754 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=393;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=25.0085;MQ=36.38;MQ0=0;QD=37.54;SB=-160.03;sumGLbyD=37.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,391:386:99:14718,1159,0 13291-ref 1390 . A G 12095.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=322;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=29.4620;MQ=36.24;MQ0=0;QD=37.57;SB=-160.03;sumGLbyD=37.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,318:319:99:11980,845,0 13291-ref 1407 . C T 13119.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=346;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=11.1242;MQ=36.56;MQ0=0;QD=37.92;SB=-592.32;sumGLbyD=37.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,343:341:99:13118,1026,0 13291-ref 1466 . C T 4660.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.8711;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.20;SB=-435.78;sumGLbyD=38.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:120:99:4660,361,0 13291-ref 1479 . 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G A 1063.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8894;MQ=33.82;MQ0=0;QD=32.24;SB=-0.01;sumGLbyD=33.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:59.27:1097,59,0 13291-ref 1677 . G A 1078.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9953;MQ=33.71;MQ0=0;QD=33.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.25:1111,96,0 13291-ref 1683 . A T 160.69 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9953;MQ=27.57;MQ0=0;QD=14.61;SB=-0.01;sumGLbyD=17.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:42.57:191,0,43 13360-ref 26 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 13360-ref 123 . A T 16.45 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.5572;MQ=23.00;MQ0=0;QD=4.11;SB=-0.01;sumGLbyD=11.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:3:18.66:46,0,19 13360-ref 473 . A C 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:50,0,31 13360-ref 476 . C T 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:50,0,31 13360-ref 501 . C G 14.37 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=2.87;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.20:44,0,105 13360-ref 569 . G A 155.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.16;SB=-0.01;sumGLbyD=37.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:189,15,0 13360-ref 594 . G T 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 13360-ref 763 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 13407-ref 100 . G A 3294.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.4681;MQ=36.88;MQ0=0;QD=37.87;SB=-0.01;sumGLbyD=37.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:85:99:3295,256,0 13407-ref 184 . G C 102.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.81;MQ0=0;QD=25.54;SB=-54.09;sumGLbyD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:135,12,0 13407-ref 235 . T A 4454.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7334;MQ=30.13;MQ0=0;QD=31.37;SB=-114.07;sumGLbyD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:140:99:4451,421,0 13407-ref 273 . T C 1791.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=137;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.3699;MQ=31.35;MQ0=0;QD=13.07;SB=-65.07;sumGLbyD=13.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,66:137:99:1821,0,1987 13407-ref 306 . C A 563.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.9014;MQ=28.86;MQ0=0;QD=11.50;SB=-0.01;sumGLbyD=12.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:48:99:594,0,554 13407-ref 307 . C T 1316.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4357;MQ=28.40;MQ0=0;QD=29.27;SB=-0.01;sumGLbyD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1350,132,0 13473-ref 115 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 13473-ref 351 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 13473-ref 372 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 13511-ref 18 . A G 2517.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.3256;MQ=36.55;MQ0=0;QD=37.58;SB=-0.01;sumGLbyD=38.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2551,202,0 13511-ref 45 . T A 5809.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=150;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=9.1185;MQ=36.80;MQ0=0;QD=38.73;SB=-0.01;sumGLbyD=38.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,149:149:99:5810,448,0 13511-ref 151 . C T 2393.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5707;MQ=34.85;MQ0=0;QD=35.20;SB=-29.63;sumGLbyD=35.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:67:99:2427,199,0 13511-ref 156 . A G 1595.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7871;MQ=34.14;MQ0=0;QD=33.25;SB=-0.01;sumGLbyD=33.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:46:99:1629,138,0 13511-ref 169 . G A 773.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.19;MQ0=0;QD=29.73;SB=-0.01;sumGLbyD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.16:806,78,0 13511-ref 179 . C G 629.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.64;MQ0=0;QD=27.35;SB=-0.01;sumGLbyD=28.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:22:66.13:662,66,0 13511-ref 224 . G A 927.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.15;MQ0=0;QD=33.13;SB=-0.01;sumGLbyD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.21:961,84,0 13511-ref 230 . C T 528.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.15;MQ0=0;QD=18.88;SB=-0.01;sumGLbyD=19.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,20:28:99:559,0,232 13511-ref 244 . T C 248.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=34.09;MQ0=0;QD=13.78;SB=-0.01;sumGLbyD=15.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:17:99:278,0,221 13511-ref 259 . A G 76.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.85;MQ0=0;QD=7.70;SB=-0.01;sumGLbyD=10.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:107,0,195 13511-ref 269 . C T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=19.40;SB=-0.01;sumGLbyD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.03:110,9,0 13511-ref 514 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 13511-ref 515 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 13511-ref 516 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 13511-ref 547 . T A 50.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.4995;MQ=24.95;MQ0=0;QD=5.66;SB=-0.01;sumGLbyD=9.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,3:3:9.01:83,9,0 13511-ref 578 . 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G T 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 13559-ref 91 . A T 442.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.88;SB=-0.01;sumGLbyD=39.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:476,36,0 13559-ref 194 . T C 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-79.31;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 13559-ref 272 . G A 821.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8583;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.35;SB=-40.01;sumGLbyD=38.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.21:855,66,0 13559-ref 380 . T C 716.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.19:749,57,0 13626-ref 83 . T C 15.69 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=2.24;SB=-0.01;sumGLbyD=6.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:45.57:46,0,155 13626-ref 127 . T G 623.35 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8549;MQ=36.66;MQ0=0;QD=20.78;SB=-0.01;sumGLbyD=21.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,20:29:99:653,0,300 13626-ref 139 . C A 791.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9882;MQ=36.71;MQ0=0;QD=22.61;SB=-0.01;sumGLbyD=23.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,25:34:99:821,0,291 13626-ref 202 . G T 341.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=34.93;MQ0=0;QD=22.75;SB=-0.01;sumGLbyD=24.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:14:74.17:371,0,74 13626-ref 204 . A C 371.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=34.78;MQ0=0;QD=26.51;SB=-0.01;sumGLbyD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:33.14:401,0,33 13626-ref 232 . C A 246.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=30.78;SB=-0.01;sumGLbyD=34.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:279,24,0 13626-ref 239 . C A 40.83 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=6.80;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:70.82:71,0,102 13626-ref 275 . T G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 13626-ref 276 . T A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 13626-ref 380 . G A 400.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.2987;MQ=34.64;MQ0=0;QD=18.22;SB=-0.01;sumGLbyD=19.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:21:99:431,0,217 13626-ref 421 . T C 672.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=32.22;MQ0=0;QD=24.91;SB=-0.01;sumGLbyD=26.02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,23:27:78.81:703,0,79 13626-ref 437 . C G 372.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=29.79;MQ0=0;QD=21.93;SB=-0.01;sumGLbyD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:17:39.08:406,39,0 13626-ref 439 . C A 271.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=18.10;SB=-0.01;sumGLbyD=20.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:99:302,0,115 13626-ref 465 . G C 334.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.93;MQ0=0;QD=30.40;SB=-0.01;sumGLbyD=33.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.08:367,33,0 13626-ref 520 . C G 83.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 13626-ref 529 . G T 11.52 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=1.65;SB=-0.01;sumGLbyD=5.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:6:41.19:41,0,138 13626-ref 550 . G T 64.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=8.05;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:94.43:94,0,124 13626-ref 584 . T A 158.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=26.35;SB=-0.01;sumGLbyD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:191,18,0 13626-ref 592 . G C 70.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=11.74;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:56.32:100,0,56 13626-ref 622 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 13638-ref 677 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 13659-ref 71 . T A 255.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.22;MQ0=0;QD=31.99;SB=-0.01;sumGLbyD=36.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:289,24,0 13659-ref 107 . C T 170.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.24;MQ0=0;QD=28.45;SB=-0.01;sumGLbyD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:204,18,0 13659-ref 141 . C G 35 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.81;MQ0=0;QD=17.50;SB=-0.01;sumGLbyD=33.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:66,6,0 13659-ref 328 . A T 133.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=22.19;SB=-0.01;sumGLbyD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.02:166,18,0 13659-ref 359 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 13659-ref 390 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 13659-ref 404 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 13792-ref 68 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 13792-ref 89 . G A 120.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.14;SB=-0.01;sumGLbyD=38.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:153,12,0 13792-ref 176 . T C 672.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9732;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.61;SB=-0.01;sumGLbyD=35.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:20:54.17:705,54,0 13792-ref 242 . G T 494.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:527,42,0 13792-ref 340 . T C 667.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.47;MQ0=0;QD=35.14;SB=-0.01;sumGLbyD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.17:701,57,0 13792-ref 366 . G A 872.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=36.34;SB=-0.01;sumGLbyD=37.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.22:905,72,0 13792-ref 376 . A C 806.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.58;MQ0=0;QD=33.62;SB=-0.01;sumGLbyD=35.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:22:66.21:840,66,0 13792-ref 481 . C T 422.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.77;MQ0=0;QD=32.46;SB=-0.01;sumGLbyD=35.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.09:455,39,0 13792-ref 513 . A G 157.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=29.55;MQ0=0;QD=26.31;SB=-0.01;sumGLbyD=31.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:191,18,0 13792-ref 518 . G T 75.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=10.85;SB=-0.01;sumGLbyD=15.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:87.15:106,0,87 13792-ref 583 . A C 616.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.44;MQ0=0;QD=34.27;SB=-0.01;sumGLbyD=36.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:17:51.16:650,51,0 13792-ref 938 . C T 1066.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.08;SB=-0.01;sumGLbyD=39.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.27:1099,84,0 13792-ref 1196 . G A 1064.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.3345;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.26;SB=-0.01;sumGLbyD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,30:32:36.82:1097,37,0 13792-ref 1527 . G T 855.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.69;SB=-0.01;sumGLbyD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,25:27:2.44:885,1,0 13792-ref 1535 . C T 1303.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.35;SB=-0.01;sumGLbyD=39.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1337,102,0 13792-ref 1555 . G A 1375.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4685;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.27;SB=-0.01;sumGLbyD=36.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:77.39:1408,77,0 13792-ref 1665 . A C 2268.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.46;SB=-0.01;sumGLbyD=39.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2302,178,0 13798-ref 277 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 13798-ref 290 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 13985-ref 333 . T C 12.42 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9998;MQ=36.07;MQ0=0;QD=1.13;SB=-0.01;sumGLbyD=3.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:42.16:42,0,308 13985-ref 498 . C T 244.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.99;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:278,21,0 13985-ref 718 . G C 215.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9933;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.59;SB=-0.01;sumGLbyD=22.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:246,0,122 13985-ref 927 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 14057-ref 114 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 14057-ref 260 . A G 159.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.85;SB=-0.01;sumGLbyD=38.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:192,15,0 14057-ref 311 . G A 370.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8579;MQ=35.24;MQ0=0;QD=9.04;SB=-0.01;sumGLbyD=9.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,15:40:99:400,0,850 14057-ref 321 . A G 323.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.4601;MQ=35.47;MQ0=0;QD=6.89;SB=-0.01;sumGLbyD=7.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,15:46:99:354,0,1091 14057-ref 339 . 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A G 31.82 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=15.91;SB=-0.01;sumGLbyD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:63,6,0 14067-ref 160 . G C 3551.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.2908;MQ=23.88;MQ0=0;QD=27.53;SB=-0.01;sumGLbyD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:126:99:3549,378,0 14067-ref 231 . T G 11771.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=318;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=15.2780;MQ=36.62;MQ0=0;QD=37.02;SB=-0.01;sumGLbyD=36.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,316:309:99:11708,904,0 14067-ref 397 . G A 11767.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=319;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=18.6131;MQ=36.46;MQ0=0;QD=36.89;SB=-0.01;sumGLbyD=36.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,316:312:99:11726,899,0 14067-ref 415 . C A 11143.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=292;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=26.7827;MQ=36.51;MQ0=0;QD=38.16;SB=-0.01;sumGLbyD=37.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,288:289:99:11040,767,0 14067-ref 482 . G A 3581.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7936;MQ=36.47;MQ0=0;QD=37.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:94:99:3581,283,0 14067-ref 505 . C T 1285.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.9774;MQ=35.53;MQ0=0;QD=36.73;SB=-0.01;sumGLbyD=37.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1318,105,0 14067-ref 515 . A T 102.24 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=30.07;MQ0=0;QD=12.78;SB=-0.01;sumGLbyD=16.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:77.80:132,0,78 14067-ref 516 . T C 94.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=23.54;SB=-0.01;sumGLbyD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:127,12,0 14067-ref 531 . G C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 14093-ref 25 . G A 297.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.01;SB=-0.01;sumGLbyD=36.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:330,27,0 14093-ref 153 . T A 118 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.50;SB=-0.01;sumGLbyD=37.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 14114-ref 491 . T G 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 14121-ref 1102 . G A 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 14121-ref 1103 . A C 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 14121-ref 1108 . G A 136.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=22.82;SB=-0.01;sumGLbyD=28.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.01:170,18,0 14121-ref 1114 . G A 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 14121-ref 1151 . T A 75.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.21;SB=-0.01;sumGLbyD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:108,9,0 14121-ref 1184 . T C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 14122-ref 283 . C G 75.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9999;MQ=26.28;MQ0=0;QD=15.02;SB=-21.73;sumGLbyD=21.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:14.61:105,0,15 14122-ref 428 . G A 73.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.39;SB=-0.01;sumGLbyD=25.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:104,0,28 14122-ref 496 . G C 65.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.14;SB=-0.01;sumGLbyD=19.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63.53:96,0,64 14122-ref 501 . G T 33.55 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.71;SB=-0.01;sumGLbyD=12.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63.54:64,0,90 14122-ref 583 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 14122-ref 607 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 14122-ref 621 . 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A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 14123-ref 450 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 14281-ref 59 . T A 320.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.66;SB=-0.01;sumGLbyD=39.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:354,27,0 14281-ref 111 . A G 380.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.62;SB=-0.01;sumGLbyD=37.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.08:414,33,0 14281-ref 116 . T G 407.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.01;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:440,33,0 14281-ref 120 . G C 64.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.58;SB=-0.01;sumGLbyD=5.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:94.47:94,0,473 14281-ref 121 . C T 129.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.18;SB=-0.01;sumGLbyD=7.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:99:160,0,500 14281-ref 837 . C T 1292.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=24.19;MQ0=0;QD=28.10;SB=-0.01;sumGLbyD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1325,138,0 14281-ref 853 . A T 1292.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.19;MQ0=0;QD=28.10;SB=-0.01;sumGLbyD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1325,138,0 14281-ref 854 . C G 1292.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.19;MQ0=0;QD=28.10;SB=-0.01;sumGLbyD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1325,138,0 14281-ref 882 . G A 583.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=27.77;SB=-0.01;sumGLbyD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.10:616,63,0 14282-ref 33 . T G 82.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:114,9,0 14282-ref 69 . G A 146.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:179,15,0 14282-ref 78 . A G 105.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.33;SB=-0.01;sumGLbyD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:138,12,0 14282-ref 103 . T G 132.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9998;MQ=32.73;MQ0=0;QD=26.44;SB=-0.01;sumGLbyD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:165,15,0 14282-ref 107 . A G 27.22 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9999;MQ=33.48;MQ0=0;QD=4.54;SB=-0.01;sumGLbyD=9.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57.21:57,0,121 14282-ref 114 . G C 184.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9999;MQ=33.48;MQ0=0;QD=30.83;SB=-0.01;sumGLbyD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:218,18,0 14282-ref 267 . G C 541.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.11;SB=-0.01;sumGLbyD=38.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:575,45,0 14282-ref 325 . T C 174.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=19.37;SB=-0.01;sumGLbyD=22.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:81.12:204,0,81 14282-ref 335 . A C 184.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=30.70;SB=-0.01;sumGLbyD=36.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:217,18,0 14282-ref 354 . T C 153.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.65;SB=-0.01;sumGLbyD=37.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:186,15,0 14282-ref 380 . G A 458.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.42;MQ0=0;QD=35.28;SB=-0.01;sumGLbyD=37.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:492,39,0 14282-ref 383 . T C 495.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.41;SB=-0.01;sumGLbyD=37.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:529,42,0 14282-ref 447 . G C 761.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.14;MQ0=0;QD=34.63;SB=-0.01;sumGLbyD=36.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.18:795,66,0 14282-ref 456 . A T 602.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.86;MQ0=0;QD=33.47;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.14:635,54,0 14282-ref 477 . G A 684.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.30;MQ0=0;QD=34.24;SB=-0.01;sumGLbyD=35.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.15:718,60,0 14282-ref 497 . A C 806.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=33.61;SB=-0.01;sumGLbyD=34.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.19:840,69,0 14282-ref 569 . A T 333.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.85;MQ0=0;QD=33.31;SB=-0.01;sumGLbyD=36.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:366,30,0 14282-ref 589 . A G 46.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=28.48;MQ0=0;QD=11.71;SB=-0.01;sumGLbyD=19.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.98:77,0,28 14282-ref 593 . C A 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.29:50,0,30 14282-ref 681 . G C 126.76 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=18.11;SB=-0.01;sumGLbyD=22.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15.09:157,0,15 14282-ref 694 . T G 126.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=18.10;SB=-0.01;sumGLbyD=22.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18.96:157,0,19 14282-ref 716 . G T 180.04 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.60;MQ0=0;QD=20.00;SB=-0.01;sumGLbyD=23.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12.95:210,0,13 14282-ref 727 . T G 180.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.60;MQ0=0;QD=20.01;SB=-0.01;sumGLbyD=23.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:10.74:210,0,11 14282-ref 743 . G A 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29.56:50,0,30 14282-ref 748 . G C 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:50,0,31 14282-ref 790 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 14282-ref 805 . G A 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 14282-ref 810 . A G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 14282-ref 838 . T A 184.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9658;MQ=28.48;MQ0=0;QD=23.10;SB=-0.01;sumGLbyD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:8:21.04:218,21,0 14282-ref 857 . G C 163.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=27.24;SB=-0.01;sumGLbyD=32.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:196,18,0 14335-ref 132 . G C 827.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8499;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.59;SB=-0.01;sumGLbyD=39.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.21:860,66,0 14335-ref 263 . T C 327.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.71;SB=-0.01;sumGLbyD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.09:360,27,0 14335-ref 317 . G T 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 14335-ref 327 . T C 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 14335-ref 333 . A T 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 14335-ref 337 . C T 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 14390-ref 200 . C G 800.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9963;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.20:834,66,0 14390-ref 291 . G A 628.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9734;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.94;SB=-0.01;sumGLbyD=36.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:17:51.16:662,51,0 14390-ref 408 . T G 14.38 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=6.9968;MQ=32.83;MQ0=0;QD=1.80;SB=-0.01;sumGLbyD=5.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:5:44.21:44,0,93 14390-ref 438 . G T 112.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.04;SB=-0.01;sumGLbyD=36.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:145,12,0 14390-ref 538 . A C 112.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.10;SB=-0.01;sumGLbyD=36.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:145,12,0 14390-ref 560 . G T 112.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.10;SB=-0.01;sumGLbyD=36.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:145,12,0 14394-ref 37 . A G 247.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.30;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:280,21,0 14394-ref 48 . T G 391.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.55;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:424,33,0 14410-ref 426 . T C 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.84;MQ0=0;QD=17.31;SB=-0.01;sumGLbyD=23.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:3:9.03:119,9,0 14410-ref 430 . C A 82.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:114,9,0 14410-ref 682 . G A 266.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=21.51;MQ0=0;QD=14.81;SB=-43.38;sumGLbyD=16.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,14:18:64.52:297,0,65 14410-ref 683 . C T 436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=21.51;MQ0=0;QD=24.22;SB=-49.38;sumGLbyD=26.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:53.97:469,54,0 14410-ref 684 . T C 61.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=21.70;MQ0=0;QD=3.22;SB=5.98;sumGLbyD=4.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:91.14:91,0,294 14410-ref 717 . A G 261.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9787;MQ=31.18;MQ0=0;QD=6.08;SB=5.98;sumGLbyD=6.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,12:43:99:292,0,874 14410-ref 747 . A G 1936.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9988;MQ=31.29;MQ0=0;QD=27.67;SB=-76.99;sumGLbyD=28.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:55:99:1970,165,0 14410-ref 756 . C T 482.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=69;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6938;MQ=31.07;MQ0=0;QD=6.99;SB=-68.35;sumGLbyD=7.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,26:43:99:512,0,892 14410-ref 1110 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 14410-ref 1133 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-38.76;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 14410-ref 1147 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-38.76;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 14488-ref 71 . A T 235.88 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.10;SB=-0.01;sumGLbyD=14.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:266,0,344 14488-ref 76 . T G 783.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.30;SB=-0.01;sumGLbyD=38.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:816,63,0 14488-ref 167 . G A 866.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.66;SB=-0.01;sumGLbyD=39.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.22:899,69,0 14488-ref 230 . T C 1066.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4022;MQ=36.65;MQ0=0;QD=36.77;SB=-0.01;sumGLbyD=37.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.26:1099,87,0 14488-ref 287 . T C 336.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.3011;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.02;SB=-0.01;sumGLbyD=15.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:366,0,441 14488-ref 320 . C T 837.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.05;SB=-0.01;sumGLbyD=39.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.22:870,66,0 14488-ref 360 . A G 838.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.09;SB=-0.01;sumGLbyD=39.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.22:871,66,0 14488-ref 385 . G A 555.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.04;SB=-0.01;sumGLbyD=39.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:589,45,0 14488-ref 422 . G A 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 14488-ref 493 . G C 312.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.77;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:346,27,0 14488-ref 494 . G A 299.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.25;SB=-0.01;sumGLbyD=36.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:332,27,0 14488-ref 582 . A G 684.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8499;MQ=35.98;MQ0=0;QD=34.20;SB=-0.01;sumGLbyD=35.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:19:57.17:717,57,0 14488-ref 589 . A G 186.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=35.80;MQ0=0;QD=10.96;SB=-0.01;sumGLbyD=12.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:216,0,313 14488-ref 689 . C T 733.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.6208;MQ=36.52;MQ0=0;QD=34.95;SB=-0.01;sumGLbyD=36.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:20:60.19:767,60,0 14488-ref 743 . C T 226.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=32.37;SB=-0.01;sumGLbyD=37.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:260,21,0 14488-ref 746 . C G 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 14493-ref 98 . G T 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 14493-ref 105 . A T 96.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:129,12,0 14493-ref 143 . C T 155.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=31.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:188,18,0 14493-ref 150 . T C 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 14493-ref 152 . C T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 14493-ref 181 . A G 417.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=34.82;SB=-0.01;sumGLbyD=37.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:451,36,0 14493-ref 207 . G A 360.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.01;SB=-0.01;sumGLbyD=39.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:393,30,0 14493-ref 268 . A C 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 14493-ref 271 . C T 85.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.36;SB=-0.01;sumGLbyD=39.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:117,9,0 14493-ref 337 . A G 243.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9713;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.23;SB=-0.01;sumGLbyD=18.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:273,0,233 14493-ref 343 . T A 472.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9734;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.33;SB=-0.01;sumGLbyD=38.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:505,39,0 14493-ref 371 . A T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 14493-ref 383 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 14493-ref 432 . T G 166.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 14493-ref 452 . T C 196.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:230,18,0 14493-ref 489 . A G 337.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.67;SB=-0.01;sumGLbyD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:6.90:367,0,7 14493-ref 509 . A T 673.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.69;SB=-0.01;sumGLbyD=35.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:20.19:707,20,0 14493-ref 566 . T C 912.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6988;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.49;SB=-0.01;sumGLbyD=37.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.23:945,75,0 14493-ref 611 . T C 481.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.45;SB=-0.01;sumGLbyD=12.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:41:99:511,0,831 14493-ref 613 . T G 597.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.00;SB=-0.01;sumGLbyD=13.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,20:45:99:628,0,840 14493-ref 720 . G A 12421.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=323;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=27.9961;MQ=36.72;MQ0=0;QD=38.46;SB=-0.01;sumGLbyD=38.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,320:319:99:12348,887,0 14493-ref 769 . C T 10320.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=295;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=9.2251;MQ=36.23;MQ0=0;QD=34.98;SB=-0.01;sumGLbyD=34.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,290:279:99:10262,807,0 14493-ref 808 . G A 9820.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=258;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=17.9495;MQ=36.12;MQ0=0;QD=38.07;SB=-229.66;sumGLbyD=38.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,258:256:99:9820,770,0 14493-ref 827 . A G 7320.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=190;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7552;MQ=36.14;MQ0=0;QD=38.53;SB=-240.04;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,189:189:99:7320,569,0 14493-ref 871 . C T 32.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=23.9884;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.73;SB=12.02;sumGLbyD=3.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:62.84:63,0,547 14493-ref 882 . A T 1164.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9654;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:31:93.30:1198,93,0 14493-ref 972 . T A 2260.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=33.60;MQ0=0;QD=34.78;SB=-0.01;sumGLbyD=35.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2294,193,0 14493-ref 987 . C T 1394.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=31.72;MQ0=0;QD=34.01;SB=-0.01;sumGLbyD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1428,123,0 14493-ref 995 . G A 1263.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.5210;MQ=31.42;MQ0=0;QD=32.39;SB=-0.01;sumGLbyD=33.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:38:99:1296,114,0 14493-ref 1002 . T C 137.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6548;MQ=29.55;MQ0=0;QD=5.74;SB=-0.01;sumGLbyD=6.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:23:99:168,0,456 14493-ref 1029 . G A 205.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=29.37;SB=-0.01;sumGLbyD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:239,21,0 14493-ref 1049 . C T 115.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.93;SB=-0.01;sumGLbyD=37.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:148,12,0 14594-ref 14 . G C 217.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=6.04;SB=-91.45;sumGLbyD=6.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:99:247,0,602 14594-ref 15 . A G 350.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=8.55;SB=-171.30;sumGLbyD=9.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,17:40:99:380,0,561 14594-ref 43 . C A 1534.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.69;MQ0=0;QD=30.08;SB=-640.50;sumGLbyD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1567,153,0 14594-ref 49 . T C 524.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.69;MQ0=0;QD=10.29;SB=-87.99;sumGLbyD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:50:99:555,0,674 14594-ref 51 . T A 651.35 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.69;MQ0=0;QD=12.77;SB=-244.34;sumGLbyD=13.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,27:48:99:681,0,497 14594-ref 77 . T G 494.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=26.69;MQ0=0;QD=9.69;SB=-61.37;sumGLbyD=10.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,23:50:99:524,0,698 14594-ref 78 . C T 501.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.4692;MQ=26.69;MQ0=0;QD=9.82;SB=-61.37;sumGLbyD=10.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,24:50:99:531,0,702 14594-ref 89 . A G 469.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9987;MQ=30.37;MQ0=0;QD=31.29;SB=-127.45;sumGLbyD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.11:502,45,0 14594-ref 93 . A T 46.86 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=11.72;SB=9.97;sumGLbyD=19.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:22.33:77,0,22 14594-ref 278 . C A 1527.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.9951;MQ=36.20;MQ0=0;QD=38.18;SB=-0.01;sumGLbyD=39.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1560,120,0 14594-ref 298 . A T 21.78 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9984;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.28;SB=-0.01;sumGLbyD=3.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:17:51.75:52,0,456 14594-ref 312 . T C 365.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.56;SB=-0.01;sumGLbyD=39.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:399,30,0 14594-ref 334 . C T 245.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:279,21,0 14594-ref 354 . A G 39.56 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.19;SB=-0.01;sumGLbyD=23.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:70,0,31 14597-ref 612 . T C 684.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7860;MQ=22.45;MQ0=0;QD=20.74;SB=-83.00;sumGLbyD=21.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:26:78.07:717,78,0 14597-ref 822 . T G 3663.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8946;MQ=36.04;MQ0=0;QD=37.77;SB=-1594.63;sumGLbyD=37.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:97:99:3663,292,0 14597-ref 842 . 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G C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 14602-ref 333 . G A 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 14602-ref 359 . T A 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 14602-ref 377 . G A 103.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=25.84;SB=-0.01;sumGLbyD=34.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:136,12,0 14602-ref 400 . A G 26.06 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.02;MQ0=0;QD=13.03;SB=-0.01;sumGLbyD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:57,6,0 14602-ref 435 . A G 26.06 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.02;MQ0=0;QD=13.03;SB=-0.01;sumGLbyD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:57,6,0 14643-ref 26 . T C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 14643-ref 200 . G C 623.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.67;SB=-0.01;sumGLbyD=38.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:656,51,0 14643-ref 427 . T A 309.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.42;SB=-0.01;sumGLbyD=38.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:343,27,0 14643-ref 428 . G C 305.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.91;SB=-0.01;sumGLbyD=37.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:338,27,0 14643-ref 533 . 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T C 795.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4930;MQ=35.66;MQ0=0;QD=34.57;SB=-0.01;sumGLbyD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:22:66.20:828,66,0 14643-ref 1053 . T C 1280.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8633;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.59;SB=-0.01;sumGLbyD=37.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:34:99:1314,102,0 14643-ref 1125 . T C 1939.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.80;MQ0=0;QD=38.03;SB=-0.01;sumGLbyD=38.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1972,153,0 14643-ref 1152 . T C 1859.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.3988;MQ=36.79;MQ0=0;QD=37.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1892,147,0 14643-ref 1211 . A C 1513.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.84;SB=-0.01;sumGLbyD=38.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1547,120,0 14643-ref 1278 . C T 1355.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=35.05;MQ0=0;QD=36.64;SB=-0.01;sumGLbyD=37.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1389,111,0 14643-ref 1302 . G A 1118.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4679;MQ=33.82;MQ0=0;QD=33.90;SB=-0.01;sumGLbyD=34.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:32:96.27:1152,96,0 14643-ref 1309 . G C 1067.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.46;MQ0=0;QD=32.34;SB=-0.01;sumGLbyD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:69.64:1100,70,0 14643-ref 1348 . C T 1073.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=33.53;SB=-0.01;sumGLbyD=34.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:31:93.25:1106,93,0 14643-ref 1365 . G A 1359 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=34.88;MQ0=0;QD=34.85;SB=-0.01;sumGLbyD=35.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:38:99:1392,114,0 14643-ref 1372 . A C 1327.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.33;MQ0=0;QD=35.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1360,111,0 14643-ref 1565 . A G 14.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.35;SB=-0.01;sumGLbyD=4.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:44.70:45,0,316 14643-ref 1566 . T A 14.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.35;SB=-0.01;sumGLbyD=4.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:44.70:45,0,317 14676-ref 52 . G A 80.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.03;SB=-0.01;sumGLbyD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.03:112,9,0 14676-ref 113 . G C 431.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.92;SB=-0.01;sumGLbyD=38.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:464,36,0 14676-ref 159 . A G 628.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=34.94;SB=-0.01;sumGLbyD=36.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.16:662,54,0 14676-ref 161 . C T 552.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=36.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:585,48,0 14676-ref 221 . T A 506.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=33.79;SB=-0.01;sumGLbyD=35.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:540,45,0 14676-ref 222 . A C 506.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=33.76;SB=-0.01;sumGLbyD=35.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:539,45,0 14676-ref 270 . G C 210.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=30.00;SB=-0.01;sumGLbyD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:243,21,0 14676-ref 291 . C A 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 14676-ref 316 . A T 107.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=26.91;SB=-0.01;sumGLbyD=35.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:140,12,0 14676-ref 381 . G C 231.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:264,21,0 14676-ref 385 . C G 231.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.04;SB=-0.01;sumGLbyD=37.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:264,21,0 14676-ref 395 . T A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 14694-ref 70 . 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G C 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 14723-ref 327 . C A 70.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.36;SB=-0.01;sumGLbyD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:102,9,0 14723-ref 328 . A C 75.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.13;SB=-0.01;sumGLbyD=35.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:107,9,0 14723-ref 588 . G C 6519.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=235;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.8364;MQ=24.39;MQ0=0;QD=27.74;SB=-0.01;sumGLbyD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,234:230:99:6487,663,0 14723-ref 599 . A G 7316.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=259;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.3073;MQ=24.39;MQ0=0;QD=28.25;SB=-0.01;sumGLbyD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,258:258:99:7283,747,0 14723-ref 681 . C T 1315.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=2.9122;MQ=23.59;MQ0=0;QD=27.41;SB=-0.01;sumGLbyD=28.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1349,144,0 14723-ref 683 . C T 50.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9122;MQ=23.25;MQ0=0;QD=1.23;SB=-0.01;sumGLbyD=1.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:80.31:80,0,817 14723-ref 686 . G C 64.69 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9989;MQ=23.38;MQ0=0;QD=2.40;SB=-0.01;sumGLbyD=3.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,6:27:94.68:95,0,500 14723-ref 871 . C G 1231.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7329;MQ=34.25;MQ0=0;QD=31.59;SB=-148.12;sumGLbyD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:38:86.60:1265,87,0 14723-ref 875 . C G 1832.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7329;MQ=34.44;MQ0=0;QD=33.94;SB=-148.12;sumGLbyD=34.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,53:52:99:1866,156,0 14723-ref 894 . G C 2795.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8676;MQ=34.96;MQ0=0;QD=32.13;SB=-148.12;sumGLbyD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:78:99:2828,235,0 14723-ref 935 . C T 1757.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6794;MQ=34.85;MQ0=0;QD=33.17;SB=-0.01;sumGLbyD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:52:99:1791,118,0 14723-ref 960 . G A 337.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.91;MQ0=0;QD=26.00;SB=-0.01;sumGLbyD=28.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:2.76:367,1,0 14723-ref 966 . G C 73.47 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=14.69;SB=-0.01;sumGLbyD=20.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.97:103,0,25 14723-ref 968 . C G 46.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=11.71;SB=-0.01;sumGLbyD=19.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.98:77,0,28 14764-ref 80 . 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C A 202.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.74;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 14764-ref 320 . T C 4156.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.5659;MQ=36.91;MQ0=0;QD=39.21;SB=-0.01;sumGLbyD=39.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:106:99:4156,319,0 14764-ref 527 . T A 2483.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.4860;MQ=36.69;MQ0=0;QD=38.21;SB=-0.01;sumGLbyD=38.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,65:65:99:2516,196,0 14764-ref 555 . T C 259.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.3348;MQ=36.07;MQ0=0;QD=23.59;SB=-0.01;sumGLbyD=26.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45.48:289,0,45 14764-ref 559 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 14764-ref 568 . 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G A 148.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=29.69;SB=-0.01;sumGLbyD=36.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:181,15,0 14765-ref 347 . G A 541.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=33.87;SB=-0.01;sumGLbyD=35.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.13:575,48,0 14765-ref 389 . C G 574.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=31.90;SB=-0.01;sumGLbyD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.12:607,54,0 14765-ref 398 . C A 552.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=30.72;SB=-0.01;sumGLbyD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:17:51.13:586,51,0 14765-ref 409 . A G 725.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=32.63;MQ0=0;QD=32.96;SB=-0.01;sumGLbyD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.15:758,66,0 14765-ref 461 . C A 717.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.04;MQ0=0;QD=32.62;SB=-0.01;sumGLbyD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.16:751,66,0 14765-ref 471 . C T 692.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.04;MQ0=0;QD=31.50;SB=-0.01;sumGLbyD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:21:63.16:726,63,0 14765-ref 491 . C T 714.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=28.58;SB=-0.01;sumGLbyD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:24:72.13:747,72,0 14765-ref 506 . T C 529.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=27.89;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.11:563,57,0 14765-ref 524 . T C 529.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8675;MQ=30.91;MQ0=0;QD=29.42;SB=-0.01;sumGLbyD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:17:51.12:563,51,0 14765-ref 525 . C A 541.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.26;MQ0=0;QD=28.49;SB=-0.01;sumGLbyD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:35.45:574,35,0 14765-ref 849 . T C 824.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.9897;MQ=36.58;MQ0=0;QD=34.37;SB=-0.01;sumGLbyD=35.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:66.21:858,66,0 14765-ref 1065 . C G 133.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.28;SB=-57.45;sumGLbyD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.95:164,0,22 14765-ref 1067 . A T 30.55 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.18;SB=-0.01;sumGLbyD=20.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:61,0,31 14768-ref 66 . T A 31.45 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.72;SB=-0.01;sumGLbyD=31.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 14768-ref 140 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 14849-ref 19 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 14849-ref 44 . A G 161.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.40;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:195,15,0 14849-ref 60 . T C 227.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.51;SB=-0.01;sumGLbyD=37.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:260,21,0 14849-ref 128 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 14849-ref 192 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 14849-ref 357 . G T 14.37 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=2.87;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.20:44,0,105 14849-ref 361 . A T 14.37 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=2.87;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.20:44,0,105 14849-ref 364 . G T 14.37 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=2.87;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.20:44,0,105 14849-ref 365 . C T 145.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.17;SB=-0.01;sumGLbyD=35.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:179,15,0 14849-ref 459 . T C 36.55 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.14;SB=-0.01;sumGLbyD=16.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66.54:67,0,68 14892-ref 191 . A T 360.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.77;SB=-0.01;sumGLbyD=35.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.10:393,30,0 14892-ref 281 . G A 1213.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=36.69;MQ0=0;QD=36.77;SB=-0.01;sumGLbyD=37.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.31:1246,96,0 14892-ref 306 . A G 882.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.5661;MQ=36.65;MQ0=0;QD=30.42;SB=-0.01;sumGLbyD=31.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:26.70:912,0,27 14892-ref 391 . C T 1461.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.73;MQ0=0;QD=38.46;SB=-0.01;sumGLbyD=39.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1495,114,0 14892-ref 401 . C T 1034.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.65;MQ0=0;QD=35.66;SB=-0.01;sumGLbyD=36.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:28:84.26:1067,84,0 14892-ref 512 . T G 1035.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.9218;MQ=36.35;MQ0=0;QD=33.39;SB=-0.01;sumGLbyD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:30:50.28:1068,50,0 14892-ref 572 . A G 899.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.58;MQ0=0;QD=37.48;SB=-0.01;sumGLbyD=38.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.23:932,72,0 14892-ref 758 . T A 859.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9993;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.37;SB=-0.01;sumGLbyD=35.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:38.25:892,38,0 14892-ref 929 . T C 575.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.64;MQ0=0;QD=35.95;SB=-156.15;sumGLbyD=38.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:608,48,0 14892-ref 977 . A T 36.43 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.81;MQ0=0;QD=18.22;SB=-0.01;sumGLbyD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:68,6,0 14907-ref 19 . G T 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 14907-ref 124 . G A 635.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=37.37;SB=-0.01;sumGLbyD=39.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:668,51,0 14907-ref 125 . T A 632.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=37.19;SB=-0.01;sumGLbyD=39.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:665,51,0 14907-ref 238 . G T 30.63 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=10.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23.48:61,0,23 14907-ref 239 . 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A T 108.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.57;SB=-0.01;sumGLbyD=19.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:93.84:139,0,94 14914-ref 5 . A G 178.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=29.80;SB=-0.01;sumGLbyD=35.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:212,18,0 14914-ref 21 . G C 466.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=35.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:499,39,0 14914-ref 45 . C G 474.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=36.50;SB=-0.01;sumGLbyD=39.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:507,39,0 14979-ref 171 . G A 44.89 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 14979-ref 361 . G A 263.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.94;SB=-0.01;sumGLbyD=26.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:9:27.05:296,27,0 14979-ref 513 . G A 150.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.10;SB=-0.01;sumGLbyD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.26:181,0,21 14979-ref 616 . A G 228.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.67;SB=-0.01;sumGLbyD=37.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:262,21,0 14979-ref 745 . C T 433.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.12;SB=-0.01;sumGLbyD=38.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:466,36,0 14979-ref 843 . G A 550.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.73;SB=-0.01;sumGLbyD=38.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:584,45,0 14979-ref 881 . A G 650.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9832;MQ=36.44;MQ0=0;QD=36.14;SB=-0.01;sumGLbyD=37.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:684,54,0 14979-ref 899 . T G 582 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=36.37;SB=-0.01;sumGLbyD=38.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:615,48,0 14979-ref 1048 . G A 810.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=2.9570;MQ=34.28;MQ0=0;QD=35.23;SB=-0.01;sumGLbyD=36.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.20:843,69,0 14979-ref 1060 . A C 985.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8618;MQ=34.49;MQ0=0;QD=33.99;SB=-0.01;sumGLbyD=35.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.24:1019,84,0 14979-ref 1066 . A T 861.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=34.84;MQ0=0;QD=35.92;SB=-0.01;sumGLbyD=37.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.21:895,72,0 14979-ref 1117 . A G 368.80 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9989;MQ=36.61;MQ0=0;QD=14.18;SB=-0.01;sumGLbyD=15.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:26:99:399,0,468 14979-ref 1229 . C T 352.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=29.36;SB=-0.01;sumGLbyD=32.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:8.44:384,8,0 14979-ref 1267 . C T 78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.50;SB=-0.01;sumGLbyD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:22.31:108,0,22 14979-ref 1299 . A G 543.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.26;SB=-0.01;sumGLbyD=38.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:577,45,0 14979-ref 1389 . C T 159.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:192,15,0 14979-ref 1404 . G A 204.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.04;SB=-0.01;sumGLbyD=39.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:237,18,0 14979-ref 1463 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15024-ref 21 . C T 120.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.11;SB=-0.01;sumGLbyD=38.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:153,12,0 15024-ref 51 . G T 615.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.19;SB=-0.01;sumGLbyD=38.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.15:648,51,0 15024-ref 156 . A G 796.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.94;SB=-0.01;sumGLbyD=39.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.21:830,63,0 15024-ref 376 . C A 698.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.6218;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.26;SB=-0.01;sumGLbyD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:21:60.18:731,60,0 15069-ref 146 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15124-ref 57 . A C 34.98 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=35.28;MQ0=0;QD=5.83;SB=-0.01;sumGLbyD=10.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:5:64.97:65,0,87 15124-ref 86 . G A 521.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=32.62;SB=-0.01;sumGLbyD=34.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.13:555,45,0 15124-ref 121 . A G 491.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=1.8311;MQ=34.93;MQ0=0;QD=32.76;SB=-0.01;sumGLbyD=34.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.13:524,42,0 15124-ref 145 . T C 307.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=35.87;MQ0=0;QD=17.07;SB=-0.01;sumGLbyD=18.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:337,0,178 15124-ref 215 . T G 363.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.14;MQ0=0;QD=33.03;SB=-40.01;sumGLbyD=36.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:396,33,0 15124-ref 225 . G A 363.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.14;MQ0=0;QD=33.03;SB=-40.01;sumGLbyD=36.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:396,33,0 15124-ref 233 . A C 355.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.14;MQ0=0;QD=32.32;SB=-0.01;sumGLbyD=35.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:389,33,0 15124-ref 271 . T A 590.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.88;SB=-0.01;sumGLbyD=38.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:623,48,0 15124-ref 304 . A C 359.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.84;SB=-0.01;sumGLbyD=13.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:26:99:390,0,464 15124-ref 326 . A C 537.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9967;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.90;SB=-0.01;sumGLbyD=18.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,18:30:99:567,0,378 15124-ref 400 . A G 933.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.60;MQ0=0;QD=37.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.24:967,75,0 15124-ref 490 . G C 1036.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.5973;MQ=35.94;MQ0=0;QD=35.74;SB=-0.01;sumGLbyD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.26:1069,87,0 15124-ref 532 . C T 1123.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.01;MQ0=0;QD=36.24;SB=-0.01;sumGLbyD=37.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:30:90.28:1157,90,0 15124-ref 586 . 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C T 1489.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.7845;MQ=35.28;MQ0=0;QD=35.47;SB=-0.01;sumGLbyD=36.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:96.76:1523,97,0 15124-ref 1156 . G A 1481.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=35.28;MQ0=0;QD=35.27;SB=-0.01;sumGLbyD=36.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:42:86.38:1514,86,0 15124-ref 1214 . C T 891.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.89;MQ0=0;QD=33.03;SB=-0.01;sumGLbyD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:26:78.22:925,78,0 15124-ref 1219 . C T 801.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.94;MQ0=0;QD=33.38;SB=-0.01;sumGLbyD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.19:834,69,0 15124-ref 1234 . C T 839.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.35;MQ0=0;QD=33.58;SB=-0.01;sumGLbyD=34.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:38.25:872,38,0 15124-ref 1363 . T G 867.30 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.9751;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.27;SB=-0.01;sumGLbyD=19.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,27:45:99:897,0,554 15124-ref 1407 . G A 396.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7873;MQ=36.75;MQ0=0;QD=9.91;SB=-0.01;sumGLbyD=10.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,14:40:99:427,0,884 15124-ref 1477 . T G 1256.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.70;MQ0=0;QD=36.94;SB=-0.01;sumGLbyD=37.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:33:99:1289,99,0 15124-ref 1590 . G A 1297.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.83;MQ0=0;QD=37.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1331,105,0 15124-ref 1603 . G C 1435.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=33.66;MQ0=0;QD=35.01;SB=-0.01;sumGLbyD=35.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1468,123,0 15124-ref 1624 . C T 1481.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.52;MQ0=0;QD=34.45;SB=-0.01;sumGLbyD=35.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1514,129,0 15124-ref 1645 . T A 1444.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.8321;MQ=32.68;MQ0=0;QD=34.40;SB=-0.01;sumGLbyD=35.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1478,126,0 15124-ref 1654 . A G 1334.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6643;MQ=33.30;MQ0=0;QD=33.37;SB=-0.01;sumGLbyD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:38:99:1368,114,0 15124-ref 1916 . A C 1602.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.3548;MQ=36.34;MQ0=0;QD=34.83;SB=-0.01;sumGLbyD=35.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:43:99:1635,129,0 15124-ref 1921 . C T 332.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=36.42;MQ0=0;QD=6.40;SB=-0.01;sumGLbyD=6.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,17:48:99:363,0,1136 15124-ref 1941 . T C 1902.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.5281;MQ=36.23;MQ0=0;QD=35.89;SB=-0.01;sumGLbyD=36.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:53:99:1935,156,0 15124-ref 1989 . C T 3391.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.3535;MQ=36.46;MQ0=0;QD=36.07;SB=-0.01;sumGLbyD=35.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,92:91:99:3321,231,0 15124-ref 2014 . A G 875.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.5976;MQ=36.59;MQ0=0;QD=8.94;SB=-0.01;sumGLbyD=9.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,34:95:99:906,0,2157 15124-ref 2106 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15124-ref 2173 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15124-ref 2193 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15135-ref 119 . A G 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 15135-ref 144 . T C 143.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8643;MQ=36.49;MQ0=0;QD=7.15;SB=-0.01;sumGLbyD=8.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:20:99:173,0,362 15135-ref 148 . C T 846.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.8643;MQ=36.58;MQ0=0;QD=35.29;SB=-0.01;sumGLbyD=36.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.22:880,69,0 15135-ref 205 . T A 1120.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.64;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.29:1154,87,0 15135-ref 222 . C A 394.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.89;SB=-0.01;sumGLbyD=38.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:428,33,0 15224-ref 62 . A G 1341.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=37.27;SB=-0.01;sumGLbyD=38.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1375,108,0 15224-ref 99 . G A 122.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=1.9992;MQ=32.41;MQ0=0;QD=17.46;SB=-0.01;sumGLbyD=21.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:6:11.58:152,0,12 15224-ref 100 . G A 129.55 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=21.59;SB=-0.01;sumGLbyD=26.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:11.57:159,0,12 15304-ref 36 . C T 663.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=33.30;MQ0=0;QD=33.17;SB=-0.01;sumGLbyD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:19:57.16:696,57,0 15304-ref 52 . G A 662.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.4076;MQ=33.30;MQ0=0;QD=33.13;SB=-0.01;sumGLbyD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:19:57.16:696,57,0 15304-ref 64 . A G 657.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4062;MQ=33.30;MQ0=0;QD=32.85;SB=-0.01;sumGLbyD=34.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:19:57.16:690,57,0 15304-ref 101 . C G 46.89 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=11.72;SB=-0.01;sumGLbyD=19.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:17.60:77,0,18 15304-ref 116 . C T 220.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=31.45;SB=-0.01;sumGLbyD=36.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:253,21,0 15304-ref 130 . T A 401.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.40;MQ0=0;QD=30.92;SB=-0.01;sumGLbyD=33.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.08:435,39,0 15304-ref 166 . G C 640.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.55;MQ0=0;QD=33.72;SB=-40.01;sumGLbyD=35.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.14:674,57,0 15304-ref 199 . G A 2255.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9987;MQ=36.62;MQ0=0;QD=37.59;SB=-80.02;sumGLbyD=38.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:59:99:2289,178,0 15304-ref 266 . G C 1295.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9979;MQ=36.01;MQ0=0;QD=37.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1329,105,0 15304-ref 290 . C T 42.37 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=29.64;MQ0=0;QD=2.49;SB=-0.01;sumGLbyD=4.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:72.36:72,0,364 15304-ref 361 . C T 991.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=145;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=10.5027;MQ=23.03;MQ0=0;QD=6.84;SB=2.99;sumGLbyD=7.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,53:140:99:1021,0,1982 15304-ref 552 . C T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 15359-ref 99 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 15359-ref 104 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 15359-ref 157 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 15359-ref 165 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 15407-ref 120 . C T 6261.70 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=327;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=28.8721;MQ=36.91;MQ0=0;QD=19.15;SB=-0.01;sumGLbyD=16.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,161:325:99:5251,0,5306 15407-ref 348 . C A 8839.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=240;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=11.9381;MQ=36.87;MQ0=0;QD=36.83;SB=-0.01;sumGLbyD=36.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,237:234:99:8764,629,0 15407-ref 736 . A G 4357.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.8236;MQ=36.91;MQ0=0;QD=37.24;SB=-0.01;sumGLbyD=37.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:116:99:4357,349,0 15419-ref 21 . G C 1925.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.50;SB=-0.01;sumGLbyD=39.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1958,150,0 15429-ref 183 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15429-ref 188 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15429-ref 192 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15478-ref 121 . G A 286.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.46;SB=-0.01;sumGLbyD=22.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:316,0,152 15478-ref 146 . A C 478.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.6418;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.16;SB=-0.01;sumGLbyD=36.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:13:39.13:511,39,0 15478-ref 315 . T A 184.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=30.83;SB=-0.01;sumGLbyD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:218,18,0 15478-ref 379 . A G 4224.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.3975;MQ=36.73;MQ0=0;QD=38.06;SB=-0.01;sumGLbyD=38.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,110:109:99:4224,328,0 15478-ref 550 . T C 3601.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.4448;MQ=35.21;MQ0=0;QD=36.75;SB=-0.01;sumGLbyD=36.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,97:97:99:3562,252,0 15478-ref 567 . C T 3715.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.1258;MQ=35.28;MQ0=0;QD=36.43;SB=-0.01;sumGLbyD=36.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,101:101:99:3675,264,0 15478-ref 568 . A G 3681.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.2937;MQ=35.27;MQ0=0;QD=36.45;SB=-0.01;sumGLbyD=36.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,100:100:99:3641,261,0 15478-ref 664 . G A 3574.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.75;MQ0=0;QD=36.48;SB=-0.01;sumGLbyD=36.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:95:99:3574,286,0 15478-ref 668 . A G 3703.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.79;MQ0=0;QD=36.66;SB=-0.01;sumGLbyD=36.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:98:99:3703,295,0 15478-ref 689 . T C 3604.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=34.31;MQ0=0;QD=35.69;SB=-0.01;sumGLbyD=35.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:97:99:3604,292,0 15478-ref 735 . G A 3380.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.5226;MQ=34.34;MQ0=0;QD=35.97;SB=-0.01;sumGLbyD=35.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,94:91:99:3380,274,0 15478-ref 750 . T C 2834.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=33.80;MQ0=0;QD=34.57;SB=-0.01;sumGLbyD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:79:99:2868,238,0 15478-ref 751 . T C 2879.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=33.75;MQ0=0;QD=35.55;SB=-0.01;sumGLbyD=35.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,81:80:99:2912,241,0 15566-ref 192 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 15566-ref 282 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 15566-ref 418 . G A 1414.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9998;MQ=36.73;MQ0=0;QD=38.22;SB=-0.01;sumGLbyD=39.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1447,111,0 15577-ref 120 . A G 270.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.03;SB=-0.01;sumGLbyD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9.93:300,0,10 15577-ref 151 . C T 241.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.52;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:275,21,0 15577-ref 191 . G A 293.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.32;SB=-0.01;sumGLbyD=32.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:7.70:323,0,8 15577-ref 429 . T C 384.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9681;MQ=35.63;MQ0=0;QD=25.62;SB=-0.01;sumGLbyD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:15:26.53:414,0,27 15577-ref 435 . A G 416.62 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9681;MQ=35.63;MQ0=0;QD=27.77;SB=-0.01;sumGLbyD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:14:2.08:446,2,0 15577-ref 455 . G T 496.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=35.80;MQ0=0;QD=29.22;SB=-0.01;sumGLbyD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:16:8.14:529,8,0 15604-ref 615 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15605-ref 64 . A G 823.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.5341;MQ=36.63;MQ0=0;QD=30.51;SB=-0.01;sumGLbyD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,24:26:1.08:852,0,1 15605-ref 166 . C T 1723.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9985;MQ=36.35;MQ0=0;QD=36.67;SB=-0.01;sumGLbyD=37.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:46:99:1756,138,0 15605-ref 213 . G C 1333.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.15;MQ0=0;QD=37.04;SB=-0.01;sumGLbyD=37.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1366,108,0 15611-ref 73 . C G 8082.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=208;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.3875;MQ=36.95;MQ0=0;QD=38.86;SB=-0.01;sumGLbyD=38.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,208:207:99:8082,623,0 15611-ref 210 . T A 8453.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=13.8706;MQ=36.82;MQ0=0;QD=37.57;SB=-0.01;sumGLbyD=37.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,224:220:99:8453,662,0 15611-ref 405 . A G 1144.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.9466;MQ=36.37;MQ0=0;QD=17.88;SB=3.00;sumGLbyD=18.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,36:64:99:1174,0,847 15611-ref 410 . G C 1779.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=36.13;MQ0=0;QD=37.86;SB=-39.32;sumGLbyD=38.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1812,141,0 15611-ref 429 . T G 472.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9633;MQ=35.60;MQ0=0;QD=21.49;SB=-37.00;sumGLbyD=22.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,16:21:99:503,0,152 15611-ref 459 . T C 44.35 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.18;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 15618-ref 19 . A G 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-88.04;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 15618-ref 42 . G T 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-88.04;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 15618-ref 43 . C A 180.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=25.72;SB=-88.43;sumGLbyD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:213,21,0 15618-ref 44 . C T 182.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=26.08;SB=-88.43;sumGLbyD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:216,21,0 15618-ref 96 . C G 782.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.56;SB=-0.01;sumGLbyD=37.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:21:63.20:815,63,0 15618-ref 264 . T G 804.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.97;SB=-0.01;sumGLbyD=36.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:22:66.20:837,66,0 15618-ref 430 . C T 90.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=4.6730;MQ=26.44;MQ0=0;QD=1.85;SB=-0.01;sumGLbyD=2.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,10:49:99:121,0,1047 15618-ref 439 . G T 22.47 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.5950;MQ=26.86;MQ0=0;QD=0.47;SB=-0.01;sumGLbyD=1.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,7:47:52.44:52,0,1076 15618-ref 554 . G C 21.57 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4650;MQ=34.04;MQ0=0;QD=2.70;SB=-0.01;sumGLbyD=6.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51.53:52,0,180 15618-ref 1403 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 15618-ref 1461 . G C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 15618-ref 1523 . G C 31.97 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=5.33;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61.96:62,0,132 15618-ref 1561 . A G 70.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.55;SB=-0.01;sumGLbyD=34.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:103,9,0 15643-ref 39 . C A 123.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=24.71;SB=-0.01;sumGLbyD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:156,15,0 15643-ref 47 . T C 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 15643-ref 58 . G C 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 15643-ref 71 . G T 2411.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.3990;MQ=25.00;MQ0=0;QD=26.50;SB=-59.25;sumGLbyD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,89:83:99:2445,249,0 15643-ref 74 . C T 2750.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.3990;MQ=26.04;MQ0=0;QD=28.06;SB=-59.25;sumGLbyD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,96:97:99:2783,232,0 15643-ref 102 . G T 7641.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=226;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8332;MQ=32.14;MQ0=0;QD=33.81;SB=-0.01;sumGLbyD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,224:220:99:7640,662,0 15643-ref 109 . T G 7977.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=235;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.5671;MQ=32.25;MQ0=0;QD=33.95;SB=-0.01;sumGLbyD=33.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,234:229:99:7976,689,0 15643-ref 167 . T C 8111.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=231;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=9.3396;MQ=34.05;MQ0=0;QD=35.12;SB=-0.01;sumGLbyD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,226:229:99:7967,546,0 15643-ref 182 . T G 6055.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.6883;MQ=33.68;MQ0=0;QD=36.05;SB=-0.01;sumGLbyD=36.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:6055,505,0 15643-ref 183 . T C 6075.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.7223;MQ=33.68;MQ0=0;QD=36.17;SB=-0.01;sumGLbyD=35.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:168:99:5965,496,0 15643-ref 208 . C A 1776.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=28.74;MQ0=0;QD=28.20;SB=-0.01;sumGLbyD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,60:63:79.79:1809,80,0 15643-ref 212 . T A 1656.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=30.46;MQ0=0;QD=30.67;SB=-0.01;sumGLbyD=31.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,52:51:99:1689,153,0 15643-ref 232 . T C 3799.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.6155;MQ=29.48;MQ0=0;QD=31.14;SB=-0.01;sumGLbyD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,119:119:99:3689,248,0 15643-ref 271 . A T 3692.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8295;MQ=27.93;MQ0=0;QD=30.77;SB=-0.01;sumGLbyD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,117:118:99:3634,324,0 15643-ref 286 . G T 2571.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8662;MQ=27.93;MQ0=0;QD=28.26;SB=-0.01;sumGLbyD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,88:90:99:2605,161,0 15643-ref 290 . G A 1924.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8651;MQ=25.41;MQ0=0;QD=26.74;SB=-0.01;sumGLbyD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,69:71:99:1958,133,0 15643-ref 297 . A C 2545.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9984;MQ=34.03;MQ0=0;QD=31.43;SB=-0.01;sumGLbyD=31.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,77:81:99:2579,104,0 15643-ref 316 . G T 4832.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=126;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.5118;MQ=36.76;MQ0=0;QD=38.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:125:99:4832,376,0 15643-ref 374 . A C 23392.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=631;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=21.4087;MQ=35.47;MQ0=0;QD=37.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,631:623:99:23390,1875,0 15643-ref 409 . A G 25149.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=677;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=34.0911;MQ=35.45;MQ0=0;QD=37.15;SB=-80.02;sumGLbyD=37.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,675:671:99:25097,2013,0 15643-ref 416 . A G 23280.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=628;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=33.5118;MQ=35.38;MQ0=0;QD=37.07;SB=-80.02;sumGLbyD=36.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,625:624:99:23197,1797,0 15643-ref 471 . C G 6514 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.4548;MQ=36.31;MQ0=0;QD=36.80;SB=-29.63;sumGLbyD=36.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:174:99:6513,523,0 15643-ref 499 . A T 671.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.44;MQ0=0;QD=37.30;SB=-0.01;sumGLbyD=39.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:704,54,0 15643-ref 500 . G T 196.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:230,18,0 15643-ref 513 . C A 260.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.59;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:294,24,0 15643-ref 518 . T A 574.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.77;SB=-0.01;sumGLbyD=35.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.15:607,48,0 15643-ref 675 . C T 911.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.58;MQ0=0;QD=37.98;SB=-0.01;sumGLbyD=39.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.23:944,72,0 15663-ref 57 . G A 1040.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=36.27;MQ0=0;QD=37.14;SB=-0.01;sumGLbyD=38.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.26:1073,84,0 15663-ref 106 . G A 1723.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.4612;MQ=36.55;MQ0=0;QD=38.30;SB=-0.01;sumGLbyD=39.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1757,135,0 15663-ref 255 . T A 66.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.8083;MQ=36.44;MQ0=0;QD=3.67;SB=-0.01;sumGLbyD=5.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:17:96.13:96,0,445 15663-ref 257 . A T 27.55 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.5948;MQ=36.37;MQ0=0;QD=1.72;SB=-0.01;sumGLbyD=3.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:15:57.54:58,0,404 15663-ref 258 . G A 33.09 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.6762;MQ=36.40;MQ0=0;QD=1.95;SB=-0.01;sumGLbyD=3.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:14:63.09:63,0,379 15663-ref 260 . G A 389.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.80;SB=-0.01;sumGLbyD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:11:33.10:422,33,0 15663-ref 488 . A G 227.88 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.32;SB=-0.01;sumGLbyD=28.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:8:2.83:256,0,0 15663-ref 500 . A G 480.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.93;SB=-0.01;sumGLbyD=39.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:513,39,0 15697-ref 50 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15697-ref 52 . A C 45.74 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:77,6,0 15697-ref 138 . G C 485.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.36;SB=-0.01;sumGLbyD=34.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:5.14:516,5,0 15697-ref 207 . C A 365.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.56;SB=-0.01;sumGLbyD=39.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:399,30,0 15711-ref 132 . T A 793.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.77;SB=-0.01;sumGLbyD=39.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:826,63,0 15711-ref 138 . T C 939.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=36.61;MQ0=0;QD=36.14;SB=-0.01;sumGLbyD=37.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:25:75.24:973,75,0 15711-ref 350 . C T 115.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4875;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.49;SB=-0.01;sumGLbyD=4.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:31:99:145,0,885 15711-ref 414 . G C 1348.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.46;SB=-0.01;sumGLbyD=38.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:35:99:1381,105,0 15711-ref 419 . T C 1306.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.44;SB=-0.01;sumGLbyD=39.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1340,102,0 15711-ref 635 . A G 891.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.16;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.23:925,72,0 15792-ref 211 . G T 384.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=34.99;SB=-0.01;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:418,33,0 15792-ref 212 . C T 384.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=34.92;SB=-0.01;sumGLbyD=37.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:417,33,0 15792-ref 229 . C T 178.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=29.82;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:212,18,0 15792-ref 246 . C T 76.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.39;SB=-0.01;sumGLbyD=36.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 15792-ref 264 . T A 190.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=31.79;SB=-0.01;sumGLbyD=37.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:224,18,0 15792-ref 401 . G C 124.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.13;SB=-0.01;sumGLbyD=39.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:157,12,0 15796-ref 26 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15796-ref 41 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15796-ref 47 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15796-ref 112 . A T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 15796-ref 118 . A T 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9997;MQ=28.48;MQ0=0;QD=5.07;SB=-0.01;sumGLbyD=12.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:3:29.56:50,0,30 15796-ref 120 . C T 24.61 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=4.92;SB=-0.01;sumGLbyD=10.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:54.59:55,0,82 15796-ref 125 . A C 14.01 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.94;MQ0=0;QD=2.00;SB=-0.01;sumGLbyD=6.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:43.83:44,0,137 15796-ref 137 . T A 125.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=25.15;SB=-0.01;sumGLbyD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:158,15,0 15796-ref 167 . G A 155.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=31.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:188,18,0 15796-ref 183 . A C 266.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.91;MQ0=0;QD=29.63;SB=-0.01;sumGLbyD=33.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.06:300,27,0 15796-ref 194 . T C 327.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.85;MQ0=0;QD=32.75;SB=-0.01;sumGLbyD=36.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:361,30,0 15796-ref 244 . G A 913.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.05;SB=-0.01;sumGLbyD=39.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.23:946,72,0 15796-ref 279 . T A 31.49 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.97;SB=-0.01;sumGLbyD=3.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:61.48:61,0,468 15796-ref 290 . A T 362 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.20;SB=-0.01;sumGLbyD=39.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:395,30,0 15796-ref 353 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 15796-ref 452 . G A 823.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.79;SB=-0.01;sumGLbyD=37.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.19:856,69,0 15796-ref 489 . A C 956.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.5774;MQ=36.61;MQ0=0;QD=36.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:25:75.24:990,75,0 15811-ref 65 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 15811-ref 109 . T C 64.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.17;SB=-0.01;sumGLbyD=13.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94.20:94,0,139 15811-ref 298 . A C 650.24 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7485;MQ=36.54;MQ0=0;QD=26.01;SB=-0.01;sumGLbyD=27.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:25:99:680,0,112 15811-ref 324 . C T 623.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.36;SB=-0.01;sumGLbyD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:83.92:654,0,84 15811-ref 809 . T C 692.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=23.00;MQ0=0;QD=15.39;SB=-0.01;sumGLbyD=16.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,31:45:99:722,0,248 15829-ref 122 . A C 76.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.64;SB=-0.01;sumGLbyD=36.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:109,9,0 15829-ref 132 . G A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 15846-ref 50 . T C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 15846-ref 63 . C T 205.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 15846-ref 171 . C T 288.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=32.08;SB=-0.01;sumGLbyD=35.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:322,27,0 15846-ref 180 . T C 28.01 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=3.50;SB=-0.01;sumGLbyD=7.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:5:58:58,0,104 15846-ref 185 . T C 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 15846-ref 188 . T C 105.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.35;SB=-0.01;sumGLbyD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:138,12,0 15846-ref 193 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 15846-ref 230 . C A 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 15846-ref 261 . G A 1593.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=36.22;SB=-0.01;sumGLbyD=36.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:99:1627,132,0 15846-ref 281 . C T 2044.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.66;MQ0=0;QD=34.65;SB=-0.01;sumGLbyD=35.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2077,177,0 15846-ref 292 . G C 3076.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5873;MQ=33.86;MQ0=0;QD=35.36;SB=-0.01;sumGLbyD=35.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:3110,262,0 15846-ref 331 . T C 4469.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.40;MQ0=0;QD=36.63;SB=-0.01;sumGLbyD=36.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:119:99:4469,358,0 15846-ref 337 . G A 5011.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=1.2579;MQ=35.70;MQ0=0;QD=37.40;SB=-0.01;sumGLbyD=37.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,133:132:99:5011,397,0 15846-ref 423 . G A 2478.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9985;MQ=35.49;MQ0=0;QD=36.45;SB=-0.01;sumGLbyD=36.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2511,205,0 15846-ref 426 . T C 2409.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8656;MQ=35.18;MQ0=0;QD=35.43;SB=-0.01;sumGLbyD=35.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:67:99:2442,199,0 15846-ref 428 . G A 2357.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8328;MQ=35.06;MQ0=0;QD=36.83;SB=-0.01;sumGLbyD=37.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:64:99:2390,193,0 15846-ref 473 . G A 3751.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.2579;MQ=36.59;MQ0=0;QD=38.28;SB=-0.01;sumGLbyD=38.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:96:99:3751,289,0 15846-ref 523 . C T 7073.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=184;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.2325;MQ=36.84;MQ0=0;QD=38.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:181:99:7073,545,0 15846-ref 678 . A C 5246.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.2178;MQ=36.93;MQ0=0;QD=37.74;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,138:137:99:5214,381,0 15846-ref 786 . T G 1798.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.79;MQ0=0;QD=36.71;SB=-0.01;sumGLbyD=37.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:48:99:1832,144,0 15846-ref 789 . G A 1442.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.6553;MQ=36.75;MQ0=0;QD=36.07;SB=-0.01;sumGLbyD=36.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:38:99:1476,114,0 15908-ref 82 . G C 340.87 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.17;SB=-0.01;sumGLbyD=13.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:27:99:371,0,506 15908-ref 355 . T C 2499.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.85;MQ0=0;QD=36.76;SB=-0.01;sumGLbyD=37.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:66:99:2533,199,0 15908-ref 394 . C T 2394.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9993;MQ=36.84;MQ0=0;QD=37.42;SB=-0.01;sumGLbyD=37.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:63:99:2428,190,0 15908-ref 413 . C G 1455.16 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=71;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9637;MQ=36.86;MQ0=0;QD=20.50;SB=-0.01;sumGLbyD=20.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,46:70:99:1485,0,756 15908-ref 462 . A C 1745.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=85;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7652;MQ=36.88;MQ0=0;QD=20.54;SB=-0.01;sumGLbyD=20.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,52:84:99:1776,0,985 15908-ref 482 . G C 748.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=72;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7333;MQ=36.86;MQ0=0;QD=10.40;SB=-0.01;sumGLbyD=10.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,26:72:99:779,0,1553 15945-ref 99 . T G 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 15945-ref 192 . T C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 16009-ref 35 . T C 231.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.00;SB=-0.01;sumGLbyD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.06:265,21,0 16009-ref 59 . C T 266.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=35.28;MQ0=0;QD=22.21;SB=-0.01;sumGLbyD=24.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:11:46.91:296,0,47 16009-ref 153 . T A 391.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.59;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:424,33,0 16009-ref 158 . T G 284.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.51;SB=-0.01;sumGLbyD=39.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:317,24,0 16009-ref 206 . G A 503.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.96;SB=-0.01;sumGLbyD=38.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:536,42,0 16009-ref 218 . C A 421.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=35.13;SB=-0.01;sumGLbyD=37.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:455,36,0 16009-ref 344 . A T 289.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=28.98;SB=-0.01;sumGLbyD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9.22:320,0,9 16009-ref 356 . T C 252.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=28.09;SB=-0.01;sumGLbyD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:9.05:283,0,9 16009-ref 359 . A G 347.89 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.15;MQ0=0;QD=28.99;SB=-0.01;sumGLbyD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:3.89:377,0,4 16009-ref 448 . G T 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 16040-ref 49 . C A 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 16040-ref 53 . A C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 16040-ref 139 . A G 24.24 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.9976;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.46;SB=-0.01;sumGLbyD=7.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54.22:54,0,154 16040-ref 140 . G C 50.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9976;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.21;SB=-0.01;sumGLbyD=11.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:80.43:80,0,134 16040-ref 142 . T C 80.47 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9976;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.36;SB=-0.01;sumGLbyD=7.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:110,0,364 16040-ref 162 . G A 727.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=15.8604;MQ=36.78;MQ0=0;QD=16.17;SB=-0.01;sumGLbyD=16.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,23:45:99:758,0,736 16040-ref 167 . G A 1229.