diff test-data/seq3_mode3.out @ 0:327f5721612f draft default tip

planemo upload for repository https://github.com/bgruening/galaxytools/tree/master/tools/rnasnp commit 6e51a331dbeab2786d8df5fd379ae3a63eb61d83

--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/seq3_mode3.out	Tue Dec 13 12:31:56 2016 -0500
@@ -0,0 +1,158 @@
+SNP	w	Slen	GC	interval	d	pvalue1	ewin	interval	d_max	pvalue2
+C18G	200	871	0.5917	7-134	0.1938	0.0521	200	8-136	0.2894	0.0300
+G19A	200	871	0.5890	10-67	0.0779	0.2841	200	147-216	0.2377	0.0488
+G19U	200	871	0.5890	9-67	0.1096	0.1738	200	14-78	0.2050	0.0686
+U22G	200	871	0.5856	11-66	0.2165	0.0348	200	15-64	0.2482	0.0518
+U22A	200	871	0.5856	17-62	0.1034	0.1982	200	15-64	0.2379	0.0572
+U24G	200	871	0.5804	13-66	0.1306	0.1342	200	15-64	0.2300	0.0612
+U24C	200	871	0.5804	17-62	0.2214	0.0354	200	15-64	0.3698	0.0165
+C29G	200	871	0.5764	17-54	0.1108	0.1880	200	15-64	0.1828	0.0998
+G47C	200	871	0.5870	27-53	0.1553	0.0924	200	13-62	0.2068	0.0970
+A58G	200	871	0.5853	7-124	0.2689	0.0171	200	11-134	0.3584	0.0286
+C61G	200	871	0.5862	7-124	0.2035	0.0469	200	12-67	0.2907	0.0436
+G119C	200	871	0.5768	102-134	0.1579	0.0634	200	106-162	0.2463	0.0656
+C123G	200	871	0.5759	104-152	0.0976	0.2067	200	106-162	0.2816	0.0527
+C132G	200	871	0.5753	101-134	0.1489	0.0857	200	86-135	0.2334	0.0898
+U173C	200	871	0.5791	161-205	0.2468	0.0151	200	157-206	0.2965	0.0409
+G175A	200	871	0.5760	168-206	0.1995	0.0337	200	157-206	0.2359	0.0722
+G175C	200	871	0.5760	159-205	0.2822	0.0084	200	157-206	0.2988	0.0400
+G175U	200	871	0.5760	160-205	0.2448	0.0158	200	157-206	0.2590	0.0580
+U176G	200	871	0.5771	168-210	0.2892	0.0083	200	148-211	0.3160	0.0330
+U176A	200	871	0.5771	161-206	0.1782	0.0523	200	148-245	0.2834	0.0449
+U177G	200	871	0.5782	168-210	0.2112	0.0275	200	148-211	0.2638	0.0535
+U177A	200	871	0.5782	159-198	0.2630	0.0112	200	157-206	0.2751	0.0480
+C180A	200	871	0.5816	161-198	0.3182	0.0049	200	157-206	0.2923	0.0420
+C180G	200	871	0.5816	142-196	0.1680	0.0591	200	150-209	0.2780	0.0480
+C183A	200	871	0.5822	168-206	0.2411	0.0148	200	157-206	0.2633	0.0557
+C183G	200	871	0.5822	168-206	0.2123	0.0245	200	157-206	0.2418	0.0682
+U185G	200	871	0.5844	164-196	0.2181	0.0224	200	157-206	0.2211	0.0739
+C186G	200	871	0.5829	168-206	0.2129	0.0243	200	157-206	0.2409	0.0598
+C190A	200	871	0.5821	168-206	0.2089	0.0342	200	157-206	0.2323	0.0781
+C190G	200	871	0.5821	169-206	0.2357	0.0223	200	157-206	0.2500	0.0664
+A193C	200	871	0.5852	161-198	0.1819	0.0387	200	157-206	0.2047	0.0970
+C194A	200	871	0.5838	161-206	0.1696	0.0525	200	157-206	0.2068	0.0923
+C194G	200	871	0.5838	169-205	0.2459	0.0140	200	157-206	0.2578	0.0570
+C195U	200	871	0.5848	162-203	0.2574	0.0103	200	157-206	0.2341	0.0684
+C207A	200	871	0.5835	168-210	0.2023	0.0355	200	148-211	0.2693	0.0573
+C208G	200	871	0.5810	146-222	0.1694	0.0608	200	146-222	0.2252	0.0852
