Mercurial > repos > iuc > mothur_get_communitytype

changeset 1:d7f03792fa5f draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/mothur commit 721531d2e9fd1e208a3fba8cfbe5dcd572599ca2
author iuc
date Tue, 05 Sep 2017 17:11:06 -0400
parents e86199dc2a7c
children 92b64ed4e08b
files test-data/test_forward.fastq test-data/test_reverse.fastq
diffstat 2 files changed, 40 insertions(+), 0 deletions(-) [+]
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/test_forward.fastq	Tue Sep 05 17:11:06 2017 -0400
@@ -0,0 +1,20 @@
+@M00967:43:000000000-A3JHG:1:1101:18327:1699 1:N:0:188
+NACGGAGGATGCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGTAGGCGGCCTGCCAAGTCAGCGGTAAAATTGCGGGGCTCAACCCCGTACAGCCGTTGAAACTGCCGGGCTCGAGTGGGCGAGAAGTATGCGGAATGCGTGGTGTAGCGGTGAAATGCATAGATATCACGCAGAACCCCGATTGCGAAGGCAGCATACCGGCGCCCTACTGACGCTGAGGCACGAAAGTGCGGGGATCAAACAG
++
+#>>AABABBFFFGGGGGGGGGGGGGGGGHHHHHHHGGGHHHHHGHGGGGGGGHGGGGGGHHHHHHHHHHGGGGGHHHHGHGGGGGGHHBGHGDGGGGGHHHGGGGHHHHHHHHGGGGGHG@DHHGHEGGGGGGBFGGEGGGGGGGG.DFEFFFFFFFDCFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFDFDFFFEFFCFF?FDFFFFFFFFAFFFFFFFFFFFBDDFFFFFEFADFFFFFBAFFFA?EFFFBFF
+@M00967:43:000000000-A3JHG:1:1101:14069:1827 1:N:0:188
+TACGGAGGATGCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGTAGGCGGCCTGCCAAGTCAGCGGTAAAATTGCGGGGCTCAACCCCGTACAGCCGTTGAAACTGCCGGGCTCGAGTGGGCGAGAAGTATGCGGAATGCGTGGTGTAGCGGTGAAATGCATAGATATCACGCAGAACCCCGATTGCGAAGGCAGCATACCGGCGCCCTACTGACGCTGAGGCACGAAAGTGCGGGGATCAAACAG
++
+3AA?ABBDBFFBEGGEGGGGAFFGGGGGHHHCGGGGGGHFGHGGCFDEFGGGHGGGEGF1GGFGHHHHHGGEGGHHHHHFGGGGGGHHHHHGGGGCDDGHHGGGFHHHHHHHHCD@CCHGGGGHEHGGG@GFGGGGGGG@BGGGEGCEBFFFBFFB;9@EFFFEFFFFFFFFFFFFAFBBBFFFFFBBBFFFFBBBFFFFFFFFFFFBBBBBBBFFFFFFFFFDDFAFFFFF.AF9/FBBBBB.EAFFE?F
+@M00967:43:000000000-A3JHG:1:1101:18044:1900 1:N:0:188
+TACGGAGGATGCGAGCGTTGTCCGGAATCACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGTTTAATAAGTCAGTGGTGAAAACTGAGGGCTCAACCCTCAGCCTGCCACTGATACTGTTAGACTTGAGTATGGAAGAGGAGAATGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGATTCTCTGGGCCAAGACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACA
++
+BA@BBBABBFFFGGGGGGGGGGHGGGGGHHHHGHHHGGGGHHHGGGGGGGGGHGGGGGGFHFHHHFHHHHHHGFHHHHHHFHGGFGHHGGHGGHHFHHHHHHHHHHHHHHGHHHGHDHHHHHHHHHGHDGFFHHHDHHHHHHHHHHHHFHHHDGHHGGGGGHHHHHGGGGEGGGGGBF0BGGGGGGGGFFFGGGDGFFFFBCFBFFBFFBEEFFEFFFFFFFFBDA9EEFFF>DFFFFDDFFFADDFFFF.
