Mercurial > repos > iuc > gecko

comparison test-data/hyopneumoniae_16S-flocculare_16S.txt @ 0:09459f6ffe08 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/gecko commit f0c70444d9781900f0af1638792818543c65acfc"
author iuc
date Fri, 27 Nov 2020 14:46:27 +0000
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:09459f6ffe08
1 >Y00149.1 Mycoplasma hyopneumoniae 16S rRNA gene ALIGNED WITH >GU227405.1 Mycoplasma flocculare strain USP20N 16S ribosomal RNA gene, partial sequence LENGTH: 1224 IDENT: 1195 STRAND: f @(219, 193)
2 X: AAGCTTCACCAAGAAATGGGGGTGCGCAACATTAGTTAGTTGGTAGGGTAAAAGCCTACCAAGACGATGA
3 ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
4 Y: AAGCTCCACCAAAAAATGGGGGTGCGCAACATTAGTTAGTTGGTAGGGTAAAGGCCTACCAAGACGATGA
5
6 X: TGTTTAGCGGGGCCAAGAGGTTGTACCGCCACACTGGGATTGAGATACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGC
7 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 Y: TGTTTAGCGGGGCCAAGAGGTTGTACCGCCACACTGGGATTGAGATACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGC
9
10 X: AGCAGTAAGGAATATTCCACAATAAGCGAAAGCTTGATGGAGCGACACAGCGTGCAGGATGAAGTCTTTC
11 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 Y: AGCAGTAAGGAATATTCCACAATGAGCGAAAGCTTGATGGAGCGACACAGCGTGCAGGATGAAGTCTTTA
13
14 X: GGGATGTAAACTGCTGTTGTAAGGGAAGAAAAAACTAGATAGGAAATGCTCTAGTCTTGACGGTACCTTA
15 || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||
16 Y: GGTATGTAAACTGCTGTTGTAAGGGAAGAAAAAATTAGGTAGGAAATGATCTAATCTTGACGGTACCTTA
17
18 X: TTAGAAAGCGACGGCAAACTATGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACATAGGTCGCAAGCGTTATCCGGAATT
19 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
20 Y: CTAGAAAGCGACGGCAAACTATGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACATAGGTCGCAAGCGTTATCCGGAATT
21
22 X: ATTGGGCGTAAAGCGTCCGTAGGTTTTTTGTTAAGTTTAAAGTTAAATGCTAAAGCTCAACTTTAGTCCG
23 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
24 Y: ATTGGGCGTAAAGCGTTCGTAGGTTTTTTGTTAAGTTTAAGGTTAAATGCTAAAGCTCAACTTTAGTCCG
25
26 X: CTTTAGATACTGGCAAAATAGAATTATGAAGAGGTTAGCGGAATTCCTAGTGGAGTGGTGGAATACGTAG
27 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
28 Y: CTTTAGATACTGGCAAAATAGAATTATGAAGAGGTTAGCGGAATTCCTAGTGGAGTGGTGGAATACGTAG
29
30 X: ATATTAGGAAGAACACCAATAGGCGAAGGCAGCTAACTGGTCATATATTGACACTAAGGGACGAAAGCGT
31 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
32 Y: ATATTAGGAAGAACACCAATAGGCGAAGGCAGCTAACTGGTCATATATTGACACTGAGGGACGAAAGCGT
33
34 X: GGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATCATTAGTTGGTGGCAAAAG
35 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
36 Y: CGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATCATTAGTTGGTGGCAGAAG
37
38 X: TCACTAACACAGCTAACGCGTTAAATGATCCGCCTGAGTAGTATGCTCGCAAGAGTGAAACTTAAAGGAA
39 |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
40 Y: TCACTAGCGCAGCTAACGCGTTAAATGATCCGCCTGAGTAGTATGCTCGCAAGAGTGAAACTTAAAGGAA
41
42 X: TTGACGGGAACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTTGAAGATACGCGTAGAACCTTACCCACT