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=14.9937;MQ=36.80;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=24.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,36:51:99:1259,0,431 16040-ref 193 . A T 421 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=80;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.8323;MQ=36.87;MQ0=0;QD=5.26;SB=-0.01;sumGLbyD=5.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,18:80:99:451,0,2173 16040-ref 218 . G A 2418.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=96;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8310;MQ=36.90;MQ0=0;QD=25.19;SB=-0.01;sumGLbyD=25.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,71:94:99:2448,0,653 16040-ref 236 . 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A G 2704.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=108;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6912;MQ=34.39;MQ0=0;QD=25.04;SB=-0.01;sumGLbyD=25.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,86:108:99:2735,0,521 16040-ref 479 . A T 811.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=106;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=16.7812;MQ=33.73;MQ0=0;QD=7.65;SB=-0.01;sumGLbyD=7.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,35:104:99:841,0,2247 16040-ref 489 . C A 190.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=101;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=27.7724;MQ=33.33;MQ0=0;QD=1.88;SB=-0.01;sumGLbyD=2.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,13:99:99:220,0,2747 16040-ref 494 . C T 22.66 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=99;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=13.9859;MQ=33.26;MQ0=0;QD=0.23;SB=-0.01;sumGLbyD=0.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,9:99:52.63:53,0,2863 16040-ref 508 . C T 402.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=75;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=29.2419;MQ=32.27;MQ0=0;QD=5.36;SB=-0.01;sumGLbyD=5.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,22:73:99:432,0,1656 16040-ref 509 . A G 1605.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=74;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=29.2419;MQ=32.21;MQ0=0;QD=21.70;SB=-0.01;sumGLbyD=22.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,56:74:99:1636,0,468 16040-ref 512 . A G 88.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=26.9874;MQ=32.12;MQ0=0;QD=1.38;SB=-0.01;sumGLbyD=1.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,8:64:99:118,0,1714 16040-ref 527 . G C 238.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9998;MQ=30.63;MQ0=0;QD=12.56;SB=-0.01;sumGLbyD=14.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,11:19:99:269,0,261 16040-ref 529 . C T 641.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9998;MQ=30.37;MQ0=0;QD=32.09;SB=-0.01;sumGLbyD=33.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.15:675,60,0 16040-ref 535 . G T 160.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.9964;MQ=32.03;MQ0=0;QD=6.18;SB=-0.01;sumGLbyD=7.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:26:99:191,0,565 16040-ref 547 . T C 131.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=32.73;MQ0=0;QD=5.27;SB=-0.01;sumGLbyD=6.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:162,0,563 16040-ref 563 . T G 437.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8656;MQ=35.46;MQ0=0;QD=21.86;SB=-0.01;sumGLbyD=23.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:20:99:467,0,163 16040-ref 569 . T C 413.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8656;MQ=35.46;MQ0=0;QD=20.65;SB=-0.01;sumGLbyD=22.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:18:99:443,0,135 16040-ref 582 . C T 50.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8655;MQ=35.66;MQ0=0;QD=2.19;SB=-0.01;sumGLbyD=3.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:80.43:80,0,658 16040-ref 611 . C T 812.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.56;MQ0=0;QD=35.34;SB=-0.01;sumGLbyD=36.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:22:66.21:846,66,0 16040-ref 633 . C T 17.18 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=0.72;SB=-0.01;sumGLbyD=1.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:47.09:47,0,749 16040-ref 678 . T A 379.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.52;SB=-0.01;sumGLbyD=37.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:413,33,0 16040-ref 717 . C T 589.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.86;SB=-0.01;sumGLbyD=38.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:623,48,0 16040-ref 825 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 16051-ref 573 . T C 354.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.85;MQ0=0;QD=35.40;SB=-0.01;sumGLbyD=38.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:387,30,0 16051-ref 666 . A G 1089.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.56;SB=-0.01;sumGLbyD=38.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.27:1122,87,0 16051-ref 705 . G A 1318.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=36.73;MQ0=0;QD=35.62;SB=-80.02;sumGLbyD=36.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:74.37:1351,74,0 16051-ref 708 . A G 1300.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=36.72;MQ0=0;QD=36.12;SB=-80.02;sumGLbyD=37.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:74.91:1333,75,0 16051-ref 864 . C T 1358.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.1806;MQ=36.77;MQ0=0;QD=30.87;SB=-0.01;sumGLbyD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,42:43:70.46:1391,70,0 16051-ref 942 . C T 829.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7333;MQ=36.25;MQ0=0;QD=30.73;SB=-0.01;sumGLbyD=31.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,25:27:2.44:859,1,0 16051-ref 990 . G A 863.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5763;MQ=36.60;MQ0=0;QD=34.54;SB=-0.01;sumGLbyD=35.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:39.98:897,40,0 16051-ref 1228 . C A 164.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.42;SB=-0.01;sumGLbyD=32.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.01:197,18,0 16107-ref 231 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 16107-ref 246 . T G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 16227-ref 103 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 16227-ref 113 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 16227-ref 115 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 16263-ref 121 . T A 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 16263-ref 149 . C T 420.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.01;SB=-0.01;sumGLbyD=37.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:453,36,0 16263-ref 291 . G T 277.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=19.82;SB=-0.01;sumGLbyD=21.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:308,0,155 16263-ref 313 . A G 243.52 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.98;MQ0=0;QD=24.35;SB=-0.01;sumGLbyD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:9:12.92:273,0,13 16263-ref 451 . T A 133.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=26.66;SB=-0.01;sumGLbyD=33.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:166,15,0 16263-ref 484 . G C 667.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.93;MQ0=0;QD=35.14;SB=-0.01;sumGLbyD=36.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.17:701,57,0 16263-ref 582 . G A 30.59 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.20;SB=-0.01;sumGLbyD=20.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:61,0,31 16300-ref 209 . T C 1228.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8595;MQ=31.56;MQ0=0;QD=29.25;SB=-0.01;sumGLbyD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:42:99:1261,117,0 16300-ref 218 . G T 466.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.20;MQ0=0;QD=23.32;SB=-0.01;sumGLbyD=24.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:18:54.02:499,54,0 16300-ref 223 . C G 468.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.23;MQ0=0;QD=26.05;SB=-0.01;sumGLbyD=27.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.06:502,54,0 16300-ref 239 . T C 295.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.16;MQ0=0;QD=22.76;SB=-0.01;sumGLbyD=25.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:12:36.02:329,36,0 16300-ref 311 . C A 2423.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.8666;MQ=23.44;MQ0=0;QD=26.34;SB=-0.01;sumGLbyD=26.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:89:99:2457,264,0 16300-ref 425 . A G 907.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=23.00;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=27.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:941,102,0 16300-ref 440 . G C 381.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=23.00;MQ0=0;QD=23.87;SB=-0.01;sumGLbyD=25.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.04:415,45,0 16300-ref 452 . T C 78.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=19.54;SB=-0.01;sumGLbyD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.01:111,12,0 16345-ref 461 . A T 232.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9967;MQ=36.47;MQ0=0;QD=12.22;SB=-0.01;sumGLbyD=13.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:262,0,366 16345-ref 493 . C T 699.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.47;MQ0=0;QD=36.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:732,57,0 16345-ref 530 . C A 221.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.66;SB=-0.01;sumGLbyD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15.24:251,0,15 16345-ref 537 . G C 21.53 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.39;SB=-0.01;sumGLbyD=5.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:51.49:51,0,249 16345-ref 607 . G T 872.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.92;SB=-0.01;sumGLbyD=39.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.22:905,69,0 16383-ref 7 . A T 81.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.30;SB=-0.01;sumGLbyD=38.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:114,9,0 16383-ref 61 . T G 711.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.49;MQ0=0;QD=35.57;SB=-0.01;sumGLbyD=37.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:19:57.18:744,57,0 16383-ref 114 . A C 71.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8625;MQ=34.93;MQ0=0;QD=14.38;SB=-0.01;sumGLbyD=20.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:4:27.97:102,0,28 16405-ref 39 . A C 62.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.99;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:92.93:93,0,197 16405-ref 69 . C A 436.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.35;SB=-0.01;sumGLbyD=39.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:469,36,0 16405-ref 97 . C T 334.70 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.43;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:1.25:363,0,1 16405-ref 123 . G A 131.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.15;MQ0=0;QD=10.98;SB=-0.01;sumGLbyD=13.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:162,0,230 16405-ref 165 . T A 337.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.98;MQ0=0;QD=33.78;SB=-0.01;sumGLbyD=37.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:371,30,0 16405-ref 286 . G A 173.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.21;SB=-0.01;sumGLbyD=8.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:23:99:203,0,544 16405-ref 423 . A C 616.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.33;SB=-0.01;sumGLbyD=15.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,20:43:99:646,0,736 16405-ref 523 . A G 48.21 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.4675;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.82;SB=-0.01;sumGLbyD=7.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:78.21:78,0,236 16405-ref 524 . A G 27.20 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.44;SB=-0.01;sumGLbyD=11.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:57.18:57,0,105 16405-ref 528 . T G 73.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.61;SB=-0.01;sumGLbyD=35.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:106,9,0 16405-ref 529 . A G 78.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.16;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:111,9,0 16411-ref 314 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 16411-ref 365 . C T 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 16424-ref 175 . C A 74.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.88;SB=-0.01;sumGLbyD=35.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:107,9,0 16424-ref 501 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 16424-ref 504 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 16424-ref 556 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 16424-ref 570 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 16424-ref 996 . A G 43.33 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.66;SB=-0.01;sumGLbyD=37.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 16424-ref 1075 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 16424-ref 1091 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 16424-ref 1113 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 16452-ref 80 . C G 9437.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=258;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=17.4065;MQ=36.88;MQ0=0;QD=36.58;SB=-0.01;sumGLbyD=35.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,252:250:99:9263,578,0 16452-ref 169 . A G 9731.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=262;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=21.1471;MQ=36.85;MQ0=0;QD=37.14;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,258:255:99:9622,658,0 16452-ref 319 . A G 897.12 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.4586;MQ=36.81;MQ0=0;QD=17.25;SB=-0.01;sumGLbyD=17.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,29:51:99:927,0,735 16452-ref 321 . G C 1936.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.4586;MQ=36.81;MQ0=0;QD=35.86;SB=-0.01;sumGLbyD=36.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,53:53:99:1969,130,0 16452-ref 360 . T C 352.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7510;MQ=33.97;MQ0=0;QD=7.83;SB=-0.01;sumGLbyD=8.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,16:44:99:382,0,948 16452-ref 366 . A C 253.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7510;MQ=33.74;MQ0=0;QD=6.03;SB=-0.01;sumGLbyD=6.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,14:40:99:283,0,951 16452-ref 396 . A G 1087.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.94;MQ0=0;QD=33.99;SB=-0.01;sumGLbyD=35.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.25:1121,96,0 16452-ref 409 . T C 1097.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9947;MQ=32.30;MQ0=0;QD=34.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.25:1130,96,0 16452-ref 455 . T C 272.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.10;SB=-0.01;sumGLbyD=38.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:306,24,0 16452-ref 459 . G A 269.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=33.63;SB=-0.01;sumGLbyD=37.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:302,24,0 16452-ref 519 . T C 302.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=21.62;SB=-0.01;sumGLbyD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:333,0,116 16452-ref 526 . C T 499.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.69;SB=-0.01;sumGLbyD=38.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:533,42,0 16452-ref 535 . G A 77.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=35.42;MQ0=0;QD=5.98;SB=-0.01;sumGLbyD=8.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:108,0,293 16452-ref 560 . C T 180.66 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.53;MQ0=0;QD=12.90;SB=-0.01;sumGLbyD=15.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:211,0,196 16452-ref 585 . C T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 16452-ref 594 . C G 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 16452-ref 630 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 16452-ref 638 . T C 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29.55:71,0,30 16465-ref 45 . C G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 16465-ref 47 . A G 436.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.35;SB=-0.01;sumGLbyD=39.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:469,36,0 16465-ref 168 . G C 6447.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.2244;MQ=36.82;MQ0=0;QD=38.38;SB=-0.01;sumGLbyD=38.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:6447,503,0 16465-ref 266 . A C 1570.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.75;MQ0=0;QD=38.30;SB=-0.01;sumGLbyD=39.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1603,123,0 16465-ref 322 . C T 1077.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=35.92;SB=-0.01;sumGLbyD=37.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:29:87.25:1111,87,0 16465-ref 336 . C T 2260.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9621;MQ=36.66;MQ0=0;QD=37.67;SB=-0.01;sumGLbyD=38.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2293,178,0 16465-ref 371 . G A 2177.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.29;MQ0=0;QD=38.20;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:99:2210,172,0 16465-ref 414 . T C 1078.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9455;MQ=35.94;MQ0=0;QD=37.20;SB=-0.01;sumGLbyD=38.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.27:1112,87,0 16465-ref 466 . C A 123.69 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9989;MQ=30.37;MQ0=0;QD=12.37;SB=-0.01;sumGLbyD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:154,0,118 16465-ref 467 . A C 123.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8646;MQ=26.80;MQ0=0;QD=15.46;SB=-0.01;sumGLbyD=19.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:37.44:154,0,37 16465-ref 485 . A C 780.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9454;MQ=30.86;MQ0=0;QD=31.22;SB=-0.01;sumGLbyD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.18:813,72,0 16465-ref 514 . G A 1199.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=31.42;MQ0=0;QD=32.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:36:99:1232,108,0 16465-ref 524 . A T 1277.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=31.28;MQ0=0;QD=31.95;SB=-0.01;sumGLbyD=32.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:38:99:1311,114,0 16465-ref 583 . C G 652.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.09;MQ0=0;QD=34.33;SB=-0.01;sumGLbyD=36.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.16:685,57,0 16465-ref 584 . G A 692.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.30;MQ0=0;QD=34.62;SB=-0.01;sumGLbyD=36.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.17:725,60,0 16465-ref 592 . C A 604.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=34.55;MQ0=0;QD=35.54;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.15:637,51,0 16465-ref 622 . C T 522.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.3285;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:555,42,0 16485-ref 24 . C T 270.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=33.81;SB=-0.01;sumGLbyD=37.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:303,24,0 16485-ref 26 . G C 272.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.05;SB=-0.01;sumGLbyD=38.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:305,24,0 16485-ref 54 . A C 465.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.58;MQ0=0;QD=19.38;SB=-0.01;sumGLbyD=20.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,15:24:99:495,0,281 16485-ref 55 . G A 919.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.3348;MQ=36.63;MQ0=0;QD=34.06;SB=-0.01;sumGLbyD=35.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:26:75.24:953,75,0 16485-ref 92 . T C 1512.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=91;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.6545;MQ=34.84;MQ0=0;QD=16.63;SB=-0.01;sumGLbyD=16.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,46:90:99:1543,0,1270 16485-ref 148 . G T 403.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=69;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.12;MQ0=0;QD=5.85;SB=-0.01;sumGLbyD=6.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,21:68:99:433,0,1657 16485-ref 149 . A C 403.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=69;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.12;MQ0=0;QD=5.84;SB=-0.01;sumGLbyD=6.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,21:69:99:433,0,1668 16485-ref 150 . A T 331.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=67;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.03;MQ0=0;QD=4.94;SB=-0.01;sumGLbyD=5.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,19:67:99:361,0,1670 16485-ref 151 . C G 304.65 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=66;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=4.62;SB=-0.01;sumGLbyD=5.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,18:66:99:335,0,1681 16485-ref 172 . C T 919.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.78;SB=-0.01;sumGLbyD=38.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.23:953,75,0 16485-ref 189 . A G 432.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.87;SB=-0.01;sumGLbyD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:9.62:464,10,0 16485-ref 244 . G A 632.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7882;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.36;SB=-0.01;sumGLbyD=27.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:23:57.13:666,57,0 16485-ref 271 . C G 2553.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=34.93;MQ0=0;QD=36.47;SB=-0.01;sumGLbyD=36.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:69:99:2586,208,0 16485-ref 277 . T C 2744.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=33.99;MQ0=0;QD=34.30;SB=-0.01;sumGLbyD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:77:99:2777,232,0 16485-ref 317 . G C 3195.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.88;MQ0=0;QD=34.36;SB=-0.01;sumGLbyD=34.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:92:99:3229,271,0 16485-ref 346 . T A 1554.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.61;MQ0=0;QD=31.09;SB=-0.01;sumGLbyD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1588,150,0 16485-ref 347 . G C 1536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=28.41;MQ0=0;QD=31.35;SB=-0.01;sumGLbyD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1569,147,0 16485-ref 365 . A C 2311.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.60;MQ0=0;QD=33.99;SB=-0.01;sumGLbyD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:67:99:2344,202,0 16485-ref 372 . 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T C 2723.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6520;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.83;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:71:99:2757,214,0 16485-ref 761 . G A 2538.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.2027;MQ=36.42;MQ0=0;QD=36.26;SB=-0.01;sumGLbyD=36.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:67:99:2571,202,0 16485-ref 767 . A G 2378.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.6907;MQ=36.39;MQ0=0;QD=35.50;SB=-0.01;sumGLbyD=36.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,67:63:99:2412,190,0 16485-ref 839 . C A 2878.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8054;MQ=36.87;MQ0=0;QD=37.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:75:99:2911,226,0 16485-ref 881 . T C 2983.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.6936;MQ=36.87;MQ0=0;QD=37.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:77:99:3017,232,0 16485-ref 980 . 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A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 16491-ref 58 . T C 6090.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=161;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.0886;MQ=36.81;MQ0=0;QD=37.83;SB=-0.01;sumGLbyD=37.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,160:157:99:6090,472,0 16491-ref 126 . A G 2859.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6980;MQ=35.82;MQ0=0;QD=36.66;SB=-0.01;sumGLbyD=37.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:78:99:2892,232,0 16491-ref 127 . T C 2835.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8313;MQ=35.79;MQ0=0;QD=37.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:75:99:2868,226,0 16491-ref 146 . C A 1941.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8661;MQ=36.06;MQ0=0;QD=35.96;SB=-0.01;sumGLbyD=36.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,53:54:99:1975,122,0 16491-ref 241 . G A 181.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=30.26;SB=-0.01;sumGLbyD=35.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:214,18,0 16491-ref 242 . C T 190.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=31.78;SB=-0.01;sumGLbyD=37.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:224,18,0 16548-ref 65 . T G 83.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 16548-ref 81 . G A 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 16548-ref 580 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 16548-ref 591 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 16548-ref 679 . G A 165.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.03;SB=-0.01;sumGLbyD=39.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:198,15,0 16548-ref 688 . T G 28.01 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.60;SB=-0.01;sumGLbyD=11.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58:58,0,104 16548-ref 1157 . A T 207.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.86;SB=-0.01;sumGLbyD=15.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:14:99:238,0,229 16548-ref 1187 . G A 280.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9983;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.70;SB=-0.01;sumGLbyD=20.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:310,0,193 16548-ref 1286 . 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G A 102.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.87;SB=-0.01;sumGLbyD=16.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:133,0,136 16548-ref 1605 . C T 100.30 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.54;SB=-0.01;sumGLbyD=16.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:130,0,136 16548-ref 1610 . G T 102.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.44;SB=-0.01;sumGLbyD=14.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:133,0,171 16548-ref 1758 . T A 21.61 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=3.60;SB=-0.01;sumGLbyD=8.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:51.57:52,0,142 16548-ref 1762 . C T 18.61 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=3.10;SB=-0.01;sumGLbyD=8.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:48.55:49,0,141 16548-ref 1812 . C T 35.08 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.77;SB=-0.01;sumGLbyD=16.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65.07:65,0,68 16548-ref 1819 . C T 106.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.66;SB=-0.01;sumGLbyD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 16548-ref 1841 . C A 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 16548-ref 1924 . G A 114.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.57;SB=-0.01;sumGLbyD=36.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:147,12,0 16548-ref 1936 . G T 41.01 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=13.67;SB=-0.01;sumGLbyD=23.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20.60:71,0,21 16548-ref 1952 . 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A G 1055.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.85;MQ0=0;QD=35.20;SB=-0.01;sumGLbyD=36.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.25:1089,90,0 16683-ref 163 . G A 1404.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7219;MQ=34.12;MQ0=0;QD=35.12;SB=-0.01;sumGLbyD=35.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:39:99:1438,117,0 16683-ref 204 . C A 2269.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8653;MQ=35.98;MQ0=0;QD=37.83;SB=-0.01;sumGLbyD=38.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2303,181,0 16683-ref 216 . G A 2056.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.25;MQ0=0;QD=38.09;SB=-0.01;sumGLbyD=38.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:99:2090,163,0 16683-ref 257 . A T 3545.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8318;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.96;SB=-0.01;sumGLbyD=38.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:90:99:3545,271,0 16683-ref 379 . G C 13424.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=363;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.3672;MQ=35.18;MQ0=0;QD=36.98;SB=-0.01;sumGLbyD=36.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,363:358:99:13423,1077,0 16683-ref 405 . G A 17124.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=463;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=13.6484;MQ=34.85;MQ0=0;QD=36.99;SB=-0.01;sumGLbyD=36.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,461:458:99:17123,1378,0 16683-ref 432 . G A 13794.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=379;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.3408;MQ=34.10;MQ0=0;QD=36.40;SB=-0.01;sumGLbyD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,379:376:99:13792,1131,0 16683-ref 444 . T C 13340.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=379;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.3475;MQ=32.75;MQ0=0;QD=35.20;SB=-0.01;sumGLbyD=35.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,378:378:99:13338,1137,0 16683-ref 495 . G A 6883.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=196;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=4.6462;MQ=32.29;MQ0=0;QD=35.12;SB=-0.01;sumGLbyD=34.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,195:195:99:6852,584,0 16683-ref 496 . C A 6989.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=199;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6464;MQ=32.36;MQ0=0;QD=35.12;SB=-0.01;sumGLbyD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:198:99:6948,593,0 16683-ref 497 . C T 6749.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6475;MQ=32.96;MQ0=0;QD=35.15;SB=-0.01;sumGLbyD=35.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,191:191:99:6724,551,0 16683-ref 587 . G T 20991.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=553;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=31.5031;MQ=36.75;MQ0=0;QD=37.96;SB=-6073.38;sumGLbyD=37.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,550:541:99:20962,1600,0 16683-ref 834 . C G 1892.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=33.02;MQ0=0;QD=33.80;SB=-0.01;sumGLbyD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:56:99:1926,165,0 16683-ref 835 . C T 1084.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=30.16;MQ0=0;QD=31.89;SB=-0.01;sumGLbyD=32.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1117,102,0 16683-ref 836 . C T 769.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=27.71;MQ0=0;QD=29.58;SB=-0.01;sumGLbyD=30.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.16:802,78,0 16683-ref 837 . A G 500.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9652;MQ=25.00;MQ0=0;QD=26.33;SB=-0.01;sumGLbyD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:18:54.10:533,54,0 16751-ref 57 . T A 281.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.22;SB=-0.01;sumGLbyD=39.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:315,24,0 16751-ref 117 . T C 319.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.55;SB=-0.01;sumGLbyD=39.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:353,27,0 16751-ref 219 . C T 57.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=7.14;SB=-0.01;sumGLbyD=10.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:7:87.14:87,0,136 16751-ref 222 . G A 296.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.87;MQ0=0;QD=32.89;SB=-0.01;sumGLbyD=36.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:329,27,0 16751-ref 288 . G A 144.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.5522;MQ=35.72;MQ0=0;QD=18.11;SB=-0.01;sumGLbyD=21.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.95:175,0,22 16751-ref 324 . T C 160.89 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=16.09;SB=-65.32;sumGLbyD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:191,0,122 16751-ref 386 . T C 15.53 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4687;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.73;SB=3.00;sumGLbyD=5.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:45.40:45,0,205 16751-ref 390 . T G 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.51;SB=-0.01;sumGLbyD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:12.04:160,12,0 16751-ref 402 . C T 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 16751-ref 426 . C T 201.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.57;SB=-0.01;sumGLbyD=39.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:234,18,0 16751-ref 508 . T C 239.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.26;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:273,21,0 16751-ref 553 . C T 151.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9947;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.22;SB=-0.01;sumGLbyD=30.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:17.19:181,0,17 16751-ref 560 . A G 103.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9947;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.73;SB=-0.01;sumGLbyD=26.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.96:134,0,25 16751-ref 628 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 16751-ref 635 . T C 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 16751-ref 805 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 16751-ref 840 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 16751-ref 940 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 16751-ref 987 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=31.58;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,2:1:1.76:40,3,0 16751-ref 996 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=31.58;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 16751-ref 1041 . G T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 16786-ref 209 . C T 279.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.91;SB=-0.01;sumGLbyD=39.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:312,24,0 16786-ref 278 . T A 83.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 16786-ref 359 . 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C T 555.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.05;SB=-0.01;sumGLbyD=39.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:589,45,0 16786-ref 962 . G C 300.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.02;SB=-0.01;sumGLbyD=16.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,10:20:99:330,0,335 16786-ref 1163 . A G 383.89 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=23.99;SB=-0.01;sumGLbyD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:15:74.88:414,0,75 16786-ref 1361 . C T 95.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.59;SB=-0.01;sumGLbyD=13.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:125,0,173 16786-ref 1403 . T C 224.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6643;MQ=34.01;MQ0=0;QD=32.13;SB=-0.01;sumGLbyD=36.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:258,21,0 16786-ref 1404 . 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T C 1169.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.56;SB=-0.01;sumGLbyD=37.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:31:93.30:1203,93,0 16786-ref 1946 . C T 1574.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=4.7284;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.49;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:41:99:1608,123,0 16786-ref 2036 . C G 860.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4657;MQ=36.72;MQ0=0;QD=23.90;SB=-0.01;sumGLbyD=24.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:34:99:890,0,216 16786-ref 2093 . A G 485.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7337;MQ=35.87;MQ0=0;QD=17.98;SB=-0.01;sumGLbyD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:27:99:516,0,308 16786-ref 2120 . T C 776.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7719;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.34;SB=-0.01;sumGLbyD=33.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:22:66.19:809,66,0 16786-ref 2141 . 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A G 25.98 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=2.89;SB=-0.01;sumGLbyD=6.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:55.97:56,0,139 16916-ref 138 . A G 85.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.59;SB=-0.01;sumGLbyD=39.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:118,9,0 16916-ref 211 . A G 152.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.51;SB=-0.01;sumGLbyD=37.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:185,15,0 16916-ref 447 . C T 202.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.78;SB=-0.01;sumGLbyD=39.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:236,18,0 16916-ref 582 . A T 468.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.06;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.10:502,39,0 16916-ref 609 . T C 383.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.91;SB=-0.01;sumGLbyD=37.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:417,33,0 16916-ref 633 . G T 205.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=35.53;MQ0=0;QD=29.39;SB=-0.01;sumGLbyD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.06:239,18,0 16916-ref 708 . T A 324.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.02;SB=-0.01;sumGLbyD=39.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:357,27,0 16916-ref 710 . G A 323.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.93;SB=-0.01;sumGLbyD=39.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:356,27,0 16916-ref 756 . A T 196.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.05;SB=-0.01;sumGLbyD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.06:229,18,0 16916-ref 1103 . A C 539.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=35.95;SB=-0.01;sumGLbyD=38.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:572,45,0 16916-ref 1229 . A C 16.08 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9379;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.79;SB=-0.01;sumGLbyD=5.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:45.96:46,0,253 16916-ref 1231 . T A 15.60 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9379;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.42;SB=-0.01;sumGLbyD=4.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:45.47:45,0,320 16916-ref 1853 . C T 750.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7273;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.52;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:783,60,0 16938-ref 834 . A T 133.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=22.19;SB=-0.01;sumGLbyD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.02:166,18,0 16955-ref 51 . G C 412.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.41;SB=-139.23;sumGLbyD=37.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:446,36,0 16955-ref 61 . T C 385.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9991;MQ=34.39;MQ0=0;QD=32.13;SB=-109.61;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:11:33.10:419,33,0 16955-ref 92 . A G 445.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.72;SB=-109.87;sumGLbyD=31.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:15.50:479,15,0 16955-ref 118 . A G 155.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=25.87;SB=-29.50;sumGLbyD=31.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:188,18,0 16955-ref 133 . T C 125.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=25.15;SB=-29.38;sumGLbyD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:158,15,0 16955-ref 145 . C T 125.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=25.15;SB=-29.38;sumGLbyD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:158,15,0 16994-ref 109 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 16994-ref 147 . T C 147.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.42;SB=-0.01;sumGLbyD=35.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:180,15,0 16994-ref 315 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 16994-ref 454 . T A 74.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9916;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.00;SB=-0.01;sumGLbyD=20.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.96:105,0,65 16994-ref 606 . C G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 16994-ref 639 . T C 33.64 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=16.82;SB=-0.01;sumGLbyD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:65,6,0 16994-ref 654 . G C 36.18 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.09;SB=-0.01;sumGLbyD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:67,6,0 16994-ref 801 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 16994-ref 811 . A G 199.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.25;SB=-0.01;sumGLbyD=38.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:232,18,0 16994-ref 849 . G A 126.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 17004-ref 34 . A G 229.65 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.15;MQ0=0;QD=19.14;SB=-0.01;sumGLbyD=21.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:260,0,107 17004-ref 56 . G A 518.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7987;MQ=36.37;MQ0=0;QD=32.42;SB=-0.01;sumGLbyD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:14:42.14:552,42,0 17004-ref 98 . T A 630.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.12;SB=-0.01;sumGLbyD=39.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:664,51,0 17004-ref 162 . G C 306.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.32;SB=-0.01;sumGLbyD=16.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:19:99:336,0,296 17004-ref 285 . G A 37.93 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.96;SB=-0.01;sumGLbyD=35.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:69,6,0 17024-ref 111 . C T 115 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.00;SB=-0.01;sumGLbyD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:20.20:145,0,20 17024-ref 138 . T A 19.75 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.29;SB=-0.01;sumGLbyD=8.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:49.70:50,0,135 17024-ref 141 . A G 122.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.69;SB=-0.01;sumGLbyD=38.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:155,12,0 17024-ref 156 . G C 325.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.18;SB=-0.01;sumGLbyD=39.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:359,27,0 17024-ref 198 . C T 720.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.91;SB=-0.01;sumGLbyD=39.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.19:753,57,0 17024-ref 257 . T C 604.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=33.58;SB=-0.01;sumGLbyD=35.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:17:51.16:637,51,0 17024-ref 268 . C T 658 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=36.56;SB=-0.01;sumGLbyD=38.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:691,54,0 17024-ref 339 . C T 911.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=36.19;MQ0=0;QD=36.45;SB=-0.01;sumGLbyD=37.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.23:944,75,0 17024-ref 361 . C T 752.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.5968;MQ=36.07;MQ0=0;QD=34.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.18:785,63,0 17024-ref 398 . G C 277.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.65;SB=-0.01;sumGLbyD=38.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:310,24,0 17024-ref 446 . G T 400.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.43;SB=-0.01;sumGLbyD=39.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:434,33,0 17024-ref 497 . C G 126.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 17024-ref 520 . A G 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 17058-ref 108 . T C 280.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.07;SB=-0.01;sumGLbyD=39.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:314,24,0 17058-ref 147 . G A 164.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:197,15,0 17058-ref 170 . G A 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 17058-ref 346 . G C 259.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.43;SB=-0.01;sumGLbyD=36.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:292,24,0 17058-ref 387 . T A 349.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.73;SB=-0.01;sumGLbyD=34.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.10:382,30,0 17058-ref 519 . G A 509.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=36.39;SB=-0.01;sumGLbyD=38.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:542,42,0 17058-ref 649 . C T 229.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=32.81;SB=-0.01;sumGLbyD=37.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:263,21,0 17058-ref 679 . A C 219.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=31.40;SB=-0.01;sumGLbyD=36.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:253,21,0 17058-ref 684 . A G 220.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=31.49;SB=-0.01;sumGLbyD=36.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:253,21,0 17058-ref 694 . T C 313.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=31.30;SB=-0.01;sumGLbyD=34.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.08:346,27,0 17058-ref 796 . G A 417.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=34.82;SB=-0.01;sumGLbyD=37.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:451,36,0 17058-ref 829 . T C 259.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=25.93;SB=-0.01;sumGLbyD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.05:292,27,0 17058-ref 841 . T C 266.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.22;MQ0=0;QD=29.61;SB=-0.01;sumGLbyD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:300,27,0 17058-ref 862 . G T 94.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=23.74;SB=-0.01;sumGLbyD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:127,12,0 17058-ref 889 . G A 111.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=27.96;SB=-0.01;sumGLbyD=36.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:144,12,0 17058-ref 979 . T C 467.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=35.98;SB=-0.01;sumGLbyD=38.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:501,39,0 17058-ref 1153 . 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C T 303.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=30.38;SB=-0.01;sumGLbyD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:337,30,0 17058-ref 1558 . T G 304 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=30.40;SB=-0.01;sumGLbyD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:337,30,0 17058-ref 1571 . A T 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 17058-ref 1573 . T A 14.38 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=2.88;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.22:44,0,74 17058-ref 1582 . G T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 17060-ref 23 . A G 44.89 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 17060-ref 83 . G C 52.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9576;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.37;SB=-0.01;sumGLbyD=6.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:82.47:82,0,317 17060-ref 120 . G A 99.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.10;SB=-0.01;sumGLbyD=14.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:130,0,162 17060-ref 137 . A G 98.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.08;SB=-0.01;sumGLbyD=18.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:95.08:129,0,95 17060-ref 158 . A G 73.24 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.31;SB=-0.01;sumGLbyD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:103,0,28 17152-ref 68 . A G 287.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:320,24,0 17152-ref 133 . C T 715.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.79;SB=-0.01;sumGLbyD=37.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:20:57.19:749,57,0 17152-ref 279 . G T 454.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.78;MQ0=0;QD=32.43;SB=-0.01;sumGLbyD=34.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.12:487,39,0 17152-ref 288 . G A 605.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=33.62;SB=-0.01;sumGLbyD=35.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:17:51.16:638,51,0 17152-ref 289 . A G 618.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=34.35;SB=-0.01;sumGLbyD=36.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.15:651,54,0 17152-ref 393 . A T 1112.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.39;MQ0=0;QD=34.76;SB=-0.01;sumGLbyD=35.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.25:1145,96,0 17152-ref 413 . T G 925.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.01;MQ0=0;QD=35.61;SB=-0.01;sumGLbyD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.23:959,78,0 17152-ref 416 . C T 729.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=34.74;SB=-0.01;sumGLbyD=36.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:20:60.19:762,60,0 17152-ref 461 . A G 544.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.03;SB=-0.01;sumGLbyD=36.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.14:577,45,0 17152-ref 772 . A G 2254.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.3266;MQ=36.84;MQ0=0;QD=35.78;SB=-0.01;sumGLbyD=36.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:61:99:2287,184,0 17152-ref 840 . C A 1974.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.0461;MQ=36.62;MQ0=0;QD=37.25;SB=-0.01;sumGLbyD=37.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:2007,156,0 17216-ref 41 . A G 46.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=11.71;SB=-0.01;sumGLbyD=19.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.98:77,0,28 17216-ref 65 . T A 112.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=14.08;SB=-0.01;sumGLbyD=17.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:93.74:143,0,94 17216-ref 78 . T C 114.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=14.35;SB=-0.01;sumGLbyD=18.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:91.20:145,0,91 17216-ref 98 . G C 184.37 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=16.76;SB=-0.01;sumGLbyD=19.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:214,0,121 17216-ref 198 . C T 63.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=35.31;MQ0=0;QD=3.37;SB=3.00;sumGLbyD=4.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:18:93.98:94,0,477 17216-ref 199 . G A 476.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=35.31;MQ0=0;QD=25.07;SB=-37.00;sumGLbyD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,15:19:99:506,0,100 17216-ref 211 . T C 369.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=35.12;MQ0=0;QD=33.63;SB=-0.01;sumGLbyD=36.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.07:403,33,0 17216-ref 234 . C A 25.40 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=34.39;MQ0=0;QD=6.35;SB=-0.01;sumGLbyD=13.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:55.38:55,0,68 17216-ref 267 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 17216-ref 333 . G A 101.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=16.93;SB=-0.01;sumGLbyD=21.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:60.53:132,0,61 17216-ref 371 . T C 90.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7333;MQ=35.53;MQ0=0;QD=12.89;SB=-0.01;sumGLbyD=17.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:88.59:120,0,89 17216-ref 386 . T C 115.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=23.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.03:148,12,0 17291-ref 54 . C G 201.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.65;SB=-0.01;sumGLbyD=39.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 17291-ref 86 . C G 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.89;SB=-0.01;sumGLbyD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:6:12.04:158,12,0 17291-ref 87 . T C 45.21 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.65;SB=-0.01;sumGLbyD=9.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:75.21:75,0,166 17291-ref 124 . C T 1741.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.0884;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.28;SB=-0.01;sumGLbyD=36.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,47:47:99:1774,101,0 17291-ref 236 . T C 2182.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.12;MQ0=0;QD=37.64;SB=-0.01;sumGLbyD=38.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2216,175,0 17291-ref 250 . T C 3062.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4076;MQ=36.26;MQ0=0;QD=37.35;SB=-0.01;sumGLbyD=37.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,81:80:99:3095,241,0 17291-ref 251 . G A 3132.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4076;MQ=36.27;MQ0=0;QD=37.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:3165,247,0 17291-ref 313 . 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T A 717.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.86;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.17:750,60,0 17317-ref 367 . T A 761.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.03;MQ0=0;QD=36.28;SB=-0.01;sumGLbyD=37.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.19:795,63,0 17317-ref 512 . G C 714.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.70;SB=-0.01;sumGLbyD=37.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:19:57.19:747,57,0 17335-ref 12 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 17335-ref 69 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 17335-ref 71 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 17335-ref 235 . A G 436.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.40;SB=-0.01;sumGLbyD=39.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:470,36,0 17335-ref 237 . G A 431.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.99;SB=-0.01;sumGLbyD=38.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:465,36,0 17335-ref 391 . G C 13.92 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=34.93;MQ0=0;QD=0.93;SB=-0.01;sumGLbyD=2.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:43.73:44,0,431 17335-ref 526 . A G 696.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.67;SB=-0.01;sumGLbyD=38.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:730,57,0 17335-ref 688 . A T 853.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.56;MQ0=0;QD=37.11;SB=-0.01;sumGLbyD=38.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.22:887,69,0 17335-ref 689 . T C 858.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.56;MQ0=0;QD=37.33;SB=-0.01;sumGLbyD=38.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.22:892,69,0 17335-ref 747 . T A 630.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.06;SB=-0.01;sumGLbyD=39.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:663,51,0 17335-ref 814 . C T 789.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.64;MQ0=0;QD=35.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.19:823,66,0 17335-ref 848 . A G 489.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=32.65;SB=-0.01;sumGLbyD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.12:523,45,0 17335-ref 849 . A C 475.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=31.72;SB=-0.01;sumGLbyD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.11:509,45,0 17335-ref 865 . T A 409.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.03;MQ0=0;QD=31.46;SB=-0.01;sumGLbyD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.09:442,39,0 17335-ref 934 . T A 714.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.63;SB=-0.01;sumGLbyD=39.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.19:748,57,0 17335-ref 952 . G A 750.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.52;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:783,60,0 17335-ref 1333 . T C 1102.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.01;MQ0=0;QD=35.56;SB=-0.01;sumGLbyD=36.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:31:90.28:1136,90,0 17335-ref 1341 . C G 1037.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=35.94;MQ0=0;QD=35.76;SB=-0.01;sumGLbyD=36.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.25:1070,87,0 17335-ref 1402 . C G 1420.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4069;MQ=36.51;MQ0=0;QD=34.65;SB=-103.07;sumGLbyD=35.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:39:99:1454,117,0 17335-ref 1548 . T C 1305.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8633;MQ=36.45;MQ0=0;QD=35.27;SB=-0.01;sumGLbyD=36.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1338,108,0 17335-ref 1585 . A G 1358.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9999;MQ=36.72;MQ0=0;QD=37.75;SB=-0.01;sumGLbyD=38.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1392,108,0 17335-ref 1682 . A G 343.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.24;SB=-0.01;sumGLbyD=34.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.09:377,30,0 17345-ref 17 . A T 504.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=36.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:537,42,0 17345-ref 27 . G A 524.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=6;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.63;MQ0=0;QD=34.96;SB=-0.01;sumGLbyD=37.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:557,45,0 17345-ref 49 . C G 981.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.22;MQ0=0;QD=37.74;SB=-0.01;sumGLbyD=39.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.25:1014,78,0 17345-ref 119 . A G 3204.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.15;SB=-0.01;sumGLbyD=38.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3238,253,0 17345-ref 332 . T A 4447.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.8063;MQ=36.83;MQ0=0;QD=38.34;SB=-0.01;sumGLbyD=38.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:114:99:4448,343,0 17345-ref 463 . T C 2675.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.3379;MQ=36.72;MQ0=0;QD=37.68;SB=-0.01;sumGLbyD=38.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:70:99:2708,211,0 17373-ref 614 . T C 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 17373-ref 644 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 17373-ref 645 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 17373-ref 731 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 17373-ref 831 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 17373-ref 851 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 17373-ref 866 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 17373-ref 1014 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 17373-ref 1035 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 17373-ref 1147 . 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C G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 17373-ref 1766 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 17373-ref 1790 . T A 33.21 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.30;SB=-0.01;sumGLbyD=15.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:3:30.98:63,0,31 17373-ref 1830 . C T 223.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.99;SB=-0.01;sumGLbyD=36.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:257,21,0 17442-ref 16 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 17442-ref 33 . T C 205.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 17442-ref 116 . G A 574.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=31.93;SB=-0.01;sumGLbyD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:16:48.15:608,48,0 17442-ref 133 . T C 798.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.6543;MQ=36.15;MQ0=0;QD=33.27;SB=-0.01;sumGLbyD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:24:32.22:831,32,0 17442-ref 262 . A T 509.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.39;SB=-0.01;sumGLbyD=38.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:543,42,0 17442-ref 282 . C G 569.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=28.49;SB=-0.01;sumGLbyD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:19:22.83:600,0,23 17442-ref 308 . C A 457.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.47;MQ0=0;QD=24.07;SB=-0.01;sumGLbyD=25.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,14:19:99:487,0,132 17442-ref 345 . C G 446.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.42;SB=-0.01;sumGLbyD=20.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,15:22:99:477,0,250 17442-ref 643 . G A 674.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.47;MQ0=0;QD=35.51;SB=-0.01;sumGLbyD=37.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:18:54.17:708,54,0 17442-ref 698 . A T 442.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9664;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.25;SB=-0.01;sumGLbyD=16.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:472,0,456 17442-ref 766 . C A 198.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.02;SB=-0.01;sumGLbyD=38.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:231,18,0 17659-ref 58 . C T 2240.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.1647;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.14;SB=-0.01;sumGLbyD=36.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:59:99:2274,178,0 17659-ref 150 . T C 2186.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.5740;MQ=36.54;MQ0=0;QD=33.14;SB=-0.01;sumGLbyD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,63:64:73.28:2220,73,0 17659-ref 192 . G C 2478.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.4862;MQ=36.58;MQ0=0;QD=33.95;SB=-0.01;sumGLbyD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,70:72:96.64:2512,97,0 17688-ref 104 . T C 271.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=27.19;SB=-0.01;sumGLbyD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:8:24.07:305,24,0 17698-ref 96 . G A 158.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.72;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:191,15,0 17698-ref 171 . C T 189.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=31.54;SB=-0.01;sumGLbyD=37.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:222,18,0 17698-ref 210 . A G 241.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=30.14;SB=-0.01;sumGLbyD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:274,24,0 17698-ref 244 . A G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 17698-ref 248 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 17698-ref 337 . T A 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 17698-ref 353 . C G 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 17698-ref 384 . G C 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 17698-ref 387 . C A 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 17698-ref 433 . G A 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 17698-ref 434 . A T 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 17698-ref 464 . G A 217.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=31.12;SB=-0.01;sumGLbyD=35.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:251,21,0 17698-ref 508 . C G 398.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.25;SB=-0.01;sumGLbyD=39.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:432,33,0 17698-ref 593 . T A 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 17698-ref 601 . A G 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 17698-ref 607 . C A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 17698-ref 611 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 17698-ref 790 . G A 44.35 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.18;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 17698-ref 799 . A C 235.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.62;SB=-0.01;sumGLbyD=38.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:268,21,0 17698-ref 931 . G A 476.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9979;MQ=32.86;MQ0=0;QD=26.47;SB=-0.01;sumGLbyD=28.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:18:16.36:506,0,16 17698-ref 941 . G C 441.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.30;MQ0=0;QD=27.61;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:9.55:474,10,0 17698-ref 951 . 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C T 1337.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.20;SB=-0.01;sumGLbyD=39.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1370,105,0 17698-ref 1427 . T G 1737.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.79;MQ0=0;QD=36.96;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1770,141,0 17698-ref 1474 . A G 1417.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=36.45;MQ0=0;QD=38.31;SB=-0.01;sumGLbyD=39.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1451,111,0 17698-ref 1502 . C G 1293.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6401;MQ=36.36;MQ0=0;QD=38.06;SB=-0.01;sumGLbyD=39.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1327,102,0 17698-ref 1631 . A G 389.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8661;MQ=35.95;MQ0=0;QD=35.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:423,33,0 17733-ref 9 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 17733-ref 24 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 17733-ref 53 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 17733-ref 70 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 17785-ref 678 . T C 85.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.36;SB=-0.01;sumGLbyD=39.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:117,9,0 17785-ref 769 . G A 457.81 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.4165;MQ=31.49;MQ0=0;QD=10.40;SB=-0.01;sumGLbyD=11.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,21:42:99:488,0,692 17785-ref 846 . A G 439.52 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.3348;MQ=30.34;MQ0=0;QD=10.72;SB=-0.01;sumGLbyD=11.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,20:41:99:470,0,632 17785-ref 858 . T C 36.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.09;MQ0=0;QD=1.28;SB=-0.01;sumGLbyD=2.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:66.99:67,0,741 17785-ref 897 . T C 135.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=23.35;MQ0=0;QD=22.51;SB=-0.01;sumGLbyD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.02:168,18,0 17785-ref 907 . T C 135.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=23.35;MQ0=0;QD=22.51;SB=-0.01;sumGLbyD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.02:168,18,0 17861-ref 133 . G A 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 17898-ref 246 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 17905-ref 68 . T C 285.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:319,24,0 17905-ref 276 . T C 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 17905-ref 283 . T C 202.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.74;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 17905-ref 326 . C T 259.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.85;MQ0=0;QD=25.93;SB=-0.01;sumGLbyD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:9.92:289,0,10 17905-ref 354 . G A 216.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.22;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12.94:246,0,13 17905-ref 377 . A G 73.47 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.4070;MQ=29.55;MQ0=0;QD=12.25;SB=-0.01;sumGLbyD=17.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:5:24.97:103,0,25 17905-ref 379 . G T 43.84 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.0647;MQ=29.55;MQ0=0;QD=7.31;SB=-0.01;sumGLbyD=12.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:5:62.77:74,0,63 17905-ref 402 . A G 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:50,0,31 17905-ref 414 . G A 63.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=15.80;SB=-0.01;sumGLbyD=23.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:93,0,28 17905-ref 429 . T C 139.41 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=23.24;SB=-0.01;sumGLbyD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:19.74:169,0,20 17905-ref 488 . T G 360.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.09;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:394,30,0 17905-ref 540 . G T 1037.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.59;MQ0=0;QD=35.76;SB=-0.01;sumGLbyD=36.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:28:84.26:1070,84,0 17905-ref 564 . T C 993.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=35.09;MQ0=0;QD=36.78;SB=-0.01;sumGLbyD=38.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.24:1026,81,0 17905-ref 571 . T C 935.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=34.60;MQ0=0;QD=36.00;SB=-0.01;sumGLbyD=37.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.23:969,78,0 17905-ref 627 . C T 307.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=25.60;SB=-0.01;sumGLbyD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:11:1.26:336,0,1 17905-ref 645 . T C 311.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=28.29;SB=-0.01;sumGLbyD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:4.70:341,0,5 17905-ref 718 . A G 1050.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.65;MQ0=0;QD=36.23;SB=-0.01;sumGLbyD=37.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:28:84.26:1084,84,0 17905-ref 785 . T G 44.17 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=10.8311;MQ=36.22;MQ0=0;QD=3.40;SB=-0.01;sumGLbyD=5.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:74.16:74,0,339 17905-ref 786 . G A 40.54 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.8294;MQ=36.22;MQ0=0;QD=3.12;SB=-0.01;sumGLbyD=5.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:70.54:71,0,330 17905-ref 792 . C G 67.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=9.8247;MQ=36.27;MQ0=0;QD=4.86;SB=-0.01;sumGLbyD=7.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:13:97.99:98,0,311 17905-ref 871 . A C 362.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=30.19;MQ0=0;QD=27.89;SB=-0.01;sumGLbyD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:12:36.08:396,36,0 17905-ref 876 . C T 361.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=30.15;SB=-0.01;sumGLbyD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.08:395,36,0 17905-ref 887 . T C 244 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.60;MQ0=0;QD=27.11;SB=-0.01;sumGLbyD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.05:277,27,0 17905-ref 893 . A T 203.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=25.38;SB=-0.01;sumGLbyD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.03:236,24,0 17905-ref 992 . A G 506.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.16;SB=-0.01;sumGLbyD=38.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:539,42,0 17905-ref 1044 . A G 795.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.87;SB=-0.01;sumGLbyD=39.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.21:828,63,0 17905-ref 1133 . A G 25.48 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.10;SB=-0.01;sumGLbyD=11.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:55.46:55,0,105 17905-ref 1153 . G T 36.57 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.19;SB=-0.01;sumGLbyD=22.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:67,0,31 17905-ref 1154 . T A 34.03 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.34;SB=-0.01;sumGLbyD=21.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:64,0,31 17905-ref 1155 . A T 36.57 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.19;SB=-0.01;sumGLbyD=22.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:67,0,31 17907-ref 53 . A G 311.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.56;SB=-0.01;sumGLbyD=38.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:344,27,0 17907-ref 1310 . T C 1231.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.6113;MQ=36.63;MQ0=0;QD=22.80;SB=-0.01;sumGLbyD=23.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,37:54:99:1261,0,502 17907-ref 1419 . C T 644.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8315;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.89;SB=-0.01;sumGLbyD=18.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:35:99:674,0,490 17907-ref 1862 . C T 48.26 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=1.9942;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.02;SB=-0.01;sumGLbyD=6.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:78.25:78,0,313 17986-ref 83 . C T 231.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=28.88;SB=-0.01;sumGLbyD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.06:264,21,0 17986-ref 129 . T C 267.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=33.44;SB=-0.01;sumGLbyD=37.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:301,24,0 17986-ref 260 . G A 257.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=32.17;SB=-0.01;sumGLbyD=36.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:290,24,0 17986-ref 272 . G C 146.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:179,15,0 17986-ref 285 . C A 14.37 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=2.87;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.20:44,0,103 17986-ref 288 . G A 14.37 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=2.87;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.20:44,0,105 17986-ref 380 . A G 225.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=32.27;SB=-0.01;sumGLbyD=36.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:259,21,0 17986-ref 405 . C A 188.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=31.46;SB=-0.01;sumGLbyD=36.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:222,18,0 17986-ref 532 . G A 190.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.81;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:224,18,0 17986-ref 637 . T A 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 17986-ref 669 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 17986-ref 832 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 17986-ref 892 . G A 102.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.81;MQ0=0;QD=25.71;SB=-0.01;sumGLbyD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:135,12,0 17986-ref 1000 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 17989-ref 125 . A T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 17989-ref 126 . T A 76.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.39;SB=-0.01;sumGLbyD=36.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 17989-ref 140 . A C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 18056-ref 216 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 18056-ref 224 . C G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 18056-ref 229 . C G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 18056-ref 318 . T C 57.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=8.16;SB=-0.01;sumGLbyD=12.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:87.14:87,0,125 18056-ref 344 . C A 16.94 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=11;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=2.82;SB=-0.01;sumGLbyD=7.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:46.85:47,0,114 18056-ref 765 . T C 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.88;SB=-0.01;sumGLbyD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.05:200,15,0 18056-ref 990 . T A 466.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=36.32;MQ0=0;QD=31.12;SB=-0.01;sumGLbyD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:8.16:499,8,0 18056-ref 1007 . C T 426.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.3359;MQ=36.32;MQ0=0;QD=28.45;SB=-0.01;sumGLbyD=30.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:14:2.08:456,2,0 18056-ref 1104 . T A 139.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.72;SB=-0.01;sumGLbyD=15.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:10:99:170,0,169 18143-ref 27 . A T 110.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=27.64;SB=-0.01;sumGLbyD=35.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:143,12,0 18143-ref 61 . C G 224.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=34.01;MQ0=0;QD=32.02;SB=-29.56;sumGLbyD=36.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:257,21,0 18143-ref 90 . A T 210.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=26.32;SB=-0.01;sumGLbyD=30.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15.93:241,0,16 18143-ref 102 . T C 15.20 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.69;SB=-0.01;sumGLbyD=5.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:45.06:45,0,250 18143-ref 188 . A C 573.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.85;SB=-0.01;sumGLbyD=37.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:607,48,0 18143-ref 308 . T C 22.95 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.1680;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.55;SB=-0.01;sumGLbyD=5.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52.93:53,0,242 18143-ref 323 . C T 218.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.32;SB=-0.01;sumGLbyD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15.24:249,0,15 18143-ref 443 . T A 246.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.20;SB=-0.01;sumGLbyD=39.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:279,21,0 18143-ref 484 . C T 204.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.06;SB=-0.01;sumGLbyD=39.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:237,18,0 18143-ref 601 . C T 234.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.49;SB=-0.01;sumGLbyD=38.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:267,21,0 18143-ref 636 . C T 371.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=33.78;SB=-0.01;sumGLbyD=36.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:405,33,0 18143-ref 672 . A T 120.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=20.14;SB=-0.01;sumGLbyD=25.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.96:151,0,22 18143-ref 678 . A C 116.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.50;SB=-0.01;sumGLbyD=24.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.96:147,0,22 18143-ref 684 . G A 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:50,0,31 18202-ref 135 . A C 16.08 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.79;SB=-0.01;sumGLbyD=5.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:45.96:46,0,253 18202-ref 167 . G T 96.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.3542;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.75;SB=-0.01;sumGLbyD=11.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:126,0,239 18202-ref 258 . C T 390.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8600;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.98;SB=-0.01;sumGLbyD=24.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:421,0,110 18202-ref 344 . C T 317.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.19;SB=-0.01;sumGLbyD=23.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:348,0,127 18202-ref 410 . T C 740.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:774,60,0 18202-ref 412 . A G 173.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.20;SB=-0.01;sumGLbyD=11.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:203,0,346 18202-ref 495 . A T 567.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=35.72;MQ0=0;QD=35.46;SB=-0.01;sumGLbyD=37.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:600,48,0 18202-ref 532 . A C 41.59 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=8.32;SB=-0.01;sumGLbyD=14.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:52.40:72,0,52 18202-ref 533 . A G 23.20 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=4.64;SB=-0.01;sumGLbyD=10.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:53.17:53,0,89 18202-ref 631 . A G 515.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.21;MQ0=0;QD=34.34;SB=-0.01;sumGLbyD=36.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:548,45,0 18202-ref 637 . C A 562.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=35.17;SB=-0.01;sumGLbyD=37.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:596,48,0 18202-ref 664 . G A 132.02 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=1.9987;MQ=34.78;MQ0=0;QD=9.43;SB=-0.01;sumGLbyD=11.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:162,0,271 18202-ref 689 . A G 440.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.60;MQ0=0;QD=33.92;SB=-0.01;sumGLbyD=36.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.11:474,39,0 18202-ref 916 . T A 270.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=33.84;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:304,24,0 18202-ref 1003 . C T 359.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.71;SB=-0.01;sumGLbyD=35.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:393,30,0 18202-ref 1097 . C G 402.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.59;SB=-0.01;sumGLbyD=39.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:435,33,0 18202-ref 1212 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 18220-ref 113 . G A 1398 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.83;SB=-0.01;sumGLbyD=39.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1431,108,0 18245-ref 180 . C T 118.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.73;SB=-0.01;sumGLbyD=37.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:151,12,0 18245-ref 219 . A G 315.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=35.03;SB=-0.01;sumGLbyD=38.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:348,27,0 18245-ref 238 . T C 370.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=33.71;SB=-0.01;sumGLbyD=36.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:404,33,0 18273-ref 24 . C T 277.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.66;SB=-0.01;sumGLbyD=38.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:310,24,0 18273-ref 80 . T C 1300.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.70;MQ0=0;QD=38.25;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1334,102,0 18273-ref 114 . A T 980.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.61;MQ0=0;QD=37.72;SB=-0.01;sumGLbyD=38.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.25:1014,78,0 18273-ref 399 . G A 1261.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.09;SB=-0.01;sumGLbyD=38.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:33:99:1294,99,0 18273-ref 413 . A G 1034.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.26:1068,81,0 18273-ref 464 . A C 1491.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1524,120,0 18273-ref 632 . T G 14.23 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.9610;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.29;SB=-0.01;sumGLbyD=4.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:44.06:44,0,299 18296-ref 140 . T C 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 18296-ref 204 . C T 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.52;SB=-0.01;sumGLbyD=26.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6.02:78,6,0 18296-ref 278 . C G 62.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=20.82;SB=-0.01;sumGLbyD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:94,9,0 18296-ref 287 . A G 25.07 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=12.54;SB=-0.01;sumGLbyD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:56,6,0 18296-ref 297 . T A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 18296-ref 312 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 18296-ref 753 . C G 226.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.27;SB=-0.01;sumGLbyD=32.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:10.28:256,0,10 18296-ref 801 . G C 244.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.89;SB=-0.01;sumGLbyD=39.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:277,21,0 18296-ref 899 . A C 385.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.07;SB=-0.01;sumGLbyD=38.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:419,33,0 18296-ref 919 . A T 93.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.17;SB=-0.01;sumGLbyD=9.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:12:99:123,0,275 18296-ref 926 . T C 243.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.23;SB=-0.01;sumGLbyD=18.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:273,0,233 18296-ref 1330 . 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C T 1405.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.00;SB=-0.01;sumGLbyD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:37:99:1439,111,0 18300-ref 312 . C A 148.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.74;SB=-0.01;sumGLbyD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:181,15,0 18300-ref 313 . C G 147.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.48;SB=-0.01;sumGLbyD=36.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:180,15,0 18368-ref 81 . T C 111.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:61.95:142,0,62 18368-ref 125 . G A 284.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.52;SB=-0.01;sumGLbyD=39.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:317,24,0 18368-ref 143 . 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A C 7158.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=193;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8288;MQ=35.40;MQ0=0;QD=37.09;SB=-0.01;sumGLbyD=36.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,192:190:99:7128,541,0 18549-ref 832 . A G 2961.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=36.88;MQ0=0;QD=35.69;SB=-270.63;sumGLbyD=36.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,80:82:99:2995,145,0 18549-ref 838 . C T 2638.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.85;MQ0=0;QD=38.24;SB=-262.51;sumGLbyD=38.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2672,208,0 18641-ref 46 . G C 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 18641-ref 186 . C T 283.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.43;SB=-0.01;sumGLbyD=39.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:316,24,0 18641-ref 311 . 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G A 704.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.25;SB=-0.01;sumGLbyD=36.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:19:57.18:738,57,0 18666-ref 835 . A C 581.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=36.32;SB=-0.01;sumGLbyD=38.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:614,48,0 18666-ref 936 . A G 1088.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.54;SB=-0.01;sumGLbyD=38.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.28:1122,87,0 18666-ref 1168 . C A 687.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.17;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.18:720,54,0 18666-ref 1351 . T C 1415.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.45;MQ0=0;QD=38.24;SB=-0.01;sumGLbyD=39.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1448,111,0 18666-ref 1413 . 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C T 156.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.24;SB=-0.01;sumGLbyD=37.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:189,15,0 18680-ref 411 . G A 191.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=31.85;SB=-0.01;sumGLbyD=37.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:224,18,0 18680-ref 438 . A G 306.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.98;MQ0=0;QD=30.61;SB=-0.01;sumGLbyD=33.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.08:339,27,0 18680-ref 564 . C T 70.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.74;SB=-0.01;sumGLbyD=25.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.01:103,9,0 18680-ref 614 . A G 583.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.44;MQ0=0;QD=32.44;SB=-0.01;sumGLbyD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:14.17:617,14,0 18680-ref 1754 . C T 749.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.50;SB=-0.01;sumGLbyD=39.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:783,60,0 18711-ref 216 . G A 865.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:24:69.22:899,69,0 18711-ref 229 . A C 1004.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.63;MQ0=0;QD=37.21;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.25:1038,81,0 18711-ref 348 . C T 690.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7356;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.50;SB=-0.01;sumGLbyD=36.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:19:57.17:723,57,0 18711-ref 632 . C G 1332.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.07;SB=-0.01;sumGLbyD=39.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1365,105,0 18711-ref 704 . G A 1215.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6553;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.99;SB=-0.01;sumGLbyD=39.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.31:1249,96,0 18711-ref 820 . C T 786.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.44;SB=-0.01;sumGLbyD=39.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:819,63,0 18711-ref 926 . G A 1063.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.65;MQ0=0;QD=36.69;SB=-0.01;sumGLbyD=37.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:28:84.27:1097,84,0 18726-ref 38 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 18726-ref 43 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 18726-ref 177 . A G 841.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8319;MQ=35.82;MQ0=0;QD=32.35;SB=-0.01;sumGLbyD=33.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:25:35.22:874,35,0 18726-ref 191 . G T 819.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=35.77;MQ0=0;QD=32.80;SB=-0.01;sumGLbyD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:35.22:853,35,0 18726-ref 209 . G C 958.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.94;MQ0=0;QD=33.06;SB=-0.01;sumGLbyD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:50.26:992,50,0 18797-ref 254 . C G 275.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9994;MQ=35.28;MQ0=0;QD=22.98;SB=-0.01;sumGLbyD=25.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:12:9.92:306,0,10 18797-ref 284 . C T 335.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=27.94;SB=-0.01;sumGLbyD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:3.90:364,0,4 18797-ref 318 . T C 151.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.4692;MQ=32.41;MQ0=0;QD=21.69;SB=-0.01;sumGLbyD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:16.74:182,0,17 18797-ref 455 . T C 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 18797-ref 485 . T G 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 18797-ref 488 . T A 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 18797-ref 493 . A T 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 18849-ref 111 . C T 156.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.81;MQ0=0;QD=26.12;SB=-0.01;sumGLbyD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:190,18,0 18849-ref 152 . C T 356.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.75;MQ0=0;QD=32.43;SB=-0.01;sumGLbyD=35.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.08:390,33,0 18849-ref 153 . T G 356.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.75;MQ0=0;QD=32.42;SB=-0.01;sumGLbyD=35.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.08:390,33,0 18849-ref 203 . T C 28.42 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=9.47;SB=-0.01;sumGLbyD=19.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23.48:58,0,23 18869-ref 450 . C A 1111.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7614;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.06;SB=-0.01;sumGLbyD=38.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:29:87.28:1145,87,0 18869-ref 705 . G A 474.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4639;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.24;SB=-0.01;sumGLbyD=19.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:504,0,350 18869-ref 781 . G A 1225.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.68;MQ0=0;QD=38.31;SB=-0.01;sumGLbyD=39.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.31:1259,96,0 18869-ref 992 . A T 1532.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.75;MQ0=0;QD=37.38;SB=-0.01;sumGLbyD=38.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1566,123,0 18869-ref 1086 . A T 44.14 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=8.83;SB=-0.01;sumGLbyD=14.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61.11:74,0,61 18869-ref 1087 . T G 12.54 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=3.14;SB=-0.01;sumGLbyD=10.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:42.29:42,0,66 18869-ref 1088 . T G 45.87 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=15.29;SB=-0.01;sumGLbyD=26.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6.02:77,6,0 18869-ref 1089 . C G 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=13.94;SB=-0.01;sumGLbyD=24.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6.02:73,6,0 18869-ref 1288 . T C 193 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.17;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:226,18,0 18869-ref 1303 . T C 536.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.71;MQ0=0;QD=33.51;SB=-0.01;sumGLbyD=35.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.12:569,48,0 18869-ref 1346 . A G 732.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8519;MQ=33.93;MQ0=0;QD=17.86;SB=-0.01;sumGLbyD=18.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,25:41:99:762,0,479 18869-ref 1362 . 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T A 89.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9993;MQ=35.87;MQ0=0;QD=9.95;SB=-0.01;sumGLbyD=13.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:120,0,164 18869-ref 1608 . C A 1784.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.53;MQ0=0;QD=36.41;SB=-0.01;sumGLbyD=37.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:48:99:1817,144,0 18869-ref 1629 . A G 747.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.7981;MQ=35.50;MQ0=0;QD=15.58;SB=-0.01;sumGLbyD=16.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,25:47:99:778,0,713 18869-ref 1642 . T C 631.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7987;MQ=35.72;MQ0=0;QD=15.79;SB=-0.01;sumGLbyD=16.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,21:40:99:662,0,626 18869-ref 1662 . T C 450.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=35.59;MQ0=0;QD=15.53;SB=-0.01;sumGLbyD=16.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,15:29:99:480,0,441 18869-ref 1712 . C T 124.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.13;SB=-0.01;sumGLbyD=39.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:157,12,0 18922-ref 61 . A C 1011.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8253;MQ=36.84;MQ0=0;QD=16.05;SB=-0.01;sumGLbyD=16.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,32:62:99:1041,0,1015 18922-ref 73 . T C 876.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9925;MQ=36.84;MQ0=0;QD=13.49;SB=-0.01;sumGLbyD=13.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,30:63:99:907,0,1192 18922-ref 145 . C T 75.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25.76:106,0,26 18956-ref 37 . T C 105.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.16;SB=-0.01;sumGLbyD=16.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:135,0,134 18956-ref 106 . 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C A 114.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.57;SB=-0.01;sumGLbyD=36.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:147,12,0 19035-ref 157 . C G 69.76 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.63;SB=-0.01;sumGLbyD=16.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:100,0,102 19035-ref 173 . G T 241.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.47;SB=-0.01;sumGLbyD=39.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:274,21,0 19035-ref 206 . A G 451.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=30.12;SB=-0.01;sumGLbyD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:13:39.12:485,39,0 19035-ref 245 . C A 733.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.54;MQ0=0;QD=33.36;SB=-0.01;sumGLbyD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:21:63.18:767,63,0 19035-ref 302 . A G 219.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8332;MQ=36.27;MQ0=0;QD=15.67;SB=-0.01;sumGLbyD=17.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:249,0,170 19035-ref 318 . A G 175.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=35.72;MQ0=0;QD=21.95;SB=-0.01;sumGLbyD=25.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:51.19:206,0,51 19035-ref 339 . C G 19.20 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=4.80;SB=-0.01;sumGLbyD=12.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:49.14:49,0,68 19035-ref 362 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 19035-ref 709 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 19035-ref 779 . C T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 19056-ref 141 . C T 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 19056-ref 221 . T C 124.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.13;SB=-0.01;sumGLbyD=39.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:157,12,0 19056-ref 273 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 19056-ref 282 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 19056-ref 287 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 19056-ref 296 . T C 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 19056-ref 374 . A G 455.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9991;MQ=36.32;MQ0=0;QD=30.36;SB=-0.01;sumGLbyD=32.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:5.13:486,5,0 19056-ref 464 . C T 543.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.18;SB=-0.01;sumGLbyD=32.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:17:11.16:576,11,0 19056-ref 465 . C G 513.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.19;SB=-0.01;sumGLbyD=32.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:16:8.15:545,8,0 19056-ref 598 . G A 287.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:320,24,0 19056-ref 665 . G C 122.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.69;SB=-0.01;sumGLbyD=38.