Mercurial > repos > workflow4metabolomics > influx_si
diff test-data/e_coli_i.ftbl @ 2:57f199aa07e4 draft default tip
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| author | workflow4metabolomics |
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--- a/test-data/e_coli_i.ftbl Wed Sep 13 19:52:44 2023 +0000 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,789 +0,0 @@ -PROJECT - NAME VERSION FORMAT DATE COMMENT - K12_MG1655.ftbl 1 101109 modele E coli K12 MG1655 WT avec voies centrales completes et voies biomasse simplifiees - -NETWORK - FLUX_NAME EDUCT_1 EDUCT_2 PRODUCT_1 PRODUCT_2 - -// Glycolyse. -// PPP -// TCA -// voies anaplerotiques: pepc. enz malique -// voie glyoxylate -// avec pool interne unique de CO2 provenant soit du metabolisme soit de l'exterieur (CO2upt laisse libre) -// saisie differentielle des substrats marques - - -// Uptake substrats - - Glucupt_1 Gluc_1 Glc6P // fehlt bei wolfgang - #ABCDEF #ABCDEF // fehlt bei wolfgang - - Glucupt_U Gluc_U Glc6P // fehlt bei wolfgang - #ABCDEF #ABCDEF // fehlt bei wolfgang - -// CO2upt CO2_ext CO2 // entree de CO2 non marque -// #A #A // ce flux est a laisser libre - -// FTHF0 FTHF_0 FTHF // prise en charge de FTHF non marque -// #A #A - -// FTHF1 FTHF_1 FTHF // prise en charge de FTHF marque -// #a #a - - -// Embden Meyerhof Parnas Pathway - - pgi Glc6P Fru6P - #ABCDEF #ABCDEF - - pfk Fru6P FruBP - #ABCDEF #ABCDEF - - ald FruBP GA3P GA3P - #ABCDEF #CBA #DEF - -// tpi DHAP GA3P -// #ABC #CBA - - pgk GA3P PGA - #ABC #ABC - - eno PGA PEP - #ABC #ABC - - pyk PEP Pyr - #ABC #ABC - - -// Methylglyoxal Pathway - -// mgs DHAP Pyr -// #ABC #ABC - - -// Pentose Phosphate Pathway - - zwf Glc6P Gnt6P - #ABCDEF #ABCDEF - - gnd Gnt6P CO2 Rib5P - #ABCDEF #A #BCDEF - - edd Gnt6P Pyr GA3P - #ABCDEF #ABC #DEF - -// ta Ery4P Fru6P GA3P Sed7P -// #ABCD #abcdef #def #abcABCD - -// tk1 GA3P Sed7P Rib5P Rib5P -// #ABC #abcdefg #abABC #cdefg - -// tk2 GA3P Fru6P Rib5P Ery4P -// #ABC #abcdef #abABC #cdef - - ta GA3P Sed7P Ery4P Fru6P - #ABC #abcdefg #defg #abcABC - - tk1 Rib5P Rib5P GA3P Sed7P - #ABCDE #abcde #CDE #ABabcde - - tk2 Rib5P Ery4P GA3P Fru6P - #ABCDE #abcd #CDE #ABabcd - - -// Tricarboxylic Acid Cycle - - pdh Pyr AcCoA CO2 - #ABC #BC #A - - citsynth AcCoA OAA ICit - #AB #abcd #dcbaBA - - idh ICit AKG CO2 - #ABCDEF #ABCEF #D - - akgdh AKG Suc CO2 - #ABCDE #BCDE #A - - fum_a Suc Mal - #ABCD #ABCD - - fum_b Suc Mal - #ABCD #DCBA - - maldh Mal OAA - #ABCD #ABCD - - -// Glyoxylate Shunt - -// gs1 ICit GlyOx Suc -// #ABCDEF #AB #DCEF - -// gs2 GlyOx AcCoA OAA -// #AB #ab #ABba - - -// Anaplerotic Reactions - - ppc PEP CO2 OAA // PEPcarboxylase - #ABC #a #ABCa - - mae Mal Pyr CO2 // enzyme malique - #ABCD #ABC #D - -// pck OAA PEP CO2 // PEP carboxykinase -// #ABCD #ABC #D - - -// Biosynthetic