view test-data/export/cdna.fa @ 11:56b9a26694c0 draft

"planemo upload for repository https://github.com/galaxy-genome-annotation/galaxy-tools/tree/master/tools/apollo commit 81492a9c8b9e5649a3867bc30afe617a30fb47a1"
author gga
date Tue, 14 Apr 2020 10:39:32 -0400
parents c3b5bc8b4080
children b763acecfb57
line wrap: on
line source

>ff2fe902-7bab-431c-be82-30ed072915d1 (mRNA) 690 residues [Merlin:2-691 + strand] [cdna] name=Unknown
CGTTTAGACAAAGGTACATTATTGTATCGTGGCCAAAAATTAGACCTTCCTACATTCGAG
CATAACGCAGAGAATAAGTTGTTCTATTTCAGAAACTACGTTTCAACTTCATTAAAGCCT
CTGATCTTTGGTGAATTTGGTCGTATGTTTATGGCACTAGATGACGATACTACAATTTAT
ACTGCTGAGACGCCTGATGATTATAATCGTTTCGCAAACCCAGAAGATATAATTGATATT
GGCGCTACTCAAAAAGACTCATTTGACGATAACAATAATGATGGAACATCTATTAATATC
GGCAAACAAGTTAATTTAGGATTCGTTATTTCCGGTGCTGAAAATGTTCGAGTTATTGTT
CCAGGTTCTTTAACTGAATATCCAGAAGAAGCGGAAGTTATTCTGCCTCGTGGTACTCTT
TTGAAGATCAATAAAATCACTACTCAAGTAGATAAACGCTCGAATAAGTTCATGGTTGAA
GGTTCAATCGTTCCGCCTTCTGAGCAAATTGATGAATCTGTTGAGATTTATGACGGTGAT
CTGTTCATGGAAACAGGTGAAGTAGTAAAACTGTCCGGATTCATGCAGTTCGTCAACGAA
TCTGCATACGATGAAGAGCAAAACCAGATGGCTGCTGAGATTCTGTCTGGATTCTTGGAC
ATTGATGACATGCCACGTAAGTTCCGCTAG
>f2e1909a-1d40-4a49-a67b-5fe2afdc4957 (mRNA) 288 residues [Merlin:752-1039 + strand] [cdna] name=Unknown
ATGAAATCAATTTTTCGTATCAACGGTGTAGAAATTGTAGTTGAAGATGTAGTTCCTATG
TCTTATGAATTCAATGAAGTTGTTTTCAAAGAGCTTAAGAAAATTTTAGGCGATAAGAAG
CTTCAAAGTACTCCAATTGGACGTTTTGGAATGAAAGAAAACGTTGATACTTATATTGAA
AGTGTAGTGACAGGGCAGTTAGAAGGTGAATTTTCTGTAGCAGTTCAAACTGTAGAAAAT
GATGAAGTTATTTTAACTTTACCAGCTTTCGTAATTTTCCGCAAATAA
>12fe0db6-c8e1-4bc9-b594-87c92c6c9669 (mRNA) 945 residues [Merlin:1067-2011 - strand] [cdna] name=Unknown
ATGCTAACTTTAGATGAATTTAAAAACCAAGCGGGTAATATAGACTTTCAGCGTACTAAT
ATGTTTAGTTGTGTATTTGCAACTACTCCGTCAGCAAAGTCTCAACAATTACTCGATCAA
TTTGGCGGTATGCTCTTTAATAACCTTCCGTTGAATAATGACTGGCTTGGATTAACACAA
GGTGAGTTCACATCAGGACTCACCTCAATTATCACTGCCGGTACTCAACAGCTGGTAAGA
AAGTCTGGTGTATCGAAATATCTTATTGGAGCAATGAGCAATCGTGTTGTTCAGTCTTTA
TTAGGTGAATTTGAAGTCGGAACTTATTTGTTAGACTTCTTTAACATGGCTTATCCGCAA
TCTGGATTGATGATTTATTCGGTCAAAATTCCAGAGAACAGATTGTCTCATGAAATGGAT
TTCAACCATAACTCACCGAATATTAGAATAACTGGACGTGAACTCGATCCGTTAACTATA
TCATTCAGAATGGATCCCGAAGCAAGTAACTATCGTGCAATGCAAGATTGGGTGAACTCC
GTTCAAGACCCGGTTACTGGATTGCGAGCATTACCAACTGACGTCGAAGCTGACATTCAG