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:155,12,0 19056-ref 671 . G T 79.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.51;SB=-0.01;sumGLbyD=37.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:112,9,0 19067-ref 468 . C T 39.26 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.63;SB=-0.01;sumGLbyD=35.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 19071-ref 51 . A G 1647.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.06;SB=-0.01;sumGLbyD=35.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,45:47:61.44:1681,61,0 19071-ref 72 . 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G A 2065.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.6935;MQ=31.30;MQ0=0;QD=31.78;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:64:99:2098,158,0 19071-ref 629 . G T 2037.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=31.09;MQ0=0;QD=33.40;SB=-0.01;sumGLbyD=33.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2071,183,0 19071-ref 650 . G T 1513.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=30.24;MQ0=0;QD=28.03;SB=-0.01;sumGLbyD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,52:51:77.23:1546,77,0 19071-ref 662 . A G 2045.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.38;MQ0=0;QD=32.99;SB=-0.01;sumGLbyD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2078,186,0 19097-ref 42 . A C 124.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.16;SB=-0.01;sumGLbyD=39.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:157,12,0 19097-ref 97 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 19097-ref 99 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 19113-ref 318 . T C 190.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.68;SB=-0.01;sumGLbyD=37.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:223,18,0 19113-ref 385 . T C 84.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:116,9,0 19113-ref 412 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 19127-ref 127 . G A 17.87 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9330;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.79;SB=-0.01;sumGLbyD=4.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:47.79:48,0,281 19127-ref 129 . A C 471.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9330;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.26;SB=-0.01;sumGLbyD=38.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:504,39,0 19127-ref 163 . C T 677.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.62;SB=-0.01;sumGLbyD=39.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:710,54,0 19401-ref 47 . T A 718.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.82;SB=-0.01;sumGLbyD=39.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.19:752,57,0 19401-ref 66 . T C 787.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.48;SB=-0.01;sumGLbyD=39.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:820,63,0 19401-ref 147 . T A 627.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.90;SB=-0.01;sumGLbyD=38.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.14:660,51,0 19401-ref 156 . G C 524.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.95;SB=-0.01;sumGLbyD=37.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.14:557,42,0 19401-ref 179 . T G 53.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.63;SB=-0.01;sumGLbyD=10.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:83.07:83,0,176 19401-ref 188 . A C 39.36 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.68;SB=-0.01;sumGLbyD=35.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 19417-ref 57 . G C 2079.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9956;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.54;SB=-0.01;sumGLbyD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,59:62:66.50:2112,67,0 19417-ref 512 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 19474-ref 203 . C T 804.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.58;MQ0=0;QD=33.50;SB=-40.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:22:66.19:837,66,0 19474-ref 230 . T C 315.52 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=32.57;MQ0=0;QD=10.52;SB=-33.99;sumGLbyD=11.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:346,0,529 19474-ref 232 . T A 319.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=32.14;MQ0=0;QD=10.64;SB=-33.99;sumGLbyD=11.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,11:30:99:349,0,522 19474-ref 291 . T C 102.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=25.37;MQ0=0;QD=4.64;SB=-0.01;sumGLbyD=6.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:22:99:132,0,377 19474-ref 537 . C T 433.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=36.09;SB=-0.01;sumGLbyD=38.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:466,36,0 19524-ref 160 . A C 4356.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.2554;MQ=36.65;MQ0=0;QD=38.21;SB=-0.01;sumGLbyD=38.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,113:112:99:4356,337,0 19524-ref 203 . C T 3327.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9664;MQ=36.41;MQ0=0;QD=38.69;SB=-0.01;sumGLbyD=38.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:86:99:3328,259,0 19524-ref 228 . G A 2816.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.2728;MQ=36.49;MQ0=0;QD=35.66;SB=-0.01;sumGLbyD=36.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,78:77:99:2850,208,0 19524-ref 339 . T A 155.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:188,15,0 19524-ref 341 . G A 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=25.06;SB=-0.01;sumGLbyD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:12.04:158,12,0 19524-ref 343 . T A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 19535-ref 82 . C T 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 19535-ref 125 . A T 187.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=31.27;SB=-0.01;sumGLbyD=36.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:220,18,0 19535-ref 156 . G A 271.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=33.93;SB=-0.01;sumGLbyD=38.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:304,24,0 19535-ref 210 . G C 338.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=33.87;SB=-0.01;sumGLbyD=37.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:372,30,0 19535-ref 211 . T C 346.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=34.63;SB=-0.01;sumGLbyD=37.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:379,30,0 19535-ref 280 . C T 454.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=32.45;SB=-0.01;sumGLbyD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.12:487,39,0 19535-ref 361 . A T 311.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.62;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:345,27,0 19535-ref 392 . T C 301.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=33.55;SB=-0.01;sumGLbyD=37.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:335,27,0 19535-ref 516 . 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A C 768.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.03;MQ0=0;QD=36.58;SB=-0.01;sumGLbyD=38.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.19:801,63,0 19535-ref 841 . T C 691.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.47;MQ0=0;QD=36.37;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.16:724,57,0 19535-ref 877 . C T 628.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=36.95;SB=-0.01;sumGLbyD=38.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:661,51,0 19535-ref 907 . T C 553.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=36.93;SB=-0.01;sumGLbyD=39.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:587,45,0 19535-ref 1007 . G A 479.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.86;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:512,39,0 19535-ref 1115 . C G 626.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:660,51,0 19535-ref 1137 . A G 387.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.27;SB=-0.01;sumGLbyD=35.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:11:33.10:420,33,0 19535-ref 1148 . G A 373.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.13;SB=-0.01;sumGLbyD=33.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:407,33,0 19535-ref 1265 . T A 741.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9947;MQ=36.49;MQ0=0;QD=37.05;SB=-0.01;sumGLbyD=38.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:774,60,0 19535-ref 1288 . A G 644.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8332;MQ=36.47;MQ0=0;QD=33.94;SB=-0.01;sumGLbyD=35.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:19:54.15:678,54,0 19535-ref 1346 . C T 355.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9993;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.53;SB=-0.01;sumGLbyD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:388,30,0 19545-ref 80 . T C 2174.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9830;MQ=35.53;MQ0=0;QD=34.52;SB=-0.01;sumGLbyD=35.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,62:62:99:2208,147,0 19545-ref 125 . T G 986.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=27.61;MQ0=0;QD=25.96;SB=-0.01;sumGLbyD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:34.22:1020,34,0 19545-ref 130 . T G 1038.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.65;MQ0=0;QD=29.66;SB=-0.01;sumGLbyD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1071,105,0 19545-ref 140 . G A 1050.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.79;MQ0=0;QD=28.38;SB=-0.01;sumGLbyD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:36:99:1083,108,0 19545-ref 158 . A C 1283.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.03;MQ0=0;QD=31.31;SB=-0.01;sumGLbyD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1317,123,0 19545-ref 184 . C T 1379.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=35.15;MQ0=0;QD=35.36;SB=-0.01;sumGLbyD=36.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,38:38:99:1412,114,0 19545-ref 185 . G A 1415.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.15;MQ0=0;QD=36.31;SB=-0.01;sumGLbyD=37.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1449,117,0 19545-ref 245 . G A 4034.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=36.42;MQ0=0;QD=38.42;SB=-0.01;sumGLbyD=38.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:104:99:4034,313,0 19545-ref 286 . A G 3550.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.1226;MQ=35.48;MQ0=0;QD=35.16;SB=-0.01;sumGLbyD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,97:97:99:3455,197,0 19545-ref 294 . A G 3215 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=4.1170;MQ=35.39;MQ0=0;QD=33.49;SB=-0.01;sumGLbyD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,93:93:99:3248,162,0 19545-ref 320 . G A 3367.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8332;MQ=35.88;MQ0=0;QD=37.00;SB=-0.01;sumGLbyD=36.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,89:90:99:3287,191,0 19545-ref 372 . G A 2999.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=85;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.5922;MQ=36.76;MQ0=0;QD=35.29;SB=-0.01;sumGLbyD=35.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,82:82:99:3033,216,0 19545-ref 393 . A G 3602.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=94;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6267;MQ=36.89;MQ0=0;QD=38.32;SB=-0.01;sumGLbyD=37.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,93:93:99:3563,241,0 19545-ref 470 . A T 54.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=4.6621;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.60;SB=-0.01;sumGLbyD=2.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:34:84.50:85,0,1040 19599-ref 152 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 19599-ref 292 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 19736-ref 20 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 19736-ref 135 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 19736-ref 140 . C G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 19736-ref 201 . T C 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 19833-ref 70 . G C 153.37 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=19.17;SB=-0.01;sumGLbyD=22.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15.96:183,0,16 19833-ref 78 . T G 153.37 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=19.17;SB=-0.01;sumGLbyD=22.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15.96:183,0,16 19833-ref 114 . A C 302.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.36;MQ0=0;QD=11.21;SB=-0.01;sumGLbyD=12.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:333,0,420 19833-ref 119 . T C 300.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=31.58;MQ0=0;QD=10.73;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,14:28:99:330,0,468 19833-ref 137 . T G 114.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=33.48;MQ0=0;QD=5.44;SB=-0.01;sumGLbyD=6.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:144,0,469 19833-ref 145 . T G 522.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=33.65;MQ0=0;QD=23.76;SB=-0.01;sumGLbyD=25.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:21:42.14:556,42,0 19833-ref 195 . A G 267.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=35.72;MQ0=0;QD=33.40;SB=-0.01;sumGLbyD=37.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:300,24,0 19833-ref 243 . T C 233.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.41;SB=-0.01;sumGLbyD=38.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:267,21,0 19833-ref 314 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 19839-ref 42 . T A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 19839-ref 246 . C T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 19839-ref 263 . A G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 19839-ref 277 . A C 80.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=13.47;SB=-0.01;sumGLbyD=18.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:59.76:111,0,60 19839-ref 282 . G T 80.84 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=13.47;SB=-0.01;sumGLbyD=18.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:54.46:111,0,54 19839-ref 315 . A G 27.22 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.54;SB=-0.01;sumGLbyD=9.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57.20:57,0,142 19839-ref 393 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 19839-ref 394 . T G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 19839-ref 401 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 19896-ref 30 . A G 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 19896-ref 64 . C T 286.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.80;SB=-0.01;sumGLbyD=39.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:319,24,0 19896-ref 174 . A G 280.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.01;SB=-0.01;sumGLbyD=39.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:313,24,0 19896-ref 217 . G T 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 19896-ref 291 . G A 205.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 19924-ref 170 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 20071-ref 53 . T C 36.43 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.22;SB=-0.01;sumGLbyD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:68,6,0 20071-ref 138 . G A 286.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.80;SB=-0.01;sumGLbyD=39.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:319,24,0 20071-ref 149 . A T 10.37 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4676;MQ=37.00;MQ0=0;QD=0.94;SB=-0.01;sumGLbyD=3.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:39.94:40,0,325 20124-ref 46 . C T 311.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.58;SB=-0.01;sumGLbyD=38.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:344,27,0 20124-ref 270 . G A 863.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4875;MQ=36.61;MQ0=0;QD=33.22;SB=-0.01;sumGLbyD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:23:69.22:897,69,0 20124-ref 452 . G A 680.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.83;SB=-0.01;sumGLbyD=37.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.18:714,54,0 20124-ref 502 . G T 542.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8665;MQ=35.80;MQ0=0;QD=31.89;SB=-0.01;sumGLbyD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.12:575,48,0 20124-ref 509 . C G 78.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.8643;MQ=35.72;MQ0=0;QD=4.92;SB=-0.01;sumGLbyD=6.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:14:99:109,0,306 20124-ref 739 . C T 867.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.16;SB=-0.01;sumGLbyD=37.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.22:901,69,0 20131-ref 155 . C G 205.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:238,18,0 20131-ref 173 . C T 205.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:238,18,0 20131-ref 893 . G C 352.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.23;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:385,30,0 20131-ref 944 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 20131-ref 1440 . A T 126.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 20131-ref 1447 . G A 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 20131-ref 1535 . G A 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.82;SB=-0.01;sumGLbyD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.03:119,9,0 20131-ref 1539 . T C 122.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.56;SB=-0.01;sumGLbyD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.04:155,12,0 20131-ref 1577 . T G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 20209-ref 39 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 20209-ref 141 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 20209-ref 163 . A C 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 20209-ref 179 . A C 359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.90;SB=-0.01;sumGLbyD=39.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:392,30,0 20209-ref 206 . A T 617.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.34;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:651,51,0 20209-ref 264 . G A 1324.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6634;MQ=36.42;MQ0=0;QD=37.84;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1357,105,0 20209-ref 354 . T C 68.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7886;MQ=35.43;MQ0=0;QD=1.85;SB=-0.01;sumGLbyD=2.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:37:98.37:98,0,1010 20209-ref 356 . G T 74.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.43;MQ0=0;QD=2.02;SB=-0.01;sumGLbyD=2.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:36:99:105,0,999 20209-ref 357 . A G 42.89 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7876;MQ=35.34;MQ0=0;QD=1.23;SB=-0.01;sumGLbyD=2.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:34:72.89:73,0,935 20209-ref 376 . A G 141.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.36;SB=-0.01;sumGLbyD=34.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:175,15,0 20302-ref 315 . A T 274.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.32;SB=-0.01;sumGLbyD=38.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:308,24,0 20302-ref 340 . C T 156.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=35.72;MQ0=0;QD=19.53;SB=-0.01;sumGLbyD=23.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:5:15.04:189,15,0 20302-ref 363 . C T 71.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.68;SB=-0.01;sumGLbyD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:103,9,0 20302-ref 766 . T A 118.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.69;SB=-0.01;sumGLbyD=37.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:151,12,0 20302-ref 777 . C T 111.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.25;SB=-0.01;sumGLbyD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.96:141,0,25 20302-ref 821 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 20302-ref 864 . C T 166.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 20302-ref 938 . A C 204.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.28;SB=-0.01;sumGLbyD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.06:238,18,0 20302-ref 982 . A T 136.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=27.23;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:169,15,0 20302-ref 989 . C T 136.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=27.23;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:169,15,0 20302-ref 1000 . A T 175.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=29.22;SB=-0.01;sumGLbyD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:208,18,0 20302-ref 1035 . G T 147.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=29.48;SB=-0.01;sumGLbyD=36.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:180,15,0 20302-ref 1036 . A T 115.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.93;SB=-0.01;sumGLbyD=37.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:148,12,0 20302-ref 1089 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 20302-ref 1158 . C T 74.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.00;SB=-0.01;sumGLbyD=20.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.96:105,0,65 20302-ref 1214 . A T 424.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.41;SB=-0.01;sumGLbyD=38.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:458,36,0 20355-ref 85 . A G 241.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.12;SB=-0.01;sumGLbyD=16.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:272,0,262 20355-ref 86 . C T 598.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.42;SB=-0.01;sumGLbyD=39.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.16:632,48,0 20355-ref 140 . G A 487.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.47;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:520,39,0 20355-ref 194 . A C 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 20355-ref 205 . A G 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 20355-ref 229 . G A 273.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.22;SB=-0.01;sumGLbyD=38.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:307,24,0 20355-ref 251 . A G 55.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=6.17;SB=-0.01;sumGLbyD=9.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:8:85.56:86,0,166 20355-ref 265 . G T 279.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.91;SB=-0.01;sumGLbyD=39.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:312,24,0 20356-ref 66 . G A 543.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.98;SB=-0.01;sumGLbyD=33.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:13.36:576,13,0 20356-ref 88 . C T 1277.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.72;MQ0=0;QD=35.50;SB=-0.01;sumGLbyD=36.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:69.77:1311,70,0 20356-ref 220 . T C 592.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.4308;MQ=36.81;MQ0=0;QD=11.18;SB=-0.01;sumGLbyD=11.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,21:52:99:622,0,1106 20356-ref 431 . G T 2102.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8472;MQ=36.26;MQ0=0;QD=38.22;SB=-0.01;sumGLbyD=38.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2135,166,0 20356-ref 492 . A T 2614.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.44;MQ0=0;QD=36.31;SB=-0.01;sumGLbyD=36.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,71:70:99:2647,211,0 20356-ref 493 . A G 2680.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.45;MQ0=0;QD=36.23;SB=-0.01;sumGLbyD=36.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:72:99:2714,217,0 20356-ref 574 . G A 3644.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.0432;MQ=35.85;MQ0=0;QD=37.19;SB=-0.01;sumGLbyD=37.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,98:96:99:3644,289,0 20356-ref 589 . A G 3480.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.9751;MQ=35.71;MQ0=0;QD=36.64;SB=-0.01;sumGLbyD=36.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:93:99:3480,280,0 20356-ref 613 . A T 2549.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.6023;MQ=35.53;MQ0=0;QD=36.42;SB=-0.01;sumGLbyD=36.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,70:68:99:2582,205,0 20356-ref 673 . T C 2500.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.80;MQ0=0;QD=36.77;SB=-0.01;sumGLbyD=37.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:67:99:2534,202,0 20356-ref 707 . A C 2543.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.8839;MQ=35.51;MQ0=0;QD=36.86;SB=-0.01;sumGLbyD=37.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:68:99:2577,205,0 20356-ref 712 . T G 2419.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.76;MQ0=0;QD=36.66;SB=-0.01;sumGLbyD=37.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:66:99:2453,199,0 20356-ref 823 . T C 1236.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=29.44;SB=-0.01;sumGLbyD=30.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:41:99:1269,123,0 20356-ref 826 . T A 1049.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=25.79;MQ0=0;QD=28.37;SB=-0.01;sumGLbyD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:36:99:1083,108,0 20356-ref 832 . A G 1369.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4689;MQ=28.27;MQ0=0;QD=29.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:45:99:1403,135,0 20356-ref 835 . A T 1552.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4665;MQ=29.12;MQ0=0;QD=31.04;SB=-0.01;sumGLbyD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:50:99:1585,147,0 20356-ref 917 . C G 3897.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.5501;MQ=36.81;MQ0=0;QD=37.48;SB=-40.01;sumGLbyD=37.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,103:102:99:3858,267,0 20356-ref 1101 . A G 504.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4357;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.12:537,42,0 20399-ref 61 . G C 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.88;SB=-0.01;sumGLbyD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:5:15.05:200,15,0 20399-ref 72 . G A 316.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.17;SB=-0.01;sumGLbyD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:349,27,0 20399-ref 159 . T A 176.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9996;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.62;SB=-0.01;sumGLbyD=20.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:206,0,129 20399-ref 167 . T C 148.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9998;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.74;SB=-0.01;sumGLbyD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.95:178,0,22 20399-ref 184 . G A 31.96 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9655;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.33;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61.95:62,0,139 20399-ref 194 . A G 24.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.00;MQ0=0;QD=8.26;SB=-0.01;sumGLbyD=18.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:55,0,31 20399-ref 287 . G A 688.02 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=33.63;MQ0=0;QD=27.52;SB=-0.01;sumGLbyD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:25:41.78:718,0,42 20399-ref 300 . C T 195.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.9778;MQ=34.31;MQ0=0;QD=6.32;SB=-0.01;sumGLbyD=7.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:30:99:226,0,672 20399-ref 382 . A C 23.95 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.0551;MQ=36.20;MQ0=0;QD=0.63;SB=-0.01;sumGLbyD=1.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:36:53.92:54,0,1100 20399-ref 400 . G C 939.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=7.9881;MQ=35.78;MQ0=0;QD=22.36;SB=-0.01;sumGLbyD=23.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,30:40:99:969,0,299 20399-ref 401 . C T 86.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.9881;MQ=35.78;MQ0=0;QD=2.06;SB=-0.01;sumGLbyD=2.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,7:41:99:117,0,1179 20399-ref 444 . C T 20.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=1.02;SB=-0.01;sumGLbyD=2.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:50.38:50,0,560 20399-ref 459 . A T 145.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.77;MQ0=0;QD=11.16;SB=-0.01;sumGLbyD=13.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:175,0,209 20399-ref 460 . G A 76.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.14;MQ0=0;QD=6.95;SB=-0.01;sumGLbyD=9.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:106,0,215 20399-ref 463 . T A 184.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=30.70;SB=-0.01;sumGLbyD=36.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:217,18,0 20399-ref 464 . T G 186.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=31.07;SB=-0.01;sumGLbyD=36.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:219,18,0 20399-ref 579 . C T 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 20399-ref 592 . G A 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 20399-ref 602 . A G 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=19.23;SB=-0.01;sumGLbyD=24.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:6:15.03:148,15,0 20399-ref 612 . C T 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 20399-ref 646 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 20399-ref 652 . A G 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 20399-ref 699 . G C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 20399-ref 704 . T C 107.41 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.34;SB=-0.01;sumGLbyD=19.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:7:52.54:137,0,53 20399-ref 738 . G A 140.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=12.7851;MQ=35.38;MQ0=0;QD=3.70;SB=-24.96;sumGLbyD=4.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:32:99:170,0,871 20399-ref 748 . T C 720.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=20.7840;MQ=35.28;MQ0=0;QD=17.16;SB=-325.44;sumGLbyD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,24:41:99:751,0,537 20399-ref 749 . T C 37.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=12.9968;MQ=35.24;MQ0=0;QD=0.92;SB=57.61;sumGLbyD=1.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,6:40:67.78:68,0,1177 20399-ref 751 . C T 927.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.9968;MQ=35.24;MQ0=0;QD=22.61;SB=-364.76;sumGLbyD=23.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,29:41:99:957,0,311 20399-ref 821 . T C 164.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.7584;MQ=35.59;MQ0=0;QD=5.66;SB=-0.01;sumGLbyD=6.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:28:99:194,0,699 20399-ref 822 . C G 160.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.6251;MQ=35.59;MQ0=0;QD=5.54;SB=-0.01;sumGLbyD=6.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:191,0,751 20399-ref 823 . C A 126.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.6251;MQ=35.91;MQ0=0;QD=4.51;SB=-0.01;sumGLbyD=5.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,7:28:99:156,0,744 20432-ref 166 . C A 162.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.57;SB=-0.01;sumGLbyD=39.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 20432-ref 222 . A T 45.74 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:77,6,0 20432-ref 249 . T A 365.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9734;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.56;SB=-0.01;sumGLbyD=39.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:399,30,0 20432-ref 325 . A T 194.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.43;SB=-0.01;sumGLbyD=37.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:227,18,0 20432-ref 418 . T C 516.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.89;SB=-0.01;sumGLbyD=39.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:550,42,0 20432-ref 544 . T C 471.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.43;SB=-0.01;sumGLbyD=33.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:5.14:502,5,0 20511-ref 220 . A G 160.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.00;SB=-0.01;sumGLbyD=38.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:193,15,0 20511-ref 234 . G A 204.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.02;SB=-0.01;sumGLbyD=39.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:237,18,0 20511-ref 305 . T C 469.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=31.32;SB=-0.01;sumGLbyD=33.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:7.35:501,7,0 20511-ref 335 . G C 429.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.78;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:462,36,0 20511-ref 358 . A G 111.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=27.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:144,12,0 20529-ref 149 . G A 73.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=18.43;SB=-0.01;sumGLbyD=26.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.02:106,9,0 20529-ref 225 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 20529-ref 284 . T G 390.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9940;MQ=35.66;MQ0=0;QD=16.98;SB=-0.01;sumGLbyD=18.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,13:22:99:421,0,291 20529-ref 324 . T C 629.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.38;MQ0=0;QD=33.14;SB=-117.81;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:18:54.16:663,54,0 20529-ref 330 . C G 84.84 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.18;MQ0=0;QD=4.99;SB=9.02;sumGLbyD=6.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:115,0,410 20529-ref 331 . T C 84.10 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.18;MQ0=0;QD=4.95;SB=9.02;sumGLbyD=6.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:114,0,410 20529-ref 343 . A G 118.88 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.91;SB=9.02;sumGLbyD=12.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:149,0,219 20529-ref 401 . G A 1210.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=33.61;SB=-0.01;sumGLbyD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:35:99:1243,105,0 20529-ref 428 . T C 2298.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.0723;MQ=36.35;MQ0=0;QD=37.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:61:99:2331,184,0 20529-ref 438 . T C 490.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=6.0730;MQ=36.31;MQ0=0;QD=8.31;SB=-0.01;sumGLbyD=8.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,18:53:99:520,0,1075 20529-ref 544 . A C 1662.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9984;MQ=36.32;MQ0=0;QD=36.94;SB=-0.01;sumGLbyD=37.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1695,135,0 20529-ref 555 . G A 272.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.07;MQ0=0;QD=8.26;SB=-0.01;sumGLbyD=9.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,11:33:99:302,0,728 20529-ref 621 . G A 168.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=5.63;SB=-0.01;sumGLbyD=6.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:99:199,0,701 20529-ref 622 . C A 169.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=5.64;SB=-0.01;sumGLbyD=6.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:29:99:199,0,687 20529-ref 648 . A C 1415.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.38;MQ0=0;QD=37.24;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1448,114,0 20529-ref 672 . C T 466.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9987;MQ=35.62;MQ0=0;QD=12.61;SB=-0.01;sumGLbyD=13.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,17:37:99:496,0,645 20529-ref 803 . G A 1451.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=66;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.4408;MQ=36.54;MQ0=0;QD=21.99;SB=-0.01;sumGLbyD=22.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,45:65:99:1481,0,581 20529-ref 855 . C T 935.16 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=60;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=6.8571;MQ=36.66;MQ0=0;QD=15.59;SB=-0.01;sumGLbyD=16.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,30:60:99:965,0,983 20529-ref 864 . C A 825.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7262;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.74;SB=-0.01;sumGLbyD=15.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,27:54:99:855,0,927 20529-ref 935 . T G 742.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.9944;MQ=36.81;MQ0=0;QD=14.28;SB=-0.01;sumGLbyD=14.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,25:51:99:773,0,822 20529-ref 1334 . G A 3384.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.2569;MQ=36.55;MQ0=0;QD=37.61;SB=-0.01;sumGLbyD=37.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:88:99:3384,265,0 20529-ref 1419 . G A 1072.72 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=69;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.2573;MQ=36.85;MQ0=0;QD=15.55;SB=-0.01;sumGLbyD=15.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,35:68:99:1103,0,1111 20529-ref 1442 . A T 1411.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=87;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8237;MQ=36.88;MQ0=0;QD=16.23;SB=-0.01;sumGLbyD=16.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,44:87:99:1442,0,1419 20529-ref 1607 . A G 410.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=8.7994;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.53;SB=-0.01;sumGLbyD=20.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:440,0,251 20529-ref 1616 . A G 40.99 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.50;SB=-0.01;sumGLbyD=36.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:72,6,0 20529-ref 1617 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 20529-ref 1797 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 20655-ref 38 . C A 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 20655-ref 46 . T C 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 20655-ref 70 . A T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 20709-ref 49 . T C 1104.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.08;SB=-0.01;sumGLbyD=39.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.28:1137,87,0 20709-ref 760 . T G 111.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.55;SB=-0.01;sumGLbyD=23.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:61.95:141,0,62 20709-ref 761 . T A 65.47 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.09;SB=-0.01;sumGLbyD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61.09:95,0,61 20709-ref 764 . T C 37.98 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.50;SB=-0.01;sumGLbyD=16.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60.71:68,0,61 20731-ref 145 . A G 66.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8653;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.52;SB=-0.01;sumGLbyD=5.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:96.78:97,0,539 20731-ref 158 . A C 226.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9654;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.20;SB=-0.01;sumGLbyD=18.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:257,0,188 20731-ref 178 . T C 315.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=35.11;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:349,27,0 20731-ref 202 . T G 270.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.87;MQ0=0;QD=30.02;SB=-0.01;sumGLbyD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:8:24.07:303,24,0 20731-ref 284 . G A 74.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=14.89;SB=-0.01;sumGLbyD=20.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.97:104,0,25 20731-ref 288 . T C 203.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=29.09;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:237,21,0 20731-ref 289 . G A 62.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=8.88;SB=-0.01;sumGLbyD=13.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:92.19:92,0,108 20731-ref 299 . C A 131.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.91;MQ0=0;QD=14.56;SB=-0.01;sumGLbyD=17.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:92.26:161,0,92 20731-ref 334 . C A 61.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.22;MQ0=0;QD=6.82;SB=-0.01;sumGLbyD=10.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:91.42:91,0,169 20731-ref 461 . G A 397.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.90;SB=-37.00;sumGLbyD=17.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:99:428,0,392 20731-ref 469 . T C 701.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.04;SB=-37.00;sumGLbyD=20.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,22:34:99:731,0,376 20731-ref 522 . A G 72.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=95;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.4878;MQ=37.00;MQ0=0;QD=0.77;SB=3.00;sumGLbyD=1.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:85,10:94:99:103,0,2958 20731-ref 565 . C A 2601.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.5279;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.25;SB=-0.01;sumGLbyD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,75:85:99:2631,0,179 20731-ref 667 . T C 2279.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.3259;MQ=36.83;MQ0=0;QD=38.00;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2313,181,0 20731-ref 753 . T C 1097.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.30;MQ0=0;QD=37.86;SB=-0.01;sumGLbyD=39.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.27:1131,87,0 20731-ref 768 . A G 742.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=35.98;MQ0=0;QD=37.10;SB=-0.01;sumGLbyD=38.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:775,60,0 20731-ref 819 . C A 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=33.48;MQ0=0;QD=12.32;SB=-0.01;sumGLbyD=23.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 20788-ref 391 . G C 750.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:784,60,0 20788-ref 881 . G A 1239.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9899;MQ=36.69;MQ0=0;QD=37.56;SB=-0.01;sumGLbyD=38.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1272,99,0 20788-ref 915 . 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G T 2210.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=35.09;SB=-0.01;sumGLbyD=35.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:62:99:2244,187,0 20806-ref 435 . T C 1522.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9830;MQ=28.94;MQ0=0;QD=31.06;SB=-0.01;sumGLbyD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:48:99:1555,144,0 20806-ref 439 . A G 644.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7717;MQ=29.72;MQ0=0;QD=13.16;SB=-0.01;sumGLbyD=13.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,26:49:99:675,0,630 20806-ref 471 . T A 3743.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.45;MQ0=0;QD=36.00;SB=-0.01;sumGLbyD=35.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:3743,313,0 20806-ref 492 . G A 4235.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.83;MQ0=0;QD=36.52;SB=-0.01;sumGLbyD=36.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,116:116:99:4235,349,0 20806-ref 511 . G C 5055.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.2357;MQ=35.80;MQ0=0;QD=37.17;SB=-0.01;sumGLbyD=37.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,136:134:99:5055,403,0 20806-ref 691 . T G 5911.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=13.4494;MQ=36.93;MQ0=0;QD=38.39;SB=-0.01;sumGLbyD=38.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,154:153:99:5911,460,0 20806-ref 742 . A T 5577.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=147;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.4306;MQ=36.93;MQ0=0;QD=37.94;SB=-0.01;sumGLbyD=37.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,147:144:99:5577,433,0 20806-ref 784 . G T 6635.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.5653;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.58;SB=-0.01;sumGLbyD=38.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,171:170:99:6635,512,0 20806-ref 849 . C G 8639.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.1815;MQ=36.87;MQ0=0;QD=38.57;SB=-0.01;sumGLbyD=38.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,224:222:99:8639,668,0 20806-ref 934 . C T 4993.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.2937;MQ=33.77;MQ0=0;QD=35.67;SB=-0.01;sumGLbyD=35.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:139:99:4993,418,0 20806-ref 948 . G C 5389.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=151;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=6.4160;MQ=33.43;MQ0=0;QD=35.69;SB=-0.01;sumGLbyD=35.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,151:150:99:5388,451,0 20806-ref 975 . T A 5815.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=162;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.3174;MQ=34.03;MQ0=0;QD=35.90;SB=-199.35;sumGLbyD=35.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,162:160:99:5815,481,0 20806-ref 986 . C T 6720.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=183;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.2537;MQ=34.56;MQ0=0;QD=36.72;SB=-200.04;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,183:182:99:6719,548,0 20806-ref 1056 . G A 8485.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.7832;MQ=36.82;MQ0=0;QD=37.38;SB=-0.01;sumGLbyD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,223:220:99:8372,549,0 20806-ref 1104 . A G 9553.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=256;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.6514;MQ=35.76;MQ0=0;QD=37.32;SB=-0.01;sumGLbyD=36.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,253:255:99:9445,660,0 20806-ref 1129 . A C 7560.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.6135;MQ=35.59;MQ0=0;QD=35.83;SB=-0.01;sumGLbyD=35.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,210:203:99:7523,575,0 20806-ref 1134 . C T 8369.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=225;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.4285;MQ=35.73;MQ0=0;QD=37.20;SB=-0.01;sumGLbyD=37.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,224:222:99:8369,668,0 20806-ref 1248 . T C 1316.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.6972;MQ=33.38;MQ0=0;QD=34.65;SB=-0.01;sumGLbyD=35.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1350,114,0 20806-ref 1256 . G C 785.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=32.73;SB=-0.01;sumGLbyD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.16:819,72,0 20806-ref 1267 . C A 245.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=7;HaplotypeScore=0.8667;MQ=28.01;MQ0=0;QD=17.56;SB=-0.01;sumGLbyD=19.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:75.09:276,0,75 20806-ref 1268 . A C 253.76 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=28.01;MQ0=0;QD=18.13;SB=-0.01;sumGLbyD=20.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:72.62:284,0,73 20896-ref 38 . G A 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 20896-ref 196 . C G 309.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.40;SB=-0.01;sumGLbyD=38.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:343,27,0 20896-ref 207 . T C 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 20896-ref 242 . C T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 20896-ref 305 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 20896-ref 355 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 21013-ref 231 . T G 156.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.27;SB=-0.01;sumGLbyD=37.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:189,15,0 21013-ref 260 . A T 233.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.30;SB=-0.01;sumGLbyD=38.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:266,21,0 21013-ref 306 . G A 322.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:356,27,0 21013-ref 357 . G A 274.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:307,24,0 21013-ref 443 . C T 204.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.16;SB=-0.01;sumGLbyD=39.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:238,18,0 21013-ref 479 . T C 163.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.68;SB=-0.01;sumGLbyD=39.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 21013-ref 534 . T C 115.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.98;SB=-0.01;sumGLbyD=37.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:148,12,0 21013-ref 732 . C T 85.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.59;SB=-0.01;sumGLbyD=39.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:118,9,0 21013-ref 783 . A G 37.97 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.66;SB=-0.01;sumGLbyD=22.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28.77:68,0,29 21013-ref 840 . A T 158.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.77;SB=-0.01;sumGLbyD=38.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:192,15,0 21013-ref 914 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 21013-ref 917 . G T 84.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:117,9,0 21013-ref 920 . C T 84.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:116,9,0 21013-ref 981 . T A 126.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 21013-ref 1119 . T C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 21013-ref 1145 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 21026-ref 38 . A C 1454.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.74;MQ0=0;QD=37.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1487,117,0 21026-ref 192 . T C 3179.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=4.6606;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.98;SB=-0.01;sumGLbyD=37.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:82:99:3213,247,0 21026-ref 413 . G T 4970.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=10.9250;MQ=36.77;MQ0=0;QD=38.53;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,127:129:99:4897,350,0 21026-ref 509 . A T 3699.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.1706;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.14;SB=-0.01;sumGLbyD=38.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,96:95:99:3700,286,0 21026-ref 528 . C T 1314.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=89;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.0917;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.77;SB=-0.01;sumGLbyD=15.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,43:88:99:1344,0,1402 21026-ref 648 . A C 193.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=34.69;MQ0=0;QD=21.45;SB=-0.01;sumGLbyD=24.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:44.48:223,0,44 21026-ref 649 . T G 126.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=18.00;SB=-0.01;sumGLbyD=22.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:46.62:156,0,47 21026-ref 655 . G T 64.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=34.93;MQ0=0;QD=12.92;SB=-0.01;sumGLbyD=18.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:58.40:95,0,58 21050-ref 23 . G A 344.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8332;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.46;SB=-0.01;sumGLbyD=37.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:378,30,0 21050-ref 233 . G T 775.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5310;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.51;SB=-0.01;sumGLbyD=24.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,23:33:99:806,0,298 21050-ref 263 . G A 237 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9352;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.78;SB=-0.01;sumGLbyD=9.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:26:99:267,0,586 21050-ref 335 . A G 199.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:233,18,0 21050-ref 345 . T A 28.48 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.12;SB=-0.01;sumGLbyD=14.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58.47:58,0,68 21050-ref 360 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 21050-ref 380 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 21084-ref 219 . A G 165.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.02;SB=-0.01;sumGLbyD=39.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:198,15,0 21084-ref 262 . A G 193.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.31;SB=-0.01;sumGLbyD=37.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:227,18,0 21084-ref 276 . A C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 21084-ref 315 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 21084-ref 386 . G A 349.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=34.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:382,30,0 21084-ref 424 . T C 114.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.53;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:147,12,0 21084-ref 439 . G A 114.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.53;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:147,12,0 21084-ref 450 . G A 114.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.56;SB=-0.01;sumGLbyD=36.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:147,12,0 21084-ref 517 . T A 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 21084-ref 529 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 21084-ref 666 . C T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 21084-ref 700 . A C 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-39.55;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 21084-ref 719 . G T 165.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.02;SB=-77.10;sumGLbyD=39.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:198,15,0 21084-ref 770 . C A 200.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:233,18,0 21084-ref 783 . A G 158.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.73;SB=-0.01;sumGLbyD=38.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:191,15,0 21084-ref 925 . G A 48.57 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.81;MQ0=0;QD=12.14;SB=-0.01;sumGLbyD=19.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.98:79,0,28 21084-ref 967 . T C 24.11 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=12.05;SB=-0.01;sumGLbyD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:55,6,0 21084-ref 968 . A C 24.11 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=12.05;SB=-0.01;sumGLbyD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:55,6,0 21084-ref 1093 . T C 88.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9997;MQ=27.62;MQ0=0;QD=11.03;SB=-33.33;sumGLbyD=14.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:83.63:118,0,84 21084-ref 1101 . T A 91.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.22;MQ0=0;QD=13.03;SB=-36.33;sumGLbyD=17.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:58.97:121,0,59 21084-ref 1120 . C T 28.98 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.22;MQ0=0;QD=4.14;SB=9.01;sumGLbyD=8.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58.97:59,0,121 21084-ref 1150 . C T 17.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=4.33;SB=10.78;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.21:47,0,67 21084-ref 1174 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 21084-ref 1357 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 21084-ref 1677 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 21084-ref 1686 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 21114-ref 153 . G C 52.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=35.87;MQ0=0;QD=5.84;SB=-0.01;sumGLbyD=9.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:82.55:83,0,213 21114-ref 173 . C G 46.54 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.9953;MQ=35.12;MQ0=0;QD=4.23;SB=-0.01;sumGLbyD=6.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:76.53:77,0,277 21114-ref 181 . C G 82.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=13.8911;MQ=34.60;MQ0=0;QD=6.32;SB=-0.01;sumGLbyD=8.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:13:99:112,0,160 21114-ref 194 . G A 37.52 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.8928;MQ=34.93;MQ0=0;QD=2.50;SB=-0.01;sumGLbyD=4.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:15:67.51:68,0,375 21114-ref 214 . A G 83.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=34.93;MQ0=0;QD=8.34;SB=-0.01;sumGLbyD=11.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:10:99:113,0,150 21114-ref 255 . A C 99.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9987;MQ=35.98;MQ0=0;QD=9.99;SB=-0.01;sumGLbyD=12.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:130,0,188 21114-ref 301 . C T 41 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.67;SB=-0.01;sumGLbyD=23.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23.47:71,0,23 21114-ref 335 . T A 54.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.8664;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.97;SB=-0.01;sumGLbyD=7.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:84.70:85,0,283 21114-ref 342 . C G 132.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.8664;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.04;SB=-0.01;sumGLbyD=14.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:10:99:162,0,169 21114-ref 362 . G C 125 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.93;SB=-0.01;sumGLbyD=11.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:155,0,307 21114-ref 363 . G A 122.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.18;SB=-0.01;sumGLbyD=10.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:153,0,336 21114-ref 388 . C T 180.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9998;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.19;SB=-0.01;sumGLbyD=9.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,7:22:99:210,0,520 21114-ref 454 . A G 36.65 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.16;SB=-0.01;sumGLbyD=3.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:66.64:67,0,507 21114-ref 455 . A G 36.65 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.16;SB=-0.01;sumGLbyD=3.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:66.64:67,0,507 21114-ref 456 . T A 36.65 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.16;SB=-0.01;sumGLbyD=3.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:66.64:67,0,509 21114-ref 491 . T C 133.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9892;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.16;SB=-0.01;sumGLbyD=13.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:164,0,230 21114-ref 494 . C T 59.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9681;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.99;SB=-0.01;sumGLbyD=8.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:89.92:90,0,248 21114-ref 495 . C T 77.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9681;MQ=36.27;MQ0=0;QD=5.54;SB=-0.01;sumGLbyD=7.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:108,0,358 21114-ref 507 . C T 50.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9789;MQ=34.60;MQ0=0;QD=3.92;SB=-0.01;sumGLbyD=6.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:80.90:81,0,328 21114-ref 532 . A T 181.80 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.9904;MQ=34.15;MQ0=0;QD=16.53;SB=-0.01;sumGLbyD=19.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:212,0,127 21114-ref 533 . G A 17.01 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.9891;MQ=34.15;MQ0=0;QD=1.55;SB=-0.01;sumGLbyD=4.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:46.92:47,0,279 21114-ref 608 . C T 177.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=8.86;SB=-0.01;sumGLbyD=10.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:207,0,445 21134-ref 67 . T C 69.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.05;SB=-0.01;sumGLbyD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:101,9,0 21134-ref 70 . C T 76.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.39;SB=-0.01;sumGLbyD=36.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 21134-ref 100 . C T 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 21134-ref 199 . A G 71.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.92;SB=-0.01;sumGLbyD=25.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:18.56:102,0,19 21134-ref 200 . C G 111.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.79;SB=-0.01;sumGLbyD=35.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:144,12,0 21134-ref 363 . T C 1710.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7880;MQ=36.80;MQ0=0;QD=33.53;SB=-0.01;sumGLbyD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,48:51:33.46:1743,33,0 21134-ref 376 . C T 1890.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6972;MQ=36.29;MQ0=0;QD=33.16;SB=-0.01;sumGLbyD=33.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,54:56:59.35:1923,59,0 21134-ref 418 . C G 1627.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.05;MQ0=0;QD=37.85;SB=-0.01;sumGLbyD=38.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1661,129,0 21134-ref 436 . G A 1597.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.05;MQ0=0;QD=37.16;SB=-0.01;sumGLbyD=37.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:42:99:1631,126,0 21134-ref 517 . C A 563.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.91;MQ0=0;QD=33.15;SB=-0.01;sumGLbyD=35.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.14:596,51,0 21134-ref 526 . T G 290.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=29.09;SB=-0.01;sumGLbyD=32.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:324,30,0 21134-ref 531 . C A 153.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=25.51;SB=-0.01;sumGLbyD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:186,18,0 21134-ref 538 . A G 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=17.20;SB=-0.01;sumGLbyD=23.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.02:118,12,0 21134-ref 549 . T C 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 21134-ref 577 . A G 234.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=29.31;SB=-0.01;sumGLbyD=33.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:267,24,0 21134-ref 592 . A G 425.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.91;MQ0=0;QD=32.77;SB=-0.01;sumGLbyD=35.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.10:459,39,0 21134-ref 593 . T C 501.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=33.91;MQ0=0;QD=29.49;SB=-0.01;sumGLbyD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:15.89:534,16,0 21134-ref 643 . T A 1355.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7086;MQ=36.75;MQ0=0;QD=33.90;SB=-0.01;sumGLbyD=34.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:38:78.23:1389,78,0 21134-ref 726 . G A 951.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=31.70;SB=-0.01;sumGLbyD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:29:51.12:984,51,0 21134-ref 738 . C T 824.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=1.9811;MQ=34.69;MQ0=0;QD=30.53;SB=-0.01;sumGLbyD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:27:78.15:857,78,0 21134-ref 757 . C T 525.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.26;MQ0=0;QD=30.94;SB=-0.01;sumGLbyD=32.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.12:559,48,0 21134-ref 773 . C G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 21134-ref 833 . G T 63.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=21.02;SB=-0.01;sumGLbyD=31.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:95,9,0 21134-ref 850 . 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T C 2939.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.21;MQ0=0;QD=38.17;SB=-0.01;sumGLbyD=38.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2972,232,0 21149-ref 173 . A C 3348.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.7348;MQ=36.31;MQ0=0;QD=38.06;SB=-0.01;sumGLbyD=38.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:87:99:3349,262,0 21149-ref 221 . T C 2527.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.25;MQ0=0;QD=37.16;SB=-0.01;sumGLbyD=37.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:67:99:2560,202,0 21149-ref 244 . C G 2183.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.43;MQ0=0;QD=37.01;SB=-0.01;sumGLbyD=37.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2217,178,0 21149-ref 250 . G A 2079.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.31;MQ0=0;QD=34.09;SB=-0.01;sumGLbyD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,59:59:99:2113,108,0 21149-ref 311 . T C 2609.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9996;MQ=35.66;MQ0=0;QD=37.82;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2642,208,0 21149-ref 314 . C T 2537.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9661;MQ=35.68;MQ0=0;QD=36.25;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,69:70:99:2570,171,0 21149-ref 358 . A G 2287.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.8054;MQ=35.93;MQ0=0;QD=34.14;SB=-0.01;sumGLbyD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,64:67:81.60:2320,82,0 21149-ref 389 . T A 1519.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=34.85;MQ0=0;QD=28.66;SB=-0.01;sumGLbyD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,49:49:27.40:1552,27,0 21149-ref 415 . C T 1233.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.63;MQ0=0;QD=32.46;SB=-0.01;sumGLbyD=33.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1266,114,0 21149-ref 428 . C G 639.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.32;MQ0=0;QD=29.07;SB=-0.01;sumGLbyD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.13:672,66,0 21149-ref 430 . G A 469.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=6;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.32;MQ0=0;QD=21.35;SB=-0.01;sumGLbyD=22.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,20:21:16.89:500,0,17 21149-ref 450 . A T 1465.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4357;MQ=33.40;MQ0=0;QD=33.32;SB=-0.01;sumGLbyD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:42:99:1499,126,0 21149-ref 488 . T C 2131.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.83;MQ0=0;QD=36.75;SB=-0.01;sumGLbyD=37.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:56:99:2164,169,0 21149-ref 517 . A T 1854.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.1630;MQ=36.42;MQ0=0;QD=35.67;SB=-0.01;sumGLbyD=36.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:51:99:1888,126,0 21149-ref 577 . T G 1848.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6385;MQ=36.79;MQ0=0;QD=37.72;SB=-0.01;sumGLbyD=38.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1881,147,0 21149-ref 649 . G C 835.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.27;MQ0=0;QD=33.43;SB=-0.01;sumGLbyD=34.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.17:869,75,0 21149-ref 676 . A G 499.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.50;MQ0=0;QD=29.38;SB=-0.01;sumGLbyD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.11:533,51,0 21149-ref 677 . A C 522.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=29.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.11:555,54,0 21149-ref 686 . G A 662.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.93;MQ0=0;QD=30.13;SB=-0.01;sumGLbyD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:21:63.15:696,63,0 21149-ref 715 . C A 1124.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=35.16;SB=-0.01;sumGLbyD=36.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:31:93.26:1158,93,0 21149-ref 758 . G T 1306.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.70;MQ0=0;QD=38.42;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1339,102,0 21149-ref 793 . C T 1196.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=34.17;SB=-0.01;sumGLbyD=35.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1229,105,0 21149-ref 798 . A G 959.80 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9995;MQ=32.36;MQ0=0;QD=25.94;SB=-0.01;sumGLbyD=26.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,32:37:80.28:990,0,80 21149-ref 819 . A C 1039.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=32.84;MQ0=0;QD=25.35;SB=-0.01;sumGLbyD=26.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,35:40:99:1069,0,116 21149-ref 846 . T C 1211.37 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=33.73;MQ0=0;QD=26.92;SB=-0.01;sumGLbyD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,39:44:99:1241,0,106 21149-ref 929 . T C 1168.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.67;MQ0=0;QD=37.69;SB=-0.01;sumGLbyD=38.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.29:1201,93,0 21149-ref 935 . G A 1205.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.68;MQ0=0;QD=37.68;SB=-0.01;sumGLbyD=38.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.31:1239,96,0 21149-ref 953 . C T 782.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.26;SB=-0.01;sumGLbyD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:815,63,0 21149-ref 1009 . T A 310.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.48;SB=-0.01;sumGLbyD=38.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:343,27,0 21149-ref 1019 . A G 281.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.14;SB=-0.01;sumGLbyD=39.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:314,24,0 21149-ref 1075 . C G 336.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.05;SB=-0.01;sumGLbyD=22.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:11.16:367,0,11 21149-ref 1107 . G A 384.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.60;MQ0=0;QD=21.35;SB=-0.01;sumGLbyD=23.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,16:17:8.14:414,0,8 21149-ref 1109 . A G 520.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.60;MQ0=0;QD=28.94;SB=-0.01;sumGLbyD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.11:554,54,0 21149-ref 1115 . A C 671.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.77;MQ0=0;QD=30.53;SB=-0.01;sumGLbyD=32.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.14:705,66,0 21149-ref 1169 . A G 633.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=30.18;SB=-0.01;sumGLbyD=31.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:23.16:667,23,0 21149-ref 1182 . T G 850.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=34.00;SB=-0.01;sumGLbyD=35.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.18:883,75,0 21149-ref 1201 . C A 476.39 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.26;MQ0=0;QD=25.07;SB=-0.01;sumGLbyD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:22.87:506,0,23 21149-ref 1209 . T C 578.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.16;MQ0=0;QD=28.91;SB=-0.01;sumGLbyD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:20.14:611,20,0 21149-ref 1310 . C A 790.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.60;MQ0=0;QD=30.41;SB=-0.01;sumGLbyD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:8.60:823,9,0 21149-ref 1319 . 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A T 226.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=32.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:259,21,0 21149-ref 2564 . G C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 21262-ref 53 . A G 36.18 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.09;SB=-0.01;sumGLbyD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:67,6,0 21262-ref 114 . G T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 21298-ref 70 . A C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 21298-ref 202 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 21298-ref 204 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 21298-ref 393 . C T 1081.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.87;SB=-0.01;sumGLbyD=35.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:29:87.25:1114,87,0 21298-ref 404 . A G 1508.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.71;SB=-0.01;sumGLbyD=38.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:39:99:1542,117,0 21298-ref 483 . C T 748.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.62;SB=-0.01;sumGLbyD=37.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:21:60.19:781,60,0 21298-ref 489 . G T 603.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.72;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.16:637,48,0 21298-ref 510 . A T 364.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.49;SB=-0.01;sumGLbyD=39.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:398,30,0 21298-ref 525 . T C 1183.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.16;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.30:1216,93,0 21298-ref 646 . C G 1194.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8561;MQ=36.05;MQ0=0;QD=37.34;SB=-0.01;sumGLbyD=38.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.30:1228,96,0 21298-ref 662 . G C 463.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=35.65;SB=-0.01;sumGLbyD=38.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:496,39,0 21298-ref 695 . 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A G 196.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.76;SB=-0.01;sumGLbyD=38.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:229,18,0 21358-ref 222 . C A 476.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=34.78;MQ0=0;QD=34.01;SB=-0.01;sumGLbyD=36.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:509,42,0 21358-ref 225 . T C 473.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=34.78;MQ0=0;QD=33.85;SB=-0.01;sumGLbyD=36.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:507,42,0 21358-ref 238 . C T 460.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.42;MQ0=0;QD=35.40;SB=-0.01;sumGLbyD=37.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:493,39,0 21358-ref 278 . T G 139.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9993;MQ=35.98;MQ0=0;QD=13.99;SB=-0.01;sumGLbyD=16.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:170,0,139 21358-ref 317 . C T 398.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.21;SB=-0.01;sumGLbyD=35.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:11:33.11:432,33,0 21358-ref 431 . G A 276.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.5226;MQ=35.87;MQ0=0;QD=30.74;SB=-0.01;sumGLbyD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:8:24.08:310,24,0 21358-ref 538 . C T 447.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.39;SB=-0.01;sumGLbyD=36.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:12:36.12:480,36,0 21358-ref 618 . G A 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 21358-ref 625 . C T 125.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=25.01;SB=-0.01;sumGLbyD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:158,15,0 21358-ref 637 . 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A G 113.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.27;SB=-0.01;sumGLbyD=36.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:146,12,0 21358-ref 963 . C G 404.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.11;SB=-0.01;sumGLbyD=33.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:0.88:433,0,1 21358-ref 1020 . T C 12.73 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.16;SB=-0.01;sumGLbyD=3.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:42.49:42,0,317 21358-ref 1110 . C G 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 21358-ref 1127 . A T 109.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=27.41;SB=-0.01;sumGLbyD=35.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:142,12,0 21358-ref 1142 . T C 68.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9497;MQ=35.28;MQ0=0;QD=11.38;SB=-0.01;sumGLbyD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:91.58:98,0,92 21358-ref 1164 . A C 74.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.86;SB=-0.01;sumGLbyD=20.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.96:104,0,65 21358-ref 1263 . A G 152.02 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.34;SB=-0.01;sumGLbyD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:17.19:182,0,17 21358-ref 1318 . A G 196.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.70;SB=-0.01;sumGLbyD=38.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:229,18,0 21358-ref 1374 . G T 82.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:114,9,0 21358-ref 1515 . 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G A 2535.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.8178;MQ=36.57;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=36.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,69:70:99:2569,173,0 21538-ref 342 . C G 2037.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.4160;MQ=36.27;MQ0=0;QD=36.38;SB=-0.01;sumGLbyD=36.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,55:54:99:2070,163,0 21538-ref 364 . T G 1854.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.7963;MQ=36.81;MQ0=0;QD=35.66;SB=-0.01;sumGLbyD=36.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:51:99:1888,116,0 21538-ref 430 . A C 2283.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9459;MQ=36.83;MQ0=0;QD=37.44;SB=-0.01;sumGLbyD=37.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:59:99:2317,178,0 21538-ref 459 . C T 1779.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.37;MQ0=0;QD=37.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1812,141,0 21538-ref 509 . C T 2251.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.31;MQ0=0;QD=38.15;SB=-0.01;sumGLbyD=38.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2284,178,0 21538-ref 513 . A G 2488.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=67;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.39;MQ0=0;QD=37.14;SB=-0.01;sumGLbyD=37.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,66:67:99:2522,166,0 21538-ref 618 . T A 2947.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.4963;MQ=36.74;MQ0=0;QD=37.31;SB=-0.01;sumGLbyD=37.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,79:78:99:2981,235,0 21538-ref 674 . C T 3982.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.9338;MQ=36.81;MQ0=0;QD=36.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:105:99:3907,310,0 21538-ref 698 . A G 3554.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.8329;MQ=36.67;MQ0=0;QD=38.22;SB=-0.01;sumGLbyD=37.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:92:99:3514,274,0 21538-ref 787 . 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T C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 21716-ref 50 . C G 23.19 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=32.73;MQ0=0;QD=4.64;SB=-0.01;sumGLbyD=10.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:53.16:53,0,89 21716-ref 69 . G C 337.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.1567;MQ=34.93;MQ0=0;QD=33.75;SB=-0.01;sumGLbyD=37.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:371,30,0 21716-ref 88 . G C 303.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.33;SB=-0.01;sumGLbyD=33.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.08:336,27,0 21716-ref 180 . C G 477.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.75;SB=-0.01;sumGLbyD=39.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:511,39,0 21716-ref 232 . G C 652.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.44;MQ0=0;QD=36.28;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.16:686,54,0 21716-ref 285 . G A 689.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.49;MQ0=0;QD=34.46;SB=-0.01;sumGLbyD=36.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:19:57.15:722,57,0 21716-ref 382 . A T 809.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.78;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.20:842,66,0 21716-ref 544 . C A 211.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=35.87;MQ0=0;QD=11.73;SB=-0.01;sumGLbyD=13.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:17:99:241,0,298 21716-ref 555 . C A 775.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.6553;MQ=36.03;MQ0=0;QD=36.92;SB=-0.01;sumGLbyD=38.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:808,63,0 21716-ref 556 . A G 276.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6219;MQ=36.03;MQ0=0;QD=13.18;SB=-0.01;sumGLbyD=14.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:21:99:307,0,340 21716-ref 629 . T A 788.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.54;SB=-0.01;sumGLbyD=39.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:821,63,0 21716-ref 705 . C T 383.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.07;MQ0=0;QD=34.86;SB=-0.01;sumGLbyD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:416,33,0 21716-ref 726 . T C 545.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=36.38;SB=-0.01;sumGLbyD=38.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:579,45,0 21716-ref 1198 . A C 1447.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9575;MQ=36.49;MQ0=0;QD=36.20;SB=-0.01;sumGLbyD=37.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:81.07:1481,81,0 21743-ref 234 . A G 1855.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.2551;MQ=36.23;MQ0=0;QD=35.01;SB=-0.01;sumGLbyD=35.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,51:53:89.86:1889,90,0 21743-ref 297 . G A 1724.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.3000;MQ=32.47;MQ0=0;QD=33.16;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1758,153,0 21743-ref 301 . C T 1451.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.95;MQ0=0;QD=30.88;SB=-0.01;sumGLbyD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,46:45:99:1485,101,0 21743-ref 339 . C A 1308.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.16;MQ0=0;QD=32.71;SB=-0.01;sumGLbyD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:39:99:1341,117,0 21743-ref 341 . A G 1279.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.32;MQ0=0;QD=32.81;SB=-0.01;sumGLbyD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1312,117,0 21743-ref 383 . T C 1090.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5184;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.09;SB=-0.01;sumGLbyD=35.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:30:90.28:1124,90,0 21743-ref 485 . T C 84.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:117,9,0 21777-ref 87 . A G 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 21784-ref 45 . A G 110.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.42;SB=-0.01;sumGLbyD=23.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:60.52:141,0,61 21784-ref 71 . C T 53.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.49;SB=-0.01;sumGLbyD=6.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:83.90:84,0,323 21784-ref 83 . G A 213.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.83;SB=-0.01;sumGLbyD=20.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:244,0,157 21784-ref 125 . G A 128.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6998;MQ=35.98;MQ0=0;QD=12.81;SB=-0.01;sumGLbyD=15.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:158,0,157 21784-ref 162 . A G 134.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=35.53;MQ0=0;QD=19.16;SB=-0.01;sumGLbyD=23.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:56.74:164,0,57 21784-ref 168 . A G 234.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.50;SB=-0.01;sumGLbyD=38.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:267,21,0 21784-ref 224 . C T 53.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.49;SB=-0.01;sumGLbyD=6.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:83.90:84,0,313 21784-ref 282 . G A 318.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.38;SB=-0.01;sumGLbyD=39.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:351,27,0 21784-ref 318 . C G 479.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.88;SB=-0.01;sumGLbyD=39.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:512,39,0 21784-ref 369 . C G 472.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:506,39,0 21784-ref 400 . C T 376.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.25;SB=-0.01;sumGLbyD=37.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:410,33,0 21784-ref 490 . A G 41.01 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=13.67;SB=-0.01;sumGLbyD=23.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20.60:71,0,21 21784-ref 495 . A G 75.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.13;SB=-0.01;sumGLbyD=35.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:107,9,0 21784-ref 496 . A G 75.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.13;SB=-0.01;sumGLbyD=35.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:107,9,0 21824-ref 138 . G C 159.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.96;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:193,15,0 21824-ref 222 . T G 39.36 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.68;SB=-0.01;sumGLbyD=35.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 21824-ref 223 . T A 35.36 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.68;SB=-0.01;sumGLbyD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:67,6,0 21824-ref 490 . G T 283.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=31.47;SB=-0.01;sumGLbyD=35.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:316,27,0 21824-ref 502 . C T 478.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.90;SB=-0.01;sumGLbyD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.12:512,42,0 21824-ref 526 . C A 595.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.18;MQ0=0;QD=35.00;SB=-0.01;sumGLbyD=36.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.13:628,51,0 21824-ref 584 . A T 62.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=20.76;SB=-0.01;sumGLbyD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.01:94,9,0 21824-ref 588 . C G 57.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=19.27;SB=-0.01;sumGLbyD=30.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:90,9,0 21824-ref 603 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 21824-ref 607 . G A 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 21824-ref 622 . C G 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 21824-ref 649 . G A 252.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=31.51;SB=-0.01;sumGLbyD=35.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:285,24,0 21824-ref 651 . C T 85.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=10.65;SB=-0.01;sumGLbyD=14.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:115,0,123 21824-ref 691 . G A 306.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=27.87;SB=-7.67;sumGLbyD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:11:10.40:339,10,0 21824-ref 700 . C T 326.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=32.70;SB=-69.61;sumGLbyD=36.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:360,30,0 21824-ref 709 . A G 184.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=26.31;SB=-69.26;sumGLbyD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.05:217,18,0 21824-ref 977 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,2:1:1.76:40,3,0 21824-ref 1149 . C T 276.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.74;SB=-0.01;sumGLbyD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.04:310,27,0 21824-ref 1666 . T C 31.96 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.33;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61.96:62,0,128 21834-ref 54 . A G 469.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.8314;MQ=36.60;MQ0=0;QD=18.78;SB=-0.01;sumGLbyD=19.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,15:25:99:499,0,318 21834-ref 95 . A G 1128.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.66;MQ0=0;QD=37.62;SB=-0.01;sumGLbyD=38.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.29:1162,90,0 21834-ref 137 . A T 1311.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=36.71;MQ0=0;QD=37.48;SB=-0.01;sumGLbyD=38.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1345,105,0 21834-ref 332 . C T 2205.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.4336;MQ=36.12;MQ0=0;QD=38.03;SB=-0.01;sumGLbyD=38.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,58:58:99:2239,175,0 21834-ref 352 . C T 1817.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7333;MQ=35.96;MQ0=0;QD=37.09;SB=-0.01;sumGLbyD=37.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1850,144,0 21834-ref 384 . T A 1461.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7067;MQ=35.87;MQ0=0;QD=32.47;SB=-0.01;sumGLbyD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,42:45:20.55:1494,21,0 21834-ref 412 . T C 1285.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.42;MQ0=0;QD=36.72;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:34:99:1318,102,0 21834-ref 443 . C T 913.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.52;SB=-0.01;sumGLbyD=37.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:24:72.23:946,72,0 21834-ref 505 . A G 126.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 21846-ref 52 . T C 635.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=35.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.14:668,54,0 21846-ref 73 . G C 850.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9958;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.44;SB=-0.01;sumGLbyD=36.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.22:884,69,0 21846-ref 109 . C T 1118.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.66;MQ0=0;QD=37.30;SB=-0.01;sumGLbyD=38.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.28:1152,90,0 21846-ref 158 . G T 333.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=33.31;SB=-0.01;sumGLbyD=36.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:366,30,0 21846-ref 182 . G A 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 21846-ref 187 . T A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 21846-ref 188 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 21846-ref 199 . C T 38.66 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.33;SB=-0.01;sumGLbyD=35.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 21846-ref 212 . C T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 21846-ref 277 . A G 324.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:358,27,0 21967-ref 80 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 21967-ref 101 . C G 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 21967-ref 146 . A G 230.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.94;SB=-0.01;sumGLbyD=37.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:264,21,0 21967-ref 239 . T A 37.12 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.37;SB=-0.01;sumGLbyD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:67,0,31 21967-ref 367 . G A 204.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.04;SB=-0.01;sumGLbyD=39.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:237,18,0 21967-ref 389 . C A 108.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.62;SB=-0.01;sumGLbyD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:7:98.95:139,0,99 21967-ref 926 . A G 253.66 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.18;SB=-0.01;sumGLbyD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12.92:284,0,13 21967-ref 1039 . A T 56.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.61;SB=-0.01;sumGLbyD=8.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:86.04:86,0,249 21967-ref 1159 . T A 18.61 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.66;SB=-0.01;sumGLbyD=6.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:48.54:49,0,176 21967-ref 1170 . T C 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 21967-ref 1216 . C A 205.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 21967-ref 1318 . G T 120.53 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9832;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.61;SB=-0.01;sumGLbyD=10.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:14:99:151,0,271 21967-ref 1372 . G T 391.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.55;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:424,33,0 21967-ref 1600 . A G 382.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=34.77;SB=-0.01;sumGLbyD=37.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:415,33,0 21967-ref 1624 . A T 341.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=34.11;SB=-0.01;sumGLbyD=37.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:374,30,0 21967-ref 1737 . C A 93.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.46;SB=-0.01;sumGLbyD=11.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:123,0,243 21967-ref 1795 . G T 214.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.11;MQ0=0;QD=23.82;SB=-0.01;sumGLbyD=27.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:8:24.05:247,24,0 21967-ref 1798 . A T 283.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=29.93;MQ0=0;QD=25.73;SB=-0.01;sumGLbyD=28.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:10:30.07:316,30,0 21967-ref 1805 . C T 276.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.12;MQ0=0;QD=27.61;SB=-0.01;sumGLbyD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.05:309,30,0 22097-ref 36 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 22097-ref 130 . A T 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 22097-ref 574 . A G 24.11 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=12.05;SB=-0.01;sumGLbyD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:55,6,0 22097-ref 740 . G A 420.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.04;MQ0=0;QD=35.08;SB=-0.01;sumGLbyD=37.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:454,36,0 22097-ref 757 . A G 412.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.04;MQ0=0;QD=34.35;SB=-0.01;sumGLbyD=37.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.09:445,36,0 22252-ref 33 . C T 233.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.38;SB=-0.01;sumGLbyD=38.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:267,21,0 22252-ref 47 . A G 291.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=32.35;SB=-0.01;sumGLbyD=36.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:324,27,0 22252-ref 60 . C A 284.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=31.57;SB=-0.01;sumGLbyD=35.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:317,27,0 22252-ref 118 . T A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 22252-ref 130 . C G 123.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.97;SB=-75.13;sumGLbyD=39.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:156,12,0 22252-ref 139 . G T 203.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.92;SB=-79.64;sumGLbyD=39.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:236,18,0 22252-ref 174 . T C 161.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.38;MQ0=0;QD=8.51;SB=-47.22;sumGLbyD=10.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:192,0,406 22252-ref 191 . G C 465.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=34.95;MQ0=0;QD=12.94;SB=-47.22;sumGLbyD=13.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,17:36:99:496,0,618 22252-ref 199 . C T 652.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=14.19;SB=-47.22;sumGLbyD=14.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,24:45:99:683,0,666 22252-ref 246 . G C 695.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9999;MQ=33.69;MQ0=0;QD=12.88;SB=-53.24;sumGLbyD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,27:54:99:725,0,862 22252-ref 262 . C G 394.10 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6204;MQ=33.57;MQ0=0;QD=9.85;SB=-0.01;sumGLbyD=10.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,17:40:99:424,0,766 22252-ref 265 . C T 373.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6204;MQ=33.58;MQ0=0;QD=10.09;SB=-0.01;sumGLbyD=10.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:403,0,710 22252-ref 269 . C G 660.84 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6204;MQ=34.01;MQ0=0;QD=18.88;SB=-0.01;sumGLbyD=19.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,21:35:99:691,0,343 22252-ref 273 . G T 676.52 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8320;MQ=34.24;MQ0=0;QD=19.90;SB=-0.01;sumGLbyD=20.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,21:34:99:707,0,323 22252-ref 286 . G T 84.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=33.65;MQ0=0;QD=3.84;SB=-0.01;sumGLbyD=5.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:21:99:115,0,514 22252-ref 326 . G A 408.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.78;MQ0=0;QD=29.16;SB=-184.81;sumGLbyD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:4.33:439,4,0 22252-ref 334 . T C 455.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.60;MQ0=0;QD=35.02;SB=-199.31;sumGLbyD=37.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:488,39,0 22252-ref 375 . G C 68.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9573;MQ=34.93;MQ0=0;QD=3.42;SB=-14.59;sumGLbyD=4.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:98.32:98,0,527 22252-ref 394 . C T 74.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=4.13;SB=-26.62;sumGLbyD=5.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:104,0,465 22252-ref 410 . C T 59.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6646;MQ=35.21;MQ0=0;QD=2.58;SB=-26.62;sumGLbyD=3.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:89.29:89,0,640 22252-ref 415 . T C 31.33 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6646;MQ=34.82;MQ0=0;QD=1.65;SB=-26.62;sumGLbyD=3.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:61.32:61,0,539 22252-ref 493 . C T 574.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.7768;MQ=36.47;MQ0=0;QD=30.23;SB=-0.01;sumGLbyD=31.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:18:24.54:607,25,0 22252-ref 537 . C A 109.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.9935;MQ=36.47;MQ0=0;QD=2.89;SB=-0.01;sumGLbyD=3.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,7:38:99:140,0,1085 22252-ref 542 . A G 286.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8602;MQ=36.59;MQ0=0;QD=5.84;SB=-0.01;sumGLbyD=6.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,12:49:99:316,0,1276 22252-ref 559 . T C 1194.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7686;MQ=36.37;MQ0=0;QD=24.89;SB=-0.01;sumGLbyD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,36:47:99:1225,0,325 22252-ref 576 . A T 607.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5787;MQ=36.04;MQ0=0;QD=13.82;SB=-0.01;sumGLbyD=14.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,20:43:99:638,0,742 22252-ref 611 . A G 176.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=8.9972;MQ=35.86;MQ0=0;QD=9.27;SB=-0.01;sumGLbyD=10.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:206,0,404 22252-ref 612 . G A 119.69 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.9976;MQ=35.64;MQ0=0;QD=7.48;SB=-0.01;sumGLbyD=9.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:150,0,354 22252-ref 622 . T C 18.34 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9996;MQ=29.00;MQ0=0;QD=6.11;SB=-0.01;sumGLbyD=16.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.99:48,0,31 22283-ref 105 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 22283-ref 117 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 22283-ref 182 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 22283-ref 192 . T C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 22283-ref 219 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,2:1:1.76:40,3,0 22283-ref 273 . C T 197.