view test-data/export/cdna.fa @ 17:f6e09a37bc8b draft default tip

planemo upload for repository https://github.com/galaxy-genome-annotation/galaxy-tools/tree/master/tools/apollo commit 12282c16658b37858f49944796fd95515ef0fc0b
author gga
date Wed, 11 Jan 2023 11:48:06 +0000
parents b763acecfb57
children
line wrap: on
line source

>df4157db-1481-4120-858c-e6a4c0f78547 (mRNA) 690 residues [Merlin:2-691 + strand] [cdna] name=Merlin_1_mRNA-00001
CGTTTAGACAAAGGTACATTATTGTATCGTGGCCAAAAATTAGACCTTCCTACATTCGAG
CATAACGCAGAGAATAAGTTGTTCTATTTCAGAAACTACGTTTCAACTTCATTAAAGCCT
CTGATCTTTGGTGAATTTGGTCGTATGTTTATGGCACTAGATGACGATACTACAATTTAT
ACTGCTGAGACGCCTGATGATTATAATCGTTTCGCAAACCCAGAAGATATAATTGATATT
GGCGCTACTCAAAAAGACTCATTTGACGATAACAATAATGATGGAACATCTATTAATATC
GGCAAACAAGTTAATTTAGGATTCGTTATTTCCGGTGCTGAAAATGTTCGAGTTATTGTT
CCAGGTTCTTTAACTGAATATCCAGAAGAAGCGGAAGTTATTCTGCCTCGTGGTACTCTT
TTGAAGATCAATAAAATCACTACTCAAGTAGATAAACGCTCGAATAAGTTCATGGTTGAA
GGTTCAATCGTTCCGCCTTCTGAGCAAATTGATGAATCTGTTGAGATTTATGACGGTGAT
CTGTTCATGGAAACAGGTGAAGTAGTAAAACTGTCCGGATTCATGCAGTTCGTCAACGAA
TCTGCATACGATGAAGAGCAAAACCAGATGGCTGCTGAGATTCTGTCTGGATTCTTGGAC
ATTGATGACATGCCACGTAAGTTCCGCTAG
>eedd9b31-f1dd-487c-a3ab-6435b2214685 (mRNA) 288 residues [Merlin:752-1039 + strand] [cdna] name=mrna-name-00001
ATGAAATCAATTTTTCGTATCAACGGTGTAGAAATTGTAGTTGAAGATGTAGTTCCTATG
TCTTATGAATTCAATGAAGTTGTTTTCAAAGAGCTTAAGAAAATTTTAGGCGATAAGAAG
CTTCAAAGTACTCCAATTGGACGTTTTGGAATGAAAGAAAACGTTGATACTTATATTGAA
AGTGTAGTGACAGGGCAGTTAGAAGGTGAATTTTCTGTAGCAGTTCAAACTGTAGAAAAT
GATGAAGTTATTTTAACTTTACCAGCTTTCGTAATTTTCCGCAAATAA
>8cd6db6d-b818-4b65-b6f2-de79844a5641 (mRNA) 945 residues [Merlin:1067-2011 - strand] [cdna] name=Merlin_3_mRNA-00001
ATGCTAACTTTAGATGAATTTAAAAACCAAGCGGGTAATATAGACTTTCAGCGTACTAAT
ATGTTTAGTTGTGTATTTGCAACTACTCCGTCAGCAAAGTCTCAACAATTACTCGATCAA
TTTGGCGGTATGCTCTTTAATAACCTTCCGTTGAATAATGACTGGCTTGGATTAACACAA
GGTGAGTTCACATCAGGACTCACCTCAATTATCACTGCCGGTACTCAACAGCTGGTAAGA
AAGTCTGGTGTATCGAAATATCTTATTGGAGCAATGAGCAATCGTGTTGTTCAGTCTTTA
TTAGGTGAATTTGAAGTCGGAACTTATTTGTTAGACTTCTTTAACATGGCTTATCCGCAA
TCTGGATTGATGATTTATTCGGTCAAAATTCCAGAGAACAGATTGTCTCATGAAATGGAT
TTCAACCATAACTCACCGAATATTAGAATAACTGGACGTGAACTCGATCCGTTAACTATA
TCATTCAGAATGGATCCCGAAGCAAGTAACTATCGTGCAATGCAAGATTGGGTGAACTCC
GTTCAAGACCCGGTTACTGGATTGCGAGCATTACCAACTGACGTCGAAGCTGACATTCAG