Pathways - - // Glucose-6-Phosphate Family - - bs_glc6P Glc6P BM_Glc6P - #ABCDEF #ABCDEF - - // Fructose-6-Phosphate Family - - bs_fru6P Fru6P BM_Fru6P // sortie de Fru6P pour biomasse - #ABCDEF #ABCDEF - - // Phosphoglycerate Family - - bs_pga PGA BM_PGA - #ABC #ABC - - bs_pga_aux BM_PGA PGA_Aux - #ABC #ABC - - bs_pga1 BM_PGA Ser - #ABC #ABC - - bs_pga1_aux Ser Ser_Aux - #ABC #ABC - - bs_pga2 Ser Cys // ce flux sert de sortie pour PGA hors formation de Gly - #ABC #ABC - - bs_pga2_aux Cys Cys_Aux // ce flux sert de sortie pour PGA hors formation de Gly - #ABC #ABC - - bs_pga3 Ser Gly FTHF // formation de gly pour biomasse - #ABC #AB #C // ce flux est reversible - - bs_pga3_aux Gly Gly_Aux // pour conserver Gly comme metabolite intracellulaire - #AB #AB - - // TrioseP Family - - bs_DHAP GA3P Glp // formation glycerolP pour lipides - #ABC #ABC - - // Pyruvate Family - - bs_pyr Pyr BM_Pyr - #ABC #ABC - - bs_pyr1 BM_Pyr Ala - #ABC #ABC - - bs_pyr1_aux Ala Ala_Aux // pour conserver Ala comme metabolite intracellulaire - #ABC #ABC - - bs_pyr2 BM_Pyr BM_Pyr AKV CO2 // AKV et Val ont le meme squelette C - #ABC #abc #ABbcC #a // cette reaction permet d'utiliser eventuellement les donnees obtenues sur Val - - bs_pyr4 AKV Val // permet de tenir compte de la sortie de Val - #ABCDE #ABCDE - - bs_pyr4_aux Val Val_Aux // permet de tenir compte de la sortie de Val - #ABCDE #ABCDE - - bs_pyr3 AKV BM_AcCoA Leu CO2 - #ABCDE #ab #abBCDE #A - - bs_pyr3_aux Leu Leu_Aux // pour conserver Leu comme metabolite intracellulaire - #ABCDEF #ABCDEF - - - // Erythrose-4-Phosphate Family - - bs_e4p Ery4P BM_Ery4P // pour utiliser les donnees sur Ery4P - #ABCD #ABCD - -// bs_e4p_aux BM_Ery4P Ery4P_aux // pour utiliser les donnees sur Ery4P -// #ABCD #ABCD - - - // Ribose-5-Phosphate Family - - bs_rib5p Rib5P BM_Rib5P // pour utiliser les donnees sur Rib5P - #ABCDE #ABCDE - - bs_rib5p1 BM_Rib5P FTHF His // pour utiliser les donnees sur Rib5P - #ABCDE #a #EDCBAa - - bs_rib5p1_aux His His_Aux // sortie pour conserver His comme metabolite intracellulaire - #ABCDEF #ABCDEF - - bs_rib5p2 BM_Rib5P Ri5P_Aux // sortie de Ri5P pour autres besoins que His - #ABCDE #ABCDE // ce flux est important pour ne pas imposer de fausses contraintes sur FTHF si on considerait His comme seule sortie - - - // Aromatic Amino Acids - - bs_pep PEP BM_PEP - #ABC #ABC - - bs_pep1 BM_PEP BM_Ery4P DAHP - #ABC #abcd #ABCabcd - - bs_pep2 BM_PEP DAHP Chor - #ABC #abcdefg #ABCabcdefg - - bs_pep3a Chor Phe CO2 - #ABCDEFGHIJ #ABCEFGHIJ #D - - bs_pep3b Chor Phe CO2 - #ABCDEFGHIJ #ABCEJIHGF #D - - bs_pep3_aux Phe Phe_Aux - #ABCEFGHIJ #ABCEFGHIJ - - bs_pep4a Chor Tyr CO2 - #ABCDEFGHIJ #ABCEFGHIJ #D - - bs_pep4b Chor Tyr CO2 - #ABCDEFGHIJ #ABCEJIHGF #D - - bs_pep4_aux Tyr Tyr_Aux - #ABCEFGHIJ #ABCEFGHIJ - - bs_pep5 BM_PEP