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.99;SB=-0.01;sumGLbyD=38.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:231,18,0 22283-ref 416 . T C 84.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.11;SB=-0.01;sumGLbyD=38.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:116,9,0 22283-ref 419 . A G 81.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.27;SB=-0.01;sumGLbyD=38.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:114,9,0 22283-ref 527 . G A 28.33 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.72;SB=-0.01;sumGLbyD=9.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58.31:58,0,141 22283-ref 562 . G T 96.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:129,12,0 22283-ref 566 . A G 96.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:129,12,0 22283-ref 584 . A T 94.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=23.74;SB=-0.01;sumGLbyD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:127,12,0 22283-ref 602 . G A 96.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:129,12,0 22283-ref 614 . C T 25.02 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=4.17;SB=-0.01;sumGLbyD=9.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,121 22283-ref 636 . T G 74.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.00;SB=-0.01;sumGLbyD=20.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.96:105,0,65 22283-ref 738 . A C 93.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.83;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:124,0,283 22283-ref 768 . C T 393.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.73;SB=-0.01;sumGLbyD=38.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:426,33,0 22283-ref 778 . T C 218.52 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.85;SB=-0.01;sumGLbyD=24.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:89.92:249,0,90 22283-ref 858 . A G 237.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:271,21,0 22283-ref 894 . G C 107.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=26.93;SB=-0.01;sumGLbyD=35.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:140,12,0 22283-ref 903 . T C 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 22283-ref 933 . A G 334.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.98;MQ0=0;QD=33.50;SB=-0.01;sumGLbyD=36.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:368,30,0 22283-ref 993 . G A 564.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.26;SB=-0.01;sumGLbyD=37.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.15:597,45,0 22283-ref 1023 . A G 365.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.24;SB=-0.01;sumGLbyD=36.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.10:399,30,0 22283-ref 1048 . G A 29.76 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9734;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.95;SB=-0.01;sumGLbyD=11.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59.75:60,0,86 22283-ref 1059 . C T 123.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.78;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:156,12,0 22283-ref 1110 . A T 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 22283-ref 1122 . A T 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 22283-ref 1139 . C T 43.12 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.56;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:74,6,0 22283-ref 1179 . G A 228.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.4692;MQ=35.53;MQ0=0;QD=32.71;SB=-0.01;sumGLbyD=37.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:262,21,0 22283-ref 1218 . C T 55.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.1764;MQ=35.87;MQ0=0;QD=6.17;SB=-0.01;sumGLbyD=9.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:9:85.56:86,0,176 22283-ref 1341 . T A 22.02 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.15;SB=-0.01;sumGLbyD=7.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51.98:52,0,171 22283-ref 1389 . A T 325.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.18;SB=-0.01;sumGLbyD=39.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:359,27,0 22283-ref 1434 . A C 79.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.66;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:112,9,0 22283-ref 1563 . T C 777.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9634;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.33;SB=-0.01;sumGLbyD=36.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.19:810,63,0 22283-ref 1614 . T C 313.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:346,27,0 22302-ref 43 . T C 1091.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9998;MQ=36.65;MQ0=0;QD=37.63;SB=-0.01;sumGLbyD=38.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.27:1124,87,0 22302-ref 101 . T C 1100.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9332;MQ=36.32;MQ0=0;QD=36.69;SB=-0.01;sumGLbyD=37.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.27:1134,90,0 22302-ref 140 . C A 777.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:811,63,0 22302-ref 265 . C G 735.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=36.77;SB=-0.01;sumGLbyD=38.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:768,60,0 22302-ref 290 . T G 362.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.15;MQ0=0;QD=30.22;SB=-0.01;sumGLbyD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:10:30.10:396,30,0 22302-ref 399 . A T 1511.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.75;MQ0=0;QD=37.79;SB=-0.01;sumGLbyD=38.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1545,120,0 22302-ref 412 . G C 1320.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8401;MQ=36.72;MQ0=0;QD=36.69;SB=-0.01;sumGLbyD=37.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:35:99:1354,105,0 22302-ref 710 . A G 1610.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.35;SB=-0.01;sumGLbyD=39.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1644,126,0 22320-ref 20 . C G 21.48 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.07;SB=-0.01;sumGLbyD=7.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51.44:51,0,167 22320-ref 23 . A T 65.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.24;SB=-0.01;sumGLbyD=11.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:95.94:96,0,174 22320-ref 89 . A G 476.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6974;MQ=35.53;MQ0=0;QD=17.02;SB=-0.01;sumGLbyD=18.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,16:28:99:506,0,395 22320-ref 106 . C T 93.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6102;MQ=34.39;MQ0=0;QD=5.86;SB=-0.01;sumGLbyD=7.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:124,0,350 22320-ref 115 . T C 66.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7781;MQ=34.69;MQ0=0;QD=3.68;SB=-0.01;sumGLbyD=5.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:96.20:96,0,459 22320-ref 229 . T G 678.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.6551;MQ=36.07;MQ0=0;QD=20.57;SB=-0.01;sumGLbyD=21.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,22:32:99:709,0,323 22320-ref 244 . G A 299.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6983;MQ=35.94;MQ0=0;QD=10.31;SB=-0.01;sumGLbyD=11.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:329,0,602 22320-ref 252 . C T 993.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.6640;MQ=35.91;MQ0=0;QD=35.47;SB=-0.01;sumGLbyD=36.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.25:1026,81,0 22320-ref 262 . G T 334.12 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.7983;MQ=36.27;MQ0=0;QD=11.93;SB=-0.01;sumGLbyD=13.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,12:28:99:364,0,457 22320-ref 445 . T C 322.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=15.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:352,0,409 22320-ref 469 . C T 442.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9998;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.39;SB=-0.01;sumGLbyD=17.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,14:27:99:472,0,429 22320-ref 531 . G A 210.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9469;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.22;SB=-0.01;sumGLbyD=18.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:241,0,198 22320-ref 614 . G C 525.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9993;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.05;SB=-79.33;sumGLbyD=37.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.14:559,42,0 22320-ref 630 . A G 211.81 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.65;SB=-72.57;sumGLbyD=20.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:242,0,164 22320-ref 694 . T C 272.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.09;SB=-36.95;sumGLbyD=38.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:306,24,0 22320-ref 718 . T A 171.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.28;SB=-33.98;sumGLbyD=14.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:202,0,223 22320-ref 793 . T C 592.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.80;MQ0=0;QD=34.87;SB=-29.63;sumGLbyD=36.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.15:626,48,0 22320-ref 811 . A C 697.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.93;MQ0=0;QD=36.70;SB=-29.63;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:730,57,0 22320-ref 819 . C T 582.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=36.42;SB=-29.63;sumGLbyD=38.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:616,48,0 22320-ref 882 . C T 292.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.12;MQ0=0;QD=29.22;SB=-0.01;sumGLbyD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:325,30,0 22320-ref 885 . A G 214.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=26.80;SB=-0.01;sumGLbyD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:247,24,0 22320-ref 887 . A T 322.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.93;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.08:356,33,0 22320-ref 906 . C G 543.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=33.96;SB=-0.01;sumGLbyD=36.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.13:576,48,0 22320-ref 972 . T G 218.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7842;MQ=36.25;MQ0=0;QD=8.10;SB=-0.01;sumGLbyD=9.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,9:27:99:249,0,626 22320-ref 976 . A T 218.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9618;MQ=36.27;MQ0=0;QD=7.79;SB=-0.01;sumGLbyD=8.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,9:28:99:248,0,619 22320-ref 1006 . C G 587.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=36.75;SB=-0.01;sumGLbyD=38.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:621,48,0 22320-ref 1080 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 22320-ref 1082 . T G 44.89 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 22360-ref 134 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 22422-ref 195 . T C 320.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.60;SB=-0.01;sumGLbyD=39.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:353,27,0 22475-ref 116 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 22475-ref 155 . A G 145.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.22;SB=-0.01;sumGLbyD=29.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.95:175,0,22 22475-ref 217 . G A 186.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.09;SB=-0.01;sumGLbyD=36.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:219,18,0 22475-ref 328 . T C 1155.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8645;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.23;SB=-0.01;sumGLbyD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,35:36:28.28:1189,28,0 22475-ref 391 . G A 2743.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.87;MQ0=0;QD=36.59;SB=-116.39;sumGLbyD=37.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:72:99:2777,217,0 22475-ref 405 . G A 2741.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.5481;MQ=36.74;MQ0=0;QD=35.15;SB=-118.59;sumGLbyD=35.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,77:75:99:2775,191,0 22475-ref 466 . C G 1159.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.74;MQ0=0;QD=33.13;SB=-0.01;sumGLbyD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1192,105,0 22475-ref 476 . A G 891.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.29;MQ0=0;QD=31.83;SB=-0.01;sumGLbyD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.20:924,84,0 22475-ref 479 . G C 836.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=30.98;SB=-0.01;sumGLbyD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.18:870,81,0 22475-ref 489 . C T 578.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.38;MQ0=0;QD=27.53;SB=-0.01;sumGLbyD=29.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:20:60.12:611,60,0 22475-ref 521 . G A 726.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=30.46;MQ0=0;QD=26.89;SB=-0.01;sumGLbyD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:69.15:759,69,0 22475-ref 525 . C T 1058.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9984;MQ=31.20;MQ0=0;QD=33.07;SB=-0.01;sumGLbyD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.23:1091,96,0 22475-ref 568 . G A 1926.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=34.54;MQ0=0;QD=35.03;SB=-0.01;sumGLbyD=35.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:53:99:1960,159,0 22475-ref 580 . C G 2160.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=34.29;SB=-0.01;sumGLbyD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:62:99:2193,186,0 22475-ref 625 . C T 1195.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=29.65;MQ0=0;QD=29.17;SB=-0.01;sumGLbyD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,39:40:85.01:1229,85,0 22475-ref 636 . G A 935.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=27.31;MQ0=0;QD=25.29;SB=-0.01;sumGLbyD=26.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,34:37:33.86:969,34,0 22475-ref 637 . A G 973.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9997;MQ=27.89;MQ0=0;QD=24.96;SB=-0.01;sumGLbyD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,37:37:31.22:1006,31,0 22475-ref 663 . T A 994.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9926;MQ=32.98;MQ0=0;QD=26.87;SB=-0.01;sumGLbyD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,33:36:27.45:1027,27,0 22475-ref 688 . 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T C 2360.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.3021;MQ=36.68;MQ0=0;QD=36.88;SB=-0.01;sumGLbyD=37.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,64:62:99:2393,187,0 22475-ref 953 . T C 2404.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.6639;MQ=36.84;MQ0=0;QD=36.99;SB=-0.01;sumGLbyD=37.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,64:64:99:2437,153,0 22475-ref 1096 . C T 1803.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4357;MQ=36.79;MQ0=0;QD=37.58;SB=-40.01;sumGLbyD=38.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1837,144,0 22475-ref 1405 . A G 1338.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8661;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.19;SB=-0.01;sumGLbyD=37.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:36:99:1372,108,0 22475-ref 1519 . A C 923.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.2244;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.78;SB=-0.01;sumGLbyD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:25.56:956,26,0 22475-ref 1636 . 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T G 243.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.75;SB=-0.01;sumGLbyD=39.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:276,21,0 22605-ref 747 . G A 355.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=32.35;SB=-0.01;sumGLbyD=35.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.07:389,33,0 22605-ref 749 . A G 382.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=34.75;SB=-0.01;sumGLbyD=37.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:415,33,0 22605-ref 792 . C T 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=35.28;MQ0=0;QD=26.15;SB=-0.01;sumGLbyD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 22605-ref 855 . G C 39.26 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.63;SB=-0.01;sumGLbyD=35.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 22605-ref 901 . T A 459.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.36;SB=-0.01;sumGLbyD=37.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:493,39,0 22605-ref 964 . T A 314.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.43;SB=-0.01;sumGLbyD=34.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:347,27,0 22605-ref 969 . T C 235.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.65;SB=-0.01;sumGLbyD=38.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:269,21,0 22605-ref 1008 . T G 474.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.54;SB=-0.01;sumGLbyD=39.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:508,39,0 22605-ref 1104 . G A 116.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.25;SB=-0.01;sumGLbyD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.04:149,12,0 22605-ref 1177 . A G 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 22627-ref 72 . A C 84.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:117,9,0 22627-ref 132 . T A 355.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.53;SB=-0.01;sumGLbyD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:388,30,0 22627-ref 140 . C T 313.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.85;SB=-0.01;sumGLbyD=38.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:347,27,0 22627-ref 164 . G A 354.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.46;SB=-0.01;sumGLbyD=38.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:388,30,0 22627-ref 258 . A T 25985.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=790;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=34.9504;MQ=30.56;MQ0=0;QD=32.89;SB=-0.01;sumGLbyD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,786:783:99:25949,2351,0 22627-ref 345 . T C 25693.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=670;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=27.8057;MQ=36.74;MQ0=0;QD=38.35;SB=-194.38;sumGLbyD=38.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,667:661:99:25692,1989,0 22627-ref 454 . C G 18940.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=508;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=21.3275;MQ=36.92;MQ0=0;QD=37.28;SB=-0.01;sumGLbyD=37.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,505:491:99:18939,1478,0 22627-ref 624 . T C 21252.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=553;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=28.8729;MQ=36.89;MQ0=0;QD=38.43;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,551:544:99:21251,1637,0 22627-ref 646 . A G 21596.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=568;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=42.2699;MQ=36.79;MQ0=0;QD=38.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,564:557:99:21557,1673,0 22627-ref 700 . G A 20871.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=548;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=24.7817;MQ=36.76;MQ0=0;QD=38.09;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,546:540:99:20800,1582,0 22627-ref 830 . T C 16360.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=422;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=21.8824;MQ=36.93;MQ0=0;QD=38.77;SB=-0.01;sumGLbyD=38.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,420:420:99:16320,1224,0 22627-ref 908 . A G 15075.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=390;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=19.7930;MQ=36.95;MQ0=0;QD=38.65;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,389:387:99:15035,1125,0 22627-ref 1036 . G A 18600.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=483;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=31.5205;MQ=36.92;MQ0=0;QD=38.51;SB=-0.01;sumGLbyD=38.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,479:479:99:18470,1334,0 22713-ref 175 . A C 118.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.53;SB=-0.01;sumGLbyD=37.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:151,12,0 22713-ref 215 . 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T A 121.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.47;SB=-0.01;sumGLbyD=38.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:154,12,0 22713-ref 627 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 22800-ref 136 . C T 693.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.52;SB=-0.01;sumGLbyD=38.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:727,57,0 22800-ref 223 . T C 945.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.84;SB=-0.01;sumGLbyD=39.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.24:979,75,0 22800-ref 239 . G A 915.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.13;SB=-0.01;sumGLbyD=39.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.23:948,72,0 22800-ref 302 . T G 986.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.61;MQ0=0;QD=37.93;SB=-40.01;sumGLbyD=39.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.25:1019,78,0 22800-ref 371 . T A 1192.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.26;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:32:93.30:1225,93,0 22800-ref 434 . C T 473.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=36.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:507,39,0 22800-ref 456 . C T 234.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.50;SB=-0.01;sumGLbyD=38.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:267,21,0 22800-ref 457 . A G 234.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.50;SB=-0.01;sumGLbyD=38.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:267,21,0 22800-ref 723 . T C 288.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=32.02;SB=-29.61;sumGLbyD=35.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:321,27,0 22800-ref 724 . G A 328.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=32.83;SB=-39.31;sumGLbyD=36.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:361,30,0 22800-ref 745 . C T 260.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=32.52;SB=-39.98;sumGLbyD=36.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:293,24,0 22800-ref 805 . C T 130.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.41;MQ0=0;QD=26.05;SB=-0.01;sumGLbyD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:163,15,0 22800-ref 917 . G C 214.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.4692;MQ=29.26;MQ0=0;QD=26.87;SB=-0.01;sumGLbyD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.04:248,24,0 22800-ref 950 . C T 157.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.98;MQ0=0;QD=22.51;SB=-0.01;sumGLbyD=27.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.03:190,18,0 22800-ref 988 . A T 202.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.74;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 22801-ref 107 . G T 300.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=33.37;SB=-0.01;sumGLbyD=37.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:333,27,0 22801-ref 119 . T C 155.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9832;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:188,15,0 22801-ref 149 . G A 76.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.04;SB=-0.01;sumGLbyD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.03:108,9,0 22817-ref 77 . T C 1943.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6006;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.11;SB=-0.01;sumGLbyD=38.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:51:99:1977,153,0 22817-ref 263 . C T 1519.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.98;SB=-0.01;sumGLbyD=38.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1552,120,0 22817-ref 497 . A G 3078.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.39;MQ0=0;QD=37.09;SB=-0.01;sumGLbyD=37.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:81:99:3112,244,0 22817-ref 512 . G A 2856.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.3247;MQ=36.32;MQ0=0;QD=38.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:2889,226,0 22817-ref 671 . G A 125.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=15.65;SB=-0.01;sumGLbyD=19.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:87.44:155,0,87 22817-ref 672 . T A 123.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=17.64;SB=-0.01;sumGLbyD=21.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:55.31:153,0,55 22817-ref 673 . G A 54.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=10.84;SB=-0.01;sumGLbyD=16.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:60.52:84,0,61 22817-ref 674 . T G 17.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.22:47,0,58 22817-ref 690 . A G 135.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=27.20;SB=-0.01;sumGLbyD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:169,15,0 22817-ref 717 . G A 338.04 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9987;MQ=32.41;MQ0=0;QD=24.15;SB=-0.01;sumGLbyD=26.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:37.92:368,0,38 22817-ref 755 . G A 340.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9332;MQ=31.58;MQ0=0;QD=28.33;SB=-0.01;sumGLbyD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.08:373,33,0 22817-ref 758 . T C 263.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.9326;MQ=31.58;MQ0=0;QD=21.97;SB=-0.01;sumGLbyD=24.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:43.92:294,0,44 22817-ref 768 . G T 34.81 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9995;MQ=31.58;MQ0=0;QD=4.35;SB=-0.01;sumGLbyD=8.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:64.81:65,0,156 22853-ref 140 . C T 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 22853-ref 232 . C T 206.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 22853-ref 239 . G C 165.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.02;SB=-0.01;sumGLbyD=39.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:198,15,0 22853-ref 251 . T C 197.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:231,18,0 22853-ref 335 . C T 116.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.11;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:149,12,0 22853-ref 365 . T C 200.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.41;SB=-0.01;sumGLbyD=38.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:233,18,0 22853-ref 512 . C G 238.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.86;SB=-0.01;sumGLbyD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.07:272,21,0 22853-ref 575 . T C 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.82;SB=-0.01;sumGLbyD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9.03:119,9,0 22853-ref 942 . A G 160.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:193,15,0 22861-ref 12 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 22861-ref 174 . C G 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 22861-ref 183 . A G 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 22886-ref 137 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 22886-ref 150 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 22886-ref 229 . C T 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 22892-ref 49 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 22903-ref 163 . G T 154.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.00;MQ0=0;QD=25.82;SB=-0.01;sumGLbyD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.04:188,15,0 22903-ref 210 . A C 69.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.83;SB=-0.01;sumGLbyD=19.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.96:99,0,65 22903-ref 211 . G T 66.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.32;SB=-0.01;sumGLbyD=19.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.96:97,0,65 22903-ref 333 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 22903-ref 417 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 22917-ref 152 . C G 53.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.60;MQ0=0;QD=4.15;SB=-0.01;sumGLbyD=6.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:12:83.92:84,0,280 22917-ref 172 . A G 132.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.60;MQ0=0;QD=10.22;SB=-0.01;sumGLbyD=12.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:163,0,234 22917-ref 175 . A T 130.72 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=8.71;SB=-0.01;sumGLbyD=10.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:14:99:161,0,264 22917-ref 194 . C A 1188.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=36.05;MQ0=0;QD=37.15;SB=-0.01;sumGLbyD=38.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.30:1222,96,0 22917-ref 304 . A G 1256.64 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.4402;MQ=36.81;MQ0=0;QD=23.27;SB=-0.01;sumGLbyD=23.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,38:53:99:1287,0,426 22917-ref 323 . C A 233.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=15.9889;MQ=36.27;MQ0=0;QD=16.69;SB=-0.01;sumGLbyD=18.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:264,0,176 22917-ref 325 . T G 73.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=9.9615;MQ=36.27;MQ0=0;QD=5.26;SB=-0.01;sumGLbyD=7.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:104,0,317 22917-ref 338 . T C 619.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=36.43;SB=-29.63;sumGLbyD=38.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:652,51,0 22917-ref 358 . C T 1454.39 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.79;MQ0=0;QD=30.30;SB=-23.56;sumGLbyD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,43:47:49.21:1484,0,49 22917-ref 431 . A G 237.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9979;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.94;SB=-0.01;sumGLbyD=19.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:267,0,185 22917-ref 444 . C T 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.94;SB=-0.01;sumGLbyD=24.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6.02:73,6,0 22920-ref 26 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 22920-ref 37 . C T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 22920-ref 42 . G A 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 22920-ref 43 . G T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 22920-ref 140 . C A 635.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.36;SB=-0.01;sumGLbyD=39.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:668,51,0 22920-ref 291 . G A 341.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.99;SB=-0.01;sumGLbyD=20.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:372,0,224 22935-ref 60 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 22935-ref 119 . T C 119.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.92;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:152,12,0 22935-ref 123 . G C 163.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.73;SB=-0.01;sumGLbyD=39.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 22935-ref 182 . C T 167.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.96;SB=-0.01;sumGLbyD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:201,18,0 22935-ref 299 . C T 163.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.73;SB=-0.01;sumGLbyD=39.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 22935-ref 422 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=25.00;MQ0=0;QD=9.34;SB=-0.01;sumGLbyD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 22935-ref 428 . C T 233.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.96;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.05:267,27,0 22935-ref 452 . A G 353.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=29.47;SB=-0.01;sumGLbyD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.08:387,36,0 22935-ref 458 . A G 353.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=29.47;SB=-0.01;sumGLbyD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.08:387,36,0 22935-ref 496 . T A 528.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.30;MQ0=0;QD=33.05;SB=-0.01;sumGLbyD=35.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.13:562,48,0 22935-ref 525 . A G 482.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.32;MQ0=0;QD=32.15;SB=-0.01;sumGLbyD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.13:515,39,0 22935-ref 629 . A C 281.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.13;SB=-0.01;sumGLbyD=39.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:314,24,0 22935-ref 688 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 22946-ref 67 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 22946-ref 91 . G A 121.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:155,15,0 22946-ref 105 . G C 381.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.04;MQ0=0;QD=27.27;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.08:415,42,0 22946-ref 113 . C A 467.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.29;MQ0=0;QD=27.47;SB=-0.01;sumGLbyD=29.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.10:500,48,0 22946-ref 145 . A C 2729.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.49;MQ0=0;QD=36.39;SB=-0.01;sumGLbyD=36.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,74:73:99:2763,220,0 22946-ref 159 . T A 2952.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.5295;MQ=35.77;MQ0=0;QD=35.57;SB=-0.01;sumGLbyD=35.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,82:81:99:2986,206,0 22946-ref 276 . G C 4201.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.9861;MQ=35.04;MQ0=0;QD=36.22;SB=-0.01;sumGLbyD=36.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,115:113:99:4201,340,0 22946-ref 323 . C T 2800.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.1979;MQ=32.79;MQ0=0;QD=32.57;SB=-0.01;sumGLbyD=32.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,83:83:99:2834,244,0 22946-ref 326 . G A 2866.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=32.68;MQ0=0;QD=34.12;SB=-0.01;sumGLbyD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:83:99:2899,250,0 22946-ref 332 . G A 3016.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4689;MQ=33.14;MQ0=0;QD=34.28;SB=-0.01;sumGLbyD=34.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:87:99:3049,262,0 22946-ref 473 . G A 3934.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=103;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4679;MQ=36.71;MQ0=0;QD=38.20;SB=-0.01;sumGLbyD=38.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,103:102:99:3934,307,0 22946-ref 482 . A T 4080.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=108;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.5566;MQ=36.72;MQ0=0;QD=37.78;SB=-0.01;sumGLbyD=37.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,107:106:99:4080,319,0 23029-ref 19 . A G 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:71,0,31 23029-ref 73 . A G 487.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7873;MQ=36.40;MQ0=0;QD=28.65;SB=-0.01;sumGLbyD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:20.86:517,0,21 23029-ref 86 . G T 578.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.37;MQ0=0;QD=36.13;SB=-0.01;sumGLbyD=38.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:611,48,0 23029-ref 120 . G A 306.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.60;SB=-35.24;sumGLbyD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.09:339,27,0 23029-ref 131 . C T 316.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.19;SB=-40.00;sumGLbyD=38.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:350,27,0 23029-ref 254 . T A 631.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.08;SB=-280.04;sumGLbyD=36.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:17:51.16:664,51,0 23029-ref 302 . A G 188.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.41;SB=-0.01;sumGLbyD=36.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:221,18,0 23046-ref 369 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23092-ref 135 . A G 276.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.75;SB=-0.01;sumGLbyD=34.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:8:24.08:310,24,0 23092-ref 142 . T A 317.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:351,27,0 23092-ref 270 . A C 621.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.57;SB=-0.01;sumGLbyD=38.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:655,51,0 23092-ref 371 . G A 300.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=33.43;SB=-0.01;sumGLbyD=37.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:334,27,0 23092-ref 390 . A G 323.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.94;SB=-0.01;sumGLbyD=39.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:356,27,0 23092-ref 928 . G A 146.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7741;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.99;SB=-0.01;sumGLbyD=8.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:99:177,0,508 23092-ref 1123 . T C 1259.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7849;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:33:99:1292,99,0 23092-ref 1237 . A T 472.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9912;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.24;SB=-0.01;sumGLbyD=16.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,16:30:99:502,0,464 23092-ref 1296 . G A 1454 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.24;MQ0=0;QD=36.35;SB=-0.01;sumGLbyD=37.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:39:99:1487,117,0 23092-ref 1327 . T C 1075.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.94;MQ0=0;QD=37.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.27:1108,87,0 23092-ref 1336 . G A 972.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=37.39;SB=-0.01;sumGLbyD=38.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.24:1005,78,0 23092-ref 1425 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23092-ref 1442 . T G 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 23092-ref 1480 . C T 354.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.14;MQ0=0;QD=32.20;SB=-0.01;sumGLbyD=35.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:387,33,0 23092-ref 1497 . T G 362.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.14;MQ0=0;QD=32.95;SB=-0.01;sumGLbyD=35.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:396,33,0 23092-ref 1523 . C T 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 23092-ref 1524 . C T 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 23092-ref 1546 . C T 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 23092-ref 1574 . A G 638.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.49;SB=-0.01;sumGLbyD=37.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:672,51,0 23092-ref 1614 . G A 875.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.08;SB=-0.01;sumGLbyD=39.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.22:909,69,0 23092-ref 1684 . A C 1215.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.68;MQ0=0;QD=37.97;SB=-0.01;sumGLbyD=39.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.31:1248,96,0 23092-ref 1707 . T C 1110.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.65;MQ0=0;QD=38.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.28:1143,87,0 23092-ref 1754 . G C 1144.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.14;SB=-0.01;sumGLbyD=39.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.29:1177,90,0 23092-ref 1819 . A T 246.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.20;SB=-0.01;sumGLbyD=39.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:279,21,0 23100-ref 75 . C G 1170.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.3633;MQ=36.67;MQ0=0;QD=37.77;SB=-0.01;sumGLbyD=38.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.30:1204,93,0 23100-ref 181 . C T 1099.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8643;MQ=34.06;MQ0=0;QD=34.36;SB=-0.01;sumGLbyD=35.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:32:93.27:1132,93,0 23100-ref 190 . G A 184.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8634;MQ=33.61;MQ0=0;QD=6.59;SB=-0.01;sumGLbyD=7.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,10:28:99:214,0,606 23100-ref 202 . A G 301.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9978;MQ=33.85;MQ0=0;QD=10.04;SB=-0.01;sumGLbyD=11.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,13:30:99:331,0,578 23100-ref 212 . A G 1090.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.4692;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.08;SB=-0.01;sumGLbyD=35.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:31:93.26:1124,93,0 23100-ref 375 . A G 314.72 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.6170;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.85;SB=-0.01;sumGLbyD=11.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:345,0,583 23103-ref 36 . C A 77.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.50;SB=-0.01;sumGLbyD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:108,0,28 23131-ref 752 . T C 620.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=36.40;MQ0=0;QD=36.50;SB=-0.01;sumGLbyD=38.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.15:654,51,0 23131-ref 772 . T C 499.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7340;MQ=36.27;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=38.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:533,42,0 23131-ref 817 . G C 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 23131-ref 889 . A G 698.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.7837;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.76;SB=-0.01;sumGLbyD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:21:27.94:732,28,0 23131-ref 961 . C A 1079.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.67;MQ0=0;QD=34.83;SB=-0.01;sumGLbyD=35.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:29:87.27:1113,87,0 23131-ref 1003 . T A 958.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.82;MQ0=0;QD=36.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.24:992,78,0 23131-ref 1030 . A T 1169.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=36.56;SB=-0.01;sumGLbyD=37.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.29:1203,96,0 23211-ref 70 . T G 158.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.78;SB=-0.01;sumGLbyD=38.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:192,15,0 23211-ref 305 . C T 430.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.89;SB=-0.01;sumGLbyD=38.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:464,36,0 23211-ref 1000 . A G 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 23215-ref 111 . T C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 23215-ref 131 . A T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 23276-ref 27 . G T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 23276-ref 29 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 23276-ref 144 . G A 445.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.14;SB=-0.01;sumGLbyD=39.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:479,36,0 23276-ref 177 . A T 123.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.6000;MQ=35.66;MQ0=0;QD=5.35;SB=-0.01;sumGLbyD=6.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:22:99:153,0,563 23276-ref 204 . G A 729.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=33.18;SB=-0.01;sumGLbyD=34.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.17:763,66,0 23276-ref 240 . A G 673.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=30.72;MQ0=0;QD=32.09;SB=-0.01;sumGLbyD=33.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.15:707,63,0 23276-ref 246 . T C 372.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.19;MQ0=0;QD=28.68;SB=-0.01;sumGLbyD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.08:406,39,0 23276-ref 248 . G T 343.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=28.60;SB=-0.01;sumGLbyD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.08:376,36,0 23276-ref 288 . T C 314.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.85;MQ0=0;QD=31.44;SB=-0.01;sumGLbyD=34.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.06:347,30,0 23276-ref 308 . A G 536 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.6651;MQ=30.52;MQ0=0;QD=31.53;SB=-0.01;sumGLbyD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.12:569,51,0 23276-ref 312 . T A 493.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=30.52;MQ0=0;QD=29.05;SB=-0.01;sumGLbyD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.07:527,51,0 23276-ref 362 . C T 271.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.45;MQ0=0;QD=27.17;SB=-0.01;sumGLbyD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.06:305,30,0 23276-ref 369 . G A 273.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.45;MQ0=0;QD=27.36;SB=-0.01;sumGLbyD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.06:307,30,0 23276-ref 396 . A T 65.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=21.93;SB=-0.01;sumGLbyD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:98,9,0 23276-ref 402 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 23276-ref 533 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23276-ref 543 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 23304-ref 139 . A T 516.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=36.91;SB=-0.01;sumGLbyD=39.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:550,42,0 23304-ref 148 . A C 516.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=36.86;SB=-0.01;sumGLbyD=39.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:549,42,0 23304-ref 170 . C T 195.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.57;SB=-0.01;sumGLbyD=38.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:228,18,0 23389-ref 222 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23389-ref 223 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23389-ref 303 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23389-ref 304 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23460-ref 157 . C T 706.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9841;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.17;SB=-0.01;sumGLbyD=38.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:739,57,0 23460-ref 355 . A T 401.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.51;SB=-0.01;sumGLbyD=39.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:435,33,0 23460-ref 538 . T C 517.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.47;SB=-0.01;sumGLbyD=36.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.14:550,42,0 23460-ref 646 . A T 672.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.5106;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.34;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.18:705,54,0 23460-ref 1076 . A G 184.53 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=26.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:54.50:215,0,55 23460-ref 1114 . G T 32.33 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.08;SB=-0.01;sumGLbyD=15.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62.32:62,0,68 23460-ref 1204 . C T 367.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.71;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:400,30,0 23465-ref 62 . A C 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 23465-ref 129 . T C 103.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.84;SB=-0.01;sumGLbyD=34.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:136,12,0 23465-ref 201 . C T 281.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:314,24,0 23465-ref 251 . C A 405.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.88;SB=-0.01;sumGLbyD=39.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:439,33,0 23465-ref 330 . T A 235.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.07;MQ0=0;QD=29.39;SB=-0.01;sumGLbyD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:268,24,0 23465-ref 332 . C G 298.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=29.86;SB=-0.01;sumGLbyD=33.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:332,30,0 23465-ref 336 . C A 300.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=30.09;SB=-0.01;sumGLbyD=33.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:334,30,0 23465-ref 365 . G T 545.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.39;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:579,45,0 23465-ref 431 . A C 871.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.91;SB=-0.01;sumGLbyD=39.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.22:905,69,0 23465-ref 495 . C T 973.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.1680;MQ=36.64;MQ0=0;QD=34.78;SB=-0.01;sumGLbyD=35.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:27:81.24:1007,81,0 23465-ref 569 . A G 854.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=28.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:28:4.24:886,4,0 23465-ref 574 . T C 986.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.09;MQ0=0;QD=36.52;SB=-0.01;sumGLbyD=37.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.24:1019,81,0 23465-ref 582 . T C 1046.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.22;MQ0=0;QD=36.08;SB=-0.01;sumGLbyD=37.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.26:1079,87,0 23465-ref 629 . T A 950.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.54;SB=-0.01;sumGLbyD=37.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.23:983,78,0 23465-ref 746 . A C 1425.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.52;SB=-0.01;sumGLbyD=38.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1459,114,0 23465-ref 917 . A T 385.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:419,33,0 23465-ref 953 . G T 516.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=34.45;SB=-0.01;sumGLbyD=36.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:15:42.13:550,42,0 23465-ref 957 . C A 627.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8661;MQ=36.40;MQ0=0;QD=36.89;SB=-0.01;sumGLbyD=38.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:660,51,0 23465-ref 1100 . T C 636.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.44;SB=-0.01;sumGLbyD=39.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:669,51,0 23487-ref 105 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 23487-ref 113 . T C 205.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 23487-ref 182 . A T 155.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.00;SB=-0.01;sumGLbyD=37.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:188,15,0 23487-ref 333 . C T 226.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=32.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:259,21,0 23487-ref 394 . C T 264.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=33.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:297,24,0 23487-ref 398 . G A 259.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=32.50;SB=-0.01;sumGLbyD=36.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:293,24,0 23487-ref 413 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23487-ref 616 . T C 82.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.52;SB=-0.01;sumGLbyD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:115,12,0 23487-ref 634 . T A 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 23487-ref 644 . T C 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 23487-ref 657 . C T 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 23502-ref 101 . A G 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 23502-ref 282 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23504-ref 182 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23504-ref 199 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23521-ref 234 . C T 388.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.1233;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.37;SB=-0.01;sumGLbyD=15.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,13:27:99:418,0,469 23526-ref 1 . A T 147.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.42;SB=-0.01;sumGLbyD=35.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:180,15,0 23526-ref 79 . T C 1702.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.3871;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.74;SB=-0.01;sumGLbyD=35.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:67.43:1735,67,0 23526-ref 284 . G A 1499.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9806;MQ=36.51;MQ0=0;QD=36.57;SB=-0.01;sumGLbyD=37.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:40:99:1532,120,0 23526-ref 318 . C T 1403.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8332;MQ=36.52;MQ0=0;QD=33.41;SB=-0.01;sumGLbyD=34.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:40:80.34:1436,80,0 23720-ref 149 . T G 22.06 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.87;MQ0=0;QD=1.23;SB=-0.01;sumGLbyD=2.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:52.02:52,0,502 23720-ref 154 . A T 590.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7333;MQ=35.80;MQ0=0;QD=34.76;SB=-0.01;sumGLbyD=36.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.15:624,48,0 23720-ref 178 . C T 543.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.80;MQ0=0;QD=31.96;SB=-0.01;sumGLbyD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.09:576,51,0 23720-ref 365 . G A 507.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=33.84;SB=-0.01;sumGLbyD=36.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.13:541,42,0 23720-ref 367 . A C 586.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=36.66;SB=-0.01;sumGLbyD=38.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:620,48,0 23720-ref 469 . T G 669.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.20;SB=-0.01;sumGLbyD=39.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:703,54,0 23720-ref 510 . A T 535.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.63;MQ0=0;QD=35.70;SB=-0.01;sumGLbyD=37.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:569,45,0 23720-ref 522 . C A 413.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=34.42;SB=-0.01;sumGLbyD=37.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:446,36,0 23720-ref 549 . A G 224.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.11;SB=-0.01;sumGLbyD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.06:258,21,0 23839-ref 97 . C G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 23839-ref 149 . T C 183.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=30.58;SB=-0.01;sumGLbyD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:216,18,0 23839-ref 188 . C A 69.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.25;SB=-0.01;sumGLbyD=34.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:102,9,0 23839-ref 200 . G T 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=10;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 23864-ref 35 . C T 144.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=28.86;SB=-0.01;sumGLbyD=35.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:177,15,0 23864-ref 52 . G A 415.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.60;MQ0=0;QD=31.97;SB=-0.01;sumGLbyD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:12:36.11:449,36,0 23864-ref 90 . C T 929.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=35.82;MQ0=0;QD=35.75;SB=-0.01;sumGLbyD=37.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:25:75.24:962,75,0 23864-ref 162 . A T 524.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.00;SB=-0.01;sumGLbyD=37.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.14:558,42,0 23864-ref 176 . C A 638.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.6999;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.56;SB=-0.01;sumGLbyD=39.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:672,51,0 23864-ref 285 . T C 27.53 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.93;SB=-0.01;sumGLbyD=8.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57.51:58,0,179 23864-ref 288 . A G 21.12 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.02;SB=-0.01;sumGLbyD=7.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51.08:51,0,179 23891-ref 506 . A C 40.14 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.07;SB=-0.01;sumGLbyD=36.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 23891-ref 559 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 23891-ref 673 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23891-ref 1021 . T C 38.36 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.18;SB=-0.01;sumGLbyD=35.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 23891-ref 1078 . C T 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 23891-ref 1510 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23902-ref 56 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 23902-ref 128 . A C 588.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.64;SB=-0.01;sumGLbyD=36.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:17:48.15:622,48,0 23902-ref 137 . G A 428.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.70;SB=-0.01;sumGLbyD=38.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.10:461,36,0 23965-ref 19 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=9;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 23965-ref 23 . T G 42.59 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:74,6,0 23965-ref 214 . A G 310.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=22.16;SB=-0.01;sumGLbyD=24.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:340,0,108 23965-ref 269 . C T 864.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.58;MQ0=0;QD=36.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.22:898,69,0 23965-ref 270 . A G 907.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.58;MQ0=0;QD=37.82;SB=-0.01;sumGLbyD=39.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.23:941,72,0 23965-ref 373 . A G 17.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9997;MQ=30.37;MQ0=0;QD=3.46;SB=-0.01;sumGLbyD=9.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:4:47.21:47,0,68 23965-ref 390 . C T 91.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=15.20;SB=-0.01;sumGLbyD=20.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:61.96:121,0,62 24032-ref 60 . A G 1032.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.88;MQ0=0;QD=33.31;SB=-0.01;sumGLbyD=34.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:31:90.24:1065,90,0 24032-ref 67 . A T 1103.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=34.48;SB=-0.01;sumGLbyD=35.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.26:1136,96,0 24032-ref 75 . T G 1202.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.38;MQ0=0;QD=34.36;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:34:99:1236,102,0 24032-ref 93 . G A 902.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7675;MQ=33.07;MQ0=0;QD=33.43;SB=-0.01;sumGLbyD=34.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:27:78.21:936,78,0 24032-ref 186 . G A 609.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.28;MQ0=0;QD=33.88;SB=-0.01;sumGLbyD=35.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:17:51.16:643,51,0 24032-ref 198 . G A 325.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=29.59;SB=-0.01;sumGLbyD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.08:359,30,0 24032-ref 247 . G T 344.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4679;MQ=34.93;MQ0=0;QD=34.42;SB=-0.01;sumGLbyD=37.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:377,30,0 24032-ref 285 . T A 25.01 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.17;SB=-0.01;sumGLbyD=9.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:54.99:55,0,134 24178-ref 89 . T G 77.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.33;SB=-0.01;sumGLbyD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:19.51:107,0,20 24178-ref 90 . C G 37.98 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.66;SB=-0.01;sumGLbyD=22.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22.52:68,0,23 24178-ref 193 . A G 588.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:622,48,0 24178-ref 261 . G A 490.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:523,42,0 24178-ref 263 . C T 102.39 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8658;MQ=35.53;MQ0=0;QD=7.31;SB=-0.01;sumGLbyD=9.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:132,0,318 24178-ref 295 . G T 316.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=35.19;SB=-0.01;sumGLbyD=38.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:350,27,0 24178-ref 332 . T C 285.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:319,24,0 24178-ref 468 . C T 660.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8332;MQ=36.44;MQ0=0;QD=36.71;SB=-0.01;sumGLbyD=38.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:694,54,0 24178-ref 481 . C G 124.89 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.32;MQ0=0;QD=8.33;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:155,0,335 24178-ref 508 . A C 17 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.55;SB=-0.01;sumGLbyD=4.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:46.90:47,0,317 24178-ref 567 . T G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 24178-ref 581 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 24206-ref 252 . T G 24.11 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=12.05;SB=-0.01;sumGLbyD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:55,6,0 24206-ref 264 . T C 188.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=23.54;SB=-0.01;sumGLbyD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.02:221,24,0 24206-ref 338 . C T 189.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.46;SB=-0.01;sumGLbyD=10.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:219,0,434 24207-ref 125 . C A 888.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.60;MQ0=0;QD=35.54;SB=-0.01;sumGLbyD=36.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.19:922,75,0 24207-ref 126 . G T 857.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.60;MQ0=0;QD=34.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:24:72.21:890,72,0 24207-ref 144 . C G 657.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=32.88;SB=-0.01;sumGLbyD=34.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:20:57.12:691,57,0 24227-ref 114 . A T 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.78;SB=-0.01;sumGLbyD=26.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6.02:79,6,0 24227-ref 119 . A T 30.33 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.11;SB=-0.01;sumGLbyD=20.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:60,0,31 24305-ref 76 . A T 316.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.1991;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.60;SB=-0.01;sumGLbyD=10.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,11:32:99:347,0,693 24305-ref 126 . G A 2054.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.6175;MQ=36.63;MQ0=0;QD=37.36;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:2088,166,0 24305-ref 159 . T A 2566.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.55;MQ0=0;QD=37.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,68:68:99:2600,205,0 24305-ref 222 . T C 4067.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8546;MQ=36.61;MQ0=0;QD=38.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:104:99:4068,313,0 24305-ref 251 . T C 3344.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.0258;MQ=36.42;MQ0=0;QD=38.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,87:87:99:3345,262,0 24333-ref 7 . G C 41.69 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.84;SB=-0.01;sumGLbyD=36.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 24333-ref 109 . T C 1156.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=77;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4659;MQ=36.74;MQ0=0;QD=15.02;SB=-0.01;sumGLbyD=15.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,38:74:99:1187,0,1202 24333-ref 118 . A G 940.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=78;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.1994;MQ=36.74;MQ0=0;QD=12.06;SB=-0.01;sumGLbyD=12.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,33:76:99:971,0,1486 24333-ref 178 . A C 796.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6274;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.44;SB=-0.01;sumGLbyD=12.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,26:64:99:826,0,1251 24333-ref 391 . A G 2396.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.3107;MQ=36.84;MQ0=0;QD=38.05;SB=-0.01;sumGLbyD=38.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2430,190,0 24333-ref 494 . C A 962.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.22;MQ0=0;QD=37.03;SB=-0.01;sumGLbyD=38.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.24:996,78,0 24333-ref 501 . C T 13.10 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.87;MQ0=0;QD=0.73;SB=-0.01;sumGLbyD=2.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:42.88:43,0,526 24333-ref 525 . C T 45.74 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:77,6,0 24368-ref 155 . T C 203.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.92;SB=-0.01;sumGLbyD=39.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:236,18,0 24368-ref 539 . T A 19.75 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9469;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.29;SB=-0.01;sumGLbyD=8.28 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:49.70:50,0,142 24368-ref 689 . G C 120.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.24;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:153,12,0 24368-ref 753 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 24368-ref 754 . G C 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 24368-ref 823 . T G 204.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.04;SB=-0.01;sumGLbyD=39.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:237,18,0 24368-ref 920 . C T 342.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:376,30,0 24368-ref 958 . A C 120.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.14;SB=-0.01;sumGLbyD=38.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:153,12,0 24424-ref 169 . C T 340.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=34.09;SB=-40.00;sumGLbyD=37.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:374,30,0 24424-ref 179 . T A 43.44 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=6.21;SB=3.00;sumGLbyD=10.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:73.44:73,0,139 24424-ref 180 . A G 11.52 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=1.92;SB=3.00;sumGLbyD=6.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:41.19:41,0,141 24424-ref 182 . G T 11.52 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=1.92;SB=3.00;sumGLbyD=6.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:41.19:41,0,142 24424-ref 234 . A C 193.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:227,18,0 24424-ref 255 . A G 193.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:227,18,0 24424-ref 280 . T C 68.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=22.70;SB=-0.01;sumGLbyD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:100,9,0 24532-ref 132 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 24532-ref 172 . C T 243.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.79;SB=-0.01;sumGLbyD=39.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:276,21,0 24532-ref 214 . C T 196.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.41;SB=-0.01;sumGLbyD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:227,0,162 24532-ref 271 . C T 93.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.83;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:124,0,284 24532-ref 326 . T C 590.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.91;SB=-0.01;sumGLbyD=38.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:624,48,0 24532-ref 378 . G T 354.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:387,30,0 24532-ref 410 . C G 393.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:427,33,0 24532-ref 419 . C T 473.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=36.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:507,39,0 24532-ref 466 . C G 524.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.44;SB=-0.01;sumGLbyD=39.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:557,42,0 24532-ref 601 . C A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.6651;MQ=25.00;MQ0=0;QD=9.34;SB=-0.01;sumGLbyD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:2:6.01:59,6,0 24532-ref 602 . A G 49.89 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=16.63;SB=-0.01;sumGLbyD=27.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:82,9,0 24532-ref 613 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 24532-ref 624 . C T 199.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=28.53;SB=-0.01;sumGLbyD=33.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:233,21,0 24532-ref 631 . A G 209.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=29.99;SB=-0.01;sumGLbyD=34.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:243,21,0 24532-ref 724 . T A 853.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.12;SB=-0.01;sumGLbyD=38.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.22:887,69,0 24532-ref 775 . T C 668.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.44;MQ0=0;QD=37.16;SB=-0.01;sumGLbyD=39.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:702,54,0 24532-ref 798 . T C 580.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=36.37;MQ0=0;QD=36.28;SB=-0.01;sumGLbyD=38.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:613,48,0 24532-ref 832 . T C 468.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.07;SB=-0.01;sumGLbyD=38.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:502,39,0 24532-ref 886 . G A 359.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.90;SB=-0.01;sumGLbyD=39.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:392,30,0 24532-ref 1087 . C G 142.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.75;SB=-0.01;sumGLbyD=29.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.04:175,15,0 24532-ref 1096 . A C 184.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=30.83;SB=-0.01;sumGLbyD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:218,18,0 24532-ref 1105 . A G 184.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=30.70;SB=-0.01;sumGLbyD=36.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:217,18,0 24532-ref 1138 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 24654-ref 1 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 24654-ref 79 . C T 427.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.61;SB=-0.01;sumGLbyD=38.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:460,36,0 24654-ref 88 . A G 212.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=30.41;SB=-0.01;sumGLbyD=35.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:246,21,0 24654-ref 132 . G A 148.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.66;MQ0=0;QD=29.68;SB=-0.01;sumGLbyD=36.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:181,15,0 24654-ref 182 . A G 822.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=33.59;MQ0=0;QD=34.25;SB=-0.01;sumGLbyD=35.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.17:855,72,0 24654-ref 226 . T C 384.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=30.62;MQ0=0;QD=10.38;SB=-132.64;sumGLbyD=11.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,16:37:99:414,0,596 24654-ref 231 . A T 544.24 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=30.62;MQ0=0;QD=14.71;SB=-9.65;sumGLbyD=15.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,21:36:99:574,0,413 24654-ref 255 . G A 586.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6553;MQ=31.04;MQ0=0;QD=20.21;SB=-160.31;sumGLbyD=21.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,23:28:99:616,0,153 24663-ref 184 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 24663-ref 213 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 24663-ref 220 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 24663-ref 303 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 24676-ref 116 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 24676-ref 196 . T C 71.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.68;SB=-0.01;sumGLbyD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:103,9,0 24676-ref 198 . A G 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 24676-ref 226 . G A 31.03 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=31.58;MQ0=0;QD=15.51;SB=-0.01;sumGLbyD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 24754-ref 19 . G A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 24754-ref 41 . G A 149.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=29.89;SB=-0.01;sumGLbyD=36.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:182,15,0 24754-ref 43 . G C 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 24754-ref 155 . A C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 24754-ref 177 . G A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 24754-ref 190 . T C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 24812-ref 5 . C A 231.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.03;SB=-0.01;sumGLbyD=37.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:264,21,0 24812-ref 100 . 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T A 4987.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=344;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=6.5146;MQ=32.69;MQ0=0;QD=14.50;SB=-0.01;sumGLbyD=11.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:194,149:341:99:3938,0,6112 24812-ref 323 . C T 7883.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=227;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=14.4877;MQ=32.72;MQ0=0;QD=34.73;SB=-0.01;sumGLbyD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,225:226:99:7804,602,0 24812-ref 332 . G A 3905.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=120;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=29.65;MQ0=0;QD=32.54;SB=-0.01;sumGLbyD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,119:119:99:3904,358,0 24812-ref 350 . C T 974.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=28.65;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1007,102,0 24812-ref 467 . G A 263.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=26.32;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.06:296,30,0 24812-ref 484 . T C 1893.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=34.43;SB=-0.01;sumGLbyD=35.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:55:99:1927,165,0 24812-ref 511 . A T 2577.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=33.23;MQ0=0;QD=35.31;SB=-0.01;sumGLbyD=35.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:2611,220,0 24812-ref 522 . T A 2428.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8150;MQ=33.23;MQ0=0;QD=33.26;SB=-0.01;sumGLbyD=33.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,72:71:99:2461,211,0 24812-ref 559 . C T 624.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=34.70;SB=-0.01;sumGLbyD=36.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.16:658,54,0 24812-ref 578 . G A 232.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.07;MQ0=0;QD=29.12;SB=-77.71;sumGLbyD=33.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:266,24,0 24812-ref 596 . G A 408.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.12;MQ0=0;QD=31.44;SB=-143.98;sumGLbyD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.10:442,39,0 24812-ref 599 . A G 49.40 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.12;MQ0=0;QD=3.80;SB=12.03;sumGLbyD=6.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:79.39:79,0,290 24812-ref 613 . A G 414.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.12;MQ0=0;QD=31.88;SB=-149.63;sumGLbyD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.10:447,39,0 24812-ref 657 . C T 62.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=20.82;SB=-28.84;sumGLbyD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:94,9,0 24812-ref 659 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-28.38;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 24814-ref 116 . T A 374.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=34.04;SB=-0.01;sumGLbyD=37.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:407,33,0 24814-ref 135 . A G 20.28 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=1.9858;MQ=31.58;MQ0=0;QD=5.07;SB=-0.01;sumGLbyD=12.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:3:27.11:50,0,27 24814-ref 136 . C G 20.28 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9858;MQ=31.58;MQ0=0;QD=5.07;SB=-0.01;sumGLbyD=12.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:3:25.33:50,0,25 24814-ref 235 . G A 774.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6198;MQ=36.54;MQ0=0;QD=35.23;SB=-0.01;sumGLbyD=36.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:21:63.20:808,63,0 24814-ref 390 . T C 434.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.25;SB=-0.01;sumGLbyD=39.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:468,36,0 24814-ref 484 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 24816-ref 79 . C T 182.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.49;SB=-0.01;sumGLbyD=35.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:216,18,0 24816-ref 101 . A G 49.15 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.10;SB=3.00;sumGLbyD=6.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:79.15:79,0,320 24816-ref 113 . A C 287.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.88;SB=-39.98;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:320,24,0 24816-ref 131 . C A 357.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.73;SB=-40.00;sumGLbyD=39.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:390,30,0 24816-ref 139 . A G 295.52 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.87;SB=-37.00;sumGLbyD=29.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:46.90:326,0,47 24816-ref 197 . G A 79.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.87;SB=-0.01;sumGLbyD=28.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:112,9,0 24816-ref 623 . G A 356.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.15;MQ0=0;QD=25.45;SB=-0.01;sumGLbyD=27.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.04:389,42,0 24816-ref 727 . T C 514.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.83;MQ0=0;QD=20.59;SB=-0.01;sumGLbyD=21.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:24:14.79:545,0,15 24816-ref 746 . C T 443.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9978;MQ=25.61;MQ0=0;QD=24.64;SB=-28.63;sumGLbyD=26.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:26.42:476,26,0 24816-ref 750 . T G 453.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8645;MQ=25.67;MQ0=0;QD=23.86;SB=-59.19;sumGLbyD=25.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:18:26.44:486,26,0 24816-ref 753 . G C 520.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=26.96;MQ0=0;QD=24.80;SB=-128.81;sumGLbyD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,19:20:32.45:554,32,0 24816-ref 768 . C T 285.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=28.55;SB=-99.14;sumGLbyD=31.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.07:319,27,0 24816-ref 806 . T C 294.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=32.77;SB=-109.52;sumGLbyD=36.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:328,27,0 24816-ref 839 . G A 136.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=27.23;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:169,15,0 24816-ref 868 . T C 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 24816-ref 878 . T A 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 24881-ref 41 . C A 241.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8658;MQ=36.64;MQ0=0;QD=4.32;SB=-0.01;sumGLbyD=4.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:52:99:272,0,1418 24881-ref 49 . T A 457.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=71;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.3338;MQ=36.72;MQ0=0;QD=6.44;SB=-0.01;sumGLbyD=6.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,19:71:99:487,0,1810 24881-ref 79 . T A 946.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=111;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.6516;MQ=35.52;MQ0=0;QD=8.52;SB=-0.01;sumGLbyD=8.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:73,37:110:99:976,0,2474 24881-ref 128 . G T 1099.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=107;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.1274;MQ=35.07;MQ0=0;QD=10.28;SB=-0.01;sumGLbyD=10.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,42:107:99:1130,0,2192 24881-ref 135 . A G 890.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=106;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.6915;MQ=35.05;MQ0=0;QD=8.40;SB=-0.01;sumGLbyD=8.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,36:103:99:921,0,2307 24881-ref 140 . G A 915.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=100;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.8248;MQ=35.04;MQ0=0;QD=9.15;SB=-0.01;sumGLbyD=9.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,36:99:99:945,0,2190 24897-ref 39 . C T 1528.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.75;MQ0=0;QD=37.27;SB=-0.01;sumGLbyD=38.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:40:99:1561,120,0 24897-ref 53 . G C 2052.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.81;MQ0=0;QD=38.73;SB=-0.01;sumGLbyD=39.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2086,160,0 24897-ref 256 . G C 1958.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.8423;MQ=36.62;MQ0=0;QD=36.95;SB=-0.01;sumGLbyD=37.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:52:99:1991,156,0 24897-ref 313 . G A 981.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.65;MQ0=0;QD=33.84;SB=-0.01;sumGLbyD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:28:84.22:1014,84,0 24897-ref 343 . C A 251.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=34.69;MQ0=0;QD=27.90;SB=-0.01;sumGLbyD=31.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:8:24.07:284,24,0 24897-ref 353 . G T 120.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:153,12,0 24943-ref 146 . T C 276.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.59;SB=-0.01;sumGLbyD=38.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:310,24,0 24943-ref 174 . C T 341.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=34.11;SB=-0.01;sumGLbyD=37.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:374,30,0 24943-ref 221 . G T 24.24 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.35;SB=-0.01;sumGLbyD=3.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:54.22:54,0,538 24943-ref 369 . T C 342.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=31.09;SB=-0.01;sumGLbyD=34.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.09:375,30,0 24943-ref 372 . T C 364.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=33.12;SB=-0.01;sumGLbyD=36.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:397,33,0 24961-ref 103 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 24961-ref 130 . A T 83.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 25032-ref 97 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 25033-ref 182 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 25033-ref 216 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25033-ref 394 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25049-ref 51 . G C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 25049-ref 62 . A T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 25049-ref 121 . C G 447.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.26;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:480,36,0 25049-ref 138 . C T 567.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.44;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:600,45,0 25049-ref 224 . T C 466.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=33.32;SB=-0.01;sumGLbyD=35.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.12:499,39,0 25049-ref 239 . G A 309.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:342,27,0 25049-ref 260 . T G 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 25065-ref 128 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25125-ref 4 . G A 124.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.18;SB=-0.01;sumGLbyD=39.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:157,12,0 25125-ref 12 . G T 239.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.27;SB=-0.01;sumGLbyD=38.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:273,21,0 25125-ref 70 . T C 1173.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=1.8055;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.67;SB=-0.01;sumGLbyD=37.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:31:93.30:1206,93,0 25125-ref 140 . G A 1758.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9579;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.23;SB=-0.01;sumGLbyD=38.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1792,138,0 25125-ref 247 . G A 1166.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.62;SB=-0.01;sumGLbyD=38.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.29:1199,93,0 25125-ref 393 . G C 1493.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:39:99:1526,117,0 25125-ref 481 . A G 1985.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=36.62;MQ0=0;QD=37.46;SB=-0.01;sumGLbyD=38.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:52:99:2018,156,0 25125-ref 507 . T A 1870.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.59;MQ0=0;QD=38.17;SB=-0.01;sumGLbyD=38.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1903,147,0 25125-ref 569 . C T 484.16 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.25;MQ0=0;QD=17.93;SB=-0.01;sumGLbyD=19.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,17:25:99:514,0,269 25125-ref 592 . A G 886.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.35;MQ0=0;QD=35.46;SB=-0.01;sumGLbyD=36.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.22:920,75,0 25125-ref 603 . A C 579.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.55;MQ0=0;QD=34.08;SB=-0.01;sumGLbyD=36.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.14:612,51,0 25125-ref 631 . G T 970.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9832;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.66;SB=-0.01;sumGLbyD=35.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.23:1004,84,0 25125-ref 670 . C T 669.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.16;MQ0=0;QD=33.47;SB=-0.01;sumGLbyD=35.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.16:702,60,0 25125-ref 688 . A G 332.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.21;MQ0=0;QD=27.74;SB=-0.01;sumGLbyD=30.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.07:366,36,0 25125-ref 696 . A G 372.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.19;MQ0=0;QD=28.63;SB=-0.01;sumGLbyD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.08:405,39,0 25125-ref 710 . C A 442.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=31.61;SB=-0.01;sumGLbyD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.10:476,42,0 25125-ref 743 . T A 401.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=33.50;SB=-0.01;sumGLbyD=36.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.10:435,36,0 25408-ref 22 . G A 238.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.09;SB=-0.01;sumGLbyD=38.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:272,21,0 25408-ref 41 . A G 437.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.64;SB=-0.01;sumGLbyD=36.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:12:36.12:470,36,0 25408-ref 89 . T A 12.72 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.22;MQ0=0;QD=0.98;SB=-0.01;sumGLbyD=3.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,2:12:42.47:42,0,340 25408-ref 92 . A G 302.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.15;MQ0=0;QD=25.23;SB=-0.01;sumGLbyD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:42.48:333,0,42 25446-ref 95 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25446-ref 139 . T C 192.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.00;SB=-0.01;sumGLbyD=37.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:225,18,0 25446-ref 175 . G A 185.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.45;SB=-0.01;sumGLbyD=30.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18.25:215,0,18 25446-ref 185 . C T 245.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:279,21,0 25446-ref 210 . C T 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:71,0,31 25446-ref 334 . G A 95.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.5774;MQ=35.72;MQ0=0;QD=11.95;SB=-0.01;sumGLbyD=15.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:126,0,124 25446-ref 352 . C T 89.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=8.96;SB=-0.01;sumGLbyD=11.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:120,0,195 25446-ref 357 . C T 137.04 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9993;MQ=36.07;MQ0=0;QD=12.46;SB=-0.01;sumGLbyD=15.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:10:99:167,0,158 25446-ref 412 . C T 707.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9664;MQ=35.35;MQ0=0;QD=28.30;SB=-0.01;sumGLbyD=29.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,22:24:20.46:737,0,20 25446-ref 442 . G A 612.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9997;MQ=34.39;MQ0=0;QD=30.62;SB=-0.01;sumGLbyD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:19:27.54:645,28,0 25446-ref 451 . T C 89.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9996;MQ=33.48;MQ0=0;QD=5.93;SB=-0.01;sumGLbyD=7.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:119,0,332 25446-ref 459 . A C 55.40 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9998;MQ=33.48;MQ0=0;QD=4.62;SB=-0.01;sumGLbyD=7.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:11:85.40:85,0,247 25446-ref 531 . T G 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 25446-ref 535 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25446-ref 544 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25623-ref 596 . C T 146.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:179,15,0 25623-ref 599 . T C 146.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:179,15,0 25623-ref 636 . T C 75.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.13;SB=-0.01;sumGLbyD=35.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:107,9,0 25623-ref 648 . C T 154.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.94;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:187,15,0 25623-ref 696 . T G 365.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.56;SB=-0.01;sumGLbyD=39.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:399,30,0 25623-ref 728 . C T 364.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.42;SB=-0.01;sumGLbyD=39.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:397,30,0 25623-ref 765 . G A 312.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.70;SB=-0.01;sumGLbyD=38.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:345,27,0 25623-ref 767 . C T 259.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=32.49;SB=-0.01;sumGLbyD=36.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:293,24,0 25623-ref 866 . G T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 25623-ref 870 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 25623-ref 1089 . C A 200.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.64;SB=-0.01;sumGLbyD=33.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:233,18,0 25623-ref 1122 . G T 162.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.57;SB=-0.01;sumGLbyD=39.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 25623-ref 1164 . C A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 25626-ref 424 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25654-ref 22 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25654-ref 53 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25654-ref 54 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25733-ref 36 . T A 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 25733-ref 67 . A C 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 25733-ref 79 . C T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 25733-ref 255 . A C 85.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.36;SB=-0.01;sumGLbyD=39.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:117,9,0 25789-ref 6 . C T 151.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=25.24;SB=-0.01;sumGLbyD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:184,18,0 25789-ref 7 . G T 40.84 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.81;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:70.83:71,0,77 25789-ref 37 . A G 1938.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.61;MQ0=0;QD=34.61;SB=-0.01;sumGLbyD=35.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:1971,168,0 25789-ref 72 . C T 6070.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=181;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.5301;MQ=30.55;MQ0=0;QD=33.54;SB=-0.01;sumGLbyD=33.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,180:180:99:6069,541,0 25789-ref 88 . G C 5657.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=180;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.4796;MQ=28.98;MQ0=0;QD=31.43;SB=-0.01;sumGLbyD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,178:176:99:5616,489,0 25789-ref 99 . C T 7145.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=231;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5310;MQ=27.63;MQ0=0;QD=30.93;SB=-0.01;sumGLbyD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,231:227:99:7143,682,0 25789-ref 124 . G T 7941.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=256;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.3626;MQ=28.93;MQ0=0;QD=31.02;SB=-0.01;sumGLbyD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,252:248:99:7912,719,0 25789-ref 147 . T C 13183.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=369;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7552;MQ=33.60;MQ0=0;QD=35.73;SB=-0.01;sumGLbyD=35.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,369:365:99:13182,1098,0 25789-ref 154 . G T 13724.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=373;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4892;MQ=34.40;MQ0=0;QD=36.79;SB=-0.01;sumGLbyD=36.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,373:372:99:13723,1119,0 25789-ref 265 . C T 12394.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=329;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=22.6146;MQ=36.23;MQ0=0;QD=37.67;SB=-0.01;sumGLbyD=37.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,327:327:99:12356,946,0 25789-ref 301 . T C 10815.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=294;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.6085;MQ=36.10;MQ0=0;QD=36.79;SB=-0.01;sumGLbyD=36.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,293:285:99:10815,858,0 25789-ref 326 . T G 6066.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8331;MQ=35.63;MQ0=0;QD=36.99;SB=-0.01;sumGLbyD=36.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,164:161:99:6066,484,0 25859-ref 67 . G A 312.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.76;SB=-0.01;sumGLbyD=38.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:346,27,0 25859-ref 70 . G C 198.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.98;MQ0=0;QD=19.82;SB=-0.01;sumGLbyD=22.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:85.18:228,0,85 25859-ref 112 . C A 51.30 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=35.72;MQ0=0;QD=6.41;SB=-0.01;sumGLbyD=10.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:81.30:81,0,160 25859-ref 130 . A G 195.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.56;SB=-0.01;sumGLbyD=38.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:228,18,0 25859-ref 169 . T C 205.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=34.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.06:238,18,0 25859-ref 182 . T G 201.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.55;SB=-0.01;sumGLbyD=39.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:234,18,0 25859-ref 300 . G A 324.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.49;SB=-0.01;sumGLbyD=35.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.09:358,27,0 25859-ref 335 . T A 87.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9787;MQ=36.07;MQ0=0;QD=7.95;SB=-0.01;sumGLbyD=10.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:10:99:117,0,209 25859-ref 351 . A G 236.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.82;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:270,21,0 25859-ref 359 . C A 196.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.53;MQ0=0;QD=28.11;SB=-0.01;sumGLbyD=32.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:6:18.05:230,18,0 25859-ref 432 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 25859-ref 454 . T G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 25859-ref 492 . C T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 25859-ref 513 . G T 74.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=24.86;SB=-0.01;sumGLbyD=35.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:107,9,0 25859-ref 534 . A G 30.62 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=33.48;MQ0=0;QD=10.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.29:61,0,30 25859-ref 571 . T C 35.36 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=17.68;SB=-0.01;sumGLbyD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:67,6,0 25859-ref 572 . C A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 25859-ref 594 . A G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 25859-ref 649 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 25859-ref 709 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25859-ref 711 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25859-ref 723 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25881-ref 47 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25881-ref 90 . C T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 25881-ref 104 . A G 96.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:129,12,0 25881-ref 125 . A C 391.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=32.59;SB=-0.01;sumGLbyD=35.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.10:424,36,0 25881-ref 140 . A T 604.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.18;MQ0=0;QD=35.58;SB=-0.01;sumGLbyD=37.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.15:638,51,0 25881-ref 165 . G A 662.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.93;MQ0=0;QD=34.84;SB=-0.01;sumGLbyD=36.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:18:54.17:695,54,0 25881-ref 206 . C T 219.