GTTAACCTTCATGCTCGAAATGGATTACCTCATACTGTGATAATGTTCACAGGTTGTGTT
CCTGTTGCGTGTGGAGCTCCTGAGCTTACATATGAAGGAGATAACCAAATTGCGGTTTTC
GATGTTACATTTGCTTACAGAGTAATGCAAACGGGTGCTGTTGGACGTCAAGCTGCTCTT
GATTGGATTGAAGATAGAGCTGTTAATTCTATAACTGGAATTAATAGTGAAATGTCTCTT
AATGGAAGTTTAAGTAGATTATCTAGACTTGGAGGAGCTGCTGGAGGGTTGTCTCACGTC
ATTAATTCGACCCGAAACTCTACTTCGAAAATACTTGGATTGTAA
>125a44c4-44da-4854-9d3b-ae2aa0221120 (mRNA) 1056 residues [Merlin:2011-3066 - strand] [cdna] name=Merlin_4_mRNA-00001
ATGAGCATTAAAGTCAGAGAATTAGATGATAAGACTGATGCTTTAATTAGCGGAGTTAAA
ACCTCCGCTGGTCAAAGTTCACAATCAGCAAAAATAAAATCCACTATAACTGCGCAATAT
CCGTCTGAACGTTCAGCTGGTAATGACACATCTGGTTCTTTACGAGTTCATGATCTTTAT
AAGAACGGGTTGTTGTTCACTGCGTATGATATGAATTCTCGTACAACCGGTGATATGCGT
AGCATGCGTTTAGGTGAAATGAAACGTACTGCAAATAGTGTAGTGAAATCAATCACTGGA
ACAAATACTAATAAAGTTGATAAAATTCCAGTAGTGAATATTTTACTTCCACGCTCGAAA
TCAGATGTTGAATCAGTTTCTCATAAATTTAATGACGTTGGAGATTCACTTATTTCTCGT
GGCGGCGGTACTGCTACAGGGGTATTAAGTAACGTTGCATCTACTGCTGTCTTTGGCGGA
TTAGAGTCATTGACTCAAGGATTAATGGCTGACCATAACGAGCAGATCTATAACACTGCT
CGATCAATGTATGGCGGCGCAGATAACCGTACGAAGGTATTCACGTGGGATTTAACTCCT
CGATCAGTACAAGATCTTATTGCTATTATCGAGATCTATGAATACTTTAACTACTATAGT
TATGGCGAAACGGGAACGTCTACTTATGCAAAAGAAGTTAAGTCTCAATTAGATGAATGG
TATAAATCAACTTTCCTTGATACATTAACTCCAGATGAAGCTAATAAAAATGACACTGTT
TTTGAGAAAATAACTTCATTCTTAAGTAATGTTATTGTTGTAAGTAACCCTACTGTGTGG
TTCGTCAGAAACTTTGGAACCACAAGTAAATTCGATGGACGTGCTGAAGTATTCGGTCCA
TGTCAAATTCAGAGTATCCGTTTTGATAAAACTCCAAATGGAAACTTTAACGGTTTAGCT
ATAGCTCCAAACCTGCCAAGTACATTCACATTAGAAATTACTATGCGTGAAATCTTGACA
TTGAACCGAGCTTCAGTATATGCGGAAGGATTCTGA
>87414073-7db0-4a60-903f-5e3593e55884 (mRNA) 1662 residues [Merlin:3066-4796 - strand] [cdna] name=Merlin_5_mRNA-00001
ATGAAAAGCGAAAACATGTCCACAATGAGACGTCGTAAAGTTATCGCTGATTCAAAGGGT
GAAAGAGATGCAGCCTCGACTGCATCTGATCAAGTAGACTCTTTAGAATTAATCGGCCTT
AAACTTGATGATGTACAAAGCGCTAATGAACTAGTTGCTGAAGTAATTGAAGAAAAGGGC
AATAACTTAATTGATTCAGTTGATAACGTCGCTGAAGGTACTGAATTAGCTGCTGAAGCA
TCTGAACGAACTACTGAGTCTATCAAGACTCTTACTGGCGTAGCGTCAACAATCAGCGAC
AAATTAAGTAAACTCGCTTCGATGCTCGAGTCGAAGGTTCAGGCTGTGGAGCAAAAAGTA
CAAGAATCTGGTGCCTCAGCTTCAACTGGGCTGTCAGTGATAGAAGATAAGCTTCCAGAT
CCTGATGAGCCTTTCTTTCCACCTGTCCCTCAGGAACCCGAGAACAACAAGAAAGATCAA
AAGAAAGATGATAAGAAACCTACCGATATGTTAGGTGACTTGCTGAAGACTACGAAGGGC
GGATTTAAAGCTACGATATCAATCACTGATAAAATATCGTCTATGCTTTTCAAATACACC