+G211C	200	871	0.5736	168-212	0.2152	0.0287	200	148-211	0.2651	0.0594
+A212G	200	871	0.5736	145-222	0.2256	0.0242	200	146-222	0.2624	0.0609
+A230C	200	871	0.5786	225-245	0.1066	0.1712	200	227-304	0.2132	0.0953
+G239A	200	871	0.5835	161-240	0.1107	0.1598	200	142-245	0.2323	0.0799
+G239C	200	871	0.5835	154-245	0.1454	0.0903	200	142-245	0.3070	0.0411
+A240U	200	871	0.5835	154-245	0.1253	0.1258	200	142-245	0.2684	0.0577
+A244G	200	871	0.5810	131-248	0.0613	0.3614	200	242-441	0.2532	0.0662
+U273G	200	871	0.5786	237-283	0.1633	0.0673	200	227-287	0.2089	0.0991
+G277C	200	871	0.5761	238-284	0.0631	0.3506	200	317-366	0.3635	0.0253
+A315G	200	871	0.5686	298-436	0.0863	0.2390	200	294-382	0.2233	0.0868
+G320C	200	871	0.5661	315-358	0.0625	0.3540	200	317-366	0.2257	0.0849
+U327G	200	871	0.5661	311-359	0.1266	0.1231	200	301-366	0.3298	0.0337
+U327C	200	871	0.5661	315-357	0.2849	0.0092	200	316-366	0.3349	0.0323
+U327A	200	871	0.5661	311-358	0.1683	0.0620	200	301-366	0.3630	0.0254
+G328A	200	871	0.5661	312-359	0.1532	0.0795	200	317-366	0.3304	0.0335
+G328C	200	871	0.5661	317-357	0.4111	0.0012	200	312-446	0.3102	0.0400
+G328U	200	871	0.5661	317-357	0.1720	0.0583	200	312-446	0.2868	0.0490
+G329A	200	871	0.5686	317-356	0.0696	0.3149	200	312-446	0.3310	0.0334
+G329C	200	871	0.5686	317-357	0.1854	0.0468	200	312-361	0.2975	0.0447
+G329U	200	871	0.5686	322-352	0.1447	0.0915	200	312-444	0.3268	0.0346
+C330A	200	871	0.5711	315-358	0.3260	0.0047	200	317-366	0.3009	0.0433
+C330G	200	871	0.5711	274-358	0.1931	0.0412	200	275-366	0.3970	0.0191
+U331G	200	871	0.5686	315-357	0.2326	0.0216	200	316-365	0.3316	0.0332
+U331C	200	871	0.5686	311-358	0.1754	0.0551	200	312-361	0.2787	0.0527
+U331A	200	871	0.5686	315-357	0.1474	0.0874	200	317-366	0.2808	0.0517
+C332G	200	871	0.5686	316-358	0.1638	0.0667	200	275-366	0.3982	0.0189
+C340A	200	871	0.5611	322-356	0.2171	0.0278	200	311-360	0.3170	0.0377
+A344C	200	871	0.5586	313-358	0.1083	0.1663	200	242-464	0.2673	0.0583
+A344U	200	871	0.5586	316-357	0.0969	0.2007	200	242-464	0.2394	0.0749
+G345A	200	871	0.5586	316-357	0.3970	0.0015	200	316-365	0.3770	0.0225
+G345C	200	871	0.5586	316-357	0.3953	0.0015	200	312-361	0.3913	0.0200
+G345U	200	871	0.5586	316-357	0.3975	0.0014	200	316-365	0.3840	0.0213
+C346A	200	871	0.5586	315-357	0.3814	0.0019	200	312-361	0.3525	0.0278
+C346G	200	871	0.5586	258-367	0.2138	0.0294	200	311-360	0.2124	0.0960
+C347A	200	871	0.5611	315-357	0.2180	0.0274	200	311-360	0.2432	0.0724
+A348C	200	871	0.5636	313-358	0.1225	0.1316	200	312-446	0.3860	0.0209
+C349A	200	871	0.5611	311-366	0.0827	0.2537	200	317-366	0.3847	0.0211
+C349G	200	871	0.5611	311-366	0.0857	0.2416	200	317-366	0.3848	0.0211
+G378C	200	871	0.5711	368-435	0.1408	0.0974	200	288-383	0.2341	0.0786
+C395G	200	871	0.5711	383-444	0.1692	0.0610	200	279-396	0.2719	0.0560