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.43;SB=-0.01;sumGLbyD=31.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:12.05:249,0,12 25881-ref 269 . T C 740.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.28;SB=-0.01;sumGLbyD=36.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:20:60.19:774,60,0 25881-ref 370 . G A 829.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.08;SB=-0.01;sumGLbyD=37.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:22:66.21:863,66,0 25881-ref 413 . C T 365.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.39;SB=-0.01;sumGLbyD=18.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,12:21:99:395,0,293 25881-ref 497 . G C 283.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.42;SB=-0.01;sumGLbyD=39.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:316,24,0 25881-ref 524 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 25911-ref 36 . A T 36.16 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=3.29;SB=-0.01;sumGLbyD=6.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:66.16:66,0,269 25911-ref 47 . A G 30.15 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.5773;MQ=34.60;MQ0=0;QD=2.32;SB=-0.01;sumGLbyD=4.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:60.14:60,0,341 25911-ref 77 . G A 459.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=34.78;MQ0=0;QD=32.83;SB=-0.01;sumGLbyD=35.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:493,42,0 25911-ref 130 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 25911-ref 137 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 25911-ref 142 . C T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 25911-ref 153 . T A 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=14.21;SB=-0.01;sumGLbyD=22.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9.02:89,9,0 25911-ref 192 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=9.34;SB=-0.01;sumGLbyD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6.01:59,6,0 25911-ref 229 . T C 214.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=26.80;SB=-29.60;sumGLbyD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:247,24,0 25911-ref 232 . C T 10.75 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.11;MQ0=0;QD=1.19;SB=3.00;sumGLbyD=4.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:40.36:40,0,191 25911-ref 235 . G A 157.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=29.12;MQ0=0;QD=15.77;SB=-26.62;sumGLbyD=18.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:76.54:188,0,77 25911-ref 254 . T C 87.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9988;MQ=32.73;MQ0=0;QD=5.86;SB=-34.00;sumGLbyD=7.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:14:99:118,0,304 25911-ref 269 . G A 379.65 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=23.73;SB=-63.62;sumGLbyD=25.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:65.32:410,0,65 25911-ref 284 . C T 70.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.9999;MQ=33.26;MQ0=0;QD=4.12;SB=-23.61;sumGLbyD=5.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:16:99:100,0,361 25911-ref 296 . T C 297.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.65;MQ0=0;QD=13.54;SB=3.00;sumGLbyD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:99:328,0,325 25911-ref 302 . A C 347.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9987;MQ=34.39;MQ0=0;QD=17.38;SB=3.00;sumGLbyD=18.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:99:378,0,249 25911-ref 339 . G T 384.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=32.06;SB=-0.01;sumGLbyD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.09:418,36,0 25911-ref 362 . G C 118.76 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=14.85;SB=-0.01;sumGLbyD=18.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:53.76:149,0,54 25911-ref 373 . G A 46.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=11.71;SB=-0.01;sumGLbyD=19.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.98:77,0,28 25911-ref 380 . T C 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:50,0,31 25911-ref 419 . T A 28.02 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9997;MQ=34.93;MQ0=0;QD=5.60;SB=-0.01;sumGLbyD=11.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58.01:58,0,95 25911-ref 458 . G A 183.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=30.58;SB=-0.01;sumGLbyD=36.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:216,18,0 25911-ref 468 . T A 153.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=21.92;SB=-0.01;sumGLbyD=26.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:16.74:183,0,17 25911-ref 497 . A G 107.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=15.35;SB=-0.01;sumGLbyD=19.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:58.96:137,0,59 25911-ref 500 . A T 61.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=7.69;SB=-0.01;sumGLbyD=11.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91.50:92,0,134 25911-ref 515 . G A 104.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=13.06;SB=-0.01;sumGLbyD=16.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:95.96:134,0,96 25911-ref 539 . T C 101.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.22;MQ0=0;QD=11.27;SB=-0.01;sumGLbyD=14.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:131,0,131 25911-ref 553 . T A 82.55 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=11.79;SB=-39.44;sumGLbyD=16.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:90.51:113,0,91 25911-ref 563 . A G 133.37 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=16.67;SB=-71.79;sumGLbyD=20.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:95.25:163,0,95 25911-ref 565 . G T 132.55 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=16.57;SB=-70.97;sumGLbyD=20.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:95.94:163,0,96 25911-ref 697 . A G 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 25911-ref 758 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25911-ref 780 . C A 33.49 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.16;SB=-0.01;sumGLbyD=21.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.29:63,0,30 25911-ref 802 . G A 126.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=25.22;SB=-0.01;sumGLbyD=31.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:12.04:159,12,0 25911-ref 829 . A G 22.10 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=35.72;MQ0=0;QD=2.76;SB=-0.01;sumGLbyD=6.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52.07:52,0,193 25911-ref 847 . T C 188.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=26.90;SB=-0.01;sumGLbyD=31.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.05:221,18,0 25911-ref 854 . G A 58.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=8.37;SB=-0.01;sumGLbyD=12.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:88.57:89,0,136 25911-ref 870 . T C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 25911-ref 895 . A G 60.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.75;SB=-0.01;sumGLbyD=10.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:90.72:91,0,210 25911-ref 899 . G A 68.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.85;SB=-0.01;sumGLbyD=14.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:98.95:99,0,138 25911-ref 992 . T A 151.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.25;SB=-0.01;sumGLbyD=36.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:184,15,0 25941-ref 7 . G A 47.75 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9940;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.41;SB=-0.01;sumGLbyD=5.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:14:77.74:78,0,275 25941-ref 9 . A G 67.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.9924;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.35;SB=-0.01;sumGLbyD=4.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:20:97.02:97,0,478 25941-ref 95 . A G 3496.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9892;MQ=36.46;MQ0=0;QD=37.59;SB=-0.01;sumGLbyD=37.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,92:90:99:3496,271,0 25941-ref 98 . C G 3805.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=98;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.4583;MQ=36.48;MQ0=0;QD=38.83;SB=-0.01;sumGLbyD=38.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:98:99:3765,292,0 25941-ref 206 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 25967-ref 78 . T C 454.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.46;SB=-0.01;sumGLbyD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.12:487,39,0 25967-ref 128 . G A 627.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.89;SB=-0.01;sumGLbyD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:660,51,0 25967-ref 233 . G A 685.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.09;SB=-0.01;sumGLbyD=37.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:18:54.18:719,54,0 25967-ref 422 . G A 934.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.39;SB=-0.01;sumGLbyD=38.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.24:968,75,0 25967-ref 433 . T C 914.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.09;SB=-0.01;sumGLbyD=39.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.23:947,72,0 25967-ref 580 . A G 947.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.60;MQ0=0;QD=37.92;SB=-0.01;sumGLbyD=39.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.24:981,75,0 25967-ref 599 . A G 922.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.60;MQ0=0;QD=36.92;SB=-0.01;sumGLbyD=38.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.23:956,75,0 25967-ref 708 . T C 25.41 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9962;MQ=31.58;MQ0=0;QD=6.35;SB=-0.01;sumGLbyD=13.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:55.39:55,0,56 25967-ref 803 . G A 466.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=35.89;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:500,39,0 25967-ref 835 . C T 424.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=35.34;SB=-0.01;sumGLbyD=38.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:457,36,0 25967-ref 845 . G A 312.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.26;SB=-0.01;sumGLbyD=34.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:346,30,0 25967-ref 889 . G A 120.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.16;SB=-0.01;sumGLbyD=38.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:153,12,0 25967-ref 929 . T C 44.89 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 25967-ref 946 . C T 43.12 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.56;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:74,6,0 25979-ref 50 . T C 505.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=36.12;SB=-0.01;sumGLbyD=38.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:539,42,0 25979-ref 58 . A T 503.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.96;SB=-0.01;sumGLbyD=38.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:536,42,0 25979-ref 92 . G C 639.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9973;MQ=35.93;MQ0=0;QD=33.67;SB=-0.01;sumGLbyD=35.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:18:54.16:673,54,0 25979-ref 363 . C G 564.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.62;SB=-0.01;sumGLbyD=39.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:597,45,0 25979-ref 715 . G A 124.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.13;SB=-0.01;sumGLbyD=39.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:157,12,0 25994-ref 223 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 25994-ref 252 . A C 139.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.29;SB=-0.01;sumGLbyD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:15.38:170,0,15 25994-ref 264 . T C 189 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.00;SB=-0.01;sumGLbyD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18.94:219,0,19 25994-ref 306 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 26037-ref 37 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 26037-ref 122 . G A 464.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.42;MQ0=0;QD=35.76;SB=-0.01;sumGLbyD=38.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:498,39,0 26037-ref 140 . A T 420.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=35.01;SB=-0.01;sumGLbyD=37.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:453,36,0 26037-ref 154 . T C 373.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=33.91;SB=-0.01;sumGLbyD=36.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:406,33,0 26037-ref 187 . A G 455.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.60;MQ0=0;QD=35.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:489,39,0 26037-ref 208 . G A 312.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.77;SB=-0.01;sumGLbyD=38.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:346,27,0 26037-ref 323 . T G 431.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.17;SB=-0.01;sumGLbyD=35.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:464,36,0 26037-ref 406 . G T 364.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.49;SB=-0.01;sumGLbyD=39.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:398,30,0 26037-ref 541 . G A 344.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=6;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=37.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:377,30,0 26037-ref 568 . A G 275.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.62;SB=-0.01;sumGLbyD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:8:24.08:309,24,0 26037-ref 580 . C T 324.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.42;SB=-0.01;sumGLbyD=35.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.09:357,27,0 26076-ref 62 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 26076-ref 84 . G A 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 26076-ref 92 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 26076-ref 101 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 26076-ref 144 . T C 83.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 26076-ref 150 . A G 69.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.51;SB=-0.01;sumGLbyD=16.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:93.51:99,0,94 26076-ref 162 . C T 187.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.85;SB=-0.01;sumGLbyD=31.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:2.63:217,0,3 26076-ref 229 . G A 501.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=33.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:10.35:534,10,0 26076-ref 382 . G A 817.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=36.76;MQ0=0;QD=19.46;SB=-0.01;sumGLbyD=20.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,26:41:99:847,0,506 26076-ref 394 . G A 608.62 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.1686;MQ=36.77;MQ0=0;QD=14.15;SB=-0.01;sumGLbyD=14.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,23:40:99:639,0,614 26082-ref 55 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 26082-ref 60 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 26082-ref 134 . T C 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 26082-ref 153 . C A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 26082-ref 193 . G C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 26082-ref 212 . C T 66.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.18;SB=-0.01;sumGLbyD=33.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 26082-ref 225 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 26082-ref 234 . A G 147.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.94;MQ0=0;QD=21.11;SB=-0.01;sumGLbyD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:8.57:177,0,9 26082-ref 244 . A G 195.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.94;MQ0=0;QD=27.88;SB=-0.01;sumGLbyD=32.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:228,21,0 26082-ref 274 . T C 43.84 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=8.77;SB=-0.01;sumGLbyD=14.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.98:74,0,65 26082-ref 298 . G C 136.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=27.23;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:169,15,0 26185-ref 157 . T C 356.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.61;SB=-0.01;sumGLbyD=38.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:389,30,0 26207-ref 243 . T A 197.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.86;MQ0=0;QD=24.71;SB=-0.01;sumGLbyD=28.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.02:231,24,0 26207-ref 396 . G A 164.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.88;SB=-78.62;sumGLbyD=39.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:197,15,0 26207-ref 487 . G A 50.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=23.00;MQ0=0;QD=12.74;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:3:9.01:83,9,0 26412-ref 65 . C A 743.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=37.17;SB=-0.01;sumGLbyD=38.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:776,60,0 26412-ref 77 . T C 846.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.12;MQ0=0;QD=36.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.22:880,69,0 26412-ref 194 . T G 1003.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.17;SB=-0.01;sumGLbyD=38.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.25:1036,81,0 26412-ref 489 . G T 294.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.75;SB=-0.01;sumGLbyD=36.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:328,27,0 26412-ref 677 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,2:1:1.76:40,3,0 26481-ref 38 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.00;SB=-0.01;sumGLbyD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.03:120,9,0 26481-ref 146 . A T 160.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:193,15,0 26511-ref 69 . G T 351.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.7340;MQ=36.07;MQ0=0;QD=31.91;SB=-0.01;sumGLbyD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.09:384,30,0 26511-ref 105 . C T 405.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=28.97;SB=-0.01;sumGLbyD=31.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:12:36.08:439,36,0 26511-ref 133 . G A 452.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.60;MQ0=0;QD=34.79;SB=-0.01;sumGLbyD=37.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.11:485,39,0 26511-ref 190 . T G 576.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=36.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:610,48,0 26511-ref 197 . T C 571.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=35.72;SB=-0.01;sumGLbyD=37.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:604,48,0 26511-ref 292 . G A 282.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.40;SB=-0.01;sumGLbyD=35.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:8:24.08:316,24,0 26511-ref 478 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 26511-ref 490 . A T 161.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:194,15,0 26511-ref 527 . C A 363.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.02;SB=-0.01;sumGLbyD=36.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,10:10:30.10:396,30,0 26511-ref 619 . G A 284.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.52;SB=-0.01;sumGLbyD=39.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:317,24,0 26541-ref 85 . C A 154.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.94;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:187,15,0 26541-ref 86 . C G 180.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=30.01;SB=-0.01;sumGLbyD=35.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:213,18,0 26541-ref 98 . G A 520.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=32.52;SB=-0.01;sumGLbyD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.12:553,48,0 26541-ref 153 . A G 528.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.79;MQ0=0;QD=31.07;SB=-0.01;sumGLbyD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.11:561,51,0 26541-ref 157 . C A 527.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.79;MQ0=0;QD=31.01;SB=-0.01;sumGLbyD=32.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.12:560,51,0 26541-ref 168 . G T 313.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.57;MQ0=0;QD=28.51;SB=-0.01;sumGLbyD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.07:347,33,0 26541-ref 175 . A G 184.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=26.40;SB=-0.01;sumGLbyD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:218,21,0 26541-ref 194 . T C 381.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=34.72;SB=-0.01;sumGLbyD=37.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:415,33,0 26541-ref 231 . G A 1506.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.4100;MQ=36.29;MQ0=0;QD=35.03;SB=-0.01;sumGLbyD=35.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,42:43:91.59:1539,92,0 26541-ref 369 . A T 1814.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1847,147,0 26783-ref 82 . T C 41.10 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.70;SB=-0.01;sumGLbyD=23.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:13.67:71,0,14 26783-ref 223 . A T 195.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.60;SB=-0.01;sumGLbyD=38.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:228,18,0 26783-ref 324 . C G 122.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.57;SB=-0.01;sumGLbyD=38.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:155,12,0 26825-ref 50 . G A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 26825-ref 78 . C T 62.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=20.82;SB=-0.01;sumGLbyD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:94,9,0 26825-ref 82 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 26825-ref 86 . G T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 26825-ref 105 . C T 62.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=20.95;SB=-0.01;sumGLbyD=31.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:95,9,0 26825-ref 183 . G A 461.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=28.83;SB=-0.01;sumGLbyD=30.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:15:6.56:493,7,0 26825-ref 230 . A C 490.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9974;MQ=34.78;MQ0=0;QD=35.06;SB=-0.01;sumGLbyD=37.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.12:524,42,0 26825-ref 249 . A G 581.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=36.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:615,48,0 26825-ref 360 . G A 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 26838-ref 110 . C T 2292.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=172;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=9.3885;MQ=36.77;MQ0=0;QD=13.33;SB=-0.01;sumGLbyD=13.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:98,74:170:99:2323,0,3266 26838-ref 285 . G A 3514.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.5791;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.62;SB=-0.01;sumGLbyD=38.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:3514,274,0 26838-ref 411 . C T 997.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=36.81;MQ0=0;QD=18.81;SB=-0.01;sumGLbyD=19.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,31:51:99:1027,0,656 26838-ref 431 . C T 855.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=9.1055;MQ=36.46;MQ0=0;QD=15.28;SB=-0.01;sumGLbyD=15.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,29:52:99:886,0,807 26838-ref 500 . A C 1340.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=87;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=8.4926;MQ=36.65;MQ0=0;QD=15.40;SB=-0.01;sumGLbyD=15.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,44:83:99:1370,0,1307 26838-ref 568 . C A 3013.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4597;MQ=36.87;MQ0=0;QD=37.67;SB=-0.01;sumGLbyD=38.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:80:99:3047,241,0 26838-ref 666 . C T 1685.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.0347;MQ=36.37;MQ0=0;QD=35.12;SB=-0.01;sumGLbyD=35.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:46:99:1719,138,0 26838-ref 716 . T C 685.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.7158;MQ=36.76;MQ0=0;QD=16.31;SB=-0.01;sumGLbyD=17.02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,22:42:99:715,0,631 26838-ref 863 . G C 443.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.44;MQ0=0;QD=12.31;SB=-0.01;sumGLbyD=13.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,15:36:99:473,0,702 26838-ref 873 . T G 1081.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.30;MQ0=0;QD=37.28;SB=-0.01;sumGLbyD=38.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.25:1114,87,0 26838-ref 927 . T C 904.11 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8656;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.18;SB=-0.01;sumGLbyD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,26:29:32.74:934,0,33 26849-ref 80 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 26849-ref 149 . T G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 26849-ref 180 . T C 245.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:279,21,0 26849-ref 213 . G C 244.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.87;SB=-0.01;sumGLbyD=39.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:277,21,0 26849-ref 236 . A G 283.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.49;SB=-0.01;sumGLbyD=35.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:316,24,0 26849-ref 410 . G A 65.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.33;SB=-0.01;sumGLbyD=10.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:95.96:96,0,159 26849-ref 454 . C T 85.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.59;SB=-0.01;sumGLbyD=39.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:118,9,0 26849-ref 472 . C G 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 26949-ref 110 . A G 1211.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8332;MQ=36.39;MQ0=0;QD=36.71;SB=-0.01;sumGLbyD=37.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1244,99,0 26949-ref 130 . C T 1504.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.51;MQ0=0;QD=36.69;SB=-0.01;sumGLbyD=37.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:40:99:1537,120,0 26949-ref 243 . A C 367.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.73;SB=-0.01;sumGLbyD=18.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,12:21:99:398,0,289 26949-ref 353 . A G 1005.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.67;SB=-0.01;sumGLbyD=35.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:28:84.25:1038,84,0 26949-ref 432 . C T 687.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.17;SB=-0.01;sumGLbyD=37.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:720,57,0 26949-ref 454 . A G 272.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.17;SB=-0.01;sumGLbyD=16.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:303,0,295 26949-ref 543 . A T 315.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.09;SB=-0.01;sumGLbyD=38.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:349,27,0 26949-ref 648 . G A 205.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=29.37;SB=-0.01;sumGLbyD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:239,21,0 26949-ref 653 . T G 205.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=29.37;SB=-0.01;sumGLbyD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:239,21,0 26949-ref 657 . C G 204.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=29.16;SB=-0.01;sumGLbyD=33.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:237,21,0 26993-ref 101 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 27059-ref 159 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 27059-ref 167 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 27176-ref 46 . T C 74.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=24.88;SB=-0.01;sumGLbyD=35.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:107,9,0 27176-ref 61 . A T 41.01 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=13.67;SB=-0.01;sumGLbyD=23.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20.60:71,0,21 27176-ref 94 . C G 432.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6553;MQ=32.91;MQ0=0;QD=33.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.11:466,39,0 27176-ref 126 . G A 509.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.60;MQ0=0;QD=29.94;SB=-0.01;sumGLbyD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:21.51:542,22,0 27176-ref 141 . A G 564.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.92;MQ0=0;QD=33.18;SB=-0.01;sumGLbyD=35.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.13:597,51,0 27176-ref 173 . G C 69.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=6.96;SB=-0.01;sumGLbyD=9.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:9:99:100,0,144 27176-ref 178 . T C 220.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=27.54;SB=-0.01;sumGLbyD=31.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:253,24,0 27176-ref 181 . T C 153.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=25.64;SB=-0.01;sumGLbyD=31.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:187,18,0 27176-ref 190 . A G 91.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9958;MQ=29.55;MQ0=0;QD=15.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:5:14.59:121,0,15 27176-ref 204 . C T 18.63 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=2.66;SB=-0.01;sumGLbyD=6.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:48.57:49,0,167 27195-ref 207 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 27195-ref 601 . T C 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 27208-ref 67 . C T 657.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.93;MQ0=0;QD=34.61;SB=-0.01;sumGLbyD=36.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:19:54.17:691,54,0 27208-ref 100 . C T 1416.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.20;MQ0=0;QD=37.27;SB=-0.01;sumGLbyD=38.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1449,114,0 27208-ref 112 . C T 1550.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.26;MQ0=0;QD=37.81;SB=-0.01;sumGLbyD=38.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1583,123,0 27208-ref 237 . A T 2372.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.0466;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.65;SB=-0.01;sumGLbyD=38.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:62:99:2405,187,0 27208-ref 312 . C T 1562.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7880;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.72;SB=-0.01;sumGLbyD=35.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:42:99:1595,126,0 27208-ref 371 . G A 2953.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4260;MQ=36.62;MQ0=0;QD=37.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2987,235,0 27208-ref 381 . A G 3383.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7316;MQ=36.55;MQ0=0;QD=37.60;SB=-0.01;sumGLbyD=37.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:89:99:3383,268,0 27208-ref 428 . C T 3470.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5476;MQ=36.78;MQ0=0;QD=37.72;SB=-0.01;sumGLbyD=37.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,91:91:99:3470,274,0 27208-ref 497 . C T 3195.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5439;MQ=35.81;MQ0=0;QD=37.15;SB=-0.01;sumGLbyD=37.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,86:85:99:3228,256,0 27208-ref 500 . C T 3386.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.5439;MQ=35.87;MQ0=0;QD=37.62;SB=-0.01;sumGLbyD=37.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:3386,268,0 27208-ref 544 . A G 3101.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.7150;MQ=35.91;MQ0=0;QD=36.92;SB=-0.01;sumGLbyD=37.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:83:99:3134,250,0 27208-ref 621 . A G 3517.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.6473;MQ=36.78;MQ0=0;QD=39.08;SB=-0.01;sumGLbyD=39.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,90:90:99:3517,271,0 27208-ref 659 . C T 2627.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=71;DS;Dels=0.01;HRun=0;HaplotypeScore=2.7547;MQ=36.14;MQ0=0;QD=37.01;SB=-0.01;sumGLbyD=37.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2661,208,0 27208-ref 704 . C T 695.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.76;SB=-0.01;sumGLbyD=36.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.16:728,60,0 27208-ref 711 . C T 489.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=33.48;MQ0=0;QD=32.63;SB=-0.01;sumGLbyD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.12:522,45,0 27208-ref 727 . G A 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 27280-ref 65 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 27280-ref 168 . T C 153.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.61;SB=-0.01;sumGLbyD=37.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:186,15,0 27280-ref 201 . A T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 27280-ref 206 . C A 36.18 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.09;SB=-0.01;sumGLbyD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:67,6,0 27280-ref 295 . A T 84.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:117,9,0 27280-ref 387 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 27280-ref 391 . C T 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 27280-ref 441 . C G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 27280-ref 448 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 27280-ref 470 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 27280-ref 483 . G T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 27280-ref 612 . C A 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 27280-ref 630 . A G 206.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 27280-ref 701 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 27415-ref 28 . A G 152.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.43;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:185,15,0 27415-ref 74 . G A 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=35.53;MQ0=0;QD=29.60;SB=-0.01;sumGLbyD=34.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.06:240,18,0 27415-ref 76 . A T 12.77 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9997;MQ=35.87;MQ0=0;QD=1.42;SB=-0.01;sumGLbyD=4.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:42.52:43,0,238 27415-ref 123 . A G 490.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8640;MQ=34.49;MQ0=0;QD=16.90;SB=-0.01;sumGLbyD=17.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,17:29:99:520,0,393 27415-ref 141 . C G 1055.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.21;MQ0=0;QD=35.20;SB=-0.01;sumGLbyD=36.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.24:1089,90,0 27415-ref 144 . C T 508.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9989;MQ=34.69;MQ0=0;QD=14.13;SB=-0.01;sumGLbyD=14.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,20:34:99:539,0,514 27415-ref 182 . C T 247.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=17.71;SB=-0.01;sumGLbyD=19.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:278,0,177 27415-ref 191 . C G 466.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.42;MQ0=0;QD=35.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:499,39,0 27415-ref 195 . A C 116.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=10.56;SB=-0.01;sumGLbyD=13.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:146,0,207 27415-ref 258 . A T 162.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=14.81;SB=3.00;sumGLbyD=17.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:10:99:193,0,123 27415-ref 262 . C A 490.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=35.04;SB=-40.01;sumGLbyD=37.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:524,42,0 27415-ref 290 . C T 476.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.1659;MQ=36.78;MQ0=0;QD=10.58;SB=-37.00;sumGLbyD=11.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,18:42:99:506,0,860 27415-ref 306 . C T 2625.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.0006;MQ=36.86;MQ0=0;QD=36.46;SB=-40.01;sumGLbyD=36.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:71:99:2658,211,0 27415-ref 353 . A C 1934.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=138;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.4095;MQ=36.71;MQ0=0;QD=14.02;SB=-35.57;sumGLbyD=14.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,63:133:99:1965,0,2327 27415-ref 386 . T G 1291.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.9317;MQ=36.53;MQ0=0;QD=15.02;SB=-58.87;sumGLbyD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,42:85:99:1322,0,1463 27422-ref 118 . G A 30.62 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:61,0,31 27424-ref 97 . A T 438.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.57;SB=-0.01;sumGLbyD=39.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:472,36,0 27432-ref 224 . C A 1073.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.6780;MQ=32.66;MQ0=0;QD=33.55;SB=-0.01;sumGLbyD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.25:1107,96,0 27432-ref 251 . C G 2117.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.3013;MQ=31.85;MQ0=0;QD=33.61;SB=-0.01;sumGLbyD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2151,186,0 27432-ref 276 . C A 2133.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.6208;MQ=31.95;MQ0=0;QD=34.40;SB=-0.01;sumGLbyD=34.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2166,186,0 27432-ref 307 . G T 857.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.46;MQ0=0;QD=31.77;SB=-0.01;sumGLbyD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.19:891,81,0 27432-ref 313 . G A 352.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=27.08;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.07:385,39,0 27432-ref 389 . A G 150.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9731;MQ=30.19;MQ0=0;QD=11.55;SB=-0.01;sumGLbyD=13.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:180,0,178 27432-ref 393 . T C 12.12 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9731;MQ=30.19;MQ0=0;QD=0.93;SB=-0.01;sumGLbyD=3.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:41.84:42,0,309 27432-ref 427 . C T 62.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.9661;MQ=30.58;MQ0=0;QD=5.23;SB=-0.01;sumGLbyD=7.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:92.78:93,0,242 27432-ref 431 . G A 122.04 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9997;MQ=30.58;MQ0=0;QD=10.17;SB=-0.01;sumGLbyD=12.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:152,0,183 27432-ref 442 . C T 62.81 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9998;MQ=30.58;MQ0=0;QD=5.23;SB=-0.01;sumGLbyD=7.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:92.80:93,0,236 27432-ref 447 . G C 159.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.9984;MQ=31.04;MQ0=0;QD=14.54;SB=-0.01;sumGLbyD=17.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:9:72.18:190,0,72 27432-ref 452 . G T 123 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9997;MQ=30.07;MQ0=0;QD=15.38;SB=-0.01;sumGLbyD=19.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:64.81:153,0,65 27432-ref 458 . T A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 27432-ref 645 . A C 172.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.64;SB=-0.01;sumGLbyD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:205,21,0 27432-ref 646 . T G 251.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.11;MQ0=0;QD=27.93;SB=-0.01;sumGLbyD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.06:284,27,0 27432-ref 687 . G A 484.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.18;MQ0=0;QD=32.27;SB=-0.01;sumGLbyD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.11:517,45,0 27432-ref 695 . G C 484.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.18;MQ0=0;QD=32.27;SB=-0.01;sumGLbyD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.11:517,45,0 27432-ref 901 . C T 659.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.37;MQ0=0;QD=30.00;SB=-55.33;sumGLbyD=31.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.10:693,66,0 27432-ref 925 . G T 428.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.82;MQ0=0;QD=30.60;SB=-55.33;sumGLbyD=32.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.08:461,42,0 27432-ref 940 . G T 301.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=31.42;MQ0=0;QD=27.41;SB=-55.31;sumGLbyD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.06:334,30,0 27449-ref 434 . A G 114.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.00;SB=-0.01;sumGLbyD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.96:145,0,25 27449-ref 454 . T C 104.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.89;SB=-0.01;sumGLbyD=19.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:91.50:134,0,92 27449-ref 459 . G A 111.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.40;SB=-0.01;sumGLbyD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:20.20:142,0,20 27449-ref 564 . C G 147.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.50;SB=-0.01;sumGLbyD=36.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:180,15,0 27519-ref 61 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 27519-ref 95 . A C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 27519-ref 141 . G A 48.20 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9990;MQ=33.02;MQ0=0;QD=6.03;SB=-0.01;sumGLbyD=9.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:7:78.20:78,0,124 27519-ref 152 . A T 77.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=11.12;SB=-0.01;sumGLbyD=15.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:88.58:108,0,89 27519-ref 166 . A G 71.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=29.55;MQ0=0;QD=7.98;SB=-0.01;sumGLbyD=11.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:102,0,142 27519-ref 173 . A G 111.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=29.55;MQ0=0;QD=12.42;SB=-0.01;sumGLbyD=15.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:142,0,102 27519-ref 191 . G C 173.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.78;SB=-0.01;sumGLbyD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:206,21,0 27519-ref 214 . C A 17.31 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.22:47,0,47 27519-ref 220 . G T 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 27519-ref 384 . C A 143.84 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.98;SB=-0.01;sumGLbyD=21.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:94.51:174,0,95 27519-ref 436 . T C 93.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4357;MQ=35.06;MQ0=0;QD=7.83;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:124,0,256 27519-ref 450 . G A 296.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=32.93;SB=-0.01;sumGLbyD=36.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:329,27,0 27519-ref 486 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 27519-ref 528 . A T 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 27519-ref 531 . G T 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:71,0,31 27519-ref 540 . G A 78.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.28;SB=-0.01;sumGLbyD=37.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:111,9,0 27585-ref 68 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.00;SB=-0.01;sumGLbyD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.03:120,9,0 27585-ref 101 . C A 315.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.05;SB=-0.01;sumGLbyD=38.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:348,27,0 27585-ref 149 . A C 406.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.94;SB=-0.01;sumGLbyD=39.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:439,33,0 27585-ref 415 . G A 247.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.30;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:280,21,0 27585-ref 462 . A G 517.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.99;SB=-0.01;sumGLbyD=39.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:551,42,0 27585-ref 530 . T C 284.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.61;SB=-0.01;sumGLbyD=39.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:318,24,0 27585-ref 696 . C T 402.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.57;SB=-0.01;sumGLbyD=39.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:435,33,0 27585-ref 725 . G C 499.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.32;SB=-0.01;sumGLbyD=35.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.13:533,42,0 27585-ref 860 . T C 676.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.56;SB=-0.01;sumGLbyD=39.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.18:709,54,0 27585-ref 875 . T A 433.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.10;SB=-0.01;sumGLbyD=38.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:466,36,0 27610-ref 267 . G A 76.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.55;SB=-0.01;sumGLbyD=36.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:109,9,0 27610-ref 297 . T C 44.89 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 27610-ref 343 . G A 161.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.26;SB=-0.01;sumGLbyD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:194,15,0 27610-ref 367 . G T 164.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:197,15,0 27610-ref 391 . G C 218.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=31.25;SB=-0.01;sumGLbyD=35.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:252,21,0 27610-ref 429 . A G 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=16.80;SB=-0.01;sumGLbyD=24.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.02:99,9,0 27610-ref 450 . C T 145.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.02;SB=-0.01;sumGLbyD=35.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:178,15,0 27610-ref 477 . G A 84.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:117,9,0 27610-ref 515 . A C 147.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.50;SB=-0.01;sumGLbyD=36.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:180,15,0 27610-ref 553 . T C 121.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.47;SB=-0.01;sumGLbyD=38.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:154,12,0 27610-ref 732 . T C 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.25;SB=-0.01;sumGLbyD=17.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:3:30.29:71,0,30 27610-ref 753 . A G 35.34 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.78;SB=-0.01;sumGLbyD=21.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29.55:65,0,30 27630-ref 186 . T A 123.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.95;SB=-0.01;sumGLbyD=39.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:156,12,0 27630-ref 259 . C T 34.95 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8662;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.74;SB=-0.01;sumGLbyD=16.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64.95:65,0,67 27630-ref 275 . A C 69.53 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.91;SB=-0.01;sumGLbyD=19.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.96:100,0,65 27630-ref 309 . C T 171.40 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.49;SB=-0.01;sumGLbyD=28.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18.94:201,0,19 27630-ref 380 . T C 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.29:71,0,30 27646-ref 22 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 27646-ref 49 . G A 84.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:117,9,0 27646-ref 109 . G A 74.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.88;SB=-0.01;sumGLbyD=35.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:107,9,0 27646-ref 157 . G C 202.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.74;SB=-0.01;sumGLbyD=39.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 27686-ref 675 . G C 1210.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.68;SB=-0.01;sumGLbyD=37.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:32:96.31:1243,96,0 27686-ref 824 . C T 877.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.8827;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.75;SB=-0.01;sumGLbyD=35.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:72.22:911,72,0 27686-ref 1103 . T G 1392.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.3107;MQ=36.48;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=36.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:38:99:1426,114,0 27705-ref 104 . A C 22.02 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9644;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.15;SB=-0.01;sumGLbyD=7.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51.98:52,0,170 27705-ref 105 . G A 26.75 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.9644;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.82;SB=-0.01;sumGLbyD=8.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56.73:57,0,171 27705-ref 164 . A G 102.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.87;SB=-0.01;sumGLbyD=16.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:133,0,133 27710-ref 98 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 27710-ref 169 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 27710-ref 281 . A G 36.42 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.14;SB=-0.01;sumGLbyD=22.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:66,0,31 27710-ref 323 . C G 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 27710-ref 439 . T A 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=19.40;SB=-0.01;sumGLbyD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9.03:110,9,0 27710-ref 457 . C T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 27710-ref 461 . G A 34.51 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=17.26;SB=-0.01;sumGLbyD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:66,6,0 27710-ref 487 . A T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 27790-ref 39 . G A 464.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.42;MQ0=0;QD=35.76;SB=-0.01;sumGLbyD=38.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:498,39,0 27790-ref 50 . A G 569.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.06;MQ0=0;QD=35.62;SB=-0.01;sumGLbyD=37.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:603,48,0 27790-ref 88 . T G 606.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.09;MQ0=0;QD=31.91;SB=-0.01;sumGLbyD=33.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:18:54.14:639,54,0 27790-ref 106 . G A 341.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=28.46;SB=-0.01;sumGLbyD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.06:374,36,0 27790-ref 127 . T C 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 27790-ref 129 . G T 231.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.07;MQ0=0;QD=28.91;SB=-0.01;sumGLbyD=33.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:264,24,0 27790-ref 139 . C T 491.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=35.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:524,42,0 27790-ref 165 . G A 759.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.96;SB=-0.01;sumGLbyD=39.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.20:792,60,0 27838-ref 83 . A T 749.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.46;SB=-0.01;sumGLbyD=39.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:782,60,0 27959-ref 172 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 27959-ref 174 . A C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 27959-ref 364 . T C 84.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.11;SB=-0.01;sumGLbyD=38.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:116,9,0 27959-ref 470 . T C 106.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.64;SB=-0.01;sumGLbyD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 27959-ref 563 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 27959-ref 791 . G C 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 27959-ref 995 . C T 282.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:316,24,0 27959-ref 1160 . A G 518.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.06;SB=-0.01;sumGLbyD=39.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:552,42,0 27959-ref 1187 . T A 12.73 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.06;SB=-0.01;sumGLbyD=3.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:11:42.49:42,0,314 27959-ref 1388 . T C 223.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.93;SB=-0.01;sumGLbyD=36.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:256,21,0 27959-ref 1454 . C A 40.30 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.43;SB=-0.01;sumGLbyD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:70,0,31 27976-ref 9 . C T 39.83 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.92;SB=-0.01;sumGLbyD=36.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 27976-ref 10 . A G 42.43 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.21;SB=-0.01;sumGLbyD=37.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:74,6,0 27976-ref 50 . T C 322.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:356,27,0 27976-ref 164 . T C 383.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.88;SB=-0.01;sumGLbyD=37.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:417,33,0 27976-ref 296 . G A 486.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.74;SB=-0.01;sumGLbyD=37.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.13:519,39,0 27976-ref 345 . C G 478.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.80;SB=-0.01;sumGLbyD=39.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:511,39,0 27976-ref 359 . C A 451.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=34.75;SB=-0.01;sumGLbyD=37.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:485,39,0 27976-ref 391 . T A 193.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:227,18,0 27976-ref 417 . T C 55.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=13.96;SB=-0.01;sumGLbyD=22.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.02:88,9,0 27976-ref 448 . G A 51.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=30.37;MQ0=0;QD=10.35;SB=-0.01;sumGLbyD=16.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:8.99:84,9,0 27976-ref 465 . C T 162.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=27.07;SB=-0.01;sumGLbyD=32.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:195,18,0 27976-ref 478 . C A 144.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=28.86;SB=-0.01;sumGLbyD=35.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:177,15,0 27976-ref 514 . T C 109.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=21.88;SB=-0.01;sumGLbyD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.03:142,12,0 27976-ref 592 . A G 421.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=30.14;SB=-0.01;sumGLbyD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:5.15:453,5,0 27976-ref 644 . A G 390.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.49;SB=-0.01;sumGLbyD=38.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:423,33,0 27976-ref 646 . C A 342.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=31.17;SB=-0.01;sumGLbyD=34.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.09:376,30,0 27976-ref 730 . A T 83.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 27976-ref 822 . A G 77.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.71;SB=-0.01;sumGLbyD=36.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:109,9,0 27976-ref 1000 . G A 272.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.10;SB=-0.01;sumGLbyD=38.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:306,24,0 27976-ref 1022 . G C 226.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:260,21,0 28142-ref 112 . C G 154.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.82;SB=-0.01;sumGLbyD=37.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:187,15,0 28142-ref 198 . C A 35.48 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.74;SB=-0.01;sumGLbyD=33.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:67,6,0 28142-ref 216 . C G 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 28234-ref 57 . T C 354.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=32.11;MQ0=0;QD=32.22;SB=-0.01;sumGLbyD=35.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:387,33,0 28234-ref 73 . C T 384.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=32.06;SB=-0.01;sumGLbyD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.09:418,36,0 28234-ref 94 . T G 195.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.07;MQ0=0;QD=24.46;SB=-38.52;sumGLbyD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.05:229,21,0 28234-ref 109 . C A 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 28245-ref 101 . T A 196.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.2160;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.57;SB=-0.01;sumGLbyD=13.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:227,0,337 28263-ref 70 . G A 1230.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.9984;MQ=28.11;MQ0=0;QD=27.96;SB=-0.01;sumGLbyD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,42:44:76.89:1263,77,0 28263-ref 74 . G A 1275.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.9946;MQ=28.11;MQ0=0;QD=28.99;SB=-0.01;sumGLbyD=29.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:44:93.66:1309,94,0 28263-ref 101 . T C 198.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=19.83;SB=-0.01;sumGLbyD=22.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:49.93:228,0,50 28263-ref 103 . G A 43.84 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=8.77;SB=-0.01;sumGLbyD=14.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.98:74,0,65 28263-ref 134 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 28263-ref 207 . G A 352.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.15;SB=-0.01;sumGLbyD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:14:39.07:385,39,0 28263-ref 212 . T C 586.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.14;MQ0=0;QD=29.35;SB=-0.01;sumGLbyD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.12:620,60,0 28263-ref 263 . G C 1083.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.45;MQ0=0;QD=27.09;SB=-0.01;sumGLbyD=27.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:39:77.23:1117,77,0 28263-ref 264 . A C 1113.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.45;MQ0=0;QD=27.84;SB=-0.01;sumGLbyD=28.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:40:80.23:1146,80,0 28263-ref 284 . G C 389.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8663;MQ=25.59;MQ0=0;QD=15.60;SB=-0.01;sumGLbyD=16.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:24:15.52:420,0,16 28263-ref 287 . A C 549.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8663;MQ=25.67;MQ0=0;QD=24.96;SB=-0.01;sumGLbyD=26.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:26.12:582,26,0 28263-ref 302 . A C 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9999;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:50,0,31 28263-ref 312 . C G 267.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9994;MQ=35.12;MQ0=0;QD=24.31;SB=-0.01;sumGLbyD=27.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:36.53:297,0,37 28263-ref 313 . T G 272.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=35.12;MQ0=0;QD=24.82;SB=-0.01;sumGLbyD=27.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:10:7.71:303,0,8 28263-ref 331 . A T 117.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9328;MQ=36.53;MQ0=0;QD=2.74;SB=-0.01;sumGLbyD=3.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,7:43:99:148,0,1273 28263-ref 402 . T C 3197.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.1718;MQ=33.69;MQ0=0;QD=35.93;SB=-0.01;sumGLbyD=36.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,89:89:99:3231,268,0 28263-ref 407 . C A 1536.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=85;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=11.3398;MQ=33.52;MQ0=0;QD=18.07;SB=-0.01;sumGLbyD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,51:85:99:1566,0,955 28263-ref 425 . T A 1293.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.9974;MQ=27.63;MQ0=0;QD=30.07;SB=-0.01;sumGLbyD=30.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1326,129,0 28263-ref 428 . C T 979.10 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.9963;MQ=27.37;MQ0=0;QD=23.31;SB=-0.01;sumGLbyD=24.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,37:42:48.25:1009,0,48 28263-ref 432 . A G 74.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.9962;MQ=27.26;MQ0=0;QD=1.70;SB=-0.01;sumGLbyD=2.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,8:44:99:105,0,1006 28263-ref 454 . T C 402.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=30.27;MQ0=0;QD=17.48;SB=-0.01;sumGLbyD=18.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:23:99:432,0,199 28263-ref 486 . C A 297.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.32;MQ0=0;QD=15.68;SB=-0.01;sumGLbyD=17.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:99:328,0,183 28263-ref 499 . C T 194.89 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9990;MQ=33.02;MQ0=0;QD=24.36;SB=-0.01;sumGLbyD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:15.94:225,0,16 28263-ref 502 . T C 37.82 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.9974;MQ=33.02;MQ0=0;QD=4.73;SB=-0.01;sumGLbyD=8.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:8:67.81:68,0,137 28263-ref 508 . A G 36.57 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.19;SB=-0.01;sumGLbyD=22.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:67,0,31 28263-ref 527 . G A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 28263-ref 528 . T A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 28263-ref 580 . T A 732.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9998;MQ=35.46;MQ0=0;QD=36.65;SB=-0.01;sumGLbyD=38.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.18:766,60,0 28263-ref 583 . T G 19.51 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9998;MQ=35.46;MQ0=0;QD=0.98;SB=-0.01;sumGLbyD=2.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:49.45:49,0,599 28263-ref 612 . A G 344.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=37.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:377,30,0 28263-ref 624 . A G 211.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=30.28;SB=-0.01;sumGLbyD=34.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:245,21,0 28305-ref 231 . G A 124.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.16;SB=-0.01;sumGLbyD=39.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:157,12,0 28305-ref 232 . C T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 28305-ref 253 . C A 84.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:116,9,0 28305-ref 300 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 28305-ref 348 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 28305-ref 365 . G C 305.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.96;SB=-0.01;sumGLbyD=37.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:339,27,0 28305-ref 407 . A G 396.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.03;SB=-0.01;sumGLbyD=39.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:429,33,0 28305-ref 532 . A G 367.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.71;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:400,30,0 28305-ref 543 . C T 389.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.43;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:423,33,0 28305-ref 603 . C T 425.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.48;SB=-0.01;sumGLbyD=38.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:459,36,0 28305-ref 611 . T C 425.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.42;SB=-0.01;sumGLbyD=38.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:458,36,0 28305-ref 715 . A G 243.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.77;SB=-0.01;sumGLbyD=39.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:276,21,0 28305-ref 865 . T C 688.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.47;MQ0=0;QD=36.25;SB=-0.01;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:722,57,0 28305-ref 913 . T A 666.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.82;MQ0=0;QD=35.06;SB=-0.01;sumGLbyD=36.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.17:699,57,0 28305-ref 920 . T G 428.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=30.61;SB=-0.01;sumGLbyD=32.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.11:461,39,0 28305-ref 954 . A T 213.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=30.44;SB=-0.01;sumGLbyD=35.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:246,21,0 28305-ref 966 . A G 201.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=28.80;SB=-0.01;sumGLbyD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:235,21,0 28305-ref 1085 . C T 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 28305-ref 1089 . G A 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 28391-ref 22 . T A 40.57 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.29;SB=-0.01;sumGLbyD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:72,6,0 28391-ref 23 . A G 40.57 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.29;SB=-0.01;sumGLbyD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:72,6,0 28391-ref 60 . T C 340.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=34.01;SB=-0.01;sumGLbyD=37.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:373,30,0 28391-ref 100 . T C 405.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.15;MQ0=0;QD=33.77;SB=-0.01;sumGLbyD=36.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:438,36,0 28427-ref 240 . T G 111.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:61.95:142,0,62 28427-ref 669 . A G 191.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.80;SB=-0.01;sumGLbyD=14.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:222,0,249 28427-ref 676 . T C 153.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.97;SB=-0.01;sumGLbyD=13.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:13:99:184,0,216 28471-ref 92 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 28471-ref 115 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 28471-ref 130 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 28471-ref 132 . T G 61.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=20.52;SB=-0.01;sumGLbyD=31.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:94,9,0 28471-ref 876 . T C 440.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.75;SB=-0.01;sumGLbyD=39.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:474,36,0 28471-ref 896 . G A 549.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.66;SB=-0.01;sumGLbyD=38.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:583,45,0 28471-ref 946 . G C 315.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9330;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.52;SB=-0.01;sumGLbyD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.09:348,27,0 28492-ref 63 . G A 135.28 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.04;MQ0=0;QD=9.66;SB=-0.01;sumGLbyD=11.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:165,0,186 28492-ref 78 . T C 83.41 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=27.82;MQ0=0;QD=5.56;SB=-0.01;sumGLbyD=7.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:113,0,272 28492-ref 81 . A T 101.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=27.82;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=8.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:9:99:131,0,107 28492-ref 85 . A T 440.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=29.35;SB=-0.01;sumGLbyD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.10:473,45,0 28492-ref 89 . G A 372.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.19;MQ0=0;QD=28.68;SB=-0.01;sumGLbyD=31.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.08:406,39,0 28492-ref 99 . T G 259.87 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=21.66;SB=-0.01;sumGLbyD=24.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:30.52:290,0,31 28492-ref 153 . A T 294.16 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.77;SB=-0.01;sumGLbyD=12.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,10:25:99:324,0,495 28492-ref 213 . T G 600.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=4.1421;MQ=36.67;MQ0=0;QD=19.37;SB=-0.01;sumGLbyD=20.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,19:31:99:631,0,366 28492-ref 219 . A C 634.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6127;MQ=36.67;MQ0=0;QD=20.48;SB=-0.01;sumGLbyD=21.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:29:51.16:668,51,0 28492-ref 310 . C G 279.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.88;SB=-0.01;sumGLbyD=39.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:312,24,0 28492-ref 335 . C G 155.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:188,15,0 28503-ref 8 . A G 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 28503-ref 17 . C A 262.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=32.83;SB=-0.01;sumGLbyD=36.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:296,24,0 28503-ref 48 . G C 704.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.85;MQ0=0;QD=35.21;SB=-0.01;sumGLbyD=36.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.17:737,60,0 28503-ref 81 . T C 1246.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.18;MQ0=0;QD=36.67;SB=-0.01;sumGLbyD=37.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1280,102,0 28503-ref 111 . A T 940.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.8631;MQ=35.72;MQ0=0;QD=29.38;SB=-0.01;sumGLbyD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,29:31:7.67:970,0,8 28503-ref 112 . A T 404.89 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.94;MQ0=0;QD=13.96;SB=-0.01;sumGLbyD=15.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,14:29:99:435,0,502 28503-ref 164 . G C 238.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.09;SB=-0.01;sumGLbyD=38.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:272,21,0 28521-ref 51 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 28521-ref 69 . G A 165.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.02;SB=-0.01;sumGLbyD=39.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:198,15,0 28521-ref 137 . A G 200.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.37;SB=-0.01;sumGLbyD=38.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:233,18,0 28521-ref 230 . G C 321.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:354,27,0 28521-ref 241 . C T 316.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.17;SB=-0.01;sumGLbyD=38.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:350,27,0 28521-ref 242 . A G 277.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.69;SB=-0.01;sumGLbyD=38.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:311,24,0 28521-ref 535 . T C 165.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 28521-ref 544 . A G 164.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.88;SB=-0.01;sumGLbyD=39.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:197,15,0 28527-ref 23 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 28527-ref 26 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:2:1.76:40,3,0 28527-ref 43 . T C 474.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.91;SB=-0.01;sumGLbyD=36.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.13:508,39,0 28593-ref 20 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 28593-ref 220 . C T 315.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.05;SB=-0.01;sumGLbyD=38.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:348,27,0 28593-ref 278 . A G 42.02 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.80;SB=6.01;sumGLbyD=4.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:72.02:72,0,412 28593-ref 290 . G A 234.53 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9992;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.64;SB=-74.00;sumGLbyD=17.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:265,0,233 28593-ref 430 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 28595-ref 10 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 28595-ref 21 . A T 96.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:129,12,0 28595-ref 71 . C T 93.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=23.49;SB=-0.01;sumGLbyD=31.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:126,12,0 28595-ref 81 . T G 55.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.62;SB=-0.01;sumGLbyD=29.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:88,9,0 28595-ref 83 . G T 53.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=17.96;SB=-0.01;sumGLbyD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.01:86,9,0 28595-ref 96 . G T 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 28595-ref 142 . G A 153.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.64;SB=-0.01;sumGLbyD=37.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:186,15,0 28595-ref 165 . T C 124.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:157,12,0 28620-ref 32 . A T 1055.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.41;SB=-40.01;sumGLbyD=37.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.24:1089,87,0 28620-ref 177 . G T 2277.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8332;MQ=36.83;MQ0=0;QD=37.96;SB=-0.01;sumGLbyD=38.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:2311,178,0 28620-ref 517 . C A 1100.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9726;MQ=36.02;MQ0=0;QD=21.17;SB=-0.01;sumGLbyD=21.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,34:51:99:1131,0,506 28620-ref 536 . T A 1736.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.4070;MQ=34.45;MQ0=0;QD=32.76;SB=-0.01;sumGLbyD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,52:52:99:1769,127,0 28620-ref 578 . A G 1779.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=34.50;MQ0=0;QD=35.60;SB=-0.01;sumGLbyD=36.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:49:99:1813,147,0 28620-ref 581 . A T 1774.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=34.55;MQ0=0;QD=34.80;SB=-0.01;sumGLbyD=35.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:51:99:1808,113,0 28674-ref 61 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 28674-ref 80 . G A 83.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.84;SB=-0.01;sumGLbyD=38.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:116,9,0 28739-ref 30 . T G 14.37 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=2.87;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.21:44,0,98 28739-ref 31 . G C 14.37 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=2.87;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.21:44,0,98 28739-ref 63 . T A 466.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.63;MQ0=0;QD=31.09;SB=-0.01;sumGLbyD=33.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:15.51:499,16,0 28739-ref 74 . G A 431.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=35.63;MQ0=0;QD=28.79;SB=-0.01;sumGLbyD=30.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,13:14:7.78:464,8,0 28739-ref 128 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 28775-ref 92 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 28775-ref 163 . C A 35.36 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=17.68;SB=-0.01;sumGLbyD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:67,6,0 28836-ref 23 . T C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 28836-ref 125 . A T 658.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8319;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.94;SB=-0.01;sumGLbyD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:20.18:692,20,0 28836-ref 150 . A G 524.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.21;MQ0=0;QD=34.94;SB=-0.01;sumGLbyD=37.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:557,45,0 28836-ref 161 . C T 389.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.54;MQ0=0;QD=32.45;SB=-0.01;sumGLbyD=35.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.10:422,36,0 28836-ref 193 . C T 454.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8453;MQ=31.58;MQ0=0;QD=32.46;SB=-0.01;sumGLbyD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:487,42,0 28836-ref 220 . G T 512.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.21;MQ0=0;QD=34.17;SB=-146.99;sumGLbyD=36.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.12:546,45,0 28836-ref 239 . C T 417.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=34.82;SB=-158.57;sumGLbyD=37.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:451,36,0 28836-ref 271 . G C 202.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.78;SB=-76.61;sumGLbyD=39.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:236,18,0 28862-ref 27 . C T 32.74 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=16.37;SB=-0.01;sumGLbyD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:64,6,0 28862-ref 57 . G A 37.70 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.85;SB=-0.01;sumGLbyD=34.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:69,6,0 28862-ref 65 . G T 28.98 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=14.49;SB=-0.01;sumGLbyD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:60,6,0 28862-ref 108 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 28862-ref 127 . C T 193.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.32;SB=-0.01;sumGLbyD=37.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:227,18,0 28862-ref 156 . A G 442.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.06;SB=-0.01;sumGLbyD=36.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:476,36,0 28862-ref 197 . G A 656.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9931;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.17:689,54,0 28862-ref 340 . A G 1001.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.52;SB=-0.01;sumGLbyD=39.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.26:1034,78,0 28862-ref 434 . T G 1128.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.66;MQ0=0;QD=37.62;SB=-0.01;sumGLbyD=38.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.28:1162,90,0 28862-ref 456 . A G 1276.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.70;MQ0=0;QD=37.53;SB=-0.01;sumGLbyD=38.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1309,102,0 28862-ref 491 . T C 1169.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.73;MQ0=0;QD=36.54;SB=-0.01;sumGLbyD=37.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.28:1202,96,0 28862-ref 529 . G A 1235.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.5992;MQ=34.51;MQ0=0;QD=36.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1268,102,0 28862-ref 539 . T A 1037.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.5009;MQ=34.57;MQ0=0;QD=34.60;SB=-0.01;sumGLbyD=35.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:30:87.25:1071,87,0 28862-ref 708 . A G 1453.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.2032;MQ=36.74;MQ0=0;QD=37.27;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,39:38:99:1486,114,0 28922-ref 179 . T A 14.24 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=1.6208;MQ=35.28;MQ0=0;QD=2.37;SB=-0.01;sumGLbyD=7.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:44.07:44,0,135 28922-ref 181 . A T 14.24 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=35.28;MQ0=0;QD=2.37;SB=-0.01;sumGLbyD=7.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:44.07:44,0,141 28922-ref 183 . T A 20.93 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=1.6208;MQ=35.28;MQ0=0;QD=3.49;SB=-0.01;sumGLbyD=8.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:50.88:51,0,133 28922-ref 214 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 29175-ref 53 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 29175-ref 98 . C T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 29175-ref 101 . T A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 29175-ref 131 . A G 76.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.39;SB=-0.01;sumGLbyD=36.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 29175-ref 140 . C G 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 29175-ref 203 . T C 152.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.43;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:185,15,0 29175-ref 212 . G A 162.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.51;SB=-0.01;sumGLbyD=39.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:195,15,0 29331-ref 30 . C T 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 29331-ref 47 . A G 161.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=26.96;SB=-0.01;sumGLbyD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:195,18,0 29331-ref 54 . C T 174.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=30.72;MQ0=0;QD=24.94;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:207,18,0 29331-ref 86 . T C 173.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=28.97;SB=-0.01;sumGLbyD=34.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:207,18,0 29357-ref 105 . G A 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 29357-ref 107 . T C 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 29426-ref 84 . A C 78.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.18;SB=-0.01;sumGLbyD=37.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:111,9,0 29426-ref 97 . G T 43.46 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.73;SB=-0.01;sumGLbyD=37.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 29426-ref 98 . C G 42.68 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.34;SB=-0.01;sumGLbyD=37.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:74,6,0 29584-ref 57 . G C 47.89 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.5774;MQ=36.27;MQ0=0;QD=3.42;SB=-0.01;sumGLbyD=5.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:77.88:78,0,386 29584-ref 96 . G A 304.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.8941;MQ=36.37;MQ0=0;QD=19.06;SB=-0.01;sumGLbyD=20.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:335,0,188 29584-ref 106 . T G 304.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=36.37;MQ0=0;QD=19.00;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:334,0,190 29584-ref 137 . G A 306.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=21.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:337,0,180 29584-ref 159 . T C 552.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=36.82;SB=-0.01;sumGLbyD=39.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:585,45,0 29584-ref 223 . T G 49.55 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=4.96;SB=-0.01;sumGLbyD=7.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:79.54:80,0,240 29584-ref 227 . A T 52.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=5.26;SB=-0.01;sumGLbyD=8.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:9:82.55:83,0,203 29584-ref 228 . A T 198.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=19.82;SB=-0.01;sumGLbyD=22.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:79.55:228,0,80 29584-ref 241 . T C 212.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9332;MQ=34.69;MQ0=0;QD=23.62;SB=-0.01;sumGLbyD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:42.55:243,0,43 29584-ref 271 . T A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 29623-ref 14 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 29623-ref 64 . C A 76.55 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.78;MQ0=0;QD=5.47;SB=-0.01;sumGLbyD=7.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:107,0,337 29623-ref 94 . T C 454.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.60;MQ0=0;QD=34.96;SB=-0.01;sumGLbyD=37.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:487,39,0 29623-ref 104 . C A 282.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=31.40;SB=-0.01;sumGLbyD=35.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:316,27,0 29623-ref 108 . A T 125.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=15.65;SB=-0.01;sumGLbyD=19.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:85.57:155,0,86 29623-ref 115 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 29652-ref 90 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 29652-ref 288 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 29652-ref 332 . C T 75.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.21;SB=-0.01;sumGLbyD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:108,9,0 29652-ref 511 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 29745-ref 50 . C T 179.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9578;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.69;SB=-0.01;sumGLbyD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18.94:210,0,19 29745-ref 123 . A G 360.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.02;SB=-0.01;sumGLbyD=39.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:393,30,0 29745-ref 294 . T C 235.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.68;SB=-0.01;sumGLbyD=38.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:269,21,0 29745-ref 348 . A G 434.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7341;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.39;SB=-0.01;sumGLbyD=35.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:12:36.12:467,36,0 29745-ref 409 . C T 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 29745-ref 424 . T A 163.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.68;SB=-0.01;sumGLbyD=39.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 29745-ref 493 . A T 579.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.19;SB=-0.01;sumGLbyD=38.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:612,48,0 29745-ref 510 . C T 317.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.86;SB=-0.01;sumGLbyD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:4.70:347,0,5 29745-ref 599 . A G 174.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=29.13;SB=-0.01;sumGLbyD=34.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:208,18,0 29745-ref 615 . A G 71.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.81;SB=-0.01;sumGLbyD=34.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:103,9,0 29745-ref 727 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-39.22;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 29745-ref 829 . G C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 29774-ref 15 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=7.8620;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 29774-ref 240 . C T 54.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=6.77;SB=-0.01;sumGLbyD=10.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:84.18:84,0,171 29774-ref 243 . T G 262.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=32.76;SB=-0.01;sumGLbyD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:295,24,0 29774-ref 300 . C T 301.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.45;SB=-0.01;sumGLbyD=37.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:334,27,0 29774-ref 366 . G C 197.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.28;SB=-0.01;sumGLbyD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:7:18.06:231,18,0 29774-ref 390 . C G 154.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:187,15,0 29774-ref 511 . G A 165.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 29774-ref 517 . G C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 29774-ref 648 . G C 118.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.60;SB=-0.01;sumGLbyD=37.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:151,12,0 29774-ref 765 . C T 350.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9996;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.10;SB=-0.01;sumGLbyD=38.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:384,30,0 29774-ref 831 . T A 98.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.85;SB=-0.01;sumGLbyD=12.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:128,0,204 29774-ref 843 . G A 138.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.32;SB=-0.01;sumGLbyD=21.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:7:48.54:169,0,49 29774-ref 933 . T A 22.02 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7324;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.75;SB=-0.01;sumGLbyD=6.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:7:51.98:52,0,177 29832-ref 11 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 29832-ref 38 . G T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 29832-ref 42 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 29832-ref 45 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 29832-ref 80 . T C 183.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=30.53;SB=-0.01;sumGLbyD=36.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:216,18,0 29832-ref 94 . A C 230.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=32.91;SB=-0.01;sumGLbyD=37.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:263,21,0 29832-ref 190 . T C 436.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:469,36,0 29832-ref 204 . A G 242.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.58;SB=-0.01;sumGLbyD=39.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:275,21,0 29832-ref 298 . T C 374.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=34.04;SB=-0.01;sumGLbyD=37.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:407,33,0 29832-ref 301 . T A 333.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=30.29;SB=-0.01;sumGLbyD=33.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.09:366,30,0 29832-ref 350 . C A 388.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:421,33,0 29832-ref 361 . A G 393.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:427,33,0 29832-ref 426 . G A 431.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8941;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.95;SB=-0.01;sumGLbyD=38.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:464,36,0 29832-ref 497 . C T 319.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:353,27,0 29832-ref 509 . T C 318.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.81;SB=-0.01;sumGLbyD=35.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:10:27.09:351,27,0 29832-ref 699 . T G 510.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:543,42,0 29832-ref 763 . A G 103.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.72;SB=-0.01;sumGLbyD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23.53:134,0,24 29832-ref 774 . A G 202.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.78;SB=-0.01;sumGLbyD=39.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:236,18,0 29832-ref 814 . C T 475.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.58;SB=-0.01;sumGLbyD=39.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:509,39,0 29832-ref 907 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=8;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 29832-ref 910 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 29838-ref 10 . C T 218.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=31.15;SB=-0.01;sumGLbyD=35.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:251,21,0 29838-ref 63 . C T 1402.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9983;MQ=26.76;MQ0=0;QD=28.63;SB=-0.01;sumGLbyD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,48:49:99:1436,114,0 29838-ref 76 . G A 1362.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.54;MQ0=0;QD=29.00;SB=-0.01;sumGLbyD=29.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:46:99:1396,138,0 29838-ref 79 . C T 1212.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.34;MQ0=0;QD=28.21;SB=-0.01;sumGLbyD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:42:99:1246,126,0 29838-ref 82 . C T 1432.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8660;MQ=27.97;MQ0=0;QD=27.55;SB=-0.01;sumGLbyD=28.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:50:99:1466,113,0 29838-ref 127 . T C 1093.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=36.01;MQ0=0;QD=35.27;SB=-169.68;sumGLbyD=36.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.27:1126,90,0 29838-ref 163 . C T 581.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.18;MQ0=0;QD=34.22;SB=-174.70;sumGLbyD=36.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.15:615,51,0 29838-ref 165 . G T 400.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=33.37;SB=-174.75;sumGLbyD=36.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.10:433,36,0 29847-ref 52 . C A 241.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.15;SB=-0.01;sumGLbyD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:8:21.07:274,21,0 29847-ref 139 . A G 242.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.65;SB=-0.01;sumGLbyD=39.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:275,21,0 29955-ref 111 . C G 45.74 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:77,6,0 29955-ref 112 . T C 41.26 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.63;SB=-0.01;sumGLbyD=36.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 29955-ref 117 . C G 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 29955-ref 249 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 30063-ref 213 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 30072-ref 43 . A C 41 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.67;SB=-0.01;sumGLbyD=23.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25.32:71,0,25 30072-ref 109 . C A 37.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9999;MQ=31.58;MQ0=0;QD=9.50;SB=-0.01;sumGLbyD=17.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.21:68,0,47 30072-ref 114 . G A 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9998;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.40;SB=-0.01;sumGLbyD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:3:9.03:110,9,0 30083-ref 179 . C G 108.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.24;SB=-0.01;sumGLbyD=35.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:141,12,0 30083-ref 231 . G A 114.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.68;SB=-0.01;sumGLbyD=36.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:147,12,0 30083-ref 305 . A G 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 30083-ref 508 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 30083-ref 586 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 30083-ref 588 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 30083-ref 628 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 30118-ref 177 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 30129-ref 9 . A C 44.35 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.18;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 30129-ref 43 . T A 238.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.12;SB=-0.01;sumGLbyD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:272,21,0 30129-ref 113 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 30129-ref 142 . A C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 30129-ref 156 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 30129-ref 275 . T C 305.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.98;SB=-0.01;sumGLbyD=37.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:339,27,0 30179-ref 87 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 30179-ref 150 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 30179-ref 324 . C T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 30179-ref 342 . G T 34.51 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=17.26;SB=-0.01;sumGLbyD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:66,6,0 30179-ref 348 . G T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 30179-ref 741 . A G 83.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.81;SB=-0.01;sumGLbyD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 30179-ref 743 . A T 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 30181-ref 10 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 30203-ref 75 . T C 76.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.39;SB=-0.01;sumGLbyD=36.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 30203-ref 115 . C G 392.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.66;SB=-0.01;sumGLbyD=38.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:425,33,0 30203-ref 140 . C G 470.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.16;SB=-0.01;sumGLbyD=38.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:503,39,0 30203-ref 204 . C T 439.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.63;SB=-0.01;sumGLbyD=39.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:473,36,0 30203-ref 234 . T C 496.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=35.46;SB=-0.01;sumGLbyD=37.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:529,42,0 30203-ref 247 . A T 424.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.36;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:457,36,0 30203-ref 387 . C T 523.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.88;SB=-0.01;sumGLbyD=37.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.14:556,42,0 30205-ref 73 . A G 117.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.48;SB=-0.01;sumGLbyD=37.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 30205-ref 100 . T C 148.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.65;SB=-0.01;sumGLbyD=36.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:181,15,0 30205-ref 145 . A C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 30205-ref 345 . A C 115.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=23.01;SB=-0.01;sumGLbyD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:14.58:145,0,15 30205-ref 350 . T C 115.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.76;SB=-0.01;sumGLbyD=36.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:148,12,0 30205-ref 369 . G A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 30211-ref 259 . G T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 30211-ref 267 . A G 71.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.99;SB=-0.01;sumGLbyD=16.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:102,0,101 30211-ref 314 . G T 585.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.62;SB=-0.01;sumGLbyD=38.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:619,48,0 30211-ref 366 . T C 1611.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.77;MQ0=0;QD=37.47;SB=-0.01;sumGLbyD=38.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:42:99:1644,126,0 30211-ref 367 . G T 1651.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.77;MQ0=0;QD=38.41;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:99:1684,129,0 30211-ref 454 . G T 546.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=34.17;SB=-0.01;sumGLbyD=36.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.14:580,45,0 30211-ref 461 . G A 315.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=26.25;SB=-0.01;sumGLbyD=28.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:39.15:345,0,39 30211-ref 474 . A C 26.18 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=6.55;SB=-0.01;sumGLbyD=14.