Mercurial > repos > pablocarb > synbiodesign

changeset 7:e328a5f60135 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
planemo upload commit 6a252d04f4b2f79606ab6679b6a91f957e33da7b-dirty
author pablocarb
date Thu, 02 May 2019 09:27:23 -0400
parents 93eb36300900
children 6572347b3e1a
files optbiodes.xml out1.csv
diffstat 2 files changed, 129 insertions(+), 129 deletions(-) [+]
line wrap: on
line diff
--- a/optbiodes.xml	Thu May 02 07:53:12 2019 -0400
+++ b/optbiodes.xml	Thu May 02 09:27:23 2019 -0400
@@ -7,7 +7,7 @@
         python $__tool_directory__/toolOptBioDes.py $input1 $input2 $output1 $output2 -server $server
     ]]></command>
     <inputs>
-        <param type="data" name="input1" format="xlsx" />
+        <param type="data" name="input1" format="txt" />
         <param type="integer" name="input2" value="48" label="Library size" help="Library size" />
     	<param name="server" type="text" label="OptBioDes RES server" value="http://doe.synbiochem.co.uk/REST" help="OptBioDes REST server" />
     </inputs>
--- a/out1.csv	Thu May 02 07:53:12 2019 -0400
+++ b/out1.csv	Thu May 02 09:27:23 2019 -0400
@@ -1,129 +1,129 @@
 promoter3,promoter5,promoter7,promoter9,gene10,promoter11,pos
-1,3,2,0,1,3,8
-0,3,1,0,0,2,17
-0,2,1,0,0,2,18
-1,2,1,0,1,3,16
-0,0,1,0,0,1,14
-0,2,1,2,1,1,8
-0,2,0,3,1,1,17
-1,1,3,3,0,3,6
-0,3,3,1,0,1,12
-1,0,0,0,1,1,6
-0,3,0,1,1,0,13
-1,3,3,3,1,3,1
-1,0,3,0,0,0,8
-0,0,2,1,0,2,3
-0,2,0,1,0,2,12
-1,3,2,1,0,2,10
-0,0,3,2,0,1,10
-0,2,3,1,1,3,17
-1,0,1,3,1,2,11
-0,0,3,2,1,3,0
-0,1,0,0,1,3,0
-1,3,0,2,0,0,14
-1,0,1,0,0,2,17
-0,1,3,2,1,2,14
-1,2,2,0,0,1,9
-0,1,2,1,1,0,11
-0,1,1,2,1,0,9
-1,1,1,1,0,1,13
-0,0,3,1,1,1,9
-0,0,3,1,1,0,19
-1,1,2,1,1,3,16
-1,3,1,1,1,1,15
-0,2,2,3,0,3,11
-0,3,3,3,1,1,2
-0,1,1,3,1,0,18
-1,1,0,2,0,3,17
-1,2,1,2,1,2,1
-1,0,0,0,0,2,2
-0,0,1,3,0,3,8
-0,2,2,3,1,1,14
-0,2,2,2,1,0,2
-0,0,1,1,0,2,0
-0,0,3,3,0,2,15
-1,2,0,1,1,2,7
-0,2,2,0,1,0,15
-1,3,0,3,1,1,4
-1,2,0,3,1,0,18
-1,2,1,1,1,3,10
-0,2,1,1,0,3,2
-0,0,1,2,0,0,4
-0,3,0,2,0,2,16
-0,3,1,3,1,0,9
-0,3,3,2,1,2,16
-1,2,3,2,1,0,5
-0,2,3,3,0,2,9
-0,1,1,3,0,0,16
-0,3,0,1,1,0,6
-0,1,3,0,1,1,2
-1,0,0,3,1,0,13
-0,2,2,0,0,1,19
-0,0,2,1,1,1,18
-0,0,2,2,0,0,5
-0,3,2,1,0,1,1
-1,3,1,2,0,1,11
-1,1,2,2,0,1,19
-1,0,0,3,1,2,7
-0,2,2,2,0,2,6
-1,0,0,3,0,0,12
-0,0,2,0,1,3,1
-0,3,2,2,1,2,13
-0,2,3,0,0,3,13
-1,3,1,2,1,3,3
-1,0,2,2,1,0,17
-1,2,0,3,0,1,0
-1,2,2,2,1,3,12
-1,3,1,1,0,3,7
-1,0,2,1,1,2,4
-1,0,3,2,1,3,10
-0,3,0,1,1,3,14
-1,2,3,0,1,0,3
-1,2,3,1,0,0,11
-1,1,3,0,0,2,4
-0,1,1,0,0,0,1
-1,2,1,1,0,3,6
-1,2,1,2,1,2,0
-0,3,2,3,0,3,4
-1,3,0,0,1,2,9
-1,3,3,3,0,2,19
-0,1,2,3,0,0,7
