Repository blast_reporting
Owner: damion
Synopsis: Provides filtered, sorted HTML and tabular reports of Blast XML format search results
NCBI BLAST+ searches can output in a range of formats, but in the past only the XML format included fields like sequence description. This tool converts the NCBI BLAST XML report into 12, 24, 26 or custom column tabular and HTML reports.  It is used as a command-line tool or via its Galaxy tool.

The tool allows almost complete control over which fields are displayed and filtered, how columns are named, and how the HTML report on each query is sectioned.  Search result records can be filtered out based on values in numeric or textual fields.  Matches (by accession id) to a selection of reference databases can be shown, and this can include a description of the matched sequence.
Type: unrestricted
Revision: 1:812de0e282bd
This revision can be installed: True
Times cloned / installed: 375

Contents of this repository

Name Description Version Minimum Galaxy Version
BLAST search results reporting tool 1.0.5 any

Categories
Sequence Analysis - Tools for performing Protein and DNA/RNA analysis