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:56.16:56,0,68 30211-ref 504 . G A 861.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.03;MQ0=0;QD=33.15;SB=-0.01;sumGLbyD=34.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.20:895,78,0 30211-ref 517 . C T 1139.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.14;MQ0=0;QD=34.52;SB=-0.01;sumGLbyD=35.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1172,99,0 30211-ref 536 . G A 1277.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=33.38;MQ0=0;QD=33.62;SB=-0.01;sumGLbyD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1310,111,0 30211-ref 554 . G A 391.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.97;MQ0=0;QD=8.71;SB=-0.01;sumGLbyD=9.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,17:45:99:422,0,914 30211-ref 645 . G C 1559.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.08;MQ0=0;QD=33.91;SB=-59.25;sumGLbyD=34.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:99:1593,138,0 30211-ref 682 . C A 1546.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9752;MQ=31.81;MQ0=0;QD=30.93;SB=-59.25;sumGLbyD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:49:99:1579,141,0 30211-ref 694 . C T 1434.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.71;MQ0=0;QD=31.88;SB=-59.25;sumGLbyD=32.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:43:99:1468,129,0 30211-ref 704 . T A 1263.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=31.58;MQ0=0;QD=33.26;SB=-0.01;sumGLbyD=34.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1297,114,0 30249-ref 84 . G C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 30262-ref 50 . T A 347.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.14;MQ0=0;QD=31.56;SB=-0.01;sumGLbyD=34.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.06:380,33,0 30262-ref 81 . G C 353.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=29.47;SB=-0.01;sumGLbyD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.08:387,36,0 30262-ref 106 . A G 685.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=32.66;SB=-0.01;sumGLbyD=34.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.16:719,63,0 30262-ref 113 . A T 667.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.16;MQ0=0;QD=33.38;SB=-0.01;sumGLbyD=35.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.16:701,60,0 30262-ref 129 . T A 999.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.78;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=36.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.23:1033,84,0 30262-ref 186 . C T 1979.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.81;MQ0=0;QD=37.35;SB=-0.01;sumGLbyD=37.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:52:99:2012,156,0 30262-ref 219 . C T 649.47 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.4625;MQ=36.09;MQ0=0;QD=11.60;SB=-0.01;sumGLbyD=12.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,23:56:99:679,0,1096 30262-ref 246 . C T 1435.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9159;MQ=34.72;MQ0=0;QD=35.00;SB=-29.63;sumGLbyD=35.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:40:99:1468,120,0 30262-ref 273 . C T 1201.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.59;MQ0=0;QD=35.35;SB=-29.63;sumGLbyD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1235,102,0 30262-ref 274 . A G 1196.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.59;MQ0=0;QD=35.19;SB=-29.63;sumGLbyD=36.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1230,102,0 30262-ref 483 . C A 824.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=28.94;MQ0=0;QD=29.46;SB=-0.01;sumGLbyD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:27:81.18:858,81,0 30262-ref 486 . T G 719.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=29.98;SB=-0.01;sumGLbyD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.15:752,72,0 30262-ref 489 . 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G C 153.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=25.51;SB=-73.98;sumGLbyD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.02:186,18,0 30262-ref 639 . C G 1606.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9973;MQ=28.94;MQ0=0;QD=30.90;SB=-27.67;sumGLbyD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,52:52:99:1640,156,0 30262-ref 787 . A G 105.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=23.00;MQ0=0;QD=21.12;SB=-0.01;sumGLbyD=27.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.01:138,15,0 30262-ref 928 . G A 133.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=22.19;SB=-0.01;sumGLbyD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.02:166,18,0 30395-ref 28 . C A 387.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.23;SB=-0.01;sumGLbyD=38.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:421,33,0 30395-ref 31 . C T 311.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=28.29;SB=-0.01;sumGLbyD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:9:27.08:344,27,0 30395-ref 76 . G A 652.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.47;MQ0=0;QD=34.32;SB=-0.01;sumGLbyD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:18:54.16:685,54,0 30395-ref 154 . T C 510.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.47;SB=-0.01;sumGLbyD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:544,42,0 30521-ref 91 . A G 82.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.58;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 30521-ref 221 . T C 247.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.30;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:280,21,0 30521-ref 274 . G A 252.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.60;SB=-0.01;sumGLbyD=35.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:286,24,0 30521-ref 447 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 30521-ref 485 . C T 204.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.05;SB=-0.01;sumGLbyD=39.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:237,18,0 30521-ref 735 . C T 198.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.12;SB=-0.01;sumGLbyD=38.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:232,18,0 30521-ref 737 . G A 154.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.74;SB=-0.01;sumGLbyD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:187,15,0 30521-ref 939 . G T 321.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.76;SB=-0.01;sumGLbyD=39.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:355,27,0 30521-ref 974 . T C 282.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:315,24,0 30521-ref 998 . C A 398.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.22;SB=-0.01;sumGLbyD=35.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:11:33.11:432,33,0 30521-ref 1067 . T C 374.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=31.22;SB=-0.01;sumGLbyD=33.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:6.49:406,6,0 30521-ref 1147 . A G 510.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.47;SB=-0.01;sumGLbyD=38.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:544,42,0 30521-ref 1155 . T C 479.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.92;SB=-0.01;sumGLbyD=39.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:513,39,0 30521-ref 1265 . G T 625.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.27;SB=-0.01;sumGLbyD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:18:54.15:658,54,0 30551-ref 139 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 30551-ref 175 . A C 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29.55:71,0,30 30551-ref 187 . T A 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 30551-ref 260 . A C 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 30551-ref 263 . T G 201.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.65;SB=-0.01;sumGLbyD=39.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 30551-ref 356 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 30620-ref 90 . T A 195.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.56;SB=-0.01;sumGLbyD=38.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:228,18,0 30721-ref 50 . C T 82.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.56;SB=-0.01;sumGLbyD=38.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 30721-ref 77 . G A 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 30739-ref 99 . T C 247.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.30;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:280,21,0 30745-ref 23 . T C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 30745-ref 68 . A T 64.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=21.40;SB=-0.01;sumGLbyD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:96,9,0 30745-ref 75 . A G 91.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=22.92;SB=-0.01;sumGLbyD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:124,12,0 30745-ref 89 . C T 180.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=30.01;SB=-0.01;sumGLbyD=35.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:213,18,0 30745-ref 144 . T C 232.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.22;SB=-0.01;sumGLbyD=37.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:265,21,0 30745-ref 166 . A G 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 30745-ref 182 . T C 33.21 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.07;SB=-0.01;sumGLbyD=21.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.29:63,0,30 30745-ref 191 . C G 118.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.71;SB=-0.01;sumGLbyD=37.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:151,12,0 30745-ref 210 . A G 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 30745-ref 243 . C A 247.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.30;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:280,21,0 30752-ref 12 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 30752-ref 182 . G A 123.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:156,12,0 30752-ref 189 . G A 81.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.27;SB=-0.01;sumGLbyD=38.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:114,9,0 30891-ref 91 . A C 350.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:384,30,0 30891-ref 151 . G T 325.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.18;SB=-0.01;sumGLbyD=39.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:359,27,0 30891-ref 185 . T C 457.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.42;MQ0=0;QD=35.20;SB=-0.01;sumGLbyD=37.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:491,39,0 30891-ref 189 . T G 188.72 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.42;MQ0=0;QD=14.52;SB=-0.01;sumGLbyD=16.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:12:99:219,0,164 30891-ref 233 . C T 222.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=31.78;SB=-0.01;sumGLbyD=36.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:255,21,0 30891-ref 240 . G A 223.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=31.90;SB=-0.01;sumGLbyD=36.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:256,21,0 30891-ref 262 . T G 64.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=12.92;SB=-0.01;sumGLbyD=18.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.28:95,0,64 30891-ref 276 . G C 41.26 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.63;SB=-0.01;sumGLbyD=36.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 30891-ref 350 . A C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 30891-ref 617 . A T 441.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.00;SB=-0.01;sumGLbyD=36.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:12:36.12:475,36,0 30891-ref 652 . C A 276.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9967;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.78;SB=-0.01;sumGLbyD=21.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:307,0,148 30891-ref 722 . T A 70.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:101,0,100 30891-ref 728 . C T 27.47 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.49;SB=-0.01;sumGLbyD=11.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:57.46:57,0,100 30891-ref 792 . C T 283.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.42;SB=-0.01;sumGLbyD=39.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:316,24,0 30891-ref 807 . A G 366.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.64;SB=-0.01;sumGLbyD=39.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:399,30,0 30891-ref 851 . A C 206.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 30891-ref 915 . T C 83.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.81;SB=-0.01;sumGLbyD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.03:115,9,0 30891-ref 938 . T C 293.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.72;SB=-0.01;sumGLbyD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:40.82:324,0,41 30891-ref 1009 . A G 192.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.06;SB=-0.01;sumGLbyD=37.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:225,18,0 30891-ref 1028 . A G 200.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.42;SB=-0.01;sumGLbyD=38.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:233,18,0 30891-ref 1224 . C G 268.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.87;SB=-0.01;sumGLbyD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:8:24.08:302,24,0 31010-ref 290 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 31010-ref 336 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 31165-ref 132 . T G 45.91 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.96;SB=-0.01;sumGLbyD=39.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:77,6,0 31248-ref 91 . T G 887.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=36.58;MQ0=0;QD=36.98;SB=-0.01;sumGLbyD=38.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.21:920,72,0 31248-ref 171 . T A 592.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.05;SB=-0.01;sumGLbyD=39.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.15:626,48,0 31248-ref 299 . T A 85.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.37;SB=-0.01;sumGLbyD=39.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:117,9,0 31257-ref 32 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 31257-ref 133 . A T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 31257-ref 163 . T C 125.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=20.96;SB=-0.01;sumGLbyD=26.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.03:158,15,0 31257-ref 188 . C T 233.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=29.15;SB=-0.01;sumGLbyD=33.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:266,24,0 31257-ref 207 . A G 205.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.22;MQ0=0;QD=22.84;SB=-0.01;sumGLbyD=26.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:7:21.05:239,21,0 31257-ref 225 . G A 210.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=30.04;SB=-0.01;sumGLbyD=34.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:243,21,0 31257-ref 310 . C T 296.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=32.95;SB=-0.01;sumGLbyD=36.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:330,27,0 31257-ref 347 . C A 180.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=33.48;MQ0=0;QD=30.12;SB=-0.01;sumGLbyD=35.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:214,18,0 31405-ref 2 . T G 32.32 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9966;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.77;SB=-0.01;sumGLbyD=20.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29.55:62,0,30 31405-ref 149 . T C 367.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.60;SB=-0.01;sumGLbyD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:0.01:395,0,0 31405-ref 278 . C G 36.54 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.18;SB=-0.01;sumGLbyD=22.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26.22:67,0,26 31405-ref 301 . G T 126.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 31405-ref 330 . T A 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 31558-ref 107 . A G 58.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.44;MQ0=0;QD=19.52;SB=-0.01;sumGLbyD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.01:91,9,0 31558-ref 153 . G T 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 31558-ref 553 . C T 194.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.06;MQ0=0;QD=32.47;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:228,18,0 31558-ref 784 . T C 240.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.05;SB=-0.01;sumGLbyD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.07:273,21,0 31624-ref 5 . C T 126.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.53;SB=-77.34;sumGLbyD=39.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 31624-ref 132 . G A 271.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.72;MQ0=0;QD=30.18;SB=-0.01;sumGLbyD=33.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.06:305,27,0 31624-ref 138 . G T 264.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.29;MQ0=0;QD=26.49;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:10:27.06:298,27,0 31624-ref 187 . C T 323.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=29.45;SB=-0.01;sumGLbyD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.06:357,30,0 31624-ref 204 . G A 40.46 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.53;SB=-0.01;sumGLbyD=4.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:70.46:70,0,441 31624-ref 296 . A G 1249.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=36.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:34:99:1283,102,0 31624-ref 299 . T C 1277.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8326;MQ=35.53;MQ0=0;QD=36.50;SB=-0.01;sumGLbyD=37.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1311,105,0 31624-ref 332 . G A 570.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.68;MQ0=0;QD=30.05;SB=-0.01;sumGLbyD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:18:54.11:604,54,0 31624-ref 387 . C T 254.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=31.81;SB=-0.01;sumGLbyD=35.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:287,24,0 31624-ref 392 . C G 243.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=30.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:277,24,0 31624-ref 402 . A C 144.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=24.05;SB=-0.01;sumGLbyD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:6:15.04:177,15,0 31675-ref 16 . A C 498.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.4357;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.64;SB=-0.01;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:532,42,0 31675-ref 79 . G C 3476.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.89;MQ0=0;QD=39.50;SB=-0.01;sumGLbyD=39.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,88:88:99:3476,265,0 31675-ref 147 . C G 2645.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.3660;MQ=34.76;MQ0=0;QD=35.75;SB=-0.01;sumGLbyD=36.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:73:99:2678,217,0 31675-ref 163 . C A 2026.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=34.25;MQ0=0;QD=35.55;SB=-0.01;sumGLbyD=36.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:56:99:2059,168,0 31675-ref 203 . C T 668.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=31.84;SB=-0.01;sumGLbyD=33.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.15:702,63,0 31675-ref 207 . G T 260.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.66;SB=-0.01;sumGLbyD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.05:293,30,0 31767-ref 23 . A G 161.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.85;SB=-0.01;sumGLbyD=32.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.05:194,15,0 31767-ref 53 . A T 185.41 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.83;SB=-0.01;sumGLbyD=10.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:215,0,485 31767-ref 84 . A G 989.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.61;MQ0=0;QD=38.04;SB=-0.01;sumGLbyD=39.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.25:1022,78,0 31767-ref 173 . C G 786.12 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.2971;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.57;SB=-0.01;sumGLbyD=25.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:32:99:816,0,212 31767-ref 377 . C T 824.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.56;MQ0=0;QD=35.84;SB=-0.01;sumGLbyD=37.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:23:66.21:857,66,0 31767-ref 455 . A T 1003.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.16;SB=-0.01;sumGLbyD=38.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.25:1036,81,0 31767-ref 563 . A G 967.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6006;MQ=32.58;MQ0=0;QD=33.35;SB=-0.01;sumGLbyD=34.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.23:1000,87,0 31767-ref 570 . G A 743.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=30.98;SB=-0.01;sumGLbyD=32.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.17:777,69,0 31767-ref 594 . G A 624.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.76;MQ0=0;QD=31.24;SB=-0.01;sumGLbyD=32.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.14:658,60,0 31767-ref 605 . A T 529.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=29.41;SB=-0.01;sumGLbyD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:17:51.12:562,51,0 31767-ref 633 . A G 536.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=35.73;SB=-0.01;sumGLbyD=37.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.14:569,45,0 31767-ref 761 . G A 1236.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.37;SB=-0.01;sumGLbyD=37.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:33:99:1270,99,0 31767-ref 936 . A T 363.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.35;SB=-0.01;sumGLbyD=39.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:397,30,0 31775-ref 268 . G A 1038.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9997;MQ=36.64;MQ0=0;QD=37.10;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.26:1072,84,0 31775-ref 341 . G C 467.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.99;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:501,39,0 31794-ref 36 . T G 92.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=23.13;SB=-0.01;sumGLbyD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:125,12,0 31794-ref 79 . G A 179.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.5784;MQ=34.60;MQ0=0;QD=13.78;SB=-0.01;sumGLbyD=16.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:12:99:209,0,164 31794-ref 83 . C A 246.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.06;MQ0=0;QD=15.41;SB=-0.01;sumGLbyD=17.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:14:99:277,0,156 31794-ref 101 . T A 351.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=20.66;SB=-0.01;sumGLbyD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:13:10.26:381,0,10 31794-ref 178 . C A 25.26 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.16;SB=-0.01;sumGLbyD=6.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55.24:55,0,209 31794-ref 190 . T C 22.96 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.55;SB=-0.01;sumGLbyD=5.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52.94:53,0,235 31794-ref 196 . G C 90.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.07;SB=-0.01;sumGLbyD=12.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:121,0,196 31794-ref 301 . G A 239.55 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.87;MQ0=0;QD=26.62;SB=-0.01;sumGLbyD=29.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12.92:269,0,13 31794-ref 363 . A G 259.40 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=35.63;MQ0=0;QD=17.29;SB=-0.01;sumGLbyD=19.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:14:99:289,0,154 31794-ref 385 . 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T C 428.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=32.97;SB=-0.01;sumGLbyD=35.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:12:36.11:462,36,0 31840-ref 88 . T G 37.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4346;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.20;SB=-0.01;sumGLbyD=3.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:67.42:67,0,494 31840-ref 175 . C T 225.30 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.04;SB=-0.01;sumGLbyD=7.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,9:32:99:255,0,794 31840-ref 191 . G A 1241.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.48;SB=-0.01;sumGLbyD=36.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:33:99:1275,99,0 31840-ref 349 . C G 315.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.06;SB=-0.01;sumGLbyD=38.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:349,27,0 31854-ref 49 . A G 952.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.61;MQ0=0;QD=36.63;SB=-0.01;sumGLbyD=37.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.23:985,78,0 31854-ref 55 . C T 1583.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8332;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.98;SB=-0.01;sumGLbyD=36.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:43:99:1616,129,0 31854-ref 106 . G A 4680.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.2267;MQ=36.22;MQ0=0;QD=36.00;SB=-0.01;sumGLbyD=35.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,127:124:99:4642,370,0 31854-ref 124 . G T 6723.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.5500;MQ=36.49;MQ0=0;QD=37.99;SB=-0.01;sumGLbyD=37.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,177:176:99:6723,530,0 31854-ref 349 . G A 4391.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=10.2203;MQ=36.83;MQ0=0;QD=37.22;SB=-0.01;sumGLbyD=36.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,116:114:99:4357,309,0 31854-ref 388 . G T 5516.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=142;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=9.6111;MQ=36.86;MQ0=0;QD=38.85;SB=-0.01;sumGLbyD=38.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:142:99:5481,424,0 31854-ref 453 . A T 5345.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=35.72;MQ0=0;QD=37.12;SB=-0.01;sumGLbyD=37.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,144:144:99:5345,433,0 31854-ref 472 . G A 5202.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=144;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6035;MQ=34.62;MQ0=0;QD=36.13;SB=-0.01;sumGLbyD=35.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,142:141:99:5172,421,0 31854-ref 501 . A G 5465.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=149;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.4889;MQ=34.56;MQ0=0;QD=36.68;SB=-0.01;sumGLbyD=36.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:148:99:5464,445,0 31854-ref 524 . A T 4112.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=113;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=34.80;MQ0=0;QD=36.39;SB=-0.01;sumGLbyD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,112:111:99:4112,334,0 31854-ref 537 . A G 4166.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=111;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.2579;MQ=35.33;MQ0=0;QD=37.53;SB=-0.01;sumGLbyD=37.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,111:111:99:4166,334,0 31854-ref 625 . T C 5492.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.5319;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.95;SB=-0.01;sumGLbyD=38.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,141:140:99:5492,421,0 31854-ref 747 . A T 43.53 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.77;SB=-0.01;sumGLbyD=37.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 31910-ref 121 . C A 142.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.88;SB=-0.01;sumGLbyD=19.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:173,0,129 31910-ref 160 . G A 390.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.50;SB=-0.01;sumGLbyD=38.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:423,33,0 31910-ref 204 . T C 549.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.35;SB=-0.01;sumGLbyD=36.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.14:583,45,0 31910-ref 269 . A G 174.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.83;SB=-0.01;sumGLbyD=18.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:204,0,161 31913-ref 36 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 31944-ref 133 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32021-ref 186 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32021-ref 200 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32021-ref 206 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=6;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32038-ref 83 . G T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 32038-ref 85 . G C 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 32044-ref 108 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32044-ref 126 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32047-ref 196 . A G 85.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.59;SB=-0.01;sumGLbyD=39.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:118,9,0 32047-ref 333 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32047-ref 342 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32086-ref 15 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32086-ref 73 . G T 266.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=34.39;MQ0=0;QD=33.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:299,24,0 32086-ref 240 . C T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 32086-ref 455 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32176-ref 90 . A T 1302.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=36.18;SB=-0.01;sumGLbyD=37.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1335,108,0 32176-ref 107 . G A 1650.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=36.68;SB=-0.01;sumGLbyD=37.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1684,135,0 32176-ref 108 . 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G T 36.56 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.19;SB=-0.01;sumGLbyD=22.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20.60:67,0,21 32396-ref 84 . T A 1881.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6988;MQ=36.38;MQ0=0;QD=38.39;SB=-0.01;sumGLbyD=39.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1914,147,0 32396-ref 147 . T G 4116.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.9241;MQ=36.54;MQ0=0;QD=37.77;SB=-0.01;sumGLbyD=37.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,107:109:99:4044,256,0 32396-ref 155 . T G 4472.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.7160;MQ=36.66;MQ0=0;QD=37.59;SB=-0.01;sumGLbyD=36.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,116:119:99:4352,238,0 32396-ref 236 . T A 2473.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=68;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.9905;MQ=36.70;MQ0=0;QD=36.38;SB=-0.01;sumGLbyD=36.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,66:68:99:2507,125,0 32396-ref 416 . T C 4733.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.0062;MQ=36.51;MQ0=0;QD=38.17;SB=-0.01;sumGLbyD=38.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,123:122:99:4733,367,0 32396-ref 486 . T A 3067.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7870;MQ=33.44;MQ0=0;QD=32.29;SB=-0.01;sumGLbyD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,90:95:99:3100,128,0 32396-ref 487 . G A 3416.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.2562;MQ=33.37;MQ0=0;QD=35.59;SB=-0.01;sumGLbyD=35.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,96:95:99:3416,286,0 32396-ref 521 . T A 2835.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8071;MQ=32.95;MQ0=0;QD=33.76;SB=-0.01;sumGLbyD=34.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:84:99:2869,247,0 32396-ref 537 . C T 1737.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=62;DS;Dels=0.02;HRun=3;HaplotypeScore=4.7182;MQ=32.51;MQ0=0;QD=28.02;SB=-0.01;sumGLbyD=28.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,56:61:2.64:1766,1,0 32396-ref 585 . C G 118.30 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=14.79;SB=-0.01;sumGLbyD=18.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:91.20:148,0,91 32396-ref 586 . A T 14.37 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=2.87;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.20:44,0,103 32396-ref 600 . C T 85.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.59;SB=-0.01;sumGLbyD=39.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:118,9,0 32396-ref 615 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32396-ref 638 . C T 924.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.30;MQ0=0;QD=31.89;SB=-0.01;sumGLbyD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,27:29:12.01:957,12,0 32396-ref 659 . A G 1678.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.6983;MQ=36.38;MQ0=0;QD=34.25;SB=-0.01;sumGLbyD=34.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,47:49:67.42:1711,67,0 32396-ref 718 . C G 760.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8661;MQ=32.83;MQ0=0;QD=33.04;SB=-0.01;sumGLbyD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.18:793,69,0 32396-ref 734 . G T 283.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=28.77;MQ0=0;QD=25.78;SB=-0.01;sumGLbyD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:317,30,0 32396-ref 735 . C T 318.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.77;MQ0=0;QD=28.97;SB=-0.01;sumGLbyD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.07:352,33,0 32396-ref 743 . C G 204.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.04:237,24,0 32594-ref 9 . C T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 32594-ref 13 . A T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 32594-ref 60 . C T 303.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.32;MQ0=0;QD=27.57;SB=-0.01;sumGLbyD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.07:336,33,0 32594-ref 74 . T G 303.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.32;MQ0=0;QD=27.57;SB=-0.01;sumGLbyD=30.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.07:336,33,0 32594-ref 90 . A G 294.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.12;MQ0=0;QD=29.44;SB=-0.01;sumGLbyD=32.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:327,30,0 32594-ref 92 . C T 254.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.11;MQ0=0;QD=28.26;SB=-0.01;sumGLbyD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.06:287,27,0 32594-ref 114 . C T 516.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.89;SB=-0.01;sumGLbyD=39.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:549,42,0 32594-ref 166 . T A 643.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:676,51,0 32594-ref 199 . C A 84.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.11;SB=-0.01;sumGLbyD=38.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:116,9,0 32594-ref 239 . C A 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=21.64;SB=-0.01;sumGLbyD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.03:119,9,0 32594-ref 254 . A T 722.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.6553;MQ=35.98;MQ0=0;QD=36.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.17:755,60,0 32594-ref 289 . A T 789.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.60;MQ0=0;QD=35.89;SB=-0.01;sumGLbyD=37.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.20:823,66,0 32638-ref 48 . C T 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 32638-ref 88 . T C 229.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=32.86;SB=-0.01;sumGLbyD=37.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:263,21,0 32638-ref 97 . A G 151.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=30.25;SB=-0.01;sumGLbyD=36.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:184,15,0 32638-ref 213 . C A 153.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.67;SB=-0.01;sumGLbyD=37.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:186,15,0 32638-ref 287 . C A 202.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.81;SB=-0.01;sumGLbyD=39.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:236,18,0 32638-ref 330 . T C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 32638-ref 346 . G C 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 32725-ref 137 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32725-ref 138 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32725-ref 155 . A T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 32725-ref 206 . C T 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 32725-ref 232 . A T 36.18 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.09;SB=-0.01;sumGLbyD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:67,6,0 32725-ref 298 . A T 223.16 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.80;SB=-0.01;sumGLbyD=28.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:8:13.72:253,0,14 32725-ref 330 . C A 352.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.28;SB=-0.01;sumGLbyD=38.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:386,30,0 32725-ref 603 . A T 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 32725-ref 605 . G T 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 32725-ref 659 . G T 100.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=25.21;SB=-0.01;sumGLbyD=33.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:133,12,0 32807-ref 180 . C T 411.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.69;SB=-0.01;sumGLbyD=15.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,15:26:99:441,0,390 32807-ref 344 . T C 369.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.47;MQ0=0;QD=19.46;SB=-0.01;sumGLbyD=21.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:99:400,0,211 32807-ref 438 . G A 314.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.68;SB=-0.01;sumGLbyD=21.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,11:16:99:345,0,136 32807-ref 530 . C A 71.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8332;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.99;SB=-0.01;sumGLbyD=16.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:93.33:102,0,93 32807-ref 553 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=9;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32807-ref 574 . T A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 32807-ref 664 . T C 199.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.23;SB=-0.01;sumGLbyD=38.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:232,18,0 32807-ref 732 . A C 138.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=13.85;SB=-0.01;sumGLbyD=16.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:169,0,157 32807-ref 773 . A C 74.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=24.90;SB=-0.01;sumGLbyD=35.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:107,9,0 32863-ref 148 . C T 94.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9928;MQ=34.93;MQ0=0;QD=18.85;SB=-0.01;sumGLbyD=24.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:22.76:124,0,23 32863-ref 149 . A G 105.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=34.39;MQ0=0;QD=26.33;SB=-0.01;sumGLbyD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:138,12,0 32879-ref 76 . A C 44.89 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 32910-ref 71 . A C 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 32910-ref 139 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32910-ref 211 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32910-ref 214 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 32910-ref 328 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 33001-ref 223 . T A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 33001-ref 239 . T C 119.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:152,12,0 33001-ref 255 . C A 166.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 33001-ref 348 . G A 616.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=36.27;SB=-0.01;sumGLbyD=38.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:650,51,0 33001-ref 477 . G A 164.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.89;SB=-0.01;sumGLbyD=39.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:197,15,0 33030-ref 53 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 33039-ref 373 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 33260-ref 32 . C A 220.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.87;MQ0=0;QD=24.53;SB=5.70;sumGLbyD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:24.23:251,0,24 33260-ref 81 . G A 258.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4688;MQ=35.98;MQ0=0;QD=25.85;SB=-0.01;sumGLbyD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:10:3.51:288,0,4 33260-ref 118 . C T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 33260-ref 177 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 33315-ref 66 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 33315-ref 462 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 33353-ref 189 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 33434-ref 12 . G T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 33434-ref 14 . C T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 33434-ref 60 . G T 1272.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.35;SB=-0.01;sumGLbyD=36.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,35:36:73.98:1306,74,0 33506-ref 100 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 33537-ref 211 . G A 65.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.87;SB=-0.01;sumGLbyD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:93.51:95,0,94 33537-ref 238 . A T 42.59 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:74,6,0 33537-ref 239 . C G 42.59 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:74,6,0 33537-ref 251 . A T 44.35 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.18;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 33537-ref 270 . C G 112.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.56;SB=-0.01;sumGLbyD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.96:143,0,25 33537-ref 373 . C T 287.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9985;MQ=35.87;MQ0=0;QD=31.90;SB=-0.01;sumGLbyD=35.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:9:24.08:320,24,0 33537-ref 413 . T A 73.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=35.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:105,9,0 33537-ref 442 . C T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=19.40;SB=-0.01;sumGLbyD=27.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.03:110,9,0 33537-ref 466 . G T 198.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.12;SB=-0.01;sumGLbyD=38.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:232,18,0 33537-ref 540 . C G 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 33605-ref 50 . A G 229.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.49;SB=-0.01;sumGLbyD=15.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:259,0,302 33605-ref 63 . A G 624.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.44;MQ0=0;QD=34.72;SB=-0.01;sumGLbyD=36.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:18:51.16:658,51,0 33605-ref 103 . A G 132.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6643;MQ=36.07;MQ0=0;QD=6.00;SB=-0.01;sumGLbyD=7.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:22:99:162,0,517 33605-ref 110 . A T 491.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7262;MQ=36.19;MQ0=0;QD=19.65;SB=-0.01;sumGLbyD=20.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,17:24:99:521,0,229 33605-ref 122 . C T 236.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.3633;MQ=35.72;MQ0=0;QD=9.87;SB=-0.01;sumGLbyD=11.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,9:24:99:267,0,488 33605-ref 159 . A G 495.65 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9946;MQ=35.28;MQ0=0;QD=16.52;SB=-0.01;sumGLbyD=17.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,17:30:99:526,0,423 33605-ref 182 . C A 274.64 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8600;MQ=34.75;MQ0=0;QD=11.94;SB=-0.01;sumGLbyD=13.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:99:305,0,399 33605-ref 203 . T C 180.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.7206;MQ=35.87;MQ0=0;QD=10.02;SB=-0.01;sumGLbyD=11.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:17:99:210,0,335 33605-ref 248 . T C 365.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9985;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.52;SB=-0.01;sumGLbyD=23.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:396,0,147 33605-ref 464 . C T 165.70 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.84;SB=-0.01;sumGLbyD=13.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:196,0,273 33605-ref 481 . C T 227.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.98;SB=-0.01;sumGLbyD=13.56 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:258,0,357 33605-ref 586 . A G 892.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.32;SB=-0.01;sumGLbyD=35.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,25:26:46.67:925,47,0 33605-ref 674 . A G 479.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.5667;MQ=36.67;MQ0=0;QD=15.48;SB=-0.01;sumGLbyD=16.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,17:30:99:510,0,462 33605-ref 710 . A T 762.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.14;SB=-0.01;sumGLbyD=39.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.20:796,60,0 33605-ref 722 . T C 152.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.05;SB=-0.01;sumGLbyD=9.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:183,0,461 33605-ref 773 . T C 72.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.63;MQ0=0;QD=4.82;SB=-0.01;sumGLbyD=6.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:102,0,357 33605-ref 779 . T C 471.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9654;MQ=35.63;MQ0=0;QD=31.46;SB=-0.01;sumGLbyD=33.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.10:505,42,0 33605-ref 834 . G C 237.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9056;MQ=35.28;MQ0=0;QD=19.83;SB=-0.01;sumGLbyD=22.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:268,0,109 33605-ref 860 . C T 160.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9968;MQ=35.98;MQ0=0;QD=16.01;SB=-0.01;sumGLbyD=19.01 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:190,0,128 33605-ref 1166 . A C 131.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.92;SB=-0.01;sumGLbyD=13.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:161,0,234 33605-ref 1210 . T C 200.82 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.45;SB=-0.01;sumGLbyD=17.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:231,0,201 33605-ref 1250 . T A 93.90 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.82;SB=-0.01;sumGLbyD=10.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:124,0,245 33605-ref 1406 . A G 98.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=14.08;SB=-0.01;sumGLbyD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:97.52:129,0,98 33605-ref 1416 . G A 95.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=11.95;SB=-0.01;sumGLbyD=15.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:126,0,136 33605-ref 1487 . C G 201.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.62;SB=-0.01;sumGLbyD=39.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:235,18,0 33654-ref 38 . G A 39.56 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.19;SB=-0.01;sumGLbyD=23.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:70,0,31 33654-ref 128 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 33655-ref 230 . A G 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 33655-ref 343 . A C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 33655-ref 364 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 33655-ref 391 . A G 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 33730-ref 35 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 33730-ref 42 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 33730-ref 196 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 33904-ref 84 . C A 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 33904-ref 139 . A G 103.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8666;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.46;SB=-0.01;sumGLbyD=14.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:9:99:133,0,136 33904-ref 216 . G C 282.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.25;SB=-0.01;sumGLbyD=39.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:315,24,0 33904-ref 408 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 33904-ref 467 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 33904-ref 468 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 33979-ref 264 . T A 352.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:386,30,0 33979-ref 360 . C G 119.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.80;SB=-0.01;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:152,12,0 34100-ref 100 . G A 438.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.56;SB=-0.01;sumGLbyD=39.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:472,36,0 34100-ref 139 . A T 27.15 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.60;SB=-0.01;sumGLbyD=3.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:57.14:57,0,505 34100-ref 158 . A G 834.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.93;SB=-0.01;sumGLbyD=39.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.21:868,66,0 34100-ref 206 . A G 812.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=36.91;SB=-0.01;sumGLbyD=38.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.21:845,66,0 34100-ref 239 . C A 115.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.93;SB=-0.01;sumGLbyD=37.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:148,12,0 34100-ref 243 . T A 76.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.39;SB=-0.01;sumGLbyD=36.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 34139-ref 70 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 34139-ref 128 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 34139-ref 158 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 34208-ref 177 . A T 131.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=26.34;SB=-0.01;sumGLbyD=32.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:164,15,0 34208-ref 178 . C G 134.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=26.94;SB=-0.01;sumGLbyD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:167,15,0 34208-ref 190 . T C 83.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=16.77;SB=-0.01;sumGLbyD=22.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.97:114,0,25 34208-ref 211 . C T 136.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=27.23;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:169,15,0 34208-ref 251 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 34208-ref 417 . C T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 34208-ref 442 . T G 30.62 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=10.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:61,0,31 34208-ref 512 . T C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 34208-ref 528 . C T 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.29:71,0,30 34208-ref 537 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 34208-ref 582 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 34235-ref 96 . G C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 34235-ref 135 . G A 79.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.51;SB=-0.01;sumGLbyD=37.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:112,9,0 34271-ref 144 . A T 30.20 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9979;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.03;SB=-0.01;sumGLbyD=10.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60.19:60,0,66 34271-ref 186 . T A 22.26 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6208;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.47;SB=-0.01;sumGLbyD=5.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52.23:52,0,252 34341-ref 80 . T C 69.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.86;SB=-0.01;sumGLbyD=19.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:57.10:99,0,57 34350-ref 33 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 34350-ref 118 . T A 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 34350-ref 132 . T A 205.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 34350-ref 225 . G A 139.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.19;SB=-0.01;sumGLbyD=28.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.02:172,15,0 34350-ref 271 . G C 174.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.92;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:207,21,0 34350-ref 281 . A G 174.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.92;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:207,21,0 34350-ref 284 . C T 212.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=26.52;SB=-37.77;sumGLbyD=30.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:245,24,0 34350-ref 288 . A C 214.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=26.80;SB=-39.98;sumGLbyD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:247,24,0 34350-ref 354 . T G 316.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.14;SB=-0.01;sumGLbyD=38.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:349,27,0 34350-ref 452 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 34350-ref 455 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 34368-ref 148 . T G 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 34368-ref 234 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 34452-ref 22 . A T 81.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.14;SB=-0.01;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:113,9,0 34452-ref 75 . A T 70.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.36;SB=-0.01;sumGLbyD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:102,9,0 34452-ref 232 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 34452-ref 233 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 34461-ref 27 . T C 196.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:230,18,0 34461-ref 54 . C T 233 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.29;SB=-0.01;sumGLbyD=38.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:266,21,0 34461-ref 72 . G A 274.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.32;SB=-0.01;sumGLbyD=38.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:308,24,0 34461-ref 207 . C A 122.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.69;SB=-0.01;sumGLbyD=38.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:155,12,0 34469-ref 75 . C A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 34469-ref 164 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,2:1:1.76:40,3,0 34469-ref 197 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 34494-ref 84 . G A 124.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.93;SB=-0.01;sumGLbyD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.04:157,12,0 34494-ref 339 . G C 122.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.57;SB=-0.01;sumGLbyD=38.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:155,12,0 34516-ref 191 . G A 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 34527-ref 37 . A C 114.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.53;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:147,12,0 34527-ref 65 . T A 116.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.11;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:149,12,0 34527-ref 82 . T C 114.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.53;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:147,12,0 34538-ref 82 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 34553-ref 45 . A C 233.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.34;SB=-0.01;sumGLbyD=38.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:266,21,0 34553-ref 67 . T C 287.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:320,24,0 34553-ref 124 . C G 237.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.99;SB=-0.01;sumGLbyD=38.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:271,21,0 34655-ref 84 . A T 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 34698-ref 426 . G C 23.09 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=11.55;SB=-0.01;sumGLbyD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 34698-ref 436 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 34698-ref 547 . C T 71.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.81;SB=-0.01;sumGLbyD=34.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:103,9,0 34698-ref 589 . C T 50.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=10.10;SB=-0.01;sumGLbyD=16.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63.54:80,0,64 34698-ref 595 . A G 146.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9993;MQ=34.93;MQ0=0;QD=29.36;SB=-0.01;sumGLbyD=35.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:180,15,0 34736-ref 23 . T C 25.48 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.10;SB=-0.01;sumGLbyD=11.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:55.46:55,0,103 34736-ref 30 . T C 198.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.11;SB=-0.01;sumGLbyD=38.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:232,18,0 34736-ref 80 . T G 470.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.16;SB=-0.01;sumGLbyD=38.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:503,39,0 34736-ref 137 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 34736-ref 160 . G C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 34736-ref 207 . A G 265.81 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.12;MQ0=0;QD=24.16;SB=-0.01;sumGLbyD=26.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:46.92:296,0,47 34736-ref 218 . T C 340.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=34.06;SB=-0.01;sumGLbyD=37.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:374,30,0 34736-ref 229 . G A 11.25 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.42;MQ0=0;QD=0.87;SB=-0.01;sumGLbyD=3.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,2:13:40.91:41,0,360 34736-ref 232 . G A 336.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.42;MQ0=0;QD=25.89;SB=-0.01;sumGLbyD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:40.89:367,0,41 34736-ref 339 . A C 204.04 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.57;SB=-0.01;sumGLbyD=16.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:234,0,217 34736-ref 658 . T C 367.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.71;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:400,30,0 34736-ref 708 . C A 28.95 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.14;SB=-0.01;sumGLbyD=8.42 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58.94:59,0,179 34857-ref 97 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 34857-ref 254 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 34857-ref 273 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 34900-ref 322 . C T 350.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:384,30,0 34900-ref 352 . A T 365.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.56;SB=-40.00;sumGLbyD=39.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:399,30,0 34900-ref 373 . C T 632.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.20;SB=-40.01;sumGLbyD=39.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:665,51,0 34900-ref 436 . C T 736.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=36.82;SB=-0.01;sumGLbyD=38.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:769,60,0 34900-ref 484 . G A 832.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.66;MQ0=0;QD=36.18;SB=-0.01;sumGLbyD=37.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.21:865,69,0 34900-ref 526 . A G 727.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9989;MQ=36.52;MQ0=0;QD=34.63;SB=-36.98;sumGLbyD=36.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:33.58:760,34,0 34900-ref 530 . G A 19.34 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=35.21;MQ0=0;QD=0.84;SB=3.00;sumGLbyD=2.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:49.28:49,0,671 34900-ref 531 . C T 22.33 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9987;MQ=35.12;MQ0=0;QD=1.01;SB=3.00;sumGLbyD=2.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:52.29:52,0,639 34900-ref 564 . A C 504.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8664;MQ=35.38;MQ0=0;QD=13.28;SB=3.00;sumGLbyD=14.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,18:38:99:535,0,668 34900-ref 578 . G C 1125.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9947;MQ=34.73;MQ0=0;QD=35.19;SB=-0.01;sumGLbyD=36.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:32:93.27:1159,93,0 34900-ref 610 . C G 187.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.9284;MQ=34.93;MQ0=0;QD=9.39;SB=-0.01;sumGLbyD=10.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:19:99:218,0,381 34900-ref 616 . G C 97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.9952;MQ=34.69;MQ0=0;QD=5.39;SB=-0.01;sumGLbyD=7.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:127,0,394 34900-ref 620 . G C 161.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=26.96;SB=-0.01;sumGLbyD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:195,18,0 34900-ref 633 . G A 100.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=25.17;SB=-0.01;sumGLbyD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:133,12,0 34900-ref 652 . A T 65.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=21.67;SB=-0.01;sumGLbyD=32.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:97,9,0 35043-ref 13 . C G 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 35043-ref 38 . G A 371.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.94;SB=-0.01;sumGLbyD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:404,33,0 35043-ref 199 . C T 623.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.71;SB=-0.01;sumGLbyD=31.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,19:21:13.12:654,0,13 35043-ref 202 . C T 794.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.82;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:827,63,0 35043-ref 316 . T A 275.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9894;MQ=32.22;MQ0=0;QD=30.65;SB=-0.01;sumGLbyD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:309,27,0 35043-ref 318 . A G 96.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9894;MQ=31.58;MQ0=0;QD=12.06;SB=-0.01;sumGLbyD=15.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:85.60:127,0,86 35043-ref 325 . A C 205.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9894;MQ=30.72;MQ0=0;QD=29.37;SB=-0.01;sumGLbyD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:239,21,0 35043-ref 334 . A C 17.31 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=28.48;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.22:47,0,58 35043-ref 353 . T C 174.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.92;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:207,21,0 35043-ref 367 . A G 233.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.96;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.05:267,27,0 35043-ref 384 . A G 388.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.22;MQ0=0;QD=29.91;SB=-0.01;sumGLbyD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.09:422,39,0 35043-ref 394 . A T 433.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.84;MQ0=0;QD=30.97;SB=-0.01;sumGLbyD=33.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.10:467,42,0 35043-ref 420 . A G 568.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.60;MQ0=0;QD=25.86;SB=-0.01;sumGLbyD=27.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:93.83:599,0,94 35043-ref 433 . G A 45.77 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9999;MQ=36.27;MQ0=0;QD=1.63;SB=-0.01;sumGLbyD=2.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:75.76:76,0,825 35043-ref 463 . T C 989.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.63;MQ0=0;QD=36.64;SB=-0.01;sumGLbyD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.25:1022,81,0 35043-ref 690 . G A 1436.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.73;MQ0=0;QD=37.79;SB=-0.01;sumGLbyD=38.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:38:99:1469,114,0 35043-ref 705 . A T 119.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.66;MQ0=0;QD=4.00;SB=-0.01;sumGLbyD=5.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,6:29:99:150,0,821 35043-ref 710 . G A 1082.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.5661;MQ=36.65;MQ0=0;QD=37.32;SB=-0.01;sumGLbyD=38.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.27:1115,87,0 35051-ref 21 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 35051-ref 128 . T C 12.74 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.16;SB=-0.01;sumGLbyD=3.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:42.49:42,0,307 35051-ref 139 . C A 204.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.16;SB=-0.01;sumGLbyD=39.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:238,18,0 35153-ref 108 . A G 89.53 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9748;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.95;SB=-0.01;sumGLbyD=11.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:120,0,210 35153-ref 295 . G A 815.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.7756;MQ=36.65;MQ0=0;QD=28.11;SB=-0.01;sumGLbyD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,25:26:1.77:845,3,0 35153-ref 362 . T C 1562.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.76;MQ0=0;QD=37.20;SB=-0.01;sumGLbyD=37.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:41:99:1595,123,0 35153-ref 414 . A G 564.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=35.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:598,48,0 35153-ref 419 . C T 46.88 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=4.69;SB=-0.01;sumGLbyD=7.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:9:76.87:77,0,211 35153-ref 435 . G C 70.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=23.55;SB=-0.01;sumGLbyD=34.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:103,9,0 35447-ref 6 . A C 104.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=26.13;SB=-0.01;sumGLbyD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:137,12,0 35447-ref 24 . G A 468.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=36.02;SB=-0.01;sumGLbyD=38.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:501,39,0 35447-ref 50 . T G 1380.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9612;MQ=34.67;MQ0=0;QD=28.17;SB=-0.01;sumGLbyD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,41:49:89.56:1410,0,90 35447-ref 58 . G C 50.52 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.6077;MQ=34.89;MQ0=0;QD=0.94;SB=-0.01;sumGLbyD=1.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,8:52:80.51:81,0,1563 35447-ref 68 . C T 59.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.5347;MQ=34.53;MQ0=0;QD=1.00;SB=-0.01;sumGLbyD=1.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,9:59:89.08:89,0,1764 35447-ref 83 . G T 114.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9662;MQ=34.49;MQ0=0;QD=2.11;SB=-0.01;sumGLbyD=2.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,10:54:99:144,0,1516 35447-ref 100 . T C 1759.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.29;MQ0=0;QD=35.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:50:99:1792,150,0 35447-ref 158 . A T 41.26 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.63;SB=-0.01;sumGLbyD=36.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 35690-ref 426 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 35690-ref 734 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 35701-ref 21 . A G 84.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.11;SB=-0.01;sumGLbyD=38.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:116,9,0 35701-ref 54 . T C 199.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.23;SB=-0.01;sumGLbyD=38.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:232,18,0 35702-ref 61 . G A 345.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.57;SB=-0.01;sumGLbyD=37.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:379,30,0 35887-ref 70 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 35887-ref 126 . A T 622.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=36.64;SB=-0.01;sumGLbyD=38.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:656,51,0 35887-ref 183 . T C 508.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=36.32;MQ0=0;QD=33.91;SB=-0.01;sumGLbyD=36.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.13:542,42,0 35887-ref 349 . T C 232.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.19;SB=-0.01;sumGLbyD=37.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:265,21,0 35887-ref 426 . C T 432.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.03;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:465,36,0 35887-ref 575 . G A 399.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:433,33,0 35887-ref 605 . C T 161.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.40;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:195,15,0 35887-ref 653 . T G 247.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.30;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:280,21,0 35887-ref 699 . T C 10.38 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=0.94;SB=-0.01;sumGLbyD=3.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:39.96:40,0,302 35887-ref 711 . C T 360.74 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=30.06;SB=-0.01;sumGLbyD=32.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:3.89:390,0,4 35887-ref 717 . G A 322.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.07;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:6.90:352,0,7 35887-ref 750 . G C 497.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.50;SB=-0.01;sumGLbyD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:530,42,0 35887-ref 864 . T C 401.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.54;SB=-0.01;sumGLbyD=39.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:435,33,0 35887-ref 924 . A T 121.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.47;SB=-0.01;sumGLbyD=38.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:154,12,0 35929-ref 163 . T C 420.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.07;SB=-0.01;sumGLbyD=37.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:454,36,0 35965-ref 31 . G T 35.76 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.92;SB=-0.01;sumGLbyD=21.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26.22:66,0,26 35965-ref 40 . C G 104.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=34.93;MQ0=0;QD=20.92;SB=-0.01;sumGLbyD=26.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.96:135,0,25 35965-ref 196 . A C 394.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4076;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.86;SB=-0.01;sumGLbyD=38.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:427,33,0 35965-ref 260 . A G 451.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=33.22;MQ0=0;QD=32.24;SB=-0.01;sumGLbyD=34.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.10:484,42,0 35965-ref 295 . A G 306.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=30.62;SB=-0.01;sumGLbyD=33.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:339,30,0 35965-ref 296 . A G 307.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=30.71;SB=-0.01;sumGLbyD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:340,30,0 36057-ref 82 . T A 502.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.37;MQ0=0;QD=31.40;SB=-0.01;sumGLbyD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:14:42.13:535,42,0 36057-ref 115 . C T 418.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=34.84;SB=-0.01;sumGLbyD=37.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:451,36,0 36057-ref 147 . G A 419.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.95;SB=-0.01;sumGLbyD=37.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:452,36,0 36057-ref 216 . A G 93.80 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=11.73;SB=-0.01;sumGLbyD=15.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:7:61.59:124,0,62 36131-ref 154 . A G 149.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.81;SB=-0.01;sumGLbyD=36.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:182,15,0 36131-ref 290 . A T 84.27 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.09;SB=-0.01;sumGLbyD=38.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:116,9,0 36131-ref 376 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 36210-ref 102 . G T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-39.55;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 36210-ref 124 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-38.76;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 36210-ref 126 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-38.76;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 36247-ref 30 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 36294-ref 51 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 36316-ref 127 . G A 37.41 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.71;SB=-0.01;sumGLbyD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:69,6,0 36316-ref 293 . T G 123.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.78;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:156,12,0 36316-ref 330 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 36316-ref 526 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 36316-ref 544 . A C 83.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 36413-ref 103 . A G 80.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.83;SB=-0.01;sumGLbyD=37.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:113,9,0 36536-ref 183 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 36536-ref 225 . G T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 36536-ref 232 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 36536-ref 271 . T A 157.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.46;SB=-0.01;sumGLbyD=38.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 36536-ref 307 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 36536-ref 335 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 36607-ref 178 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 36607-ref 208 . G C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 36607-ref 219 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 36607-ref 220 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 36680-ref 138 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 36680-ref 292 . G T 107.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.89;SB=-0.01;sumGLbyD=35.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:140,12,0 36785-ref 108 . G C 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 36785-ref 119 . C T 82.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:114,9,0 36810-ref 22 . A G 199.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.23;SB=-0.01;sumGLbyD=38.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:232,18,0 36810-ref 76 . T C 541.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.26;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=33.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.13:575,48,0 36810-ref 90 . A G 561.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.60;MQ0=0;QD=33.05;SB=-0.01;sumGLbyD=34.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.14:595,51,0 36810-ref 124 . T C 393.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.22;MQ0=0;QD=30.28;SB=-0.01;sumGLbyD=32.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.09:427,39,0 36810-ref 136 . A G 473.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=31.58;SB=-0.01;sumGLbyD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.11:507,45,0 36810-ref 175 . A G 213.74 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.63;MQ0=0;QD=14.25;SB=-0.01;sumGLbyD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:244,0,233 36810-ref 176 . G T 526.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.63;MQ0=0;QD=35.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:559,45,0 36810-ref 283 . G T 416.47 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.83;SB=-0.01;sumGLbyD=21.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,13:21:99:446,0,253 36810-ref 292 . A C 155.24 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.13;SB=-0.01;sumGLbyD=10.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:185,0,389 36810-ref 294 . G A 606.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.90;SB=-0.01;sumGLbyD=39.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.16:639,48,0 36810-ref 316 . T G 182.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.33;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:90.81:213,0,91 36810-ref 331 . C T 31.80 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.95;SB=-0.01;sumGLbyD=15.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61.79:62,0,67 36908-ref 52 . A G 136.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=27.23;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:169,15,0 36908-ref 68 . A T 519.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.21;MQ0=0;QD=34.60;SB=-0.01;sumGLbyD=36.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:552,45,0 36908-ref 90 . T C 475.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=33.96;SB=-0.01;sumGLbyD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.12:508,42,0 36908-ref 108 . C T 439.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.77;MQ0=0;QD=33.84;SB=-0.01;sumGLbyD=36.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.11:473,39,0 36908-ref 270 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 36908-ref 285 . C G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 36908-ref 311 . A G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 36908-ref 325 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 36908-ref 370 . C T 155.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.19;SB=-0.01;sumGLbyD=37.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:189,15,0 36908-ref 435 . C G 186.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.05;SB=-0.01;sumGLbyD=36.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:219,18,0 36908-ref 452 . T C 165.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.18;SB=-0.01;sumGLbyD=39.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 36908-ref 454 . A G 158.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.70;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:191,15,0 36928-ref 80 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 36928-ref 96 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 36928-ref 359 . C T 121.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.47;SB=-0.01;sumGLbyD=38.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:154,12,0 36928-ref 547 . G A 155.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.18;SB=-0.01;sumGLbyD=37.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:189,15,0 36928-ref 745 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 36928-ref 835 . G T 154.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.82;SB=-0.01;sumGLbyD=37.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:187,15,0 36928-ref 951 . C G 103.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.73;SB=-0.01;sumGLbyD=26.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.96:134,0,25 36928-ref 1002 . A C 365.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.56;SB=-0.01;sumGLbyD=39.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:399,30,0 36928-ref 1091 . T C 317.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.33;SB=-0.01;sumGLbyD=38.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:351,27,0 36928-ref 1107 . T C 197.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.24;SB=-0.01;sumGLbyD=32.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.06:231,18,0 36928-ref 1229 . C G 150.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.09;SB=-0.01;sumGLbyD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.95:181,0,22 36928-ref 1252 . T C 163.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.68;SB=-0.01;sumGLbyD=39.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 37006-ref 69 . C A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 37006-ref 91 . G C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 37006-ref 109 . A G 17.31 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9992;MQ=25.00;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.22:47,0,47 37006-ref 132 . G T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.21;SB=-0.01;sumGLbyD=22.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 37006-ref 163 . G C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 37063-ref 12 . A G 189.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.53;SB=-0.01;sumGLbyD=37.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:222,18,0 37063-ref 33 . G A 2372.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.6553;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.66;SB=-0.01;sumGLbyD=38.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,62:62:99:2405,187,0 37063-ref 120 . A T 64.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=21.40;SB=-0.01;sumGLbyD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:96,9,0 37063-ref 121 . G T 62.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=20.82;SB=-0.01;sumGLbyD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:94,9,0 37063-ref 122 . A T 62.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=20.82;SB=-0.01;sumGLbyD=31.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:94,9,0 37099-ref 27 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37099-ref 40 . T C 33.91 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.30;SB=-0.01;sumGLbyD=21.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:64,0,31 37099-ref 61 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 37099-ref 136 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37099-ref 140 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37220-ref 278 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 37273-ref 93 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37273-ref 136 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 37273-ref 181 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 37273-ref 182 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 37273-ref 196 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 37273-ref 240 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 37413-ref 55 . T C 725.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.20;SB=-80.02;sumGLbyD=39.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.19:759,57,0 37454-ref 129 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 37454-ref 130 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 37454-ref 164 . C A 17.31 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=4.33;SB=10.77;sumGLbyD=11.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.22:47,0,47 37454-ref 180 . A G 73.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.61;MQ0=0;QD=14.72;SB=-45.59;sumGLbyD=20.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:12.64:103,0,13 37454-ref 192 . G A 14.39 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.61;MQ0=0;QD=2.88;SB=6.03;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.22:44,0,72 37454-ref 193 . A G 14.39 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.61;MQ0=0;QD=2.88;SB=6.03;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.22:44,0,72 37454-ref 194 . A C 14.39 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.61;MQ0=0;QD=2.88;SB=6.03;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.22:44,0,72 37462-ref 66 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 37462-ref 68 . C A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=9.34;SB=-0.01;sumGLbyD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6.01:59,6,0 37462-ref 103 . G A 433.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.91;MQ0=0;QD=33.31;SB=-0.01;sumGLbyD=35.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.11:466,39,0 37462-ref 135 . G C 675.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9987;MQ=32.11;MQ0=0;QD=30.72;SB=-0.01;sumGLbyD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,21:22:36.55:709,37,0 37462-ref 141 . A G 605.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=32.41;MQ0=0;QD=28.84;SB=-0.01;sumGLbyD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:20:30.53:639,31,0 37462-ref 185 . C T 457.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=32.66;SB=-40.01;sumGLbyD=35.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:490,42,0 37462-ref 195 . C A 245.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=30.69;SB=-39.98;sumGLbyD=34.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:279,24,0 37462-ref 199 . T C 156.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.24;SB=-39.76;sumGLbyD=37.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:189,15,0 37462-ref 404 . A G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-28.84;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 37462-ref 417 . G A 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-28.84;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 37462-ref 440 . 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T C 678.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.9952;MQ=36.39;MQ0=0;QD=13.58;SB=-0.01;sumGLbyD=14.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,22:49:99:709,0,881 37506-ref 390 . G C 234.72 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.4665;MQ=36.20;MQ0=0;QD=6.18;SB=-0.01;sumGLbyD=6.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,10:38:99:265,0,963 37506-ref 410 . C T 1006.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9992;MQ=35.63;MQ0=0;QD=33.54;SB=-0.01;sumGLbyD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,29:29:57.65:1039,58,0 37506-ref 416 . A G 1258.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.9991;MQ=35.23;MQ0=0;QD=35.94;SB=-29.63;sumGLbyD=36.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1291,105,0 37506-ref 430 . C T 1198.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.83;MQ0=0;QD=34.23;SB=-29.63;sumGLbyD=35.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:33:99:1231,99,0 37506-ref 462 . C T 644.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.2574;MQ=35.94;MQ0=0;QD=13.42;SB=-0.01;sumGLbyD=14.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:46:99:674,0,790 37506-ref 492 . T C 704.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.57;MQ0=0;QD=14.99;SB=-0.01;sumGLbyD=15.63 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,23:46:99:734,0,743 37506-ref 503 . A G 1534.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.51;MQ0=0;QD=37.42;SB=-0.01;sumGLbyD=38.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1567,123,0 37506-ref 683 . A G 1147.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9980;MQ=36.68;MQ0=0;QD=35.87;SB=29.62;sumGLbyD=36.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:66.68:1181,67,0 37506-ref 794 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37506-ref 1096 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37506-ref 1141 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 37506-ref 1209 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37506-ref 1273 . G A 247.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.30;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:280,21,0 37523-ref 86 . C A 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 37523-ref 94 . T C 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 37550-ref 14 . C G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 37550-ref 18 . A G 204.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.07;SB=-0.01;sumGLbyD=39.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:237,18,0 37550-ref 55 . C T 942.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.60;MQ0=0;QD=37.68;SB=-0.01;sumGLbyD=39.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.24:975,75,0 37550-ref 106 . C T 790.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9979;MQ=33.02;MQ0=0;QD=32.92;SB=-0.01;sumGLbyD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:24:69.19:823,69,0 37550-ref 119 . A T 480.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.18;MQ0=0;QD=32.07;SB=-0.01;sumGLbyD=34.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.11:514,45,0 37550-ref 126 . T C 364 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=30.33;SB=-0.01;sumGLbyD=33.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.08:397,36,0 37550-ref 152 . C G 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:148,15,0 37565-ref 96 . G A 1990.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.30;MQ0=0;QD=34.32;SB=-0.01;sumGLbyD=34.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,57:57:99:2023,136,0 37565-ref 125 . T C 83.12 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.02;HRun=1;HaplotypeScore=13.6698;MQ=35.59;MQ0=0;QD=1.63;SB=-0.01;sumGLbyD=2.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,7:50:99:113,0,1487 37565-ref 144 . G T 1617.13 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8665;MQ=35.67;MQ0=0;QD=29.95;SB=-0.01;sumGLbyD=30.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,48:54:72.79:1647,0,73 37565-ref 309 . T C 22.95 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.55;SB=-0.01;sumGLbyD=5.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52.93:53,0,240 37568-ref 162 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37662-ref 124 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 37662-ref 271 . T C 109.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9578;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.87;SB=-0.01;sumGLbyD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.96:139,0,25 37663-ref 15 . A G 950.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.82;MQ0=0;QD=36.54;SB=-462.82;sumGLbyD=37.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.24:983,78,0 37663-ref 19 . T C 600.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.83;MQ0=0;QD=17.17;SB=-270.51;sumGLbyD=18.03 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,19:34:99:631,0,420 37663-ref 47 . A G 775.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=36.07;MQ0=0;QD=14.10;SB=-113.53;sumGLbyD=14.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,26:54:99:805,0,943 37663-ref 64 . C T 2696.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.20;MQ0=0;QD=35.48;SB=-468.31;sumGLbyD=35.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,74:75:99:2729,146,0 37663-ref 104 . A T 2685.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.3639;MQ=36.74;MQ0=0;QD=34.87;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,73:76:99:2718,109,0 37663-ref 187 . A T 4915.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=129;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.8644;MQ=36.92;MQ0=0;QD=38.11;SB=-0.01;sumGLbyD=37.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,128:127:99:4878,379,0 37663-ref 322 . G A 2199.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.9311;MQ=36.84;MQ0=0;QD=34.37;SB=-80.02;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,62:61:99:2232,104,0 37691-ref 162 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37691-ref 175 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37691-ref 193 . G T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 37691-ref 264 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37691-ref 266 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37730-ref 32 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37730-ref 116 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37730-ref 128 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37761-ref 240 . T C 32.74 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=16.37;SB=-0.01;sumGLbyD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:64,6,0 37761-ref 277 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37761-ref 282 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 37804-ref 13 . A T 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 37804-ref 154 . A G 414.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.54;SB=-0.01;sumGLbyD=37.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:447,36,0 37804-ref 156 . A G 141.81 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8656;MQ=34.39;MQ0=0;QD=11.82;SB=-0.01;sumGLbyD=14.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:172,0,204 37804-ref 177 . G A 215.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=30.75;SB=-0.01;sumGLbyD=35.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:248,21,0 37804-ref 205 . A G 263.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=26.32;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.06:296,30,0 37804-ref 214 . G T 204.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.04:237,24,0 37804-ref 227 . A G 204.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.04:237,24,0 37804-ref 233 . C T 204.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.04:237,24,0 38010-ref 55 . A T 82.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:114,9,0 38010-ref 224 . G A 74.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.00;SB=-0.01;sumGLbyD=20.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63.53:105,0,64 38010-ref 248 . T C 501.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.79;SB=-0.01;sumGLbyD=38.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:534,42,0 38010-ref 331 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 38010-ref 421 . G A 190.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.80;SB=-0.01;sumGLbyD=37.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:224,18,0 38010-ref 697 . G A 135.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.52;SB=-0.01;sumGLbyD=16.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:165,0,167 38010-ref 701 . T C 364.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.49;SB=-0.01;sumGLbyD=39.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:398,30,0 38010-ref 772 . T C 389.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:423,33,0 38010-ref 780 . A G 16.54 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.8645;MQ=35.72;MQ0=0;QD=2.07;SB=-0.01;sumGLbyD=5.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:46.44:46,0,194 38010-ref 790 . A T 24.22 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.53;MQ0=0;QD=3.46;SB=-0.01;sumGLbyD=7.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54.20:54,0,164 38010-ref 808 . A C 10.73 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=1.19;SB=-0.01;sumGLbyD=4.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:40.34:40,0,235 38010-ref 872 . G C 239.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.16;SB=-0.01;sumGLbyD=38.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:272,21,0 38255-ref 56 . T A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 38301-ref 50 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 38301-ref 88 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 38301-ref 97 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 38348-ref 85 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 38348-ref 109 . G T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 38376-ref 16 . T C 196.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.14;SB=-0.01;sumGLbyD=32.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.06:230,18,0 38376-ref 86 . G C 1243.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.69;MQ0=0;QD=37.69;SB=-0.01;sumGLbyD=38.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1277,99,0 38376-ref 87 . C T 1240.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.69;MQ0=0;QD=37.59;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1274,99,0 38376-ref 136 . A G 1124.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.35;MQ0=0;QD=36.28;SB=-0.01;sumGLbyD=37.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:30:90.26:1158,90,0 38376-ref 174 . C T 1127.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.98;MQ0=0;QD=37.59;SB=-0.01;sumGLbyD=38.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.28:1161,90,0 38376-ref 176 . T G 1123.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.98;MQ0=0;QD=37.46;SB=-0.01;sumGLbyD=38.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:90.28:1157,90,0 38376-ref 250 . A G 1544.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9832;MQ=36.75;MQ0=0;QD=38.60;SB=-0.01;sumGLbyD=39.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1577,120,0 38376-ref 274 . C A 1523.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4681;MQ=36.75;MQ0=0;QD=38.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1556,120,0 38376-ref 323 . T A 711.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.42;SB=-0.01;sumGLbyD=39.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:744,57,0 38376-ref 362 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 38376-ref 369 . G A 161.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.40;SB=-35.89;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:195,15,0 38376-ref 371 . C T 161.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.33;SB=-39.76;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:194,15,0 38376-ref 421 . G A 445.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.14;SB=-40.01;sumGLbyD=39.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:479,36,0 38376-ref 443 . A T 326.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.26;SB=-0.01;sumGLbyD=39.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:359,27,0 38376-ref 474 . T C 358.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.89;SB=-39.31;sumGLbyD=39.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:392,30,0 38376-ref 480 . T A 356.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.69;SB=-40.00;sumGLbyD=38.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:390,30,0 38376-ref 530 . C T 598.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=6;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.40;SB=-40.01;sumGLbyD=39.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.16:631,48,0 38376-ref 618 . A T 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 38450-ref 113 . G A 126.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 38450-ref 114 . C T 118.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.53;SB=-0.01;sumGLbyD=37.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:151,12,0 38450-ref 139 . T G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 38450-ref 199 . C T 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.51;SB=-0.01;sumGLbyD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.04:160,12,0 38450-ref 202 . T C 120.