+@M00967:43:000000000-A3JHG:1:1101:13234:1983 1:N:0:188
+TACGGAGGATGCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGCAGGCGGAAGATCAAGTCAGCGGTAAAATTGAGAGGCTCAACCTCTTCGAGCCGTTGAAACTGGTTTTCTTGAGTGAGCGAGAAGTATGCGGAATGCGTGGTGTAGCGGTGAAATGCATAGATATCACGCAGAACTCCGATTGCGAAGGCAGCATACCGGCGCTCAACTGACGCTCATGCACGAAAGTGTGGGTATCGAACAG
++
+BCBCCCCCCFFFGGGGGGGGGGHGGGGGHHHHHHHGGGHHHHHGHGGGGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHGGGGGHHHHHHHHHGGHHHHHHHHGHHHGHGGGGGGHHHHHHHGHHGHHHGHHHHHHHGGGGGHHHHHHGGGGGHHGGGGHGHHHHGGGGGGGGGGGGGGGGGGFGGGGGGGGGGGGGFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFAFFFFFFFFAFFFFFFFFFFFFFFBFFFFFFFFFFEFFFF
+@M00967:43:000000000-A3JHG:1:1101:16780:2259 1:N:0:188
+TACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGATTTACTGGGTGTAAAGGGCGTGTAGGCGGGGACGCAAGTCAGATGTGAAAACCACGGGCTCAACCTGTGGCCTGCATTTGAAACTGTGTTTCTTGAGTACTGGAGAGGCAGACGGAATTCCTAGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATTAGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGTCTGCTGGACAGCAACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACG
++
+BBCCBFFCDFCFGGGGGGGGGGHGGGGGHHHHHHHHGGHFHHHGGGEGGHHHGGGGGGGEFGGGHHHHFHHHHGHHHHG/FGGGFGHFHHHGA?CGEHGGGHGHHFBGHHHGGHHHHDGHHFHFHHHHHEC0DDDEDAFFDDEGHHHHHEHHHHHEGGAFFGGGGBDGGGGGGFFFGGFFG.FFFFFFFFFFFFFFFDEFF@=FFFFFF.AFFEFFFFFFFDFFFBFF.:;F-@FFBDAFAAC.;9?FFE.
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/test_reverse.fastq	Tue Sep 05 17:11:06 2017 -0400
@@ -0,0 +1,20 @@
+@M00967:43:000000000-A3JHG:1:1101:18327:1699 2:N:0:188
+CCTGTTTGATCCCCGCACTTTCGTGCCTCAGCGTCAGTAGGGCGCCGGTATGCTGCCTTCGCAATCGGGGTTCTGCGTGATATCTATGCATTTCACCGCTACACCACGCATTCCGCATACTTCTCGCCCACTCGAGCCCGGCAGTTTCAACGGCTGTACGGGGTTGAGCCCCGCAATTTTACCGCTGACTTGGCAGGCCGCCTACGCACCCTTTAAACCCAATAAATCCGGATAACGCCCGCCTCCTCCGT
++
+BABBBFFFFFFFFGEGGGGGGGGHGGHHHHHGGGGGGHHHGGHGGGGGGEGHHGHHHHHHHG11EHEGCGGGHHHHGFGEHHHHGHHHHHHHHHFHHGGGCGHHHHHGGGGGGFHG@EGHHHHHHGFGGGGGGAGDGGGGGGFGHHGHHECDGGGGFGGGDFG:D-FFGGGGFCFBDFBFFFF.;--.BBFFFF/9B.;>-@DDF.-9B@DFFF/FFF/AFAB/B/B/FFF.AAFBA--@=F-.AA.;B..
