Mercurial > repos > devteam > cummerbund_to_tabular
view test-data/isoform_fpkm.tabular @ 0:648c27c78eed draft
Initial commit with version 1.0.0 of the tool.
| author | devteam |
|---|---|
| date | Tue, 23 Dec 2014 16:01:24 -0500 |
| parents | |
| children |
line wrap: on
line source
tracking_id class_code nearest_ref_id gene_id gene_short_name tss_id locus length coverage q1_FPKM q1_conf_lo q1_conf_hi q1_status q2_FPKM q2_conf_lo q2_conf_hi q2_status TCONS_00000001 c Xkr4 XLOC_000001 Xkr4 TCONS_00000001 chr1:3204754-3204833 79 - 0 0 0 OK 9459860 33303500 0 OK TCONS_00000002 - - XLOC_000002 - TCONS_00000002 chr1:3111449-3111490 41 - 0 0 0 OK 243637000 952723000 0 OK TCONS_00000003 - - XLOC_000003 - TCONS_00000003 chr1:3111545-3111576 31 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000009 - - XLOC_000011 - TCONS_00000009 chr1:3192441-3192494 53 - 0 0 0 OK 97002000 317699000 0 OK TCONS_00000010 - - XLOC_000012 - TCONS_00000010 chr1:3192550-3192629 79 - 0 0 0 OK 4729930 18496100 0 OK TCONS_00000011 - - XLOC_000014 - TCONS_00000011 chr1:3192731-3192811 80 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000012 - - XLOC_000015 - TCONS_00000012 chr1:3192940-3193042 102 - 0 0 0 OK 6863860 21424300 0 OK TCONS_00000013 - - XLOC_000016 - TCONS_00000013 chr1:3194185-3194226 41 - 0 0 0 OK 243637000 952723000 0 OK TCONS_00000014 - - XLOC_000017 - TCONS_00000014 chr1:3194302-3194329 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000015 - - XLOC_000019 - TCONS_00000015 chr1:3195083-3195110 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000016 - - XLOC_000020 - TCONS_00000016 chr1:3195450-3195477 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000017 - - XLOC_000021 - TCONS_00000017 chr1:3197089-3197116 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000018 - - XLOC_000022 - TCONS_00000018 chr1:3197246-3197273 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000019 - - XLOC_000023 - TCONS_00000019 chr1:3197346-3197373 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000020 - - XLOC_000025 - TCONS_00000020 chr1:3200022-3200191 169 - 826392 2653610 0 OK 803108 2630330 0 OK TCONS_00000021 - - XLOC_000026 - TCONS_00000021 chr1:3200325-3200352 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000022 - - XLOC_000029 - TCONS_00000022 chr1:3201077-3201481 404 - 66791.3 214473 0 OK 324548 802006 0 OK TCONS_00000023 - - XLOC_000031 - TCONS_00000023 chr1:3201672-3201699 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000024 i Xkr4 XLOC_000034 Xkr4 TCONS_00000024 chr1:3212213-3212292 79 - 0 0 0 OK 9459860 33303500 0 OK TCONS_00000025 i Xkr4 XLOC_000035 Xkr4 TCONS_00000025 chr1:3212367-3212439 72 - 0 0 0 OK 28083700 87658400 0 OK TCONS_00000026 i Xkr4 XLOC_000037 Xkr4 TCONS_00000026 chr1:3213095-3213242 97 - 4244630 15581400 0 OK 2082090 8141870 0 OK TCONS_00000027 i Xkr4 XLOC_000040 Xkr4 TCONS_00000027 chr1:3242633-3242923 290 - 48522.7 185766 0 OK 424400 1302890 0 OK TCONS_00000028 i Xkr4 XLOC_000042 Xkr4 TCONS_00000028 chr1:3243018-3243079 61 - 0 0 0 OK 30305300 106690000 0 OK TCONS_00000029 i Xkr4 XLOC_000044 Xkr4 TCONS_00000029 chr1:3243347-3243401 54 - 0 0 0 OK 57999100 204186000 0 OK TCONS_00000030 i Xkr4 XLOC_000046 Xkr4 TCONS_00000030 chr1:3256974-3257011 37 - 0 0 0 OK 2354230000 8288060000 0 OK TCONS_00000031 i Xkr4 XLOC_000048 Xkr4 TCONS_00000031 chr1:3277190-3277218 28 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000033 i Xkr4 XLOC_000052 Xkr4 TCONS_00000033 chr1:3280686-3280741 55 - 0 0 0 OK 26133400 102193000 0 OK TCONS_00000034 i Xkr4 XLOC_000057 Xkr4 TCONS_00000034 chr1:3290488-3290553 65 - 0 0 0 OK 11150300 43602600 0 OK TCONS_00000037 i Xkr4 XLOC_000060 Xkr4 TCONS_00000037 chr1:3299443-3299664 55 - 0 163195 0 OK 0 163195 0 OK TCONS_00000038 i Xkr4 XLOC_000062 