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.00;SB=-0.01;sumGLbyD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.04:153,12,0 38450-ref 227 . T G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 38450-ref 276 . T C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 38450-ref 287 . T A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.00;SB=-0.01;sumGLbyD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:3:9.03:120,9,0 38450-ref 361 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 38531-ref 34 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 38531-ref 99 . G A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 38614-ref 20 . A T 268.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=33.52;SB=-0.01;sumGLbyD=37.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:301,24,0 38614-ref 74 . T G 810.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.54;MQ0=0;QD=36.83;SB=-0.01;sumGLbyD=38.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.21:843,66,0 38614-ref 113 . A T 739.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=36.96;SB=-0.01;sumGLbyD=38.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:772,60,0 38614-ref 187 . T G 603.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.72;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.16:636,48,0 38614-ref 227 . C T 677.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.65;SB=-0.01;sumGLbyD=37.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.15:710,57,0 38614-ref 278 . T C 820.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.28;SB=-0.01;sumGLbyD=38.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.21:853,66,0 38614-ref 362 . C T 278.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.83;SB=-0.01;sumGLbyD=38.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:312,24,0 38614-ref 404 . G A 404.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.75;SB=-0.01;sumGLbyD=39.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:437,33,0 38614-ref 476 . G A 315.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:349,27,0 38614-ref 524 . G A 165.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.02;SB=-0.01;sumGLbyD=39.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:198,15,0 38614-ref 581 . A G 622.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=36.60;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:655,51,0 38641-ref 93 . G A 641.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=35.62;SB=-0.01;sumGLbyD=37.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.16:674,54,0 38641-ref 108 . G T 290.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=32.29;SB=-0.01;sumGLbyD=35.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:324,27,0 38641-ref 118 . C T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 38641-ref 123 . A G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 38645-ref 12 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 38754-ref 19 . A G 184.81 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=12.32;SB=-0.01;sumGLbyD=14.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:215,0,269 38754-ref 23 . T C 741.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=37.05;SB=-0.01;sumGLbyD=38.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.19:774,60,0 38754-ref 70 . A G 2626.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.56;MQ0=0;QD=38.06;SB=-0.01;sumGLbyD=38.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:68:99:2659,205,0 38754-ref 94 . G A 2372.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.6289;MQ=36.71;MQ0=0;QD=33.89;SB=-0.01;sumGLbyD=34.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,68:65:99:2405,157,0 38830-ref 49 . T A 926.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.65;MQ0=0;QD=34.31;SB=-0.01;sumGLbyD=35.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.22:959,81,0 38830-ref 51 . G T 922.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.65;MQ0=0;QD=34.16;SB=-0.01;sumGLbyD=35.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.22:955,81,0 38830-ref 86 . C G 946.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.97;MQ0=0;QD=32.63;SB=-0.01;sumGLbyD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:28:84.20:979,84,0 38830-ref 101 . G C 869.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=33.07;MQ0=0;QD=32.20;SB=-0.01;sumGLbyD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:26:78.19:902,78,0 38830-ref 255 . C A 1420.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.72;MQ0=0;QD=35.52;SB=-0.01;sumGLbyD=36.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:39:99:1454,117,0 38830-ref 270 . C A 1291.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.38;MQ0=0;QD=33.99;SB=-0.01;sumGLbyD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,37:38:74.33:1324,74,0 38830-ref 271 . T C 1259.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.03;HRun=4;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.33;MQ0=0;QD=34.03;SB=-0.01;sumGLbyD=34.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:35:99:1292,105,0 38830-ref 341 . 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G A 1013.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.63;MQ0=0;QD=37.55;SB=-0.01;sumGLbyD=38.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.25:1047,81,0 38830-ref 569 . T C 1113.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.00;MQ0=0;QD=35.92;SB=-0.01;sumGLbyD=36.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.26:1146,93,0 38830-ref 601 . T C 1122.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9999;MQ=34.31;MQ0=0;QD=36.22;SB=-0.01;sumGLbyD=37.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93.27:1156,93,0 38830-ref 612 . G T 1045.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.49;MQ0=0;QD=36.06;SB=-0.01;sumGLbyD=37.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.25:1079,87,0 38830-ref 616 . C T 1263.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=36.11;SB=-0.01;sumGLbyD=37.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:99:1297,105,0 38830-ref 690 . 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T C 2375.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.17;MQ0=0;QD=32.54;SB=-77.16;sumGLbyD=32.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,73:72:99:2409,217,0 38830-ref 889 . C G 2621.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.26;MQ0=0;QD=34.05;SB=-77.16;sumGLbyD=34.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,77:77:99:2655,232,0 38830-ref 907 . T C 2802.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8316;MQ=34.68;MQ0=0;QD=36.88;SB=-80.02;sumGLbyD=37.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,76:76:99:2836,229,0 38830-ref 964 . G A 2096.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.09;MQ0=0;QD=37.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2129,169,0 38830-ref 985 . A T 2081.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.67;MQ0=0;QD=34.13;SB=-0.01;sumGLbyD=34.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2115,183,0 38830-ref 1003 . C T 1703.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.04;MQ0=0;QD=30.98;SB=-0.01;sumGLbyD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,55:53:99:1737,159,0 38830-ref 1026 . C T 806.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.53;MQ0=0;QD=28.81;SB=-0.01;sumGLbyD=29.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.16:840,84,0 38830-ref 1027 . C T 803.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.53;MQ0=0;QD=28.71;SB=-0.01;sumGLbyD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.16:837,84,0 38974-ref 93 . A G 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 39077-ref 89 . T C 205.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 39077-ref 121 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 39077-ref 143 . A G 165.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.53;SB=-0.01;sumGLbyD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.05:198,15,0 39077-ref 170 . A G 25.02 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.17;SB=-0.01;sumGLbyD=9.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,128 39077-ref 184 . G C 198.05 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:231,18,0 39077-ref 261 . G C 301.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=35.87;MQ0=0;QD=33.55;SB=-0.01;sumGLbyD=37.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:335,27,0 39077-ref 263 . T C 189.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=31.55;SB=-0.01;sumGLbyD=37.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:222,18,0 39077-ref 334 . C T 28.09 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=4.68;SB=-0.01;sumGLbyD=9.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58.08:58,0,138 39117-ref 48 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 39232-ref 462 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 39232-ref 471 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 39269-ref 38 . C T 191.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=31.91;SB=-0.01;sumGLbyD=37.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:224,18,0 39269-ref 83 . C G 564.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=35.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.14:598,48,0 39269-ref 148 . C T 811.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.58;MQ0=0;QD=33.81;SB=-0.01;sumGLbyD=35.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.20:844,69,0 39405-ref 50 . A G 107.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.58;SB=-0.01;sumGLbyD=27.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.96:138,0,25 39405-ref 100 . C T 358.74 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.90;SB=-0.01;sumGLbyD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:3.89:388,0,4 39405-ref 233 . A G 521.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.26;SB=-0.01;sumGLbyD=39.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:555,42,0 39405-ref 299 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 39532-ref 51 . T G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 39532-ref 58 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 39532-ref 81 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 39532-ref 134 . G A 74.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=24.86;SB=-0.01;sumGLbyD=35.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:107,9,0 39532-ref 164 . A G 134.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=26.87;SB=-0.01;sumGLbyD=33.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:167,15,0 39532-ref 202 . A G 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 39532-ref 203 . C A 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 39630-ref 505 . A C 107.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6946;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.45;SB=-0.01;sumGLbyD=17.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:74.98:138,0,75 39739-ref 134 . C T 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 39964-ref 101 . C G 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 40056-ref 50 . A C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 40067-ref 106 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 40100-ref 85 . A G 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 40100-ref 119 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 40116-ref 108 . T A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 40116-ref 128 . A T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 40116-ref 131 . T C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 40116-ref 165 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 40116-ref 180 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.9995;MQ=25.00;MQ0=0;QD=9.34;SB=-0.01;sumGLbyD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:2:6.01:59,6,0 40116-ref 182 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9996;MQ=25.00;MQ0=0;QD=9.34;SB=-0.01;sumGLbyD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:2:6.01:59,6,0 40116-ref 207 . A G 20.29 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20.61:50,0,21 40116-ref 240 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 40155-ref 93 . C T 72.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.41;SB=-0.01;sumGLbyD=20.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:4:24.09:102,0,24 40155-ref 128 . G A 71.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.95;SB=-0.01;sumGLbyD=34.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:104,9,0 40155-ref 163 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 40155-ref 280 . A T 206.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 40155-ref 388 . A T 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 40155-ref 466 . C G 194.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.44;SB=-0.01;sumGLbyD=37.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:228,18,0 40155-ref 500 . T A 237.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.86;SB=-0.01;sumGLbyD=38.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:270,21,0 40155-ref 627 . C T 325.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=34.93;MQ0=0;QD=32.53;SB=-0.01;sumGLbyD=35.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:358,30,0 40155-ref 655 . A G 135.69 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=19.38;SB=-0.01;sumGLbyD=23.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:48.57:166,0,49 40155-ref 676 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9983;MQ=29.55;MQ0=0;QD=9.34;SB=-0.01;sumGLbyD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6.01:59,6,0 40155-ref 677 . G A 24.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=8.33;SB=-0.01;sumGLbyD=18.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20.60:55,0,21 40155-ref 765 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 40155-ref 790 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 40172-ref 127 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 40172-ref 159 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 40172-ref 182 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 40172-ref 202 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 40174-ref 26 . C A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 40174-ref 31 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 40174-ref 49 . T A 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 40174-ref 67 . C G 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:50,0,31 40174-ref 741 . T C 38.36 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.18;SB=-0.01;sumGLbyD=35.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 40174-ref 774 . C G 159.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.64;SB=-0.01;sumGLbyD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.05:193,15,0 40174-ref 812 . T A 155.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.19;SB=-0.01;sumGLbyD=37.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:189,15,0 40174-ref 832 . T C 123.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.91;SB=-0.01;sumGLbyD=39.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:156,12,0 40174-ref 1054 . A G 34.28 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.86;SB=-0.01;sumGLbyD=12.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64.27:64,0,101 40174-ref 1075 . A G 44.87 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.3359;MQ=36.27;MQ0=0;QD=3.20;SB=-0.01;sumGLbyD=5.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74.86:75,0,378 40174-ref 1087 . T G 14.08 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9999;MQ=36.27;MQ0=0;QD=1.01;SB=-0.01;sumGLbyD=3.14 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:43.90:44,0,345 40174-ref 1136 . A G 382.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=35.28;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.08:416,36,0 40174-ref 1157 . G A 39.65 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=3.30;SB=-0.01;sumGLbyD=5.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:69.65:70,0,318 40174-ref 1174 . G A 11.24 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=0.86;SB=-0.01;sumGLbyD=3.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,2:13:40.89:41,0,379 40174-ref 1188 . G T 339.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9779;MQ=36.27;MQ0=0;QD=24.27;SB=-0.01;sumGLbyD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:13:38.69:370,0,39 40174-ref 1198 . A T 14.08 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.17;SB=-0.01;sumGLbyD=3.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:43.90:44,0,345 40174-ref 1228 . T C 89.16 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.43;SB=-0.01;sumGLbyD=9.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:119,0,275 40174-ref 1258 . A G 348.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:381,30,0 40174-ref 1285 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 40359-ref 76 . C T 81.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.31;SB=-0.01;sumGLbyD=38.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:114,9,0 40359-ref 139 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 40359-ref 179 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 40374-ref 56 . T A 41.26 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.63;SB=-0.01;sumGLbyD=36.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 40374-ref 404 . C T 45.91 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.96;SB=-0.01;sumGLbyD=39.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:77,6,0 40402-ref 383 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 40402-ref 402 . T C 82.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:114,9,0 40402-ref 421 . C T 35.48 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.74;SB=-0.01;sumGLbyD=33.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:67,6,0 40517-ref 20 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 40517-ref 84 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 40517-ref 646 . T C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 40517-ref 706 . A T 221.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.60;SB=-0.01;sumGLbyD=36.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:254,21,0 40517-ref 756 . C T 165.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 40517-ref 877 . C A 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=6;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 40517-ref 880 . A C 65.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=21.93;SB=-0.01;sumGLbyD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:98,9,0 40517-ref 884 . C A 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=6;HaplotypeScore=1.8653;MQ=29.55;MQ0=0;QD=12.32;SB=-0.01;sumGLbyD=23.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 40629-ref 95 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 40647-ref 226 . G C 22.95 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.55;SB=-0.01;sumGLbyD=5.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52.92:53,0,251 40647-ref 261 . A G 359.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.97;SB=-0.01;sumGLbyD=39.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:393,30,0 40841-ref 6 . C G 28.41 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=9.47;SB=-0.01;sumGLbyD=19.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28.77:58,0,29 40841-ref 27 . C T 270.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.87;MQ0=0;QD=30.09;SB=-0.01;sumGLbyD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:304,24,0 40841-ref 49 . G C 427.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=35.63;SB=-0.01;sumGLbyD=38.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.11:461,36,0 40841-ref 127 . T A 364.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.49;SB=-0.01;sumGLbyD=39.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:398,30,0 40841-ref 177 . C G 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 40841-ref 233 . C T 322.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.86;SB=-0.01;sumGLbyD=39.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:356,27,0 40841-ref 251 . A C 326.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.64;SB=-0.01;sumGLbyD=35.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.09:359,27,0 40841-ref 378 . T C 273.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.21;SB=-0.01;sumGLbyD=38.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:307,24,0 40853-ref 104 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 40897-ref 92 . G A 29.94 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=14.97;SB=-0.01;sumGLbyD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:61,6,0 40897-ref 94 . T C 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 40897-ref 258 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 40954-ref 205 . A G 39.26 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.63;SB=-0.01;sumGLbyD=35.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:71,6,0 40954-ref 211 . A G 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 40954-ref 524 . C A 37.98 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.49;SB=-0.01;sumGLbyD=16.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65.76:68,0,66 40954-ref 556 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 40986-ref 102 . 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T G 1799.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.8321;MQ=36.57;MQ0=0;QD=38.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1833,141,0 41017-ref 123 . G A 2797.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8653;MQ=36.33;MQ0=0;QD=36.81;SB=-0.01;sumGLbyD=37.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,75:75:99:2831,226,0 41017-ref 145 . A G 3378.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=34.89;MQ0=0;QD=36.33;SB=-0.01;sumGLbyD=36.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,93:91:99:3378,274,0 41017-ref 191 . G C 1425.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9658;MQ=32.95;MQ0=0;QD=33.93;SB=-0.01;sumGLbyD=34.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:41:99:1458,123,0 41017-ref 203 . T C 1022.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=32.30;MQ0=0;QD=31.97;SB=-0.01;sumGLbyD=33.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:31:93.24:1056,93,0 41017-ref 213 . G T 262.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=21.88;SB=-0.01;sumGLbyD=24.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:1.89:292,3,0 41019-ref 44 . G A 280.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.05;SB=-38.55;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:313,24,0 41244-ref 56 . A G 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 41244-ref 287 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 41244-ref 294 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 41245-ref 80 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 41245-ref 131 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 41248-ref 100 . A C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 41248-ref 131 . G A 124.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.90;SB=-0.01;sumGLbyD=31.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:12.04:157,12,0 41248-ref 226 . G C 434.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.18;SB=-0.01;sumGLbyD=38.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:467,36,0 41248-ref 279 . G A 251.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=31.50;SB=-0.01;sumGLbyD=35.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:285,24,0 41248-ref 282 . G A 301.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=33.55;SB=-0.01;sumGLbyD=37.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:335,27,0 41248-ref 306 . C G 326.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=32.67;SB=-0.01;sumGLbyD=35.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:360,30,0 41248-ref 345 . C A 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 41385-ref 40 . G T 467.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:500,39,0 41385-ref 89 . C G 828.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7853;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.01;SB=-0.01;sumGLbyD=37.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:22:66.21:861,66,0 41385-ref 205 . C T 827.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.6809;MQ=36.15;MQ0=0;QD=34.48;SB=-0.01;sumGLbyD=35.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,23:23:69.21:861,69,0 41385-ref 253 . T C 892.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.3013;MQ=34.93;MQ0=0;QD=35.70;SB=-0.01;sumGLbyD=37.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75.22:926,75,0 41385-ref 271 . G A 929.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4679;MQ=35.09;MQ0=0;QD=34.42;SB=-0.01;sumGLbyD=35.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:78.23:962,78,0 41385-ref 513 . G C 205.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.3633;MQ=34.78;MQ0=0;QD=14.65;SB=-0.01;sumGLbyD=16.79 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:235,0,194 41385-ref 559 . G A 418.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.6649;MQ=35.28;MQ0=0;QD=34.88;SB=-0.01;sumGLbyD=37.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.10:452,36,0 41385-ref 566 . A G 36.09 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7219;MQ=35.53;MQ0=0;QD=2.58;SB=-0.01;sumGLbyD=4.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:66.08:66,0,371 41385-ref 636 . G T 62.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.87;SB=-0.01;sumGLbyD=11.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92.92:93,0,164 41385-ref 639 . T G 56.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.10;SB=-0.01;sumGLbyD=10.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:86.77:87,0,172 41442-ref 38 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 41494-ref 25 . T C 163.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.68;SB=-0.01;sumGLbyD=39.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 41494-ref 67 . T G 321.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.77;SB=-0.01;sumGLbyD=39.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:355,27,0 41494-ref 84 . A C 236.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.78;SB=-0.01;sumGLbyD=38.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:269,21,0 41494-ref 135 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 41494-ref 167 . C T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-28.38;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 41494-ref 179 . T G 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-39.22;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 41494-ref 219 . T A 253.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8321;MQ=33.48;MQ0=0;QD=28.22;SB=-0.01;sumGLbyD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:287,24,0 41494-ref 222 . T C 291.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=32.35;SB=-0.01;sumGLbyD=36.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:324,27,0 41494-ref 238 . T C 266.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=33.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:299,24,0 41494-ref 357 . C A 552.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.71;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=36.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.13:586,48,0 41494-ref 361 . C T 560.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.91;MQ0=0;QD=32.97;SB=-0.01;sumGLbyD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:16:48.14:593,48,0 41494-ref 398 . A G 205.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=29.37;SB=-0.01;sumGLbyD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.05:239,21,0 41494-ref 412 . A G 253.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=31.63;SB=-0.01;sumGLbyD=35.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:286,24,0 41494-ref 454 . T C 327.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.34;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:360,27,0 41494-ref 500 . C T 274.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:308,24,0 41549-ref 12 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 41549-ref 34 . T A 49.89 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=31.58;MQ0=0;QD=12.47;SB=-0.01;sumGLbyD=20.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:3:9:82,9,0 41549-ref 68 . G T 209.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=29.98;SB=-0.01;sumGLbyD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:243,21,0 41549-ref 84 . C T 60.89 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9995;MQ=34.01;MQ0=0;QD=8.70;SB=-0.01;sumGLbyD=12.98 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:6:90.89:91,0,101 41549-ref 85 . G A 61.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9995;MQ=34.01;MQ0=0;QD=8.80;SB=-0.01;sumGLbyD=13.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:7:90.15:92,0,90 41549-ref 86 . C T 98.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=1.9995;MQ=34.01;MQ0=0;QD=14.08;SB=-0.01;sumGLbyD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:80.12:129,0,80 41549-ref 120 . C G 99.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=9.99;SB=-0.01;sumGLbyD=12.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:130,0,198 41549-ref 157 . T C 111.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:51.55:142,0,52 41597-ref 235 . C T 82.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.64;SB=-0.01;sumGLbyD=38.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 41618-ref 111 . G T 244.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.87;SB=-0.01;sumGLbyD=39.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:277,21,0 41618-ref 130 . C T 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 41618-ref 190 . G A 518.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.06;SB=-0.01;sumGLbyD=39.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.14:552,42,0 41618-ref 194 . T C 632.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.21;SB=-0.01;sumGLbyD=39.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.17:666,51,0 41626-ref 41 . C G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 41626-ref 74 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 41635-ref 178 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 41668-ref 16 . A T 109.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=27.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.01:142,12,0 41668-ref 154 . G A 25.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=2.34;SB=-0.01;sumGLbyD=5.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:55.77:56,0,277 41668-ref 182 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=1.90;SB=-0.01;sumGLbyD=4.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:52.76:53,0,318 41668-ref 185 . C G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=1.90;SB=-0.01;sumGLbyD=4.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:52.76:53,0,323 41668-ref 186 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=1.90;SB=-0.01;sumGLbyD=4.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:52.76:53,0,323 41668-ref 295 . A G 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 41674-ref 51 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 41674-ref 64 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 41700-ref 107 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 41767-ref 102 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=7;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 41767-ref 130 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 41794-ref 23 . C A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 41794-ref 32 . T A 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 41794-ref 51 . A G 96.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:129,12,0 41794-ref 62 . T A 233.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=29.15;SB=-0.01;sumGLbyD=33.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:266,24,0 41794-ref 92 . T G 807.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.54;MQ0=0;QD=36.71;SB=-0.01;sumGLbyD=38.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.18:841,66,0 41801-ref 19 . T A 104.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9983;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.89;SB=-0.01;sumGLbyD=19.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:90.17:134,0,90 41801-ref 39 . G A 558.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.22;SB=-0.01;sumGLbyD=39.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.15:591,45,0 41801-ref 63 . T A 481.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.95;SB=-0.01;sumGLbyD=22.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,16:22:99:512,0,201 41801-ref 102 . G A 630.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7067;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.00;SB=-0.01;sumGLbyD=36.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:17:51.16:663,51,0 41801-ref 225 . C T 10.80 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9989;MQ=36.56;MQ0=0;QD=0.47;SB=-0.01;sumGLbyD=1.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:40.42:40,0,702 41801-ref 240 . C T 290.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.7533;MQ=36.54;MQ0=0;QD=13.20;SB=3.00;sumGLbyD=14.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:21:99:320,0,341 41801-ref 256 . C A 247.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9997;MQ=36.49;MQ0=0;QD=12.39;SB=-37.00;sumGLbyD=13.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,9:20:99:278,0,375 41801-ref 313 . A T 121.89 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.37;MQ0=0;QD=7.62;SB=-0.01;sumGLbyD=9.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:152,0,371 41801-ref 330 . 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A T 747.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.24;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=25.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,25:31:99:777,0,147 41931-ref 68 . G C 107.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.14;MQ0=0;QD=3.27;SB=-0.01;sumGLbyD=4.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,6:33:99:138,0,837 41931-ref 95 . A G 899.70 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=32.26;MQ0=0;QD=26.46;SB=-0.01;sumGLbyD=27.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,30:34:55.55:930,0,56 41931-ref 117 . C T 597.62 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.7887;MQ=31.15;MQ0=0;QD=21.34;SB=-0.01;sumGLbyD=22.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:26:81.15:628,0,81 41931-ref 124 . C A 304.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9664;MQ=26.80;MQ0=0;QD=19.00;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,13:16:59.33:334,0,59 41931-ref 131 . A G 25.82 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9999;MQ=27.57;MQ0=0;QD=2.35;SB=-0.01;sumGLbyD=5.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:55.80:56,0,214 41931-ref 146 . C T 360.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8105;MQ=26.60;MQ0=0;QD=20.01;SB=-0.01;sumGLbyD=21.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:38.22:390,0,38 41931-ref 153 . C T 472.34 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.8086;MQ=26.01;MQ0=0;QD=16.29;SB=-0.01;sumGLbyD=17.32 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,20:29:99:502,0,200 41931-ref 162 . T A 38.62 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.8312;MQ=25.84;MQ0=0;QD=1.10;SB=-0.01;sumGLbyD=1.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:34:68.61:69,0,742 41931-ref 172 . G A 75.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.8311;MQ=25.43;MQ0=0;QD=2.21;SB=-0.01;sumGLbyD=3.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,7:34:99:105,0,700 41931-ref 189 . T C 888.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=25.00;MQ0=0;QD=26.92;SB=-0.01;sumGLbyD=27.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:72.50:921,73,0 41931-ref 194 . C T 640.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.00;SB=-0.01;sumGLbyD=20.94 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,26:32:75.64:670,0,76 41931-ref 217 . C T 527.55 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.18;MQ0=0;QD=23.98;SB=-0.01;sumGLbyD=25.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,20:22:13.87:557,0,14 41931-ref 229 . C T 477.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.09;MQ0=0;QD=25.12;SB=-0.01;sumGLbyD=26.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,16:19:60.66:507,0,61 41931-ref 237 . C T 391.65 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=26.11;SB=-0.01;sumGLbyD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,12:15:74.87:422,0,75 41931-ref 247 . C G 128.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.9996;MQ=35.34;MQ0=0;QD=4.15;SB=-0.01;sumGLbyD=5.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,7:30:99:159,0,784 41931-ref 249 . G A 118.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.44;MQ0=0;QD=3.60;SB=-0.01;sumGLbyD=4.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:33:99:149,0,902 41931-ref 275 . C A 327.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=89;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=8.4931;MQ=32.55;MQ0=0;QD=3.68;SB=-26.62;sumGLbyD=4.02 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,21:88:99:357,0,2212 41931-ref 299 . A T 198.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=133;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=60.1884;MQ=32.49;MQ0=0;QD=1.49;SB=-23.61;sumGLbyD=1.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,21:131:99:228,0,3606 41931-ref 301 . T C 3233.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=139;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=50.2254;MQ=32.70;MQ0=0;QD=23.26;SB=-23.61;sumGLbyD=23.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,109:138:99:3264,0,733 41931-ref 302 . G A 217.36 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=140;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=49.3933;MQ=32.73;MQ0=0;QD=1.55;SB=-23.61;sumGLbyD=1.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:118,22:136:99:247,0,3685 41931-ref 304 . C A 557.02 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=150;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=50.9236;MQ=32.96;MQ0=0;QD=3.71;SB=-34.00;sumGLbyD=3.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,27:148:99:587,0,3717 41931-ref 318 . G A 1737.87 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=141;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.9982;MQ=32.84;MQ0=0;QD=12.33;SB=6.01;sumGLbyD=12.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,64:140:99:1768,0,2106 41931-ref 319 . T C 1666.04 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=138;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.4680;MQ=32.91;MQ0=0;QD=12.07;SB=6.01;sumGLbyD=12.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,61:136:99:1696,0,2311 41931-ref 341 . A G 624.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=83;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=50.9870;MQ=33.97;MQ0=0;QD=7.52;SB=-37.00;sumGLbyD=7.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,23:83:99:654,0,1883 41931-ref 342 . C T 732.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=82;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=50.9870;MQ=33.93;MQ0=0;QD=8.93;SB=3.00;sumGLbyD=9.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,31:81:99:762,0,1629 41931-ref 343 . G A 440.52 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=82;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=50.9870;MQ=33.93;MQ0=0;QD=5.37;SB=3.00;sumGLbyD=5.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,18:82:99:471,0,2015 41931-ref 374 . G A 13.04 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7333;MQ=36.12;MQ0=0;QD=0.57;SB=-0.01;sumGLbyD=1.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:42.81:43,0,662 42032-ref 98 . A T 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 42032-ref 151 . T A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 42033-ref 138 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42083-ref 151 . A G 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 42083-ref 158 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42109-ref 187 . T G 41.69 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.84;SB=-0.01;sumGLbyD=36.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 42308-ref 16 . A G 320.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.65;SB=-0.01;sumGLbyD=39.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:354,27,0 42308-ref 23 . C G 54.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.05;SB=-0.01;sumGLbyD=9.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:84.48:84,0,213 42308-ref 75 . T G 245.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.33;SB=-0.01;sumGLbyD=25.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:11:21.07:279,21,0 42383-ref 44 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42383-ref 84 . C T 126.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 42383-ref 125 . A G 470.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.22;SB=-0.01;sumGLbyD=38.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:504,39,0 42383-ref 145 . 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C G 5002.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=128;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.0324;MQ=36.84;MQ0=0;QD=39.08;SB=-0.01;sumGLbyD=38.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,126:128:99:4922,379,0 42383-ref 668 . A T 1875.84 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=128;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.2081;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.66;SB=-0.01;sumGLbyD=14.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,59:127:99:1906,0,2285 42383-ref 885 . T G 5264.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=141;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=18.3793;MQ=36.86;MQ0=0;QD=37.34;SB=-0.01;sumGLbyD=36.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,137:138:99:5192,343,0 42383-ref 939 . A C 6431.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=166;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=10.9453;MQ=36.82;MQ0=0;QD=38.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,165:165:99:6431,497,0 42383-ref 1011 . G T 6658.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=173;DS;Dels=0.01;HRun=2;HaplotypeScore=11.0825;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.49;SB=-0.01;sumGLbyD=38.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,170:171:99:6626,482,0 42383-ref 1093 . T C 8069.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=15.3779;MQ=36.57;MQ0=0;QD=38.24;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,209:208:99:8041,623,0 42383-ref 1128 . A G 7338.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=192;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=9.4388;MQ=36.47;MQ0=0;QD=38.22;SB=-0.01;sumGLbyD=38.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,192:190:99:7338,572,0 42383-ref 1339 . A C 8331.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=217;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.1751;MQ=36.95;MQ0=0;QD=38.39;SB=-0.01;sumGLbyD=38.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,216:215:99:8301,644,0 42383-ref 1402 . A T 7565.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=211;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.7368;MQ=33.34;MQ0=0;QD=35.85;SB=-0.01;sumGLbyD=35.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,211:210:99:7564,632,0 42383-ref 1413 . G A 8290.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=235;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.5418;MQ=33.40;MQ0=0;QD=35.28;SB=-0.01;sumGLbyD=35.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,235:232:99:8289,698,0 42383-ref 1438 . G A 7822.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=221;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=6.1165;MQ=33.06;MQ0=0;QD=35.40;SB=-0.01;sumGLbyD=35.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,220:219:99:7821,659,0 42383-ref 1452 . T C 8294.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=234;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=8.1189;MQ=33.53;MQ0=0;QD=35.45;SB=-0.01;sumGLbyD=35.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,232:233:99:8256,664,0 42383-ref 1521 . G C 9288.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=248;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=17.0368;MQ=36.72;MQ0=0;QD=37.45;SB=-0.01;sumGLbyD=37.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,246:243:99:9287,731,0 42383-ref 1573 . G A 5547.10 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=255;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=17.9455;MQ=36.44;MQ0=0;QD=21.75;SB=-0.01;sumGLbyD=18.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:109,145:250:99:4794,0,3413 42383-ref 1587 . T C 4962.50 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=221;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=17.7257;MQ=36.45;MQ0=0;QD=22.45;SB=-0.01;sumGLbyD=19.51 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,131:216:99:4312,0,2778 42383-ref 1620 . T C 8978.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=237;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.3915;MQ=36.74;MQ0=0;QD=37.89;SB=-0.01;sumGLbyD=37.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,236:234:99:8978,704,0 42383-ref 1731 . G A 8636.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=224;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=8.7922;MQ=36.91;MQ0=0;QD=38.56;SB=-0.01;sumGLbyD=38.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,222:222:99:8600,632,0 42401-ref 72 . C A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 42401-ref 78 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 42401-ref 83 . T C 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 42401-ref 150 . T G 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 42401-ref 151 . G A 115.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.93;SB=-0.01;sumGLbyD=37.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:148,12,0 42401-ref 161 . C T 29.94 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=14.97;SB=-0.01;sumGLbyD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:61,6,0 42401-ref 177 . G A 34.98 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9993;MQ=34.93;MQ0=0;QD=7.00;SB=-0.01;sumGLbyD=13.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64.98:65,0,81 42401-ref 239 . C T 65.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.24;SB=-0.01;sumGLbyD=11.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:95.94:96,0,173 42401-ref 270 . G C 71.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.98;SB=-0.01;sumGLbyD=25.48 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:102,0,28 42463-ref 84 . T C 136.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=27.39;SB=-0.01;sumGLbyD=33.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:170,15,0 42463-ref 118 . G A 67.72 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=22.57;SB=-0.01;sumGLbyD=33.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:100,9,0 42463-ref 219 . A G 85.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.62;SB=-0.01;sumGLbyD=39.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:118,9,0 42463-ref 256 . A G 126.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 42463-ref 337 . C A 25.07 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=12.54;SB=-0.01;sumGLbyD=28.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:56,6,0 42463-ref 346 . G T 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 42463-ref 347 . C G 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 42463-ref 387 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42463-ref 390 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42493-ref 124 . T C 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 42493-ref 275 . C G 197.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:231,18,0 42510-ref 73 . A T 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 42510-ref 119 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42560-ref 112 . A C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 42560-ref 120 . C T 76.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.39;SB=-0.01;sumGLbyD=36.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 42560-ref 162 . T C 218.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.01;MQ0=0;QD=31.26;SB=-0.01;sumGLbyD=35.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:252,21,0 42560-ref 187 . T C 239.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.12;MQ0=0;QD=23.96;SB=-0.01;sumGLbyD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:2.79:268,0,0 42560-ref 214 . A G 258.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.12;MQ0=0;QD=25.81;SB=-0.01;sumGLbyD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.06:291,27,0 42560-ref 223 . C T 214.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=26.80;SB=-0.01;sumGLbyD=30.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:247,24,0 42560-ref 234 . C A 149.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.37;MQ0=0;QD=24.88;SB=-0.01;sumGLbyD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.02:182,18,0 42560-ref 252 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42565-ref 87 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 42565-ref 101 . A C 197.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9979;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.20;SB=-0.01;sumGLbyD=17.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:79.42:228,0,79 42565-ref 120 . C G 351.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=27.01;SB=-0.01;sumGLbyD=29.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.07:384,39,0 42565-ref 127 . A G 197.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.20;SB=-0.01;sumGLbyD=17.50 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:79.42:228,0,79 42565-ref 131 . T C 19.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=25.00;MQ0=0;QD=1.53;SB=-0.01;sumGLbyD=3.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:49.79:50,0,257 42565-ref 157 . A C 19.85 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=1.53;SB=-0.01;sumGLbyD=3.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:49.79:50,0,257 42565-ref 161 . T C 292.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=26.62;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.06:326,33,0 42669-ref 110 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 42669-ref 124 . A G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 42669-ref 127 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 42669-ref 135 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 42669-ref 231 . T C 166.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.77;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.05:199,15,0 42669-ref 242 . A C 184.76 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.79;SB=-0.01;sumGLbyD=36.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:218,18,0 42669-ref 286 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42669-ref 295 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42669-ref 324 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 42694-ref 25 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42694-ref 102 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 42694-ref 110 . T G 83.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 42694-ref 112 . A G 81.41 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.14;SB=-0.01;sumGLbyD=37.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:113,9,0 42694-ref 184 . G A 76.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.54;SB=-0.01;sumGLbyD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:109,9,0 42694-ref 208 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42694-ref 250 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42694-ref 280 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42697-ref 78 . T C 153.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.77;SB=-39.76;sumGLbyD=37.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:187,15,0 42697-ref 181 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42697-ref 231 . A G 206.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.41;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 42697-ref 260 . G C 200.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.37;SB=-0.01;sumGLbyD=38.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:233,18,0 42709-ref 139 . C T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 42709-ref 237 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42709-ref 258 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 42709-ref 278 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 42709-ref 334 . G A 40.91 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.45;SB=-0.01;sumGLbyD=36.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:72,6,0 42778-ref 23 . T C 440.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.69;SB=-0.01;sumGLbyD=39.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.12:473,36,0 42778-ref 135 . A T 267.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.42;SB=-0.01;sumGLbyD=37.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:300,24,0 42778-ref 139 . C T 204.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.28;SB=-0.01;sumGLbyD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.06:238,18,0 42778-ref 224 . G A 699.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.99;SB=-0.01;sumGLbyD=36.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:19:57.18:733,57,0 42778-ref 236 . A T 103.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.98;SB=-0.01;sumGLbyD=10.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:134,0,279 42778-ref 295 . A T 285.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.74;SB=-0.01;sumGLbyD=35.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:8:24.08:319,24,0 42846-ref 105 . T A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 42846-ref 184 . A C 25.48 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.10;SB=-0.01;sumGLbyD=11.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:55.47:55,0,81 42846-ref 187 . T C 43.12 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.56;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:74,6,0 42866-ref 86 . G T 33.54 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.71;SB=-0.01;sumGLbyD=12.71 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63.53:64,0,105 42866-ref 127 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 42866-ref 136 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 42866-ref 496 . T A 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:71,0,31 42866-ref 509 . T A 37.98 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.49;SB=-0.01;sumGLbyD=16.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67.97:68,0,68 42866-ref 804 . G C 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:71,0,31 42899-ref 221 . C T 161.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.37;SB=-0.01;sumGLbyD=38.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:195,15,0 42899-ref 256 . A T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 42899-ref 452 . C T 220.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.48;SB=-0.01;sumGLbyD=28.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:7:21.05:253,21,0 42899-ref 472 . T C 353.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:386,30,0 42899-ref 559 . T G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 42931-ref 173 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 42931-ref 185 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 43067-ref 61 . G C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.51;SB=-0.01;sumGLbyD=32.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.04:160,12,0 43067-ref 63 . T C 166.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.32;SB=-39.07;sumGLbyD=39.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:199,15,0 43067-ref 92 . G C 158.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.77;SB=-31.31;sumGLbyD=38.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:192,15,0 43103-ref 73 . C T 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 43103-ref 141 . G A 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 43103-ref 191 . A G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 43103-ref 201 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 43103-ref 216 . T A 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 43103-ref 248 . C T 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 43163-ref 83 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43163-ref 217 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43256-ref 33 . G A 44.31 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.16;SB=-0.01;sumGLbyD=38.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 43256-ref 96 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43309-ref 227 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43309-ref 244 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43309-ref 245 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43399-ref 147 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43399-ref 187 . C T 36.18 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.09;SB=-0.01;sumGLbyD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:67,6,0 43399-ref 211 . C A 106.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.52;SB=-0.01;sumGLbyD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 43399-ref 225 . T C 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 43399-ref 239 . A G 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 43399-ref 332 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43399-ref 345 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43399-ref 367 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 43399-ref 412 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43399-ref 417 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43491-ref 96 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43512-ref 15 . G A 498.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=33.21;SB=-0.01;sumGLbyD=35.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.13:531,42,0 43512-ref 21 . C G 32.84 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.44;MQ0=0;QD=1.82;SB=-0.01;sumGLbyD=3.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62.83:63,0,508 43512-ref 45 . G A 1369.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.72;MQ0=0;QD=38.04;SB=-0.01;sumGLbyD=38.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:99:1402,108,0 43512-ref 99 . A G 3038.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=81;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8656;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.52;SB=-0.01;sumGLbyD=37.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,80:81:99:3072,207,0 43527-ref 10 . T C 78.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.19;SB=-0.01;sumGLbyD=37.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:111,9,0 43626-ref 125 . C T 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 43683-ref 104 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 43683-ref 256 . T C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 43683-ref 273 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43882-ref 59 . C T 280.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.06;SB=-0.01;sumGLbyD=39.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:313,24,0 43882-ref 134 . T A 511.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.51;SB=-0.01;sumGLbyD=38.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:544,42,0 43887-ref 106 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 43887-ref 110 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43892-ref 94 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 43911-ref 43 . T C 85.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.59;SB=-0.01;sumGLbyD=39.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:118,9,0 43911-ref 156 . A T 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 43930-ref 73 . A C 483.26 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.27;MQ0=0;QD=34.52;SB=-0.01;sumGLbyD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.11:516,42,0 43930-ref 76 . G A 381.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.22;MQ0=0;QD=29.34;SB=-0.01;sumGLbyD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:11:33.10:414,33,0 43930-ref 158 . A G 282.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:316,24,0 43945-ref 191 . C T 226.54 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.32;SB=-0.01;sumGLbyD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:5.55:256,0,6 43945-ref 257 . G T 158.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.67;SB=-0.01;sumGLbyD=38.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:191,15,0 43945-ref 280 . T G 163.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 43945-ref 310 . A G 205.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.17;SB=-0.01;sumGLbyD=39.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:238,18,0 43945-ref 464 . A G 85.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.18;SB=-0.01;sumGLbyD=16.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:96.75:115,0,97 43945-ref 555 . G T 599.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.25;SB=-0.01;sumGLbyD=37.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:17:48.16:632,48,0 43945-ref 562 . G A 603.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.70;SB=-0.01;sumGLbyD=39.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.16:636,48,0 43945-ref 617 . C T 404.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.74;SB=-0.01;sumGLbyD=39.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:437,33,0 44074-ref 67 . G A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 44074-ref 97 . G A 82.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.58;SB=-0.01;sumGLbyD=38.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:115,9,0 44074-ref 109 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 44074-ref 194 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 44074-ref 218 . T G 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 44167-ref 55 . C A 42.20 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.10;SB=-0.01;sumGLbyD=37.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 44300-ref 60 . A C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 44300-ref 82 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 44300-ref 92 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,1:1:1.76:40,3,0 44300-ref 120 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 44389-ref 161 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 44389-ref 169 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 44389-ref 252 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 44538-ref 120 . A T 41.26 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.63;SB=-0.01;sumGLbyD=36.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 44544-ref 41 . T A 178.62 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=25.52;SB=-0.01;sumGLbyD=29.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18.94:209,0,19 44544-ref 58 . G A 174.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=24.96;SB=-0.01;sumGLbyD=29.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18.94:205,0,19 44544-ref 92 . C A 346.32 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9330;MQ=36.22;MQ0=0;QD=26.64;SB=-0.01;sumGLbyD=29.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:12:3.90:376,0,4 44544-ref 126 . G T 363.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.26;SB=-0.01;sumGLbyD=32.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:3.89:392,0,4 44544-ref 194 . G A 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 44544-ref 196 . T C 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 44544-ref 200 . G A 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 44603-ref 54 . A G 312.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.76;SB=-0.01;sumGLbyD=38.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:346,27,0 44603-ref 68 . G A 372.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=33.84;SB=-0.01;sumGLbyD=36.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:405,33,0 44603-ref 75 . G A 372.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=33.82;SB=-0.01;sumGLbyD=36.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:405,33,0 44603-ref 116 . G A 94.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=23.61;SB=-0.01;sumGLbyD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:127,12,0 44603-ref 130 . G A 96.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:129,12,0 44794-ref 193 . G C 187.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.80;SB=-0.01;sumGLbyD=31.08 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18.94:218,0,19 44794-ref 227 . A T 77.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.60;SB=-0.01;sumGLbyD=21.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:4:27.97:108,0,28 44794-ref 325 . T C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 44794-ref 488 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 44794-ref 562 . G A 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 44794-ref 592 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 44799-ref 17 . A C 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:71,0,31 44799-ref 101 . A C 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 44799-ref 125 . A T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 44799-ref 126 . C T 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 44800-ref 28 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 44800-ref 79 . A G 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 44858-ref 101 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 44919-ref 31 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 44919-ref 47 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 44919-ref 72 . T G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 44919-ref 89 . A T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 44919-ref 103 . C T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 44999-ref 50 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 44999-ref 87 . T G 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 44999-ref 108 . G A 85.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.59;SB=-0.01;sumGLbyD=39.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:118,9,0 44999-ref 149 . T C 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.90;SB=-0.01;sumGLbyD=37.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:73,6,0 45178-ref 18 . T C 736.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.03;MQ0=0;QD=35.06;SB=-0.01;sumGLbyD=36.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:20:60.19:769,60,0 45178-ref 25 . G C 1004.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.30;MQ0=0;QD=34.65;SB=-0.01;sumGLbyD=35.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:47.27:1038,47,0 45178-ref 117 . T C 3706.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=96;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.8278;MQ=36.37;MQ0=0;QD=38.61;SB=-0.01;sumGLbyD=38.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:96:99:3666,286,0 45178-ref 123 . C T 2938.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=86;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.6980;MQ=35.81;MQ0=0;QD=34.17;SB=-0.01;sumGLbyD=34.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,84:83:99:2972,182,0 45178-ref 190 . G T 37.35 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4444;MQ=33.48;MQ0=0;QD=2.08;SB=-0.01;sumGLbyD=3.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:67.34:67,0,452 45178-ref 191 . G T 63.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4444;MQ=33.48;MQ0=0;QD=3.55;SB=-0.01;sumGLbyD=5.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:93.96:94,0,440 45178-ref 192 . G C 469.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8660;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.36;SB=-0.01;sumGLbyD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,15:16:11.15:502,11,0 45252-ref 126 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 45289-ref 161 . A G 121.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.34;SB=-0.01;sumGLbyD=38.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:154,12,0 45384-ref 69 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 45418-ref 36 . T A 155.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.04;SB=-0.01;sumGLbyD=37.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:188,15,0 45424-ref 26 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 45424-ref 166 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 45493-ref 50 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 45493-ref 106 . T A 158.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.77;SB=-0.01;sumGLbyD=38.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:192,15,0 45493-ref 133 . G T 123.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.91;SB=-0.01;sumGLbyD=39.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:156,12,0 45496-ref 36 . 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C T 491.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=35.14;SB=-0.01;sumGLbyD=37.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:525,42,0 45556-ref 124 . T A 652.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.93;MQ0=0;QD=34.34;SB=-0.01;sumGLbyD=36.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:18:54.17:685,54,0 45556-ref 160 . G A 823.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.54;MQ0=0;QD=37.41;SB=-120.02;sumGLbyD=38.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.21:856,66,0 45556-ref 167 . C A 708.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.27;SB=-120.02;sumGLbyD=39.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:741,57,0 45591-ref 51 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 45724-ref 85 . A T 349.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=34.98;SB=-0.01;sumGLbyD=38.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:383,30,0 45724-ref 96 . C G 356.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=35.67;SB=-0.01;sumGLbyD=38.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:390,30,0 45724-ref 110 . G A 129.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=35.72;MQ0=0;QD=16.24;SB=-0.01;sumGLbyD=19.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:91.19:160,0,91 45724-ref 147 . G C 74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.67;SB=-0.01;sumGLbyD=35.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:106,9,0 45724-ref 156 . T C 86.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.87;SB=-0.01;sumGLbyD=39.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 45724-ref 272 . A C 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 45927-ref 80 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 45927-ref 204 . G A 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 45927-ref 249 . T G 146.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:179,15,0 45927-ref 256 . A T 146.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:179,15,0 45927-ref 280 . C G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 45935-ref 46 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 45935-ref 73 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 45935-ref 76 . A G 94.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=23.74;SB=-0.01;sumGLbyD=31.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:127,12,0 45935-ref 91 . C T 133.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=26.79;SB=-0.01;sumGLbyD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:167,15,0 45935-ref 179 . C T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 45935-ref 192 . A G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 45979-ref 39 . C T 151.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.33;SB=-0.01;sumGLbyD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21.95:182,0,22 46035-ref 12 . C G 174.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.92;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:207,21,0 46035-ref 54 . T G 320.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.19;MQ0=0;QD=24.62;SB=-65.68;sumGLbyD=27.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:11:33.07:353,33,0 46035-ref 57 . C T 436.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=31.17;SB=-108.21;sumGLbyD=33.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.10:469,42,0 46035-ref 58 . C T 418.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.72;MQ0=0;QD=29.90;SB=-94.34;sumGLbyD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.09:452,42,0 46035-ref 159 . C A 686.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.93;MQ0=0;QD=36.14;SB=-0.01;sumGLbyD=37.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.17:720,57,0 46035-ref 168 . C G 185.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=30.84;SB=-0.01;sumGLbyD=36.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:218,18,0 46126-ref 89 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 46299-ref 116 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 46344-ref 132 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 46344-ref 165 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 46344-ref 173 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 46369-ref 121 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 46535-ref 47 . G A 502.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.89;SB=-0.01;sumGLbyD=38.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.13:535,42,0 46535-ref 115 . T C 185.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9967;MQ=35.28;MQ0=0;QD=31.00;SB=-0.01;sumGLbyD=36.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:219,18,0 46535-ref 155 . G T 219.24 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8640;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.36;SB=-0.01;sumGLbyD=27.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:45.84:249,0,46 46535-ref 157 . A G 12.79 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8640;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.42;SB=-0.01;sumGLbyD=4.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:42.54:43,0,249 46535-ref 211 . A G 135.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.7340;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.02;SB=-0.01;sumGLbyD=18.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:165,0,124 46535-ref 255 . T C 68.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.49;SB=-0.01;sumGLbyD=16.49 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:95.39:99,0,95 46535-ref 330 . C T 595.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.10;SB=-0.01;sumGLbyD=34.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:15.60:629,16,0 46535-ref 438 . C G 163.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.73;SB=-0.01;sumGLbyD=39.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:196,15,0 46687-ref 72 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 46836-ref 38 . C A 126.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 46836-ref 53 . G C 192.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.05;SB=-0.01;sumGLbyD=37.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:225,18,0 46836-ref 104 . G A 213.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=30.46;SB=-0.01;sumGLbyD=35.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:246,21,0 46836-ref 121 . T C 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=28.97;SB=-0.01;sumGLbyD=35.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:178,15,0 46948-ref 72 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 46948-ref 99 . A C 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 46948-ref 362 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 47047-ref 43 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 47047-ref 65 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 47047-ref 237 . G A 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 47047-ref 421 . C G 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 47047-ref 422 . C A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 47047-ref 423 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 47047-ref 424 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 47095-ref 248 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 47095-ref 252 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 47095-ref 275 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 47159-ref 75 . C T 189.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=36.32;MQ0=0;QD=12.61;SB=-0.01;sumGLbyD=14.61 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:219,0,275 47159-ref 102 . G A 126.55 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.6311;MQ=36.15;MQ0=0;QD=10.55;SB=-0.01;sumGLbyD=13.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:11:99:157,0,198 47159-ref 252 . T C 77.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=19.50;SB=-0.01;sumGLbyD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:108,0,28 47193-ref 38 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 47246-ref 7 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 47246-ref 173 . T C 124.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.13;SB=-0.01;sumGLbyD=39.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:157,12,0 47379-ref 28 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 47379-ref 33 . C T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 47379-ref 52 . G A 106.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.52;SB=-0.01;sumGLbyD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 47379-ref 57 . A T 142.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=28.58;SB=-0.01;sumGLbyD=35.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:176,15,0 47400-ref 73 . T C 355.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4687;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.32;SB=-0.01;sumGLbyD=35.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:389,30,0 47400-ref 128 . G C 16.53 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.07;SB=-0.01;sumGLbyD=5.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:46.43:46,0,207 47400-ref 190 . C A 105.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.16;SB=-0.01;sumGLbyD=16.91 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:135,0,129 47400-ref 205 . G C 67.53 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.65;SB=-0.01;sumGLbyD=13.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:97.52:98,0,133 47400-ref 257 . G C 110.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.7319;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.43;SB=-0.01;sumGLbyD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:5:22.75:141,0,23 47400-ref 262 . T A 41 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.67;SB=-0.01;sumGLbyD=23.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23.47:71,0,23 47559-ref 13 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,2:1:1.76:40,3,0 47559-ref 25 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 47746-ref 56 . G A 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 47746-ref 85 . C T 207.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=40.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:240,18,0 47977-ref 77 . G A 38.78 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.93;SB=-0.01;sumGLbyD=22.93 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:69,0,31 47977-ref 128 . G A 114.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.73;SB=-0.01;sumGLbyD=36.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:147,12,0 47978-ref 88 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 47994-ref 133 . T C 476.90 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.06;SB=-0.01;sumGLbyD=36.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:13:39.13:510,39,0 47994-ref 160 . T A 353.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9979;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.16;SB=-0.01;sumGLbyD=35.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:10:30.09:387,30,0 48012-ref 213 . G T 309.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.35;SB=-0.01;sumGLbyD=38.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:342,27,0 48018-ref 71 . A G 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:71,0,31 48018-ref 78 . G A 35.77 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.94;SB=-0.01;sumGLbyD=16.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65.76:66,0,67 48018-ref 88 . T G 117.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.28;SB=-0.01;sumGLbyD=37.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 48080-ref 78 . G A 44.89 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:76,6,0 48080-ref 132 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 48132-ref 25 . C T 11.53 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9999;MQ=29.55;MQ0=0;QD=1.92;SB=-0.01;sumGLbyD=6.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:41.20:41,0,119 48132-ref 61 . A G 285.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=32.22;MQ0=0;QD=31.73;SB=-0.01;sumGLbyD=35.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:319,27,0 48132-ref 91 . C G 260.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=34.39;MQ0=0;QD=32.52;SB=-0.01;sumGLbyD=36.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:293,24,0 48132-ref 129 . T C 149.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=29.81;SB=-0.01;sumGLbyD=36.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:182,15,0 48132-ref 151 . G A 44.89 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=14.96;SB=-0.01;sumGLbyD=25.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6.02:76,6,0 48132-ref 184 . C T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=12.80;SB=-0.01;sumGLbyD=23.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:2:6.02:70,6,0 48170-ref 130 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 48181-ref 181 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 48379-ref 131 . T A 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.66;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.29:71,0,30 48379-ref 153 . C T 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-0.01;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 48379-ref 155 . T C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 48397-ref 141 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 48480-ref 127 . G T 115.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=28.94;SB=-0.01;sumGLbyD=37.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:148,12,0 48480-ref 131 . C T 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 48498-ref 105 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 48498-ref 308 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 48498-ref 429 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 48690-ref 23 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 48690-ref 50 . T G 82.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.44;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:114,9,0 48690-ref 113 . T A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 48690-ref 189 . A G 65.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.90;SB=-0.01;sumGLbyD=32.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.01:98,9,0 48690-ref 233 . T C 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 48798-ref 105 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 48798-ref 204 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 48798-ref 264 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 48828-ref 72 . T G 155.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.19;SB=-0.01;sumGLbyD=37.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:189,15,0 48828-ref 99 . T C 193.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.33;SB=-0.01;sumGLbyD=37.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:227,18,0 48828-ref 101 . G A 200.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.38;SB=-0.01;sumGLbyD=38.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:233,18,0 48829-ref 29 . G T 237.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9971;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.18;SB=-0.01;sumGLbyD=14.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:17:99:267,0,265 48829-ref 137 . C T 1235.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.45;SB=-0.01;sumGLbyD=38.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1269,99,0 48829-ref 257 . G A 286.70 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.9968;MQ=36.58;MQ0=0;QD=11.95;SB=-0.01;sumGLbyD=13.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,10:23:99:317,0,403 48855-ref 57 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:2:1.76:40,3,0 48855-ref 59 . T C 28.41 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=9.47;SB=-0.01;sumGLbyD=19.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:58,0,31 48855-ref 93 . G C 199.85 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9998;MQ=35.42;MQ0=0;QD=15.37;SB=-0.01;sumGLbyD=17.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:230,0,189 48855-ref 142 . A G 142.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.88;SB=-0.01;sumGLbyD=19.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:173,0,133 48908-ref 105 . T C 248.64 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.76;SB=-0.01;sumGLbyD=19.90 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:12:99:279,0,109 49051-ref 89 . G A 65.40 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=16.35;SB=-0.01;sumGLbyD=23.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:95,0,28 49051-ref 133 . A G 67.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=34.39;MQ0=0;QD=16.90;SB=-0.01;sumGLbyD=24.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27.97:98,0,28 49071-ref 89 . T C 127.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.88;SB=-0.01;sumGLbyD=40.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:160,12,0 49088-ref 21 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 49088-ref 66 . G A 233.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.30;SB=-0.01;sumGLbyD=38.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:266,21,0 49088-ref 89 . T A 198.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.12;SB=-0.01;sumGLbyD=38.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:232,18,0 49088-ref 142 . C T 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 49088-ref 149 . T A 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=16.80;SB=-0.01;sumGLbyD=24.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:3:9.02:99,9,0 49088-ref 187 . T C 219.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.02;MQ0=0;QD=27.47;SB=-0.01;sumGLbyD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:7:21.06:253,21,0 49088-ref 189 . T C 327.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.85;MQ0=0;QD=32.71;SB=-0.01;sumGLbyD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:360,30,0 49111-ref 127 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49111-ref 130 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49111-ref 169 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49136-ref 117 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49137-ref 121 . A G 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 49145-ref 96 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49318-ref 47 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49318-ref 69 . C G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49318-ref 84 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49341-ref 93 . A G 79.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.51;SB=-0.01;sumGLbyD=37.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:112,9,0 49341-ref 109 . G A 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 49341-ref 192 . G C 136.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=27.23;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:169,15,0 49341-ref 213 . C G 96.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=24.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:129,12,0 49341-ref 255 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 49341-ref 262 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 49342-ref 170 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49342-ref 213 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49380-ref 90 . T G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8941;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.00;SB=-0.01;sumGLbyD=30.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:3:9.03:120,9,0 49535-ref 83 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49535-ref 103 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49607-ref 101 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49747-ref 97 . T G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 49753-ref 61 . T C 160.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.10;SB=-0.01;sumGLbyD=38.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:193,15,0 49753-ref 65 . T G 203.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.94;SB=-0.01;sumGLbyD=39.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:236,18,0 49753-ref 177 . G T 85.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.36;SB=-0.01;sumGLbyD=39.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:117,9,0 49764-ref 80 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49854-ref 31 . C A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 49854-ref 52 . T C 69.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.22;SB=-0.01;sumGLbyD=34.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:102,9,0 49854-ref 98 . G A 242.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.62;SB=-0.01;sumGLbyD=39.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:275,21,0 50008-ref 133 . C A 429.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.9627;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.49;SB=-0.01;sumGLbyD=22.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:20:99:460,0,140 50055-ref 4 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 50055-ref 84 . A C 243.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.06;SB=-0.01;sumGLbyD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:11.50:273,0,11 50055-ref 99 . T C 284.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.53;SB=-0.01;sumGLbyD=39.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:317,24,0 50055-ref 130 . G A 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 50355-ref 131 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 50355-ref 195 . G A 39.68 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.23;SB=-0.01;sumGLbyD=23.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:13.67:70,0,14 50355-ref 197 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 50355-ref 221 . A G 84.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.32;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:117,9,0 50464-ref 101 . G A 186.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=31.07;SB=-0.01;sumGLbyD=36.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:219,18,0 50464-ref 123 . A C 132.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=26.57;SB=-0.01;sumGLbyD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:166,15,0 50464-ref 135 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 50464-ref 136 . A T 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 50464-ref 162 . A C 43.12 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.56;SB=-0.01;sumGLbyD=37.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:74,6,0 50464-ref 163 . T A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 50500-ref 164 . G T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 50802-ref 17 . T C 195.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.61;SB=-0.01;sumGLbyD=38.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:229,18,0 50802-ref 121 . A G 35.05 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9972;MQ=24.17;MQ0=0;QD=5.84;SB=-0.01;sumGLbyD=10.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:4:22.35:65,0,22 50802-ref 122 . A G 40.99 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.9804;MQ=24.17;MQ0=0;QD=6.83;SB=-0.01;sumGLbyD=11.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:4:22.34:71,0,22 50808-ref 353 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 50808-ref 372 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 50808-ref 414 . A G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 50808-ref 455 . T C 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 50808-ref 456 . G A 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 50816-ref 124 . C A 105.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=21.12;SB=-0.01;sumGLbyD=27.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.01:138,15,0 50816-ref 206 . A G 145.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.87;MQ0=0;QD=24.24;SB=-0.01;sumGLbyD=29.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.02:178,18,0 50816-ref 466 . A C 16.45 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=5.48;SB=-0.01;sumGLbyD=15.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:18.66:46,0,19 50816-ref 471 . C A 169.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.81;MQ0=0;QD=28.24;SB=-82.16;sumGLbyD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.04:202,18,0 50816-ref 499 . G A 328.61 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.42;MQ0=0;QD=32.86;SB=-119.97;sumGLbyD=36.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:362,30,0 50816-ref 546 . A G 345.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.50;SB=-0.01;sumGLbyD=37.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:378,30,0 50816-ref 926 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 50816-ref 1389 . T G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 50816-ref 1405 . C G 317.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.28;SB=-0.01;sumGLbyD=38.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:351,27,0 50816-ref 1473 . T C 652.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=32.61;SB=-0.01;sumGLbyD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:30.54:685,31,0 50816-ref 1485 . C A 504.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.32;MQ0=0;QD=33.63;SB=-0.01;sumGLbyD=35.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:14:42.13:537,42,0 50838-ref 464 . C T 1026 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.5774;MQ=22.45;MQ0=0;QD=20.12;SB=-54.28;sumGLbyD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,47:49:29.54:1059,30,0 50838-ref 560 . T G 462.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=66;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=33.0183;MQ=30.77;MQ0=0;QD=7.01;SB=3.00;sumGLbyD=7.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,28:66:99:493,0,1256 50838-ref 620 . T C 4631.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=122;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8914;MQ=36.67;MQ0=0;QD=37.96;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,122:119:99:4631,358,0 50838-ref 625 . A G 4491.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=118;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.8941;MQ=36.66;MQ0=0;QD=38.06;SB=-0.01;sumGLbyD=37.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,117:116:99:4460,346,0 50880-ref 111 . C T 988.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.1799;MQ=36.69;MQ0=0;QD=29.96;SB=-0.01;sumGLbyD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,29:30:14.70:1021,15,0 50880-ref 292 . A G 5322.88 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=200;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.8982;MQ=36.75;MQ0=0;QD=26.61;SB=-0.01;sumGLbyD=23.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,139:200:99:4720,0,1814 50880-ref 332 . A G 1751.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=161;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=68.1230;MQ=36.87;MQ0=0;QD=10.88;SB=-0.01;sumGLbyD=11.07 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,59:156:99:1782,0,3361 50880-ref 393 . G C 401.06 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=84;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.6508;MQ=36.88;MQ0=0;QD=4.77;SB=-0.01;sumGLbyD=5.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,18:84:99:431,0,2329 50880-ref 395 . C A 3269.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.6508;MQ=36.88;MQ0=0;QD=38.92;SB=-0.01;sumGLbyD=38.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:83:99:3269,250,0 50915-ref 271 . T C 24.11 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9332;MQ=28.44;MQ0=0;QD=8.04;SB=-0.01;sumGLbyD=18.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:55,6,0 50915-ref 308 . A G 102.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.14;MQ0=0;QD=20.57;SB=-0.01;sumGLbyD=27.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.03:135,12,0 50915-ref 328 . A G 260.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.04;MQ0=0;QD=32.62;SB=-0.01;sumGLbyD=36.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:294,24,0 51001-ref 67 . T C 1125.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.06;MQ0=0;QD=35.17;SB=-0.01;sumGLbyD=36.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.27:1158,96,0 51001-ref 90 . A G 2503.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.0064;MQ=34.69;MQ0=0;QD=34.77;SB=-0.01;sumGLbyD=35.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,70:69:99:2536,208,0 51001-ref 100 . C G 1009.91 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=113;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.4771;MQ=35.18;MQ0=0;QD=8.94;SB=-0.01;sumGLbyD=9.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,41:112:99:1040,0,2435 51001-ref 130 . T C 6775.67 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=213;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.6508;MQ=35.85;MQ0=0;QD=31.81;SB=-0.01;sumGLbyD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,182:210:99:6116,0,548 51001-ref 155 . C T 8294.53 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=286;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=24.5092;MQ=36.22;MQ0=0;QD=29.00;SB=-793.13;sumGLbyD=26.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,217:285:99:7436,0,1832 51001-ref 170 . G A 207.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=249;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=18.9512;MQ=36.43;MQ0=0;QD=0.83;SB=35.23;sumGLbyD=0.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:223,26:247:99:237,0,7790 51001-ref 209 . 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C A 1095.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6643;MQ=36.30;MQ0=0;QD=37.76;SB=-0.01;sumGLbyD=38.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:87.27:1128,87,0 51001-ref 543 . T G 428.55 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8311;MQ=35.28;MQ0=0;QD=23.81;SB=-0.01;sumGLbyD=25.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:53.55:459,0,54 51001-ref 565 . G A 753.83 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.21;MQ0=0;QD=32.78;SB=-0.01;sumGLbyD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,22:23:29.20:787,29,0 51001-ref 588 . G C 354.72 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=13.14;SB=-0.01;sumGLbyD=14.