GTAACAGCATTAGCTGAAGCTGCTAAAATGGCTGCTATGCTATTTGCATTAGTATTAGGC
ATAGATTTACTTCGTATTCATTTTAAGTATTGGACTGATAAATTCATGAGTAACTTCGAT
GAATTCAGTGCTGAAGCTGGTGAATGGGGTGGACTGCTTCAATCAATTTTTGGAATGTTA
GGAGATATTAAAAAGTTCTGGGAAGCTGGAGACTGGAGTGGATTAGCAGTAGCTATTGTC
AAAGGATTAGCTGATGTGATTTACAACCTGAGCGAAATAATGTCTTTGGGAATTTCAAAG
ATATCTGCTTCTATACTCGATGCACTTGGCTTTGAAAATGCAGCAACTACTATTCGTGGT
TCAGCACTAGAAGGATTCCAGGAACGCACTGGTAATTCATTGTCTGAAGATGATCAAAAA
GCTTTGGCTAAATATCAGAGTAAGCGTATTGAAGAAGGTCCTGGAATTATTGATAAAGCT
GGCGAATTTAAAACTCGTGCATTTGATTGGGTACTAGGAAGAGAGAATAAAATCGATTCT
ACACAAGCATCTGACCGTGATCAAGAGACTCAGAATCTTAAAGCAATGGCTCCTGAAAAA
CGCGAAGAAACACTGATCAAACAAAACGAAGCTCGTGCAGCTGTTCAGCGTTTAGAAAAA
TATATTGGTGATGTTGATCCAGAGAATCCAACTAATATGCAATCTTTAGAGAAGGCATAT
AACAGTGCCAAAAAGTCTATTAGTGATTCTGCTATAAGTGATCAACCAGCTACTAAAAAG
GAACTCGATAAAAGATTCCAACGAGTAGAATCCAAGTATCAGAAGCTCAAAGAAGATAAC
ACTCCGAAGCCTGCGGCTCCAGCTACTTCGGAAGATAATCAACGAGTTCAAAATATTCAA
AAAGCTGAAAATGCTAAAGAGCAATCTAAAAAATCAACCGGTGATATGAATGTTGCTAAC
ACTCAGGTTAATAACGTAAATAATAGTAAGACTATTCACCAGGTTCAAACAGTCACGGCT
ACTCCAGCTCCTGGAGTATTCGGGGCAACAGGAGTTAATTAA
>1dcb3fc3-3307-4476-9c8a-04d252f9371f (mRNA) 1056 residues [Merlin:5011-6066 - strand] [cdna] name=Merlin_42_mRNA-00001
CTTTAATGACGCTGGTGAATCAATAAAAGAGATGATCGGTGCAATTTATGAATCAAAACC
TCTTATAGCACCTGCGATGAACACAATCAACACATATGTTCCTCGAGTTCCATGGACGAG
TAACATAACTGAATACAAGAAATATGTTCGAGATGTTGCATTAGCAGTAGATAATGACCA
ATTCGTTTTTGTATGGGAAGATATCTATGGCTTGAACATGATGGATTATGACGCAATGAT
TAACCAAGAATCAATCAAGGTTATTGTCGGTGAACCACGCACAATAGGTCAATTTGTCGG
TGAGCTGGAATATAATCTCGCTTATGACTTCCAGTGGTTAACGAAGGCTAATGCCCATAC
ACGCGATCCTATTTTTAACGCTACAATCTATTCACACTCATTCTTGGATAATAACCTTCC
TAGAATAGTAACAGGTGATGGACAGAATAGCATCTTCGTTTCTCGCTCGGGTGCATATTC
TGAAATGACTTATCGAAATGGATATGAAGAAGCTATCAGGCTTCAGACTATGGCACAATA
CGACGGTTATGCAACTTGTAAAATGGTTGGAGACTTTGAAATGACTCCTGGAGATAAGAT
TAATTTCTTTGATCCAAAGAAACAATTCAAAGCTGATTTTTACATTGATGAAGTAATTCA
TGAAGTAAGTAATAACCAAAGCATAACTACACTTTATATGTTTACTAACTCTCGTAAGTT
GGAAACAGTAGAACCAATAAAGGTTAAAAATGAACTTAAATCTGATACTACCACTTAAGA
AAATACAAGTCAATGGCAAAACCATTTCTATTCCTAAGCTTGGCTTGAAGCATCACACGT
TGATTAAAGATGTTCGTGCAATGGATGAGAACATGGGAATTCTTTTGGACTCAATTCATC
CTGGGCTAAACGCTGCTGAATCAGATTTAGTGTCTATTCATTTGCTAGAGTTCAATGGCA
AGTTAAAATCAAGTGTCGTTAAAGATGGATACACTTACAATATCAATGACATTTATATTT
GCCAACGCCTTGAATTCCAGTTCCAAGGAAAGACAT