PEP_Aux - #ABC #ABC - - bs_pep6 Chor BM_Rib5P Trp PyrCO2 - #ABCDEFGHIJ #abcde #edcbaJEFGHI #ABCD - - bs_pep6_aux Trp Trp_Aux - #ABCDEFGHIJK #ABCDEFGHIJK - - bs_pep7 PyrCO2 Pyr CO2 - #ABCD #ABC #D - - - // Acetyl-CoA - - bs_accoa AcCoA BM_AcCoA - #AB #AB - - bs_accoa_aux BM_AcCoA AcCoA_Aux - #AB #AB - - - // Alpha-Ketoglutarate Family - - bs_akg AKG BM_AKG // Les donnees sur Glu peuvent etre assimilee a AKG - #ABCDE #ABCDE - - bs_akg1 BM_AKG Glu // Les donnees sur Glu peuvent etre assimilee a AKG - #ABCDE #ABCDE - - bs_akg2 Glu Pro // Les donnees sur Glu peuvent etre assimilee a AKG - #ABCDE #ABCDE - - bs_akg3 Glu Gln // Les donnees sur Glu peuvent etre assimilee a AKG - #ABCDE #ABCDE - - bs_akg4 Glu CO2 Arg // Les donnees sur Glu peuvent etre assimilee a AKG - #ABCDE #a #ABCDEa - - bs_akg4_aux Arg Arg_Aux // Les donnees sur Glu peuvent etre assimilee a AKG - #ABCDEF #ABCDEF - - - // Oxaloacetate Family - - bs_oaa OAA BM_OAA - #ABCD #ABCD - - bs_oaa1 BM_OAA Asp - #ABCD #ABCD - - bs_oaa1_aux Asp Asp_Aux - #ABCD #ABCD - - bs_oaa2 Thr BM_Pyr Ile CO2 - #ABCD #abc #ABbCDc #a - - bs_oaa2_aux Ile Ile_Aux - #ABCDEF #ABCDEF - - bs_oaa3a BM_OAA BM_Pyr Lys CO2 - #ABCD #abc #ABCDcb #a - - bs_oaa3b BM_OAA BM_Pyr Lys CO2 - #ABCD #abc #abcDCB #A - - bs_oaa3_aux Lys Lys_Aux - #ABCDEF #ABCDEF - - bs_oaa4 BM_OAA OAA_Aux - #ABCD #ABCD - - bs_oaa5 BM_OAA Thr - #ABCD #ABCD - - bs_oaa5_aux Thr Thr_Aux - #ABCD #ABCD - - bs_oaa6 BM_OAA FTHF Met - #ABCD #a #ABCDa - - bs_oaa6_aux Met Met_Aux - #ABCDE #ABCDE - - bs_oaa7 BM_OAA Asn - #ABCD #ABCD - - bs_oaa7_aux Asn Asn_Aux - #ABCD #ABCD - - -// Flux de sortie - - out_co2 CO2 CO2_out // Sortie de CO2 - #A #A - - out_Ac AcCoA Acetate // Sortie d'acetate - #AB #AB - - out_FTHF FTHF FTHF_out - #A #A - -FLUXES - NET - NAME FCD VALUE(F/C) ED_WEIGHT LOW(F) INC(F) UP(F) - - Glucupt_1 F 0.7 //0.807194 - Glucupt_U D -// CO2upt F 0.669589 -// FTHF0 F 0.00224836 -// FTHF1 F 0.001 - - pgi D - pfk D - ald D -// tpi D - pgk D - eno D - pyk F 1.4 - - zwf F 0.2 - gnd F 0.15062 - edd D - ta D - tk1 D - tk2 D - - pdh D - citsynth D - idh D - akgdh D - fum_a D - fum_b D - maldh D - -// gs1 C 0 -// gs2 D - - ppc D - mae D -// pck D - - // flux de biomasse - - bs_glc6P C 0.0109 // sortie de G6P - bs_fru6P C 0.0038 // sortie de F6P - bs_pga C 0.0791 // sortie de PGA pour formation de biomasse - bs_pga_aux D // sortie de PGA pour formation de biomasse - bs_pga1 D // conversion PGA donne ser - bs_pga1_aux C 0.0109 // conversion PGA donne ser - bs_pga2 D - bs_pga2_aux C 0.0046 // conversion PGA donne Cys - bs_pga3 D // reaction de synthese de Gly - bs_pga3_aux C 0.0308 // sortie de Gly - bs_DHAP C 0.0068 // formation de glycerolP pour lipides - bs_pyr C 0.1501 // avant : 0.1547 // sortie de Pyr pour formation de biomasse - bs_pyr1 D // formation d'Ala - bs_pyr1_aux D // sortie d'Ala. correspond aux sorties de Pyr qui ne sont pas associees a Val et Leu - bs_pyr2 D // synthese d'AKV. consomme 2 Pyr - bs_pyr4 D - bs_pyr4_aux C 0.0213 // sortie correspondant a l'utilisation de Val pour la biomasse - bs_pyr3 D // synthese de Leu (AKV+AcCoA consommes) - bs_pyr3_aux C 0.0227 // sortie de Leu - bs_e4p D // sortie d'Ery4p pour biomasse -// bs_e4p_aux C 0 // sortie d'Ery4p pour Trp - bs_rib5p C 0.0476 // synthese d'His - bs_rib5p1 D // synthese d'His - bs_rib5p1_aux C 0.0048 // sortie d'His - bs_rib5p2 D // sortie de Rib5P autre que His - bs_pep C 0.0381 // sortie de PEP - bs_pep1 D // sortie de PEP - bs_pep2 D - bs_pep3a D - bs_pep3b D - bs_pep3_aux C 0.0093 - bs_pep4a D - bs_pep4b D - bs_pep4_aux C 0.0069 - bs_pep5 C 0.0027 - bs_pep6 D - bs_pep6_aux D - bs_pep7 D - bs_accoa C 0.1565 // sortie d'AcCoA pour biomasse - bs_accoa_aux D // sortie d'AcCoA pour biomasse en dehors de synthese Leu - bs_akg C 0.0571 // sortie d'AKG - bs_akg1 D - bs_akg2 C 0.0111 - bs_akg3 C 0.0132 - bs_akg4 D - bs_akg4_aux D - bs_oaa C 0.0947 // sortie d'OAA pour formation de biomasse - bs_oaa1 D // sortie d'OAA pour Asp - bs_oaa1_aux C 0.0121 // sortie d'Asp - bs_oaa2 D // synthese d'Ile - bs_oaa2_aux C 0.0146 // sortie d'Ile - bs_oaa3a D - bs_oaa3b D - bs_oaa3_aux C 0.0173 - bs_oaa4 D - bs_oaa5 D - bs_oaa5_aux C 0.0128 - bs_oaa6 D - bs_oaa6_aux C 0.0077 - bs_oaa7 D - bs_oaa7_aux C 0.0121 - - // Flux de sortie - - out_co2 D // sortie de CO2 - out_Ac F 0.213 // sortie d'acetate - out_FTHF D // sortie de FTHF. a laisser libre pour ne pas imposer de contraintes sur FTHF - - - XCH - NAME FCD VALUE(F/C) ED_WEIGHT LOW(F) INC(F) UP(F) - - Glucupt_1 D - Glucupt_U D -// CO2upt D -// FTHF0 D -// FTHF1 D - - pgi C 0.752386 // 2011-02-22 ssg: was F => often unresolved with --irand option - pfk C 0 - ald F 0.413926 -// tpi F 0.5 - pgk C 0.984718 // 2011-02-22 ssg: was F => often unresolved with --irand option - eno F 0.800962 - pyk C 0.0109591 // 2010-10-01 ssg: was F => unresolved if co2 uptake is unlimited - - zwf C 0 - gnd C 0 - edd C 0 - ta F 0.359468 - tk1 F 0.166316 - tk2 F 2.11559e-03 - - pdh C 0.0322745 // 2010-10-02 ssg: was F, otherwise unsolvable in monte-carlo - citsynth C 0 - idh C 0 - akgdh C 0 - fum_a F 0.395958 - fum_b D - maldh C 0.647115 //********************************************** C pour analyse de sensibilite, F pour minimisation - -// gs1 C 0 -// gs2 C 0 - - ppc F 0.256772 - mae C 0 -// pck C 0 - - bs_glc6P D // sortie de G6P - bs_fru6P D // sortie de F6P - bs_pga C 0 // conversion PGA donne Ser - bs_pga_aux D // conversion PGA donne Ser - bs_pga1 C 0 // conversion PGA donne Ser - bs_pga1_aux D // conversion PGA donne Ser - bs_pga2 C 0 // ser donne Cys. correspond a la sortie de PGA pour biomasse autre que formation