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,12:27:99:385,0,496 51001-ref 605 . C T 495.72 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.5017;MQ=35.98;MQ0=0;QD=16.52;SB=-0.01;sumGLbyD=17.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,16:29:99:526,0,407 51001-ref 690 . C T 367.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.71;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:400,30,0 51001-ref 723 . A T 46.56 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.28;SB=-0.01;sumGLbyD=39.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:78,6,0 51115-ref 463 . T G 107.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.41;MQ0=0;QD=21.51;SB=-0.01;sumGLbyD=28.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.02:140,15,0 51201-ref 388 . A G 1528.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7876;MQ=36.21;MQ0=0;QD=36.40;SB=-27.67;sumGLbyD=37.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:99:1562,123,0 51284-ref 344 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 51412-ref 794 . T C 12025.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=330;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=21.3896;MQ=35.86;MQ0=0;QD=36.44;SB=-109.64;sumGLbyD=35.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,325:324:99:11836,787,0 51412-ref 832 . C G 12242.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=338;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=16.6414;MQ=35.68;MQ0=0;QD=36.22;SB=-109.64;sumGLbyD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,335:330:99:12170,987,0 51412-ref 858 . G C 8266.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=234;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=10.0686;MQ=34.16;MQ0=0;QD=35.33;SB=-29.63;sumGLbyD=35.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,233:228:99:8265,686,0 51412-ref 943 . C G 24.11 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.9228;MQ=23.00;MQ0=0;QD=8.04;SB=-0.01;sumGLbyD=18.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:55,6,0 51460-ref 635 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 51487-ref 20 . G T 123.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.64;SB=-0.01;sumGLbyD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.04:156,12,0 51487-ref 32 . T C 111.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.00;SB=-0.01;sumGLbyD=17.75 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:6:61.95:142,0,62 51487-ref 44 . A G 96.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.75;SB=-0.01;sumGLbyD=11.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:126,0,244 51487-ref 53 . A G 99.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=9.08;SB=-0.01;sumGLbyD=11.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:10:99:130,0,209 51487-ref 112 . G A 459.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.42;MQ0=0;QD=35.37;SB=-0.01;sumGLbyD=37.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.12:493,39,0 51487-ref 129 . C G 461.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.63;MQ0=0;QD=30.77;SB=-0.01;sumGLbyD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:6.56:493,7,0 51487-ref 175 . T C 307.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8662;MQ=34.60;MQ0=0;QD=23.65;SB=-0.01;sumGLbyD=25.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:30.54:337,0,31 51487-ref 226 . T C 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 51487-ref 237 . A G 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 51487-ref 250 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 51487-ref 382 . T G 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 51529-ref 11 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 51529-ref 12 . C A 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 51529-ref 13 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 51529-ref 396 . C G 440.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8311;MQ=31.03;MQ0=0;QD=31.44;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.09:473,42,0 51529-ref 446 . C T 109.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.82;MQ0=0;QD=21.90;SB=-0.01;sumGLbyD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.02:142,15,0 51600-ref 23 . A G 20250.65 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=36.6181;MQ=25.27;MQ0=0;QD=20.25;SB=-0.01;sumGLbyD=17.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:289,710:994:99:17240,0,5255 51600-ref 51 . G A 28176.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=999;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=52.4948;MQ=25.27;MQ0=0;QD=28.20;SB=-0.01;sumGLbyD=28.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,988:987:99:28009,2844,0 51600-ref 89 . A G 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:118,12,0 51600-ref 90 . A C 82.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.52;SB=-0.01;sumGLbyD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:115,12,0 51600-ref 319 . G T 41.20 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=130;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.7373;MQ=19.22;MQ0=0;QD=0.32;SB=3.00;sumGLbyD=0.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:123,5:25:71.19:71,0,443 51600-ref 372 . G A 1336.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=476;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=80.2034;MQ=18.84;MQ0=0;QD=2.81;SB=2.97;sumGLbyD=2.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:57,419:56:60.49:1370,60,0 51600-ref 381 . G A 1298.68 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=474;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=20.5946;MQ=18.82;MQ0=0;QD=2.74;SB=-1.01;sumGLbyD=2.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,468:54:78.37:1332,78,0 51688-ref 196 . A G 35.74 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.81;MQ0=0;QD=17.87;SB=-26.42;sumGLbyD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:67,6,0 51688-ref 293 . T A 126.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 51688-ref 331 . G A 47.34 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=23.67;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 51688-ref 442 . C A 34.97 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9995;MQ=28.44;MQ0=0;QD=5.83;SB=-0.01;sumGLbyD=10.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:64.96:65,0,79 51688-ref 480 . T C 28269.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=999;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=44.0840;MQ=24.73;MQ0=0;QD=28.30;SB=-0.01;sumGLbyD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,995:983:99:28194,2922,0 51688-ref 530 . G T 1148.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.7303;MQ=34.34;MQ0=0;QD=20.50;SB=-0.01;sumGLbyD=21.04 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,39:56:99:1178,0,416 51688-ref 532 . G A 34.34 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.69;MQ0=0;QD=1.91;SB=-0.01;sumGLbyD=3.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:64.34:64,0,476 51688-ref 573 . T C 205.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=29.39;SB=-0.01;sumGLbyD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:6:18.06:239,18,0 51688-ref 606 . T G 73.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=24.65;SB=-0.01;sumGLbyD=35.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:106,9,0 51750-ref 242 . A G 589.39 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.29;MQ0=0;QD=32.74;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54.13:622,54,0 51750-ref 423 . C T 212.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=27.18;MQ0=0;QD=26.50;SB=-0.01;sumGLbyD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.04:245,24,0 51750-ref 497 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 51798-ref 1 . G C 73.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=24.39;SB=-0.01;sumGLbyD=35.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:105,9,0 51798-ref 2 . A G 181.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=30.26;SB=-0.01;sumGLbyD=35.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:214,18,0 51798-ref 72 . A G 8521.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=250;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.7788;MQ=34.64;MQ0=0;QD=34.09;SB=-0.01;sumGLbyD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,234:246:99:8021,241,0 51798-ref 95 . T G 6670.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=198;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9822;MQ=31.23;MQ0=0;QD=33.69;SB=-88.87;sumGLbyD=33.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,198:197:99:6668,592,0 51798-ref 118 . A G 3727.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=119;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.29;MQ0=0;QD=31.32;SB=-88.87;sumGLbyD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,119:119:99:3726,358,0 51798-ref 123 . C G 2541.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.16;MQ0=0;QD=27.93;SB=-88.87;sumGLbyD=28.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,90:89:99:2574,238,0 51798-ref 139 . G A 1470.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=25.00;MQ0=0;QD=28.28;SB=-88.87;sumGLbyD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,51:51:99:1504,153,0 51798-ref 190 . T A 766.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=28.40;SB=-59.25;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81.15:800,81,0 51798-ref 198 . G T 1619.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.04;MQ0=0;QD=31.76;SB=-535.98;sumGLbyD=32.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:50:99:1653,150,0 51798-ref 215 . C G 2408.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=30.39;MQ0=0;QD=32.11;SB=-1045.30;sumGLbyD=32.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:73:99:2441,220,0 51798-ref 239 . A G 2474.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.39;MQ0=0;QD=33.00;SB=-1072.49;sumGLbyD=33.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,75:75:99:2508,226,0 51798-ref 271 . C A 663.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9945;MQ=30.70;MQ0=0;QD=25.50;SB=-213.71;sumGLbyD=26.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:24:39.53:696,40,0 51846-ref 264 . G A 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 51846-ref 286 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 51846-ref 287 . T G 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 51846-ref 288 . T C 56.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:89,9,0 51846-ref 442 . A G 253.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.16;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:284,0,119 51846-ref 679 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 51943-ref 121 . C T 126.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9762;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.14;SB=-0.01;sumGLbyD=22.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:8.58:157,0,9 51943-ref 140 . G A 171.18 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=17;HaplotypeScore=6.7141;MQ=26.60;MQ0=0;QD=19.02;SB=-35.20;sumGLbyD=22.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:12.97:201,0,13 52035-ref 3 . T G 41.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.94;SB=-0.01;sumGLbyD=24.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6.02:73,6,0 52035-ref 16 . C T 137.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7988;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.77;SB=3.00;sumGLbyD=16.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:168,0,159 52035-ref 113 . G A 460.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.91;SB=-74.00;sumGLbyD=23.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,14:20:99:490,0,179 52035-ref 131 . T C 852.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.51;SB=-76.99;sumGLbyD=36.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.22:885,69,0 52035-ref 171 . A G 770.12 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.67;SB=-0.01;sumGLbyD=38.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.19:803,63,0 52035-ref 212 . G A 643.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.67;MQ0=0;QD=30.64;SB=-0.01;sumGLbyD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:23.16:676,23,0 52035-ref 260 . A G 276.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.72;MQ0=0;QD=30.67;SB=-0.01;sumGLbyD=34.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.06:309,27,0 52035-ref 274 . G C 26.06 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.02;MQ0=0;QD=13.03;SB=-0.01;sumGLbyD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:57,6,0 52035-ref 410 . C T 38.87 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.96;SB=-0.01;sumGLbyD=22.96 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:69,0,31 52035-ref 418 . A G 65.47 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.09;SB=-0.01;sumGLbyD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.96:95,0,65 52035-ref 420 . C T 71.26 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=14.25;SB=-0.01;sumGLbyD=20.25 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.27:101,0,64 52194-ref 1 . G A 114.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.63;SB=-0.01;sumGLbyD=36.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:147,12,0 52194-ref 63 . G T 1764.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=51;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.6651;MQ=34.94;MQ0=0;QD=34.60;SB=-0.01;sumGLbyD=35.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,51:49:99:1798,147,0 52194-ref 125 . G T 122.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.45;SB=-39.55;sumGLbyD=31.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.04:155,12,0 52194-ref 132 . A G 86.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.85;SB=-39.22;sumGLbyD=39.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 52194-ref 143 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 52497-ref 179 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 52639-ref 54 . G A 322.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=25.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:12.46:355,12,0 52639-ref 86 . A C 411.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8318;MQ=25.00;MQ0=0;QD=27.42;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.08:444,45,0 52639-ref 88 . G T 352.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.15;SB=-0.01;sumGLbyD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:13:39.07:385,39,0 52639-ref 89 . T A 322.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8321;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.07;SB=-0.01;sumGLbyD=25.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:12.46:355,12,0 52639-ref 110 . G A 146.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:179,15,0 52639-ref 128 . T A 117.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.29;SB=-0.01;sumGLbyD=37.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:150,12,0 52639-ref 565 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 52652-ref 20 . G A 1170.35 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9663;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.47;SB=-0.01;sumGLbyD=36.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,32:33:59.31:1203,59,0 52652-ref 94 . A G 5705.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=155;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.5166;MQ=36.21;MQ0=0;QD=36.81;SB=-80.02;sumGLbyD=36.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,155:152:99:5705,457,0 52652-ref 101 . G T 5023.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=138;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.12;MQ0=0;QD=36.40;SB=-71.56;sumGLbyD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,138:137:99:5022,412,0 52652-ref 114 . G C 3106.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.78;MQ0=0;QD=36.98;SB=-76.99;sumGLbyD=37.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:99:3139,253,0 52652-ref 439 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 52652-ref 524 . A G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 52652-ref 540 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 52656-ref 26 . G A 77.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.87;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:110,9,0 52656-ref 44 . G A 103.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9998;MQ=32.73;MQ0=0;QD=20.80;SB=-0.01;sumGLbyD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:14.58:134,0,15 52656-ref 60 . A C 146.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.73;MQ0=0;QD=29.30;SB=-0.01;sumGLbyD=35.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:179,15,0 52656-ref 92 . T G 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:50,0,31 52656-ref 96 . T A 20.27 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:50,0,31 52792-ref 330 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 52792-ref 490 . T A 254.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.04;MQ0=0;QD=31.77;SB=-0.01;sumGLbyD=35.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.06:287,24,0 52792-ref 561 . T C 834.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=34.39;MQ0=0;QD=34.77;SB=-0.01;sumGLbyD=36.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:72.18:867,72,0 52792-ref 569 . A T 766.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.65;MQ0=0;QD=34.82;SB=-0.01;sumGLbyD=36.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66.18:799,66,0 52792-ref 593 . G T 343.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.04;MQ0=0;QD=31.21;SB=-0.01;sumGLbyD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.08:376,33,0 52792-ref 610 . A C 204.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.50;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.04:237,24,0 52792-ref 623 . A T 73.47 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=27.82;MQ0=0;QD=14.69;SB=-0.01;sumGLbyD=20.69 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.97:103,0,25 52792-ref 642 . G A 494.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=34.55;MQ0=0;QD=29.12;SB=-0.01;sumGLbyD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,15:16:8.14:527,8,0 52792-ref 643 . G T 484.92 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=34.55;MQ0=0;QD=28.52;SB=-0.01;sumGLbyD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:16:8.14:517,8,0 52792-ref 669 . A G 1317.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9996;MQ=36.45;MQ0=0;QD=35.62;SB=-0.01;sumGLbyD=36.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,36:37:71.34:1351,71,0 52792-ref 732 . T G 1590.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.05;MQ0=0;QD=37.00;SB=-0.01;sumGLbyD=37.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:42:99:1624,126,0 52792-ref 750 . A G 710.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=35.54;SB=-0.01;sumGLbyD=37.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.18:744,60,0 52792-ref 758 . T C 517.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.21;MQ0=0;QD=34.52;SB=-0.01;sumGLbyD=36.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:551,45,0 52801-ref 684 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 52861-ref 149 . G T 47.63 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=23.00;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=7.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:77.62:78,0,161 52861-ref 297 . C A 1101.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4530;MQ=23.00;MQ0=0;QD=25.03;SB=-0.01;sumGLbyD=25.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,43:43:99:1134,101,0 52861-ref 375 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 52861-ref 376 . G C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 52861-ref 377 . G A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 52861-ref 378 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 52881-ref 25 . T C 435.39 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=54;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9958;MQ=23.50;MQ0=0;QD=8.06;SB=-0.01;sumGLbyD=8.62 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,22:54:99:465,0,713 52881-ref 37 . T C 2313.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=80;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.57;MQ0=0;QD=28.91;SB=-0.01;sumGLbyD=29.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,80:79:99:2346,237,0 52881-ref 57 . A T 3426.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7864;MQ=28.25;MQ0=0;QD=29.80;SB=-0.01;sumGLbyD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:111:99:3397,330,0 52881-ref 58 . C A 1310.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=115;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.7864;MQ=28.25;MQ0=0;QD=11.40;SB=-0.01;sumGLbyD=11.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,55:112:99:1341,0,1447 53021-ref 37 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 53021-ref 305 . C T 27.61 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9967;MQ=34.39;MQ0=0;QD=6.90;SB=-0.01;sumGLbyD=14.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:57.59:58,0,65 53021-ref 326 . C G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=12.80;SB=-0.01;sumGLbyD=23.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6.02:70,6,0 53021-ref 530 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,2:1:1.76:40,3,0 53328-ref 41 . G T 2247.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.52;MQ0=0;QD=35.68;SB=-0.01;sumGLbyD=36.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:61:99:2281,184,0 53328-ref 71 . C A 2565.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9996;MQ=34.43;MQ0=0;QD=33.32;SB=-0.01;sumGLbyD=33.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,75:75:99:2598,184,0 53328-ref 84 . C A 1654.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.87;MQ0=0;QD=33.77;SB=-0.01;sumGLbyD=34.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,49:49:99:1688,147,0 53328-ref 102 . A C 440.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=27.56;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.09:474,48,0 53328-ref 103 . C T 411.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=25.71;SB=-0.01;sumGLbyD=27.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:15:45.08:444,45,0 53329-ref 1 . C T 662.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.89;SB=-0.01;sumGLbyD=36.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:696,57,0 53329-ref 3 . G C 631.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=35.73;MQ0=0;QD=30.08;SB=-0.01;sumGLbyD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:19:57.14:665,57,0 53329-ref 79 . C A 983.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=21.62;MQ0=0;QD=24.58;SB=-0.01;sumGLbyD=25.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:39:99:1016,117,0 53329-ref 80 . C G 786.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=22.01;MQ0=0;QD=24.58;SB=-0.01;sumGLbyD=25.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:31:92.97:820,93,0 53329-ref 81 . T A 638.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=22.34;MQ0=0;QD=25.54;SB=-0.01;sumGLbyD=26.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:671,75,0 53329-ref 82 . T A 292.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=26.62;SB=-0.01;sumGLbyD=29.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.06:326,33,0 53349-ref 129 . G A 273.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.17;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:306,24,0 53388-ref 67 . G C 238.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.02;SB=-0.01;sumGLbyD=38.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:271,21,0 53388-ref 137 . A G 17.87 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.4357;MQ=37.00;MQ0=0;QD=0.74;SB=-0.01;sumGLbyD=1.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:47.79:48,0,748 53388-ref 139 . C T 857.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9983;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.27;SB=-0.01;sumGLbyD=38.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.22:890,69,0 53388-ref 174 . G A 378.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9992;MQ=36.44;MQ0=0;QD=21.00;SB=-0.01;sumGLbyD=22.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:17:99:408,0,138 53388-ref 227 . T C 276.43 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9996;MQ=36.15;MQ0=0;QD=23.04;SB=-0.01;sumGLbyD=25.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:69.12:306,0,69 53388-ref 251 . A C 94.74 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9789;MQ=37.00;MQ0=0;QD=18.95;SB=-0.01;sumGLbyD=24.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24.96:125,0,25 53388-ref 315 . G A 51.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=29.55;MQ0=0;QD=8.54;SB=-0.01;sumGLbyD=13.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:81.21:81,0,81 53388-ref 318 . A G 11.54 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=29.55;MQ0=0;QD=1.92;SB=-0.01;sumGLbyD=6.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:41.22:41,0,115 53388-ref 353 . T A 48.21 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.9965;MQ=30.72;MQ0=0;QD=6.89;SB=-0.01;sumGLbyD=11.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:78.20:78,0,117 53388-ref 355 . G A 147.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9977;MQ=30.72;MQ0=0;QD=21.07;SB=-0.01;sumGLbyD=25.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:17.52:177,0,18 53388-ref 362 . C T 43.84 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.9967;MQ=30.37;MQ0=0;QD=8.77;SB=-0.01;sumGLbyD=14.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64.98:74,0,65 53388-ref 407 . C T 39.56 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.19;SB=-0.01;sumGLbyD=23.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:70,0,31 53388-ref 518 . G C 36.96 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.48;SB=-0.01;sumGLbyD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:68,6,0 53388-ref 519 . T C 26.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=13.40;SB=-0.01;sumGLbyD=29.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 53388-ref 522 . G C 33.64 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=16.82;SB=-0.01;sumGLbyD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:65,6,0 53414-ref 20 . G C 21175.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=94.2182;MQ=36.68;MQ0=0;QD=21.18;SB=-21.95;sumGLbyD=18.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:446,553:991:99:18165,0,13895 53414-ref 76 . G A 691.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=6;HaplotypeScore=204.2119;MQ=34.59;MQ0=0;QD=0.69;SB=971.35;sumGLbyD=0.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:887,109:964:99:721,0,27383 53414-ref 112 . C G 37305.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=995;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=40.4162;MQ=35.55;MQ0=0;QD=37.49;SB=-3071.70;sumGLbyD=37.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,993:989:99:37271,2945,0 53414-ref 154 . G C 3791.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=112;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=15.5602;MQ=34.55;MQ0=0;QD=33.85;SB=-0.01;sumGLbyD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,111:112:99:3754,300,0 53414-ref 158 . G A 2582.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.6651;MQ=33.70;MQ0=0;QD=33.53;SB=-0.01;sumGLbyD=33.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,76:77:99:2615,197,0 53414-ref 159 . C A 260.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.21;MQ0=0;QD=21.72;SB=-0.01;sumGLbyD=24.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:3.93:290,0,4 53414-ref 199 . G C 79.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.51;SB=-0.01;sumGLbyD=37.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:112,9,0 53414-ref 423 . C T 44.02 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.01;SB=-0.01;sumGLbyD=38.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:75,6,0 53414-ref 437 . G C 4365.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=116;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.3024;MQ=36.71;MQ0=0;QD=37.64;SB=-1573.31;sumGLbyD=37.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,114:113:99:4365,340,0 53414-ref 439 . A C 8448.60 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=276;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=9.0118;MQ=29.25;MQ0=0;QD=30.61;SB=-3231.01;sumGLbyD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,269:275:99:8230,672,0 53414-ref 498 . C T 34980.23 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=999;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=58.9229;MQ=33.82;MQ0=0;QD=35.02;SB=-5497.81;sumGLbyD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,984:978:99:34817,2866,0 53414-ref 533 . C T 9525.85 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=320;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=19.7735;MQ=29.34;MQ0=0;QD=29.77;SB=-2133.26;sumGLbyD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,304:308:99:9265,789,0 53414-ref 557 . G C 18034.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=711;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.4513;MQ=21.30;MQ0=0;QD=25.36;SB=-4.94;sumGLbyD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,702:705:99:17838,1944,0 53414-ref 570 . G A 24883.97 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=992;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=11.8956;MQ=20.82;MQ0=0;QD=25.08;SB=-29.63;sumGLbyD=25.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,990:978:99:24845,2931,0 53414-ref 587 . 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C T 5999.35 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=230;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=57.7677;MQ=35.25;MQ0=0;QD=26.08;SB=-0.01;sumGLbyD=22.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,156:227:99:5245,0,1819 53414-ref 706 . C A 255.63 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=24.4530;MQ=34.46;MQ0=0;QD=6.23;SB=-0.01;sumGLbyD=6.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:286,0,927 53414-ref 707 . T A 146.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.9910;MQ=35.03;MQ0=0;QD=7.00;SB=-0.01;sumGLbyD=8.43 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:21:99:177,0,389 53414-ref 715 . T A 98.59 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=8;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=14.08;SB=-0.01;sumGLbyD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:82.39:129,0,82 53439-ref 95 . G A 123.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.81;SB=-39.55;sumGLbyD=39.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:156,12,0 53439-ref 1055 . T C 564.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.04;MQ0=0;QD=26.87;SB=-0.01;sumGLbyD=28.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.07:597,63,0 53439-ref 1082 . C T 92.47 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.05;MQ0=0;QD=23.12;SB=-0.01;sumGLbyD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:125,12,0 53439-ref 1083 . G A 94.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.05;MQ0=0;QD=23.61;SB=-0.01;sumGLbyD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:127,12,0 53460-ref 492 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 53460-ref 511 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 53460-ref 561 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 53460-ref 634 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 53460-ref 635 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 53491-ref 202 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 53491-ref 207 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 53491-ref 213 . A T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 53628-ref 99 . A G 674.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.47;MQ0=0;QD=35.52;SB=-0.01;sumGLbyD=37.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.17:708,57,0 53638-ref 124 . C G 531.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=35.42;SB=-0.01;sumGLbyD=37.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:564,45,0 53638-ref 142 . C G 365.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.15;MQ0=0;QD=33.20;SB=-0.01;sumGLbyD=36.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:398,33,0 53638-ref 144 . A G 321.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.85;MQ0=0;QD=32.14;SB=-0.01;sumGLbyD=35.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.08:354,30,0 53638-ref 153 . G T 40.75 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=4.53;SB=-0.01;sumGLbyD=7.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:70.75:71,0,200 53638-ref 186 . T C 33.41 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.35;SB=-0.01;sumGLbyD=15.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63.41:63,0,65 53638-ref 231 . C T 306.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=34.01;SB=-0.01;sumGLbyD=37.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:339,27,0 53638-ref 233 . C G 336.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.98;MQ0=0;QD=33.69;SB=-0.01;sumGLbyD=36.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:370,30,0 53638-ref 282 . G T 602.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.99;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.14:636,57,0 53638-ref 292 . G T 511.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.05;MQ0=0;QD=30.07;SB=-0.01;sumGLbyD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.11:544,51,0 53638-ref 325 . G C 481.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.28;MQ0=0;QD=30.11;SB=-0.01;sumGLbyD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.11:515,48,0 53638-ref 326 . G A 480.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.28;MQ0=0;QD=30.02;SB=-0.01;sumGLbyD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48.11:513,48,0 53638-ref 432 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 53650-ref 124 . T C 289.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=72;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.5980;MQ=25.30;MQ0=0;QD=4.03;SB=6.41;sumGLbyD=4.44 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,18:71:99:320,0,1303 53650-ref 146 . T C 347.05 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=329;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=24.4274;MQ=25.16;MQ0=0;QD=1.05;SB=459.83;sumGLbyD=1.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:283,46:326:99:377,0,7271 53650-ref 152 . T A 6754.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=387;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=40.8095;MQ=26.83;MQ0=0;QD=17.45;SB=-2401.47;sumGLbyD=14.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:108,267:334:99:5643,0,2080 53650-ref 155 . T A 7511.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=418;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=44.1029;MQ=26.89;MQ0=0;QD=17.97;SB=-2780.19;sumGLbyD=15.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:120,288:372:99:6310,0,2369 53650-ref 158 . A G 2668.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=476;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=43.6055;MQ=26.60;MQ0=0;QD=5.61;SB=-61.64;sumGLbyD=5.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:346,126:416:99:2698,0,7159 53650-ref 176 . G A 16488.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=571;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=10.0839;MQ=26.21;MQ0=0;QD=28.88;SB=-7067.98;sumGLbyD=28.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,571:553:99:16480,1662,0 53650-ref 197 . C T 12634.69 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=521;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=9.2118;MQ=26.28;MQ0=0;QD=24.25;SB=-4631.63;sumGLbyD=21.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:102,418:519:99:11040,0,1464 53650-ref 227 . G A 4459.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=170;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=22.0897;MQ=24.32;MQ0=0;QD=26.23;SB=-1690.96;sumGLbyD=24.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,159:164:99:4133,276,0 53650-ref 243 . C A 115.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.15;MQ0=0;QD=23.18;SB=-0.01;sumGLbyD=29.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.01:149,15,0 53650-ref 245 . C G 91.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.15;MQ0=0;QD=18.29;SB=-0.01;sumGLbyD=24.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:4:12.02:124,12,0 53650-ref 248 . C T 14.40 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.15;MQ0=0;QD=2.88;SB=-0.01;sumGLbyD=8.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.23:44,0,74 53703-ref 110 . C G 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-28.84;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 53703-ref 122 . C G 92.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=23.12;SB=-28.19;sumGLbyD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.02:125,12,0 53703-ref 139 . G A 17.31 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7887;MQ=28.48;MQ0=0;QD=4.33;SB=3.00;sumGLbyD=11.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.22:47,0,58 53871-ref 196 . T G 14.39 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9997;MQ=30.06;MQ0=0;QD=2.88;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.22:44,0,77 53871-ref 207 . T C 134.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=30.06;MQ0=0;QD=26.84;SB=-0.01;sumGLbyD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.03:167,15,0 53871-ref 210 . T C 14.38 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=30.06;MQ0=0;QD=2.88;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.21:44,0,90 53871-ref 213 . T C 14.38 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=30.06;MQ0=0;QD=2.88;SB=-0.01;sumGLbyD=8.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:44.21:44,0,89 53871-ref 247 . A G 75.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.00;MQ0=0;QD=25.21;SB=-0.01;sumGLbyD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:108,9,0 53871-ref 438 . G T 660.55 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.08;MQ0=0;QD=25.41;SB=-0.01;sumGLbyD=26.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:25:75.07:694,75,0 53871-ref 518 . A C 188.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9993;MQ=23.00;MQ0=0;QD=23.54;SB=-0.01;sumGLbyD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.02:221,24,0 53923-ref 96 . G T 50.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=16.99;SB=-0.01;sumGLbyD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.01:83,9,0 53923-ref 175 . A C 26.06 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=24.02;MQ0=0;QD=13.03;SB=-0.01;sumGLbyD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:57,6,0 53923-ref 224 . G A 312.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.29;MQ0=0;QD=31.22;SB=-40.00;sumGLbyD=34.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.07:345,30,0 53923-ref 235 . T C 353.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.12;MQ0=0;QD=29.46;SB=-40.01;sumGLbyD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:11:33.08:387,33,0 53923-ref 575 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 53950-ref 108 . G A 24.11 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.00;MQ0=0;QD=12.05;SB=-0.01;sumGLbyD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:55,6,0 53950-ref 137 . G C 109.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.82;MQ0=0;QD=21.90;SB=-0.01;sumGLbyD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.02:142,15,0 53950-ref 193 . T C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 53950-ref 194 . C A 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 53950-ref 195 . A C 28.01 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.01;SB=-0.01;sumGLbyD=30.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:59,6,0 54031-ref 155 . A G 222.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.60;MQ0=0;QD=31.77;SB=-39.95;sumGLbyD=36.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:255,21,0 54050-ref 139 . C T 48.08 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.04;SB=-0.01;sumGLbyD=40.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:79,6,0 54050-ref 167 . G C 167.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.46;SB=-0.01;sumGLbyD=40.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:200,15,0 54111-ref 121 . T G 312.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.72;MQ0=0;QD=34.72;SB=-0.01;sumGLbyD=38.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.08:346,27,0 54111-ref 135 . G A 353.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.85;MQ0=0;QD=35.33;SB=-0.01;sumGLbyD=38.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:386,30,0 54111-ref 222 . C T 1342.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8941;MQ=36.45;MQ0=0;QD=36.28;SB=-0.01;sumGLbyD=37.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:36:99:1375,108,0 54111-ref 335 . T C 345.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.53;SB=-0.01;sumGLbyD=37.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.09:378,30,0 54222-ref 12 . A G 384.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9916;MQ=35.95;MQ0=0;QD=34.94;SB=-0.01;sumGLbyD=37.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:417,33,0 54222-ref 36 . T G 172.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.95;MQ0=0;QD=15.65;SB=-0.01;sumGLbyD=18.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:202,0,155 54237-ref 434 . T C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 54237-ref 470 . A G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 54237-ref 496 . T C 87.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.10;SB=-0.01;sumGLbyD=39.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:119,9,0 54312-ref 507 . T C 3815.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.3439;MQ=36.04;MQ0=0;QD=38.16;SB=-1738.49;sumGLbyD=38.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:3815,301,0 54312-ref 531 . G A 3778.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.5220;MQ=35.94;MQ0=0;QD=37.05;SB=-1727.23;sumGLbyD=37.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,102:99:99:3779,298,0 54312-ref 578 . T G 6076.80 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=157;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.4195;MQ=36.93;MQ0=0;QD=38.71;SB=-2599.09;sumGLbyD=38.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,157:156:99:6076,469,0 54450-ref 94 . C T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 54450-ref 110 . A T 48.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.38;SB=-0.01;sumGLbyD=40.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:80,6,0 54450-ref 205 . G A 194.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.39;SB=-0.01;sumGLbyD=37.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:227,18,0 54450-ref 301 . A T 356.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.95;MQ0=0;QD=32.44;SB=-0.01;sumGLbyD=35.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.06:390,33,0 54450-ref 414 . G A 285.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:319,24,0 54450-ref 450 . A G 205.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.29;SB=-0.01;sumGLbyD=39.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.06:239,18,0 54450-ref 519 . G T 373.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.88;MQ0=0;QD=33.99;SB=-0.01;sumGLbyD=36.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.09:407,33,0 54450-ref 544 . A G 47.03 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.12;MQ0=0;QD=3.62;SB=6.01;sumGLbyD=5.92 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77.02:77,0,338 54450-ref 564 . G A 126.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=15.80;SB=-74.00;sumGLbyD=19.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:95.96:156,0,96 54450-ref 588 . A T 65.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.33;SB=12.03;sumGLbyD=10.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:8:95.94:96,0,165 54450-ref 627 . A G 101.20 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=12.65;SB=6.01;sumGLbyD=16.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:131,0,135 54450-ref 727 . C T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 54495-ref 457 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 54495-ref 473 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 54668-ref 40 . T A 235.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=33.61;SB=-0.01;sumGLbyD=38.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.06:268,21,0 54668-ref 49 . G A 255.31 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.33;MQ0=0;QD=28.37;SB=-0.01;sumGLbyD=31.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:1.98:285,2,0 54668-ref 54 . A G 47.47 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.9997;MQ=32.25;MQ0=0;QD=3.96;SB=-0.01;sumGLbyD=6.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:77.47:77,0,271 54668-ref 61 . C A 16.62 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8661;MQ=30.02;MQ0=0;QD=0.79;SB=-0.01;sumGLbyD=2.22 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:46.52:47,0,521 54668-ref 98 . C T 164.68 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.3518;MQ=31.35;MQ0=0;QD=7.84;SB=-0.01;sumGLbyD=9.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,10:19:99:195,0,339 54668-ref 112 . T C 19.81 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9598;MQ=34.60;MQ0=0;QD=1.52;SB=-0.01;sumGLbyD=3.83 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:49.75:50,0,350 54668-ref 173 . T C 99.07 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9999;MQ=37.00;MQ0=0;QD=11.01;SB=-0.01;sumGLbyD=14.34 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:129,0,163 54668-ref 207 . C A 226.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.6651;MQ=37.00;MQ0=0;QD=28.33;SB=-0.01;sumGLbyD=32.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:7:21.06:260,21,0 54668-ref 241 . T C 396.18 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.02;SB=-0.01;sumGLbyD=39.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.11:429,33,0 54668-ref 308 . T A 371.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=30.92;SB=-0.01;sumGLbyD=33.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:11:33.10:404,33,0 54668-ref 326 . A G 54.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=35.87;MQ0=0;QD=6.02;SB=-0.01;sumGLbyD=9.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:8:84.14:84,0,158 54668-ref 341 . G A 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 54701-ref 330 . G A 6846.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=256;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.5831;MQ=23.11;MQ0=0;QD=26.74;SB=-1067.91;sumGLbyD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,255:248:99:6840,744,0 54701-ref 331 . G A 6799.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=256;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.5814;MQ=23.11;MQ0=0;QD=26.56;SB=-1037.47;sumGLbyD=26.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,253:248:99:6734,712,0 54701-ref 333 . G C 6876.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=256;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.7874;MQ=23.11;MQ0=0;QD=26.86;SB=-1041.02;sumGLbyD=26.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,256:249:99:6870,747,0 54701-ref 350 . A C 2074.12 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=261;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.7226;MQ=23.39;MQ0=0;QD=7.95;SB=93.64;sumGLbyD=8.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:165,96:248:99:2104,0,3270 54701-ref 382 . G T 305.28 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.9722;MQ=31.58;MQ0=0;QD=25.44;SB=-69.34;sumGLbyD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,11:12:8.42:337,8,0 54701-ref 400 . G A 163.89 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=20.49;SB=-0.01;sumGLbyD=24.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:10.30:194,0,10 54701-ref 401 . T G 224.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=28.10;SB=-0.01;sumGLbyD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:258,24,0 54701-ref 405 . T A 195.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=3.7298;MQ=26.14;MQ0=0;QD=19.52;SB=-0.01;sumGLbyD=22.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,7:7:21.05:228,21,0 54701-ref 410 . C T 451.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=142;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=11.5416;MQ=26.78;MQ0=0;QD=3.18;SB=3.00;sumGLbyD=3.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,38:60:99:482,0,1290 54701-ref 457 . T A 15698.41 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=38.5117;MQ=28.90;MQ0=0;QD=15.70;SB=-61.97;sumGLbyD=13.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:382,616:726:99:13451,0,7003 54701-ref 468 . G C 15776.73 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1000;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=40.7777;MQ=28.90;MQ0=0;QD=15.78;SB=-61.97;sumGLbyD=13.53 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:381,618:732:99:13532,0,7064 54701-ref 499 . A G 6778.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=451;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=30.3586;MQ=20.12;MQ0=0;QD=15.03;SB=34.77;sumGLbyD=14.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,447:267:99:6637,700,0 54745-ref 33 . C T 2736.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=99;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.4406;MQ=23.55;MQ0=0;QD=27.64;SB=-0.01;sumGLbyD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:2770,297,0 54745-ref 102 . G A 635.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.05;MQ0=0;QD=25.43;SB=-109.62;sumGLbyD=26.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,24:25:35.10:669,35,0 54745-ref 111 . G T 1292.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9660;MQ=30.01;MQ0=0;QD=32.31;SB=-429.69;sumGLbyD=33.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1325,120,0 54745-ref 120 . T C 1516.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9660;MQ=32.31;MQ0=0;QD=33.70;SB=-421.23;sumGLbyD=34.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:45:99:1549,135,0 54745-ref 188 . G A 778.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.52;MQ0=0;QD=37.07;SB=-0.01;sumGLbyD=38.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.20:811,63,0 54745-ref 226 . A G 633.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.21;SB=-0.01;sumGLbyD=37.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:17:51.17:667,51,0 54745-ref 229 . T C 629.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.02;SB=-0.01;sumGLbyD=38.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.16:662,51,0 54745-ref 391 . A T 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 54745-ref 393 . A G 38.39 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=19.19;SB=-0.01;sumGLbyD=35.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:70,6,0 54745-ref 411 . A G 33.64 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=16.82;SB=-0.01;sumGLbyD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:65,6,0 54745-ref 517 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.21;SB=-0.01;sumGLbyD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,2:1:1.76:40,3,0 54766-ref 203 . C A 126.84 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.71;SB=-0.01;sumGLbyD=39.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:159,12,0 54841-ref 111 . A C 5126.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=152;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.6475;MQ=32.86;MQ0=0;QD=33.73;SB=-1540.33;sumGLbyD=33.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,149:149:99:5090,413,0 54841-ref 130 . A G 669.39 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=483;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=12.1243;MQ=35.77;MQ0=0;QD=1.39;SB=-294.32;sumGLbyD=1.45 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:416,67:442:99:699,0,12342 54841-ref 149 . G C 18567.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=493;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.8842;MQ=35.73;MQ0=0;QD=37.66;SB=-5835.85;sumGLbyD=37.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,490:486:99:18504,1438,0 54841-ref 151 . G C 2927.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=493;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.2049;MQ=35.73;MQ0=0;QD=5.94;SB=-946.11;sumGLbyD=6.00 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:379,114:493:99:2958,0,12879 54841-ref 176 . A G 15384.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=407;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.2201;MQ=36.85;MQ0=0;QD=37.80;SB=-4789.51;sumGLbyD=37.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,398:398:99:15177,1177,0 54841-ref 203 . A T 856.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.96;SB=-0.01;sumGLbyD=34.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:25:47.57:890,48,0 55010-ref 228 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 55236-ref 9 . A T 730.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.92;MQ0=0;QD=31.76;SB=-0.01;sumGLbyD=33.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:69.15:764,69,0 55236-ref 32 . A G 1163.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.65;MQ0=0;QD=30.61;SB=-0.01;sumGLbyD=31.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,38:36:99:1196,108,0 55236-ref 69 . C G 1437.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=50;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.3322;MQ=28.40;MQ0=0;QD=28.75;SB=-0.01;sumGLbyD=29.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,50:49:99:1470,147,0 55236-ref 84 . C T 739.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.77;MQ0=0;QD=26.43;SB=-0.01;sumGLbyD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:27:81.09:773,81,0 55236-ref 98 . T A 535.94 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=23.82;MQ0=0;QD=26.80;SB=-0.01;sumGLbyD=28.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.08:569,60,0 55236-ref 120 . A G 20.29 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=6.76;SB=-0.01;sumGLbyD=16.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20.61:50,0,21 55236-ref 329 . C T 115.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=19.23;SB=-0.01;sumGLbyD=24.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:5:15.03:148,15,0 55236-ref 335 . T C 144.86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.14;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.03:178,18,0 55236-ref 388 . G A 2892.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.6988;MQ=33.75;MQ0=0;QD=34.85;SB=-239.35;sumGLbyD=35.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,83:81:99:2926,244,0 55236-ref 393 . C T 3400.88 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=95;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.2306;MQ=34.17;MQ0=0;QD=35.80;SB=-228.82;sumGLbyD=35.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,95:94:99:3400,283,0 55236-ref 443 . A T 3108.95 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.2082;MQ=35.24;MQ0=0;QD=29.89;SB=-0.01;sumGLbyD=30.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,95:99:48.86:3142,49,0 55236-ref 586 . C G 3763.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.6187;MQ=33.64;MQ0=0;QD=35.84;SB=-0.01;sumGLbyD=35.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:105:99:3763,316,0 55236-ref 609 . G A 3308.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=97;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9832;MQ=33.23;MQ0=0;QD=34.11;SB=-40.01;sumGLbyD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,97:93:99:3308,280,0 55236-ref 633 . C T 2574.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=74;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=33.28;MQ0=0;QD=34.80;SB=-40.01;sumGLbyD=35.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,74:73:99:2608,220,0 55279-ref 210 . G T 276.67 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.58;SB=-0.01;sumGLbyD=38.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.08:310,24,0 55279-ref 255 . C G 62.94 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=6.99;SB=-0.01;sumGLbyD=10.33 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:92.93:93,0,201 55279-ref 273 . A T 96.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.7887;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.81;SB=-0.01;sumGLbyD=11.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:127,0,239 55279-ref 287 . A T 207.36 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.7882;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.28;SB=-0.01;sumGLbyD=19.78 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:237,0,164 55279-ref 361 . G A 247.11 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.30;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:280,21,0 55279-ref 416 . G A 195.33 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9732;MQ=35.28;MQ0=0;QD=10.85;SB=-0.01;sumGLbyD=12.52 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:225,0,330 55279-ref 418 . C G 191.42 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9732;MQ=35.28;MQ0=0;QD=10.63;SB=-0.01;sumGLbyD=12.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:221,0,346 55279-ref 474 . T A 28.98 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=14.49;SB=-0.01;sumGLbyD=30.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:60,6,0 55279-ref 519 . G A 210.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.4536;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.08;SB=-24.67;sumGLbyD=9.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,9:25:99:240,0,561 55279-ref 608 . A T 26.81 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.68;SB=-0.01;sumGLbyD=3.55 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:15:56.80:57,0,430 55505-ref 39 . G T 174.42 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=25.00;MQ0=0;QD=24.92;SB=-0.01;sumGLbyD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.04:207,21,0 55505-ref 42 . G C 206.24 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=26.80;MQ0=0;QD=25.78;SB=-0.01;sumGLbyD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.03:239,24,0 55505-ref 61 . T C 364.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.58;MQ0=0;QD=30.36;SB=-0.01;sumGLbyD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.09:397,36,0 55505-ref 78 . G A 1161.16 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.05;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=32.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:35:99:1194,102,0 55505-ref 188 . A G 1473.69 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9992;MQ=36.87;MQ0=0;QD=18.65;SB=-0.01;sumGLbyD=19.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,41:77:85.58:1507,86,0 55505-ref 201 . C T 2548.74 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.6862;MQ=35.16;MQ0=0;QD=33.98;SB=-0.01;sumGLbyD=34.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,73:73:99:2582,197,0 55505-ref 270 . G A 105.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8656;MQ=23.00;MQ0=0;QD=9.63;SB=-0.01;sumGLbyD=12.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:10:80.63:136,0,81 55505-ref 395 . C T 1578.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.6799;MQ=22.79;MQ0=0;QD=26.76;SB=-0.01;sumGLbyD=27.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,59:59:99:1612,177,0 55505-ref 596 . C T 2379.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9967;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.05;SB=-0.01;sumGLbyD=36.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,66:63:99:2412,190,0 55505-ref 690 . C T 3328.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=88;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.2010;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.83;SB=-0.01;sumGLbyD=37.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:86:99:3290,220,0 55505-ref 951 . A G 3874.45 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=4.8633;MQ=36.70;MQ0=0;QD=37.25;SB=-0.01;sumGLbyD=37.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,104:101:99:3874,304,0 55505-ref 1041 . A G 1815.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=37.81;SB=-0.01;sumGLbyD=38.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1848,144,0 55505-ref 1045 . C G 1738.96 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9989;MQ=36.13;MQ0=0;QD=37.00;SB=-0.01;sumGLbyD=37.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:46:99:1772,138,0 55505-ref 1080 . C A 1564.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=36.27;MQ0=0;QD=37.25;SB=-0.01;sumGLbyD=38.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1598,126,0 55519-ref 53 . C G 234.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.43;SB=-0.01;sumGLbyD=38.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21.07:267,21,0 55519-ref 135 . A T 3871.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=106;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=3.4338;MQ=35.18;MQ0=0;QD=36.52;SB=-0.01;sumGLbyD=36.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,106:104:99:3871,313,0 55519-ref 182 . C T 5330.43 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=164;DS;Dels=0.02;HRun=0;HaplotypeScore=8.2188;MQ=32.00;MQ0=0;QD=32.50;SB=-55.33;sumGLbyD=32.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,161:156:99:5329,469,0 55519-ref 801 . A G 1550.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.2380;MQ=36.47;MQ0=0;QD=36.06;SB=-29.63;sumGLbyD=36.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:99:1583,123,0 55607-ref 115 . G T 130.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.07;SB=-0.01;sumGLbyD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:161,0,256 55607-ref 152 . C T 116.03 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.25;SB=-0.01;sumGLbyD=9.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:146,0,383 55607-ref 196 . C T 480.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.96;SB=-0.01;sumGLbyD=39.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39.13:514,39,0 55607-ref 219 . A T 312.19 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.81;SB=-0.01;sumGLbyD=22.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:342,0,149 55607-ref 235 . T G 23.57 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=1.57;SB=-0.01;sumGLbyD=3.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:53.54:54,0,404 55607-ref 318 . A G 304.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=37.00;MQ0=0;QD=33.80;SB=-0.01;sumGLbyD=37.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.07:337,27,0 55607-ref 347 . A T 59.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.99;SB=-0.01;sumGLbyD=8.99 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:89.92:90,0,242 55607-ref 365 . G A 123.60 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9979;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.24;SB=-0.01;sumGLbyD=10.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:154,0,297 55607-ref 489 . C T 190.70 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7549;MQ=35.53;MQ0=0;QD=27.24;SB=-0.01;sumGLbyD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:6:18.05:224,18,0 55607-ref 557 . C T 318.19 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.82;SB=-0.01;sumGLbyD=35.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:9:27.09:351,27,0 55607-ref 638 . C G 454.99 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.80;MQ0=0;QD=32.50;SB=-69.63;sumGLbyD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42.10:488,42,0 55607-ref 658 . C T 385.89 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.05;MQ0=0;QD=32.16;SB=-69.63;sumGLbyD=34.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36.09:419,36,0 55607-ref 686 . A T 28.84 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.90;MQ0=0;QD=2.88;SB=-26.62;sumGLbyD=5.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:58.83:59,0,193 55607-ref 695 . C G 303.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.19;MQ0=0;QD=25.30;SB=-29.62;sumGLbyD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:10:30.07:337,30,0 55607-ref 704 . T C 79.17 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.60;MQ0=0;QD=6.09;SB=-26.62;sumGLbyD=8.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:10:99:109,0,203 55607-ref 707 . A G 137.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.78;MQ0=0;QD=9.83;SB=-26.62;sumGLbyD=11.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:13:99:168,0,234 55607-ref 767 . C T 407.57 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=20.38;SB=-0.01;sumGLbyD=21.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,14:19:99:438,0,177 55607-ref 783 . G T 14.25 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.58;MQ0=0;QD=0.59;SB=-0.01;sumGLbyD=1.84 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:44.07:44,0,725 55607-ref 794 . A T 570.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.8332;MQ=36.54;MQ0=0;QD=25.93;SB=-0.01;sumGLbyD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,17:21:80.79:600,0,81 55607-ref 815 . T C 604.62 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=36.56;MQ0=0;QD=26.29;SB=-0.01;sumGLbyD=27.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,18:23:99:635,0,122 55607-ref 860 . T C 322.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.81;SB=-0.01;sumGLbyD=39.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27.09:355,27,0 55607-ref 887 . T A 227.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8667;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.40;SB=-0.01;sumGLbyD=15.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:258,0,308 55607-ref 895 . G A 237.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=13.97;SB=-0.01;sumGLbyD=15.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:99:267,0,300 55607-ref 911 . T C 91.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9933;MQ=37.00;MQ0=0;QD=3.53;SB=3.00;sumGLbyD=4.68 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:26:99:122,0,739 55607-ref 984 . G T 42.77 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.8300;MQ=36.24;MQ0=0;QD=2.85;SB=6.01;sumGLbyD=4.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:72.76:73,0,404 55607-ref 1021 . A T 138.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.31;SB=-0.01;sumGLbyD=21.05 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:95.94:168,0,96 55607-ref 1034 . T A 367.06 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.71;SB=-0.01;sumGLbyD=40.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30.10:400,30,0 55607-ref 1181 . T A 109.83 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9997;MQ=37.00;MQ0=0;QD=5.78;SB=-0.01;sumGLbyD=7.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:140,0,491 55607-ref 1194 . A G 150.01 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.9986;MQ=37.00;MQ0=0;QD=7.90;SB=-0.01;sumGLbyD=9.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:180,0,434 55607-ref 1301 . A G 194.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=16.20;SB=-0.01;sumGLbyD=18.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:224,0,162 55607-ref 1586 . A T 366.99 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9660;MQ=36.58;MQ0=0;QD=15.29;SB=-0.01;sumGLbyD=16.54 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,13:23:99:397,0,358 55607-ref 1595 . C T 820.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9243;MQ=36.56;MQ0=0;QD=35.66;SB=-0.01;sumGLbyD=37.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:22:66.21:853,66,0 55607-ref 1601 . T C 143.75 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.44;MQ0=0;QD=7.99;SB=-0.01;sumGLbyD=9.65 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:17:99:174,0,370 55607-ref 1639 . T C 260.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=32.58;SB=-0.01;sumGLbyD=36.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.07:294,24,0 55607-ref 1656 . A G 73.95 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.41;MQ0=0;QD=10.56;SB=-0.01;sumGLbyD=14.85 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:93.66:104,0,94 55607-ref 1662 . T C 67.22 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=29.55;MQ0=0;QD=22.41;SB=-0.01;sumGLbyD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:99,9,0 55607-ref 1695 . T C 148.98 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9993;MQ=33.02;MQ0=0;QD=18.62;SB=-0.01;sumGLbyD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:7:38.18:179,0,38 55607-ref 1724 . C T 196.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.80;SB=-0.01;sumGLbyD=38.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:230,18,0 55607-ref 1769 . A G 36.18 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=18.09;SB=-0.01;sumGLbyD=34.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:67,6,0 55657-ref 135 . G C 582.30 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=5;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.40;MQ0=0;QD=34.25;SB=-0.01;sumGLbyD=36.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51.13:615,51,0 55657-ref 157 . G A 762.78 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=36.54;MQ0=0;QD=34.67;SB=-0.01;sumGLbyD=36.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:21:63.20:796,63,0 55657-ref 190 . C T 679.63 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.77;SB=-0.01;sumGLbyD=37.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.18:713,57,0 55657-ref 354 . A G 847.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=36.58;MQ0=0;QD=35.32;SB=-0.01;sumGLbyD=36.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:23:69.22:881,69,0 55657-ref 527 . C G 758.31 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.53;MQ0=0;QD=36.11;SB=-0.01;sumGLbyD=37.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63.19:791,63,0 55657-ref 529 . G C 722.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.46;MQ0=0;QD=36.15;SB=-0.01;sumGLbyD=37.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.18:756,60,0 55657-ref 530 . G A 703.04 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.46;MQ0=0;QD=35.15;SB=-0.01;sumGLbyD=36.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60.17:736,60,0 55657-ref 744 . 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G T 1614.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.44;MQ0=0;QD=34.35;SB=-0.01;sumGLbyD=35.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:47:99:1647,141,0 55657-ref 1120 . G T 1648.57 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9989;MQ=32.30;MQ0=0;QD=34.35;SB=-0.01;sumGLbyD=35.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1682,144,0 55657-ref 1151 . C G 1554.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9987;MQ=30.32;MQ0=0;QD=32.38;SB=-0.01;sumGLbyD=33.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:99:1587,144,0 55657-ref 1162 . G T 1049.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.29;MQ0=0;QD=30.88;SB=-0.01;sumGLbyD=31.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1083,102,0 55657-ref 1192 . G T 1080.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=32.30;MQ0=0;QD=33.77;SB=-0.01;sumGLbyD=34.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96.24:1114,96,0 55657-ref 1201 . 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A G 1297.50 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=32.44;SB=-0.01;sumGLbyD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:99:1331,120,0 55657-ref 1400 . A C 1018.38 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=40;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.37;MQ0=0;QD=25.46;SB=-0.01;sumGLbyD=26.23 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,36:39:2.77:1047,0,3 55657-ref 1431 . A C 1654.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.8300;MQ=33.25;MQ0=0;QD=34.47;SB=-0.01;sumGLbyD=35.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:47:99:1687,141,0 55657-ref 1455 . A T 1553.15 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.45;MQ0=0;QD=34.51;SB=-0.01;sumGLbyD=35.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,45:44:99:1586,132,0 55657-ref 1476 . A G 1705.51 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=47;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=1.7987;MQ=36.57;MQ0=0;QD=36.29;SB=-0.01;sumGLbyD=36.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,47:45:99:1739,135,0 55657-ref 1570 . 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A G 3421.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.6275;MQ=37.00;MQ0=0;QD=38.01;SB=-0.01;sumGLbyD=37.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,87:89:99:3347,194,0 55657-ref 2362 . C G 4436.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=115;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.3187;MQ=36.91;MQ0=0;QD=38.58;SB=-0.01;sumGLbyD=38.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,115:114:99:4436,343,0 55657-ref 2530 . G A 3383.38 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.9124;MQ=36.89;MQ0=0;QD=38.02;SB=-0.01;sumGLbyD=37.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,87:88:99:3343,225,0 55657-ref 2588 . T C 2636.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.5290;MQ=37.00;MQ0=0;QD=36.61;SB=-0.01;sumGLbyD=37.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,70:72:99:2669,138,0 55657-ref 2807 . G C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 55657-ref 2810 . 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T G 87.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.33;SB=-0.01;sumGLbyD=40.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:120,9,0 55819-ref 237 . G A 139.39 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=17.42;SB=-0.01;sumGLbyD=21.17 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:84.87:169,0,85 55819-ref 304 . C T 67.22 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=11.20;SB=-0.01;sumGLbyD=16.20 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:88.55:97,0,89 55819-ref 314 . T C 194.66 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.28;MQ0=0;QD=32.44;SB=-0.01;sumGLbyD=37.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:228,18,0 55819-ref 344 . G T 106.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.69;SB=-0.01;sumGLbyD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 55819-ref 395 . 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G T 75.64 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.21;SB=-0.01;sumGLbyD=36.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.02:108,9,0 55819-ref 677 . A G 76.17 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=25.39;SB=-0.01;sumGLbyD=36.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:108,9,0 55819-ref 706 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 55827-ref 123 . C A 744.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;DS;Dels=0.00;HRun=4;HaplotypeScore=0.9967;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.46;SB=-0.01;sumGLbyD=37.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:21:60.19:778,60,0 55827-ref 152 . A C 760.71 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9817;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.17;SB=-0.01;sumGLbyD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,22:28:99:791,0,153 55827-ref 180 . G A 1211.98 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.71;MQ0=0;QD=34.63;SB=-0.01;sumGLbyD=35.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:34:74.66:1245,75,0 55827-ref 240 . T A 2079.58 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=58;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.9203;MQ=36.65;MQ0=0;QD=35.85;SB=-0.01;sumGLbyD=36.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,56:57:99:2113,147,0 55827-ref 673 . C G 2161.34 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=64;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.4206;MQ=36.84;MQ0=0;QD=33.77;SB=-0.01;sumGLbyD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,63:60:99:2194,145,0 55827-ref 755 . A G 1178.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.3990;MQ=36.13;MQ0=0;QD=33.67;SB=-0.01;sumGLbyD=34.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,34:34:67.05:1212,67,0 55827-ref 771 . A T 1041.79 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.5317;MQ=36.35;MQ0=0;QD=33.61;SB=-0.01;sumGLbyD=34.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,30:31:53.96:1075,54,0 55827-ref 811 . G C 1010.54 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=5.4445;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.60;SB=-0.01;sumGLbyD=33.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,28:29:54.78:1044,55,0 55827-ref 860 . A G 1063.10 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4960;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.97;SB=-0.01;sumGLbyD=39.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84.27:1096,84,0 55827-ref 894 . T G 393.25 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.49;MQ0=0;QD=19.66;SB=-0.01;sumGLbyD=21.16 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,13:20:99:423,0,202 55827-ref 921 . C T 393.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.7340;MQ=36.07;MQ0=0;QD=35.74;SB=-0.01;sumGLbyD=38.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33.10:426,33,0 55877-ref 118 . C T 106.07 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=26.52;SB=-0.01;sumGLbyD=34.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.03:139,12,0 55877-ref 161 . A G 508.65 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=33.91;SB=-0.01;sumGLbyD=36.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45.13:542,45,0 55877-ref 173 . T C 660.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.38;MQ0=0;QD=34.79;SB=-0.01;sumGLbyD=36.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57.17:694,57,0 55877-ref 369 . G C 1726.36 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.1213;MQ=36.81;MQ0=0;QD=33.20;SB=-0.01;sumGLbyD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,50:48:99:1759,110,0 55877-ref 567 . T A 1462.53 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9996;MQ=37.00;MQ0=0;QD=35.67;SB=-0.01;sumGLbyD=36.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,40:41:83.35:1496,83,0 55877-ref 909 . T A 2461.49 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=39.07;SB=-0.01;sumGLbyD=39.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:99:2494,190,0 55877-ref 1365 . A C 2950.48 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.5747;MQ=36.61;MQ0=0;QD=37.83;SB=-0.01;sumGLbyD=38.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:99:2983,235,0 55877-ref 1392 . A T 3067.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=82;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=1.9172;MQ=36.75;MQ0=0;QD=37.41;SB=-0.01;sumGLbyD=37.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,82:82:99:3100,247,0 55877-ref 1762 . A G 3699.62 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=100;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.0979;MQ=37.00;MQ0=0;QD=37.00;SB=-0.01;sumGLbyD=35.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,97:97:99:3586,216,0 55877-ref 1945 . A G 147.73 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=29.55;SB=-0.01;sumGLbyD=36.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:180,15,0 55877-ref 1946 . T A 149.25 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=29.85;SB=-0.01;sumGLbyD=36.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:182,15,0 55877-ref 1948 . T A 33.64 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=16.82;SB=-0.01;sumGLbyD=32.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:65,6,0 55877-ref 1957 . G A 119.33 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=29.83;SB=-0.01;sumGLbyD=38.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:152,12,0 55877-ref 2008 . A G 3543.56 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.9575;MQ=36.89;MQ0=0;QD=38.94;SB=-0.01;sumGLbyD=38.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,91:91:99:3543,274,0 55877-ref 2169 . T A 5485.13 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=154;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.1981;MQ=36.93;MQ0=0;QD=35.62;SB=-0.01;sumGLbyD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,148:151:99:5268,238,0 55877-ref 2251 . A G 6533.21 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=168;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=8.9782;MQ=36.76;MQ0=0;QD=38.89;SB=-0.01;sumGLbyD=38.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,168:168:99:6533,506,0 55877-ref 2365 . C T 6526.87 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=10.4169;MQ=36.52;MQ0=0;QD=39.08;SB=-0.01;sumGLbyD=39.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,167:167:99:6527,503,0 55877-ref 2393 . A G 6014.77 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=167;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.4532;MQ=33.79;MQ0=0;QD=36.02;SB=-0.01;sumGLbyD=36.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,165:165:99:6014,496,0 55877-ref 2431 . T C 4217.08 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.4692;MQ=30.96;MQ0=0;QD=33.74;SB=-0.01;sumGLbyD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,125:124:99:4216,373,0 55877-ref 2443 . T C 4703.82 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=139;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.70;MQ0=0;QD=33.84;SB=-0.01;sumGLbyD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,139:138:99:4703,415,0 55877-ref 2446 . A G 4555.93 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=135;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.62;MQ0=0;QD=33.75;SB=-0.01;sumGLbyD=33.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,135:132:99:4555,397,0 55877-ref 2486 . T C 4149.59 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=109;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.7779;MQ=36.25;MQ0=0;QD=38.07;SB=-0.01;sumGLbyD=38.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,108:108:99:4149,325,0 55877-ref 2528 . T C 5777.29 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=148;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.3092;MQ=36.86;MQ0=0;QD=39.04;SB=-0.01;sumGLbyD=39.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,148:147:99:5777,442,0 55877-ref 2585 . T C 5371.03 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=143;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=5.8928;MQ=36.79;MQ0=0;QD=37.56;SB=-0.01;sumGLbyD=37.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,143:138:99:5371,415,0 55877-ref 2731 . T G 18.57 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=2.06;SB=-0.01;sumGLbyD=5.39 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:48.50:49,0,250 55877-ref 2750 . A G 125.32 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=31.33;SB=-0.01;sumGLbyD=39.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:158,12,0 55877-ref 2766 . A G 45.74 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.87;SB=-0.01;sumGLbyD=38.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.02:77,6,0 55877-ref 2987 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 55889-ref 224 . T C 170.15 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.9998;MQ=35.53;MQ0=0;QD=24.31;SB=-0.01;sumGLbyD=28.60 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18.94:200,0,19 55889-ref 246 . G A 290.01 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7199;MQ=33.85;MQ0=0;QD=29.00;SB=-0.01;sumGLbyD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:9:27.08:323,27,0 55889-ref 257 . C A 162.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=10;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9734;MQ=33.85;MQ0=0;QD=16.26;SB=-0.01;sumGLbyD=19.26 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:193,0,109 55889-ref 288 . 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T A 99.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=14;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9665;MQ=34.78;MQ0=0;QD=7.13;SB=-0.01;sumGLbyD=9.27 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:13:99:130,0,276 55889-ref 481 . G C 22.80 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=12;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=1.90;SB=-0.01;sumGLbyD=4.40 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:52.77:53,0,300 55889-ref 483 . T A 49.39 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=13;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.77;MQ0=0;QD=3.80;SB=-0.01;sumGLbyD=6.11 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:79.39:79,0,291 55889-ref 527 . C T 198.88 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.3990;MQ=31.58;MQ0=0;QD=12.43;SB=-0.01;sumGLbyD=14.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,9:16:99:229,0,210 55889-ref 542 . G C 225.55 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=16;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=30.83;MQ0=0;QD=14.10;SB=-0.01;sumGLbyD=15.97 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:99:256,0,192 55889-ref 544 . G A 265.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=17;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.23;MQ0=0;QD=15.62;SB=-0.01;sumGLbyD=17.38 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:99:295,0,189 55889-ref 568 . G A 405.78 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=26;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9933;MQ=33.77;MQ0=0;QD=15.61;SB=-0.01;sumGLbyD=16.76 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,15:26:99:436,0,356 55889-ref 599 . A G 304.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=20;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.9994;MQ=33.85;MQ0=0;QD=15.22;SB=-26.62;sumGLbyD=16.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:334,0,272 55889-ref 627 . T C 257.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=15;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.21;MQ0=0;QD=17.15;SB=-0.01;sumGLbyD=19.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,9:15:99:287,0,171 55889-ref 640 . T A 16.46 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9987;MQ=33.48;MQ0=0;QD=1.83;SB=-0.01;sumGLbyD=5.15 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:7:46.36:46,0,159 55889-ref 644 . G C 94.30 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=30.37;MQ0=0;QD=18.86;SB=-0.01;sumGLbyD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:14.59:124,0,15 55889-ref 645 . G C 136.14 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9987;MQ=30.37;MQ0=0;QD=27.23;SB=-0.01;sumGLbyD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.04:169,15,0 55889-ref 728 . C A 65.48 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=3.64;SB=-0.01;sumGLbyD=5.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:95.47:95,0,489 55889-ref 729 . T A 512.37 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=35.87;MQ0=0;QD=28.46;SB=-0.01;sumGLbyD=30.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:18:42.13:545,42,0 55889-ref 744 . T C 599.04 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=24;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.15;MQ0=0;QD=24.96;SB=-0.01;sumGLbyD=26.21 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,18:24:99:629,0,153 55889-ref 751 . G T 815.51 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=30;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=36.66;MQ0=0;QD=27.18;SB=-0.01;sumGLbyD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,24:30:99:846,0,135 55889-ref 797 . C T 1173.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=2.6547;MQ=36.77;MQ0=0;QD=26.68;SB=-0.01;sumGLbyD=27.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,35:43:99:1204,0,202 55889-ref 801 . G T 102.77 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=45;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=4.4815;MQ=36.78;MQ0=0;QD=2.28;SB=-0.01;sumGLbyD=2.95 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,9:43:99:133,0,1240 55889-ref 804 . C G 144.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=43;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8262;MQ=36.77;MQ0=0;QD=3.36;SB=-0.01;sumGLbyD=4.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:99:174,0,1234 55889-ref 921 . T G 1064.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8312;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.19;SB=-0.01;sumGLbyD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,33:43:99:1094,0,291 55889-ref 962 . G A 800.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=36;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=22.22;SB=-0.01;sumGLbyD=23.06 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:99:830,0,358 55889-ref 992 . C A 601.96 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=28;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9469;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.50;SB=-0.01;sumGLbyD=22.57 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,18:28:99:632,0,310 55889-ref 1051 . C A 798.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=35;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.5226;MQ=36.71;MQ0=0;QD=22.81;SB=-0.01;sumGLbyD=23.66 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,24:35:99:828,0,332 55889-ref 1224 . T C 817.56 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=38;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=4.5721;MQ=37.00;MQ0=0;QD=21.51;SB=-0.01;sumGLbyD=22.30 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,25:36:99:848,0,355 55889-ref 1320 . T C 516.29 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=63;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7953;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.20;SB=-37.00;sumGLbyD=8.67 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,19:61:99:546,0,1441 55889-ref 1353 . C T 2120.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.2233;MQ=36.82;MQ0=0;QD=37.87;SB=-63.69;sumGLbyD=38.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,56:56:99:2154,169,0 55889-ref 1461 . C T 847.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=42;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.9452;MQ=37.00;MQ0=0;QD=20.18;SB=-0.01;sumGLbyD=20.89 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:42:99:877,0,467 55889-ref 1671 . T G 420.61 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=44;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.7328;MQ=36.54;MQ0=0;QD=9.56;SB=-0.01;sumGLbyD=10.24 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,15:44:99:451,0,984 55889-ref 1685 . G T 1443.75 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7219;MQ=36.51;MQ0=0;QD=35.21;SB=-0.01;sumGLbyD=36.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,39:38:99:1477,114,0 55889-ref 1695 . G T 2043.20 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.7887;MQ=36.62;MQ0=0;QD=38.55;SB=-0.01;sumGLbyD=39.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,53:53:99:2076,160,0 55889-ref 1907 . C G 656.86 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=80;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8298;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.21;SB=-0.01;sumGLbyD=8.59 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,24:79:99:687,0,1879 55889-ref 1908 . T C 674.93 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=81;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.8298;MQ=37.00;MQ0=0;QD=8.33;SB=-0.01;sumGLbyD=8.70 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,25:80:99:705,0,1919 55889-ref 2073 . T C 1061.58 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=114;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=1.7333;MQ=36.73;MQ0=0;QD=9.31;SB=-0.01;sumGLbyD=9.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,38:112:99:1092,0,2572 55889-ref 2079 . C G 2378.44 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=113;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=3.6536;MQ=36.73;MQ0=0;QD=21.05;SB=-0.01;sumGLbyD=21.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,72:110:99:2408,0,1193 55889-ref 2082 . C T 3981.44 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.3817;MQ=36.71;MQ0=0;QD=37.92;SB=-0.01;sumGLbyD=37.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,105:104:99:3981,313,0 55889-ref 2223 . C T 1511.97 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=71;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=2.4440;MQ=36.72;MQ0=0;QD=21.30;SB=-0.01;sumGLbyD=21.72 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,46:70:99:1542,0,763 55889-ref 2240 . G A 578.23 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=65;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=4.3268;MQ=36.69;MQ0=0;QD=8.90;SB=-0.01;sumGLbyD=9.36 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,21:63:99:608,0,1462 55889-ref 2247 . G C 1384.92 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=62;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.2802;MQ=36.67;MQ0=0;QD=22.34;SB=-0.01;sumGLbyD=22.82 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,41:62:99:1415,0,626 55889-ref 2272 . A C 552.09 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=55;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=36.45;MQ0=0;QD=10.04;SB=-0.01;sumGLbyD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,19:55:99:582,0,1233 55889-ref 2290 . C G 1377.71 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9999;MQ=36.45;MQ0=0;QD=37.24;SB=-0.01;sumGLbyD=38.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:99:1411,111,0 55889-ref 2300 . T A 250.46 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=23;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=2.7551;MQ=36.12;MQ0=0;QD=10.89;SB=-0.01;sumGLbyD=12.19 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:280,0,476 55889-ref 2348 . G A 81.02 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=27.01;SB=-0.01;sumGLbyD=37.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9.03:113,9,0 55889-ref 2352 . A C 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 55938-ref 253 . A T 35.36 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;DS;Dels=0.00;HRun=3;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=17.68;SB=-0.01;sumGLbyD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6.01:67,6,0 56072-ref 38 . G A 195.81 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.8321;MQ=37.00;MQ0=0;QD=32.63;SB=-0.01;sumGLbyD=38.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:229,18,0 56072-ref 637 . T C 622.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=101;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=1.4625;MQ=34.93;MQ0=0;QD=6.16;SB=-0.01;sumGLbyD=6.46 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,25:100:99:652,0,2441 56072-ref 658 . G A 2005.79 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=161;DS;Dels=0.00;HRun=2;HaplotypeScore=4.8173;MQ=34.86;MQ0=0;QD=12.46;SB=-0.01;sumGLbyD=12.64 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,73:159:99:2036,0,2914 56072-ref 693 . C A 1074.27 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=180;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=6.7343;MQ=35.11;MQ0=0;QD=5.97;SB=-0.01;sumGLbyD=6.13 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:129,50:177:99:1104,0,4432 56072-ref 696 . T C 855.49 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=173;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=7.6010;MQ=35.03;MQ0=0;QD=4.95;SB=-0.01;sumGLbyD=5.12 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:127,45:172:99:885,0,4463 56072-ref 697 . C G 6378.52 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=171;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=7.6010;MQ=35.01;MQ0=0;QD=37.30;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,171:171:99:6378,514,0 56072-ref 721 . A T 797.70 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=192;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=17.0331;MQ=36.42;MQ0=0;QD=4.15;SB=-0.01;sumGLbyD=4.31 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:154,37:187:99:828,0,5212 56072-ref 810 . T G 5569.21 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=244;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=5.6274;MQ=36.69;MQ0=0;QD=22.82;SB=-0.01;sumGLbyD=19.86 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,142:240:99:4846,0,3094 56072-ref 868 . A G 90.08 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=25;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=6.7593;MQ=34.71;MQ0=0;QD=3.60;SB=-0.01;sumGLbyD=4.80 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:99:120,0,614 56072-ref 874 . G A 12.81 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=9;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.8318;MQ=30.22;MQ0=0;QD=1.42;SB=-0.01;sumGLbyD=4.73 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:42.57:43,0,199 56130-ref 486 . T C 12.55 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=4.18;SB=-0.01;sumGLbyD=14.10 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26.26:42,0,26 56130-ref 498 . A T 116.46 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.39;MQ0=0;QD=29.11;SB=-0.01;sumGLbyD=37.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12.04:149,12,0 56130-ref 599 . G A 28.41 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=3;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9995;MQ=33.48;MQ0=0;QD=9.47;SB=-0.01;sumGLbyD=19.47 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30.98:58,0,31 56130-ref 612 . G A 17.32 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=4;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=31.58;MQ0=0;QD=4.33;SB=-0.01;sumGLbyD=11.81 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47.24:47,0,51 56130-ref 657 . T C 224.09 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=28.48;MQ0=0;QD=28.01;SB=-0.01;sumGLbyD=32.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24.05:257,24,0 56130-ref 672 . C A 86 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9999;MQ=27.04;MQ0=0;QD=12.29;SB=-0.01;sumGLbyD=16.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:7:12.02:118,12,0 56130-ref 687 . A C 70.45 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=2.9994;MQ=28.94;MQ0=0;QD=10.06;SB=-0.01;sumGLbyD=14.35 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:6:61.97:100,0,62 56130-ref 691 . A G 137.10 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=7;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.9999;MQ=28.94;MQ0=0;QD=19.59;SB=-0.01;sumGLbyD=23.88 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18.96:167,0,19 56130-ref 705 . A G 165.14 PASS AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=11;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.9973;MQ=32.11;MQ0=0;QD=15.01;SB=-0.01;sumGLbyD=17.74 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:195,0,125 56130-ref 785 . C T 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=3.9989;MQ=33.48;MQ0=0;QD=26.15;SB=-0.01;sumGLbyD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:5:15.05:190,15,0 56130-ref 789 . A G 186.40 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=33.48;MQ0=0;QD=31.07;SB=-0.01;sumGLbyD=36.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18.05:219,18,0 56130-ref 798 . A G 156.91 PASS AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=34.93;MQ0=0;QD=31.38;SB=-0.01;sumGLbyD=37.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15.05:190,15,0 56130-ref 952 . G A 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=1;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 56130-ref 957 . T G 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0 56130-ref 961 . G T 10.43 LowQual AC=1;AF=0.50;AN=2;DP=1;DS;Dels=0.00;HRun=0;HaplotypeScore=0.0000;MQ=37.00;MQ0=0;QD=10.43;SB=-0.01;sumGLbyD=41.77 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:0,1:1:1.76:40,3,0