Repository megan_sam2rma
Owner: iuc
Synopsis: MEGAN: Generate a MEGAN rma6 file tool from the megan suite
MEGAN Community Edition - Interactive exploration and analysis of large-scale microbiome sequencing data.  MEGAN 
is a tool for studying the taxonomic content of a set of DNA reads, typically collected in a metagenomics project.
In a preprocessing step, a sequence alignment of all reads against a suitable database of reference DNA or protein
sequences must be performed to produce an input file for the program. MEGAN is suitable for DNA reads (metagenome
data), RNA reads (metatranscriptome data), peptide sequences (metaproteomics data) and, using a suitable synonyms
file that maps SILVA ids to taxon ids, for 16S rRNA data (amplicon sequencing).
Type: unrestricted
Revision: 1:ef0443c0eaba
This revision can be installed: True
Times cloned / installed: 81

Contents of this repository

Name Description Version Minimum Galaxy Version
from a DIAMOND or MALT sam file 6.21.7+galaxy0 20.09

Sequence Analysis - Tools for performing Protein and DNA/RNA analysis