GTTAACCTTCATGCTCGAAATGGATTACCTCATACTGTGATAATGTTCACAGGTTGTGTT
CCTGTTGCGTGTGGAGCTCCTGAGCTTACATATGAAGGAGATAACCAAATTGCGGTTTTC
GATGTTACATTTGCTTACAGAGTAATGCAAACGGGTGCTGTTGGACGTCAAGCTGCTCTT
GATTGGATTGAAGATAGAGCTGTTAATTCTATAACTGGAATTAATAGTGAAATGTCTCTT
AATGGAAGTTTAAGTAGATTATCTAGACTTGGAGGAGCTGCTGGAGGGTTGTCTCACGTC
ATTAATTCGACCCGAAACTCTACTTCGAAAATACTTGGATTGTAA
>58fc8255-95ed-4417-a373-238f826810ac (mRNA) 1056 residues [Merlin:2011-3066 - strand] [cdna] name=Unknown
ATGAGCATTAAAGTCAGAGAATTAGATGATAAGACTGATGCTTTAATTAGCGGAGTTAAA
ACCTCCGCTGGTCAAAGTTCACAATCAGCAAAAATAAAATCCACTATAACTGCGCAATAT
CCGTCTGAACGTTCAGCTGGTAATGACACATCTGGTTCTTTACGAGTTCATGATCTTTAT
AAGAACGGGTTGTTGTTCACTGCGTATGATATGAATTCTCGTACAACCGGTGATATGCGT
AGCATGCGTTTAGGTGAAATGAAACGTACTGCAAATAGTGTAGTGAAATCAATCACTGGA
ACAAATACTAATAAAGTTGATAAAATTCCAGTAGTGAATATTTTACTTCCACGCTCGAAA
TCAGATGTTGAATCAGTTTCTCATAAATTTAATGACGTTGGAGATTCACTTATTTCTCGT
GGCGGCGGTACTGCTACAGGGGTATTAAGTAACGTTGCATCTACTGCTGTCTTTGGCGGA
TTAGAGTCATTGACTCAAGGATTAATGGCTGACCATAACGAGCAGATCTATAACACTGCT
CGATCAATGTATGGCGGCGCAGATAACCGTACGAAGGTATTCACGTGGGATTTAACTCCT
CGATCAGTACAAGATCTTATTGCTATTATCGAGATCTATGAATACTTTAACTACTATAGT
TATGGCGAAACGGGAACGTCTACTTATGCAAAAGAAGTTAAGTCTCAATTAGATGAATGG
TATAAATCAACTTTCCTTGATACATTAACTCCAGATGAAGCTAATAAAAATGACACTGTT
TTTGAGAAAATAACTTCATTCTTAAGTAATGTTATTGTTGTAAGTAACCCTACTGTGTGG
TTCGTCAGAAACTTTGGAACCACAAGTAAATTCGATGGACGTGCTGAAGTATTCGGTCCA
TGTCAAATTCAGAGTATCCGTTTTGATAAAACTCCAAATGGAAACTTTAACGGTTTAGCT
ATAGCTCCAAACCTGCCAAGTACATTCACATTAGAAATTACTATGCGTGAAATCTTGACA
TTGAACCGAGCTTCAGTATATGCGGAAGGATTCTGA
>c009dd7a-3284-4e7f-9ee1-3b56e2598e07 (mRNA) 1662 residues [Merlin:3066-4796 - strand] [cdna] name=multiexongene
ATGAAAAGCGAAAACATGTCCACAATGAGACGTCGTAAAGTTATCGCTGATTCAAAGGGT
GAAAGAGATGCAGCCTCGACTGCATCTGATCAAGTAGACTCTTTAGAATTAATCGGCCTT
AAACTTGATGATGTACAAAGCGCTAATGAACTAGTTGCTGAAGTAATTGAAGAAAAGGGC
AATAACTTAATTGATTCAGTTGATAACGTCGCTGAAGGTACTGAATTAGCTGCTGAAGCA
TCTGAACGAACTACTGAGTCTATCAAGACTCTTACTGGCGTAGCGTCAACAATCAGCGAC
AAATTAAGTAAACTCGCTTCGATGCTCGAGTCGAAGGTTCAGGCTGTGGAGCAAAAAGTA
CAAGAATCTGGTGCCTCAGCTTCAACTGGGCTGTCAGTGATAGAAGATAAGCTTCCAGAT
CCTGATGAGCCTTTCTTTCCACCTGTCCCTCAGGAACCCGAGAACAACAAGAAAGATCAA
AAGAAAGATGATAAGAAACCTACCGATATGTTAGGTGACTTGCTGAAGACTACGAAGGGC
GGATTTAAAGCTACGATATCAATCACTGATAAAATATCGTCTATGCTTTTCAAATACACC