43 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
44 Y: TTGACGGGAACCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTTGATGATACGCGTAGAACCTTACCCACT
45
46 X: CTTGACATTCTCGCAAAACTATAGAGATATAGCCGAGGCTAACGAGATCACAGATGGTGCATGGTTGTCG
47 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
48 Y: CTTGACATTCTCGCAAAACTATAGAGATATAGCGGAGGCTAACGAGATTACAGATGGTGCATGGTTGTCG
49
50 X: TCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTAGGTTAAGTCCTGCAACGAGCGCAACCCTTTTCTTTAGTTGCTAACAT
51 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
52 Y: TCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTAGGTTAAGTCCTGCAACGAGCGCAACCCTTTTCTTTAGTTGCTAACAT
53
54 X: TTAGTTGAGAACCCTAAAGATACTGCCGGCGCAAGCCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAATCATCATG
55 | |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
56 Y: TAAGTTGAGAACCCTAGAGATACTGCCGGTGTAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATG
57
58 X: CCTCTTACGAGTGGGGCAACACACGTGCTACAATGGCTACTACAAAGAGCAGCAAAACAGTGATGTCAAG
59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
60 Y: CCTCTTACGAGTGGGGCAACACACGTGCTACAATGGCTACTACAAAGAGCAGCAAAACAGTGATGTCAAG
61
62 X: CTAATCTCAAAAAAGTAGTCTCAGTTCGGATTGAAGTCTGCAACTCGACTTCATGAAGTCGGAATCGCTA
63 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
64 Y: CTAATCTCAAAAAAGTAGTCTCAGTTCGGATTGAAGTCTGCAACTCGACTTCATGAAGTCGGAATCGCTA
65
66 X: GTAATCGCAGGTCAGCTATACTGCGGTGAATACGTTCTCGGGTTTTGTACACACCGCCCGTCACACCATG
67 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
68 Y: GTAATCGCAGGTCAGCTATACTGCGGTGAATACGTTCTCGGGTTTTGTACACACCGCCCGTCACACCATG
69
70 X: GGAGTTGGTAATGCCCAAAGTCGGTGAGTTAACT
71 ||||||||||||||||||||||||||||| | ||
72 Y: GGAGTTGGTAATGCCCAAAGTCGGTGAGTAACCT
73
74
75 >Y00149.1 Mycoplasma hyopneumoniae 16S rRNA gene ALIGNED WITH >GU227405.1 Mycoplasma flocculare strain USP20N 16S ribosomal RNA gene, partial sequence LENGTH: 121 IDENT: 113 STRAND: f @(94, 66)
76 X: TTTAGTAGCAAATGGGTGAGTAACACGTACCTAACCTACCTTTTGGACTGGGATAACCATTGGAAACAGT
77 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
78 Y: TTTAGTAGCAAATGGGTGAGTAACACGTACCTAACCTACCTTTTGGACCGGGATAACCATTGGAAACAGT
79
80 X: GGCTAATACCAGATATGATAAAAATTTGCATGAATTTTTATTCAAAGGAGC
81 |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||
82 Y: GGCTAATACCGGATATCATAAAAATTCATATGAATTTTTATGAAAAGGAGC
83
84
85 >Y00149.1 Mycoplasma hyopneumoniae 16S rRNA gene ALIGNED WITH >GU227405.1 Mycoplasma flocculare strain USP20N 16S ribosomal RNA gene, partial sequence LENGTH: 23 IDENT: 22 STRAND: f @(53, 17)
86 X: ATACATGCATGTTGAACGGAATA
87 ||||||||||||||||||| |||
88 Y: ATACATGCATGTTGAACGGGATA
89
90
91 >Y00149.1 Mycoplasma hyopneumoniae 16S rRNA gene ALIGNED WITH >GU227405.1 Mycoplasma flocculare strain USP20N 16S ribosomal RNA gene, partial sequence LENGTH: 24 IDENT: 21 STRAND: r @(181, 1271)
92 X: ATAAAAATTTGCATGAATTTTTAT
93 ||||||||| ||||||||||||
94 Y: ATAAAAATTCATATGAATTTTTAT
95
96