+@M00967:43:000000000-A3JHG:1:1101:14069:1827 2:N:0:188
+CCTGTTTGATCCCCGCACTTTCGTGCCTCAGCGTCAGTAGGGCGCCGGTATGCTGCCTTCGCAATCGGGGTTCTGCGTGATATCTATGCATTTCACCGCTACACCACGCATTCCGCATACTTCTCGCCCACTCGAGCCCGGCAGTTTCAACGGCTGTACGGGGTTGAGCCCCGCAATTTTACCGCTGACTTGGCAGGCCGCCTACGCACCCTTTAAACCCAATAAATCCGGGTAAAGCTCGCATCCTCCGG
++
+BABBBFFFFFFFGGGGGGGGGGGHGGHHHHHHGGGGGHHHHFHGGGGGGFGHHGHHHHGHGGGGGHGGCGGGHHHHGGGDBGHHHFHHHHHHGHHHHGGGGGHHHEHGGGGGHHHGGGGHGHHHHGGGGGGHHEHGGGGG@FCCGHHHHGHGGGAGFBCEFGGGADGFGFGGFF;ADFFFFFBDFA>.BFFEFFFFFAFF;D..FFAA;BFEFFBBFFFF?EFFFFB/FDC-99B9FB/;AF-ABFFFF.-
+@M00967:43:000000000-A3JHG:1:1101:18044:1900 2:N:0:188
+CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAGCGTCAGTCTTGGCCCAGAGAATCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCTAATATCTACGCATTTCACCGCTACACTAGGAATTCCATTCTCCTCTTCCATACTCAAGTCTAACAGTATCAGTGGCAGGCTGAGGGTTGAGCCCTCAGTTTTCACCACTGACTTATTAAACCGCCTACGCGCCCTTTAAGCCCAGTGATTCCGGACAAAGCCCGCCTCCCCCG
++
+>AAABFFFFFFFGGGGGGGGGGGGGGGGGGHGGGGGGHHGHGGCEGEGGGHHFHFGGGGHHGGGGBFHHGHGGHGHGHEHH4FHHHGGGGGGHHHFHGGGGGHH3FHGFGGHHHFFHDFHFHHHHHHHFHHHHDFG2FFFHHHHFHHHHHGHHGHGG/000<CDDHC01<CE/<.C=DDGDDGHBC/CCGHBCGF00CGB-;:E.CFGAAFG?CF009:9E..;//BB/:/9.9-.::B.9---9:..9D-
+@M00967:43:000000000-A3JHG:1:1101:13234:1983 2:N:0:188
+CCTGTTCGATACCCACACTTTCGTGCATGAGCGTCAGTTGAGCGCCGGTATGCTGCCTTCGCAATCGGAGTTCTGCGTGATATCTATGCATTTCACCGCTACACCACGCATTCCGCATACTTCTCGCTCACTCAAGAAAACCAGTTTCAACGGCTCGAAGAGGTTGAGCCTCTCAATTTTACCGCTGCCTTGATCTTCCGCCTGCGCCCCCTTTAAACCCAATAAATCCGGATAACGCTCGCATCCTCCGT
++
+ABBBBFFBBFBBGGGGGGGGGGGHGGHGGHHHGGGGGHHHHHHGGGGGGGGHHHHHHHHHHGGGGHGGGGGHHGHHGGGGHHHHHGHHHHHHHHHHHGGGGGHHHHGGGGGGHHHGGGGHHHHFHGGGHGHHGHHHHHHHHDGHGHHHFHHGGGFDC<C.AGHC/C/C0GG//:GBB0CF9009??-..9;/0;;B90;.;D.C.B9.:-@-:F/BF//;EE./;::/9.@.A.B:.9.9;-999B99/.;
+@M00967:43:000000000-A3JHG:1:1101:16780:2259 2:N:0:188
+CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAGCGTCAGTTGCTGTCCAGCAGACCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCTAATATCTACGCATTTCACCGCTACACTAGGAATTCCGTCTGCCTCTCCAGTACTCAAGAAACACAGTTTCAAATGCAGGCCACAGGTTGAGCCCGTGGTTTTCACATCTGACTTGCGTCCCCGCCTACACGCCCTTTACACCCAGTAAATCCGGATAACGCTTGCCACCTACG
++
+>AABAFFFFFFFGGGGGGGGGGGGGGGGGHHHGGGGGGHHHGFHHHHHHHHBGHGGGGGHHGGGGFHHFHHEFHHHHHEHHFHHHFFGGGGGHHFHHGGGGGFHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHFHHHHHHHHHEHHHHHHHHHHHGGGHHHHGGGGHGFHHHFG<CFHGGCDC.EHGHHGFHHGG0CGHHHCD@BFGF?B?DGGGDCEFFFFFFFFB?EFFFF/BFFD;?FFFBD=AEEFB/FFFFF?