+C445G	200	871	0.5636	436-555	0.1233	0.1299	200	435-556	0.2090	0.0990
+A462G	200	871	0.5636	443-504	0.1476	0.0871	200	447-560	0.2724	0.0557
+G468C	200	871	0.5711	452-484	0.1562	0.0756	200	448-561	0.3013	0.0432
+G469C	200	871	0.5711	451-481	0.1341	0.1088	200	376-556	0.3278	0.0343
+G470U	200	871	0.5736	461-481	0.2249	0.0245	200	448-555	0.2621	0.0611
+A474G	200	871	0.5786	468-560	0.1339	0.1092	200	448-560	0.3886	0.0205
+C477A	200	871	0.5786	466-486	0.1731	0.0573	200	447-560	0.2653	0.0594
+C477G	200	871	0.5786	466-486	0.2043	0.0343	200	448-560	0.2516	0.0671
+C478A	200	871	0.5786	461-481	0.2074	0.0326	200	447-558	0.2269	0.0839
+C478G	200	871	0.5786	461-481	0.1727	0.0577	200	447-558	0.2257	0.0849
+C478U	200	871	0.5786	461-531	0.2135	0.0295	200	448-558	0.2703	0.0568
+C486G	200	871	0.5810	469-560	0.1792	0.0519	200	452-560	0.3707	0.0238
+C486U	200	871	0.5810	442-555	0.1434	0.0933	200	437-556	0.2605	0.0619
+A488U	200	871	0.5835	442-504	0.1024	0.1833	200	437-556	0.2591	0.0627
+G490C	200	871	0.5810	443-504	0.1223	0.1322	200	437-556	0.2745	0.0547
+C498G	200	871	0.5786	442-504	0.1122	0.1560	200	451-504	0.2145	0.0941
+A500U	200	871	0.5786	443-504	0.1220	0.1329	200	435-546	0.2655	0.0592
+U501G	200	871	0.5810	442-556	0.1350	0.1072	200	452-564	0.2959	0.0453
+U501C	200	871	0.5810	442-556	0.0792	0.2687	200	452-564	0.2582	0.0632
+U501A	200	871	0.5810	442-556	0.1216	0.1336	200	452-564	0.2873	0.0488
+G502A	200	871	0.5786	442-504	0.0737	0.2944	200	448-564	0.2112	0.0970
+G502U	200	871	0.5786	443-504	0.0872	0.2357	200	447-564	0.2088	0.0992
+G503A	200	871	0.5761	443-504	0.1000	0.1906	200	375-556	0.2807	0.0518
+G503C	200	871	0.5761	442-504	0.0578	0.3828	200	375-556	0.3079	0.0408
+G503U	200	871	0.5761	439-504	0.1370	0.1037	200	375-556	0.3375	0.0316
+C504G	200	871	0.5736	484-504	0.1543	0.0781	200	485-536	0.2287	0.0826
+C505U	200	871	0.5736	462-531	0.1406	0.0977	200	467-531	0.2824	0.0510
+C506A	200	871	0.5761	498-545	0.1543	0.0781	200	500-549	0.2323	0.0799
+U507G	200	871	0.5786	501-536	0.1399	0.0988	200	487-536	0.2751	0.0544
+U507A	200	871	0.5786	498-536	0.1579	0.0736	200	487-536	0.2953	0.0455
+A510G	200	871	0.5786	461-531	0.1746	0.0559	200	467-531	0.2998	0.0437
+G526C	200	871	0.5786	504-527	0.1315	0.1135	200	371-543	0.2739	0.0550
+C528G	200	871	0.5786	484-504	0.1174	0.1433	200	448-560	0.2623	0.0610
+U538G	200	871	0.5761	479-550	0.1485	0.0858	200	448-560	0.3685	0.0242
+C542G	200	871	0.5761	437-556	0.1471	0.0878	200	436-556	0.2684	0.0577
+C546G	200	871	0.5786	442-560	0.0765	0.2811	200	447-559	0.2643	0.0599
+C546U	200	871	0.5786	436-555	0.0950	0.2071	200	437-556	0.2194	0.0900
+A567U	200	871	0.5786	564-641	0.1412	0.0968	200	562-641	0.2266	0.0842
+G611C	200	871	0.5711	587-637	0.4460	0.0007	200	588-637	0.4910	0.0088
+G611U	200	871	0.5711	582-631	0.2850	0.0091	200	588-637	0.3935	0.0196
+U615G	200	871	0.5736	580-623	0.3044	0.0066	200	575-631	0.4179	0.0160
