diff test-data/test.gfa1 @ 0:575b4d5bd444 draft

"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/salsa2 commit 67cd735c6709a56ad1c4d65cd84e38fccd59603b"
author iuc
date Sun, 17 Jan 2021 13:24:22 +0000
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/test.gfa1	Sun Jan 17 13:24:22 2021 +0000
@@ -0,0 +1,137 @@
+# Downloaded from https://github.com/sjackman/gfalint/blob/master/examples/big1.gfa
+H	VN:Z:1.0
+S	3	*	LN:i:5376	KC:i:485841
+S	5	*	LN:i:124	KC:i:6306
+S	7	*	LN:i:3602	KC:i:327981
+S	8	*	LN:i:52	KC:i:2218
+S	9	*	LN:i:48	KC:i:154
+S	10	*	LN:i:144	KC:i:4604
+S	11	*	LN:i:6491	KC:i:611916
+S	13	*	LN:i:10648	KC:i:1023627
+S	14	*	LN:i:48	KC:i:16
+S	15	*	LN:i:5930	KC:i:599587
+S	17	*	LN:i:9404	KC:i:991226
+S	18	*	LN:i:2206	KC:i:240150
+S	19	*	LN:i:893	KC:i:82277
+S	20	*	LN:i:12201	KC:i:1351219
+S	21	*	LN:i:49	KC:i:300
+S	22	*	LN:i:11669	KC:i:1131776
+S	23	*	LN:i:7665	KC:i:766424
+S	27	*	LN:i:48	KC:i:35
+S	28	*	LN:i:1597	KC:i:142681
+S	30	*	LN:i:48	KC:i:7874
+S	31	*	LN:i:94	KC:i:805
+S	32	*	LN:i:3065	KC:i:275287
+S	33	*	LN:i:70	KC:i:5123
+S	34	*	LN:i:49	KC:i:23
+S	36	*	LN:i:12335	KC:i:1315304
+S	37	*	LN:i:130	KC:i:5258
+S	38	*	LN:i:4516	KC:i:440430
+S	39	*	LN:i:59	KC:i:4094
+S	41	*	LN:i:215	KC:i:11423
+S	42	*	LN:i:146	KC:i:3161
+S	43	*	LN:i:50	KC:i:563
+S	44	*	LN:i:3913	KC:i:434585
+S	46	*	LN:i:2710	KC:i:268203
+S	47	*	LN:i:49	KC:i:200
+S	49	*	LN:i:61	KC:i:3442
+S	50	*	LN:i:5010	KC:i:532820
+S	51	*	LN:i:9644	KC:i:950549
+S	52	*	LN:i:417	KC:i:16750
+S	54	*	LN:i:50	KC:i:600
+S	55	*	LN:i:69	KC:i:11532
+S	56	*	LN:i:1550	KC:i:141042
+S	57	*	LN:i:346	KC:i:12512
+S	58	*	LN:i:3825	KC:i:349334
+S	59	*	LN:i:11508	KC:i:1237494
+S	60	*	LN:i:720	KC:i:72448
+S	61	*	LN:i:1086	KC:i:83405
+S	62	*	LN:i:4818	KC:i:464490
+S	63	*	LN:i:8207	KC:i:822244
+S	65	*	LN:i:67	KC:i:2088
+S	66	*	LN:i:4375	KC:i:421128
+S	67	*	LN:i:5063	KC:i:530425
+S	68	*	LN:i:78	KC:i:10057
+S	69	*	LN:i:10204	KC:i:1039066
+S	71	*	LN:i:789	KC:i:65350
+S	72	*	LN:i:95	KC:i:6170
+S	73	*	LN:i:48	KC:i:14
+S	76	*	LN:i:54	KC:i:1373
+S	77	*	LN:i:4167	KC:i:460259
+S	78	*	LN:i:49	KC:i:925
+S	79	*	LN:i:95	KC:i:5402
+S	83	*	LN:i:15015	KC:i:1487985
+S	84	*	LN:i:9811	KC:i:1021233
+S	85	*	LN:i:3483	KC:i:365113
+S	86	*	LN:i:7953	KC:i:722908
+L	3	+	65	-	47M
+L	3	-	76	-	47M
+L	5	+	47	-	47M
+L	5	-	22	-	47M
+L	5	-	32	+	47M
+L	7	+	49	-	47M
+L	8	+	33	-	47M
+L	8	+	55	-	36M
+L	8	-	78	+	47M
+L	8	-	79	+	47M
+L	9	+	37	-	47M
+L	9	+	47	+	46M
+L	9	-	67	-	47M
+L	9	-	69	-	47M
+L	10	+	47	+	47M
+L	11	-	43	-	47M
+L	14	+	30	+	47M
+L	14	+	31	+	47M
+L	14	+	73	-	47M
+L	17	+	21	-	47M
+L	18	+	78	-	47M
+L	19	+	76	+	47M
+L	19	-	76	-	47M
+L	20	-	76	+	47M
+L	21	+	51	-	47M
+L	21	-	32	-	47M
+L	21	-	66	+	47M
+L	22	+	63	+	47M
+L	23	+	68	-	47M
+L	27	+	30	+	47M
+L	27	+	31	+	47M
+L	27	+	73	-	47M
+L	27	-	31	-	47M
+L	27	-	83	+	47M
+L	28	+	43	+	47M
+L	30	+	30	+	47M
+L	30	+	31	+	47M
+L	30	+	73	-	47M
+L	30	-	34	-	47M
+L	31	-	34	-	47M
+L	32	-	63	+	47M
+L	33	+	72	-	47M
+L	33	-	44	-	47M
+L	33	-	55	-	16M
+L	34	+	73	-	47M
+L	36	-	63	-	47M
+L	36	-	85	+	47M
+L	37	-	49	+	47M
+L	39	+	56	+	47M
+L	39	+	67	+	47M
+L	39	-	71	-	47M
+L	39	-	65	+	14M
+L	41	+	43	+	47M
+L	42	+	65	-	47M
+L	43	+	60	+	47M
+L	47	+	59	+	47M
+L	49	+	71	+	47M
+L	49	-	84	+	47M
+L	52	-	65	+	47M
+L	54	+	77	-	47M
+L	54	+	54	+	46M
+L	54	-	58	-	47M
+L	55	+	72	-	36M
+L	55	-	79	-	47M
+L	55	-	78	-	44M
+L	57	+	63	-	47M
+L	57	+	85	+	47M
+L	61	+	68	+	47M
+L	68	+	68	+	26M
+L	72	-	78	+	47M
+L	72	-	79	+	47M