-0,1,0,2,0,3,3
-1,1,2,3,0,3,15
-0,3,3,0,1,1,7
-1,3,2,0,0,0,0
-1,1,2,2,1,2,2
-1,2,3,3,0,1,3
-1,1,1,0,1,1,12
-1,0,1,1,0,0,2
-0,2,0,2,1,1,4
-1,0,2,3,0,1,16
-1,3,3,2,0,0,6
-0,0,1,2,0,1,7
-0,1,1,3,1,2,12
-1,3,1,0,1,0,19
-1,0,3,3,0,3,13
-1,1,2,1,0,1,5
-0,3,3,0,0,3,18
-1,3,2,2,0,1,18
-1,1,0,2,0,3,9
-0,1,1,3,1,1,10
-0,2,0,0,0,0,10
-1,1,0,2,0,1,1
-0,3,0,0,0,2,5
-0,1,2,0,1,2,3
-0,1,0,1,0,0,8
-1,2,3,1,0,0,14
-1,0,0,0,1,1,11
-0,1,0,0,0,3,11
-1,1,3,0,1,0,15
-0,3,1,3,1,3,5
-1,1,3,1,1,2,8
-1,3,2,3,0,0,10
-0,1,2,3,1,2,6
-0,0,0,2,0,3,15
-1,0,2,0,1,3,14
-1,1,3,1,0,2,18
-1,1,0,1,1,1,5
-0,0,0,1,1,3,19
-1,2,0,3,0,2,19
+1,3,2,2,1,0,0
+0,1,2,0,0,2,15
+1,0,3,3,0,1,16
+0,2,1,2,1,3,13
+1,2,2,0,1,2,7
+1,0,1,1,0,0,15
+0,1,0,1,1,2,19
+0,0,3,2,0,3,6
+1,3,3,1,0,2,7
+1,2,2,1,0,0,10
+0,3,3,0,1,3,11
+0,3,2,3,0,0,18
+1,1,0,3,1,1,6
+0,1,3,2,1,1,1
+0,3,3,0,0,0,5
+1,3,0,3,1,2,0
+1,2,3,2,0,2,11
+0,3,0,2,0,2,2
+1,1,1,2,0,3,18
+1,3,0,1,1,2,10
+1,3,0,0,0,3,4
+0,2,1,3,0,3,7
+0,2,3,1,1,1,14
+1,2,2,0,1,3,2
+0,2,1,3,0,2,6
+1,2,0,1,0,1,11
+1,2,1,3,1,2,3
+1,3,2,2,0,1,14
+0,2,2,2,0,2,17
+0,1,3,3,1,2,5
+0,3,1,1,0,1,17
+1,3,2,1,0,0,5
+1,1,1,2,1,3,8
+1,1,2,2,0,2,13
+0,1,3,1,1,2,14
+1,2,3,0,0,2,2
+0,1,2,2,0,0,17
+1,1,0,0,1,0,7
+0,0,2,1,0,2,16
+1,1,3,1,1,0,3
+0,0,0,1,1,0,19
+1,0,2,2,1,1,7
+0,2,3,0,0,3,0
+1,2,2,1,0,2,0
+0,0,1,0,0,2,3
+0,3,1,3,1,1,7
+1,3,1,0,0,2,13
+0,0,3,0,1,0,10
+1,2,3,1,0,1,9
+0,2,0,3,0,3,3
+1,3,3,3,1,3,8
+1,0,2,3,0,2,8
+0,1,3,2,0,3,0
+1,3,1,1,1,3,6
+0,2,1,2,1,0,12
+1,1,1,1,0,3,5
+0,1,2,3,0,0,9
+0,3,3,3,1,0,13
+0,3,2,2,1,3,9
+0,1,0,1,0,3,7
+1,1,1,1,1,1,0
+1,0,0,0,0,3,13
+0,2,1,0,0,1,8
+1,3,3,1,0,3,18
+0,3,0,2,0,1,3
+0,0,2,1,0,3,4
+0,2,2,0,1,1,19
+1,0,2,2,1,1,18
+0,0,0,1,1,1,13
+1,1,0,0,0,1,12
+0,0,3,3,1,2,15
+0,1,3,1,1,2,8
+0,0,2,3,1,0,11
+1,2,3,2,1,0,15
+0,2,0,2,1,0,12
+1,1,1,2,0,0,19
+1,3,3,0,0,1,9
+0,3,2,0,1,3,15
+0,0,0,0,1,2,18
+0,1,2,1,0,1,6
+1,0,1,0,1,0,9
+1,3,3,0,0,0,3
+0,0,0,2,0,0,8
+1,1,1,0,1,2,17
+0,2,2,3,0,3,1
+0,1,1,3,1,3,2
+0,2,0,1,1,2,9
+0,3,1,3,0,0,4
+0,1,3,3,0,1,13
+1,0,3,2,0,3,19
+0,1,0,0,1,3,16
+1,0,1,3,0,2,12
+1,2,0,1,1,3,1
+1,1,3,2,1,2,4
+1,3,2,3,1,1,2
+0,3,2,1,1,3,12
+1,1,0,3,0,0,1
+0,2,1,0,1,1,5
+1,2,1,1,1,0,16
+1,3,1,3,0,2,19
+0,0,1,0,1,1,0
+0,0,1,1,0,0,2
+0,0,1,0,0,3,14
+1,3,1,2,1,1,11
+1,2,0,2,1,0,4
+1,1,2,0,1,1,10
+1,2,3,0,1,0,6
+0,2,2,3,1,1,4
+1,2,0,3,0,3,10
+0,0,1,2,1,2,10
+0,2,3,3,1,0,18
+0,3,0,2,0,2,14
+0,3,0,2,1,2,16
+1,1,2,0,0,0,16
+0,3,1,1,1,0,1
+0,3,0,0,0,1,8
+0,0,3,2,0,1,1
+0,1,0,0,0,0,11
+0,1,1,3,0,1,10
+1,0,2,0,1,2,1
+1,0,3,3,1,3,17
+1,1,2,3,1,3,14
+1,0,0,2,1,3,5
+1,0,0,3,1,1,17
+1,2,0,2,0,1,15
+1,0,0,3,0,0,14
+0,0,2,1,1,3,3
+1,0,3,1,0,1,12