+G616C	200	871	0.5711	580-617	0.3617	0.0026	200	580-631	0.3970	0.0191
+A623G	200	871	0.5586	564-636	0.1137	0.1523	200	562-636	0.2217	0.0881
+A627C	200	871	0.5511	564-636	0.1108	0.1595	200	562-636	0.2152	0.0935
+A629G	200	871	0.5511	565-636	0.1348	0.1076	200	562-636	0.2352	0.0778
+U637G	200	871	0.5486	561-641	0.1374	0.1030	200	562-641	0.2370	0.0766
+A639U	200	871	0.5486	561-641	0.1267	0.1229	200	562-641	0.2487	0.0689
+G673C	200	871	0.5338	632-674	0.0744	0.2848	200	632-681	0.2025	0.0896
+C678U	200	871	0.5381	670-745	0.2001	0.0314	200	632-681	0.2926	0.0412
+G682U	200	871	0.5359	670-781	0.1327	0.1047	200	634-683	0.3026	0.0371
+C700A	200	871	0.5323	687-734	0.3024	0.0069	200	688-737	0.2130	0.0874
+C700G	200	871	0.5323	687-734	0.2348	0.0200	200	688-737	0.2303	0.0739
+A702G	200	871	0.5351	670-745	0.2305	0.0204	200	677-745	0.2007	0.0987
+G705A	200	871	0.5313	688-734	0.2973	0.0101	200	688-737	0.3114	0.0402
+G705C	200	871	0.5313	688-734	0.3418	0.0052	200	688-737	0.3277	0.0348
+G705U	200	871	0.5313	688-734	0.3782	0.0030	200	688-737	0.3589	0.0265
+G706C	200	871	0.5301	688-734	0.2760	0.0092	200	688-737	0.2796	0.0480
+G706U	200	871	0.5301	688-734	0.3926	0.0013	200	688-737	0.3664	0.0220
+C709G	200	871	0.5289	688-734	0.2638	0.0130	200	688-737	0.2477	0.0659
+U725G	200	871	0.5331	688-734	0.3898	0.0018	200	688-737	0.3540	0.0271
+A729U	200	871	0.5306	700-734	0.2789	0.0089	200	681-741	0.2549	0.0618
+G730U	200	871	0.5292	688-734	0.3585	0.0039	200	688-737	0.3104	0.0448
+C731A	200	871	0.5279	688-734	0.4156	0.0021	200	687-736	0.3854	0.0223
+C731G	200	871	0.5279	688-734	0.3453	0.0057	200	688-737	0.3380	0.0330
+C732A	200	871	0.5294	688-734	0.3023	0.0076	200	686-736	0.2990	0.0407
+U734C	200	871	0.5325	688-734	0.2446	0.0187	200	686-735	0.2282	0.0829
+A767G	200	871	0.5213	746-771	0.0963	0.2207	200	737-786	0.2207	0.0937
+A775U	200	871	0.5185	770-843	0.0638	0.3782	200	737-786	0.2391	0.0796
+U787G	200	871	0.5193	770-814	0.2678	0.0135	200	757-814	0.2145	0.0946
+G811C	200	871	0.5211	773-814	0.1850	0.0578	200	673-819	0.2061	0.0954
+C812G	200	871	0.5192	777-814	0.3720	0.0024	200	765-814	0.2643	0.0577
+C838U	200	871	0.5342	824-862	0.0937	0.2344	200	821-870	0.2084	0.0786
+U855G	200	871	0.5300	812-861	0.1019	0.1781	200	813-862	0.1722	0.0971
+A858G	200	871	0.5280	824-862	0.1187	0.1149	200	813-862	0.2035	0.0669
+C860G	200	871	0.5283	826-863	0.1000	0.1610	200	814-863	0.1686	0.0927
+U862G	200	871	0.5238	800-870	0.0646	0.2581	200	764-871	0.1600	0.0978
+U862A	200	871	0.5238	830-866	0.1325	0.0769	200	770-866	0.1756	0.0819
+U863G	200	871	0.5215	824-866	0.1291	0.0891	200	817-866	0.2549	0.0360
+A867G	200	871	0.5171	830-871	0.1078	0.0925	200	817-871	0.1844	0.0678
+G869C	200	871	0.5172	830-871	0.0884	0.0736	200	814-871	0.1601	0.0522
+C870G	200	871	0.5149	823-870	0.0480	0.0976	200	817-870	0.1080	0.0490