Repository revision
repository tip
Select a revision to inspect and download versions of Galaxy utilities from this repository.

Repository isocor
Name: isocor
Owner: gmat
Synopsis: Isotope Correction for mass spectrometry labeling experiments
IsoCor is a scientific software dedicated to the correction of mass spectrometry (MS) data for naturally occuring isotopes. IsoCor corrects raw MS data (mass fractions) for naturally-occurring isotopes of all elements and purity of the isotopic tracer. The output of IsoCor is the isotopologue distribution of the molecule (i.e. the relative fractions of molecular entities differing only in the number of isotopic substitutions of the tracer). IsoCor also calculates the mean enrichment (i.e. the mean isotopic content in the molecule) in metabolites.
It is one of the routine tools that we use at the MetaSys team and MetaToul platform in isotopic studies of metabolic systems.
The code is open-source, and available under a GPLv3 license. Additional information can be found in IsoCor publication.
Detailed documentation can be found online at Read the Docs (https://isocor.readthedocs.io/). Check out the Tutorials to use the best correction option!
Clone this repository: hg clone https://toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/gmat/isocor
Type: unrestricted
Revision: 1:fa183805db31
This revision can be installed: True
Times cloned / installed: 154

Contents of this repository

Name Description Version Minimum Galaxy Version
0.1.3 16.01

Categories
Metabolomics - Tools for use in the study of Metabolomics
Systems Biology - Systems biology tools