Mercurial > repos > goeckslab > bayestme_deconvolve
view test-data/refBased_test_data/marker_genes.csv @ 2:8139addbe3c3 draft default tip
planemo upload for repository https://github.com/goeckslab/tools-st/tree/main/tools/bayesTME commit 9f02aac27bf6c59325790d90fa12434128213bb0
| author | goeckslab |
|---|---|
| date | Wed, 10 Dec 2025 21:15:14 +0000 |
| parents | 4f6d716e5da2 |
| children |
line wrap: on
line source
gene_name,rank_in_cell_type,cell_type BRI3,0,1 SRSF3,1,1 IFITM3,2,1 LSM3,3,1 MYL6,4,1 AGR2,5,1 CPNE3,6,1 TOMM5,7,1 SNRPG,8,1 MORF4L2,9,1 APOE,10,1 TOMM7,11,1 RAD21,12,1 GFRA1,13,1 WBP1,14,1 CCT2,15,1 NAA20,16,1 NOP10,17,1 DHX30,18,1 HLA-DRA,19,1 KRT10,20,1 RARRES2,21,1 SRSF5,22,1 HMGA1,23,1 MT2A,24,1 POMP,25,1 TKT,26,1 TMED10,27,1 TSTD1,28,1 CNIH4,29,1 PSMD2,30,1 RABEP1,31,1 APEX1,32,1 TYROBP,33,1 BANF1,34,1 SNRPE,35,1 ACADSB,36,1 HSP90AB1,37,1 PRDX3,38,1 CSTB,39,1 CNIH4,0,2 ACADSB,1,2 TKT,2,2 HSP90AB1,3,2 RAD21,4,2 WBP1,5,2 CCT2,6,2 HMGA1,7,2 BANF1,8,2 HLA-DRA,9,2 TSTD1,10,2 PSMD2,11,2 POMP,12,2 BRI3,13,2 MT2A,14,2 MORF4L2,15,2 TOMM7,16,2 RARRES2,17,2 SNRPG,18,2 APEX1,19,2 AGR2,20,2 NAA20,21,2 NOP10,22,2 TMED10,23,2 TOMM5,24,2 KRT10,25,2 DHX30,26,2 TYROBP,27,2 PRDX3,28,2 SRSF3,29,2 SNRPE,30,2 IFITM3,31,2 RABEP1,32,2 GFRA1,33,2 LSM3,34,2 CPNE3,35,2 APOE,36,2 SRSF5,37,2 MYL6,38,2 CSTB,39,2 MT2A,0,3 WBP1,1,3 CSTB,2,3 SRSF5,3,3 NOP10,4,3 TMED10,5,3 SRSF3,6,3 DHX30,7,3 MYL6,8,3 TYROBP,9,3 TSTD1,10,3 APOE,11,3 CCT2,12,3 RAD21,13,3 CPNE3,14,3 NAA20,15,3 LSM3,16,3 ACADSB,17,3 RARRES2,18,3 RABEP1,19,3 TOMM5,20,3 SNRPE,21,3 TKT,22,3 IFITM3,23,3 PRDX3,24,3 HMGA1,25,3 HLA-DRA,26,3 POMP,27,3 HSP90AB1,28,3 KRT10,29,3 TOMM7,30,3 MORF4L2,31,3 BANF1,32,3 APEX1,33,3 AGR2,34,3 SNRPG,35,3 GFRA1,36,3 PSMD2,37,3 CNIH4,38,3 BRI3,39,3 RABEP1,0,4 PRDX3,1,4 HSP90AB1,2,4 SNRPE,3,4 TYROBP,4,4 SRSF5,5,4 RAD21,6,4 RARRES2,7,4 POMP,8,4 NAA20,9,4 TKT,10,4 MYL6,11,4 CCT2,12,4 GFRA1,13,4 SRSF3,14,4 ACADSB,15,4 NOP10,16,4 TOMM7,17,4 BANF1,18,4 HMGA1,19,4 APEX1,20,4 CSTB,21,4 TMED10,22,4 AGR2,23,4 TSTD1,24,4 HLA-DRA,25,4 CNIH4,26,4 TOMM5,27,4 MORF4L2,28,4 PSMD2,29,4 KRT10,30,4 IFITM3,31,4 LSM3,32,4 DHX30,33,4 MT2A,34,4 WBP1,35,4 CPNE3,36,4 SNRPG,37,4 APOE,38,4 BRI3,39,4 APEX1,0,5 CPNE3,1,5 CNIH4,2,5 CSTB,3,5 BANF1,4,5 HLA-DRA,5,5 TOMM5,6,5 MT2A,7,5 MYL6,8,5 KRT10,9,5 SNRPE,10,5 TMED10,11,5 POMP,12,5 AGR2,13,5 MORF4L2,14,5 LSM3,15,5 PRDX3,16,5 APOE,17,5 HSP90AB1,18,5 TYROBP,19,5 HMGA1,20,5 NOP10,21,5 DHX30,22,5 CCT2,23,5 SRSF3,24,5 SNRPG,25,5 PSMD2,26,5 TSTD1,27,5 GFRA1,28,5 RABEP1,29,5 WBP1,30,5 TOMM7,31,5 IFITM3,32,5 TKT,33,5 NAA20,34,5 ACADSB,35,5 RAD21,36,5 RARRES2,37,5 BRI3,38,5 SRSF5,39,5 PSMD2,0,6 GFRA1,1,6 DHX30,2,6 SNRPG,3,6 KRT10,4,6 IFITM3,5,6 APOE,6,6 SNRPE,7,6 LSM3,8,6 SRSF5,9,6 AGR2,10,6 ACADSB,11,6 TKT,12,6 RARRES2,13,6 HLA-DRA,14,6 HMGA1,15,6 TYROBP,16,6 PRDX3,17,6 NAA20,18,6 BRI3,19,6 TOMM7,20,6 TSTD1,21,6 BANF1,22,6 RABEP1,23,6 POMP,24,6 MORF4L2,25,6 CPNE3,26,6 APEX1,27,6 TOMM5,28,6 CSTB,29,6 TMED10,30,6 NOP10,31,6 RAD21,32,6 WBP1,33,6 MYL6,34,6 CCT2,35,6 HSP90AB1,36,6 SRSF3,37,6 CNIH4,38,6 MT2A,39,6