GTAACAGCATTAGCTGAAGCTGCTAAAATGGCTGCTATGCTATTTGCATTAGTATTAGGC
ATAGATTTACTTCGTATTCATTTTAAGTATTGGACTGATAAATTCATGAGTAACTTCGAT
GAATTCAGTGCTGAAGCTGGTGAATGGGGTGGACTGCTTCAATCAATTTTTGGAATGTTA
GGAGATATTAAAAAGTTCTGGGAAGCTGGAGACTGGAGTGGATTAGCAGTAGCTATTGTC
AAAGGATTAGCTGATGTGATTTACAACCTGAGCGAAATAATGTCTTTGGGAATTTCAAAG
ATATCTGCTTCTATACTCGATGCACTTGGCTTTGAAAATGCAGCAACTACTATTCGTGGT
TCAGCACTAGAAGGATTCCAGGAACGCACTGGTAATTCATTGTCTGAAGATGATCAAAAA
GCTTTGGCTAAATATCAGAGTAAGCGTATTGAAGAAGGTCCTGGAATTATTGATAAAGCT
GGCGAATTTAAAACTCGTGCATTTGATTGGGTACTAGGAAGAGAGAATAAAATCGATTCT
ACACAAGCATCTGACCGTGATCAAGAGACTCAGAATCTTAAAGCAATGGCTCCTGAAAAA
CGCGAAGAAACACTGATCAAACAAAACGAAGCTCGTGCAGCTGTTCAGCGTTTAGAAAAA
TATATTGGTGATGTTGATCCAGAGAATCCAACTAATATGCAATCTTTAGAGAAGGCATAT
AACAGTGCCAAAAAGTCTATTAGTGATTCTGCTATAAGTGATCAACCAGCTACTAAAAAG
GAACTCGATAAAAGATTCCAACGAGTAGAATCCAAGTATCAGAAGCTCAAAGAAGATAAC
ACTCCGAAGCCTGCGGCTCCAGCTACTTCGGAAGATAATCAACGAGTTCAAAATATTCAA
AAAGCTGAAAATGCTAAAGAGCAATCTAAAAAATCAACCGGTGATATGAATGTTGCTAAC
ACTCAGGTTAATAACGTAAATAATAGTAAGACTATTCACCAGGTTCAAACAGTCACGGCT
ACTCCAGCTCCTGGAGTATTCGGGGCAACAGGAGTTAATTAA
>2706ea76-172a-48c1-b940-eb603996f082 (mRNA) 1056 residues [Merlin:5011-6066 - strand] [cdna] name=cds-not-under-exon
CTTTAATGACGCTGGTGAATCAATAAAAGAGATGATCGGTGCAATTTATGAATCAAAACC
TCTTATAGCACCTGCGATGAACACAATCAACACATATGTTCCTCGAGTTCCATGGACGAG
TAACATAACTGAATACAAGAAATATGTTCGAGATGTTGCATTAGCAGTAGATAATGACCA
ATTCGTTTTTGTATGGGAAGATATCTATGGCTTGAACATGATGGATTATGACGCAATGAT
TAACCAAGAATCAATCAAGGTTATTGTCGGTGAACCACGCACAATAGGTCAATTTGTCGG
TGAGCTGGAATATAATCTCGCTTATGACTTCCAGTGGTTAACGAAGGCTAATGCCCATAC
ACGCGATCCTATTTTTAACGCTACAATCTATTCACACTCATTCTTGGATAATAACCTTCC
TAGAATAGTAACAGGTGATGGACAGAATAGCATCTTCGTTTCTCGCTCGGGTGCATATTC
TGAAATGACTTATCGAAATGGATATGAAGAAGCTATCAGGCTTCAGACTATGGCACAATA
CGACGGTTATGCAACTTGTAAAATGGTTGGAGACTTTGAAATGACTCCTGGAGATAAGAT
TAATTTCTTTGATCCAAAGAAACAATTCAAAGCTGATTTTTACATTGATGAAGTAATTCA
TGAAGTAAGTAATAACCAAAGCATAACTACACTTTATATGTTTACTAACTCTCGTAAGTT
GGAAACAGTAGAACCAATAAAGGTTAAAAATGAACTTAAATCTGATACTACCACTTAAGA
AAATACAAGTCAATGGCAAAACCATTTCTATTCCTAAGCTTGGCTTGAAGCATCACACGT
TGATTAAAGATGTTCGTGCAATGGATGAGAACATGGGAATTCTTTTGGACTCAATTCATC
CTGGGCTAAACGCTGCTGAATCAGATTTAGTGTCTATTCATTTGCTAGAGTTCAATGGCA
AGTTAAAATCAAGTGTCGTTAAAGATGGATACACTTACAATATCAATGACATTTATATTT
GCCAACGCCTTGAATTCCAGTTCCAAGGAAAGACAT