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comparison test-data/lastz_diffs.txt @ 0:0801f8207d30 draft
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author | devteam |
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date | Mon, 26 Nov 2012 09:47:51 -0500 |
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4 phiX 2992 2993 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:458:1629 23 24 + 36 G T GCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGAGGCGGT GCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTTTTTGGAGGCGGT | |
5 phiX 4783 4784 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:646:59 18 19 - 36 C T CATTTCCATGCGGTGCACTTTATGCGGACACTTCC CATTTCCATGCGGTGCATTTTATGCGGACACTTCC | |
6 phiX 1649 1650 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:295:694 24 25 + 36 A G GTGATTACTTCATGCAGCGTTACCATGATGTTATTT GTGATTACTTCATGCAGCGTTACCGTGATGTTATTT | |
7 phiX 1995 1996 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:590:331 14 15 + 36 G T GAAATTTCTATGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGAT GAAATTTCTATGAATGATGTTTTCCGTTCTGGTGAT | |
8 phiX 3261 3262 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:221:1238 17 18 - 36 C A AAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGATAC AAGTCTGCCGATGATAAAGGAAAGGATAC | |
9 phiX 4109 4110 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:478:252 12 13 - 36 C A ATGCTTGGCTTCCATAAGCAGATGGATAACCGCATC ATGCTTGGCTTCAATAAGCAGATGGATAACCGCATC | |
10 phiX 2972 2973 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:836:1204 17 18 + 36 G T TTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAAT TTGCTTCTGCTCTTGCTTGTGGCGCCATGTCTAAAT | |
11 phiX 2234 2235 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:172:1412 13 14 - 36 C A AAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCTGCCGACC AAATTTAATGTGAACGTTTATCGCAATCTGCCGACC | |
12 phiX 2902 2903 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:540:1415 18 19 + 36 G T TTATTAAAGAGATTATTTGTCTCCAGCCACTTA TTATTAAAGAGATTATTTTTCTCCAGCCACTTA | |
13 phiX 2837 2838 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:253:1162 14 15 - 36 T A ATGGTTTGGTCTAACTTTACCGCTACTAAATGC ATGGTTTGGTCAAACTTTACCGCTACTAAATGC | |
14 phiX 4662 4663 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:828:754 26 27 + 36 G T TTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGGTCGTATGGT TTTGCGTGACTATTTTCGTGATATTGTTCGTATGGT | |
15 phiX 4783 4784 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:1566:499 9 10 + 36 C T TGCGGTGCACTTTATGCGGACACTTCCTACAGGTAG TGCGGTGCATTTTATGCGGACACTTCCTACAGGTAG | |
16 phiX 2857 2858 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:578:971 15 16 + 36 G T CGCTACTAAATGCCGCGGATTGGTTTCG CGCTACTAAATTCCGCGGATTGGTTTCG | |
17 phiX 3112 3113 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:1721:1800 27 28 - 36 T C TCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCC TCAAGGCTCTAATGTCCCTAACCC | |
18 phiX 4825 4826 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:815:1640 9 10 - 36 T G CCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCA CCCTAATTTGGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCA | |
19 phiX 4517 4518 + 5386 HWI-EAS91_1_306UPAAXX:6:1:1485:741 19 20 - 36 G A GAAATCGCGTAGAGGCTTTGCTATTCAGCGTTTGAT GAAATCGCGTAGAGGCTTTACTATTCAGCGTTTGAT |