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file CTCF_peaks_first.txt 9035 -rw-r--r--
file CTCF_peaks_second.txt 6006 -rw-r--r--
file CTCF_peaks_shifted.bed 2009 -rw-r--r--
file CTCF_peaks_third.txt 9454 -rw-r--r--
file all_fasta.loc 231 -rw-r--r--
file annotations_default.txt 7618 -rw-r--r--
file annotations_default_simplified.txt 5768 -rw-r--r--
file annotations_default_stats.txt 329 -rw-r--r--
file annotations_exon_start.txt 7244 -rw-r--r--
file annotations_exon_start_stats.txt 300 -rw-r--r--
file annotations_small_TSSTTS.txt 11081 -rw-r--r--
file annotations_small_TSSTTS_stats.txt 330 -rw-r--r--
file chr2_subset.fa.gz 416684 -rw-r--r--
file fake_phix_peaks.bed 18 -rw-r--r--
file fake_phix_peaks.subset.bed 36 -rw-r--r--
file generate_tests.sh 4508 -rw-r--r--
file phiX174.fasta 5473 -rw-r--r--
file phiX_nothing.txt 339 -rw-r--r--
file phiXcpg.txt 390 -rw-r--r--
file scanMotif_res1.bed 58 -rw-r--r--
file scanMotif_res1.txt 101 -rw-r--r--
file small.gtf 115259 -rw-r--r--
file small_simplified.gtf 65658 -rw-r--r--