Xkr4 TCONS_00000038 chr1:3300051-3300078 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000039 i Xkr4 XLOC_000065 Xkr4 TCONS_00000039 chr1:3318999-3319051 52 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000040 i Xkr4 XLOC_000068 Xkr4 TCONS_00000040 chr1:3355887-3356119 27 - 0 332434 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000041 i Xkr4 XLOC_000071 Xkr4 TCONS_00000041 chr1:3363214-3363278 64 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000042 i Xkr4 XLOC_000073 Xkr4 TCONS_00000042 chr1:3363753-3363849 96 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000043 i Xkr4 XLOC_000075 Xkr4 TCONS_00000043 chr1:3367135-3367162 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000044 i Xkr4 XLOC_000077 Xkr4 TCONS_00000044 chr1:3367333-3367382 49 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000045 i Xkr4 XLOC_000080 Xkr4 TCONS_00000045 chr1:3377211-3377262 51 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000046 i Xkr4 XLOC_000083 Xkr4 TCONS_00000046 chr1:3391325-3391352 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000047 i Xkr4 XLOC_000084 Xkr4 TCONS_00000047 chr1:3435841-3435880 39 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000048 i Xkr4 XLOC_000085 Xkr4 TCONS_00000048 chr1:3447761-3447788 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000049 i Xkr4 XLOC_000086 Xkr4 TCONS_00000049 chr1:3450906-3450965 59 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000050 i Xkr4 XLOC_000087 Xkr4 TCONS_00000050 chr1:3451051-3451109 58 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000051 - - XLOC_000004 - TCONS_00000051 chr1:3174765-3174792 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000052 - - XLOC_000005 - TCONS_00000052 chr1:3187401-3187428 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000053 - - XLOC_000006 - TCONS_00000053 chr1:3188521-3188548 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000054 - - XLOC_000007 - TCONS_00000054 chr1:3189810-3190789 979 - 358326 581565 135086 OK 522345 633911 410780 OK TCONS_00000055 - - XLOC_000008 - TCONS_00000055 chr1:3190858-3191434 576 - 408511 762496 54526.1 OK 420354 779200 61509.1 OK TCONS_00000056 - - XLOC_000009 - TCONS_00000056 chr1:3191512-3192077 565 - 433286 803020 63552.3 OK 842157 1341790 342520 OK TCONS_00000057 - - XLOC_000010 - TCONS_00000057 chr1:3192250-3192336 86 - 3441510 13175600 0 OK 3344550 13078600 0 OK TCONS_00000058 - - XLOC_000013 - TCONS_00000058 chr1:3192649-3192676 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000059 - - XLOC_000018 - TCONS_00000059 chr1:3194706-3194733 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000060 - - XLOC_000024 - TCONS_00000060 chr1:3197425-3197452 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000062 - - XLOC_000027 - TCONS_00000062 chr1:3200430-3200457 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000063 - - XLOC_000028 - TCONS_00000063 chr1:3201007-3201039 32 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000065 - - XLOC_000030 - TCONS_00000065 chr1:3201596-3201666 70 - 16359000 59640900 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000066 - - XLOC_000032 - TCONS_00000066 chr1:3201725-3201809 84 - 15136000 46339600 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000067 i Xkr4 XLOC_000033 Xkr4 TCONS_00000067 chr1:3211521-3211561 40 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000068 i Xkr4 XLOC_000036 Xkr4 TCONS_00000068 chr1:3212717-3212801 84 - 3784000 14486800 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000069 i Xkr4 XLOC_000037 Xkr4 TCONS_00000069 chr1:3213095-3213242 124 - 863189 4252220 0 OK 0 72384.9 0 OK TCONS_00000070 i Xkr4 XLOC_000038 Xkr4 TCONS_00000070 chr1:3240606-3240633 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000071 i