Gly - bs_pga2_aux D - bs_pga3 C 0.011799 // reaction de synthese de Gly. cette reaction est reversible - bs_pga3_aux D // sortie de Gly - bs_DHAP D // formation de glycerolP pour lipides - bs_pyr C 0 // formation d'Ala - bs_pyr1 C 0 // formation d'Ala - bs_pyr1_aux D // sortie d'Ala. correspond aux sorties de Pyr qui ne sont pas associees a Val et Ile - bs_pyr2 C 0 // synthese d'AKV. consomme 2 Pyr - bs_pyr4 C 0 - bs_pyr4_aux D // sortie correspondant a l'utilisation de Val pour la biomasse - bs_pyr3 C 0 // synthese de Leu (AKV+AcCoA consommes) - bs_pyr3_aux D // sortie de Leu - bs_e4p C 0 // sortie d'Ery4p -// bs_e4p_aux D // sortie d'Ery4p pour Trp - bs_rib5p C 0 // synthese d'His - bs_rib5p1 C 0 // synthese d'His - bs_rib5p1_aux D // sortie d'His - bs_rib5p2 D // sortie de Rib5P autre que His - bs_accoa C 0 // sortie d'AcCoA pour biomasse - bs_accoa_aux D // sortie d'AcCoA pour biomasse en dehors de synthese Leu - bs_pep C 0 // sortie de PEP - bs_pep1 C 0 // sortie de PEP - bs_pep2 C 0 - bs_pep3a C 0 - bs_pep3b C 0 - bs_pep3_aux D - bs_pep4a C 0 - bs_pep4b C 0 - bs_pep4_aux D - bs_pep5 D - bs_pep6 C 0 - bs_pep6_aux D - bs_pep7 C 0 - bs_akg C 0 // sortie d'AKG - bs_akg1 C 0 - bs_akg2 D - bs_akg3 D - bs_akg4 C 0 - bs_akg4_aux D - bs_oaa C 0 - bs_oaa1 C 0 // sortie d'OAA autres que Met - bs_oaa1_aux D // sortie d'OAA autres que Met - bs_oaa2 C 0 // synthese de Met - bs_oaa2_aux D // sortie de Met - bs_oaa3a C 0 - bs_oaa3b C 0 - bs_oaa3_aux D - bs_oaa4 D - bs_oaa5 C 0 - bs_oaa5_aux D - bs_oaa6 C 0 - bs_oaa6_aux D - bs_oaa7 C 0 - bs_oaa7_aux D - - // Flux de sortie - - out_co2 D // sortie de CO2 - out_Ac D // sortie d'acetate - out_FTHF D // sortie de FTHF. a laisser libre pour ne pas imposer de contraintes sur FTHF - - -EQUALITIES - NET - VALUE FORMULA - - 0 fum_a-fum_b // scrambling reaction - 1 Glucupt_1+Glucupt_U - 0 bs_oaa3a-bs_oaa3b - 0 bs_pep3a-bs_pep3b - 0 bs_pep4a-bs_pep4b - - XCH - VALUE FORMULA - - 0 fum_a-fum_b - -INEQUALITIES - NET - VALUE COMP FORMULA -// Inequalities for Input and Output Fluxes are generated automatically - 1 <= pyk - 0.0001 <= edd - 0.0001 <= gnd - 0.0001 <= zwf - 0.0001 <= ppc - 0.0001 <= mae -// 2 >= CO2upt // 2010-08-18 too high value makes jacobian rank deficient - XCH - VALUE COMP FORMULA -// Inequalities for Input and Output Fluxes are generated automatically - METAB - VALUE COMP FORMULA -// 1.2 >= AKG - - -FLUX_MEASUREMENTS - FLUX_NAME VALUE DEVIATION // Val Dev - out_Ac 0.213 0.0001 - -LABEL_INPUT - META_NAME ISOTOPOMER VALUE - - Gluc_U #111111 1 - #000000 0. - Gluc_1 #100000 1. - #000000 0. -// CO2_ext #0 0.989 -// #1 0.011 - -// FTHF_0 #0 1 -// FTHF_1 #1 1 - - -LABEL_MEASUREMENTS - META_NAME CUM_GROUP VALUE DEVIATION CUM_CONSTRAINTS - // Example - -PEAK_MEASUREMENTS - META_NAME PEAK_NO VALUE_S VALUE_D- VALUE_D+ VALUE_DD VALUE_T DEVIATION_S DEVIATION_D- DEVIATION_D+ DEVIATION_DD/T - - -MASS_SPECTROMETRY - META_NAME FRAGMENT WEIGHT VALUE DEVIATION - -// Deviation fixee a 0.02 // correction inoc 0.062 - - - - Suc 1,2,3,4 1 0.371605319 0.01 - 2 0.360829749 0.01 - 3 0.208425325 0.01 - 4 0.059139607 0.01 -// Mal 1,2,3,4 0 0.164619329483 0.02 -// 1 0.110072868518 0.02 -// 2 0.637801316225333 0.02 -// 3 0.0863461044204333 0.02 -// 4 0.00116038135315367 0.02 - ICit 1,2,3,4,5,6 0 0.131864539419667 0.02 - 1 0.225857638569 0.02 - 2 0.256421170949333 0.02 - 3 0.209230210478667 0.02 - 4 0.116863585449667 0.02 - 5 0.0457727744643333 0.02 - 6 0.0139900806697867 0.02 - PEP 1,2,3 0 0.421359839367667 0.01 - 1 0.358998301162333 0.01 - 2 0.0348521859365667 0.01 - 3 0.184789673534 0.01 - PGA 1,2,3 0 0.434335785072667 0.01 - 1 0.352829683224667 0.01 - 2 0.0323479804176 0.01 - 3 0.180486551285333 0.01 - FruBP 1,2,3,4,5,6 0 0.0738121029259333 0.01 - 1 0.454450017158667 0.01 - 2 0.160823529969333 0.01 - 3 0.0944468077710667 0.01 - 4 0.105281338489667 0.01 - 5 0.0155016033633 0.01 - 6 0.0956846003217333 0.01 - Glc6P 1,2,3,4,5,6 0 0.0160587173349 0.01 - 1 0.673510772480667 0.01 - 2 0.0930110047641 0.01 - 3 0.0280359937297 0.01 - 4 0.0397315614067667 0.01 - 5 0.0145524520950667 0.01 - 6 0.135099498189 0.01 - Fru6P 1,2,3,4,5,6 0 0.0235029951295 0.01 - 1 0.624253565357667 0.01 - 2 0.113068441282333 0.01 - 3 0.0456605631765 0.01 - 4 0.0516089447155667 0.01 - 5 0.0185881765378333 0.01 - 6 0.123317313800333 0.01 - Rib5P 1,2,3,4,5 0 0.341615670498667 0.01 - 1 0.25454117519 0.01 - 2 0.159027180368333 0.01 - 3 0.113789577528667 0.01 - 4 0.0615266612553333 0.01 - 5 0.0694997351590667 0.01 - Gnt6P 1,2,3,4,5,6 0 0.0249552273874 0.01 - 1 0.672556163913 0.01 - 2 0.0866890773125333 0.01 - 3 0.0313987199704333 0.01 - 4 0.0314691889898667 0.01 - 5 0.0138168327362333 0.01 - 6 0.139114789690333 0.01 -// Ery4P 1,2,3,4 0 0.178453461108 0.01 -// 1 0.412398433968333 0.01 -// 2 0.273694508221667 0.01 -// 3 0.116142498670667 0.01 -// 4 0.0193110980315 0.01 -METABOLITE_POOLS - META_NAME META_SIZE - AKG -1 - AKV 1 - AcCoA 1 - Ala 1 - Arg 1 - Asn 1 - Asp 1 - BM_AKG 1 - BM_AcCoA 1 - BM_Ery4P 1 - BM_OAA 1 - BM_PEP 1 - BM_PGA 1 - BM_Pyr 1 - BM_Rib5P 1 - CO2 1 - Chor 1 - Cys 1 - DAHP 1 - Ery4P -1 - FTHF 1 - Fru6P -1 - FruBP -1 - GA3P -1 - Glc6P 1 - Glu 1 - Gly 1 - Gnt6P -1 - His 1 - ICit -1 - Ile 1 - Leu 1 - Lys 1 - Mal 1 - Met 1 - OAA -1 - PEP -1 - PGA -1 - Phe 1 - Pyr -1 - PyrCO2 1 - Rib5P -1 - Sed7P -1 - Ser 1 - Suc -1 - Thr 1 - Trp 1 - Tyr 1 - Val 1 -METAB_MEASUREMENTS - META_NAME VALUE DEVIATION - Fru6P 0.4263681348074568 0.01 - GA3P 0.469998855791378 0.01 - FruBP 1.860001398406723 0.01 - PEP 0.1099999780931608 0.01 - Rib5P 0.01933825682263468 0.01 - 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