Xkr4 XLOC_000039 Xkr4 TCONS_00000071 chr1:3242479-3242512 33 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000072 i Xkr4 XLOC_000041 Xkr4 TCONS_00000072 chr1:3242924-3243005 81 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000073 i Xkr4 XLOC_000043 Xkr4 TCONS_00000073 chr1:3243108-3243154 46 - 86160000 329857000 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000074 i Xkr4 XLOC_000045 Xkr4 TCONS_00000074 chr1:3254079-3254106 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000075 i Xkr4 XLOC_000047 Xkr4 TCONS_00000075 chr1:3277155-3277182 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000076 i Xkr4 XLOC_000049 Xkr4 TCONS_00000076 chr1:3277913-3278390 477 - 228872 561229 0 OK 47662.2 156103 0 OK TCONS_00000077 i Xkr4 XLOC_000050 Xkr4 TCONS_00000077 chr1:3280117-3280144 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000078 i Xkr4 XLOC_000051 Xkr4 TCONS_00000078 chr1:3280498-3280525 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000079 i Xkr4 XLOC_000053 Xkr4 TCONS_00000079 chr1:3282504-3282531 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000080 i Xkr4 XLOC_000054 Xkr4 TCONS_00000080 chr1:3282650-3282677 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000081 i Xkr4 XLOC_000055 Xkr4 TCONS_00000081 chr1:3282760-3282832 72 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000082 i Xkr4 XLOC_000056 Xkr4 TCONS_00000082 chr1:3284966-3284993 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000083 i Xkr4 XLOC_000058 Xkr4 TCONS_00000083 chr1:3290798-3290859 61 - 15591900 59692600 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000084 i Xkr4 XLOC_000059 Xkr4 TCONS_00000084 chr1:3290919-3291273 354 - 294879 740137 0 OK 85971.3 281572 0 OK TCONS_00000085 i Xkr4 XLOC_000060 Xkr4 TCONS_00000085 chr1:3299443-3299664 197 - 807732 2390560 0 OK 156995 613917 0 OK TCONS_00000086 i Xkr4 XLOC_000061 Xkr4 TCONS_00000086 chr1:3299691-3299733 42 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000087 i Xkr4 XLOC_000063 Xkr4 TCONS_00000087 chr1:3307748-3307775 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000088 i Xkr4 XLOC_000064 Xkr4 TCONS_00000088 chr1:3318620-3318647 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000089 i Xkr4 XLOC_000066 Xkr4 TCONS_00000089 chr1:3330527-3330554 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000090 i Xkr4 XLOC_000067 Xkr4 TCONS_00000090 chr1:3351240-3351311 71 - 7681690 29408800 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000091 i Xkr4 XLOC_000068 Xkr4 TCONS_00000091 chr1:3355887-3356119 212 - 504790 1545440 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000092 i Xkr4 XLOC_000069 Xkr4 TCONS_00000092 chr1:3356180-3356225 45 - 102717000 393246000 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000093 i Xkr4 XLOC_000070 Xkr4 TCONS_00000093 chr1:3363076-3363176 100 - 3810010 13890300 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000094 i Xkr4 XLOC_000072 Xkr4 TCONS_00000094 chr1:3363387-3363446 59 - 55365400 177783000 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000095 i Xkr4 XLOC_000074 Xkr4 TCONS_00000095 chr1:3364871-3364919 48 - 62896600 240795000 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000096 i Xkr4 XLOC_000076 Xkr4 TCONS_00000096 chr1:3367210-3367237 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000097 i Xkr4 XLOC_000078 Xkr4 TCONS_00000097 chr1:3369580-3369607 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000098 i Xkr4 XLOC_000079 Xkr4 TCONS_00000098 chr1:3375001-3375028 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000099 i Xkr4 XLOC_000081 Xkr4 TCONS_00000099 chr1:3379888-3379915 27 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK TCONS_00000100 i Xkr4 XLOC_000082 Xkr4 TCONS_00000100 chr1:3386739-3386836 97 - 0 0 0 OK 0 0 0 OK